
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3292] =>      3292 nucs 'mol-32-22b2-076763_3292'

Score:        3292
Aligned:      3292        nucs
Identic:      3292 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60342985,60346276]
 second seq =>  [       1,    3292]

 60342985 GAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATATTGTATCCTGCAACGCTGTA 60343044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATATTGTATCCTGCAACGCTGTA 60

 60343045 ACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTGGAGAATTTACACTTTTCTA 60343104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTGGAGAATTTACACTTTTCTA 120

 60343105 AATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGACTTCTTCTGTTCCAATTTGG 60343164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGACTTCTTCTGTTCCAATTTGG 180

 60343165 ATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAAGACTTCCAGTACTATGCTG 60343224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAAGACTTCCAGTACTATGCTG 240

 60343225 AATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTC 60343284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTC 300

 60343285 GGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTT 60343344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTT 360

 60343345 ATTGTGTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGA 60343404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGTGTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGA 420

 60343405 TGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCC 60343464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCC 480

 60343465 TTCATTCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGC 60343524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCATTCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGC 540

 60343525 ATCTCTGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATT 60343584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCTCTGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATT 600

 60343585 CAGTTTGCTACTATTTTGTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTG 60343644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTTTGCTACTATTTTGTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTG 660

 60343645 TAGTTTTCTTGATTTGATATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGG 60343704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTTTTCTTGATTTGATATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGG 720

 60343705 TAGAATGCGTTTGGAAGTATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGT 60343764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGAATGCGTTTGGAAGTATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGT 780

 60343765 ATTAGTTCTTCTTTAAATGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGC 60343824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTAGTTCTTCTTTAAATGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGC 840

 60343825 TTGGAGACTTTTATTACAACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGA 60343884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGAGACTTTTATTACAACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGA 900

 60343885 TTTCTTTATGGTTCAGTCTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTA 60343944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCTTTATGGTTCAGTCTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTA 960

 60343945 GATTTTCGAATTAATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTT 60344004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTTTCGAATTAATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTT 1020

 60344005 CTGAGGTATCAATTATAATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTT 60344064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGAGGTATCAATTATAATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTT 1080

 60344065 TTTACTAGTCTGTCTAAAGCTTTGTCAAGTTAATTTATCTTTTCAAAAAAAACAATTTTT 60344124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTACTAGTCTGTCTAAAGCTTTGTCAAGTTAATTTATCTTTTCAAAAAAAACAATTTTT 1140

 60344125 CATTTCATTTATTTTTATTTGTTTGTTCCCATTTCATTTGTTTCTGCTCTGATATTTATT 60344184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTCATTTATTTTTATTTGTTTGTTCCCATTTCATTTGTTTCTGCTCTGATATTTATT 1200

 60344185 CTTTCTTTGTTTCTACTAACTTTGGGTTTGATTTGCTCTTGTTTTTCGAATTCTTTAAGA 60344244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTCTTTGTTTCTACTAACTTTGGGTTTGATTTGCTCTTGTTTTTCGAATTCTTTAAGA 1260

 60344245 TGCATTATTATGTTGCTCATTTGAAGTTTTTCTACTTTTTTGATGTAGGGCTTATTGCAT 60344304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCATTATTATGTTGCTCATTTGAAGTTTTTCTACTTTTTTGATGTAGGGCTTATTGCAT 1320

 60344305 AAACTTTCCTCTTAATACTGCTTTCAGTGTATTCCACAGGTATTGGTATATTGTGTTTCC 60344364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACTTTCCTCTTAATACTGCTTTCAGTGTATTCCACAGGTATTGGTATATTGTGTTTCC 1380

 60344365 ATTTTCATGTAGTTCAAGACATTTTTTCATTCTTAATTTCAATGAAGAAATTAGAAGAAA 60344424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTTCATGTAGTTCAAGACATTTTTTCATTCTTAATTTCAATGAAGAAATTAGAAGAAA 1440

 60344425 TCATTGACATGATTTCAATTTTTTTGAAATTTTAAAGACTTGTTTTGTGGCTTAACATAT 60344484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCATTGACATGATTTCAATTTTTTTGAAATTTTAAAGACTTGTTTTGTGGCTTAACATAT 1500

 60344485 GGTCTATTCTTGAGAATGATCTATATGCTAAGAAGAAGAATGTATATTCTGCAGCCATTG 60344544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTCTATTCTTGAGAATGATCTATATGCTAAGAAGAAGAATGTATATTCTGCAGCCATTG 1560

 60344545 GTTAAATAGTCTGTAAATACCTATTAGGTCTATTTGGTCTATAGATAAATTCTGATATTT 60344604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTAAATAGTCTGTAAATACCTATTAGGTCTATTTGGTCTATAGATAAATTCTGATATTT 1620

 60344605 CTTTTGTGATTATCTATCTATATGTTCTGTCCAGTGCTGAAAGTGGGGTGTTCATGTGTC 60344664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTTGTGATTATCTATCTATATGTTCTGTCCAGTGCTGAAAGTGGGGTGTTCATGTGTC 1680

 60344665 CAGCTACTATTGTATTGGAGTTTGTCTCTCTCTTTAGCTCAATTAATATTTGCTATATAT 60344724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGCTACTATTGTATTGGAGTTTGTCTCTCTCTTTAGCTCAATTAATATTTGCTATATAT 1740

 60344725 ATTTGGGTGCAGTGTTGGGTGCATATATATTTATAATTGTTATATCCCCTTGACGAATTA 60344784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTGGGTGCAGTGTTGGGTGCATATATATTTATAATTGTTATATCCCCTTGACGAATTA 1800

 60344785 ACTCCTTTATCATTATATAATGATCTTCTTTGTCTCTTCTTATAGTTTTTGTATTTAAAT 60344844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTCCTTTATCATTATATAATGATCTTCTTTGTCTCTTCTTATAGTTTTTGTATTTAAAT 1860

 60344845 CTATTTTATCGGGTATAAGTATAGTTCTGCTTTTGTTTCCATTCACATAAAATATCTTTT 60344904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTATTTTATCGGGTATAAGTATAGTTCTGCTTTTGTTTCCATTCACATAAAATATCTTTT 1920

 60344905 TCTGTCCCTTCATTTTCAGTCTATGTAGTTCTTTATAGGTGAAGTGTTTCTTGTAGGCAA 60344964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTGTCCCTTCATTTTCAGTCTATGTAGTTCTTTATAGGTGAAGTGTTTCTTGTAGGCAA 1980

 60344965 CAGATTATTTGGTCTTGTTTTTTAATCCATTCAACCACTGTATATCTTTTGATTGGAGAG 60345024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGATTATTTGGTCTTGTTTTTTAATCCATTCAACCACTGTATATCTTTTGATTGGAGAG 2040

 60345025 TTTAGTTCATTTACATTCAGTGTTATTAGGGATAAGTAAGAACTTACTCCTGCATTTTAT 60345084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTAGTTCATTTACATTCAGTGTTATTAGGGATAAGTAAGAACTTACTCCTGCATTTTAT 2100

 60345085 TTGTTTTCTGCTTGTTTTGTGGTCTTTTCTTCCTTCTTTCCTTTCTTCCTGTGTTCCACT 60345144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGTTTTCTGCTTGTTTTGTGGTCTTTTCTTCCTTCTTTCCTTTCTTCCTGTGTTCCACT 2160

 60345145 TAGTGAAGGTGATTTTCTCAGGTGGTATGCCTTAAATTCTTGCTTTTGTTTGTGTGTATC 60345204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGTGAAGGTGATTTTCTCAGGTGGTATGCCTTAAATTCTTGCTTTTGTTTGTGTGTATC 2220

 60345205 GTATATTTTTAGATTTGAGGTTACCATGAGGCTTGTGAATACTATCTTATAACCCATTAT 60345264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTATATTTTTAGATTTGAGGTTACCATGAGGCTTGTGAATACTATCTTATAACCCATTAT 2280

 60345265 TTTTAACCAATGAAAATCTAACACTGATTGCAAAAACAAACAAGCGAGGAGAAAACTAAC 60345324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTAACCAATGAAAATCTAACACTGATTGCAAAAACAAACAAGCGAGGAGAAAACTAAC 2340

 60345325 AGAAACTATACTTTAACTTCATCCCCCCTGCTTTTTAACTTTTTGTTGTTTCTATTTATA 60345384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGAAACTATACTTTAACTTCATCCCCCCTGCTTTTTAACTTTTTGTTGTTTCTATTTATA 2400

 60345385 TTTTATTATACTATGTCTTGAAAAATTGTTGTAATTTTTTTTATTGGTTTATCTTTTAGT 60345444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTATTATACTATGTCTTGAAAAATTGTTGTAATTTTTTTTATTGGTTTATCTTTTAGT 2460

 60345445 ATCTGTACTCAATATATGAGTAGTTTACACACCACAATTATAGGGTTACAATACTCTGTG 60345504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATCTGTACTCAATATATGAGTAGTTTACACACCACAATTATAGGGTTACAATACTCTGTG 2520

 60345505 TTTTTCTGTGTACTTACTACTACCAGTGAGTTTTGTACCTTCAGATGACTTTTTTCAAAT 60345564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTTCTGTGTACTTACTACTACCAGTGAGTTTTGTACCTTCAGATGACTTTTTTCAAAT 2580

 60345565 TAAAGTACTCCCTTTAGCATTTCTTCTAGGACACGTCTGGTGTTGATGAAATCCCTCAGC 60345624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAAGTACTCCCTTTAGCATTTCTTCTAGGACACGTCTGGTGTTGATGAAATCCCTCAGC 2640

 60345625 TTTTGTTTTTTCTGGGAACATTTGTATTTCACCTTTATGCTTGAAGGATATTTTTACTGG 60345684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTGTTTTTTCTGGGAACATTTGTATTTCACCTTTATGCTTGAAGGATATTTTTACTGG 2700

 60345685 ATATACTATTCTAGGATAAAGGCTGTTTTACCTTCAGCACTTTAAATATGTCTTGCCACT 60345744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATATACTATTCTAGGATAAAGGCTGTTTTACCTTCAGCACTTTAAATATGTCTTGCCACT 2760

 60345745 CTCTCCTAGCCTGTAAGATTTTCACTGAGAAGTCTAATGCCAGATGTATTGGAACTCTTT 60345804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCTCCTAGCCTGTAAGATTTTCACTGAGAAGTCTAATGCCAGATGTATTGGAACTCTTT 2820

 60345805 TGCATGTTATTTTTTTTTCTCTTGCTGCTTTTACGATCCTATATCCTTGACCTTTGGGAG 60345864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGCATGTTATTTTTTTTTCTCTTGCTGCTTTTACGATCCTATATCCTTGACCTTTGGGAG 2880

 60345865 TTTGGTTGTTAAATGTCTTGAGGCAGTCTTATTTGGGTCAAATCTGCTTGGTGTTCTATA 60345924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTGGTTGTTAAATGTCTTGAGGCAGTCTTATTTGGGTCAAATCTGCTTGGTGTTCTATA 2940

 60345925 ATCTTCTTGTACTTGAATATTGATATCTTTCTCTAGATTTGGGAAGTTCTCTGCTATTAT 60345984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCTTCTTGTACTTGAATATTGATATCTTTCTCTAGATTTGGGAAGTTCTCTGCTATTAT 3000

 60345985 CTCTTTGAATAAATTTTCTACCCCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCCTCCTTAAGGCCAATA 60346044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCTTTGAATAAATTTTCTACCCCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCCTCCTTAAGGCCAATA 3060

 60346045 ACTCTTAGATTTGTCCTTTTGAGGCTATTTTCTAGATCTTGTAGGCATGTTTCATTCTTT 60346104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACTCTTAGATTTGTCCTTTTGAGGCTATTTTCTAGATCTTGTAGGCATGTTTCATTCTTT 3120

 60346105 TTATTATTTCTTCTTTTGTCTTCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCCATCTTCAGGCT 60346164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTATTATTTCTTCTTTTGTCTTCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCCATCTTCAGGCT 3180

 60346165 CACTAATTGTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTGTTGAGAGACTCTGATGTACTCTTCG 60346224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CACTAATTGTTTCTTCTGCTTGATCAATTCTGCTGTTGAGAGACTCTGATGTACTCTTCG 3240

 60346225 GTATGTCAATTATGTTTTTTGCTCCAGAATTTCTACTTTTTAAAGCTTATTT 60346276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTATGTCAATTATGTTTTTTGCTCCAGAATTTCTACTTTTTAAAGCTTATTT 3292

Alignment time is 3.78423 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2473] =>      2473 nucs 'mol-32-22e9-049181_2473'

Score:        2440
Aligned:      2473        nucs
Identic:      2470 (100%) nucs =>      2141 (100%)       329 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60339254,60341397] EXCISED REGION [60343242,60343570]
 second seq =>  [       1,    2144] EXCISED REGION [    2145,    2473]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [2144,2144] to [2145,2145]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60339254 TAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACA 60339313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACA 60

 60339314 AAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAA 60339373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAA 120

 60339374 AAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTG 60339433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTG 180

 60339434 GGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAA 60339493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAA 240

 60339494 TGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAAC 60339553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAAC 300

 60339554 ATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGC 60339613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGC 360

 60339614 ACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGG 60339673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGG 420

 60339674 ATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAAT 60339733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAAT 480

 60339734 GATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAA 60339793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAA 540

 60339794 TTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTG 60339853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTG 600

 60339854 CTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACT 60339913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACT 660

 60339914 TTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGC 60339973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGC 720

 60339974 TTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTT 60340033
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTCCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTT 780

 60340034 ATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGG 60340093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGG 840

 60340094 GACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCC 60340153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCC 900

 60340154 TCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGAT 60340213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGAT 960

 60340214 TTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGA 60340273
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTTTTAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGA 1020

 60340274 GATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCAT 60340333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCAT 1080

 60340334 CACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTG 60340393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTG 1140

 60340394 TTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACT 60340453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACT 1200

 60340454 AGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCC 60340513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCC 1260

 60340514 ATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGT 60340573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGT 1320

 60340574 TCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAG 60340633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAG 1380

 60340634 AACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTT 60340693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTT 1440

 60340694 CCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCAT 60340753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCAT 1500

 60340754 TGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTT 60340813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTT 1560

 60340814 CCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCT 60340873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCT 1620

 60340874 CTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAA 60340933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAA 1680

 60340934 ACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAA 60340993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAA 1740

 60340994 TGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAA 60341053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAA 1800

 60341054 AATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAAT 60341113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAAT 1860

 60341114 AAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGA 60341173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGA 1920

 60341174 TTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTA 60341233
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTCTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTA 1980

 60341234 GTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTT 60341293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTT 2040

 60341294 GCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTA 60341353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTA 2100

 60341354 ATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 60341397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 2144

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 2204

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 2264

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 2324

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 2384

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 2444

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAA 60343570
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2445 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAA 2473

Alignment time is 3.09764 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2868] =>      2868 nucs 'mol-32-2e0a-068668_2868'

Score:        1454
Aligned:      1465        nucs
Identic:      1464 (100%) nucs =>        20 (100%)      1444 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60341761,60341780] EXCISED REGION [60341834,60343278]
 second seq =>  [    1108,    1127] EXCISED REGION [    1425,    2868]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        53 nucs [60341781,60341833]
 second seq =>       297 nucs [1128,1424]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60341761 CGAGTAGCTGGGATTACAGG 60341780
          ||||||||||||||||||||
     1108 CGAGTAGCTGGGATTACAGG 1127

EXCISED REGION

 60341834 ACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCT 60341893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 ACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCT 1484

 60341894 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCT 60341953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCT 1544

 60341954 TTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATT 60342013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATT 1604

 60342014 TTTGTATACAACAAGAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTG 60342073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TTTGTATACAACAAGAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTG 1664

 60342074 TCCCAGAACTATTTTTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTT 60342133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 TCCCAGAACTATTTTTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTT 1724

 60342134 TTTCAAAAATGAATTCACTGCAGATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCC 60342193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TTTCAAAAATGAATTCACTGCAGATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCC 1784

 60342194 ATTGGTCTATTTTTTTTTATGCCAGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCT 60342253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 ATTGGTCTATTTTTTTTTATGCCAGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCT 1844

 60342254 GTAGTACAATTCGAAGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTG 60342313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 GTAGTACAATTCGAAGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTG 1904

 60342314 GCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTTATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATT 60342373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTTATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATT 1964

 60342374 TCTGTGATGAGTATCATTGGTATTTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTT 60342433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 TCTGTGATGAGTATCATTGGTATTTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTT 2024

 60342434 GGTAGTAGGGATGTTTTAACAATACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTC 60342493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 GGTAGTAGGGATGTTTTAACAATACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTC 2084

 60342494 CATTTTTGTGTGTCCTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGA 60342553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 CATTTTTGTGTGTCCTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGA 2144

 60342554 TCTTTCACTTCTTTGATTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTA 60342613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 TCTTTCACTTCTTTGATTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTA 2204

 60342614 AATGGGATTACTTTCTTGATTTCTTTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCT 60342673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 AATGGGATTACTTTCTTGATTTCTTTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCT 2264

 60342674 ACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAA 60342733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 ACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAA 2324

 60342734 GGCAAGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCA 60342793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 GGCAAGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCA 2384

 60342794 TCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCT 60342853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 TCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCT 2444

 60342854 ACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCAGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCC 60342913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 ACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCAGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCC 2504

 60342914 GAGGTTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCCATCTCAAAAAAAAA 60342973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     2505 GAGGTTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCCATCTC-AAAAAAAA 2563

 60342974 AAAAAAGAAACGAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATATTGTATCCT 60343033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 AAAAAAGAAACGAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATATTGTATCCT 2623

 60343034 GCAACGCTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTGGAGAATTT 60343093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 GCAACGCTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTGGAGAATTT 2683

 60343094 ACACTTTTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGACTTCTTCTG 60343153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 ACACTTTTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGACTTCTTCTG 2743

 60343154 TTCCAATTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAAGACTTCCA 60343213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 TTCCAATTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAAGACTTCCA 2803

 60343214 GTACTATGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAG 60343273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 GTACTATGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAG 2863

 60343274 AAAAG 60343278
          |||||
     2864 AAAAG 2868

Alignment time is 3.53893 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3891] =>      3891 nucs 'mol-32-2f07-107895_3891'

Score:        3858
Aligned:      3891        nucs
Identic:      3888 (100%) nucs =>      3116 (100%)       772 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60338280,60341397] EXCISED REGION [60343242,60344014]
 second seq =>  [       1,    3118] EXCISED REGION [    3119,    3891]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [3118,3118] to [3119,3119]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60338280 GATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAAACCCAAACTCAGAGGAGGAAAGTGACTTGCCT 60338339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAAACCCAAACTCAGAGGAGGAAAGTGACTTGCCT 60

 60338340 TATCATATGTTGTGCCCATACGAAGACCCATCTTTTCAAATGTCTTGTGTTTTATTGGTT 60338399
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCATGTGTTGTGCCCATACGAAGACCCATCTTTTCAAATGTCTTGTGTTTTATTGGTT 120

 60338400 CCCAAGTTGTTTATATAATAAAATAATGTGCCTTTAAAAACTAAGATTCACCACAACACA 60338459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCAAGTTGTTTATATAATAAAATAATGTGCCTTTAAAAACTAAGATTCACCACAACACA 180

 60338460 CAGGGTGAAGGAATAGGTTTTTCTGCTGTTTCTTCTCTAGGAAAGGTGGGCGCAGACGGT 60338519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGGGTGAAGGAATAGGTTTTTCTGCTGTTTCTTCTCTAGGAAAGGTGGGCGCAGACGGT 240

 60338520 ACCGCACACACTGTGAGACTGTGGGACTCTTGGCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTCAT 60338579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCGCACACACTGTGAGACTGTGGGACTCTTGGCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTCAT 300

 60338580 ACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCAACTTCAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATAAT 60338639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCAACTTCAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATAAT 360

 60338640 GCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAATCTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGTTC 60338699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAATCTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGTTC 420

 60338700 AAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAATCATTCACTAAACAATAAATATGGCCTCCTGAA 60338759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAATCATTCACTAAACAATAAATATGGCCTCCTGAA 480

 60338760 GCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCAAAATTTTACATTTTTGACATACTCAAAA 60338819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCAAAATTTTACATTTTTGACATACTCAAAA 540

 60338820 TTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTATCTAGATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGCAA 60338879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTATCTAGATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGCAA 600

 60338880 ACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGTAAATATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTTAT 60338939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGTAAATATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTTAT 660

 60338940 AACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTCATCCAAAAACAACAAAATAATTGGTTATCATG 60338999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTCATCCAAAAACAACAAAATAATTGGTTATCATG 720

 60339000 AATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCCATGGGAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACCGT 60339059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCCATGGGAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACCGT 780

 60339060 TAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTTCCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAATT 60339119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTTCCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAATT 840

 60339120 AGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATTACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAAAT 60339179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATTACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAAAT 900

 60339180 ACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTATTACTGATAACAAGACAAGAACATAGACAATTC 60339239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTATTACTGATAACAAGACAAGAACATAGACAATTC 960

 60339240 TAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAA 60339299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAA 1020

 60339300 AGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATG 60339359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATG 1080

 60339360 AAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAAT 60339419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAAT 1140

 60339420 AGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAAT 60339479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAAT 1200

 60339480 ACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTT 60339539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTT 1260

 60339540 AAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCT 60339599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCT 1320

 60339600 GAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTA 60339659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTA 1380

 60339660 GACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATG 60339719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATG 1440

 60339720 CTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGA 60339779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGA 1500

 60339780 CAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGG 60339839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGG 1560

 60339840 GGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAA 60339899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAA 1620

 60339900 ATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCAC 60339959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCAC 1680

 60339960 GTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGA 60340019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGA 1740

 60340020 AATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGG 60340079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGG 1800

 60340080 AAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGA 60340139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGA 1860

 60340140 AATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAAC 60340199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAAC 1920

 60340200 TGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATT 60340259
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTAACCTGGAGATTTTTTTTTAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATT 1980

 60340260 TATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTA 60340319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTA 2040

 60340320 AATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTA 60340379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTA 2100

 60340380 TAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTG 60340439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTG 2160

 60340440 TGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTA 60340499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTA 2220

 60340500 ACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGC 60340559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGC 2280

 60340560 CTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTAC 60340619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTAC 2340

 60340620 CACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACA 60340679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACA 2400

 60340680 GATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACT 60340739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACT 2460

 60340740 GAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAA 60340799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAA 2520

 60340800 CACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTG 60340859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTG 2580

 60340860 GAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAA 60340919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAA 2640

 60340920 ACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAG 60340979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAG 2700

 60340980 CATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGAT 60341039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGAT 2760

 60341040 CACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCA 60341099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCA 2820

 60341100 CAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATAT 60341159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATAT 2880

 60341160 ATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGAT 60341219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGAT 2940

 60341220 GACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTT 60341279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTT 3000

 60341280 TCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATAT 60341339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATAT 3060

 60341340 TTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 60341397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 3118

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 3178

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 3238

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 3298

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 3358

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3359 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATGCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 3418

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 60343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 3478

 60343602 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 60343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 3538

 60343662 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 60343721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 3598

 60343722 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 60343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 3658

 60343782 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 60343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 3718

 60343842 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 60343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 3778

 60343902 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 60343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 3838

 60343962 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATC 60344014
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATC 3891

Alignment time is 4.83492 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2973] =>      2973 nucs 'mol-32-2f12-083168_2973'

Score:        2951
Aligned:      2973        nucs
Identic:      2971 (100%) nucs =>      2138 (100%)       833 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60339258,60341397] EXCISED REGION [60343242,60344074]
 second seq =>  [       1,    2140] EXCISED REGION [    2141,    2973]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [2140,2140] to [2141,2141]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60339258 GTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACAAAAT 60339317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACAAAAT 60

 60339318 AATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAAAAAA 60339377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAAAAAA 120

 60339378 CTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTGGGGA 60339437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTGGGGA 180

 60339438 TATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTG 60339497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTG 240

 60339498 TGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTA 60339557
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAGGAAATGGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTA 300

 60339558 TTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAA 60339617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAA 360

 60339618 GATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGT 60339677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGT 420

 60339678 ATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATT 60339737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATT 480

 60339738 CATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTG 60339797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTG 540

 60339798 AAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCT 60339857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCT 600

 60339858 AAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTA 60339917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTA 660

 60339918 AAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTT 60339977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTT 720

 60339978 GTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTT 60340037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTT 780

 60340038 AGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACA 60340097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACA 840

 60340098 TGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAA 60340157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAA 900

 60340158 TATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTT 60340217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTT 960

 60340218 TTTAAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATA 60340277
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATA 1020

 60340278 TTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACC 60340337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACC 1080

 60340338 TCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTT 60340397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTT 1140

 60340398 GAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGAT 60340457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGAT 1200

 60340458 CTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGC 60340517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGC 1260

 60340518 CCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTA 60340577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTA 1320

 60340578 CTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACA 60340637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACA 1380

 60340638 TAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCAT 60340697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCAT 1440

 60340698 CCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTG 60340757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTG 1500

 60340758 TATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAA 60340817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAA 1560

 60340818 ATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTC 60340877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTC 1620

 60340878 AATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACAT 60340937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACAT 1680

 60340938 TGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCC 60340997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCC 1740

 60340998 CCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATC 60341057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATC 1800

 60341058 TTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAA 60341117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAA 1860

 60341118 TTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGC 60341177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGC 1920

 60341178 TGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTC 60341237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTC 1980

 60341238 TGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTA 60341297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTA 2040

 60341298 TTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTG 60341357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTG 2100

 60341358 GATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 60341397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 2140

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 2200

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 2260

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 2320

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 2380

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 2440

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 60343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 2500

 60343602 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 60343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 2560

 60343662 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 60343721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 2620

 60343722 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 60343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 2680

 60343782 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 60343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 2740

 60343842 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 60343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 2800

 60343902 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 60343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 2860

 60343962 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 60344021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 2920

 60344022 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTC 60344074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTC 2973

Alignment time is 4.09537 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3144] =>      3144 nucs 'mol-32-2f12-104060_3144'

Score:        3143
Aligned:      3143        nucs
Identic:      3143 (100%) nucs =>         9 (100%)      3134 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60333533,60333541] EXCISED REGION [60343040,60346173]
 second seq =>  [       1,       9] EXCISED REGION [      11,    3144]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      9498 nucs [60333542,60343039]
 second seq =>         1 nucs [10,10]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      8022 nucs [60335018,60343039]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [9,9] to [10,10]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60333542,60333542] to [60343039,60343039]
 second seq =>         0 nucs

 60333533 ATAAAAAAT 60333541
          |||||||||
        1 ATAAAAAAT 9

EXCISED REGION

 60343040 CTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTGGAGAATTTACACTT 60343099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       11 CTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTGGAGAATTTACACTT 70

 60343100 TTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGACTTCTTCTGTTCCAA 60343159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       71 TTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGACTTCTTCTGTTCCAA 130

 60343160 TTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAAGACTTCCAGTACTA 60343219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      131 TTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAAGACTTCCAGTACTA 190

 60343220 TGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGG 60343279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 TGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGG 250

 60343280 CTTTCGGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGG 60343339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 CTTTCGGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGG 310

 60343340 CTTTTATTGTGTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAA 60343399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 CTTTTATTGTGTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAA 370

 60343400 AGGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATT 60343459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 AGGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATT 430

 60343460 TGCCCTTCATTCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATC 60343519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 TGCCCTTCATTCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATC 490

 60343520 CTTGCATCTCTGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTT 60343579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 CTTGCATCTCTGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTT 550

 60343580 GAATTCAGTTTGCTACTATTTTGTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTG 60343639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 GAATTCAGTTTGCTACTATTTTGTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTG 610

 60343640 GCCTGTAGTTTTCTTGATTTGATATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAG 60343699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 GCCTGTAGTTTTCTTGATTTGATATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAG 670

 60343700 CCAGGTAGAATGCGTTTGGAAGTATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGT 60343759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 CCAGGTAGAATGCGTTTGGAAGTATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGT 730

 60343760 TTAGTATTAGTTCTTCTTTAAATGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTT 60343819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 TTAGTATTAGTTCTTCTTTAAATGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTT 790

 60343820 CTTGCTTGGAGACTTTTATTACAACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGT 60343879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 CTTGCTTGGAGACTTTTATTACAACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGT 850

 60343880 TTAGATTTCTTTATGGTTCAGTCTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTC 60343939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 TTAGATTTCTTTATGGTTCAGTCTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTC 910

 60343940 TTTTAGATTTTCGAATTAATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTG 60343999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TTTTAGATTTTCGAATTAATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTG 970

 60344000 CATTTCTGAGGTATCAATTATAATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTC 60344059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 CATTTCTGAGGTATCAATTATAATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTC 1030

 60344060 TTTTTTTTACTAGTCTGTCTAAAGCTTTGTCAAGTTAATTTATCTTTTCAAAAAAAACAA 60344119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 TTTTTTTTACTAGTCTGTCTAAAGCTTTGTCAAGTTAATTTATCTTTTCAAAAAAAACAA 1090

 60344120 TTTTTCATTTCATTTATTTTTATTTGTTTGTTCCCATTTCATTTGTTTCTGCTCTGATAT 60344179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 TTTTTCATTTCATTTATTTTTATTTGTTTGTTCCCATTTCATTTGTTTCTGCTCTGATAT 1150

 60344180 TTATTCTTTCTTTGTTTCTACTAACTTTGGGTTTGATTTGCTCTTGTTTTTCGAATTCTT 60344239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 TTATTCTTTCTTTGTTTCTACTAACTTTGGGTTTGATTTGCTCTTGTTTTTCGAATTCTT 1210

 60344240 TAAGATGCATTATTATGTTGCTCATTTGAAGTTTTTCTACTTTTTTGATGTAGGGCTTAT 60344299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 TAAGATGCATTATTATGTTGCTCATTTGAAGTTTTTCTACTTTTTTGATGTAGGGCTTAT 1270

 60344300 TGCATAAACTTTCCTCTTAATACTGCTTTCAGTGTATTCCACAGGTATTGGTATATTGTG 60344359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TGCATAAACTTTCCTCTTAATACTGCTTTCAGTGTATTCCACAGGTATTGGTATATTGTG 1330

 60344360 TTTCCATTTTCATGTAGTTCAAGACATTTTTTCATTCTTAATTTCAATGAAGAAATTAGA 60344419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 TTTCCATTTTCATGTAGTTCAAGACATTTTTTCATTCTTAATTTCAATGAAGAAATTAGA 1390

 60344420 AGAAATCATTGACATGATTTCAATTTTTTTGAAATTTTAAAGACTTGTTTTGTGGCTTAA 60344479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 AGAAATCATTGACATGATTTCAATTTTTTTGAAATTTTAAAGACTTGTTTTGTGGCTTAA 1450

 60344480 CATATGGTCTATTCTTGAGAATGATCTATATGCTAAGAAGAAGAATGTATATTCTGCAGC 60344539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 CATATGGTCTATTCTTGAGAATGATCTATATGCTAAGAAGAAGAATGTATATTCTGCAGC 1510

 60344540 CATTGGTTAAATAGTCTGTAAATACCTATTAGGTCTATTTGGTCTATAGATAAATTCTGA 60344599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 CATTGGTTAAATAGTCTGTAAATACCTATTAGGTCTATTTGGTCTATAGATAAATTCTGA 1570

 60344600 TATTTCTTTTGTGATTATCTATCTATATGTTCTGTCCAGTGCTGAAAGTGGGGTGTTCAT 60344659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TATTTCTTTTGTGATTATCTATCTATATGTTCTGTCCAGTGCTGAAAGTGGGGTGTTCAT 1630

 60344660 GTGTCCAGCTACTATTGTATTGGAGTTTGTCTCTCTCTTTAGCTCAATTAATATTTGCTA 60344719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 GTGTCCAGCTACTATTGTATTGGAGTTTGTCTCTCTCTTTAGCTCAATTAATATTTGCTA 1690

 60344720 TATATATTTGGGTGCAGTGTTGGGTGCATATATATTTATAATTGTTATATCCCCTTGACG 60344779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TATATATTTGGGTGCAGTGTTGGGTGCATATATATTTATAATTGTTATATCCCCTTGACG 1750

 60344780 AATTAACTCCTTTATCATTATATAATGATCTTCTTTGTCTCTTCTTATAGTTTTTGTATT 60344839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 AATTAACTCCTTTATCATTATATAATGATCTTCTTTGTCTCTTCTTATAGTTTTTGTATT 1810

 60344840 TAAATCTATTTTATCGGGTATAAGTATAGTTCTGCTTTTGTTTCCATTCACATAAAATAT 60344899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 TAAATCTATTTTATCGGGTATAAGTATAGTTCTGCTTTTGTTTCCATTCACATAAAATAT 1870

 60344900 CTTTTTCTGTCCCTTCATTTTCAGTCTATGTAGTTCTTTATAGGTGAAGTGTTTCTTGTA 60344959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CTTTTTCTGTCCCTTCATTTTCAGTCTATGTAGTTCTTTATAGGTGAAGTGTTTCTTGTA 1930

 60344960 GGCAACAGATTATTTGGTCTTGTTTTTTAATCCATTCAACCACTGTATATCTTTTGATTG 60345019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GGCAACAGATTATTTGGTCTTGTTTTTTAATCCATTCAACCACTGTATATCTTTTGATTG 1990

 60345020 GAGAGTTTAGTTCATTTACATTCAGTGTTATTAGGGATAAGTAAGAACTTACTCCTGCAT 60345079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GAGAGTTTAGTTCATTTACATTCAGTGTTATTAGGGATAAGTAAGAACTTACTCCTGCAT 2050

 60345080 TTTATTTGTTTTCTGCTTGTTTTGTGGTCTTTTCTTCCTTCTTTCCTTTCTTCCTGTGTT 60345139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TTTATTTGTTTTCTGCTTGTTTTGTGGTCTTTTCTTCCTTCTTTCCTTTCTTCCTGTGTT 2110

 60345140 CCACTTAGTGAAGGTGATTTTCTCAGGTGGTATGCCTTAAATTCTTGCTTTTGTTTGTGT 60345199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CCACTTAGTGAAGGTGATTTTCTCAGGTGGTATGCCTTAAATTCTTGCTTTTGTTTGTGT 2170

 60345200 GTATCGTATATTTTTAGATTTGAGGTTACCATGAGGCTTGTGAATACTATCTTATAACCC 60345259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 GTATCGTATATTTTTAGATTTGAGGTTACCATGAGGCTTGTGAATACTATCTTATAACCC 2230

 60345260 ATTATTTTTAACCAATGAAAATCTAACACTGATTGCAAAAACAAACAAGCGAGGAGAAAA 60345319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 ATTATTTTTAACCAATGAAAATCTAACACTGATTGCAAAAACAAACAAGCGAGGAGAAAA 2290

 60345320 CTAACAGAAACTATACTTTAACTTCATCCCCCCTGCTTTTTAACTTTTTGTTGTTTCTAT 60345379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 CTAACAGAAACTATACTTTAACTTCATCCCCCCTGCTTTTTAACTTTTTGTTGTTTCTAT 2350

 60345380 TTATATTTTATTATACTATGTCTTGAAAAATTGTTGTAATTTTTTTTATTGGTTTATCTT 60345439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TTATATTTTATTATACTATGTCTTGAAAAATTGTTGTAATTTTTTTTATTGGTTTATCTT 2410

 60345440 TTAGTATCTGTACTCAATATATGAGTAGTTTACACACCACAATTATAGGGTTACAATACT 60345499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TTAGTATCTGTACTCAATATATGAGTAGTTTACACACCACAATTATAGGGTTACAATACT 2470

 60345500 CTGTGTTTTTCTGTGTACTTACTACTACCAGTGAGTTTTGTACCTTCAGATGACTTTTTT 60345559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 CTGTGTTTTTCTGTGTACTTACTACTACCAGTGAGTTTTGTACCTTCAGATGACTTTTTT 2530

 60345560 CAAATTAAAGTACTCCCTTTAGCATTTCTTCTAGGACACGTCTGGTGTTGATGAAATCCC 60345619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 CAAATTAAAGTACTCCCTTTAGCATTTCTTCTAGGACACGTCTGGTGTTGATGAAATCCC 2590

 60345620 TCAGCTTTTGTTTTTTCTGGGAACATTTGTATTTCACCTTTATGCTTGAAGGATATTTTT 60345679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TCAGCTTTTGTTTTTTCTGGGAACATTTGTATTTCACCTTTATGCTTGAAGGATATTTTT 2650

 60345680 ACTGGATATACTATTCTAGGATAAAGGCTGTTTTACCTTCAGCACTTTAAATATGTCTTG 60345739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 ACTGGATATACTATTCTAGGATAAAGGCTGTTTTACCTTCAGCACTTTAAATATGTCTTG 2710

 60345740 CCACTCTCTCCTAGCCTGTAAGATTTTCACTGAGAAGTCTAATGCCAGATGTATTGGAAC 60345799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 CCACTCTCTCCTAGCCTGTAAGATTTTCACTGAGAAGTCTAATGCCAGATGTATTGGAAC 2770

 60345800 TCTTTTGCATGTTATTTTTTTTTCTCTTGCTGCTTTTACGATCCTATATCCTTGACCTTT 60345859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 TCTTTTGCATGTTATTTTTTTTTCTCTTGCTGCTTTTACGATCCTATATCCTTGACCTTT 2830

 60345860 GGGAGTTTGGTTGTTAAATGTCTTGAGGCAGTCTTATTTGGGTCAAATCTGCTTGGTGTT 60345919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 GGGAGTTTGGTTGTTAAATGTCTTGAGGCAGTCTTATTTGGGTCAAATCTGCTTGGTGTT 2890

 60345920 CTATAATCTTCTTGTACTTGAATATTGATATCTTTCTCTAGATTTGGGAAGTTCTCTGCT 60345979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 CTATAATCTTCTTGTACTTGAATATTGATATCTTTCTCTAGATTTGGGAAGTTCTCTGCT 2950

 60345980 ATTATCTCTTTGAATAAATTTTCTACCCCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCCTCCTTAAGGC 60346039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 ATTATCTCTTTGAATAAATTTTCTACCCCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCCTCCTTAAGGC 3010

 60346040 CAATAACTCTTAGATTTGTCCTTTTGAGGCTATTTTCTAGATCTTGTAGGCATGTTTCAT 60346099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 CAATAACTCTTAGATTTGTCCTTTTGAGGCTATTTTCTAGATCTTGTAGGCATGTTTCAT 3070

 60346100 TCTTTTTATTATTTCTTCTTTTGTCTTCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCCATCTTC 60346159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 TCTTTTTATTATTTCTTCTTTTGTCTTCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCCATCTTC 3130

 60346160 AGGCTCACTAATTG 60346173
          ||||||||||||||
     3131 AGGCTCACTAATTG 3144

Alignment time is 4.45261 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4444] =>      4444 nucs 'mol-32-2f1d-018661_4444'

Score:        4422
Aligned:      4444        nucs
Identic:      4442 (100%) nucs =>      3609 (100%)       833 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60337787,60341397] EXCISED REGION [60343242,60344074]
 second seq =>  [       1,    3611] EXCISED REGION [    3612,    4444]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [3611,3611] to [3612,3612]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60337787 CCAGCAAGTAGCAGCAGCCACCAGCAGCGTCGCCTTCCCAACTGAGAAAGTTAAGCCCCG 60337846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGCAAGTAGCAGCAGCCACCAGCAGCGTCGCCTTCCCAACTGAGAAAGTTAAGCCCCG 60

 60337847 ACTGGTGTCCTGGGTCCCGAGGCAAAGAGGGAAAGCTAGAGAACTCAGGGCCACAGTTCT 60337906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGGTGTCCTGGGTCCCGAGGCAAAGAGGGAAAGCTAGAGAACTCAGGGCCACAGTTCT 120

 60337907 GAGAGTGACCAGTATGAGTTGTGGAGGGGACACAGGTCTGAACGGGGAAGGGGTGGAGAT 60337966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAGTGACCAGTATGAGTTGTGGAGGGGACACAGGTCTGAACGGGGAAGGGGTGGAGAT 180

 60337967 GGGTTCTGATGGCAGATGGAGACCAGGGAAGCTGCAACCCCGCGGTTAAATCCTGCGTTT 60338026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGTTCTGATGGCAGATGGAGACCAGGGAAGCTGCAACCCCGCGGTTAAATCCTGCGTTT 240

 60338027 CCAGAATGGGCCTGAAAATAGTGGAGTAAAGAAATGAGTTATCAGGACAGCCTCCAAAAA 60338086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGAATGGGCCTGAAAATAGTGGAGTAAAGAAATGAGTTATCAGGACAGCCTCCAAAAA 300

 60338087 AAGCTTAACAGATCTCACCCTGACCAGCCCTGAGGGCAAACAGGGTGTCAATAGGCAAGG 60338146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGCTTAACAGATCTCACCCTGACCAGCCCTGAGGGCAAACAGGGTGTCAATAGGCAAGG 360

 60338147 ACAAAAGCTGTACATTTGCTTTCAGAAACACTGAGCCAAGGCCATCCTAATCATAAGCTG 60338206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAAAGCTGTACATTTGCTTTCAGAAACACTGAGCCAAGGCCATCCTAATCATAAGCTG 420

 60338207 TCTGTGCAGTCCGTTGTATTTCAGAATTTGGACATTCCATGAAGCTTGCATCTTTTTCTT 60338266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGTGCAGTCCGTTGTATTTCAGAATTTGGACATTCCATGAAGCTTGCATCTTTTTCTT 480

 60338267 TACAGTTCACTGTGATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAAACCCAAACTCAGAGGAGGA 60338326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACAGTTCACTGTGATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAAACCCAAACTCAGAGGAGGA 540

 60338327 AAGTGACTTGCCTTATCATATGTTGTGCCCATACGAAGACCCATCTTTTCAAATGTCTTG 60338386
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTGACTTGCCTTATCATGTGTTGTGCCCATACGAAGACCCATCTTTTCAAATGTCTTG 600

 60338387 TGTTTTATTGGTTCCCAAGTTGTTTATATAATAAAATAATGTGCCTTTAAAAACTAAGAT 60338446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTTTATTGGTTCCCAAGTTGTTTATATAATAAAATAATGTGCCTTTAAAAACTAAGAT 660

 60338447 TCACCACAACACACAGGGTGAAGGAATAGGTTTTTCTGCTGTTTCTTCTCTAGGAAAGGT 60338506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCACCACAACACACAGGGTGAAGGAATAGGTTTTTCTGCTGTTTCTTCTCTAGGAAAGGT 720

 60338507 GGGCGCAGACGGTACCGCACACACTGTGAGACTGTGGGACTCTTGGCCACCATGCGCATC 60338566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGCGCAGACGGTACCGCACACACTGTGAGACTGTGGGACTCTTGGCCACCATGCGCATC 780

 60338567 TTGAGGATTTCATACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCAACTTCAGGACCATTCAGGT 60338626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGAGGATTTCATACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCAACTTCAGGACCATTCAGGT 840

 60338627 GCTCCTCAATAATGCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAATCTTTTGTTCTGCTAG 60338686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTCCTCAATAATGCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAATCTTTTGTTCTGCTAG 900

 60338687 TGCACTAATGTTCAAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAATCATTCACTAAACAATAAAT 60338746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCACTAATGTTCAAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAATCATTCACTAAACAATAAAT 960

 60338747 ATGGCCTCCTGAAGCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCAAAATTTTACATTTTT 60338806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGGCCTCCTGAAGCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCAAAATTTTACATTTTT 1020

 60338807 GACATACTCAAAATTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTATCTAGATTGTGGTTATAGC 60338866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACATACTCAAAATTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTATCTAGATTGTGGTTATAGC 1080

 60338867 TTCACAGGTGCAAACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGTAAATATGAACAATTTAATG 60338926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCACAGGTGCAAACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGTAAATATGAACAATTTAATG 1140

 60338927 TGTTGTCAGTTATAACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTCATCCAAAAACAACAAAATA 60338986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTGTCAGTTATAACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTCATCCAAAAACAACAAAATA 1200

 60338987 ATTGGTTATCATGAATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCCATGGGAAAACAAGAGTGTA 60339046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTGGTTATCATGAATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCCATGGGAAAACAAGAGTGTA 1260

 60339047 TTTAAAAAACCGTTAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTTCCATGGAGCTTAATC 60339106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTAAAAAACCGTTAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTTCCATGGAGCTTAATC 1320

 60339107 CTGTCTTGTAATTAGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATTACTTAGTATTCCCTA 60339166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGTCTTGTAATTAGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATTACTTAGTATTCCCTA 1380

 60339167 AAGCATCAGAAATACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTATTACTGATAACAAGACAAGA 60339226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGCATCAGAAATACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTATTACTGATAACAAGACAAGA 1440

 60339227 ACATAGACAATTCTAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAG 60339286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACATAGACAATTCTAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAG 1500

 60339287 AATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTG 60339346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTG 1560

 60339347 AGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTT 60339406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTT 1620

 60339407 CCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTT 60339466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTT 1680

 60339467 CATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTA 60339526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTA 1740

 60339527 GAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCT 60339586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCT 1800

 60339587 ATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTA 60339646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTA 1860

 60339647 ACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAAT 60339706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAAT 1920

 60339707 TTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCAC 60339766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCAC 1980

 60339767 CGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGC 60339826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGC 2040

 60339827 AATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTC 60339886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTC 2100

 60339887 AGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACA 60339946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACA 2160

 60339947 AAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCA 60340006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCA 2220

 60340007 TTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACC 60340066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACC 2280

 60340067 ATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCT 60340126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCT 2340

 60340127 TTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACC 60340186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACC 2400

 60340187 CAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGT 60340246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTTAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGT 2460

 60340247 AGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAA 60340306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAA 2520

 60340307 TCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACA 60340366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACA 2580

 60340367 AACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGT 60340426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGT 2640

 60340427 AGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTT 60340486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTT 2700

 60340487 ATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCAC 60340546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCAC 2760

 60340547 TACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTT 60340606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTT 2820

 60340607 AATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTT 60340666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTT 2880

 60340667 ATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATT 60340726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATT 2940

 60340727 CTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTT 60340786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTT 3000

 60340787 GTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCT 60340846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCT 3060

 60340847 GTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATAT 60340906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATAT 3120

 60340907 ACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATAT 60340966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATAT 3180

 60340967 TGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAAT 60341026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAAT 3240

 60341027 GGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTG 60341086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTG 3300

 60341087 AAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTA 60341146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTA 3360

 60341147 ATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTA 60341206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTA 3420

 60341207 ATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGAT 60341266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGAT 3480

 60341267 ATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATG 60341326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATG 3540

 60341327 TCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTA 60341386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTA 3600

 60341387 TTTGAGCTCGT 60341397
          |||||||||||
     3601 TTTGAGCTCGT 3611

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 3671

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 3731

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 3791

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 3851

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 3911

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 60343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 3971

 60343602 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 60343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 4031

 60343662 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 60343721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 4091

 60343722 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 60343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 4151

 60343782 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 60343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 4211

 60343842 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 60343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 4271

 60343902 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 60343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 4331

 60343962 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 60344021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 4391

 60344022 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTC 60344074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTC 4444

Alignment time is 5.83438 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    5200] =>      5200 nucs 'mol-32-2f33-096014_5200'

Score:        5199
Aligned:      5199        nucs
Identic:      5199 (100%) nucs =>       526 (100%)      4673 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60337421,60337946] EXCISED REGION [60337948,60342620]
 second seq =>  [       1,     526] EXCISED REGION [     528,    5200]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [60337947,60337947]
 second seq =>         1 nucs [527,527]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60337947,60337947] to [60337948,60337948]
 second seq =>         1 nucs [526,526] to [527,527]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60337421 GCTGCTGTCCCCGGAGGGACTCGGCGCTCAGGGAAGCTGCGGTGTCTCAGCGTCGCCGCC 60337480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGCTGTCCCCGGAGGGACTCGGCGCTCAGGGAAGCTGCGGTGTCTCAGCGTCGCCGCC 60

 60337481 GCCTCTGCTGCAACTCCGCCGAGCCGCTGCCTGCCGCTCTTCCCGCTTCAGCTCCTCCTT 60337540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTCTGCTGCAACTCCGCCGAGCCGCTGCCTGCCGCTCTTCCCGCTTCAGCTCCTCCTT 120

 60337541 CTCCCCCCTCCTCTTCCTCCGGCCCCGCCGCGGCCGCTGCCTGCGCTCCTCCTCCTACTC 60337600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCCCCCTCCTCTTCCTCCGGCCCCGCCGCGGCCGCTGCCTGCGCTCCTCCTCCTACTC 180

 60337601 CACTCGCTGCTGCCGCCGCTGCTTCGCTATTCCCAATCCTGTTATTACGCAGGTGAAAAT 60337660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTCGCTGCTGCCGCCGCTGCTTCGCTATTCCCAATCCTGTTATTACGCAGGTGAAAAT 240

 60337661 GGCCTGCTTGGTCCGGGTCCTCCTGGGCACGTCAGCCCCCAACCTGCAAATGGCAGGCCC 60337720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCCTGCTTGGTCCGGGTCCTCCTGGGCACGTCAGCCCCCAACCTGCAAATGGCAGGCCC 300

 60337721 CGGTTAGGGGATGTGCCAAATCCACTCGAATCTTCCTCTCGTTTGGGGAGGAAAAAAAAG 60337780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGGTTAGGGGATGTGCCAAATCCACTCGAATCTTCCTCTCGTTTGGGGAGGAAAAAAAAG 360

 60337781 GAAGAACCAGCAAGTAGCAGCAGCCACCAGCAGCGTCGCCTTCCCAACTGAGAAAGTTAA 60337840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAGAACCAGCAAGTAGCAGCAGCCACCAGCAGCGTCGCCTTCCCAACTGAGAAAGTTAA 420

 60337841 GCCCCGACTGGTGTCCTGGGTCCCGAGGCAAAGAGGGAAAGCTAGAGAACTCAGGGCCAC 60337900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCCCGACTGGTGTCCTGGGTCCCGAGGCAAAGAGGGAAAGCTAGAGAACTCAGGGCCAC 480

 60337901 AGTTCTGAGAGTGACCAGTATGAGTTGTGGAGGGGACACAGGTCTG 60337946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTTCTGAGAGTGACCAGTATGAGTTGTGGAGGGGACACAGGTCTG 526

EXCISED REGION

 60337948 ACGGGGAAGGGGTGGAGATGGGTTCTGATGGCAGATGGAGACCAGGGAAGCTGCAACCCC 60338007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 ACGGGGAAGGGGTGGAGATGGGTTCTGATGGCAGATGGAGACCAGGGAAGCTGCAACCCC 587

 60338008 GCGGTTAAATCCTGCGTTTCCAGAATGGGCCTGAAAATAGTGGAGTAAAGAAATGAGTTA 60338067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 GCGGTTAAATCCTGCGTTTCCAGAATGGGCCTGAAAATAGTGGAGTAAAGAAATGAGTTA 647

 60338068 TCAGGACAGCCTCCAAAAAAAGCTTAACAGATCTCACCCTGACCAGCCCTGAGGGCAAAC 60338127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 TCAGGACAGCCTCCAAAAAAAGCTTAACAGATCTCACCCTGACCAGCCCTGAGGGCAAAC 707

 60338128 AGGGTGTCAATAGGCAAGGACAAAAGCTGTACATTTGCTTTCAGAAACACTGAGCCAAGG 60338187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 AGGGTGTCAATAGGCAAGGACAAAAGCTGTACATTTGCTTTCAGAAACACTGAGCCAAGG 767

 60338188 CCATCCTAATCATAAGCTGTCTGTGCAGTCCGTTGTATTTCAGAATTTGGACATTCCATG 60338247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 CCATCCTAATCATAAGCTGTCTGTGCAGTCCGTTGTATTTCAGAATTTGGACATTCCATG 827

 60338248 AAGCTTGCATCTTTTTCTTTACAGTTCACTGTGATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAA 60338307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 AAGCTTGCATCTTTTTCTTTACAGTTCACTGTGATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAA 887

 60338308 ACCCAAACTCAGAGGAGGAAAGTGACTTGCCTTATCATATGTTGTGCCCATACGAAGACC 60338367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 ACCCAAACTCAGAGGAGGAAAGTGACTTGCCTTATCATATGTTGTGCCCATACGAAGACC 947

 60338368 CATCTTTTCAAATGTCTTGTGTTTTATTGGTTCCCAAGTTGTTTATATAATAAAATAATG 60338427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 CATCTTTTCAAATGTCTTGTGTTTTATTGGTTCCCAAGTTGTTTATATAATAAAATAATG 1007

 60338428 TGCCTTTAAAAACTAAGATTCACCACAACACACAGGGTGAAGGAATAGGTTTTTCTGCTG 60338487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 TGCCTTTAAAAACTAAGATTCACCACAACACACAGGGTGAAGGAATAGGTTTTTCTGCTG 1067

 60338488 TTTCTTCTCTAGGAAAGGTGGGCGCAGACGGTACCGCACACACTGTGAGACTGTGGGACT 60338547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 TTTCTTCTCTAGGAAAGGTGGGCGCAGACGGTACCGCACACACTGTGAGACTGTGGGACT 1127

 60338548 CTTGGCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTCATACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCA 60338607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 CTTGGCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTCATACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCA 1187

 60338608 ACTTCAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATAATGCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCC 60338667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 ACTTCAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATAATGCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCC 1247

 60338668 TAATCTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGTTCAAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAAT 60338727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 TAATCTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGTTCAAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAAT 1307

 60338728 CATTCACTAAACAATAAATATGGCCTCCTGAAGCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTC 60338787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 CATTCACTAAACAATAAATATGGCCTCCTGAAGCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTC 1367

 60338788 ACCAAAATTTTACATTTTTGACATACTCAAAATTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTA 60338847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 ACCAAAATTTTACATTTTTGACATACTCAAAATTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTA 1427

 60338848 TCTAGATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGCAAACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGT 60338907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 TCTAGATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGCAAACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGT 1487

 60338908 AAATATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTTATAACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTC 60338967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 AAATATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTTATAACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTC 1547

 60338968 ATCCAAAAACAACAAAATAATTGGTTATCATGAATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCC 60339027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 ATCCAAAAACAACAAAATAATTGGTTATCATGAATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCC 1607

 60339028 ATGGGAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACCGTTAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGT 60339087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 ATGGGAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACCGTTAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGT 1667

 60339088 ATTTCCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAATTAGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATC 60339147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 ATTTCCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAATTAGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATC 1727

 60339148 TATTACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAAATACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTAT 60339207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 TATTACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAAATACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTAT 1787

 60339208 TACTGATAACAAGACAAGAACATAGACAATTCTAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTG 60339267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 TACTGATAACAAGACAAGAACATAGACAATTCTAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTG 1847

 60339268 ATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGT 60339327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 ATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGT 1907

 60339328 ATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACC 60339387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 ATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACC 1967

 60339388 TAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTA 60339447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTA 2027

 60339448 ATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAAT 60339507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 ATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAAT 2087

 60339508 AGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTC 60339567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 AGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTC 2147

 60339568 CATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTG 60339627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 CATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTG 2207

 60339628 TTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTA 60339687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 TTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTA 2267

 60339688 TCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATT 60339747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 TCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATT 2327

 60339748 AATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATG 60339807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 AATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATG 2387

 60339808 GGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAA 60339867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 GGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAA 2447

 60339868 TTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTT 60339927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 TTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTT 2507

 60339928 AGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGA 60339987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 AGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGA 2567

 60339988 AAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCT 60340047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 AAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCT 2627

 60340048 TCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGA 60340107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 TCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGA 2687

 60340108 GCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTT 60340167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 GCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTT 2747

 60340168 ACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTT 60340227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 ACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTT 2807

 60340228 TTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACA 60340287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 TTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACA 2867

 60340288 GGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTT 60340347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTT 2927

 60340348 ATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAA 60340407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 ATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAA 2987

 60340408 ATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACT 60340467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 ATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACT 3047

 60340468 CGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCC 60340527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 CGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCC 3107

 60340528 CCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCT 60340587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 CCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCT 3167

 60340588 CCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTT 60340647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 CCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTT 3227

 60340648 GTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTG 60340707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 GTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTG 3287

 60340708 CAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACC 60340767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 CAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACC 3347

 60340768 ACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTA 60340827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 ACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTA 3407

 60340828 GTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTT 60340887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 GTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTT 3467

 60340888 TGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTG 60340947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 TGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTG 3527

 60340948 GGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCAC 60341007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 GGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCAC 3587

 60341008 AGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAG 60341067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 AGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAG 3647

 60341068 CAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTA 60341127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTA 3707

 60341128 TCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATAT 60341187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 TCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATAT 3767

 60341188 GGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCAT 60341247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 GGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCAT 3827

 60341248 TTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTA 60341307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTA 3887

 60341308 TGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATA 60341367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATA 3947

 60341368 TTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAG 60341427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 TTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAG 4007

 60341428 ATGGATAATTTGCAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTC 60341487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 ATGGATAATTTGCAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTC 4067

 60341488 TTTTGCTGTGCAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGT 60341547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 TTTTGCTGTGCAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGT 4127

 60341548 TGCCTGTGCTTATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACT 60341607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 TGCCTGTGCTTATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACT 4187

 60341608 TTCCCCAATGTTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTT 60341667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 TTCCCCAATGTTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTT 4247

 60341668 GGTCTGTCACCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTC 60341727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 GGTCTGTCACCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTC 4307

 60341728 CCAGGCTCAAGCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGC 60341787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 CCAGGCTCAAGCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGC 4367

 60341788 CACCATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAG 60341847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 CACCATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAG 4427

 60341848 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGG 60341907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGG 4487

 60341908 ATTACAGGTATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCT 60341967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 ATTACAGGTATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCT 4547

 60341968 AGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAA 60342027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 AGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAA 4607

 60342028 GAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTT 60342087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 GAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTT 4667

 60342088 TTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAAT 60342147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 TTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAAT 4727

 60342148 TCACTGCAGATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTT 60342207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 TCACTGCAGATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTT 4787

 60342208 TTTTATGCCAGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGA 60342267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 TTTTATGCCAGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGA 4847

 60342268 AGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCT 60342327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 AGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCT 4907

 60342328 GGGTCTTTTATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTAT 60342387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 GGGTCTTTTATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTAT 4967

 60342388 CATTGGTATTTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGT 60342447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 CATTGGTATTTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGT 5027

 60342448 TTTAACAATACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTC 60342507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 TTTAACAATACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTC 5087

 60342508 CTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTT 60342567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 CTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTT 5147

 60342568 GATTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGA 60342620
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 GATTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGA 5200

Alignment time is 6.92132 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3221] =>      3221 nucs 'mol-32-2fc2-184275_3221'

Score:        3221
Aligned:      3221        nucs
Identic:      3221 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60339567,60342787]
 second seq =>  [       1,    3221]

 60339567 CCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGT 60339626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGT 60

 60339627 GTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATT 60339686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATT 120

 60339687 ATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTAT 60339746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTAT 180

 60339747 TAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTAT 60339806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTAT 240

 60339807 GGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGA 60339866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGA 300

 60339867 ATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCT 60339926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCT 360

 60339927 TAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGG 60339986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGG 420

 60339987 AAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGC 60340046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGC 480

 60340047 TTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAG 60340106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAG 540

 60340107 AGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGT 60340166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGT 600

 60340167 TACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATT 60340226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATT 660

 60340227 TTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATAC 60340286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATAC 720

 60340287 AGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTT 60340346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTT 780

 60340347 TATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAA 60340406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAA 840

 60340407 AATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCAC 60340466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCAC 900

 60340467 TCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGC 60340526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGC 960

 60340527 CCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATC 60340586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATC 1020

 60340587 TCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTT 60340646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTT 1080

 60340647 TGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGT 60340706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGT 1140

 60340707 GCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTAC 60340766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTAC 1200

 60340767 CACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCT 60340826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCT 1260

 60340827 AGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTT 60340886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTT 1320

 60340887 TTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACT 60340946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACT 1380

 60340947 GGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCA 60341006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCA 1440

 60341007 CAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACA 60341066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACA 1500

 60341067 GCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATT 60341126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATT 1560

 60341127 ATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATA 60341186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATA 1620

 60341187 TGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCA 60341246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCA 1680

 60341247 TTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGT 60341306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGT 1740

 60341307 ATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTAT 60341366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTAT 1800

 60341367 ATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCA 60341426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCA 1860

 60341427 GATGGATAATTTGCAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTT 60341486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATGGATAATTTGCAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTT 1920

 60341487 CTTTTGCTGTGCAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGG 60341546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTTTGCTGTGCAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGG 1980

 60341547 TTGCCTGTGCTTATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGAC 60341606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGCCTGTGCTTATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGAC 2040

 60341607 TTTCCCCAATGTTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCT 60341666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTCCCCAATGTTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCT 2100

 60341667 TGGTCTGTCACCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCT 60341726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGTCTGTCACCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCT 2160

 60341727 CCCAGGCTCAAGCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTG 60341786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCAGGCTCAAGCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTG 2220

 60341787 CCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCA 60341846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCA 2280

 60341847 GGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGG 60341906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGG 2340

 60341907 GATTACAGGTATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCC 60341966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATTACAGGTATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCC 2400

 60341967 TAGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACA 60342026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACA 2460

 60342027 AGAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATT 60342086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATT 2520

 60342087 TTTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAA 60342146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAA 2580

 60342147 TTCACTGCAGATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTT 60342206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCACTGCAGATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTT 2640

 60342207 TTTTTATGCCAGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCG 60342266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTTATGCCAGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCG 2700

 60342267 AAGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTC 60342326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTC 2760

 60342327 TGGGTCTTTTATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTA 60342386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGGTCTTTTATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTA 2820

 60342387 TCATTGGTATTTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATG 60342446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCATTGGTATTTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATG 2880

 60342447 TTTTAACAATACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGT 60342506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTTAACAATACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGT 2940

 60342507 CCTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTT 60342566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTT 3000

 60342567 TGATTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTT 60342626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGATTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTT 3060

 60342627 TCTTGATTTCTTTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGC 60342686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTTGATTTCTTTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGC 3120

 60342687 CGGGTGCCGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCA 60342746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CGGGTGCCGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCA 3180

 60342747 TGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAA 60342787
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAA 3221

Alignment time is 3.99594 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2657] =>      2657 nucs 'mol-32-2fe3-049264_2657'

Score:        2657
Aligned:      2657        nucs
Identic:      2657 (100%) nucs =>      1705 (100%)       952 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60341260,60342964] EXCISED REGION [60342966,60343917]
 second seq =>  [       1,    1705] EXCISED REGION [    1706,    2657]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [60342965,60342965]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [60342965,60342978] to [60342966,60342979]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60341260 CAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTG 60341319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTG 60

 60341320 AGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAAT 60341379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAAT 120

 60341380 AGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAGATGGATAATTTG 60341439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAGATGGATAATTTG 180

 60341440 CAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTCTTTTGCTGTGCA 60341499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTCTTTTGCTGTGCA 240

 60341500 GAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGTTGCCTGTGCTTA 60341559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGTTGCCTGTGCTTA 300

 60341560 TGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACTTTCCCCAATGTT 60341619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACTTTCCCCAATGTT 360

 60341620 TCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTTGGTCTGTCACCC 60341679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTTGGTCTGTCACCC 420

 60341680 AGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGCTCAAGC 60341739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGCTCAAGC 480

 60341740 AAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCCTGG 60341799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCCTGG 540

 60341800 CTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAA 60341859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAA 600

 60341860 CTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATG 60341919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATG 660

 60341920 AGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGGTCT 60341979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGGTCT 720

 60341980 TCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAAGAGTTAGGGGTC 60342039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAAGAGTTAGGGGTC 780

 60342040 TAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTTTTATTAAAGAGA 60342099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTTTTATTAAAGAGA 840

 60342100 CTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAATTCACTGCAGATT 60342159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAATTCACTGCAGATT 900

 60342160 AATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTTTTTTATGCCAGT 60342219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTTTTTTATGCCAGT 960

 60342220 ACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGAAGTAGGTAATGT 60342279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGAAGTAGGTAATGT 1020

 60342280 GATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTTATG 60342339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTTATG 1080

 60342340 GTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTATCATTGGTATTTT 60342399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTATCATTGGTATTTT 1140

 60342400 GATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGTTTTAACAATACT 60342459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGTTTTAACAATACT 1200

 60342460 GACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTCCTCTTCAATTTC 60342519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTCCTCTTCAATTTC 1260

 60342520 TTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTTGATTAAGTTTAT 60342579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTTGATTAAGTTTAT 1320

 60342580 TCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTTTCTTGATTTCTTT 60342639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTTTCTTGATTTCTTT 1380

 60342640 TTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGTGGC 60342699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGTGGC 1440

 60342700 TCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCATGAGGTCAGGAGA 60342759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCATGAGGTCAGGAGA 1500

 60342760 TCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAG 60342819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAG 1560

 60342820 CCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATG 60342879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATG 1620

 60342880 GTGTGAACCCAGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTCCAGCCT 60342939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGTGAACCCAGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTCCAGCCT 1680

 60342940 GGGCAACAGAGAGAGACTCCATCTC 60342964
          |||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGCAACAGAGAGAGACTCCATCTC 1705

EXCISED REGION

 60342966 AAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATAT 60343025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 AAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATAT 1765

 60343026 TGTATCCTGCAACGCTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTG 60343085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TGTATCCTGCAACGCTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTG 1825

 60343086 GAGAATTTACACTTTTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGAC 60343145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 GAGAATTTACACTTTTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGAC 1885

 60343146 TTCTTCTGTTCCAATTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAA 60343205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 TTCTTCTGTTCCAATTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAA 1945

 60343206 GACTTCCAGTACTATGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGA 60343265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 GACTTCCAGTACTATGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGA 2005

 60343266 TCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCA 60343325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCA 2065

 60343326 TCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAG 60343385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 TCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAG 2125

 60343386 GGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAAT 60343445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 GGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAAT 2185

 60343446 GATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCA 60343505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 GATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCA 2245

 60343506 TATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTT 60343565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 TATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTT 2305

 60343566 TTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTTGTTTATGATTTTTACATCAATGTT 60343625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 TTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTTGTTTATGATTTTTACATCAATGTT 2365

 60343626 CATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGATATGTCTTTGTCTGGTTCTGATAT 60343685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 CATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGATATGTCTTTGTCTGGTTCTGATAT 2425

 60343686 CAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAGTATTCCATCCTGTTCTATTTTTTG 60343745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 CAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAGTATTCCATCCTGTTCTATTTTTTG 2485

 60343746 TAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAATGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAA 60343805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 TAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAATGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAA 2545

 60343806 CACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTACAACTTTGATCTCATTACTTGTTAT 60343865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 CACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTACAACTTTGATCTCATTACTTGTTAT 2605

 60343866 TAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGTCTTGGTAGGTTGTATG 60343917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 TAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGTCTTGGTAGGTTGTATG 2657

Alignment time is 3.95925 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3107] =>      3107 nucs 'mol-32-2ff9-091152_3107'

Score:        3084
Aligned:      3106        nucs
Identic:      3104 (100%) nucs =>       205 (100%)      2899 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60339732,60339936] EXCISED REGION [60339938,60342838]
 second seq =>  [       1,     205] EXCISED REGION [     207,    3107]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [60339937,60339937]
 second seq =>         1 nucs [206,206]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [205,206] to [206,207]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60339936,60339936] to [60339938,60339938]
 second seq =>         1 nucs [205,205] to [207,207]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60339732 ATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACT 60339791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACT 60

 60339792 AATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGT 60339851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGT 120

 60339852 TGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCA 60339911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCA 180

 60339912 CTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAG 60339936
          |||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAG 205

EXCISED REGION

 60339938 GTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTT 60339997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 GTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTT 266

 60339998 TGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTA 60340057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 TGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTA 326

 60340058 GTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAG 60340117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 GTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAG 386

 60340118 TAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATC 60340177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 TAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATC 446

 60340178 TCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGG 60340237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 TCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGG 506

 60340238 GTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAAT 60340297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 GTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAAT 566

 60340298 GAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTT 60340357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 GAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTT 626

 60340358 TGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATT 60340417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 TGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATT 686

 60340418 GTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAAC 60340477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 GTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAAC 746

 60340478 TATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCC 60340537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 TATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCC 806

 60340538 TCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTC 60340597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 TCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTC 866

 60340598 AACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGT 60340657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 AACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGT 926

 60340658 GCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAG 60340717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 GCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAG 986

 60340718 GATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTT 60340777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 GATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTT 1046

 60340778 TATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAA 60340837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 TATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAA 1106

 60340838 TATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTT 60340897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 TATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTT 1166

 60340898 TGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCT 60340957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 TGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCT 1226

 60340958 CCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAA 60341017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 CCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAA 1286

 60341018 AGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAAC 60341077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 AGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAAC 1346

 60341078 AACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGAC 60341137
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 AACTAGGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGAC 1406

 60341138 AAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTA 60341197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 AAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTA 1466

 60341198 GTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATG 60341257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 GTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATG 1526

 60341258 ATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTT 60341317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 ATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTT 1586

 60341318 TGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTA 60341377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTA 1646

 60341378 ATAGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAGATGGATAATT 60341437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1647 ATAGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATACCTTGTCAGATGGATAATT 1706

 60341438 TGCAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTCTTTTGCTGTG 60341497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TGCAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTCTTTTGCTGTG 1766

 60341498 CAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGTTGCCTGTGCT 60341557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 CAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGTTGCCTGTGCT 1826

 60341558 TATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACTTTCCCCAATG 60341617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACTTTCCCCAATG 1886

 60341618 TTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTTGGTCTGTCAC 60341677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 TTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTTGGTCTGTCAC 1946

 60341678 CCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGCTCAA 60341737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 CCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGCTCAA 2006

 60341738 GCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCCT 60341797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCCT 2066

 60341798 GGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTG 60341857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 GGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTG 2126

 60341858 AACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTA 60341917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 AACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTA 2186

 60341918 TGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGGT 60341977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 TGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGGT 2246

 60341978 CTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAAGAGTTAGGGG 60342037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 CTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAAGAGTTAGGGG 2306

 60342038 TCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTTTTATTAAAGA 60342097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 TCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTTTTATTAAAGA 2366

 60342098 GACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAATTCACTGCAGA 60342157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 GACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAATTCACTGCAGA 2426

 60342158 TTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTTTTTTATGCCA 60342217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTTTTTTATGCCA 2486

 60342218 GTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGAAGTAGGTAAT 60342277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 GTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGAAGTAGGTAAT 2546

 60342278 GTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTTA 60342337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 GTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTTA 2606

 60342338 TGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTATCATTGGTATT 60342397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 TGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTATCATTGGTATT 2666

 60342398 TTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGTTTTAACAATA 60342457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGTTTTAACAATA 2726

 60342458 CTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTCCTCTTCAATT 60342517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 CTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTCCTCTTCAATT 2786

 60342518 TCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTTGATTAAGTTT 60342577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTTGATTAAGTTT 2846

 60342578 ATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTTTCTTGATTTCT 60342637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 ATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTTTCTTGATTTCT 2906

 60342638 TTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGTG 60342697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 TTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGTG 2966

 60342698 GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCATGAGGTCAGGA 60342757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCATGAGGTCAGGA 3026

 60342758 GATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATT 60342817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 GATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATT 3086

 60342818 AGCCGGGCGTGGTGGCGGGCA 60342838
          |||||||||||||||||||||
     3087 AGCCGGGCGTGGTGGCGGGCA 3107

Alignment time is 4.33527 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2883] =>      2883 nucs 'mol-32-3025-031724_2883'

Score:        2872
Aligned:      2883        nucs
Identic:      2882 (100%) nucs =>      2083 (100%)       799 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60339314,60341397] EXCISED REGION [60343242,60344040]
 second seq =>  [       1,    2084] EXCISED REGION [    2085,    2883]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [2084,2084] to [2085,2085]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60339314 AAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAA 60339373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAA 60

 60339374 AAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTG 60339433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTG 120

 60339434 GGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAA 60339493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAA 180

 60339494 TGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAAC 60339553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAAC 240

 60339554 ATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGC 60339613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGC 300

 60339614 ACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGG 60339673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGG 360

 60339674 ATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAAT 60339733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAAT 420

 60339734 GATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAA 60339793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAA 480

 60339794 TTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTG 60339853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTG 540

 60339854 CTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACT 60339913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACT 600

 60339914 TTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGC 60339973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGC 660

 60339974 TTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTT 60340033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTT 720

 60340034 ATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGG 60340093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGG 780

 60340094 GACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCC 60340153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCC 840

 60340154 TCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGAT 60340213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGAT 900

 60340214 TTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGA 60340273
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTTTTAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGA 960

 60340274 GATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCAT 60340333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCAT 1020

 60340334 CACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTG 60340393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTG 1080

 60340394 TTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACT 60340453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACT 1140

 60340454 AGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCC 60340513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCC 1200

 60340514 ATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGT 60340573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGT 1260

 60340574 TCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAG 60340633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAG 1320

 60340634 AACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTT 60340693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTT 1380

 60340694 CCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCAT 60340753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCAT 1440

 60340754 TGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTT 60340813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTT 1500

 60340814 CCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCT 60340873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCT 1560

 60340874 CTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAA 60340933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAA 1620

 60340934 ACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAA 60340993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAA 1680

 60340994 TGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAA 60341053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAA 1740

 60341054 AATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAAT 60341113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAAT 1800

 60341114 AAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGA 60341173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGA 1860

 60341174 TTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTA 60341233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTA 1920

 60341234 GTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTT 60341293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTT 1980

 60341294 GCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTA 60341353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTA 2040

 60341354 ATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 60341397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 2084

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 2144

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 2204

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 2264

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 2324

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 2384

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 60343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 2444

 60343602 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 60343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 2504

 60343662 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 60343721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 2564

 60343722 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 60343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 2624

 60343782 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 60343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 2684

 60343842 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 60343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 2744

 60343902 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 60343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 2804

 60343962 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 60344021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 2864

 60344022 ATGTTTCCTTTTGCATCTC 60344040
          |||||||||||||||||||
     2865 ATGTTTCCTTTTGCATCTC 2883

Alignment time is 3.93832 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,   10238] =>     10238 nucs 'mol-32-30f6-201012_10238'

Score:       10078
Aligned:     10238        nucs
Identic:     10221 (100%) nucs =>      3296 (100%)      6925 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60338098,60341397] EXCISED REGION [60343242,60350175]
 second seq =>  [       1,    3300] EXCISED REGION [    3301,   10238]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [3300,3300] to [3301,3301]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60338098 ATCTCACCCTGACCAGCCCTGAGGGCAAACAGGGTGTCAATAGGCAAGGACAAAAGCTGT 60338157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTCACCCTGACCAGCCCTGAGGGCAAACAGGGTGTCAATAGGCAAGGACAAAAGCTGT 60

 60338158 ACATTTGCTTTCAGAAACACTGAGCCAAGGCCATCCTAATCATAAGCTGTCTGTGCAGTC 60338217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATTTGCTTTCAGAAACACTGAGCCAAGGCCATCCTAATCATAAGCTGTCTGTGCAGTC 120

 60338218 CGTTGTATTTCAGAATTTGGACATTCCATGAAGCTTGCATCTTTTTCTTTACAGTTCACT 60338277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGTTGTATTTCAGAATTTGGACATTCCATGAAGCTTGCATCTTTTTCTTTACAGTTCACT 180

 60338278 GTGATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAAACCCAAACTCAGAGGAGGAAAGTGACTTGC 60338337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAAACCCAAACTCAGAGGAGGAAAGTGACTTGC 240

 60338338 CTTATCATATGTTGTGCCCATACGAAGACCCATCTTTTCAAATGTCTTGTGTTTTATTGG 60338397
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTATCATGTGTTGTGCCCATACGAAGACCCATCTTTTCAAATGTCTTGTGTTTTATTGG 300

 60338398 TTCCCAAGTTGTTTATATAATAAAATAATGTGCCTTTAAAAACTAAGATTCACCACAACA 60338457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCCCAAGTTGTTTATATAATAAAATAATGTGCCTTTAAAAACTAAGATTCACCACAACA 360

 60338458 CACAGGGTGAAGGAATAGGTTTTTCTGCTGTTTCTTCTCTAGGAAAGGTGGGCGCAGACG 60338517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAGGGTGAAGGAATAGGTTTTTCTGCTGTTTCTTCTCTAGGAAAGGTGGGCGCAGACG 420

 60338518 GTACCGCACACACTGTGAGACTGTGGGACTCTTGGCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTC 60338577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTACCGCACACACTGTGAGACTGTGGGACTCTTGGCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTC 480

 60338578 ATACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCAACTTCAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATA 60338637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCAACTTCAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATA 540

 60338638 ATGCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAATCTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGT 60338697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAATCTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGT 600

 60338698 TCAAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAATCATTCACTAAACAATAAATATGGCCTCCTG 60338757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAATCATTCACTAAACAATAAATATGGCCTCCTG 660

 60338758 AAGCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCAAAATTTTACATTTTTGACATACTCAA 60338817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCAAAATTTTACATTTTTGACATACTCAA 720

 60338818 AATTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTATCTAGATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGC 60338877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTATCTAGATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGC 780

 60338878 AAACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGTAAATATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTT 60338937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGTAAATATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTT 840

 60338938 ATAACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTCATCCAAAAACAACAAAATAATTGGTTATCA 60338997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTCATCCAAAAACAACAAAATAATTGGTTATCA 900

 60338998 TGAATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCCATGGGAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACC 60339057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCCATGGGAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACC 960

 60339058 GTTAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTTCCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAA 60339117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTTCCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAA 1020

 60339118 TTAGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATTACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAA 60339177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATTACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAA 1080

 60339178 ATACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTATTACTGATAACAAGACAAGAACATAGACAAT 60339237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTATTACTGATAACAAGACAAGAACATAGACAAT 1140

 60339238 TCTAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGC 60339297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGC 1200

 60339298 AAAGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAA 60339357
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAA 1260

 60339358 TGAAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTA 60339417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTA 1320

 60339418 ATAGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCA 60339477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCA 1380

 60339478 ATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTG 60339537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTG 1440

 60339538 TTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTG 60339597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTG 1500

 60339598 CTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTAT 60339657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTAT 1560

 60339658 TAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTA 60339717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTA 1620

 60339718 TGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACT 60339777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACT 1680

 60339778 GACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCT 60339837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCT 1740

 60339838 GGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGA 60339897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGA 1800

 60339898 AAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTC 60339957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTC 1860

 60339958 ACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAA 60340017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAA 1920

 60340018 GAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGG 60340077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGG 1980

 60340078 GGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGAT 60340137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGAT 2040

 60340138 GAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCA 60340197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCA 2100

 60340198 ACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATA 60340257
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTTAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATA 2160

 60340258 TTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGG 60340317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGG 2220

 60340318 TAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGAT 60340377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGAT 2280

 60340378 TATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCAT 60340437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCAT 2340

 60340438 TGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCAT 60340497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCAT 2400

 60340498 TAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTG 60340557
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCACTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTG 2460

 60340558 GCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTT 60340617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTT 2520

 60340618 ACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAA 60340677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAA 2580

 60340678 CAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGA 60340737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGA 2640

 60340738 CTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATG 60340797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATG 2700

 60340798 AACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGT 60340857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGT 2760

 60340858 TGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAAC 60340917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAAC 2820

 60340918 AAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCA 60340977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCA 2880

 60340978 AGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGG 60341037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGG 2940

 60341038 ATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACC 60341097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACC 3000

 60341098 CACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAAT 60341157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAAT 3060

 60341158 ATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAG 60341217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAG 3120

 60341218 ATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCT 60341277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCT 3180

 60341278 TTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGAT 60341337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGAT 3240

 60341338 ATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 60341397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 3300

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 3360

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 3420

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 3480

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 3540

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 3600

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 60343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 3660

 60343602 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 60343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 3720

 60343662 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 60343721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 3780

 60343722 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 60343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 3840

 60343782 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 60343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 3900

 60343842 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 60343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 3960

 60343902 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 60343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 4020

 60343962 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 60344021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 4080

 60344022 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTCTGTCTAA 60344081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTCTGTCTAA 4140

 60344082 AGCTTTGTCAAGTTAATTTATCTTTTCAAAAAAAACAATTTTTCATTTCATTTATTTTTA 60344141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGCTTTGTCAAGTTAATTTATCTTTTCAAAAAAAACAATTTTTCATTTCATTTATTTTTA 4200

 60344142 TTTGTTTGTTCCCATTTCATTTGTTTCTGCTCTGATATTTATTCTTTCTTTGTTTCTACT 60344201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTTGTTTGTTCCCATTTCATTTGTTTCTGCTCTGATATTTATTCTTTCTTTGTTTCTACT 4260

 60344202 AACTTTGGGTTTGATTTGCTCTTGTTTTTCGAATTCTTTAAGATGCATTATTATGTTGCT 60344261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AACTTTGGGTTTGATTTGCTCTTGTTTTTCGAATTCTTTAAGATGCATTATTATGTTGCT 4320

 60344262 CATTTGAAGTTTTTCTACTTTTTTGATGTAGGGCTTATTGCATAAACTTTCCTCTTAATA 60344321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CATTTGAAGTTTTTCTACTTTTTTGATGTAGGGCTTATTGCATAAACTTTCCTCTTAATA 4380

 60344322 CTGCTTTCAGTGTATTCCACAGGTATTGGTATATTGTGTTTCCATTTTCATGTAGTTCAA 60344381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTGCTTTCAGTGTATTCCACAGGTATTGGTATATTGTGTTTCCATTTTCATGTAGTTCAA 4440

 60344382 GACATTTTTTCATTCTTAATTTCAATGAAGAAATTAGAAGAAATCATTGACATGATTTCA 60344441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GACATTTTTTCATTCTTAATTTCAATGAAGAAATTAGAAGAAATCATTGACATGATTTCA 4500

 60344442 ATTTTTTTGAAATTTTAAAGACTTGTTTTGTGGCTTAACATATGGTCTATTCTTGAGAAT 60344501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATTTTTTTGAAATTTTAAAGACTTGTTTTGTGGCTTAACATATGGTCTATTCTTGAGAAT 4560

 60344502 GATCTATATGCTAAGAAGAAGAATGTATATTCTGCAGCCATTGGTTAAATAGTCTGTAAA 60344561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GATCTATATGCTAAGAAGAAGAATGTATATTCTGCAGCCATTGGTTAAATAGTCTGTAAA 4620

 60344562 TACCTATTAGGTCTATTTGGTCTATAGATAAATTCTGATATTTCTTTTGTGATTATCTAT 60344621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TACCTATTAGGTCTATTTGGTCTATAGATAAATTCTGATATTTCTTTTGTGATTATCTAT 4680

 60344622 CTATATGTTCTGTCCAGTGCTGAAAGTGGGGTGTTCATGTGTCCAGCTACTATTGTATTG 60344681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTATATGTTCTGTCCAGTGCTGAAAGTGGGGTGTTCATGTGTCCAGCTACTATTGTATTG 4740

 60344682 GAGTTTGTCTCTCTCTTTAGCTCAATTAATATTTGCTATATATATTTGGGTGCAGTGTTG 60344741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAGTTTGTCTCTCTCTTTAGCTCAATTAATATTTGCTATATATATTTGGGTGCAGTGTTG 4800

 60344742 GGTGCATATATATTTATAATTGTTATATCCCCTTGACGAATTAACTCCTTTATCATTATA 60344801
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GGTGCATATATATTTATAATCGTTATATCCCCTTGACGAATTAACTCCTTTATCATTATA 4860

 60344802 TAATGATCTTCTTTGTCTCTTCTTATAGTTTTTGTATTTAAATCTATTTTATCGGGTATA 60344861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAATGATCTTCTTTGTCTCTTCTTATAGTTTTTGTATTTAAATCTATTTTATCGGGTATA 4920

 60344862 AGTATAGTTCTGCTTTTGTTTCCATTCACATAAAATATCTTTTTCTGTCCCTTCATTTTC 60344921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AGTATAGTTCTGCTTTTGTTTCCATTCACATAAAATATCTTTTTCTGTCCCTTCATTTTC 4980

 60344922 AGTCTATGTAGTTCTTTATAGGTGAAGTGTTTCTTGTAGGCAACAGATTATTTGGTCTTG 60344981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGTCTATGTAGTTCTTTATAGGTGAAGTGTTTCTTGTAGGCAACAGATTATTTGGTCTTG 5040

 60344982 TTTTTTAATCCATTCAACCACTGTATATCTTTTGATTGGAGAGTTTAGTTCATTTACATT 60345041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTTTTTAATCCATTCAACCACTGTATATCTTTTGATTGGAGAGTTTAGTTCATTTACATT 5100

 60345042 CAGTGTTATTAGGGATAAGTAAGAACTTACTCCTGCATTTTATTTGTTTTCTGCTTGTTT 60345101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CAGTGTTATTAGGGATAAGTAAGAACTTACTCCTGCATTTTATTTGTTTTCTGCTTGTTT 5160

 60345102 TGTGGTCTTTTCTTCCTTCTTTCCTTTCTTCCTGTGTTCCACTTAGTGAAGGTGATTTTC 60345161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGTGGTCTTTTCTTCCTTCTTTCCTTTCTTCCTGTGTTCCACTTAGTGAAGGTGATTTTC 5220

 60345162 TCAGGTGGTATGCCTTAAATTCTTGCTTTTGTTTGTGTGTATCGTATATTTTTAGATTTG 60345221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TCAGGTGGTATGCCTTAAATTCTTGCTTTTGTTTGTGTGTATCGTATATTTTTAGATTTG 5280

 60345222 AGGTTACCATGAGGCTTGTGAATACTATCTTATAACCCATTATTTTTAACCAATGAAAAT 60345281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGGTTACCATGAGGCTTGTGAATACTATCTTATAACCCATTATTTTTAACCAATGAAAAT 5340

 60345282 CTAACACTGATTGCAAAAACAAACAAGCGAGGAGAAAACTAACAGAAACTATACTTTAAC 60345341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTAACACTGATTGCAAAAACAAACAAGCGAGGAGAAAACTAACAGAAACTATACTTTAAC 5400

 60345342 TTCATCCCCCCTGCTTTTTAACTTTTTGTTGTTTCTATTTATATTTTATTAT----ACTA 60345397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||
     5401 TTCATCCCCCCTGCTTTTTAACTTTTTGTTGTTTCTATTTATATTTTATTATACTGACTA 5460

 60345398 TGTCTTGAAAAATTGTTGTAATTTTTTTTATTGGTTTATCTTTTAGTATCTGTACTCAAT 60345457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTCTTGAAAAATTGTTGTAATTTTTTTTATTGGTTTATCTTTTAGTATCTGTACTCAAT 5520

 60345458 ATATGAGTAGTTTACACACCACAATTATAGGGTTACAATACTCTGTGTTTTTCTGTGTAC 60345517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATATGAGTAGTTTACACACCACAATTATAGGGTTACAATACTCTGTGTTTTTCTGTGTAC 5580

 60345518 TTACTACTACCAGTGAGTTTTGTACCTTCAGATGACTTTTTTCAAATTAAAGTACTCCCT 60345577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTACTACTACCAGTGAGTTTTGTACCTTCAGATGACTTTTTTCAAATTAAAGTACTCCCT 5640

 60345578 TTAGCATTTCTTCTAGGACACGTCTGGTGTTGATGAAATCCCTCAGCTTTTGTTTTTTCT 60345637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TTAGCATTTCTTCTAGGACACGTCTGGTGTTGATGAAATCCCTCAGCTTTTGTTTTTTCT 5700

 60345638 GGGAACATTTGTATTTCACCTTTATGCTTGAAGGATATTTTTACTGGATATACTATTCTA 60345697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GGGAACATTTGTATTTCACCTTTATGCTTGAAGGATATTTTTACTGGATATACTATTCTA 5760

 60345698 GGATAAAGGCTGTTTTACCTTCAGCACTTTAAATATGTCTTGCCACTCTCTCCTAGCCTG 60345757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GGATAAAGGCTGTTTTACCTTCAGCACTTTAAATATGTCTTGCCACTCTCTCCTAGCCTG 5820

 60345758 TAAGATTTTCACTGAGAAGTCTAATGCCAGATGTATTGGAACTCTTTTGCATGTTATTTT 60345817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TAAGATTTTCACTGAGAAGTCTAATGCCAGATGTATTGGAACTCTTTTGCATGTTATTTT 5880

 60345818 TTTTTCTCTTGCTGCTTTTACGATCCTATATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGGTTGTTAAA 60345877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TTTTTCTCTTGCTGCTTTTACGATCCTATATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGGTTGTTAAA 5940

 60345878 TGTCTTGAGGCAGTCTTATTTGGGTCAAATCTGCTTGGTGTTCTATAATCTTCTTGTACT 60345937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TGTCTTGAGGCAGTCTTATTTGGGTCAAATCTGCTTGGTGTTCTATAATCTTCTTGTACT 6000

 60345938 TGAATATTGATATCTTTCTCTAGATTTGGGAAGTTCTCTGCTATTATCTCTTTGAATAAA 60345997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGAATATTGATATCTTTCTCTAGATTTGGGAAGTTCTCTGCTATTATCTCTTTGAATAAA 6060

 60345998 TTTTCTACCCCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCCTCCTTAAGGCCAATAACTCTTAGATTTG 60346057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TTTTCTACCCCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCCTCCTTAAGGCCAATAACTCTTAGATTTG 6120

 60346058 TCCTTTTGAGGCTATTTTCTAGATCTTGTAGGCATGTTTCATTCTTTTTATTATTTCTTC 60346117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TCCTTTTGAGGCTATTTTCTAGATCTTGTAGGCATGTTTCATTCTTTTTATTATTTCTTC 6180

 60346118 TTTTGTCTTCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCCATCTTCAGGCTCACTAATTGTTTC 60346177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TTTTGTCTTCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCCATCTTCAGGCTCACTAATTGTTTC 6240

 60346178 TTCTGCTTGATCAATTCTGCTGTTGAGAGACTCTGATGTACTCTTCGGTATGTCAATTAT 60346237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TTCTGCTTGATCAATTCTGCTGTTGAGAGACTCTGATGTACTCTTCGGTATGTCAATTAT 6300

 60346238 GTTTTTTGCTCCAGAATTTCTACTTTTTAAAGCTTATTTCAATGGCTTTTTAAACTTGTC 60346297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GTTTTTTGCTCCAGAATTTCTACTTTTTAAAGCTTATTTCAATGGCTTTTTAAACTTGTC 6360

 60346298 TGATAGAATTCTGAATTCTTTCTCTGTGTTACTTTGAATTTTGTTGAGCTTCCGCAAAAC 60346357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TGATAGAATTCTGAATTCTTTCTCTGTGTTACTTTGAATTTTGTTGAGCTTCCGCAAAAC 6420

 60346358 AGCTATACTAAATTCTGTGTCTGAAAGGCCACACATCTCTGTCTCTCCAAGGTTGGTCAC 60346417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AGCTATACTAAATTCTGTGTCTGAAAGGCCACACATCTCTGTCTCTCCAAGGTTGGTCAC 6480

 60346418 TGGTGACTTATTTAGTTCATCTCATGAGCTCATGGATTGTCCTGATGGTTGTGGATGTAT 60346477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TGGTGACTTATTTAGTTCATCTCATGAGCTCATGGATTGTCCTGATGGTTGTGGATGTAT 6540

 60346478 GTTGTTGTCTTGAAATTGAAGGGTTAAATATTTATATTCACAGTCTGGGCTTGTTCGTAC 60346537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GTTGTTGTCTTGAAATTGAAGGGTTAAATATTTATATTCACAGTCTGGGCTTGTTCGTAC 6600

 60346538 CCATCCTTCTTGGGAAGACTTTCCAGGTATTCAGAGGGAATTAGGCGTTGTAATCTGTCT 60346597
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6601 CCATCCTTCTTGGGAAGACTTTCCAGGTATTCAGAGGGACTTAGGCGTTGTAATCTGTCT 6660

 60346598 TTGGTCACTGTAGCCATGTCTGCATTAGGAGGCACCCCAAGCCCAGTAATGCTATGGCTC 60346657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TTGGTCACTGTAGCCATGTCTGCATTAGGAGGCACCCCAAGCCCAGTAATGCTATGGCTC 6720

 60346658 TTGCAGACTCATAGAAGTACTGCCTTGCTGAACTTGGGTAAGATCTGAGAGAAGTCCCTG 60346717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TTGCAGACTCATAGAAGTACTGCCTTGCTGAACTTGGGTAAGATCTGAGAGAAGTCCCTG 6780

 60346718 GATTACCAAGGAGATACTCTTATTGTCTTCCCTTACTTTACAGAGTCTCTCTCTCTCTCT 60346777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GATTACCAAGGAGATACTCTTATTGTCTTCCCTTACTTTACAGAGTCTCTCTCTCTCTCT 6840

 60346778 CTGTGATGAGATGCCTGGAGCTGGGAGAGGGGTGACACAAGCACTCTGTGGTCATCACCA 60346837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CTGTGATGAGATGCCTGGAGCTGGGAGAGGGGTGACACAAGCACTCTGTGGTCATCACCA 6900

 60346838 CTGGGATTTTACCGGATCAGACTTGAAGTCAGCACAGTACTGTCTCTTGCCCAAGGCCCG 60346897
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CTGGGATTTTACTGGATCAGACTTGAAGTCAGCACAGTACTGTCTCTTGCCCAAGGCCCG 6960

 60346898 CAGTTACCACCACTTGGCTACCACCAATGTTCACTCAAGGACCAATGGCTCTACAATCAG 60346957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CAGTTACCACCACTTGGCTACCACCAATGTTCACTCAAGGACCAATGGCTCTACAATCAG 7020

 60346958 CAGGTGGCAAATCCAGCCAGGCTTGTGTCCTTCCCTTCAGGGCAGTGAGTTCCCCCAGCC 60347017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CAGGTGGCAAATCCAGCCAGGCTTGTGTCCTTCCCTTCAGGGCAGTGAGTTCCCCCAGCC 7080

 60347018 CTGGGAAGGTCCAGAGATGTCATCTGAGAGCCAGGGCCTGGAGTTGGGATCCTTAGGAAT 60347077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 CTGGGAAGGTCCAGAGATGTCATCTGAGAGCCAGGGCCTGGAGTTGGGATCCTTAGGAAT 7140

 60347078 CTACCCAGTGCTCTACTCTACTGCATATAAGATGGCTCCCAAGCTGCAAGAAAAAGCCCT 60347137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CTACCCAGTGCTCTACTCTACTGCATATAAGATGGCTCCCAAGCTGCAAGAAAAAGCCCT 7200

 60347138 TTCCACTCTTCCTTCGCCTTTCCTCAATCAGAGGTGACTCTCCCCATGGCCATCACCACC 60347197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TTCCACTCTTCCTTCGCCTTTCCTCAATCAGAGGTGACTCTCCCCATGGCCATCACCACC 7260

 60347198 AGTGGCCCATAGCAAGTACTGCCTGGCTACTACCTATGTTCACTCAAGGCCCAAGAGCTC 60347257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 AGTGGCCCATAGCAAGTACTGCCTGGCTACTACCTATGTTCACTCAAGGCCCAAGAGCTC 7320

 60347258 TTCGTTCAGTCTGAGGTGAATGCTGCCAGTACTGAGTCTGTCCCTTCAGGGAAGTGGGTG 60347317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TTCGTTCAGTCTGAGGTGAATGCTGCCAGTACTGAGTCTGTCCCTTCAGGGAAGTGGGTG 7380

 60347318 CTCCTGTGGCTTAGGGTAGTTCCCAAAGTACCATACAGAAAACAAGGCCTAGAGGCAGGA 60347377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 CTCCTGTGGCTTAGGGTAGTTCCCAAAGTACCATACAGAAAACAAGGCCTAGAGGCAGGA 7440

 60347378 ACCCCAGGAGATATTTGGTGCTCTACCCCACTGCGGTGAAGCTGCTACCCAAGCTGGTAC 60347437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 ACCCCAGGAGATATTTGGTGCTCTACCCCACTGCGGTGAAGCTGCTACCCAAGCTGGTAC 7500

 60347438 CCAAGCTGCAAGACAAAGTCCCCTTTACTCTTCCCTCTTCTTTCCTCAAGCAGAAGCACT 60347497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 CCAAGCTGCAAGACAAAGTCCCCTTTACTCTTCCCTCTTCTTTCCTCAAGCAGAAGCACT 7560

 60347498 CTCTCCCTATGGCCACCACAGCTTGGAATATGCTGGATCACACCTGAAACCAGCATAGCT 60347557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 CTCTCCCTATGGCCACCACAGCTTGGAATATGCTGGATCACACCTGAAACCAGCATAGCT 7620

 60347558 CTGAGTCTCACCCAAGGCCCATAGTGACTATTACCTGTATACCACTGGTGACTATTCAGG 60347617
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7621 CTGAGTCTCACCCAAGGCCCATAGTGACTATTACCTGTATACCACTGATGACTATTCAGG 7680

 60347618 GAACAAAGGCATTTTAGTCAGCAAATGATAAATCCTGCCAGGATTGGGTTCTTCCCTTCA 60347677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 GAACAAAGGCATTTTAGTCAGCAAATGATAAATCCTGCCAGGATTGGGTTCTTCCCTTCA 7740

 60347678 AGGCAGTAAGTTCCCTTCTGGCCCAAGGTGTGTCTAGAAATGTTGTTCAGGAGCTAGGAC 60347737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 AGGCAGTAAGTTCCCTTCTGGCCCAAGGTGTGTCTAGAAATGTTGTTCAGGAGCTAGGAC 7800

 60347738 CTGGAACTGGGGCCTCAGGACTCTGCCTGATGCCTTATTTTACTGTTGCTGAGCTGGTAT 60347797
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     7801 CTGGAACTGGGGCCTCAGGACTCTGCCTGATGCCTTATTTTGCTGTTGCTGAGCTGGTAT 7860

 60347798 CCAAGTTGCAGAACAAAGTCCTCTTTACTCTCCATTTTCTCCTCAAGCAGAGGTAAGGAG 60347857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 CCAAGTTGCAGAACAAAGTCCTCTTTACTCTCCATTTTCTCCTCAAGCAGAGGTAAGGAG 7920

 60347858 TCTCTCCCAGAGCTGCAAGCTGTGCTGCCTAAGATTGGAGAAAGGGTGATGTAAGCCATC 60347917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TCTCTCCCAGAGCTGCAAGCTGTGCTGCCTAAGATTGGAGAAAGGGTGATGTAAGCCATC 7980

 60347918 CCTTGGCCACCCTGGCTTGTGCCTCACTGGGTCACATGCACCCCAAGTTCTGAGCCCTGC 60347977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 CCTTGGCCACCCTGGCTTGTGCCTCACTGGGTCACATGCACCCCAAGTTCTGAGCCCTGC 8040

 60347978 ACAGCACTAGGACTTGCCCAGGAACTGCAAGGCCTTGTGGCCTATGCTGCCTTTCAAATT 60348037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 ACAGCACTAGGACTTGCCCAGGAACTGCAAGGCCTTGTGGCCTATGCTGCCTTTCAAATT 8100

 60348038 TATTCAGGACCCCAGAGCTGTTTAGTGCATGGTGGCGGGGCTTACTAGACCTCAGGTTCT 60348097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 TATTCAGGACCCCAGAGCTGTTTAGTGCATGGTGGCGGGGCTTACTAGACCTCAGGTTCT 8160

 60348098 GACCACTGGGATGGATGATTCACCTCTGGCTAGGGCTGGCCTAAATACTTCCTCCATGGG 60348157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 GACCACTGGGATGGATGATTCACCTCTGGCTAGGGCTGGCCTAAATACTTCCTCCATGGG 8220

 60348158 CCCTGGCTAAATTTTGCCCCATGTTGCTTTCTGCTGTGACAGGGCAGCACCGAGTTCCAA 60348217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 CCCTGGCTAAATTTTGCCCCATGTTGCTTTCTGCTGTGACAGGGCAGCACCGAGTTCCAA 8280

 60348218 TGCAAAGTTCCACAATCACTTTGCTGTCTCTCCTAAATGCAAAGATTCTCTCTCTACGCC 60348277
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     8281 TGCAAAGTTCCACAATCACTTTGCTGTCTCTCCTAAATGCAAAGATTCTCTCTCTACACC 8340

 60348278 GTGTGGCCACTCCCAGGGAATTGGGGAGAGTTGGTGTAGGCAATTAAAGACTGTCATTCC 60348337
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     8341 GTGTGGCCACTCCCAGGGAATTGGGGAGAGTTGGTGTAGGCAATTCAAGACTGTCATTCC 8400

 60348338 TGCCCTCTTCAGAGCCTCTTTCCTTAATATCATGTTAAAGGCAGGTACTGTGGTCACTCA 60348397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 TGCCCTCTTCAGAGCCTCTTTCCTTAATATCATGTTAAAGGCAGGTACTGTGGTCACTCA 8460

 60348398 CCTGATTTTTGGTTCTTATAAAGTTGCTTTTTTATGTGGATAGTTGTTCAATGTGGTGTT 60348457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 CCTGATTTTTGGTTCTTATAAAGTTGCTTTTTTATGTGGATAGTTGTTCAATGTGGTGTT 8520

 60348458 CCTGTGGGAGGTGCAACAATCGCTGGAGGCTTCTATTCAGCCATCTTGCTCTGCTTTTTC 60348517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 CCTGTGGGAGGTGCAACAATCGCTGGAGGCTTCTATTCAGCCATCTTGCTCTGCTTTTTC 8580

 60348518 TCCCTGGAGATTTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCA 60348577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 TCCCTGGAGATTTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCA 8640

 60348578 AGGCTAGAGTGCAATGGCAGAATTGCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAGACGATTC 60348637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 AGGCTAGAGTGCAATGGCAGAATTGCACTGCAACTTCTGCCTCCCAGGTTCAGACGATTC 8700

 60348638 TCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACCACACCTGGCTAAT 60348697
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 TTCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACCACACCTGGCTAAT 8760

 60348698 TTTTGTATTTTTGGTAGAGGTGGGAGTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTACT 60348757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 TTTTGTATTTTTGGTAGAGGTGGGAGTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTACT 8820

 60348758 GACTTCAGGTGATCCAACTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA 60348817
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 GACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA 8880

 60348818 CCGCCCCCAGCCTCTCCCTGGAGATTTTAACAGTACATCCTGCAGGGGCTTTAGGAGAGT 60348877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 CCGCCCCCAGCCTCTCCCTGGAGATTTTAACAGTACATCCTGCAGGGGCTTTAGGAGAGT 8940

 60348878 ACTAAATGGGTTGACATATGTAAAGCATATTATTAATTAAGATGATAATAGCACATGCCA 60348937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 ACTAAATGGGTTGACATATGTAAAGCATATTATTAATTAAGATGATAATAGCACATGCCA 9000

 60348938 AATCATTTCTAGGAAATGGTTTATAATGCTGAAAGTTCTACTTGGGTATTTACATTTGTT 60348997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 AATCATTTCTAGGAAATGGTTTATAATGCTGAAAGTTCTACTTGGGTATTTACATTTGTT 9060

 60348998 ACAGACCAAAGAGTCAATGATAACCACTTCAGGCACTTAAAGCAAATTAGATGAGGAATG 60349057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 ACAGACCAAAGAGTCAATGATAACCACTTCAGGCACTTAAAGCAAATTAGATGAGGAATG 9120

 60349058 TTCCCTATATTGAGTAACCACTGGACTGTTTCTACTTAAAATTCCTATATTCCAAAAGGT 60349117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 TTCCCTATATTGAGTAACCACTGGACTGTTTCTACTTAAAATTCCTATATTCCAAAAGGT 9180

 60349118 AAACCTTATATAAAGACAAATATACTTTTAAAGTTATTTTAAGTAGTTGAGTCAAAAATA 60349177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 AAACCTTATATAAAGACAAATATACTTTTAAAGTTATTTTAAGTAGTTGAGTCAAAAATA 9240

 60349178 TATACAGATACATTTCAACTTTGAATAACCTATAACAGGAATGGCAAACAGGGTTCATTG 60349237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 TATACAGATACATTTCAACTTTGAATAACCTATAACAGGAATGGCAAACAGGGTTCATTG 9300

 60349238 ACTAATTAGTAATGAATGCTGAGAGGGCTGTGTTAAGAAAGAATCTTGGACCATATTCAG 60349297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9301 ACTAATTAGTAATGAATGCTGAGAGGGCTGTGTTAAGAAAGAATCTTGGACCATATTCAG 9360

 60349298 ATTCCATAGATGTGTCTAGAAGGATAAGTATTAGCTACATTCAGGTAAGTGAAGGAGTCA 60349357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9361 ATTCCATAGATGTGTCTAGAAGGATAAGTATTAGCTACATTCAGGTAAGTGAAGGAGTCA 9420

 60349358 AGCAACAACACATGCCAAATATTTTCCTTCTCTGGCTTATATTTAAGCTTATCAGCATCC 60349417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9421 AGCAACAACACATGCCAAATATTTTCCTTCTCTGGCTTATATTTAAGCTTATCAGCATCC 9480

 60349418 AAAATAAGGCCCTACTTTTGAACCTTTTAAGAGAGAATGCAACGGTGGAATCACTCCCAC 60349477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9481 AAAATAAGGCCCTACTTTTGAACCTTTTAAGAGAGAATGCAACGGTGGAATCACTCCCAC 9540

 60349478 TGACTTAGCAAGATAAATGTTTGACTTAAGATGAGACTCATTCTGGTGCCTCAAATTTCT 60349537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9541 TGACTTAGCAAGATAAATGTTTGACTTAAGATGAGACTCATTCTGGTGCCTCAAATTTCT 9600

 60349538 CTGAAATCAATCTATGTGGAGTTGCTTTAGGGCTTAATTTGTCTATGTAGCATCCAAATC 60349597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9601 CTGAAATCAATCTATGTGGAGTTGCTTTAGGGCTTAATTTGTCTATGTAGCATCCAAATC 9660

 60349598 ATTTTGCAACATAGTTTTCACTTTCTACAGTGTGTGGAAGCTCTTGAATTTGATACAGAA 60349657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9661 ATTTTGCAACATAGTTTTCACTTTCTACAGTGTGTGGAAGCTCTTGAATTTGATACAGAA 9720

 60349658 AAGAGTTCTCCATCTCCCAGTGCAAGAAAAGAATATTTAGATTGACACTAATTTATAGAG 60349717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9721 AAGAGTTCTCCATCTCCCAGTGCAAGAAAAGAATATTTAGATTGACACTAATTTATAGAG 9780

 60349718 GCTACAGGCTGGTGCATGAGACAGCTGTGTTTTCTCCAGGACATCACTACAGCACTCATA 60349777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9781 GCTACAGGCTGGTGCATGAGACAGCTGTGTTTTCTCCAGGACATCACTACAGCACTCATA 9840

 60349778 AATGCCACACAACACATTTGGAACACACCAGGCTCCTTCTGTCTATGGACAGTGGCTGCT 60349837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9841 AATGCCACACAACACATTTGGAACACACCAGGCTCCTTCTGTCTATGGACAGTGGCTGCT 9900

 60349838 GTTACTTAATTTGCCATTTGAGGGGATAAAGCATAGACGCTTCTAATGTCCTCCAGTAGG 60349897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9901 GTTACTTAATTTGCCATTTGAGGGGATAAAGCATAGACGCTTCTAATGTCCTCCAGTAGG 9960

 60349898 GGGTGGGAAGAAGAAAGTTGGCCACTTTTCATTGAACCTAGTTTCTTTTTTCTTTACTTA 60349957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9961 GGGTGGGAAGAAGAAAGTTGGCCACTTTTCATTGAACCTAGTTTCTTTTTTCTTTACTTA 10020

 60349958 ATTTGTACATTTCTGTACAACTGTAAATATTTTTTATTTCTTTGGGCAAAAAAATATTAA 60350017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10021 ATTTGTACATTTCTGTACAACTGTAAATATTTTTTATTTCTTTGGGCAAAAAAATATTAA 10080

 60350018 TTAGGAAATCTGTAATTTGAATTATCCATGCTTTGGGCTCACAATAAAAATGTCTAAGAT 60350077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10081 TTAGGAAATCTGTAATTTGAATTATCCATGCTTTGGGCTCACAATAAAAATGTCTAAGAT 10140

 60350078 ATTCTGAGCTTGAGAAGCAGAACCAAAATATATATGATAGAATTAAATTGCTTATGAATA 60350137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10141 ATTCTGAGCTTGAGAAGCAGAACCAAAATATATATGATAGAATTAAATTGCTTATGAATA 10200

 60350138 CTTCTTTGCAGTTTACAAAGTATACACACATATATATT 60350175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10201 CTTCTTTGCAGTTTACAAAGTATACACACATATATATT 10238

Alignment time is 12.8521 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3301] =>      3301 nucs 'mol-32-30f6-201012_3301'

Score:        3267
Aligned:      3300        nucs
Identic:      3297 (100%) nucs =>       248 (100%)      3049 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60338098,60338345] EXCISED REGION [60338347,60341398]
 second seq =>  [       1,     248] EXCISED REGION [     250,    3301]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [60338346,60338346]
 second seq =>         1 nucs [249,249]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60338345,60338345] to [60338347,60338347]
 second seq =>         1 nucs [248,248] to [250,250]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60338098 ATCTCACCCTGACCAGCCCTGAGGGCAAACAGGGTGTCAATAGGCAAGGACAAAAGCTGT 60338157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTCACCCTGACCAGCCCTGAGGGCAAACAGGGTGTCAATAGGCAAGGACAAAAGCTGT 60

 60338158 ACATTTGCTTTCAGAAACACTGAGCCAAGGCCATCCTAATCATAAGCTGTCTGTGCAGTC 60338217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATTTGCTTTCAGAAACACTGAGCCAAGGCCATCCTAATCATAAGCTGTCTGTGCAGTC 120

 60338218 CGTTGTATTTCAGAATTTGGACATTCCATGAAGCTTGCATCTTTTTCTTTACAGTTCACT 60338277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGTTGTATTTCAGAATTTGGACATTCCATGAAGCTTGCATCTTTTTCTTTACAGTTCACT 180

 60338278 GTGATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAAACCCAAACTCAGAGGAGGAAAGTGACTTGC 60338337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGATAAAATGGAAGATAGTCAGCAAATAAACCCAAACTCAGAGGAGGAAAGTGACTTGC 240

 60338338 CTTATCAT 60338345
          ||||||||
      241 CTTATCAT 248

EXCISED REGION

 60338347 TGTTGTGCCCATACGAAGACCCATCTTTTCAAATGTCTTGTGTTTTATTGGTTCCCAAGT 60338406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 TGTTGTGCCCATACGAAGACCCATCTTTTCAAATGTCTTGTGTTTTATTGGTTCCCAAGT 309

 60338407 TGTTTATATAATAAAATAATGTGCCTTTAAAAACTAAGATTCACCACAACACACAGGGTG 60338466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 TGTTTATATAATAAAATAATGTGCCTTTAAAAACTAAGATTCACCACAACACACAGGGTG 369

 60338467 AAGGAATAGGTTTTTCTGCTGTTTCTTCTCTAGGAAAGGTGGGCGCAGACGGTACCGCAC 60338526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 AAGGAATAGGTTTTTCTGCTGTTTCTTCTCTAGGAAAGGTGGGCGCAGACGGTACCGCAC 429

 60338527 ACACTGTGAGACTGTGGGACTCTTGGCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTCATACCTGTC 60338586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 ACACTGTGAGACTGTGGGACTCTTGGCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTCATACCTGTC 489

 60338587 CATTGGTATATTCAAAGGCCAACTTCAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATAATGCTAAAA 60338646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 CATTGGTATATTCAAAGGCCAACTTCAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATAATGCTAAAA 549

 60338647 TGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAATCTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGTTCAAAAGAT 60338706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 TGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAATCTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGTTCAAAAGAT 609

 60338707 GACAATAAATTAGAGAAAAATCATTCACTAAACAATAAATATGGCCTCCTGAAGCCAGAT 60338766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 GACAATAAATTAGAGAAAAATCATTCACTAAACAATAAATATGGCCTCCTGAAGCCAGAT 669

 60338767 ATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCAAAATTTTACATTTTTGACATACTCAAAATTATGTC 60338826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 ATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCAAAATTTTACATTTTTGACATACTCAAAATTATGTC 729

 60338827 TCATGATGGAAATATTCACTATCTAGATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGCAAACATATG 60338886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TCATGATGGAAATATTCACTATCTAGATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGCAAACATATG 789

 60338887 TCAAAACTTATTGTTTACTGTAAATATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTTATAACTCAA 60338946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 TCAAAACTTATTGTTTACTGTAAATATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTTATAACTCAA 849

 60338947 TAAATCTATAAAAATAATCTCATCCAAAAACAACAAAATAATTGGTTATCATGAATCATA 60339006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 TAAATCTATAAAAATAATCTCATCCAAAAACAACAAAATAATTGGTTATCATGAATCATA 909

 60339007 ATGATTTTTAAACATCTTTCCATGGGAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACCGTTAAGTTG 60339066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 ATGATTTTTAAACATCTTTCCATGGGAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACCGTTAAGTTG 969

 60339067 AAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTTCCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAATTAGAGGGC 60339126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 AAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTTCCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAATTAGAGGGC 1029

 60339127 ACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATTACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAAATACTAGAT 60339186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 ACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATTACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAAATACTAGAT 1089

 60339187 GGGAATTTCTCATGGTTTTATTACTGATAACAAGACAAGAACATAGACAATTCTAATGAT 60339246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 GGGAATTTCTCATGGTTTTATTACTGATAACAAGACAAGAACATAGACAATTCTAATGAT 1149

 60339247 ATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTT 60339306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1150 ATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGAATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAGGGAGTT 1209

 60339307 ACATACAAAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCA 60339366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 ACATACAAAATAATATGAAGTATATTCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCA 1269

 60339367 TCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGG 60339426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 TCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAGCAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGG 1329

 60339427 AAGTTTGGGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCA 60339486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AAGTTTGGGGATATGATTCTAATTATTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCA 1389

 60339487 TTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAA 60339546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 TTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAA 1449

 60339547 ATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGA 60339606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 ATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGA 1509

 60339607 GATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCA 60339666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 GATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCA 1569

 60339667 CCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGAC 60339726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 CCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGAC 1629

 60339727 TTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCT 60339786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCT 1689

 60339787 TGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTAC 60339846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTAC 1749

 60339847 ATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGAT 60339906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 ATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGAT 1809

 60339907 TGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGT 60339966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 TGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGT 1869

 60339967 TTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGG 60340026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGG 1929

 60340027 AGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACG 60340086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 AGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACG 1989

 60340087 GTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTT 60340146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 GTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTT 2049

 60340147 TCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACC 60340206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 TCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACC 2109

 60340207 TGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGG 60340266
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TGGAGATTTTTTTTTAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGG 2169

 60340267 TATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGG 60340326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 TATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGG 2229

 60340327 TATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTT 60340386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 TATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTT 2289

 60340387 TTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGT 60340446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 TTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGT 2349

 60340447 GAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCC 60340506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 GAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCC 2409

 60340507 CACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGG 60340566
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 CACCTCCATGCCCCTCAGGCCACTGCCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGG 2469

 60340567 AAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACAT 60340626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 AAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACAT 2529

 60340627 AAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCC 60340686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 AAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCC 2589

 60340687 TCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAAT 60340746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 TCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAAT 2649

 60340747 AGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGG 60340806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 AGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGG 2709

 60340807 GTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCA 60340866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 GTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCA 2769

 60340867 GATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAA 60340926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 GATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAA 2829

 60340927 CAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCT 60340986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 CAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCT 2889

 60340987 AGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCA 60341046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 AGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCA 2949

 60341047 AGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATA 60341106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 AGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATA 3009

 60341107 AGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAA 60341166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 AGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAA 3069

 60341167 ACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCT 60341226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 ACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCT 3129

 60341227 CATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATG 60341286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 CATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATG 3189

 60341287 TCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCC 60341346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCC 3249

 60341347 ATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGTT 60341398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 ATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGTT 3301

Alignment time is 4.67499 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2528] =>      2528 nucs 'mol-32-30f6-230163_2528'

Score:        2049
Aligned:      2060        nucs
Identic:      2059 (100%) nucs =>       295 (100%)      1764 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60341103,60341397] EXCISED REGION [60343242,60345006]
 second seq =>  [       1,     295] EXCISED REGION [     296,    2060]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [295,295] to [296,296]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60341103 AATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATA 60341162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATA 60

 60341163 AAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGAC 60341222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGAC 120

 60341223 ATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCA 60341282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCA 180

 60341283 TATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTT 60341342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTT 240

 60341343 GCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 60341397
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 295

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 355

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 415

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 475

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 535

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 595

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 60343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 655

 60343602 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 60343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 715

 60343662 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 60343721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 775

 60343722 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 60343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 835

 60343782 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 60343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 895

 60343842 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 60343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 955

 60343902 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 60343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 1015

 60343962 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 60344021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 1075

 60344022 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTCTGTCTAA 60344081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTCTGTCTAA 1135

 60344082 AGCTTTGTCAAGTTAATTTATCTTTTCAAAAAAAACAATTTTTCATTTCATTTATTTTTA 60344141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 AGCTTTGTCAAGTTAATTTATCTTTTCAAAAAAAACAATTTTTCATTTCATTTATTTTTA 1195

 60344142 TTTGTTTGTTCCCATTTCATTTGTTTCTGCTCTGATATTTATTCTTTCTTTGTTTCTACT 60344201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TTTGTTTGTTCCCATTTCATTTGTTTCTGCTCTGATATTTATTCTTTCTTTGTTTCTACT 1255

 60344202 AACTTTGGGTTTGATTTGCTCTTGTTTTTCGAATTCTTTAAGATGCATTATTATGTTGCT 60344261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 AACTTTGGGTTTGATTTGCTCTTGTTTTTCGAATTCTTTAAGATGCATTATTATGTTGCT 1315

 60344262 CATTTGAAGTTTTTCTACTTTTTTGATGTAGGGCTTATTGCATAAACTTTCCTCTTAATA 60344321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 CATTTGAAGTTTTTCTACTTTTTTGATGTAGGGCTTATTGCATAAACTTTCCTCTTAATA 1375

 60344322 CTGCTTTCAGTGTATTCCACAGGTATTGGTATATTGTGTTTCCATTTTCATGTAGTTCAA 60344381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 CTGCTTTCAGTGTATTCCACAGGTATTGGTATATTGTGTTTCCATTTTCATGTAGTTCAA 1435

 60344382 GACATTTTTTCATTCTTAATTTCAATGAAGAAATTAGAAGAAATCATTGACATGATTTCA 60344441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GACATTTTTTCATTCTTAATTTCAATGAAGAAATTAGAAGAAATCATTGACATGATTTCA 1495

 60344442 ATTTTTTTGAAATTTTAAAGACTTGTTTTGTGGCTTAACATATGGTCTATTCTTGAGAAT 60344501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 ATTTTTTTGAAATTTTAAAGACTTGTTTTGTGGCTTAACATATGGTCTATTCTTGAGAAT 1555

 60344502 GATCTATATGCTAAGAAGAAGAATGTATATTCTGCAGCCATTGGTTAAATAGTCTGTAAA 60344561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 GATCTATATGCTAAGAAGAAGAATGTATATTCTGCAGCCATTGGTTAAATAGTCTGTAAA 1615

 60344562 TACCTATTAGGTCTATTTGGTCTATAGATAAATTCTGATATTTCTTTTGTGATTATCTAT 60344621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TACCTATTAGGTCTATTTGGTCTATAGATAAATTCTGATATTTCTTTTGTGATTATCTAT 1675

 60344622 CTATATGTTCTGTCCAGTGCTGAAAGTGGGGTGTTCATGTGTCCAGCTACTATTGTATTG 60344681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CTATATGTTCTGTCCAGTGCTGAAAGTGGGGTGTTCATGTGTCCAGCTACTATTGTATTG 1735

 60344682 GAGTTTGTCTCTCTCTTTAGCTCAATTAATATTTGCTATATATATTTGGGTGCAGTGTTG 60344741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 GAGTTTGTCTCTCTCTTTAGCTCAATTAATATTTGCTATATATATTTGGGTGCAGTGTTG 1795

 60344742 GGTGCATATATATTTATAATTGTTATATCCCCTTGACGAATTAACTCCTTTATCATTATA 60344801
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 GGTGCATATATATTTATAATCGTTATATCCCCTTGACGAATTAACTCCTTTATCATTATA 1855

 60344802 TAATGATCTTCTTTGTCTCTTCTTATAGTTTTTGTATTTAAATCTATTTTATCGGGTATA 60344861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TAATGATCTTCTTTGTCTCTTCTTATAGTTTTTGTATTTAAATCTATTTTATCGGGTATA 1915

 60344862 AGTATAGTTCTGCTTTTGTTTCCATTCACATAAAATATCTTTTTCTGTCCCTTCATTTTC 60344921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 AGTATAGTTCTGCTTTTGTTTCCATTCACATAAAATATCTTTTTCTGTCCCTTCATTTTC 1975

 60344922 AGTCTATGTAGTTCTTTATAGGTGAAGTGTTTCTTGTAGGCAACAGATTATTTGGTCTTG 60344981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGTCTATGTAGTTCTTTATAGGTGAAGTGTTTCTTGTAGGCAACAGATTATTTGGTCTTG 2035

 60344982 TTTTTTAATCCATTCAACCACTGTA 60345006
          |||||||||||||||||||||||||
     2036 TTTTTTAATCCATTCAACCACTGTA 2060

Alignment time is 3.66682 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4113] =>      4113 nucs 'mol-32-3143-006021_4113'

Score:        4113
Aligned:      4113        nucs
Identic:      4113 (100%) nucs =>      3508 (100%)       605 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60339457,60342964] EXCISED REGION [60342966,60343570]
 second seq =>  [       1,    3508] EXCISED REGION [    3509,    4113]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [60342965,60342965]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [60342965,60342978] to [60342966,60342979]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60339457 CAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTA 60339516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTA 60

 60339517 AATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGAT 60339576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGAT 120

 60339577 AAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATT 60339636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATT 180

 60339637 TTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGG 60339696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGG 240

 60339697 GGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATT 60339756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATT 300

 60339757 TATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACA 60339816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACA 360

 60339817 CACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAA 60339876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAA 420

 60339877 AATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAG 60339936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAG 480

 60339937 AGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTT 60339996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTT 540

 60339997 TTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTT 60340056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTT 600

 60340057 AGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAA 60340116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAA 660

 60340117 GTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACAT 60340176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACAT 720

 60340177 CTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTG 60340236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTG 780

 60340237 GGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAA 60340296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAA 840

 60340297 TGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCT 60340356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCT 900

 60340357 TTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTAT 60340416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTAT 960

 60340417 TGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAA 60340476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAA 1020

 60340477 CTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGC 60340536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGC 1080

 60340537 CTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATT 60340596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATT 1140

 60340597 CAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTG 60340656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTG 1200

 60340657 TGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACA 60340716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACA 1260

 60340717 GGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCT 60340776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCT 1320

 60340777 TTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATA 60340836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATA 1380

 60340837 ATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTT 60340896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTT 1440

 60340897 TTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTC 60340956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTC 1500

 60340957 TCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCA 60341016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCA 1560

 60341017 AAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAA 60341076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAA 1620

 60341077 CAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGA 60341136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGA 1680

 60341137 CAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCT 60341196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCT 1740

 60341197 AGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAAT 60341256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAAT 1800

 60341257 GATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTT 60341316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTT 1860

 60341317 TTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTT 60341376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTT 1920

 60341377 AATAGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAGATGGATAAT 60341436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATAGAGCTATTTGAGCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAGATGGATAAT 1980

 60341437 TTGCAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTCTTTTGCTGT 60341496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGCAATTTTTTTCTCTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTCTTTTGCTGT 2040

 60341497 GCAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGTTGCCTGTGC 60341556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGTTGCCTGTGC 2100

 60341557 TTATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACTTTCCCCAAT 60341616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACTTTCCCCAAT 2160

 60341617 GTTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTTGGTCTGTCA 60341676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTTGGTCTGTCA 2220

 60341677 CCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGCTCA 60341736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGCTCA 2280

 60341737 AGCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCC 60341796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCC 2340

 60341797 TGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTT 60341856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTT 2400

 60341857 GAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 60341916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 2460

 60341917 ATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGG 60341976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGG 2520

 60341977 TCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAAGAGTTAGGG 60342036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAAGAGTTAGGG 2580

 60342037 GTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTTTTATTAAAG 60342096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTTTTATTAAAG 2640

 60342097 AGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAATTCACTGCAG 60342156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAATTCACTGCAG 2700

 60342157 ATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTTTTTTATGCC 60342216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTTTTTTATGCC 2760

 60342217 AGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGAAGTAGGTAA 60342276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGAAGTAGGTAA 2820

 60342277 TGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTT 60342336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTT 2880

 60342337 ATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTATCATTGGTAT 60342396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTATCATTGGTAT 2940

 60342397 TTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGTTTTAACAAT 60342456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGTTTTAACAAT 3000

 60342457 ACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTCCTCTTCAAT 60342516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTCCTCTTCAAT 3060

 60342517 TTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTTGATTAAGTT 60342576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTTGATTAAGTT 3120

 60342577 TATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTTTCTTGATTTC 60342636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTTTCTTGATTTC 3180

 60342637 TTTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGT 60342696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGT 3240

 60342697 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCATGAGGTCAGG 60342756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCATGAGGTCAGG 3300

 60342757 AGATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 60342816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 3360

 60342817 TAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 60342876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3420

 60342877 ATGGTGTGAACCCAGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTCCAG 60342936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGGTGTGAACCCAGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTCCAG 3480

 60342937 CCTGGGCAACAGAGAGAGACTCCATCTC 60342964
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CCTGGGCAACAGAGAGAGACTCCATCTC 3508

EXCISED REGION

 60342966 AAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATAT 60343025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 AAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATAT 3568

 60343026 TGTATCCTGCAACGCTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTG 60343085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 TGTATCCTGCAACGCTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTG 3628

 60343086 GAGAATTTACACTTTTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGAC 60343145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 GAGAATTTACACTTTTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGAC 3688

 60343146 TTCTTCTGTTCCAATTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAA 60343205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 TTCTTCTGTTCCAATTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAA 3748

 60343206 GACTTCCAGTACTATGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGA 60343265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 GACTTCCAGTACTATGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGA 3808

 60343266 TCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCA 60343325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 TCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCA 3868

 60343326 TCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAG 60343385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 TCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAG 3928

 60343386 GGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAAT 60343445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 GGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAAT 3988

 60343446 GATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCA 60343505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 GATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCA 4048

 60343506 TATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTT 60343565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 TATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTT 4108

 60343566 TTTAA 60343570
          |||||
     4109 TTTAA 4113

Alignment time is 5.54434 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2081] =>      2081 nucs 'mol-32-3143-249511_2081'

Score:        2081
Aligned:      2081        nucs
Identic:      2081 (100%) nucs =>      1692 (100%)       389 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60341272,60342963] EXCISED REGION [60342965,60343353]
 second seq =>  [       1,    1692] EXCISED REGION [    1693,    2081]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [60342964,60342964]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60341272 GCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTAT 60341331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTAT 60

 60341332 TTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGA 60341391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGA 120

 60341392 GCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAGATGGATAATTTGCAATTTTTTTCT 60341451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCGTTATATATTATGGTTATTAATCCCTTGTCAGATGGATAATTTGCAATTTTTTTCT 180

 60341452 CTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGATTTTTAA 60341511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTATTCTGTGGGTTGTCTCTTCACTTAGTTGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGATTTTTAA 240

 60341512 CTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGTTGCCTGTGCTTATGGGGTATTACT 60341571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTTTTGCTTTGGTTGCCTGTGCTTATGGGGTATTACT 300

 60341572 CTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACTTTCCCCAATGTTTCAATGTTTTCT 60341631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATATCCTTGAGACTTTCCCCAATGTTTCAATGTTTTCT 360

 60341632 TGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTTGGTCTGTCACCCAGGGTGGAGTGC 60341691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACTGAGTCTTGGTCTGTCACCCAGGGTGGAGTGC 420

 60341692 AGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGCTCAAGCAAATCTCTTACC 60341751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGCTCAAGCAAATCTCTTACC 480

 60341752 TCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTG 60341811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTG 540

 60341812 TTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCA 60341871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCA 600

 60341872 AGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACATC 60341931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACATC 660

 60341932 TATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTC 60341991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTAATGGTTTCCTAGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTC 720

 60341992 TTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAAGAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCT 60342051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTGTATACAACAAGAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCT 780

 60342052 TTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTTTTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCC 60342111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCCAGAACTATTTTTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCC 840

 60342112 CAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAATTCACTGCAGATTAATGGATTTGTT 60342171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTCAAAAATGAATTCACTGCAGATTAATGGATTTGTT 900

 60342172 TCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTTTTTTATGCCAGTACCATGCTGGCA 60342231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATTTTTTTTTATGCCAGTACCATGCTGGCA 960

 60342232 TGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGAAGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGT 60342291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAGTACAATTCGAAGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGT 1020

 60342292 TTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTTATGGTTCCACATAAA 60342351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTTTTGCTATTCTGGGTCTTTTATGGTTCCACATAAA 1080

 60342352 TTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTATCATTGGTATTTTGATAGATATTTG 60342411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTGTGATGAGTATCATTGGTATTTTGATAGATATTTG 1140

 60342412 ATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGTTTTAACAATACTGACTCTTTCAAT 60342471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTAGTAGGGATGTTTTAACAATACTGACTCTTTCAAT 1200

 60342472 CCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTCCTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGT 60342531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATGAACATGGAATATCCTTCCATTTTTGTGTGTCCTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGT 1260

 60342532 TTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTTGATTAAGTTTATTCCTAGGTATTT 60342591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTTTCACTTCTTTGATTAAGTTTATTCCTAGGTATTT 1320

 60342592 TATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTTTCTTGATTTCTTTTTCAGATTGTTT 60342651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATGGGATTACTTTCTTGATTTCTTTTTCAGATTGTTT 1380

 60342652 GCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGTGGCTCACACCTGTAA 60342711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTGATTTTGGGCCGGGTGCCGTGGCTCACACCTGTAA 1440

 60342712 TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 60342771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAAGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCC 1500

 60342772 TGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTG 60342831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTG 1560

 60342832 GCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCAG 60342891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCAG 1620

 60342892 GAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGA 60342951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGA 1680

 60342952 GAGACTCCATCT 60342963
          ||||||||||||
     1681 GAGACTCCATCT 1692

EXCISED REGION

 60342965 AAAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATA 60343024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 AAAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAAGAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATA 1752

 60343025 TTGTATCCTGCAACGCTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGT 60343084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 TTGTATCCTGCAACGCTGTAACTTTACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGT 1812

 60343085 GGAGAATTTACACTTTTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGA 60343144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 GGAGAATTTACACTTTTCTAAATATAAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGA 1872

 60343145 CTTCTTCTGTTCCAATTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAA 60343204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 CTTCTTCTGTTCCAATTTGGATGTCCTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAA 1932

 60343205 AGACTTCCAGTACTATGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAG 60343264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 AGACTTCCAGTACTATGCTGAATAACAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAG 1992

 60343265 ATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGC 60343324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 ATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGC 2052

 60343325 ATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTG 60343353
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2053 ATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTG 2081

Alignment time is 3.22273 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2758] =>      2758 nucs 'mol-32-322a-057926_2758'

Score:        2747
Aligned:      2758        nucs
Identic:      2757 (100%) nucs =>      1924 (100%)       833 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60339473,60341397] EXCISED REGION [60343242,60344074]
 second seq =>  [       1,    1925] EXCISED REGION [    1926,    2758]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [1925,1925] to [1926,1926]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60339473 AATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGT 60339532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCCAGTTAAATCTATTTAGAGTGT 60

 60339533 AGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTA 60339592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATTTTGATAAAGTATTCTATTTTA 120

 60339593 CACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTC 60339652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAGCAATTTTCATTACTAACTTTC 180

 60339653 CTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAG 60339712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTATTTGGGGGAAGAAATTTTCAG 240

 60339713 GTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCT 60339772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATATTATTTATTTTGCACCGCTCT 300

 60339773 GAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGG 60339832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCAAAACACACAGTCGGCAATGGG 360

 60339833 ATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACAC 60339892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTACTCTAAAATGCTTTTCAGACAC 420

 60339893 AGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAA 60339952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCAAGAAGAGTTGAGACAAAAGAA 480

 60339953 CTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAA 60340012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAGAAGTTTTGTTCATCATTTGAA 540

 60340013 AAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATAT 60340072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTTAACTTAGTCCAAACCATATAT 600

 60340073 CATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACC 60340132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGCCACAAGTAACAAGCTTTAACC 660

 60340133 AAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTT 60340192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCTAACATCTCTACAACCCAGGTT 720

 60340193 CCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGT 60340252
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTTAAATTTTTGTGGGTGGGTACATAGTAGGTGT 780

 60340253 ATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATAT 60340312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCATACAATGAATAATAATCATAT 840

 60340313 CATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAAT 60340372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCCTTTCTTTGTGTTACAAACAAT 900

 60340373 CCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGC 60340432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAAATTATTGTTGACTGTAGGTGC 960

 60340433 CCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCT 60340492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTATCTAACTATATTTTTATATCT 1020

 60340493 ACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACT 60340552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTGCCAGCCTCCCAGCACTACACT 1080

 60340553 TCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTT 60340612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCATGAATTCAACTGTTTTAATTTT 1140

 60340613 AATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCA 60340672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCTTTCTGTGCTTGGCTTATATCA 1200

 60340673 CTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTT 60340732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAATGACAGGATCTCATTCTTTTT 1260

 60340733 TATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCT 60340792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCATTTGTCTCT 1320

 60340793 TGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATA 60340852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGTGAATAATATAGTGCTGTGATA 1380

 60340853 AACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAA 60340912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCTTTCTTTTGGGTATATACCCAA 1440

 60340913 CAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTT 60340972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGAAACTCTCCAGGATATTGGTTT 1500

 60340973 GGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAA 60341032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGCAACCAAAGCAAAAATGGACAA 1560

 60341033 ATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGA 60341092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAACTAAGTGAAGAGA 1620

 60341093 CAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACC 60341152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCATCTGACAAGGGATTAATAACC 1680

 60341153 ATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGA 60341212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTAGCTCTAGTTTTTTTAATTGGA 1740

 60341213 GTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAG 60341272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAATGATATTGAG 1800

 60341273 CACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATT 60341332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTCTTCTTTTGAGTAATGTCTATT 1860

 60341333 TAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAG 60341392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTTTTCTTAATAGAGCTATTTGAG 1920

 60341393 CTCGT 60341397
          |||||
     1921 CTCGT 1925

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 1985

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 2045

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 2105

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 2165

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 2225

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 60343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 2285

 60343602 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 60343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 2345

 60343662 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 60343721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 2405

 60343722 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 60343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 2465

 60343782 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 60343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 2525

 60343842 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 60343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 2585

 60343902 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 60343961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 CTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTTTCGAATTAATTG 2645

 60343962 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 60344021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAGGTATCAATTATA 2705

 60344022 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTC 60344074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 ATGTTTCCTTTTGCATCTCTGATTTATTTGGTCTTCTCTTTTTTTTACTAGTC 2758

Alignment time is 3.82858 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2543] =>      2543 nucs 'mol-32-3332-102427_2543'

Score:        2530
Aligned:      2543        nucs
Identic:      2541 (100%) nucs =>      1332 (100%)      1209 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60341478,60342809] EXCISED REGION [60342810,60344020]
 second seq =>  [       1,    1332] EXCISED REGION [    1335,    2543]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1333,1334]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [60342965,60342966]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [1333,1338] to [1335,1340]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1333,1333] to [1334,1334]

 60341478 TAGTTGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTT 60341537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGTTGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGATTTTTAACTTGATGTGATCCCATTTGTCCATTT 60

 60341538 TTGCTTTGGTTGCCTGTGCTTATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATAT 60341597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCTTTGGTTGCCTGTGCTTATGGGGTATTACTCTAGAAATCTTTGCCCAGACCAATAT 120

 60341598 CCTTGAGACTTTCCCCAATGTTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAG 60341657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTGAGACTTTCCCCAATGTTTCAATGTTTTCTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAG 180

 60341658 ACTGAGTCTTGGTCTGTCACCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAA 60341717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGAGTCTTGGTCTGTCACCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAA 240

 60341718 CCTCCACCTCCCAGGCTCAAGCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTAC 60341777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCCACCTCCCAGGCTCAAGCAAATCTCTTACCTCTGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTAC 300

 60341778 AGGTGCCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTA 60341837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGTGCCTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTA 360

 60341838 TGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCA 60341897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCATCTCCGCCTCCCA 420

 60341898 AAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTA 60341957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACCACATCTATTTGGCCCCCAGTGTTTTCTTTTA 480

 60341958 ATGGTTTCCTAGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTG 60342017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGTTTCCTAGCTTGAGGTCTTCAGTATAAGTCTTTCATCTATTTTGATTTGATTTTTG 540

 60342018 TATACAACAAGAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCC 60342077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATACAACAAGAGTTAGGGGTCTAGTTTCATTCTTTTGCATATGAATGTAATGTTGTCCC 600

 60342078 AGAACTATTTTTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTC 60342137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAACTATTTTTATTAAAGAGACTGTCCTTTCCCCAGTGTGTGTTCTTGGCACCTTTTTC 660

 60342138 AAAAATGAATTCACTGCAGATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTG 60342197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAATGAATTCACTGCAGATTAATGGATTTGTTTCTGGCTTCTCTACTCTGTTCCATTG 720

 60342198 GTCTATTTTTTTTTATGCCAGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAG 60342257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCTATTTTTTTTTATGCCAGTACCATGCTGGCATGGTTTTGGTTACTATAGCTCTGTAG 780

 60342258 TACAATTCGAAGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTT 60342317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACAATTCGAAGTAGGTAATGTGATTCTTCCAGTTTTGTTCTTTTTGCTCAGGGTGGCTT 840

 60342318 TTGCTATTCTGGGTCTTTTATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTG 60342377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGCTATTCTGGGTCTTTTATGGTTCCACATAAATTTTAGGATTATTTTTCCTATTTCTG 900

 60342378 TGATGAGTATCATTGGTATTTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTA 60342437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGATGAGTATCATTGGTATTTTGATAGATATTTGATTGAATCTATAGATTGCTTTTGGTA 960

 60342438 GTAGGGATGTTTTAACAATACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATT 60342497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTAGGGATGTTTTAACAATACTGACTCTTTCAATCCATGAACATGGAATATCCTTCCATT 1020

 60342498 TTTGTGTGTCCTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTT 60342557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTGTGTCCTCTTCAATTTCTTTCAGCAATGTTTTATAGCTTTTATTGTAGAGATCTT 1080

 60342558 TCACTTCTTTGATTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATG 60342617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCACTTCTTTGATTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTTATTTGCAGTTATTGTAAATG 1140

 60342618 GGATTACTTTCTTGATTTCTTTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTG 60342677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGATTACTTTCTTGATTTCTTTTTCAGATTGTTTGCTGTTTGCATATAGAAATGCTACTG 1200

 60342678 ATTTTGGGCCGGGTGCCGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCA 60342737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTTGGGCCGGGTGCCGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCA 1260

 60342738 AGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTC 60342797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTC 1320

 60342798 TACTAAAAATAC 60342809
          ||||||||||||
     1321 TACTAAAAATAC 1332

EXCISED REGION

 60342810 AAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 60342869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 AAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 1394

 60342870 CAGGAGAATGGTGTGAACCCAGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGC 60342929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 CAGGAGAATGGTGTGAACCCAGGAAGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTTGCGCCACTGC 1454

 60342930 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAA 60342989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
     1455 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAGAGACTCCATCTC--AAAAAAAAAAAAAGAAACGAAAA 1512

 60342990 GAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATATTGTATCCTGCAACGCTGTAACTTT 60343049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 GAAAAAAGAAATGCTGCTGATTTTGTATGCTGATATTGTATCCTGCAACGCTGTAACTTT 1572

 60343050 ACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTGGAGAATTTACACTTTTCTAAATAT 60343109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 ACTGAATTTTTTATCAATTCTAAGAGTTTTCCAGTGGAGAATTTACACTTTTCTAAATAT 1632

 60343110 AAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGACTTCTTCTGTTCCAATTTGGATGTC 60343169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 AAAATCATATCATCTGCAAAACAGGGATAATTTGACTTCTTCTGTTCCAATTTGGATGTC 1692

 60343170 CTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAAGACTTCCAGTACTATGCTGAATAA 60343229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 CTTTATTTCTTTCTTTTATCTGATTGCTCCAGCAAAGACTTCCAGTACTATGCTGAATAA 1752

 60343230 CAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTT 60343289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 CAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTT 1812

 60343290 TCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGT 60343349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 TCAGAAAACCCAATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGT 1872

 60343350 GTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTG 60343409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 GTTGAGGTATGTTCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTG 1932

 60343410 AATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCAT 60343469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 AATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCAT 1992

 60343470 TCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTC 60343529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TCTGTTGATACAATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTC 2052

 60343530 TGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTT 60343589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 TGAGATAAATCCCACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTT 2112

 60343590 TGCTACTATTTTGTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTT 60343649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 TGCTACTATTTTGTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTT 2172

 60343650 TTCTTGATTTGATATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAA 60343709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 TTCTTGATTTGATATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAA 2232

 60343710 TGCGTTTGGAAGTATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAG 60343769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 TGCGTTTGGAAGTATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAG 2292

 60343770 TTCTTCTTTAAATGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGA 60343829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 TTCTTCTTTAAATGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGA 2352

 60343830 GACTTTTATTACAACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCT 60343889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GACTTTTATTACAACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCT 2412

 60343890 TTATGGTTCAGTCTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTT 60343949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TTATGGTTCAGTCTTGGTAGGTTGTATGTGTCTATGAATTTATCCATTTCTTTTAGATTT 2472

 60343950 TCGAATTAATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAG 60344009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 TCGAATTAATTGGCATATAGTTGCTCATAGTAGTCTCTAATGTTCCTTTGCATTTCTGAG 2532

 60344010 GTATCAATTAT 60344020
          |||||||||||
     2533 GTATCAATTAT 2543

Alignment time is 3.80862 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [60331397,60353241] =>     21845 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3542] =>      3542 nucs 'mol-32-3419-061784_3542'

Score:        3491
Aligned:      3513        nucs
Identic:      3511 (100%) nucs =>      2844 (100%)       667 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [60338552,60341397] EXCISED REGION [60343242,60343908]
 second seq =>  [       1,    2846] EXCISED REGION [    2847,    3513]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1844 nucs [60341398,60343241]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341398,60341398] to [60343242,60343242]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [60341397,60341397] to [60343242,60343242]
 second seq =>         1 nucs [2846,2846] to [2847,2847]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 60338552 GCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTCATACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCAACTT 60338611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCACCATGCGCATCTTGAGGATTTCATACCTGTCCATTGGTATATTCAAAGGCCAACTT 60

 60338612 CAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATAATGCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAAT 60338671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGACCATTCAGGTGCTCCTCAATAATGCTAAAATGAAAAAGCCCAGAGTCTGCCTAAT 120

 60338672 CTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGTTCAAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAATCATT 60338731
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTTGTTCTGCTAGTGCACTAATGTTCGAAAGATGACAATAAATTAGAGAAAAATCATT 180

 60338732 CACTAAACAATAAATATGGCCTCCTGAAGCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCA 60338791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTAAACAATAAATATGGCCTCCTGAAGCCAGATATCCCTGGAAATCTGATGGTCACCA 240

 60338792 AAATTTTACATTTTTGACATACTCAAAATTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTATCTA 60338851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATTTTACATTTTTGACATACTCAAAATTATGTCTCATGATGGAAATATTCACTATCTA 300

 60338852 GATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGCAAACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGTAAAT 60338911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTGTGGTTATAGCTTCACAGGTGCAAACATATGTCAAAACTTATTGTTTACTGTAAAT 360

 60338912 ATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTTATAACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTCATCC 60338971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGAACAATTTAATGTGTTGTCAGTTATAACTCAATAAATCTATAAAAATAATCTCATCC 420

 60338972 AAAAACAACAAAATAATTGGTTATCATGAATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCCATGG 60339031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAACAACAAAATAATTGGTTATCATGAATCATAATGATTTTTAAACATCTTTCCATGG 480

 60339032 GAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACCGTTAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTT 60339091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAACAAGAGTGTATTTAAAAAACCGTTAAGTTGAAAAGCTTATTCCACTGCTGTATTT 540

 60339092 CCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAATTAGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATT 60339151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATGGAGCTTAATCCTGTCTTGTAATTAGAGGGCACTTGTAAGTTTTTTCAAATCTATT 600

 60339152 ACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAAATACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTATTACT 60339211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTAGTATTCCCTAAAGCATCAGAAATACTAGATGGGAATTTCTCATGGTTTTATTACT 660

 60339212 GATAACAAGACAAGAACATAGACAATTCTAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGA 60339271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATAACAAGACAAGAACATAGACAATTCTAATGATATAACCTTAAAGTGGTTATTGATGA 720

 60339272 ATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGTATAT 60339331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATACTAATATTTGAGAATTGCTATGCAAAGGAGTTACATACAAAATAATATGAAGTATAT 780

 60339332 TCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAG 60339391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTTTGTTTCTCTGAGAAACATGAATGAAAGTCATCATTAAAAAACTGGGAGACCTAAG 840

 60339392 CAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTAATTA 60339451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGCCTCTGTGTTTCCTTATGATTAATAGATAGGAAGTTTGGGGATATGATTCTAATTA 900

 60339452 TTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCC 60339511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGTCAATTTCTTTCATACTAATCAATACTCTCATTGAGAATGTGTGAAGGAAATAGCC 960

 60339512 AGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATT 60339571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTTAAATCTATTTAGAGTGTAGTTGTTAAAGGAAATTGAACATTATTGACAGTTCCATT 1020

 60339572 TTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAG 60339631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGATAAAGTATTCTATTTTACACTGCTGAAAAGAGATGAGCACAAGATTTCAGTGTTAG 1080

 60339632 CAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTA 60339691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATTTTCATTACTAACTTTCCTTATTAGACTCCACCTTTGGATGTATAAAAATTATCTA 1140

 60339692 TTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATA 60339751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTGGGGGAAGAAATTTTCAGGTTTATGCTATGACTTGAAATGATTCATGTTTATTAATA 1200

 60339752 TTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCA 60339811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATTTATTTTGCACCGCTCTGAACTGACAAAGCTTGACTAATTTGAAGATTTATGGGCA 1260

 60339812 AAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTAC 60339871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAACACACAGTCGGCAATGGGATTCTGGGGCTTACATAGTTGCTCTAAGTTACGAATTAC 1320

 60339872 TCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCA 60339931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAAAATGCTTTTCAGACACAGAGAAAATAGGATTGTCACTTTTAAAAGGTTCTTAGCA 1380

 60339932 AGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAG 60339991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAGAGTTGAGACAAAAGAACTGTCACGTTTTGTTTTCAGCTTTTGTTTTTTGGAAAAG 1440

 60339992 AAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTT 60340051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTTTTGTTCATCATTTGAAAAGAAGAAATGAGGAGCATTTATTTAGCACTAGCTTCTT 1500

 60340052 AACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGC 60340111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACTTAGTCCAAACCATATATCATGGGGAAACACGGTGTGGGGACATGCAGGAAGAGCGC 1560

 60340112 CACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCT 60340171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACAAGTAACAAGCTTTAACCAAGATGAAATTCTTTCCAGCCTCAATATTAAAGTTACCT 1620

 60340172 AACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTAAAATTTTTGT 60340231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1621 AACATCTCTACAACCCAGGTTCCTCAACTGTAACCTGGAGATTTTTTTTTAAATTTTTGT 1680

 60340232 GGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCA 60340291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGTGGGTACATAGTAGGTGTATATATTTATGGGGTATATGAGATATTTTAATACAGGCA 1740

 60340292 TACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCC 60340351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACAATGAATAATAATCATATCATGGTAAATAAGGTATCCATCACCTCAAGCTTTTATCC 1800

 60340352 TTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAA 60340411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTCTTTGTGTTACAAACAATCCGATTATAATCTTTTTGTTGTTTTGAAATATAAAATAA 1860

 60340412 ATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTA 60340471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTATTGTTGACTGTAGGTGCCCCATTGTGCCAGTGAATACTAGATCTTATTCACTCGTA 1920

 60340472 TCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTG 60340531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTAACTATATTTTTATATCTACCATTAACTGTCCCACCTCCATGCCCCTCAGGCCCCTG 1980

 60340532 CCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCAT 60340591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAGCCTCCCAGCACTACACTTCTTGGCCTCTGGGAAACCGTTCTACTCTCTATCTCCAT 2040

 60340592 GAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCT 60340651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAATTCAACTGTTTTAATTTTAATTTACCACACATAAGTGAGAACATAAGAAGTTTGTCT 2100

 60340652 TTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAA 60340711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCTGTGCTTGGCTTATATCACTTAACAGATGTCCTCCAGTTCCATCCATGTTGTGCAAA 2160

 60340712 TGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACAT 60340771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGACAGGATCTCATTCTTTTTTATGACTGAATAATAGTCCATTGTGTATATGTACCACAT 2220

 60340772 TTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGT 60340831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTCTTTATCCATTTGTCTCTTGATGAACACATGGGTTGCTTCCAAATTTTGGCTAGTGT 2280

 60340832 GAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCT 60340891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAATAATATAGTGCTGTGATAAACGTTGGAGTGCAGATATCTCTTCAATATACTTTTGCT 2340

 60340892 TTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGA 60340951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTCTTTTGGGTATATACCCAACAAACAAACAAAAACAAGAAAACATTGAAACACTGGGGA 2400

 60340952 AACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGC 60341011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTCTCCAGGATATTGGTTTGGGCAAGCATTTCTAGAGTAATGCCCCATAAGCACAGGC 2460

 60341012 AACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAA 60341071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACCAAAGCAAAAATGGACAAATGGGATCACATCAAGTTAAAAATCTTCTGCACAGCAAA 2520

 60341072 AGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCA 60341131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGAAACAACTAAGTGAAGAGACAACCCACAGAATAAGAGAATAAAATTGCAAATTATCCA 2580

 60341132 TCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTA 60341191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTGACAAGGGATTAATAACCATAATATATAAAAAACTGGGATTGCTGGATCATATGGTA 2640

 60341192 GCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCT 60341251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTCTAGTTTTTTTAATTGGAGTCAGATGACATCTCATTGTAGTTCTGATTTGCATTTCT 2700

 60341252 CTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTC 60341311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTAATGATCAATGATATTGAGCACCTTTTCATATGTCTGTTTGCTATTTATTTGTATGTC 2760

 60341312 TTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTT 60341371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCTTTTGAGTAATGTCTATTTAGATATTTTGCCCATTTTTAATTGGATCATTATATTTT 2820

 60341372 TTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 60341397
          ||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTCTTAATAGAGCTATTTGAGCTCGT 2846

EXCISED REGION

 60343242 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 60343301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 TGGGCATCCTTGTAATGTTTCAGATCTTGCAGAAAAGGCTTTCGGTTTTCAGAAAACCCA 2906

 60343302 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 60343361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 ATTTAGAATGATACTAGTTTTGCATCTGTCATATATGGCTTTTATTGTGTTGAGGTATGT 2966

 60343362 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 60343421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TCCTTCAATACCCAGTTTCTTGAGGGTTTTTACCACAAAGGGATGTTGAATTTTATCAAA 3026

 60343422 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 60343481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 TGCTTTTTCAGCATCAACTGAAATGATCATATGGTATTTGCCCTTCATTCTGTTGATACA 3086

 60343482 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 60343541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 ATGCGCTGCACTGATGGATTTGCATATGTTGAACCATCCTTGCATCTCTGAGATAAATCC 3146

 60343542 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 60343601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 CACTTGGTCATGATTAATGATCTTTTTAATGTGTTGTTGAATTCAGTTTGCTACTATTTT 3206

 60343602 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 60343661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 GTTTATGATTTTTACATCAATGTTCATCAGGGATATTGGCCTGTAGTTTTCTTGATTTGA 3266

 60343662 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 60343721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 TATGTCTTTGTCTGGTTCTGATATCAGGGTAATACTAGCCAGGTAGAATGCGTTTGGAAG 3326

 60343722 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 60343781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 TATTCCATCCTGTTCTATTTTTTGTAATAGCTTGAGGTTTAGTATTAGTTCTTCTTTAAA 3386

 60343782 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 60343841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 TGTTTGGTAAAATTCAGCAATGAACACATCAGGCTTTTCTTGCTTGGAGACTTTTATTAC 3446

 60343842 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 60343901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 AACTTTGATCTCATTACTTGTTATTAGTTTATTCATGTTTAGATTTCTTTATGGTTCAGT 3506

 60343902 CTTGGTA 60343908
          |||||||
     3507 CTTGGTA 3513

Alignment time is 4.88144 s

