
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5018] =>      5018 nucs 'mol-32-1e7c-157879_5018'

Score:        4944
Aligned:      5010        nucs
Identic:      5004 (100%) nucs =>      4492 (100%)       512 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054741,39059236] EXCISED REGION [39059245,39059758]
 second seq =>  [       1,    4496] EXCISED REGION [    4505,    5018]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [39059237,39059244]
 second seq =>         8 nucs [4497,4504]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39059237,39059237] to [39059245,39059245]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [39059235,39059236] to [39059245,39059246]
 second seq =>         2 nucs [4495,4496] to [4505,4506]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39059237,39059237] to [39059244,39059244]
 second seq =>         0 nucs

 39054741 AGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAAT 39054800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAAT 60

 39054801 CCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTT 39054860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTT 120

 39054861 CAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTG 39054920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTG 180

 39054921 AATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGG 39054980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGG 240

 39054981 TATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGA 39055040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGA 300

 39055041 CCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAA 39055100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAA 360

 39055101 CAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAAT 39055160
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAAT 420

 39055161 GTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATAC 39055220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATAC 480

 39055221 CCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGC 39055280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGC 540

 39055281 AAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCC 39055340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCC 600

 39055341 AACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCC 39055400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCC 660

 39055401 CCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAG 39055460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAG 720

 39055461 AAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTAT 39055520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTAT 780

 39055521 GCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAAT 39055580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAAT 840

 39055581 CCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATA 39055640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATA 900

 39055641 AATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAA 39055700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAA 960

 39055701 AGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAG 39055760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAG 1020

 39055761 CTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAA 39055820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAA 1080

 39055821 TGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCT 39055880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCT 1140

 39055881 TGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGA 39055940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGA 1200

 39055941 GGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATA 39056000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATA 1260

 39056001 ATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCA 39056060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCA 1320

 39056061 GAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGC 39056120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGC 1380

 39056121 TGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCA 39056180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCA 1440

 39056181 CAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAA 39056240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAA 1500

 39056241 TACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCT 39056300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1501 TACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCT 1560

 39056301 GAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCA 39056360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCA 1620

 39056361 CTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAA 39056420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAA 1680

 39056421 AAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTG 39056480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTG 1740

 39056481 GCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGAT 39056540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGAT 1800

 39056541 GCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGT 39056600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGT 1860

 39056601 CTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCC 39056660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCC 1920

 39056661 AATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTT 39056720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTT 1980

 39056721 CAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATAT 39056780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATAT 2040

 39056781 CTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACA 39056840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACA 2100

 39056841 TTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGT 39056900
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAACCATCATGAAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGT 2160

 39056901 TTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATT 39056960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATT 2220

 39056961 GGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATT 39057020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATT 2280

 39057021 ATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATA 39057080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATA 2340

 39057081 GATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAAT 39057140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAAT 2400

 39057141 TTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAA 39057200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAA 2460

 39057201 CCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACC 39057260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACC 2520

 39057261 TGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAAA 39057320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAAA 2580

 39057321 AAGTACATTTTGAATTCTTATACATTTATAATTAATTCAGTCATCTAACAAACACTTGTT 39057380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGTACATTTTGAATTCTTATACATTTATAATTAATTCAGTCATCTAACAAACACTTGTT 2640

 39057381 TAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTAAGTGGGATCTCAGATCCCTTTAATCTCCCTTTG 39057440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTAAGTGGGATCTCAGATCCCTTTAATCTCCCTTTG 2700

 39057441 TGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGCAGATGAAATAGAAACCATGACTTTCTAACTGTT 39057500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGCAGATGAAATAGAAACCATGACTTTCTAACTGTT 2760

 39057501 GAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATACACCTGCTCAAACTTAAGCTTTCAATTTTTAATG 39057560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATACACCTGCTCAAACTTAAGCTTTCAATTTTTAATG 2820

 39057561 AGGAGAATCATGTGACTAATCATCCCCTGTCAAAAATTGTCATTTTTGATTCTTATGCTT 39057620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGGAGAATCATGTGACTAATCATCCCCTGTCAAAAATTGTCATTTTTGATTCTTATGCTT 2880

 39057621 GCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCCATAAATATATTTTGTCCATAATGAAATTTGTCTA 39057680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCCATAAATATATTTTGTCCATAATGAAATTTGTCTA 2940

 39057681 TAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGAGGTTGTGCTTGAATATTTTTGTGGGCCCAGGATT 39057740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGAGGTTGTGCTTGAATATTTTTGTGGGCCCAGGATT 3000

 39057741 CTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGAGGAATTCCCATACTGGGACAGTTATGAATTGGTA 39057800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGAGGAATTCCCATACTGGGACAGTTATGAATTGGTA 3060

 39057801 TTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAGGACTACTCTATCTTGTTAACACTTTCAATTTAAG 39057860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAGGACTACTCTATCTTGTTAACACTTTCAATTTAAG 3120

 39057861 AGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAAGCACCTAAGGCAATCTGGAAGGCTAGAGACTACC 39057920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAAGCACCTAAGGCAATCTGGAAGGCTAGAGACTACC 3180

 39057921 TCCTTATTCAGCATAACTAACATTAGGCCATATACTGACATCAAAGAGGAAGTGAAAGCT 39057980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCCTTATTCAGCATAACTAACATTAGGCCATATACTGACATCAAAGAGGAAGTGAAAGCT 3240

 39057981 CTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCAATTGTGGAGGCAGTGGAATGTAGTGAAAGGTCTG 39058040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCAATTGTGGAGGCAGTGGAATGTAGTGAAAGGTCTG 3300

 39058041 GATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCCTGGCTCTACTGGGTAATAACTATGTGACCCTGTC 39058100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCCTGGCTCTACTGGGTAATAACTATGTGACCCTGTC 3360

 39058101 TGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCATCTGCCTCACTTTCTTTTCAAAATATGAAAAATGG 39058160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCATCTGCCTCACTTTCTTTTCAAAATATGAAAAATGG 3420

 39058161 CAATATGTTTTCAATTAGAACTACATAAAATAATACACAAAGAATGCTTAGAACCAGAGG 39058220
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAATATGTTTTCAATTAGAACTATATAAAATAATACACAAAGAATGCTTAGAACCAGAGG 3480

 39058221 AATCCTTGTAAAATGATAACCAGAAAAAAAATTCTCAAAATTATAGAATTTGCCAATTTC 39058280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATCCTTGTAAAATGATAACCAGAAAAAAAATTCTCAAAATTATAGAATTTGCCAATTTC 3540

 39058281 TATTGTGCAAATCTTCCCCCTCCCCTGCCCCCAACTCAATTTCAAGCTGCCAATGTGACA 39058340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TATTGTGCAAATCTTCCCCCTCCCCTGCCCCCAACTCAATTTCAAGCTGCCAATGTGACA 3600

 39058341 TCACTGAATTCAGAGGTAGAGATGTGCTAATTGGATCTTTGGAGATGGTATGAGCCAGCT 39058400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCACTGAATTCAGAGGTAGAGATGTGCTAATTGGATCTTTGGAGATGGTATGAGCCAGCT 3660

 39058401 CTAGCACACCGCTGCTTTTAACAGTGCCTTCACATTCAACAAAAAGAAATTATGCCTTCC 39058460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTAGCACACCGCTGCTTTTAACAGTGCCTTCACATTCAACAAAAAGAAATTATGCCTTCC 3720

 39058461 AAGTTTATCCATGTTGTCACATGTGGCAGGATTTTATTCTTTTTAAGGCTTAGTAATATT 39058520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGTTTATCCATGTTGTCACATGTGGCAGGATTTTATTCTTTTTAAGGCTTAGTAATATT 3780

 39058521 TCATCATATATATACACACACACATATATATATGAATATATATGCACACATATATACACA 39058580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCATCATATATATACACACACACATATATATATGAATATATATGCACACATATATACACA 3840

 39058581 TATATATGAAGTATCACATATAAAGTATCTGAAATAGTCAAAGTCAAAGGAACAGAGTAT 39058640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TATATATGAAGTATCACATATAAAGTATCTGAAATAGTCAAAGTCAAAGGAACAGAGTAT 3900

 39058641 AATATACATGTATATGTATATTATGCCTCATTTTCTTTATGTTTTCTTCTGTCAGTGGAC 39058700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AATATACATGTATATGTATATTATGCCTCATTTTCTTTATGTTTTCTTCTGTCAGTGGAC 3960

 39058701 ACAGGTTGATTCCATATTTTAGCTATTGTAAACACAGCTGCAACAAACTTGAGAGTGCAG 39058760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACAGGTTGATTCCATATTTTAGCTATTGTAAACACAGCTGCAACAAACTTGAGAGTGCAG 4020

 39058761 ATATCTCTTTGATATACTGATTTCCTTTCCTTTGGGTATATACCAGGAGTGGGATTGGTG 39058820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATATCTCTTTGATATACTGATTTCCTTTCCTTTGGGTATATACCAGGAGTGGGATTGGTG 4080

 39058821 GATCATATAGTAGCTCTATTTTTAATTTTTTGAGGACCTGCTGTGCTGTTTTTCATACTG 39058880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GATCATATAGTAGCTCTATTTTTAATTTTTTGAGGACCTGCTGTGCTGTTTTTCATACTG 4140

 39058881 GCTGCACCATTATACATTCCCTCCAAGAGTGTACAAGGGTCCCAATTTCTCCACATCCTC 39058940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCTGCACCATTATACATTCCCTCCAAGAGTGTACAAGGGTCCCAATTTCTCCACATCCTC 4200

 39058941 ACTAACATTGTTATGTCTTGCTTTGGATAATAGCTGTCCTAACAGGTATGAAGTACTATC 39059000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACTAACATTGTTATGTCTTGCTTTGGATAATAGCTGTCCTAACAGGTATGAAGTACTATC 4260

 39059001 TCATTACGGTTTTGATTTGCATATGCCAAGTAAAATAAGCCATCCACAAAAGGGCAAATA 39059060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCATTACGGTTTTGATTTGCATATGCCAAGTAAAATAAGCCATCCACAAAAGGGCAAATA 4320

 39059061 GTACATGACTCCATTTATATGAAGTATCTAAAATAGTCAAACTCAAAGGAACAGGGTATA 39059120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTACATGACTCCATTTATATGAAGTATCTAAAATAGTCAAACTCAAAGGAACAGGGTATA 4380

 39059121 ATGGTGGTTGCCGGGGGTTTGGGGTAAGGGGGAAATGGGGCGTTGCTGTTAAATGGGTAG 39059180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATGGTGGTTGCCGGGGGTTTGGGGTAAGGGGGAAATGGGGCGTTGCTGTTAAATGGGTAG 4440

 39059181 CAAATACAGTTAACACAAGATGAGTAAGTTTCAAAGATCTGTTGTACAATATTTTA 39059236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CAAATACAGTTAACACAAGATGAGTAAGTTTCAAAGATCTGTTGTACAATATTTTA 4496

EXCISED REGION

 39059245 TAACAATACTGTATTTTTTAGTTAGAAATTTATTAAAAGAATAAATTGAACTGTGTTAAG 39059304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 TAACAATACTGTATTTTTTAGTTAGAAATTTATTAAAAGAATAAATTGAACTGTGTTAAG 4564

 39059305 TGTTTGTATTATAAATAAATAAATATTAGTAGTAGTCCTACTTTCTTGAAAACTTATAAG 39059364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TGTTTGTATTATAAATAAATAAATATTAGTAGTAGTCCTACTTTCTTGAAAACTTATAAG 4624

 39059365 TAAACGTTGTCTCATCAAAGAGGTCACCATAACAGGCAGATTCTGAAACACTCTTTTAGT 39059424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TAAACGTTGTCTCATCAAAGAGGTCACCATAACAGGCAGATTCTGAAACACTCTTTTAGT 4684

 39059425 CTGCTTTATGCTGCTGTAACAGAATTCCTGAGGCTGAGGAATTTATAATCTACATATATT 39059484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4685 CTGCTTTATGCTGCTGTAACAGAATTCCTGAGACTGAGGAATTTATAATCTACATATATT 4744

 39059485 TATGTGGCTTATGGCTCCGGAGACTGTGAAGTCCAAGATCAAAGGGGTGCATCTGCTGAG 39059544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 TATGTGGCTTATGGCTCCGGAGACTGTGAAGTCCAAGATCAAAGGGGTGCATCTGCTGAG 4804

 39059545 GGCCTTCTTGCTGTGTCATCCCATGGCAGAAGGTAGAAGGGCATGCCAGACAGAGAGAAA 39059604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 GGCCTTCTTGCTGTGTCATCCCATGGCAGAAGGTAGAAGGGCATGCCAGACAGAGAGAAA 4864

 39059605 GTGAGAGAGGAGGAGGTTGAACTCACAACCCCAAGCCCTTTTTTAATCTGCGTTAATCCA 39059664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 GTGAGAGAGGAGGAGGTTGAACTCACAACCCCAAGCCCTTTTTTAATCTGCGTTAATCCA 4924

 39059665 TTCATGAGGGCAAAGCCCTAATGACCTGAATACCTCTCATTAGGCCCCACCTCCCAACAC 39059724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 TTCATGAGGGCAAAGCCCTAATGACCTGAATACCTCTCATTAGGCCCCACCTCCCAACAC 4984

 39059725 TGTTTCAGTACGGATTGGTTCCAACACATGAATT 39059758
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4985 TGTTTCAGTACGGATTGTTTCCAACACATGAATT 5018

Alignment time is 4.48488 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,   10082] =>     10082 nucs 'mol-32-1e7c-219340_10082'

Score:        9920
Aligned:     10074        nucs
Identic:     10060 (100%) nucs =>      8120 (100%)      1940 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39051107,39059236] EXCISED REGION [39059245,39061188]
 second seq =>  [       1,    8130] EXCISED REGION [    8139,   10082]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [39059237,39059244]
 second seq =>         8 nucs [8131,8138]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39059237,39059237] to [39059245,39059245]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [39059235,39059236] to [39059245,39059246]
 second seq =>         2 nucs [8129,8130] to [8139,8140]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39059237,39059237] to [39059244,39059244]
 second seq =>         0 nucs

 39051107 AGGCAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTG 39051166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTG 60

 39051167 CAACCTCCGCCTCCTGGATTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 39051226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAACCTCCGCCTCCTGGATTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 120

 39051227 TACAGACATGTGCCACCACGCTGGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCTC 39051286
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACAGACATGTGCCACCATGCTGGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCTC 180

 39051287 CACGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCC 39051346
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCC 240

 39051347 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAGCACGCCCGGCCACCTTAATGCTAATTTTAA 39051406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAGCACGCCCGGCCACCTTAATGCTAATTTTAA 300

 39051407 TGCTTTATTCCTTATGACAGATGAATTCAGTGATGACATTGATTTCAGTTTCCTATAAAA 39051466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTTTATTCCTTATGACAGATGAATTCAGTGATGACATTGATTTCAGTTTCCTATAAAA 360

 39051467 TGGCATTTGAATAGCAATACATTGGGAAGAACACCTTTATTCAGAAGGATATAAAGGAAA 39051526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGCATTTGAATAGCAATACATTGGGAAGAACACCTTTATTCAGAAGGATATAAAGGAAA 420

 39051527 TAAAGGATATCATCTCCAACAGTAGTTGACACAAATTATCATGTGGACCTTCAACATTTT 39051586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAGGATATCATCTCCAACAGTAGTTGACACAAATTATCATGTGGACCTTCAACATTTT 480

 39051587 TTTAGAAACTATTTGTTTACAAGTATGATTCCCTGCTTCAGAGCTAAAGCACTATCTTAC 39051646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAGAAACTATTTGTTTACAAGTATGATTCCCTGCTTCAGAGCTAAAGCACTATCTTAC 540

 39051647 TTATTTTTATTTCCCAAGTAATAGCAGAATTATTTCCAAATAGAAGGTGTTCAATAAATG 39051706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATTTTTATTTCCCAAGTAATAGCAGAATTATTTCCAAATAGAAGGTGTTCAATAAATG 600

 39051707 TTTAATACATAACATATAATGTTGGCAAATCATAGCAACAAGTTTTGTTAAAGAGACCTG 39051766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTAATACATAACATATAATGTTGGCAAATCATAGCAACAAGTTTTGTTAAAGAGACCTG 660

 39051767 GAGATCTTGACCAAAAAGAATATTCAATAGTTTTATTCATATTTAATTAACAACAATAAA 39051826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGATCTTGACCAAAAAGAATATTCAATAGTTTTATTCATATTTAATTAACAACAATAAA 720

 39051827 AGGAGACACTCTAGTATTAGACAAATTTCATTAGTTGATAATATGAACAAATGTGCAGGT 39051886
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      721 AGGAGACACTCTAGTATTAGACAAATTTCATTAGTTGATAATATGAACAAAAGTGCAGGT 780

 39051887 ATCAACAGTGTGCTCTGCCCAGAGCCCTCAGCATACACCATTTCCCTACCGTCTAGGGCT 39051946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCAACAGTGTGCTCTGCCCAGAGCCCTCAGCATACACCATTTCCCTACCGTCTAGGGCT 840

 39051947 TCCTATTGCAAGCACCTGCAAGTTTGTGCTTGAGGACTTTCAGTGGTCACAAGAGCCTGT 39052006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTATTGCAAGCACCTGCAAGTTTGTGCTTGAGGACTTTCAGTGGTCACAAGAGCCTGT 900

 39052007 CCCACCATGTAACCCATGTAAAGGGCTGCCTGGACGTGCCAGGAATTTATGTCCTTGGGA 39052066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCACCATGTAACCCATGTAAAGGGCTGCCTGGACGTGCCAGGAATTTATGTCCTTGGGA 960

 39052067 GCAGCTAATATGATATGTAGTTGGTAGATACATACCCAGCACCTTCACCCTCATGTATAA 39052126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAGCTAATATGATATGTAGTTGGTAGATACATACCCAGCACCTTCACCCTCATGTATAA 1020

 39052127 ACATAGTCTCCCAGAATTCCTTATCAGAATTGAGCCCCAGGTGCTTACTCTGCCATTGGC 39052186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACATAGTCTCCCAGAATTCCTTATCAGAATTGAGCCCCAGGTGCTTACTCTGCCATTGGC 1080

 39052187 TGGCTTCTCTTTCTCACATTTCTGCTCCCCTACTACTCCCAGAGCTCAAATAAGCTAACT 39052246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGCTTCTCTTTCTCACATTTCTGCTCCCCTACTACTCCCAGAGCTCAAATAAGCTAACT 1140

 39052247 GCATATATATCTTTTTCTCAGTCTGACCTGTTTTATCATACAAAACTATTTTTTCTTTCA 39052306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCATATATATCTTTTTCTCAGTCTGACCTGTTTTATCATACAAAACTATTTTTTCTTTCA 1200

 39052307 GTAAAAATCTAAATTATTTATTTATATTTCATTGTTCTTTCATTCAATATGCATCTACTG 39052366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAAAAATCTAAATTATTTATTTATATTTCATTGTTCTTTCATTCAATATGCATCTACTG 1260

 39052367 TCACCCATCATGTACAGTGAATTCTTGTTAACACTAAAATGTTCTTTTAAATAGGCCATT 39052426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCACCCATCATGTACAGTGAATTCTTGTTAACACTAAAATGTTCTTTTAAATAGGCCATT 1320

 39052427 TTCAAACAGAATTTCTAGCTTTCATAAGAATTTAGGAAATAATTGTTTCAAACAAATTTC 39052486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCAAACAGAATTTCTAGCTTTCATAAGAATTTAGGAAATAATTGTTTCAAACAAATTTC 1380

 39052487 AATTGATTAATTAAGCCTGTTTGTTTTTAGGCCAGAAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAA 39052546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTGATTAATTAAGCCTGTTTGTTTTTAGGCCAGAAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAA 1440

 39052547 AATGGCTTTCATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATA 39052606
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGGCTTTTATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATA 1500

 39052607 CCTACATTATTCATAATATCTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGA 39052666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTACATTATTCATAATATCTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGA 1560

 39052667 AAACAAGAAATACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGT 39052726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAACAAGAAATACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGT 1620

 39052727 AACAGAATTAAAGCTCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTT 39052786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACAGAATTAAAGCTCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTT 1680

 39052787 TCACATGCAAAACCCTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACT 39052846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCACATGCAAAACCCTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACT 1740

 39052847 CTCTAGCACCAAATAGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTT 39052906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCTAGCACCAAATAGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTT 1800

 39052907 ACTTCAAGACATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAA 39052966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTTCAAGACATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAA 1860

 39052967 TTATTTCCTTCTCTAGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGG 39053026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATTTCCTTCTCTAGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGG 1920

 39053027 GGCATCTATTTTCAAAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTC 39053086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCATCTATTTTCAAAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTC 1980

 39053087 ACTTGGGGGAAACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCG 39053146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTTGGGGGAAACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCG 2040

 39053147 GGAATAGTCCAAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACG 39053206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGAATAGTCCAAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACG 2100

 39053207 TGGGTGGAATGGATAACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGT 39053266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGGTGGAATGGATAACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGT 2160

 39053267 ATTATCAGAGAATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATG 39053326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTATCAGAGAATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATG 2220

 39053327 TCCCTAGAAACACATTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGT 39053386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCCTAGAAACACATTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGT 2280

 39053387 TGAATCAAATCAAATTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTT 39053446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGAATCAAATCAAATTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTT 2340

 39053447 TTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAA 39053506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAA 2400

 39053507 GTGCAGTGGCGCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCC 39053566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTGCAGTGGCGCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCC 2460

 39053567 TGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAG 39053626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAG 2520

 39053627 CATAAATCCTGTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTG 39053686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATAAATCCTGTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTG 2580

 39053687 CTGAAGCTAACATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAA 39053746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGAAGCTAACATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAA 2640

 39053747 AAATACTGTCATCACATCAATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAA 39053806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAATACTGTCATCACATCAATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAA 2700

 39053807 ATAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTA 39053866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTA 2760

 39053867 CATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGG 39053926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGG 2820

 39053927 TCTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAG 39053986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAG 2880

 39053987 TTAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAA 39054046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAA 2940

 39054047 TCCTACATATAGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTG 39054106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCCTACATATAGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTG 3000

 39054107 TTTTATATAAGAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTAT 39054166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTATATAAGAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTAT 3060

 39054167 CAACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAAT 39054226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAAT 3120

 39054227 GTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAAT 39054286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAAT 3180

 39054287 GTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTT 39054346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTT 3240

 39054347 AAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTAT 39054406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTAT 3300

 39054407 TCAATTCAATGAACATTATTGATTTCTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTC 39054466
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCAATTCAATGAACATTATTGATTTGTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTC 3360

 39054467 TTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAAC 39054526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAAC 3420

 39054527 TCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGA 39054586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGA 3480

 39054587 GCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGA 39054646
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCCACTGCACCAAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGA 3540

 39054647 ACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAA 39054706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAA 3600

 39054707 AAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTG 39054766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTG 3660

 39054767 TGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCC 39054826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCC 3720

 39054827 ACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTG 39054886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTG 3780

 39054887 GATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGA 39054946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGA 3840

 39054947 GCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTC 39055006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTC 3900

 39055007 TCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATA 39055066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATA 3960

 39055067 TTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTA 39055126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTA 4020

 39055127 GCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGT 39055186
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGT 4080

 39055187 GGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAA 39055246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAA 4140

 39055247 AACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACA 39055306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACA 4200

 39055307 ACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAA 39055366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAA 4260

 39055367 GGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGAC 39055426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGAC 4320

 39055427 TCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTT 39055486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTT 4380

 39055487 GTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGC 39055546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGC 4440

 39055547 TTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCT 39055606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCT 4500

 39055607 TGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTAT 39055666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTAT 4560

 39055667 CTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAA 39055726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAA 4620

 39055727 ATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACA 39055786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACA 4680

 39055787 AGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGC 39055846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGC 4740

 39055847 TATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCC 39055906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCC 4800

 39055907 ACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTT 39055966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTT 4860

 39055967 TCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACA 39056026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACA 4920

 39056027 TTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACA 39056086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACA 4980

 39056087 GAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAAT 39056146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAAT 5040

 39056147 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCT 39056206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCT 5100

 39056207 GGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTG 39056266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTG 5160

 39056267 GTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGG 39056326
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GTGTGCACCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGG 5220

 39056327 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTG 39056386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTG 5280

 39056387 AGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAA 39056446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAA 5340

 39056447 CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGC 39056506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGC 5400

 39056507 TGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTG 39056566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTG 5460

 39056567 GAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAA 39056626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAA 5520

 39056627 TAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGAT 39056686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGAT 5580

 39056687 GAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGT 39056746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGT 5640

 39056747 TAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACT 39056806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACT 5700

 39056807 GGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAA 39056866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5701 GGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGAAGGAGGGTACAAA 5760

 39056867 AATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGT 39056926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGT 5820

 39056927 GGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAAT 39056986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAAT 5880

 39056987 GTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAG 39057046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAG 5940

 39057047 CTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATA 39057106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATA 6000

 39057107 GATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATA 39057166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATA 6060

 39057167 CCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTG 39057226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTG 6120

 39057227 ATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAG 39057286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 ATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAG 6180

 39057287 GGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATT 39057346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATT 6240

 39057347 TATAATTAATTCAGTCATCTAACAAACACTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATT 39057406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TATAATTAATTCAGTCATCTAACAAACACTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATT 6300

 39057407 AAGTGGGATCTCAGATCCCTTTAATCTCCCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAG 39057466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AAGTGGGATCTCAGATCCCTTTAATCTCCCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAG 6360

 39057467 CAGATGAAATAGAAACCATGACTTTCTAACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATA 39057526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CAGATGAAATAGAAACCATGACTTTCTAACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATA 6420

 39057527 CACCTGCTCAAACTTAAGCTTTCAATTTTTAATGAGGAGAATCATGTGACTAATCATCCC 39057586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CACCTGCTCAAACTTAAGCTTTCAATTTTTAATGAGGAGAATCATGTGACTAATCATCCC 6480

 39057587 CTGTCAAAAATTGTCATTTTTGATTCTTATGCTTGCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCC 39057646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CTGTCAAAAATTGTCATTTTTGATTCTTATGCTTGCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCC 6540

 39057647 ATAAATATATTTTGTCCATAATGAAATTTGTCTATAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGA 39057706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 ATAAATATATTTTGTCCATAATGAAATTTGTCTATAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGA 6600

 39057707 GGTTGTGCTTGAATATTTTTGTGGGCCCAGGATTCTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGA 39057766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 GGTTGTGCTTGAATATTTTTGTGGGCCCAGGATTCTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGA 6660

 39057767 GGAATTCCCATACTGGGACAGTTATGAATTGGTATTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAG 39057826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GGAATTCCCATACTGGGACAGTTATGAATTGGTATTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAG 6720

 39057827 GACTACTCTATCTTGTTAACACTTTCAATTTAAGAGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAA 39057886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 GACTACTCTATCTTGTTAACACTTTCAATTTAAGAGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAA 6780

 39057887 GCACCTAAGGCAATCTGGAAGGCTAGAGACTACCTCCTTATTCAGCATAACTAACATTAG 39057946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GCACCTAAGGCAATCTGGAAGGCTAGAGACTACCTCCTTATTCAGCATAACTAACATTAG 6840

 39057947 GCCATATACTGACATCAAAGAGGAAGTGAAAGCTCTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCA 39058006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 GCCATATACTGACATCAAAGAGGAAGTGAAAGCTCTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCA 6900

 39058007 ATTGTGGAGGCAGTGGAATGTAGTGAAAGGTCTGGATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCC 39058066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 ATTGTGGAGGCAGTGGAATGTAGTGAAAGGTCTGGATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCC 6960

 39058067 TGGCTCTACTGGGTAATAACTATGTGACCCTGTCTGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCAT 39058126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TGGCTCTACTGGGTAATAACTATGTGACCCTGTCTGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCAT 7020

 39058127 CTGCCTCACTTTCTTTTCAAAATATGAAAAATGGCAATATGTTTTCAATTAGAACTACAT 39058186
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7021 CTGCCTCACTTTCTTTTCAAAATATGAAAAATGGCAATATGTTTTCAATTAGAACTATAT 7080

 39058187 AAAATAATACACAAAGAATGCTTAGAACCAGAGGAATCCTTGTAAAATGATAACCAGAAA 39058246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 AAAATAATACACAAAGAATGCTTAGAACCAGAGGAATCCTTGTAAAATGATAACCAGAAA 7140

 39058247 AAAAATTCTCAAAATTATAGAATTTGCCAATTTCTATTGTGCAAATCTTCCCCCTCCCCT 39058306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 AAAAATTCTCAAAATTATAGAATTTGCCAATTTCTATTGTGCAAATCTTCCCCCTCCCCT 7200

 39058307 GCCCCCAACTCAATTTCAAGCTGCCAATGTGACATCACTGAATTCAGAGGTAGAGATGTG 39058366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 GCCCCCAACTCAATTTCAAGCTGCCAATGTGACATCACTGAATTCAGAGGTAGAGATGTG 7260

 39058367 CTAATTGGATCTTTGGAGATGGTATGAGCCAGCTCTAGCACACCGCTGCTTTTAACAGTG 39058426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 CTAATTGGATCTTTGGAGATGGTATGAGCCAGCTCTAGCACACCGCTGCTTTTAACAGTG 7320

 39058427 CCTTCACATTCAACAAAAAGAAATTATGCCTTCCAAGTTTATCCATGTTGTCACATGTGG 39058486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CCTTCACATTCAACAAAAAGAAATTATGCCTTCCAAGTTTATCCATGTTGTCACATGTGG 7380

 39058487 CAGGATTTTATTCTTTTTAAGGCTTAGTAATATTTCATCATATATATACACACACACATA 39058546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 CAGGATTTTATTCTTTTTAAGGCTTAGTAATATTTCATCATATATATACACACACACATA 7440

 39058547 TATATATGAATATATATGCACACATATATACACATATATATGAAGTATCACATATAAAGT 39058606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 TATATATGAATATATATGCACACATATATACACATATATATGAAGTATCACATATAAAGT 7500

 39058607 ATCTGAAATAGTCAAAGTCAAAGGAACAGAGTATAATATACATGTATATGTATATTATGC 39058666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 ATCTGAAATAGTCAAAGTCAAAGGAACAGAGTATAATATACATGTATATGTATATTATGC 7560

 39058667 CTCATTTTCTTTATGTTTTCTTCTGTCAGTGGACACAGGTTGATTCCATATTTTAGCTAT 39058726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 CTCATTTTCTTTATGTTTTCTTCTGTCAGTGGACACAGGTTGATTCCATATTTTAGCTAT 7620

 39058727 TGTAAACACAGCTGCAACAAACTTGAGAGTGCAGATATCTCTTTGATATACTGATTTCCT 39058786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 TGTAAACACAGCTGCAACAAACTTGAGAGTGCAGATATCTCTTTGATATACTGATTTCCT 7680

 39058787 TTCCTTTGGGTATATACCAGGAGTGGGATTGGTGGATCATATAGTAGCTCTATTTTTAAT 39058846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 TTCCTTTGGGTATATACCAGGAGTGGGATTGGTGGATCATATAGTAGCTCTATTTTTAAT 7740

 39058847 TTTTTGAGGACCTGCTGTGCTGTTTTTCATACTGGCTGCACCATTATACATTCCCTCCAA 39058906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 TTTTTGAGGACCTGCTGTGCTGTTTTTCATACTGGCTGCACCATTATACATTCCCTCCAA 7800

 39058907 GAGTGTACAAGGGTCCCAATTTCTCCACATCCTCACTAACATTGTTATGTCTTGCTTTGG 39058966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 GAGTGTACAAGGGTCCCAATTTCTCCACATCCTCACTAACATTGTTATGTCTTGCTTTGG 7860

 39058967 ATAATAGCTGTCCTAACAGGTATGAAGTACTATCTCATTACGGTTTTGATTTGCATATGC 39059026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 ATAATAGCTGTCCTAACAGGTATGAAGTACTATCTCATTACGGTTTTGATTTGCATATGC 7920

 39059027 CAAGTAAAATAAGCCATCCACAAAAGGGCAAATAGTACATGACTCCATTTATATGAAGTA 39059086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 CAAGTAAAATAAGCCATCCACAAAAGGGCAAATAGTACATGACTCCATTTATATGAAGTA 7980

 39059087 TCTAAAATAGTCAAACTCAAAGGAACAGGGTATAATGGTGGTTGCCGGGGGTTTGGGGTA 39059146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 TCTAAAATAGTCAAACTCAAAGGAACAGGGTATAATGGTGGTTGCCGGGGGTTTGGGGTA 8040

 39059147 AGGGGGAAATGGGGCGTTGCTGTTAAATGGGTAGCAAATACAGTTAACACAAGATGAGTA 39059206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 AGGGGGAAATGGGGCGTTGCTGTTAAATGGGTAGCAAATACAGTTAACACAAGATGAGTA 8100

 39059207 AGTTTCAAAGATCTGTTGTACAATATTTTA 39059236
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 AGTTTCAAAGATCTGTTGTACAATATTTTA 8130

EXCISED REGION

 39059245 TAACAATACTGTATTTTTTAGTTAGAAATTTATTAAAAGAATAAATTGAACTGTGTTAAG 39059304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8139 TAACAATACTGTATTTTTTAGTTAGAAATTTATTAAAAGAATAAATTGAACTGTGTTAAG 8198

 39059305 TGTTTGTATTATAAATAAATAAATATTAGTAGTAGTCCTACTTTCTTGAAAACTTATAAG 39059364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8199 TGTTTGTATTATAAATAAATAAATATTAGTAGTAGTCCTACTTTCTTGAAAACTTATAAG 8258

 39059365 TAAACGTTGTCTCATCAAAGAGGTCACCATAACAGGCAGATTCTGAAACACTCTTTTAGT 39059424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8259 TAAACGTTGTCTCATCAAAGAGGTCACCATAACAGGCAGATTCTGAAACACTCTTTTAGT 8318

 39059425 CTGCTTTATGCTGCTGTAACAGAATTCCTGAGGCTGAGGAATTTATAATCTACATATATT 39059484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     8319 CTGCTTTATGCTGCTGTAACAGAATTCCTGAGACTGAGGAATTTATAATCTACATATATT 8378

 39059485 TATGTGGCTTATGGCTCCGGAGACTGTGAAGTCCAAGATCAAAGGGGTGCATCTGCTGAG 39059544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8379 TATGTGGCTTATGGCTCCGGAGACTGTGAAGTCCAAGATCAAAGGGGTGCATCTGCTGAG 8438

 39059545 GGCCTTCTTGCTGTGTCATCCCATGGCAGAAGGTAGAAGGGCATGCCAGACAGAGAGAAA 39059604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8439 GGCCTTCTTGCTGTGTCATCCCATGGCAGAAGGTAGAAGGGCATGCCAGACAGAGAGAAA 8498

 39059605 GTGAGAGAGGAGGAGGTTGAACTCACAACCCCAAGCCCTTTTTTAATCTGCGTTAATCCA 39059664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8499 GTGAGAGAGGAGGAGGTTGAACTCACAACCCCAAGCCCTTTTTTAATCTGCGTTAATCCA 8558

 39059665 TTCATGAGGGCAAAGCCCTAATGACCTGAATACCTCTCATTAGGCCCCACCTCCCAACAC 39059724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8559 TTCATGAGGGCAAAGCCCTAATGACCTGAATACCTCTCATTAGGCCCCACCTCCCAACAC 8618

 39059725 TGTTTCAGTACGGATTGGTTCCAACACATGAATTTTGAGGGACACATTCAAACGATAGCA 39059784
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8619 TGTTTCAGTACGGATTGTTTCCAACACATGAATTTTGAGGGACACATTCAAACGATAGCA 8678

 39059785 CTCCTCAAGTTCCTAGCACCTACTTTATGACATCCCCTGGTCAACAAGAGAAAGATGCAT 39059844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
     8679 CTCCTCAAGTTCCTAGCACCTACTTTATGACATCCCCTGGTCAACAAGACAAAGATGCGT 8738

 39059845 CTGTTCTGTAGACCTACTTTTTTCATGCTGTAGTTATTATTTTTCTACTTCGGCTGCTCT 39059904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8739 CTGTTCTGTAGACCTACTTTTTTCATGCTGTAGTTATTATTTTTCTACTTCGGCTGCTCT 8798

 39059905 TATCAAGATCAGGGCAATTAGCAGCAAAAACTTAACCTGCCATGGTGCTATCCATGGTCG 39059964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8799 TATCAAGATCAGGGCAATTAGCAGCAAAAACTTAACCTGCCATGGTGCTATCCATGGTCG 8858

 39059965 GACAAATCTTCAGCTGTTCTTCTTACATATAAGCAACTACTCAGGGACAGAGAATGTGTT 39060024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8859 GACAAATCTTCAGCTGTTCTTCTTACATATAAGCAACTACTCAGGGACAGAGAATGTGTT 8918

 39060025 TGTTGGTTCTAAATTACAGCTTGAGACCTAAACATATATCTTAATAGCTACTCTAGTTTT 39060084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8919 TGTTGGTTCTAAATTACAGCTTGAGACCTAAACATATATCTTAATAGCTACTCTAGTTTT 8978

 39060085 AAAACCAAAAGTGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTGAGTGTTCTCTG 39060144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8979 AAAACCAAAAGTGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTGAGTGTTCTCTG 9038

 39060145 GTTCCAGGTAGCTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAATGAATTTTGGA 39060204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9039 GTTCCAGGTAGCTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAATGAATTTTGGA 9098

 39060205 ACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTAATC 39060264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9099 ACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTAATC 9158

 39060265 AGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTACAAA 39060324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9159 AGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTACAAA 9218

 39060325 ACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAAAAA 39060384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9219 ACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAAAAA 9278

 39060385 GGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTCCCC 39060444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9279 GGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTCCCC 9338

 39060445 AACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAAAAT 39060504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9339 AACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAAAAT 9398

 39060505 ATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACACTTC 39060564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9399 ATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACACTTC 9458

 39060565 TCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATATCCC 39060624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9459 TCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATATCCC 9518

 39060625 TAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAGGAC 39060684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9519 TAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAGGAC 9578

 39060685 ACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCAAAA 39060744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9579 ACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCAAAA 9638

 39060745 AGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACTATC 39060804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9639 AGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACTATC 9698

 39060805 TTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTTGGC 39060864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9699 TTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTTGGC 9758

 39060865 GAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATAAAA 39060924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9759 GAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATAAAA 9818

 39060925 TTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGGCAT 39060984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9819 TTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGGCAT 9878

 39060985 GGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGTCCT 39061044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9879 GGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGTCCT 9938

 39061045 CATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACATAAT 39061104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9939 CATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACATAAT 9998

 39061105 ATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCATGGT 39061164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9999 ATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCATGGT 10058

 39061165 TGAAATATTGTTTTAGACAAGGTG 39061188
          ||||||||||||||||||||||||
    10059 TGAAATATTGTTTTAGACAAGGTG 10082

Alignment time is 8.05869 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3674] =>      3674 nucs 'mol-32-1f21-076101_3674'

Score:        3630
Aligned:      3674        nucs
Identic:      3670 (100%) nucs =>       868 (100%)      2802 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39056447,39057315] EXCISED REGION [39060202,39063005]
 second seq =>  [       1,     869] EXCISED REGION [     870,    3674]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39056447 CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGC 39056506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGC 60

 39056507 TGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTG 39056566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTG 120

 39056567 GAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAA 39056626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAA 180

 39056627 TAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGAT 39056686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGAT 240

 39056687 GAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGT 39056746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGT 300

 39056747 TAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACT 39056806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACT 360

 39056807 GGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAA 39056866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAA 420

 39056867 AATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGT 39056926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGT 480

 39056927 GGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAAT 39056986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAAT 540

 39056987 GTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAG 39057046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAG 600

 39057047 CTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATA 39057106
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATA 660

 39057107 GATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATA 39057166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATA 720

 39057167 CCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTG 39057226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTG 780

 39057227 ATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAG 39057286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAG 840

 39057287 GGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          |||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 869

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 929

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 989

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 1049

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 1109

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 1169

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 1229

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 1289

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 1349

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 1409

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 1469

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 1529

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 1589

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 1649

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 1709

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 1769

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 1829

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 1889

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 1949

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 2009

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 2069

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 2129

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 2189

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 2249

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 2309

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 2369

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 39061761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 2429

 39061762 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 39061821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 2489

 39061822 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 39061881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 2549

 39061882 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 39061941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 2609

 39061942 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 39062001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 2669

 39062002 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 39062061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 2729

 39062062 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 39062121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 2789

 39062122 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 39062181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 2849

 39062182 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 39062241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 2909

 39062242 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 39062301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 2969

 39062302 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 39062361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 3029

 39062362 GCATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 39062421
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 GCATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 3089

 39062422 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGA 39062480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     3090 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGA 3149

 39062481 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 39062540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 3209

 39062541 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 39062600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 3269

 39062601 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 39062660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 3329

 39062661 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 39062720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 3389

 39062721 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 39062780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 3449

 39062781 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 39062840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 3509

 39062841 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 39062900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 3569

 39062901 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 39062960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 3629

 39062961 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCT 39063005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCT 3674

Alignment time is 3.34546 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2826] =>      2826 nucs 'mol-32-206b-100485_2826'

Score:        2814
Aligned:      2825        nucs
Identic:      2824 (100%) nucs =>      2293 (100%)       531 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39060074,39062366] EXCISED REGION [39062368,39062898]
 second seq =>  [       1,    2293] EXCISED REGION [    2295,    2826]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39062367,39062367]
 second seq =>         1 nucs [2294,2294]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2390,2390]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39060074 ACTCTAGTTTTAAAACCAAAAGTGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTG 39060133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCTAGTTTTAAAACCAAAAGTGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTG 60

 39060134 AGTGTTCTCTGGTTCCAGGTAGCTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAA 39060193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGTTCTCTGGTTCCAGGTAGCTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAA 120

 39060194 TGAATTTTGGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTC 39060253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAATTTTGGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTC 180

 39060254 TTATTTTAATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTT 39060313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATTTTAATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTT 240

 39060314 GATATTACAAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAAC 39060373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATATTACAAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAAC 300

 39060374 TATTCCAAAAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAG 39060433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTCCAAAAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAG 360

 39060434 ACACCTTCCCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCA 39060493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACACCTTCCCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCA 420

 39060494 TTTAGCAAAATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGA 39060553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAGCAAAATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGA 480

 39060554 TAGAACACTTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAA 39060613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGAACACTTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAA 540

 39060614 CTAAATATCCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAA 39060673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAAATATCCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAA 600

 39060674 TATTTAAGGACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGA 39060733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTTAAGGACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGA 660

 39060734 TAAACCCAAAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAA 39060793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAACCCAAAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAA 720

 39060794 ATCACACTATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCA 39060853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCACACTATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCA 780

 39060854 TTCAGGTTGGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTT 39060913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAGGTTGGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTT 840

 39060914 AACCTATAAAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCT 39060973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACCTATAAAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCT 900

 39060974 GTTCTAGGCATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAA 39061033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTCTAGGCATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAA 960

 39061034 GTCACTGTCCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAAT 39061093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCACTGTCCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAAT 1020

 39061094 TAATACATAATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGA 39061153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATACATAATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGA 1080

 39061154 TAAATCATGGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGT 39061213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAATCATGGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGT 1140

 39061214 GAGGCAGAGGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGC 39061273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGGCAGAGGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGC 1200

 39061274 ATTGACAAGAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAAC 39061333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTGACAAGAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAAC 1260

 39061334 AGGATTGTGACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCAC 39061393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGATTGTGACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCAC 1320

 39061394 ACTTAGTGGCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCC 39061453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTTAGTGGCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCC 1380

 39061454 AGACACAGCTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGG 39061513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGACACAGCTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGG 1440

 39061514 CCAGGCTGCATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCA 39061573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAGGCTGCATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCA 1500

 39061574 GGTTGTTGAAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTA 39061633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTTGTTGAAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTA 1560

 39061634 GTTCTCAGCTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAAT 39061693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTCTCAGCTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAAT 1620

 39061694 TAACAAAATGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGT 39061753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAACAAAATGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGT 1680

 39061754 CTCTCTTCCAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAA 39061813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTCTTCCAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAA 1740

 39061814 CTTAAGATCAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAAT 39061873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTAAGATCAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAAT 1800

 39061874 ATAATGTAACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTC 39061933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAATGTAACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTC 1860

 39061934 ACTCTTAAGGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCA 39061993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTCTTAAGGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCA 1920

 39061994 TTTTAGCATTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGG 39062053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTAGCATTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGG 1980

 39062054 GAAGTCATTAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGA 39062113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAGTCATTAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGA 2040

 39062114 TTACACTTGCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAA 39062173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTACACTTGCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAA 2100

 39062174 AATTAGGAGGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGAT 39062233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATTAGGAGGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGAT 2160

 39062234 AGCAATGAGTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAA 39062293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCAATGAGTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAA 2220

 39062294 GATATGTATTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATA 39062353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATATGTATTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATA 2280

 39062354 TGCATTTAGCATT 39062366
          |||||||||||||
     2281 TGCATTTAGCATT 2293

EXCISED REGION

 39062368 GTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTATTTGGAA 39062427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTATTTGGAA 2354

 39062428 GAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGAATTTAT 39062486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     2355 GAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGAATTTAT 2414

 39062487 AAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAAATGAGC 39062546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 AAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAAATGAGC 2474

 39062547 AGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAAATTCAG 39062606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 AGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAAATTCAG 2534

 39062607 TGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTTTTTGGA 39062666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 TGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTTTTTGGA 2594

 39062667 TGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCTGAAAGT 39062726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 TGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCTGAAAGT 2654

 39062727 ACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAGAGAGAA 39062786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 ACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAGAGAGAA 2714

 39062787 AAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCATTTGTTG 39062846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 AAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCATTTGTTG 2774

 39062847 AAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGA 39062898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 AAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGA 2826

Alignment time is 2.91604 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2379] =>      2379 nucs 'mol-32-2076-000914_2379'

Score:        2357
Aligned:      2379        nucs
Identic:      2377 (100%) nucs =>      1140 (100%)      1237 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39055141,39056280] EXCISED REGION [39056282,39057520]
 second seq =>  [       1,    1140] EXCISED REGION [    1142,    2379]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39056281,39056281]
 second seq =>         1 nucs [1141,1141]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [39056433,39056433]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [39056281,39056283] to [39056282,39056284]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39055141 AGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACC 39055200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACC 60

 39055201 TGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCT 39055260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCT 120

 39055261 GTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATG 39055320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATG 180

 39055321 AATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAAT 39055380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAAT 240

 39055381 CAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCA 39055440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCA 300

 39055441 TCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTA 39055500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTA 360

 39055501 AATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTG 39055560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTG 420

 39055561 GCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATC 39055620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATC 480

 39055621 CTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGAC 39055680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGAC 540

 39055681 TTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTC 39055740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTC 600

 39055741 ACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGT 39055800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGT 660

 39055801 TTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGC 39055860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGC 720

 39055861 TCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGG 39055920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGG 780

 39055921 CCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGA 39055980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGA 840

 39055981 AGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGA 39056040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGA 900

 39056041 GGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTG 39056100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTG 960

 39056101 TTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 39056160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 1020

 39056161 AGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGA 39056220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGA 1080

 39056221 AACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAG 39056280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAG 1140

EXCISED REGION

 39056282 CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCA 39056341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCA 1201

 39056342 GTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAA 39056401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 GTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAA 1261

 39056402 ACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCT 39056461
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1262 ACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAAC-AAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCT 1320

 39056462 CATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAAT 39056521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAAT 1380

 39056522 TCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCT 39056581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCT 1440

 39056582 TCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTG 39056641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTG 1500

 39056642 GATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACAT 39056701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACAT 1560

 39056702 GATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAA 39056761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAA 1620

 39056762 AATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTA 39056821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTA 1680

 39056822 GCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTT 39056881
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGAAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTT 1740

 39056882 CCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAA 39056941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAA 1800

 39056942 CAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCA 39057001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCA 1860

 39057002 AAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTAT 39057061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTAT 1920

 39057062 ACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATT 39057121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATT 1980

 39057122 ATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATA 39057181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATA 2040

 39057182 ATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAA 39057241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAA 2100

 39057242 TTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAA 39057301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAA 2160

 39057302 CATGCCATCTTTGAGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATTTATAATTAATTCAGT 39057361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATGCCATCTTTGAGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATTTATAATTAATTCAGT 2220

 39057362 CATCTAACAAACACTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTAAGTGGGATCTCAGA 39057421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATCTAACAAACACTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTAAGTGGGATCTCAGA 2280

 39057422 TCCCTTTAATCTCCCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGCAGATGAAATAGAAA 39057481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCCTTTAATCTCCCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGCAGATGAAATAGAAA 2340

 39057482 CCATGACTTTCTAACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACC 39057520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCATGACTTTCTAACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACC 2379

Alignment time is 1.95832 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    7486] =>      7486 nucs 'mol-32-2874-097895_7486'

Score:        7354
Aligned:      7486        nucs
Identic:      7474 (100%) nucs =>       148 (100%)      7326 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39050719,39050866] EXCISED REGION [39050868,39058205]
 second seq =>  [       1,     148] EXCISED REGION [     150,    7486]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39050867,39050867]
 second seq =>         1 nucs [149,149]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [39056433,39056433]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [149,149] to [150,150]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39050719 TTTATTTATTTATTTATTTTGAGACGAATTTTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGT 39050778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTATTTATTTATTTATTTTGAGACGAATTTTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGT 60

 39050779 GGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCCCGGGGTTCAAGCAATTCTGCCTCAGTCT 39050838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCCCGGGGTTCAAGCAATTCTGCCTCAGTCT 120

 39050839 CCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCACCTG 39050866
          ||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCACCTG 148

EXCISED REGION

 39050868 CACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAG 39050927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      150 CACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAG 209

 39050928 GCTGGTCTCAAACTCCTGACTTCAGTTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 39050987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      210 GCTGGTCTCAAACTCCTGACTTCAGTTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 269

 39050988 ATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCTGATGAAAAGTCACATCTTTTTATTTAATCCTTCAC 39051047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      270 ATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCTGATGAAAAGTCACATCTTTTTATTTAATCCTTCAC 329

 39051048 AGAGACAGAAAATCATATCTTTATAGAAATACATTTATGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGA 39051107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      330 AGAGACAGAAAATCATATCTTTATAGAAATACATTTATGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGA 389

 39051108 GGCAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGC 39051167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      390 GGCAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGC 449

 39051168 AACCTCCGCCTCCTGGATTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 39051227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      450 AACCTCCGCCTCCTGGATTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 509

 39051228 ACAGACATGTGCCACCACGCTGGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCTCC 39051287
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 ACAGACATGTGCCACCATGCTGGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCTCC 569

 39051288 ACGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCC 39051347
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCC 629

 39051348 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAGCACGCCCGGCCACCTTAATGCTAATTTTAAT 39051407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAGCACGCCCGGCCACCTTAATGCTAATTTTAAT 689

 39051408 GCTTTATTCCTTATGACAGATGAATTCAGTGATGACATTGATTTCAGTTTCCTATAAAAT 39051467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 GCTTTATTCCTTATGACAGATGAATTCAGTGATGACATTGATTTCAGTTTCCTATAAAAT 749

 39051468 GGCATTTGAATAGCAATACATTGGGAAGAACACCTTTATTCAGAAGGATATAAAGGAAAT 39051527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 GGCATTTGAATAGCAATACATTGGGAAGAACACCTTTATTCAGAAGGATATAAAGGAAAT 809

 39051528 AAAGGATATCATCTCCAACAGTAGTTGACACAAATTATCATGTGGACCTTCAACATTTTT 39051587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 AAAGGATATCATCTCCAACAGTAGTTGACACAAATTATCATGTGGACCTTCAACATTTTT 869

 39051588 TTAGAAACTATTTGTTTACAAGTATGATTCCCTGCTTCAGAGCTAAAGCACTATCTTACT 39051647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TTAGAAACTATTTGTTTACAAGTATGATTCCCTGCTTCAGAGCTAAAGCACTATCTTACT 929

 39051648 TATTTTTATTTCCCAAGTAATAGCAGAATTATTTCCAAATAGAAGGTGTTCAATAAATGT 39051707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 TATTTTTATTTCCCAAGTAATAGCAGAATTATTTCCAAATAGAAGGTGTTCAATAAATGT 989

 39051708 TTAATACATAACATATAATGTTGGCAAATCATAGCAACAAGTTTTGTTAAAGAGACCTGG 39051767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 TTAATACATAACATATAATGTTGGCAAATCATAGCAACAAGTTTTGTTAAAGAGACCTGG 1049

 39051768 AGATCTTGACCAAAAAGAATATTCAATAGTTTTATTCATATTTAATTAACAACAATAAAA 39051827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 AGATCTTGACCAAAAAGAATATTCAATAGTTTTATTCATATTTAATTAACAACAATAAAA 1109

 39051828 GGAGACACTCTAGTATTAGACAAATTTCATTAGTTGATAATATGAACAAATGTGCAGGTA 39051887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1110 GGAGACACTCTAGTATTAGACAAATTTCATTAGTTGATAATATGAACAAAAGTGCAGGTA 1169

 39051888 TCAACAGTGTGCTCTGCCCAGAGCCCTCAGCATACACCATTTCCCTACCGTCTAGGGCTT 39051947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 TCAACAGTGTGCTCTGCCCAGAGCCCTCAGCATACACCATTTCCCTACCGTCTAGGGCTT 1229

 39051948 CCTATTGCAAGCACCTGCAAGTTTGTGCTTGAGGACTTTCAGTGGTCACAAGAGCCTGTC 39052007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 CCTATTGCAAGCACCTGCAAGTTTGTGCTTGAGGACTTTCAGTGGTCACAAGAGCCTGTC 1289

 39052008 CCACCATGTAACCCATGTAAAGGGCTGCCTGGACGTGCCAGGAATTTATGTCCTTGGGAG 39052067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CCACCATGTAACCCATGTAAAGGGCTGCCTGGACGTGCCAGGAATTTATGTCCTTGGGAG 1349

 39052068 CAGCTAATATGATATGTAGTTGGTAGATACATACCCAGCACCTTCACCCTCATGTATAAA 39052127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 CAGCTAATATGATATGTAGTTGGTAGATACATACCCAGCACCTTCACCCTCATGTATAAA 1409

 39052128 CATAGTCTCCCAGAATTCCTTATCAGAATTGAGCCCCAGGTGCTTACTCTGCCATTGGCT 39052187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 CATAGTCTCCCAGAATTCCTTATCAGAATTGAGCCCCAGGTGCTTACTCTGCCATTGGCT 1469

 39052188 GGCTTCTCTTTCTCACATTTCTGCTCCCCTACTACTCCCAGAGCTCAAATAAGCTAACTG 39052247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 GGCTTCTCTTTCTCACATTTCTGCTCCCCTACTACTCCCAGAGCTCAAATAAGCTAACTG 1529

 39052248 CATATATATCTTTTTCTCAGTCTGACCTGTTTTATCATACAAAACTATTTTTTCTTTCAG 39052307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 CATATATATCTTTTTCTCAGTCTGACCTGTTTTATCATACAAAACTATTTTTTCTTTCAG 1589

 39052308 TAAAAATCTAAATTATTTATTTATATTTCATTGTTCTTTCATTCAATATGCATCTACTGT 39052367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TAAAAATCTAAATTATTTATTTATATTTCATTGTTCTTTCATTCAATATGCATCTACTGT 1649

 39052368 CACCCATCATGTACAGTGAATTCTTGTTAACACTAAAATGTTCTTTTAAATAGGCCATTT 39052427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 CACCCATCATGTACAGTGAATTCTTGTTAACACTAAAATGTTCTTTTAAATAGGCCATTT 1709

 39052428 TCAAACAGAATTTCTAGCTTTCATAAGAATTTAGGAAATAATTGTTTCAAACAAATTTCA 39052487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TCAAACAGAATTTCTAGCTTTCATAAGAATTTAGGAAATAATTGTTTCAAACAAATTTCA 1769

 39052488 ATTGATTAATTAAGCCTGTTTGTTTTTAGGCCAGAAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAA 39052547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 ATTGATTAATTAAGCCTGTTTGTTTTTAGGCCAGAAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAA 1829

 39052548 ATGGCTTTCATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATAC 39052607
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 ATGGCTTTTATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATAC 1889

 39052608 CTACATTATTCATAATATCTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAA 39052667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CTACATTATTCATAATATCTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAA 1949

 39052668 AACAAGAAATACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTA 39052727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AACAAGAAATACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTA 2009

 39052728 ACAGAATTAAAGCTCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTT 39052787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 ACAGAATTAAAGCTCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTT 2069

 39052788 CACATGCAAAACCCTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTC 39052847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 CACATGCAAAACCCTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTC 2129

 39052848 TCTAGCACCAAATAGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTA 39052907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 TCTAGCACCAAATAGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTA 2189

 39052908 CTTCAAGACATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAAT 39052967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 CTTCAAGACATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAAT 2249

 39052968 TATTTCCTTCTCTAGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGG 39053027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TATTTCCTTCTCTAGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGG 2309

 39053028 GCATCTATTTTCAAAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCA 39053087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 GCATCTATTTTCAAAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCA 2369

 39053088 CTTGGGGGAAACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGG 39053147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 CTTGGGGGAAACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGG 2429

 39053148 GAATAGTCCAAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGT 39053207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 GAATAGTCCAAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGT 2489

 39053208 GGGTGGAATGGATAACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTA 39053267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 GGGTGGAATGGATAACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTA 2549

 39053268 TTATCAGAGAATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGT 39053327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TTATCAGAGAATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGT 2609

 39053328 CCCTAGAAACACATTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTT 39053387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 CCCTAGAAACACATTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTT 2669

 39053388 GAATCAAATCAAATTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTT 39053447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 GAATCAAATCAAATTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTT 2729

 39053448 TTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAG 39053507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAG 2789

 39053508 TGCAGTGGCGCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCT 39053567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 TGCAGTGGCGCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCT 2849

 39053568 GCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGC 39053627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGC 2909

 39053628 ATAAATCCTGTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGC 39053687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 ATAAATCCTGTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGC 2969

 39053688 TGAAGCTAACATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAA 39053747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 TGAAGCTAACATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAA 3029

 39053748 AATACTGTCATCACATCAATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAA 39053807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 AATACTGTCATCACATCAATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAA 3089

 39053808 TAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTAC 39053867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 TAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTAC 3149

 39053868 ATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGT 39053927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 ATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGT 3209

 39053928 CTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGT 39053987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 CTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGT 3269

 39053988 TAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAAT 39054047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 TAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAAT 3329

 39054048 CCTACATATAGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGT 39054107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 CCTACATATAGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGT 3389

 39054108 TTTATATAAGAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATC 39054167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 TTTATATAAGAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATC 3449

 39054168 AACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATG 39054227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 AACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATG 3509

 39054228 TTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATG 39054287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 TTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATG 3569

 39054288 TATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTA 39054347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 TATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTA 3629

 39054348 AAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATT 39054407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 AAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATT 3689

 39054408 CAATTCAATGAACATTATTGATTTCTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCT 39054467
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 CAATTCAATGAACATTATTGATTTGTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCT 3749

 39054468 TACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACT 39054527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 TACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACT 3809

 39054528 CTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAG 39054587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 CTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAG 3869

 39054588 CCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAA 39054647
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 CCACTGCACCAAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAA 3929

 39054648 CTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAA 39054707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 CTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAA 3989

 39054708 AGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGT 39054767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 AGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGT 4049

 39054768 GGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCA 39054827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 GGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCA 4109

 39054828 CCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGG 39054887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 CCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGG 4169

 39054888 ATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAG 39054947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 ATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAG 4229

 39054948 CTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCT 39055007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 CTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCT 4289

 39055008 CACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATAT 39055067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 CACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATAT 4349

 39055068 TCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAG 39055127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 TCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAG 4409

 39055128 CCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTG 39055187
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 ACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTG 4469

 39055188 GTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAA 39055247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 GTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAA 4529

 39055248 ACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAA 39055307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 ACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAA 4589

 39055308 CTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAG 39055367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 CTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAG 4649

 39055368 GAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACT 39055427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 GAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACT 4709

 39055428 CAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTG 39055487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 CAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTG 4769

 39055488 TTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCT 39055547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 TTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCT 4829

 39055548 TCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTT 39055607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 TCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTT 4889

 39055608 GCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATC 39055667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 GCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATC 4949

 39055668 TATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAA 39055727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 TATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAA 5009

 39055728 TACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAA 39055787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 TACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAA 5069

 39055788 GACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCT 39055847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 GACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCT 5129

 39055848 ATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCA 39055907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 ATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCA 5189

 39055908 CCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTT 39055967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5190 CCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTT 5249

 39055968 CAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACAT 39056027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 CAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACAT 5309

 39056028 TGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAG 39056087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 TGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAG 5369

 39056088 AGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATC 39056147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 AGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATC 5429

 39056148 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTG 39056207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTG 5489

 39056208 GCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGG 39056267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 GCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGG 5549

 39056268 TGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGG 39056327
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 TGTGCACCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGG 5609

 39056328 AGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGA 39056387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 AGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGA 5669

 39056388 GACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAAC 39056447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     5670 GACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAAC-AAAAAAAAAAAAAC 5728

 39056448 AAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCT 39056507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 AAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCT 5788

 39056508 GGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGG 39056567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 GGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGG 5848

 39056568 AAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAAT 39056627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 AAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAAT 5908

 39056628 AATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATG 39056687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 AATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATG 5968

 39056688 AGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTT 39056747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 AGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTT 6028

 39056748 AATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTG 39056807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6029 AATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTG 6088

 39056808 GGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAA 39056867
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6089 GGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGAAGGAGGGTACAAAA 6148

 39056868 ATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTG 39056927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6149 ATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTG 6208

 39056928 GACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATG 39056987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6209 GACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATG 6268

 39056988 TCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGC 39057047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6269 TCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGC 6328

 39057048 TTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAG 39057107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6329 TTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAG 6388

 39057108 ATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATAC 39057167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6389 ATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATAC 6448

 39057168 CCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGA 39057227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6449 CCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGA 6508

 39057228 TTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGG 39057287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6509 TTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGG 6568

 39057288 GCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATTT 39057347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6569 GCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATTT 6628

 39057348 ATAATTAATTCAGTCATCTAACAAACACTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTA 39057407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6629 ATAATTAATTCAGTCATCTAACAAACACTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTA 6688

 39057408 AGTGGGATCTCAGATCCCTTTAATCTCCCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGC 39057467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6689 AGTGGGATCTCAGATCCCTTTAATCTCCCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGC 6748

 39057468 AGATGAAATAGAAACCATGACTTTCTAACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATAC 39057527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6749 AGATGAAATAGAAACCATGACTTTCTAACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATAC 6808

 39057528 ACCTGCTCAAACTTAAGCTTTCAATTTTTAATGAGGAGAATCATGTGACTAATCATCCCC 39057587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6809 ACCTGCTCAAACTTAAGCTTTCAATTTTTAATGAGGAGAATCATGTGACTAATCATCCCC 6868

 39057588 TGTCAAAAATTGTCATTTTTGATTCTTATGCTTGCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCCA 39057647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6869 TGTCAAAAATTGTCATTTTTGATTCTTATGCTTGCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCCA 6928

 39057648 TAAATATATTTTGTCCATAATGAAATTTGTCTATAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGAG 39057707
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6929 TAAATATAGTTTGTCCATAATGAAATTTGTCTATAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGAG 6988

 39057708 GTTGTGCTTGAATATTTTTGTGGGCCCAGGATTCTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGAG 39057767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6989 GTTGTGCTTGAATATTTTTGTGGGCCCAGGATTCTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGAG 7048

 39057768 GAATTCCCATACTGGGACAGTTATGAATTGGTATTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAGG 39057827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7049 GAATTCCCATACTGGGACAGTTATGAATTGGTATTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAGG 7108

 39057828 ACTACTCTATCTTGTTAACACTTTCAATTTAAGAGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAAG 39057887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7109 ACTACTCTATCTTGTTAACACTTTCAATTTAAGAGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAAG 7168

 39057888 CACCTAAGGCAATCTGGAAGGCTAGAGACTACCTCCTTATTCAGCATAACTAACATTAGG 39057947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7169 CACCTAAGGCAATCTGGAAGGCTAGAGACTACCTCCTTATTCAGCATAACTAACATTAGG 7228

 39057948 CCATATACTGACATCAAAGAGGAAGTGAAAGCTCTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCAA 39058007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7229 CCATATACTGACATCAAAGAGGAAGTGAAAGCTCTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCAA 7288

 39058008 TTGTGGAGGCAGTGGAATGTAGTGAAAGGTCTGGATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCCT 39058067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7289 TTGTGGAGGCAGTGGAATGTAGTGAAAGGTCTGGATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCCT 7348

 39058068 GGCTCTACTGGGTAATAACTATGTGACCCTGTCTGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCATC 39058127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7349 GGCTCTACTGGGTAATAACTATGTGACCCTGTCTGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCATC 7408

 39058128 TGCCTCACTTTCTTTTCAAAATATGAAAAATGGCAATATGTTTTCAATTAGAACTACATA 39058187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7409 TGCCTCACTTTCTTTTCAAAATATGAAAAATGGCAATATGTTTTCAATTAGAACTATATA 7468

 39058188 AAATAATACACAAAGAAT 39058205
          ||||||||||||||||||
     7469 AAATAATACACAAAGAAT 7486

Alignment time is 6.54711 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4631] =>      4631 nucs 'mol-32-287f-026010_4631'

Score:        4566
Aligned:      4632        nucs
Identic:      4626 (100%) nucs =>      3099 (100%)      1527 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054212,39057315] EXCISED REGION [39060202,39061729]
 second seq =>  [       1,    3103] EXCISED REGION [    3104,    4631]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054212 ATATGCTTTTATAATGTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGAT 39054271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGCTTTTATAATGTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGAT 60

 39054272 TATCTGGATTTTAATGTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTT 39054331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTGGATTTTAATGTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTT 120

 39054332 TAAATTTATTTTCTTAAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCA 39054391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAATTTATTTTCTTAAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCA 180

 39054392 TTATAGACATTTTATTCAATTCAATGAACATTATTGATTTCTAATTAATTAATTAAATTT 39054451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      181 TTATAGACATTTTATTCAATTCAATGAACATTATTGATTTGTAATTAATTAATTAAATTT 240

 39054452 ATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTC 39054511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTC 300

 39054512 ACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTG 39054571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTG 360

 39054572 AGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATT 39054631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATT 420

 39054632 GAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCT 39054691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCT 480

 39054692 TTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCT 39054751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCT 540

 39054752 AGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTT 39054811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTT 600

 39054812 ATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTA 39054871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTA 660

 39054872 GAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAA 39054931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAA 720

 39054932 AGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCC 39054991
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGAAGATCAGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCC 780

 39054992 TATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTT 39055051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTT 840

 39055052 TGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGT 39055111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGT 900

 39055112 GATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTT 39055171
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATACTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTT 960

 39055172 GTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGG 39055231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGG 1020

 39055232 GAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGG 39055291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGG 1080

 39055292 GACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTC 39055351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTC 1140

 39055352 AGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGA 39055411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGA 1200

 39055412 CCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGA 39055471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGA 1260

 39055472 TAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGA 39055531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGA 1320

 39055532 GGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTC 39055591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTC 1380

 39055592 TGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTT 39055651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTT 1440

 39055652 TTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGAT 39055711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGAT 1500

 39055712 TCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTA 39055771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTA 1560

 39055772 GCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCC 39055831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCC 1620

 39055832 TTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAG 39055891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAG 1680

 39055892 ACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTG 39055951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTG 1740

 39055952 TGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTG 39056011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTG 1800

 39056012 CTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCC 39056071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCC 1860

 39056072 AATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTG 39056131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTG 1920

 39056132 GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGA 39056191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGA 1980

 39056192 GTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAAT 39056251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAAT 2040

 39056252 TAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGG 39056311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGG 2100

 39056312 ATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAG 39056371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAG 2160

 39056372 CCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAA 39056431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAA 2220

 39056432 CAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAA 39056491
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAAAAAAAAAAAA-CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAA 2279

 39056492 ATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAA 39056551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAA 2339

 39056552 TTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTA 39056611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTA 2399

 39056612 AGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTA 39056671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTA 2459

 39056672 TTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGC 39056731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGC 2519

 39056732 TGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATG 39056791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATG 2579

 39056792 TTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCAT 39056851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCAT 2639

 39056852 GGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATT 39056911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATT 2699

 39056912 ATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTAT 39056971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTAT 2759

 39056972 CTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACA 39057031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACA 2819

 39057032 GTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCAT 39057091
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GTAAATATCCATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCAT 2879

 39057092 TGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAAT 39057151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAAT 2939

 39057152 TCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCA 39057211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCA 2999

 39057212 GAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATA 39057271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATA 3059

 39057272 TGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 3103

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 3163

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 3223

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 3283

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 3343

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 3403

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 3463

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 3523

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 3583

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 3643

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 3703

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 3763

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 3823

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 3883

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 3943

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 4003

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 4063

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 4123

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 4183

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 4243

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 4303

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 4363

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 4423

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 4483

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 4543

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 4603

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGA 39061729
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4604 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGA 4631

Alignment time is 3.73442 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8323] =>      8323 nucs 'mol-32-2895-024259_8323'

Score:        8104
Aligned:      8324        nucs
Identic:      8304 (100%) nucs =>      2506 (100%)      5798 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054805,39057315] EXCISED REGION [39060202,39066012]
 second seq =>  [       1,    2510] EXCISED REGION [    2511,    8323]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054805 ACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGC 39054864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGC 60

 39054865 ATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATT 39054924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATT 120

 39054925 AATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATG 39054984
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCAAAAGGAAGATCAGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATG 180

 39054985 TGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTG 39055044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTG 240

 39055045 GAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAAT 39055104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAAT 300

 39055105 AAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTAC 39055164
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTAC 360

 39055165 AGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAG 39055224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAG 420

 39055225 GACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAA 39055284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAA 480

 39055285 TGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACT 39055344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACT 540

 39055345 GAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCT 39055404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCT 600

 39055405 GGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAAC 39055464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAAC 660

 39055465 TGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAG 39055524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAG 720

 39055525 CAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAG 39055584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAG 780

 39055585 GACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATT 39055644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATT 840

 39055645 AGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTA 39055704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTA 900

 39055705 AAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAG 39055764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAG 960

 39055765 ACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGAC 39055824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGAC 1020

 39055825 AACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAA 39055884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAA 1080

 39055885 ACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCT 39055944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCT 1140

 39055945 GGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGC 39056004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGC 1200

 39056005 AGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGA 39056064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGA 1260

 39056065 AATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGG 39056124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGG 1320

 39056125 CGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAG 39056184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAG 1380

 39056185 GTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACA 39056244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACA 1440

 39056245 AAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 39056304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1441 AAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCTGCTACTCAGGAGGCTGAGG 1500

 39056305 CAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGC 39056364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGC 1560

 39056365 ACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAAC 39056424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAAC 1620

 39056425 AAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAA 39056484
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAACCAACAAAAAAAAAAAAA-CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAA 1679

 39056485 GTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAG 39056544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAG 1739

 39056545 TCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTT 39056604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTT 1799

 39056605 TTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATC 39056664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATC 1859

 39056665 ATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGT 39056724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGT 1919

 39056725 TGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAA 39056784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAA 1979

 39056785 ACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAA 39056844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAA 2039

 39056845 CCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTT 39056904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTT 2099

 39056905 CTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAG 39056964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAG 2159

 39056965 ATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGG 39057024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGG 2219

 39057025 GAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATT 39057084
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GAACACAGTAAATATCCATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATT 2279

 39057085 ACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTAT 39057144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTAT 2339

 39057145 CTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCAT 39057204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCAT 2399

 39057205 ACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCC 39057264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCC 2459

 39057265 TATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 2510

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 2570

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 2630

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAGGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 2690

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 2750

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 2810

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 2870

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 2930

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 2990

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 3050

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 3110

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 3170

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 3230

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 3290

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 3350

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 3410

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 3470

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 3530

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 3590

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 3650

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 3710

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 3770

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 3830

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 3890

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 3950

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 4010

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 39061761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 4070

 39061762 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 39061821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 4130

 39061822 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 39061881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 4190

 39061882 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 39061941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 4250

 39061942 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 39062001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 4310

 39062002 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 39062061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 4370

 39062062 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 39062121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 4430

 39062122 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 39062181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 4490

 39062182 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 39062241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 4550

 39062242 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 39062301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 4610

 39062302 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 39062361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 4670

 39062362 GCATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 39062421
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 GCATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 4730

 39062422 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGA 39062480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     4731 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGA 4790

 39062481 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 39062540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 4850

 39062541 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 39062600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 4910

 39062601 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 39062660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 4970

 39062661 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 39062720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 5030

 39062721 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 39062780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 5090

 39062781 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 39062840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 5150

 39062841 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 39062900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 5210

 39062901 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 39062960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 5270

 39062961 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 39063020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 5330

 39063021 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 39063080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 5390

 39063081 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 39063140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 5450

 39063141 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 39063200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 5510

 39063201 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAATTGAAGGGAGGGATGAGGTTCTA 39063260
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
     5511 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAACTGAAGGGAAGGATGAGGTTCTA 5570

 39063261 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 39063320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 5630

 39063321 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 39063380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 5690

 39063381 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 39063440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 5750

 39063441 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 39063500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 5810

 39063501 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 39063560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 5870

 39063561 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 39063620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 5930

 39063621 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 39063680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 5990

 39063681 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 39063740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 6050

 39063741 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 39063800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6051 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 6110

 39063801 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 39063860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 6170

 39063861 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 39063920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 6230

 39063921 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 39063980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 6290

 39063981 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 39064040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 6350

 39064041 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 39064100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 6410

 39064101 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 39064160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 6470

 39064161 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 39064220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 6530

 39064221 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 39064280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 6590

 39064281 GTTTTT-TGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 39064339
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 GTTTTTCTGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 6650

 39064340 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 39064399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 6710

 39064400 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 39064459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 6770

 39064460 CCCACACTTAAGTGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAA 39064519
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 CCCACACTTAAGGGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAA 6830

 39064520 TTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATA 39064579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 TTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATA 6890

 39064580 CCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAA 39064639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 CCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAA 6950

 39064640 TGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGTTCTCTTTCAAAT 39064699
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6951 TGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGATCTCTTTCAAAT 7010

 39064700 GACTCCTGTGTCCTTTTTACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTT 39064759
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 GACTCCTGTGTCCTTTTGACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTT 7070

 39064760 CTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCA 39064819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 CTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCA 7130

 39064820 TCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTG 39064879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7131 TCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTG 7190

 39064880 TGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGA 39064939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7191 TGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGA 7250

 39064940 GAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCT 39064999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 GAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCT 7310

 39065000 CTACATGTATCTTCCTGTATGTATGCAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCGAG 39065059
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7311 CTACATGTATCTTCCTGTATGTATACAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCCAG 7370

 39065060 GTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCA 39065119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 GTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCA 7430

 39065120 TTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGT 39065179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 TTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGT 7490

 39065180 ACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAG 39065239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 ACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAG 7550

 39065240 TACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGAT 39065299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 TACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGAT 7610

 39065300 TTACTTGGGTAAGCATCTTTTGCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTAT 39065359
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 TTACTTGGGTAAGCATCTTTTCCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTAT 7670

 39065360 TTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCC 39065419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 TTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCC 7730

 39065420 TTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATG 39065479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 TTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATG 7790

 39065480 ATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAAT 39065539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 ATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAAT 7850

 39065540 TAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACT 39065599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 TAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACT 7910

 39065600 AGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTG 39065659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 AGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTG 7970

 39065660 AACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCAT 39065719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 AACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCAT 8030

 39065720 TCTGTCAATATGATACATGATATTAATTTATTTGTGAAAGTTGGAAGCAATATTGCATTC 39065779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8031 TCTGTCAATATGATACATGATATTAATTTATTTGTGAAAGTTGGAAGCAATATTGCATTC 8090

 39065780 CTGGAATAAACCATTTGGTTTTGATGTATTAACCTTTTTGTATATTGCTGGATTCAATCT 39065839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 CTGGAATAAACCATTTGGTTTTGATGTATTAACCTTTTTGTATATTGCTGGATTCAATCT 8150

 39065840 GCTACTATTTGATTAACGATGGCATCTTCATTTATAAGACATGTCGGTCTGTAGTTTTAT 39065899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     8151 GCTACTATTTGATTAACGATGGCATCTTCATTTATAAGACATGTTGGTCTGTAGTTTTAT 8210

 39065900 TTTCTTGCAGTGCCTTATGTTGACATTAAGGTAATGTTAGTTTAATAAAATGAGATAAGA 39065959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8211 TTTCTTGCAGTGCCTTATGTTGACATTAAGGTAATGTTAGTTTAATAAAATGAGATAAGA 8270

 39065960 AGTGTTCTTTCTATTTCTACATTATGGAGAAATTGTAGAAAATCAGTATAATT 39066012
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     8271 AGTGTTCTTTCTATTTCTACATTATGGGGAAATTGTAGAAAATCAGTATAATT 8323

Alignment time is 6.97063 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2514] =>      2514 nucs 'mol-32-2895-024259_2514'

Score:        2470
Aligned:      2514        nucs
Identic:      2510 (100%) nucs =>       136 (100%)      2374 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054805,39054940] EXCISED REGION [39054942,39057319]
 second seq =>  [       1,     136] EXCISED REGION [     138,    2514]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39054941,39054941]
 second seq =>         1 nucs [137,137]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [39056433,39056433]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39054941,39054941] to [39054942,39054942]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054805 ACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGC 39054864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGC 60

 39054865 ATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATT 39054924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATT 120

 39054925 AATCAAAAGGAAGATC 39054940
          ||||||||||||||||
      121 AATCAAAAGGAAGATC 136

EXCISED REGION

 39054942 GCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGG 39055001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      138 GCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGG 197

 39055002 TCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAA 39055061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      198 TCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAA 257

 39055062 GAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAG 39055121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      258 GAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAG 317

 39055122 TCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGA 39055181
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      318 TCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGA 377

 39055182 TTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTC 39055241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 TTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTC 437

 39055242 TAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATC 39055301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 TAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATC 497

 39055302 ATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCT 39055361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 ATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCT 557

 39055362 TCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAG 39055421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 TCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAG 617

 39055422 ACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGA 39055481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 ACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGA 677

 39055482 ATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGT 39055541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 ATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGT 737

 39055542 GGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGAT 39055601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 GGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGAT 797

 39055602 GGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTT 39055661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 GGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTT 857

 39055662 GCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTT 39055721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 GCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTT 917

 39055722 ATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAG 39055781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 ATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAG 977

 39055782 GGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCA 39055841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 GGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCA 1037

 39055842 GCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTT 39055901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 GCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTT 1097

 39055902 GTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTG 39055961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 GTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTG 1157

 39055962 AACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTT 39056021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 AACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTT 1217

 39056022 TTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGT 39056081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 TTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGT 1277

 39056082 GTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCT 39056141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 GTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCT 1337

 39056142 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACC 39056201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACC 1397

 39056202 ATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGG 39056261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 ATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGG 1457

 39056262 TGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAA 39056321
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 TGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCTGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAA 1517

 39056322 CCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACG 39056381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 CCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACG 1577

 39056382 GAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAA 39056441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     1578 GAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAAC-AAAAAAAA 1636

 39056442 AAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGG 39056501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 AAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGG 1696

 39056502 CAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTC 39056561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 CAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTC 1756

 39056562 AGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAA 39056621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 AGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAA 1816

 39056622 CTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGAT 39056681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 CTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGAT 1876

 39056682 TGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTA 39056741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 TGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTA 1936

 39056742 AATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAG 39056801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 AATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAG 1996

 39056802 CAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGT 39056861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 CAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGT 2056

 39056862 ACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTT 39056921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 ACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTT 2116

 39056922 ACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAA 39056981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 ACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAA 2176

 39056982 TTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCC 39057041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCC 2236

 39057042 ATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAA 39057101
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 ATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAA 2296

 39057102 AAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACC 39057161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 AAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACC 2356

 39057162 ATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTAT 39057221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 ATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTAT 2416

 39057222 AGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGA 39057281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 AGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGA 2476

 39057282 ATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAA 39057319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 ATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAA 2514

Alignment time is 2.12827 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5728] =>      5728 nucs 'mol-32-29a8-058488_5728'

Score:        5640
Aligned:      5728        nucs
Identic:      5720 (100%) nucs =>       973 (100%)      4747 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39052741,39053713] EXCISED REGION [39053715,39058469]
 second seq =>  [       1,     973] EXCISED REGION [     975,    5728]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39053714,39053714]
 second seq =>         1 nucs [974,974]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [39056433,39056433]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [973,973] to [974,974]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39052741 TCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAAAACC 39052800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAAAACC 60

 39052801 CTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACCAAAT 39052860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACCAAAT 120

 39052861 AGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGACATAT 39052920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGACATAT 180

 39052921 ATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTTCTCT 39052980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTTCTCT 240

 39052981 AGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATTTTCA 39053040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATTTTCA 300

 39053041 AAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGAAACC 39053100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGAAACC 360

 39053101 AGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCCAAGG 39053160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCCAAGG 420

 39053161 TGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAATGGAT 39053220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAATGGAT 480

 39053221 AACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAGAATT 39053280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAGAATT 540

 39053281 CTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAACACA 39053340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAACACA 600

 39053341 TTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAATCAAA 39053400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAATCAAA 660

 39053401 TTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTTCTTT 39053460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTTCTTT 720

 39053461 TTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGA 39053520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGA 780

 39053521 TCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCA 39053580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCA 840

 39053581 GAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCTGTGC 39053640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCTGTGC 900

 39053641 AAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAACATC 39053700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAACATC 960

 39053701 TGGTAAATGTATA 39053713
          |||||||||||||
      961 TGGTAAATGTATA 973

EXCISED REGION

 39053715 CTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTCATCACATCAATGGTCAGC 39053774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 CTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTCATCACATCAATGGTCAGC 1034

 39053775 CAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAA 39053834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 CAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAA 1094

 39053835 CTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCA 39053894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 CTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCA 1154

 39053895 ACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAA 39053954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 ACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAA 1214

 39053955 ATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGTTAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAA 39054014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 ATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGTTAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAA 1274

 39054015 TACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATATAGAGGAGAATGATATTTG 39054074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 TACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATATAGAGGAGAATGATATTTG 1334

 39054075 TAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAAGAAAATGATTCACTACAT 39054134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 TAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAAGAAAATGATTCACTACAT 1394

 39054135 TTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAA 39054194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 TTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAA 1454

 39054195 AGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGA 39054254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 AGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGA 1514

 39054255 AAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTA 39054314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 AAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTA 1574

 39054315 TAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATT 39054374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATT 1634

 39054375 GGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAATGAACATTATTGATTTCTA 39054434
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1635 GGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAATGAACATTATTGATTTGTA 1694

 39054435 ATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAG 39054494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 ATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAG 1754

 39054495 TGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTC 39054554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 TGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTC 1814

 39054555 AGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAAT 39054614
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1815 AGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCAAGACTCATTGATTAAT 1874

 39054615 AACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATA 39054674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 AACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATA 1934

 39054675 ATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACA 39054734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 ATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACA 1994

 39054735 AAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCT 39054794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 AAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCT 2054

 39054795 AAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCT 39054854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 AAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCT 2114

 39054855 CTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTG 39054914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 CTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTG 2174

 39054915 ATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGAT 39054974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 ATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGAT 2234

 39054975 CCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAA 39055034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 CCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAA 2294

 39055035 AATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAA 39055094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 AATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAA 2354

 39055095 CAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGA 39055154
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2355 CAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGA 2414

 39055155 AAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTC 39055214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 AAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTC 2474

 39055215 ACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAA 39055274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 ACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAA 2534

 39055275 GCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAG 39055334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 GCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAG 2594

 39055335 CTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTG 39055394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTG 2654

 39055395 ATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGAC 39055454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 ATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGAC 2714

 39055455 ATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATT 39055514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 ATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATT 2774

 39055515 TGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGAT 39055574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGAT 2834

 39055575 GAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTC 39055634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 GAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTC 2894

 39055635 CATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGA 39055694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 CATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGA 2954

 39055695 AATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAA 39055754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 AATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAA 3014

 39055755 GAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGG 39055814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 GAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGG 3074

 39055815 CTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTT 39055874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 CTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTT 3134

 39055875 CAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGT 39055934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 CAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGT 3194

 39055935 CATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAA 39055994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 CATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAA 3254

 39055995 GAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCAT 39056054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 GAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCAT 3314

 39056055 TCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGC 39056114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 TCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGC 3374

 39056115 CTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGC 39056174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 CTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGC 3434

 39056175 AGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTAC 39056234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 AGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTAC 3494

 39056235 TAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAG 39056294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3495 TAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGTCCCAGCTACTCAG 3554

 39056295 GAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATC 39056354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 GAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATC 3614

 39056355 ATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACA 39056414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 ATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACA 3674

 39056415 AAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGG 39056474
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 AAACAAAAACAAACCAAC-AAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGG 3733

 39056475 AGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGT 39056534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 AGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGT 3793

 39056535 GATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGC 39056594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 GATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGC 3853

 39056595 CTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATA 39056654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 CTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATA 3913

 39056655 TAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAAT 39056714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 TAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAAT 3973

 39056715 CTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAG 39056774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 CTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAG 4033

 39056775 TAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACAC 39056834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 TAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACAC 4093

 39056835 GTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCAT 39056894
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 GTAACATTAACCATCATGAAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCAT 4153

 39056895 ATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTG 39056954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 ATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTG 4213

 39056955 AAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTG 39057014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 AAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTG 4273

 39057015 AAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAA 39057074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 AAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAA 4333

 39057075 AAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGA 39057134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 AAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGA 4393

 39057135 AACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGT 39057194
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 AACAATTTATCTTAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGT 4453

 39057195 GAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTAT 39057254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 GAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTAT 4513

 39057255 GGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTG 39057314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 GGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTG 4573

 39057315 AGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATTTATAATTAATTCAGTCATCTAACAAACA 39057374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 AGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATTTATAATTAATTCAGTCATCTAACAAACA 4633

 39057375 CTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTAAGTGGGATCTCAGATCCCTTTAATCTC 39057434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 CTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTAAGTGGGATCTCAGATCCCTTTAATCTC 4693

 39057435 CCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGCAGATGAAATAGAAACCATGACTTTCTA 39057494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 CCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGCAGATGAAATAGAAACCATGACTTTCTA 4753

 39057495 ACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATACACCTGCTCAAACTTAAGCTTTCAATTT 39057554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 ACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATACACCTGCTCAAACTTAAGCTTTCAATTT 4813

 39057555 TTAATGAGGAGAATCATGTGACTAATCATCCCCTGTCAAAAATTGTCATTTTTGATTCTT 39057614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 TTAATGAGGAGAATCATGTGACTAATCATCCCCTGTCAAAAATTGTCATTTTTGATTCTT 4873

 39057615 ATGCTTGCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCCATAAATATATTTTGTCCATAATGAAATT 39057674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 ATGCTTGCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCCATAAATATATTTTGTCCATAATGAAATT 4933

 39057675 TGTCTATAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGAGGTTGTGCTTGAATATTTTTGTGGGCCC 39057734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 TGTCTATAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGAGGTTGTGCTTGAATATTTTTGTGGGCCC 4993

 39057735 AGGATTCTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGAGGAATTCCCATACTGGGACAGTTATGAA 39057794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 AGGATTCTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGAGGAATTCCCATACTGGGACAGTTATGAA 5053

 39057795 TTGGTATTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAGGACTACTCTATCTTGTTAACACTTTCAA 39057854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 TTGGTATTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAGGACTACTCTATCTTGTTAACACTTTCAA 5113

 39057855 TTTAAGAGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAAGCACCTAAGGCAATCTGGAAGGCTAGAG 39057914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 TTTAAGAGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAAGCACCTAAGGCAATCTGGAAGGCTAGAG 5173

 39057915 ACTACCTCCTTATTCAGCATAACTAACATTAGGCCATATACTGACATCAAAGAGGAAGTG 39057974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 ACTACCTCCTTATTCAGCATAACTAACATTAGGCCATATACTGACATCAAAGAGGAAGTG 5233

 39057975 AAAGCTCTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCAATTGTGGAGGCAGTGGAATGTAGTGAAA 39058034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 AAAGCTCTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCAATTGTGGAGGCAGTGGAATGTAGTGAAA 5293

 39058035 GGTCTGGATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCCTGGCTCTACTGGGTAATAACTATGTGAC 39058094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 GGTCTGGATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCCTGGCTCTACTGGGTAATAACTATGTGAC 5353

 39058095 CCTGTCTGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCATCTGCCTCACTTTCTTTTCAAAATATGAA 39058154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 CCTGTCTGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCATCTGCCTCACTTTCTTTTCAAAATATGAA 5413

 39058155 AAATGGCAATATGTTTTCAATTAGAACTACATAAAATAATACACAAAGAATGCTTAGAAC 39058214
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 AAATGGCAATATGTTTTCAATTAGAACTATATAAAATAATACACAAAGAATGCTTAGAAC 5473

 39058215 CAGAGGAATCCTTGTAAAATGATAACCAGAAAAAAAATTCTCAAAATTATAGAATTTGCC 39058274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 CAGAGGAATCCTTGTAAAATGATAACCAGAAAAAAAATTCTCAAAATTATAGAATTTGCC 5533

 39058275 AATTTCTATTGTGCAAATCTTCCCCCTCCCCTGCCCCCAACTCAATTTCAAGCTGCCAAT 39058334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 AATTTCTATTGTGCAAATCTTCCCCCTCCCCTGCCCCCAACTCAATTTCAAGCTGCCAAT 5593

 39058335 GTGACATCACTGAATTCAGAGGTAGAGATGTGCTAATTGGATCTTTGGAGATGGTATGAG 39058394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 GTGACATCACTGAATTCAGAGGTAGAGATGTGCTAATTGGATCTTTGGAGATGGTATGAG 5653

 39058395 CCAGCTCTAGCACACCGCTGCTTTTAACAGTGCCTTCACATTCAACAAAAAGAAATTATG 39058454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 CCAGCTCTAGCACACCGCTGCTTTTAACAGTGCCTTCACATTCAACAAAAAGAAATTATG 5713

 39058455 CCTTCCAAGTTTATC 39058469
          |||||||||||||||
     5714 CCTTCCAAGTTTATC 5728

Alignment time is 4.59355 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5332] =>      5332 nucs 'mol-32-2b08-058919_5332'

Score:        5234
Aligned:      5333        nucs
Identic:      5324 (100%) nucs =>      1025 (100%)      4299 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39056289,39057315] EXCISED REGION [39060202,39064505]
 second seq =>  [       1,    1026] EXCISED REGION [    1027,    5332]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39056289 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCT 39056348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCT 60

 39056349 GAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAAC 39056408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAAC 120

 39056409 CGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAA 39056468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
      121 CGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAA-CAAAATGAGTCGGCTCATGCAA 179

 39056469 TGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCA 39056528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCA 239

 39056529 AGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTT 39056588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 AGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTT 299

 39056589 AGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATT 39056648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATT 359

 39056649 ATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAG 39056708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 ATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAG 419

 39056709 AGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCT 39056768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 AGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCT 479

 39056769 TCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGT 39056828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGT 539

 39056829 CGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGC 39056888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGC 599

 39056889 CTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAG 39056948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAG 659

 39056949 ATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACT 39057008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACT 719

 39057009 ACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATA 39057068
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      720 ACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATA 779

 39057069 GAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCA 39057128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCA 839

 39057129 TGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAA 39057188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAA 899

 39057189 ATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAA 39057248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 ATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAA 959

 39057249 ATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCA 39057308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCA 1019

 39057309 TCTTTGA 39057315
          |||||||
     1020 TCTTTGA 1026

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 1086

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 1146

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 1206

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 1266

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 1326

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 1386

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 1446

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 1506

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 1566

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 1626

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 1686

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 1746

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 1806

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 1866

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 1926

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 1986

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 2046

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 2106

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 2166

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 2226

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 2286

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 2346

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 2406

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 2466

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 2526

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 39061761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 2586

 39061762 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 39061821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 2646

 39061822 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 39061881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 2706

 39061882 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 39061941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 2766

 39061942 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 39062001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 2826

 39062002 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 39062061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 2886

 39062062 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 39062121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 2946

 39062122 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 39062181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 3006

 39062182 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 39062241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 3066

 39062242 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 39062301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 3126

 39062302 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 39062361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 3186

 39062362 GCATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 39062421
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 GCATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 3246

 39062422 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGA 39062480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     3247 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGA 3306

 39062481 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 39062540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 3366

 39062541 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 39062600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 3426

 39062601 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 39062660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 3486

 39062661 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 39062720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 3546

 39062721 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 39062780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 3606

 39062781 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 39062840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 3666

 39062841 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 39062900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 3726

 39062901 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 39062960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 3786

 39062961 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 39063020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 3846

 39063021 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 39063080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 3906

 39063081 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 39063140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 3966

 39063141 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 39063200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 4026

 39063201 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAATTGAAGGGAGGGATGAGGTTCTA 39063260
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
     4027 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAACTGAAGGGAAGGATGAGGTTCTA 4086

 39063261 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 39063320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 4146

 39063321 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 39063380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 4206

 39063381 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 39063440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 4266

 39063441 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 39063500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 4326

 39063501 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 39063560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 4386

 39063561 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 39063620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 4446

 39063621 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 39063680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 4506

 39063681 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 39063740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 4566

 39063741 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 39063800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 4626

 39063801 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 39063860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 4686

 39063861 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 39063920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 4746

 39063921 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 39063980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 4806

 39063981 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 39064040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 4866

 39064041 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 39064100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 4926

 39064101 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 39064160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 4986

 39064161 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 39064220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 5046

 39064221 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 39064280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 5106

 39064281 GTTTTT-TGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 39064339
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 GTTTTTCTGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 5166

 39064340 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 39064399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 5226

 39064400 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 39064459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 5286

 39064460 CCCACACTTAAGTGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAG 39064505
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 CCCACACTTAAGGGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAG 5332

Alignment time is 4.58663 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5570] =>      5570 nucs 'mol-32-2b4a-139764_5570'

Score:        5441
Aligned:      5551        nucs
Identic:      5541 (100%) nucs =>      3380 (100%)      2161 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39059856,39063237] EXCISED REGION [39063248,39065414]
 second seq =>  [       1,    3383] EXCISED REGION [    3394,    5561]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [39063238,39063247]
 second seq =>        10 nucs [3384,3393]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3382,3383] to [3392,3393]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39059856 ACCTACTTTTTTCATGCTGTAGTTATTATTTTTCTACTTCGGCTGCTCTTATCAAGATCA 39059915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTACTTTTTTCATGCTGTAGTTATTATTTTTCTACTTCGGCTGCTCTTATCAAGATCA 60

 39059916 GGGCAATTAGCAGCAAAAACTTAACCTGCCATGGTGCTATCCATGGTCGGACAAATCTTC 39059975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCAATTAGCAGCAAAAACTTAACCTGCCATGGTGCTATCCATGGTCGGACAAATCTTC 120

 39059976 AGCTGTTCTTCTTACATATAAGCAACTACTCAGGGACAGAGAATGTGTTTGTTGGTTCTA 39060035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTGTTCTTCTTACATATAAGCAACTACTCAGGGACAGAGAATGTGTTTGTTGGTTCTA 180

 39060036 AATTACAGCTTGAGACCTAAACATATATCTTAATAGCTACTCTAGTTTTAAAACCAAAAG 39060095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTACAGCTTGAGACCTAAACATATATCTTAATAGCTACTCTAGTTTTAAAACCAAAAG 240

 39060096 TGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTGAGTGTTCTCTGGTTCCAGGTAG 39060155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTGAGTGTTCTCTGGTTCCAGGTAG 300

 39060156 CTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAATGAATTTTGGAACAAAATTTGC 39060215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAATGAATTTTGGAACAAAATTTGC 360

 39060216 CTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTAATCAGTGTTGAAAA 39060275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTAATCAGTGTTGAAAA 420

 39060276 TAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTACAAAACTCTTTTCTT 39060335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTACAAAACTCTTTTCTT 480

 39060336 TGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAAAAAGGCAAAGTAAA 39060395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAAAAAGGCAAAGTAAA 540

 39060396 ACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTCCCCAACTCCTCATC 39060455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTCCCCAACTCCTCATC 600

 39060456 CTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAAAATATTAAATGTTT 39060515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAAAATATTAAATGTTT 660

 39060516 GTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACACTTCTCTGATTTCCA 39060575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACACTTCTCTGATTTCCA 720

 39060576 CGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATATCCCTAGATTTTCAT 39060635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATATCCCTAGATTTTCAT 780

 39060636 GTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAGGACACTTTCAGCTA 39060695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAGGACACTTTCAGCTA 840

 39060696 AATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCAAAAAGATCAAACGT 39060755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCAAAAAGATCAAACGT 900

 39060756 TTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACTATCTTTTTTTCTTT 39060815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACTATCTTTTTTTCTTT 960

 39060816 ACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTTGGCGAGGTCATTGT 39060875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTTGGCGAGGTCATTGT 1020

 39060876 TCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATAAAATTTATTCATTT 39060935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATAAAATTTATTCATTT 1080

 39060936 GACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGGCATGGTTCAGGGCC 39060995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGGCATGGTTCAGGGCC 1140

 39060996 TGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGTCCTCATGGAGATTA 39061055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGTCCTCATGGAGATTA 1200

 39061056 CATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACATAATATTAAGTAGCA 39061115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACATAATATTAAGTAGCA 1260

 39061116 ATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCATGGTTGAAATATTGT 39061175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCATGGTTGAAATATTGT 1320

 39061176 TTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGAGGAAGAACAAGAGC 39061235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGAGGAAGAACAAGAGC 1380

 39061236 CAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAAGAAAATCAGGGTAG 39061295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAAGAAAATCAGGGTAG 1440

 39061296 TTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGTGACAGCATATGTAG 39061355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGTGACAGCATATGTAG 1500

 39061356 GCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTGGCTTAAAATAACTT 39061415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTGGCTTAAAATAACTT 1560

 39061416 ACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAGCTTAACTGGGTCCT 39061475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAGCTTAACTGGGTCCT 1620

 39061476 CTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTGCATCCTCATCTGGA 39061535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTGCATCCTCATCTGGA 1680

 39061536 GGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTGAAAGAATTTGTTTT 39061595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTGAAAGAATTTGTTTT 1740

 39061596 CTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAGCTTCTGGATGTTGC 39061655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAGCTTCTGGATGTTGC 1800

 39061656 TCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAATGCCTGTTTCTTTA 39061715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAATGCCTGTTTCTTTA 1860

 39061716 AGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTCCAATGGATTTCATC 39061775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTCCAATGGATTTCATC 1920

 39061776 TAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGATCAACTGATCTGGGA 39061835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGATCAACTGATCTGGGA 1980

 39061836 TCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTAACCTACTTAAAAAA 39061895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTAACCTACTTAAAAAA 2040

 39061896 GTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAAGGGAAGGGAATTAT 39061955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAAGGGAAGGGAATTAT 2100

 39061956 AAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCATTTTGCCCACCACA 39062015
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2101 AAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAACATTTTGCCCACCACA 2160

 39062016 CCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCATTAGAATATTCTATG 39062075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCATTAGAATATTCTATG 2220

 39062076 CAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTTGCTGCTCTGTGGGG 39062135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTTGCTGCTCTGTGGGG 2280

 39062136 AATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGAGGCTTATGCAGTAG 39062195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGAGGCTTATGCAGTAG 2340

 39062196 TGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGAGTCTAGTCATATAT 39062255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGAGTCTAGTCATATAT 2400

 39062256 TTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTATTTAGCATTAGTAA 39062315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTATTTAGCATTAGTAA 2460

 39062316 TGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTAGCATTCGTAGATAC 39062375
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2461 TGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTAGCATTAGTAGATAC 2520

 39062376 TAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTATTTGGAAGAGATACT 39062435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTATTTGGAAGAGATACT 2580

 39062436 ATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGAATTTATAAATTTAC 39062494
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGAATTTATAAATTTAC 2640

 39062495 AGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAAATGAGCAGTGAAAG 39062554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAAATGAGCAGTGAAAG 2700

 39062555 TTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAAATTCAGTGTACATT 39062614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAAATTCAGTGTACATT 2760

 39062615 ATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTTTTTGGATGTAAGAC 39062674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTTTTTGGATGTAAGAC 2820

 39062675 TCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCTGAAAGTACTAAGTT 39062734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCTGAAAGTACTAAGTT 2880

 39062735 ATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAGAGAGAAAAAAAATT 39062794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAGAGAGAAAAAAAATT 2940

 39062795 ATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCATTTGTTGAAACAGCC 39062854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCATTTGTTGAAACAGCC 3000

 39062855 ATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAATTTCCATTATGTTTG 39062914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAATTTCCATTATGTTTG 3060

 39062915 TATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGATGGCTGAGGTTTAAT 39062974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGATGGCTGAGGTTTAAT 3120

 39062975 AAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTTTAGAAGACACTACT 39063034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTTTAGAAGACACTACT 3180

 39063035 ATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACAAAGTTGATTAAAAT 39063094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACAAAGTTGATTAAAAT 3240

 39063095 TTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATCAAAGAGATCCCCAT 39063154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATCAAAGAGATCCCCAT 3300

 39063155 ATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTATGTATGTGGCAACTA 39063214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTATGTATGTGGCAACTA 3360

 39063215 TGCTATACAAACTAACTTTACAA 39063237
          |||||||||||||||||||||||
     3361 TGCTATACAAACTAACTTTACAA 3383

EXCISED REGION

 39063248 GGATGAGGTTCTATTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGA 39063307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 GGATGAGGTTCTATTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGA 3453

 39063308 GGTTCTAAAATCTACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGT 39063367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 GGTTCTAAAATCTACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGT 3513

 39063368 CTATAGGTTTCACGCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATA 39063427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 CTATAGGTTTCACGCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATA 3573

 39063428 AGTCAATTTTTAAAAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTT 39063487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 AGTCAATTTTTAAAAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTT 3633

 39063488 CTAATCTCCAGAATCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACC 39063547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 CTAATCTCCAGAATCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACC 3693

 39063548 TTGAGACAGCAAGATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCA 39063607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 TTGAGACAGCAAGATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCA 3753

 39063608 CTTCCTGGCTAAAGTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTG 39063667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 CTTCCTGGCTAAAGTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTG 3813

 39063668 GACCTATAATTACTGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCA 39063727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 GACCTATAATTACTGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCA 3873

 39063728 CCTCAAAGACTGGGAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCC 39063787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 CCTCAAAGACTGGGAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCC 3933

 39063788 TACAATGGAAAGGAACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTAC 39063847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 TACAATGGAAAGGAACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTAC 3993

 39063848 CTTAAAGTCTACAGAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCC 39063907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 CTTAAAGTCTACAGAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCC 4053

 39063908 CCATGCCAGATAATATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTAT 39063967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 CCATGCCAGATAATATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTAT 4113

 39063968 GGCAGCAATGGACATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATA 39064027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 GGCAGCAATGGACATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATA 4173

 39064028 ATAAATTTTGTATTTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGA 39064087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 ATAAATTTTGTATTTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGA 4233

 39064088 TTTCCCATAAATCCCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTAT 39064147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 TTTCCCATAAATCCCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTAT 4293

 39064148 GTGAGTCACAAACAGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTA 39064207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 GTGAGTCACAAACAGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTA 4353

 39064208 TTCAGGTTTGTTTCATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATT 39064267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 TTCAGGTTTGTTTCATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATT 4413

 39064268 AGACTTGTCTGATGTTTTT-TGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCA 39064326
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 AGACTTGTCTGATGTTTTTCTGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCA 4473

 39064327 CAGCAAAGTGCCATACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATC 39064386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 CAGCAAAGTGCCATACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATC 4533

 39064387 AGTGCGGATCACCTGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAG 39064446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 AGTGCGGATCACCTGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAG 4593

 39064447 CCATTGTATCTAGCCCACACTTAAGTGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGT 39064506
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 CCATTGTATCTAGCCCACACTTAAGGGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGT 4653

 39064507 AATAACTATATAATTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATT 39064566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 AATAACTATATAATTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATT 4713

 39064567 TATTTATTCAATACCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTG 39064626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 TATTTATTCAATACCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTG 4773

 39064627 GGTTATAGTTTAATGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGG 39064686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 GGTTATAGTTTAATGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGG 4833

 39064687 TTCTCTTTCAAATGACTCCTGTGTCCTTTTTACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACT 39064746
          .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4834 ATCTCTTTCAAATGACTCCTGTGTCCTTTTGACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACT 4893

 39064747 ACTTTCTTATTTTCTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCC 39064806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 ACTTTCTTATTTTCTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCC 4953

 39064807 AATCCTAGACTCATCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATT 39064866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 AATCCTAGACTCATCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATT 5013

 39064867 TAAAAATCAGTTGTGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACT 39064926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 TAAAAATCAGTTGTGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACT 5073

 39064927 TTCTCAGCTGAGAGAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTA 39064986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 TTCTCAGCTGAGAGAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTA 5133

 39064987 TCTATAAATATCTCTACATGTATCTTCCTGTATGTATGCAAAGCTAGACATGACCTCATA 39065046
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5134 TCTATAAATATCTCTACATGTATCTTCCTGTATGTATACAAAGCTAGACATGACCTCATA 5193

 39065047 TTGATGGCTCGAGGTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGT 39065106
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 TTGATGGCTCCAGGTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGT 5253

 39065107 CTAGAACCTCCCATTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTA 39065166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 CTAGAACCTCCCATTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTA 5313

 39065167 CATGTTCCATTGTACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCT 39065226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 CATGTTCCATTGTACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCT 5373

 39065227 TTACCAAGGAGAGTACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCA 39065286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 TTACCAAGGAGAGTACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCA 5433

 39065287 TTCATTTCTGGATTTACTTGGGTAAGCATCTTTTGCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTT 39065346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5434 TTCATTTCTGGATTTACTTGGGTAAGCATCTTTTCCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTT 5493

 39065347 CATACATTTGTATTTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAG 39065406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 CATACATTTGTATTTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAG 5553

 39065407 GTTTATTT 39065414
          ||||||||
     5554 GTTTATTT 5561

Alignment time is 5.10849 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3868] =>      3868 nucs 'mol-32-2e15-051378_3868'

Score:        3803
Aligned:      3869        nucs
Identic:      3863 (100%) nucs =>      3503 (100%)       360 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39053807,39057315] EXCISED REGION [39060202,39060561]
 second seq =>  [       1,    3508] EXCISED REGION [    3509,    3868]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39053807 ATAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTA 39053866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTA 60

 39053867 CATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGG 39053926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGG 120

 39053927 TCTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAG 39053986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      121 TCTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGACAAG 180

 39053987 TTAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAA 39054046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAA 240

 39054047 TCCTACATATAGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTG 39054106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCTACATATAGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTG 300

 39054107 TTTTATATAAGAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTAT 39054166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTATATAAGAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTAT 360

 39054167 CAACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAAT 39054226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAAT 420

 39054227 GTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAAT 39054286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAAT 480

 39054287 GTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTT 39054346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTT 540

 39054347 AAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTAT 39054406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTAT 600

 39054407 TCAATTCAATGAACATTATTGATTTCTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTC 39054466
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAATTCAATGAACATTATTGATTTGTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTC 660

 39054467 TTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAAC 39054526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAAC 720

 39054527 TCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGA 39054586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGA 780

 39054587 GCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGA 39054646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGA 840

 39054647 ACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAA 39054706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAA 900

 39054707 AAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTG 39054766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTG 960

 39054767 TGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCC 39054826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCC 1020

 39054827 ACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTG 39054886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTG 1080

 39054887 GATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGA 39054946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1081 GATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCAGCTGA 1140

 39054947 GCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTC 39055006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTC 1200

 39055007 TCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATA 39055066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATA 1260

 39055067 TTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTA 39055126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTA 1320

 39055127 GCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGT 39055186
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGT 1380

 39055187 GGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAA 39055246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAA 1440

 39055247 AACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACA 39055306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACA 1500

 39055307 ACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAA 39055366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAA 1560

 39055367 GGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGAC 39055426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGAC 1620

 39055427 TCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTT 39055486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTT 1680

 39055487 GTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGC 39055546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGC 1740

 39055547 TTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCT 39055606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCT 1800

 39055607 TGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTAT 39055666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTAT 1860

 39055667 CTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAA 39055726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAA 1920

 39055727 ATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACA 39055786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACA 1980

 39055787 AGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGC 39055846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGC 2040

 39055847 TATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCC 39055906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCC 2100

 39055907 ACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTT 39055966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTT 2160

 39055967 TCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACA 39056026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACA 2220

 39056027 TTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACA 39056086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACA 2280

 39056087 GAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAAT 39056146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAAT 2340

 39056147 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCT 39056206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCT 2400

 39056207 GGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTG 39056266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTG 2460

 39056267 GTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGG 39056326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGG 2520

 39056327 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTG 39056386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTG 2580

 39056387 AGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAA 39056446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2581 AGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAA- 2639

 39056447 CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGC 39056506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGC 2699

 39056507 TGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTG 39056566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTG 2759

 39056567 GAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAA 39056626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAA 2819

 39056627 TAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGAT 39056686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGAT 2879

 39056687 GAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGT 39056746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGT 2939

 39056747 TAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACT 39056806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACT 2999

 39056807 GGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAA 39056866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAA 3059

 39056867 AATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGT 39056926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGT 3119

 39056927 GGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAAT 39056986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAAT 3179

 39056987 GTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAG 39057046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAG 3239

 39057047 CTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATA 39057106
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATA 3299

 39057107 GATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATA 39057166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATA 3359

 39057167 CCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTG 39057226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTG 3419

 39057227 ATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAG 39057286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAG 3479

 39057287 GGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 3508

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 3568

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 3628

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 3688

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 3748

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 3808

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 3868

Alignment time is 3.19272 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    7006] =>      7006 nucs 'mol-32-2e15-206294_7006'

Score:        6906
Aligned:      7005        nucs
Identic:      6996 (100%) nucs =>       596 (100%)      6400 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39051960,39052555] EXCISED REGION [39052557,39058965]
 second seq =>  [       1,     596] EXCISED REGION [     598,    7006]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39052556,39052556]
 second seq =>         1 nucs [597,597]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [594,596] to [595,597]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39051960 ACCTGCAAGTTTGTGCTTGAGGACTTTCAGTGGTCACAAGAGCCTGTCCCACCATGTAAC 39052019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTGCAAGTTTGTGCTTGAGGACTTTCAGTGGTCACAAGAGCCTGTCCCACCATGTAAC 60

 39052020 CCATGTAAAGGGCTGCCTGGACGTGCCAGGAATTTATGTCCTTGGGAGCAGCTAATATGA 39052079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCATGTAAAGGGCTGCCTGGACGTGCCAGGAATTTATGTCCTTGGGAGCAGCTAATATGA 120

 39052080 TATGTAGTTGGTAGATACATACCCAGCACCTTCACCCTCATGTATAAACATAGTCTCCCA 39052139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGTAGTTGGTAGATACATACCCAGCACCTTCACCCTCATGTATAAACATAGTCTCCCA 180

 39052140 GAATTCCTTATCAGAATTGAGCCCCAGGTGCTTACTCTGCCATTGGCTGGCTTCTCTTTC 39052199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATTCCTTATCAGAATTGAGCCCCAGGTGCTTACTCTGCCATTGGCTGGCTTCTCTTTC 240

 39052200 TCACATTTCTGCTCCCCTACTACTCCCAGAGCTCAAATAAGCTAACTGCATATATATCTT 39052259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCACATTTCTGCTCCCCTACTACTCCCAGAGCTCAAATAAGCTAACTGCATATATATCTT 300

 39052260 TTTCTCAGTCTGACCTGTTTTATCATACAAAACTATTTTTTCTTTCAGTAAAAATCTAAA 39052319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCTCAGTCTGACCTGTTTTATCATACAAAACTATTTTTTCTTTCAGTAAAAATCTAAA 360

 39052320 TTATTTATTTATATTTCATTGTTCTTTCATTCAATATGCATCTACTGTCACCCATCATGT 39052379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATTTATTTATATTTCATTGTTCTTTCATTCAATATGCATCTACTGTCACCCATCATGT 420

 39052380 ACAGTGAATTCTTGTTAACACTAAAATGTTCTTTTAAATAGGCCATTTTCAAACAGAATT 39052439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGTGAATTCTTGTTAACACTAAAATGTTCTTTTAAATAGGCCATTTTCAAACAGAATT 480

 39052440 TCTAGCTTTCATAAGAATTTAGGAAATAATTGTTTCAAACAAATTTCAATTGATTAATTA 39052499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTAGCTTTCATAAGAATTTAGGAAATAATTGTTTCAAACAAATTTCAATTGATTAATTA 540

 39052500 AGCCTGTTTGTTTTTAGGCCAGAAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAAATGGCTTT 39052555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCCTGTTTGTTTTTAGGCCAGAAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAAATGGCTTT 596

EXCISED REGION

 39052557 ATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATACCTACATTAT 39052616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 ATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATACCTACATTAT 657

 39052617 TCATAATATCTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAAAACAAGAAA 39052676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 TCATAATATCTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAAAACAAGAAA 717

 39052677 TACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTAACAGAATTA 39052736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTAACAGAATTA 777

 39052737 AAGCTCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAA 39052796
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 AAGCCCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAA 837

 39052797 AACCCTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACC 39052856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 AACCCTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACC 897

 39052857 AAATAGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGAC 39052916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 AAATAGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGAC 957

 39052917 ATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTT 39052976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 ATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTT 1017

 39052977 CTCTAGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATT 39053036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CTCTAGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATT 1077

 39053037 TTCAAAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGA 39053096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TTCAAAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGA 1137

 39053097 AACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCC 39053156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 AACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCC 1197

 39053157 AAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAAT 39053216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAAT 1257

 39053217 GGATAACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAG 39053276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GGATAACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAG 1317

 39053277 AATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAA 39053336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAA 1377

 39053337 CACATTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAAT 39053396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CACATTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAAT 1437

 39053397 CAAATTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTT 39053456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CAAATTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTT 1497

 39053457 CTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGC 39053516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGC 1557

 39053517 GCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCC 39053576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCC 1617

 39053577 TCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCT 39053636
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCTGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCT 1677

 39053637 GTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAA 39053696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAA 1737

 39053697 CATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTC 39053756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 CATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTC 1797

 39053757 ATCACATCAATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCA 39053816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 ATCACATCAATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCA 1857

 39053817 AAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGG 39053876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGG 1917

 39053877 CAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAG 39053936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAG 1977

 39053937 AACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGTTAATAGGTA 39053996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGTTAATAGGTA 2037

 39053997 TTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATAT 39054056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATAT 2097

 39054057 AGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAA 39054116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAA 2157

 39054117 GAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGT 39054176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGT 2217

 39054177 GTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGG 39054236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGG 2277

 39054237 GGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAG 39054296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 GGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAG 2337

 39054297 AATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATT 39054356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATT 2397

 39054357 TAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAAT 39054416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAAT 2457

 39054417 GAACATTATTGATTTCTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTC 39054476
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GAACATTATTGATTTGTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTC 2517

 39054477 ACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTC 39054536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 ACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTC 2577

 39054537 AAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCAC 39054596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 AAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCAC 2637

 39054597 CGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCT 39054656
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CAAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCT 2697

 39054657 TACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAAT 39054716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAAT 2757

 39054717 TATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAG 39054776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAG 2817

 39054777 AATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAAT 39054836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAAT 2877

 39054837 GATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAAC 39054896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 GATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAAC 2937

 39054897 CCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTA 39054956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTA 2997

 39054957 CTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACC 39055016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 CTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACC 3057

 39055017 AGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATT 39055076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATT 3117

 39055077 TCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTT 39055136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3118 TCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTT 3177

 39055137 CTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAG 39055196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 CTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAG 3237

 39055197 GACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCA 39055256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCA 3297

 39055257 GTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAG 39055316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAG 3357

 39055317 CATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCA 39055376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 CATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCA 3417

 39055377 AAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACT 39055436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACT 3477

 39055437 GGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCC 39055496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCC 3537

 39055497 ACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCT 39055556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCT 3597

 39055557 ACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAA 39055616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 ACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAA 3657

 39055617 CATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGC 39055676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGC 3717

 39055677 TGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATA 39055736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATA 3777

 39055737 TCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAA 39055796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAA 3837

 39055797 CAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAA 39055856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAA 3897

 39055857 TGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCA 39055916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCA 3957

 39055917 CAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCAT 39055976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 CAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCAT 4017

 39055977 AAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGA 39056036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 AAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGA 4077

 39056037 TGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATA 39056096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATA 4137

 39056097 ATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT 39056156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 ATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT 4197

 39056157 TGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATG 39056216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATG 4257

 39056217 GTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCT 39056276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 GTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCT 4317

 39056277 ATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGG 39056336
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 ATAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGG 4377

 39056337 TTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTC 39056396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTC 4437

 39056397 TCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGT 39056456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGT 4497

 39056457 CGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAG 39056516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 CGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAG 4557

 39056517 AAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAA 39056576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAA 4617

 39056577 TTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAAT 39056636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAAT 4677

 39056637 GATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGC 39056696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGC 4737

 39056697 CACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACC 39056756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 CACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACC 4797

 39056757 TAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACA 39056816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACA 4857

 39056817 GGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAA 39056876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4858 GGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGAAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAA 4917

 39056877 GGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAA 39056936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 GGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAA 4977

 39056937 ACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGC 39056996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 ACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGC 5037

 39056997 AACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAA 39057056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 AACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAA 5097

 39057057 TTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAA 39057116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAA 5157

 39057117 ATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTAC 39057176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 ATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTAC 5217

 39057177 TAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGA 39057236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGA 5277

 39057237 TTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAAT 39057296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAAT 5337

 39057297 TAAAACATGCCATCTTTGAGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATTTATAATTAAT 39057356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 TAAAACATGCCATCTTTGAGGAAAAAGTACATTTTGAATTCTTATACATTTATAATTAAT 5397

 39057357 TCAGTCATCTAACAAACACTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTAAGTGGGATC 39057416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TCAGTCATCTAACAAACACTTGTTTAGTGCTGGTTCTGTAGAAAATTATTAAGTGGGATC 5457

 39057417 TCAGATCCCTTTAATCTCCCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGCAGATGAAAT 39057476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 TCAGATCCCTTTAATCTCCCTTTGTGATAACTTTATTGTCTTGCAGGAAGCAGATGAAAT 5517

 39057477 AGAAACCATGACTTTCTAACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATACACCTGCTCA 39057536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AGAAACCATGACTTTCTAACTGTTGAATAAAGGACTTTAGGACCCTAATACACCTGCTCA 5577

 39057537 AACTTAAGCTTTCAATTTTTAATGAGGAGAATCATGTGACTAATCATCCCCTGTCAAAAA 39057596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5578 AACTTAAGCTTTCAATTTTTAATGAGGAGAATCATGTGACTAATCATCCCTTGTCAAAAA 5637

 39057597 TTGTCATTTTTGATTCTTATGCTTGCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCCATAAATATAT 39057656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 TTGTCATTTTTGATTCTTATGCTTGCTTGGTTATTGACATTTGTATTTCCATAAATATAT 5697

 39057657 TTTGTCCATAATGAAATTTGTCTATAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGAGGTTGTGCTT 39057716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TTTGTCCATAATGAAATTTGTCTATAAATGTTCCAGACATGTGTAATGGAGGTTGTGCTT 5757

 39057717 GAATATTTTTGTGGGCCCAGGATTCTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGAGGAATTCCCA 39057776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 GAATATTTTTGTGGGCCCAGGATTCTAGCTTAATCAGGACAAATGTTTGAGGAATTCCCA 5817

 39057777 TACTGGGACAGTTATGAATTGGTATTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAGGACTACTCTA 39057836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TACTGGGACAGTTATGAATTGGTATTACTAAGGGTTGGCTGTAAATAGAGGACTACTCTA 5877

 39057837 TCTTGTTAACACTTTCAATTTAAGAGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAAGCACCTAAGG 39057896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TCTTGTTAACACTTTCAATTTAAGAGTGAGGACAATTCTTTCACATTCAAGCACCTAAGG 5937

 39057897 CAATCTGGAAGGCTAGAGACTACCTCCTTATTCAGCATAACTAACATTAGGCCATATACT 39057956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 CAATCTGGAAGGCTAGAGACTACCTCCTTATTCAGCATAACTAACATTAGGCCATATACT 5997

 39057957 GACATCAAAGAGGAAGTGAAAGCTCTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCAATTGTGGAGG 39058016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 GACATCAAAGAGGAAGTGAAAGCTCTTTAATTTCTAATCTTTTACTGTCAATTGTGGAGG 6057

 39058017 CAGTGGAATGTAGTGAAAGGTCTGGATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCCTGGCTCTACT 39058076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 CAGTGGAATGTAGTGAAAGGTCTGGATTCGGAGTGCCTTAACTAGAACCCTGGCTCTACT 6117

 39058077 GGGTAATAACTATGTGACCCTGTCTGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCATCTGCCTCACT 39058136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 GGGTAATAACTATGTGACCCTGTCTGCTTTTCTCAGGTTCTCTGCCTCATCTGCCTCACT 6177

 39058137 TTCTTTTCAAAATATGAAAAATGGCAATATGTTTTCAATTAGAACTACATAAAATAATAC 39058196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6178 TTCTTTTCAAAATATGAAAAATGGCAATATGTTTTCAATTAGAACTATATAAAATAATAC 6237

 39058197 ACAAAGAATGCTTAGAACCAGAGGAATCCTTGTAAAATGATAACCAGAAAAAAAATTCTC 39058256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 ACAAAGAATGCTTAGAACCAGAGGAATCCTTGTAAAATGATAACCAGAAAAAAAATTCTC 6297

 39058257 AAAATTATAGAATTTGCCAATTTCTATTGTGCAAATCTTCCCCCTCCCCTGCCCCCAACT 39058316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 AAAATTATAGAATTTGCCAATTTCTATTGTGCAAATCTTCCCCCTCCCCTGCCCCCAACT 6357

 39058317 CAATTTCAAGCTGCCAATGTGACATCACTGAATTCAGAGGTAGAGATGTGCTAATTGGAT 39058376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 CAATTTCAAGCTGCCAATGTGACATCACTGAATTCAGAGGTAGAGATGTGCTAATTGGAT 6417

 39058377 CTTTGGAGATGGTATGAGCCAGCTCTAGCACACCGCTGCTTTTAACAGTGCCTTCACATT 39058436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 CTTTGGAGATGGTATGAGCCAGCTCTAGCACACCGCTGCTTTTAACAGTGCCTTCACATT 6477

 39058437 CAACAAAAAGAAATTATGCCTTCCAAGTTTATCCATGTTGTCACATGTGGCAGGATTTTA 39058496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 CAACAAAAAGAAATTATGCCTTCCAAGTTTATCCATGTTGTCACATGTGGCAGGATTTTA 6537

 39058497 TTCTTTTTAAGGCTTAGTAATATTTCATCATATATATACACACACACATATATATATGAA 39058556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 TTCTTTTTAAGGCTTAGTAATATTTCATCATATATATACACACACACATATATATATGAA 6597

 39058557 TATATATGCACACATATATACACATATATATGAAGTATCACATATAAAGTATCTGAAATA 39058616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 TATATATGCACACATATATACACATATATATGAAGTATCACATATAAAGTATCTGAAATA 6657

 39058617 GTCAAAGTCAAAGGAACAGAGTATAATATACATGTATATGTATATTATGCCTCATTTTCT 39058676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 GTCAAAGTCAAAGGAACAGAGTATAATATACATGTATATGTATATTATGCCTCATTTTCT 6717

 39058677 TTATGTTTTCTTCTGTCAGTGGACACAGGTTGATTCCATATTTTAGCTATTGTAAACACA 39058736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 TTATGTTTTCTTCTGTCAGTGGACACAGGTTGATTCCATATTTTAGCTATTGTAAACACA 6777

 39058737 GCTGCAACAAACTTGAGAGTGCAGATATCTCTTTGATATACTGATTTCCTTTCCTTTGGG 39058796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 GCTGCAACAAACTTGAGAGTGCAGATATCTCTTTGATATACTGATTTCCTTTCCTTTGGG 6837

 39058797 TATATACCAGGAGTGGGATTGGTGGATCATATAGTAGCTCTATTTTTAATTTTTTGAGGA 39058856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 TATATACCAGGAGTGGGATTGGTGGATCATATAGTAGCTCTATTTTTAATTTTTTGAGGA 6897

 39058857 CCTGCTGTGCTGTTTTTCATACTGGCTGCACCATTATACATTCCCTCCAAGAGTGTACAA 39058916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 CCTGCTGTGCTGTTTTTCATACTGGCTGCACCATTATACATTCCCTCCAAGAGTGTACAA 6957

 39058917 GGGTCCCAATTTCTCCACATCCTCACTAACATTGTTATGTCTTGCTTTG 39058965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 GGGTCCCAATTTCTCCACATCCTCACTAACATTGTTATGTCTTGCTTTG 7006

Alignment time is 5.72131 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2297] =>      2297 nucs 'mol-32-2e57-071489_2297'

Score:        2264
Aligned:      2297        nucs
Identic:      2294 (100%) nucs =>      2202 (100%)        92 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39055111,39057315] EXCISED REGION [39060202,39060293]
 second seq =>  [       1,    2205] EXCISED REGION [    2206,    2297]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39055111 TGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCT 39055170
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCT 60

 39055171 TGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTG 39055230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTG 120

 39055231 GGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAG 39055290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAG 180

 39055291 GGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACT 39055350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACT 240

 39055351 CAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAG 39055410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAG 300

 39055411 ACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAG 39055470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAG 360

 39055471 ATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAG 39055530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAG 420

 39055531 AGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGT 39055590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGT 480

 39055591 CTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTT 39055650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTT 540

 39055651 TTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGA 39055710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGA 600

 39055711 TTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCT 39055770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCT 660

 39055771 AGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGC 39055830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGC 720

 39055831 CTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCA 39055890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCA 780

 39055891 GACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGT 39055950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGT 840

 39055951 GTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATT 39056010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATT 900

 39056011 GCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGC 39056070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGC 960

 39056071 CAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGT 39056130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGT 1020

 39056131 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGG 39056190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGG 1080

 39056191 AGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAA 39056250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1081 AGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGGATACAAAAAAA 1140

 39056251 TTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 39056310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 1200

 39056311 GATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCA 39056370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCA 1260

 39056371 GCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCA 39056430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCA 1320

 39056431 ACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAA 39056490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAA 1380

 39056491 AATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGA 39056550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGA 1440

 39056551 ATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATT 39056610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATT 1500

 39056611 AAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATT 39056670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATT 1560

 39056671 ATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGG 39056730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGG 1620

 39056731 CTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGAT 39056790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGAT 1680

 39056791 GTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCA 39056850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCA 1740

 39056851 TGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATAT 39056910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATAT 1800

 39056911 TATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTA 39056970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTA 1860

 39056971 TCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACAC 39057030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACAC 1920

 39057031 AGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCA 39057090
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTAAATATCCATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCA 1980

 39057091 TTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAA 39057150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAA 2040

 39057151 TTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGC 39057210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGC 2100

 39057211 AGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGAT 39057270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGAT 2160

 39057271 ATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 2205

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 2265

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTT 39060293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTT 2297

Alignment time is 1.87995 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6663] =>      6663 nucs 'mol-32-2f28-063036_6663'

Score:        6479
Aligned:      6655        nucs
Identic:      6639 (100%) nucs =>        70 (100%)      6569 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39059167,39059236] EXCISED REGION [39059245,39065827]
 second seq =>  [       1,      70] EXCISED REGION [      79,    6663]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [39059237,39059244]
 second seq =>         8 nucs [71,78]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39059237,39059237] to [39059245,39059245]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [39059235,39059236] to [39059245,39059246]
 second seq =>         2 nucs [69,70] to [79,80]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39059237,39059237] to [39059244,39059244]
 second seq =>         0 nucs

 39059167 TGTTAAATGGGTAGCAAATACAGTTAACACAAGATGAGTAAGTTTCAAAGATCTGTTGTA 39059226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTAAATGGGTAGCAAATACAGTTAACACAAGATGAGTAAGTTTCAAAGATCTGTTGTA 60

 39059227 CAATATTTTA 39059236
          ||||||||||
       61 CAATATTTTA 70

EXCISED REGION

 39059245 TAACAATACTGTATTTTTTAGTTAGAAATTTATTAAAAGAATAAATTGAACTGTGTTAAG 39059304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       79 TAACAATACTGTATTTTTTAGTTAGAAATTTATTAAAAGAATAAATTGAACTGTGTTAAG 138

 39059305 TGTTTGTATTATAAATAAATAAATATTAGTAGTAGTCCTACTTTCTTGAAAACTTATAAG 39059364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      139 TGTTTGTATTATAAATAAATAAATATTAGTAGTAGTCCTACTTTCTTGAAAACTTATAAG 198

 39059365 TAAACGTTGTCTCATCAAAGAGGTCACCATAACAGGCAGATTCTGAAACACTCTTTTAGT 39059424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      199 TAAACGTTGTCTCATCAAAGAGGTCACCATAACAGGCAGATTCTGAAACACTCTTTTAGT 258

 39059425 CTGCTTTATGCTGCTGTAACAGAATTCCTGAGGCTGAGGAATTTATAATCTACATATATT 39059484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      259 CTGCTTTATGCTGCTGTAACAGAATTCCTGAGACTGAGGAATTTATAATCTACATATATT 318

 39059485 TATGTGGCTTATGGCTCCGGAGACTGTGAAGTCCAAGATCAAAGGGGTGCATCTGCTGAG 39059544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 TATGTGGCTTATGGCTCCGGAGACTGTGAAGTCCAAGATCAAAGGGGTGCATCTGCTGAG 378

 39059545 GGCCTTCTTGCTGTGTCATCCCATGGCAGAAGGTAGAAGGGCATGCCAGACAGAGAGAAA 39059604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 GGCCTTCTTGCTGTGTCATCCCATGGCAGAAGGTAGAAGGGCATGCCAGACAGAGAGAAA 438

 39059605 GTGAGAGAGGAGGAGGTTGAACTCACAACCCCAAGCCCTTTTTTAATCTGCGTTAATCCA 39059664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 GTGAGAGAGGAGGAGGTTGAACTCACAACCCCAAGCCCTTTTTTAATCTGCGTTAATCCA 498

 39059665 TTCATGAGGGCAAAGCCCTAATGACCTGAATACCTCTCATTAGGCCCCACCTCCCAACAC 39059724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 TTCATGAGGGCAAAGCCCTAATGACCTGAATACCTCTCATTAGGCCCCACCTCCCAACAC 558

 39059725 TGTTTCAGTACGGATTGGTTCCAACACATGAATTTTGAGGGACACATTCAAACGATAGCA 39059784
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 TGTTTCAGTACGGATTGTTTCCAACACATGAATTTTGAGGGACACATTCAAACGATAGCA 618

 39059785 CTCCTCAAGTTCCTAGCACCTACTTTATGACATCCCCTGGTCAACAAGAGAAAGATGCAT 39059844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
      619 CTCCTCAAGTTCCTAGCACCTACTTTATGACATCCCCTGGTCAACAAGACAAAGATGCGT 678

 39059845 CTGTTCTGTAGACCTACTTTTTTCATGCTGTAGTTATTATTTTTCTACTTCGGCTGCTCT 39059904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 CTGTTCTGTAGACCTACTTTTTTCATGCTGTAGTTATTATTTTTCTACTTCGGCTGCTCT 738

 39059905 TATCAAGATCAGGGCAATTAGCAGCAAAAACTTAACCTGCCATGGTGCTATCCATGGTCG 39059964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 TATCAAGATCAGGGCAATTAGCAGCAAAAACTTAACCTGCCATGGTGCTATCCATGGTCG 798

 39059965 GACAAATCTTCAGCTGTTCTTCTTACATATAAGCAACTACTCAGGGACAGAGAATGTGTT 39060024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 GACAAATCTTCAGCTGTTCTTCTTACATATAAGCAACTACTCAGGGACAGAGAATGTGTT 858

 39060025 TGTTGGTTCTAAATTACAGCTTGAGACCTAAACATATATCTTAATAGCTACTCTAGTTTT 39060084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 TGTTGGTTCTAAATTACAGCTTGAGACCTAAACATATATCTTAATAGCTACTCTAGTTTT 918

 39060085 AAAACCAAAAGTGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTGAGTGTTCTCTG 39060144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 AAAACCAAAAGTGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTGAGTGTTCTCTG 978

 39060145 GTTCCAGGTAGCTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAATGAATTTTGGA 39060204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 GTTCCAGGTAGCTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAATGAATTTTGGA 1038

 39060205 ACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTAATC 39060264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 ACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTAATC 1098

 39060265 AGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTACAAA 39060324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 AGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTACAAA 1158

 39060325 ACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAAAAA 39060384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 ACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAAAAA 1218

 39060385 GGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTCCCC 39060444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 GGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTCCCC 1278

 39060445 AACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAAAAT 39060504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 AACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAAAAT 1338

 39060505 ATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACACTTC 39060564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 ATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACACTTC 1398

 39060565 TCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATATCCC 39060624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 TCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATATCCC 1458

 39060625 TAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAGGAC 39060684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAGGAC 1518

 39060685 ACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCAAAA 39060744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 ACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCAAAA 1578

 39060745 AGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACTATC 39060804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 AGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACTATC 1638

 39060805 TTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTTGGC 39060864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTTGGC 1698

 39060865 GAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATAAAA 39060924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 GAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATAAAA 1758

 39060925 TTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGGCAT 39060984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 TTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGGCAT 1818

 39060985 GGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGTCCT 39061044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 GGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGTCCT 1878

 39061045 CATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACATAAT 39061104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 CATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACATAAT 1938

 39061105 ATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCATGGT 39061164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 ATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCATGGT 1998

 39061165 TGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGAGGA 39061224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGAGGA 2058

 39061225 AGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAAGAA 39061284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 AGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAAGAA 2118

 39061285 AATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGTGAC 39061344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 AATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGTGAC 2178

 39061345 AGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTGGCT 39061404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 AGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTGGCT 2238

 39061405 TAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAGCTT 39061464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 TAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAGCTT 2298

 39061465 AACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTGCAT 39061524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 AACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTGCAT 2358

 39061525 CCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTGAAA 39061584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 CCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTGAAA 2418

 39061585 GAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAGCTT 39061644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 GAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAGCTT 2478

 39061645 CTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAATGC 39061704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 CTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAATGC 2538

 39061705 CTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTCCAA 39061764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 CTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTCCAA 2598

 39061765 TGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGATCAA 39061824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 TGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGATCAA 2658

 39061825 CTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTAACC 39061884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 CTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTAACC 2718

 39061885 TACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAAGGG 39061944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 TACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAAGGG 2778

 39061945 AAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCATTT 39062004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 AAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCATTT 2838

 39062005 TGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCATTAG 39062064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 TGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCATTAG 2898

 39062065 AATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTTGCT 39062124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 AATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTTGCT 2958

 39062125 GCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGAGGC 39062184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 GCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGAGGC 3018

 39062185 TTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGAGTC 39062244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGAGTC 3078

 39062245 TAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTATTT 39062304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 TAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTATTT 3138

 39062305 AGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTAGCA 39062364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 AGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTAGCA 3198

 39062365 TTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTATTTG 39062424
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 TTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTATTTG 3258

 39062425 GAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGAATT 39062483
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     3259 GAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGAATT 3318

 39062484 TATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAAATG 39062543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 TATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAAATG 3378

 39062544 AGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAAATT 39062603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 AGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAAATT 3438

 39062604 CAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTTTTT 39062663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 CAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTTTTT 3498

 39062664 GGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCTGAA 39062723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 GGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCTGAA 3558

 39062724 AGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAGAGA 39062783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 AGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAGAGA 3618

 39062784 GAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCATTTG 39062843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 GAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCATTTG 3678

 39062844 TTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAATTTC 39062903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 TTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAATTTC 3738

 39062904 CATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGATGGC 39062963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 CATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGATGGC 3798

 39062964 TGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTTTAG 39063023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTTTAG 3858

 39063024 AAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACAAAG 39063083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 AAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACAAAG 3918

 39063084 TTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATCAAA 39063143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 TTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATCAAA 3978

 39063144 GAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTATGTA 39063203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 GAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTATGTA 4038

 39063204 TGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAATTGAAGGGAGGGATGAGGTTCTATTG 39063263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
     4039 TGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAACTGAAGGGAAGGATGAGGTTCTATTG 4098

 39063264 CTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCTACG 39063323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 CTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCTACG 4158

 39063324 TGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCACGCC 39063383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 TGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCACGCC 4218

 39063384 AAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAAAAA 39063443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 AAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAAAAA 4278

 39063444 TAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAATCT 39063503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 TAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAATCT 4338

 39063504 GCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAGATT 39063563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 GCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAGATT 4398

 39063564 ACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAAGTC 39063623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 ACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAAGTC 4458

 39063624 AGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTACTGG 39063683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 AGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTACTGG 4518

 39063684 CTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGGGAA 39063743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 CTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGGGAA 4578

 39063744 TAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGGAAC 39063803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 TAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGGAAC 4638

 39063804 TGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACAGAG 39063863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 TGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACAGAG 4698

 39063864 AGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAATAT 39063923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 AGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAATAT 4758

 39063924 TAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGACATA 39063983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGACATA 4818

 39063984 ATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTATTTT 39064043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 ATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTATTTT 4878

 39064044 AAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATCCCA 39064103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 AAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATCCCA 4938

 39064104 CATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAACAGT 39064163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 CATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAACAGT 4998

 39064164 AAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTTCAT 39064223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 AAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTTCAT 5058

 39064224 TTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGATGTT 39064283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 TTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGATGTT 5118

 39064284 TTT-TGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCATAC 39064342
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 TTTCTGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCATAC 5178

 39064343 TCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACCTGG 39064402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 TCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACCTGG 5238

 39064403 CATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAGCCC 39064462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 CATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAGCCC 5298

 39064463 ACACTTAAGTGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAATTT 39064522
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 ACACTTAAGGGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAATTT 5358

 39064523 ATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATACCT 39064582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 ATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATACCT 5418

 39064583 TGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAATGC 39064642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 TGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAATGC 5478

 39064643 TACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGTTCTCTTTCAAATGAC 39064702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5479 TACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGATCTCTTTCAAATGAC 5538

 39064703 TCCTGTGTCCTTTTTACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTTCTT 39064762
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 TCCTGTGTCCTTTTGACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTTCTT 5598

 39064763 TTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCATCC 39064822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 TTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCATCC 5658

 39064823 ATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTGTGA 39064882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 ATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTGTGA 5718

 39064883 GTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGAGAA 39064942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 GTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGAGAA 5778

 39064943 CAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCTCTA 39065002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 CAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCTCTA 5838

 39065003 CATGTATCTTCCTGTATGTATGCAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCGAGGTA 39065062
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5839 CATGTATCTTCCTGTATGTATACAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCCAGGTA 5898

 39065063 TCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCATTA 39065122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 TCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCATTA 5958

 39065123 CAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGTACT 39065182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 CAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGTACT 6018

 39065183 ATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAGTAC 39065242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 ATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAGTAC 6078

 39065243 AGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGATTTA 39065302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 AGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGATTTA 6138

 39065303 CTTGGGTAAGCATCTTTTGCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTATTTA 39065362
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 CTTGGGTAAGCATCTTTTCCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTATTTA 6198

 39065363 GAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCCTTT 39065422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 GAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCCTTT 6258

 39065423 ACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATGATG 39065482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 ACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATGATG 6318

 39065483 ATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAATTAA 39065542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 ATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAATTAA 6378

 39065543 TTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACTAGG 39065602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 TTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACTAGG 6438

 39065603 TTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTGAAC 39065662
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 TTAAGGATTTCTATTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTGAAC 6498

 39065663 TTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCATTCT 39065722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 TTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCATTCT 6558

 39065723 GTCAATATGATACATGATATTAATTTATTTGTGAAAGTTGGAAGCAATATTGCATTCCTG 39065782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 GTCAATATGATACATGATATTAATTTATTTGTGAAAGTTGGAAGCAATATTGCATTCCTG 6618

 39065783 GAATAAACCATTTGGTTTTGATGTATTAACCTTTTTGTATATTGC 39065827
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 GAATAAACCATTTGGTTTTGATGTATTAACCTTTTTGTATATTGC 6663

Alignment time is 5.29252 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5859] =>      5859 nucs 'mol-32-2fd8-208394_5859'

Score:        5723
Aligned:      5833        nucs
Identic:      5823 (100%) nucs =>      3393 (100%)      2430 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39059844,39063237] EXCISED REGION [39063248,39065684]
 second seq =>  [      17,    3411] EXCISED REGION [    3422,    5859]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [39063238,39063247]
 second seq =>        10 nucs [3412,3421]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3410,3411] to [3420,3421]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39059844 TCTGTTCTGTAGACCTACTTTTTTCATGCTGTAGTTATTATTTTTCTACTTCGGCTGCTC 39059903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       17 TCTGTTCTGTAGACCTACTTTTTTCATGCTGTAGTTATTATTTTTCTACTTCGGCTGCTC 76

 39059904 TTATCAAGATCAGGGCAATTAGCAGCAAAAACTTAACCTGCCATGGTGCTATCCATGGTC 39059963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       77 TTATCAAGATCAGGGCAATTAGCAGCAAAAACTTAACCTGCCATGGTGCTATCCATGGTC 136

 39059964 GGACAAATCTTCAGCTGTTCTTCTTACATATAAGCAACTACTCAGGGACAGAGAATGTGT 39060023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      137 GGACAAATCTTCAGCTGTTCTTCTTACATATAAGCAACTACTCAGGGACAGAGAATGTGT 196

 39060024 TTGTTGGTTCTAAATTACAGCTTGAGACCTAAACATATATCTTAATAGCTACTCTAGTTT 39060083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      197 TTGTTGGTTCTAAATTACAGCTTGAGACCTAAACATATATCTTAATAGCTACTCTAGTTT 256

 39060084 TAAAACCAAAAGTGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTGAGTGTTCTCT 39060143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      257 TAAAACCAAAAGTGCCATGATTTGTTTGACTAATTTCAGAATTTCTATTGAGTGTTCTCT 316

 39060144 GGTTCCAGGTAGCTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAATGAATTTTGG 39060203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      317 GGTTCCAGGTAGCTGCATGGGGATGGAGTCTTCATCTTTTTCATAGCAAATGAATTTTGG 376

 39060204 AACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTAAT 39060263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      377 AACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTAAT 436

 39060264 CAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTACAA 39060323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 CAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTACAA 496

 39060324 AACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAAAA 39060383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 AACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAAAA 556

 39060384 AGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTCCC 39060443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 AGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTCCC 616

 39060444 CAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAAAA 39060503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 CAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAAAA 676

 39060504 TATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACACTT 39060563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 TATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACACTT 736

 39060564 CTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATATCC 39060623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 CTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATATCC 796

 39060624 CTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAGGA 39060683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 CTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAGGA 856

 39060684 CACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCAAA 39060743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 CACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCAAA 916

 39060744 AAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACTAT 39060803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 AAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACTAT 976

 39060804 CTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTTGG 39060863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 CTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTTGG 1036

 39060864 CGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATAAA 39060923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 CGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATAAA 1096

 39060924 ATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGGCA 39060983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 ATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGGCA 1156

 39060984 TGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGTCC 39061043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 TGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGTCC 1216

 39061044 TCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACATAA 39061103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 TCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACATAA 1276

 39061104 TATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCATGG 39061163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCATGG 1336

 39061164 TTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGAGG 39061223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 TTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGAGG 1396

 39061224 AAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAAGA 39061283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 AAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAAGA 1456

 39061284 AAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGTGA 39061343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 AAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGTGA 1516

 39061344 CAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTGGC 39061403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 CAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTGGC 1576

 39061404 TTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAGCT 39061463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 TTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAGCT 1636

 39061464 TAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTGCA 39061523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 TAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTGCA 1696

 39061524 TCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTGAA 39061583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTGAA 1756

 39061584 AGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAGCT 39061643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 AGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAGCT 1816

 39061644 TCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAATG 39061703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAATG 1876

 39061704 CCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTCCA 39061763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 CCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTCCA 1936

 39061764 ATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGATCA 39061823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 ATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGATCA 1996

 39061824 ACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTAAC 39061883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 ACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTAAC 2056

 39061884 CTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAAGG 39061943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 CTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAAGG 2116

 39061944 GAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCATT 39062003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 GAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCATT 2176

 39062004 TTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCATTA 39062063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCATTA 2236

 39062064 GAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTTGC 39062123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 GAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTTGC 2296

 39062124 TGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGAGG 39062183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 TGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGAGG 2356

 39062184 CTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGAGT 39062243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 CTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGAGT 2416

 39062244 CTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTATT 39062303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 CTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTATT 2476

 39062304 TAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTAGC 39062363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 TAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTAGC 2536

 39062364 ATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTATTT 39062423
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 ATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTATTT 2596

 39062424 GGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGAAT 39062482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2597 GGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGAAT 2656

 39062483 TTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAAAT 39062542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 TTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAAAT 2716

 39062543 GAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAAAT 39062602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 GAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAAAT 2776

 39062603 TCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTTTT 39062662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 TCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTTTT 2836

 39062663 TGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCTGA 39062722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 TGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCTGA 2896

 39062723 AAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAGAG 39062782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 AAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAGAG 2956

 39062783 AGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCATTT 39062842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 AGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCATTT 3016

 39062843 GTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAATTT 39062902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 GTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAATTT 3076

 39062903 CCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGATGG 39062962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 CCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGATGG 3136

 39062963 CTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTTTA 39063022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 CTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTTTA 3196

 39063023 GAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACAAA 39063082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 GAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACAAA 3256

 39063083 GTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATCAA 39063142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 GTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATCAA 3316

 39063143 AGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTATGT 39063202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 AGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTATGT 3376

 39063203 ATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAA 39063237
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 ATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAA 3411

EXCISED REGION

 39063248 GGATGAGGTTCTATTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGA 39063307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 GGATGAGGTTCTATTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGA 3481

 39063308 GGTTCTAAAATCTACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGT 39063367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 GGTTCTAAAATCTACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGT 3541

 39063368 CTATAGGTTTCACGCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATA 39063427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 CTATAGGTTTCACGCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATA 3601

 39063428 AGTCAATTTTTAAAAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTT 39063487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 AGTCAATTTTTAAAAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTT 3661

 39063488 CTAATCTCCAGAATCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACC 39063547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 CTAATCTCCAGAATCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACC 3721

 39063548 TTGAGACAGCAAGATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCA 39063607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 TTGAGACAGCAAGATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCA 3781

 39063608 CTTCCTGGCTAAAGTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTG 39063667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 CTTCCTGGCTAAAGTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTG 3841

 39063668 GACCTATAATTACTGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCA 39063727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 GACCTATAATTACTGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCA 3901

 39063728 CCTCAAAGACTGGGAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCC 39063787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 CCTCAAAGACTGGGAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCC 3961

 39063788 TACAATGGAAAGGAACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTAC 39063847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 TACAATGGAAAGGAACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTAC 4021

 39063848 CTTAAAGTCTACAGAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCC 39063907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 CTTAAAGTCTACAGAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCC 4081

 39063908 CCATGCCAGATAATATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTAT 39063967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 CCATGCCAGATAATATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTAT 4141

 39063968 GGCAGCAATGGACATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATA 39064027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 GGCAGCAATGGACATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATA 4201

 39064028 ATAAATTTTGTATTTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGA 39064087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 ATAAATTTTGTATTTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGA 4261

 39064088 TTTCCCATAAATCCCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTAT 39064147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 TTTCCCATAAATCCCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTAT 4321

 39064148 GTGAGTCACAAACAGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTA 39064207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 GTGAGTCACAAACAGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTA 4381

 39064208 TTCAGGTTTGTTTCATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATT 39064267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4382 TTCAGGTTTGTTTCATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATT 4441

 39064268 AGACTTGTCTGATGTTTTT-TGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCA 39064326
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 AGACTTGTCTGATGTTTTTCTGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCA 4501

 39064327 CAGCAAAGTGCCATACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATC 39064386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 CAGCAAAGTGCCATACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATC 4561

 39064387 AGTGCGGATCACCTGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAG 39064446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 AGTGCGGATCACCTGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAG 4621

 39064447 CCATTGTATCTAGCCCACACTTAAGTGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGT 39064506
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 CCATTGTATCTAGCCCACACTTAAGGGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGT 4681

 39064507 AATAACTATATAATTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATT 39064566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 AATAACTATATAATTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATT 4741

 39064567 TATTTATTCAATACCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTG 39064626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 TATTTATTCAATACCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTG 4801

 39064627 GGTTATAGTTTAATGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGG 39064686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 GGTTATAGTTTAATGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGG 4861

 39064687 TTCTCTTTCAAATGACTCCTGTGTCCTTTTTACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACT 39064746
          .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4862 ATCTCTTTCAAATGACTCCTGTGTCCTTTTGACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACT 4921

 39064747 ACTTTCTTATTTTCTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCC 39064806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 ACTTTCTTATTTTCTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCC 4981

 39064807 AATCCTAGACTCATCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATT 39064866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4982 AATCCTAGACTCATCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATT 5041

 39064867 TAAAAATCAGTTGTGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACT 39064926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5042 TAAAAATCAGTTGTGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACT 5101

 39064927 TTCTCAGCTGAGAGAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTA 39064986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5102 TTCTCAGCTGAGAGAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTA 5161

 39064987 TCTATAAATATCTCTACATGTATCTTCCTGTATGTATGCAAAGCTAGACATGACCTCATA 39065046
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5162 TCTATAAATATCTCTACATGTATCTTCCTGTATGTATACAAAGCTAGACATGACCTCATA 5221

 39065047 TTGATGGCTCGAGGTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGT 39065106
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5222 TTGATGGCTCCAGGTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGT 5281

 39065107 CTAGAACCTCCCATTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTA 39065166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5282 CTAGAACCTCCCATTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTA 5341

 39065167 CATGTTCCATTGTACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCT 39065226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5342 CATGTTCCATTGTACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCT 5401

 39065227 TTACCAAGGAGAGTACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCA 39065286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5402 TTACCAAGGAGAGTACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCA 5461

 39065287 TTCATTTCTGGATTTACTTGGGTAAGCATCTTTTGCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTT 39065346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5462 TTCATTTCTGGATTTACTTGGGTAAGCATCTTTTCCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTT 5521

 39065347 CATACATTTGTATTTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAG 39065406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5522 CATACATTTGTATTTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAG 5581

 39065407 GTTTATTTTTTCCTTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAG 39065466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5582 GTTTATTTTTTCCTTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAG 5641

 39065467 GACTTAAAGAATGATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAA 39065526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5642 GACTTAAAGAATGATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAA 5701

 39065527 TATTAGGGGGAATTAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGT 39065586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5702 TATTAGGGGGAATTAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGT 5761

 39065587 TATTCCCTTTACTAGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTA 39065646
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5762 TATTCCCTTTACTAGGTTAAGGATTTCTATTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTA 5821

 39065647 TGAATAGGTATTGAACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAA 39065684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5822 TGAATAGGTATTGAACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAA 5859

Alignment time is 5.05898 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3129] =>      3129 nucs 'mol-32-2ff9-102264_3129'

Score:        3085
Aligned:      3129        nucs
Identic:      3125 (100%) nucs =>      3028 (100%)        97 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054284,39057315] EXCISED REGION [39060202,39060298]
 second seq =>  [       1,    3032] EXCISED REGION [    3033,    3129]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054284 AATGTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTT 39054343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTT 60

 39054344 CTTAAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTT 39054403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTAAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTT 120

 39054404 TATTCAATTCAATGAACATTATTGATTTCTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATG 39054463
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTCAATTCAATGAACATTATTGATTTGTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATG 180

 39054464 GTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCG 39054523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCG 240

 39054524 AACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCT 39054583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCT 300

 39054584 TGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTA 39054643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTA 360

 39054644 TGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAG 39054703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAG 420

 39054704 TAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGC 39054763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGC 480

 39054764 TTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTT 39054823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTT 540

 39054824 TCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAAT 39054883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAAT 600

 39054884 CTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGC 39054943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      601 CTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCAGC 660

 39054944 TGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTC 39055003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTC 720

 39055004 CTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGA 39055063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGA 780

 39055064 ATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTC 39055123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTC 840

 39055124 TTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATT 39055183
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATT 900

 39055184 GGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTA 39055243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTA 960

 39055244 GAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCAT 39055303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCAT 1020

 39055304 ACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTC 39055363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTC 1080

 39055364 CAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGAC 39055423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGAC 1140

 39055424 GACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAAT 39055483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAAT 1200

 39055484 GTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGG 39055543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGG 1260

 39055544 TGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGG 39055603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGG 1320

 39055604 TCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGC 39055663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGC 1380

 39055664 TATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTAT 39055723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTAT 1440

 39055724 GAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGG 39055783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGG 1500

 39055784 ACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGC 39055843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGC 1560

 39055844 TGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGT 39055903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGT 1620

 39055904 CCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAA 39055963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAA 1680

 39055964 CTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTT 39056023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTT 1740

 39056024 ACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGT 39056083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGT 1800

 39056084 ACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGT 39056143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGT 1860

 39056144 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAT 39056203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAT 1920

 39056204 CCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTG 39056263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTG 1980

 39056264 GTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACC 39056323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACC 2040

 39056324 AGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGA 39056383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGA 2100

 39056384 GTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAA 39056443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAA 2160

 39056444 AAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCA 39056503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCA 2220

 39056504 GGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAG 39056563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAG 2280

 39056564 CTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACT 39056623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACT 2340

 39056624 TAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTG 39056683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTG 2400

 39056684 GATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAA 39056743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAA 2460

 39056744 TGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCA 39056803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCA 2520

 39056804 ACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTAC 39056863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTAC 2580

 39056864 AAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTAC 39056923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTAC 2640

 39056924 TGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATT 39056983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATT 2700

 39056984 AATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCAT 39057043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCAT 2760

 39057044 GAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAA 39057103
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAA 2820

 39057104 ATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCAT 39057163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCAT 2880

 39057164 ATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAG 39057223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAG 2940

 39057224 TTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAAT 39057283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAAT 3000

 39057284 TAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 3032

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 3092

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACT 39060298
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACT 3129

Alignment time is 2.56265 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2582] =>      2582 nucs 'mol-32-300f-059795_2582'

Score:        2549
Aligned:      2582        nucs
Identic:      2579 (100%) nucs =>      2557 (100%)        22 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054756,39057315] EXCISED REGION [39060202,39060223]
 second seq =>  [       1,    2560] EXCISED REGION [    2561,    2582]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054756 AAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGT 39054815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGT 60

 39054816 GCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAAC 39054875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAAC 120

 39054876 CTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGA 39054935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGA 180

 39054936 AGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATC 39054995
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATCAGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATC 240

 39054996 CACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGAC 39055055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGAC 300

 39055056 CAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATA 39055115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATA 360

 39055116 CTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCA 39055175
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCA 420

 39055176 GAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGC 39055235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGC 480

 39055236 CTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACC 39055295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACC 540

 39055296 TCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGG 39055355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGG 600

 39055356 TCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCT 39055415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCT 660

 39055416 ACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAAT 39055475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAAT 720

 39055476 AAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAA 39055535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAA 780

 39055536 TAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGAT 39055595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGAT 840

 39055596 TATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTT 39055655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTT 900

 39055656 TTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCA 39055715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCA 960

 39055716 TTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCT 39055775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCT 1020

 39055776 TAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTG 39055835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTG 1080

 39055836 TAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTC 39055895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTC 1140

 39055896 CTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGAT 39055955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGAT 1200

 39055956 TGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTT 39056015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTT 1260

 39056016 TTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATG 39056075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATG 1320

 39056076 AAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTC 39056135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTC 1380

 39056136 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTC 39056195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTC 1440

 39056196 GAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGC 39056255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGC 1500

 39056256 TGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAG 39056315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAG 1560

 39056316 CTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTG 39056375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTG 1620

 39056376 GTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAA 39056435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAA 1680

 39056436 AAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTC 39056495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTC 1740

 39056496 ACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCA 39056555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCA 1800

 39056556 AATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGC 39056615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGC 1860

 39056616 CTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTAT 39056675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTAT 1920

 39056676 AATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCT 39056735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCT 1980

 39056736 GATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTA 39056795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTA 2040

 39056796 ACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAG 39056855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAG 2100

 39056856 GAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAG 39056915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAG 2160

 39056916 CCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTT 39056975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTT 2220

 39056976 CCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAA 39057035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAA 2280

 39057036 ATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAA 39057095
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATCCATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAA 2340

 39057096 TTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCC 39057155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCC 2400

 39057156 TTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAA 39057215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAA 2460

 39057216 CATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGAT 39057275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGAT 2520

 39057276 TGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 2560

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATG 39060223
          ||||||||||||||||||||||
     2561 GGAACAAAATTTGCCTGTAATG 2582

Alignment time is 2.13529 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8479] =>      8479 nucs 'mol-32-30f6-031615_8479'

Score:        8314
Aligned:      8479        nucs
Identic:      8464 (100%) nucs =>      2880 (100%)      5584 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054433,39057315] EXCISED REGION [39060202,39065795]
 second seq =>  [       1,    2883] EXCISED REGION [    2884,    8479]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054433 TAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGT 39054492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGT 60

 39054493 AGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCC 39054552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCC 120

 39054553 TCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTA 39054612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTA 180

 39054613 ATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACA 39054672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACA 240

 39054673 TAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCA 39054732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCA 300

 39054733 CAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCT 39054792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCT 360

 39054793 CTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCC 39054852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCC 420

 39054853 CTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGT 39054912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGT 480

 39054913 TGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGG 39054972
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCAGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGG 540

 39054973 ATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGA 39055032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGA 600

 39055033 AAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGAT 39055092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGAT 660

 39055093 AACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATAT 39055152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      661 AACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATAT 720

 39055153 GAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGG 39055212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGG 780

 39055213 TCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGG 39055272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGG 840

 39055273 AAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTG 39055332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTG 900

 39055333 AGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCT 39055392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCT 960

 39055393 TGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAG 39055452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAG 1020

 39055453 ACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCA 39055512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCA 1080

 39055513 TTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAG 39055572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAG 1140

 39055573 ATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATT 39055632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATT 1200

 39055633 TCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACT 39055692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACT 1260

 39055693 GAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAA 39055752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAA 1320

 39055753 AAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCT 39055812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCT 1380

 39055813 GGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGC 39055872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGC 1440

 39055873 TTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTA 39055932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTA 1500

 39055933 GTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAA 39055992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAA 1560

 39055993 AAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGC 39056052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGC 1620

 39056053 ATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATT 39056112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATT 1680

 39056113 GCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGG 39056172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGG 1740

 39056173 GCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCT 39056232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCT 1800

 39056233 ACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTC 39056292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTC 1860

 39056293 AGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 39056352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 1920

 39056353 TCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAA 39056412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAA 1980

 39056413 CAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGT 39056472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGT 2040

 39056473 GGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGG 39056532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGG 2100

 39056533 GTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGG 39056592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGG 2160

 39056593 GCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTA 39056652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTA 2220

 39056653 TATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGA 39056712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGA 2280

 39056713 ATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCAC 39056772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCAC 2340

 39056773 AGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGAC 39056832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGAC 2400

 39056833 ACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCC 39056892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCC 2460

 39056893 ATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTC 39056952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTC 2520

 39056953 TGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACAC 39057012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACAC 2580

 39057013 TGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAA 39057072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2581 TGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAA 2640

 39057073 AAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCT 39057132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCT 2700

 39057133 GAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGA 39057192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGA 2760

 39057193 GTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCT 39057252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCT 2820

 39057253 ATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTT 39057312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTT 2880

 39057313 TGA 39057315
          |||
     2881 TGA 2883

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 2943

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 3003

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 3063

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 3123

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 3183

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 3243

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 3303

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 3363

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 3423

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 3483

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 3543

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 3603

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 3663

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 3723

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 3783

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 3843

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 3903

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 3963

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 4023

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 4083

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 4143

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 4203

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 4263

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 4323

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 4383

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 39061761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 4443

 39061762 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 39061821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 4503

 39061822 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 39061881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 4563

 39061882 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 39061941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 4623

 39061942 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 39062001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 4683

 39062002 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 39062061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 4743

 39062062 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 39062121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 4803

 39062122 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 39062181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 4863

 39062182 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 39062241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 4923

 39062242 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 39062301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 4983

 39062302 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 39062361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 5043

 39062362 GCATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 39062421
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 GCATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 5103

 39062422 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGA 39062480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     5104 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGA 5163

 39062481 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 39062540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 5223

 39062541 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 39062600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 5283

 39062601 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 39062660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 5343

 39062661 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 39062720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 5403

 39062721 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 39062780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 5463

 39062781 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 39062840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 5523

 39062841 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 39062900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 5583

 39062901 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 39062960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 5643

 39062961 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 39063020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 5703

 39063021 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 39063080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 5763

 39063081 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 39063140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 5823

 39063141 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 39063200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 5883

 39063201 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAATTGAAGGGAGGGATGAGGTTCTA 39063260
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
     5884 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAACTGAAGGGAAGGATGAGGTTCTA 5943

 39063261 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 39063320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5944 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 6003

 39063321 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 39063380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6004 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 6063

 39063381 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 39063440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6064 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 6123

 39063441 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 39063500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6124 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 6183

 39063501 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 39063560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6184 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 6243

 39063561 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 39063620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6244 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 6303

 39063621 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 39063680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6304 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 6363

 39063681 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 39063740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6364 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 6423

 39063741 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 39063800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6424 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 6483

 39063801 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 39063860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6484 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 6543

 39063861 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 39063920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6544 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 6603

 39063921 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 39063980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6604 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 6663

 39063981 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 39064040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 6723

 39064041 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 39064100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6724 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 6783

 39064101 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 39064160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 6843

 39064161 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 39064220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 6903

 39064221 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 39064280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 6963

 39064281 GTTTTT-TGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 39064339
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6964 GTTTTTCTGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 7023

 39064340 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 39064399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7024 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 7083

 39064400 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 39064459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7084 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 7143

 39064460 CCCACACTTAAGTGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAA 39064519
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7144 CCCACACTTAAGGGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAA 7203

 39064520 TTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATA 39064579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7204 TTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATA 7263

 39064580 CCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAA 39064639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7264 CCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAA 7323

 39064640 TGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGTTCTCTTTCAAAT 39064699
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7324 TGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGATCTCTTTCAAAT 7383

 39064700 GACTCCTGTGTCCTTTTTACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTT 39064759
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 GACTCCTGTGTCCTTTTGACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTT 7443

 39064760 CTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCA 39064819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 CTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCA 7503

 39064820 TCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTG 39064879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 TCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTG 7563

 39064880 TGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGA 39064939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 TGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGA 7623

 39064940 GAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCT 39064999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 GAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCT 7683

 39065000 CTACATGTATCTTCCTGTATGTATGCAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCGAG 39065059
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7684 CTACATGTATCTTCCTGTATGTATACAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCCAG 7743

 39065060 GTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCA 39065119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7744 GTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCA 7803

 39065120 TTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGT 39065179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7804 TTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGT 7863

 39065180 ACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAG 39065239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7864 ACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAG 7923

 39065240 TACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGAT 39065299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7924 TACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGAT 7983

 39065300 TTACTTGGGTAAGCATCTTTTGCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTAT 39065359
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7984 TTACTTGGGTAAGCATCTTTTCCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTAT 8043

 39065360 TTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCC 39065419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8044 TTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCC 8103

 39065420 TTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATG 39065479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8104 TTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATG 8163

 39065480 ATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAAT 39065539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 ATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAAT 8223

 39065540 TAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACT 39065599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 TAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACT 8283

 39065600 AGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTG 39065659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8284 AGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTG 8343

 39065660 AACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCAT 39065719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8344 AACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCAT 8403

 39065720 TCTGTCAATATGATACATGATATTAATTTATTTGTGAAAGTTGGAAGCAATATTGCATTC 39065779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8404 TCTGTCAATATGATACATGATATTAATTTATTTGTGAAAGTTGGAAGCAATATTGCATTC 8463

 39065780 CTGGAATAAACCATTT 39065795
          ||||||||||||||||
     8464 CTGGAATAAACCATTT 8479

Alignment time is 6.77768 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2887] =>      2887 nucs 'mol-32-30f6-031615_2887'

Score:        2864
Aligned:      2886        nucs
Identic:      2884 (100%) nucs =>       508 (100%)      2376 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054433,39054940] EXCISED REGION [39054942,39057319]
 second seq =>  [       1,     508] EXCISED REGION [     510,    2887]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39054941,39054941]
 second seq =>         1 nucs [509,509]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39054941,39054941] to [39054942,39054942]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054433 TAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGT 39054492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGT 60

 39054493 AGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCC 39054552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCC 120

 39054553 TCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTA 39054612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTA 180

 39054613 ATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACA 39054672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACA 240

 39054673 TAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCA 39054732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCA 300

 39054733 CAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCT 39054792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCT 360

 39054793 CTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCC 39054852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCC 420

 39054853 CTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGT 39054912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGT 480

 39054913 TGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATC 39054940
          ||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATC 508

EXCISED REGION

 39054942 GCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGG 39055001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 GCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGG 569

 39055002 TCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAA 39055061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 TCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAA 629

 39055062 GAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAG 39055121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 GAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAG 689

 39055122 TCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGA 39055181
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 TCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGA 749

 39055182 TTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTC 39055241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 TTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTC 809

 39055242 TAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATC 39055301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATC 869

 39055302 ATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCT 39055361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 ATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCT 929

 39055362 TCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAG 39055421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 TCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAG 989

 39055422 ACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGA 39055481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 ACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGA 1049

 39055482 ATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGT 39055541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 ATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGT 1109

 39055542 GGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGAT 39055601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 GGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGAT 1169

 39055602 GGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTT 39055661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 GGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTT 1229

 39055662 GCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTT 39055721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 GCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTT 1289

 39055722 ATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAG 39055781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 ATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAG 1349

 39055782 GGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCA 39055841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 GGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCA 1409

 39055842 GCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTT 39055901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 GCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTT 1469

 39055902 GTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTG 39055961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 GTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTG 1529

 39055962 AACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTT 39056021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 AACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTT 1589

 39056022 TTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGT 39056081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGT 1649

 39056082 GTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCT 39056141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 GTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCT 1709

 39056142 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACC 39056201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACC 1769

 39056202 ATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGG 39056261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 ATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGG 1829

 39056262 TGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAA 39056321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 TGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAA 1889

 39056322 CCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACG 39056381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACG 1949

 39056382 GAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAA 39056441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 GAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAA 2009

 39056442 AAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGG 39056501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 AAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGG 2069

 39056502 CAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTC 39056561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 CAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTC 2129

 39056562 AGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAA 39056621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAA 2189

 39056622 CTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGAT 39056681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 CTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGAT 2249

 39056682 TGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTA 39056741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTA 2309

 39056742 AATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAG 39056801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 AATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAG 2369

 39056802 CAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGT 39056861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 CAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGT 2429

 39056862 ACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTT 39056921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 ACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTT 2489

 39056922 ACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAA 39056981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 ACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAA 2549

 39056982 TTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCC 39057041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCC 2609

 39057042 ATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAA 39057101
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 ATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAA 2669

 39057102 AAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACC 39057161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 AAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACC 2729

 39057162 ATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTAT 39057221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 ATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTAT 2789

 39057222 AGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGA 39057281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 AGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGA 2849

 39057282 ATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAA 39057319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 ATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAA 2887

Alignment time is 2.36643 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,   10415] =>     10415 nucs 'mol-32-310c-215940_10415'

Score:       10196
Aligned:     10416        nucs
Identic:     10396 (100%) nucs =>      4786 (100%)      5610 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39052522,39057315] EXCISED REGION [39060202,39065821]
 second seq =>  [       1,    4793] EXCISED REGION [    4794,   10415]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39052522 AAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAAATGGCTTTCATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCA 39052581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAAATGGCTTTTATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCA 60

 39052582 AACATAAGCTTATTGTTACCTAATACCTACATTATTCATAATATCTAGGATTGATAAGCC 39052641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACATAAGCTTATTGTTACCTAATACCTACATTATTCATAATATCTAGGATTGATAAGCC 120

 39052642 ACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAAAACAAGAAATACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAG 39052701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAAAACAAGAAATACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAG 180

 39052702 TCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTAACAGAATTAAAGCTCTATTAAACTTTACAGAAAC 39052761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTAACAGAATTAAAGCTCTATTAAACTTTACAGAAAC 240

 39052762 TATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAAAACCCTCACAGGATAACTCTCAGTA 39052821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAAAACCCTCACAGGATAACTCTCAGTA 300

 39052822 GATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACCAAATAGAATTACAGAGGTATTTATT 39052881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACCAAATAGAATTACAGAGGTATTTATT 360

 39052882 TCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGACATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAA 39052941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGACATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAA 420

 39052942 AAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTTCTCTAGCCCAATATAATACTATCAC 39053001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTTCTCTAGCCCAATATAATACTATCAC 480

 39053002 AATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATTTTCAAAGAGATTTCAAGTACACTAT 39053061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATTTTCAAAGAGATTTCAAGTACACTAT 540

 39053062 TTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGAAACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCA 39053121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGAAACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCA 600

 39053122 ACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCCAAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGG 39053181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCCAAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGG 660

 39053182 GTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAATGGATAACACCTCCGACCAGGGGGAA 39053241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAATGGATAACACCTCCGACCAGGGGGAA 720

 39053242 AATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAGAATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAAT 39053301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAGAATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAAT 780

 39053302 ATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAACACATTTATATCTTCAATGAAGAGG 39053361
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      781 ATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAACACATTTATATCTTCAATGAAGGGG 840

 39053362 CAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAATCAAATTCTTGGATGAAAGAATTTAC 39053421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAATCAAATTCTTGGATGAAAGAATTTAC 900

 39053422 AAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGA 39053481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGA 960

 39053482 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCC 39053541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCC 1020

 39053542 GCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCA 39053601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCA 1080

 39053602 CCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCTGTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGA 39053661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCTGTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGA 1140

 39053662 GCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAACATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTG 39053721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAACATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTG 1200

 39053722 TACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTCATCACATCAATGGTCAGCCAACATC 39053781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTCATCACATCAATGGTCAGCCAACATC 1260

 39053782 AAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAACTGATTA 39053841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCAAAGAAAATGTATTTCTAACTGATTA 1320

 39053842 GCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAG 39053901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGGCAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAG 1380

 39053902 CAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAAATCAGTG 39053961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAGAACAATAAATGGGGGGAAATCAGTG 1440

 39053962 TAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGTTAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTT 39054021
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAACTTGAAAAAATCAGGAGACAAGTTAATAGGTATTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTT 1500

 39054022 ACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATATAGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAA 39054081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATATAGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAA 1560

 39054082 ACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAAGAAAATGATTCACTACATTTTTTAT 39054141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAAGAAAATGATTCACTACATTTTTTAT 1620

 39054142 TATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATA 39054201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGTGTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATA 1680

 39054202 AATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACA 39054261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGGGGATCAAATCATAGAAGAAAACACA 1740

 39054262 TTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATA 39054321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAGAATTTTCACAAAATGTTATAATATA 1800

 39054322 TAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTT 39054381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATTTAAACTTTCAATGGGATTGGACTTT 1860

 39054382 TGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAATGAACATTATTGATTTCTAATTAATT 39054441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1861 TGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAATGAACATTATTGATTTGTAATTAATT 1920

 39054442 AATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCA 39054501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCA 1980

 39054502 ATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCC 39054561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCC 2040

 39054562 CAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTT 39054621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTT 2100

 39054622 TCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTT 39054681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTT 2160

 39054682 TACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAA 39054741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAA 2220

 39054742 GCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATC 39054801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATC 2280

 39054802 CTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTC 39054861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTC 2340

 39054862 AGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGA 39054921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGA 2400

 39054922 ATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGT 39054981
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTAATCAAAAGGAAGATCAGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGT 2460

 39054982 ATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGAC 39055041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGAC 2520

 39055042 CTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAAC 39055101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAAC 2580

 39055102 AATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATG 39055161
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATG 2640

 39055162 TACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACC 39055221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACC 2700

 39055222 CAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCA 39055281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCA 2760

 39055282 AAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCA 39055341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCA 2820

 39055342 ACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCC 39055401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCC 2880

 39055402 CCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGA 39055461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGA 2940

 39055462 AACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATG 39055521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATG 3000

 39055522 CAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATC 39055581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATC 3060

 39055582 CAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAA 39055641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAA 3120

 39055642 ATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAA 39055701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAA 3180

 39055702 GTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGC 39055761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGC 3240

 39055762 TAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAAT 39055821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAAT 3300

 39055822 GACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTT 39055881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTT 3360

 39055882 GAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAG 39055941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAG 3420

 39055942 GCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAA 39056001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAA 3480

 39056002 TGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAG 39056061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAG 3540

 39056062 AGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCT 39056121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCT 3600

 39056122 GGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCAC 39056181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCAC 3660

 39056182 AAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAAT 39056241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAAT 3720

 39056242 ACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTG 39056301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTG 3780

 39056302 AGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCAC 39056361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCAC 3840

 39056362 TGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAA 39056421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAA 3900

 39056422 AACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGG 39056481
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AACAAACCAACAAAAAAAAAAAAA-CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGG 3959

 39056482 CAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATG 39056541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATG 4019

 39056542 CAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTC 39056601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTC 4079

 39056602 TTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCA 39056661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCA 4139

 39056662 ATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTC 39056721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 ATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTC 4199

 39056722 AGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATC 39056781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATC 4259

 39056782 TAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACAT 39056841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACAT 4319

 39056842 TAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTT 39056901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTT 4379

 39056902 TTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTG 39056961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTG 4439

 39056962 GAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTA 39057021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 GAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTA 4499

 39057022 TGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAG 39057081
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAG 4559

 39057082 ATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATT 39057141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 ATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATT 4619

 39057142 TATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAAC 39057201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAAC 4679

 39057202 CATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCT 39057261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 CATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCT 4739

 39057262 GCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 4793

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 4853

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 4913

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 4973

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 5033

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 5093

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 5153

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 5213

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 5273

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 5333

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 5393

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 5453

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 5513

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 5573

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 5633

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 5693

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 5753

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 5813

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 5873

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 5933

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 5993

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 6053

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 6113

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 6173

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 6233

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 6293

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 39061761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 6353

 39061762 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 39061821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 6413

 39061822 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 39061881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 6473

 39061882 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 39061941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 6533

 39061942 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 39062001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 6593

 39062002 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 39062061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 6653

 39062062 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 39062121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 6713

 39062122 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 39062181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 6773

 39062182 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 39062241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 6833

 39062242 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 39062301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 6893

 39062302 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 39062361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 6953

 39062362 GCATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 39062421
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 GCATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 7013

 39062422 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGA 39062480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     7014 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGA 7073

 39062481 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 39062540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 7133

 39062541 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 39062600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7134 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 7193

 39062601 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 39062660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 7253

 39062661 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 39062720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 7313

 39062721 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 39062780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 7373

 39062781 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 39062840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 7433

 39062841 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 39062900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 7493

 39062901 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 39062960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 7553

 39062961 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 39063020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7554 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 7613

 39063021 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 39063080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7614 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 7673

 39063081 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 39063140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 7733

 39063141 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 39063200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 7793

 39063201 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAATTGAAGGGAGGGATGAGGTTCTA 39063260
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
     7794 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAACTGAAGGGAAGGATGAGGTTCTA 7853

 39063261 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 39063320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 7913

 39063321 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 39063380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 7973

 39063381 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 39063440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 8033

 39063441 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 39063500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 8093

 39063501 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 39063560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 8153

 39063561 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 39063620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8154 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 8213

 39063621 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 39063680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8214 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 8273

 39063681 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 39063740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8274 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 8333

 39063741 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 39063800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8334 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 8393

 39063801 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 39063860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8394 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 8453

 39063861 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 39063920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8454 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 8513

 39063921 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 39063980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8514 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 8573

 39063981 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 39064040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8574 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 8633

 39064041 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 39064100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8634 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 8693

 39064101 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 39064160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8694 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 8753

 39064161 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 39064220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8754 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 8813

 39064221 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 39064280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8814 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 8873

 39064281 GTTTTT-TGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 39064339
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8874 GTTTTTCTGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 8933

 39064340 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 39064399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8934 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 8993

 39064400 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 39064459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8994 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 9053

 39064460 CCCACACTTAAGTGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAA 39064519
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9054 CCCACACTTAAGGGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAA 9113

 39064520 TTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATA 39064579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9114 TTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATA 9173

 39064580 CCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAA 39064639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9174 CCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAA 9233

 39064640 TGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGTTCTCTTTCAAAT 39064699
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     9234 TGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGATCTCTTTCAAAT 9293

 39064700 GACTCCTGTGTCCTTTTTACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTT 39064759
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9294 GACTCCTGTGTCCTTTTGACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTT 9353

 39064760 CTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCA 39064819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9354 CTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCA 9413

 39064820 TCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTG 39064879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9414 TCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTG 9473

 39064880 TGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGA 39064939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9474 TGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGA 9533

 39064940 GAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCT 39064999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9534 GAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCT 9593

 39065000 CTACATGTATCTTCCTGTATGTATGCAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCGAG 39065059
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     9594 CTACATGTATCTTCCTGTATGTATACAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCCAG 9653

 39065060 GTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCA 39065119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9654 GTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCA 9713

 39065120 TTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGT 39065179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9714 TTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGT 9773

 39065180 ACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAG 39065239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9774 ACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAG 9833

 39065240 TACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGAT 39065299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9834 TACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGAT 9893

 39065300 TTACTTGGGTAAGCATCTTTTGCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTAT 39065359
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9894 TTACTTGGGTAAGCATCTTTTCCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTAT 9953

 39065360 TTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCC 39065419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9954 TTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCC 10013

 39065420 TTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATG 39065479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10014 TTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATG 10073

 39065480 ATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAAT 39065539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10074 ATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAAT 10133

 39065540 TAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACT 39065599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10134 TAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACT 10193

 39065600 AGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTG 39065659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10194 AGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTG 10253

 39065660 AACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCAT 39065719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10254 AACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCAT 10313

 39065720 TCTGTCAATATGATACATGATATTAATTTATTTGTGAAAGTTGGAAGCAATATTGCATTC 39065779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10314 TCTGTCAATATGATACATGATATTAATTTATTTGTGAAAGTTGGAAGCAATATTGCATTC 10373

 39065780 CTGGAATAAACCATTTGGTTTTGATGTATTAACCTTTTTGTA 39065821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10374 CTGGAATAAACCATTTGGTTTTGATGTATTAACCTTTTTGTA 10415

Alignment time is 8.37274 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4797] =>      4797 nucs 'mol-32-310c-215940_4797'

Score:        4720
Aligned:      4797        nucs
Identic:      4790 (100%) nucs =>        34 (100%)      4756 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39052522,39052555] EXCISED REGION [39052557,39057319]
 second seq =>  [       1,      34] EXCISED REGION [      36,    4797]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39052556,39052556]
 second seq =>         1 nucs [35,35]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [39056433,39056433]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [32,34] to [33,35]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39052522 AAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAAATGGCTTT 39052555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAAATGGCTTT 34

EXCISED REGION

 39052557 ATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATACCTACATTAT 39052616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       36 ATCTCCAAATCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATACCTACATTAT 95

 39052617 TCATAATATCTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAAAACAAGAAA 39052676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       96 TCATAATATCTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAAAACAAGAAA 155

 39052677 TACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTAACAGAATTA 39052736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 TACTGGAAGATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTAACAGAATTA 215

 39052737 AAGCTCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAA 39052796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 AAGCTCTATTAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAA 275

 39052797 AACCCTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACC 39052856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 AACCCTCACAGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACC 335

 39052857 AAATAGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGAC 39052916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 AAATAGAATTACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGAC 395

 39052917 ATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTT 39052976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 ATATATTTTGTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTT 455

 39052977 CTCTAGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATT 39053036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 CTCTAGCCCAATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATT 515

 39053037 TTCAAAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGA 39053096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 TTCAAAGAGATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGA 575

 39053097 AACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCC 39053156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 AACCAGTACTCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCC 635

 39053157 AAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAAT 39053216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 AAGGTGGCCTTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAAT 695

 39053217 GGATAACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAG 39053276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 GGATAACACCTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAG 755

 39053277 AATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAA 39053336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 AATTCTTGCATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAA 815

 39053337 CACATTTATATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAAT 39053396
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 CACATTTATATCTTCAATGAAGGGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAAT 875

 39053397 CAAATTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTT 39053456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 CAAATTCTTGGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTT 935

 39053457 CTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGC 39053516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 CTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGC 995

 39053517 GCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCC 39053576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 GCGATCTCGCCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCC 1055

 39053577 TCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCT 39053636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 TCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCT 1115

 39053637 GTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAA 39053696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 GTGCAAATGGTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAA 1175

 39053697 CATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTC 39053756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 CATCTGGTAAATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTC 1235

 39053757 ATCACATCAATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCA 39053816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 ATCACATCAATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCA 1295

 39053817 AAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGG 39053876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 AAGAAAATGTATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGG 1355

 39053877 CAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAG 39053936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 CAACTTTGTTTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAG 1415

 39053937 AACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGTTAATAGGTA 39053996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1416 AACAATAAATGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGACAAGTTAATAGGTA 1475

 39053997 TTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATAT 39054056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TTGAGTAAAGTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATAT 1535

 39054057 AGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAA 39054116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 AGAGGAGAATGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAA 1595

 39054117 GAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGT 39054176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 GAAAATGATTCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGT 1655

 39054177 GTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGG 39054236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 GTTAAGAAATGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGG 1715

 39054237 GGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAG 39054296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 GGATCAAATCATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAG 1775

 39054297 AATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATT 39054356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 AATTTTCACAAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATT 1835

 39054357 TAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAAT 39054416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TAAACTTTCAATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAAT 1895

 39054417 GAACATTATTGATTTCTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTC 39054476
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 GAACATTATTGATTTGTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTC 1955

 39054477 ACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTC 39054536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 ACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTC 2015

 39054537 AAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCAC 39054596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 AAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCAC 2075

 39054597 CGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCT 39054656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 CGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCT 2135

 39054657 TACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAAT 39054716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAAT 2195

 39054717 TATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAG 39054776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAG 2255

 39054777 AATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAAT 39054836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 AATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAAT 2315

 39054837 GATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAAC 39054896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 GATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAAC 2375

 39054897 CCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTA 39054956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2376 CCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCAGCTGAGCTTGATCTA 2435

 39054957 CTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACC 39055016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 CTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACC 2495

 39055017 AGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATT 39055076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 AGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATT 2555

 39055077 TCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTT 39055136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2556 TCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTT 2615

 39055137 CTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAG 39055196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 CTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAG 2675

 39055197 GACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCA 39055256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 GACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCA 2735

 39055257 GTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAG 39055316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 GTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAG 2795

 39055317 CATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCA 39055376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 CATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCA 2855

 39055377 AAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACT 39055436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 AAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACT 2915

 39055437 GGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCC 39055496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 GGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCC 2975

 39055497 ACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCT 39055556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 ACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCT 3035

 39055557 ACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAA 39055616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 ACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAA 3095

 39055617 CATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGC 39055676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 CATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGC 3155

 39055677 TGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATA 39055736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 TGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATA 3215

 39055737 TCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAA 39055796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 TCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAA 3275

 39055797 CAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAA 39055856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 CAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAA 3335

 39055857 TGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCA 39055916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCA 3395

 39055917 CAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCAT 39055976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 CAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCAT 3455

 39055977 AAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGA 39056036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 AAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGA 3515

 39056037 TGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATA 39056096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 TGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATA 3575

 39056097 ATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT 39056156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 ATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT 3635

 39056157 TGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATG 39056216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 TGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATG 3695

 39056217 GTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCT 39056276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 GTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCT 3755

 39056277 ATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGG 39056336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 ATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGG 3815

 39056337 TTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTC 39056396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 TTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTC 3875

 39056397 TCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGT 39056456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     3876 TCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAAC-AAAAAAAAAAAAACAAAATGAGT 3934

 39056457 CGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAG 39056516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 CGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAG 3994

 39056517 AAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAA 39056576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 AAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAA 4054

 39056577 TTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAAT 39056636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 TTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAAT 4114

 39056637 GATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGC 39056696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 GATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGC 4174

 39056697 CACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACC 39056756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 CACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACC 4234

 39056757 TAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACA 39056816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 TAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACA 4294

 39056817 GGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAA 39056876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 GGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAA 4354

 39056877 GGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAA 39056936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 GGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAA 4414

 39056937 ACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGC 39056996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 ACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGC 4474

 39056997 AACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAA 39057056
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4475 AACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTAGGACAA 4534

 39057057 TTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAA 39057116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 TTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAA 4594

 39057117 ATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTAC 39057176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 ATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTAC 4654

 39057177 TAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGA 39057236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 TAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGA 4714

 39057237 TTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAAT 39057296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAAT 4774

 39057297 TAAAACATGCCATCTTTGAGGAA 39057319
          |||||||||||||||||||||||
     4775 TAAAACATGCCATCTTTGAGGAA 4797

Alignment time is 3.87761 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,   11967] =>     11967 nucs 'mol-32-3311-180131_11967'

Score:       11781
Aligned:     11968        nucs
Identic:     11951 (100%) nucs =>      8038 (100%)      3913 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39049266,39057315] EXCISED REGION [39060202,39064118]
 second seq =>  [       1,    8049] EXCISED REGION [    8050,   11967]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39049266 CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCCATCTGGGCTCACTCACTGCAACCTCTGTC 39049325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCCATCTGGGCTCACTCACTGCAACCTCTGTC 60

 39049326 TCCGATTCTCCTGCCTCAGCCACCCAAGTTGCTGGGATTACAGGCTCCTGCCACCTACAC 39049385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCGATTCTCCTGCCTCAGCCACCCAAGTTGCTGGGATTACAGGCTCCTGCCACCTACAC 120

 39049386 CCGGCCAATTTTTTGTATTTTTATTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTC 39049445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCGGCCAATTTTTTGTATTTTTATTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTC 180

 39049446 TTTAGCTCCCGACCTCAAATGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAACTGCTGGGATTATAA 39049505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTAGCTCCCGACCTCAAATGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAACTGCTGGGATTATAA 240

 39049506 GTGTGAACCACCGCCTCCGGCCTAATTTACCTTTTTAAGCCTTTAGTTGATGGAATGAAA 39049565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTGAACCACCGCCTCCGGCCTAATTTACCTTTTTAAGCCTTTAGTTGATGGAATGAAA 300

 39049566 AGTAACAATTCAGTGGGCGACTAAGAGAGAAGAAAATGGCATTTGTTTCCTGTCAGAACT 39049625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTAACAATTCAGTGGGCGACTAAGAGAGAAGAAAATGGCATTTGTTTCCTGTCAGAACT 360

 39049626 GGAATTTGATTGTTGCTAACATTTCTGAACATAGCAGTTACTTAAGCAGAAAAAAGAGGA 39049685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAATTTGATTGTTGCTAACATTTCTGAACATAGCAGTTACTTAAGCAGAAAAAAGAGGA 420

 39049686 GAGAAAAAGACAACACATCTAAAAGCAAAAAAATGTGTCCTTTCCTTTTATTCTTGGTTG 39049745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAAAAAGACAACACATCTAAAAGCAAAAAAATGTGTCCTTTCCTTTTATTCTTGGTTG 480

 39049746 ATGGAACCCAGTGTATAATGAAATCAACTTTGTTCCCCTCTTGGTCTTGGAGGTCCCATT 39049805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGAACCCAGTGTATAATGAAATCAACTTTGTTCCCCTCTTGGTCTTGGAGGTCCCATT 540

 39049806 TGGTTCTTTTATGTCAGTCTTTGTAGTTGCCATCCCTCATGTATCAGACCAGCTTTCACA 39049865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGTTCTTTTATGTCAGTCTTTGTAGTTGCCATCCCTCATGTATCAGACCAGCTTTCACA 600

 39049866 AGTTCAGGTGGGCTGTCTTGCGTTTGGTGATGCTGGCTCTCCACGGCCCAATTACAAGGA 39049925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTTCAGGTGGGCTGTCTTGCGTTTGGTGATGCTGGCTCTCCACGGCCCAATTACAAGGA 660

 39049926 TAAGGCATGCTTGTGAACAAAGCTGTTAACCCTTAGATCTTACCACAAGGTAGCATATAG 39049985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAGGCATGCTTGTGAACAAAGCTGTTAACCCTTAGATCTTACCACAAGGTAGCATATAG 720

 39049986 ATGGAGGACAAAACTCCTCAGGTCACTTTGATTGTCTTTGTCTCTTATGGTGCAAAGTGA 39050045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGGAGGACAAAACTCCTCAGGTCACTTTGATTGTCTTTGTCTCTTATGGTGCAAAGTGA 780

 39050046 TGACCTAGACAGTAACAAGGCCTTGATTATCTATCCCCCAGGGTCCAAAAGCAAATACAC 39050105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGACCTAGACAGTAACAAGGCCTTGATTATCTATCCCCCAGGGTCCAAAAGCAAATACAC 840

 39050106 ATGACCTTTTCATTTTGAAAAAAAAATCAAAAGTAACCAGGGGCTAGGTGTGAACTGTTT 39050165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGACCTTTTCATTTTGAAAAAAAAATCAAAAGTAACCAGGGGCTAGGTGTGAACTGTTT 900

 39050166 CTCTTAAGATTGAATCTTTGCAAAAAGAATTTGCTAAAGAATATAGTCCCTCAGCCAGGC 39050225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTTAAGATTGAATCTTTGCAAAAAGAATTTGCTAAAGAATATAGTCCCTCAGCCAGGC 960

 39050226 ACGGTGGCTCACACCCGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACTTGA 39050285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACGGTGGCTCACACCCGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACTTGA 1020

 39050286 GGTCAGGAGTTTGAGACCAACTTGGGCCACCATGGTTAAGCCCCATCTCCACTAAAAATA 39050345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTCAGGAGTTTGAGACCAACTTGGGCCACCATGGTTAAGCCCCATCTCCACTAAAAATA 1080

 39050346 CAAAAATTTAACCGGGCGTGGTAATGCAGGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAG 39050405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAAATTTAACCGGGCGTGGTAATGCAGGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAG 1140

 39050406 ACAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGACTGCGCCACTGCAC 39050465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGACTGCGCCACTGCAC 1200

 39050466 TCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCCTCTGAAAAACAAAATAAATAATAATAATAAT 39050525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCCTCTGAAAAACAAAATAAATAATAATAATAAT 1260

 39050526 ATAGTCCCTGAGCCTCTTTATGTATGTCTTACTTTCCTCCACTAAGTTATAATTATTATA 39050585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAGTCCCTGAGCCTCTTTATGTATGTCTTACTTTCCTCCACTAAGTTATAATTATTATA 1320

 39050586 TATAATCATGCAAAATACACTGTAAATCTAGAGGAATAGAAAGTTTCAATAATATAAGGA 39050645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATAATCATGCAAAATACACTGTAAATCTAGAGGAATAGAAAGTTTCAATAATATAAGGA 1380

 39050646 AATAATTGAGTTATTTTTTTCATTCTGAAGTTAATTTCTCCTAAAAGTTGTTGAAAATCA 39050705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAATTGAGTTATTTTTTTCATTCTGAAGTTAATTTCTCCTAAAAGTTGTTGAAAATCA 1440

 39050706 CATGTTTATTTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGACGAATTTTCACTCTGTTGCCCAG 39050765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATGTTTATTTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGACGAATTTTCACTCTGTTGCCCAG 1500

 39050766 GCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCCCGGGGTTCAAGCAAT 39050825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAACTCTGCCCCGGGGTTCAAGCAAT 1560

 39050826 TCTGCCTCAGTCTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCACCTGTCACCATGCCCGGCTAATT 39050885
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1561 TCTGCCTCAGTCTCCTGAGTAGCTGGGATTATAGGCACCTGCCACCATGCCCGGCTAATT 1620

 39050886 TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTG 39050945
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTG 1680

 39050946 ACTTCAGTTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 39051005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTCAGTTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 1740

 39051006 TGCACCTGATGAAAAGTCACATCTTTTTATTTAATCCTTCACAGAGACAGAAAATCATAT 39051065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCACCTGATGAAAAGTCACATCTTTTTATTTAATCCTTCACAGAGACAGAAAATCATAT 1800

 39051066 CTTTATAGAAATACATTTATGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGAGTTTCACTCTTG 39051125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     1801 CTTTATAGAAATACATTTATGCTAATTTTTTTTTTTTTT-GAGGCAGAGTTTCACTCTTG 1859

 39051126 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGAT 39051185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGAT 1919

 39051186 TCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGTGCCACCAC 39051245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGTGCCACCAC 1979

 39051246 GCTGGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCTCCACGTTGGTCAGGCTGGTC 39051305
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1980 GCTGGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGGCGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTC 2039

 39051306 TCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 39051365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 2099

 39051366 GCATGAGCCAGCACGCCCGGCCACCTTAATGCTAATTTTAATGCTTTATTCCTTATGACA 39051425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2100 GCATGAGCCAGCACGCCCGGCCACCTTAATGCTAATTTTAATGCTTTACTCCTTATGACA 2159

 39051426 GATGAATTCAGTGATGACATTGATTTCAGTTTCCTATAAAATGGCATTTGAATAGCAATA 39051485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GATGAATTCAGTGATGACATTGATTTCAGTTTCCTATAAAATGGCATTTGAATAGCAATA 2219

 39051486 CATTGGGAAGAACACCTTTATTCAGAAGGATATAAAGGAAATAAAGGATATCATCTCCAA 39051545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CATTGGGAAGAACACCTTTATTCAGAAGGATATAAAGGAAATAAAGGATATCATCTCCAA 2279

 39051546 CAGTAGTTGACACAAATTATCATGTGGACCTTCAACATTTTTTTAGAAACTATTTGTTTA 39051605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CAGTAGTTGACACAAATTATCATGTGGACCTTCAACATTTTTTTAGAAACTATTTGTTTA 2339

 39051606 CAAGTATGATTCCCTGCTTCAGAGCTAAAGCACTATCTTACTTATTTTTATTTCCCAAGT 39051665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CAAGTATGATTCCCTGCTTCAGAGCTAAAGCACTATCTTACTTATTTTTATTTCCCAAGT 2399

 39051666 AATAGCAGAATTATTTCCAAATAGAAGGTGTTCAATAAATGTTTAATACATAACATATAA 39051725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AATAGCAGAATTATTTCCAAATAGAAGGTGTTCAATAAATGTTTAATACATAACATATAA 2459

 39051726 TGTTGGCAAATCATAGCAACAAGTTTTGTTAAAGAGACCTGGAGATCTTGACCAAAAAGA 39051785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGTTGGCAAATCATAGCAACAAGTTTTGTTAAAGAGACCTGGAGATCTTGACCAAAAAGA 2519

 39051786 ATATTCAATAGTTTTATTCATATTTAATTAACAACAATAAAAGGAGACACTCTAGTATTA 39051845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATATTCAATAGTTTTATTCATATTTAATTAACAACAATAAAAGGAGACACTCTAGTATTA 2579

 39051846 GACAAATTTCATTAGTTGATAATATGAACAAATGTGCAGGTATCAACAGTGTGCTCTGCC 39051905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GACAAATTTCATTAGTTGATAATATGAACAAATGTGCAGGTATCAACAGTGTGCTCTGCC 2639

 39051906 CAGAGCCCTCAGCATACACCATTTCCCTACCGTCTAGGGCTTCCTATTGCAAGCACCTGC 39051965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAGAGCCCTCAGCATACACCATTTCCCTACCGTCTAGGGCTTCCTATTGCAAGCACCTGC 2699

 39051966 AAGTTTGTGCTTGAGGACTTTCAGTGGTCACAAGAGCCTGTCCCACCATGTAACCCATGT 39052025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AAGTTTGTGCTTGAGGACTTTCAGTGGTCACAAGAGCCTGTCCCACCATGTAACCCATGT 2759

 39052026 AAAGGGCTGCCTGGACGTGCCAGGAATTTATGTCCTTGGGAGCAGCTAATATGATATGTA 39052085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AAAGGGCTGCCTGGACGTGCCAGGAATTTATGTCCTTGGGAGCAGCTAATATGATATGTA 2819

 39052086 GTTGGTAGATACATACCCAGCACCTTCACCCTCATGTATAAACATAGTCTCCCAGAATTC 39052145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GTTGGTAGATACATACCCAGCACCTTCACCCTCATGTATAAACATAGTCTCCCAGAATTC 2879

 39052146 CTTATCAGAATTGAGCCCCAGGTGCTTACTCTGCCATTGGCTGGCTTCTCTTTCTCACAT 39052205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CTTATCAGAATTGAGCCCCAGGTGCTTACTCTGCCATTGGCTGGCTTCTCTTTCTCACAT 2939

 39052206 TTCTGCTCCCCTACTACTCCCAGAGCTCAAATAAGCTAACTGCATATATATCTTTTTCTC 39052265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TTCTGCTCCCCTACTACTCCCAGAGCTCAAATAAGCTAACTGCATATATATCTTTTTCTC 2999

 39052266 AGTCTGACCTGTTTTATCATACAAAACTATTTTTTCTTTCAGTAAAAATCTAAATTATTT 39052325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AGTCTGACCTGTTTTATCATACAAAACTATTTTTTCTTTCAGTAAAAATCTAAATTATTT 3059

 39052326 ATTTATATTTCATTGTTCTTTCATTCAATATGCATCTACTGTCACCCATCATGTACAGTG 39052385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ATTTATATTTCATTGTTCTTTCATTCAATATGCATCTACTGTCACCCATCATGTACAGTG 3119

 39052386 AATTCTTGTTAACACTAAAATGTTCTTTTAAATAGGCCATTTTCAAACAGAATTTCTAGC 39052445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AATTCTTGTTAACACTAAAATGTTCTTTTAAATAGGCCATTTTCAAACAGAATTTCTAGC 3179

 39052446 TTTCATAAGAATTTAGGAAATAATTGTTTCAAACAAATTTCAATTGATTAATTAAGCCTG 39052505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTTCATAAGAATTTAGGAAATAATTGTTTCAAACAAATTTCAATTGATTAATTAAGCCTG 3239

 39052506 TTTGTTTTTAGGCCAGAAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAAATGGCTTTCATCTCCAAA 39052565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3240 TTTGTTTTTAGGCCAGAAGGGCAATGAAGCATTGAGCTCAAAATGGCTTTTATCTCCAAA 3299

 39052566 TCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATACCTACATTATTCATAATAT 39052625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TCTCCAGTACTTTGCAAACATAAGCTTATTGTTACCTAATACCTACATTATTCATAATAT 3359

 39052626 CTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAAAACAAGAAATACTGGAAG 39052685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CTAGGATTGATAAGCCACATATTCTCAGTTCTATCTTAGGAAAACAAGAAATACTGGAAG 3419

 39052686 ATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTAACAGAATTAAAGCTCTAT 39052745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATTTCTGGTGCTTCAGTCAAGAGAGAATTTTAAATCCCAGTAACAGAATTAAAGCTCTAT 3479

 39052746 TAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAAAACCCTCAC 39052805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TAAACTTTACAGAAACTATAGAGACCACAATACATCTTGTTTCACATGCAAAACCCTCAC 3539

 39052806 AGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACCAAATAGAAT 39052865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AGGATAACTCTCAGTAGATGCACTTCTAATTACTTAGCACTCTCTAGCACCAAATAGAAT 3599

 39052866 TACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGACATATATTTT 39052925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TACAGAGGTATTTATTTCAACATTTAAATAACTAAATGCTTACTTCAAGACATATATTTT 3659

 39052926 GTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTTCTCTAGCCC 39052985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GTTATTTTCCTTAGAAAAAGAAACTCAGAAGAATCTTAGAATTATTTCCTTCTCTAGCCC 3719

 39052986 AATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATTTTCAAAGAG 39053045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AATATAATACTATCACAATTGTGCCTATATTGTTTATATGGGGCATCTATTTTCAAAGAG 3779

 39053046 ATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGAAACCAGTAC 39053105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ATTTCAAGTACACTATTTCGTAGAAAGCTGTTGTTATTTTCACTTGGGGGAAACCAGTAC 3839

 39053106 TCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCCAAGGTGGCC 39053165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TCCTAGAGGCTGAGCAACTGGACAGACAGGACATGCAATCGGGAATAGTCCAAGGTGGCC 3899

 39053166 TTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAATGGATAACAC 39053225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTCACCACATTTCAGGGTGATTCCACTTGACCATGCTAACGTGGGTGGAATGGATAACAC 3959

 39053226 CTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAGAATTCTTGC 39053285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CTCCGACCAGGGGGAAAATGCTCATCCACTGTGAATTCTGTATTATCAGAGAATTCTTGC 4019

 39053286 ATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAACACATTTAT 39053345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 ATTGCCTGAAAAGAATATACAGTTTCAGAGGAAAAAGAATGTCCCTAGAAACACATTTAT 4079

 39053346 ATCTTCAATGAAGAGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAATCAAATTCTT 39053405
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 ATCTTCAATGAAGGGGCAATGCTTATTTCATTTCTTTGTGTTGAATCAAATCAAATTCTT 4139

 39053406 GGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT 39053465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GGATGAAAGAATTTACAAAATAGTCATTATGTAGAAATTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTT 4199

 39053466 TTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCG 39053525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCG 4259

 39053526 CCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTA 39053585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 CCTCTCTTCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTA 4319

 39053586 GCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCTGTGCAAATG 39053645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 GCTGGGACTACAGGCACCCGCCCTGTAGAAAATTTTAAAAGCATAAATCCTGTGCAAATG 4379

 39053646 GTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAACATCTGGTA 39053705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GTTGGATCTTAGTGGAGCAGTAAAGTCATTGATTTTCTTTGCTGAAGCTAACATCTGGTA 4439

 39053706 AATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTCATCACATCA 39053765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 AATGTATAGCTTCTTGTACTGTAGCTTAGCGGCAATAACAAAAATACTGTCATCACATCA 4499

 39053766 ATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCAAAGAAAATG 39053825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 ATGGTCAGCCAACATCAAGAGTAAACGTTATTATCCAGAAAATAAATCCCAAAGAAAATG 4559

 39053826 TATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGGCAACTTTGT 39053885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TATTTCTAACTGATTAGCAAAGCTGGCACTTGGGGACCCTACATAAAGAGGCAACTTTGT 4619

 39053886 TTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAGAACAATAAA 39053945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TTCTTAGCAACAGAAGCAGAAAACAAACTGAAATATGATGGTCTTGACAAGAACAATAAA 4679

 39053946 TGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGAGAAGTTAATAGGTATTGAGTAAA 39054005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4680 TGGGGGGAAATCAGTGTAACTTGAAAAAATCAGGAGACAAGTTAATAGGTATTGAGTAAA 4739

 39054006 GTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATATAGAGGAGAA 39054065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GTGGCAGAATACTTTTACTTTTAAGAGATTTTGAGCACAAATCCTACATATAGAGGAGAA 4799

 39054066 TGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAAGAAAATGAT 39054125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TGATATTTGTAGCCAAACAAAAATCTTTAGAAAAAAATTTGTTTTATATAAGAAAATGAT 4859

 39054126 TCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGTGTTAAGAAA 39054185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 TCACTACATTTTTTATTATATTGCAATCTATTACAATCTATCAACTAATGTGTTAAGAAA 4919

 39054186 TGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGGGGATCAAAT 39054245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TGAGAGTAAAGGAATAAATCATACTTATATGCTTTTATAATGTTATACTGGGGATCAAAT 4979

 39054246 CATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAGAATTTTCAC 39054305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CATAGAAGAAAACACATTTTACAGATTATCTGGATTTTAATGTATTAAGAGAATTTTCAC 5039

 39054306 AAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATTTAAACTTTC 39054365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AAAATGTTATAATATATAAAATATTTTAAATTTATTTTCTTAAAACTCATTTAAACTTTC 5099

 39054366 AATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAATGAACATTAT 39054425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 AATGGGATTGGACTTTTGAAAACGCATTATAGACATTTTATTCAATTCAATGAACATTAT 5159

 39054426 TGATTTCTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCT 39054485
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 TGATTTGTAATTAATTAATTAAATTTATTAGAGACATGGTCTTACCTCCTCACCCAGGCT 5219

 39054486 GGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCC 39054545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 GGAGTGTAGTGGCTCAATCTTGGCTCACTGCAGCCTCGAACTCTTAGACTCAAGTGATCC 5279

 39054546 TTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCA 39054605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 TTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAGCTTGAGCCACTGCACCGAGACTCA 5339

 39054606 TTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCC 39054665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 TTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTACTATGAACTGAGCTCTTACTAATCC 5399

 39054666 ATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCT 39054725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 ATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGCAGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCT 5459

 39054726 CTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAAC 39054785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 CTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCTGCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAAC 5519

 39054786 GGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACAT 39054845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 GGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACACTTTCCACCCCTTAATGATGTACAT 5579

 39054846 AATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGT 39054905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 AATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAAATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGT 5639

 39054906 TATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCGGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAG 39054965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5640 TATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCAGCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAG 5699

 39054966 CCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTT 39055025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 CCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGGTCCTCTCACACAACCAGTCTCTTT 5759

 39055026 ACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAA 39055085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 ACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAAGAATATTCAATAATTTCATACTAA 5819

 39055086 TTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTA 39055145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5820 TTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAGTCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTA 5879

 39055146 TTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTG 39055205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGATTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTG 5939

 39055206 GTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTC 39055265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 GTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTCTAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTC 5999

 39055266 TGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTC 39055325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 TGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATCATACAACTGCAAAAGCATGAATTC 6059

 39055326 TGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGA 39055385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 TGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCTTCCAAGGAACCACCAAAATCAGGA 6119

 39055386 AACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAG 39055445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 AACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAGACGACTCAGCTAACTGGCATCCAG 6179

 39055446 ATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTT 39055505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 ATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGAATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTT 6239

 39055506 GTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGT 39055565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 GTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGTGGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGT 6299

 39055566 AAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCAT 39055625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 AAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGATGGTCTTGCTTTCAAACATCCTCAT 6359

 39055626 ATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTG 39055685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 ATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTTGCTATCTATAGAAGCTGACTTCTG 6419

 39055686 GCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGA 39055745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 GCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTTATGAAATACTGAATATCTCACAGA 6479

 39055746 ATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCA 39055805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 ATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAGGGACAAGACAGGGAACAGTTTCCA 6539

 39055806 GAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTC 39055865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 GAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCAGCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTC 6599

 39055866 TCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCAC 39055925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 TCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTTGTCCCACCTAAGTCACAGGCCCAC 6659

 39055926 ATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGG 39055985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 ATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTGAACTTTCAGAATCATAAGAAGTGG 6719

 39055986 AGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTG 39056045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 AGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTTTTACATTGTAAGAGATGGAGGTTG 6779

 39056046 TATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTT 39056105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 TATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGTGTACAGAGTTAGATAATTGTTTTT 6839

 39056106 AAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT 39056165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 AAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT 6899

 39056166 GAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCC 39056225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 GAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCATCCTGGCAAACATGGTGAAACCC 6959

 39056226 CATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCA 39056285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 CATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGGTGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCA 7019

 39056286 GCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 39056345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 GCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 7079

 39056346 GCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAA 39056405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 GCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACGGAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAA 7139

 39056406 AACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATG 39056465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 AACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAAAAAAACAAAATGAGTCGGCTCATG 7199

 39056466 CAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCA 39056525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 CAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGGCAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCA 7259

 39056526 GCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCT 39056585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 GCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTCAGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCT 7319

 39056586 CTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATT 39056645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 CTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAACTTAATAATAATAATGATTGGATT 7379

 39056646 ATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATG 39056705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 ATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGATTGGATGAGACTCAGCCACATGATG 7439

 39056706 GAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATA 39056765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 GAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTAAATGTTAATCACACCTAAAAAATA 7499

 39056766 CCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCA 39056825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 CCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAGCAACTGGGAATCACAGGCTAGCCA 7559

 39056826 GGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGG 39056885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 GGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGTACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGG 7619

 39056886 TGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAA 39056945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 TGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTTACTGTGGACCAAGAAACCAACAAA 7679

 39056946 AAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGT 39057005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 AAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAATTAATGTCACAATGCAACCAAAGT 7739

 39057006 ACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTTGGACAATTTATACTG 39057065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     7740 ACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCCATGAGCTTAGGACAATTTATACTG 7799

 39057066 ATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAA 39057125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 ATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAAAAATAGATGTAAAAAATATTATAA 7859

 39057126 TCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATAT 39057185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 TCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACCATATACCCATTTTACTAATAATAT 7919

 39057186 TAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTA 39057245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 TAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTATAGTTGATTAATTGGATTTAATTTA 7979

 39057246 AAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATG 39057305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 AAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGAATTAGGGCAAAAAATTAAAACATG 8039

 39057306 CCATCTTTGA 39057315
          ||||||||||
     8040 CCATCTTTGA 8049

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8050 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 8109

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8110 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 8169

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8170 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 8229

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8230 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 8289

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8290 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 8349

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8350 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 8409

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8410 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 8469

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8470 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 8529

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8530 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 8589

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8590 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 8649

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8650 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 8709

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8710 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 8769

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8770 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 8829

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8830 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 8889

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8890 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 8949

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8950 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 9009

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9010 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 9069

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9070 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 9129

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9130 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 9189

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9190 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 9249

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9250 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 9309

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9310 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 9369

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9370 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 9429

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9430 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 9489

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9490 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 9549

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 39061761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9550 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 9609

 39061762 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 39061821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9610 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 9669

 39061822 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 39061881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9670 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 9729

 39061882 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 39061941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9730 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 9789

 39061942 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 39062001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9790 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 9849

 39062002 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 39062061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9850 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 9909

 39062062 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 39062121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9910 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 9969

 39062122 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 39062181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9970 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 10029

 39062182 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 39062241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10030 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 10089

 39062242 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 39062301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10090 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 10149

 39062302 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 39062361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10150 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 10209

 39062362 GCATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 39062421
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10210 GCATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 10269

 39062422 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGA 39062480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
    10270 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGA 10329

 39062481 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 39062540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10330 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 10389

 39062541 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 39062600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10390 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 10449

 39062601 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 39062660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10450 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 10509

 39062661 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 39062720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10510 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 10569

 39062721 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 39062780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10570 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 10629

 39062781 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 39062840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10630 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 10689

 39062841 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 39062900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10690 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 10749

 39062901 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 39062960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10750 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 10809

 39062961 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 39063020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10810 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 10869

 39063021 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 39063080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10870 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 10929

 39063081 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 39063140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10930 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 10989

 39063141 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 39063200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10990 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 11049

 39063201 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAATTGAAGGGAGGGATGAGGTTCTA 39063260
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
    11050 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAACTGAAGGGAAGGATGAGGTTCTA 11109

 39063261 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 39063320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11110 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 11169

 39063321 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 39063380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11170 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 11229

 39063381 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 39063440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11230 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 11289

 39063441 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 39063500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11290 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 11349

 39063501 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 39063560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11350 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 11409

 39063561 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 39063620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11410 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 11469

 39063621 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 39063680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11470 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 11529

 39063681 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 39063740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11530 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 11589

 39063741 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 39063800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11590 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 11649

 39063801 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 39063860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11650 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 11709

 39063861 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 39063920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11710 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 11769

 39063921 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 39063980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11770 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 11829

 39063981 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 39064040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11830 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 11889

 39064041 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 39064100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11890 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 11949

 39064101 CCACATCCATCTGCCTTT 39064118
          ||||||||||||||||||
    11950 CCACATCCATCTGCCTTT 11967

Alignment time is 9.63511 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3918] =>      3918 nucs 'mol-32-3311-180131_3918'

Score:        3875
Aligned:      3908        nucs
Identic:      3905 (100%) nucs =>      3034 (100%)       871 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39060202,39063237] EXCISED REGION [39063248,39064118]
 second seq =>  [       1,    3037] EXCISED REGION [    3048,    3918]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [39063238,39063247]
 second seq =>        10 nucs [3038,3047]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3036,3037] to [3046,3047]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 60

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 120

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 180

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 240

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 300

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 360

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 420

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 480

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 540

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 600

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 660

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 720

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 780

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 840

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 900

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 960

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 1020

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 1080

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 1140

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 1200

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 1260

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 1320

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 1380

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 1440

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 1500

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 39061761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 1560

 39061762 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 39061821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 1620

 39061822 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 39061881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 1680

 39061882 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 39061941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 1740

 39061942 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 39062001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 1800

 39062002 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 39062061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 1860

 39062062 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 39062121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 1920

 39062122 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 39062181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 1980

 39062182 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 39062241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 2040

 39062242 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 39062301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 2100

 39062302 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 39062361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 2160

 39062362 GCATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 39062421
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 2220

 39062422 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGA 39062480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     2221 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGA 2280

 39062481 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 39062540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 2340

 39062541 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 39062600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 2400

 39062601 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 39062660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 2460

 39062661 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 39062720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 2520

 39062721 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 39062780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 2580

 39062781 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 39062840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 2640

 39062841 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 39062900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 2700

 39062901 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 39062960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 2760

 39062961 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 39063020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 2820

 39063021 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 39063080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 2880

 39063081 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 39063140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 2940

 39063141 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 39063200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 3000

 39063201 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAA 39063237
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAA 3037

EXCISED REGION

 39063248 GGATGAGGTTCTATTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGA 39063307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 GGATGAGGTTCTATTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGA 3107

 39063308 GGTTCTAAAATCTACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGT 39063367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 GGTTCTAAAATCTACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGT 3167

 39063368 CTATAGGTTTCACGCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATA 39063427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 CTATAGGTTTCACGCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATA 3227

 39063428 AGTCAATTTTTAAAAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTT 39063487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 AGTCAATTTTTAAAAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTT 3287

 39063488 CTAATCTCCAGAATCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACC 39063547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 CTAATCTCCAGAATCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACC 3347

 39063548 TTGAGACAGCAAGATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCA 39063607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 TTGAGACAGCAAGATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCA 3407

 39063608 CTTCCTGGCTAAAGTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTG 39063667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 CTTCCTGGCTAAAGTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTG 3467

 39063668 GACCTATAATTACTGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCA 39063727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 GACCTATAATTACTGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCA 3527

 39063728 CCTCAAAGACTGGGAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCC 39063787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 CCTCAAAGACTGGGAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCC 3587

 39063788 TACAATGGAAAGGAACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTAC 39063847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TACAATGGAAAGGAACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTAC 3647

 39063848 CTTAAAGTCTACAGAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCC 39063907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CTTAAAGTCTACAGAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCC 3707

 39063908 CCATGCCAGATAATATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTAT 39063967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 CCATGCCAGATAATATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTAT 3767

 39063968 GGCAGCAATGGACATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATA 39064027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 GGCAGCAATGGACATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATA 3827

 39064028 ATAAATTTTGTATTTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGA 39064087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 ATAAATTTTGTATTTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGA 3887

 39064088 TTTCCCATAAATCCCACATCCATCTGCCTTT 39064118
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TTTCCCATAAATCCCACATCCATCTGCCTTT 3918

Alignment time is 3.19859 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8322] =>      8322 nucs 'mol-32-3311-295775_8322'

Score:        8147
Aligned:      8323        nucs
Identic:      8307 (100%) nucs =>      2790 (100%)      5517 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054522,39057315] EXCISED REGION [39060202,39065728]
 second seq =>  [       1,    2793] EXCISED REGION [    2794,    8322]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2886 nucs [39057316,39060201]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [39057316,39057319] to [39060202,39060205]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054522 CGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAG 39054581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAG 60

 39054582 CTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTAC 39054641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTAC 120

 39054642 TATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGC 39054701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGC 180

 39054702 AGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCT 39054761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCT 240

 39054762 GCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACAC 39054821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACAC 300

 39054822 TTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAA 39054881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAA 360

 39054882 ATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCG 39054941
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      361 ATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATCA 420

 39054942 GCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGG 39055001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGG 480

 39055002 TCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAA 39055061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAA 540

 39055062 GAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAG 39055121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAG 600

 39055122 TCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGA 39055181
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGA 660

 39055182 TTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTC 39055241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTC 720

 39055242 TAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATC 39055301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATC 780

 39055302 ATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCT 39055361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCT 840

 39055362 TCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAG 39055421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAG 900

 39055422 ACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGA 39055481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGA 960

 39055482 ATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGT 39055541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGT 1020

 39055542 GGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGAT 39055601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGAT 1080

 39055602 GGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTT 39055661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTT 1140

 39055662 GCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTT 39055721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTT 1200

 39055722 ATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAG 39055781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAG 1260

 39055782 GGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCA 39055841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCA 1320

 39055842 GCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTT 39055901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTT 1380

 39055902 GTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTG 39055961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTG 1440

 39055962 AACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTT 39056021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTT 1500

 39056022 TTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGT 39056081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGT 1560

 39056082 GTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCT 39056141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCT 1620

 39056142 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACC 39056201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACC 1680

 39056202 ATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGG 39056261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGG 1740

 39056262 TGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAA 39056321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAA 1800

 39056322 CCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACG 39056381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACG 1860

 39056382 GAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAA 39056441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAA 1920

 39056442 AAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGG 39056501
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAA-CAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGG 1979

 39056502 CAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTC 39056561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTC 2039

 39056562 AGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAA 39056621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAA 2099

 39056622 CTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGAT 39056681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGAT 2159

 39056682 TGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTA 39056741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTA 2219

 39056742 AATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAG 39056801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAG 2279

 39056802 CAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGT 39056861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGT 2339

 39056862 ACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTT 39056921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTT 2399

 39056922 ACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAA 39056981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAA 2459

 39056982 TTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCC 39057041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCC 2519

 39057042 ATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAA 39057101
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAA 2579

 39057102 AAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACC 39057161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACC 2639

 39057162 ATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTAT 39057221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTAT 2699

 39057222 AGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGA 39057281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGA 2759

 39057282 ATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 39057315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGA 2793

EXCISED REGION

 39060202 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 39060261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 GGAACAAAATTTGCCTGTAATGAGTGTTATTTTCTCAATGGGAGGAAACCTCTTATTTTA 2853

 39060262 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 39060321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 ATCAGTGTTGAAAATAAATATTACTTTGATTTGGACTTGTATTATTTTATTTGATATTAC 2913

 39060322 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 39060381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 AAAACTCTTTTCTTTGTGAAAAAGGAGATGGAATATTATTTTGCTTTTAAACTATTCCAA 2973

 39060382 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 39060441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 AAAGGCAAAGTAAAACCACACAATCTGATGATATGACTCAATCATGTTGAAGACACCTTC 3033

 39060442 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 39060501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 CCCAACTCCTCATCCTGGCACCAATTTGTATGATTCTTGTATGATTGTACCATTTAGCAA 3093

 39060502 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 39060561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 AATATTAAATGTTTGTGATTACTTTGTTTTAAAATAAAATTTGTTTGTAAGATAGAACAC 3153

 39060562 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 39060621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 TTCTCTGATTTCCACGATTTCTCTATCAAAGAATATGATATTGGACAAGTAACTAAATAT 3213

 39060622 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 39060681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 CCCTAGATTTTCATGTCTTCACCTGTAAAATTAAAAATGTACAGTAAGGGAATATTTAAG 3273

 39060682 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 39060741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 GACACTTTCAGCTAAATTAGTATATTTTTAAAGAAACACCAAATCAAAATGATAAACCCA 3333

 39060742 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 39060801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 AAAAGATCAAACGTTTTGGTGTCAGAGATCATCAAGAAACATTTTGCATAAAATCACACT 3393

 39060802 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 39060861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 ATCTTTTTTTCTTTACTCCTGAATTTTGTATTTGAAAGTGAATAGGCTTTCATTCAGGTT 3453

 39060862 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 39060921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 GGCGAGGTCATTGTTCAAATCCTAACCTTACTATATATTGCTTATTGACTTTAACCTATA 3513

 39060922 AAATTTATTCATTTGACAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 39060981
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 AAATTTATTCATTTGAAAAACATTTTTGAGCACCTTCTCTGTACCAGCCTCTGTTCTAGG 3573

 39060982 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 39061041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 CATGGTTCAGGGCCTGTTCTAAGATAATAAAATTTGGATATAAGGATACAAAGTCACTGT 3633

 39061042 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 39061101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 CCTCATGGAGATTACATTCTGGTGGGTGAATACAGAAATTTAAAAGATAAATTAATACAT 3693

 39061102 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 39061161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 AATATTAAGTAGCAATAAGAACTAACAAGAAAATTAAAGTCAAGGAAGAGGATAAATCAT 3753

 39061162 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 39061221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 GGTTGAAATATTGTTTTAGACAAGGTGGTCAAGAAGAACTCTCTAAAGAGGTGAGGCAGA 3813

 39061222 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 39061281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 GGAAGAACAAGAGCCAATTCCCTGAGGTGGAATCACACTGGTGTGTTCAAGCATTGACAA 3873

 39061282 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 39061341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 GAAAATCAGGGTAGTTGAAACATACTGAGTGATGGTGACTGATAGTGTGAACAGGATTGT 3933

 39061342 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 39061401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 GACAGCATATGTAGGCCAAGTGTATTTGTCATTATGTAACAAATTATCTCACACTTAGTG 3993

 39061402 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 39061461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 GCTTAAAATAACTTACGTTTATTATCTTACAGTTTCCATGGATCATAAATCCAGACACAG 4053

 39061462 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 39061521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 CTTAACTGGGTCCTCTGCCCAGGGTCTCATGAGGCTGCAGTCAAGGTGTTGGCCAGGCTG 4113

 39061522 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 39061581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 CATCCTCATCTGGAGGCTCAGCTGGTTAAGAGTTCACTTCCAGATTCATTCAGGTTGTTG 4173

 39061582 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 39061641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 AAAGAATTTGTTTTCTTGAAAGCATATGACTGAATAACCCATTTTCTTGTTAGTTCTCAG 4233

 39061642 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 39061701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 CTTCTGGATGTTGCTCTCAGGCACTGGCCATGTGGCCCACTCAATAGCTAATTAACAAAA 4293

 39061702 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 39061761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 TGCCTGTTTCTTTAAGGTAGGCACGGGAAGCTATTTTCAGGAAGTCTTCAGTCTCTCTTC 4353

 39061762 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 39061821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 CAATGGATTTCATCTAAATCAAGCATCCCAGGATAATTTCCTTTTCATTTAACTTAAGAT 4413

 39061822 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 39061881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 CAACTGATCTGGGATCTTAACTATATTTGCAAAATCCCTTCACATTCACAATATAATGTA 4473

 39061882 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 39061941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 ACCTACTTAAAAAAGTGACAGCCAATTTGTATCCTATTCATGGACCCCGCTCACTCTTAA 4533

 39061942 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 39062001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 GGGAAGGGAATTATAAAGGATAGGTACACCAGGGTGGGTATCTTGAGAGCCATTTTAGCA 4593

 39062002 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 39062061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 TTTTGCCCACCACACCAAGGTAAAAACCTTAGATTTTGTCTTAGAGTAATGGGAAGTCAT 4653

 39062062 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 39062121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 TAGAATATTCTATGCAGGAGGGTGACATAATTAAGTATAGTTTTTAAAAGGATTACACTT 4713

 39062122 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 39062181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 GCTGCTCTGTGGGGAATTTACTGTAGGGCTACAAGAATGGAAGCAGTGAAAAAATTAGGA 4773

 39062182 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 39062241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 GGCTTATGCAGTAGTGTAGGAGTGAGATGATGATGATCTGGACTGGTGTGATAGCAATGA 4833

 39062242 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 39062301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 GTCTAGTCATATATTTTCTATATATTTTGATATGGCATTTAGATGGTTATAAGATATGTA 4893

 39062302 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 39062361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 TTTAGCATTAGTAATGAATAAGATATGCATTTAGCATATGATGAATAAGATATGCATTTA 4953

 39062362 GCATTCGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 39062421
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 GCATTAGTAGATACTAAACAAAGGTAAGTTACCTTTCATTCATATTATTATATTTCTTAT 5013

 39062422 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAA-AACTGGCACCCTGACAGA 39062480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     5014 TTGGAAGAGATACTATTTTCTTTAAATAATCTCATGGCAAAGAACTGGCACCCTGACAGA 5073

 39062481 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 39062540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 ATTTATAAATTTACAGAGTTTATTTTTTTAATCAAAATCTAAGTAGTTGAAGATTAAGAA 5133

 39062541 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 39062600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 ATGAGCAGTGAAAGTTCAGGATATAAAGAAAAATTGATTCATTTTCTTCTCACTCTGAAA 5193

 39062601 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 39062660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 ATTCAGTGTACATTATTATTCTCTTTGCTTTATACTCAACCAAGTAAAAGGAGAGTGGTT 5253

 39062661 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 39062720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 TTTGGATGTAAGACTCAACTACATTTAATTGCACCCTTTAATTAAATCTGGCTTGTGTCT 5313

 39062721 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 39062780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 GAAAGTACTAAGTTATACCAGAGAAAAATGGCTCCTTTCACCAGTAAGATATCCTGTGAG 5373

 39062781 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 39062840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 AGAGAAAAAAAATTATGGCTTCAAATCTCAATCTCTAGAGTACCACTAAAGTAAAAGCAT 5433

 39062841 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 39062900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 TTGTTGAAACAGCCATATCCACGAGTCTCAGTGGTTCAGCCCAGAACAGTATTTCAGAAT 5493

 39062901 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 39062960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 TTCCATTATGTTTGTATGCAAGAAACCAAGAGAAATGAGCCAGTTCTCTCCCCAGAGGAT 5553

 39062961 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 39063020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 GGCTGAGGTTTAATAAGTACGTGGTTGTAGGAGCTTTTAGCTCCTGTGTATACAAGTTTT 5613

 39063021 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 39063080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 TAGAAGACACTACTATATTAAGAGTATAATATACACAAGGCCTACATCCTTTTAGAAACA 5673

 39063081 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 39063140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 AAGTTGATTAAAATTTTTAAGATAAGAATTGTAAAGATAATTTCTCACTGGCTTTTCATC 5733

 39063141 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 39063200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 AAAGAGATCCCCATATTCAGTAATCAGAAATATTGATTGATGACTTAAGATGCCAGGTAT 5793

 39063201 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAATTGAAGGGAGGGATGAGGTTCTA 39063260
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
     5794 GTATGTGGCAACTATGCTATACAAACTAACTTTACAACTGAAGGGAAGGATGAGGTTCTA 5853

 39063261 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 39063320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 TTGCTAGTGCCCATGAGAATGACACTCCTGCTGACTTCTAGAACAGAGGTTCTAAAATCT 5913

 39063321 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 39063380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 ACGTGCATATTAGAATTTTCTGGGTACTTTTTAGAAATTACCAAGGTCTATAGGTTTCAC 5973

 39063381 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 39063440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 GCCAAGAGATGATGATCTAATTAATTTGGAGGTAGATTCTGAGCATAAGTCAATTTTTAA 6033

 39063441 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 39063500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 AAATAAACATGATAGGCAAAATTTTGGCCCCAAAATGTGTTCCTTTTCTAATCTCCAGAA 6093

 39063501 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 39063560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 TCTGCCAGTGTTATAGGACTTTACAGATGTGGTTCAGGTAACAGACCTTGAGACAGCAAG 6153

 39063561 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 39063620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 ATTACTGGGCAGAATCCAATCACAGGAGCACTTAAAATCAAAGACCACTTCCTGGCTAAA 6213

 39063621 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 39063680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 GTCAGGGATGGGCCAGAAGAAAGGAAAGATTTGAGTTTGAGCAACTGGACCTATAATTAC 6273

 39063681 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 39063740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 TGGCTTTGAAGAGGAGAGAAGGCCCATGAGCCAAGGAATATGGGGCACCTCAAAGACTGG 6333

 39063741 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 39063800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6334 GAATAGCCCTCAGCTGACATCAACCAAATAAATAGGAATATCAGTCCTACAATGGAAAGG 6393

 39063801 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 39063860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 AACTGAATTCTGCTAACAACTGGGAAAAACTAGGAAACAAATTCTACCTTAAAGTCTACA 6453

 39063861 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 39063920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 GAGAGGAACATAATTCTGTTGTTATCTTGATTTTAGTCCAGTGAGCCCCATGCCAGATAA 6513

 39063921 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 39063980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6514 TATTAAATTGTGTTGTTTAAGCTCCTAGTTTGTGGTAGTTTGTTTATGGCAGCAATGGAC 6573

 39063981 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 39064040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 ATAATTATAAATAATTTTGTATATATTATACATAAAATAAAAATATAATAAATTTTGTAT 6633

 39064041 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 39064100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6634 TTTAAACTAGTTTTAGGTTTACAGAAAAGTTGCAGAGATAGTACAGATTTCCCATAAATC 6693

 39064101 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 39064160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6694 CCACATCCATCTGCCTTTGCTATTAGCATCTTACATTGGTATGCTATGTGAGTCACAAAC 6753

 39064161 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 39064220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6754 AGTAAAACAATATTAATTCATTATTACTAACTAAAATTCATACTTTATTCAGGTTTGTTT 6813

 39064221 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 39064280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6814 CATTTTTACCTAATGTTCTTTTTCTGTTCTGGGATCCAATCTAGATTAGACTTGTCTGAT 6873

 39064281 GTTTTT-TGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 39064339
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6874 GTTTTTCTGGGATTATGTGATGTATGTGATTCTGGGGAGGAAGATCACAGCAAAGTGCCA 6933

 39064340 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 39064399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6934 TACTCATCACATCATATCCAGGGTACTTGCAACCTGAGGGGTTTATCAGTGCGGATCACC 6993

 39064400 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 39064459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6994 TGGCATTTGACAGGCTTCTCCTCTCTTTCATCCTCCTTGGAAAGGAGCCATTGTATCTAG 7053

 39064460 CCCACACTTAAGTGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAA 39064519
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7054 CCCACACTTAAGGGGTGGGGAGTTATGCCTCATCTCCTTGAGGAAGTAATAACTATATAA 7113

 39064520 TTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATA 39064579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7114 TTTATTTGGAATTAGTCTACACAGGAAATGTATTCTTTTCCATTATTTATTTATTCAATA 7173

 39064580 CCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAA 39064639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7174 CCTTGTTTACATCAGTGTGGACTCATGGATATTTATCTTATACTTTGGGTTATAGTTTAA 7233

 39064640 TGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGTTCTCTTTCAAAT 39064699
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7234 TGCTACTTTATTTTGTTGCTTAAATTGTTCTAGATTTGGCTAGCAGGATCTCTTTCAAAT 7293

 39064700 GACTCCTGTGTCCTTTTTACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTT 39064759
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7294 GACTCCTGTGTCCTTTTGACATACTTTTATTATCATGTTTTTTGACTACTTTCTTATTTT 7353

 39064760 CTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCA 39064819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7354 CTTTTGCTACAAGATGTTCCAGAATTATCTCATGTATTCCTTACCCCAATCCTAGACTCA 7413

 39064820 TCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTG 39064879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7414 TCCATTTCCCCAAGAAGCTCTAGTTTCTTTTATTTGAGAATGGTATTTAAAAATCAGTTG 7473

 39064880 TGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGA 39064939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7474 TGAGTTGAATATAGTCATGGCTACTGAGATGGCGTTGCTTCTGAACTTTCTCAGCTGAGA 7533

 39064940 GAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCT 39064999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7534 GAACAAGGAAATACATGTGCGTATACTAACCCACAAATAAACACCTATCTATAAATATCT 7593

 39065000 CTACATGTATCTTCCTGTATGTATGCAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCGAG 39065059
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7594 CTACATGTATCTTCCTGTATGTATACAAAGCTAGACATGACCTCATATTGATGGCTCCAG 7653

 39065060 GTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCA 39065119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7654 GTATCATCCATACCACATGGATTATTGTAGCCTTCCCTCTTACCTGTCTAGAACCTCCCA 7713

 39065120 TTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGT 39065179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7714 TTACAAAAGTGAAAAACCTGGTTCCCACCAGCCTCCCACCATTTTTACATGTTCCATTGT 7773

 39065180 ACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAG 39065239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7774 ACTATACATGTATAGTGGTTTCAGAATTGTCAATCTGGGAAGCAGCTTTACCAAGGAGAG 7833

 39065240 TACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGAT 39065299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7834 TACAGAACTTATAATTAGTTCCTTTTGTTTTGGTTTTGCAGTCACCATTCATTTCTGGAT 7893

 39065300 TTACTTGGGTAAGCATCTTTTGCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTAT 39065359
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7894 TTACTTGGGTAAGCATCTTTTCCCCCACAGCCATAGCGAAGTTATTTCATACATTTGTAT 7953

 39065360 TTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCC 39065419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7954 TTAGAGTTTTCTATTTAGCTAATCATGTCATTTGCAAATAAGCACAGGTTTATTTTTTCC 8013

 39065420 TTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATG 39065479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8014 TTTACAATATTTATATATTTCATTTTTTGTTTCATTTTAATATCTAGGACTTAAAGAATG 8073

 39065480 ATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAAT 39065539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8074 ATGATAAATAGGGATGATGAATGAGGACATCCTTGCCTTTTTCCTAATATTAGGGGGAAT 8133

 39065540 TAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACT 39065599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8134 TAATTCAGTCTCACATTAAGTATGATGTTAGCTCTAGGATTTTTAGTTATTCCCTTTACT 8193

 39065600 AGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTG 39065659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8194 AGGTTAAGGATTTCTCTTCTTTTCCTATGATTTTGAGAGTTTTATTATGAATAGGTATTG 8253

 39065660 AACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCAT 39065719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8254 AACTTTGTTGATTGCTTTTTCTGAATCTATTGATATGATCACATGGTTTCTCCCATTCAT 8313

 39065720 TCTGTCAAT 39065728
          |||||||||
     8314 TCTGTCAAT 8322

Alignment time is 6.74299 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [39047315,39070201] =>     22887 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2797] =>      2797 nucs 'mol-32-3311-295775_2797'

Score:        2764
Aligned:      2797        nucs
Identic:      2794 (100%) nucs =>       419 (100%)      2375 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [39054522,39054940] EXCISED REGION [39054942,39057319]
 second seq =>  [       1,     419] EXCISED REGION [     421,    2797]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [39054941,39054941]
 second seq =>         1 nucs [420,420]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [39056433,39056433]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [39054941,39054941] to [39054942,39054942]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 39054522 CGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAG 39054581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGAACTCTTAGACTCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAATCACTGAGATTACAAG 60

 39054582 CTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTAC 39054641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGAGCCACTGCACCGAGACTCATTGATTAATAACAGTTTCTATTTATTGAATGCTTAC 120

 39054642 TATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGC 39054701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGAACTGAGCTCTTACTAATCCATTTACATAATTATTTTACTTCATCTTTACAACAGC 180

 39054702 AGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCT 39054761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTAAAAGTAGAAATTATTTTCCTCTTTTCACAAAAGAAAGCAAATACCTAGAGAAATCT 240

 39054762 GCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACAC 39054821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTGTGGTAGGCAGAATCCTAACGGAGCCTCTAAGAATCCTAACCTGTTATGTGCACAC 300

 39054822 TTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAA 39054881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCCACCCCTTAATGATGTACATAATTCCCCTCTCCTTCAGCATGGGTAGAACCTATAA 360

 39054882 ATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATC 39054940
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTGGATGGTAAACCCCTCTTGTTATTGGTTGATTTTGAATTAATCAAAAGGAAGATC 419

EXCISED REGION

 39054942 GCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGG 39055001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGAGCTTGATCTACTCAGTGAGCCCTTGGATCCTGGGTATGTGGCCCCTATCCACAGG 480

 39055002 TCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAA 39055061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTCTCACACAACCAGTCTCTTTACTTTGAAAAATAGACCTGGAGATTTTGACCAAAAA 540

 39055062 GAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAG 39055121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAATATTCAATAATTTCATACTAATTTAGATAACAGCAACAATAAAAAGTGATACTCCAG 600

 39055122 TCTTAGCCAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGA 39055181
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTTAGACAAAATTTCTTTAGGTATTTATATGAAAAAATGTACAGATCTTGTCAGAGAGA 660

 39055182 TTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTC 39055241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGTGGTTTGAGAGGACCTGTTGGTGGGGGTCACATACCCAGGACCTGGGAGCCTCCTC 720

 39055242 TAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATC 39055301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGAAAACGAGAGCAGTCTGTCTCTGGATGGAAGCCTGCAAAATGGCAGGGACCTCCATC 780

 39055302 ATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCT 39055361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATACAACTGCAAAAGCATGAATTCTGCCTTGAGCTTCCCAACTGAAACTCAGGGTCCTCT 840

 39055362 TCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAG 39055421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCAAGGAACCACCAAAATCAGGAAACATCTTGATTTCCCCCTGGTCAGACCCTACAAAG 900

 39055422 ACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGA 39055481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACGACTCAGCTAACTGGCATCCAGATAAAAGACATTCAGAAACTGTGAGATAATAAATGA 960

 39055482 ATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGT 39055541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTTGTTTTAAGCCACTAAATTTGTGATCATTTGTTATGCAGCAATAGAGGAATAATGT 1020

 39055542 GGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGAT 39055601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTGCTTCGAGTCCTACTGGCAGTAAGTGAGATGAAAATCCAGGACAGTCTGATTATGAT 1080

 39055602 GGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTT 39055661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTCTTGCTTTCAAACATCCTCATATCCATTTCCATATAAATTAGGCTTTTTTTTTGTTT 1140

 39055662 GCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTT 39055721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTATCTATAGAAGCTGACTTCTGGCAAACTGAAATAAAAGTAAAAAGATTCCATTTCTT 1200

 39055722 ATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAG 39055781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGAAATACTGAATATCTCACAGAATGATAAAAGAAAAGCTAGACAGCTAGCCTTAGGAG 1260

 39055782 GGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCA 39055841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGACAAGACAGGGAACAGTTTCCAGAATCCTGGCTGAAATGACAACAGCCTTTGTAGGCA 1320

 39055842 GCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTT 39055901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTGCTATTGGAAAATGGCTCTTCTCACTGCTTCAGTCTTGAAACTCCAGACTCCTAGTT 1380

 39055902 GTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTG 39055961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCCCACCTAAGTCACAGGCCCACATCTGTAGTCATAGAGGCTGGAAGTGTGATTGATTG 1440

 39055962 AACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTT 39056021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACTTTCAGAATCATAAGAAGTGGAGAGAAAAAGAAATAATGCAGAATTGCTTTTTGTTT 1500

 39056022 TTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGT 39056081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTACATTGTAAGAGATGGAGGTTGTATTAGCATTCTCCAGAGAAATCGCCAATGAAATGT 1560

 39056082 GTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCT 39056141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTACAGAGTTAGATAATTGTTTTTAAGAATTGCCTTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACGCCT 1620

 39056142 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACC 39056201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACC 1680

 39056202 ATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGG 39056261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCCTGGCAAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAGAATACAAAAAAATTAGCTGGGGG 1740

 39056262 TGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAA 39056321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGTGGTGTGCACCTATAGCCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATAGCTTGAA 1800

 39056322 CCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACG 39056381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACG 1860

 39056382 GAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAACAAAAAAAAA 39056441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     1861 GAGTGAGACTCCGTCTCAAAACAAAACCGAACAAAACAAAAACAAACCAAC-AAAAAAAA 1919

 39056442 AAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGG 39056501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AAAAACAAAATGAGTCGGCTCATGCAATGGTGGAGACTGGCAAGTTAAAAATTCACAGGG 1979

 39056502 CAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTC 39056561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CAGGCTGGCAAGCAGAAAATTCCAGCAAGGGGTGATGATGCAGTCTTGAATTCAAATGTC 2039

 39056562 AGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAA 39056621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AGCTGGAAGGTAGAATTCCTTCCTCTTAGGGGCCTCAGTCTTTTTTATTAAGGCCTCCAA 2099

 39056622 CTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGAT 39056681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CTTAATAATAATAATGATTGGATTATTATTATATAATCCAATCATTATTATTATAATGAT 2159

 39056682 TGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTA 39056741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TGGATGAGACTCAGCCACATGATGGAGAGGAATCTGCTTCAGTTGGAGGCTGCTGATTTA 2219

 39056742 AATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAG 39056801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AATGTTAATCACACCTAAAAAATACCTTCACAGTAATATCTAAACTGATGTTTAACCAAG 2279

 39056802 CAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGT 39056861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CAACTGGGAATCACAGGCTAGCCAGGTCGACACGTAACATTAACCATCATGGAGGAGGGT 2339

 39056862 ACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTT 39056921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ACAAAAATTGGTTAAGGCTTCCGGTGCCTCCATATGGGTTTTTCTATATTATAGCCCTTT 2399

 39056922 ACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAA 39056981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ACTGTGGACCAAGAAACCAACAAAAAGATTCTGAAAATTGGAGATCTTATCTTTCCATAA 2459

 39056982 TTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCC 39057041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTAATGTCACAATGCAACCAAAGTACTACACTGAAAATTATGGGAACACAGTAAATATCC 2519

 39057042 ATGAGCTTTGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAA 39057101
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATGAGCTTAGGACAATTTATACTGATAGAAAAAAAAATAGATTACTTCATTGAATTTTAA 2579

 39057102 AAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACC 39057161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AAATAGATGTAAAAAATATTATAATCATGCTGAAACAATTTATCTGAAATTCCCTTCACC 2639

 39057162 ATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTAT 39057221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ATATACCCATTTTACTAATAATATTAAATGAGTGAACAACCATACATGCAGAAACATTAT 2699

 39057222 AGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGA 39057281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AGTTGATTAATTGGATTTAATTTAAAAATCTATGGGACCTGCCTATGATATGATTGCAGA 2759

 39057282 ATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAA 39057319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATTAGGGCAAAAAATTAAAACATGCCATCTTTGAGGAA 2797

Alignment time is 2.2536 s

