
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   4363] =>      4363 nucs 'mol-32-1e7c-086985_4363'

Score:        4298
Aligned:      4364        nucs
Identic:      4358 (100%) nucs =>       546 (100%)      3812 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734239,3734784] EXCISED REGION [3735843,3739660]
 second seq =>  [      1,    546] EXCISED REGION [    547,   4363]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734239 CTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCC 3734298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCC 60

  3734299 AGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCA 3734358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCA 120

  3734359 CCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCT 3734418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCT 180

  3734419 GGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 3734478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 240

  3734479 ACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCT 3734538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCT 300

  3734539 TTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGT 3734598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGT 360

  3734599 CGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAG 3734658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAG 420

  3734659 AGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAAT 3734718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAAT 480

  3734719 TAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGA 3734778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGA 540

  3734779 ATGGCG 3734784
          ||||||
      541 ATGGCG 546

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 606

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 666

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 726

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 786

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 846

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 906

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 966

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 1026

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 1086

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 1146

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1147 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 1206

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 1266

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 1326

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1386

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1446

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1506

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1566

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1626

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1686

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1746

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1806

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1866

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 1926

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 1986

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 2046

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 2106

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 2166

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 2226

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 2286

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 2346

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 2406

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 2466

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 2526

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 2586

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 2646

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 2706

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 2766

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 2826

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 AAAC-AAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 2885

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 2945

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3005

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3065

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3125

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3185

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3245

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3305

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3365

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3425

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3485

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3545

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3605

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3665

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3725

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3785

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3845

  3739143 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3905

  3739203 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3965

  3739263 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 4025

  3739323 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 4085

  3739383 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 4145

  3739443 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 4205

  3739503 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 4265

  3739563 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3739622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 4325

  3739623 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCT 3739660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCT 4363

Alignment time is 3.30088 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   5690] =>      5690 nucs 'mol-32-1eea-056651_5690'

Score:        5599
Aligned:      5691        nucs
Identic:      5681 (100%) nucs =>      4593 (100%)      1088 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3730188,3734784] EXCISED REGION [3735843,3736933]
 second seq =>  [      1,   4599] EXCISED REGION [   4600,   5690]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3730188 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAG- 3730246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
        1 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGC 60

  3730247 --TGAGCCGAGATGATGCCACACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCA 3730304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGAGCCGAGATGATGCCACACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCA 120

  3730305 AGAAAAAACAAAAGGAATGGAACAGAATGGAACGGAACGGAAAGGAAAAGGGAAGGGGGA 3730364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAAAACAAAAGGAATGGAACAGAATGGAACGGAACGGAAAGGAAAAGGGAAGGGGGA 180

  3730365 AGGGTAGGGGGAAAGGGGAAGGGGGAAGGGAAAAGATGGAAGGGAAGGGGAGGGAAAAGA 3730424
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGGAAGGGGGAAAGGGGAAGGGGGAAGGGAAAAGATGGAAGGGAAGGGGAGGGAAAAGA 240

  3730425 AAGAAAAGGGTAGTAAAATCTCTCTGATGAAATTAGCCTAGAGCTGCGTTTCCAAACTGG 3730484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGAAAAGGGTAGTAAAATCTCTCTGATGAAATTAGCCTAGAGCTGCGTTTCCAAACTGG 300

  3730485 GTTCCACAAAATAACTTAAGTATTCCATGAAAAAGAGTTGTGTATATTTAAACTACTTGG 3730544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCCACAAAATAACTTAAGTATTCCATGAAAAAGAGTTGTGTATATTTAAACTACTTGG 360

  3730545 AACAGAACACAGGTAGTTAAACACTCAATATGTAAGTATTAGCAGTTCTTGATAACTGTC 3730604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAGAACACAGGTAGTTAAACACTCAATATGTAAGTATTAGCAGTTCTTGATAACTGTC 420

  3730605 AAGTAAGTTTGGATTGTCCTTTACACTACCGCCCCCTACAGGGAAGCCCTTTGCTGCTCC 3730664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTAAGTTTGGATTGTCCTTTACACTACCGCCCCCTACAGGGAAGCCCTTTGCTGCTCC 480

  3730665 TTGTCAGGACATGCTAAACGAATTCCCCCTTCATCATTCCCATTGGAAAACGTGGATGAT 3730724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTCAGGACATGCTAAACGAATTCCCCCTTCATCATTCCCATTGGAAAACGTGGATGAT 540

  3730725 GAAGGTATCCCTGGGATATGTAGAATGGAGGCATGACAGCCAGTTGGCTTTGTAGCAACT 3730784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAGGTATCCCTGGGATATGTAGAATGGAGGCATGACAGCCAGTTGGCTTTGTAGCAACT 600

  3730785 AATTTAATGTGCCTCTTTAAGGAAGATAATTTAGCAAGAAAAGAGCTTTGAGAAATCTTA 3730844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTTAATGTGCCTCTTTAAGGAAGATAATTTAGCAAGAAAAGAGCTTTGAGAAATCTTA 660

  3730845 CGGAAAATAAACTTAAAAGAGTATTTCTCAAAACTATGCGTCCCCTATATCTCAGTTTGG 3730904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGGAAAATAAACTTAAAAGAGTATTTCTCAAAACTATGCGTCCCCTATATCTCAGTTTGG 720

  3730905 GAAATGAAGCTCTGAGGCTCTCACTTCTGTTACTAATGTGCCATGTGGCCTGAGGCAAAT 3730964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAATGAAGCTCTGAGGCTCTCACTTCTGTTACTAATGTGCCATGTGGCCTGAGGCAAAT 780

  3730965 ATGTTCCTTCCTCTGTTTCTCAGGTTCTGATAAATAATACAAGGTAGGTGAACTATGTAA 3731024
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTTCCTTCCTCTATTTCTCAGGTTCTGATAAATAATACAAGGTAGGTGAACTATGTAA 840

  3731025 TTCTGAGAGTCCCTCCAATTCTAATATACCTTAGTCACAGTTTTAATGACTTAAATCAGG 3731084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGAGAGTCCCTCCAATTCTAATATACCTTAGTCACAGTTTTAATGACTTAAATCAGG 900

  3731085 GTTAGTAAACTATAACCCTCAAGCAAAATCTAGCCCACCACCTGTTGTTTATTTACATTT 3731144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTAGTAAACTATAACCCTCAAGCAAAATCTAGCCCACCACCTGTTGTTTATTTACATTT 960

  3731145 GTACCAGCTTTATTTAGGTTTAATTAATGTACAATAAACTACACACATCTACCACCTGCT 3731204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTACCAGCTTTATTTAGGTTTAATTAATGTACAATAAACTACACACATCTACCACCTGCT 1020

  3731205 TTTGTTTTTGTTTTTTCTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAG 3731264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTTTTTGTTTTTTCTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAG 1080

  3731265 TGTAGTGGCACTATCTTGGCTCACTGCTGCCTCTGCCTCCCAGATTCAAGCAATTCTCCT 3731324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTAGTGGCACTATCTTGGCTCACTGCTGCCTCTGCCTCCCAGATTCAAGCAATTCTCCT 1140

  3731325 GCCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGTGCATCGCCACATGAGGCTAATTTTT 3731384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGTGCATCGCCACATGAGGCTAATTTTT 1200

  3731385 GTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATC 3731444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATC 1260

  3731445 TCAAGTGATCCTCCCGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGT 3731504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAAGTGATCCTCCCGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGT 1320

  3731505 GCCTGGCCTACCGCCTGTTTTTGTAAATAAAGTTCTACTGGAAAACAGCCAGACTCATAG 3731564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCCTGGCCTACCGCCTGTTTTTGTAAATAAAGTTCTACTGGAAAACAGCCAGACTCATAG 1380

  3731565 CTTCTGTATTATTTATAGTTGCTTTCATGCTACCACAGCAGAGCTGAGCAGATGTGACAG 3731624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTCTGTATTATTTATAGTTGCTTTCATGCTACCACAGCAGAGCTGAGCAGATGTGACAG 1440

  3731625 AGACCGTTAAGCCTACAAAGCCTCAAGTATCTGCATTCCAGCCCTTTACAGAAAAAGGTC 3731684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGACCGTTAAGCCTACAAAGCCTCAAGTATCTGCATTCCAGCCCTTTACAGAAAAAGGTC 1500

  3731685 TGCCAATTCCCGATTTGGATAGTGTAAGTTAAACAGAAAGAAAACAGGAGAAAAATGTTT 3731744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCCAATTCCCGATTTGGATAGTGTAAGTTAAACAGAAAGAAAACAGGAGAAAAATGTTT 1560

  3731745 CACTCAGTCATGTTTGTCTTTCAATGAAAACATCTTCCTACGAGAGCAGCTAAGAAAACC 3731804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACTCAGTCATGTTTGTCTTTCAATGAAAACATCTTCCTACGAGAGCAGCTAAGAAAACC 1620

  3731805 GGCTGCCATCTAGGGTGCTACCCAGCAGGTCAGCCAGCTGGCAGCAAGTAAAGCCAGACT 3731864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCTGCCATCTAGGGTGCTACCCAGCAGGTCAGCCAGCTGGCAGCAAGTAAAGCCAGACT 1680

  3731865 AGAAGTAAGTCAAGACAAGAAGCCAGCAAAGCAGTAACAAGAGGTCAGGCCAGACTTACA 3731924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAAGTAAGTCAAGACAAGAAGCCAGCAAAGCAGTAACAAGAGGTCAGGCCAGACTTACA 1740

  3731925 GTAAGCAGGCAAGTTAAAAATTACAGTTGGCCCACAAGTTGGAAAGCTCATGGGTCAGGG 3731984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTAAGCAGGCAAGTTAAAAATTACAGTTGGCCCACAAGTTGGAAAGCTCATGGGTCAGGG 1800

  3731985 CAAGCAGGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAG 3732044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAGCAGGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAG 1860

  3732045 AGTGTTTAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCT 3732104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTGTTTAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCT 1920

  3732105 GGTCTATCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGG 3732164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTCTATCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGG 1980

  3732165 CAGTAATGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCT 3732224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGTAATGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCT 2040

  3732225 CTCCTTTGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGA 3732284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCCTTTGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGA 2100

  3732285 GGCCAGTAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTAT 3732344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGCCAGTAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTAT 2160

  3732345 GGGGTATGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTC 3732404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGGGTATGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTC 2220

  3732405 TCTCCTGGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCAC 3732464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTCCTGGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCAC 2280

  3732465 CATCTCTGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTC 3732524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CATCTCTGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTC 2340

  3732525 GGGTGTACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAA 3732584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGGTGTACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAA 2400

  3732585 AATAGGAAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCA 3732644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATAGGAAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCA 2460

  3732645 GTCTCACCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGT 3732704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTCTCACCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGT 2520

  3732705 CCGCAACTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAA 3732764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCGCAACTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAA 2580

  3732765 AGAAACATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGT 3732824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGAAACATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGT 2640

  3732825 AAACTATCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCT 3732884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAACTATCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCT 2700

  3732885 CAGAAAGATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTG 3732944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGAAAGATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTG 2760

  3732945 TAGCAATCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTC 3733004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGCAATCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTC 2820

  3733005 TAAAATTTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAG 3733064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAAAATTTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAG 2880

  3733065 AAGAGATGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATT 3733124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGAGATGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATT 2940

  3733125 AAGAAGAAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACAT 3733184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGAAGAAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACAT 3000

  3733185 AAAAGGAAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATC 3733244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAAGGAAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATC 3060

  3733245 ATTAACATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTA 3733304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTAACATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTA 3120

  3733305 TTTTTCCTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCT 3733364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTTTCCTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCT 3180

  3733365 GGCAGTAAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGC 3733424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGCAGTAAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGC 3240

  3733425 AAATGGAAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCA 3733484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAATGGAAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCA 3300

  3733485 GTCCTCAGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGA 3733544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTCCTCAGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGA 3360

  3733545 AGATGTTTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGC 3733604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGATGTTTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGC 3420

  3733605 TTTATCCACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAG 3733664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTATCCACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAG 3480

  3733665 ATTCTAAGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATG 3733724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTCTAAGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATG 3540

  3733725 ACATTAAACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAA 3733784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACATTAAACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAA 3600

  3733785 AAGGCCAATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAA 3733844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAGGCCAATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAA 3660

  3733845 GGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGA 3733904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGA 3720

  3733905 TGGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACC 3733964
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGGAGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACC 3780

  3733965 TCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAG 3734024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAG 3840

  3734025 GAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTG 3734084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTG 3900

  3734085 GTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCT 3734144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCT 3960

  3734145 GGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTT 3734204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTT 4020

  3734205 TTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATG 3734264
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTTTTT-CTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATG 4079

  3734265 GTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAG 3734324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 GTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAG 4139

  3734325 CCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTT 3734384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTT 4199

  3734385 AGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGA 3734444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGA 4259

  3734445 TCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCT 3734504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCT 4319

  3734505 TTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAA 3734564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAA 4379

  3734565 TATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTT 3734624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTT 4439

  3734625 TGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGG 3734684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGG 4499

  3734685 TGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTG 3734744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTG 4559

  3734745 TAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 4599

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 4659

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 4719

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 4779

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 4839

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 4899

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 4959

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 5019

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 5079

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 5139

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 5199

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5200 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 5259

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 5319

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 5379

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 5439

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 5499

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 5559

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 5619

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 5679

  3736923 AGACCTTCTCT 3736933
          |||||||||||
     5680 AGACCTTCTCT 5690

Alignment time is 4.3375 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   7201] =>      7201 nucs 'mol-32-1f00-182100_7201'

Score:        7068
Aligned:      7206        nucs
Identic:      7191 (100%) nucs =>      1023 (100%)      6168 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3733761,3734784] EXCISED REGION [3735843,3742021]
 second seq =>  [      1,   1025] EXCISED REGION [   1026,   7201]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3733761 ATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTAC 3733820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTAC 60

  3733821 TTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGA 3733880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGA 120

  3733881 CTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTG 3733940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTG 180

  3733941 GCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 3734000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 240

  3734001 CCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTT 3734060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTT 300

  3734061 AAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCA 3734120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCA 360

  3734121 CCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATT 3734180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATT 420

  3734181 GCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCT 3734240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCT 480

  3734241 TGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAG 3734300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAG 540

  3734301 GTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACC 3734360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACC 600

  3734361 ACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGG 3734420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGG 660

  3734421 TCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 3734480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 720

  3734481 AGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTT 3734540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTT 780

  3734541 AATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCG 3734600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCG 840

  3734601 CTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAG 3734660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAG 900

  3734661 GTCGAGACCATC-TGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATT 3734719
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATT 960

  3734720 AGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAA 3734779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAA 1020

  3734780 TGGCG 3734784
          |||||
     1021 TGGCG 1025

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 1085

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 1145

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 1205

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 1265

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 1325

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 1385

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 1445

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 1505

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 1565

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 1625

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1626 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 1685

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 1745

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 1805

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1865

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1925

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1985

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 2045

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 2105

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 2165

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 2225

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 2285

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 2345

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 2405

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 2465

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 2525

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 2585

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 2645

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 2705

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 2765

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 2825

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 2885

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 2945

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3005

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3065

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3125

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3185

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3245

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3305

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 AAAC-AAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3364

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3424

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3484

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3544

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3604

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3664

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3724

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3784

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3844

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3904

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3964

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 4024

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 4084

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 4144

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 4204

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 4264

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 4324

  3739143 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 4384

  3739203 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 4444

  3739263 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 4504

  3739323 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 4564

  3739383 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 4624

  3739443 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 4684

  3739503 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 4744

  3739563 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3739622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 4804

  3739623 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 3739682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 4864

  3739683 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 3739742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 4924

  3739743 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGC 3739802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGC 4984

  3739803 TGGCCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCA 3739862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 TGGCCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCA 5044

  3739863 TTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTATAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTA 3739922
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 TTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTA 5104

  3739923 GGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCTGTCATC 3739982
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 GGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCTGTCATC 5163

  3739983 TGCCTTTCCAGATAAGGAAACTGAGATTTTTAGAGGCTAAATAACTTGCCCGAGGCCATA 3740042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 TGCCTTTCCAGATAAGGAAACTGAGATTTTTAGAGGCTAAATAACTTGCCCGAGGCCATA 5223

  3740043 GAGCTAGAAAGTAACAGATTAAGATTTGAATCCAGGTAACTAGGCTTCAGAGCTCATGCT 3740102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 GAGCTAGAAAGTAACAGATTAAGATTTGAATCCAGGTAACTAGGCTTCAGAGCTCATGCT 5283

  3740103 CATAACCATGAAACCAATGGTCCTCAATCCTGTCTGCACATTAAAAGTACCTGAAAAGAT 3740162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 CATAACCATGAAACCAATGGTCCTCAATCCTGTCTGCACATTAAAAGTACCTGAAAAGAT 5343

  3740163 GGCCTGGCGCAATGGCTCACACCTACAACGCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGA 3740222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 GGCCTGGCGCAATGGCTCACACCTACAACGCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGA 5403

  3740223 TCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCACCCTGGTCAACATGGTGAAAACTCGTCTCTATTAA 3740282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 TCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCACCCTGGTCAACATGGTGAAAACTCGTCTCTATTAA 5463

  3740283 ATACAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT 3740342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 ATACAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT 5523

  3740343 GAGGCAGGGGAATCACTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCGTGCCA 3740402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 GAGGCAGGGGAATCACTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCGTGCCA 5583

  3740403 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAAA 3740462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAAA 5643

  3740463 AATAAATAAATAAAAATTACCTGAGAAGATATAAAAAGAATAACTATCAGCCGGGCGCAG 3740522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 AATAAATAAATAAAAATTACCTGAGAAGATATAAAAAGAATAACTATCAGCCGGGCGCAG 5703

  3740523 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAG 3740582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAG 5763

  3740583 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAACTACAAAAAT 3740642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAACTACAAAAAT 5823

  3740643 TAGCTGGGCACGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGA 3740702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 TAGCTGGGCACGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGA 5883

  3740703 ATCGCTTGAACCCGGGCGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAG 3740762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5884 ATCGCTTGAACCCGGGCGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAG 5943

  3740763 CCTGGGCTACAGAAAGAGAGGAAAAAAAAAATGCTGGGCAGTGGCCAAGGTGGGTGGATC 3740822
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5944 CCTGGGCTACAGAAAGAGAGG-AAAAAAAAATGCTGGGCAGTGGCCAAGGTGGGTGGATC 6002

  3740823 ACGAGGTCAGGAGGTCAGGAGCTTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATACAAAAAATTAG 3740882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 ACGAGGTCAGGAGGTCAGGAGCTTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATACAAAAAATTAG 6062

  3740883 CTGGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATC 3740942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 CTGGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATC 6122

  3740943 GCTTGAACCCAGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCT 3741002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 GCTTGAACCCAGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCT 6182

  3741003 GGGTGACAGAGCAAGCCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACCAGTAAC 3741062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 GGGTGACAGAGCAAGCCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACCAGTAAC 6242

  3741063 TATCCCTGGGACCTATCCAACTCCAACTAATATAAAGTGGTCTGAGATGGGCAGCAGGGT 3741122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 TATCCCTGGGACCTATCCAACTCCAACTAATATAAAGTGGTCTGAGATGGGCAGCAGGGT 6302

  3741123 TCCCCAGGGCTCAGGAACACTATCCTAGGCCATGCTGCCTCCTGGACAAAGAATCGACTG 3741182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 TCCCCAGGGCTCAGGAACACTATCCTAGGCCATGCTGCCTCCTGGACAAAGAATCGACTG 6362

  3741183 AAATAAGCAAGCTTCCCCAGCTGACATCCCACGGCCGACCTTACTGCCTTTTTTAGGAAT 3741242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 AAATAAGCAAGCTTCCCCAGCTGACATCCCACGGCCGACCTTACTGCCTTTTTTAGGAAT 6422

  3741243 ATCTTTAGAACCGTGAGACTGGAGTTGTACGTTAAAAAAAAAAATT--TTTTTAAATTAA 3741300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
     6423 ATCTTTAGAACCGTGAGACTGGAGTTGTACGTTAAAAAAAAAAA--AATTTTTAAATTAA 6480

  3741301 AAGTTAACCCCAAAAGTGATCCTATTAAGGTAAGTATCATATTTCCATTTTACAGACAAG 3741360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 AAGTTAACCCCAAAAGTGATCCTATTAAGGTAAGTATCATATTTCCATTTTACAGACAAG 6540

  3741361 GAGACTGAAACTAACAAGGCTCAAGAACTTGTCCTCAGTCACAAAGGAACTGAGACTAGA 3741420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GAGACTGAAACTAACAAGGCTCAAGAACTTGTCCTCAGTCACAAAGGAACTGAGACTAGA 6600

  3741421 TTCTACGAGGCTTTTGCGCCCTAAAGAGCTCCAACAGATGTGAGAAAACACTTCAAGTGG 3741480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TTCTACGAGGCTTTTGCGCCCTAAAGAGCTCCAACAGATGTGAGAAAACACTTCAAGTGG 6660

  3741481 GTGAGCAGAGATGCTCCACGGGGGAAGTGACACCTGACCAGAGATAAAGCATGGGACAAG 3741540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GTGAGCAGAGATGCTCCACGGGGGAAGTGACACCTGACCAGAGATAAAGCATGGGACAAG 6720

  3741541 GAAGGGCAAATGCACAGAATGAAAGGCATGAGCCGTATCAGAGGCAAGCCGCCTCAAGGA 3741600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 GAAGGGCAAATGCACAGAATGAAAGGCATGAGCCGTATCAGAGGCAAGCCGCCTCAAGGA 6780

  3741601 ATGCTCTCGGGACCAGAGGTCGACAGGTGTGATAAAGCTATGACGCCCTCGCGGTAGAGT 3741660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 ATGCTCTCGGGACCAGAGGTCGACAGGTGTGATAAAGCTATGACGCCCTCGCGGTAGAGT 6840

  3741661 TGTGAGAGAGACTCACAGGTATGCTTGCGCCCGGCTGTGCAGGCACATGAAGGTCAAGCC 3741720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TGTGAGAGAGACTCACAGGTATGCTTGCGCCCGGCTGTGCAGGCACATGAAGGTCAAGCC 6900

  3741721 ACACCTGGCCTTCACAGGACTTCTCCTCAAACAGAAACCCCGCCCATGAGGGAAGCAAGG 3741780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 ACACCTGGCCTTCACAGGACTTCTCCTCAAACAGAAACCCCGCCCATGAGGGAAGCAAGG 6960

  3741781 GCGTGTTTCTGACTTGAACTGGTCATGCAGGATAAAGAGTGAAGCAGCTTCCAGAGTTCA 3741840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 GCGTGTTTCTGACTTGAACTGGTCATGCAGGATAAAGAGTGAAGCAGCTTCCAGAGTTCA 7020

  3741841 GCTCTGCATCCACACTGCTGGGCCCATTAGGACTGACTGAGGAGGGACGCAATATCAGTC 3741900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 GCTCTGCATCCACACTGCTGGGCCCATTAGGACTGACTGAGGAGGGACGCAATATCAGTC 7080

  3741901 GATAGCACCACATCCTACATTACACAGCAACAGAGCAAAGGAGTTAAGGGCAAGGCTCTA 3741960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GATAGCACCACATCCTACATTACACAGCAACAGAGCAAAGGAGTTAAGGGCAAGGCTCTA 7140

  3741961 GAGTCAAAGAAACTGGGTGTGAATCCTGACTCCACCTTTACTAGCTACATGACCCTGGGC 3742020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GAGTCAAAGAAACTGGGTGTGAATCCTGACTCCACCTTTACTAGCTACATGACCCTGGGC 7200

  3742021 A 3742021
          |
     7201 A 7201

Alignment time is 5.39682 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2538] =>      2538 nucs 'mol-32-1f58-013971_2538'

Score:        2537
Aligned:      2537        nucs
Identic:      2537 (100%) nucs =>      1662 (100%)       875 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3732251,3733912] EXCISED REGION [3733914,3734788]
 second seq =>  [      1,   1662] EXCISED REGION [   1664,   2538]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [3733913,3733913]
 second seq =>         1 nucs [1663,1663]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1662,1662] to [1663,1663]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  3732251 TAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAGTAACCCACCTCCTAGAGCCC 3732310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAGTAACCCACCTCCTAGAGCCC 60

  3732311 TGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTATGAGCTGGCAGACTGGCAAG 3732370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTATGAGCTGGCAGACTGGCAAG 120

  3732371 GGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCTGGACTAACAGCAGAAGTTCG 3732430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCTGGACTAACAGCAGAAGTTCG 180

  3732431 GCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTCTGATGGCAAGAACTCTTGAA 3732490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTCTGATGGCAAGAACTCTTGAA 240

  3732491 AAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGTACTTACAGGAGGTATCATCC 3732550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGTACTTACAGGAGGTATCATCC 300

  3732551 AACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGGAAAAGACATCTTGGGTGCTC 3732610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGGAAAAGACATCTTGGGTGCTC 360

  3732611 ATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCACCTTGGGGATTGCTAGAAAG 3732670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCACCTTGGGGATTGCTAGAAAG 420

  3732671 ACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAACTGCACATCCCATCCACACT 3732730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAACTGCACATCCCATCCACACT 480

  3732731 CCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAACATGCTGAGAGAAACTATAAT 3732790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAACATGCTGAGAGAAACTATAAT 540

  3732791 TATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTATCTTAATTTTTATCACTCAA 3732850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTATCTTAATTTTTATCACTCAA 600

  3732851 CGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAAGATTAAACAAAGGGTGTTGA 3732910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAAGATTAAACAAAGGGTGTTGA 660

  3732911 TAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAATCAGAGCACTATCAAGCTCA 3732970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAATCAGAGCACTATCAAGCTCA 720

  3732971 ACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAATTTTTAAATGTATGTTAAAGA 3733030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAATTTTTAAATGTATGTTAAAGA 780

  3733031 GAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGATGCTGCCCGTGACTATGTCA 3733090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGATGCTGCCCGTGACTATGTCA 840

  3733091 AAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAGAAAAAGACAACCCAAAATAA 3733150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAGAAAAAGACAACCCAAAATAA 900

  3733151 AAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGGAAATACAAAAGGCCAATAAA 3733210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGGAAATACAAAAGGCCAATAAA 960

  3733211 TATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAACATGCACATGAAAACAAGAAG 3733270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAACATGCACATGAAAACAAGAAG 1020

  3733271 ACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTCCTGCGTCTCTGGTCCTTGAA 3733330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTCCTGCGTCTCTGGTCCTTGAA 1080

  3733331 TCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGTAAGTAGGGGAAAGGCTTACT 3733390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGTAAGTAGGGGAAAGGCTTACT 1140

  3733391 TCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGGAAGGGTCTGCAGAAAACGTG 3733450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGGAAGGGTCTGCAGAAAACGTG 1200

  3733451 ATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTCAGTATCGCCCCTCAACAAAC 3733510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTCAGTATCGCCCCTCAACAAAC 1260

  3733511 ACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGTTTGCTAAGGCACGATTTCTA 3733570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGTTTGCTAAGGCACGATTTCTA 1320

  3733571 ATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATCCACATTATAAAATATTATGT 3733630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATCCACATTATAAAATATTATGT 1380

  3733631 GGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTAAGATGTATCACAGAGTGAAA 3733690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTAAGATGTATCACAGAGTGAAA 1440

  3733691 AAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTAAACAATACCATACATTTACT 3733750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTAAACAATACCATACATTTACT 1500

  3733751 AAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACACTGATAA 3733810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACACTGATAA 1560

  3733811 CTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGC 3733870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGC 1620

  3733871 CTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCT 3733912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCT 1662

EXCISED REGION

  3733914 GCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTC 3733973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 GCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTC 1723

  3733974 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACC 3734033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACC 1783

  3734034 ACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATG 3734093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 ACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATG 1843

  3734094 GTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACA 3734153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 GTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACA 1903

  3734154 GGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTC 3734213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 GGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTC 1963

  3734214 TTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCT 3734273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCT 2023

  3734274 CGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAG 3734333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 CGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAG 2083

  3734334 TAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 3734393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 TAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 2143

  3734394 GACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGC 3734453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 GACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGC 2203

  3734454 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACT 3734513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACT 2263

  3734514 ACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAAT 3734573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 ACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAAT 2323

  3734574 AAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCA 3734633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 AAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCA 2383

  3734634 GAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCC 3734693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 GAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCC 2443

  3734694 ATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAG 3734753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 ATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAG 2503

  3734754 CTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAA 3734788
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 CTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAA 2538

Alignment time is 1.9309 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2216] =>      2216 nucs 'mol-32-22b2-029981_2216'

Score:        2172
Aligned:      2216        nucs
Identic:      2212 (100%) nucs =>       330 (100%)      1882 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734455,3734784] EXCISED REGION [3735843,3737728]
 second seq =>  [      1,    330] EXCISED REGION [    331,   2216]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734455 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTA 3734514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTA 60

  3734515 CATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATA 3734574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATA 120

  3734575 AATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAG 3734634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAG 180

  3734635 AGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 3734694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 240

  3734695 TCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGC 3734754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGC 300

  3734755 TACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 330

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      331 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 390

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      391 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 450

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 510

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 570

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 630

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 690

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 750

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 810

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 870

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 930

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      931 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 990

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 1050

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 1110

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1170

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1230

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1290

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1350

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1410

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1470

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1530

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1590

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1650

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 1710

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 1770

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 1830

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 1890

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 1950

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 2010

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 2070

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 2130

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 2190

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGA 3737728
          ||||||||||||||||||||||||||
     2191 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGA 2216

Alignment time is 1.69449 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   5503] =>      5503 nucs 'mol-32-299d-014874_5503'

Score:        5415
Aligned:      5503        nucs
Identic:      5495 (100%) nucs =>      3693 (100%)      1802 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3731090,3734784] EXCISED REGION [3735843,3737650]
 second seq =>  [      1,   3695] EXCISED REGION [   3696,   5503]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3731090 TAAACTATAACCCTCAAGCAAAATCTAGCCCACCACCTGTTGTTTATTTACATTTGTACC 3731149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAACTATAACCCTCAAGCAAAATCTAGCCCACCACCTGTTGTTTATTTACATTTGTACC 60

  3731150 AGCTTTATTTAGGTTTAATTAATGTACAATAAACTACACACATCTACCACCTGCTTTTGT 3731209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTTTATTTAGGTTTAATTAATGTACAATAAACTACACACATCTACCACCTGCTTTTGT 120

  3731210 TTTTGTTTTTTCTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAG 3731269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTGTTTTTTCTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAG 180

  3731270 TGGCACTATCTTGGCTCACTGCTGCCTCTGCCTCCCAGATTCAAGCAATTCTCCTGCCTC 3731329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCACTATCTTGGCTCACTGCTGCCTCTGCCTCCCAGATTCAAGCAATTCTCCTGCCTC 240

  3731330 AGCCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGTGCATCGCCACATGAGGCTAATTTTTGTATT 3731389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGTGCATCGCCACATGAGGCTAATTTTTGTATT 300

  3731390 TTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAAG 3731449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAAG 360

  3731450 TGATCCTCCCGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGTGCCTG 3731509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATCCTCCCGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGTGCCTG 420

  3731510 GCCTACCGCCTGTTTTTGTAAATAAAGTTCTACTGGAAAACAGCCAGACTCATAGCTTCT 3731569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCTACCGCCTGTTTTTGTAAATAAAGTTCTACTGGAAAACAGCCAGACTCATAGCTTCT 480

  3731570 GTATTATTTATAGTTGCTTTCATGCTACCACAGCAGAGCTGAGCAGATGTGACAGAGACC 3731629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTATTATTTATAGTTGCTTTCATGCTACCACAGCAGAGCTGAGCAGATGTGACAGAGACC 540

  3731630 GTTAAGCCTACAAAGCCTCAAGTATCTGCATTCCAGCCCTTTACAGAAAAAGGTCTGCCA 3731689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTAAGCCTACAAAGCCTCAAGTATCTGCATTCCAGCCCTTTACAGAAAAAGGTCTGCCA 600

  3731690 ATTCCCGATTTGGATAGTGTAAGTTAAACAGAAAGAAAACAGGAGAAAAATGTTTCACTC 3731749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTCCCGATTTGGATAGTGTAAGTTAAACAGAAAGAAAACAGGAGAAAAATGTTTCACTC 660

  3731750 AGTCATGTTTGTCTTTCAATGAAAACATCTTCCTACGAGAGCAGCTAAGAAAACCGGCTG 3731809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTCATGTTTGTCTTTCAATGAAAACATCTTCCTACGAGAGCAGCTAAGAAAACCGGCTG 720

  3731810 CCATCTAGGGTGCTACCCAGCAGGTCAGCCAGCTGGCAGCAAGTAAAGCCAGACTAGAAG 3731869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCATCTAGGGTGCTACCCAGCAGGTCAGCCAGCTGGCAGCAAGTAAAGCCAGACTAGAAG 780

  3731870 TAAGTCAAGACAAGAAGCCAGCAAAGCAGTAACAAGAGGTCAGGCCAGACTTACAGTAAG 3731929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAGTCAAGACAAGAAGCCAGCAAAGCAGTAACAAGAGGTCAGGCCAGACTTACAGTAAG 840

  3731930 CAGGCAAGTTAAAAATTACAGTTGGCCCACAAGTTGGAAAGCTCATGGGTCAGGGCAAGC 3731989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGGCAAGTTAAAAATTACAGTTGGCCCACAAGTTGGAAAGCTCATGGGTCAGGGCAAGC 900

  3731990 AGGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGT 3732049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGT 960

  3732050 TTAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCT 3732109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCT 1020

  3732110 ATCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTA 3732169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTA 1080

  3732170 ATGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCT 3732229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCT 1140

  3732230 TTGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCA 3732289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCA 1200

  3732290 GTAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGT 3732349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGT 1260

  3732350 ATGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCC 3732409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCC 1320

  3732410 TGGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCT 3732469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCT 1380

  3732470 CTGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTG 3732529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTG 1440

  3732530 TACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAG 3732589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAG 1500

  3732590 GAAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTC 3732649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTC 1560

  3732650 ACCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCA 3732709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCA 1620

  3732710 ACTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAA 3732769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAA 1680

  3732770 CATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACT 3732829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACT 1740

  3732830 ATCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAA 3732889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAA 1800

  3732890 AGATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCA 3732949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCA 1860

  3732950 ATCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAA 3733009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAA 1920

  3733010 TTTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAG 3733069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAG 1980

  3733070 ATGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAA 3733129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAA 2040

  3733130 GAAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAG 3733189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAG 2100

  3733190 GAAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAA 3733249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAA 2160

  3733250 CATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTT 3733309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTT 2220

  3733310 CCTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAG 3733369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAG 2280

  3733370 TAAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATG 3733429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATG 2340

  3733430 GAAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCT 3733489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCT 2400

  3733490 CAGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATG 3733549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATG 2460

  3733550 TTTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTAT 3733609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTAT 2520

  3733610 CCACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCT 3733669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCT 2580

  3733670 AAGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATT 3733729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATT 2640

  3733730 AAACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGC 3733789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGC 2700

  3733790 CAATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTA 3733849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTA 2760

  3733850 TGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAG 3733909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAG 2820

  3733910 TCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 3733969
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2821 TCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCATTGCAACCTCCGC 2880

  3733970 CTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCG 3734029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCG 2940

  3734030 TACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAG 3734089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAG 3000

  3734090 CATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGAT 3734149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGAT 3060

  3734150 TACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTT 3734209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTT 3120

  3734210 TTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCA 3734269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCA 3180

  3734270 ATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCC 3734329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCC 3240

  3734330 CAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAG 3734389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAG 3300

  3734390 AGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGC 3734449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGC 3360

  3734450 CTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTT 3734509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTT 3420

  3734510 TACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATAT 3734569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATAT 3480

  3734570 CAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 3734629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 3540

  3734630 GGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAA 3734689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAA 3600

  3734690 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTC 3734749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTC 3660

  3734750 CCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3695

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3755

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3815

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3875

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3935

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3995

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 4055

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 4115

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 4175

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 4235

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 4295

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4296 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 4355

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 4415

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 4475

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 4535

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 GTGCACCACTGCACCTAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 4595

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 4655

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 4715

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 4775

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 4835

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 4895

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 4955

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 5015

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 5075

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 5135

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 5195

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGTCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 5255

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 5315

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 5375

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 5435

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 5495

  3737643 GGGTTTGG 3737650
          ||||||||
     5496 GGGTTTGG 5503

Alignment time is 4.1502 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2002] =>      2002 nucs 'mol-32-299d-014874_2002'

Score:        1936
Aligned:      2002        nucs
Identic:      1996 (100%) nucs =>       194 (100%)      1802 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734591,3734784] EXCISED REGION [3735843,3737650]
 second seq =>  [      1,    194] EXCISED REGION [    195,   2002]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734591 GGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACG 3734650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACG 60

  3734651 AGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAC 3734710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAC 120

  3734711 AAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAG 3734770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAG 180

  3734771 GCAGGAGAATGGCG 3734784
          ||||||||||||||
      181 GCAGGAGAATGGCG 194

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 254

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 314

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 374

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 434

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 494

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 554

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 614

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 674

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 734

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 794

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      795 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 854

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 914

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 974

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1034

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 GTGCACCACTGCACCTAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1094

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1154

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1214

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1274

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1334

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1394

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1454

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1514

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 1574

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 1634

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 1694

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGTCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 1754

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 1814

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 1874

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 1934

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 1994

  3737643 GGGTTTGG 3737650
          ||||||||
     1995 GGGTTTGG 2002

Alignment time is 1.5215 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2871] =>      2871 nucs 'mol-32-2b4a-075403_2871'

Score:        2786
Aligned:      2841        nucs
Identic:      2836 (100%) nucs =>       647 (100%)      2189 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734137,3734784] EXCISED REGION [3735843,3738035]
 second seq =>  [     32,    678] EXCISED REGION [    679,   2871]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734137 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACT 3734196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       32 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACT 91

  3734197 ACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGA 3734256
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       92 ACCTTTTTTTTTTTT-CTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGA 150

  3734257 ATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCC 3734316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      151 ATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCC 210

  3734317 CGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTT 3734376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      211 CGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTT 270

  3734377 GTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACC 3734436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      271 GTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACC 330

  3734437 TCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCAC 3734496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      331 TCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCAC 390

  3734497 ACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAA 3734556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      391 ACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAA 450

  3734557 TTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCC 3734616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 TTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCC 510

  3734617 CAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGC 3734676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 CAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGC 570

  3734677 CAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCA 3734736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 CAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCA 630

  3734737 GGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 GGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 678

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 738

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 798

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 858

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 918

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 978

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 1038

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 1098

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 1158

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 1218

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 1278

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1279 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 1338

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 1398

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 1458

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1518

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1578

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1638

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1698

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1758

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1818

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1878

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1938

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1998

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 2058

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 2118

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 2178

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 2238

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 2298

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 2358

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 2418

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 2478

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 2538

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 2598

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 2658

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 2718

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 2778

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 2838

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATC 3738035
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATC 2871

Alignment time is 2.19255 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   5400] =>      5400 nucs 'mol-32-2f28-078071_5400'

Score:        5325
Aligned:      5402        nucs
Identic:      5395 (100%) nucs =>      3378 (100%)      2017 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3731404,3734784] EXCISED REGION [3735843,3737863]
 second seq =>  [      1,   3379] EXCISED REGION [   3380,   5400]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3731404 GGTTTTGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCTCCCGCCC 3731463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTTTGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCTCCCGCCC 60

  3731464 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGTGCCTGGCCTACCGCCTGTT 3731523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGTGCCTGGCCTACCGCCTGTT 120

  3731524 TTTGTAAATAAAGTTCTACTGGAAAACAGCCAGACTCATAGCTTCTGTATTATTTATAGT 3731583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTAAATAAAGTTCTACTGGAAAACAGCCAGACTCATAGCTTCTGTATTATTTATAGT 180

  3731584 TGCTTTCATGCTACCACAGCAGAGCTGAGCAGATGTGACAGAGACCGTTAAGCCTACAAA 3731643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTTTCATGCTACCACAGCAGAGCTGAGCAGATGTGACAGAGACCGTTAAGCCTACAAA 240

  3731644 GCCTCAAGTATCTGCATTCCAGCCCTTTACAGAAAAAGGTCTGCCAATTCCCGATTTGGA 3731703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCTCAAGTATCTGCATTCCAGCCCTTTACAGAAAAAGGTCTGCCAATTCCCGATTTGGA 300

  3731704 TAGTGTAAGTTAAACAGAAAGAAAACAGGAGAAAAATGTTTCACTCAGTCATGTTTGTCT 3731763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTGTAAGTTAAACAGAAAGAAAACAGGAGAAAAATGTTTCACTCAGTCATGTTTGTCT 360

  3731764 TTCAATGAAAACATCTTCCTACGAGAGCAGCTAAGAAAACCGGCTGCCATCTAGGGTGCT 3731823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCAATGAAAACATCTTCCTACGAGAGCAGCTAAGAAAACCGGCTGCCATCTAGGGTGCT 420

  3731824 ACCCAGCAGGTCAGCCAGCTGGCAGCAAGTAAAGCCAGACTAGAAGTAAGTCAAGACAAG 3731883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCCAGCAGGTCAGCCAGCTGGCAGCAAGTAAAGCCAGACTAGAAGTAAGTCAAGACAAG 480

  3731884 AAGCCAGCAAAGCAGTAACAAGAGGTCAGGCCAGACTTACAGTAAGCAGGCAAGTTAAAA 3731943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCCAGCAAAGCAGTAACAAGAGGTCAGGCCAGACTTACAGTAAGCAGGCAAGTTAAAA 540

  3731944 ATTACAGTTGGCCCACAAGTTGGAAAGCTCATGGGTCAGGGCAAGCAGGTGACATTCTAG 3732003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTACAGTTGGCCCACAAGTTGGAAAGCTCATGGGTCAGGGCAAGCAGGTGACATTCTAG 600

  3732004 AACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGTTTAGCTCTAGGTCA 3732063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGTTTAGCTCTAGGTCA 660

  3732064 TTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCTATCTCTAGGTCAGA 3732123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCTATCTCTAGGTCAGA 720

  3732124 GACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTAATGACAAAGTCCAA 3732183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTAATGACAAAGTCCAA 780

  3732184 GGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCTTTGTTGGGAAAAGG 3732243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCTTTGTTGGGAAAAGG 840

  3732244 TGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAGTAACCCACCTCCT 3732303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAGTAACCCACCTCCT 900

  3732304 AGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTATGAGCTGGCAGAC 3732363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTATGAGCTGGCAGAC 960

  3732364 TGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCTGGACTAACAGCAG 3732423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCTGGACTAACAGCAG 1020

  3732424 AAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTCTGATGGCAAGAAC 3732483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTCTGATGGCAAGAAC 1080

  3732484 TCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGTACTTACAGGAGGT 3732543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGTACTTACAGGAGGT 1140

  3732544 ATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGGAAAAGACATCTTG 3732603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGGAAAAGACATCTTG 1200

  3732604 GGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCACCTTGGGGATTGC 3732663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCACCTTGGGGATTGC 1260

  3732664 TAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAACTGCACATCCCAT 3732723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAACTGCACATCCCAT 1320

  3732724 CCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAACATGCTGAGAGAAA 3732783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAACATGCTGAGAGAAA 1380

  3732784 CTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTATCTTAATTTTTAT 3732843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTATCTTAATTTTTAT 1440

  3732844 CACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAAGATTAAACAAAGG 3732903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAAGATTAAACAAAGG 1500

  3732904 GTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAATCAGAGCACTATC 3732963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAATCAGAGCACTATC 1560

  3732964 AAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAATTTTTAAATGTATG 3733023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAATTTTTAAATGTATG 1620

  3733024 TTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGATGCTGCCCGTGAC 3733083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGATGCTGCCCGTGAC 1680

  3733084 TATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAGAAAAAGACAACCC 3733143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAGAAAAAGACAACCC 1740

  3733144 AAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGGAAATACAAAAGGC 3733203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGGAAATACAAAAGGC 1800

  3733204 CAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAACATGCACATGAAAA 3733263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAACATGCACATGAAAA 1860

  3733264 CAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTCCTGCGTCTCTGGT 3733323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTCCTGCGTCTCTGGT 1920

  3733324 CCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGTAAGTAGGGGAAAG 3733383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGTAAGTAGGGGAAAG 1980

  3733384 GCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGGAAGGGTCTGCAGA 3733443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGGAAGGGTCTGCAGA 2040

  3733444 AAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTCAGTATCGCCCCTC 3733503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTCAGTATCGCCCCTC 2100

  3733504 AACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGTTTGCTAAGGCACG 3733563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGTTTGCTAAGGCACG 2160

  3733564 ATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATCCACATTATAAAAT 3733623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATCCACATTATAAAAT 2220

  3733624 ATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTAAGATGTATCACAG 3733683
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTATGTGGTAAAAA-TGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTAAGATGTATCACAG 2279

  3733684 AGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTAAACAATACCATAC 3733743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTAAACAATACCATAC 2339

  3733744 ATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACA 3733803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACA 2399

  3733804 CTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAA 3733863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAA 2459

  3733864 ACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGC 3733923
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2460 ACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGC 2519

  3733924 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAG 3733983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAG 2579

  3733984 CGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCG 3734043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCG 2639

  3734044 GCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCC 3734103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCC 2699

  3734104 CTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC 3734163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC 2759

  3734164 ACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTG 3734223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     2760 ACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTT-CTTTTTTTTTG 2818

  3734224 AGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTG 3734283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTG 2878

  3734284 CAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAT 3734343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAT 2938

  3734344 TACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTC 3734403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTC 2998

  3734404 CATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCC 3734463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCC 3058

  3734464 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTA 3734523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTA 3118

  3734524 AGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTT 3734583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTT 3178

  3734584 AAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCA 3734643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 AAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCA 3238

  3734644 GATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTA 3734703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTA 3298

  3734704 AAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGA 3734763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGA 3358

  3734764 GGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          |||||||||||||||||||||
     3359 GGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3379

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3439

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3499

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3559

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3619

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3679

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3739

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3799

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3859

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3919

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3979

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3980 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 4039

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 4099

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 4159

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 4219

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 4279

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 4339

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 4399

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 4459

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 4519

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 4579

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 4639

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 4699

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 4759

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 4819

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 4879

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 4939

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 4999

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 5059

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 5119

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 5179

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 5239

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 5299

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 5359

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGA 3737863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGA 5400

Alignment time is 4.07349 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2215] =>      2215 nucs 'mol-32-2f28-078071_2215'

Score:        2171
Aligned:      2215        nucs
Identic:      2211 (100%) nucs =>       194 (100%)      2017 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734591,3734784] EXCISED REGION [3735843,3737863]
 second seq =>  [      1,    194] EXCISED REGION [    195,   2215]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734591 GGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACG 3734650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACG 60

  3734651 AGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAC 3734710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAC 120

  3734711 AAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAG 3734770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAG 180

  3734771 GCAGGAGAATGGCG 3734784
          ||||||||||||||
      181 GCAGGAGAATGGCG 194

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 254

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 314

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 374

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 434

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 494

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 554

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 614

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 674

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 734

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 794

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      795 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 854

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 914

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 974

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1034

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1094

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1154

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1214

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1274

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1334

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1394

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1454

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1514

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 1574

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 1634

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 1694

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 1754

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 1814

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 1874

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 1934

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 1994

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 2054

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 2114

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 2174

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGA 3737863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGA 2215

Alignment time is 1.67704 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   7575] =>      7575 nucs 'mol-32-2f33-015617_7575'

Score:        7453
Aligned:      7582        nucs
Identic:      7567 (100%) nucs =>      2791 (100%)      4776 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3731991,3734784] EXCISED REGION [3735843,3740630]
 second seq =>  [      1,   2792] EXCISED REGION [   2793,   7575]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3731991 GGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGTT 3732050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGTT 60

  3732051 TAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCTA 3732110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCTA 120

  3732111 TCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTAA 3732170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTAA 180

  3732171 TGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCTT 3732230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCTT 240

  3732231 TGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAG 3732290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAG 300

  3732291 TAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTA 3732350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTA 360

  3732351 TGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCT 3732410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCT 420

  3732411 GGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTC 3732470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTC 480

  3732471 TGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGT 3732530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGT 540

  3732531 ACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGG 3732590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGG 600

  3732591 AAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCA 3732650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCA 660

  3732651 CCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAA 3732710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAA 720

  3732711 CTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAAC 3732770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAAC 780

  3732771 ATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTA 3732830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTA 840

  3732831 TCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAA 3732890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAA 900

  3732891 GATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAA 3732950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAA 960

  3732951 TCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAAT 3733010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAAT 1020

  3733011 TTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGA 3733070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGA 1080

  3733071 TGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAG 3733130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAG 1140

  3733131 AAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGG 3733190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGG 1200

  3733191 AAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAAC 3733250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAAC 1260

  3733251 ATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTC 3733310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTC 1320

  3733311 CTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGT 3733370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGT 1380

  3733371 AAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGG 3733430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGG 1440

  3733431 AAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTC 3733490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTC 1500

  3733491 AGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGT 3733550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGT 1560

  3733551 TTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATC 3733610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATC 1620

  3733611 CACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTA 3733670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTA 1680

  3733671 AGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTA 3733730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTA 1740

  3733731 AACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCC 3733790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCC 1800

  3733791 AATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTAT 3733850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTAT 1860

  3733851 GGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGT 3733910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGT 1920

  3733911 CTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCC 3733970
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCC 1980

  3733971 TTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGT 3734030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGT 2040

  3734031 ACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGC 3734090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGC 2100

  3734091 ATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATT 3734150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATT 2160

  3734151 ACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTT 3734210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTT 2220

  3734211 TTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAA 3734270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAA 2280

  3734271 TCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCC 3734330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCC 2340

  3734331 AAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGA 3734390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGA 2400

  3734391 GACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCC 3734450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCC 2460

  3734451 TGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTT 3734510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTT 2520

  3734511 ACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATC 3734570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATC 2580

  3734571 AATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 3734630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 2640

  3734631 GCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAAC 3734690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAAC 2700

  3734691 CCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCC 3734750
          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCATCTCTACTAAAAATACAA--AAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCC 2758

  3734751 CAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 2792

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 2852

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 2912

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 2972

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3032

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3092

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3152

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3212

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3272

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3332

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3392

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
     3393 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGGTGCAATGAGCCATGATCG 3452

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3512

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3572

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3632

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3692

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3752

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3812

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3872

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3932

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3992

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 4052

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 4112

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 4172

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 4232

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 4292

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 4352

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 4412

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 4472

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 4532

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 4592

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 4652

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 4712

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 4772

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 4832

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 4892

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 4952

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 5012

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 5072

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 AAAC-AAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 5131

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 5191

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 5251

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 5311

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 5371

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 5431

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 5491

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 5551

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 5611

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 5671

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 5731

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 5791

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 5851

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 5911

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 5971

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 6031

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 6091

  3739143 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 6151

  3739203 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 6211

  3739263 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 6271

  3739323 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 6331

  3739383 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 6391

  3739443 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 6451

  3739503 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 6511

  3739563 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3739622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 6571

  3739623 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 3739682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 6631

  3739683 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 3739742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 6691

  3739743 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGC 3739802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGC 6751

  3739803 TGGCCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCA 3739862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 TGGCCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCA 6811

  3739863 TTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTATAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTA 3739922
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 TTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTA 6871

  3739923 GGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCTGTCATC 3739982
          ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 GGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCTC----AAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCTGTCATC 6927

  3739983 TGCCTTTCCAGATAAGGAAACTGAGATTTTTAGAGGCTAAATAACTTGCCCGAGGCCATA 3740042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6928 TGCCTTTCCAGATAAGGAAACTGAGATTTTTAGAGGCTAAATAACTTGCCCGAGGCCATA 6987

  3740043 GAGCTAGAAAGTAACAGATTAAGATTTGAATCCAGGTAACTAGGCTTCAGAGCTCATGCT 3740102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6988 GAGCTAGAAAGTAACAGATTAAGATTTGAATCCAGGTAACTAGGCTTCAGAGCTCATGCT 7047

  3740103 CATAACCATGAAACCAATGGTCCTCAATCCTGTCTGCACATTAAAAGTACCTGAAAAGAT 3740162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7048 CATAACCATGAAACCAATGGTCCTCAATCCTGTCTGCACATTAAAAGTACCTGAAAAGAT 7107

  3740163 GGCCTGGCGCAATGGCTCACACCTACAACGCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGA 3740222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7108 GGCCTGGCGCAATGGCTCACACCTACAACGCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGA 7167

  3740223 TCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCACCCTGGTCAACATGGTGAAAACTCGTCTCTATTAA 3740282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7168 TCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCACCCTGGTCAACATGGTGAAAACTCGTCTCTATTAA 7227

  3740283 ATACAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT 3740342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7228 ATACAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT 7287

  3740343 GAGGCAGGGGAATCACTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCGTGCCA 3740402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7288 GAGGCAGGGGAATCACTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCGTGCCA 7347

  3740403 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAAA 3740462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7348 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAAA 7407

  3740463 AATAAATAAATAAAAATTACCTGAGAAGATATAAAAAGAATAACTATCAGCCGGGCGCAG 3740522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7408 AATAAATAAATAAAAATTACCTGAGAAGATATAAAAAGAATAACTATCAGCCGGGCGCAG 7467

  3740523 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAG 3740582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7468 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAG 7527

  3740583 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAA 3740630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7528 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAA 7575

Alignment time is 5.61559 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2849] =>      2849 nucs 'mol-32-2f33-015617_2849'

Score:        2827
Aligned:      2851        nucs
Identic:      2848 (100%) nucs =>      2791 (100%)        57 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3731991,3734784] EXCISED REGION [3735843,3735899]
 second seq =>  [      1,   2792] EXCISED REGION [   2793,   2849]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3731991 GGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGTT 3732050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGTT 60

  3732051 TAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCTA 3732110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCTA 120

  3732111 TCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTAA 3732170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTAA 180

  3732171 TGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCTT 3732230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCTT 240

  3732231 TGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAG 3732290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAG 300

  3732291 TAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTA 3732350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTA 360

  3732351 TGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCT 3732410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCT 420

  3732411 GGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTC 3732470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTC 480

  3732471 TGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGT 3732530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGT 540

  3732531 ACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGG 3732590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGG 600

  3732591 AAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCA 3732650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCA 660

  3732651 CCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAA 3732710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAA 720

  3732711 CTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAAC 3732770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAAC 780

  3732771 ATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTA 3732830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTA 840

  3732831 TCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAA 3732890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAA 900

  3732891 GATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAA 3732950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAA 960

  3732951 TCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAAT 3733010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAAT 1020

  3733011 TTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGA 3733070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGA 1080

  3733071 TGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAG 3733130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAG 1140

  3733131 AAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGG 3733190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGG 1200

  3733191 AAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAAC 3733250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAAC 1260

  3733251 ATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTC 3733310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTC 1320

  3733311 CTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGT 3733370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGT 1380

  3733371 AAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGG 3733430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGG 1440

  3733431 AAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTC 3733490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTC 1500

  3733491 AGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGT 3733550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGT 1560

  3733551 TTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATC 3733610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATC 1620

  3733611 CACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTA 3733670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTA 1680

  3733671 AGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTA 3733730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTA 1740

  3733731 AACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCC 3733790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCC 1800

  3733791 AATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTAT 3733850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTAT 1860

  3733851 GGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGT 3733910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGT 1920

  3733911 CTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCC 3733970
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCC 1980

  3733971 TTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGT 3734030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGT 2040

  3734031 ACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGC 3734090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGC 2100

  3734091 ATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATT 3734150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATT 2160

  3734151 ACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTT 3734210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTT 2220

  3734211 TTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAA 3734270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAA 2280

  3734271 TCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCC 3734330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCC 2340

  3734331 AAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGA 3734390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGA 2400

  3734391 GACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCC 3734450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCC 2460

  3734451 TGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTT 3734510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTT 2520

  3734511 ACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATC 3734570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATC 2580

  3734571 AATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 3734630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 2640

  3734631 GCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAAC 3734690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAAC 2700

  3734691 CCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCC 3734750
          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCATCTCTACTAAAAATACAA--AAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCC 2758

  3734751 CAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 2792

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCT 3735899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCT 2849

Alignment time is 2.60167 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   4241] =>      4241 nucs 'mol-32-3143-066823_4241'

Score:        4165
Aligned:      4242        nucs
Identic:      4235 (100%) nucs =>       967 (100%)      3268 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3733817,3734784] EXCISED REGION [3735843,3739116]
 second seq =>  [      1,    968] EXCISED REGION [    969,   4241]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3733817 TTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATC 3733876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATC 60

  3733877 AGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGC 3733936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
       61 AGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGC 120

  3733937 AGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCC 3733996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCC 180

  3733997 TCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTTTGTAT 3734056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTTTGTAT 240

  3734057 TTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGA 3734116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGA 300

  3734117 TCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCC 3734176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCC 360

  3734177 AATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCA 3734236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCA 420

  3734237 CTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTC 3734296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTC 480

  3734297 CCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGC 3734356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGC 540

  3734357 CACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGG 3734416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGG 600

  3734417 CTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 3734476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 660

  3734477 TTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTC 3734536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTC 720

  3734537 CTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCG 3734596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCG 780

  3734597 GTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCA 3734656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCA 840

  3734657 AGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAA 3734716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAA 900

  3734717 ATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGA 3734776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGA 960

  3734777 GAATGGCG 3734784
          ||||||||
      961 GAATGGCG 968

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 1028

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 1088

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 1148

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 1208

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 1268

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 1328

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 1388

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 1448

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 1508

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 1568

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1569 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 1628

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 1688

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 1748

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1808

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1868

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1928

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1988

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 2048

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 2108

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 2168

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 2228

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 2288

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 2348

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 2408

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 2468

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 2528

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 2588

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 2648

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 2708

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 2768

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 2828

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 2888

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 2948

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3008

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3068

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3128

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3188

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3248

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AAAC-AAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3307

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3367

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3427

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3487

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3547

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3607

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3667

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3727

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3787

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3847

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3907

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3967

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 4027

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 4087

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 4147

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 4207

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAAT 3739116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAAT 4241

Alignment time is 3.15787 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3780] =>      3780 nucs 'mol-32-3164-175133_3780'

Score:        3715
Aligned:      3781        nucs
Identic:      3775 (100%) nucs =>        49 (100%)      3726 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734736,3734784] EXCISED REGION [3735843,3739574]
 second seq =>  [      1,     49] EXCISED REGION [     50,   3780]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734736 AGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 49

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       50 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 109

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      110 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 169

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      170 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 229

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      230 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 289

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      290 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 349

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      350 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 409

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      410 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 469

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      470 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 529

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 589

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 649

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      650 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 709

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 769

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 829

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 889

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 949

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1009

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1069

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1129

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1189

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1249

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1309

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1369

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 1429

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 1489

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 1549

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 1609

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 1669

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 1729

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 1789

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 1849

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 1909

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 1969

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 2029

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 2089

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 2149

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 2209

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 2269

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 2329

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 AAAC-AAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 2388

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 2448

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 2508

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 2568

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 2628

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 2688

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 2748

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 2808

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 2868

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 2928

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 2988

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3048

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3108

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3168

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3228

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3288

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3348

  3739143 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3408

  3739203 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3468

  3739263 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3528

  3739323 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3588

  3739383 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3648

  3739443 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3708

  3739503 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3768

  3739563 AATAAGCCACAT 3739574
          ||||||||||||
     3769 AATAAGCCACAT 3780

Alignment time is 2.82192 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   8179] =>      8179 nucs 'mol-32-33ab-110761_8179'

Score:        8091
Aligned:      8181        nucs
Identic:      8172 (100%) nucs =>      4251 (100%)      3921 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3730532,3734784] EXCISED REGION [3735843,3739770]
 second seq =>  [      1,   4253] EXCISED REGION [   4254,   8179]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3730532 TTAAACTACTTGGAACAGAACACAGGTAGTTAAACACTCAATATGTAAGTATTAGCAGTT 3730591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAAACTACTTGGAACAGAACACAGGTAGTTAAACACTCAATATGTAAGTATTAGCAGTT 60

  3730592 CTTGATAACTGTCAAGTAAGTTTGGATTGTCCTTTACACTACCGCCCCCTACAGGGAAGC 3730651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGATAACTGTCAAGTAAGTTTGGATTGTCCTTTACACTACCGCCCCCTACAGGGAAGC 120

  3730652 CCTTTGCTGCTCCTTGTCAGGACATGCTAAACGAATTCCCCCTTCATCATTCCCATTGGA 3730711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTTGCTGCTCCTTGTCAGGACATGCTAAACGAATTCCCCCTTCATCATTCCCATTGGA 180

  3730712 AAACGTGGATGATGAAGGTATCCCTGGGATATGTAGAATGGAGGCATGACAGCCAGTTGG 3730771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACGTGGATGATGAAGGTATCCCTGGGATATGTAGAATGGAGGCATGACAGCCAGTTGG 240

  3730772 CTTTGTAGCAACTAATTTAATGTGCCTCTTTAAGGAAGATAATTTAGCAAGAAAAGAGCT 3730831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTGTAGCAACTAATTTAATGTGCCTCTTTAAGGAAGATAATTTAGCAAGAAAAGAGCT 300

  3730832 TTGAGAAATCTTACGGAAAATAAACTTAAAAGAGTATTTCTCAAAACTATGCGTCCCCTA 3730891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAGAAATCTTACGGAAAATAAACTTAAAAGAGTATTTCTCAAAACTATGCGTCCCCTA 360

  3730892 TATCTCAGTTTGGGAAATGAAGCTCTGAGGCTCTCACTTCTGTTACTAATGTGCCATGTG 3730951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATCTCAGTTTGGGAAATGAAGCTCTGAGGCTCTCACTTCTGTTACTAATGTGCCATGTG 420

  3730952 GCCTGAGGCAAATATGTTCCTTCCTCTGTTTCTCAGGTTCTGATAAATAATACAAGGTAG 3731011
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCTGAGGCAAATATGTTCCTTCCTCTATTTCTCAGGTTCTGATAAATAATACAAGGTAG 480

  3731012 GTGAACTATGTAATTCTGAGAGTCCCTCCAATTCTAATATACCTTAGTCACAGTTTTAAT 3731071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGAACTATGTAATTCTGAGAGTCCCTCCAATTCTAATATACCTTAGTCACAGTTTTAAT 540

  3731072 GACTTAAATCAGGGTTAGTAAACTATAACCCTCAAGCAAAATCTAGCCCACCACCTGTTG 3731131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACTTAAATCAGGGTTAGTAAACTATAACCCTCAAGCAAAATCTAGCCCACCACCTGTTG 600

  3731132 TTTATTTACATTTGTACCAGCTTTATTTAGGTTTAATTAATGTACAATAAACTACACACA 3731191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTATTTACATTTGTACCAGCTTTATTTAGGTTTAATTAATGTACAATAAACTACACACA 660

  3731192 TCTACCACCTGCTTTTGTTTTTGTTTTTTCTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTT 3731251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTACCACCTGCTTTTGTTTTTGTTTTTTCTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTT 720

  3731252 GCCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACTATCTTGGCTCACTGCTGCCTCTGCCTCCCAGATTC 3731311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACTATCTTGGCTCACTGCTGCCTCTGCCTCCCAGATTC 780

  3731312 AAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGTGCATCGCCACAT 3731371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGTGCATCGCCACAT 840

  3731372 GAGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCT 3731431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCT 900

  3731432 TGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCTCCCGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 3731491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCTCCCGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 960

  3731492 CCTGAGCCACCGTGCCTGGCCTACCGCCTGTTTTTGTAAATAAAGTTCTACTGGAAAACA 3731551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTGAGCCACCGTGCCTGGCCTACCGCCTGTTTTTGTAAATAAAGTTCTACTGGAAAACA 1020

  3731552 GCCAGACTCATAGCTTCTGTATTATTTATAGTTGCTTTCATGCTACCACAGCAGAGCTGA 3731611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCAGACTCATAGCTTCTGTATTATTTATAGTTGCTTTCATGCTACCACAGCAGAGCTGA 1080

  3731612 GCAGATGTGACAGAGACCGTTAAGCCTACAAAGCCTCAAGTATCTGCATTCCAGCCCTTT 3731671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAGATGTGACAGAGACCGTTAAGCCTACAAAGCCTCAAGTATCTGCATTCCAGCCCTTT 1140

  3731672 ACAGAAAAAGGTCTGCCAATTCCCGATTTGGATAGTGTAAGTTAAACAGAAAGAAAACAG 3731731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGAAAAAGGTCTGCCAATTCCCGATTTGGATAGTGTAAGTTAAACAGAAAGAAAACAG 1200

  3731732 GAGAAAAATGTTTCACTCAGTCATGTTTGTCTTTCAATGAAAACATCTTCCTACGAGAGC 3731791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGAAAAATGTTTCACTCAGTCATGTTTGTCTTTCAATGAAAACATCTTCCTACGAGAGC 1260

  3731792 AGCTAAGAAAACCGGCTGCCATCTAGGGTGCTACCCAGCAGGTCAGCCAGCTGGCAGCAA 3731851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCTAAGAAAACCGGCTGCCATCTAGGGTGCTACCCAGCAGGTCAGCCAGCTGGCAGCAA 1320

  3731852 GTAAAGCCAGACTAGAAGTAAGTCAAGACAAGAAGCCAGCAAAGCAGTAACAAGAGGTCA 3731911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAAAGCCAGACTAGAAGTAAGTCAAGACAAGAAGCCAGCAAAGCAGTAACAAGAGGTCA 1380

  3731912 GGCCAGACTTACAGTAAGCAGGCAAGTTAAAAATTACAGTTGGCCCACAAGTTGGAAAGC 3731971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCCAGACTTACAGTAAGCAGGCAAGTTAAAAATTACAGTTGGCCCACAAGTTGGAAAGC 1440

  3731972 TCATGGGTCAGGGCAAGCAGGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATG 3732031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCATGGGTCAGGGCAAGCAGGTGACATTCTAGAACACACAGTTCAAGGCAAGCAGAAATG 1500

  3732032 AGAAGTCTAGTAGAGTGTTTAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTC 3732091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAAGTCTAGTAGAGTGTTTAGCTCTAGGTCATTCTGTCTATTCAGAATGACACTCTGTC 1560

  3732092 CAGTGTCTATTCTGGTCTATCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTA 3732151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGTGTCTATTCTGGTCTATCTCTAGGTCAGAGACACAGGCAGAGTCAGCCCTCTGAGTA 1620

  3732152 ACAGTACAGAAGGCAGTAATGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTAC 3732211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAGTACAGAAGGCAGTAATGACAAAGTCCAAGGCTCTGAAAATGCAGCCCCAAGTCTAC 1680

  3732212 GCAGTTGGATCCTCTCCTTTGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTA 3732271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCAGTTGGATCCTCTCCTTTGTTGGGAAAAGGTGAGTGTTAAAGAGGCCTCAATCAACTA 1740

  3732272 CGGCAGATTCAGAGGCCAGTAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGA 3732331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGGCAGATTCAGAGGCCAGTAACCCACCTCCTAGAGCCCTGGCCACCACCTCTCAGCTGA 1800

  3732332 CGTGGGACACTATGGGGTATGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCT 3732391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CGTGGGACACTATGGGGTATGAGCTGGCAGACTGGCAAGGGCATGCTGCGTTTCACTGCT 1860

  3732392 CGACAATTTTTTCTCTCCTGGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGC 3732451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CGACAATTTTTTCTCTCCTGGACTAACAGCAGAAGTTCGGCATAAACAAGTAGTATGGGC 1920

  3732452 CAGAACCATTCACCATCTCTGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATAT 3732511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGAACCATTCACCATCTCTGATGGCAAGAACTCTTGAAAAATCATCAACAAAAGCATAT 1980

  3732512 TCACAGGAAACTCGGGTGTACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGA 3732571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCACAGGAAACTCGGGTGTACTTACAGGAGGTATCATCCAACCATTCGATGTGAGCTGGA 2040

  3732572 GGATATTCTTTAAAATAGGAAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATA 3732631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGATATTCTTTAAAATAGGAAAAGACATCTTGGGTGCTCATCTCATCTACTCCGCAAATA 2100

  3732632 TAGATTGTCTCCAGTCTCACCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGAT 3732691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGATTGTCTCCAGTCTCACCTTGGGGATTGCTAGAAAGACAAGACACAGAAAAGATGAT 2160

  3732692 AGAATTTTCCTGTCCGCAACTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAA 3732751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAATTTTCCTGTCCGCAACTGCACATCCCATCCACACTCCTTCCTAATAGTTCAGACAA 2220

  3732752 CACGAGTTTAGAAAGAAACATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGAC 3732811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACGAGTTTAGAAAGAAACATGCTGAGAGAAACTATAATTATTTCAAAAGAGCACGAGAC 2280

  3732812 ATAACAGTAAGGTAAACTATCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACA 3732871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAACAGTAAGGTAAACTATCTTAATTTTTATCACTCAACGACAGCATTAATTCAGAACA 2340

  3732872 GGCCTATCAGGCTCAGAAAGATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCC 3732931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGCCTATCAGGCTCAGAAAGATTAAACAAAGGGTGTTGATAAAATACACGATACCTCTCC 2400

  3732932 CCACATTAATCTGTAGCAATCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTT 3732991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCACATTAATCTGTAGCAATCAGAGCACTATCAAGCTCAACAGGAGTATTTGTTGAAGTT 2460

  3732992 AGCCAGCTGCTTCTAAAATTTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGAC 3733051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCCAGCTGCTTCTAAAATTTTTAAATGTATGTTAAAGAGAAACGCGCAGTAGTGGAGAC 2520

  3733052 AATTCTGAAAGAGAAGAGATGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATG 3733111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATTCTGAAAGAGAAGAGATGCTGCCCGTGACTATGTCAAAGCATGAAACTAAAGAGATG 2580

  3733112 CTACAAGTCAATTAAGAAGAAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGT 3733171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTACAAGTCAATTAAGAAGAAAAAGACAACCCAAAATAAAAATGGGCAAAGGACATGAGT 2640

  3733172 AAGCAATTTACATAAAAGGAAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGAC 3733231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGCAATTTACATAAAAGGAAATACAAAAGGCCAATAAATATATGAGGAGATGGGTTGAC 2700

  3733232 CTCACTACCAATCATTAACATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAG 3733291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTCACTACCAATCATTAACATGCACATGAAAACAAGAAGACACCAGTTTTCACGGACCAG 2760

  3733292 ATTTTACACCTTATTTTTCCTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTT 3733351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTTACACCTTATTTTTCCTGCGTCTCTGGTCCTTGAATCGAGATATCTTACATCTTTT 2820

  3733352 AGTGTGAAGTGCTGGCAGTAAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGT 3733411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTGTGAAGTGCTGGCAGTAAGTAGGGGAAAGGCTTACTTCCCCGGCTGGTGGGCATCGT 2880

  3733412 CACTGCGGAGGGCAAATGGAAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGA 3733471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CACTGCGGAGGGCAAATGGAAGGGTCTGCAGAAAACGTGATTTTGCACGTGCCCTACGGA 2940

  3733472 CCTAGGAACTCCAGTCCTCAGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAA 3733531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCTAGGAACTCCAGTCCTCAGTATCGCCCCTCAACAAACACATACATGTGGGCTCACGAA 3000

  3733532 GTAGCTCACACGAAGATGTTTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGG 3733591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTAGCTCACACGAAGATGTTTGCTAAGGCACGATTTCTAATAACCCAGTAGTTACCAGGG 3060

  3733592 TAATAAATTATGCTTTATCCACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTAT 3733651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAATAAATTATGCTTTATCCACATTATAAAATATTATGTGGTAAAAAATGAGATAATTAT 3120

  3733652 ATACCACAGAAAGATTCTAAGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTAC 3733711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATACCACAGAAAGATTCTAAGATGTATCACAGAGTGAAAAAACAAGTTGTAAAAAATTAC 3180

  3733712 ATGCAAGGTGATGACATTAAACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACA 3733771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGCAAGGTGATGACATTAAACAATACCATACATTTACTAAGGGTACATATTTATGTACA 3240

  3733772 CAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGG 3733831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACACTGATAACTGCTGTTACTTCTGAGGAGG 3300

  3733832 CAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTT 3733891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCCTTATCAGGACTGCATACTTT 3360

  3733892 TTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCG 3733951
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTATTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCG 3420

  3733952 GCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTA 3734011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTA 3480

  3734012 GCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGG 3734071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTAAGAGATGGGG 3540

  3734072 TTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGC 3734131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCTCGTGATCCACCCGCCTTGGC 3600

  3734132 CTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTT 3734191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCCCAGCCAATTGCGTACTTTTT 3660

  3734192 TAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGG 3734251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGG 3720

  3734252 CTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTAT 3734311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTAT 3780

  3734312 TCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTA 3734371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCATGCTA 3840

  3734372 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCC 3734431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCC 3900

  3734432 CGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCC 3734491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCC 3960

  3734492 ACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTG 3734551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTATCTCCTTTAATCTCAATTG 4020

  3734552 CAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGT 3734611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGCGCGGTCGCTCAAGCCTGT 4080

  3734612 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCAT 3734671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGGTCGAGACCAT 4140

  3734672 CTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGG 3734731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCTGGGTGTGG 4200

  3734732 TGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 4253

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 4313

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 4373

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 4433

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 4493

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 4553

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 4613

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 4673

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 4733

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 4793

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 4853

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4854 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 4913

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 4973

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 5033

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 5093

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 5153

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 5213

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 5273

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 5333

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 5393

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 5453

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 5513

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 5573

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 5633

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 5693

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 5753

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 5813

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 5873

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 5933

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 5993

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 6053

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 6113

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 6173

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 6233

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 6293

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 6353

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 6413

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 6473

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 6533

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 AAAC--AAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 6591

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 6651

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6652 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 6711

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6712 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 6771

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6772 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 6831

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 6891

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6892 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 6951

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6952 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 7011

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 7071

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 7131

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 7191

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 7251

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7252 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 7311

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7312 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 7371

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7372 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 7431

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7432 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 7491

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7492 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 7551

  3739143 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7552 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 7611

  3739203 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7612 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 7671

  3739263 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7672 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 7731

  3739323 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7732 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 7791

  3739383 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7792 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 7851

  3739443 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7852 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 7911

  3739503 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7912 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 7971

  3739563 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3739622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7972 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 8031

  3739623 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 3739682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8032 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 8091

  3739683 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 3739742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8092 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 8151

  3739743 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAA 3739770
          ||||||||||||||||||||||||||||
     8152 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAA 8179

Alignment time is 5.98396 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   4120] =>      4120 nucs 'mol-32-33ab-110761_4120'

Score:        4054
Aligned:      4122        nucs
Identic:      4115 (100%) nucs =>       194 (100%)      3921 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734591,3734784] EXCISED REGION [3735843,3739770]
 second seq =>  [      1,    194] EXCISED REGION [    195,   4120]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734591 GGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACG 3734650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACG 60

  3734651 AGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAC 3734710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAC 120

  3734711 AAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAG 3734770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAG 180

  3734771 GCAGGAGAATGGCG 3734784
          ||||||||||||||
      181 GCAGGAGAATGGCG 194

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 254

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 314

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 374

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 434

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 494

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 554

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 614

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 674

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 734

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 794

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      795 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 854

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 914

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 974

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1034

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1094

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1154

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1214

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1274

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1334

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1394

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1454

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1514

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 1574

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 1634

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 1694

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 1754

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 1814

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 1874

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 1934

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 1994

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 2054

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 2114

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 2174

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 2234

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 2294

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 2354

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 2414

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 2474

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 AAAC--AAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 2532

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 2592

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 2652

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 2712

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 2772

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 2832

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 2892

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 2952

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3012

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3072

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3132

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3192

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3252

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3312

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3372

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3432

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3492

  3739143 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3552

  3739203 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3612

  3739263 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3672

  3739323 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3732

  3739383 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3792

  3739443 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3852

  3739503 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3912

  3739563 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3739622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3972

  3739623 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 3739682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 4032

  3739683 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 3739742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 4092

  3739743 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAA 3739770
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4093 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAA 4120

Alignment time is 3.05018 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6344] =>      6344 nucs 'mol-32-340e-034544_6344'

Score:        6266
Aligned:      6343        nucs
Identic:      6336 (100%) nucs =>      5435 (100%)       901 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3735845,3741286] EXCISED REGION [3741290,3742190]
 second seq =>  [      1,   5441] EXCISED REGION [   5444,   6344]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [3741287,3741289]
 second seq =>         2 nucs [5442,5443]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [3741287,3741290] to [3741290,3741293]
 second seq =>        11 nucs [5431,5441] to [5433,5443]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3741287,3741287] to [3741289,3741289]
 second seq =>         1 nucs [5442,5442] to [5443,5443]

  3735845 AACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGGTG 3735904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
        1 AACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGGCG 60

  3735905 ACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAAAA 3735964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAAAA 120

  3735965 GGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAAAT 3736024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAAAT 180

  3736025 TTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAAAA 3736084
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      181 TTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAAAT 240

  3736085 TTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAAAG 3736144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAAAG 300

  3736145 AGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGAGT 3736204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGAGT 360

  3736205 GCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCAGG 3736264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCAGG 420

  3736265 TGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTG 3736324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGACTG 480

  3736325 CTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTACAA 3736384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTACAA 540

  3736385 AAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGGAG 3736444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGGAG 600

  3736445 GCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCACA 3736504
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      601 GCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCGCA 660

  3736505 CAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACCAT 3736564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACCAT 720

  3736565 GCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGT 3736624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGT 780

  3736625 CTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGTGT 3736684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGTGT 840

  3736685 GCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCTGC 3736744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCTGC 900

  3736745 TTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAATTA 3736804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAATTA 960

  3736805 AAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGAGG 3736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGAGG 1020

  3736865 CCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTGAG 3736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTGAG 1080

  3736925 ACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTACAC 3736984
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTACAC 1140

  3736985 TCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTGTA 3737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTGTA 1200

  3737045 ATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTGTT 3737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTGTT 1260

  3737105 TTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAATGT 3737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAATGT 1320

  3737165 TTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTCTG 3737224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTCTG 1380

  3737225 CTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCATGG 3737284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCATGG 1440

  3737285 CTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAGGC 3737344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAGGC 1500

  3737345 CTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAAAG 3737404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAAAG 1560

  3737405 AGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGACG 3737464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGACG 1620

  3737465 GATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATGGA 3737524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATGGA 1680

  3737525 AATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAAAA 3737584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAAAA 1740

  3737585 ACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACGGG 3737644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACGGG 1800

  3737645 GTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTTGG 3737704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTTGG 1860

  3737705 TGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAACAG 3737764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAACAG 1920

  3737765 GCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACAC 3737824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACAC 1980

  3737825 TTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAA 3737884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAA 2040

  3737885 CATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATGCC 3737944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATGCC 2100

  3737945 TGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCAAG 3738004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCAAG 2160

  3738005 ACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCAAA 3738064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCAAA 2220

  3738065 TCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATGAA 3738124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATGAA 2280

  3738125 ACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACCAG 3738184
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACAAAAAAAAAAA-GAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACCAG 2339

  3738185 ATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGTAA 3738244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGTAA 2399

  3738245 TCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTTAT 3738304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTTAT 2459

  3738305 GATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCACGT 3738364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCACGT 2519

  3738365 GTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTACG 3738424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTACG 2579

  3738425 ATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTAAT 3738484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTAAT 2639

  3738485 AGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAGAC 3738544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAGAC 2699

  3738545 TGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGATG 3738604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGATG 2759

  3738605 AGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCTCT 3738664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCTCT 2819

  3738665 CTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAACGG 3738724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAACGG 2879

  3738725 CAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGAAT 3738784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGAAT 2939

  3738785 GGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAGTC 3738844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAGTC 2999

  3738845 ACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACCCA 3738904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACCCA 3059

  3738905 AAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAGGC 3738964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAGGC 3119

  3738965 AGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGTTA 3739024
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGTTA 3179

  3739025 ACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAGAG 3739084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 ACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAGAG 3239

  3739085 ACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGACAG 3739144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGACAG 3299

  3739145 TCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGTTT 3739204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGTTT 3359

  3739205 CAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAGCA 3739264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAGCA 3419

  3739265 AGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACACC 3739324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACACC 3479

  3739325 TTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACATA 3739384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACATA 3539

  3739385 GTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAACTT 3739444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAACTT 3599

  3739445 GAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTTGC 3739504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTTGC 3659

  3739505 CCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGATAA 3739564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGATAA 3719

  3739565 TAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACATT 3739624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACATT 3779

  3739625 TTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGCTC 3739684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGCTC 3839

  3739685 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTC 3739744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTC 3899

  3739745 AAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGCTG 3739804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGCTG 3959

  3739805 GCCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCATT 3739864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GCCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCATT 4019

  3739865 TGAACCCAGGAGGCGGAGGTTATAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGG 3739924
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGG 4079

  3739925 CAACAGAGTGAGACTCCGTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCTGTCATCTG 3739984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 CAACAGAGTGAGACTCCGTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCTGTCATCTG 4139

  3739985 CCTTTCCAGATAAGGAAACTGAGATTTTTAGAGGCTAAATAACTTGCCCGAGGCCATAGA 3740044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CCTTTCCAGATAAGGAAACTGAGATTTTTAGAGGCTAAATAACTTGCCCGAGGCCATAGA 4199

  3740045 GCTAGAAAGTAACAGATTAAGATTTGAATCCAGGTAACTAGGCTTCAGAGCTCATGCTCA 3740104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GCTAGAAAGTAACAGATTAAGATTTGAATCCAGGTAACTAGGCTTCAGAGCTCATGCTCA 4259

  3740105 TAACCATGAAACCAATGGTCCTCAATCCTGTCTGCACATTAAAAGTACCTGAAAAGATGG 3740164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TAACCATGAAACCAATGGTCCTCAATCCTGTCTGCACATTAAAAGTACCTGAAAAGATGG 4319

  3740165 CCTGGCGCAATGGCTCACACCTACAACGCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATC 3740224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 CCTGGCGCAATGGCTCACACCTACAACGCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATC 4379

  3740225 ACAAGGTCAGGAGATCGAGACCACCCTGGTCAACATGGTGAAAACTCGTCTCTATTAAAT 3740284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 ACAAGGTCAGGAGATCGAGACCACCCTGGTCAACATGGTGAAAACTCGTCTCTATTAAAT 4439

  3740285 ACAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA 3740344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ACAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA 4499

  3740345 GGCAGGGGAATCACTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCGTGCCACT 3740404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GGCAGGGGAATCACTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCGTGCCACT 4559

  3740405 GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAAAAA 3740464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAAAAA 4619

  3740465 TAAATAAATAAAAATTACCTGAGAAGATATAAAAAGAATAACTATCAGCCGGGCGCAGTG 3740524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TAAATAAATAAAAATTACCTGAGAAGATATAAAAAGAATAACTATCAGCCGGGCGCAGTG 4679

  3740525 GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGA 3740584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGA 4739

  3740585 GTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAACTACAAAAATTA 3740644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAACTACAAAAATTA 4799

  3740645 GCTGGGCACGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAAT 3740704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 GCTGGGCACGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAAT 4859

  3740705 CGCTTGAACCCGGGCGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCC 3740764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 CGCTTGAACCCGGGCGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCC 4919

  3740765 TGGGCTACAGAAAGAGAGGAAAAAAAAAATGCTGGGCAGTGGCCAAGGTGGGTGGATCAC 3740824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TGGGCTACAGAAAGAGAGGAAAAAAAAAATGCTGGGCAGTGGCCAAGGTGGGTGGATCAC 4979

  3740825 GAGGTCAGGAGGTCAGGAGCTTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCT 3740884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 GAGGTCAGGAGGTCAGGAGCTTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATACAAAAAATTAGCT 5039

  3740885 GGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATCGC 3740944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 GGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATCGC 5099

  3740945 TTGAACCCAGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGG 3741004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 TTGAACCCAGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGG 5159

  3741005 GTGACAGAGCAAGCCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACCAGTAACTA 3741064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 GTGACAGAGCAAGCCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACCAGTAACTA 5219

  3741065 TCCCTGGGACCTATCCAACTCCAACTAATATAAAGTGGTCTGAGATGGGCAGCAGGGTTC 3741124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 TCCCTGGGACCTATCCAACTCCAACTAATATAAAGTGGTCTGAGATGGGCAGCAGGGTTC 5279

  3741125 CCCAGGGCTCAGGAACACTATCCTAGGCCATGCTGCCTCCTGGACAAAGAATCGACTGAA 3741184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 CCCAGGGCTCAGGAACACTATCCTAGGCCATGCTGCCTCCTGGACAAAGAATCGACTGAA 5339

  3741185 ATAAGCAAGCTTCCCCAGCTGACATCCCACGGCCGACCTTACTGCCTTTTTTAGGAATAT 3741244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 ATAAGCAAGCTTCCCCAGCTGACATCCCACGGCCGACCTTACTGCCTTTTTTAGGAATAT 5399

  3741245 CTTTAGAACCGTGAGACTGGAGTTGTACGTTAAAAAAAAAAA 3741286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 CTTTAGAACCGTGAGACTGGAGTTGTACGTTAAAAAAAAAAA 5441

EXCISED REGION

  3741290 TTTTAAATTAAAAGTTAACCCCAAAAGTGATCCTATTAAGGTAAGTATCATATTTCCATT 3741349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 TTTTAAATTAAAAGTTAACCCCAAAAGTGATCCTATTAAGGTAAGTATCATATTTCCATT 5503

  3741350 TTACAGACAAGGAGACTGAAACTAACAAGGCTCAAGAACTTGTCCTCAGTCACAAAGGAA 3741409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 TTACAGACAAGGAGACTGAAACTAACAAGGCTCAAGAACTTGTCCTCAGTCACAAAGGAA 5563

  3741410 CTGAGACTAGATTCTACGAGGCTTTTGCGCCCTAAAGAGCTCCAACAGATGTGAGAAAAC 3741469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 CTGAGACTAGATTCTACGAGGCTTTTGCGCCCTAAAGAGCTCCAACAGATGTGAGAAAAC 5623

  3741470 ACTTCAAGTGGGTGAGCAGAGATGCTCCACGGGGGAAGTGACACCTGACCAGAGATAAAG 3741529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 ACTTCAAGTGGGTGAGCAGAGATGCTCCACGGGGGAAGTGACACCTGACCAGAGATAAAG 5683

  3741530 CATGGGACAAGGAAGGGCAAATGCACAGAATGAAAGGCATGAGCCGTATCAGAGGCAAGC 3741589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 CATGGGACAAGGAAGGGCAAATGCACAGAATGAAAGGCATGAGCCGTATCAGAGGCAAGC 5743

  3741590 CGCCTCAAGGAATGCTCTCGGGACCAGAGGTCGACAGGTGTGATAAAGCTATGACGCCCT 3741649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 CGCCTCAAGGAATGCTCTCGGGACCAGAGGTCGACAGGTGTGATAAAGCTATGACGCCCT 5803

  3741650 CGCGGTAGAGTTGTGAGAGAGACTCACAGGTATGCTTGCGCCCGGCTGTGCAGGCACATG 3741709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 CGCGGTAGAGTTGTGAGAGAGACTCACAGGTATGCTTGCGCCCGGCTGTGCAGGCACATG 5863

  3741710 AAGGTCAAGCCACACCTGGCCTTCACAGGACTTCTCCTCAAACAGAAACCCCGCCCATGA 3741769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 AAGGTCAAGCCACACCTGGCCTTCACAGGACTTCTCCTCAAACAGAAACCCCGCCCATGA 5923

  3741770 GGGAAGCAAGGGCGTGTTTCTGACTTGAACTGGTCATGCAGGATAAAGAGTGAAGCAGCT 3741829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 GGGAAGCAAGGGCGTGTTTCTGACTTGAACTGGTCATGCAGGATAAAGAGTGAAGCAGCT 5983

  3741830 TCCAGAGTTCAGCTCTGCATCCACACTGCTGGGCCCATTAGGACTGACTGAGGAGGGACG 3741889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 TCCAGAGTTCAGCTCTGCATCCACACTGCTGGGCCCATTAGGACTGACTGAGGAGGGACG 6043

  3741890 CAATATCAGTCGATAGCACCACATCCTACATTACACAGCAACAGAGCAAAGGAGTTAAGG 3741949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 CAATATCAGTCGATAGCACCACATCCTACATTACACAGCAACAGAGCAAAGGAGTTAAGG 6103

  3741950 GCAAGGCTCTAGAGTCAAAGAAACTGGGTGTGAATCCTGACTCCACCTTTACTAGCTACA 3742009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 GCAAGGCTCTAGAGTCAAAGAAACTGGGTGTGAATCCTGACTCCACCTTTACTAGCTACA 6163

  3742010 TGACCCTGGGCAATTTATTAAACTTCTTTGAGCCTGCTTCCTCTTTATAAAATAGGGATA 3742069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 TGACCCTGGGCAATTTATTAAACTTCTTTGAGCCTGCTTCCTCTTTATAAAATAGGGATA 6223

  3742070 AAAATAAATTCCTCATACAGTTGTTGTGAGCAACAAAAAAGAAAGAAATATATAATGTGC 3742129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 AAAATAAATTCCTCATACAGTTGTTGTGAGCAACAAAAAAGAAAGAAATATATAATGTGC 6283

  3742130 TTAACGAGTCTAGTAAAAAAGCAAGTTCACAACAAATAGCAGCTATTCTTTCATTCATTC 3742189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 TTAACGAGTCTAGTAAAAAAGCAAGTTCACAACAAATAGCAGCTATTCTTTCATTCATTC 6343

  3742190 A 3742190
          |
     6344 A 6344

Alignment time is 4.6929 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   9477] =>      9477 nucs 'mol-32-340e-054781_9477'

Score:        9334
Aligned:      9490        nucs
Identic:      9466 (100%) nucs =>       371 (100%)      9095 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734414,3734784] EXCISED REGION [3735843,3744958]
 second seq =>  [      1,    371] EXCISED REGION [    372,   9477]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734414 AGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 3734473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 60

  3734474 GGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTAT 3734533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATTAT 120

  3734534 CTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGC 3734593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGGGC 180

  3734594 GCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGG 3734653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGAGG 240

  3734654 TCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAG 3734713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAG 300

  3734714 AAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCA 3734773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCA 360

  3734774 GGAGAATGGCG 3734784
          |||||||||||
      361 GGAGAATGGCG 371

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 431

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 491

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 551

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 611

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 671

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 731

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 791

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 851

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 911

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 971

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      972 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 1031

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 1091

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 1151

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 1211

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 1271

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1331

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1391

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1451

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1511

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1571

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1631

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1691

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 1751

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 1811

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 1871

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 1931

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 1991

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 2051

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 2111

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 2171

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 2231

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 2291

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 2351

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 2411

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 2471

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 2531

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 2591

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 2651

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 AAAC--AAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 2709

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 2769

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 2829

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 2889

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 2949

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3009

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3069

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3129

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3189

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3249

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3309

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3369

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3429

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3489

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3549

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3609

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3669

  3739143 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3729

  3739203 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3789

  3739263 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3849

  3739323 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3909

  3739383 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3969

  3739443 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 4029

  3739503 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 4089

  3739563 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3739622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 4149

  3739623 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 3739682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 4209

  3739683 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 3739742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 4269

  3739743 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGC 3739802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 TCAAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTGGC 4329

  3739803 TGGCCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCA 3739862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 TGGCCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCA 4389

  3739863 TTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTATAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTA 3739922
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 TTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTA 4449

  3739923 GGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCCTGTCATC 3739982
          ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||
     4450 GGCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCTC-------AAAAAAAAAAAAAGAATTCCTGTCATC 4502

  3739983 TGCCTTTCCAGATAAGGAAACTGAGATTTTTAGAGGCTAAATAACTTGCCCGAGGCCATA 3740042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 TGCCTTTCCAGATAAGGAAACTGAGATTTTTAGAGGCTAAATAACTTGCCCGAGGCCATA 4562

  3740043 GAGCTAGAAAGTAACAGATTAAGATTTGAATCCAGGTAACTAGGCTTCAGAGCTCATGCT 3740102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 GAGCTAGAAAGTAACAGATTAAGATTTGAATCCAGGTAACTAGGCTTCAGAGCTCATGCT 4622

  3740103 CATAACCATGAAACCAATGGTCCTCAATCCTGTCTGCACATTAAAAGTACCTGAAAAGAT 3740162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 CATAACCATGAAACCAATGGTCCTCAATCCTGTCTGCACATTAAAAGTACCTGAAAAGAT 4682

  3740163 GGCCTGGCGCAATGGCTCACACCTACAACGCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGA 3740222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 GGCCTGGCGCAATGGCTCACACCTACAACGCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGA 4742

  3740223 TCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCACCCTGGTCAACATGGTGAAAACTCGTCTCTATTAA 3740282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 TCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCACCCTGGTCAACATGGTGAAAACTCGTCTCTATTAA 4802

  3740283 ATACAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT 3740342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 ATACAAAAAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGCGTCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCT 4862

  3740343 GAGGCAGGGGAATCACTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCGTGCCA 3740402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 GAGGCAGGGGAATCACTTGAATCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCGTGCCA 4922

  3740403 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAAA 3740462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAAA 4982

  3740463 AATAAATAAATAAAAATTACCTGAGAAGATATAAAAAGAATAACTATCAGCCGGGCGCAG 3740522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 AATAAATAAATAAAAATTACCTGAGAAGATATAAAAAGAATAACTATCAGCCGGGCGCAG 5042

  3740523 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAG 3740582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAG 5102

  3740583 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAACTACAAAAAT 3740642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAACTACAAAAAT 5162

  3740643 TAGCTGGGCACGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGA 3740702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 TAGCTGGGCACGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGA 5222

  3740703 ATCGCTTGAACCCGGGCGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAG 3740762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 ATCGCTTGAACCCGGGCGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAG 5282

  3740763 CCTGGGCTACAGAAAGAGAGGAAAAAAAAAATGCTGGGCAGTGGCCAAGGTGGGTGGATC 3740822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 CCTGGGCTACAGAAAGAGAGGAAAAAAAAAATGCTGGGCAGTGGCCAAGGTGGGTGGATC 5342

  3740823 ACGAGGTCAGGAGGTCAGGAGCTTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATACAAAAAATTAG 3740882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 ACGAGGTCAGGAGGTCAGGAGCTTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAAATACAAAAAATTAG 5402

  3740883 CTGGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATC 3740942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 CTGGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGGGGCAGGAGAATC 5462

  3740943 GCTTGAACCCAGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCT 3741002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 GCTTGAACCCAGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCT 5522

  3741003 GGGTGACAGAGCAAGCCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACCAGTAAC 3741062
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 GGGTGACAGAGCAAGCCTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAACCAGTAAC 5581

  3741063 TATCCCTGGGACCTATCCAACTCCAACTAATATAAAGTGGTCTGAGATGGGCAGCAGGGT 3741122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5582 TATCCCTGGGACCTATCCAACTCCAACTAATATAAAGTGGTCTGAGATGGGCAGCAGGGT 5641

  3741123 TCCCCAGGGCTCAGGAACACTATCCTAGGCCATGCTGCCTCCTGGACAAAGAATCGACTG 3741182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5642 TCCCCAGGGCTCAGGAACACTATCCTAGGCCATGCTGCCTCCTGGACAAAGAATCGACTG 5701

  3741183 AAATAAGCAAGCTTCCCCAGCTGACATCCCACGGCCGACCTTACTGCCTTTTTTAGGAAT 3741242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5702 AAATAAGCAAGCTTCCCCAGCTGACATCCCACGGCCGACCTTACTGCCTTTTTTAGGAAT 5761

  3741243 ATCTTTAGAACCGTGAGACTGGAGTTGTACGTTAAAAAAAAAAATTT---TTTTAAATTA 3741299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||
     5762 ATCTTTAGAACCGTGAGACTGGAGTTGTACGTTAAAAAAAAAAA---AAATTTTAAATTA 5818

  3741300 AAAGTTAACCCCAAAAGTGATCCTATTAAGGTAAGTATCATATTTCCATTTTACAGACAA 3741359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 AAAGTTAACCCCAAAAGTGATCCTATTAAGGTAAGTATCATATTTCCATTTTACAGACAA 5878

  3741360 GGAGACTGAAACTAACAAGGCTCAAGAACTTGTCCTCAGTCACAAAGGAACTGAGACTAG 3741419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 GGAGACTGAAACTAACAAGGCTCAAGAACTTGTCCTCAGTCACAAAGGAACTGAGACTAG 5938

  3741420 ATTCTACGAGGCTTTTGCGCCCTAAAGAGCTCCAACAGATGTGAGAAAACACTTCAAGTG 3741479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 ATTCTACGAGGCTTTTGCGCCCTAAAGAGCTCCAACAGATGTGAGAAAACACTTCAAGTG 5998

  3741480 GGTGAGCAGAGATGCTCCACGGGGGAAGTGACACCTGACCAGAGATAAAGCATGGGACAA 3741539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 GGTGAGCAGAGATGCTCCACGGGGGAAGTGACACCTGACCAGAGATAAAGCATGGGACAA 6058

  3741540 GGAAGGGCAAATGCACAGAATGAAAGGCATGAGCCGTATCAGAGGCAAGCCGCCTCAAGG 3741599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 GGAAGGGCAAATGCACAGAATGAAAGGCATGAGCCGTATCAGAGGCAAGCCGCCTCAAGG 6118

  3741600 AATGCTCTCGGGACCAGAGGTCGACAGGTGTGATAAAGCTATGACGCCCTCGCGGTAGAG 3741659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 AATGCTCTCGGGACCAGAGGTCGACAGGTGTGATAAAGCTATGACGCCCTCGCGGTAGAG 6178

  3741660 TTGTGAGAGAGACTCACAGGTATGCTTGCGCCCGGCTGTGCAGGCACATGAAGGTCAAGC 3741719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 TTGTGAGAGAGACTCACAGGTATGCTTGCGCCCGGCTGTGCAGGCACATGAAGGTCAAGC 6238

  3741720 CACACCTGGCCTTCACAGGACTTCTCCTCAAACAGAAACCCCGCCCATGAGGGAAGCAAG 3741779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 CACACCTGGCCTTCACAGGACTTCTCCTCAAACAGAAACCCCGCCCATGAGGGAAGCAAG 6298

  3741780 GGCGTGTTTCTGACTTGAACTGGTCATGCAGGATAAAGAGTGAAGCAGCTTCCAGAGTTC 3741839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 GGCGTGTTTCTGACTTGAACTGGTCATGCAGGATAAAGAGTGAAGCAGCTTCCAGAGTTC 6358

  3741840 AGCTCTGCATCCACACTGCTGGGCCCATTAGGACTGACTGAGGAGGGACGCAATATCAGT 3741899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 AGCTCTGCATCCACACTGCTGGGCCCATTAGGACTGACTGAGGAGGGACGCAATATCAGT 6418

  3741900 CGATAGCACCACATCCTACATTACACAGCAACAGAGCAAAGGAGTTAAGGGCAAGGCTCT 3741959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 CGATAGCACCACATCCTACATTACACAGCAACAGAGCAAAGGAGTTAAGGGCAAGGCTCT 6478

  3741960 AGAGTCAAAGAAACTGGGTGTGAATCCTGACTCCACCTTTACTAGCTACATGACCCTGGG 3742019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 AGAGTCAAAGAAACTGGGTGTGAATCCTGACTCCACCTTTACTAGCTACATGACCCTGGG 6538

  3742020 CAATTTATTAAACTTCTTTGAGCCTGCTTCCTCTTTATAAAATAGGGATAAAAATAAATT 3742079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 CAATTTATTAAACTTCTTTGAGCCTGCTTCCTCTTTATAAAATAGGGATAAAAATAAATT 6598

  3742080 CCTCATACAGTTGTTGTGAGCAACAAAAAAGAAAGAAATATATAATGTGCTTAACGAGTC 3742139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 CCTCATACAGTTGTTGTGAGCAACAAAAAAGAAAGAAATATATAATGTGCTTAACGAGTC 6658

  3742140 TAGTAAAAAAGCAAGTTCACAACAAATAGCAGCTATTCTTTCATTCATTCAATATATTTA 3742199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 TAGTAAAAAAGCAAGTTCACAACAAATAGCAGCTATTCTTTCATTCATTCAATATATTTA 6718

  3742200 CAGAGCTTTTGCTTTTATCAACCAAACAAGGCTAGAGAAGCTCATACAATACAGCACAGG 3742259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 CAGAGCTTTTGCTTTTATCAACCAAACAAGGCTAGAGAAGCTCATACAATACAGCACAGG 6778

  3742260 CCTTTAACATGCATTCAGAAGGCTGCCTACTAAACCCTTTATGAACACCCAAATTTGCAA 3742319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 CCTTTAACATGCATTCAGAAGGCTGCCTACTAAACCCTTTATGAACACCCAAATTTGCAA 6838

  3742320 ATAACACAGAGGGAAGCCTTCTGCATTCATGGATTTATATTATAGTAGAATAATAAATAA 3742379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 ATAACACAGAGGGAAGCCTTCTGCATTCATGGATTTATATTATAGTAGAATAATAAATAA 6898

  3742380 GAACATAGACTCACTAAAAAAGTAGTAATTTTTCCTTTTATTTATAAATTGCTTTAGAAA 3742439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 GAACATAGACTCACTAAAAAAGTAGTAATTTTTCCTTTTATTTATAAATTGCTTTAGAAA 6958

  3742440 ACTGCGGCAGATTACTATATACAATAATTCGGGGTGAGTTCTAGGGAGCAAAATACCCCA 3742499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 ACTGCGGCAGATTACTATATACAATAATTCGGGGTGAGTTCTAGGGAGCAAAATACCCCA 7018

  3742500 AAAAAACACAAAGATCAAATCAAATCACAAGTCCAACTGTAAGCGCAGGCTTAAAACTCA 3742559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 AAAAAACACAAAGATCAAATCAAATCACAAGTCCAACTGTAAGCGCAGGCTTAAAACTCA 7078

  3742560 GGGCAGGATTAGTTTAGCTTTCTCTGACAACAGGATGTTACTGAGTGGTTTACATATATC 3742619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 GGGCAGGATTAGTTTAGCTTTCTCTGACAACAGGATGTTACTGAGTGGTTTACATATATC 7138

  3742620 AGATATTCAGATTATCAATAGATTCAGAATTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTCGCTCTGT 3742679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 AGATATTCAGATTATCAATAGATTCAGAATTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTCGCTCTGT 7198

  3742680 CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGATCACGGCAACCTCTGCCTCCCAGGTT 3742739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGATCACGGCAACCTCTGCCTCCCAGGTT 7258

  3742740 CAAGCGATTCTCACGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCGCCAGCCATCACT 3742799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 CAAGCGATTCTCACGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGATTACAGGCGCCAGCCATCACT 7318

  3742800 CCCAGCTGATTTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGTTGGTC 3742859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 CCCAGCTGATTTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGTTGGTC 7378

  3742860 TCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 3742919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7379 TCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 7438

  3742920 GCATGAGCCACCACACCTGGCCAATAGATTCAGATTATCAACAAAAGTGTTAATGGCTTT 3742979
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7439 GCGTGAGCCACCACACCTGGCCAATAGATTCAGATTATCAACAAAAGTGTTAATGGCTTT 7498

  3742980 TCCCCACCAATCTCAAAATTGCTCTAACTCCCCGAAAAGAAGGTCTCACTGTGATACACT 3743039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 TCCCCACCAATCTCAAAATTGCTCTAACTCCCCGAAAAGAAGGTCTCACTGTGATACACT 7558

  3743040 TTCACTACGTTTAAAGGCAAAGAAAAGTTAACACCTCTACGATAAAAGGAGAAAATGAGT 3743099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7559 TTCACTACGTTTAAAGGCAAAGAAAAGTTAACACCTCTACGATAAAAGGAGAAAATGAGT 7618

  3743100 AAGGGTCCTTAGAAGCACAGGTTCGAATCTCAGCTCTGCCACTAACTGGTAACTTTTTCT 3743159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7619 AAGGGTCCTTAGAAGCACAGGTTCGAATCTCAGCTCTGCCACTAACTGGTAACTTTTTCT 7678

  3743160 GGGCCTCCTCAGAAAAGACAATCTCTTATTTCCCAGCTCTAACATCTGAGCCAGCTGACA 3743219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7679 GGGCCTCCTCAGAAAAGACAATCTCTTATTTCCCAGCTCTAACATCTGAGCCAGCTGACA 7738

  3743220 GCATCTGAACTTTAAACAGGTGACCTCAGAAATGGAGACTTCACAGGTCCCTTCTCACAA 3743279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7739 GCATCTGAACTTTAAACAGGTGACCTCAGAAATGGAGACTTCACAGGTCCCTTCTCACAA 7798

  3743280 GAGTGCTTGGATAAGGAGTGGACACGCAAGGCAAGGCCAGAAGCATGAGGTGATGGCAGG 3743339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7799 GAGTGCTTGGATAAGGAGTGGACACGCAAGGCAAGGCCAGAAGCATGAGGTGATGGCAGG 7858

  3743340 GAAAAGGCACTCTCTGGGGAAATGTGGACAAATTTCCCACAAAACACCCTGTACCTTTCT 3743399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7859 GAAAAGGCACTCTCTGGGGAAATGTGGACAAATTTCCCACAAAACACCCTGTACCTTTCT 7918

  3743400 TCATCATGTCTCGGTCCAAGGCTACATTTCTTTGGGCAAGATTTACTTCCGATCGAAAAT 3743459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7919 TCATCATGTCTCGGTCCAAGGCTACATTTCTTTGGGCAAGATTTACTTCCGATCGAAAAT 7978

  3743460 GGAAGCGCTTGGCTCGCTGCTCTTTCTTTTCAATTGCTTCCTAGAAAGTACAGAAAAAGT 3743519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7979 GGAAGCGCTTGGCTCGCTGCTCTTTCTTTTCAATTGCTTCCTAGAAAGTACAGAAAAAGT 8038

  3743520 GAAAGTAGTAAAATATGGAGAAGGCGAGTTAAATCACACATGCATCATGATGCATCAGTG 3743579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8039 GAAAGTAGTAAAATATGGAGAAGGCGAGTTAAATCACACATGCATCATGATGCATCAGTG 8098

  3743580 ACAAACCTGAACTAAAAAAGAAGAAATAAGCAACACTACACCTTGAATCAGTCTGGCAGA 3743639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8099 ACAAACCTGAACTAAAAAAGAAGAAATAAGCAACACTACACCTTGAATCAGTCTGGCAGA 8158

  3743640 GACCTGGATATTCACACTCAATGACTGGGGGGATATGTTAATATCGCTGTAATTTGCAAC 3743699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8159 GACCTGGATATTCACACTCAATGACTGGGGGGATATGTTAATATCGCTGTAATTTGCAAC 8218

  3743700 CATCTCCGACATAACACAGCCTATCACTGTGCCTGGGACATAGTAGGAACTCAGTGAGTA 3743759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8219 CATCTCCGACATAACACAGCCTATCACTGTGCCTGGGACATAGTAGGAACTCAGTGAGTA 8278

  3743760 TCTGCTGACTGAATGAATAGTCCTTTAAAGTTTATAAAGTTATATGACACTTCATTTGTT 3743819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8279 TCTGCTGACTGAATGAATAGTCCTTTAAAGTTTATAAAGTTATATGACACTTCATTTGTT 8338

  3743820 ATTATCAATTATGCCAACAAATTACAACTAAACAATTTCAACATCCCAATTTTCCAGGTG 3743879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8339 ATTATCAATTATGCCAACAAATTACAACTAAACAATTTCAACATCCCAATTTTCCAGGTG 8398

  3743880 CAGAAATGGAGGCACAAAAAAGCAAAAAGGTTTGCTGGAGATACTTCAGCTATTAAGCAA 3743939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8399 CAGAAATGGAGGCACAAAAAAGCAAAAAGGTTTGCTGGAGATACTTCAGCTATTAAGCAA 8458

  3743940 GCAGATCTGATTCCAGTGCTATTTCTAGGAGCCCACCTACAACCACTTCACATTGTCTGA 3743999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8459 GCAGATCTGATTCCAGTGCTATTTCTAGGAGCCCACCTACAACCACTTCACATTGTCTGA 8518

  3744000 GCAATGGTAATCACACCTATCACGCTCTTCCACATTATAACTGCCTGAGCAGTCCACTCC 3744059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8519 GCAATGGTAATCACACCTATCACGCTCTTCCACATTATAACTGCCTGAGCAGTCCACTCC 8578

  3744060 CTAAAGCTAGTCTGTTTAAAAATAACACCGAAGCAAAGAAACTCTCCCTCCTCTTCCAGC 3744119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8579 CTAAAGCTAGTCTGTTTAAAAATAACACCGAAGCAAAGAAACTCTCCCTCCTCTTCCAGC 8638

  3744120 CTCGTGTCCACGGAATCACCAGTTTTCATCTCTAAGTGATAAGAACCATTGACACTTTAC 3744179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8639 CTCGTGTCCACGGAATCACCAGTTTTCATCTCTAAGTGATAAGAACCATTGACACTTTAC 8698

  3744180 TGAAAAAATAATCAGCTTTGTAAGTTTCTTCTAAGAGCTAAAATAAACCCAGGTCCAACT 3744239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8699 TGAAAAAATAATCAGCTTTGTAAGTTTCTTCTAAGAGCTAAAATAAACCCAGGTCCAACT 8758

  3744240 GTGGGTTTCTGATGGCTCTTAGGAACCCTTCACTAATTGGTTTTGTTTGTTTTTGTTTTT 3744299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8759 GTGGGTTTCTGATGGCTCTTAGGAACCCTTCACTAATTGGTTTTGTTTGTTTTTGTTTTT 8818

  3744300 GAGACGGACTCTCACTCTGTCGCCAGGCTGCCACGATCTCAGCTCACAGCAACCTCCGCC 3744359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8819 GAGACGGACTCTCACTCTGTCGCCAGGCTGCCACGATCTCAGCTCACAGCAACCTCCGCC 8878

  3744360 TCCCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGTGCAC 3744419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8879 TCCCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAGGTGCAC 8938

  3744420 ACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCC 3744479
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     8939 ACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCC 8998

  3744480 AGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCCAGG 3744539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8999 AGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCCAGG 9058

  3744540 ATTACAGATGTGAGCCACCGCGCCCAGTCCCCTTCACTAATTGTATATTGACTTTGCCAC 3744599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9059 ATTACAGATGTGAGCCACCGCGCCCAGTCCCCTTCACTAATTGTATATTGACTTTGCCAC 9118

  3744600 ACTAATTGAAGGTCTGACTACAGAGAGCTTGTGGGGATTGGTAAAGTTGCAACACTTCTG 3744659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9119 ACTAATTGAAGGTCTGACTACAGAGAGCTTGTGGGGATTGGTAAAGTTGCAACACTTCTG 9178

  3744660 TTCTTTCCCAATAGTTAACGCTCATTTTCTTCACTGAAGTCTTCCTAGTACAAACAACAA 3744719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9179 TTCTTTCCCAATAGTTAACGCTCATTTTCTTCACTGAAGTCTTCCTAGTACAAACAACAA 9238

  3744720 TTTACCTTCCTTTAGAAACAAAGTACTAACTCTGAGACTATCACCCTTTTCCCATATACC 3744779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9239 TTTACCTTCCTTTAGAAACAAAGTACTAACTCTGAGACTATCACCCTTTTCCCATATACC 9298

  3744780 TGTGTCATATAATGGCAAACAGTGTAAGATTATGAATAGTTTACTTTTTCAATTACAGTA 3744839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9299 TGTGTCATATAATGGCAAACAGTGTAAGATTATGAATAGTTTACTTTTTCAATTACAGTA 9358

  3744840 AGAAAAGATTTTCACTTTATTCTCTTTTCTTGTCTAAAAGATGACCAATTCTCTCTCTTT 3744899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9359 AGAAAAGATTTTCACTTTATTCTCTTTTCTTGTCTAAAAGATGACCAATTCTCTCTCTTT 9418

  3744900 TTTTTTTTTTTTTTTTGCGGGGATGGGGGGCCTTTAAGTGATTGGAAACACAAGAGACA 3744958
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9419 TTTTTTTTTTTTTTTTGCGGGGATGGGGGGCCTTTAAGTGATTGGAAACACAAGAGACA 9477

Alignment time is 6.96048 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3970] =>      3970 nucs 'mol-32-34be-214046_3970'

Score:        3905
Aligned:      3971        nucs
Identic:      3965 (100%) nucs =>        51 (100%)      3914 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3734734,3734784] EXCISED REGION [3735843,3739762]
 second seq =>  [      1,     51] EXCISED REGION [     52,   3970]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3734734 GCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 3734784
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCG 51

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       52 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 111

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 171

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 231

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 291

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 351

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 411

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 471

  3736263 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 3736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 GGTGGGCATGGTGGCTCATGCGTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGAC 531

  3736323 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 3736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 TGCTTGAGTCCAGGAGTTCGAGAGGCCAGCCTGGGTAACACAGGGAGACCCCATCTCTAC 591

  3736383 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 3736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 AAAAAATTTTAAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGTGTACAGCTATAGTCCCAGGTACTCAGG 651

  3736443 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCA 3736502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      652 AGGCTGAGGTGGTATGATCGCCTGAGCCCAGGAGGTTGAGGCTGCAATGAGCCATGATCG 711

  3736503 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 3736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 CACAACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTTTGTTTCAAAAGAAAAAACCACC 771

  3736563 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 3736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 ATGCTCAGCTAATTTTTTTATTTTTTGCAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTG 831

  3736623 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 3736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 GTCTTGAATTCCTGACCTCAAGTGATCTGTCTTGGTCTCCCAAAGTGTTGGATTACAGGT 891

  3736683 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 3736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 GTGCACCACTGCACCCAGCGCCTGCATCTCTCTCTTTTTTTGTTCTTTGTATCTTTACCT 951

  3736743 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 3736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 GCTTCTTTTGAACAGGATTATCCATTGCCCAAGTTTTGATGTGTACGACTTTCCCTAAAT 1011

  3736803 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 3736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TAAAATAGACATGTGAGGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACCTTGGGA 1071

  3736863 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 3736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 GGCCGAGATGAGAGGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGTGACACAGTG 1131

  3736923 AGACCTTCTCTATTTTTTTTAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 3736982
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 AGACCTTCTCTATTTTTTTAAAAAAAAAAGACATCTGAGGCCAGAAATTTTGTTCCTTAC 1191

  3736983 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 3737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 ACTCTTTCCTGTTTGCTTTTAAGGTATTTCTTCACCTGTATGTAGGTTTTTTTAATGTTG 1251

  3737043 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 3737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TAATGTTAGAACAATGTTATGATGCTCTTGATAATTATTTTTGTCATTTTTTGGTCTTTG 1311

  3737103 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 3737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TTTTCTATGCTAGTCTCATTTAAAATTAAATTTTTTGTCAGATCAATAAGTCTCCCTAAT 1371

  3737163 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 3737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GTTTTCTCCCTAATCCTCAGTCTGTTCCCTCTACTATCACTCAGGACTCTCCTTGCTTTC 1431

  3737223 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 3737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TGCTGCATTCTAGGAAACCATCTCTTTACTTCCCTTAGGCTGTTTCTGTTCCAAAGTCAT 1491

  3737283 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 3737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 GGCTTTTAATTCCAAGAACCGAGAAGGCCCTTGGACTCAATAAACCTTATCCGCATTTAG 1551

  3737343 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 3737402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 GCCTCTGTTCACTATTGCACTGCCGGTCACTAATAAGGATTTCCTGGGGTTCCCTAGAAA 1611

  3737403 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 3737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AGAGAAGGTAGCGAATTTTAGGTGAGCACAACTGACCAAGGCACACATGTAGGAGAGAGA 1671

  3737463 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 3737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CGGATTACAATGAGAATGGCACAAATCTGAACGACTAATGCCAGTCTACACAGTAACATG 1731

  3737523 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 3737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GAAATGCTGACCATAGACTGTCCAGGGAATGGAAAAAAGCAGTGTGACTGCAAAGGAGAA 1791

  3737583 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 3737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 AAACAAAAGTTCACTGCCATAAGAGATTAGAAGGAAACACACAGACTGTTGACAATGACG 1851

  3737643 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 3737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 GGGTTTGGATGGTAGACCGTGGGCAACTTTTCTTCCTGTTCTATGTTACAAATTTTCTTT 1911

  3737703 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 3737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 GGTGAGCATGAACTGTTTGTAAAAGAGCTAATGAAGAAAAGATTAGAGTCCAGAGTGAAC 1971

  3737763 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 3737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 AGGCTCATCAAAAATGCTGACAGCAGGCTAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAAC 2031

  3737823 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 3737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACC 2091

  3737883 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 3737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 AACATGGAGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTTGTGGCTCATG 2151

  3737943 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 3738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 CCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTAAGGCGGGAGGATCACTTGAATCCAGAAGTTCA 2211

  3738003 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 3738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AGACCACCCTGGGCAACACAGTGAGACCCCATCTCTAAAAAATAAATAAATAAATAACCA 2271

  3738063 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 3738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 AATCTTTCCCACAGGAAATGACAACAGTTCCATAAGAAGCAAGCTCCAAGACTGTGGATG 2331

  3738123 AAACAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 3738182
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 AAAC-AAAAAAAAAAAGAAGAAAGCCACACTAACCTCATTTCTTTTTTGATAGGATTACC 2390

  3738183 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 3738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 AGATCAAGAAATTCAGAGAATACATAGACGGTGCTCTATTTCAAGTTCATTAAGCCACGT 2450

  3738243 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 3738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 AATCCAGTTCCTCATGACAGTAAAAGGAACTGTGGGCCTTATGGTAATAGAATAAGACTT 2510

  3738303 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 3738362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 ATGATACTGGAAGACACTGCCCACCCTTCACCAACCACTGGATGAAGAAACAGAAGCCAC 2570

  3738363 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 3738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GTGTACACAATGGAGAGCAAGAAGCTGAGGAGTAGAGCTAGGAGCTGAAAGGTAGAGTTA 2630

  3738423 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 3738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 CGATGAAAATGCACTCAGCAGACTGAAAGCAGAGGTTTGAAATCAACAAGATGTAATTTA 2690

  3738483 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 3738542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 ATAGGACTACATTTAAAAGTAATTTTTTTAAAAAAGTGCCTCAAGTACATGATGAGAAAG 2750

  3738543 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 3738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 ACTGTTCTGATGGGCACAATTCCTGGGGAAAAGACCTAAGTGCTTTGGCTGCATATAGGA 2810

  3738603 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 3738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 TGAGTGCAACACTGAAATGGCTGAGACAGAGACAACGGTGAGGAACAGTCCTGCCGTTCT 2870

  3738663 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 3738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CTCTGTGAATCCAACCATAACTGGAACCCATATCTCACCTCAGAAAGAACATTCAGAAAC 2930

  3738723 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 3738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 GGCAAAGCGTTTAGAGAAGGGAGACCAGAAAGTTGCGACACATGAAGCAAAGTTGAGCGA 2990

  3738783 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 ATGGGCAGCAAGCCTGTGCTTCCAGCACCCGAAGGGCTACTGTATGAAAGGACTTCACAG 3050

  3738843 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 TCACACAGTAACTGACGGACAGAAATTACTAGAAGGCAATGCTCAACACAAGTAAGTACC 3110

  3738903 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 CAAAAATAAAGTTGCCTGTCTCATAAATAGTTCTCACACTGTCACTTAAGAAACATTCAG 3170

  3738963 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTTTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3739022
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 GCAGCCGCCAAAAGACCAGTAGGAAGTCTGCCAAAAGGCCTGCAGGGTTGGGCACAAGGT 3230

  3739023 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 TAACCTAGATGACCTCTGAGGTCTCTTCCAACCATGAGAGTTTGAATCTTGGGCATAAAG 3290

  3739083 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 AGACTGAACCTTTTTGACACTGAATCGTTCAAATGTAGCGAGTCACTCTTGATGCAGGAC 3350

  3739143 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 AGTCCAGTGTGCCACAGCCCAAACTGTCTGAATGCTGGCAGAGCAGTTAGGAACACACGT 3410

  3739203 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TTCAGTCAGATCAGTCTTTGAACCTCAGCCTTGCTACTTACATAGCTGTGGGACTATGAG 3470

  3739263 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 CAAGTTTCCCAACCCCTCAGCACCTTCATTTTCTCCCCAGTGAAACGGAAATAATCAACA 3530

  3739323 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 CCTTCTCCTCACAGGGCTGTTGAAAGGATCAGTTAATGACACAGCAGAGCGACTGGCACA 3590

  3739383 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TAGTAAGCACTTAACACACGTTATCTTTTATTATTGTTGTTGGTATTAATAACAAATAAC 3650

  3739443 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TTGAACTTGACGCCTAGTGTGGATGCAGGAGTCAACATGGTTATTCCAATTTCCTCACTT 3710

  3739503 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GCCCAAGAAGCTAGGTCACTTAAATGACGGCTGGGAAGATGGAGAATACCAGATGATGAT 3770

  3739563 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3739622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 AATAAGCCACATTAACTGGGCACCTGCCATGTGCCAAGCGCCACTCTATGGACTGTAACA 3830

  3739623 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 3739682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TTTTGTTAGAGTCTCCCAGCAGCCCTATAAGAATTCCTGTCATTGGCCGGGCGCAGTGGC 3890

  3739683 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 3739742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGT 3950

  3739743 TCAAGACCAGCCTGGCTAAC 3739762
          ||||||||||||||||||||
     3951 TCAAGACCAGCCTGGCTAAC 3970

Alignment time is 2.98045 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [3724784,3745842] =>     21059 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3659] =>      3659 nucs 'mol-32-34c9-221156_3659'

Score:        3590
Aligned:      3623        nucs
Identic:      3620 (100%) nucs =>      3192 (100%)       428 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [3731592,3734784] EXCISED REGION [3735843,3736272]
 second seq =>  [      1,   3193] EXCISED REGION [   3194,   3623]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1058 nucs [3734785,3735842]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [3734785,3734802] to [3735843,3735860]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [3734785,3734785] to [3735842,3735842]
 second seq =>         0 nucs

  3731592 TGCTACCACAGCAGAGCTGAGCAGATGTGACAGAGACCGTTAAGCCTACAAAGCCTCAAG 3731651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTACCACAGCAGAGCTGAGCAGATGTGACAGAGACCGTTAAGCCTACAAAGCCTCAAG 60

  3731652 TATCTGCATTCCAGCCCTTTACAGAAAAAGGTCTGCCAATTCCCGATTTGGATAGTGTAA 3731711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTGCATTCCAGCCCTTTACAGAAAAAGGTCTGCCAATTCCCGATTTGGATAGTGTAA 120

  3731712 GTTAAACAGAAAGAAAACAGGAGAAAAATGTTTCACTCAGTCATGTTTGTCTTTCAATGA 3731771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTAAACAGAAAGAAAACAGGAGAAAAATGTTTCACTCAGTCATGTTTGTCTTTCAATGA 180

  3731772 AAACATCTTCCTACGAGAGCAGCTAAGAAAACCGGCTGCCATCTAGGGTGCTACCCAGCA 3731831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACATCTTCCTACGAGAGCAGCTAAGAAAACCGGCTGCCATCTAGGGTGCTACCCAGCA 240

  3731832 GGTCAGCCAGCTGGCAGCAAGTAAAGCCAGACTAGAAGTAAGTCAAGACAAGAAGCCAGC 3731891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTCAGCCAGCTGGCAGCAAGTAAAGCCAGACTAGAAGTAAGTCAAGACAAGAAGCCAGC 300

  3731892 AAAGCAGTAACAAGAGGTCAGGCCAGACTTACAGTAAGCAGGCAAGTTAAAAATTACAGT 3731951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGCAGTAACAAGAGGTCAGGCCAGACTTACAGTAAGCAGGCAAGTTAAAAATTACAGT 360

  3731952 TGGCCCACAAGTTGGAAAGCTCATGGGTCAGGGCAAGCAGGTGACATTCTAGAACACACA 3732011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGCCCACAAGTTGGAAAGCTCATGGGTCAGGGCAAGCAGGTGACATTCTAGAACACACA 420

  3732012 GTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGTTTAGCTCTAGGTCATTCTGTCT 3732071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTCAAGGCAAGCAGAAATGAGAAGTCTAGTAGAGTGTTTAGCTCTAGGTCATTCTGTCT 480

  3732072 ATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCTATCTCTAGGTCAGAGACACAGG 3732131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCAGAATGACACTCTGTCCAGTGTCTATTCTGGTCTATCTCTAGGTCAGAGACACAGG 540

  3732132 CAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTAATGACAAAGTCCAAGGCTCTGA 3732191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGAGTCAGCCCTCTGAGTAACAGTACAGAAGGCAGTAATGACAAAGTCCAAGGCTCTGA 600

  3732192 AAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCTTTGTTGGGAAAAGGTGAGTGTT 3732251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATGCAGCCCCAAGTCTACGCAGTTGGATCCTCTCCTTTGTTGGGAAAAGGTGAGTGTT 660

  3732252 AAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAGTAACCCACCTCCTAGAGCCCT 3732311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGAGGCCTCAATCAACTACGGCAGATTCAGAGGCCAGTAACCCACCTCCTAGAGCCCT 720

  3732312 GGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTATGAGCTGGCAGACTGGCAAGG 3732371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCCACCACCTCTCAGCTGACGTGGGACACTATGGGGTATGAGCTGGCAGACTGGCAAGG 780

  3732372 GCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCTGGACTAACAGCAGAAGTTCGG 3732431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCATGCTGCGTTTCACTGCTCGACAATTTTTTCTCTCCTGGACTAACAGCAGAAGTTCGG 840

  3732432 CATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTCTGATGGCAAGAACTCTTGAAA 3732491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATAAACAAGTAGTATGGGCCAGAACCATTCACCATCTCTGATGGCAAGAACTCTTGAAA 900

  3732492 AATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGTACTTACAGGAGGTATCATCCA 3732551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCATCAACAAAAGCATATTCACAGGAAACTCGGGTGTACTTACAGGAGGTATCATCCA 960

  3732552 ACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGGAAAAGACATCTTGGGTGCTCA 3732611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCATTCGATGTGAGCTGGAGGATATTCTTTAAAATAGGAAAAGACATCTTGGGTGCTCA 1020

  3732612 TCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCACCTTGGGGATTGCTAGAAAGA 3732671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCATCTACTCCGCAAATATAGATTGTCTCCAGTCTCACCTTGGGGATTGCTAGAAAGA 1080

  3732672 CAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAACTGCACATCCCATCCACACTC 3732731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAGACACAGAAAAGATGATAGAATTTTCCTGTCCGCAACTGCACATCCCATCCACACTC 1140

  3732732 CTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAACATGCTGAGAGAAACTATAATT 3732791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCCTAATAGTTCAGACAACACGAGTTTAGAAAGAAACATGCTGAGAGAAACTATAATT 1200

  3732792 ATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTATCTTAATTTTTATCACTCAAC 3732851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTCAAAAGAGCACGAGACATAACAGTAAGGTAAACTATCTTAATTTTTATCACTCAAC 1260

  3732852 GACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAAGATTAAACAAAGGGTGTTGAT 3732911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACAGCATTAATTCAGAACAGGCCTATCAGGCTCAGAAAGATTAAACAAAGGGTGTTGAT 1320

  3732912 AAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAATCAGAGCACTATCAAGCTCAA 3732971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAATACACGATACCTCTCCCCACATTAATCTGTAGCAATCAGAGCACTATCAAGCTCAA 1380

  3732972 CAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAATTTTTAAATGTATGTTAAAGAG 3733031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGAGTATTTGTTGAAGTTAGCCAGCTGCTTCTAAAATTTTTAAATGTATGTTAAAGAG 1440

  3733032 AAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGATGCTGCCCGTGACTATGTCAA 3733091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAACGCGCAGTAGTGGAGACAATTCTGAAAGAGAAGAGATGCTGCCCGTGACTATGTCAA 1500

  3733092 AGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAGAAAAAGACAACCCAAAATAAA 3733151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCATGAAACTAAAGAGATGCTACAAGTCAATTAAGAAGAAAAAGACAACCCAAAATAAA 1560

  3733152 AATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGGAAATACAAAAGGCCAATAAAT 3733211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATGGGCAAAGGACATGAGTAAGCAATTTACATAAAAGGAAATACAAAAGGCCAATAAAT 1620

  3733212 ATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAACATGCACATGAAAACAAGAAGA 3733271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATGAGGAGATGGGTTGACCTCACTACCAATCATTAACATGCACATGAAAACAAGAAGA 1680

  3733272 CACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTCCTGCGTCTCTGGTCCTTGAAT 3733331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACCAGTTTTCACGGACCAGATTTTACACCTTATTTTTCCTGCGTCTCTGGTCCTTGAAT 1740

  3733332 CGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGTAAGTAGGGGAAAGGCTTACTT 3733391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGAGATATCTTACATCTTTTAGTGTGAAGTGCTGGCAGTAAGTAGGGGAAAGGCTTACTT 1800

  3733392 CCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGGAAGGGTCTGCAGAAAACGTGA 3733451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCCCGGCTGGTGGGCATCGTCACTGCGGAGGGCAAATGGAAGGGTCTGCAGAAAACGTGA 1860

  3733452 TTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTCAGTATCGCCCCTCAACAAACA 3733511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTGCACGTGCCCTACGGACCTAGGAACTCCAGTCCTCAGTATCGCCCCTCAACAAACA 1920

  3733512 CATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGTTTGCTAAGGCACGATTTCTAA 3733571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATACATGTGGGCTCACGAAGTAGCTCACACGAAGATGTTTGCTAAGGCACGATTTCTAA 1980

  3733572 TAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATCCACATTATAAAATATTATGTG 3733631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAACCCAGTAGTTACCAGGGTAATAAATTATGCTTTATCCACATTATAAAATATTATGTG 2040

  3733632 GTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTAAGATGTATCACAGAGTGAAAA 3733691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAAAAAATGAGATAATTATATACCACAGAAAGATTCTAAGATGTATCACAGAGTGAAAA 2100

  3733692 AACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTAAACAATACCATACATTTACTA 3733751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACAAGTTGTAAAAAATTACATGCAAGGTGATGACATTAAACAATACCATACATTTACTA 2160

  3733752 AGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACACTGATAAC 3733811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGGTACATATTTATGTACACAGACACCCAGAAAAGGCCAATATGAGTCACACTGATAAC 2220

  3733812 TGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCC 3733871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCTGTTACTTCTGAGGAGGCAGAAAGGTTGAAGGCTATGGTCAAAAAAGAAACTTAGCC 2280

  3733872 TTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGG 3733931
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2281 TTATCAGGACTGCATACTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGG 2340

  3733932 AGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTC 3733991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTC 2400

  3733992 CTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTT 3734051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTATAGGAGCGTACCACCACACCCGGCTAATTT 2460

  3734052 TGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCT 3734111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTATTTTTAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGCATGGTCTCCATCCCTTGCCCT 2520

  3734112 CGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCC 3734171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACGGCGCC 2580

  3734172 CAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAG 3734231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGCCAATTGCGTACTTTTTTAACTACCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGAGATGGAG 2640

  3734232 TTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCT 3734291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCT 2700

  3734292 GCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 3734351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCCGTCTAAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 2760

  3734352 TGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGG 3734411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGCGCCACCACGCCATGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGACGTTTCTCCATGGTGG 2820

  3734412 TCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 3734471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGC 2880

  3734472 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATT 3734531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGGCTTTTTTTACTACATATTTTAAGTACATT 2940

  3734532 ATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGG 3734591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCTCCTTTAATCTCAATTGCAAAATTTGTAAATATATCAATAAATAAACTTAAGGTCGG 3000

  3734592 GCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGA 3734651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCGCGGTCGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCACGA 3060

  3734652 GGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 3734711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGTCAAGAGGTCGAGACCATCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 3120

  3734712 AGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGG 3734771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGG 3180

  3734772 CAGGAGAATGGCG 3734784
          |||||||||||||
     3181 CAGGAGAATGGCG 3193

EXCISED REGION

  3735843 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3735902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 TGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGACTGCACTCCAGCCTGGG 3253

  3735903 TGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3735962
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 CGACAGAGCGAGAGGCCATCTCAAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAAATAAAAA 3313

  3735963 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 AAGGATTTAATGTCTATTACTACCAAGCATGTTTTTACATGCTATTAACAAAATTTAAAA 3373

  3736023 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 ATTTTTTAGCCCATCCTTCTTCTGCAGATATATGCTATTACTTCCATTTAAAACAAAAAA 3433

  3736083 AATTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3736142
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 ATTTTACAAACAAAAAAATGCATTTAATAATTTTAAACACATAATAATTTTAAATCTCAA 3493

  3736143 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 AGAGTTAAGAGATGGGTTTAACATGAGCCCATGTAAGTGTGGCCAGACTAATTCAGTTGA 3553

  3736203 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 GTGCTTTCCTGACATCCCAGATTTAAAAAGATAAAGACACCATGAAGATTTATGAATCCA 3613

  3736263 GGTGGGCATG 3736272
          ||||||||||
     3614 GGTGGGCATG 3623

Alignment time is 2.72852 s

