
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3977] =>      3977 nucs 'mol-32-1ef5-064998_3977'

Score:        3860
Aligned:      3978        nucs
Identic:      3955 ( 99%) nucs =>      2246 ( 99%)      1709 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39002270,39004518] EXCISED REGION [39005028,39006740]
 second seq =>  [       1,    2264] EXCISED REGION [    2265,    3977]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39002270 AAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGA 39002329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGA 60

 39002330 TATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTA 39002389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTA 120

 39002390 ACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCAT 39002449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCAT 180

 39002450 ATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTT 39002509
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGGATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTT 240

 39002510 TACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTG 39002569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTG 300

 39002570 GAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGG 39002629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGG 360

 39002630 GCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGA 39002689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGA 420

 39002690 TCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTG 39002749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      421 TCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTGTGTAACAAACCTG 480

 39002750 CACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAA 39002809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAA 540

 39002810 GAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAA 39002869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAA 600

 39002870 GCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTA 39002929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTA 660

 39002930 AAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAA 39002989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAA 720

 39002990 CCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAAT 39003049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAAT 780

 39003050 GAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACAT 39003109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACAT 840

 39003110 AAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAAC 39003169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAAC 900

 39003170 GAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAAT 39003229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAAT 960

 39003230 AGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGAC 39003289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGAC 1020

 39003290 CCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACC 39003349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACC 1080

 39003350 ATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATT 39003409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATT 1140

 39003410 GCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAG 39003469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAG 1200

 39003470 GGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAA 39003529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAA 1260

 39003530 TAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATT 39003589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATT 1320

 39003590 TATTTATTTAT----------------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTT 39003633
          |||||||||||                |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTT 1380

 39003634 GGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTC 39003693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTC 1440

 39003694 TCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAAT 39003753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAAT 1500

 39003754 TTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCT 39003813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCT 1560

 39003814 GACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCA 39003873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCA 1620

 39003874 CTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAG 39003933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAG 1680

 39003934 TTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGC 39003993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGC 1740

 39003994 TTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAA 39004053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAA 1800

 39004054 AGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTT 39004113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTT 1860

 39004114 GACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAA 39004173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAA 1920

 39004174 AACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAAT 39004233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAAT 1980

 39004234 ATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATG 39004293
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATG 2039

 39004294 TAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTAT 39004353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTAT 2099

 39004354 CTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAA 39004413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAA 2159

 39004414 AAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGG 39004473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGG 2219

 39004474 GGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 2264

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 2324

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 2384

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 2444

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 2504

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 2564

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 2624

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 2684

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 2744

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 2804

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 2864

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 2924

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 2984

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2985 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGACTGACTAAGACCAACATTTTATCC 3044

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 3104

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 3164

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 3224

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 3284

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 3344

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 3404

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 3464

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 3524

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 3584

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 3644

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 3704

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 3764

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 3824

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 3884

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3885 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAAACC 3944

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACT 39006740
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACT 3977

Alignment time is 3.05084 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3288] =>      3288 nucs 'mol-32-1f58-024554_3288'

Score:        3275
Aligned:      3275        nucs
Identic:      3275 (100%) nucs =>      3268 (100%)         7 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004287,39007554] EXCISED REGION [39014054,39014060]
 second seq =>  [       1,    3268] EXCISED REGION [    3274,    3280]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6499 nucs [39007555,39014053]
 second seq =>         5 nucs [3269,3273]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      1909 nucs [39007555,39009463]
 second seq =>         1 nucs [3269,3269]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39007554,39007554] to [39014053,39014053]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39004287 GGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACAT 39004346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACAT 60

 39004347 TTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACAT 39004406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACAT 120

 39004407 AAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAA 39004466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAA 180

 39004467 ACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCA 39004526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCA 240

 39004527 AAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAG 39004586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAG 300

 39004587 AAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAA 39004646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAA 360

 39004647 ATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAA 39004706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAA 420

 39004707 GGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGT 39004766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGT 480

 39004767 CTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAAT 39004826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAAT 540

 39004827 GAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCC 39004886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCC 600

 39004887 CAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATG 39004946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATG 660

 39004947 TTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATG 39005006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATG 720

 39005007 ATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATG 39005066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATG 780

 39005067 CAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAA 39005126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAA 840

 39005127 TCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTG 39005186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTG 900

 39005187 GCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGA 39005246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGA 960

 39005247 TAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATC 39005306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATC 1020

 39005307 TTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAA 39005366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAA 1080

 39005367 GGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGT 39005426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGT 1140

 39005427 TTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAAT 39005486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAAT 1200

 39005487 AAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGA 39005546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGA 1260

 39005547 GATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGT 39005606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGT 1320

 39005607 AATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTG 39005666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTG 1380

 39005667 ATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTG 39005726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTG 1440

 39005727 AATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTG 39005786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTG 1500

 39005787 ACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAAC 39005846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAAC 1560

 39005847 TTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATA 39005906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATA 1620

 39005907 CTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAA 39005966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAA 1680

 39005967 TTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGA 39006026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGA 1740

 39006027 GTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCT 39006086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCT 1800

 39006087 AAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTG 39006146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTG 1860

 39006147 GAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTT 39006206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTT 1920

 39006207 AGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAA 39006266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAA 1980

 39006267 ATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGC 39006326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGC 2040

 39006327 AAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAG 39006386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAG 2100

 39006387 TTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATT 39006446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATT 2160

 39006447 GCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTG 39006506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTG 2220

 39006507 CCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAA 39006566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAA 2280

 39006567 GTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGC 39006626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGC 2340

 39006627 AAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCG 39006686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCG 2400

 39006687 CAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTT 39006746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTT 2460

 39006747 TTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACT 39006806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACT 2520

 39006807 CTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAA 39006866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAA 2580

 39006867 TGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAG 39006926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAG 2640

 39006927 CTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATG 39006986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATG 2700

 39006987 TGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGG 39007046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGG 2760

 39007047 GACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAA 39007106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAA 2820

 39007107 AATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGAT 39007166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGAT 2880

 39007167 CACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGA 39007226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGA 2940

 39007227 GTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGC 39007286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGC 3000

 39007287 CCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGG 39007346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGG 3060

 39007347 AGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACT 39007406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACT 3120

 39007407 CAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACT 39007466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACT 3180

 39007467 GATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAA 39007526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAA 3240

 39007527 ATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCA 39007554
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCA 3268

EXCISED REGION

 39014054 GGTGGGC 39014060
          |||||||
     3274 GGTGGGC 3280

Alignment time is 2.51752 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    5794] =>      5794 nucs 'mol-32-206b-055281_5794'

Score:        5794
Aligned:      5794        nucs
Identic:      5794 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39001702,39007495]
 second seq =>  [       1,    5794]

 39001702 TACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCC 39001761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCC 60

 39001762 ACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGG 39001821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGG 120

 39001822 AGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATA 39001881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATA 180

 39001882 GTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCAT 39001941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCAT 240

 39001942 GGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCA 39002001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCA 300

 39002002 GTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAA 39002061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAA 360

 39002062 ATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTA 39002121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTA 420

 39002122 AATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGG 39002181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGG 480

 39002182 AGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGT 39002241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGT 540

 39002242 ATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTT 39002301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTT 600

 39002302 TCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCT 39002361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCT 660

 39002362 TACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTT 39002421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTT 720

 39002422 CTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGC 39002481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGC 780

 39002482 CTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTG 39002541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTG 840

 39002542 CAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGT 39002601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGT 900

 39002602 GTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAA 39002661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAA 960

 39002662 TACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATG 39002721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATG 1020

 39002722 GCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAG 39002781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAG 1080

 39002782 TATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTA 39002841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTA 1140

 39002842 ACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCT 39002901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCT 1200

 39002902 TAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGA 39002961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGA 1260

 39002962 TGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTT 39003021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTT 1320

 39003022 CATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGC 39003081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGC 1380

 39003082 AGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAG 39003141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAG 1440

 39003142 CGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCC 39003201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCC 1500

 39003202 AGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTAT 39003261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTAT 1560

 39003262 AGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAA 39003321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAA 1620

 39003322 GACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATG 39003381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATG 1680

 39003382 CATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGA 39003441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGA 1740

 39003442 GGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAG 39003501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAG 1800

 39003502 ACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTG 39003561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTG 1860

 39003562 CAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCT 39003621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCT 1920

 39003622 GTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGG 39003681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGG 1980

 39003682 TTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCA 39003741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCA 2040

 39003742 CACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGG 39003801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGG 2100

 39003802 TCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTAC 39003861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTAC 2160

 39003862 AGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAA 39003921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAA 2220

 39003922 ACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAAT 39003981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAAT 2280

 39003982 TATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGT 39004041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGT 2340

 39004042 AGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAAT 39004101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAAT 2400

 39004102 ATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTC 39004161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTC 2460

 39004162 TTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTA 39004221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTA 2520

 39004222 TGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTC 39004281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTC 2580

 39004282 GAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATT 39004341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATT 2640

 39004342 CACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGA 39004401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGA 2700

 39004402 TACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCAC 39004461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCAC 2760

 39004462 AAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATG 39004521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATG 2820

 39004522 ACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTG 39004581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTG 2880

 39004582 TAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGA 39004641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGA 2940

 39004642 TTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAA 39004701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAA 3000

 39004702 CACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACT 39004761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACT 3060

 39004762 AGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACT 39004821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACT 3120

 39004822 CTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGG 39004881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGG 3180

 39004882 GCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAA 39004941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAA 3240

 39004942 CCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAA 39005001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAA 3300

 39005002 GGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGT 39005061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGT 3360

 39005062 TTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTA 39005121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTA 3420

 39005122 GCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACT 39005181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACT 3480

 39005182 GCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAG 39005241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAG 3540

 39005242 TGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACC 39005301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACC 3600

 39005302 TCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATG 39005361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATG 3660

 39005362 CAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTA 39005421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTA 3720

 39005422 AAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTT 39005481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTT 3780

 39005482 GGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATG 39005541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATG 3840

 39005542 AAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAA 39005601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAA 3900

 39005602 TATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAAT 39005661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAAT 3960

 39005662 AGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCT 39005721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCT 4020

 39005722 GGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGA 39005781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGA 4080

 39005782 GCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGA 39005841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGA 4140

 39005842 GAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCA 39005901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCA 4200

 39005902 GAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATA 39005961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATA 4260

 39005962 ACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTA 39006021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTA 4320

 39006022 GGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACT 39006081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACT 4380

 39006082 CATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGC 39006141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGC 4440

 39006142 CAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCG 39006201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCG 4500

 39006202 GCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTA 39006261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTA 4560

 39006262 ATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAG 39006321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAG 4620

 39006322 TTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACA 39006381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACA 4680

 39006382 GGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAAT 39006441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAAT 4740

 39006442 TCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAA 39006501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAA 4800

 39006502 ATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGA 39006561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGA 4860

 39006562 GAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCT 39006621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCT 4920

 39006622 CCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCC 39006681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCC 4980

 39006682 CTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTA 39006741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTA 5040

 39006742 TCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAA 39006801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAA 5100

 39006802 AAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCA 39006861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCA 5160

 39006862 ACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAA 39006921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAA 5220

 39006922 GGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACC 39006981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACC 5280

 39006982 TGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCT 39007041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCT 5340

 39007042 AGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAAT 39007101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAAT 5400

 39007102 GGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCAC 39007161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCAC 5460

 39007162 ACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAG 39007221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAG 5520

 39007222 TCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCG 39007281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCG 5580

 39007282 AAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAA 39007341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAA 5640

 39007342 CTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGA 39007401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGA 5700

 39007402 AGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGG 39007461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGG 5760

 39007462 CAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGG 39007495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGG 5794

Alignment time is 3.8459 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4255] =>      4255 nucs 'mol-32-20fa-124136_4255'

Score:        4181
Aligned:      4181        nucs
Identic:      4181 (100%) nucs =>      4172 (100%)         9 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004278,39008449] EXCISED REGION [39014390,39014398]
 second seq =>  [       1,    4172] EXCISED REGION [    4237,    4245]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5940 nucs [39008450,39014389]
 second seq =>        64 nucs [4173,4236]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      4604 nucs [39008450,39013053]
 second seq =>         6 nucs [4173,4178]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4173,4173] to [4237,4237]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [39008448,39008449] to [39014390,39014391]
 second seq =>         2 nucs [4171,4172] to [4237,4238]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39008450,39008450] to [39014389,39014389]
 second seq =>         1 nucs [4173,4173] to [4236,4236]

 39004278 CTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAA 39004337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAA 60

 39004338 AATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGA 39004397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGA 120

 39004398 GAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAA 39004457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAA 180

 39004458 GCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCA 39004517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCA 240

 39004518 AATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTG 39004577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTG 300

 39004578 ACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCC 39004637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCC 360

 39004638 CAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGC 39004697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGC 420

 39004698 TCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTC 39004757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTC 480

 39004758 TACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATA 39004817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATA 540

 39004818 GACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGG 39004877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGG 600

 39004878 TGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATC 39004937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATC 660

 39004938 TTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCAT 39004997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCAT 720

 39004998 AGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTG 39005057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTG 780

 39005058 TAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACG 39005117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACG 840

 39005118 TCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATG 39005177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATG 900

 39005178 TACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAAT 39005237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAAT 960

 39005238 GGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTC 39005297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTC 1020

 39005298 CACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAAT 39005357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAAT 1080

 39005358 AATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCA 39005417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCA 1140

 39005418 TCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGA 39005477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGA 1200

 39005478 CTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGA 39005537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGA 1260

 39005538 AATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAA 39005597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAA 1320

 39005598 TAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTC 39005657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTC 1380

 39005658 TAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAG 39005717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAG 1440

 39005718 TCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAA 39005777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAA 1500

 39005778 TGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCA 39005837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCA 1560

 39005838 TGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGT 39005897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGT 1620

 39005898 CCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAAT 39005957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAAT 1680

 39005958 AATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAA 39006017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAA 1740

 39006018 AGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGG 39006077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGG 1800

 39006078 AACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAG 39006137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAG 1860

 39006138 CAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAAT 39006197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAAT 1920

 39006198 CCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGA 39006257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGA 1980

 39006258 ACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAAT 39006317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAAT 2040

 39006318 CTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAA 39006377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAA 2100

 39006378 AACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAA 39006437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAA 2160

 39006438 AAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGC 39006497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGC 2220

 39006498 AGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATA 39006557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATA 2280

 39006558 AGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCC 39006617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCC 2340

 39006618 TTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGAC 39006677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGAC 2400

 39006678 TCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGAC 39006737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGAC 2460

 39006738 ACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGA 39006797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGA 2520

 39006798 AAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTAT 39006857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTAT 2580

 39006858 TTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTT 39006917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTT 2640

 39006918 CTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAAC 39006977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAAC 2700

 39006978 CACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTT 39007037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTT 2760

 39007038 CTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAG 39007097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAG 2820

 39007098 CAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGAC 39007157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGAC 2880

 39007158 TCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAG 39007217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAG 2940

 39007218 CCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTG 39007277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTG 3000

 39007278 GCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGA 39007337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGA 3060

 39007338 AGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAA 39007397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAA 3120

 39007398 TGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCA 39007457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCA 3180

 39007458 CTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCA 39007517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCA 3240

 39007518 CTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCT 39007577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCT 3300

 39007578 TTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAA 39007637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAA 3360

 39007638 GGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTC 39007697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTC 3420

 39007698 TTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTG 39007757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTG 3480

 39007758 GCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTAT 39007817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTAT 3540

 39007818 TGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAAT 39007877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAAT 3600

 39007878 AATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTC 39007937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTC 3660

 39007938 TTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTA 39007997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTA 3720

 39007998 ATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAA 39008057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAA 3780

 39008058 ATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGC 39008117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGC 3840

 39008118 TGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAA 39008177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAA 3900

 39008178 AAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAA 39008237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAA 3960

 39008238 GAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGA 39008297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGA 4020

 39008298 CAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAA 39008357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAA 4080

 39008358 TTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTT 39008417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTT 4140

 39008418 GATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAG 39008449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAG 4172

EXCISED REGION

 39014390 AGAAATGGA 39014398
          |||||||||
     4237 AGAAATGGA 4245

Alignment time is 3.19697 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3893] =>      3893 nucs 'mol-32-20fa-132764_3893'

Score:        3809
Aligned:      3894        nucs
Identic:      3874 ( 99%) nucs =>      1901 ( 99%)      1973 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39002616,39004518] EXCISED REGION [39005028,39007002]
 second seq =>  [       1,    1918] EXCISED REGION [    1919,    3893]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39002616 CATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAA 39002675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAA 60

 39002676 ATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCT 39002735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCT 120

 39002736 ATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAA 39002795
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAA 180

 39002796 AAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTC 39002855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTC 240

 39002856 ACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTG 39002915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTG 300

 39002916 GGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTG 39002975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTG 360

 39002976 GTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGT 39003035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGT 420

 39003036 CCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAG 39003095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAG 480

 39003096 ACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAAT 39003155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAAT 540

 39003156 GTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATG 39003215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATG 600

 39003216 TGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACT 39003275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACT 660

 39003276 GGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGAC 39003335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGAC 720

 39003336 ACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAG 39003395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAG 780

 39003396 GAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCC 39003455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCC 840

 39003456 TAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGA 39003515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGA 900

 39003516 GAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTA 39003575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTA 960

 39003576 TTTATTTATTTATTTATTTATTTAT----------------GTTGAGACAGAGTCTCACT 39003619
          |||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||
      961 TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACT 1020

 39003620 CTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTG 39003679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTG 1080

 39003680 GGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCAC 39003739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCAC 1140

 39003740 CACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCT 39003799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCT 1200

 39003800 GGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATT 39003859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATT 1260

 39003860 ACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAG 39003919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAG 1320

 39003920 AAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAA 39003979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAA 1380

 39003980 ATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAAT 39004039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAAT 1440

 39004040 GTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGA 39004099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGA 1500

 39004100 ATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTT 39004159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTT 1560

 39004160 TCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCAC 39004219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCAC 1620

 39004220 TATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCT 39004279
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCT 1679

 39004280 TCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAA 39004339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAA 1739

 39004340 TTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGA 39004399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGA 1799

 39004400 GATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGC 39004459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGC 1859

 39004460 ACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 1918

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 1978

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 2038

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 2098

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 2158

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 2218

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 2278

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 2338

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 2398

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 2458

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 2518

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 2578

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 2638

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 2698

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 2758

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 2818

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 2878

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 2938

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 2998

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 3058

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 3118

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 3178

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 3238

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 3298

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 3358

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 3418

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 3478

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 3538

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 3598

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 3658

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 3718

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 3778

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 3838

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATG 39007002
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATG 3893

Alignment time is 2.90304 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    5785] =>      5785 nucs 'mol-32-21ec-010055_5785'

Score:        5742
Aligned:      5786        nucs
Identic:      5782 (100%) nucs =>       459 (100%)      5323 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004059,39004518] EXCISED REGION [39005028,39010353]
 second seq =>  [       1,     459] EXCISED REGION [     460,    5785]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39004059 AAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTT 39004118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTT 60

 39004119 TTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTA 39004178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTA 120

 39004179 GGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATG 39004238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATG 180

 39004239 GACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATA 39004298
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATA 239

 39004299 TTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACT 39004358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACT 299

 39004359 ATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGA 39004418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 ATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGA 359

 39004419 AGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGG 39004478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGG 419

 39004479 GTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 459

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      460 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 519

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      520 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 579

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 639

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 699

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 759

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 819

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 879

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 939

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 999

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 1059

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 1119

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 1179

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 1239

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 1299

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 1359

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 1419

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 1479

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 1539

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 1599

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 1659

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 1719

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 1779

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 1839

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 1899

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 1959

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 2019

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 2079

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 2139

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 2199

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 2259

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 2319

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 2379

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 2439

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 2499

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 2559

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 2619

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 2679

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 2739

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 2799

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 2859

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 2919

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 2979

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 3039

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 3099

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 3159

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 3219

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 3279

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 3339

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 3399

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 3459

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 3519

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 3579

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 3639

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 3699

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 3759

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 3819

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 3879

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 3939

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 3999

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 4059

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 39008687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 4119

 39008688 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 39008747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 4179

 39008748 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 39008807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 4239

 39008808 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 39008867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 4299

 39008868 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 39008927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 4359

 39008928 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 39008987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 4419

 39008988 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 39009047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 4479

 39009048 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 39009107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 4539

 39009108 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 39009167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 4599

 39009168 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 39009227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 4659

 39009228 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 39009287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 4719

 39009288 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 39009347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 4779

 39009348 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 39009407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 4839

 39009408 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 39009467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 4899

 39009468 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 39009527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 4959

 39009528 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 39009587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 5019

 39009588 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 39009647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 5079

 39009648 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 39009707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 5139

 39009708 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 39009767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 5199

 39009768 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 39009827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 5259

 39009828 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 39009887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 5319

 39009888 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 39009947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 5379

 39009948 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 39010007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 5439

 39010008 AATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 39010067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 AATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 5499

 39010068 CCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 39010127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 CCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 5559

 39010128 TTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 39010187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 TTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 5619

 39010188 CTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGC 39010247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 CTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGC 5679

 39010248 TCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTT 39010307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 TCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTT 5739

 39010308 GCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATT 39010353
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 TCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATT 5785

Alignment time is 4.18016 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    7260] =>      7260 nucs 'mol-32-2874-132613_7260'

Score:        7176
Aligned:      7261        nucs
Identic:      7241 (100%) nucs =>      1523 ( 99%)      5718 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39002995,39004518] EXCISED REGION [39005028,39010748]
 second seq =>  [       1,    1539] EXCISED REGION [    1540,    7260]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39002995 AGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACT 39003054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACT 60

 39003055 GTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGC 39003114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGC 120

 39003115 TTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGA 39003174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGA 180

 39003175 GTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGT 39003234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGT 240

 39003235 CTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAA 39003294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAA 300

 39003295 ATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATG 39003354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATG 360

 39003355 AAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCAT 39003414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCAT 420

 39003415 CCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGT 39003474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGT 480

 39003475 ATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAAT 39003534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAAT 540

 39003535 TGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTT 39003594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTT 600

 39003595 ATTTAT----------------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGT 39003638
          ||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGT 660

 39003639 GGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATG 39003698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATG 720

 39003699 CCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTA 39003758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTA 780

 39003759 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCT 39003818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCT 840

 39003819 CAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTG 39003878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTG 900

 39003879 CCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAAT 39003938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAAT 960

 39003939 AATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTA 39003998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTA 1020

 39003999 AGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCA 39004058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCA 1080

 39004059 AAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTT 39004118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTT 1140

 39004119 TTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTA 39004178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTA 1200

 39004179 GGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATG 39004238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATG 1260

 39004239 GACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATA 39004298
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATA 1319

 39004299 TTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACT 39004358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACT 1379

 39004359 ATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGA 39004418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGA 1439

 39004419 AGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGG 39004478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGG 1499

 39004479 GTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 1539

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 1599

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 1659

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 1719

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 1779

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 1839

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 1899

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 1959

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 2019

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 2079

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 2139

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 2199

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 2259

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 2319

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 2379

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 2439

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 2499

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 2559

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 2619

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 2679

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 2739

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 2799

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 2859

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 2919

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 2979

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 3039

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 3099

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 3159

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 3219

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 3279

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 3339

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 3399

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 3459

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 3519

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 3579

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 3639

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 3699

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 3759

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 3819

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 3879

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 3939

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 3999

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 4059

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 4119

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 4179

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 4239

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 4299

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 4359

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 4419

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 4479

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 4539

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 4599

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 4659

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 4719

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 4779

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 4839

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 4899

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 4959

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 5019

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 5079

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 5139

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 39008687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 5199

 39008688 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 39008747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 5259

 39008748 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 39008807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 5319

 39008808 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 39008867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 5379

 39008868 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 39008927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 5439

 39008928 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 39008987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 5499

 39008988 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 39009047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 5559

 39009048 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 39009107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 5619

 39009108 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 39009167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 5679

 39009168 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 39009227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 5739

 39009228 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 39009287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 5799

 39009288 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 39009347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 5859

 39009348 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 39009407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 5919

 39009408 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 39009467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 5979

 39009468 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 39009527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 6039

 39009528 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 39009587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 6099

 39009588 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 39009647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 6159

 39009648 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 39009707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 6219

 39009708 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 39009767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 6279

 39009768 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 39009827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 6339

 39009828 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 39009887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6340 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 6399

 39009888 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 39009947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 6459

 39009948 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 39010007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 6519

 39010008 AATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 39010067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6520 AATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 6579

 39010068 CCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 39010127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6580 CCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 6639

 39010128 TTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 39010187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6640 TTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 6699

 39010188 CTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGC 39010247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6700 CTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGC 6759

 39010248 TCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTT 39010307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6760 TCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTT 6819

 39010308 GCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCATT 39010367
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6820 TCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCATT 6879

 39010368 CTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGAC 39010427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6880 CTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGAC 6939

 39010428 TACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTTT 39010487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6940 TACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTTT 6999

 39010488 ACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTTA 39010547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7000 ACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTTA 7059

 39010548 ATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAAT 39010607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7060 ATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAAT 7119

 39010608 ACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTAT 39010667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7120 ACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTAT 7179

 39010668 AAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAGA 39010727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7180 AAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAGA 7239

 39010728 GCTTTTAGGGTATCTGTCACC 39010748
          |||||||||||||||||||||
     7240 GCTTTTAGGGTATCTGTCACC 7260

Alignment time is 5.6764 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    6088] =>      6088 nucs 'mol-32-288a-048114_6088'

Score:        6087
Aligned:      6087        nucs
Identic:      6087 (100%) nucs =>      2009 (100%)      4078 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38999895,39001903] EXCISED REGION [39001904,39005981]
 second seq =>  [       1,    2009] EXCISED REGION [    2011,    6088]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2010,2010]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [2010,2022] to [2011,2023]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38999895 CTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGATGATAGACA 38999954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGATGATAGACA 60

 38999955 AATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGTTGAGAT 39000014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGTTGAGAT 120

 39000015 CTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAAGGGAAC 39000074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAAGGGAAC 180

 39000075 AATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGCAAAGGC 39000134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGCAAAGGC 240

 39000135 CAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAGCTTGGC 39000194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAGCTTGGC 300

 39000195 AAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACATTCCAAA 39000254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACATTCCAAA 360

 39000255 CATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCTAATGAG 39000314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCTAATGAG 420

 39000315 ACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCAA 39000374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCAA 480

 39000375 AATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTCT 39000434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTCT 540

 39000435 TGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAGA 39000494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAGA 600

 39000495 CAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTCA 39000554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTCA 660

 39000555 AGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGTA 39000614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGTA 720

 39000615 GGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACAT 39000674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACAT 780

 39000675 CAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCTC 39000734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCTC 840

 39000735 TCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGTT 39000794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGTT 900

 39000795 CTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGAG 39000854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGAG 960

 39000855 ATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGTA 39000914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGTA 1020

 39000915 CTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGCT 39000974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGCT 1080

 39000975 GCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGCA 39001034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGCA 1140

 39001035 GCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGC 39001094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGC 1200

 39001095 CAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGCA 39001154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGCA 1260

 39001155 ATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTA 39001214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTA 1320

 39001215 TGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACA 39001274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACA 1380

 39001275 GAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTG 39001334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTG 1440

 39001335 GTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGT 39001394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGT 1500

 39001395 CAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAG 39001454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAG 1560

 39001455 TCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACAT 39001514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACAT 1620

 39001515 TATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAA 39001574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAA 1680

 39001575 AAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCAT 39001634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCAT 1740

 39001635 GCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATG 39001694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATG 1800

 39001695 GCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAA 39001754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAA 1860

 39001755 TACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCT 39001814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCT 1920

 39001815 GTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCT 39001874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCT 1980

 39001875 CAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACT 39001903
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACT 2009

EXCISED REGION

 39001904 AAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCT 39001963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 AAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCT 2070

 39001964 ATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCA 39002023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 ATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCA 2130

 39002024 TTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATAC 39002083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 TTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATAC 2190

 39002084 TACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATT 39002143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATT 2250

 39002144 TTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATT 39002203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATT 2310

 39002204 GCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTT 39002263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 GCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTT 2370

 39002264 AAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTT 39002323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 AAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTT 2430

 39002324 AACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTG 39002383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 AACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTG 2490

 39002384 TTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTT 39002443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTT 2550

 39002444 TGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATC 39002503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 TGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATC 2610

 39002504 TTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACA 39002563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 TTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACA 2670

 39002564 TTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACAC 39002623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 TTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACAC 2730

 39002624 ACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAA 39002683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 ACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAA 2790

 39002684 TGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACA 39002743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 TGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACA 2850

 39002744 AACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAG 39002803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 AACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAG 2910

 39002804 ATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAA 39002863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 ATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAA 2970

 39002864 AGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACG 39002923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 AGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACG 3030

 39002924 TAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTC 39002983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 TAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTC 3090

 39002984 TTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGG 39003043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGG 3150

 39003044 TACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTG 39003103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTG 3210

 39003104 ACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTAC 39003163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 ACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTAC 3270

 39003164 TGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTT 39003223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 TGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTT 3330

 39003224 GGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACG 39003283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 GGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACG 3390

 39003284 GTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAA 39003343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 GTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAA 3450

 39003344 GAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCA 39003403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 GAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCA 3510

 39003404 AGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCT 39003463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 AGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCT 3570

 39003464 TTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATA 39003523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 TTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATA 3630

 39003524 GAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTA 39003583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 GAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTA 3690

 39003584 TTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGT 39003643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 TTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGT 3750

 39003644 GGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCA 39003703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 GGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCA 3810

 39003704 GCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTT 39003763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 GCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTT 3870

 39003764 TTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGT 39003823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 TTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGT 3930

 39003824 GATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGG 39003883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 GATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGG 3990

 39003884 CCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAA 39003943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 CCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAA 4050

 39003944 TTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTA 39004003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 TTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTA 4110

 39004004 TAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGT 39004063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGT 4170

 39004064 AAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCT 39004123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 AAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCT 4230

 39004124 ATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATC 39004183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 ATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATC 4290

 39004184 ATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACAC 39004243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 ATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACAC 4350

 39004244 TTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCA 39004303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 TTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCA 4410

 39004304 TTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTG 39004363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 TTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTG 4470

 39004364 CTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTA 39004423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 CTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTA 4530

 39004424 TATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGG 39004483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 TATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGG 4590

 39004484 TAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGG 39004543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 TAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGG 4650

 39004544 TCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATG 39004603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 TCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATG 4710

 39004604 AGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAG 39004663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 AGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAG 4770

 39004664 AGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGA 39004723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 AGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGA 4830

 39004724 GTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACT 39004783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 GTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACT 4890

 39004784 TCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATT 39004843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 TCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATT 4950

 39004844 TCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCA 39004903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 TCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCA 5010

 39004904 GCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGG 39004963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 GCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGG 5070

 39004964 TAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGAC 39005023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 TAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGAC 5130

 39005024 ATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTC 39005083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 ATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTC 5190

 39005084 ACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAG 39005143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 ACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAG 5250

 39005144 ATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGA 39005203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 ATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGA 5310

 39005204 TGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGT 39005263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 TGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGT 5370

 39005264 TGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTA 39005323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 TGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTA 5430

 39005324 TTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAG 39005383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 TTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAG 5490

 39005384 AAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTA 39005443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 AAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTA 5550

 39005444 TTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGA 39005503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 TTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGA 5610

 39005504 GGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCA 39005563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 GGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCA 5670

 39005564 TTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGT 39005623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 TTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGT 5730

 39005624 GTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATT 39005683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 GTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATT 5790

 39005684 TGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACC 39005743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 TGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACC 5850

 39005744 CACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTT 39005803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 CACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTT 5910

 39005804 ATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAG 39005863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5911 ATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAG 5970

 39005864 CCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGAT 39005923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5971 CCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGAT 6030

 39005924 CTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTT 39005981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6031 CTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTT 6088

Alignment time is 4.37335 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    8498] =>      8498 nucs 'mol-32-29b3-027390_8498'

Score:        8497
Aligned:      8497        nucs
Identic:      8497 (100%) nucs =>      3157 (100%)      5340 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39003174,39006330] EXCISED REGION [39006332,39011671]
 second seq =>  [       1,    3157] EXCISED REGION [    3159,    8498]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39006331,39006331]
 second seq =>         1 nucs [3158,3158]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39003174 AGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTG 39003233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTG 60

 39003234 TCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTA 39003293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTA 120

 39003294 AATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATAT 39003353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATAT 180

 39003354 GAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCA 39003413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCA 240

 39003414 TCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAG 39003473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAG 300

 39003474 TATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAA 39003533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAA 360

 39003534 TTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATT 39003593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATT 420

 39003594 TATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCT 39003653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCT 480

 39003654 CAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG 39003713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG 540

 39003714 CAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA 39003773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA 600

 39003774 TGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCA 39003833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCA 660

 39003834 CCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCA 39003893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCA 720

 39003894 TAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATG 39003953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATG 780

 39003954 AAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAAT 39004013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAAT 840

 39004014 ACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATA 39004073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATA 900

 39004074 CCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATAT 39004133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATAT 960

 39004134 ATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCA 39004193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCA 1020

 39004194 TGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGT 39004253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGT 1080

 39004254 CAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCAC 39004313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCAC 1140

 39004314 CATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAG 39004373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAG 1200

 39004374 AATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTG 39004433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTG 1260

 39004434 TGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTC 39004493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTC 1320

 39004494 CAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGC 39004553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGC 1380

 39004554 AGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGG 39004613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGG 1440

 39004614 ATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGT 39004673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGT 1500

 39004674 AAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATC 39004733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATC 1560

 39004734 AGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTT 39004793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTT 1620

 39004794 ATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGC 39004853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGC 1680

 39004854 TTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGG 39004913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGG 1740

 39004914 CCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTC 39004973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTC 1800

 39004974 AAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAAT 39005033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAAT 1860

 39005034 GATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATA 39005093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATA 1920

 39005094 TTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATG 39005153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATG 1980

 39005154 GGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGA 39005213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGA 2040

 39005214 GGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATT 39005273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATT 2100

 39005274 TGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAG 39005333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAG 2160

 39005334 AAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGA 39005393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGA 2220

 39005394 GACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAA 39005453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAA 2280

 39005454 TGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCT 39005513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCT 2340

 39005514 GTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATA 39005573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATA 2400

 39005574 ATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGG 39005633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGG 2460

 39005634 ATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTC 39005693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTC 2520

 39005694 TTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTA 39005753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTA 2580

 39005754 TCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTAC 39005813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTAC 2640

 39005814 AAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTA 39005873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTA 2700

 39005874 TAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCT 39005933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCT 2760

 39005934 GGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAA 39005993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAA 2820

 39005994 TCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAG 39006053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAG 2880

 39006054 TCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGA 39006113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGA 2940

 39006114 TGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAG 39006173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAG 3000

 39006174 GGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAG 39006233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAG 3060

 39006234 GCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATC 39006293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATC 3120

 39006294 CATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAAC 39006330
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAAC 3157

EXCISED REGION

 39006332 GTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATT 39006391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 GTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATT 3218

 39006392 AACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATT 39006451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 AACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATT 3278

 39006452 GTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTA 39006511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 GTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTA 3338

 39006512 GAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCA 39006571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 GAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCA 3398

 39006572 ACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATG 39006631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 ACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATG 3458

 39006632 TACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACT 39006691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 TACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACT 3518

 39006692 ATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAAT 39006751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 ATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAAT 3578

 39006752 ATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACT 39006811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 ATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACT 3638

 39006812 TATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTAC 39006871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 TATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTAC 3698

 39006872 ACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTT 39006931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 ACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTT 3758

 39006932 ATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGT 39006991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 ATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGT 3818

 39006992 CCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAG 39007051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 CCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAG 3878

 39007052 AACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAA 39007111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 AACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAA 3938

 39007112 AAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAA 39007171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3939 AAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAA 3998

 39007172 GGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCC 39007231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3999 GGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCC 4058

 39007232 AAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAG 39007291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4059 AAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAG 4118

 39007292 AGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCC 39007351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4119 AGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCC 4178

 39007352 GATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCA 39007411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4179 GATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCA 4238

 39007412 AGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTA 39007471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4239 AGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTA 4298

 39007472 GACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTT 39007531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4299 GACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTT 4358

 39007532 AATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAAT 39007591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4359 AATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAAT 4418

 39007592 CCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCT 39007651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4419 CCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCT 4478

 39007652 CCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGA 39007711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4479 CCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGA 4538

 39007712 TATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATAC 39007771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4539 TATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATAC 4598

 39007772 CTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGA 39007831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4599 CTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGA 4658

 39007832 AAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGA 39007891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4659 AAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGA 4718

 39007892 TAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTT 39007951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4719 TAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTT 4778

 39007952 TGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAAT 39008011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4779 TGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAAT 4838

 39008012 GCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGAT 39008071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4839 GCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGAT 4898

 39008072 AAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCC 39008131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4899 AAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCC 4958

 39008132 TGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGC 39008191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4959 TGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGC 5018

 39008192 CACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAG 39008251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5019 CACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAG 5078

 39008252 TAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAG 39008311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5079 TAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAG 5138

 39008312 AGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAA 39008371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5139 AGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAA 5198

 39008372 AGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAG 39008431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5199 AGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAG 5258

 39008432 CCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGT 39008491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5259 CCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGT 5318

 39008492 GCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTG 39008551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5319 GCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTG 5378

 39008552 ACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGT 39008611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5379 ACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGT 5438

 39008612 CCCTGGGTTCCAATGAGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAA 39008671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5439 CCCTGGGTTCCAATGAGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAA 5498

 39008672 ATCACAGAAAATGAGAAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAAT 39008731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5499 ATCACAGAAAATGAGAAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAAT 5558

 39008732 AGAATAAGTATTATTAATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACC 39008791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5559 AGAATAAGTATTATTAATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACC 5618

 39008792 AGAATTTATCTTATGCATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTG 39008851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5619 AGAATTTATCTTATGCATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTG 5678

 39008852 GAGAGTTCCCTTTAAATTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTAC 39008911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5679 GAGAGTTCCCTTTAAATTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTAC 5738

 39008912 TAAAAAATAAGAATTGTATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGA 39008971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5739 TAAAAAATAAGAATTGTATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGA 5798

 39008972 TGAAAAGAATCATTAATCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGT 39009031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5799 TGAAAAGAATCATTAATCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGT 5858

 39009032 TGGCATTTCAGTAATTTCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAA 39009091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5859 TGGCATTTCAGTAATTTCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAA 5918

 39009092 TTTAGTAACAAAGTTTTTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCA 39009151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5919 TTTAGTAACAAAGTTTTTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCA 5978

 39009152 TGAACCCATGCTACTTTGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATT 39009211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5979 TGAACCCATGCTACTTTGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATT 6038

 39009212 CAGTATTACTGTCTGCCTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAG 39009271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 CAGTATTACTGTCTGCCTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAG 6098

 39009272 GACCTGCAAATATTAGGTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGC 39009331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6099 GACCTGCAAATATTAGGTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGC 6158

 39009332 AAAGCAATTACATTTGTACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGAT 39009391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 AAAGCAATTACATTTGTACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGAT 6218

 39009392 ATTCTCCAAAGCCAAGCTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAG 39009451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 ATTCTCCAAAGCCAAGCTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAG 6278

 39009452 TTTTTTTAATTGTCTGGGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTT 39009511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6279 TTTTTTTAATTGTCTGGGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTT 6338

 39009512 ATTGTCTCAATGTGATTTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTT 39009571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6339 ATTGTCTCAATGTGATTTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTT 6398

 39009572 TGAACCTCATGGACAGGGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTC 39009631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6399 TGAACCTCATGGACAGGGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTC 6458

 39009632 ACTGTTTGTTTTCTTTGTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCA 39009691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6459 ACTGTTTGTTTTCTTTGTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCA 6518

 39009692 GCAAAACATCCCCTTAGCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATG 39009751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6519 GCAAAACATCCCCTTAGCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATG 6578

 39009752 TCTCTTCTCCTTGTTAGTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCC 39009811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6579 TCTCTTCTCCTTGTTAGTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCC 6638

 39009812 TGCCCCTGCTAATTTTTCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGT 39009871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6639 TGCCCCTGCTAATTTTTCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGT 6698

 39009872 CAAACAATTGCAATGTTTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAAC 39009931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6699 CAAACAATTGCAATGTTTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAAC 6758

 39009932 TCATCCAGCCGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 39009991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6759 TCATCCAGCCGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 6818

 39009992 TGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATT 39010051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6819 TGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATT 6878

 39010052 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAAT 39010111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6879 CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAAT 6938

 39010112 TTTTTTGTATTTTTAGTTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTC 39010171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6939 TTTTTTGTATTTTTAGTTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTC 6998

 39010172 CTGGCCTCAAGTGATCCTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGC 39010231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6999 CTGGCCTCAAGTGATCCTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGC 7058

 39010232 CACCATGCCCGGCCGCTCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCT 39010291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7059 CACCATGCCCGGCCGCTCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCT 7118

 39010292 TTAGGAATCTGACTTTGCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGA 39010351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7119 TTAGGAATCTGACTTTGCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGA 7178

 39010352 TTTTCTTCCATGCATTCTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTT 39010411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7179 TTTTCTTCCATGCATTCTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTT 7238

 39010412 TTTAGTTTAGGGTGACTACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTG 39010471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7239 TTTAGTTTAGGGTGACTACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTG 7298

 39010472 TCTAAGTCACTGTTTTACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATA 39010531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7299 TCTAAGTCACTGTTTTACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATA 7358

 39010532 TAAGGAAAACCCTTTAATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAG 39010591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7359 TAAGGAAAACCCTTTAATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAG 7418

 39010592 GGAAATAATTGAAAATACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGT 39010651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7419 GGAAATAATTGAAAATACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGT 7478

 39010652 ATTTTAAAAAATTTATAAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTG 39010711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7479 ATTTTAAAAAATTTATAAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTG 7538

 39010712 TAGTGGCCAAGTCAGAGCTTTTAGGGTATCTGTCACCAAAATAATATATATTACACATGC 39010771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7539 TAGTGGCCAAGTCAGAGCTTTTAGGGTATCTGTCACCAAAATAATATATATTACACATGC 7598

 39010772 ATTTAGATTCAGCAAAATCAATTCATAGGTATAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTAT 39010831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7599 ATTTAGATTCAGCAAAATCAATTCATAGGTATAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTAT 7658

 39010832 ATTTAAAAATCAGGCTGTTTTGATTGACTAAAAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCT 39010891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7659 ATTTAAAAATCAGGCTGTTTTGATTGACTAAAAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCT 7718

 39010892 TCCTATTAAAAAATTTACTTTGCATGTGTATCCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTT 39010951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7719 TCCTATTAAAAAATTTACTTTGCATGTGTATCCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTT 7778

 39010952 TCACAGTGGTCACACCATCTCTAGAGGGTTGAGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGAC 39011011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7779 TCACAGTGGTCACACCATCTCTAGAGGGTTGAGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGAC 7838

 39011012 AGACCGTGGCCATTTGGAATGTGTTCAGAGAAGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCA 39011071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7839 AGACCGTGGCCATTTGGAATGTGTTCAGAGAAGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCA 7898

 39011072 TTATAGATGTGATGGTTAAATAAAGTATATCATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATA 39011131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7899 TTATAGATGTGATGGTTAAATAAAGTATATCATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATA 7958

 39011132 CTACTATAAAGAACTGCCCAAGACTGAGTAATTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCA 39011191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7959 CTACTATAAAGAACTGCCCAAGACTGAGTAATTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCA 8018

 39011192 CAGTTCCACATGGCTGAGGAGGCCTCGGGAAACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGA 39011251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8019 CAGTTCCACATGGCTGAGGAGGCCTCGGGAAACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGA 8078

 39011252 AGCAAGGCACCTTCTTCACAAGGCGGCAGGAAGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAG 39011311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8079 AGCAAGGCACCTTCTTCACAAGGCGGCAGGAAGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAG 8138

 39011312 CCCTTTATAAAACCACCAGATCTCATGGGAACTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGG 39011371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8139 CCCTTTATAAAACCACCAGATCTCATGGGAACTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGG 8198

 39011372 CAAACGAACCCCAGATTCAATTACCTCCACCTGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCT 39011431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8199 CAAACGAACCCCAGATTCAATTACCTCCACCTGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCT 8258

 39011432 GGGATTACAATTCAAGATGAGATTTGTGTGGGAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTG 39011491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8259 GGGATTACAATTCAAGATGAGATTTGTGTGGGAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTG 8318

 39011492 ACAAAGTGTTTTGGGATGGGCAGATAGGAAAGGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTAT 39011551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8319 ACAAAGTGTTTTGGGATGGGCAGATAGGAAAGGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTAT 8378

 39011552 TTGTTGATTGCAAGATAGTCTTATGAAAGAGAGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAA 39011611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8379 TTGTTGATTGCAAGATAGTCTTATGAAAGAGAGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAA 8438

 39011612 CAAGGATCAATGAGCCAAATTTACAGAAAGCAAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGA 39011671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8439 CAAGGATCAATGAGCCAAATTTACAGAAAGCAAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGA 8498

Alignment time is 6.10235 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2235] =>      2235 nucs 'mol-32-29c9-051206_2235'

Score:        2162
Aligned:      2236        nucs
Identic:      2217 ( 99%) nucs =>      2166 ( 99%)        51 (100%)
Gaps:           17 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39002350,39004518] EXCISED REGION [39005028,39005078]
 second seq =>  [       1,    2184] EXCISED REGION [    2185,    2235]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39002350 TTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCT 39002409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCT 60

 39002410 CAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATC 39002469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATC 120

 39002470 CAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATAC 39002529
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGATCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATAC 180

 39002530 GCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAA 39002589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAA 240

 39002590 GAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGA 39002649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGA 300

 39002650 CTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAG 39002709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAG 360

 39002710 CAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCC 39002769
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAACCACCATGGCACGTGTATACCTGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCC 420

 39002770 CAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAA 39002829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAA 480

 39002830 CTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAA 39002889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAA 540

 39002890 CTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGC 39002949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGC 600

 39002950 CTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATC 39003009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATC 660

 39003010 ATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATAC 39003069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATAC 720

 39003070 TCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACC 39003129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACC 780

 39003130 CTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAAT 39003189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAAT 840

 39003190 TCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAAC 39003249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAAC 900

 39003250 TAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATG 39003309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATG 960

 39003310 TCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAG 39003369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAG 1020

 39003370 ACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCT 39003429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCT 1080

 39003430 AGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAA 39003489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAA 1140

 39003490 TCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAA 39003549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAA 1200

 39003550 CCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT--------- 39003600
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
     1201 CCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 1260

 39003601 -------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCT 39003653
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCT 1320

 39003654 CAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG 39003713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG 1380

 39003714 CAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA 39003773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA 1440

 39003774 TGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCA 39003833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCA 1500

 39003834 CCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCA 39003893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCA 1560

 39003894 TAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATG 39003953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATG 1620

 39003954 AAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAAT 39004013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAAT 1680

 39004014 ACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATA 39004073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATA 1740

 39004074 CCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATAT 39004133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATAT 1800

 39004134 ATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCA 39004193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCA 1860

 39004194 TGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGT 39004253
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     1861 TGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTAC-TGT 1919

 39004254 CAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCAC 39004313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCAC 1979

 39004314 CATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAG 39004373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAG 2039

 39004374 AATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTG 39004433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTG 2099

 39004434 TGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTC 39004493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTC 2159

 39004494 CAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          |||||||||||||||||||||||||
     2160 CAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 2184

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCT 39005078
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCT 2235

Alignment time is 1.63842 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4555] =>      4555 nucs 'mol-32-2afd-055930_4555'

Score:        4555
Aligned:      4555        nucs
Identic:      4555 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39003573,39008127]
 second seq =>  [       1,    4555]

 39003573 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGT 39003632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGT 60

 39003633 TGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATT 39003692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATT 120

 39003693 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAA 39003752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAA 180

 39003753 TTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 39003812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 240

 39003813 TGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCC 39003872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCC 300

 39003873 ACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAA 39003932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAA 360

 39003933 GTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGG 39003992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGG 420

 39003993 CTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATA 39004052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATA 480

 39004053 AAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTT 39004112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTT 540

 39004113 TGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACA 39004172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACA 600

 39004173 AAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAA 39004232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAA 660

 39004233 TATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTAT 39004292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTAT 720

 39004293 GTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTA 39004352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTA 780

 39004353 TCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAA 39004412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAA 840

 39004413 AAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTG 39004472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTG 900

 39004473 GGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAA 39004532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAA 960

 39004533 GAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAA 39004592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAA 1020

 39004593 CAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGAC 39004652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGAC 1080

 39004653 TCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACT 39004712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACT 1140

 39004713 ATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACA 39004772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACA 1200

 39004773 AGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCA 39004832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCA 1260

 39004833 TAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAG 39004892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAG 1320

 39004893 GCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAG 39004952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAG 1380

 39004953 AATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTAT 39005012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTAT 1440

 39005013 TACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATT 39005072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATT 1500

 39005073 GGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCT 39005132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCT 1560

 39005133 TAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTA 39005192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTA 1620

 39005193 TTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCT 39005252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCT 1680

 39005253 AGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTC 39005312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTC 1740

 39005313 AGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCC 39005372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCC 1800

 39005373 AATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGA 39005432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGA 1860

 39005433 TAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCT 39005492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCT 1920

 39005493 GATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAA 39005552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAA 1980

 39005553 CCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGA 39005612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGA 2040

 39005613 AGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCT 39005672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCT 2100

 39005673 CAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCT 39005732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCT 2160

 39005733 GTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAG 39005792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAG 2220

 39005793 ACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTC 39005852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTC 2280

 39005853 AGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCC 39005912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCC 2340

 39005913 ACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTAT 39005972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTAT 2400

 39005973 GTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAAT 39006032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAAT 2460

 39006033 CAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTG 39006092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTG 2520

 39006093 CATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGG 39006152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGG 2580

 39006153 CTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGT 39006212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGT 2640

 39006213 GTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTC 39006272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTC 2700

 39006273 AAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTG 39006332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTG 2760

 39006333 TCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTA 39006392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTA 2820

 39006393 ACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTG 39006452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTG 2880

 39006453 TCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAG 39006512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAG 2940

 39006513 AAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAA 39006572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAA 3000

 39006573 CAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGT 39006632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGT 3060

 39006633 ACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTA 39006692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTA 3120

 39006693 TTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATA 39006752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATA 3180

 39006753 TGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTT 39006812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTT 3240

 39006813 ATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACA 39006872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACA 3300

 39006873 CTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTA 39006932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTA 3360

 39006933 TTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTC 39006992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTC 3420

 39006993 CTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGA 39007052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGA 3480

 39007053 ACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAA 39007112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAA 3540

 39007113 AGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAG 39007172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAG 3600

 39007173 GTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCA 39007232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCA 3660

 39007233 AAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGA 39007292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGA 3720

 39007293 GCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCG 39007352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCG 3780

 39007353 ATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAA 39007412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAA 3840

 39007413 GTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAG 39007472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAG 3900

 39007473 ACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTA 39007532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTA 3960

 39007533 ATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATC 39007592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATC 4020

 39007593 CAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTC 39007652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTC 4080

 39007653 CGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGAT 39007712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGAT 4140

 39007713 ATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACC 39007772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACC 4200

 39007773 TTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAA 39007832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAA 4260

 39007833 AGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGAT 39007892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGAT 4320

 39007893 AATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTT 39007952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTT 4380

 39007953 GTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATG 39008012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATG 4440

 39008013 CCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATA 39008072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATA 4500

 39008073 AATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAA 39008127
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAA 4555

Alignment time is 2.93124 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    7571] =>      7571 nucs 'mol-32-2b08-124595_7571'

Score:        7473
Aligned:      7572        nucs
Identic:      7563 (100%) nucs =>       731 (100%)      6832 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39003787,39004518] EXCISED REGION [39005028,39011867]
 second seq =>  [       1,     731] EXCISED REGION [     732,    7571]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39003787 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCA 39003846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCA 60

 39003847 AAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTA 39003906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTA 120

 39003907 CAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCT 39003966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCT 180

 39003967 CGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCT 39004026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCT 240

 39004027 AACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACA 39004086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACA 300

 39004087 GATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTT 39004146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTT 360

 39004147 TCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTT 39004206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTT 420

 39004207 GTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAA 39004266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
      421 GTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAA 479

 39004267 TCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTC 39004326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTC 539

 39004327 ACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTC 39004386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTC 599

 39004387 AAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTC 39004446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTC 659

 39004447 AGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAA 39004506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAA 719

 39004507 CAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||
      720 CAGATTATGCAA 731

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 791

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 851

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 911

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 971

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 1031

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 1091

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 1151

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 1211

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 1271

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 1331

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 1391

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 1451

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 1511

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 1571

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 1631

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1632 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCCTTGAATCC 1691

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 1751

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 1811

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 1871

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 1931

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 1991

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 2051

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 2111

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 2171

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 2231

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 2291

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 2351

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 2411

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 2471

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 2531

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 2591

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 2651

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2652 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTAAGCACTA 2711

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 CGTGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 2771

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 2831

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 2891

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 2951

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 3011

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 3071

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 3131

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 3191

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 3251

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 3311

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 3371

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 3431

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 3491

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 3551

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 3611

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 3671

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 3731

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 3791

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 3851

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 3911

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 3971

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 4031

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 4091

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 4151

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 4211

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 4271

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 4331

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 39008687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 4391

 39008688 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 39008747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 4451

 39008748 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 39008807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 4511

 39008808 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 39008867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 4571

 39008868 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 39008927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 4631

 39008928 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 39008987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 4691

 39008988 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 39009047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 4751

 39009048 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 39009107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 4811

 39009108 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 39009167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 4871

 39009168 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 39009227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 4931

 39009228 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 39009287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4932 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 4991

 39009288 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 39009347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4992 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 5051

 39009348 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 39009407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5052 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 5111

 39009408 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 39009467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5112 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 5171

 39009468 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 39009527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5172 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 5231

 39009528 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 39009587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5232 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 5291

 39009588 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 39009647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5292 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGCTTTCTTT 5351

 39009648 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 39009707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5352 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 5411

 39009708 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 39009767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5412 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 5471

 39009768 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 39009827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5472 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 5531

 39009828 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 39009887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5532 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 5591

 39009888 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 39009947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5592 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 5651

 39009948 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 39010007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5652 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 5711

 39010008 AATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 39010067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5712 AATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 5771

 39010068 CCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 39010127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5772 CCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 5831

 39010128 TTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 39010187
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5832 TCGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 5891

 39010188 CTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGC 39010247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5892 CTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGC 5951

 39010248 TCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTT 39010307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5952 TCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTT 6011

 39010308 GCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCATT 39010367
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6012 TCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCATT 6071

 39010368 CTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGAC 39010427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6072 CTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGAC 6131

 39010428 TACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTTT 39010487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6132 TACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTTT 6191

 39010488 ACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTTA 39010547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6192 ACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTTA 6251

 39010548 ATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAAT 39010607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6252 ATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAAT 6311

 39010608 ACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTAT 39010667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6312 ACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTAT 6371

 39010668 AAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAGA 39010727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6372 AAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAGA 6431

 39010728 GCTTTTAGGGTATCTGTCACCAAAATAATATATATTACACATGCATTTAGATTCAGCAAA 39010787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6432 GCTTTTAGGGTATCTGTCACCAAAATAATATATATTACACATGCATTTAGATTCAGCAAA 6491

 39010788 ATCAATTCATAGGTATAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTATATTTAAAAATCAGGCT 39010847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6492 ATCAATTCATAGGTATAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTATATTTAAAAATCAGGCT 6551

 39010848 GTTTTGATTGACTAAAAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCTTCCTATTAAAAAATTT 39010907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6552 GTTTTGATTGACTAAAAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCTTCCTATTAAAAAATTT 6611

 39010908 ACTTTGCATGTGTATCCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTTTCACAGTGGTCACACC 39010967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6612 ACTTTGCATGTGTATCCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTTTCACAGTGGTCACACC 6671

 39010968 ATCTCTAGAGGGTTGAGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGACAGACCGTGGCCATTTG 39011027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6672 ATCTCTAGAGGGTTGAGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGACAGACCGTGGCCATTTG 6731

 39011028 GAATGTGTTCAGAGAAGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCATTATAGATGTGATGGT 39011087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6732 GAATGTGTTCAGAGAAGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCATTATAGATGTGATGGT 6791

 39011088 TAAATAAAGTATATCATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATACTACTATAAAGAACTG 39011147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6792 TAAATAAAGTATATCATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATACTACTATAAAGAACTG 6851

 39011148 CCCAAGACTGAGTAATTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCACAGTTCCACATGGCTG 39011207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6852 CCCAAGACTGAGTAATTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCACAGTTCCACATGGCTG 6911

 39011208 AGGAGGCCTCGGGAAACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGAAGCAAGGCACCTTCTT 39011267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6912 AGGAGGCCTCGGGAAACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGAAGCAAGGCACCTTCTT 6971

 39011268 CACAAGGCGGCAGGAAGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAGCCCTTTATAAAACCAC 39011327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6972 CACAAGGCGGCAGGAAGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAGCCCTTTATAAAACCAC 7031

 39011328 CAGATCTCATGGGAACTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGGCAAACGAACCCCAGAT 39011387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7032 CAGATCTCATGGGAACTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGGCAAACGAACCCCAGAT 7091

 39011388 TCAATTACCTCCACCTGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCTGGGATTACAATTCAAG 39011447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7092 TCAATTACCTCCACCTGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCTGGGATTACAATTCAAG 7151

 39011448 ATGAGATTTGTGTGGGAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTGACAAAGTGTTTTGGGA 39011507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7152 ATGAGATTTGTGTGGGAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTGACAAAGTGTTTTGGGA 7211

 39011508 TGGGCAGATAGGAAAGGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTATTTGTTGATTGCAAGAT 39011567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7212 TGGGCAGATAGGAAAGGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTATTTGTTGATTGCAAGAT 7271

 39011568 AGTCTTATGAAAGAGAGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAACAAGGATCAATGAGCC 39011627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7272 AGTCTTATGAAAGAGAGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAACAAGGATCAATGAGCC 7331

 39011628 AAATTTACAGAAAGCAAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGAAATTTCTCATCAGTAC 39011687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7332 AAATTTACAGAAAGCAAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGAAATTTCTCATCAGTAC 7391

 39011688 ACTTATCTAAAAATTAAATGGATAATAAAGGGTAAAAGAAATCTTTATACATTAGATACA 39011747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7392 ACTTATCTAAAAATTAAATGGATAATAAAGGGTAAAAGAAATCTTTATACATTAGATACA 7451

 39011748 CACACACTGGAGTATATATGAGTTAAATGAGCTGATGTGTAGGATTTGCTTTAAAATAAT 39011807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7452 CACACACTGGAGTATATATGAGTTAAATGAGCTGATGTGTAGGATTTGCTTTAAAATAAT 7511

 39011808 ACAGCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCG 39011867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7512 ACAGCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCG 7571

Alignment time is 5.53424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    8425] =>      8425 nucs 'mol-32-2b13-101473_8425'

Score:        8275
Aligned:      8428        nucs
Identic:      8401 (100%) nucs =>      4616 ( 99%)      3785 (100%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38999894,39004518] EXCISED REGION [39005028,39008814]
 second seq =>  [       1,    4638] EXCISED REGION [    4639,    8425]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38999894 TCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGATGATAGAC 38999953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGATGATAGAC 60

 38999954 AAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGTTGAGA 39000013
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATAAATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGTTGAGA 120

 39000014 TCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAAGGGAA 39000073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAAGGGAA 180

 39000074 CAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGCAAAGG 39000133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGCAAAGG 240

 39000134 CCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAGCTTGG 39000193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAGCTTGG 300

 39000194 CAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACATTCCAA 39000253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACATTCCAA 360

 39000254 ACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCTAATGA 39000313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCTAATGA 420

 39000314 GACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCA 39000373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCA 480

 39000374 AAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTC 39000433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTC 540

 39000434 TTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAG 39000493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAG 600

 39000494 ACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTC 39000553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTC 660

 39000554 AAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGT 39000613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGT 720

 39000614 AGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACA 39000673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACA 780

 39000674 TCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCT 39000733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCT 840

 39000734 CTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGT 39000793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGT 900

 39000794 TCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGA 39000853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGA 960

 39000854 GATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGT 39000913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGT 1020

 39000914 ACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGC 39000973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGC 1080

 39000974 TGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGC 39001033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGC 1140

 39001034 AGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAG 39001093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAG 1200

 39001094 CCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGC 39001153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1201 CCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACACGGAAATAGC 1260

 39001154 AATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATT 39001213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATT 1320

 39001214 ATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAAC 39001273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAAC 1380

 39001274 AGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGT 39001333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGT 1440

 39001334 GGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAG 39001393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAG 1500

 39001394 TCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCA 39001453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCA 1560

 39001454 GTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACA 39001513
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTGTTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACA 1620

 39001514 TTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTA 39001573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTA 1680

 39001574 AAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCA 39001633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCA 1740

 39001634 TGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACAT 39001693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACAT 1800

 39001694 GGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTA 39001753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTA 1860

 39001754 ATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTC 39001813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1861 ATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACCCTTTC 1920

 39001814 TGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTC 39001873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTC 1980

 39001874 TCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGG 39001933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
     1981 TCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAA--CAGTAATGAAATCATGG 2038

 39001934 CTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTT 39001993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTT 2098

 39001994 CTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTT 39002053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTT 2158

 39002054 AGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTC 39002113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTC 2218

 39002114 ATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGC 39002173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGC 2278

 39002174 CCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAA 39002233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAA 2338

 39002234 CAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAA 39002293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAA 2398

 39002294 ATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGG 39002353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGG 2458

 39002354 AAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAAT 39002413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAAT 2518

 39002414 CTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGT 39002473
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2519 CTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGA 2578

 39002474 TCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTC 39002533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTC 2638

 39002534 TATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAA 39002593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAA 2698

 39002594 TTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTAC 39002653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTAC 2758

 39002654 GGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAA 39002713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAA 2818

 39002714 CCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGA 39002773
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CCACCATGGCACGTGTATACCTGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGA 2878

 39002774 ATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCT 39002833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCT 2938

 39002834 TGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTAC 39002893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTAC 2998

 39002894 AAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGG 39002953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGG 3058

 39002954 AGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCC 39003013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCC 3118

 39003014 CATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCT 39003073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCT 3178

 39003074 GAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTG 39003133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTG 3238

 39003134 TTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCAC 39003193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCAC 3298

 39003194 GTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGT 39003253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGT 3358

 39003254 TATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCC 39003313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCC 3418

 39003314 TTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTG 39003373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTG 3478

 39003374 GATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAA 39003433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAA 3538

 39003434 AAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTT 39003493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTT 3598

 39003494 CTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCAT 39003553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCAT 3658

 39003554 CCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT------------- 39003600
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
     3659 CCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 3718

 39003601 ---GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGC 39003657
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGC 3778

 39003658 TCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGC 39003717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGC 3838

 39003718 TGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGG 39003777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGG 3898

 39003778 GTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTC 39003837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTC 3958

 39003838 GGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGT 39003897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGT 4018

 39003898 AATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAAT 39003957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAAT 4078

 39003958 CTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAG 39004017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 CTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAG 4138

 39004018 ATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTT 39004077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 ATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTT 4198

 39004078 TATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAA 39004137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAA 4258

 39004138 GCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTT 39004197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 GCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTT 4318

 39004198 TTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAAT 39004257
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     4319 TTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTAC-TGTCAAT 4377

 39004258 ATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATC 39004317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATC 4437

 39004318 TCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATA 39004377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATA 4497

 39004378 TTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAA 39004437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAA 4557

 39004438 AAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAG 39004497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAG 4617

 39004498 CACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          |||||||||||||||||||||
     4618 CACAGGGAACAGATTATGCAA 4638

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 4698

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 4758

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 4818

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 4878

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 4938

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 4998

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 5058

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 5118

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 5178

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 5238

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 5298

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 5358

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 5418

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 5478

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 5538

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 5598

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 5658

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 5718

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 5778

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 5838

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 5898

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 5958

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 6018

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 6078

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 6138

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 6198

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 6258

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 6318

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 6378

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 6438

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 6498

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 6558

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 6618

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 6678

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 6738

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 6798

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 6858

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 6918

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 6978

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 7038

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 7098

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 7158

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 7218

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 7278

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 7338

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 7398

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 7458

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 7518

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 7578

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 7638

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7639 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 7698

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7699 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 7758

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7759 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 7818

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7819 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 7878

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7879 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 7938

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7939 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 7998

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7999 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 8058

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8059 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 8118

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8119 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 8178

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8179 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 8238

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 39008687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8239 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 8298

 39008688 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 39008747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8299 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 8358

 39008748 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 39008807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8359 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 8418

 39008808 ATCAAGG 39008814
          |||||||
     8419 ATCAAGG 8425

Alignment time is 6.13384 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3787] =>      3787 nucs 'mol-32-2b13-101473_3787'

Score:        3775
Aligned:      3786        nucs
Identic:      3785 (100%) nucs =>       421 (100%)      3364 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39005028,39005448] EXCISED REGION [39005450,39008814]
 second seq =>  [       1,     421] EXCISED REGION [     423,    3787]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39005449,39005449]
 second seq =>         1 nucs [422,422]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39005449,39005452] to [39005450,39005453]
 second seq =>         1 nucs [421,421] to [422,422]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 60

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 120

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 180

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 240

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 300

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 360

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 420

 39005448 G 39005448
          |
      421 G 421

EXCISED REGION

 39005450 AAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTA 39005509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 AAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTA 482

 39005510 GGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCA 39005569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 GGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCA 542

 39005570 GATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATT 39005629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 GATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATT 602

 39005630 AAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAA 39005689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 AAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAA 662

 39005690 ATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATG 39005749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 ATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATG 722

 39005750 GCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAG 39005809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 GCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAG 782

 39005810 TTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGC 39005869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 TTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGC 842

 39005870 CTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCT 39005929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 CTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCT 902

 39005930 TCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTG 39005989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTG 962

 39005990 CCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTC 39006049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 CCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTC 1022

 39006050 ACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGT 39006109
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 ACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGT 1082

 39006110 CTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGC 39006169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 CTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGC 1142

 39006170 GAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTC 39006229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 GAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTC 1202

 39006230 TCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCC 39006289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCC 1262

 39006290 AATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAA 39006349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 AATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAA 1322

 39006350 GATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTA 39006409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 GATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTA 1382

 39006410 AATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTT 39006469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 AATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTT 1442

 39006470 TTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGT 39006529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 TTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGT 1502

 39006530 TTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGT 39006589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGT 1562

 39006590 GACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGA 39006649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 GACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGA 1622

 39006650 GGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTC 39006709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 GGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTC 1682

 39006710 CTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCT 39006769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 CTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCT 1742

 39006770 ATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAG 39006829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 ATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAG 1802

 39006830 AAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACC 39006889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 AAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACC 1862

 39006890 AGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATG 39006949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 AGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATG 1922

 39006950 CTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACG 39007009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 CTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACG 1982

 39007010 GGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAA 39007069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 GGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAA 2042

 39007070 AAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATAT 39007129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 AAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATAT 2102

 39007130 GAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAG 39007189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 GAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAG 2162

 39007190 GCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGG 39007249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 GCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGG 2222

 39007250 GAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACT 39007309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 GAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACT 2282

 39007310 GGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAA 39007369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 GGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAA 2342

 39007370 GCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGT 39007429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 GCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGT 2402

 39007430 TCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGAT 39007489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 TCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGAT 2462

 39007490 TGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCAC 39007549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 TGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCAC 2522

 39007550 CCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATC 39007609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 CCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATC 2582

 39007610 AATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGA 39007669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 AATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGA 2642

 39007670 CAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACT 39007729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 CAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACT 2702

 39007730 CAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATT 39007789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 CAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATT 2762

 39007790 ATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAAT 39007849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 ATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAAT 2822

 39007850 CGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAG 39007909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 CGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAG 2882

 39007910 CACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCA 39007969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 CACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCA 2942

 39007970 CTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTA 39008029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 CTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTA 3002

 39008030 CTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCT 39008089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 CTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCT 3062

 39008090 ACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCAT 39008149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 ACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCAT 3122

 39008150 AAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCT 39008209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 AAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCT 3182

 39008210 TGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATC 39008269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 TGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATC 3242

 39008270 TTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTG 39008329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 TTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTG 3302

 39008330 CTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAA 39008389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 CTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAA 3362

 39008390 GGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAG 39008449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 GGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAG 3422

 39008450 TTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCATA 39008509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 TTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCATA 3482

 39008510 AGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGCTC 39008569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 AGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGCTC 3542

 39008570 TTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGAGT 39008629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 TTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGAGT 3602

 39008630 CAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGAAA 39008689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 CAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGAAA 3662

 39008690 TAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTAAT 39008749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 TAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTAAT 3722

 39008750 TTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGCAT 39008809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 TTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGCAT 3782

 39008810 CAAGG 39008814
          |||||
     3783 CAAGG 3787

Alignment time is 2.78567 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    5378] =>      5378 nucs 'mol-32-2b55-091038_5378'

Score:        5239
Aligned:      5381        nucs
Identic:      5355 (100%) nucs =>      4623 ( 99%)       732 (100%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38999887,39004518] EXCISED REGION [39005028,39005760]
 second seq =>  [       1,    4645] EXCISED REGION [    4646,    5378]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38999887 ATATATATCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGAT 38999946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATATATCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGAT 60

 38999947 GATAGACAAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAA 39000006
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATAGACAAATAAATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAA 120

 39000007 GTTGAGATCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAA 39000066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTGAGATCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAA 180

 39000067 AAGGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGG 39000126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGG 240

 39000127 GCAAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACA 39000186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACA 300

 39000187 AGCTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGAC 39000246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGAC 360

 39000247 ATTCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAG 39000306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAG 420

 39000307 CTAATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATAT 39000366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATAT 480

 39000367 GTTTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAG 39000426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAG 540

 39000427 ATAACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGT 39000486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGT 600

 39000487 GATGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATA 39000546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATA 660

 39000547 GTGACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCAT 39000606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCAT 720

 39000607 CTAGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTA 39000666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTA 780

 39000667 AGCCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCT 39000726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCT 840

 39000727 GGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTT 39000786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTT 900

 39000787 GCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACA 39000846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACA 960

 39000847 TTATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAA 39000906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAA 1020

 39000907 AATTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAAT 39000966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAAT 1080

 39000967 AAATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTC 39001026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTC 1140

 39001027 CATGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTT 39001086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTT 1200

 39001087 TTCTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGG 39001146
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1201 TTCTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACACGG 1260

 39001147 AAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAA 39001206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAA 1320

 39001207 GTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCA 39001266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCA 1380

 39001267 GGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATT 39001326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATT 1440

 39001327 ACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAG 39001386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAG 1500

 39001387 GGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTC 39001446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTC 1560

 39001447 CAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCT 39001506
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTGTTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCT 1620

 39001507 ACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTC 39001566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTC 1680

 39001567 ATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTC 39001626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTC 1740

 39001627 TTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCA 39001686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCA 1800

 39001687 TCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAG 39001746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAG 1860

 39001747 CAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAA 39001806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAA 1920

 39001807 CGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATT 39001866
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATT 1980

 39001867 CCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAA 39001926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
     1981 CCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAA--CAGTAATGAA 2038

 39001927 ATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTAC 39001986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTAC 2098

 39001987 TTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTT 39002046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTT 2158

 39002047 CAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGA 39002106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGA 2218

 39002107 AAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTT 39002166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTT 2278

 39002167 TTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATA 39002226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATA 2338

 39002227 GCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATT 39002286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATT 2398

 39002287 GTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGA 39002346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGA 2458

 39002347 TTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGA 39002406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGA 2518

 39002407 CCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGAT 39002466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGAT 2578

 39002467 ATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGA 39002526
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATCCAGATCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGA 2638

 39002527 TACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAAT 39002586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAAT 2698

 39002587 AAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGG 39002646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGG 2758

 39002647 GGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTG 39002706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTG 2818

 39002707 CAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTA 39002766
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTA 2878

 39002767 TCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCT 39002826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCT 2938

 39002827 AAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAG 39002886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAG 2998

 39002887 AAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGA 39002946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGA 3058

 39002947 AGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAAT 39003006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAAT 3118

 39003007 ATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGA 39003066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 ATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGA 3178

 39003067 TACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTG 39003126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTG 3238

 39003127 ACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAA 39003186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAA 3298

 39003187 AATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGT 39003246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGT 3358

 39003247 AACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTG 39003306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTG 3418

 39003307 ATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCA 39003366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 ATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCA 3478

 39003367 GAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAG 39003426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAG 3538

 39003427 GCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTG 39003486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTG 3598

 39003487 AAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTT 39003546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTT 3658

 39003547 AAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT------ 39003600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
     3659 AAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 3718

 39003601 ----------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGA 39003650
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 ATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGA 3778

 39003651 TCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCC 39003710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCC 3838

 39003711 AAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAG 39003770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAG 3898

 39003771 AGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCAC 39003830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 AGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCAC 3958

 39003831 CCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGT 39003890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 CCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGT 4018

 39003891 TCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAA 39003950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAA 4078

 39003951 ATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGC 39004010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 ATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGC 4138

 39004011 AATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCC 39004070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCC 4198

 39004071 ATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATA 39004130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 ATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATA 4258

 39004131 TATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGT 39004190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGT 4318

 39004191 GCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACA 39004250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4319 GCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTAC- 4377

 39004251 TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGC 39004310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGC 4437

 39004311 CACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAA 39004370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAA 4497

 39004371 CAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCA 39004430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 CAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCA 4557

 39004431 GTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATA 39004490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 GTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATA 4617

 39004491 TTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 4645

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 4705

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 4765

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 4825

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 4885

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 4945

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 5005

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 5065

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 5125

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 5185

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 5245

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 5305

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 5365

 39005748 TGGCTATCTGTCT 39005760
          |||||||||||||
     5366 TGGCTATCTGTCT 5378

Alignment time is 3.96908 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    9581] =>      9581 nucs 'mol-32-2e15-125672_9581'

Score:        9560
Aligned:      9582        nucs
Identic:      9580 (100%) nucs =>      1507 (100%)      8073 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38996926,38998432] EXCISED REGION [38998434,39006508]
 second seq =>  [       1,    1507] EXCISED REGION [    1509,    9581]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [38998433,38998433]
 second seq =>         1 nucs [1508,1508]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [38999640,38999640]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1506,1508] to [1507,1509]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38998432,38998432] to [38998434,38998434]
 second seq =>         1 nucs [1507,1507] to [1509,1509]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38996926 GTCCAATGCAGCTGTGGGAAGTGGTGGGAAAATGGACCAGGTAGTTGGTGGAAACACAAG 38996985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCCAATGCAGCTGTGGGAAGTGGTGGGAAAATGGACCAGGTAGTTGGTGGAAACACAAG 60

 38996986 CCAAGACTTAGTATGTCTATGTCTGTTTAGCACAGAACTAGAAGATATAAAAGATATTTA 38997045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAGACTTAGTATGTCTATGTCTGTTTAGCACAGAACTAGAAGATATAAAAGATATTTA 120

 38997046 GACTTCCAGTTTGGGGTCCAATATGTAAAATGTTTGTAAATTATCATTTCCATCCTTATG 38997105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTTCCAGTTTGGGGTCCAATATGTAAAATGTTTGTAAATTATCATTTCCATCCTTATG 180

 38997106 ACAAGAAAATGATGGGGGAAAAAAAAACAAAACAGAAATTCAGTGACTTTTCTTGGACCC 38997165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAGAAAATGATGGGGGAAAAAAAAACAAAACAGAAATTCAGTGACTTTTCTTGGACCC 240

 38997166 ACTGGATAACTGAGGTCACAGGAGATCTAGGCAGATCCAGAGAGATGCAAGTGAGAGCTG 38997225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTGGATAACTGAGGTCACAGGAGATCTAGGCAGATCCAGAGAGATGCAAGTGAGAGCTG 300

 38997226 CTCACCTGGACCAGAAGCCACTGGGGCCATAAACTGGTAGGAAAACTTAAATGGTAATTT 38997285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCACCTGGACCAGAAGCCACTGGGGCCATAAACTGGTAGGAAAACTTAAATGGTAATTT 360

 38997286 TGATATATTTCTGGAGGATGAGTGTGGACTAGCTTGAGAGTGAGAATATCCTGGGGACTG 38997345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATATATTTCTGGAGGATGAGTGTGGACTAGCTTGAGAGTGAGAATATCCTGGGGACTG 420

 38997346 CAAGTCTTAAAGAGCCCTTTCATGGGTTCTGCCTCTAGGAATGCTACCAGGTTCTCATGG 38997405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGTCTTAAAGAGCCCTTTCATGGGTTCTGCCTCTAGGAATGCTACCAGGTTCTCATGG 480

 38997406 TCAAGAGCCAAGAAAGATCACCTTCTGGCTATAGCAAGGGGAAGGGAAGAGTAACCATTG 38997465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAAGAGCCAAGAAAGATCACCTTCTGGCTATAGCAAGGGGAAGGGAAGAGTAACCATTG 540

 38997466 CAAAATACGCCTACACGTTCTATATAACAAAGACCTACTCACCAGAGGGAAAGACTTTGC 38997525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAATACGCCTACACGTTCTATATAACAAAGACCTACTCACCAGAGGGAAAGACTTTGC 600

 38997526 CAGAGGCTTATCTCATCTAGAATAAGGGCATTTTCTCCCACTACAGCACCCTCTAGCATT 38997585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGAGGCTTATCTCATCTAGAATAAGGGCATTTTCTCCCACTACAGCACCCTCTAGCATT 660

 38997586 TATCTCACTTAAGGGAGTGGGTAGTGGGTGAGCTAAGAAACCCTCGAGAAGGTCACAGTC 38997645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATCTCACTTAAGGGAGTGGGTAGTGGGTGAGCTAAGAAACCCTCGAGAAGGTCACAGTC 720

 38997646 CAGAGATACCTGCCCACTAAAAGATTGAGATTTAAAGATAAGATAATGGCAAACTTCCTC 38997705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGAGATACCTGCCCACTAAAAGATTGAGATTTAAAGATAAGATAATGGCAAACTTCCTC 780

 38997706 TCCCCCATAATTTACCACCACAATGAAAGGGCTCCAGTAAAGCAACAGGGGATTCAGCTG 38997765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCCCATAATTTACCACCACAATGAAAGGGCTCCAGTAAAGCAACAGGGGATTCAGCTG 840

 38997766 AAAGAGGTGCAAGAATCAGACTCTTTTTAAGGAGTAATTTTTAGGAAAAACAAAAGACAA 38997825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGAGGTGCAAGAATCAGACTCTTTTTAAGGAGTAATTTTTAGGAAAAACAAAAGACAA 900

 38997826 CAGGAGAGACAAAAACAAGGATGCCAGAAAAGTTGAAGCCTCTGGTACCTACAGCTACAA 38997885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGAGAGACAAAAACAAGGATGCCAGAAAAGTTGAAGCCTCTGGTACCTACAGCTACAA 960

 38997886 CAAATATCAACACAGTTCAATTACTAGCCAAATTGGCAGAAAAAACTCATACTAAAGGTT 38997945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAATATCAACACAGTTCAATTACTAGCCAAATTGGCAGAAAAAACTCATACTAAAGGTT 1020

 38997946 CATTTCCCTTAGTTCCCATTACCCAATATATCATGGCCAGATTTCAACAACCACATTACA 38998005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATTTCCCTTAGTTCCCATTACCCAATATATCATGGCCAGATTTCAACAACCACATTACA 1080

 38998006 AGGTGTGCTAAAACACACACACACACACAAAAACATGCTGTGAAGAAACAAAGCAAACAT 38998065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGTGTGCTAAAACACACACACACACACAAAAACATGCTGTGAAGAAACAAAGCAAACAT 1140

 38998066 CAGAATCAGATTCAAATGTGAAACAGATGTTGGTACTATCAGGCCTGAAATTTTAAATAA 38998125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGAATCAGATTCAAATGTGAAACAGATGTTGGTACTATCAGGCCTGAAATTTTAAATAA 1200

 38998126 TTATGATTATGATTAATATGCTTAGATCTCTAACAGGTAAAAGTAGACAACATGCAAGAA 38998185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATGATTATGATTAATATGCTTAGATCTCTAACAGGTAAAAGTAGACAACATGCAAGAA 1260

 38998186 CAGAAGTGATATATAAGCAGAGAGATGAAAACATTAAGACAAATAAAAAGGAAACACTAG 38998245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGAAGTGATATATAAGCAGAGAGATGAAAACATTAAGACAAATAAAAAGGAAACACTAG 1320

 38998246 AAATTGAAAACACTGTAACAAAAGTTAAAGAATGCCTTCAATGGGCTCATCAGCAGATTG 38998305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATTGAAAACACTGTAACAAAAGTTAAAGAATGCCTTCAATGGGCTCATCAGCAGATTG 1380

 38998306 GACATGGCTAAACAATCAGTGAGACTAAAGACACATCAATAGAAACTCCAAAACTGAGAA 38998365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACATGGCTAAACAATCAGTGAGACTAAAGACACATCAATAGAAACTCCAAAACTGAGAA 1440

 38998366 GCAAAGAGAAAGGAGAATTTAAAAAGAAAATAGAATACAACACTCAAGAACTGTCAGATA 38998425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCAAAGAGAAAGGAGAATTTAAAAAGAAAATAGAATACAACACTCAAGAACTGTCAGATA 1500

 38998426 GTTTTAA 38998432
          |||||||
     1501 GTTTTAA 1507

EXCISED REGION

 38998434 AGGTATAACTTACACATAATTGAAACACCAGAAGGAAAAGAAGGAGAAAACAGAGCAGGA 38998493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 AGGTATAACTTACACATAATTGAAACACCAGAAGGAAAAGAAGGAGAAAACAGAGCAGGA 1568

 38998494 GAAATATTTGGAGTAATAATGGCTGAGAATTGTCCAAAATTAATGACACCAAACCACAGA 38998553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 GAAATATTTGGAGTAATAATGGCTGAGAATTGTCCAAAATTAATGACACCAAACCACAGA 1628

 38998554 TCCAGGAAGCTAACACCAAGCAGGGAACACCAAACAGAATACCAAGAAATATATTATTTG 38998613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 TCCAGGAAGCTAACACCAAGCAGGGAACACCAAACAGAATACCAAGAAATATATTATTTG 1688

 38998614 GTATATTATATATAAACTGTTAAAAACCAAGGACACAGGGAAAATCATGAAAGAAGCCAT 38998673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 GTATATTATATATAAACTGTTAAAAACCAAGGACACAGGGAAAATCATGAAAGAAGCCAT 1748

 38998674 AGGGGTAAAAGAAAAGTACCTTACCTATGGAGGAAGAAGGGTGAGAATGACAGTGGACTT 38998733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 AGGGGTAAAAGAAAAGTACCTTACCTATGGAGGAAGAAGGGTGAGAATGACAGTGGACTT 1808

 38998734 CTCAGTGGACACCATGCAAGCAAAGAGAGTGACATGAAATACTGAGGGTTGAAAGGAAAA 38998793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 CTCAGTGGACACCATGCAAGCAAAGAGAGTGACATGAAATACTGAGGGTTGAAAGGAAAA 1868

 38998794 AAATCCACTAATCTAGAAATTTATGTCCAGCAAAAATATCCTCCATAAGTAAGGGTGAAA 38998853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 AAATCCACTAATCTAGAAATTTATGTCCAGCAAAAATATCCTCCATAAGTAAGGGTGAAA 1928

 38998854 TAACAACCAAGAATAATGAGCATAAGGTATTGTTCCTGCTATTGTAGTGGCTTTTAGCTC 38998913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 TAACAACCAAGAATAATGAGCATAAGGTATTGTTCCTGCTATTGTAGTGGCTTTTAGCTC 1988

 38998914 CACTCACCCTCAAAAGACAAAACCAAGGGACTATAAGCTGGTTCCAGTAAGCTGATCATC 38998973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 CACTCACCCTCAAAAGACAAAACCAAGGGACTATAAGCTGGTTCCAGTAAGCTGATCATC 2048

 38998974 CTTACTGGAAACATGAGGAAGAGGGAGTGACAGAGATCTGGGCTGCATTAGGAAAGACAG 38999033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CTTACTGGAAACATGAGGAAGAGGGAGTGACAGAGATCTGGGCTGCATTAGGAAAGACAG 2108

 38999034 TCCCTAAAATTGAAATGTCAAAATAATAGGATTGTTGGTGGGGTGGGGGGTTAATGCAAG 38999093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 TCCCTAAAATTGAAATGTCAAAATAATAGGATTGTTGGTGGGGTGGGGGGTTAATGCAAG 2168

 38999094 GATAGACATAAAGTGTGCTGAATAGTGAGTTTTCAATATGCAACGGGTTGCTTTTATTAC 38999153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 GATAGACATAAAGTGTGCTGAATAGTGAGTTTTCAATATGCAACGGGTTGCTTTTATTAC 2228

 38999154 TAAACCTCATATCTTTTGTGGCCTCATGGTGTTTCTCCCTAAAATAGCCAACCACATGCT 38999213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 TAAACCTCATATCTTTTGTGGCCTCATGGTGTTTCTCCCTAAAATAGCCAACCACATGCT 2288

 38999214 AAGCACCAATTGTACCTAACCCCTCTCGCCTCAAGGAATTTAAAATCTATAGACATTCAG 38999273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 AAGCACCAATTGTACCTAACCCCTCTCGCCTCAAGGAATTTAAAATCTATAGACATTCAG 2348

 38999274 AGAAATACATTAATAATAGTAAAATATCATATAGCAGTAGAAACAAACGCTAAATTATGA 38999333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 AGAAATACATTAATAATAGTAAAATATCATATAGCAGTAGAAACAAACGCTAAATTATGA 2408

 38999334 GCTACAGGCAATAATCTTTCAGTCAAGTCTAATCAAGAAATATTTATTGAGCTTGTTATG 38999393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 GCTACAGGCAATAATCTTTCAGTCAAGTCTAATCAAGAAATATTTATTGAGCTTGTTATG 2468

 38999394 TACTTAATGTGTTTCCCAAAAATTCATATGTTGACATGCTAACCCCCAATGTGATTATAT 38999453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 TACTTAATGTGTTTCCCAAAAATTCATATGTTGACATGCTAACCCCCAATGTGATTATAT 2528

 38999454 TTGGAGGTGAGACCTTTGGGAGATGATTAGAGTGATATAAAAATCATAAGGGTAGGTTCT 38999513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TTGGAGGTGAGACCTTTGGGAGATGATTAGAGTGATATAAAAATCATAAGGGTAGGTTCT 2588

 38999514 AATATGAGATTAATGTCCTCATAATAAGAGGAAGAAAAAGATCCCTATCTCTTCCCCCTG 38999573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 AATATGAGATTAATGTCCTCATAATAAGAGGAAGAAAAAGATCCCTATCTCTTCCCCCTG 2648

 38999574 AGCACTTGTACTGAGGAAAAAAGCCTTTTGTGAACAGGTGATAAAGCAGCTTTCTTCAGG 38999633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 AGCACTTGTACTGAGGAAAAAAGCCTTTTGTGAACAGGTGATAAAGCAGCTTTCTTCAGG 2708

 38999634 CTAAGGAAAGAGGCCTCCCCAGGAACCAAATGGTTCGACAGCTTCATCTTGGACTTCCCA 38999693
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 CTAAGG-AAGAGGCCTCCCCAGGAACCAAATGGTTCGACAGCTTCATCTTGGACTTCCCA 2767

 38999694 GCCTTAAGAACTGTGAGAAAATAAATTTCTGTTAAGCCACCCAGTCTGTGCTATTTTGTT 38999753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 GCCTTAAGAACTGTGAGAAAATAAATTTCTGTTAAGCCACCCAGTCTGTGCTATTTTGTT 2827

 38999754 ATGGCAGCTGAAGCAGACTAAGACAGAGCTTTCACTCTGTGTCAGACACTCTTGTAATCT 38999813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 ATGGCAGCTGAAGCAGACTAAGACAGAGCTTTCACTCTGTGTCAGACACTCTTGTAATCT 2887

 38999814 CCAGAAATTTGCATTTAAGGAGTGGAAACAAAAATAAGATAAAGATAGAAGAAAGTTATA 38999873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CCAGAAATTTGCATTTAAGGAGTGGAAACAAAAATAAGATAAAGATAGAAGAAAGTTATA 2947

 38999874 TATATATATATATATATATATCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTG 38999933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TATATATATATATATATATATCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTG 3007

 38999934 ATTGATGATAGATGATAGACAAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGAT 38999993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 ATTGATGATAGATGATAGACAAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGAT 3067

 38999994 AGAAAATATATAAGTTGAGATCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAG 39000053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 AGAAAATATATAAGTTGAGATCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAG 3127

 39000054 ATAACATTCCAAAAAGGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAG 39000113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 ATAACATTCCAAAAAGGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAG 3187

 39000114 CCTGAATTTTAGGGCAAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGT 39000173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CCTGAATTTTAGGGCAAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGT 3247

 39000174 ATTTAAAGCCACAAGCTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGAC 39000233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 ATTTAAAGCCACAAGCTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGAC 3307

 39000234 TGAACCTTTGGACATTCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTA 39000293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TGAACCTTTGGACATTCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTA 3367

 39000294 TGAGAAGGAATAGCTAATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGA 39000353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 TGAGAAGGAATAGCTAATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGA 3427

 39000354 CTAAAGAAAATATGTTTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGA 39000413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 CTAAAGAAAATATGTTTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGA 3487

 39000414 TAAGACCATAGAGATAACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTA 39000473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 TAAGACCATAGAGATAACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTA 3547

 39000474 GTCTTTGTGGTGTGATGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTG 39000533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 GTCTTTGTGGTGTGATGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTG 3607

 39000534 AGGAGCAGAGATAGTGACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGT 39000593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 AGGAGCAGAGATAGTGACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGT 3667

 39000594 CTCTGAGGGGCATCTAGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAA 39000653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 CTCTGAGGGGCATCTAGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAA 3727

 39000654 ATGGTAGTGCCTAAGCCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCA 39000713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 ATGGTAGTGCCTAAGCCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCA 3787

 39000714 GTTGAACACATCTGGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTT 39000773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 GTTGAACACATCTGGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTT 3847

 39000774 TCTCTGAGGATTTGCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGT 39000833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TCTCTGAGGATTTGCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGT 3907

 39000834 TTCTTTATCTACATTATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGAC 39000893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 TTCTTTATCTACATTATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGAC 3967

 39000894 AACTGTAATGTAAAATTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAAT 39000953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 AACTGTAATGTAAAATTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAAT 4027

 39000954 TACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGG 39001013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 TACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGG 4087

 39001014 AAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCA 39001073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 AAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCA 4147

 39001074 GTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCT 39001133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 GTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCT 4207

 39001134 TGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCA 39001193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 TGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCA 4267

 39001194 AACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGG 39001253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 AACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGG 4327

 39001254 TCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAA 39001313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 TCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAA 4387

 39001314 TAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAG 39001373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 TAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAG 4447

 39001374 GCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCA 39001433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCA 4507

 39001434 GAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGA 39001493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 GAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGA 4567

 39001494 TTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATAT 39001553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 TTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATAT 4627

 39001554 AAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTT 39001613
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 AAATGTTAATCTCATCTTT-AAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTT 4686

 39001614 GACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACA 39001673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 GACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACA 4746

 39001674 AGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAA 39001733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 AGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAA 4806

 39001734 ACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCC 39001793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 ACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCC 4866

 39001794 AGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATT 39001853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 AGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATT 4926

 39001854 CTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAA 39001913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 CTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAA 4986

 39001914 AAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAG 39001973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 AAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAG 5046

 39001974 ATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTA 39002033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 ATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTA 5106

 39002034 TCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTG 39002093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTG 5166

 39002094 ACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCT 39002153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 ACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCT 5226

 39002154 CACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTA 39002213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTA 5286

 39002214 CTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGC 39002273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 CTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGC 5346

 39002274 TAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATA 39002333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATA 5406

 39002334 TTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACAT 39002393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACAT 5466

 39002394 TGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAG 39002453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAG 5526

 39002454 GATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACA 39002513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 GATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACA 5586

 39002514 AAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGT 39002573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 AAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGT 5646

 39002574 GAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCT 39002633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 GAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCT 5706

 39002634 GCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAA 39002693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 GCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAA 5766

 39002694 GGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACA 39002753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 GGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACA 5826

 39002754 TTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAA 39002813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAA 5886

 39002814 AAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTA 39002873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 AAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTA 5946

 39002874 GAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGT 39002933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 GAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGT 6006

 39002934 GCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTG 39002993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 GCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTG 6066

 39002994 TAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAAC 39003053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAAC 6126

 39003054 TGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAG 39003113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 TGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAG 6186

 39003114 CTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAG 39003173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 CTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAG 6246

 39003174 AGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTG 39003233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 AGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTG 6306

 39003234 TCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTA 39003293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 TCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTA 6366

 39003294 AATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATAT 39003353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 AATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATAT 6426

 39003354 GAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCA 39003413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 GAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCA 6486

 39003414 TCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAG 39003473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 TCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAG 6546

 39003474 TATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAA 39003533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 TATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAA 6606

 39003534 TTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATT 39003593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 TTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATT 6666

 39003594 TATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCT 39003653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 TATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCT 6726

 39003654 CAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG 39003713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 CAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG 6786

 39003714 CAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA 39003773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 CAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA 6846

 39003774 TGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCA 39003833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 TGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCA 6906

 39003834 CCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCA 39003893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 CCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCA 6966

 39003894 TAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATG 39003953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 TAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATG 7026

 39003954 AAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAAT 39004013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 AAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAAT 7086

 39004014 ACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATA 39004073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 ACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATA 7146

 39004074 CCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATAT 39004133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 CCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATAT 7206

 39004134 ATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCA 39004193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 ATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCA 7266

 39004194 TGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGT 39004253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 TGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGT 7326

 39004254 CAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCAC 39004313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 CAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCAC 7386

 39004314 CATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAG 39004373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 CATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAG 7446

 39004374 AATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTG 39004433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 AATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTG 7506

 39004434 TGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTC 39004493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 TGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTC 7566

 39004494 CAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGC 39004553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 CAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGC 7626

 39004554 AGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGG 39004613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 AGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGG 7686

 39004614 ATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGT 39004673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 ATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGT 7746

 39004674 AAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATC 39004733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 AAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATC 7806

 39004734 AGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTT 39004793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 AGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTT 7866

 39004794 ATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGC 39004853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 ATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGC 7926

 39004854 TTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGG 39004913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 TTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGG 7986

 39004914 CCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTC 39004973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7987 CCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTC 8046

 39004974 AAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAAT 39005033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8047 AAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAAT 8106

 39005034 GATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATA 39005093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8107 GATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATA 8166

 39005094 TTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATG 39005153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8167 TTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATG 8226

 39005154 GGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGA 39005213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8227 GGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGA 8286

 39005214 GGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATT 39005273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8287 GGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATT 8346

 39005274 TGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAG 39005333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8347 TGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAG 8406

 39005334 AAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGA 39005393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8407 AAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGA 8466

 39005394 GACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAA 39005453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8467 GACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAA 8526

 39005454 TGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCT 39005513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8527 TGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCT 8586

 39005514 GTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATA 39005573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8587 GTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATA 8646

 39005574 ATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGG 39005633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8647 ATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGG 8706

 39005634 ATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTC 39005693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8707 ATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTC 8766

 39005694 TTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTA 39005753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8767 TTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTA 8826

 39005754 TCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTAC 39005813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8827 TCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTAC 8886

 39005814 AAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTA 39005873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8887 AAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTA 8946

 39005874 TAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCT 39005933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8947 TAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCT 9006

 39005934 GGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAA 39005993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9007 GGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAA 9066

 39005994 TCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAG 39006053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9067 TCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAG 9126

 39006054 TCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGA 39006113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9127 TCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGA 9186

 39006114 TGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAG 39006173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9187 TGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAG 9246

 39006174 GGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAG 39006233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9247 GGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAG 9306

 39006234 GCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATC 39006293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9307 GCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATC 9366

 39006294 CATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATC 39006353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9367 CATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATC 9426

 39006354 ATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATC 39006413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9427 ATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATC 9486

 39006414 TTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCT 39006473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9487 TTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCT 9546

 39006474 TCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCC 39006508
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9547 TCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCC 9581

Alignment time is 6.95407 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    7431] =>      7431 nucs 'mol-32-2e20-015818_7431'

Score:        7282
Aligned:      7433        nucs
Identic:      7407 (100%) nucs =>      4458 ( 99%)      2949 (100%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39000054,39004518] EXCISED REGION [39005028,39007979]
 second seq =>  [       1,    4479] EXCISED REGION [    4480,    7431]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39000054 ATAACATTCCAAAAAGGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAG 39000113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAACATTCCAAAAAGGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAG 60

 39000114 CCTGAATTTTAGGGCAAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGT 39000173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGAATTTTAGGGCAAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGT 120

 39000174 ATTTAAAGCCACAAGCTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGAC 39000233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTAAAGCCACAAGCTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGAC 180

 39000234 TGAACCTTTGGACATTCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTA 39000293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAACCTTTGGACATTCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTA 240

 39000294 TGAGAAGGAATAGCTAATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGA 39000353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGAAGGAATAGCTAATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGA 300

 39000354 CTAAAGAAAATATGTTTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGA 39000413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAAAGAAAATATGTTTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGA 360

 39000414 TAAGACCATAGAGATAACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTA 39000473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGACCATAGAGATAACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTA 420

 39000474 GTCTTTGTGGTGTGATGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTG 39000533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTTTGTGGTGTGATGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTG 480

 39000534 AGGAGCAGAGATAGTGACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGT 39000593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGAGCAGAGATAGTGACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGT 540

 39000594 CTCTGAGGGGCATCTAGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAA 39000653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTGAGGGGCATCTAGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAA 600

 39000654 ATGGTAGTGCCTAAGCCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCA 39000713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGTAGTGCCTAAGCCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCA 660

 39000714 GTTGAACACATCTGGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTT 39000773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTGAACACATCTGGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTT 720

 39000774 TCTCTGAGGATTTGCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGT 39000833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTCTGAGGATTTGCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGT 780

 39000834 TTCTTTATCTACATTATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGAC 39000893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTTTATCTACATTATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGAC 840

 39000894 AACTGTAATGTAAAATTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAAT 39000953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTGTAATGTAAAATTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAAT 900

 39000954 TACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGG 39001013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGG 960

 39001014 AAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCA 39001073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCA 1020

 39001074 GTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCT 39001133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCT 1080

 39001134 TGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCA 39001193
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGACCAAACACGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCA 1140

 39001194 AACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGG 39001253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGG 1200

 39001254 TCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAA 39001313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAA 1260

 39001314 TAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAG 39001373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAG 1320

 39001374 GCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCA 39001433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCA 1380

 39001434 GAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGA 39001493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1381 GAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTGTTAAGGTCTTCAAATGA 1440

 39001494 TTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATAT 39001553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATAT 1500

 39001554 AAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTT 39001613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTT 1560

 39001614 GACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACA 39001673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACA 1620

 39001674 AGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAA 39001733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAA 1680

 39001734 ACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCC 39001793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCC 1740

 39001794 AGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATT 39001853
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAAAGGCACTAACCCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATT 1800

 39001854 CTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAA 39001913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAA 1860

 39001914 AAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAG 39001973
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AA-CAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAG 1919

 39001974 ATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTA 39002033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTA 1979

 39002034 TCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTG 39002093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTG 2039

 39002094 ACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCT 39002153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCT 2099

 39002154 CACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTA 39002213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTA 2159

 39002214 CTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGC 39002273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGC 2219

 39002274 TAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATA 39002333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATA 2279

 39002334 TTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACAT 39002393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACAT 2339

 39002394 TGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAG 39002453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAG 2399

 39002454 GATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACA 39002513
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACA 2459

 39002514 AAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGT 39002573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGT 2519

 39002574 GAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCT 39002633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCT 2579

 39002634 GCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAA 39002693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAA 2639

 39002694 GGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACA 39002753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2640 GGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTGTGTAACAAACCTGCACA 2699

 39002754 TTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAA 39002813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAA 2759

 39002814 AAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTA 39002873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTA 2819

 39002874 GAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGT 39002933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGT 2879

 39002934 GCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTG 39002993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTG 2939

 39002994 TAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAAC 39003053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAAC 2999

 39003054 TGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAG 39003113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAG 3059

 39003114 CTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAG 39003173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAG 3119

 39003174 AGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTG 39003233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTG 3179

 39003234 TCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTA 39003293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTA 3239

 39003294 AATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATAT 39003353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATAT 3299

 39003354 GAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCA 39003413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCA 3359

 39003414 TCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAG 39003473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAG 3419

 39003474 TATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAA 39003533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAA 3479

 39003534 TTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATT 39003593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATT 3539

 39003594 TATTTAT----------------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAG 39003637
          |||||||                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAG 3599

 39003638 TGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCAT 39003697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCAT 3659

 39003698 GCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTT 39003757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTT 3719

 39003758 ATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACC 39003817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACC 3779

 39003818 TCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGT 39003877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGT 3839

 39003878 GCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAA 39003937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 GCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAA 3899

 39003938 TAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTT 39003997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTT 3959

 39003998 AAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCC 39004057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 AAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCC 4019

 39004058 AAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACT 39004117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACT 4079

 39004118 TTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACT 39004177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACT 4139

 39004178 AGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATAT 39004237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATAT 4199

 39004238 GGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAAT 39004297
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAAT 4258

 39004298 ATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTAC 39004357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 ATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTAC 4318

 39004358 TATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGG 39004417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGG 4378

 39004418 AAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAG 39004477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 AAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAG 4438

 39004478 GGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 GGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 4479

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 4539

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 4599

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 4659

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 GTGGGAGGCTACATGCAAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 4719

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 4779

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 4839

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 4899

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 4959

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 5019

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 5079

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 5139

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 5199

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 5259

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 5319

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 5379

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 5439

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 5499

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 5559

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 5619

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 5679

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 5739

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 5799

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 5859

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 5919

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 5979

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 6039

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 6099

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 6159

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 6219

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 6279

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 6339

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6340 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 6399

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 6459

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 6519

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6520 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 6579

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6580 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 6639

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6640 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 6699

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6700 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 6759

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6760 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 6819

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6820 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 6879

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6880 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 6939

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6940 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 6999

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7000 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 7059

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7060 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 7119

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7120 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 7179

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7180 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 7239

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7240 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 7299

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7300 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 7359

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7360 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 7419

 39007968 CACTAAGCACTT 39007979
          ||||||||||||
     7420 CACTAAGCACTT 7431

Alignment time is 5.42357 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2952] =>      2952 nucs 'mol-32-2e20-015818_2952'

Score:        2929
Aligned:      2951        nucs
Identic:      2949 (100%) nucs =>       196 (100%)      2753 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39005028,39005223] EXCISED REGION [39005225,39007979]
 second seq =>  [       1,     196] EXCISED REGION [     198,    2952]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39005224,39005224]
 second seq =>         1 nucs [197,197]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39005223,39005223] to [39005224,39005224]
 second seq =>         2 nucs [197,198] to [198,199]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 60

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 120

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 180

 39005208 GTGGGAGGCTACATGC 39005223
          ||||||||||||||||
      181 GTGGGAGGCTACATGC 196

EXCISED REGION

 39005225 AACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCT 39005284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      198 AACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCT 257

 39005285 GAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTA 39005344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      258 GAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTA 317

 39005345 AGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCC 39005404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      318 AGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCC 377

 39005405 CCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGT 39005464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      378 CCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGGAAAATGTCCAATTGT 437

 39005465 TCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGC 39005524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 TCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGC 497

 39005525 AGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGAC 39005584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 AGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGAC 557

 39005585 TTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCA 39005644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 TTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCA 617

 39005645 TTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGG 39005704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 TTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGG 677

 39005705 GTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAA 39005764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 GTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAA 737

 39005765 GTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTA 39005824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 GTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTA 797

 39005825 TCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATT 39005884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 TCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATT 857

 39005885 TCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGC 39005944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 TCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGC 917

 39005945 TGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATT 39006004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 TGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATT 977

 39006005 TGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACA 39006064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 TGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACA 1037

 39006065 GCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTAC 39006124
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 GCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTAC 1097

 39006125 TCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACA 39006184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 TCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACA 1157

 39006185 CCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTT 39006244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 CCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTT 1217

 39006245 TTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCA 39006304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 TTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCA 1277

 39006305 GATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACA 39006364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 GATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACA 1337

 39006365 ACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAA 39006424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 ACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAA 1397

 39006425 GGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTG 39006484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 GGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTG 1457

 39006485 CAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTG 39006544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 CAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTG 1517

 39006545 AGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAG 39006604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 AGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAG 1577

 39006605 TCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCC 39006664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 TCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCC 1637

 39006665 CTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAA 39006724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 CTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAA 1697

 39006725 TCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAG 39006784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 TCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAG 1757

 39006785 TAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTT 39006844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 TAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTT 1817

 39006845 ATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAA 39006904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 ATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAA 1877

 39006905 CATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAAT 39006964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 CATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAAT 1937

 39006965 GCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTA 39007024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 GCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTA 1997

 39007025 ATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTT 39007084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 ATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTT 2057

 39007085 TTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATT 39007144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 TTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATT 2117

 39007145 AAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTG 39007204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 AAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTG 2177

 39007205 AGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAG 39007264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 AGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAG 2237

 39007265 CCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGA 39007324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 CCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGA 2297

 39007325 GTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGA 39007384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 GTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGA 2357

 39007385 GGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTT 39007444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 GGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTT 2417

 39007445 TATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGC 39007504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 TATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGC 2477

 39007505 CTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACC 39007564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 CTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACC 2537

 39007565 CAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCAC 39007624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 CAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCAC 2597

 39007625 AGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCT 39007684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 AGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCT 2657

 39007685 CTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCA 39007744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 CTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCA 2717

 39007745 AAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAG 39007804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 AAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAG 2777

 39007805 ATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAA 39007864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 ATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAA 2837

 39007865 ATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATA 39007924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 ATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATA 2897

 39007925 AGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTT 39007979
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 AGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTT 2952

Alignment time is 2.17089 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    5694] =>      5694 nucs 'mol-32-2e20-043590_5694'

Score:        5682
Aligned:      5693        nucs
Identic:      5692 (100%) nucs =>      2744 (100%)      2948 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38999889,39002632] EXCISED REGION [39002634,39005582]
 second seq =>  [       1,    2744] EXCISED REGION [    2746,    5694]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39002633,39002633]
 second seq =>         1 nucs [2745,2745]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2743,2744] to [2744,2745]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38999889 ATATATCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGATGA 38999948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATATCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGATGA 60

 38999949 TAGACAAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGT 39000008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGACAAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGT 120

 39000009 TGAGATCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAA 39000068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGATCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAA 180

 39000069 GGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGC 39000128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGC 240

 39000129 AAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAG 39000188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAG 300

 39000189 CTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACAT 39000248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACAT 360

 39000249 TCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCT 39000308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCT 420

 39000309 AATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGT 39000368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGT 480

 39000369 TTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGAT 39000428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGAT 540

 39000429 AACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGA 39000488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGA 600

 39000489 TGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGT 39000548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGT 660

 39000549 GACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCT 39000608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCT 720

 39000609 AGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAG 39000668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAG 780

 39000669 CCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGG 39000728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGG 840

 39000729 CCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGC 39000788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGC 900

 39000789 GTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATT 39000848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATT 960

 39000849 ATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAA 39000908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAA 1020

 39000909 TTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAA 39000968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAA 1080

 39000969 ATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCA 39001028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCA 1140

 39001029 TGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTT 39001088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTT 1200

 39001089 CTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAA 39001148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAA 1260

 39001149 ATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGT 39001208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGT 1320

 39001209 CTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGG 39001268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGG 1380

 39001269 GAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTAC 39001328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTAC 1440

 39001329 ACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGG 39001388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGG 1500

 39001389 ATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCA 39001448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCA 1560

 39001449 GAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTAC 39001508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTAC 1620

 39001509 TTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCAT 39001568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCAT 1680

 39001569 CTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTT 39001628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTT 1740

 39001629 TTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATC 39001688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATC 1800

 39001689 AACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCA 39001748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCA 1860

 39001749 AGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACG 39001808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACG 1920

 39001809 CTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCC 39001868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCC 1980

 39001869 ATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAAT 39001928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAAT 2040

 39001929 CATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTT 39001988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTT 2100

 39001989 GTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCA 39002048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCA 2160

 39002049 AACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAA 39002108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAA 2220

 39002109 ACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTT 39002168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTT 2280

 39002169 TTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGC 39002228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGC 2340

 39002229 ATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGT 39002288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGT 2400

 39002289 TACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATT 39002348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATT 2460

 39002349 CTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACC 39002408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACC 2520

 39002409 TCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATAT 39002468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATAT 2580

 39002469 CCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATA 39002528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATA 2640

 39002529 CGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAA 39002588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAA 2700

 39002589 AGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCC 39002632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCC 2744

EXCISED REGION

 39002634 GCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAA 39002693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 GCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAA 2805

 39002694 GGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACA 39002753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 GGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACA 2865

 39002754 TTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAA 39002813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAA 2925

 39002814 AAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTA 39002873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 AAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTA 2985

 39002874 GAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGT 39002933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 GAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGT 3045

 39002934 GCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTG 39002993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 GCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTG 3105

 39002994 TAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAAC 39003053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 TAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAAC 3165

 39003054 TGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAG 39003113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAG 3225

 39003114 CTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAG 39003173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 CTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAG 3285

 39003174 AGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTG 39003233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 AGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTG 3345

 39003234 TCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTA 39003293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 TCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTA 3405

 39003294 AATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATAT 39003353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 AATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATAT 3465

 39003354 GAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCA 39003413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 GAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCA 3525

 39003414 TCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAG 39003473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAG 3585

 39003474 TATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAA 39003533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 TATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAA 3645

 39003534 TTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATT 39003593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 TTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATT 3705

 39003594 TATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCT 39003653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 TATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCT 3765

 39003654 CAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG 39003713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 CAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG 3825

 39003714 CAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA 39003773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 CAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA 3885

 39003774 TGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCA 39003833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 TGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCA 3945

 39003834 CCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCA 39003893
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3946 CCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCGAGTTCA 4005

 39003894 TAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATG 39003953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 TAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATG 4065

 39003954 AAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAAT 39004013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 AAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAAT 4125

 39004014 ACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATA 39004073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 ACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATA 4185

 39004074 CCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATAT 39004133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 CCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATAT 4245

 39004134 ATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCA 39004193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 ATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCA 4305

 39004194 TGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGT 39004253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 TGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGT 4365

 39004254 CAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCAC 39004313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 CAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCAC 4425

 39004314 CATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAG 39004373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 CATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAG 4485

 39004374 AATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTG 39004433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 AATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTG 4545

 39004434 TGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTC 39004493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 TGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTC 4605

 39004494 CAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGC 39004553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 CAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGC 4665

 39004554 AGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGG 39004613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 AGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGG 4725

 39004614 ATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGT 39004673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 ATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGT 4785

 39004674 AAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATC 39004733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 AAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATC 4845

 39004734 AGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTT 39004793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 AGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTT 4905

 39004794 ATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGC 39004853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 ATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGC 4965

 39004854 TTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGG 39004913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 TTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGG 5025

 39004914 CCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTC 39004973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 CCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTC 5085

 39004974 AAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAAT 39005033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 AAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAAT 5145

 39005034 GATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATA 39005093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 GATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATA 5205

 39005094 TTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATG 39005153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 TTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATG 5265

 39005154 GGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGA 39005213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 GGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGA 5325

 39005214 GGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATT 39005273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 GGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATT 5385

 39005274 TGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAG 39005333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 TGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAG 5445

 39005334 AAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGA 39005393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5446 AAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGA 5505

 39005394 GACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAA 39005453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 GACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAA 5565

 39005454 TGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCT 39005513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 TGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCT 5625

 39005514 GTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATA 39005573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 GTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATA 5685

 39005574 ATTTAATTG 39005582
          |||||||||
     5686 ATTTAATTG 5694

Alignment time is 4.12747 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    6712] =>      6712 nucs 'mol-32-2ef1-092772_6712'

Score:        6596
Aligned:      6714        nucs
Identic:      6691 (100%) nucs =>      2919 ( 99%)      3772 (100%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39001595,39004518] EXCISED REGION [39005028,39008801]
 second seq =>  [       1,    2938] EXCISED REGION [    2939,    6712]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39001595 AACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAA 39001654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAA 60

 39001655 AAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTT 39001714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTT 120

 39001715 AAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATA 39001774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATA 180

 39001775 AAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTA 39001834
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACCCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTA 240

 39001835 CTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAG 39001894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAG 300

 39001895 AGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTT 39001954
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCCTCACTAAAAAAAAAAAA-CAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTT 359

 39001955 ATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCAC 39002014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 ATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCAC 419

 39002015 ATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGA 39002074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 ATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGA 479

 39002075 TACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTC 39002134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTC 539

 39002135 TCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAA 39002194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAA 599

 39002195 ATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGAT 39002254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGAT 659

 39002255 TTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGA 39002314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGA 719

 39002315 CTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAA 39002374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAA 779

 39002375 GATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCA 39002434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCA 839

 39002435 CAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAA 39002494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      840 CAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCTGGTAAACATAA 899

 39002495 GATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTG 39002554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTG 959

 39002555 CTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGA 39002614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGA 1019

 39002615 ACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGA 39002674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGA 1079

 39002675 AATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACC 39002734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACC 1139

 39002735 TATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACA 39002794
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACA 1199

 39002795 AAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCT 39002854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCT 1259

 39002855 CACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCT 39002914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCT 1319

 39002915 GGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTT 39002974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTT 1379

 39002975 GGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTG 39003034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTG 1439

 39003035 TCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAA 39003094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAA 1499

 39003095 GACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAA 39003154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAA 1559

 39003155 TGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAAT 39003214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAAT 1619

 39003215 GTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATAC 39003274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATAC 1679

 39003275 TGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGA 39003334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGA 1739

 39003335 CACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAA 39003394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAA 1799

 39003395 GGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTC 39003454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTC 1859

 39003455 CTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCG 39003514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCG 1919

 39003515 AGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTT 39003574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTT 1979

 39003575 ATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT----------------GTTGAGACAGAGTCTCAC 39003618
          ||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||
     1980 ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCAC 2039

 39003619 TCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTT 39003678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTT 2099

 39003679 GGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCA 39003738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCA 2159

 39003739 CCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGC 39003798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGC 2219

 39003799 TGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGAT 39003858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGAT 2279

 39003859 TACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAA 39003918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAA 2339

 39003919 GAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAA 39003978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAA 2399

 39003979 AATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAA 39004038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAA 2459

 39004039 TGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTG 39004098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTG 2519

 39004099 AATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTT 39004158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTT 2579

 39004159 TTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCA 39004218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCA 2639

 39004219 CTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCC 39004278
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCC 2698

 39004279 TTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAA 39004338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAA 2758

 39004339 ATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAG 39004398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAG 2818

 39004399 AGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAG 39004458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAG 2878

 39004459 CACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 2938

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 2998

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 3058

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 3118

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 3178

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 3238

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 3298

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 3358

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 3418

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 3478

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 3538

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 3598

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 3658

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 3718

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 3778

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 3838

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 3898

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 3958

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 4018

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 4078

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 4138

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 4198

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 4258

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 4318

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 4378

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 4438

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 4498

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 4558

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 4618

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 4678

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 4738

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 4798

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 4858

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 4918

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 4978

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 5038

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 5098

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 5158

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 5218

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 5278

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 5338

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 5398

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 5458

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 5518

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 5578

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 5638

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 5698

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 5758

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 5818

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 5878

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 5938

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 5998

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 6058

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 6118

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 6178

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 6238

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 6298

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 6358

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 6418

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 6478

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 6538

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 39008687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 6598

 39008688 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 39008747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 6658

 39008748 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATC 39008801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATC 6712

Alignment time is 4.83125 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2938] =>      2938 nucs 'mol-32-2ef1-092772_2938'

Score:        2869
Aligned:      2924        nucs
Identic:      2919 (100%) nucs =>      1974 (100%)       945 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39001595,39003572] EXCISED REGION [39003573,39004518]
 second seq =>  [       1,    1977] EXCISED REGION [    1994,    2938]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        16 nucs [1978,1993]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        28 nucs [1978,2005] to [1994,2021]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [1978,1985] to [1986,1993]

 39001595 AACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAA 39001654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAA 60

 39001655 AAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTT 39001714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTT 120

 39001715 AAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATA 39001774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATA 180

 39001775 AAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTA 39001834
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACCCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTA 240

 39001835 CTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAG 39001894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAG 300

 39001895 AGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTT 39001954
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCCTCACTAAAAAAAAAAAA-CAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTT 359

 39001955 ATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCAC 39002014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 ATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCAC 419

 39002015 ATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGA 39002074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 ATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGA 479

 39002075 TACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTC 39002134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTC 539

 39002135 TCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAA 39002194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAA 599

 39002195 ATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGAT 39002254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGAT 659

 39002255 TTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGA 39002314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGA 719

 39002315 CTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAA 39002374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAA 779

 39002375 GATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCA 39002434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCA 839

 39002435 CAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAA 39002494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      840 CAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCTGGTAAACATAA 899

 39002495 GATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTG 39002554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTG 959

 39002555 CTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGA 39002614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGA 1019

 39002615 ACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGA 39002674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGA 1079

 39002675 AATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACC 39002734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACC 1139

 39002735 TATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACA 39002794
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACA 1199

 39002795 AAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCT 39002854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCT 1259

 39002855 CACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCT 39002914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCT 1319

 39002915 GGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTT 39002974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTT 1379

 39002975 GGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTG 39003034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTG 1439

 39003035 TCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAA 39003094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAA 1499

 39003095 GACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAA 39003154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAA 1559

 39003155 TGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAAT 39003214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAAT 1619

 39003215 GTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATAC 39003274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATAC 1679

 39003275 TGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGA 39003334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGA 1739

 39003335 CACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAA 39003394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAA 1799

 39003395 GGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTC 39003454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTC 1859

 39003455 CTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCG 39003514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCG 1919

 39003515 AGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGG 39003572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGG 1977

EXCISED REGION

 39003573 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGT 39003632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGT 2053

 39003633 TGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATT 39003692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATT 2113

 39003693 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAA 39003752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAA 2173

 39003753 TTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 39003812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 2233

 39003813 TGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCC 39003872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCC 2293

 39003873 ACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAA 39003932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 ACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAA 2353

 39003933 GTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGG 39003992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 GTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGG 2413

 39003993 CTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATA 39004052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 CTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATA 2473

 39004053 AAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTT 39004112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 AAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTT 2533

 39004113 TGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACA 39004172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 TGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACA 2593

 39004173 AAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAA 39004232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 AAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAA 2653

 39004233 TATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTAT 39004292
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTAT 2712

 39004293 GTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTA 39004352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 GTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTA 2772

 39004353 TCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAA 39004412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 TCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAA 2832

 39004413 AAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTG 39004472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 AAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTG 2892

 39004473 GGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 GGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 2938

Alignment time is 2.19598 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    8187] =>      8187 nucs 'mol-32-2f33-068271_8187'

Score:        8060
Aligned:      8189        nucs
Identic:      8165 (100%) nucs =>      3225 ( 99%)      4940 (100%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39001288,39004518] EXCISED REGION [39005028,39009969]
 second seq =>  [       1,    3245] EXCISED REGION [    3246,    8187]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39001288 ATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGT 39001347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGT 60

 39001348 TCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATT 39001407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATT 120

 39001408 CAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTT 39001467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTT 180

 39001468 TTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAAT 39001527
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTTTTGTTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAAT 240

 39001528 CTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGT 39001587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGT 300

 39001588 TTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTT 39001647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTT 360

 39001648 GACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATA 39001707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATA 420

 39001708 TCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGA 39001767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGA 480

 39001768 CATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATG 39001827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      481 CATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACCCTTTCTGTAGAGGAGGATG 540

 39001828 TGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCC 39001887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCC 600

 39001888 AGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATG 39001947
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAA-CAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATG 659

 39001948 TCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGT 39002007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGT 719

 39002008 TTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTG 39002067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTG 779

 39002068 ACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCA 39002127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 ACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCA 839

 39002128 GAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGG 39002187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGG 899

 39002188 GACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGAT 39002247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGAT 959

 39002248 AACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACC 39002307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACC 1019

 39002308 GTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAA 39002367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAA 1079

 39002368 TGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCAC 39002427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCAC 1139

 39002428 TGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTA 39002487
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1140 TGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCTGGTA 1199

 39002488 AACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATA 39002547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATA 1259

 39002548 ATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCT 39002607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCT 1319

 39002608 AAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCAT 39002667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCAT 1379

 39002668 TAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGT 39002727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGT 1439

 39002728 GTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAAC 39002787
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GTATACCTGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAAC 1499

 39002788 AACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAAC 39002847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAAC 1559

 39002848 AAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCT 39002907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCT 1619

 39002908 CAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCT 39002967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCT 1679

 39002968 GAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCT 39003027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCT 1739

 39003028 ATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTT 39003087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTT 1799

 39003088 CAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCT 39003147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCT 1859

 39003148 TTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGC 39003207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGC 1919

 39003208 TCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAA 39003267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAA 1979

 39003268 GTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTAT 39003327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTAT 2039

 39003328 GTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGC 39003387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGC 2099

 39003388 AAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGA 39003447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGA 2159

 39003448 TTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTC 39003507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTC 2219

 39003508 AGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAA 39003567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAA 2279

 39003568 TTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT----------------GTTGAGACAGA 39003611
          |||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||
     2280 TTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGA 2339

 39003612 GTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCC 39003671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCC 2399

 39003672 GCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCA 39003731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCA 2459

 39003732 TGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTG 39003791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTG 2519

 39003792 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTA 39003851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTA 2579

 39003852 CTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCA 39003911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCA 2639

 39003912 GCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGG 39003971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGG 2699

 39003972 TTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAA 39004031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAA 2759

 39004032 ATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTT 39004091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTT 2819

 39004092 TACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTT 39004151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTT 2879

 39004152 TTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTT 39004211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTT 2939

 39004212 TCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAAC 39004271
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     2940 TCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAAC 2998

 39004272 ATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATT 39004331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATT 3058

 39004332 TTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGA 39004391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGA 3118

 39004392 GGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGG 39004451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGG 3178

 39004452 CCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGAT 39004511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGAT 3238

 39004512 TATGCAA 39004518
          |||||||
     3239 TATGCAA 3245

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 3305

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 3365

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 3425

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 3485

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 3545

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 3605

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 3665

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 3725

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 3785

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 3845

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 3905

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 3965

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 4025

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 4085

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 4145

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 4205

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 4265

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 4325

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 4385

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 4445

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 4505

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 4565

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 4625

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 4685

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 4745

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 4805

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 4865

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 4925

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 4985

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 5045

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 5105

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 5165

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 5225

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 5285

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 5345

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 5405

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5406 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 5465

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5466 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 5525

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5526 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 5585

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5586 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 5645

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5646 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 5705

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5706 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 5765

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5766 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 5825

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5826 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 5885

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 5945

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5946 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 6005

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6006 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 6065

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6066 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 6125

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6126 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 6185

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6186 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 6245

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6246 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 6305

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6306 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 6365

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6366 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 6425

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6426 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 6485

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6486 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 6545

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6546 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 6605

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 6665

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 6725

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 6785

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 6845

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 39008687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 6905

 39008688 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 39008747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 6965

 39008748 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 39008807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 7025

 39008808 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 39008867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 7085

 39008868 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 39008927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 7145

 39008928 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 39008987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 7205

 39008988 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 39009047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 7265

 39009048 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 39009107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 7325

 39009108 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 39009167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 7385

 39009168 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 39009227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 7445

 39009228 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 39009287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 7505

 39009288 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 39009347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 7565

 39009348 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 39009407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 7625

 39009408 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 39009467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 7685

 39009468 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 39009527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 7745

 39009528 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 39009587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 7805

 39009588 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 39009647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 7865

 39009648 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 39009707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 7925

 39009708 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 39009767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 7985

 39009768 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 39009827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 8045

 39009828 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 39009887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 8105

 39009888 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 39009947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 8165

 39009948 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAG 39009969
          ||||||||||||||||||||||
     8166 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAG 8187

Alignment time is 5.86211 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3245] =>      3245 nucs 'mol-32-2f33-068271_3245'

Score:        3165
Aligned:      3231        nucs
Identic:      3225 (100%) nucs =>      2280 (100%)       945 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39001288,39003572] EXCISED REGION [39003573,39004518]
 second seq =>  [       1,    2284] EXCISED REGION [    2301,    3245]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        16 nucs [2285,2300]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        28 nucs [2285,2312] to [2301,2328]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [2285,2292] to [2293,2300]

 39001288 ATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGT 39001347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGT 60

 39001348 TCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATT 39001407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATT 120

 39001408 CAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTT 39001467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTT 180

 39001468 TTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAAT 39001527
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTTTTGTTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAAT 240

 39001528 CTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGT 39001587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGT 300

 39001588 TTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTT 39001647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTT 360

 39001648 GACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATA 39001707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATA 420

 39001708 TCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGA 39001767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGA 480

 39001768 CATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATG 39001827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      481 CATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACCCTTTCTGTAGAGGAGGATG 540

 39001828 TGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCC 39001887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCC 600

 39001888 AGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATG 39001947
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAA-CAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATG 659

 39001948 TCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGT 39002007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGT 719

 39002008 TTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTG 39002067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTG 779

 39002068 ACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCA 39002127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 ACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCA 839

 39002128 GAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGG 39002187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGG 899

 39002188 GACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGAT 39002247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGAT 959

 39002248 AACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACC 39002307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACC 1019

 39002308 GTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAA 39002367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAA 1079

 39002368 TGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCAC 39002427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCAC 1139

 39002428 TGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTA 39002487
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1140 TGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCTGGTA 1199

 39002488 AACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATA 39002547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATA 1259

 39002548 ATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCT 39002607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCT 1319

 39002608 AAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCAT 39002667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCAT 1379

 39002668 TAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGT 39002727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGT 1439

 39002728 GTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAAC 39002787
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GTATACCTGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAAC 1499

 39002788 AACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAAC 39002847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAAC 1559

 39002848 AAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCT 39002907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCT 1619

 39002908 CAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCT 39002967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCT 1679

 39002968 GAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCT 39003027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCT 1739

 39003028 ATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTT 39003087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTT 1799

 39003088 CAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCT 39003147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCT 1859

 39003148 TTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGC 39003207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGC 1919

 39003208 TCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAA 39003267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAA 1979

 39003268 GTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTAT 39003327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTAT 2039

 39003328 GTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGC 39003387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGC 2099

 39003388 AAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGA 39003447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGA 2159

 39003448 TTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTC 39003507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTC 2219

 39003508 AGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAA 39003567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAA 2279

 39003568 TTTGG 39003572
          |||||
     2280 TTTGG 2284

EXCISED REGION

 39003573 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGT 39003632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGT 2360

 39003633 TGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATT 39003692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATT 2420

 39003693 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAA 39003752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAA 2480

 39003753 TTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 39003812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 2540

 39003813 TGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCC 39003872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 TGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCC 2600

 39003873 ACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAA 39003932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 ACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAA 2660

 39003933 GTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGG 39003992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 GTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGG 2720

 39003993 CTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATA 39004052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 CTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATA 2780

 39004053 AAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTT 39004112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 AAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTT 2840

 39004113 TGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACA 39004172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACA 2900

 39004173 AAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAA 39004232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 AAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAA 2960

 39004233 TATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTAT 39004292
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 TATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTAT 3019

 39004293 GTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTA 39004352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 GTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTA 3079

 39004353 TCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAA 39004412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAA 3139

 39004413 AAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTG 39004472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 AAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTG 3199

 39004473 GGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 GGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 3245

Alignment time is 2.38162 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    7929] =>      7929 nucs 'mol-32-2fcd-074061_7929'

Score:        7895
Aligned:      7928        nucs
Identic:      7925 (100%) nucs =>      2180 (100%)      5745 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004046,39006225] EXCISED REGION [39006227,39011974]
 second seq =>  [       1,    2180] EXCISED REGION [    2182,    7929]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39006226,39006226]
 second seq =>         1 nucs [2181,2181]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39004046 ACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTT 39004105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTT 60

 39004106 ATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTT 39004165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTT 120

 39004166 CTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTT 39004225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTT 180

 39004226 AAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGT 39004285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGT 240

 39004286 AGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACA 39004345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACA 300

 39004346 TTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACA 39004405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACA 360

 39004406 TAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGA 39004465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGA 420

 39004466 AACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCC 39004525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCC 480

 39004526 AAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAA 39004585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAA 540

 39004586 GAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTA 39004645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTA 600

 39004646 AATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACA 39004705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACA 660

 39004706 AGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTG 39004765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTG 720

 39004766 TCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAA 39004825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAA 780

 39004826 TGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTC 39004885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTC 840

 39004886 CCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCAT 39004945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCAT 900

 39004946 GTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGAT 39005005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGAT 960

 39005006 GATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTAT 39005065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTAT 1020

 39005066 GCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTA 39005125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTA 1080

 39005126 ATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCT 39005185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCT 1140

 39005186 GGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGG 39005245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGG 1200

 39005246 ATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCAT 39005305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCAT 1260

 39005306 CTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAA 39005365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAA 1320

 39005366 AGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAG 39005425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAG 1380

 39005426 TTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAA 39005485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAA 1440

 39005486 TAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAG 39005545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAG 1500

 39005546 AGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATG 39005605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATG 1560

 39005606 TAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCT 39005665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCT 1620

 39005666 GATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCT 39005725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCT 1680

 39005726 GAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCT 39005785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCT 1740

 39005786 GACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAA 39005845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAA 1800

 39005846 CTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAAT 39005905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAAT 1860

 39005906 ACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTA 39005965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTA 1920

 39005966 ATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAG 39006025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAG 1980

 39006026 AGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATC 39006085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATC 2040

 39006086 TAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGT 39006145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGT 2100

 39006146 GGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCT 39006205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCT 2160

 39006206 TAGCTGTGTCTCCACTTGGA 39006225
          ||||||||||||||||||||
     2161 TAGCTGTGTCTCCACTTGGA 2180

EXCISED REGION

 39006227 GTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTA 39006286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 GTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTA 2241

 39006287 GCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGA 39006346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 GCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGA 2301

 39006347 AAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTT 39006406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 AAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTT 2361

 39006407 TTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCA 39006466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCA 2421

 39006467 TTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAAT 39006526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAAT 2481

 39006527 TGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTG 39006586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 TGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTG 2541

 39006587 TGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATT 39006646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATT 2601

 39006647 TGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACC 39006706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 TGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACC 2661

 39006707 CTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTAT 39006766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 CTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTAT 2721

 39006767 GCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAA 39006826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 GCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAA 2781

 39006827 CAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAAT 39006886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 CAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAAT 2841

 39006887 ACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTG 39006946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 ACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTG 2901

 39006947 ATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACT 39007006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 ATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACT 2961

 39007007 ACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATG 39007066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 ACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATG 3021

 39007067 CAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACA 39007126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 CAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACA 3081

 39007127 TATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAA 39007186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 TATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAA 3141

 39007187 TAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTA 39007246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTA 3201

 39007247 GGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGC 39007306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 GGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGC 3261

 39007307 ACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAG 39007366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 ACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAG 3321

 39007367 GAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCA 39007426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 GAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCA 3381

 39007427 CGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCA 39007486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 CGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCA 3441

 39007487 GATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCAC 39007546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 GATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCAC 3501

 39007547 CACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACA 39007606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 CACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACA 3561

 39007607 ATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCAT 39007666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 ATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCAT 3621

 39007667 GGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCA 39007726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 GGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCA 3681

 39007727 ACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAA 39007786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 ACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAA 3741

 39007787 ATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGT 39007846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 ATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGT 3801

 39007847 AATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGG 39007906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 AATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGG 3861

 39007907 CAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTT 39007966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 CAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTT 3921

 39007967 GCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACT 39008026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 GCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACT 3981

 39008027 CTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTG 39008086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 CTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTG 4041

 39008087 CCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATT 39008146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 CCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATT 4101

 39008147 CATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTT 39008206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 CATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTT 4161

 39008207 TCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAA 39008266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAA 4221

 39008267 ATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATT 39008326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 ATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATT 4281

 39008327 TTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTT 39008386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 TTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTT 4341

 39008387 AAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATA 39008446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 AAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATA 4401

 39008447 CAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTC 39008506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 CAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTC 4461

 39008507 ATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATG 39008566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 ATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATG 4521

 39008567 CTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATG 39008626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 CTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATG 4581

 39008627 AGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAG 39008686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 AGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAG 4641

 39008687 AAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATT 39008746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 AAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATT 4701

 39008747 AATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATG 39008806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATG 4761

 39008807 CATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAA 39008866
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4762 CATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTCAA 4821

 39008867 ATTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATT 39008926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 ATTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATT 4881

 39008927 GTATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTA 39008986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 GTATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTA 4941

 39008987 ATCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAAT 39009046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 ATCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAAT 5001

 39009047 TTCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTT 39009106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 TTCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTT 5061

 39009107 TTTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACT 39009166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 TTTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACT 5121

 39009167 TTGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTG 39009226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 TTGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTG 5181

 39009227 CCTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTA 39009286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 CCTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTA 5241

 39009287 GGTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTT 39009346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 GGTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTT 5301

 39009347 GTACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAA 39009406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 GTACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAA 5361

 39009407 GCTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCT 39009466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 GCTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCT 5421

 39009467 GGGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGA 39009526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 GGGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGA 5481

 39009527 TTTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACA 39009586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 TTTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACA 5541

 39009587 GGGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTT 39009646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 GGGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTT 5601

 39009647 TGTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTT 39009706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 TGTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTT 5661

 39009707 AGCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTT 39009766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 AGCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTT 5721

 39009767 AGTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTT 39009826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 AGTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTT 5781

 39009827 TTCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATG 39009886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 TTCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATG 5841

 39009887 TTTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTT 39009946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 TTTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTT 5901

 39009947 TTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTG 39010006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 TTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTG 5961

 39010007 CAATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 39010066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 CAATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 6021

 39010067 CCCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTA 39010126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 CCCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTA 6081

 39010127 GTTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGAT 39010186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 GTTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGAT 6141

 39010187 CCTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCG 39010246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 CCTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCG 6201

 39010247 CTCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTT 39010306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 CTCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTT 6261

 39010307 TGCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCAT 39010366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 TGCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCAT 6321

 39010367 TCTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGA 39010426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 TCTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGA 6381

 39010427 CTACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTT 39010486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 CTACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTT 6441

 39010487 TACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTT 39010546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6442 TACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTT 6501

 39010547 AATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAA 39010606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6502 AATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAA 6561

 39010607 TACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTA 39010666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6562 TACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTA 6621

 39010667 TAAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAG 39010726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6622 TAAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCGG 6681

 39010727 AGCTTTTAGGGTATCTGTCACCAAAATAATATATATTACACATGCATTTAGATTCAGCAA 39010786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6682 AGCTTTTAGGGTATCTGTCACCAAAATAATATATATTACACATGCATTTAGATTCAGCAA 6741

 39010787 AATCAATTCATAGGTATAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTATATTTAAAAATCAGGC 39010846
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6742 AATCAATTCATAGGTATAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTATATCTAAAAATCAGGC 6801

 39010847 TGTTTTGATTGACTAAAAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCTTCCTATTAAAAAATT 39010906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6802 TGTTTTGATTGACTAAAAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCTTCCTATTAAAAAATT 6861

 39010907 TACTTTGCATGTGTATCCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTTTCACAGTGGTCACAC 39010966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6862 TACTTTGCATGTGTATCCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTTTCACAGTGGTCACAC 6921

 39010967 CATCTCTAGAGGGTTGAGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGACAGACCGTGGCCATTT 39011026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6922 CATCTCTAGAGGGTTGAGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGACAGACCGTGGCCATTT 6981

 39011027 GGAATGTGTTCAGAGAAGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCATTATAGATGTGATGG 39011086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6982 GGAATGTGTTCAGAGAAGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCATTATAGATGTGATGG 7041

 39011087 TTAAATAAAGTATATCATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATACTACTATAAAGAACT 39011146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7042 TTAAATAAAGTATATCATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATACTACTATAAAGAACT 7101

 39011147 GCCCAAGACTGAGTAATTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCACAGTTCCACATGGCT 39011206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7102 GCCCAAGACTGAGTAATTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCACAGTTCCACATGGCT 7161

 39011207 GAGGAGGCCTCGGGAAACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGAAGCAAGGCACCTTCT 39011266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7162 GAGGAGGCCTCGGGAAACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGAAGCAAGGCACCTTCT 7221

 39011267 TCACAAGGCGGCAGGAAGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAGCCCTTTATAAAACCA 39011326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7222 TCACAAGGCGGCAGGAAGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAGCCCTTTATAAAACCA 7281

 39011327 CCAGATCTCATGGGAACTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGGCAAACGAACCCCAGA 39011386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7282 CCAGATCTCATGGGAACTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGGCAAACGAACCCCAGA 7341

 39011387 TTCAATTACCTCCACCTGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCTGGGATTACAATTCAA 39011446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7342 TTCAATTACCTCCACCTGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCTGGGATTACAATTCAA 7401

 39011447 GATGAGATTTGTGTGGGAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTGACAAAGTGTTTTGGG 39011506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7402 GATGAGATTTGTGTGGGAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTGACAAAGTGTTTTGGG 7461

 39011507 ATGGGCAGATAGGAAAGGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTATTTGTTGATTGCAAGA 39011566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7462 ATGGGCAGATAGGAAAGGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTATTTGTTGATTGCAAGA 7521

 39011567 TAGTCTTATGAAAGAGAGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAACAAGGATCAATGAGC 39011626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7522 TAGTCTTATGAAAGAGAGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAACAAGGATCAATGAGC 7581

 39011627 CAAATTTACAGAAAGCAAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGAAATTTCTCATCAGTA 39011686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7582 CAAATTTACAGAAAGCAAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGAAATTTCTCATCAGTA 7641

 39011687 CACTTATCTAAAAATTAAATGGATAATAAAGGGTAAAAGAAATCTTTATACATTAGATAC 39011746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7642 CACTTATCTAAAAATTAAATGGATAATAAAGGGTAAAAGAAATCTTTATACATTAGATAC 7701

 39011747 ACACACACTGGAGTATATATGAGTTAAATGAGCTGATGTGTAGGATTTGCTTTAAAATAA 39011806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7702 ACACACACTGGAGTATATATGAGTTAAATGAGCTGATGTGTAGGATTTGCTTTAAAATAA 7761

 39011807 TACAGCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGC 39011866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7762 TACAGCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGC 7821

 39011867 GGGCAGATCACGAGGTCAGGAAATCCAGACCGTCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCT 39011926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7822 GGGCAGATCACGAGGTCAGGAAATCCAGACCGTCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCT 7881

 39011927 CTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCAGGGCGTGGGGGCGGGCACCTGT 39011974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7882 CTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCAGGGCGTGGGGGCGGGCACCTGT 7929

Alignment time is 5.71183 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4083] =>      4083 nucs 'mol-32-2fd8-209004_4083'

Score:        4082
Aligned:      4082        nucs
Identic:      4082 (100%) nucs =>      3469 (100%)       613 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39002247,39005715] EXCISED REGION [39005717,39006329]
 second seq =>  [       1,    3469] EXCISED REGION [    3471,    4083]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39005716,39005716]
 second seq =>         1 nucs [3470,3470]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39005715,39005715] to [39005717,39005717]
 second seq =>         1 nucs [3469,3469] to [3471,3471]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39002247 TAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTAC 39002306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTAC 60

 39002307 CGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCA 39002366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCA 120

 39002367 ATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCA 39002426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCA 180

 39002427 CTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGT 39002486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGT 240

 39002487 AAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGAT 39002546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGAT 300

 39002547 AATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCC 39002606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCC 360

 39002607 TAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCA 39002666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCA 420

 39002667 TTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACG 39002726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACG 480

 39002727 TGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAA 39002786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAA 540

 39002787 CAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAA 39002846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAA 600

 39002847 CAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATC 39002906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATC 660

 39002907 TCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACC 39002966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACC 720

 39002967 TGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCC 39003026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCC 780

 39003027 TATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCT 39003086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCT 840

 39003087 TCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTC 39003146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTC 900

 39003147 TTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAG 39003206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAG 960

 39003207 CTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAA 39003266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAA 1020

 39003267 AGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTA 39003326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTA 1080

 39003327 TGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTG 39003386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTG 1140

 39003387 CAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAG 39003446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAG 1200

 39003447 ATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTT 39003506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTT 1260

 39003507 CAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTA 39003566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTA 1320

 39003567 ATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGC 39003626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGC 1380

 39003627 CCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAA 39003686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAA 1440

 39003687 GCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCT 39003746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCT 1500

 39003747 GGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCG 39003806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCG 1560

 39003807 AACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTG 39003866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTG 1620

 39003867 TGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAA 39003926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAA 1680

 39003927 TTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTT 39003986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTT 1740

 39003987 ATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAA 39004046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAA 1800

 39004047 CTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTA 39004106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTA 1860

 39004107 TATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTC 39004166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTC 1920

 39004167 TTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTA 39004226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTA 1980

 39004227 AAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTA 39004286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTA 2040

 39004287 GGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACAT 39004346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACAT 2100

 39004347 TTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACAT 39004406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACAT 2160

 39004407 AAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAA 39004466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAA 2220

 39004467 ACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCA 39004526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCA 2280

 39004527 AAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAG 39004586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAG 2340

 39004587 AAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAA 39004646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAA 2400

 39004647 ATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAA 39004706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAA 2460

 39004707 GGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGT 39004766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGT 2520

 39004767 CTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAAT 39004826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAAT 2580

 39004827 GAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCC 39004886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCC 2640

 39004887 CAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATG 39004946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATG 2700

 39004947 TTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATG 39005006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATG 2760

 39005007 ATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATG 39005066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATG 2820

 39005067 CAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAA 39005126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAA 2880

 39005127 TCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTG 39005186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTG 2940

 39005187 GCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGA 39005246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGA 3000

 39005247 TAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATC 39005306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATC 3060

 39005307 TTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAA 39005366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAA 3120

 39005367 GGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGT 39005426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGT 3180

 39005427 TTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAAT 39005486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAAT 3240

 39005487 AAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGA 39005546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGA 3300

 39005547 GATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGT 39005606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGT 3360

 39005607 AATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTG 39005666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTG 3420

 39005667 ATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATG 39005715
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATG 3469

EXCISED REGION

 39005717 GTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCA 39005776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCA 3530

 39005777 ATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGC 39005836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 ATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGC 3590

 39005837 ATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAG 39005896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 ATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAG 3650

 39005897 TCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAA 39005956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAA 3710

 39005957 TAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGA 39006016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGA 3770

 39006017 AAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAG 39006076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 AAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAG 3830

 39006077 GAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCA 39006136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 GAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCA 3890

 39006137 GCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAA 39006196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 GCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAA 3950

 39006197 TCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAG 39006256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAG 4010

 39006257 AACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAA 39006316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 AACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAA 4070

 39006317 TCTAGTTAGCAAA 39006329
          |||||||||||||
     4071 TCTAGTTAGCAAA 4083

Alignment time is 3.02178 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3461] =>      3461 nucs 'mol-32-2ff9-133562_3461'

Score:        3461
Aligned:      3461        nucs
Identic:      3461 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004301,39007761]
 second seq =>  [       1,    3461]

 39004301 CCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTAT 39004360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTAT 60

 39004361 GTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAG 39004420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAG 120

 39004421 TTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGT 39004480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGT 180

 39004481 AGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATA 39004540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATA 240

 39004541 GGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCAT 39004600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCAT 300

 39004601 ATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTC 39004660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTC 360

 39004661 AAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCA 39004720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCA 420

 39004721 GGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCAT 39004780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCAT 480

 39004781 ACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAG 39004840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAG 540

 39004841 ATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACC 39004900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACC 600

 39004901 CCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGA 39004960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGA 660

 39004961 AGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAG 39005020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAG 720

 39005021 GACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGA 39005080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGA 780

 39005081 TTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACA 39005140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACA 840

 39005141 GAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGG 39005200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGG 900

 39005201 TGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCA 39005260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCA 960

 39005261 AGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAG 39005320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAG 1020

 39005321 TTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAG 39005380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAG 1080

 39005381 CAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAG 39005440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAG 1140

 39005441 GTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATG 39005500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATG 1200

 39005501 AGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAA 39005560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAA 1260

 39005561 TCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTAC 39005620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTAC 1320

 39005621 TGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACT 39005680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACT 1380

 39005681 ATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTC 39005740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTC 1440

 39005741 ACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACAT 39005800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACAT 1500

 39005801 TTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTT 39005860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTT 1560

 39005861 AAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCA 39005920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCA 1620

 39005921 GATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTT 39005980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTT 1680

 39005981 TGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAG 39006040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAG 1740

 39006041 TCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCAT 39006100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCAT 1800

 39006101 TCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTA 39006160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTA 1860

 39006161 AGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCAC 39006220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCAC 1920

 39006221 TTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATG 39006280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATG 1980

 39006281 TTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATT 39006340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATT 2040

 39006341 TCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAA 39006400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAA 2100

 39006401 TTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTT 39006460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTT 2160

 39006461 TTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAA 39006520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAA 2220

 39006521 AACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAG 39006580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAG 2280

 39006581 AGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGC 39006640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGC 2340

 39006641 ACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCA 39006700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCA 2400

 39006701 GGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCAT 39006760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCAT 2460

 39006761 ATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCA 39006820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCA 2520

 39006821 ATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAA 39006880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAA 2580

 39006881 TAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTA 39006940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTA 2640

 39006941 GTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTA 39007000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTA 2700

 39007001 TGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGG 39007060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGG 2760

 39007061 TTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGA 39007120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGA 2820

 39007121 CATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTC 39007180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTC 2880

 39007181 CCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCA 39007240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCA 2940

 39007241 AAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGA 39007300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGA 3000

 39007301 CAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAA 39007360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAA 3060

 39007361 AGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTC 39007420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTC 3120

 39007421 CTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCC 39007480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCC 3180

 39007481 CACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTT 39007540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTT 3240

 39007541 TGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAG 39007600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAG 3300

 39007601 TTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAG 39007660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAG 3360

 39007661 TCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATAT 39007720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATAT 3420

 39007721 TTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCAT 39007761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCAT 3461

Alignment time is 2.29809 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    8022] =>      8022 nucs 'mol-32-30eb-196339_8022'

Score:        7938
Aligned:      8023        nucs
Identic:      8003 (100%) nucs =>      1102 ( 98%)      6901 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39003416,39004518] EXCISED REGION [39005028,39011931]
 second seq =>  [       1,    1118] EXCISED REGION [    1119,    8022]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39003416 CATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTA 39003475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTA 60

 39003476 TGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATT 39003535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATT 120

 39003536 GCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTA 39003595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTA 180

 39003596 TTTAT----------------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTG 39003639
          |||||                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTG 240

 39003640 GAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGC 39003699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGC 300

 39003700 CTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTAT 39003759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTAT 360

 39003760 ATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTC 39003819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTC 420

 39003820 AAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGC 39003879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGC 480

 39003880 CTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATA 39003939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATA 540

 39003940 ATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAA 39003999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAA 600

 39004000 GTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAA 39004059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAA 660

 39004060 AAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTT 39004119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTT 720

 39004120 TTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAG 39004179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAG 780

 39004180 GATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGG 39004239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGG 840

 39004240 ACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATAT 39004299
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATAT 899

 39004300 TCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTA 39004359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTA 959

 39004360 TGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAA 39004419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAA 1019

 39004420 GTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGG 39004479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGG 1079

 39004480 TAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 1118

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 1178

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 1238

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 1298

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 1358

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 1418

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 1478

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 1538

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 1598

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 1658

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 1718

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 1778

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 1838

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 1898

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 1958

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 2018

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 2078

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 2138

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 2198

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 2258

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 2318

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 2378

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 2438

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 2498

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 2558

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 2618

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 2678

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 2738

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 2798

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 2858

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 2918

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 2978

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 3038

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 3098

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3099 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 3158

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 3218

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 3278

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 3338

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 3398

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 3458

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 3518

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 3578

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 3638

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 3698

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 3758

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 3818

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 3878

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 3938

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3939 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 3998

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3999 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 4058

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4059 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 4118

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4119 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 4178

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4179 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 4238

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4239 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 4298

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4299 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 4358

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4359 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 4418

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4419 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 4478

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4479 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 4538

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4539 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 4598

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4599 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 4658

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4659 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 4718

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 39008687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4719 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 4778

 39008688 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 39008747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4779 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 4838

 39008748 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 39008807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4839 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 4898

 39008808 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 39008867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4899 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 4958

 39008868 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 39008927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4959 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 5018

 39008928 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 39008987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5019 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 5078

 39008988 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 39009047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5079 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 5138

 39009048 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 39009107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5139 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 5198

 39009108 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 39009167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5199 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 5258

 39009168 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 39009227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5259 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 5318

 39009228 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 39009287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5319 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAG 5378

 39009288 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 39009347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5379 GTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTG 5438

 39009348 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 39009407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5439 TACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAG 5498

 39009408 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 39009467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5499 CTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTG 5558

 39009468 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 39009527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5559 GGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGAT 5618

 39009528 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 39009587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5619 TTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAG 5678

 39009588 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 39009647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5679 GGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTT 5738

 39009648 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 39009707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5739 GTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTA 5798

 39009708 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 39009767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5799 GCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTA 5858

 39009768 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 39009827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5859 GTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTT 5918

 39009828 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 39009887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5919 TCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGT 5978

 39009888 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 39009947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5979 TTTTAATGTTTATTGTATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTT 6038

 39009948 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 39010007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 TTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 6098

 39010008 AATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 39010067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6099 AATCTCAGTTCACTGCAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTC 6158

 39010068 CCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 39010127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 CCGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAG 6218

 39010128 TTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 39010187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 TTGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 6278

 39010188 CTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGC 39010247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6279 CTCCCGCCTCGTCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGC 6338

 39010248 TCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTT 39010307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6339 TCTTTTGGTATTATGTGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTT 6398

 39010308 GCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCATT 39010367
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6399 TCTGGACTCATCTGGATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCATT 6458

 39010368 CTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGAC 39010427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6459 CTATGCTGCTCTTTTTAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGAC 6518

 39010428 TACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTTT 39010487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6519 TACTGATTTTCAGAGTAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTTT 6578

 39010488 ACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTTA 39010547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6579 ACCAACTAATTTCTATCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTTA 6638

 39010548 ATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAAT 39010607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6639 ATATGAAACATGTTTTGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAAT 6698

 39010608 ACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTAT 39010667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6699 ACCTAAACCATACATACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTAT 6758

 39010668 AAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAGA 39010727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6759 AAGGTATATGTGCAATTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAGA 6818

 39010728 GCTTTTAGGGTATCTGTCACCAAAATAATATATATTACACATGCATTTAGATTCAGCAAA 39010787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6819 GCTTTTAGGGTATCTGTCACCAAAATAATATATATTACACATGCATTTAGATTCAGCAAA 6878

 39010788 ATCAATTCATAGGTATAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTATATTTAAAAATCAGGCT 39010847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6879 ATCAATTCATAGGTATAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTATATTTAAAAATCAGGCT 6938

 39010848 GTTTTGATTGACTAAAAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCTTCCTATTAAAAAATTT 39010907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6939 GTTTTGATTGACTAAAAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCTTCCTATTAAAAAATTT 6998

 39010908 ACTTTGCATGTGTATCCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTTTCACAGTGGTCACACC 39010967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6999 ACTTTGCATGTGTATCCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTTTCACAGTGGTCACACC 7058

 39010968 ATCTCTAGAGGGTTGAGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGACAGACCGTGGCCATTTG 39011027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7059 ATCTCTAGAGGGTTGAGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGACAGACCGTGGCCATTTG 7118

 39011028 GAATGTGTTCAGAGAAGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCATTATAGATGTGATGGT 39011087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7119 GAATGTGTTCAGAGAAGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCATTATAGATGTGATGGT 7178

 39011088 TAAATAAAGTATATCATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATACTACTATAAAGAACTG 39011147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7179 TAAATAAAGTATATCATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATACTACTATAAAGAACTG 7238

 39011148 CCCAAGACTGAGTAATTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCACAGTTCCACATGGCTG 39011207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7239 CCCAAGACTGAGTAATTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCACAGTTCCACATGGCTG 7298

 39011208 AGGAGGCCTCGGGAAACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGAAGCAAGGCACCTTCTT 39011267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7299 AGGAGGCCTCGGGAAACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGAAGCAAGGCACCTTCTT 7358

 39011268 CACAAGGCGGCAGGAAGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAGCCCTTTATAAAACCAC 39011327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7359 CACAAGGCGGCAGGAAGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAGCCCTTTATAAAACCAC 7418

 39011328 CAGATCTCATGGGAACTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGGCAAACGAACCCCAGAT 39011387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7419 CAGATCTCATGGGAACTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGGCAAACGAACCCCAGAT 7478

 39011388 TCAATTACCTCCACCTGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCTGGGATTACAATTCAAG 39011447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7479 TCAATTACCTCCACCTGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCTGGGATTACAATTCAAG 7538

 39011448 ATGAGATTTGTGTGGGAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTGACAAAGTGTTTTGGGA 39011507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7539 ATGAGATTTGTGTGGGAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTGACAAAGTGTTTTGGGA 7598

 39011508 TGGGCAGATAGGAAAGGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTATTTGTTGATTGCAAGAT 39011567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7599 TGGGCAGATAGGAAAGGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTATTTGTTGATTGCAAGAT 7658

 39011568 AGTCTTATGAAAGAGAGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAACAAGGATCAATGAGCC 39011627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7659 AGTCTTATGAAAGAGAGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAACAAGGATCAATGAGCC 7718

 39011628 AAATTTACAGAAAGCAAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGAAATTTCTCATCAGTAC 39011687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7719 AAATTTACAGAAAGCAAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGAAATTTCTCATCAGTAC 7778

 39011688 ACTTATCTAAAAATTAAATGGATAATAAAGGGTAAAAGAAATCTTTATACATTAGATACA 39011747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7779 ACTTATCTAAAAATTAAATGGATAATAAAGGGTAAAAGAAATCTTTATACATTAGATACA 7838

 39011748 CACACACTGGAGTATATATGAGTTAAATGAGCTGATGTGTAGGATTTGCTTTAAAATAAT 39011807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7839 CACACACTGGAGTATATATGAGTTAAATGAGCTGATGTGTAGGATTTGCTTTAAAATAAT 7898

 39011808 ACAGCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCG 39011867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7899 ACAGCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCG 7958

 39011868 GGCAGATCACGAGGTCAGGAAATCCAGACCGTCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTC 39011927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7959 GGCAGATCACGAGGTCAGGAAATCCAGACCGTCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTC 8018

 39011928 TACT 39011931
          ||||
     8019 TACT 8022

Alignment time is 5.82099 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4758] =>      4758 nucs 'mol-32-3101-070511_4758'

Score:        4757
Aligned:      4757        nucs
Identic:      4757 (100%) nucs =>      4215 (100%)       542 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004087,39008301] EXCISED REGION [39008303,39008844]
 second seq =>  [       1,    4215] EXCISED REGION [    4217,    4758]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39008302,39008302]
 second seq =>         1 nucs [4216,4216]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [39008301,39008302] to [39008302,39008303]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39008301,39008301] to [39008303,39008303]
 second seq =>         1 nucs [4215,4215] to [4217,4217]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39004087 GATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTT 39004146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTT 60

 39004147 TCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTT 39004206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTT 120

 39004207 GTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAA 39004266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAA 180

 39004267 TCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTC 39004326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTC 240

 39004327 ACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTC 39004386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTC 300

 39004387 AAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTC 39004446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTC 360

 39004447 AGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAA 39004506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAA 420

 39004507 CAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCAT 39004566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCAT 480

 39004567 TCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTG 39004626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTG 540

 39004627 ATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAAT 39004686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAAT 600

 39004687 GATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGT 39004746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGT 660

 39004747 ATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCC 39004806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCC 720

 39004807 ATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATG 39004866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATG 780

 39004867 CAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAG 39004926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAG 840

 39004927 CTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAA 39004986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAA 900

 39004987 ATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAAT 39005046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAAT 960

 39005047 GAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAAT 39005106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAAT 1020

 39005107 TCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTG 39005166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTG 1080

 39005167 AGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAA 39005226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAA 1140

 39005227 CCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGA 39005286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGA 1200

 39005287 AACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAG 39005346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAG 1260

 39005347 TTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCC 39005406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCC 1320

 39005407 AAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTC 39005466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTC 1380

 39005467 ATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAG 39005526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAG 1440

 39005527 TGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTT 39005586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTT 1500

 39005587 TAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATT 39005646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATT 1560

 39005647 GAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGT 39005706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGT 1620

 39005707 GCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGT 39005766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGT 1680

 39005767 GTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATC 39005826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATC 1740

 39005827 AGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTC 39005886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTC 1800

 39005887 TCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTG 39005946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTG 1860

 39005947 AATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTG 39006006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTG 1920

 39006007 GGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGC 39006066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGC 1980

 39006067 TTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTC 39006126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTC 2040

 39006127 AGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACC 39006186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACC 2100

 39006187 ACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTT 39006246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTT 2160

 39006247 GGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGA 39006306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGA 2220

 39006307 TTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAAC 39006366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAAC 2280

 39006367 AACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGG 39006426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGG 2340

 39006427 AGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCA 39006486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCA 2400

 39006487 AACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAG 39006546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAG 2460

 39006547 GAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTC 39006606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTC 2520

 39006607 TGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCT 39006666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCT 2580

 39006667 ATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATC 39006726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATC 2640

 39006727 TCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTA 39006786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTA 2700

 39006787 AATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTAT 39006846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTAT 2760

 39006847 ATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACA 39006906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACA 2820

 39006907 TAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGC 39006966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGC 2880

 39006967 TGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAAT 39007026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAAT 2940

 39007027 TAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTT 39007086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTT 3000

 39007087 GCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAA 39007146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAA 3060

 39007147 GGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAG 39007206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAG 3120

 39007207 GAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCC 39007266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCC 3180

 39007267 TTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGT 39007326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGT 3240

 39007327 CCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGG 39007386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGG 3300

 39007387 AAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTA 39007446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTA 3360

 39007447 TCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCT 39007506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCT 3420

 39007507 CTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCA 39007566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCA 3480

 39007567 GGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAG 39007626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAG 3540

 39007627 GAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCT 39007686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCT 3600

 39007687 CTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAA 39007746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAA 3660

 39007747 GACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGAT 39007806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGAT 3720

 39007807 ATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAAT 39007866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAAT 3780

 39007867 TCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAG 39007926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAG 3840

 39007927 AAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCA 39007986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCA 3900

 39007987 TTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAA 39008046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAA 3960

 39008047 TAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCA 39008106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCA 4020

 39008107 TAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAG 39008166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAG 4080

 39008167 CTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAG 39008226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAG 4140

 39008227 CTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAAC 39008286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAAC 4200

 39008287 TTAACTGATGACAGA 39008301
          |||||||||||||||
     4201 TTAACTGATGACAGA 4215

EXCISED REGION

 39008303 ATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTC 39008362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 ATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTC 4276

 39008363 AAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATAT 39008422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 AAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATAT 4336

 39008423 TAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAAT 39008482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 TAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAAT 4396

 39008483 ATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCT 39008542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 ATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCT 4456

 39008543 GGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGA 39008602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 GGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGA 4516

 39008603 AGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGAGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTA 39008662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 AGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGAGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTA 4576

 39008663 ATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGAAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGC 39008722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 ATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGAAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGC 4636

 39008723 ACAGCAAATAGAATAAGTATTATTAATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCA 39008782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 ACAGCAAATAGAATAAGTATTATTAATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCA 4696

 39008783 CTCTGCACCAGAATTTATCTTATGCATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTAT 39008842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 CTCTGCACCAGAATTTATCTTATGCATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTAT 4756

 39008843 CA 39008844
          ||
     4757 CA 4758

Alignment time is 3.45543 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    9713] =>      9713 nucs 'mol-32-310c-087111_9713'

Score:        9713
Aligned:      9713        nucs
Identic:      9713 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39003963,39013675]
 second seq =>  [       1,    9713]

 39003963 GTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTA 39004022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTA 60

 39004023 ATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAA 39004082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAA 120

 39004083 CACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACC 39004142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACC 180

 39004143 TTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCA 39004202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCA 240

 39004203 TCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATA 39004262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATA 300

 39004263 GAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATA 39004322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATA 360

 39004323 ATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGT 39004382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGT 420

 39004383 TTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATC 39004442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATC 480

 39004443 CTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAG 39004502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAG 540

 39004503 GGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCA 39004562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCA 600

 39004563 TCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAA 39004622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAA 660

 39004623 CCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATT 39004682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATT 720

 39004683 TAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAAC 39004742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAAC 780

 39004743 AAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCT 39004802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCT 840

 39004803 GGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAG 39004862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAG 900

 39004863 GATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACC 39004922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACC 960

 39004923 ACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAAT 39004982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAAT 1020

 39004983 CTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCT 39005042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCT 1080

 39005043 TAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTA 39005102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTA 1140

 39005103 AAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTG 39005162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTG 1200

 39005163 TCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATG 39005222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATG 1260

 39005223 CCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATAC 39005282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATAC 1320

 39005283 CTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTC 39005342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTC 1380

 39005343 TAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATAC 39005402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATAC 1440

 39005403 CCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATT 39005462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATT 1500

 39005463 GTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCT 39005522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCT 1560

 39005523 GCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTG 39005582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTG 1620

 39005583 ACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTAT 39005642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTAT 1680

 39005643 CATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCAC 39005702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCAC 1740

 39005703 GGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGA 39005762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGA 1800

 39005763 AAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTT 39005822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTT 1860

 39005823 TATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAA 39005882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAA 1920

 39005883 TTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATT 39005942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATT 1980

 39005943 GCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTA 39006002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTA 2040

 39006003 TTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGA 39006062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGA 2100

 39006063 CAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTT 39006122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTT 2160

 39006123 ACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAA 39006182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAA 2220

 39006183 CACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTG 39006242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTG 2280

 39006243 TTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTAC 39006302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTAC 2340

 39006303 CAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAA 39006362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAA 2400

 39006363 CAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAA 39006422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAA 2460

 39006423 AAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGG 39006482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGG 2520

 39006483 TGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATT 39006542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATT 2580

 39006543 TGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCC 39006602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCC 2640

 39006603 AGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATG 39006662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATG 2700

 39006663 CCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAG 39006722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAG 2760

 39006723 AATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAA 39006782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAA 2820

 39006783 AGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAAC 39006842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAAC 2880

 39006843 TTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCAC 39006902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCAC 2940

 39006903 AACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACA 39006962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACA 3000

 39006963 ATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGT 39007022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGT 3060

 39007023 TAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGT 39007082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGT 3120

 39007083 TTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTA 39007142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTA 3180

 39007143 TTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGC 39007202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGC 3240

 39007203 TGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGC 39007262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGC 3300

 39007263 AGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAA 39007322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAA 3360

 39007323 GAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGG 39007382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGG 3420

 39007383 GAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCT 39007442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCT 3480

 39007443 TTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCT 39007502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCT 3540

 39007503 GCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACA 39007562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACA 3600

 39007563 CCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATC 39007622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATC 3660

 39007623 ACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACAC 39007682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACAC 3720

 39007683 CTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTG 39007742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTG 3780

 39007743 CAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATG 39007802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATG 3840

 39007803 AGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAAT 39007862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAAT 3900

 39007863 AAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAA 39007922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAA 3960

 39007923 TAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCAT 39007982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCAT 4020

 39007983 GTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGT 39008042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGT 4080

 39008043 TTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACA 39008102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACA 4140

 39008103 AGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGC 39008162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGC 4200

 39008163 AAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGC 39008222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGC 4260

 39008223 TAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTA 39008282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTA 4320

 39008283 AAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAG 39008342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAG 4380

 39008343 CATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAA 39008402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAA 4440

 39008403 CTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTC 39008462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTC 4500

 39008463 ATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGA 39008522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGA 4560

 39008523 CAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTA 39008582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTA 4620

 39008583 TGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGAGTCAAATTACACAGG 39008642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGAGTCAAATTACACAGG 4680

 39008643 ATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGAAATAAAGTGGAAGAT 39008702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGAAATAAAGTGGAAGAT 4740

 39008703 AAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTAATTTGATTAGAGGTA 39008762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTAATTTGATTAGAGGTA 4800

 39008763 CTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGCATCAAGGAAAGTTCA 39008822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGCATCAAGGAAAGTTCA 4860

 39008823 CAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAATTTTAGATGCTATAA 39008882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAATTTTAGATGCTATAA 4920

 39008883 AAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTGTATGCATCTCATCAC 39008942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTGTATGCATCTCATCAC 4980

 39008943 ATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAATCACTTTTAAATAAA 39009002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAATCACTTTTAAATAAA 5040

 39009003 GTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATTTCCTGTAATTGTAAT 39009062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATTTCCTGTAATTGTAAT 5100

 39009063 AATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTTTTTGGTTATTACATT 39009122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTTTTTGGTTATTACATT 5160

 39009123 TGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTTTGTCCTGGACCCACT 39009182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTTTGTCCTGGACCCACT 5220

 39009183 ACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGCCTTTTTGACTTCTTG 39009242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGCCTTTTTGACTTCTTG 5280

 39009243 ATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAGGTTGATACAAAAGTA 39009302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAGGTTGATACAAAAGTA 5340

 39009303 ATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTGTACCAACCTAATATT 39009362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAATGGCAAAGCAATTACATTTGTACCAACCTAATATT 5400

 39009363 TTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAGCTATCACCAAAACTC 39009422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAATTGATATTCTCCAAAGCCAAGCTATCACCAAAACTC 5460

 39009423 ATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTGGGTTCAAGCTGTTAC 39009482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGTTGAGTTTTTTTAATTGTCTGGGTTCAAGCTGTTAC 5520

 39009483 ATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGATTTTACCATTAGAAAG 39009542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATCCTTAATAATGATTTATTTGATCTGTTATTGTCTCAATGTGATTTTACCATTAGAAAG 5580

 39009543 TATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAGGGGAAAAAGTCCAGA 39009602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TATATACATTTAGGTCTAGCTTTACATTTTGAACCTCATGGACAGGGGAAAAAGTCCAGA 5640

 39009603 AACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTTGTCAATAACTTTTAG 39009662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AACAGAATCGAATAATCAATACAGGGCTCACTGTTTGTTTTCTTTGTCAATAACTTTTAG 5700

 39009663 TAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTAGCTAGACTGTATTAT 39009722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATTGGCAGCAAAACATCCCCTTAGCTAGACTGTATTAT 5760

 39009723 ACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTAGTTACAGGCCTCTGA 39009782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAATAATGTCTCTTCTCCTTGTTAGTTACAGGCCTCTGA 5820

 39009783 AACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTTTCCAAAAGTTAATTC 39009842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AACCCCTGAACTCTCTATATCTTCCACCCTGCCCCTGCTAATTTTTCCAAAAGTTAATTC 5880

 39009843 TGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGTTTTTAATGTTTATTG 39009902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTTAAGTCAAACAATTGCAATGTTTTTAATGTTTATTG 5940

 39009903 TATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTT 39009962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TATGGCTTTCCTTCATATTTGGCAAAAACTCATCCAGCCGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTT 6000

 39009963 GAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGTTCACTG 39010022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGTTCACTG 6060

 39010023 CAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGAT 39010082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CAACCTTTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGCAGCTGGGAT 6120

 39010083 TACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTTGAAACGGGGTTTC 39010142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TACAGGCACGTGCACCACACCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTTGAAACGGGGTTTC 6180

 39010143 ACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCGCCTCGTCCT 39010202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCGCCTCGTCCT 6240

 39010203 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGCTCTTTTGGTATTATG 39010262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACCATGCCCGGCCGCTCTTTTGGTATTATG 6300

 39010263 TGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTTGCTGGACTCATCTGG 39010322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TGGAGACAACAGACAAGTAGTGATAACCTTTAGGAATCTGACTTTGCTGGACTCATCTGG 6360

 39010323 ATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCATTCTATGCTGCTCTTTT 39010382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ATTCTTTTTAATTGAACACGTTCTAGAGATTTTCTTCCATGCATTCTATGCTGCTCTTTT 6420

 39010383 TAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGACTACTGATTTTCAGAG 39010442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TAAAGCCATCTGTCCTGAGATATTACTTTTTTAGTTTAGGGTGACTACTGATTTTCAGAG 6480

 39010443 TAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTTTACCAACTAATTTCTA 39010502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TAACTTAGCAATTTCAGTTTATAAACTTGTCTAAGTCACTGTTTTACCAACTAATTTCTA 6540

 39010503 TCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTTAATATGAAACATGTTT 39010562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TCAACTGACTTCAGAATATTTCTGCAATATAAGGAAAACCCTTTAATATGAAACATGTTT 6600

 39010563 TGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAATACCTAAACCATACAT 39010622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TGGATGTAGGAAATCTCTGCTCATAGGAGGGAAATAATTGAAAATACCTAAACCATACAT 6660

 39010623 ACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTATAAGGTATATGTGCAA 39010682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 ACTGCTTGTTTTGTGTGTTTCTTTTCTGTATTTTAAAAAATTTATAAGGTATATGTGCAA 6720

 39010683 TTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAGAGCTTTTAGGGTATCT 39010742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TTTTGTTATATGCATATAACAAAACTGTGTAGTGGCCAAGTCAGAGCTTTTAGGGTATCT 6780

 39010743 GTCACCAAAATAATATATATTACACATGCATTTAGATTCAGCAAAATCAATTCATAGGTA 39010802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GTCACCAAAATAATATATATTACACATGCATTTAGATTCAGCAAAATCAATTCATAGGTA 6840

 39010803 TAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTATATTTAAAAATCAGGCTGTTTTGATTGACTAA 39010862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TAAAAGGAAGTCCCTTTGTAATAATTTATATTTAAAAATCAGGCTGTTTTGATTGACTAA 6900

 39010863 AAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCTTCCTATTAAAAAATTTACTTTGCATGTGTAT 39010922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AAGCTCAATATCAGTCAATAAGTTATGCTTCCTATTAAAAAATTTACTTTGCATGTGTAT 6960

 39010923 CCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTTTCACAGTGGTCACACCATCTCTAGAGGGTTG 39010982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CCAGACCAAGGAAAACAGCACTGCTCTTTTCACAGTGGTCACACCATCTCTAGAGGGTTG 7020

 39010983 AGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGACAGACCGTGGCCATTTGGAATGTGTTCAGAGA 39011042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 AGTTGTATTCTGACACTTCATTTTAGGACAGACCGTGGCCATTTGGAATGTGTTCAGAGA 7080

 39011043 AGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCATTATAGATGTGATGGTTAAATAAAGTATATC 39011102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 AGGATGGCTAAGACAATAAAGAAATTTCATTATAGATGTGATGGTTAAATAAAGTATATC 7140

 39011103 ATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATACTACTATAAAGAACTGCCCAAGACTGAGTAA 39011162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 ATGTGTGGTTGTATTAATCTGCTTTCATACTACTATAAAGAACTGCCCAAGACTGAGTAA 7200

 39011163 TTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCACAGTTCCACATGGCTGAGGAGGCCTCGGGAA 39011222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TTTATAAAGAAAGGAGTTAATTCGACTCACAGTTCCACATGGCTGAGGAGGCCTCGGGAA 7260

 39011223 ACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGAAGCAAGGCACCTTCTTCACAAGGCGGCAGGA 39011282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 ACTTACAATCATGGCCAAGGTGAAGGGGAAGCAAGGCACCTTCTTCACAAGGCGGCAGGA 7320

 39011283 AGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAGCCCTTTATAAAACCACCAGATCTCATGGGAA 39011342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 AGCAGAAGGGCCGAGTGAAGGAGGAAGAGCCCTTTATAAAACCACCAGATCTCATGGGAA 7380

 39011343 CTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGGCAAACGAACCCCAGATTCAATTACCTCCACC 39011402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 CTCACCACTATCACAAGAACAGCATGGGGCAAACGAACCCCAGATTCAATTACCTCCACC 7440

 39011403 TGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCTGGGATTACAATTCAAGATGAGATTTGTGTGG 39011462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 TGGTCTCTTCCTTGACACGTGGGGATTCTGGGATTACAATTCAAGATGAGATTTGTGTGG 7500

 39011463 GAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTGACAAAGTGTTTTGGGATGGGCAGATAGGAAA 39011522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 GAACACAAAGCCTAACTGTATCAGTGGTGACAAAGTGTTTTGGGATGGGCAGATAGGAAA 7560

 39011523 GGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTATTTGTTGATTGCAAGATAGTCTTATGAAAGAG 39011582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GGTAGCTATCATAAACAGAATTTAAGTATTTGTTGATTGCAAGATAGTCTTATGAAAGAG 7620

 39011583 AGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAACAAGGATCAATGAGCCAAATTTACAGAAAGC 39011642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 AGGTTATTATGCATTGTTCCAAAGACAAACAAGGATCAATGAGCCAAATTTACAGAAAGC 7680

 39011643 AAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGAAATTTCTCATCAGTACACTTATCTAAAAATT 39011702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 AAATTTTCAGCATAATATTCAAAGAAAGAAATTTCTCATCAGTACACTTATCTAAAAATT 7740

 39011703 AAATGGATAATAAAGGGTAAAAGAAATCTTTATACATTAGATACACACACACTGGAGTAT 39011762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 AAATGGATAATAAAGGGTAAAAGAAATCTTTATACATTAGATACACACACACTGGAGTAT 7800

 39011763 ATATGAGTTAAATGAGCTGATGTGTAGGATTTGCTTTAAAATAATACAGCAGGCCGGGCG 39011822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 ATATGAGTTAAATGAGCTGATGTGTAGGATTTGCTTTAAAATAATACAGCAGGCCGGGCG 7860

 39011823 CAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGT 39011882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 CAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGT 7920

 39011883 CAGGAAATCCAGACCGTCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA 39011942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 CAGGAAATCCAGACCGTCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA 7980

 39011943 AAAATTAGCAGGGCGTGGGGGCGGGCACCTGTTGTCCCAGCCACTCGGGAGGCTGAGGCA 39012002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 AAAATTAGCAGGGCGTGGGGGCGGGCACCTGTTGTCCCAGCCACTCGGGAGGCTGAGGCA 8040

 39012003 GGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTTCAATGAGCCGAGATCGCGCCACTGCAC 39012062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 GGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTTCAATGAGCCGAGATCGCGCCACTGCAC 8100

 39012063 TCCAGCCTGGGGGACAGAGCGAGACTCAGTCTCAAGATAAAATAAAATAAAATAGCAAAG 39012122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 TCCAGCCTGGGGGACAGAGCGAGACTCAGTCTCAAGATAAAATAAAATAAAATAGCAAAG 8160

 39012123 AAAATTTGCATGGGAGATCACAAATACAAGAATAGCAAAACATTGATACTTGCTTAAATT 39012182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 AAAATTTGCATGGGAGATCACAAATACAAGAATAGCAAAACATTGATACTTGCTTAAATT 8220

 39012183 AGATGGTGAGTACTCAAGATTCCATATATAATACTTTCTATGTTTGTATGCAACTGAAAG 39012242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 AGATGGTGAGTACTCAAGATTCCATATATAATACTTTCTATGTTTGTATGCAACTGAAAG 8280

 39012243 TTTTACTTTTTAAACAAAAAGAATACATTGCTTCTGGGGGTAGTGAGGTCCCTGCTTTAG 39012302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 TTTTACTTTTTAAACAAAAAGAATACATTGCTTCTGGGGGTAGTGAGGTCCCTGCTTTAG 8340

 39012303 ATATGTTCACACAAAGACTGGATCTCCACCTGAAAAGAATATTATTGCATAGTATACACA 39012362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 ATATGTTCACACAAAGACTGGATCTCCACCTGAAAAGAATATTATTGCATAGTATACACA 8400

 39012363 ATGTTGGATCTTTATTTTTATTTATTTATTTTGAGACGGAGTCTCACTCTTTTGCCCAAG 39012422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 ATGTTGGATCTTTATTTTTATTTATTTATTTTGAGACGGAGTCTCACTCTTTTGCCCAAG 8460

 39012423 CCGGACTGCAGTGGCGCTATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCAT 39012482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 CCGGACTGCAGTGGCGCTATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACGCCAT 8520

 39012483 TCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGACTGCAGGTGCCCGCCACCGCGCCCGGCTA 39012542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 TCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGACTGCAGGTGCCCGCCACCGCGCCCGGCTA 8580

 39012543 ATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCT 39012602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 ATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCT 8640

 39012603 CCTGACCTCGTAATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTCTGATTACAGGCGTGAGCC 39012662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 CCTGACCTCGTAATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTCTGATTACAGGCGTGAGCC 8700

 39012663 ACCGCACACTGCCAGTGTTGTATCTTTCTAAGATTCTGACTCTGGAAAGGAAGTTAGAAA 39012722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 ACCGCACACTGCCAGTGTTGTATCTTTCTAAGATTCTGACTCTGGAAAGGAAGTTAGAAA 8760

 39012723 AACAATGTAAAGTAATTCAGAGGAGATGACCTTTACCCAGCCTTTCATTCCTGACAGCTT 39012782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 AACAATGTAAAGTAATTCAGAGGAGATGACCTTTACCCAGCCTTTCATTCCTGACAGCTT 8820

 39012783 TTTGCTGCCTGCTCCTCATGTCTCCTGCTTGCTACCCTCTTTTGCTCTCCGGATCACCTG 39012842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 TTTGCTGCCTGCTCCTCATGTCTCCTGCTTGCTACCCTCTTTTGCTCTCCGGATCACCTG 8880

 39012843 TCACTTCCCTGGGGATTTGGCTGCTTTCAAGGTCAACTATTGCACAACAGAAACTTACAT 39012902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 TCACTTCCCTGGGGATTTGGCTGCTTTCAAGGTCAACTATTGCACAACAGAAACTTACAT 8940

 39012903 AGTAAGCCCTGTAGCTAAGAAACCAAAGCTGTCAAATAGCCTTCAACTGATGACTCTCTC 39012962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 AGTAAGCCCTGTAGCTAAGAAACCAAAGCTGTCAAATAGCCTTCAACTGATGACTCTCTC 9000

 39012963 AAACTTGAAACATTCACTTCACACATAAAAAATAGATCATTCTTTGAACACAGAATCAAA 39013022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 AAACTTGAAACATTCACTTCACACATAAAAAATAGATCATTCTTTGAACACAGAATCAAA 9060

 39013023 ATATTTCACTTTCCTTAAAGATACTTTATGAAATCTACCACCAGTTAATCATGAGACGTC 39013082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 ATATTTCACTTTCCTTAAAGATACTTTATGAAATCTACCACCAGTTAATCATGAGACGTC 9120

 39013083 TCAAATGGAGTGCAAGTACTATCAAATGTGAATACTTGAGAGAATTTTCCTGAGGAAGCT 39013142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 TCAAATGGAGTGCAAGTACTATCAAATGTGAATACTTGAGAGAATTTTCCTGAGGAAGCT 9180

 39013143 GGTTGAGTACCATGTTAGCCCATCTGTAAGTGACAACCTGAATGTATAAATAGATGAAAG 39013202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 GGTTGAGTACCATGTTAGCCCATCTGTAAGTGACAACCTGAATGTATAAATAGATGAAAG 9240

 39013203 TGATGGTGATTCACCAGGCCAGGCACTGTGGTTCACGCTTATAATCCCAGCACTTTGGGA 39013262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 TGATGGTGATTCACCAGGCCAGGCACTGTGGTTCACGCTTATAATCCCAGCACTTTGGGA 9300

 39013263 GGTCAAGTCAGGGGACCACTTGGGGCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGACAACATGGTAA 39013322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9301 GGTCAAGTCAGGGGACCACTTGGGGCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGACAACATGGTAA 9360

 39013323 AACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGTGGCACACATATGTAGTCC 39013382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9361 AACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGTGGCACACATATGTAGTCC 9420

 39013383 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCACAAGAATGGCTTGAACCCTGGAGGCGGAGGTTGCGGT 39013442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9421 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCACAAGAATGGCTTGAACCCTGGAGGCGGAGGTTGCGGT 9480

 39013443 GAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAAAGCGAGATTCTGTCAAAAAA 39013502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9481 GAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAAAGCGAGATTCTGTCAAAAAA 9540

 39013503 AAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAAGGAAAGAAAAAAAAAGAAAGTGACTCACCAGA 39013562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9541 AAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAAGGAAAGAAAAAAAAAGAAAGTGACTCACCAGA 9600

 39013563 TATTTCAGTTTCTTAGGCACATGGTAGTATTGTACTTCCTGGTCCTCATGTGGTTGGGTA 39013622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9601 TATTTCAGTTTCTTAGGCACATGGTAGTATTGTACTTCCTGGTCCTCATGTGGTTGGGTA 9660

 39013623 TGGTCACATAATTCTAGCTAATGGATTGTGAGTAAAGCATTTAATTGTCAAGG 39013675
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9661 TGGTCACATAATTCTAGCTAATGGATTGTGAGTAAAGCATTTAATTGTCAAGG 9713

Alignment time is 6.31236 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3976] =>      3976 nucs 'mol-32-3143-060289_3976'

Score:        3976
Aligned:      3976        nucs
Identic:      3976 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004780,39008755]
 second seq =>  [       1,    3976]

 39004780 TACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTA 39004839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTA 60

 39004840 GATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTAC 39004899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTAC 120

 39004900 CCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTG 39004959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTG 180

 39004960 AAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAA 39005019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAA 240

 39005020 GGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTG 39005079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTG 300

 39005080 ATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCAC 39005139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCAC 360

 39005140 AGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAG 39005199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAG 420

 39005200 GTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACC 39005259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACC 480

 39005260 AAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCA 39005319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCA 540

 39005320 GTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATA 39005379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATA 600

 39005380 GCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAA 39005439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAA 660

 39005440 GGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGAT 39005499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGAT 720

 39005500 GAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAA 39005559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAA 780

 39005560 ATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTA 39005619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTA 840

 39005620 CTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAAC 39005679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAAC 900

 39005680 TATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCT 39005739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCT 960

 39005740 CACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACA 39005799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACA 1020

 39005800 TTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGT 39005859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGT 1080

 39005860 TAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGC 39005919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGC 1140

 39005920 AGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCT 39005979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCT 1200

 39005980 TTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTA 39006039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTA 1260

 39006040 GTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCA 39006099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCA 1320

 39006100 TTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTT 39006159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTT 1380

 39006160 AAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCA 39006219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCA 1440

 39006220 CTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAAT 39006279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAAT 1500

 39006280 GTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCAT 39006339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCAT 1560

 39006340 TTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGA 39006399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGA 1620

 39006400 ATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCT 39006459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCT 1680

 39006460 TTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAA 39006519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAA 1740

 39006520 AAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGA 39006579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGA 1800

 39006580 GAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGG 39006639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGG 1860

 39006640 CACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTC 39006699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTC 1920

 39006700 AGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCA 39006759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCA 1980

 39006760 TATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCC 39006819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCC 2040

 39006820 AATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATA 39006879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATA 2100

 39006880 ATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCT 39006939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCT 2160

 39006940 AGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACT 39006999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACT 2220

 39007000 ATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAG 39007059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAG 2280

 39007060 GTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAG 39007119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAG 2340

 39007120 ACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGT 39007179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGT 2400

 39007180 CCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTC 39007239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTC 2460

 39007240 AAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTG 39007299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTG 2520

 39007300 ACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCA 39007359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCA 2580

 39007360 AAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGT 39007419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGT 2640

 39007420 CCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGC 39007479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGC 2700

 39007480 CCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCT 39007539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCT 2760

 39007540 TTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGA 39007599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGA 2820

 39007600 GTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTA 39007659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTA 2880

 39007660 GTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATA 39007719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATA 2940

 39007720 TTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAA 39007779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAA 3000

 39007780 CTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATA 39007839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATA 3060

 39007840 AAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATG 39007899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATG 3120

 39007900 ATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAA 39007959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAA 3180

 39007960 GGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAA 39008019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAA 3240

 39008020 GCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGAT 39008079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGAT 3300

 39008080 AGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTG 39008139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTG 3360

 39008140 TCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAA 39008199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAA 3420

 39008200 AGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTT 39008259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTT 3480

 39008260 GGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTA 39008319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTA 3540

 39008320 AACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAA 39008379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAA 3600

 39008380 TACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAA 39008439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAA 3660

 39008440 AATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCT 39008499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCT 3720

 39008500 CAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGG 39008559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGG 3780

 39008560 CTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGT 39008619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGT 3840

 39008620 TCCAATGAGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGA 39008679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCCAATGAGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGA 3900

 39008680 AAATGAGAAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAG 39008739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAATGAGAAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAG 3960

 39008740 TATTATTAATTTGATT 39008755
          ||||||||||||||||
     3961 TATTATTAATTTGATT 3976

Alignment time is 2.53222 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    9395] =>      9395 nucs 'mol-32-316f-213193_9395'

Score:        9352
Aligned:      9396        nucs
Identic:      9392 (100%) nucs =>      4508 (100%)      4884 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38996954,39001464] EXCISED REGION [39001467,39006351]
 second seq =>  [       1,    4510] EXCISED REGION [    4511,    9395]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [39001465,39001466]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [39001465,39001473] to [39001467,39001475]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39001465,39001465] to [39001466,39001466]
 second seq =>         0 nucs

 38996954 AAAATGGACCAGGTAGTTGGTGGAAACACAAGCCAAGACTTAGTATGTCTATGTCTGTTT 38997013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAATGGACCAGGTAGTTGGTGGAAACACAAGCCAAGACTTAGTATGTCTATGTCTGTTT 60

 38997014 AGCACAGAACTAGAAGATATAAAAGATATTTAGACTTCCAGTTTGGGGTCCAATATGTAA 38997073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCACAGAACTAGAAGATATAAAAGATATTTAGACTTCCAGTTTGGGGTCCAATATGTAA 120

 38997074 AATGTTTGTAAATTATCATTTCCATCCTTATGACAAGAAAATGATGGGGGAAAAAAAAAC 38997133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGTTTGTAAATTATCATTTCCATCCTTATGACAAGAAAATGATGGGGGAAAAAAAAAC 180

 38997134 AAAACAGAAATTCAGTGACTTTTCTTGGACCCACTGGATAACTGAGGTCACAGGAGATCT 38997193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAACAGAAATTCAGTGACTTTTCTTGGACCCACTGGATAACTGAGGTCACAGGAGATCT 240

 38997194 AGGCAGATCCAGAGAGATGCAAGTGAGAGCTGCTCACCTGGACCAGAAGCCACTGGGGCC 38997253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCAGATCCAGAGAGATGCAAGTGAGAGCTGCTCACCTGGACCAGAAGCCACTGGGGCC 300

 38997254 ATAAACTGGTAGGAAAACTTAAATGGTAATTTTGATATATTTCTGGAGGATGAGTGTGGA 38997313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAACTGGTAGGAAAACTTAAATGGTAATTTTGATATATTTCTGGAGGATGAGTGTGGA 360

 38997314 CTAGCTTGAGAGTGAGAATATCCTGGGGACTGCAAGTCTTAAAGAGCCCTTTCATGGGTT 38997373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      361 CTAGCTTGAGAGTGAGAATATCCTGGGGACTGCAAGTCTTAAAGAGCCCTTTCACGGGTT 420

 38997374 CTGCCTCTAGGAATGCTACCAGGTTCTCATGGTCAAGAGCCAAGAAAGATCACCTTCTGG 38997433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGCCTCTAGGAATGCTACCAGGTTCTCATGGTCAAGAGCCAAGAAAGATCACCTTCTGG 480

 38997434 CTATAGCAAGGGGAAGGGAAGAGTAACCATTGCAAAATACGCCTACACGTTCTATATAAC 38997493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATAGCAAGGGGAAGGGAAGAGTAACCATTGCAAAATACGCCTACACGTTCTATATAAC 540

 38997494 AAAGACCTACTCACCAGAGGGAAAGACTTTGCCAGAGGCTTATCTCATCTAGAATAAGGG 38997553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGACCTACTCACCAGAGGGAAAGACTTTGCCAGAGGCTTATCTCATCTAGAATAAGGG 600

 38997554 CATTTTCTCCCACTACAGCACCCTCTAGCATTTATCTCACTTAAGGGAGTGGGTAGTGGG 38997613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTTTCTCCCACTACAGCACCCTCTAGCATTTATCTCACTTAAGGGAGTGGGTAGTGGG 660

 38997614 TGAGCTAAGAAACCCTCGAGAAGGTCACAGTCCAGAGATACCTGCCCACTAAAAGATTGA 38997673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGCTAAGAAACCCTCGAGAAGGTCACAGTCCAGAGATACCTGCCCACTAAAAGATTGA 720

 38997674 GATTTAAAGATAAGATAATGGCAAACTTCCTCTCCCCCATAATTTACCACCACAATGAAA 38997733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTAAAGATAAGATAATGGCAAACTTCCTCTCCCCCATAATTTACCACCACAATGAAA 780

 38997734 GGGCTCCAGTAAAGCAACAGGGGATTCAGCTGAAAGAGGTGCAAGAATCAGACTCTTTTT 38997793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGCTCCAGTAAAGCAACAGGGGATTCAGCTGAAAGAGGTGCAAGAATCAGACTCTTTTT 840

 38997794 AAGGAGTAATTTTTAGGAAAAACAAAAGACAACAGGAGAGACAAAAACAAGGATGCCAGA 38997853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGGAGTAATTTTTAGGAAAAACAAAAGACAACAGGAGAGACAAAAACAAGGATGCCAGA 900

 38997854 AAAGTTGAAGCCTCTGGTACCTACAGCTACAACAAATATCAACACAGTTCAATTACTAGC 38997913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAGTTGAAGCCTCTGGTACCTACAGCTACAACAAATATCAACACAGTTCAATTACTAGC 960

 38997914 CAAATTGGCAGAAAAAACTCATACTAAAGGTTCATTTCCCTTAGTTCCCATTACCCAATA 38997973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAATTGGCAGAAAAAACTCATACTAAAGGTTCATTTCCCTTAGTTCCCATTACCCAATA 1020

 38997974 TATCATGGCCAGATTTCAACAACCACATTACAAGGTGTGCTAAAACACACACACACACAC 38998033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATCATGGCCAGATTTCAACAACCACATTACAAGGTGTGCTAAAACACACACACACACAC 1080

 38998034 AAAAACATGCTGTGAAGAAACAAAGCAAACATCAGAATCAGATTCAAATGTGAAACAGAT 38998093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAACATGCTGTGAAGAAACAAAGCAAACATCAGAATCAGATTCAAATGTGAAACAGAT 1140

 38998094 GTTGGTACTATCAGGCCTGAAATTTTAAATAATTATGATTATGATTAATATGCTTAGATC 38998153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTGGTACTATCAGGCCTGAAATTTTAAATAATTATGATTATGATTAATATGCTTAGATC 1200

 38998154 TCTAACAGGTAAAAGTAGACAACATGCAAGAACAGAAGTGATATATAAGCAGAGAGATGA 38998213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTAACAGGTAAAAGTAGACAACATGCAAGAACAGAAGTGATATATAAGCAGAGAGATGA 1260

 38998214 AAACATTAAGACAAATAAAAAGGAAACACTAGAAATTGAAAACACTGTAACAAAAGTTAA 38998273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAACATTAAGACAAATAAAAAGGAAACACTAGAAATTGAAAACACTGTAACAAAAGTTAA 1320

 38998274 AGAATGCCTTCAATGGGCTCATCAGCAGATTGGACATGGCTAAACAATCAGTGAGACTAA 38998333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAATGCCTTCAATGGGCTCATCAGCAGATTGGACATGGCTAAACAATCAGTGAGACTAA 1380

 38998334 AGACACATCAATAGAAACTCCAAAACTGAGAAGCAAAGAGAAAGGAGAATTTAAAAAGAA 38998393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGACACATCAATAGAAACTCCAAAACTGAGAAGCAAAGAGAAAGGAGAATTTAAAAAGAA 1440

 38998394 AATAGAATACAACACTCAAGAACTGTCAGATAGTTTTAAGAGGTATAACTTACACATAAT 38998453
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1441 AATAGAATACAACACTCAAGAACTGTCAGATAGTTTTAAAAGGTATAACTTACACATAAT 1500

 38998454 TGAAACACCAGAAGGAAAAGAAGGAGAAAACAGAGCAGGAGAAATATTTGGAGTAATAAT 38998513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAAACACCAGAAGGAAAAGAAGGAGAAAACAGAGCAGGAGAAATATTTGGAGTAATAAT 1560

 38998514 GGCTGAGAATTGTCCAAAATTAATGACACCAAACCACAGATCCAGGAAGCTAACACCAAG 38998573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGCTGAGAATTGTCCAAAATTAATGACACCAAACCACAGATCCAGGAAGCTAACACCAAG 1620

 38998574 CAGGGAACACCAAACAGAATACCAAGAAATATATTATTTGGTATATTATATATAAACTGT 38998633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGGGAACACCAAACAGAATACCAAGAAATATATTATTTGGTATATTATATATAAACTGT 1680

 38998634 TAAAAACCAAGGACACAGGGAAAATCATGAAAGAAGCCATAGGGGTAAAAGAAAAGTACC 38998693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAAAACCAAGGACACAGGGAAAATCATGAAAGAAGCCATAGGGGTAAAAGAAAAGTACC 1740

 38998694 TTACCTATGGAGGAAGAAGGGTGAGAATGACAGTGGACTTCTCAGTGGACACCATGCAAG 38998753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTACCTATGGAGGAAGAAGGGTGAGAATGACAGTGGACTTCTCAGTGGACACCATGCAAG 1800

 38998754 CAAAGAGAGTGACATGAAATACTGAGGGTTGAAAGGAAAAAAATCCACTAATCTAGAAAT 38998813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAAGAGAGTGACATGAAATACTGAGGGTTGAAAGGAAAAAAATCCACTAATCTAGAAAT 1860

 38998814 TTATGTCCAGCAAAAATATCCTCCATAAGTAAGGGTGAAATAACAACCAAGAATAATGAG 38998873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATGTCCAGCAAAAATATCCTCCATAAGTAAGGGTGAAATAACAACCAAGAATAATGAG 1920

 38998874 CATAAGGTATTGTTCCTGCTATTGTAGTGGCTTTTAGCTCCACTCACCCTCAAAAGACAA 38998933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATAAGGTATTGTTCCTGCTATTGTAGTGGCTTTTAGCTCCACTCACCCTCAAAAGACAA 1980

 38998934 AACCAAGGGACTATAAGCTGGTTCCAGTAAGCTGATCATCCTTACTGGAAACATGAGGAA 38998993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACCAAGGGACTATAAGCTGGTTCCAGTAAGCTGATCATCCTTACTGGAAACATGAGGAA 2040

 38998994 GAGGGAGTGACAGAGATCTGGGCTGCATTAGGAAAGACAGTCCCTAAAATTGAAATGTCA 38999053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGGGAGTGACAGAGATCTGGGCTGCATTAGGAAAGACAGTCCCTAAAATTGAAATGTCA 2100

 38999054 AAATAATAGGATTGTTGGTGGGGTGGGGGGTTAATGCAAGGATAGACATAAAGTGTGCTG 38999113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATAATAGGATTGTTGGTGGGGTGGGGGGTTAATGCAAGGATAGACATAAAGTGTGCTG 2160

 38999114 AATAGTGAGTTTTCAATATGCAACGGGTTGCTTTTATTACTAAACCTCATATCTTTTGTG 38999173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATAGTGAGTTTTCAATATGCAACGGGTTGCTTTTATTACTAAACCTCATATCTTTTGTG 2220

 38999174 GCCTCATGGTGTTTCTCCCTAAAATAGCCAACCACATGCTAAGCACCAATTGTACCTAAC 38999233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCCTCATGGTGTTTCTCCCTAAAATAGCCAACCACATGCTAAGCACCAATTGTACCTAAC 2280

 38999234 CCCTCTCGCCTCAAGGAATTTAAAATCTATAGACATTCAGAGAAATACATTAATAATAGT 38999293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCCTCTCGCCTCAAGGAATTTAAAATCTATAGACATTCAGAGAAATACATTAATAATAGT 2340

 38999294 AAAATATCATATAGCAGTAGAAACAAACGCTAAATTATGAGCTACAGGCAATAATCTTTC 38999353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAATATCATATAGCAGTAGAAACAAACGCTAAATTATGAGCTACAGGCAATAATCTTTC 2400

 38999354 AGTCAAGTCTAATCAAGAAATATTTATTGAGCTTGTTATGTACTTAATGTGTTTCCCAAA 38999413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTCAAGTCTAATCAAGAAATATTTATTGAGCTTGTTATGTACTTAATGTGTTTCCCAAA 2460

 38999414 AATTCATATGTTGACATGCTAACCCCCAATGTGATTATATTTGGAGGTGAGACCTTTGGG 38999473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTCATATGTTGACATGCTAACCCCCAATGTGATTATATTTGGAGGTGAGACCTTTGGG 2520

 38999474 AGATGATTAGAGTGATATAAAAATCATAAGGGTAGGTTCTAATATGAGATTAATGTCCTC 38999533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGATGATTAGAGTGATATAAAAATCATAAGGGTAGGTTCTAATATGAGATTAATGTCCTC 2580

 38999534 ATAATAAGAGGAAGAAAAAGATCCCTATCTCTTCCCCCTGAGCACTTGTACTGAGGAAAA 38999593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATAATAAGAGGAAGAAAAAGATCCCTATCTCTTCCCCCTGAGCACTTGTACTGAGGAAAA 2640

 38999594 AAGCCTTTTGTGAACAGGTGATAAAGCAGCTTTCTTCAGGCTAAGGAAAGAGGCCTCCCC 38999653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     2641 AAGCCTTTTGTGAACAGGTGATAAAGCAGCTTTCTTCAGGCTAAGGAA-GAGGCCTCCCC 2699

 38999654 AGGAACCAAATGGTTCGACAGCTTCATCTTGGACTTCCCAGCCTTAAGAACTGTGAGAAA 38999713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AGGAACCAAATGGTTCGACAGCTTCATCTTGGACTTCCCAGCCTTAAGAACTGTGAGAAA 2759

 38999714 ATAAATTTCTGTTAAGCCACCCAGTCTGTGCTATTTTGTTATGGCAGCTGAAGCAGACTA 38999773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATAAATTTCTGTTAAGCCACCCAGTCTGTGCTATTTTGTTATGGCAGCTGAAGCAGACTA 2819

 38999774 AGACAGAGCTTTCACTCTGTGTCAGACACTCTTGTAATCTCCAGAAATTTGCATTTAAGG 38999833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AGACAGAGCTTTCACTCTGTGTCAGACACTCTTGTAATCTCCAGAAATTTGCATTTAAGG 2879

 38999834 AGTGGAAACAAAAATAAGATAAAGATAGAAGAAAGTTATATATATATATATATATATATA 38999893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AGTGGAAACAAAAATAAGATAAAGATAGAAGAAAGTTATATATATATATATATATATATA 2939

 38999894 TCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGATGATAGAC 38999953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATGTGATTGATGATAGATGATAGAC 2999

 38999954 AAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGTTGAGA 39000013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGTTGAGA 3059

 39000014 TCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAAGGGAA 39000073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAAGGGAA 3119

 39000074 CAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGCAAAGG 39000133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGCAAAGG 3179

 39000134 CCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAGCTTGG 39000193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAGCTTGG 3239

 39000194 CAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACATTCCAA 39000253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACATTCCAA 3299

 39000254 ACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCTAATGA 39000313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCTAATGA 3359

 39000314 GACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCA 39000373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCA 3419

 39000374 AAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTC 39000433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTC 3479

 39000434 TTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAG 39000493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAG 3539

 39000494 ACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTC 39000553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 ACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTC 3599

 39000554 AAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGT 39000613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGT 3659

 39000614 AGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACA 39000673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACA 3719

 39000674 TCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCT 39000733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCT 3779

 39000734 CTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGT 39000793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGT 3839

 39000794 TCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGA 39000853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGA 3899

 39000854 GATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGT 39000913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGT 3959

 39000914 ACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGC 39000973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 ACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGC 4019

 39000974 TGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGC 39001033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGC 4079

 39001034 AGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAG 39001093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAG 4139

 39001094 CCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGC 39001153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGC 4199

 39001154 AATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATT 39001213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATT 4259

 39001214 ATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAAC 39001273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 ATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAAC 4319

 39001274 AGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGT 39001333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 AGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGT 4379

 39001334 GGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAG 39001393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAG 4439

 39001394 TCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCA 39001453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCA 4499

 39001454 GTCAGGTTTTA 39001464
          |||||||||||
     4500 GTCAGGTTTTA 4510

EXCISED REGION

 39001467 TTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAA 39001526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 TTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAA 4570

 39001527 TCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGG 39001586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 TCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGG 4630

 39001587 TTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGT 39001646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 TTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGT 4690

 39001647 TGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACAT 39001706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 TGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACAT 4750

 39001707 ATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATG 39001766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 ATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATG 4810

 39001767 ACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGAT 39001826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 ACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGAT 4870

 39001827 GTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCC 39001886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 GTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCC 4930

 39001887 CAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAAT 39001946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 CAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAAT 4990

 39001947 GTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGG 39002006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 GTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGG 5050

 39002007 TTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCT 39002066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 TTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCT 5110

 39002067 GACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTC 39002126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 GACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTC 5170

 39002127 AGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAG 39002186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 AGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAG 5230

 39002187 GGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGA 39002246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 GGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGA 5290

 39002247 TAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTAC 39002306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 TAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTAC 5350

 39002307 CGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCA 39002366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5351 CGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCA 5410

 39002367 ATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCA 39002426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5411 ATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCA 5470

 39002427 CTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGT 39002486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5471 CTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGT 5530

 39002487 AAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGAT 39002546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5531 AAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGAT 5590

 39002547 AATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCC 39002606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5591 AATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCC 5650

 39002607 TAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCA 39002666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5651 TAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCA 5710

 39002667 TTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACG 39002726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5711 TTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACG 5770

 39002727 TGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAA 39002786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5771 TGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAA 5830

 39002787 CAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAA 39002846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5831 CAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAA 5890

 39002847 CAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATC 39002906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5891 CAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATC 5950

 39002907 TCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACC 39002966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5951 TCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACC 6010

 39002967 TGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCC 39003026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6011 TGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCC 6070

 39003027 TATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCT 39003086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6071 TATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCT 6130

 39003087 TCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTC 39003146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6131 TCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTC 6190

 39003147 TTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAG 39003206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6191 TTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAG 6250

 39003207 CTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAA 39003266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6251 CTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAA 6310

 39003267 AGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTA 39003326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6311 AGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTA 6370

 39003327 TGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTG 39003386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6371 TGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTG 6430

 39003387 CAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAG 39003446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6431 CAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAG 6490

 39003447 ATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTT 39003506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6491 ATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTT 6550

 39003507 CAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTA 39003566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6551 CAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTA 6610

 39003567 ATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGC 39003626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6611 ATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGC 6670

 39003627 CCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAA 39003686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6671 CCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAA 6730

 39003687 GCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCT 39003746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6731 GCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCT 6790

 39003747 GGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCG 39003806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6791 GGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCG 6850

 39003807 AACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTG 39003866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6851 AACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTG 6910

 39003867 TGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAA 39003926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6911 TGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAA 6970

 39003927 TTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTT 39003986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6971 TTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTT 7030

 39003987 ATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAA 39004046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7031 ATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAA 7090

 39004047 CTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTA 39004106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7091 CTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTA 7150

 39004107 TATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTC 39004166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7151 TATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTC 7210

 39004167 TTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTA 39004226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7211 TTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTA 7270

 39004227 AAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTA 39004286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7271 AAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTA 7330

 39004287 GGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACAT 39004346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7331 GGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACAT 7390

 39004347 TTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACAT 39004406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7391 TTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACAT 7450

 39004407 AAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAA 39004466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7451 AAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAA 7510

 39004467 ACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCA 39004526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7511 ACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCA 7570

 39004527 AAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAG 39004586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7571 AAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAG 7630

 39004587 AAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAA 39004646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7631 AAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAA 7690

 39004647 ATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAA 39004706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7691 ATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAA 7750

 39004707 GGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGT 39004766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7751 GGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGT 7810

 39004767 CTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAAT 39004826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7811 CTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAAT 7870

 39004827 GAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCC 39004886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7871 GAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCC 7930

 39004887 CAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATG 39004946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7931 CAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATG 7990

 39004947 TTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATG 39005006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7991 TTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATG 8050

 39005007 ATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATG 39005066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8051 ATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATG 8110

 39005067 CAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAA 39005126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8111 CAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAA 8170

 39005127 TCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTG 39005186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8171 TCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTG 8230

 39005187 GCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGA 39005246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8231 GCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGA 8290

 39005247 TAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATC 39005306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8291 TAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATC 8350

 39005307 TTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAA 39005366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8351 TTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAA 8410

 39005367 GGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGT 39005426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8411 GGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGT 8470

 39005427 TTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAAT 39005486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8471 TTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAAT 8530

 39005487 AAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGA 39005546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8531 AAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGA 8590

 39005547 GATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGT 39005606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     8591 GATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTCAAGTCTGAAATAAATATGT 8650

 39005607 AATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTG 39005666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8651 AATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTG 8710

 39005667 ATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTG 39005726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8711 ATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTG 8770

 39005727 AATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTG 39005786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8771 AATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTG 8830

 39005787 ACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAAC 39005846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8831 ACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAAC 8890

 39005847 TTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATA 39005906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8891 TTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATA 8950

 39005907 CTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAA 39005966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8951 CTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAA 9010

 39005967 TTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGA 39006026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9011 TTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGA 9070

 39006027 GTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCT 39006086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9071 GTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCT 9130

 39006087 AAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTG 39006146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9131 AAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTG 9190

 39006147 GAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTT 39006206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9191 GAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTT 9250

 39006207 AGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAA 39006266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9251 AGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAA 9310

 39006267 ATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGC 39006326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9311 ATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGC 9370

 39006327 AAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGA 39006351
          |||||||||||||||||||||||||
     9371 AAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGA 9395

Alignment time is 6.8077 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4396] =>      4396 nucs 'mol-32-317a-146921_4396'

Score:        4246
Aligned:      4399        nucs
Identic:      4372 ( 99%) nucs =>      3388 ( 99%)       984 (100%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39001122,39004518] EXCISED REGION [39005028,39006013]
 second seq =>  [       1,    3410] EXCISED REGION [    3411,    4396]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39001122 AGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGA 39001181
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGTAATGCCTTGACCAAACACGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGA 60

 39001182 CTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAA 39001241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAA 120

 39001242 AATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGA 39001301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGA 180

 39001302 TGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACG 39001361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACG 240

 39001362 ACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGC 39001421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGC 300

 39001422 AATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAG 39001481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      301 AATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTGTTAAG 360

 39001482 GTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAA 39001541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAA 420

 39001542 GTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCT 39001601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCT 480

 39001602 AGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTA 39001661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTA 540

 39001662 TTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAAT 39001721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAAT 600

 39001722 ACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTAT 39001781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTAT 660

 39001782 CCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGT 39001841
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACCCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGT 720

 39001842 GATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCA 39001901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCA 780

 39001902 CTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTG 39001961
          |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAAAAAAAAAAA--CAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTG 838

 39001962 CTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAAC 39002021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAAC 898

 39002022 CATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAAT 39002081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAAT 958

 39002082 ACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCA 39002141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 ACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCA 1018

 39002142 TTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCA 39002201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCA 1078

 39002202 TTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGC 39002261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGC 1138

 39002262 TTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGT 39002321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGT 1198

 39002322 TTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAG 39002381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAG 1258

 39002382 TGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGC 39002441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGC 1318

 39002442 TTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAA 39002501
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAA 1378

 39002502 TCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCA 39002561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCA 1438

 39002562 CATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCAC 39002621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCAC 1498

 39002622 ACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCT 39002681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 ACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCT 1558

 39002682 AATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAA 39002741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1559 AATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTGTGTAA 1618

 39002742 CAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCT 39002801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCT 1678

 39002802 AGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCA 39002861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCA 1738

 39002862 AAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAA 39002921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAA 1798

 39002922 CGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGT 39002981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGT 1858

 39002982 TCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATG 39003041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATG 1918

 39003042 GGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTT 39003101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTT 1978

 39003102 TGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGT 39003161
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1979 TGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGCCTGT 2038

 39003162 ACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCT 39003221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCT 2098

 39003222 TTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTA 39003281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTA 2158

 39003282 CGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAG 39003341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAG 2218

 39003342 AAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGC 39003401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGC 2278

 39003402 CAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGC 39003461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGC 2338

 39003462 CTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTA 39003521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTA 2398

 39003522 TAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATT 39003581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATT 2458

 39003582 TATTTATTTATTTATTTAT----------------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAG 39003625
          |||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||
     2459 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAG 2518

 39003626 CCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCA 39003685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCA 2578

 39003686 AGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACC 39003745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACC 2638

 39003746 TGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTC 39003805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTC 2698

 39003806 GAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGT 39003865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGT 2758

 39003866 GTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTA 39003925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTA 2818

 39003926 ATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATT 39003985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATT 2878

 39003986 TATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAA 39004045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAA 2938

 39004046 ACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTT 39004105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTT 2998

 39004106 ATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTT 39004165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTT 3058

 39004166 CTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTT 39004225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTT 3118

 39004226 AAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGT 39004285
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AAAAAAATATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGT 3177

 39004286 AGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACA 39004345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACA 3237

 39004346 TTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACA 39004405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACA 3297

 39004406 TAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGA 39004465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGA 3357

 39004466 AACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 AACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 3410

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 3470

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 3530

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 3590

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 3650

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 3710

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 3770

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 3830

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 3890

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 3950

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CAGATAACTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 4010

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 4070

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 4130

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 4190

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 4250

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 4310

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 4370

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAG 39006013
          ||||||||||||||||||||||||||
     4371 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAG 4396

Alignment time is 3.245 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    2502] =>      2502 nucs 'mol-32-3185-257612_2502'

Score:        2470
Aligned:      2503        nucs
Identic:      2500 (100%) nucs =>       337 (100%)      2163 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004181,39004518] EXCISED REGION [39005028,39007192]
 second seq =>  [       1,     337] EXCISED REGION [     338,    2502]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39004181 ATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGA 39004240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGA 60

 39004241 CACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATT 39004300
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATT 119

 39004301 CCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTAT 39004360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 CCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTAT 179

 39004361 GTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAG 39004420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 GTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAG 239

 39004421 TTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGT 39004480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGT 299

 39004481 AGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 337

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      338 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 397

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 457

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 517

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 577

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 637

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 697

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 757

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 817

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 877

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 937

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 997

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 1057

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 1117

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 1177

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 1237

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 1297

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 1357

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 1417

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 1477

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 1537

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 1597

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 1657

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 1717

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 1777

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 1837

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 1897

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 1957

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 2017

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 2077

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 2137

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 2197

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 2257

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 2317

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 2377

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 2437

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 2497

 39007188 AGGCC 39007192
          |||||
     2498 AGGCC 2502

Alignment time is 1.8439 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4942] =>      4942 nucs 'mol-32-321f-281058_4942'

Score:        4942
Aligned:      4942        nucs
Identic:      4942 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004371,39009312]
 second seq =>  [       1,    4942]

 39004371 CAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCA 39004430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCA 60

 39004431 GTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATA 39004490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATA 120

 39004491 TTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACA 39004550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACA 180

 39004551 AGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTC 39004610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTC 240

 39004611 TGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTA 39004670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTA 300

 39004671 TGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTT 39004730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTT 360

 39004731 ATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTAT 39004790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTAT 420

 39004791 CTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGA 39004850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGA 480

 39004851 TGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATG 39004910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATG 540

 39004911 AGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATT 39004970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATT 600

 39004971 CTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAA 39005030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAA 660

 39005031 AATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTG 39005090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTG 720

 39005091 ATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTA 39005150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTA 780

 39005151 ATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTG 39005210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTG 840

 39005211 GGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCC 39005270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCC 900

 39005271 ATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAG 39005330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAG 960

 39005331 GAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAAT 39005390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAAT 1020

 39005391 TGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAA 39005450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAA 1080

 39005451 AAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAG 39005510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAG 1140

 39005511 GCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAG 39005570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAG 1200

 39005571 ATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTA 39005630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTA 1260

 39005631 AGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAA 39005690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAA 1320

 39005691 TTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGG 39005750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGG 1380

 39005751 CTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGT 39005810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGT 1440

 39005811 TACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCC 39005870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCC 1500

 39005871 TTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTT 39005930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTT 1560

 39005931 CCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGC 39005990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGC 1620

 39005991 CAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCA 39006050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCA 1680

 39006051 CAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTC 39006110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTC 1740

 39006111 TGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCG 39006170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCG 1800

 39006171 AAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCT 39006230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCT 1860

 39006231 CAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCA 39006290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCA 1920

 39006291 ATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAG 39006350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAG 1980

 39006351 ATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAA 39006410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAA 2040

 39006411 ATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTT 39006470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCATTTT 2100

 39006471 TCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTT 39006530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATTGTT 2160

 39006531 TTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTG 39006590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGTGTG 2220

 39006591 ACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAG 39006650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTTGAG 2280

 39006651 GCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCC 39006710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCCTCC 2340

 39006711 TGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTA 39006770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATGCTA 2400

 39006771 TTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGA 39006830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAACAGA 2460

 39006831 AGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCA 39006890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATACCA 2520

 39006891 GTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGC 39006950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGATGC 2580

 39006951 TCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGG 39007010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTACGG 2640

 39007011 GATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAA 39007070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGCAAA 2700

 39007071 AGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATG 39007130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACATATG 2760

 39007131 AAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGG 39007190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAATAGG 2820

 39007191 CCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGG 39007250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGG 2880

 39007251 AGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTG 39007310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCACTG 2940

 39007311 GTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAG 39007370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAG 3000

 39007371 CATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTT 39007430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTT 3060

 39007431 CTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATT 39007490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAGATT 3120

 39007491 GAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACC 39007550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACCACC 3180

 39007551 CTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCA 39007610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAATCA 3240

 39007611 ATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGAC 39007670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATGGAC 3300

 39007671 AAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTC 39007730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAACTC 3360

 39007731 AGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTA 39007790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAATTA 3420

 39007791 TCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATC 39007850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTAATC 3480

 39007851 GTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGC 39007910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGCAGC 3540

 39007911 ACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCAC 39007970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTGCAC 3600

 39007971 TAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTAC 39008030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTCTAC 3660

 39008031 TATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCTA 39008090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGCCTA 3720

 39008091 CTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCATA 39008150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTCATA 3780

 39008151 AACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCTT 39008210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTTCTT 3840

 39008211 GTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCT 39008270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCT 3900

 39008271 TAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTGC 39008330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTTTGC 3960

 39008331 TTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAAG 39008390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTAAAG 4020

 39008391 GAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAGT 39008450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATACAGT 4080

 39008451 TTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCATAA 39008510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCATAA 4140

 39008511 GTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGCTCT 39008570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGCTCT 4200

 39008571 TTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGAGTC 39008630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGAGTC 4260

 39008631 AAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGAAAT 39008690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGAAAT 4320

 39008691 AAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTAATT 39008750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTAATT 4380

 39008751 TGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGCATC 39008810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGCATC 4440

 39008811 AAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAATTT 39008870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAATTT 4500

 39008871 TAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTGTAT 39008930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTGTAT 4560

 39008931 GCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAATCA 39008990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAATCA 4620

 39008991 CTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATTTCC 39009050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATTTCC 4680

 39009051 TGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTTTTT 39009110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTTTTT 4740

 39009111 GGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTTTGT 39009170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTTTGT 4800

 39009171 CCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGCCTT 39009230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGCCTT 4860

 39009231 TTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAGGTT 39009290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTAGGTT 4920

 39009291 GATACAAAAGTAATTGTGGTTT 39009312
          ||||||||||||||||||||||
     4921 GATACAAAAGTAATTGTGGTTT 4942

Alignment time is 3.17831 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3929] =>      3929 nucs 'mol-32-3235-045595_3929'

Score:        3928
Aligned:      3928        nucs
Identic:      3928 (100%) nucs =>      3912 (100%)        16 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39004711,39008622] EXCISED REGION [39008624,39008639]
 second seq =>  [       1,    3912] EXCISED REGION [    3914,    3929]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39008623,39008623]
 second seq =>         1 nucs [3913,3913]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39008623,39008623] to [39008624,39008624]
 second seq =>         2 nucs [3911,3912] to [3912,3913]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39004711 CTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTA 39004770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTA 60

 39004771 CAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAAT 39004830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAAT 120

 39004831 CATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAAC 39004890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAAC 180

 39004891 AGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGA 39004950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGA 240

 39004951 AGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTT 39005010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTT 300

 39005011 ATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAA 39005070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAA 360

 39005071 TTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAG 39005130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAG 420

 39005131 CTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTT 39005190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTT 480

 39005191 TATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGT 39005250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGT 540

 39005251 CTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTC 39005310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTC 600

 39005311 TCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGC 39005370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGC 660

 39005371 CCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTT 39005430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTT 720

 39005431 GATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAAC 39005490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAAC 780

 39005491 CTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATG 39005550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATG 840

 39005551 AACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATG 39005610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATG 900

 39005611 GAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGC 39005670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGC 960

 39005671 CTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATG 39005730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATG 1020

 39005731 CTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTA 39005790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTA 1080

 39005791 AGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCC 39005850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCC 1140

 39005851 TCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTT 39005910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTT 1200

 39005911 CCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTT 39005970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTT 1260

 39005971 ATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCA 39006030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCA 1320

 39006031 ATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAAT 39006090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAAT 1380

 39006091 TGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGG 39006150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGG 1440

 39006151 GGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCT 39006210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCT 1500

 39006211 GTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTG 39006270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTG 1560

 39006271 TCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAAC 39006330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAAC 1620

 39006331 TGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTAT 39006390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTAT 1680

 39006391 TAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCAT 39006450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCAT 1740

 39006451 TGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCT 39006510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCT 1800

 39006511 AGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGC 39006570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGC 1860

 39006571 AACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAAT 39006630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAAT 1920

 39006631 GTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAAC 39006690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAAC 1980

 39006691 TATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAA 39006750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAA 2040

 39006751 TATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTAC 39006810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTAC 2100

 39006811 TTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTA 39006870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTA 2160

 39006871 CACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTT 39006930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTT 2220

 39006931 TATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTG 39006990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTG 2280

 39006991 TCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACA 39007050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACA 2340

 39007051 GAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATA 39007110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATA 2400

 39007111 AAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACA 39007170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACA 2460

 39007171 AGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCC 39007230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCC 2520

 39007231 CAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAA 39007290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAA 2580

 39007291 GAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTC 39007350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTC 2640

 39007351 CGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGC 39007410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGC 2700

 39007411 AAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATT 39007470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATT 2760

 39007471 AGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGT 39007530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGT 2820

 39007531 TAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAA 39007590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAA 2880

 39007591 TCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTC 39007650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTC 2940

 39007651 TCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAG 39007710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAG 3000

 39007711 ATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATA 39007770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATA 3060

 39007771 CCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAG 39007830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAG 3120

 39007831 AAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATG 39007890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATG 3180

 39007891 ATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCT 39007950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCT 3240

 39007951 TTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAA 39008010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAA 3300

 39008011 TGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGA 39008070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGA 3360

 39008071 TAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCC 39008130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCC 3420

 39008131 CTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAG 39008190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAG 3480

 39008191 CCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAA 39008250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAA 3540

 39008251 GTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATA 39008310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATA 3600

 39008311 GAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGA 39008370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGA 3660

 39008371 AAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGA 39008430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGA 3720

 39008431 GCCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGG 39008490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGG 3780

 39008491 TGCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCT 39008550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCT 3840

 39008551 GACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAG 39008610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAG 3900

 39008611 TCCCTGGGTTCC 39008622
          ||||||||||||
     3901 TCCCTGGGTTCC 3912

EXCISED REGION

 39008624 ATGAGTCAAATTACAC 39008639
          ||||||||||||||||
     3914 ATGAGTCAAATTACAC 3929

Alignment time is 2.92644 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    4876] =>      4876 nucs 'mol-32-3327-087592_4876'

Score:        4876
Aligned:      4876        nucs
Identic:      4876 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39005008,39009883]
 second seq =>  [       1,    4876]

 39005008 TTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGC 39005067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGC 60

 39005068 AAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAAT 39005127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAAT 120

 39005128 CAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGG 39005187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGG 180

 39005188 CTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGAT 39005247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGAT 240

 39005248 AGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCT 39005307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCT 300

 39005308 TTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAG 39005367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAG 360

 39005368 GGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTT 39005427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTT 420

 39005428 TTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATA 39005487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATA 480

 39005488 AACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAG 39005547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAG 540

 39005548 ATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTA 39005607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTA 600

 39005608 ATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGA 39005667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGA 660

 39005668 TGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGA 39005727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGA 720

 39005728 ATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGA 39005787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGA 780

 39005788 CTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACT 39005847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACT 840

 39005848 TCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATAC 39005907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATAC 900

 39005908 TTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAAT 39005967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAAT 960

 39005968 TTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAG 39006027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAG 1020

 39006028 TCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTA 39006087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTA 1080

 39006088 AATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGG 39006147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGG 1140

 39006148 AGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTA 39006207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTA 1200

 39006208 GCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAA 39006267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAA 1260

 39006268 TTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCA 39006327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCA 1320

 39006328 AACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGT 39006387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGT 1380

 39006388 TATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTG 39006447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTG 1440

 39006448 CATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGC 39006507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGC 1500

 39006508 CCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAG 39006567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAG 1560

 39006568 TGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCA 39006627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCA 1620

 39006628 AATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGC 39006687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGC 1680

 39006688 AACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTT 39006747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTT 1740

 39006748 TAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTC 39006807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTC 1800

 39006808 TACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAAT 39006867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAAT 1860

 39006868 GTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGC 39006927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGC 1920

 39006928 TTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGT 39006987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGT 1980

 39006988 GTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGG 39007047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGG 2040

 39007048 ACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAA 39007107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAA 2100

 39007108 ATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATC 39007167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATAAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATC 2160

 39007168 ACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAG 39007227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAG 2220

 39007228 TCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCC 39007287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCC 2280

 39007288 CAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGA 39007347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGA 2340

 39007348 GTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTC 39007407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTC 2400

 39007408 AGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTG 39007467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTG 2460

 39007468 ATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAA 39007527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAA 2520

 39007528 TGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTT 39007587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTT 2580

 39007588 CAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAG 39007647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAG 2640

 39007648 CTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTG 39007707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTG 2700

 39007708 GAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAA 39007767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAA 2760

 39007768 ATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAA 39007827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAA 2820

 39007828 TAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATG 39007887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATG 2880

 39007888 ATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTT 39007947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTT 2940

 39007948 TCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAA 39008007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAA 3000

 39008008 CAATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTT 39008067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTT 3060

 39008068 AGATAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAA 39008127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGATAAATTGATAGACTTGCCTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAA 3120

 39008128 GCCCTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGA 39008187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCCCTGGTTCTGTCTGATTCATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGA 3180

 39008188 AAGCCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAA 39008247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAGCCACCAAAAAGACCTTTCTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAA 3240

 39008248 TAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAA 39008307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAAGTAGAGCTTGGCCTAAATCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAA 3300

 39008308 ATAGAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACT 39008367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATAGAGATATTAAACTATTTTGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACT 3360

 39008368 GGAAAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAA 39008427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGAAAGAATAAATACAGTTAAAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAA 3420

 39008428 GGAGCCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTT 39008487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GGAGCCTCAAAAAATCATACAGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTT 3480

 39008488 AGGTGCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCAT 39008547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGGTGCCTTGCTCAAAGTCATAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCAT 3540

 39008548 CCTGACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTC 39008607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCTGACTCCTGGCTTAATGCTCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTC 3600

 39008608 AAGTCCCTGGGTTCCAATGAGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTC 39008667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAGTCCCTGGGTTCCAATGAGTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTC 3660

 39008668 TCAAATCACAGAAAATGAGAAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGC 39008727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCAAATCACAGAAAATGAGAAATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGC 3720

 39008728 AAATAGAATAAGTATTATTAATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTG 39008787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAATAGAATAAGTATTATTAATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTG 3780

 39008788 CACCAGAATTTATCTTATGCATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATA 39008847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CACCAGAATTTATCTTATGCATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATA 3840

 39008848 ACTGGAGAGTTCCCTTTAAATTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTT 39008907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACTGGAGAGTTCCCTTTAAATTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTT 3900

 39008908 TTACTAAAAAATAAGAATTGTATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCC 39008967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTACTAAAAAATAAGAATTGTATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCC 3960

 39008968 ATGATGAAAAGAATCATTAATCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATA 39009027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATGATGAAAAGAATCATTAATCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATA 4020

 39009028 ATGTTGGCATTTCAGTAATTTCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTC 39009087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATGTTGGCATTTCAGTAATTTCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTC 4080

 39009088 TCAATTTAGTAACAAAGTTTTTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAA 39009147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCAATTTAGTAACAAAGTTTTTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAA 4140

 39009148 TGCATGAACCCATGCTACTTTGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGT 39009207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGCATGAACCCATGCTACTTTGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGT 4200

 39009208 CATTCAGTATTACTGTCTGCCTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCT 39009267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CATTCAGTATTACTGTCTGCCTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCT 4260

 39009268 TTAGGACCTGCAAATATTAGGTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAA 39009327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTAGGACCTGCAAATATTAGGTTGATACAAAAGTAATTGTGGTTTTTCCCATTTCTTTAA 4320

 39009328 TGGCAAAGCAATTACATTTGTACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAAT 39009387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGGCAAAGCAATTACATTTGTACCAACCTAATATTTTAAAGAAAAGAGGTTCAGTAAAAT 4380

 39009388 TGATATTCTCCAAAGCCAAGCTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGT 39009447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGATATTCTCCAAAGCCAAGCTATCACCAAAACTCATTGAAAGGCAAAGGGCTATAATGT 4440

 39009448 TGAGTTTTTTTAATTGTCTGGGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATC 39009507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TGAGTTTTTTTAATTGTCTGGGTTCAAGCTGTTACATCCTTAATAATGATTTATTTGATC 4500

 39009508 TGTTATTGTCTCAATGTGATTTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTAC 39009567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGTTATTGTCTCAATGTGATTTTACCATTAGAAAGTATATACATTTAGGTCTAGCTTTAC 4560

 39009568 ATTTTGAACCTCATGGACAGGGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGG 39009627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATTTTGAACCTCATGGACAGGGGAAAAAGTCCAGAAACAGAATCGAATAATCAATACAGG 4620

 39009628 GCTCACTGTTTGTTTTCTTTGTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATT 39009687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GCTCACTGTTTGTTTTCTTTGTCAATAACTTTTAGTAGATACAGTGTGTCTGTCTCAATT 4680

 39009688 GGCAGCAAAACATCCCCTTAGCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAAT 39009747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GGCAGCAAAACATCCCCTTAGCTAGACTGTATTATACCTGTCTGTGAAAAAGAAAATAAT 4740

 39009748 AATGTCTCTTCTCCTTGTTAGTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCC 39009807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AATGTCTCTTCTCCTTGTTAGTTACAGGCCTCTGAAACCCCTGAACTCTCTATATCTTCC 4800

 39009808 ACCCTGCCCCTGCTAATTTTTCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTT 39009867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACCCTGCCCCTGCTAATTTTTCCAAAAGTTAATTCTGGCACACTCTTCAGTCTCTCATTT 4860

 39009868 AAGTCAAACAATTGCA 39009883
          ||||||||||||||||
     4861 AAGTCAAACAATTGCA 4876

Alignment time is 3.11632 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    7708] =>      7708 nucs 'mol-32-3332-002659_7708'

Score:        7708
Aligned:      7708        nucs
Identic:      7708 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39000330,39008037]
 second seq =>  [       1,    7708]

 39000330 ATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCAAAATAACAGAATGGTT 39000389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCAAAATAACAGAATGGTT 60

 39000390 AGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTCTTGAATTTGGCAACTT 39000449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTCTTGAATTTGGCAACTT 120

 39000450 GAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAGACAAGAGCCTGAATGG 39000509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAGACAAGAGCCTGAATGG 180

 39000510 TCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTCAAGAAGTTTTGCCATG 39000569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTCAAGAAGTTTTGCCATG 240

 39000570 AAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGTAGGCACAAAGCTCCAT 39000629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGTAGGCACAAAGCTCCAT 300

 39000630 TTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACATCAGGTGAGAAGAACT 39000689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACATCAGGTGAGAAGAACT 360

 39000690 GTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCC 39000749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCC 420

 39000750 ATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAA 39000809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAA 480

 39000810 GAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGAGATAACGACATCCCTC 39000869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGAGATAACGACATCCCTC 540

 39000870 TCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGTACTAACAACCAAAGTT 39000929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGTACTAACAACCAAAGTT 600

 39000930 CCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCTAGTCCC 39000989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCTAGTCCC 660

 39000990 CATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAAGAATCT 39001049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAAGAATCT 720

 39001050 AGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAACAACACA 39001109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAACAACACA 780

 39001110 GCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAG 39001169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAG 840

 39001170 TGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTG 39001229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTG 900

 39001230 TGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATAT 39001289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATAT 960

 39001290 AGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTC 39001349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTC 1020

 39001350 AAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCA 39001409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCA 1080

 39001410 AGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTT 39001469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTT 1140

 39001470 TTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCT 39001529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCT 1200

 39001530 GCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTT 39001589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTT 1260

 39001590 ACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGA 39001649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGA 1320

 39001650 CACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATC 39001709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATC 1380

 39001710 TTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACA 39001769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACA 1440

 39001770 TGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTG 39001829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTG 1500

 39001830 GAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAG 39001889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAG 1560

 39001890 GGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTC 39001949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTC 1620

 39001950 AATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTT 39002009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTT 1680

 39002010 GCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGAC 39002069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGAC 1740

 39002070 TCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGA 39002129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGA 1800

 39002130 ATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGA 39002189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGA 1860

 39002190 CAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAA 39002249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAA 1920

 39002250 CTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGT 39002309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGT 1980

 39002310 AAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATG 39002369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATG 2040

 39002370 GAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTG 39002429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTG 2100

 39002430 GTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAA 39002489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAA 2160

 39002490 CATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAAT 39002549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAAT 2220

 39002550 ATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAA 39002609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAA 2280

 39002610 GGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTA 39002669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTA 2340

 39002670 GGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGT 39002729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGT 2400

 39002730 ATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAA 39002789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAA 2460

 39002790 CAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAA 39002849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAA 2520

 39002850 AATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCA 39002909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCA 2580

 39002910 AAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGA 39002969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGA 2640

 39002970 AGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTAT 39003029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTAT 2700

 39003030 GCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCA 39003089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCA 2760

 39003090 GAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTT 39003149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTT 2820

 39003150 AGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTC 39003209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTC 2880

 39003210 AGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGT 39003269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGT 2940

 39003270 TATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGT 39003329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGT 3000

 39003330 AAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAA 39003389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAA 3060

 39003390 GCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATT 39003449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATT 3120

 39003450 CTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAG 39003509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAG 3180

 39003510 CCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATT 39003569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATT 3240

 39003570 TGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCA 39003629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCA 3300

 39003630 GGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCA 39003689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCA 3360

 39003690 ATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGC 39003749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGC 3420

 39003750 TAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 39003809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 3480

 39003810 TCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGA 39003869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGA 3540

 39003870 GCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTT 39003929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTT 3600

 39003930 TAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATT 39003989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATT 3660

 39003990 GGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTG 39004049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTG 3720

 39004050 ATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATAT 39004109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATAT 3780

 39004110 TTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTT 39004169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTT 3840

 39004170 ACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAA 39004229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAA 3900

 39004230 AAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGC 39004289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGC 3960

 39004290 TATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTA 39004349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTA 4020

 39004350 TTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAG 39004409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAG 4080

 39004410 TAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACT 39004469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACT 4140

 39004470 GTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAA 39004529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAA 4200

 39004530 TAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAA 39004589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAA 4260

 39004590 AAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATA 39004649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATA 4320

 39004650 GACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGA 39004709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGA 4380

 39004710 ACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTT 39004769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTT 4440

 39004770 ACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAA 39004829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAA 4500

 39004830 TCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAA 39004889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAA 4560

 39004890 CAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTG 39004949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTG 4620

 39004950 AAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATT 39005009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATT 4680

 39005010 TATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAA 39005069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAA 4740

 39005070 ATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCA 39005129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCA 4800

 39005130 GCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCT 39005189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCT 4860

 39005190 TTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAG 39005249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAG 4920

 39005250 TCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTT 39005309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTT 4980

 39005310 CTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGG 39005369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGG 5040

 39005370 CCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTT 39005429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTT 5100

 39005430 TGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAA 39005489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAA 5160

 39005490 CCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGAT 39005549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGAT 5220

 39005550 GAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAAT 39005609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAAT 5280

 39005610 GGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATG 39005669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATG 5340

 39005670 CCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAAT 39005729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAAT 5400

 39005730 GCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACT 39005789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACT 5460

 39005790 AAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTC 39005849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTC 5520

 39005850 CTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTT 39005909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTT 5580

 39005910 TCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTT 39005969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTT 5640

 39005970 TATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTC 39006029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTC 5700

 39006030 AATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAA 39006089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAA 5760

 39006090 TTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAG 39006149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAG 5820

 39006150 GGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGC 39006209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGC 5880

 39006210 TGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATT 39006269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATT 5940

 39006270 GTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAA 39006329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAA 6000

 39006330 CTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTA 39006389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTA 6060

 39006390 TTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCA 39006449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCA 6120

 39006450 TTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCC 39006509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TTGTCCTTCTTTTTCCATTTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCC 6180

 39006510 TAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTG 39006569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TAGAAGGCAAAAACAATTGTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTG 6240

 39006570 CAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAA 39006629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CAACAAATGAGAGTGTGTGTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAA 6300

 39006630 TGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAA 39006689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TGTACCCAGGCACAATTTGAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAA 6360

 39006690 CTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTA 39006749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CTATTACCTCAGGAACCCTCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTA 6420

 39006750 ATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTA 39006809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 ATATGTATCATATGTATGCTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTA 6480

 39006810 CTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGT 39006869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CTTATGAGCCAATGTAACAGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGT 6540

 39006870 ACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTT 39006929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 ACACTCTATAATAAAATACCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTT 6600

 39006930 TTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGT 39006989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TTATTTTTCTAGTGCTGATGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGT 6660

 39006990 GTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGAC 39007049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GTCCTGTACTATGCACTACGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGAC 6720

 39007050 AGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAAT 39007109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AGAACTATAGGTTGATGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAAT 6780

 39007110 AAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCAC 39007169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 AAAAGGATAGACATACATATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCAC 6840

 39007170 AAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTC 39007229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 AAGGTGAAGTCCCACAATAGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTC 6900

 39007230 CCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCA 39007289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CCAAAACCTCAAAAGTAGGGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCA 6960

 39007290 AGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGT 39007349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 AGAGCCCCTGACAAAGCACTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGT 7020

 39007350 CCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAG 39007409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CCGATGTTCAAAGGCAGGAAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAG 7080

 39007410 CAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGAT 39007469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 CAAGTCAAGTCCTTCCACGTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGAT 7140

 39007470 TAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATG 39007529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TAGACTGTGCCCACCCAGATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATG 7200

 39007530 TTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCA 39007589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TTAATCTCCTTTGGCACCACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCA 7260

 39007590 ATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCT 39007649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 ATCCAATCGAGTTGACAATCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCT 7320

 39007650 CTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGA 39007709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CTCCGTGTTAGTCCCATGGACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGA 7380

 39007710 GATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAAT 39007769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 GATATGAATATTTTTCAACTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAAT 7440

 39007770 ACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATA 39007829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 ACCTTGTAAACTATAAAATTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATA 7500

 39007830 GAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGAT 39007889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 GAAAGTGATAAAAAAGTAATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGAT 7560

 39007890 GATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTC 39007949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GATAATGATGATGATGGCAGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTC 7620

 39007950 TTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACA 39008009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 TTTGTGCCAAGGCATTTGCACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACA 7680

 39008010 ATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATC 39008037
          ||||||||||||||||||||||||||||
     7681 ATGCCATGAAGCAGACTCTACTATTATC 7708

Alignment time is 4.99624 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    7243] =>      7243 nucs 'mol-32-3395-136184_7243'

Score:        7073
Aligned:      7246        nucs
Identic:      7218 (100%) nucs =>      3587 ( 99%)      3631 (100%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39000924,39004518] EXCISED REGION [39005028,39008662]
 second seq =>  [       1,    3609] EXCISED REGION [    3610,    7243]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39000924 AAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCT 39000983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCT 60

 39000984 AGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAA 39001043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAA 120

 39001044 GAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAAC 39001103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      121 GAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAAG 180

 39001104 AACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGG 39001163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      181 AACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACACGGAAATAGCAATGATAGGG 240

 39001164 AATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTAT 39001223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTAT 300

 39001224 AGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATA 39001283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATA 360

 39001284 GGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGC 39001343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGC 420

 39001344 AAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGC 39001403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGC 480

 39001404 AATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTT 39001463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTT 540

 39001464 ATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGG 39001523
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTTTTTTTTTGTTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGG 600

 39001524 TAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAA 39001583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAA 660

 39001584 AGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCA 39001643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCA 720

 39001644 AGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTA 39001703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTA 780

 39001704 CATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCAC 39001763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCAC 840

 39001764 ATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAG 39001823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      841 ATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACCCTTTCTGTAGAGGAG 900

 39001824 GATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGT 39001883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGT 960

 39001884 GCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGG 39001943
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAA-CAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGG 1019

 39001944 AATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGT 39002003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGT 1079

 39002004 AGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAAT 39002063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAAT 1139

 39002064 TCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAA 39002123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAA 1199

 39002124 TTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAG 39002183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAG 1259

 39002184 AAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTAT 39002243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTAT 1319

 39002244 AGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTC 39002303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTC 1379

 39002304 TACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTA 39002363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTA 1439

 39002364 CCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCT 39002423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCT 1499

 39002424 GCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCT 39002483
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1500 GCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCT 1559

 39002484 GGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCA 39002543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCA 1619

 39002544 GATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGT 39002603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGT 1679

 39002604 TCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATA 39002663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATA 1739

 39002664 CCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGC 39002723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGC 1799

 39002724 ACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTA 39002783
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ACGTGTATACCTGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTA 1859

 39002784 TAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAAC 39002843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAAC 1919

 39002844 AAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTA 39002903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTA 1979

 39002904 ATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATG 39002963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATG 2039

 39002964 ACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCA 39003023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCA 2099

 39003024 TCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAG 39003083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAG 2159

 39003084 CCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCG 39003143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCG 2219

 39003144 TTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAG 39003203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAG 2279

 39003204 AAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAG 39003263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAG 2339

 39003264 CAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGA 39003323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGA 2399

 39003324 CTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCA 39003383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCA 2459

 39003384 TTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGG 39003443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGG 2519

 39003444 AAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGAC 39003503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGAC 2579

 39003504 TTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCA 39003563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCA 2639

 39003564 GTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT----------------GTTGAGA 39003607
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||
     2640 GTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGA 2699

 39003608 CAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAAC 39003667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAAC 2759

 39003668 CTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACA 39003727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACA 2819

 39003728 GGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCAT 39003787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCAT 2879

 39003788 GTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAA 39003847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAA 2939

 39003848 AGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTAC 39003907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTAC 2999

 39003908 AGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTC 39003967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTC 3059

 39003968 GTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTA 39004027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTA 3119

 39004028 ACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAG 39004087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAG 3179

 39004088 ATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTT 39004147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 ATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTT 3239

 39004148 CTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTG 39004207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTG 3299

 39004208 TTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAAT 39004267
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     3300 TTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAAT 3358

 39004268 CAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCA 39004327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCA 3418

 39004328 CATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCA 39004387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 CATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCA 3478

 39004388 AGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCA 39004447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCA 3538

 39004448 GTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAAC 39004507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAAC 3598

 39004508 AGATTATGCAA 39004518
          |||||||||||
     3599 AGATTATGCAA 3609

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 3669

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 3729

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 3789

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 3849

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 3909

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 3969

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 4029

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 4089

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 4149

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 4209

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 4269

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 4329

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 4389

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 4449

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 GCCTTATAATCATAATTTCACATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 4509

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 4569

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 4629

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 4689

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 4749

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 4809

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 4869

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 4929

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4930 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 4989

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 5049

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5050 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 5109

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5110 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 5169

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5170 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 5229

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 5289

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5290 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 5349

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 5409

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5410 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 5469

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 5529

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 5589

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5590 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 5649

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5650 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 5709

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5710 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 5769

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5770 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 5829

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5830 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 5889

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5890 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 5949

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 6009

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 6069

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 6129

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 6189

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 6249

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 6309

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6310 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 6369

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6370 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 6429

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 6489

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 6549

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6550 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 6609

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6610 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 6669

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6670 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 6729

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6730 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGC-AAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 6788

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6789 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 6848

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6849 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 6908

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6909 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 6968

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6969 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 7028

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7029 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 7088

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7089 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 7148

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7149 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 7208

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTA 39008662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7209 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTA 7243

Alignment time is 5.30342 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3609] =>      3609 nucs 'mol-32-3395-136184_3609'

Score:        3507
Aligned:      3595        nucs
Identic:      3587 (100%) nucs =>      2642 (100%)       945 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39000924,39003572] EXCISED REGION [39003573,39004518]
 second seq =>  [       1,    2648] EXCISED REGION [    2665,    3609]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        16 nucs [2649,2664]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        28 nucs [2649,2676] to [2665,2692]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [2649,2656] to [2657,2664]

 39000924 AAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCT 39000983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCT 60

 39000984 AGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAA 39001043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAA 120

 39001044 GAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAAC 39001103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      121 GAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAAG 180

 39001104 AACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGG 39001163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      181 AACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACACGGAAATAGCAATGATAGGG 240

 39001164 AATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTAT 39001223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTAT 300

 39001224 AGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATA 39001283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATA 360

 39001284 GGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGC 39001343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGC 420

 39001344 AAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGC 39001403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGC 480

 39001404 AATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTT 39001463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTT 540

 39001464 ATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGG 39001523
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTTTTTTTTTGTTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGG 600

 39001524 TAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAA 39001583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAA 660

 39001584 AGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCA 39001643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCA 720

 39001644 AGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTA 39001703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTA 780

 39001704 CATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCAC 39001763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCAC 840

 39001764 ATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAG 39001823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      841 ATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACCCTTTCTGTAGAGGAG 900

 39001824 GATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGT 39001883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGT 960

 39001884 GCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGG 39001943
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAA-CAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGG 1019

 39001944 AATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGT 39002003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGT 1079

 39002004 AGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAAT 39002063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAAT 1139

 39002064 TCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAA 39002123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAA 1199

 39002124 TTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAG 39002183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAG 1259

 39002184 AAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTAT 39002243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTAT 1319

 39002244 AGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTC 39002303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTC 1379

 39002304 TACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTA 39002363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTA 1439

 39002364 CCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCT 39002423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCT 1499

 39002424 GCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCT 39002483
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1500 GCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGATCTCCCGCCT 1559

 39002484 GGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCA 39002543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCA 1619

 39002544 GATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGT 39002603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGT 1679

 39002604 TCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATA 39002663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATA 1739

 39002664 CCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGC 39002723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGC 1799

 39002724 ACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTA 39002783
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ACGTGTATACCTGTGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTA 1859

 39002784 TAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAAC 39002843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAAC 1919

 39002844 AAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTA 39002903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTA 1979

 39002904 ATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATG 39002963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATG 2039

 39002964 ACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCA 39003023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCA 2099

 39003024 TCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAG 39003083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAG 2159

 39003084 CCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCG 39003143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCG 2219

 39003144 TTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAG 39003203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAG 2279

 39003204 AAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAG 39003263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAG 2339

 39003264 CAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGA 39003323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGA 2399

 39003324 CTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCA 39003383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCA 2459

 39003384 TTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGG 39003443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGG 2519

 39003444 AAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGAC 39003503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGAC 2579

 39003504 TTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCA 39003563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCA 2639

 39003564 GTAATTTGG 39003572
          |||||||||
     2640 GTAATTTGG 2648

EXCISED REGION

 39003573 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGT 39003632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGT 2724

 39003633 TGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATT 39003692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATT 2784

 39003693 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAA 39003752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 CTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAA 2844

 39003753 TTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 39003812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 TTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 2904

 39003813 TGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCC 39003872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 TGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCC 2964

 39003873 ACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAA 39003932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 ACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAA 3024

 39003933 GTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGG 39003992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 GTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGG 3084

 39003993 CTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATA 39004052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 CTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATA 3144

 39004053 AAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTT 39004112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 AAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTT 3204

 39004113 TGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACA 39004172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 TGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACA 3264

 39004173 AAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAA 39004232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 AAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAA 3324

 39004233 TATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTAT 39004292
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 TATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTAT 3383

 39004293 GTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTA 39004352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 GTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTA 3443

 39004353 TCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAA 39004412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 TCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAA 3503

 39004413 AAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTG 39004472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 AAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTG 3563

 39004473 GGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 GGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 3609

Alignment time is 2.67876 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    6479] =>      6479 nucs 'mol-32-33f8-090604_6479'

Score:        6469
Aligned:      6480        nucs
Identic:      6479 (100%) nucs =>      1619 (100%)      4860 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38999954,39001572] EXCISED REGION [39001574,39006434]
 second seq =>  [       1,    1619] EXCISED REGION [    1620,    6479]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39001573,39001573]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [39001573,39001583] to [39001574,39001584]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38999954 AAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGTTGAGA 39000013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTGATAGAAAATATATAAGTTGAGA 60

 39000014 TCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAAGGGAA 39000073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAGAGATAACATTCCAAAAAGGGAA 120

 39000074 CAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGCAAAGG 39000133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATAAGCCTGAATTTTAGGGCAAAGG 180

 39000134 CCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAGCTTGG 39000193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATTGTATTTAAAGCCACAAGCTTGG 240

 39000194 CAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACATTCCAA 39000253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGGACTGAACCTTTGGACATTCCAA 300

 39000254 ACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCTAATGA 39000313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATGTATGAGAAGGAATAGCTAATGA 360

 39000314 GACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCA 39000373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAAGACTAAAGAAAATATGTTTGCA 420

 39000374 AAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTC 39000433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAAGATAAGACCATAGAGATAACTC 480

 39000434 TTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAG 39000493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGACTAGTCTTTGTGGTGTGATGAAG 540

 39000494 ACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTC 39000553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGGTGAGGAGCAGAGATAGTGACTC 600

 39000554 AAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGT 39000613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCAGTCTCTGAGGGGCATCTAGAGT 660

 39000614 AGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACA 39000673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGGAAATGGTAGTGCCTAAGCCACA 720

 39000674 TCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCT 39000733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACCCAGTTGAACACATCTGGCCCCT 780

 39000734 CTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGT 39000793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCTTTTCTCTGAGGATTTGCGTGGT 840

 39000794 TCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGA 39000853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTTGTTTCTTTATCTACATTATGGA 900

 39000854 GATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGT 39000913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAGACAACTGTAATGTAAAATTAGT 960

 39000914 ACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGC 39000973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTAATTACTCACACCAATAAATGGC 1020

 39000974 TGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGC 39001033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAAGGAAATGTGAGATTCCATGAGC 1080

 39001034 AGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAG 39001093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTTCAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAG 1140

 39001094 CCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGC 39001153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGCCTTGACCAAACATGGAAATAGC 1200

 39001154 AATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATT 39001213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCTCAAACTCAGCAGGAAGTCTATT 1260

 39001214 ATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAAC 39001273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATTGGTCAGGGTTCCCCAGGGAAAC 1320

 39001274 AGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGT 39001333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTAAATAATTGGTGTATTACACTGT 1380

 39001334 GGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAG 39001393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGTAGGCTGGACATGCAGGGATGAG 1440

 39001394 TCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCA 39001453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGGCAGAACTTCCTCTTCCAGAGCA 1500

 39001454 GTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACA 39001513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAATGATTGGGTGAGGCCTACTTACA 1560

 39001514 TTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTT 39001572
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGATATAAATGTTAATCTCATCTTT 1619

EXCISED REGION

 39001574 AAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCA 39001633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGTTTGACCAACCATCTCTTTTCCA 1679

 39001634 TGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACAT 39001693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTACAAGTCTACCCCTCATCAACAT 1739

 39001694 GGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTA 39001753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCCAAACAAAGATAATAGCAAGGTA 1799

 39001754 ATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTC 39001813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTTCCAGAAAGGCACTAACGCTTTC 1859

 39001814 TGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTC 39001873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCATTCTGCTAACAGATTCCATTTC 1919

 39001874 TCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGG 39001933
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACT-AAAAAAAAAAAACAGTAATGAAATCATGG 1978

 39001934 CTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTT 39001993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAGAGATCCTTTAATTACTTGTTTT 2038

 39001994 CTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTT 39002053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTTTATCTGTTGAATGTTCAAACTT 2098

 39002054 AGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTC 39002113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATGTGACAGAAAAAAAGAAAACCTC 2158

 39002114 ATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGC 39002173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 ATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCTCTCACCATGTGATTTTTTTAGC 2218

 39002174 CCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAA 39002233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAGTACTTTGTGCAAATAGCATTAA 2278

 39002234 CAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAA 39002293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAAGCTAAACAGTAAATTGTTACAA 2338

 39002294 ATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGG 39002353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATATATTTAAGAGCCAGATTCTTGG 2398

 39002354 AAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAAT 39002413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAACATTGTAAACTATTGACCTCAAT 2458

 39002414 CTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGT 39002473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATATAGGATTTTTAATGATATCCAGT 2518

 39002474 TCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTC 39002533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTACAAAGAGTATTTGGATACGCTC 2578

 39002534 TATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAA 39002593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGAGTGAATATAAGAAATAAAGAAA 2638

 39002594 TTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTAC 39002653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGCCTGCTGGGGGGTGGGGGACTAC 2698

 39002654 GGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAA 39002713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATCAAGGGTTGATGGGTGCAGCAAA 2758

 39002714 CCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGA 39002773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACATGTATCCCAGA 2818

 39002774 ATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCT 39002833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGAAAAAAAAGTTTCCCTAAACTCT 2878

 39002834 TGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTAC 39002893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGCTAGAGACTAGAAGAGAAACTAC 2938

 39002894 AAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGG 39002953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATTCAGGTCGAAGCCTGG 2998

 39002954 AGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCC 39003013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCAGCAATAATATCATCC 3058

 39003014 CATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCT 39003073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAATGGTGAGATACTCCT 3118

 39003074 GAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTG 39003133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGTCGATACTGACCCTTG 3178

 39003134 TTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCAC 39003193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCAC 3238

 39003194 GTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGT 39003253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGT 3298

 39003254 TATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCC 39003313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCC 3358

 39003314 TTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTG 39003373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTG 3418

 39003374 GATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAA 39003433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 GATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAA 3478

 39003434 AAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTT 39003493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTT 3538

 39003494 CTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCAT 39003553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCAT 3598

 39003554 CCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGT 39003613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGT 3658

 39003614 CTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGC 39003673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGC 3718

 39003674 CTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATG 39003733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 CTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATG 3778

 39003734 CACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGC 39003793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGC 3838

 39003794 CAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACT 39003853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACT 3898

 39003854 GCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGC 39003913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGC 3958

 39003914 CATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTT 39003973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 CATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTT 4018

 39003974 TAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAAT 39004033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAAT 4078

 39004034 CAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTA 39004093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 CAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTA 4138

 39004094 CCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTT 39004153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 CCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTT 4198

 39004154 TTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTC 39004213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTC 4258

 39004214 ATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACAT 39004273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 ATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACAT 4318

 39004274 CCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTT 39004333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTT 4378

 39004334 ATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGG 39004393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 ATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGG 4438

 39004394 AGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCC 39004453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCC 4498

 39004454 TCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTA 39004513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTA 4558

 39004514 TGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACA 39004573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAAGCAGAATCTCATCATTCTCACA 4618

 39004574 AGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATT 39004633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 AGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCTGGATTCTAAAACCTGATAAATT 4678

 39004634 TTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGT 39004693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTATGTAAAATTATTTAATGATCAGT 4738

 39004694 TGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTT 39004753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTATCAGTTTTAACAAGTATGACTT 4798

 39004754 GCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCA 39004813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 GCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATCTTATGGGTCCTGGCCATTGGCA 4858

 39004814 CATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACT 39004873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 CATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGATGCTTTTTCAAGGATGCAACACT 4918

 39004874 GAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGT 39004933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 GAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGAGGCCAAAGACCACAGCTAAAGT 4978

 39004934 GATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCC 39004993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 GATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTCTCAAGCTCAATCTAAATGAGCC 5038

 39004994 CCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCAC 39005053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 CCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCAC 5098

 39005054 CTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAAT 39005113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 CTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGATATTGGACTTAAAATTCCTAAT 5158

 39005114 GACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTT 39005173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 GACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTT 5218

 39005174 GATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTG 39005233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 GATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTG 5278

 39005234 CAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTC 39005293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCTTCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTC 5338

 39005294 TCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCAC 39005353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 TCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAGGAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCAC 5398

 39005354 CAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAG 39005413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 CAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAAAATTGAGACAGATACCCCCAAATCAG 5458

 39005414 TTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGT 39005473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 TTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAAGAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGT 5518

 39005474 AGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATA 39005533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 AGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTTTAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATA 5578

 39005534 AGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCT 39005593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 AGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTTCAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCT 5638

 39005594 GAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTAT 39005653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 GAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTATTAAGGATAAATTATCATTGAATTAT 5698

 39005654 TCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCA 39005713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGCAAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCA 5758

 39005714 TGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTG 39005773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 TGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACATGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTG 5818

 39005774 GCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCC 39005833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 GCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCCAGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCC 5878

 39005834 GGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCC 39005893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 GGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTTGCCTTATAATCATAATTTCTCATTCC 5938

 39005894 TAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGC 39005953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 TAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTGCTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGC 5998

 39005954 CAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAG 39006013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 CAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCCTGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAG 6058

 39006014 AGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAG 39006073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 AGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATTTCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAG 6118

 39006074 AAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGT 39006133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 AAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCAGTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGT 6178

 39006134 GCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGA 39006193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 GCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTTGCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGA 6238

 39006194 TAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCC 39006253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATGTCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCC 6298

 39006254 AAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGC 39006313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 AAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAGCCAATCCATATTTACCAGATTTTAGC 6358

 39006314 AAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACA 39006373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 AAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAAAAGATCATTTTTAAACAACAACAACA 6418

 39006374 ACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTA 39006433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 ACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTTTAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTA 6478

 39006434 T 39006434
          |
     6479 T 6479

Alignment time is 4.80444 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    6320] =>      6320 nucs 'mol-32-33f8-091231_6320'

Score:        6289
Aligned:      6322        nucs
Identic:      6319 (100%) nucs =>       945 (100%)      5374 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [38998924,38999869] EXCISED REGION [38999872,39005247]
 second seq =>  [       1,     945] EXCISED REGION [     946,    6320]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [38999870,38999871]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        23 nucs [38999870,38999892] to [38999872,38999894]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [38999869,38999869] to [38999872,38999872]
 second seq =>         1 nucs [945,945] to [946,946]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 38998924 CAAAAGACAAAACCAAGGGACTATAAGCTGGTTCCAGTAAGCTGATCATCCTTACTGGAA 38998983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAAGACAAAACCAAGGGACTATAAGCTGGTTCCAGTAAGCTGATCATCCTTACTGGAA 60

 38998984 ACATGAGGAAGAGGGAGTGACAGAGATCTGGGCTGCATTAGGAAAGACAGTCCCTAAAAT 38999043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATGAGGAAGAGGGAGTGACAGAGATCTGGGCTGCATTAGGAAAGACAGTCCCTAAAAT 120

 38999044 TGAAATGTCAAAATAATAGGATTGTTGGTGGGGTGGGGGGTTAATGCAAGGATAGACATA 38999103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAATGTCAAAATAATAGGATTGTTGGTGGGGTGGGGGGTTAATGCAAGGATAGACATA 180

 38999104 AAGTGTGCTGAATAGTGAGTTTTCAATATGCAACGGGTTGCTTTTATTACTAAACCTCAT 38999163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTGTGCTGAATAGTGAGTTTTCAATATGCAACGGGTTGCTTTTATTACTAAACCTCAT 240

 38999164 ATCTTTTGTGGCCTCATGGTGTTTCTCCCTAAAATAGCCAACCACATGCTAAGCACCAAT 38999223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTTTTGTGGCCTCATGGTGTTTCTCCCTAAAATAGCCAACCACATGCTAAGCACCAAT 300

 38999224 TGTACCTAACCCCTCTCGCCTCAAGGAATTTAAAATCTATAGACATTCAGAGAAATACAT 38999283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTACCTAACCCCTCTCGCCTCAAGGAATTTAAAATCTATAGACATTCAGAGAAATACAT 360

 38999284 TAATAATAGTAAAATATCATATAGCAGTAGAAACAAACGCTAAATTATGAGCTACAGGCA 38999343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATAATAGTAAAATATCATATAGCAGTAGAAACAAACGCTAAATTATGAGCTACAGGCA 420

 38999344 ATAATCTTTCAGTCAAGTCTAATCAAGAAATATTTATTGAGCTTGTTATGTACTTAATGT 38999403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAATCTTTCAGTCAAGTCTAATCAAGAAATATTTATTGAGCTTGTTATGTACTTAATGT 480

 38999404 GTTTCCCAAAAATTCATATGTTGACATGCTAACCCCCAATGTGATTATATTTGGAGGTGA 38999463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTCCCAAAAATTCATATGTTGACATGCTAACCCCCAATGTGATTATATTTGGAGGTGA 540

 38999464 GACCTTTGGGAGATGATTAGAGTGATATAAAAATCATAAGGGTAGGTTCTAATATGAGAT 38999523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACCTTTGGGAGATGATTAGAGTGATATAAAAATCATAAGGGTAGGTTCTAATATGAGAT 600

 38999524 TAATGTCCTCATAATAAGAGGAAGAAAAAGATCCCTATCTCTTCCCCCTGAGCACTTGTA 38999583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATGTCCTCATAATAAGAGGAAGAAAAAGATCCCTATCTCTTCCCCCTGAGCACTTGTA 660

 38999584 CTGAGGAAAAAAGCCTTTTGTGAACAGGTGATAAAGCAGCTTTCTTCAGGCTAAGGAAAG 38999643
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
      661 CTGAGGAAAAAAGCCTTTTGTGAACAGGTGATAAAGCAGCTTTCTTCAGGCTAAGGAA-G 719

 38999644 AGGCCTCCCCAGGAACCAAATGGTTCGACAGCTTCATCTTGGACTTCCCAGCCTTAAGAA 38999703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AGGCCTCCCCAGGAACCAAATGGTTCGACAGCTTCATCTTGGACTTCCCAGCCTTAAGAA 779

 38999704 CTGTGAGAAAATAAATTTCTGTTAAGCCACCCAGTCTGTGCTATTTTGTTATGGCAGCTG 38999763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTGTGAGAAAATAAATTTCTGTTAAGCCACCCAGTCTGTGCTATTTTGTTATGGCAGCTG 839

 38999764 AAGCAGACTAAGACAGAGCTTTCACTCTGTGTCAGACACTCTTGTAATCTCCAGAAATTT 38999823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AAGCAGACTAAGACAGAGCTTTCACTCTGTGTCAGACACTCTTGTAATCTCCAGAAATTT 899

 38999824 GCATTTAAGGAGTGGAAACAAAAATAAGATAAAGATAGAAGAAAGT 38999869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GCATTTAAGGAGTGGAAACAAAAATAAGATAAAGATAGAAGAAAGT 945

EXCISED REGION

 38999872 TATATATATATATATATATATATCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATG 38999931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 TATATATATATATATATATATATCTGTGCAAGTTGTGCATAGAATTAAAACTGAATAATG 1005

 38999932 TGATTGATGATAGATGATAGACAAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTG 38999991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 TGATTGATGATAGATGATAGACAAATAGATAGATAAGGTTTCCAGGGAAGATCTGTCCTG 1065

 38999992 ATAGAAAATATATAAGTTGAGATCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAG 39000051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 ATAGAAAATATATAAGTTGAGATCTAAATAACAAGAAAGAACCAGCTGTGAAAAGATCAG 1125

 39000052 AGATAACATTCCAAAAAGGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATA 39000111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 AGATAACATTCCAAAAAGGGAACAATTAGGAAAGGTGTGAAGTAGGCAATTGGGTGTATA 1185

 39000112 AGCCTGAATTTTAGGGCAAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATT 39000171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 AGCCTGAATTTTAGGGCAAAGGCCAGGAATGGATGTATCAATCTGTGAGACTTATGGATT 1245

 39000172 GTATTTAAAGCCACAAGCTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGG 39000231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 GTATTTAAAGCCACAAGCTTGGCAAGATTACTTATGCAGAGTATGTAGGCAGGGCACAGG 1305

 39000232 ACTGAACCTTTGGACATTCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATG 39000291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 ACTGAACCTTTGGACATTCCAAACATTCATGGTTAGGCAGCAGAGGTACCAGGAAAGATG 1365

 39000292 TATGAGAAGGAATAGCTAATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAA 39000351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 TATGAGAAGGAATAGCTAATGAGACAGGAGGAAAACCCATTTCAATTCTACTCAATAGAA 1425

 39000352 GACTAAAGAAAATATGTTTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAA 39000411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 GACTAAAGAAAATATGTTTGCAAAATAACAGAATGGTTAGTGCTGCTGAGATATGAGGAA 1485

 39000412 GATAAGACCATAGAGATAACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGAC 39000471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 GATAAGACCATAGAGATAACTCTTGAATTTGGCAACTTGAAGGTCATAAGGGACCTTGAC 1545

 39000472 TAGTCTTTGTGGTGTGATGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGG 39000531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 TAGTCTTTGTGGTGTGATGAAGACAAGAGCCTGAATGGTCTGTTATGGAAGCAAGTGAGG 1605

 39000532 TGAGGAGCAGAGATAGTGACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCA 39000591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 TGAGGAGCAGAGATAGTGACTCAAGAAGTTTTGCCATGAAAAGGAGTAGAGAGATGGGCA 1665

 39000592 GTCTCTGAGGGGCATCTAGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGG 39000651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 GTCTCTGAGGGGCATCTAGAGTAGGCACAAAGCTCCATTTAGGTTTAGGAAGCCTAATGG 1725

 39000652 AAATGGTAGTGCCTAAGCCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACC 39000711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 AAATGGTAGTGCCTAAGCCACATCAGGTGAGAAGAACTGTGTGAGGAAAGACAGAAGACC 1785

 39000712 CAGTTGAACACATCTGGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCT 39000771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 CAGTTGAACACATCTGGCCCCTCTCCTGCTCTGCCTCCATTGCCTTGGACTGGTGCTTCT 1845

 39000772 TTTCTCTGAGGATTTGCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTT 39000831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TTTCTCTGAGGATTTGCGTGGTTCTAGTTATGGAGGAAGAAGATGCGGGCCATCATATTT 1905

 39000832 GTTTCTTTATCTACATTATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAG 39000891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 GTTTCTTTATCTACATTATGGAGATAACGACATCCCTCTCCTAAACACTAAGACATCTAG 1965

 39000892 ACAACTGTAATGTAAAATTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTA 39000951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 ACAACTGTAATGTAAAATTAGTACTAACAACCAAAGTTCCATTTGATTAAGAAAATACTA 2025

 39000952 ATTACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAA 39001011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 ATTACTCACACCAATAAATGGCTGCAACATCTAGTCCCCATTCAATTTGGGGAAATTAAA 2085

 39001012 GGAAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTT 39001071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 GGAAATGTGAGATTCCATGAGCAGCGGCTTAAGAATCTAGAGGAAGCTTCATTCACTCTT 2145

 39001072 CAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGC 39001131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 CAGTAGAAGCTTCTTTTCTTAGCCAAAGAAACAACACAGCCTGCATCTCCAGTGTAATGC 2205

 39001132 CTTGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCT 39001191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CTTGACCAAACATGGAAATAGCAATGATAGGGAATCAGTGCCTACCATGACTTGAGGTCT 2265

 39001192 CAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATT 39001251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CAAACTCAGCAGGAAGTCTATTATGCCTCTATAGGCTGTGTCCCTCTTAAAATCTGTATT 2325

 39001252 GGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTA 39001311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 GGTCAGGGTTCCCCAGGGAAACAGAACCAATAGGATATAGGGAGAGAGGATGTGTGATTA 2385

 39001312 AATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGT 39001371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 AATAATTGGTGTATTACACTGTGGTGTCTGGCAAGTTCAAAATCTGCACGACAGACCAGT 2445

 39001372 AGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGG 39001431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AGGCTGGACATGCAGGGATGAGTCAATGTTGCAATTCAAGTCTTGAAGGCAATATGCTGG 2505

 39001432 CAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAAT 39001491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 CAGAACTTCCTCTTCCAGAGCAGTCAGGTTTTATTTTTTTTTTTATTAAGGTCTTCAAAT 2565

 39001492 GATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGAT 39001551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GATTGGGTGAGGCCTACTTACATTATGAAGGGTAATCTGCTTTTCTCAAAGTCTACTGAT 2625

 39001552 ATAAATGTTAATCTCATCTTTAAAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGT 39001611
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 ATAAATGTTAATCTCATCTTT-AAAAAAAAAAAGGTTTACAGAAACATCTAGAAGAATGT 2684

 39001612 TTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTA 39001671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 TTGACCAACCATCTCTTTTCCATGCCTAGCCAAGTTGACACAAAAAATTATTAACCATTA 2744

 39001672 CAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCC 39001731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 CAAGTCTACCCCTCATCAACATGGCACCCTTACATATCTTCTTAAATAATACTAATCTCC 2804

 39001732 AAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTT 39001791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 AAACAAAGATAATAGCAAGGTAATACCTCCACATGACATGATAAAATTATCCCGCGTTTT 2864

 39001792 CCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCA 39001851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 CCAGAAAGGCACTAACGCTTTCTGTAGAGGAGGATGTGGAGTACTTGGGTGATATGCTCA 2924

 39001852 TTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGGGAAGAGCCTCACTAAAAAAAA 39001911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2925 TTCTGCTAACAGATTCCATTTCTCAGAATAGTGCCCAGCGAAGAGCCTCACTAAAAAAAA 2984

 39001912 AAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAG 39001971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 AAAAACAGTAATGAAATCATGGCTTCCCATGGAATGTCAATTTATGGCTGCTATTTTAAG 3044

 39001972 AGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTT 39002031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 AGATCCTTTAATTACTTGTTTTCTGGAGCAGTAGGTTTGCCACATAAAACCATTTTCTTT 3104

 39002032 TATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATG 39002091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 TATCTGTTGAATGTTCAAACTTAGCTCTAAATTCTGACTCTGATACAAATACTACATATG 3164

 39002092 TGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCT 39002151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 TGACAGAAAAAAAGAAAACCTCATGAATTAAATTCAGAATGTCTCTTGCATTTTCTTTCT 3224

 39002152 CTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAG 39002211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 CTCACCATGTGATTTTTTTAGCCCTTTGGGAGAAGGGACAGAAATTTGCATTGCACAGAG 3284

 39002212 TACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAA 39002271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 TACTTTGTGCAAATAGCATTAACAGTAAGTATAGATAACTGATTTGAGGCTTAAGGAAAA 3344

 39002272 GCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATA 39002331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 GCTAAACAGTAAATTGTTACAAATAAATTTTCTACCGTAAAGACTGTGGTTTAACTGATA 3404

 39002332 TATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAAC 39002391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 TATTTAAGAGCCAGATTCTTGGAAGGAGCTTACCAATGGAAAAGATACAGTGTTAGTAAC 3464

 39002392 ATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATAT 39002451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 ATTGTAAACTATTGACCTCAATCTTTCCTTCTGCACTGGTTCACAAATGCTTTGCCATAT 3524

 39002452 AGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTA 39002511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 AGGATTTTTAATGATATCCAGTTCTCCCGCCTGGTAAACATAAGATCAAATCTTGCTTTA 3584

 39002512 CAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGA 39002571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 CAAAGAGTATTTGGATACGCTCTATCCTTGCAGATAATATGTGCTGATCACATTTGTGGA 3644

 39002572 GTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGC 39002631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 GTGAATATAAGAAATAAAGAAATTAAAAGTGTTCCTAAGGGGAACATCACACACGAGGGC 3704

 39002632 CTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATC 39002691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 CTGCTGGGGGGTGGGGGACTACGGGAGGAATACCATTAGGAGAAATACCTAATGTAGATC 3764

 39002692 AAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCA 39002751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 AAGGGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGTGTATACCTATGTAACAAACCTGCA 3824

 39002752 CATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGA 39002811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 CATTCTGCACATGTATCCCAGAATTTAAAGTATAACAACAACAAAAACCTAGATTAAAGA 3884

 39002812 AAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGC 39002871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 AAAAAAAGTTTCCCTAAACTCTTGTTATTAACAAACAAAATCTCACACCAAAAGTAAAGC 3944

 39002872 TAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAA 39002931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 TAGAGACTAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAA 4004

 39002932 GTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACC 39002991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 GTGCATTCAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACC 4064

 39002992 TGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGA 39003051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 TGTAGCAGCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGA 4124

 39003052 ACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAA 39003111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 ACTGTAATGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAA 4184

 39003112 AGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGA 39003171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AGCTTGTCGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGA 4244

 39003172 AGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAG 39003231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 AGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAG 4304

 39003232 TGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCC 39003291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 TGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCC 4364

 39003292 TAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCAT 39003351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 TAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCAT 4424

 39003352 ATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGC 39003411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 ATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGC 4484

 39003412 CATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGG 39003471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 CATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGG 4544

 39003472 AGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATA 39003531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 AGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATA 4604

 39003532 AATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTA 39003591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 AATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTA 4664

 39003592 TTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGAT 39003651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 TTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGAT 4724

 39003652 CTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCA 39003711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 CTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCA 4784

 39003712 AGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGA 39003771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 AGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGA 4844

 39003772 GATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACC 39003831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 GATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACC 4904

 39003832 CACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTT 39003891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 CACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTT 4964

 39003892 CATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAA 39003951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 CATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATAATTTGCAAA 5024

 39003952 TGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCA 39004011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 TGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTTATAACAGCA 5084

 39004012 ATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCA 39004071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 ATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCA 5144

 39004072 TACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATAT 39004131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 TACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTCTATGAATAT 5204

 39004132 ATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTG 39004191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 ATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGATCATCCTGTG 5264

 39004192 CATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACAT 39004251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 CATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACACTTTTACAT 5324

 39004252 GTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCC 39004311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 GTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCCATTAGAGCC 5384

 39004312 ACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAAC 39004371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 ACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGTGCTAGGAAC 5444

 39004372 AGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAG 39004431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 AGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTTATATGGCAG 5504

 39004432 TGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATAT 39004491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 TGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAGGTAGGATAT 5564

 39004492 TCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAA 39004551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 TCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAAATGACCCAAAATAAGAATAATAGGGTCAAACAA 5624

 39004552 GCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCT 39004611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 GCAGAATCTCATCATTCTCACAAGTGACTGTAAAGAAAAAACAATTCATATGAGAGCTCT 5684

 39004612 GGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTAT 39004671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 GGATTCTAAAACCTGATAAATTTTCCCAGATTTAAATAGACTCATTTTCAAGAGGGGTAT 5744

 39004672 GTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTA 39004731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5745 GTAAAATTATTTAATGATCAGTTGGCTCAACACAAGGAACTATTTGGCAGGAGTACTTTA 5804

 39004732 TCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATC 39004791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 TCAGTTTTAACAAGTATGACTTGCTCTACTAGTGTCTTACAAGATGCATACTTCATTATC 5864

 39004792 TTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGAT 39004851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5865 TTATGGGTCCTGGCCATTGGCACATAGACTCTAATGAATCATAGTTTAGATTTCAAGGAT 5924

 39004852 GCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGA 39004911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5925 GCTTTTTCAAGGATGCAACACTGAGGTGGGGCTCCCAACAGGCATTACCCCAGCAAATGA 5984

 39004912 GGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTC 39004971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 GGCCAAAGACCACAGCTAAAGTGATCTTAACCATGTTGAAGAATTCTGAAGGTAAAATTC 6044

 39004972 TCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAA 39005031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6045 TCAAGCTCAATCTAAATGAGCCCCATAGAAGGATGATTTATTACCAAAGGACATAGGAAA 6104

 39005032 ATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGA 39005091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6105 ATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCACTGA 6164

 39005092 TATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAA 39005151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6165 TATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGCCTAA 6224

 39005152 TGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGG 39005211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6225 TGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGGGTGG 6284

 39005212 GAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGAT 39005247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6285 GAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGAT 6320

Alignment time is 4.63739 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    5628] =>      5628 nucs 'mol-32-3492-072725_5628'

Score:        5555
Aligned:      5629        nucs
Identic:      5610 (100%) nucs =>      1353 ( 99%)      4257 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39003165,39004518] EXCISED REGION [39005028,39009286]
 second seq =>  [       1,    1369] EXCISED REGION [    1370,    5628]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39003165 GGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTG 39003224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAACGAAGAGTGTCCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTG 60

 39003225 GAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGG 39003284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAATAGTGTCTTTGTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGG 120

 39003285 TAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAG 39003344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGACCCTAAATCCAATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAG 180

 39003345 AAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAA 39003404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACCATATGAAGACCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAA 240

 39003405 GGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTT 39003464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATTGCCATCCATCACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTT 300

 39003465 TGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAG 39003524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAGGGAGTATGGCTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAG 360

 39003525 AAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTAT 39003584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAATAAATTGCTGTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTAT 420

 39003585 TTATTTATTTATTTAT----------------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCC 39003628
          ||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCC 480

 39003629 AGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGC 39003688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGTTGGAGTGGAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGC 540

 39003689 AATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGG 39003748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGG 600

 39003749 CTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAA 39003808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAA 660

 39003809 CTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTG 39003868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTG 720

 39003869 AGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATT 39003928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCCACTGTGCCTGGCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATT 780

 39003929 TTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTAT 39003988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAAGTTAATAATAATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTAT 840

 39003989 TGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACT 39004048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGGCTTTTAAGTTATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACT 900

 39004049 GATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATA 39004108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATAAAGCCAAAAGTAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATA 960

 39004109 TTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTT 39004168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTGACTTTTTCTATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTT 1020

 39004169 TACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAA 39004228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACAAAACTAGGATCATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAA 1080

 39004229 AAAATATATGGACACTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGG 39004288
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAATATATGGACACTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGG 1139

 39004289 CTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTT 39004348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTATGTAATATTCCATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTT 1199

 39004349 ATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAA 39004408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATTATCTACTATGTGCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAA 1259

 39004409 GTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAAC 39004468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GTAAAAAGGAAGTTATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAAC 1319

 39004469 TGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGTGGGGAGGGTAGGTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 1369

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 1429

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 1489

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 1549

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 1609

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 1669

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 1729

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 1789

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 1849

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 1909

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 1969

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 2029

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 2089

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 2149

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 2209

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 2269

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 2329

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 2389

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 2449

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 2509

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 2569

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 2629

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 2689

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 2749

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 2809

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 2869

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 2929

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 2989

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 3049

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 3109

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 3169

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 39006887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAATA 3229

 39006888 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 39006947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 CCAGTATTCTCTCACAACATAAAGTTTTTTCTAAGGAAGCTTTTATTTTTCTAGTGCTGA 3289

 39006948 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 39007007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TGCTCATCACAGACAATGCTGTCACAAAACCACCTGATGTGTGTCCTGTACTATGCACTA 3349

 39007008 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 39007067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 CGGGATTGGGGAAGTTAATTAATCAGAGTTCTCTAGAGGGACAGAACTATAGGTTGATGC 3409

 39007068 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 39007127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 AAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGCAATGGCAAAATAAAAGGATAGACATACAT 3469

 39007128 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 39007187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 ATGAAGGGTAGTTTATTAAGGAGTATTGACTCACACGATCACAAGGTGAAGTCCCACAAT 3529

 39007188 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 39007247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 AGGCCGTCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGAAGCCAGTCCGAGTCCCAAAACCTCAAAAGTAG 3589

 39007248 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 39007307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 GGGAGCCAACAGTGCAGCCTTCAGTCTGTGGCCGAAGGCCCAAGAGCCCCTGACAAAGCA 3649

 39007308 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 39007367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 CTGGTGTAAGCCCAAGAGTCCCAAAGCTGAAGAACTTGGAGTCCGATGTTCAAAGGCAGG 3709

 39007368 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 39007427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 AAGCATCCAGCAGGGGAGGAAGATGAGGAATGGAAGACTCAGCAAGTCAAGTCCTTCCAC 3769

 39007428 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 39007487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 GTTCTTCTGCCTGCTTTTATCCTAGCTGCACTGGCAACTGATTAGACTGTGCCCACCCAG 3829

 39007488 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 39007547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 ATTGAGGGTGAGTCTGCCTCTCCCAGTCCACTGACTCAAATGTTAATCTCCTTTGGCACC 3889

 39007548 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 39007607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 ACCCTCACAGACACACCCAGGAACAATGCTTTGCATCCTTCAATCCAATCGAGTTGACAA 3949

 39007608 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 39007667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 TCAATATTAACCATCACAGGAAGTAAACAAGGAGACCAAGCTCTCCGTGTTAGTCCCATG 4009

 39007668 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 39007727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 GACAAGTTACTACACCTCTCTGAGACTCTCTTGTGGTGTGGAGATATGAATATTTTTCAA 4069

 39007728 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 39007787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 CTCAGAGCATTATTGCAAAGACCAGCTTTGGCATGTAGAAATACCTTGTAAACTATAAAA 4129

 39007788 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 39007847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 TTATCTACATGTATGAGATATCATAGTTATTGATTTTTAATAGAAAGTGATAAAAAAGTA 4189

 39007848 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 39007907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 ATCGTTTTCAAAAATAAATTCCAGAGTAATAATGACAATGATGATAATGATGATGATGGC 4249

 39007908 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 39007967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 AGCACAATGTAAAAATAAGAAAAACATTTCTTTAGGGCTTTCTTTGTGCCAAGGCATTTG 4309

 39007968 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 39008027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 CACTAAGCACTTCATGTCATTTTTCATGTAATCCCCACAACAATGCCATGAAGCAGACTC 4369

 39008028 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 39008087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 TACTATTATCACAGTTTAATAAATGAGAAAATTGAATTTTAGATAAATTGATAGACTTGC 4429

 39008088 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 39008147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 CTACTTCACACAACAAGCATAAGTCAGAGCTGCGATTCAAGCCCTGGTTCTGTCTGATTC 4489

 39008148 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 39008207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 ATAAACCTTGCAAGCAAAGCTTAGCAAAAAAAAAATCAGAAAGCCACCAAAAAGACCTTT 4549

 39008208 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 39008267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 CTTGTTTGTTAAAGCTAAGCTTAGAGCAAAGAGAAAAAAATAAGTAGAGCTTGGCCTAAA 4609

 39008268 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 39008327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 TCTTAAAAAGATGTAAAACTTAACTGATGACAGAAATGAAATAGAGATATTAAACTATTT 4669

 39008328 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 39008387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 TGCTTCCCTTTACAGCATCACAAAGAATAATTGTCAAACTGGAAAGAATAAATACAGTTA 4729

 39008388 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 39008447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 AAGGAAAACCAAAAACTGAGGTAGAATTTTGATATTAGAAGGAGCCTCAAAAAATCATAC 4789

 39008448 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 39008507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4790 AGTTTTATGTTTTTCATAACAGATAAGGAACCAATATTTTAGGTGCCTTGCTCAAAGTCA 4849

 39008508 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 39008567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 TAAGTAAGTCCTTGACAATATTTGGACAGAACTCTGGCATCCTGACTCCTGGCTTAATGC 4909

 39008568 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 39008627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 TCTTTCCACCTATTATGTTTGAGAGATAATAATGAAGCTCAAGTCCCTGGGTTCCAATGA 4969

 39008628 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 39008687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 GTCAAATTACACAGGATATGGAATATCTGATGGTAATTTCTCAAATCACAGAAAATGAGA 5029

 39008688 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 39008747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 AATAAAGTGGAAGATAAGAGTTATCCTTACACTGCACAGCAAATAGAATAAGTATTATTA 5089

 39008748 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 39008807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 ATTTGATTAGAGGTACTGCTTACCTTGTTTGCTCACTCTGCACCAGAATTTATCTTATGC 5149

 39008808 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 39008867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5150 ATCAAGGAAAGTTCACAATTTATTTAGCTATGTATCAATAACTGGAGAGTTCCCTTTAAA 5209

 39008868 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 39008927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 TTTTAGATGCTATAAAAGTTAATGGAACATAGGTAGACTTTTACTAAAAAATAAGAATTG 5269

 39008928 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 39008987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 TATGCATCTCATCACATATACGCTAGCTATATTACCTGCCATGATGAAAAGAATCATTAA 5329

 39008988 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 39009047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 TCACTTTTAAATAAAGTTTAATACAAATAATTAAAAAATAATGTTGGCATTTCAGTAATT 5389

 39009048 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 39009107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5390 TCCTGTAATTGTAATAATTAATGTAGGGTTGAAATATTTCTCAATTTAGTAACAAAGTTT 5449

 39009108 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 39009167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5450 TTTGGTTATTACATTTGTCATTCTATGTCCAGAGTACAAATGCATGAACCCATGCTACTT 5509

 39009168 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 39009227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 TGTCCTGGACCCACTACATAGGGCTGCCCCTGTAAAAGGTCATTCAGTATTACTGTCTGC 5569

 39009228 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTA 39009286
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5570 CTTTTTGACTTCTTGATTTTCAGAGTAAAACAAATTTTCTTTAGGACCTGCAAATATTA 5628

Alignment time is 4.08142 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [38994518,39015027] =>     20510 nucs '14 dna:chromosome chromosome:GRCh37:14:1:107349540:1'
Second seq [       1,    3514] =>      3514 nucs 'mol-32-34d4-198315_3514'

Score:        3441
Aligned:      3515        nucs
Identic:      3496 ( 99%) nucs =>      1639 ( 99%)      1857 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39002879,39004518] EXCISED REGION [39005028,39006886]
 second seq =>  [       1,    1655] EXCISED REGION [    1656,    3514]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       509 nucs [39004519,39005027]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39002879 TAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATT 39002938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAAGAGAAACTACAAGCTGCTTAATCTCAAAGCTGGGGTAACGTAAGTAAAGTGCATT 60

 39002939 CAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCA 39002998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGTCGAAGCCTGGAGGAGAGATGACCTGAAGCTTGGTAAGTTCTTCAAACCTGTAGCA 120

 39002999 GCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAA 39003058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAATAATATCATCCCATGCTTTCATCCTATGCCTGTCCAATGGGTACAATGAACTGTAA 180

 39003059 TGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGT 39003118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTGAGATACTCCTGAGATGGCAGCCTTCAGAAAAGACTTTTTGACACATAAAGCTTGT 240

 39003119 CGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGT 39003178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGATACTGACCCTTGTTTGTAAGCGTTCTTTAGTAATGTCTGTACTGGAACGAAGAGTGT 300

 39003179 CCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTT 39003238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCCTCAAAATTCACGTCCATCCAGAAGCTCAGAATGTGACCTTTGGAAATAGTGTCTTT 360

 39003239 GTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCC 39003298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTATATGTAACTAGTTATGTTATAGCAAAGTTATACTGGATTACGGTAGACCCTAAATCC 420

 39003299 AATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGA 39003358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGACTGATGTCCCTTTAAGAAGACTATGTAAAGACACAGAGAAGAAACCATATGAAGA 480

 39003359 CCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCAT 39003418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAAGGCAGAGACTGGATTGATGCATTGCAAGCTAAGGAATGCCAAGGATTGCCATCCAT 540

 39003419 CACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGG 39003478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACCAGAGGCTAGAAAAAGCAGAGGAAGATTCTTTCCTAGGGCCTTTGGAGGGAGTATGG 600

 39003479 CTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCT 39003538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTACTGAAATCTTCTTTTCAGACTTTCAGCCTCGAGAACTATAGAAGAATAAATTGCT 660

 39003539 GTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 39003598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTATTTTTAAACCATCCAGTTTGCAGTAATTTGGTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 720

 39003599 AT----------------GTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAG 39003642
          ||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTATTTATTTATTTATGTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTAGCCCAGGTTGGAGTGGAG 780

 39003643 TGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTC 39003702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTC 840

 39003703 AGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATT 39003762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCTCCCAAGCAGCTGGTATTACAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTATATT 900

 39003763 TTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAG 39003822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTAGTAGAGATGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAG 960

 39003823 TGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTG 39003882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGCGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTG 1020

 39003883 GCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATA 39003942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCCCAGTTCATAGTAATTTGTTACAGCAGCCATAAGAAACTAATTTTAAGTTAATAATA 1080

 39003943 ATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTT 39004002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTGCAAATGAAATCTATAGTCTCGTGGTTTAAAAAATTATTTATTGGGCTTTTAAGTT 1140

 39004003 ATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAG 39004062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAACAGCAATACAGATTTAATCTAACAAATCAAAATGTAGAAACTGATAAAGCCAAAAG 1200

 39004063 TAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTC 39004122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAAAGCCATACCTTTATAACACAGATTTTACCCTGAATATTTATATTTTTGACTTTTTC 1260

 39004123 TATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGAT 39004182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATGAATATATATAAGCACCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTACAAAACTAGGAT 1320

 39004183 CATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACA 39004242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATCCTGTGCATGTTTTTCATCTTGTTTTTCATTCACTATGTTAAAAAAATATATGGACA 1380

 39004243 CTTTTACATGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCC 39004302
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTTTAC-TGTCAATATATAGAAATCAACATCCTCCTTCGAGTAGGCTATGTAATATTCC 1439

 39004303 ATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGT 39004362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ATTAGAGCCACCATCTCATAATTCACATTTTATAAAATTCACATTTATTATCTACTATGT 1499

 39004363 GCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTT 39004422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GCTAGGAACAGAATATTTGTTTTCAAGGAGGAGGAGAGATACATAAGTAAAAAGGAAGTT 1559

 39004423 ATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAG 39004482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATATGGCAGTGTGAAAAATCCTTCAGTGGCCTCAAGCACAAGAAACTGTGGGGAGGGTAG 1619

 39004483 GTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 39004518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GTAGGATATTCCAAGCACAGGGAACAGATTATGCAA 1655

EXCISED REGION

 39005028 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 39005087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 GAAAATGATTAGCCTTAATGAAGCACCTTGTAGTTTATGCAAATTGGATCTGATTCACCA 1715

 39005088 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 39005147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CTGATATTGGACTTAAAATTCCTAATGACGTCTAGCTAATCAGCTTAATCACAGAGATGC 1775

 39005148 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 39005207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 CTAATGGGCTTTTTGTCTGAGGCCTTGATGTACTGCCTGGCTTTATTATGAGGTGATGGG 1835

 39005208 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 39005267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 GTGGGAGGCTACATGCCAACCATTTGCAATGGAGTGGGATAGTCTAGACACCAAGTTGCT 1895

 39005268 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 39005327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TCCATTTGGGAATACCTGAAACCTTCTCTCCACCTCATCTTTCTCAGTTCCAGTTATTAG 1955

 39005328 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 39005387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 GAGGAGAAACAGGTCTAAGTTCCCACCAATAATGCAAAAGGGCCCAATTATAGCAGAAAA 2015

 39005388 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 39005447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 AATTGAGACAGATACCCCCAAATCAGTTCATCTAAAAGTTTTTGATAATCAAGGTATTAA 2075

 39005448 GAAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 39005507
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 GGAAAATGTCCAATTGTTCATTCTGTAGGACTTTGGAATAAACCTGATGGATGAGAGGTT 2135

 39005508 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 39005567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TAGGCTGTCATAGCTGCAGTGCAATAAGGAAATGAAAGAGATGAACCCAGAAATCATTTT 2195

 39005568 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 39005627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CAGATAATTTAATTGACTTTAAGTCTGAAATAAATATGTAATGGAAGTTGTACTGTGTTA 2255

 39005628 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 39005687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TTAAGGATAAATTATCATTGAATTATTCTCTAATAGCTGATGCCTCAGGAACTATTTGGC 2315

 39005688 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 39005747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 AAATTCTTGTACCACGGGTGCATGCATGAGTCCTGGCTGAATGCTGTCTGCTCACCCACA 2375

 39005748 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 39005807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 TGGCTATCTGTCTGAAAGTGTCTGTGGCAATGGAGCCTGACTAAGACCAACATTTTATCC 2435

 39005808 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 39005867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 AGTTACAAAGCAGTTTATCAGCTGCCGGCATGGAGAAACTTCCTCAGCTAGTTAAGCCTT 2495

 39005868 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 39005927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 GCCTTATAATCATAATTTCTCATTCCTAGTCCCAGAATACTTTCCACTTAGCAGATCTTG 2555

 39005928 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 39005987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 CTTCCTGGCTTTATTGCTGAATCAGCCAATAATAACTAATTTTATGTCTCCTTTGAATCC 2615

 39005988 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 39006047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 TGCCAATCTGGCTTATTTGGGGAGAGAGAAAGTAGGAGAGTCAATCAAAGTAGTCACATT 2675

 39006048 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCAGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 39006107
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 TCACAGTCTCTCTGACAGCTTTTCGGAAGGAACTCATCTAAATTGCATTCCATTCACTCA 2735

 39006108 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 39006167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 GTCTGATGGATGTTTACTCAGAGGGTGCAGCAGCCAGTGGAGGGGCTCTGTTAAGCACTT 2795

 39006168 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 39006227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 GCGAAGGGCCTCCAACACCACACAGATAATCCCGGCCTTAGCTGTGTCTCCACTTGGATG 2855

 39006228 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 39006287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 TCTCAGGCCTCAGTGTTTTGGATTCCAAGAACTAATAAAATTGTCAAAGAATGTTGGTAG 2915

 39006288 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 39006347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 CCAATCCATATTTACCAGATTTTAGCAAATCTAGTTAGCAAACTGTCATCATTTCAGGAA 2975

 39006348 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 39006407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 AAGATCATTTTTAAACAACAACAACAACAAAACAGGAAGTTATTAACTAAGAATTTTTTT 3035

 39006408 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 39006467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TAAATCTTAGCATAAAAGGAGCATTATGAAAAATTCATTGCATTGTCCTTCTTTTTCCAT 3095

 39006468 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 39006527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 TTTTCTTCAAATTGGTGCAAACTTTCTTGCAGAAATGTGCCCTAGAAGGCAAAAACAATT 3155

 39006528 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 39006587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 GTTTTCCTCTTTATTTGAGGAAGATTAATAAGGAGAGAAGTGCAACAAATGAGAGTGTGT 3215

 39006588 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 39006647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 GTGACTTTCCATGCCAGTCTGTCTGTGTCCTTCTCCAGCAAATGTACCCAGGCACAATTT 3275

 39006648 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 39006707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 GAGGCCTTTTTCATGCCCTATGACCACGACTCCCCTCCGCAACTATTACCTCAGGAACCC 3335

 39006708 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 39006767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TCCTGAACCTCCTAGAATCTCGCATTGGACACTATCTTTTTAATATGTATCATATGTATG 3395

 39006768 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 39006827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 CTATTCAAAATTAAAAGTAAATTTTGAAGAAAAAAAACTCTACTTATGAGCCAATGTAAC 3455

 39006828 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAAT 39006886
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 AGAAGAAAAAAAAACTTATATTTTTTCTATTTCAACAAATGTACACTCTATAATAAAAT 3514

Alignment time is 2.57897 s

