
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4297] =>      4297 nucs 'mol-32-1e66-043777_4297'

Score:        4285
Aligned:      4296        nucs
Identic:      4295 (100%) nucs =>       803 (100%)      3492 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383959,58384761] EXCISED REGION [58384763,58388255]
 second seq =>  [       1,     803] EXCISED REGION [     805,    4297]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [804,804]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [803,803] to [805,805]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383959 GGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCA 58384018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCA 60

 58384019 GGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAA 58384078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAA 120

 58384079 TCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCA 58384138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCA 180

 58384139 AGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGAC 58384198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGAC 240

 58384199 AAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCC 58384258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCC 300

 58384259 TTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAG 58384318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAG 360

 58384319 ACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCT 58384378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCT 420

 58384379 TCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACT 58384438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACT 480

 58384439 GGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTC 58384498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTC 540

 58384499 AAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGA 58384558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGA 600

 58384559 CTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAA 58384618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAA 660

 58384619 TGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAA 58384678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAA 720

 58384679 TCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTA 58384738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTA 780

 58384739 AACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||
      781 AACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 803

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 864

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 924

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 984

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1044

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1104

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1164

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1224

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1284

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1344

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1404

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1464

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1524

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1584

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1644

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1704

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1764

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1824

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 1884

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 1944

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2004

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2064

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2124

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2184

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2185 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2244

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2304

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2364

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2424

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 2484

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 2544

 58386503 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 58386562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 2604

 58386563 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 58386622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 2664

 58386623 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 58386682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 2724

 58386683 GACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTT 58386742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 GACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTT 2784

 58386743 ACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAA 58386802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 ACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAA 2844

 58386803 AAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATG 58386862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 AAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATG 2904

 58386863 CCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGAT 58386922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 CCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGAT 2964

 58386923 ATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTC 58386982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 ATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTC 3024

 58386983 ATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTG 58387042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 ATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTG 3084

 58387043 TTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCT 58387102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCT 3144

 58387103 TAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTT 58387162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTT 3204

 58387163 AAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAA 58387222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 AAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAA 3264

 58387223 ATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTG 58387282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 ATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTG 3324

 58387283 TAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTG 58387342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 TAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTG 3384

 58387343 CTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTC 58387402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 CTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTC 3444

 58387403 ATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTAC 58387462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 ATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTAC 3504

 58387463 CTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGT 58387522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 CTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGT 3564

 58387523 TAATGATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACAT 58387582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 TAATGATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACAT 3624

 58387583 GGTAAAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAG 58387642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 GGTAAAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAG 3684

 58387643 AAATTTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTT 58387702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 AAATTTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTT 3744

 58387703 CATTTGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAA 58387762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 CATTTGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAA 3804

 58387763 TATGAACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACA 58387822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 TATGAACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACA 3864

 58387823 TTGAAAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAG 58387882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 TTGAAAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAG 3924

 58387883 AAAGTAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCT 58387942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 AAAGTAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCT 3984

 58387943 TATGCAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTAC 58388002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TATGCAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTAC 4044

 58388003 AATGCTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCA 58388062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 AATGCTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCA 4104

 58388063 ATCTCTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTT 58388122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 ATCTCTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTT 4164

 58388123 ACATTAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAAT 58388182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 ACATTAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAAT 4224

 58388183 TCAGAATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTT 58388242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 TCAGAATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTT 4284

 58388243 ATTCACTAGCTAT 58388255
          |||||||||||||
     4285 ATTCACTAGCTAT 4297

Alignment time is 3.08081 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2183] =>      2183 nucs 'mol-32-1e87-147690_2183'

Score:        2182
Aligned:      2182        nucs
Identic:      2182 (100%) nucs =>      2052 (100%)       130 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58384125,58386176] EXCISED REGION [58386178,58386307]
 second seq =>  [       1,    2052] EXCISED REGION [    2054,    2183]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386177,58386177]
 second seq =>         1 nucs [2053,2053]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2052,2053] to [2053,2054]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [58386174,58386176] to [58386178,58386180]
 second seq =>         3 nucs [2050,2052] to [2054,2056]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58384125 ATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATC 58384184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATC 60

 58384185 AACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACA 58384244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACA 120

 58384245 AAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCC 58384304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCC 180

 58384305 TCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAG 58384364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAG 240

 58384365 TTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTA 58384424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTA 300

 58384425 TTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTG 58384484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTG 360

 58384485 GAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATA 58384544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATA 420

 58384545 GAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTT 58384604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTT 480

 58384605 TCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACT 58384664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACT 540

 58384665 ACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACT 58384724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACT 600

 58384725 TAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGA 58384784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGA 660

 58384785 TAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAG 58384844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAG 720

 58384845 AAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTC 58384904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTC 780

 58384905 CCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGG 58384964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGG 840

 58384965 AACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGAC 58385024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGAC 900

 58385025 ATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCAC 58385084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCAC 960

 58385085 TGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCA 58385144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCA 1020

 58385145 CATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGAT 58385204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGAT 1080

 58385205 AAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAA 58385264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAA 1140

 58385265 TTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAAT 58385324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAAT 1200

 58385325 CTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATT 58385384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATT 1260

 58385385 GGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAA 58385444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAA 1320

 58385445 CAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGT 58385504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGT 1380

 58385505 GAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATT 58385564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATT 1440

 58385565 AATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATG 58385624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATG 1500

 58385625 AGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATAT 58385684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATAT 1560

 58385685 GAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATAC 58385744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATAC 1620

 58385745 CACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGG 58385804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGG 1680

 58385805 CCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATC 58385864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATC 1740

 58385865 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCT 58385924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCT 1800

 58385925 GGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAG 58385984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAG 1860

 58385985 GATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAA 58386044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAA 1920

 58386045 TTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGG 58386104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGG 1980

 58386105 GCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTA 58386164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTA 2040

 58386165 TGGCAGCACTAT 58386176
          ||||||||||||
     2041 TGGCAGCACTAT 2052

EXCISED REGION

 58386178 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 58386237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 2113

 58386238 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 58386297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 2173

 58386298 TAACATGGAT 58386307
          ||||||||||
     2174 TAACATGGAT 2183

Alignment time is 1.62566 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5850] =>      5850 nucs 'mol-32-1ef5-096362_5850'

Score:        5817
Aligned:      5850        nucs
Identic:      5847 (100%) nucs =>      2313 (100%)      3534 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58384071,58386385] EXCISED REGION [58386388,58389922]
 second seq =>  [       1,    2315] EXCISED REGION [    2316,    5850]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [58386386,58386387]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [58386386,58386397] to [58386388,58386399]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58386386,58386386] to [58386387,58386387]
 second seq =>         0 nucs

 58384071 AAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCA 58384130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCA 60

 58384131 GGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGA 58384190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGA 120

 58384191 GAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTC 58384250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTC 180

 58384251 AACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACA 58384310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACA 240

 58384311 CAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACA 58384370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACA 300

 58384371 ACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCAC 58384430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCAC 360

 58384431 ATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGG 58384490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGG 420

 58384491 AGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAAC 58384550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAAC 480

 58384551 CCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCC 58384610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCC 540

 58384611 TACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAA 58384670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAA 600

 58384671 AAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCAT 58384730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCAT 660

 58384731 TAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAAT 58384790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAAT 720

 58384791 AAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTA 58384850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTA 780

 58384851 ATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATT 58384910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATT 840

 58384911 AAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCAT 58384970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCAT 900

 58384971 GAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACA 58385030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACA 960

 58385031 CTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCAT 58385090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCAT 1020

 58385091 AAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACT 58385150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACT 1080

 58385151 TATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCT 58385210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCT 1140

 58385211 CCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAA 58385270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAA 1200

 58385271 CCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAA 58385330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAA 1260

 58385331 CCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTG 58385390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1261 CCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCAGGGCATTGGGCTG 1320

 58385391 GGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATG 58385450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATG 1380

 58385451 GTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAA 58385510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAA 1440

 58385511 ACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATA 58385570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATA 1500

 58385571 CAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAA 58385630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAA 1560

 58385631 ATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAA 58385690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAA 1620

 58385691 TGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTC 58385750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTC 1680

 58385751 ACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACT 58385810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACT 1740

 58385811 ACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA 58385870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA 1800

 58385871 GCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAA 58385930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAA 1860

 58385931 CAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTG 58385990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTG 1920

 58385991 GAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCAT 58386050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCAT 1980

 58386051 GGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATAC 58386110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATAC 2040

 58386111 ATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAG 58386170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAG 2100

 58386171 CACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAA 58386230
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAA 2160

 58386231 ATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTA 58386290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTA 2220

 58386291 TTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAA 58386350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAA 2280

 58386351 GACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGGAAT 58386385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGGAAT 2315

EXCISED REGION

 58386388 AAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCA 58386447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 AAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCA 2375

 58386448 GAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACA 58386507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 GAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACA 2435

 58386508 TTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGT 58386567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 TTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGT 2495

 58386568 CAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGT 58386627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 CAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGT 2555

 58386628 GATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGAGACAT 58386687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 GATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGAGACAT 2615

 58386688 CAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTTACATT 58386747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 CAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTTACATT 2675

 58386748 TATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAAA 58386807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 TATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAAA 2735

 58386808 AAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTGC 58386867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 AAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTGC 2795

 58386868 AGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGAA 58386927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 AGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGAA 2855

 58386928 CATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTAG 58386987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 CATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTAG 2915

 58386988 GAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCTA 58387047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 GAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCTA 2975

 58387048 TAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAACA 58387107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 TAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAACA 3035

 58387108 TTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAAT 58387167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAAT 3095

 58387168 TTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGTT 58387227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 TTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGTT 3155

 58387228 TCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAAT 58387287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 TCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAAT 3215

 58387288 ATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCAC 58387347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 ATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCAC 3275

 58387348 TTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTTC 58387407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 TTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTTC 3335

 58387408 TCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTTA 58387467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTTA 3395

 58387468 CAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAATG 58387527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 CAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAATG 3455

 58387528 ATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTAA 58387587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 ATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTAA 3515

 58387588 AATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAATT 58387647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 AATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAATT 3575

 58387648 TTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATTT 58387707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATTT 3635

 58387708 GGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATGA 58387767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 GGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATGA 3695

 58387768 ACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGAA 58387827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 ACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGAA 3755

 58387828 AAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAGT 58387887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 AAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAGT 3815

 58387888 AGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATGC 58387947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 AGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATGC 3875

 58387948 AGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATGC 58388007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 AGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATGC 3935

 58388008 TGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCTC 58388067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 TGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCTC 3995

 58388068 TCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACATT 58388127
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3996 TCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACGTT 4055

 58388128 AAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAGA 58388187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 AAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAGA 4115

 58388188 ATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTCA 58388247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 ATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTCA 4175

 58388248 CTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCCA 58388307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 CTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCCA 4235

 58388308 TTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTCT 58388367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 TTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTCT 4295

 58388368 CTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTAT 58388427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 CTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTAT 4355

 58388428 TTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAACA 58388487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 TTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAACA 4415

 58388488 GAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTAA 58388547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 GAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTAA 4475

 58388548 ACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAAA 58388607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 ACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAAA 4535

 58388608 TTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTTT 58388667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 TTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTTT 4595

 58388668 AAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAAA 58388727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 AAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAAA 4655

 58388728 CCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGGC 58388787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 CCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGGC 4715

 58388788 CCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAAC 58388847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 CCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAAC 4775

 58388848 ATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGTC 58388907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 ATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGTC 4835

 58388908 TCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTAA 58388967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 TCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTAA 4895

 58388968 TTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTCT 58389027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 TTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTCT 4955

 58389028 GTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTTA 58389087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 GTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTTA 5015

 58389088 ACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCTT 58389147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 ACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCTT 5075

 58389148 CACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTATA 58389207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 CACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTATA 5135

 58389208 TTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGTGGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTAT 58389267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 TTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGTGGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTAT 5195

 58389268 GCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATAGCATT 58389327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 GCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATAGCATT 5255

 58389328 TAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTCTAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTCCAATG 58389387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 TAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTCTAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTCCAATG 5315

 58389388 ATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAATTTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCTGTGAG 58389447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 ATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAATTTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCTGTGAG 5375

 58389448 GAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCTATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGTAAGGG 58389507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 GAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCTATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGTAAGGG 5435

 58389508 ACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTACCGCATGGTAACAACAACTACAAAACCCCCAA 58389567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 ACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTACCGCATGGTAACAACAACTACAAAACCCCCAA 5495

 58389568 AACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACATAAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCAAGTGA 58389627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 AACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACATAAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCAAGTGA 5555

 58389628 AATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATTTAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCCTTGTG 58389687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 AATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATTTAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCCTTGTG 5615

 58389688 GATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAGGAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGGCATGG 58389747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 GATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAGGAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGGCATGG 5675

 58389748 GTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGAGACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTATCCAGG 58389807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 GTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGAGACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTATCCAGG 5735

 58389808 GTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAAATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGGCCATG 58389867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 GTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAAATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGGCCATG 5795

 58389868 TGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACTCTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAG 58389922
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 TGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACTCTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAG 5850

Alignment time is 4.2023 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2533] =>      2533 nucs 'mol-32-2399-031179_2533'

Score:        2510
Aligned:      2532        nucs
Identic:      2530 (100%) nucs =>       959 (100%)      1571 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383803,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386335]
 second seq =>  [       1,     959] EXCISED REGION [     961,    2533]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [960,960]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [959,959] to [961,961]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383803 TAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGAT 58383862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGAT 60

 58383863 GGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAA 58383922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAA 120

 58383923 CTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAA 58383982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAA 180

 58383983 AACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAA 58384042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAA 240

 58384043 ATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTA 58384102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTA 300

 58384103 TTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACC 58384162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACC 360

 58384163 AATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATA 58384222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATA 420

 58384223 CAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAA 58384282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAA 480

 58384283 TTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTG 58384342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTG 540

 58384343 GCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAG 58384402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAG 600

 58384403 ATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAA 58384462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAA 660

 58384463 AAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTAC 58384522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTAC 720

 58384523 AGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACT 58384582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACT 780

 58384583 AGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGT 58384642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGT 840

 58384643 GTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAA 58384702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAA 900

 58384703 TAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 959

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 1020

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1080

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1140

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1200

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1260

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1320

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1380

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1440

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1500

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1560

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1620

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1680

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1740

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1800

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1860

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1920

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1980

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTATTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2040

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2100

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2160

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2220

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2280

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2340

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2341 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2400

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2460

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2520

 58386323 TATAAGTGAAATA 58386335
          |||||||||||||
     2521 TATAAGTGAAATA 2533

Alignment time is 1.88427 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2268] =>      2268 nucs 'mol-32-23af-081359_2268'

Score:        2256
Aligned:      2267        nucs
Identic:      2266 (100%) nucs =>       309 (100%)      1957 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58384453,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386720]
 second seq =>  [       1,     309] EXCISED REGION [     311,    2268]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [310,310]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [309,309] to [311,311]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58384453 AGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACA 58384512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACA 60

 58384513 ACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGC 58384572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGC 120

 58384573 TATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAA 58384632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAA 180

 58384633 TCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATT 58384692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATT 240

 58384693 CCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAA 58384752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAA 300

 58384753 AGATCCCTA 58384761
          |||||||||
      301 AGATCCCTA 309

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 370

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 430

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 490

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 550

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 610

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 670

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 730

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 790

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 850

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 910

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 970

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1030

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1090

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1150

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1210

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1270

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1330

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 1390

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 1450

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 1510

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 1570

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 1630

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 1690

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1691 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 1750

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 1810

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 1870

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 1930

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 1990

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 2050

 58386503 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 58386562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 2110

 58386563 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 58386622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 2170

 58386623 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 58386682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 2230

 58386683 GACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAA 58386720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 GACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAA 2268

Alignment time is 1.65264 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2396] =>      2396 nucs 'mol-32-299d-045172_2396'

Score:        2384
Aligned:      2395        nucs
Identic:      2394 (100%) nucs =>       789 (100%)      1605 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383973,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386368]
 second seq =>  [       1,     789] EXCISED REGION [     791,    2396]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [790,790]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [789,789] to [791,791]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383973 CTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCA 58384032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCA 60

 58384033 ATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATT 58384092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATT 120

 58384093 AAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACA 58384152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACA 180

 58384153 TATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAAT 58384212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAAT 240

 58384213 TATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGC 58384272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGC 300

 58384273 TGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAA 58384332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAA 360

 58384333 CCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAA 58384392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAA 420

 58384393 CAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCA 58384452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCA 480

 58384453 AGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACA 58384512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACA 540

 58384513 ACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGC 58384572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGC 600

 58384573 TATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAA 58384632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAA 660

 58384633 TCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATT 58384692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATT 720

 58384693 CCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAA 58384752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAA 780

 58384753 AGATCCCTA 58384761
          |||||||||
      781 AGATCCCTA 789

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 850

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 910

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 970

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1030

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1090

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1150

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1210

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1270

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1330

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1390

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1450

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1510

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1570

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1630

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1690

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1750

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1810

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 1870

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 1930

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 1990

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2050

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2110

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2170

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2171 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2230

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2290

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2350

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATT 58386368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATT 2396

Alignment time is 1.74588 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2500] =>      2500 nucs 'mol-32-29a8-077756_2500'

Score:        2499
Aligned:      2499        nucs
Identic:      2499 (100%) nucs =>      2348 (100%)       151 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383829,58386176] EXCISED REGION [58386178,58386328]
 second seq =>  [       1,    2348] EXCISED REGION [    2350,    2500]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386177,58386177]
 second seq =>         1 nucs [2349,2349]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2348,2349] to [2349,2350]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [58386174,58386176] to [58386178,58386180]
 second seq =>         3 nucs [2346,2348] to [2350,2352]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383829 AAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAAC 58383888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAAC 60

 58383889 AGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGA 58383948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGA 120

 58383949 ATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAA 58384008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAA 180

 58384009 GAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGA 58384068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGA 240

 58384069 GCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCC 58384128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCC 300

 58384129 CAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACA 58384188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACA 360

 58384189 GAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAAT 58384248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAAT 420

 58384249 TCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAA 58384308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAA 480

 58384309 CACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGA 58384368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGA 540

 58384369 CAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTC 58384428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTC 600

 58384429 ACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAA 58384488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAA 660

 58384489 GGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAA 58384548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAA 720

 58384549 ACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAC 58384608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAC 780

 58384609 CCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCT 58384668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCT 840

 58384669 AAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGC 58384728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGC 900

 58384729 ATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAA 58384788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAA 960

 58384789 ATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAAT 58384848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAAT 1020

 58384849 TAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTA 58384908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTA 1080

 58384909 TTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACC 58384968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACC 1140

 58384969 ATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCA 58385028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCA 1200

 58385029 CACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGC 58385088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGC 1260

 58385089 ATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATA 58385148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATA 1320

 58385149 CTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGT 58385208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGT 1380

 58385209 CTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAG 58385268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAG 1440

 58385269 AACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAA 58385328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAA 1500

 58385329 AACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGC 58385388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGC 1560

 58385389 TGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAA 58385448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAA 1620

 58385449 TGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAG 58385508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAG 1680

 58385509 AAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATA 58385568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATA 1740

 58385569 TACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCA 58385628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCA 1800

 58385629 AAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAA 58385688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAA 1860

 58385689 AATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACC 58385748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACC 1920

 58385749 TCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTA 58385808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTA 1980

 58385809 CTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTT 58385868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTT 2040

 58385869 GAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGC 58385928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGC 2100

 58385929 AACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATG 58385988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATG 2160

 58385989 TGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTC 58386048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTC 2220

 58386049 ATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCAT 58386108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCAT 2280

 58386109 ACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGC 58386168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGC 2340

 58386169 AGCACTAT 58386176
          ||||||||
     2341 AGCACTAT 2348

EXCISED REGION

 58386178 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 58386237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 2409

 58386238 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 58386297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 2469

 58386298 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAG 58386328
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAG 2500

Alignment time is 1.80791 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4186] =>      4186 nucs 'mol-32-29b3-066059_4186'

Score:        4174
Aligned:      4185        nucs
Identic:      4184 (100%) nucs =>      1047 (100%)      3137 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58385130,58386176] EXCISED REGION [58386178,58389315]
 second seq =>  [       1,    1047] EXCISED REGION [    1049,    4186]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386177,58386177]
 second seq =>         1 nucs [1048,1048]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1047,1048] to [1048,1049]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [58386174,58386176] to [58386178,58386180]
 second seq =>         3 nucs [1045,1047] to [1049,1051]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58385130 TAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACA 58385189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACA 60

 58385190 CATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTG 58385249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTG 120

 58385250 CAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGG 58385309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGG 180

 58385310 ATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAA 58385369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAA 240

 58385370 ACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAA 58385429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAA 300

 58385430 CAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGA 58385489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGA 360

 58385490 AACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCAT 58385549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCAT 420

 58385550 ATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAA 58385609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAA 480

 58385610 CCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAAT 58385669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAAT 540

 58385670 ATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAA 58385729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAA 600

 58385730 ACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTA 58385789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTA 660

 58385790 AACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGC 58385849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGC 720

 58385850 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCC 58385909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCC 780

 58385910 ACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACA 58385969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACA 840

 58385970 AATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTAC 58386029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTAC 900

 58386030 AGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAG 58386089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAG 960

 58386090 CAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCT 58386149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCT 1020

 58386150 ACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTAT 58386176
          |||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTAT 1047

EXCISED REGION

 58386178 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 58386237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 1108

 58386238 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 58386297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 1168

 58386298 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAAC 58386357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAAC 1228

 58386358 GCCACATAATTTCACTCATATGTGGAATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCC 58386417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 GCCACATAATTTCACTCATATGTGGAATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCC 1288

 58386418 TAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGG 58386477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 TAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGG 1348

 58386478 ATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGG 58386537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 ATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGG 1408

 58386538 TGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATA 58386597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 TGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATA 1468

 58386598 GCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATC 58386657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 GCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATC 1528

 58386658 ATTATACAACACGTATATGTATTGAGACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTG 58386717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 ATTATACAACACGTATATGTATTGAGACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTG 1588

 58386718 CAATGTATTAATTACAAATACATTTACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAA 58386777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 CAATGTATTAATTACAAATACATTTACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAA 1648

 58386778 TTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAA 58386837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 TTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAA 1708

 58386838 ATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCAC 58386897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 ATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCAC 1768

 58386898 AATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAAC 58386957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 AATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAAC 1828

 58386958 ATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATG 58387017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 ATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATG 1888

 58387018 TTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAA 58387077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAA 1948

 58387078 AATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCT 58387137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1949 AATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTGTCT 2008

 58387138 TTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTT 58387197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 TTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTT 2068

 58387198 GAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATG 58387257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 GAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATG 2128

 58387258 CTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTA 58387317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 CTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTA 2188

 58387318 TTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAA 58387377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAA 2248

 58387378 TTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCC 58387437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 TTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCC 2308

 58387438 TTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTA 58387497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 TTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTA 2368

 58387498 GTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAATGATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTT 58387557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 GTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAATGATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTT 2428

 58387558 GGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTAAAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATAT 58387617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTAAAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATAT 2488

 58387618 ATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAATTTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTT 58387677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 ATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAATTTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTT 2548

 58387678 GAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATTTGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAAT 58387737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 GAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATTTGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAAT 2608

 58387738 ATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATGAACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGC 58387797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 ATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATGAACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGC 2668

 58387798 CACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGAAAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTA 58387857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 CACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGAAAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTA 2728

 58387858 ATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAGTAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAA 58387917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 ATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAGTAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAA 2788

 58387918 TTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATGCAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTT 58387977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 TTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATGCAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTT 2848

 58387978 CTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATGCTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTT 58388037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 CTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATGCTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTT 2908

 58388038 AATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCTCTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTT 58388097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 AATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCTCTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTT 2968

 58388098 CCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACATTAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGC 58388157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 CCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACATTAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGC 3028

 58388158 TAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAGAATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCC 58388217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 TAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAGAATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCC 3088

 58388218 AGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTCACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAA 58388277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 AGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTCACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAA 3148

 58388278 AAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCCATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTC 58388337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 AAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCCATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTC 3208

 58388338 ATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTCTCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATG 58388397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 ATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTCTCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATG 3268

 58388398 TATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTATTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAG 58388457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 TATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTATTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAG 3328

 58388458 CATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAACAGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCC 58388517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 CATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAACAGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCC 3388

 58388518 TAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTAAACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAG 58388577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 TAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTAAACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAG 3448

 58388578 GAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAAATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTAT 58388637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 GAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAAATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTAT 3508

 58388638 ACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTTTAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTC 58388697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 ACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTTTAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTC 3568

 58388698 CATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAAACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTA 58388757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 CATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAAACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTA 3628

 58388758 TCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGGCCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATAC 58388817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 TCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGGCCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATAC 3688

 58388818 ATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAACATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTC 58388877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 ATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAACATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTC 3748

 58388878 AGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGTCTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTA 58388937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 AGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGTCTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTA 3808

 58388938 CATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTAATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACA 58388997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 CATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTAATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACA 3868

 58388998 AGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTCTGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTAC 58389057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 AGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTCTGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTAC 3928

 58389058 ATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTTAACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCC 58389117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 ATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTTAACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCC 3988

 58389118 TAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCTTCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATT 58389177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 TAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCTTCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATT 4048

 58389178 TTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTATATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGT 58389237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 TTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTATATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGT 4108

 58389238 GGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTATGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGA 58389297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 GGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTATGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGA 4168

 58389298 TGTGTTACTCTTCCCAAG 58389315
          ||||||||||||||||||
     4169 TGTGTTACTCTTCCCAAG 4186

Alignment time is 2.99953 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8367] =>      8367 nucs 'mol-32-2afd-024903_8367'

Score:        8312
Aligned:      8367        nucs
Identic:      8362 (100%) nucs =>      1458 (100%)      6904 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58380865,58382322] EXCISED REGION [58382324,58389231]
 second seq =>  [       1,    1458] EXCISED REGION [    1460,    8367]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58382323,58382323]
 second seq =>         1 nucs [1459,1459]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [58386386,58386386]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58380865 AGCCGTGGCCACTGAGAATTGCAGAGGTTGCTGAGGTGGATTAAGGTAAAGAAACTGCGT 58380924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCGTGGCCACTGAGAATTGCAGAGGTTGCTGAGGTGGATTAAGGTAAAGAAACTGCGT 60

 58380925 GGAGACCAAACTATGAGTCCACTTGGAATCAAAGCCAATATACTATATTCAACTGACACC 58380984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAGACCAAACTATGAGTCCACTTGGAATCAAAGCCAATATACTATATTCAACTGACACC 120

 58380985 TCAGGAACCACCTAGAGGGAAATCTCTACGTATGGAAGCTACTTAAAAAAATTGTAAAAA 58381044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGGAACCACCTAGAGGGAAATCTCTACGTATGGAAGCTACTTAAAAAAATTGTAAAAA 180

 58381045 GTGACTATTCTACTAGATGTTCAGCTATCAAAGTAGGGAATCAAGAAATATGAAAAAGCA 58381104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGACTATTCTACTAGATGTTCAGCTATCAAAGTAGGGAATCAAGAAATATGAAAAAGCA 240

 58381105 AGGAAAGATGACATCCCCAAAGAAAGAATGAAATAAGTTTCCAATACCAGACCTTCCCCC 58381164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGAAAGATGACATCCCCAAAGAAAGAATGAAATAAGTTTCCAATACCAGACCTTCCCCC 300

 58381165 AAAAAGAACATATCAGAAATGCATGACAAGAAATTCAAAATACTTAACCTTAAGGAAACT 58381224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAGAACATATCAGAAATGCATGACAAGAAATTCAAAATACTTAACCTTAAGGAAACT 360

 58381225 CAGTGAGGTACAAAAGAACACAAACAAACAATTAAATGAAATCAGAAAAATAATTAATAA 58381284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTGAGGTACAAAAGAACACAAACAAACAATTAAATGAAATCAGAAAAATAATTAATAA 420

 58381285 TCTGAATGAGAAATCCAACAAAGAAATAGATATAAATAAGAACCAATAGAAATCTTGGAA 58381344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGAATGAGAAATCCAACAAAGAAATAGATATAAATAAGAACCAATAGAAATCTTGGAA 480

 58381345 CTGAAGAGTTCAATAAATAAAAAAATACAGTTGAGAGCTTCAAAAATAGACTAAATCAAG 58381404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGAAGAGTTCAATAAATAAAAAAATACAGTTGAGAGCTTCAAAAATAGACTAAATCAAG 540

 58381405 CAGAAGAATCAGTTTATGAACTTGAAGACAGGTCTTTTGAAATAACTGAATCAGAGAAAA 58381464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGAAGAATCAGTTTATGAACTTGAAGACAGGTCTTTTGAAATAACTGAATCAGAGAAAA 600

 58381465 AATATATAAAAATAAAACAAGAATAATTAGAGCCTATGGGATTTAGAGGACACCATTAAG 58381524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATATATAAAAATAAAACAAGAATAATTAGAGCCTATGGGATTTAGAGGACACCATTAAG 660

 58381525 CAAACAAATATTTACATGATAAGTTTTCACAGACACAAGAGATGGAAAAAGATACAGAAA 58381584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAACAAATATTTACATGATAAGTTTTCACAGACACAAGAGATGGAAAAAGATACAGAAA 720

 58381585 ACCTATTTAATTAAAAATAATAGAAAACTTCTGAAGTATTGAGAGAGAGATGAAATCCAG 58381644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCTATTTAATTAAAAATAATAGAAAACTTCTGAAGTATTGAGAGAGAGATGAAATCCAG 780

 58381645 ATGCAGAAAGCTAAAATGTTTCAAATTAAATTCAACCCCTAAAAAGGTCATCTTCAAGGA 58381704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCAGAAAGCTAAAATGTTTCAAATTAAATTCAACCCCTAAAAAGGTCATCTTCAAGGA 840

 58381705 ATATTATAATCAAATGGTCAAAAATCAAAGGCAAAGAGAAATTTAAAAGCCTCAGGGGAA 58381764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATTATAATCAAATGGTCAAAAATCAAAGGCAAAGAGAAATTTAAAAGCCTCAGGGGAA 900

 58381765 AAGTTAAGTCACATATAAGGTATTCCCATTAGAGTATCAACAGATTTATCAGCAGAAATC 58381824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTTAAGTCACATATAAGGTATTCCCATTAGAGTATCAACAGATTTATCAGCAGAAATC 960

 58381825 ATGCAGGCCAGGAGAGAATAGGATAATATATTCAAGGTGCTGAAAGAAGAAAAGCCTACC 58381884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGCAGGCCAGGAGAGAATAGGATAATATATTCAAGGTGCTGAAAGAAGAAAAGCCTACC 1020

 58381885 AGCAAAGAATGCTTCATCTAGCAAAGCTATCATTCTGAAATAAAGGAGAAATAAAGATCT 58381944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCAAAGAATGCTTCATCTAGCAAAGCTATCATTCTGAAATAAAGGAGAAATAAAGATCT 1080

 58381945 TTCCTGACAAGCAAAAACTAAGGAAATTCATCACCACCATTCTAGCCTTATAAAAAATTA 58382004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCCTGACAAGCAAAAACTAAGGAAATTCATCACCACCATTCTAGCCTTATAAAAAATTA 1140

 58382005 TTAAGGAAATGCTAAAACTGAAAATGGAAGAACAATCATTATTGTCATGAAAACACACAA 58382064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAAGGAAATGCTAAAACTGAAAATGGAAGAACAATCATTATTGTCATGAAAACACACAA 1200

 58382065 ACCTATACAACTAACCAGTAGAGGTAAGTTCAGAATTCAAACTCAGTGTTCCTCAGTAAT 58382124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCTATACAACTAACCAGTAGAGGTAAGTTCAGAATTCAAACTCAGTGTTCCTCAGTAAT 1260

 58382125 ATGACGGTGCTATGTAAGTCCTTCAGTCCTCTGCTGTAAAGATTTAAAGGCCAAATGGTC 58382184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGACGGTGCTATGTAAGTCCTTCAGTCCTCTGCTGTAAAGATTTAAAGGCCAAATGGTC 1320

 58382185 AAAACCAACAGCAGCTACAGTTGGTGGCTAAGGAATACACAATAAATAAAGAAGTAAAAT 58382244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAACCAACAGCAGCTACAGTTGGTGGCTAAGGAATACACAATAAATAAAGAAGTAAAAT 1380

 58382245 AAGGAAACAAAATTATAAATTTTACCCCAGAGGAAAACTGTCTAGAGTAATTTTATGCAA 58382304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGGAAACAAAATTATAAATTTTACCCCAGAGGAAAACTGTCTAGAGTAATTTTATGCAA 1440

 58382305 CCAGAATTAAGTTTCTAT 58382322
          ||||||||||||||||||
     1441 CCAGAATTAAGTTTCTAT 1458

EXCISED REGION

 58382324 ACCTTAAAATAGTCTATTATAATGACAAGGCTGTTTATATTTCCCCATGTTAACCACAAA 58382383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 ACCTTAAAATAGTCTATTATAATGACAAGGCTGTTTATATTTCCCCATGTTAACCACAAA 1519

 58382384 GAAAAAAATCATAGCAGATGCACGAATGAGAAAGAGAAAGGAGACAAAGCTTAGCGCCAT 58382443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 GAAAAAAATCATAGCAGATGCACGAATGAGAAAGAGAAAGGAGACAAAGCTTAGCGCCAT 1579

 58382444 AGAAAACTACCAAACTACAGAGCTAAAAAAAAGAGGATTAACACTTAACAAAATGGTAGG 58382503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 AGAAAACTACCAAACTACAGAGCTAAAAAAAAGAGGATTAACACTTAACAAAATGGTAGG 1639

 58382504 AGTAAGCTCTTACCTATTGATTATAAACTTGAATGTGAATTCTTTGATTAAAAGTGGAGT 58382563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 AGTAAGCTCTTACCTATTGATTATAAACTTGAATGTGAATTCTTTGATTAAAAGTGGAGT 1699

 58382564 GGATGAATAGA-TTTTTTTTTTTAAAAAAAGACCCAACTATATGCTGCCTATATGAGACA 58382622
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 GGATGAATAGATTTTTTTTTTTTAAAAAAAGACCCAACTATATGCTGCCTATATGAGACA 1759

 58382623 CACTTCACTGATAAAGAGCAAAAGATTGAAAGGACGGAAAAAGAGTATTCCATACAAATG 58382682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 CACTTCACTGATAAAGAGCAAAAGATTGAAAGGACGGAAAAAGAGTATTCCATACAAATG 1819

 58382683 GAAACAAAAACTGAGTAGGAGTACTTAAACCAGATAAAATTGACTTTAAGTGAAAAACTC 58382742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GAAACAAAAACTGAGTAGGAGTACTTAAACCAGATAAAATTGACTTTAAGTGAAAAACTC 1879

 58382743 TAAAAATAGACAAAGAAGGTCGTTATATAATAATAAAAAAATGATTTAACCAGAAGATAT 58382802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TAAAAATAGACAAAGAAGGTCGTTATATAATAATAAAAAAATGATTTAACCAGAAGATAT 1939

 58382803 GATTATAAATATACATGAACTCAACACTACAGCACCTAGATATACAAAGCAAATATTATT 58382862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 GATTATAAATATACATGAACTCAACACTACAGCACCTAGATATACAAAGCAAATATTATT 1999

 58382863 AGATTTAAAGAGAGAGACAGACTACAATGCAATAATAGTAGGGAACTTTAATACTCCACT 58382922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 AGATTTAAAGAGAGAGACAGACTACAATGCAATAATAGTAGGGAACTTTAATACTCCACT 2059

 58382923 TTCAATAATAAGCAGGTCATCTAGATAAAAAATCAACAAAGAAAGGTTGAACTTAAACTG 58382982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TTCAATAATAAGCAGGTCATCTAGATAAAAAATCAACAAAGAAAGGTTGAACTTAAACTG 2119

 58382983 TACCATAGGCCAAATGAACCTAAAAGATATTTAAAGAATGTATTATCCAATTCCTGTAGA 58383042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 TACCATAGGCCAAATGAACCTAAAAGATATTTAAAGAATGTATTATCCAATTCCTGTAGA 2179

 58383043 CTTAAATATTCTTTTAAACTTCACGCGGAACATTCCCCAGGAGATCATATCTTAGGGCAC 58383102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 CTTAAATATTCTTTTAAACTTCACGCGGAACATTCCCCAGGAGATCATATCTTAGGGCAC 2239

 58383103 AAAATAACACTTAACAAATTTAAGAGGATAGACATCATATTAAGTAATTTTTTTTTCTGG 58383162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 AAAATAACACTTAACAAATTTAAGAGGATAGACATCATATTAAGTAATTTTTTTTTCTGG 2299

 58383163 CCACAGTGGTATAAACTAAATCAACAACAAGAAAAACTTCAGAAATTTTACAAACACATG 58383222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CCACAGTGGTATAAACTAAATCAACAACAAGAAAAACTTCAGAAATTTTACAAACACATG 2359

 58383223 GAAATTAAACAACATCCTCCTAAACAAACAGTGGGTCAATGGAAATTTAAAAATTAAATT 58383282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GAAATTAAACAACATCCTCCTAAACAAACAGTGGGTCAATGGAAATTTAAAAATTAAATT 2419

 58383283 GGAAATTAAAAATTAAAATGGAAATTAAAAAATTTCTTGAGTCAAATGAGAATAGAAACA 58383342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 GGAAATTAAAAATTAAAATGGAAATTAAAAAATTTCTTGAGTCAAATGAGAATAGAAACA 2479

 58383343 CATGATAACAAAACCTATGGGACACAGCAAAATCAGTTCTAAGAGGGAGGTTTATAACAA 58383402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 CATGATAACAAAACCTATGGGACACAGCAAAATCAGTTCTAAGAGGGAGGTTTATAACAA 2539

 58383403 TACACAACTACATCAAAACATAAGAAAAATTTCCAACTAACAACCTAACAATGCACCTCA 58383462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TACACAACTACATCAAAACATAAGAAAAATTTCCAACTAACAACCTAACAATGCACCTCA 2599

 58383463 AGAAAGTAGGTAAACAAACTAAACTAAACTAAACACAAAATTGGTAAAATAAGACAATAA 58383522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AGAAAGTAGGTAAACAAACTAAACTAAACTAAACACAAAATTGGTAAAATAAGACAATAA 2659

 58383523 TAAAGTTCAGAGTAGAAATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAAATATCAGTGAAACAA 58383582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 TAAAGTTCAGAGTAGAAATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAAATATCAGTGAAACAA 2719

 58383583 AAATTTTTTTGAAAAGATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCA 58383642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AAATTTTTTTGAAAAGATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCA 2779

 58383643 AGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTT 58383702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 AGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTT 2839

 58383703 TTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACAT 58383762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 TTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACAT 2899

 58383763 TAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGT 58383822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 TAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGT 2959

 58383823 AATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCA 58383882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 AATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCA 3019

 58383883 CCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAG 58383942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 CCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAG 3079

 58383943 TGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACA 58384002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACA 3139

 58384003 GAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATG 58384062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATG 3199

 58384063 ATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGAT 58384122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 ATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGAT 3259

 58384123 TCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACA 58384182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 TCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACA 3319

 58384183 TCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGA 58384242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 TCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGA 3379

 58384243 CAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTG 58384302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 CAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTG 3439

 58384303 CCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAA 58384362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 CCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAA 3499

 58384363 AGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTC 58384422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 AGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTC 3559

 58384423 TATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAAT 58384482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 TATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAAT 3619

 58384483 TGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATA 58384542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 TGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATA 3679

 58384543 TAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAG 58384602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 TAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAG 3739

 58384603 TTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCA 58384662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 TTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCA 3799

 58384663 CTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCA 58384722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 CTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCA 3859

 58384723 CTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACT 58384782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 CTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACT 3919

 58384783 GATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGG 58384842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 GATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGG 3979

 58384843 AGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAAC 58384902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 AGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAAC 4039

 58384903 TCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATAT 58384962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 TCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATAT 4099

 58384963 GGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAG 58385022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 GGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAG 4159

 58385023 ACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGC 58385082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 ACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGC 4219

 58385083 ACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATT 58385142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 ACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATT 4279

 58385143 CACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATG 58385202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 CACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATG 4339

 58385203 ATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAA 58385262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 ATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAA 4399

 58385263 AATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAA 58385322
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4400 AATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAGGGGATTAAATAGTCAA 4459

 58385323 ATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCA 58385382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 ATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCA 4519

 58385383 TTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTT 58385442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 TTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTT 4579

 58385443 AACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGA 58385502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 AACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGA 4639

 58385503 GTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGA 58385562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 GTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGA 4699

 58385563 TTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAA 58385622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 TTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAA 4759

 58385623 TGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAAT 58385682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 TGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAAT 4819

 58385683 ATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGAT 58385742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 ATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGAT 4879

 58385743 ACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGA 58385802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 ACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGA 4939

 58385803 GGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAA 58385862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 GGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAA 4999

 58385863 TCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGT 58385922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 TCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGT 5059

 58385923 CTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTG 58385982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 CTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTG 5119

 58385983 AGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAA 58386042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 AGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAA 5179

 58386043 AATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACT 58386102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 AATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACT 5239

 58386103 GGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTT 58386162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 GGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTT 5299

 58386163 TATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAA 58386222
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 TATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAA 5359

 58386223 TGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAA 58386282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 TGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAA 5419

 58386283 TCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATG 58386342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 TCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATG 5479

 58386343 CATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGGAATAAAAAAAAAAAAAAGAA 58386402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     5480 CATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGGAAT-AAAAAAAAAAAAAGAA 5538

 58386403 AAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTG 58386462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 AAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTG 5598

 58386463 AAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGATAGG 58386522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 AAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGATAGG 5658

 58386523 AGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAGTATC 58386582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 AGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAGTATC 5718

 58386583 GTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGTGATAGCTACATTAAT 58386642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 GTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGTGATAGCTACATTAAT 5778

 58386643 TACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGAGACATCAAATTGTACCCTAT 58386702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 TACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGAGACATCAAATTGTACCCTAT 5838

 58386703 AAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTTACATTTATTTTTAAATTTTT 58386762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 AAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTTACATTTATTTTTAAATTTTT 5898

 58386763 ATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAAAAAAGAAAATCGTAAG 58386822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 ATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAAAAAAGAAAATCGTAAG 5958

 58386823 AGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTGCAGAACATGAGTAAAT 58386882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 AGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTGCAGAACATGAGTAAAT 6018

 58386883 ATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGAACATGAAATTCTTAGT 58386942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 ATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGAACATGAAATTCTTAGT 6078

 58386943 GAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTAGGAACCCAGTAATATC 58387002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 GAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTAGGAACCCAGTAATATC 6138

 58387003 TGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCTATAATGTTTTAAAATA 58387062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 TGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCTATAATGTTTTAAAATA 6198

 58387063 TTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAACATTAAATAAATGTTGT 58387122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 TTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAACATTAAATAAATGTTGT 6258

 58387123 ATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAATTTTTATATCAACCAT 58387182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 ATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAATTTTTATATCAACCAT 6318

 58387183 TTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGTTTCCATGCTTAAGGCA 58387242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 TTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGTTTCCATGCTTAAGGCA 6378

 58387243 GTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAATATAAGTTTGCTTCAG 58387302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 GTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAATATAAGTTTGCTTCAG 6438

 58387303 ATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCACTTATTCTAACTGGCA 58387362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 ATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCACTTATTCTAACTGGCA 6498

 58387363 GAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTTCTCTTTTGAAGTGCAA 58387422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 GAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTTCTCTTTTGAAGTGCAA 6558

 58387423 GTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTTACAAGTCAAATTCAGA 58387482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 GTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTTACAAGTCAAATTCAGA 6618

 58387483 TTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAATGATAATAATAAAATGT 58387542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 TTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAATGATAATAATAAAATGT 6678

 58387543 TACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTAAAATGATTTACAGTTC 58387602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 TACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTAAAATGATTTACAGTTC 6738

 58387603 TTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAATTTTTACACTTTTAAAT 58387662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 TTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAATTTTTACACTTTTAAAT 6798

 58387663 TGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATTTGGTTTTGAAATTGTT 58387722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 TGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATTTGGTTTTGAAATTGTT 6858

 58387723 TTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATGAACATTTTCTGGCAAA 58387782
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6859 TTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATGAGCATTTTCTGGCAAA 6918

 58387783 GTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGAAAAAAATTGATAACAG 58387842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 GTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGAAAAAAATTGATAACAG 6978

 58387843 AAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAGTAGCTGAGACTACTGG 58387902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 AAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAGTAGCTGAGACTACTGG 7038

 58387903 GATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATGCAGTTCTCAGCTCCTC 58387962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 GATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATGCAGTTCTCAGCTCCTC 7098

 58387963 CCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATGCTGACTCTGTCTTACT 58388022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 CCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATGCTGACTCTGTCTTACT 7158

 58388023 CAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCTCTCGCATCGCTTGCCT 58388082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 CAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCTCTCGCATCGCTTGCCT 7218

 58388083 TTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACATTAAATATTAATGATTT 58388142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 TTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACATTAAATATTAATGATTT 7278

 58388143 CTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAGAATGGTATTTTACATA 58388202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 CTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAGAATGGTATTTTACATA 7338

 58388203 ACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTCACTAGCTATGGCTAAT 58388262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 ACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTCACTAGCTATGGCTAAT 7398

 58388263 TGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCCATTTTATAATTTTTTT 58388322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 TGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCCATTTTATAATTTTTTT 7458

 58388323 GGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTCTCTTGTAGGTCAGTTA 58388382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 GGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTCTCTTGTAGGTCAGTTA 7518

 58388383 GGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTATTTGTATCTATCACAT 58388442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 GGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTATTTGTATCTATCACAT 7578

 58388443 TTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAACAGAACTGACCCTGCAG 58388502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 TTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAACAGAACTGACCCTGCAG 7638

 58388503 CTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTAAACTAAACAATGTTTA 58388562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7639 CTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTAAACTAAACAATGTTTA 7698

 58388563 ATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAAATTGCTACACTGTGAA 58388622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7699 ATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAAATTGCTACACTGTGAA 7758

 58388623 GCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTTTAAATATAAGACGTAA 58388682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7759 GCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTTTAAATATAAGACGTAA 7818

 58388683 ATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAAACCAATAGTTAGTAGC 58388742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7819 ATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAAACCAATAGTTAGTAGC 7878

 58388743 TGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGGCCCCAGTTAAAGTAGC 58388802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7879 TGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGGCCCCAGTTAAAGTAGC 7938

 58388803 CACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAACATTGTTTAATTAACA 58388862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7939 CACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAACATTGTTTAATTAACA 7998

 58388863 TCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGTCTCAGTTTATGGATAG 58388922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7999 TCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGTCTCAGTTTATGGATAG 8058

 58388923 AAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTAATTAATCTGGTCTTTC 58388982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8059 AAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTAATTAATCTGGTCTTTC 8118

 58388983 ACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTCTGTCCTACCCTAACAG 58389042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8119 ACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTCTGTCCTACCCTAACAG 8178

 58389043 ATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTTAACCAGAATCTTTATC 58389102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8179 ATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTTAACCAGAATCTTTATC 8238

 58389103 TATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCTTCACACAGATATTGCC 58389162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8239 TATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCTTCACACAGATATTGCC 8298

 58389163 ACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTATATTTTAGTGAAAAAAT 58389222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8299 ACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTATATTTTAGTGAAAAAAT 8358

 58389223 TTAAGGAGT 58389231
          |||||||||
     8359 TTAAGGAGT 8367

Alignment time is 5.90826 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3813] =>      3813 nucs 'mol-32-2b13-088996_3813'

Score:        3782
Aligned:      3793        nucs
Identic:      3792 (100%) nucs =>      1154 (100%)      2638 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58382579,58383732] EXCISED REGION [58383734,58386372]
 second seq =>  [      20,    1173] EXCISED REGION [    1175,    3813]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58383733,58383733]
 second seq =>         1 nucs [1174,1174]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58383732,58383732] to [58383734,58383734]
 second seq =>         1 nucs [1173,1173] to [1175,1175]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58382579 TTTTTTTAAAAAAAGACCCAACTATATGCTGCCTATATGAGACACACTTCACTGATAAAG 58382638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       20 TTTTTTTAAAAAAAGACCCAACTATATGCTGCCTATATGAGACACACTTCACTGATAAAG 79

 58382639 AGCAAAAGATTGAAAGGACGGAAAAAGAGTATTCCATACAAATGGAAACAAAAACTGAGT 58382698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       80 AGCAAAAGATTGAAAGGACGGAAAAAGAGTATTCCATACAAATGGAAACAAAAACTGAGT 139

 58382699 AGGAGTACTTAAACCAGATAAAATTGACTTTAAGTGAAAAACTCTAAAAATAGACAAAGA 58382758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      140 AGGAGTACTTAAACCAGATAAAATTGACTTTAAGTGAAAAACTCTAAAAATAGACAAAGA 199

 58382759 AGGTCGTTATATAATAATAAAAAAATGATTTAACCAGAAGATATGATTATAAATATACAT 58382818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 AGGTCGTTATATAATAATAAAAAAATGATTTAACCAGAAGATATGATTATAAATATACAT 259

 58382819 GAACTCAACACTACAGCACCTAGATATACAAAGCAAATATTATTAGATTTAAAGAGAGAG 58382878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 GAACTCAACACTACAGCACCTAGATATACAAAGCAAATATTATTAGATTTAAAGAGAGAG 319

 58382879 ACAGACTACAATGCAATAATAGTAGGGAACTTTAATACTCCACTTTCAATAATAAGCAGG 58382938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 ACAGACTACAATGCAATAATAGTAGGGAACTTTAATACTCCACTTTCAATAATAAGCAGG 379

 58382939 TCATCTAGATAAAAAATCAACAAAGAAAGGTTGAACTTAAACTGTACCATAGGCCAAATG 58382998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 TCATCTAGATAAAAAATCAACAAAGAAAGGTTGAACTTAAACTGTACCATAGGCCAAATG 439

 58382999 AACCTAAAAGATATTTAAAGAATGTATTATCCAATTCCTGTAGACTTAAATATTCTTTTA 58383058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 AACCTAAAAGATATTTAAAGAATGTATTATCCAATTCCTGTAGACTTAAATATTCTTTTA 499

 58383059 AACTTCACGCGGAACATTCCCCAGGAGATCATATCTTAGGGCACAAAATAACACTTAACA 58383118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 AACTTCACGCGGAACATTCCCCAGGAGATCATATCTTAGGGCACAAAATAACACTTAACA 559

 58383119 AATTTAAGAGGATAGACATCATATTAAGTAATTTTTTTTTCTGGCCACAGTGGTATAAAC 58383178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 AATTTAAGAGGATAGACATCATATTAAGTAATTTTTTTTTCTGGCCACAGTGGTATAAAC 619

 58383179 TAAATCAACAACAAGAAAAACTTCAGAAATTTTACAAACACATGGAAATTAAACAACATC 58383238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 TAAATCAACAACAAGAAAAACTTCAGAAATTTTACAAACACATGGAAATTAAACAACATC 679

 58383239 CTCCTAAACAAACAGTGGGTCAATGGAAATTTAAAAATTAAATTGGAAATTAAAAATTAA 58383298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 CTCCTAAACAAACAGTGGGTCAATGGAAATTTAAAAATTAAATTGGAAATTAAAAATTAA 739

 58383299 AATGGAAATTAAAAAATTTCTTGAGTCAAATGAGAATAGAAACACATGATAACAAAACCT 58383358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 AATGGAAATTAAAAAATTTCTTGAGTCAAATGAGAATAGAAACACATGATAACAAAACCT 799

 58383359 ATGGGACACAGCAAAATCAGTTCTAAGAGGGAGGTTTATAACAATACACAACTACATCAA 58383418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 ATGGGACACAGCAAAATCAGTTCTAAGAGGGAGGTTTATAACAATACACAACTACATCAA 859

 58383419 AACATAAGAAAAATTTCCAACTAACAACCTAACAATGCACCTCAAGAAAGTAGGTAAACA 58383478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 AACATAAGAAAAATTTCCAACTAACAACCTAACAATGCACCTCAAGAAAGTAGGTAAACA 919

 58383479 AACTAAACTAAACTAAACACAAAATTGGTAAAATAAGACAATAATAAAGTTCAGAGTAGA 58383538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 AACTAAACTAAACTAAACACAAAATTGGTAAAATAAGACAATAATAAAGTTCAGAGTAGA 979

 58383539 AATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAAATATCAGTGAAACAAAAATTTTTTTGAAAAG 58383598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 AATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAAATATCAGTGAAACAAAAATTTTTTTGAAAAG 1039

 58383599 ATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATT 58383658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 ATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATT 1099

 58383659 ATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTT 58383718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 ATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTT 1159

 58383719 GATAACACAGAAGA 58383732
          ||||||||||||||
     1160 GATAACACAGAAGA 1173

EXCISED REGION

 58383734 ATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGG 58383793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 ATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGG 1234

 58383794 ACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTA 58383853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 ACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTA 1294

 58383854 GGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATC 58383913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 GGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATC 1354

 58383914 TTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCC 58383973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 TTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCC 1414

 58383974 TGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAA 58384033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 TGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAA 1474

 58384034 TGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTA 58384093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 TGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTA 1534

 58384094 AAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACAT 58384153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 AAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACAT 1594

 58384154 ATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATT 58384213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 ATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATT 1654

 58384214 ATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCT 58384273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 ATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCT 1714

 58384274 GTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAAC 58384333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 GTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAAC 1774

 58384334 CCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAAC 58384393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 CCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAAC 1834

 58384394 AAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAA 58384453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 AAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAA 1894

 58384454 GATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAA 58384513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 GATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAA 1954

 58384514 CATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCT 58384573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 CATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCT 2014

 58384574 ATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAAT 58384633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 ATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAAT 2074

 58384634 CAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTC 58384693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 CAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTC 2134

 58384694 CATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAA 58384753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 CATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAA 2194

 58384754 GATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAA 58384813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 GATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAA 2254

 58384814 TAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATA 58384873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATA 2314

 58384874 CCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGA 58384933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 CCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGA 2374

 58384934 AGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGC 58384993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 AGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGC 2434

 58384994 AATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTG 58385053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 AATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTG 2494

 58385054 CAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTG 58385113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 CAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTG 2554

 58385114 GAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAA 58385173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 GAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAA 2614

 58385174 AGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAA 58385233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 AGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAA 2674

 58385234 ATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAA 58385293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 ATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAA 2734

 58385294 AATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGT 58385353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 AATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGT 2794

 58385354 AGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGAC 58385413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 AGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGAC 2854

 58385414 CTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCT 58385473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 CTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCT 2914

 58385474 TTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAA 58385533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 TTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAA 2974

 58385534 TATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTA 58385593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 TATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTA 3034

 58385594 GAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAG 58385653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 GAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAG 3094

 58385654 TAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAG 58385713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 TAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAG 3154

 58385714 GGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTAT 58385773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 GGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTAT 3214

 58385774 CAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCC 58385833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 CAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCC 3274

 58385834 CACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAAT 58385893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 CACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAAT 3334

 58385894 GAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAAC 58385953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 GAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAAC 3394

 58385954 AACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACAC 58386013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 AACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACAC 3454

 58386014 TGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAA 58386073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 TGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAA 3514

 58386074 ACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTA 58386133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 ACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTA 3574

 58386134 AGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATA 58386193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3575 AGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATA 3634

 58386194 TGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAA 58386253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAA 3694

 58386254 ATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCT 58386313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 ATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCT 3754

 58386314 GGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCAC 58386372
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 GGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCAC 3813

Alignment time is 2.92289 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5994] =>      5994 nucs 'mol-32-2b4a-106890_5994'

Score:        5961
Aligned:      5994        nucs
Identic:      5991 (100%) nucs =>       196 (100%)      5795 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58386190,58386385] EXCISED REGION [58386387,58392183]
 second seq =>  [       1,     196] EXCISED REGION [     197,    5994]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386386,58386386]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4825,4825]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [58386386,58386398] to [58386387,58386399]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58386190 GATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAA 58386249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAA 60

 58386250 TGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGG 58386309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGG 120

 58386310 ACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTT 58386369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTT 180

 58386370 CACTCATATGTGGAAT 58386385
          ||||||||||||||||
      181 CACTCATATGTGGAAT 196

EXCISED REGION

 58386387 AAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATC 58386446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      197 AAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATC 256

 58386447 AGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAAC 58386506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      257 AGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAAC 316

 58386507 ATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAG 58386566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      317 ATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAG 376

 58386567 TCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGG 58386626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      377 TCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGG 436

 58386627 TGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGAGACA 58386686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 TGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGAGACA 496

 58386687 TCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTTACAT 58386746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 TCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTTACAT 556

 58386747 TTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAA 58386806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 TTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAA 616

 58386807 AAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTG 58386866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 AAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTG 676

 58386867 CAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGA 58386926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 CAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGA 736

 58386927 ACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTA 58386986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 ACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTA 796

 58386987 GGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCT 58387046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 GGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCT 856

 58387047 ATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAAC 58387106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 ATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAAC 916

 58387107 ATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAA 58387166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 ATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAA 976

 58387167 TTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGT 58387226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 TTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGT 1036

 58387227 TTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAA 58387286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 TTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAA 1096

 58387287 TATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCA 58387346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 TATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCA 1156

 58387347 CTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTT 58387406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 CTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTT 1216

 58387407 CTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTT 58387466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 CTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTT 1276

 58387467 ACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAAT 58387526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 ACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAAT 1336

 58387527 GATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTA 58387586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 GATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTA 1396

 58387587 AAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAAT 58387646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 AAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAAT 1456

 58387647 TTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATT 58387706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 TTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATT 1516

 58387707 TGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATG 58387766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 TGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATG 1576

 58387767 AACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGA 58387826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 AACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGA 1636

 58387827 AAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAG 58387886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 AAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAG 1696

 58387887 TAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATG 58387946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATG 1756

 58387947 CAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATG 58388006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 CAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATG 1816

 58388007 CTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCT 58388066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 CTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCT 1876

 58388067 CTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACAT 58388126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 CTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACAT 1936

 58388127 TAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAG 58388186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 TAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAG 1996

 58388187 AATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTC 58388246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 AATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTC 2056

 58388247 ACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCC 58388306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 ACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCC 2116

 58388307 ATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTC 58388366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 ATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTC 2176

 58388367 TCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTA 58388426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTA 2236

 58388427 TTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAAC 58388486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 TTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAAC 2296

 58388487 AGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTA 58388546
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 AGAACTGACCCTGCGGCTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTA 2356

 58388547 AACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAA 58388606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 AACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAA 2416

 58388607 ATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTT 58388666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 ATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTT 2476

 58388667 TAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAA 58388726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 TAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAA 2536

 58388727 ACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGG 58388786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 ACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGG 2596

 58388787 CCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAA 58388846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 CCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAA 2656

 58388847 CATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGT 58388906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 CATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGT 2716

 58388907 CTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTA 58388966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 CTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTA 2776

 58388967 ATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTC 58389026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 ATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTC 2836

 58389027 TGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTT 58389086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 TGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTT 2896

 58389087 AACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCT 58389146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 AACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCT 2956

 58389147 TCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTAT 58389206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 TCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTAT 3016

 58389207 ATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGTGGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTA 58389266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 ATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGTGGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTA 3076

 58389267 TGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATAGCAT 58389326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 TGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATAGCAT 3136

 58389327 TTAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTCTAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTCCAAT 58389386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 TTAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTCTAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTCCAAT 3196

 58389387 GATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAATTTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCTGTGA 58389446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 GATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAATTTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCTGTGA 3256

 58389447 GGAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCTATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGTAAGG 58389506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 GGAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCTATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGTAAGG 3316

 58389507 GACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTACCGCATGGTAACAACAACTACAAAACCCCCA 58389566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 GACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTACCGCATGGTAACAACAACTACAAAACCCCCA 3376

 58389567 AAACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACATAAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCAAGTG 58389626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 AAACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACATAAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCAAGTG 3436

 58389627 AAATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATTTAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCCTTGT 58389686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 AAATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATTTAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCCTTGT 3496

 58389687 GGATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAGGAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGGCATG 58389746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 GGATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAGGAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGGCATG 3556

 58389747 GGTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGAGACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTATCCAG 58389806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 GGTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGAGACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTATCCAG 3616

 58389807 GGTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAAATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGGCCAT 58389866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 GGTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAAATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGGCCAT 3676

 58389867 GTGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACTCTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAGCATT 58389926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 GTGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACTCTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAGCATT 3736

 58389927 TTGAACAAAGTCATAACATAAATATAGGTTTTAAATTGGATCCATCTGGCTGCTATGATG 58389986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 TTGAACAAAGTCATAACATAAATATAGGTTTTAAATTGGATCCATCTGGCTGCTATGATG 3796

 58389987 AGTGGGGAAAGAGTAAATGTAGGGAAAACTATCACAAAGCTATTAAAGTATCCAGGTGGC 58390046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 AGTGGGGAAAGAGTAAATGTAGGGAAAACTATCACAAAGCTATTAAAGTATCCAGGTGGC 3856

 58390047 ATAGATTATAGTGGTTGCAGCTCAGATGGTGAAAACCAAGTGATATTCTTTGAGAAGGTA 58390106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 ATAGATTATAGTGGTTGCAGCTCAGATGGTGAAAACCAAGTGATATTCTTTGAGAAGGTA 3916

 58390107 GAGCAAAAAAGATTTTGTTTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTC 58390166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 GAGCAAAAAAGATTTTGTTTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTC 3976

 58390167 ATATCCTTTGCCCACTTTTTGATAGGGTTATTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGT 58390226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 ATATCCTTTGCCCACTTTTTGATAGGGTTATTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGT 4036

 58390227 CTTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCC 58390286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 CTTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCC 4096

 58390287 CATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTATTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTG 58390346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 CATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTATTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTG 4156

 58390347 AGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTA 58390406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 AGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTA 4216

 58390407 GACACGAAGTCCTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGG 58390466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 GACACGAAGTCCTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGG 4276

 58390467 GTTTTTATGGTTTTACGTCTAACATTTAAGTTTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTA 58390526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 GTTTTTATGGTTTTACGTCTAACATTTAAGTTTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTA 4336

 58390527 TAAGGTGTAAAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTGAAACATGAAAAAATGCTCATCATCA 58390586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 TAAGGTGTAAAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTGAAACATGAAAAAATGCTCATCATCA 4396

 58390587 CTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATAACATCTCACAACAGTTAGA 58390646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 CTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATAACATCTCACAACAGTTAGA 4456

 58390647 ATGGCAATCACTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGACAGGATGTGGAGAAATAGGA 58390706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 ATGGCAATCACTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGACAGGATGTGGAGAAATAGGA 4516

 58390707 ACACTAAATAATTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTTTGGAAGAC 58390766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 ACACTAAATAATTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTTTGGAAGAC 4576

 58390767 AGTGTGGCAATTCCTTAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATT 58390826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 AGTGTGGCAATTCCTTAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATT 4636

 58390827 ACTGGGTATATACCCAAAGGATTATAAATCATGTTGCTATAAAGACACATGCACATGTAT 58390886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 ACTGGGTATATACCCAAAGGATTATAAATCATGTTGCTATAAAGACACATGCACATGTAT 4696

 58390887 GTTTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAAT 58390946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 GTTTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAAT 4756

 58390947 GGTAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGTCATAAA 58391006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 GGTAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGTCATAAA 4816

 58391007 AAAGGATG-GTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAG 58391065
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 AAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAG 4876

 58391066 CAAACTATCACAAGGACAAAAAACCAAACACCACATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTG 58391125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 CAAACTATCACAAGGACAAAAAACCAAACACCACATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTG 4936

 58391126 AACAATGAGAACACTTGGACACAGGAAGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCATGGGG 58391185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 AACAATGAGAACACTTGGACACAGGAAGGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCATGGGG 4996

 58391186 TGGGGAGGCGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTAAATGACTAGTTAATGG 58391245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 TGGGGAGGCGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTAAATGACTAGTTAATGG 5056

 58391246 GTGCAACACACCAACATGGCACATGTATACATAGGTAACAAATCTGCACGTTGTGCACAT 58391305
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 GTGCAACACACCAACATGGCGCATGTATACATAGGTAACAAATCTGCACGTTGTGCACAT 5116

 58391306 GTGCCCTAGAACTTAAAGTATAATAATTTAAAAAAAAAAAGGTTTTGTTTAAGGGAGAAA 58391365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 GTGCCCTAGAACTTAAAGTATAATAATTTAAAAAAAAAAAGGTTTTGTTTAAGGGAGAAA 5176

 58391366 GGAGCCTAGGGTGAATCTAAGGTATTTATCCGAGCAACTAGATATGTGGACCTTTGCAGG 58391425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 GGAGCCTAGGGTGAATCTAAGGTATTTATCCGAGCAACTAGATATGTGGACCTTTGCAGG 5236

 58391426 AAGTAAAGGTTTGGAAGGGAATCACAGATCATTTGGATCCATTCTACTTGAGATGCCTGT 58391485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 AAGTAAAGGTTTGGAAGGGAATCACAGATCATTTGGATCCATTCTACTTGAGATGCCTGT 5296

 58391486 TAGACTTCTAAATGTTGAGTAGGCAGTTGGATATACAGAAATCTGAAGTTCAATAAAGAG 58391545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 TAGACTTCTAAATGTTGAGTAGGCAGTTGGATATACAGAAATCTGAAGTTCAATAAAGAG 5356

 58391546 GTACAGGGTAGAGGTATATATTGGGGTTCAGCAAATAAATGATGTTTAATTCATAATGTG 58391605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 GTACAGGGTAGAGGTATATATTGGGGTTCAGCAAATAAATGATGTTTAATTCATAATGTG 5416

 58391606 GGATGGGATCACTTGGGGGTAAATTTCAATAGAAAAAAAGTCTATTTAATATGATAGACT 58391665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 GGATGGGATCACTTGGGGGTAAATTTCAATAGAAAAAAAGTCTATTTAATATGATAGACT 5476

 58391666 TTATGTACACCATTGTTGTAAAATCACTACCTACACATTATTCTCCCTTCTTCCCACCTC 58391725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 TTATGTACACCATTGTTGTAAAATCACTACCTACACATTATTCTCCCTTCTTCCCACCTC 5536

 58391726 TGCAATACATTGCATATAAACAAAACGCTTAACCCATTGTGTATTCTTTATAAAAACCTG 58391785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 TGCAATACATTGCATATAAACAAAACGCTTAACCCATTGTGTATTCTTTATAAAAACCTG 5596

 58391786 GCGAACTCTTACTAATGATTTATGATTCAGTTTAGATATCACATTCTTCATCATATATCT 58391845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 GCGAACTCTTACTAATGATTTATGATTCAGTTTAGATATCACATTCTTCATCATATATCT 5656

 58391846 AGAGAATGGATGAGTTGTCACTTTAATGGGGAATATATTATCACACATTAACTCCCCTTT 58391905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 AGAGAATGGATGAGTTGTCACTTTAATGGGGAATATATTATCACACATTAACTCCCCTTT 5716

 58391906 ATTTAACTTAAATTTCTACATTGTTGTTGTTTTTTATCACCTTTCTCACTTATTAGATCA 58391965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 ATTTAACTTAAATTTCTACATTGTTGTTGTTTTTTATCACCTTTCTCACTTATTAGATCA 5776

 58391966 TAAACTTCATTAAGTAGGGATCACATATTTTCAATGCCCAGTAATATGCTTAAAAAATTG 58392025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 TAAACTTCATTAAGTAGGGATCACATATTTTCAATGCCCAGTAATATGCTTAAAAAATTG 5836

 58392026 AAGACATAAAGTATATATTGATGAATAGAATAATAGAATAAAATAAAATAAATAATAATA 58392085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 AAGACATAAAGTATATATTGATGAATAGAATAATAGAATAAAATAAAATAAATAATAATA 5896

 58392086 GAAGGACAGGGGAAGAAGAAACAGAGTTTACAGAGTAAGTGGCGGAAAGAGATGTGAAAG 58392145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 GAAGGACAGGGGAAGAAGAAACAGAGTTTACAGAGTAAGTGGCGGAAAGAGATGTGAAAG 5956

 58392146 AAGAAGACCAATATATATTTTATCTAGCGTGTAAGCCT 58392183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 AAGAAGACCAATATATATTTTATCTAGCGTGTAAGCCT 5994

Alignment time is 4.85615 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2494] =>      2494 nucs 'mol-32-2efc-019257_2494'

Score:        2461
Aligned:      2494        nucs
Identic:      2491 (100%) nucs =>       637 (100%)      1854 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58384125,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386618]
 second seq =>  [       1,     637] EXCISED REGION [     639,    2494]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [638,638]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2261,2261]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [637,637] to [639,639]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58384125 ATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATC 58384184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATC 60

 58384185 AACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACA 58384244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACA 120

 58384245 AAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCC 58384304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCC 180

 58384305 TCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAG 58384364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAG 240

 58384365 TTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTA 58384424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTA 300

 58384425 TTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTG 58384484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTG 360

 58384485 GAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATA 58384544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATA 420

 58384545 GAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTT 58384604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTT 480

 58384605 TCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACT 58384664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACT 540

 58384665 ACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACT 58384724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACT 600

 58384725 TAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 637

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 698

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 758

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
      759 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGC-AAAAA 817

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 877

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 937

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 997

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1057

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1117

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1177

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1237

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1297

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1357

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1417

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1477

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1537

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1597

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1657

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 1717

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 1777

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 1837

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 1897

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 1957

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2017

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2018 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2077

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2137

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2197

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2257

 58386383 AAT-AAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGG 58386441
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 AATAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGG 2317

 58386442 TTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGAT 58386501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGAT 2377

 58386502 ATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGAC 58386561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 ATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGAC 2437

 58386562 TATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAAC 58386618
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 TATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAAC 2494

Alignment time is 2.44172 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2897] =>      2897 nucs 'mol-32-2f07-080779_2897'

Score:        2885
Aligned:      2896        nucs
Identic:      2895 (100%) nucs =>      1034 (100%)      1861 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383728,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386624]
 second seq =>  [       1,    1034] EXCISED REGION [    1036,    2897]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [1035,1035]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [1034,1034] to [1036,1036]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383728 GAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCT 58383787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCT 60

 58383788 GAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAA 58383847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAA 120

 58383848 AGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATT 58383907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATT 180

 58383908 CCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATA 58383967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATA 240

 58383968 TAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATAT 58384027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATAT 300

 58384028 CACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGC 58384087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGC 360

 58384088 ACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATT 58384147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATT 420

 58384148 AAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCAT 58384207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCAT 480

 58384208 CCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATA 58384267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATA 540

 58384268 AAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATAT 58384327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATAT 600

 58384328 GACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATC 58384387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATC 660

 58384388 AGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATT 58384447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATT 720

 58384448 ACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGC 58384507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGC 780

 58384508 AGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAG 58384567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAG 840

 58384568 AAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATAC 58384627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATAC 900

 58384628 AAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAA 58384687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAA 960

 58384688 TAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAG 58384747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAG 1020

 58384748 AAGAAAGATCCCTA 58384761
          ||||||||||||||
     1021 AAGAAAGATCCCTA 1034

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 1095

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1155

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1215

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1275

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1335

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1395

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1455

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1515

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1575

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1635

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1695

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1755

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1815

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1875

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1935

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1995

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 2055

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2115

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2175

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2235

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2295

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2355

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2415

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2416 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2475

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2535

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2595

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2655

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 2715

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 2775

 58386503 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 58386562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 2835

 58386563 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 58386622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 2895

 58386623 AA 58386624
          ||
     2896 AA 2897

Alignment time is 2.08043 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2171] =>      2171 nucs 'mol-32-2f12-056367_2171'

Score:        2159
Aligned:      2170        nucs
Identic:      2169 (100%) nucs =>       316 (100%)      1853 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58384446,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386616]
 second seq =>  [       1,     316] EXCISED REGION [     318,    2171]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [317,317]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [316,316] to [318,318]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58384446 TTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTT 58384505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTT 60

 58384506 GCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTT 58384565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTT 120

 58384566 AGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACAT 58384625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACAT 180

 58384626 ACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAA 58384685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAA 240

 58384686 AATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGG 58384745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGG 300

 58384746 AGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          ||||||||||||||||
      301 AGAAGAAAGATCCCTA 316

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      318 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 377

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 437

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 497

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 557

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 617

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 677

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 737

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 797

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 857

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 917

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 977

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1037

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1097

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1157

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1217

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1277

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1337

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 1397

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 1457

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 1517

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 1577

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 1637

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 1697

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1698 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 1757

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 1817

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 1877

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 1937

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 1997

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 2057

 58386503 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 58386562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 2117

 58386563 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAA 58386616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAA 2171

Alignment time is 1.57036 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2745] =>      2745 nucs 'mol-32-2fcd-190930_2745'

Score:        2722
Aligned:      2744        nucs
Identic:      2742 (100%) nucs =>       867 (100%)      1875 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383626,58384492] EXCISED REGION [58384494,58386370]
 second seq =>  [       1,     867] EXCISED REGION [     869,    2745]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384493,58384493]
 second seq =>         1 nucs [868,868]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [58384493,58384494] to [58384494,58384495]
 second seq =>         1 nucs [867,867] to [868,868]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383626 AGACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGG 58383685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGG 60

 58383686 CACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACAC 58383745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACAC 120

 58383746 ATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAG 58383805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAG 180

 58383806 TAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGC 58383865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGC 240

 58383866 TTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTA 58383925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTA 300

 58383926 TTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAAC 58383985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAAC 360

 58383986 TGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATA 58384045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATA 420

 58384046 TAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTC 58384105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTC 480

 58384106 AATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAAT 58384165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAAT 540

 58384166 TAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAA 58384225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAA 600

 58384226 GCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTA 58384285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTA 660

 58384286 GGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCA 58384345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCA 720

 58384346 TCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATG 58384405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATG 780

 58384406 CCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAA 58384465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAA 840

 58384466 AATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAG 58384492
          |||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAG 867

EXCISED REGION

 58384494 AAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCT 58384553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 AAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCT 928

 58384554 GAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTAC 58384613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      929 GAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTAC 988

 58384614 AAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAA 58384673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      989 AAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAA 1048

 58384674 AGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAA 58384733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 AGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAA 1108

 58384734 ACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAA 58384793
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 ACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTACAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAA 1168

 58384794 TTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATA 58384853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 TTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATA 1228

 58384854 TTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAA 58384913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAA 1288

 58384914 ATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAA 58384973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 ATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAA 1348

 58384974 ATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTA 58385033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 ATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTA 1408

 58385034 CCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAA 58385093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 CCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAA 1468

 58385094 AACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTAT 58385153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 AACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTAT 1528

 58385154 AGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCT 58385213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 AGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCT 1588

 58385214 TAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCC 58385273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 TAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCC 1648

 58385274 TACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCT 58385333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 TACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCT 1708

 58385334 GAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGA 58385393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 GAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGA 1768

 58385394 ATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTA 58385453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 ATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTA 1828

 58385454 TTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACA 58385513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 TTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACA 1888

 58385514 ACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAG 58385573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 ACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAG 1948

 58385574 ACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATA 58385633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 ACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATA 2008

 58385634 TTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGC 58385693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 TTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGC 2068

 58385694 TCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACT 58385753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 TCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACT 2128

 58385754 CTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACA 58385813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 CTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACA 2188

 58385814 ATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCC 58385873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 ATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCC 2248

 58385874 CAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAG 58385933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 CAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAG 2308

 58385934 TGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAG 58385993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 TGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAG 2368

 58385994 ATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGA 58386053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 ATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGA 2428

 58386054 GGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATC 58386113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATC 2488

 58386114 CAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCAC 58386173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 CAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCAC 2548

 58386174 TATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATG 58386233
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 TATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATG 2608

 58386234 TGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTT 58386293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 TGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTT 2668

 58386294 GTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGAC 58386353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 GTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGAC 2728

 58386354 AAACGCCACATAATTTC 58386370
          |||||||||||||||||
     2729 AAACGCCACATAATTTC 2745

Alignment time is 2.09401 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2535] =>      2535 nucs 'mol-32-2fe3-027661_2535'

Score:        2524
Aligned:      2535        nucs
Identic:      2534 (100%) nucs =>      2121 (100%)       413 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58384056,58386176] EXCISED REGION [58386178,58386591]
 second seq =>  [       1,    2121] EXCISED REGION [    2123,    2535]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386177,58386177]
 second seq =>         1 nucs [2122,2122]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [58386385,58386385]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2121,2122] to [2122,2123]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [58386174,58386176] to [58386178,58386180]
 second seq =>         3 nucs [2119,2121] to [2123,2125]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58384056 GCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAA 58384115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAA 60

 58384116 GTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATA 58384175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATA 120

 58384176 TACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAG 58384235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAG 180

 58384236 CATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAG 58384295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAG 240

 58384296 ATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAA 58384355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAA 300

 58384356 CAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCA 58384415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCA 360

 58384416 CCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCA 58384475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCA 420

 58384476 CTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATA 58384535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATA 480

 58384536 GTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTC 58384595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTC 540

 58384596 AGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAA 58384655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAA 600

 58384656 TAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAA 58384715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAA 660

 58384716 TACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACA 58384775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACA 720

 58384776 AAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCAT 58384835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCAT 780

 58384836 GGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGA 58384895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGA 840

 58384896 ATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACA 58384955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACA 900

 58384956 TTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACA 58385015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACA 960

 58385016 GCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACA 58385075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACA 1020

 58385076 ACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAA 58385135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAA 1080

 58385136 AAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGG 58385195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGG 1140

 58385196 GGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAG 58385255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAG 1200

 58385256 GATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAA 58385315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAA 1260

 58385316 TAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCT 58385375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCT 1320

 58385376 CATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAG 58385435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAG 1380

 58385436 CAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTAT 58385495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTAT 1440

 58385496 TAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAA 58385555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAA 1500

 58385556 CAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAAT 58385615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAAT 1560

 58385616 TTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAA 58385675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAA 1620

 58385676 GAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATA 58385735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATA 1680

 58385736 ATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATA 58385795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATA 1740

 58385796 TGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGC 58385855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGC 1800

 58385856 AGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACA 58385915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACA 1860

 58385916 CTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATA 58385975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATA 1920

 58385976 ACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCAT 58386035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCAT 1980

 58386036 TATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTT 58386095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTT 2040

 58386096 CACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTC 58386155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTC 2100

 58386156 CCATGTTTATGGCAGCACTAT 58386176
          |||||||||||||||||||||
     2101 CCATGTTTATGGCAGCACTAT 2121

EXCISED REGION

 58386178 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 58386237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 2182

 58386238 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 58386297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 2242

 58386298 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAAC 58386357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAAC 2302

 58386358 GCCACATAATTTCACTCATATGTGGAATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCC 58386417
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 GCCACATAATTTCACTCATATGTGGAA-AAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCC 2361

 58386418 TAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGG 58386477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGG 2421

 58386478 ATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGG 58386537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 ATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGG 2481

 58386538 TGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTAC 58386591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 TGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTAC 2535

Alignment time is 1.84984 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2505] =>      2505 nucs 'mol-32-2fe3-248813_2505'

Score:        2493
Aligned:      2504        nucs
Identic:      2503 (100%) nucs =>      1001 (100%)      1502 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383761,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386265]
 second seq =>  [       1,    1001] EXCISED REGION [    1003,    2505]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [1002,1002]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [1001,1001] to [1003,1003]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383761 ATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCA 58383820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCA 60

 58383821 GTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTC 58383880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTC 120

 58383881 CACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAA 58383940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAA 180

 58383941 AGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGA 58384000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGA 240

 58384001 CAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACA 58384060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACA 300

 58384061 TGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGG 58384120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGG 360

 58384121 ATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCA 58384180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCA 420

 58384181 CATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTT 58384240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTT 480

 58384241 GACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATG 58384300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATG 540

 58384301 TGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGA 58384360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGA 600

 58384361 AAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACT 58384420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACT 660

 58384421 TCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAA 58384480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAA 720

 58384481 ATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATA 58384540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATA 780

 58384541 TATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAA 58384600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAA 840

 58384601 AGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTG 58384660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTG 900

 58384661 CACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCT 58384720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCT 960

 58384721 CACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 1001

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 1062

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1122

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1182

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1242

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1302

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1362

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1422

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1482

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1542

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1602

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1662

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1722

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1782

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1842

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1902

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1962

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 2022

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2082

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2142

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2202

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2262

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2322

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2382

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2383 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2442

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2502

 58386263 AGC 58386265
          |||
     2503 AGC 2505

Alignment time is 1.82518 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2419] =>      2419 nucs 'mol-32-2fee-162984_2419'

Score:        2418
Aligned:      2418        nucs
Identic:      2418 (100%) nucs =>      2223 (100%)       195 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383954,58386176] EXCISED REGION [58386178,58386372]
 second seq =>  [       1,    2223] EXCISED REGION [    2225,    2419]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386177,58386177]
 second seq =>         1 nucs [2224,2224]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2223,2224] to [2224,2225]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [58386174,58386176] to [58386178,58386180]
 second seq =>         3 nucs [2221,2223] to [2225,2227]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383954 TTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAA 58384013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAA 60

 58384014 TTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAA 58384073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAA 120

 58384074 TTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGG 58384133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGG 180

 58384134 ATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAG 58384193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAG 240

 58384194 AAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAAC 58384253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAAC 300

 58384254 ATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAG 58384313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAG 360

 58384314 TAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACA 58384373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACA 420

 58384374 CTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATA 58384433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATA 480

 58384434 GTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGA 58384493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGA 540

 58384494 AAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCT 58384553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCT 600

 58384554 GAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTAC 58384613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTAC 660

 58384614 AAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAA 58384673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAA 720

 58384674 AGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAA 58384733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAA 780

 58384734 ACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAA 58384793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAA 840

 58384794 TTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATA 58384853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATA 900

 58384854 TTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAA 58384913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAA 960

 58384914 ATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAA 58384973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAA 1020

 58384974 ATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTA 58385033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTA 1080

 58385034 CCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAA 58385093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAA 1140

 58385094 AACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTAT 58385153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTAT 1200

 58385154 AGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCT 58385213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCT 1260

 58385214 TAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCC 58385273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCC 1320

 58385274 TACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCT 58385333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCT 1380

 58385334 GAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGA 58385393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGA 1440

 58385394 ATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTA 58385453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTA 1500

 58385454 TTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACA 58385513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACA 1560

 58385514 ACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAG 58385573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAG 1620

 58385574 ACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATA 58385633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATA 1680

 58385634 TTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGC 58385693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGC 1740

 58385694 TCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACT 58385753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACT 1800

 58385754 CTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACA 58385813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACA 1860

 58385814 ATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCC 58385873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCC 1920

 58385874 CAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAG 58385933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAG 1980

 58385934 TGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAG 58385993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAG 2040

 58385994 ATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGA 58386053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGA 2100

 58386054 GGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATC 58386113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATC 2160

 58386114 CAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCAC 58386173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCAC 2220

 58386174 TAT 58386176
          |||
     2221 TAT 2223

EXCISED REGION

 58386178 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 58386237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 2284

 58386238 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 58386297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 2344

 58386298 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAAC 58386357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAAC 2404

 58386358 GCCACATAATTTCAC 58386372
          |||||||||||||||
     2405 GCCACATAATTTCAC 2419

Alignment time is 1.76318 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3070] =>      3070 nucs 'mol-32-300f-244983_3070'

Score:        3058
Aligned:      3069        nucs
Identic:      3068 (100%) nucs =>      1121 (100%)      1947 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383641,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386710]
 second seq =>  [       1,    1121] EXCISED REGION [    1123,    3070]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [1122,1122]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [1121,1121] to [1123,1123]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383641 CAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAAT 58383700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAAT 60

 58383701 TTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAAC 58383760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAAC 120

 58383761 ATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCA 58383820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCA 180

 58383821 GTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTC 58383880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTC 240

 58383881 CACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAA 58383940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAA 300

 58383941 AGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGA 58384000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGA 360

 58384001 CAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACA 58384060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACA 420

 58384061 TGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGG 58384120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGG 480

 58384121 ATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCA 58384180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCA 540

 58384181 CATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTT 58384240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTT 600

 58384241 GACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATG 58384300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATG 660

 58384301 TGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGA 58384360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGA 720

 58384361 AAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACT 58384420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACT 780

 58384421 TCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAA 58384480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAA 840

 58384481 ATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATA 58384540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATA 900

 58384541 TATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAA 58384600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAA 960

 58384601 AGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTG 58384660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTG 1020

 58384661 CACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCT 58384720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCT 1080

 58384721 CACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 1121

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 1182

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1242

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1302

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1362

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1422

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1482

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1542

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1602

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1662

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1722

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1782

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1842

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1902

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1962

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 2022

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 2082

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 2142

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2202

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2262

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2322

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2382

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2442

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2502

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2503 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2562

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2622

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2682

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2742

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 2802

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 2862

 58386503 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 58386562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 2922

 58386563 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 58386622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 2982

 58386623 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 58386682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 3042

 58386683 GACATCAAATTGTACCCTATAAATATGT 58386710
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GACATCAAATTGTACCCTATAAATATGT 3070

Alignment time is 2.25279 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2244] =>      2244 nucs 'mol-32-3030-184094_2244'

Score:        2232
Aligned:      2243        nucs
Identic:      2242 (100%) nucs =>      2105 (100%)       137 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58384072,58386176] EXCISED REGION [58386178,58386315]
 second seq =>  [       1,    2105] EXCISED REGION [    2107,    2244]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386177,58386177]
 second seq =>         1 nucs [2106,2106]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2105,2106] to [2106,2107]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [58386174,58386176] to [58386178,58386180]
 second seq =>         3 nucs [2103,2105] to [2107,2109]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58384072 AATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAG 58384131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAG 60

 58384132 GGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAG 58384191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAG 120

 58384192 AGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCA 58384251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCA 180

 58384252 ACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACAC 58384311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACAC 240

 58384312 AGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAA 58384371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAA 300

 58384372 CACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACA 58384431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACA 360

 58384432 TAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGA 58384491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGA 420

 58384492 GAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACC 58384551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACC 480

 58384552 CTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCT 58384611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCT 540

 58384612 ACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAA 58384671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAA 600

 58384672 AAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATT 58384731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATT 660

 58384732 AAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATA 58384791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATA 720

 58384792 AATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAA 58384851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAA 780

 58384852 TATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTA 58384911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTA 840

 58384912 AAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATG 58384971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATG 900

 58384972 AAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACAC 58385031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACAC 960

 58385032 TACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATA 58385091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATA 1020

 58385092 AAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTT 58385151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTT 1080

 58385152 ATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTC 58385211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTC 1140

 58385212 CTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAAC 58385271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAAC 1200

 58385272 CCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAAC 58385331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAAC 1260

 58385332 CTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGG 58385391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGG 1320

 58385392 GAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGG 58385451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGG 1380

 58385452 TATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAA 58385511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAA 1440

 58385512 CAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATAC 58385571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATAC 1500

 58385572 AGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAA 58385631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAA 1560

 58385632 TATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAAT 58385691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAAT 1620

 58385692 GCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCA 58385751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCA 1680

 58385752 CTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTA 58385811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTA 1740

 58385812 CAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAG 58385871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAG 1800

 58385872 CCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAAC 58385931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAAC 1860

 58385932 AGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGG 58385991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGG 1920

 58385992 AGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATG 58386051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATG 1980

 58386052 GAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACA 58386111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACA 2040

 58386112 TCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGC 58386171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGC 2100

 58386172 ACTAT 58386176
          |||||
     2101 ACTAT 2105

EXCISED REGION

 58386178 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 58386237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 2166

 58386238 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 58386297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2167 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCCGTTATTTGTGG 2226

 58386298 TAACATGGATGGACCTGG 58386315
          ||||||||||||||||||
     2227 TAACATGGATGGACCTGG 2244

Alignment time is 1.63257 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2404] =>      2404 nucs 'mol-32-3030-189794_2404'

Score:        2370
Aligned:      2403        nucs
Identic:      2400 (100%) nucs =>       622 (100%)      1778 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383909,58384530] EXCISED REGION [58384532,58386312]
 second seq =>  [       1,     622] EXCISED REGION [     624,    2404]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384531,58384531]
 second seq =>         1 nucs [623,623]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383909 CAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATAT 58383968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATAT 60

 58383969 AACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATC 58384028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATC 120

 58384029 ACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCA 58384088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCA 180

 58384089 CATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTA 58384148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTA 240

 58384149 AACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATC 58384208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATC 300

 58384209 CAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAA 58384268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAA 360

 58384269 AAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATG 58384328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATG 420

 58384329 ACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCA 58384388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCA 480

 58384389 GGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTA 58384448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTA 540

 58384449 CGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCA 58384508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCA 600

 58384509 GACAACATGTTTACAGACAACA 58384530
          ||||||||||||||||||||||
      601 GACAACATGTTTACAGACAACA 622

EXCISED REGION

 58384532 GATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAA 58384591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 GATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAA 683

 58384592 ATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATG 58384651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 ATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATG 743

 58384652 CTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAA 58384711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 CTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAA 803

 58384712 AAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAAC 58384771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      804 AAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTACAATGAAAAC 863

 58384772 TACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGC 58384831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 TACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGC 923

 58384832 TCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGG 58384891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 TCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGG 983

 58384892 TTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCT 58384951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 TTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCT 1043

 58384952 AACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAA 58385011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 AACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAA 1103

 58385012 CACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAA 58385071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 CACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAA 1163

 58385072 AACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTA 58385131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 AACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTA 1223

 58385132 AGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACA 58385191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 AGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACA 1283

 58385192 TTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCA 58385251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 TTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCA 1343

 58385252 GAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGAT 58385311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 GAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGAT 1403

 58385312 TAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAAC 58385371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 TAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAAC 1463

 58385372 ACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACA 58385431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 ACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACA 1523

 58385432 AAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAA 58385491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 AAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAA 1583

 58385492 CTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATAT 58385551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 CTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATAT 1643

 58385552 CTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACC 58385611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 CTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACC 1703

 58385612 CAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATAT 58385671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 CAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATAT 1763

 58385672 TTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAAC 58385731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAAC 1823

 58385732 CATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAA 58385791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 CATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAA 1883

 58385792 CATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTG 58385851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 CATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTG 1943

 58385852 AGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCAC 58385911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 AGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCAC 2003

 58385912 TACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAA 58385971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAA 2063

 58385972 TATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAG 58386031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAG 2123

 58386032 CCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCA 58386091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 CCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCA 2183

 58386092 GTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTAC 58386151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTAC 2243

 58386152 ACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAA 58386211
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 ACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAA 2303

 58386212 CAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAA 58386271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2304 CAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTTAGCCATAAA 2363

 58386272 AAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACC 58386312
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 AAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACC 2404

Alignment time is 2.40295 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2476] =>      2476 nucs 'mol-32-3164-201301_2476'

Score:        2464
Aligned:      2475        nucs
Identic:      2474 (100%) nucs =>       923 (100%)      1551 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383839,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386314]
 second seq =>  [       1,     923] EXCISED REGION [     925,    2476]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [924,924]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [923,923] to [925,925]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383839 TTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGA 58383898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGA 60

 58383899 AAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACA 58383958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACA 120

 58383959 GGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCA 58384018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCA 180

 58384019 GGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAA 58384078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAA 240

 58384079 TCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCA 58384138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCA 300

 58384139 AGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGAC 58384198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGAC 360

 58384199 AAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCC 58384258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCC 420

 58384259 TTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAG 58384318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAG 480

 58384319 ACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCT 58384378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCT 540

 58384379 TCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACT 58384438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACT 600

 58384439 GGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTC 58384498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTC 660

 58384499 AAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGA 58384558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGA 720

 58384559 CTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAA 58384618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAA 780

 58384619 TGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAA 58384678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAA 840

 58384679 TCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTA 58384738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTA 900

 58384739 AACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||
      901 AACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 923

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 984

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1044

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1104

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1164

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1224

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1284

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1344

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1404

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1464

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1524

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1584

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1644

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1704

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1764

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1824

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1884

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1944

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2004

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2064

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2124

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2184

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2244

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2304

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2305 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2364

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2424

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTG 58386314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTG 2476

Alignment time is 2.61041 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2534] =>      2534 nucs 'mol-32-321f-252233_2534'

Score:        2512
Aligned:      2534        nucs
Identic:      2532 (100%) nucs =>       787 (100%)      1745 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383975,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386509]
 second seq =>  [       1,     787] EXCISED REGION [     789,    2534]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [788,788]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [58386386,58386386]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [787,787] to [789,789]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383975 GATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAAT 58384034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAAT 60

 58384035 GAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAA 58384094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAA 120

 58384095 AAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATA 58384154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATA 180

 58384155 TGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTA 58384214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTA 240

 58384215 TTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTG 58384274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTG 300

 58384275 TCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACC 58384334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACC 360

 58384335 CACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACA 58384394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACA 420

 58384395 AGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAG 58384454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAG 480

 58384455 ATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAAC 58384514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAAC 540

 58384515 ATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTA 58384574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTA 600

 58384575 TTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATC 58384634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATC 660

 58384635 AGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCC 58384694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCC 720

 58384695 ATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAG 58384754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAG 780

 58384755 ATCCCTA 58384761
          |||||||
      781 ATCCCTA 787

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 848

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 908

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 968

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1028

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1088

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1148

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1208

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1268

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1328

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1388

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1448

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1508

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1568

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1628

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1688

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1748

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1808

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 1868

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 1928

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 1988

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2048

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2108

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2168

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2169 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2228

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2288

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2348

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2408

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 AAT-AAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 2467

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 2527

 58386503 TAACATT 58386509
          |||||||
     2528 TAACATT 2534

Alignment time is 2.50132 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3964] =>      3964 nucs 'mol-32-32f0-043531_3964'

Score:        3942
Aligned:      3964        nucs
Identic:      3962 (100%) nucs =>       921 (100%)      3041 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383537,58384457] EXCISED REGION [58384459,58387501]
 second seq =>  [       1,     921] EXCISED REGION [     922,    3964]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384458,58384458]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [1225,1225]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [58384458,58384466] to [58384459,58384467]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383537 GAAATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAAATATCAGTGAAACAAAAATTTTTTTGAAA 58383596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAAATATCAGTGAAACAAAAATTTTTTTGAAA 60

 58383597 AGATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAA 58383656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAA 120

 58383657 TTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAAT 58383716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAAT 180

 58383717 TTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAA 58383776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAA 240

 58383777 ACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTC 58383836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTC 300

 58383837 CATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGA 58383896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGA 360

 58383897 GAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTA 58383956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTA 420

 58383957 CAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTT 58384016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTT 480

 58384017 CAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTG 58384076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTG 540

 58384077 AATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATT 58384136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATT 600

 58384137 CAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAG 58384196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAG 660

 58384197 ACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATG 58384256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATG 720

 58384257 CCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAA 58384316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAA 780

 58384317 AGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTT 58384376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTT 840

 58384377 CTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTA 58384436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTA 900

 58384437 CTGGAGCAATTACGCAAGATT 58384457
          |||||||||||||||||||||
      901 CTGGAGCAATTACGCAAGATT 921

EXCISED REGION

 58384459 AAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGT 58384518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 AAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGT 981

 58384519 TTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAG 58384578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 TTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAG 1041

 58384579 AACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTA 58384638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 AACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTA 1101

 58384639 ATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTT 58384698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 ATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTT 1161

 58384699 ACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCC 58384758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 ACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCC 1221

 58384759 CTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAA 58384818
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 CTACAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAA 1281

 58384819 ATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAA 58384878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 ATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAA 1341

 58384879 GCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAA 58384938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 GCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAA 1401

 58384939 AAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATAC 58384998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 AAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATAC 1461

 58384999 TGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAG 58385058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 TGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAG 1521

 58385059 TTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACA 58385118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 TTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACA 1581

 58385119 GAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTG 58385178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 GAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTG 1641

 58385179 CCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAG 58385238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 CCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAG 1701

 58385239 ATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCA 58385298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 ATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCA 1761

 58385299 ACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGA 58385358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 ACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGA 1821

 58385359 ACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAA 58385418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 ACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAA 1881

 58385419 AACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGC 58385478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 AACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGC 1941

 58385479 ACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTT 58385538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 ACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTT 2001

 58385539 GAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAA 58385598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 GAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAA 2061

 58385599 AGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAA 58385658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 AGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAA 2121

 58385659 TTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGA 58385718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 TTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGA 2181

 58385719 CGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAA 58385778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 CGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAA 2241

 58385779 AGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCA 58385838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 AGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCA 2301

 58385839 CTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCT 58385898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCT 2361

 58385899 ATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAA 58385958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 ATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAA 2421

 58385959 AAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTG 58386018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 AAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTG 2481

 58386019 TAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACC 58386078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 TAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACC 2541

 58386079 ATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTG 58386138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 ATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTG 2601

 58386139 AAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAA 58386198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2602 AAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAA 2661

 58386199 TGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACT 58386258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 TGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACT 2721

 58386259 ATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGG 58386318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 ATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGG 2781

 58386319 ATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATAT 58386378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 ATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATAT 2841

 58386379 GTGGAATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAG 58386438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 GTGGAATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAG 2901

 58386439 TGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATG 58386498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 TGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATG 2961

 58386499 GATATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGT 58386558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GATATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGT 3021

 58386559 GACTATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAAC 58386618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 GACTATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAAC 3081

 58386619 ACATAAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTA 58386678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 ACATAAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTA 3141

 58386679 TTGAGACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATAC 58386738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TTGAGACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATAC 3201

 58386739 ATTTACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAA 58386798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 ATTTACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAA 3261

 58386799 CTAAAAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAA 58386858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 CTAAAAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAA 3321

 58386859 TATGCCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTA 58386918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 TATGCCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTA 3381

 58386919 TGATATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTC 58386978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 TGATATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTC 3441

 58386979 GTTCATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTAT 58387038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 GTTCATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTAT 3501

 58387039 CTTGTTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGT 58387098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 CTTGTTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGT 3561

 58387099 ATCTTAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCAC 58387158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 ATCTTAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCAC 3621

 58387159 TTTTAAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAA 58387218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 TTTTAAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAA 3681

 58387219 ATAAATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATC 58387278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 ATAAATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATC 3741

 58387279 CTTGTAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTT 58387338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CTTGTAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTT 3801

 58387339 TTTGCTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACT 58387398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 TTTGCTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACT 3861

 58387399 GTTCATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACA 58387458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 GTTCATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACA 3921

 58387459 TTACCTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGA 58387501
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 TTACCTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGA 3964

Alignment time is 3.90809 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3280] =>      3280 nucs 'mol-32-32fb-099964_3280'

Score:        3257
Aligned:      3279        nucs
Identic:      3277 (100%) nucs =>      1473 (100%)      1804 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383289,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386568]
 second seq =>  [       1,    1473] EXCISED REGION [    1475,    3280]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [1474,1474]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [1473,1473] to [1475,1475]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383289 TAAAAATTAAAATGGAAATTAAAAAATTTCTTGAGTCAAATGAGAATAGAAACACATGAT 58383348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAAATTAAAATGGAAATTAAAAAATTTCTTGAGTCAAATGAGAATAGAAACACATGAT 60

 58383349 AACAAAACCTATGGGACACAGCAAAATCAGTTCTAAGAGGGAGGTTTATAACAATACACA 58383408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAAAACCTATGGGACACAGCAAAATCAGTTCTAAGAGGGAGGTTTATAACAATACACA 120

 58383409 ACTACATCAAAACATAAGAAAAATTTCCAACTAACAACCTAACAATGCACCTCAAGAAAG 58383468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTACATCAAAACATAAGAAAAATTTCCAACTAACAACCTAACAATGCACCTCAAGAAAG 180

 58383469 TAGGTAAACAAACTAAACTAAACTAAACACAAAATTGGTAAAATAAGACAATAATAAAGT 58383528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGGTAAACAAACTAAACTAAACTAAACACAAAATTGGTAAAATAAGACAATAATAAAGT 240

 58383529 TCAGAGTAGAAATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAAATATCAGTGAAACAAAAATTT 58383588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAGAGTAGAAATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAAATATCAGTGAAACAAAAATTT 300

 58383589 TTTTGAAAAGATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCAAGTAAA 58383648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTGAAAAGATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCAAGTAAA 360

 58383649 ATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGC 58383708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGC 420

 58383709 TACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATT 58383768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATT 480

 58383769 ATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATA 58383828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATA 540

 58383829 AAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAAC 58383888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAAC 600

 58383889 AGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGA 58383948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGA 660

 58383949 ATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAA 58384008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAA 720

 58384009 GAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGA 58384068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGA 780

 58384069 GCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCC 58384128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCC 840

 58384129 CAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACA 58384188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACA 900

 58384189 GAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAAT 58384248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAAT 960

 58384249 TCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAA 58384308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAA 1020

 58384309 CACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGA 58384368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGA 1080

 58384369 CAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTC 58384428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTC 1140

 58384429 ACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAA 58384488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAA 1200

 58384489 GGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAA 58384548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAA 1260

 58384549 ACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAC 58384608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCAC 1320

 58384609 CCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCT 58384668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCT 1380

 58384669 AAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGC 58384728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGC 1440

 58384729 ATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 1473

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 1534

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1594

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1654

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1655 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAGGCAATACTGAG 1714

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1774

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1834

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1894

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1954

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 2014

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 2074

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 2134

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 2194

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 2254

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 2314

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 2374

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 2434

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 2494

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2554

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2614

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2674

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2734

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2794

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2854

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2855 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2914

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2974

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 3034

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 3094

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 3154

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 3214

 58386503 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 58386562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 3274

 58386563 ATAGTC 58386568
          ||||||
     3275 ATAGTC 3280

Alignment time is 2.33925 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2544] =>      2544 nucs 'mol-32-3306-221478_2544'

Score:        2532
Aligned:      2543        nucs
Identic:      2542 (100%) nucs =>       877 (100%)      1665 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383885,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386428]
 second seq =>  [       1,     877] EXCISED REGION [     879,    2544]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [878,878]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [877,877] to [879,879]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383885 AAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTG 58383944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTG 60

 58383945 GAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGA 58384004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGA 120

 58384005 AAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGAT 58384064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGAT 180

 58384065 TTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTC 58384124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTC 240

 58384125 ATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATC 58384184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATC 300

 58384185 AACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACA 58384244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACA 360

 58384245 AAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCC 58384304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCC 420

 58384305 TCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAG 58384364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAG 480

 58384365 TTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTA 58384424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTA 540

 58384425 TTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTG 58384484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTG 600

 58384485 GAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATA 58384544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATA 660

 58384545 GAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTT 58384604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTT 720

 58384605 TCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACT 58384664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACT 780

 58384665 ACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACT 58384724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACT 840

 58384725 TAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 877

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 938

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 998

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1058

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1118

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1178

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1238

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1298

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1358

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1418

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1478

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1538

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1598

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1658

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1718

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1778

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1838

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1898

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 1958

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2018

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2078

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2138

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2198

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2258

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2259 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2318

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2378

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2438

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2498

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAAT 58386428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAAT 2544

Alignment time is 1.84604 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2905] =>      2905 nucs 'mol-32-3311-114396_2905'

Score:        2894
Aligned:      2905        nucs
Identic:      2904 (100%) nucs =>      1848 (100%)      1056 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383770,58385617] EXCISED REGION [58385619,58386675]
 second seq =>  [       1,    1848] EXCISED REGION [    1849,    2905]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58385618,58385618]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [58386177,58386177]
 second seq =>         1 nucs [2407,2407]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [58385618,58385621] to [58385619,58385622]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383770 TGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAA 58383829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAA 60

 58383830 AGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACA 58383889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACA 120

 58383890 GTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAA 58383949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAA 180

 58383950 TATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAG 58384009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAG 240

 58384010 AAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAG 58384069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAG 300

 58384070 CAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCC 58384129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCC 360

 58384130 AGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAG 58384189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAG 420

 58384190 AGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATT 58384249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATT 480

 58384250 CAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAAC 58384309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAAC 540

 58384310 ACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGAC 58384369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGAC 600

 58384370 AACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCA 58384429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCA 660

 58384430 CATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAG 58384489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAG 720

 58384490 GAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAA 58384549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAA 780

 58384550 CCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACC 58384609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACC 840

 58384610 CTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTA 58384669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTA 900

 58384670 AAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCA 58384729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCA 960

 58384730 TTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAA 58384789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAA 1020

 58384790 TAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATT 58384849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATT 1080

 58384850 AATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTAT 58384909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTAT 1140

 58384910 TAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCA 58384969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCA 1200

 58384970 TGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCAC 58385029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCAC 1260

 58385030 ACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCA 58385089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCA 1320

 58385090 TAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATAC 58385149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATAC 1380

 58385150 TTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTC 58385209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTC 1440

 58385210 TCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGA 58385269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGA 1500

 58385270 ACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAA 58385329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAA 1560

 58385330 ACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCT 58385389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCT 1620

 58385390 GGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAAT 58385449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAAT 1680

 58385450 GGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGA 58385509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGA 1740

 58385510 AACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATAT 58385569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATAT 1800

 58385570 ACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTT 58385617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTT 1848

EXCISED REGION

 58385619 AAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAA 58385678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 AAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAA 1908

 58385679 GAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATG 58385738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 GAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATG 1968

 58385739 AGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGT 58385798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 AGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGT 2028

 58385799 TGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGG 58385858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGG 2088

 58385859 AGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTC 58385918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 AGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTC 2148

 58385919 CAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACT 58385978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACT 2208

 58385979 AGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTAT 58386038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 AGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTAT 2268

 58386039 GAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCAC 58386098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 GAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCAC 2328

 58386099 TACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCA 58386158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 TACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCA 2388

 58386159 TGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGA 58386218
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGA 2448

 58386219 TGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAAT 58386278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAAT 2508

 58386279 AAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGC 58386338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 AAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGC 2568

 58386339 CATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGGAATAAAAAAAAAAAAA 58386398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 CATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGGAATAAAAAAAAAAAAA 2628

 58386399 AGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGA 58386458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 AGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGA 2688

 58386459 GGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGA 58386518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 GGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGA 2748

 58386519 TAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAG 58386578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAG 2808

 58386579 TATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGTGATAGCTACAT 58386638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGTGATAGCTACAT 2868

 58386639 TAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATAT 58386675
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATAT 2905

Alignment time is 2.73738 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6653] =>      6653 nucs 'mol-32-331c-166325_6653'

Score:        6641
Aligned:      6652        nucs
Identic:      6651 (100%) nucs =>      2569 (100%)      4082 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383608,58386176] EXCISED REGION [58386178,58390259]
 second seq =>  [       1,    2569] EXCISED REGION [    2571,    6653]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386177,58386177]
 second seq =>         1 nucs [2570,2570]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2779,2779]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2569,2570] to [2570,2571]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [58386174,58386176] to [58386178,58386180]
 second seq =>         3 nucs [2567,2569] to [2571,2573]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383608 ATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAG 58383667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGATGAACATTTAGCTAGACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAG 60

 58383668 ATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACA 58383727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTACAACTGATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACA 120

 58383728 GAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCT 58383787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGATATTCCTGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCT 180

 58383788 GAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAA 58383847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATGGACCAATAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAA 240

 58383848 AGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATT 58383907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTTTAGGGCCCGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATT 300

 58383908 CCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATA 58383967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATA 360

 58383968 TAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATAT 58384027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATAT 420

 58384028 CACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGC 58384087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGC 480

 58384088 ACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATT 58384147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATT 540

 58384148 AAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCAT 58384207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCAT 600

 58384208 CCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATA 58384267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATA 660

 58384268 AAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATAT 58384327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATAT 720

 58384328 GACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATC 58384387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATC 780

 58384388 AGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATT 58384447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATT 840

 58384448 ACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGC 58384507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGC 900

 58384508 AGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAG 58384567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAG 960

 58384568 AAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATAC 58384627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATAC 1020

 58384628 AAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAA 58384687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAA 1080

 58384688 TAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAG 58384747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAG 1140

 58384748 AAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAA 58384807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGAAAGATCCCTATAATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAA 1200

 58384808 ACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACC 58384867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTAAATAGAAATATATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACC 1260

 58384868 ATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTA 58384927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAATACCCAAGCTAATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTA 1320

 58384928 TTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGT 58384987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCAGAAGCAAAAAAAAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGT 1380

 58384988 CAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAAT 58385047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAAGCAATACTGAGAAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAAT 1440

 58385048 GTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGA 58385107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTACTGCAAAGTTACAGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGA 1500

 58385108 CCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTT 58385167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAGTGGAACAGAATAGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTT 1560

 58385168 GGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCT 58385227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTCAAAGGTGCCAAGAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCT 1620

 58385228 GGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATA 58385287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGAAAATTAGATATCTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATA 1680

 58385288 TATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACT 58385347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATGAAAATCAACTCAAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACT 1740

 58385348 ACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAA 58385407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTAGTAGAGAACATAGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAA 1800

 58385408 TAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAA 58385467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAGACCTCAAAACACAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAA 1860

 58385468 AAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAG 58385527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGCTTTTGCACAGCAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAG 1920

 58385528 AGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAAT 58385587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAAAATATTTGAAAACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAAT 1980

 58385588 TAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATT 58385647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAATTAGAGAAAGAACAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATT 2040

 58385648 TATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAAT 58385707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATCAGTAGAATTCATACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAAT 2100

 58385708 AATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGAC 58385767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATCAGGGAGACGAAAATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGAC 2160

 58385768 CATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTG 58385827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTATCAAAAAGACAAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTG 2220

 58385828 TAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGC 58385887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAATCCCACCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGC 2280

 58385888 TGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTC 58385947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGCAATGAGCTATGAAGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTC 2340

 58385948 TCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTT 58386007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCAAACAACAAAAACAAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTT 2400

 58386008 ACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAA 58386067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACACACTGTTGTAAACTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAA 2460

 58386068 TTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAA 58386127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAAAAACACCATAAAATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAA 2520

 58386128 TCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTAT 58386176
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCAGTAAGTTGAAGAGATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTAT 2569

EXCISED REGION

 58386178 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 58386237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TATAATAGCCAAGATATGGAATGTAAGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGT 2630

 58386238 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 58386297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 ATATATACAGAATGAAATACTATTCAGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGG 2690

 58386298 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAAC 58386357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAAC 2750

 58386358 GCCACATAATTTCACTCATATGTGGAAT-AAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATC 58386416
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 GCCACATAATTTCACTCATATGTGGAATAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATC 2810

 58386417 CTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAG 58386476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 CTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAG 2870

 58386477 GATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTG 58386536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 GATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTG 2930

 58386537 GTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAAT 58386596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 GTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAAT 2990

 58386597 AGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGAT 58386656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 AGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGAT 3050

 58386657 CATTATACAACACGTATATGTATTGAGACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATT 58386716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 CATTATACAACACGTATATGTATTGAGACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATT 3110

 58386717 GCAATGTATTAATTACAAATACATTTACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTA 58386776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 GCAATGTATTAATTACAAATACATTTACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTA 3170

 58386777 ATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCA 58386836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 ATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCA 3230

 58386837 AATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCA 58386896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 AATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCA 3290

 58386897 CAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAA 58386956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAA 3350

 58386957 CATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCAT 58387016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCAT 3410

 58387017 GTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACA 58387076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACA 3470

 58387077 AAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATC 58387136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 AAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATC 3530

 58387137 TTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGT 58387196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGT 3590

 58387197 TGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCAT 58387256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCAT 3650

 58387257 GCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGT 58387316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 GCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGT 3710

 58387317 ATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAA 58387376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 ATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAA 3770

 58387377 ATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGC 58387436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 ATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGC 3830

 58387437 CTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTT 58387496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 CTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTT 3890

 58387497 AGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAATGATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGT 58387556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 AGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAATGATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGT 3950

 58387557 TGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTAAAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATA 58387616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTAAAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATA 4010

 58387617 TATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAATTTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCT 58387676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAATTTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCT 4070

 58387677 TGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATTTGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAA 58387736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATTTGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAA 4130

 58387737 TATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATGAACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAG 58387796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATGAACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAG 4190

 58387797 CCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGAAAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCT 58387856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 CCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGAAAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCT 4250

 58387857 AATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAGTAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCA 58387916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 AATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAGTAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCA 4310

 58387917 ATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATGCAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGT 58387976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 ATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATGCAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGT 4370

 58387977 TCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATGCTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCT 58388036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 TCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATGCTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCT 4430

 58388037 TAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCTCTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCT 58388096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCTCTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCT 4490

 58388097 TCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACATTAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTG 58388156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 TCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACATTAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTG 4550

 58388157 CTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAGAATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTC 58388216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 CTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAGAATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTC 4610

 58388217 CAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTCACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAA 58388276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 CAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTCACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAA 4670

 58388277 AAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCCATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGT 58388336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 AAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCCATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGT 4730

 58388337 CATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTCTCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGAT 58388396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 CATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTCTCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGAT 4790

 58388397 GTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTATTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTA 58388456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 GTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTATTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTA 4850

 58388457 GCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAACAGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTC 58388516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 GCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAACAGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTC 4910

 58388517 CTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTAAACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAA 58388576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 CTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTAAACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAA 4970

 58388577 GGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAAATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTA 58388636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 GGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAAATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTA 5030

 58388637 TACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTTTAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCT 58388696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 TACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTTTAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCT 5090

 58388697 CCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAAACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGT 58388756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 CCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAAACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGT 5150

 58388757 ATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGGCCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATA 58388816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 ATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGGCCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATA 5210

 58388817 CATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAACATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTT 58388876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 CATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAACATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTT 5270

 58388877 CAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGTCTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATT 58388936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 CAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGTCTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATT 5330

 58388937 ACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTAATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAAC 58388996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 ACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTAATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAAC 5390

 58388997 AAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTCTGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTA 58389056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 AAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTCTGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTA 5450

 58389057 CATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTTAACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTC 58389116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 CATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTTAACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTC 5510

 58389117 CTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCTTCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTAT 58389176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 CTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCTTCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTAT 5570

 58389177 TTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTATATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCG 58389236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 TTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTATATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCG 5630

 58389237 TGGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTATGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTG 58389296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 TGGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTATGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTG 5690

 58389297 ATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATAGCATTTAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTC 58389356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 ATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATAGCATTTAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTC 5750

 58389357 TAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTCCAATGATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAAT 58389416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 TAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTCCAATGATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAAT 5810

 58389417 TTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCTGTGAGGAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCT 58389476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 TTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCTGTGAGGAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCT 5870

 58389477 ATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGTAAGGGACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTAC 58389536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 ATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGTAAGGGACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTAC 5930

 58389537 CGCATGGTAACAACAACTACAAAACCCCCAAAACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACAT 58389596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 CGCATGGTAACAACAACTACAAAACCCCCAAAACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACAT 5990

 58389597 AAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCAAGTGAAATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATT 58389656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 AAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCAAGTGAAATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATT 6050

 58389657 TAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCCTTGTGGATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAG 58389716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6051 TAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCCTTGTGGATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAG 6110

 58389717 GAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGGCATGGGTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGA 58389776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 GAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGGCATGGGTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGA 6170

 58389777 GACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTATCCAGGGTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAA 58389836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 GACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTATCCAGGGTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAA 6230

 58389837 ATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGGCCATGTGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACT 58389896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 ATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGGCCATGTGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACT 6290

 58389897 CTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAGCATTTTGAACAAAGTCATAACATAAATATAGGTT 58389956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 CTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAGCATTTTGAACAAAGTCATAACATAAATATAGGTT 6350

 58389957 TTAAATTGGATCCATCTGGCTGCTATGATGAGTGGGGAAAGAGTAAATGTAGGGAAAACT 58390016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 TTAAATTGGATCCATCTGGCTGCTATGATGAGTGGGGAAAGAGTAAATGTAGGGAAAACT 6410

 58390017 ATCACAAAGCTATTAAAGTATCCAGGTGGCATAGATTATAGTGGTTGCAGCTCAGATGGT 58390076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 ATCACAAAGCTATTAAAGTATCCAGGTGGCATAGATTATAGTGGTTGCAGCTCAGATGGT 6470

 58390077 GAAAACCAAGTGATATTCTTTGAGAAGGTAGAGCAAAAAAGATTTTGTTTGTTGGCTGCA 58390136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 GAAAACCAAGTGATATTCTTTGAGAAGGTAGAGCAAAAAAGATTTTGTTTGTTGGCTGCA 6530

 58390137 TAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATAGGGTTA 58390196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 TAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATAGGGTTA 6590

 58390197 TTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTCTTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTG 58390256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 TTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTCTTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTG 6650

 58390257 TCA 58390259
          |||
     6651 TCA 6653

Alignment time is 5.43508 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6408] =>      6408 nucs 'mol-32-33b6-138888_6408'

Score:        6374
Aligned:      6407        nucs
Identic:      6404 (100%) nucs =>      1083 (100%)      5321 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383679,58384761] EXCISED REGION [58384763,58390086]
 second seq =>  [       1,    1083] EXCISED REGION [    1085,    6408]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [1084,1084]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [1083,1083] to [1085,1085]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383679 GATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCC 58383738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATACGGCACAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCC 60

 58383739 TGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAA 58383798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAACACATGCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAA 120

 58383799 TAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCC 58383858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACTAGTAAAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCC 180

 58383859 CGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCT 58383918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGATGGCTTAATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCT 240

 58383919 CAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATT 58383978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATT 300

 58383979 CCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAA 58384038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAA 360

 58384039 ACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAG 58384098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAG 420

 58384099 ATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCA 58384158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCA 480

 58384159 AACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTC 58384218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTC 540

 58384219 AATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAA 58384278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAA 600

 58384279 CAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACA 58384338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACA 660

 58384339 GCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGAC 58384398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGAC 720

 58384399 AAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTA 58384458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTA 780

 58384459 AAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGT 58384518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGT 840

 58384519 TTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAG 58384578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAG 900

 58384579 AACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTA 58384638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTA 960

 58384639 ATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTT 58384698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTT 1020

 58384699 ACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCC 58384758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCC 1080

 58384759 CTA 58384761
          |||
     1081 CTA 1083

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 1144

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1204

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1264

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1324

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1384

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1444

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1504

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1564

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1624

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1684

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1744

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1804

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1864

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 ACTGCATATCTAACAAGGGGTTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1924

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1984

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 2044

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 2104

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2164

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2224

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2284

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2344

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2404

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2464

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2465 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2524

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2584

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2644

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2704

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 2764

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 2824

 58386503 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 58386562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 2884

 58386563 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 58386622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 2944

 58386623 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 58386682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 3004

 58386683 GACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTT 58386742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 GACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTT 3064

 58386743 ACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAA 58386802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 ACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAA 3124

 58386803 AAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATG 58386862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 AAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATG 3184

 58386863 CCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGAT 58386922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 CCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGAT 3244

 58386923 ATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTC 58386982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 ATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTC 3304

 58386983 ATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTG 58387042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 ATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTG 3364

 58387043 TTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCT 58387102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 TTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCT 3424

 58387103 TAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTT 58387162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 TAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTT 3484

 58387163 AAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAA 58387222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 AAAATTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAA 3544

 58387223 ATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTG 58387282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 ATGTTTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTG 3604

 58387283 TAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTG 58387342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 TAAATATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTG 3664

 58387343 CTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTC 58387402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 CTCACTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTC 3724

 58387403 ATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTAC 58387462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 ATTTCTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTAC 3784

 58387463 CTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGT 58387522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 CTTTACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGT 3844

 58387523 TAATGATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACAT 58387582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 TAATGATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACAT 3904

 58387583 GGTAAAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAG 58387642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 GGTAAAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAG 3964

 58387643 AAATTTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTT 58387702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 AAATTTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTT 4024

 58387703 CATTTGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAA 58387762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 CATTTGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAA 4084

 58387763 TATGAACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACA 58387822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 TATGAACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACA 4144

 58387823 TTGAAAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAG 58387882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 TTGAAAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAG 4204

 58387883 AAAGTAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCT 58387942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 AAAGTAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCT 4264

 58387943 TATGCAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTAC 58388002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 TATGCAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTAC 4324

 58388003 AATGCTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCA 58388062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 AATGCTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCA 4384

 58388063 ATCTCTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTT 58388122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 ATCTCTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTT 4444

 58388123 ACATTAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAAT 58388182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 ACATTAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAAT 4504

 58388183 TCAGAATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTT 58388242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 TCAGAATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTT 4564

 58388243 ATTCACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATAT 58388302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 ATTCACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATAT 4624

 58388303 TCCCATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCA 58388362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TCCCATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCA 4684

 58388363 TCTCTCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAA 58388422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 TCTCTCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAA 4744

 58388423 TTTATTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTA 58388482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 TTTATTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTA 4804

 58388483 AAACAGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAA 58388542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 AAACAGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAA 4864

 58388543 ACTAAACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATA 58388602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 ACTAAACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATA 4924

 58388603 CAAAATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTAT 58388662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 CAAAATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTAT 4984

 58388663 GTTTTAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAAT 58388722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 GTTTTAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAAT 5044

 58388723 ATAAACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAG 58388782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 ATAAACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAG 5104

 58388783 CTGGCCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTA 58388842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 CTGGCCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTA 5164

 58388843 AAAACATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCT 58388902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 AAAACATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCT 5224

 58388903 GAGTCTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAA 58388962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 GAGTCTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAA 5284

 58388963 ATTAATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTC 58389022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 ATTAATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTC 5344

 58389023 TTTCTGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCA 58389082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 TTTCTGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCA 5404

 58389083 TGTTAACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAAC 58389142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 TGTTAACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAAC 5464

 58389143 TCCTTCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCC 58389202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 TCCTTCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCC 5524

 58389203 CTATATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGTGGAAGCAAAATATACAGTTAATGAT 58389262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 CTATATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGTGGAAGCAAAATATACAGTTAATGAT 5584

 58389263 TTTATGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATA 58389322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 TTTATGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATA 5644

 58389323 GCATTTAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTCTAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTC 58389382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 GCATTTAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTCTAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTC 5704

 58389383 CAATGATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAATTTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCT 58389442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 CAATGATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAATTTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCT 5764

 58389443 GTGAGGAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCTATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGT 58389502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 GTGAGGAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCTATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGT 5824

 58389503 AAGGGACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTACCGCATGGTAACAACAACTACAAAACC 58389562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 AAGGGACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTACCGCATGGTAACAACAACTACAAAACC 5884

 58389563 CCCAAAACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACATAAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCA 58389622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 CCCAAAACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACATAAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCA 5944

 58389623 AGTGAAATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATTTAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCC 58389682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 AGTGAAATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATTTAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCC 6004

 58389683 TTGTGGATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAGGAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGG 58389742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 TTGTGGATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAGGAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGG 6064

 58389743 CATGGGTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGAGACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTAT 58389802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 CATGGGTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGAGACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTAT 6124

 58389803 CCAGGGTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAAATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGG 58389862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 CCAGGGTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAAATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGG 6184

 58389863 CCATGTGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACTCTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAG 58389922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6185 CCATGTGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACTCTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAG 6244

 58389923 CATTTTGAACAAAGTCATAACATAAATATAGGTTTTAAATTGGATCCATCTGGCTGCTAT 58389982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 CATTTTGAACAAAGTCATAACATAAATATAGGTTTTAAATTGGATCCATCTGGCTGCTAT 6304

 58389983 GATGAGTGGGGAAAGAGTAAATGTAGGGAAAACTATCACAAAGCTATTAAAGTATCCAGG 58390042
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6305 GATGAGTGGGGAAAGAGTAAATGTAGGGAAAACTATCACAAAGCTATTACAGTATCCAGG 6364

 58390043 TGGCATAGATTATAGTGGTTGCAGCTCAGATGGTGAAAACCAAG 58390086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6365 TGGCATAGATTATAGTGGTTGCAGCTCAGATGGTGAAAACCAAG 6408

Alignment time is 4.88046 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2404] =>      2404 nucs 'mol-32-3403-153869_2404'

Score:        2392
Aligned:      2403        nucs
Identic:      2402 (100%) nucs =>       872 (100%)      1530 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383890,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386293]
 second seq =>  [       1,     872] EXCISED REGION [     874,    2404]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [873,873]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [872,872] to [874,874]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383890 GTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAA 58383949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCAGAAATTTTAAAGTGGAGAA 60

 58383950 TATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAG 58384009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAACAAGGAGATGACAGAAAAAG 120

 58384010 AAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAG 58384069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAAATACTGCACATGATTTGAG 180

 58384070 CAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCC 58384129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATATATCAAGTGGGATTCATCCC 240

 58384130 AGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAG 58384189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATGCAATATACCACATCAACAG 300

 58384190 AGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATT 58384249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACAAAAAGCATTTGACAAAATT 360

 58384250 CAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAAC 58384309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAGAGAAGATATGTGCCTCAAC 420

 58384310 ACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGAC 58384369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATACTGAACAGGAAAAGTTGAC 480

 58384370 AACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCA 58384429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCACTGTCACCACTTCTATTTCA 540

 58384430 CATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAG 58384489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGAAGGCACTAAAATTGGAAAG 600

 58384490 GAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAA 58384549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACATGATAGTATATATAGAAAA 660

 58384550 CCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACC 58384609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACAAATTCAGTAAAGTTTCACC 720

 58384610 CTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTA 58384669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATATGCTAATAGTGCACTACCTA 780

 58384670 AAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCA 58384729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACAAAAAATACCTCACTTAGCA 840

 58384730 TTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 872

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 933

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 993

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1053

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1113

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1173

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1233

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1293

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1353

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1413

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1473

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1533

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1593

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1653

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1713

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 1773

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 1833

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 1893

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 1953

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2013

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2073

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2133

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2193

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2253

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2254 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2313

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2373

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTT 58386293
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTT 2404

Alignment time is 2.05199 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3067] =>      3067 nucs 'mol-32-3487-083382_3067'

Score:        3055
Aligned:      3066        nucs
Identic:      3065 (100%) nucs =>      1131 (100%)      1934 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383631,58384761] EXCISED REGION [58384763,58386697]
 second seq =>  [       1,    1131] EXCISED REGION [    1133,    3067]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [1132,1132]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [1131,1131] to [1133,1133]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383631 AAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAA 58383690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCACAA 60

 58383691 GTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCA 58383750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACATGCA 120

 58383751 ACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAA 58383810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTAAAA 180

 58383811 AATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAAT 58383870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTTAAT 240

 58383871 TGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCA 58383930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATTGCA 300

 58383931 GAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAAC 58383990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTGAAC 360

 58383991 AAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAA 58384050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATAAAA 420

 58384051 ATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATAT 58384110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAATAT 480

 58384111 ATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATG 58384170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTAATG 540

 58384171 CAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACA 58384230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGCACA 600

 58384231 AAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAG 58384290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGGTAG 660

 58384291 AGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATA 58384350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATCATA 720

 58384351 CTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCAC 58384410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCCCAC 780

 58384411 TGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGA 58384470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAATGA 840

 58384471 AGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACA 58384530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACAACA 900

 58384531 TGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACA 58384590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAAACA 960

 58384591 AATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATAT 58384650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTATAT 1020

 58384651 GCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACA 58384710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCTACA 1080

 58384711 AAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 1131

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 1192

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1252

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1312

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1372

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1432

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1492

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1552

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1612

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1672

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1732

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 1792

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 1852

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 1912

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 1972

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 2032

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 2092

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 2152

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2212

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2272

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2332

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2392

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2452

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2512

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2513 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2572

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2632

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2692

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2752

 58386383 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 58386442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 AATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGT 2812

 58386443 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 58386502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 TATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATA 2872

 58386503 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 58386562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 TAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACT 2932

 58386563 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 58386622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 ATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACAT 2992

 58386623 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 58386682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 AAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGA 3052

 58386683 GACATCAAATTGTAC 58386697
          |||||||||||||||
     3053 GACATCAAATTGTAC 3067

Alignment time is 3.02953 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4340] =>      4340 nucs 'mol-32-34a8-108516_4340'

Score:        4340
Aligned:      4340        nucs
Identic:      4340 (100%) nucs =>       114 (100%)      4226 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58386272,58386385] EXCISED REGION [58386387,58390612]
 second seq =>  [       1,     114] EXCISED REGION [     115,    4340]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58386386,58386386]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [58386386,58386398] to [58386387,58386399]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58386272 AAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGA 58386331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATATTATAAGTGA 60

 58386332 AATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGGAAT 58386385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGGAAT 114

EXCISED REGION

 58386387 AAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATC 58386446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      115 AAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGGTTATC 174

 58386447 AGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAAC 58386506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      175 AGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGATATAAC 234

 58386507 ATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAG 58386566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      235 ATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGACTATAG 294

 58386567 TCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGG 58386626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      295 TCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACATAAGG 354

 58386627 TGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGAGACA 58386686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 TGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTGAGACA 414

 58386687 TCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTTACAT 58386746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 TCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATTTACAT 474

 58386747 TTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAA 58386806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 TTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTAAAAAA 534

 58386807 AAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTG 58386866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 AAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATATGCCTG 594

 58386867 CAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGA 58386926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 CAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGATATGA 654

 58386927 ACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTA 58386986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 ACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTTCATTA 714

 58386987 GGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCT 58387046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 GGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTTGTTCT 774

 58387047 ATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAAC 58387106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 ATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATCTTAAC 834

 58387107 ATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAA 58387166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 ATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTTTAAAA 894

 58387167 TTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGT 58387226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 TTTTTATATCAACCATTTTTTTCAAGTGGTTGAACTCATTATTCTGTTGTAAATAAATGT 954

 58387227 TTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAA 58387286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 TTCCATGCTTAAGGCAGTCTTTGTGTGCATGCTTTTTTAAAAAAAATATATCCTTGTAAA 1014

 58387287 TATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCA 58387346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 TATAAGTTTGCTTCAGATTTTCTTTCAAGTATTACTAAATTTCTAATTTTTTTTTGCTCA 1074

 58387347 CTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTT 58387406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 CTTATTCTAACTGGCAGAAGTCCTTTAGAAATTTCCTTTGGGCTTTCACACTGTTCATTT 1134

 58387407 CTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTT 58387466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 CTCTTTTGAAGTGCAAGTGTGTATTTATGCCTTGCTGAGGTGCTAAGCCACATTACCTTT 1194

 58387467 ACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAAT 58387526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 ACAAGTCAAATTCAGATTTTTCCAGATCTTAGTGATGCCTTAAGAAGAGTACCAGTTAAT 1254

 58387527 GATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTA 58387586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 GATAATAATAAAATGTTACTTACTTGATGTTGGCGGGAGGACTGTGAAATTCACATGGTA 1314

 58387587 AAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAAT 58387646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 AAATGATTTACAGTTCTTAGAAACAAAATATATTACAAAAACTAAATGTGATAAAGAAAT 1374

 58387647 TTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATT 58387706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TTTTACACTTTTAAATTGCTGCCATTTTCTTGAGGAAACAGGAGAACATGTTTTTTCATT 1434

 58387707 TGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATG 58387766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TGGTTTTGAAATTGTTTTGAGTTGTACTAATATATGCTGTAGTATATCATAATGAATATG 1494

 58387767 AACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGA 58387826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 AACATTTTCTGGCAAAGTCTTATCTTTGAGCCACTGCAAGATGATTCTGCAGGACATTGA 1554

 58387827 AAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAG 58387886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 AAAAAATTGATAACAGAAAGAGTTCATTCTAATCTAAAAGTGCTTTGTGGAGCTAGAAAG 1614

 58387887 TAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATG 58387946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 TAGCTGAGACTACTGGGATAATCTGAGTCAATTATGTTGAATTCACATAGGGTGCTTATG 1674

 58387947 CAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATG 58388006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 CAGTTCTCAGCTCCTCCCTTCAACAGCTGTTCTTAATCAGTCCTGATGCCCTCTACAATG 1734

 58388007 CTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCT 58388066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 CTGACTCTGTCTTACTCAAGCAAGACTCCTTAATAATTGCTCACTCATCTGGATCAATCT 1794

 58388067 CTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACAT 58388126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 CTCGCATCGCTTGCCTTTTCACTTTTTGCTTCCTCTCAGTTATTTCTGACTTCTTTACAT 1854

 58388127 TAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAG 58388186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TAAATATTAATGATTTCTTGTTTTATTTTGCTAAAACTTTACATAAAATGTGAAATTCAG 1914

 58388187 AATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTC 58388246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 AATGGTATTTTACATAACAGAGTGGAGGTCCAGAGAAGTCTAAGAGCTTTATTTTTATTC 1974

 58388247 ACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCC 58388306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 ACTAGCTATGGCTAATTGCTAGACATAAAAAAAAATCAAGAAATAGACATCTATATTCCC 2034

 58388307 ATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTC 58388366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 ATTTTATAATTTTTTTGGAACTATAACTGTCATCTGTGATATTATATCTTTGCCCATCTC 2094

 58388367 TCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTA 58388426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TCTTGTAGGTCAGTTAGGATTCAGAGTGATGTATTTACTAAATGGAAATGAAATAATTTA 2154

 58388427 TTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAAC 58388486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TTTGTATCTATCACATTTTGACCTCTTCTAGCATCTATTTTTAGGAAATCGTTTTAAAAC 2214

 58388487 AGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTA 58388546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 AGAACTGACCCTGCAGCTGAGACCACATTCCTAAGTTTGCATAATATATTAACAAAACTA 2274

 58388547 AACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAA 58388606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 AACTAAACAATGTTTAATGATTTTGTGGAAGGAGATTCCTTCACAAGCATGGAATACAAA 2334

 58388607 ATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTT 58388666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 ATTGCTACACTGTGAAGCCTCTATAATGTATACCTTTGGTATTGCCAACTATTTATGTTT 2394

 58388667 TAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAA 58388726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TAAATATAAGACGTAAATAATATGGTGTCTCCATGGGAGCAGTGAAATGTATCAATATAA 2454

 58388727 ACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGG 58388786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 ACCAATAGTTAGTAGCTGAATCCTCAGTGTATCCTAATAGCTGGCTCCACTTAAAGCTGG 2514

 58388787 CCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAA 58388846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 CCCCAGTTAAAGTAGCCACTGTTTGCCATACATGAAGCTAAGTGTTAAGTGTTTTAAAAA 2574

 58388847 CATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGT 58388906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 CATTGTTTAATTAACATCTTAATATGTTTTCAGTATAAAACCTGCCGAGTAAGTCTGAGT 2634

 58388907 CTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTA 58388966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 CTCAGTTTATGGATAGAAGTGTTCAACATTACATTCATGGGTTGAATTTTTCCAAAATTA 2694

 58388967 ATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTC 58389026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 ATTAATCTGGTCTTTCACTCAGAATTAAACAAGCATTTCTTCATCAGTTCAGTTTCTTTC 2754

 58389027 TGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTT 58389086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 TGTCCTACCCTAACAGATGTTTTTGAATTACATAGTTAAAGTGTCCACACATAGCATGTT 2814

 58389087 AACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCT 58389146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 AACCAGAATCTTTATCTATTACTATGTCTCCTAGCTTCCTTAGTAGTGGTCCAAACTCCT 2874

 58389147 TCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTAT 58389206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TCACACAGATATTGCCACGTTTTTCACTATTTTTTCTTTTTCCCACGTGCGAATCCCTAT 2934

 58389207 ATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGTGGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTA 58389266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 ATTTTAGTGAAAAAATTTAAGGAGTTGCCGTGGAAGCAAAATATACAGTTAATGATTTTA 2994

 58389267 TGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATAGCAT 58389326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TGCTAATGTATTAATGTTTCATGTAAATTGATGTGTTACTCTTCCCAAGAGTAATAGCAT 3054

 58389327 TTAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTCTAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTCCAAT 58389386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 TTAGAAAGGGAAGAAAAATCTTTTTTATTCTAAGCCACTTTCGATAAAGAAATTTCCAAT 3114

 58389387 GATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAATTTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCTGTGA 58389446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 GATGAAAAAGTGCTTCCGAGTGGAAGCAATTTTCTTCCATTCTCATCCAAGTGTCTGTGA 3174

 58389447 GGAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCTATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGTAAGG 58389506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 GGAATGATGTGCTGGAGCTGGTTTGCACCTATGGTTAAGAACTGATTGTCAGTGGTAAGG 3234

 58389507 GACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTACCGCATGGTAACAACAACTACAAAACCCCCA 58389566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 GACATTACCCCTATATATCTTGCATTGTACCGCATGGTAACAACAACTACAAAACCCCCA 3294

 58389567 AAACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACATAAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCAAGTG 58389626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 AAACAAAAAAGGCAAAAACAAGATATACATAAAAAATATATTTTAGAAAGATGGCAAGTG 3354

 58389627 AAATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATTTAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCCTTGT 58389686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 AAATTCTCATTAAGAAGGTGACATTTGATTTAAGACTTAAAGGAAGAGAGTGAGCCTTGT 3414

 58389687 GGATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAGGAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGGCATG 58389746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 GGATATCTGAGCCGGAGTATTTCCAGTAAGGAATGACAAGTGCTAAGATCCCGTGGCATG 3474

 58389747 GGTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGAGACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTATCCAG 58389806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 GGTGTGCCTTGTGTGTTTGAGGAACAGGGAGACTTGCATGGCTAAAGCCAAGCTATCCAG 3534

 58389807 GGTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAAATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGGCCAT 58389866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 GGTTAAGGAGATGGAAGTAAGAGCAGAGAAATAGGAAATGAACAGTTCATGGAGGGCCAT 3594

 58389867 GTGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACTCTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAGCATT 58389926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 GTGGTTATCATAAGGACTGTGGCTATTACTCTACATGAGATGAGAAGGCTTTCAAGCATT 3654

 58389927 TTGAACAAAGTCATAACATAAATATAGGTTTTAAATTGGATCCATCTGGCTGCTATGATG 58389986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 TTGAACAAAGTCATAACATAAATATAGGTTTTAAATTGGATCCATCTGGCTGCTATGATG 3714

 58389987 AGTGGGGAAAGAGTAAATGTAGGGAAAACTATCACAAAGCTATTAAAGTATCCAGGTGGC 58390046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 AGTGGGGAAAGAGTAAATGTAGGGAAAACTATCACAAAGCTATTAAAGTATCCAGGTGGC 3774

 58390047 ATAGATTATAGTGGTTGCAGCTCAGATGGTGAAAACCAAGTGATATTCTTTGAGAAGGTA 58390106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 ATAGATTATAGTGGTTGCAGCTCAGATGGTGAAAACCAAGTGATATTCTTTGAGAAGGTA 3834

 58390107 GAGCAAAAAAGATTTTGTTTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTC 58390166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 GAGCAAAAAAGATTTTGTTTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTC 3894

 58390167 ATATCCTTTGCCCACTTTTTGATAGGGTTATTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGT 58390226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 ATATCCTTTGCCCACTTTTTGATAGGGTTATTTGTTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGT 3954

 58390227 CTTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCC 58390286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 CTTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTAGATTGCAAAAATTTTCTCC 4014

 58390287 CATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTATTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTG 58390346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 CATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTATTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTG 4074

 58390347 AGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTA 58390406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 AGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTA 4134

 58390407 GACACGAAGTCCTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGG 58390466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 GACACGAAGTCCTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGGTATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGG 4194

 58390467 GTTTTTATGGTTTTACGTCTAACATTTAAGTTTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTA 58390526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 GTTTTTATGGTTTTACGTCTAACATTTAAGTTTTTAATCCATCTTGAATTAATTTTTGTA 4254

 58390527 TAAGGTGTAAAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTGAAACATGAAAAAATGCTCATCATCA 58390586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 TAAGGTGTAAAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTGAAACATGAAAAAATGCTCATCATCA 4314

 58390587 CTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAA 58390612
          ||||||||||||||||||||||||||
     4315 CTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAA 4340

Alignment time is 3.17315 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [58376069,58396451] =>     20383 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3789] =>      3789 nucs 'mol-32-34a8-117793_3789'

Score:        3766
Aligned:      3788        nucs
Identic:      3786 (100%) nucs =>      1374 (100%)      2412 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [58383388,58384761] EXCISED REGION [58384763,58387175]
 second seq =>  [       1,    1374] EXCISED REGION [    1376,    3789]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [58384762,58384762]
 second seq =>         1 nucs [1375,1375]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2999,2999]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [58384761,58384761] to [58384763,58384763]
 second seq =>         1 nucs [1374,1374] to [1376,1376]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 58383388 GGAGGTTTATAACAATACACAACTACATCAAAACATAAGAAAAATTTCCAACTAACAACC 58383447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAGGTTTATAACAATACACAACTACATCAAAACATAAGAAAAATTTCCAACTAACAACC 60

 58383448 TAACAATGCACCTCAAGAAAGTAGGTAAACAAACTAAACTAAACTAAACACAAAATTGGT 58383507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACAATGCACCTCAAGAAAGTAGGTAAACAAACTAAACTAAACTAAACACAAAATTGGT 120

 58383508 AAAATAAGACAATAATAAAGTTCAGAGTAGAAATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAA 58383567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATAAGACAATAATAAAGTTCAGAGTAGAAATAAACACAACAGATTAAAAGTTCAAAA 180

 58383568 ATATCAGTGAAACAAAAATTTTTTTGAAAAGATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAG 58383627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATCAGTGAAACAAAAATTTTTTTGAAAAGATTAACAGAATTGATGAACATTTAGCTAG 240

 58383628 ACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCA 58383687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTAAGTAAGACTCAAGTAAAATCAGAAATTATAAAGGAGATATTACAACTGATACGGCA 300

 58383688 CAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACAT 58383747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAGTACAAAAATTTTTATGCTACTAAATTTGATAACACAGAAGATATTCCTGAACACAT 360

 58383748 GCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTA 58383807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAACCTACCAACATTAAATTATGGAGAAACAGAAAATCTGAATGGACCAATAACTAGTA 420

 58383808 AAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTT 58383867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAATTGAATCAGTAATATAAAGTTTTCCATTGAAAAAAAGTTTAGGGCCCGATGGCTT 480

 58383868 AATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATT 58383927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTGCTGAATTCCACCAAACAGTTAAGAGAAAACTAATTCCAATCTTCCTCAAACTATT 540

 58383928 GCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTG 58383987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAGAAATTTTAAAGTGGAGAATATTTTACAGGATCAATATAACCCTGATTCCAAAACTG 600

 58383988 AACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATA 58384047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACAAGGAGATGACAGAAAAAGAAAATTTCAGGCCAATATCACCAATGAAAACAAATATA 660

 58384048 AAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAA 58384107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATACTGCACATGATTTGAGCAAATTGAATCCAACAGCACATTAAAAAGATTATTCAA 720

 58384108 TATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTA 58384167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATATCAAGTGGGATTCATCCCAGGGATTCAAGGATGATTAAACATATGCAAACCAATTA 780

 58384168 ATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGC 58384227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCAATATACCACATCAACAGAGAGAAGACAAAATCCATCCAATTATTTCAATACAAGC 840

 58384228 ACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGG 58384287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAAAAGCATTTGACAAAATTCAACATGCCTTTAGGATAAAAGCTGTCAACAAATTAGG 900

 58384288 TAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATC 58384347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGAGAAGATATGTGCCTCAACACAGTAAAGACTATATATGACAACCCACAGCTGGCATC 960

 58384348 ATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCC 58384407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATACTGAACAGGAAAAGTTGACAACACTTCTTCTAAGATCAGGAACAAGACAAAGATGCC 1020

 58384408 CACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAA 58384467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACTGTCACCACTTCTATTTCACATAGTACTGGAGCAATTACGCAAGATTAAAAAAAAAA 1080

 58384468 TGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACA 58384527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAAGGCACTAAAATTGGAAAGGAGAAAGTCAAATTTTGCAGACAACATGTTTACAGACA 1140

 58384528 ACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAA 58384587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATGATAGTATATATAGAAAACCCTGAAGACTCCCTTAGAAAGCTATTAGAACTAGTAA 1200

 58384588 ACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTA 58384647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAAATTCAGTAAAGTTTCACCCTACAAAAATGAACATACAAAAATCAGTAATGTGTCTA 1260

 58384648 TATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCT 58384707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATGCTAATAGTGCACTACCTAAAAAAGAAATCAAGAAAATAATTCCATTTACAATAGCT 1320

 58384708 ACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 58384761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAAAAAATACCTCACTTAGCATTAAACTTAAACAAGGAGAAGAAAGATCCCTA 1374

EXCISED REGION

 58384763 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 58384822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 AATGAAAACTACAAAACACTGATAAAATAAATTGAAGAGAACAAAACTAAATAGAAATAT 1435

 58384823 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 58384882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 ATCTCTTGCTCATGGATTGGAGAAATTAATATTGTTAAAATGACCATAATACCCAAGCTA 1495

 58384883 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 58384942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 ATTTACAGGTTGAATACAACTCCCTATTAAAATACTAATGATCTATTCAGAAGCAAAAAA 1555

 58384943 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 58385002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 AAAAGTCCTAACATTCATATGGAACCATGAAATACCCTGAAGAGTCAAAGCAATACTGAG 1615

 58385003 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 58385062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 AAAAAGGAACACAGCTGAAGACATCACACTACCTGACTTCAAAATGTACTGCAAAGTTAC 1675

 58385063 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 58385122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 AGCAACTAAAACAACATGGCACTGGCATAAAAACAGACATAGAGACCAGTGGAACAGAAT 1735

 58385123 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 58385182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AGAGAACTAAGAAAAGAATTCACATACTTATAGCAAACTGATTTTGGTCAAAGGTGCCAA 1795

 58385183 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 58385242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 GAATACACATTGGGGAAATGATAAGTCTCCTTAATAAATTATGCTGGGAAAATTAGATAT 1855

 58385243 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 58385302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 CTACTTGCAGAAGGATAAAAAATTAGAACCCTACCTCTCAGCATATATGAAAATCAACTC 1915

 58385303 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 58385362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 AAAAGGGATTAAATAGTCAAATCTAAAACCTGAAACTATGAAACTACTAGTAGAGAACAT 1975

 58385363 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 58385422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGGGGAAACACCTCATGGCATTGGGCTGGGAATGGGGTTTAAAAATAAGACCTCAAAACA 2035

 58385423 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 58385482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CAGAAAACAAAAGCAAATTTAACAAATGGTATTACATTGAATTAAAAAGCTTTTGCACAG 2095

 58385483 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 58385542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CAAAGGAAACTATTAACAGAGTGAAGAAACAACCTACAGAATGAGAGAAAATATTTGAAA 2155

 58385543 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 58385602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 ACTGCATATCTAACAAGGGATTAATATACAGACTATAGAAAGAATTAATTAGAGAAAGAA 2215

 58385603 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 58385662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CAAATAACCCAATTTAAAAATGAGCAAAATATTTTAATAAACATTTATCAGTAGAATTCA 2275

 58385663 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 58385722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TACAAATATTTAAGAAGAATATGAAAAATGCTCAGCATCACTAATAATCAGGGAGACGAA 2335

 58385723 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 58385782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AATCAAAACCATAATGAGATACCACCTCACTCTAGTTAGAATGACCATTATCAAAAAGAC 2395

 58385783 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 58385842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AAAAGTAAACATATGTTGGAGGCCTACTACAATGGCTCATGCCTGTAATCCCACCACTTT 2455

 58385843 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 58385902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 GGGAAGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCAATGAGCTATGA 2515

 58385903 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 58385962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AGGCTCCACTACACTCCAGTCTGGGCAACAGTGTGAGACCTTGTCTCAAACAACAAAAAC 2575

 58385963 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 58386022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AAAAACAAATATAACTAGTGAGGATGTGGAGATAAGGGAACACTTACACACTGTTGTAAA 2635

 58386023 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 58386082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CTAGTACAGCCATTATGAAAAATTTCATGGAGGGTCCCCCCAAAATTAAAAACACCATAA 2695

 58386083 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 58386142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AATTCAGCAGTTTCACTACTGGGCATACATCCAAAGGAAATGAAATCAGTAAGTTGAAGA 2755

 58386143 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATATATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 58386202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2756 GATATCTACACTCCCATGTTTATGGCAGCACTATTTATAATAGCCAAGATATGGAATGTA 2815

 58386203 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 58386262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 AGTGTCCAACAATAGATGAATGAAGAAAATGTGGTATATATACAGAATGAAATACTATTC 2875

 58386263 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 58386322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 AGCCATAAAAAAGAATAAAATCCTGTTATTTGTGGTAACATGGATGGACCTGGGGGATAT 2935

 58386323 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 58386382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TATAAGTGAAATAAGCCATGCATAGAAAGACAAACGCCACATAATTTCACTCATATGTGG 2995

 58386383 AAT-AAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGG 58386441
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 AATAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACTCTTGATATCCTAGAAGTAAATAGTAGAACAGTGG 3055

 58386442 TTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGAT 58386501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TTATCAGAGACTGGGGAGGTGAAAGGGAAAAGGAGGATGGGGAGACATTAGCCAATGGAT 3115

 58386502 ATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGAC 58386561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ATAACATTACCAGTAGATAGGAGGAATAATTTCTGGTGTTCTATTACACAGCAAGGTGAC 3175

 58386562 TATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACA 58386621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TATAGTCAACAGTAAAGTATCGTATACTACAAAATAGCTGGGAGAGGAATGATAAACACA 3235

 58386622 TAAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTG 58386681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 TAAGGTGATAGCTACATTAATTACACTGATTGGATCATTATACAACACGTATATGTATTG 3295

 58386682 AGACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATT 58386741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 AGACATCAAATTGTACCCTATAAATATGTATTATTGCAATGTATTAATTACAAATACATT 3355

 58386742 TACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTA 58386801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TACATTTATTTTTAAATTTTTATTAAAAAATTTTAATTTGACAATTTAAATTGTCAACTA 3415

 58386802 AAAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATAT 58386861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AAAAAAAAAGAAAATCGTAAGAGCCGAAGTACTCAAATATTGTACATGGTGCTGAAATAT 3475

 58386862 GCCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGA 58386921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 GCCTGCAGAACATGAGTAAATATAGGGATGTTTCACAATTCAAAGCTCTAACTCCTATGA 3535

 58386922 TATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTT 58386981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TATGAACATGAAATTCTTAGTGAAATATAACGGAACATATTTCAACTAGAGTAATTCGTT 3595

 58386982 CATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTT 58387041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 CATTAGGAACCCAGTAATATCTGGTTTTTGCCCATGTTATGCAGCATTTTTTATTATCTT 3655

 58387042 GTTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATC 58387101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GTTCTATAATGTTTTAAAATATTAAAGCTAGTACAAAATTCTTTATGTAAAAGATGTATC 3715

 58387102 TTAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTT 58387161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TTAACATTAAATAAATGTTGTATGAGTCCATTATCTTTTTAAATTTATCTAAAGCACTTT 3775

 58387162 TAAAATTTTTATAT 58387175
          ||||||||||||||
     3776 TAAAATTTTTATAT 3789

Alignment time is 2.74284 s

