
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    7672] =>      7672 nucs 'mol-32-1e7c-088392_7672'

Score:        7081
Aligned:      7693        nucs
Identic:      7621 ( 99%) nucs =>      3522 ( 99%)      4099 ( 99%)
Gaps:           26 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264590,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273186]
 second seq =>  [       1,    3549] EXCISED REGION [    3550,    7672]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264590 TAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTA 28264648
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
        1 TAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTA 60

 28264649 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCT 28264708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
       61 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCT 120

 28264709 CCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGAT 28264768
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      121 CACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGAT 180

 28264769 CCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAA 28264828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAA 240

 28264829 ATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGC 28264888
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      241 ATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGC 300

 28264889 ACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACC 28264948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACC 360

 28264949 ATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGC 28265008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGC 420

 28265009 TTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAA 28265068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAA 480

 28265069 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 28265128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 540

 28265129 AAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 28265188
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 600

 28265189 AGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 28265248
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 660

 28265249 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 28265308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 720

 28265309 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 28265368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 780

 28265369 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 28265428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 840

 28265429 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 28265488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 900

 28265489 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTG 28265548
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      901 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTG 960

 28265549 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAT 28265608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      961 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAC 1020

 28265609 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 28265668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 1080

 28265669 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGA 28265728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1081 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGA 1140

 28265729 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 28265788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 1200

 28265789 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 28265848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 1260

 28265849 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 28265908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 1320

 28265909 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 28265968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 1380

 28265969 ACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATC 28266027
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATC 1440

 28266028 CCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAG 28266087
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAG 1500

 28266088 TGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAA 28266147
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAA 1560

 28266148 AAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAA 28266206
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAA 1620

 28266207 CTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATT 28266266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATT 1680

 28266267 AAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTT 28266326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTT 1740

 28266327 TAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGG 28266386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1741 TAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGG 1800

 28266387 TAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAA 28266446
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAA 1860

 28266447 TGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGA 28266506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGA 1920

 28266507 AAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATG 28266566
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATG 1980

 28266567 CTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAA 28266626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAA 2040

 28266627 ATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAG 28266686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAG 2100

 28266687 TCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCAT 28266746
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
     2101 TCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCAT 2156

 28266747 TGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATT 28266806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATT 2216

 28266807 TTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAG 28266866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAG 2276

 28266867 CCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCAC 28266926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCAC 2336

 28266927 CATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTC 28266986
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 CATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTC 2396

 28266987 TGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTC 28267046
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTC 2456

 28267047 CAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATT 28267106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATT 2516

 28267107 TTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCT 28267166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCT 2576

 28267167 ACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGT 28267226
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 ACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGT 2636

 28267227 GTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCC 28267286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCC 2696

 28267287 CCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTG 28267346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 CCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTG 2756

 28267347 TTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTAT 28267406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTAT 2816

 28267407 TCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCT 28267466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCT 2876

 28267467 TCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAAT 28267526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAAT 2936

 28267527 GCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTT 28267586
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTT 2996

 28267587 TGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCA 28267646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCA 3056

 28267647 CAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTT 28267706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTT 3116

 28267707 GTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGG 28267766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3117 GTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGG 3176

 28267767 TACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCT 28267826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCT 3236

 28267827 CTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCT 28267886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCT 3296

 28267887 CCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGG 28267946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGG 3356

 28267947 ATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTAT 28268006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 ATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTAT 3416

 28268007 GGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTG 28268064
          |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTG 3474

 28268065 GTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACA 28268124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 GTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACA 3534

 28268125 TGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||
     3535 TGTTTGTGTCTTTTT 3549

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3609

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3669

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3729

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3789

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3790 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3849

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3909

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 3969

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3970 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 4028

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4074

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4134

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4135 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4194

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 4254

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 4314

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4374

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4434

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4435 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4494

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4495 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4554

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4614

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4615 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4674

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4734

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4794

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4854

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4855 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 4914

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 4974

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 5034

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 5094

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 5154

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5155 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 5214

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 5274

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 5334

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 5394

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 5454

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 5514

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5515 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 5574

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5575 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 5634

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5635 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 5694

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 5754

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 5814

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 5874

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 5934

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 5994

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 6054

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 6114

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 6174

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 6234

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6235 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 6294

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 6354

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 6414

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 6474

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 6534

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 6594

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 6654

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 6714

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 6774

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 6834

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 6894

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6895 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 6954

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 7014

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7015 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 7074

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7075 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 7134

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7135 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 7194

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7195 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 7254

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7255 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 7314

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7315 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 7374

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7375 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 7434

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7435 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 7494

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7495 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 7554

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7555 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 7614

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTT 28273186
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7615 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTT 7672

Alignment time is 9.47013 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3553] =>      3553 nucs 'mol-32-1e7c-088392_3553'

Score:        3263
Aligned:      3555        nucs
Identic:      3526 ( 99%) nucs =>      2113 ( 99%)      1413 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264590,28266719] EXCISED REGION [28266724,28268143]
 second seq =>  [       1,    2133] EXCISED REGION [    2134,    3553]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28266720,28266723]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [28268022,28268023]
 second seq =>         2 nucs [3432,3433]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [28266720,28266737] to [28266724,28266741]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264590 TAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTA 28264648
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
        1 TAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTA 60

 28264649 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCT 28264708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
       61 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCT 120

 28264709 CCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGAT 28264768
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      121 CACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGAT 180

 28264769 CCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAA 28264828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAA 240

 28264829 ATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGC 28264888
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      241 ATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGC 300

 28264889 ACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACC 28264948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACC 360

 28264949 ATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGC 28265008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGC 420

 28265009 TTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAA 28265068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAA 480

 28265069 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 28265128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 540

 28265129 AAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 28265188
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 600

 28265189 AGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 28265248
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 660

 28265249 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 28265308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 720

 28265309 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 28265368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 780

 28265369 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 28265428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 840

 28265429 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 28265488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 900

 28265489 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTG 28265548
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      901 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTG 960

 28265549 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAT 28265608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      961 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAC 1020

 28265609 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 28265668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 1080

 28265669 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGA 28265728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1081 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGA 1140

 28265729 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 28265788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 1200

 28265789 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 28265848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 1260

 28265849 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 28265908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 1320

 28265909 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 28265968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 1380

 28265969 ACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATC 28266027
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATC 1440

 28266028 CCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAG 28266087
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAG 1500

 28266088 TGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAA 28266147
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAA 1560

 28266148 AAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAA 28266206
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAA 1620

 28266207 CTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATT 28266266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATT 1680

 28266267 AAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTT 28266326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTT 1740

 28266327 TAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGG 28266386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1741 TAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGG 1800

 28266387 TAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAA 28266446
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAA 1860

 28266447 TGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGA 28266506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGA 1920

 28266507 AAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATG 28266566
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATG 1980

 28266567 CTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAA 28266626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAA 2040

 28266627 ATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAG 28266686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAG 2100

 28266687 TCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 28266719
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 2133

EXCISED REGION

 28266724 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 28266783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 2193

 28266784 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 28266843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 2253

 28266844 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 28266903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 2313

 28266904 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTT 28266963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2314 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTT 2373

 28266964 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 28267023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2374 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 2433

 28267024 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 28267083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 2493

 28267084 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 28267143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 2553

 28267144 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 28267203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2554 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 2613

 28267204 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 28267263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 2673

 28267264 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 28267323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 2733

 28267324 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 28267383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 2793

 28267384 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 28267443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 2853

 28267444 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 28267503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 2913

 28267504 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAAC 28267563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2914 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAAC 2973

 28267564 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 28267623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 3033

 28267624 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 28267683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 3093

 28267684 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 28267743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 3153

 28267744 TGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 28267803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 TGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 3213

 28267804 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 28267863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 3273

 28267864 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 28267923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 3333

 28267924 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 28267983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 3393

 28267984 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     3394 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCA 3451

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 3511

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 3553

Alignment time is 4.70357 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3015] =>      3015 nucs 'mol-32-1e7c-139870_3015'

Score:        3014
Aligned:      3014        nucs
Identic:      3014 (100%) nucs =>       834 (100%)      2180 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268867,28269700] EXCISED REGION [28269702,28271881]
 second seq =>  [       1,     834] EXCISED REGION [     836,    3015]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [835,835]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [834,834] to [836,836]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268867 TCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTAC 28268926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTAC 60

 28268927 CTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCAT 28268986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCAT 120

 28268987 TGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGT 28269046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGT 180

 28269047 AAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGG 28269106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGG 240

 28269107 CTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGAT 28269166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGAT 300

 28269167 GTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATT 28269226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATT 360

 28269227 TCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCAT 28269286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCAT 420

 28269287 CTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGG 28269346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGG 480

 28269347 TTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGC 28269406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGC 540

 28269407 TCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACA 28269466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACA 600

 28269467 CCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCA 28269526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCA 660

 28269527 AAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTAT 28269586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTAT 720

 28269587 CTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAG 28269646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAG 780

 28269647 GAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 834

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 895

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 955

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 1015

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 1075

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 1135

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 1195

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 1255

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 1315

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 1375

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 1435

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 1495

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 1555

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 1615

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 1675

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 1735

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 1795

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 1855

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 1915

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 1975

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 2035

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 2095

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 2155

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 2215

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 2275

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 2335

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 2395

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 2455

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 2515

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 2575

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 2635

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 2695

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 2755

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 2815

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 2875

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 2935

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 2995

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTC 28271881
          ||||||||||||||||||||
     2996 TAGAGGTGTTCATAATAGTC 3015

Alignment time is 3.76651 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    7021] =>      7021 nucs 'mol-32-1e87-127917_7021'

Score:        6507
Aligned:      7042        nucs
Identic:      6977 ( 99%) nucs =>      3009 ( 99%)      3968 ( 99%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265108,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273054]
 second seq =>  [       1,    3030] EXCISED REGION [    3031,    7021]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265108 AATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCAT 28265167
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCAT 60

 28265168 ATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAG 28265227
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAG 120

 28265228 AGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAAT 28265287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAAT 180

 28265288 TGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATAC 28265347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATAC 240

 28265348 TTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTT 28265407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTT 300

 28265408 AAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATAC 28265467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATAC 360

 28265468 AGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAG 28265527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAG 420

 28265528 TGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAA 28265587
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAA 480

 28265588 CAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTA 28265647
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTA 540

 28265648 GGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAAC 28265707
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      541 GGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAAT 600

 28265708 ACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCT 28265767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCT 660

 28265768 CCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCT 28265827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCT 720

 28265828 AAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTG 28265887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTG 780

 28265888 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGAC 28265947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGAC 840

 28265948 CAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCA 28266006
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCA 900

 28266007 TGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAA 28266066
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAA 960

 28266067 CCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGAC 28266126
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGAC 1020

 28266127 AGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAA 28266185
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAA 1080

 28266186 GATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTAC 28266245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTAC 1140

 28266246 ATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTAT 28266305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTAT 1200

 28266306 AGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAA 28266365
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1201 AGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAA 1260

 28266366 ACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGA 28266425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGA 1320

 28266426 TAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATA 28266485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATA 1380

 28266486 TTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGG 28266545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
     1381 TTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGG 1440

 28266546 AGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACA 28266605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACA 1500

 28266606 ATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCT 28266665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCT 1560

 28266666 ATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATA 28266725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATA 1620

 28266726 AATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACC 28266785
          ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACC 1676

 28266786 CGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTAT 28266845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTAT 1736

 28266846 ATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGA 28266905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 ATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGA 1796

 28266906 AGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCC 28266965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1797 AGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCC 1856

 28266966 TATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGT 28267025
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1857 TATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGT 1916

 28267026 TGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGA 28267085
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TGGGAAGTCGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGA 1976

 28267086 TGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGG 28267145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGG 2036

 28267146 AGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAAT 28267205
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAAT 2096

 28267206 TGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGG 28267265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGG 2156

 28267266 CTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCT 28267325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 CTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCT 2216

 28267326 CAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATAT 28267385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 CAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATAT 2276

 28267386 CTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGC 28267445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGC 2336

 28267446 CTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAAT 28267505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 CTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAAT 2396

 28267506 TGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAG 28267565
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2397 TGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAG 2456

 28267566 TCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCA 28267625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCA 2516

 28267626 TTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTC 28267685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTC 2576

 28267686 AGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTG 28267745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTG 2636

 28267746 CAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTC 28267805
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTC 2696

 28267806 CGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCC 28267865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 CGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCC 2756

 28267866 ATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTG 28267925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 ATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTG 2816

 28267926 TTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGAT 28267985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGAT 2876

 28267986 ATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACG 28268043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||
     2877 ATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACG 2934

 28268044 TTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTG 28268103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 TTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTG 2994

 28268104 CAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 CAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 3030

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3090

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3150

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3210

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3270

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3271 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3330

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3390

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 3450

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3451 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 3509

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 3555

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 3615

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3616 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 3675

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 3735

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 3795

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 3855

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 3915

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3916 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 3975

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     3976 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4035

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4095

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4096 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4155

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4215

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4275

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4335

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4336 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 4395

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 4455

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 4515

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 4575

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 4635

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4636 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 4695

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 4755

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 4815

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 4875

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 4935

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4936 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 4995

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4996 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 5055

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5056 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 5115

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5116 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 5175

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5176 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 5235

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5236 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 5295

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5296 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 5355

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5356 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 5415

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5416 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 5475

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 5535

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 5595

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 5655

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 5715

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 5775

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5776 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 5835

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 5895

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5896 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 5955

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5956 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 6015

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6016 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 6075

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6076 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 6135

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6136 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 6195

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6196 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 6255

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6256 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 6315

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6316 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 6375

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6376 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 6435

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6436 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 6495

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6496 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 6555

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6556 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 6615

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6616 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 6675

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6676 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 6735

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6736 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 6795

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6796 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 6855

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6856 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 6915

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6916 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 6975

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCT 28273054
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6976 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCT 7021

Alignment time is 8.47112 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3034] =>      3034 nucs 'mol-32-1e87-127917_3034'

Score:        2810
Aligned:      3036        nucs
Identic:      3013 ( 99%) nucs =>      1601 ( 99%)      1412 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265108,28266719] EXCISED REGION [28266724,28268143]
 second seq =>  [       1,    1614] EXCISED REGION [    1615,    3034]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28266720,28266723]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [28268022,28268023]
 second seq =>         2 nucs [2913,2914]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [28266720,28266737] to [28266724,28266741]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265108 AATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCAT 28265167
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCAT 60

 28265168 ATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAG 28265227
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAG 120

 28265228 AGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAAT 28265287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAAT 180

 28265288 TGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATAC 28265347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATAC 240

 28265348 TTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTT 28265407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTT 300

 28265408 AAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATAC 28265467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATAC 360

 28265468 AGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAG 28265527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAG 420

 28265528 TGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAA 28265587
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAA 480

 28265588 CAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTA 28265647
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTA 540

 28265648 GGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAAC 28265707
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      541 GGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAAT 600

 28265708 ACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCT 28265767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCT 660

 28265768 CCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCT 28265827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCT 720

 28265828 AAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTG 28265887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTG 780

 28265888 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGAC 28265947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGAC 840

 28265948 CAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCA 28266006
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCA 900

 28266007 TGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAA 28266066
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAA 960

 28266067 CCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGAC 28266126
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGAC 1020

 28266127 AGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAA 28266185
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAA 1080

 28266186 GATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTAC 28266245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTAC 1140

 28266246 ATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTAT 28266305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTAT 1200

 28266306 AGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAA 28266365
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1201 AGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAA 1260

 28266366 ACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGA 28266425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGA 1320

 28266426 TAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATA 28266485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATA 1380

 28266486 TTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGG 28266545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
     1381 TTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGG 1440

 28266546 AGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACA 28266605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACA 1500

 28266606 ATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCT 28266665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCT 1560

 28266666 ATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 28266719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 1614

EXCISED REGION

 28266724 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 28266783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 1674

 28266784 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 28266843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 1734

 28266844 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 28266903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 1794

 28266904 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTT 28266963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1795 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTT 1854

 28266964 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 28267023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1855 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 1914

 28267024 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 28267083
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GTTGGGAAGTCGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 1974

 28267084 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 28267143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 2034

 28267144 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 28267203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 2094

 28267204 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 28267263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 2154

 28267264 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 28267323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 2214

 28267324 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 28267383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 2274

 28267384 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 28267443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 2334

 28267444 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 28267503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 2394

 28267504 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAAC 28267563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2395 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAAC 2454

 28267564 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 28267623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 2514

 28267624 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 28267683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 2574

 28267684 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 28267743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 2634

 28267744 TGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 28267803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 2694

 28267804 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 28267863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 2754

 28267864 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 28267923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 2814

 28267924 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 28267983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 2874

 28267984 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     2875 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCA 2932

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 2992

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 3034

Alignment time is 4.14939 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    9422] =>      9422 nucs 'mol-32-1f00-049844_9422'

Score:        8655
Aligned:      9450        nucs
Identic:      9345 ( 99%) nucs =>      3958 ( 99%)      5387 ( 99%)
Gaps:           50 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264151,28268139] EXCISED REGION [28269049,28274487]
 second seq =>  [       1,    4001] EXCISED REGION [    4002,    9422]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264151 CACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGAC 28264210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGAC 60

 28264211 AGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGA 28264270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGA 120

 28264271 AAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTC 28264330
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGCAGTGGATCCATCCCAACCGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTC 180

 28264331 CACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAG 28264390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAG 240

 28264391 ACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGC 28264450
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAAGGCAGGAGCCAAGACTTACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGC 300

 28264451 CCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTT-------------GAGACGGAGTCTCGCTCT 28264497
          |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||
      301 CCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCT 360

 28264498 GTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGG 28264557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGG 420

 28264558 TTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCT 28264617
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      421 TTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCT 480

 28264618 GGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGT 28264676
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGT 540

 28264677 CTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGA 28264736
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGA 600

 28264737 TTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTG 28264796
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTG 660

 28264797 TCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATA 28264856
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      661 TCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATA 720

 28264857 TCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAA 28264916
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAA 780

 28264917 ATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTT 28264976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTT 840

 28264977 ACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACA 28265036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACA 900

 28265037 AATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTT 28265096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTT 960

 28265097 TTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGT 28265156
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGT 1020

 28265157 GGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCC 28265216
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCC 1080

 28265217 AAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGT 28265276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGT 1140

 28265277 AACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTT 28265336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTT 1200

 28265337 TGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAG 28265396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAG 1260

 28265397 CCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAG 28265456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAG 1320

 28265457 ACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATA 28265516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATA 1380

 28265517 CCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAA 28265576
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAA 1440

 28265577 ACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTT 28265636
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTT 1500

 28265637 GCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGG 28265696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGG 1560

 28265697 AATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTAC 28265756
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTAC 1620

 28265757 ATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCT 28265816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCT 1680

 28265817 GATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTG 28265876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTG 1740

 28265877 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAG 28265936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAG 1800

 28265937 GAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAA 28265995
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1801 GAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAA 1860

 28265996 TTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG 28266055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG 1920

 28266056 GATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCA 28266115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1921 GATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCA 1980

 28266116 ACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATA 28266174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     1981 ACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATA 2040

 28266175 AAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTG 28266234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTG 2100

 28266235 TGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTC 28266294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTC 2160

 28266295 AAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAG 28266354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAG 2220

 28266355 CAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCT 28266414
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2221 CAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCT 2280

 28266415 GGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAAT 28266474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAAT 2340

 28266475 TTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAG 28266534
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2341 TCTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAG 2400

 28266535 ATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGAT 28266594
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGAT 2460

 28266595 AGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTC 28266654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTC 2520

 28266655 AGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACA 28266714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACA 2580

 28266715 AGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGG 28266774
          |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGG 2636

 28266775 GAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTG 28266834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTG 2696

 28266835 GAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGG 28266894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGG 2756

 28266895 GGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAA 28266954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2757 GGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAA 2816

 28266955 TTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAG 28267014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2817 TTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAG 2876

 28267015 GTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACA 28267074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 GTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACA 2936

 28267075 GAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACA 28267134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACA 2996

 28267135 TGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTAC 28267194
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2997 TGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTAC 3056

 28267195 CAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGC 28267254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGC 3116

 28267255 CTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTT 28267314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTT 3176

 28267315 CCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTG 28267374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTG 3236

 28267375 TATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATC 28267434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATC 3296

 28267435 TTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCC 28267494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCC 3356

 28267495 TATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATT 28267554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3357 TATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATT 3416

 28267555 TTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGT 28267614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGT 3476

 28267615 TTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTT 28267674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTT 3536

 28267675 ATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGA 28267734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 ATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGA 3596

 28267735 GATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATT 28267794
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATT 3656

 28267795 TTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCA 28267854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCA 3716

 28267855 TCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTAT 28267914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 TCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTAT 3776

 28267915 TTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTG 28267974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTG 3836

 28267975 CTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATA 28268032
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||
     3837 CTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATA 3894

 28268033 TATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGT 28268092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 TATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGT 3954

 28268093 CTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 CTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 4001

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 4061

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 4121

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 4181

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 4241

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4242 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 4301

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 4361

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 4421

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4422 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 4480

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4526

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4586

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4587 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4646

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 4706

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 4766

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4826

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4886

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4887 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4946

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4947 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 5006

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 5066

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5067 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 5126

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 5186

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 5246

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 5306

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5307 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 5366

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 5426

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5427 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 5486

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5487 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 5546

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5547 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 5606

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5607 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 5666

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 5726

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 5786

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5787 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 5846

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 5906

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 5966

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5967 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 6026

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6027 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 6086

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6087 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 6146

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6147 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 6206

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6207 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 6266

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6267 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 6326

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6327 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 6386

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6387 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 6446

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6447 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 6506

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6507 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 6566

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6567 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 6626

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6627 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 6686

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6687 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 6746

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6747 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 6806

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6807 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 6866

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6867 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 6926

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6927 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 6986

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6987 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 7046

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7047 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 7106

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7107 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 7166

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7167 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 7226

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7227 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 7286

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7287 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 7346

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     7347 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 7406

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7407 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 7466

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7467 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 7526

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7527 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 7586

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7587 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 7646

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7647 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 7706

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7707 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 7766

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7767 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 7826

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7827 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 7886

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7887 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 7946

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7947 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 8006

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8007 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 8066

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     8067 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 8126

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8127 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 8186

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCAC 28273306
          |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8187 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCAC 8246

 28273307 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACG 28273366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8247 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACG 8306

 28273367 TTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTA 28273426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8307 TTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTA 8366

 28273427 CGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATG 28273486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8367 CGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATG 8426

 28273487 GTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACA 28273546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8427 GTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACA 8486

 28273547 GGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAA 28273606
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     8487 GGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAA 8546

 28273607 CCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCT 28273666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8547 CCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCT 8606

 28273667 TACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTC 28273726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8607 TACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTC 8666

 28273727 TTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGT 28273786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8667 TTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGT 8726

 28273787 ATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCG--TTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 28273844
          ||||||||||||||||||||||||    |||.||||||     |||||||||||||||||
     8727 ATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGT--TTTTTTTTTGTC-----TTTTTTTTTTTTTTTTT 8779

 28273845 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGAATGCAGTGGCGTGATCTCTGC 28273904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8780 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGAATGCAGTGGCGTGATCTCTGC 8839

 28273905 TCCCTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 28273964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8840 TCCCTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 8899

 28273965 TGGGATGCCCACCACAATGCCTGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 28274024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8900 TGGGATGCCCACCACAATGCCTGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC 8959

 28274025 CATGTTGGCCAGGCTGGTTTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCC 28274084
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8960 CATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCC 9019

 28274085 CAAAGTACTGGGATTACAGGCTGGGATTACCTGACCTCAGATGAGCCACCTCGCTTGGCC 28274144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9020 CAAAGTACTGGGATTACAGGCTGGGATTACCTGACCTCAGATGAGCCACCTCGCTTGGCC 9079

 28274145 TCTGTCTACCTTTTGTTTCCTTGTCTTGTCATATTGCATTAACTAGAACTTCTTCTACAA 28274204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9080 TCTGTCTACCTTTTGTTTCCTTGTCTTGTCATATTGCATTAACTAGAACTTCTTCTACAA 9139

 28274205 TGTTAAATAAGAGTGAGTAATAGGGGATATTCTTACCTCCTTCTTGATCTTAGCAGGAAA 28274264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9140 TGTTAAATAAGAGTGAGTAATAGGGGATATTCTTACCTCCTTCTTGATCTTAGCAGGAAA 9199

 28274265 GTCTAGTCATCTCACAGTATCCATGAGGAATTGACTCCAAGATTCACTGTGCATACGCAA 28274324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||
     9200 GTCTAGTCATCTCACAGTATCCATGAGGAATTGACTCCAAGATTCAATGTGGATACGCAA 9259

 28274325 ATCCGCAAATACTCAAGTTCCTTGCATAATATGTACAGTATTTGCATATAAAATATGTAC 28274384
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9260 ATCCGCCAATACTCAAGTTCCTTGCATAATATGTACAGTATTTGCATATAAAATATGTAC 9319

 28274385 ATCCCTCCGTATACTTTAAATCATCTCTAAATTACTTATAATACCTAATACAATGTAAAT 28274444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9320 ATCCCTCCGTATACTTTAAATCATCTCTAAATTACTTATAATACCTAATACAATGTAAAT 9379

 28274445 GCTATGTAAATGACTATATTTTTAAATTTGCATTGTTTTTTAT 28274487
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9380 GCTATGTAAATGACTATATTTTTAAATTTGCATTGTTTTTTAT 9422

Alignment time is 11.6067 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4005] =>      4005 nucs 'mol-32-1f00-049844_4005'

Score:        3656
Aligned:      3998        nucs
Identic:      3962 ( 99%) nucs =>       316 ( 99%)      3646 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264151,28264468] EXCISED REGION [28264469,28268143]
 second seq =>  [       1,     318] EXCISED REGION [     332,    4005]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [319,331]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [319,329] to [332,342]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [319,324] to [326,331]

 28264151 CACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGAC 28264210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGAC 60

 28264211 AGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGA 28264270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGA 120

 28264271 AAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTC 28264330
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGCAGTGGATCCATCCCAACCGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTC 180

 28264331 CACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAG 28264390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAG 240

 28264391 ACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGC 28264450
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAAGGCAGGAGCCAAGACTTACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGC 300

 28264451 CCCTACCTGGCAGTGTCC 28264468
          ||||||||||||||||||
      301 CCCTACCTGGCAGTGTCC 318

EXCISED REGION

 28264469 TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATC 28264528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      332 TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATC 391

 28264529 TCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 28264588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      392 TCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 451

 28264589 GTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGT 28264647
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      452 GTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGT 511

 28264648 AGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCC 28264707
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      512 AGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCC 571

 28264708 TCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGA 28264767
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      572 TCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGA 631

 28264768 TCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTA 28264827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 TCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTA 691

 28264828 AATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTG 28264887
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      692 AATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTG 751

 28264888 CACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACAC 28264947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 CACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACAC 811

 28264948 CATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATG 28265007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 CATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATG 871

 28265008 CTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGA 28265067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 CTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGA 931

 28265068 AGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTA 28265127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 AGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTA 991

 28265128 AAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGG 28265187
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 AACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGG 1051

 28265188 AAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATA 28265247
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATA 1111

 28265248 AACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGA 28265307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 AACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGA 1171

 28265308 ATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAA 28265367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 ATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAA 1231

 28265368 AAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAA 28265427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 AAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAA 1291

 28265428 AACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTA 28265487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 AACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTA 1351

 28265488 AAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCT 28265547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1352 AAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCT 1411

 28265548 GTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGA 28265607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 GTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGA 1471

 28265608 TAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCT 28265667
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 CAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCT 1531

 28265668 CAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGG 28265727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1532 CAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGG 1591

 28265728 AAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATT 28265787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 AAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATT 1651

 28265788 ACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATA 28265847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 ACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATA 1711

 28265848 TTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 28265907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 TTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 1771

 28265908 GCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGA 28265967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 GCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGA 1831

 28265968 AA-CCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGAT 28266026
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 AACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGAT 1891

 28266027 CCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCA 28266086
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 CACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCA 1951

 28266087 GTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTC-A 28266145
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     1952 GTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAA 2011

 28266146 AAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGA 28266205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGA 2071

 28266206 ACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCAT 28266265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 ACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCAT 2131

 28266266 TAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATT 28266325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATT 2191

 28266326 TTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAG 28266385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2192 TTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAG 2251

 28266386 GTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGA 28266445
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 GTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGA 2311

 28266446 ATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAG 28266505
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2312 ATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTCTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAG 2371

 28266506 AAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGAT 28266565
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2372 AAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGAT 2431

 28266566 GCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGA 28266625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 GCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGA 2491

 28266626 AATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAA 28266685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 AATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAA 2551

 28266686 GTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCA 28266745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||
     2552 GTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC----TAAATAAATAAATAAATAGGCA 2607

 28266746 TTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTAT 28266805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTAT 2667

 28266806 TTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGA 28266865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 TTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGA 2727

 28266866 GCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCA 28266925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 GCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCA 2787

 28266926 CCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCT 28266985
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 CCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCT 2847

 28266986 CTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTT 28267045
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 CTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTT 2907

 28267046 CCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCAT 28267105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 CCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCAT 2967

 28267106 TTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCC 28267165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 TTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCC 3027

 28267166 TACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATG 28267225
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 TACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATG 3087

 28267226 TGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCC 28267285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCC 3147

 28267286 CCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGT 28267345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 CCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGT 3207

 28267346 GTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTA 28267405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 GTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTA 3267

 28267406 TTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATC 28267465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 TTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATC 3327

 28267466 TTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAA 28267525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 TTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAA 3387

 28267526 TGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTT 28267585
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 TGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTT 3447

 28267586 TTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTC 28267645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 TTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTC 3507

 28267646 ACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTT 28267705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 ACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTT 3567

 28267706 TGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAG 28267765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3568 TGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAG 3627

 28267766 GTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCC 28267825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 GTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCC 3687

 28267826 TCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGC 28267885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 TCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGC 3747

 28267886 TCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAG 28267945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 TCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAG 3807

 28267946 GATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTA 28268005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 GATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTA 3867

 28268006 TGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACT 28268063
          ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 TGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACT 3925

 28268064 GGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAAC 28268123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 GGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAAC 3985

 28268124 ATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||
     3986 ATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 4005

Alignment time is 5.25394 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8361] =>      8361 nucs 'mol-32-1f0b-024002_8361'

Score:        7748
Aligned:      8382        nucs
Identic:      8308 ( 99%) nucs =>      3606 ( 99%)      4702 ( 99%)
Gaps:           27 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264506,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273790]
 second seq =>  [       1,    3633] EXCISED REGION [    3634,    8361]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264506 GGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCC 28264565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCC 60

 28264566 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGC 28264625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
       61 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGC 120

 28264626 TAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTT 28264684
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTT 180

 28264685 TAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGC 28264744
          .||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGC 240

 28264745 ATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGA 28264804
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGA 300

 28264805 AGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGAT 28264864
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGAT 360

 28264865 TTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAA 28264924
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAA 420

 28264925 ACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGAT 28264984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGAT 480

 28264985 TTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAA 28265044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAA 540

 28265045 ATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATG 28265104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATG 600

 28265105 AAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGC 28265164
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGC 660

 28265165 CATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACA 28265224
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACA 720

 28265225 GAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAA 28265284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAA 780

 28265285 AATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAA 28265344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAA 840

 28265345 TACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTA 28265404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTA 900

 28265405 TTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAA 28265464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAA 960

 28265465 TACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGG 28265524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGG 1020

 28265525 AAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATT 28265584
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATT 1080

 28265585 CAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTT 28265644
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTT 1140

 28265645 TTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGA 28265704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGA 1200

 28265705 AACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTT 28265764
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTT 1260

 28265765 TCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGT 28265824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGT 1320

 28265825 TCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGC 28265884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGC 1380

 28265885 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAA 28265944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAA 1440

 28265945 GACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGG 28266003
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGG 1500

 28266004 GCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTT 28266063
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTT 1560

 28266064 GAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGT 28266123
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGT 1620

 28266124 GACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAG 28266182
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAG 1680

 28266183 TAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAAT 28266242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAAT 1740

 28266243 TACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTAC 28266302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTAC 1800

 28266303 TATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAA 28266362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAA 1860

 28266363 GAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTG 28266422
          .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1861 AAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTG 1920

 28266423 TGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTAC 28266482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTAC 1980

 28266483 ATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGAT 28266542
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
     1981 ATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGAC 2040

 28266543 AGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTG 28266602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTG 2100

 28266603 ACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTC 28266662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTC 2160

 28266663 CCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAA 28266722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAA 2220

 28266723 ATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAAT 28266782
          |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAAT 2276

 28266783 ACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCAT 28266842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 ACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCAT 2336

 28266843 TATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGC 28266902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGC 2396

 28266903 AGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCT 28266962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2397 AGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCT 2456

 28266963 TCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGT 28267022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2457 TCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGT 2516

 28267023 AGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGA 28267082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 AGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGA 2576

 28267083 AGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAA 28267142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAA 2636

 28267143 AGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGA 28267202
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGA 2696

 28267203 AATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAG 28267262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAG 2756

 28267263 TGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCC 28267322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCC 2816

 28267323 TCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGA 28267382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGA 2876

 28267383 TATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATA 28267442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATA 2936

 28267443 TGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTAT 28267502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTAT 2996

 28267503 AATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAA 28267562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2997 AATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAA 3056

 28267563 CAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTT 28267622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTT 3116

 28267623 TCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGA 28267682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGA 3176

 28267683 TTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGG 28267742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGG 3236

 28267743 GTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACC 28267802
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACC 3296

 28267803 CTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATG 28267862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATG 3356

 28267863 TCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTT 28267922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTT 3416

 28267923 CTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAG 28267982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAG 3476

 28267983 GATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACC 28268040
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     3477 GATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACC 3534

 28268041 ACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTA 28268100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 ACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTA 3594

 28268101 TTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 TTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 3633

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3693

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3753

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3813

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3873

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3874 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3933

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3993

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 4053

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4054 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 4112

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4158

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4218

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4219 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4278

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 4338

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 4398

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4458

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4518

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4519 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4578

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4579 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4638

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4698

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4699 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4758

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4818

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4878

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4938

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4939 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 4998

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 5058

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 5118

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 5178

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 5238

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5239 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 5298

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 5358

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 5418

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 5478

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 5538

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 5598

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5599 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 5658

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5659 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 5718

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5719 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 5778

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 5838

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 5898

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 5958

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 6018

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 6078

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 6138

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 6198

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 6258

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 6318

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 6378

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 6438

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 6498

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 6558

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 6618

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 6678

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 6738

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 6798

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 6858

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 6918

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 6978

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6979 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 7038

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 7098

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 7158

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 7218

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 7278

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 7338

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 7398

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 7458

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7459 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 7518

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 7578

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 7638

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7639 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 7698

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7699 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 7758

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7759 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 7818

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACT 28273307
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7819 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACT 7878

 28273308 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGT 28273367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7879 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGT 7938

 28273368 TCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTAC 28273427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7939 TCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTAC 7998

 28273428 GCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGG 28273487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7999 GCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGG 8058

 28273488 TCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAG 28273547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8059 TCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAG 8118

 28273548 GCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAAC 28273607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     8119 GCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAAC 8178

 28273608 CCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTT 28273667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8179 CCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTT 8238

 28273668 ACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCT 28273727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8239 ACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCT 8298

 28273728 TCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTA 28273787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8299 TCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTA 8358

 28273788 TAC 28273790
          |||
     8359 TAC 8361

Alignment time is 10.1753 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3637] =>      3637 nucs 'mol-32-1f0b-024002_3637'

Score:        3347
Aligned:      3639        nucs
Identic:      3610 ( 99%) nucs =>      2197 ( 99%)      1413 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264506,28266719] EXCISED REGION [28266724,28268143]
 second seq =>  [       1,    2217] EXCISED REGION [    2218,    3637]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28266720,28266723]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [28268022,28268023]
 second seq =>         2 nucs [3516,3517]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [28266720,28266737] to [28266724,28266741]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264506 GGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCC 28264565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCC 60

 28264566 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGC 28264625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
       61 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGC 120

 28264626 TAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTT 28264684
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTT 180

 28264685 TAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGC 28264744
          .||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGC 240

 28264745 ATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGA 28264804
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGA 300

 28264805 AGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGAT 28264864
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGAT 360

 28264865 TTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAA 28264924
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAA 420

 28264925 ACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGAT 28264984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGAT 480

 28264985 TTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAA 28265044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAA 540

 28265045 ATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATG 28265104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATG 600

 28265105 AAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGC 28265164
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGC 660

 28265165 CATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACA 28265224
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACA 720

 28265225 GAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAA 28265284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAA 780

 28265285 AATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAA 28265344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAA 840

 28265345 TACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTA 28265404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTA 900

 28265405 TTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAA 28265464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAA 960

 28265465 TACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGG 28265524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGG 1020

 28265525 AAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATT 28265584
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATT 1080

 28265585 CAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTT 28265644
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTT 1140

 28265645 TTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGA 28265704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGA 1200

 28265705 AACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTT 28265764
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTT 1260

 28265765 TCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGT 28265824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGT 1320

 28265825 TCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGC 28265884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGC 1380

 28265885 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAA 28265944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAA 1440

 28265945 GACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGG 28266003
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGG 1500

 28266004 GCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTT 28266063
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTT 1560

 28266064 GAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGT 28266123
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGT 1620

 28266124 GACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAG 28266182
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAG 1680

 28266183 TAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAAT 28266242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAAT 1740

 28266243 TACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTAC 28266302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTAC 1800

 28266303 TATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAA 28266362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAA 1860

 28266363 GAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTG 28266422
          .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1861 AAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTG 1920

 28266423 TGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTAC 28266482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTAC 1980

 28266483 ATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGAT 28266542
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
     1981 ATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGAC 2040

 28266543 AGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTG 28266602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTG 2100

 28266603 ACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTC 28266662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTC 2160

 28266663 CCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 28266719
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 2217

EXCISED REGION

 28266724 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 28266783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 2277

 28266784 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 28266843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 2337

 28266844 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 28266903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 2397

 28266904 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTT 28266963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2398 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTT 2457

 28266964 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 28267023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2458 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 2517

 28267024 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 28267083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 2577

 28267084 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 28267143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 2637

 28267144 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 28267203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 2697

 28267204 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 28267263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 2757

 28267264 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 28267323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 2817

 28267324 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 28267383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 2877

 28267384 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 28267443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 2937

 28267444 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 28267503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 2997

 28267504 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAAC 28267563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2998 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAAC 3057

 28267564 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 28267623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 3117

 28267624 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 28267683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 3177

 28267684 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 28267743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 3237

 28267744 TGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 28267803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 3297

 28267804 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 28267863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 3357

 28267864 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 28267923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 3417

 28267924 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 28267983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 3477

 28267984 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     3478 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCA 3535

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 3595

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 3637

Alignment time is 4.67965 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4919] =>      4919 nucs 'mol-32-1f0b-176691_4919'

Score:        4907
Aligned:      4918        nucs
Identic:      4917 (100%) nucs =>       836 (100%)      4081 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268865,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273783]
 second seq =>  [       1,     836] EXCISED REGION [     838,    4919]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [837,837]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [836,836] to [838,838]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268865 TATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTT 28268924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTT 60

 28268925 ACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCC 28268984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCC 120

 28268985 ATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAA 28269044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAA 180

 28269045 GTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCA 28269104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCA 240

 28269105 GGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATG 28269164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATG 300

 28269165 ATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCA 28269224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCA 360

 28269225 TTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTC 28269284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTC 420

 28269285 ATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTT 28269344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTT 480

 28269345 GGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTG 28269404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTG 540

 28269405 GCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCA 28269464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCA 600

 28269465 CACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCT 28269524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCT 660

 28269525 CAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGT 28269584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGT 720

 28269585 ATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGAT 28269644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGAT 780

 28269645 AGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 836

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 897

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 957

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 1017

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 1077

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 1137

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 1197

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 1257

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 1317

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 1377

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 1437

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 1497

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 1557

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 1617

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 1677

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 1737

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 1797

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 1857

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 1917

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 1977

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 2037

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 2097

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 2157

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TACGCGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 2217

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 2277

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 2337

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 2397

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 2457

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 2517

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 2577

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 2637

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 2697

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 2757

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 2817

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 2877

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 2937

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 2997

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 3057

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 3117

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 3177

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 3237

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 3297

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 3357

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 3417

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 3477

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 3537

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 3597

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 3657

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 3717

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 3777

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 3837

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 3897

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 3957

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 4017

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 4077

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 4137

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 4197

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 4257

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 4317

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 4377

 28273242 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 28273301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 4437

 28273302 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 28273361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 4497

 28273362 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 28273421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 4557

 28273422 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 28273481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 4617

 28273482 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 28273541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 4677

 28273542 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 28273601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 4737

 28273602 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 28273661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 4797

 28273662 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 28273721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 4857

 28273722 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 28273781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 4917

 28273782 CC 28273783
          ||
     4918 CC 4919

Alignment time is 6.39327 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2271] =>      2271 nucs 'mol-32-1f21-130662_2271'

Score:        2122
Aligned:      2277        nucs
Identic:      2258 ( 99%) nucs =>      2044 ( 99%)       214 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266080,28268139] EXCISED REGION [28269049,28269262]
 second seq =>  [       1,    2057] EXCISED REGION [    2058,    2271]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266080 GATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCC 28266139
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCC 60

 28266140 TTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACT 28266198
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACT 120

 28266199 CACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAG 28266258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAG 180

 28266259 CAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAA 28266318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAA 240

 28266319 TGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAG 28266378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      241 TGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAG 300

 28266379 TTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATAT 28266438
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATAT 360

 28266439 GGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGT 28266498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGT 420

 28266499 GAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAA 28266558
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||
      421 GAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAA 480

 28266559 TGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGA 28266618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGA 540

 28266619 TCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCT 28266678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCT 600

 28266679 AGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAA 28266738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      601 AGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA- 659

 28266739 ATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGA 28266798
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ---GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGA 716

 28266799 GTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTC 28266858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 GTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTC 776

 28266859 CACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGAT 28266918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 CACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGAT 836

 28266919 CTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACT 28266978
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      837 CTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACT 896

 28266979 TTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAG 28267038
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAG 956

 28267039 AATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACC 28267098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 AATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACC 1016

 28267099 AGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGT 28267158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 AGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGT 1076

 28267159 GTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAG 28267218
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAG 1136

 28267219 GACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTG 28267278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTG 1196

 28267279 CATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGT 28267338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 CATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGT 1256

 28267339 TATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAA 28267398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAA 1316

 28267399 TTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGT 28267458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGT 1376

 28267459 GTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTT 28267518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTT 1436

 28267519 TTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAAT 28267578
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAAT 1496

 28267579 AGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGG 28267638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGG 1556

 28267639 GTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGT 28267698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 GTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGT 1616

 28267699 GGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCT 28267758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1617 GGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGT 1676

 28267759 CACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCC 28267818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCC 1736

 28267819 TCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCAT 28267878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCAT 1796

 28267879 GTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAAT 28267938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAAT 1856

 28267939 GCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCT 28267998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 GCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCT 1916

 28267999 TTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCA 28268056
          |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCA 1974

 28268057 ATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGC 28268116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 ATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGC 2034

 28268117 ATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||
     2035 ATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 2057

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 2117

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 2177

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 2237

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAG 28269262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAG 2271

Alignment time is 3.27433 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4594] =>      4594 nucs 'mol-32-1f21-202832_4594'

Score:        4223
Aligned:      4617        nucs
Identic:      4564 ( 99%) nucs =>      3157 ( 99%)      1407 ( 98%)
Gaps:           27 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264960,28268139] EXCISED REGION [28269049,28270481]
 second seq =>  [       1,    3177] EXCISED REGION [    3178,    4594]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264960 GATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTA 28265019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTA 60

 28265020 CAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAA 28265079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAA 120

 28265080 GAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGA 28265139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      121 GAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGA 180

 28265140 TGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAA 28265199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      181 TGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAA 240

 28265200 TAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCA 28265259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCA 300

 28265260 GGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAG 28265319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAG 360

 28265320 GAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGT 28265379
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
      361 GAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAA-GCCTCAAGT 419

 28265380 TTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCC 28265439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCC 479

 28265440 CAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAA 28265499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAA 539

 28265500 AAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAA 28265559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      540 AAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAA 599

 28265560 TTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATG 28265619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      600 TTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATG 659

 28265620 AAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAG 28265679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAG 719

 28265680 AAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAAT 28265739
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAAT 779

 28265740 CATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCA 28265799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCA 839

 28265800 AAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATT 28265859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATT 899

 28265860 AAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGT 28265919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGT 959

 28265920 GGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCT 28265978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
      960 GGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCT 1019

 28265979 ACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTG 28266038
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1020 ACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTG 1079

 28266039 GGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGAT 28266098
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1080 GGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGAT 1139

 28266099 CATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTT 28266157
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     1140 CATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTT 1199

 28266158 ATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATA 28266217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATA 1259

 28266218 ATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTA 28266277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTA 1319

 28266278 TGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTT 28266337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTT 1379

 28266338 CCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGT 28266397
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGT 1439

 28266398 TAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGG 28266457
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGG 1499

 28266458 AGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAAT 28266517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAAT 1559

 28266518 CTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAG 28266577
          ||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAG 1619

 28266578 AAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTA 28266637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTA 1679

 28266638 CAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCT 28266697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCT 1739

 28266698 TGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAG 28266757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
     1740 TGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAG 1795

 28266758 AGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGC 28266817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 AGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGC 1855

 28266818 ATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACAC 28266877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 ATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACAC 1915

 28266878 TGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTA 28266937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTA 1975

 28266938 ATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGG 28266997
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 ATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGG 2035

 28266998 AACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATC 28267057
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 AGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATC 2095

 28267058 ACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTT 28267117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 ACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTT 2155

 28267118 ATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAG 28267177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2156 ATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAG 2215

 28267178 TGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAG 28267237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAG 2275

 28267238 GGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAA 28267297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAA 2335

 28267298 TGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTT 28267357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTT 2395

 28267358 AGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGAC 28267417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGAC 2455

 28267418 ATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAG 28267477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 ATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAG 2515

 28267478 TGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTA 28267537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTA 2575

 28267538 AGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTT 28267597
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTT 2635

 28267598 TTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAAT 28267657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAAT 2695

 28267658 ATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGT 28267717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGT 2755

 28267718 ATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATC 28267777
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2756 ATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATC 2815

 28267778 ATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCC 28267837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 ATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCC 2875

 28267838 CAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAA 28267897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAA 2935

 28267898 GTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTC 28267957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTC 2995

 28267958 CAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGT 28268017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 CAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGT 3055

 28268018 ATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCAC 28268075
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 ATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCAC 3113

 28268076 CTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCT 28268135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 CTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCT 3173

 28268136 TTTT 28268139
          ||||
     3174 TTTT 3177

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3237

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3297

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3357

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3417

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3418 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3477

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3537

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 3597

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     3598 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCA-- 3655

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 3701

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 3761

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3762 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 3821

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 3881

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 3941

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4001

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4061

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4062 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4121

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4122 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4181

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4241

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4242 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4301

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4361

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4421

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4481

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4482 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 4541

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 4594

Alignment time is 5.9443 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8375] =>      8375 nucs 'mol-32-1f58-126773_8375'

Score:        7758
Aligned:      8396        nucs
Identic:      8320 ( 99%) nucs =>      3634 ( 99%)      4686 ( 99%)
Gaps:           29 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264478,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273774]
 second seq =>  [       1,    3661] EXCISED REGION [    3662,    8375]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264478 TTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTAC 28264537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTAC 60

 28264538 TGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 28264597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 120

 28264598 ACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGG 28264656
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
      121 ACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGG 180

 28264657 GTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTC 28264716
          ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
      181 GTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTC 240

 28264717 AGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTC 28264776
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      241 AGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTC 300

 28264777 TTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTC 28264836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      301 TTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTC 360

 28264837 CAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGA 28264896
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      361 CAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGA 420

 28264897 CCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAAT 28264956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAAT 480

 28264957 ATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAA 28265016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAA 540

 28265017 TTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAA 28265076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAA 600

 28265077 TAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAAT 28265136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      601 TAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAAT 660

 28265137 AGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAA 28265196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      661 AGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAA 720

 28265197 TAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCC 28265256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCC 780

 28265257 TCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGA 28265316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGA 840

 28265317 GAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCA 28265376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCA 900

 28265377 AGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATAT 28265436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATAT 960

 28265437 GCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAAT 28265496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAAT 1020

 28265497 TAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCA 28265556
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1021 TAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCA 1080

 28265557 GAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAA 28265616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1081 GAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAA 1140

 28265617 ATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGT 28265676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGT 1200

 28265677 AAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAA 28265736
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAA 1260

 28265737 AATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGAT 28265796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGAT 1320

 28265797 GCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACA 28265856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACA 1380

 28265857 ATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCA 28265916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCA 1440

 28265917 GGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATC 28265975
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     1441 GGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATC 1500

 28265976 TCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTAC 28266035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1501 TCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTAC 1560

 28266036 TTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGA 28266095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1561 TTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAA 1620

 28266096 GATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA- 28266154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1621 GATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAA 1680

 28266155 GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAA 28266214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAA 1740

 28266215 ATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAG 28266274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAG 1800

 28266275 CTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAAT 28266334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAAT 1860

 28266335 GTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACA 28266394
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACA 1920

 28266395 GGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTT 28266454
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTT 1980

 28266455 GGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGG 28266514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGG 2040

 28266515 AATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTC 28266574
          |||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTC 2100

 28266575 CAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAA 28266634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAA 2160

 28266635 TTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGT 28266694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGT 2220

 28266695 GCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTT 28266754
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
     2221 GCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTT 2276

 28266755 CAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAA 28266814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAA 2336

 28266815 TGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACA 28266874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACA 2396

 28266875 CACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCAC 28266934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCAC 2456

 28266935 CTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTT 28266994
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTT 2516

 28266995 TGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGG 28267054
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGG 2576

 28267055 ATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCAT 28267114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 ATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCAT 2636

 28267115 CTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTG 28267174
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2637 CTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTA 2696

 28267175 AAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACC 28267234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACC 2756

 28267235 CAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAAT 28267294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAAT 2816

 28267295 GAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGAT 28267354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 GAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGAT 2876

 28267355 TTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGAT 28267414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGAT 2936

 28267415 GACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGT 28267474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGT 2996

 28267475 GAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTT 28267534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTT 3056

 28267535 TTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGA 28267594
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGA 3116

 28267595 TTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAA 28267654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAA 3176

 28267655 AATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTA 28267714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 AATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTA 3236

 28267715 GGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGC 28267774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3237 GGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGC 3296

 28267775 ATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGT 28267834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 ATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGT 3356

 28267835 CCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTA 28267894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTA 3416

 28267895 TAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGC 28267954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGC 3476

 28267955 CTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGT 28268014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGT 3536

 28268015 AGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGG 28268072
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGG 3594

 28268073 CACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTG 28268132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTG 3654

 28268133 TCTTTTT 28268139
          |||||||
     3655 TCTTTTT 3661

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3721

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3781

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3841

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3901

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3902 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3961

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 4021

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 4081

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4082 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 4140

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4186

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4246

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4247 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4306

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 4366

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 4426

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4486

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4546

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4547 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4606

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4607 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4666

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4726

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4727 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4786

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4846

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4906

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4966

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4967 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 5026

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 5086

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 5146

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 5206

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 5266

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5267 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 5326

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 5386

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 5446

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 5506

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 5566

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 5626

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5627 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 5686

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5687 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 5746

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5747 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 5806

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 5866

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 5926

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 5986

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 6046

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 6106

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 6166

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 6226

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 6286

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 6346

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 6406

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 6466

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 6526

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 6586

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 6646

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 6706

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 6766

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 6826

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 6886

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 6946

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 7006

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     7007 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 7066

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 7126

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 7186

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 7246

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 7306

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 7366

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 7426

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 7486

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7487 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 7546

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7547 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 7606

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7607 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 7666

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7667 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 7726

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7727 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 7786

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7787 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 7846

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCA 28273305
          |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7847 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCA 7906

 28273306 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCAC 28273365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7907 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCAC 7966

 28273366 GTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACT 28273425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7967 GTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACT 8026

 28273426 ACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGAT 28273485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8027 ACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGAT 8086

 28273486 GGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTAC 28273545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8087 GGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTAC 8146

 28273546 AGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAA 28273605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     8147 AGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAA 8206

 28273606 ACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTC 28273665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8207 ACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTC 8266

 28273666 TTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTT 28273725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8267 TTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTT 8326

 28273726 CTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTC 28273774
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8327 CTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTC 8375

Alignment time is 10.184 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3665] =>      3665 nucs 'mol-32-1f58-126773_3665'

Score:        3375
Aligned:      3667        nucs
Identic:      3638 ( 99%) nucs =>      2225 ( 99%)      1413 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264478,28266719] EXCISED REGION [28266724,28268143]
 second seq =>  [       1,    2245] EXCISED REGION [    2246,    3665]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28266720,28266723]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [28268022,28268023]
 second seq =>         2 nucs [3544,3545]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [28266720,28266737] to [28266724,28266741]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264478 TTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTAC 28264537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTAC 60

 28264538 TGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 28264597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 120

 28264598 ACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGG 28264656
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
      121 ACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGG 180

 28264657 GTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTC 28264716
          ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
      181 GTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTC 240

 28264717 AGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTC 28264776
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      241 AGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTC 300

 28264777 TTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTC 28264836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      301 TTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTC 360

 28264837 CAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGA 28264896
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      361 CAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGA 420

 28264897 CCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAAT 28264956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAAT 480

 28264957 ATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAA 28265016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAA 540

 28265017 TTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAA 28265076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAA 600

 28265077 TAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAAT 28265136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      601 TAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAAT 660

 28265137 AGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAA 28265196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      661 AGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAA 720

 28265197 TAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCC 28265256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCC 780

 28265257 TCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGA 28265316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGA 840

 28265317 GAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCA 28265376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCA 900

 28265377 AGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATAT 28265436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATAT 960

 28265437 GCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAAT 28265496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAAT 1020

 28265497 TAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCA 28265556
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1021 TAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCA 1080

 28265557 GAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAA 28265616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1081 GAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAA 1140

 28265617 ATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGT 28265676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGT 1200

 28265677 AAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAA 28265736
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAA 1260

 28265737 AATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGAT 28265796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGAT 1320

 28265797 GCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACA 28265856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACA 1380

 28265857 ATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCA 28265916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCA 1440

 28265917 GGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATC 28265975
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     1441 GGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATC 1500

 28265976 TCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTAC 28266035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1501 TCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTAC 1560

 28266036 TTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGA 28266095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1561 TTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAA 1620

 28266096 GATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA- 28266154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1621 GATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAA 1680

 28266155 GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAA 28266214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAA 1740

 28266215 ATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAG 28266274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAG 1800

 28266275 CTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAAT 28266334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAAT 1860

 28266335 GTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACA 28266394
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACA 1920

 28266395 GGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTT 28266454
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTT 1980

 28266455 GGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGG 28266514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGG 2040

 28266515 AATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTC 28266574
          |||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTC 2100

 28266575 CAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAA 28266634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAA 2160

 28266635 TTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGT 28266694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGT 2220

 28266695 GCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 28266719
          |||||||||||||||||||||||||
     2221 GCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 2245

EXCISED REGION

 28266724 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 28266783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 2305

 28266784 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 28266843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 2365

 28266844 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 28266903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 2425

 28266904 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTT 28266963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2426 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTT 2485

 28266964 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 28267023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2486 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 2545

 28267024 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 28267083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 2605

 28267084 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 28267143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 2665

 28267144 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 28267203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2666 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 2725

 28267204 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 28267263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 2785

 28267264 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 28267323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 2845

 28267324 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 28267383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 2905

 28267384 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 28267443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 2965

 28267444 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 28267503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 3025

 28267504 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAAC 28267563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3026 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAAC 3085

 28267564 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 28267623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 3145

 28267624 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 28267683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 3205

 28267684 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 28267743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 3265

 28267744 TGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 28267803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 TGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 3325

 28267804 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 28267863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 3385

 28267864 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 28267923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 3445

 28267924 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 28267983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 3505

 28267984 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     3506 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCA 3563

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 3623

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 3665

Alignment time is 4.73427 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4074] =>      4074 nucs 'mol-32-1f63-041975_4074'

Score:        4062
Aligned:      4073        nucs
Identic:      4072 (100%) nucs =>       812 (100%)      3260 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268889,28269700] EXCISED REGION [28269702,28272962]
 second seq =>  [       1,     812] EXCISED REGION [     814,    4074]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [813,813]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [812,812] to [814,814]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268889 GGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGG 28268948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGG 60

 28268949 TGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGT 28269008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGT 120

 28269009 ACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGC 28269068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGC 180

 28269069 TTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAA 28269128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAA 240

 28269129 TTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAG 28269188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAG 300

 28269189 TGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGA 28269248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGA 360

 28269249 TCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGT 28269308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGT 420

 28269309 TTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTT 28269368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTT 480

 28269369 TAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGAT 28269428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGAT 540

 28269429 GTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATT 28269488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATT 600

 28269489 GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAA 28269548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAA 660

 28269549 AAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCAT 28269608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCAT 720

 28269609 TAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGT 28269668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGT 780

 28269669 ATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 812

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 873

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 933

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 993

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 1053

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 1113

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 TGTTCCTTTGACGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 1173

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 1233

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 1293

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 1353

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 1413

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 1473

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 1533

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 1593

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 1653

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 1713

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 1773

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 1833

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 1893

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 1953

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 2013

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 2073

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 2133

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 2193

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 2253

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 2313

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 2373

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 2433

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 2493

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 2553

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 2613

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 2673

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 2733

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 2793

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 2853

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 2913

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 2973

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 3033

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 3093

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 3153

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 3213

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 3273

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 3333

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 3393

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 3453

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 3513

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 3573

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 3633

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 3693

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 3753

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 3813

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 3873

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 3933

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 3993

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 4053

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAG 28272962
          |||||||||||||||||||||
     4054 GAATGTGGTTGATGAGTGGAG 4074

Alignment time is 5.39455 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6043] =>      6043 nucs 'mol-32-21f7-016370_6043'

Score:        5590
Aligned:      6059        nucs
Identic:      6000 ( 99%) nucs =>      2028 ( 99%)      3972 ( 99%)
Gaps:           24 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266095,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273059]
 second seq =>  [       6,    2047] EXCISED REGION [    2048,    6043]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266095 AGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA 28266154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 AGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA 65

 28266155 -GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAA 28266213
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
       66 AGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGGACTGGTAA 125

 28266214 AATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAA 28266273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 AATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAA 185

 28266274 GCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAA 28266333
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 GCTATGCAAGGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAA 245

 28266334 TGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTAC 28266393
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTAC 305

 28266394 AGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTT 28266453
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 AGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTT 365

 28266454 TGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAG 28266513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAG 425

 28266514 GAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGT 28266573
          ||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      426 GAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGT 485

 28266574 CCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAA 28266633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 CCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAA 545

 28266634 ATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGG 28266693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 ATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGG 605

 28266694 TGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCT 28266753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||
      606 TGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCT 661

 28266754 TCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGA 28266813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 TCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGA 721

 28266814 ATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCAC 28266873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 ATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCAC 781

 28266874 ACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCA 28266933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 ACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCA 841

 28266934 CCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGT 28266993
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 CCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGT 901

 28266994 TTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGG 28267053
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 TTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGG 961

 28267054 GATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCA 28267113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 GATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCA 1021

 28267114 TCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTT 28267173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 TCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTT 1081

 28267174 GAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAAC 28267233
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 AAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAAC 1141

 28267234 CCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAA 28267293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 CCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAA 1201

 28267294 TGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGA 28267353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 TGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGA 1261

 28267354 TTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGA 28267413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 TTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGA 1321

 28267414 TGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGG 28267473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 TGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGG 1381

 28267474 TGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGT 28267533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 TGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGT 1441

 28267534 TTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAG 28267593
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 TTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAG 1501

 28267594 ATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCA 28267653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 ATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCA 1561

 28267654 AAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCT 28267713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 AAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCT 1621

 28267714 AGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAG 28267773
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1622 AGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAG 1681

 28267774 CATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAG 28267833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 CATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAG 1741

 28267834 TCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTT 28267893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 TCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTT 1801

 28267894 ATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGG 28267953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 ATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGG 1861

 28267954 CCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTG 28268013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 CCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTG 1921

 28268014 TAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGG 28268071
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 TAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGG 1979

 28268072 GCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGT 28268131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGT 2039

 28268132 GTCTTTTT 28268139
          ||||||||
     2040 GTCTTTTT 2047

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 2107

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 2167

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 2227

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 2287

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2288 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 2347

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 2407

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 2467

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2468 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 2526

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 2572

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 2632

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2633 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 2692

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 2752

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 2812

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 2872

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 2932

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2933 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 2992

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     2993 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 3052

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 3112

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3113 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 3172

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 3232

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 3292

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 3352

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3353 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 3412

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 3472

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 3532

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 3592

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 3652

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3653 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 3712

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 3772

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 3832

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 3892

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 3952

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 4012

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4013 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 4072

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4073 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 4132

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4133 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 4192

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 4252

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 4312

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 4372

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 4432

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 4492

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 4552

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 4612

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 4672

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 4732

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 TAGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 4792

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 4852

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 4912

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 4972

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 5032

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 5092

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 5152

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 5212

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 5272

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 5332

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 5392

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5393 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 5452

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 5512

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 5572

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 5632

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 5692

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 5752

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 5812

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 5872

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5873 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 5932

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 5992

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGC 28273059
          ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGC 6043

Alignment time is 7.62621 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2051] =>      2051 nucs 'mol-32-21f7-016370_2051'

Score:        1899
Aligned:      2048        nucs
Identic:      2032 ( 99%) nucs =>       619 ( 99%)      1413 ( 99%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266095,28266719] EXCISED REGION [28266724,28268143]
 second seq =>  [       6,     631] EXCISED REGION [     632,    2051]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28266720,28266723]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [28268022,28268023]
 second seq =>         2 nucs [1930,1931]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [28266720,28266737] to [28266724,28266741]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266095 AGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA 28266154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 AGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA 65

 28266155 -GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAA 28266213
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
       66 AGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGGACTGGTAA 125

 28266214 AATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAA 28266273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 AATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAA 185

 28266274 GCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAA 28266333
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 GCTATGCAAGGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAA 245

 28266334 TGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTAC 28266393
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTAC 305

 28266394 AGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTT 28266453
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 AGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTT 365

 28266454 TGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAG 28266513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAG 425

 28266514 GAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGT 28266573
          ||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      426 GAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGT 485

 28266574 CCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAA 28266633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 CCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAA 545

 28266634 ATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGG 28266693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 ATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGG 605

 28266694 TGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 28266719
          ||||||||||||||||||||||||||
      606 TGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 631

EXCISED REGION

 28266724 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 28266783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 691

 28266784 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 28266843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 751

 28266844 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 28266903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 811

 28266904 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTT 28266963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      812 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTT 871

 28266964 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 28267023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      872 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 931

 28267024 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 28267083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 991

 28267084 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 28267143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 1051

 28267144 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 28267203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1052 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 1111

 28267204 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 28267263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 1171

 28267264 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 28267323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 1231

 28267324 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 28267383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 1291

 28267384 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 28267443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 1351

 28267444 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 28267503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 1411

 28267504 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAAC 28267563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1412 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAAC 1471

 28267564 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 28267623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 1531

 28267624 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 28267683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 1591

 28267684 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 28267743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 1651

 28267744 TGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 28267803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 1711

 28267804 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 28267863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 1771

 28267864 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 28267923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 1831

 28267924 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 28267983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 1891

 28267984 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     1892 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCA 1949

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 2009

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 2051

Alignment time is 3.109 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4972] =>      4972 nucs 'mol-32-22b2-007255_4972'

Score:        4546
Aligned:      4993        nucs
Identic:      4936 ( 99%) nucs =>      2244 ( 99%)      2692 ( 99%)
Gaps:           25 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265879,28268139] EXCISED REGION [28269049,28271776]
 second seq =>  [       1,    2259] EXCISED REGION [    2260,    4972]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265879 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGA 28265938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGA 60

 28265939 GTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATT 28265997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATT 120

 28265998 AGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 28266057
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 180

 28266058 TCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAAC 28266117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      181 TCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAAC 240

 28266118 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAA 28266176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
      241 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAA 300

 28266177 AGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTG 28266236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTG 360

 28266237 ATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAA 28266296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAA 420

 28266297 AAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCA 28266356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCA 480

 28266357 AGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGG 28266416
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      481 AGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGG 540

 28266417 ATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTT 28266476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTT 600

 28266477 TCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGAT 28266536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      601 TCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGAT 660

 28266537 TTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAG 28266596
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAG 720

 28266597 AGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAG 28266656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAG 780

 28266657 TTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAG 28266716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAG 840

 28266717 GTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGA 28266776
          |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGA 896

 28266777 GAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGA 28266836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGA 956

 28266837 GACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGG 28266896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 GACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGG 1016

 28266897 TGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATT 28266956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1017 TGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATT 1076

 28266957 TTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGT 28267016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1077 TTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGT 1136

 28267017 GGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGA 28267076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGA 1196

 28267077 ACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATG 28267136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 ACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATG 1256

 28267137 CGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCA 28267196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1257 CGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCA 1316

 28267197 AACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCT 28267256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 AACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCT 1376

 28267257 CTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCC 28267316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCC 1436

 28267317 ACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTA 28267376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTA 1496

 28267377 TAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTT 28267436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTT 1556

 28267437 TAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTA 28267496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTA 1616

 28267497 TTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTT 28267556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1617 TTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTT 1676

 28267557 GGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTT 28267616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 GGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTT 1736

 28267617 GTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTAT 28267676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTAT 1796

 28267677 TTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGA 28267736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGA 1856

 28267737 TTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTT 28267796
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTT 1916

 28267797 TCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATC 28267856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATC 1976

 28267857 TTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTT 28267916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTT 2036

 28267917 GGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCT 28267976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCT 2096

 28267977 GCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATA 28268034
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||
     2097 GCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATA 2154

 28268035 TATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCT 28268094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCT 2214

 28268095 TTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 2259

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 2319

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 2379

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 2439

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 2499

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2500 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 2559

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 2619

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 2679

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2680 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 2738

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 2784

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 2844

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2845 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 2904

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 2964

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 3024

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 CTGATTGCCCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 3084

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 3144

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3145 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 3204

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     3205 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 3264

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 3324

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3325 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 3384

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 3444

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 TTTGTCTCACTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 3504

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 3564

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3565 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 3624

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 3684

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 3744

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 3804

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 3864

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3865 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 3924

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 3984

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 4044

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 4104

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 4164

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 4224

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4225 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 4284

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4285 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 4344

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4345 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 4404

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4405 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCATTGGTCAG 4464

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 4524

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 4584

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 4644

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 4704

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 4764

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 4824

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 4884

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 4944

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGT 28271776
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4945 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGT 4972

Alignment time is 6.317 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2263] =>      2263 nucs 'mol-32-22b2-007255_2263'

Score:        2105
Aligned:      2265        nucs
Identic:      2248 ( 99%) nucs =>       835 ( 99%)      1413 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265879,28266719] EXCISED REGION [28266724,28268143]
 second seq =>  [       1,     843] EXCISED REGION [     844,    2263]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28266720,28266723]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [28268022,28268023]
 second seq =>         2 nucs [2142,2143]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [28266720,28266737] to [28266724,28266741]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265879 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGA 28265938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGA 60

 28265939 GTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATT 28265997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATT 120

 28265998 AGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 28266057
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 180

 28266058 TCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAAC 28266117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      181 TCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAAC 240

 28266118 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAA 28266176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
      241 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAA 300

 28266177 AGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTG 28266236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTG 360

 28266237 ATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAA 28266296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAA 420

 28266297 AAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCA 28266356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCA 480

 28266357 AGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGG 28266416
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      481 AGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGG 540

 28266417 ATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTT 28266476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTT 600

 28266477 TCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGAT 28266536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      601 TCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGAT 660

 28266537 TTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAG 28266596
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAG 720

 28266597 AGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAG 28266656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAG 780

 28266657 TTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAG 28266716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAG 840

 28266717 GTC 28266719
          |||
      841 GTC 843

EXCISED REGION

 28266724 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 28266783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 903

 28266784 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 28266843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 963

 28266844 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 28266903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 1023

 28266904 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTT 28266963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1024 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTT 1083

 28266964 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 28267023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1084 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 1143

 28267024 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 28267083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 1203

 28267084 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 28267143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 1263

 28267144 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 28267203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 1323

 28267204 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 28267263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 1383

 28267264 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 28267323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 1443

 28267324 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 28267383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 1503

 28267384 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 28267443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 1563

 28267444 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 28267503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 1623

 28267504 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAAC 28267563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1624 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAAC 1683

 28267564 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 28267623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 1743

 28267624 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 28267683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 1803

 28267684 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 28267743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 1863

 28267744 TGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 28267803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 1923

 28267804 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 28267863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 1983

 28267864 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 28267923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 2043

 28267924 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 28267983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 2103

 28267984 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     2104 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCA 2161

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 2221

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 2263

Alignment time is 3.3446 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5518] =>      5518 nucs 'mol-32-22bd-000808_5518'

Score:        5506
Aligned:      5517        nucs
Identic:      5516 (100%) nucs =>      2524 (100%)      2992 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264841,28267364] EXCISED REGION [28267366,28270358]
 second seq =>  [       1,    2524] EXCISED REGION [    2526,    5518]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28267365,28267365]
 second seq =>         1 nucs [2525,2525]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28267364,28267364] to [28267366,28267366]
 second seq =>         1 nucs [2524,2524] to [2526,2526]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264841 CTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAG 28264900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAG 60

 28264901 CAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAG 28264960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAG 120

 28264961 ATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTAC 28265020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTAC 180

 28265021 AAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAG 28265080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAG 240

 28265081 AACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGAT 28265140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGAT 300

 28265141 GATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAAT 28265200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAAT 360

 28265201 AAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAG 28265260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAG 420

 28265261 GGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGG 28265320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGG 480

 28265321 AGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTT 28265380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTT 540

 28265381 TGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCC 28265440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCC 600

 28265441 AAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAA 28265500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAA 660

 28265501 AAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAAT 28265560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAAT 720

 28265561 TCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGA 28265620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGA 780

 28265621 AAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGA 28265680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGA 840

 28265681 AAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATC 28265740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATC 900

 28265741 ATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAA 28265800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAA 960

 28265801 AAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTA 28265860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTA 1020

 28265861 AGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTG 28265920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTG 1080

 28265921 GATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTAC 28265980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTAC 1140

 28265981 CAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGG 28266040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGG 1200

 28266041 AGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCA 28266100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCA 1260

 28266101 TGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATA 28266160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATA 1320

 28266161 AATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATG 28266220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATG 1380

 28266221 ACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGC 28266280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGC 1440

 28266281 AAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCA 28266340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCA 1500

 28266341 AAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAG 28266400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAG 1560

 28266401 AAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGT 28266460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGT 1620

 28266461 AAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTA 28266520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTA 1680

 28266521 GAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAG 28266580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAG 1740

 28266581 ACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAG 28266640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAG 1800

 28266641 ATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGG 28266700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGG 1860

 28266701 TTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGA 28266760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGA 1920

 28266761 TGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATT 28266820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATT 1980

 28266821 TATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGC 28266880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGC 2040

 28266881 TTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATA 28266940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATA 2100

 28266941 GTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAAC 28267000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAAC 2160

 28267001 TCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACA 28267060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACA 2220

 28267061 TGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATG 28267120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATG 2280

 28267121 CCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGA 28267180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGA 2340

 28267181 TTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGG 28267240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGG 2400

 28267241 ACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGA 28267300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGA 2460

 28267301 CAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGC 28267360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGC 2520

 28267361 CATT 28267364
          ||||
     2521 CATT 2524

EXCISED REGION

 28267366 TGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATG 28267425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 TGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATG 2585

 28267426 TTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAG 28267485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAG 2645

 28267486 TATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCT 28267545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCT 2705

 28267546 TTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCA 28267605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 TTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCA 2765

 28267606 GTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTT 28267665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 GTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTT 2825

 28267666 TCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTA 28267725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTA 2885

 28267726 TGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAA 28267785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 TGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAA 2945

 28267786 GAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTA 28267845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 GAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTA 3005

 28267846 TTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAAC 28267905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 TTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAAC 3065

 28267906 ACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCA 28267965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 ACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCA 3125

 28267966 TCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATG 28268025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 TCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATG 3185

 28268026 ATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTAT 28268085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 ATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTAT 3245

 28268086 TCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGA 28268145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 TCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGA 3305

 28268146 ATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCT 28268205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 ATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCT 3365

 28268206 CTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTAC 28268265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTAC 3425

 28268266 ATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGT 28268325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 ATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGT 3485

 28268326 TTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTT 28268385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTT 3545

 28268386 TTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCT 28268445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCT 3605

 28268446 GCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGT 28268505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 GCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGT 3665

 28268506 TGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGT 28268565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 TGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGT 3725

 28268566 TTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTG 28268625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 TTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTG 3785

 28268626 CTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACA 28268685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 CTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACA 3845

 28268686 TTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCC 28268745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCC 3905

 28268746 TAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATT 28268805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATT 3965

 28268806 TTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCT 28268865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 TTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCT 4025

 28268866 ATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTA 28268925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 ATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTA 4085

 28268926 CCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCA 28268985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 CCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCA 4145

 28268986 TTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAG 28269045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAG 4205

 28269046 TAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAG 28269105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 TAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAG 4265

 28269106 GCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGA 28269165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 GCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGA 4325

 28269166 TGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCAT 28269225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 TGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCAT 4385

 28269226 TTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCA 28269285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 TTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCA 4445

 28269286 TCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTG 28269345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 TCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTG 4505

 28269346 GTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGG 28269405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 GTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGG 4565

 28269406 CTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCAC 28269465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 CTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCAC 4625

 28269466 ACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTC 28269525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 ACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTC 4685

 28269526 AAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTA 28269585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 AAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTA 4745

 28269586 TCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATA 28269645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 TCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATA 4805

 28269646 GGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAAC 28269705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4806 GGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAAC 4865

 28269706 AGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCC 28269765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 AGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCC 4925

 28269766 ACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCT 28269825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 ACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCT 4985

 28269826 TGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGG 28269885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 TGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGG 5045

 28269886 CATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATG 28269945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 CATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATG 5105

 28269946 ATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTT 28270005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 ATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTT 5165

 28270006 CCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAA 28270065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 CCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAA 5225

 28270066 GATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGA 28270125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 GATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGA 5285

 28270126 ATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACT 28270185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 ATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACT 5345

 28270186 TGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTAT 28270245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 TGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTAT 5405

 28270246 ATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAAC 28270305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5406 ATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAAC 5465

 28270306 ATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACT 28270358
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5466 ATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACT 5518

Alignment time is 6.83032 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2014] =>      2014 nucs 'mol-32-2378-015929_2014'

Score:        2013
Aligned:      2013        nucs
Identic:      2013 (100%) nucs =>      1577 (100%)       436 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268124,28269700] EXCISED REGION [28269702,28270137]
 second seq =>  [       1,    1577] EXCISED REGION [    1579,    2014]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [1578,1578]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [1577,1577] to [1579,1579]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268124 ATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGG 28268183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGG 60

 28268184 ATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTC 28268243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTC 120

 28268244 CATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTA 28268303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTA 180

 28268304 AAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGT 28268363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGT 240

 28268364 GAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCA 28268423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCA 300

 28268424 TTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTA 28268483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTA 360

 28268484 TTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGA 28268543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGA 420

 28268544 TATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTT 28268603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTT 480

 28268604 ACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTG 28268663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTG 540

 28268664 TCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGT 28268723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGT 600

 28268724 CAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATT 28268783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATT 660

 28268784 TGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTC 28268843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTC 720

 28268844 TTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCC 28268903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCC 780

 28268904 ATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTT 28268963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTT 840

 28268964 CTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTT 28269023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTT 900

 28269024 CTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCT 28269083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCT 960

 28269084 CGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTT 28269143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTT 1020

 28269144 TTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGA 28269203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGA 1080

 28269204 TTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGT 28269263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGT 1140

 28269264 GTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTT 28269323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTT 1200

 28269324 GCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAA 28269383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAA 1260

 28269384 TGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTAC 28269443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTAC 1320

 28269444 TGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGG 28269503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGG 1380

 28269504 CAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCG 28269563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCG 1440

 28269564 GTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAA 28269623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAA 1500

 28269624 TTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCA 28269683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCA 1560

 28269684 GCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          |||||||||||||||||
     1561 GCTATCCCTTGAAAGGA 1577

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 1638

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 1698

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 1758

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 1818

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 1878

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 1938

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 1998

 28270122 GTGAATCACATTTATT 28270137
          ||||||||||||||||
     1999 GTGAATCACATTTATT 2014

Alignment time is 3.01722 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2706] =>      2706 nucs 'mol-32-2874-067433_2706'

Score:        2462
Aligned:      2715        nucs
Identic:      2683 ( 99%) nucs =>      2648 ( 99%)        35 (100%)
Gaps:           16 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265467,28268139] EXCISED REGION [28269049,28269083]
 second seq =>  [       1,    2671] EXCISED REGION [    2672,    2706]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265467 CAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAA 28265526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAA 60

 28265527 GTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCA 28265586
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCA 120

 28265587 ACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTT 28265646
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTT 180

 28265647 AGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAA 28265706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAA 240

 28265707 CACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTC 28265766
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTC 300

 28265767 TCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTC 28265826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTC 360

 28265827 TAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCT 28265886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCT 420

 28265887 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGC---AGGAGTTCA 28265943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||
      421 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAG---GTCAGGAGTTCA 477

 28265944 AGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTG 28266002
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
      478 AGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTG 537

 28266003 GGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACT 28266062
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 GGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACT 597

 28266063 TGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGG 28266122
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      598 TGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGG 657

 28266123 TGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGA 28266181
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      658 TGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGA 717

 28266182 GTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAA 28266241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAA 777

 28266242 TTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTA 28266301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTA 837

 28266302 CTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAA 28266361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAA 897

 28266362 AGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATT 28266421
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      898 AAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATT 957

 28266422 GTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTA 28266481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTA 1017

 28266482 CATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGA 28266541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1018 CATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGA 1077

 28266542 TAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTT 28266601
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTT 1137

 28266602 GACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTT 28266661
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GACAATTTATTGCTAGATCTTAGGAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTT 1197

 28266662 CCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTA 28266721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTA 1257

 28266722 AATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAA 28266781
          ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 AATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAA 1313

 28266782 TACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCA 28266841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCA 1373

 28266842 TTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGG 28266901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGG 1433

 28266902 CAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGC 28266961
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1434 CAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGC 1493

 28266962 TTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGG 28267021
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1494 TTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGG 1553

 28267022 TAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAG 28267081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAG 1613

 28267082 AAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAA 28267141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 AAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAA 1673

 28267142 AAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTG 28267201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1674 AAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTG 1733

 28267202 AAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAA 28267261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAA 1793

 28267262 GTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACC 28267321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 GTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACC 1853

 28267322 CTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTG 28267381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTG 1913

 28267382 ATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAAT 28267441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 ATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAAT 1973

 28267442 ATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTA 28267501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 ATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTA 2033

 28267502 TAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATA 28267561
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2034 TAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATA 2093

 28267562 ACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTT 28267621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 ACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTT 2153

 28267622 TTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAG 28267681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAG 2213

 28267682 ATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAG 28267741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 ATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAG 2273

 28267742 GGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAAC 28267801
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 GGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAAC 2333

 28267802 CCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTAT 28267861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 CCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTAT 2393

 28267862 GTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTT 28267921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 GTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTT 2453

 28267922 TCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGA 28267981
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGA 2513

 28267982 GGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATAC 28268039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
     2514 GGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATAC 2571

 28268040 CACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCT 28268099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 CACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCT 2631

 28268100 ATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 ATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 2671

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCT 28269083
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCT 2706

Alignment time is 3.83431 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5131] =>      5131 nucs 'mol-32-287f-119060_5131'

Score:        5120
Aligned:      5131        nucs
Identic:      5130 (100%) nucs =>      1044 (100%)      4086 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268657,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273788]
 second seq =>  [       1,    1044] EXCISED REGION [    1046,    5131]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [1045,1045]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [28273272,28273272]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [1044,1044] to [1046,1046]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268657 CCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTC 28268716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTC 60

 28268717 CCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACT 28268776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACT 120

 28268777 CTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGT 28268836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGT 180

 28268837 TATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCA 28268896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCA 240

 28268897 TTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGC 28268956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGC 300

 28268957 TTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATAC 28269016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATAC 360

 28269017 CATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCT 28269076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCT 420

 28269077 TTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAA 28269136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAA 480

 28269137 TAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAAT 28269196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAAT 540

 28269197 ATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGT 28269256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGT 600

 28269257 ATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGT 28269316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGT 660

 28269317 TCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTA 28269376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTA 720

 28269377 TTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAA 28269436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAA 780

 28269437 ATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCA 28269496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCA 840

 28269497 GCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAAT 28269556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAAT 900

 28269557 GCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTT 28269616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTT 960

 28269617 GAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGG 28269676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGG 1020

 28269677 CTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 1044

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 1105

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 1165

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 1225

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 1285

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 1345

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 1405

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 1465

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 1525

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 1585

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 1645

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 1705

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 1765

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 1825

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 1885

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 1945

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 2005

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 2065

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 2125

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 2185

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 2245

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 2305

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 2365

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 2425

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 2485

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 2545

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 2605

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 2665

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 2725

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 2785

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 2845

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 2905

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 2965

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 3025

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 3085

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 3145

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 3205

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 3265

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 3325

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 3385

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 3445

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 3505

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 3565

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 3625

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 3685

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 3745

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 3805

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 3865

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 3925

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 3985

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 4045

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 4105

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 4165

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 4225

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 4285

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 4345

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 4405

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 4465

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 4525

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 4585

 28273242 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 28273301
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     4586 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 4644

 28273302 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 28273361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 4704

 28273362 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 28273421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 4764

 28273422 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 28273481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 4824

 28273482 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 28273541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 4884

 28273542 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 28273601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 4944

 28273602 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 28273661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 5004

 28273662 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 28273721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 5064

 28273722 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 28273781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 5124

 28273782 CCTGTAT 28273788
          |||||||
     5125 CCTGTAT 5131

Alignment time is 6.2783 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8115] =>      8115 nucs 'mol-32-2895-081859_8115'

Score:        8103
Aligned:      8114        nucs
Identic:      8113 (100%) nucs =>      4879 (100%)      3234 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28262027,28266905] EXCISED REGION [28266907,28270141]
 second seq =>  [       1,    4879] EXCISED REGION [    4881,    8115]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28266906,28266906]
 second seq =>         1 nucs [4880,4880]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28266905,28266905] to [28266906,28266906]
 second seq =>         1 nucs [4880,4880] to [4881,4881]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28262027 AGCTTTATGCTTTAAATATATTACTTTGTTTTATACCAATTATGCCTCAATATAGTTGTT 28262086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTTTATGCTTTAAATATATTACTTTGTTTTATACCAATTATGCCTCAATATAGTTGTT 60

 28262087 TTAAAAATGTTATCAGAGAAAGAAGAAAACTAAAGTGAAGTAAATAATCATCCAGCTATT 28262146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAAAAATGTTATCAGAGAAAGAAGAAAACTAAAGTGAAGTAAATAATCATCCAGCTATT 120

 28262147 GGCTGATGGGTATTGTTATTCACATAAAAATTTTTCTAATAAAGAGTAAAAGTTGTATTT 28262206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCTGATGGGTATTGTTATTCACATAAAAATTTTTCTAATAAAGAGTAAAAGTTGTATTT 180

 28262207 GAAAAAAAATCCTGGCACCCCAGTCCCGAGGATCCCTAGAAAATTTACAGGGGTGGCAGT 28262266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAAAAAATCCTGGCACCCCAGTCCCGAGGATCCCTAGAAAATTTACAGGGGTGGCAGT 240

 28262267 CTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGATTTTCAATCTTTGGCTTGCATATACCTTGCCAAGACA 28262326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGATTTTCAATCTTTGGCTTGCATATACCTTGCCAAGACA 300

 28262327 TCCAAGGCACCTGCAATTTCTTGCTTACCAGGAATTTCCATCACCTGCCAGCAAGATTTT 28262386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAAGGCACCTGCAATTTCTTGCTTACCAGGAATTTCCATCACCTGCCAGCAAGATTTT 360

 28262387 ATTATATCAATGTAGCAGACCAGCCTGAAGTGCTATGGACTGATAGGGGTACAGTCTTTA 28262446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTATATCAATGTAGCAGACCAGCCTGAAGTGCTATGGACTGATAGGGGTACAGTCTTTA 420

 28262447 TGGGCTTGACTATAATAAAGAGACAGAGGGTCTAGTCAGGTAAACAAAAACAGTTTCTGG 28262506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGCTTGACTATAATAAAGAGACAGAGGGTCTAGTCAGGTAAACAAAAACAGTTTCTGG 480

 28262507 GCTCTTTGCTTAGGGGAAGTAATGAGACAAAGACATATTTCAGATTGATAGGTAAATACA 28262566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTCTTTGCTTAGGGGAAGTAATGAGACAAAGACATATTTCAGATTGATAGGTAAATACA 540

 28262567 AGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAGTGAAGAAACTACATGTGGGACAGTAGCTGCAGTTGGA 28262626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAGTGAAGAAACTACATGTGGGACAGTAGCTGCAGTTGGA 600

 28262627 GTCATCATCTGATTAAGTTTATGATGATACACTCTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCTTTG 28262686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCATCATCTGATTAAGTTTATGATGATACACTCTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCTTTG 660

 28262687 AAGCATATACTAAACAGGTGAGTCAAATGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCATTTT 28262746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGCATATACTAAACAGGTGAGTCAAATGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCATTTT 720

 28262747 TAGTCTTGCTTGGTTACGTTCATCTTTGAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCTTCT 28262806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGTCTTGCTTGGTTACGTTCATCTTTGAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCTTCT 780

 28262807 ATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGGTCCTTCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTGTTA 28262866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGGTCCTTCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTGTTA 840

 28262867 TTCGATGTGTCAGAAAGCCAATGTGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTGAAG 28262926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCGATGTGTCAGAAAGCCAATGTGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTGAAG 900

 28262927 CATTCACTCAGGAACAGTATAAATAACCACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACCAGC 28262986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTCACTCAGGAACAGTATAAATAACCACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACCAGC 960

 28262987 TATGAGAAGGACTCAACAAAATTCCATTTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTTTGA 28263046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGAGAAGGACTCAACAAAATTCCATTTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTTTGA 1020

 28263047 TGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCTGGGTTCCGGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCTAGA 28263106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCTGGGTTCCGGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCTAGA 1080

 28263107 AAGTCTGGATATTTTCCTTTCTCTAGAACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATATTCC 28263166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGTCTGGATATTTTCCTTTCTCTAGAACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATATTCC 1140

 28263167 TTTGGGGAAATACTAGGAAGAAGCAACAGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCTGGC 28263226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTGGGGAAATACTAGGAAGAAGCAACAGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCTGGC 1200

 28263227 CTCTTATTTTAGGTCAAGTTATTGAAGAATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTTAAA 28263286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCTTATTTTAGGTCAAGTTATTGAAGAATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTTAAA 1260

 28263287 AAGTGTATAGTACAGTTCAACAAGCTTTGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCATCA 28263346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGTGTATAGTACAGTTCAACAAGCTTTGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCATCA 1320

 28263347 TAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAATGTCAGTTGACAAGCTCATCCAAAAATTTGCACA 28263406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAATGTCAGTTGACAAGCTCATCCAAAAATTTGCACA 1380

 28263407 GCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTGAATCAGAAAAAATATGACAATTT 28263466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTGAATCAGAAAAAATATGACAATTT 1440

 28263467 TGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGTATTAAATATAGTGTGAAATTATG 28263526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGTATTAAATATAGTGTGAAATTATG 1500

 28263527 CAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTAGAAACAGACTCATTCCTATAGAC 28263586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTAGAAACAGACTCATTCCTATAGAC 1560

 28263587 AAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGGGATAAAGTATAAAATTTTCAATC 28263646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGGGATAAAGTATAAAATTTTCAATC 1620

 28263647 CATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAATAATTGATCCCTACATCTCCCACA 28263706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAATAATTGATCCCTACATCTCCCACA 1680

 28263707 ACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTAAATGGGAAAAGCGAACTTAAAAA 28263766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTAAATGGGAAAAGCGAACTTAAAAA 1740

 28263767 TCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTTTTGTTTTTTTAAAAAAGAGATCA 28263826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTTTTGTTTTTTTAAAAAAGAGATCA 1800

 28263827 AGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACA 28263886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACA 1860

 28263887 TCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGT 28263946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGT 1920

 28263947 ATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACA 28264006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACA 1980

 28264007 AGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAG 28264066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAG 2040

 28264067 AAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAG 28264126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAG 2100

 28264127 CTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTC 28264186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTC 2160

 28264187 TAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATG 28264246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATG 2220

 28264247 CTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAA 28264306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAA 2280

 28264307 GGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACT 28264366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACT 2340

 28264367 CCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGG 28264426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGG 2400

 28264427 TGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTTGAGACGG 28264486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTTGAGACGG 2460

 28264487 AGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTC 28264546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTC 2520

 28264547 CGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGC 28264606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGC 2580

 28264607 ATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAT 28264666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCAT 2640

 28264667 GTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAA 28264726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAA 2700

 28264727 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCC 28264786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCC 2760

 28264787 TGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTA 28264846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTA 2820

 28264847 TAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGAT 28264906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGAT 2880

 28264907 CTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTA 28264966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTA 2940

 28264967 GGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATAC 28265026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATAC 3000

 28265027 CCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAA 28265086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAA 3060

 28265087 GTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTA 28265146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTA 3120

 28265147 ACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAAT 28265206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAAT 3180

 28265207 TACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCT 28265266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCT 3240

 28265267 GTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAG 28265326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAG 3300

 28265327 AGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAA 28265386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAA 3360

 28265387 AAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAA 28265446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAA 3420

 28265447 ATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAA 28265506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAA 3480

 28265507 CTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATA 28265566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATA 3540

 28265567 TCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAA 28265626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAA 3600

 28265627 ATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAA 28265686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAA 3660

 28265687 TAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGA 28265746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGA 3720

 28265747 AATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTA 28265806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTA 3780

 28265807 TAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCT 28265866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCT 3840

 28265867 GGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCAC 28265926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCAC 3900

 28265927 CTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAA 28265986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAA 3960

 28265987 TACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTG 28266046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTG 4020

 28266047 AGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCAC 28266106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCAC 4080

 28266107 TGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGG 28266166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGG 4140

 28266167 AGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCA 28266226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCA 4200

 28266227 GTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAG 28266286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAG 4260

 28266287 GTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCC 28266346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCC 4320

 28266347 ACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGT 28266406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGT 4380

 28266407 AATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATT 28266466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATT 4440

 28266467 TACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGA 28266526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGA 4500

 28266527 TTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGA 28266586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGA 4560

 28266587 AAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAA 28266646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAA 4620

 28266647 TTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAG 28266706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAG 4680

 28266707 TGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAG 28266766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAG 4740

 28266767 TAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTT 28266826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTT 4800

 28266827 TTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCA 28266886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCA 4860

 28266887 AATCAAGGGGTGAGGCAGA 28266905
          |||||||||||||||||||
     4861 AATCAAGGGGTGAGGCAGA 4879

EXCISED REGION

 28266907 GTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCT 28266966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4881 GTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCT 4940

 28266967 ATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTT 28267026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4941 ATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTT 5000

 28267027 GGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGAT 28267086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5001 GGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGAT 5060

 28267087 GAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGA 28267146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5061 GAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGA 5120

 28267147 GGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATT 28267206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5121 GGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATT 5180

 28267207 GGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGC 28267266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5181 GGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGC 5240

 28267267 TATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTC 28267326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5241 TATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTC 5300

 28267327 AGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATC 28267386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 AGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATC 5360

 28267387 TCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCC 28267446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 TCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCC 5420

 28267447 TACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATT 28267506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 TACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATT 5480

 28267507 GGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGT 28267566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5481 GGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGT 5540

 28267567 CCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCAT 28267626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5541 CCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCAT 5600

 28267627 TCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCA 28267686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5601 TCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCA 5660

 28267687 GGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGC 28267746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 GGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGC 5720

 28267747 AAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCC 28267806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 AAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCC 5780

 28267807 GCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCA 28267866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 GCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCA 5840

 28267867 TGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGT 28267926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5841 TGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGT 5900

 28267927 TCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATA 28267986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 TCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATA 5960

 28267987 TAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTT 28268046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5961 TAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTT 6020

 28268047 TCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAA 28268106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6021 TCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAA 6080

 28268107 ATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGAT 28268166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6081 ATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGAT 6140

 28268167 ATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAA 28268226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6141 ATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAA 6200

 28268227 ATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAA 28268286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6201 ATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAA 6260

 28268287 ACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATA 28268346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6261 ACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATA 6320

 28268347 GCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATG 28268406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6321 GCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATG 6380

 28268407 ATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAG 28268466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6381 ATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAG 6440

 28268467 AAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGT 28268526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6441 AAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGT 6500

 28268527 TTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATT 28268586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6501 TTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATT 6560

 28268587 TTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTT 28268646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6561 TTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTT 6620

 28268647 TAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGT 28268706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6621 TAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGT 6680

 28268707 AAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTT 28268766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6681 AAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTT 6740

 28268767 AGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATA 28268826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6741 AGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATA 6800

 28268827 GAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAA 28268886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6801 GAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAA 6860

 28268887 GAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTA 28268946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6861 GAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTA 6920

 28268947 GGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTT 28269006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6921 GGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTT 6980

 28269007 GTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTG 28269066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6981 GTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTG 7040

 28269067 GCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATG 28269126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7041 GCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATG 7100

 28269127 AATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAAT 28269186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7101 AATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAAT 7160

 28269187 AGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCT 28269246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7161 AGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCT 7220

 28269247 GATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGT 28269306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7221 GATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGT 7280

 28269307 GTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCT 28269366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7281 GTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCT 7340

 28269367 TTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTG 28269426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7341 TTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTG 7400

 28269427 ATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCA 28269486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7401 ATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCA 7460

 28269487 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAA 28269546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7461 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAA 7520

 28269547 AAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTC 28269606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7521 AAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTC 7580

 28269607 ATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCT 28269666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7581 ATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCT 7640

 28269667 GTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCA 28269726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7641 GTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCA 7700

 28269727 GAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACT 28269786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7701 GAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACT 7760

 28269787 TTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGC 28269846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7761 TTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGC 7820

 28269847 ACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTT 28269906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7821 ACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTT 7880

 28269907 TCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGG 28269966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7881 TCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGG 7940

 28269967 TGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTG 28270026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7941 TGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTG 8000

 28270027 GGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAG 28270086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8001 GGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAG 8060

 28270087 ATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATT 28270141
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8061 ATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATT 8115

Alignment time is 9.51287 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2878] =>      2878 nucs 'mol-32-29a8-057338_2878'

Score:        1951
Aligned:      1962        nucs
Identic:      1961 (100%) nucs =>      1949 (100%)        12 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28267582,28269531] EXCISED REGION [28272259,28272270]
 second seq =>  [       1,    1950] EXCISED REGION [    2710,    2721]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2727 nucs [28269532,28272258]
 second seq =>       759 nucs [1951,2709]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269532,28269532] to [28272259,28272259]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269532,28269532] to [28272258,28272258]
 second seq =>         0 nucs

 28267582 TGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTC 28267641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTC 60

 28267642 TTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGA 28267701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGA 120

 28267702 GGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCAC 28267761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCAC 180

 28267762 CCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCC 28267821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCC 240

 28267822 TCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTT 28267881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTT 300

 28267882 TAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCT 28267941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCT 360

 28267942 TTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTT 28268001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTT 420

 28268002 TTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCA 28268061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCA 480

 28268062 CTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCA 28268121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCA 540

 28268122 ACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATG 28268181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATG 600

 28268182 GGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTT 28268241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTT 660

 28268242 TCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTC 28268301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTC 720

 28268302 TAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGT 28268361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGT 780

 28268362 GTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAG 28268421
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGAGATGGTACCTCACTGTGATTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAG 840

 28268422 CATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATG 28268481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATG 900

 28268482 TATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTC 28268541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTC 960

 28268542 GATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCT 28268601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCT 1020

 28268602 TTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACT 28268661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACT 1080

 28268662 TGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAG 28268721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAG 1140

 28268722 GTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAA 28268781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAA 1200

 28268782 TTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATAT 28268841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATAT 1260

 28268842 TCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCC 28268901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCC 1320

 28268902 CCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTT 28268961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTT 1380

 28268962 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGC 28269021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGC 1440

 28269022 TTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTG 28269081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTG 1500

 28269082 CTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTT 28269141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTT 1560

 28269142 TTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTA 28269201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTA 1620

 28269202 GATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAA 28269261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAA 1680

 28269262 GTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTT 28269321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTT 1740

 28269322 TTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTA 28269381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTA 1800

 28269382 AATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCT 28269441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCT 1860

 28269442 ACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTG 28269501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTG 1920

 28269502 GGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAA 28269531
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAA 1950

EXCISED REGION

 28272259 TGGTATGTTGTG 28272270
          ||||||||||||
     2710 TGGTATGTTGTG 2721

Alignment time is 3.60705 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6461] =>      6461 nucs 'mol-32-2b08-047591_6461'

Score:        6460
Aligned:      6460        nucs
Identic:      6460 (100%) nucs =>      6377 (100%)        83 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28263324,28269700] EXCISED REGION [28269702,28269784]
 second seq =>  [       1,    6377] EXCISED REGION [    6379,    6461]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [6378,6378]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [6377,6377] to [6379,6379]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28263324 ATACAATCATGTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAATGTCAGTTGAC 28263383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACAATCATGTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAATGTCAGTTGAC 60

 28263384 AAGCTCATCCAAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTG 28263443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGCTCATCCAAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTG 120

 28263444 AATCAGAAAAAATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGT 28263503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCAGAAAAAATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGT 180

 28263504 ATTAAATATAGTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTA 28263563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAAATATAGTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTA 240

 28263564 GAAACAGACTCATTCCTATAGACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGG 28263623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAACAGACTCATTCCTATAGACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGG 300

 28263624 GATAAAGTATAAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAAT 28263683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATAAAGTATAAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAAT 360

 28263684 AATTGATCCCTACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTA 28263743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTGATCCCTACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTA 420

 28263744 AATGGGAAAAGCGAACTTAAAAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTT 28263803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGGGAAAAGCGAACTTAAAAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTT 480

 28263804 TTGTTTTTTTAAAAAAGAGATCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTA 28263863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTTTTTTTAAAAAAGAGATCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTA 540

 28263864 AAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATAC 28263923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATAC 600

 28263924 TTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATA 28263983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATA 660

 28263984 CCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACT 28264043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACT 720

 28264044 GGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTG 28264103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTG 780

 28264104 CCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTAC 28264163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTAC 840

 28264164 AGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGAC 28264223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGAC 900

 28264224 AGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGAT 28264283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGAT 960

 28264284 CCATCCCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGG 28264343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCATCCCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGG 1020

 28264344 CTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAG 28264403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAG 1080

 28264404 CCAAGACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAG 28264463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAAGACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAG 1140

 28264464 TGTCCTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 28264523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTCCTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 1200

 28264524 CGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCT 28264583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCT 1260

 28264584 CCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTT 28264643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTT 1320

 28264644 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATG 28264703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATG 1380

 28264704 ATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGC 28264763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGC 1440

 28264764 CGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGG 28264823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGG 1500

 28264824 TTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAA 28264883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAA 1560

 28264884 ATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCA 28264943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCA 1620

 28264944 ACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAA 28265003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAA 1680

 28265004 AATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAA 28265063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAA 1740

 28265064 TAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAA 28265123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAA 1800

 28265124 AGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGA 28265183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGA 1860

 28265184 CTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAA 28265243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAA 1920

 28265244 AATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCAT 28265303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCAT 1980

 28265304 CAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGC 28265363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGC 2040

 28265364 TGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAAT 28265423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAAT 2100

 28265424 ACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAA 28265483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAA 2160

 28265484 ACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAG 28265543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAG 2220

 28265544 TGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATC 28265603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATC 2280

 28265604 AAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAA 28265663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAA 2340

 28265664 CTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACA 28265723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACA 2400

 28265724 GTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTA 28265783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTA 2460

 28265784 AATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGA 28265843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGA 2520

 28265844 AATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 28265903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 2580

 28265904 GGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAG 28265963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAG 2640

 28265964 ATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGT 28266023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGT 2700

 28266024 GATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATT 28266083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATT 2760

 28266084 GCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCT 28266143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCT 2820

 28266144 CAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCA 28266203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCA 2880

 28266204 GAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACC 28266263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACC 2940

 28266264 ATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAA 28266323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAA 3000

 28266324 TTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGG 28266383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGG 3060

 28266384 AGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACA 28266443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACA 3120

 28266444 GAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAG 28266503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAG 3180

 28266504 AGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTG 28266563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTG 3240

 28266564 ATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTA 28266623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTA 3300

 28266624 GAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAA 28266683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAA 3360

 28266684 AAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGG 28266743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGG 3420

 28266744 CATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCT 28266803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCT 3480

 28266804 ATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAA 28266863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAA 3540

 28266864 GAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCT 28266923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCT 3600

 28266924 CACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAG 28266983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAG 3660

 28266984 CTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGC 28267043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGC 3720

 28267044 TTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCC 28267103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCC 3780

 28267104 ATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTAC 28267163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTAC 3840

 28267164 CCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTA 28267223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTA 3900

 28267224 TGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCC 28267283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCC 3960

 28267284 CCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCA 28267343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCA 4020

 28267344 GTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGC 28267403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGC 4080

 28267404 TATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATA 28267463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATA 4140

 28267464 TCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTT 28267523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTT 4200

 28267524 AATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTG 28267583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTG 4260

 28267584 TTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTT 28267643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTT 4320

 28267644 TCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGG 28267703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGG 4380

 28267704 TTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCC 28267763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCC 4440

 28267764 AGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTC 28267823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTC 4500

 28267824 CCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTA 28267883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTA 4560

 28267884 GCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTT 28267943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTT 4620

 28267944 AGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTT 28268003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTT 4680

 28268004 TATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACT 28268063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACT 4740

 28268064 GGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAAC 28268123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAAC 4800

 28268124 ATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGG 28268183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGG 4860

 28268184 ATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTC 28268243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTC 4920

 28268244 CATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTA 28268303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTA 4980

 28268304 AAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGT 28268363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGT 5040

 28268364 GAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCA 28268423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCA 5100

 28268424 TTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTA 28268483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTA 5160

 28268484 TTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGA 28268543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGA 5220

 28268544 TATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTT 28268603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTT 5280

 28268604 ACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTG 28268663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTG 5340

 28268664 TCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGT 28268723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGT 5400

 28268724 CAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATT 28268783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATT 5460

 28268784 TGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTC 28268843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTC 5520

 28268844 TTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCC 28268903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCC 5580

 28268904 ATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTT 28268963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTT 5640

 28268964 CTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTT 28269023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTT 5700

 28269024 CTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCT 28269083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCT 5760

 28269084 CGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTT 28269143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTT 5820

 28269144 TTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGA 28269203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGA 5880

 28269204 TTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGT 28269263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGT 5940

 28269264 GTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTT 28269323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTT 6000

 28269324 GCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAA 28269383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAA 6060

 28269384 TGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTAC 28269443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTAC 6120

 28269444 TGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGG 28269503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGG 6180

 28269504 CAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCG 28269563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 CAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCG 6240

 28269564 GTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAA 28269623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAA 6300

 28269624 TTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCA 28269683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCA 6360

 28269684 GCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          |||||||||||||||||
     6361 GCTATCCCTTGAAAGGA 6377

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 6438

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGA 28269784
          |||||||||||||||||||||||
     6439 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGA 6461

Alignment time is 7.59504 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5185] =>      5185 nucs 'mol-32-2b13-005338_5185'

Score:        5164
Aligned:      5175        nucs
Identic:      5174 (100%) nucs =>      1021 (100%)      4153 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268680,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273855]
 second seq =>  [       1,    1021] EXCISED REGION [    1023,    5176]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [1022,1022]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [1021,1021] to [1023,1023]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268680 TGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGT 28268739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGT 60

 28268740 GTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAG 28268799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAG 120

 28268800 TTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCT 28268859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCT 180

 28268860 CCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATT 28268919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATT 240

 28268920 GACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCT 28268979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCT 300

 28268980 GTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGC 28269039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGC 360

 28269040 TTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCT 28269099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCT 420

 28269100 ATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAA 28269159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAA 480

 28269160 AAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTAT 28269219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTAT 540

 28269220 GGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTT 28269279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTT 600

 28269280 ATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACC 28269339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACC 660

 28269340 TCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTG 28269399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTG 720

 28269400 ATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTG 28269459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTG 780

 28269460 GCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTC 28269519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTC 840

 28269520 CGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGAT 28269579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGAT 900

 28269580 TTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGA 28269639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGA 960

 28269640 AAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGG 28269699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGG 1020

 28269700 A 28269700
          |
     1021 A 1021

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 1082

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 1142

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 1202

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 1262

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 1322

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 1382

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 1442

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 1502

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 1562

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 1622

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 1682

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 1742

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 1802

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 1862

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 1922

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 1982

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 2042

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 2102

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 2162

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 2222

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 2282

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 2342

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 2402

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 2462

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 2522

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 2582

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 2642

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 2702

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 2762

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 2822

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 2882

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 2942

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 3002

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 3062

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 3122

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 3182

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 3242

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 3302

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 3362

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 3422

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 3482

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 3542

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 3602

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 3662

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 3722

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 3782

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 3842

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 3902

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 3962

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 4022

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 4082

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 4142

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 4202

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 4262

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 4322

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 4382

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 4442

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 4502

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 4562

 28273242 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 28273301
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 4622

 28273302 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 28273361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 4682

 28273362 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 28273421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 4742

 28273422 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 28273481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 4802

 28273482 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 28273541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 4862

 28273542 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 28273601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 4922

 28273602 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 28273661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 4982

 28273662 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 28273721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 5042

 28273722 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 28273781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 5102

 28273782 CCTGTATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTT 28273841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 CCTGTATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTT 5162

 28273842 TTTTTTTTTTTTTT 28273855
          ||||||||||||||
     5163 TTTTTTTTTTTTTT 5176

Alignment time is 6.21668 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2599] =>      2599 nucs 'mol-32-2b3f-024835_2599'

Score:        2587
Aligned:      2598        nucs
Identic:      2597 (100%) nucs =>       754 (100%)      1843 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268947,28269700] EXCISED REGION [28269702,28271545]
 second seq =>  [       1,     754] EXCISED REGION [     756,    2599]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [755,755]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [754,754] to [756,756]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268947 GGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTT 28269006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTT 60

 28269007 GTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTG 28269066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTG 120

 28269067 GCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATG 28269126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATG 180

 28269127 AATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAAT 28269186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAAT 240

 28269187 AGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCT 28269246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCT 300

 28269247 GATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGT 28269306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGT 360

 28269307 GTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCT 28269366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCT 420

 28269367 TTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTG 28269426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTG 480

 28269427 ATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCA 28269486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCA 540

 28269487 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAA 28269546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAA 600

 28269547 AAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTC 28269606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTC 660

 28269607 ATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCT 28269666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCT 720

 28269667 GTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 754

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 815

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 875

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 935

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 995

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 1055

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 1115

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 1175

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 1235

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 1295

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 1355

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 1415

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 1475

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 1535

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 1595

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 1655

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 1715

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 1775

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 1835

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 1895

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 1955

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1956 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTGCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 2015

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 2075

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 2135

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 2195

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 2255

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 2315

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 2375

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 2435

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 2495

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 2555

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGG 28271545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGG 2599

Alignment time is 3.24931 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6705] =>      6705 nucs 'mol-32-2b4a-056944_6705'

Score:        6704
Aligned:      6704        nucs
Identic:      6704 (100%) nucs =>      2612 (100%)      4092 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28267089,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273793]
 second seq =>  [       1,    2612] EXCISED REGION [    2614,    6705]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [2613,2613]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [2612,2612] to [2614,2614]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28267089 GACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGG 28267148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGG 60

 28267149 GAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGG 28267208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGG 120

 28267209 AGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTA 28267268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTA 180

 28267269 TACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAG 28267328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAG 240

 28267329 CATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTC 28267388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTC 300

 28267389 ATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTA 28267448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTA 360

 28267449 CTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGG 28267508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGG 420

 28267509 GCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCC 28267568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCC 480

 28267569 TTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTC 28267628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTC 540

 28267629 TATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGG 28267688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGG 600

 28267689 GGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAA 28267748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAA 660

 28267749 GTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGC 28267808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGC 720

 28267809 ACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATG 28267868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATG 780

 28267869 AGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTC 28267928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTC 840

 28267929 CTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATA 28267988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATA 900

 28267989 ATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTC 28268048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTC 960

 28268049 TTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAAT 28268108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAAT 1020

 28268109 AGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATAT 28268168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATAT 1080

 28268169 ATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAAT 28268228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAAT 1140

 28268229 CTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAAC 28268288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAAC 1200

 28268289 ATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGC 28268348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGC 1260

 28268349 CATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGAT 28268408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGAT 1320

 28268409 TAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAA 28268468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAA 1380

 28268469 ATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTT 28268528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTT 1440

 28268529 CTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTT 28268588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTT 1500

 28268589 GTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTA 28268648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTA 1560

 28268649 ATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAA 28268708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAA 1620

 28268709 ATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAG 28268768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAG 1680

 28268769 ATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGA 28268828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGA 1740

 28268829 GGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGA 28268888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGA 1800

 28268889 GGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGG 28268948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGG 1860

 28268949 TGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGT 28269008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGT 1920

 28269009 ACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGC 28269068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGC 1980

 28269069 TTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAA 28269128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAA 2040

 28269129 TTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAG 28269188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAG 2100

 28269189 TGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGA 28269248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGA 2160

 28269249 TCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGT 28269308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGT 2220

 28269309 TTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTT 28269368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTT 2280

 28269369 TAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGAT 28269428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGAT 2340

 28269429 GTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATT 28269488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATT 2400

 28269489 GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAA 28269548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAA 2460

 28269549 AAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCAT 28269608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCAT 2520

 28269609 TAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGT 28269668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGT 2580

 28269669 ATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 2612

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 2673

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 2733

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 2793

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 2853

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 2913

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 2973

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 3033

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 3093

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 3153

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 3213

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 3273

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 3333

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 3393

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 3453

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 3513

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 3573

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 3633

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 3693

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 3753

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 3813

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 3873

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 3933

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 3993

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 4053

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 4113

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 4173

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 4233

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 4293

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 4353

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 4413

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 4473

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 4533

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 4593

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 4653

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 4713

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 4773

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 4833

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 4893

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 4953

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 5013

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 5073

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 5133

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 5193

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 5253

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 5313

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 5373

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 5433

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 5493

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 5553

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 5613

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 5673

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 5733

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 5793

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 5853

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 5913

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 5973

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 6033

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 6093

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 6153

 28273242 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 28273301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 6213

 28273302 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 28273361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 6273

 28273362 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 28273421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 6333

 28273422 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 28273481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6334 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 6393

 28273482 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 28273541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 6453

 28273542 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 28273601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 6513

 28273602 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 28273661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6514 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 6573

 28273662 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 28273721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 6633

 28273722 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 28273781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6634 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 6693

 28273782 CCTGTATACTTT 28273793
          ||||||||||||
     6694 CCTGTATACTTT 6705

Alignment time is 8.53482 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,   10046] =>     10046 nucs 'mol-32-2dff-077577_10046'

Score:        9284
Aligned:     10069        nucs
Identic:      9969 ( 99%) nucs =>      4273 ( 99%)      5696 ( 99%)
Gaps:           44 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28263837,28268139] EXCISED REGION [28269049,28274796]
 second seq =>  [       4,    4316] EXCISED REGION [    4317,   10046]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28263837 TTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCA 28263896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 TTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCA 63

 28263897 AGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCT 28263956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 AGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCT 123

 28263957 ACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGA 28264016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 ACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGA 183

 28264017 CGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATG 28264076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 CGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATG 243

 28264077 ATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGC 28264136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 ATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGC 303

 28264137 CAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGA 28264196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 CAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGA 363

 28264197 ACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAG 28264256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 ACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAG 423

 28264257 CCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGG 28264316
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      424 CCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACCGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGG 483

 28264317 AAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGG 28264376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 AAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGG 543

 28264377 TAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAG 28264436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      544 TAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACTTACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAG 603

 28264437 AGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTT-----------GAGACG 28264485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||
      604 AGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACG 663

 28264486 GAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCT 28264545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCT 723

 28264546 CCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGG 28264605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGG 783

 28264606 CATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACC 28264664
          |||.|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
      784 CATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACC 843

 28264665 ATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCA 28264724
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      844 ATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCA 903

 28264725 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACT 28264784
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      904 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACT 963

 28264785 CCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTT 28264844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      964 CCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTT 1023

 28264845 TATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAG 28264904
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1024 TATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAG 1083

 28264905 ATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGT 28264964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 ATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGT 1143

 28264965 TAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAAT 28265024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 TAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAAT 1203

 28265025 ACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACC 28265084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 ACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACC 1263

 28265085 AAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATT 28265144
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1264 AAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATT 1323

 28265145 TAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAA 28265204
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1324 TAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAA 1383

 28265205 ATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGAC 28265264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 ATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGAC 1443

 28265265 CTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAA 28265324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAA 1503

 28265325 AGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGC 28265384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGC 1563

 28265385 AAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAAT 28265444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 AAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAAT 1623

 28265445 AAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGA 28265504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 AAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGA 1683

 28265505 AACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTA 28265564
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1684 AACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTA 1743

 28265565 TATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGG 28265624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1744 TATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGG 1803

 28265625 AAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAAT 28265684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAAT 1863

 28265685 AATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGG 28265744
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 AATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGG 1923

 28265745 GAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAAT 28265804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 GAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAAT 1983

 28265805 TATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAG 28265864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAG 2043

 28265865 CTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATC 28265924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 CTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATC 2103

 28265925 ACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAA 28265983
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     2104 ACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAA 2163

 28265984 AAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGG 28266043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2164 AAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGG 2223

 28266044 CTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGC 28266103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2224 CTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGC 2283

 28266104 CACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAA 28266162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     2284 CACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAA 2343

 28266163 TAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGAC 28266222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGAC 2403

 28266223 ATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAA 28266282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 ATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAA 2463

 28266283 AGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAA 28266342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 AGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAA 2523

 28266343 ACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAA 28266402
          ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2524 ACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAG 2583

 28266403 GTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAA 28266462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 GTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAA 2643

 28266463 AATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGA 28266522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 AATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGA 2703

 28266523 ATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGAC 28266582
          |||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 ATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGAC 2763

 28266583 TAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGAT 28266642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 TAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGAT 2823

 28266643 TAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTT 28266702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 TAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTT 2883

 28266703 AAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATG 28266762
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     2884 AAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATG 2939

 28266763 GCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTA 28266822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTA 2999

 28266823 TGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTT 28266882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTT 3059

 28266883 TGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGT 28266942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGT 3119

 28266943 CTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTC 28267002
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3120 CTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTC 3179

 28267003 TTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATG 28267062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATG 3239

 28267063 AATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCC 28267122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCC 3299

 28267123 ACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATT 28267182
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3300 ACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATT 3359

 28267183 GATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGAC 28267242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGAC 3419

 28267243 TCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACA 28267302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACA 3479

 28267303 GTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCA 28267362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCA 3539

 28267363 TTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATG 28267422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATG 3599

 28267423 ATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCT 28267482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCT 3659

 28267483 AAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGT 28267542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGT 3719

 28267543 TCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTC 28267602
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTC 3779

 28267603 CCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTAT 28267662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTAT 3839

 28267663 TTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATC 28267722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATC 3899

 28267723 GTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACC 28267782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3900 GTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACC 3959

 28267783 AAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGC 28267842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 AAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGC 4019

 28267843 CTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAG 28267902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAG 4079

 28267903 AACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCT 28267962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCT 4139

 28267963 GCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCC 28268022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4140 GCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC- 4198

 28268023 A--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGG 28268080
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 -TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGG 4257

 28268081 TTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 TTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 4316

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 4376

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 4436

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 4496

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 4556

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4557 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 4616

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 4676

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 4736

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4737 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 4795

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4841

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4901

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4902 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4961

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 5021

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 5081

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 5141

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 5201

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5202 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 5261

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     5262 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 5321

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 5381

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5382 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 5441

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 5501

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 5561

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 5621

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5622 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 5681

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 5741

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 5801

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 5861

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 5921

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5922 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 5981

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 6041

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 6101

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 6161

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 6221

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 6281

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6282 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 6341

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6342 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 6401

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6402 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 6461

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 6521

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 6581

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 6641

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6642 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 6701

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 6761

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6762 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 6821

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 6881

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 6941

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6942 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 7001

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7002 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 7061

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7062 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 7121

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7122 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 7181

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7182 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 7241

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7242 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 7301

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7302 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 7361

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7362 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 7421

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7422 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 7481

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7482 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 7541

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7542 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 7601

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7602 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 7661

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     7662 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 7721

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7722 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 7781

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7782 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 7841

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7842 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 7901

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7902 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 7961

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7962 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 8021

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8022 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 8081

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8082 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 8141

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     8142 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 8201

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8202 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 8261

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8262 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 8321

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8322 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 8381

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     8382 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 8441

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8442 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 8501

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCAC 28273306
          |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8502 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCAC 8561

 28273307 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACG 28273366
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     8562 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCTCACG 8621

 28273367 TTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTA 28273426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8622 TTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTA 8681

 28273427 CGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATG 28273486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8682 CGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATG 8741

 28273487 GTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACA 28273546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8742 GTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACA 8801

 28273547 GGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAA 28273606
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     8802 GGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAA 8861

 28273607 CCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCT 28273666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8862 CCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCT 8921

 28273667 TACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTC 28273726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8922 TACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTC 8981

 28273727 TTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGT 28273786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8982 TTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGT 9041

 28273787 ATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 28273846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9042 ATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 9101

 28273847 TTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGAATGCAGTGGCGTGATCTCTGCTC 28273906
          |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9102 TTTTTTT-----ACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGAATGCAGTGGCGTGATCTCTGCTC 9156

 28273907 CCTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 28273966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9157 CCTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 9216

 28273967 GGATGCCCACCACAATGCCTGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCA 28274026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9217 GGATGCCCACCACAATGCCTGGCTAATTTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCA 9276

 28274027 TGTTGGCCAGGCTGGTTTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCA 28274086
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9277 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCA 9336

 28274087 AAGTACTGGGATTACAGGCTGGGATTACCTGACCTCAGATGAGCCACCTCGCTTGGCCTC 28274146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9337 AAGTACTGGGATTACAGGCTGGGATTACCTGACCTCAGATGAGCCACCTCGCTTGGCCTC 9396

 28274147 TGTCTACCTTTTGTTTCCTTGTCTTGTCATATTGCATTAACTAGAACTTCTTCTACAATG 28274206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9397 TGTCTACCTTTTGTTTCCTTGTCTTGTCATATTGCATTAACTAGAACTTCTTCTACAATG 9456

 28274207 TTAAATAAGAGTGAGTAATAGGGGATATTCTTACCTCCTTCTTGATCTTAGCAGGAAAGT 28274266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9457 TTAAATAAGAGTGAGTAATAGGGGATATTCTTACCTCCTTCTTGATCTTAGCAGGAAAGT 9516

 28274267 CTAGTCATCTCACAGTATCCATGAGGAATTGACTCCAAGATTCACTGTGCATACGCAAAT 28274326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
     9517 CTAGTCATCTCACAGTATCCATGAGGAATTGACTCCAAGATTCAATGTGGATACGCAAAT 9576

 28274327 CCGCAAATACTCAAGTTCCTTGCATAATATGTACAGTATTTGCATATAAAATATGTACAT 28274386
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9577 CCGCCAATACTCAAGTTCCTTGCATAATATGTACAGTATTTGCATATAAAATATGTACAT 9636

 28274387 CCCTCCGTATACTTTAAATCATCTCTAAATTACTTATAATACCTAATACAATGTAAATGC 28274446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9637 CCCTCCGTATACTTTAAATCATCTCTAAATTACTTATAATACCTAATACAATGTAAATGC 9696

 28274447 TATGTAAATGACTATATTTTTAAATTTGCATTGTTTTTTATTGTATTATTGTTTTTCATT 28274506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9697 TATGTAAATGACTATATTTTTAAATTTGCATTGTTTTTTATTGTATTATTGTTTTTCATT 9756

 28274507 GTTTTAAAAACATTTTTGATCCACAGTTGGTTGAATCTGCAAATGCAGAACCCACACATT 28274566
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     9757 GTTTTAAAAACATTTTTGATCCACAGTTGGTTGAATCTGCAAATGCAGAGCCCACACATT 9816

 28274567 CAGAGGGCTGACTGTATCTAGTTTCTCACCATTAAGTATGATGTTTGCTGTAGGTTTTTT 28274626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9817 CAGAGGGCTGACTGTATCTAGTTTCTCACCATTAAGTATGATGTTTGCTGTAGGTTTTTT 9876

 28274627 TGTAGATTTTTAAAAACCAAAGTTCCCCTCTCTAGTAAACTTACAGTTTTTATCATGAAT 28274686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9877 TGTAGATTTTTAAAAACCAAAGTTCCCCTCTCTAGTAAACTTACAGTTTTTATCATGAAT 9936

 28274687 GGTGTTGGATTTTGTCAAATGCCTTTTCTGTATCTATTGACATGATCACATAATTTTTTT 28274746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9937 GGTGTTGGATTTTGTCAAATGCCTTTTCTGTATCTATTGACATGATCACATAATTTTTTT 9996

 28274747 AGCTGTTTATGTGATGGACTGCATTAGTTAATTTTCAGATGTTAAACCAG 28274796
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     9997 AGCTGTTTATGTGATGGATTGCATTAGTTAATTTTCAGATGTTAAACCAG 10046

Alignment time is 12.2463 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4320] =>      4320 nucs 'mol-32-2dff-077577_4320'

Score:        3981
Aligned:      4312        nucs
Identic:      4277 ( 99%) nucs =>       630 (100%)      3647 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28263837,28264468] EXCISED REGION [28264469,28268143]
 second seq =>  [       4,     635] EXCISED REGION [     647,    4320]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [636,646]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [636,646] to [647,657]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [636,640] to [642,646]

 28263837 TTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCA 28263896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 TTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCA 63

 28263897 AGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCT 28263956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 AGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCT 123

 28263957 ACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGA 28264016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 ACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGA 183

 28264017 CGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATG 28264076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 CGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATG 243

 28264077 ATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGC 28264136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 ATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGC 303

 28264137 CAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGA 28264196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 CAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGA 363

 28264197 ACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAG 28264256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 ACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAG 423

 28264257 CCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGG 28264316
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      424 CCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACCGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGG 483

 28264317 AAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGG 28264376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 AAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGG 543

 28264377 TAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAG 28264436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      544 TAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACTTACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAG 603

 28264437 AGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCC 28264468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCC 635

EXCISED REGION

 28264469 TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATC 28264528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATC 706

 28264529 TCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 28264588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 TCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 766

 28264589 GTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGT 28264647
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      767 GTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGT 826

 28264648 AGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCC 28264707
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      827 AGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCC 886

 28264708 TCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGA 28264767
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      887 TCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGA 946

 28264768 TCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTA 28264827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTA 1006

 28264828 AATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTG 28264887
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1007 AATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTG 1066

 28264888 CACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACAC 28264947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 CACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACAC 1126

 28264948 CATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATG 28265007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 CATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATG 1186

 28265008 CTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGA 28265067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 CTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGA 1246

 28265068 AGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTA 28265127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 AGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTA 1306

 28265128 AAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGG 28265187
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 AACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGG 1366

 28265188 AAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATA 28265247
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 AAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATA 1426

 28265248 AACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGA 28265307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 AACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGA 1486

 28265308 ATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAA 28265367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 ATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAA 1546

 28265368 AAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAA 28265427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 AAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAA 1606

 28265428 AACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTA 28265487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTA 1666

 28265488 AAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCT 28265547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1667 AAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCT 1726

 28265548 GTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGA 28265607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 GTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGA 1786

 28265608 TAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCT 28265667
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCT 1846

 28265668 CAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGG 28265727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1847 CAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGG 1906

 28265728 AAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATT 28265787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 AAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATT 1966

 28265788 ACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATA 28265847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 ACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATA 2026

 28265848 TTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 28265907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 TTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 2086

 28265908 GCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGA 28265967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 GCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGA 2146

 28265968 AA-CCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGAT 28266026
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 AACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGAT 2206

 28266027 CCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCA 28266086
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 CACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCA 2266

 28266087 GTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTC-A 28266145
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2267 GTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAA 2326

 28266146 AAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGA 28266205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 AAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGA 2386

 28266206 ACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCAT 28266265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 ACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCAT 2446

 28266266 TAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATT 28266325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 TAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATT 2506

 28266326 TTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAG 28266385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2507 TTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAG 2566

 28266386 GTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGA 28266445
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGA 2626

 28266446 ATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAG 28266505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 ATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAG 2686

 28266506 AAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGAT 28266565
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2687 AAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGAT 2746

 28266566 GCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGA 28266625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 GCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGA 2806

 28266626 AATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAA 28266685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 AATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAA 2866

 28266686 GTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCA 28266745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||
     2867 GTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC----TAAATAAATAAATAAATAGGCA 2922

 28266746 TTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTAT 28266805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 TTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTAT 2982

 28266806 TTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGA 28266865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGA 3042

 28266866 GCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCA 28266925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCA 3102

 28266926 CCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCT 28266985
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 CCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCT 3162

 28266986 CTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTT 28267045
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 CTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTT 3222

 28267046 CCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCAT 28267105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 CCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCAT 3282

 28267106 TTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCC 28267165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 TTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCC 3342

 28267166 TACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATG 28267225
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 TACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATG 3402

 28267226 TGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCC 28267285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCC 3462

 28267286 CCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGT 28267345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 CCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGT 3522

 28267346 GTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTA 28267405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 GTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTA 3582

 28267406 TTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATC 28267465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATC 3642

 28267466 TTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAA 28267525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAA 3702

 28267526 TGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTT 28267585
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 TGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTT 3762

 28267586 TTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTC 28267645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 TTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTC 3822

 28267646 ACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTT 28267705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 ACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTT 3882

 28267706 TGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAG 28267765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3883 TGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAG 3942

 28267766 GTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCC 28267825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 GTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCC 4002

 28267826 TCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGC 28267885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGC 4062

 28267886 TCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAG 28267945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 TCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAG 4122

 28267946 GATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTA 28268005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 GATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTA 4182

 28268006 TGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACT 28268063
          ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 TGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACT 4240

 28268064 GGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAAC 28268123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 GGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAAC 4300

 28268124 ATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||
     4301 ATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 4320

Alignment time is 5.65118 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3594] =>      3594 nucs 'mol-32-2e20-159922_3594'

Score:        3298
Aligned:      3596        nucs
Identic:      3564 ( 99%) nucs =>      1050 ( 99%)      2514 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264549,28265607] EXCISED REGION [28265612,28268143]
 second seq =>  [       1,    1060] EXCISED REGION [    1065,    3594]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28265608,28265611]
 second seq =>         4 nucs [1061,1064]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1061,1061] to [1065,1065]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28265608,28265608] to [28265611,28265611]
 second seq =>         1 nucs [1061,1061] to [1064,1064]

 28264549 CCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAT 28264608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAT 60

 28264609 ATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATG 28264667
          .|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATG 120

 28264668 TTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAA 28264727
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      121 TTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAA 180

 28264728 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCT 28264787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      181 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCT 240

 28264788 GGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTAT 28264847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      241 GGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTAT 300

 28264848 AACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATC 28264907
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATC 360

 28264908 TCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAG 28264967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAG 420

 28264968 GATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACC 28265027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACC 480

 28265028 CTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAG 28265087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAG 540

 28265088 TAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAA 28265147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      541 TAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAA 600

 28265148 CAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATT 28265207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      601 CAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATT 660

 28265208 ACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTG 28265267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTG 720

 28265268 TGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGA 28265327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGA 780

 28265328 GGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAA 28265387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAA 840

 28265388 AGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAA 28265447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAA 900

 28265448 TTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAAC 28265507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAAC 960

 28265508 TGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATAT 28265567
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATAT 1020

 28265568 CCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGA 28265607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGA 1060

EXCISED REGION

 28265612 CTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAA 28265671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 CTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAA 1124

 28265672 ACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAA 28265731
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1125 ACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAA 1184

 28265732 AGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGG 28265791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 AGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGG 1244

 28265792 TTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAA 28265851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAA 1304

 28265852 AAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCA 28265911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 AAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCA 1364

 28265912 AGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAA-C 28265970
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     1365 AGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACC 1424

 28265971 CCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCT 28266030
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1425 CCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACT 1484

 28266031 GCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGA 28266090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 GCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGA 1544

 28266091 GCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTC-AAAAA 28266149
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     1545 GCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAA 1604

 28266150 AAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTG 28266209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 AAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTG 1664

 28266210 GTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAA 28266269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAA 1724

 28266270 AAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAA 28266329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 AAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAA 1784

 28266330 AAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAA 28266389
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1785 AAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAA 1844

 28266390 TTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGT 28266449
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGT 1904

 28266450 AGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAA 28266509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 AGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAA 1964

 28266510 AAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTG 28266569
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1965 AAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTG 2024

 28266570 AGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATG 28266629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 AGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATG 2084

 28266630 TTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCC 28266689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCC 2144

 28266690 CTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGT 28266749
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     2145 CTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC----TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGT 2200

 28266750 TGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTA 28266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTA 2260

 28266810 CAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCA 28266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 CAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCA 2320

 28266870 GCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCAT 28266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 GCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCAT 2380

 28266930 TGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGC 28266989
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGC 2440

 28266990 TGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAG 28267049
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAG 2500

 28267050 CAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTG 28267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTG 2560

 28267110 GGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACT 28267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 GGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACT 2620

 28267170 TGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTG 28267229
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTG 2680

 28267230 GAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCA 28267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCA 2740

 28267290 GCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTT 28267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 GCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTT 2800

 28267350 TGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCC 28267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCC 2860

 28267410 CTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCT 28267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 CTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCT 2920

 28267470 TTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCT 28267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 TTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCT 2980

 28267530 GAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGC 28267589
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 GAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGC 3040

 28267590 AAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAG 28267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 AAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAG 3100

 28267650 AGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTT 28267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 AGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTT 3160

 28267710 ACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTAC 28267769
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3161 ACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTAC 3220

 28267770 TGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTG 28267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTG 3280

 28267830 GTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCC 28267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 GTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCC 3340

 28267890 ACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATA 28267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 ACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATA 3400

 28267950 ATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGC 28268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 ATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGC 3460

 28268010 TGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTG 28268067
          ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTG 3518

 28268068 ATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGT 28268127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 ATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGT 3578

 28268128 TTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||
     3579 TTGTGTCTTTTTGGTA 3594

Alignment time is 4.60907 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4280] =>      4280 nucs 'mol-32-2edb-168355_4280'

Score:        4279
Aligned:      4279        nucs
Identic:      4279 (100%) nucs =>      1534 (100%)      2745 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264566,28266099] EXCISED REGION [28266101,28268845]
 second seq =>  [       1,    1534] EXCISED REGION [    1536,    4280]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28266100,28266100]
 second seq =>         1 nucs [1535,1535]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264566 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGC 28264625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGC 60

 28264626 TAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTT 28264685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTT 120

 28264686 AACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCA 28264745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCA 180

 28264746 TGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAA 28264805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAA 240

 28264806 GCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATT 28264865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATT 300

 28264866 TCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAA 28264925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAA 360

 28264926 CACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATT 28264985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATT 420

 28264986 TTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAA 28265045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAA 480

 28265046 TATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGA 28265105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGA 540

 28265106 AAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCC 28265165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCC 600

 28265166 ATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAG 28265225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAG 660

 28265226 AGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAA 28265285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAA 720

 28265286 ATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAAT 28265345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAAT 780

 28265346 ACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTAT 28265405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTAT 840

 28265406 TTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAAT 28265465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAAT 900

 28265466 ACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGA 28265525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGA 960

 28265526 AGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTC 28265585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTC 1020

 28265586 AACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTT 28265645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTT 1080

 28265646 TAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAA 28265705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAA 1140

 28265706 ACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTT 28265765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTT 1200

 28265766 CTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTT 28265825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTT 1260

 28265826 CTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCC 28265885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCC 1320

 28265886 TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAG 28265945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAG 1380

 28265946 ACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGC 28266005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGC 1440

 28266006 ATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGA 28266065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGA 1500

 28266066 ACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATC 28266099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATC 1534

EXCISED REGION

 28266101 TGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATA 28266160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 TGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATA 1595

 28266161 AATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATG 28266220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 AATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATG 1655

 28266221 ACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGC 28266280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 ACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGC 1715

 28266281 AAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCA 28266340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 AAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCA 1775

 28266341 AAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAG 28266400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 AAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAG 1835

 28266401 AAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGT 28266460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 AAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGT 1895

 28266461 AAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTA 28266520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 AAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTA 1955

 28266521 GAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAG 28266580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 GAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAG 2015

 28266581 ACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAG 28266640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 ACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAG 2075

 28266641 ATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGG 28266700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 ATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGG 2135

 28266701 TTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGA 28266760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGA 2195

 28266761 TGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATT 28266820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATT 2255

 28266821 TATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGC 28266880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGC 2315

 28266881 TTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATA 28266940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATA 2375

 28266941 GTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAAC 28267000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 GTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAAC 2435

 28267001 TCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACA 28267060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 TCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACA 2495

 28267061 TGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATG 28267120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 TGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATG 2555

 28267121 CCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGA 28267180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 CCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGA 2615

 28267181 TTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGG 28267240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 TTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGG 2675

 28267241 ACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGA 28267300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 ACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGA 2735

 28267301 CAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGC 28267360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 CAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGC 2795

 28267361 CATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATA 28267420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 CATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATA 2855

 28267421 TGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGT 28267480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 TGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGT 2915

 28267481 CTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGA 28267540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 CTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGA 2975

 28267541 GTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTT 28267600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 GTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTT 3035

 28267601 TCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATT 28267660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATT 3095

 28267661 ATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATA 28267720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 ATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATA 3155

 28267721 TCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATA 28267780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 TCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATA 3215

 28267781 CCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAG 28267840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 CCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAG 3275

 28267841 GCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTG 28267900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 GCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTG 3335

 28267901 AGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAG 28267960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 AGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAG 3395

 28267961 CTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATT 28268020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 CTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATT 3455

 28268021 CCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGG 28268080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 CCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGG 3515

 28268081 TTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTG 28268140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 TTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTG 3575

 28268141 GTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCG 28268200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 GTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCG 3635

 28268201 TAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAA 28268260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 TAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAA 3695

 28268261 TTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCT 28268320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 TTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCT 3755

 28268321 GTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTG 28268380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 GTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTG 3815

 28268381 TGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGT 28268440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 TGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGT 3875

 28268441 TGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAAT 28268500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 TGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAAT 3935

 28268501 AGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGC 28268560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 AGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGC 3995

 28268561 ATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTC 28268620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 ATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTC 4055

 28268621 TTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGT 28268680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 TTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGT 4115

 28268681 GGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTG 28268740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 GGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTG 4175

 28268741 TTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGT 28268800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGT 4235

 28268801 TAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTT 28268845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 TAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTT 4280

Alignment time is 5.54192 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    9581] =>      9581 nucs 'mol-32-2efc-012003_9581'

Score:        9558
Aligned:      9580        nucs
Identic:      9578 (100%) nucs =>       745 (100%)      8833 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28262643,28263387] EXCISED REGION [28263389,28272223]
 second seq =>  [       1,     745] EXCISED REGION [     747,    9581]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28263388,28263388]
 second seq =>         1 nucs [746,746]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [745,746] to [746,747]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28263387,28263387] to [28263389,28263389]
 second seq =>         1 nucs [745,745] to [747,747]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28262643 GTTTATGATGATACACTCTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCTTTGAAGCATATACTAAACA 28262702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTATGATGATACACTCTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCTTTGAAGCATATACTAAACA 60

 28262703 GGTGAGTCAAATGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCATTTTTAGTCTTGCTTGGTTA 28262762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTGAGTCAAATGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCATTTTTAGTCTTGCTTGGTTA 120

 28262763 CGTTCATCTTTGAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCTTCTATTTTTTGTAGGGTAA 28262822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGTTCATCTTTGAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCTTCTATTTTTTGTAGGGTAA 180

 28262823 TCCCAGGTCCTTCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTGTTATTCGATGTGTCAGAAA 28262882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCAGGTCCTTCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTGTTATTCGATGTGTCAGAAA 240

 28262883 GCCAATGTGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTGAAGCATTCACTCAGGAACA 28262942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCAATGTGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTGAAGCATTCACTCAGGAACA 300

 28262943 GTATAAATAACCACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACCAGCTATGAGAAGGACTCAA 28263002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATAAATAACCACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACCAGCTATGAGAAGGACTCAA 360

 28263003 CAAAATTCCATTTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTTTGATGGGTGGGCCACAGTG 28263062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAAATTCCATTTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTTTGATGGGTGGGCCACAGTG 420

 28263063 GAGTCCTGGGTTCCGGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCTAGAAAGTCTGGATATTTTC 28263122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGTCCTGGGTTCCGGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCTAGAAAGTCTGGATATTTTC 480

 28263123 CTTTCTCTAGAACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATATTCCTTTGGGGAAATACTAG 28263182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTCTCTAGAACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATATTCCTTTGGGGAAATACTAG 540

 28263183 GAAGAAGCAACAGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCTGGCCTCTTATTTTAGGTCA 28263242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAGAAGCAACAGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCTGGCCTCTTATTTTAGGTCA 600

 28263243 AGTTATTGAAGAATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTTAAAAAGTGTATAGTACAGT 28263302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTTATTGAAGAATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTTAAAAAGTGTATAGTACAGT 660

 28263303 TCAACAAGCTTTGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTA 28263362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAACAAGCTTTGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTA 720

 28263363 GGGGTTTTAATGTCAGTTGACAAGC 28263387
          |||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGTTTTAATGTCAGTTGACAAGC 745

EXCISED REGION

 28263389 CATCCAAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTGAATCA 28263448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 CATCCAAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTGAATCA 806

 28263449 GAAAAAATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGTATTAA 28263508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 GAAAAAATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGTATTAA 866

 28263509 ATATAGTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTAGAAAC 28263568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 ATATAGTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTAGAAAC 926

 28263569 AGACTCATTCCTATAGACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGGGATAA 28263628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 AGACTCATTCCTATAGACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGGGATAA 986

 28263629 AGTATAAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAATAATTG 28263688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 AGTATAAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAATAATTG 1046

 28263689 ATCCCTACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTAAATGG 28263748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 ATCCCTACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTAAATGG 1106

 28263749 GAAAAGCGAACTTAAAAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTTTTGTT 28263808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 GAAAAGCGAACTTAAAAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTTTTGTT 1166

 28263809 TTTTTAAAAAAGAGATCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACT 28263868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 TTTTTAAAAAAGAGATCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACT 1226

 28263869 CATGCATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTG 28263928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 CATGCATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTG 1286

 28263929 AGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTG 28263988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 AGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTG 1346

 28263989 GACATTATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTA 28264048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 GACATTATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTA 1406

 28264049 AGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCA 28264108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 AGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCA 1466

 28264109 TATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATC 28264168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 TATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATC 1526

 28264169 TTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAA 28264228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAA 1586

 28264229 ACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATC 28264288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 ACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATC 1646

 28264289 CCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTA 28264348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 CCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTA 1706

 28264349 ATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAG 28264408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 ATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAG 1766

 28264409 ACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCC 28264468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 ACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCC 1826

 28264469 TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATC 28264528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATC 1886

 28264529 TCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 28264588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 TCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA 1946

 28264589 GTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTA 28264648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 GTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTA 2006

 28264649 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCT 28264708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCT 2066

 28264709 CCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGAT 28264768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 CCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGAT 2126

 28264769 CCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAA 28264828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 CCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAA 2186

 28264829 ATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGC 28264888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 ATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGC 2246

 28264889 ACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACC 28264948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 ACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACC 2306

 28264949 ATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGC 28265008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGC 2366

 28265009 TTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAA 28265068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAA 2426

 28265069 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 28265128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 2486

 28265129 AAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 28265188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 AAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 2546

 28265189 AGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 28265248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 AGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 2606

 28265249 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 28265308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 2666

 28265309 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 28265368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 2726

 28265369 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 28265428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 2786

 28265429 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 28265488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 2846

 28265489 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTG 28265548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTG 2906

 28265549 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAT 28265608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAT 2966

 28265609 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 28265668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 3026

 28265669 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGA 28265728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGA 3086

 28265729 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 28265788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 3146

 28265789 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 28265848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 3206

 28265849 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 28265908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 3266

 28265909 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 28265968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 3326

 28265969 ACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCC 28266028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 ACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCC 3386

 28266029 CTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGT 28266088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 CTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGT 3446

 28266089 GAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAA 28266148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 GAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAA 3506

 28266149 AAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACT 28266208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 AAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACT 3566

 28266209 GGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAA 28266268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 GGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAA 3626

 28266269 AAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTA 28266328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 AAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTA 3686

 28266329 AAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTA 28266388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 AAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTA 3746

 28266389 ATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATG 28266448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 ATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATG 3806

 28266449 TAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAA 28266508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 TAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAA 3866

 28266509 AAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCT 28266568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 AAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCT 3926

 28266569 GAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAAT 28266628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 GAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAAT 3986

 28266629 GTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTC 28266688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 GTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTC 4046

 28266689 CCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTG 28266748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 CCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTG 4106

 28266749 TTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTT 28266808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 TTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTT 4166

 28266809 ACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCC 28266868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 ACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCC 4226

 28266869 AGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCA 28266928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 AGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCA 4286

 28266929 TTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTG 28266988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 TTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTG 4346

 28266989 CTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCA 28267048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 CTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCA 4406

 28267049 GCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTT 28267108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 GCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTT 4466

 28267109 GGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTAC 28267168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 GGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTAC 4526

 28267169 TTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGT 28267228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGT 4586

 28267229 GGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCC 28267288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 GGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCC 4646

 28267289 AGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTT 28267348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 AGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTT 4706

 28267349 TTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTC 28267408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 TTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTC 4766

 28267409 CCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTC 28267468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 CCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTC 4826

 28267469 TTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGC 28267528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 TTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGC 4886

 28267529 TGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTG 28267588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 TGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTG 4946

 28267589 CAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACA 28267648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 CAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACA 5006

 28267649 GAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGT 28267708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 GAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGT 5066

 28267709 TACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTA 28267768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 TACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTA 5126

 28267769 CTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCT 28267828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 CTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCT 5186

 28267829 GGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCC 28267888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 GGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCC 5246

 28267889 CACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGAT 28267948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 CACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGAT 5306

 28267949 AATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGG 28268008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5307 AATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGG 5366

 28268009 CTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGA 28268068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 CTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGA 5426

 28268069 TGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTT 28268128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5427 TGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTT 5486

 28268129 TGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGC 28268188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5487 TGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGC 5546

 28268189 TGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTA 28268248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5547 TGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTA 5606

 28268249 CAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCC 28268308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5607 CAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCC 5666

 28268309 TCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGAT 28268368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 TCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGAT 5726

 28268369 GGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTT 28268428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 GGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTT 5786

 28268429 TCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTG 28268488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5787 TCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTG 5846

 28268489 TCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTA 28268548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 TCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTA 5906

 28268549 GACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCT 28268608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 GACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCT 5966

 28268609 GTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAAT 28268668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5967 GTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAAT 6026

 28268669 TTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATG 28268728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6027 TTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATG 6086

 28268729 TCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAA 28268788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6087 TCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAA 6146

 28268789 TCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTG 28268848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6147 TCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTG 6206

 28268849 CATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGC 28268908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6207 CATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGC 6266

 28268909 TTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGG 28268968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6267 TTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGG 6326

 28268969 TTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATG 28269028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6327 TTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATG 6386

 28269029 GTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGA 28269088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6387 GTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGA 6446

 28269089 TTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCT 28269148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6447 TTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCT 6506

 28269149 AGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCT 28269208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6507 AGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCT 6566

 28269209 TTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTT 28269268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6567 TTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTT 6626

 28269269 TCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGA 28269328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6627 TCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGA 6686

 28269329 GATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGA 28269388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6687 GATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGA 6746

 28269389 TTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGC 28269448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6747 TTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGC 6806

 28269449 CAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 28269508
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6807 CAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCATTCCAGCCTGGGCAACA 6866

 28269509 GAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTT 28269568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6867 GAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTT 6926

 28269569 TGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTT 28269628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6927 TGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTT 6986

 28269629 ATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTAT 28269688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6987 ATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTAT 7046

 28269689 CCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGT 28269748
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7047 CCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGT 7106

 28269749 ATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATAC 28269808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7107 ATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATAC 7166

 28269809 CTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATA 28269868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7167 CTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATA 7226

 28269869 GGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTT 28269928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7227 GGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTT 7286

 28269929 TTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTA 28269988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7287 TTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTA 7346

 28269989 TTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTT 28270048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7347 TTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTT 7406

 28270049 GTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTT 28270108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7407 GTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTT 7466

 28270109 AATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCT 28270168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7467 AATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCT 7526

 28270169 AAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGA 28270228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7527 AAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGA 7586

 28270229 CTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTA 28270288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7587 CTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTA 7646

 28270289 CTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATC 28270348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7647 CTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATC 7706

 28270349 TTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACAT 28270408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7707 TTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACAT 7766

 28270409 TTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCA 28270468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7767 TTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCA 7826

 28270469 ACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTT 28270528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7827 ACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTT 7886

 28270529 AAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAAC 28270588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7887 AAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAAC 7946

 28270589 AATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTA 28270648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7947 AATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTA 8006

 28270649 CACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAG 28270708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8007 CACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAG 8066

 28270709 TTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTC 28270768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8067 TTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTC 8126

 28270769 TTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTT 28270828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8127 TTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTT 8186

 28270829 CACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTT 28270888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8187 CACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTT 8246

 28270889 CTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACT 28270948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8247 CTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACT 8306

 28270949 TTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTT 28271008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8307 TTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTT 8366

 28271009 CCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTC 28271068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8367 CCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTC 8426

 28271069 GTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACA 28271128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8427 GTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACA 8486

 28271129 TTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTT 28271188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8487 TTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTT 8546

 28271189 CAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTA 28271248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8547 CAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTA 8606

 28271249 TCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAG 28271308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8607 TCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAG 8666

 28271309 GGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAA 28271368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8667 GGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAA 8726

 28271369 GAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTC 28271428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8727 GAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTC 8786

 28271429 ATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGT 28271488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8787 ATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGT 8846

 28271489 TGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTG 28271548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8847 TGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTG 8906

 28271549 TATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGT 28271608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8907 TATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGT 8966

 28271609 GTCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTA 28271668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8967 GTCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTA 9026

 28271669 CATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGAT 28271728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9027 CATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGAT 9086

 28271729 TTTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTC 28271788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9087 TTTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTC 9146

 28271789 CTGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTC 28271848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9147 CTGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTC 9206

 28271849 TAGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGG 28271908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9207 TAGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGG 9266

 28271909 ATTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTT 28271968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9267 ATTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTT 9326

 28271969 CCTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTC 28272028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9327 CCTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTC 9386

 28272029 TGGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATC 28272088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9387 TGGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATC 9446

 28272089 TTAGTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCT 28272148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9447 TTAGTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCT 9506

 28272149 GTAGGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTA 28272208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9507 GTAGGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTA 9566

 28272209 GTGCTATAAGCTTTT 28272223
          |||||||||||||||
     9567 GTGCTATAAGCTTTT 9581

Alignment time is 11.4878 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4331] =>      4331 nucs 'mol-32-2efc-062299_4331'

Score:        4028
Aligned:      4348        nucs
Identic:      4305 ( 99%) nucs =>       180 ( 98%)      4125 ( 99%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28267958,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273212]
 second seq =>  [       1,     182] EXCISED REGION [     183,    4331]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28267958 CAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGT 28268017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGT 60

 28268018 ATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCAC 28268075
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCAC 118

 28268076 CTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCT 28268135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 CTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCT 178

 28268136 TTTT 28268139
          ||||
      179 TTTT 182

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      183 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 242

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 302

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 362

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 422

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      423 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 482

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 542

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 602

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      603 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 661

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 707

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 767

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      768 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 827

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 887

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 947

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 1007

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 1067

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1068 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 1127

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     1128 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 1187

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 1247

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1248 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 1307

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 1367

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 1427

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 1487

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1488 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 1547

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 1607

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 1667

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 1727

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 1787

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1788 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 1847

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 1907

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 1967

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 2027

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 2087

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 2147

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2148 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 2207

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2208 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 2267

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2268 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 2327

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 2387

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 2447

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 2507

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 2567

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 2627

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 2687

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 2747

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 2807

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 2867

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 2927

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 2987

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 3047

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 3107

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 3167

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 3227

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 3287

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 3347

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 3407

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 3467

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 3527

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3528 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 3587

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 3647

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 3707

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 3767

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 3827

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 3887

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 3947

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 4007

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4008 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 4067

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 4127

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 4187

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 4247

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4248 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 4307

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTT 28273212
          ||||||||||||||||||||||||
     4308 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTT 4331

Alignment time is 5.63352 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    9522] =>      9522 nucs 'mol-32-2f12-009184_9522'

Score:        9499
Aligned:      9521        nucs
Identic:      9519 (100%) nucs =>      3246 (100%)      6273 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264291,28267536] EXCISED REGION [28267538,28273812]
 second seq =>  [       1,    3246] EXCISED REGION [    3248,    9522]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28267537,28267537]
 second seq =>         1 nucs [3247,3247]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28267537,28267537] to [28267538,28267538]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264291 AACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAAT 28264350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAAT 60

 28264351 GGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGAC 28264410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGAC 120

 28264411 ATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTT 28264470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTT 180

 28264471 TTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTC 28264530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTC 240

 28264531 GGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 28264590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 300

 28264591 AGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGA 28264650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGA 360

 28264651 GATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCC 28264710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCC 420

 28264711 CACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCC 28264770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCC 480

 28264771 ACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAAT 28264830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAAT 540

 28264831 AAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCAC 28264890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCAC 600

 28264891 CAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCAT 28264950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCAT 660

 28264951 GGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTT 28265010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTT 720

 28265011 CAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGT 28265070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGT 780

 28265071 TATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAA 28265130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAA 840

 28265131 ATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAG 28265190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAG 900

 28265191 ATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAAC 28265250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAAC 960

 28265251 AGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATT 28265310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATT 1020

 28265311 TCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAA 28265370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAA 1080

 28265371 GCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAAC 28265430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAAC 1140

 28265431 GGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAG 28265490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAG 1200

 28265491 ACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTC 28265550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTC 1260

 28265551 AACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAG 28265610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAG 1320

 28265611 TCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAA 28265670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAA 1380

 28265671 AACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAA 28265730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAA 1440

 28265731 AAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACG 28265790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACG 1500

 28265791 GTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTA 28265850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTA 1560

 28265851 AAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 28265910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 1620

 28265911 AAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAAC 28265970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAAC 1680

 28265971 CCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCT 28266030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCT 1740

 28266031 GCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGA 28266090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGA 1800

 28266091 GCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAA 28266150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAA 1860

 28266151 AAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGG 28266210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGG 1920

 28266211 TAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAA 28266270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAA 1980

 28266271 AAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAA 28266330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAA 2040

 28266331 AAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAAT 28266390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAAT 2100

 28266391 TACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTA 28266450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTA 2160

 28266451 GTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAA 28266510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAA 2220

 28266511 AAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGA 28266570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGA 2280

 28266571 GGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGT 28266630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGT 2340

 28266631 TAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCC 28266690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCC 2400

 28266691 TGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTT 28266750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTT 2460

 28266751 GCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTAC 28266810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTAC 2520

 28266811 AGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAG 28266870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAG 2580

 28266871 CACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATT 28266930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATT 2640

 28266931 GCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCT 28266990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCT 2700

 28266991 GGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGC 28267050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGC 2760

 28267051 AGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGG 28267110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGG 2820

 28267111 GCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTT 28267170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTT 2880

 28267171 GTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGG 28267230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGG 2940

 28267231 AACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAG 28267290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAG 3000

 28267291 CAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTT 28267350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTT 3060

 28267351 GGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCC 28267410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCC 3120

 28267411 TGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTT 28267470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTT 3180

 28267471 TGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTG 28267530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTG 3240

 28267531 AGTTTT 28267536
          ||||||
     3241 AGTTTT 3246

EXCISED REGION

 28267538 AGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTT 28267597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 AGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTT 3307

 28267598 TTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAAT 28267657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAAT 3367

 28267658 ATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGT 28267717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 ATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGT 3427

 28267718 ATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATC 28267777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 ATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATC 3487

 28267778 ATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCC 28267837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 ATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCC 3547

 28267838 CAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAA 28267897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAA 3607

 28267898 GTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTC 28267957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 GTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTC 3667

 28267958 CAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGT 28268017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 CAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGT 3727

 28268018 ATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCT 28268077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 ATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCT 3787

 28268078 AGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTT 28268137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 AGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTT 3847

 28268138 TTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAA 28268197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAA 3907

 28268198 TCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGAC 28268257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 TCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGAC 3967

 28268258 TAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCA 28268317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 TAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCA 4027

 28268318 CCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCA 28268377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 CCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCA 4087

 28268378 CTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTT 28268437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 CTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTT 4147

 28268438 TGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTT 28268497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 TGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTT 4207

 28268498 AATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGA 28268557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 AATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGA 4267

 28268558 TGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGT 28268617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGT 4327

 28268618 TTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTT 28268677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 TTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTT 4387

 28268678 TGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATG 28268737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 TGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATG 4447

 28268738 GTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTG 28268797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTG 4507

 28268798 AGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTG 28268857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 AGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTG 4567

 28268858 CTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTA 28268917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 CTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTA 4627

 28268918 TTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATT 28268977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATT 4687

 28268978 CTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTA 28269037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 CTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTA 4747

 28269038 GCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGG 28269097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 GCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGG 4807

 28269098 CTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTG 28269157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 CTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTG 4867

 28269158 AAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGT 28269217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 AAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGT 4927

 28269218 ATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGT 28269277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 ATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGT 4987

 28269278 TTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCA 28269337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 TTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCA 5047

 28269338 CCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCT 28269397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 CCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCT 5107

 28269398 TGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGG 28269457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 TGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGG 5167

 28269458 TGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAG 28269517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAG 5227

 28269518 TCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTG 28269577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 TCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTG 5287

 28269578 ATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGT 28269637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 ATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGT 5347

 28269638 GAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAA 28269697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 GAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAA 5407

 28269698 GGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCA 28269757
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 GGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCA 5467

 28269758 TTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTT 28269817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 TTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTT 5527

 28269818 CTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATG 28269877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 CTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATG 5587

 28269878 AGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGT 28269937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 AGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGT 5647

 28269938 TCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGA 28269997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 TCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGA 5707

 28269998 AATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTT 28270057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 AATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTT 5767

 28270058 TATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTA 28270117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 TATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTA 5827

 28270118 TGTAGTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAA 28270177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5828 TGTAGTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAA 5887

 28270178 AGCCTACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTC 28270237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 AGCCTACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTC 5947

 28270238 ATATGTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCT 28270297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 ATATGTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCT 6007

 28270298 ATCATAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAAC 28270357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6008 ATCATAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAAC 6067

 28270358 TAAACAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAAT 28270417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 TAAACAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAAT 6127

 28270418 ACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACT 28270477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 ACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACT 6187

 28270478 GAAATGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACT 28270537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 GAAATGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACT 6247

 28270538 TCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCA 28270597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 TCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCA 6307

 28270598 CATAATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTT 28270657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6308 CATAATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTT 6367

 28270658 GCATTTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCT 28270717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6368 GCATTTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCT 6427

 28270718 CTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATT 28270777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6428 CTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATT 6487

 28270778 CTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGC 28270837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6488 CTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGC 6547

 28270838 TTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAG 28270897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6548 TTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAG 6607

 28270898 CAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATA 28270957
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6608 CAGCAACTTTTTTCTGTGAAATATTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATA 6667

 28270958 TACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAG 28271017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6668 TACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAG 6727

 28271018 CTACTACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCA 28271077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6728 CTACTACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCA 6787

 28271078 CAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAG 28271137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6788 CAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAG 6847

 28271138 TTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGT 28271197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6848 TTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGT 6907

 28271198 GCAATTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAA 28271257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6908 GCAATTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAA 6967

 28271258 TCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCAT 28271317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6968 TCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCAT 7027

 28271318 TTCCATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACA 28271377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 TTCCATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACA 7087

 28271378 AATGGAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGG 28271437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 AATGGAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGG 7147

 28271438 AACTGAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTT 28271497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 AACTGAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTT 7207

 28271498 TTGCATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTAC 28271557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 TTGCATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTAC 7267

 28271558 CAGATTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCC 28271617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 CAGATTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCC 7327

 28271618 CTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTA 28271677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7328 CTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTA 7387

 28271678 GAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTAC 28271737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7388 GAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTAC 7447

 28271738 TGCTTCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAA 28271797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7448 TGCTTCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAA 7507

 28271798 TATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTG 28271857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7508 TATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTG 7567

 28271858 TGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGT 28271917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7568 TGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGT 7627

 28271918 AATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTA 28271977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7628 AATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTA 7687

 28271978 ATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCAT 28272037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7688 ATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCAT 7747

 28272038 TGATTCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATT 28272097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7748 TGATTCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATT 7807

 28272098 TCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTG 28272157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7808 TCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTG 7867

 28272158 ATGTTAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAA 28272217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7868 ATGTTAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAA 7927

 28272218 GCTTTTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTAT 28272277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7928 GCTTTTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTAT 7987

 28272278 ATGTTAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGA 28272337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7988 ATGTTAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGA 8047

 28272338 AAAGAGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCT 28272397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8048 AAAGAGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCT 8107

 28272398 TCTTGGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATC 28272457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8108 TCTTGGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATC 8167

 28272458 TGGAATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTT 28272517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8168 TGGAATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTT 8227

 28272518 AAACAACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAG 28272577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8228 AAACAACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAG 8287

 28272578 CACCAAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCC 28272637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8288 CACCAAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCC 8347

 28272638 TCATTTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTT 28272697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8348 TCATTTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTT 8407

 28272698 ATCTTAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGC 28272757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8408 ATCTTAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGC 8467

 28272758 AAGTAGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCT 28272817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8468 AAGTAGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCT 8527

 28272818 ATTTTTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTAT 28272877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8528 ATTTTTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTAT 8587

 28272878 TGAGACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATG 28272937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8588 TGAGACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATG 8647

 28272938 AGAAGAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGA 28272997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8648 AGAAGAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGA 8707

 28272998 GTGTTGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAAT 28273057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8708 GTGTTGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAAT 8767

 28273058 GCTGTCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCT 28273117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8768 GCTGTCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCT 8827

 28273118 GTACTTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTA 28273177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8828 GTACTTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTA 8887

 28273178 AGTCTTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAAT 28273237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8888 AGTCTTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAAT 8947

 28273238 ACTTTTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGA 28273297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8948 ACTTTTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGA 9007

 28273298 GTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCG 28273357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9008 GTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCG 9067

 28273358 CCTCCCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGT 28273417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9068 CCTCCCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGT 9127

 28273418 CCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTA 28273477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9128 CCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTA 9187

 28273478 CCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCT 28273537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9188 CCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCT 9247

 28273538 GGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTT 28273597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9248 GGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTT 9307

 28273598 ATCAACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGT 28273657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9308 ATCAACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGT 9367

 28273658 TTTATGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAA 28273717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9368 TTTATGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAA 9427

 28273718 ATTGGTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTT 28273777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9428 ATTGGTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTT 9487

 28273778 CTGACCTGTATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCG 28273812
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9488 CTGACCTGTATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCG 9522

Alignment time is 10.9878 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6499] =>      6499 nucs 'mol-32-2fb7-118561_6499'

Score:        5995
Aligned:      6521        nucs
Identic:      6456 ( 99%) nucs =>      3464 ( 99%)      2992 ( 99%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264649,28268139] EXCISED REGION [28269049,28272075]
 second seq =>  [       1,    3488] EXCISED REGION [    3489,    6499]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264649 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCT 28264708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
        1 GAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCT 60

 28264709 CCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGAT 28264768
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
       61 CACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGAT 120

 28264769 CCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAA 28264828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAA 180

 28264829 ATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGC 28264888
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      181 ATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGC 240

 28264889 ACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACC 28264948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACC 300

 28264949 ATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGC 28265008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGC 360

 28265009 TTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAA 28265068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAA 420

 28265069 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 28265128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 480

 28265129 AAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 28265188
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 540

 28265189 AGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 28265248
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 600

 28265249 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 28265308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 660

 28265309 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 28265368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 720

 28265369 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 28265428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 780

 28265429 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 28265488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 840

 28265489 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTG 28265548
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      841 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTG 900

 28265549 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAT 28265608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      901 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAC 960

 28265609 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 28265668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 1020

 28265669 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGA 28265728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1021 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGA 1080

 28265729 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 28265788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 1140

 28265789 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 28265848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 1200

 28265849 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 28265908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 1260

 28265909 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 28265968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 1320

 28265969 ACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATC 28266027
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATC 1380

 28266028 CCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAG 28266087
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAG 1440

 28266088 TGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAA 28266147
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAA 1500

 28266148 AAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAAC 28266207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAAC 1560

 28266208 TGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTA 28266267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTA 1620

 28266268 AAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTT 28266327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTT 1680

 28266328 AAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGT 28266387
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGT 1740

 28266388 AATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAAT 28266447
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAAT 1800

 28266448 GTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAA 28266507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAA 1860

 28266508 AAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGC 28266567
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGC 1920

 28266568 TGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAA 28266627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAA 1980

 28266628 TGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGT 28266687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGT 2040

 28266688 CCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATT 28266747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
     2041 CCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATT 2096

 28266748 GTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTT 28266807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 GTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTT 2156

 28266808 TACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGC 28266867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGC 2216

 28266868 CAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACC 28266927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 CAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACC 2276

 28266928 ATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCT 28266987
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 ATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCT 2336

 28266988 GCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCC 28267047
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCC 2396

 28267048 AGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTT 28267107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTT 2456

 28267108 TGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTA 28267167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTA 2516

 28267168 CTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTG 28267227
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTG 2576

 28267228 TGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCC 28267287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCC 2636

 28267288 CAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGT 28267347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGT 2696

 28267348 TTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATT 28267407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATT 2756

 28267408 CCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTT 28267467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTT 2816

 28267468 CTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATG 28267527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATG 2876

 28267528 CTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTT 28267587
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTT 2936

 28267588 GCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCAC 28267647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCAC 2996

 28267648 AGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTG 28267707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTG 3056

 28267708 TTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGT 28267767
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3057 TTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGT 3116

 28267768 ACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTC 28267827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 ACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTC 3176

 28267828 TGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTC 28267887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTC 3236

 28267888 CCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGA 28267947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGA 3296

 28267948 TAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATG 28268007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATG 3356

 28268008 GCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGG 28268065
          ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGG 3414

 28268066 TGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACAT 28268125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 TGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACAT 3474

 28268126 GTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||
     3475 GTTTGTGTCTTTTT 3488

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3548

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3608

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3668

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3728

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3729 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3788

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3848

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 3908

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     3909 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCA-- 3966

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4012

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4072

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4073 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4132

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 4192

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 4252

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4312

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4372

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4373 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4432

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4433 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4492

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4552

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4553 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4612

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4672

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4732

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4792

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4793 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 4852

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 4912

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 4972

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 5032

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 5092

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5093 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 5152

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 5212

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 5272

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 GTTTCCTAATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 5332

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 5392

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 5452

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5453 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 5512

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5513 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 5572

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5573 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 5632

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 5692

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 5752

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 5812

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 5872

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 5932

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 5992

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 6052

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 6112

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 6172

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 6232

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 6292

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 6352

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 6412

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 6472

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCA 28272075
          |||||||||||||||||||||||||||
     6473 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCA 6499

Alignment time is 8.10413 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3011] =>      3011 nucs 'mol-32-2fb7-118561_3011'

Score:        2802
Aligned:      3011        nucs
Identic:      2992 ( 99%) nucs =>       477 (100%)      2515 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28269049,28269526] EXCISED REGION [28269543,28272075]
 second seq =>  [       1,     478] EXCISED REGION [     479,    3011]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        16 nucs [28269527,28269542]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [28269527,28269531] to [28269543,28269547]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269526,28269526] to [28269543,28269543]
 second seq =>         1 nucs [478,478] to [479,479]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 60

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 120

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 180

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 240

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      241 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 300

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 360

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 420

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCA 28269526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCA 478

EXCISED REGION

 28269543 AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGA 28269602
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      479 AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACTGA 538

 28269603 AGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTC 28269662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 AGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTC 598

 28269663 TTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTT 28269722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      599 TTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTT 658

 28269723 GGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTT 28269782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTT 718

 28269783 GACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGC 28269842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGC 778

 28269843 TAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCC 28269902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      779 TAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCTTTGTCTTGTTCC 838

 28269903 AGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATG 28269962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATG 898

 28269963 CTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCT 28270022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      899 CTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCTTTGATGCCCAGTCT 958

 28270023 CTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTAC 28270082
          ||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      959 CTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGATTTTTCTGTGTCTAC 1018

 28270083 TGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTC 28270142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTC 1078

 28270143 ACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAA 28270202
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 ACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAA 1138

 28270203 CTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACC 28270262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACC 1198

 28270263 ATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAA 28270322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 ATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAA 1258

 28270323 AACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATAT 28270382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATAT 1318

 28270383 TCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGC 28270442
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1319 TCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGC 1378

 28270443 ATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCG 28270502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCG 1438

 28270503 TAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAAT 28270562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAAT 1498

 28270563 AGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCAC 28270622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1499 AGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAATGTGGTTTCCAC 1558

 28270623 TTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTAC 28270682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTAC 1618

 28270683 AGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTT 28270742
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTT 1678

 28270743 TATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTG 28270802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTG 1738

 28270803 GCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATC 28270862
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1739 GCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTAATCATC 1798

 28270863 TTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTT 28270922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTT 1858

 28270923 GCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTC 28270982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTC 1918

 28270983 CTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATG 28271042
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATG 1978

 28271043 CACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCC 28271102
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCC 2038

 28271103 AAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATT 28271162
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2039 AAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTTACTTTAATTGGATT 2098

 28271163 TCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCC 28271222
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCC 2158

 28271223 TAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAA 28271282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAA 2218

 28271283 CCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATG 28271342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATG 2278

 28271343 GGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCC 28271402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCC 2338

 28271403 AGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCT 28271462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCT 2398

 28271463 GTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATAT 28271522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATAT 2458

 28271523 GGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGT 28271582
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGT 2518

 28271583 AGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAG 28271642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAG 2578

 28271643 TAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGT 28271702
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGT 2638

 28271703 CCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATATT 28271762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATATT 2698

 28271763 GGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGG 28271822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGG 2758

 28271823 GATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCT 28271882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCT 2818

 28271883 CTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATT 28271942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATT 2878

 28271943 GTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTT 28272002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTT 2938

 28272003 GTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGTC 28272062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGTC 2998

 28272063 TCAATTTCCTTCA 28272075
          |||||||||||||
     2999 TCAATTTCCTTCA 3011

Alignment time is 4.01609 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4660] =>      4660 nucs 'mol-32-2fe3-008279_4660'

Score:        4196
Aligned:      4621        nucs
Identic:      4566 ( 99%) nucs =>      3493 ( 99%)      1073 ( 98%)
Gaps:           26 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264620,28268139] EXCISED REGION [28269049,28270144]
 second seq =>  [       1,    3519] EXCISED REGION [    3520,    4600]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264620 CCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCT 28264678
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCT 60

 28264679 GGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATT 28264738
          ||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATT 120

 28264739 ACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTC 28264798
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTC 180

 28264799 ATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATC 28264858
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATC 240

 28264859 CTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAAT 28264918
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAAT 300

 28264919 GAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTAC 28264978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTAC 360

 28264979 AAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAA 28265038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAA 420

 28265039 TGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTT 28265098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTT 480

 28265099 GAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGG 28265158
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGG 540

 28265159 AGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAA 28265218
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAA 600

 28265219 ACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAA 28265278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAA 660

 28265279 CAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTG 28265338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTG 720

 28265339 AAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCC 28265398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCC 780

 28265399 TACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGAC 28265458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGAC 840

 28265459 ACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACC 28265518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACC 900

 28265519 AGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAAC 28265578
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAAC 960

 28265579 GTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGC 28265638
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGC 1020

 28265639 TGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAA 28265698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAA 1080

 28265699 TCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACAT 28265758
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACAT 1140

 28265759 TTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGA 28265818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGA 1200

 28265819 TGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGC 28265878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGC 1260

 28265879 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGA 28265938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGA 1320

 28265939 GTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATT 28265997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATT 1380

 28265998 AGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 28266057
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 1440

 28266058 TCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAAC 28266117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1441 TCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAAC 1500

 28266118 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAA 28266176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     1501 CTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAA 1560

 28266177 AGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTG 28266236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTG 1620

 28266237 ATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAA 28266296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAA 1680

 28266297 AAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCA 28266356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCA 1740

 28266357 AGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGG 28266416
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1741 AGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGG 1800

 28266417 ATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTT 28266476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTT 1860

 28266477 TCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGAT 28266536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1861 TCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGAT 1920

 28266537 TTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAG 28266596
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAG 1980

 28266597 AGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAG 28266656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAG 2040

 28266657 TTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAG 28266716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAG 2100

 28266717 GTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGA 28266776
          |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGA 2156

 28266777 GAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGA 28266836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGA 2216

 28266837 GACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGG 28266896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGG 2276

 28266897 TGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATT 28266956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2277 TGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATT 2336

 28266957 TTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGT 28267016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2337 TTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGT 2396

 28267017 GGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGA 28267076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGA 2456

 28267077 ACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATG 28267136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 ACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATG 2516

 28267137 CGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCA 28267196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2517 CGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCA 2576

 28267197 AACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCT 28267256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCT 2636

 28267257 CTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCC 28267316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCC 2696

 28267317 ACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTA 28267376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTA 2756

 28267377 TAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTT 28267436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTT 2816

 28267437 TAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTA 28267496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTA 2876

 28267497 TTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTT 28267556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2877 TTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTT 2936

 28267557 GGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTT 28267616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTT 2996

 28267617 GTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTAT 28267676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTAT 3056

 28267677 TTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGA 28267736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGA 3116

 28267737 TTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTT 28267796
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTT 3176

 28267797 TCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATC 28267856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATC 3236

 28267857 TTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTT 28267916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTT 3296

 28267917 GGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCT 28267976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCT 3356

 28267977 GCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATA 28268034
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||
     3357 GCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATA 3414

 28268035 TATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCT 28268094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 TATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCT 3474

 28268095 TTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 TTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 3519

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3579

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3639

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3699

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3759

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3760 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3819

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3879

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 3939

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3940 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 3998

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3999 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4044

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4104

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4105 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4164

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 4224

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 4284

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4344

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4404

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4405 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4464

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4465 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4524

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4584

 28270129 ACATTTATTGATTCAC 28270144
          ||||||||||||||||
     4585 ACATTTATTGATTCAC 4600

Alignment time is 5.89128 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3397] =>      3397 nucs 'mol-32-2fe3-328499_3397'

Score:        3385
Aligned:      3396        nucs
Identic:      3395 (100%) nucs =>      2855 (100%)       540 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266446,28269300] EXCISED REGION [28269302,28269842]
 second seq =>  [       1,    2855] EXCISED REGION [    2857,    3397]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269301,28269301]
 second seq =>         1 nucs [2856,2856]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266446 ATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAG 28266505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAG 60

 28266506 AAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGAT 28266565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGAT 120

 28266566 GCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGA 28266625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGA 180

 28266626 AATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAA 28266685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAA 240

 28266686 GTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCA 28266745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCA 300

 28266746 TTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTAT 28266805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTAT 360

 28266806 TTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGA 28266865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGA 420

 28266866 GCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCA 28266925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCA 480

 28266926 CCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCT 28266985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCT 540

 28266986 CTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTT 28267045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTT 600

 28267046 CCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCAT 28267105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCAT 660

 28267106 TTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCC 28267165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCC 720

 28267166 TACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATG 28267225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATG 780

 28267226 TGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCC 28267285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCC 840

 28267286 CCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGT 28267345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGT 900

 28267346 GTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTA 28267405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTA 960

 28267406 TTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATC 28267465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATC 1020

 28267466 TTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAA 28267525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAA 1080

 28267526 TGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTT 28267585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTT 1140

 28267586 TTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTC 28267645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTC 1200

 28267646 ACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTT 28267705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTT 1260

 28267706 TGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAG 28267765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAG 1320

 28267766 GTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCC 28267825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCC 1380

 28267826 TCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGC 28267885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGC 1440

 28267886 TCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAG 28267945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAG 1500

 28267946 GATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTA 28268005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTA 1560

 28268006 TGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGG 28268065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGG 1620

 28268066 TGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACAT 28268125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACAT 1680

 28268126 GTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGAT 28268185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGAT 1740

 28268186 TGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCA 28268245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCA 1800

 28268246 TTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAA 28268305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAA 1860

 28268306 GCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGA 28268365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGA 1920

 28268366 GATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATT 28268425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATT 1980

 28268426 TTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATT 28268485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATT 2040

 28268486 TTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATA 28268545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATA 2100

 28268546 TTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTAC 28268605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTAC 2160

 28268606 TCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTC 28268665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTC 2220

 28268666 AATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCA 28268725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCA 2280

 28268726 ATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTG 28268785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTG 2340

 28268786 TAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTT 28268845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTT 2400

 28268846 CTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCAT 28268905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCAT 2460

 28268906 TGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCT 28268965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCT 2520

 28268966 GGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCT 28269025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCT 2580

 28269026 ATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCG 28269085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCG 2640

 28269086 GGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTT 28269145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTT 2700

 28269146 TCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATT 28269205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATT 2760

 28269206 GCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGT 28269265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGT 2820

 28269266 TTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTT 28269300
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTT 2855

EXCISED REGION

 28269302 GCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTA 28269361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 GCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTA 2916

 28269362 GCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACAT 28269421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 GCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACAT 2976

 28269422 TATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCG 28269481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCG 3036

 28269482 CACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAA 28269541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 CACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAA 3096

 28269542 GAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCG 28269601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 GAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCG 3156

 28269602 AAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATT 28269661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 AAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATT 3216

 28269662 CTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTT 28269721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3217 CTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTT 3276

 28269722 TGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTT 28269781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTT 3336

 28269782 TGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGG 28269841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 TGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGG 3396

 28269842 C 28269842
          |
     3397 C 3397

Alignment time is 4.65114 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3482] =>      3482 nucs 'mol-32-2fee-062801_3482'

Score:        3470
Aligned:      3481        nucs
Identic:      3480 (100%) nucs =>      1393 (100%)      2087 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265153,28266545] EXCISED REGION [28266547,28268634]
 second seq =>  [       1,    1393] EXCISED REGION [    1395,    3482]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28266546,28266546]
 second seq =>         1 nucs [1394,1394]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1392,1394] to [1393,1395]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28266545,28266545] to [28266547,28266547]
 second seq =>         1 nucs [1393,1393] to [1395,1395]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265153 GAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTA 28265212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTA 60

 28265213 ATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGG 28265272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGG 120

 28265273 CTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCA 28265332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCA 180

 28265333 GGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCA 28265392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCA 240

 28265393 TAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACA 28265452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACA 300

 28265453 CCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGG 28265512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGG 360

 28265513 TATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGC 28265572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGC 420

 28265573 AAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGA 28265632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGA 480

 28265633 ATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAG 28265692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAG 540

 28265693 AAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATA 28265752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATA 600

 28265753 CTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACAC 28265812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACAC 660

 28265813 ATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCAT 28265872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCAT 720

 28265873 GGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGT 28265932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGT 780

 28265933 GCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATA 28265992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATA 840

 28265993 CAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGG 28266052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGG 900

 28266053 GAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACT 28266112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACT 960

 28266113 CCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAA 28266172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAA 1020

 28266173 TAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGAT 28266232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGAT 1080

 28266233 TGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACAC 28266292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACAC 1140

 28266293 TCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGG 28266352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGG 1200

 28266353 AGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGAT 28266412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGAT 1260

 28266413 CTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAA 28266472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAA 1320

 28266473 ATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTA 28266532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTA 1380

 28266533 AGATTTTGATAGG 28266545
          |||||||||||||
     1381 AGATTTTGATAGG 1393

EXCISED REGION

 28266547 GCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAA 28266606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 GCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAA 1454

 28266607 TTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTA 28266666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTA 1514

 28266667 TATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAA 28266726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 TATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAA 1574

 28266727 ATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCC 28266786
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1575 ATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGGGAAAATACCC 1634

 28266787 GGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATA 28266846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 GGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATA 1694

 28266847 TGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAA 28266906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAA 1754

 28266907 GTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCT 28266966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 GTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCT 1814

 28266967 ATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTT 28267026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 ATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTT 1874

 28267027 GGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGAT 28267086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGAT 1934

 28267087 GAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGA 28267146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 GAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGA 1994

 28267147 GGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATT 28267206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATT 2054

 28267207 GGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGC 28267266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGC 2114

 28267267 TATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTC 28267326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 TATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTC 2174

 28267327 AGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATC 28267386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 AGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATC 2234

 28267387 TCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCC 28267446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 TCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCC 2294

 28267447 TACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATT 28267506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATT 2354

 28267507 GGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGT 28267566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 GGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGT 2414

 28267567 CCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCAT 28267626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 CCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCAT 2474

 28267627 TCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCA 28267686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCA 2534

 28267687 GGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGC 28267746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 GGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGC 2594

 28267747 AAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCC 28267806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 AAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCC 2654

 28267807 GCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCA 28267866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 GCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCA 2714

 28267867 TGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGT 28267926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 TGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGT 2774

 28267927 TCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATA 28267986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATA 2834

 28267987 TAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTT 28268046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 TAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTT 2894

 28268047 TCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAA 28268106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 TCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAA 2954

 28268107 ATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGAT 28268166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 ATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGAT 3014

 28268167 ATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAA 28268226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 ATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAA 3074

 28268227 ATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAA 28268286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 ATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAA 3134

 28268287 ACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATA 28268346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 ACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATA 3194

 28268347 GCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATG 28268406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 GCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATG 3254

 28268407 ATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAG 28268466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 ATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAG 3314

 28268467 AAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGT 28268526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 AAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGT 3374

 28268527 TTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATT 28268586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 TTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATT 3434

 28268587 TTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAG 28268634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 TTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAG 3482

Alignment time is 4.64093 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8192] =>      8192 nucs 'mol-32-3004-026987_8192'

Score:        8191
Aligned:      8191        nucs
Identic:      8191 (100%) nucs =>      4632 (100%)      3559 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265069,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273260]
 second seq =>  [       1,    4632] EXCISED REGION [    4634,    8192]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [4633,4633]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [4632,4632] to [4634,4634]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265069 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 28265128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAA 60

 28265129 AAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 28265188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGA 120

 28265189 AGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 28265248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAA 180

 28265249 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 28265308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAA 240

 28265309 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 28265368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAA 300

 28265369 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 28265428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAA 360

 28265429 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 28265488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAA 420

 28265489 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTG 28265548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTG 480

 28265549 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAT 28265608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGAT 540

 28265609 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 28265668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTC 600

 28265669 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGA 28265728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGA 660

 28265729 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 28265788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTA 720

 28265789 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 28265848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATAT 780

 28265849 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 28265908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 840

 28265909 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 28265968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAA 900

 28265969 ACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCC 28266028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCC 960

 28266029 CTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGT 28266088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGT 1020

 28266089 GAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAA 28266148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAA 1080

 28266149 AAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACT 28266208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACT 1140

 28266209 GGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAA 28266268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAA 1200

 28266269 AAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTA 28266328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTA 1260

 28266329 AAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTA 28266388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTA 1320

 28266389 ATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATG 28266448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATG 1380

 28266449 TAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAA 28266508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAA 1440

 28266509 AAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCT 28266568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCT 1500

 28266569 GAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAAT 28266628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAAT 1560

 28266629 GTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTC 28266688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTC 1620

 28266689 CCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTG 28266748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTG 1680

 28266749 TTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTT 28266808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTT 1740

 28266809 ACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCC 28266868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCC 1800

 28266869 AGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCA 28266928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCA 1860

 28266929 TTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTG 28266988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTG 1920

 28266989 CTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCA 28267048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCA 1980

 28267049 GCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTT 28267108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTT 2040

 28267109 GGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTAC 28267168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTAC 2100

 28267169 TTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGT 28267228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGT 2160

 28267229 GGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCC 28267288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCC 2220

 28267289 AGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTT 28267348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTT 2280

 28267349 TTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTC 28267408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTC 2340

 28267409 CCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTC 28267468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTC 2400

 28267469 TTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGC 28267528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGC 2460

 28267529 TGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTG 28267588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTG 2520

 28267589 CAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACA 28267648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACA 2580

 28267649 GAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGT 28267708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGT 2640

 28267709 TACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTA 28267768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTA 2700

 28267769 CTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCT 28267828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCT 2760

 28267829 GGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCC 28267888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCC 2820

 28267889 CACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGAT 28267948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGAT 2880

 28267949 AATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGG 28268008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGG 2940

 28268009 CTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGA 28268068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGA 3000

 28268069 TGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTT 28268128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTT 3060

 28268129 TGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGC 28268188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGC 3120

 28268189 TGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTA 28268248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTA 3180

 28268249 CAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCC 28268308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCC 3240

 28268309 TCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGAT 28268368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGAT 3300

 28268369 GGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTT 28268428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTT 3360

 28268429 TCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTG 28268488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTG 3420

 28268489 TCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTA 28268548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTA 3480

 28268549 GACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCT 28268608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCT 3540

 28268609 GTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAAT 28268668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAAT 3600

 28268669 TTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATG 28268728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATG 3660

 28268729 TCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAA 28268788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAA 3720

 28268789 TCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTG 28268848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTG 3780

 28268849 CATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGC 28268908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGC 3840

 28268909 TTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGG 28268968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGG 3900

 28268969 TTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATG 28269028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATG 3960

 28269029 GTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGA 28269088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGA 4020

 28269089 TTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCT 28269148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCT 4080

 28269149 AGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCT 28269208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCT 4140

 28269209 TTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTT 28269268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTT 4200

 28269269 TCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGA 28269328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGA 4260

 28269329 GATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGA 28269388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGA 4320

 28269389 TTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGC 28269448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGC 4380

 28269449 CAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 28269508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 4440

 28269509 GAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTT 28269568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTT 4500

 28269569 TGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTT 28269628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTT 4560

 28269629 ATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTAT 28269688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTAT 4620

 28269689 CCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||
     4621 CCCTTGAAAGGA 4632

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 4693

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 4753

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 4813

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 4873

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 4933

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 4993

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 5053

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 5113

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 5173

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 5233

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 5293

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 5353

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 5413

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 5473

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 5533

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 5593

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 5653

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 5713

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 5773

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 5833

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 5893

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 5953

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 6013

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 6073

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 6133

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6134 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 6193

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6194 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 6253

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6254 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 6313

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6314 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 6373

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6374 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 6433

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6434 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 6493

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6494 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 6553

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6554 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 6613

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6614 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 6673

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6674 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 6733

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6734 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 6793

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6794 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 6853

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6854 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 6913

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6914 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 6973

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6974 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 7033

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7034 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 7093

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7094 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 7153

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7154 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 7213

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7214 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 7273

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7274 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 7333

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7334 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 7393

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7394 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 7453

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7454 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 7513

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7514 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 7573

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7574 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 7633

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7634 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 7693

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7694 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 7753

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7754 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 7813

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7814 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 7873

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 7933

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7934 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 7993

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7994 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 8053

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8054 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 8113

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8114 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 8173

 28273242 TTTCTTCCATAGATTATAC 28273260
          |||||||||||||||||||
     8174 TTTCTTCCATAGATTATAC 8192

Alignment time is 10.1703 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2171] =>      2171 nucs 'mol-32-300f-147128_2171'

Score:        2040
Aligned:      2173        nucs
Identic:      2156 ( 99%) nucs =>      1723 ( 99%)       433 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266403,28268139] EXCISED REGION [28269049,28269482]
 second seq =>  [       5,    1737] EXCISED REGION [    1738,    2171]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266403 GTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAA 28266462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 GTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAA 64

 28266463 AATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGA 28266522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 AATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGA 124

 28266523 ATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGAC 28266582
          |||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 ATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGAC 184

 28266583 TAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGAT 28266642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 TAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGAT 244

 28266643 TAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTT 28266702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 TAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTT 304

 28266703 AAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATG 28266762
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
      305 AAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATG 360

 28266763 GCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTA 28266822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTA 420

 28266823 TGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTT 28266882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTT 480

 28266883 TGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGT 28266942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGT 540

 28266943 CTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTC 28267002
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      541 CTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTC 600

 28267003 TTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATG 28267062
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGTCGCCAAGGTGGTGGCAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATG 660

 28267063 AATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCC 28267122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCC 720

 28267123 ACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATT 28267182
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      721 ACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATT 780

 28267183 GATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGAC 28267242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGAC 840

 28267243 TCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACA 28267302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACA 900

 28267303 GTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCA 28267362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCA 960

 28267363 TTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATG 28267422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATG 1020

 28267423 ATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCT 28267482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCT 1080

 28267483 AAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGT 28267542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGT 1140

 28267543 TCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTC 28267602
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTC 1200

 28267603 CCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTAT 28267662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTAT 1260

 28267663 TTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATC 28267722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATC 1320

 28267723 GTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACC 28267782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1321 GTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACC 1380

 28267783 AAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGC 28267842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGC 1440

 28267843 CTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAG 28267902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAG 1500

 28267903 AACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCT 28267962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCT 1560

 28267963 GCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCC 28268022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1561 GCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC- 1619

 28268023 A--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGG 28268080
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 -TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGG 1678

 28268081 TTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 1737

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 1797

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 1857

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 1917

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 1977

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1978 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 2037

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 2097

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 2157

 28269469 TGAGCCGAGATCGC 28269482
          ||||||||||||||
     2158 TGAGCCGAGATCGC 2171

Alignment time is 3.16791 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4032] =>      4032 nucs 'mol-32-301a-016100_4032'

Score:        4020
Aligned:      4031        nucs
Identic:      4030 (100%) nucs =>      3198 (100%)       832 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266503,28269700] EXCISED REGION [28269702,28270534]
 second seq =>  [       1,    3198] EXCISED REGION [    3200,    4032]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [3199,3199]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [3198,3198] to [3200,3200]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266503 GAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCT 28266562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCT 60

 28266563 GATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTT 28266622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTT 120

 28266623 AGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAA 28266682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAA 180

 28266683 AAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAG 28266742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAG 240

 28266743 GCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTC 28266802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTC 300

 28266803 TATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACA 28266862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACA 360

 28266863 AGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTC 28266922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTC 420

 28266923 TCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGA 28266982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGA 480

 28266983 GCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATG 28267042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATG 540

 28267043 CTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGC 28267102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGC 600

 28267103 CATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTA 28267162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTA 660

 28267163 CCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACT 28267222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACT 720

 28267223 ATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATC 28267282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATC 780

 28267283 CCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATC 28267342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATC 840

 28267343 AGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTG 28267402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTG 900

 28267403 CTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTAT 28267462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTAT 960

 28267463 ATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCT 28267522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCT 1020

 28267523 TAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTT 28267582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTT 1080

 28267583 GTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCT 28267642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCT 1140

 28267643 TTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAG 28267702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAG 1200

 28267703 GTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACC 28267762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACC 1260

 28267763 CAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCT 28267822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCT 1320

 28267823 CCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTT 28267882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTT 1380

 28267883 AGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTT 28267942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTT 1440

 28267943 TAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTT 28268002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTT 1500

 28268003 TTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCAC 28268062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCAC 1560

 28268063 TGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAA 28268122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAA 1620

 28268123 CATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGG 28268182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGG 1680

 28268183 GATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTT 28268242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTT 1740

 28268243 CCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCT 28268302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCT 1800

 28268303 AAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTG 28268362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTG 1860

 28268363 TGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGC 28268422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGC 1920

 28268423 ATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGT 28268482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGT 1980

 28268483 ATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCG 28268542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCG 2040

 28268543 ATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTT 28268602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTT 2100

 28268603 TACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTT 28268662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTT 2160

 28268663 GTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGG 28268722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGG 2220

 28268723 TCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAAT 28268782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAAT 2280

 28268783 TTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATT 28268842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATT 2340

 28268843 CTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCC 28268902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCC 2400

 28268903 CATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTT 28268962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTT 2460

 28268963 TCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCT 28269022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCT 2520

 28269023 TCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGC 28269082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGC 2580

 28269083 TCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTT 28269142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTT 2640

 28269143 TTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAG 28269202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAG 2700

 28269203 ATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAG 28269262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAG 2760

 28269263 TGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTT 28269322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTT 2820

 28269323 TGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAA 28269382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAA 2880

 28269383 ATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTA 28269442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTA 2940

 28269443 CTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGG 28269502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGG 3000

 28269503 GCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACC 28269562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACC 3060

 28269563 GGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTA 28269622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTA 3120

 28269623 ATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGC 28269682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGC 3180

 28269683 AGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||||||||
     3181 AGCTATCCCTTGAAAGGA 3198

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 3259

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 3319

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 3379

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 3439

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 3499

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 3559

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 3619

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 GTGAATCGCATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 3679

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 3739

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 3799

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 3859

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 3919

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 3979

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAG 28270534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAG 4032

Alignment time is 5.16505 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6335] =>      6335 nucs 'mol-32-3025-179481_6335'

Score:        5937
Aligned:      6340        nucs
Identic:      6287 ( 99%) nucs =>      1586 ( 99%)      4701 ( 99%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266543,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273789]
 second seq =>  [      17,    1609] EXCISED REGION [    1610,    6335]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266543 AGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTG 28266602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       17 AGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTG 76

 28266603 ACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTC 28266662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       77 ACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTC 136

 28266663 CCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAA 28266722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      137 CCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAA 196

 28266723 ATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAAT 28266782
          |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      197 ATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAAT 252

 28266783 ACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCAT 28266842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      253 ACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCAT 312

 28266843 TATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGC 28266902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      313 TATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGC 372

 28266903 AGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCT 28266962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      373 AGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCT 432

 28266963 TCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGT 28267022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      433 TCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGT 492

 28267023 AGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGA 28267082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 AGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGA 552

 28267083 AGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAA 28267142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      553 AGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAA 612

 28267143 AGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGA 28267202
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      613 AGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGA 672

 28267203 AATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAG 28267262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 AATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAG 732

 28267263 TGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCC 28267322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 TGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCC 792

 28267323 TCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGA 28267382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 TCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGA 852

 28267383 TATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATA 28267442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 TATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATA 912

 28267443 TGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTAT 28267502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 TGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTAT 972

 28267503 AATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAA 28267562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      973 AATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAA 1032

 28267563 CAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTT 28267622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 CAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTT 1092

 28267623 TCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGA 28267682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 TCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGA 1152

 28267683 TTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGG 28267742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 TTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGG 1212

 28267743 GTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACC 28267802
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 GTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACC 1272

 28267803 CTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATG 28267862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 CTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATG 1332

 28267863 TCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTT 28267922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 TCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTT 1392

 28267923 CTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAG 28267982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 CTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAG 1452

 28267983 GATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACC 28268040
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     1453 GATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACC 1510

 28268041 ACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTA 28268100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 ACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTA 1570

 28268101 TTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 1609

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 1669

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 1729

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 1789

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 1849

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1850 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 1909

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 1969

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 2029

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2030 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 2088

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 2134

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 2194

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2195 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 2254

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 2314

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 2374

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 2434

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 2494

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2495 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 2554

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     2555 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 2614

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 2674

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2675 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 2734

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 2794

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 2854

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 2914

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2915 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 2974

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 3034

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 3094

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 3154

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 3214

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3215 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 3274

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 3334

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 3394

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 3454

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 3514

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 3574

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3575 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 3634

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3635 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 3694

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3695 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 3754

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 3814

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 3874

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 3934

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 3994

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 4054

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 4114

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 4174

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 4234

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 4294

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 4354

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 4414

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 4474

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 4534

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 4594

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 4654

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 4714

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 4774

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 4834

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 4894

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 4954

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4955 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 5014

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 5074

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 5134

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 5194

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 5254

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 5314

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 5374

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 5434

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5435 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 5494

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 5554

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 5614

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 5674

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5675 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 5734

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 5794

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 28273308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 5854

 28273309 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 28273368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 5914

 28273369 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 28273428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 5974

 28273429 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 28273488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 6034

 28273489 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 28273548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6094

 28273549 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAACC 28273608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6095 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAACC 6154

 28273609 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 28273668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 6214

 28273669 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 28273728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 6274

 28273729 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTAT 28273788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTAT 6334

 28273789 A 28273789
          |
     6335 A 6335

Alignment time is 8.11469 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    9330] =>      9330 nucs 'mol-32-3025-193868_9330'

Score:        9297
Aligned:      9330        nucs
Identic:      9327 (100%) nucs =>       401 (100%)      8926 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264068,28264468] EXCISED REGION [28264470,28273398]
 second seq =>  [       1,     401] EXCISED REGION [     402,    9330]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28264469,28264469]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [28269582,28269582]
 second seq =>         1 nucs [5514,5514]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [28264469,28264478] to [28264470,28264479]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264068 AACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGC 28264127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGC 60

 28264128 TGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCT 28264187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCT 120

 28264188 AGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGC 28264247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGC 180

 28264248 TCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAAG 28264307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAAG 240

 28264308 GCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTC 28264367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTC 300

 28264368 CCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGGT 28264427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGGT 360

 28264428 GGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCC 28264468
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCC 401

EXCISED REGION

 28264470 TTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCT 28264529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 TTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCT 461

 28264530 CGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 28264589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 CGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 521

 28264590 TAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAG 28264649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 TAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAG 581

 28264650 AGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTC 28264709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 AGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTC 641

 28264710 CCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATC 28264769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 CCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATC 701

 28264770 CACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAA 28264829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 CACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAA 761

 28264830 TAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCA 28264889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 TAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCA 821

 28264890 CCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCA 28264949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 CCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCA 881

 28264950 TGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCT 28265009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCT 941

 28265010 TCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAG 28265069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 TCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAG 1001

 28265070 TTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAA 28265129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 TTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAA 1061

 28265130 AATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAA 28265189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 AATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAA 1121

 28265190 GATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAA 28265249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 GATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAA 1181

 28265250 CAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAAT 28265309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 CAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAAT 1241

 28265310 TTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAA 28265369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 TTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAA 1301

 28265370 AGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAA 28265429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 AGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAA 1361

 28265430 CGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAA 28265489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAA 1421

 28265490 GACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGT 28265549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 GACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGT 1481

 28265550 CAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATA 28265609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 CAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATA 1541

 28265610 GTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCA 28265669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 GTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCA 1601

 28265670 AAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAA 28265729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 AAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAA 1661

 28265730 AAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTAC 28265789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 AAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTAC 1721

 28265790 GGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATT 28265849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 GGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATT 1781

 28265850 AAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 28265909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 AAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 1841

 28265910 CAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAA 28265969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 CAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAA 1901

 28265970 CCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCC 28266029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 CCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCC 1961

 28266030 TGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTG 28266089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTG 2021

 28266090 AGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAA 28266149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 AGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAA 2081

 28266150 AAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTG 28266209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 AAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTG 2141

 28266210 GTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAA 28266269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 GTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAA 2201

 28266270 AAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAA 28266329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 AAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAA 2261

 28266330 AAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAA 28266389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 AAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAA 2321

 28266390 TTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGT 28266449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGT 2381

 28266450 AGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAA 28266509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 AGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAA 2441

 28266510 AAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTG 28266569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTG 2501

 28266570 AGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATG 28266629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 AGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATG 2561

 28266630 TTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCC 28266689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCC 2621

 28266690 CTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGT 28266749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 CTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGT 2681

 28266750 TGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTA 28266809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 TGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTA 2741

 28266810 CAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCA 28266869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 CAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCA 2801

 28266870 GCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCAT 28266929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 GCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCAT 2861

 28266930 TGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGC 28266989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGC 2921

 28266990 TGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAG 28267049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAG 2981

 28267050 CAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTG 28267109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 CAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTG 3041

 28267110 GGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACT 28267169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 GGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACT 3101

 28267170 TGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTG 28267229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 TGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTG 3161

 28267230 GAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCA 28267289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 GAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCA 3221

 28267290 GCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTT 28267349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 GCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTT 3281

 28267350 TGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCC 28267409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 TGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCC 3341

 28267410 CTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCT 28267469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 CTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCT 3401

 28267470 TTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCT 28267529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 TTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCT 3461

 28267530 GAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGC 28267589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 GAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGC 3521

 28267590 AAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAG 28267649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 AAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAG 3581

 28267650 AGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTT 28267709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 AGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTT 3641

 28267710 ACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTAC 28267769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 ACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTAC 3701

 28267770 TGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTG 28267829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTG 3761

 28267830 GTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCC 28267889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 GTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCC 3821

 28267890 ACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATA 28267949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 ACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATA 3881

 28267950 ATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGC 28268009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 ATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGC 3941

 28268010 TGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGAT 28268069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 TGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGAT 4001

 28268070 GGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTT 28268129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 GGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTT 4061

 28268130 GTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCT 28268189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 GTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCT 4121

 28268190 GGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTAC 28268249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 GGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTAC 4181

 28268250 AGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCT 28268309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 AGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCT 4241

 28268310 CACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATG 28268369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 CACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATG 4301

 28268370 GTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTT 28268429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 GTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTT 4361

 28268430 CATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGT 28268489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 CATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGT 4421

 28268490 CAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAG 28268549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 CAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAG 4481

 28268550 ACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTG 28268609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 ACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTG 4541

 28268610 TTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATT 28268669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 TTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATT 4601

 28268670 TTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGT 28268729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 TTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGT 4661

 28268730 CCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAAT 28268789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 CCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAAT 4721

 28268790 CCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGC 28268849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 CCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGC 4781

 28268850 ATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCT 28268909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 ATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCT 4841

 28268910 TATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGT 28268969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 TATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGT 4901

 28268970 TCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGG 28269029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 TCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGG 4961

 28269030 TTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGAT 28269089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 TTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGAT 5021

 28269090 TGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTA 28269149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 TGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTA 5081

 28269150 GTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTT 28269209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 GTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTT 5141

 28269210 TGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTT 28269269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 TGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTT 5201

 28269270 CCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAG 28269329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 CCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAG 5261

 28269330 ATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGAT 28269389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 ATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGAT 5321

 28269390 TGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCC 28269449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 TGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCC 5381

 28269450 AGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 28269509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 AGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 5441

 28269510 AGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTT 28269569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 AGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTT 5501

 28269570 GTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTA 28269629
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 GTACATTGATTTCGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTA 5561

 28269630 TTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATC 28269689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 TTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATC 5621

 28269690 CCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTA 28269749
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 CCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTA 5681

 28269750 TAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACC 28269809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 TAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACC 5741

 28269810 TTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAG 28269869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 TTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAG 5801

 28269870 GATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTT 28269929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 GATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTT 5861

 28269930 TTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTAT 28269989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 TTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTAT 5921

 28269990 TATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTG 28270049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 TATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTG 5981

 28270050 TTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTA 28270109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 TTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTA 6041

 28270110 ATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTA 28270169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 ATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTA 6101

 28270170 AGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGAC 28270229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 AGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGAC 6161

 28270230 TTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTAC 28270289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 TTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTAC 6221

 28270290 TATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCT 28270349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 TATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCT 6281

 28270350 TTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATT 28270409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 TTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATT 6341

 28270410 TACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAA 28270469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 TACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAA 6401

 28270470 CTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTA 28270529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 CTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTA 6461

 28270530 AAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACA 28270589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 AAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACA 6521

 28270590 ATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTAC 28270649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 ATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTAC 6581

 28270650 ACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGT 28270709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 ACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGT 6641

 28270710 TTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCT 28270769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6642 TTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCT 6701

 28270770 TTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTC 28270829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 TTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTC 6761

 28270830 ACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTC 28270889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6762 ACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTC 6821

 28270890 TTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTT 28270949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 TTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTT 6881

 28270950 TCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTC 28271009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 TCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTC 6941

 28271010 CTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCG 28271069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6942 CTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCG 7001

 28271070 TAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACAT 28271129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7002 TAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACAT 7061

 28271130 TTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTC 28271189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7062 TTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTC 7121

 28271190 AACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTAT 28271249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7122 AACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTAT 7181

 28271250 CCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGG 28271309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7182 CCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGG 7241

 28271310 GGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAG 28271369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7242 GGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAG 7301

 28271370 AGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCA 28271429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7302 AGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCA 7361

 28271430 TACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTT 28271489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7362 TACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTT 7421

 28271490 GAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGT 28271549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7422 GAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGT 7481

 28271550 ATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTG 28271609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7482 ATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTG 7541

 28271610 TCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTAC 28271669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7542 TCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTAC 7601

 28271670 ATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATT 28271729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7602 ATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATT 7661

 28271730 TTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCC 28271789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7662 TTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCC 7721

 28271790 TGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCT 28271849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7722 TGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCT 7781

 28271850 AGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGA 28271909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7782 AGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGA 7841

 28271910 TTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTC 28271969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7842 TTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTC 7901

 28271970 CTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCT 28272029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7902 CTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCT 7961

 28272030 GGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCT 28272089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7962 GGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCT 8021

 28272090 TAGTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTG 28272149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8022 TAGTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTG 8081

 28272150 TAGGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAG 28272209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8082 TAGGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAG 8141

 28272210 TGCTATAAGCTTTTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGT 28272269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8142 TGCTATAAGCTTTTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGT 8201

 28272270 GTCTCTATATGTTAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATT 28272329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8202 GTCTCTATATGTTAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATT 8261

 28272330 TATAAAGAAAAGAGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCAC 28272389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8262 TATAAAGAAAAGAGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCAC 8321

 28272390 CAGCATCTTCTTGGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAA 28272449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8322 CAGCATCTTCTTGGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAA 8381

 28272450 GTGGGATCTGGAATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCAC 28272509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8382 GTGGGATCTGGAATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCAC 8441

 28272510 AATTTCTTAAACAACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGC 28272569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8442 AATTTCTTAAACAACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGC 8501

 28272570 TAGGACAGCACCAAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTA 28272629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8502 TAGGACAGCACCAAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTA 8561

 28272630 GCCCCTCCTCATTTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGT 28272689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8562 GCCCCTCCTCATTTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGT 8621

 28272690 TTTCATTTATCTTAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCAT 28272749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8622 TTTCATTTATCTTAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCAT 8681

 28272750 TCAAGAGCAAGTAGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTAT 28272809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8682 TCAAGAGCAAGTAGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTAT 8741

 28272810 TGATTTCTATTTTTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTT 28272869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8742 TGATTTCTATTTTTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTT 8801

 28272870 TAATTTATTGAGACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATG 28272929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8802 TAATTTATTGAGACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATG 8861

 28272930 TGTAGATGAGAAGAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAA 28272989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8862 TGTAGATGAGAAGAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAA 8921

 28272990 TTGATCGAGTGTTGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATC 28273049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8922 TTGATCGAGTGTTGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATC 8981

 28273050 TGTCTAATGCTGTCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTT 28273109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8982 TGTCTAATGCTGTCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTT 9041

 28273110 GTAGATCTGTACTTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAG 28273169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9042 GTAGATCTGTACTTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAG 9101

 28273170 GATAGTTAAGTCTTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCC 28273229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9102 GATAGTTAAGTCTTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCC 9161

 28273230 AAATTAATACTTTTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 28273289
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     9162 AAATTAATACTTTTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 9221

 28273290 GAAACAGAGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGC 28273349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9222 GAAACAGAGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGC 9281

 28273350 AAGCTCCGCCTCCCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAG 28273398
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9282 AAGCTCCGCCTCCCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAG 9330

Alignment time is 11.3088 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3026] =>      3026 nucs 'mol-32-3046-085882_3026'

Score:        3026
Aligned:      3026        nucs
Identic:      3026 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265153,28268178]
 second seq =>  [       1,    3026]

 28265153 GAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTA 28265212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTA 60

 28265213 ATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGG 28265272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGG 120

 28265273 CTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCA 28265332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCA 180

 28265333 GGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCA 28265392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCA 240

 28265393 TAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACA 28265452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACA 300

 28265453 CCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGG 28265512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGG 360

 28265513 TATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGC 28265572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGC 420

 28265573 AAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGA 28265632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGA 480

 28265633 ATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAG 28265692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAG 540

 28265693 AAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATA 28265752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATA 600

 28265753 CTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACAC 28265812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACAC 660

 28265813 ATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCAT 28265872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCAT 720

 28265873 GGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGT 28265932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGT 780

 28265933 GCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATA 28265992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATA 840

 28265993 CAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGG 28266052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGG 900

 28266053 GAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACT 28266112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACT 960

 28266113 CCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAA 28266172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAA 1020

 28266173 TAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGAT 28266232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGAT 1080

 28266233 TGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACAC 28266292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACAC 1140

 28266293 TCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGG 28266352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGG 1200

 28266353 AGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGAT 28266412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGAT 1260

 28266413 CTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAA 28266472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAA 1320

 28266473 ATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTA 28266532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTA 1380

 28266533 AGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAG 28266592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAG 1440

 28266593 ATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGG 28266652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGG 1500

 28266653 TCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATA 28266712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATA 1560

 28266713 CAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTT 28266772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTT 1620

 28266773 GGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAAT 28266832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAAT 1680

 28266833 TGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAA 28266892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAA 1740

 28266893 GGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGG 28266952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGG 1800

 28266953 AATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCA 28267012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCA 1860

 28267013 AGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCA 28267072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCA 1920

 28267073 CAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAA 28267132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAA 1980

 28267133 CATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATT 28267192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATT 2040

 28267193 ACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGT 28267252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGT 2100

 28267253 GCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTG 28267312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTG 2160

 28267313 TTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGG 28267372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGG 2220

 28267373 TGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACA 28267432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACA 2280

 28267433 TCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTG 28267492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTG 2340

 28267493 CCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTA 28267552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTA 2400

 28267553 TTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATG 28267612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATG 2460

 28267613 GTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTT 28267672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTT 2520

 28267673 TTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCT 28267732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCT 2580

 28267733 GAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAA 28267792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAA 2640

 28267793 TTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGC 28267852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGC 2700

 28267853 CATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGT 28267912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGT 2760

 28267913 ATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGT 28267972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGT 2820

 28267973 TGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATA 28268032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATA 2880

 28268033 TATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGT 28268092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGT 2940

 28268093 CTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTT 28268152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTT 3000

 28268153 GTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTA 28268178
          ||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTA 3026

Alignment time is 3.52966 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    9454] =>      9454 nucs 'mol-32-30f6-145550_9454'

Score:        9453
Aligned:      9453        nucs
Identic:      9453 (100%) nucs =>      7867 (100%)      1586 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28261834,28269700] EXCISED REGION [28269702,28271287]
 second seq =>  [       1,    7867] EXCISED REGION [    7869,    9454]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [7868,7868]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [7867,7867] to [7869,7869]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28261834 ATCTAAAATTCTAAAAAGTGCAAACATCTATAGTGACAGAAAGCAGATCAGTGGTTGCCT 28261893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTAAAATTCTAAAAAGTGCAAACATCTATAGTGACAGAAAGCAGATCAGTGGTTGCCT 60

 28261894 GCGGTGGGGTTGAAGTGAGGAACAGGCAGACGTGAACAAAGGGGAACGAGGAAATGCTAG 28261953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCGGTGGGGTTGAAGTGAGGAACAGGCAGACGTGAACAAAGGGGAACGAGGAAATGCTAG 120

 28261954 GGGTAATTAATATGTTCATTATCTTGATTATGGTGATGGTTTCACAGGTGTGTGCATAGG 28262013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGTAATTAATATGTTCATTATCTTGATTATGGTGATGGTTTCACAGGTGTGTGCATAGG 180

 28262014 TCAACATGTATAAAGCTTTATGCTTTAAATATATTACTTTGTTTTATACCAATTATGCCT 28262073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAACATGTATAAAGCTTTATGCTTTAAATATATTACTTTGTTTTATACCAATTATGCCT 240

 28262074 CAATATAGTTGTTTTAAAAATGTTATCAGAGAAAGAAGAAAACTAAAGTGAAGTAAATAA 28262133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAATATAGTTGTTTTAAAAATGTTATCAGAGAAAGAAGAAAACTAAAGTGAAGTAAATAA 300

 28262134 TCATCCAGCTATTGGCTGATGGGTATTGTTATTCACATAAAAATTTTTCTAATAAAGAGT 28262193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATCCAGCTATTGGCTGATGGGTATTGTTATTCACATAAAAATTTTTCTAATAAAGAGT 360

 28262194 AAAAGTTGTATTTGAAAAAAAATCCTGGCACCCCAGTCCCGAGGATCCCTAGAAAATTTA 28262253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAGTTGTATTTGAAAAAAAATCCTGGCACCCCAGTCCCGAGGATCCCTAGAAAATTTA 420

 28262254 CAGGGGTGGCAGTCTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGATTTTCAATCTTTGGCTTGCATATA 28262313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGGGTGGCAGTCTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGATTTTCAATCTTTGGCTTGCATATA 480

 28262314 CCTTGCCAAGACATCCAAGGCACCTGCAATTTCTTGCTTACCAGGAATTTCCATCACCTG 28262373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTGCCAAGACATCCAAGGCACCTGCAATTTCTTGCTTACCAGGAATTTCCATCACCTG 540

 28262374 CCAGCAAGATTTTATTATATCAATGTAGCAGACCAGCCTGAAGTGCTATGGACTGATAGG 28262433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGCAAGATTTTATTATATCAATGTAGCAGACCAGCCTGAAGTGCTATGGACTGATAGG 600

 28262434 GGTACAGTCTTTATGGGCTTGACTATAATAAAGAGACAGAGGGTCTAGTCAGGTAAACAA 28262493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTACAGTCTTTATGGGCTTGACTATAATAAAGAGACAGAGGGTCTAGTCAGGTAAACAA 660

 28262494 AAACAGTTTCTGGGCTCTTTGCTTAGGGGAAGTAATGAGACAAAGACATATTTCAGATTG 28262553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAACAGTTTCTGGGCTCTTTGCTTAGGGGAAGTAATGAGACAAAGACATATTTCAGATTG 720

 28262554 ATAGGTAAATACAAGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAGTGAAGAAACTACATGTGGGACAGT 28262613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAGGTAAATACAAGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAGTGAAGAAACTACATGTGGGACAGT 780

 28262614 AGCTGCAGTTGGAGTCATCATCTGATTAAGTTTATGATGATACACTCTTACCCTCTAAGA 28262673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCTGCAGTTGGAGTCATCATCTGATTAAGTTTATGATGATACACTCTTACCCTCTAAGA 840

 28262674 CTGTCAGTCTTTGAAGCATATACTAAACAGGTGAGTCAAATGCAGATTGATAGGAATAAT 28262733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGTCAGTCTTTGAAGCATATACTAAACAGGTGAGTCAAATGCAGATTGATAGGAATAAT 900

 28262734 TACCCTGCATTTTTAGTCTTGCTTGGTTACGTTCATCTTTGAGGTTCCACACAGGGATTT 28262793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCCTGCATTTTTAGTCTTGCTTGGTTACGTTCATCTTTGAGGTTCCACACAGGGATTT 960

 28262794 AGTATTGCCTTCTATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGGTCCTTCCACTTGGTTATTTCTACC 28262853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTATTGCCTTCTATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGGTCCTTCCACTTGGTTATTTCTACC 1020

 28262854 ATAATAACTGTTATTCGATGTGTCAGAAAGCCAATGTGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGT 28262913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAATAACTGTTATTCGATGTGTCAGAAAGCCAATGTGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGT 1080

 28262914 GTGCTTATTGAAGCATTCACTCAGGAACAGTATAAATAACCACAAGACAGGTTTATGGAT 28262973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGCTTATTGAAGCATTCACTCAGGAACAGTATAAATAACCACAAGACAGGTTTATGGAT 1140

 28262974 ACATTGAACCAGCTATGAGAAGGACTCAACAAAATTCCATTTGTTATCACACCCGTATAA 28263033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATTGAACCAGCTATGAGAAGGACTCAACAAAATTCCATTTGTTATCACACCCGTATAA 1200

 28263034 ACACCCATTTTGATGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCTGGGTTCCGGCAAATTAACCATGTC 28263093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACCCATTTTGATGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCTGGGTTCCGGCAAATTAACCATGTC 1260

 28263094 CAGAATTCCTAGAAAGTCTGGATATTTTCCTTTCTCTAGAACACAATTATTCTAATACAT 28263153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGAATTCCTAGAAAGTCTGGATATTTTCCTTTCTCTAGAACACAATTATTCTAATACAT 1320

 28263154 GGCTGCATATTCCTTTGGGGAAATACTAGGAAGAAGCAACAGAGTATACATTCCTTTTAC 28263213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCTGCATATTCCTTTGGGGAAATACTAGGAAGAAGCAACAGAGTATACATTCCTTTTAC 1380

 28263214 AAGGGTATCTGGCCTCTTATTTTAGGTCAAGTTATTGAAGAATAGTTTACATACAATAAA 28263273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGGGTATCTGGCCTCTTATTTTAGGTCAAGTTATTGAAGAATAGTTTACATACAATAAA 1440

 28263274 ATTTACTTTTAAAAAGTGTATAGTACAGTTCAACAAGCTTTGACAAATGAATACAATCAT 28263333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTTACTTTTAAAAAGTGTATAGTACAGTTCAACAAGCTTTGACAAATGAATACAATCAT 1500

 28263334 GTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAATGTCAGTTGACAAGCTCATCC 28263393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAATGTCAGTTGACAAGCTCATCC 1560

 28263394 AAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTGAATCAGAAAA 28263453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTGAATCAGAAAA 1620

 28263454 AATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGTATTAAATATA 28263513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGTATTAAATATA 1680

 28263514 GTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTAGAAACAGACT 28263573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTAGAAACAGACT 1740

 28263574 CATTCCTATAGACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGGGATAAAGTAT 28263633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTCCTATAGACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGGGATAAAGTAT 1800

 28263634 AAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAATAATTGATCCC 28263693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAATAATTGATCCC 1860

 28263694 TACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTAAATGGGAAAA 28263753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTAAATGGGAAAA 1920

 28263754 GCGAACTTAAAAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTTTTGTTTTTTT 28263813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCGAACTTAAAAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTTTTGTTTTTTT 1980

 28263814 AAAAAAGAGATCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGC 28263873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAAAGAGATCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGC 2040

 28263874 ATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAG 28263933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAG 2100

 28263934 ATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACAT 28263993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACAT 2160

 28263994 TATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGAC 28264053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGAC 2220

 28264054 CTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATAT 28264113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATAT 2280

 28264114 CCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAA 28264173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAA 2340

 28264174 AGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTT 28264233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTT 2400

 28264234 CAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAAC 28264293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAAC 2460

 28264294 TGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGA 28264353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGA 2520

 28264354 GCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATA 28264413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATA 2580

 28264414 CATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTT 28264473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTT 2640

 28264474 TTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGC 28264533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGC 2700

 28264534 TTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGC 28264593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGC 2760

 28264594 TGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGAT 28264653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGAT 2820

 28264654 GGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCAC 28264713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCAC 2880

 28264714 CTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACC 28264773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACC 2940

 28264774 CTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAG 28264833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAG 3000

 28264834 TTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAA 28264893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAA 3060

 28264894 GGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGT 28264953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGT 3120

 28264954 AATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAA 28265013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAA 3180

 28265014 CAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTAT 28265073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTAT 3240

 28265074 AAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATT 28265133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATT 3300

 28265134 AATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATA 28265193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATA 3360

 28265194 GAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGA 28265253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGA 3420

 28265254 GCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCA 28265313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCA 3480

 28265314 AGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCC 28265373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCC 3540

 28265374 TCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGA 28265433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGA 3600

 28265434 TATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACA 28265493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACA 3660

 28265494 AATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAAC 28265553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAAC 3720

 28265554 TCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCT 28265613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCT 3780

 28265614 CAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAAC 28265673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAAC 3840

 28265674 AGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAG 28265733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAG 3900

 28265734 TAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTT 28265793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTT 3960

 28265794 GATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAA 28265853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAA 4020

 28265854 ACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG 28265913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAG 4080

 28265914 GCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCA 28265973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCA 4140

 28265974 TCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCT 28266033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCT 4200

 28266034 ACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCC 28266093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCC 4260

 28266094 GAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAA 28266153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAA 4320

 28266154 AGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAA 28266213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAA 4380

 28266214 AATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAA 28266273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAA 4440

 28266274 GCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAA 28266333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAA 4500

 28266334 TGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTAC 28266393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTAC 4560

 28266394 AGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTT 28266453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTT 4620

 28266454 TGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAG 28266513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAG 4680

 28266514 GAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGT 28266573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGT 4740

 28266574 CCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAA 28266633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAA 4800

 28266634 ATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGG 28266693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGG 4860

 28266694 TGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCT 28266753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCT 4920

 28266754 TCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGA 28266813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGA 4980

 28266814 ATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCAC 28266873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCAC 5040

 28266874 ACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCA 28266933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCA 5100

 28266934 CCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGT 28266993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGT 5160

 28266994 TTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGG 28267053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGG 5220

 28267054 GATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCA 28267113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCA 5280

 28267114 TCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTT 28267173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTT 5340

 28267174 GAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAAC 28267233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAAC 5400

 28267234 CCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAA 28267293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAA 5460

 28267294 TGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGA 28267353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGA 5520

 28267354 TTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGA 28267413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGA 5580

 28267414 TGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGG 28267473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGG 5640

 28267474 TGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGT 28267533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGT 5700

 28267534 TTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAG 28267593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAG 5760

 28267594 ATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCA 28267653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCA 5820

 28267654 AAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCT 28267713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCT 5880

 28267714 AGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAG 28267773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAG 5940

 28267774 CATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAG 28267833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAG 6000

 28267834 TCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTT 28267893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTT 6060

 28267894 ATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGG 28267953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGG 6120

 28267954 CCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTG 28268013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 CCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTG 6180

 28268014 TAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGC 28268073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGC 6240

 28268074 ACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGT 28268133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGT 6300

 28268134 CTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGT 28268193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGT 6360

 28268194 CAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCG 28268253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCG 6420

 28268254 GGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACC 28268313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 GGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACC 6480

 28268314 AGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTAC 28268373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 AGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTAC 6540

 28268374 CTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATA 28268433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATA 6600

 28268434 TGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAAT 28268493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAAT 6660

 28268494 TTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCT 28268553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCT 6720

 28268554 TTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGA 28268613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGA 6780

 28268614 TAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTG 28268673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTG 6840

 28268674 CTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAG 28268733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAG 6900

 28268734 AATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCAT 28268793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCAT 6960

 28268794 CTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATAT 28268853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATAT 7020

 28268854 GGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATT 28268913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 GGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATT 7080

 28268914 TTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTC 28268973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTC 7140

 28268974 TATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGC 28269033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGC 7200

 28269034 TGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCT 28269093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCT 7260

 28269094 TTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTC 28269153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTC 7320

 28269154 TGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGA 28269213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGA 7380

 28269214 AAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCAT 28269273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 AAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCAT 7440

 28269274 GTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCT 28269333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 GTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCT 7500

 28269334 TTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTG 28269393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 TTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTG 7560

 28269394 TCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGC 28269453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 TCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGC 7620

 28269454 ACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTG 28269513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 ACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTG 7680

 28269514 AGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTAC 28269573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 AGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTAC 7740

 28269574 ATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTA 28269633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 ATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTA 7800

 28269634 TGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTT 28269693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 TGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTT 7860

 28269694 GAAAGGA 28269700
          |||||||
     7861 GAAAGGA 7867

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7869 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 7928

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7929 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 7988

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7989 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 8048

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8049 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 8108

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8109 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 8168

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8169 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 8228

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8229 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 8288

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8289 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 8348

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8349 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 8408

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8409 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 8468

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8469 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 8528

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8529 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 8588

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8589 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 8648

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8649 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 8708

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8709 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 8768

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8769 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 8828

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8829 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 8888

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8889 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 8948

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8949 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 9008

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9009 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 9068

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9069 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 9128

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9129 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 9188

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9189 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 9248

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9249 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 9308

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9309 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 9368

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9369 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 9428

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAA 28271287
          ||||||||||||||||||||||||||
     9429 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAA 9454

Alignment time is 11.4957 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    7494] =>      7494 nucs 'mol-32-314e-198983_7494'

Score:        6925
Aligned:      7515        nucs
Identic:      7445 ( 99%) nucs =>      3570 ( 99%)      3875 ( 99%)
Gaps:           26 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264542,28268139] EXCISED REGION [28269049,28272960]
 second seq =>  [       1,    3597] EXCISED REGION [    3598,    7494]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264542 AGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 28264601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 60

 28264602 CAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 28264660
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 120

 28264661 CACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCC 28264720
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      121 CACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCC 180

 28264721 TCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTC 28264780
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      181 TCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTC 240

 28264781 TACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGA 28264840
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      241 TACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGA 300

 28264841 CTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAG 28264900
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAG 360

 28264901 CAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAG 28264960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAG 420

 28264961 ATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTAC 28265020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTAC 480

 28265021 AAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAG 28265080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAG 540

 28265081 AACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGAT 28265140
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      541 AACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGAT 600

 28265141 GATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAAT 28265200
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      601 GATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAAT 660

 28265201 AAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAG 28265260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAG 720

 28265261 GGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGG 28265320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGG 780

 28265321 AGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTT 28265380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTT 840

 28265381 TGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCC 28265440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCC 900

 28265441 AAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAA 28265500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAA 960

 28265501 AAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAAT 28265560
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      961 AAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAAT 1020

 28265561 TCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGA 28265620
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1021 TCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGA 1080

 28265621 AAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGA 28265680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGA 1140

 28265681 AAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATC 28265740
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATC 1200

 28265741 ATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAA 28265800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAA 1260

 28265801 AAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTA 28265860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTA 1320

 28265861 AGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTG 28265920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTG 1380

 28265921 GATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTA 28265979
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     1381 GATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTA 1440

 28265980 CCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGG 28266039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1441 CCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGG 1500

 28266040 GAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATC 28266099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1501 GAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATC 1560

 28266100 ATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTA 28266158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     1561 ATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTA 1620

 28266159 TAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAA 28266218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAA 1680

 28266219 TGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTAT 28266278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTAT 1740

 28266279 GCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTC 28266338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTC 1800

 28266339 CAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTT 28266398
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTT 1860

 28266399 AGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGA 28266458
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGA 1920

 28266459 GTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATC 28266518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATC 1980

 28266519 TAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGA 28266578
          |||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGA 2040

 28266579 AGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTAC 28266638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTAC 2100

 28266639 AGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTT 28266698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTT 2160

 28266699 GGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGA 28266758
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||
     2161 GGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGA 2216

 28266759 GATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCA 28266818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCA 2276

 28266819 TTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACT 28266878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACT 2336

 28266879 GCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAA 28266938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAA 2396

 28266939 TAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGA 28266998
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGA 2456

 28266999 ACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCA 28267058
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCA 2516

 28267059 CATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTA 28267118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTA 2576

 28267119 TGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGT 28267178
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2577 TGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGT 2636

 28267179 GATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGG 28267238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGG 2696

 28267239 GGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAAT 28267298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAAT 2756

 28267299 GACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTA 28267358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTA 2816

 28267359 GCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACA 28267418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 GCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACA 2876

 28267419 TATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGT 28267478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGT 2936

 28267479 GTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAA 28267538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAA 2996

 28267539 GAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTT 28267598
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTT 3056

 28267599 TTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATA 28267658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATA 3116

 28267659 TTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTA 28267718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTA 3176

 28267719 TATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCA 28267778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3177 TATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCA 3236

 28267779 TACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCC 28267838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCC 3296

 28267839 AGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAG 28267898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAG 3356

 28267899 TGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCC 28267958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCC 3416

 28267959 AGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTA 28268018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTA 3476

 28268019 TTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACC 28268076
          |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACC 3534

 28268077 TAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTT 28268136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 TAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTT 3594

 28268137 TTT 28268139
          |||
     3595 TTT 3597

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3657

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3717

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3777

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3837

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3838 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3897

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3957

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 4017

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4018 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 4076

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4122

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4182

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4183 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4242

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 4302

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 4362

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4422

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4482

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4483 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4542

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4543 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4602

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4662

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4663 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4722

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4782

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4842

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4902

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4903 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 4962

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 5022

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 5082

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 5142

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 5202

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5203 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 5262

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 5322

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 5382

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 5442

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 5502

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 5562

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5563 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 5622

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5623 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 5682

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5683 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 5742

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 5802

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 5862

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 5922

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 5982

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 6042

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 6102

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 6162

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 6222

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 6282

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 6342

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 6402

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 6462

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 6522

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 6582

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 6642

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 6702

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 6762

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 6822

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 6882

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 6942

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6943 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 7002

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 7062

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 7122

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 7182

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 7242

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7243 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 7302

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 7362

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 7422

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7423 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 7482

 28272949 GTTGATGAGTGG 28272960
          ||||||||||||
     7483 GTTGATGAGTGG 7494

Alignment time is 9.38477 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3601] =>      3601 nucs 'mol-32-314e-198983_3601'

Score:        3311
Aligned:      3603        nucs
Identic:      3574 ( 99%) nucs =>      2161 ( 99%)      1413 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264542,28266719] EXCISED REGION [28266724,28268143]
 second seq =>  [       1,    2181] EXCISED REGION [    2182,    3601]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28266720,28266723]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [28268022,28268023]
 second seq =>         2 nucs [3480,3481]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [28266720,28266737] to [28266724,28266741]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264542 AGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 28264601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 60

 28264602 CAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 28264660
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 120

 28264661 CACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCC 28264720
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      121 CACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCC 180

 28264721 TCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTC 28264780
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      181 TCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTC 240

 28264781 TACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGA 28264840
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      241 TACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGA 300

 28264841 CTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAG 28264900
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAG 360

 28264901 CAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAG 28264960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAG 420

 28264961 ATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTAC 28265020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTAC 480

 28265021 AAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAG 28265080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAG 540

 28265081 AACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGAT 28265140
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      541 AACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGAT 600

 28265141 GATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAAT 28265200
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      601 GATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAAT 660

 28265201 AAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAG 28265260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAG 720

 28265261 GGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGG 28265320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGG 780

 28265321 AGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTT 28265380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTT 840

 28265381 TGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCC 28265440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCC 900

 28265441 AAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAA 28265500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAA 960

 28265501 AAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAAT 28265560
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      961 AAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAAT 1020

 28265561 TCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGA 28265620
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1021 TCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGA 1080

 28265621 AAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGA 28265680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGA 1140

 28265681 AAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATC 28265740
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATC 1200

 28265741 ATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAA 28265800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAA 1260

 28265801 AAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTA 28265860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTA 1320

 28265861 AGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTG 28265920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTG 1380

 28265921 GATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTA 28265979
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     1381 GATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTA 1440

 28265980 CCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGG 28266039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1441 CCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGG 1500

 28266040 GAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATC 28266099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1501 GAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATC 1560

 28266100 ATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTA 28266158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     1561 ATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTA 1620

 28266159 TAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAA 28266218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAA 1680

 28266219 TGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTAT 28266278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTAT 1740

 28266279 GCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTC 28266338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTC 1800

 28266339 CAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTT 28266398
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTT 1860

 28266399 AGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGA 28266458
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGA 1920

 28266459 GTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATC 28266518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATC 1980

 28266519 TAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGA 28266578
          |||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGA 2040

 28266579 AGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTAC 28266638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTAC 2100

 28266639 AGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTT 28266698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTT 2160

 28266699 GGTTAAAGTGCATACAAGGTC 28266719
          |||||||||||||||||||||
     2161 GGTTAAAGTGCATACAAGGTC 2181

EXCISED REGION

 28266724 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 28266783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 2241

 28266784 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 28266843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 2301

 28266844 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 28266903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 2361

 28266904 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTT 28266963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2362 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTT 2421

 28266964 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 28267023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2422 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 2481

 28267024 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 28267083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 2541

 28267084 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 28267143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 2601

 28267144 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 28267203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2602 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 2661

 28267204 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 28267263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 2721

 28267264 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 28267323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 2781

 28267324 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 28267383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 2841

 28267384 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 28267443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 2901

 28267444 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 28267503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 2961

 28267504 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAAC 28267563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2962 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAAC 3021

 28267564 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 28267623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 3081

 28267624 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 28267683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 3141

 28267684 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 28267743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 3201

 28267744 TGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 28267803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 3261

 28267804 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 28267863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 3321

 28267864 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 28267923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 3381

 28267924 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 28267983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 3441

 28267984 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     3442 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCA 3499

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 3559

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 3601

Alignment time is 4.75821 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2637] =>      2637 nucs 'mol-32-3164-135024_2637'

Score:        2431
Aligned:      2658        nucs
Identic:      2621 ( 99%) nucs =>      1463 ( 99%)      1158 ( 98%)
Gaps:           23 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266666,28268139] EXCISED REGION [28269049,28270230]
 second seq =>  [       1,    1470] EXCISED REGION [    1471,    2637]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266666 ATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATA 28266725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATA 60

 28266726 AATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACC 28266785
          ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACC 116

 28266786 CGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTAT 28266845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      117 CGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTAT 176

 28266846 ATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGA 28266905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 ATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGA 236

 28266906 AGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCC 28266965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      237 AGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCC 296

 28266966 TATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGT 28267025
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      297 TATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGT 356

 28267026 TGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGA 28267085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 TGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGA 416

 28267086 TGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGG 28267145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGG 476

 28267146 AGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAAT 28267205
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      477 AGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAAT 536

 28267206 TGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGG 28267265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 TGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGG 596

 28267266 CTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCT 28267325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 CTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCT 656

 28267326 CAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATAT 28267385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 CAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATAT 716

 28267386 CTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGC 28267445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 CTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGC 776

 28267446 CTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAAT 28267505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 CTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAAT 836

 28267506 TGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAG 28267565
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      837 TGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAG 896

 28267566 TCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCA 28267625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCA 956

 28267626 TTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTC 28267685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTC 1016

 28267686 AGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTG 28267745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 AGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTG 1076

 28267746 CAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTC 28267805
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 CAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTC 1136

 28267806 CGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCC 28267865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCC 1196

 28267866 ATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTG 28267925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 ATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTG 1256

 28267926 TTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGAT 28267985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGAT 1316

 28267986 ATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACG 28268043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||
     1317 ATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACG 1374

 28268044 TTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTG 28268103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTG 1434

 28268104 CAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 CAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 1470

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 1530

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 1590

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 1650

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 1710

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1711 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 1770

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 1830

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 1890

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1891 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 1949

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 1995

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 2055

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2056 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 2115

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 2175

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 2235

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 2295

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 2355

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2356 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 2415

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     2416 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 2475

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 2535

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2536 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 2595

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACT 28270230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACT 2637

Alignment time is 3.82104 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4716] =>      4716 nucs 'mol-32-3164-254806_4716'

Score:        4417
Aligned:      4731        nucs
Identic:      4691 ( 99%) nucs =>       106 (100%)      4585 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268034,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273673]
 second seq =>  [       1,     106] EXCISED REGION [     107,    4716]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268034 ATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTC 28268093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTC 60

 28268094 TTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 106

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      107 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 166

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      167 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 226

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      227 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 286

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      287 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 346

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      347 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 406

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      407 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 466

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 526

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      527 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 585

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 631

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 691

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      692 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 751

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 811

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 871

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 931

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 991

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      992 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 1051

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     1052 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 1111

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 1171

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1172 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 1231

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 1291

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 1351

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 1411

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1412 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 1471

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 1531

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 1591

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 1651

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 1711

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1712 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 1771

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 1831

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 1891

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 1951

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 2011

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 2071

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2072 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 2131

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2132 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 2191

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2192 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 2251

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 2311

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 2371

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 2431

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 2491

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 2551

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 2611

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 2671

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 2731

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 2791

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 2851

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 2911

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 2971

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 3031

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 3091

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 3151

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 3211

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 3271

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 3331

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 3391

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 3451

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3452 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 3511

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 3571

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 3631

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 3691

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 3751

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 3811

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 3871

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 3931

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3932 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 3991

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 4051

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 4111

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 4171

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4172 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 4231

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 4291

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 28273308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 4351

 28273309 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 28273368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 4411

 28273369 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 28273428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 4471

 28273429 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 28273488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 4531

 28273489 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 28273548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 4591

 28273549 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAACC 28273608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4592 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAACC 4651

 28273609 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 28273668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 4711

 28273669 CATTT 28273673
          |||||
     4712 CATTT 4716

Alignment time is 6.28087 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    7226] =>      7226 nucs 'mol-32-316f-258801_7226'

Score:        7215
Aligned:      7226        nucs
Identic:      7225 (100%) nucs =>      3144 (100%)      4081 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266557,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273783]
 second seq =>  [       1,    3144] EXCISED REGION [    3146,    7226]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [3145,3145]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [28273272,28273272]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [3144,3144] to [3146,3146]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266557 AATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTA 28266616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTA 60

 28266617 GATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAAC 28266676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAAC 120

 28266677 CTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAAT 28266736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAAT 180

 28266737 AAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATG 28266796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATG 240

 28266797 GAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTC 28266856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTC 300

 28266857 TCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGG 28266916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGG 360

 28266917 ATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAA 28266976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAA 420

 28266977 CTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGG 28267036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGG 480

 28267037 AGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTA 28267096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTA 540

 28267097 CCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTG 28267156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTG 600

 28267157 GTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGG 28267216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGG 660

 28267217 AGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTT 28267276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTT 720

 28267277 TGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGAT 28267336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGAT 780

 28267337 GTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATT 28267396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATT 840

 28267397 AATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCAT 28267456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCAT 900

 28267457 GTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTG 28267516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTG 960

 28267517 TTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAA 28267576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAA 1020

 28267577 ATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCA 28267636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCA 1080

 28267637 GGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACAT 28267696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACAT 1140

 28267697 GTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCT 28267756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCT 1200

 28267757 CTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTT 28267816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTT 1260

 28267817 CCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCC 28267876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCC 1320

 28267877 ATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCA 28267936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCA 1380

 28267937 ATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATT 28267996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATT 1440

 28267997 CTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCA 28268056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCA 1500

 28268057 ATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGC 28268116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGC 1560

 28268117 ATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAG 28268176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAG 1620

 28268177 TAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAAC 28268236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAAC 1680

 28268237 TGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTT 28268296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTT 1740

 28268297 TTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGA 28268356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGA 1800

 28268357 CTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATA 28268416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATA 1860

 28268417 TGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGT 28268476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGT 1920

 28268477 TCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGA 28268536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGA 1980

 28268537 TTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTG 28268596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTG 2040

 28268597 TCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATC 28268656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATC 2100

 28268657 CCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTC 28268716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTC 2160

 28268717 CCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACT 28268776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACT 2220

 28268777 CTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGT 28268836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGT 2280

 28268837 TATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCA 28268896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCA 2340

 28268897 TTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGC 28268956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGC 2400

 28268957 TTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATAC 28269016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATAC 2460

 28269017 CATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCT 28269076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCT 2520

 28269077 TTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAA 28269136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAA 2580

 28269137 TAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAAT 28269196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAAT 2640

 28269197 ATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGT 28269256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGT 2700

 28269257 ATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGT 28269316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGT 2760

 28269317 TCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTA 28269376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTA 2820

 28269377 TTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAA 28269436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAA 2880

 28269437 ATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCA 28269496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCA 2940

 28269497 GCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAAT 28269556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAAT 3000

 28269557 GCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTT 28269616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTT 3060

 28269617 GAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGG 28269676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGG 3120

 28269677 CTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          ||||||||||||||||||||||||
     3121 CTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 3144

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 3205

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 3265

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 3325

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 3385

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 3445

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 3505

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 3565

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 3625

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 3685

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 3745

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 3805

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 3865

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 3925

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 3985

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 4045

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 4105

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 4165

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 4225

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 4285

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 4345

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 4405

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 4465

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 4525

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 4585

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 4645

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 4705

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 4765

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 4825

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 4885

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 4945

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 5005

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 5065

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 5125

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 5185

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 5245

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 5305

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 5365

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 5425

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 5485

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 5545

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 5605

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 5665

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 5725

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 5785

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 5845

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 5905

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 5965

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 6025

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 6085

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 6145

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 6205

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 6265

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 6325

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 6385

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 6445

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 6505

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 6565

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 6625

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 6685

 28273242 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 28273301
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     6686 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 6744

 28273302 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 28273361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 6804

 28273362 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 28273421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 6864

 28273422 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 28273481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 6924

 28273482 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 28273541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6925 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 6984

 28273542 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 28273601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6985 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 7044

 28273602 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 28273661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7045 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 7104

 28273662 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 28273721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7105 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 7164

 28273722 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 28273781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7165 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 7224

 28273782 CC 28273783
          ||
     7225 CC 7226

Alignment time is 9.06166 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5615] =>      5615 nucs 'mol-32-3185-026059_5615'

Score:        5169
Aligned:      5627        nucs
Identic:      5569 ( 99%) nucs =>      3052 ( 99%)      2517 ( 99%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265066,28268139] EXCISED REGION [28269049,28271597]
 second seq =>  [      10,    3081] EXCISED REGION [    3082,    5615]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265066 GAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAG 28265125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 GAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAG 69

 28265126 TAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACT 28265185
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 TAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACT 129

 28265186 GGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAA 28265245
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 GGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAA 189

 28265246 TAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCA 28265305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 TAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCA 249

 28265306 GAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTG 28265365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 GAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTG 309

 28265366 AAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATAC 28265425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 AAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATAC 369

 28265426 AAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAAC 28265485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 AAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAAC 429

 28265486 TAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTG 28265545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      430 TAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTG 489

 28265546 CTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAA 28265605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 CTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAA 549

 28265606 GATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACT 28265665
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 GACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACT 609

 28265666 CTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGT 28265725
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      610 CTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGT 669

 28265726 GGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAA 28265785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 GGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAA 729

 28265786 TTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAA 28265845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAA 789

 28265846 TATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 28265905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 TATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 849

 28265906 AGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGAT 28265965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 AGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGAT 909

 28265966 GAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTG 28266024
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 GAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTG 969

 28266025 ATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTG 28266084
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 ATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTG 1029

 28266085 CAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTC 28266144
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 CAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTC 1089

 28266145 AAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCA 28266203
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 AAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCA 1149

 28266204 GAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACC 28266263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 GAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACC 1209

 28266264 ATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAA 28266323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 ATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAA 1269

 28266324 TTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGG 28266383
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1270 TTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGG 1329

 28266384 AGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACA 28266443
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACA 1389

 28266444 GAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAG 28266503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 GAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAG 1449

 28266504 AGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTG 28266563
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||
     1450 AGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTG 1509

 28266564 ATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTA 28266623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 ATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTA 1569

 28266624 GAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAA 28266683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 GAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAA 1629

 28266684 AAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGG 28266743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||
     1630 AAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GG 1685

 28266744 CATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCT 28266803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 CATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCT 1745

 28266804 ATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAA 28266863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 ATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAA 1805

 28266864 GAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCT 28266923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 GAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCT 1865

 28266924 CACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAG 28266983
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAG 1925

 28266984 CTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGC 28267043
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 CTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGC 1985

 28267044 TTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCC 28267103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCC 2045

 28267104 ATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTAC 28267163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 ATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTAC 2105

 28267164 CCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTA 28267223
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 CCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTA 2165

 28267224 TGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCC 28267283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCC 2225

 28267284 CCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCA 28267343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCA 2285

 28267344 GTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGC 28267403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGC 2345

 28267404 TATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATA 28267463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 TATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATA 2405

 28267464 TCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTT 28267523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTT 2465

 28267524 AATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTG 28267583
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 AATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTG 2525

 28267584 TTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTT 28267643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 TTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTT 2585

 28267644 TCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGG 28267703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGG 2645

 28267704 TTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCC 28267763
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2646 TTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCC 2705

 28267764 AGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTC 28267823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 AGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTC 2765

 28267824 CCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTA 28267883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 CCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTA 2825

 28267884 GCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTT 28267943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 GCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTT 2885

 28267944 AGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTT 28268003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 AGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTT 2945

 28268004 TATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCA 28268061
          ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 TATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCA 3003

 28268062 CTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCA 28268121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 CTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCA 3063

 28268122 ACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||
     3064 ACATGTTTGTGTCTTTTT 3081

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3141

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3201

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3261

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3321

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3322 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3381

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3441

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 3501

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3502 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 3560

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 3606

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 3666

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3667 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 3726

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 3786

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 3846

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 3906

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 3966

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3967 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4026

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4027 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4086

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4146

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4147 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4206

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4266

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4326

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4386

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4387 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 4446

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 4506

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 4566

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 4626

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 4686

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4687 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 4746

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 4806

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 4866

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 4926

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 4986

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 5046

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5047 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 5106

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5107 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 5166

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5167 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 5226

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 5286

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 5346

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 5406

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 5466

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 5526

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 5586

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGA 28271597
          |||||||||||||||||||||||||||||
     5587 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGA 5615

Alignment time is 7.01702 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2534] =>      2534 nucs 'mol-32-3185-026059_2534'

Score:        2347
Aligned:      2534        nucs
Identic:      2517 ( 99%) nucs =>       478 (100%)      2039 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28269049,28269527] EXCISED REGION [28269543,28271597]
 second seq =>  [       1,     479] EXCISED REGION [     480,    2534]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [28269528,28269542]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28269528,28269531] to [28269543,28269546]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [28269526,28269527] to [28269543,28269544]
 second seq =>         2 nucs [478,479] to [480,481]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 60

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 120

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 180

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 240

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      241 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 300

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 360

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 420

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA 28269527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA 479

EXCISED REGION

 28269543 AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGA 28269602
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      480 AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACTGA 539

 28269603 AGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTC 28269662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTC 599

 28269663 TTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTT 28269722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      600 TTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTT 659

 28269723 GGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTT 28269782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTT 719

 28269783 GACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGC 28269842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGC 779

 28269843 TAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCC 28269902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      780 TAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCTTTGTCTTGTTCC 839

 28269903 AGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATG 28269962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATG 899

 28269963 CTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCT 28270022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      900 CTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCTTTGATGCCCAGTCT 959

 28270023 CTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTAC 28270082
          ||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      960 CTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGATTTTTCTGTGTCTAC 1019

 28270083 TGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTC 28270142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTC 1079

 28270143 ACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAA 28270202
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAA 1139

 28270203 CTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACC 28270262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACC 1199

 28270263 ATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAA 28270322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAA 1259

 28270323 AACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATAT 28270382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATAT 1319

 28270383 TCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGC 28270442
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1320 TCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGC 1379

 28270443 ATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCG 28270502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCG 1439

 28270503 TAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAAT 28270562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAAT 1499

 28270563 AGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCAC 28270622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1500 AGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAATGTGGTTTCCAC 1559

 28270623 TTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTAC 28270682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTAC 1619

 28270683 AGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTT 28270742
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTT 1679

 28270743 TATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTG 28270802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTG 1739

 28270803 GCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATC 28270862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATC 1799

 28270863 TTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTT 28270922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTT 1859

 28270923 GCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTC 28270982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTC 1919

 28270983 CTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATG 28271042
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATG 1979

 28271043 CACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCC 28271102
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCC 2039

 28271103 AAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATT 28271162
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2040 AAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTTACTTTAATTGGATT 2099

 28271163 TCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCC 28271222
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCC 2159

 28271223 TAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAA 28271282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAA 2219

 28271283 CCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATG 28271342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATG 2279

 28271343 GGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCC 28271402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCC 2339

 28271403 AGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCT 28271462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCT 2399

 28271463 GTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATAT 28271522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATAT 2459

 28271523 GGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGT 28271582
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGT 2519

 28271583 AGCTTCATAAAATGA 28271597
          |||||||||||||||
     2520 AGCTTCATAAAATGA 2534

Alignment time is 3.64569 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4415] =>      4415 nucs 'mol-32-3185-265634_4415'

Score:        4415
Aligned:      4415        nucs
Identic:      4415 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264904,28269318]
 second seq =>  [       1,    4415]

 28264904 GATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATG 28264963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATG 60

 28264964 TTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAA 28265023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAA 120

 28265024 TACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAAC 28265083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAAC 180

 28265084 CAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGAT 28265143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGAT 240

 28265144 TTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAA 28265203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAA 300

 28265204 AATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGA 28265263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGA 360

 28265264 CCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGA 28265323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGA 420

 28265324 AAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGG 28265383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGG 480

 28265384 CAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAA 28265443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAA 540

 28265444 TAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAG 28265503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAG 600

 28265504 AAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCT 28265563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCT 660

 28265564 ATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAG 28265623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAG 720

 28265624 GAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAA 28265683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAA 780

 28265684 TAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATG 28265743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATG 840

 28265744 GGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAA 28265803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAA 900

 28265804 TTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGA 28265863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGA 960

 28265864 GCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGAT 28265923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGAT 1020

 28265924 CACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAA 28265983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAA 1080

 28265984 AAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGG 28266043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGG 1140

 28266044 CTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGC 28266103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGC 1200

 28266104 CACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAAT 28266163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAAT 1260

 28266164 AGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACA 28266223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACA 1320

 28266224 TCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAA 28266283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAA 1380

 28266284 GAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAA 28266343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAA 1440

 28266344 CCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAG 28266403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAG 1500

 28266404 TGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAA 28266463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAA 1560

 28266464 ATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAA 28266523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAA 1620

 28266524 TGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACT 28266583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACT 1680

 28266584 AGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATT 28266643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATT 1740

 28266644 AAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTA 28266703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTA 1800

 28266704 AAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGG 28266763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGG 1860

 28266764 CAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTAT 28266823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTAT 1920

 28266824 GTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTT 28266883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTT 1980

 28266884 GCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTC 28266943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTC 2040

 28266944 TTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCT 28267003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCT 2100

 28267004 TAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGA 28267063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGA 2160

 28267064 ATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCA 28267123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCA 2220

 28267124 CTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTG 28267183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTG 2280

 28267184 ATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACT 28267243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACT 2340

 28267244 CTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAG 28267303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAG 2400

 28267304 TTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCAT 28267363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCAT 2460

 28267364 TCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGA 28267423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGA 2520

 28267424 TGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTA 28267483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTA 2580

 28267484 AGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTT 28267543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTT 2640

 28267544 CTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCC 28267603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCC 2700

 28267604 CAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATT 28267663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATT 2760

 28267664 TTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCG 28267723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCG 2820

 28267724 TATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCA 28267783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCA 2880

 28267784 AAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCC 28267843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCC 2940

 28267844 TATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGA 28267903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGA 3000

 28267904 ACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTG 28267963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTG 3060

 28267964 CATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA 28268023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA 3120

 28268024 TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTT 28268083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTT 3180

 28268084 ATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 3240

 28268144 GAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAG 28268203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAG 3300

 28268204 CTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTT 28268263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTT 3360

 28268264 ACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTT 28268323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTT 3420

 28268324 GTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGG 28268383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGG 3480

 28268384 TTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGG 28268443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGG 3540

 28268444 CTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGG 28268503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGG 3600

 28268504 GTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATA 28268563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATA 3660

 28268564 GTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTT 28268623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTT 3720

 28268624 TGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGA 28268683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGA 3780

 28268684 CATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTT 28268743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTT 3840

 28268744 CCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAA 28268803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAA 3900

 28268804 TTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAG 28268863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAG 3960

 28268864 CTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACT 28268923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACT 4020

 28268924 TACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTC 28268983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTC 4080

 28268984 CATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGA 28269043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGA 4140

 28269044 AGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTC 28269103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTC 4200

 28269104 AGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAAT 28269163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAAT 4260

 28269164 GATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCC 28269223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCC 4320

 28269224 ATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGT 28269283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGT 4380

 28269284 CATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTC 28269318
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTC 4415

Alignment time is 4.88564 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5968] =>      5968 nucs 'mol-32-3185-277027_5968'

Score:        5553
Aligned:      5989        nucs
Identic:      5933 ( 99%) nucs =>      1722 ( 99%)      4211 ( 99%)
Gaps:           24 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266405,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273299]
 second seq =>  [       1,    1731] EXCISED REGION [    1732,    5968]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266405 GTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAA 28266464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAA 60

 28266465 TTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAAT 28266524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAAT 120

 28266525 GATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTA 28266584
          |||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTA 180

 28266585 GAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTA 28266644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTA 240

 28266645 AATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAA 28266704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAA 300

 28266705 AGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGC 28266764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||
      301 AGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGC 356

 28266765 AGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATG 28266824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 AGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATG 416

 28266825 TTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTG 28266884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTG 476

 28266885 CAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCT 28266944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 CAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCT 536

 28266945 TCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTT 28267004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      537 TCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTT 596

 28267005 AGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAA 28267064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 AGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAA 656

 28267065 TGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCAC 28267124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCAC 716

 28267125 TGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGA 28267184
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      717 TGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGA 776

 28267185 TTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTC 28267244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTC 836

 28267245 TCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGT 28267304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGT 896

 28267305 TCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATT 28267364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATT 956

 28267365 CTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGAT 28267424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGAT 1016

 28267425 GTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAA 28267484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAA 1076

 28267485 GTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTC 28267544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTC 1136

 28267545 TTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCC 28267604
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCC 1196

 28267605 AGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTT 28267664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 AGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTT 1256

 28267665 TTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGT 28267724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGT 1316

 28267725 ATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAA 28267784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1317 ATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAA 1376

 28267785 AGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCT 28267844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 AGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCT 1436

 28267845 ATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAA 28267904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAA 1496

 28267905 CACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGC 28267964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 CACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGC 1556

 28267965 ATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA- 28268023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
     1557 ATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--T 1614

 28268024 -TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTT 28268082
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 GTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTT 1674

 28268083 TATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 1731

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 1791

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 1851

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 1911

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 1971

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1972 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 2031

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 2091

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 2151

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2152 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 2210

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 2256

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 2316

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2317 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 2376

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 2436

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 2496

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 2556

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 2616

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2617 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 2676

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     2677 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 2736

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 2796

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2797 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 2856

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 2916

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 2976

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 3036

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3037 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 3096

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 3156

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 3216

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 3276

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 3336

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3337 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 3396

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 3456

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 3516

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 3576

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 3636

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 3696

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3697 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 3756

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3757 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 3816

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3817 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 3876

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 3936

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 3996

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 4056

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 4116

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 4176

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 4236

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 4296

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 4356

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 4416

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 4476

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 4536

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 4596

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 4656

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 4716

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 4776

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 4836

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 4896

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 4956

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 5016

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 5076

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5077 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 5136

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 5196

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 5256

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 5316

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 5376

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 5436

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 5496

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 5556

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5557 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 5616

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 5676

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 5736

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 5796

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5797 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 5856

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 5916

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCA-TTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGT 28273299
          |||||||||||||||||||| ||.||||||||||||||||||||||||||||
     5917 CATAGATTATACCTTTGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGT 5968

Alignment time is 7.57431 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5374] =>      5374 nucs 'mol-32-3235-036442_5374'

Score:        5038
Aligned:      5391        nucs
Identic:      5345 ( 99%) nucs =>       583 ( 99%)      4762 ( 99%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28267554,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273851]
 second seq =>  [       1,     586] EXCISED REGION [     587,    5374]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28267554 TTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGG 28267613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGG 60

 28267614 TTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTT 28267673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTT 120

 28267674 TATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTG 28267733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTG 180

 28267734 AGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAAT 28267793
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAAT 240

 28267794 TTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCC 28267853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCC 300

 28267854 ATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTA 28267913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTA 360

 28267914 TTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTT 28267973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTT 420

 28267974 GCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTAT 28268031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||
      421 GCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTAT 478

 28268032 ATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATG 28268091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 ATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATG 538

 28268092 TCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 586

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 646

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 706

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 766

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 826

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      827 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 886

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 946

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 1006

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1007 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 1065

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 1111

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 1171

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1172 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 1231

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 1291

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 1351

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 1411

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 1471

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1472 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 1531

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     1532 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 1591

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 1651

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1652 ACATTTATTGATTCACATATGTTAAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 1711

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 1771

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 1831

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 1891

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1892 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 1951

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 2011

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 2071

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 2131

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 2191

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2192 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 2251

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 2311

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 2371

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 2431

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 2491

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 2551

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2552 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 2611

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2612 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 2671

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2672 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 2731

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 2791

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 2851

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 2911

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 2971

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 3031

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 3091

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 3151

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 3211

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 3271

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 3331

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 3391

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 3451

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 3511

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 3571

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 3631

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 3691

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 3751

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 3811

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 3871

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 3931

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3932 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 3991

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 4051

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 4111

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 4171

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 4231

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 4291

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 4351

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 4411

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4412 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 4471

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 4531

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 4591

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 4651

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4652 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 4711

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4712 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 4771

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 28273308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 4831

 28273309 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 28273368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 4891

 28273369 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 28273428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 4951

 28273429 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 28273488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 5011

 28273489 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 28273548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 5071

 28273549 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAACC 28273608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5072 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAACC 5131

 28273609 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 28273668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 5191

 28273669 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 28273728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 5251

 28273729 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTAT 28273788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTAT 5311

 28273789 ACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 28273848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 ACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 5371

 28273849 TTT 28273851
          |||
     5372 TTT 5374

Alignment time is 6.70096 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6987] =>      6987 nucs 'mol-32-3235-076834_6987'

Score:        6506
Aligned:      7008        nucs
Identic:      6946 ( 99%) nucs =>      2246 ( 99%)      4700 ( 99%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265877,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273789]
 second seq =>  [       1,    2261] EXCISED REGION [    2262,    6987]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265877 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAG 28265936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAG 60

 28265937 GAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAA 28265995
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
       61 GAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAA 120

 28265996 TTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG 28266055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG 180

 28266056 GATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCA 28266115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      181 GATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCA 240

 28266116 ACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATA 28266174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
      241 ACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATA 300

 28266175 AAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTG 28266234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTG 360

 28266235 TGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTC 28266294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTC 420

 28266295 AAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAG 28266354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAG 480

 28266355 CAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCT 28266414
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      481 CAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCT 540

 28266415 GGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAAT 28266474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAAT 600

 28266475 TTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAG 28266534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      601 TTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAG 660

 28266535 ATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGAT 28266594
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGAT 720

 28266595 AGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTC 28266654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTC 780

 28266655 AGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACA 28266714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACA 840

 28266715 AGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGG 28266774
          |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGG 896

 28266775 GAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTG 28266834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTG 956

 28266835 GAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGG 28266894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 GAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGG 1016

 28266895 GGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAA 28266954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1017 GGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAA 1076

 28266955 TTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAG 28267014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1077 TTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAG 1136

 28267015 GTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACA 28267074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACA 1196

 28267075 GAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACA 28267134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACA 1256

 28267135 TGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTAC 28267194
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1257 TGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTAC 1316

 28267195 CAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGC 28267254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGC 1376

 28267255 CTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTT 28267314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTT 1436

 28267315 CCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTG 28267374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 CCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTG 1496

 28267375 TATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATC 28267434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATC 1556

 28267435 TTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCC 28267494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCC 1616

 28267495 TATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATT 28267554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1617 TATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATT 1676

 28267555 TTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGT 28267614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGT 1736

 28267615 TTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTT 28267674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTT 1796

 28267675 ATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGA 28267734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 ATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGA 1856

 28267735 GATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATT 28267794
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 GATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATT 1916

 28267795 TTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCA 28267854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCA 1976

 28267855 TCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTAT 28267914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTAT 2036

 28267915 TTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTG 28267974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 TTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTG 2096

 28267975 CTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATA 28268032
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||
     2097 CTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATA 2154

 28268033 TATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGT 28268092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGT 2214

 28268093 CTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 CTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 2261

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 2321

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 2381

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 2441

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 2501

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2502 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 2561

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 2621

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 2681

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2682 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 2740

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 2786

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 2846

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2847 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 2906

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 2966

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 3026

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 3086

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 3146

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3147 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 3206

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     3207 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 3266

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 3326

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3327 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 3386

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 3446

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 3506

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 3566

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3567 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 3626

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 3686

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 3746

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 3806

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 3866

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3867 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 3926

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 3986

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 4046

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 4106

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 4166

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 4226

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4227 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 4286

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4287 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 4346

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4347 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 4406

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 4466

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 4526

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 4586

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 4646

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 4706

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 4766

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 4826

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 4886

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 4946

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 5006

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 5066

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 5126

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 5186

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 5246

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 5306

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5307 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 5366

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 5426

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5427 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 5486

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5487 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 5546

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5547 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 5606

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5607 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 5666

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 5726

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 5786

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5787 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 5846

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 5906

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 5966

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5967 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 6026

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6027 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 6086

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6087 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 6146

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6147 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 6206

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6207 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 6266

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6267 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 6326

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6327 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 6386

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6387 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 6446

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 28273308
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6447 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACAGAGTCTTGCACTG 6506

 28273309 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 28273368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6507 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 6566

 28273369 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 28273428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6567 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 6626

 28273429 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 28273488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6627 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 6686

 28273489 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 28273548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6687 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6746

 28273549 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAACC 28273608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6747 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAACC 6806

 28273609 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 28273668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6807 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 6866

 28273669 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 28273728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6867 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 6926

 28273729 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTAT 28273788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6927 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTAT 6986

 28273789 A 28273789
          |
     6987 A 6987

Alignment time is 8.60094 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2265] =>      2265 nucs 'mol-32-3235-076834_2265'

Score:        2107
Aligned:      2267        nucs
Identic:      2250 ( 99%) nucs =>       837 ( 99%)      1413 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265877,28266719] EXCISED REGION [28266724,28268143]
 second seq =>  [       1,     845] EXCISED REGION [     846,    2265]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [28266720,28266723]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [28268022,28268023]
 second seq =>         2 nucs [2144,2145]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [28266720,28266737] to [28266724,28266741]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265877 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAG 28265936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAG 60

 28265937 GAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAA 28265995
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
       61 GAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAA 120

 28265996 TTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG 28266055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAG 180

 28266056 GATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCA 28266115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      181 GATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCA 240

 28266116 ACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATA 28266174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
      241 ACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATA 300

 28266175 AAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTG 28266234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTG 360

 28266235 TGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTC 28266294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTC 420

 28266295 AAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAG 28266354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAG 480

 28266355 CAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCT 28266414
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      481 CAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCT 540

 28266415 GGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAAT 28266474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAAT 600

 28266475 TTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAG 28266534
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      601 TTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAG 660

 28266535 ATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGAT 28266594
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGAT 720

 28266595 AGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTC 28266654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTC 780

 28266655 AGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACA 28266714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACA 840

 28266715 AGGTC 28266719
          |||||
      841 AGGTC 845

EXCISED REGION

 28266724 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 28266783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 TAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATA 905

 28266784 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 28266843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 CCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATT 965

 28266844 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 28266903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 ATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCA 1025

 28266904 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTT 28266963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1026 GAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTT 1085

 28266964 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 28267023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1086 CCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTA 1145

 28267024 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 28267083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAA 1205

 28267084 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 28267143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 GATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAA 1265

 28267144 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 28267203
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1266 GGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAA 1325

 28267204 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 28267263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 ATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGT 1385

 28267264 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 28267323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 GGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCT 1445

 28267324 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 28267383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGAT 1505

 28267384 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 28267443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 ATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATAT 1565

 28267444 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 28267503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATA 1625

 28267504 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAAC 28267563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1626 ATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAAC 1685

 28267564 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 28267623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTT 1745

 28267624 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 28267683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGAT 1805

 28267684 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 28267743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGG 1865

 28267744 TGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 28267803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCC 1925

 28267804 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 28267863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGT 1985

 28267864 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 28267923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 CCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTC 2045

 28267924 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 28267983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGG 2105

 28267984 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     2106 ATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCA 2163

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 2223

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 2265

Alignment time is 2.68191 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6137] =>      6137 nucs 'mol-32-3235-093115_6137'

Score:        5708
Aligned:      6100        nucs
Identic:      6048 ( 99%) nucs =>      1571 ( 99%)      4477 ( 99%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266558,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273564]
 second seq =>  [       1,    1578] EXCISED REGION [    1579,    6079]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266558 ATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAG 28266617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAG 60

 28266618 ATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACC 28266677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACC 120

 28266678 TAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA 28266737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA 180

 28266738 AATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGG 28266797
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGG 236

 28266798 AGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCT 28266857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 AGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCT 296

 28266858 CCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGA 28266917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 CCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGA 356

 28266918 TCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAAC 28266977
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      357 TCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAAC 416

 28266978 TTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGA 28267037
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGA 476

 28267038 GAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTAC 28267097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 GAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTAC 536

 28267098 CAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGG 28267157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 CAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGG 596

 28267158 TGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGA 28267217
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 TGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGA 656

 28267218 GGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTT 28267277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 GGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTT 716

 28267278 GCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATG 28267337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 GCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATG 776

 28267338 TTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTA 28267397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTA 836

 28267398 ATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATG 28267457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 ATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATG 896

 28267458 TGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGT 28267517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGT 956

 28267518 TTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAA 28267577
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      957 TTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAA 1016

 28267578 TAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAG 28267637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAG 1076

 28267638 GGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATG 28267697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATG 1136

 28267698 TGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTC 28267757
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1137 TGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTG 1196

 28267758 TCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTC 28267817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTC 1256

 28267818 CTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCA 28267877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 CTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCA 1316

 28267878 TGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAA 28267937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAA 1376

 28267938 TGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTC 28267997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTC 1436

 28267998 TTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCC 28268055
          ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCC 1494

 28268056 AATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTG 28268115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 AATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTG 1554

 28268116 CATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||
     1555 CATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 1578

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 1638

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 1698

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 1758

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 1818

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1819 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 1878

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 1938

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 1998

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1999 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 2057

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 2103

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 2163

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2164 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 2223

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 2283

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 2343

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 2403

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 2463

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2464 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 2523

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     2524 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 2583

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 2643

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2644 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 2703

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 2763

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 2823

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 2883

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2884 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 2943

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 3003

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 3063

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 3123

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 3183

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3184 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 3243

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 3303

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 3363

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 3423

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 3483

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 3543

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3544 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 3603

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3604 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 3663

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3664 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 3723

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 3783

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 3843

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 3903

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 3963

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 4023

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 4083

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 4143

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 4203

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 4263

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 4323

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 4383

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 4443

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 4503

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 4563

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 4623

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 4683

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 4743

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 4803

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 4863

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 4923

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4924 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 4983

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 5043

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 5103

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 5163

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 5223

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 5283

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 5343

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 5403

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5404 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 5463

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 5523

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 5583

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 5643

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5644 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 5703

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 5763

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 28273308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 5823

 28273309 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 28273368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 5883

 28273369 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 28273428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5884 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 5943

 28273429 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 28273488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5944 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 6003

 28273489 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 28273548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6004 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6063

 28273549 CGTGAGCCACCGTGCC 28273564
          ||||||||||||||||
     6064 CGTGAGCCACCGTGCC 6079

Alignment time is 7.18957 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4615] =>      4615 nucs 'mol-32-3235-249769_4615'

Score:        4603
Aligned:      4614        nucs
Identic:      4613 (100%) nucs =>       478 (100%)      4135 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268553,28269030] EXCISED REGION [28269032,28273167]
 second seq =>  [       1,     478] EXCISED REGION [     480,    4615]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269031,28269031]
 second seq =>         1 nucs [479,479]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269030,28269030] to [28269031,28269031]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28268553 TTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTG 28268612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTG 60

 28268613 ATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTT 28268672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTT 120

 28268673 GCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCA 28268732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCA 180

 28268733 GAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCA 28268792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCA 240

 28268793 TCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATA 28268852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATA 300

 28268853 TGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTAT 28268912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTAT 360

 28268913 TTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCT 28268972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCT 420

 28268973 CTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGT 28269030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGT 478

EXCISED REGION

 28269032 GCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTG 28269091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTG 539

 28269092 CTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGT 28269151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGT 599

 28269152 TCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTG 28269211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTG 659

 28269212 GAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCC 28269271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCC 719

 28269272 ATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGAT 28269331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGAT 779

 28269332 CTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTG 28269391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTG 839

 28269392 TGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAG 28269451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAG 899

 28269452 GCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAG 28269511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAG 959

 28269512 TGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGT 28269571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGT 1019

 28269572 ACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATT 28269631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATT 1079

 28269632 TATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCC 28269691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCC 1139

 28269692 TTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATA 28269751
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATA 1199

 28269752 GAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTT 28269811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTT 1259

 28269812 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGA 28269871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGA 1319

 28269872 TTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTT 28269931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTT 1379

 28269932 GCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTA 28269991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTA 1439

 28269992 TTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTT 28270051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTT 1499

 28270052 GGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAAT 28270111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAAT 1559

 28270112 TATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAG 28270171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAG 1619

 28270172 GAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTT 28270231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTT 1679

 28270232 TATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTA 28270291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTA 1739

 28270292 TGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTT 28270351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTT 1799

 28270352 AAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTA 28270411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTA 1859

 28270412 CCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACT 28270471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACT 1919

 28270472 GTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAA 28270531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAA 1979

 28270532 GAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAAT 28270591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAAT 2039

 28270592 TCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACAC 28270651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACAC 2099

 28270652 TTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTT 28270711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTT 2159

 28270712 TTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTT 28270771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTT 2219

 28270772 TCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCAC 28270831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCAC 2279

 28270832 TTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTT 28270891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTT 2339

 28270892 CATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTC 28270951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTC 2399

 28270952 CAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCT 28271011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCT 2459

 28271012 CTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTA 28271071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTA 2519

 28271072 AAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTT 28271131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTT 2579

 28271132 TCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAA 28271191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAA 2639

 28271192 CAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCC 28271251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCC 2699

 28271252 AGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGG 28271311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGG 2759

 28271312 GCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAG 28271371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAG 2819

 28271372 AAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATA 28271431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATA 2879

 28271432 CCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGA 28271491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGA 2939

 28271492 GGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTAT 28271551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTAT 2999

 28271552 CTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTC 28271611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTC 3059

 28271612 CTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACAT 28271671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACAT 3119

 28271672 CTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTT 28271731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTT 3179

 28271732 TCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTG 28271791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTG 3239

 28271792 ATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAG 28271851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAG 3299

 28271852 CTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATT 28271911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATT 3359

 28271912 GGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCT 28271971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCT 3419

 28271972 TTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGG 28272031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGG 3479

 28272032 TTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTA 28272091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTA 3539

 28272092 GTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTA 28272151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTA 3599

 28272152 GGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTG 28272211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTG 3659

 28272212 CTATAAGCTTTTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGT 28272271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CTATAAGCTTTTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGT 3719

 28272272 CTCTATATGTTAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTA 28272331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CTCTATATGTTAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTA 3779

 28272332 TAAAGAAAAGAGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCA 28272391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TAAAGAAAAGAGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCA 3839

 28272392 GCATCTTCTTGGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGT 28272451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 GCATCTTCTTGGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGT 3899

 28272452 GGGATCTGGAATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAA 28272511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GGGATCTGGAATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAA 3959

 28272512 TTTCTTAAACAACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTA 28272571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TTTCTTAAACAACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTA 4019

 28272572 GGACAGCACCAAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGC 28272631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 GGACAGCACCAAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGC 4079

 28272632 CCCTCCTCATTTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTT 28272691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 CCCTCCTCATTTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTT 4139

 28272692 TCATTTATCTTAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTC 28272751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TCATTTATCTTAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTC 4199

 28272752 AAGAGCAAGTAGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTG 28272811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AAGAGCAAGTAGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTG 4259

 28272812 ATTTCTATTTTTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTA 28272871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 ATTTCTATTTTTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTA 4319

 28272872 ATTTATTGAGACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTG 28272931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 ATTTATTGAGACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTG 4379

 28272932 TAGATGAGAAGAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATT 28272991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TAGATGAGAAGAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATT 4439

 28272992 GATCGAGTGTTGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTG 28273051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 GATCGAGTGTTGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTG 4499

 28273052 TCTAATGCTGTCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGT 28273111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TCTAATGCTGTCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGT 4559

 28273112 AGATCTGTACTTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTT 28273167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 AGATCTGTACTTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTT 4615

Alignment time is 5.63321 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    6284] =>      6284 nucs 'mol-32-32fb-162353_6284'

Score:        5891
Aligned:      6305        nucs
Identic:      6251 ( 99%) nucs =>      1558 ( 99%)      4693 ( 99%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266571,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273782]
 second seq =>  [       1,    1565] EXCISED REGION [    1566,    6284]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266571 GGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGT 28266630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGT 60

 28266631 TAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCC 28266690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCC 120

 28266691 TGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTT 28266750
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||
      121 TGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTT 176

 28266751 GCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTAC 28266810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 GCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTAC 236

 28266811 AGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAG 28266870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 AGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAG 296

 28266871 CACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATT 28266930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 CACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATT 356

 28266931 GCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCT 28266990
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 GCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCT 416

 28266991 GGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGC 28267050
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 GGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGC 476

 28267051 AGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGG 28267110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 AGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGG 536

 28267111 GCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTT 28267170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 GCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTT 596

 28267171 GTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGG 28267230
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 GTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGG 656

 28267231 AACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAG 28267290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 AACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAG 716

 28267291 CAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTT 28267350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 CAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTT 776

 28267351 GGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCC 28267410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 GGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCC 836

 28267411 TGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTT 28267470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTT 896

 28267471 TGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTG 28267530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTG 956

 28267531 AGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCA 28267590
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 AGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCA 1016

 28267591 AAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGA 28267650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 AAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGA 1076

 28267651 GCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTA 28267710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTA 1136

 28267711 CCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACT 28267770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1137 CCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACT 1196

 28267771 GAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGG 28267830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGG 1256

 28267831 TAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCA 28267890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCA 1316

 28267891 CTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAA 28267950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAA 1376

 28267951 TGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCT 28268010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCT 1436

 28268011 GTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGA 28268068
          |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 GTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGA 1494

 28268069 TGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTT 28268128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTT 1554

 28268129 TGTGTCTTTTT 28268139
          |||||||||||
     1555 TGTGTCTTTTT 1565

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 1625

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 1685

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 1745

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 1805

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1806 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 1865

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 1925

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 1985

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1986 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 2044

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 2090

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 2150

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2151 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 2210

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 2270

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 2330

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 2390

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 2450

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2451 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 2510

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     2511 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 2570

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 2630

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2631 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 2690

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 2750

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 2810

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 2870

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2871 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 2930

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 2990

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 3050

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 3110

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 3170

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3171 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 3230

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 3290

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 3350

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 3410

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 3470

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 3530

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3531 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 3590

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3591 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 3650

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3651 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 3710

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 3770

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 3830

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 3890

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3891 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACGGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 3950

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 4010

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 4070

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 4130

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 4190

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 4250

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 4310

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 4370

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 4430

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 4490

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 4550

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 4610

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 4670

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 4730

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 4790

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 4850

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 4910

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4911 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 4970

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 5030

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 5090

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 5150

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 5210

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 5270

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 5330

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 5390

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5391 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 5450

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 5510

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 5570

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 5630

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5631 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 5690

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 5750

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 28273308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 5810

 28273309 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 28273368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 5870

 28273369 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 28273428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 5930

 28273429 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 28273488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 5990

 28273489 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 28273548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6050

 28273549 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAACC 28273608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6051 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAACC 6110

 28273609 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 28273668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 6170

 28273669 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 28273728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 6230

 28273729 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGAC 28273782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGAC 6284

Alignment time is 7.3983 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4106] =>      4106 nucs 'mol-32-3306-043618_4106'

Score:        4089
Aligned:      4100        nucs
Identic:      4099 (100%) nucs =>       480 (100%)      3619 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264537,28265016] EXCISED REGION [28265018,28268637]
 second seq =>  [       6,     485] EXCISED REGION [     487,    4106]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28265017,28265017]
 second seq =>         1 nucs [486,486]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28265017,28265017] to [28265018,28265018]
 second seq =>         2 nucs [484,485] to [485,486]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264537 CTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 28264596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 CTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 65

 28264597 GACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGATGGG 28264656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 GACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGATGGG 125

 28264657 GTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTC 28264716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 GTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTC 185

 28264717 AGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTC 28264776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 AGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTC 245

 28264777 TTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTC 28264836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTC 305

 28264837 CAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGA 28264896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 CAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGA 365

 28264897 CCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAAT 28264956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 CCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAAT 425

 28264957 ATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAA 28265016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 ATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAA 485

EXCISED REGION

 28265018 TACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAAT 28265077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 TACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAAT 546

 28265078 AAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATA 28265137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 AAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATA 606

 28265138 GATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAAT 28265197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 GATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAAT 666

 28265198 AATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCT 28265257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 AATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCT 726

 28265258 CAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAG 28265317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 CAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAG 786

 28265318 AGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAA 28265377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 AGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAA 846

 28265378 GTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATG 28265437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 GTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATG 906

 28265438 CCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATT 28265497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 CCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATT 966

 28265498 AAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAG 28265557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 AAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAG 1026

 28265558 AATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAA 28265617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 AATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAA 1086

 28265618 TGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTA 28265677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 TGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTA 1146

 28265678 AGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAA 28265737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 AGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAA 1206

 28265738 ATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATG 28265797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 ATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATG 1266

 28265798 CAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAA 28265857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 CAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAA 1326

 28265858 TTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAG 28265917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 TTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAG 1386

 28265918 GTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTC 28265977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 GTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTC 1446

 28265978 TACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTT 28266037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTT 1506

 28266038 GGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGA 28266097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGA 1566

 28266098 TCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTT 28266157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTT 1626

 28266158 ATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATA 28266217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 ATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATA 1686

 28266218 ATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTA 28266277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 ATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTA 1746

 28266278 TGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTT 28266337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTT 1806

 28266338 CCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGT 28266397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 CCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGT 1866

 28266398 TAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGG 28266457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGG 1926

 28266458 AGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAAT 28266517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 AGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAAT 1986

 28266518 CTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAG 28266577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 CTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAG 2046

 28266578 AAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTA 28266637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 AAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTA 2106

 28266638 CAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCT 28266697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 CAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCT 2166

 28266698 TGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAG 28266757
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TGGTTGAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAG 2226

 28266758 AGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGC 28266817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGC 2286

 28266818 ATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACAC 28266877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 ATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACAC 2346

 28266878 TGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTA 28266937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 TGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTA 2406

 28266938 ATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGG 28266997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 ATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGG 2466

 28266998 AACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATC 28267057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 AACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATC 2526

 28267058 ACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTT 28267117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 ACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTT 2586

 28267118 ATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAG 28267177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 ATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAG 2646

 28267178 TGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAG 28267237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 TGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAG 2706

 28267238 GGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAA 28267297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 GGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAA 2766

 28267298 TGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTT 28267357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTT 2826

 28267358 AGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGAC 28267417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 AGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGAC 2886

 28267418 ATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAG 28267477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 ATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAG 2946

 28267478 TGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTA 28267537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTA 3006

 28267538 AGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTT 28267597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 AGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTT 3066

 28267598 TTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAAT 28267657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAAT 3126

 28267658 ATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGT 28267717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 ATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGT 3186

 28267718 ATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATC 28267777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 ATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATC 3246

 28267778 ATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCC 28267837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 ATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCC 3306

 28267838 CAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAA 28267897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 CAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAA 3366

 28267898 GTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTC 28267957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 GTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTC 3426

 28267958 CAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGT 28268017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGT 3486

 28268018 ATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCT 28268077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 ATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCT 3546

 28268078 AGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTT 28268137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 AGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTT 3606

 28268138 TTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAA 28268197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAA 3666

 28268198 TCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGAC 28268257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 TCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGAC 3726

 28268258 TAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCA 28268317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCA 3786

 28268318 CCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCA 28268377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 CCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCA 3846

 28268378 CTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTT 28268437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 CTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTT 3906

 28268438 TGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTT 28268497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTT 3966

 28268498 AATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGA 28268557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 AATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGA 4026

 28268558 TGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGT 28268617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGT 4086

 28268618 TTCTTTTGCTGTGCAAGAGC 28268637
          ||||||||||||||||||||
     4087 TTCTTTTGCTGTGCAAGAGC 4106

Alignment time is 5.3681 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4798] =>      4798 nucs 'mol-32-3327-029191_4798'

Score:        4787
Aligned:      4798        nucs
Identic:      4797 (100%) nucs =>      4403 (100%)       394 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28268868,28273271] EXCISED REGION [28273274,28273667]
 second seq =>  [       1,    4404] EXCISED REGION [    4405,    4798]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [28273272,28273273]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [28273272,28273287] to [28273274,28273289]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28273272,28273272] to [28273273,28273273]
 second seq =>         0 nucs

 28268868 CCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACC 28268927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACC 60

 28268928 TGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATT 28268987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATT 120

 28268988 GTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTA 28269047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTA 180

 28269048 AGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGC 28269107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGC 240

 28269108 TCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATG 28269167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATG 300

 28269168 TTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTT 28269227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTT 360

 28269228 CAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATC 28269287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATC 420

 28269288 TATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGT 28269347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGT 480

 28269348 TAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCT 28269407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCT 540

 28269408 CTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACAC 28269467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACAC 600

 28269468 CTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA 28269527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA 660

 28269528 AAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATC 28269587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATC 720

 28269588 TTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGG 28269647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGG 780

 28269648 AGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAG 28269707
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      781 AGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAG 840

 28269708 TTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCAC 28269767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCAC 900

 28269768 AAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTG 28269827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTG 960

 28269828 CCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCA 28269887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCA 1020

 28269888 TCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGAT 28269947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGAT 1080

 28269948 GCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCC 28270007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCC 1140

 28270008 TTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGA 28270067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGA 1200

 28270068 TTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAAT 28270127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAAT 1260

 28270128 CACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTG 28270187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTG 1320

 28270188 ATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATAT 28270247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATAT 1380

 28270248 TTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACAT 28270307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACAT 1440

 28270308 TCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCA 28270367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCA 1500

 28270368 TTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGA 28270427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGA 1560

 28270428 AAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAAT 28270487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAAT 1620

 28270488 AAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTG 28270547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTG 1680

 28270548 CCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGAT 28270607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGAT 1740

 28270608 GAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGC 28270667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGC 1800

 28270668 TTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAG 28270727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAG 1860

 28270728 GATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGAC 28270787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGAC 1920

 28270788 TTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTC 28270847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTC 1980

 28270848 AGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTT 28270907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTT 2040

 28270908 TTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAG 28270967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAG 2100

 28270968 TTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTG 28271027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTG 2160

 28271028 CTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGT 28271087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGT 2220

 28271088 TATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGT 28271147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGT 2280

 28271148 TACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATC 28271207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATC 2340

 28271208 CCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCA 28271267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCA 2400

 28271268 GCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCC 28271327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCC 2460

 28271328 ACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATA 28271387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATA 2520

 28271388 AAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTA 28271447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTA 2580

 28271448 ACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTAT 28271507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTAT 2640

 28271508 GTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGG 28271567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGG 2700

 28271568 TATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTT 28271627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTT 2760

 28271628 TTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCT 28271687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCT 2820

 28271688 GTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATT 28271747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATT 2880

 28271748 TTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGG 28271807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGG 2940

 28271808 TTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGG 28271867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGG 3000

 28271868 TGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCT 28271927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCT 3060

 28271928 TTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAG 28271987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAG 3120

 28271988 TAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTA 28272047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTA 3180

 28272048 TATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTC 28272107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTC 3240

 28272108 TGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATC 28272167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATC 3300

 28272168 ATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCT 28272227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCT 3360

 28272228 TAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCT 28272287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCT 3420

 28272288 GCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTT 28272347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTT 3480

 28272348 AATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTC 28272407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTC 3540

 28272408 TGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCA 28272467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCA 3600

 28272468 CATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAG 28272527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAG 3660

 28272528 ATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCA 28272587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCA 3720

 28272588 TCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACA 28272647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACA 3780

 28272648 TGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGA 28272707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGA 3840

 28272708 ATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTA 28272767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTA 3900

 28272768 ATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTC 28272827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTC 3960

 28272828 CACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGC 28272887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGC 4020

 28272888 CTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGT 28272947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGT 4080

 28272948 GGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATT 28273007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATT 4140

 28273008 TAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTG 28273067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTG 4200

 28273068 GGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTT 28273127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTT 4260

 28273128 TATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTG 28273187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTG 4320

 28273188 TTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTT 28273247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTT 4380

 28273248 CCATAGATTATACCTTTGGCATTC 28273271
          ||||||||||||||||||||||||
     4381 CCATAGATTATACCTTTGGCATTC 4404

EXCISED REGION

 28273274 TTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTG 28273333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 TTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTG 4464

 28273334 CGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 28273393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 CGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTC 4524

 28273394 CTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAG 28273453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 CTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAG 4584

 28273454 TAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCA 28273513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 TAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCA 4644

 28273514 CCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTAC 28273573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 CCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTAC 4704

 28273574 CTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTAT 28273633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 CTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTAT 4764

 28273634 TTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTT 28273667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 TTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTT 4798

Alignment time is 6.3433 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5307] =>      5307 nucs 'mol-32-3332-136461_5307'

Score:        4954
Aligned:      5309        nucs
Identic:      5262 ( 99%) nucs =>       497 ( 99%)      4765 ( 99%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28267640,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273855]
 second seq =>  [       1,     500] EXCISED REGION [     501,    5291]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28267640 TCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTG 28267699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTG 60

 28267700 GAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTC 28267759
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
       61 GAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTC 120

 28267760 ACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCT 28267819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCT 180

 28267820 CCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATG 28267879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATG 240

 28267880 TTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATG 28267939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATG 300

 28267940 CTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTT 28267999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTT 360

 28268000 TTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAA 28268057
          ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAA 418

 28268058 TCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCA 28268117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCA 478

 28268118 TTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||
      479 TTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 500

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 560

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 620

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 680

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 740

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      741 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 800

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 860

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 920

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
      921 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCA-- 978

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 1024

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 1084

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1085 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 1144

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 1204

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 1264

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 1324

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 1384

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1385 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 1444

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     1445 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 1504

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 1564

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1565 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 1624

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 1684

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 1744

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 1804

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1805 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 1864

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 1924

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 1984

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 2044

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 2104

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2105 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 2164

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 2224

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 2284

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 2344

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 2404

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 2464

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2465 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 2524

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2525 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 2584

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2585 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 2644

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 2704

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 2764

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 2824

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 2884

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 2944

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 3004

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 3064

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 3124

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 3184

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 3244

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 3304

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 3364

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 3424

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 3484

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 3544

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 3604

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 3664

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 3724

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 3784

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 3844

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3845 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 3904

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 3964

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 4024

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 4084

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 4144

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 4204

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 4264

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 4324

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4325 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 4384

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 4444

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 4504

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 4564

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4565 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 4624

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 4684

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCACTG 28273308
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4685 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACAGAGTCTTGCACTG 4744

 28273309 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 28273368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACGTT 4804

 28273369 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 28273428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTACG 4864

 28273429 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 28273488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATGGT 4924

 28273489 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 28273548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 CTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 4984

 28273549 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAACC 28273608
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4985 CGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAACC 5044

 28273609 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 28273668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 CAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCTTA 5104

 28273669 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 28273728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 CATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTCTT 5164

 28273729 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTAT 28273788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 CAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGTAT 5224

 28273789 ACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 28273848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 ACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 5284

 28273849 TTTTTTT 28273855
          |||||||
     5285 TTTTTTT 5291

Alignment time is 6.81818 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    4461] =>      4461 nucs 'mol-32-33a0-085544_4461'

Score:        4449
Aligned:      4460        nucs
Identic:      4459 (100%) nucs =>      1255 (100%)      3204 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265650,28266904] EXCISED REGION [28266906,28270110]
 second seq =>  [       1,    1255] EXCISED REGION [    1257,    4461]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28266905,28266905]
 second seq =>         1 nucs [1256,1256]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28266905,28266905] to [28266906,28266906]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [28266903,28266904] to [28266906,28266907]
 second seq =>         2 nucs [1254,1255] to [1257,1258]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265650 ATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACAC 28265709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACAC 60

 28265710 AAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCC 28265769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCC 120

 28265770 TCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAA 28265829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAA 180

 28265830 ATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTA 28265889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTA 240

 28265890 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCA 28265949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCA 300

 28265950 GCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGG 28266009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGG 360

 28266010 TGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCT 28266069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCT 420

 28266070 GAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGA 28266129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGA 480

 28266130 GTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATT 28266189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATT 540

 28266190 TAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAA 28266249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAA 600

 28266250 TACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGAT 28266309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGAT 660

 28266310 AAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAG 28266369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAG 720

 28266370 AAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAAC 28266429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAAC 780

 28266430 AGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAG 28266489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAG 840

 28266490 ATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCA 28266549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCA 900

 28266550 TATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTT 28266609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTT 960

 28266610 ATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATAT 28266669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATAT 1020

 28266670 TAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATA 28266729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATA 1080

 28266730 AATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGG 28266789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGG 1140

 28266790 AGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGG 28266849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGG 1200

 28266850 TGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAG 28266904
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAG 1255

EXCISED REGION

 28266906 AGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCC 28266965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCC 1316

 28266966 TATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGT 28267025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGT 1376

 28267026 TGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGA 28267085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGA 1436

 28267086 TGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGG 28267145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGG 1496

 28267146 AGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAAT 28267205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAAT 1556

 28267206 TGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGG 28267265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGG 1616

 28267266 CTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCT 28267325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCT 1676

 28267326 CAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATAT 28267385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATAT 1736

 28267386 CTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGC 28267445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGC 1796

 28267446 CTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAAT 28267505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 CTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAAT 1856

 28267506 TGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAG 28267565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAG 1916

 28267566 TCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCA 28267625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCA 1976

 28267626 TTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTC 28267685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTC 2036

 28267686 AGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTG 28267745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTG 2096

 28267746 CAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTC 28267805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTC 2156

 28267806 CGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCC 28267865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 CGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCC 2216

 28267866 ATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTG 28267925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 ATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTG 2276

 28267926 TTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGAT 28267985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGAT 2336

 28267986 ATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTT 28268045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 ATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTT 2396

 28268046 TTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCA 28268105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCA 2456

 28268106 AATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGA 28268165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 AATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGA 2516

 28268166 TATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGA 28268225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGA 2576

 28268226 AATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATA 28268285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATA 2636

 28268286 AACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAAT 28268345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAAT 2696

 28268346 AGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGAT 28268405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGAT 2756

 28268406 GATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGA 28268465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGA 2816

 28268466 GAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTG 28268525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 GAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTG 2876

 28268526 TTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCAT 28268585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCAT 2936

 28268586 TTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGT 28268645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGT 2996

 28268646 TTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCG 28268705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCG 3056

 28268706 TAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTT 28268765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTT 3116

 28268766 TAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGAT 28268825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGAT 3176

 28268826 AGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGA 28268885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 AGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGA 3236

 28268886 AGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGT 28268945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 AGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGT 3296

 28268946 AGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTT 28269005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTT 3356

 28269006 TGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCT 28269065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCT 3416

 28269066 GGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATAT 28269125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATAT 3476

 28269126 GAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAA 28269185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAA 3536

 28269186 TAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTC 28269245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTC 3596

 28269246 TGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAG 28269305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 TGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAG 3656

 28269306 TGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTC 28269365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTC 3716

 28269366 TTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATT 28269425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 TTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATT 3776

 28269426 GATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACC 28269485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACC 3836

 28269486 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAA 28269545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAA 3896

 28269546 AAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGT 28269605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 AAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGT 3956

 28269606 CATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTC 28269665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 CATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTC 4016

 28269666 TGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGC 28269725
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4017 TGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGC 4076

 28269726 AGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGAC 28269785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 AGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTTGAC 4136

 28269786 TTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAG 28269845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAG 4196

 28269846 CACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGT 28269905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 CACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGT 4256

 28269906 TTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTG 28269965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 TTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATGCTG 4316

 28269966 GTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTT 28270025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 GTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTT 4376

 28270026 GGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGA 28270085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGA 4436

 28270086 GATAATATATGGTTTTTGTCTTTAA 28270110
          |||||||||||||||||||||||||
     4437 GATAATATATGGTTTTTGTCTTTAA 4461

Alignment time is 5.282 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5716] =>      5716 nucs 'mol-32-33ab-133124_5716'

Score:        5704
Aligned:      5715        nucs
Identic:      5714 (100%) nucs =>        74 (100%)      5640 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266467,28266540] EXCISED REGION [28266542,28272182]
 second seq =>  [       1,      74] EXCISED REGION [      76,    5716]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28266541,28266541]
 second seq =>         1 nucs [75,75]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [74,74] to [75,75]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266467 TACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGA 28266526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGA 60

 28266527 TTTCTAAGATTTTG 28266540
          ||||||||||||||
       61 TTTCTAAGATTTTG 74

EXCISED REGION

 28266542 TAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTT 28266601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       76 TAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTT 135

 28266602 GACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTT 28266661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 GACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTT 195

 28266662 CCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTA 28266721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 CCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTA 255

 28266722 AATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAA 28266781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 AATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAA 315

 28266782 TACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCA 28266841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 TACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCA 375

 28266842 TTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGG 28266901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 TTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGG 435

 28266902 CAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGC 28266961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 CAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGC 495

 28266962 TTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGG 28267021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 TTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGG 555

 28267022 TAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAG 28267081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 TAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAG 615

 28267082 AAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAA 28267141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 AAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAA 675

 28267142 AAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTG 28267201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 AAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTG 735

 28267202 AAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAA 28267261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 AAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAA 795

 28267262 GTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACC 28267321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 GTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACC 855

 28267322 CTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTG 28267381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 CTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTG 915

 28267382 ATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAAT 28267441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 ATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAAT 975

 28267442 ATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTA 28267501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 ATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTA 1035

 28267502 TAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATA 28267561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 TAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATA 1095

 28267562 ACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTT 28267621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 ACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTT 1155

 28267622 TTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAG 28267681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 TTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAG 1215

 28267682 ATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAG 28267741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 ATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAG 1275

 28267742 GGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAAC 28267801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 GGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAAC 1335

 28267802 CCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTAT 28267861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTAT 1395

 28267862 GTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTT 28267921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 GTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTT 1455

 28267922 TCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGA 28267981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 TCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGA 1515

 28267982 GGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 GGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCA 1575

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 1635

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTT 28268161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTT 1695

 28268162 TGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTT 28268221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 TGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTT 1755

 28268222 GAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATG 28268281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 GAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATG 1815

 28268282 TATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAA 28268341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 TATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAA 1875

 28268342 TAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTC 28268401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTC 1935

 28268402 TGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTT 28268461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTT 1995

 28268462 TTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTG 28268521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 TTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTG 2055

 28268522 TTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTT 28268581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 TTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTT 2115

 28268582 CCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTT 28268641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 CCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTT 2175

 28268642 TAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTT 28268701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTT 2235

 28268702 GTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGG 28268761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 GTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGG 2295

 28268762 ATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAA 28268821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 ATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAA 2355

 28268822 AGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTA 28268881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 AGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTA 2415

 28268882 TTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGG 28268941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGG 2475

 28268942 CTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTG 28269001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 CTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTG 2535

 28269002 TTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGC 28269061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 TTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGC 2595

 28269062 CTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCC 28269121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 CTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCC 2655

 28269122 ATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATA 28269181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 ATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATA 2715

 28269182 GGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATT 28269241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATT 2775

 28269242 CTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTA 28269301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 CTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTA 2835

 28269302 GCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTA 28269361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 GCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTA 2895

 28269362 GCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACAT 28269421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 GCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACAT 2955

 28269422 TATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCG 28269481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCG 3015

 28269482 CACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAA 28269541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 CACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAA 3075

 28269542 GAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCG 28269601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 GAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCG 3135

 28269602 AAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATT 28269661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 AAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATT 3195

 28269662 CTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTT 28269721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3196 CTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTT 3255

 28269722 TGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTT 28269781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 TGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTT 3315

 28269782 TGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGG 28269841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 TGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGG 3375

 28269842 CTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTC 28269901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 CTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTC 3435

 28269902 CAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGAT 28269961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 CAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGAT 3495

 28269962 GCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTC 28270021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 GCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTC 3555

 28270022 TCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTA 28270081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 TCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTA 3615

 28270082 CTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATT 28270141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 CTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATT 3675

 28270142 CACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTA 28270201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 CACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTA 3735

 28270202 ACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTAC 28270261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 ACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTAC 3795

 28270262 CATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTA 28270321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 CATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTA 3855

 28270322 AAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATA 28270381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 AAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATA 3915

 28270382 TTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTG 28270441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 TTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTG 3975

 28270442 CATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTC 28270501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 CATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTC 4035

 28270502 GTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAA 28270561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 GTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAA 4095

 28270562 TAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCA 28270621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 TAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCA 4155

 28270622 CTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTA 28270681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 CTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTA 4215

 28270682 CAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTT 28270741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 CAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTT 4275

 28270742 TTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTT 28270801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 TTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTT 4335

 28270802 GGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCAT 28270861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 GGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCAT 4395

 28270862 CTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCT 28270921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 CTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCT 4455

 28270922 TGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCT 28270981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 TGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCT 4515

 28270982 CCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTAT 28271041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 CCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTAT 4575

 28271042 GCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCC 28271101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 GCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCC 4635

 28271102 CAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGAT 28271161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 CAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGAT 4695

 28271162 TTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCC 28271221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 TTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCC 4755

 28271222 CTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACA 28271281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 CTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACA 4815

 28271282 ACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCAT 28271341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 ACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCAT 4875

 28271342 GGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTC 28271401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 GGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTC 4935

 28271402 CAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGC 28271461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4936 CAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGC 4995

 28271462 TGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATA 28271521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4996 TGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATA 5055

 28271522 TGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGG 28271581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5056 TGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGG 5115

 28271582 TAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTA 28271641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5116 TAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTA 5175

 28271642 GTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGG 28271701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5176 GTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGG 5235

 28271702 TCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATAT 28271761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5236 TCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATAT 5295

 28271762 TGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAG 28271821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5296 TGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAG 5355

 28271822 GGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTC 28271881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5356 GGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTC 5415

 28271882 TCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGAT 28271941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5416 TCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGAT 5475

 28271942 TGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCT 28272001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 TGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCT 5535

 28272002 TGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGT 28272061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 TGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGT 5595

 28272062 CTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGT 28272121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 CTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGT 5655

 28272122 TACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATC 28272181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 TACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATC 5715

 28272182 T 28272182
          |
     5716 T 5716

Alignment time is 6.81995 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8946] =>      8946 nucs 'mol-32-33b6-120450_8946'

Score:        8225
Aligned:      8967        nucs
Identic:      8875 ( 99%) nucs =>      6701 ( 99%)      2174 ( 99%)
Gaps:           37 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28261394,28268139] EXCISED REGION [28269049,28271253]
 second seq =>  [       1,    6756] EXCISED REGION [    6757,    8946]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28261394 TAGCAACAATGTGAAGCAACTACAGCTCTCATACACTGATGATAGAAATGTAAAATTGTA 28261453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGCAACAATGTGAAGCAACTACAGCTCTCATACACTGATGATAGAAATGTAAAATTGTA 60

 28261454 CAACTACTTTATAAAACAGTTTGACAGGTTTTTAAATGGTTACACATATATTTATTATAT 28261513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAACTACTTTATAAAACAGTTTGACAGGTTTTTAAATGGTTACACATATATTTATTATAT 120

 28261514 AATGCAGCGATTCCTTTCTTAGGTGTCTTACCCAAGAGAAAGGAAGTCATATGCCCATAC 28261573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGCAGCGATTCCTTTCTTAGGTGTCTTACCCAAGAGAAAGGAAGTCATATGCCCATAC 180

 28261574 AAATACTTATTCATAAACATTCCTAACAGCACTATTTGTAATAGTCAAAAACTGAAAACA 28261633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATACTTATTCATAAACATTCCTAACAGCACTATTTGTAATAGTCAAAAACTGAAAACA 240

 28261634 ACCCAAATGTCCATCAAGAGGTGAATACATTATCAAGTTATGGTATATTTATGCAACAGA 28261693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCCAAATGTCCATCAAGAGGTGAATACATTATCAAGTTATGGTATATTTATGCAACAGA 300

 28261694 ATACTGCTCAGCAATAAAAATAATTTAGTATTGATTTATACAATAACATGAATCACATGG 28261753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATACTGCTCAGCAATAAAAATAATTTAGTATTGATTTATACAATAACATGAATCACATGG 360

 28261754 ATAAATGTTGATAAACTTCAAAATAATTATGCTGAATGAAAGAAGTCAGATGAAGAGAGT 28261813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAATGTTGATAAACTTCAAAATAATTATGCTGAATGAAAGAAGTCAGATGAAGAGAGT 420

 28261814 ACACAGTTTTGCTTCCCTTTATCTAAAATTCTAAAAAGTGCAAACATCTATAGTGACAGA 28261873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACACAGTTTTGCTTCCCTTTATCTAAAATTCTAAAAAGTGCAAACATCTATAGTGACAGA 480

 28261874 AAGCAGATCAGTGGTTGCCTGCGGTGGGGTTGAAGTGAGGAACAGGCAGACGTGAACAAA 28261933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      481 AAGCAGATCAGTGGTTGCCTGCGGTGGGGTTGAAGTGAGGAACAGGCAGACATGAACAAA 540

 28261934 GGGGAACGAGGAAATGCTAGGGGTAATTAATATGTTCATTATCTTGATTATGGTGATGGT 28261993
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGGAATGAGGAAATGCTAGGGGTAATTAATATGTTCATTATCTTGATTATGGTGATGGT 600

 28261994 TTCACAGGTGTGTGCATAGGTCAACATGTATAAAGCTTTATGCTTTAAATATATTACTTT 28262053
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||
      601 TTCACAGGTGTGTGCATAGGTCAACATGTATAAAGCTTTATACTTTAAATACATTACTTT 660

 28262054 GTTTTATACCAATTATGCCTCAATATAGTTGTTTTAAAAATGTTATCAGAGAAAGAAGAA 28262113
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      661 GTTTTATACCAATTATGCCTCAATATAGTTGTTTTAAAAATGTTATCAGAGAAAGAATAA 720

 28262114 AACTAAAGTGAAGTAAATAATCATCCAGCTATTGGCTGATGGGTATTGTTATTCACATAA 28262173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTAAAGTGAAGTAAATAATCATCCAGCTATTGGCTGATGGGTATTGTTATTCACATAA 780

 28262174 AAATTTTTCTAATAAAGAGTAAAAGTTGTATTTGAAAAAAAATCCTGGCACCCCAGTCCC 28262233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      781 AAATTTTTCTAATAAAGAGTAAAAGTTGTATTTGAAAAAAAATCCTGGCATCCCAGTCCC 840

 28262234 GAGGATCCCTAGAAAATTTACAGGGGTGGCAGTCTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGATTTT 28262293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGATCCCTAGAAAATTTACAGGGGTGGCAGTCTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGATTTT 900

 28262294 CAATCTTTGGCTTGCATATACCTTGCCAAGACATCCAAGGCACCTGCAATTTCTTGCTTA 28262353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATCTTTGGCTTGCATATACCTTGCCAAGACATCCAAGGCACCTGCAATTTCTTGCTTA 960

 28262354 CCAGGAATTTCCATCACCTGCCAGCAAGATTTTATTATATCAATGTAGCAGACCAGCCTG 28262413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAGGAATTTCCATCACCTGCCAGCAAGATTTTATTATATCAATGTAGCAGACCAGCCTG 1020

 28262414 AAGTGCTATGGACTGATAGGGGTACAGTCTTTATGGGCTTGACTATAATAAAGAGACAGA 28262473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTGCTATGGACTGATAGGGGTACAGTCTTTATGGGCTTGACTATAATAAAGAGACAGA 1080

 28262474 GGGTCTAGTCAGGTAAACAAAAACAGTTTCTGGGCTCTTTGCTTAGGGGAAGTAATGAGA 28262533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1081 GGGTCTAGTCAGGTAAACAAAAACAGTTTCTGGGCTTTTTGCTTAGGGGAAGTAATGAGA 1140

 28262534 CAAAGACATATTTCAGATTGATAGGTAAATACAAGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAGTGAA 28262593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAAGACATATTTCAGATTGATAGGTAAATACAAGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAGTGAA 1200

 28262594 GAAACTACATGTGGGACAGTAGCTGCAGTTGGAGTCATCATCTGATTAAGTTTATGATGA 28262653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAACTACATGTGGGACAGTAGCTGCAGTTGGAGTCATCATCTGATTAAGTTTATGATGA 1260

 28262654 TACACTCTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCTTTGAAGCATATACTAAACAGGTGAGTCAAA 28262713
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACACTGTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCTTTGAAGCATATACTAAACAGGTGAGTCAAA 1320

 28262714 TGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCATTTTTAGTCTTGCTTGGTTACGTTCATCTTT 28262773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1321 TGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCATTTTTAGTCTTGCTTGGTTACATTCATCTTT 1380

 28262774 GAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCTTCTATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGGTCCT 28262833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCTTCTATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGGTCCT 1440

 28262834 TCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTGTTATTCGATGTGTCAGAAAGCCAATGTGGG 28262893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTGTTATTCGATGTGTCAGAAAGCCAATGTGGG 1500

 28262894 AATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTGAAGCATTCACTCAGGAACAGTATAAATAAC 28262953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTGAAGCATTCACTCAGGAACAGTATAAATAAC 1560

 28262954 CACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACCAGCTATGAGAAGGACTCAACAAAATTCCAT 28263013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACCAGCTATGAGAAGGACTCAACAAAATTCCAT 1620

 28263014 TTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTTTGATGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCTGGGT 28263073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTTTGATGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCTGGGT 1680

 28263074 TCCGGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCTAGAAAGTCTGGATATTTTCCTTTCTCTAGA 28263133
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCAGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCTAGAAAGTCTGGATATTTTCCTTTCTCTAGA 1740

 28263134 ACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATATTCCTTTGGGGAAATACTAGGAAGAAGCAAC 28263193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATATTCCTTTGGGGAAATACTAGGAAGAAGCAAC 1800

 28263194 AGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCTGGCCTCTTATTTTAGGTCAAGTTATTGAAG 28263253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCTGGCCTCTTATTTTAGGTCAAGTTATTGAAG 1860

 28263254 AATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTTAAAAAGTGTATAGTACAGTTCAACAAGCTT 28263313
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTTCAAAAGTGTATAGTACAGTTCAACAAGCTT 1920

 28263314 TGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAAT 28263373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAAT 1980

 28263374 GTCAGTTGACAAGCTCATCCAAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACAT 28263433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCAGTTGACAAGCTCATCCAAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACAT 2040

 28263434 GAAAATTCTGAATCAGAAAAAATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATT 28263493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAATTCTGAATCAGAAAAAATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATT 2100

 28263494 AACCTTTAGTATTAAATATAGTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGA 28263553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2101 AACCTTTAGTATTAAATATAGTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGACTAATGAAACAGA 2160

 28263554 ATAAATTCTAGAAACAGACTCATTCCTATAGACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTA 28263613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAAATTCTAGAAACAGACTCATTCCTATAGAGAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTA 2220

 28263614 AAAATCAAGGGATAAAGTATAAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTAC 28263673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAATCAAGGGATAAAGTATAAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTAC 2280

 28263674 ATAGGAAAATAATTGATCCCTACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGAC 28263733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAGGAAAATAATTGATCCCTACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGAC 2340

 28263734 TAAAAACTTAAATGGGAAAAGCGAACTTAAAAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAG 28263793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAAAACTTAAATGGGAAAAGCGAACTTAAAAATTTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAG 2400

 28263794 TACAGGATTTTTGTTTTTTTAAAAAAGAGATCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACA 28263853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2401 TACAGGATTTTTGTTTTTTTAAAAAAGAGATCAAGTGGAGTATTTATACATCTGAATACA 2460

 28263854 TTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTA 28263913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTA 2520

 28263914 CTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTA 28263973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTA 2580

 28263974 CAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAG 28264033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAG 2640

 28264034 AAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGC 28264093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGC 2700

 28264094 TTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACAC 28264153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACAC 2760

 28264154 CAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGC 28264213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGC 2820

 28264214 CTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAA 28264273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAA 2880

 28264274 AGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCAC 28264333
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGCAGTGGATCCATCCCAACCGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCAC 2940

 28264334 TCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACC 28264393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACC 3000

 28264394 AAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCC 28264453
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGGCAGGAGCCAAGACTTACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCC 3060

 28264454 TACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTT-----------GAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGC 28264502
          ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||
     3061 TACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGC 3120

 28264503 TCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCC 28264562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCC 3180

 28264563 GCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCT 28264622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3181 GCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCT 3240

 28264623 GGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGT 28264681
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGT 3300

 28264682 CTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACA 28264741
          |||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACA 3360

 28264742 GGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATA 28264801
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATA 3420

 28264802 TGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTA 28264861
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTA 3480

 28264862 GATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAA 28264921
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAA 3540

 28264922 AAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAA 28264981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAA 3600

 28264982 GATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGA 28265041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGA 3660

 28265042 AAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAA 28265101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAA 3720

 28265102 ATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGG 28265161
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGG 3780

 28265162 AGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACA 28265221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACA 3840

 28265222 ACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAA 28265281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAA 3900

 28265282 AAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAA 28265341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAA 3960

 28265342 AAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTAC 28265401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTAC 4020

 28265402 GTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACA 28265461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACA 4080

 28265462 TAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGA 28265521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGA 4140

 28265522 AGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTC 28265581
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTC 4200

 28265582 ATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGC 28265641
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGC 4260

 28265642 CTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCT 28265701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCT 4320

 28265702 TGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTT 28265761
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTT 4380

 28265762 CTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGT 28265821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGT 4440

 28265822 GGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCA 28265881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCA 4500

 28265882 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTT 28265941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTT 4560

 28265942 CAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGT 28266000
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGT 4620

 28266001 TGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCA 28266060
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCA 4680

 28266061 CTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTG 28266120
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTG 4740

 28266121 GGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGG 28266179
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     4741 GGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGG 4800

 28266180 GAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATA 28266239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATA 4860

 28266240 AATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAG 28266299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAG 4920

 28266300 TACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGG 28266359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGG 4980

 28266360 AAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATA 28266419
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4981 AAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATA 5040

 28266420 TTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCT 28266479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCT 5100

 28266480 TACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTT 28266539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5101 TACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTT 5160

 28266540 GATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGG 28266599
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGG 5220

 28266600 TTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTT 28266659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTT 5280

 28266660 TTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 28266719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC 5340

 28266720 TAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAA 28266779
          ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAA 5396

 28266780 AATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGAC 28266839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGAC 5456

 28266840 CATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGA 28266899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 CATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGA 5516

 28266900 GGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTT 28266959
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5517 GGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTT 5576

 28266960 GCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGT 28267019
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5577 GCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGT 5636

 28267020 GGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACT 28267079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACT 5696

 28267080 AGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGT 28267139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 AGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGT 5756

 28267140 AAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAAC 28267199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5757 AAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAAC 5816

 28267200 TGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTT 28267259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTT 5876

 28267260 AAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACA 28267319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 AAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACA 5936

 28267320 CCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAG 28267379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAG 5996

 28267380 TGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAA 28267439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 TGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAA 6056

 28267440 ATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTT 28267499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 ATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTT 6116

 28267500 TATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGA 28267559
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6117 TATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGA 6176

 28267560 TAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTC 28267619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTC 6236

 28267620 TTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTT 28267679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTT 6296

 28267680 AGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTT 28267739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 AGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTT 6356

 28267740 AGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCA 28267799
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 AGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCA 6416

 28267800 ACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTT 28267859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 ACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTT 6476

 28267860 ATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGT 28267919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 ATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGT 6536

 28267920 TTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCA 28267979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCA 6596

 28267980 GAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATAT 28268037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||
     6597 GAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATAT 6654

 28268038 ACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTG 28268097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 ACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTG 6714

 28268098 CTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 CTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 6756

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6757 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 6816

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6817 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 6876

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6877 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 6936

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6937 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 6996

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6997 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 7056

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7057 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 7116

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7117 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 7176

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     7177 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 7235

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7236 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 7281

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7282 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 7341

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     7342 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 7401

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7402 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 7461

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7462 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 7521

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7522 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 7581

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7582 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 7641

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     7642 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 7701

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     7702 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 7761

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7762 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 7821

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7822 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 7881

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7882 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 7941

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7942 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 8001

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8002 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 8061

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     8062 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 8121

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8122 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 8181

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8182 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 8241

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8242 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 8301

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8302 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 8361

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     8362 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 8421

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8422 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 8481

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8482 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 8541

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8542 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 8601

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8602 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 8661

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8662 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 8721

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     8722 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 8781

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     8782 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 8841

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     8842 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 8901

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAG 28271253
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8902 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAG 8946

Alignment time is 10.4577 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    2190] =>      2190 nucs 'mol-32-33b6-120450_2190'

Score:        2014
Aligned:      2190        nucs
Identic:      2174 ( 99%) nucs =>       478 (100%)      1696 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28269049,28269527] EXCISED REGION [28269543,28271253]
 second seq =>  [       1,     479] EXCISED REGION [     480,    2190]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [28269528,28269542]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28269528,28269531] to [28269543,28269546]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [28269526,28269527] to [28269543,28269544]
 second seq =>         2 nucs [478,479] to [480,481]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 60

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 120

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 180

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 240

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      241 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 300

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 360

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 420

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA 28269527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA 479

EXCISED REGION

 28269543 AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGA 28269602
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      480 AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACTGA 539

 28269603 AGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTC 28269662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTC 599

 28269663 TTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTTT 28269722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      600 TTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTTT 659

 28269723 GGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTT 28269782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTTT 719

 28269783 GACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGC 28269842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGC 779

 28269843 TAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCC 28269902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      780 TAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCTTTGTCTTGTTCC 839

 28269903 AGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATG 28269962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGATG 899

 28269963 CTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTCT 28270022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      900 CTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCTTTGATGCCCAGTCT 959

 28270023 CTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTAC 28270082
          ||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      960 CTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGATTTTTCTGTGTCTAC 1019

 28270083 TGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTC 28270142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATTC 1079

 28270143 ACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAA 28270202
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTAA 1139

 28270203 CTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACC 28270262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTACC 1199

 28270263 ATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAA 28270322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTAA 1259

 28270323 AACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATAT 28270382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATAT 1319

 28270383 TCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGC 28270442
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1320 TCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAAAGTTCTCATTCTGC 1379

 28270443 ATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCG 28270502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTCG 1439

 28270503 TAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAAT 28270562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAAT 1499

 28270563 AGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCAC 28270622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1500 AGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAATGTGGTTTCCAC 1559

 28270623 TTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTAC 28270682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTAC 1619

 28270683 AGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTT 28270742
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTTT 1679

 28270743 TATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTG 28270802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTTG 1739

 28270803 GCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATC 28270862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCATC 1799

 28270863 TTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTT 28270922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCTT 1859

 28270923 GCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTC 28270982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCTC 1919

 28270983 CTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATG 28271042
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTATG 1979

 28271043 CACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCC 28271102
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCCC 2039

 28271103 AAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGATT 28271162
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2040 AAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTTACTTTAATTGGATT 2099

 28271163 TCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCC 28271222
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCCC 2159

 28271223 TAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAG 28271253
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAG 2190

Alignment time is 2.5854 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5612] =>      5612 nucs 'mol-32-33b6-142902_5612'

Score:        5239
Aligned:      5629        nucs
Identic:      5578 ( 99%) nucs =>      1037 ( 99%)      4541 ( 99%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28267098,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273630]
 second seq =>  [       1,    1042] EXCISED REGION [    1043,    5612]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28267098 CAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGG 28267157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGG 60

 28267158 TGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGA 28267217
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGA 120

 28267218 GGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTT 28267277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTT 180

 28267278 GCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATG 28267337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATG 240

 28267338 TTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTA 28267397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTA 300

 28267398 ATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATG 28267457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATG 360

 28267458 TGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGT 28267517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGT 420

 28267518 TTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAA 28267577
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAA 480

 28267578 TAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAG 28267637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAG 540

 28267638 GGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATG 28267697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATG 600

 28267698 TGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTC 28267757
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      601 TGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTG 660

 28267758 TCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTC 28267817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTC 720

 28267818 CTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCA 28267877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCA 780

 28267878 TGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAA 28267937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAA 840

 28267938 TGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTC 28267997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTC 900

 28267998 TTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCC 28268055
          ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCC 958

 28268056 AATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTG 28268115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTG 1018

 28268116 CATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||
     1019 CATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 1042

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 1102

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 1162

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 1222

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 1282

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1283 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 1342

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 1402

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 1462

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1463 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 1521

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 1567

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 1627

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1628 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 1687

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 1747

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 1807

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 1867

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 1927

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1928 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 1987

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     1988 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 2047

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 2107

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2108 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 2167

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 2227

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 2287

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 2347

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2348 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 2407

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 2467

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 2527

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 2587

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 2647

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2648 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 2707

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 2767

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 2827

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 2887

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 2947

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 3007

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3008 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 3067

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3068 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 3127

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3128 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 3187

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 3247

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 3307

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 3367

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 3427

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 3487

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 3547

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 3607

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 3667

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 3727

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 3787

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 3847

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 3907

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 3967

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 4027

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 4087

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 4147

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 4207

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 4267

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 4327

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 4387

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4388 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 4447

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 4507

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 4567

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 4627

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 4687

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 4747

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 4807

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 4867

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4868 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 4927

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 4987

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 5047

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATCCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 5107

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5108 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 5167

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 5227

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCA 28273305
          |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCA 5287

 28273306 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCAC 28273365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCAC 5347

 28273366 GTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACT 28273425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 GTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACT 5407

 28273426 ACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGAT 28273485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 ACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGAT 5467

 28273486 GGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTAC 28273545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 GGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTAC 5527

 28273546 AGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAA 28273605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5528 AGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAA 5587

 28273606 ACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCC 28273630
          |||||||||||||||||||||||||
     5588 ACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCC 5612

Alignment time is 6.60454 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    7036] =>      7036 nucs 'mol-32-3403-085930_7036'

Score:        6423
Aligned:      7059        nucs
Identic:      6975 ( 99%) nucs =>      6222 ( 99%)       753 ( 98%)
Gaps:           41 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28261870,28268139] EXCISED REGION [28269049,28269819]
 second seq =>  [       1,    6280] EXCISED REGION [    6281,    7036]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28261870 CAGAAAGCAGATCAGTGGTTGCCTGCGGTGGGGTTGAAGTGAGGAACAGGCAGACGTGAA 28261929
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
        1 CAGAAAGCAGATCAGTGGTTGCCTGCGGTGGGGTTGAAGTGAGGAACAGGCAGACATGAA 60

 28261930 CAAAGGGGAACGAGGAAATGCTAGGGGTAATTAATATGTTCATTATCTTGATTATGGTGA 28261989
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAGGGGAATGAGGAAATGCTAGGGGTAATTAATATGTTCATTATCTTGATTATGGTGA 120

 28261990 TGGTTTCACAGGTGTGTGCATAGGTCAACATGTATAAAGCTTTATGCTTTAAATATATTA 28262049
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||
      121 TGGTTTCACAGGTGTGTGCATAGGTCAACATGTATAAAGCTTTATACTTTAAATACATTA 180

 28262050 CTTTGTTTTATACCAATTATGCCTCAATATAGTTGTTTTAAAAATGTTATCAGAGAAAGA 28262109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTGTTTTATACCAATTATGCCTCAATATAGTTGTTTTAAAAATGTTATCAGAGAAAGA 240

 28262110 AGAAAACTAAAGTGAAGTAAATAATCATCCAGCTATTGGCTGATGGGTATTGTTATTCAC 28262169
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAAAACTAAAGTGAAGTAAATAATCATCCAGCTATTGGCTGATGGGTATTGTTATTCAC 300

 28262170 ATAAAAATTTTTCTAATAAAGAGTAAAAGTTGTATTTGAAAAAAAATCCTGGCACCCCAG 28262229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      301 ATAAAAATTTTTCTAATAAAGAGTAAAAGTTGTATTTGAAAAAAAATCCTGGCATCCCAG 360

 28262230 TCCCGAGGATCCCTAGAAAATTTACAGGGGTGGCAGTCTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGA 28262289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCGAGGATCCCTAGAAAATTTACAGGGGTGGCAGTCTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGA 420

 28262290 TTTTCAATCTTTGGCTTGCATATACCTTGCCAAGACATCCAAGGCACCTGCAATTTCTTG 28262349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTCAATCTTTGGCTTGCATATACCTTGCCAAGACATCCAAGGCACCTGCAATTTCTTG 480

 28262350 CTTACCAGGAATTTCCATCACCTGCCAGCAAGATTTTATTATATCAATGTAGCAGACCAG 28262409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTACCAGGAATTTCCATCACCTGCCAGCAAGATTTTATTATATCAATGTAGCAGACCAG 540

 28262410 CCTGAAGTGCTATGGACTGATAGGGGTACAGTCTTTATGGGCTTGACTATAATAAAGAGA 28262469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGAAGTGCTATGGACTGATAGGGGTACAGTCTTTATGGGCTTGACTATAATAAAGAGA 600

 28262470 CAGAGGGTCTAGTCAGGTAAACAAAAACAGTTTCTGGGCTCTTTGCTTAGGGGAAGTAAT 28262529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      601 CAGAGGGTCTAGTCAGGTAAACAAAAACAGTTTCTGGGCTTTTTGCTTAGGGGAAGTAAT 660

 28262530 GAGACAAAGACATATTTCAGATTGATAGGTAAATACAAGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAG 28262589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGACAAAGACATATTTCAGATTGATAGGTAAATACAAGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAG 720

 28262590 TGAAGAAACTACATGTGGGACAGTAGCTGCAGTTGGAGTCATCATCTGATTAAGTTTATG 28262649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAAGAAACTACATGTGGGACAGTAGCTGCAGTTGGAGTCATCATCTGATTAAGTTTATG 780

 28262650 ATGATACACTCTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCTTTGAAGCATATACTAAACAGGTGAGT 28262709
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGATACACTGTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCTTTGAAGCATATACTAAACAGGTGAGT 840

 28262710 CAAATGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCATTTTTAGTCTTGCTTGGTTACGTTCAT 28262769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      841 CAAATGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCATTTTTAGTCTTGCTTGGTTACATTCAT 900

 28262770 CTTTGAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCTTCTATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGG 28262829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTGAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCTTCTATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGG 960

 28262830 TCCTTCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTGTTATTCGATGTGTCAGAAAGCCAATG 28262889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTTCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTGTTATTCGATGTGTCAGAAAGCCAATG 1020

 28262890 TGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTGAAGCATTCACTCAGGAACAGTATAAA 28262949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTGAAGCATTCACTCAGGAACAGTATAAA 1080

 28262950 TAACCACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACCAGCTATGAGAAGGACTCAACAAAATT 28263009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAACCACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACCAGCTATGAGAAGGACTCAACAAAATT 1140

 28263010 CCATTTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTTTGATGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCT 28263069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATTTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTTTGATGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCT 1200

 28263070 GGGTTCCGGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCTAGAAAGTCTGGATATTTTCCTTTCTC 28263129
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGTTCCAGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCTAGAAAGTCTGGATATTTTCCTTTCTC 1260

 28263130 TAGAACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATATTCCTTTGGGGAAATACTAGGAAGAAG 28263189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGAACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATATTCCTTTGGGGAAATACTAGGAAGAAG 1320

 28263190 CAACAGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCTGGCCTCTTATTTTAGGTCAAGTTATT 28263249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAACAGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCTGGCCTCTTATTTTAGGTCAAGTTATT 1380

 28263250 GAAGAATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTTAAAAAGTGTATAGTACAGTTCAACAA 28263309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAGAATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTTCAAAAGTGTATAGTACAGTTCAACAA 1440

 28263310 GCTTTGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTT 28263369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTTTGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCATCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTT 1500

 28263370 TAATGTCAGTTGACAAGCTCATCCAAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTA 28263429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAATGTCAGTTGACAAGCTCATCCAAAAATTTGCACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTA 1560

 28263430 ACATGAAAATTCTGAATCAGAAAAAATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAAT 28263489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATGAAAATTCTGAATCAGAAAAAATATGACAATTTTGACCAGATATGAAGACTTTAAT 1620

 28263490 GATTAACCTTTAGTATTAAATATAGTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAA 28263549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1621 GATTAACCTTTAGTATTAAATATAGTGTGAAATTATGCAGATATCAGTAGACTAATGAAA 1680

 28263550 CAGAATAAATTCTAGAAACAGACTCATTCCTATAGACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGC 28263609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1681 CAGAATAAATTCTAGAAACAGACTCATTCCTATAGAGAAGTAATGTATTACAGAGGTGGC 1740

 28263610 ATTAAAAATCAAGGGATAAAGTATAAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTAT 28263669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTAAAAATCAAGGGATAAAGTATAAAATTTTCAATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTAT 1800

 28263670 CTACATAGGAAAATAATTGATCCCTACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGT 28263729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTACATAGGAAAATAATTGATCCCTACATCTCCCACAACATACCACAATATATTCCAGGT 1860

 28263730 AGACTAAAAACTTAAATGGGAAAAGCGAACTTAAAAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTA 28263789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1861 AGACTAAAAACTTAAATGGGAAAAGCGAACTTAAAAATTTTTGGAGGAAAATATGATGTA 1920

 28263790 AGAGTACAGGATTTTTGTTTTTTTAAAAAAGAGATCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAA 28263849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1921 AGAGTACAGGATTTTTGTTTTTTTAAAAAAGAGATCAAGTGGAGTATTTATACATCTGAA 1980

 28263850 TACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAA 28263909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGGACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAA 2040

 28263910 ACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTA 28263969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGATGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTA 2100

 28263970 AGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGT 28264029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAAACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGT 2160

 28264030 CAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCC 28264089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCCAAGAAACATCATGATGATGAGTTCCC 2220

 28264090 TAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAA 28264149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTGGAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAA 2280

 28264150 ACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGA 28264209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCTCTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGA 2340

 28264210 CAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAG 28264269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAAATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAG 2400

 28264270 AAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTT 28264329
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACCGATGTCAGAAAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTT 2460

 28264330 CCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAA 28264389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAATACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAA 2520

 28264390 GACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAG 28264449
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2521 GACCAAGGCAGGAGCCAAGACTTACATCCCCAGTGGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCA- 2579

 28264450 CCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTT-------------GAGACGGAGTCTCGCTC 28264496
          |||| ||||||||||.||||||||||||||             |||||||||||||||||
     2580 CCCC-ACCTGGCAGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTC 2638

 28264497 TGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGG 28264556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGG 2698

 28264557 GTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACC 28264616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2699 GTTCCCGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACC 2758

 28264617 TGGCCTGGCTAATTTTTTT-TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAG 28264675
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGGCCTGGCTAATTTTTTTCTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAG 2818

 28264676 TCTGGTCTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGG 28264735
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2819 TCTGGTCTTCAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGG 2878

 28264736 ATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGT 28264795
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ATTACAGGCATGAGCCACTGCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGT 2938

 28264796 GTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAAT 28264855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2939 GTCATATGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTATAACATAAT 2998

 28264856 ATCCTAGATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTA 28264915
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ATCCTAGATTTCCAGGTTTCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTA 3058

 28264916 AATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTT 28264975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AATGAAAAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTT 3118

 28264976 TACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAAC 28265035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TACAAAGATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAAC 3178

 28265036 AAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATT 28265095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 AAATGAAAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATT 3238

 28265096 TTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAG 28265155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3239 TTTGAAATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAG 3298

 28265156 TGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATC 28265215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3299 TGGAGGAGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATC 3358

 28265216 CAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTG 28265275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CAAACAACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTG 3418

 28265276 TAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGT 28265335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TAACAAAAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGT 3478

 28265336 TTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAA 28265395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TTGAAAAAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAA 3538

 28265396 GCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCA 28265455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GCCTACGTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCA 3598

 28265456 GACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTAT 28265515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GACACATAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTAT 3658

 28265516 ACCAGAAGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAA 28265575
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 ACCAGAAGGAAGTGGTACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAA 3718

 28265576 AACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATT 28265635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3719 AACGTCATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATT 3778

 28265636 TGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAG 28265695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TGCTGCCTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAG 3838

 28265696 GAATCTTGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTA 28265755
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GAATCTTGAAATACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTA 3898

 28265756 CATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATC 28265815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATC 3958

 28265816 TGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGT 28265875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGT 4018

 28265876 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCA 28265935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCA 4078

 28265936 GGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACA 28265994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     4079 GGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACA 4138

 28265995 ATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGA 28266054
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4139 ATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGA 4198

 28266055 GGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCC 28266114
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4199 GGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCC 4258

 28266115 AACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAAT 28266173
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     4259 AACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAAT 4318

 28266174 AAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATT 28266233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 AAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATT 4378

 28266234 GTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACT 28266293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACT 4438

 28266294 CAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGA 28266353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 CAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGA 4498

 28266354 GCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATC 28266413
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4499 GCAAGGAAAAAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATC 4558

 28266414 TGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAA 28266473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAA 4618

 28266474 TTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAA 28266533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4619 TTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTA 4678

 28266534 GATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGA 28266593
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GATTTTGACAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGA 4738

 28266594 TAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGT 28266653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGT 4798

 28266654 CAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATAC 28266713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATAC 4858

 28266714 AAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTG 28266773
          ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 AAGGTCTAAATAAATAAATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTG 4914

 28266774 GGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATT 28266833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 GGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATT 4974

 28266834 GGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAG 28266893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 GGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAG 5034

 28266894 GGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGA 28266953
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5035 GGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGA 5094

 28266954 ATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAA 28267013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5095 ATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAA 5154

 28267014 GGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCAC 28267073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 GGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCAC 5214

 28267074 AGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAAC 28267133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 AGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAAC 5274

 28267134 ATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTA 28267193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5275 ATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTA 5334

 28267194 CCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTG 28267253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 CCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTG 5394

 28267254 CCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGT 28267313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5395 CCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGT 5454

 28267314 TCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGT 28267373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 TCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGT 5514

 28267374 GTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACAT 28267433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 GTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACAT 5574

 28267434 CTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGC 28267493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 CTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGC 5634

 28267494 CTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTAT 28267553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5635 CTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTAT 5694

 28267554 TTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGG 28267613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 TTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGG 5754

 28267614 TTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTT 28267673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 TTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTT 5814

 28267674 TATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTG 28267733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 TATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTG 5874

 28267734 AGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAAT 28267793
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 AGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAAT 5934

 28267794 TTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCC 28267853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 TTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCC 5994

 28267854 ATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTA 28267913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 ATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTA 6054

 28267914 TTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTT 28267973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 TTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTT 6114

 28267974 GCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTAT 28268031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||
     6115 GCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTAT 6172

 28268032 ATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATG 28268091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 ATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATG 6232

 28268092 TCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 TCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 6280

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 6340

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 6400

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 6460

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 6520

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6521 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 6580

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 6640

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 6700

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     6701 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAA- 6759

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6760 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 6805

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 6865

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     6866 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 6925

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 6985

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCT 28269819
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCT 7036

Alignment time is 8.22871 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    5977] =>      5977 nucs 'mol-32-3492-015327_5977'

Score:        5974
Aligned:      5974        nucs
Identic:      5974 (100%) nucs =>      2425 (100%)      3549 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28267276,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273250]
 second seq =>  [       1,    2425] EXCISED REGION [    2427,    5975]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [2426,2426]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [2425,2425] to [2427,2427]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28267276 TTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGA 28267335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGA 60

 28267336 TGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTAT 28267395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTAT 120

 28267396 TAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCA 28267455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCA 180

 28267456 TGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTT 28267515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTT 240

 28267516 GTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCA 28267575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCA 300

 28267576 AATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACC 28267635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACC 360

 28267636 AGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACA 28267695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACA 420

 28267696 TGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCC 28267755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCC 480

 28267756 TCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCT 28267815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCT 540

 28267816 TCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCC 28267875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCC 600

 28267876 CATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATC 28267935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATC 660

 28267936 AATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCAT 28267995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCAT 720

 28267996 TCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCC 28268055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCC 780

 28268056 AATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTG 28268115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTG 840

 28268116 CATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCA 28268175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCA 900

 28268176 GTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAA 28268235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAA 960

 28268236 CTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCT 28268295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCT 1020

 28268296 TTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTG 28268355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTG 1080

 28268356 ACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGAT 28268415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGAT 1140

 28268416 ATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTG 28268475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTG 1200

 28268476 TTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAG 28268535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAG 1260

 28268536 ATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTT 28268595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTT 1320

 28268596 GTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGAT 28268655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGAT 1380

 28268656 CCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTT 28268715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTT 1440

 28268716 CCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTAC 28268775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTAC 1500

 28268776 TCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAG 28268835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAG 1560

 28268836 TTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTC 28268895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTC 1620

 28268896 ATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGG 28268955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGG 1680

 28268956 CTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATA 28269015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATA 1740

 28269016 CCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTC 28269075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTC 1800

 28269076 TTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATA 28269135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATA 1860

 28269136 ATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAA 28269195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAA 1920

 28269196 TATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAG 28269255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAG 1980

 28269256 TATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAG 28269315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAG 2040

 28269316 TTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACT 28269375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACT 2100

 28269376 ATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGA 28269435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGA 2160

 28269436 AATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCC 28269495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCC 2220

 28269496 AGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAA 28269555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAA 2280

 28269556 TGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTT 28269615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTT 2340

 28269616 TGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATG 28269675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATG 2400

 28269676 GCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          |||||||||||||||||||||||||
     2401 GCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 2425

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 2486

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 2546

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 2606

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 2666

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 2726

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 2786

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 2846

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 2906

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 2966

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 3026

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 3086

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 3146

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 3206

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 3266

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 3326

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 3386

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 3446

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 3506

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 3566

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 3626

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 3686

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 3746

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 3806

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 3866

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 3926

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 3986

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 4046

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 4106

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 4166

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 4226

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 4286

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 4346

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 4406

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 4466

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 4526

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 4586

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 4646

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 4706

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 4766

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 4826

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 4886

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 4946

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 5006

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 5066

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 5126

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 5186

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 5246

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 5306

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5307 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 5366

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 5426

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5427 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 5486

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5487 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 5546

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5547 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 5606

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5607 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 5666

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 5726

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 5786

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5787 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 5846

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 5906

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 5966

 28273242 TTTCTTCCA 28273250
          |||||||||
     5967 TTTCTTCCA 5975

Alignment time is 7.01166 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8086] =>      8086 nucs 'mol-32-3492-191253_8086'

Score:        8075
Aligned:      8086        nucs
Identic:      8085 (100%) nucs =>      3955 (100%)      4130 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28265746,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273832]
 second seq =>  [       1,    3955] EXCISED REGION [    3957,    8086]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [3956,3956]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [28273272,28273272]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [3955,3955] to [3957,3957]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28265746 AAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATT 28265805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATT 60

 28265806 ATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGC 28265865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGC 120

 28265866 TGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCA 28265925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCA 180

 28265926 CCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAA 28265985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAA 240

 28265986 ATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCT 28266045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCT 300

 28266046 GAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCA 28266105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCA 360

 28266106 CTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAG 28266165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAG 420

 28266166 GAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATC 28266225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATC 480

 28266226 AGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGA 28266285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGA 540

 28266286 GGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACC 28266345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACC 600

 28266346 CACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTG 28266405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTG 660

 28266406 TAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAAT 28266465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAAT 720

 28266466 TTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATG 28266525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATG 780

 28266526 ATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAG 28266585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAG 840

 28266586 AAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAA 28266645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAA 900

 28266646 ATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAA 28266705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAA 960

 28266706 GTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCA 28266765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCA 1020

 28266766 GTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGT 28266825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGT 1080

 28266826 TTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGC 28266885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGC 1140

 28266886 AAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTT 28266945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTT 1200

 28266946 CTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTA 28267005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTA 1260

 28267006 GTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAAT 28267065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAAT 1320

 28267066 GGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACT 28267125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACT 1380

 28267126 GAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGAT 28267185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGAT 1440

 28267186 TCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCT 28267245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCT 1500

 28267246 CTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTT 28267305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTT 1560

 28267306 CCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTC 28267365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTC 1620

 28267366 TGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATG 28267425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATG 1680

 28267426 TTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAG 28267485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAG 1740

 28267486 TATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCT 28267545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCT 1800

 28267546 TTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCA 28267605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCA 1860

 28267606 GTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTT 28267665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTT 1920

 28267666 TCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTA 28267725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTA 1980

 28267726 TGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAA 28267785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAA 2040

 28267786 GAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTA 28267845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTA 2100

 28267846 TTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAAC 28267905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAAC 2160

 28267906 ACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCA 28267965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCA 2220

 28267966 TCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATG 28268025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATG 2280

 28268026 ATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTAT 28268085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGTATATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTAT 2340

 28268086 TCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGA 28268145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGA 2400

 28268146 ATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCT 28268205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGATTTGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCT 2460

 28268206 CTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTAC 28268265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGTTTTAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTAC 2520

 28268266 ATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGT 28268325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTCCCACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGT 2580

 28268326 TTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTT 28268385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTTTTGACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTT 2640

 28268386 TTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCT 28268445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGATTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCT 2700

 28268446 GCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGT 28268505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGT 2760

 28268506 TGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGT 28268565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTTTGTTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGT 2820

 28268566 TTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTG 28268625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGAAAATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTG 2880

 28268626 CTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACA 28268685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGTGCAAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACA 2940

 28268686 TTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCC 28268745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGCTTTTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCC 3000

 28268746 TAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATT 28268805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAGAATTTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATT 3060

 28268806 TTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCT 28268865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTGTTTATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCT 3120

 28268866 ATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTA 28268925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATCCCAGCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTA 3180

 28268926 CCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCA 28268985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCTGAAGATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCA 3240

 28268986 TTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAG 28269045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAG 3300

 28269046 TAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAG 28269105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TAAGGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAG 3360

 28269106 GCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGA 28269165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGA 3420

 28269166 TGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCAT 28269225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGTTAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCAT 3480

 28269226 TTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCA 28269285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTCAACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCA 3540

 28269286 TCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTG 28269345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTG 3600

 28269346 GTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGG 28269405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTTAGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGG 3660

 28269406 CTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCAC 28269465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTCTCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCAC 3720

 28269466 ACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTC 28269525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACCTGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTC 3780

 28269526 AAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTA 28269585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAAAAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTA 3840

 28269586 TCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATA 28269645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTTGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATA 3900

 28269646 GGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGAGTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 3955

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 4016

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 4076

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 4136

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 4196

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 4256

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 4316

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 4376

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 4436

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 4496

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 4556

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 4616

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 4676

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 4736

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 4796

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 4856

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 4916

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 4976

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 5036

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 5096

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 5156

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 5216

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 5276

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 5336

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 5396

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 5456

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 5516

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 5576

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 5636

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 5696

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 5756

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 5816

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 5876

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 5936

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 5996

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 6056

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 6116

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 6176

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 6236

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 6296

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 6356

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 6416

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 6476

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 6536

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 6596

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 6656

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 6716

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 6776

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 6836

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 6896

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 6956

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 7016

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 7076

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 7136

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 7196

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 7256

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 7316

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 7376

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 7436

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 7496

 28273242 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 28273301
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     7497 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 7555

 28273302 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 28273361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7556 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 7615

 28273362 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 28273421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7616 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 7675

 28273422 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 28273481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7676 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 7735

 28273482 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 28273541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7736 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 7795

 28273542 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 28273601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7796 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 7855

 28273602 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 28273661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7856 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 7915

 28273662 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 28273721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7916 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 7975

 28273722 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 28273781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7976 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 8035

 28273782 CCTGTATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTT 28273832
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8036 CCTGTATACTTTTTGGGGTTTTTTTTTGTCGTTTGTTTGTCTGTCTTTTTT 8086

Alignment time is 9.37791 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    8357] =>      8357 nucs 'mol-32-34a8-191102_8357'

Score:        7723
Aligned:      8382        nucs
Identic:      8300 ( 99%) nucs =>      3594 ( 99%)      4706 ( 99%)
Gaps:           35 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264516,28268139] EXCISED REGION [28269049,28273796]
 second seq =>  [       1,    3623] EXCISED REGION [    3624,    8357]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       909 nucs [28268140,28269048]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [28268140,28268143] to [28269049,28269052]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28264516 CAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGC 28264575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGC 60

 28264576 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT 28264635
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT 120

 28264636 -TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGA 28264694
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      121 CTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGA 180

 28264695 CCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACT 28264754
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACT 240

 28264755 GCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAA 28264814
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAA 300

 28264815 AACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTTT 28264874
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      301 AACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTT- 359

 28264875 CA---ATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAAT 28264931
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 --GCGATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAAT 417

 28264932 CAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGT 28264991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 CAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGT 477

 28264992 AGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTC 28265051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 AGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTC 537

 28265052 TCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATA 28265111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATA 597

 28265112 CAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGA 28265171
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CAATAACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGA 657

 28265172 AAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAA 28265231
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AAGAAGCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAA 717

 28265232 AACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAA 28265291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAA 777

 28265292 CATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGA 28265351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 CATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGA 837

 28265352 AGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGA 28265411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 AGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGA 897

 28265412 AGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTC 28265471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 AGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTC 957

 28265472 AAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGT 28265531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 AAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGT 1017

 28265532 ACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAAT 28265591
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 ACATTTTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAAT 1077

 28265592 GAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGAT 28265651
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GAAAGGAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGAT 1137

 28265652 GACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAA 28265711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1138 GACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAA 1197

 28265712 GAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTC 28265771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTC 1257

 28265772 TTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAAT 28265831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAAT 1317

 28265832 GTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAAT 28265891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAAT 1377

 28265892 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGC 28265951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGC 1437

 28265952 CTGGGCAACAAGATGAAACCC-ATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGT 28266010
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CTGGGCAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGT 1497

 28266011 GGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTG 28266070
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GGTGTGTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTG 1557

 28266071 AGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAG 28266130
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAG 1617

 28266131 TGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAA-GTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATT 28266189
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATT 1677

 28266190 TAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAA 28266249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAA 1737

 28266250 TACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGAT 28266309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGAT 1797

 28266310 AAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAG 28266369
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1798 AAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAG 1857

 28266370 AAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAAC 28266429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1858 AAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAAC 1917

 28266430 AGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAG 28266489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAG 1977

 28266490 ATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCA 28266549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
     1978 ATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCA 2037

 28266550 TATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTT 28266609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTT 2097

 28266610 ATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATAT 28266669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 ATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATAT 2157

 28266670 TAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATA 28266729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATA 2217

 28266730 AATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGG 28266789
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AATAAATA----GGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGG 2273

 28266790 AGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGG 28266849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGG 2333

 28266850 TGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTG 28266909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTG 2393

 28266910 AGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATC 28266969
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2394 AGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATC 2453

 28266970 CCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGG 28267029
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGG 2513

 28267030 AAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAG 28267089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAG 2573

 28267090 ACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGG 28267149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 ACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGG 2633

 28267150 AGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGA 28267209
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 AGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGA 2693

 28267210 GGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTAT 28267269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTAT 2753

 28267270 ACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGC 28267329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 ACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGC 2813

 28267330 ATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCA 28267389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 ATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCA 2873

 28267390 TTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTAC 28267449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 TTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTAC 2933

 28267450 TAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGG 28267509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 TAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGG 2993

 28267510 CTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCT 28267569
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2994 CTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCT 3053

 28267570 TTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCT 28267629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCT 3113

 28267630 ATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGG 28267689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGG 3173

 28267690 GGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAG 28267749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 GGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAG 3233

 28267750 TGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCA 28267809
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TGATCCTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCA 3293

 28267810 CTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGA 28267869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGA 3353

 28267870 GTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCC 28267929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 GTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCC 3413

 28267930 TGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAA 28267989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 TGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAA 3473

 28267990 TTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTT 28268047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||
     3474 TTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTT 3531

 28268048 CTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAA 28268107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 CTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAA 3591

 28268108 TAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 28268139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 TAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTT 3623

EXCISED REGION

 28269049 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 28269108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 GGTAATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCT 3683

 28269109 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 28269168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 CTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGT 3743

 28269169 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 28269228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 TAGTAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTC 3803

 28269229 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 28269288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 AACAATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCT 3863

 28269289 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTT 28269348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3864 ATGATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGCTCTTTCACCTCCTTGGTT 3923

 28269349 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 28269408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 AGATGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTC 3983

 28269409 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 28269468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 TCAGCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACC 4043

 28269469 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAA 28269528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     4044 TGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCA-- 4101

 28269529 AAATAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 28269588
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 --------------AAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCT 4147

 28269589 TGAAATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 28269648
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 TGAAATTTTACTGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGA 4207

 28269649 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGT 28269708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4208 GTCCAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGT 4267

 28269709 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 28269768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACA 4327

 28269769 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 28269828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 AAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGC 4387

 28269829 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 28269888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 CTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCAT 4447

 28269889 CCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 28269948
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 CTTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATG 4507

 28269949 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCT 28270008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4508 CTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAGTATGTTCCT 4567

 28270009 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGAT 28270068
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
     4568 TTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGTTTTTATCATGAAGTGATGTTGGATTTTACTGAAAGAT 4627

 28270069 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 28270128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATC 4687

 28270129 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 28270188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4688 ACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGAATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGA 4747

 28270189 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 28270248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 TCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATT 4807

 28270249 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 28270308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 TTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATT 4867

 28270309 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 28270368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 CCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCAT 4927

 28270369 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAA 28270428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4928 TTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACAGTAGGGAA 4987

 28270429 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 28270488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 AGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATA 5047

 28270489 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 28270548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 AGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGC 5107

 28270549 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 28270608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 CAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATG 5167

 28270609 AACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 28270668
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 AATGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCT 5227

 28270669 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGG 28270728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5228 TTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTCTCTCTTTTTGAAGG 5287

 28270729 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 28270788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 ATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACT 5347

 28270789 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 28270848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 TCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCA 5407

 28270849 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 28270908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 GTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTT 5467

 28270909 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 28270968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 TTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGT 5527

 28270969 TTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 28271028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 TTTACAACCTCCTCCTTTTCCTCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGC 5587

 28271029 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 28271088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5588 TGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTTGTAAAAGCACAGGTGGTGTT 5647

 28271089 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTT 28271148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5648 ATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCTGGTGTT 5707

 28271149 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCC 28271208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5708 ACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTTAACAATGTGCAATTTATCC 5767

 28271209 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 28271268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 CTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAG 5827

 28271269 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 28271328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5828 CCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCA 5887

 28271329 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 28271388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 CCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAA 5947

 28271389 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 28271448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 AGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAA 6007

 28271449 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 28271508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6008 CTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATG 6067

 28271509 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 28271568
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 TTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTCCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGT 6127

 28271569 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 28271628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 ATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTT 6187

 28271629 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 28271688
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 TGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACTGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTG 6247

 28271689 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 28271748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 TGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTT 6307

 28271749 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 28271808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6308 TGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGT 6367

 28271809 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 28271868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6368 TGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGT 6427

 28271869 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 28271928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6428 GTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTT 6487

 28271929 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 28271988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6488 TTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGT 6547

 28271989 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 28272048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6548 AGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTAT 6607

 28272049 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 28272108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6608 ATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCT 6667

 28272109 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 28272168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6668 GCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCA 6727

 28272169 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 28272228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6728 TTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTT 6787

 28272229 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 28272288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6788 AGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTG 6847

 28272289 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 28272348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6848 CTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAGAGGTTTA 6907

 28272349 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 28272408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6908 ATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTTGGCTTCT 6967

 28272409 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGAATATCAC 28272468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6968 GCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGCGGGATCTGGAATATCAC 7027

 28272469 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 28272528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 ATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAACAACCAGA 7087

 28272529 TCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 28272588
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 TCTCACGTGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACCAAGCCAT 7147

 28272589 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 28272648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 CCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCATTTCACAT 7207

 28272649 GAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 28272708
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 GAGATTTGGAGGGGACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCTTAAAGAA 7267

 28272709 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 28272768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 TTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGTAGTTTAA 7327

 28272769 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 28272828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7328 TTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTTTTATTCC 7387

 28272829 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 28272888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7388 ACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAGACTTGCC 7447

 28272889 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 28272948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7448 TTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCTATGTGTAGATGAGAAGAATGTG 7507

 28272949 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 28273008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7508 GTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGTTGAATTT 7567

 28273009 AATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 28273068
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7568 AAGTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTGTCAGTGG 7627

 28273069 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 28273128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7628 GTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTACTTGTTTT 7687

 28273129 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 28273188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7688 ATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTATTTAGGATAGTTAAGTCTTCTTGT 7747

 28273189 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 28273248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7748 TGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTTTTTCTTC 7807

 28273249 CATAGATTATACCTTTGGCATTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCAC 28273306
          |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7808 CATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTTGCAC 7867

 28273307 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACG 28273366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7868 TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTCCCACG 7927

 28273367 TTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGCCACTA 28273426
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     7928 TTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCTTCCGCCACTA 7987

 28273427 CGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATG 28273486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7988 CGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCAGGATG 8047

 28273487 GTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACA 28273546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8048 GTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACA 8107

 28273547 GGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCAACAAA 28273606
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     8108 GGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCACCAAA 8167

 28273607 CCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCT 28273666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8168 CCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTATGTCT 8227

 28273667 TACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTC 28273726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8228 TACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTGGTTTC 8287

 28273727 TTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGT 28273786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8288 TTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGACCTGT 8347

 28273787 ATACTTTTTG 28273796
          ||||||||||
     8348 ATACTTTTTG 8357

Alignment time is 9.74624 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    3627] =>      3627 nucs 'mol-32-34a8-191102_3627'

Score:        3332
Aligned:      3630        nucs
Identic:      3598 ( 99%) nucs =>       353 ( 98%)      3245 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28264516,28264873] EXCISED REGION [28264877,28268143]
 second seq =>  [       1,     359] EXCISED REGION [     363,    3627]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [28264874,28264876]
 second seq =>         3 nucs [360,362]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [360,360] to [362,362]

 28264516 CAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGC 28264575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCCCGCCATTCTCCTGC 60

 28264576 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT 28264635
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCTGGCCTGGCTAATTTTTTT 120

 28264636 -TGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTTAACTCCTGA 28264694
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      121 CTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGTCTTCAACTCCTGA 180

 28264695 CCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACT 28264754
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCAAATGATCCTCACACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACT 240

 28264755 GCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAA 28264814
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAGCTGGCTGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATATGAAGCCAGCTAA 300

 28264815 AACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTT 28264873
          |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAGAAGGTTTAAATACGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTAGATTTCCAGGTT 359

EXCISED REGION

 28264877 ATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATA 28264936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 ATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAAAAAACACAATCAATA 422

 28264937 GATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCA 28264996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 GATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAAGATTTTAGGTAGCCA 482

 28264997 CCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGT 28265056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 CCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGAAAAATATGTCTCAGT 542

 28265057 AAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATA 28265116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 AAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAAATGAAAAATACAATA 602

 28265117 ACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAA 28265176
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 ACTGAAAAGTAAACATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGGAGCCATATGAAAGAA 662

 28265177 GCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCT 28265236
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 GCAGTGACTGGAAGATACAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACAACAGAGAGAAAACCT 722

 28265237 TGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTT 28265296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 TGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAAAAAAATTGAACATTT 782

 28265297 ATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAA 28265356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 ATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAAAAATACTTGAAGAAA 842

 28265357 TAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTG 28265416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 TAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTACGTATTTAAGAAGCTG 902

 28265417 AATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACT 28265476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 AATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACATAATACAGTCAAACT 962

 28265477 TCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATA 28265536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      963 TCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGAAGGAAGTGGTACATT 1022

 28265537 TTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAG 28265596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 TTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTCATTCAACAATGAAAG 1082

 28265597 GAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTA 28265656
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 GAAAATCAAGACAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGCCTTTTAGGATGACTA 1142

 28265657 AAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAACACAAGAATA 28265716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1143 AAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCTTGAAATACAAGAATA 1202

 28265717 AAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAG 28265776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 AAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTTCTTTCTCCTCTTGAG 1262

 28265777 TTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATA 28265836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 TTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGTGGTTCTAAATGTATA 1322

 28265837 TAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAG 28265896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 TAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAG 1382

 28265897 CACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGG 28265956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 CACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGG 1442

 28265957 CAACAAGATGAAA-CCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGT 28266015
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 CAACAAGATGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTTGGGCATGGTGGTGT 1502

 28266016 GTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGG 28266075
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 GTGCCTGTGATCACTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCTGAGAGG 1562

 28266076 CAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGA 28266135
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 CAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAGA 1622

 28266136 CCCCTTCTC-AAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAAT 28266194
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 CCCCTTCTCAAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGAGTAAGATTTAAAT 1682

 28266195 GACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCC 28266254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 GACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAATTACATAATACCC 1742

 28266255 AAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATA 28266314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 AAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTACTATAGATAAATA 1802

 28266315 AAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAGAAACAGAAAGA 28266374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1803 AAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAAAAAAACAGAAAGA 1862

 28266375 CTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAG 28266434
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 CTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAGGTGTAATGATCTGGATATTGTGATAACAGTAG 1922

 28266435 ATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATG 28266494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 ATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTACATATTAGATATG 1982

 28266495 AGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGATAGGAGCATATGA 28266554
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
     1983 AGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTTAGATTTTGACAGGAGCATATGA 2042

 28266555 GTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGC 28266614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 GTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTTGACAATTTATTGC 2102

 28266615 TAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGA 28266674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTTCCCTATATTAAGA 2162

 28266675 ACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTAAATAAATAAATAA 28266734
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||
     2163 ACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTC----TAAATAAATAA 2218

 28266735 ATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAA 28266794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAATACCCGGGAGGAA 2278

 28266795 TGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTG 28266854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCATTATATGGTGCTG 2338

 28266855 TCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAAT 28266914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAAT 2398

 28266915 GGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGC 28266974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2399 GGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCATGGAATTTTTGCTTCCTATCCCAGC 2458

 28266975 AACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTG 28267034
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAGCTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTG 2518

 28267035 GGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGC 28267094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAGAAGATGAGACTGC 2578

 28267095 TACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGG 28267154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGG 2638

 28267155 TGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAA 28267214
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGGTGTTACCCTACTTGTTAAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTGAAATTGGAGGCAA 2698

 28267215 GGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCAT 28267274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAAGTGGCTATACCAT 2758

 28267275 TTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTG 28267334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACCCTCTCAGCATTTG 2818

 28267335 ATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTA 28267394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTGATATCTCATTGTA 2878

 28267395 TTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCC 28267454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAATATGCCTACTAGCC 2938

 28267455 ATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTT 28267514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTATAATTGGGCTGTT 2998

 28267515 TGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATC 28267574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2999 TGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGTGTATTTTGGATAACAGTCCTTTATC 3058

 28267575 AAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTAC 28267634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTTTTCATTCTATTAC 3118

 28267635 CAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTAC 28267694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAGATTCAGGGGGTAC 3178

 28267695 ATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATC 28267754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAGGGTGCAAGTGATC 3238

 28267755 CTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCC 28267814
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CTGTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAACCCTCCGCACTTCC 3298

 28267815 TTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACC 28267874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCATGAGTACC 3358

 28267875 CCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCAT 28267934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCAT 3418

 28267935 CAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCA 28267994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 CAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGAGGATATAATTTCA 3478

 28267995 TTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCA--TGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTA 28268052
          |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTC--TGTGATGTATATATATACCACGTTTTCTTTA 3536

 28268053 TCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTG 28268112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTATTGCAAATAGTG 3596

 28268113 CTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 28268143
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTA 3627

Alignment time is 4.28191 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,    7132] =>      7132 nucs 'mol-32-34be-122612_7132'

Score:        7131
Aligned:      7131        nucs
Identic:      7131 (100%) nucs =>      3049 (100%)      4082 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28266652,28269700] EXCISED REGION [28269702,28273783]
 second seq =>  [       1,    3049] EXCISED REGION [    3051,    7132]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28269701,28269701]
 second seq =>         1 nucs [3050,3050]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28269700,28269700] to [28269702,28269702]
 second seq =>         1 nucs [3049,3049] to [3051,3051]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28266652 GTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCAT 28266711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCAGTTTTTCCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCAT 60

 28266712 ACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACT 28266771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAGGTCTAAATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACT 120

 28266772 TGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAA 28266831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGAGAAAATACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAA 180

 28266832 TTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCA 28266891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGAGACCATTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCA 240

 28266892 AGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTG 28266951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGGGTGAGGCAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTG 300

 28266952 GAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCC 28267011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATTTTTGCTTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCC 360

 28267012 AAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCC 28267071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGTGGTGGTAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCC 420

 28267072 ACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCA 28267131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGAACTAGAAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCA 480

 28267132 ACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAAT 28267191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATGCGTAAAAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAAT 540

 28267192 TACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGG 28267251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACCAAACTGAAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGG 600

 28267252 TGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGT 28267311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCTCTTAAGTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGT 660

 28267312 GTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAG 28267371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTCCACACCCTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAG 720

 28267372 GTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAAC 28267431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTATAGTGATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAAC 780

 28267432 ATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTT 28267491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCTTTAAATATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTT 840

 28267492 GCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGT 28267551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCTATTTTATAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGT 900

 28267552 ATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTAT 28267611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTTGGATAACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTAT 960

 28267612 GGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACT 28267671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTTGTCTTTTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACT 1020

 28267672 TTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGC 28267731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTATTTTAGATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGC 1080

 28267732 TGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTA 28267791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAGATTTAGGGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTA 1140

 28267792 ATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTG 28267851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTTTCAACCCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTG 1200

 28267852 CCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAG 28267911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATCTTTATGTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAG 1260

 28267912 TATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATG 28267971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATG 1320

 28267972 TTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTAT 28268031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGCTGCAGAGGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTAT 1380

 28268032 ATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATG 28268091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATATACCACGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATG 1440

 28268092 TCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATT 28268151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTTTGCTATTGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATT 1500

 28268152 TGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTT 28268211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTTTTCTTTTGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTT 1560

 28268212 TAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCC 28268271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAGTTCTTTGAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCC 1620

 28268272 ACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTT 28268331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCACCAATGTATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTT 1680

 28268332 GACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATT 28268391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GACTTTTTAATAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATT 1740

 28268392 TGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGT 28268451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCATTTCTCTGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGT 1800

 28268452 ATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTG 28268511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTCTTCTTTTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTG 1860

 28268512 TTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAA 28268571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTTCTTGTTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAA 1920

 28268572 ATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGC 28268631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATATTTTCTTCCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGC 1980

 28268632 AAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTT 28268691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTT 2040

 28268692 TTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAAT 28268751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGAGGATTTGTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAAT 2100

 28268752 TTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTT 28268811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTTCTAGGATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTT 2160

 28268812 TATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCA 28268871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATGGTAAAAAGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCA 2220

 28268872 GCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAA 28268931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCACCATTTATTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAA 2280

 28268932 GATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTC 28268991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATTGGGTGGCTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTC 2340

 28268992 TATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGT 28269051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATGTGTCTGTTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGT 2400

 28269052 AATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTT 28269111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATGTAATGCCTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTT 2460

 28269112 TTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAG 28269171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTGGTTCCATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAG 2520

 28269172 TAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAAC 28269231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAGTTTGATAGGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAAC 2580

 28269232 AATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATG 28269291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATATTGATTCTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATG 2640

 28269292 ATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGA 28269351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTCTTTTAGCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGA 2700

 28269352 TGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCA 28269411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTATTCCTAGCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCA 2760

 28269412 GCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGA 28269471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCTTGAACATTATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGA 2820

 28269472 GCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAA 28269531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAA 2880

 28269532 TAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGA 28269591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAAAAAGAAAGAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGA 2940

 28269592 AATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTC 28269651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATTTTACCGAAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTC 3000

 28269652 CAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 28269700
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGTATCATTCTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGA 3049

EXCISED REGION

 28269702 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 28269761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 AAACAGTTCCAGGAGCATTTTGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTC 3110

 28269762 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 28269821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 ATCCACAAAGAAAGATAGTTTGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTT 3170

 28269822 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 28269881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 CTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAG 3230

 28269882 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 28269941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 TGGGCATCCTTGTCTTGTTCCAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAG 3290

 28269942 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 28270001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 TATGATGCTGGCTTTATGATGCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATA 3350

 28270002 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 28270061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 TGTTCCTTTGATGCCCAGTCTCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATT 3410

 28270062 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 28270121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GAAAGATTTTTCTGTGTCTACTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTA 3470

 28270122 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 28270181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GTGAATCACATTTATTGATTCACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCC 3530

 28270182 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 28270241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TACTTGATCATGGTGAATTAACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATAT 3590

 28270242 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 28270301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GTATATTTTTGTCTCCCTACCATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCA 3650

 28270302 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 28270361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TAACATTCCATACGTACTTAAAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAA 3710

 28270362 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 28270421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 CAGGCATTTTGGACAACATATTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGG 3770

 28270422 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 28270481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TAGGGAAAGTTCTCATTCTGCATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAA 3830

 28270482 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 28270541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TGAAATAAGATGGAATATTCGTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCT 3890

 28270542 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 28270601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 TCACTGCCAGAGATCTTGAATAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATA 3950

 28270602 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 28270661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 ATTGATGAACGTGGTTTCCACTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCAT 4010

 28270662 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 28270721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TTTTGCTTTAATATCTTCTACAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTT 4070

 28270722 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 28270781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TTGAAGGATTCTTGTCTTTTTTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCG 4130

 28270782 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 28270841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TTTGACTTCTGTGCTTTTTTGGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTT 4190

 28270842 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 28270901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TTTTTCAGTTTCCTCATCATCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGC 4250

 28270902 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 28270961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 AACTTTTTTCTGTGAAATCTTGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACT 4310

 28270962 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 28271021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 TAAGAGTTTTACAACCTCCTCCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTAC 4370

 28271022 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 28271081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 TACGTGCTGTCCACTATTATGCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGG 4430

 28271082 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 28271141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TGGTGTTATTTCAAAGCCCCCAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGC 4490

 28271142 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 28271201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 CGGTGTTACTTTAATTGGATTTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAA 4550

 28271202 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 28271261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TTTATCCCTCACACCAGCCCCTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTT 4610

 28271262 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 28271321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TGGTCAGCCTTTAGTTCACAACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCC 4670

 28271322 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 28271381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 ATGTCCACCAAATCTTCCATGGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATG 4730

 28271382 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 28271441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 GAGATAAAGGACTACTGCTCCAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACT 4790

 28271442 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 28271501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 GAATTAACTTTTTGATGTGCTGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGC 4850

 28271502 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 28271561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 ATTTATGTTCATCAGGGATATGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGA 4910

 28271562 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 28271621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 TTTTGGTATCAGGATGATGGTAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTG 4970

 28271622 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 28271681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 ACTTTTTTGGAATAGTTTTAGTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAAT 5030

 28271682 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 28271741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 TCAGCTGTGAATCCATCTGGTCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCT 5090

 28271742 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 28271801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 TCAATTTTGGTATTCGATATTGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATT 5150

 28271802 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 28271861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 GGGAGGTTGTGTGTTTCCAGGGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCA 5210

 28271862 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 28271921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 TAGAGGTGTTCATAATAGTCTCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATG 5270

 28271922 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 28271981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 TCACCTTTTTTGTTTCCGATTGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATAT 5330

 28271982 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 28272041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 AGCTAGTAGTCTCTTTATCTTGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGAT 5390

 28272042 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 28272101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 TCTTTATATGGACTTTGGGTCTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTC 5450

 28272102 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 28272161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 TTCTTCTGCTAGTTTGGGGTTACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGT 5510

 28272162 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 28272221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 TAGATCATTCATTTGAAATCTTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTT 5570

 28272222 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 28272281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 TTCCCTTAGCATTGCTTTTGCTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGT 5630

 28272282 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 28272341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 TAGTCTGCTTTTGTGTCATTATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAGAAAAG 5690

 28272342 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 28272401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 AGGTTTAATTGGCTCATGATTCTGCAGGCTGTACAGAAAGCATGGCACCAGCATCTTCTT 5750

 28272402 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 28272461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 GGCTTCTGCTGAGGCCTCAGAGGGCTTACAATCATGTTGGAAGACAAAGTGGGATCTGGA 5810

 28272462 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 28272521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 ATATCACATGGTGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAAGTGGGGAGGTGCCACAATTTCTTAAAC 5870

 28272522 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 28272581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 AACCAGATCTCACATGAACTAATAGAGTGAGCATTCACTCAATATTGCTAGGACAGCACC 5930

 28272582 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 28272641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 AAGCCATCCATGAGGGAGCCACCTCCATGACCCAAACACCTGCCACTAGCCCCTCCTCAT 5990

 28272642 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 28272701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 TTCACATGAGATTTGGAGGGTACACACATCCAAACCGTATCACTCTGTTTTCATTTATCT 6050

 28272702 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 28272761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6051 TAAAGAATTTCTTGACTTCTGCCTTAACTTTGTTGTCCCAAAAATCATTCAAGAGCAAGT 6110

 28272762 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 28272821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 AGTTTAATTTCCATGTAATCGTGCAATTTTGAGAGATCATCTTAGTATTGATTTCTATTT 6170

 28272822 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 28272881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 TTATTCCACTATGGTCCAAGAGTATGATTGGTATGACTTTGATTTTTTTAATTTATTGAG 6230

 28272882 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 28272941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 ACTTGCCTTGTGGCCAAGCATGTGACTGATCTTGGAGTATGTTCCATGTGTAGATGAGAA 6290

 28272942 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 28273001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 GAATGTGGTTGATGAGTGGAGTATTCTGTAGATGTCTATTTGTTCCAATTGATCGAGTGT 6350

 28273002 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 28273061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 TGAATTTAATTCCAGAACTTTTTTTGTTAGTTTTCTGCCTCAGTGATCTGTCTAATGCTG 6410

 28273062 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 28273121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 TCAGTGGGTTGTTGAAGTCCCCCATTATTATTCTGTGGCTAAGTCTTTGTAGATCTGTAC 6470

 28273122 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 28273181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 TTGTTTTATAAATCTGGGTGCTCCAATGTTGAGTGCATATCTGTTTAGGATAGTTAAGTC 6530

 28273182 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 28273241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 TTCTTGTTGAATTGCACTCCTTAAATGATTTTAATTGTAATGAAGTCCAAATTAATACTT 6590

 28273242 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 28273301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 TTTCTTCCATAGATTATACCTTTGGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGAGTCT 6650

 28273302 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 28273361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 TGCACTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCGATCTCGGCTCGGGCAAGCTCCGCCTC 6710

 28273362 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 28273421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 CCACGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCGTCCGC 6770

 28273422 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 28273481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 CACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCACTGTGTTACCCA 6830

 28273482 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 28273541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 GGATGGTCTCAATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTAGGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 6890

 28273542 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 28273601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 TTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCTGCCTTACCTTTGGTATTCTATCTAAAAACTTATCA 6950

 28273602 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 28273661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 ACAAACCCAAGGTCACCTAGAGTTTCTCCTATTTTATCTTCTAAGAATTTTATAGTTTTA 7010

 28273662 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 28273721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 TGTCTTACATTTAGGCGTATGATCCATTTTGAGGGTTTTTTCAGGGTTTTTTAAAAATTG 7070

 28273722 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 28273781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 GTTTCTTCAGATTTTCTTCATAGACAATCTATGAACAAAGACGGTGTTCTCTCTTTCTGA 7130

 28273782 CC 28273783
          ||
     7131 CC 7132

Alignment time is 8.28413 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [28258139,28279048] =>     20910 nucs '13 dna:chromosome chromosome:GRCh37:13:1:115169878:1'
Second seq [       1,   11513] =>     11513 nucs 'mol-32-34c9-158889_11513'

Score:       11490
Aligned:     11512        nucs
Identic:     11510 (100%) nucs =>      3677 (100%)      7833 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [28260824,28264500] EXCISED REGION [28264502,28272336]
 second seq =>  [       1,    3677] EXCISED REGION [    3679,   11513]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [28264501,28264501]
 second seq =>         1 nucs [3678,3678]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [28264500,28264500] to [28264502,28264502]
 second seq =>         1 nucs [3677,3677] to [3679,3679]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 28260824 GTTTCCAACAAAAAAAACTATGAGACATGCAAAGAAACAGGAAAATATGGCTCATATACT 28260883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTCCAACAAAAAAAACTATGAGACATGCAAAGAAACAGGAAAATATGGCTCATATACT 60

 28260884 GAGGGAAAAAAGCAGGCAACAGAAATTACCTGTGAAAGTGACCAGATTTTGGATTTAACA 28260943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGGAAAAAAGCAGGCAACAGAAATTACCTGTGAAAGTGACCAGATTTTGGATTTAACA 120

 28260944 AAGACTTCAAAGTAGCCATTATAAATATGTTCAAAGAACTAAAGGAAACCATGATTAAAG 28261003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGACTTCAAAGTAGCCATTATAAATATGTTCAAAGAACTAAAGGAAACCATGATTAAAG 180

 28261004 AAGTAAATGAAGGTGTGATGACAATATTGCATCAGATAGACAGTATTAATAAAGATACAA 28261063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTAAATGAAGGTGTGATGACAATATTGCATCAGATAGACAGTATTAATAAAGATACAA 240

 28261064 ATTATTTAAAAAGATAGAAATTCTGGGGTTGAAAGGTACAATGATTGAAATGAAAAGTTT 28261123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATTTAAAAAGATAGAAATTCTGGGGTTGAAAGGTACAATGATTGAAATGAAAAGTTT 300

 28261124 ATCAGAGGGGCTCAACTTCTTGTGAAAGAATTAGCAGACTTGAAGATAGATTGATTCAGA 28261183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCAGAGGGGCTCAACTTCTTGTGAAAGAATTAGCAGACTTGAAGATAGATTGATTCAGA 360

 28261184 TTATACAATCCAAAGAACACAGAGAAAAAGAATGAAGAAAAATGAACAGAGTCTCAGAGA 28261243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATACAATCCAAAGAACACAGAGAAAAAGAATGAAGAAAAATGAACAGAGTCTCAGAGA 420

 28261244 AATGTGGGATATCATTAAGCACGCCAACATAAATGTAATGAGAGTACCAGAAGAACAGAA 28261303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGTGGGATATCATTAAGCACGCCAACATAAATGTAATGAGAGTACCAGAAGAACAGAA 480

 28261304 GAGAAAGGATTTATTTGTATATAAAAACCATAATGACCTGACACATCAATTAGAATATCT 28261363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAAAGGATTTATTTGTATATAAAAACCATAATGACCTGACACATCAATTAGAATATCT 540

 28261364 AAAATTAAAAATAGCAGCCATCCCAAATGTTAGCAACAATGTGAAGCAACTACAGCTCTC 28261423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATTAAAAATAGCAGCCATCCCAAATGTTAGCAACAATGTGAAGCAACTACAGCTCTC 600

 28261424 ATACACTGATGATAGAAATGTAAAATTGTACAACTACTTTATAAAACAGTTTGACAGGTT 28261483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATACACTGATGATAGAAATGTAAAATTGTACAACTACTTTATAAAACAGTTTGACAGGTT 660

 28261484 TTTAAATGGTTACACATATATTTATTATATAATGCAGCGATTCCTTTCTTAGGTGTCTTA 28261543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTAAATGGTTACACATATATTTATTATATAATGCAGCGATTCCTTTCTTAGGTGTCTTA 720

 28261544 CCCAAGAGAAAGGAAGTCATATGCCCATACAAATACTTATTCATAAACATTCCTAACAGC 28261603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAAGAGAAAGGAAGTCATATGCCCATACAAATACTTATTCATAAACATTCCTAACAGC 780

 28261604 ACTATTTGTAATAGTCAAAAACTGAAAACAACCCAAATGTCCATCAAGAGGTGAATACAT 28261663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTATTTGTAATAGTCAAAAACTGAAAACAACCCAAATGTCCATCAAGAGGTGAATACAT 840

 28261664 TATCAAGTTATGGTATATTTATGCAACAGAATACTGCTCAGCAATAAAAATAATTTAGTA 28261723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATCAAGTTATGGTATATTTATGCAACAGAATACTGCTCAGCAATAAAAATAATTTAGTA 900

 28261724 TTGATTTATACAATAACATGAATCACATGGATAAATGTTGATAAACTTCAAAATAATTAT 28261783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGATTTATACAATAACATGAATCACATGGATAAATGTTGATAAACTTCAAAATAATTAT 960

 28261784 GCTGAATGAAAGAAGTCAGATGAAGAGAGTACACAGTTTTGCTTCCCTTTATCTAAAATT 28261843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGAATGAAAGAAGTCAGATGAAGAGAGTACACAGTTTTGCTTCCCTTTATCTAAAATT 1020

 28261844 CTAAAAAGTGCAAACATCTATAGTGACAGAAAGCAGATCAGTGGTTGCCTGCGGTGGGGT 28261903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAAAAAGTGCAAACATCTATAGTGACAGAAAGCAGATCAGTGGTTGCCTGCGGTGGGGT 1080

 28261904 TGAAGTGAGGAACAGGCAGACGTGAACAAAGGGGAACGAGGAAATGCTAGGGGTAATTAA 28261963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAAGTGAGGAACAGGCAGACGTGAACAAAGGGGAACGAGGAAATGCTAGGGGTAATTAA 1140

 28261964 TATGTTCATTATCTTGATTATGGTGATGGTTTCACAGGTGTGTGCATAGGTCAACATGTA 28262023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATGTTCATTATCTTGATTATGGTGATGGTTTCACAGGTGTGTGCATAGGTCAACATGTA 1200

 28262024 TAAAGCTTTATGCTTTAAATATATTACTTTGTTTTATACCAATTATGCCTCAATATAGTT 28262083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAAGCTTTATGCTTTAAATATATTACTTTGTTTTATACCAATTATGCCTCAATATAGTT 1260

 28262084 GTTTTAAAAATGTTATCAGAGAAAGAAGAAAACTAAAGTGAAGTAAATAATCATCCAGCT 28262143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTTTAAAAATGTTATCAGAGAAAGAAGAAAACTAAAGTGAAGTAAATAATCATCCAGCT 1320

 28262144 ATTGGCTGATGGGTATTGTTATTCACATAAAAATTTTTCTAATAAAGAGTAAAAGTTGTA 28262203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTGGCTGATGGGTATTGTTATTCACATAAAAATTTTTCTAATAAAGAGTAAAAGTTGTA 1380

 28262204 TTTGAAAAAAAATCCTGGCACCCCAGTCCCGAGGATCCCTAGAAAATTTACAGGGGTGGC 28262263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGAAAAAAAATCCTGGCACCCCAGTCCCGAGGATCCCTAGAAAATTTACAGGGGTGGC 1440

 28262264 AGTCTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGATTTTCAATCTTTGGCTTGCATATACCTTGCCAAG 28262323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTCTTCAAAAATTTTTAAGGGCAGATTTTCAATCTTTGGCTTGCATATACCTTGCCAAG 1500

 28262324 ACATCCAAGGCACCTGCAATTTCTTGCTTACCAGGAATTTCCATCACCTGCCAGCAAGAT 28262383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACATCCAAGGCACCTGCAATTTCTTGCTTACCAGGAATTTCCATCACCTGCCAGCAAGAT 1560

 28262384 TTTATTATATCAATGTAGCAGACCAGCCTGAAGTGCTATGGACTGATAGGGGTACAGTCT 28262443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTATTATATCAATGTAGCAGACCAGCCTGAAGTGCTATGGACTGATAGGGGTACAGTCT 1620

 28262444 TTATGGGCTTGACTATAATAAAGAGACAGAGGGTCTAGTCAGGTAAACAAAAACAGTTTC 28262503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTATGGGCTTGACTATAATAAAGAGACAGAGGGTCTAGTCAGGTAAACAAAAACAGTTTC 1680

 28262504 TGGGCTCTTTGCTTAGGGGAAGTAATGAGACAAAGACATATTTCAGATTGATAGGTAAAT 28262563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGGCTCTTTGCTTAGGGGAAGTAATGAGACAAAGACATATTTCAGATTGATAGGTAAAT 1740

 28262564 ACAAGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAGTGAAGAAACTACATGTGGGACAGTAGCTGCAGTT 28262623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACAAGAGGCCAAAGGTTTTACTCCAGTGAAGAAACTACATGTGGGACAGTAGCTGCAGTT 1800

 28262624 GGAGTCATCATCTGATTAAGTTTATGATGATACACTCTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCT 28262683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGAGTCATCATCTGATTAAGTTTATGATGATACACTCTTACCCTCTAAGACTGTCAGTCT 1860

 28262684 TTGAAGCATATACTAAACAGGTGAGTCAAATGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCAT 28262743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGAAGCATATACTAAACAGGTGAGTCAAATGCAGATTGATAGGAATAATTACCCTGCAT 1920

 28262744 TTTTAGTCTTGCTTGGTTACGTTCATCTTTGAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCT 28262803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTAGTCTTGCTTGGTTACGTTCATCTTTGAGGTTCCACACAGGGATTTAGTATTGCCT 1980

 28262804 TCTATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGGTCCTTCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTG 28262863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTATTTTTTGTAGGGTAATCCCAGGTCCTTCCACTTGGTTATTTCTACCATAATAACTG 2040

 28262864 TTATTCGATGTGTCAGAAAGCCAATGTGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTG 28262923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTATTCGATGTGTCAGAAAGCCAATGTGGGAATTCCATCAGTTGTCAGGTGTGCTTATTG 2100

 28262924 AAGCATTCACTCAGGAACAGTATAAATAACCACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACC 28262983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGCATTCACTCAGGAACAGTATAAATAACCACAAGACAGGTTTATGGATACATTGAACC 2160

 28262984 AGCTATGAGAAGGACTCAACAAAATTCCATTTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTT 28263043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCTATGAGAAGGACTCAACAAAATTCCATTTGTTATCACACCCGTATAAACACCCATTT 2220

 28263044 TGATGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCTGGGTTCCGGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCT 28263103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGATGGGTGGGCCACAGTGGAGTCCTGGGTTCCGGCAAATTAACCATGTCCAGAATTCCT 2280

 28263104 AGAAAGTCTGGATATTTTCCTTTCTCTAGAACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATAT 28263163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAAAGTCTGGATATTTTCCTTTCTCTAGAACACAATTATTCTAATACATGGCTGCATAT 2340

 28263164 TCCTTTGGGGAAATACTAGGAAGAAGCAACAGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCT 28263223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCTTTGGGGAAATACTAGGAAGAAGCAACAGAGTATACATTCCTTTTACAAGGGTATCT 2400

 28263224 GGCCTCTTATTTTAGGTCAAGTTATTGAAGAATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTT 28263283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGCCTCTTATTTTAGGTCAAGTTATTGAAGAATAGTTTACATACAATAAAATTTACTTTT 2460

 28263284 AAAAAGTGTATAGTACAGTTCAACAAGCTTTGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCA 28263343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAAGTGTATAGTACAGTTCAACAAGCTTTGACAAATGAATACAATCATGTAACCACCA 2520

 28263344 TCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAATGTCAGTTGACAAGCTCATCCAAAAATTTGC 28263403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCATAATTGAGATTCATTAGGGGTTTTAATGTCAGTTGACAAGCTCATCCAAAAATTTGC 2580

 28263404 ACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTGAATCAGAAAAAATATGACAA 28263463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACAGCAGAGCAAGACTCCAAAAATTAACATGAAAATTCTGAATCAGAAAAAATATGACAA 2640

 28263464 TTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGTATTAAATATAGTGTGAAATT 28263523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTGACCAGATATGAAGACTTTAATGATTAACCTTTAGTATTAAATATAGTGTGAAATT 2700

 28263524 ATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTAGAAACAGACTCATTCCTATA 28263583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGCAGATATCAGTAGTCTAATGAAACAGAATAAATTCTAGAAACAGACTCATTCCTATA 2760

 28263584 GACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGGGATAAAGTATAAAATTTTCA 28263643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GACAAGTAATGTATTACAGAGGTGGCATTAAAAATCAAGGGATAAAGTATAAAATTTTCA 2820

 28263644 ATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAATAATTGATCCCTACATCTCCC 28263703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATCCATGTGTTGGGACAACTGGTTATCTACATAGGAAAATAATTGATCCCTACATCTCCC 2880

 28263704 ACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTAAATGGGAAAAGCGAACTTAA 28263763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACAACATACCACAATATATTCCAGGTAGACTAAAAACTTAAATGGGAAAAGCGAACTTAA 2940

 28263764 AAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTTTTGTTTTTTTAAAAAAGAGA 28263823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAATCTTTGGAGGAAAATATGATGTAAGAGTACAGGATTTTTGTTTTTTTAAAAAAGAGA 3000

 28263824 TCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGG 28263883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCAAGTGGAGTACTTATACATCTGAATACATTAAAATTTAAAACTCATGCATAACAAAGG 3060

 28263884 ACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGA 28263943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACATCATAAACCAAGCTAAAAGACAAACTACTGTATATACTTCTGAGAAGATGAAATCGA 3120

 28263944 TGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAA 28264003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGTATTTTTCTCTACCCCTCTTGCTAAGTACAATTACATACCCTGGACATTATACATAAA 3180

 28264004 ACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCC 28264063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACAAGCATAACGACGTTCTGAAAAGTCAAGAAGACAAACTGGGTAAGGACCTTGGAACCC 3240

 28264064 AAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTG 28264123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAGAAACATCATGATGATGAGTTCCCTAGCTTTTCTTTTGCCTCATATATCCCAGACTTG 3300

 28264124 GAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCT 28264183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGCTGAGGAAGCCAGCAGTCAGGAAACACCAAAGGGTACAGATCTTAAAAGCCTGCTCT 3360

 28264184 CTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAA 28264243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTCTAGCCAAAGAACTAGGAAAGGGACAGCCTAGGAAGACAGAAAACTTTCAGACAATAA 3420

 28264244 ATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGA 28264303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGCTCTATCTAGCCAAATACCATAGAAAAAGCAGTGGATCCATCCCAACTGATGTCAGA 3480

 28264304 AAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAAT 28264363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAAGGCTTAGTGGAAAACCTAGACTTCCACTCTTGCCGGGCTGTAATGGAGCATCACAAT 3540

 28264364 ACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGT 28264423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACTCCCACTAGGGTAATGTCAAAGAAGACCAAGGCAGGAGCCAAGACATACATCCCCAGT 3600

 28264424 GGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTTGAGA 28264483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGGTGGTAATGAGAGCTGATCCCCAGCCCCTACCTGGCAGTGTCCTTTTTTTTTTTGAGA 3660

 28264484 CGGAGTCTCGCTCTGTC 28264500
          |||||||||||||||||
     3661 CGGAGTCTCGCTCTGTC 3677

EXCISED REGION

 28264502 CTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCC 28264561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 CTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCC 3738

 28264562 CGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCC 28264621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 CGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATATGCCACCTGGCC 3798

 28264622 TGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGT 28264681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGTCTGGT 3858

 28264682 CTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACA 28264741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 CTTTAACTCCTGACCTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACA 3918

 28264742 GGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATA 28264801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 GGCATGAGCCACTGCAGCTGGCCGGATCCACCCTCTTTCTACTCCTGGAATGGTGTCATA 3978

 28264802 TGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTA 28264861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 TGAAGCCAGCTAAAACAGAAGGTTTAAATAAGTTCCAGACTTTTATAACATAATATCCTA 4038

 28264862 GATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAA 28264921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 GATTTCCAGGTTTCAATAAAAAATTGCACCAAGGACCAGCAAGATCTCAAACTAAATGAA 4098

 28264922 AAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAA 28264981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 AAAACACAATCAATAGATGCCAACACCATGGTAATATAGATGTTAGGATTATTTTACAAA 4158

 28264982 GATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGA 28265041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 GATTTTAGGTAGCCACCATAAAAATGCTTCAACAATTACAAATACCCTTGAAACAAATGA 4218

 28265042 AAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAA 28265101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 AAAATATGTCTCAGTAAAGAAATAGAAGTTATAAATAAGAACCAAGTAGAAATTTTTGAA 4278

 28265102 ATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGG 28265161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 ATGAAAAATACAATAACTGAAAAGTAAAAATTAATAGATGATTTAACAGCAGAGTGGAGG 4338

 28265162 AGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACA 28265221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 AGCCATATGAAAGAAGCAGTGACTGGAAGATAGAATAATAAAAATTACTTAATCCAAACA 4398

 28265222 ACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAA 28265281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 ACAGAGAGAAAACCTTGAGAAAAATAAACAGAGCCTCAGGGACCTGTGAGGCTGTAACAA 4458

 28265282 AAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAA 28265341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 AAAAATTGAACATTTATGTCATCAGAATTTCAAGAGAGGAGAAAGAGGGCAGGTTTGAAA 4518

 28265342 AAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTAC 28265401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 AAATACTTGAAGAAATAAAGGCTGAAAAAGCCTCAAGTTTGGCAAAAGGCATAAGCCTAC 4578

 28265402 GTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACA 28265461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 GTATTTAAGAAGCTGAATGAATACAAAACGGATATGCCCAAATAAATTACACCAGACACA 4638

 28265462 TAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGA 28265521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 TAATACAGTCAAACTTCTGAAAACTAAAGACAAATTAAAAAGAAACTGTGGTATACCAGA 4698

 28265522 AGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTC 28265581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 AGGAAGTGGTACATATTTCAAGTGCTGTCAACTCAGAATTCTATATCCAGCAAAAACGTC 4758

 28265582 ATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGC 28265641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 ATTCAACAATGAAAGGAAAATCAAGATAGTCTCAAATGAAAGGAAATGAGAATTTGCTGC 4818

 28265642 CTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCT 28265701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 CTTTTAGGATGACTAAAGAAAACTCTCAAAACAGTAAGAAAATAATAAAAGAAGGAATCT 4878

 28265702 TGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTT 28265761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 TGAAACACAAGAATAAAGAACAGTGGAAAAAGTAAAATCATGGGAAATATACTACATTTT 4938

 28265762 CTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGT 28265821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 CTTTCTCCTCTTGAGTTTTCTAAATTACGGTTGATGCAAAAATTATAACACATCTGATGT 4998

 28265822 GGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCA 28265881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 GGTTCTAAATGTATATAGAGGAAATATTAAAAACAATTAAGAGCTGGGCATGGTGGCTCA 5058

 28265882 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTT 28265941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCTGAGTGCAGGAGTT 5118

 28265942 CAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTT 28266001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 CAAGACCAGCCTGGGCAACAAGATGAAACCCATCTCTACCAAAAATACATACAATTAGTT 5178

 28266002 GGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCAC 28266061
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5179 GGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTGATCCCTGCTACTTGGGAGGCTGGGGTGGGAGGATCAC 5238

 28266062 TTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGG 28266121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 TTGAACCTGAGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGG 5298

 28266122 GTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGA 28266181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 GTGACAGAGTGAGACCCCTTCTCAAAAAAAAAAGTTATAAATAGGAGAGAATAAAAGGGA 5358

 28266182 GTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAA 28266241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 GTAAGATTTAAATGACTCACCAGAACTGGTAAAATAATGACATCAGTAGATTGTGATAAA 5418

 28266242 TTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTA 28266301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 TTACATAATACCCAAAGCAACCATTAAAAAAAGCTATGCAAAGAGGTACACTCAAAAGTA 5478

 28266302 CTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAA 28266361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 CTATAGATAAATAAAAATGGAATTTTAAAAAATGTTCCAAAACCCACATGGAGCAAGGAA 5538

 28266362 AGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATT 28266421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 AGAAACAGAAAGACTAGTTAGGAGGTAATTACAGGTTAGAAGTGTAATGATCTGGATATT 5598

 28266422 GTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTA 28266481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 GTGATAACAGTAGATATGGACAGAATGTAGTTTGGGAGTAAAATTTACTAAATTTTCTTA 5658

 28266482 CATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGA 28266541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 CATATTAGATATGAGGTGAGAGAGAAAAAAAGGAATCTAGAATGATTTCTAAGATTTTGA 5718

 28266542 TAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTT 28266601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 TAGGAGCATATGAGTAATGCTGATGCTGAGGTCCAGAAGACTAGAAAAGAGATAGAGGTT 5778

 28266602 GACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTT 28266661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 GACAATTTATTGCTAGATCTTAGAAATGTTAAATTACAGATTAAATTCAGGTCAGTTTTT 5838

 28266662 CCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTA 28266721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 CCCTATATTAAGAACCTAGAAAAAGTCCCTGGTGCTTGGTTAAAGTGCATACAAGGTCTA 5898

 28266722 AATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAA 28266781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 AATAAATAAATAAATAAATAGGCATTGTTGCTTCAGAGATGGCAGTAACTTGGGAGAAAA 5958

 28266782 TACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCA 28266841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 TACCCGGGAGGAATGGAGTTCTATTTTACAGAATGCATTTATGTTTTGAATTGGAGACCA 6018

 28266842 TTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGG 28266901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 TTATATGGTGCTGTCTCCACAAGAGCCAGCACACACTGCTTTGCAAATCAAGGGGTGAGG 6078

 28266902 CAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGC 28266961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 CAGAAGTGAGAATGGATCTTCTCACCATTGCACCTAATAGTCTTCTCCTGGAATTTTTGC 6138

 28266962 TTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGG 28267021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 TTCCTATCCCAGCAACTTTGAGCTCTGCTGGTTTGGAACTCTTAGTCGCCAAGGTGGTGG 6198

 28267022 TAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAG 28267081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 TAGTTGGGAAGTGGGAGAATGCTTCCAGCAGGGATCACATGAATGGTTCCACAGAACTAG 6258

 28267082 AAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAA 28267141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 AAGATGAGACTGCTACCAGGCCATTTTGGGCATCTTATGCCACTGAAGCAACATGCGTAA 6318

 28267142 AAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTG 28267201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 AAGGAGGGAGGGGTGGTGTTACCCTACTTGTTGAAGTGATTGATTCCAATTACCAAACTG 6378

 28267202 AAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAA 28267261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 AAATTGGAGGCAAGGAGGACTATGTGTGGAACCCAGGGGACTCTCTGGGGTGCCTCTTAA 6438

 28267262 GTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACC 28267321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 GTGGCTATACCATTTTGCATCCCCCCCAGCAATGAATGACAGTTCCTGGTGTTCCACACC 6498

 28267322 CTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTG 28267381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 CTCTCAGCATTTGATGTTATCAGTGTTTTGGATTTTAGCCATTCTGATAGGTGTATAGTG 6558

 28267382 ATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAAT 28267441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 ATATCTCATTGTATTAATTTGCTATTCCCTGATGACATATGATGTTGAACATCTTTAAAT 6618

 28267442 ATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTA 28267501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 ATGCCTACTAGCCATGTGTATATCTTCTTTGGTGAGTGTCTAAGTATTTTGCCTATTTTA 6678

 28267502 TAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATA 28267561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 TAATTGGGCTGTTTGTTTTCTTAATGCTGAGTTTTAAGAGTTCTTTGCGTATTTTGGATA 6738

 28267562 ACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTT 28267621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 ACAGTCCTTTATCAAATAGTTGTTTTGCAAAGATTTTTTTCCCAGTCTATGGTTTGTCTT 6798

 28267622 TTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAG 28267681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 TTCATTCTATTACCAGGGTCTTTCACAGAGCAAAATATTATTTTTCAACTTTTATTTTAG 6858

 28267682 ATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAG 28267741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 ATTCAGGGGGTACATGTGGAGGTTTGTTACCTAGGTATATCGTATGATGCTGAGATTTAG 6918

 28267742 GGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAAC 28267801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 GGTGCAAGTGATCCTCTCACCCAGGTACTGAGCATCATACCAAAGAGTTAATTTTTCAAC 6978

 28267802 CCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTAT 28267861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 CCTCCGCACTTCCTTCCTCCTCCCTCTGGTAGTCCCCAGGCCTATTGTTGCCATCTTTAT 7038

 28267862 GTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTT 28267921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 GTCCATGAGTACCCCATGTTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACACACAGTATTTGGTTT 7098

 28267922 TCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGA 28267981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 TCTGTTCCTGCATCAATGCTTTAGGATAATGGCCTCCAGCTGCATCTATGTTGCTGCAGA 7158

 28267982 GGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCA 28268041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 GGATATAATTTCATTCTTTTTTTATGGCTGTGTAGTATTCCATGATGTATATATATACCA 7218

 28268042 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 28268101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 CGTTTTCTTTATCCAATCCACTGGTGATGGGCACCTAGGTTTATTCCATGTCTTTGCTAT 7278

 28268102 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTT 28268161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 TGCAAATAGTGCTGCATTCAACATGTTTGTGTCTTTTTGGTAGAATGATTTGTTTTCTTT 7338

 28268162 TGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTT 28268221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 TGGATATATATCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAATCGTAGCTCTGTTTTAAGTTCTTT 7398

 28268222 GAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATG 28268281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 GAGAAATCTCCAAACTGCTTTCCATTACAGCGGGACTAATTTACATTCCCACCACCAATG 7458

 28268282 TATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAA 28268341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 TATAAACATTCCCTTTTCTCTAAAGCCTCACCAGCACCTGTTGTTTTTTTGACTTTTTAA 7518

 28268342 TAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTC 28268401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 TAATAGCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTACCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTC 7578

 28268402 TGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTT 28268461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 TGATGATTAGTGATATGGAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGCTGCTTGTATGTCTTCTT 7638

 28268462 TTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTG 28268521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7639 TTGAGAAATAACTGTTCATGTATTTTGTCAATTTTTAATAGGGTTGTTTGTTTTTTCTTG 7698

 28268522 TTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTT 28268581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7699 TTTGTTTCTTATAGATTCTCGATATTAGACCTTTGATGCATAGTTTGAAAATATTTTCTT 7758

 28268582 CCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTT 28268641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7759 CCATTTTGTATGTTGTCTCTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAAGAGCTCTT 7818

 28268642 TAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTT 28268701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7819 TAGTTTAATTAGATCCCACTTGTCAATTTTTGCTTTTGTGGACATTGCTTTTGAGGATTT 7878

 28268702 GTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGG 28268761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7879 GTCGTAAATTCTTTCCCAAGGTCAATGTCCAGAATGGTGTTTCCTAGAATTTTTTCTAGG 7938

 28268762 ATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAA 28268821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7939 ATTTTAGATCTTACTCTAAATTTGTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTTTATGGTAAAA 7998

 28268822 AGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTA 28268881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7999 AGATAGAGGTCCAGTTATATTCTTCTGCATATGGTGCTCCAGCTATCCCAGCACCATTTA 8058

 28268882 TTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGG 28268941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8059 TTGAAGAGGGAGTCATTTCCCCATTGCTTATTTTTATTGACTTACCTGAAGATTGGGTGG 8118

 28268942 CTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTG 28269001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8119 CTGTAGGTGTGTGGCTTTTTTTCTGGGTTCTCTATTCTGTTCCATTGTTCTATGTGTCTG 8178

 28269002 TTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGC 28269061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8179 TTTTTGTACCAATACCATGCTTCTATGGTTGCTGTAGCTTGAAGTAAGGTAATGTAATGC 8238

 28269062 CTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCC 28269121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8239 CTCTGGCTTTGTTCTTTTTGCTCGGGATTGCTTTGGCTATTCAGGCTCTTTTTTGGTTCC 8298

 28269122 ATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATA 28269181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8299 ATATGAATTTTATAATAGTTTTTTTCTAGTTCTGTGAAAAATGATGTTAGTAGTTTGATA 8358

 28269182 GGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATT 28269241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8359 GGAATAGTGTTGAATATGTAGATTGCTTTGGAAAGTATGGCCATTTCAACAATATTGATT 8418

 28269242 CTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTA 28269301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8419 CTTCTGATCTGTAGTATAAAGTGTTTTTCCATGTGTTTATGTCATCTATGATTTCTTTTA 8478

 28269302 GCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTA 28269361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8479 GCAGTGTTTTGTAGTTCTTTTTGCAGAGATCTTTCACCTCCTTGGTTAGATGTATTCCTA 8538

 28269362 GCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACAT 28269421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8539 GCTCTTTTAAGACTATTGTAAATGGGATTGTGTCCTTGATTTGGCTCTCAGCTTGAACAT 8598

 28269422 TATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCG 28269481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8599 TATTGATGTATAGAAATGCTACTGGGCCAGGCACGGTGGCTCACACCTGAGCCGAGATCG 8658

 28269482 CACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAA 28269541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8659 CACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGAGTCCGTCTCAAAAAATAAAAAGAAA 8718

 28269542 GAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCG 28269601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8719 GAAAAAAAAAGAAATGCTACCGGTTTTTGTACATTGATTTTGTATCTTGAAATTTTACCG 8778

 28269602 AAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATT 28269661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8779 AAGTCATTAATTTTTGAGTTAATTTTTATTTATGGTGAAAGATAGGAGTCCAGTATCATT 8838

 28269662 CTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGACAAACAGTTCCAGGAGCATTT 28269721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     8839 CTTCTGTATATATGGCTAAGCAGCTATCCCTTGAAAGGATAAACAGTTCCAGGAGCATTT 8898

 28269722 TGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTT 28269781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8899 TGGCAGAGTCTTTAGGGGTTTCTAGGTATAGAATCATTTCATCCACAAAGAAAGATAGTT 8958

 28269782 TGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGG 28269841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8959 TGACTTTTCCTCTTCCTATTTGGATACCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGG 9018

 28269842 CTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTC 28269901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9019 CTAGCACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGATTGATGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTC 9078

 28269902 CAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGAT 28269961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9079 CAGTTTCCAAGGAGAAGGCTTCTGGTTTTTGCCTGTTCAGTATGATGCTGGCTTTATGAT 9138

 28269962 GCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTC 28270021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9139 GCTGGTGTGTTTGTCATAGATGGCTTATTATTTTGAAATATGTTCCTTTGATGCCCAGTC 9198

 28270022 TCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTA 28270081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9199 TCTTGGGGGCTTTTATCATGAAGTGTTGTTGGATTTTATTGAAAGATTTTTCTGTGTCTA 9258

 28270082 CTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATT 28270141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9259 CTGAGATAATATATGGTTTTTGTCTTTAATTATTTATGTAGTGAATCACATTTATTGATT 9318

 28270142 CACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTA 28270201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9319 CACATATGTTGAACCAAATTTGCATCTAAGGAATAAAGCCTACTTGATCATGGTGAATTA 9378

 28270202 ACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTAC 28270261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9379 ACTTTTTTTATTTTATTAAAATATTGACTTTATTTCATATGTATATTTTTGTCTCCCTAC 9438

 28270262 CATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTA 28270321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9439 CATTTCCATTTCTGACCACTGCTACTACTATGTCCTATCATAACATTCCATACGTACTTA 9498

 28270322 AAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATA 28270381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9499 AAACCAAGCAAAGGGTGGAGTTCCATCTTTAAAAACTAAACAGGCATTTTGGACAACATA 9558

 28270382 TTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTG 28270441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9559 TTCTTGGCAATGGTACCTGGACAACATTTACCAAATACGGTAGGGAAAGTTCTCATTCTG 9618

 28270442 CATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTC 28270501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9619 CATTATAAAAAGGACAGCCAGATATCAACTGTTACTGAAATGAAATAAGATGGAATATTC 9678

 28270502 GTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAA 28270561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9679 GTAACAAACTATTTAAATTATTTTCTTAAAGAGACTTCCTTCACTGCCAGAGATCTTGAA 9738

 28270562 TAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCA 28270621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9739 TAGCCTCCTGGTCAGTCATCCAGAAACAATTCTTCACATAATTGATGAACGTGGTTTCCA 9798

 28270622 CTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTA 28270681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9799 CTTTGGGAAGAGAACCACCTTTTTCTACACTTGCTTGCATTTTTGCTTTAATATCTTCTA 9858

 28270682 CAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTT 28270741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9859 CAGAACTAGATCCTTTTGGTGTTTCAGTTTTTTTCTCTTTTTGAAGGATTCTTGTCTTTT 9918

 28270742 TTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTT 28270801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9919 TTATCTTGGTGTTGATGGTTTTGAGTCTTTTCCATTCTCGTTTGACTTCTGTGCTTTTTT 9978

 28270802 GGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCAT 28270861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9979 GGCTGGAGTATCTGGTATAGATTTCTTCACTTGTGCTTTTTTTTTCAGTTTCCTCATCAT 10038

 28270862 CTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCT 28270921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10039 CTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCATCAGCAGCAACTTTTTTCTGTGAAATCT 10098

 28270922 TGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCT 28270981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10099 TGCTACCACCTCCAGGGGCAGATCACTTTCCAGATATACTTAAGAGTTTTACAACCTCCT 10158

 28270982 CCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTAT 28271041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10159 CCTTTTCATCTTCTGACTCTGCATCTTCCTCTACAGCTACTACGTGCTGTCCACTATTAT 10218

 28271042 GCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCC 28271101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10219 GCACTGGCCCTGAACCACACTTCAGTCGTAAAAGCACAGGTGGTGTTATTTCAAAGCCCC 10278

 28271102 CAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGAT 28271161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10279 CAAGGGAAACCATTGGCTATGCAAACATTTTCAAAGTTGCCGGTGTTACTTTAATTGGAT 10338

 28271162 TTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCC 28271221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10339 TTCCTTCATAATTCATTGCCTCTGCTTCAACAATGTGCAATTTATCCCTCACACCAGCCC 10398

 28271222 CTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACA 28271281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10399 CTAAACTGGTGCTCATTTTCATCATTATCCAGATAATCTTTGGTCAGCCTTTAGTTCACA 10458

 28271282 ACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCAT 28271341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10459 ACCAAAAAGATAGTTCTGGGGCCTCAGGGGGCTCATTTCCATGTCCACCAAATCTTCCAT 10518

 28271342 GGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTC 28271401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10519 GGGGTGGTGGCATGCACTAAGGCAGAAGAGAAGACAAATGGAGATAAAGGACTACTGCTC 10578

 28271402 CAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGC 28271461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10579 CAGAGAATAGCTGCTCAGGAGACAGTCATACCAGGGAACTGAATTAACTTTTTGATGTGC 10638

 28271462 TGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATA 28271521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10639 TGTTGAATTCAGTTTCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTTGCATTTATGTTCATCAGGGATA 10698

 28271522 TGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGG 28271581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10699 TGGGCCTGCAGTTTTCTTTTTTGGTTGTATCTTTACCAGATTTTGGTATCAGGATGATGG 10758

 28271582 TAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTA 28271641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10759 TAGCTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGTGTCCTCCCCCTTGACTTTTTTGGAATAGTTTTA 10818

 28271642 GTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGG 28271701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10819 GTAGATTTGGTACCGGCTCTTCTTTTACATCTGGTAGAATTCAGCTGTGAATCCATCTGG 10878

 28271702 TCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATAT 28271761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10879 TCCAGGGCTTTTTTTGGTTGGTAGGATTTTTCTTACTGCTTCAATTTTGGTATTCGATAT 10938

 28271762 TGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAG 28271821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10939 TGGTCTGTTCAGGGTTTCAATTTCTTCCTGATTCAATATTGGGAGGTTGTGTGTTTCCAG 10998

 28271822 GGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTC 28271881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10999 GGATTTATTCATTTTCTCTAGATTTTCTAGCTTTTGTGCATAGAGGTGTTCATAATAGTC 11058

 28271882 TCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGAT 28271941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11059 TCTGAGGACCTTTTGTATTTCTGGGGGATTGGTTGTAATGTCACCTTTTTTGTTTCCGAT 11118

 28271942 TGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCT 28272001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11119 TGTGTTTATTTGGATCTTCTATTTTTTCCTTTGTTAATATAGCTAGTAGTCTCTTTATCT 11178

 28272002 TGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGT 28272061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11179 TGTTTATCCTTTAAAGAAATCAACTTCTGGTTTCATTGATTCTTTATATGGACTTTGGGT 11238

 28272062 CTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGT 28272121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11239 CTCAATTTCCTTCAGTTTGTTCTGATCTTAGTTATTTCTCTTCTTCTGCTAGTTTGGGGT 11298

 28272122 TACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATC 28272181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11299 TACTTTGTTCTTGTTTTTCTACTTCCTGTAGGTGTGATGTTAGATCATTCATTTGAAATC 11358

 28272182 TTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTTAGCATTGCTTTTG 28272241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11359 TTTCTAACTTTTTGTGGTAGGCATTTAGTGCTATAAGCTTTTCCCTTAGCATTGCTTTTG 11418

 28272242 CTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTGCTTTTGTGTCATT 28272301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11419 CTGTCTCCCAGAGATTTTGGTATGTTGTGTCTCTATATGTTAGTCTGCTTTTGTGTCATT 11478

 28272302 ATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAG 28272336
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11479 ATAAAGAAATACCTGAAGCTGGGTAATTTATAAAG 11513

Alignment time is 13.3645 s

