
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2005] =>      2005 nucs 'mol-32-1e87-090541_2005'

Score:        1850
Aligned:      2004        nucs
Identic:      1990 ( 99%) nucs =>        28 (100%)      1962 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5597499,5597526] EXCISED REGION [5597528,5599502]
 second seq =>  [      1,     28] EXCISED REGION [     30,   2005]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5597527,5597527]
 second seq =>         1 nucs [29,29]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1211,1211]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAG 5597526
          ||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAG 28

EXCISED REGION

  5597528 CTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTT 5597587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       30 CTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTT 89

  5597588 GAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAG 5597647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       90 GAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAG 149

  5597648 GATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGAT 5597707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      150 GATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGAT 209

  5597708 CAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAAC 5597767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      210 CAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAAC 269

  5597768 TTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAA 5597827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      270 TTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAA 329

  5597828 GAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGC 5597887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      330 GAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGC 389

  5597888 TCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAAC 5597947
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|
      390 TCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACC 449

  5597948 GAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGC 5598007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      450 GAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGC 509

  5598008 AACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTT 5598067
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 AACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTT 569

  5598068 TAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGA 5598127
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      570 TAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGA 629

  5598128 TGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAG 5598187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 TGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAG 689

  5598188 TTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCC 5598247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 TTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCC 749

  5598248 AAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTT 5598307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 AAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTT 809

  5598308 CCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAA 5598367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 CCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAA 869

  5598368 ATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTT 5598427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 ATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTT 929

  5598428 TCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGT 5598487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 TCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGT 989

  5598488 AGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGT 5598547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 AGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGT 1049

  5598548 GGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGG 5598607
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1050 GGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAAAAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGG 1109

  5598608 CATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGC 5598667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 CATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGC 1169

  5598668 CAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTA 5598726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     1170 CAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTA 1229

  5598727 GTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTC 5598786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 GTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTC 1289

  5598787 CCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCA 5598846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCA 1349

  5598847 GCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATT 5598906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 GCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATT 1409

  5598907 TACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCC 5598966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCC 1469

  5598967 CCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCAT 5599026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1470 CCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCAT 1529

  5599027 GGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTT 5599086
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 GGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTT 1589

  5599087 TATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGG 5599146
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGG 1649

  5599147 TACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTA 5599206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 TACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTA 1709

  5599207 TGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCT 5599266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCT 1769

  5599267 TTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAAT 5599326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 TTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAAT 1829

  5599327 ATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGG 5599386
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 ACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGG 1889

  5599387 GAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTG 5599446
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1890 GAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTCTGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTG 1949

  5599447 TTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGC 5599502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 TTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGC 2005

Alignment time is 1.70544 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2031] =>      2031 nucs 'mol-32-1ef5-002464_2031'

Score:        2031
Aligned:      2031        nucs
Identic:      2031 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5595049,5597079]
 second seq =>  [      1,   2031]

  5595049 CAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGT 5595108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGT 60

  5595109 TGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACA 5595168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACA 120

  5595169 GGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAA 5595228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAA 180

  5595229 CTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTC 5595288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTC 240

  5595289 TAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTT 5595348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTT 300

  5595349 TGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAA 5595408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAA 360

  5595409 ATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTAT 5595468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTAT 420

  5595469 CTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAG 5595528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAG 480

  5595529 AATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCAT 5595588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCAT 540

  5595589 GCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACT 5595648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACT 600

  5595649 GAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCA 5595708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCA 660

  5595709 TTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACA 5595768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACA 720

  5595769 TTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTG 5595828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTG 780

  5595829 AGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGT 5595888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGT 840

  5595889 GATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGG 5595948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGG 900

  5595949 GCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT 5596008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT 960

  5596009 CTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCT 5596068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCT 1020

  5596069 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGAT 5596128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGAT 1080

  5596129 CACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA 5596188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA 1140

  5596189 TTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATA 5596248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATA 1200

  5596249 GTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCC 5596308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCC 1260

  5596309 ATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGG 5596368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGG 1320

  5596369 TCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACG 5596428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACG 1380

  5596429 AACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGC 5596488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGC 1440

  5596489 CCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGA 5596548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGA 1500

  5596549 AAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTC 5596608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTC 1560

  5596609 ACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGA 5596668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGA 1620

  5596669 GCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGA 5596728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGA 1680

  5596729 AATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGA 5596788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGA 1740

  5596789 GTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTG 5596848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTG 1800

  5596849 CTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAG 5596908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAG 1860

  5596909 AAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGC 5596968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGC 1920

  5596969 TTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGG 5597028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGG 1980

  5597029 GTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAA 5597079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAA 2031

Alignment time is 1.43973 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   4152] =>      4152 nucs 'mol-32-1f00-114963_4152'

Score:        4152
Aligned:      4152        nucs
Identic:      4152 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593274,5597425]
 second seq =>  [      1,   4152]

  5593274 ATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGG 5593333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGG 60

  5593334 CTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGG 5593393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGG 120

  5593394 GCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTT 5593453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTT 180

  5593454 CTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGG 5593513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGG 240

  5593514 GAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAA 5593573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAA 300

  5593574 CCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCA 5593633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCA 360

  5593634 TTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTC 5593693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTC 420

  5593694 AGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTC 5593753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTC 480

  5593754 CCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGT 5593813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGT 540

  5593814 GTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAAT 5593873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAAT 600

  5593874 GTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCC 5593933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCC 660

  5593934 TTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTT 5593993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTT 720

  5593994 ACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGAT 5594053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGAT 780

  5594054 CTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTA 5594113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTA 840

  5594114 ATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTC 5594173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTC 900

  5594174 CTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGC 5594233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGC 960

  5594234 CACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTT 5594293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTT 1020

  5594294 TCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTC 5594353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTC 1080

  5594354 TGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATAC 5594413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATAC 1140

  5594414 GAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTA 5594473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTA 1200

  5594474 GTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTG 5594533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTG 1260

  5594534 AAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTA 5594593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTA 1320

  5594594 TGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGC 5594653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGC 1380

  5594654 ACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAA 5594713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAA 1440

  5594714 AAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGC 5594773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGC 1500

  5594774 TGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACC 5594833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACC 1560

  5594834 ATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAA 5594893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAA 1620

  5594894 AAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTT 5594953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTT 1680

  5594954 TTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTC 5595013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTC 1740

  5595014 TGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGAC 5595073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGAC 1800

  5595074 TGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGA 5595133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGA 1860

  5595134 ATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACT 5595193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACT 1920

  5595194 ATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTT 5595253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTT 1980

  5595254 TAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTA 5595313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTA 2040

  5595314 CTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTA 5595373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTA 2100

  5595374 GACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCA 5595433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCA 2160

  5595434 CTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATC 5595493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATC 2220

  5595494 TTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTA 5595553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTA 2280

  5595554 TGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGA 5595613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGA 2340

  5595614 AAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGA 5595673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGA 2400

  5595674 GGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTA 5595733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTA 2460

  5595734 CATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAA 5595793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAA 2520

  5595794 AGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCA 5595853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCA 2580

  5595854 GGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCAC 5595913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCAC 2640

  5595914 ACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTC 5595973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTC 2700

  5595974 AAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGG 5596033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGG 2760

  5596034 GTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTT 5596093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTT 2820

  5596094 GAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGT 5596153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGT 2880

  5596154 CACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAG 5596213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAG 2940

  5596214 GTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTC 5596273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTC 3000

  5596274 GGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAA 5596333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAA 3060

  5596334 TTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAA 5596393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAA 3120

  5596394 CAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTAC 5596453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTAC 3180

  5596454 AATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAG 5596513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAG 3240

  5596514 GATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACC 5596573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACC 3300

  5596574 AGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTC 5596633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTC 3360

  5596634 TAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTC 5596693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTC 3420

  5596694 TTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAA 5596753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAA 3480

  5596754 AGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTATT 5596813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTATT 3540

  5596814 TGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGT 5596873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGT 3600

  5596874 CGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGG 5596933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGG 3660

  5596934 AGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTC 5596993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTC 3720

  5596994 AACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAG 5597053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAG 3780

  5597054 CAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAAC 5597113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAAC 3840

  5597114 TCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTG 5597173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTG 3900

  5597174 ACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCC 5597233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCC 3960

  5597234 TCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTC 5597293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTC 4020

  5597294 CCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGG 5597353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGG 4080

  5597354 GTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGAT 5597413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGAT 4140

  5597414 GGTAACAGCCGG 5597425
          ||||||||||||
     4141 GGTAACAGCCGG 4152

Alignment time is 2.85905 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   4057] =>      4057 nucs 'mol-32-1f16-052108_4057'

Score:        4056
Aligned:      4056        nucs
Identic:      4056 (100%) nucs =>      3998 (100%)        58 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5596197,5600194] EXCISED REGION [5600196,5600253]
 second seq =>  [      1,   3998] EXCISED REGION [   4000,   4057]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5600195,5600195]
 second seq =>         1 nucs [3999,3999]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5600195,5600195] to [5600196,5600196]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5596197 AGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGT 5596256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGT 60

  5596257 CCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTG 5596316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTG 120

  5596317 TTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATAC 5596376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATAC 180

  5596377 GCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAG 5596436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAG 240

  5596437 CCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGA 5596496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGA 300

  5596497 ACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAG 5596556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAG 360

  5596557 GGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCA 5596616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCA 420

  5596617 GCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAG 5596676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAG 480

  5596677 AGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCA 5596736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCA 540

  5596737 GAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTT 5596796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTT 600

  5596797 ATATCCATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCA 5596856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATCCATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCA 660

  5596857 CTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGG 5596916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGG 720

  5596917 AAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTT 5596976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTT 780

  5596977 TTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTT 5597036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTT 840

  5597037 GAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGC 5597096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGC 900

  5597097 CACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAA 5597156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAA 960

  5597157 GAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAG 5597216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAG 1020

  5597217 GTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAG 5597276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAG 1080

  5597277 CACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCT 5597336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCT 1140

  5597337 ACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCA 5597396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCA 1200

  5597397 GCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTT 5597456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTT 1260

  5597457 ATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGA 5597516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGA 1320

  5597517 GGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTG 5597576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTG 1380

  5597577 ACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGC 5597636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGC 1440

  5597637 TTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACA 5597696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACA 1500

  5597697 GAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTT 5597756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTT 1560

  5597757 TAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGT 5597816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGT 1620

  5597817 TATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAG 5597876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAG 1680

  5597877 TGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGC 5597936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGC 1740

  5597937 TGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCT 5597996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCT 1800

  5597997 TCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACA 5598056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACA 1860

  5598057 GTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGG 5598116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGG 1920

  5598117 AAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAAT 5598176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAAT 1980

  5598177 TTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCC 5598236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCC 2040

  5598237 TTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAA 5598296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAA 2100

  5598297 GGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGA 5598356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGA 2160

  5598357 CTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGC 5598416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGC 2220

  5598417 AGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGC 5598476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGC 2280

  5598477 ACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGC 5598536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGC 2340

  5598537 CAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACT 5598596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACT 2400

  5598597 GCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGC 5598656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGC 2460

  5598657 CTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCAC 5598716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCAC 2520

  5598717 AATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGAT 5598776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGAT 2580

  5598777 ATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCA 5598836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCA 2640

  5598837 GCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAG 5598896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAG 2700

  5598897 TTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGA 5598956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGA 2760

  5598957 ACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTA 5599016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTA 2820

  5599017 ATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGAT 5599076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGAT 2880

  5599077 CGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTT 5599136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTT 2940

  5599137 ATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCC 5599196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCC 3000

  5599197 TCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAA 5599256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAA 3060

  5599257 CCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAA 5599316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAA 3120

  5599317 ACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCA 5599376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCA 3180

  5599377 GAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATG 5599436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATG 3240

  5599437 TTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGC 5599496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGC 3300

  5599497 TTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGC 5599556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGC 3360

  5599557 AGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAA 5599616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAA 3420

  5599617 CTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGC 5599676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGC 3480

  5599677 TGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCT 5599736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCT 3540

  5599737 GGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCC 5599796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCC 3600

  5599797 TTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGA 5599856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGA 3660

  5599857 CACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATA 5599916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATA 3720

  5599917 TTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGC 5599976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGC 3780

  5599977 CCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTT 5600036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTT 3840

  5600037 GAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAG 5600096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAG 3900

  5600097 CTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTG 5600156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTG 3960

  5600157 CACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGT 5600194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGT 3998

EXCISED REGION

  5600196 CACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGG 5600253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 CACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGG 4057

Alignment time is 3.17824 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   4827] =>      4827 nucs 'mol-32-1f21-108961_4827'

Score:        4480
Aligned:      4821        nucs
Identic:      4790 ( 99%) nucs =>      2998 ( 99%)      1792 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5597499,5600518] EXCISED REGION [5600525,5602324]
 second seq =>  [      1,   3021] EXCISED REGION [   3028,   4827]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [5600519,5600524]
 second seq =>         6 nucs [3022,3027]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5600518,5600518] to [5600524,5600524]
 second seq =>         2 nucs [3022,3023] to [3028,3029]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 60

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 120

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 180

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 240

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 300

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 360

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 420

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 480

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      481 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 540

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 600

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 660

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 720

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 780

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 840

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 900

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 960

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1020

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1021 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 1080

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 1140

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 1200

  5598699 AACTCCATTTA-TCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 1260

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 1320

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 1380

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 1440

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 1500

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1501 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 1560

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1561 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 1620

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 1680

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 1740

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 1800

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 1860

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1861 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 1920

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 1980

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2040

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 2100

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 2160

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2161 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 2220

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 2280

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 2340

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 2400

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 2460

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 2520

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 2580

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2581 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 2640

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 2700

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 2760

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 2820

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 2880

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 2940

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 3000

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTC 5600518
          |||||||||||||||||||||
     3001 CATTCTAGCATGAAAACACTC 3021

EXCISED REGION

  5600525 AATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTC 5600584
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 AATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTC 3087

  5600585 CCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACA 5600644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 CCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACA 3147

  5600645 GACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATG 5600704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 GACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATG 3207

  5600705 TAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCT 5600764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 TAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCT 3267

  5600765 GTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGA 5600824
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 GTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGA 3327

  5600825 GAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGG 5600884
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3328 GAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGG 3387

  5600885 CTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTT 5600944
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTT 3447

  5600945 TTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGT 5601004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 TTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGT 3507

  5601005 GCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATAT 5601064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 GCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATAT 3567

  5601065 TTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAA 5601124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAA 3627

  5601125 TTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGC 5601184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGC 3687

  5601185 AAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTG 5601244
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3688 AAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTG 3747

  5601245 CTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGT 5601304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 CTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGT 3807

  5601305 TCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTC 5601364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 TCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTC 3867

  5601365 AGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGA 5601424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 AGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGA 3927

  5601425 AAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCG 5601484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 AAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCG 3987

  5601485 TTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTG 5601544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 TTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTG 4047

  5601545 GGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAA 5601604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 GGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAA 4107

  5601605 TTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTG 5601664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTG 4167

  5601665 CTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGG 5601724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 CTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGG 4227

  5601725 TGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTC 5601784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 TGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTC 4287

  5601785 ATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAA 5601844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 ATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAA 4347

  5601845 AGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTT 5601904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 AGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTT 4407

  5601905 GTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTA 5601964
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 GTAGGACTAACAAGTGCCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTA 4467

  5601965 GAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACT 5602024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 GAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACT 4527

  5602025 GCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTA 5602084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 GCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTA 4587

  5602085 CCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGA 5602144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 CCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGA 4647

  5602145 GCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGC 5602204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 GCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGC 4707

  5602205 TCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCG 5602264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4708 TCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCGG 4767

  5602265 AAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATT 5602324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 AAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATT 4827

Alignment time is 3.80395 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3764] =>      3764 nucs 'mol-32-1f58-247390_3764'

Score:        3084
Aligned:      3392        nucs
Identic:      3364 ( 99%) nucs =>       145 ( 99%)      3219 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5595558,5595704] EXCISED REGION [5597499,5600742]
 second seq =>  [    373,    519] EXCISED REGION [    520,   3764]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1794 nucs [5595705,5597498]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5595705,5595707] to [5597499,5597501]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5595704,5595704] to [5597499,5597499]
 second seq =>         1 nucs [519,519] to [520,520]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5595558 GATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGG 5595617
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      373 GATGGAGGACTCCTGCAGAGCCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGG 432

  5595618 GCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAG 5595677
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      433 GCAAGCGCTGGATCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAG 492

  5595678 GTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 5595704
          |||||||||||||||||||||||||||
      493 GTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 519

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      520 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 579

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 639

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 699

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 759

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 819

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 879

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 939

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 999

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1000 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 1059

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 1119

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 1179

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 1239

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 1299

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 1359

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 1419

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 1479

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1539

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1540 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 1599

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 1659

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 1719

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 1779

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 1839

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 1899

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 1959

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 2019

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2020 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 2079

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2080 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 2139

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 2199

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 2259

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 2319

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2320 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 2379

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2380 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 2439

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 2499

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2559

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2560 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 2619

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 2679

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2680 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 2739

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 2799

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 2859

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 2919

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2920 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 2979

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 3039

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 3099

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3100 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 3159

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 3219

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 3279

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 3339

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 3399

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 3459

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 3519

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3520 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 3579

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 3639

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 3699

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 3759

  5600738 GGGAC 5600742
          |||||
     3760 GGGAC 3764

Alignment time is 2.9751 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3239] =>      3239 nucs 'mol-32-2291-063857_3239'

Score:        3239
Aligned:      3239        nucs
Identic:      3239 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5596579,5599817]
 second seq =>  [      1,   3239]

  5596579 AATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATA 5596638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATA 60

  5596639 TGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTT 5596698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTT 120

  5596699 TAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGA 5596758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGA 180

  5596759 ATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATG 5596818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATG 240

  5596819 ACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGG 5596878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGG 300

  5596879 AGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGG 5596938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGG 360

  5596939 TAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAG 5596998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAG 420

  5596999 TAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATT 5597058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATT 480

  5597059 GTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCT 5597118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCT 540

  5597119 TATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCA 5597178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCA 600

  5597179 AATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGT 5597238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGT 660

  5597239 GTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCA 5597298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCA 720

  5597299 GGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTC 5597358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTC 780

  5597359 CGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAA 5597418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAA 840

  5597419 CAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTT 5597478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTT 900

  5597479 TGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGC 5597538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGC 960

  5597539 TCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACT 5597598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACT 1020

  5597599 CTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGA 5597658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGA 1080

  5597659 ACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAAC 5597718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAAC 1140

  5597719 CCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCT 5597778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCT 1200

  5597779 GAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGG 5597838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGG 1260

  5597839 CTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGC 5597898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGC 1320

  5597899 GGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAG 5597958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAG 1380

  5597959 GGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCT 5598018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCT 1440

  5598019 CTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGC 5598078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGC 1500

  5598079 TCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCA 5598138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCA 1560

  5598139 CGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAAC 5598198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAAC 1620

  5598199 ATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAAC 5598258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAAC 1680

  5598259 ACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGA 5598318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGA 1740

  5598319 ATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACG 5598378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACG 1800

  5598379 TGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTG 5598438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTG 1860

  5598439 GGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCC 5598498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCC 1920

  5598499 ATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACAT 5598558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACAT 1980

  5598559 AGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAG 5598618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAG 2040

  5598619 ACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTC 5598678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTC 2100

  5598679 CTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGT 5598738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGT 2160

  5598739 TCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATAC 5598798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATAC 2220

  5598799 AACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTC 5598858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTC 2280

  5598859 ATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATA 5598918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATA 2340

  5598919 TGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCA 5598978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCA 2400

  5598979 TAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTC 5599038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTC 2460

  5599039 CCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTC 5599098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTC 2520

  5599099 TTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCC 5599158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCC 2580

  5599159 CCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTT 5599218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTT 2640

  5599219 TCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAA 5599278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAA 2700

  5599279 TTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTC 5599338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTC 2760

  5599339 TGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATT 5599398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATT 2820

  5599399 TGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCT 5599458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCT 2880

  5599459 CCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTG 5599518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTG 2940

  5599519 GTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGG 5599578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGG 3000

  5599579 TCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGT 5599638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGT 3060

  5599639 AAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGAC 5599698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGAC 3120

  5599699 TGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAAT 5599758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAAT 3180

  5599759 GTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTC 5599817
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTC 3239

Alignment time is 2.23124 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   8388] =>      8388 nucs 'mol-32-29b3-068075_8388'

Score:        8387
Aligned:      8387        nucs
Identic:      8387 (100%) nucs =>       413 (100%)      7974 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5589378,5589790] EXCISED REGION [5589792,5597765]
 second seq =>  [      1,    413] EXCISED REGION [    415,   8388]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5589791,5589791]
 second seq =>         1 nucs [414,414]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5589791,5589791] to [5589792,5589792]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5589789,5589790] to [5589792,5589793]
 second seq =>         2 nucs [412,413] to [415,416]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5589378 GGCTTGAATCCTGGGTTTTTGACCTCCTGCTGAGTAAATTTGGGCCCCACTGCTTAGATT 5589437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTTGAATCCTGGGTTTTTGACCTCCTGCTGAGTAAATTTGGGCCCCACTGCTTAGATT 60

  5589438 TTATATGTCTCTATCTCCTCACCTACAAGGCCTTCGTCACAGGCTGATTCCGGATATCCA 5589497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATATGTCTCTATCTCCTCACCTACAAGGCCTTCGTCACAGGCTGATTCCGGATATCCA 120

  5589498 ATGTGTTGATGTATGGGAGGTGCATTGTAAACTGTAAAGTGCTGGGCAGATGGTAATTGT 5589557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTGTTGATGTATGGGAGGTGCATTGTAAACTGTAAAGTGCTGGGCAGATGGTAATTGT 180

  5589558 TTCAGAGATTTCATGAGTCATGCTATGCATTTAGCATGGGCTGAATTGTGTCCTCCTGCC 5589617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAGAGATTTCATGAGTCATGCTATGCATTTAGCATGGGCTGAATTGTGTCCTCCTGCC 240

  5589618 CCCAGTTCGTTTGTCAGCAATCTAACCCCTAATGTGATGGTATTTGGAGATGGGACCTTT 5589677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCAGTTCGTTTGTCAGCAATCTAACCCCTAATGTGATGGTATTTGGAGATGGGACCTTT 300

  5589678 GGGAGATAATTAGGGTTAGATGAGGTCATGTGAGTGGAGATCTGCTGTGACAGGATTAAT 5589737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGAGATAATTAGGGTTAGATGAGGTCATGTGAGTGGAGATCTGCTGTGACAGGATTAAT 360

  5589738 GTTCTTATAACAAGAGACACCAGACAGCTGGCTCTCTTGCCTTGGGGGGATAC 5589790
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTCTTATAACAAGAGACACCAGACAGCTGGCTCTCTTGCCTTGGGGGGATAC 413

EXCISED REGION

  5589792 ACAAGAGGACGGAATGTCTGCAAACCAGGAAGAGAGCCCTCACTGGGATGCAATTGGCTG 5589851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 ACAAGAGGACGGAATGTCTGCAAACCAGGAAGAGAGCCCTCACTGGGATGCAATTGGCTG 474

  5589852 GCACCTTAATCTTGGATTTTCCAGCCTCTAGAATTGTGCAAAATAAATGTCTGTTGTTGA 5589911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 GCACCTTAATCTTGGATTTTCCAGCCTCTAGAATTGTGCAAAATAAATGTCTGTTGTTGA 534

  5589912 AGCCACCTAGCCTTTGGTATTTTGCTATGGCAGCTTGAGCTGACGAAGACAGCGTGCTGC 5589971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 AGCCACCTAGCCTTTGGTATTTTGCTATGGCAGCTTGAGCTGACGAAGACAGCGTGCTGC 594

  5589972 CCCTCTTTCTCTTTGCAAAGCTTCATAGACATACATGGCCTATACACTGAAAAAACTCAC 5590031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 CCCTCTTTCTCTTTGCAAAGCTTCATAGACATACATGGCCTATACACTGAAAAAACTCAC 654

  5590032 ATTCCTGAGGGGCTAACTGTTCGGTAGGTGTCAGTTCTGGGGCTGGGCTGGGTGACGGGT 5590091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 ATTCCTGAGGGGCTAACTGTTCGGTAGGTGTCAGTTCTGGGGCTGGGCTGGGTGACGGGT 714

  5590092 TCCTCCAGTGGAAAACATGCAGTAGCCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAG 5590151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 TCCTCCAGTGGAAAACATGCAGTAGCCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAG 774

  5590152 GAAGCCGATGTTTCTTTTTCTTGTTTGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGT 5590211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 GAAGCCGATGTTTCTTTTTCTTGTTTGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGT 834

  5590212 GGAGACTCCAGGGTAGAAAGGAGAGGATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAG 5590271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 GGAGACTCCAGGGTAGAAAGGAGAGGATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAG 894

  5590272 CAGAAGTGCTTTTCATTTGGTGCAGATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCAT 5590331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 CAGAAGTGCTTTTCATTTGGTGCAGATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCAT 954

  5590332 TTTACAGCTGGGGGGACTCAAGCTCAGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCA 5590391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 TTTACAGCTGGGGGGACTCAAGCTCAGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCA 1014

  5590392 TAGGAACCAGGACTGAAGCTGAAGGCCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATT 5590451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 TAGGAACCAGGACTGAAGCTGAAGGCCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATT 1074

  5590452 AGTCTGGGTAGGCTAGATTATGCTGCAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGT 5590511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 AGTCTGGGTAGGCTAGATTATGCTGCAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGT 1134

  5590512 TGTCTTACAGCGACACAACTTTTTCTCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCT 5590571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 TGTCTTACAGCGACACAACTTTTTCTCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCT 1194

  5590572 GCTGCCCCTTATCTCGTCACTCCGAGTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATAT 5590631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 GCTGCCCCTTATCTCGTCACTCCGAGTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATAT 1254

  5590632 GGATGGATCTCCCAAGGGTCTCACACTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTT 5590691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 GGATGGATCTCCCAAGGGTCTCACACTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTT 1314

  5590692 CATCATTTCCACTCAAATTCACTGACCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTA 5590751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 CATCATTTCCACTCAAATTCACTGACCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTA 1374

  5590752 TTCTAGCTCCCCAGCTGAATGCACAGGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAG 5590811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TTCTAGCTCCCCAGCTGAATGCACAGGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAG 1434

  5590812 GCAGAGGGGGCAAGTATTATGGGGGCAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCA 5590871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 GCAGAGGGGGCAAGTATTATGGGGGCAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCA 1494

  5590872 TGCATGAATGAATGCACTTAGAATCTCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGG 5590931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TGCATGAATGAATGCACTTAGAATCTCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGG 1554

  5590932 AAAAGACAGCATAGACTTGCAACTGCTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCT 5590991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 AAAAGACAGCATAGACTTGCAACTGCTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCT 1614

  5590992 AATAATAGGTTTAAGCATCTTGAAAATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAG 5591051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 AATAATAGGTTTAAGCATCTTGAAAATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAG 1674

  5591052 CTCCCCTGCCTACATGTCCTCTCTTTCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACA 5591111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 CTCCCCTGCCTACATGTCCTCTCTTTCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACA 1734

  5591112 GAGCCACCCCACCCACACAGGCCCCATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACAC 5591171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 GAGCCACCCCACCCACACAGGCCCCATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACAC 1794

  5591172 AGATGGACACACAGAGAAATTTCTACTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAG 5591231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 AGATGGACACACAGAGAAATTTCTACTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAG 1854

  5591232 TAATTTTTCAAGTAAGTGTTAGCTCAGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACC 5591291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TAATTTTTCAAGTAAGTGTTAGCTCAGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACC 1914

  5591292 CAGACAGACTCTGGGAGATGAAAAATAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTT 5591351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 CAGACAGACTCTGGGAGATGAAAAATAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTT 1974

  5591352 TCTTTTTCCTCCTAGAAAAGAAACTTATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAG 5591411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 TCTTTTTCCTCCTAGAAAAGAAACTTATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAG 2034

  5591412 TGTGGAAGGATTAAGCCTTTGAAACTGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTT 5591471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TGTGGAAGGATTAAGCCTTTGAAACTGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTT 2094

  5591472 GTCCTGGAGAGCAGCAAGCTTTCCAAATTGGAAAATCGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCAT 5591531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 GTCCTGGAGAGCAGCAAGCTTTCCAAATTGGAAAATCGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCAT 2154

  5591532 TCACTCAGCGGCTCATTCACTAAATATTTACTGAGCATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCT 5591591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TCACTCAGCGGCTCATTCACTAAATATTTACTGAGCATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCT 2214

  5591592 TCAGGAGCTGGGGACGCAGAGCCCATGTCAGAGGGCACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTT 5591651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TCAGGAGCTGGGGACGCAGAGCCCATGTCAGAGGGCACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTT 2274

  5591652 GCAATCTACAGGGGAAATAAATGCCAGAGGCCTGTACAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAG 5591711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 GCAATCTACAGGGGAAATAAATGCCAGAGGCCTGTACAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAG 2334

  5591712 GACCGGGGAGCTTTGTCAAGTAGCATGGAGGAACTTAACCTGGAAGGACAAGGAGGAACC 5591771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GACCGGGGAGCTTTGTCAAGTAGCATGGAGGAACTTAACCTGGAAGGACAAGGAGGAACC 2394

  5591772 AGCCAGCCAAGGAGGACAAAGAGGGAAGATTCTGACGGAAGGAATGGCATCGTCAGATGA 5591831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 AGCCAGCCAAGGAGGACAAAGAGGGAAGATTCTGACGGAAGGAATGGCATCGTCAGATGA 2454

  5591832 GGGGAGGTGGGCGAGGCTGCAGTGTAGTTGGGCTTCACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGG 5591891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GGGGAGGTGGGCGAGGCTGCAGTGTAGTTGGGCTTCACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGG 2514

  5591892 AGATAAGCCTCTGGGCTCCGGGTTCAAATCCCAGCCTTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACC 5591951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 AGATAAGCCTCTGGGCTCCGGGTTCAAATCCCAGCCTTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACC 2574

  5591952 ATCTATAAAATGGGGAGAGAAGCTGTAACTCCCTCACTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGG 5592011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 ATCTATAAAATGGGGAGAGAAGCTGTAACTCCCTCACTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGG 2634

  5592012 GTTGAAATGCATAAGGAGGCCAGAGCAGTGCCTGGAGTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTG 5592071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 GTTGAAATGCATAAGGAGGCCAGAGCAGTGCCTGGAGTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTG 2694

  5592072 TGACCTGTTCTCATTTTGCTGAGGCTTGAGTAGAAAAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGG 5592131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 TGACCTGTTCTCATTTTGCTGAGGCTTGAGTAGAAAAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGG 2754

  5592132 GCAAGGACCTGAATGTCAGGGTGAGGGGCTGAGGCTCTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAG 5592191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GCAAGGACCTGAATGTCAGGGTGAGGGGCTGAGGCTCTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAG 2814

  5592192 GGATGCAAAGGATGTGTGGATTTTGGGGGCCTGTTCTGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTG 5592251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GGATGCAAAGGATGTGTGGATTTTGGGGGCCTGTTCTGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTG 2874

  5592252 GGTGGTCCTGAGAGAGACTCTACATTAAGGGTAGAGTTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCT 5592311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 GGTGGTCCTGAGAGAGACTCTACATTAAGGGTAGAGTTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCT 2934

  5592312 CAGCGGGGGAGGTCCCACAGGGTCAGTCAGAGGAGGGGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGG 5592371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 CAGCGGGGGAGGTCCCACAGGGTCAGTCAGAGGAGGGGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGG 2994

  5592372 TCAGTCAGAGGAGGTGTGGCCCAAGTCATGGGGTCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAG 5592431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TCAGTCAGAGGAGGTGTGGCCCAAGTCATGGGGTCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAG 3054

  5592432 AGGATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAACCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGG 5592491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 AGGATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAACCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGG 3114

  5592492 TGAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCT 5592551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TGAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCT 3174

  5592552 CTGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGC 5592611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 CTGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGC 3234

  5592612 CCCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCT 5592671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CCCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCT 3294

  5592672 CTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACG 5592731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 CTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACG 3354

  5592732 GATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGA 5592791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 GATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGA 3414

  5592792 AGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTG 5592851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 AGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTG 3474

  5592852 GTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGC 5592911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 GTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGC 3534

  5592912 CTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTG 5592971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 CTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTG 3594

  5592972 TTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCA 5593031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 TTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCA 3654

  5593032 GCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAG 5593091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 GCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAG 3714

  5593092 TCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACT 5593151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 TCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACT 3774

  5593152 TCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGA 5593211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 TCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGA 3834

  5593212 GACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTG 5593271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 GACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTG 3894

  5593272 CTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGG 5593331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 CTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGG 3954

  5593332 GGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAG 5593391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 GGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAG 4014

  5593392 GGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGC 5593451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 GGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGC 4074

  5593452 TTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCAT 5593511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 TTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCAT 4134

  5593512 GGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGA 5593571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 GGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGA 4194

  5593572 AACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTAT 5593631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 AACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTAT 4254

  5593632 CATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTC 5593691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 CATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTC 4314

  5593692 TCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATG 5593751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 TCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATG 4374

  5593752 TCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGT 5593811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 TCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGT 4434

  5593812 GTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGA 5593871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 GTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGA 4494

  5593872 ATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCT 5593931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 ATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCT 4554

  5593932 CCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTG 5593991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 CCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTG 4614

  5593992 TTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAG 5594051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 TTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAG 4674

  5594052 ATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGC 5594111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 ATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGC 4734

  5594112 TAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAAC 5594171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAAC 4794

  5594172 TCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGA 5594231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 TCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGA 4854

  5594232 GCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAG 5594291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 GCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAG 4914

  5594292 TTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAAT 5594351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 TTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAAT 4974

  5594352 TCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAAT 5594411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 TCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAAT 5034

  5594412 ACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACT 5594471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 ACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACT 5094

  5594472 TAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTG 5594531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 TAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTG 5154

  5594532 TGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTAT 5594591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 TGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTAT 5214

  5594592 TATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCA 5594651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 TATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCA 5274

  5594652 GCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACA 5594711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 GCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACA 5334

  5594712 AAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAA 5594771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 AAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAA 5394

  5594772 GCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACA 5594831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 GCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACA 5454

  5594832 CCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAA 5594891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 CCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAA 5514

  5594892 AAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGC 5594951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 AAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGC 5574

  5594952 TTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTT 5595011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 TTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTT 5634

  5595012 TCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGG 5595071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 TCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGG 5694

  5595072 ACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGA 5595131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 ACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGA 5754

  5595132 GAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATA 5595191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 GAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATA 5814

  5595192 CTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAG 5595251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 CTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAG 5874

  5595252 TTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATT 5595311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 TTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATT 5934

  5595312 TACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTG 5595371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 TACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTG 5994

  5595372 TAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCC 5595431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 TAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCC 6054

  5595432 CACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGA 5595491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 CACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGA 6114

  5595492 TCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTC 5595551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 TCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTC 6174

  5595552 TATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCT 5595611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 TATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCT 6234

  5595612 GAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGA 5595671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6235 GAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGA 6294

  5595672 GAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAAT 5595731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 GAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAAT 6354

  5595732 TACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGAT 5595791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 TACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGAT 6414

  5595792 AAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCC 5595851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 AAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCC 6474

  5595852 CAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTC 5595911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 CAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTC 6534

  5595912 ACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGT 5595971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 ACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGT 6594

  5595972 TCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCC 5596031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 TCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCC 6654

  5596032 GGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGC 5596091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 GGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGC 6714

  5596092 TTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGA 5596151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 TTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGA 6774

  5596152 GTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGG 5596211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 GTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGG 6834

  5596212 AGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCC 5596271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 AGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCC 6894

  5596272 TCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAAT 5596331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6895 TCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAAT 6954

  5596332 AATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTG 5596391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 AATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTG 7014

  5596392 AACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCT 5596451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7015 AACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCT 7074

  5596452 ACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTT 5596511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7075 ACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTT 7134

  5596512 AGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGA 5596571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7135 AGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGA 7194

  5596572 CCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTT 5596631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7195 CCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTT 7254

  5596632 TCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCT 5596691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7255 TCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCT 7314

  5596692 TCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATC 5596751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7315 TCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATC 7374

  5596752 AAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTA 5596811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7375 AAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTA 7434

  5596812 TTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGA 5596871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7435 TTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGA 7494

  5596872 GTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAG 5596931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7495 GTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAG 7554

  5596932 GGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTT 5596991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7555 GGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTT 7614

  5596992 TCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCG 5597051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7615 TCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCG 7674

  5597052 AGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACA 5597111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7675 AGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACA 7734

  5597112 ACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTT 5597171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7735 ACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTT 7794

  5597172 TGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGC 5597231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7795 TGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGC 7854

  5597232 CCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGC 5597291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7855 CCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGC 7914

  5597292 TCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCT 5597351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7915 TCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCT 7974

  5597352 GGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATG 5597411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7975 GGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATG 8034

  5597412 ATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAG 5597471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8035 ATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAG 8094

  5597472 AGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTG 5597531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8095 AGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTG 8154

  5597532 GAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAAC 5597591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8155 GAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAAC 8214

  5597592 TTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATC 5597651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8215 TTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATC 8274

  5597652 CTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAAT 5597711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8275 CTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAAT 8334

  5597712 GAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATA 5597765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8335 GAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATA 8388

Alignment time is 6.52007 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6677] =>      6677 nucs 'mol-32-29df-047088_6677'

Score:        6072
Aligned:      6479        nucs
Identic:      6442 ( 99%) nucs =>       145 ( 99%)      6297 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5595558,5595704] EXCISED REGION [5597499,5603829]
 second seq =>  [    199,    345] EXCISED REGION [    346,   6677]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1794 nucs [5595705,5597498]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5595705,5595707] to [5597499,5597501]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5595704,5595704] to [5597499,5597499]
 second seq =>         1 nucs [345,345] to [346,346]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5595558 GATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGG 5595617
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      199 GATGGAGGACTCCTGCAGAGCCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGG 258

  5595618 GCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAG 5595677
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      259 GCAAGCGCTGGATCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAG 318

  5595678 GTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 5595704
          |||||||||||||||||||||||||||
      319 GTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 345

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      346 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 405

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      406 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 465

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      466 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 525

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 585

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 645

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      646 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 705

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 765

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 825

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      826 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 885

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 945

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 1005

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 1065

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 1125

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 1185

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 1245

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 1305

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1365

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1366 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 1425

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 1485

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 1545

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 1605

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 1665

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 1725

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 1785

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 1845

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1846 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 1905

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1906 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 1965

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 2025

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 2085

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 2145

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 2205

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2206 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 2265

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 2325

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2385

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2386 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 2445

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 2505

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2506 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 2565

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 2625

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 2685

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 2745

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2746 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 2805

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 2865

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 2925

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2926 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 2985

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 3045

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 3105

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 3165

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 3225

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 3285

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 3345

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3346 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 3405

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 3465

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 3525

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 3585

  5600738 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGG 5600797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3586 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGG 3645

  5600798 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5600857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3646 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 3705

  5600858 GGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCT 5600917
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3706 GGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCT 3765

  5600918 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5600977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 3825

  5600978 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5601037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 3885

  5601038 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5601097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 3945

  5601098 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5601157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 4005

  5601158 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5601217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 4065

  5601218 TGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5601277
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 TGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 4125

  5601278 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5601337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 4185

  5601338 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5601397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 4245

  5601398 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5601457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 4305

  5601458 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5601517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 4365

  5601518 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5601577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 4425

  5601578 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5601637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 4485

  5601638 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5601697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 4545

  5601698 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 5601757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 4605

  5601758 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 5601817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 4665

  5601818 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 5601877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 4725

  5601878 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGC 5601937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4726 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGCCACATTAGAAATGTGC 4785

  5601938 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 5601997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 4845

  5601998 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 5602057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 4905

  5602058 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 5602117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 4965

  5602118 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 5602177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 5025

  5602178 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 5602237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 5085

  5602238 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 5602297
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCGGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 5145

  5602298 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 5602357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 5205

  5602358 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5602417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5265

  5602418 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5602477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5325

  5602478 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5602537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5385

  5602538 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5602597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5445

  5602598 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5602657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5446 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5505

  5602658 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5602717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5565

  5602718 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5602777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5625

  5602778 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 5602837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 5685

  5602838 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGC 5602897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5686 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGATGC 5745

  5602898 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 5602957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5746 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 5805

  5602958 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 5603017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5806 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 5865

  5603018 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 5603077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5866 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 5925

  5603078 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 5603137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 5985

  5603138 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 5603197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5986 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 6045

  5603198 GGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCTT 5603257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6046 GGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCTT 6105

  5603258 CCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGC 5603317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6106 CCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGC 6165

  5603318 CCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTG 5603377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6166 CCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTG 6225

  5603378 TCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGC 5603437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6226 TCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGC 6285

  5603438 GAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAAC 5603497
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6286 GAGGCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAAC 6345

  5603498 TCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCT 5603557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6346 TCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCT 6405

  5603558 GCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATA 5603617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6406 GCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATA 6465

  5603618 GCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTC 5603677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6466 GCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTC 6525

  5603678 ATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGAT 5603737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6526 ATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGAT 6585

  5603738 TTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCT 5603797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6586 TTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCT 6645

  5603798 GTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACT 5603829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     6646 GTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACT 6677

Alignment time is 5.24342 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6280] =>      6280 nucs 'mol-32-2af2-022110_6280'

Score:        6280
Aligned:      6280        nucs
Identic:      6280 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5596935,5603214]
 second seq =>  [      1,   6280]

  5596935 GGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCA 5596994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCA 60

  5596995 ACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGC 5597054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGC 120

  5597055 AATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACT 5597114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACT 180

  5597115 CTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGA 5597174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGA 240

  5597175 CTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCT 5597234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCT 300

  5597235 CTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCC 5597294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCC 360

  5597295 CCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGG 5597354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGG 420

  5597355 TCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATG 5597414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATG 480

  5597415 GTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGC 5597474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGC 540

  5597475 TTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAG 5597534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAG 600

  5597535 AAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTC 5597594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTC 660

  5597595 CACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTG 5597654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTG 720

  5597655 GAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAA 5597714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAA 780

  5597715 AAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCA 5597774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCA 840

  5597775 GCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCA 5597834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCA 900

  5597835 AGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAG 5597894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAG 960

  5597895 AGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAG 5597954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAG 1020

  5597955 GGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACA 5598014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACA 1080

  5598015 GGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGG 5598074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGG 1140

  5598075 CAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATA 5598134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATA 1200

  5598135 TTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAG 5598194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAG 1260

  5598195 GAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACC 5598254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACC 1320

  5598255 TAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTT 5598314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTT 1380

  5598315 CAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGA 5598374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGA 1440

  5598375 TACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGG 5598434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGG 1500

  5598435 TCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCA 5598494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCA 1560

  5598495 TCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAG 5598554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAG 1620

  5598555 ACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCC 5598614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCC 1680

  5598615 CAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGC 5598674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGC 1740

  5598675 TGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTT 5598734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTT 1800

  5598735 ATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTC 5598794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTC 1860

  5598795 ATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGG 5598854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGG 1920

  5598855 GCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTAT 5598914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTAT 1980

  5598915 GATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATT 5598974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATT 2040

  5598975 CCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGG 5599034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGG 2100

  5599035 TTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGG 5599094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGG 2160

  5599095 GCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGC 5599154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGC 2220

  5599155 TTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTA 5599214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTA 2280

  5599215 AGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTA 5599274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTA 2340

  5599275 TCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTC 5599334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTC 2400

  5599335 GTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACC 5599394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACC 2460

  5599395 AATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTA 5599454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTA 2520

  5599455 ATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTA 5599514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTA 2580

  5599515 AGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCC 5599574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCC 2640

  5599575 TGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCT 5599634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCT 2700

  5599635 CAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGA 5599694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGA 2760

  5599695 TGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGT 5599754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGT 2820

  5599755 GAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAAT 5599814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAAT 2880

  5599815 CTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCA 5599874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCA 2940

  5599875 CTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCC 5599934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCC 3000

  5599935 CAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATT 5599994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATT 3060

  5599995 GAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGT 5600054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGT 3120

  5600055 CCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAG 5600114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAG 3180

  5600115 CATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAA 5600174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAA 3240

  5600175 CTTCACCAGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGA 5600234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTTCACCAGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGA 3300

  5600235 GGGAGGTGTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTT 5600294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGGAGGTGTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTT 3360

  5600295 CTCACCGTGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGAC 5600354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTCACCGTGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGAC 3420

  5600355 TACAGCTAGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAA 5600414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TACAGCTAGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAA 3480

  5600415 AGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGA 5600474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGA 3540

  5600475 TTTCCCTGAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAG 5600534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTCCCTGAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAG 3600

  5600535 CTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTT 5600594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTT 3660

  5600595 CATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAA 5600654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAA 3720

  5600655 CAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAA 5600714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAA 3780

  5600715 TTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGAT 5600774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGAT 3840

  5600775 TTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCC 5600834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCC 3900

  5600835 CGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCT 5600894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCT 3960

  5600895 GTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGA 5600954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGA 4020

  5600955 CGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGG 5601014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGG 4080

  5601015 ACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATT 5601074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATT 4140

  5601075 GGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGG 5601134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGG 4200

  5601135 AAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGG 5601194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGG 4260

  5601195 CAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGT 5601254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGT 4320

  5601255 CAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTG 5601314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTG 4380

  5601315 GTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTC 5601374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTC 4440

  5601375 CTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCAC 5601434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCAC 4500

  5601435 AGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCT 5601494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCT 4560

  5601495 GTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTAT 5601554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTAT 4620

  5601555 TTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCA 5601614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCA 4680

  5601615 TTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGC 5601674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGC 4740

  5601675 CCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAAT 5601734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAAT 4800

  5601735 CTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGC 5601794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGC 4860

  5601795 GTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAAC 5601854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAAC 4920

  5601855 AGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAA 5601914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAA 4980

  5601915 CAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGG 5601974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGG 5040

  5601975 TTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGA 5602034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGA 5100

  5602035 TCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGAT 5602094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGAT 5160

  5602095 CAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAG 5602154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAG 5220

  5602155 ACAGCTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTT 5602214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACAGCTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTT 5280

  5602215 CTCCCCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATT 5602274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTCCCCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATT 5340

  5602275 TGAGTAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTC 5602334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TGAGTAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTC 5400

  5602335 TATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCC 5602394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCC 5460

  5602395 CTTGGGTGGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCAT 5602454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CTTGGGTGGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCAT 5520

  5602455 CTGTCATCCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTT 5602514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CTGTCATCCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTT 5580

  5602515 TGCACATGCAGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGC 5602574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGCACATGCAGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGC 5640

  5602575 CAACCCTTCAATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTA 5602634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CAACCCTTCAATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTA 5700

  5602635 AGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTAC 5602694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTAC 5760

  5602695 CACAGTCATAATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAA 5602754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CACAGTCATAATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAA 5820

  5602755 CCCTTGCCTTACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGC 5602814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CCCTTGCCTTACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGC 5880

  5602815 AGCAGGAAACATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGC 5602874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGCAGGAAACATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGC 5940

  5602875 TGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATG 5602934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATG 6000

  5602935 GTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCAT 5602994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCAT 6060

  5602995 TGCCACTAACCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATG 5603054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TGCCACTAACCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATG 6120

  5603055 GGGGCTGAGATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAG 5603114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GGGGCTGAGATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAG 6180

  5603115 GGGGTGGACACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGG 5603174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GGGGTGGACACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGG 6240

  5603175 GGGCCCTGGAGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCT 5603214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GGGCCCTGGAGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCT 6280

Alignment time is 4.26781 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3206] =>      3206 nucs 'mol-32-2af2-022317_3206'

Score:        3206
Aligned:      3206        nucs
Identic:      3206 (100%) nucs =>      2403 (100%)       803 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593664,5596066] EXCISED REGION [5596068,5596870]
 second seq =>  [      1,   2403] EXCISED REGION [   2404,   3206]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5596067,5596067]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5596066,5596066] to [5596068,5596068]
 second seq =>         1 nucs [2403,2403] to [2404,2404]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5593664 GCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCAC 5593723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCAC 60

  5593724 AGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTC 5593783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTC 120

  5593784 CCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTG 5593843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTG 180

  5593844 AAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATG 5593903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATG 240

  5593904 CTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCC 5593963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCC 300

  5593964 TTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCAC 5594023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCAC 360

  5594024 TGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGG 5594083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGG 420

  5594084 ATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCT 5594143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCT 480

  5594144 CACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCC 5594203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCC 540

  5594204 CCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATC 5594263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATC 600

  5594264 CTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAA 5594323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAA 660

  5594324 AACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCT 5594383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCT 720

  5594384 CTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTC 5594443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTC 780

  5594444 ACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTT 5594503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTT 840

  5594504 TTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTG 5594563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTG 900

  5594564 GAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGC 5594623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGC 960

  5594624 ACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTG 5594683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTG 1020

  5594684 GGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTA 5594743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTA 1080

  5594744 GGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGG 5594803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGG 1140

  5594804 GTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAG 5594863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAG 1200

  5594864 ACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATT 5594923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATT 1260

  5594924 TTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGC 5594983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGC 1320

  5594984 TCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTG 5595043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTG 1380

  5595044 TTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTT 5595103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTT 1440

  5595104 TTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTA 5595163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTA 1500

  5595164 AAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTC 5595223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTC 1560

  5595224 CTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAA 5595283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAA 1620

  5595284 TGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATC 5595343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATC 1680

  5595344 CATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTG 5595403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTG 1740

  5595404 AAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAG 5595463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAG 1800

  5595464 TCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGG 5595523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGG 1860

  5595524 GGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACA 5595583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACA 1920

  5595584 GTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTA 5595643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTA 1980

  5595644 GGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATA 5595703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATA 2040

  5595704 TTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAA 5595763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAA 2100

  5595764 CCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTT 5595823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTT 2160

  5595824 TTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAA 5595883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAA 2220

  5595884 AATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGA 5595943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGA 2280

  5595944 GGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC 5596003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC 2340

  5596004 CGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCT 5596063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCT 2400

  5596064 ACT 5596066
          |||
     2401 ACT 2403

EXCISED REGION

  5596068 TGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 5596127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 TGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 2463

  5596128 TCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAA 5596187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAA 2523

  5596188 ATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCAT 5596247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 ATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCAT 2583

  5596248 AGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCC 5596307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 AGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCC 2643

  5596308 CATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATG 5596367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATG 2703

  5596368 GTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGAC 5596427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 GTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGAC 2763

  5596428 GAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAG 5596487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 GAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAG 2823

  5596488 CCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTG 5596547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 CCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTG 2883

  5596548 AAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCT 5596607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 AAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCT 2943

  5596608 CACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAG 5596667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 CACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAG 3003

  5596668 AGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAG 5596727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 AGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAG 3063

  5596728 AAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAG 5596787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 AAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAG 3123

  5596788 AGTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTT 5596847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 AGTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTT 3183

  5596848 GCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAG 5596870
          |||||||||||||||||||||||
     3184 GCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAG 3206

Alignment time is 2.5126 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   4620] =>      4620 nucs 'mol-32-2b13-060500_4620'

Score:        4014
Aligned:      4377        nucs
Identic:      4344 ( 99%) nucs =>       145 ( 99%)      4199 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5595558,5595704] EXCISED REGION [5597499,5601727]
 second seq =>  [    244,    390] EXCISED REGION [    391,   4620]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1794 nucs [5595705,5597498]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5595705,5595707] to [5597499,5597501]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5595704,5595704] to [5597499,5597499]
 second seq =>         1 nucs [390,390] to [391,391]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5595558 GATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGG 5595617
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 GATGGAGGACTCCTGCAGAGCCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGG 303

  5595618 GCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAG 5595677
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 GCAAGCGCTGGATCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAG 363

  5595678 GTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 5595704
          |||||||||||||||||||||||||||
      364 GTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 390

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      391 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 450

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 510

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 570

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 630

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 690

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 750

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 810

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 870

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      871 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 930

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 990

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 1050

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 1110

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 1170

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 1230

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 1290

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 1350

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1410

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1411 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 1470

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 1530

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 1590

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 1650

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 1710

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 1770

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 1830

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 1890

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1891 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 1950

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1951 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 2010

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 2070

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 2130

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 2190

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 2250

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2251 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 2310

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 2370

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2430

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2431 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 2490

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 2550

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2551 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 2610

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 2670

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 2730

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 2790

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2791 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 2850

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 2910

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 2970

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2971 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 3030

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 3090

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 3150

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 3210

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 3270

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 3330

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 3390

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3391 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 3450

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 3510

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 3570

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 3630

  5600738 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGG 5600797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3631 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGG 3690

  5600798 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5600857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3691 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 3750

  5600858 GGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCT 5600917
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3751 GGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCT 3810

  5600918 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5600977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 3870

  5600978 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5601037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 3930

  5601038 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5601097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 3990

  5601098 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5601157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 4050

  5601158 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5601217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 4110

  5601218 TGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5601277
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 4170

  5601278 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5601337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 4230

  5601338 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5601397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 4290

  5601398 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5601457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 4350

  5601458 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5601517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 4410

  5601518 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5601577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 4470

  5601578 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5601637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 4530

  5601638 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5601697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 4590

  5601698 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGA 5601727
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGA 4620

Alignment time is 3.63164 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2921] =>      2921 nucs 'mol-32-2dff-106632_2921'

Score:        2256
Aligned:      2498        nucs
Identic:      2476 ( 99%) nucs =>       301 ( 99%)      2175 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5594395,5594699] EXCISED REGION [5597499,5599690]
 second seq =>  [      3,    307] EXCISED REGION [    729,   2921]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2799 nucs [5594700,5597498]
 second seq =>       421 nucs [308,728]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [308,309] to [727,728]

  5594395 ATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACC 5594454
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||
        3 ATCCACATACGGAAAATACGAAAAGTAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACTTACC 62

  5594455 ACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAG 5594514
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       63 ATTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAG 122

  5594515 AGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGA 5594574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      123 AGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGA 182

  5594575 CAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGAC 5594634
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      183 CAATTATATAGTGTCATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGAC 242

  5594635 TCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAG 5594694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 TCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAG 302

  5594695 GAGAC 5594699
          |||||
      303 GAGAC 307

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      729 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 788

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 848

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 908

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 968

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 1028

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 1088

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 1148

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 1208

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1209 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 1268

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 1328

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 1388

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 1448

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 1508

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 1568

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 1628

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 1688

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1748

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1749 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 1808

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 1868

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 1928

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 1988

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 2048

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 2108

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 2168

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 2228

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2229 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 2288

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2289 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 2348

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 2408

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 2468

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 2528

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 2588

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2589 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 2648

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 2708

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2768

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2769 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 2828

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2829 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGTGGCAAGGTGGC 2888

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCT 5599690
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCT 2921

Alignment time is 2.27872 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3752] =>      3752 nucs 'mol-32-2e0a-011764_3752'

Score:        3751
Aligned:      3751        nucs
Identic:      3751 (100%) nucs =>        21 (100%)      3730 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5592383,5592403] EXCISED REGION [5592405,5596134]
 second seq =>  [      1,     21] EXCISED REGION [     23,   3752]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5592404,5592404]
 second seq =>         1 nucs [22,22]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5592401,5592403] to [5592402,5592404]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5592383 AGGTGTGGCCCAAGTCATGGG 5592403
          |||||||||||||||||||||
        1 AGGTGTGGCCCAAGTCATGGG 21

EXCISED REGION

  5592405 TCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGAGGATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAA 5592464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       23 TCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGAGGATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAA 82

  5592465 CCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGTGAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCC 5592524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       83 CCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGTGAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCC 142

  5592525 TCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTCTGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAA 5592584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      143 TCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTCTGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAA 202

  5592585 GCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCCCCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCA 5592644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      203 GCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCCCCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCA 262

  5592645 GGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTG 5592704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      263 GGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTG 322

  5592705 CAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGG 5592764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      323 CAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGG 382

  5592765 GGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGC 5592824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 GGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGC 442

  5592825 TGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTC 5592884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 TGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTC 502

  5592885 CAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAG 5592944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 CAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAG 562

  5592945 GATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTC 5593004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 GATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTC 622

  5593005 TGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCT 5593064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 TGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCT 682

  5593065 AATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTC 5593124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 AATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTC 742

  5593125 ACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCT 5593184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 ACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCT 802

  5593185 ATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATT 5593244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 ATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATT 862

  5593245 TACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATG 5593304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 TACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATG 922

  5593305 GGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGT 5593364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 GGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGT 982

  5593365 GCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGG 5593424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 GCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGG 1042

  5593425 GGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACA 5593484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 GGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACA 1102

  5593485 AGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAG 5593544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 AGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAG 1162

  5593545 ATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTG 5593604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 ATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTG 1222

  5593605 AACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGG 5593664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 AACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGG 1282

  5593665 CACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACA 5593724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 CACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACA 1342

  5593725 GCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCC 5593784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 GCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCC 1402

  5593785 CAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGA 5593844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 CAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGA 1462

  5593845 AATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGC 5593904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 AATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGC 1522

  5593905 TATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCT 5593964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 TATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCT 1582

  5593965 TGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACT 5594024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 TGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACT 1642

  5594025 GCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGA 5594084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 GCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGA 1702

  5594085 TCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTC 5594144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTC 1762

  5594145 ACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCC 5594204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 ACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCC 1822

  5594205 CCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCC 5594264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 CCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCC 1882

  5594265 TTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAA 5594324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 TTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAA 1942

  5594325 ACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTC 5594384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 ACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTC 2002

  5594385 TTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCA 5594444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 TTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCA 2062

  5594445 CATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTT 5594504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 CATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTT 2122

  5594505 TCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGG 5594564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 TCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGG 2182

  5594565 AATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCA 5594624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 AATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCA 2242

  5594625 CGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGG 5594684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 CGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGG 2302

  5594685 GCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAG 5594744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 GCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAG 2362

  5594745 GTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGG 5594804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 GTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGG 2422

  5594805 TGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGA 5594864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 TGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGA 2482

  5594865 CCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTT 5594924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 CCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTT 2542

  5594925 TACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCT 5594984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 TACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCT 2602

  5594985 CTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGT 5595044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 CTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGT 2662

  5595045 TTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTT 5595104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 TTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTT 2722

  5595105 TAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAA 5595164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 TAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAA 2782

  5595165 AACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCC 5595224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 AACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCC 2842

  5595225 TAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAAT 5595284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 TAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAAT 2902

  5595285 GTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCC 5595344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 GTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCC 2962

  5595345 ATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGA 5595404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 ATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGA 3022

  5595405 AAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGT 5595464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 AAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGT 3082

  5595465 CTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGG 5595524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 CTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGG 3142

  5595525 GAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAG 5595584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 GAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAG 3202

  5595585 TCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAG 5595644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 TCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAG 3262

  5595645 GACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 5595704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 GACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 3322

  5595705 TCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAAC 5595764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 TCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAAC 3382

  5595765 CACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTT 5595824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 CACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTT 3442

  5595825 TTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAA 5595884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 TTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAA 3502

  5595885 ATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAG 5595944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 ATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAG 3562

  5595945 GCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCC 5596004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 GCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCC 3622

  5596005 GTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTA 5596064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 GTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTA 3682

  5596065 CTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTG 5596124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 CTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTG 3742

  5596125 AGATCACTCC 5596134
          ||||||||||
     3743 AGATCACTCC 3752

Alignment time is 2.9215 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,  11766] =>     11766 nucs 'mol-32-2efc-057657_11766'

Score:       11735
Aligned:     11757        nucs
Identic:     11755 (100%) nucs =>       129 (100%)     11626 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5594727,5594855] EXCISED REGION [5594857,5606484]
 second seq =>  [      1,    129] EXCISED REGION [    131,  11758]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5594856,5594856]
 second seq =>         1 nucs [130,130]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [130,130] to [131,131]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5594727 AGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGA 5594786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGA 60

  5594787 TCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGC 5594846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGC 120

  5594847 CTGGGTGAC 5594855
          |||||||||
      121 CTGGGTGAC 129

EXCISED REGION

  5594857 GAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAAT 5594916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      131 GAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAAT 190

  5594917 ACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAG 5594976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 ACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAG 250

  5594977 GTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGA 5595036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 GTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGA 310

  5595037 TTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACC 5595096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 TTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACC 370

  5595097 AAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCC 5595156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 AAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCC 430

  5595157 TGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAG 5595216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 TGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAG 490

  5595217 TACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAA 5595276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 TACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAA 550

  5595277 ATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGA 5595336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 ATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGA 610

  5595337 TTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAA 5595396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAA 670

  5595397 AAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTG 5595456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 AAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTG 730

  5595457 GGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGG 5595516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 GGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGG 790

  5595517 GAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGA 5595576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 GAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGA 850

  5595577 GGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGAC 5595636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 GGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGAC 910

  5595637 GGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTG 5595696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 GGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTG 970

  5595697 AATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATAT 5595756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 AATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATAT 1030

  5595757 GTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCT 5595816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 GTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCT 1090

  5595817 TTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGG 5595876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 TTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGG 1150

  5595877 GAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGG 5595936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 GAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGG 1210

  5595937 AGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 5595996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 AGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 1270

  5595997 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAAT 5596056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAAT 1330

  5596057 TCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCA 5596116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 TCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCA 1390

  5596117 GTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCA 5596176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 GTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCA 1450

  5596177 AAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGC 5596236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 AAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGC 1510

  5596237 CTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTG 5596296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 CTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTG 1570

  5596297 TGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTG 5596356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTG 1630

  5596357 AGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTT 5596416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 AGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTT 1690

  5596417 ACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCC 5596476
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 ACTTTTGAGACTAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCC 1750

  5596477 CAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTT 5596536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 CAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTT 1810

  5596537 ATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGG 5596596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 ATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGG 1870

  5596597 GATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCT 5596656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 GATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCT 1930

  5596657 GTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCC 5596716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCC 1990

  5596717 CCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTT 5596776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 CCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTT 2050

  5596777 AGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGA 5596836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 AGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGA 2110

  5596837 CCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAA 5596896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAA 2170

  5596897 GGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAAT 5596956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 GGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAAT 2230

  5596957 GTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCT 5597016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 GTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCT 2290

  5597017 ATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTA 5597076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 ATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTA 2350

  5597077 AAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATA 5597136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 AAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATA 2410

  5597137 TTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTG 5597196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTG 2470

  5597197 CTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCA 5597256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 CTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCA 2530

  5597257 GTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTC 5597316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 GTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTC 2590

  5597317 ACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTA 5597376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 ACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTA 2650

  5597377 ACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCT 5597436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 ACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCT 2710

  5597437 CGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCA 5597496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 CGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCA 2770

  5597497 TGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGT 5597556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 TGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGT 2830

  5597557 GTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAG 5597616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 GTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAG 2890

  5597617 CGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCA 5597676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 CGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCA 2950

  5597677 CTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATC 5597736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 CTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATC 3010

  5597737 GGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAA 5597796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 GGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAA 3070

  5597797 GATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGC 5597856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 GATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGC 3130

  5597857 AGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAG 5597916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 AGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAG 3190

  5597917 AGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCAT 5597976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 AGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCAT 3250

  5597977 ACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTC 5598036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 ACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTC 3310

  5598037 CCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTC 5598096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 CCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTC 3370

  5598097 CCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGA 5598156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 CCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGA 3430

  5598157 GCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCT 5598216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 GCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCT 3490

  5598217 GCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACT 5598276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 GCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACT 3550

  5598277 GGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTC 5598336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 GGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTC 3610

  5598337 TCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTC 5598396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 TCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTC 3670

  5598397 AGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAG 5598456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 AGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAG 3730

  5598457 GAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAG 5598516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 GAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAG 3790

  5598517 GCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAAT 5598576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 GCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAAT 3850

  5598577 AAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAA 5598636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 AAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAA 3910

  5598637 CAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTA 5598696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 CAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTA 3970

  5598697 TCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGA 5598756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 TCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGA 4030

  5598757 GGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAG 5598816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 GGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAG 4090

  5598817 TTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATAT 5598876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 TTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATAT 4150

  5598877 GGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCC 5598936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 GGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCC 4210

  5598937 CCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAG 5598996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 CCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAG 4270

  5598997 GGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACG 5599056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 GGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACG 4330

  5599057 ATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCA 5599116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 ATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCA 4390

  5599117 TTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATA 5599176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 TTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATA 4450

  5599177 ATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGA 5599236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 ATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGA 4510

  5599237 CATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAG 5599296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 CATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAG 4570

  5599297 TTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACC 5599356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 TTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACC 4630

  5599357 CAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGT 5599416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 CAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGT 4690

  5599417 CTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTT 5599476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 CTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTT 4750

  5599477 GGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGC 5599536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 GGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGC 4810

  5599537 CCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGG 5599596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 CCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGG 4870

  5599597 AGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGG 5599656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 AGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGG 4930

  5599657 CCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGT 5599716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 CCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGT 4990

  5599717 GCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAA 5599776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 GCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAA 5050

  5599777 TTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCT 5599836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 TTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCT 5110

  5599837 GGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTC 5599896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 GGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTC 5170

  5599897 TCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTAC 5599956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 TCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTAC 5230

  5599957 CCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTG 5600016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 CCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTG 5290

  5600017 CCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGT 5600076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 CCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGT 5350

  5600077 GAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCA 5600136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5351 GAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCA 5410

  5600137 TAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCC 5600196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5411 TAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCC 5470

  5600197 ACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCC 5600256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5471 ACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCC 5530

  5600257 ATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATT 5600316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5531 ATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATT 5590

  5600317 TAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGAC 5600376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5591 TAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGAC 5650

  5600377 AACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAG 5600436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5651 AACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAG 5710

  5600437 CCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGC 5600496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5711 CCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGC 5770

  5600497 CCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTT 5600556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5771 CCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTT 5830

  5600557 CAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGG 5600616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5831 CAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGG 5890

  5600617 CAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACC 5600676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5891 CAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACC 5950

  5600677 CCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTT 5600736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5951 CCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTT 6010

  5600737 TGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATG 5600796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6011 TGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATG 6070

  5600797 GGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGT 5600856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6071 GGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGT 6130

  5600857 GGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGC 5600916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6131 GGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGC 6190

  5600917 TCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAG 5600976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6191 TCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAG 6250

  5600977 TGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGA 5601036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6251 TGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGA 6310

  5601037 GAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAA 5601096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6311 GAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAA 6370

  5601097 TCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGC 5601156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6371 TCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGC 6430

  5601157 TCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGT 5601216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6431 TCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGT 6490

  5601217 GTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGC 5601276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6491 GTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGC 6550

  5601277 TCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTG 5601336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6551 TCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTG 6610

  5601337 AGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACA 5601396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6611 AGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACA 6670

  5601397 GCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACAC 5601456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6671 GCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACAC 6730

  5601457 GTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGG 5601516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6731 GTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGG 6790

  5601517 AGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTG 5601576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6791 AGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTG 6850

  5601577 CCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGA 5601636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6851 CCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGA 6910

  5601637 AATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAAC 5601696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6911 AATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAAC 6970

  5601697 TGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTT 5601756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6971 TGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTT 7030

  5601757 GCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGA 5601816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7031 GCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGA 7090

  5601817 GAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTC 5601876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7091 GAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTC 7150

  5601877 CTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTG 5601936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7151 CTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTG 7210

  5601937 CCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAG 5601996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7211 CCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAG 7270

  5601997 GCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCC 5602056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7271 GCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCC 7330

  5602057 GACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATC 5602116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7331 GACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATC 7390

  5602117 TTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATT 5602176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7391 TTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATT 7450

  5602177 TCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCC 5602236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7451 TCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCC 7510

  5602237 TTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGT 5602296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7511 TTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGT 7570

  5602297 CTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGA 5602356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7571 CTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGA 7630

  5602357 TGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTT 5602416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7631 TGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTT 7690

  5602417 ATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTT 5602476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7691 ATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTT 7750

  5602477 GTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCC 5602536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7751 GTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCC 7810

  5602537 CAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTA 5602596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7811 CAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTA 7870

  5602597 AGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTT 5602656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7871 AGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTT 7930

  5602657 ATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATAT 5602716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7931 ATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATAT 7990

  5602717 AATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTAT 5602776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7991 AATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTAT 8050

  5602777 ACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTT 5602836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8051 ACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTT 8110

  5602837 AATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTG 5602896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8111 AATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTG 8170

  5602897 CACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGG 5602956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8171 CACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGG 8230

  5602957 TGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTG 5603016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8231 TGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTG 8290

  5603017 AGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCC 5603076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8291 AGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCC 8350

  5603077 TTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGG 5603136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8351 TTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGG 8410

  5603137 ATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAA 5603196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8411 ATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAA 8470

  5603197 AGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCT 5603256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8471 AGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCT 8530

  5603257 TCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCG 5603316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8531 TCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCG 8590

  5603317 CCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGT 5603376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8591 CCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGT 8650

  5603377 GTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAG 5603436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8651 GTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAG 8710

  5603437 CGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAA 5603496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8711 CGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAA 8770

  5603497 CTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCC 5603556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8771 CTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCC 8830

  5603557 TGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGAT 5603616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8831 TGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGAT 8890

  5603617 AGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTT 5603676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8891 AGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTT 8950

  5603677 CATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGA 5603736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8951 CATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGA 9010

  5603737 TTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTC 5603796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9011 TTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTC 9070

  5603797 TGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGT 5603856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9071 TGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGT 9130

  5603857 GGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCAATGAAATAAATAG 5603916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9131 GGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCAATGAAATAAATAG 9190

  5603917 AATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAACTTGAAAGC 5603976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9191 AATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAACTTGAAAGC 9250

  5603977 ACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTCATTTAAACT 5604036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9251 ACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTCATTTAAACT 9310

  5604037 CAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAAC 5604096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9311 CAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAAC 9370

  5604097 CAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCTGAACCTTTTCCCT 5604156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9371 CAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCTGAACCTTTTCCCT 9430

  5604157 ACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACACAGGTTTCCATGGA 5604216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9431 ACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACACAGGTTTCCATGGA 9490

  5604217 AAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGATGTGCCTTTCACATG 5604276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9491 AAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGATGTGCCTTTCACATG 9550

  5604277 GCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGCCCAGCAGGTCATGGC 5604336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9551 GCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGCCCAGCAGGTCATGGC 9610

  5604337 AGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCTGCACTTTTCCACATG 5604396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9611 AGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCTGCACTTTTCCACATG 9670

  5604397 CTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGAATGGTCTTGGAGCTT 5604456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9671 CTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGAATGGTCTTGGAGCTT 9730

  5604457 CCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGTGGTACTGCCTACCTC 5604516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9731 CCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGTGGTACTGCCTACCTC 9790

  5604517 TACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTTAGGGAGGTGGCCAGG 5604576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9791 TACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTTAGGGAGGTGGCCAGG 9850

  5604577 CTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGACCCAGAGAGATGGGG 5604636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9851 CTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGACCCAGAGAGATGGGG 9910

  5604637 GTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGGCCCAGAGAGACTCAA 5604696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9911 GTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGGCCCAGAGAGACTCAA 9970

  5604697 TAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCGGTACTCACTCAGGTG 5604756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9971 TAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCGGTACTCACTCAGGTG 10030

  5604757 CTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTCTGAACCATGTCCTTG 5604816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10031 CTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTCTGAACCATGTCCTTG 10090

  5604817 GCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGGCAGAATGACAAATGG 5604876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10091 GCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGGCAGAATGACAAATGG 10150

  5604877 GCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCCAACAGAGCCATTTAT 5604936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10151 GCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCCAACAGAGCCATTTAT 10210

  5604937 CCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGAGAACAGGGGGGTGTA 5604996
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
    10211 CCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGAGAACAGGGGGCTGTA 10270

  5604997 AAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAGGGCTGACCAGCAC 5605056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10271 AAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAGGGCTGACCAGCAC 10330

  5605057 TTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAACATCCTTTTAATA 5605116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10331 TTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAACATCCTTTTAATA 10390

  5605117 TAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAATCGAAGTCTTGCA 5605176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10391 TAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAATCGAAGTCTTGCA 10450

  5605177 ATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCATAGTATACAGGAT 5605236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10451 ATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCATAGTATACAGGAT 10510

  5605237 GTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTTTTAGGGAGCATTT 5605296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10511 GTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTTTTAGGGAGCATTT 10570

  5605297 GGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGGAATTCCATTTCTA 5605356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10571 GGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGGAATTCCATTTCTA 10630

  5605357 GAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTGTTACAGCATTAAA 5605416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10631 GAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTGTTACAGCATTAAA 10690

  5605417 TTAGATCTAATCTTAATATCCCACCATTAAGACAATGGTAGAGTGTAGTATATCCATTTG 5605476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10691 TTAGATCTAATCTTAATATCCCACCATTAAGACAATGGTAGAGTGTAGTATATCCATTTG 10750

  5605477 GTAAATTATTATGAATCATTCAAAAATGATGTAAAGAATTCTAATGAAATAAGAAAATGC 5605536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10751 GTAAATTATTATGAATCATTCAAAAATGATGTAAAGAATTCTAATGAAATAAGAAAATGC 10810

  5605537 TTATGATATAATGTCAAACAAAAAAGTAGGGTATACAACTGCATGTACATATGTTTCAAC 5605596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10811 TTATGATATAATGTCAAACAAAAAAGTAGGGTATACAACTGCATGTACATATGTTTCAAC 10870

  5605597 CATTAAATCTATATGTTTATTTCTCTTTCTCCACATAATCTTAGAAAGAAGGGTAAGAAA 5605656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10871 CATTAAATCTATATGTTTATTTCTCTTTCTCCACATAATCTTAGAAAGAAGGGTAAGAAA 10930

  5605657 AAAACCATGGGAAGTGTATATAGTGTTTTCCCTCTCAAAGGAGGTGATTTGGGTGATTTT 5605716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10931 AAAACCATGGGAAGTGTATATAGTGTTTTCCCTCTCAAAGGAGGTGATTTGGGTGATTTT 10990

  5605717 TAAACACCTTCCTCAATTTTTCATACTGTGAGTGTGTGTGTTTAGGATTGCACACACATA 5605776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10991 TAAACACCTTCCTCAATTTTTCATACTGTGAGTGTGTGTGTTTAGGATTGCACACACATA 11050

  5605777 GCAGAGGTTTTATCTGGGCTGGAGCTGAGATTTGGGTATCTCTGATGGGTGGAGGTGACA 5605836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11051 GCAGAGGTTTTATCTGGGCTGGAGCTGAGATTTGGGTATCTCTGATGGGTGGAGGTGACA 11110

  5605837 ACCTCTCTCTCTCAGATATGTTTACCTCCATTGATCTCTAGGGGCCGGCAGACTGTCCTT 5605896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11111 ACCTCTCTCTCTCAGATATGTTTACCTCCATTGATCTCTAGGGGCCGGCAGACTGTCCTT 11170

  5605897 GACTGGTGCTATGATTTGAATGTGTGCCCCAGATTTCATGTGTTGAAAACTTAATCCCCA 5605956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11171 GACTGGTGCTATGATTTGAATGTGTGCCCCAGATTTCATGTGTTGAAAACTTAATCCCCA 11230

  5605957 AATTCATATGTTGATTAGGAGTGGGAGCTTTGGGAGGTAATTAGGATTAGATAAGGGCAT 5606016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11231 AATTCATATGTTGATTAGGAGTGGGAGCTTTGGGAGGTAATTAGGATTAGATAAGGGCAT 11290

  5606017 CAGAGTGAAGCTGCTGGGATGGGACTGGAGGCTTTATAAGAAAAGGAATGGAGACCTGAG 5606076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11291 CAGAGTGAAGCTGCTGGGATGGGACTGGAGGCTTTATAAGAAAAGGAATGGAGACCTGAG 11350

  5606077 CTGGCATGCTCTTGCCCTCTTGCCATGTGATAACTTCAGCCTTGTTATGACAAAGCATGA 5606136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11351 CTGGCATGCTCTTGCCCTCTTGCCATGTGATAACTTCAGCCTTGTTATGACAAAGCATGA 11410

  5606137 AGGTCCCTACAAGATGCTGGTGCCGTGTACTTGGACTTCCCAGCCTCCAGAACCATGAGC 5606196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11411 AGGTCCCTACAAGATGCTGGTGCCGTGTACTTGGACTTCCCAGCCTCCAGAACCATGAGC 11470

  5606197 TAAATGAACTTCTTTTTTAGAAAAATAAATCACCCAGTCTGTGGTATTCTGTTATAGCAA 5606256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11471 TAAATGAACTTCTTTTTTAGAAAAATAAATCACCCAGTCTGTGGTATTCTGTTATAGCAA 11530

  5606257 TAGCAACAGAAAACAGACTAAGACAACGGGAACACAGGCATTTATGGATGTGCTTAGCAA 5606316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11531 TAGCAACAGAAAACAGACTAAGACAACGGGAACACAGGCATTTATGGATGTGCTTAGCAA 11590

  5606317 GCCTGGGTTGGGGCCCCAGCTCCTTCTATCCATGTAAATGGCAAGGGGCCCAGGACAAAG 5606376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11591 GCCTGGGTTGGGGCCCCAGCTCCTTCTATCCATGTAAATGGCAAGGGGCCCAGGACAAAG 11650

  5606377 GGAGCAGAGCAAACAATGCTCAGAAAGGGGGCCTGGGAGTCAGAGGAGGGCTTGTTCTGA 5606436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11651 GGAGCAGAGCAAACAATGCTCAGAAAGGGGGCCTGGGAGTCAGAGGAGGGCTTGTTCTGA 11710

  5606437 GAAACAACATAATGGCTGCTGCTTGAAAGTCCTCCCTTGCTACCTGTT 5606484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11711 GAAACAACATAATGGCTGCTGCTTGAAAGTCCTCCCTTGCTACCTGTT 11758

Alignment time is 8.98946 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2167] =>      2167 nucs 'mol-32-2f1d-056611_2167'

Score:        1962
Aligned:      2160        nucs
Identic:      2142 ( 99%) nucs =>        34 (100%)      2108 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5595671,5595704] EXCISED REGION [5597499,5599623]
 second seq =>  [      1,     34] EXCISED REGION [     35,   2160]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1794 nucs [5595705,5597498]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5595705,5595707] to [5597499,5597501]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5595704,5595704] to [5597499,5597499]
 second seq =>         1 nucs [34,34] to [35,35]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5595671 AGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 5595704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATAT 34

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
       35 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 94

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       95 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 154

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      155 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 214

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      215 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 274

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      275 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 334

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 394

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      395 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 454

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 514

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      515 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 574

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 634

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 694

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      695 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTAC 754

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 814

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 874

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 934

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 994

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1054

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1055 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 1114

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 1174

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 1234

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 1294

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 1354

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 1414

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 1474

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 CACCTAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 1534

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1535 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 1594

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1595 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 1654

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 1714

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 1774

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 1834

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1835 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 1894

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1895 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 1954

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 2014

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2074

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2075 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 2134

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGG 5599623
          ||||||||||||||||||||||||||
     2135 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGG 2160

Alignment time is 1.72753 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   5839] =>      5839 nucs 'mol-32-2fcd-060980_5839'

Score:        5827
Aligned:      5838        nucs
Identic:      5837 (100%) nucs =>      1390 (100%)      4447 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5590117,5591506] EXCISED REGION [5591508,5595955]
 second seq =>  [      1,   1390] EXCISED REGION [   1392,   5839]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5591507,5591507]
 second seq =>         1 nucs [1391,1391]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1391,1391] to [1392,1392]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5590117 CCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAGGAAGCCGATGTTTCTTTTTCTTGTT 5590176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAGGAAGCCGATGTTTCTTTTTCTTGTT 60

  5590177 TGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGTGGAGACTCCAGGGTAGAAAGGAGAG 5590236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGTGGAGACTCCAGGGTAGAAAGGAGAG 120

  5590237 GATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAGCAGAAGTGCTTTTCATTTGGTGCAG 5590296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAGCAGAAGTGCTTTTCATTTGGTGCAG 180

  5590297 ATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCATTTTACAGCTGGGGGGACTCAAGCTC 5590356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCATTTTACAGCTGGGGGGACTCAAGCTC 240

  5590357 AGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCATAGGAACCAGGACTGAAGCTGAAGG 5590416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCATAGGAACCAGGACTGAAGCTGAAGG 300

  5590417 CCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATTAGTCTGGGTAGGCTAGATTATGCTG 5590476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATTAGTCTGGGTAGGCTAGATTATGCTG 360

  5590477 CAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGTTGTCTTACAGCGACACAACTTTTTC 5590536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGTTGTCTTACAGCGACACAACTTTTTC 420

  5590537 TCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCTGCTGCCCCTTATCTCGTCACTCCGA 5590596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCTGCTGCCCCTTATCTCGTCACTCCGA 480

  5590597 GTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATATGGATGGATCTCCCAAGGGTCTCACA 5590656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATATGGATGGATCTCCCAAGGGTCTCACA 540

  5590657 CTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTTCATCATTTCCACTCAAATTCACTGA 5590716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTTCATCATTTCCACTCAAATTCACTGA 600

  5590717 CCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTATTCTAGCTCCCCAGCTGAATGCACA 5590776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTATTCTAGCTCCCCAGCTGAATGCACA 660

  5590777 GGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAGGCAGAGGGGGCAAGTATTATGGGGG 5590836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAGGCAGAGGGGGCAAGTATTATGGGGG 720

  5590837 CAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCATGCATGAATGAATGCACTTAGAATC 5590896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCATGCATGAATGAATGCACTTAGAATC 780

  5590897 TCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGGAAAAGACAGCATAGACTTGCAACTG 5590956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGGAAAAGACAGCATAGACTTGCAACTG 840

  5590957 CTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCTAATAATAGGTTTAAGCATCTTGAAA 5591016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCTAATAATAGGTTTAAGCATCTTGAAA 900

  5591017 ATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAGCTCCCCTGCCTACATGTCCTCTCTT 5591076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAGCTCCCCTGCCTACATGTCCTCTCTT 960

  5591077 TCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACAGAGCCACCCCACCCACACAGGCCCC 5591136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACAGAGCCACCCCACCCACACAGGCCCC 1020

  5591137 ATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACACAGATGGACACACAGAGAAATTTCTA 5591196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACACAGATGGACACACAGAGAAATTTCTA 1080

  5591197 CTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAGTAATTTTTCAAGTAAGTGTTAGCTC 5591256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAGTAATTTTTCAAGTAAGTGTTAGCTC 1140

  5591257 AGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACCCAGACAGACTCTGGGAGATGAAAAA 5591316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACCCAGACAGACTCTGGGAGATGAAAAA 1200

  5591317 TAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTTTCTTTTTCCTCCTAGAAAAGAAACT 5591376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTTTCTTTTTCCTCCTAGAAAAGAAACT 1260

  5591377 TATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAGTGTGGAAGGATTAAGCCTTTGAAAC 5591436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAGTGTGGAAGGATTAAGCCTTTGAAAC 1320

  5591437 TGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTTGTCCTGGAGAGCAGCAAGCTTTCCA 5591496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTTGTCCTGGAGAGCAGCAAGCTTTCCA 1380

  5591497 AATTGGAAAA 5591506
          ||||||||||
     1381 AATTGGAAAA 1390

EXCISED REGION

  5591508 CGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCATTCACTCAGCGGCTCATTCACTAAATATTTACTGAGC 5591567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 CGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCATTCACTCAGCGGCTCATTCACTAAATATTTACTGAGC 1451

  5591568 ATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCTTCAGGAGCTGGGGACGCAGAGCCCATGTCAGAGGGC 5591627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 ATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCTTCAGGAGCTGGGGACGCAGAGCCCATGTCAGAGGGC 1511

  5591628 ACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTTGCAATCTACAGGGGAAATAAATGCCAGAGGCCTGTA 5591687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 ACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTTGCAATCTACAGGGGAAATAAATGCCAGAGGCCTGTA 1571

  5591688 CAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAGGACCGGGGAGCTTTGTCAAGTAGCATGGAGGAACTT 5591747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 CAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAGGACCGGGGAGCTTTGTCAAGTAGCATGGAGGAACTT 1631

  5591748 AACCTGGAAGGACAAGGAGGAACCAGCCAGCCAAGGAGGACAAAGAGGGAAGATTCTGAC 5591807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 AACCTGGAAGGACAAGGAGGAACCAGCCAGCCAAGGAGGACAAAGAGGGAAGATTCTGAC 1691

  5591808 GGAAGGAATGGCATCGTCAGATGAGGGGAGGTGGGCGAGGCTGCAGTGTAGTTGGGCTTC 5591867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 GGAAGGAATGGCATCGTCAGATGAGGGGAGGTGGGCGAGGCTGCAGTGTAGTTGGGCTTC 1751

  5591868 ACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGGAGATAAGCCTCTGGGCTCCGGGTTCAAATCCCAGCC 5591927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 ACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGGAGATAAGCCTCTGGGCTCCGGGTTCAAATCCCAGCC 1811

  5591928 TTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACCATCTATAAAATGGGGAGAGAAGCTGTAACTCCCTCA 5591987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACCATCTATAAAATGGGGAGAGAAGCTGTAACTCCCTCA 1871

  5591988 CTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGGGTTGAAATGCATAAGGAGGCCAGAGCAGTGCCTGGA 5592047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGGGTTGAAATGCATAAGGAGGCCAGAGCAGTGCCTGGA 1931

  5592048 GTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTGTGACCTGTTCTCATTTTGCTGAGGCTTGAGTAGAAA 5592107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTGTGACCTGTTCTCATTTTGCTGAGGCTTGAGTAGAAA 1991

  5592108 AGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGGGCAAGGACCTGAATGTCAGGGTGAGGGGCTGAGGCT 5592167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 AGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGGGCAAGGACCTGAATGTCAGGGTGAGGGGCTGAGGCT 2051

  5592168 CTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAGGGATGCAAAGGATGTGTGGATTTTGGGGGCCTGTTC 5592227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAGGGATGCAAAGGATGTGTGGATTTTGGGGGCCTGTTC 2111

  5592228 TGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTGGGTGGTCCTGAGAGAGACTCTACATTAAGGGTAGAG 5592287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTGGGTGGTCCTGAGAGAGACTCTACATTAAGGGTAGAG 2171

  5592288 TTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCTCAGCGGGGGAGGTCCCACAGGGTCAGTCAGAGGAGG 5592347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCTCAGCGGGGGAGGTCCCACAGGGTCAGTCAGAGGAGG 2231

  5592348 GGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGGTCAGTCAGAGGAGGTGTGGCCCAAGTCATGGGGTCT 5592407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 GGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGGTCAGTCAGAGGAGGTGTGGCCCAAGTCATGGGGTCT 2291

  5592408 GCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGAGGATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAACCC 5592467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 GCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGAGGATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAACCC 2351

  5592468 CCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGTGAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCT 5592527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGTGAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCT 2411

  5592528 GCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTCTGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCC 5592587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTCTGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCC 2471

  5592588 CAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCCCCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGG 5592647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 CAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCCCCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGG 2531

  5592648 GTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAG 5592707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 GTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAG 2591

  5592708 TGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGG 5592767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGG 2651

  5592768 TGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGA 5592827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGA 2711

  5592828 GATTCACAGGATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAG 5592887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 GATTCACAGGATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAG 2771

  5592888 GTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGAT 5592947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 GTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGAT 2831

  5592948 TGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGA 5593007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 TGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGA 2891

  5593008 GACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAAT 5593067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 GACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAAT 2951

  5593068 TGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACT 5593127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 TGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACT 3011

  5593128 TCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATA 5593187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 TCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATA 3071

  5593188 AATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTAC 5593247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 AATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTAC 3131

  5593248 TGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGG 5593307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 TGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGG 3191

  5593308 AAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCA 5593367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 AAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCA 3251

  5593368 ATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGG 5593427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 ATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGG 3311

  5593428 TTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGG 5593487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 TTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGG 3371

  5593488 GGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATG 5593547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 GGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATG 3431

  5593548 TACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAAC 5593607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 TACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAAC 3491

  5593608 ACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCAC 5593667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 ACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCAC 3551

  5593668 GGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCC 5593727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 GGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCC 3611

  5593728 ACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAA 5593787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 ACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAA 3671

  5593788 GCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAAT 5593847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 GCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAAT 3731

  5593848 GTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTAT 5593907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 GTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTAT 3791

  5593908 CCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGT 5593967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGT 3851

  5593968 TTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCA 5594027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 TTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCA 3911

  5594028 GCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCA 5594087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 GCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCA 3971

  5594088 CAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACT 5594147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 CAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACT 4031

  5594148 ATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCC 5594207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 ATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCC 4091

  5594208 AAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTA 5594267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 AAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTA 4151

  5594268 AAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACA 5594327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 AAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACA 4211

  5594328 CAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTT 5594387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 CAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTT 4271

  5594388 GCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACAT 5594447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 GCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACAT 4331

  5594448 ACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCA 5594507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 ACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCA 4391

  5594508 AAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAAT 5594567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 AAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAAT 4451

  5594568 ATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGG 5594627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 ATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGG 4511

  5594628 TGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCA 5594687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 TGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCA 4571

  5594688 ACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTG 5594747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 ACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTG 4631

  5594748 CCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGA 5594807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 CCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGA 4691

  5594808 CGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCC 5594867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 CGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCC 4751

  5594868 TGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTAC 5594927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 TGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTAC 4811

  5594928 TTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTG 5594987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 TTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTG 4871

  5594988 TGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTG 5595047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 TGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTG 4931

  5595048 CCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAG 5595107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4932 CCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAG 4991

  5595108 TTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAAC 5595167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4992 TTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAAC 5051

  5595168 AGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAA 5595227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5052 AGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAA 5111

  5595228 ACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTT 5595287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5112 ACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTT 5171

  5595288 CTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATT 5595347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5172 CTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATT 5231

  5595348 TTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAA 5595407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5232 TTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAA 5291

  5595408 AATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTA 5595467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5292 AATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTA 5351

  5595468 TCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAA 5595527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5352 TCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAA 5411

  5595528 GAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCA 5595587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5412 GAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCA 5471

  5595588 TGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGAC 5595647
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5472 TGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTGGGAC 5531

  5595648 TGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCC 5595707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5532 TGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCC 5591

  5595708 ATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCAC 5595767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5592 ATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCAC 5651

  5595768 ATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTT 5595827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5652 ATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTT 5711

  5595828 GAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATG 5595887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5712 GAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATG 5771

  5595888 TGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCG 5595947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5772 TGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCG 5831

  5595948 GGCGGATC 5595955
          ||||||||
     5832 GGCGGATC 5839

Alignment time is 4.43992 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3170] =>      3170 nucs 'mol-32-2fcd-061081_3170'

Score:        3170
Aligned:      3170        nucs
Identic:      3170 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5596912,5600081]
 second seq =>  [      1,   3170]

  5596912 AGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTT 5596971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTT 60

  5596972 TATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTA 5597031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTA 120

  5597032 GTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTA 5597091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTA 180

  5597092 CAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTT 5597151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTT 240

  5597152 AATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCC 5597211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCC 300

  5597212 TTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTG 5597271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTG 360

  5597272 CCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCT 5597331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCT 420

  5597332 GAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGG 5597391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGG 480

  5597392 ACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAG 5597451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAG 540

  5597452 AAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACC 5597511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACC 600

  5597512 GGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCT 5597571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCT 660

  5597572 GTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGC 5597631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGC 720

  5597632 GCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAG 5597691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAG 780

  5597692 TAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCC 5597751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCC 840

  5597752 TGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATT 5597811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATT 900

  5597812 CTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCC 5597871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCC 960

  5597872 AGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGA 5597931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGA 1020

  5597932 GGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACA 5597991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACA 1080

  5597992 GCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGG 5598051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGG 1140

  5598052 GCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAA 5598111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAA 1200

  5598112 AATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAA 5598171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAA 1260

  5598172 GGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAG 5598231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAG 1320

  5598232 CTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCC 5598291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCC 1380

  5598292 TTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAA 5598351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAA 1440

  5598352 CTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAG 5598411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAG 1500

  5598412 GAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGC 5598471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGC 1560

  5598472 CAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGT 5598531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGT 1620

  5598532 AACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACC 5598591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACC 1680

  5598592 AAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCA 5598651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCA 1740

  5598652 TGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATC 5598711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATC 1800

  5598712 TTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACA 5598771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACA 1860

  5598772 GAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCC 5598831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCC 1920

  5598832 AGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAG 5598891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAG 1980

  5598892 GCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCAT 5598951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCAT 2040

  5598952 CTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGG 5599011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGG 2100

  5599012 AGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAA 5599071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAA 2160

  5599072 GAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCT 5599131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCT 2220

  5599132 GTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTG 5599191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTG 2280

  5599192 AGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGA 5599251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGA 2340

  5599252 GTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTA 5599311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTA 2400

  5599312 TAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGA 5599371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGA 2460

  5599372 GGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTG 5599431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTG 2520

  5599432 GTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGA 5599491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGA 2580

  5599492 GAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGG 5599551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGG 2640

  5599552 AAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTG 5599611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTG 2700

  5599612 GAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACAC 5599671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACAC 2760

  5599672 TGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGA 5599731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGA 2820

  5599732 TACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGT 5599791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGT 2880

  5599792 CCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACAT 5599851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACAT 2940

  5599852 CCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTC 5599911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTC 3000

  5599912 TGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCA 5599971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCA 3060

  5599972 CCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTT 5600031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTT 3120

  5600032 GTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATT 5600081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATT 3170

Alignment time is 2.15657 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3864] =>      3864 nucs 'mol-32-2fe3-036807_3864'

Score:        3124
Aligned:      3443        nucs
Identic:      3414 ( 99%) nucs =>      1042 ( 99%)      2372 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593649,5594699] EXCISED REGION [5597499,5599889]
 second seq =>  [      1,   1051] EXCISED REGION [   1473,   3864]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2799 nucs [5594700,5597498]
 second seq =>       421 nucs [1052,1472]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1052,1053] to [1471,1472]

  5593649 GGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCA 5593708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCA 60

  5593709 TGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGC 5593768
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCGTGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGC 120

  5593769 CGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAG 5593828
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAG 180

  5593829 TGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCT 5593888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCT 240

  5593889 CAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTC 5593948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTC 300

  5593949 TCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTG 5594008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTG 360

  5594009 CAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCC 5594068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCC 420

  5594069 TCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTT 5594128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTT 480

  5594129 GTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAAT 5594188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAAT 540

  5594189 CCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCC 5594248
          |||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTCCCACCTCAGCCCCGCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCC 600

  5594249 TCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTT 5594308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTT 660

  5594309 GGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAA 5594368
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCAGAGTATATGAAAACACAAGTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAA 720

  5594369 ATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAA 5594428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      721 ATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAGTAGAGAAAA 780

  5594429 GAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTT 5594488
          |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGAGAAATTTCTCACATACTTACCATTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTT 840

  5594489 TTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAG 5594548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAG 900

  5594549 AACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACT 5594608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      901 AACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTCATTATGTGACAAGAAAACT 960

  5594609 TTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAG 5594668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAG 1020

  5594669 TTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGAC 5594699
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGAC 1051

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 1532

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 1592

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 1652

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 1712

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 1772

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 1832

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 1892

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 1952

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1953 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 2012

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 2072

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 2132

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 2192

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 2252

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 2312

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 2372

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 2432

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 2492

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2493 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 2552

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 2612

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 2672

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 2732

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 2792

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 2852

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 2912

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 2972

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2973 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 3032

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3033 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 3092

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 3152

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 3212

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 3272

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3273 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 3332

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3333 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 3392

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 3452

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 3512

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||
     3513 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTAGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 3572

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 3632

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3633 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 3692

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 3752

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 3812

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACC 5599889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACC 3864

Alignment time is 3.06121 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   9357] =>      9357 nucs 'mol-32-2ff9-075046_9357'

Score:        8395
Aligned:      8936        nucs
Identic:      8886 ( 99%) nucs =>      2212 (100%)      6674 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5592477,5594699] EXCISED REGION [5597499,5604208]
 second seq =>  [      1,   2223] EXCISED REGION [   2645,   9357]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2799 nucs [5594700,5597498]
 second seq =>       421 nucs [2224,2644]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2224,2225] to [2643,2644]

  5592477 GTGCCCAGTGGAGGGTGAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCAT 5592536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCCCAGTGGAGGGTGAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCAT 60

  5592537 GAGTGAGGGGCCCCTCTGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAG 5592596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGTGAGGGGCCCCTCTGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAG 120

  5592597 CCCGATAAGCTGAGCCCCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGT 5592656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCGATAAGCTGAGCCCCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGT 180

  5592657 GAGTTAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAA 5592716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGTTAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAA 240

  5592717 AGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACT 5592776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACT 300

  5592777 GGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAG 5592836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAG 360

  5592837 GATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGA 5592896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGA 420

  5592897 TGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACT 5592956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACT 480

  5592957 GCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAA 5593016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAA 540

  5593017 GAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGG 5593076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGG 600

  5593077 TGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTG 5593136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTG 660

  5593137 TGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTT 5593196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATTTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTT 720

  5593197 TCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCT 5593256
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATGTGAGGACGGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCT 780

  5593257 GCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAG 5593316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAG 840

  5593317 TCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAA 5593376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAA 900

  5593377 AATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGG 5593436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGG 960

  5593437 ATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAG 5593496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAG 1020

  5593497 CTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTA 5593556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTA 1080

  5593557 CAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGA 5593616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGA 1140

  5593617 GCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGG 5593676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGG 1200

  5593677 TGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTA 5593736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1201 TGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCGTGGCCTGCACAGCCACAATCCTA 1260

  5593737 ACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTT 5593796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCTGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTT 1320

  5593797 ACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACC 5593856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACC 1380

  5593857 GACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTG 5593916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTG 1440

  5593917 CCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGA 5593976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGA 1500

  5593977 CAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACC 5594036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACC 1560

  5594037 TCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGT 5594096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGT 1620

  5594097 GCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCC 5594156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCC 1680

  5594157 AGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTG 5594216
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||
     1681 AGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCGCAAAGTGCTG 1740

  5594217 GGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAG 5594276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAG 1800

  5594277 GCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCT 5594336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1801 GCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAAGTTGCT 1860

  5594337 TAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATAT 5594396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATAT 1920

  5594397 CCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCAC 5594456
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
     1921 CCACATACGGAAAATACGAAAAGTAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACTTACCAT 1980

  5594457 TTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAG 5594516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAG 2040

  5594517 GGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACA 5594576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACA 2100

  5594577 ATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTC 5594636
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTATATAGTGTCATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTC 2160

  5594637 ATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGA 5594696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGA 2220

  5594697 GAC 5594699
          |||
     2221 GAC 2223

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 2704

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 2764

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 2824

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 2884

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 2944

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 3004

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 3064

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 3124

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3125 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 3184

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 3244

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 3304

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 3364

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 3424

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 3484

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 3544

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 3604

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 3664

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3665 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 3724

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 3784

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 3844

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 3904

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 3964

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 4024

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 4084

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 4144

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4145 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 4204

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4205 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 4264

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 4324

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 4384

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 4444

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4445 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 4504

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4505 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 4564

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 4624

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 4684

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4685 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 4744

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 4804

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4805 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 4864

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 4924

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 4984

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5044

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5045 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5104

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5164

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5224

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5225 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5284

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5344

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5404

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5464

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5524

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5584

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5644

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5645 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 5704

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5764

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5824

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5884

  5600738 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGG 5600797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5885 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGG 5944

  5600798 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5600857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5945 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 6004

  5600858 GGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCT 5600917
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6005 GGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCT 6064

  5600918 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5600977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 6124

  5600978 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5601037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 6184

  5601038 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5601097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6185 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 6244

  5601098 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5601157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 6304

  5601158 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5601217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6305 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 6364

  5601218 TGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5601277
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6365 TGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 6424

  5601278 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5601337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6425 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 6484

  5601338 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5601397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6485 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 6544

  5601398 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5601457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6545 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 6604

  5601458 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5601517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6605 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 6664

  5601518 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5601577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6665 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 6724

  5601578 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5601637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6725 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 6784

  5601638 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5601697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6785 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 6844

  5601698 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 5601757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6845 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 6904

  5601758 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 5601817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6905 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 6964

  5601818 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 5601877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6965 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 7024

  5601878 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGC 5601937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7025 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGCCACATTAGAAATGTGC 7084

  5601938 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 5601997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7085 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 7144

  5601998 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 5602057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7145 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 7204

  5602058 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 5602117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7205 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 7264

  5602118 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 5602177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7265 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 7324

  5602178 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 5602237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7325 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 7384

  5602238 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 5602297
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7385 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCGGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 7444

  5602298 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 5602357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7445 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 7504

  5602358 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5602417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7505 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 7564

  5602418 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5602477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7565 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 7624

  5602478 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5602537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7625 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 7684

  5602538 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5602597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7685 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 7744

  5602598 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5602657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7745 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 7804

  5602658 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5602717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7805 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 7864

  5602718 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5602777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7865 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 7924

  5602778 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 5602837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7925 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 7984

  5602838 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGC 5602897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7985 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGATGC 8044

  5602898 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 5602957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8045 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 8104

  5602958 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 5603017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8105 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 8164

  5603018 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 5603077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8165 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 8224

  5603078 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 5603137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8225 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 8284

  5603138 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 5603197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8285 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 8344

  5603198 GGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCTT 5603257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8345 GGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCTT 8404

  5603258 CCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGC 5603317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8405 CCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGC 8464

  5603318 CCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTG 5603377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8465 CCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTG 8524

  5603378 TCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGC 5603437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8525 TCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGC 8584

  5603438 GAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAAC 5603497
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8585 GAGGCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAAC 8644

  5603498 TCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCT 5603557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8645 TCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCT 8704

  5603558 GCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATA 5603617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8705 GCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATA 8764

  5603618 GCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTC 5603677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8765 GCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTC 8824

  5603678 ATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGAT 5603737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8825 ATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGAT 8884

  5603738 TTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCT 5603797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8885 TTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCT 8944

  5603798 GTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGTG 5603857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8945 GTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGTG 9004

  5603858 GCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCAATGAAATAAATAGA 5603917
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     9005 GCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTCGTCAGATTTAAAAGCAATGAAATAAATAGA 9064

  5603918 ATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAACTTGAAAGCA 5603977
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9065 ATTGCATTTTTCACTTGGTGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAACTTGAAAGCA 9124

  5603978 CCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTCATTTAAACTC 5604037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9125 CCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTCATTTAAACTC 9184

  5604038 AGGG--ACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAA 5604095
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9185 AGGGACACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAA 9244

  5604096 CCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCTGAACCTTTTCCC 5604155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9245 CCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCTGAACCTTTTCCC 9304

  5604156 TACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACACAGGTT 5604208
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9305 TACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACACAGGTT 9357

Alignment time is 7.31564 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   8604] =>      8604 nucs 'mol-32-2ff9-080496_8604'

Score:        8603
Aligned:      8603        nucs
Identic:      8603 (100%) nucs =>      7984 (100%)       619 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5597008,5604991] EXCISED REGION [5604993,5605611]
 second seq =>  [      1,   7984] EXCISED REGION [   7986,   8604]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5604992,5604992]
 second seq =>         1 nucs [7985,7985]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [5604987,5604991] to [5604988,5604992]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5597008 GGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCT 5597067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCT 60

  5597068 CAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGAT 5597127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGAT 120

  5597128 TTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCAT 5597187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCAT 180

  5597188 GTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGC 5597247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGC 240

  5597248 CTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTT 5597307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTT 300

  5597308 GCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGG 5597367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGG 360

  5597368 CTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCT 5597427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCT 420

  5597428 TGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGG 5597487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGG 480

  5597488 TGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTG 5597547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTG 540

  5597548 TGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCT 5597607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCT 600

  5597608 GAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCAT 5597667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCAT 660

  5597668 TTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAA 5597727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAA 720

  5597728 GTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTA 5597787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTA 780

  5597788 TTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTT 5597847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTT 840

  5597848 TGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAG 5597907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAG 900

  5597908 GAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTC 5597967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTC 960

  5597968 TAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATC 5598027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATC 1020

  5598028 AGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAA 5598087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAA 1080

  5598088 GGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGA 5598147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGA 1140

  5598148 ATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATG 5598207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATG 1200

  5598208 CCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTC 5598267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTC 1260

  5598268 TTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATA 5598327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATA 1320

  5598328 TGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTC 5598387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTC 1380

  5598388 TGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCC 5598447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCC 1440

  5598448 TGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCC 5598507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCC 1500

  5598508 TGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCT 5598567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCT 1560

  5598568 TGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTA 5598627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTA 1620

  5598628 TAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACA 5598687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACA 1680

  5598688 TTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATAT 5598747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATAT 1740

  5598748 TATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGA 5598807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGA 1800

  5598808 CTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTT 5598867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTT 1860

  5598868 GTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGC 5598927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGC 1920

  5598928 TTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCA 5598987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCA 1980

  5598988 TGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCT 5599047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCT 2040

  5599048 GTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTT 5599107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTT 2100

  5599108 TGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCT 5599167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCT 2160

  5599168 TCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGC 5599227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGC 2220

  5599228 CTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGT 5599287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGT 2280

  5599288 CTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGAT 5599347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGAT 2340

  5599348 TCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTC 5599407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTC 2400

  5599408 CCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAA 5599467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAA 2460

  5599468 AGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCT 5599527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCT 2520

  5599528 GAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGAT 5599587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGAT 2580

  5599588 CTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAG 5599647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAG 2640

  5599648 GCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGA 5599707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGA 2700

  5599708 CCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCC 5599767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCC 2760

  5599768 CAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATA 5599827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATA 2820

  5599828 TCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGA 5599887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGA 2880

  5599888 CCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTT 5599947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTT 2940

  5599948 CTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATG 5600007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATG 3000

  5600008 AACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCAT 5600067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCAT 3060

  5600068 CCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTT 5600127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTT 3120

  5600128 CATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACA 5600187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACA 3180

  5600188 ATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTA 5600247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTA 3240

  5600248 TAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGAT 5600307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGAT 3300

  5600308 TCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAG 5600367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAG 3360

  5600368 TTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAA 5600427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAA 3420

  5600428 GCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGA 5600487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGA 3480

  5600488 ATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTT 5600547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTT 3540

  5600548 CCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTG 5600607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTG 3600

  5600608 GGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATG 5600667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATG 3660

  5600668 GGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTA 5600727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTA 3720

  5600728 TCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACAC 5600787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACAC 3780

  5600788 TTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAAT 5600847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAAT 3840

  5600848 AAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGA 5600907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGA 3900

  5600908 ATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAG 5600967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAG 3960

  5600968 ACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCAC 5601027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCAC 4020

  5601028 TAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAG 5601087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAG 4080

  5601088 GCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTC 5601147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTC 4140

  5601148 ATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTC 5601207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTC 4200

  5601208 TCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTG 5601267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTG 4260

  5601268 GCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATG 5601327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATG 4320

  5601328 CTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAG 5601387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAG 4380

  5601388 ACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGC 5601447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGC 4440

  5601448 ACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAG 5601507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAG 4500

  5601508 GTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAG 5601567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAG 4560

  5601568 AACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAG 5601627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAG 4620

  5601628 AAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAA 5601687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAA 4680

  5601688 CAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGA 5601747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGA 4740

  5601748 CTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTA 5601807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTA 4800

  5601808 ACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAA 5601867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAA 4860

  5601868 ACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATT 5601927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATT 4920

  5601928 AGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATG 5601987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATG 4980

  5601988 CAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGA 5602047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGA 5040

  5602048 CGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCT 5602107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCT 5100

  5602108 CATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTC 5602167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTC 5160

  5602168 CCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACC 5602227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACC 5220

  5602228 AACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAG 5602287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAG 5280

  5602288 AACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCT 5602347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCT 5340

  5602348 CTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTAC 5602407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTAC 5400

  5602408 AACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTG 5602467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTG 5460

  5602468 GAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTT 5602527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTT 5520

  5602528 TCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATT 5602587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATT 5580

  5602588 TTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTC 5602647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTC 5640

  5602648 CTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATT 5602707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATT 5700

  5602708 TTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACT 5602767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACT 5760

  5602768 CACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATT 5602827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATT 5820

  5602828 TGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGC 5602887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGC 5880

  5602888 CATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAA 5602947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAA 5940

  5602948 GCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTT 5603007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTT 6000

  5603008 CAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTA 5603067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTA 6060

  5603068 GATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCC 5603127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCC 6120

  5603128 CCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGA 5603187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 CCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGA 6180

  5603188 CTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATA 5603247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 CTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATA 6240

  5603248 GGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCA 5603307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCA 6300

  5603308 GAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGAC 5603367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGAC 6360

  5603368 TGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTC 5603427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTC 6420

  5603428 TTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGC 5603487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGC 6480

  5603488 ACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACT 5603547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 ACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACT 6540

  5603548 GGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAG 5603607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAG 6600

  5603608 CTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTG 5603667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 CTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTG 6660

  5603668 AGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCA 5603727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCA 6720

  5603728 TTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTT 5603787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTT 6780

  5603788 TGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCT 5603847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCT 6840

  5603848 CTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCAATGA 5603907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCAATGA 6900

  5603908 AATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAA 5603967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAA 6960

  5603968 CTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTC 5604027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTC 7020

  5604028 ATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGA 5604087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGA 7080

  5604088 GTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCTGAAC 5604147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCTGAAC 7140

  5604148 CTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACACAGGT 5604207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACACAGGT 7200

  5604208 TTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGATGTGCC 5604267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGATGTGCC 7260

  5604268 TTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGCCCAGCA 5604327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGCCCAGCA 7320

  5604328 GGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCTGCACTT 5604387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 GGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCTGCACTT 7380

  5604388 TTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGAATGGTC 5604447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 TTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGAATGGTC 7440

  5604448 TTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGTGGTACT 5604507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 TTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGTGGTACT 7500

  5604508 GCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTTAGGGAG 5604567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 GCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTTAGGGAG 7560

  5604568 GTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGACCCAGA 5604627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGACCCAGA 7620

  5604628 GAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGGCCCAGA 5604687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 GAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGGCCCAGA 7680

  5604688 GAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCGGTACTC 5604747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 GAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCGGTACTC 7740

  5604748 ACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTCTGAACC 5604807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 ACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTCTGAACC 7800

  5604808 ATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGGCAGAAT 5604867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 ATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGGCAGAAT 7860

  5604868 GACAAATGGGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCCAACAGA 5604927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 GACAAATGGGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCCAACAGA 7920

  5604928 GCCATTTATCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGAGAACAG 5604987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 GCCATTTATCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGAGAACAG 7980

  5604988 GGGG 5604991
          ||||
     7981 GGGG 7984

EXCISED REGION

  5604993 TGTAAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAGGGCTGACCA 5605052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 TGTAAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAGGGCTGACCA 8045

  5605053 GCACTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAACATCCTTTT 5605112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 GCACTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAACATCCTTTT 8105

  5605113 AATATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAATCGAAGTCT 5605172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 AATATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAATCGAAGTCT 8165

  5605173 TGCAATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCATAGTATACA 5605232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 TGCAATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCATAGTATACA 8225

  5605233 GGATGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTTTTAGGGAGC 5605292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 GGATGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTTTTAGGGAGC 8285

  5605293 ATTTGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGGAATTCCATT 5605352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 ATTTGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGGAATTCCATT 8345

  5605353 TCTAGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTGTTACAGCAT 5605412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 TCTAGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTGTTACAGCAT 8405

  5605413 TAAATTAGATCTAATCTTAATATCCCACCATTAAGACAATGGTAGAGTGTAGTATATCCA 5605472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 TAAATTAGATCTAATCTTAATATCCCACCATTAAGACAATGGTAGAGTGTAGTATATCCA 8465

  5605473 TTTGGTAAATTATTATGAATCATTCAAAAATGATGTAAAGAATTCTAATGAAATAAGAAA 5605532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 TTTGGTAAATTATTATGAATCATTCAAAAATGATGTAAAGAATTCTAATGAAATAAGAAA 8525

  5605533 ATGCTTATGATATAATGTCAAACAAAAAAGTAGGGTATACAACTGCATGTACATATGTTT 5605592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8526 ATGCTTATGATATAATGTCAAACAAAAAAGTAGGGTATACAACTGCATGTACATATGTTT 8585

  5605593 CAACCATTAAATCTATATG 5605611
          |||||||||||||||||||
     8586 CAACCATTAAATCTATATG 8604

Alignment time is 6.73927 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2293] =>      2293 nucs 'mol-32-303b-245751_2293'

Score:        2293
Aligned:      2293        nucs
Identic:      2293 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593590,5595882]
 second seq =>  [      1,   2293]

  5593590 TTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAG 5593649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAG 60

  5593650 GTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCAT 5593709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCAT 120

  5593710 GGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCC 5593769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCC 180

  5593770 GGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGT 5593829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGT 240

  5593830 GCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTC 5593889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTC 300

  5593890 AAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCT 5593949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCT 360

  5593950 CCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGC 5594009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGC 420

  5594010 AGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCT 5594069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCT 480

  5594070 CCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTG 5594129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTG 540

  5594130 TAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATC 5594189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATC 600

  5594190 CTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCT 5594249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCT 660

  5594250 CTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTG 5594309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTG 720

  5594310 GCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAA 5594369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAA 780

  5594370 TACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAG 5594429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAG 840

  5594430 AAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTT 5594489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTT 900

  5594490 TCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGA 5594549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGA 960

  5594550 ACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTT 5594609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTT 1020

  5594610 TGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGT 5594669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGT 1080

  5594670 TCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGC 5594729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGC 1140

  5594730 TGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCT 5594789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCT 1200

  5594790 TTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTG 5594849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTG 1260

  5594850 GGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATA 5594909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATA 1320

  5594910 ATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGG 5594969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGG 1380

  5594970 GCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTC 5595029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTC 1440

  5595030 TCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCAT 5595089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCAT 1500

  5595090 GGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTG 5595149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTG 1560

  5595150 AGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGA 5595209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGA 1620

  5595210 ATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTA 5595269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTA 1680

  5595270 TATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACC 5595329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACC 1740

  5595330 CCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCT 5595389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCT 1800

  5595390 TGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGA 5595449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGA 1860

  5595450 TGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTC 5595509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTC 1920

  5595510 AGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTC 5595569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTC 1980

  5595570 CTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGG 5595629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGG 2040

  5595630 TCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATG 5595689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATG 2100

  5595690 GAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCC 5595749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCC 2160

  5595750 ATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGT 5595809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGT 2220

  5595810 TGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAG 5595869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAG 2280

  5595870 CGCATGGGAGTTA 5595882
          |||||||||||||
     2281 CGCATGGGAGTTA 2293

Alignment time is 1.81124 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   9403] =>      9403 nucs 'mol-32-303b-245752_9403'

Score:        9391
Aligned:      9402        nucs
Identic:      9401 (100%) nucs =>      3615 (100%)      5786 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5596028,5599642] EXCISED REGION [5599644,5605430]
 second seq =>  [      1,   3615] EXCISED REGION [   3617,   9403]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5599643,5599643]
 second seq =>         1 nucs [3616,3616]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [3615,3617] to [3616,3618]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5599642,5599642] to [5599644,5599644]
 second seq =>         1 nucs [3615,3615] to [3617,3617]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5596028 AGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 5596087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 60

  5596088 TCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGC 5596147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGC 120

  5596148 CTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCA 5596207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCA 180

  5596208 CTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGT 5596267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGT 240

  5596268 GTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGT 5596327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGT 300

  5596328 TAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCAC 5596387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCAC 360

  5596388 TCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGA 5596447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGA 420

  5596448 AGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACA 5596507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACA 480

  5596508 TCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAG 5596567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAG 540

  5596568 CTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTT 5596627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTT 600

  5596628 GTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTG 5596687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTG 660

  5596688 CTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTC 5596747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTC 720

  5596748 CATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTAT 5596807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTAT 780

  5596808 CTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGT 5596867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGT 840

  5596868 GAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGG 5596927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGG 900

  5596928 GAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCAT 5596987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCAT 960

  5596988 TTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGA 5597047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGA 1020

  5597048 CTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCT 5597107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCT 1080

  5597108 GACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTC 5597167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTC 1140

  5597168 TTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGC 5597227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGC 1200

  5597228 AGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGG 5597287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGG 1260

  5597288 TGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGAT 5597347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGAT 1320

  5597348 GCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACC 5597407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACC 1380

  5597408 CATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACA 5597467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACA 1440

  5597468 TCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGA 5597527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGA 1500

  5597528 CTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTT 5597587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTT 1560

  5597588 GAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAG 5597647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAG 1620

  5597648 GATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGAT 5597707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGAT 1680

  5597708 CAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAAC 5597767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAAC 1740

  5597768 TTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAA 5597827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAA 1800

  5597828 GAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGC 5597887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGC 1860

  5597888 TCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAAC 5597947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAAC 1920

  5597948 GAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGC 5598007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGC 1980

  5598008 AACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTT 5598067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTT 2040

  5598068 TAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGA 5598127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGA 2100

  5598128 TGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAG 5598187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAG 2160

  5598188 TTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCC 5598247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCC 2220

  5598248 AAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTT 5598307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTT 2280

  5598308 CCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAA 5598367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAA 2340

  5598368 ATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTT 5598427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTT 2400

  5598428 TCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGT 5598487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGT 2460

  5598488 AGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGT 5598547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGT 2520

  5598548 GGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGG 5598607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGG 2580

  5598608 CATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGC 5598667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGC 2640

  5598668 CAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAG 5598727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAG 2700

  5598728 TACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCC 5598787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCC 2760

  5598788 CACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAG 5598847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAG 2820

  5598848 CAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTT 5598907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTT 2880

  5598908 ACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCC 5598967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCC 2940

  5598968 CACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATG 5599027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATG 3000

  5599028 GGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTT 5599087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTT 3060

  5599088 ATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGT 5599147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGT 3120

  5599148 ACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTAT 5599207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTAT 3180

  5599208 GATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTT 5599267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTT 3240

  5599268 TCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATA 5599327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATA 3300

  5599328 TACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGG 5599387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGG 3360

  5599388 AGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGT 5599447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGT 3420

  5599448 TTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAG 5599507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAG 3480

  5599508 CTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAA 5599567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAA 3540

  5599568 GGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAG 5599627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAG 3600

  5599628 CTTGGCTCAGTAAAG 5599642
          |||||||||||||||
     3601 CTTGGCTCAGTAAAG 3615

EXCISED REGION

  5599644 GGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGT 5599703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 GGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGT 3676

  5599704 GTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGC 5599763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 GTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGC 3736

  5599764 ATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCC 5599823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 ATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCC 3796

  5599824 AATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTA 5599883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 AATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTA 3856

  5599884 TAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTC 5599943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 TAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTC 3916

  5599944 CCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAG 5600003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 CCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAG 3976

  5600004 CATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTA 5600063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 CATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTA 4036

  5600064 TCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTT 5600123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 TCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTT 4096

  5600124 TCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAG 5600183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 TCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAG 4156

  5600184 GACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGT 5600243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 GACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGT 4216

  5600244 ATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTG 5600303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 ATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTG 4276

  5600304 AGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAG 5600363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 AGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAG 4336

  5600364 TGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAG 5600423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 TGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAG 4396

  5600424 TGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGA 5600483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 TGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGA 4456

  5600484 GAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAAT 5600543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 GAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAAT 4516

  5600544 ATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGC 5600603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 ATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGC 4576

  5600604 CTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAA 5600663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 CTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAA 4636

  5600664 AATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCT 5600723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 AATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCT 4696

  5600724 TCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAA 5600783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 TCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAA 4756

  5600784 ACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGAT 5600843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 ACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGAT 4816

  5600844 GAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGG 5600903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 GAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGG 4876

  5600904 CTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCA 5600963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 CTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCA 4936

  5600964 TGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAAT 5601023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 TGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAAT 4996

  5601024 CCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGC 5601083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 CCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGC 5056

  5601084 ATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGAT 5601143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 ATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGAT 5116

  5601144 GCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGC 5601203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 GCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGC 5176

  5601204 TGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCT 5601263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 TGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCT 5236

  5601264 GGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTA 5601323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 GGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTA 5296

  5601324 CATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAAT 5601383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 CATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAAT 5356

  5601384 GGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGC 5601443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 GGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGC 5416

  5601444 CAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCT 5601503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 CAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCT 5476

  5601504 AAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGG 5601563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 AAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGG 5536

  5601564 GGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTA 5601623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 GGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTA 5596

  5601624 GGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTT 5601683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 GGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTT 5656

  5601684 GTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAA 5601743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 GTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAA 5716

  5601744 CTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGA 5601803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 CTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGA 5776

  5601804 ACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCC 5601863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 ACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCC 5836

  5601864 CAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCA 5601923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 CAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCA 5896

  5601924 CATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGT 5601983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 CATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGT 5956

  5601984 CATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTT 5602043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 CATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTT 6016

  5602044 GAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACT 5602103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6017 GAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACT 6076

  5602104 GGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCA 5602163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 GGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCA 6136

  5602164 ACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCC 5602223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 ACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCC 6196

  5602224 CACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATA 5602283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 CACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATA 6256

  5602284 ATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAAT 5602343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6257 ATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAAT 6316

  5602344 TCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGG 5602403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6317 TCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGG 6376

  5602404 TTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCC 5602463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6377 TTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCC 6436

  5602464 TTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGC 5602523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6437 TTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGC 6496

  5602524 AGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTC 5602583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6497 AGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTC 6556

  5602584 AATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCC 5602643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6557 AATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCC 6616

  5602644 AGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCAT 5602703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6617 AGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCAT 6676

  5602704 AATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCT 5602763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6677 AATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCT 6736

  5602764 TACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAA 5602823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6737 TACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAA 6796

  5602824 CATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAG 5602883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6797 CATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAG 6856

  5602884 GGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGA 5602943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6857 GGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGA 6916

  5602944 AGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAA 5603003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6917 AGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAA 6976

  5603004 CCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAG 5603063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6977 CCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAG 7036

  5603064 ATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGAC 5603123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7037 ATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGAC 7096

  5603124 ACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGG 5603183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7097 ACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGG 7156

  5603184 AGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACC 5603243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7157 AGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACC 7216

  5603244 AATAGGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGC 5603303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7217 AATAGGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGC 7276

  5603304 CTCAGAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAG 5603363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7277 CTCAGAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAG 7336

  5603364 AGACTGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCAT 5603423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7337 AGACTGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCAT 7396

  5603424 CTTCTTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTT 5603483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7397 CTTCTTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTT 7456

  5603484 GGGCACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGC 5603543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7457 GGGCACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGC 7516

  5603544 TACTGGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGA 5603603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7517 TACTGGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGA 7576

  5603604 GCAGCTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAG 5603663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7577 GCAGCTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAG 7636

  5603664 TGTGAGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGC 5603723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7637 TGTGAGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGC 7696

  5603724 AGCATTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTA 5603783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7697 AGCATTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTA 7756

  5603784 TTTTTGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGA 5603843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7757 TTTTTGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGA 7816

  5603844 GGCTCTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCA 5603903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7817 GGCTCTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCA 7876

  5603904 ATGAAATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGT 5603963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7877 ATGAAATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGT 7936

  5603964 ACAACTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGC 5604023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7937 ACAACTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGC 7996

  5604024 TTTCATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCC 5604083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7997 TTTCATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCC 8056

  5604084 TGGAGTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCT 5604143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8057 TGGAGTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCT 8116

  5604144 GAACCTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACAC 5604203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8117 GAACCTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACAC 8176

  5604204 AGGTTTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGATG 5604263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8177 AGGTTTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGATG 8236

  5604264 TGCCTTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGCCC 5604323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8237 TGCCTTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGCCC 8296

  5604324 AGCAGGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCTGC 5604383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8297 AGCAGGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCTGC 8356

  5604384 ACTTTTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGAAT 5604443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8357 ACTTTTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGAAT 8416

  5604444 GGTCTTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGTGG 5604503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8417 GGTCTTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGTGG 8476

  5604504 TACTGCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTTAG 5604563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8477 TACTGCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTTAG 8536

  5604564 GGAGGTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGACC 5604623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8537 GGAGGTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGACC 8596

  5604624 CAGAGAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGGCC 5604683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8597 CAGAGAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGGCC 8656

  5604684 CAGAGAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCGGT 5604743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8657 CAGAGAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCGGT 8716

  5604744 ACTCACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTCTG 5604803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8717 ACTCACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTCTG 8776

  5604804 AACCATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGGCA 5604863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8777 AACCATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGGCA 8836

  5604864 GAATGACAAATGGGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCCAA 5604923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8837 GAATGACAAATGGGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCCAA 8896

  5604924 CAGAGCCATTTATCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGAGA 5604983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8897 CAGAGCCATTTATCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGAGA 8956

  5604984 ACAGGGGGGTGTAAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAG 5605043
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8957 ACAGGGGGCTGTAAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAG 9016

  5605044 GGCTGACCAGCACTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAA 5605103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9017 GGCTGACCAGCACTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAA 9076

  5605104 CATCCTTTTAATATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAA 5605163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9077 CATCCTTTTAATATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAA 9136

  5605164 TCGAAGTCTTGCAATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCA 5605223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9137 TCGAAGTCTTGCAATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCA 9196

  5605224 TAGTATACAGGATGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTT 5605283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9197 TAGTATACAGGATGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTT 9256

  5605284 TTAGGGAGCATTTGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGG 5605343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9257 TTAGGGAGCATTTGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGG 9316

  5605344 AATTCCATTTCTAGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTG 5605403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9317 AATTCCATTTCTAGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTG 9376

  5605404 TTACAGCATTAAATTAGATCTAATCTT 5605430
          |||||||||||||||||||||||||||
     9377 TTACAGCATTAAATTAGATCTAATCTT 9403

Alignment time is 7.38301 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   7329] =>      7329 nucs 'mol-32-3046-263419_7329'

Score:        7329
Aligned:      7329        nucs
Identic:      7329 (100%) nucs =>       302 (100%)      7027 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5588470,5588771] EXCISED REGION [5588773,5595799]
 second seq =>  [      1,    302] EXCISED REGION [    303,   7329]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5588772,5588772]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [5588772,5588790] to [5588773,5588791]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5588470 CTAATCCAATCCAACTGGTGTCCTTATAAGAAGAGGAGATTCCTGTTATCCTGGCACTTT 5588529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAATCCAATCCAACTGGTGTCCTTATAAGAAGAGGAGATTCCTGTTATCCTGGCACTTT 60

  5588530 GAGAGGCTGAGGTGAGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACAC 5588589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAGGCTGAGGTGAGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACAC 120

  5588590 GGCAAAACCATGTATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCAAGCCTG 5588649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCAAAACCATGTATCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCAAGCCTG 180

  5588650 TAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGT 5588709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGT 240

  5588710 TGCCATGAGCCGAGATTGCACGACTGCCCTCCAGTCTCGGCAACAGAGCGAGACTCTATC 5588769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCCATGAGCCGAGATTGCACGACTGCCCTCCAGTCTCGGCAACAGAGCGAGACTCTATC 300

  5588770 TC 5588771
          ||
      301 TC 302

EXCISED REGION

  5588773 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAGGAGAGACAGCAGGCGTGAGCTCACATAGGGGAAAG 5588832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAGGAGAGACAGCAGGCGTGAGCTCACATAGGGGAAAG 362

  5588833 ACCTGTGAGGACATGGTGAAGAGGAGGCTGGAGGGCAGTCATCTGTAAGCCAAGGGGAGA 5588892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 ACCTGTGAGGACATGGTGAAGAGGAGGCTGGAGGGCAGTCATCTGTAAGCCAAGGGGAGA 422

  5588893 GACATTCAGAAGAAACAACCCTGCTGACACCTCCACCTTGGACTTCCAGCCTCCAGAACT 5588952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 GACATTCAGAAGAAACAACCCTGCTGACACCTCCACCTTGGACTTCCAGCCTCCAGAACT 482

  5588953 GTGAAAAATAAACTTCTGTTGCTTCAGCCACCCTGCCTGTGGTATTTTGTCAAGGCAGCC 5589012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 GTGAAAAATAAACTTCTGTTGCTTCAGCCACCCTGCCTGTGGTATTTTGTCAAGGCAGCC 542

  5589013 CTAGCAGACTAATACAAGGACTTTCTTTGTGCTGGGCTCTGTGCTTAGCTCATGCTTTAT 5589072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 CTAGCAGACTAATACAAGGACTTTCTTTGTGCTGGGCTCTGTGCTTAGCTCATGCTTTAT 602

  5589073 CTCACTGAATCCCCATATCAACCCTGTAGGGTAGGAACAATGGTGACCTCAGTGTTACAG 5589132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 CTCACTGAATCCCCATATCAACCCTGTAGGGTAGGAACAATGGTGACCTCAGTGTTACAG 662

  5589133 GTGGAGGACTGAGCTTGGAGGTAAATGACTTGCCCAGGGTCAGAACACAGGCAGCAGCCT 5589192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 GTGGAGGACTGAGCTTGGAGGTAAATGACTTGCCCAGGGTCAGAACACAGGCAGCAGCCT 722

  5589193 GAGCCAGGACTGGAACTCAGGGCTGCCTGTCCAGAGCCCTTGAACTGAACCGTCATGCCC 5589252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 GAGCCAGGACTGGAACTCAGGGCTGCCTGTCCAGAGCCCTTGAACTGAACCGTCATGCCC 782

  5589253 ACCTCACTCATCTGCTAGGTCGTTCATGGCCCACTCCCAGCCCCTGGTTATTTGAATAAT 5589312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 ACCTCACTCATCTGCTAGGTCGTTCATGGCCCACTCCCAGCCCCTGGTTATTTGAATAAT 842

  5589313 GGCCGTATTAGGTTTTGCAGTTTAGTGTAAAGAAGGGAGAGTGTGCTTGGGAGGCAGAAG 5589372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 GGCCGTATTAGGTTTTGCAGTTTAGTGTAAAGAAGGGAGAGTGTGCTTGGGAGGCAGAAG 902

  5589373 ATCTGGGCTTGAATCCTGGGTTTTTGACCTCCTGCTGAGTAAATTTGGGCCCCACTGCTT 5589432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 ATCTGGGCTTGAATCCTGGGTTTTTGACCTCCTGCTGAGTAAATTTGGGCCCCACTGCTT 962

  5589433 AGATTTTATATGTCTCTATCTCCTCACCTACAAGGCCTTCGTCACAGGCTGATTCCGGAT 5589492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 AGATTTTATATGTCTCTATCTCCTCACCTACAAGGCCTTCGTCACAGGCTGATTCCGGAT 1022

  5589493 ATCCAATGTGTTGATGTATGGGAGGTGCATTGTAAACTGTAAAGTGCTGGGCAGATGGTA 5589552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 ATCCAATGTGTTGATGTATGGGAGGTGCATTGTAAACTGTAAAGTGCTGGGCAGATGGTA 1082

  5589553 ATTGTTTCAGAGATTTCATGAGTCATGCTATGCATTTAGCATGGGCTGAATTGTGTCCTC 5589612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 ATTGTTTCAGAGATTTCATGAGTCATGCTATGCATTTAGCATGGGCTGAATTGTGTCCTC 1142

  5589613 CTGCCCCCAGTTCGTTTGTCAGCAATCTAACCCCTAATGTGATGGTATTTGGAGATGGGA 5589672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 CTGCCCCCAGTTCGTTTGTCAGCAATCTAACCCCTAATGTGATGGTATTTGGAGATGGGA 1202

  5589673 CCTTTGGGAGATAATTAGGGTTAGATGAGGTCATGTGAGTGGAGATCTGCTGTGACAGGA 5589732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 CCTTTGGGAGATAATTAGGGTTAGATGAGGTCATGTGAGTGGAGATCTGCTGTGACAGGA 1262

  5589733 TTAATGTTCTTATAACAAGAGACACCAGACAGCTGGCTCTCTTGCCTTGGGGGGATACAA 5589792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 TTAATGTTCTTATAACAAGAGACACCAGACAGCTGGCTCTCTTGCCTTGGGGGGATACAA 1322

  5589793 CAAGAGGACGGAATGTCTGCAAACCAGGAAGAGAGCCCTCACTGGGATGCAATTGGCTGG 5589852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 CAAGAGGACGGAATGTCTGCAAACCAGGAAGAGAGCCCTCACTGGGATGCAATTGGCTGG 1382

  5589853 CACCTTAATCTTGGATTTTCCAGCCTCTAGAATTGTGCAAAATAAATGTCTGTTGTTGAA 5589912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 CACCTTAATCTTGGATTTTCCAGCCTCTAGAATTGTGCAAAATAAATGTCTGTTGTTGAA 1442

  5589913 GCCACCTAGCCTTTGGTATTTTGCTATGGCAGCTTGAGCTGACGAAGACAGCGTGCTGCC 5589972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GCCACCTAGCCTTTGGTATTTTGCTATGGCAGCTTGAGCTGACGAAGACAGCGTGCTGCC 1502

  5589973 CCTCTTTCTCTTTGCAAAGCTTCATAGACATACATGGCCTATACACTGAAAAAACTCACA 5590032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 CCTCTTTCTCTTTGCAAAGCTTCATAGACATACATGGCCTATACACTGAAAAAACTCACA 1562

  5590033 TTCCTGAGGGGCTAACTGTTCGGTAGGTGTCAGTTCTGGGGCTGGGCTGGGTGACGGGTT 5590092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 TTCCTGAGGGGCTAACTGTTCGGTAGGTGTCAGTTCTGGGGCTGGGCTGGGTGACGGGTT 1622

  5590093 CCTCCAGTGGAAAACATGCAGTAGCCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAGG 5590152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 CCTCCAGTGGAAAACATGCAGTAGCCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAGG 1682

  5590153 AAGCCGATGTTTCTTTTTCTTGTTTGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGTG 5590212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 AAGCCGATGTTTCTTTTTCTTGTTTGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGTG 1742

  5590213 GAGACTCCAGGGTAGAAAGGAGAGGATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAGC 5590272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 GAGACTCCAGGGTAGAAAGGAGAGGATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAGC 1802

  5590273 AGAAGTGCTTTTCATTTGGTGCAGATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCATT 5590332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 AGAAGTGCTTTTCATTTGGTGCAGATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCATT 1862

  5590333 TTACAGCTGGGGGGACTCAAGCTCAGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCAT 5590392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 TTACAGCTGGGGGGACTCAAGCTCAGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCAT 1922

  5590393 AGGAACCAGGACTGAAGCTGAAGGCCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATTA 5590452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 AGGAACCAGGACTGAAGCTGAAGGCCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATTA 1982

  5590453 GTCTGGGTAGGCTAGATTATGCTGCAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGTT 5590512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 GTCTGGGTAGGCTAGATTATGCTGCAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGTT 2042

  5590513 GTCTTACAGCGACACAACTTTTTCTCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCTG 5590572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 GTCTTACAGCGACACAACTTTTTCTCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCTG 2102

  5590573 CTGCCCCTTATCTCGTCACTCCGAGTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATATG 5590632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 CTGCCCCTTATCTCGTCACTCCGAGTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATATG 2162

  5590633 GATGGATCTCCCAAGGGTCTCACACTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTTC 5590692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 GATGGATCTCCCAAGGGTCTCACACTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTTC 2222

  5590693 ATCATTTCCACTCAAATTCACTGACCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTAT 5590752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 ATCATTTCCACTCAAATTCACTGACCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTAT 2282

  5590753 TCTAGCTCCCCAGCTGAATGCACAGGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAGG 5590812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TCTAGCTCCCCAGCTGAATGCACAGGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAGG 2342

  5590813 CAGAGGGGGCAAGTATTATGGGGGCAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCAT 5590872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 CAGAGGGGGCAAGTATTATGGGGGCAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCAT 2402

  5590873 GCATGAATGAATGCACTTAGAATCTCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGGA 5590932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 GCATGAATGAATGCACTTAGAATCTCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGGA 2462

  5590933 AAAGACAGCATAGACTTGCAACTGCTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCTA 5590992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 AAAGACAGCATAGACTTGCAACTGCTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCTA 2522

  5590993 ATAATAGGTTTAAGCATCTTGAAAATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAGC 5591052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 ATAATAGGTTTAAGCATCTTGAAAATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAGC 2582

  5591053 TCCCCTGCCTACATGTCCTCTCTTTCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACAG 5591112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 TCCCCTGCCTACATGTCCTCTCTTTCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACAG 2642

  5591113 AGCCACCCCACCCACACAGGCCCCATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACACA 5591172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 AGCCACCCCACCCACACAGGCCCCATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACACA 2702

  5591173 GATGGACACACAGAGAAATTTCTACTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAGT 5591232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 GATGGACACACAGAGAAATTTCTACTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAGT 2762

  5591233 AATTTTTCAAGTAAGTGTTAGCTCAGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACCC 5591292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 AATTTTTCAAGTAAGTGTTAGCTCAGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACCC 2822

  5591293 AGACAGACTCTGGGAGATGAAAAATAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTTT 5591352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 AGACAGACTCTGGGAGATGAAAAATAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTTT 2882

  5591353 CTTTTTCCTCCTAGAAAAGAAACTTATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAGT 5591412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 CTTTTTCCTCCTAGAAAAGAAACTTATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAGT 2942

  5591413 GTGGAAGGATTAAGCCTTTGAAACTGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTTG 5591472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 GTGGAAGGATTAAGCCTTTGAAACTGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTTG 3002

  5591473 TCCTGGAGAGCAGCAAGCTTTCCAAATTGGAAAATCGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCATT 5591532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 TCCTGGAGAGCAGCAAGCTTTCCAAATTGGAAAATCGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCATT 3062

  5591533 CACTCAGCGGCTCATTCACTAAATATTTACTGAGCATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCTT 5591592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 CACTCAGCGGCTCATTCACTAAATATTTACTGAGCATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCTT 3122

  5591593 CAGGAGCTGGGGACGCAGAGCCCATGTCAGAGGGCACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTTG 5591652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 CAGGAGCTGGGGACGCAGAGCCCATGTCAGAGGGCACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTTG 3182

  5591653 CAATCTACAGGGGAAATAAATGCCAGAGGCCTGTACAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAGG 5591712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 CAATCTACAGGGGAAATAAATGCCAGAGGCCTGTACAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAGG 3242

  5591713 ACCGGGGAGCTTTGTCAAGTAGCATGGAGGAACTTAACCTGGAAGGACAAGGAGGAACCA 5591772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 ACCGGGGAGCTTTGTCAAGTAGCATGGAGGAACTTAACCTGGAAGGACAAGGAGGAACCA 3302

  5591773 GCCAGCCAAGGAGGACAAAGAGGGAAGATTCTGACGGAAGGAATGGCATCGTCAGATGAG 5591832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 GCCAGCCAAGGAGGACAAAGAGGGAAGATTCTGACGGAAGGAATGGCATCGTCAGATGAG 3362

  5591833 GGGAGGTGGGCGAGGCTGCAGTGTAGTTGGGCTTCACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGGA 5591892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 GGGAGGTGGGCGAGGCTGCAGTGTAGTTGGGCTTCACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGGA 3422

  5591893 GATAAGCCTCTGGGCTCCGGGTTCAAATCCCAGCCTTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACCA 5591952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 GATAAGCCTCTGGGCTCCGGGTTCAAATCCCAGCCTTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACCA 3482

  5591953 TCTATAAAATGGGGAGAGAAGCTGTAACTCCCTCACTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGGG 5592012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 TCTATAAAATGGGGAGAGAAGCTGTAACTCCCTCACTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGGG 3542

  5592013 TTGAAATGCATAAGGAGGCCAGAGCAGTGCCTGGAGTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTGT 5592072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 TTGAAATGCATAAGGAGGCCAGAGCAGTGCCTGGAGTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTGT 3602

  5592073 GACCTGTTCTCATTTTGCTGAGGCTTGAGTAGAAAAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGGG 5592132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 GACCTGTTCTCATTTTGCTGAGGCTTGAGTAGAAAAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGGG 3662

  5592133 CAAGGACCTGAATGTCAGGGTGAGGGGCTGAGGCTCTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAGG 5592192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 CAAGGACCTGAATGTCAGGGTGAGGGGCTGAGGCTCTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAGG 3722

  5592193 GATGCAAAGGATGTGTGGATTTTGGGGGCCTGTTCTGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTGG 5592252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 GATGCAAAGGATGTGTGGATTTTGGGGGCCTGTTCTGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTGG 3782

  5592253 GTGGTCCTGAGAGAGACTCTACATTAAGGGTAGAGTTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCTC 5592312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 GTGGTCCTGAGAGAGACTCTACATTAAGGGTAGAGTTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCTC 3842

  5592313 AGCGGGGGAGGTCCCACAGGGTCAGTCAGAGGAGGGGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGGT 5592372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 AGCGGGGGAGGTCCCACAGGGTCAGTCAGAGGAGGGGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGGT 3902

  5592373 CAGTCAGAGGAGGTGTGGCCCAAGTCATGGGGTCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGA 5592432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 CAGTCAGAGGAGGTGTGGCCCAAGTCATGGGGTCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGA 3962

  5592433 GGATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAACCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGT 5592492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 GGATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAACCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGT 4022

  5592493 GAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTC 5592552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 GAAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTC 4082

  5592553 TGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCC 5592612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 TGGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCC 4142

  5592613 CCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTC 5592672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 CCCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTC 4202

  5592673 TTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGG 5592732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 TTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGG 4262

  5592733 ATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAA 5592792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 ATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAA 4322

  5592793 GACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTGG 5592852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 GACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTGG 4382

  5592853 TATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCC 5592912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 TATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCC 4442

  5592913 TGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGT 5592972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 TGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGT 4502

  5592973 TGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAG 5593032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 TGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAG 4562

  5593033 CAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGT 5593092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGT 4622

  5593093 CAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTT 5593152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 CAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTT 4682

  5593153 CGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAG 5593212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 CGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAG 4742

  5593213 ACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGC 5593272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 ACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGC 4802

  5593273 TATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGG 5593332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 TATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGG 4862

  5593333 GCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGG 5593392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 GCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGG 4922

  5593393 GGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCT 5593452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 GGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCT 4982

  5593453 TCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATG 5593512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 TCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATG 5042

  5593513 GGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAA 5593572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 GGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAA 5102

  5593573 ACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATC 5593632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 ACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATC 5162

  5593633 ATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCT 5593692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 ATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCT 5222

  5593693 CAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGT 5593752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 CAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGT 5282

  5593753 CCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTG 5593812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 CCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTG 5342

  5593813 TGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAA 5593872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 TGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAA 5402

  5593873 TGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTC 5593932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 TGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTC 5462

  5593933 CTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGT 5593992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 CTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGT 5522

  5593993 TACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGA 5594052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 TACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGA 5582

  5594053 TCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCT 5594112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 TCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCT 5642

  5594113 AATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACT 5594172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 AATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACT 5702

  5594173 CCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAG 5594232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 CCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAG 5762

  5594233 CCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGT 5594292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 CCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGT 5822

  5594293 TTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATT 5594352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 TTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATT 5882

  5594353 CTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATA 5594412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 CTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATA 5942

  5594413 CGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTT 5594472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 CGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTT 6002

  5594473 AGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGT 5594532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 AGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGT 6062

  5594533 GAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATT 5594592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 GAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATT 6122

  5594593 ATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAG 5594652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 ATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAG 6182

  5594653 CACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAA 5594712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 CACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAA 6242

  5594713 AAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAG 5594772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 AAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAG 6302

  5594773 CTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACAC 5594832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 CTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACAC 6362

  5594833 CATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAA 5594892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 CATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAA 6422

  5594893 AAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCT 5594952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 AAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCT 6482

  5594953 TTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTT 5595012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 TTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTT 6542

  5595013 CTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGA 5595072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 CTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGA 6602

  5595073 CTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAG 5595132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 CTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAG 6662

  5595133 AATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATAC 5595192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 AATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATAC 6722

  5595193 TATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGT 5595252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 TATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGT 6782

  5595253 TTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTT 5595312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 TTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTT 6842

  5595313 ACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGT 5595372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 ACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGT 6902

  5595373 AGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCC 5595432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 AGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCC 6962

  5595433 ACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGAT 5595492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6963 ACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGAT 7022

  5595493 CTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCT 5595552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7023 CTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCT 7082

  5595553 ATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTG 5595612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7083 ATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTG 7142

  5595613 AAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAG 5595672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7143 AAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAG 7202

  5595673 AGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATT 5595732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7203 AGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATT 7262

  5595733 ACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATA 5595792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7263 ACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATA 7322

  5595793 AAGATGG 5595799
          |||||||
     7323 AAGATGG 7329

Alignment time is 5.68214 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   7990] =>      7990 nucs 'mol-32-30f6-059597_7990'

Score:        7990
Aligned:      7990        nucs
Identic:      7990 (100%) nucs =>      1066 (100%)      6924 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5587706,5588771] EXCISED REGION [5588774,5595697]
 second seq =>  [      1,   1066] EXCISED REGION [   1067,   7990]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [5588772,5588773]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [5588772,5588789] to [5588774,5588791]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5588772,5588772] to [5588773,5588773]
 second seq =>         0 nucs

  5587706 GGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCA 5587765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCA 60

  5587766 CCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCTCCATGTTGGCCGGGCT 5587825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCTCCATGTTGGCCGGGCT 120

  5587826 AGTCTTGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCTCCTTGGCCTATCAAAGCACTGGGGTT 5587885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTCTTGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCTCCTTGGCCTATCAAAGCACTGGGGTT 180

  5587886 ACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGTGTGCAGCTTCTTTTGCTCAACCTTCTACCTG 5587945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCAGTGTGCAGCTTCTTTTGCTCAACCTTCTACCTG 240

  5587946 TGAGGTTCACCCAGGTTGCTGTGGTTTCTTCATTCTCACGGCAGGGTGGAGTATTCCATT 5588005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGGTTCACCCAGGTTGCTGTGGTTTCTTCATTCTCACGGCAGGGTGGAGTATTCCATT 300

  5588006 GTGTGATGACACCACACATTATTTATCCATTTAACAGTTTCTAAGTGTCTGGGTGTCTTC 5588065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGTGATGACACCACACATTATTTATCCATTTAACAGTTTCTAAGTGTCTGGGTGTCTTC 360

  5588066 CAGTTTGGGGCTATCATGGATAGGGCTGCAATGAACATTCATTCGGGTGGCTGTCTTTGG 5588125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTTTGGGGCTATCATGGATAGGGCTGCAATGAACATTCATTCGGGTGGCTGTCTTTGG 420

  5588126 GTGAACACATGGATGCATTTCTGGTGGGGGTGGAGTTGCCCGGTCATAAGGTATGTGCAT 5588185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGAACACATGGATGCATTTCTGGTGGGGGTGGAGTTGCCCGGTCATAAGGTATGTGCAT 480

  5588186 GTTCACCTTGAGTAGATACTGCATAGCAGCGCAGTCCACCCAAAGCGGGTAGACAAATTT 5588245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTCACCTTGAGTAGATACTGCATAGCAGCGCAGTCCACCCAAAGCGGGTAGACAAATTT 540

  5588246 GCAATGCCATTGGCAGTGTGATGGGAGACACAGAAAGAGAGAGTTATGCTCTAGTCCTCC 5588305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAATGCCATTGGCAGTGTGATGGGAGACACAGAAAGAGAGAGTTATGCTCTAGTCCTCC 600

  5588306 CTCTAAGAGCGAATAGGCACTGAATACTTTATGAGATGAATTGCGTCTCCCCCAAATACT 5588365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTAAGAGCGAATAGGCACTGAATACTTTATGAGATGAATTGCGTCTCCCCCAAATACT 660

  5588366 CATACATTGAAGCCCTCACTGCCAGTACCTCAGAAGGTGACTGCATTTGGAGATAGGGCT 5588425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATACATTGAAGCCCTCACTGCCAGTACCTCAGAAGGTGACTGCATTTGGAGATAGGGCT 720

  5588426 TTCTAAGAGTTAAGTAAGTTAAAATGAGGCCTTGAGGGTGGTCCCTAATCCAATCCAACT 5588485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTAAGAGTTAAGTAAGTTAAAATGAGGCCTTGAGGGTGGTCCCTAATCCAATCCAACT 780

  5588486 GGTGTCCTTATAAGAAGAGGAGATTCCTGTTATCCTGGCACTTTGAGAGGCTGAGGTGAG 5588545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTGTCCTTATAAGAAGAGGAGATTCCTGTTATCCTGGCACTTTGAGAGGCTGAGGTGAG 840

  5588546 TAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCAAAACCATGTATC 5588605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCAAAACCATGTATC 900

  5588606 TACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 5588665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCAAGCCTGTAATCCCAGCTACTCG 960

  5588666 GGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCCATGAGCCGAGAT 5588725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCCATGAGCCGAGAT 1020

  5588726 TGCACGACTGCCCTCCAGTCTCGGCAACAGAGCGAGACTCTATCTC 5588771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCACGACTGCCCTCCAGTCTCGGCAACAGAGCGAGACTCTATCTC 1066

EXCISED REGION

  5588774 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAGGAGAGACAGCAGGCGTGAGCTCACATAGGGGAAAGA 5588833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAGGAGAGACAGCAGGCGTGAGCTCACATAGGGGAAAGA 1126

  5588834 CCTGTGAGGACATGGTGAAGAGGAGGCTGGAGGGCAGTCATCTGTAAGCCAAGGGGAGAG 5588893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 CCTGTGAGGACATGGTGAAGAGGAGGCTGGAGGGCAGTCATCTGTAAGCCAAGGGGAGAG 1186

  5588894 ACATTCAGAAGAAACAACCCTGCTGACACCTCCACCTTGGACTTCCAGCCTCCAGAACTG 5588953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 ACATTCAGAAGAAACAACCCTGCTGACACCTCCACCTTGGACTTCCAGCCTCCAGAACTG 1246

  5588954 TGAAAAATAAACTTCTGTTGCTTCAGCCACCCTGCCTGTGGTATTTTGTCAAGGCAGCCC 5589013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TGAAAAATAAACTTCTGTTGCTTCAGCCACCCTGCCTGTGGTATTTTGTCAAGGCAGCCC 1306

  5589014 TAGCAGACTAATACAAGGACTTTCTTTGTGCTGGGCTCTGTGCTTAGCTCATGCTTTATC 5589073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 TAGCAGACTAATACAAGGACTTTCTTTGTGCTGGGCTCTGTGCTTAGCTCATGCTTTATC 1366

  5589074 TCACTGAATCCCCATATCAACCCTGTAGGGTAGGAACAATGGTGACCTCAGTGTTACAGG 5589133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 TCACTGAATCCCCATATCAACCCTGTAGGGTAGGAACAATGGTGACCTCAGTGTTACAGG 1426

  5589134 TGGAGGACTGAGCTTGGAGGTAAATGACTTGCCCAGGGTCAGAACACAGGCAGCAGCCTG 5589193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 TGGAGGACTGAGCTTGGAGGTAAATGACTTGCCCAGGGTCAGAACACAGGCAGCAGCCTG 1486

  5589194 AGCCAGGACTGGAACTCAGGGCTGCCTGTCCAGAGCCCTTGAACTGAACCGTCATGCCCA 5589253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 AGCCAGGACTGGAACTCAGGGCTGCCTGTCCAGAGCCCTTGAACTGAACCGTCATGCCCA 1546

  5589254 CCTCACTCATCTGCTAGGTCGTTCATGGCCCACTCCCAGCCCCTGGTTATTTGAATAATG 5589313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 CCTCACTCATCTGCTAGGTCGTTCATGGCCCACTCCCAGCCCCTGGTTATTTGAATAATG 1606

  5589314 GCCGTATTAGGTTTTGCAGTTTAGTGTAAAGAAGGGAGAGTGTGCTTGGGAGGCAGAAGA 5589373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 GCCGTATTAGGTTTTGCAGTTTAGTGTAAAGAAGGGAGAGTGTGCTTGGGAGGCAGAAGA 1666

  5589374 TCTGGGCTTGAATCCTGGGTTTTTGACCTCCTGCTGAGTAAATTTGGGCCCCACTGCTTA 5589433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 TCTGGGCTTGAATCCTGGGTTTTTGACCTCCTGCTGAGTAAATTTGGGCCCCACTGCTTA 1726

  5589434 GATTTTATATGTCTCTATCTCCTCACCTACAAGGCCTTCGTCACAGGCTGATTCCGGATA 5589493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 GATTTTATATGTCTCTATCTCCTCACCTACAAGGCCTTCGTCACAGGCTGATTCCGGATA 1786

  5589494 TCCAATGTGTTGATGTATGGGAGGTGCATTGTAAACTGTAAAGTGCTGGGCAGATGGTAA 5589553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 TCCAATGTGTTGATGTATGGGAGGTGCATTGTAAACTGTAAAGTGCTGGGCAGATGGTAA 1846

  5589554 TTGTTTCAGAGATTTCATGAGTCATGCTATGCATTTAGCATGGGCTGAATTGTGTCCTCC 5589613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TTGTTTCAGAGATTTCATGAGTCATGCTATGCATTTAGCATGGGCTGAATTGTGTCCTCC 1906

  5589614 TGCCCCCAGTTCGTTTGTCAGCAATCTAACCCCTAATGTGATGGTATTTGGAGATGGGAC 5589673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TGCCCCCAGTTCGTTTGTCAGCAATCTAACCCCTAATGTGATGGTATTTGGAGATGGGAC 1966

  5589674 CTTTGGGAGATAATTAGGGTTAGATGAGGTCATGTGAGTGGAGATCTGCTGTGACAGGAT 5589733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 CTTTGGGAGATAATTAGGGTTAGATGAGGTCATGTGAGTGGAGATCTGCTGTGACAGGAT 2026

  5589734 TAATGTTCTTATAACAAGAGACACCAGACAGCTGGCTCTCTTGCCTTGGGGGGATACAAC 5589793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 TAATGTTCTTATAACAAGAGACACCAGACAGCTGGCTCTCTTGCCTTGGGGGGATACAAC 2086

  5589794 AAGAGGACGGAATGTCTGCAAACCAGGAAGAGAGCCCTCACTGGGATGCAATTGGCTGGC 5589853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 AAGAGGACGGAATGTCTGCAAACCAGGAAGAGAGCCCTCACTGGGATGCAATTGGCTGGC 2146

  5589854 ACCTTAATCTTGGATTTTCCAGCCTCTAGAATTGTGCAAAATAAATGTCTGTTGTTGAAG 5589913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 ACCTTAATCTTGGATTTTCCAGCCTCTAGAATTGTGCAAAATAAATGTCTGTTGTTGAAG 2206

  5589914 CCACCTAGCCTTTGGTATTTTGCTATGGCAGCTTGAGCTGACGAAGACAGCGTGCTGCCC 5589973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 CCACCTAGCCTTTGGTATTTTGCTATGGCAGCTTGAGCTGACGAAGACAGCGTGCTGCCC 2266

  5589974 CTCTTTCTCTTTGCAAAGCTTCATAGACATACATGGCCTATACACTGAAAAAACTCACAT 5590033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 CTCTTTCTCTTTGCAAAGCTTCATAGACATACATGGCCTATACACTGAAAAAACTCACAT 2326

  5590034 TCCTGAGGGGCTAACTGTTCGGTAGGTGTCAGTTCTGGGGCTGGGCTGGGTGACGGGTTC 5590093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 TCCTGAGGGGCTAACTGTTCGGTAGGTGTCAGTTCTGGGGCTGGGCTGGGTGACGGGTTC 2386

  5590094 CTCCAGTGGAAAACATGCAGTAGCCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAGGA 5590153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 CTCCAGTGGAAAACATGCAGTAGCCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAGGA 2446

  5590154 AGCCGATGTTTCTTTTTCTTGTTTGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGTGG 5590213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 AGCCGATGTTTCTTTTTCTTGTTTGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGTGG 2506

  5590214 AGACTCCAGGGTAGAAAGGAGAGGATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAGCA 5590273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 AGACTCCAGGGTAGAAAGGAGAGGATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAGCA 2566

  5590274 GAAGTGCTTTTCATTTGGTGCAGATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCATTT 5590333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GAAGTGCTTTTCATTTGGTGCAGATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCATTT 2626

  5590334 TACAGCTGGGGGGACTCAAGCTCAGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCATA 5590393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 TACAGCTGGGGGGACTCAAGCTCAGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCATA 2686

  5590394 GGAACCAGGACTGAAGCTGAAGGCCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATTAG 5590453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 GGAACCAGGACTGAAGCTGAAGGCCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATTAG 2746

  5590454 TCTGGGTAGGCTAGATTATGCTGCAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGTTG 5590513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TCTGGGTAGGCTAGATTATGCTGCAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGTTG 2806

  5590514 TCTTACAGCGACACAACTTTTTCTCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCTGC 5590573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 TCTTACAGCGACACAACTTTTTCTCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCTGC 2866

  5590574 TGCCCCTTATCTCGTCACTCCGAGTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATATGG 5590633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TGCCCCTTATCTCGTCACTCCGAGTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATATGG 2926

  5590634 ATGGATCTCCCAAGGGTCTCACACTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTTCA 5590693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 ATGGATCTCCCAAGGGTCTCACACTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTTCA 2986

  5590694 TCATTTCCACTCAAATTCACTGACCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTATT 5590753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 TCATTTCCACTCAAATTCACTGACCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTATT 3046

  5590754 CTAGCTCCCCAGCTGAATGCACAGGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAGGC 5590813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 CTAGCTCCCCAGCTGAATGCACAGGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAGGC 3106

  5590814 AGAGGGGGCAAGTATTATGGGGGCAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCATG 5590873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 AGAGGGGGCAAGTATTATGGGGGCAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCATG 3166

  5590874 CATGAATGAATGCACTTAGAATCTCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGGAA 5590933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 CATGAATGAATGCACTTAGAATCTCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGGAA 3226

  5590934 AAGACAGCATAGACTTGCAACTGCTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCTAA 5590993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 AAGACAGCATAGACTTGCAACTGCTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCTAA 3286

  5590994 TAATAGGTTTAAGCATCTTGAAAATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAGCT 5591053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 TAATAGGTTTAAGCATCTTGAAAATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAGCT 3346

  5591054 CCCCTGCCTACATGTCCTCTCTTTCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACAGA 5591113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 CCCCTGCCTACATGTCCTCTCTTTCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACAGA 3406

  5591114 GCCACCCCACCCACACAGGCCCCATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACACAG 5591173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 GCCACCCCACCCACACAGGCCCCATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACACAG 3466

  5591174 ATGGACACACAGAGAAATTTCTACTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAGTA 5591233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 ATGGACACACAGAGAAATTTCTACTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAGTA 3526

  5591234 ATTTTTCAAGTAAGTGTTAGCTCAGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACCCA 5591293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 ATTTTTCAAGTAAGTGTTAGCTCAGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACCCA 3586

  5591294 GACAGACTCTGGGAGATGAAAAATAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTTTC 5591353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 GACAGACTCTGGGAGATGAAAAATAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTTTC 3646

  5591354 TTTTTCCTCCTAGAAAAGAAACTTATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAGTG 5591413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 TTTTTCCTCCTAGAAAAGAAACTTATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAGTG 3706

  5591414 TGGAAGGATTAAGCCTTTGAAACTGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTTGT 5591473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 TGGAAGGATTAAGCCTTTGAAACTGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTTGT 3766

  5591474 CCTGGAGAGCAGCAAGCTTTCCAAATTGGAAAATCGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCATTC 5591533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 CCTGGAGAGCAGCAAGCTTTCCAAATTGGAAAATCGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCATTC 3826

  5591534 ACTCAGCGGCTCATTCACTAAATATTTACTGAGCATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCTTC 5591593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 ACTCAGCGGCTCATTCACTAAATATTTACTGAGCATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCTTC 3886

  5591594 AGGAGCTGGGGACGCAGAGCCCATGTCAGAGGGCACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTTGC 5591653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 AGGAGCTGGGGACGCAGAGCCCATGTCAGAGGGCACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTTGC 3946

  5591654 AATCTACAGGGGAAATAAATGCCAGAGGCCTGTACAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAGGA 5591713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 AATCTACAGGGGAAATAAATGCCAGAGGCCTGTACAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAGGA 4006

  5591714 CCGGGGAGCTTTGTCAAGTAGCATGGAGGAACTTAACCTGGAAGGACAAGGAGGAACCAG 5591773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 CCGGGGAGCTTTGTCAAGTAGCATGGAGGAACTTAACCTGGAAGGACAAGGAGGAACCAG 4066

  5591774 CCAGCCAAGGAGGACAAAGAGGGAAGATTCTGACGGAAGGAATGGCATCGTCAGATGAGG 5591833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 CCAGCCAAGGAGGACAAAGAGGGAAGATTCTGACGGAAGGAATGGCATCGTCAGATGAGG 4126

  5591834 GGAGGTGGGCGAGGCTGCAGTGTAGTTGGGCTTCACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGGAG 5591893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 GGAGGTGGGCGAGGCTGCAGTGTAGTTGGGCTTCACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGGAG 4186

  5591894 ATAAGCCTCTGGGCTCCGGGTTCAAATCCCAGCCTTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACCAT 5591953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 ATAAGCCTCTGGGCTCCGGGTTCAAATCCCAGCCTTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACCAT 4246

  5591954 CTATAAAATGGGGAGAGAAGCTGTAACTCCCTCACTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGGGT 5592013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 CTATAAAATGGGGAGAGAAGCTGTAACTCCCTCACTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGGGT 4306

  5592014 TGAAATGCATAAGGAGGCCAGAGCAGTGCCTGGAGTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTGTG 5592073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 TGAAATGCATAAGGAGGCCAGAGCAGTGCCTGGAGTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTGTG 4366

  5592074 ACCTGTTCTCATTTTGCTGAGGCTTGAGTAGAAAAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGGGC 5592133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 ACCTGTTCTCATTTTGCTGAGGCTTGAGTAGAAAAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGGGC 4426

  5592134 AAGGACCTGAATGTCAGGGTGAGGGGCTGAGGCTCTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAGGG 5592193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 AAGGACCTGAATGTCAGGGTGAGGGGCTGAGGCTCTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAGGG 4486

  5592194 ATGCAAAGGATGTGTGGATTTTGGGGGCCTGTTCTGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTGGG 5592253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 ATGCAAAGGATGTGTGGATTTTGGGGGCCTGTTCTGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTGGG 4546

  5592254 TGGTCCTGAGAGAGACTCTACATTAAGGGTAGAGTTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCTCA 5592313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 TGGTCCTGAGAGAGACTCTACATTAAGGGTAGAGTTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCTCA 4606

  5592314 GCGGGGGAGGTCCCACAGGGTCAGTCAGAGGAGGGGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGGTC 5592373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 GCGGGGGAGGTCCCACAGGGTCAGTCAGAGGAGGGGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGGTC 4666

  5592374 AGTCAGAGGAGGTGTGGCCCAAGTCATGGGGTCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGAG 5592433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 AGTCAGAGGAGGTGTGGCCCAAGTCATGGGGTCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGAG 4726

  5592434 GATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAACCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGTG 5592493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 GATGGGTGGTTCTGAAGGACCCACACCAGAACCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGTG 4786

  5592494 AAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTCT 5592553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 AAGAGTGCAGAGGAGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTCT 4846

  5592554 GGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCCC 5592613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 GGCTCTAGAGTAAGACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCCC 4906

  5592614 CCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTCT 5592673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 CCATAATGGGGGTGATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTCT 4966

  5592674 TTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGA 5592733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 TTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGA 5026

  5592734 TTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAG 5592793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 TTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAG 5086

  5592794 ACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTGGT 5592853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 ACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTGGT 5146

  5592854 ATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCT 5592913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 ATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCT 5206

  5592914 GGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTT 5592973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 GGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTT 5266

  5592974 GCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGC 5593033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 GCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGC 5326

  5593034 AGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTC 5593093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 AGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTC 5386

  5593094 AGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTC 5593153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 AGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTC 5446

  5593154 GCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGA 5593213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 GCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGA 5506

  5593214 CGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCT 5593273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 CGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCT 5566

  5593274 ATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGG 5593333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 ATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGG 5626

  5593334 CTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGG 5593393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 CTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGG 5686

  5593394 GCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTT 5593453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 GCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTT 5746

  5593454 CTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGG 5593513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 CTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGG 5806

  5593514 GAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAA 5593573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 GAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAA 5866

  5593574 CCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCA 5593633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 CCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCA 5926

  5593634 TTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTC 5593693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 TTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTC 5986

  5593694 AGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTC 5593753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 AGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTC 6046

  5593754 CCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGT 5593813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 CCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGT 6106

  5593814 GTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAAT 5593873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 GTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAAT 6166

  5593874 GTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCC 5593933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 GTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCC 6226

  5593934 TTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTT 5593993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 TTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTT 6286

  5593994 ACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGAT 5594053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 ACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGAT 6346

  5594054 CTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTA 5594113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 CTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTA 6406

  5594114 ATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTC 5594173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 ATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTC 6466

  5594174 CTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGC 5594233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 CTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGC 6526

  5594234 CACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTT 5594293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 CACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTT 6586

  5594294 TCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTC 5594353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 TCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTC 6646

  5594354 TGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATAC 5594413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 TGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATAC 6706

  5594414 GAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTA 5594473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 GAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTA 6766

  5594474 GTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTG 5594533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 GTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTG 6826

  5594534 AAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTA 5594593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 AAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTA 6886

  5594594 TGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGC 5594653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 TGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGC 6946

  5594654 ACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAA 5594713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 ACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAA 7006

  5594714 AAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGC 5594773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 AAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGC 7066

  5594774 TGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACC 5594833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 TGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACC 7126

  5594834 ATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAA 5594893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 ATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAA 7186

  5594894 AAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTT 5594953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 AAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTT 7246

  5594954 TTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTC 5595013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 TTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTC 7306

  5595014 TGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGAC 5595073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 TGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGAC 7366

  5595074 TGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGA 5595133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 TGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGA 7426

  5595134 ATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACT 5595193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 ATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACT 7486

  5595194 ATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTT 5595253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7487 ATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTT 7546

  5595254 TAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTA 5595313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7547 TAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTA 7606

  5595314 CTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTA 5595373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7607 CTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTA 7666

  5595374 GACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCA 5595433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7667 GACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCA 7726

  5595434 CTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATC 5595493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7727 CTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATC 7786

  5595494 TTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTA 5595553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7787 TTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTA 7846

  5595554 TGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGA 5595613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7847 TGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGA 7906

  5595614 AAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGA 5595673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7907 AAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGA 7966

  5595674 GGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGA 5595697
          ||||||||||||||||||||||||
     7967 GGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGA 7990

Alignment time is 6.18904 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2251] =>      2251 nucs 'mol-32-3143-014820_2251'

Score:        2250
Aligned:      2250        nucs
Identic:      2250 (100%) nucs =>      2228 (100%)        22 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593588,5595815] EXCISED REGION [5595816,5595837]
 second seq =>  [      1,   2228] EXCISED REGION [   2230,   2251]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2229,2229]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        12 nucs [2229,2240] to [2230,2241]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5593588 AATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTAC 5593647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTAC 60

  5593648 AGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTC 5593707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTC 120

  5593708 ATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGG 5593767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGG 180

  5593768 CCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGA 5593827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGA 240

  5593828 GTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATC 5593887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATC 300

  5593888 TCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCT 5593947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCT 360

  5593948 CTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGT 5594007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGT 420

  5594008 GCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGC 5594067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGC 480

  5594068 CTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTT 5594127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTT 540

  5594128 TGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAA 5594187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAA 600

  5594188 TCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCC 5594247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCC 660

  5594248 CTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCT 5594307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCT 720

  5594308 TGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGA 5594367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGA 780

  5594368 AATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAA 5594427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAA 840

  5594428 AGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGT 5594487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGT 900

  5594488 TTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAA 5594547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAA 960

  5594548 GAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAAC 5594607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAAC 1020

  5594608 TTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGA 5594667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGA 1080

  5594668 GTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTA 5594727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTA 1140

  5594728 GCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGAT 5594787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGAT 1200

  5594788 CTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCC 5594847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCC 1260

  5594848 TGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAA 5594907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAA 1320

  5594908 TAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCA 5594967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCA 1380

  5594968 GGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTC 5595027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTC 1440

  5595028 TCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCC 5595087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCC 1500

  5595088 ATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTT 5595147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTT 1560

  5595148 TGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCA 5595207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCA 1620

  5595208 GAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTT 5595267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTT 1680

  5595268 TATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACA 5595327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACA 1740

  5595328 CCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATAT 5595387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATAT 1800

  5595388 CTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCT 5595447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCT 1860

  5595448 GATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGG 5595507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGG 1920

  5595508 TCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGAC 5595567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGAC 1980

  5595568 TCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTG 5595627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTG 2040

  5595628 GGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAA 5595687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAA 2100

  5595688 TGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATC 5595747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATC 2160

  5595748 CCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGA 5595807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGA 2220

  5595808 GTTGCTTC 5595815
          ||||||||
     2221 GTTGCTTC 2228

EXCISED REGION

  5595816 TTTTTTTTTTTTGAGACCGAGT 5595837
          ||||||||||||||||||||||
     2230 TTTTTTTTTTTTGAGACCGAGT 2251

Alignment time is 1.78504 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2644] =>      2644 nucs 'mol-32-314e-117057_2644'

Score:        2622
Aligned:      2644        nucs
Identic:      2642 (100%) nucs =>        52 (100%)      2590 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5594232,5594283] EXCISED REGION [5594285,5596875]
 second seq =>  [      1,     52] EXCISED REGION [     54,   2644]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5594284,5594284]
 second seq =>         1 nucs [53,53]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [5596176,5596176]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5594283,5594284] to [5594284,5594285]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5594283,5594283] to [5594285,5594285]
 second seq =>         1 nucs [52,52] to [54,54]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5594232 GCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTG 5594283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTG 52

EXCISED REGION

  5594285 GCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGG 5594344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       54 GCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGG 113

  5594345 GAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATAC 5594404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      114 GAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATAC 173

  5594405 GGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATAT 5594464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      174 GGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATAT 233

  5594465 AAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTC 5594524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      234 AAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTC 293

  5594525 AGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATA 5594584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      294 AGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATA 353

  5594585 GTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGT 5594644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      354 GTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGT 413

  5594645 AATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGT 5594704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      414 AATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGT 473

  5594705 CACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTAC 5594764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      474 CACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTAC 533

  5594765 TCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGA 5594824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 TCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGA 593

  5594825 GATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAA 5594884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 GATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAA 653

  5594885 AAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAA 5594944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 AAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAA 713

  5594945 TATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGA 5595004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 TATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGA 773

  5595005 CCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACC 5595064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACC 833

  5595065 TAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTG 5595124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTG 893

  5595125 TATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATA 5595184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATA 953

  5595185 AATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAA 5595244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAA 1013

  5595245 CACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCA 5595304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCA 1073

  5595305 CACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGAC 5595364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 CACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGAC 1133

  5595365 AGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACAC 5595424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 AGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACAC 1193

  5595425 CAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAA 5595484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAA 1253

  5595485 ATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGAC 5595544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 ATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGAC 1313

  5595545 CAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCT 5595604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCT 1373

  5595605 TTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAAT 5595664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAAT 1433

  5595665 AAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATT 5595724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 AAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATT 1493

  5595725 AATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTC 5595784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 AATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTC 1553

  5595785 ATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTC 5595844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 ATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTC 1613

  5595845 TGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTG 5595904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTG 1673

  5595905 GTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGT 5595964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 GTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGT 1733

  5595965 TAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAC-AA 5596023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     1734 TAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA 1793

  5596024 AGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGG 5596083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGG 1853

  5596084 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCC 5596143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCC 1913

  5596144 CAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGA 5596203
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1914 CAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGA 1972

  5596204 GGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCT 5596263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 GGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCT 2032

  5596264 CTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATG 5596323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 CTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATG 2092

  5596324 GGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAA 5596383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAA 2152

  5596384 GCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAAT 5596443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 GCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAAT 2212

  5596444 TTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGA 5596503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGA 2272

  5596504 GACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACC 5596563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 GACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACC 2332

  5596564 TCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGG 5596623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGG 2392

  5596624 TTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGT 5596683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 TTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGT 2452

  5596684 TTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACT 5596743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 TTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACT 2512

  5596744 CTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCA 5596803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 CTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCA 2572

  5596804 TTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGG 5596863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 TTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGG 2632

  5596864 GAGTGAGAGTCG 5596875
          ||||||||||||
     2633 GAGTGAGAGTCG 2644

Alignment time is 2.09232 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   7089] =>      7089 nucs 'mol-32-3159-054540_7089'

Score:        6206
Aligned:      6668        nucs
Identic:      6626 ( 99%) nucs =>      1333 ( 99%)      5293 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593358,5594699] EXCISED REGION [5597499,5602823]
 second seq =>  [      1,   1342] EXCISED REGION [   1764,   7089]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2799 nucs [5594700,5597498]
 second seq =>       421 nucs [1343,1763]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1343,1344] to [1762,1763]

  5593358 CATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTG 5593417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTG 60

  5593418 GGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACA 5593477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACA 120

  5593478 AATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCC 5593537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCC 180

  5593538 TCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCC 5593597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCC 240

  5593598 ACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAA 5593657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAA 300

  5593658 ACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGC 5593717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      301 ACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCGTGGC 360

  5593718 CTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGC 5593777
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      361 CTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCTGGATAAGC 420

  5593778 TCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCA 5593837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCA 480

  5593838 AATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGT 5593897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGT 540

  5593898 GGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCC 5593957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCC 600

  5593958 TCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGT 5594017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGT 660

  5594018 AGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTA 5594077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTA 720

  5594078 GCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATG 5594137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATG 780

  5594138 CAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACC 5594197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACC 840

  5594198 TCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCT 5594257
          ||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAGCCCCGCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCT 900

  5594258 GATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTA 5594317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTA 960

  5594318 TATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCG 5594377
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGAAAACACAAGTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCG 1020

  5594378 TTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAA 5594437
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1021 TTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAGTAGAGAAAAGAAGAGAAA 1080

  5594438 TTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTA 5594497
          ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTCTCACATACTTACCATTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTA 1140

  5594498 CTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAG 5594557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAG 1200

  5594558 GTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGG 5594617
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTCATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGG 1260

  5594618 CCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATC 5594677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATC 1320

  5594678 GGCCTGGGCAACACGAGGAGAC 5594699
          ||||||||||||||||||||||
     1321 GGCCTGGGCAACACGAGGAGAC 1342

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 1823

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 1883

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 1943

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 2003

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 2063

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 2123

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 2183

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 2243

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2244 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 2303

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 2363

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 2423

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 2483

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 2543

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 2603

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 2663

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 2723

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 2783

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2784 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 2843

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 2903

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 2963

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 3023

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 3083

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 3143

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 3203

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 3263

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3264 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 3323

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3324 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 3383

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 3443

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 3503

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 3563

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3564 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 3623

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3624 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 3683

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 3743

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 3803

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3804 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 3863

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 3923

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3924 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 3983

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 4043

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 4103

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 4163

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4164 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 4223

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 4283

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 4343

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4344 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 4403

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 4463

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 4523

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 4583

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 4643

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 4703

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 4763

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4764 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 4823

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 4883

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 4943

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5003

  5600738 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGG 5600797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5004 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGG 5063

  5600798 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5600857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5064 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5123

  5600858 GGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCT 5600917
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5124 GGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCT 5183

  5600918 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5600977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5243

  5600978 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5601037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5303

  5601038 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5601097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5363

  5601098 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5601157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5423

  5601158 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5601217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5424 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5483

  5601218 TGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5601277
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 TGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5543

  5601278 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5601337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5603

  5601338 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5601397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5663

  5601398 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5601457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5723

  5601458 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5601517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5783

  5601518 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5601577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5784 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5843

  5601578 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5601637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5903

  5601638 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5601697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5963

  5601698 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 5601757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 6023

  5601758 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 5601817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6024 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 6083

  5601818 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 5601877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 6143

  5601878 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGC 5601937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6144 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGCCACATTAGAAATGTGC 6203

  5601938 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 5601997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 6263

  5601998 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 5602057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 6323

  5602058 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 5602117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 6383

  5602118 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 5602177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 6443

  5602178 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 5602237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 6503

  5602238 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 5602297
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6504 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCGGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 6563

  5602298 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 5602357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6564 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 6623

  5602358 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5602417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6624 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 6683

  5602418 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5602477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6684 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 6743

  5602478 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5602537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6744 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 6803

  5602538 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5602597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6804 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 6863

  5602598 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5602657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6864 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 6923

  5602658 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5602717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6924 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 6983

  5602718 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5602777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6984 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 7043

  5602778 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAA 5602823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7044 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAA 7089

Alignment time is 5.50279 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   5786] =>      5786 nucs 'mol-32-316f-062133_5786'

Score:        5404
Aligned:      5778        nucs
Identic:      5744 ( 99%) nucs =>        75 (100%)      5669 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5595630,5595704] EXCISED REGION [5597499,5603200]
 second seq =>  [      9,     83] EXCISED REGION [     84,   5786]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1794 nucs [5595705,5597498]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [5595705,5595707] to [5597499,5597501]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5595704,5595704] to [5597499,5597499]
 second seq =>         1 nucs [83,83] to [84,84]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5595630 TCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATG 5595689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        9 TCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATG 68

  5595690 GAGGGTGAATAATAT 5595704
          |||||||||||||||
       69 GAGGGTGAATAATAT 83

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
       84 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 143

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      144 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 203

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 263

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 323

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      324 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 383

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 443

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 503

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 563

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      564 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 623

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 683

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 743

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 803

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 863

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 923

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 983

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 1043

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1103

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1104 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 1163

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 1223

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 1283

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 1343

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 1403

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 1463

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 1523

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 1583

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1584 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 1643

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1644 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 1703

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 1763

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 1823

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 1883

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 1943

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1944 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 2003

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 2063

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2123

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2124 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 2183

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 2243

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2244 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 2303

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 2363

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 2423

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 2483

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2484 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 2543

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 2603

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 2663

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2664 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 2723

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 2783

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 2843

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 2903

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 2963

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 3023

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 3083

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3084 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 3143

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 3203

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 3263

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 3323

  5600738 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGG 5600797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3324 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGG 3383

  5600798 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5600857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3384 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 3443

  5600858 GGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCT 5600917
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3444 GGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCT 3503

  5600918 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5600977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 3563

  5600978 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5601037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 3623

  5601038 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5601097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 3683

  5601098 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5601157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 3743

  5601158 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5601217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 3803

  5601218 TGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5601277
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 TGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 3863

  5601278 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5601337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 3923

  5601338 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5601397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 3983

  5601398 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5601457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 4043

  5601458 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5601517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 4103

  5601518 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5601577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 4163

  5601578 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5601637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 4223

  5601638 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5601697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 4283

  5601698 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 5601757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 4343

  5601758 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 5601817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 4403

  5601818 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 5601877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 4463

  5601878 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGC 5601937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4464 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGCCACATTAGAAATGTGC 4523

  5601938 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 5601997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 4583

  5601998 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 5602057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 4643

  5602058 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 5602117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 4703

  5602118 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 5602177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 4763

  5602178 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 5602237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 4823

  5602238 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 5602297
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCGGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 4883

  5602298 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 5602357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 4943

  5602358 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5602417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5003

  5602418 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5602477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5063

  5602478 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5602537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5123

  5602538 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5602597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5183

  5602598 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5602657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5243

  5602658 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5602717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5303

  5602718 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5602777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5363

  5602778 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 5602837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 5423

  5602838 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGC 5602897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5424 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGATGC 5483

  5602898 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 5602957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 5543

  5602958 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 5603017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 5603

  5603018 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 5603077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 5663

  5603078 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 5603137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 5723

  5603138 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 5603197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 5783

  5603198 GGC 5603200
          |||
     5784 GGC 5786

Alignment time is 4.85457 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6684] =>      6684 nucs 'mol-32-321f-185185_6684'

Score:        6672
Aligned:      6683        nucs
Identic:      6682 (100%) nucs =>      3636 (100%)      3046 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5589207,5592842] EXCISED REGION [5592844,5595890]
 second seq =>  [      1,   3636] EXCISED REGION [   3638,   6684]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5592843,5592843]
 second seq =>         1 nucs [3637,3637]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5589207 ACTCAGGGCTGCCTGTCCAGAGCCCTTGAACTGAACCGTCATGCCCACCTCACTCATCTG 5589266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCAGGGCTGCCTGTCCAGAGCCCTTGAACTGAACCGTCATGCCCACCTCACTCATCTG 60

  5589267 CTAGGTCGTTCATGGCCCACTCCCAGCCCCTGGTTATTTGAATAATGGCCGTATTAGGTT 5589326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAGGTCGTTCATGGCCCACTCCCAGCCCCTGGTTATTTGAATAATGGCCGTATTAGGTT 120

  5589327 TTGCAGTTTAGTGTAAAGAAGGGAGAGTGTGCTTGGGAGGCAGAAGATCTGGGCTTGAAT 5589386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCAGTTTAGTGTAAAGAAGGGAGAGTGTGCTTGGGAGGCAGAAGATCTGGGCTTGAAT 180

  5589387 CCTGGGTTTTTGACCTCCTGCTGAGTAAATTTGGGCCCCACTGCTTAGATTTTATATGTC 5589446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGGGTTTTTGACCTCCTGCTGAGTAAATTTGGGCCCCACTGCTTAGATTTTATATGTC 240

  5589447 TCTATCTCCTCACCTACAAGGCCTTCGTCACAGGCTGATTCCGGATATCCAATGTGTTGA 5589506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTATCTCCTCACCTACAAGGCCTTCGTCACAGGCTGATTCCGGATATCCAATGTGTTGA 300

  5589507 TGTATGGGAGGTGCATTGTAAACTGTAAAGTGCTGGGCAGATGGTAATTGTTTCAGAGAT 5589566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATGGGAGGTGCATTGTAAACTGTAAAGTGCTGGGCAGATGGTAATTGTTTCAGAGAT 360

  5589567 TTCATGAGTCATGCTATGCATTTAGCATGGGCTGAATTGTGTCCTCCTGCCCCCAGTTCG 5589626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCATGAGTCATGCTATGCATTTAGCATGGGCTGAATTGTGTCCTCCTGCCCCCAGTTCG 420

  5589627 TTTGTCAGCAATCTAACCCCTAATGTGATGGTATTTGGAGATGGGACCTTTGGGAGATAA 5589686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGTCAGCAATCTAACCCCTAATGTGATGGTATTTGGAGATGGGACCTTTGGGAGATAA 480

  5589687 TTAGGGTTAGATGAGGTCATGTGAGTGGAGATCTGCTGTGACAGGATTAATGTTCTTATA 5589746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGGGTTAGATGAGGTCATGTGAGTGGAGATCTGCTGTGACAGGATTAATGTTCTTATA 540

  5589747 ACAAGAGACACCAGACAGCTGGCTCTCTTGCCTTGGGGGGATACAACAAGAGGACGGAAT 5589806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAGAGACACCAGACAGCTGGCTCTCTTGCCTTGGGGGGATACAACAAGAGGACGGAAT 600

  5589807 GTCTGCAAACCAGGAAGAGAGCCCTCACTGGGATGCAATTGGCTGGCACCTTAATCTTGG 5589866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCTGCAAACCAGGAAGAGAGCCCTCACTGGGATGCAATTGGCTGGCACCTTAATCTTGG 660

  5589867 ATTTTCCAGCCTCTAGAATTGTGCAAAATAAATGTCTGTTGTTGAAGCCACCTAGCCTTT 5589926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTCCAGCCTCTAGAATTGTGCAAAATAAATGTCTGTTGTTGAAGCCACCTAGCCTTT 720

  5589927 GGTATTTTGCTATGGCAGCTTGAGCTGACGAAGACAGCGTGCTGCCCCTCTTTCTCTTTG 5589986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTATTTTGCTATGGCAGCTTGAGCTGACGAAGACAGCGTGCTGCCCCTCTTTCTCTTTG 780

  5589987 CAAAGCTTCATAGACATACATGGCCTATACACTGAAAAAACTCACATTCCTGAGGGGCTA 5590046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAGCTTCATAGACATACATGGCCTATACACTGAAAAAACTCACATTCCTGAGGGGCTA 840

  5590047 ACTGTTCGGTAGGTGTCAGTTCTGGGGCTGGGCTGGGTGACGGGTTCCTCCAGTGGAAAA 5590106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGTTCGGTAGGTGTCAGTTCTGGGGCTGGGCTGGGTGACGGGTTCCTCCAGTGGAAAA 900

  5590107 CATGCAGTAGCCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAGGAAGCCGATGTTTCT 5590166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATGCAGTAGCCATGTGTCTGCTCTGGGGCTGGTGTTTGGTGAAGGAAGCCGATGTTTCT 960

  5590167 TTTTCTTGTTTGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGTGGAGACTCCAGGGTA 5590226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTCTTGTTTGTCTCATGCCAGGACTGTGAACTGCTCTTGTTGTGGAGACTCCAGGGTA 1020

  5590227 GAAAGGAGAGGATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAGCAGAAGTGCTTTTCA 5590286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAAGGAGAGGATGGGGTAGGGACCCAGGTACAGGAAAGGGACAGCAGAAGTGCTTTTCA 1080

  5590287 TTTGGTGCAGATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCATTTTACAGCTGGGGGG 5590346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGGTGCAGATGCTCAGAGAGGAAGGTTTTGCTGTTATCCCCATTTTACAGCTGGGGGG 1140

  5590347 ACTCAAGCTCAGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCATAGGAACCAGGACTG 5590406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTCAAGCTCAGAGACTTACTCAACAATGCTTTACTAATATGTCATAGGAACCAGGACTG 1200

  5590407 AAGCTGAAGGCCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATTAGTCTGGGTAGGCTA 5590466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGCTGAAGGCCTCTGGATTTGGGGTCAGTTGATTACTTGGTATTAGTCTGGGTAGGCTA 1260

  5590467 GATTATGCTGCAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGTTGTCTTACAGCGACA 5590526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATTATGCTGCAGTAACAAGCAACAACAACACCCAGATCTTTTGTTGTCTTACAGCGACA 1320

  5590527 CAACTTTTTCTCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCTGCTGCCCCTTATCTC 5590586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAACTTTTTCTCACTCATGCCACATCCATCCTAGTGGCTGGTGCTGCTGCCCCTTATCTC 1380

  5590587 GTCACTCCGAGTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATATGGATGGATCTCCCAA 5590646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCACTCCGAGTCCAGGCCAGCAGAGTGGCCACCAACTCCAATATGGATGGATCTCCCAA 1440

  5590647 GGGTCTCACACTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTTCATCATTTCCACTCA 5590706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGTCTCACACTGGCAATTCAATGCCCCAACCCAGAAGTGACGTTCATCATTTCCACTCA 1500

  5590707 AATTCACTGACCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTATTCTAGCTCCCCAGC 5590766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTCACTGACCGGAGTTAGTTATTGGCCAGAGTTAGTCTAGTTATTCTAGCTCCCCAGC 1560

  5590767 TGAATGCACAGGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAGGCAGAGGGGGCAAGT 5590826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAATGCACAGGGGGCTAGAATATTCACCCTGGTGTGCCCAGCAGGCAGAGGGGGCAAGT 1620

  5590827 ATTATGGGGGCAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCATGCATGAATGAATGC 5590886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTATGGGGGCAGCATTAATGCCCATGTCAGAATGCATGCGTGCATGCATGAATGAATGC 1680

  5590887 ACTTAGAATCTCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGGAAAAGACAGCATAGA 5590946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTAGAATCTCCATCTGAGTTTAGTGGTTATTGACGGACCCAGGAAAAGACAGCATAGA 1740

  5590947 CTTGCAACTGCTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCTAATAATAGGTTTAAG 5591006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTGCAACTGCTCCACTTTAAGGGCATTGGAACTCCTTGGGTCCTAATAATAGGTTTAAG 1800

  5591007 CATCTTGAAAATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAGCTCCCCTGCCTACAT 5591066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATCTTGAAAATGTATGCGTGTTTTTTCCTCTCCATCGTTTCCAGCTCCCCTGCCTACAT 1860

  5591067 GTCCTCTCTTTCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACAGAGCCACCCCACCCA 5591126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCCTCTCTTTCACCAAATCTGTTTGCCATTTACTGTGGATGACAGAGCCACCCCACCCA 1920

  5591127 CACAGGCCCCATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACACAGATGGACACACAGA 5591186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACAGGCCCCATTCTGAGGTTGATTGATAACCCTTGGACACACACAGATGGACACACAGA 1980

  5591187 GAAATTTCTACTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAGTAATTTTTCAAGTAA 5591246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAATTTCTACTCCTTCCACGCGCCTTGGGCAGCCGTGGAGACAGTAATTTTTCAAGTAA 2040

  5591247 GTGTTAGCTCAGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACCCAGACAGACTCTGGG 5591306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGTTAGCTCAGAGTCTTTCGCGGGCTCCAGAGCATAACTAAACCCAGACAGACTCTGGG 2100

  5591307 AGATGAAAAATAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTTTCTTTTTCCTCCTAG 5591366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGATGAAAAATAAACCGTTGTTTTTATGATGCCATGAAAAAGCTTTCTTTTTCCTCCTAG 2160

  5591367 AAAAGAAACTTATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAGTGTGGAAGGATTAAG 5591426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAGAAACTTATTTATTTTCATGTGTGTATGGGTTTGCAGTAAGTGTGGAAGGATTAAG 2220

  5591427 CCTTTGAAACTGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTTGTCCTGGAGAGCAGC 5591486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTTTGAAACTGTCGATTTATATCCATGAGTGATGTGAAGTCTTTGTCCTGGAGAGCAGC 2280

  5591487 AAGCTTTCCAAATTGGAAAATCGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCATTCACTCAGCGGCTCA 5591546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGCTTTCCAAATTGGAAAATCGAGAGTCGGGCCCCTTTGCTCATTCACTCAGCGGCTCA 2340

  5591547 TTCACTAAATATTTACTGAGCATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCTTCAGGAGCTGGGGAC 5591606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTCACTAAATATTTACTGAGCATCTCTTGCCTTCCAGGCCTGGCTTCAGGAGCTGGGGAC 2400

  5591607 GCAGAGCCCATGTCAGAGGGCACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTTGCAATCTACAGGGGA 5591666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCAGAGCCCATGTCAGAGGGCACCATCCCTGCCCTTAGGGAGTTTGCAATCTACAGGGGA 2460

  5591667 AATAAATGCCAGAGGCCTGTACAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAGGACCGGGGAGCTTTG 5591726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAAATGCCAGAGGCCTGTACAAAGGGTGTGGGGTACTGAGCAGGACCGGGGAGCTTTG 2520

  5591727 TCAAGTAGCATGGAGGAACTTAACCTGGAAGGACAAGGAGGAACCAGCCAGCCAAGGAGG 5591786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCAAGTAGCATGGAGGAACTTAACCTGGAAGGACAAGGAGGAACCAGCCAGCCAAGGAGG 2580

  5591787 ACAAAGAGGGAAGATTCTGACGGAAGGAATGGCATCGTCAGATGAGGGGAGGTGGGCGAG 5591846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACAAAGAGGGAAGATTCTGACGGAAGGAATGGCATCGTCAGATGAGGGGAGGTGGGCGAG 2640

  5591847 GCTGCAGTGTAGTTGGGCTTCACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGGAGATAAGCCTCTGGG 5591906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTGCAGTGTAGTTGGGCTTCACCAGGTAGGTCATGTAGTAGAGGAGATAAGCCTCTGGG 2700

  5591907 CTCCGGGTTCAAATCCCAGCCTTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACCATCTATAAAATGGGG 5591966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTCCGGGTTCAAATCCCAGCCTTGCCCCTTCCTTGCTATGCGACCATCTATAAAATGGGG 2760

  5591967 AGAGAAGCTGTAACTCCCTCACTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGGGTTGAAATGCATAAG 5592026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGAGAAGCTGTAACTCCCTCACTGGGTATTGTGAAGAGTCGATGGGTTGAAATGCATAAG 2820

  5592027 GAGGCCAGAGCAGTGCCTGGAGTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTGTGACCTGTTCTCATT 5592086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGGCCAGAGCAGTGCCTGGAGTGCCAAAAATTGCTTAGTAGCTGTGACCTGTTCTCATT 2880

  5592087 TTGCTGAGGCTTGAGTAGAAAAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGGGCAAGGACCTGAATG 5592146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGCTGAGGCTTGAGTAGAAAAGAAGAGGAAGAAGGAAAAGGTGGGCAAGGACCTGAATG 2940

  5592147 TCAGGGTGAGGGGCTGAGGCTCTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAGGGATGCAAAGGATGT 5592206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCAGGGTGAGGGGCTGAGGCTCTGACTCGTACTTGCAGTGTCCAGGGATGCAAAGGATGT 3000

  5592207 GTGGATTTTGGGGGCCTGTTCTGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTGGGTGGTCCTGAGAGA 5592266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTGGATTTTGGGGGCCTGTTCTGCCCTAGGGAGGAAGCCCAACTGGGTGGTCCTGAGAGA 3060

  5592267 GACTCTACATTAAGGGTAGAGTTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCTCAGCGGGGGAGGTCC 5592326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GACTCTACATTAAGGGTAGAGTTACGCACTGGAAGCCTGGGGGCTCAGCGGGGGAGGTCC 3120

  5592327 CACAGGGTCAGTCAGAGGAGGGGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGGTCAGTCAGAGGAGGT 5592386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CACAGGGTCAGTCAGAGGAGGGGCTGAGGGGGAGGTCCCATGGGGTCAGTCAGAGGAGGT 3180

  5592387 GTGGCCCAAGTCATGGGGTCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGAGGATGGGTGGTTCT 5592446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTGGCCCAAGTCATGGGGTCTGCAGAAGAGAGACCCTTAGACAAGAGGATGGGTGGTTCT 3240

  5592447 GAAGGACCCACACCAGAACCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGTGAAGAGTGCAGAGG 5592506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAAGGACCCACACCAGAACCCCCCTGCTGGGTGCCCAGTGGAGGGTGAAGAGTGCAGAGG 3300

  5592507 AGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTCTGGCTCTAGAGTAA 5592566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGAAGTGGGCACTGGGCCTCTGCATGGCATGAGTGAGGGGCCCCTCTGGCTCTAGAGTAA 3360

  5592567 GACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCCCCCATAATGGGGGT 5592626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GACTAGCTTGAACCCAAAGCCCAGGCTGAGCCCGATAAGCTGAGCCCCCATAATGGGGGT 3420

  5592627 GATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGA 5592686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GATGACACCCATCGTTCAGGGGTGTTTTGTGAGTTAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGA 3480

  5592687 TCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTC 5592746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTC 3540

  5592747 TGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGA 5592806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGA 3600

  5592807 ACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATGAC 5592842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATGAC 3636

EXCISED REGION

  5592844 AGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATG 5592903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 AGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATG 3697

  5592904 GGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGT 5592963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 GGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGT 3757

  5592964 GTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAG 5593023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 GTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAG 3817

  5593024 TGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCC 5593083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCC 3877

  5593084 TCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCC 5593143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 TCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCC 3937

  5593144 CAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTG 5593203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 CAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTG 3997

  5593204 AGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAG 5593263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 AGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAG 4057

  5593264 GCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGC 5593323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 GCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGC 4117

  5593324 CCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAG 5593383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 CCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAG 4177

  5593384 CAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCA 5593443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 CAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCA 4237

  5593444 GGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTG 5593503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 GGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTG 4297

  5593504 GGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAG 5593563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 GGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAG 4357

  5593564 TGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGC 5593623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 TGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGC 4417

  5593624 ACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTG 5593683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 ACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTG 4477

  5593684 GCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTC 5593743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 GCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTC 4537

  5593744 TCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGG 5593803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 TCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGG 4597

  5593804 GGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTT 5593863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 GGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTT 4657

  5593864 TCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATAT 5593923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4658 TCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATAT 4717

  5593924 TCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTC 5593983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 TCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTC 4777

  5593984 TTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGG 5594043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4778 TTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGG 4837

  5594044 CGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCA 5594103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4838 CGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCA 4897

  5594104 CGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGG 5594163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4898 CGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGG 4957

  5594164 TCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTAC 5594223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4958 TCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTAC 5017

  5594224 AGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTG 5594283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5018 AGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTG 5077

  5594284 GGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCG 5594343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5078 GGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCG 5137

  5594344 GGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATA 5594403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5138 GGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATA 5197

  5594404 CGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATA 5594463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5198 CGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATA 5257

  5594464 TAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTT 5594523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5258 TAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTT 5317

  5594524 CAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATAT 5594583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5318 CAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATAT 5377

  5594584 AGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTG 5594643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5378 AGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTG 5437

  5594644 TAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTG 5594703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5438 TAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTG 5497

  5594704 TCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTA 5594763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5498 TCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTA 5557

  5594764 CTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTG 5594823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5558 CTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTG 5617

  5594824 AGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAA 5594883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5618 AGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAA 5677

  5594884 AAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAA 5594943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5678 AAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAA 5737

  5594944 ATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAG 5595003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5738 ATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAG 5797

  5595004 ACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCAC 5595063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5798 ACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCAC 5857

  5595064 CTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTT 5595123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5858 CTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTT 5917

  5595124 GTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTAT 5595183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5918 GTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTAT 5977

  5595184 AAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTA 5595243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5978 AAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTA 6037

  5595244 ACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCC 5595303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6038 ACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCC 6097

  5595304 ACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGA 5595363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6098 ACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGA 6157

  5595364 CAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACA 5595423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6158 CAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACA 6217

  5595424 CCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATA 5595483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 CCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATA 6277

  5595484 AATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGA 5595543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 AATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGA 6337

  5595544 CCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTC 5595603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 CCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTC 6397

  5595604 TTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAA 5595663
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 TTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCCGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAA 6457

  5595664 TAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAAT 5595723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 TAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAAT 6517

  5595724 TAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTT 5595783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6518 TAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTT 6577

  5595784 CATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCT 5595843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 CATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCT 6637

  5595844 CTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGA 5595890
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6638 CTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGA 6684

Alignment time is 5.18283 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3213] =>      3213 nucs 'mol-32-322a-123274_3213'

Score:        2943
Aligned:      3207        nucs
Identic:      3183 ( 99%) nucs =>      2998 ( 99%)       185 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5597499,5600518] EXCISED REGION [5600525,5600710]
 second seq =>  [      1,   3021] EXCISED REGION [   3028,   3213]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [5600519,5600524]
 second seq =>         6 nucs [3022,3027]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5600518,5600518] to [5600524,5600524]
 second seq =>         2 nucs [3022,3023] to [3028,3029]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 60

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 120

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 180

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 240

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 300

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 360

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 420

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 480

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      481 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 540

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 600

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 660

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 720

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 780

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 840

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 900

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 960

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1020

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1021 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 1080

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 1140

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 1200

  5598699 AACTCCATTTA-TCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 1260

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 1320

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 1380

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 1440

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 1500

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1501 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 1560

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1561 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 1620

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 1680

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 1740

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 1800

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 1860

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1861 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 1920

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 1980

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2040

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 2100

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 2160

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2161 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 2220

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 2280

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 2340

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 2400

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 2460

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 2520

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 2580

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2581 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 2640

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 2700

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 2760

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 2820

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 2880

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 2940

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 3000

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTC 5600518
          |||||||||||||||||||||
     3001 CATTCTAGCATGAAAACACTC 3021

EXCISED REGION

  5600525 AATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTC 5600584
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 AATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTC 3087

  5600585 CCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACA 5600644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 CCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACA 3147

  5600645 GACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATG 5600704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 GACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATG 3207

  5600705 TAGACT 5600710
          ||||||
     3208 TAGACT 3213

Alignment time is 2.51065 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6018] =>      6018 nucs 'mol-32-32fb-124582_6018'

Score:        6017
Aligned:      6017        nucs
Identic:      6017 (100%) nucs =>        12 (100%)      6005 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5597301,5597312] EXCISED REGION [5597314,5603318]
 second seq =>  [      1,     12] EXCISED REGION [     14,   6018]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5597313,5597313]
 second seq =>         1 nucs [13,13]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5597312,5597313] to [5597313,5597314]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5597312,5597312] to [5597314,5597314]
 second seq =>         1 nucs [12,12] to [14,14]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5597301 GGCCCTTGCTAC 5597312
          ||||||||||||
        1 GGCCCTTGCTAC 12

EXCISED REGION

  5597314 CTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGG 5597373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       14 CTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGG 73

  5597374 CTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGG 5597433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       74 CTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGG 133

  5597434 CCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAA 5597493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      134 CCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAA 193

  5597494 TCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTA 5597553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      194 TCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTA 253

  5597554 AGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAG 5597613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      254 AGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAG 313

  5597614 AAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCA 5597673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      314 AAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCA 373

  5597674 TCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTC 5597733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      374 TCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTC 433

  5597734 ATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCC 5597793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      434 ATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCC 493

  5597794 AAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGG 5597853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      494 AAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGG 553

  5597854 AGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGG 5597913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      554 AGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGG 613

  5597914 AAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCC 5597973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      614 AAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCC 673

  5597974 CATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTT 5598033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      674 CATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTT 733

  5598034 TTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCAT 5598093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      734 TTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCAT 793

  5598094 CTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAG 5598153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 CTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAG 853

  5598154 CGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTT 5598213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 CGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTT 913

  5598214 GCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTT 5598273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 GCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTT 973

  5598274 ACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTA 5598333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 ACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTA 1033

  5598334 TTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTC 5598393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 TTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTC 1093

  5598394 TTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAG 5598453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 TTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAG 1153

  5598454 CAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAG 5598513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 CAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAG 1213

  5598514 TAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCC 5598573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 TAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCC 1273

  5598574 AATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAA 5598633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 AATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAA 1333

  5598634 GAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGT 5598693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 GAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGT 1393

  5598694 TTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGA 5598753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 TTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGA 1453

  5598754 TGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGG 5598813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 TGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGG 1513

  5598814 GAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTA 5598873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 GAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTA 1573

  5598874 TATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTG 5598933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTG 1633

  5598934 TCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTC 5598993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 TCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTC 1693

  5598994 AAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTC 5599053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 AAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTC 1753

  5599054 ACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTG 5599113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 ACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTG 1813

  5599114 GCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCC 5599173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 GCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCC 1873

  5599174 ATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCC 5599233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 ATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCC 1933

  5599234 AGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGG 5599293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 AGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGG 1993

  5599294 CAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGG 5599353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 CAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGG 2053

  5599354 ACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGA 5599413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 ACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGA 2113

  5599414 TGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACA 5599473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 TGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACA 2173

  5599474 TTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCA 5599533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCA 2233

  5599534 GGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAA 5599593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 GGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAA 2293

  5599594 GGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGG 5599653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 GGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGG 2353

  5599654 TGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGA 5599713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 TGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGA 2413

  5599714 AGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCT 5599773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 AGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCT 2473

  5599774 GAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTT 5599833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 GAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTT 2533

  5599834 TCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCT 5599893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 TCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCT 2593

  5599894 GTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCC 5599953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 GTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCC 2653

  5599954 TACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCA 5600013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCA 2713

  5600014 GTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAG 5600073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 GTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAG 2773

  5600074 TGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTT 5600133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 TGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTT 2833

  5600134 CCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATG 5600193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 CCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATG 2893

  5600194 TCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGG 5600253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 TCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGG 2953

  5600254 CCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATA 5600313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 CCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATA 3013

  5600314 ATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGAT 5600373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 ATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGAT 3073

  5600374 GACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGG 5600433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 GACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGG 3133

  5600434 GAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATT 5600493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 GAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATT 3193

  5600494 AGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGT 5600553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 AGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGT 3253

  5600554 TTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAAT 5600613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 TTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAAT 3313

  5600614 AGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTT 5600673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 AGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTT 3373

  5600674 ACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTG 5600733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 ACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTG 3433

  5600734 CTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACA 5600793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 CTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACA 3493

  5600794 ATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCAT 5600853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 ATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCAT 3553

  5600854 GGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAG 5600913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 GGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAG 3613

  5600914 AGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGG 5600973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 AGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGG 3673

  5600974 CAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTG 5601033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 CAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTG 3733

  5601034 GGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTG 5601093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 GGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTG 3793

  5601094 GAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAA 5601153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 GAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAA 3853

  5601154 TGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAA 5601213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 TGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAA 3913

  5601214 TGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACC 5601273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 TGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACC 3973

  5601274 AGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTT 5601333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 AGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTT 4033

  5601334 GTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACG 5601393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 GTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACG 4093

  5601394 ACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAA 5601453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 ACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAA 4153

  5601454 CACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAA 5601513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 CACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAA 4213

  5601514 TGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTT 5601573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 TGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTT 4273

  5601574 TTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGC 5601633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 TTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGC 4333

  5601634 AGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGA 5601693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 AGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGA 4393

  5601694 AACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGT 5601753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 AACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGT 4453

  5601754 TTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTG 5601813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 TTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTG 4513

  5601814 GGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGAT 5601873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 GGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGAT 4573

  5601874 CTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAAT 5601933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 CTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAAT 4633

  5601934 GTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTG 5601993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 GTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTG 4693

  5601994 GAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTT 5602053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 GAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTT 4753

  5602054 GCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTG 5602113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 GCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTG 4813

  5602114 ATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATG 5602173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 ATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATG 4873

  5602174 ATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTA 5602233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 ATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTA 4933

  5602234 TCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCT 5602293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 TCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCT 4993

  5602294 GGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCT 5602353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 GGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCT 5053

  5602354 TGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGG 5602413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 TGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGG 5113

  5602414 CTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTT 5602473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 CTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTT 5173

  5602474 CTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCT 5602533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 CTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCT 5233

  5602534 GCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAAC 5602593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 GCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAAC 5293

  5602594 TTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTT 5602653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 TTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTT 5353

  5602654 CTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCA 5602713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 CTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCA 5413

  5602714 TATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGC 5602773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 TATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGC 5473

  5602774 TATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGG 5602833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 TATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGG 5533

  5602834 TTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAG 5602893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 TTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAG 5593

  5602894 GTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTC 5602953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 GTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTC 5653

  5602954 AGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCT 5603013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 AGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCT 5713

  5603014 CTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTAT 5603073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 CTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTAT 5773

  5603074 TCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGT 5603133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 TCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGT 5833

  5603134 GGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCA 5603193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 GGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCA 5893

  5603194 CAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACC 5603253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 CAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACC 5953

  5603254 CCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAA 5603313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 CCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAA 6013

  5603314 TCGCC 5603318
          |||||
     6014 TCGCC 6018

Alignment time is 4.67269 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   7659] =>      7659 nucs 'mol-32-3306-072338_7659'

Score:        6754
Aligned:      7238        nucs
Identic:      7194 ( 99%) nucs =>      1611 ( 99%)      5583 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593079,5594699] EXCISED REGION [5597499,5603114]
 second seq =>  [      1,   1621] EXCISED REGION [   2043,   7659]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2799 nucs [5594700,5597498]
 second seq =>       421 nucs [1622,2042]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1622,1623] to [2041,2042]

  5593079 AGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTG 5593138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTG 60

  5593139 TGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTC 5593198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATTTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTC 120

  5593199 ATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGC 5593258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGC 180

  5593259 TATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTC 5593318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTC 240

  5593319 TCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAA 5593378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAA 300

  5593379 TCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGAT 5593438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGAT 360

  5593439 GGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCT 5593498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCT 420

  5593499 GTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACA 5593558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACA 480

  5593559 GGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGC 5593618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGC 540

  5593619 CAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTG 5593678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTG 600

  5593679 GCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAAC 5593738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      601 GCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCGTGGCCTGCACAGCCACAATCCTAAC 660

  5593739 CACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTAC 5593798
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCTGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTAC 720

  5593799 CGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGA 5593858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGA 780

  5593859 CATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCC 5593918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCC 840

  5593919 AATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACA 5593978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACA 900

  5593979 AGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTC 5594038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTC 960

  5594039 CTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGC 5594098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGC 1020

  5594099 CACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAG 5594158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAG 1080

  5594159 GTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGG 5594218
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||
     1081 GTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCGCAAAGTGCTGGG 1140

  5594219 ATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGC 5594278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGC 1200

  5594279 CTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTA 5594338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1201 CTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAAGTTGCTTA 1260

  5594339 GGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCC 5594398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCC 1320

  5594399 ACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTT 5594458
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
     1321 ACATACGGAAAATACGAAAAGTAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACTTACCATTT 1380

  5594459 AAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGG 5594518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGG 1440

  5594519 TGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAAT 5594578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAAT 1500

  5594579 TATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCAT 5594638
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATATAGTGTCATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCAT 1560

  5594639 GCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGA 5594698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGA 1620

  5594699 C 5594699
          |
     1621 C 1621

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 2102

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 2162

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 2222

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 2282

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 2342

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 2402

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 2462

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 2522

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2523 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 2582

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 2642

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 2702

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 2762

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 2822

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 2882

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 2942

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 3002

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 3062

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3063 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 3122

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 3182

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 3242

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 3302

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 3362

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 3422

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 3482

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 3542

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3543 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 3602

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3603 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 3662

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 3722

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 3782

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 3842

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3843 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 3902

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3903 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 3962

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 4022

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 4082

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4083 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 4142

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 4202

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4203 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 4262

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 4322

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 4382

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 4442

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4443 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 4502

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 4562

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 4622

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4623 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 4682

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 4742

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 4802

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 4862

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 4922

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 4982

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5042

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5043 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 5102

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5162

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5222

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5282

  5600738 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGG 5600797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5283 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGG 5342

  5600798 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5600857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5343 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5402

  5600858 GGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCT 5600917
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5403 GGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCT 5462

  5600918 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5600977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5522

  5600978 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5601037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5582

  5601038 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5601097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5642

  5601098 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5601157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5702

  5601158 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5601217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5762

  5601218 TGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5601277
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 TGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5822

  5601278 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5601337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5882

  5601338 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5601397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5942

  5601398 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5601457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 6002

  5601458 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5601517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 6062

  5601518 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5601577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 6122

  5601578 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5601637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 6182

  5601638 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5601697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 6242

  5601698 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 5601757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 6302

  5601758 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 5601817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 6362

  5601818 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 5601877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 6422

  5601878 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGC 5601937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6423 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGCCACATTAGAAATGTGC 6482

  5601938 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 5601997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 6542

  5601998 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 5602057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 6602

  5602058 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 5602117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 6662

  5602118 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 5602177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 6722

  5602178 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 5602237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 6782

  5602238 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 5602297
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCGGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 6842

  5602298 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 5602357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 6902

  5602358 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5602417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 6962

  5602418 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5602477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6963 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 7022

  5602478 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5602537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7023 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 7082

  5602538 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5602597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7083 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 7142

  5602598 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5602657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7143 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 7202

  5602658 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5602717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7203 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 7262

  5602718 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5602777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7263 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 7322

  5602778 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 5602837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7323 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 7382

  5602838 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGC 5602897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7383 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGATGC 7442

  5602898 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 5602957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7443 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 7502

  5602958 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 5603017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7503 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 7562

  5603018 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 5603077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7563 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 7622

  5603078 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAG 5603114
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7623 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAG 7659

Alignment time is 5.85403 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3568] =>      3568 nucs 'mol-32-3306-249097_3568'

Score:        2820
Aligned:      3128        nucs
Identic:      3100 ( 99%) nucs =>       479 ( 99%)      2621 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5594215,5594699] EXCISED REGION [5597499,5600140]
 second seq =>  [     20,    504] EXCISED REGION [    926,   3568]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2799 nucs [5594700,5597498]
 second seq =>       421 nucs [505,925]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [505,506] to [924,925]

  5594215 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAA 5594274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       20 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAA 79

  5594275 AGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTG 5594334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
       80 AGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAAGTTG 139

  5594335 CTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATAT 5594394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      140 CTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATAT 199

  5594395 ATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACC 5594454
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      200 ATCCACATACGGAAAATACGAAAAGTAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACTTACC 259

  5594455 ACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAG 5594514
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 ATTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAG 319

  5594515 AGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGA 5594574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 AGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGA 379

  5594575 CAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGAC 5594634
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 CAATTATATAGTGTCATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGAC 439

  5594635 TCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAG 5594694
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 TCATGCCTGTAATTCCAGCACATGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAG 499

  5594695 GAGAC 5594699
          |||||
      500 GAGAC 504

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      926 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 985

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 1045

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 1105

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 1165

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 1225

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 1285

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 1345

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 1405

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1406 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 1465

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 1525

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 1585

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 1645

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 1705

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 1765

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 1825

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 1885

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 1945

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1946 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 2005

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 2065

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 2125

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 2185

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 2245

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 2305

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 2365

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 2425

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2426 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 2485

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2486 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 2545

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 2605

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 2665

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 2725

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2726 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 2785

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2786 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 2845

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 2905

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 2965

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2966 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 3025

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 3085

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3086 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 3145

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 3205

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 3265

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 3325

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3326 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 3385

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 3445

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 3505

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3506 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 3565

  5600138 AGG 5600140
          |||
     3566 AGG 3568

Alignment time is 2.8088 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2065] =>      2065 nucs 'mol-32-3311-114827_2065'

Score:        2065
Aligned:      2065        nucs
Identic:      2065 (100%) nucs =>      1996 (100%)        69 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593820,5595815] EXCISED REGION [5595817,5595885]
 second seq =>  [      1,   1996] EXCISED REGION [   1997,   2065]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5595816,5595816]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [5595816,5595826] to [5595817,5595827]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5593820 ATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAG 5593879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAG 60

  5593880 GAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCC 5593939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCC 120

  5593940 CTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAG 5593999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAG 180

  5594000 GTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCT 5594059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCT 240

  5594060 ACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTT 5594119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTT 300

  5594120 GGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGC 5594179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGC 360

  5594180 TTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCAC 5594239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCAC 420

  5594240 ACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGT 5594299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGT 480

  5594300 GTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAA 5594359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAA 540

  5594360 ACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAA 5594419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAA 600

  5594420 TAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTT 5594479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTT 660

  5594480 TGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAG 5594539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAG 720

  5594540 AAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGAC 5594599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGAC 780

  5594600 AAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGA 5594659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGA 840

  5594660 GCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAA 5594719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAA 900

  5594720 AACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGAT 5594779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGAT 960

  5594780 GGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCA 5594839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCA 1020

  5594840 TTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAA 5594899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAA 1080

  5594900 ATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAA 5594959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAA 1140

  5594960 ACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTG 5595019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTG 1200

  5595020 GTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCAC 5595079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCAC 1260

  5595080 CTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTC 5595139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTC 1320

  5595140 ATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACC 5595199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACC 1380

  5595200 AATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTT 5595259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTT 1440

  5595260 CTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTT 5595319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTT 1500

  5595320 TGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGA 5595379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGA 1560

  5595380 CATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAG 5595439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAG 1620

  5595440 GAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCAC 5595499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCAC 1680

  5595500 TTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGA 5595559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGA 1740

  5595560 TGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGC 5595619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGC 1800

  5595620 AAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGT 5595679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGT 1860

  5595680 GCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCA 5595739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCA 1920

  5595740 ATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGG 5595799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGG 1980

  5595800 ACACTTGAGTTGCTTC 5595815
          ||||||||||||||||
     1981 ACACTTGAGTTGCTTC 1996

EXCISED REGION

  5595817 TTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGG 5595876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 TTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGG 2056

  5595877 GAGTTAAAA 5595885
          |||||||||
     2057 GAGTTAAAA 2065

Alignment time is 1.63067 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   8388] =>      8388 nucs 'mol-32-33a0-052483_8388'

Score:        8387
Aligned:      8387        nucs
Identic:      8387 (100%) nucs =>      2554 (100%)      5833 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5594127,5596680] EXCISED REGION [5596682,5602514]
 second seq =>  [      1,   2554] EXCISED REGION [   2556,   8388]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5596681,5596681]
 second seq =>         1 nucs [2555,2555]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2554,2555] to [2555,2556]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [5596680,5596680] to [5596682,5596682]
 second seq =>         1 nucs [2554,2554] to [2556,2556]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5594127 TTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCA 5594186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCA 60

  5594187 ATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGC 5594246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGC 120

  5594247 CCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTC 5594306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTC 180

  5594307 TTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAG 5594366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAG 240

  5594367 AAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAA 5594426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAA 300

  5594427 AAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATG 5594486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATG 360

  5594487 TTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAA 5594546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAA 420

  5594547 AGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAA 5594606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAA 480

  5594607 CTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGG 5594666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGG 540

  5594667 AGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCT 5594726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCT 600

  5594727 AGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGA 5594786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGA 660

  5594787 TCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGC 5594846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGC 720

  5594847 CTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGA 5594906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGA 780

  5594907 ATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTC 5594966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTC 840

  5594967 AGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTT 5595026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTT 900

  5595027 CTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTC 5595086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTC 960

  5595087 CATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTT 5595146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTT 1020

  5595147 TTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGC 5595206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGC 1080

  5595207 AGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTT 5595266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTT 1140

  5595267 TTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCAC 5595326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCAC 1200

  5595327 ACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATA 5595386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATA 1260

  5595387 TCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTC 5595446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTC 1320

  5595447 TGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAG 5595506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAG 1380

  5595507 GTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGA 5595566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGA 1440

  5595567 CTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCT 5595626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCT 1500

  5595627 GGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGA 5595686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGA 1560

  5595687 ATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATAT 5595746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATAT 1620

  5595747 CCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTG 5595806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTG 1680

  5595807 AGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAG 5595866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAG 1740

  5595867 TAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCA 5595926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCA 1800

  5595927 GCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 5595986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 1860

  5595987 CCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGA 5596046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGA 1920

  5596047 TGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGT 5596106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGT 1980

  5596107 GGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAA 5596166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAA 2040

  5596167 TTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGG 5596226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGG 2100

  5596227 GCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTT 5596286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTT 2160

  5596287 CGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACA 5596346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACA 2220

  5596347 GGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAAT 5596406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAAT 2280

  5596407 GTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGA 5596466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGA 2340

  5596467 AAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTG 5596526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTG 2400

  5596527 GGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTG 5596586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTG 2460

  5596587 TGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGG 5596646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGG 2520

  5596647 CCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAG 5596680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAG 2554

EXCISED REGION

  5596682 GTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGA 5596741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 GTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGA 2615

  5596742 CTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATC 5596801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 CTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATC 2675

  5596802 CATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAG 5596861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 CATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAG 2735

  5596862 GGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGG 5596921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 GGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGG 2795

  5596922 AGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATT 5596981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 AGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATT 2855

  5596982 TTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACT 5597041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 TTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACT 2915

  5597042 CCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCA 5597101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 CCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCA 2975

  5597102 CACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACC 5597161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 CACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACC 3035

  5597162 TGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGG 5597221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGG 3095

  5597222 AGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAA 5597281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 AGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAA 3155

  5597282 GGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGA 5597341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 GGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGA 3215

  5597342 TCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAG 5597401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 TCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAG 3275

  5597402 GTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGA 5597461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 GTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGA 3335

  5597462 ATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACG 5597521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 ATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACG 3395

  5597522 CTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTC 5597581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 CTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTC 3455

  5597582 GAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTA 5597641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 GAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTA 3515

  5597642 GAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGA 5597701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 GAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGA 3575

  5597702 AATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAAT 5597761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 AATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAAT 3635

  5597762 CATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTC 5597821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 CATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTC 3695

  5597822 AAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAG 5597881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 AAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAG 3755

  5597882 GTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAG 5597941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 GTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAG 3815

  5597942 CCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCC 5598001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 CCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCC 3875

  5598002 TGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAA 5598061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 TGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAA 3935

  5598062 GTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAA 5598121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 GTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAA 3995

  5598122 TGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATA 5598181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 TGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATA 4055

  5598182 AATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCT 5598241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 AATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCT 4115

  5598242 TCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAG 5598301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 TCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAG 4175

  5598302 TCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTA 5598361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTA 4235

  5598362 AAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTT 5598421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 AAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTT 4295

  5598422 TGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGT 5598481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 TGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGT 4355

  5598482 TTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCA 5598541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 TTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCA 4415

  5598542 ACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACT 5598601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 ACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACT 4475

  5598602 CCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACC 5598661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 CCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACC 4535

  5598662 TTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAA 5598721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 TTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAA 4595

  5598722 CCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAA 5598781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 CCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAA 4655

  5598782 CTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTG 5598841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 CTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTG 4715

  5598842 ACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTA 5598901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 ACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTA 4775

  5598902 CCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTAC 5598961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 CCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTAC 4835

  5598962 AATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGG 5599021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 AATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGG 4895

  5599022 ATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGAT 5599081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 ATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGAT 4955

  5599082 GGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAA 5599141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 GGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAA 5015

  5599142 GAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCC 5599201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 GAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCC 5075

  5599202 AGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAA 5599261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 AGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAA 5135

  5599262 CCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGA 5599321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 CCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGA 5195

  5599322 CGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCT 5599381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 CGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCT 5255

  5599382 GCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTG 5599441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 GCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTG 5315

  5599442 GGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCG 5599501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 GGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCG 5375

  5599502 CTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCC 5599561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 CTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCC 5435

  5599562 TGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTG 5599621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 TGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTG 5495

  5599622 GGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGG 5599681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 GGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGG 5555

  5599682 TACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGA 5599741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 TACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGA 5615

  5599742 TATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAG 5599801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 TATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAG 5675

  5599802 AGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTG 5599861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 AGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTG 5735

  5599862 CTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGT 5599921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 CTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGT 5795

  5599922 CCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGG 5599981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 CCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGG 5855

  5599982 CTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGG 5600041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 CTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGG 5915

  5600042 GGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAG 5600101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 GGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAG 5975

  5600102 TTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTG 5600161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5976 TTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTG 6035

  5600162 GCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCT 5600221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6036 GCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCT 6095

  5600222 GTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACC 5600281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6096 GTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACC 6155

  5600282 TGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATT 5600341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 TGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATT 6215

  5600342 GTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTG 5600401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6216 GTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTG 6275

  5600402 TGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAG 5600461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6276 TGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAG 6335

  5600462 TCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAA 5600521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6336 TCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAA 6395

  5600522 AACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATT 5600581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6396 AACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATT 6455

  5600582 TTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTT 5600641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6456 TTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTT 6515

  5600642 ACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCA 5600701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6516 ACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCA 6575

  5600702 ATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCAT 5600761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6576 ATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCAT 6635

  5600762 GCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAG 5600821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6636 GCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAG 6695

  5600822 GGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGA 5600881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6696 GGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGA 6755

  5600882 TGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCC 5600941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6756 TGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCC 6815

  5600942 CTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACAC 5601001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6816 CTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACAC 6875

  5601002 AGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAA 5601061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6876 AGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAA 6935

  5601062 TATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGC 5601121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6936 TATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGC 6995

  5601122 AAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCA 5601181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6996 AAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCA 7055

  5601182 GGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAG 5601241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7056 GGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAG 7115

  5601242 GTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTT 5601301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7116 GTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTT 7175

  5601302 GGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCT 5601361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7176 GGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCT 7235

  5601362 CTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCT 5601421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7236 CTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCT 7295

  5601422 AGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTG 5601481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7296 AGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTG 7355

  5601482 TCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAA 5601541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7356 TCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAA 7415

  5601542 GTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTT 5601601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7416 GTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTT 7475

  5601602 CAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTC 5601661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7476 CAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTC 7535

  5601662 CTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGA 5601721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7536 CTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGA 7595

  5601722 CGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTG 5601781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7596 CGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTG 7655

  5601782 TTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAA 5601841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7656 TTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAA 7715

  5601842 CAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTC 5601901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7716 CAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTC 7775

  5601902 TTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGA 5601961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7776 TTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGA 7835

  5601962 TTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAA 5602021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7836 TTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAA 7895

  5602022 ACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTG 5602081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7896 ACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTG 7955

  5602082 GTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGAC 5602141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7956 GTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGAC 8015

  5602142 TGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCT 5602201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8016 TGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCT 8075

  5602202 GGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCT 5602261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8076 GGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCT 8135

  5602262 CCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGA 5602321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8136 CCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGA 8195

  5602322 ATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGG 5602381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8196 ATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGG 8255

  5602382 GCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCT 5602441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8256 GCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCT 8315

  5602442 CACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTA 5602501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8316 CACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTA 8375

  5602502 GCCTCAGGGCCTT 5602514
          |||||||||||||
     8376 GCCTCAGGGCCTT 8388

Alignment time is 6.43813 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,  10271] =>     10271 nucs 'mol-32-33a0-155362_10271'

Score:        9309
Aligned:      9850        nucs
Identic:      9800 ( 99%) nucs =>      1853 ( 99%)      7947 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5592837,5594699] EXCISED REGION [5597499,5605482]
 second seq =>  [      1,   1863] EXCISED REGION [   2285,  10271]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2799 nucs [5594700,5597498]
 second seq =>       421 nucs [1864,2284]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1864,1865] to [2283,2284]

  5592837 GATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGA 5592896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGA 60

  5592897 TGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACT 5592956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACT 120

  5592957 GCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAA 5593016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAA 180

  5593017 GAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGG 5593076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGG 240

  5593077 TGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTG 5593136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTG 300

  5593137 TGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTT 5593196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATTTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTT 360

  5593197 TCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCT 5593256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCT 420

  5593257 GCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAG 5593316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAG 480

  5593317 TCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAA 5593376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAA 540

  5593377 AATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGG 5593436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGG 600

  5593437 ATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAG 5593496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAG 660

  5593497 CTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTA 5593556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTA 720

  5593557 CAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGA 5593616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGA 780

  5593617 GCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGG 5593676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGG 840

  5593677 TGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTA 5593736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      841 TGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCGTGGCCTGCACAGCCACAATCCTA 900

  5593737 ACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTT 5593796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCTGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTT 960

  5593797 ACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACC 5593856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACC 1020

  5593857 GACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTG 5593916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTG 1080

  5593917 CCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGA 5593976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGA 1140

  5593977 CAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACC 5594036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACC 1200

  5594037 TCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGT 5594096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGT 1260

  5594097 GCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCC 5594156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCC 1320

  5594157 AGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTG 5594216
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||
     1321 AGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCGCAAAGTGCTG 1380

  5594217 GGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAG 5594276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAG 1440

  5594277 GCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCT 5594336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1441 GCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAAGTTGCT 1500

  5594337 TAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATAT 5594396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATAT 1560

  5594397 CCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCAC 5594456
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
     1561 CCACATACGGAAAATACGAAAAGTAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACTTACCAT 1620

  5594457 TTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAG 5594516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAG 1680

  5594517 GGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACA 5594576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACA 1740

  5594577 ATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTC 5594636
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTATATAGTGTCATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTC 1800

  5594637 ATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGA 5594696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGA 1860

  5594697 GAC 5594699
          |||
     1861 GAC 1863

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 2344

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 2404

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 2464

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 2524

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 2584

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 2644

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 2704

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 2764

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2765 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 2824

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 2884

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 2944

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 3004

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 3064

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 3124

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 3184

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 3244

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 3304

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3305 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 3364

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 3424

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 3484

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 3544

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 3604

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 3664

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 3724

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 3784

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3785 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 3844

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3845 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 3904

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 3964

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 4024

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 4084

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4085 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 4144

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4145 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 4204

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 4264

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 4324

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4325 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 4384

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 4444

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4445 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 4504

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 4564

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 4624

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 4684

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4685 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 4744

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 4804

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 4864

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4865 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 4924

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 4984

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5044

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5104

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5164

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5224

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5284

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5285 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 5344

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5404

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5464

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5524

  5600738 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGG 5600797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5525 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGG 5584

  5600798 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5600857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5585 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5644

  5600858 GGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCT 5600917
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5645 GGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCT 5704

  5600918 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5600977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5764

  5600978 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5601037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5824

  5601038 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5601097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5884

  5601098 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5601157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5944

  5601158 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5601217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 6004

  5601218 TGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5601277
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 TGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 6064

  5601278 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5601337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 6124

  5601338 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5601397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 6184

  5601398 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5601457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6185 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 6244

  5601458 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5601517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 6304

  5601518 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5601577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6305 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 6364

  5601578 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5601637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6365 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 6424

  5601638 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5601697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6425 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 6484

  5601698 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 5601757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6485 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 6544

  5601758 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 5601817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6545 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 6604

  5601818 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 5601877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6605 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 6664

  5601878 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGC 5601937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6665 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGCCACATTAGAAATGTGC 6724

  5601938 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 5601997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6725 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 6784

  5601998 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 5602057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6785 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 6844

  5602058 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 5602117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6845 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 6904

  5602118 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 5602177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6905 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 6964

  5602178 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 5602237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6965 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 7024

  5602238 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 5602297
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7025 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCGGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 7084

  5602298 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 5602357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7085 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 7144

  5602358 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5602417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7145 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 7204

  5602418 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5602477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7205 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 7264

  5602478 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5602537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7265 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 7324

  5602538 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5602597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7325 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 7384

  5602598 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5602657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7385 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 7444

  5602658 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5602717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7445 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 7504

  5602718 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5602777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7505 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 7564

  5602778 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 5602837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7565 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 7624

  5602838 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGC 5602897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7625 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGATGC 7684

  5602898 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 5602957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7685 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 7744

  5602958 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 5603017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7745 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 7804

  5603018 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 5603077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7805 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 7864

  5603078 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 5603137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7865 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 7924

  5603138 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 5603197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7925 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 7984

  5603198 GGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCTT 5603257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7985 GGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCTT 8044

  5603258 CCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGC 5603317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8045 CCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGC 8104

  5603318 CCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTG 5603377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8105 CCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTG 8164

  5603378 TCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGC 5603437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8165 TCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGC 8224

  5603438 GAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAAC 5603497
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8225 GAGGCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAAC 8284

  5603498 TCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCT 5603557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8285 TCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCT 8344

  5603558 GCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATA 5603617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8345 GCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATA 8404

  5603618 GCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTC 5603677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8405 GCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTC 8464

  5603678 ATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGAT 5603737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8465 ATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGAT 8524

  5603738 TTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCT 5603797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8525 TTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCT 8584

  5603798 GTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGTG 5603857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8585 GTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGTG 8644

  5603858 GCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCAATGAAATAAATAGA 5603917
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     8645 GCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTCGTCAGATTTAAAAGCAATGAAATAAATAGA 8704

  5603918 ATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAACTTGAAAGCA 5603977
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8705 ATTGCATTTTTCACTTGGTGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAACTTGAAAGCA 8764

  5603978 CCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTCATTTAAACTC 5604037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8765 CCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTCATTTAAACTC 8824

  5604038 AGGG--ACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAA 5604095
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8825 AGGGACACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAA 8884

  5604096 CCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCTGAACCTTTTCCC 5604155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8885 CCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCTCTGAACCTTTTCCC 8944

  5604156 TACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACACAGGTTTCCATGG 5604215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8945 TACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAACACAGGTTTCCATGG 9004

  5604216 AAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGATGTGCCTTTCACAT 5604275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9005 AAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGATGTGCCTTTCACAT 9064

  5604276 GGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGCCCAGCAGGTCATGG 5604335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9065 GGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGCCCAGCAGGTCATGG 9124

  5604336 CAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCTGCACTTTTCCACAT 5604395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9125 CAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCTGCACTTTTCCACAT 9184

  5604396 GCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGAATGGTCTTGGAGCT 5604455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9185 GCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGAATGGTCTTGGAGCT 9244

  5604456 TCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGTGGTACTGCCTACCT 5604515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9245 TCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGTGGTACTGCCTACCT 9304

  5604516 CTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTTAGGGAGGTGGCCAG 5604575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9305 CTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTTAGGGAGGTGGCCAG 9364

  5604576 GCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGACCCAGAGAGATGGG 5604635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9365 GCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGACCCAGAGAGATGGG 9424

  5604636 GGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGGCCCAGAGAGACTCA 5604695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9425 GGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGGCCCAGAGAGACTCA 9484

  5604696 ATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCGGTACTCACTCAGGT 5604755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9485 ATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCGGTACTCACTCAGGT 9544

  5604756 GCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTCTGAACCATGTCCTT 5604815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9545 GCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTCTGAACCATGTCCTT 9604

  5604816 GGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGGCAGAATGACAAATG 5604875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9605 GGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGGCAGAATGACAAATG 9664

  5604876 GGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCCAACAGAGCCATTTA 5604935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9665 GGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCCAACAGAGCCATTTA 9724

  5604936 TCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGAGAACAGGGGGGTGT 5604995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     9725 TCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGAGAACAGGGGGCTGT 9784

  5604996 AAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAGGGCTGACCAGCA 5605055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9785 AAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAGGGCTGACCAGCA 9844

  5605056 CTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAACATCCTTTTAAT 5605115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9845 CTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAACATCCTTTTAAT 9904

  5605116 ATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAATCGAAGTCTTGC 5605175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9905 ATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAATCGAAGTCTTGC 9964

  5605176 AATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCATAGTATACAGGA 5605235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9965 AATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCATAGTATACAGGA 10024

  5605236 TGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTTTTAGGGAGCATT 5605295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10025 TGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTTTTAGGGAGCATT 10084

  5605296 TGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGGAATTCCATTTCT 5605355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10085 TGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGGAATTCCATTTCT 10144

  5605356 AGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTGTTACAGCATTAA 5605415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10145 AGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTGTTACAGCATTAA 10204

  5605416 ATTAGATCTAATCTTAATATCCCACCATTAAGACAATGGTAGAGTGTAGTATATCCATTT 5605475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10205 ATTAGATCTAATCTTAATATCCCACCATTAAGACAATGGTAGAGTGTAGTATATCCATTT 10264

  5605476 GGTAAAT 5605482
          |||||||
    10265 GGTAAAT 10271

Alignment time is 8.02709 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2163] =>      2163 nucs 'mol-32-33ab-121741_2163'

Score:        2163
Aligned:      2163        nucs
Identic:      2163 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5593821,5595983]
 second seq =>  [      1,   2163]

  5593821 TTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGG 5593880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGG 60

  5593881 AAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCC 5593940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCC 120

  5593941 TCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGG 5594000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGG 180

  5594001 TTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTA 5594060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTA 240

  5594061 CCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTG 5594120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTG 300

  5594121 GATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCT 5594180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCT 360

  5594181 TAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACA 5594240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACA 420

  5594241 CCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTG 5594300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTG 480

  5594301 TGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAA 5594360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAA 540

  5594361 CAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAAT 5594420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAAT 600

  5594421 AGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTT 5594480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTT 660

  5594481 GGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGA 5594540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGA 720

  5594541 AAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACA 5594600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACA 780

  5594601 AGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAG 5594660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAG 840

  5594661 CCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAA 5594720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAA 900

  5594721 ACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATG 5594780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATG 960

  5594781 GGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCAT 5594840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCAT 1020

  5594841 TCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAA 5594900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAA 1080

  5594901 TTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAA 5594960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAA 1140

  5594961 CAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGG 5595020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGG 1200

  5595021 TCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACC 5595080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACC 1260

  5595081 TGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCA 5595140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCA 1320

  5595141 TAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCA 5595200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCA 1380

  5595201 ATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTC 5595260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTC 1440

  5595261 TTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTT 5595320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTT 1500

  5595321 GCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGAC 5595380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGAC 1560

  5595381 ATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGG 5595440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGG 1620

  5595441 AACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACT 5595500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACT 1680

  5595501 TACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGAT 5595560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGAT 1740

  5595561 GGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCA 5595620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCA 1800

  5595621 AGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTG 5595680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTG 1860

  5595681 CACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAA 5595740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAA 1920

  5595741 TAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGA 5595800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGA 1980

  5595801 CACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGA 5595860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGA 2040

  5595861 GTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTA 5595920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTA 2100

  5595921 ATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCA 5595980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCA 2160

  5595981 GCC 5595983
          |||
     2161 GCC 2163

Alignment time is 1.50141 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   9088] =>      9088 nucs 'mol-32-33ab-252215_9088'

Score:        8126
Aligned:      8667        nucs
Identic:      8617 ( 99%) nucs =>      2029 (100%)      6588 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5592661,5594699] EXCISED REGION [5597499,5604123]
 second seq =>  [      1,   2039] EXCISED REGION [   2461,   9088]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2799 nucs [5594700,5597498]
 second seq =>       421 nucs [2040,2460]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2040,2041] to [2459,2460]

  5592661 TAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAG 5592720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAATGTCTCTCTTTGTCCTTATGGATCTTAGAACATGGGGGTGCAGTGCAGGTAAAGAG 60

  5592721 GATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCA 5592780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAGGGGGTGGCTGACTGGCA 120

  5592781 GTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATG 5592840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGGCTGAGATTCACAGGATG 180

  5592841 ACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGAC 5592900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGAC 240

  5592901 ATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAG 5592960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACAGGATTGAGACACTGCAG 300

  5592961 GGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGT 5593020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGT 360

  5593021 GAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAG 5593080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAG 420

  5593081 TCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTG 5593140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTG 480

  5593141 CCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCAT 5593200
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATTTGTTTCCATCCCTATAAATTAGGTTTCAT 540

  5593201 GTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTA 5593260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATATTTACTGAGTGGCTGCTA 600

  5593261 TAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTC 5593320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATATGGGGAAGATCAAGTCTC 660

  5593321 TGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATC 5593380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAGTGCAATGAAGAAAAATC 720

  5593381 AAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGG 5593440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGG 780

  5593441 TCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGT 5593500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGT 840

  5593501 GTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGG 5593560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTAGATGTACTAAGTACAGG 900

  5593561 AAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCA 5593620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTTGAACACCATGAGAGCCA 960

  5593621 AGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGC 5593680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGC 1020

  5593681 TTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCA 5593740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCGTGGCCTGCACAGCCACAATCCTAACCA 1080

  5593741 CTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCG 5593800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCTGGATAAGCTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCG 1140

  5593801 TGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACA 5593860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTGAAATGTTGTCACCGACA 1200

  5593861 TTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAA 5593920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATGCTATCCACTTCTGCCAA 1260

  5593921 TATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAG 5593980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAG 1320

  5593981 GTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCT 5594040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCT 1380

  5594041 GGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCA 5594100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCA 1440

  5594101 CCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGT 5594160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGT 1500

  5594161 TGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGAT 5594220
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||
     1501 TGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCCCGCAAAGTGCTGGGAT 1560

  5594221 TACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCT 5594280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCT 1620

  5594281 GTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGG 5594340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1621 GTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAAGTTGCTTAGG 1680

  5594341 GCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCAC 5594400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCAC 1740

  5594401 ATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAA 5594460
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
     1741 ATACGGAAAATACGAAAAGTAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACTTACCATTTAA 1800

  5594461 ATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTG 5594520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTG 1860

  5594521 TTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTA 5594580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTA 1920

  5594581 TATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGC 5594640
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATAGTGTCATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGC 1980

  5594641 CTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGAC 5594699
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGAC 2039

EXCISED REGION

  5597499 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 5597558
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGTCTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGT 2520

  5597559 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 5597618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCG 2580

  5597619 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 5597678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACT 2640

  5597679 CAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 5597738
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGGCCAAGAGAGCAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGG 2700

  5597739 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 5597798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGA 2760

  5597799 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 5597858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAG 2820

  5597859 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 5597918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAG 2880

  5597919 CAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 5597978
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAGGGGAGGAGGAGGGCCTGGAGCCCACCGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATAC 2940

  5597979 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCC 5598038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2941 TGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTCACCATCAGCCTTTTCCC 3000

  5598039 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 5598098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCC 3060

  5598099 GCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 5598158
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGC 3120

  5598159 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 5598218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGC 3180

  5598219 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 5598278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGG 3240

  5598279 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 5598338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTC 3300

  5598339 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 5598398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAG 3360

  5598399 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 5598458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGA 3420

  5598459 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 5598518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGC 3480

  5598519 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAA 5598578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3481 ACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTCGGCCCAATAA 3540

  5598579 AAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 5598638
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAACAGGAGAAGCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACA 3600

  5598639 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 5598698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATC 3660

  5598699 AACTCCATTT-ATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 5598757
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AACTCCATTTAATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAG 3720

  5598758 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 5598817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGT 3780

  5598818 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 5598877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATG 3840

  5598878 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 5598937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCC 3900

  5598938 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 5598997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGG 3960

  5598998 GAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGA 5599057
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3961 GAGAGACCAGGTGGAGGTGATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCCGTTCTCACGA 4020

  5599058 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCAT 5599117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4021 TAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTCGGCAT 4080

  5599118 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 5599177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAA 4140

  5599178 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 5599237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGAC 4200

  5599238 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 5599297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGT 4260

  5599298 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 5599357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATACACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCC 4320

  5599358 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTC 5599417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4321 AGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGGTGTC 4380

  5599418 TGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 5599477
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGTTTGCCGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTG 4440

  5599478 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 5599537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCC 4500

  5599538 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 5599597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4501 CCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACACCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGA 4560

  5599598 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 5599657
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGAAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGC 4620

  5599658 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 5599717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4621 CTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGACGACTGTGTGTGACCAGGAAGTG 4680

  5599718 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 5599777
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATACTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAAT 4740

  5599778 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 5599837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTG 4800

  5599838 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 5599897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCT 4860

  5599898 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 5599957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4861 CTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGTCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACC 4920

  5599958 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 5600017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGC 4980

  5600018 CCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5600077
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CCTGGAGTCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTG 5040

  5600078 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5600137
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5041 AATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCACGGGCTTTCTTCATTTTCCAT 5100

  5600138 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5600197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCA 5160

  5600198 CCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5600257
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCACGATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCA 5220

  5600258 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5600317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTT 5280

  5600318 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5600377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACA 5340

  5600378 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5600437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGC 5400

  5600438 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5600497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCC 5460

  5600498 CATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTC 5600557
          |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5461 CATTCTAGCATGAAAACACTCAAAAAGAATCTCATAGCTAGAAAATACTTCCTGGTTTTC 5520

  5600558 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5600617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGC 5580

  5600618 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5600677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCC 5640

  5600678 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5600737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTT 5700

  5600738 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGG 5600797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5701 GGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAGTGG 5760

  5600798 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5600857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5761 GCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATCCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTG 5820

  5600858 GGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCT 5600917
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5821 GGTTGAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGGGCT 5880

  5600918 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5600977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGT 5940

  5600978 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 5601037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAG 6000

  5601038 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 5601097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAAT 6060

  5601098 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 5601157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCT 6120

  5601158 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTG 5601217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6121 CCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGCG 6180

  5601218 TGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 5601277
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TGAAGCTCCAGCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCT 6240

  5601278 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 5601337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGA 6300

  5601338 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 5601397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAG 6360

  5601398 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 5601457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACG 6420

  5601458 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 5601517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGA 6480

  5601518 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 5601577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGC 6540

  5601578 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 5601637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAA 6600

  5601638 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 5601697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 ATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACT 6660

  5601698 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 5601757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTG 6720

  5601758 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 5601817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 CTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAG 6780

  5601818 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 5601877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 AAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCC 6840

  5601878 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGC 5601937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6841 TTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGCCACATTAGAAATGTGC 6900

  5601938 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 5601997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGG 6960

  5601998 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 5602057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCG 7020

  5602058 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 5602117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAACTGGCTCATCTGATCT 7080

  5602118 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 5602177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTCCAACTCCCTATGATTT 7140

  5602178 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 5602237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCT 7200

  5602238 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 5602297
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCGGAAGACTGATTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTC 7260

  5602298 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 5602357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGAT 7320

  5602358 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 5602417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 GAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTA 7380

  5602418 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 5602477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 TCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTG 7440

  5602478 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 5602537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 TATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCC 7500

  5602538 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 5602597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 AGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAA 7560

  5602598 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 5602657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTA 7620

  5602658 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 5602717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 TATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTCATAATTTTTTCATATA 7680

  5602718 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 5602777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 ATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGCCTTACTCACTGCTATA 7740

  5602778 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 5602837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 CTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTA 7800

  5602838 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGC 5602897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7801 ATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTTAGGGGCCATGAGATGC 7860

  5602898 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 5602957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 ACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGT 7920

  5602958 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 5603017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 GAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGA 7980

  5603018 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 5603077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 GGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCT 8040

  5603078 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 5603137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 TCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGA 8100

  5603138 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 5603197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 TGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAA 8160

  5603198 GGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCTT 5603257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 GGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACACCAATAGGAACCCCTT 8220

  5603258 CCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGC 5603317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 CCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGC 8280

  5603318 CCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTG 5603377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 CCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTG 8340

  5603378 TCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGC 5603437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 TCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGC 8400

  5603438 GAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAAC 5603497
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 GAGGCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAAC 8460

  5603498 TCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCT 5603557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 TCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCT 8520

  5603558 GCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATA 5603617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 GCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATA 8580

  5603618 GCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTC 5603677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 GCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTC 8640

  5603678 ATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGAT 5603737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 ATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAGGCAGCATTGGGGTGAT 8700

  5603738 TTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCT 5603797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 TTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCT 8760

  5603798 GTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGTG 5603857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 GTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGTG 8820

  5603858 GCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAGCAATGAAATAAATAGA 5603917
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 GCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTCGTCAGATTTAAAAGCAATGAAATAAATAGA 8880

  5603918 ATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAACTTGAAAGCA 5603977
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 ATTGCATTTTTCACTTGGTGTCAAGACGGTGGAGACACACCCACGTACAACTTGAAAGCA 8940

  5603978 CCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTCATTTAAACTC 5604037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 CCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCCGCTTTCATTTAAACTC 9000

  5604038 AGGG--ACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAA 5604095
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 AGGGACACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAA 9060

  5604096 CCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTG 5604123
          ||||||||||||||||||||||||||||
     9061 CCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTG 9088

Alignment time is 7.06435 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,  10788] =>     10788 nucs 'mol-32-33b6-032006_10788'

Score:       10787
Aligned:     10787        nucs
Identic:     10787 (100%) nucs =>       216 (100%)     10571 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5594076,5594291] EXCISED REGION [5594293,5604863]
 second seq =>  [      1,    216] EXCISED REGION [    218,  10788]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5594292,5594292]
 second seq =>         1 nucs [217,217]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5594292,5594293] to [5594293,5594294]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5594076 TAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGA 5594135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGA 60

  5594136 TGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCA 5594195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCA 120

  5594196 CCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTG 5594255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTG 180

  5594256 CTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAG 5594291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAG 216

EXCISED REGION

  5594293 TTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATT 5594352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      218 TTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATT 277

  5594353 CTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATA 5594412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      278 CTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATA 337

  5594413 CGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTT 5594472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      338 CGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTT 397

  5594473 AGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGT 5594532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 AGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGT 457

  5594533 GAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATT 5594592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 GAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATT 517

  5594593 ATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAG 5594652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 ATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAG 577

  5594653 CACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAA 5594712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 CACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAA 637

  5594713 AAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAG 5594772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 AAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAG 697

  5594773 CTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACAC 5594832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 CTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACAC 757

  5594833 CATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAA 5594892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 CATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAA 817

  5594893 AAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCT 5594952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 AAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCT 877

  5594953 TTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTT 5595012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 TTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTT 937

  5595013 CTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGA 5595072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 CTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGA 997

  5595073 CTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAG 5595132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 CTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAG 1057

  5595133 AATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATAC 5595192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 AATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATAC 1117

  5595193 TATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGT 5595252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGT 1177

  5595253 TTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTT 5595312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTT 1237

  5595313 ACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGT 5595372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 ACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGT 1297

  5595373 AGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCC 5595432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 AGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCC 1357

  5595433 ACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGAT 5595492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 ACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGAT 1417

  5595493 CTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCT 5595552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 CTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCT 1477

  5595553 ATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTG 5595612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 ATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTG 1537

  5595613 AAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAG 5595672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 AAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAG 1597

  5595673 AGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATT 5595732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 AGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATT 1657

  5595733 ACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATA 5595792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 ACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATA 1717

  5595793 AAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCC 5595852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 AAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCC 1777

  5595853 AGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCA 5595912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 AGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCA 1837

  5595913 CACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTT 5595972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTT 1897

  5595973 CAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCG 5596032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCG 1957

  5596033 GGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCT 5596092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCT 2017

  5596093 TGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAG 5596152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAG 2077

  5596153 TCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGA 5596212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGA 2137

  5596213 GGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCT 5596272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCT 2197

  5596273 CGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATA 5596332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 CGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATA 2257

  5596333 ATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGA 5596392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 ATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGA 2317

  5596393 ACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTA 5596452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 ACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTA 2377

  5596453 CAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTA 5596512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 CAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTA 2437

  5596513 GGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGAC 5596572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 GGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGAC 2497

  5596573 CAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTT 5596632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 CAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTT 2557

  5596633 CTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTT 5596692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 CTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTT 2617

  5596693 CTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCA 5596752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 CTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCA 2677

  5596753 AAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTAT 5596812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 AAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTAT 2737

  5596813 TTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAG 5596872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 TTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAG 2797

  5596873 TCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGG 5596932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGG 2857

  5596933 GAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTT 5596992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 GAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTT 2917

  5596993 CAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGA 5597052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 CAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGA 2977

  5597053 GCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAA 5597112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 GCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAA 3037

  5597113 CTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTT 5597172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 CTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTT 3097

  5597173 GACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCC 5597232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 GACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCC 3157

  5597233 CTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCT 5597292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 CTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCT 3217

  5597293 CCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTG 5597352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 CCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTG 3277

  5597353 GGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGA 5597412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 GGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGA 3337

  5597413 TGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGA 5597472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 TGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGA 3397

  5597473 GCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGG 5597532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 GCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGG 3457

  5597533 AGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACT 5597592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 AGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACT 3517

  5597593 TCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCC 5597652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 TCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCC 3577

  5597653 TGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATG 5597712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 TGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATG 3637

  5597713 AAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAG 5597772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 AAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAG 3697

  5597773 CAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGC 5597832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 CAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGC 3757

  5597833 CAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGA 5597892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 CAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGA 3817

  5597893 AGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAG 5597952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 AGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAG 3877

  5597953 AGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGA 5598012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 AGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGA 3937

  5598013 CAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGT 5598072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 CAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGT 3997

  5598073 GGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTA 5598132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 GGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTA 4057

  5598133 TATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACT 5598192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 TATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACT 4117

  5598193 AGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATA 5598252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 AGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATA 4177

  5598253 CCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTT 5598312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 CCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTT 4237

  5598313 TTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAAT 5598372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 TTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAAT 4297

  5598373 GATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTT 5598432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 GATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTT 4357

  5598433 GGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTG 5598492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 GGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTG 4417

  5598493 CATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCT 5598552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 CATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCT 4477

  5598553 AGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTC 5598612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 AGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTC 4537

  5598613 CCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACT 5598672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 CCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACT 4597

  5598673 GCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTG 5598732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 GCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTG 4657

  5598733 TTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTT 5598792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4658 TTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTT 4717

  5598793 TCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACA 5598852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 TCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACA 4777

  5598853 GGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCT 5598912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4778 GGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCT 4837

  5598913 ATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAA 5598972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4838 ATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAA 4897

  5598973 TTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGT 5599032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4898 TTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGT 4957

  5599033 GGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAG 5599092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4958 GGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAG 5017

  5599093 GGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTT 5599152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5018 GGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTT 5077

  5599153 GCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTG 5599212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5078 GCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTG 5137

  5599213 TAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTT 5599272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5138 TAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTT 5197

  5599273 TATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCC 5599332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5198 TATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCC 5257

  5599333 TCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCA 5599392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5258 TCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCA 5317

  5599393 CCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTG 5599452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5318 CCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTG 5377

  5599453 TAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTT 5599512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5378 TAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTT 5437

  5599513 TAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACG 5599572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5438 TAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACG 5497

  5599573 CCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGG 5599632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5498 CCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGG 5557

  5599633 CTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAA 5599692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5558 CTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAA 5617

  5599693 GATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTG 5599752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5618 GATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTG 5677

  5599753 GTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGA 5599812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5678 GTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGA 5737

  5599813 ATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGT 5599872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5738 ATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGT 5797

  5599873 CACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGC 5599932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5798 CACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGC 5857

  5599933 CCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATA 5599992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5858 CCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATA 5917

  5599993 TTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACA 5600052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5918 TTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACA 5977

  5600053 GTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTA 5600112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5978 GTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTA 6037

  5600113 AGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCA 5600172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6038 AGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCA 6097

  5600173 AACTTCACCAGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGT 5600232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6098 AACTTCACCAGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGT 6157

  5600233 GAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTC 5600292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6158 GAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTC 6217

  5600293 TTCTCACCGTGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAG 5600352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 TTCTCACCGTGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAG 6277

  5600353 ACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAA 5600412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 ACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAA 6337

  5600413 AAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAG 5600472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 AAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAG 6397

  5600473 GATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCAT 5600532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 GATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCAT 6457

  5600533 AGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCT 5600592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 AGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCT 6517

  5600593 TTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGA 5600652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6518 TTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGA 6577

  5600653 AACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCA 5600712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 AACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCA 6637

  5600713 AATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTG 5600772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6638 AATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTG 6697

  5600773 ATTTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATT 5600832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6698 ATTTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATT 6757

  5600833 CCCGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGC 5600892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6758 CCCGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGC 6817

  5600893 CTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGG 5600952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6818 CTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGG 6877

  5600953 GACGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAA 5601012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6878 GACGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAA 6937

  5601013 GGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTA 5601072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6938 GGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTA 6997

  5601073 TTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAA 5601132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6998 TTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAA 7057

  5601133 GGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGA 5601192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7058 GGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGA 7117

  5601193 GGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGT 5601252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7118 GGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGT 7177

  5601253 GTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCC 5601312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7178 GTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCC 7237

  5601313 TGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTG 5601372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7238 TGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTG 7297

  5601373 TCCTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTC 5601432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7298 TCCTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTC 7357

  5601433 ACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATC 5601492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7358 ACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATC 7417

  5601493 CTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTT 5601552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7418 CTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTT 7477

  5601553 ATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTT 5601612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7478 ATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTT 7537

  5601613 CATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCG 5601672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7538 CATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCG 7597

  5601673 GCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAA 5601732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7598 GCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAA 7657

  5601733 ATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 5601792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7658 ATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGG 7717

  5601793 GCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTA 5601852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7718 GCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTA 7777

  5601853 ACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACT 5601912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7778 ACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACT 7837

  5601913 AACAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTAT 5601972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7838 AACAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTAT 7897

  5601973 GGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAA 5602032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7898 GGTTTTGGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAA 7957

  5602033 GATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAG 5602092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7958 GATCAGTGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAG 8017

  5602093 ATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGA 5602152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8018 ATCAATAAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGA 8077

  5602153 AGACAGCTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCC 5602212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8078 AGACAGCTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCC 8137

  5602213 TTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGA 5602272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8138 TTCTCCCCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGA 8197

  5602273 TTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTC 5602332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8198 TTTGAGTAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTC 8257

  5602333 TCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAAC 5602392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8258 TCTATTGCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAAC 8317

  5602393 CCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCC 5602452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8318 CCCTTGGGTGGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCC 8377

  5602453 ATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCC 5602512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8378 ATCTGTCATCCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCC 8437

  5602513 TTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCT 5602572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8438 TTTGCACATGCAGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCT 8497

  5602573 GCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTC 5602632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8498 GCCAACCCTTCAATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTC 8557

  5602633 TAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTT 5602692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8558 TAAGTGAGGCCAGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTT 8617

  5602693 ACCACAGTCATAATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAAC 5602752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8618 ACCACAGTCATAATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAAC 8677

  5602753 AACCCTTGCCTTACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAG 5602812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8678 AACCCTTGCCTTACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAG 8737

  5602813 GCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGG 5602872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8738 GCAGCAGGAAACATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGG 8797

  5602873 GCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACA 5602932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8798 GCTGCCTTTAGGGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACA 8857

  5602933 TGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTC 5602992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8858 TGGTGAGCTGAAGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTC 8917

  5602993 ATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGA 5603052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8918 ATTGCCACTAACCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGA 8977

  5603053 TGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGA 5603112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8978 TGGGGGCTGAGATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGA 9037

  5603113 AGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGG 5603172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9038 AGGGGGTGGACACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGG 9097

  5603173 GGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCT 5603232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9098 GGGGGCCCTGGAGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCT 9157

  5603233 GAGTCTACACCAATAGGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGC 5603292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9158 GAGTCTACACCAATAGGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGC 9217

  5603293 ACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAA 5603352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9218 ACTCACAAAGCCTCAGAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAA 9277

  5603353 GGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGT 5603412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9278 GGCAAGGCAAGAGACTGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGT 9337

  5603413 CCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAG 5603472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9338 CCTGGGTGCATCTTCTTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAG 9397

  5603473 GGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCAC 5603532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9398 GGTCACAGCTTGGGCACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCAC 9457

  5603533 CAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAA 5603592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9458 CAACGTCCAGCTACTGGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAA 9517

  5603593 ACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGC 5603652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9518 ACGTCTACAGAGCAGCTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGC 9577

  5603653 ATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTG 5603712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9578 ATCTTCTGCAGTGTGAGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTG 9637

  5603713 GAATCACAGGCAGCATTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGA 5603772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9638 GAATCACAGGCAGCATTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGA 9697

  5603773 GCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCA 5603832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9698 GCGCCCGGTTATTTTTGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCA 9757

  5603833 TTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAG 5603892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9758 TTGGCACCCGAGGCTCTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAG 9817

  5603893 ATTTAAAAGCAATGAAATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGA 5603952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9818 ATTTAAAAGCAATGAAATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGA 9877

  5603953 CACACCCACGTACAACTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGAT 5604012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9878 CACACCCACGTACAACTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGAT 9937

  5604013 CAATCAGCCGCTTTCATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCT 5604072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9938 CAATCAGCCGCTTTCATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCT 9997

  5604073 TTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCC 5604132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9998 TTTCTCCTTCCTGGAGTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCC 10057

  5604133 TCCCATCCTCTGAACCTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACA 5604192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10058 TCCCATCCTCTGAACCTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACA 10117

  5604193 TCTGGCAACACAGGTTTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGC 5604252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10118 TCTGGCAACACAGGTTTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGC 10177

  5604253 TGATGGAGATGTGCCTTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGC 5604312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10178 TGATGGAGATGTGCCTTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGC 10237

  5604313 GCTCAGAGCCCAGCAGGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCC 5604372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10238 GCTCAGAGCCCAGCAGGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCC 10297

  5604373 TTTTTTGCTGCACTTTTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGG 5604432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10298 TTTTTTGCTGCACTTTTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGG 10357

  5604433 ACATAGAGAATGGTCTTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCA 5604492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10358 ACATAGAGAATGGTCTTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCA 10417

  5604493 ACTCCATGTGGTACTGCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATT 5604552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10418 ACTCCATGTGGTACTGCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATT 10477

  5604553 GATGACTTTAGGGAGGTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCT 5604612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10478 GATGACTTTAGGGAGGTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCT 10537

  5604613 CATCTGGGACCCAGAGAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAG 5604672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10538 CATCTGGGACCCAGAGAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAG 10597

  5604673 ACCCTCAGGCCCAGAGAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTG 5604732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10598 ACCCTCAGGCCCAGAGAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTG 10657

  5604733 GACCTCCCGGTACTCACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGT 5604792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10658 GACCTCCCGGTACTCACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGT 10717

  5604793 TGGCCCTTCTGAACCATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGA 5604852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10718 TGGCCCTTCTGAACCATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGA 10777

  5604853 GCTCTGTGGCA 5604863
          |||||||||||
    10778 GCTCTGTGGCA 10788

Alignment time is 8.29315 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   9329] =>      9329 nucs 'mol-32-33f8-086636_9329'

Score:        9328
Aligned:      9328        nucs
Identic:      9328 (100%) nucs =>      8530 (100%)       798 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5596462,5604991] EXCISED REGION [5604993,5605790]
 second seq =>  [      1,   8530] EXCISED REGION [   8532,   9329]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5604992,5604992]
 second seq =>         1 nucs [8531,8531]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [5604987,5604991] to [5604988,5604992]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5596462 GTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGT 5596521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGT 60

  5596522 GCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAAT 5596581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAAT 120

  5596582 TGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGA 5596641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGA 180

  5596642 TGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAG 5596701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAG 240

  5596702 TGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATA 5596761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATA 300

  5596762 TTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATGACC 5596821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATCCATTATCTTATTTGATGACC 360

  5596822 CCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGGAGA 5596881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAGGGGAGTGAGAGTCGGGGAGA 420

  5596882 GAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAA 5596941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAA 480

  5596942 AAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAG 5597001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAG 540

  5597002 AGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTC 5597061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTC 600

  5597062 TTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTAT 5597121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTAT 660

  5597122 TTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAAT 5597181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAAT 720

  5597182 ATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTG 5597241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTG 780

  5597242 CCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGG 5597301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGG 840

  5597302 GCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGC 5597361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGC 900

  5597362 CAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAG 5597421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAG 960

  5597422 CCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGA 5597481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGA 1020

  5597482 GGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCC 5597541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCC 1080

  5597542 CATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTC 5597601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTC 1140

  5597602 CACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACT 5597661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACT 1200

  5597662 ATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCT 5597721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCT 1260

  5597722 CCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAA 5597781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAA 1320

  5597782 ATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTG 5597841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTG 1380

  5597842 GGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGA 5597901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGA 1440

  5597902 AGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGG 5597961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGG 1500

  5597962 CCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTT 5598021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTT 1560

  5598022 ACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCC 5598081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCC 1620

  5598082 GCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGG 5598141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGG 1680

  5598142 CAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATT 5598201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATT 1740

  5598202 AAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACA 5598261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACA 1800

  5598262 TCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATA 5598321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATA 1860

  5598322 AATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGC 5598381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGC 1920

  5598382 TTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGA 5598441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGA 1980

  5598442 CATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATG 5598501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATG 2040

  5598502 CGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGT 5598561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGT 2100

  5598562 CAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACT 5598621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACT 2160

  5598622 CTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTA 5598681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTA 2220

  5598682 AGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCT 5598741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCT 2280

  5598742 CCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAAC 5598801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAAC 2340

  5598802 CAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATA 5598861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATA 2400

  5598862 AACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGA 5598921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGA 2460

  5598922 TCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAA 5598981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAA 2520

  5598982 TCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCC 5599041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCC 2580

  5599042 TGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTC 5599101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTC 2640

  5599102 CCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCT 5599161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCT 2700

  5599162 TCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCC 5599221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCC 2760

  5599222 TGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTA 5599281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTA 2820

  5599282 CCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGG 5599341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGG 2880

  5599342 GAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGG 5599401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGG 2940

  5599402 TTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCA 5599461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCA 3000

  5599462 CCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTG 5599521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTG 3060

  5599522 GCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCT 5599581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCT 3120

  5599582 GGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAA 5599641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAA 3180

  5599642 GAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGT 5599701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGT 3240

  5599702 GTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTA 5599761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTA 3300

  5599762 GCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTG 5599821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTG 3360

  5599822 CCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTC 5599881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTC 3420

  5599882 TATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTC 5599941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTC 3480

  5599942 TCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTC 5600001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTC 3540

  5600002 AGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTC 5600061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTC 3600

  5600062 TATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGC 5600121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGC 3660

  5600122 TTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACC 5600181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACC 3720

  5600182 AGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGT 5600241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGT 3780

  5600242 GTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCG 5600301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCG 3840

  5600302 TGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCT 5600361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCT 3900

  5600362 AGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAAT 5600421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAAT 3960

  5600422 AGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCT 5600481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCT 4020

  5600482 GAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAA 5600541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAA 4080

  5600542 ATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACA 5600601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACA 4140

  5600602 GCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAG 5600661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAG 4200

  5600662 AAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCT 5600721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCT 4260

  5600722 CTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCA 5600781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCA 4320

  5600782 AAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTG 5600841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTG 4380

  5600842 ATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGAT 5600901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGAT 4440

  5600902 GGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTC 5600961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTC 4500

  5600962 CATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTA 5601021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTA 4560

  5601022 ATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGG 5601081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGG 4620

  5601082 GCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAG 5601141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAG 4680

  5601142 ATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATT 5601201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATT 4740

  5601202 GCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACC 5601261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACC 4800

  5601262 CTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCAC 5601321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCAC 4860

  5601322 TACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAA 5601381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAA 4920

  5601382 ATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTA 5601441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTA 4980

  5601442 GCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCC 5601501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCC 5040

  5601502 CTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTA 5601561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTA 5100

  5601562 GGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCT 5601621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCT 5160

  5601622 TAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGAC 5601681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGAC 5220

  5601682 TTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTT 5601741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTT 5280

  5601742 AACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCT 5601801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCT 5340

  5601802 GAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTT 5601861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTT 5400

  5601862 CCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGT 5601921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGT 5460

  5601922 CACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGA 5601981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTTGGA 5520

  5601982 GTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGC 5602041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAGTGC 5580

  5602042 TTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAA 5602101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAATAAA 5640

  5602102 CTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTC 5602161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAGCTC 5700

  5602162 CAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCG 5602221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCCCCG 5760

  5602222 CCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAA 5602281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAGTAA 5820

  5602282 TAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCA 5602341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATTGCA 5880

  5602342 ATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGT 5602401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTGGGT 5940

  5602402 GGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCAT 5602461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGTCAT 6000

  5602462 CCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACAT 5602521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCACAT 6060

  5602522 GCAGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCT 5602581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GCAGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAACCCT 6120

  5602582 TCAATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGG 5602641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TCAATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTGAGG 6180

  5602642 CCAGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTC 5602701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 CCAGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACAGTC 6240

  5602702 ATAATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGC 5602761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ATAATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCTTGC 6300

  5602762 CTTACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGA 5602821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CTTACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCAGGA 6360

  5602822 AACATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTT 5602881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 AACATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCCTTT 6420

  5602882 AGGGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCT 5602941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AGGGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGAGCT 6480

  5602942 GAAGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACT 5603001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GAAGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCCACT 6540

  5603002 AACCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTG 5603061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 AACCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGGCTG 6600

  5603062 AGATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGG 5603121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AGATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGGTGG 6660

  5603122 ACACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCT 5603181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 ACACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGCCCT 6720

  5603182 GGAGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACA 5603241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 GGAGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCTACA 6780

  5603242 CCAATAGGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAA 5603301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 CCAATAGGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCACAAA 6840

  5603302 GCCTCAGAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCA 5603361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 GCCTCAGAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAGGCA 6900

  5603362 AGAGACTGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGC 5603421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AGAGACTGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGGTGC 6960

  5603422 ATCTTCTTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGC 5603481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 ATCTTCTTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCACAGC 7020

  5603482 TTGGGCACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCA 5603541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 TTGGGCACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGTCCA 7080

  5603542 GCTACTGGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACA 5603601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GCTACTGGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCTACA 7140

  5603602 GAGCAGCTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGC 5603661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GAGCAGCTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTCTGC 7200

  5603662 AGTGTGAGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAG 5603721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 AGTGTGAGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCACAG 7260

  5603722 GCAGCATTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGT 5603781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 GCAGCATTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCCGGT 7320

  5603782 TATTTTTGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCC 5603841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TATTTTTGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCACCC 7380

  5603842 GAGGCTCTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAG 5603901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 GAGGCTCTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAAAAG 7440

  5603902 CAATGAAATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCAC 5603961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 CAATGAAATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACCCAC 7500

  5603962 GTACAACTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCC 5604021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 GTACAACTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCAGCC 7560

  5604022 GCTTTCATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTT 5604081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GCTTTCATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTCCTT 7620

  5604082 CCTGGAGTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCT 5604141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 CCTGGAGTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCATCCT 7680

  5604142 CTGAACCTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAAC 5604201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 CTGAACCTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGCAAC 7740

  5604202 ACAGGTTTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGA 5604261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 ACAGGTTTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGGAGA 7800

  5604262 TGTGCCTTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGC 5604321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 TGTGCCTTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAGAGC 7860

  5604322 CCAGCAGGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCT 5604381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 CCAGCAGGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTTGCT 7920

  5604382 GCACTTTTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGA 5604441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 GCACTTTTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAGAGA 7980

  5604442 ATGGTCTTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGT 5604501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 ATGGTCTTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCATGT 8040

  5604502 GGTACTGCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTT 5604561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 GGTACTGCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGACTTT 8100

  5604562 AGGGAGGTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGA 5604621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 AGGGAGGTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTGGGA 8160

  5604622 CCCAGAGAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGG 5604681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 CCCAGAGAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTCAGG 8220

  5604682 CCCAGAGAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCG 5604741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 CCCAGAGAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTCCCG 8280

  5604742 GTACTCACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTC 5604801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 GTACTCACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCCTTC 8340

  5604802 TGAACCATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGG 5604861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 TGAACCATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTGTGG 8400

  5604862 CAGAATGACAAATGGGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCC 5604921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 CAGAATGACAAATGGGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCAGCC 8460

  5604922 AACAGAGCCATTTATCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGA 5604981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 AACAGAGCCATTTATCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAGAGA 8520

  5604982 GAACAGGGGG 5604991
          ||||||||||
     8521 GAACAGGGGG 8530

EXCISED REGION

  5604993 TGTAAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAGGGCTGACCA 5605052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8532 TGTAAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCATCCAGGGCTGACCA 8591

  5605053 GCACTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAACATCCTTTT 5605112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8592 GCACTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTGAAGAACATCCTTTT 8651

  5605113 AATATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAATCGAAGTCT 5605172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8652 AATATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATTGCAAATCGAAGTCT 8711

  5605173 TGCAATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCATAGTATACA 5605232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8712 TGCAATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAACAGCATAGTATACA 8771

  5605233 GGATGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTTTTAGGGAGC 5605292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8772 GGATGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATAATTTTTTAGGGAGC 8831

  5605293 ATTTGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGGAATTCCATT 5605352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8832 ATTTGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTCTTAGGAATTCCATT 8891

  5605353 TCTAGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTGTTACAGCAT 5605412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8892 TCTAGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAGACAATAATGTTTGTTACAGCAT 8951

  5605413 TAAATTAGATCTAATCTTAATATCCCACCATTAAGACAATGGTAGAGTGTAGTATATCCA 5605472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8952 TAAATTAGATCTAATCTTAATATCCCACCATTAAGACAATGGTAGAGTGTAGTATATCCA 9011

  5605473 TTTGGTAAATTATTATGAATCATTCAAAAATGATGTAAAGAATTCTAATGAAATAAGAAA 5605532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9012 TTTGGTAAATTATTATGAATCATTCAAAAATGATGTAAAGAATTCTAATGAAATAAGAAA 9071

  5605533 ATGCTTATGATATAATGTCAAACAAAAAAGTAGGGTATACAACTGCATGTACATATGTTT 5605592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9072 ATGCTTATGATATAATGTCAAACAAAAAAGTAGGGTATACAACTGCATGTACATATGTTT 9131

  5605593 CAACCATTAAATCTATATGTTTATTTCTCTTTCTCCACATAATCTTAGAAAGAAGGGTAA 5605652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9132 CAACCATTAAATCTATATGTTTATTTCTCTTTCTCCACATAATCTTAGAAAGAAGGGTAA 9191

  5605653 GAAAAAAACCATGGGAAGTGTATATAGTGTTTTCCCTCTCAAAGGAGGTGATTTGGGTGA 5605712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9192 GAAAAAAACCATGGGAAGTGTATATAGTGTTTTCCCTCTCAAAGGAGGTGATTTGGGTGA 9251

  5605713 TTTTTAAACACCTTCCTCAATTTTTCATACTGTGAGTGTGTGTGTTTAGGATTGCACACA 5605772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9252 TTTTTAAACACCTTCCTCAATTTTTCATACTGTGAGTGTGTGTGTTTAGGATTGCACACA 9311

  5605773 CATAGCAGAGGTTTTATC 5605790
          ||||||||||||||||||
     9312 CATAGCAGAGGTTTTATC 9329

Alignment time is 7.1475 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   5058] =>      5058 nucs 'mol-32-3492-025573_5058'

Score:        5058
Aligned:      5058        nucs
Identic:      5058 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5596913,5601970]
 second seq =>  [      1,   5058]

  5596913 GAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTT 5596972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGAAAGGAGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTT 60

  5596973 ATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAG 5597032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAG 120

  5597033 TCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTAC 5597092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTAC 180

  5597093 AGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTA 5597152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTA 240

  5597153 ATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCT 5597212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCT 300

  5597213 TCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGC 5597272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGC 360

  5597273 CCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTG 5597332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTG 420

  5597333 AGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGA 5597392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGA 480

  5597393 CTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGA 5597452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGA 540

  5597453 AGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCG 5597512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCG 600

  5597513 GTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTG 5597572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTG 660

  5597573 TCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCG 5597632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCG 720

  5597633 CTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGT 5597692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGT 780

  5597693 AACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCT 5597752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCT 840

  5597753 GCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTC 5597812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTC 900

  5597813 TGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCA 5597872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCA 960

  5597873 GGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAG 5597932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAG 1020

  5597933 GGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAG 5597992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAG 1080

  5597993 CTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGG 5598052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGG 1140

  5598053 CACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAA 5598112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAA 1200

  5598113 ATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAG 5598172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAG 1260

  5598173 GAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGC 5598232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGC 1320

  5598233 TTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCT 5598292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCT 1380

  5598293 TCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAAC 5598352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAAC 1440

  5598353 TCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGG 5598412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGG 1500

  5598413 AGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCC 5598472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCC 1560

  5598473 AAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTA 5598532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTA 1620

  5598533 ACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCA 5598592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCA 1680

  5598593 AACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCAT 5598652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCAT 1740

  5598653 GAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCT 5598712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCT 1800

  5598713 TCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAG 5598772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAG 1860

  5598773 AGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCA 5598832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCA 1920

  5598833 GGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGG 5598892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGG 1980

  5598893 CTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 5598952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 2040

  5598953 TTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGA 5599012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGA 2100

  5599013 GGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAG 5599072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAG 2160

  5599073 AGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTG 5599132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTG 2220

  5599133 TCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGA 5599192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGA 2280

  5599193 GGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAG 5599252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAG 2340

  5599253 TCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTAT 5599312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTAT 2400

  5599313 AAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAG 5599372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAG 2460

  5599373 GGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGG 5599432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGG 2520

  5599433 TATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAG 5599492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAG 2580

  5599493 AGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGA 5599552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGA 2640

  5599553 AGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGG 5599612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAGATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGG 2700

  5599613 AGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACT 5599672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGGAGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACT 2760

  5599673 GGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGAT 5599732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGTGACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGAT 2820

  5599733 ACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTC 5599792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCATCCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTC 2880

  5599793 CTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATC 5599852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAATATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATC 2940

  5599853 CAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCT 5599912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATAGACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCT 3000

  5599913 GATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCAC 5599972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCCTTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCAC 3060

  5599973 CTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTG 5600032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCATGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTG 3120

  5600033 TCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTT 5600092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATCATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTT 3180

  5600093 TGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAG 5600152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTCTTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAG 3240

  5600153 GCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGC 5600212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGACAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGC 3300

  5600213 AGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGAT 5600272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTATTATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGAT 3360

  5600273 GATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAA 5600332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAGATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAA 3420

  5600333 AGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACA 5600392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTGAGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACA 3480

  5600393 GCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCT 5600452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTGAAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCT 3540

  5600453 GAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAA 5600512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGAGAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAA 3600

  5600513 ACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTT 5600572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATATTTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTT 3660

  5600573 ACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACAT 5600632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCTTGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACAT 3720

  5600633 GCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTA 5600692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAATGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTA 3780

  5600693 AGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATA 5600752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTCTATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATA 3840

  5600753 ACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGA 5600812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAACACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGA 3900

  5600813 GGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGG 5600872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGAATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGG 3960

  5600873 CCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCT 5600932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTTTGATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCT 4020

  5600933 GCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCT 5600992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGACTTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCT 4080

  5600993 TGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAAT 5601052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAGCTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAAT 4140

  5601053 AATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGA 5601112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AATTGAGAATATTTGATGTATTGGAGAGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGA 4200

  5601113 ACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTT 5601172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAGCAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTT 4260

  5601173 CTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTA 5601232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGGATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTA 4320

  5601233 ATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACT 5601292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAATACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACT 4380

  5601293 GACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCT 5601352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTCCACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCT 4440

  5601353 ACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGG 5601412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGTAAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGG 4500

  5601413 ATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTT 5601472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTGGTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTT 4560

  5601473 CCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAAC 5601532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGACCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAAC 4620

  5601533 TTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTG 5601592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGTGTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTG 4680

  5601593 AACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACC 5601652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AACACTTTTCAATTCCACTTCATTACCCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACC 4740

  5601653 CCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGA 5601712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTTGACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGA 4800

  5601713 TGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAG 5601772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTATCTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAG 4860

  5601773 CTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTA 5601832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAGGCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTA 4920

  5601833 CAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGAC 5601892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCCTTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGAC 4980

  5601893 TAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACAT 5601952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAGTGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACAT 5040

  5601953 AAGCAAAGATTAGAGATT 5601970
          ||||||||||||||||||
     5041 AAGCAAAGATTAGAGATT 5058

Alignment time is 3.43289 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3927] =>      3927 nucs 'mol-32-3492-025574_3927'

Score:        3926
Aligned:      3926        nucs
Identic:      3926 (100%) nucs =>      1922 (100%)      2004 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5592877,5594798] EXCISED REGION [5594800,5596803]
 second seq =>  [      1,   1922] EXCISED REGION [   1924,   3927]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5594799,5594799]
 second seq =>         1 nucs [1923,1923]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [1923,1927] to [1924,1928]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5592877 GAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGG 5592936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGGCTCCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGG 60

  5592937 TGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGAT 5592996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTCACAGGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGAT 120

  5592997 GAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAG 5593056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGTGTTCTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAG 180

  5593057 AGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGC 5593116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAGGCTAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGC 240

  5593117 ACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTT 5593176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTGGGTCACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTT 300

  5593177 CCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAG 5593236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATCCCTATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAG 360

  5593237 CAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTC 5593296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGATATTTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTC 420

  5593297 AGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACC 5593356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAATATGGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACC 480

  5593357 TCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGT 5593416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATAAGTGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGT 540

  5593417 GGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAAC 5593476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGGTTGGGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAAC 600

  5593477 AAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCC 5593536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATGACAAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCC 660

  5593537 CTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTC 5593596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCGGTAGATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTC 720

  5593597 CACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAA 5593656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACCCTTGAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAA 780

  5593657 AACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGG 5593716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACGGAGGCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGG 840

  5593717 CCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAG 5593776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTGCACAGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAG 900

  5593777 CTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGC 5593836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCAGTCCCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGC 960

  5593837 AAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAG 5593896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATGTGAAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAG 1020

  5593897 TGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTC 5593956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGCATGCTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTC 1080

  5593957 CTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTG 5594016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCCTCCTTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTG 1140

  5594017 TAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGT 5594076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGTCACTGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGT 1200

  5594077 AGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGAT 5594136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCTGGGATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGAT 1260

  5594137 GCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCAC 5594196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCAGTCTCACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCAC 1320

  5594197 CTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGC 5594256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCAGCCCCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGC 1380

  5594257 TGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGT 5594316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGATATCCTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGT 1440

  5594317 ATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGC 5594376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATGAAAACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGC 1500

  5594377 GTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAA 5594436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTTGCTCTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAA 1560

  5594437 ATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTT 5594496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTCTCACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTT 1620

  5594497 ACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGA 5594556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTCTTTTTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGA 1680

  5594557 GGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAG 5594616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTTTTGGAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAG 1740

  5594617 GCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGAT 5594676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCATGCACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGAT 1800

  5594677 CGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCAT 5594736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CGGCCTGGGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCAT 1860

  5594737 CGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGC 5594796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CGTGGTAGGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGC 1920

  5594797 TC 5594798
          ||
     1921 TC 1922

EXCISED REGION

  5594800 GGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAG 5594859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 GGGGGTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAG 1983

  5594860 CAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACC 5594919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 CAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACC 2043

  5594920 CATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTA 5594979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 CATTTTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTA 2103

  5594980 GAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTA 5595039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 GAGCTCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTA 2163

  5595040 CCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAG 5595099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CCTGTTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAG 2223

  5595100 CGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGT 5595159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CGTTTTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGT 2283

  5595160 CTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTAC 5595219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 CTTAAAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTAC 2343

  5595220 ATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATA 5595279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 ATTCCTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATA 2403

  5595280 TAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTT 5595339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 TAAATGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTT 2463

  5595340 AATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAG 5595399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 AATCCATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAG 2523

  5595400 GGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGC 5595459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 GGTGAAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGC 2583

  5595460 ACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAG 5595519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 ACAGTCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAG 2643

  5595520 AAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGC 5595579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 AAGGGGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGC 2703

  5595580 CACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGG 5595639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CACAGTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGG 2763

  5595640 GCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAAT 5595699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 GCTAGGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAAT 2823

  5595700 AATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTA 5595759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 AATATTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTA 2883

  5595760 TTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTT 5595819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TTAACCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTT 2943

  5595820 TTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAG 5595879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 TTTTTTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAG 3003

  5595880 TTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGG 5595939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 TTAAAATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGG 3063

  5595940 CTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA 5595999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 CTGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA 3123

  5596000 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCC 5596059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCC 3183

  5596060 AGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 5596119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 AGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 3243

  5596120 AGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAA 5596179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 AGCTGAGATCACTCCACTGCACCCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAA 3303

  5596180 AAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTG 5596239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 AAAAAAAAATTGTGATGAGATAGAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTG 3363

  5596240 GCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGC 5596299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 GCTGCCATAGTTAGTGTCCTAGCTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGC 3423

  5596300 CCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGG 5596359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 CCCATTCCCATCATCTGTTAAATGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGG 3483

  5596360 AGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACT 5596419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 AGTGGATGGTCTAATACGCACAAAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACT 3543

  5596420 TTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAG 5596479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 TTTGAGACGAACGCCAGCCGGAATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAG 3603

  5596480 ACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATT 5596539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 ACTTTGAGCCCCTGAGAACTCAGAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATT 3663

  5596540 CCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGAT 5596599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 CCAATGTGAAAGGACAGGGTGACCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGAT 3723

  5596600 TTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTC 5596659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 TTGGTTCTCACCTCCCAGCCTGGGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTC 3783

  5596660 ATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCC 5596719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 ATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGAGTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCC 3843

  5596720 AACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGA 5596779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 AACCATAGAAATCCCCAGAGGACTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGA 3903

  5596780 GTTGACAGAGTCCCTTTATATCCA 5596803
          ||||||||||||||||||||||||
     3904 GTTGACAGAGTCCCTTTATATCCA 3927

Alignment time is 3.06852 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   8445] =>      8445 nucs 'mol-32-34a8-078981_8445'

Score:        8433
Aligned:      8444        nucs
Identic:      8443 (100%) nucs =>      3952 (100%)      4491 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5596946,5600897] EXCISED REGION [5600899,5605390]
 second seq =>  [      1,   3952] EXCISED REGION [   3954,   8445]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [5600898,5600898]
 second seq =>         1 nucs [3953,3953]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [5600896,5600897] to [5600897,5600898]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5596946 AATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGAT 5597005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATTTTTCATTTTTTCAACAGTAGAGAT 60

  5597006 GGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGC 5597065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACTCCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGC 120

  5597066 CTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTG 5597125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCACACCCTGACAACTCTCTTATTTTG 180

  5597126 ATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCC 5597185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACCTGGGTCTTTTTGACTCAAATATCC 240

  5597186 ATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCA 5597245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGGAGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCA 300

  5597246 GCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCC 5597305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAAGGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCC 360

  5597306 TTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAG 5597365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGATCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAG 420

  5597366 GGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGG 5597425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAGGTGACCCATGATGGTAACAGCCGG 480

  5597426 CTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCA 5597485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGAATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCA 540

  5597486 GGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATC 5597545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACGCTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATC 600

  5597546 TGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACT 5597605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTCGAAGTTGAACTTCCACTCTCCACT 660

  5597606 CTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTC 5597665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTAGAAAAGGATCCTGGAGAACTATTC 720

  5597666 ATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAA 5597725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGAAATGATCAATGAAAAACCCTCCAA 780

  5597726 AAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGG 5597785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAATCATAACTTAAGCAGCCTGAAATGG 840

  5597786 TATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGG 5597845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTCAAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGG 900

  5597846 TTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGG 5597905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAGGTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGG 960

  5597906 AGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTG 5597965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAGCCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTG 1020

  5597966 TCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCA 5598025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCCTGGGGCAACGACAGGCTCTTACCA 1080

  5598026 TCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAA 5598085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAAGTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAA 1140

  5598086 AAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAA 5598145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAATGGTGATGCTATATTCACGGCAAA 1200

  5598146 GAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAA 5598205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATAAATCAGTTACTAGGAACATTAAAA 1260

  5598206 TGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAG 5598265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCTTCTTCCAAATACCTAACACATCAG 1320

  5598266 TCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATA 5598325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAGTCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATA 1380

  5598326 TATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTAC 5598385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTAAAACAAATAATGATACGTGCTTAC 1440

  5598386 TCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATC 5598445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTTTGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATC 1500

  5598446 CCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGAT 5598505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGTTTCTGTAGCTGCATCCCATGCGAT 1560

  5598506 CCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAG 5598565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCAACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAG 1620

  5598566 CTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTG 5598625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACTCCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTG 1680

  5598626 TATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCA 5598685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACCTTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCA 1740

  5598686 CATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCAT 5598745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAACCCTAGTACTGTTATGTTCTCCAT 1800

  5598746 ATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGT 5598805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAACTTTCCCACTTTCATACAACCAGT 1860

  5598806 GACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACT 5598865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTGACCCAGCAACAGGGCTCATAAACT 1920

  5598866 TTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAG 5598925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTACCATTTACCCTATGATATGATCAG 1980

  5598926 GCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCC 5598985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTACAATCCCCACAATTCCCATAATCCC 2040

  5598986 CATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTG 5599045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGGATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTG 2100

  5599046 CTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCC 5599105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGATGGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCC 2160

  5599106 TTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCAC 5599165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAAGAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCAC 2220

  5599166 CTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAG 5599225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCCAGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAG 2280

  5599226 GCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCG 5599285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAACCTCTTTCCTTTATCAATTACCCG 2340

  5599286 GTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGG 5599345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGACGAATATACCCTCGTTCTGGGAGG 2400

  5599346 ATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTAT 5599405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCTGCTGGGAGCCACCAATTTGGTTAT 2460

  5599406 TCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTT 5599465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTGGGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTT 2520

  5599466 AAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAG 5599525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCGCTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAG 2580

  5599526 CTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAG 5599585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGAGGCAGGCCCCTGTCACTCAGGGAAGGCAGCCCTGTGAAGGACGCCTGGGTCTGGAG 2640

  5599586 ATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGG 5599645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATCTGCAAGGGAGAGACTTTCTCCTGGAGAACTTTGGGGAAGCTTGGCTCAGTAAAGAGG 2700

  5599646 AGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGT 5599705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGGCAAGGTGGCCTGAACACAGACACTGGGCTGAGGTACATCTCTAAGATGACTGTGTGT 2760

  5599706 GACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCAT 5599765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GACCAGGAAGTGCTTCTGATCCTGGATACCTGGTGATATTCCAGCTGGTGAATGTAGCAT 2820

  5599766 CCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAA 5599825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCCAGCCTGAATTTCAGCATTTGGGTCCTCCTTGAGAGATTCTGAGAATCTCCTTGCCAA 2880

  5599826 TATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATA 5599885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATCTGTTTCTGGTCCTTGCAGACATCCAGACACTGCTGGACTTAGTCACTCACTCTATA 2940

  5599886 GACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCC 5599945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GACCAGCTGTCTCTTTCATGCCTTTCTGATATTGGTCCAAAGGGGGCCCCAATGTCTCCC 3000

  5599946 TTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCA 5600005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCTGGCCTACCCCCGCCCCCATGCACCTGCCCAGGCTTCTGGAATATTGAGGCTCAGCA 3060

  5600006 TGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATC 5600065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGAACCCAGTGCCCTGGAGCCCCCTTGTCTTGAGGGGGCAATGGACAGTCCTGCTCTATC 3120

  5600066 ATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTC 5600125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATCCTTAGTGTGAATTCCTGACCTCTTTGAGCTTAGTTGGAATTGTAAGCATGGGCTTTC 3180

  5600126 TTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGA 5600185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCATTTTCCATAGGTGTGGCCGTGAGGCTGCACTGGCACTAGGCCAAACTTCACCAGGA 3240

  5600186 CAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTAT 5600245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAATCATGTCCACCACAATGGGGCAGCAGGAATTCTGTGTGGCCAGTGAGGGAGGTGTAT 3300

  5600246 TATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAG 5600305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATAGAGGCCCATGGTGAAATCCAGATGATTTCACCTGTAGAGTCTCTTCTCACCGTGAG 3360

  5600306 ATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTG 5600365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTCCATAATTTAGAATGGAAATCTAAAGGGAGATTGTAGATGAAAGACTACAGCTAGTG 3420

  5600366 AGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTG 5600425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTTAGATGACAACCTCCAGCTCAACAGCTGAGTTGTGAGCAAGGAAAAAGAAAATAGTG 3480

  5600426 AAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGA 5600485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAGCCAGGGAGCCAATGTGGGTTCCCTGAGAAAAAGTCATACCCAAGGATTTCCCTGAGA 3540

  5600486 GAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATAT 5600545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAATTATTAGCCCATTCTAGCATGAAAACACTCTAAAACAATCTCATAGCTAGAAAATAT 3600

  5600546 TTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCT 5600605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTCCTGGTTTTCAAGGCATTTTCCTTTACTATTATTTTCCCCCCTCTTTCATAACAGCCT 3660

  5600606 TGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAA 5600665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGGGAAATAGGCAGGGAAGTATAACATGCCCATTTTACAGACAAGGAAACAGAAAGAAAA 3720

  5600666 TGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTC 5600725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGGGATTTACCCCGGAGCACGCAGCTAAGTTATGCAATGTAGACTCAAATTGATCTCTTC 3780

  5600726 TATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAAC 5600785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TATCTCTGCTTTGGGACCCTTTCTATAACTCTGCATGCTGTATTTTGATTTTTGCAAAAC 3840

  5600786 ACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGA 5600845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACTTGACAATGGGCATGATCTCCTTGAGGACCAGAGGGAGAAGCATTCCCGATGTGATGA 3900

  5600846 ATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTT 5600897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATAAGCATGGTGGGTTAAACATGGAGGCCCATTTGATGGCTATAAGCCTGTT 3952

EXCISED REGION

  5600899 GATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGAC 5600958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 GATGGCTGAATGAAGAGCTCTCTGGTGCACACCTGCCACAGCCCTTTTGTCCGGGACGAC 4013

  5600959 TTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAG 5601018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TTCCATGAGACACGGCAGTGTTTGTCAGACTTCTTGATGACACAGTGCTGGAAAGGACAG 4073

  5601019 CTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAG 5601078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 CTAATCCACTAGTTGGGAGAACTGAGTAGAAAATAATTGAGAATATTTGATGTATTGGAG 4133

  5601079 AGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAG 5601138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 AGGGCATAGGCTGTGGAATCAGACCAGCTGCAGAACCTTGGGCAAATTACTTAAGGAAAG 4193

  5601139 CAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGG 5601198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 CAGATGCTCATTTAATGCTCCTTCCCCTTCCTTTCTTCCTTCAGGCAAAGAAGAGGCAGG 4253

  5601199 ATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAAT 5601258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 ATTGCTGTCTCCCAATGTGTGAAGCTCCATCTTAATAAAGCAGGTGCTGCCTGTGTCAAT 4313

  5601259 ACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTC 5601318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 ACCCTGGTGGCTACCAGCTCAGCCCCTGGAAACTGACTGCCTTGGTTCCTTTCCTGGTTC 4373

  5601319 CACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGT 5601378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 CACTACATGCTAGTTGTGAGATCTTGGGCAAGCTACACCCTCTCTCAGCACCTGTCCTGT 4433

  5601379 AAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTG 5601438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 AAAATGGAGACAACGACAGCACCCATCTCACAGGATTATCGCTAGAAAGCACTCACAGTG 4493

  5601439 GTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGA 5601498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 GTAGCCAGCACCCAACACGTACTATGACAAATTTCCATTGTTGTCGTTATCATCCTGTGA 4553

  5601499 CCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGT 5601558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 CCCCTAAAGGTAAAATGGAGCTGAACGCTGTAACTTACAGAAAGTGGGGTTTTTATTTGT 4613

  5601559 GTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTAC 5601618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 GTAGGGGAGAACTTTTTGCCTCACTCCCCTGCTGAACACTTTTCAATTCCACTTCATTAC 4673

  5601619 CCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTT 5601678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 CCTTAGGAGAAAGGCAGAAATCTTTAACGTGACCCCCACGGTCCTGCTCATGCGGCCCTT 4733

  5601679 GACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTAT 5601738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 GACTTGTAACAGTGAAACTGCCTATGCAAAATGATGACTGAGACGGTGAAAGAAATCTAT 4793

  5601739 CTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAG 5601798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 CTTAACTGACTCTGTTTTGCTTCTAACCTCCAAGCTGTCCTTGTTCATTCCTGGGCGTAG 4853

  5601799 GCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCC 5601858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 GCTGAACTAACTTTGGGAGAAACTTTATAGTTTACAGTTTAAACAAAGACAGTAACAGCC 4913

  5601859 TTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAG 5601918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 TTTCCCAAAACAGATCTCCTTCTGGTCTGGGGACTAGACTGTCTTTGTAGGACTAACAAG 4973

  5601919 TGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTT 5601978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 TGTCACATTAGAAATGTGCCAAGATTAGAAACATAAGCAAAGATTAGAGATTATGGTTTT 5033

  5601979 GGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAG 5602038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 GGAGTCATGCAGCTGGAGGCTACAAGATTCTGACCCTCCCTAAACTGCTCCTAAGATCAG 5093

  5602039 TGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAAT 5602098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 TGCTTGAGACGTTTTGCCGACCCTGCACTTGATGGATCAGCTGGTACCACCCAGATCAAT 5153

  5602099 AAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAG 5602158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 AAACTGGCTCATCTGATCTTGTGGCCCCCACCCGGGAACTGACTGAGCACAAGAAGACAG 5213

  5602159 CTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCC 5602218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CTCCAACTCCCTATGATTTCACCTCTGACCAATCAACAGTCCTGGCTCTCTTCCTTCTCC 5273

  5602219 CCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAG 5602278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 CCGCCCACCAACTTATCCTTAAAAACTCTGCTCCCCGAATGCTCCGAAGACTGATTTGAG 5333

  5602279 TAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATT 5602338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 TAATAATAGAACTCTGGTCTCCTGCACAGCCAGCTCTGCATGAATTACTCTTTCTCTATT 5393

  5602339 GCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTG 5602398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 GCAATTCCTCTGTCTTGATGAATTGGCTCTGTCCAGGCAGTGGGCAAGGTGAACCCCTTG 5453

  5602399 GGTGGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGT 5602458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 GGTGGTTACAACAGGCTTATCTTGCACTCCTTGGTCCCTTGCTCACTGTACTCCATCTGT 5513

  5602459 CATCCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCA 5602518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 CATCCTTTGGAATTTCTTGTATGCACAATGCCCCCTGCCTCTAGCCTCAGGGCCTTTGCA 5573

  5602519 CATGCAGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAAC 5602578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 CATGCAGTTTCTTCTGCCCAGAACAATCTTCTATCTTCCTCCTGGCCAATCTCTGCCAAC 5633

  5602579 CCTTCAATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTG 5602638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 CCTTCAATTTTCAACTTAAGTATCATTTCCTTAGAGAAACTTTTCCAGATCTTCTAAGTG 5693

  5602639 AGGCCAGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACA 5602698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 AGGCCAGTCCTCCTTCTTATATATCCTCATAGTATCCTATTCTCTGTAGCAGTTACCACA 5753

  5602699 GTCATAATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCT 5602758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 GTCATAATTTTTTCATATAATTATTTAATGTCTACTTCTAATGGTACCAGAAACAACCCT 5813

  5602759 TGCCTTACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCA 5602818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 TGCCTTACTCACTGCTATACTCTCAGCTCCCAGCACAGTGCCTGGCACTGATAGGCAGCA 5873

  5602819 GGAAACATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCC 5602878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 GGAAACATTTGGGGGTTTAATGAATACATTTTCTCACCAGCTTTGCTGGGCAGGGCTGCC 5933

  5602879 TTTAGGGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGA 5602938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 TTTAGGGGCCATGAGGTGCACATCCCCGGAGATGTACAACCAAAGCCAGGGACATGGTGA 5993

  5602939 GCTGAAGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCC 5602998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GCTGAAGAAGCACTCAGGTGAATGAGGCCTCTCTGCTTCCTCCAGGGAGAATTCATTGCC 6053

  5602999 ACTAACCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGG 5603058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 ACTAACCTTCAAGCTCTGAGGCTGCAAAATTTGCAAGACAACAGCTGAGACTGATGGGGG 6113

  5603059 CTGAGATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGG 5603118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 CTGAGATTAGATTATTCCTTCAGGGAGGGGTATCACCTCCTGGGGGAAAAGGGAAGGGGG 6173

  5603119 TGGACACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGC 5603178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 TGGACACCCCCAAGTGGGATGGGGGAAAGGAATAGCTGCAAGAAAAGAAGGAGGGGGGGC 6233

  5603179 CCTGGAGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCT 5603238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 CCTGGAGGACTAGCACAAAGGCCGGATTTAGCCGCTGTGCAGGTCAACATCCCTGAGTCT 6293

  5603239 ACACCAATAGGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCAC 5603298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 ACACCAATAGGAACCCCTTCCCTCTCCTCCTCTCCAGCTGCCTCTGCCCTCTGCACTCAC 6353

  5603299 AAAGCCTCAGAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAG 5603358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 AAAGCCTCAGAGCAATCGCCCAACCCATATGGTAAAATATTCATCGGGATGCAAGGCAAG 6413

  5603359 GCAAGAGACTGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGG 5603418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 GCAAGAGACTGAGGCAGTGTCAGAAGAGGGGGTGGGGTTTCCTGGCTGAGAGGTCCTGGG 6473

  5603419 TGCATCTTCTTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCAC 5603478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 TGCATCTTCTTTGGGCAGCGAGCCACGATGTTCTCTGCTTGGGAGCTGCGTGAGGGTCAC 6533

  5603479 AGCTTGGGCACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGT 5603538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 AGCTTGGGCACAGCTAAACTCCTGAGGCTAGCACAAATGTATTTAACATTCCACCAACGT 6593

  5603539 CCAGCTACTGGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCT 5603598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 CCAGCTACTGGGGACTCCTGCATTATTTATTTATTTTTGTACTAATGGCCTGAAACGTCT 6653

  5603599 ACAGAGCAGCTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTC 5603658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 ACAGAGCAGCTCTTGGATAGCATGGTGACTAGAAACCCAGGCCCCTTGCTCCGCATCTTC 6713

  5603659 TGCAGTGTGAGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCA 5603718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 TGCAGTGTGAGCAGAGTTCATGGTCTTGGGTCCCACTGACTAGCCCTGGGTCTGGAATCA 6773

  5603719 CAGGCAGCATTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCC 5603778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 CAGGCAGCATTGGGGTGATTTTCCTCCTTGCCAAGACACAGATCCCTCTGAGGAGCGCCC 6833

  5603779 GGTTATTTTTGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCA 5603838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 GGTTATTTTTGAGTCTTCTGTGCTCAATCTTATCCCTCATTTCCAGGAACTGCATTGGCA 6893

  5603839 CCCGAGGCTCTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAA 5603898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 CCCGAGGCTCTTGCAAGTGGCAATTTACTAGAACAAAATAAAATCCCTAGTCAGATTTAA 6953

  5603899 AAGCAATGAAATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACC 5603958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 AAGCAATGAAATAAATAGAATTGCATTTTTCACTTGGCGTCAAGACGGTGGAGACACACC 7013

  5603959 CACGTACAACTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCA 5604018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 CACGTACAACTTGAAAGCACCTTGTTTGCTTCCTTTTAAAGAGAGGCGGCTGATCAATCA 7073

  5604019 GCCGCTTTCATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTC 5604078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 GCCGCTTTCATTTAAACTCAGGGACAGGGGAAAAGACAGAAAGCAAAAGCCCCTTTTCTC 7133

  5604079 CTTCCTGGAGTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCAT 5604138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7134 CTTCCTGGAGTCTGAAACCAACTGTTCCTATTTCTTAAATCTGTGGACTTCCCCTCCCAT 7193

  5604139 CCTCTGAACCTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGC 5604198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 CCTCTGAACCTTTTCCCTACTTTTTCTCAGGATATATTCCACAGGAATTGAACATCTGGC 7253

  5604199 AACACAGGTTTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGG 5604258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 AACACAGGTTTCCATGGAAAAGACAGCAGGCTGGGCTTTGTTCTCACCCACAGCTGATGG 7313

  5604259 AGATGTGCCTTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAG 5604318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 AGATGTGCCTTTCACATGGCAGTAGGGAGCCACTGTTAGCCACAGCAGGCTGGCGCTCAG 7373

  5604319 AGCCCAGCAGGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTT 5604378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 AGCCCAGCAGGTCATGGCAGCGCTGGGAGCTGCCTCTGTCTTCTAGCTCTTTCCTTTTTT 7433

  5604379 GCTGCACTTTTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAG 5604438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 GCTGCACTTTTCCACATGCTGACTTTCCCCCAGACTTGGCTTTATCCTGCCAGGACATAG 7493

  5604439 AGAATGGTCTTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCA 5604498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 AGAATGGTCTTGGAGCTTCCCTGATTCTTTCCAATGTCTCCAGTCTCTGCTCCAACTCCA 7553

  5604499 TGTGGTACTGCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGAC 5604558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7554 TGTGGTACTGCCTACCTCTACATGACCTGGAATATTATTTCAGCTCTGTTCATTGATGAC 7613

  5604559 TTTAGGGAGGTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTG 5604618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7614 TTTAGGGAGGTGGCCAGGCTCTGCCCATCAGTAGGACCAAAGTGGCCATTTTCTCATCTG 7673

  5604619 GGACCCAGAGAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTC 5604678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 GGACCCAGAGAGATGGGGGTGGGGTGCCTTGGAGATGGTAGAGTCCAGCTGAAGACCCTC 7733

  5604679 AGGCCCAGAGAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTC 5604738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 AGGCCCAGAGAGACTCAATAGCTGGCCCAAGGTCACACAGCCAGTTAGACATTGGACCTC 7793

  5604739 CCGGTACTCACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCC 5604798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7794 CCGGTACTCACTCAGGTGCTCTGTCCAGTGCTCCATAAAGCCTGAGATCTGAGTTGGCCC 7853

  5604799 TTCTGAACCATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTG 5604858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 TTCTGAACCATGTCCTTGGCAGGGGAGGCAGAATGAGATATCTGGCAGAGCTGAGCTCTG 7913

  5604859 TGGCAGAATGACAAATGGGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCA 5604918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 TGGCAGAATGACAAATGGGCCCCTTGTATTGCTAGGAAGTGGGTTCTGGGAACAAGGGCA 7973

  5604919 GCCAACAGAGCCATTTATCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAG 5604978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 GCCAACAGAGCCATTTATCCACCTCCCAGTCAGTGACTCGGCCAGCAGTGGAGAAGTCAG 8033

  5604979 AGAGAACAGGGGGGTGTAAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCA 5605038
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 AGAGAACAGGGGGCTGTAAAGGCTATGGGTTCTCTAACTCATTACTGGCAGGGACTGCCA 8093

  5605039 TCCAGGGCTGACCAGCACTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTG 5605098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 TCCAGGGCTGACCAGCACTTCAAACGTGAGGCCTGTTGTCCTAAAGACCAGGGCCAGGTG 8153

  5605099 AAGAACATCCTTTTAATATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATT 5605158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8154 AAGAACATCCTTTTAATATAAATTGCACTTAAATTCAGTGCTTCTCAATTTATGTTAATT 8213

  5605159 GCAAATCGAAGTCTTGCAATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAA 5605218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8214 GCAAATCGAAGTCTTGCAATTTCACATGTGTATACATATACCTATATTTAATTTTTTAAA 8273

  5605219 CAGCATAGTATACAGGATGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATA 5605278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8274 CAGCATAGTATACAGGATGTTCTAAGACAGGAGTTTTCAAATGTAGATGATAGAAAAATA 8333

  5605279 ATTTTTTAGGGAGCATTTGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTC 5605338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8334 ATTTTTTAGGGAGCATTTGGCAAGCGTTATCAAAACTTTAAAATATTTATACTCTTTGTC 8393

  5605339 TTAGGAATTCCATTTCTAGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAG 5605390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8394 TTAGGAATTCCATTTCTAGAAATACAGCCTAGGAAAATAATCAGAGATAGAG 8445

Alignment time is 6.55139 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [5585704,5607498] =>     21795 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6837] =>      6837 nucs 'mol-32-34c9-171929_6837'

Score:        6825
Aligned:      6836        nucs
Identic:      6835 (100%) nucs =>      3318 (100%)      3517 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [5592704,5596021] EXCISED REGION [5596022,5599539]
 second seq =>  [      1,   3318] EXCISED REGION [   3320,   6837]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3319,3319]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [5596892,5596892]
 second seq =>         1 nucs [4190,4190]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [3319,3321] to [3320,3322]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  5592704 GCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAG 5592763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAGTGCAGGTAAAGAGGATTAAATACGGATTGACACGTGGTCTGTGGGAACACAGAGAG 60

  5592764 GGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGG 5592823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGGTGGCTGACTGGCAGTCAATCAGGAAGACTTCCTGGAAGAACGGGCCTTCTGAGAGG 120

  5592824 CTGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCT 5592883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAGATTCACAGGATGACTAGAAGTTGGTATCCAGGTGAAGAGAAGCAGGGAGAGGGCT 180

  5592884 CCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACA 5592943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGTGAGGAGATGACATGGGTAAGGCCTGGAGGTGAGTGAGGTGAGTGAGGTGTCACA 240

  5592944 GGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTT 5593003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATTGAGACACTGCAGGGTGTTCAGTGTTGCCAGAGCAAGGAGTGCAGAGATGAGTGTT 300

  5593004 CTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGC 5593063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGAGACAGGGAAGAGTGAGTGGGTCCAGCAGAGAGACTCAAGTGGCCTTCAGAGAAGGC 360

  5593064 TAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGT 5593123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATTGGGAAAGGTGAGTCCTCCTGGAGTCAGAAGACCTGGCTTCAAGGCTGCACTGGGT 420

  5593124 CACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCC 5593183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACTTCTTGGCTGTGTGCCCCAGACACTTCGCTTTACCTCTCTGCATCTGTTTCCATCCC 480

  5593184 TATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATAT 5593243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATAAATTAGGTTTCATGTGAGGACAGAGACGGAATGTACTCATTCATTCAAGCAGATAT 540

  5593244 TTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATAT 5593303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACTGAGTGGCTGCTATAGGCCAGGTGCTATTCTAAGCACTGGGGATTATTCAGAATAT 600

  5593304 GGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAG 5593363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGGAAGATCAAGTCTCTGCCCTCATGGGGCTTACACTTTAGCAGGGAACACCTCATAAG 660

  5593364 TGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTG 5593423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCAATGAAGAAAAATCAAGCAGGGTAGGGGCCAGAGGGTGGCAGGGTACAGTGGGGTTG 720

  5593424 GGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGAC 5593483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGTTGGATGGGATGGTCAGGGAAGGCTTCTCAGAGGAGGGCACCTTTGAACAAATGAC 780

  5593484 AAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTA 5593543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGGGGGAGTGAGCTGTGTGGGATTCATGGGAAATAAACATTACAGCAGATCCCTCGGTA 840

  5593544 GATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTT 5593603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATGTACTAAGTACAGGAAGTGCTCTGAAACCTTTGCCTGGATTAATTCATTCCACCCTT 900

  5593604 GAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAG 5593663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAACACCATGAGAGCCAAGCACCATTATCATTACACCCCATTACAGGTGGCAAAACGGAG 960

  5593664 GCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCAC 5593723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCACGGAGTTAGGTGGCTTGGCCAGGTCTCAGGATTTGAACCTCATGGCATGGCCTGCAC 1020

  5593724 AGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTC 5593783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCACAATCCTAACCACTCTCACCATGTCCCAGACAGGCAGGGCCGGATAAGCTCAGTC 1080

  5593784 CCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTG 5593843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAAGCCGGGCTTACCGTGGGGGATGGTGTGTGCAGATTGCAGAGTGCAAGGCAAATGTG 1140

  5593844 AAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATG 5593903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATGTTGTCACCGACATTTTCTTTGGAATGTGAAGGAAACATCTCAAACCAGTGGCATG 1200

  5593904 CTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCC 5593963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTATCCACTTCTGCCAATATTCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCTCC 1260

  5593964 TTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCAC 5594023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTTTTTTGAGACAAGGTCTTGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTGCAGTGGTGTAGTCAC 1320

  5594024 TGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGG 5594083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCAGCCTCTACCTCCTGGGCGCAAGAGATCTTCCTACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGG 1380

  5594084 ATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCT 5594143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATGTTTGGATTTTTTGTAGAGATGCAGTCT 1440

  5594144 CACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCC 5594203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACTATGTTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCC 1500

  5594204 CCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATC 5594263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCGGGCCCTCTTTTGCTGATATC 1560

  5594264 CTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAA 5594323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTAAAAATAAAGGCCTGTGGGCCTCAGTTTCCTGTGTGGTTCTTGGCAGAGTATATGAA 1620

  5594324 AACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCT 5594383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACACAACTTGCTTAGGGCGGGAAAAATTCTGAAAAACAAAAGAAATACCTGCGTTTGCT 1680

  5594384 CTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTC 5594443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTGCAATATATCCACATACGGAAAATACGAAAAATAGAGAAAAGAAGAGAAATTTCTC 1740

  5594444 ACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTT 5594503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACATACGTACCACTTAAATATAAGCACTTAGTATTTTGGAATGTTTTCTGTTTACTCTTT 1800

  5594504 TTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTG 5594563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCAAAAGGAGAGGGTGTTTCAGTTGTGTGAAGCAGAAAATAAAGAACTTAGAGGTTTTG 1860

  5594564 GAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGC 5594623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAATATATAGACAATTATATAGTGTTATTATGTGACAAGAAAACTTTGGCTAGGCCATGC 1920

  5594624 ACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTG 5594683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACGGTGGTGACTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTGAGCCCAGGAGTTCGAGATCGGCCTG 1980

  5594684 GGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTA 5594743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCAACACGAGGAGACCCTGTCACTACAAAAAATAAAACACCTAGCTGGGCATCGTGGTA 2040

  5594744 GGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGG 5594803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTGCCTGTAGTTCCGGCTACTCAGAAAGCTGAGATGGGAGGATCTTTTGAGCTCAGGGG 2100

  5594804 GTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAG 5594863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGACGGTTTCAGGGAGCTGAGATTACACCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAG 2160

  5594864 ACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATT 5594923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCCTGTCTCAAAAAAATAAAAAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAATAATGCAATACCCATT 2220

  5594924 TTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGC 5594983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTACTTTTCTATTCTCCAAAATATTAGCTTTTGCAAACAGCTCAGGGCAGCAGGTAGAGC 2280

  5594984 TCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTG 5595043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTGTGGCAGATCACTAGAGACCAGGTTTCTGATTGGTCAGTTCTCTCTGAGATTACCTG 2340

  5595044 TTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTT 5595103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTGCCAGCTTGATGGTCACCTAACCGGACTGTCACCTGGTTCCATGGTCACCAAGCGTT 2400

  5595104 TTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTA 5595163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTAGTTGCTCCCCCATCTTTGTATGAGAGAATGCTCATAATTTTTGAGCACCCTGTCTTA 2460

  5595164 AAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTC 5595223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAACAGGCACATTTATTTATAAATCATACTATTACCAATCTGCAGAATATTAGTACATTC 2520

  5595224 CTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAA 5595283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTAAACTATGTTAATATTTAACACATAGTTTAATTTCTTATTTTTATATAAAAATATAAA 2580

  5595284 TGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATC 5595343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTTCTAATATTTTCCTCCCACACTATTTACTGGTTTGCTCACACCCCATTGATTTAATC 2640

  5595344 CATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTG 5595403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CATTTTGCCCAGTCCAGAGACAGTTTTGTAGACAGACATGATATCTTGTGAAAAAGGGTG 2700

  5595404 AAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAG 5595463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAAAATGTGTCATTTCACACCAAATCCCACTGTAGGAACCTCTGATGGGGTGGGCACAG 2760

  5595464 TCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGG 5595523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTATCTCAGTGGGAAAATAAATCCTGATCTTCCACTTACAAGGTCAGGGAGGGAGAAGG 2820

  5595524 GGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACA 5595583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGAAGAATGAAATTTCAAGACCAGGCTCTATGTGGATGGAGGACTCCTGCAGAGGCCACA 2880

  5595584 GTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTA 5595643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTCATGCCATTTTTTGCCTCTTTGGCCTGAAAGGGCAAGCGCTGGGTCCTGACGGGGCTA 2940

  5595644 GGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATA 5595703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGACTGAATGCTTGGCATAATAAAGTGAGAGGAGGTGCACTGAATGGAGGGTGAATAATA 3000

  5595704 TTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAA 5595763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCCATTAGTATTAAGTAATTAATTAATTACATCCAATAATATCCCATCATATGTATTAA 3060

  5595764 CCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTT 5595823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCACATTTTCTTTATCCGTTCATTGGATAAAGATGGACACTTGAGTTGCTTCTTTTTTTT 3120

  5595824 TTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAA 5595883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTTGAGACCGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGGAGTAGCGCATGGGAGTTAA 3180

  5595884 AATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGA 5595943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATGTGATGAAGCCCGGCGTGGTGCCTCACACCTGTAATCCCAGCACCCTGGGAGGCTGA 3240

  5595944 GGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC 5596003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGCGGGCGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC 3300

  5596004 CGTCTCTACTAAAAATAC 5596021
          ||||||||||||||||||
     3301 CGTCTCTACTAAAAATAC 3318

EXCISED REGION

  5596022 AAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCA 5596081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 AAAGTTAGCCGGGTGTGGTGGCAGATGCCTGTAATTCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCA 3379

  5596082 GGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCAC 5596141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 GGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACTCCACTGCAC 3439

  5596142 CCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATA 5596201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 CCCAGCCTGAGTCACACGAGTAAAATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTGTGATGAGATA 3499

  5596202 GAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAG 5596261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 GAGGCACTGGAGGTTAGGAGCTTGGGCGCTGGTGCCTGGCTGCCATAGTTAGTGTCCTAG 3559

  5596262 CTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAA 5596321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 CTCTGTGTCCTCGGGCAAGTTACTTCGCCTCTCTGTGCCCCATTCCCATCATCTGTTAAA 3619

  5596322 TGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACA 5596381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 TGGGGTTAATAATTTCTACCTCACAGGGGGTTGTGAGGAGTGGATGGTCTAATACGCACA 3679

  5596382 AAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGA 5596441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 AAGCACTCTGAACAGCTTAATAAATGTTAGCTGTTACTTTTGAGACGAACGCCAGCCGGA 3739

  5596442 ATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCA 5596501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 ATTTGAAGCTACAATGCAGAGTTGAAAGTAATCCCCAGACTTTGAGCCCCTGAGAACTCA 3799

  5596502 GAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGA 5596561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 GAGACATCTTAGGATTCAGTGCTTGGGCCAATCTTATTCCAATGTGAAAGGACAGGGTGA 3859

  5596562 CCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTG 5596621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 CCTCAGCTGACCAGCCCAATTGCTGTGGTGACTGGGATTTGGTTCTCACCTCCCAGCCTG 3919

  5596622 GGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGA 5596681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 GGTTTTGTTTTCTAATATGATGAGGCCCCAATGCTGTCATCTCGAGAGCAGGAAGAGAGA 3979

  5596682 GTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGA 5596741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 GTTTTGCTCTTCTTGTTTAGTGCCAACCAGGCTCCCCCAACCATAGAAATCCCCAGAGGA 4039

  5596742 CTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATC 5596801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 CTCTTCCATCAAAGTGAATATTCATAAAGTGCTTTAGAGTTGACAGAGTCCCTTTATATC 4099

  5596802 CATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAG 5596861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 CATTATCTTATTTGATGACCCCAATAATATTATGACCCTTCTATTTGCTGGGGCACTGAG 4159

  5596862 GGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGGGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGG 5596921
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4160 GGGAGTGAGAGTCGGGGAGAGAGGTGGGAGAGGAAGGGAGGAGGGAGAAGAGAGGAAAGG 4219

  5596922 AGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATT 5596981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 AGAGGGGAAGGGAGGGGTAAAAGTAATGCTGAAATGTTGAGACTGGCTTTTATTTTTATT 4279

  5596982 TTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACT 5597041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 TTTCATTTTTTCAACAGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGTTGGCCAGGGTAGTCTTGAACT 4339

  5597042 CCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCA 5597101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 CCTGGACTCGAGCAATTGTCTTGCCTCAGCCTCTAAAAATGCTGAGATTACAGGCCACCA 4399

  5597102 CACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACC 5597161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 CACCCTGACAACTCTCTTATTTTGATTTTATTATATTTATTTTTGTTTTTAATAAGAACC 4459

  5597162 TGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGG 5597221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 TGGGTCTTTTTGACTCAAATATCCATGTGCTTCTGCTTTACCAGCTGGCCTTCAGGTGGG 4519

  5597222 AGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAA 5597281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 AGAAGCAGGCCCTCTGTGTGCCCAGCCTGGGTTCAGTCACTGACTCAGTGCCCAGCACAA 4579

  5597282 GGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGA 5597341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 GGTGGGTGGCTCCCCCAGGGGCCCTTGCTACCCTCACCATGAGCCACGCTGAGCTACAGA 4639

  5597342 TCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAG 5597401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 TCTGATGCCTGGGTCTCCGCCAAGGGCTCGGGCTAACACGCCCTGTTTGGACTCAGCCAG 4699

  5597402 GTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGA 5597461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 GTGACCCATGATGGTAACAGCCGGCTTGCCGGCCTCGCCTTCCTTGCAAGAAGTTATGGA 4759

  5597462 ATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACG 5597521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 ATAACATCAGAGCTTTTTGAGGCAGGTGTTAATCATGTCCCCATTTTACCGGTGAGGACG 4819

  5597522 CTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTC 5597581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 CTGAGACTTGGAGAAGCTCCCATCTGTGAGTAAGTGTTGGAGCCAGGTCTGTCTGACCTC 4879

  5597582 GAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTA 5597641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GAAGTTGAACTTCCACTCTCCACTCTGAGAAGAAGCGTGCTTAGGGAGGCGCTGCTTGTA 4939

  5597642 GAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGA 5597701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 GAAAAGGATCCTGGAGAACTATTCATTTGTCATCACTCAGGCCAAGAGAGTAACAGAAGA 4999

  5597702 AATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAAT 5597761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 AATGATCAATGAAAAACCCTCCAAAAGTTGTCATCGGCTTGGGTTTATCCTGCTTTAAAT 5059

  5597762 CATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTC 5597821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 CATAACTTAAGCAGCCTGAAATGGTATTTCCCAAAGATGGGAATGAAATTCTGGTTATTC 5119

  5597822 AAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAG 5597881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 AAGGAAGAAGCCAAGGGCTGGGGGTTTGCAGGAGCAGTTTCCAGACTCCCAGGAGTGCAG 5179

  5597882 GTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAG 5597941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 GTAAGCTCTGAAGAGGCGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGCAGGGGAGGAGGAGGGGCTGGAG 5239

  5597942 CCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCC 5598001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 CCCAACGAGAGAGGGAGGGGCCTGTCTAAGCCCATACTGCACTGGGGACAGCTCTTCCCC 5299

  5598002 TGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAA 5598061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 TGGGGCAACGACAGGCTCTTACCATCAGCCTTTTCCCAAGATGCCCCGGGGCACAGTTAA 5359

  5598062 GTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAA 5598121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 GTGCTTTAAGTGGCAGCTCCGCAAAAGGCCATCTCCCGCCAAGACTATAAAATGGAAAAA 5419

  5598122 TGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATA 5598181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 TGGTGATGCTATATTCACGGCAAAGAATCAAGCGAGCAGAGCCTTAACAAGGAATTTATA 5479

  5598182 AATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCT 5598241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 AATCAGTTACTAGGAACATTAAAATGCCTCTTGCTGCACTTAATCTCCAGCTTCCTTTCT 5539

  5598242 TCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAG 5598301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 TCTTCCAAATACCTAACACATCAGTCTTTTTTACTGGCTCTGGTGGACCCTTCAAGGAAG 5599

  5598302 TCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTA 5598361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 TCTGTTCCTTTTTCAGAATAAATATATGTGTATTCTCTTGTCTGACTCAACTCGACTGTA 5659

  5598362 AAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTT 5598421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 AAACAAATAATGATACGTGCTTACTCTGGTTCTTCAGATAAATATGAGAGGAGGCAGTTT 5719

  5598422 TGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGT 5598481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 TGTCTTTCTTTGGTCTGGGACATCCCTGGGAGCAGGAATCATGGCTGTGCCAAGCACAGT 5779

  5598482 TTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCA 5598541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TTCTGTAGCTGCATCCCATGCGATCCTGTAAGTAGGCACACTTGGAATGTAACGCCAGCA 5839

  5598542 ACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACT 5598601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 ACGCGTGGTCTAGACATAGTCAAGCTTGGCCCAATAAAAACAGGAGAACCAAACTGCACT 5899

  5598602 CCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACC 5598661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 CCAAGGCATTCCCCAAGACTCTTGTATAATAAGAACAGCCAACGCTTCCATGAGCCTACC 5959

  5598662 TTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAA 5598721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 TTAGGCCAACTGCTGTCCTAAGCACATTGCGTTTATCAACTCCATTTATCTTCACAATAA 6019

  5598722 CCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAA 5598781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 CCCTAGTACTGTTATGTTCTCCATATTATAGATGAGGAAACAGAGGCACAGAGATATTAA 6079

  5598782 CTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTG 5598841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 CTTTCCCACTTTCATACAACCAGTGACTGGGGGAGTTGGCCTGTGGACCCAGGCAGCCTG 6139

  5598842 ACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTA 5598901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 ACCCAGCAACAGGGCTCATAAACTTTGTGCTATATGGCTGTAACAAGAAGGCTAGTTTTA 6199

  5598902 CCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTAC 5598961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 CCATTTACCCTATGATATGATCAGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAACTAC 6259

  5598962 AATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGG 5599021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 AATCCCCACAATTCCCATAATCCCCATGTGTCAAGGGAGAGACCAGGTGGAGGTAATTGG 6319

  5599022 ATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGAT 5599081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 ATCATGGGCGTGGTTTCCCCTGTGCTGTTCTCACGATAGTGAATTCTCAAGAGATCGGAT 6379

  5599082 GGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAA 5599141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 GGTTTTATAAGGGGCTCTTCCCCCTTTGCTTGGCATTTCTCCTCCCTGCTGTCTTATGAA 6439

  5599142 GAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCC 5599201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 GAAGGTACCTTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATAATTGTAAGTTTTCTGAGGCCTCCCC 6499

  5599202 AGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAA 5599261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 AGCTATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCCTCCCCAGACATGATGAGCTGTGAGTCAACCAAA 6559

  5599262 CCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGA 5599321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 CCTCTTTCCTTTATCAATTACCCGGTCTCAGGCAGTTCTTTATAGGAGTATAAAAACAGA 6619

  5599322 CGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCT 5599381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 CGAATATACCCTCGTTCTGGGAGGATTCAGGGACCCAGGCTGCAATGAGAGGGCAGAGCT 6679

  5599382 GCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTG 5599441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 GCTGGGAGCCACCAATTTGGTTATTCCCAGGATGTCTGTTTGCTGGGCTGGTATGTTGTG 6739

  5599442 GGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCG 5599501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 GGTTGTTTTTGTAATCTCCACCTTAAAGCACATTTGGTCAAGTCTTATGAGAGGCTTCCG 6799

  5599502 CTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCC 5599539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 CTGGAGCTGTTTAAGTGGTGGCAGCTGAGGCAGGCCCC 6837

Alignment time is 5.29628 s

