
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2926] =>      2926 nucs 'mol-32-1ef5-011397_2926'

Score:        2855
Aligned:      2907        nucs
Identic:      2899 (100%) nucs =>      1102 (100%)      1797 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26779284,26780385] EXCISED REGION [26783492,26785296]
 second seq =>  [       1,    1102] EXCISED REGION [    1103,    2900]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3106 nucs [26780386,26783491]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [26780386,26780387] to [26783492,26783493]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26779284 TAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTC 26779343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTC 60

 26779344 CGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAA 26779403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAA 120

 26779404 GATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGAC 26779463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGAC 180

 26779464 TCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAG 26779523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAG 240

 26779524 CATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAAC 26779583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAAC 300

 26779584 TCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTT 26779643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTT 360

 26779644 TTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGG 26779703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGG 420

 26779704 TGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAAT 26779763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAAT 480

 26779764 TGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCAT 26779823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCAT 540

 26779824 ATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCT 26779883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCT 600

 26779884 TTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAG 26779943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAG 660

 26779944 AGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTC 26780003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTC 720

 26780004 AATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCT 26780063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCT 780

 26780064 TCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCT 26780123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCT 840

 26780124 TTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGA 26780183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGA 900

 26780184 ACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAA 26780243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAA 960

 26780244 ACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTG 26780303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTG 1020

 26780304 GAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCT 26780363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCT 1080

 26780364 ATAATTCAATTCAATTCTGACA 26780385
          ||||||||||||||||||||||
     1081 ATAATTCAATTCAATTCTGACA 1102

EXCISED REGION

 26783492 CTCCGATGGTGGGACTTCTCAGCCTCCATAGTTGCATGAGCCAATTCCCATAACACATCT 26783551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 CTCCGATGGTGGGACTTCTCAGCCTCCATAGTTGCATGAGCCAATTCCCATAACACATCT 1162

 26783552 CTTTATACATGTATACATTTGTATAAATAGACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT 26783611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||
     1163 CTTTATACATGTATACATTTGTATAAATAGAC----GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT 1218

 26783612 AGTCTGTTTCTCTGGAGAACGCTGACAATACAGCTTCTCAGGAGTAATCATAAAGGAGGT 26783671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 AGTCTGTTTCTCTGGAGAACGCTGACAATACAGCTTCTCAGGAGTAATCATAAAGGAGGT 1278

 26783672 CTGGTACCTAATGCTGAGCACTGTTGGTGTAGACAGTCGTAGCAGTGGGGTCTGTGCTAG 26783731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 CTGGTACCTAATGCTGAGCACTGTTGGTGTAGACAGTCGTAGCAGTGGGGTCTGTGCTAG 1338

 26783732 AGAAGCCTTGTGGTCTGGTTTGAGTATTGTTAATGGTAGCAGAGGCTCTAAGCCTGAACT 26783791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 AGAAGCCTTGTGGTCTGGTTTGAGTATTGTTAATGGTAGCAGAGGCTCTAAGCCTGAACT 1398

 26783792 CTGGCTGTCCCAGGGATTTTTCAAAAGACTTAATCAATTATTTTCTGCTAAAACTAGTTA 26783851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 CTGGCTGTCCCAGGGATTTTTCAAAAGACTTAATCAATTATTTTCTGCTAAAACTAGTTA 1458

 26783852 CAGTAAAGTATGTTATTTGCTATTAGGAATGCTAACTGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGC 26783911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 CAGTAAAGTATGTTATTTGCTATTAGGAATGCTAACTGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGC 1518

 26783912 CTGTAATCCTAACACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGA 26783971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CTGTAATCCTAACACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGA 1578

 26783972 CCAGCCTGGCCAACATGAGGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCCAGACG 26784031
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 CCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCCAGACG 1638

 26784032 TGGTGGTAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTCGAA 26784091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TGGTGGTAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTCGAA 1698

 26784092 CCTAGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCACCCTGGGCAAC 26784151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 CCTAGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCACCCTGGGCAAC 1758

 26784152 AAGAGCAAGACTCCATCTGAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAATGCTAACTGAT 26784211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AAGAGCAAGACTCCATCTGAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAATGCTAACTGAT 1818

 26784212 ACACACTGAGAGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTTTTAATTACAAAAATAGAATCACGGTCA 26784271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 ACACACTGAGAGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTTTTAATTACAAAAATAGAATCACGGTCA 1878

 26784272 GAGTCAGTGGCTTACGCCGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCCGGGGCAGGAAGATTACTT 26784331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 GAGTCAGTGGCTTACGCCGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCCGGGGCAGGAAGATTACTT 1938

 26784332 GAGGTCAGGGATTTGAGACAAGCCTGAGAAACATAGCAAGATCTCCTGTCTCCTCAAAAA 26784391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     1939 GAGGTCAGGGATTTGAGACAAGCCTGAGAAACATAGCAAGATCTCCTGTCTCCTC-AAAA 1997

 26784392 AAAAAAAAAAAATGTTGGCTAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGA 26784451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 AAAAAAAAAAAATGTTGGCTAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGA 2057

 26784452 GGCCAAGATGGGCAATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAA 26784511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 GGCCAAGATGGGCAATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAA 2117

 26784512 CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCT 26784571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCT 2177

 26784572 AGTTACTCAGGAGGCTGGGGCAGGAGAATCACTTGAACTCAGGAAGTAGAGGTTGCAATG 26784631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 AGTTACTCAGGAGGCTGGGGCAGGAGAATCACTTGAACTCAGGAAGTAGAGGTTGCAATG 2237

 26784632 AGCCAAGATTGCACCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACTCTGTCTCAAAAA 26784691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 AGCCAAGATTGCACCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACTCTGTCTCAAAAA 2297

 26784692 TAAATAATAAATAAATACTGAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTGCACCTGTAATCCC 26784751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 TAAATAATAAATAAATACTGAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTGCACCTGTAATCCC 2357

 26784752 AACTACTTGGGAGGGTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCTGCCATG 26784811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AACTACTTGGGAGGGTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCTGCCATG 2417

 26784812 AGCCATGATCATGCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGAGAGAGGAAGACCTTGTCTCAAAAA 26784871
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
     2418 AGCCATGATCATGCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGAGAGAGGAAGACCTTGTCTC--AAA 2475

 26784872 AAAAAAAAAAAAAAAGCAATCATTTTGCTGCATTCATTTAAGAGTGTACTGATGTACTGT 26784931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AAAAAAAAAAAAAAAGCAATCATTTTGCTGCATTCATTTAAGAGTGTACTGATGTACTGT 2535

 26784932 GAAGATTCCTCCATGTACCTTCATATAGGCCGTTCTTTTTAATGGCTGCATAATATTTCA 26784991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GAAGATTCCTCCATGTACCTTCATATAGGCCGTTCTTTTTAATGGCTGCATAATATTTCA 2595

 26784992 TTGTACAGATACTTCATAATTTATATATGTAATCCTTAACTATTAAAAATAAAGTTTTAA 26785051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 TTGTACAGATACTTCATAATTTATATATGTAATCCTTAACTATTAAAAATAAAGTTTTAA 2655

 26785052 TGAATATTCTTGTACAAAAAAAGTTTGGACATTTGAATAAGTCTGCAGGATAGATTTCCT 26785111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 TGAATATTCTTGTACAAAAAAAGTTTGGACATTTGAATAAGTCTGCAGGATAGATTTCCT 2715

 26785112 AGAAGGAAGATTCCTGAGTCAAAGGAATTTGCATTTAAAATTGGGATAAATCTCTCCCTC 26785171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 AGAAGGAAGATTCCTGAGTCAAAGGAATTTGCATTTAAAATTGGGATAAATCTCTCCCTC 2775

 26785172 CCCCTCCCCCTCCCCCGCTCCCTCTCCCCATGGTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCCAC 26785231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 CCCCTCCCCCTCCCCCGCTCCCTCTCCCCATGGTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCCAC 2835

 26785232 CGTCTCCCTCTGATGCCGAGCGGAAGCTGGACTGTACTGCTGCCATCTCGGCTCACTGCA 26785291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 CGTCTCCCTCTGATGCCGAGCGGAAGCTGGACTGTACTGCTGCCATCTCGGCTCACTGCA 2895

 26785292 ACCTC 26785296
          |||||
     2896 ACCTC 2900

Alignment time is 2.51648 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2771] =>      2771 nucs 'mol-32-1ef5-024029_2771'

Score:        2729
Aligned:      2775        nucs
Identic:      2770 (100%) nucs =>      1417 (100%)      1353 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26778968,26780385] EXCISED REGION [26783492,26784848]
 second seq =>  [       1,    1417] EXCISED REGION [    1418,    2771]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3106 nucs [26780386,26783491]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [26780386,26780387] to [26783492,26783493]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26778968 GGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTGTT 26779027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTGTT 60

 26779028 CTTTTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAG 26779087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAG 120

 26779088 ATAGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCT 26779147
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCT 179

 26779148 GGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 26779207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 GGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 239

 26779208 TCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAAT 26779267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAAT 299

 26779268 TTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTC 26779327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTC 359

 26779328 CTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGC 26779387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 CTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGC 419

 26779388 CACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGA 26779447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGA 479

 26779448 TAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGAT 26779507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGAT 539

 26779508 TCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTG 26779567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTG 599

 26779568 AGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCT 26779627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCT 659

 26779628 AGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTG 26779687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTG 719

 26779688 GCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCT 26779747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCT 779

 26779748 GAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTT 26779807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTT 839

 26779808 CTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTT 26779867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTT 899

 26779868 GGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTT 26779927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTT 959

 26779928 GAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTC 26779987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTC 1019

 26779988 CAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTAT 26780047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTAT 1079

 26780048 TTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGA 26780107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGA 1139

 26780108 ATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAA 26780167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAA 1199

 26780168 TCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAA 26780227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAA 1259

 26780228 ACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTC 26780287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTC 1319

 26780288 TGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGAC 26780347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGAC 1379

 26780348 ATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACA 26780385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACA 1417

EXCISED REGION

 26783492 CTCCGATGGTGGGACTTCTCAGCCTCCATAGTTGCATGAGCCAATTCCCATAACACATCT 26783551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 CTCCGATGGTGGGACTTCTCAGCCTCCATAGTTGCATGAGCCAATTCCCATAACACATCT 1477

 26783552 CTTTATACATGTATACATTTGTATAAATAGACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT 26783611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     1478 CTTTATACATGTATACATTTGTATAAATAGAC--GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT 1535

 26783612 AGTCTGTTTCTCTGGAGAACGCTGACAATACAGCTTCTCAGGAGTAATCATAAAGGAGGT 26783671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 AGTCTGTTTCTCTGGAGAACGCTGACAATACAGCTTCTCAGGAGTAATCATAAAGGAGGT 1595

 26783672 CTGGTACCTAATGCTGAGCACTGTTGGTGTAGACAGTCGTAGCAGTGGGGTCTGTGCTAG 26783731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 CTGGTACCTAATGCTGAGCACTGTTGGTGTAGACAGTCGTAGCAGTGGGGTCTGTGCTAG 1655

 26783732 AGAAGCCTTGTGGTCTGGTTTGAGTATTGTTAATGGTAGCAGAGGCTCTAAGCCTGAACT 26783791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AGAAGCCTTGTGGTCTGGTTTGAGTATTGTTAATGGTAGCAGAGGCTCTAAGCCTGAACT 1715

 26783792 CTGGCTGTCCCAGGGATTTTTCAAAAGACTTAATCAATTATTTTCTGCTAAAACTAGTTA 26783851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CTGGCTGTCCCAGGGATTTTTCAAAAGACTTAATCAATTATTTTCTGCTAAAACTAGTTA 1775

 26783852 CAGTAAAGTATGTTATTTGCTATTAGGAATGCTAACTGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGC 26783911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 CAGTAAAGTATGTTATTTGCTATTAGGAATGCTAACTGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGC 1835

 26783912 CTGTAATCCTAACACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGA 26783971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 CTGTAATCCTAACACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGA 1895

 26783972 CCAGCCTGGCCAACATGAGGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCCAGACG 26784031
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 CCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCCAGACG 1955

 26784032 TGGTGGTAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTCGAA 26784091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 TGGTGGTAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTCGAA 2015

 26784092 CCTAGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCACCCTGGGCAAC 26784151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 CCTAGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCACCCTGGGCAAC 2075

 26784152 AAGAGCAAGACTCCATCTGAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAATGCTAACTGAT 26784211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 AAGAGCAAGACTCCATCTGAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAATGCTAACTGAT 2135

 26784212 ACACACTGAGAGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTTTTAATTACAAAAATAGAATCACGGTCA 26784271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 ACACACTGAGAGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTTTTAATTACAAAAATAGAATCACGGTCA 2195

 26784272 GAGTCAGTGGCTTACGCCGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCCGGGGCAGGAAGATTACTT 26784331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 GAGTCAGTGGCTTACGCCGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCCGGGGCAGGAAGATTACTT 2255

 26784332 GAGGTCAGGGATTTGAGACAAGCCTGAGAAACATAGCAAGATCTCCTGTCTCCTCAAAAA 26784391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     2256 GAGGTCAGGGATTTGAGACAAGCCTGAGAAACATAGCAAGATCTCCTGTCTCCTC-AAAA 2314

 26784392 AAAAAAAAAAAATGTTGGCTAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGA 26784451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 AAAAAAAAAAAATGTTGGCTAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGA 2374

 26784452 GGCCAAGATGGGCAATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAA 26784511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 GGCCAAGATGGGCAATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAA 2434

 26784512 CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCT 26784571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCT 2494

 26784572 AGTTACTCAGGAGGCTGGGGCAGGAGAATCACTTGAACTCAGGAAGTAGAGGTTGCAATG 26784631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AGTTACTCAGGAGGCTGGGGCAGGAGAATCACTTGAACTCAGGAAGTAGAGGTTGCAATG 2554

 26784632 AGCCAAGATTGCACCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACTCTGTCTCAAAAA 26784691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AGCCAAGATTGCACCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACTCTGTCTCAAAAA 2614

 26784692 TAAATAATAAATAAATACTGAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTGCACCTGTAATCCC 26784751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TAAATAATAAATAAATACTGAAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTGCACCTGTAATCCC 2674

 26784752 AACTACTTGGGAGGGTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCTGCCATG 26784811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 AACTACTTGGGAGGGTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCTGCCATG 2734

 26784812 AGCCATGATCATGCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGAG 26784848
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 AGCCATGATCATGCCACTGCATTCCAGCCTGGGTGAG 2771

Alignment time is 2.26724 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2026] =>      2026 nucs 'mol-32-1f16-057367_2026'

Score:        2026
Aligned:      2026        nucs
Identic:      2026 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26779506,26781531]
 second seq =>  [       1,    2026]

 26779506 ATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATT 26779565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATT 60

 26779566 TGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTC 26779625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTC 120

 26779626 CTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCT 26779685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCT 180

 26779686 TGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATC 26779745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATC 240

 26779746 CTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTT 26779805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTT 300

 26779806 TTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTAT 26779865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTAT 360

 26779866 TTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTG 26779925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTG 420

 26779926 TTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCT 26779985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCT 480

 26779986 TCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATT 26780045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATT 540

 26780046 ATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTT 26780105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTT 600

 26780106 GAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACC 26780165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACC 660

 26780166 AATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACA 26780225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACA 720

 26780226 AAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATT 26780285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATT 780

 26780286 TCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGG 26780345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGG 840

 26780346 ACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTG 26780405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTG 900

 26780406 TCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGT 26780465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGT 960

 26780466 CACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTAC 26780525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTAC 1020

 26780526 CATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATA 26780585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATA 1080

 26780586 CTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATAC 26780645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATAC 1140

 26780646 CCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAAC 26780705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAAC 1200

 26780706 TTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCA 26780765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCA 1260

 26780766 ATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACA 26780825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACA 1320

 26780826 CCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTA 26780885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTA 1380

 26780886 GGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCC 26780945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCC 1440

 26780946 TGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACA 26781005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACA 1500

 26781006 GATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTT 26781065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTT 1560

 26781066 TCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAA 26781125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAA 1620

 26781126 GCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGA 26781185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGA 1680

 26781186 TTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGT 26781245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGT 1740

 26781246 TGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGC 26781305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGC 1800

 26781306 CCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCT 26781365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCT 1860

 26781366 TATCACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACC 26781425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATCACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACC 1920

 26781426 AAATATATATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGA 26781485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATATATATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGA 1980

 26781486 CATCCATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAG 26781531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATCCATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAG 2026

Alignment time is 1.45791 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    5895] =>      5895 nucs 'mol-32-1f16-167481_5895'

Score:        5836
Aligned:      5897        nucs
Identic:      5889 (100%) nucs =>      4874 (100%)      1015 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26775510,26780385] EXCISED REGION [26783492,26784509]
 second seq =>  [       1,    4879] EXCISED REGION [    4880,    5895]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3106 nucs [26780386,26783491]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [26780386,26780387] to [26783492,26783493]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26775510 AGACCAACCTGGGCAGCAGAGTGAGACCCTATCTCTACAATACATATATTTTAAAATAAA 26775569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACCAACCTGGGCAGCAGAGTGAGACCCTATCTCTACAATACATATATTTTAAAATAAA 60

 26775570 TAGATAAAATAATTGAGACAGGGTCTTGTTATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGG 26775629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGATAAAATAATTGAGACAGGGTCTTGTTATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGG 120

 26775630 ACCAGCCTGAGCTGGTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGATTT 26775689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCAGCCTGAGCTGGTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGATTT 180

 26775690 CAATTATTTAAAAAAAGAAAAGACAAGAGTGTTACCAGAAATAAAAAGAGACATGACCAT 26775749
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      181 CAATTATTTAAAAAAAGAAAAGACAAGAGTGTTACCAGAAATAAAAAGAGAAATGACCAT 240

 26775750 AATGACGAAACAGTCAATCCTTCAGAAAGCTATACCAATGTTAAACATGTTTGCACCTAT 26775809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGACGAAACAGTCAATCCTTCAGAAAGCTATACCAATGTTAAACATGTTTGCACCTAT 300

 26775810 AACAAAGATTCAAAATATATGAAAAGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGC 26775869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAAAGATTCAAAATATATGAAAAGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGC 360

 26775870 ACTTTGGGAGGCTAAGGCAGGCCGACCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCT 26775929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTTGGGAGGCTAAGGCAGGCCGACCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCT 420

 26775930 AACATGGTGAAACCTCGTCTCTATTAAAAATATAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGTTGCAT 26775989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACATGGTGAAACCTCGTCTCTATTAAAAATATAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGTTGCAT 480

 26775990 GCCTGTAGTCCCAGCTTACTCCAGAGGCTAAGACAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAAGC 26776049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTGTAGTCCCAGCTTACTCCAGAGGCTAAGACAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAAGC 540

 26776050 GGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACAGCAGACCAAGACTGTTTCAAAAAAAAAGA 26776109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACAGCAGACCAAGACTGTTTCAAAAAAAAAGA 600

 26776110 CAAAAACAAAAAATATATATATGAAGAAAAACTGACAGAGCAAAAGGGAGAAATAAGCAA 26776169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAAACAAAAAATATATATATGAAGAAAAACTGACAGAGCAAAAGGGAGAAATAAGCAA 660

 26776170 ATTCACAACTGTAGTTGGAGATGTTTACACCTCTCTCAATAATTGATGGATCAAGTAGAT 26776229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTCACAACTGTAGTTGGAGATGTTTACACCTCTCTCAATAATTGATGGATCAAGTAGAT 720

 26776230 AATAAATCAGAAAACATAGATGATTTGAACAATTCTAACAACAAACTTGACCTAATTGAC 26776289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATAAATCAGAAAACATAGATGATTTGAACAATTCTAACAACAAACTTGACCTAATTGAC 780

 26776290 ATTTATAAAATGCTATTTACAGCAACTGCAAAATACACATTCTTTTCAAATGCAACTAGA 26776349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTATAAAATGCTATTTACAGCAACTGCAAAATACACATTCTTTTCAAATGCAACTAGA 840

 26776350 ATGTCCACCCAGATAGATCATATTCTGGTCCATGGTCTATTTATTGAAGCTCGACAAATT 26776409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGTCCACCCAGATAGATCATATTCTGGTCCATGGTCTATTTATTGAAGCTCGACAAATT 900

 26776410 TTACCAGATTTTTCATGTGGGATGAAGCCAACATGGTCCTCTAAAGGAAATTTATAGCTT 26776469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTACCAGATTTTTCATGTGGGATGAAGCCAACATGGTCCTCTAAAGGAAATTTATAGCTT 960

 26776470 TAAATGCGTATATTAGAAAAGCAAGGGGCTGATAATCAGATAGGTCTTAAATTAAGAAGT 26776529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAATGCGTATATTAGAAAAGCAAGGGGCTGATAATCAGATAGGTCTTAAATTAAGAAGT 1020

 26776530 CAGAAAAAGAATACTGAAAAAAAAAGAAAGCAAGCATGTTCCCATGCTTCCACCAGGGAA 26776589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGAAAAAGAATACTGAAAAAAAAAGAAAGCAAGCATGTTCCCATGCTTCCACCAGGGAA 1080

 26776590 CACAAGAATGGTTCCATTGAACTGGAAGTTGACACTGTCTCCTAGACTTTTGGGGCTTTT 26776649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACAAGAATGGTTCCATTGAACTGGAAGTTGACACTGTCTCCTAGACTTTTGGGGCTTTT 1140

 26776650 CTACCATTGAATAATCAGGAAAAAGATGAGATCAAAATATTGGATCATTATTGGTTATTG 26776709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1141 CTACCATTGAATAATCAGGAAAAAGATGAGATCAAAATATTGGATTATTATTGGTTATTG 1200

 26776710 ATCCTGATTTTCAAAAATGTGAAATAGAAGAAATAGGGTTGCTGCTGTACAATGGGAGCA 26776769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCCTGATTTTCAAAAATGTGAAATAGAAGAAATAGGGTTGCTGCTGTACAATGGGAGCA 1260

 26776770 AAAAAAAAGAGCTACTTAGAATCTAGGGGAATATCTTGCAGATGGCTCCTAATATCATAT 26776829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAAAAAGAGCTACTTAGAATCTAGGGGAATATCTTGCAGATGGCTCCTAATATCATAT 1320

 26776830 TTAGGGGTTAAAAGTTAATAGAAAGCAACCTCATAAGGGCACCAAGGGCCCAGATTCTTT 26776889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAGGGGTTAAAAGTTAATAGAAAGCAACCTCATAAGGGCACCAAGGGCCCAGATTCTTT 1380

 26776890 AGAAATAAAGGTCTGGGTCACACCACCAGATGAAGAGCTGCTGGGCTGAGTTGCTGGGCT 26776949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAATAAAGGTCTGGGTCACACCACCAGATGAAGAGCTGCTGGGCTGAGTTGCTGGGCT 1440

 26776950 GAGCTGCTGGTTGTGAGCTAAGAGAGCATGGAATGAGTAGTGGAAGGAGGAAATTACAAA 26777009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGCTGCTGGTTGTGAGCTAAGAGAGCATGGAATGAGTAGTGGAAGGAGGAAATTACAAA 1500

 26777010 GATCAACTCTGGCCTAGCGATCAGTTGCATAAATGAGGACTATAGTATGCACCCATATTT 26777069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATCAACTCTGGCCTAGCGATCAGTTGCATAAATGAGGACTATAGTATGCACCCATATTT 1560

 26777070 TCTTATTTGCTGTGTTGACATTTTTTATGAATTTTCCCCATTTTATAAAAATATTTATTT 26777129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTTATTTGCTGTGTTGACATTTTTTATGAATTTTCCCCATTTTATAAAAATATTTATTT 1620

 26777130 TTTGTTAGTTAACTTTACAATCTATTTGCAGAATACCAAGGCAGGACTATGACAGAATTA 26777189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGTTAGTTAACTTTACAATCTATTTGCAGAATACCAAGGCAGGACTATGACAGAATTA 1680

 26777190 AAAGAAAATGGGACATTACCCAGAGATCCTAGTCTTGGAGCTAGATGCAGTAAGTCTTGG 26777249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAGAAAATGGGACATTACCCAGAGATCCTAGTCTTGGAGCTAGATGCAGTAAGTCTTGG 1740

 26777250 GGCTTTCAAATGTCCTCCTATGGGGGGAAGAGTAAGTTCATTTTCATTTGTACACAGGAT 26777309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTTTCAAATGTCCTCCTATGGGGGGAAGAGTAAGTTCATTTTCATTTGTACACAGGAT 1800

 26777310 AAATAAATTATGAGTTAGAAGAGTTTGTTGTTATTGTTTTGGGAATTTAAATATGAAAGC 26777369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATAAATTATGAGTTAGAAGAGTTTGTTGTTATTGTTTTGGGAATTTAAATATGAAAGC 1860

 26777370 AGATGTTGGGCAGCCAAGGGGAGGAGTGCAGTGAACATGCATCATGCTTTGTGTATCTTC 26777429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGATGTTGGGCAGCCAAGGGGAGGAGTGCAGTGAACATGCATCATGCTTTGTGTATCTTC 1920

 26777430 TGAATAGGTTTTCTATTTGGGGAAAACTAGGATCTTTTGAATAGCTTTCCTATTTGGGGG 26777489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAATAGGTTTTCTATTTGGGGAAAACTAGGATCTTTTGAATAGCTTTCCTATTTGGGGG 1980

 26777490 GCATTCCTGACATTATGCAGTTCATCTTACCAACAGAGGAGCTAGAATTTCTTTTCCCTT 26777549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCATTCCTGACATTATGCAGTTCATCTTACCAACAGAGGAGCTAGAATTTCTTTTCCCTT 2040

 26777550 GCTGCTAGAACTCAGGCTGTGACTGAGGCTCTATACTATTTTTTTAACTTTTATTTAGGT 26777609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTGCTAGAACTCAGGCTGTGACTGAGGCTCTATACTATTTTTTTAACTTTTATTTAGGT 2100

 26777610 TGAGGGGTACCTGTGCAAGCTTGTTATATAGGTAAACTCAGGTCACAGGAGTTTGTTGTA 26777669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGAGGGGTACCTGTGCAAGCTTGTTATATAGGTAAACTCAGGTCACAGGAGTTTGTTGTA 2160

 26777670 CAGATTATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTTGTACCCAATAGTTATTTTTTCTGATCAC 26777729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGATTATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTTGTACCCAATAGTTATTTTTTCTGATCAC 2220

 26777730 CTCCCTACTCCCATCCTCCACCCTCAAGTAGGCCTCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGT 26777789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCCCTACTCCCATCCTCCACCCTCAAGTAGGCCTCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGT 2280

 26777790 GTCCATAAGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGTGAATTTGGTTTT 26777849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTCCATAAGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGTGAATTTGGTTTT 2340

 26777850 CTGTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCCATGTTCCCACAAA 26777909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCCATGTTCCCACAAA 2400

 26777910 AGACATGATCTCATTCTTTTTATGGCTGCATAATATTCCATAGTGTATATATACCACATT 26777969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGACATGATCTCATTCTTTTTATGGCTGCATAATATTCCATAGTGTATATATACCACATT 2460

 26777970 TCCTTTATCCAGTCTGTCACTGATGGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTG 26778029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCTTTATCCAGTCTGTCACTGATGGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTG 2520

 26778030 AATAGTGCTTCATTGAACATTCGCATGCATGTGTCTTTATGGTAGAATGATTTCTATTCC 26778089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATAGTGCTTCATTGAACATTCGCATGCATGTGTCTTTATGGTAGAATGATTTCTATTCC 2580

 26778090 TTTGGGTATATACCCAATAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTTTAGCACT 26778149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTGGGTATATACCCAATAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTTTAGCACT 2640

 26778150 TTGAGGAATCACCACACTGCTTTCCATAAAGGTTGAACTAATTTACACTCCCACCAAGAG 26778209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGAGGAATCACCACACTGCTTTCCATAAAGGTTGAACTAATTTACACTCCCACCAAGAG 2700

 26778210 CGTGTAAGTGTTCCCTCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCTGTTATTTTTTGACTTTTTA 26778269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CGTGTAAGTGTTCCCTCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCTGTTATTTTTTGACTTTTTA 2760

 26778270 ATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCT 26778329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCT 2820

 26778330 CTAATGATCAGTGATATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTTGGCCGCATGTATGTCTTGT 26778389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAATGATCAGTGATATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTTGGCCGCATGTATGTCTTGT 2880

 26778390 TTTGAAAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGGTTTTTTT 26778449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTGAAAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGGTTTTTTT 2940

 26778450 CTTGTAAATTTGTTTTAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATTAGACCTTTGTCACATGCAT 26778509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTTGTAAATTTGTTTTAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATTAGACCTTTGTCACATGCAT 3000

 26778510 AGTTTGTTAATATTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTT 26778569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGTTTGTTAATATTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTT 3060

 26778570 TTGCTGTGCAGAAGCTCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTA 26778629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTGCTGTGCAGAAGCTCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTA 3120

 26778630 CGATTGCTTTTGGTGTTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTTCCTATGTCCAGAATGGTAT 26778689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CGATTGCTTTTGGTGTTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTTCCTATGTCCAGAATGGTAT 3180

 26778690 TGCTTGGGTTGTCTTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCTTGAGTTTATTTTTGCTTAT 26778749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGCTTGGGTTGTCTTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCTTGAGTTTATTTTTGCTTAT 3240

 26778750 GGTGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCCTACCCAGTTCTGCATATCC 26778809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGTGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCCTACCCAGTTCTGCATATCC 3300

 26778810 CAGCACCATTTATTGAATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGACAGCTTTGTTG 26778869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAGCACCATTTATTGAATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGACAGCTTTGTTG 3360

 26778870 AAGATCAGATGGTTGTAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTTATCTATTCCATTCTGTTGG 26778929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAGATCAGATGGTTGTAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTTATCTATTCCATTCTGTTGG 3420

 26778930 TCTATGTGTTTGTTTTTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTAT 26778989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTATGTGTTTGTTTTTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTAT 3480

 26778990 AGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTTTTCACTCAGAATTGCCTTG 26779049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTTTTCACTCAGAATTGCCTTG 3540

 26779050 GCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATAGGTTGTTTTTTTTTTTTTT 26779109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATAGGTTGTTTTTTTTTTTTTT 3600

 26779110 TTTTTTT---GAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATC 26779166
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATC 3660

 26779167 TTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCA 26779226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCA 3720

 26779227 GTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAG 26779286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAG 3780

 26779287 AGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGC 26779346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGC 3840

 26779347 CCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGAT 26779406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGAT 3900

 26779407 AGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCT 26779466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCT 3960

 26779467 GTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCAT 26779526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCAT 4020

 26779527 GAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCT 26779586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCT 4080

 26779587 CATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTG 26779646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTG 4140

 26779647 TGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGT 26779706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGT 4200

 26779707 AAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGT 26779766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGT 4260

 26779767 TTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATC 26779826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATC 4320

 26779827 ATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTC 26779886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTC 4380

 26779887 TCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGA 26779946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGA 4440

 26779947 GGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAAT 26780006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAAT 4500

 26780007 ATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCA 26780066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCA 4560

 26780067 ATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTT 26780126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTT 4620

 26780127 CTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACA 26780186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACA 4680

 26780187 GAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACT 26780246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACT 4740

 26780247 TTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAG 26780306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAG 4800

 26780307 TTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATA 26780366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATA 4860

 26780367 ATTCAATTCAATTCTGACA 26780385
          |||||||||||||||||||
     4861 ATTCAATTCAATTCTGACA 4879

EXCISED REGION

 26783492 CTCCGATGGTGGGACTTCTCAGCCTCCATAGTTGCATGAGCCAATTCCCATAACACATCT 26783551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 CTCCGATGGTGGGACTTCTCAGCCTCCATAGTTGCATGAGCCAATTCCCATAACACATCT 4939

 26783552 CTTTATACATGTATACATTTGTATAAATAGACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT 26783611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     4940 CTTTATACATGTATACATTTGTATAAATAGAC--GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT 4997

 26783612 AGTCTGTTTCTCTGGAGAACGCTGACAATACAGCTTCTCAGGAGTAATCATAAAGGAGGT 26783671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 AGTCTGTTTCTCTGGAGAACGCTGACAATACAGCTTCTCAGGAGTAATCATAAAGGAGGT 5057

 26783672 CTGGTACCTAATGCTGAGCACTGTTGGTGTAGACAGTCGTAGCAGTGGGGTCTGTGCTAG 26783731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 CTGGTACCTAATGCTGAGCACTGTTGGTGTAGACAGTCGTAGCAGTGGGGTCTGTGCTAG 5117

 26783732 AGAAGCCTTGTGGTCTGGTTTGAGTATTGTTAATGGTAGCAGAGGCTCTAAGCCTGAACT 26783791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 AGAAGCCTTGTGGTCTGGTTTGAGTATTGTTAATGGTAGCAGAGGCTCTAAGCCTGAACT 5177

 26783792 CTGGCTGTCCCAGGGATTTTTCAAAAGACTTAATCAATTATTTTCTGCTAAAACTAGTTA 26783851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 CTGGCTGTCCCAGGGATTTTTCAAAAGACTTAATCAATTATTTTCTGCTAAAACTAGTTA 5237

 26783852 CAGTAAAGTATGTTATTTGCTATTAGGAATGCTAACTGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGC 26783911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 CAGTAAAGTATGTTATTTGCTATTAGGAATGCTAACTGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGC 5297

 26783912 CTGTAATCCTAACACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGA 26783971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 CTGTAATCCTAACACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGA 5357

 26783972 CCAGCCTGGCCAACATGAGGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCCAGACG 26784031
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 CCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCCAGACG 5417

 26784032 TGGTGGTAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTCGAA 26784091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 TGGTGGTAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTCGAA 5477

 26784092 CCTAGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCACCCTGGGCAAC 26784151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 CCTAGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCACCCTGGGCAAC 5537

 26784152 AAGAGCAAGACTCCATCTGAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAATGCTAACTGAT 26784211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 AAGAGCAAGACTCCATCTGAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAATGCTAACTGAT 5597

 26784212 ACACACTGAGAGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTTTTAATTACAAAAATAGAATCACGGTCA 26784271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 ACACACTGAGAGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTTTTAATTACAAAAATAGAATCACGGTCA 5657

 26784272 GAGTCAGTGGCTTACGCCGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCCGGGGCAGGAAGATTACTT 26784331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5658 GAGTCAGTGGCTTACGCCGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCCGGGGCAGGAAGATTACTT 5717

 26784332 GAGGTCAGGGATTTGAGACAAGCCTGAGAAACATAGCAAGATCTCCTGTCTCCTCAAAAA 26784391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5718 GAGGTCAGGGATTTGAGACAAGCCTGAGAAACATAGCAAGATCTCCTGTCTCCTCAAAAA 5777

 26784392 AAAAAAAAAAAATGTTGGCTAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGA 26784451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5778 AAAAAAAAAAAATGTTGGCTAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGA 5837

 26784452 GGCCAAGATGGGCAATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGA 26784509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5838 GGCCAAGATGGGCAATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGA 5895

Alignment time is 4.84128 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2619] =>      2619 nucs 'mol-32-1f21-014303_2619'

Score:        2619
Aligned:      2619        nucs
Identic:      2619 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26779117,26781735]
 second seq =>  [       1,    2619]

 26779117 GAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACT 26779176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACT 60

 26779177 GCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGA 26779236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGA 120

 26779237 TTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTT 26779296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTT 180

 26779297 TCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGC 26779356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGC 240

 26779357 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCT 26779416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCT 300

 26779417 AGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTT 26779476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTT 360

 26779477 TGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTT 26779536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTT 420

 26779537 CCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAG 26779596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAG 480

 26779597 ATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGT 26779656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGT 540

 26779657 GAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGC 26779716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGC 600

 26779717 TAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTG 26779776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTG 660

 26779777 AAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAAC 26779836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAAC 720

 26779837 AAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTA 26779896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTA 780

 26779897 TTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTT 26779956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTT 840

 26779957 GTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGG 26780016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGG 900

 26780017 CTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTT 26780076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTT 960

 26780077 TATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTAT 26780136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTAT 1020

 26780137 TGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGG 26780196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGG 1080

 26780197 GCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCC 26780256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCC 1140

 26780257 TATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCC 26780316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCC 1200

 26780317 CACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCA 26780376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCA 1260

 26780377 ATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCA 26780436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCA 1320

 26780437 CAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTG 26780496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTG 1380

 26780497 ACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATA 26780556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATA 1440

 26780557 AGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGT 26780616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGT 1500

 26780617 TTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGT 26780676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGT 1560

 26780677 GCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCA 26780736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCA 1620

 26780737 GTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATA 26780796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATA 1680

 26780797 AAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGG 26780856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGG 1740

 26780857 TGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGC 26780916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGC 1800

 26780917 ACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATT 26780976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATT 1860

 26780977 AAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGG 26781036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGG 1920

 26781037 GCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAA 26781096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAA 1980

 26781097 GCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTA 26781156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTA 2040

 26781157 TGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAA 26781216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAA 2100

 26781217 GCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTA 26781276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTA 2160

 26781277 ATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAG 26781336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAG 2220

 26781337 CCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAA 26781396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAA 2280

 26781397 GTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACCAAATATATATTTCACAATATCACAAACAGGA 26781456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACCAAATATATATTTCACAATATCACAAACAGGA 2340

 26781457 AATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATCCATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGA 26781516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATCCATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGA 2400

 26781517 GTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGACTTACACCAGAGCCTCCCAACCTCCAC 26781576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGACTTACACCAGAGCCTCCCAACCTCCAC 2460

 26781577 CCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGGAGTTACATCATCAGGTCTCCTGGTTCC 26781636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGGAGTTACATCATCAGGTCTCCTGGTTCC 2520

 26781637 CAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACACGCTGGCTTTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATC 26781696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACACGCTGGCTTTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATC 2580

 26781697 CTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTCAAGTGT 26781735
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTCAAGTGT 2619

Alignment time is 1.90053 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2134] =>      2134 nucs 'mol-32-1f21-077886_2134'

Score:        2134
Aligned:      2134        nucs
Identic:      2134 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26779256,26781389]
 second seq =>  [       1,    2134]

 26779256 TGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCT 26779315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCT 60

 26779316 GGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 26779375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 120

 26779376 ACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCA 26779435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCA 180

 26779436 TTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTT 26779495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTT 240

 26779496 AATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCT 26779555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCT 300

 26779556 ATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTT 26779615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTT 360

 26779616 AGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTG 26779675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTG 420

 26779676 ATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTG 26779735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTG 480

 26779736 ATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGA 26779795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGA 540

 26779796 CTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCT 26779855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCT 600

 26779856 CTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTC 26779915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTC 660

 26779916 CAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAA 26779975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAA 720

 26779976 GGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGAT 26780035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGAT 780

 26780036 GGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACAT 26780095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACAT 840

 26780096 GAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGAT 26780155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGAT 900

 26780156 TGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACA 26780215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACA 960

 26780216 AAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCA 26780275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCA 1020

 26780276 GTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAAT 26780335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAAT 1080

 26780336 TCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCT 26780395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCT 1140

 26780396 GGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTC 26780455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTC 1200

 26780456 AGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTG 26780515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTG 1260

 26780516 GGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACT 26780575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACT 1320

 26780576 CAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCAT 26780635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCAT 1380

 26780636 CATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGA 26780695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGA 1440

 26780696 ATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACC 26780755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACC 1500

 26780756 ACCCTGGGCAATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATG 26780815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCCTGGGCAATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATG 1560

 26780816 GAGGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGC 26780875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGC 1620

 26780876 CGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAG 26780935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAG 1680

 26780936 AGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCAC 26780995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCAC 1740

 26780996 AAAGGATACAGATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAG 26781055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAGGATACAGATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAG 1800

 26781056 CACGGAGCTTTCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAG 26781115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACGGAGCTTTCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAG 1860

 26781116 CTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAA 26781175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAA 1920

 26781176 ACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCT 26781235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCT 1980

 26781236 CCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCT 26781295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCT 2040

 26781296 GGTGACCAGCCCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAA 26781355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTGACCAGCCCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAA 2100

 26781356 AAGATGCTCTTATCACTGTGGAGATTCCAAGGGT 26781389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGATGCTCTTATCACTGTGGAGATTCCAAGGGT 2134

Alignment time is 2.52481 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2342] =>      2342 nucs 'mol-32-2105-024290_2342'

Score:        2320
Aligned:      2344        nucs
Identic:      2341 (100%) nucs =>      1253 (100%)      1088 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26779133,26780385] EXCISED REGION [26783492,26784582]
 second seq =>  [       1,    1253] EXCISED REGION [    1254,    2342]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3106 nucs [26780386,26783491]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [26780386,26780387] to [26783492,26783493]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26779133 CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCC 26779192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCC 60

 26779193 AGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCA 26779252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCA 120

 26779253 CCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAG 26779312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAG 180

 26779313 GCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 26779372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 240

 26779373 ATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATG 26779432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATG 300

 26779433 TCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCAT 26779492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCAT 360

 26779493 TTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTA 26779552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTA 420

 26779553 TCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTG 26779612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTG 480

 26779613 GTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCC 26779672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCC 540

 26779673 CTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATG 26779732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATG 600

 26779733 TTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTG 26779792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTG 660

 26779793 AGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTT 26779852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTT 720

 26779853 CCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGAC 26779912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGAC 780

 26779913 TTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTT 26779972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTT 840

 26779973 CAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATA 26780032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATA 900

 26780033 GATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAA 26780092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAA 960

 26780093 CATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAA 26780152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAA 1020

 26780153 GATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTA 26780212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTA 1080

 26780213 ACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCAC 26780272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCAC 1140

 26780273 TCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTC 26780332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTC 1200

 26780333 AATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACA 26780385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACA 1253

EXCISED REGION

 26783492 CTCCGATGGTGGGACTTCTCAGCCTCCATAGTTGCATGAGCCAATTCCCATAACACATCT 26783551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CTCCGATGGTGGGACTTCTCAGCCTCCATAGTTGCATGAGCCAATTCCCATAACACATCT 1313

 26783552 CTTTATACATGTATACATTTGTATAAATAGACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT 26783611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     1314 CTTTATACATGTATACATTTGTATAAATAGAC--GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT 1371

 26783612 AGTCTGTTTCTCTGGAGAACGCTGACAATACAGCTTCTCAGGAGTAATCATAAAGGAGGT 26783671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AGTCTGTTTCTCTGGAGAACGCTGACAATACAGCTTCTCAGGAGTAATCATAAAGGAGGT 1431

 26783672 CTGGTACCTAATGCTGAGCACTGTTGGTGTAGACAGTCGTAGCAGTGGGGTCTGTGCTAG 26783731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 CTGGTACCTAATGCTGAGCACTGTTGGTGTAGACAGTCGTAGCAGTGGGGTCTGTGCTAG 1491

 26783732 AGAAGCCTTGTGGTCTGGTTTGAGTATTGTTAATGGTAGCAGAGGCTCTAAGCCTGAACT 26783791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 AGAAGCCTTGTGGTCTGGTTTGAGTATTGTTAATGGTAGCAGAGGCTCTAAGCCTGAACT 1551

 26783792 CTGGCTGTCCCAGGGATTTTTCAAAAGACTTAATCAATTATTTTCTGCTAAAACTAGTTA 26783851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 CTGGCTGTCCCAGGGATTTTTCAAAAGACTTAATCAATTATTTTCTGCTAAAACTAGTTA 1611

 26783852 CAGTAAAGTATGTTATTTGCTATTAGGAATGCTAACTGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGC 26783911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 CAGTAAAGTATGTTATTTGCTATTAGGAATGCTAACTGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGC 1671

 26783912 CTGTAATCCTAACACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGA 26783971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CTGTAATCCTAACACTTTGGGAGGCCGAGGCTGGCGGATTACGAGGTCAGGAGTTCAAGA 1731

 26783972 CCAGCCTGGCCAACATGAGGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCCAGACG 26784031
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 CCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCCAGACG 1791

 26784032 TGGTGGTAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTCGAA 26784091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TGGTGGTAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTCGAA 1851

 26784092 CCTAGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCACCCTGGGCAAC 26784151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 CCTAGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCATTGCACTCCACCCTGGGCAAC 1911

 26784152 AAGAGCAAGACTCCATCTGAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAATGCTAACTGAT 26784211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 AAGAGCAAGACTCCATCTGAAAAACAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAATGCTAACTGAT 1971

 26784212 ACACACTGAGAGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTTTTAATTACAAAAATAGAATCACGGTCA 26784271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 ACACACTGAGAGTTTTGATTGTTGTTGTTGTTTTTAATTACAAAAATAGAATCACGGTCA 2031

 26784272 GAGTCAGTGGCTTACGCCGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCCGGGGCAGGAAGATTACTT 26784331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 GAGTCAGTGGCTTACGCCGTAATCCCAGCATTTTGAGAGGCCGGGGCAGGAAGATTACTT 2091

 26784332 GAGGTCAGGGATTTGAGACAAGCCTGAGAAACATAGCAAGATCTCCTGTCTCCTCAAAAA 26784391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 GAGGTCAGGGATTTGAGACAAGCCTGAGAAACATAGCAAGATCTCCTGTCTCCTCAAAAA 2151

 26784392 AAAAAAAAAAAATGTTGGCTAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGA 26784451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 AAAAAAAAAAAATGTTGGCTAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGA 2211

 26784452 GGCCAAGATGGGCAATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAA 26784511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 GGCCAAGATGGGCAATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAA 2271

 26784512 CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCT 26784571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCACGTGCCTGTAGTCCT 2331

 26784572 AGTTACTCAGG 26784582
          |||||||||||
     2332 AGTTACTCAGG 2342

Alignment time is 2.33149 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2319] =>      2319 nucs 'mol-32-2378-047825_2319'

Score:        2307
Aligned:      2318        nucs
Identic:      2317 (100%) nucs =>      1776 (100%)       541 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26779538,26781313] EXCISED REGION [26781315,26781856]
 second seq =>  [       1,    1776] EXCISED REGION [    1778,    2319]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [26781314,26781314]
 second seq =>         1 nucs [1777,1777]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1775,1776] to [1776,1777]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26779538 CATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGA 26779597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGA 60

 26779598 TGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTG 26779657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTG 120

 26779658 AATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCT 26779717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCT 180

 26779718 AGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGA 26779777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGA 240

 26779778 AGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACA 26779837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACA 300

 26779838 AGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTAT 26779897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTAT 360

 26779898 TGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTG 26779957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTG 420

 26779958 TCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGC 26780017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGC 480

 26780018 TGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTT 26780077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTT 540

 26780078 ATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATT 26780137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATT 600

 26780138 GAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGG 26780197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGG 660

 26780198 CAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCT 26780257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCT 720

 26780258 ATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCC 26780317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCC 780

 26780318 ACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAA 26780377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAA 840

 26780378 TTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCAC 26780437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCAC 900

 26780438 AAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGA 26780497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGA 960

 26780498 CCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAA 26780557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAA 1020

 26780558 GACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTT 26780617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTT 1080

 26780618 TATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTG 26780677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTG 1140

 26780678 CAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAG 26780737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAG 1200

 26780738 TCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAA 26780797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAA 1260

 26780798 AAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGT 26780857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGT 1320

 26780858 GGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCA 26780917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCA 1380

 26780918 CTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTA 26780977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTA 1440

 26780978 AATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGG 26781037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGG 1500

 26781038 CAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAG 26781097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAG 1560

 26781098 CACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTAT 26781157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTAT 1620

 26781158 GGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAG 26781217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAG 1680

 26781218 CTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAA 26781277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAA 1740

 26781278 TCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCC 26781313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCC 1776

EXCISED REGION

 26781315 GAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACTGT 26781374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACTGT 1837

 26781375 GGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACCAAATATATA 26781434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 GGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACCAAATATATA 1897

 26781435 TTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATCCATCT 26781494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATCCATCT 1957

 26781495 TCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGACTTAC 26781554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 TCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGACTTAC 2017

 26781555 ACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGGAGTTA 26781614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 ACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGGAGTTA 2077

 26781615 CATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACACGCTGGCTTT 26781674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACACGCTGGCTTT 2137

 26781675 GGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTCAAGTG 26781734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2138 GGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAATACTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTCAAGTG 2197

 26781735 TGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCAAGAGGTCCTCCCAACATGTGCCCAAGGTAG 26781794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCAAGAGGTCCTCCCAACATGTGCCCAAGGTAG 2257

 26781795 TTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTAGGGAGATGTTAAGACATCAGTCAATACATA 26781854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTAGGGAGATGTTAAGACATCAGTCAATACATA 2317

 26781855 TG 26781856
          ||
     2318 TG 2319

Alignment time is 2.42687 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    4516] =>      4516 nucs 'mol-32-23a4-013038_4516'

Score:        4494
Aligned:      4516        nucs
Identic:      4514 (100%) nucs =>      2252 (100%)      2262 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26776843,26779095] EXCISED REGION [26779098,26781360]
 second seq =>  [       1,    2253] EXCISED REGION [    2254,    4516]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [26779096,26779097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [26779096,26779114] to [26779098,26779116]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [26779096,26779096] to [26779097,26779097]
 second seq =>         0 nucs

 26776843 GTTAATAGAAAGCAACCTCATAAGGGCACCAAGGGCCCAGATTCTTTAGAAATAAAGGTC 26776902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTAATAGAAAGCAACCTCATAAGGGCACCAAGGGCCCAGATTCTTTAGAAATAAAGGTC 60

 26776903 TGGGTCACACCACCAGATGAAGAGCTGCTGGGCTGAGTTGCTGGGCTGAGCTGCTGGTTG 26776962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGTCACACCACCAGATGAAGAGCTGCTGGGCTGAGTTGCTGGGCTGAGCTGCTGGTTG 120

 26776963 TGAGCTAAGAGAGCATGGAATGAGTAGTGGAAGGAGGAAATTACAAAGATCAACTCTGGC 26777022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGCTAAGAGAGCATGGAATGAGTAGTGGAAGGAGGAAATTACAAAGATCAACTCTGGC 180

 26777023 CTAGCGATCAGTTGCATAAATGAGGACTATAGTATGCACCCATATTTTCTTATTTGCTGT 26777082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAGCGATCAGTTGCATAAATGAGGACTATAGTATGCACCCATATTTTCTTATTTGCTGT 240

 26777083 GTTGACATTTTTTATGAATTTTCCCCATTTTATAAAAATATTTATTTTTTGTTAGTTAAC 26777142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTGACATTTTTTATGAATTTTCCCCATTTTATAAAAATATTTATTTTTTGTTAGTTAAC 300

 26777143 TTTACAATCTATTTGCAGAATACCAAGGCAGGACTATGACAGAATTAAAAGAAAATGGGA 26777202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTACAATCTATTTGCAGAATACCAAGGCAGGACTATGACAGAATTAAAAGAAAATGGGA 360

 26777203 CATTACCCAGAGATCCTAGTCTTGGAGCTAGATGCAGTAAGTCTTGGGGCTTTCAAATGT 26777262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTACCCAGAGATCCTAGTCTTGGAGCTAGATGCAGTAAGTCTTGGGGCTTTCAAATGT 420

 26777263 CCTCCTATGGGGGGAAGAGTAAGTTCATTTTCATTTGTACACAGGATAAATAAATTATGA 26777322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCCTATGGGGGGAAGAGTAAGTTCATTTTCATTTGTACACAGGATAAATAAATTATGA 480

 26777323 GTTAGAAGAGTTTGTTGTTATTGTTTTGGGAATTTAAATATGAAAGCAGATGTTGGGCAG 26777382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTAGAAGAGTTTGTTGTTATTGTTTTGGGAATTTAAATATGAAAGCAGATGTTGGGCAG 540

 26777383 CCAAGGGGAGGAGTGCAGTGAACATGCATCATGCTTTGTGTATCTTCTGAATAGGTTTTC 26777442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAAGGGGAGGAGTGCAGTGAACATGCATCATGCTTTGTGTATCTTCTGAATAGGTTTTC 600

 26777443 TATTTGGGGAAAACTAGGATCTTTTGAATAGCTTTCCTATTTGGGGGGCATTCCTGACAT 26777502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTTGGGGAAAACTAGGATCTTTTGAATAGCTTTCCTATTTGGGGGGCATTCCTGACAT 660

 26777503 TATGCAGTTCATCTTACCAACAGAGGAGCTAGAATTTCTTTTCCCTTGCTGCTAGAACTC 26777562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATGCAGTTCATCTTACCAACAGAGGAGCTAGAATTTCTTTTCCCTTGCTGCTAGAACTC 720

 26777563 AGGCTGTGACTGAGGCTCTATACTATTTTTTTAACTTTTATTTAGGTTGAGGGGTACCTG 26777622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCTGTGACTGAGGCTCTATACTATTTTTTTAACTTTTATTTAGGTTGAGGGGTACCTG 780

 26777623 TGCAAGCTTGTTATATAGGTAAACTCAGGTCACAGGAGTTTGTTGTACAGATTATTTTGT 26777682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCAAGCTTGTTATATAGGTAAACTCAGGTCACAGGAGTTTGTTGTACAGATTATTTTGT 840

 26777683 CACCCAGGTACTAAGCCTTGTACCCAATAGTTATTTTTTCTGATCACCTCCCTACTCCCA 26777742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACCCAGGTACTAAGCCTTGTACCCAATAGTTATTTTTTCTGATCACCTCCCTACTCCCA 900

 26777743 TCCTCCACCCTCAAGTAGGCCTCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATAAGTTCT 26777802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTCCACCCTCAAGTAGGCCTCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATAAGTTCT 960

 26777803 CATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGTGAATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATT 26777862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGTGAATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATT 1020

 26777863 AGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCCATGTTCCCACAAAAGACATGATCTCA 26777922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCCATGTTCCCACAAAAGACATGATCTCA 1080

 26777923 TTCTTTTTATGGCTGCATAATATTCCATAGTGTATATATACCACATTTCCTTTATCCAGT 26777982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTTTTTATGGCTGCATAATATTCCATAGTGTATATATACCACATTTCCTTTATCCAGT 1140

 26777983 CTGTCACTGATGGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTTCAT 26778042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGTCACTGATGGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTTCAT 1200

 26778043 TGAACATTCGCATGCATGTGTCTTTATGGTAGAATGATTTCTATTCCTTTGGGTATATAC 26778102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAACATTCGCATGCATGTGTCTTTATGGTAGAATGATTTCTATTCCTTTGGGTATATAC 1260

 26778103 CCAATAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTTTAGCACTTTGAGGAATCACC 26778162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAATAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTTTAGCACTTTGAGGAATCACC 1320

 26778163 ACACTGCTTTCCATAAAGGTTGAACTAATTTACACTCCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTC 26778222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACTGCTTTCCATAAAGGTTGAACTAATTTACACTCCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTC 1380

 26778223 CCTCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCTGTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTC 26778282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCTGTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTC 1440

 26778283 TGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTG 26778342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTG 1500

 26778343 ATATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTTGGCCGCATGTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTC 26778402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTTGGCCGCATGTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTC 1560

 26778403 TGTTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGT 26778462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGT 1620

 26778463 TTTAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATTAGACCTTTGTCACATGCATAGTTTGTTAATAT 26778522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATTAGACCTTTGTCACATGCATAGTTTGTTAATAT 1680

 26778523 TTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAA 26778582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAA 1740

 26778583 GCTCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGG 26778642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGG 1800

 26778643 TGTTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTTCCTATGTCCAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTC 26778702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTTCCTATGTCCAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTC 1860

 26778703 TTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCTTGAGTTTATTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGG 26778762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCTTGAGTTTATTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGG 1920

 26778763 GGTCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCCTACCCAGTTCTGCATATCCCAGCACCATTTAT 26778822
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGTCTACCCAGTTCTGCATATCCCAGCACCATTTAT 1980

 26778823 TGAATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGACAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGT 26778882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGAATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGACAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGT 2040

 26778883 TGTAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTTATCTATTCCATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGT 26778942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTTATCTATTCCATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGT 2100

 26778943 TTTTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAG 26779002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAG 2160

 26779003 GTAACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTTTTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCT 26779062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTAACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTTTTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCT 2220

 26779063 TTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATAGGTTG 26779095
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATAGGTTG 2253

EXCISED REGION

 26779098 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAAT 26779157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAAT 2313

 26779158 GGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTA 26779217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 GGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTA 2373

 26779218 GCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTAT 26779277
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 GCCTCCTCAGTAGTTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTAT 2433

 26779278 TTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAG 26779337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 TTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAG 2493

 26779338 GTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCC 26779397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 GTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCC 2553

 26779398 GGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGC 26779457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 GGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGC 2613

 26779458 ATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATG 26779517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 ATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATG 2673

 26779518 CATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTT 26779577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 CATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTT 2733

 26779578 TGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTA 26779637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 TGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTA 2793

 26779638 ATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGT 26779697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 ATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGT 2853

 26779698 TGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGC 26779757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 TGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGC 2913

 26779758 TGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTAC 26779817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTAC 2973

 26779818 AATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTT 26779877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 AATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTT 3033

 26779878 ATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGT 26779937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 ATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGT 3093

 26779938 GGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGC 26779997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 GGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGC 3153

 26779998 CCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTAT 26780057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 CCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTAT 3213

 26780058 ATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGA 26780117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 ATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGA 3273

 26780118 AAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGG 26780177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 AAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGG 3333

 26780178 CCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAA 26780237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 CCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAA 3393

 26780238 CAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGA 26780297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 CAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGA 3453

 26780298 TGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGA 26780357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 TGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGA 3513

 26780358 TGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACA 26780417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 TGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACA 3573

 26780418 GGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAA 26780477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 GGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAA 3633

 26780478 GTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTC 26780537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 GTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTC 3693

 26780538 AGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACC 26780597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 AGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACC 3753

 26780598 CATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTA 26780657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 CATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTA 3813

 26780658 AAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCA 26780717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 AAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCA 3873

 26780718 AGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAAC 26780777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 AGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAAC 3933

 26780778 CCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCA 26780837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 CCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCA 3993

 26780838 GCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGA 26780897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 GCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGA 4053

 26780898 GCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAA 26780957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 GCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAA 4113

 26780958 ATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCA 26781017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 ATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCA 4173

 26781018 CATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTC 26781077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 CATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTC 4233

 26781078 CAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACC 26781137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 CAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACC 4293

 26781138 AATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGG 26781197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 AATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGG 4353

 26781198 CCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAG 26781257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 CCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAG 4413

 26781258 TGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCCTGAA 26781317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 TGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCCTGAA 4473

 26781318 GTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGAT 26781360
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 GTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGAT 4516

Alignment time is 4.17736 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    3227] =>      3227 nucs 'mol-32-2e15-047229_3227'

Score:        3226
Aligned:      3226        nucs
Identic:      3226 (100%) nucs =>      2886 (100%)       340 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26778199,26781084] EXCISED REGION [26781086,26781425]
 second seq =>  [       1,    2886] EXCISED REGION [    2888,    3227]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [26781085,26781085]
 second seq =>         1 nucs [2887,2887]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [26781084,26781084] to [26781086,26781086]
 second seq =>         1 nucs [2886,2886] to [2888,2888]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26778199 CCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTCCCTCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCTGTTATTTT 26778258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTCCCTCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCTGTTATTTT 60

 26778259 TTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGCGGTTTTGA 26778318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGCGGTTTTGA 120

 26778319 TTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTTGGCCGCAT 26778378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTTGGCCGCAT 180

 26778379 GTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGT 26778438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGT 240

 26778439 TTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTTAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATTAGACCTTT 26778498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTTAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATTAGACCTTT 300

 26778499 GTCACATGCATAGTTTGTTAATATTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTTACTCTGTT 26778558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCACATGCATAGTTTGTTAATATTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTTACTCTGTT 360

 26778559 GATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTGTCAATTTT 26778618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTGTCAATTTT 420

 26778619 TGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGGTGTTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTTCCTATGTC 26778678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGGTGTTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTTCCTATGTC 480

 26778679 CAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTCTTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCTTGAGTTTA 26778738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTCTTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCTTGAGTTTA 540

 26778739 TTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCCTACCCAGT 26778798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCCTACCCAGT 600

 26778799 TCTGCATATCCCAGCACCATTTATTGAATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGA 26778858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTGCATATCCCAGCACCATTTATTGAATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGA 660

 26778859 CAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGTTGTAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTTATCTATTC 26778918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGTTGTAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTTATCTATTC 720

 26778919 CATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGTTTTTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGTTACTGTAG 26778978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGTTTTTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGTTACTGTAG 780

 26778979 CCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTTTTCACTCA 26779038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTTTTCACTCA 840

 26779039 GAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATAGGTTGTTT 26779098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATAGGTTGTTT 900

 26779099 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATG 26779158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATG 960

 26779159 GCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAG 26779218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAG 1020

 26779219 CCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATT 26779278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATT 1080

 26779279 TTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGG 26779338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGG 1140

 26779339 TGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCG 26779398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCG 1200

 26779399 GCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCA 26779458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCA 1260

 26779459 TTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGC 26779518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGC 1320

 26779519 ATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTT 26779578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTT 1380

 26779579 GTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAA 26779638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAA 1440

 26779639 TCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTT 26779698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTT 1500

 26779699 GTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCT 26779758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCT 1560

 26779759 GAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACA 26779818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACA 1620

 26779819 ATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTA 26779878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTA 1680

 26779879 TTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTG 26779938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTG 1740

 26779939 GTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCC 26779998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCC 1800

 26779999 CATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATA 26780058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATA 1860

 26780059 TTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAA 26780118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAA 1920

 26780119 AGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGC 26780178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGC 1980

 26780179 CTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAAC 26780238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAAC 2040

 26780239 AAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGAT 26780298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGAT 2100

 26780299 GTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGAT 26780358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGAT 2160

 26780359 GGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAG 26780418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAG 2220

 26780419 GTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAG 26780478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAG 2280

 26780479 TTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCA 26780538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCA 2340

 26780539 GGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCC 26780598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCC 2400

 26780599 ATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAA 26780658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAA 2460

 26780659 AGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAA 26780718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAA 2520

 26780719 GGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAACC 26780778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAACC 2580

 26780779 CCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCAG 26780838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCAG 2640

 26780839 CTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAG 26780898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAG 2700

 26780899 CCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAA 26780958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAA 2760

 26780959 TAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCAC 26781018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCAC 2820

 26781019 ATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTCC 26781078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTCC 2880

 26781079 AGGCTC 26781084
          ||||||
     2881 AGGCTC 2886

EXCISED REGION

 26781086 CCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTT 26781145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTT 2947

 26781146 TTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGT 26781205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGT 3007

 26781206 GACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTT 26781265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 GACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTT 3067

 26781266 CCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCCTGAAGTTCCCTG 26781325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 CCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCCTGAAGTTCCCTG 3127

 26781326 GGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACTGTGGAGATTCCAA 26781385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 GGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACTGTGGAGATTCCAA 3187

 26781386 GGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACC 26781425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 GGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACC 3227

Alignment time is 2.60394 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    6240] =>      6240 nucs 'mol-32-3004-117445_6240'

Score:        6240
Aligned:      6240        nucs
Identic:      6240 (100%) nucs =>      5927 (100%)       313 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26776485,26782411] EXCISED REGION [26782414,26782726]
 second seq =>  [       1,    5927] EXCISED REGION [    5928,    6240]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [26782412,26782413]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [26782412,26782431] to [26782414,26782433]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [26782412,26782412] to [26782413,26782413]
 second seq =>         0 nucs

 26776485 GAAAAGCAAGGGGCTGATAATCAGATAGGTCTTAAATTAAGAAGTCAGAAAAAGAATACT 26776544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAAGCAAGGGGCTGATAATCAGATAGGTCTTAAATTAAGAAGTCAGAAAAAGAATACT 60

 26776545 GAAAAAAAAAGAAAGCAAGCATGTTCCCATGCTTCCACCAGGGAACACAAGAATGGTTCC 26776604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAAAAAAAGAAAGCAAGCATGTTCCCATGCTTCCACCAGGGAACACAAGAATGGTTCC 120

 26776605 ATTGAACTGGAAGTTGACACTGTCTCCTAGACTTTTGGGGCTTTTCTACCATTGAATAAT 26776664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGAACTGGAAGTTGACACTGTCTCCTAGACTTTTGGGGCTTTTCTACCATTGAATAAT 180

 26776665 CAGGAAAAAGATGAGATCAAAATATTGGATCATTATTGGTTATTGATCCTGATTTTCAAA 26776724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGGAAAAAGATGAGATCAAAATATTGGATCATTATTGGTTATTGATCCTGATTTTCAAA 240

 26776725 AATGTGAAATAGAAGAAATAGGGTTGCTGCTGTACAATGGGAGCAAAAAAAAAGAGCTAC 26776784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGTGAAATAGAAGAAATAGGGTTGCTGCTGTACAATGGGAGCAAAAAAAAAGAGCTAC 300

 26776785 TTAGAATCTAGGGGAATATCTTGCAGATGGCTCCTAATATCATATTTAGGGGTTAAAAGT 26776844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGAATCTAGGGGAATATCTTGCAGATGGCTCCTAATATCATATTTAGGGGTTAAAAGT 360

 26776845 TAATAGAAAGCAACCTCATAAGGGCACCAAGGGCCCAGATTCTTTAGAAATAAAGGTCTG 26776904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATAGAAAGCAACCTCATAAGGGCACCAAGGGCCCAGATTCTTTAGAAATAAAGGTCTG 420

 26776905 GGTCACACCACCAGATGAAGAGCTGCTGGGCTGAGTTGCTGGGCTGAGCTGCTGGTTGTG 26776964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTCACACCACCAGATGAAGAGCTGCTGGGCTGAGTTGCTGGGCTGAGCTGCTGGTTGTG 480

 26776965 AGCTAAGAGAGCATGGAATGAGTAGTGGAAGGAGGAAATTACAAAGATCAACTCTGGCCT 26777024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTAAGAGAGCATGGAATGAGTAGTGGAAGGAGGAAATTACAAAGATCAACTCTGGCCT 540

 26777025 AGCGATCAGTTGCATAAATGAGGACTATAGTATGCACCCATATTTTCTTATTTGCTGTGT 26777084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCGATCAGTTGCATAAATGAGGACTATAGTATGCACCCATATTTTCTTATTTGCTGTGT 600

 26777085 TGACATTTTTTATGAATTTTCCCCATTTTATAAAAATATTTATTTTTTGTTAGTTAACTT 26777144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGACATTTTTTATGAATTTTCCCCATTTTATAAAAATATTTATTTTTTGTTAGTTAACTT 660

 26777145 TACAATCTATTTGCAGAATACCAAGGCAGGACTATGACAGAATTAAAAGAAAATGGGACA 26777204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACAATCTATTTGCAGAATACCAAGGCAGGACTATGACAGAATTAAAAGAAAATGGGACA 720

 26777205 TTACCCAGAGATCCTAGTCTTGGAGCTAGATGCAGTAAGTCTTGGGGCTTTCAAATGTCC 26777264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTACCCAGAGATCCTAGTCTTGGAGCTAGATGCAGTAAGTCTTGGGGCTTTCAAATGTCC 780

 26777265 TCCTATGGGGGGAAGAGTAAGTTCATTTTCATTTGTACACAGGATAAATAAATTATGAGT 26777324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCTATGGGGGGAAGAGTAAGTTCATTTTCATTTGTACACAGGATAAATAAATTATGAGT 840

 26777325 TAGAAGAGTTTGTTGTTATTGTTTTGGGAATTTAAATATGAAAGCAGATGTTGGGCAGCC 26777384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGAAGAGTTTGTTGTTATTGTTTTGGGAATTTAAATATGAAAGCAGATGTTGGGCAGCC 900

 26777385 AAGGGGAGGAGTGCAGTGAACATGCATCATGCTTTGTGTATCTTCTGAATAGGTTTTCTA 26777444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGGGGAGGAGTGCAGTGAACATGCATCATGCTTTGTGTATCTTCTGAATAGGTTTTCTA 960

 26777445 TTTGGGGAAAACTAGGATCTTTTGAATAGCTTTCCTATTTGGGGGGCATTCCTGACATTA 26777504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTGGGGAAAACTAGGATCTTTTGAATAGCTTTCCTATTTGGGGGGCATTCCTGACATTA 1020

 26777505 TGCAGTTCATCTTACCAACAGAGGAGCTAGAATTTCTTTTCCCTTGCTGCTAGAACTCAG 26777564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCAGTTCATCTTACCAACAGAGGAGCTAGAATTTCTTTTCCCTTGCTGCTAGAACTCAG 1080

 26777565 GCTGTGACTGAGGCTCTATACTATTTTTTTAACTTTTATTTAGGTTGAGGGGTACCTGTG 26777624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTGTGACTGAGGCTCTATACTATTTTTTTAACTTTTATTTAGGTTGAGGGGTACCTGTG 1140

 26777625 CAAGCTTGTTATATAGGTAAACTCAGGTCACAGGAGTTTGTTGTACAGATTATTTTGTCA 26777684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAGCTTGTTATATAGGTAAACTCAGGTCACAGGAGTTTGTTGTACAGATTATTTTGTCA 1200

 26777685 CCCAGGTACTAAGCCTTGTACCCAATAGTTATTTTTTCTGATCACCTCCCTACTCCCATC 26777744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCAGGTACTAAGCCTTGTACCCAATAGTTATTTTTTCTGATCACCTCCCTACTCCCATC 1260

 26777745 CTCCACCCTCAAGTAGGCCTCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATAAGTTCTCA 26777804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCCACCCTCAAGTAGGCCTCAGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATAAGTTCTCA 1320

 26777805 TCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGTGAATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAG 26777864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGTGAATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAG 1380

 26777865 TTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCCATGTTCCCACAAAAGACATGATCTCATT 26777924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCCATGTTCCCACAAAAGACATGATCTCATT 1440

 26777925 CTTTTTATGGCTGCATAATATTCCATAGTGTATATATACCACATTTCCTTTATCCAGTCT 26777984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTTTATGGCTGCATAATATTCCATAGTGTATATATACCACATTTCCTTTATCCAGTCT 1500

 26777985 GTCACTGATGGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTTCATTG 26778044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCACTGATGGGCATTTAGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTTCATTG 1560

 26778045 AACATTCGCATGCATGTGTCTTTATGGTAGAATGATTTCTATTCCTTTGGGTATATACCC 26778104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACATTCGCATGCATGTGTCTTTATGGTAGAATGATTTCTATTCCTTTGGGTATATACCC 1620

 26778105 AATAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTTTAGCACTTTGAGGAATCACCAC 26778164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATAATGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGTTTTTAGCACTTTGAGGAATCACCAC 1680

 26778165 ACTGCTTTCCATAAAGGTTGAACTAATTTACACTCCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTCCC 26778224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTGCTTTCCATAAAGGTTGAACTAATTTACACTCCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTCCC 1740

 26778225 TCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCTGTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTG 26778284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCTGTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTG 1800

 26778285 ACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGAT 26778344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGAT 1860

 26778345 ATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTTGGCCGCATGTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTCTG 26778404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTTGGCCGCATGTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTCTG 1920

 26778405 TTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTT 26778464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAATGGAGTTGTTTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTT 1980

 26778465 TAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATTAGACCTTTGTCACATGCATAGTTTGTTAATATTT 26778524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATTAGACCTTTGTCACATGCATAGTTTGTTAATATTT 2040

 26778525 TCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGC 26778584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGC 2100

 26778585 TCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGGTG 26778644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGGTG 2160

 26778645 TTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTTCCTATGTCCAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTCTT 26778704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTTCCTATGTCCAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTCTT 2220

 26778705 CCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCTTGAGTTTATTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGGGG 26778764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCTTGAGTTTATTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGGGG 2280

 26778765 TCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCCTACCCAGTTCTGCATATCCCAGCACCATTTATTG 26778824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCCTACCCAGTTCTGCATATCCCAGCACCATTTATTG 2340

 26778825 AATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGACAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGTTG 26778884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTGACAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGTTG 2400

 26778885 TAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTTATCTATTCCATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGTTT 26778944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTTATCTATTCCATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGTTT 2460

 26778945 TTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGT 26779004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGT 2520

 26779005 AACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTTTTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTT 26779064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTTTTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTT 2580

 26779065 TTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATAGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGA 26779124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATAGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGA 2640

 26779125 GTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTC 26779184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTC 2700

 26779185 TGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGC 26779244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGC 2760

 26779245 ATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATG 26779304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATG 2820

 26779305 TTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAA 26779364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAA 2880

 26779365 GTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGT 26779424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGT 2940

 26779425 GAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGT 26779484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGT 3000

 26779485 ATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGT 26779544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGT 3060

 26779545 TTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCA 26779604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCA 3120

 26779605 CCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGA 26779664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGA 3180

 26779665 TTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATT 26779724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATT 3240

 26779725 TTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGAT 26779784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGAT 3300

 26779785 TTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAG 26779844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAG 3360

 26779845 TTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTG 26779904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTG 3420

 26779905 GCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTG 26779964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTG 3480

 26779965 CTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGT 26780024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGT 3540

 26780025 TTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGA 26780084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGA 3600

 26780085 ATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAA 26780144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAA 3660

 26780145 TCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTA 26780204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTA 3720

 26780205 AAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCT 26780264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCT 3780

 26780265 ACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACC 26780324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACC 3840

 26780325 AAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGAC 26780384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGAC 3900

 26780385 ACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATA 26780444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATA 3960

 26780445 CCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCA 26780504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCA 4020

 26780505 GATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCT 26780564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCT 4080

 26780565 CCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAA 26780624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAA 4140

 26780625 GTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGC 26780684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGC 4200

 26780685 TCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGG 26780744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGG 4260

 26780745 AGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATT 26780804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATT 4320

 26780805 AGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGA 26780864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGA 4380

 26780865 TCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGC 26780924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGC 4440

 26780925 CTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAA 26780984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAA 4500

 26780985 AGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCA 26781044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCA 4560

 26781045 TGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTC 26781104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTC 4620

 26781105 AACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCT 26781164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCT 4680

 26781165 TCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAAC 26781224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAAC 4740

 26781225 CCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCC 26781284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCC 4800

 26781285 TTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCA 26781344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCA 4860

 26781345 TTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGG 26781404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGG 4920

 26781405 CCAGGAAACAGGGACAAAACCAAATATATATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCT 26781464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CCAGGAAACAGGGACAAAACCAAATATATATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCT 4980

 26781465 TCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATCCATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGG 26781524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATCCATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGG 5040

 26781525 TTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGACTTACACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTC 26781584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGACTTACACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTC 5100

 26781585 ATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGGAGTTACATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTT 26781644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGGAGTTACATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTT 5160

 26781645 CGGGTTCAAACTGAATTACACGCTGGCTTTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAA 26781704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CGGGTTCAAACTGAATTACACGCTGGCTTTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAA 5220

 26781705 TATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTCAAGTGTGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCA 26781764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTCAAGTGTGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCA 5280

 26781765 AGAGGTCCTCCCAACATGTGCCCAAGGTAGTTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTA 26781824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGAGGTCCTCCCAACATGTGCCCAAGGTAGTTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTA 5340

 26781825 GGGAGATGTTAAGACATCAGTCAATACATATGGGTTAGGCCAGATGCCGTGGTTCACGCC 26781884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GGGAGATGTTAAGACATCAGTCAATACATATGGGTTAGGCCAGATGCCGTGGTTCACGCC 5400

 26781885 TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAG 26781944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAG 5460

 26781945 ACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACGCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGAGTGT 26782004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACGCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGAGTGT 5520

 26782005 GGTGGCGCACGCCTGTAGTCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 26782064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GGTGGCGCACGCCTGTAGTCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 5580

 26782065 CCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGAGCCACTGCACTCCACCCTGGGAGACA 26782124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGAGCCACTGCACTCCACCCTGGGAGACA 5640

 26782125 AAGTAAGACTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAAAGAAACATTTTCACGTAAAATAT 26782184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAGTAAGACTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAAAGAAACATTTTCACGTAAAATAT 5700

 26782185 TTTGATTTCCTTCTATTTCTGTTATGTGATGTTATGCCACAGTCAAGTTGGAAAGTACAC 26782244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTTGATTTCCTTCTATTTCTGTTATGTGATGTTATGCCACAGTCAAGTTGGAAAGTACAC 5760

 26782245 TACATTATATAGGGTTAAATAAAATCCATCTGATGAGATTTTATGGTTTGTAGGGCATAA 26782304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TACATTATATAGGGTTAAATAAAATCCATCTGATGAGATTTTATGGTTTGTAGGGCATAA 5820

 26782305 CTCCTCAGGTCCCTTGGATAAGAATTTGGGCAAGCAAGGAAAAAGGTCAGAGTTTAGCCC 26782364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTCCTCAGGTCCCTTGGATAAGAATTTGGGCAAGCAAGGAAAAAGGTCAGAGTTTAGCCC 5880

 26782365 TCACCTTCCTGGTTCTCCAGCTTATAGATGACAGATGGTGGGACTTC 26782411
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TCACCTTCCTGGTTCTCCAGCTTATAGATGACAGATGGTGGGACTTC 5927

EXCISED REGION

 26782414 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTATTTTTTTATTGATAATTCTTGGGTGTTTCTCAC 26782473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTATTTTTTTATTGATAATTCTTGGGTGTTTCTCAC 5987

 26782474 AGAGGGGGATTTGGCAGGGTCATGGGACAATAGTGGAGGGAAGGTCAGCAGATAAACAAG 26782533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 AGAGGGGGATTTGGCAGGGTCATGGGACAATAGTGGAGGGAAGGTCAGCAGATAAACAAG 6047

 26782534 TGAACAAAGGTCTCTGGTTTTCCTAGGCAGAGGACCCTGCGGCCTTCCGCAGTGTTTGTG 26782593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6048 TGAACAAAGGTCTCTGGTTTTCCTAGGCAGAGGACCCTGCGGCCTTCCGCAGTGTTTGTG 6107

 26782594 TCCCTGATTACTTGAGATTAGGGATGGGTGATGACTCTTAACGAGCATGCTGCCTTCAAG 26782653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 TCCCTGATTACTTGAGATTAGGGATGGGTGATGACTCTTAACGAGCATGCTGCCTTCAAG 6167

 26782654 CATCTGTTTAACAAAGCACATCTTGCACCGCCCTTAATCCATTTAACCCTGAGTGGACAC 26782713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 CATCTGTTTAACAAAGCACATCTTGCACCGCCCTTAATCCATTTAACCCTGAGTGGACAC 6227

 26782714 AGCACATGTTTCA 26782726
          |||||||||||||
     6228 AGCACATGTTTCA 6240

Alignment time is 5.53375 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2932] =>      2932 nucs 'mol-32-316f-051106_2932'

Score:        2920
Aligned:      2931        nucs
Identic:      2930 (100%) nucs =>      1036 (100%)      1894 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26779133,26780168] EXCISED REGION [26780170,26782064]
 second seq =>  [       1,    1036] EXCISED REGION [    1038,    2932]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [26780169,26780169]
 second seq =>         1 nucs [1037,1037]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1036,1037] to [1037,1038]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [26780168,26780168] to [26780170,26780170]
 second seq =>         1 nucs [1036,1036] to [1038,1038]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26779133 CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCC 26779192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCC 60

 26779193 AGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCA 26779252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCA 120

 26779253 CCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAG 26779312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATGCCTGGCTAATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAG 180

 26779313 GCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 26779372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 240

 26779373 ATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATG 26779432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATG 300

 26779433 TCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCAT 26779492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCAT 360

 26779493 TTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTA 26779552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTA 420

 26779553 TCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTG 26779612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTG 480

 26779613 GTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCC 26779672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCC 540

 26779673 CTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATG 26779732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATG 600

 26779733 TTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTG 26779792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTG 660

 26779793 AGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTT 26779852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTT 720

 26779853 CCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGAC 26779912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGAC 780

 26779913 TTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTT 26779972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTT 840

 26779973 CAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATA 26780032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATA 900

 26780033 GATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAA 26780092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAA 960

 26780093 CATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAA 26780152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAA 1020

 26780153 GATTGCCCTCACCAAT 26780168
          ||||||||||||||||
     1021 GATTGCCCTCACCAAT 1036

EXCISED REGION

 26780170 TATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAAC 26780229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 TATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAAC 1097

 26780230 AACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTG 26780289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 AACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTG 1157

 26780290 ACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACAT 26780349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 ACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACAT 1217

 26780350 CAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAG 26780409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 CAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAG 1277

 26780410 ATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACA 26780469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 ATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACA 1337

 26780470 AGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATC 26780529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 AGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATC 1397

 26780530 TCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTA 26780589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTA 1457

 26780590 CAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCAT 26780649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 CAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCAT 1517

 26780650 TTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTG 26780709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 TTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTG 1577

 26780710 GGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATAT 26780769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 GGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATAT 1637

 26780770 GGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTG 26780829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 GGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTG 1697

 26780830 TGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGA 26780889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 TGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGA 1757

 26780890 TGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCC 26780949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 TGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCC 1817

 26780950 TCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATG 26781009
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 TCAATAAAATAAAAGTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATG 1877

 26781010 AGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCAT 26781069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 AGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCAT 1937

 26781070 GCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTC 26781129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 GCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTC 1997

 26781130 TCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAA 26781189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAA 2057

 26781190 ATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGG 26781249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 ATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGG 2117

 26781250 GGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCT 26781309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 GGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCT 2177

 26781310 ATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATC 26781369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 ATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATC 2237

 26781370 ACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACCAAAT 26781429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 ACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACCAAAT 2297

 26781430 ATATATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATC 26781489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 ATATATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATC 2357

 26781490 CATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGA 26781549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 CATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGA 2417

 26781550 CTTACACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGG 26781609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 CTTACACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGG 2477

 26781610 AGTTACATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACACGCTG 26781669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 AGTTACATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACACGCTG 2537

 26781670 GCTTTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTC 26781729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 GCTTTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTC 2597

 26781730 AAGTGTGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCAAGAGGTCCTCCCAACATGTGCCCAA 26781789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 AAGTGTGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCAAGAGGTCCTCCCAACATGTGCCCAA 2657

 26781790 GGTAGTTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTAGGGAGATGTTAAGACATCAGTCAAT 26781849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 GGTAGTTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTAGGGAGATGTTAAGACATCAGTCAAT 2717

 26781850 ACATATGGGTTAGGCCAGATGCCGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 26781909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 ACATATGGGTTAGGCCAGATGCCGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 2777

 26781910 AAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 26781969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 AAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 2837

 26781970 GCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGAGTGTGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCTAGC 26782029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 GCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGAGTGTGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCTAGC 2897

 26782030 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 26782064
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 2932

Alignment time is 2.36177 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    8490] =>      8490 nucs 'mol-32-32f0-150208_8490'

Score:        8457
Aligned:      8490        nucs
Identic:      8487 (100%) nucs =>      2836 (100%)      5651 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26773549,26776384] EXCISED REGION [26776386,26782039]
 second seq =>  [       1,    2836] EXCISED REGION [    2838,    8490]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [26776385,26776385]
 second seq =>         1 nucs [2837,2837]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [26779096,26779096]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2837,2837] to [2838,2838]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26773549 CCGAGATCAAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAATA 26773608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCGAGATCAAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAATA 60

 26773609 AATAAATATATAAAAAATAAATAATAAACAATTCATAAGGTTTTTGTTTTGTTTTGAAAC 26773668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAAATATATAAAAAATAAATAATAAACAATTCATAAGGTTTTTGTTTTGTTTTGAAAC 120

 26773669 AGGATCTCAGTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTAGAGTGGCATGATCATGGCTCACCGCAGCC 26773728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGATCTCAGTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTAGAGTGGCATGATCATGGCTCACCGCAGCC 180

 26773729 TCAATCTCCTGGGCTCAGATGATCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCACATG 26773788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAATCTCCTGGGCTCAGATGATCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCACATG 240

 26773789 CCACCACGCTCAGCTAATTTTTTGTATTATTTGTAGAGACAGGGTTATGCCATGTTGCCC 26773848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACCACGCTCAGCTAATTTTTTGTATTATTTGTAGAGACAGGGTTATGCCATGTTGCCC 300

 26773849 AAGCTGGTCTCGAAGAATTGTGTGCCATTCTGAGTAGCGTGATGAAATCTCACGCCGTCC 26773908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGCTGGTCTCGAAGAATTGTGTGCCATTCTGAGTAGCGTGATGAAATCTCACGCCGTCC 360

 26773909 TGCTCCATCCCACCTGGGACATGAGTCATCCCTTTGTCCAGCATATCAATGCTGTGTATG 26773968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCCATCCCACCTGGGACATGAGTCATCCCTTTGTCCAGCATATCAATGCTGTGTATG 420

 26773969 CTACCTGCCCATTAGTCACTTAGCCACCTTGGTTATCAGATCGGCTGTTGTAGAATCACA 26774028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACCTGCCCATTAGTCACTTAGCCACCTTGGTTATCAGATCGGCTGTTGTAGAATCACA 480

 26774029 GTGCTTGTATTCAAGTAACCCTTATTTTACTTAATAATGGGTCCACAAAGTGCAAGAGTA 26774088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGCTTGTATTCAAGTAACCCTTATTTTACTTAATAATGGGTCCACAAAGTGCAAGAGTA 540

 26774089 GTGATGCTGGCATATTGTTATAATTGTTTAATTGTATTATTATTTTTGTTAATATCTTAC 26774148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGATGCTGGCATATTGTTATAATTGTTTAATTGTATTATTATTTTTGTTAATATCTTAC 600

 26774149 TGTGCCTGATTTATAAATTAAATGCTCTCGTAGGTACAAGAAAAATGTAGTATACATATG 26774208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGCCTGATTTATAAATTAAATGCTCTCGTAGGTACAAGAAAAATGTAGTATACATATG 660

 26774209 GTTTGGTACTATCTGTGGTTTCAATCATGCCCTGGGGGTCTGCAATAAGGGCGGACTAGG 26774268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTTGGTACTATCTGTGGTTTCAATCATGCCCTGGGGGTCTGCAATAAGGGCGGACTAGG 720

 26774269 ATATGTGGAGATGGAGTCTTTGACAGGTAATTAGGTTTAGATGAGCTCAGGAGGGTAGAA 26774328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATGTGGAGATGGAGTCTTTGACAGGTAATTAGGTTTAGATGAGCTCAGGAGGGTAGAA 780

 26774329 GCATCAGGATAGGACTAGTGCCTTATAAGAAGAGACACAGGAGAGCTTGTTCTTGCTCTT 26774388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCATCAGGATAGGACTAGTGCCTTATAAGAAGAGACACAGGAGAGCTTGTTCTTGCTCTT 840

 26774389 TTTCCACCATGCAAGGACACAGTGTGAAAAGTGGCCATGGGGCACATGTTCTCAGGACCT 26774448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCCACCATGCAAGGACACAGTGTGAAAAGTGGCCATGGGGCACATGTTCTCAGGACCT 900

 26774449 CCTCGAGCTGTGTCATGGGGGAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAGAGAGAAAGAAAATG 26774508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTCGAGCTGTGTCATGGGGGAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAGAGAGAAAGAAAATG 960

 26774509 GCCATCTTCAAGCCAGGAAGAGAGCCCTCACCAGAACTCGACCATGCTGGCACCCTGATC 26774568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCATCTTCAAGCCAGGAAGAGAGCCCTCACCAGAACTCGACCATGCTGGCACCCTGATC 1020

 26774569 TTGAACTTTCAGCCGCCAAAACTGGGAAGAAAGTTTCTGTTATTTAAGCCACCCAGTCTA 26774628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGAACTTTCAGCCGCCAAAACTGGGAAGAAAGTTTCTGTTATTTAAGCCACCCAGTCTA 1080

 26774629 TGGTATTTTGTTACGGCAGCCAGACCTAACTAAGACACCCACCAAAACAAATAAACAAAA 26774688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGTATTTTGTTACGGCAGCCAGACCTAACTAAGACACCCACCAAAACAAATAAACAAAA 1140

 26774689 ACAAAACCTGTACTTGTTGGTAGTCAACTCCCCTTTCCCCAGCACCTCCTCCACAGGTCT 26774748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAAAACCTGTACTTGTTGGTAGTCAACTCCCCTTTCCCCAGCACCTCCTCCACAGGTCT 1200

 26774749 AGGCAACCGTTGAACTATTTTCTGTCACTACAGATTTTCCTATTCTGTACATCTCATAAA 26774808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGCAACCGTTGAACTATTTTCTGTCACTACAGATTTTCCTATTCTGTACATCTCATAAA 1260

 26774809 AATGGAATCATACAGCTTGTGGTCTTTTGTGACTGGCTTCATTCACCTAGCATAATGTTA 26774868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGGAATCATACAGCTTGTGGTCTTTTGTGACTGGCTTCATTCACCTAGCATAATGTTA 1320

 26774869 AACAAAAAATAACATTGTATTTTGGGGTTTACAATGTATGTATAAATAAAATATATGACA 26774928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACAAAAAATAACATTGTATTTTGGGGTTTACAATGTATGTATAAATAAAATATATGACA 1380

 26774929 ACAGTGTTACAGAAGAAAGAGAAGTAAACAGAATTATATTATTGTAATTCTACATAGGCT 26774988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAGTGTTACAGAAGAAAGAGAAGTAAACAGAATTATATTATTGTAATTCTACATAGGCT 1440

 26774989 GTATATTTTAATAACTAGCTCAACCACTAAAAATAAAAAGAGGCATAACTAAAAAGCCAA 26775048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTATATTTTAATAACTAGCTCAACCACTAAAAATAAAAAGAGGCATAACTAAAAAGCCAA 1500

 26775049 TAGAGGAAATAAATAAAATAGAGTTCTAAAAATATAATCAGTTAACCTAAAAGAAGGAAA 26775108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGAGGAAATAAATAAAATAGAGTTCTAAAAATATAATCAGTTAACCTAAAAGAAGGAAA 1560

 26775109 GAAAGGCGAATTGATGTACAAATAGACGGGATAAATAAAAAACAAATAGCAAGATGTTAA 26775168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAAGGCGAATTGATGTACAAATAGACGGGATAAATAAAAAACAAATAGCAAGATGTTAA 1620

 26775169 ACGTAAATACAACCATTTCAATAATTACATCAAGTATAAATGGACTAAGCCATTCAATTA 26775228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACGTAAATACAACCATTTCAATAATTACATCAAGTATAAATGGACTAAGCCATTCAATTA 1680

 26775229 AAAGGCAAGAGATTTACAGACTGGGGGAAAAAAAGACCCAACTATTTGTTATCTACAAGA 26775288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAGGCAAGAGATTTACAGACTGGGGGAAAAAAAGACCCAACTATTTGTTATCTACAAGA 1740

 26775289 GATGTACTTTAAATGTAAAGACACAGATCAGTTGAAAGTAAAAGGATGGAAAAAGGATAT 26775348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATGTACTTTAAATGTAAAGACACAGATCAGTTGAAAGTAAAAGGATGGAAAAAGGATAT 1800

 26775349 AACATGCTAACTGGAAGCATAAGAAAGCTAGTGTAACTATTTTAATATCAGATAAGGCAG 26775408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACATGCTAACTGGAAGCATAAGAAAGCTAGTGTAACTATTTTAATATCAGATAAGGCAG 1860

 26775409 ACTTCAAGACAAGGAGTATTGGCCAGACACAGTGGTTCACACCTGTAATCCCAACACTTT 26775468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTCAAGACAAGGAGTATTGGCCAGACACAGTGGTTCACACCTGTAATCCCAACACTTT 1920

 26775469 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGTCAGGATTTGAAGACCAACCTGGGCAGCAG 26775528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGTCAGGATTTGAAGACCAACCTGGGCAGCAG 1980

 26775529 AGTGAGACCCTATCTCTACAATACATATATTTTAAAATAAATAGATAAAATAATTGAGAC 26775588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTGAGACCCTATCTCTACAATACATATATTTTAAAATAAATAGATAAAATAATTGAGAC 2040

 26775589 AGGGTCTTGTTATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGACCAGCCTGAGCTGGTCCC 26775648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGGTCTTGTTATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGACCAGCCTGAGCTGGTCCC 2100

 26775649 AAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGATTTCAATTATTTAAAAAAAGAA 26775708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGTGATGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCGATTTCAATTATTTAAAAAAAGAA 2160

 26775709 AAGACAAGAGTGTTACCAGAAATAAAAAGAGACATGACCATAATGACGAAACAGTCAATC 26775768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGACAAGAGTGTTACCAGAAATAAAAAGAGACATGACCATAATGACGAAACAGTCAATC 2220

 26775769 CTTCAGAAAGCTATACCAATGTTAAACATGTTTGCACCTATAACAAAGATTCAAAATATA 26775828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTCAGAAAGCTATACCAATGTTAAACATGTTTGCACCTATAACAAAGATTCAAAATATA 2280

 26775829 TGAAAAGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTAAGGCA 26775888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGAAAAGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTAAGGCA 2340

 26775889 GGCCGACCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCTCGTC 26775948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGCCGACCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCTCGTC 2400

 26775949 TCTATTAAAAATATAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGTTGCATGCCTGTAGTCCCAGCTTAC 26776008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTATTAAAAATATAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGTTGCATGCCTGTAGTCCCAGCTTAC 2460

 26776009 TCCAGAGGCTAAGACAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGA 26776068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCAGAGGCTAAGACAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGA 2520

 26776069 GATTGCGCCACAGCAGACCAAGACTGTTTCAAAAAAAAAGACAAAAACAAAAAATATATA 26776128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATTGCGCCACAGCAGACCAAGACTGTTTCAAAAAAAAAGACAAAAACAAAAAATATATA 2580

 26776129 TATGAAGAAAAACTGACAGAGCAAAAGGGAGAAATAAGCAAATTCACAACTGTAGTTGGA 26776188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TATGAAGAAAAACTGACAGAGCAAAAGGGAGAAATAAGCAAATTCACAACTGTAGTTGGA 2640

 26776189 GATGTTTACACCTCTCTCAATAATTGATGGATCAAGTAGATAATAAATCAGAAAACATAG 26776248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATGTTTACACCTCTCTCAATAATTGATGGATCAAGTAGATAATAAATCAGAAAACATAG 2700

 26776249 ATGATTTGAACAATTCTAACAACAAACTTGACCTAATTGACATTTATAAAATGCTATTTA 26776308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGATTTGAACAATTCTAACAACAAACTTGACCTAATTGACATTTATAAAATGCTATTTA 2760

 26776309 CAGCAACTGCAAAATACACATTCTTTTCAAATGCAACTAGAATGTCCACCCAGATAGATC 26776368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGCAACTGCAAAATACACATTCTTTTCAAATGCAACTAGAATGTCCACCCAGATAGATC 2820

 26776369 ATATTCTGGTCCATGG 26776384
          ||||||||||||||||
     2821 ATATTCTGGTCCATGG 2836

EXCISED REGION

 26776386 CTATTTATTGAAGCTCGACAAATTTTACCAGATTTTTCATGTGGGATGAAGCCAACATGG 26776445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 CTATTTATTGAAGCTCGACAAATTTTACCAGATTTTTCATGTGGGATGAAGCCAACATGG 2897

 26776446 TCCTCTAAAGGAAATTTATAGCTTTAAATGCGTATATTAGAAAAGCAAGGGGCTGATAAT 26776505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 TCCTCTAAAGGAAATTTATAGCTTTAAATGCGTATATTAGAAAAGCAAGGGGCTGATAAT 2957

 26776506 CAGATAGGTCTTAAATTAAGAAGTCAGAAAAAGAATACTGAAAAAAAAAGAAAGCAAGCA 26776565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 CAGATAGGTCTTAAATTAAGAAGTCAGAAAAAGAATACTGAAAAAAAAAGAAAGCAAGCA 3017

 26776566 TGTTCCCATGCTTCCACCAGGGAACACAAGAATGGTTCCATTGAACTGGAAGTTGACACT 26776625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TGTTCCCATGCTTCCACCAGGGAACACAAGAATGGTTCCATTGAACTGGAAGTTGACACT 3077

 26776626 GTCTCCTAGACTTTTGGGGCTTTTCTACCATTGAATAATCAGGAAAAAGATGAGATCAAA 26776685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 GTCTCCTAGACTTTTGGGGCTTTTCTACCATTGAATAATCAGGAAAAAGATGAGATCAAA 3137

 26776686 ATATTGGATCATTATTGGTTATTGATCCTGATTTTCAAAAATGTGAAATAGAAGAAATAG 26776745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 ATATTGGATCATTATTGGTTATTGATCCTGATTTTCAAAAATGTGAAATAGAAGAAATAG 3197

 26776746 GGTTGCTGCTGTACAATGGGAGCAAAAAAAAAGAGCTACTTAGAATCTAGGGGAATATCT 26776805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 GGTTGCTGCTGTACAATGGGAGCAAAAAAAAAGAGCTACTTAGAATCTAGGGGAATATCT 3257

 26776806 TGCAGATGGCTCCTAATATCATATTTAGGGGTTAAAAGTTAATAGAAAGCAACCTCATAA 26776865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 TGCAGATGGCTCCTAATATCATATTTAGGGGTTAAAAGTTAATAGAAAGCAACCTCATAA 3317

 26776866 GGGCACCAAGGGCCCAGATTCTTTAGAAATAAAGGTCTGGGTCACACCACCAGATGAAGA 26776925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 GGGCACCAAGGGCCCAGATTCTTTAGAAATAAAGGTCTGGGTCACACCACCAGATGAAGA 3377

 26776926 GCTGCTGGGCTGAGTTGCTGGGCTGAGCTGCTGGTTGTGAGCTAAGAGAGCATGGAATGA 26776985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 GCTGCTGGGCTGAGTTGCTGGGCTGAGCTGCTGGTTGTGAGCTAAGAGAGCATGGAATGA 3437

 26776986 GTAGTGGAAGGAGGAAATTACAAAGATCAACTCTGGCCTAGCGATCAGTTGCATAAATGA 26777045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 GTAGTGGAAGGAGGAAATTACAAAGATCAACTCTGGCCTAGCGATCAGTTGCATAAATGA 3497

 26777046 GGACTATAGTATGCACCCATATTTTCTTATTTGCTGTGTTGACATTTTTTATGAATTTTC 26777105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 GGACTATAGTATGCACCCATATTTTCTTATTTGCTGTGTTGACATTTTTTATGAATTTTC 3557

 26777106 CCCATTTTATAAAAATATTTATTTTTTGTTAGTTAACTTTACAATCTATTTGCAGAATAC 26777165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 CCCATTTTATAAAAATATTTATTTTTTGTTAGTTAACTTTACAATCTATTTGCAGAATAC 3617

 26777166 CAAGGCAGGACTATGACAGAATTAAAAGAAAATGGGACATTACCCAGAGATCCTAGTCTT 26777225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 CAAGGCAGGACTATGACAGAATTAAAAGAAAATGGGACATTACCCAGAGATCCTAGTCTT 3677

 26777226 GGAGCTAGATGCAGTAAGTCTTGGGGCTTTCAAATGTCCTCCTATGGGGGGAAGAGTAAG 26777285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 GGAGCTAGATGCAGTAAGTCTTGGGGCTTTCAAATGTCCTCCTATGGGGGGAAGAGTAAG 3737

 26777286 TTCATTTTCATTTGTACACAGGATAAATAAATTATGAGTTAGAAGAGTTTGTTGTTATTG 26777345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 TTCATTTTCATTTGTACACAGGATAAATAAATTATGAGTTAGAAGAGTTTGTTGTTATTG 3797

 26777346 TTTTGGGAATTTAAATATGAAAGCAGATGTTGGGCAGCCAAGGGGAGGAGTGCAGTGAAC 26777405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 TTTTGGGAATTTAAATATGAAAGCAGATGTTGGGCAGCCAAGGGGAGGAGTGCAGTGAAC 3857

 26777406 ATGCATCATGCTTTGTGTATCTTCTGAATAGGTTTTCTATTTGGGGAAAACTAGGATCTT 26777465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 ATGCATCATGCTTTGTGTATCTTCTGAATAGGTTTTCTATTTGGGGAAAACTAGGATCTT 3917

 26777466 TTGAATAGCTTTCCTATTTGGGGGGCATTCCTGACATTATGCAGTTCATCTTACCAACAG 26777525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 TTGAATAGCTTTCCTATTTGGGGGGCATTCCTGACATTATGCAGTTCATCTTACCAACAG 3977

 26777526 AGGAGCTAGAATTTCTTTTCCCTTGCTGCTAGAACTCAGGCTGTGACTGAGGCTCTATAC 26777585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 AGGAGCTAGAATTTCTTTTCCCTTGCTGCTAGAACTCAGGCTGTGACTGAGGCTCTATAC 4037

 26777586 TATTTTTTTAACTTTTATTTAGGTTGAGGGGTACCTGTGCAAGCTTGTTATATAGGTAAA 26777645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 TATTTTTTTAACTTTTATTTAGGTTGAGGGGTACCTGTGCAAGCTTGTTATATAGGTAAA 4097

 26777646 CTCAGGTCACAGGAGTTTGTTGTACAGATTATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTTGTAC 26777705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 CTCAGGTCACAGGAGTTTGTTGTACAGATTATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTTGTAC 4157

 26777706 CCAATAGTTATTTTTTCTGATCACCTCCCTACTCCCATCCTCCACCCTCAAGTAGGCCTC 26777765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 CCAATAGTTATTTTTTCTGATCACCTCCCTACTCCCATCCTCCACCCTCAAGTAGGCCTC 4217

 26777766 AGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATAAGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAA 26777825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4218 AGTGTCTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATAAGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAA 4277

 26777826 GTGAGAACATGTGAATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTC 26777885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 GTGAGAACATGTGAATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTC 4337

 26777886 CAGCTGCATCCATGTTCCCACAAAAGACATGATCTCATTCTTTTTATGGCTGCATAATAT 26777945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 CAGCTGCATCCATGTTCCCACAAAAGACATGATCTCATTCTTTTTATGGCTGCATAATAT 4397

 26777946 TCCATAGTGTATATATACCACATTTCCTTTATCCAGTCTGTCACTGATGGGCATTTAGGT 26778005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 TCCATAGTGTATATATACCACATTTCCTTTATCCAGTCTGTCACTGATGGGCATTTAGGT 4457

 26778006 TGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTTCATTGAACATTCGCATGCATGTGTCT 26778065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 TGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTTCATTGAACATTCGCATGCATGTGTCT 4517

 26778066 TTATGGTAGAATGATTTCTATTCCTTTGGGTATATACCCAATAATGGGATTGCTGGGTCA 26778125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 TTATGGTAGAATGATTTCTATTCCTTTGGGTATATACCCAATAATGGGATTGCTGGGTCA 4577

 26778126 AATGGTAGTTCTGTTTTTAGCACTTTGAGGAATCACCACACTGCTTTCCATAAAGGTTGA 26778185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 AATGGTAGTTCTGTTTTTAGCACTTTGAGGAATCACCACACTGCTTTCCATAAAGGTTGA 4637

 26778186 ACTAATTTACACTCCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTCCCTCTTCTCCTCCACTTCACCAG 26778245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 ACTAATTTACACTCCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTCCCTCTTCTCCTCCACTTCACCAG 4697

 26778246 CATCTGTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTC 26778305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 CATCTGTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTC 4757

 26778306 ATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATATTGAGGTTTTCTTCATATGC 26778365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 ATTGCGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATATTGAGGTTTTCTTCATATGC 4817

 26778366 TTGTTGGCCGCATGTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCACTTT 26778425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 TTGTTGGCCGCATGTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCACTTT 4877

 26778426 TTAATGGAGTTGTTTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTTAAGTTCTTTATAGATGCTGG 26778485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 TTAATGGAGTTGTTTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTTAAGTTCTTTATAGATGCTGG 4937

 26778486 ATATTAGACCTTTGTCACATGCATAGTTTGTTAATATTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTT 26778545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 ATATTAGACCTTTGTCACATGCATAGTTTGTTAATATTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTT 4997

 26778546 TGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTAAGTTCAATCAGATTCC 26778605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4998 TGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAAAGCTCTTAAGTTCAATCAGATTCC 5057

 26778606 ATTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGGTGTTTTCATCATGAAATCTTTCC 26778665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 ATTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGGTGTTTTCATCATGAAATCTTTCC 5117

 26778666 CTGTTCCTATGTCCAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTCTTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATT 26778725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 CTGTTCCTATGTCCAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTCTTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATT 5177

 26778726 CATCTTGAGTTTATTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAATCTTCTGCAT 26778785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 CATCTTGAGTTTATTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAATCTTCTGCAT 5237

 26778786 ATGCCTACCCAGTTCTGCATATCCCAGCACCATTTATTGAATAGGGATTCCTTTCCCCAT 26778845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 ATGCCTACCCAGTTCTGCATATCCCAGCACCATTTATTGAATAGGGATTCCTTTCCCCAT 5297

 26778846 TGCTTGTTTTTGACAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGTTGTAGGTGTACATACTTATTTCT 26778905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 TGCTTGTTTTTGACAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGTTGTAGGTGTACATACTTATTTCT 5357

 26778906 GGGTTATCTATTCCATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGTTTTTGTACCAGTTCCATGTCATT 26778965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 GGGTTATCTATTCCATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGTTTTTGTACCAGTTCCATGTCATT 5417

 26778966 TTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTG 26779025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 TTGGTTACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTG 5477

 26779026 TTCTTTTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTA 26779085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 TTCTTTTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTA 5537

 26779086 AGATAGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGG 26779145
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 AGATAGGTTG-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGG 5596

 26779146 CTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 26779205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 CTGGAGTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 5656

 26779206 TCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTA 26779265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 TCTCCTGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTA 5716

 26779266 ATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAAC 26779325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 ATTTTTTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAAC 5776

 26779326 TCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGA 26779385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 TCCTGACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGA 5836

 26779386 GCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTT 26779445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 GCCACCGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTT 5896

 26779446 GATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTG 26779505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 GATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTG 5956

 26779506 ATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATT 26779565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 ATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATT 6016

 26779566 TGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTC 26779625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6017 TGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTC 6076

 26779626 CTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCT 26779685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 CTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCT 6136

 26779686 TGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATC 26779745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 TGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATC 6196

 26779746 CTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTT 26779805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 CTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTT 6256

 26779806 TTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTAT 26779865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6257 TTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTAT 6316

 26779866 TTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTG 26779925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6317 TTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTG 6376

 26779926 TTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCT 26779985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6377 TTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCT 6436

 26779986 TCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATT 26780045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6437 TCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATT 6496

 26780046 ATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTT 26780105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6497 ATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTT 6556

 26780106 GAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACC 26780165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6557 GAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACC 6616

 26780166 AATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACA 26780225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6617 AATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACA 6676

 26780226 AAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATT 26780285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6677 AAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATT 6736

 26780286 TCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGG 26780345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6737 TCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGG 6796

 26780346 ACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTG 26780405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6797 ACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTG 6856

 26780406 TCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGT 26780465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6857 TCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGT 6916

 26780466 CACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTAC 26780525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6917 CACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTAC 6976

 26780526 CATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATA 26780585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6977 CATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATA 7036

 26780586 CTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATAC 26780645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7037 CTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATAC 7096

 26780646 CCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAAC 26780705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7097 CCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAAC 7156

 26780706 TTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCA 26780765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7157 TTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCA 7216

 26780766 ATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACA 26780825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7217 ATATGGCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACA 7276

 26780826 CCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTA 26780885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7277 CCTGTGGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTA 7336

 26780886 GGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCC 26780945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7337 GGGATGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCC 7396

 26780946 TGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACA 26781005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7397 TGCCTCAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACA 7456

 26781006 GATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTT 26781065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7457 GATGAGCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTT 7516

 26781066 TCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAA 26781125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7517 TCATGCCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAA 7576

 26781126 GCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGA 26781185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7577 GCTCTCCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGA 7636

 26781186 TTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGT 26781245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7637 TTAAATCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGT 7696

 26781246 TGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGC 26781305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7697 TGGGGGTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGC 7756

 26781306 CCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCT 26781365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7757 CCCTATCCTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCT 7816

 26781366 TATCACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACC 26781425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7817 TATCACTGTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACC 7876

 26781426 AAATATATATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGA 26781485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7877 AAATATATATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGA 7936

 26781486 CATCCATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTAC 26781545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7937 CATCCATCTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTAC 7996

 26781546 TGGACTTACACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGAC 26781605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7997 TGGACTTACACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGAC 8056

 26781606 TGGGAGTTACATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACAC 26781665
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8057 TGGGAGTTACACCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACAC 8116

 26781666 GCTGGCTTTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTG 26781725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8117 GCTGGCTTTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTG 8176

 26781726 AGTCAAGTGTGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCAAGAGGTCCTCCCAACATGTGC 26781785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8177 AGTCAAGTGTGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCAAGAGGTCCTCCCAACATGTGC 8236

 26781786 CCAAGGTAGTTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTAGGGAGATGTTAAGACATCAGT 26781845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8237 CCAAGGTAGTTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTAGGGAGATGTTAAGACATCAGT 8296

 26781846 CAATACATATGGGTTAGGCCAGATGCCGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 26781905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8297 CAATACATATGGGTTAGGCCAGATGCCGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 8356

 26781906 GGCCAAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTG 26781965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8357 GGCCAAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTG 8416

 26781966 AAACGCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGAGTGTGGTGGCGCACGCCTGTAGTCC 26782025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8417 AAACGCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGAGTGTGGTGGCGCACGCCTGTAGTCC 8476

 26782026 TAGCTACTCGGGAG 26782039
          ||||||||||||||
     8477 TAGCTACTCGGGAG 8490

Alignment time is 6.86181 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2701] =>      2701 nucs 'mol-32-32fb-183486_2701'

Score:        2678
Aligned:      2700        nucs
Identic:      2698 (100%) nucs =>      1349 (100%)      1349 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26779423,26780771] EXCISED REGION [26780773,26782123]
 second seq =>  [       1,    1349] EXCISED REGION [    1351,    2701]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [26780772,26780772]
 second seq =>         1 nucs [1350,1350]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1350,1353] to [1351,1354]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26779423 GTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCA 26779482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCA 60

 26779483 GTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTT 26779542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCTTCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTT 120

 26779543 GTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTT 26779602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGCAGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTT 180

 26779603 CACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGG 26779662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGG 240

 26779663 GATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGA 26779722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCTTGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGA 300

 26779723 TTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAG 26779782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAAACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAG 360

 26779783 ATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGAT 26779842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTAGATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGAT 420

 26779843 AGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTC 26779902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGATCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTC 480

 26779903 TGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTG 26779962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTG 540

 26779963 TGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGG 26780022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAGCTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGG 600

 26780023 GTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGA 26780082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTTGAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGA 660

 26780083 GAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGAT 26780142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATTTTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGAT 720

 26780143 AATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAG 26780202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCTATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAG 780

 26780203 TAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTT 26780262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTT 840

 26780263 CTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACA 26780322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGACATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACA 900

 26780323 CCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTG 26780382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATCAACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTG 960

 26780383 ACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAA 26780442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGATCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAA 1020

 26780443 TACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAAT 26780502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAAGTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAAT 1080

 26780503 CAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAG 26780562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCTCCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAG 1140

 26780563 CTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTT 26780622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTACAATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTT 1200

 26780623 AAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTG 26780682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATTTATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTG 1260

 26780683 GCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCA 26780742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCA 1320

 26780743 GGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGG 26780771
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATGG 1349

EXCISED REGION

 26780773 AAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGG 26780832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 AAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGTGG 1410

 26780833 TCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGC 26780892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 TCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGATGC 1470

 26780893 AGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCA 26780952
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 AGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCTCA 1530

 26780953 ATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGC 26781012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 ATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGAGC 1590

 26781013 AGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCC 26781072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 AGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATGCC 1650

 26781073 GTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCC 26781132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 GTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCTCC 1710

 26781133 AAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATC 26781192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 AAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAATC 1770

 26781193 ATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGT 26781252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 ATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGGGT 1830

 26781253 GGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATC 26781312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 GGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCCCTATC 1890

 26781313 CTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACT 26781372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 CTGAAGTTCCCTGGGAGTCGTCAGCCGCCTCATTAGGATACAAAAGATGCTCTTATCACT 1950

 26781373 GTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACCAAATATA 26781432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 GTGGAGATTCCAAGGGTTTTAGAAGTTGTGGGCCAGGAAACAGGGACAAAACCAAATATA 2010

 26781433 TATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATCCAT 26781492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TATTTCACAATATCACAAACAGGAAATTCTCTTCCTCTCTTCTTGAACTGGGACATCCAT 2070

 26781493 CTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGACTT 26781552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 CTTCTCCTGCCCTGGGACATCAGAGTTCCCGGTTCTCAGTCCTGCCAGACTACTGGACTT 2130

 26781553 ACACCAGAGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGGAGT 26781612
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 ACACCAGTGCCTCCCAACCTCCACCCCCTCTCATCAGGCATCCTTACTTGGACTGGGAGT 2190

 26781613 TACATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACACGCTGGCT 26781672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TACATCATCAGGTCTCCTGGTTCCCAGGCCTTCGGGTTCAAACTGAATTACACGCTGGCT 2250

 26781673 TTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTCAAG 26781732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TTGGTCAATGAAAAGAGTCAAATCCTATAAAATATTTAAGGAGGTTTATTCTGAGTCAAG 2310

 26781733 TGTGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCAAGAGGTCCTCCCAACATGTGCCCAAGGT 26781792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TGTGAGTGACCAAGGCCTGAGGCACAGTCTCAAGAGGTCCTCCCAACATGTGCCCAAGGT 2370

 26781793 AGTTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTAGGGAGATGTTAAGACATCAGTCAATACA 26781852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 AGTTGGGTTACAATTTGATTTGATAAATTTTAGGGAGATGTTAAGACATCAGTCAATACA 2430

 26781853 TATGGGTTAGGCCAGATGCCGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG 26781912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 TATGGGTTAGGCCAGATGCCGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG 2490

 26781913 GCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACGCT 26781972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 GCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACGCT 2550

 26781973 CTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGAGTGTGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCTAGCTAC 26782032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 CTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGAGTGTGGTGGCGCACGCCTGTAGTCCTAGCTAC 2610

 26782033 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAA 26782092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAA 2670

 26782093 GATTGAGCCACTGCACTCCACCCTGGGAGAC 26782123
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 GATTGAGCCACTGCACTCCACCCTGGGAGAC 2701

Alignment time is 2.22215 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [26770385,26793491] =>     23107 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    6899] =>      6899 nucs 'mol-32-3487-105130_6899'

Score:        6878
Aligned:      6900        nucs
Identic:      6898 (100%) nucs =>        63 (100%)      6835 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [26774407,26774469] EXCISED REGION [26774471,26781307]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    6899]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [26774470,26774470]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [26775326,26775326]
 second seq =>         1 nucs [919,919]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [26774470,26774483] to [26774471,26774484]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 26774407 ACAGTGTGAAAAGTGGCCATGGGGCACATGTTCTCAGGACCTCCTCGAGCTGTGTCATGG 26774466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGTGTGAAAAGTGGCCATGGGGCACATGTTCTCAGGACCTCCTCGAGCTGTGTCATGG 60

 26774467 GGG 26774469
          |||
       61 GGG 63

EXCISED REGION

 26774471 AAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAGAGAGAAAGAAAATGGCCATCTTCAAGCCAGGAAGAG 26774530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 AAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAGAGAGAAAGAAAATGGCCATCTTCAAGCCAGGAAGAG 123

 26774531 AGCCCTCACCAGAACTCGACCATGCTGGCACCCTGATCTTGAACTTTCAGCCGCCAAAAC 26774590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 AGCCCTCACCAGAACTCGACCATGCTGGCACCCTGATCTTGAACTTTCAGCCGCCAAAAC 183

 26774591 TGGGAAGAAAGTTTCTGTTATTTAAGCCACCCAGTCTATGGTATTTTGTTACGGCAGCCA 26774650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TGGGAAGAAAGTTTCTGTTATTTAAGCCACCCAGTCTATGGTATTTTGTTACGGCAGCCA 243

 26774651 GACCTAACTAAGACACCCACCAAAACAAATAAACAAAAACAAAACCTGTACTTGTTGGTA 26774710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 GACCTAACTAAGACACCCACCAAAACAAATAAACAAAAACAAAACCTGTACTTGTTGGTA 303

 26774711 GTCAACTCCCCTTTCCCCAGCACCTCCTCCACAGGTCTAGGCAACCGTTGAACTATTTTC 26774770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 GTCAACTCCCCTTTCCCCAGCACCTCCTCCACAGGTCTAGGCAACCGTTGAACTATTTTC 363

 26774771 TGTCACTACAGATTTTCCTATTCTGTACATCTCATAAAAATGGAATCATACAGCTTGTGG 26774830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTCACTACAGATTTTCCTATTCTGTACATCTCATAAAAATGGAATCATACAGCTTGTGG 423

 26774831 TCTTTTGTGACTGGCTTCATTCACCTAGCATAATGTTAAACAAAAAATAACATTGTATTT 26774890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 TCTTTTGTGACTGGCTTCATTCACCTAGCATAATGTTAAACAAAAAATAACATTGTATTT 483

 26774891 TGGGGTTTACAATGTATGTATAAATAAAATATATGACAACAGTGTTACAGAAGAAAGAGA 26774950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TGGGGTTTACAATGTATGTATAAATAAAATATATGACAACAGTGTTACAGAAGAAAGAGA 543

 26774951 AGTAAACAGAATTATATTATTGTAATTCTACATAGGCTGTATATTTTAATAACTAGCTCA 26775010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 AGTAAACAGAATTATATTATTGTAATTCTACATAGGCTGTATATTTTAATAACTAGCTCA 603

 26775011 ACCACTAAAAATAAAAAGAGGCATAACTAAAAAGCCAATAGAGGAAATAAATAAAATAGA 26775070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 ACCACTAAAAATAAAAAGAGGCATAACTAAAAAGCCAATAGAGGAAATAAATAAAATAGA 663

 26775071 GTTCTAAAAATATAATCAGTTAACCTAAAAGAAGGAAAGAAAGGCGAATTGATGTACAAA 26775130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTCTAAAAATATAATCAGTTAACCTAAAAGAAGGAAAGAAAGGCGAATTGATGTACAAA 723

 26775131 TAGACGGGATAAATAAAAAACAAATAGCAAGATGTTAAACGTAAATACAACCATTTCAAT 26775190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TAGACGGGATAAATAAAAAACAAATAGCAAGATGTTAAACGTAAATACAACCATTTCAAT 783

 26775191 AATTACATCAAGTATAAATGGACTAAGCCATTCAATTAAAAGGCAAGAGATTTACAGACT 26775250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 AATTACATCAAGTATAAATGGACTAAGCCATTCAATTAAAAGGCAAGAGATTTACAGACT 843

 26775251 GGGGGAAAAAAAGACCCAACTATTTGTTATCTACAAGAGATGTACTTTAAATGTAAAGAC 26775310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 GGGGGAAAAAAAGACCCAACTATTTGTTATCTACAAGAGATGTACTTTAAATGTAAAGAC 903

 26775311 ACAGATCAGTTGAAAGTAAAAGGATGGAAAAAGGATATAACATGCTAACTGGAAGCATAA 26775370
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 ACAGATCAGTTGAAAATAAAAGGATGGAAAAAGGATATAACATGCTAACTGGAAGCATAA 963

 26775371 GAAAGCTAGTGTAACTATTTTAATATCAGATAAGGCAGACTTCAAGACAAGGAGTATTGG 26775430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAAAGCTAGTGTAACTATTTTAATATCAGATAAGGCAGACTTCAAGACAAGGAGTATTGG 1023

 26775431 CCAGACACAGTGGTTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATT 26775490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 CCAGACACAGTGGTTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATT 1083

 26775491 GCTTGAGGTCAGGATTTGAAGACCAACCTGGGCAGCAGAGTGAGACCCTATCTCTACAAT 26775550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 GCTTGAGGTCAGGATTTGAAGACCAACCTGGGCAGCAGAGTGAGACCCTATCTCTACAAT 1143

 26775551 ACATATATTTTAAAATAAATAGATAAAATAATTGAGACAGGGTCTTGTTATGTTGCTCAG 26775610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 ACATATATTTTAAAATAAATAGATAAAATAATTGAGACAGGGTCTTGTTATGTTGCTCAG 1203

 26775611 GCTGGTCTTGAACTCCTGGACCAGCCTGAGCTGGTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGCAT 26775670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 GCTGGTCTTGAACTCCTGGACCAGCCTGAGCTGGTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGCAT 1263

 26775671 GAGCCACCACACCCGATTTCAATTATTTAAAAAAAGAAAAGACAAGAGTGTTACCAGAAA 26775730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GAGCCACCACACCCGATTTCAATTATTTAAAAAAAGAAAAGACAAGAGTGTTACCAGAAA 1323

 26775731 TAAAAAGAGACATGACCATAATGACGAAACAGTCAATCCTTCAGAAAGCTATACCAATGT 26775790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TAAAAAGAGACATGACCATAATGACGAAACAGTCAATCCTTCAGAAAGCTATACCAATGT 1383

 26775791 TAAACATGTTTGCACCTATAACAAAGATTCAAAATATATGAAAAGGCCAGGCACAGTGGC 26775850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TAAACATGTTTGCACCTATAACAAAGATTCAAAATATATGAAAAGGCCAGGCACAGTGGC 1443

 26775851 TCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTAAGGCAGGCCGACCACTTGAGGTCAGGA 26775910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 TCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTAAGGCAGGCCGACCACTTGAGGTCAGGA 1503

 26775911 GTTCGAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCTCGTCTCTATTAAAAATATAAAAATTA 26775970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 GTTCGAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCTCGTCTCTATTAAAAATATAAAAATTA 1563

 26775971 GCCAGGCGTGGTGTTGCATGCCTGTAGTCCCAGCTTACTCCAGAGGCTAAGACAGGAGAA 26776030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GCCAGGCGTGGTGTTGCATGCCTGTAGTCCCAGCTTACTCCAGAGGCTAAGACAGGAGAA 1623

 26776031 TCGCTTGAACTCAGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACAGCAGACCAAG 26776090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 TCGCTTGAACTCAGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACAGCAGACCAAG 1683

 26776091 ACTGTTTCAAAAAAAAAGACAAAAACAAAAAATATATATATGAAGAAAAACTGACAGAGC 26776150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 ACTGTTTCAAAAAAAAAGACAAAAACAAAAAATATATATATGAAGAAAAACTGACAGAGC 1743

 26776151 AAAAGGGAGAAATAAGCAAATTCACAACTGTAGTTGGAGATGTTTACACCTCTCTCAATA 26776210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AAAAGGGAGAAATAAGCAAATTCACAACTGTAGTTGGAGATGTTTACACCTCTCTCAATA 1803

 26776211 ATTGATGGATCAAGTAGATAATAAATCAGAAAACATAGATGATTTGAACAATTCTAACAA 26776270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 ATTGATGGATCAAGTAGATAATAAATCAGAAAACATAGATGATTTGAACAATTCTAACAA 1863

 26776271 CAAACTTGACCTAATTGACATTTATAAAATGCTATTTACAGCAACTGCAAAATACACATT 26776330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 CAAACTTGACCTAATTGACATTTATAAAATGCTATTTACAGCAACTGCAAAATACACATT 1923

 26776331 CTTTTCAAATGCAACTAGAATGTCCACCCAGATAGATCATATTCTGGTCCATGGTCTATT 26776390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 CTTTTCAAATGCAACTAGAATGTCCACCCAGATAGATCATATTCTGGTCCATGGTCTATT 1983

 26776391 TATTGAAGCTCGACAAATTTTACCAGATTTTTCATGTGGGATGAAGCCAACATGGTCCTC 26776450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TATTGAAGCTCGACAAATTTTACCAGATTTTTCATGTGGGATGAAGCCAACATGGTCCTC 2043

 26776451 TAAAGGAAATTTATAGCTTTAAATGCGTATATTAGAAAAGCAAGGGGCTGATAATCAGAT 26776510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 TAAAGGAAATTTATAGCTTTAAATGCGTATATTAGAAAAGCAAGGGGCTGATAATCAGAT 2103

 26776511 AGGTCTTAAATTAAGAAGTCAGAAAAAGAATACTGAAAAAAAAAGAAAGCAAGCATGTTC 26776570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 AGGTCTTAAATTAAGAAGTCAGAAAAAGAATACTGAAAAAAAAAGAAAGCAAGCATGTTC 2163

 26776571 CCATGCTTCCACCAGGGAACACAAGAATGGTTCCATTGAACTGGAAGTTGACACTGTCTC 26776630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CCATGCTTCCACCAGGGAACACAAGAATGGTTCCATTGAACTGGAAGTTGACACTGTCTC 2223

 26776631 CTAGACTTTTGGGGCTTTTCTACCATTGAATAATCAGGAAAAAGATGAGATCAAAATATT 26776690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGACTTTTGGGGCTTTTCTACCATTGAATAATCAGGAAAAAGATGAGATCAAAATATT 2283

 26776691 GGATCATTATTGGTTATTGATCCTGATTTTCAAAAATGTGAAATAGAAGAAATAGGGTTG 26776750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 GGATCATTATTGGTTATTGATCCTGATTTTCAAAAATGTGAAATAGAAGAAATAGGGTTG 2343

 26776751 CTGCTGTACAATGGGAGCAAAAAAAAAGAGCTACTTAGAATCTAGGGGAATATCTTGCAG 26776810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTGCTGTACAATGGGAGCAAAAAAAAAGAGCTACTTAGAATCTAGGGGAATATCTTGCAG 2403

 26776811 ATGGCTCCTAATATCATATTTAGGGGTTAAAAGTTAATAGAAAGCAACCTCATAAGGGCA 26776870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 ATGGCTCCTAATATCATATTTAGGGGTTAAAAGTTAATAGAAAGCAACCTCATAAGGGCA 2463

 26776871 CCAAGGGCCCAGATTCTTTAGAAATAAAGGTCTGGGTCACACCACCAGATGAAGAGCTGC 26776930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 CCAAGGGCCCAGATTCTTTAGAAATAAAGGTCTGGGTCACACCACCAGATGAAGAGCTGC 2523

 26776931 TGGGCTGAGTTGCTGGGCTGAGCTGCTGGTTGTGAGCTAAGAGAGCATGGAATGAGTAGT 26776990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 TGGGCTGAGTTGCTGGGCTGAGCTGCTGGTTGTGAGCTAAGAGAGCATGGAATGAGTAGT 2583

 26776991 GGAAGGAGGAAATTACAAAGATCAACTCTGGCCTAGCGATCAGTTGCATAAATGAGGACT 26777050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 GGAAGGAGGAAATTACAAAGATCAACTCTGGCCTAGCGATCAGTTGCATAAATGAGGACT 2643

 26777051 ATAGTATGCACCCATATTTTCTTATTTGCTGTGTTGACATTTTTTATGAATTTTCCCCAT 26777110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 ATAGTATGCACCCATATTTTCTTATTTGCTGTGTTGACATTTTTTATGAATTTTCCCCAT 2703

 26777111 TTTATAAAAATATTTATTTTTTGTTAGTTAACTTTACAATCTATTTGCAGAATACCAAGG 26777170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TTTATAAAAATATTTATTTTTTGTTAGTTAACTTTACAATCTATTTGCAGAATACCAAGG 2763

 26777171 CAGGACTATGACAGAATTAAAAGAAAATGGGACATTACCCAGAGATCCTAGTCTTGGAGC 26777230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 CAGGACTATGACAGAATTAAAAGAAAATGGGACATTACCCAGAGATCCTAGTCTTGGAGC 2823

 26777231 TAGATGCAGTAAGTCTTGGGGCTTTCAAATGTCCTCCTATGGGGGGAAGAGTAAGTTCAT 26777290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 TAGATGCAGTAAGTCTTGGGGCTTTCAAATGTCCTCCTATGGGGGGAAGAGTAAGTTCAT 2883

 26777291 TTTCATTTGTACACAGGATAAATAAATTATGAGTTAGAAGAGTTTGTTGTTATTGTTTTG 26777350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TTTCATTTGTACACAGGATAAATAAATTATGAGTTAGAAGAGTTTGTTGTTATTGTTTTG 2943

 26777351 GGAATTTAAATATGAAAGCAGATGTTGGGCAGCCAAGGGGAGGAGTGCAGTGAACATGCA 26777410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 GGAATTTAAATATGAAAGCAGATGTTGGGCAGCCAAGGGGAGGAGTGCAGTGAACATGCA 3003

 26777411 TCATGCTTTGTGTATCTTCTGAATAGGTTTTCTATTTGGGGAAAACTAGGATCTTTTGAA 26777470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 TCATGCTTTGTGTATCTTCTGAATAGGTTTTCTATTTGGGGAAAACTAGGATCTTTTGAA 3063

 26777471 TAGCTTTCCTATTTGGGGGGCATTCCTGACATTATGCAGTTCATCTTACCAACAGAGGAG 26777530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 TAGCTTTCCTATTTGGGGGGCATTCCTGACATTATGCAGTTCATCTTACCAACAGAGGAG 3123

 26777531 CTAGAATTTCTTTTCCCTTGCTGCTAGAACTCAGGCTGTGACTGAGGCTCTATACTATTT 26777590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 CTAGAATTTCTTTTCCCTTGCTGCTAGAACTCAGGCTGTGACTGAGGCTCTATACTATTT 3183

 26777591 TTTTAACTTTTATTTAGGTTGAGGGGTACCTGTGCAAGCTTGTTATATAGGTAAACTCAG 26777650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 TTTTAACTTTTATTTAGGTTGAGGGGTACCTGTGCAAGCTTGTTATATAGGTAAACTCAG 3243

 26777651 GTCACAGGAGTTTGTTGTACAGATTATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTTGTACCCAAT 26777710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 GTCACAGGAGTTTGTTGTACAGATTATTTTGTCACCCAGGTACTAAGCCTTGTACCCAAT 3303

 26777711 AGTTATTTTTTCTGATCACCTCCCTACTCCCATCCTCCACCCTCAAGTAGGCCTCAGTGT 26777770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 AGTTATTTTTTCTGATCACCTCCCTACTCCCATCCTCCACCCTCAAGTAGGCCTCAGTGT 3363

 26777771 CTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATAAGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAG 26777830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 CTGTTGTTCCCCTCTTTGTGTCCATAAGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAG 3423

 26777831 AACATGTGAATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCT 26777890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 AACATGTGAATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCT 3483

 26777891 GCATCCATGTTCCCACAAAAGACATGATCTCATTCTTTTTATGGCTGCATAATATTCCAT 26777950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 GCATCCATGTTCCCACAAAAGACATGATCTCATTCTTTTTATGGCTGCATAATATTCCAT 3543

 26777951 AGTGTATATATACCACATTTCCTTTATCCAGTCTGTCACTGATGGGCATTTAGGTTGATT 26778010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 AGTGTATATATACCACATTTCCTTTATCCAGTCTGTCACTGATGGGCATTTAGGTTGATT 3603

 26778011 CCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTTCATTGAACATTCGCATGCATGTGTCTTTATG 26778070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 CCATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTTCATTGAACATTCGCATGCATGTGTCTTTATG 3663

 26778071 GTAGAATGATTTCTATTCCTTTGGGTATATACCCAATAATGGGATTGCTGGGTCAAATGG 26778130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 GTAGAATGATTTCTATTCCTTTGGGTATATACCCAATAATGGGATTGCTGGGTCAAATGG 3723

 26778131 TAGTTCTGTTTTTAGCACTTTGAGGAATCACCACACTGCTTTCCATAAAGGTTGAACTAA 26778190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 TAGTTCTGTTTTTAGCACTTTGAGGAATCACCACACTGCTTTCCATAAAGGTTGAACTAA 3783

 26778191 TTTACACTCCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTCCCTCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCT 26778250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 TTTACACTCCCACCAAGAGCGTGTAAGTGTTCCCTCTTCTCCTCCACTTCACCAGCATCT 3843

 26778251 GTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGC 26778310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 GTTATTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGC 3903

 26778311 GGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTT 26778370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 GGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATATTGAGGTTTTCTTCATATGCTTGTT 3963

 26778371 GGCCGCATGTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAAT 26778430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 GGCCGCATGTATGTCTTGTTTTGAAAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCCACTTTTTAAT 4023

 26778431 GGAGTTGTTTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTTAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATT 26778490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 GGAGTTGTTTGGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTTAAGTTCTTTATAGATGCTGGATATT 4083

 26778491 AGACCTTTGTCACATGCATAGTTTGTTAATATTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTT 26778550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 AGACCTTTGTCACATGCATAGTTTGTTAATATTTTCTCCCATTCTGTGGGTTGTTTGTTT 4143

 26778551 ACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTG 26778610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 ACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTAAGTTCAATCAGATTCCATTTG 4203

 26778611 TCAATTTTTGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGGTGTTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTT 26778670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 TCAATTTTTGCTCTTGTTACGATTGCTTTTGGTGTTTTCATCATGAAATCTTTCCCTGTT 4263

 26778671 CCTATGTCCAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTCTTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCT 26778730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 CCTATGTCCAGAATGGTATTGCTTGGGTTGTCTTCCAGGGTTTAGGGCTTTAATTCATCT 4323

 26778731 TGAGTTTATTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCC 26778790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 TGAGTTTATTTTTGCTTATGGTGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAATCTTCTGCATATGCC 4383

 26778791 TACCCAGTTCTGCATATCCCAGCACCATTTATTGAATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTT 26778850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 TACCCAGTTCTGCATATCCCAGCACCATTTATTGAATAGGGATTCCTTTCCCCATTGCTT 4443

 26778851 GTTTTTGACAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGTTGTAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTT 26778910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 GTTTTTGACAGCTTTGTTGAAGATCAGATGGTTGTAGGTGTACATACTTATTTCTGGGTT 4503

 26778911 ATCTATTCCATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGTTTTTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGT 26778970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 ATCTATTCCATTCTGTTGGTCTATGTGTTTGTTTTTGTACCAGTTCCATGTCATTTTGGT 4563

 26778971 TACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTT 26779030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 TACTGTAGCCCTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAACATGATGCCTCTAGCATTGTTCTT 4623

 26779031 TTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATA 26779090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 TTCACTCAGAATTGCCTTGGCTATCGGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAAGATA 4683

 26779091 GGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGA 26779150
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 GGTTG-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGA 4742

 26779151 GTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCC 26779210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 GTGCAATGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCC 4802

 26779211 TGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTT 26779270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 TGCCTTAGCCTCCTCAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTT 4862

 26779271 TTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTG 26779330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 TTGGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTG 4922

 26779331 ACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 26779390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 ACCTCAGGTGGTCCGCCCACCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 4982

 26779391 CGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAG 26779450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 CGCGCCCGGCCAAGATAGTTTTCTCTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTAGTTTGATAG 5042

 26779451 GAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCT 26779510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 GAATAGCATTGACTCTGTAATTGCTTTGGGCAGTATGTCCATTTTAATGATATTGATTCT 5102

 26779511 TCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGC 26779570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 TCCTATGCATGAGCATGAAATGTTTTCCATTTGTTTGTGTTATCTATGATTTATTTGAGC 5162

 26779571 AGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGG 26779630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 AGTGTTTTGTAACTCTCATTGTAGAGATGTTTCACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGG 5222

 26779631 TATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCT 26779690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 TATTTTAATCTTTTTGTGGCAATTGTGAATGGGATTCCGTCCCTGATTTGGCTCTTGGCT 5282

 26779691 TGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAA 26779750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 TGGCTGTTGTTGGTGTAAAGGAATGCTAGTGATTTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGAA 5342

 26779751 ACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTA 26779810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 ACTTTGCTGAAATTGTTTATCACCTGAAGGAGATTTGGGCTGAGACTACGGGGTTTTCTA 5402

 26779811 GATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGA 26779870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 GATGTACAATCATATCATCTGCAAACAAGGATAGTTTGATTTCCTCTCCTCCTATTTGGA 5462

 26779871 TCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAA 26779930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 TCCCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTTATTGCTCTGGCCAGGACTTCCAATACTGTGTTGAA 5522

 26779931 TAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAG 26779990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 TAGGAGTGGTGAGAGAGGGCATCCTTGTCTTGTGCTGGTTTTCAAGGGGAATGCTTCCAG 5582

 26779991 CTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTT 26780050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 CTTTTGCCCATTCAATATGATGTTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATGGCTCTTATTATTTT 5642

 26780051 GAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATT 26780110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 GAGGTATATTCCTTCAATGCCTAGTTTATTGAGAATTTTTAACATGAAGGATGTTGAATT 5702

 26780111 TTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCT 26780170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 TTATTGAAAGCCTTTTCTACATCTATTGAGATAATCAATCAAGATTGCCCTCACCAATCT 5762

 26780171 ATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACA 26780230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 ATTGAGGCCTCGAACAGAACAACAGGGCAGAGTAAAGGTGTAACAAAACAAAACAAAACA 5822

 26780231 ACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGA 26780290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 ACAACAACAAAAAACTTTGCTTTTCCTATTTTCTACTCTCACTCAGTACAATATTTCTGA 5882

 26780291 CATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATC 26780350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 CATTGGATGTGTGGAGTTATTTTCCCCACACACCAAGCAGTCAATTCTCTGGTGGACATC 5942

 26780351 AACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGA 26780410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 AACTGGATGGCCTATAATTCAATTCAATTCTGACACTATCTGCCTGGAGATAGTGTCAGA 6002

 26780411 TCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAA 26780470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 TCCTACAGGTTGAGGGCTCAATCCCACAAGAATACCCCCCATTTCAGATACCAGTCACAA 6062

 26780471 GTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCT 26780530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 GTAATAAGTTGTCATCTATACTTCTGACCAATCAGATATAAACTGGGGTTTCTACCATCT 6122

 26780531 CCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTAC 26780590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 CCTTCTCAGGTTCAATTAATTTGATAAGACAGCTCCCACAGAACTCAGGAAAATACTTAC 6182

 26780591 AATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATT 26780650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 AATTACCCATTTATTTACTTATTTGTTTATTTAAGTAGTCATCATCATTGGATACCCATT 6242

 26780651 TATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGG 26780710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 TATTCTAAAGAATATCACGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGGAATCTCAGAACTTTGG 6302

 26780711 GAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATG 26780770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 GAGGCCAAGGCAGGAGGATCAGACCAGTCTCAGGAGTTTGAAACCACCCTGGGCAATATG 6362

 26780771 GCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGT 26780830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 GCAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGCACACACCTGT 6422

 26780831 GGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGAT 26780890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 GGTCCCAGCTACTCATGAGGCCGAGGTGGAAGGATCACTTGAGGCCGGGAGGTTAGGGAT 6482

 26780891 GCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCT 26780950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 GCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGGCCCTGCCT 6542

 26780951 CAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGA 26781010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 CAATAAAATAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAGGGATTTCACAAAGGATACAGATGA 6602

 26781011 GCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATG 26781070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 GCAGCCACATGGAAGAGATGCATAGGGCAACGCATGTGGGAAGAGCACGGAGCTTTCATG 6662

 26781071 CCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCT 26781130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 CCGTCTCCAGGCTCACCACCCTCCAAGCACCTTCAACATGTTCAGCTATTTGGAAGCTCT 6722

 26781131 CCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAA 26781190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 CCAAACCAATTCCTTTTGGGTTTTTATGGAAGCTTCATTGTGTAAACATAATTGATTAAA 6782

 26781191 TCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGG 26781250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 TCATTGGCCATTGGTGACCAACTCAAGCTTTAACCCATCTCCCCTCCTGAGAGGTTGGGG 6842

 26781251 GTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCC 26781307
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 GTGGGAGTGAAAGTTCCAACCCTCTAATCATGCCTTGGTTTTTCTGGTGACCAGCCC 6899

Alignment time is 5.57283 s

