
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3805] =>      3805 nucs 'mol-32-1e7c-143313_3805'

Score:        3804
Aligned:      3804        nucs
Identic:      3804 (100%) nucs =>      3163 (100%)       641 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83169270,83172432] EXCISED REGION [83172434,83173074]
 second seq =>  [       1,    3163] EXCISED REGION [    3165,    3805]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83172433,83172433]
 second seq =>         1 nucs [3164,3164]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83172433,83172433] to [83172434,83172434]
 second seq =>         1 nucs [3163,3163] to [3164,3164]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83169270 GCTAACATCATACTAAATAGGGAAAAATTACAAGCTTCTTCTCTCAGAACTGGAACAAGA 83169329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTAACATCATACTAAATAGGGAAAAATTACAAGCTTCTTCTCTCAGAACTGGAACAAGA 60

 83169330 CAAGGATACCTACTTTCACCATTCCTAATCAACATACTACTGGAAGTCTTAGCTAGAGCA 83169389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGGATACCTACTTTCACCATTCCTAATCAACATACTACTGGAAGTCTTAGCTAGAGCA 120

 83169390 ATTAGGCCAGAAAAGTAACGAAAGAAATTTAAATTAGAAAAGAGGAAGTCAAATTGTTTC 83169449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTAGGCCAGAAAAGTAACGAAAGAAATTTAAATTAGAAAAGAGGAAGTCAAATTGTTTC 180

 83169450 TTTTTTTTGGAGGTGATATGATCTTATATTTAGAAAAAACCAAAGACGTCACCTAAAACT 83169509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTTTTGGAGGTGATATGATCTTATATTTAGAAAAAACCAAAGACGTCACCTAAAACT 240

 83169510 GTTAAAGCTGATAAGCAAATTCAGTAAATGTGTAGTGTACAAAATTATCATACAAATAAC 83169569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTAAAGCTGATAAGCAAATTCAGTAAATGTGTAGTGTACAAAATTATCATACAAATAAC 300

 83169570 AGTAGTGTTTTTATGCATCGATATTGAAATAGCAGAAAAATAAGTCAAGAAGAAAATGCT 83169629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTAGTGTTTTTATGCATCGATATTGAAATAGCAGAAAAATAAGTCAAGAAGAAAATGCT 360

 83169630 GTTTAAAATAGCTACAAAATAAAACAAAATATTTATGAATAAAGTTAACCAAGTACGTGA 83169689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTAAAATAGCTACAAAATAAAACAAAATATTTATGAATAAAGTTAACCAAGTACGTGA 420

 83169690 AGATCTACAGAAATATGAATACTACAGTGCATTGATGAAGTAAACTGAAGAGAAGAAAAA 83169749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATCTACAGAAATATGAATACTACAGTGCATTGATGAAGTAAACTGAAGAGAAGAAAAA 480

 83169750 TGGAAAGATGTCTCATGCTCACAAATAGGAAAGATTAATATCAGTAAAATGACTACACTG 83169809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGAAAGATGTCTCATGCTCACAAATAGGAAAGATTAATATCAGTAAAATGACTACACTG 540

 83169810 CCAAAAGCCGTCTACAGATTTGATGCAATCCTGATCAAAACACCAATGTTATTTTTCACA 83169869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAAAAGCCGTCTACAGATTTGATGCAATCCTGATCAAAACACCAATGTTATTTTTCACA 600

 83169870 GACACAGAAAAAAAATACTAAAATTCGTATGGAAGCAAAAAAGAGCCATAATAGCCAAAG 83169929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACACAGAAAAAAAATACTAAAATTCGTATGGAAGCAAAAAAGAGCCATAATAGCCAAAG 660

 83169930 CAATTCTGAGCAAAAATAAGAAAGCTGGACGCTTCACATTACCCGATGTCAAAATATATT 83169989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATTCTGAGCAAAAATAAGAAAGCTGGACGCTTCACATTACCCGATGTCAAAATATATT 720

 83169990 ACAAGGCTATAGAAACCAAAACAGAATGGTATTGGTATACAAACAGACACATAGATTAAT 83170049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAAGGCTATAGAAACCAAAACAGAATGGTATTGGTATACAAACAGACACATAGATTAAT 780

 83170050 GGAACAGAATAGAGCACACAGCAATAAATCTACATATTTATCACCAACTGATTTTTGACA 83170109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAACAGAATAGAGCACACAGCAATAAATCTACATATTTATCACCAACTGATTTTTGACA 840

 83170110 AAAGCACCAAGAAAATACACTGGGGGAATCGACACCTTTTTCAGTAACGGTGCCAGGAAA 83170169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGCACCAAGAAAATACACTGGGGGAATCGACACCTTTTTCAGTAACGGTGCCAGGAAA 900

 83170170 ATTGGATATTCACATGCAGAAGAATGAAACTGAATCTCTATTTCTCATCATATACAAAAA 83170229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTGGATATTCACATGCAGAAGAATGAAACTGAATCTCTATTTCTCATCATATACAAAAA 960

 83170230 GCAACTCAAGATGAATTAAGAGTTAAACAGGAGACCCCAAACTATCAAATTACTAAAAGG 83170289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAACTCAAGATGAATTAAGAGTTAAACAGGAGACCCCAAACTATCAAATTACTAAAAGG 1020

 83170290 AAACATAGGAAAAACACTCCAAGACATTGGTTTAGGTTAAAGGTTTTATGGGAAAGTCCT 83170349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAACATAGGAAAAACACTCCAAGACATTGGTTTAGGTTAAAGGTTTTATGGGAAAGTCCT 1080

 83170350 TAAAAGCAGACACCAAAAATAAAACATATTGGACTATATTAAACTAAAAATTATCTGTAC 83170409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAAAGCAGACACCAAAAATAAAACATATTGGACTATATTAAACTAAAAATTATCTGTAC 1140

 83170410 AGCAATAAACAAAATAAAACAAGAAAGAAAAACAGTAAAGAGTCAACCTTTTGATATGAA 83170469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCAATAAACAAAATAAAACAAGAAAGAAAAACAGTAAAGAGTCAACCTTTTGATATGAA 1200

 83170470 TAGACATTTCTCAAAAGAAGACATACAAATGGCCAACAGGTATGTGAAAATATAATCAAC 83170529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGACATTTCTCAAAAGAAGACATACAAATGGCCAACAGGTATGTGAAAATATAATCAAC 1260

 83170530 ATCACTAAGCAACGAGGGAATGCATCAAAACCAAAATGAAATTTTACCTTACCCCAGTTA 83170589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCACTAAGCAACGAGGGAATGCATCAAAACCAAAATGAAATTTTACCTTACCCCAGTTA 1320

 83170590 GAATGGCTATTAATAAAAGACAAAAAATAACAGATGCTAGTGAGGATATGGAGAAAAGGA 83170649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAATGGCTATTAATAAAAGACAAAAAATAACAGATGCTAGTGAGGATATGGAGAAAAGGA 1380

 83170650 AACCCTTATTCACTGTTGGCAGGATTGTATGTAGTATAACCAATATAAAAAATAACATGA 83170709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACCCTTATTCACTGTTGGCAGGATTGTATGTAGTATAACCAATATAAAAAATAACATGA 1440

 83170710 CATTTTCTTTAAAAAACTAAAAATAGAATTGCCATATGATCCAGCAATCCCACTACTGGG 83170769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTTTCTTTAAAAAACTAAAAATAGAATTGCCATATGATCCAGCAATCCCACTACTGGG 1500

 83170770 TATCCATGCAAAGGAAAATAAATTAGTATTTCAGATGGATACCTGCACTCACATGTTTGT 83170829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATCCATGCAAAGGAAAATAAATTAGTATTTCAGATGGATACCTGCACTCACATGTTTGT 1560

 83170830 CACAGCACTATTCATAACAGCAAAAATATAGGAATTAACCTAAGTGACCAACAATGAACA 83170889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACAGCACTATTCATAACAGCAAAAATATAGGAATTAACCTAAGTGACCAACAATGAACA 1620

 83170890 AATGGACAAAGAAAATGTGGTATGTGTACAAAATAAAATATCATTTAGTCATAAAAAGAA 83170949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATGGACAAAGAAAATGTGGTATGTGTACAAAATAAAATATCATTTAGTCATAAAAAGAA 1680

 83170950 TAAAATTATGCCACTTGAAGCAACATAGCTGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAGAT 83171009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAAATTATGCCACTTGAAGCAACATAGCTGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAGAT 1740

 83171010 AGCCTATACACAAAAAAACAAATACCACATACCCTTACTCTTATGTGAGAGCTAAAAATC 83171069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGCCTATACACAAAAAAACAAATACCACATACCCTTACTCTTATGTGAGAGCTAAAAATC 1800

 83171070 TTTATGACATGAAAATAGAGATAGAATGATAGACACCAGAGTCTGGGAAGGGTGTGAGGG 83171129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTATGACATGAAAATAGAGATAGAATGATAGACACCAGAGTCTGGGAAGGGTGTGAGGG 1860

 83171130 TGAGAGGGGGAAATAAATGAAATTTGGTGAATGGGTACACATTGATAGTTAGATAAAAGA 83171189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAGAGGGGGAAATAAATGAAATTTGGTGAATGGGTACACATTGATAGTTAGATAAAAGA 1920

 83171190 AATAACTTGTAATGTTCTATAGTAGACTAGGGTGACCATAGTTGGTAACACTGTATTTTA 83171249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATAACTTGTAATGTTCTATAGTAGACTAGGGTGACCATAGTTGGTAACACTGTATTTTA 1980

 83171250 TATTTCTAAGTAGCTGGAAGAGAGGACTTAAAAATGTTACCAACCCATGGAAGTGATACT 83171309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTTCTAAGTAGCTGGAAGAGAGGACTTAAAAATGTTACCAACCCATGGAAGTGATACT 2040

 83171310 TAGAAATGGTAAATATTTAAGGTGATGCATACGCCAAATACCCTAAGTTGATCATTCCAC 83171369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGAAATGGTAAATATTTAAGGTGATGCATACGCCAAATACCCTAAGTTGATCATTCCAC 2100

 83171370 ATTCTATGCTCACATGTAACCCCCAAATATATAAAATATTATGCATAAAGGAAAAATAAA 83171429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTCTATGCTCACATGTAACCCCCAAATATATAAAATATTATGCATAAAGGAAAAATAAA 2160

 83171430 TACATTAAGAGATAATAAATTCAACTAAAGTGGAGATTTTATAGGTATGAAAATGTAGTT 83171489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACATTAAGAGATAATAAATTCAACTAAAGTGGAGATTTTATAGGTATGAAAATGTAGTT 2220

 83171490 AAACATTTGAAAAATTATCAATCAGTATAATTAATTACATGAGTTGAATTAGAAAAATTT 83171549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAACATTTGAAAAATTATCAATCAGTATAATTAATTACATGAGTTGAATTAGAAAAATTT 2280

 83171550 CTTGCTTATCCCAATAACGTGCCAACAAACATTTGATAAAAGGCATAGTAAATAGAAAAT 83171609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTGCTTATCCCAATAACGTGCCAACAAACATTTGATAAAAGGCATAGTAAATAGAAAAT 2340

 83171610 GAAATGGAACTCTCTTAATTTGATTCATAAGAGTACTTTTGAATAAATATCATGTGAAAA 83171669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAATGGAACTCTCTTAATTTGATTCATAAGAGTACTTTTGAATAAATATCATGTGAAAA 2400

 83171670 ATTATACATGTCTCTGTAAGACAGTTTTGGAAGTTATGACTTGACAAGAAAGCCAAGAAA 83171729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTATACATGTCTCTGTAAGACAGTTTTGGAAGTTATGACTTGACAAGAAAGCCAAGAAA 2460

 83171730 TTTTTAAAAAGAAAGAATACAGAGAAATTAAATAAATAAAACTGTTTTTCTTAGATATAT 83171789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTTAAAAAGAAAGAATACAGAGAAATTAAATAAATAAAACTGTTTTTCTTAGATATAT 2520

 83171790 GATTGCAAATGTAGAAATTTCTCCCCTAACCTTCCCAGATTAACTGCTACAACAAATAAA 83171849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATTGCAAATGTAGAAATTTCTCCCCTAACCTTCCCAGATTAACTGCTACAACAAATAAA 2580

 83171850 TGGAGTTAGTGAGTTGTCTATATAAAGAATTAATAGAGACATTTTTTAAGAAAACTTTTT 83171909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGAGTTAGTGAGTTGTCTATATAAAGAATTAATAGAGACATTTTTTAAGAAAACTTTTT 2640

 83171910 TTTTCCTAAATGAACGGTATGTAAGTAGAGTGAGTTAGTGAAAAAGCACCAGAGAAAGAG 83171969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTCCTAAATGAACGGTATGTAAGTAGAGTGAGTTAGTGAAAAAGCACCAGAGAAAGAG 2700

 83171970 AAGGTTAAGGAGAACCTGGTTTAATATGAATAGGCCACCTGTGTTTGCTAATTGGTATTT 83172029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGGTTAAGGAGAACCTGGTTTAATATGAATAGGCCACCTGTGTTTGCTAATTGGTATTT 2760

 83172030 ATCATAGTTAGGATCCTACCCTCCCACAGAGAATGAAAATAGGGACTCTATCCTTCATGA 83172089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATCATAGTTAGGATCCTACCCTCCCACAGAGAATGAAAATAGGGACTCTATCCTTCATGA 2820

 83172090 TAATTACATTTCAAAGAGATGGCTCCTGGGTCTTTGAGAAAGACATTCCTGAGCAAAACT 83172149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAATTACATTTCAAAGAGATGGCTCCTGGGTCTTTGAGAAAGACATTCCTGAGCAAAACT 2880

 83172150 GGCAAGAGGCTGGGGGAAGATTTACATCCCCAAGGGAAAGAGAAAAAATTTACAATTGCG 83172209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGCAAGAGGCTGGGGGAAGATTTACATCCCCAAGGGAAAGAGAAAAAATTTACAATTGCG 2940

 83172210 AGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCACGCT 83172269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCACGCT 3000

 83172270 TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAG 83172329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAG 3060

 83172330 ACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGCCAGA 83172389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGCCAGA 3120

 83172390 CGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA 83172432
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA 3163

EXCISED REGION

 83172434 GCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGACAAGATTGCACCATTG 83172493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 GCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGACAAGATTGCACCATTG 3224

 83172494 CATCCCAGCCTGGGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATAATTAATTAATTAATT 83172553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 CATCCCAGCCTGGGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATAATTAATTAATTAATT 3284

 83172554 AATTAAAAATAAAAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGGAAGTAACTGGTCTAA 83172613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 AATTAAAAATAAAAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGGAAGTAACTGGTCTAA 3344

 83172614 AAGTTTAGTCAAGCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAATGTCCATAACAAAAAT 83172673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 AAGTTTAGTCAAGCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAATGTCCATAACAAAAAT 3404

 83172674 CAGCATATTTATTTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGGATATTAGATTTTTCT 83172733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 CAGCATATTTATTTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGGATATTAGATTTTTCT 3464

 83172734 AGCTATCTTTTGTTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCAGCAAATGCAATATGT 83172793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 AGCTATCTTTTGTTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCAGCAAATGCAATATGT 3524

 83172794 ACAATATTAATTTTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATACTATTTTCCATATAT 83172853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 ACAATATTAATTTTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATACTATTTTCCATATAT 3584

 83172854 GTTCCAAAAGTTTCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACACATACACACACACAT 83172913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 GTTCCAAAAGTTTCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACACATACACACACACAT 3644

 83172914 ACATACACATATACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCATAACTATATACACAT 83172973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 ACATACACATATACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCATAACTATATACACAT 3704

 83172974 ATATGGATATATACAAGCATTTATATATACTATAAATGATATTCCACTATAGGATGAGAG 83173033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 ATATGGATATATACAAGCATTTATATATACTATAAATGATATTCCACTATAGGATGAGAG 3764

 83173034 ATATTTAATATGTTATGAACAGATTTTGCCATACTATATAA 83173074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 ATATTTAATATGTTATGAACAGATTTTGCCATACTATATAA 3805

Alignment time is 3.63526 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2629] =>      2629 nucs 'mol-32-1e87-015213_2629'

Score:        2629
Aligned:      2629        nucs
Identic:      2629 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164875,83167503]
 second seq =>  [       1,    2629]

 83164875 AGATATATATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCA 83164934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATATATATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCA 60

 83164935 TAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAG 83164994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAG 120

 83164995 AAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTG 83165054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTG 180

 83165055 GATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACA 83165114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACA 240

 83165115 ACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATA 83165174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATA 300

 83165175 GTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGC 83165234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGC 360

 83165235 CAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTG 83165294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTG 420

 83165295 TTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTC 83165354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTC 480

 83165355 TCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACC 83165414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACC 540

 83165415 TCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAA 83165474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAA 600

 83165475 GCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCC 83165534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCC 660

 83165535 AGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 83165594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 720

 83165595 GGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATT 83165654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATT 780

 83165655 ACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATT 83165714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATT 840

 83165715 GTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGG 83165774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGG 900

 83165775 GATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAA 83165834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAA 960

 83165835 AAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTG 83165894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTG 1020

 83165895 AGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACA 83165954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACA 1080

 83165955 ACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCC 83166014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCC 1140

 83166015 TTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAA 83166074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAA 1200

 83166075 GGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGT 83166134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGT 1260

 83166135 GCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGG 83166194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGG 1320

 83166195 GACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGG 83166254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGG 1380

 83166255 CTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGT 83166314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGT 1440

 83166315 ACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCA 83166374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCA 1500

 83166375 GCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCC 83166434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCC 1560

 83166435 ACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTC 83166494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTC 1620

 83166495 CTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAG 83166554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAG 1680

 83166555 AGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAG 83166614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAG 1740

 83166615 CCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTC 83166674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTC 1800

 83166675 TGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACC 83166734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACC 1860

 83166735 ACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTA 83166794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTA 1920

 83166795 CACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGT 83166854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGT 1980

 83166855 CCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCA 83166914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCA 2040

 83166915 CCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCT 83166974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCT 2100

 83166975 GGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGC 83167034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGC 2160

 83167035 CTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACT 83167094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACT 2220

 83167095 CTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCA 83167154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCA 2280

 83167155 GAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACC 83167214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACC 2340

 83167215 ATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGA 83167274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGA 2400

 83167275 AAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATC 83167334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATC 2460

 83167335 AAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAA 83167394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAA 2520

 83167395 CAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAAACTCAGTGAA 83167454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAAACTCAGTGAA 2580

 83167455 ATATAAAAGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAATAATTC 83167503
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATAAAAGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAATAATTC 2629

Alignment time is 2.2277 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5235] =>      5235 nucs 'mol-32-21f7-006166_5235'

Score:        5235
Aligned:      5235        nucs
Identic:      5235 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83161485,83166719]
 second seq =>  [       1,    5235]

 83161485 TTTCTGTTAGATCTTTACTTCCTTTCCAGAAGACAAGGGCACTCATTTGAAAATATGTGA 83161544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTGTTAGATCTTTACTTCCTTTCCAGAAGACAAGGGCACTCATTTGAAAATATGTGA 60

 83161545 CTGAGAGCAAAATCTGAGCACCTATTTTGATGTGTAACTGAAAAATAAATGTGGATTATA 83161604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGAGAGCAAAATCTGAGCACCTATTTTGATGTGTAACTGAAAAATAAATGTGGATTATA 120

 83161605 TGTATAAAACAATGAACACTTAGATTACTCTTATCTGGAATAGTATATGTCAAAAAGAAA 83161664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTATAAAACAATGAACACTTAGATTACTCTTATCTGGAATAGTATATGTCAAAAAGAAA 180

 83161665 AGCTAAGGAGACCATCTGGTGTAGGTAAAAGCTAAGGAGACTGTTTCATCAAGGTTAAAT 83161724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTAAGGAGACCATCTGGTGTAGGTAAAAGCTAAGGAGACTGTTTCATCAAGGTTAAAT 240

 83161725 GAATCAGCAAACGTTATGACAATAAATAATATCAAAGTTATTTCTAGAAAACACTTCATG 83161784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAATCAGCAAACGTTATGACAATAAATAATATCAAAGTTATTTCTAGAAAACACTTCATG 300

 83161785 ATCCTAGTCCAGTGACTTCCCTTCCATATTGTTGTTTCCTTATAGATATATTTCAGATGA 83161844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCCTAGTCCAGTGACTTCCCTTCCATATTGTTGTTTCCTTATAGATATATTTCAGATGA 360

 83161845 AACGTTTTAAAAACTGTATTTAGTTTTACTAATAAACACATATATGTATGATTTACAAAA 83161904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACGTTTTAAAAACTGTATTTAGTTTTACTAATAAACACATATATGTATGATTTACAAAA 420

 83161905 TAAAATGTAGGCTCATGACAACTGGGATTTTGTCATTTCTAGGGCAACATAAACTTGTAT 83161964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAATGTAGGCTCATGACAACTGGGATTTTGTCATTTCTAGGGCAACATAAACTTGTAT 480

 83161965 GGTTCATTCTCATTACTGAGTATAATTGAGAATTTATCTCTTGAGTATTTTACAAGCATT 83162024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTTCATTCTCATTACTGAGTATAATTGAGAATTTATCTCTTGAGTATTTTACAAGCATT 540

 83162025 TATAAATGTAAATGATTTGGAAATTATCAATAGCATTATAATGCTAGATATAAACTAAGG 83162084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATAAATGTAAATGATTTGGAAATTATCAATAGCATTATAATGCTAGATATAAACTAAGG 600

 83162085 TGAGCTTAGCAGTCAGCCTTAATTAATATCCTCAAATATTTAAAGCAAATGCATAGTTGT 83162144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGCTTAGCAGTCAGCCTTAATTAATATCCTCAAATATTTAAAGCAAATGCATAGTTGT 660

 83162145 GTATGTTTAAGTGTGTGATAATAAGATAAAAAAGTTAAAGAAAGAAGAAAGATAGGGAGA 83162204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTATGTTTAAGTGTGTGATAATAAGATAAAAAAGTTAAAGAAAGAAGAAAGATAGGGAGA 720

 83162205 CTACAAGATTAATATTTAACTTCAGATATTGCAAACATAAATGAGAAAAGAACAGTCTAC 83162264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTACAAGATTAATATTTAACTTCAGATATTGCAAACATAAATGAGAAAAGAACAGTCTAC 780

 83162265 ATAAATGTATACAGTCTGTAAATATATAGACTATATGTAAAAAGAGAGATATTTTTTTTT 83162324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAATGTATACAGTCTGTAAATATATAGACTATATGTAAAAAGAGAGATATTTTTTTTT 840

 83162325 GCTGTTTTGAGCTTTTCTATTTTTCAACATTTCCTTTACAATATCTTGTTAAATAGTTAT 83162384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTGTTTTGAGCTTTTCTATTTTTCAACATTTCCTTTACAATATCTTGTTAAATAGTTAT 900

 83162385 GGCTGAAATATTTTTATGTTATTATTTAGAATTGACACCAAACTTCTGATACTAGAATTC 83162444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCTGAAATATTTTTATGTTATTATTTAGAATTGACACCAAACTTCTGATACTAGAATTC 960

 83162445 TGTTAACTTGAGAATAGCTTCAAGCACAAGAAAATTTATTCTAATGAGTGAATTTTTTCA 83162504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTAACTTGAGAATAGCTTCAAGCACAAGAAAATTTATTCTAATGAGTGAATTTTTTCA 1020

 83162505 AAATGTGTTTGGAGGAATGTTGAAGAGAAAAACCAGCAAAAGGATTACTTTTTTCTTCAA 83162564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATGTGTTTGGAGGAATGTTGAAGAGAAAAACCAGCAAAAGGATTACTTTTTTCTTCAA 1080

 83162565 ATATTCCAGTAAGACCTAAAATTAAATCTGTGATTGTTATTAATATGATTAATGTTCTAT 83162624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATTCCAGTAAGACCTAAAATTAAATCTGTGATTGTTATTAATATGATTAATGTTCTAT 1140

 83162625 TGTTTTGATAGTTTTATTTTATATCATAGATCAATCTCTTAAAAAGAAATAGCAATACAA 83162684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTTTGATAGTTTTATTTTATATCATAGATCAATCTCTTAAAAAGAAATAGCAATACAA 1200

 83162685 TTCAGTGATTTAGTTACTCAGTCTGACATAATGTGTATAGAAGCATTACAATTTATAACC 83162744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCAGTGATTTAGTTACTCAGTCTGACATAATGTGTATAGAAGCATTACAATTTATAACC 1260

 83162745 ATTCATCTTCTTGTAGCTTTATTTTTTAATTATTTATTTATTTATTTATTTGAGATGGAG 83162804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTCATCTTCTTGTAGCTTTATTTTTTAATTATTTATTTATTTATTTATTTGAGATGGAG 1320

 83162805 TTTTGCTCTGTCACCAAGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 83162864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTGCTCTGTCACCAAGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 1380

 83162865 CTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCCCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTATG 83162924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCCCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTATG 1440

 83162925 CGCTGCCACCACACTCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAAACGAGTTTCACCATGTTG 83162984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGCTGCCACCACACTCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAAACGAGTTTCACCATGTTG 1500

 83162985 GTCAAGATGGTCTCTATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGCT 83163044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCAAGATGGTCTCTATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGCT 1560

 83163045 GGGATTACAGGGGTGAACCACCGCGCCTGGCCTTCTTCTGGCTTTTTAAATGTGTTATCT 83163104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGGATTACAGGGGTGAACCACCGCGCCTGGCCTTCTTCTGGCTTTTTAAATGTGTTATCT 1620

 83163105 TATTTCTTTATAACTGAGGTAAACACTTCATTTGTGGAAAAAAATGAATTAAAGAATGTT 83163164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATTTCTTTATAACTGAGGTAAACACTTCATTTGTGGAAAAAAATGAATTAAAGAATGTT 1680

 83163165 TATTTGTTCCTGACTCTTCCACGTTCTCTACTTTATGCAAGGTTCTATATATTGGCTTTT 83163224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATTTGTTCCTGACTCTTCCACGTTCTCTACTTTATGCAAGGTTCTATATATTGGCTTTT 1740

 83163225 GGATTAGCTGGTCTTTCTCTTTTTATTTATTCTGTTCTTTCTCCATTTATTTTTTTTCAT 83163284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGATTAGCTGGTCTTTCTCTTTTTATTTATTCTGTTCTTTCTCCATTTATTTTTTTTCAT 1800

 83163285 TTGTTCTCACTTACAACAGCACTGTCCAGTTATGAAAGTATCAAGATGTAGAAGAGATTT 83163344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGTTCTCACTTACAACAGCACTGTCCAGTTATGAAAGTATCAAGATGTAGAAGAGATTT 1860

 83163345 TGAGAGTTTGCCCTGAATTTAATTCAGAACAGAGTTTAGAATCTGACTTGACACTTAATA 83163404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAGAGTTTGCCCTGAATTTAATTCAGAACAGAGTTTAGAATCTGACTTGACACTTAATA 1920

 83163405 ATTAGATAATCTAATTAAATTAATTAGACAATCTGAGGTTGAGTACCTTGATTTGAGTAT 83163464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTAGATAATCTAATTAAATTAATTAGACAATCTGAGGTTGAGTACCTTGATTTGAGTAT 1980

 83163465 TGTTAACATAAAATGTAACACTATATATATTCATCTGACATTTATATAGGATGGTATCCC 83163524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTTAACATAAAATGTAACACTATATATATTCATCTGACATTTATATAGGATGGTATCCC 2040

 83163525 AAAGAGCCAATGATGTTGTTGATATGGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAACCTCATCTTGA 83163584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAGAGCCAATGATGTTGTTGATATGGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAACCTCATCTTGA 2100

 83163585 ATTGTAGCTCCCATAATTTCTACATGTCATGGGAAAAACCCGGTGCGAGGTAATTGAATC 83163644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTGTAGCTCCCATAATTTCTACATGTCATGGGAAAAACCCGGTGCGAGGTAATTGAATC 2160

 83163645 ATGGGGTGGGGGGGGTATTTCCCATGCTGTTCTTGTAATAGTGAACAAGTTTCATGAGAT 83163704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGGGGTGGGGGGGGTATTTCCCATGCTGTTCTTGTAATAGTGAACAAGTTTCATGAGAT 2220

 83163705 CTGATGGTTTTATAAAGGGGAGTTTTCCTACACACTCTCTTTTGCCTGCCTCCATGTAAG 83163764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGATGGTTTTATAAAGGGGAGTTTTCCTACACACTCTCTTTTGCCTGCCTCCATGTAAG 2280

 83163765 ACATGACTTTGTTCCTCCTTGCCTGCCACCATGATTGTGAAGCCTCCCCAGCCATGTGGA 83163824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACATGACTTTGTTCCTCCTTGCCTGCCACCATGATTGTGAAGCCTCCCCAGCCATGTGGA 2340

 83163825 ACTGTGAGTCAGTTTAACCTCTTTCATTTGTAAATTACCCAGTCTCAGGCATGTCTTTAT 83163884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACTGTGAGTCAGTTTAACCTCTTTCATTTGTAAATTACCCAGTCTCAGGCATGTCTTTAT 2400

 83163885 TAACAGCATAGCAATGGACTAATACAGCTGCCGTCAATGAGATTATAGTCCAATATTATA 83163944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAACAGCATAGCAATGGACTAATACAGCTGCCGTCAATGAGATTATAGTCCAATATTATA 2460

 83163945 TTAAATATATGTCATCTTAGTAAACATAATCGTCACAAATATGGATTGTTTGACTTGATT 83164004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAAATATATGTCATCTTAGTAAACATAATCGTCACAAATATGGATTGTTTGACTTGATT 2520

 83164005 TGAGGTATGAAAGAGCTAAGTGAAAATAATAAAATGTTAATTGATTAGTGGCCCAAATAG 83164064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAGGTATGAAAGAGCTAAGTGAAAATAATAAAATGTTAATTGATTAGTGGCCCAAATAG 2580

 83164065 AGAGGTTAAGATGTCATGAAAACTAAAAGACAGATTTTCATGAAACAAAGACATCAATTA 83164124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGAGGTTAAGATGTCATGAAAACTAAAAGACAGATTTTCATGAAACAAAGACATCAATTA 2640

 83164125 TTTCAAATAGTGGTGAGCTATCAAAATTTAGGCATATTAAAAGTTGGTCTTTGGAGTAAA 83164184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTCAAATAGTGGTGAGCTATCAAAATTTAGGCATATTAAAAGTTGGTCTTTGGAGTAAA 2700

 83164185 AATCTAGAAGTCACTTGTTACAAGAGAAGGGATATTTTATTGGGATAGTAGGGCATAGAT 83164244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATCTAGAAGTCACTTGTTACAAGAGAAGGGATATTTTATTGGGATAGTAGGGCATAGAT 2760

 83164245 GCATGTTGGATTGAATTGAAGAGAGAAAAAAATTCTAGTTTTCCATAAGTGTGAATTAAA 83164304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCATGTTGGATTGAATTGAAGAGAGAAAAAAATTCTAGTTTTCCATAAGTGTGAATTAAA 2820

 83164305 AACAATAAAAATGGTGGACAAATTGTGAAACAACTAAATTTCAAAACCAAAACATCATCT 83164364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACAATAAAAATGGTGGACAAATTGTGAAACAACTAAATTTCAAAACCAAAACATCATCT 2880

 83164365 TAAAAATATTGAAGGACAAAAATAAAGGTCAAAAAATTGAGAACTTTCAATGAGGTGCTA 83164424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAAAAATATTGAAGGACAAAAATAAAGGTCAAAAAATTGAGAACTTTCAATGAGGTGCTA 2940

 83164425 TAAATAGAAATGCAATCACCACATAATATTAAAGCACTATTGTAAGAATACAGAAACATT 83164484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAAATAGAAATGCAATCACCACATAATATTAAAGCACTATTGTAAGAATACAGAAACATT 3000

 83164485 AAATGTAAGAAAACAGAAAAATTTATATATTATATAAGTGTATATACACAATGAGACTGA 83164544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAATGTAAGAAAACAGAAAAATTTATATATTATATAAGTGTATATACACAATGAGACTGA 3060

 83164545 CCAAAACAAGCTGATTGATATCTGAAAATAACTTAGAGCAAATGCTATGGGAAACAAATA 83164604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCAAAACAAGCTGATTGATATCTGAAAATAACTTAGAGCAAATGCTATGGGAAACAAATA 3120

 83164605 TGCAAATTTTGCAATAATCAGGAATGAAATCCAATGAAATGATACAATAATTTAAAATAT 83164664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGCAAATTTTGCAATAATCAGGAATGAAATCCAATGAAATGATACAATAATTTAAAATAT 3180

 83164665 TTCTATACCTGAAAGAATACCTACATTATATAAAGATAGAGAAAGAAAAGGCTAAATAGA 83164724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCTATACCTGAAAGAATACCTACATTATATAAAGATAGAGAAAGAAAAGGCTAAATAGA 3240

 83164725 TGAATTCACACAAACCATTGTGATATTGTAATATAAGTCAGTGTATAAGTAGTAGTACAT 83164784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGAATTCACACAAACCATTGTGATATTGTAATATAAGTCAGTGTATAAGTAGTAGTACAT 3300

 83164785 GCAGGTAATCATAAAGCATATAGATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGAA 83164844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCAGGTAATCATAAAGCATATAGATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGAA 3360

 83164845 TGTCTATTAAACATCAAACCCCAAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCATATGGAA 83164904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGTCTATTAAACATCAAACCCCAAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCATATGGAA 3420

 83164905 TTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAAC 83164964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAAC 3480

 83164965 TGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAG 83165024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAG 3540

 83165025 AGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACA 83165084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACA 3600

 83165085 ATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACT 83165144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACT 3660

 83165145 GGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTA 83165204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTA 3720

 83165205 CAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTAT 83165264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTAT 3780

 83165265 CAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAA 83165324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAA 3840

 83165325 AATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTG 83165384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTG 3900

 83165385 GCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAG 83165444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAG 3960

 83165445 CCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTT 83165504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTT 4020

 83165505 TAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAA 83165564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAA 4080

 83165565 GTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAAC 83165624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAAC 4140

 83165625 TGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACA 83165684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACA 4200

 83165685 AGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTA 83165744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTA 4260

 83165745 TAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAG 83165804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAG 4320

 83165805 AGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAA 83165864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAA 4380

 83165865 GAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGG 83165924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGG 4440

 83165925 TATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTAC 83165984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTAC 4500

 83165985 AATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCT 83166044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCT 4560

 83166045 GCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTAT 83166104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTAT 4620

 83166105 TCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCT 83166164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCT 4680

 83166165 GTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTA 83166224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTA 4740

 83166225 GACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGG 83166284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGG 4800

 83166285 ACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGG 83166344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGG 4860

 83166345 TGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACAC 83166404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACAC 4920

 83166405 TTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCA 83166464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCA 4980

 83166465 TCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTT 83166524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTT 5040

 83166525 TGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATG 83166584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATG 5100

 83166585 AATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACC 83166644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACC 5160

 83166645 ACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTAT 83166704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTAT 5220

 83166705 TACCATAGAAGGCAT 83166719
          |||||||||||||||
     5221 TACCATAGAAGGCAT 5235

Alignment time is 5.20065 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2400] =>      2400 nucs 'mol-32-2874-089254_2400'

Score:        2377
Aligned:      2399        nucs
Identic:      2397 (100%) nucs =>       422 (100%)      1975 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83170676,83171097] EXCISED REGION [83171099,83173075]
 second seq =>  [       1,     422] EXCISED REGION [     424,    2400]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83171098,83171098]
 second seq =>         1 nucs [423,423]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [422,422] to [423,423]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83170676 GTATGTAGTATAACCAATATAAAAAATAACATGACATTTTCTTTAAAAAACTAAAAATAG 83170735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATGTAGTATAACCAATATAAAAAATAACATGACATTTTCTTTAAAAAACTAAAAATAG 60

 83170736 AATTGCCATATGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCATGCAAAGGAAAATAAATTAG 83170795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTGCCATATGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCATGCAAAGGAAAATAAATTAG 120

 83170796 TATTTCAGATGGATACCTGCACTCACATGTTTGTCACAGCACTATTCATAACAGCAAAAA 83170855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTCAGATGGATACCTGCACTCACATGTTTGTCACAGCACTATTCATAACAGCAAAAA 180

 83170856 TATAGGAATTAACCTAAGTGACCAACAATGAACAAATGGACAAAGAAAATGTGGTATGTG 83170915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAGGAATTAACCTAAGTGACCAACAATGAACAAATGGACAAAGAAAATGTGGTATGTG 240

 83170916 TACAAAATAAAATATCATTTAGTCATAAAAAGAATAAAATTATGCCACTTGAAGCAACAT 83170975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACAAAATAAAATATCATTTAGTCATAAAAAGAATAAAATTATGCCACTTGAAGCAACAT 300

 83170976 AGCTGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAGATAGCCTATACACAAAAAAACAAATACC 83171035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAGATAGCCTATACACAAAAAAACAAATACC 360

 83171036 ACATACCCTTACTCTTATGTGAGAGCTAAAAATCTTTATGACATGAAAATAGAGATAGAA 83171095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATACCCTTACTCTTATGTGAGAGCTAAAAATCTTTATGACATGAAAATAGAGATAGAA 420

 83171096 TG 83171097
          ||
      421 TG 422

EXCISED REGION

 83171099 TAGACACCAGAGTCTGGGAAGGGTGTGAGGGTGAGAGGGGGAAATAAATGAAATTTGGTG 83171158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 TAGACACCAGAGTCTGGGAAGGGTGTGAGGGTGAGAGGGGGAAATAAATGAAATTTGGTG 483

 83171159 AATGGGTACACATTGATAGTTAGATAAAAGAAATAACTTGTAATGTTCTATAGTAGACTA 83171218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      484 AATGGGTACACATTGATAGTTAGATAAAAGAAATAACTTGTATTGTTCTATAGTAGACTA 543

 83171219 GGGTGACCATAGTTGGTAACACTGTATTTTATATTTCTAAGTAGCTGGAAGAGAGGACTT 83171278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 GGGTGACCATAGTTGGTAACACTGTATTTTATATTTCTAAGTAGCTGGAAGAGAGGACTT 603

 83171279 AAAAATGTTACCAACCCATGGAAGTGATACTTAGAAATGGTAAATATTTAAGGTGATGCA 83171338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAAAATGTTACCAACCCATGGAAGTGATACTTAGAAATGGTAAATATTTAAGGTGATGCA 663

 83171339 TACGCCAAATACCCTAAGTTGATCATTCCACATTCTATGCTCACATGTAACCCCCAAATA 83171398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 TACGCCAAATACCCTAAGTTGATCATTCCACATTCTATGCTCACATGTAACCCCCAAATA 723

 83171399 TATAAAATATTATGCATAAAGGAAAAATAAATACATTAAGAGATAATAAATTCAACTAAA 83171458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TATAAAATATTATGCATAAAGGAAAAATAAATACATTAAGAGATAATAAATTCAACTAAA 783

 83171459 GTGGAGATTTTATAGGTATGAAAATGTAGTTAAACATTTGAAAAATTATCAATCAGTATA 83171518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 GTGGAGATTTTATAGGTATGAAAATGTAGTTAAACATTTGAAAAATTATCAATCAGTATA 843

 83171519 ATTAATTACATGAGTTGAATTAGAAAAATTTCTTGCTTATCCCAATAACGTGCCAACAAA 83171578
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 ATTAATTACATGAGTTGAACTAGAAAAATTTCTTGCTTATCCCAATAACGTGCCAACAAA 903

 83171579 CATTTGATAAAAGGCATAGTAAATAGAAAATGAAATGGAACTCTCTTAATTTGATTCATA 83171638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 CATTTGATAAAAGGCATAGTAAATAGAAAATGAAATGGAACTCTCTTAATTTGATTCATA 963

 83171639 AGAGTACTTTTGAATAAATATCATGTGAAAAATTATACATGTCTCTGTAAGACAGTTTTG 83171698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 AGAGTACTTTTGAATAAATATCATGTGAAAAATTATACATGTCTCTGTAAGACAGTTTTG 1023

 83171699 GAAGTTATGACTTGACAAGAAAGCCAAGAAATTTTTAAAAAGAAAGAATACAGAGAAATT 83171758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 GAAGTTATGACTTGACAAGAAAGCCAAGAAATTTTTAAAAAGAAAGAATACAGAGAAATT 1083

 83171759 AAATAAATAAAACTGTTTTTCTTAGATATATGATTGCAAATGTAGAAATTTCTCCCCTAA 83171818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAATAAATAAAACTGTTTTTCTTAGATATATGATTGCAAATGTAGAAATTTCTCCCCTAA 1143

 83171819 CCTTCCCAGATTAACTGCTACAACAAATAAATGGAGTTAGTGAGTTGTCTATATAAAGAA 83171878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 CCTTCCCAGATTAACTGCTACAACAAATAAATGGAGTTAGTGAGTTGTCTATATAAAGAA 1203

 83171879 TTAATAGAGACATTTTTTAAGAAAACTTTTTTTTTCCTAAATGAACGGTATGTAAGTAGA 83171938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 TTAATAGAGACATTTTTTAAGAAAACTTTTTTTTTCCTAAATGAACGGTATGTAAGTAGA 1263

 83171939 GTGAGTTAGTGAAAAAGCACCAGAGAAAGAGAAGGTTAAGGAGAACCTGGTTTAATATGA 83171998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GTGAGTTAGTGAAAAAGCACCAGAGAAAGAGAAGGTTAAGGAGAACCTGGTTTAATATGA 1323

 83171999 ATAGGCCACCTGTGTTTGCTAATTGGTATTTATCATAGTTAGGATCCTACCCTCCCACAG 83172058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 ATAGGCCACCTGTGTTTGCTAATTGGTATTTATCATAGTTAGGATCCTACCCTCCCACAG 1383

 83172059 AGAATGAAAATAGGGACTCTATCCTTCATGATAATTACATTTCAAAGAGATGGCTCCTGG 83172118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 AGAATGAAAATAGGGACTCTATCCTTCATGATAATTACATTTCAAAGAGATGGCTCCTGG 1443

 83172119 GTCTTTGAGAAAGACATTCCTGAGCAAAACTGGCAAGAGGCTGGGGGAAGATTTACATCC 83172178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 GTCTTTGAGAAAGACATTCCTGAGCAAAACTGGCAAGAGGCTGGGGGAAGATTTACATCC 1503

 83172179 CCAAGGGAAAGAGAAAAAATTTACAATTGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAG 83172238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 CCAAGGGAAAGAGAAAAAATTTACAATTGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAG 1563

 83172239 GGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGG 83172298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGG 1623

 83172299 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCG 83172358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCG 1683

 83172359 TCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCT 83172418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCT 1743

 83172419 ACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGAC 83172478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 ACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGAC 1803

 83172479 AAGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTGGGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATA 83172538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AAGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTGGGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATA 1863

 83172539 ATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGG 83172598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 ATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGG 1923

 83172599 AAGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAAGCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAAT 83172658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 AAGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAAGCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAAT 1983

 83172659 GTCCATAACAAAAATCAGCATATTTATTTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGG 83172718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 GTCCATAACAAAAATCAGCATATTTATTTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGG 2043

 83172719 ATATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTGTTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCA 83172778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTGTTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCA 2103

 83172779 GCAAATGCAATATGTACAATATTAATTTTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATA 83172838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 GCAAATGCAATATGTACAATATTAATTTTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATA 2163

 83172839 CTATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTTTCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACA 83172898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CTATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTTTCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACA 2223

 83172899 CATACACACACACATACATACACATATACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCA 83172958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CATACACACACACATACATACACATATACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCA 2283

 83172959 TAACTATATACACATATATGGATATATACAAGCATTTATATATACTATAAATGATATTCC 83173018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TAACTATATACACATATATGGATATATACAAGCATTTATATATACTATAAATGATATTCC 2343

 83173019 ACTATAGGATGAGAGATATTTAATATGTTATGAACAGATTTTGCCATACTATATAAT 83173075
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 ACTATAGGATGAGAGATATTTAATATGTTATGAACAGATTTTGCCATACTATATAAT 2400

Alignment time is 2.22207 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2821] =>      2821 nucs 'mol-32-2af2-043625_2821'

Score:        2821
Aligned:      2821        nucs
Identic:      2821 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83169383,83172203]
 second seq =>  [       1,    2821]

 83169383 TAGAGCAATTAGGCCAGAAAAGTAACGAAAGAAATTTAAATTAGAAAAGAGGAAGTCAAA 83169442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAGCAATTAGGCCAGAAAAGTAACGAAAGAAATTTAAATTAGAAAAGAGGAAGTCAAA 60

 83169443 TTGTTTCTTTTTTTTGGAGGTGATATGATCTTATATTTAGAAAAAACCAAAGACGTCACC 83169502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTTTCTTTTTTTTGGAGGTGATATGATCTTATATTTAGAAAAAACCAAAGACGTCACC 120

 83169503 TAAAACTGTTAAAGCTGATAAGCAAATTCAGTAAATGTGTAGTGTACAAAATTATCATAC 83169562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAACTGTTAAAGCTGATAAGCAAATTCAGTAAATGTGTAGTGTACAAAATTATCATAC 180

 83169563 AAATAACAGTAGTGTTTTTATGCATCGATATTGAAATAGCAGAAAAATAAGTCAAGAAGA 83169622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATAACAGTAGTGTTTTTATGCATCGATATTGAAATAGCAGAAAAATAAGTCAAGAAGA 240

 83169623 AAATGCTGTTTAAAATAGCTACAAAATAAAACAAAATATTTATGAATAAAGTTAACCAAG 83169682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATGCTGTTTAAAATAGCTACAAAATAAAACAAAATATTTATGAATAAAGTTAACCAAG 300

 83169683 TACGTGAAGATCTACAGAAATATGAATACTACAGTGCATTGATGAAGTAAACTGAAGAGA 83169742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACGTGAAGATCTACAGAAATATGAATACTACAGTGCATTGATGAAGTAAACTGAAGAGA 360

 83169743 AGAAAAATGGAAAGATGTCTCATGCTCACAAATAGGAAAGATTAATATCAGTAAAATGAC 83169802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAAAAATGGAAAGATGTCTCATGCTCACAAATAGGAAAGATTAATATCAGTAAAATGAC 420

 83169803 TACACTGCCAAAAGCCGTCTACAGATTTGATGCAATCCTGATCAAAACACCAATGTTATT 83169862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACACTGCCAAAAGCCGTCTACAGATTTGATGCAATCCTGATCAAAACACCAATGTTATT 480

 83169863 TTTCACAGACACAGAAAAAAAATACTAAAATTCGTATGGAAGCAAAAAAGAGCCATAATA 83169922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCACAGACACAGAAAAAAAATACTAAAATTCGTATGGAAGCAAAAAAGAGCCATAATA 540

 83169923 GCCAAAGCAATTCTGAGCAAAAATAAGAAAGCTGGACGCTTCACATTACCCGATGTCAAA 83169982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCAAAGCAATTCTGAGCAAAAATAAGAAAGCTGGACGCTTCACATTACCCGATGTCAAA 600

 83169983 ATATATTACAAGGCTATAGAAACCAAAACAGAATGGTATTGGTATACAAACAGACACATA 83170042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATATTACAAGGCTATAGAAACCAAAACAGAATGGTATTGGTATACAAACAGACACATA 660

 83170043 GATTAATGGAACAGAATAGAGCACACAGCAATAAATCTACATATTTATCACCAACTGATT 83170102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATTAATGGAACAGAATAGAGCACACAGCAATAAATCTACATATTTATCACCAACTGATT 720

 83170103 TTTGACAAAAGCACCAAGAAAATACACTGGGGGAATCGACACCTTTTTCAGTAACGGTGC 83170162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGACAAAAGCACCAAGAAAATACACTGGGGGAATCGACACCTTTTTCAGTAACGGTGC 780

 83170163 CAGGAAAATTGGATATTCACATGCAGAAGAATGAAACTGAATCTCTATTTCTCATCATAT 83170222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGGAAAATTGGATATTCACATGCAGAAGAATGAAACTGAATCTCTATTTCTCATCATAT 840

 83170223 ACAAAAAGCAACTCAAGATGAATTAAGAGTTAAACAGGAGACCCCAAACTATCAAATTAC 83170282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAAAAGCAACTCAAGATGAATTAAGAGTTAAACAGGAGACCCCAAACTATCAAATTAC 900

 83170283 TAAAAGGAAACATAGGAAAAACACTCCAAGACATTGGTTTAGGTTAAAGGTTTTATGGGA 83170342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAAGGAAACATAGGAAAAACACTCCAAGACATTGGTTTAGGTTAAAGGTTTTATGGGA 960

 83170343 AAGTCCTTAAAAGCAGACACCAAAAATAAAACATATTGGACTATATTAAACTAAAAATTA 83170402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTCCTTAAAAGCAGACACCAAAAATAAAACATATTGGACTATATTAAACTAAAAATTA 1020

 83170403 TCTGTACAGCAATAAACAAAATAAAACAAGAAAGAAAAACAGTAAAGAGTCAACCTTTTG 83170462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGTACAGCAATAAACAAAATAAAACAAGAAAGAAAAACAGTAAAGAGTCAACCTTTTG 1080

 83170463 ATATGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGACATACAAATGGCCAACAGGTATGTGAAAATAT 83170522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGACATACAAATGGCCAACAGGTATGTGAAAATAT 1140

 83170523 AATCAACATCACTAAGCAACGAGGGAATGCATCAAAACCAAAATGAAATTTTACCTTACC 83170582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATCAACATCACTAAGCAACGAGGGAATGCATCAAAACCAAAATGAAATTTTACCTTACC 1200

 83170583 CCAGTTAGAATGGCTATTAATAAAAGACAAAAAATAACAGATGCTAGTGAGGATATGGAG 83170642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGTTAGAATGGCTATTAATAAAAGACAAAAAATAACAGATGCTAGTGAGGATATGGAG 1260

 83170643 AAAAGGAAACCCTTATTCACTGTTGGCAGGATTGTATGTAGTATAACCAATATAAAAAAT 83170702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAGGAAACCCTTATTCACTGTTGGCAGGATTGTATGTAGTATAACCAATATAAAAAAT 1320

 83170703 AACATGACATTTTCTTTAAAAAACTAAAAATAGAATTGCCATATGATCCAGCAATCCCAC 83170762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACATGACATTTTCTTTAAAAAACTAAAAATAGAATTGCCATATGATCCAGCAATCCCAC 1380

 83170763 TACTGGGTATCCATGCAAAGGAAAATAAATTAGTATTTCAGATGGATACCTGCACTCACA 83170822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACTGGGTATCCATGCAAAGGAAAATAAATTAGTATTTCAGATGGATACCTGCACTCACA 1440

 83170823 TGTTTGTCACAGCACTATTCATAACAGCAAAAATATAGGAATTAACCTAAGTGACCAACA 83170882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTTGTCACAGCACTATTCATAACAGCAAAAATATAGGAATTAACCTAAGTGACCAACA 1500

 83170883 ATGAACAAATGGACAAAGAAAATGTGGTATGTGTACAAAATAAAATATCATTTAGTCATA 83170942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGAACAAATGGACAAAGAAAATGTGGTATGTGTACAAAATAAAATATCATTTAGTCATA 1560

 83170943 AAAAGAATAAAATTATGCCACTTGAAGCAACATAGCTGGAACTGGAGATCATTATGTTAA 83171002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAGAATAAAATTATGCCACTTGAAGCAACATAGCTGGAACTGGAGATCATTATGTTAA 1620

 83171003 GTGAGATAGCCTATACACAAAAAAACAAATACCACATACCCTTACTCTTATGTGAGAGCT 83171062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGAGATAGCCTATACACAAAAAAACAAATACCACATACCCTTACTCTTATGTGAGAGCT 1680

 83171063 AAAAATCTTTATGACATGAAAATAGAGATAGAATGATAGACACCAGAGTCTGGGAAGGGT 83171122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAATCTTTATGACATGAAAATAGAGATAGAATGATAGACACCAGAGTCTGGGAAGGGT 1740

 83171123 GTGAGGGTGAGAGGGGGAAATAAATGAAATTTGGTGAATGGGTACACATTGATAGTTAGA 83171182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGAGGGTGAGAGGGGGAAATAAATGAAATTTGGTGAATGGGTACACATTGATAGTTAGA 1800

 83171183 TAAAAGAAATAACTTGTAATGTTCTATAGTAGACTAGGGTGACCATAGTTGGTAACACTG 83171242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAAAGAAATAACTTGTAATGTTCTATAGTAGACTAGGGTGACCATAGTTGGTAACACTG 1860

 83171243 TATTTTATATTTCTAAGTAGCTGGAAGAGAGGACTTAAAAATGTTACCAACCCATGGAAG 83171302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATTTTATATTTCTAAGTAGCTGGAAGAGAGGACTTAAAAATGTTACCAACCCATGGAAG 1920

 83171303 TGATACTTAGAAATGGTAAATATTTAAGGTGATGCATACGCCAAATACCCTAAGTTGATC 83171362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGATACTTAGAAATGGTAAATATTTAAGGTGATGCATACGCCAAATACCCTAAGTTGATC 1980

 83171363 ATTCCACATTCTATGCTCACATGTAACCCCCAAATATATAAAATATTATGCATAAAGGAA 83171422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTCCACATTCTATGCTCACATGTAACCCCCAAATATATAAAATATTATGCATAAAGGAA 2040

 83171423 AAATAAATACATTAAGAGATAATAAATTCAACTAAAGTGGAGATTTTATAGGTATGAAAA 83171482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAATAAATACATTAAGAGATAATAAATTCAACTAAAGTGGAGATTTTATAGGTATGAAAA 2100

 83171483 TGTAGTTAAACATTTGAAAAATTATCAATCAGTATAATTAATTACATGAGTTGAATTAGA 83171542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTAGTTAAACATTTGAAAAATTATCAATCAGTATAATTAATTACATGAGTTGAATTAGA 2160

 83171543 AAAATTTCTTGCTTATCCCAATAACGTGCCAACAAACATTTGATAAAAGGCATAGTAAAT 83171602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAATTTCTTGCTTATCCCAATAACGTGCCAACAAACATTTGATAAAAGGCATAGTAAAT 2220

 83171603 AGAAAATGAAATGGAACTCTCTTAATTTGATTCATAAGAGTACTTTTGAATAAATATCAT 83171662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGAAAATGAAATGGAACTCTCTTAATTTGATTCATAAGAGTACTTTTGAATAAATATCAT 2280

 83171663 GTGAAAAATTATACATGTCTCTGTAAGACAGTTTTGGAAGTTATGACTTGACAAGAAAGC 83171722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTGAAAAATTATACATGTCTCTGTAAGACAGTTTTGGAAGTTATGACTTGACAAGAAAGC 2340

 83171723 CAAGAAATTTTTAAAAAGAAAGAATACAGAGAAATTAAATAAATAAAACTGTTTTTCTTA 83171782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAGAAATTTTTAAAAAGAAAGAATACAGAGAAATTAAATAAATAAAACTGTTTTTCTTA 2400

 83171783 GATATATGATTGCAAATGTAGAAATTTCTCCCCTAACCTTCCCAGATTAACTGCTACAAC 83171842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATATATGATTGCAAATGTAGAAATTTCTCCCCTAACCTTCCCAGATTAACTGCTACAAC 2460

 83171843 AAATAAATGGAGTTAGTGAGTTGTCTATATAAAGAATTAATAGAGACATTTTTTAAGAAA 83171902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAATAAATGGAGTTAGTGAGTTGTCTATATAAAGAATTAATAGAGACATTTTTTAAGAAA 2520

 83171903 ACTTTTTTTTTCCTAAATGAACGGTATGTAAGTAGAGTGAGTTAGTGAAAAAGCACCAGA 83171962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTTTTTTTTTCCTAAATGAACGGTATGTAAGTAGAGTGAGTTAGTGAAAAAGCACCAGA 2580

 83171963 GAAAGAGAAGGTTAAGGAGAACCTGGTTTAATATGAATAGGCCACCTGTGTTTGCTAATT 83172022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAAAGAGAAGGTTAAGGAGAACCTGGTTTAATATGAATAGGCCACCTGTGTTTGCTAATT 2640

 83172023 GGTATTTATCATAGTTAGGATCCTACCCTCCCACAGAGAATGAAAATAGGGACTCTATCC 83172082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGTATTTATCATAGTTAGGATCCTACCCTCCCACAGAGAATGAAAATAGGGACTCTATCC 2700

 83172083 TTCATGATAATTACATTTCAAAGAGATGGCTCCTGGGTCTTTGAGAAAGACATTCCTGAG 83172142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCATGATAATTACATTTCAAAGAGATGGCTCCTGGGTCTTTGAGAAAGACATTCCTGAG 2760

 83172143 CAAAACTGGCAAGAGGCTGGGGGAAGATTTACATCCCCAAGGGAAAGAGAAAAAATTTAC 83172202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAAAACTGGCAAGAGGCTGGGGGAAGATTTACATCCCCAAGGGAAAGAGAAAAAATTTAC 2820

 83172203 A 83172203
          |
     2821 A 2821

Alignment time is 2.28547 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2036] =>      2036 nucs 'mol-32-2b3f-070737_2036'

Score:        2025
Aligned:      2036        nucs
Identic:      2035 (100%) nucs =>      1238 (100%)       797 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164697,83165934] EXCISED REGION [83172206,83173003]
 second seq =>  [       1,    1238] EXCISED REGION [    1239,    2036]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6271 nucs [83165935,83172205]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83165935,83165936] to [83172206,83172207]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83165935,83165935] to [83172205,83172205]
 second seq =>         0 nucs

 83164697 AAGATAGAGAAAGAAAAGGCTAAATAGATGAATTCACACAAACCATTGTGATATTGTAAT 83164756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGATAGAGAAAGAAAAGGCTAAATAGATGAATTCACACAAACCATTGTGATATTGTAAT 60

 83164757 ATAAGTCAGTGTATAAGTAGTAGTACATGCAGGTAATCATAAAGCATATAGATTTGGAAA 83164816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAGTCAGTGTATAAGTAGTAGTACATGCAGGTAATCATAAAGCATATAGATTTGGAAA 120

 83164817 ACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGAATGTCTATTAAACATCAAACCCCAAAGAGCAAG 83164876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGAATGTCTATTAAACATCAAACCCCAAAGAGCAAG 180

 83164877 ATATATATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATA 83164936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATATATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATA 240

 83164937 AAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAA 83164996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAA 300

 83164997 AGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGA 83165056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGA 360

 83165057 TAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAAC 83165116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAAC 420

 83165117 AAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGT 83165176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGT 480

 83165177 CCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCA 83165236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCA 540

 83165237 GGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTT 83165296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTT 600

 83165297 ATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTC 83165356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTC 660

 83165357 GCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTC 83165416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTC 720

 83165417 CCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGC 83165476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGC 780

 83165477 CAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAG 83165536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAG 840

 83165537 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 83165596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 900

 83165597 ATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTAC 83165656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTAC 960

 83165657 AATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGT 83165716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGT 1020

 83165717 AAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGA 83165776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGA 1080

 83165777 TAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAA 83165836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAA 1140

 83165837 GTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAG 83165896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAG 1200

 83165897 ATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAA 83165934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAA 1238

EXCISED REGION

 83172206 TGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCA 83172265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 TGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCA 1298

 83172266 CGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 83172325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 CGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 1358

 83172326 CGAGACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGC 83172385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 CGAGACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGC 1418

 83172386 CAGACGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 83172445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 CAGACGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 1478

 83172446 CTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGACAAGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTG 83172505
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 CTTGAACCCAGAAGGCGGAGGTCGCAGTGAGACAAGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTG 1538

 83172506 GGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAA 83172565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 GGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAA 1598

 83172566 AAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGGAAGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAA 83172625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 AAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGGAAGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAA 1658

 83172626 GCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAATGTCCATAACAAAAATCAGCATATTTAT 83172685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 GCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAATGTCCATAACAAAAATCAGCATATTTAT 1718

 83172686 TTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGGATATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTG 83172745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 TTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGGATATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTG 1778

 83172746 TTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCAGCAAATGCAATATGTACAATATTAATT 83172805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCAGCAAATGCAATATGTACAATATTAATT 1838

 83172806 TTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATACTATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTT 83172865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 TTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATACTATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTT 1898

 83172866 TCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACACATACACACACACATACATACACATAT 83172925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACACATACACACACACATACATACACATAT 1958

 83172926 ACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCATAACTATATACACATATATGGATATAT 83172985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 ACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCATAACTATATACACATATATGGATATAT 2018

 83172986 ACAAGCATTTATATATAC 83173003
          ||||||||||||||||||
     2019 ACAAGCATTTATATATAC 2036

Alignment time is 2.62258 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2500] =>      2500 nucs 'mol-32-2efc-074970_2500'

Score:        2500
Aligned:      2500        nucs
Identic:      2500 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165027,83167526]
 second seq =>  [       1,    2500]

 83165027 ATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAAT 83165086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAAT 60

 83165087 AAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGG 83165146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGG 120

 83165147 AAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACA 83165206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACA 180

 83165207 ATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCA 83165266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCA 240

 83165267 AATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAA 83165326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAA 300

 83165327 TACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGC 83165386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGC 360

 83165387 ACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCC 83165446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCC 420

 83165447 TCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTA 83165506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTA 480

 83165507 GTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGT 83165566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGT 540

 83165567 CTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTG 83165626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTG 600

 83165627 GAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAG 83165686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAG 660

 83165687 AAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATA 83165746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATA 720

 83165747 AAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAG 83165806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAG 780

 83165807 GGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGA 83165866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGA 840

 83165867 AAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTA 83165926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTA 900

 83165927 TAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAA 83165986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAA 960

 83165987 TCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGC 83166046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGC 1020

 83166047 CAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTC 83166106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTC 1080

 83166107 CCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGT 83166166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGT 1140

 83166167 ACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGA 83166226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGA 1200

 83166227 CCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGAC 83166286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGAC 1260

 83166287 TGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTG 83166346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTG 1320

 83166347 GCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTT 83166406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTT 1380

 83166407 CCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATC 83166466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATC 1440

 83166467 AGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTG 83166526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTG 1500

 83166527 ACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAA 83166586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAA 1560

 83166587 TTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCAC 83166646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCAC 1620

 83166647 TGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTA 83166706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTA 1680

 83166707 CCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCC 83166766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCC 1740

 83166767 ATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCA 83166826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCA 1800

 83166827 CAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTG 83166886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTG 1860

 83166887 CTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCC 83166946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCC 1920

 83166947 CACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTA 83167006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTA 1980

 83167007 GTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTG 83167066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTG 2040

 83167067 CACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAA 83167126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAA 2100

 83167127 TGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAA 83167186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAA 2160

 83167187 ACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTT 83167246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTT 2220

 83167247 AGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCA 83167306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCA 2280

 83167307 CCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTA 83167366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTA 2340

 83167367 ATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAA 83167426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAA 2400

 83167427 ATCATTAATTCTAAAGAAACTCAGTGAAATATAAAAGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACA 83167486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATCATTAATTCTAAAGAAACTCAGTGAAATATAAAAGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACA 2460

 83167487 AATTTGAAAAATAATTCAGAATATGAATGAGAAATTTACC 83167526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTTGAAAAATAATTCAGAATATGAATGAGAAATTTACC 2500

Alignment time is 2.50661 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3520] =>      3520 nucs 'mol-32-2f33-098985_3520'

Score:        3509
Aligned:      3520        nucs
Identic:      3519 (100%) nucs =>       535 (100%)      2984 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164802,83165336] EXCISED REGION [83165338,83168322]
 second seq =>  [       1,     535] EXCISED REGION [     536,    3520]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83165337,83165337]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [83166436,83166436]
 second seq =>         1 nucs [1634,1634]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [83165337,83165347] to [83165338,83165348]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83164802 ATATAGATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGAATGTCTATTAAACATCAA 83164861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATAGATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGAATGTCTATTAAACATCAA 60

 83164862 ACCCCAAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATC 83164921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCCAAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATC 120

 83164922 ATTTTTTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGT 83164981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTTTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGT 180

 83164982 GTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCC 83165041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCC 240

 83165042 TTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAA 83165101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAA 300

 83165102 TATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATA 83165161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATA 360

 83165162 GAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAAC 83165221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAAC 420

 83165222 ACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAA 83165281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAA 480

 83165282 AACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAAC 83165336
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAAC 535

EXCISED REGION

 83165338 TTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGC 83165397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 TTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGC 595

 83165398 TCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGC 83165457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGC 655

 83165458 TGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGG 83165517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 TGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGG 715

 83165518 GTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTC 83165577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 GTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTC 775

 83165578 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCT 83165637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCT 835

 83165638 ACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATT 83165697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 ACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATT 895

 83165698 TTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAA 83165757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 TTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAA 955

 83165758 AATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGA 83165817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 AATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGA 1015

 83165818 ATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAA 83165877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 ATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAA 1075

 83165878 GGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGG 83165937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 GGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGG 1135

 83165938 TAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATG 83165997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATG 1195

 83165998 GGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCT 83166057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 GGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCT 1255

 83166058 GTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTA 83166117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 GTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTA 1315

 83166118 AACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTG 83166177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 AACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTG 1375

 83166178 GAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCA 83166237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 GAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCA 1435

 83166238 GGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAA 83166297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAA 1495

 83166298 TGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGC 83166357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 TGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGC 1555

 83166358 CCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTG 83166417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTG 1615

 83166418 AGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAA 83166477
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 AGAATCATCCCACCTCCATCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAA 1675

 83166478 AGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCC 83166537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 AGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCC 1735

 83166538 TGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATC 83166597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATC 1795

 83166598 CTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAA 83166657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAA 1855

 83166658 CTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGC 83166717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 CTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGC 1915

 83166718 ATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACA 83166777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 ATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACA 1975

 83166778 CTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCA 83166837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCA 2035

 83166838 CGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATC 83166897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATC 2095

 83166898 AGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTG 83166957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 AGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTG 2155

 83166958 ATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACT 83167017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 ATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACT 2215

 83167018 GTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTT 83167077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTT 2275

 83167078 CCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACA 83167137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 CCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACA 2335

 83167138 GCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTAC 83167197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTAC 2395

 83167198 CCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAA 83167257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAA 2455

 83167258 ATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACA 83167317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 ATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACA 2515

 83167318 AAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCA 83167377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCA 2575

 83167378 ACAGATTCTAATCAAAACAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTC 83167437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 ACAGATTCTAATCAAAACAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTC 2635

 83167438 TAAAGAAACTCAGTGAAATATAAAAGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAA 83167497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TAAAGAAACTCAGTGAAATATAAAAGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAA 2695

 83167498 TAATTCAGAATATGAATGAGAAATTTACCAAAGATACAGATACCATAAAAAAGAAGGAAA 83167557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TAATTCAGAATATGAATGAGAAATTTACCAAAGATACAGATACCATAAAAAAGAAGGAAA 2755

 83167558 CAAAAATGCTGACTGCGAAAATTCCTTGAGTAAAATATAAAATACATTTGAAAACCTTAA 83167617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CAAAAATGCTGACTGCGAAAATTCCTTGAGTAAAATATAAAATACATTTGAAAACCTTAA 2815

 83167618 CAATAGACTAGGTCAATTACAAGAAATAATCTCAGAACTTGACAGTTGTTTTGAAATAAC 83167677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 CAATAGACTAGGTCAATTACAAGAAATAATCTCAGAACTTGACAGTTGTTTTGAAATAAC 2875

 83167678 CCAGTAAGATACAAATTAAACAAAATAATAAAAAGAAAGAGAAATGAAATAAATAATGCC 83167737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CCAGTAAGATACAAATTAAACAAAATAATAAAAAGAAAGAGAAATGAAATAAATAATGCC 2935

 83167738 ACTGTAGGAGAGCACCAAACCACAATAACAAACAATAAAAGAAAAGAGAAAGAAAAAGAA 83167797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 ACTGTAGGAGAGCACCAAACCACAATAACAAACAATAAAAGAAAAGAGAAAGAAAAAGAA 2995

 83167798 AGAAAGAATGTGACAAAAAAACCCAGAAAATAATGAACAATATCAAAGGAACAAAAGTTT 83167857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AGAAAGAATGTGACAAAAAAACCCAGAAAATAATGAACAATATCAAAGGAACAAAAGTTT 3055

 83167858 CTGTGTAAGTAATAACTTTCAACATAAATGGATTAAATTCTCTACTTAAAAGGTATAAAT 83167917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 CTGTGTAAGTAATAACTTTCAACATAAATGGATTAAATTCTCTACTTAAAAGGTATAAAT 3115

 83167918 GTTCTGAGTAGATGAGAAACCATAATCCAACCATATGCTCTCTACAAGAAATGAACTTTA 83167977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 GTTCTGAGTAGATGAGAAACCATAATCCAACCATATGCTCTCTACAAGAAATGAACTTTA 3175

 83167978 CTTGTGAAAACACATACAGACCGAAAGTAAAGGAATGAAACAAATATTTTACACAAAAAC 83168037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 CTTGTGAAAACACATACAGACCGAAAGTAAAGGAATGAAACAAATATTTTACACAAAAAC 3235

 83168038 TAAAAGTGAGTGGGAGTGGCTATATTTACATCAGATAATACAGACTTTAAGCCAAAAACT 83168097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 TAAAAGTGAGTGGGAGTGGCTATATTTACATCAGATAATACAGACTTTAAGCCAAAAACT 3295

 83168098 GTAAAATAAAAAAGACAAAGAACACCATTATATAATTAAAAAGGAATTCAGCAAGATAAT 83168157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 GTAAAATAAAAAAGACAAAGAACACCATTATATAATTAAAAAGGAATTCAGCAAGATAAT 3355

 83168158 ATAACAATTCTAAGTATGCATGCATCCAACATGAAGCACCCAGATTCATAAAGCAAATAT 83168217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 ATAACAATTCTAAGTATGCATGCATCCAACATGAAGCACCCAGATTCATAAAGCAAATAT 3415

 83168218 TACTAGATATAAAGAGAGATAGACTCCAGTACGGTAATAGTGGGGGACTTCAACACCTCA 83168277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TACTAGATATAAAGAGAGATAGACTCCAGTACGGTAATAGTGGGGGACTTCAACACCTCA 3475

 83168278 CTCTCAGCATTAGACAGATCACGTAGACAGAATATCAATGAAGAA 83168322
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 CTCTCAGCATTAGACAGATCACGTAGACAGAATATCAATGAAGAA 3520

Alignment time is 3.44775 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2440] =>      2440 nucs 'mol-32-2f3e-072242_2440'

Score:        2439
Aligned:      2439        nucs
Identic:      2439 (100%) nucs =>      1360 (100%)      1079 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164952,83166311] EXCISED REGION [83166313,83167391]
 second seq =>  [       1,    1360] EXCISED REGION [    1362,    2440]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83166312,83166312]
 second seq =>         1 nucs [1361,1361]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1360,1360] to [1361,1361]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83164952 AATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAA 83165011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAA 60

 83165012 ATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAA 83165071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAA 120

 83165072 CATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAA 83165131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAA 180

 83165132 TGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAA 83165191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAA 240

 83165192 TAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTA 83165251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTA 300

 83165252 ACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTA 83165311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTA 360

 83165312 CCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGG 83165371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGG 420

 83165372 CTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAAT 83165431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAAT 480

 83165432 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTA 83165491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTA 540

 83165492 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTC 83165551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTC 600

 83165552 CTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGC 83165611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGC 660

 83165612 AACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAA 83165671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAA 720

 83165672 CAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGA 83165731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGA 780

 83165732 AAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAA 83165791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAA 840

 83165792 TAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACT 83165851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACT 900

 83165852 TAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAG 83165911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAG 960

 83165912 GGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCAC 83165971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCAC 1020

 83165972 CATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCT 83166031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCT 1080

 83166032 TATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCT 83166091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCT 1140

 83166092 GGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCA 83166151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCA 1200

 83166152 CATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAA 83166211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAA 1260

 83166212 ACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGT 83166271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGT 1320

 83166272 GAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTC 83166311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTC 1360

EXCISED REGION

 83166313 GTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCC 83166372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 GTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCC 1421

 83166373 CAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCT 83166432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 CAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCT 1481

 83166433 CCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTG 83166492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 CCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTG 1541

 83166493 TCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTG 83166552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTG 1601

 83166553 AGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGG 83166612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 AGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGG 1661

 83166613 AGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAG 83166672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 AGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAG 1721

 83166673 TCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATA 83166732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 TCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATA 1781

 83166733 CCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTG 83166792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 CCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTG 1841

 83166793 TACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACG 83166852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACG 1901

 83166853 GTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGC 83166912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 GTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGC 1961

 83166913 CACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACC 83166972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 CACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACC 2021

 83166973 CTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTA 83167032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 CTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTA 2081

 83167033 GCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAA 83167092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 GCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAA 2141

 83167093 CTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATC 83167152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATC 2201

 83167153 CAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACA 83167212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACA 2261

 83167213 CCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGA 83167272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 CCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGA 2321

 83167273 GAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAA 83167332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 GAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAA 2381

 83167333 TCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCA 83167391
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCA 2440

Alignment time is 2.28972 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2370] =>      2370 nucs 'mol-32-2fd8-117305_2370'

Score:        2370
Aligned:      2370        nucs
Identic:      2370 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164942,83167311]
 second seq =>  [       1,    2370]

 83164942 AGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAAT 83165001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAAT 60

 83165002 AAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGT 83165061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGT 120

 83165062 ACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATT 83165121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATT 180

 83165122 GTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCAC 83165181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCAC 240

 83165182 ATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCC 83165241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCC 300

 83165242 TGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCAC 83165301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCAC 360

 83165302 ACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTC 83165361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTC 420

 83165362 TTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGG 83165421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGG 480

 83165422 TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATA 83165481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATA 540

 83165482 TGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGG 83165541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGG 600

 83165542 TCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 83165601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 660

 83165602 AGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTG 83165661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTG 720

 83165662 TAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGG 83165721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGG 780

 83165722 CAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAG 83165781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAG 840

 83165782 ACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGAC 83165841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGAC 900

 83165842 AGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGG 83165901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGG 960

 83165902 CTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTG 83165961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTG 1020

 83165962 ACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGG 83166021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGG 1080

 83166022 CCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAA 83166081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAA 1140

 83166082 AGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTT 83166141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTT 1200

 83166142 TAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAG 83166201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAG 1260

 83166202 GTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGC 83166261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGC 1320

 83166262 ATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTA 83166321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTA 1380

 83166322 GCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGC 83166381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGC 1440

 83166382 TGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTC 83166441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTC 1500

 83166442 ACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTT 83166501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTT 1560

 83166502 GACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCA 83166561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCA 1620

 83166562 CAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTG 83166621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTG 1680

 83166622 ATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACT 83166681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACT 1740

 83166682 GAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCA 83166741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCA 1800

 83166742 GGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCT 83166801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCT 1860

 83166802 TGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGA 83166861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGA 1920

 83166862 AACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAG 83166921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAG 1980

 83166922 GTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAG 83166981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAG 2040

 83166982 AAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTG 83167041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTG 2100

 83167042 GGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCA 83167101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCA 2160

 83167102 TTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTA 83167161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTA 2220

 83167162 AACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATT 83167221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATT 2280

 83167222 AATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAG 83167281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAG 2340

 83167282 TGTTACACTGGATACACACATATCACCATA 83167311
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTTACACTGGATACACACATATCACCATA 2370

Alignment time is 1.92202 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2448] =>      2448 nucs 'mol-32-2fd8-197714_2448'

Score:        2448
Aligned:      2448        nucs
Identic:      2448 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164933,83167380]
 second seq =>  [       1,    2448]

 83164933 CATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACA 83164992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACA 60

 83164993 AGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTT 83165052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTT 120

 83165053 TGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAA 83165112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAA 180

 83165113 CAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAA 83165172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAA 240

 83165173 TAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAAT 83165232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAAT 300

 83165233 GCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCAC 83165292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCAC 360

 83165293 TGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAG 83165352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAG 420

 83165353 TCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCA 83165412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCA 480

 83165413 CCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCAC 83165472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCAC 540

 83165473 AAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGG 83165532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGG 600

 83165533 CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGC 83165592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGC 660

 83165593 TGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTA 83165652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTA 720

 83165653 TTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATA 83165712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATA 780

 83165713 TTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAA 83165772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAA 840

 83165773 GGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAA 83165832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAA 900

 83165833 AAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGC 83165892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGC 960

 83165893 TGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCA 83165952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCA 1020

 83165953 CAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGAC 83166012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGAC 1080

 83166013 CCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCC 83166072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCC 1140

 83166073 AAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAG 83166132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAG 1200

 83166133 GTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCT 83166192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCT 1260

 83166193 GGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCAT 83166252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCAT 1320

 83166253 GGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCT 83166312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCT 1380

 83166313 GTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCC 83166372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCC 1440

 83166373 CAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCT 83166432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCT 1500

 83166433 CCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTG 83166492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTG 1560

 83166493 TCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTG 83166552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTG 1620

 83166553 AGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGG 83166612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGG 1680

 83166613 AGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAG 83166672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAG 1740

 83166673 TCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATA 83166732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATA 1800

 83166733 CCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTG 83166792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTG 1860

 83166793 TACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACG 83166852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACG 1920

 83166853 GTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGC 83166912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGC 1980

 83166913 CACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACC 83166972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACC 2040

 83166973 CTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTA 83167032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTA 2100

 83167033 GCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAA 83167092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAA 2160

 83167093 CTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATC 83167152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATC 2220

 83167153 CAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACA 83167212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACA 2280

 83167213 CCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGA 83167272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGA 2340

 83167273 GAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAA 83167332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAA 2400

 83167333 TCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACA 83167380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACA 2448

Alignment time is 1.99828 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2365] =>      2365 nucs 'mol-32-301a-189145_2365'

Score:        2365
Aligned:      2365        nucs
Identic:      2365 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165039,83167403]
 second seq =>  [       1,    2365]

 83165039 GCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAA 83165098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAA 60

 83165099 CAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGA 83165158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGA 120

 83165159 ATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATT 83165218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATT 180

 83165219 AACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAG 83165278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAG 240

 83165279 AAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTT 83165338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTT 300

 83165339 TTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCT 83165398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCT 360

 83165399 CAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 83165458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 420

 83165459 GGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 83165518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 480

 83165519 TTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCG 83165578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCG 540

 83165579 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTA 83165638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTA 600

 83165639 CAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTT 83165698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTT 660

 83165699 TAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAA 83165758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAA 720

 83165759 ATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAA 83165818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAA 780

 83165819 TTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAG 83165878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAG 840

 83165879 GGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGT 83165938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGT 900

 83165939 AAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGG 83165998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGG 960

 83165999 GAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTG 83166058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTG 1020

 83166059 TGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAA 83166118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAA 1080

 83166119 ACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGG 83166178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGG 1140

 83166179 AGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAG 83166238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAG 1200

 83166239 GTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAAT 83166298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAAT 1260

 83166299 GGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCC 83166358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCC 1320

 83166359 CAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGA 83166418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGA 1380

 83166419 GAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAA 83166478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAA 1440

 83166479 GACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCT 83166538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCT 1500

 83166539 GTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCC 83166598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCC 1560

 83166599 TAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAAC 83166658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAAC 1620

 83166659 TTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCA 83166718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCA 1680

 83166719 TCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACAC 83166778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACAC 1740

 83166779 TGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCAC 83166838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCAC 1800

 83166839 GCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCA 83166898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCA 1860

 83166899 GCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGA 83166958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGA 1920

 83166959 TGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTG 83167018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTG 1980

 83167019 TGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTC 83167078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTC 2040

 83167079 CACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAG 83167138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAG 2100

 83167139 CCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACC 83167198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACC 2160

 83167199 CTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAA 83167258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAA 2220

 83167259 TTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAA 83167318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAA 2280

 83167319 AGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAA 83167378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAA 2340

 83167379 CAGATTCTAATCAAAACAAACTCAC 83167403
          |||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGATTCTAATCAAAACAAACTCAC 2365

Alignment time is 1.97523 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2375] =>      2375 nucs 'mol-32-3030-103974_2375'

Score:        2375
Aligned:      2375        nucs
Identic:      2375 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165026,83167400]
 second seq =>  [       1,    2375]

 83165026 GATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAA 83165085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAA 60

 83165086 TAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTG 83165145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTG 120

 83165146 GAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTAC 83165205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTAC 180

 83165206 AATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATC 83165265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATC 240

 83165266 AAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAA 83165325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAA 300

 83165326 ATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGG 83165385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGG 360

 83165386 CACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGC 83165445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGC 420

 83165446 CTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTT 83165505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTT 480

 83165506 AGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAG 83165565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAG 540

 83165566 TCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACT 83165625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACT 600

 83165626 GGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAA 83165685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAA 660

 83165686 GAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTAT 83165745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTAT 720

 83165746 AAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGA 83165805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGA 780

 83165806 GGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAG 83165865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAG 840

 83165866 AAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGT 83165925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGT 900

 83165926 ATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACA 83165985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACA 960

 83165986 ATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTG 83166045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTG 1020

 83166046 CCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATT 83166105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATT 1080

 83166106 CCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTG 83166165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTG 1140

 83166166 TACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAG 83166225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAG 1200

 83166226 ACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGA 83166285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGA 1260

 83166286 CTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGT 83166345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGT 1320

 83166346 GGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACT 83166405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACT 1380

 83166406 TCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCAT 83166465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCAT 1440

 83166466 CAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTT 83166525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTT 1500

 83166526 GACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGA 83166585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGA 1560

 83166586 ATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCA 83166645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCA 1620

 83166646 CTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATT 83166705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATT 1680

 83166706 ACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGC 83166765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGC 1740

 83166766 CATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCC 83166825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCC 1800

 83166826 ACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACT 83166885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACT 1860

 83166886 GCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCC 83166945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCC 1920

 83166946 CCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACT 83167005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACT 1980

 83167006 AGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCT 83167065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCT 2040

 83167066 GCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTA 83167125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTA 2100

 83167126 ATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCA 83167185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCA 2160

 83167186 AACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACT 83167245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACT 2220

 83167246 TAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATC 83167305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATC 2280

 83167306 ACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGT 83167365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGT 2340

 83167366 AATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAAACT 83167400
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAAACT 2375

Alignment time is 1.97133 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2145] =>      2145 nucs 'mol-32-3030-183663_2145'

Score:        2145
Aligned:      2145        nucs
Identic:      2145 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165162,83167306]
 second seq =>  [       1,    2145]

 83165162 GAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAAC 83165221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAAC 60

 83165222 ACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAA 83165281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAA 120

 83165282 AACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTT 83165341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTT 180

 83165342 TTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAG 83165401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAG 240

 83165402 TGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGT 83165461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGT 300

 83165462 ATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 83165521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 360

 83165522 CACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCC 83165581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCC 420

 83165582 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAA 83165641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAA 480

 83165642 AGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAG 83165701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAG 540

 83165702 ACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATG 83165761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATG 600

 83165762 ACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTC 83165821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTC 660

 83165822 AACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGT 83165881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGT 720

 83165882 GCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAG 83165941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAG 780

 83165942 CGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAG 83166001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAG 840

 83166002 AGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGA 83166061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGA 900

 83166062 TGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACA 83166121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACA 960

 83166122 GCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGT 83166181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGT 1020

 83166182 CCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTG 83166241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTG 1080

 83166242 TGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGT 83166301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGT 1140

 83166302 GCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAA 83166361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAA 1200

 83166362 GTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAA 83166421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAA 1260

 83166422 TCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGAC 83166481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGAC 1320

 83166482 ATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTT 83166541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTT 1380

 83166542 GTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAG 83166601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAG 1440

 83166602 ACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTT 83166661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTT 1500

 83166662 ACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCT 83166721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCT 1560

 83166722 AGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGC 83166781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGC 1620

 83166782 CAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCC 83166841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCC 1680

 83166842 ATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCA 83166901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCA 1740

 83166902 TCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGG 83166961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGG 1800

 83166962 TGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGG 83167021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGG 1860

 83167022 CCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCAC 83167081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCAC 1920

 83167082 TAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCA 83167141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCA 1980

 83167142 AAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTA 83167201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTA 2040

 83167202 TGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTC 83167261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTC 2100

 83167262 AGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCA 83167306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCA 2145

Alignment time is 1.77182 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3544] =>      3544 nucs 'mol-32-3046-010791_3544'

Score:        3467
Aligned:      3544        nucs
Identic:      3537 (100%) nucs =>      3484 (100%)        53 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83162444,83165934] EXCISED REGION [83172206,83172258]
 second seq =>  [       1,    3491] EXCISED REGION [    3492,    3544]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6271 nucs [83165935,83172205]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83165935,83165936] to [83172206,83172207]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83165935,83165935] to [83172205,83172205]
 second seq =>         0 nucs

 83162444 CTGTTAACTTGAGAATAGCTTCAAGCACAAGAAAATTTATTCTAATGAGTGAATTTTTTC 83162503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTTAACTTGAGAATAGCTTCAAGCACAAGAAAATTTATTCTAATGAGTGAATTTTTTC 60

 83162504 AAAATGTGTTTGGAGGAATGTTGAAGAGAAAAACCAGCAAAAGGATTACTTTTTTCTTCA 83162563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATGTGTTTGGAGGAATGTTGAAGAGAAAAACCAGCAAAAGGATTACTTTTTTCTTCA 120

 83162564 AATATTCCAGTAAGACCTAAAATTAAATCTGTGATTGTTATTAATATGATTAATGTTCTA 83162623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATATTCCAGTAAGACCTAAAATTAAATCTGTGATTGTTATTAATATGATTAATGTTCTA 180

 83162624 TTGTTTTGATAGTTTTATTTTATATCATAGATCAATCTCTTAAAAAGAAATAGCAATACA 83162683
          ||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTTTTGATAGCTTTATTTTATGTCATAGATCAATCTCTTAAAAAGAAATAGCAATACA 240

 83162684 ATTCAGTGATTTAGTTACTCAGTCTGACATAATGTGTATAGAAGCATTACAATTTATAAC 83162743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCAGTGATTTAGTTACTCAGTCTGACATAATGTGTATAGAAGCATTACAATTTATAAC 300

 83162744 CATTCATCTTCTTGTAGCTTTATTTTTTAATTATTTATTTATTTATTTATTTGAGATGGA 83162803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTCATCTTCTTGTAGCTTTATTTTTTAATTATTTATTTATTTATTTATTTGAGATGGA 360

 83162804 GTTTTGCTCTGTCACCAAGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCG 83162863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTTGCTCTGTCACCAAGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCG 420

 83162864 CCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCCCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTAT 83162923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCCCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTAT 480

 83162924 GCGCTGCCACCACACTCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAAACGAGTTTCACCATGTT 83162983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCGCTGCCACCACACTCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAAACGAGTTTCACCATGTT 540

 83162984 GGTCAAGATGGTCTCTATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGC 83163043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      541 GGTCAAGATGGTCTCTATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGTCTTAGCCTCCCAAAGTGC 600

 83163044 TGGGATTACAGGGGTGAACCACCGCGCCTGGCCTTCTTCTGGCTTTTTAAATGTGTTATC 83163103
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGATTACAGGGGTGAACCACAGCGCCTGGCCTTCTTCTGGCTTTTTAAATGTGTTATC 660

 83163104 TTATTTCTTTATAACTGAGGTAAACACTTCATTTGTGGAAAAAAATGAATTAAAGAATGT 83163163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATTTCTTTATAACTGAGGTAAACACTTCATTTGTGGAAAAAAATGAATTAAAGAATGT 720

 83163164 TTATTTGTTCCTGACTCTTCCACGTTCTCTACTTTATGCAAGGTTCTATATATTGGCTTT 83163223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATTTGTTCCTGACTCTTCCACGTTCTCTACTTTATGCAAGGTTCTATATATTGGCTTT 780

 83163224 TGGATTAGCTGGTCTTTCTCTTTTTATTTATTCTGTTCTTTCTCCATTTATTTTTTTTCA 83163283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGATTAGCTGGTCTTTCTCTTTTTATTTATTCTGTTCTTTCTCCATTTATTTTTTTTCA 840

 83163284 TTTGTTCTCACTTACAACAGCACTGTCCAGTTATGAAAGTATCAAGATGTAGAAGAGATT 83163343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGTTCTCACTTACAACAGCACTGTCCAGTTATGAAAGTATCAAGATGTAGAAGAGATT 900

 83163344 TTGAGAGTTTGCCCTGAATTTAATTCAGAACAGAGTTTAGAATCTGACTTGACACTTAAT 83163403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGAGAGTTTGCCCTGAATTTAATTCAGAACAGAGTTTAGAATCTGACTTGACACTTAAT 960

 83163404 AATTAGATAATCTAATTAAATTAATTAGACAATCTGAGGTTGAGTACCTTGATTTGAGTA 83163463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTAGATAATCTAATTAAATTAATTAGACAATCTGAGGTTGAGTACCTTGATTTGAGTA 1020

 83163464 TTGTTAACATAAAATGTAACACTATATATATTCATCTGACATTTATATAGGATGGTATCC 83163523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGTTAACATAAAATGTAACACTATATATATTCATCTGACATTTATATAGGATGGTATCC 1080

 83163524 CAAAGAGCCAATGATGTTGTTGATATGGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAACCTCATCTTG 83163583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAGAGCCAATGATGTTGTTGATATGGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAACCTCATCTTG 1140

 83163584 AATTGTAGCTCCCATAATTTCTACATGTCATGGGAAAAACCCGGTGCGAGGTAATTGAAT 83163643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTGTAGCTCCCATAATTTCTACATGTCATGGGAAAAACCCGGTGCGAGGTAATTGAAT 1200

 83163644 CATGGGGTGGGGGGGGTATTTCCCATGCTGTTCTTGTAATAGTGAACAAGTTTCATGAGA 83163703
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGGGGTGGGGGGTGTATTTCCCATGCTGTTCTTGTAATAGTGAACAAGTTTCATGAGA 1260

 83163704 TCTGATGGTTTTATAAAGGGGAGTTTTCCTACACACTCTCTTTTGCCTGCCTCCATGTAA 83163763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGATGGTTTTATAAAGGGGAGTTTTCCTACACACTCTCTTTTGCCTGCCTCCATGTAA 1320

 83163764 GACATGACTTTGTTCCTCCTTGCCTGCCACCATGATTGTGAAGCCTCCCCAGCCATGTGG 83163823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACATGACTTTGTTCCTCCTTGCCTGCCACCATGATTGTGAAGCCTCCCCAGCCATGTGG 1380

 83163824 AACTGTGAGTCAGTTTAACCTCTTTCATTTGTAAATTACCCAGTCTCAGGCATGTCTTTA 83163883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACTGTGAGTCAGTTTAACCTCTTTCATTTGTAAATTACCCAGTCTCAGGCATGTCTTTA 1440

 83163884 TTAACAGCATAGCAATGGACTAATACAGCTGCCGTCAATGAGATTATAGTCCAATATTAT 83163943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAACAGCATAGCAATGGACTAATACAGCTGCCATCAATGAGATTATAGTCCAATATTAT 1500

 83163944 ATTAAATATATGTCATCTTAGTAAACATAATCGTCACAAATATGGATTGTTTGACTTGAT 83164003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTAAATATATGTCATCTTAGTAAACATAATCGTCACAAATATGGATTGTTTGACTTGAT 1560

 83164004 TTGAGGTATGAAAGAGCTAAGTGAAAATAATAAAATGTTAATTGATTAGTGGCCCAAATA 83164063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGAGGTATGAAAGAGCTAAGTGAAAATAATAAAATGTTAATTGATTAGTGGCCCAAATA 1620

 83164064 GAGAGGTTAAGATGTCATGAAAACTAAAAGACAGATTTTCATGAAACAAAGACATCAATT 83164123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGAGGTTAAGATGTCATGAAAACTAAAAGACAGATTTTCATGAAACAAAGACATCAATT 1680

 83164124 ATTTCAAATAGTGGTGAGCTATCAAAATTTAGGCATATTAAAAGTTGGTCTTTGGAGTAA 83164183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTCAAATAGTGGTGAGCTATCAAAATTTAGGCATATTAAAAGTTGGTCTTTGGAGTAA 1740

 83164184 AAATCTAGAAGTCACTTGTTACAAGAGAAGGGATATTTTATTGGGATAGTAGGGCATAGA 83164243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATCTAGAAGTCACTTGTTACAAGAGAAGGGATATTTTATTGGGATAGTAGGGCATAGA 1800

 83164244 TGCATGTTGGATTGAATTGAAGAGAGAAAAAAATTCTAGTTTTCCATAAGTGTGAATTAA 83164303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCATGTTGGATTGAATTGAAGAGAGAAAAAAATTCTAGTTTTCCATAAGTGTGAATTAA 1860

 83164304 AAACAATAAAAATGGTGGACAAATTGTGAAACAACTAAATTTCAAAACCAAAACATCATC 83164363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAACAATAAAAATGGTGGACAAATTGTGAAACAACTAAATTTCAAAACCAAAACATCATC 1920

 83164364 TTAAAAATATTGAAGGACAAAAATAAAGGTCAAAAAATTGAGAACTTTCAATGAGGTGCT 83164423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAAAAATATTGAAGGACAAAAATAAAGGTCAAAAAATTGAGAACTTTCAATGAGGTGCT 1980

 83164424 ATAAATAGAAATGCAATCACCACATAATATTAAAGCACTATTGTAAGAATACAGAAACAT 83164483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAAATAGAAATGCAATCACCACATAATATTAAAGCACTATTGTAAGAATACAGAAACAT 2040

 83164484 TAAATGTAAGAAAACAGAAAAATTTATATATTATATAAGTGTATATACACAATGAGACTG 83164543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAATGTAAGAAAACAGAAAAATTTATATATTATATAAGTGTATATACACAATGAGACTG 2100

 83164544 ACCAAAACAAGCTGATTGATATCTGAAAATAACTTAGAGCAAATGCTATGGGAAACAAAT 83164603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCAAAACAAGCTGATTGATATCTGAAAATAACTTAGAGCAAATGCTATGGGAAACAAAT 2160

 83164604 ATGCAAATTTTGCAATAATCAGGAATGAAATCCAATGAAATGATACAATAATTTAAAATA 83164663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGCAAATTTTGCAATAATCAGGAATGAAATCCAATGAAATGATACAATAATTTAAAATA 2220

 83164664 TTTCTATACCTGAAAGAATACCTACATTATATAAAGATAGAGAAAGAAAAGGCTAAATAG 83164723
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTCTATACCTGAAAGAACACCTACATTATATAAAGATAGAGAAAGAAAAGGCTAAATAG 2280

 83164724 ATGAATTCACACAAACCATTGTGATATTGTAATATAAGTCAGTGTATAAGTAGTAGTACA 83164783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGAATTCACACAAACCATTGTGATATTGTAATATAAGTCAGTGTATAAGTAGTAGTACA 2340

 83164784 TGCAGGTAATCATAAAGCATATAGATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGA 83164843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGCAGGTAATCATAAAGCATATAGATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGA 2400

 83164844 ATGTCTATTAAACATCAAACCCCAAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCATATGGA 83164903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGTCTATTAAACATCAAACCCCAAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCATATGGA 2460

 83164904 ATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAA 83164963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAA 2520

 83164964 CTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAA 83165023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAA 2580

 83165024 GAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGAC 83165083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGAC 2640

 83165084 AATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCAC 83165143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCAC 2700

 83165144 TGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTT 83165203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTT 2760

 83165204 ACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTA 83165263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTA 2820

 83165264 TCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAA 83165323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAA 2880

 83165324 AAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGT 83165383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGT 2940

 83165384 GGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCA 83165443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCA 3000

 83165444 GCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTT 83165503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTT 3060

 83165504 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGA 83165563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGA 3120

 83165564 AGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAA 83165623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAA 3180

 83165624 CTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTAC 83165683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTAC 3240

 83165684 AAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATT 83165743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATT 3300

 83165744 ATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAA 83165803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAA 3360

 83165804 GAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAA 83165863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAA 3420

 83165864 AGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAG 83165923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAG 3480

 83165924 GTATAAGGAAA 83165934
          |||||||||||
     3481 GTATAAGGAAA 3491

EXCISED REGION

 83172206 TGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGG 83172258
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 TGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGG 3544

Alignment time is 3.32449 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2780] =>      2780 nucs 'mol-32-3046-064801_2780'

Score:        2780
Aligned:      2780        nucs
Identic:      2780 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164687,83167466]
 second seq =>  [       1,    2780]

 83164687 ACATTATATAAAGATAGAGAAAGAAAAGGCTAAATAGATGAATTCACACAAACCATTGTG 83164746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATTATATAAAGATAGAGAAAGAAAAGGCTAAATAGATGAATTCACACAAACCATTGTG 60

 83164747 ATATTGTAATATAAGTCAGTGTATAAGTAGTAGTACATGCAGGTAATCATAAAGCATATA 83164806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTGTAATATAAGTCAGTGTATAAGTAGTAGTACATGCAGGTAATCATAAAGCATATA 120

 83164807 GATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGAATGTCTATTAAACATCAAACCCC 83164866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCTAAAGAATGTCTATTAAACATCAAACCCC 180

 83164867 AAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTT 83164926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTT 240

 83164927 TTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGT 83164986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGT 300

 83164987 CTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTA 83165046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTA 360

 83165047 AATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTT 83165106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTT 420

 83165107 AATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAA 83165166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAA 480

 83165167 TGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAA 83165226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAA 540

 83165227 GGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAA 83165286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAA 600

 83165287 TAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTT 83165346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTT 660

 83165347 TTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAA 83165406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAA 720

 83165407 CCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTAC 83165466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTAC 780

 83165467 AGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTA 83165526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTA 840

 83165527 CGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCA 83165586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCA 900

 83165587 AAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCA 83165646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCA 960

 83165647 ACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAA 83165706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAA 1020

 83165707 TCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATA 83165766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATA 1080

 83165767 TATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAA 83165826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAA 1140

 83165827 CAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTC 83165886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTC 1200

 83165887 CCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGA 83165946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGA 1260

 83165947 GACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCAC 83166006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCAC 1320

 83166007 TTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACG 83166066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACG 1380

 83166067 TTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTC 83166126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTC 1440

 83166127 AGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGT 83166186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGT 1500

 83166187 GGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGT 83166246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGT 1560

 83166247 GACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATG 83166306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATG 1620

 83166307 CACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGC 83166366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGC 1680

 83166367 AGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATC 83166426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATC 1740

 83166427 CCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTC 83166486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTC 1800

 83166487 AGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGG 83166546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGG 1860

 83166547 TAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCT 83166606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCT 1920

 83166607 AGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCT 83166666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCT 1980

 83166667 CAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTG 83166726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTG 2040

 83166727 CATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATA 83166786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATA 2100

 83166787 CCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTG 83166846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTG 2160

 83166847 CCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGT 83166906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGT 2220

 83166907 GTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGT 83166966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGT 2280

 83166967 GCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGA 83167026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGA 2340

 83167027 AGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATA 83167086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATA 2400

 83167087 ACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAA 83167146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAA 2460

 83167147 GTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAA 83167206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAA 2520

 83167207 CCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAA 83167266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAA 2580

 83167267 AGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACA 83167326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACA 2640

 83167327 TAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCT 83167386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCT 2700

 83167387 AATCAAAACAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAAAC 83167446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATCAAAACAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAAAC 2760

 83167447 TCAGTGAAATATAAAAGAAT 83167466
          ||||||||||||||||||||
     2761 TCAGTGAAATATAAAAGAAT 2780

Alignment time is 2.29047 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2180] =>      2180 nucs 'mol-32-3101-089625_2180'

Score:        2180
Aligned:      2180        nucs
Identic:      2180 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165132,83167311]
 second seq =>  [       1,    2180]

 83165132 TGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAA 83165191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAA 60

 83165192 TAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTA 83165251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTA 120

 83165252 ACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTA 83165311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTA 180

 83165312 CCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGG 83165371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGG 240

 83165372 CTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAAT 83165431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAAT 300

 83165432 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTA 83165491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTA 360

 83165492 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTC 83165551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTC 420

 83165552 CTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGC 83165611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGC 480

 83165612 AACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAA 83165671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAA 540

 83165672 CAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGA 83165731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGA 600

 83165732 AAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAA 83165791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAA 660

 83165792 TAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACT 83165851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACT 720

 83165852 TAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAG 83165911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAG 780

 83165912 GGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCAC 83165971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCAC 840

 83165972 CATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCT 83166031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCT 900

 83166032 TATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCT 83166091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCT 960

 83166092 GGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCA 83166151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCA 1020

 83166152 CATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAA 83166211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAA 1080

 83166212 ACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGT 83166271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGT 1140

 83166272 GAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTG 83166331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTG 1200

 83166332 CCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCT 83166391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCT 1260

 83166392 GACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCA 83166451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCA 1320

 83166452 CCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACC 83166511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACC 1380

 83166512 CCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGA 83166571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGA 1440

 83166572 GATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGC 83166631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGC 1500

 83166632 CAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCA 83166691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCA 1560

 83166692 ACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGA 83166751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGA 1620

 83166752 CTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAA 83166811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAA 1680

 83166812 AGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCAT 83166871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCAT 1740

 83166872 CTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGAT 83166931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGAT 1800

 83166932 TGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCC 83166991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCC 1860

 83166992 ATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCAC 83167051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCAC 1920

 83167052 TTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAAT 83167111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAAT 1980

 83167112 CATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCA 83167171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCA 2040

 83167172 TGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGG 83167231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGG 2100

 83167232 AAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTG 83167291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTG 2160

 83167292 GATACACACATATCACCATA 83167311
          ||||||||||||||||||||
     2161 GATACACACATATCACCATA 2180

Alignment time is 1.8328 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2298] =>      2298 nucs 'mol-32-3190-076790_2298'

Score:        2298
Aligned:      2298        nucs
Identic:      2298 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165039,83167336]
 second seq =>  [       1,    2298]

 83165039 GCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAA 83165098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAA 60

 83165099 CAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGA 83165158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGA 120

 83165159 ATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATT 83165218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATT 180

 83165219 AACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAG 83165278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAG 240

 83165279 AAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTT 83165338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTT 300

 83165339 TTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCT 83165398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCT 360

 83165399 CAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 83165458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 420

 83165459 GGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 83165518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 480

 83165519 TTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCG 83165578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCG 540

 83165579 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTA 83165638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTA 600

 83165639 CAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTT 83165698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTT 660

 83165699 TAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAA 83165758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAA 720

 83165759 ATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAA 83165818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAA 780

 83165819 TTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAG 83165878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAG 840

 83165879 GGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGT 83165938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGT 900

 83165939 AAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGG 83165998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGG 960

 83165999 GAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTG 83166058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTG 1020

 83166059 TGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAA 83166118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAA 1080

 83166119 ACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGG 83166178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGG 1140

 83166179 AGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAG 83166238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAG 1200

 83166239 GTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAAT 83166298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAAT 1260

 83166299 GGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCC 83166358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCC 1320

 83166359 CAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGA 83166418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGA 1380

 83166419 GAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAA 83166478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAA 1440

 83166479 GACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCT 83166538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCT 1500

 83166539 GTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCC 83166598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCC 1560

 83166599 TAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAAC 83166658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAAC 1620

 83166659 TTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCA 83166718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCA 1680

 83166719 TCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACAC 83166778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACAC 1740

 83166779 TGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCAC 83166838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCAC 1800

 83166839 GCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCA 83166898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCA 1860

 83166899 GCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGA 83166958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGA 1920

 83166959 TGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTG 83167018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTG 1980

 83167019 TGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTC 83167078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTC 2040

 83167079 CACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAG 83167138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAG 2100

 83167139 CCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACC 83167198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACC 2160

 83167199 CTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAA 83167258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAA 2220

 83167259 TTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAA 83167318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAA 2280

 83167319 AGGAAACATAAAAATCAA 83167336
          ||||||||||||||||||
     2281 AGGAAACATAAAAATCAA 2298

Alignment time is 1.90581 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2322] =>      2322 nucs 'mol-32-3190-167803_2322'

Score:        2322
Aligned:      2322        nucs
Identic:      2322 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165039,83167360]
 second seq =>  [       1,    2322]

 83165039 GCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAA 83165098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAA 60

 83165099 CAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGA 83165158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGA 120

 83165159 ATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATT 83165218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATT 180

 83165219 AACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAG 83165278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAG 240

 83165279 AAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTT 83165338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTT 300

 83165339 TTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCT 83165398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCT 360

 83165399 CAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 83165458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 420

 83165459 GGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 83165518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 480

 83165519 TTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCG 83165578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCG 540

 83165579 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTA 83165638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTA 600

 83165639 CAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTT 83165698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTT 660

 83165699 TAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAA 83165758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAA 720

 83165759 ATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAA 83165818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAA 780

 83165819 TTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAG 83165878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAG 840

 83165879 GGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGT 83165938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGT 900

 83165939 AAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGG 83165998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGG 960

 83165999 GAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTG 83166058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTG 1020

 83166059 TGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAA 83166118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAA 1080

 83166119 ACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGG 83166178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGG 1140

 83166179 AGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAG 83166238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAG 1200

 83166239 GTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAAT 83166298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAAT 1260

 83166299 GGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCC 83166358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCC 1320

 83166359 CAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGA 83166418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGA 1380

 83166419 GAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAA 83166478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAA 1440

 83166479 GACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCT 83166538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCT 1500

 83166539 GTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCC 83166598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCC 1560

 83166599 TAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAAC 83166658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAAC 1620

 83166659 TTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCA 83166718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCA 1680

 83166719 TCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACAC 83166778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACAC 1740

 83166779 TGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCAC 83166838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCAC 1800

 83166839 GCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCA 83166898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCA 1860

 83166899 GCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGA 83166958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGA 1920

 83166959 TGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTG 83167018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTG 1980

 83167019 TGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTC 83167078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTC 2040

 83167079 CACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAG 83167138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAG 2100

 83167139 CCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACC 83167198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACC 2160

 83167199 CTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAA 83167258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAA 2220

 83167259 TTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAA 83167318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAA 2280

 83167319 AGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAAC 83167360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAAC 2322

Alignment time is 1.90355 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2679] =>      2679 nucs 'mol-32-3240-082158_2679'

Score:        2679
Aligned:      2679        nucs
Identic:      2679 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164719,83167397]
 second seq =>  [       1,    2679]

 83164719 AATAGATGAATTCACACAAACCATTGTGATATTGTAATATAAGTCAGTGTATAAGTAGTA 83164778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAGATGAATTCACACAAACCATTGTGATATTGTAATATAAGTCAGTGTATAAGTAGTA 60

 83164779 GTACATGCAGGTAATCATAAAGCATATAGATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCT 83164838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTACATGCAGGTAATCATAAAGCATATAGATTTGGAAAACATGCATAATAAAATAGATCT 120

 83164839 AAAGAATGTCTATTAAACATCAAACCCCAAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCAT 83164898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGAATGTCTATTAAACATCAAACCCCAAAGAGCAAGATATATATTATTTGATGTGCAT 180

 83164899 ATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCA 83164958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATAAAATAAGTCTAAACAAATACCA 240

 83164959 AAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGA 83165018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAATAAAGTAATAAATCAAGA 300

 83165019 TTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTT 83165078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGTACTTTATAAACATCTTT 360

 83165079 GTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAA 83165138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAA 420

 83165139 GTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAA 83165198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAA 480

 83165199 TTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAG 83165258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAG 540

 83165259 AACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAA 83165318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAA 600

 83165319 ATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGT 83165378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGT 660

 83165379 GTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTG 83165438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTG 720

 83165439 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTG 83165498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTG 780

 83165499 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCT 83165558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCT 840

 83165559 CAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCA 83165618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCA 900

 83165619 CCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTC 83165678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTC 960

 83165679 ATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAA 83165738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAA 1020

 83165739 TTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCA 83165798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCA 1080

 83165799 TACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACA 83165858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACA 1140

 83165859 AGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACT 83165918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACT 1200

 83165919 CCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAAT 83165978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAAT 1260

 83165979 TTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAA 83166038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAA 1320

 83166039 GGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCC 83166098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCC 1380

 83166099 ATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAA 83166158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAA 1440

 83166159 CATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAG 83166218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAG 1500

 83166219 CTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCC 83166278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCC 1560

 83166279 ACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCAC 83166338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCAC 1620

 83166339 TGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAA 83166398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAA 1680

 83166399 GAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTAC 83166458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTAC 1740

 83166459 ACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAG 83166518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAG 1800

 83166519 TAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCC 83166578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCC 1860

 83166579 ACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCC 83166638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCC 1920

 83166639 ACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGC 83166698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGC 1980

 83166699 CACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCT 83166758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCT 2040

 83166759 GCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCT 83166818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCT 2100

 83166819 TTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTG 83166878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTG 2160

 83166879 GCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTG 83166938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTG 2220

 83166939 CCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCA 83166998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCA 2280

 83166999 GCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAG 83167058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAG 2340

 83167059 AAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGAT 83167118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGAT 2400

 83167119 ACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTC 83167178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTC 2460

 83167179 AGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATT 83167238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATT 2520

 83167239 TTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACAC 83167298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACAC 2580

 83167299 ACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGA 83167358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGA 2640

 83167359 ACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAA 83167397
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAA 2679

Alignment time is 2.21781 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6807] =>      6807 nucs 'mol-32-32f0-171189_6807'

Score:        6807
Aligned:      6807        nucs
Identic:      6807 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83169460,83176266]
 second seq =>  [       1,    6807]

 83169460 AGGTGATATGATCTTATATTTAGAAAAAACCAAAGACGTCACCTAAAACTGTTAAAGCTG 83169519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTGATATGATCTTATATTTAGAAAAAACCAAAGACGTCACCTAAAACTGTTAAAGCTG 60

 83169520 ATAAGCAAATTCAGTAAATGTGTAGTGTACAAAATTATCATACAAATAACAGTAGTGTTT 83169579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAGCAAATTCAGTAAATGTGTAGTGTACAAAATTATCATACAAATAACAGTAGTGTTT 120

 83169580 TTATGCATCGATATTGAAATAGCAGAAAAATAAGTCAAGAAGAAAATGCTGTTTAAAATA 83169639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATGCATCGATATTGAAATAGCAGAAAAATAAGTCAAGAAGAAAATGCTGTTTAAAATA 180

 83169640 GCTACAAAATAAAACAAAATATTTATGAATAAAGTTAACCAAGTACGTGAAGATCTACAG 83169699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTACAAAATAAAACAAAATATTTATGAATAAAGTTAACCAAGTACGTGAAGATCTACAG 240

 83169700 AAATATGAATACTACAGTGCATTGATGAAGTAAACTGAAGAGAAGAAAAATGGAAAGATG 83169759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATGAATACTACAGTGCATTGATGAAGTAAACTGAAGAGAAGAAAAATGGAAAGATG 300

 83169760 TCTCATGCTCACAAATAGGAAAGATTAATATCAGTAAAATGACTACACTGCCAAAAGCCG 83169819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCATGCTCACAAATAGGAAAGATTAATATCAGTAAAATGACTACACTGCCAAAAGCCG 360

 83169820 TCTACAGATTTGATGCAATCCTGATCAAAACACCAATGTTATTTTTCACAGACACAGAAA 83169879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTACAGATTTGATGCAATCCTGATCAAAACACCAATGTTATTTTTCACAGACACAGAAA 420

 83169880 AAAAATACTAAAATTCGTATGGAAGCAAAAAAGAGCCATAATAGCCAAAGCAATTCTGAG 83169939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAATACTAAAATTCGTATGGAAGCAAAAAAGAGCCATAATAGCCAAAGCAATTCTGAG 480

 83169940 CAAAAATAAGAAAGCTGGACGCTTCACATTACCCGATGTCAAAATATATTACAAGGCTAT 83169999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAAAATAAGAAAGCTGGACGCTTCACATTACCCGATGTCAAAATATATTACAAGGCTAT 540

 83170000 AGAAACCAAAACAGAATGGTATTGGTATACAAACAGACACATAGATTAATGGAACAGAAT 83170059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAACCAAAACAGAATGGTATTGGTATACAAACAGACACATAGATTAATGGAACAGAAT 600

 83170060 AGAGCACACAGCAATAAATCTACATATTTATCACCAACTGATTTTTGACAAAAGCACCAA 83170119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGCACACAGCAATAAATCTACATATTTATCACCAACTGATTTTTGACAAAAGCACCAA 660

 83170120 GAAAATACACTGGGGGAATCGACACCTTTTTCAGTAACGGTGCCAGGAAAATTGGATATT 83170179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAATACACTGGGGGAATCGACACCTTTTTCAGTAACGGTGCCAGGAAAATTGGATATT 720

 83170180 CACATGCAGAAGAATGAAACTGAATCTCTATTTCTCATCATATACAAAAAGCAACTCAAG 83170239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACATGCAGAAGAATGAAACTGAATCTCTATTTCTCATCATATACAAAAAGCAACTCAAG 780

 83170240 ATGAATTAAGAGTTAAACAGGAGACCCCAAACTATCAAATTACTAAAAGGAAACATAGGA 83170299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAATTAAGAGTTAAACAGGAGACCCCAAACTATCAAATTACTAAAAGGAAACATAGGA 840

 83170300 AAAACACTCCAAGACATTGGTTTAGGTTAAAGGTTTTATGGGAAAGTCCTTAAAAGCAGA 83170359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAACACTCCAAGACATTGGTTTAGGTTAAAGGTTTTATGGGAAAGTCCTTAAAAGCAGA 900

 83170360 CACCAAAAATAAAACATATTGGACTATATTAAACTAAAAATTATCTGTACAGCAATAAAC 83170419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACCAAAAATAAAACATATTGGACTATATTAAACTAAAAATTATCTGTACAGCAATAAAC 960

 83170420 AAAATAAAACAAGAAAGAAAAACAGTAAAGAGTCAACCTTTTGATATGAATAGACATTTC 83170479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAATAAAACAAGAAAGAAAAACAGTAAAGAGTCAACCTTTTGATATGAATAGACATTTC 1020

 83170480 TCAAAAGAAGACATACAAATGGCCAACAGGTATGTGAAAATATAATCAACATCACTAAGC 83170539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAAAAGAAGACATACAAATGGCCAACAGGTATGTGAAAATATAATCAACATCACTAAGC 1080

 83170540 AACGAGGGAATGCATCAAAACCAAAATGAAATTTTACCTTACCCCAGTTAGAATGGCTAT 83170599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACGAGGGAATGCATCAAAACCAAAATGAAATTTTACCTTACCCCAGTTAGAATGGCTAT 1140

 83170600 TAATAAAAGACAAAAAATAACAGATGCTAGTGAGGATATGGAGAAAAGGAAACCCTTATT 83170659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAATAAAAGACAAAAAATAACAGATGCTAGTGAGGATATGGAGAAAAGGAAACCCTTATT 1200

 83170660 CACTGTTGGCAGGATTGTATGTAGTATAACCAATATAAAAAATAACATGACATTTTCTTT 83170719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTGTTGGCAGGATTGTATGTAGTATAACCAATATAAAAAATAACATGACATTTTCTTT 1260

 83170720 AAAAAACTAAAAATAGAATTGCCATATGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCATGCA 83170779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAAACTAAAAATAGAATTGCCATATGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCATGCA 1320

 83170780 AAGGAAAATAAATTAGTATTTCAGATGGATACCTGCACTCACATGTTTGTCACAGCACTA 83170839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGGAAAATAAATTAGTATTTCAGATGGATACCTGCACTCACATGTTTGTCACAGCACTA 1380

 83170840 TTCATAACAGCAAAAATATAGGAATTAACCTAAGTGACCAACAATGAACAAATGGACAAA 83170899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCATAACAGCAAAAATATAGGAATTAACCTAAGTGACCAACAATGAACAAATGGACAAA 1440

 83170900 GAAAATGTGGTATGTGTACAAAATAAAATATCATTTAGTCATAAAAAGAATAAAATTATG 83170959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAAATGTGGTATGTGTACAAAATAAAATATCATTTAGTCATAAAAAGAATAAAATTATG 1500

 83170960 CCACTTGAAGCAACATAGCTGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAGATAGCCTATACA 83171019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCACTTGAAGCAACATAGCTGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAGATAGCCTATACA 1560

 83171020 CAAAAAAACAAATACCACATACCCTTACTCTTATGTGAGAGCTAAAAATCTTTATGACAT 83171079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAAAAAACAAATACCACATACCCTTACTCTTATGTGAGAGCTAAAAATCTTTATGACAT 1620

 83171080 GAAAATAGAGATAGAATGATAGACACCAGAGTCTGGGAAGGGTGTGAGGGTGAGAGGGGG 83171139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAAATAGAGATAGAATGATAGACACCAGAGTCTGGGAAGGGTGTGAGGGTGAGAGGGGG 1680

 83171140 AAATAAATGAAATTTGGTGAATGGGTACACATTGATAGTTAGATAAAAGAAATAACTTGT 83171199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATAAATGAAATTTGGTGAATGGGTACACATTGATAGTTAGATAAAAGAAATAACTTGT 1740

 83171200 AATGTTCTATAGTAGACTAGGGTGACCATAGTTGGTAACACTGTATTTTATATTTCTAAG 83171259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATGTTCTATAGTAGACTAGGGTGACCATAGTTGGTAACACTGTATTTTATATTTCTAAG 1800

 83171260 TAGCTGGAAGAGAGGACTTAAAAATGTTACCAACCCATGGAAGTGATACTTAGAAATGGT 83171319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGCTGGAAGAGAGGACTTAAAAATGTTACCAACCCATGGAAGTGATACTTAGAAATGGT 1860

 83171320 AAATATTTAAGGTGATGCATACGCCAAATACCCTAAGTTGATCATTCCACATTCTATGCT 83171379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATATTTAAGGTGATGCATACGCCAAATACCCTAAGTTGATCATTCCACATTCTATGCT 1920

 83171380 CACATGTAACCCCCAAATATATAAAATATTATGCATAAAGGAAAAATAAATACATTAAGA 83171439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACATGTAACCCCCAAATATATAAAATATTATGCATAAAGGAAAAATAAATACATTAAGA 1980

 83171440 GATAATAAATTCAACTAAAGTGGAGATTTTATAGGTATGAAAATGTAGTTAAACATTTGA 83171499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATAATAAATTCAACTAAAGTGGAGATTTTATAGGTATGAAAATGTAGTTAAACATTTGA 2040

 83171500 AAAATTATCAATCAGTATAATTAATTACATGAGTTGAATTAGAAAAATTTCTTGCTTATC 83171559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAATTATCAATCAGTATAATTAATTACATGAGTTGAATTAGAAAAATTTCTTGCTTATC 2100

 83171560 CCAATAACGTGCCAACAAACATTTGATAAAAGGCATAGTAAATAGAAAATGAAATGGAAC 83171619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAATAACGTGCCAACAAACATTTGATAAAAGGCATAGTAAATAGAAAATGAAATGGAAC 2160

 83171620 TCTCTTAATTTGATTCATAAGAGTACTTTTGAATAAATATCATGTGAAAAATTATACATG 83171679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTCTTAATTTGATTCATAAGAGTACTTTTGAATAAATATCATGTGAAAAATTATACATG 2220

 83171680 TCTCTGTAAGACAGTTTTGGAAGTTATGACTTGACAAGAAAGCCAAGAAATTTTTAAAAA 83171739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTCTGTAAGACAGTTTTGGAAGTTATGACTTGACAAGAAAGCCAAGAAATTTTTAAAAA 2280

 83171740 GAAAGAATACAGAGAAATTAAATAAATAAAACTGTTTTTCTTAGATATATGATTGCAAAT 83171799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAAGAATACAGAGAAATTAAATAAATAAAACTGTTTTTCTTAGATATATGATTGCAAAT 2340

 83171800 GTAGAAATTTCTCCCCTAACCTTCCCAGATTAACTGCTACAACAAATAAATGGAGTTAGT 83171859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTAGAAATTTCTCCCCTAACCTTCCCAGATTAACTGCTACAACAAATAAATGGAGTTAGT 2400

 83171860 GAGTTGTCTATATAAAGAATTAATAGAGACATTTTTTAAGAAAACTTTTTTTTTCCTAAA 83171919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGTTGTCTATATAAAGAATTAATAGAGACATTTTTTAAGAAAACTTTTTTTTTCCTAAA 2460

 83171920 TGAACGGTATGTAAGTAGAGTGAGTTAGTGAAAAAGCACCAGAGAAAGAGAAGGTTAAGG 83171979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAACGGTATGTAAGTAGAGTGAGTTAGTGAAAAAGCACCAGAGAAAGAGAAGGTTAAGG 2520

 83171980 AGAACCTGGTTTAATATGAATAGGCCACCTGTGTTTGCTAATTGGTATTTATCATAGTTA 83172039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGAACCTGGTTTAATATGAATAGGCCACCTGTGTTTGCTAATTGGTATTTATCATAGTTA 2580

 83172040 GGATCCTACCCTCCCACAGAGAATGAAAATAGGGACTCTATCCTTCATGATAATTACATT 83172099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGATCCTACCCTCCCACAGAGAATGAAAATAGGGACTCTATCCTTCATGATAATTACATT 2640

 83172100 TCAAAGAGATGGCTCCTGGGTCTTTGAGAAAGACATTCCTGAGCAAAACTGGCAAGAGGC 83172159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCAAAGAGATGGCTCCTGGGTCTTTGAGAAAGACATTCCTGAGCAAAACTGGCAAGAGGC 2700

 83172160 TGGGGGAAGATTTACATCCCCAAGGGAAAGAGAAAAAATTTACAATTGCGAGTTTTCAAA 83172219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGGGGAAGATTTACATCCCCAAGGGAAAGAGAAAAAATTTACAATTGCGAGTTTTCAAA 2760

 83172220 AGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCA 83172279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCA 2820

 83172280 GCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGG 83172339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGG 2880

 83172340 ACAACGTGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGCG 83172399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACAACGTGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGCG 2940

 83172400 CATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAG 83172459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAG 3000

 83172460 GCGGAGGTCGCAGTGAGACAAGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTGGGTAACAAGAGTGA 83172519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCGGAGGTCGCAGTGAGACAAGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTGGGTAACAAGAGTGA 3060

 83172520 GACTCTGTCTCAAAAAATAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAAGAAGGGGAGG 83172579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GACTCTGTCTCAAAAAATAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAAGAAGGGGAGG 3120

 83172580 TCGGAGGCCTATTGTCAGGAAGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAAGCTAAGAGGAAAAT 83172639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCGGAGGCCTATTGTCAGGAAGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAAGCTAAGAGGAAAAT 3180

 83172640 TAAGACCATCTTTGTCAATGTCCATAACAAAAATCAGCATATTTATTTGTTAATTTGACA 83172699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAAGACCATCTTTGTCAATGTCCATAACAAAAATCAGCATATTTATTTGTTAATTTGACA 3240

 83172700 AAGTTTTTGTTCTTATAGGATATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTGTTACTGGTTCCTTA 83172759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAGTTTTTGTTCTTATAGGATATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTGTTACTGGTTCCTTA 3300

 83172760 TTCCATTAAATTATGGTCAGCAAATGCAATATGTACAATATTAATTTTTTAAAATCTCTG 83172819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTCCATTAAATTATGGTCAGCAAATGCAATATGTACAATATTAATTTTTTAAAATCTCTG 3360

 83172820 AGATTTGCATTCTGAAATACTATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTTTCTTAAAACAATCA 83172879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGATTTGCATTCTGAAATACTATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTTTCTTAAAACAATCA 3420

 83172880 TAATTTGCCATTATACACACATACACACACACATACATACACATATACACATATACATAT 83172939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAATTTGCCATTATACACACATACACACACACATACATACACATATACACATATACATAT 3480

 83172940 ATAAGCACACATCCTTCCATAACTATATACACATATATGGATATATACAAGCATTTATAT 83172999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATAAGCACACATCCTTCCATAACTATATACACATATATGGATATATACAAGCATTTATAT 3540

 83173000 ATACTATAAATGATATTCCACTATAGGATGAGAGATATTTAATATGTTATGAACAGATTT 83173059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATACTATAAATGATATTCCACTATAGGATGAGAGATATTTAATATGTTATGAACAGATTT 3600

 83173060 TGCCATACTATATAATACAGAACATGTTCACAATATTAAGAACATAATCTAGAGTACTCA 83173119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGCCATACTATATAATACAGAACATGTTCACAATATTAAGAACATAATCTAGAGTACTCA 3660

 83173120 AGCTATAGTTACATGCTTGTTGCTAGACATGAATAGTCTGATTTTCATCAATGTTAGGGC 83173179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGCTATAGTTACATGCTTGTTGCTAGACATGAATAGTCTGATTTTCATCAATGTTAGGGC 3720

 83173180 TAAACCAAATATATAAAAGTATTACATGAATATAGGGAAAAAGAACTTAAGAAAATATAA 83173239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAAACCAAATATATAAAAGTATTACATGAATATAGGGAAAAAGAACTTAAGAAAATATAA 3780

 83173240 TTTTCTGCTGCTTTATCTATGCTTACTAATTATACGAAGTCCTTTGAAATGAATTACTTA 83173299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTTCTGCTGCTTTATCTATGCTTACTAATTATACGAAGTCCTTTGAAATGAATTACTTA 3840

 83173300 TTAAGTAAAAGTACTTATTAAGGAATATTTCACAGTAAGTTCAGTAAGTTGGAGAACAAT 83173359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTAAGTAAAAGTACTTATTAAGGAATATTTCACAGTAAGTTCAGTAAGTTGGAGAACAAT 3900

 83173360 TTCTTTTAACAATTCATATTTCTGCAGATAAACTAAAGATTGTAAGATTATTGGCAAAAA 83173419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTCTTTTAACAATTCATATTTCTGCAGATAAACTAAAGATTGTAAGATTATTGGCAAAAA 3960

 83173420 AGTAATGTTAATTAAGAAAGACTTTTGAGGTCCCCACTATTCATTTCTAGAAATAAACTG 83173479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGTAATGTTAATTAAGAAAGACTTTTGAGGTCCCCACTATTCATTTCTAGAAATAAACTG 4020

 83173480 ATATCAGTTTGGTATTAATTTGGGGAATACCTTTTTAATTGTTCAAAATGTTGGACTATG 83173539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATATCAGTTTGGTATTAATTTGGGGAATACCTTTTTAATTGTTCAAAATGTTGGACTATG 4080

 83173540 CAATGTAATTAATGACCCAATTTCAATGATTTTTTCATTGTATATTCTTTGACCAAATAT 83173599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAATGTAATTAATGACCCAATTTCAATGATTTTTTCATTGTATATTCTTTGACCAAATAT 4140

 83173600 AGAAAAAATAGATAACGTAATATGCCTATAAAAATTATCTGGGCAAAATACAACTTTTTC 83173659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGAAAAAATAGATAACGTAATATGCCTATAAAAATTATCTGGGCAAAATACAACTTTTTC 4200

 83173660 TATTCTTTCCTGAAATTAAACCATGTTGAGCATGGTGTTGCAAAAAATGTCCTGGTAACT 83173719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TATTCTTTCCTGAAATTAAACCATGTTGAGCATGGTGTTGCAAAAAATGTCCTGGTAACT 4260

 83173720 CATCAATGGCAATTTTGTGAAATTCAATTATCACTGAATTTTACCTTATACAATTACATT 83173779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CATCAATGGCAATTTTGTGAAATTCAATTATCACTGAATTTTACCTTATACAATTACATT 4320

 83173780 ATAAATGAAAAACTTTTTTTCCTGAAAAGAGTCTTAAGTACAAATTAGTTTCAGCAGGGA 83173839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATAAATGAAAAACTTTTTTTCCTGAAAAGAGTCTTAAGTACAAATTAGTTTCAGCAGGGA 4380

 83173840 TTCTGTTTTACAAATCATCACAATCTGCTCAACTCACTTCCTGGAGAAATGCCTAAGCTG 83173899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTCTGTTTTACAAATCATCACAATCTGCTCAACTCACTTCCTGGAGAAATGCCTAAGCTG 4440

 83173900 TTTGGTTAAGAATTATACACTTGGAAAATTCTTGTTTGCTATAATACATATAAAAAAGGA 83173959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTGGTTAAGAATTATACACTTGGAAAATTCTTGTTTGCTATAATACATATAAAAAAGGA 4500

 83173960 TTATAAACCAACAGTGCTGAATAATATTACAGTGTATTATCTTGTGCTTCTTGTCACCTA 83174019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTATAAACCAACAGTGCTGAATAATATTACAGTGTATTATCTTGTGCTTCTTGTCACCTA 4560

 83174020 CAGTGACTGATGCTTATCATTCACTTAATTACTGTATTTAAAACATATGTGTTGTTGTCT 83174079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAGTGACTGATGCTTATCATTCACTTAATTACTGTATTTAAAACATATGTGTTGTTGTCT 4620

 83174080 TTAACCGCTACAGTATTCTATCCTTTAAAATTTCTGGGTTCCCATGTTATTGCTACTAAT 83174139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTAACCGCTACAGTATTCTATCCTTTAAAATTTCTGGGTTCCCATGTTATTGCTACTAAT 4680

 83174140 AATAAGCTGTTTATTCAAGTTTTTCAGAAACAAAAATTTGAATATAGAAAGATTTGTGTA 83174199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATAAGCTGTTTATTCAAGTTTTTCAGAAACAAAAATTTGAATATAGAAAGATTTGTGTA 4740

 83174200 TTCACTAGAGTTGATCTTAAAGGAATGTCTAAACAGAAATATAAAATGTCTCACACATAA 83174259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTCACTAGAGTTGATCTTAAAGGAATGTCTAAACAGAAATATAAAATGTCTCACACATAA 4800

 83174260 ATTTTAAATAAATATGTCAAATATCTGTTTATGTTGGTTCCAAGAATGTAAGTCAAACTC 83174319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATTTTAAATAAATATGTCAAATATCTGTTTATGTTGGTTCCAAGAATGTAAGTCAAACTC 4860

 83174320 TTTACCTGTTTATGTATGTGTAAAATAAACAAATAAATAAACAAAAATGACACTTATTTG 83174379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTTACCTGTTTATGTATGTGTAAAATAAACAAATAAATAAACAAAAATGACACTTATTTG 4920

 83174380 AAAGGCTGGGGCAACTTTTTAAGCAAGTAAAATAAATTATCTAGTTGATGTTTTTATAAA 83174439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AAAGGCTGGGGCAACTTTTTAAGCAAGTAAAATAAATTATCTAGTTGATGTTTTTATAAA 4980

 83174440 TCCATTCTTATGCTTTTGTCATTATTAAAACAGCATTTTGAGGTCAGTGTTTATACAGAA 83174499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TCCATTCTTATGCTTTTGTCATTATTAAAACAGCATTTTGAGGTCAGTGTTTATACAGAA 5040

 83174500 AGCAGTAATAATAGTAGCACATAATTGTATGCAACTTTATATTTTATAAAAAAACAATTT 83174559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AGCAGTAATAATAGTAGCACATAATTGTATGCAACTTTATATTTTATAAAAAAACAATTT 5100

 83174560 TTATACTCTATCATTTCATTACTCTTTTTAAACAACAAGGAATAAGACTCATAATCTGTA 83174619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTATACTCTATCATTTCATTACTCTTTTTAAACAACAAGGAATAAGACTCATAATCTGTA 5160

 83174620 GAGTCTAGGATTTCTAATTTTCACTTATCTGGGTATCCCACTATAGCATGCTAGAGAAGT 83174679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GAGTCTAGGATTTCTAATTTTCACTTATCTGGGTATCCCACTATAGCATGCTAGAGAAGT 5220

 83174680 ATAAATTAAGCCTTATGTAACAGTGGAGTAATAAGTATAGATTATTTTATCGTATGCAAC 83174739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ATAAATTAAGCCTTATGTAACAGTGGAGTAATAAGTATAGATTATTTTATCGTATGCAAC 5280

 83174740 AATAATCATTCCTGAAAGGCGGTAAATCAGATCCAAAGGCCATTGACTGTACATGTTTTA 83174799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AATAATCATTCCTGAAAGGCGGTAAATCAGATCCAAAGGCCATTGACTGTACATGTTTTA 5340

 83174800 AAAAATCAAGACTGACAAAAAGGGAAAGAAAAACATATGACTACATATCCACATGTACAC 83174859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAAAATCAAGACTGACAAAAAGGGAAAGAAAAACATATGACTACATATCCACATGTACAC 5400

 83174860 ACACACTGATATAATCAGATTGTGCATTCCAAAATTCATGTGTTGAAACTTAATCTGCAG 83174919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ACACACTGATATAATCAGATTGTGCATTCCAAAATTCATGTGTTGAAACTTAATCTGCAG 5460

 83174920 TGTGATAGTATTAAGAGGTGAGGCCTTTAGGGTGTGACTAAGTCATGAGGCAAAGCCCCC 83174979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTGATAGTATTAAGAGGTGAGGCCTTTAGGGTGTGACTAAGTCATGAGGCAAAGCCCCC 5520

 83174980 ATGAATGAGATTAGCAACTTTATAGAAGAGGTGGGTGGGATCAACACTCCTTTGTTCCTT 83175039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATGAATGAGATTAGCAACTTTATAGAAGAGGTGGGTGGGATCAACACTCCTTTGTTCCTT 5580

 83175040 TTGCTCTCCAGACCATTCTGTCCTCTGTGGACACAGCATCCATCCCTTCCAGAGAACACA 83175099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTGCTCTCCAGACCATTCTGTCCTCTGTGGACACAGCATCCATCCCTTCCAGAGAACACA 5640

 83175100 GCATTCAAGGCATCGTATCAGAAGCACAGGACTGTGCTCTCACCGGACACCAAACCTGTC 83175159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GCATTCAAGGCATCGTATCAGAAGCACAGGACTGTGCTCTCACCGGACACCAAACCTGTC 5700

 83175160 AGTGTCTTGATCTTGGACTTCCAGCTTCAGAACTGTGAGAAATAAGTTTATAATCCTTAT 83175219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AGTGTCTTGATCTTGGACTTCCAGCTTCAGAACTGTGAGAAATAAGTTTATAATCCTTAT 5760

 83175220 AAATTACCCAATCTCAGGTATTTTGCTATAGCAGCACTACAGCACTGAGGCATATACAGT 83175279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AAATTACCCAATCTCAGGTATTTTGCTATAGCAGCACTACAGCACTGAGGCATATACAGT 5820

 83175280 GCACAATATTTAACATCAGTTTTCTTGTGAGAATTGTCCACAATTCAAATTCTCAGAAGA 83175339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GCACAATATTTAACATCAGTTTTCTTGTGAGAATTGTCCACAATTCAAATTCTCAGAAGA 5880

 83175340 TATGAGGTGATCTTATTTTGTGTTAATCATGGGACAGGATGTAGGAGCAACACGATTAGG 83175399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TATGAGGTGATCTTATTTTGTGTTAATCATGGGACAGGATGTAGGAGCAACACGATTAGG 5940

 83175400 TCGCAGTTTAGCGGCCTTTGCTTAGAAAATTGGGGTGTAGCAAGAGTTGGGGAAAATGGT 83175459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TCGCAGTTTAGCGGCCTTTGCTTAGAAAATTGGGGTGTAGCAAGAGTTGGGGAAAATGGT 6000

 83175460 TTGGGGATAAGATCTAGAAGGGTCATCACCTAAGATACTTAGTCCCGAAGAGTCCTTAGC 83175519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TTGGGGATAAGATCTAGAAGGGTCATCACCTAAGATACTTAGTCCCGAAGAGTCCTTAGC 6060

 83175520 AAGGAAGGGAACAATTAACATTGTTTTGAAATGTTTCTGTACTATTACTTGATTTCATTT 83175579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AAGGAAGGGAACAATTAACATTGTTTTGAAATGTTTCTGTACTATTACTTGATTTCATTT 6120

 83175580 CTTAGAGTTGACAACATATTATTTCTTTAGGTATTTAAAATAATTTGGAACAAAACAATG 83175639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 CTTAGAGTTGACAACATATTATTTCTTTAGGTATTTAAAATAATTTGGAACAAAACAATG 6180

 83175640 GTTTCTAAACAAAAATAAGTGATTGTTTTTGTTTGATTCCTTAATAATTGTTTAATATCA 83175699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GTTTCTAAACAAAAATAAGTGATTGTTTTTGTTTGATTCCTTAATAATTGTTTAATATCA 6240

 83175700 CTATATTTACCACGTAACAAAGTGTCTTAGTTTAAATGACTCAGTTCTAGGCCAAACACT 83175759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CTATATTTACCACGTAACAAAGTGTCTTAGTTTAAATGACTCAGTTCTAGGCCAAACACT 6300

 83175760 TGGCAATGCCTTTGTACCTCCAATCCTACTTTCATGTTTATTCTATTGTAAAAACTATAA 83175819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TGGCAATGCCTTTGTACCTCCAATCCTACTTTCATGTTTATTCTATTGTAAAAACTATAA 6360

 83175820 ATGCCACTAAGTTGTATCAATGTACTAAAGAGACTTTTCTATGTTGGTTAAATTTAAGAC 83175879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ATGCCACTAAGTTGTATCAATGTACTAAAGAGACTTTTCTATGTTGGTTAAATTTAAGAC 6420

 83175880 AGCCCCCATTTGATTGTCATTGGTCATTTCAAACATTTTATATATTAGTTTGTTTTCATA 83175939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AGCCCCCATTTGATTGTCATTGGTCATTTCAAACATTTTATATATTAGTTTGTTTTCATA 6480

 83175940 CTGCTGATAAAGACATACTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGATT 83175999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CTGCTGATAAAGACATACTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGATT 6540

 83176000 CACAGCTCCACATGACTGGGAAAGCCTCACAATCATGGCAGAAGGCAAAAGGCACGTCTT 83176059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CACAGCTCCACATGACTGGGAAAGCCTCACAATCATGGCAGAAGGCAAAAGGCACGTCTT 6600

 83176060 ACATGGCAGCAGACGAGAGGGAATGAGAGCTAAGCAAAAGGGGAAACCTCTTATAAGACC 83176119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 ACATGGCAGCAGACGAGAGGGAATGAGAGCTAAGCAAAAGGGGAAACCTCTTATAAGACC 6660

 83176120 ATCACTTCTCATGAGACTTATTCACTACCATAGGAACAGTATGGAGGAAACTGCCCCCAT 83176179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 ATCACTTCTCATGAGACTTATTCACTACCATAGGAACAGTATGGAGGAAACTGCCCCCAT 6720

 83176180 GATTTAATTATCTCCCACCATGTTCTTCCCACAACACATGGGAATTATGGGAACTATAAT 83176239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 GATTTAATTATCTCCCACCATGTTCTTCCCACAACACATGGGAATTATGGGAACTATAAT 6780

 83176240 TCAAGATGAGATTGGGGTGGGGACACA 83176266
          |||||||||||||||||||||||||||
     6781 TCAAGATGAGATTGGGGTGGGGACACA 6807

Alignment time is 5.90387 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2129] =>      2129 nucs 'mol-32-3311-035017_2129'

Score:        2129
Aligned:      2129        nucs
Identic:      2129 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165102,83167230]
 second seq =>  [       1,    2129]

 83165102 TATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATA 83165161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTAATAAACAACAAATTGTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATA 60

 83165162 GAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAAC 83165221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAAC 120

 83165222 ACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAA 83165281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAA 180

 83165282 AACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTT 83165341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAATAGCACTGTTATCACACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTT 240

 83165342 TTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAG 83165401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAG 300

 83165402 TGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGT 83165461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGT 360

 83165462 ATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 83165521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 420

 83165522 CACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCC 83165581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCC 480

 83165582 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAA 83165641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAA 540

 83165642 AGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAG 83165701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAG 600

 83165702 ACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATG 83165761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATG 660

 83165762 ACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTC 83165821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTC 720

 83165822 AACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGT 83165881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGT 780

 83165882 GCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAG 83165941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAG 840

 83165942 CGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAG 83166001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAG 900

 83166002 AGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGA 83166061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGA 960

 83166062 TGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACA 83166121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACA 1020

 83166122 GCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGT 83166181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGT 1080

 83166182 CCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTG 83166241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTG 1140

 83166242 TGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGT 83166301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGT 1200

 83166302 GCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAA 83166361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAA 1260

 83166362 GTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAA 83166421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAA 1320

 83166422 TCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGAC 83166481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGAC 1380

 83166482 ATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTT 83166541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTT 1440

 83166542 GTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAG 83166601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAG 1500

 83166602 ACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTT 83166661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTT 1560

 83166662 ACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCT 83166721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCT 1620

 83166722 AGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGC 83166781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGC 1680

 83166782 CAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCC 83166841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCC 1740

 83166842 ATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCA 83166901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCA 1800

 83166902 TCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGG 83166961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGG 1860

 83166962 TGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGG 83167021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGG 1920

 83167022 CCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCAC 83167081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCAC 1980

 83167082 TAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCA 83167141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCA 2040

 83167142 AAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTA 83167201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTA 2100

 83167202 TGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAG 83167230
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGAACCAACACCATAGATTAATAATAAG 2129

Alignment time is 2.53112 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2090] =>      2090 nucs 'mol-32-33a0-111732_2090'

Score:        2090
Aligned:      2090        nucs
Identic:      2090 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165585,83167674]
 second seq =>  [       1,    2090]

 83165585 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGT 83165644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGT 60

 83165645 CAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACC 83165704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAACATTATTACAATTGTAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACC 120

 83165705 AATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACA 83165764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCCATATTGTAAAGGCAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACA 180

 83165765 TATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAAC 83165824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATATAAAGGGATAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAAC 240

 83165825 AACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCC 83165884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAACAAAAAAGTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCC 300

 83165885 TCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGA 83165944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGA 360

 83165945 GAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGC 83166004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGACCCACAACAGTTGACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGC 420

 83166005 ACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGA 83166064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGA 480

 83166065 CGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCT 83166124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCT 540

 83166125 TCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCT 83166184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCT 600

 83166185 GTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGA 83166244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGA 660

 83166245 GTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCA 83166304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGACCATGGCTACTGCATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCA 720

 83166305 TGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTG 83166364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTG 780

 83166365 GCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCA 83166424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCA 840

 83166425 TCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATG 83166484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCCACCTCCACCTCTCACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATG 900

 83166485 TCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTG 83166544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTG 960

 83166545 GGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACC 83166604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTAAGTGAGAGACCCACAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACC 1020

 83166605 CTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACT 83166664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACT 1080

 83166665 CTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGC 83166724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGC 1140

 83166725 TGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAA 83166784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCATATACCACCTGCAGGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAA 1200

 83166785 TACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATC 83166844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACCTGTGTACACGGCTTGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATC 1260

 83166845 TGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCG 83166904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCG 1320

 83166905 GTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGT 83166964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGT 1380

 83166965 GTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCT 83167024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCT 1440

 83167025 GAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAA 83167084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAA 1500

 83167085 TAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAG 83167144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAACTGAACTCTAACCATTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAG 1560

 83167145 AAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGG 83167204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGTTATCCAGAGATTAAACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGG 1620

 83167205 AACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGA 83167264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACCAACACCATAGATTAATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGA 1680

 83167265 AAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAA 83167324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAA 1740

 83167325 CATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATT 83167384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATAAAAATCAAAGAATTATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATT 1800

 83167385 CTAATCAAAACAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAA 83167444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAATCAAAACAAACTCACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAA 1860

 83167445 ACTCAGTGAAATATAAAAGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAATAATTCA 83167504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTCAGTGAAATATAAAAGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAATAATTCA 1920

 83167505 GAATATGAATGAGAAATTTACCAAAGATACAGATACCATAAAAAAGAAGGAAACAAAAAT 83167564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAATATGAATGAGAAATTTACCAAAGATACAGATACCATAAAAAAGAAGGAAACAAAAAT 1980

 83167565 GCTGACTGCGAAAATTCCTTGAGTAAAATATAAAATACATTTGAAAACCTTAACAATAGA 83167624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTGACTGCGAAAATTCCTTGAGTAAAATATAAAATACATTTGAAAACCTTAACAATAGA 2040

 83167625 CTAGGTCAATTACAAGAAATAATCTCAGAACTTGACAGTTGTTTTGAAAT 83167674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAGGTCAATTACAAGAAATAATCTCAGAACTTGACAGTTGTTTTGAAAT 2090

Alignment time is 2.3196 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4643] =>      4643 nucs 'mol-32-3403-128157_4643'

Score:        4642
Aligned:      4642        nucs
Identic:      4642 (100%) nucs =>      3838 (100%)       804 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83168401,83172238] EXCISED REGION [83172240,83173043]
 second seq =>  [       1,    3838] EXCISED REGION [    3840,    4643]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [83172239,83172239]
 second seq =>         1 nucs [3839,3839]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83172238,83172239] to [83172239,83172240]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [83172235,83172238] to [83172240,83172243]
 second seq =>         4 nucs [3835,3838] to [3840,3843]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 83168401 CACATTCTTCTCTTCAGTACGTGGAACATTCTCCAGAATAGATTGTATGTTAGGCCAAAA 83168460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACATTCTTCTCTTCAGTACGTGGAACATTCTCCAGAATAGATTGTATGTTAGGCCAAAA 60

 83168461 AACAATTTTTGAGCACTTTTTAAACATTGATATTATATTAACCTTCTCAGACCAAAATTG 83168520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAATTTTTGAGCACTTTTTAAACATTGATATTATATTAACCTTCTCAGACCAAAATTG 120

 83168521 AATAAAACTAAAAATAAACATAAAAACCATTATCAAGAGGAACTTTGGAAACTTTCCAAA 83168580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATAAAACTAAAAATAAACATAAAAACCATTATCAAGAGGAACTTTGGAAACTTTCCAAA 180

 83168581 ACATAGAAATTAAATCAGAAGCTTCTGAATAACCACTAAGTCAATGGAGAAATTAAAATG 83168640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATAGAAATTAAATCAGAAGCTTCTGAATAACCACTAAGTCAATGGAGAAATTAAAATG 240

 83168641 GAACTCAAAACTTTTCTTGAAACAAATGAAAATGGAAACACAACTTCAAAACCTGTGAGA 83168700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAACTCAAAACTTTTCTTGAAACAAATGAAAATGGAAACACAACTTCAAAACCTGTGAGA 300

 83168701 TGCAGCAAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTGTAGCAATAAATGCTACATGAAAAACACA 83168760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCAGCAAAAGCAGTACTAAGAGGGAAATTTGTAGCAATAAATGCTACATGAAAAACACA 360

 83168761 GAAAGATTTTGAATAAACAATCTAACAATGTACCTCAGTGAACTAGAAAAGCAAAAACAA 83168820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAGATTTTGAATAAACAATCTAACAATGTACCTCAGTGAACTAGAAAAGCAAAAACAA 420

 83168821 ACCAATCCAAAATTAACAGAAAAAAAGAAATAATAAAGATCACAGCAGAACTAAATGAAA 83168880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCAATCCAAAATTAACAGAAAAAAAGAAATAATAAAGATCACAGCAGAACTAAATGAAA 480

 83168881 TAGAGATCTAAAAAACAGTACAAATAACCAATGAAATTAAAAGTTGCTTCTTTGAAAAGA 83168940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGAGATCTAAAAAACAGTACAAATAACCAATGAAATTAAAAGTTGCTTCTTTGAAAAGA 540

 83168941 TAAAATTAATAAACTGCTAGCTTGACTAACCAAAAATTCACAACAAAATATTAGCAAACA 83169000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAAATTAATAAACTGCTAGCTTGACTAACCAAAAATTCACAACAAAATATTAGCAAACA 600

 83169001 GAATTCAAGAGCAAATATAAAAGTTAATGGATCATGCATGATCAAATGACATTTCCTCAA 83169060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAATTCAAGAGCAAATATAAAAGTTAATGGATCATGCATGATCAAATGACATTTCCTCAA 660

 83169061 GGGATTCAAGGATGTTTTAACATATACAAATCCATACATGTAATATACCACTTTAACAGA 83169120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGATTCAAGGATGTTTTAACATATACAAATCCATACATGTAATATACCACTTTAACAGA 720

 83169121 ATGAAAAATAAAAACCTTACAGTCATCTCAATAGACACAGAAAAGGCATTTGATAAAATT 83169180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGAAAAATAAAAACCTTACAGTCATCTCAATAGACACAGAAAAGGCATTTGATAAAATT 780

 83169181 CAAAATCCCTTCATATGAAAACTCTCAACAAACTAGATATAGAAGAAATATATCTCAAAA 83169240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAAAATCCCTTCATATGAAAACTCTCAACAAACTAGATATAGAAGAAATATATCTCAAAA 840

 83169241 TAATAAACACCATTTATGACAAACCAACAGCTAACATCATACTAAATAGGGAAAAATTAC 83169300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATAAACACCATTTATGACAAACCAACAGCTAACATCATACTAAATAGGGAAAAATTAC 900

 83169301 AAGCTTCTTCTCTCAGAACTGGAACAAGACAAGGATACCTACTTTCACCATTCCTAATCA 83169360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGCTTCTTCTCTCAGAACTGGAACAAGACAAGGATACCTACTTTCACCATTCCTAATCA 960

 83169361 ACATACTACTGGAAGTCTTAGCTAGAGCAATTAGGCCAGAAAAGTAACGAAAGAAATTTA 83169420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATACTACTGGAAGTCTTAGCTAGAGCAATTAGGCCAGAAAAGTAACGAAAGAAATTTA 1020

 83169421 AATTAGAAAAGAGGAAGTCAAATTGTTTCTTTTTTTTGGAGGTGATATGATCTTATATTT 83169480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTAGAAAAGAGGAAGTCAAATTGTTTCTTTTTTTTGGAGGTGATATGATCTTATATTT 1080

 83169481 AGAAAAAACCAAAGACGTCACCTAAAACTGTTAAAGCTGATAAGCAAATTCAGTAAATGT 83169540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAAAAAACCAAAGACGTCACCTAAAACTGTTAAAGCTGATAAGCAAATTCAGTAAATGT 1140

 83169541 GTAGTGTACAAAATTATCATACAAATAACAGTAGTGTTTTTATGCATCGATATTGAAATA 83169600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTAGTGTACAAAATTATCATACAAATAACAGTAGTGTTTTTATGCATCGATATTGAAATA 1200

 83169601 GCAGAAAAATAAGTCAAGAAGAAAATGCTGTTTAAAATAGCTACAAAATAAAACAAAATA 83169660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGAAAAATAAGTCAAGAAGAAAATGCTGTTTAAAATAGCTACAAAATAAAACAAAATA 1260

 83169661 TTTATGAATAAAGTTAACCAAGTACGTGAAGATCTACAGAAATATGAATACTACAGTGCA 83169720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTATGAATAAAGTTAACCAAGTACGTGAAGATCTACAGAAATATGAATACTACAGTGCA 1320

 83169721 TTGATGAAGTAAACTGAAGAGAAGAAAAATGGAAAGATGTCTCATGCTCACAAATAGGAA 83169780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGATGAAGTAAACTGAAGAGAAGAAAAATGGAAAGATGTCTCATGCTCACAAATAGGAA 1380

 83169781 AGATTAATATCAGTAAAATGACTACACTGCCAAAAGCCGTCTACAGATTTGATGCAATCC 83169840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATTAATATCAGTAAAATGACTACACTGCCAAAAGCCGTCTACAGATTTGATGCAATCC 1440

 83169841 TGATCAAAACACCAATGTTATTTTTCACAGACACAGAAAAAAAATACTAAAATTCGTATG 83169900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGATCAAAACACCAATGTTATTTTTCACAGACACAGAAAAAAAATACTAAAATTCGTATG 1500

 83169901 GAAGCAAAAAAGAGCCATAATAGCCAAAGCAATTCTGAGCAAAAATAAGAAAGCTGGACG 83169960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGCAAAAAAGAGCCATAATAGCCAAAGCAATTCTGAGCAAAAATAAGAAAGCTGGACG 1560

 83169961 CTTCACATTACCCGATGTCAAAATATATTACAAGGCTATAGAAACCAAAACAGAATGGTA 83170020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTCACATTACCCGATGTCAAAATATATTACAAGGCTATAGAAACCAAAACAGAATGGTA 1620

 83170021 TTGGTATACAAACAGACACATAGATTAATGGAACAGAATAGAGCACACAGCAATAAATCT 83170080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGTATACAAACAGACACATAGATTAATGGAACAGAATAGAGCACACAGCAATAAATCT 1680

 83170081 ACATATTTATCACCAACTGATTTTTGACAAAAGCACCAAGAAAATACACTGGGGGAATCG 83170140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATATTTATCACCAACTGATTTTTGACAAAAGCACCAAGAAAATACACTGGGGGAATCG 1740

 83170141 ACACCTTTTTCAGTAACGGTGCCAGGAAAATTGGATATTCACATGCAGAAGAATGAAACT 83170200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACACCTTTTTCAGTAACGGTGCCAGGAAAATTGGATATTCACATGCAGAAGAATGAAACT 1800

 83170201 GAATCTCTATTTCTCATCATATACAAAAAGCAACTCAAGATGAATTAAGAGTTAAACAGG 83170260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAATCTCTATTTCTCATCATATACAAAAAGCAACTCAAGATGAATTAAGAGTTAAACAGG 1860

 83170261 AGACCCCAAACTATCAAATTACTAAAAGGAAACATAGGAAAAACACTCCAAGACATTGGT 83170320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGACCCCAAACTATCAAATTACTAAAAGGAAACATAGGAAAAACACTCCAAGACATTGGT 1920

 83170321 TTAGGTTAAAGGTTTTATGGGAAAGTCCTTAAAAGCAGACACCAAAAATAAAACATATTG 83170380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAGGTTAAAGGTTTTATGGGAAAGTCCTTAAAAGCAGACACCAAAAATAAAACATATTG 1980

 83170381 GACTATATTAAACTAAAAATTATCTGTACAGCAATAAACAAAATAAAACAAGAAAGAAAA 83170440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACTATATTAAACTAAAAATTATCTGTACAGCAATAAACAAAATAAAACAAGAAAGAAAA 2040

 83170441 ACAGTAAAGAGTCAACCTTTTGATATGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGACATACAAATG 83170500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAGTAAAGAGTCAACCTTTTGATATGAATAGACATTTCTCAAAAGAAGACATACAAATG 2100

 83170501 GCCAACAGGTATGTGAAAATATAATCAACATCACTAAGCAACGAGGGAATGCATCAAAAC 83170560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCAACAGGTATGTGAAAATATAATCAACATCACTAAGCAACGAGGGAATGCATCAAAAC 2160

 83170561 CAAAATGAAATTTTACCTTACCCCAGTTAGAATGGCTATTAATAAAAGACAAAAAATAAC 83170620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAAAATGAAATTTTACCTTACCCCAGTTAGAATGGCTATTAATAAAAGACAAAAAATAAC 2220

 83170621 AGATGCTAGTGAGGATATGGAGAAAAGGAAACCCTTATTCACTGTTGGCAGGATTGTATG 83170680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGATGCTAGTGAGGATATGGAGAAAAGGAAACCCTTATTCACTGTTGGCAGGATTGTATG 2280

 83170681 TAGTATAACCAATATAAAAAATAACATGACATTTTCTTTAAAAAACTAAAAATAGAATTG 83170740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGTATAACCAATATAAAAAATAACATGACATTTTCTTTAAAAAACTAAAAATAGAATTG 2340

 83170741 CCATATGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCATGCAAAGGAAAATAAATTAGTATTT 83170800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCATATGATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCCATGCAAAGGAAAATAAATTAGTATTT 2400

 83170801 CAGATGGATACCTGCACTCACATGTTTGTCACAGCACTATTCATAACAGCAAAAATATAG 83170860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGATGGATACCTGCACTCACATGTTTGTCACAGCACTATTCATAACAGCAAAAATATAG 2460

 83170861 GAATTAACCTAAGTGACCAACAATGAACAAATGGACAAAGAAAATGTGGTATGTGTACAA 83170920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAATTAACCTAAGTGACCAACAATGAACAAATGGACAAAGAAAATGTGGTATGTGTACAA 2520

 83170921 AATAAAATATCATTTAGTCATAAAAAGAATAAAATTATGCCACTTGAAGCAACATAGCTG 83170980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATAAAATATCATTTAGTCATAAAAAGAATAAAATTATGCCACTTGAAGCAACATAGCTG 2580

 83170981 GAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAGATAGCCTATACACAAAAAAACAAATACCACATA 83171040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAGATAGCCTATACACAAAAAAACAAATACCACATA 2640

 83171041 CCCTTACTCTTATGTGAGAGCTAAAAATCTTTATGACATGAAAATAGAGATAGAATGATA 83171100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCTTACTCTTATGTGAGAGCTAAAAATCTTTATGACATGAAAATAGAGATAGAATGATA 2700

 83171101 GACACCAGAGTCTGGGAAGGGTGTGAGGGTGAGAGGGGGAAATAAATGAAATTTGGTGAA 83171160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACACCAGAGTCTGGGAAGGGTGTGAGGGTGAGAGGGGGAAATAAATGAAATTTGGTGAA 2760

 83171161 TGGGTACACATTGATAGTTAGATAAAAGAAATAACTTGTAATGTTCTATAGTAGACTAGG 83171220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGGTACACATTGATAGTTAGATAAAAGAAATAACTTGTAATGTTCTATAGTAGACTAGG 2820

 83171221 GTGACCATAGTTGGTAACACTGTATTTTATATTTCTAAGTAGCTGGAAGAGAGGACTTAA 83171280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGACCATAGTTGGTAACACTGTATTTTATATTTCTAAGTAGCTGGAAGAGAGGACTTAA 2880

 83171281 AAATGTTACCAACCCATGGAAGTGATACTTAGAAATGGTAAATATTTAAGGTGATGCATA 83171340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAATGTTACCAACCCATGGAAGTGATACTTAGAAATGGTAAATATTTAAGGTGATGCATA 2940

 83171341 CGCCAAATACCCTAAGTTGATCATTCCACATTCTATGCTCACATGTAACCCCCAAATATA 83171400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CGCCAAATACCCTAAGTTGATCATTCCACATTCTATGCTCACATGTAACCCCCAAATATA 3000

 83171401 TAAAATATTATGCATAAAGGAAAAATAAATACATTAAGAGATAATAAATTCAACTAAAGT 83171460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAAAATATTATGCATAAAGGAAAAATAAATACATTAAGAGATAATAAATTCAACTAAAGT 3060

 83171461 GGAGATTTTATAGGTATGAAAATGTAGTTAAACATTTGAAAAATTATCAATCAGTATAAT 83171520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGAGATTTTATAGGTATGAAAATGTAGTTAAACATTTGAAAAATTATCAATCAGTATAAT 3120

 83171521 TAATTACATGAGTTGAATTAGAAAAATTTCTTGCTTATCCCAATAACGTGCCAACAAACA 83171580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAATTACATGAGTTGAATTAGAAAAATTTCTTGCTTATCCCAATAACGTGCCAACAAACA 3180

 83171581 TTTGATAAAAGGCATAGTAAATAGAAAATGAAATGGAACTCTCTTAATTTGATTCATAAG 83171640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTGATAAAAGGCATAGTAAATAGAAAATGAAATGGAACTCTCTTAATTTGATTCATAAG 3240

 83171641 AGTACTTTTGAATAAATATCATGTGAAAAATTATACATGTCTCTGTAAGACAGTTTTGGA 83171700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGTACTTTTGAATAAATATCATGTGAAAAATTATACATGTCTCTGTAAGACAGTTTTGGA 3300

 83171701 AGTTATGACTTGACAAGAAAGCCAAGAAATTTTTAAAAAGAAAGAATACAGAGAAATTAA 83171760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGTTATGACTTGACAAGAAAGCCAAGAAATTTTTAAAAAGAAAGAATACAGAGAAATTAA 3360

 83171761 ATAAATAAAACTGTTTTTCTTAGATATATGATTGCAAATGTAGAAATTTCTCCCCTAACC 83171820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATAAATAAAACTGTTTTTCTTAGATATATGATTGCAAATGTAGAAATTTCTCCCCTAACC 3420

 83171821 TTCCCAGATTAACTGCTACAACAAATAAATGGAGTTAGTGAGTTGTCTATATAAAGAATT 83171880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTCCCAGATTAACTGCTACAACAAATAAATGGAGTTAGTGAGTTGTCTATATAAAGAATT 3480

 83171881 AATAGAGACATTTTTTAAGAAAACTTTTTTTTTCCTAAATGAACGGTATGTAAGTAGAGT 83171940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATAGAGACATTTTTTAAGAAAACTTTTTTTTTCCTAAATGAACGGTATGTAAGTAGAGT 3540

 83171941 GAGTTAGTGAAAAAGCACCAGAGAAAGAGAAGGTTAAGGAGAACCTGGTTTAATATGAAT 83172000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAGTTAGTGAAAAAGCACCAGAGAAAGAGAAGGTTAAGGAGAACCTGGTTTAATATGAAT 3600

 83172001 AGGCCACCTGTGTTTGCTAATTGGTATTTATCATAGTTAGGATCCTACCCTCCCACAGAG 83172060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGGCCACCTGTGTTTGCTAATTGGTATTTATCATAGTTAGGATCCTACCCTCCCACAGAG 3660

 83172061 AATGAAAATAGGGACTCTATCCTTCATGATAATTACATTTCAAAGAGATGGCTCCTGGGT 83172120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AATGAAAATAGGGACTCTATCCTTCATGATAATTACATTTCAAAGAGATGGCTCCTGGGT 3720

 83172121 CTTTGAGAAAGACATTCCTGAGCAAAACTGGCAAGAGGCTGGGGGAAGATTTACATCCCC 83172180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTTGAGAAAGACATTCCTGAGCAAAACTGGCAAGAGGCTGGGGGAAGATTTACATCCCC 3780

 83172181 AAGGGAAAGAGAAAAAATTTACAATTGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAG 83172238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAGGGAAAGAGAAAAAATTTACAATTGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAG 3838

EXCISED REGION

 83172240 GAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT 83172299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 GAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT 3899

 83172300 GGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCGT 83172359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCGT 3959

 83172360 CTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTA 83172419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTA 4019

 83172420 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGACA 83172479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGACA 4079

 83172480 AGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTGGGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATAA 83172539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTGGGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATAA 4139

 83172540 TTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGGA 83172599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TTAATTAATTAATTAATTAAAAATAAAAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGGA 4199

 83172600 AGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAAGCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAATG 83172659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAAGCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAATG 4259

 83172660 TCCATAACAAAAATCAGCATATTTATTTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGGA 83172719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TCCATAACAAAAATCAGCATATTTATTTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGGA 4319

 83172720 TATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTGTTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCAG 83172779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTGTTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCAG 4379

 83172780 CAAATGCAATATGTACAATATTAATTTTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATAC 83172839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 CAAATGCAATATGTACAATATTAATTTTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATAC 4439

 83172840 TATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTTTCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACAC 83172899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTTTCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACAC 4499

 83172900 ATACACACACACATACATACACATATACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCAT 83172959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 ATACACACACACATACATACACATATACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCAT 4559

 83172960 AACTATATACACATATATGGATATATACAAGCATTTATATATACTATAAATGATATTCCA 83173019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 AACTATATACACATATATGGATATATACAAGCATTTATATATACTATAAATGATATTCCA 4619

 83173020 CTATAGGATGAGAGATATTTAATA 83173043
          ||||||||||||||||||||||||
     4620 CTATAGGATGAGAGATATTTAATA 4643

Alignment time is 4.25009 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2609] =>      2609 nucs 'mol-32-340e-096265_2609'

Score:        2609
Aligned:      2609        nucs
Identic:      2609 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165129,83167737]
 second seq =>  [       1,    2609]

 83165129 AAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTT 83165188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCACATCGCTT 60

 83165189 AAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAA 83165248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCCTGGTGAA 120

 83165249 TTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAAT 83165308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCACACAAAAT 180

 83165309 GTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCC 83165368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTCTTCACCC 240

 83165369 AGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 83165428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 300

 83165429 AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGG 83165488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATATGCCTGG 360

 83165489 CTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAA 83165548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAA 420

 83165549 CTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTG 83165608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTG 480

 83165609 AGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACT 83165668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTGTAATACT 540

 83165669 TAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATT 83165728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGGCAAAATT 600

 83165729 TGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTT 83165788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAGACACTTT 660

 83165789 GAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAAT 83165848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGACAGAGAAT 720

 83165849 ACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTT 83165908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGGCTGAGTT 780

 83165909 GAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTC 83165968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTGACATTTC 840

 83165969 CACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAA 83166028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGGCCCTGAA 900

 83166029 CCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGC 83166088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAAAGCTTGC 960

 83166089 CCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATG 83166148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTTTAGAATG 1020

 83166149 TCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGA 83166208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAGGTGCTGA 1080

 83166209 GAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGG 83166268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGCATCTGGG 1140

 83166269 TGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGG 83166328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTAGCCTAGG 1200

 83166329 CTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCC 83166388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGCTGCTGCC 1260

 83166389 TCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCA 83166448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTCACAGCCA 1320

 83166449 GCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTC 83166508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTTGACACTC 1380

 83166509 ACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGT 83166568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCACAACAGT 1440

 83166569 TGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCC 83166628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTGATTGCCC 1500

 83166629 AGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTA 83166688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACTGAGCCTA 1560

 83166689 CCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGA 83166748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCAGGCCTGA 1620

 83166749 AGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACC 83166808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCTTGGAACC 1680

 83166809 CAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTC 83166868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGAAACGTTC 1740

 83166869 CATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAG 83166928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAGGTCCAAG 1800

 83166929 GATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACA 83166988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAGAAAGACA 1860

 83166989 GCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCC 83167048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTGGGTGTCC 1920

 83167049 CACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGA 83167108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCATTGAGGA 1980

 83167109 AATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATT 83167168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTAAACTATT 2040

 83167169 GCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATA 83167228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATTAATAATA 2100

 83167229 AGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACA 83167288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAGTGTTACA 2160

 83167289 CTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCA 83167348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAATTATGGCA 2220

 83167349 ACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAAACTCACAAAAT 83167408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAAACTCACAAAAT 2280

 83167409 GGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAAACTCAGTGAAATATAAAAGAATTC 83167468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAAACTCAGTGAAATATAAAAGAATTC 2340

 83167469 TGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAATAATTCAGAATATGAATGAGAAATTTACCAA 83167528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAATAATTCAGAATATGAATGAGAAATTTACCAA 2400

 83167529 AGATACAGATACCATAAAAAAGAAGGAAACAAAAATGCTGACTGCGAAAATTCCTTGAGT 83167588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGATACAGATACCATAAAAAAGAAGGAAACAAAAATGCTGACTGCGAAAATTCCTTGAGT 2460

 83167589 AAAATATAAAATACATTTGAAAACCTTAACAATAGACTAGGTCAATTACAAGAAATAATC 83167648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAATATAAAATACATTTGAAAACCTTAACAATAGACTAGGTCAATTACAAGAAATAATC 2520

 83167649 TCAGAACTTGACAGTTGTTTTGAAATAACCCAGTAAGATACAAATTAAACAAAATAATAA 83167708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCAGAACTTGACAGTTGTTTTGAAATAACCCAGTAAGATACAAATTAAACAAAATAATAA 2580

 83167709 AAAGAAAGAGAAATGAAATAAATAATGCC 83167737
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAAGAAAGAGAAATGAAATAAATAATGCC 2609

Alignment time is 2.11919 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2113] =>      2113 nucs 'mol-32-3492-129086_2113'

Score:        2091
Aligned:      2113        nucs
Identic:      2111 (100%) nucs =>       158 (100%)      1953 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83165777,83165934] EXCISED REGION [83172206,83174160]
 second seq =>  [       1,     158] EXCISED REGION [     159,    2113]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6271 nucs [83165935,83172205]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [83165935,83165936] to [83172206,83172207]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [83165935,83165935] to [83172205,83172205]
 second seq =>         0 nucs

 83165777 TAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAA 83165836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAGACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAA 60

 83165837 GTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAG 83165896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGACAGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAG 120

 83165897 ATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAA 83165934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGGGCTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAA 158

EXCISED REGION

 83172206 TGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCA 83172265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      159 TGCGAGTTTTCAAAAGTAAGTGCTCTAAAGAAGGGAAGATCAGCCGGCCGCGGTGGCTCA 218

 83172266 CGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 83172325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      219 CGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTT 278

 83172326 CGAGACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGC 83172385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      279 CGAGACAAGCCTGGACAACGTGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAATATAAAAATTAGC 338

 83172386 CAGACGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 83172445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      339 CAGACGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTG 398

 83172446 CTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGACAAGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTG 83172505
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      399 CTTGAACCCAGAAGGCGGAGGTCGCAGTGAGACAAGATTGCACCATTGCATCCCAGCCTG 458

 83172506 GGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAA 83172565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      459 GGTAACAAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAATAATTAATTAATTAATTAATTAAAAATAA 518

 83172566 AAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGGAAGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAA 83172625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      519 AAAAGAAGGGGAGGTCGGAGGCCTATTGTCAGGAAGTAACTGGTCTAAAAGTTTAGTCAA 578

 83172626 GCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAATGTCCATAACAAAAATCAGCATATTTAT 83172685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      579 GCTAAGAGGAAAATTAAGACCATCTTTGTCAATGTCCATAACAAAAATCAGCATATTTAT 638

 83172686 TTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGGATATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTG 83172745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 TTGTTAATTTGACAAAGTTTTTGTTCTTATAGGATATTAGATTTTTCTAGCTATCTTTTG 698

 83172746 TTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCAGCAAATGCAATATGTACAATATTAATT 83172805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 TTACTGGTTCCTTATTCCATTAAATTATGGTCAGCAAATGCAATATGTACAATATTAATT 758

 83172806 TTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATACTATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTT 83172865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      759 TTTTAAAATCTCTGAGATTTGCATTCTGAAATACTATTTTCCATATATGTTCCAAAAGTT 818

 83172866 TCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACACATACACACACACATACATACACATAT 83172925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 TCTTAAAACAATCATAATTTGCCATTATACACACATACACACACACATACATACACATAT 878

 83172926 ACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCATAACTATATACACATATATGGATATAT 83172985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 ACACATATACATATATAAGCACACATCCTTCCATAACTATATACACATATATGGATATAT 938

 83172986 ACAAGCATTTATATATACTATAAATGATATTCCACTATAGGATGAGAGATATTTAATATG 83173045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 ACAAGCATTTATATATACTATAAATGATATTCCACTATAGGATGAGAGATATTTAATATG 998

 83173046 TTATGAACAGATTTTGCCATACTATATAATACAGAACATGTTCACAATATTAAGAACATA 83173105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 TTATGAACAGATTTTGCCATACTATATAATACAGAACATGTTCACAATATTAAGAACATA 1058

 83173106 ATCTAGAGTACTCAAGCTATAGTTACATGCTTGTTGCTAGACATGAATAGTCTGATTTTC 83173165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 ATCTAGAGTACTCAAGCTATAGTTACATGCTTGTTGCTAGACATGAATAGTCTGATTTTC 1118

 83173166 ATCAATGTTAGGGCTAAACCAAATATATAAAAGTATTACATGAATATAGGGAAAAAGAAC 83173225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 ATCAATGTTAGGGCTAAACCAAATATATAAAAGTATTACATGAATATAGGGAAAAAGAAC 1178

 83173226 TTAAGAAAATATAATTTTCTGCTGCTTTATCTATGCTTACTAATTATACGAAGTCCTTTG 83173285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1179 TTAAGAAAATATAATTTTCTGCTGCTTTATCTATGCTTACTAATTATATGAAGTCCTTTG 1238

 83173286 AAATGAATTACTTATTAAGTAAAAGTACTTATTAAGGAATATTTCACAGTAAGTTCAGTA 83173345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 AAATGAATTACTTATTAAGTAAAAGTACTTATTAAGGAATATTTCACAGTAAGTTCAGTA 1298

 83173346 AGTTGGAGAACAATTTCTTTTAACAATTCATATTTCTGCAGATAAACTAAAGATTGTAAG 83173405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 AGTTGGAGAACAATTTCTTTTAACAATTCATATTTCTGCAGATAAACTAAAGATTGTAAG 1358

 83173406 ATTATTGGCAAAAAAGTAATGTTAATTAAGAAAGACTTTTGAGGTCCCCACTATTCATTT 83173465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 ATTATTGGCAAAAAAGTAATGTTAATTAAGAAAGACTTTTGAGGTCCCCACTATTCATTT 1418

 83173466 CTAGAAATAAACTGATATCAGTTTGGTATTAATTTGGGGAATACCTTTTTAATTGTTCAA 83173525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 CTAGAAATAAACTGATATCAGTTTGGTATTAATTTGGGGAATACCTTTTTAATTGTTCAA 1478

 83173526 AATGTTGGACTATGCAATGTAATTAATGACCCAATTTCAATGATTTTTTCATTGTATATT 83173585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 AATGTTGGACTATGCAATGTAATTAATGACCCAATTTCAATGATTTTTTCATTGTATATT 1538

 83173586 CTTTGACCAAATATAGAAAAAATAGATAACGTAATATGCCTATAAAAATTATCTGGGCAA 83173645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 CTTTGACCAAATATAGAAAAAATAGATAACGTAATATGCCTATAAAAATTATCTGGGCAA 1598

 83173646 AATACAACTTTTTCTATTCTTTCCTGAAATTAAACCATGTTGAGCATGGTGTTGCAAAAA 83173705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 AATACAACTTTTTCTATTCTTTCCTGAAATTAAACCATGTTGAGCATGGTGTTGCAAAAA 1658

 83173706 ATGTCCTGGTAACTCATCAATGGCAATTTTGTGAAATTCAATTATCACTGAATTTTACCT 83173765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 ATGTCCTGGTAACTCATCAATGGCAATTTTGTGAAATTCAATTATCACTGAATTTTACCT 1718

 83173766 TATACAATTACATTATAAATGAAAAACTTTTTTTCCTGAAAAGAGTCTTAAGTACAAATT 83173825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 TATACAATTACATTATAAATGAAAAACTTTTTTTCCTGAAAAGAGTCTTAAGTACAAATT 1778

 83173826 AGTTTCAGCAGGGATTCTGTTTTACAAATCATCACAATCTGCTCAACTCACTTCCTGGAG 83173885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 AGTTTCAGCAGGGATTCTGTTTTACAAATCATCACAATCTGCTCAACTCACTTCCTGGAG 1838

 83173886 AAATGCCTAAGCTGTTTGGTTAAGAATTATACACTTGGAAAATTCTTGTTTGCTATAATA 83173945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 AAATGCCTAAGCTGTTTGGTTAAGAATTATACACTTGGAAAATTCTTGTTTGCTATAATA 1898

 83173946 CATATAAAAAAGGATTATAAACCAACAGTGCTGAATAATATTACAGTGTATTATCTTGTG 83174005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 CATATAAAAAAGGATTATAAACCAACAGTGCTGAATAATATTACAGTGTATTATCTTGTG 1958

 83174006 CTTCTTGTCACCTACAGTGACTGATGCTTATCATTCACTTAATTACTGTATTTAAAACAT 83174065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 CTTCTTGTCACCTACAGTGACTGATGCTTATCATTCACTTAATTACTGTATTTAAAACAT 2018

 83174066 ATGTGTTGTTGTCTTTAACCGCTACAGTATTCTATCCTTTAAAATTTCTGGGTTCCCATG 83174125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 ATGTGTTGTTGTCTTTAACCGCTACAGTATTCTATCCTTTAAAATTTCTGGGTTCCCATG 2078

 83174126 TTATTGCTACTAATAATAAGCTGTTTATTCAAGTT 83174160
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 TTATTGCTACTAATAATAAGCTGTTTATTCAAGTT 2113

Alignment time is 2.75809 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [83155934,83182205] =>     26272 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2866] =>      2866 nucs 'mol-32-3492-181025_2866'

Score:        2866
Aligned:      2866        nucs
Identic:      2866 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [83164882,83167747]
 second seq =>  [       1,    2866]

 83164882 TATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATAAAATA 83164941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTATTTGATGTGCATATGGAATTGTTCACAAAGTAATCATTTTTTGACCCATAAAATA 60

 83164942 AGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAAT 83165001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTCTAAACAAATACCAAAAAACTGAAATAAAGAAAATGTGTTGTCTCACAAGAAAGAAT 120

 83165002 AAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGT 83165061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGTAATAAATCAAGATTAAAGAGATAATTAATATTGCCTTCTAAATTTTTGGATAAGT 180

 83165062 ACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATT 83165121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTTATAAACATCTTTGTGACAATAAGCTCTCATAACAATATTTAATAAACAACAAATT 240

 83165122 GTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCAC 83165181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTAGAGGAAATGGCCAAGTCACTGGAAAAAAATAAGAATAGAAAATGGAAATAGTCCCAC 300

 83165182 ATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCC 83165241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCGCTTAAATAGATAATTTTTACAATTGAAATTATTAACACCAAGGAAATGCCAGGCCC 360

 83165242 TGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCAC 83165301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTGAATTAACCAGAGAACTATCAAATACATTTAAGAAAAACAATAGCACTGTTATCAC 420

 83165302 ACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTC 83165361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAAAATGTACCAGGAAATTAAAAATACCAGAAACTTTTTTTTTTTTACAGTCTCGCTTC 480

 83165362 TTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGG 83165421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCACGATCTCAGCTCAGTGAAACCTCCACCTCCCAGG 540

 83165422 TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATA 83165481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCACAAGCCAATA 600

 83165482 TGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGG 83165541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCTGGCTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTGGCCAGGCTGG 660

 83165542 TCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 83165601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTGAACTCCTGACCTCAAGAAGTCTCCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 720

 83165602 AGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTG 83165661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCTTGAGCAACTGCACCCAACTGGAAACTTTTCTACAAAGTCAACATTATTACAATTG 780

 83165662 TAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGG 83165721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATACTTAACAAGGTCATTACAAGAAAAAATAATTTTAGACCAATCCATATTGTAAAGG 840

 83165722 CAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAG 83165781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAAATTTGAAAACAAATTATTATAAAACAAAATAAAATGACATATATAAAGGGATAGAG 900

 83165782 ACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGAC 83165841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACACTTTGAATAGATCATACAAGAGGGAACACTGGAATTCAACAACAACAAAAAAGTGAC 960

 83165842 AGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGG 83165901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGAATACTTAAAACAAGGAAAGAAAATCAGGTAAGGGTGCCTCCCTGGCTGAGATGGG 1020

 83165902 CTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTG 83165961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGAGTTGAGGGAGACTCCCAGGTATAAGGAAATGGTAAGCGAGAGACCCACAACAGTTG 1080

 83165962 ACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGG 83166021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACATTTCCACCATGAATTTCTACAATCCTAGACATGGGAGAGCACTTTGACCCTTGCAGG 1140

 83166022 CCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAA 83166081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCTGAACCTTATATAAGGAGCTGCCAGGAGAATCTGTGATGACGTTGCCCAAGGAAGAA 1200

 83166082 AGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTT 83166141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCTTGCCCTGGGTTCCATGTATTCCCTGAGACCTAAACAGCTTCAGCAAGGTGCCTTTT 1260

 83166142 TAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAG 83166201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGAATGTCACATCCAACATGCTGTACACTGTACTGGAGTCCTGTGGTGCTGGGACTGAG 1320

 83166202 GTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGC 83166261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGCTGAGAAACACAAGCTGCTAGACCTGGGGTTCAGGTGTGAGTGACCATGGCTACTGC 1380

 83166262 ATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTA 83166321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTGGGTGTGAGAGCCACGAGGACTGAGGTGTGAATGGTGCATGCACTCTGTACTCTTA 1440

 83166322 GCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGC 83166381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCCTAGGCTGCCATCACTGAAGGTGGCATTGCTTGCCCAAGTGGCAGACCCCAGCCATGC 1500

 83166382 TGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTC 83166441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTGCCTCTGACCCAAGAACACTTCCAGTGGCCTGAGAATCATCCCACCTCCACCTCTC 1560

 83166442 ACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTT 83166501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAGCCAGCACCCGTACACACCATCAGGGGACCTAAAGACATGTCAGTCTGTCCTGGTTT 1620

 83166502 GACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCA 83166561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACACTCACCCCCAGAGTAAGTTTGACACTTACCCCTGTTGTGGGTAAGTGAGAGACCCA 1680

 83166562 CAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTG 83166621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAACAGTTGAGATTTCCACCATGAATTCCTACAATCCTAGACCCTAGTGGGAGCCAGGTG 1740

 83166622 ATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACT 83166681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTGCCCAGCCAAGTCCACCACCACTGATACCTGAACTTTACTCTCAGGAGTCTGAGACT 1800

 83166682 GAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCA 83166741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGCCTACCAACTCAGCCACTATTACCATAGAAGGCATCTAGCTGCATATACCACCTGCA 1860

 83166742 GGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCT 83166801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGCCTGAAGACTTGCCTGCATAGCCATTCACAGACACTGCCAATACCTGTGTACACGGCT 1920

 83166802 TGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGA 83166861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGAACCCAAAGGGCCTTTATGCCACAGCCACTGCACGCCATCTGCCCACGGTCCTGAGA 1980

 83166862 AACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAG 83166921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACGTTCCATCTGCCTGGCCCACTGCTGCAATTATCAGCATCGGTGTAAGCCACCTGAAG 2040

 83166922 GTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAG 83166981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTCCAAGGATTGGCCTGCCTGGCCCCACTACTGGTGATGGTGTGTGCCACCCTGGGGCAG 2100

 83166982 AAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTG 83167041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGACAGCCATGATCAGCCCACTAGTCCCACCACTGTGGCCTGAAGACTAGCCTACCTG 2160

 83167042 GGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCA 83167101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTGTCCCACTTCCCAGAAAACCTGCACCACAGCTTCCACTAATAACTGAACTCTAACCA 2220

 83167102 TTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTA 83167161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGAGGAAATCATAGATACCACTAATGCCACTGACAGCCAAAGAAGTTATCCAGAGATTA 2280

 83167162 AACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATT 83167221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACTATTGCATGCATTCAGAATCAAACTCAAAGTACCCTATGGAACCAACACCATAGATT 2340

 83167222 AATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAG 83167281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATAATAAGGAAACATTTTTCACTTAGGAAAGCAAAATTCAGAAAAGGGGAGAAAGCAAG 2400

 83167282 TGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAAT 83167341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTTACACTGGATACACACATATCACCATAAGGACAAAGGAAACATAAAAATCAAAGAAT 2460

 83167342 TATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAAACTC 83167401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATGGCAACTCCAAGGAACTCAGTAATTCTCCAGCAACAGATTCTAATCAAAACAAACTC 2520

 83167402 ACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAAACTCAGTGAAATATAAA 83167461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACAAAATGGAGGGAAAATCATTCAAATCATTAATTCTAAAGAAACTCAGTGAAATATAAA 2580

 83167462 AGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAATAATTCAGAATATGAATGAGAAAT 83167521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGAATTCTGAAAAAGTATGCAAACAAATTTGAAAAATAATTCAGAATATGAATGAGAAAT 2640

 83167522 TTACCAAAGATACAGATACCATAAAAAAGAAGGAAACAAAAATGCTGACTGCGAAAATTC 83167581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTACCAAAGATACAGATACCATAAAAAAGAAGGAAACAAAAATGCTGACTGCGAAAATTC 2700

 83167582 CTTGAGTAAAATATAAAATACATTTGAAAACCTTAACAATAGACTAGGTCAATTACAAGA 83167641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTGAGTAAAATATAAAATACATTTGAAAACCTTAACAATAGACTAGGTCAATTACAAGA 2760

 83167642 AATAATCTCAGAACTTGACAGTTGTTTTGAAATAACCCAGTAAGATACAAATTAAACAAA 83167701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATAATCTCAGAACTTGACAGTTGTTTTGAAATAACCCAGTAAGATACAAATTAAACAAA 2820

 83167702 ATAATAAAAAGAAAGAGAAATGAAATAAATAATGCCACTGTAGGAG 83167747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATAATAAAAAGAAAGAGAAATGAAATAAATAATGCCACTGTAGGAG 2866

Alignment time is 2.32712 s

