
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3480] =>      3480 nucs 'mol-32-29c9-052133_3480'

Score:        3480
Aligned:      3480        nucs
Identic:      3480 (100%) nucs =>      2306 (100%)      1174 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2720307,2722612] EXCISED REGION [2722615,2723788]
 second seq =>  [      1,   2306] EXCISED REGION [   2307,   3480]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [2722613,2722614]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [2722613,2722625] to [2722615,2722627]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [2722613,2722613] to [2722614,2722614]
 second seq =>         0 nucs

  2720307 GGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTC 2720366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTC 60

  2720367 CACTTCCCAGGCTCAAGCGTTTCTCGTGCCTCAGCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGT 2720426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTTCCCAGGCTCAAGCGTTTCTCGTGCCTCAGCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGT 120

  2720427 GTGCACCACCACACAAGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGC 2720486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCACCACCACACAAGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGC 180

  2720487 CATGATGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCC 2720546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGATGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCC 240

  2720547 TAAGGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCATGCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTT 2720606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAGGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCATGCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTT 300

  2720607 AAGACTGAATAATATCCCATTGTTGCATGTATCACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTG 2720666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGACTGAATAATATCCCATTGTTGCATGTATCACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTG 360

  2720667 ATGGACATCTGAGTTGCTTCCAATTTTTTTTTGCTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACG 2720726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGACATCTGAGTTGCTTCCAATTTTTTTTTGCTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACG 420

  2720727 TAGGTGTATAAATATCTGGGTCTCTGTTTTCAGTTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAG 2720786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGGTGTATAAATATCTGGGTCTCTGTTTTCAGTTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAG 480

  2720787 AATTGCTGATCGTATGGCAATTCTATGTATAGTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTA 2720846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTGCTGATCGTATGGCAATTCTATGTATAGTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTA 540

  2720847 CTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 2720906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 600

  2720907 CTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCTGCC 2720966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCTGCC 660

  2720967 ACCACACACGGCTAAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGG 2721026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCACACACGGCTAAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGG 720

  2721027 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCAACTGCCTCAACCTCCCAAAGTGTTAGGA 2721086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCAACTGCCTCAACCTCCCAAAGTGTTAGGA 780

  2721087 TTACAGGCATGAGCCACTGCGTCTGGCCTCTATGTTTAATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTT 2721146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTACAGGCATGAGCCACTGCGTCTGGCCTCTATGTTTAATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTT 840

  2721147 TTTGAGATGGAGTCTGGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAATGTAGGGCACAATCTCAGCTCAC 2721206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGAGATGGAGTCTGGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAATGTAGGGCACAATCTCAGCTCAC 900

  2721207 TGCAACCTCTGCTTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG 2721266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCAACCTCTGCTTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG 960

  2721267 ACTACAGGTGCCCACGACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTT 2721326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTACAGGTGCCCACGACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTT 1020

  2721327 TCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCT 2721386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCT 1080

  2721387 CCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTT 2721446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTT 1140

  2721447 TAGCTTTTTTTAAAATTAAAGAAATAAAACACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCAT 2721506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGCTTTTTTTAAAATTAAAGAAATAAAACACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCAT 1200

  2721507 TTCTGCTTGCCTCCGTTCCTCTATTTCTTCCATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATT 2721566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTGCTTGCCTCCGTTCCTCTATTTCTTCCATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATT 1260

  2721567 TTGTGTTTTCTCTCAGCCCACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 2721626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTGTTTTCTCTCAGCCCACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 1320

  2721627 ATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCT 2721686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCT 1380

  2721687 TGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 2721746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 1440

  2721747 AGCTGGGATTACAAGTGCGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAG 2721806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCTGGGATTACAAGTGCGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAG 1500

  2721807 AGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCAC 2721866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCAC 1560

  2721867 CTGCCTTGGCCTCCCAAAGTTTTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGC 2721926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGCCTTGGCCTCCCAAAGTTTTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGC 1620

  2721927 CCACATTTTTAATGCTTTCACATTCATACACAGGTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGT 2721986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCACATTTTTAATGCTTTCACATTCATACACAGGTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGT 1680

  2721987 GTGCATTAAAAAGGGACATACCTGACATCCTTTTGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGC 2722046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGCATTAAAAAGGGACATACCTGACATCCTTTTGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGC 1740

  2722047 GCTAGATTGCCTGGGTTCAGATCTTGGCTCTGACACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCA 2722106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTAGATTGCCTGGGTTCAGATCTTGGCTCTGACACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCA 1800

  2722107 GGTTCCTTCATCTCTCCATGCCTCCCTTTTCTAATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAG 2722166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTTCCTTCATCTCTCCATGCCTCCCTTTTCTAATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAG 1860

  2722167 CCTGAAACCTACTGCAAGGGTTGTTTTGGAGACTGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCT 2722226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTGAAACCTACTGCAAGGGTTGTTTTGGAGACTGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCT 1920

  2722227 TAGAACAGAGAGGGGATGTAGCAGACACAGGATGGATATATTACCATTATCGTTCTGCAT 2722286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGAACAGAGAGGGGATGTAGCAGACACAGGATGGATATATTACCATTATCGTTCTGCAT 1980

  2722287 GTGTGTCTGTCCACATGGTTGTAAAGTCTATTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACT 2722346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGTGTCTGTCCACATGGTTGTAAAGTCTATTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACT 2040

  2722347 CTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCA 2722406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCA 2100

  2722407 GGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCGCTAC 2722466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCGCTAC 2160

  2722467 CACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAG 2722526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAG 2220

  2722527 GATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATCATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAT 2722586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATCATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAT 2280

  2722587 TACAGATGTGAGCCACCATGCCTTGC 2722612
          ||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACAGATGTGAGCCACCATGCCTTGC 2306

EXCISED REGION

  2722615 TTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAGACTGAGTCTTGCTCTGCTGGAGTGCAGTGGCAGGA 2722674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 TTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAGACTGAGTCTTGCTCTGCTGGAGTGCAGTGGCAGGA 2366

  2722675 TCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTACAAGTGATTCTCTTGCATCAGCCTTCC 2722734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTACAAGTGATTCTCTTGCATCAGCCTTCC 2426

  2722735 AAGCAGCTGGGATCACAGGAGCATGCCACCACACACTTTTTTTTTTCTTTTTTGACGGAG 2722794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 AAGCAGCTGGGATCACAGGAGCATGCCACCACACACTTTTTTTTTTCTTTTTTGACGGAG 2486

  2722795 TCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCATTGCAGCCTCTG 2722854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 TCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCATTGCAGCCTCTG 2546

  2722855 CCTCCCGGGTTCCAGCGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGTGC 2722914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 CCTCCCGGGTTCCAGCGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGTGC 2606

  2722915 ATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTGGTAGAGACGGGGTTTTTTGGCCAGGC 2722974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 ATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTGGTAGAGACGGGGTTTTTTGGCCAGGC 2666

  2722975 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 2723034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 2726

  2723035 TACAGGCATGAGCCTCAGCGCCTGGTGATAGATCTAGTTTCTTCTCTCTTTCTCCTTTTT 2723094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TACAGGCATGAGCCTCAGCGCCTGGTGATAGATCTAGTTTCTTCTCTCTTTCTCCTTTTT 2786

  2723095 TTTTTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCTCAAGGTGGTGTGATCCTGGCTCACT 2723154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TTTTTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCTCAAGGTGGTGTGATCCTGGCTCACT 2846

  2723155 GTAGCCTCAATACCCCCAGGGCTCAAGTGATTCTCCAACCTCAGCCTCCCACGTGGTTGG 2723214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 GTAGCCTCAATACCCCCAGGGCTCAAGTGATTCTCCAACCTCAGCCTCCCACGTGGTTGG 2906

  2723215 GACTACAGCATGCACCACCATGCTTGGTTAAGTTTTTAAGAAATTTTTGTAGAGATGAGG 2723274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 GACTACAGCATGCACCACCATGCTTGGTTAAGTTTTTAAGAAATTTTTGTAGAGATGAGG 2966

  2723275 TTTCACCATCTTGCTGTCTCAAACTTCTGGGCTCAAATGATTCTCCAACCTTGGCCTCCC 2723334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TTTCACCATCTTGCTGTCTCAAACTTCTGGGCTCAAATGATTCTCCAACCTTGGCCTCCC 3026

  2723335 AAAGTGTTGGGATTACAGGCGGGAGCCACCACTTCTGGCCTAGTTTTTTCTTTTTGGTGC 2723394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 AAAGTGTTGGGATTACAGGCGGGAGCCACCACTTCTGGCCTAGTTTTTTCTTTTTGGTGC 3086

  2723395 CATGCATATTAATTTGTACAAATAGATCACATTTTTTTTGTATCCCCCATTGATCCCCTC 2723454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 CATGCATATTAATTTGTACAAATAGATCACATTTTTTTTGTATCCCCCATTGATCCCCTC 3146

  2723455 TTGCTGGACACCTAGGTCGTTTCCATTTTCTGATATTGCAAGCAATGCTGCAGGCAGTGG 2723514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TTGCTGGACACCTAGGTCGTTTCCATTTTCTGATATTGCAAGCAATGCTGCAGGCAGTGG 3206

  2723515 CTTTCCCCTTGCCTGGCCCTCTGTGCGTTTGTGTGAGGTCATGAGGGGTACCTAGAGGTG 2723574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 CTTTCCCCTTGCCTGGCCCTCTGTGCGTTTGTGTGAGGTCATGAGGGGTACCTAGAGGTG 3266

  2723575 GGGCTGTTGGGTCGCAGCTCTACTGGATGCTGCCAGATTGCCCTCAAGAGAGGACTTAGG 2723634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 GGGCTGTTGGGTCGCAGCTCTACTGGATGCTGCCAGATTGCCCTCAAGAGAGGACTTAGG 3326

  2723635 CTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAGCACTTTGGCAGGCCAAGGTGGGCGGATC 2723694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 CTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAGCACTTTGGCAGGCCAAGGTGGGCGGATC 3386

  2723695 ACTTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAA 2723754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 ACTTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAA 3446

  2723755 AAACACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTG 2723788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 AAACACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTG 3480

Alignment time is 3.09812 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3812] =>      3812 nucs 'mol-32-29d4-012275_3812'

Score:        3771
Aligned:      3815        nucs
Identic:      3811 (100%) nucs =>       764 (100%)      3047 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2717987,2718750] EXCISED REGION [2718754,2721803]
 second seq =>  [      1,    765] EXCISED REGION [    766,   3812]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [2718751,2718753]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        40 nucs [2718751,2718790] to [2718754,2718793]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [2718751,2718751] to [2718753,2718753]
 second seq =>         0 nucs

  2717987 GGTTGAGCTGTGAACCAGTAGGTTACCGCAGTGTGGTACCACCCCCCCC-AACCCCAACA 2718045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
        1 GGTTGAGCTGTGAACCAGTAGGTTACCGCAGTGTGGTACCACCCCCCCCCAACCCCAACA 60

  2718046 CCCAGCTCATTCTGAGAGGGTGGAGTGGGCGGAAATCCGTGCCTGGCAGACCACAAAGCC 2718105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAGCTCATTCTGAGAGGGTGGAGTGGGCGGAAATCCGTGCCTGGCAGACCACAAAGCC 120

  2718106 ACATAACTGACTTTTGTAGCCCTGCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAGGGTTGACGGCAGCCA 2718165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATAACTGACTTTTGTAGCCCTGCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAGGGTTGACGGCAGCCA 180

  2718166 TTGCCCCTTTCTTCGGTGCTTTGCCACCAGCAGACGCCCCGTGGAATTGAGGAGCTTTGT 2718225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCCCCTTTCTTCGGTGCTTTGCCACCAGCAGACGCCCCGTGGAATTGAGGAGCTTTGT 240

  2718226 TCTACGAGCTCGGGAACGGGACTTGGGAGGGACAGCCCCTGTCCCACCCTGCCATGCCCT 2718285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTACGAGCTCGGGAACGGGACTTGGGAGGGACAGCCCCTGTCCCACCCTGCCATGCCCT 300

  2718286 GTTCAACCCTGTCAGGCAGCTGAACGTAGGCTGGACCCATGGCTGCCCACCCTGGCTGCA 2718345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCAACCCTGTCAGGCAGCTGAACGTAGGCTGGACCCATGGCTGCCCACCCTGGCTGCA 360

  2718346 GTACAGAATCACCTAGGGGACCTCGTTAAAATGCAGCTTCCGGACCCCACCCTGGGGCTT 2718405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTACAGAATCACCTAGGGGACCTCGTTAAAATGCAGCTTCCGGACCCCACCCTGGGGCTT 420

  2718406 GGGGATTCTGCCTCATCAGCCTGGGTGGGGCCCAGGAAACCTGTGTGTTACCAGCGCTGA 2718465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGGATTCTGCCTCATCAGCCTGGGTGGGGCCCAGGAAACCTGTGTGTTACCAGCGCTGA 480

  2718466 GGTGCTGCTGATGAGGCAGCTGGCTTCACAGCTGCACGGGAACCAGTGCCGTTTAAAGCA 2718525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTGCTGCTGATGAGGCAGCTGGCTTCACAGCTGCACGGGAACCAGTGCCGTTTAAAGCA 540

  2718526 CTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTCTGGGTGACCTGGGGCAG 2718585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTCTGGGTGACCTGGGGCAG 600

  2718586 GCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATAATAACAGTACCTGCACG 2718645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATAATAACAGTACCTGCACG 660

  2718646 TGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGAAATGGGAACAGAGTGCC 2718705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGAAATGGGAACAGAGTGCC 720

  2718706 TGGTACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCTGA 2718750
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGTACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCTGA 765

EXCISED REGION

  2718754 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTTTGT 2718813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTTTGT 825

  2718814 CACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCGGTT 2718873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 CACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCGGTT 885

  2718874 CAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCACG 2718933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 CAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCACG 945

  2718934 CCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTGGTC 2718993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 CCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTGGTC 1005

  2718994 TTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 2719053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 TTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1065

  2719054 GCGCGAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGCGGT 2719113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 GCGCGAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGCGGT 1125

  2719114 CACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCACAC 2719173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 CACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCACAC 1185

  2719174 TGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGTACA 2719233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 TGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGTACA 1245

  2719234 TGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACAAGG 2719293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 TGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACAAGG 1305

  2719294 CCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAGCAGCA 2719353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 CCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAGCAGCA 1365

  2719354 CCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCTGGT 2719413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 CCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCTGGT 1425

  2719414 AAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATCCTG 2719473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 AAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATCCTG 1485

  2719474 CCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTGTTT 2719533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 CCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTGTTT 1545

  2719534 TTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTGACA 2719593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 TTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTGACA 1605

  2719594 CTTGTTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTGAGA 2719653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 CTTGTTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTGAGA 1665

  2719654 CGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAC 2719713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 CGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAC 1725

  2719714 CTCCGCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATCACA 2719773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 CTCCGCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATCACA 1785

  2719774 GGCGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCA 2719833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     1786 GGCGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATA-TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCA 1844

  2719834 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCA 2719893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCA 1904

  2719894 AAGTGCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAACTGTGTTAAAATATACATATTATAA 2719953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 AAGTGCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAACTGTGTTAAAATATACATATTATAA 1964

  2719954 AACTTACCATTTAAAGCATTTTTAAGTGCACCATTCTGTGACATTAAGTACATTTACAAT 2720013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 AACTTACCATTTAAAGCATTTTTAAGTGCACCATTCTGTGACATTAAGTACATTTACAAT 2024

  2720014 GCTGTGCAAGGATCACCATTATTTCTAGAAGTTTTTCATCATCCCAAACTGAAACTTCGT 2720073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 GCTGTGCAAGGATCACCATTATTTCTAGAAGTTTTTCATCATCCCAAACTGAAACTTCGT 2084

  2720074 ATACATTAAATAATAACTCCCTATTCCCTCATCTCCACAGCACCCTGCAGCCACCATTCT 2720133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 ATACATTAAATAATAACTCCCTATTCCCTCATCTCCACAGCACCCTGCAGCCACCATTCT 2144

  2720134 GCTTTCTGTTTCTATGAATTTGACTGCTCGGTGAACTGTGTATAGGTGAAATCACACAGT 2720193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 GCTTTCTGTTTCTATGAATTTGACTGCTCGGTGAACTGTGTATAGGTGAAATCACACAGT 2204

  2720194 ACTTGTCCTTCTGTGTCTGGCTTATTTCACTTCCCATAATGTCTTCAAGGTTCATCCATG 2720253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 ACTTGTCCTTCTGTGTCTGGCTTATTTCACTTCCCATAATGTCTTCAAGGTTCATCCATG 2264

  2720254 TTGTAGCGTGTGTCAGAATTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTCTTG 2720313
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 TTGTAGCGTGTGTCAGAATTTCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTCTTG 2323

  2720314 CTCTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACTTCC 2720373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 CTCTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACTTCC 2383

  2720374 CAGGCTCAAGCGTTTCTCGTGCCTCAGCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACC 2720433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 CAGGCTCAAGCGTTTCTCGTGCCTCAGCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACC 2443

  2720434 ACCACACAAGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGCCATGATG 2720493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 ACCACACAAGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGCCATGATG 2503

  2720494 GCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCTAAGGTG 2720553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 GCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCTAAGGTG 2563

  2720554 CTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCATGCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTTAAGACTG 2720613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 CTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCATGCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTTAAGACTG 2623

  2720614 AATAATATCCCATTGTTGCATGTATCACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTGATGGACA 2720673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 AATAATATCCCATTGTTGCATGTATCACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTGATGGACA 2683

  2720674 TCTGAGTTGCTTCCAATTTTTTTTTGCTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACGTAGGTGT 2720733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TCTGAGTTGCTTCCAATTTTTTTTTGCTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACGTAGGTGT 2743

  2720734 ATAAATATCTGGGTCTCTGTTTTCAGTTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAGAATTGCT 2720793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 ATAAATATCTGGGTCTCTGTTTTCAGTTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAGAATTGCT 2803

  2720794 GATCGTATGGCAATTCTATGTATAGTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTACTGTGTT 2720853
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 GATCGTATGGCAATTCTATGTATAG-TTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTACTGTGTT 2862

  2720854 GCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCTGGTTC 2720913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 GCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCTGGTTC 2922

  2720914 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCTGCCACCACAC 2720973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCTGCCACCACAC 2982

  2720974 ACGGCTAAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGGTCT 2721033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 ACGGCTAAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGGTCT 3042

  2721034 TGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCAACTGCCTCAACCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGG 2721093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 TGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCAACTGCCTCAACCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGG 3102

  2721094 CATGAGCCACTGCGTCTGGCCTCTATGTTTAATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGA 2721153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 CATGAGCCACTGCGTCTGGCCTCTATGTTTAATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGA 3162

  2721154 TGGAGTCTGGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAATGTAGGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACC 2721213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 TGGAGTCTGGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAATGTAGGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACC 3222

  2721214 TCTGCTTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAG 2721273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 TCTGCTTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAG 3282

  2721274 GTGCCCACGACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGT 2721333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 GTGCCCACGACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGT 3342

  2721334 GTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAG 2721393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 GTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAG 3402

  2721394 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTT 2721453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTT 3462

  2721454 TTTTAAAATTAAAGAAATAAAACACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCT 2721513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 TTTTAAAATTAAAGAAATAAAACACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCT 3522

  2721514 TGCCTCCGTTCCTCTATTTCTTCCATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTT 2721573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TGCCTCCGTTCCTCTATTTCTTCCATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTT 3582

  2721574 TTCTCTCAGCCCACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 2721633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TTCTCTCAGCCCACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 3642

  2721634 TATTTTTGAGACGGAGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCA 2721693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TATTTTTGAGACGGAGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCA 3702

  2721694 CTGCAACCTCCGCCTCCCGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 2721753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 CTGCAACCTCCGCCTCCCGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 3762

  2721754 ATTACAAGTGCGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAG 2721803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 ATTACAAGTGCGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAG 3812

Alignment time is 3.05546 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   5619] =>      5619 nucs 'mol-32-2edb-074611_5619'

Score:        5430
Aligned:      5631        nucs
Identic:      5607 (100%) nucs =>      1411 ( 99%)      4196 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2718509,2719928] EXCISED REGION [2721218,2725427]
 second seq =>  [      1,   1419] EXCISED REGION [   1420,   5619]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1289 nucs [2719929,2721217]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [2719929,2719930] to [2721218,2721219]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [2719929,2719931] to [2721215,2721217]
 second seq =>         0 nucs

  2718509 CAGTGCCGTTTAAAGCACTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTC 2718568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTGCCGTTTAAAGCACTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTC 60

  2718569 TGGGTGACCTGGGGCAGGCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATA 2718628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGTGACCTGGGGCAGGCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATA 120

  2718629 ATAACAGTACCTGCACGTGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGA 2718688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAACAGTACCTGCACGTGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGA 180

  2718689 AATGGGAACAGAGTGCCTGGTACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCT 2718748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGGGAACAGAGTGCCTGGTACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCT 240

  2718749 GATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGC 2718808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGC 300

  2718809 TTTGTCACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCC 2718868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGTCACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCC 360

  2718869 CGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCA 2718928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCA 420

  2718929 CCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGC 2718988
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCACGCCCAGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGC 480

  2718989 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 2719048
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      481 TGGTCTTGAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGAT 540

  2719049 TACAGGCGCGAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGT 2719108
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACAGGCGCGAGCCACCGCACCCAGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGT 600

  2719109 GCGGTCACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGG 2719168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCGGTCACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGG 660

  2719169 CACACTGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTG 2719228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACACTGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTG 720

  2719229 GTACATGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACA 2719288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTACATGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACA 780

  2719289 CAAGGCCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAG 2719348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      781 CAAGGCCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTCGAGTTAG 840

  2719349 CAGCACCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAAT 2719408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGCACCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAAT 900

  2719409 CTGGTAAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCA 2719468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGTAAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCA 960

  2719469 TCCTGCCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTT 2719528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTGCCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTT 1020

  2719529 TGTTTTTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAAT 2719588
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTTTTTTTTTT-CTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAAT 1079

  2719589 TGACACTTGTTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTT 2719648
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TGACACTTGTTAACATTTTGTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTT 1139

  2719649 TGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACT 2719708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACT 1199

  2719709 GCAACCTCCGCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA 2719768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GCAACCTCCGCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA 1259

  2719769 TCACAGGCGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 2719828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCACAGGCGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 1319

  2719829 CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCC 2719888
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1320 CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCACCCACCTCGGCC 1379

  2719889 TCCCAAAGTGCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAA 2719928
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCCCAAAATGCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAA 1419

EXCISED REGION

  2721218 CTTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 2721277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 CTTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 1479

  2721278 CCACGACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTA 2721337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 CCACGACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTA 1539

  2721338 GCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAGTGCT 2721397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAGTGCT 1599

  2721398 GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTTTTTT 2721457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTTTTTT 1659

  2721458 AAAATTAAAGAAATAAAACACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCTTGCC 2721517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 AAAATTAAAGAAATAAAACACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCTTGCC 1719

  2721518 TCCGTTCCTCTATTTCTTCCATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTTTTCT 2721577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TCCGTTCCTCTATTTCTTCCATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTTTTCT 1779

  2721578 CTCAGCCCACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 2721637
          ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 CTCAGCCCAC--------TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 1831

  2721638 TTTGAGACGGAGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGC 2721697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TTTGAGACGGAGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGC 1891

  2721698 AACCTCCGCCTCCCGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTA 2721757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 AACCTCCGCCTCCCGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTA 1951

  2721758 CAAGTGCGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 2721817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 CAAGTGCGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 2011

  2721818 CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCC 2721877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCC 2071

  2721878 TCCCAAAGTTTTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGCCCACATTTTTA 2721937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TCCCAAAGTTTTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGCCCACATTTTTA 2131

  2721938 ATGCTTTCACATTCATACACAGGTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGTGTGCATTAAAA 2721997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 ATGCTTTCACATTCATACACAGGTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGTGTGCATTAAAA 2191

  2721998 AGGGACATACCTGACATCCTTTTGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGCGCTAGATTGCC 2722057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AGGGACATACCTGACATCCTTTTGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGCGCTAGATTGCC 2251

  2722058 TGGGTTCAGATCTTGGCTCTGACACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCAGGTTCCTTCAT 2722117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TGGGTTCAGATCTTGGCTCTGACACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCAGGTTCCTTCAT 2311

  2722118 CTCTCCATGCCTCCCTTTTCTAATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAGCCTGAAACCTA 2722177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 CTCTCCATGCCTCCCTTTTCTAATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAGCCTGAAACCTA 2371

  2722178 CTGCAAGGGTTGTTTTGGAGACTGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCTTAGAACAGAGA 2722237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CTGCAAGGGTTGTTTTGGAGACTGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCTTAGAACAGAGA 2431

  2722238 GGGGATGTAGCAGACACAGGATGGATATATTACCATTATCGTTCTGCATGTGTGTCTGTC 2722297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 GGGGATGTAGCAGACACAGGATGGATATATTACCATTATCGTTCTGCATGTGTGTCTGTC 2491

  2722298 CACATGGTTGTAAAGTCTATTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAG 2722357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 CACATGGTTGTAAAGTCTATTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAG 2551

  2722358 GCTGGAATGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCA 2722417
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 GCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCA 2611

  2722418 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCGCTACCACACCCGGCT 2722477
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGAACCTGGGACTACAGGCGCCCGCTACCACACCCGGCT 2671

  2722478 AATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA 2722537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 AATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA 2731

  2722538 TCTCCTGACCTCATCATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGATGTGA 2722597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TCTCCTGACCTCATCATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGATGTGA 2791

  2722598 GCCACCATGCCTTGCTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAGACTGAGTCTTGCTCTGCT 2722657
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 GCCACCATGCCTTGC-TTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAGACTGAGTCTTGCTCTGCT 2850

  2722658 GGAGTGCAGTGGCAGGATCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTACAAGTGATTC 2722717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 GGAGTGCAGTGGCAGGATCTTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTACAAGTGATTC 2910

  2722718 TCTTGCATCAGCCTTCCAAGCAGCTGGGATCACAGGAGCATGCCACCACACACTTTTTTT 2722777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TCTTGCATCAGCCTTCCAAGCAGCTGGGATCACAGGAGCATGCCACCACACACTTTTTTT 2970

  2722778 TTTCTTTTTTGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCG 2722837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TTTCTTTTTTGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCG 3030

  2722838 GCTCATTGCAGCCTCTGCCTCCCGGGTTCCAGCGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTA 2722897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 GCTCATTGCAGCCTCTGCCTCCCGGGTTCCAGCGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTA 3090

  2722898 GCTGGGATTACAGGTGCATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTGGTAGAGACG 2722957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 GCTGGGATTACAGGTGCATGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTGGTAGAGACG 3150

  2722958 GGGTTTTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCTGCCTCGGCC 2723017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 GGGTTTTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCTGCCTCGGCC 3210

  2723018 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCTCAGCGCCTGGTGATAGATCTAGTTTCTT 2723077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCTCAGCGCCTGGTGATAGATCTAGTTTCTT 3270

  2723078 CTCTCTTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCTCAAGGTGG 2723137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 CTCTCTTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCTCAAGGTGG 3330

  2723138 TGTGATCCTGGCTCACTGTAGCCTCAATACCCCCAGGGCTCAAGTGATTCTCCAACCTCA 2723197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 TGTGATCCTGGCTCACTGTAGCCTCAATACCCCCAGGGCTCAAGTGATTCTCCAACCTCA 3390

  2723198 GCCTCCCACGTGGTTGGGACTACAGCATGCACCACCATGCTTGGTTAAGTTTTTAAGAAA 2723257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 GCCTCCCACGTGGTTGGGACTACAGCATGCACCACCATGCTTGGTTAAGTTTTTAAGAAA 3450

  2723258 TTTTTGTAGAGATGAGGTTTCACCATCTTGCTGTCTCAAACTTCTGGGCTCAAATGATTC 2723317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TTTTTGTAGAGATGAGGTTTCACCATCTTGCTGTCTCAAACTTCTGGGCTCAAATGATTC 3510

  2723318 TCCAACCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGGGAGCCACCACTTCTGGCCTAG 2723377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 TCCAACCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGGGAGCCACCACTTCTGGCCTAG 3570

  2723378 TTTTTTCTTTTTGGTGCCATGCATATTAATTTGTACAAATAGATCACATTTTTTTTGTAT 2723437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 TTTTTTCTTTTTGGTGCCATGCATATTAATTTGTACAAATAGATCACATTTTTTTTGTAT 3630

  2723438 CCCCCATTGATCCCCTCTTGCTGGACACCTAGGTCGTTTCCATTTTCTGATATTGCAAGC 2723497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 CCCCCATTGATCCCCTCTTGCTGGACACCTAGGTCGTTTCCATTTTCTGATATTGCAAGC 3690

  2723498 AATGCTGCAGGCAGTGGCTTTCCCCTTGCCTGGCCCTCTGTGCGTTTGTGTGAGGTCATG 2723557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 AATGCTGCAGGCAGTGGCTTTCCCCTTGCCTGGCCCTCTGTGCGTTTGTGTGAGGTCATG 3750

  2723558 AGGGGTACCTAGAGGTGGGGCTGTTGGGTCGCAGCTCTACTGGATGCTGCCAGATTGCCC 2723617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 AGGGGTACCTAGAGGTGGGGCTGTTGGGTCGCAGCTCTACTGGATGCTGCCAGATTGCCC 3810

  2723618 TCAAGAGAGGACTTAGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAGCACTTTGGCAG 2723677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 TCAAGAGAGGACTTAGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAGCACTTTGGCAG 3870

  2723678 GCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAA 2723737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 GCCAAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAA 3930

  2723738 AACCCCGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATC 2723797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 AACCCCGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATC 3990

  2723798 CAGCTACTAGGGTGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGACGGGAGGCAGAGGCTGCAGT 2723857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 CAGCTACTAGGGTGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAAGACGGGAGGCAGAGGCTGCAGT 4050

  2723858 GAGCTGAGATCTCATCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAATGAGAGACACCGTCTCAAAA 2723917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 GAGCTGAGATCTCATCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAATGAGAGACACCGTCTCAAAA 4110

  2723918 AAAAAAAAAAAAAGAGGACTTAGTATTTTCACTGCTCCCAATTCTATGATTCCCATTCCC 2723977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 AAAAAAAAAAAAAGAGGACTTAGTATTTTCACTGCTCCCAATTCTATGATTCCCATTCCC 4170

  2723978 CACGTCCTCACTGATGTTTGATTTTCATGTTGATTTGAGTGACAGAAGCATATTTTATTT 2724037
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 CACGTCCTCATTGATGTTTGATTTTCATGTTGATTTGAGTGACAGAAGCATATTTTATTT 4230

  2724038 TATTTTATTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTATAGTGGCATGATCTCGGCTCACTAAAAT 2724097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 TATTTTATTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTATAGTGGCATGATCTCGGCTCACTAAAAT 4290

  2724098 CTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACA 2724157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 CTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACA 4350

  2724158 GGTGCCCGCCACCACGGCCCGGATAATGG-TTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAG 2724216
          ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 GGTGCCCGCCACCAC-GCCCGGATAATGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAG 4409

  2724217 AGATAGGTTTCATTATGTTGGCCAGGCTGCTCTCGAACTGCTGACCTGTTGATCTGCCTG 2724276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 AGATAGGTTTCATTATGTTGGCCAGGCTGCTCTCGAACTGCTGACCTGTTGATCTGCCTG 4469

  2724277 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGTCCTGCCTATTATTT 2724336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGTCCTGCCTATTATTT 4529

  2724337 TATTCTTTATTATACAAACATGAACAGATCTCTGAATAAGCGCTTGGAAACCCTCATGGC 2724396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 TATTCTTTATTATACAAACATGAACAGATCTCTGAATAAGCGCTTGGAAACCCTCATGGC 4589

  2724397 TCCACTGTCAGATCGCTGTGTCTGAGCCTCCCTCGAGTCCCTCTCCACAGGCCCAGGGAT 2724456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 TCCACTGTCAGATCGCTGTGTCTGAGCCTCCCTCGAGTCCCTCTCCACAGGCCCAGGGAT 4649

  2724457 GCGCTTCTCTTCACCCTTTTTCTGTGTCACAAGCATTTCCATATATTGCTACATTCTTTT 2724516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 GCGCTTCTCTTCACCCTTTTTCTGTGTCACAAGCATTTCCATATATTGCTACATTCTTTT 4709

  2724517 TTCCCCTCTTTAAAAATAGCACTTTTCCTGATTATAAAAATAGTACATGCTCACTGTAGA 2724576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 TTCCCCTCTTTAAAAATAGCACTTTTCCTGATTATAAAAATAGTACATGCTCACTGTAGA 4769

  2724577 ACATTTAGAGAATATGTACAAATAGAGATTAAAAAATAAAAATATGACCCATCACCCAAA 2724636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 ACATTTAGAGAATATGTACAAATAGAGATTAAAAAATAAAAATATGACCCATCACCCAAA 4829

  2724637 ATGTTATCATTCTGATGTATTTCTTTACACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAG 2724696
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     4830 ATGTTATCATTCTGATGTATTTCTTTACACC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAG 4888

  2724697 TCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGCTTACAGTTCACTGCAACCTCCA 2724756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 TCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGCTTACAGTTCACTGCAACCTCCA 4948

  2724757 CCTCCTAGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTTAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACCACAGCATC 2724816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 CCTCCTAGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTTAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACCACAGCATC 5008

  2724817 TGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAAGTTTTGCCATGTTGCCC 2724876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 TGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAAGTTTTGCCATGTTGCCC 5068

  2724877 AGGCTGGTTTTGAACTCCTGGTCTCAAGCAATCCATCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 2724936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 AGGCTGGTTTTGAACTCCTGGTCTCAAGCAATCCATCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 5128

  2724937 GGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCCCCGCCAAGTGTGGTGTTTTAAATTTAAGTGAATT 2724996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 GGATTACAGGTGTGAGCCACCTTGCCCCGCCAAGTGTGGTGTTTTAAATTTAAGTGAATT 5188

  2724997 AAGTACAATTAAAAATGCAGCTCCTCGGTTGCACTAGCCACATCTCAAGGGCTCAGTAGC 2725056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 AAGTACAATTAAAAATGCAGCTCCTCGGTTGCACTAGCCACATCTCAAGGGCTCAGTAGC 5248

  2725057 CACATGTGGCTGGTGGCTACCATAGGGAACAACGCAGGTACAGAACATTACAGAACATTT 2725116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 CACATGTGGCTGGTGGCTACCATAGGGAACAACGCAGGTACAGAACATTACAGAACATTT 5308

  2725117 TCATCATCCCAGAAAGTTCTACTGTACAGCGCTGGTTGAGAATGAGGTCCAGACTCCCCT 2725176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5309 TCATCATCCCAGAAAGTTCTACTGTACAGCGCTGGTTGAGAATGAGGTCCAGACTCCCCT 5368

  2725177 GGAGGACTTCCAAGGGCTGGACAAGCCCAGAGAGTCTATGCTGTCTATGATGGATTACGC 2725236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5369 GGAGGACTTCCAAGGGCTGGACAAGCCCAGAGAGTCTATGCTGTCTATGATGGATTACGC 5428

  2725237 ACTGCAGAAACGTCCCTGGACCCCCAGGCCAGAAGGCATCTGAACCGCATAAAGCCAGTG 2725296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5429 ACTGCAGAAACGTCCCTGGACCCCCAGGCCAGAAGGCATCTGAACCGCATAAAGCCAGTG 5488

  2725297 CCACCGGGTGGTGCTGAGGAGGAGGAGGCGGCAAGCTGGTGTCTGGGGCAGTGAGGATTT 2725356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5489 CCACCGGGTGGTGCTGAGGAGGAGGAGGCGGCAAGCTGGTGTCTGGGGCAGTGAGGATTT 5548

  2725357 CAGATGCAGCTCCTGCCTCCTTGGGCAGACAGAACTGTCACCTCCAGGGTTGCCCAATCC 2725416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 CAGATGCAGCTCCTGCCTCCTTGGGCAGACAGAACTGTCACCTCCAGGGTTGCCCAATCC 5608

  2725417 CATGGTCAGCA 2725427
          |||||||||||
     5609 CATGGTCAGCA 5619

Alignment time is 4.34761 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3228] =>      3228 nucs 'mol-32-2f1d-008359_3228'

Score:        3177
Aligned:      3232        nucs
Identic:      3227 (100%) nucs =>      3185 (100%)        42 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2720997,2724186] EXCISED REGION [2724190,2724231]
 second seq =>  [      1,   3186] EXCISED REGION [   3187,   3228]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [2724187,2724189]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [2724187,2724200] to [2724190,2724203]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [2724187,2724187] to [2724189,2724189]
 second seq =>         0 nucs

  2720997 TAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATC 2721056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATC 60

  2721057 CAACTGCCTCAACCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCTGGCCTC 2721116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAACTGCCTCAACCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCTGGCCTC 120

  2721117 TATGTTTAATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGATGGAGTCTGGCTTTGTTGCCCAG 2721176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGTTTAATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGATGGAGTCTGGCTTTGTTGCCCAG 180

  2721177 GCTGGAATGTAGGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCAGGTTCATGCCAT 2721236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGGAATGTAGGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCAGGTTCATGCCAT 240

  2721237 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACGACCACGCCTGGCTA 2721296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACGACCACGCCTGGCTA 300

  2721297 ATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCT 2721356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCT 360

  2721357 CCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 2721416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 420

  2721417 ACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTTTTTTAAAATTAAAGAAATAAAAC 2721476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTTTTTTAAAATTAAAGAAATAAAAC 480

  2721477 ACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCTTGCCTCCGTTCCTCTATTTCTTC 2721536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCTTGCCTCCGTTCCTCTATTTCTTC 540

  2721537 CATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTTTTCTCTCAGCCCACTTTATTTAT 2721596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTTTTCTCTCAGCCCACTTTATTTAT 600

  2721597 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCTGT 2721656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCTGT 660

  2721657 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGTTC 2721716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGTTC 720

  2721717 AAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGTGCCACCACGC 2721776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGTGCCACCACGC 780

  2721777 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 2721836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 840

  2721837 GTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTTTTGGGATTG 2721896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTTTTGGGATTG 900

  2721897 CAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGCCCACATTTTTAATGCTTTCACATTCATACA 2721956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGCCCACATTTTTAATGCTTTCACATTCATACA 960

  2721957 CAGGTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGTGTGCATTAAAAAGGGACATACCTGACATCC 2722016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGTGTGCATTAAAAAGGGACATACCTGACATCC 1020

  2722017 TTTTGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGCGCTAGATTGCCTGGGTTCAGATCTTGGCTC 2722076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGCGCTAGATTGCCTGGGTTCAGATCTTGGCTC 1080

  2722077 TGACACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCAGGTTCCTTCATCTCTCCATGCCTCCCTTTT 2722136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGACACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCAGGTTCCTTCATCTCTCCATGCCTCCCTTTT 1140

  2722137 CTAATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAGCCTGAAACCTACTGCAAGGGTTGTTTTGGA 2722196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAGCCTGAAACCTACTGCAAGGGTTGTTTTGGA 1200

  2722197 GACTGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCTTAGAACAGAGAGGGGATGTAGCAGACACAG 2722256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GACTGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCTTAGAACAGAGAGGGGATGTAGCAGACACAG 1260

  2722257 GATGGATATATTACCATTATCGTTCTGCATGTGTGTCTGTCCACATGGTTGTAAAGTCTA 2722316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATGGATATATTACCATTATCGTTCTGCATGTGTGTCTGTCCACATGGTTGTAAAGTCTA 1320

  2722317 TTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCG 2722376
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCG 1379

  2722377 ATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 2722436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 1439

  2722437 CAAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCGCTACCACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTA 2722496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CAAGTACCTGGGACTACAGGCGCCCGCTACCACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTA 1499

  2722497 GTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATCATCT 2722556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATCATCT 1559

  2722557 GCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGATGTGAGCCACCATGCCTTGCTTTT 2722616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGATGTGAGCCACCATGCCTTGCTTTT 1619

  2722617 TTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAGACTGAGTCTTGCTCTGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATC 2722676
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TTTTTTTTTT-CTTTTTTTGGAGACTGAGTCTTGCTCTGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATC 1678

  2722677 TTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTACAAGTGATTCTCTTGCATCAGCCTTCCAA 2722736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TTGGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTACAAGTGATTCTCTTGCATCAGCCTTCCAA 1738

  2722737 GCAGCTGGGATCACAGGAGCATGCCACCACACACTTTTTTTTTTCTTTTTTGACGGAGTC 2722796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GCAGCTGGGATCACAGGAGCATGCCACCACACACTTTTTTTTTTCTTTTTTGACGGAGTC 1798

  2722797 TTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCATTGCAGCCTCTGCC 2722856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCATTGCAGCCTCTGCC 1858

  2722857 TCCCGGGTTCCAGCGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCAT 2722916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TCCCGGGTTCCAGCGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCAT 1918

  2722917 GCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTGGTAGAGACGGGGTTTTTTGGCCAGGCTG 2722976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTGGTAGAGACGGGGTTTTTTGGCCAGGCTG 1978

  2722977 GTCTTGAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 2723036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GTCTTGAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 2038

  2723037 CAGGCATGAGCCTCAGCGCCTGGTGATAGATCTAGTTTCTTCTCTCTTTCTCCTTTTTTT 2723096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CAGGCATGAGCCTCAGCGCCTGGTGATAGATCTAGTTTCTTCTCTCTTTCTCCTTTTTTT 2098

  2723097 TTTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCTCAAGGTGGTGTGATCCTGGCTCACTGT 2723156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCTCAAGGTGGTGTGATCCTGGCTCACTGT 2158

  2723157 AGCCTCAATACCCCCAGGGCTCAAGTGATTCTCCAACCTCAGCCTCCCACGTGGTTGGGA 2723216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGCCTCAATACCCCCAGGGCTCAAGTGATTCTCCAACCTCAGCCTCCCACGTGGTTGGGA 2218

  2723217 CTACAGCATGCACCACCATGCTTGGTTAAGTTTTTAAGAAATTTTTGTAGAGATGAGGTT 2723276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CTACAGCATGCACCACCATGCTTGGTTAAGTTTTTAAGAAATTTTTGTAGAGATGAGGTT 2278

  2723277 TCACCATCTTGCTGTCTCAAACTTCTGGGCTCAAATGATTCTCCAACCTTGGCCTCCCAA 2723336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCACCATCTTGCTGTCTCAAACTTCTGGGCTCAAATGATTCTCCAACCTTGGCCTCCCAA 2338

  2723337 AGTGTTGGGATTACAGGCGGGAGCCACCACTTCTGGCCTAGTTTTTTCTTTTTGGTGCCA 2723396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AGTGTTGGGATTACAGGCGGGAGCCACCACTTCTGGCCTAGTTTTTTCTTTTTGGTGCCA 2398

  2723397 TGCATATTAATTTGTACAAATAGATCACATTTTTTTTGTATCCCCCATTGATCCCCTCTT 2723456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TGCATATTAATTTGTACAAATAGATCACATTTTTTTTGTATCCCCCATTGATCCCCTCTT 2458

  2723457 GCTGGACACCTAGGTCGTTTCCATTTTCTGATATTGCAAGCAATGCTGCAGGCAGTGGCT 2723516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GCTGGACACCTAGGTCGTTTCCATTTTCTGATATTGCAAGCAATGCTGCAGGCAGTGGCT 2518

  2723517 TTCCCCTTGCCTGGCCCTCTGTGCGTTTGTGTGAGGTCATGAGGGGTACCTAGAGGTGGG 2723576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTCCCCTTGCCTGGCCCTCTGTGCGTTTGTGTGAGGTCATGAGGGGTACCTAGAGGTGGG 2578

  2723577 GCTGTTGGGTCGCAGCTCTACTGGATGCTGCCAGATTGCCCTCAAGAGAGGACTTAGGCT 2723636
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GCTGTTGGGTCGCAGCTCTACTGGATGCTACCAGATTGCCCTCAAGAGAGGACTTAGGCT 2638

  2723637 GGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAGCACTTTGGCAGGCCAAGGTGGGCGGATCAC 2723696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAGCACTTTGGCAGGCCAAGGTGGGCGGATCAC 2698

  2723697 TTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAA 2723756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTGAGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAA 2758

  2723757 ACACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCAGCTACTAGGGTGGCTGA 2723816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ACACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCAGCTACTAGGGTGGCTGA 2818

  2723817 GGCAGGAGAATCACTTGAAGACGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCTCATCACT 2723876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGCAGGAGAATCACTTGAAGACGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCTCATCACT 2878

  2723877 GCACTCCAGCCTGGGCAGCAATGAGAGACACCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGAC 2723936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     2879 GCACTCCAGCCTGGGCAGCAATGAGAGACACCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAA-GAGGAC 2937

  2723937 TTAGTATTTTCACTGCTCCCAATTCTATGATTCCCATTCCCCACGTCCTCACTGATGTTT 2723996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TTAGTATTTTCACTGCTCCCAATTCTATGATTCCCATTCCCCACGTCCTCACTGATGTTT 2997

  2723997 GATTTTCATGTTGATTTGAGTGACAGAAGCATATTTTATTTTATTTTATTTTGAGACGGA 2724056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GATTTTCATGTTGATTTGAGTGACAGAAGCATATTTTATTTTATTTTATTTTGAGACGGA 3057

  2724057 GTCTCACTCTGTATAGTGGCATGATCTCGGCTCACTAAAATCTCCGCCTCCCGGGTTCAA 2724116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GTCTCACTCTGTATAGTGGCATGATCTCGGCTCACTAAAATCTCCGCCTCCCGGGTTCAA 3117

  2724117 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGGCC 2724176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     3118 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACG-CC 3176

  2724177 CGGATAATGG 2724186
          ||||||||||
     3177 CGGATAATGG 3186

EXCISED REGION

  2724190 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGTTTCATTA 2724231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGTTTCATTA 3228

Alignment time is 2.54451 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6675] =>      6675 nucs 'mol-32-30f6-187388_6675'

Score:        6634
Aligned:      6678        nucs
Identic:      6674 (100%) nucs =>      2200 (100%)      4474 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2714170,2716369] EXCISED REGION [2716371,2720847]
 second seq =>  [      1,   2200] EXCISED REGION [   2201,   6675]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [2716370,2716370]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2648,2648]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [2716370,2716382] to [2716371,2716383]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  2714170 CTAGTCACCCAGGCTGAGCTTGGTTACCTGTGGGGACAGTGAGCTCATTACCTTGTATGG 2714229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAGTCACCCAGGCTGAGCTTGGTTACCTGTGGGGACAGTGAGCTCATTACCTTGTATGG 60

  2714230 ATGCCTATTTTATTGTAGTACAACTTTGCTCGAAGCTGACCGCTGTTTTCATCTGGAATC 2714289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCCTATTTTATTGTAGTACAACTTTGCTCGAAGCTGACCGCTGTTTTCATCTGGAATC 120

  2714290 TCTGTAACTGCATTGCTCGGTCCAGTCTTGACCCTTGGCCCGCACGTCCCCACTTACCCC 2714349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGTAACTGCATTGCTCGGTCCAGTCTTGACCCTTGGCCCGCACGTCCCCACTTACCCC 180

  2714350 CATTCAACAAGGTTCACCCCTCTTTCCACTAAGAGCCCTGCAGACACTGGAAGGCTGCTT 2714409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTCAACAAGGTTCACCCCTCTTTCCACTAAGAGCCCTGCAGACACTGGAAGGCTGCTT 240

  2714410 TTTCACCCTGAGTCTTCCCTTCCCTCCCCTTGGCTGGTCACCCCGGCCTCTGCAGCTATA 2714469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCACCCTGAGTCTTCCCTTCCCTCCCCTTGGCTGGTCACCCCGGCCTCTGCAGCTATA 300

  2714470 TTTGGGATTCCTCACCTGCCTGGGCTGATCTTTGTCGGAAGGGTTCAGGTTTTGCAGGCA 2714529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGGGATTCCTCACCTGCCTGGGCTGATCTTTGTCGGAAGGGTTCAGGTTTTGCAGGCA 360

  2714530 CCCTGCAGGAGCCCCATGGACACGAGGATGGACAGCTAGAGGCGATGGGCCTCACCCTCC 2714589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTGCAGGAGCCCCATGGACACGAGGATGGACAGCTAGAGGCGATGGGCCTCACCCTCC 420

  2714590 TTATTTACAGATCAGTAAGCTGAGACCCTGAGCAGGGGTGCTGCTAACTTGCGATAGGAC 2714649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATTTACAGATCAGTAAGCTGAGACCCTGAGCAGGGGTGCTGCTAACTTGCGATAGGAC 480

  2714650 AACACAGAGGTGGTCAGGGCAGGGTCGGGACGTGAGGGGCTGCTCTTGTCGTCTGTGACG 2714709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACACAGAGGTGGTCAGGGCAGGGTCGGGACGTGAGGGGCTGCTCTTGTCGTCTGTGACG 540

  2714710 TGCTGGCCCCTGGTTCTTTTCCTGCTTCTCCATCAGCTCCATCCTTGCTGCTTTCTGACT 2714769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTGGCCCCTGGTTCTTTTCCTGCTTCTCCATCAGCTCCATCCTTGCTGCTTTCTGACT 600

  2714770 TGGACCCTCAGCTCTTGGGCACTGCAAGAATGCTGGCCTGTCTTAGCGGATCTTCCATTT 2714829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGACCCTCAGCTCTTGGGCACTGCAAGAATGCTGGCCTGTCTTAGCGGATCTTCCATTT 660

  2714830 TATAACAGCAGCTGGAAATCCGTTTCTTTGTGTGTGTATTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTT 2714889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATAACAGCAGCTGGAAATCCGTTTCTTTGTGTGTGTATTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTT 720

  2714890 GAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGTGCATTG 2714949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGTGCATTG 780

  2714950 CAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAT 2715009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAT 840

  2715010 TACAGGCATGCGCCACCATTTCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 2715069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TACAGGCATGCGCCACCATTTCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 900

  2715070 ACCACGTTGAGCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCTGCTT 2715129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCACGTTGAGCAGGCTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCTGCTT 960

  2715130 CCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGATTTTTGTATTTTTA 2715189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGATTTTTGTATTTTTA 1020

  2715190 CTAGAGGCGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGAT 2715249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAGAGGCGAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGAT 1080

  2715250 CCCCCCAGCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACTGCGCCTGGCCG 2715309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCCCCAGCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGTCACTGCGCCTGGCCG 1140

  2715310 GAAATCTGGAGTTTTAGACAAAATCTTGACAACTAACTGCAGACTTTAAAGAACAGAGCT 2715369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAATCTGGAGTTTTAGACAAAATCTTGACAACTAACTGCAGACTTTAAAGAACAGAGCT 1200

  2715370 GGCCGCAGCCTACCCTGCAGACCAGAGTCAGCCGGACCCTCTGCTCTGCTCACCTCCTTA 2715429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCCGCAGCCTACCCTGCAGACCAGAGTCAGCCGGACCCTCTGCTCTGCTCACCTCCTTA 1260

  2715430 GGCCTCAGCTCTTGTTTCTTTGTGGCTGACTCCCAAGTCCCTCTCCCCAGGTCATCCCCA 2715489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCCTCAGCTCTTGTTTCTTTGTGGCTGACTCCCAAGTCCCTCTCCCCAGGTCATCCCCA 1320

  2715490 AGAACAGTGCTCTTGCCCCGACCTCAGTGGCTGGCTGGTCATTTCGGCTCTGTTCCCAGA 2715549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAACAGTGCTCTTGCCCCGACCTCAGTGGCTGGCTGGTCATTTCGGCTCTGTTCCCAGA 1380

  2715550 CTGAACTGACTCTCAATTAACCTTTTCTCTCTTTCAGATCCAGTTCTTTTCTGTCACTGG 2715609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGAACTGACTCTCAATTAACCTTTTCTCTCTTTCAGATCCAGTTCTTTTCTGTCACTGG 1440

  2715610 GTTGAGAAGCCTCTGAGTCATGGGGGGGTGGTTCCTCCTGTCTCCCGGTTCAGGCCCATT 2715669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTGAGAAGCCTCTGAGTCATGGGGGGGTGGTTCCTCCTGTCTCCCGGTTCAGGCCCATT 1500

  2715670 ATCTCCTGCCCAGTGACACAGGCTTTCTAATTAACCTCCTCCTCCGGTCTCTGCCAGCTG 2715729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCTCCTGCCCAGTGACACAGGCTTTCTAATTAACCTCCTCCTCCGGTCTCTGCCAGCTG 1560

  2715730 TGACTAACTCTTCATCCCTCAAGCTGGCTCCAGCTCTGCCTTCCCTATTACTAGACGCTG 2715789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGACTAACTCTTCATCCCTCAAGCTGGCTCCAGCTCTGCCTTCCCTATTACTAGACGCTG 1620

  2715790 GCCCGAAGGCAGACCTTGATAGTGCTGACTCTGATGGGCTTCTCATGCCAGGATGCTGGT 2715849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCCCGAAGGCAGACCTTGATAGTGCTGACTCTGATGGGCTTCTCATGCCAGGATGCTGGT 1680

  2715850 GTAGGGACCCCCAGCCCCCATCTGGTGGGGGGCTGTCTTTGGGTCACAGCAAATAGTTTG 2715909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTAGGGACCCCCAGCCCCCATCTGGTGGGGGGCTGTCTTTGGGTCACAGCAAATAGTTTG 1740

  2715910 TTTGTTCCTTCCTTCCCTCCCCCAGGACGGTGGTTCTCAAACTTTTCTACAATTTGGTTT 2715969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGTTCCTTCCTTCCCTCCCCCAGGACGGTGGTTCTCAAACTTTTCTACAATTTGGTTT 1800

  2715970 CACCTGGAGGTGCTTTTAAAAATTCTGATGCCGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAA 2716029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACCTGGAGGTGCTTTTAAAAATTCTGATGCCGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAA 1860

  2716030 TCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCAG 2716089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCAG 1920

  2716090 CCTGACCAATATAATGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAACTAGCCAGGCGTGGT 2716149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTGACCAATATAATGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAACTAGCCAGGCGTGGT 1980

  2716150 GGTGGTTCCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCG 2716209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTGGTTCCCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCG 2040

  2716210 GGAGATGGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCTAGCCTGGGTAACAAGA 2716269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGAGATGGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCTAGCCTGGGTAACAAGA 2100

  2716270 GTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATTCTGATGCCCAGGTTGTACCCAGTTCCAA 2716329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATTCTGATGCCCAGGTTGTACCCAGTTCCAA 2160

  2716330 TTAAATCTGAATGTCGGAGGGTAGAACCCAGCATCAGTAC 2716369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAAATCTGAATGTCGGAGGGTAGAACCCAGCATCAGTAC 2200

EXCISED REGION

  2716371 TTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCCCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAA 2716430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCCCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAA 2260

  2716431 TCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTTCTCCTGCCTCCGTCTCC 2716490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTTCTCCTGCCTCCGTCTCC 2320

  2716491 TGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCATGCCACCATGCCCAGATAATGTTTTGTATCTTTAGT 2716550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCATGCCACCATGCCCAGATAATGTTTTGTATCTTTAGT 2380

  2716551 AGAGATGGGGTTTAGTAGCCATGTTGGCCAGGCTGACCTCGAACTCCTGACCTCGTGATC 2716610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 AGAGATGGGGTTTAGTAGCCATGTTGGCCAGGCTGACCTCGAACTCCTGACCTCGTGATC 2440

  2716611 TGCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAATACAGGCGTGAGCTGCGGTGCCCAACTAT 2716670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TGCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAATACAGGCGTGAGCTGCGGTGCCCAACTAT 2500

  2716671 ACTTTTAAAAGATCCCCCGTTCATTCCAATAGGCAGCCAAACCTGGGAAGCACTTCCCCA 2716730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 ACTTTTAAAAGATCCCCCGTTCATTCCAATAGGCAGCCAAACCTGGGAAGCACTTCCCCA 2560

  2716731 AGGGATACACAAGTGTGGTGACCGTCAGTGGTTGGGCAATGACTCAGGTCAGGCTGGATG 2716790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 AGGGATACACAAGTGTGGTGACCGTCAGTGGTTGGGCAATGACTCAGGTCAGGCTGGATG 2620

  2716791 TTAAAATGGGCTCCTGGTGGGCGTGAG-CCCTCTGGGCCAGGGCTTCTGGTAACATTTGA 2716849
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TTAAAATGGGCTCCTGGTGGGCGTGAGCCCCTCTGGGCCAGGGCTTCTGGTAACATTTGA 2680

  2716850 GGCTGGCTGACTCTTTGTTTTACGGTGCCATCCTGTGCGTTGTAGGGTGTTGCGCAGCCT 2716909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GGCTGGCTGACTCTTTGTTTTACGGTGCCATCCTGTGCGTTGTAGGGTGTTGCGCAGCCT 2740

  2716910 CTCTAGCCTGTATCCACAAGATGCCCACAACCCACCCCTCACTGTGATAATGAAAATGTC 2716969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 CTCTAGCCTGTATCCACAAGATGCCCACAACCCACCCCTCACTGTGATAATGAAAATGTC 2800

  2716970 TCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGCAGGTGGAT 2717029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGCAGGTGGAT 2860

  2717030 CACCTGAGGTCAGGAGTTCGTCGAGACCAGCCGGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTA 2717089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 CACCTGAGGTCAGGAGTTCGTCGAGACCAGCCGGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTA 2920

  2717090 CTAAAAAAGTACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAATCGTAGCTACTC 2717149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 CTAAAAAAGTACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAATCGTAGCTACTC 2980

  2717150 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTAAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGA 2717209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTAAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGA 3040

  2717210 TCGCACCATTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAAAA 2717269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TCGCACCATTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAAAA 3100

  2717270 AAGAAAAGAAAAAAAGAAAATGTCTCCAGACGTTGCTCTATTTCTGGGGCAGTGGTATAA 2717329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 AAGAAAAGAAAAAAAGAAAATGTCTCCAGACGTTGCTCTATTTCTGGGGCAGTGGTATAA 3160

  2717330 AATCTCCCCGACTCCGTTGAAAACTACTGTTCTAGGCCTAGTAGGTTCACCTTGACAGCA 2717389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 AATCTCCCCGACTCCGTTGAAAACTACTGTTCTAGGCCTAGTAGGTTCACCTTGACAGCA 3220

  2717390 TTCTCAAATATTCACAGAAGAAAAGGGGCAAAGGACACCAAGTGGGGACCCCAGCTTACT 2717449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TTCTCAAATATTCACAGAAGAAAAGGGGCAAAGGACACCAAGTGGGGACCCCAGCTTACT 3280

  2717450 GATTGATTTGTGGGCTTGGCAGTCAGGCAGCCTCTGTTTAAATCCTGACTCTACCAGCTG 2717509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 GATTGATTTGTGGGCTTGGCAGTCAGGCAGCCTCTGTTTAAATCCTGACTCTACCAGCTG 3340

  2717510 GGTGACCTTGGACAAGTTACTTAACCTCTCTGTGCCTCTGTCAGTTCTGGTTTTGTTTTC 2717569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 GGTGACCTTGGACAAGTTACTTAACCTCTCTGTGCCTCTGTCAGTTCTGGTTTTGTTTTC 3400

  2717570 TCACAATCGTGCCTCCTCTTGATCTTCAGCTGCAGCCCGAGGGTGGAACTTGCTGTGTGT 2717629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TCACAATCGTGCCTCCTCTTGATCTTCAGCTGCAGCCCGAGGGTGGAACTTGCTGTGTGT 3460

  2717630 GGCTGGGCACTTTCGCCTGTGGCTGTGCTGCTCTGCCCACAGGGAACATGCCTTTGCTGC 2717689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 GGCTGGGCACTTTCGCCTGTGGCTGTGCTGCTCTGCCCACAGGGAACATGCCTTTGCTGC 3520

  2717690 CCCTTCCCTGTCAGCATCAGGGTCACAACCTGCCCGTCCTTCCAGGGCCAGCTTCCATGC 2717749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 CCCTTCCCTGTCAGCATCAGGGTCACAACCTGCCCGTCCTTCCAGGGCCAGCTTCCATGC 3580

  2717750 AGCTTCCTCCACGCACAGCCCCTTCCCCATCGGCATGGAAGGCTCTCTTCCTTGTGCCCC 2717809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 AGCTTCCTCCACGCACAGCCCCTTCCCCATCGGCATGGAAGGCTCTCTTCCTTGTGCCCC 3640

  2717810 TGGGGCAGCCGGAACCTCAGGTCACATGCAGCTCCTCCCGCGCCGTGGGGATCTGGTGGT 2717869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 TGGGGCAGCCGGAACCTCAGGTCACATGCAGCTCCTCCCGCGCCGTGGGGATCTGGTGGT 3700

  2717870 TTCTGTCTGAGTTCCTCCCCACTTGGGGTCTGAGACCGTGGGAGCCTCTAGCGTGCCCAG 2717929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TTCTGTCTGAGTTCCTCCCCACTTGGGGTCTGAGACCGTGGGAGCCTCTAGCGTGCCCAG 3760

  2717930 CTCGGGCTGTCTCACTGTTTGTTACCCAGGTGAGGTGGCTGTCCCCTCCCTACCTTGGGT 2717989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 CTCGGGCTGTCTCACTGTTTGTTACCCAGGTGAGGTGGCTGTCCCCTCCCTACCTTGGGT 3820

  2717990 TGAGCTGTGAACCAGTAGGTTACCGCAGTGTGGTACCACCCCCCCCAACCCCAACACCCA 2718049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 TGAGCTGTGAACCAGTAGGTTACCGCAGTGTGGTACCACCCCCCCCAACCCCAACACCCA 3880

  2718050 GCTCATTCTGAGAGGGTGGAGTGGGCGGAAATCCGTGCCTGGCAGACCACAAAGCCACAT 2718109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 GCTCATTCTGAGAGGGTGGAGTGGGCGGAAATCCGTGCCTGGCAGACCACAAAGCCACAT 3940

  2718110 AACTGACTTTTGTAGCCCTGCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAGGGTTGACGGCAGCCATTGC 2718169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 AACTGACTTTTGTAGCCCTGCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAGGGTTGACGGCAGCCATTGC 4000

  2718170 CCCTTTCTTCGGTGCTTTGCCACCAGCAGACGCCCCGTGGAATTGAGGAGCTTTGTTCTA 2718229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 CCCTTTCTTCGGTGCTTTGCCACCAGCAGACGCCCCGTGGAATTGAGGAGCTTTGTTCTA 4060

  2718230 CGAGCTCGGGAACGGGACTTGGGAGGGACAGCCCCTGTCCCACCCTGCCATGCCCTGTTC 2718289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 CGAGCTCGGGAACGGGACTTGGGAGGGACAGCCCCTGTCCCACCCTGCCATGCCCTGTTC 4120

  2718290 AACCCTGTCAGGCAGCTGAACGTAGGCTGGACCCATGGCTGCCCACCCTGGCTGCAGTAC 2718349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 AACCCTGTCAGGCAGCTGAACGTAGGCTGGACCCATGGCTGCCCACCCTGGCTGCAGTAC 4180

  2718350 AGAATCACCTAGGGGACCTCGTTAAAATGCAGCTTCCGGACCCCACCCTGGGGCTTGGGG 2718409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 AGAATCACCTAGGGGACCTCGTTAAAATGCAGCTTCCGGACCCCACCCTGGGGCTTGGGG 4240

  2718410 ATTCTGCCTCATCAGCCTGGGTGGGGCCCAGGAAACCTGTGTGTTACCAGCGCTGAGGTG 2718469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 ATTCTGCCTCATCAGCCTGGGTGGGGCCCAGGAAACCTGTGTGTTACCAGCGCTGAGGTG 4300

  2718470 CTGCTGATGAGGCAGCTGGCTTCACAGCTGCACGGGAACCAGTGCCGTTTAAAGCACTTT 2718529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 CTGCTGATGAGGCAGCTGGCTTCACAGCTGCACGGGAACCAGTGCCGTTTAAAGCACTTT 4360

  2718530 CCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTCTGGGTGACCTGGGGCAGGCTG 2718589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 CCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTCTGGGTGACCTGGGGCAGGCTG 4420

  2718590 CGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATAATAACAGTACCTGCACGTGGG 2718649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 CGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATAATAACAGTACCTGCACGTGGG 4480

  2718650 TGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGAAATGGGAACAGAGTGCCTGGT 2718709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 TGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGAAATGGGAACAGAGTGCCTGGT 4540

  2718710 ACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCTGATATTATTATTATTATTATT 2718769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 ACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCTGATATTATTATTATTATTATT 4600

  2718770 ATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTTTGTCACCCAGGCTGGATTG 2718829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 ATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTTTGTCACCCAGGCTGGATTG 4660

  2718830 CAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCGGTTCAAGCGATTCTCCTGT 2718889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 CAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCGGTTCAAGCGATTCTCCTGT 4720

  2718890 CTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGT 2718949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 CTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGT 4780

  2718950 ATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTC 2719009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 ATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTC 4840

  2719010 AGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCACCGCAC 2719069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 AGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCACCGCAC 4900

  2719070 CCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGCGGTCACACACGTGTAACTG 2719129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 CCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGCGGTCACACACGTGTAACTG 4960

  2719130 TGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCACACTGAGCATTGTGTACCG 2719189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCACACTGAGCATTGTGTACCG 5020

  2719190 GGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGTACATGCGTGGACGCAGTCA 2719249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 GGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGTACATGCGTGGACGCAGTCA 5080

  2719250 CTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACAAGGCCCAGACAAGCGGGTT 2719309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 CTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACAAGGCCCAGACAAGCGGGTT 5140

  2719310 TTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAGCAGCACCTGGGCTGAGCTCTG 2719369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 TTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAGCAGCACCTGGGCTGAGCTCTG 5200

  2719370 GGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCTGGTAAAAATAGGCGGGGGA 2719429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 GGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCTGGTAAAAATAGGCGGGGGA 5260

  2719430 GGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATCCTGCCTGCTAAGGTCCTTT 2719489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 GGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATCCTGCCTGCTAAGGTCCTTT 5320

  2719490 TTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTAGGA 2719549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTAGGA 5380

  2719550 TAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTGACACTTGTTAACATTTTTT 2719609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 TAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTGACACTTGTTAACATTTTTT 5440

  2719610 CTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGT 2719669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 CTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGT 5500

  2719670 CGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTTCGGGTT 2719729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 CGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTTCGGGTT 5560

  2719730 CAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCCGACACCACA 2719789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 CAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCCGACACCACA 5620

  2719790 CCTGGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT 2719849
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 CCTGGCTAATTTTTATA-TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT 5679

  2719850 CTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 2719909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 CTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 5739

  2719910 TCAAAGTCTTTTTAAAAAACTGTGTTAAAATATACATATTATAAAACTTACCATTTAAAG 2719969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 TCAAAGTCTTTTTAAAAAACTGTGTTAAAATATACATATTATAAAACTTACCATTTAAAG 5799

  2719970 CATTTTTAAGTGCACCATTCTGTGACATTAAGTACATTTACAATGCTGTGCAAGGATCAC 2720029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 CATTTTTAAGTGCACCATTCTGTGACATTAAGTACATTTACAATGCTGTGCAAGGATCAC 5859

  2720030 CATTATTTCTAGAAGTTTTTCATCATCCCAAACTGAAACTTCGTATACATTAAATAATAA 2720089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 CATTATTTCTAGAAGTTTTTCATCATCCCAAACTGAAACTTCGTATACATTAAATAATAA 5919

  2720090 CTCCCTATTCCCTCATCTCCACAGCACCCTGCAGCCACCATTCTGCTTTCTGTTTCTATG 2720149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 CTCCCTATTCCCTCATCTCCACAGCACCCTGCAGCCACCATTCTGCTTTCTGTTTCTATG 5979

  2720150 AATTTGACTGCTCGGTGAACTGTGTATAGGTGAAATCACACAGTACTTGTCCTTCTGTGT 2720209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 AATTTGACTGCTCGGTGAACTGTGTATAGGTGAAATCACACAGTACTTGTCCTTCTGTGT 6039

  2720210 CTGGCTTATTTCACTTCCCATAATGTCTTCAAGGTTCATCCATGTTGTAGCGTGTGTCAG 2720269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 CTGGCTTATTTCACTTCCCATAATGTCTTCAAGGTTCATCCATGTTGTAGCGTGTGTCAG 6099

  2720270 AATTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCT 2720329
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 AATTTCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCT 6158

  2720330 GGATTGCCGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACTTCCCAGGCTCAAGCGTTTC 2720389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 GGATTGCCGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACTTCCCAGGCTCAAGCGTTTC 6218

  2720390 TCGTGCCTCAGCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACAAGGCTAAT 2720449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 TCGTGCCTCAGCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACAAGGCTAAT 6278

  2720450 TTCTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGCCATGATGGCCAGGCTGGTCTTGA 2720509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6279 TTCTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGCCATGATGGCCAGGCTGGTCTTGA 6338

  2720510 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCTAAGGTGCTGGGATTACAGGGGT 2720569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6339 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCTAAGGTGCTGGGATTACAGGGGT 6398

  2720570 GAGCCACCATGCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTTAAGACTGAATAATATCCCATTGT 2720629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6399 GAGCCACCATGCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTTAAGACTGAATAATATCCCATTGT 6458

  2720630 TGCATGTATCACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTGATGGACATCTGAGTTGCTTCCAA 2720689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6459 TGCATGTATCACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTGATGGACATCTGAGTTGCTTCCAA 6518

  2720690 TTTTTTTTTGCTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACGTAGGTGTATAAATATCTGGGTCT 2720749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6519 TTTTTTTTTGCTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACGTAGGTGTATAAATATCTGGGTCT 6578

  2720750 CTGTTTTCAGTTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAGAATTGCTGATCGTATGGCAATTC 2720809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6579 CTGTTTTCAGTTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAGAATTGCTGATCGTATGGCAATTC 6638

  2720810 TATGTATAGTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTAC 2720847
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     6639 TATGTATAG-TTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTAC 6675

Alignment time is 5.0446 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6732] =>      6732 nucs 'mol-32-33f8-060863_6732'

Score:        6396
Aligned:      6746        nucs
Identic:      6706 ( 99%) nucs =>      5639 ( 99%)      1067 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2714260,2719928] EXCISED REGION [2721218,2722292]
 second seq =>  [      1,   5665] EXCISED REGION [   5666,   6732]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1289 nucs [2719929,2721217]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [2719929,2719930] to [2721218,2721219]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [2719929,2719931] to [2721215,2721217]
 second seq =>         0 nucs

  2714260 CGAAGCTGACCGCTGTTTTCATCTGGAATCTCTGTAACTGCATTGCTCGGTCCAGTCTTG 2714319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGAAGCTGACCGCTGTTTTCATCTGGAATCTCTGTAACTGCATTGCTCGGTCCAGTCTTG 60

  2714320 ACCCTTGGCCCGCACGTCCCCACTTACCCCCATTCAACAAGGTTCACCCCTCTTTCCACT 2714379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCTTGGCCCGCACGTCCCCACTTACCCCCATTCAACAAGGTTCACCCCTCTTTCCACT 120

  2714380 AAGAGCCCTGCAGACACTGGAAGGCTGCTTTTTCACCCTGAGTCTTCCCTTCCCTCCCCT 2714439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAGCCCTGCAGACACTGGAAGGCTGCTTTTTCACCCTGAGTCTTCCCTTCCCTCCCCT 180

  2714440 TGGCTGGTCACCCCGGCCTCTGCAGCTATATTTGGGATTCCTCACCTGCCTGGGCTGATC 2714499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCTGGTCACCCCGGCCTCTGCAGCTATATTTGGGATTCCTCACCTGCCTGGGCTGATC 240

  2714500 TTTGTCGGAAGGGTTCAGGTTTTGCAGGCACCCTGCAGGAGCCCCATGGACACGAGGATG 2714559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGTCGGAAGGGTTCAGGTTTTGCAGGCACCCTGCAGGAGCCCCATGGACACGAGGATG 300

  2714560 GACAGCTAGAGGCGATGGGCCTCACCCTCCTTATTTACAGATCAGTAAGCTGAGACCCTG 2714619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACAGCTAGAGGCGATGGGCCTCACCCTCCTTATTTACAGATCAGTAAGCTGAGACCCTG 360

  2714620 AGCAGGGGTGCTGCTAACTTGCGATAGGACAACACAGAGGTGGTCAGGGCAGGGTCGGGA 2714679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCAGGGGTGCTGCTAACTTGCGATAGGACAACACAGAGGTGGTCAGGGCAGGGTCGGGA 420

  2714680 CGTGAGGGGCTGCTCTTGTCGTCTGTGACGTGCTGGCCCCTGGTTCTTTTCCTGCTTCTC 2714739
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGTGAGGGGCTGCTCTTGTCGTCTGTGACATGCTGGCCCCTGGTTCTTTTCCTGCTTCTC 480

  2714740 CATCAGCTCCATCCTTGCTGCTTTCTGACTTGGACCCTCAGCTCTTGGGCACTGCAAGAA 2714799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCAGCTCCATCCTTGCTGCTTTCTGACTTGGACCCTCAGCTCTTGGGCACTGCAAGAA 540

  2714800 TGCTGGCCTGTCTTAGCGGATCTTCCATTTTATAACAGCAGCTGGAAATCCGTTTCTTTG 2714859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTGGCCTGTCTTAGCGGATCTTCCATTTTATAACAGCAGCTGGAAATCCGTTTCTTTG 600

  2714860 TGTGTGTATTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCT 2714919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGTGTATTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCT 660

  2714920 GGAGTGCAATGGCACGATCTTGGTGCATTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTC 2714979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGTGCAATGGCACGATCTTGGTGCATTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTC 720

  2714980 TCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATTTCTGGCTAAT 2715039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATTTCTGGCTAAT 780

  2715040 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACGTTGAGCAGGCTGGTCCCGAACTCC 2715099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACGTTGAGCAGGCTGGTCCCGAACTCC 840

  2715100 TGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCTGCTTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 2715159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCTGCTTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 900

  2715160 ACTGCGCCTGGCCTGATTTTTGTATTTTTACTAGAGGCGAGGTTTCACCATGTTGGCCAG 2715219
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCGCGCCTGGCCTGATTTTTGTATTTTTACTAGAGGCGAGGTTTCACCATGTTGGCCAG 960

  2715220 GCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCCCCCAGCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 2715279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCCCCCAGCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 1020

  2715280 ATTACAGGCATGAGTCACTGCGCCTGGCCGGAAATCTGGAGTTTTAGACAAAATCTTGAC 2715339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTACAGGCATGAGTCACTGCGCCTGGCCGGAAATCTGGAGTTTTAGACAAAATCTTGAC 1080

  2715340 AACTAACTGCAGACTTTAAAGAACAGAGCTGGCCGCAGCCTACCCTGCAGACCAGAGTCA 2715399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTAACTGCAGACTTTAAAGAACAGAGCTGGCTGCAGCCTACCCTGCAGACCAGAGTCA 1140

  2715400 GCCGGACCCTCTGCTCTGCTCACCTCCTTAGGCCTCAGCTCTTGTTTCTTTGTGGCTGAC 2715459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCGGACCCTCTGCTCTGCTCACCTCCTTAGGCCTCAGCTCTTGTTTCTTTGTGGCTGAC 1200

  2715460 TCCCAAGTCCCTCTCCCCAGGTCATCCCCAAGAACAGTGCTCTTGCCCCGACCTCAGTGG 2715519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCCAAGTCCCTCTCCCCAGGTCATCCCCAAGAACAGTGCTCTTGCCCCGACCTCAGTGG 1260

  2715520 CTGGCTGGTCATTTCGGCTCTGTTCCCAGACTGAACTGACTCTCAATTAACCTTTTCTCT 2715579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGCTGGTCATTTCGGCTCTGTTCCCAGACTGAACTGACTCTCAATTAACCTTTTCTCT 1320

  2715580 CTTTCAGATCCAGTTCTTTTCTGTCACTGGGTTGAGAAGCCTCTGAGTCATGGGGGGGTG 2715639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTTCAGATCCAGTTCTTTTCTGTCACTGGGTTGAGAAGCCTCTGAGTCATGGGGGGGTG 1380

  2715640 GTTCCTCCTGTCTCCCGGTTCAGGCCCATTATCTCCTGCCCAGTGACACAGGCTTTCTAA 2715699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTCCTCCTGTCTCCCGGTTCAGGCCCATTATCTCCTGCCCAGTGACACAGGCTTTCTAA 1440

  2715700 TTAACCTCCTCCTCCGGTCTCTGCCAGCTGTGACTAACTCTTCATCCCTCAAGCTGGCTC 2715759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAACCTCCTCCTCCGGTCTCTGCCAGCTGTGACTAACTCTTCATCCCTCAAGCTGGCTC 1500

  2715760 CAGCTCTGCCTTCCCTATTACTAGACGCTGGCCCGAAGGCAGACCTTGATAGTGCTGACT 2715819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1501 CAGCTCTGCCTTCCCTATTACTAGACGCTGGCCCGAAGGCAGACCTTGATAGTGTTGACT 1560

  2715820 CTGATGGGCTTCTCATGCCAGGATGCTGGTGTAGGGACCCCCAGCCCCCATCTGGTGGGG 2715879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGATGGGCTTCTCATGCCAGGATGCTGGTGTAGGGACCCCCAGCCCCCATCTGGTGGGG 1620

  2715880 GGCTGTCTTTGGGTCACAGCAAATAGTTTGTTTGTTCCTTCCTTCCCTCCCCCAGGACGG 2715939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCTGTCTTTGGGTCACAGCAAATAGTTTGTT----CCTTCCTTCCCTCCCCCAGGACGG 1676

  2715940 TGGTTCTCAAACTTTTCTACAATTTGGTTTCACCTGGAGGTGCTTTTAAAAATTCTGATG 2715999
          |||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TGGTTCTCAAACTTTTCTACACTTTGGTCTCACCTGGAGGTGCTTTTAAAAATTCTGATG 1736

  2716000 CCGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTG 2716059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CCGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTG 1796

  2716060 GATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGACCAATATAATGAAACCCTGTCTCTA 2716119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGACCAATATAATGAAACCCTGTCTCTA 1856

  2716120 CTAAAAATACAAAAACTAGCCAGGCGTGGTGGTGGTTCCCTGTAATCCTAGCTACTCAGG 2716179
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1857 CTAAAAATACAAAAACTAGCCAGGCGTGGTGGTGGCTCCCTGTAATCCTAGCTACTCAGG 1916

  2716180 AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGATGGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCG 2716239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGATGGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCG 1976

  2716240 CACCATTGCACTCTAGCCTGGGTAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA 2716299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 CACCATTGCACTCTAGCCTGGGTAACAAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA 2036

  2716300 -TTCTGATGCCCAGGTTGTACCCAGTTCCAATTAAATCTGAATGTCGGAGGGTAGAACCC 2716358
           |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 ATTCTGATGCCCAGGTTGTACCCAGTTCTAATTAAATCTGAATGTCGGAGGGTAGAACCC 2096

  2716359 AGCATCAGTACTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCCCTGTCGCCCAGGCTGGAGT 2716418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 AGCATCAGTACTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCGCCCTGTCGCCCAGGCTGGAGT 2156

  2716419 GCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTTCTCCT 2716478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTTCTCCT 2216

  2716479 GCCTCCGTCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCATGCCACCATGCCCAGATAATGTTT 2716538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2217 GCCTCCGTCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCATGCCACCATGCCCAGATAATTTTT 2276

  2716539 TGTATCTTTAGTAGAGATGGGGTTTAGTAGCCATGTTGGCCAGGCTGACCTCGAACTCCT 2716598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TGTATCTTTAGTAGAGATGGGGTTTAGTAGCCATGTTGGCCAGGCTGACCTCGAACTCCT 2336

  2716599 GACCTCGTGATCTGCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAATACAGGCGTGAGCTGCG 2716658
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2337 GACCTCATGATCTGCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTGCG 2396

  2716659 GTGCCCAACTATACTTTTAAAAGATCCCCCGTTCATTCCAATAGGCAGCCAAACCTGGGA 2716718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GTGCCCAACTATACTTTTAAAAGATCCCCCGTTCATTCCAATAGGCAGCCAAACCTGGGA 2456

  2716719 AGCACTTCCCCAAGGGATACACAAGTGTGGTGACCGTCAGTGGTTGGGCAATGACTCAGG 2716778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 AGCACTTCCCCAAGGGATACACAAGTGTGGTGACCGTCAGTGGTTGGGCAATGACTCAGG 2516

  2716779 TCAGGCTGGATGTTAAAATGGGCTCCTGGTGGGCGTGAGCCC-TCTGGGCCAGGGCTTCT 2716837
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2517 TCAGGCTGGATGTTAAAATGGGCTCCTGGTGGGCGTGAGCCCCTCTGGGCCAGGGCTTCT 2576

  2716838 GGTAACATTTGAGGCTGGCTGACTCTTTGTTTTACGGTGCCATCCTGTGCGTTGTAGGGT 2716897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GGTAACATTTGAGGCTGGCTGACTCTTTGTTTTACGGTGCCATCCTGTGCGTTGTAGGGT 2636

  2716898 GTTGCGCAGCCTCTCTAGCCTGTATCCACAAGATGCCCACAACCCACCCCTCACTGTGAT 2716957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GTTGCGCAGCCTCTCTAGCCTGTATCCACAAGATGCCCACAACCCACCCCTCACTGTGAT 2696

  2716958 AATGAAAATGTCTCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCC 2717017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AATGAAAATGTCTCCAGGCCAGGCATGGTGGCTCACAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCC 2756

  2717018 AGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGTCGAGACCAGCCGGGCCAACATGGTGAA 2717077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGTCGAGACCAGCCGGGCCAACATGGTGAA 2816

  2717078 ACCCTGTCTCTACTAAAAAAGTACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAA 2717137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ACCCTGTCTCTACTAAAAAAGTACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAA 2876

  2717138 TCGTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTAAACCCGGGAGGCGGAGGTTGC 2717197
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TCGTAGTTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTAAACCCGGGAGGCGGAGGTTGC 2936

  2717198 AGTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCA 2717257
          ||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 AGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTTTAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCA 2996

  2717258 AAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAAGAAAATGTCTCCAGACGTTGCTCTATTTCTGGG 2717317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAAGAAAATGTCTCCAGACGTTGCTCTATTTCTGGG 3056

  2717318 GCAGTGGTATAAAATCTCCCCGACTCCGTTGAAAACTACTGTTCTAGGCCTAGTAGGTTC 2717377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GCAGTGGTATAAAATCTCCCCGACTCCGTTGAAAACTACTGTTCTAGGCCTAGTAGGTTC 3116

  2717378 ACCTTGACAGCATTCTCAAATATTCACAGAAGAAAAGGGGCAAAGGACACCAAGTGGGGA 2717437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 ACCTTGACAGCATTCTCAAATATTCACAGAAGAAAAGGGGCAAAGGACACCAAGTGGGGA 3176

  2717438 CCCCAGCTTACTGATTGATTTGTGGGCTTGGCAGTCAGGCAGCCTCTGTTTAAATCCTGA 2717497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CCCCAGCTTACTGATTGATTTGTGGGCTTGGCAGTCAGGCAGCCTCTGTTTAAATCCTGA 3236

  2717498 CTCTACCAGCTGGGTGACCTTGGACAAGTTACTTAACCTCTCTGTGCCTCTGTCAGTTCT 2717557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CTCTACCAGCTGGGTGACCTTGGACAAGTTACTTAACCTCTCTGTGCCTCTGTCAGTTCT 3296

  2717558 GGTTTTGTTTTCTCACAATCGTGCCTCCTCTTGATCTTCAGCTGCAGCCCGAGGGTGGAA 2717617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GGTTTTGTTTTCTCACAATCGTGCCTCCTCTTGATCTTCAGCTGCAGCCCGAGGGTGGAA 3356

  2717618 CTTGCTGTGTGTGGCTGGGCACTTTCGCCTGTGGCTGTGCTGCTCTGCCCACAGGGAACA 2717677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CTTGCTGTGTGTGGCTGGGCACTTTCGCCTGTGGCTGTGCTGCTCTGCCCACAGGGAACA 3416

  2717678 TGCCTTTGCTGCCCCTTCCCTGTCAGCATCAGGGTCACAACCTGCCCGTCCTTCCAGGGC 2717737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TGCCTTTGCTGCCCCTTCCCTGTCAGCATCAGGGTCACAACCTGCCCGTCCTTCCAGGGC 3476

  2717738 CAGCTTCCATGCAGCTTCCTCCACGCACAGCCCCTTCCCCATCGGCATGGAAGGCTCTCT 2717797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CAGCTTCCATGCAGCTTCCTCCACGCACAGCCCCTTCCCCATCGGCATGGAAGGCTCTCT 3536

  2717798 TCCTTGTGCCCCTGGGGCAGCCGGAACCTCAGGTCACATGCAGCTCCTCCCGCGCCGTGG 2717857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TCCTTGTGCCCCTGGGGCAGCCGGAACCTCAGGTCACATGCAGCTCCTCCCGCGCCGTGG 3596

  2717858 GGATCTGGTGGTTTCTGTCTGAGTTCCTCCCCACTTGGGGTCTGAGACCGTGGGAGCCTC 2717917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GGATCTGGTGGTTTCTGTCTGAGTTCCTCCCCACTTGGGGTCTGAGACCGTGGGAGCCTC 3656

  2717918 TAGCGTGCCCAGCTCGGGCTGTCTCACTGTTTGTTACCCAGGTGAGGTGGCTGTCCCCTC 2717977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TAGCGTGCCCAGCTCGGGCTGTCTCACTGTTTGTTACCCAGGTGAGGTGGCTGTCCCCTC 3716

  2717978 CCTACCTTGGGTTGAGCTGTGAACCAGTAGGTTACCGCAGTGTGGTACCACCCCCCCCAA 2718037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CCTACCTTGGGTTGAGCTGTGAACCAGTAGGTTACCGCAGTGTGGTACCACCCCCCCCAA 3776

  2718038 CCCCAACACCCAGCTCATTCTGAGAGGGTGGAGTGGGCGGAAATCCGTGCCTGGCAGACC 2718097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CCCCAACACCCAGCTCATTCTGAGAGGGTGGAGTGGGCGGAAATCCGTGCCTGGCAGACC 3836

  2718098 ACAAAGCCACATAACTGACTTTTGTAGCCCTGCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAGGGTTGAC 2718157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 ACAAAGCCACATAACTGACTTTTGTAGCCCTGCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAGGGTTGAC 3896

  2718158 GGCAGCCATTGCCCCTTTCTTCGGTGCTTTGCCACCAGCAGACGCCCCGTGGAATTGAGG 2718217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 GGCAGCCATTGCCCCTTTCTTCGGTGCTTTGCCACCAGCAGACGCCCCGTGGAATTGAGG 3956

  2718218 AGCTTTGTTCTACGAGCTCGGGAACGGGACTTGGGAGGGACAGCCCCTGTCCCACCCTGC 2718277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AGCTTTGTTCTACGAGCTCGGGAACGGGACTTGGGAGGGACAGCCCCTGTCCCACCCTGC 4016

  2718278 CATGCCCTGTTCAACCCTGTCAGGCAGCTGAACGTAGGCTGGACCCATGGCTGCCCACCC 2718337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CATGCCCTGTTCAACCCTGTCAGGCAGCTGAACGTAGGCTGGACCCATGGCTGCCCACCC 4076

  2718338 TGGCTGCAGTACAGAATCACCTAGGGGACCTCGTTAAAATGCAGCTTCCGGACCCCACCC 2718397
          |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4077 TGGCTGCAGTACAGAGTCACCTAGGGGACCGCGTTAAAATGCAGCTTCCGGACCCCACCC 4136

  2718398 TGGGGCTTGGGGATTCTGCCTCATCAGCCTGGGTGGGGCCCAGGAAACCTGTGTGTTACC 2718457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TGGGGCTTGGGGATTCTGCCTCATCAGCCTGGGTGGGGCCCAGGAAACCTGTGTGTTACC 4196

  2718458 AGCGCTGAGGTGCTGCTGATGAGGCAGCTGGCTTCACAGCTGCACGGGAACCAGTGCCGT 2718517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 AGCGCTGAGGTGCTGCTGATGAGGCAGCTGGCTTCACAGCTGCACGGGAACCAGTGCCGT 4256

  2718518 TTAAAGCACTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTCTGGGTGACC 2718577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 TTAAAGCACTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTCTGGGTGACC 4316

  2718578 TGGGGCAGGCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATAATAACAGTA 2718637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 TGGGGCAGGCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATAATAACAGTA 4376

  2718638 CCTGCACGTGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGAAATGGGAAC 2718697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 CCTGCACGTGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGAAATGGGAAC 4436

  2718698 AGAGTGCCTGGTACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCTGATATTATT 2718757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 AGAGTGCCTGGTACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCTGATATTATT 4496

  2718758 ATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTTTGTCACC 2718817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 ATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTTTGTCACC 4556

  2718818 CAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCGGTTCAAG 2718877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 CAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCGGTTCAAG 4616

  2718878 CGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCACGCCCA 2718937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 CGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCACGCCCA 4676

  2718938 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTGGTCTTGA 2718997
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 GCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTGGTCTTGA 4736

  2718998 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGC 2719057
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4737 ACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGC 4796

  2719058 GAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGCGGTCACA 2719117
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 GAGCCACCGCACCCAGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGCGGTCACA 4856

  2719118 CACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCACACTGAG 2719177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 CACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCACACTGAG 4916

  2719178 CATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGTACATGCG 2719237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 CATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGTACATGCG 4976

  2719238 TGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACAAGGCCCA 2719297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 TGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACAAGGCCCA 5036

  2719298 GACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAGCAGCACCTG 2719357
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5037 GACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTCGAGTTAGCAGCACCTG 5096

  2719358 GGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCTGGTAAAA 2719417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 GGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCTGGTAAAA 5156

  2719418 ATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATCCTGCCTG 2719477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 ATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATCCTGCCTG 5216

  2719478 CTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTGTTTTTTT 2719537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 CTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTGTTTTTTT 5276

  2719538 TTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTGACACTTG 2719597
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 TTTT-CTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTGACACTTG 5335

  2719598 TTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGA 2719657
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 TTAACATTTTGTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGA 5395

  2719658 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCC 2719717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCC 5455

  2719718 GCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATCACAGGCG 2719777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 GCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATCACAGGCG 5515

  2719778 CCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTT 2719837
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     5516 CCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTT-AGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTT 5574

  2719838 GGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGT 2719897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
     5575 GGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAAT 5634

  2719898 GCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAA 2719928
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 GCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAA 5665

EXCISED REGION

  2721218 CTTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 2721277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 CTTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 5725

  2721278 CCACGACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTA 2721337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 CCACGACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTA 5785

  2721338 GCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAGTGCT 2721397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 GCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAGTGCT 5845

  2721398 GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTTTTTT 2721457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTTTTTT 5905

  2721458 AAAATTAAAGAAATAAAACACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCTTGCC 2721517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 AAAATTAAAGAAATAAAACACACACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCTTGCC 5965

  2721518 TCCGTTCCTCTATTTCTTCCATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTTTTCT 2721577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 TCCGTTCCTCTATTTCTTCCATCCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTTTTCT 6025

  2721578 CTCAGCCCACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 2721637
          ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 CTCAGCCCAC--------TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 6077

  2721638 TTTGAGACGGAGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGC 2721697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 TTTGAGACGGAGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGC 6137

  2721698 AACCTCCGCCTCCCGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTA 2721757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 AACCTCCGCCTCCCGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTA 6197

  2721758 CAAGTGCGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 2721817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 CAAGTGCGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 6257

  2721818 CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCC 2721877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCC 6317

  2721878 TCCCAAAGTTTTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGCCCACATTTTTA 2721937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 TCCCAAAGTTTTGGGATTGCAGGTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGCCCACATTTTTA 6377

  2721938 ATGCTTTCACATTCATACACAGGTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGTGTGCATTAAAA 2721997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6378 ATGCTTTCACATTCATACACAGGTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGTGTGCATTAAAA 6437

  2721998 AGGGACATACCTGACATCCTTTTGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGCGCTAGATTGCC 2722057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 AGGGACATACCTGACATCCTTTTGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGCGCTAGATTGCC 6497

  2722058 TGGGTTCAGATCTTGGCTCTGACACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCAGGTTCCTTCAT 2722117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 TGGGTTCAGATCTTGGCTCTGACACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCAGGTTCCTTCAT 6557

  2722118 CTCTCCATGCCTCCCTTTTCTAATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAGCCTGAAACCTA 2722177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6558 CTCTCCATGCCTCCCTTTTCTAATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAGCCTGAAACCTA 6617

  2722178 CTGCAAGGGTTGTTTTGGAGACTGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCTTAGAACAGAGA 2722237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6618 CTGCAAGGGTTGTTTTGGAGACTGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCTTAGAACAGAGA 6677

  2722238 GGGGATGTAGCAGACACAGGATGGATATATTACCATTATCGTTCTGCATGTGTGT 2722292
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6678 GGGGATGTAGCAGACACAGGATGGATATATTACCATTATCGTTCTGCATGTGTGT 6732

Alignment time is 5.11741 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   6438] =>      6438 nucs 'mol-32-340e-097417_6438'

Score:        6371
Aligned:      6443        nucs
Identic:      6434 (100%) nucs =>      1542 (100%)      4892 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2718735,2720276] EXCISED REGION [2720280,2725177]
 second seq =>  [      1,   1542] EXCISED REGION [   1543,   6438]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [2720277,2720279]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [2720277,2720296] to [2720280,2720299]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [2720277,2720277] to [2720279,2720279]
 second seq =>         0 nucs

  2718735 GCCTTAACATCTCTGATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTG 2718794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTAACATCTCTGATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTG 60

  2718795 AGACAGAGTCTCGCTTTGTCACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGC 2718854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGACAGAGTCTCGCTTTGTCACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGC 120

  2718855 AACCTCCACCTCCCCGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATT 2718914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCTCCACCTCCCCGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATT 180

  2718915 ACAGGCGCGCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 2718974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAGGCGCGCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 240

  2718975 CACGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCC 2719034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCC 300

  2719035 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAA 2719094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAA 360

  2719095 CAGTCCTGGGCTGTGCGGTCACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGG 2719154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTCCTGGGCTGTGCGGTCACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGG 420

  2719155 CGTACCTACGCAGGCACACTGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGAC 2719214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGTACCTACGCAGGCACACTGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGAC 480

  2719215 AGAGCATCCCTGTGGTACATGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCA 2719274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGCATCCCTGTGGTACATGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCA 540

  2719275 GACGTGTGTGTACACAAGGCCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTT 2719334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACGTGTGTGTACACAAGGCCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTT 600

  2719335 ATTCCTTGAGTTAGCAGCACCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCC 2719394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTCCTTGAGTTAGCAGCACCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCC 660

  2719395 ATAGCAACCATAATCTGGTAAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGC 2719454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGCAACCATAATCTGGTAAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGC 720

  2719455 CGGCTCCGGGGGCATCCTGCCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAG 2719514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGGCTCCGGGGGCATCCTGCCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAG 780

  2719515 GTGCTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTAC 2719574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGCTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTAC 840

  2719575 TCATGACTCAGAATTGACACTTGTTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATT 2719634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATGACTCAGAATTGACACTTGTTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATT 900

  2719635 TATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGC 2719694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGC 960

  2719695 GATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 2719754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 1020

  2719755 CTGAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTTAG 2719814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTTAG 1080

  2719815 TAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATC 2719874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATC 1140

  2719875 CACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAACTGTGT 2719934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAACTGTGT 1200

  2719935 TAAAATATACATATTATAAAACTTACCATTTAAAGCATTTTTAAGTGCACCATTCTGTGA 2719994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAAATATACATATTATAAAACTTACCATTTAAAGCATTTTTAAGTGCACCATTCTGTGA 1260

  2719995 CATTAAGTACATTTACAATGCTGTGCAAGGATCACCATTATTTCTAGAAGTTTTTCATCA 2720054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATTAAGTACATTTACAATGCTGTGCAAGGATCACCATTATTTCTAGAAGTTTTTCATCA 1320

  2720055 TCCCAAACTGAAACTTCGTATACATTAAATAATAACTCCCTATTCCCTCATCTCCACAGC 2720114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCCAAACTGAAACTTCGTATACATTAAATAATAACTCCCTATTCCCTCATCTCCACAGC 1380

  2720115 ACCCTGCAGCCACCATTCTGCTTTCTGTTTCTATGAATTTGACTGCTCGGTGAACTGTGT 2720174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCCTGCAGCCACCATTCTGCTTTCTGTTTCTATGAATTTGACTGCTCGGTGAACTGTGT 1440

  2720175 ATAGGTGAAATCACACAGTACTTGTCCTTCTGTGTCTGGCTTATTTCACTTCCCATAATG 2720234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAGGTGAAATCACACAGTACTTGTCCTTCTGTGTCTGGCTTATTTCACTTCCCATAATG 1500

  2720235 TCTTCAAGGTTCATCCATGTTGTAGCGTGTGTCAGAATTTCC 2720276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTCAAGGTTCATCCATGTTGTAGCGTGTGTCAGAATTTCC 1542

EXCISED REGION

  2720280 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCGT 2720339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCGT 1602

  2720340 GGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACTTCCCAGGCTCAAGCGTTTCTCGTGCCTCA 2720399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 GGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACTTCCCAGGCTCAAGCGTTTCTCGTGCCTCA 1662

  2720400 GCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACAAGGCTAATTTCTGTATTT 2720459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 GCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACAAGGCTAATTTCTGTATTT 1722

  2720460 TTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGCCATGATGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACC 2720519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 TTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGCCATGATGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACC 1782

  2720520 TCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCTAAGGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCAT 2720579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 TCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCTAAGGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCAT 1842

  2720580 GCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTTAAGACTGAATAATATCCCATTGTTGCATGTATC 2720639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 GCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTTAAGACTGAATAATATCCCATTGTTGCATGTATC 1902

  2720640 ACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTGATGGACATCTGAGTTGCTTCCAATTTTTTTTTG 2720699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 ACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTGATGGACATCTGAGTTGCTTCCAATTTTTTTTTG 1962

  2720700 CTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACGTAGGTGTATAAATATCTGGGTCTCTGTTTTCAG 2720759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 CTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACGTAGGTGTATAAATATCTGGGTCTCTGTTTTCAG 2022

  2720760 TTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAGAATTGCTGATCGTATGGCAATTCTATGTATAGT 2720819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAGAATTGCTGATCGTATGGCAATTCTATGTATAGT 2082

  2720820 TTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCATGA 2720879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCATGA 2142

  2720880 TCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 2720939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCTGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 2202

  2720940 AAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCTGCCACCACACACGGCTAAATTTTGTATTTTTAGTAG 2720999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 AAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCTGCCACCACACACGGCTAAATTTTGTATTTTTAGTAG 2262

  2721000 AGACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCAA 2721059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 AGACGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCAA 2322

  2721060 CTGCCTCAACCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCTGGCCTCTAT 2721119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 CTGCCTCAACCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCTGGCCTCTAT 2382

  2721120 GTTTAATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGATGGAGTCTGGCTTTGTTGCCCAGGCT 2721179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 GTTTAATTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGATGGAGTCTGGCTTTGTTGCCCAGGCT 2442

  2721180 GGAATGTAGGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCAGGTTCATGCCATTCT 2721239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 GGAATGTAGGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCCAGGTTCATGCCATTCT 2502

  2721240 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACGACCACGCCTGGCTAATT 2721299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACGACCACGCCTGGCTAATT 2562

  2721300 TTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCT 2721359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TTTTGTATTTTTAACAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCT 2622

  2721360 GACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACT 2721419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 GACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCTAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACT 2682

  2721420 GCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTTTTTTAAAATTAAAGAAATAAAACACA 2721479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 GCGCCCGGCCTCTATGTTTAATTTTTTTAGCTTTTTTTAAAATTAAAGAAATAAAACACA 2742

  2721480 CACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCTTGCCTCCGTTCCTCTATTTCTTCCAT 2721539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 CACATAAAGTTAAGTTCCGGTCATCATTTCTGCTTGCCTCCGTTCCTCTATTTCTTCCAT 2802

  2721540 CCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTTTTCTCTCAGCCCACTTTATTTATTTA 2721599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 CCATAGGGGCTACCATTAGCAGGAATTTTGTGTTTTCTCTCAGCCCACTTTATTTATTTA 2862

  2721600 TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCTGTTGC 2721659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTCTGTTGC 2922

  2721660 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGTTCAAG 2721719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGTTCAAG 2982

  2721720 TAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGTGCCACCACGCCCG 2721779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGTGCCACCACGCCCG 3042

  2721780 GCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTC 2721839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTC 3102

  2721840 TTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTTTTGGGATTGCAG 2721899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 TTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTTTTGGGATTGCAG 3162

  2721900 GTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGCCCACATTTTTAATGCTTTCACATTCATACACAG 2721959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 GTGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCAGCCCACATTTTTAATGCTTTCACATTCATACACAG 3222

  2721960 GTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGTGTGCATTAAAAAGGGACATACCTGACATCCTTT 2722019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 GTATCTAGAAACATTTATAGTTTTTGTGTGCATTAAAAAGGGACATACCTGACATCCTTT 3282

  2722020 TGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGCGCTAGATTGCCTGGGTTCAGATCTTGGCTCTGA 2722079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 TGAATTTGTGTGAGGTGGCGTTCTGGCGCTAGATTGCCTGGGTTCAGATCTTGGCTCTGA 3342

  2722080 CACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCAGGTTCCTTCATCTCTCCATGCCTCCCTTTTCTA 2722139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 CACGCAGCAGCTGTGAGACCTCAGGCAGGTTCCTTCATCTCTCCATGCCTCCCTTTTCTA 3402

  2722140 ATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAGCCTGAAACCTACTGCAAGGGTTGTTTTGGAGAC 2722199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 ATCTTTGAAACTGGACTAATAGCAAAGCCTGAAACCTACTGCAAGGGTTGTTTTGGAGAC 3462

  2722200 TGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCTTAGAACAGAGAGGGGATGTAGCAGACACAGGAT 2722259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 TGAGTAAGTTTATACATGTCTAGTGCTTAGAACAGAGAGGGGATGTAGCAGACACAGGAT 3522

  2722260 GGATATATTACCATTATCGTTCTGCATGTGTGTCTGTCCACATGGTTGTAAAGTCTATTT 2722319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     3523 GGATATATTACCATTATCGTTCTGCATGTGTGTCTGTCCACATGGTTGTAAAGTCTA-TT 3581

  2722320 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATC 2722379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATC 3641

  2722380 TTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 2722439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 3701

  2722440 GTACCTGGGACTACAGGCGCCCGCTACCACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTA 2722499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 GTACCTGGGACTACAGGCGCCCGCTACCACACCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTA 3761

  2722500 GAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATCATCTGCC 2722559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 GAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATCATCTGCC 3821

  2722560 TGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGATGTGAGCCACCATGCCTTGCTTTTTTT 2722619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 TGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGATGTGAGCCACCATGCCTTGCTTTTTTT 3881

  2722620 TTTTTTTTCTTTTTTTGGAGACTGAGTCTTGCTCTGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTTG 2722679
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 TTTTTTTTCTTTTTTTGGAGACCGAGTCTTGCTCTGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCTTG 3941

  2722680 GCTGACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTACAAGTGATTCTCTTGCATCAGCCTTCCAAGCA 2722739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 GCTGACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTACAAGTGATTCTCTTGCATCAGCCTTCCAAGCA 4001

  2722740 GCTGGGATCACAGGAGCATGCCACCACACACTTTTTTTTTTCTTTTTTGACGGAGTCTTG 2722799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 GCTGGGATCACAGGAGCATGCCACCACACACTTTTTTTTTTCTTTTTTGACGGAGTCTTG 4061

  2722800 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCATTGCAGCCTCTGCCTCC 2722859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCATTGCAGCCTCTGCCTCC 4121

  2722860 CGGGTTCCAGCGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCATGCC 2722919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 CGGGTTCCAGCGACTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCATGCC 4181

  2722920 ACCATGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTGGTAGAGACGGGGTTTTTTGGCCAGGCTGGTC 2722979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 ACCATGCCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTGGTAGAGACGGGGTTTTTTGGCCAGGCTGGTC 4241

  2722980 TTGAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 2723039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 TTGAACTCCTGACCTCAGATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 4301

  2723040 GCATGAGCCTCAGCGCCTGGTGATAGATCTAGTTTCTTCTCTCTTTCTCCTTTTTTTTTT 2723099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 GCATGAGCCTCAGCGCCTGGTGATAGATCTAGTTTCTTCTCTCTTTCTCCTTTTTTTTTT 4361

  2723100 TTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCTCAAGGTGGTGTGATCCTGGCTCACTGTAGC 2723159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 TTTTTTGAGACAGGATCTCACTCTGTTGCTCAAGGTGGTGTGATCCTGGCTCACTGTAGC 4421

  2723160 CTCAATACCCCCAGGGCTCAAGTGATTCTCCAACCTCAGCCTCCCACGTGGTTGGGACTA 2723219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 CTCAATACCCCCAGGGCTCAAGTGATTCTCCAACCTCAGCCTCCCACGTGGTTGGGACTA 4481

  2723220 CAGCATGCACCACCATGCTTGGTTAAGTTTTTAAGAAATTTTTGTAGAGATGAGGTTTCA 2723279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 CAGCATGCACCACCATGCTTGGTTAAGTTTTTAAGAAATTTTTGTAGAGATGAGGTTTCA 4541

  2723280 CCATCTTGCTGTCTCAAACTTCTGGGCTCAAATGATTCTCCAACCTTGGCCTCCCAAAGT 2723339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 CCATCTTGCTGTCTCAAACTTCTGGGCTCAAATGATTCTCCAACCTTGGCCTCCCAAAGT 4601

  2723340 GTTGGGATTACAGGCGGGAGCCACCACTTCTGGCCTAGTTTTTTCTTTTTGGTGCCATGC 2723399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 GTTGGGATTACAGGCGGGAGCCACCACTTCTGGCCTAGTTTTTTCTTTTTGGTGCCATGC 4661

  2723400 ATATTAATTTGTACAAATAGATCACATTTTTTTTGTATCCCCCATTGATCCCCTCTTGCT 2723459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 ATATTAATTTGTACAAATAGATCACATTTTTTTTGTATCCCCCATTGATCCCCTCTTGCT 4721

  2723460 GGACACCTAGGTCGTTTCCATTTTCTGATATTGCAAGCAATGCTGCAGGCAGTGGCTTTC 2723519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 GGACACCTAGGTCGTTTCCATTTTCTGATATTGCAAGCAATGCTGCAGGCAGTGGCTTTC 4781

  2723520 CCCTTGCCTGGCCCTCTGTGCGTTTGTGTGAGGTCATGAGGGGTACCTAGAGGTGGGGCT 2723579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 CCCTTGCCTGGCCCTCTGTGCGTTTGTGTGAGGTCATGAGGGGTACCTAGAGGTGGGGCT 4841

  2723580 GTTGGGTCGCAGCTCTACTGGATGCTGCCAGATTGCCCTCAAGAGAGGACTTAGGCTGGG 2723639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 GTTGGGTCGCAGCTCTACTGGATGCTGCCAGATTGCCCTCAAGAGAGGACTTAGGCTGGG 4901

  2723640 CGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAGCACTTTGGCAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTG 2723699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 CGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAGCACTTTGGCAGGCCAAGGTGGGCGGATCACTTG 4961

  2723700 AGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAACA 2723759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 AGGTCAGGAGCTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAACA 5021

  2723760 CAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCAGCTACTAGGGTGGCTGAGGC 2723819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 CAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCAGCTACTAGGGTGGCTGAGGC 5081

  2723820 AGGAGAATCACTTGAAGACGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCTCATCACTGCA 2723879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 AGGAGAATCACTTGAAGACGGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCTCATCACTGCA 5141

  2723880 CTCCAGCCTGGGCAGCAATGAGAGACACCGTCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGACT 2723937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     5142 CTCCAGCCTGGGCAGCAATGAGAGACACCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGACT 5201

  2723938 TAGTATTTTCACTGCTCCCAATTCTATGATTCCCATTCCCCACGTCCTCACTGATGTTTG 2723997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 TAGTATTTTCACTGCTCCCAATTCTATGATTCCCATTCCCCACGTCCTCACTGATGTTTG 5261

  2723998 ATTTTCATGTTGATTTGAGTGACAGAAGCATATTTTATTTTATTTTATTTTGAGACGGAG 2724057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 ATTTTCATGTTGATTTGAGTGACAGAAGCATATTTTATTTTATTTTATTTTGAGACGGAG 5321

  2724058 TCTCACTCTGTATAGTGGCATGATCTCGGCTCACTAAAATCTCCGCCTCCCGGGTTCAAG 2724117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 TCTCACTCTGTATAGTGGCATGATCTCGGCTCACTAAAATCTCCGCCTCCCGGGTTCAAG 5381

  2724118 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACGGCCC 2724177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     5382 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCAC-GCCC 5440

  2724178 GGATAATGG-TTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGTTTCATTATGTTG 2724236
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 GGATAATGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGTTTCATTATGTTG 5500

  2724237 GCCAGGCTGCTCTCGAACTGCTGACCTGTTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 2724296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 GCCAGGCTGCTCTCGAACTGCTGACCTGTTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 5560

  2724297 GGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGTCCTGCCTATTATTTTATTCTTTATTATACAAACA 2724356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 GGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGTCCTGCCTATTATTTTATTCTTTATTATACAAACA 5620

  2724357 TGAACAGATCTCTGAATAAGCGCTTGGAAACCCTCATGGCTCCACTGTCAGATCGCTGTG 2724416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 TGAACAGATCTCTGAATAAGCGCTTGGAAACCCTCATGGCTCCACTGTCAGATCGCTGTG 5680

  2724417 TCTGAGCCTCCCTCGAGTCCCTCTCCACAGGCCCAGGGATGCGCTTCTCTTCACCCTTTT 2724476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 TCTGAGCCTCCCTCGAGTCCCTCTCCACAGGCCCAGGGATGCGCTTCTCTTCACCCTTTT 5740

  2724477 TCTGTGTCACAAGCATTTCCATATATTGCTACATTCTTTTTTCCCCTCTTTAAAAATAGC 2724536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 TCTGTGTCACAAGCATTTCCATATATTGCTACATTCTTTTTTCCCCTCTTTAAAAATAGC 5800

  2724537 ACTTTTCCTGATTATAAAAATAGTACATGCTCACTGTAGAACATTTAGAGAATATGTACA 2724596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 ACTTTTCCTGATTATAAAAATAGTACATGCTCACTGTAGAACATTTAGAGAATATGTACA 5860

  2724597 AATAGAGATTAAAAAATAAAAATATGACCCATCACCCAAAATGTTATCATTCTGATGTAT 2724656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 AATAGAGATTAAAAAATAAAAATATGACCCATCACCCAAAATGTTATCATTCTGATGTAT 5920

  2724657 TTCTTTACACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 2724716
          |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 TTCTTTACACC---TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC 5977

  2724717 TGGAGTGCAGTGGCACGCTTACAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCTAGGCTCAAGCGATC 2724776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5978 TGGAGTGCAGTGGCACGCTTACAGTTCACTGCAACCTCCACCTCCTAGGCTCAAGCGATC 6037

  2724777 CTCCCACCTTAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACCACAGCATCTGCCACCATGCCTGGCTAAT 2724836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6038 CTCCCACCTTAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACCACAGCATCTGCCACCATGCCTGGCTAAT 6097

  2724837 TTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAAGTTTTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTG 2724896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6098 TTTTTTTTTTTTGTAGAGATGAAGTTTTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTTTTGAACTCCTG 6157

  2724897 GTCTCAAGCAATCCATCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 2724956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6158 GTCTCAAGCAATCCATCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 6217

  2724957 CTTGCCCCGCCAAGTGTGGTGTTTTAAATTTAAGTGAATTAAGTACAATTAAAAATGCAG 2725016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 CTTGCCCCGCCAAGTGTGGTGTTTTAAATTTAAGTGAATTAAGTACAATTAAAAATGCAG 6277

  2725017 CTCCTCGGTTGCACTAGCCACATCTCAAGGGCTCAGTAGCCACATGTGGCTGGTGGCTAC 2725076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 CTCCTCGGTTGCACTAGCCACATCTCAAGGGCTCAGTAGCCACATGTGGCTGGTGGCTAC 6337

  2725077 CATAGGGAACAACGCAGGTACAGAACATTACAGAACATTTTCATCATCCCAGAAAGTTCT 2725136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 CATAGGGAACAACGCAGGTACAGAACATTACAGAACATTTTCATCATCCCAGAAAGTTCT 6397

  2725137 ACTGTACAGCGCTGGTTGAGAATGAGGTCCAGACTCCCCTG 2725177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 ACTGTACAGCGCTGGTTGAGAATGAGGTCCAGACTCCCCTG 6438

Alignment time is 4.78832 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   2353] =>      2353 nucs 'mol-32-3487-061024_2353'

Score:        2255
Aligned:      2354        nucs
Identic:      2345 (100%) nucs =>      1400 (100%)       945 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2717349,2718750] EXCISED REGION [2718754,2719705]
 second seq =>  [      1,   1402] EXCISED REGION [   1403,   2353]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [2718751,2718753]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        40 nucs [2718751,2718790] to [2718754,2718793]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [2718751,2718751] to [2718753,2718753]
 second seq =>         0 nucs

  2717349 AAAACTACTGTTCTAGGCCTAGTAGGTTCACCTTGACAGCATTCTCAAATATTCACAGAA 2717408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAACTACTGTTCTAGGCCTAGTAGGTTCACCTTGACAGCATTCTCAAATATTCACAGAA 60

  2717409 GAAAAGGGGCAAAGGACACCAAGTGGGGACCCCAGCTTACTGATTGATTTGTGGGCTTGG 2717468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAAGGGGCAAAGGACACCAAGTGGGGACCCCAGCTTACTGATTGATTTGTGGGCTTGG 120

  2717469 CAGTCAGGCAGCCTCTGTTTAAATCCTGACTCTACCAGCTGGGTGACCTTGGACAAGTTA 2717528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTCAGGCAGCCTCTGTTTAAATCCTGACTCTACCAGCTGGGTGACCTTGGACAAGTTA 180

  2717529 CTTAACCTCTCTGTGCCTCTGTCAGTTCTGGTTTTGTTTTCTCACAATCGTGCCTCCTCT 2717588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTAACCTCTCTGTGCCTCTGTCAGTTCTGGTTTTGTTTTCTCACAATCGTGCCTCCTCT 240

  2717589 TGATCTTCAGCTGCAGCCCGAGGGTGGAACTTGCTGTGTGTGGCTGGGCACTTTCGCCTG 2717648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGATCTTCAGCTGCAGCCCGAGGGTGGAACTTGCTGTGTGTGGCTGGGCACTTTCGCCTG 300

  2717649 TGGCTGTGCTGCTCTGCCCACAGGGAACATGCCTTTGCTGCCCCTTCCCTGTCAGCATCA 2717708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCTGTGCTGCTCTGCCCACAGGGAACATGCCTTTGCTGCCCCTTCCCTGTCAGCATCA 360

  2717709 GGGTCACAACCTGCCCGTCCTTCCAGGGCCAGCTTCCATGCAGCTTCCTCCACGCACAGC 2717768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTCACAACCTGCCCGTCCTTCCAGGGCCAGCTTCCATGCAGCTTCCTCCACGCACAGC 420

  2717769 CCCTTCCCCATCGGCATGGAAGGCTCTCTTCCTTGTGCCCCTGGGGCAGCCGGAACCTCA 2717828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTTCCCCATCGGCATGGAAGGCTCTCTTCCTTGTGCCCCTGGGGCAGCCGGAACCTCA 480

  2717829 GGTCACATGCAGCTCCTCCCGCGCCGTGGGGATCTGGTGGTTTCTGTCTGAGTTCCTCCC 2717888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTCACATGCAGCTCCTCCCGCGCCGTGGGGATCTGGTGGTTTCTGTCTGAGTTCCTCCC 540

  2717889 CACTTGGGGTCTGAGACCGTGGGAGCCTCTAGCGTGCCCAGCTCGGGCTGTCTCACTGTT 2717948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTTGGGGTCTGAGACCGTGGGAGCCTCTAGCGTGCCCAGCTCGGGCTGTCTCACTGTT 600

  2717949 TGTTACCCAGGTGAGGTGGCTGTCCCCTCCCTACCTTGGGTTGAGCTGTGAACCAGTAGG 2718008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTACCCAGGTGAGGTGGCTGTCCCCTCCCTACCTTGGGTTGAGCTGTGAACCAGTAGG 660

  2718009 TTACCGCAGTGTGGTACCACCCCCCCCAACCCCAACACCCAGCTCATTCTGAGAGGGTGG 2718068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACCGCAGTGTGGTACCACCCCCCCCAACCCCAACACCCAGCTCATTCTGAGAGGGTGG 720

  2718069 AGTGGGCGGAAATCCGTGCCTGGCAGACCACAAAGCCACATAACTGACTTTTGTAGCCCT 2718128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTGGGCGGAAATCCGTGCCTGGCAGACCACAAAGCCACATAACTGACTTTTGTAGCCCT 780

  2718129 GCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAGGGTTGACGGCAGCCATTGCCCCTTTCTTCGGTGCTTTG 2718188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAGGGTTGACGGCAGCCATTGCCCCTTTCTTCGGTGCTTTG 840

  2718189 CCACCAGCAGACGCCCCGTGGAATTGAGGAGCTTTGTTCTACGAGCTCGGGAACGGGACT 2718248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACCAGCAGACGCCCCGTGGAATTGAGGAGCTTTGTTCTACGAGCTCGGGAACGGGACT 900

  2718249 TGGGAGGGACAGCCCCTGTCCCACCCTGCCATGCCCTGTTCAACCCTGTCAGGCAGCTGA 2718308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGGAGGGACAGCCCCTGTCCCACCCTGCCATGCCCTGTTCAACCCTGTCAGGCAGCTGA 960

  2718309 ACGTAGGCTGGACCCATGGCTGCCCACCCTGGCTGCAGTACAGAATCACCTAGGGGACCT 2718368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
      961 ACGTAGGCTGGACCCATGGCTGCCCACCCTGGCTGCAGTACAGAGTCACCTAGGGGACCG 1020

  2718369 CGTTAAAATGCAGCTTCCGGACCCCACCCTGGGGCTTGGGGATTCTGCCTCATCAGCCTG 2718428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGTTAAAATGCAGCTTCCGGACCCCACCCTGGGGCTTGGGGATTCTGCCTCATCAGCCTG 1080

  2718429 GGTGGGGCCCAGGAAACCTGTGTGTTACCAGCGCTGAGGTGCTGCTGATGAGGCAGCTGG 2718488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTGGGGCCCAGGAAACCTGTGTGTTACCAGCGCTGAGGTGCTGCTGATGAGGCAGCTGG 1140

  2718489 CTTCACAGCTGCACGGGAACCAGTGCCGTTTAAAGCACTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCA 2718548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCACAGCTGCACGGGAACCAGTGCCGTTTAAAGCACTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCA 1200

  2718549 GCAGTCAGGTTCACGTACTCTGGGTGACCTGGGGCAGGCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCC 2718608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGTCAGGTTCACGTACTCTGGGTGACCTGGGGCAGGCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCC 1260

  2718609 AGTTTCTTTGTCTGAGGATAATAACAGTACCTGCACGTGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTT 2718668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTTTCTTTGTCTGAGGATAATAACAGTACCTGCACGTGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTT 1320

  2718669 AAATGAGATTATCCAGGTGAAATGGGAACAGAGTGCCTGGTACCTAGTGCTCAACACATG 2718728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATGAGATTATCCAGGTGAAATGGGAACAGAGTGCCTGGTACCTAGTGCTCAACACATG 1380

  2718729 TAACCTGCCTTAACATCTCTGA 2718750
          ||||||||||||||||||||||
     1381 TAACCTGCCTTAACATCTCTGA 1402

EXCISED REGION

  2718754 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTTTGT 2718813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTTTGT 1462

  2718814 CACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCGGTT 2718873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 CACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCGGTT 1522

  2718874 CAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCACG 2718933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 CAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCACG 1582

  2718934 CCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTGGTC 2718993
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 CCCAGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTGGTC 1642

  2718994 TTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 2719053
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1643 TTGAACTCCTGAACTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAG 1702

  2719054 GCGCGAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGCGGT 2719113
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 GCGCGAGCCACCGCACCCAGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGCGGT 1762

  2719114 CACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCACAC 2719173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 CACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCACAC 1822

  2719174 TGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGTACA 2719233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 TGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGTACA 1882

  2719234 TGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACAAGG 2719293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 TGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACAAGG 1942

  2719294 CCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAGCAGCA 2719353
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1943 CCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTCGAGTTAGCAGCA 2002

  2719354 CCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCTGGT 2719413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 CCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCTGGT 2062

  2719414 AAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATCCTG 2719473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 AAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATCCTG 2122

  2719474 CCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTGTTT 2719533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     2123 CCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTG-TT 2181

  2719534 TTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTGACA 2719593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTGACA 2241

  2719594 CTTGTTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTGAGA 2719653
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 CTTGTTAACATTTTGTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTGAGA 2301

  2719654 CGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTC 2719705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTC 2353

Alignment time is 1.938 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [2709692,2731679] =>     21988 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [      1,   3633] =>      3633 nucs 'mol-32-34b3-067677_3633'

Score:        3612
Aligned:      3634        nucs
Identic:      3632 (100%) nucs =>       428 (100%)      3204 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [2717242,2717669] EXCISED REGION [2717671,2720876]
 second seq =>  [      1,    428] EXCISED REGION [    430,   3633]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [2717670,2717670]
 second seq =>         1 nucs [429,429]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [2719807,2719807]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [429,431] to [430,432]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  2717242 GTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAAGAAAATGTCTCCAGACG 2717301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAAGAAAATGTCTCCAGACG 60

  2717302 TTGCTCTATTTCTGGGGCAGTGGTATAAAATCTCCCCGACTCCGTTGAAAACTACTGTTC 2717361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCTCTATTTCTGGGGCAGTGGTATAAAATCTCCCCGACTCCGTTGAAAACTACTGTTC 120

  2717362 TAGGCCTAGTAGGTTCACCTTGACAGCATTCTCAAATATTCACAGAAGAAAAGGGGCAAA 2717421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGGCCTAGTAGGTTCACCTTGACAGCATTCTCAAATATTCACAGAAGAAAAGGGGCAAA 180

  2717422 GGACACCAAGTGGGGACCCCAGCTTACTGATTGATTTGTGGGCTTGGCAGTCAGGCAGCC 2717481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGACACCAAGTGGGGACCCCAGCTTACTGATTGATTTGTGGGCTTGGCAGTCAGGCAGCC 240

  2717482 TCTGTTTAAATCCTGACTCTACCAGCTGGGTGACCTTGGACAAGTTACTTAACCTCTCTG 2717541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGTTTAAATCCTGACTCTACCAGCTGGGTGACCTTGGACAAGTTACTTAACCTCTCTG 300

  2717542 TGCCTCTGTCAGTTCTGGTTTTGTTTTCTCACAATCGTGCCTCCTCTTGATCTTCAGCTG 2717601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCCTCTGTCAGTTCTGGTTTTGTTTTCTCACAATCGTGCCTCCTCTTGATCTTCAGCTG 360

  2717602 CAGCCCGAGGGTGGAACTTGCTGTGTGTGGCTGGGCACTTTCGCCTGTGGCTGTGCTGCT 2717661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGCCCGAGGGTGGAACTTGCTGTGTGTGGCTGGGCACTTTCGCCTGTGGCTGTGCTGCT 420

  2717662 CTGCCCAC 2717669
          ||||||||
      421 CTGCCCAC 428

EXCISED REGION

  2717671 GGGAACATGCCTTTGCTGCCCCTTCCCTGTCAGCATCAGGGTCACAACCTGCCCGTCCTT 2717730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 GGGAACATGCCTTTGCTGCCCCTTCCCTGTCAGCATCAGGGTCACAACCTGCCCGTCCTT 489

  2717731 CCAGGGCCAGCTTCCATGCAGCTTCCTCCACGCACAGCCCCTTCCCCATCGGCATGGAAG 2717790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 CCAGGGCCAGCTTCCATGCAGCTTCCTCCACGCACAGCCCCTTCCCCATCGGCATGGAAG 549

  2717791 GCTCTCTTCCTTGTGCCCCTGGGGCAGCCGGAACCTCAGGTCACATGCAGCTCCTCCCGC 2717850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 GCTCTCTTCCTTGTGCCCCTGGGGCAGCCGGAACCTCAGGTCACATGCAGCTCCTCCCGC 609

  2717851 GCCGTGGGGATCTGGTGGTTTCTGTCTGAGTTCCTCCCCACTTGGGGTCTGAGACCGTGG 2717910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 GCCGTGGGGATCTGGTGGTTTCTGTCTGAGTTCCTCCCCACTTGGGGTCTGAGACCGTGG 669

  2717911 GAGCCTCTAGCGTGCCCAGCTCGGGCTGTCTCACTGTTTGTTACCCAGGTGAGGTGGCTG 2717970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 GAGCCTCTAGCGTGCCCAGCTCGGGCTGTCTCACTGTTTGTTACCCAGGTGAGGTGGCTG 729

  2717971 TCCCCTCCCTACCTTGGGTTGAGCTGTGAACCAGTAGGTTACCGCAGTGTGGTACCACCC 2718030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TCCCCTCCCTACCTTGGGTTGAGCTGTGAACCAGTAGGTTACCGCAGTGTGGTACCACCC 789

  2718031 CCCCCAACCCCAACACCCAGCTCATTCTGAGAGGGTGGAGTGGGCGGAAATCCGTGCCTG 2718090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 CCCCCAACCCCAACACCCAGCTCATTCTGAGAGGGTGGAGTGGGCGGAAATCCGTGCCTG 849

  2718091 GCAGACCACAAAGCCACATAACTGACTTTTGTAGCCCTGCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAG 2718150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 GCAGACCACAAAGCCACATAACTGACTTTTGTAGCCCTGCCCTGGGGTGTTGGGGGGGAG 909

  2718151 GGTTGACGGCAGCCATTGCCCCTTTCTTCGGTGCTTTGCCACCAGCAGACGCCCCGTGGA 2718210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 GGTTGACGGCAGCCATTGCCCCTTTCTTCGGTGCTTTGCCACCAGCAGACGCCCCGTGGA 969

  2718211 ATTGAGGAGCTTTGTTCTACGAGCTCGGGAACGGGACTTGGGAGGGACAGCCCCTGTCCC 2718270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 ATTGAGGAGCTTTGTTCTACGAGCTCGGGAACGGGACTTGGGAGGGACAGCCCCTGTCCC 1029

  2718271 ACCCTGCCATGCCCTGTTCAACCCTGTCAGGCAGCTGAACGTAGGCTGGACCCATGGCTG 2718330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 ACCCTGCCATGCCCTGTTCAACCCTGTCAGGCAGCTGAACGTAGGCTGGACCCATGGCTG 1089

  2718331 CCCACCCTGGCTGCAGTACAGAATCACCTAGGGGACCTCGTTAAAATGCAGCTTCCGGAC 2718390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 CCCACCCTGGCTGCAGTACAGAATCACCTAGGGGACCTCGTTAAAATGCAGCTTCCGGAC 1149

  2718391 CCCACCCTGGGGCTTGGGGATTCTGCCTCATCAGCCTGGGTGGGGCCCAGGAAACCTGTG 2718450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 CCCACCCTGGGGCTTGGGGATTCTGCCTCATCAGCCTGGGTGGGGCCCAGGAAACCTGTG 1209

  2718451 TGTTACCAGCGCTGAGGTGCTGCTGATGAGGCAGCTGGCTTCACAGCTGCACGGGAACCA 2718510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 TGTTACCAGCGCTGAGGTGCTGCTGATGAGGCAGCTGGCTTCACAGCTGCACGGGAACCA 1269

  2718511 GTGCCGTTTAAAGCACTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTCTG 2718570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 GTGCCGTTTAAAGCACTTTCCCCCACAGTGCGGCTCCAGCAGTCAGGTTCACGTACTCTG 1329

  2718571 GGTGACCTGGGGCAGGCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATAAT 2718630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 GGTGACCTGGGGCAGGCTGCGCAACCTCTCTGTGCCCCAGTTTCTTTGTCTGAGGATAAT 1389

  2718631 AACAGTACCTGCACGTGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGAAA 2718690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 AACAGTACCTGCACGTGGGTGCGCTTGTTGTGAGGCTTAAATGAGATTATCCAGGTGAAA 1449

  2718691 TGGGAACAGAGTGCCTGGTACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCTGA 2718750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 TGGGAACAGAGTGCCTGGTACCTAGTGCTCAACACATGTAACCTGCCTTAACATCTCTGA 1509

  2718751 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTT 2718810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGAGTCTCGCTT 1569

  2718811 TGTCACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCG 2718870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 TGTCACCCAGGCTGGATTGCAGTGGCATAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCG 1629

  2718871 GTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACC 2718930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 GTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACC 1689

  2718931 ACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTG 2718990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 ACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGACCAGGCTG 1749

  2718991 GTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 2719050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 GTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 1809

  2719051 CAGGCGCGAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGC 2719110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 CAGGCGCGAGCCACCGCACCCGGCCCCATTTCCGATATTAACAACAGTCCTGGGCTGTGC 1869

  2719111 GGTCACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCA 2719170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 GGTCACACACGTGTAACTGTGCGATGTGCCCTCGTGCCTGCAGGCGTACCTACGCAGGCA 1929

  2719171 CACTGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGT 2719230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 CACTGAGCATTGTGTACCGGGACCCAGGCCTCCCTGCTGAGGACAGAGCATCCCTGTGGT 1989

  2719231 ACATGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACA 2719290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 ACATGCGTGGACGCAGTCACTGGCTGGACGTGGTCAGAAGGGCAGACGTGTGTGTACACA 2049

  2719291 AGGCCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAGCA 2719350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 AGGCCCAGACAAGCGGGTTTTTATTTGATTCACACTCTGACCTTATTCCTTGAGTTAGCA 2109

  2719351 GCACCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCT 2719410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 GCACCTGGGCTGAGCTCTGGGAGCCCAAGGTGCCCCTTGTTTCCATAGCAACCATAATCT 2169

  2719411 GGTAAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATC 2719470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 GGTAAAAATAGGCGGGGGAGGGAAGAGCTGGAAGAGGCCCGAGCCGGCTCCGGGGGCATC 2229

  2719471 CTGCCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTG 2719530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 CTGCCTGCTAAGGTCCTTTTTTCCACATTGCTGACCATACAGAGGTGCTGTTTTGTTTTG 2289

  2719531 TTTTTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTG 2719590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 TTTTTTTTTTTTCTTAGGATAATGACATGCAAACCTCTGAGTACTCATGACTCAGAATTG 2349

  2719591 ACACTTGTTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTG 2719650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 ACACTTGTTAACATTTTTTCTCATTTTCATCAAACCCTCTTATTTATTTATTTATTTTTG 2409

  2719651 AGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGC 2719710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 AGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGC 2469

  2719711 AACCTCCGCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATC 2719770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 AACCTCCGCCTTTCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATC 2529

  2719771 ACAGGCGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 2719830
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2530 ACAGGCGCCCGACACCACACCTGGCTAATTTTTATA-TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 2588

  2719831 CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTC 2719890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 CCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTC 2648

  2719891 CCAAAGTGCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAACTGTGTTAAAATATACATATTA 2719950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 CCAAAGTGCTGGGATTACATCAAAGTCTTTTTAAAAAACTGTGTTAAAATATACATATTA 2708

  2719951 TAAAACTTACCATTTAAAGCATTTTTAAGTGCACCATTCTGTGACATTAAGTACATTTAC 2720010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 TAAAACTTACCATTTAAAGCATTTTTAAGTGCACCATTCTGTGACATTAAGTACATTTAC 2768

  2720011 AATGCTGTGCAAGGATCACCATTATTTCTAGAAGTTTTTCATCATCCCAAACTGAAACTT 2720070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 AATGCTGTGCAAGGATCACCATTATTTCTAGAAGTTTTTCATCATCCCAAACTGAAACTT 2828

  2720071 CGTATACATTAAATAATAACTCCCTATTCCCTCATCTCCACAGCACCCTGCAGCCACCAT 2720130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 CGTATACATTAAATAATAACTCCCTATTCCCTCATCTCCACAGCACCCTGCAGCCACCAT 2888

  2720131 TCTGCTTTCTGTTTCTATGAATTTGACTGCTCGGTGAACTGTGTATAGGTGAAATCACAC 2720190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 TCTGCTTTCTGTTTCTATGAATTTGACTGCTCGGTGAACTGTGTATAGGTGAAATCACAC 2948

  2720191 AGTACTTGTCCTTCTGTGTCTGGCTTATTTCACTTCCCATAATGTCTTCAAGGTTCATCC 2720250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 AGTACTTGTCCTTCTGTGTCTGGCTTATTTCACTTCCCATAATGTCTTCAAGGTTCATCC 3008

  2720251 ATGTTGTAGCGTGTGTCAGAATTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTC 2720310
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 ATGTTGTAGCGTGTGTCAGAATTTCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTC 3067

  2720311 TTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACT 2720370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 TTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGATTGCCGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCACT 3127

  2720371 TCCCAGGCTCAAGCGTTTCTCGTGCCTCAGCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGTGTGC 2720430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TCCCAGGCTCAAGCGTTTCTCGTGCCTCAGCCTCCTATGTAGCTGGGATTACAGGTGTGC 3187

  2720431 ACCACCACACAAGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGCCATG 2720490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 ACCACCACACAAGGCTAATTTCTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGATAGGGTTTCGCCATG 3247

  2720491 ATGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCTAAG 2720550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 ATGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCTAAG 3307

  2720551 GTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCATGCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTTAAGA 2720610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 GTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACCATGCCTGGCCTAGAATTTCCTTTCCTTTTAAGA 3367

  2720611 CTGAATAATATCCCATTGTTGCATGTATCACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTGATGG 2720670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CTGAATAATATCCCATTGTTGCATGTATCACATTTTGTTTATCCATGTGTTCACTGATGG 3427

  2720671 ACATCTGAGTTGCTTCCAATTTTTTTTTGCTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACGTAGG 2720730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 ACATCTGAGTTGCTTCCAATTTTTTTTTGCTGTTGCGAATAATGCCACAGTGAACGTAGG 3487

  2720731 TGTATAAATATCTGGGTCTCTGTTTTCAGTTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAGAATT 2720790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 TGTATAAATATCTGGGTCTCTGTTTTCAGTTCTTTTGGGTATCTATTTAGGAGCAGAATT 3547

  2720791 GCTGATCGTATGGCAATTCTATGTATAGTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTACTGT 2720850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 GCTGATCGTATGGCAATTCTATGTATAGTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTTTTACTGT 3607

  2720851 GTTGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCA 2720876
          ||||||||||||||||||||||||||
     3608 GTTGCCCAGGCTGGAGTGAAGTGGCA 3633

Alignment time is 3.20575 s

