
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    6336] =>      6336 nucs 'mol-32-1e66-077413_6336'

Score:        6209
Aligned:      6361        nucs
Identic:      6330 (100%) nucs =>       204 (100%)      6126 ( 99%)
Gaps:           26 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955198,98955401] EXCISED REGION [98959001,98965156]
 second seq =>  [       1,     204] EXCISED REGION [     205,    6336]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955198 GTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGG 98955257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGG 60

 98955258 AGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTC 98955317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTC 120

 98955318 CATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAAT 98955377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAAT 180

 98955378 AATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 98955401
          ||||||||||||||||||||||||
      181 AATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 204

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 264

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 324

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 384

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 444

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 504

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 564

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 624

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 684

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 744

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 804

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 864

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      865 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 924

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 984

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 1044

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1104

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1164

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1224

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1284

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1344

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1404

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1464

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1524

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1584

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1644

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1704

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1764

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1824

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1884

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1944

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 2004

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 2064

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2124

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2125 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 2184

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 98961040
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AAAGCGTGAAACCATGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 2243

 98961041 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 98961100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 2303

 98961101 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 98961160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 2363

 98961161 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 98961220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 2423

 98961221 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 98961280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 2483

 98961281 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 98961340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 2543

 98961341 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 98961400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 2603

 98961401 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 98961460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 2663

 98961461 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 98961520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 2723

 98961521 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 98961580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 2783

 98961581 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 98961640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 2843

 98961641 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 98961700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 2903

 98961701 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 98961760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 2963

 98961761 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 98961820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 3023

 98961821 TCTTTCCAGAGATATCACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 98961880
          |||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TCTTTCCAGAGATATCACATG----------CACACACACACACACACACACACACACAC 3073

 98961881 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 98961940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 3133

 98961941 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 98962000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 3193

 98962001 CATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATA 98962060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 CATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATA 3253

 98962061 ATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTA 98962120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 ATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTA 3313

 98962121 ATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAA 98962180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 ATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAA 3373

 98962181 TAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGAT 98962240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 TAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGAT 3433

 98962241 AGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 98962300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 AGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 3493

 98962301 TGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCG 98962360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 TGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCG 3553

 98962361 TCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCC 98962420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 TCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCC 3613

 98962421 CAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGT 98962480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 CAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGT 3673

 98962481 GAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAA 98962540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAA 3733

 98962541 AGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACC 98962600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 AGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACC 3793

 98962601 TCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTT 98962660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 TCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTT 3853

 98962661 GATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTT 98962720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 GATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTT 3913

 98962721 TCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAA 98962780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 TCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAA 3973

 98962781 TATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 98962840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 TATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 4033

 98962841 TTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTG 98962900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 TTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTG 4093

 98962901 AATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTT 98962960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     4094 AATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGT-- 4151

 98962961 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACC 98963020
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 ----------TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACC 4201

 98963021 CAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAG 98963080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 CAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAG 4261

 98963081 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTG 98963140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTG 4321

 98963141 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAA 98963200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAA 4381

 98963201 TCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 98963260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4382 TCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 4441

 98963261 GCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTC 98963320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 GCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTC 4501

 98963321 TCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTC 98963380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 TCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTC 4561

 98963381 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCT 98963440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCT 4621

 98963441 CAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGG 98963500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 CAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGG 4681

 98963501 GGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATT 98963560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 GGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATT 4741

 98963561 TTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTC 98963620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 TTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTC 4801

 98963621 CTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCA 98963680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 CTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCA 4861

 98963681 AGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATT 98963740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 AGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATT 4921

 98963741 TCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACA 98963800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 TCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACA 4981

 98963801 GTCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTG 98963860
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4982 GTCTG--TTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTG 5039

 98963861 GCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 98963920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 GCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 5099

 98963921 CCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 98963980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 CCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 5159

 98963981 AGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGATC 98964040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 AGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGATC 5219

 98964041 CGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTA 98964100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 CGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTA 5279

 98964101 TTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCTTCCCAGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTGA 98964160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 TTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCTTCCCAGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTGA 5339

 98964161 GATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTGC 98964220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 GATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTGC 5399

 98964221 AACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 98964280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 AACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 5459

 98964281 ACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCC 98964340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 ACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCC 5519

 98964341 ATGTTGAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAA 98964400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 ATGTTGAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAA 5579

 98964401 GTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGCCCAGCTGCTTTAATGTTGTTTTGTTAATT 98964460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 GTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGCCCAGCTGCTTTAATGTTGTTTTGTTAATT 5639

 98964461 AACCATATAAATCTTGATGTAAGAGGACTTTAACAAAGCTGAACATAAAGAATTGAGTTT 98964520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 AACCATATAAATCTTGATGTAAGAGGACTTTAACAAAGCTGAACATAAAGAATTGAGTTT 5699

 98964521 ATGTATGCATTAAATCCATCAAGTGAGCATTCAAATGTTCTCTCTATAGTATGTTATTTC 98964580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 ATGTATGCATTAAATCCATCAAGTGAGCATTCAAATGTTCTCTCTATAGTATGTTATTTC 5759

 98964581 AGGGTCTAAATGTGTTGCTACAATAGATTGCTTTCAAACAGAACTCCTATATTGCTGTGC 98964640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 AGGGTCTAAATGTGTTGCTACAATAGATTGCTTTCAAACAGAACTCCTATATTGCTGTGC 5819

 98964641 TGGTTAAGCTATTGTTTCTCCGCTCCAAACCCACTCCTCTATAGTTTCTGACAGTTGGGC 98964700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 TGGTTAAGCTATTGTTTCTCCGCTCCAAACCCACTCCTCTATAGTTTCTGACAGTTGGGC 5879

 98964701 TGAGACAATGCAAAAGACTATTATAGGCTCACCTGAACAGGGGGTAGTAAAGGAGATTGG 98964760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TGAGACAATGCAAAAGACTATTATAGGCTCACCTGAACAGGGGGTAGTAAAGGAGATTGG 5939

 98964761 ACGGCAGGAGGAGGATGGGACTTGGCTGCTGCTCCTGTCCCACCTCTTCACATCACTTCT 98964820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 ACGGCAGGAGGAGGATGGGACTTGGCTGCTGCTCCTGTCCCACCTCTTCACATCACTTCT 5999

 98964821 TCCTCCCTTCACTCTGGCAGCAACAGTTGGTTTGTACCCAGC-TTTTTTTTTTTTTTTTT 98964879
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     6000 TCCTCCCTTCACTCTGGCAGCAACAGTTGGTTTGTACCCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 6059

 98964880 TTTAGACAGAGTCTAGCTCCATTGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAC 98964939
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 TTTAGACAGAGTCTAGCTCCATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAC 6119

 98964940 TGCAACCTCTGCTTCCCGGATTCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGG 98964999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TGCAACCTCTGCTTCCCGGATTCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGG 6179

 98965000 ATTACAGGTGCCCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGATGGGGTTT 98965059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 ATTACAGGTGCCCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGATGGGGTTT 6239

 98965060 CACTGTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCATTGGCCTC 98965119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 CACTGTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCATTGGCCTC 6299

 98965120 CTAAAGTGCTGGGATTAAAAGCATGAGCCACCAGGCC 98965156
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 CTAAAGTGCTGGGATTAAAAGCATGAGCCACCAGGCC 6336

Alignment time is 5.56303 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2298] =>      2298 nucs 'mol-32-1e71-030361_2298'

Score:        2298
Aligned:      2298        nucs
Identic:      2298 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98958979,98961276]
 second seq =>  [       1,    2298]

 98958979 CTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTC 98959038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTC 60

 98959039 CTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGC 98959098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGC 120

 98959099 GGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCA 98959158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCA 180

 98959159 GCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTT 98959218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTT 240

 98959219 TTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 98959278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 300

 98959279 GATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGG 98959338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGG 360

 98959339 CTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGG 98959398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGG 420

 98959399 AATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTT 98959458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTT 480

 98959459 TAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTT 98959518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTT 540

 98959519 GCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCC 98959578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCC 600

 98959579 TTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAA 98959638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAA 660

 98959639 AGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTG 98959698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTG 720

 98959699 AGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACC 98959758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACC 780

 98959759 CCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAG 98959818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAG 840

 98959819 CTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAG 98959878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAG 900

 98959879 CCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAA 98959938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAA 960

 98959939 TAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGC 98959998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGC 1020

 98959999 CCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCA 98960058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCA 1080

 98960059 GTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTG 98960118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTG 1140

 98960119 AAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAA 98960178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAA 1200

 98960179 ACATTATATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAA 98960238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATTATATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAA 1260

 98960239 TAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGT 98960298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGT 1320

 98960299 CCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACA 98960358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACA 1380

 98960359 TTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGT 98960418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGT 1440

 98960419 GCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATT 98960478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATT 1500

 98960479 GAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATG 98960538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATG 1560

 98960539 TAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCA 98960598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCA 1620

 98960599 ACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCG 98960658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCG 1680

 98960659 CACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATA 98960718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATA 1740

 98960719 ATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAA 98960778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAA 1800

 98960779 AGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAG 98960838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAG 1860

 98960839 AGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTG 98960898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTG 1920

 98960899 GCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAA 98960958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAA 1980

 98960959 GAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 98961018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2040

 98961019 AAAAAATTGTAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTG 98961078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAAAATTGTAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTG 2100

 98961079 AGGCGGGTGGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 98961138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGCGGGTGGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 2160

 98961139 CTTGTCTCTACCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCA 98961198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTGTCTCTACCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCA 2220

 98961199 GCTACTCGGGAGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 98961258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCTACTCGGGAGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 2280

 98961259 GCTGAGATGGCGCCATTG 98961276
          ||||||||||||||||||
     2281 GCTGAGATGGCGCCATTG 2298

Alignment time is 1.69373 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    3212] =>      3212 nucs 'mol-32-1f00-081811_3212'

Score:        3137
Aligned:      3225        nucs
Identic:      3208 ( 99%) nucs =>       211 (100%)      2997 ( 99%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955191,98955401] EXCISED REGION [98959001,98962014]
 second seq =>  [       1,     211] EXCISED REGION [     212,    3212]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955191 TGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGG 98955250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGG 60

 98955251 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGT 98955310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGT 120

 98955311 GAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATG 98955370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATG 180

 98955371 GAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 98955401
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 211

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      212 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 271

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      272 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 331

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      332 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 391

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      392 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 451

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      452 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 511

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 571

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 631

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 691

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 751

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 811

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 871

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      872 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 931

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 991

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 1051

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1111

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1171

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1231

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1291

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1351

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1411

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1471

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1531

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1591

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1651

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1711

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1771

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1831

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1891

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1951

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 2011

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 2071

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2131

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2132 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 2191

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 98961040
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AAAGCGTGAAACCATGTCTT---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 2248

 98961041 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 98961100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 2308

 98961101 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 98961160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 2368

 98961161 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 98961220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 2428

 98961221 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 98961280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 2488

 98961281 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 98961340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 2548

 98961341 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 98961400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 2608

 98961401 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 98961460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 2668

 98961461 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 98961520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 2728

 98961521 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 98961580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 2788

 98961581 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 98961640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 2848

 98961641 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 98961700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 2908

 98961701 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 98961760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 2968

 98961761 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 98961820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 3028

 98961821 TCTTTCCAGAGATATCACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 98961880
          |||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||
     3029 TCTTTCCAGAGATATCACATG----------CACACACACACACACACACACACACACAC 3078

 98961881 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 98961940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 3138

 98961941 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 98962000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 3198

 98962001 CATTTTATTTATTT 98962014
          ||||||||||||||
     3199 CATTTTATTTATTT 3212

Alignment time is 2.73955 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2132] =>      2132 nucs 'mol-32-1f0b-151426_2132'

Score:        2088
Aligned:      2132        nucs
Identic:      2128 (100%) nucs =>       152 (100%)      1976 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955250,98955401] EXCISED REGION [98959001,98960980]
 second seq =>  [       1,     152] EXCISED REGION [     153,    2132]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955250 GGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAG 98955309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAG 60

 98955310 TGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAAT 98955369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAAT 120

 98955370 GGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 98955401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 152

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      153 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 212

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      213 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 272

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      273 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 332

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      333 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 392

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      393 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 452

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      453 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 512

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      513 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 572

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      573 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 632

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      633 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 692

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      693 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 752

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 812

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      813 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 872

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 932

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 992

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1052

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1112

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1172

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1232

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1292

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1352

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1412

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1472

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1532

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1592

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1652

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1712

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1772

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1832

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1892

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 1952

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 2012

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2072

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2073 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 2132

Alignment time is 1.81122 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2650] =>      2650 nucs 'mol-32-2874-116982_2650'

Score:        2650
Aligned:      2650        nucs
Identic:      2650 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98958346,98960995]
 second seq =>  [       1,    2650]

 98958346 CAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGC 98958405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGC 60

 98958406 ACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGGCCAATAAG 98958465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGGCCAATAAG 120

 98958466 CATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATACAAGGAGATATCAC 98958525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATACAAGGAGATATCAC 180

 98958526 CTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTGGCAAGGATGTGAG 98958585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTGGCAAGGATGTGAG 240

 98958586 AAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAGCCATTATGGAAAA 98958645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAGCCATTATGGAAAA 300

 98958646 CAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGATCCAGCAAACACAC 98958705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGATCCAGCAAACACAC 360

 98958706 TTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAA 98958765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAA 420

 98958766 TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCC 98958825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCC 480

 98958826 TGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCTGGT 98958885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCTGGT 540

 98958886 GTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCA 98958945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCA 600

 98958946 GAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACT 98959005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACT 660

 98959006 CCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGG 98959065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGG 720

 98959066 AGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTC 98959125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTC 780

 98959126 TGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGT 98959185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGT 840

 98959186 GCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTT 98959245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTT 900

 98959246 GACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGA 98959305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGA 960

 98959306 GCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATG 98959365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATG 1020

 98959366 AAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGA 98959425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGA 1080

 98959426 AGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTT 98959485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTT 1140

 98959486 TGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAG 98959545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAG 1200

 98959546 CTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATG 98959605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATG 1260

 98959606 AGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGG 98959665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGG 1320

 98959666 CTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGA 98959725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGA 1380

 98959726 GTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTA 98959785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTA 1440

 98959786 GCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAAT 98959845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAAT 1500

 98959846 CGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCC 98959905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCC 1560

 98959906 TGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTA 98959965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTA 1620

 98959966 ATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAA 98960025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAA 1680

 98960026 AGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAG 98960085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAG 1740

 98960086 CTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAA 98960145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAA 1800

 98960146 CAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATAACTAA 98960205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATAACTAA 1860

 98960206 ATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATT 98960265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATT 1920

 98960266 TTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTG 98960325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTG 1980

 98960326 GTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCC 98960385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCC 2040

 98960386 CAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCAT 98960445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCAT 2100

 98960446 ACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTA 98960505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTA 2160

 98960506 ATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCA 98960565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCA 2220

 98960566 ACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCT 98960625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCT 2280

 98960626 AAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTT 98960685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTT 2340

 98960686 AGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGG 98960745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGG 2400

 98960746 TATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAAC 98960805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAAC 2460

 98960806 TCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGT 98960865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGT 2520

 98960866 TATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTA 98960925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTA 2580

 98960926 GGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGC 98960985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGC 2640

 98960986 GTGAAACCAT 98960995
          ||||||||||
     2641 GTGAAACCAT 2650

Alignment time is 1.9745 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2239] =>      2239 nucs 'mol-32-2b4a-038409_2239'

Score:        2140
Aligned:      2184        nucs
Identic:      2180 (100%) nucs =>       196 (100%)      1984 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955206,98955401] EXCISED REGION [98959001,98960988]
 second seq =>  [      56,     251] EXCISED REGION [     252,    2239]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955206 CACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCA 98955265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       56 CACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCA 115

 98955266 GTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAA 98955325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      116 GTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAA 175

 98955326 AAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAA 98955385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 AAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAA 235

 98955386 GCAATTAAGCAATTGC 98955401
          ||||||||||||||||
      236 GCAATTAAGCAATTGC 251

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      252 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 311

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      312 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 371

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 431

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 491

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 551

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 611

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 671

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 731

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 791

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 851

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 911

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      912 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 971

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 1031

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 1091

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1151

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1211

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1271

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1331

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1391

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1451

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1511

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1571

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1631

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1691

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1751

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1811

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1871

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1931

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1991

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 2051

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 2111

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2171

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2172 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 2231

 98960981 AAAGCGTG 98960988
          ||||||||
     2232 AAAGCGTG 2239

Alignment time is 1.91488 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    6692] =>      6692 nucs 'mol-32-2fe3-068389_6692'

Score:        6676
Aligned:      6687        nucs
Identic:      6686 (100%) nucs =>      4883 (100%)      1803 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98950269,98955151] EXCISED REGION [98955156,98956959]
 second seq =>  [       1,    4883] EXCISED REGION [    4890,    6692]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [98955152,98955155]
 second seq =>         6 nucs [4884,4889]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4883,4883] to [4889,4889]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955151,98955151] to [98955156,98955156]
 second seq =>         1 nucs [4883,4883] to [4890,4890]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955152,98955153] to [98955154,98955155]
 second seq =>         0 nucs

 98950269 CTTCTTTCAGTAGCTGGTATAACAAAAATTCAGCAAGTTTATAAAAGACATTAACAGTAC 98950328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCTTTCAGTAGCTGGTATAACAAAAATTCAGCAAGTTTATAAAAGACATTAACAGTAC 60

 98950329 CTTCAACTAATTTGACCTAATTGACATTTATAGAATGCTACATCCAATGACAGCAGAATA 98950388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCAACTAATTTGACCTAATTGACATTTATAGAATGCTACATCCAATGACAGCAGAATA 120

 98950389 CACATTCTTCTCAAGGGCACATGGAGCATTCATAAAGATATAATTTTTGTTGGGTAATAA 98950448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACATTCTTCTCAAGGGCACATGGAGCATTCATAAAGATATAATTTTTGTTGGGTAATAA 180

 98950449 GTCTCAATAAAGTCTCAAAAAAATTGAAACAAACTATACTTCCTCATCAGGATAGAATTA 98950508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCAATAAAGTCTCAAAAAAATTGAAACAAACTATACTTCCTCATCAGGATAGAATTA 240

 98950509 AAAGTCAATAACAAAAGCATATCTGGAAAATCCTCAAATATTTCAAGTTAAATACCATAA 98950568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTCAATAACAAAAGCATATCTGGAAAATCCTCAAATATTTCAAGTTAAATACCATAA 300

 98950569 TTAAATCCATGGGCCAAAGAAATCACAAGGGAAAGTATTTTGAACCAAATGATAACTCAA 98950628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAAATCCATGGGCCAAAGAAATCACAAGGGAAAGTATTTTGAACCAAATGATAACTCAA 360

 98950629 ATAATCATGCAAATTTAATATAATCACATGTATCTGCATACACAGAGAATATATTTCCAT 98950688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAATCATGCAAATTTAATATAATCACATGTATCTGCATACACAGAGAATATATTTCCAT 420

 98950689 TATATAGATCTGACAAAGAACTTGTATTCAGAATATATAAAGAAAACCTAAAGAATTGGT 98950748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATATAGATCTGACAAAGAACTTGTATTCAGAATATATAAAGAAAACCTAAAGAATTGGT 480

 98950749 CAAGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCACCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCA 98950808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCACCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCA 540

 98950809 CGAGGTCAGGAGTTTCAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAA 98950868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGAGGTCAGGAGTTTCAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAA 600

 98950869 TAAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGTGCGCGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG 98950928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGTGCGCGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG 660

 98950929 GCAGAAGAATCACTTGAACCCGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTG 98950988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAGAAGAATCACTTGAACCCGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTG 720

 98950989 CACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAGAAAAAACTAAAAAGAAAGCCAA 98951048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAGAAAAAACTAAAAAGAAAGCCAA 780

 98951049 AAGAATTGAGGGTTTCAGTAGATATTTAACAAAATATAGGAATGGCTAGTAACCACTGGT 98951108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAATTGAGGGTTTCAGTAGATATTTAACAAAATATAGGAATGGCTAGTAACCACTGGT 840

 98951109 GCAACATTATTAGTATTCAGAGGAATGCAAATTAAAATTACAATGGACTACATACCCATT 98951168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAACATTATTAGTATTCAGAGGAATGCAAATTAAAATTACAATGGACTACATACCCATT 900

 98951169 GGAATGCCTAAAATTAAAAAGCTTGACAACAAAATATTGATGAGGATGTGGAGAAGCTGG 98951228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAATGCCTAAAATTAAAAAGCTTGACAACAAAATATTGATGAGGATGTGGAGAAGCTGG 960

 98951229 AACTCATACATTGCTGGTGGGAGTGTAAAACATTTGAAAAACAGTTTGGCAATTGTTGTA 98951288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACTCATACATTGCTGGTGGGAGTGTAAAACATTTGAAAAACAGTTTGGCAATTGTTGTA 1020

 98951289 TATTGTTAAGCATACACTTACCATAAGATGCAATAATTCCACTCCTAAGTATTTTCTGAA 98951348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTGTTAAGCATACACTTACCATAAGATGCAATAATTCCACTCCTAAGTATTTTCTGAA 1080

 98951349 GAGAAGTGGAAACGTGTCTACAAATCTTTTATTCATAATAGCAAAAAACTAGAAATAACC 98951408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGAAGTGGAAACGTGTCTACAAATCTTTTATTCATAATAGCAAAAAACTAGAAATAACC 1140

 98951409 CAAATATCTAACAAAGGACAGTGGTTAAATTCTAGTATATGCATTCAGTCAGATTTAACA 98951468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAATATCTAACAAAGGACAGTGGTTAAATTCTAGTATATGCATTCAGTCAGATTTAACA 1200

 98951469 AAGAAGTATTGATACACACAACAACATATGTGAATCTCAAAAACGCTGAGTAAAAGAAGC 98951528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAAGTATTGATACACACAACAACATATGTGAATCTCAAAAACGCTGAGTAAAAGAAGC 1260

 98951529 AAGGTATGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGTCCGAGGTG 98951588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGTATGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGTCCGAGGTG 1320

 98951589 GGCCAATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTC 98951648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCCAATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTC 1380

 98951649 TACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCGTGCCTCTAATTCCATCTATCTG 98951708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCGTGCCTCTAATTCCATCTATCTG 1440

 98951709 GGGGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACTTGGGAGGCTCTAAGATTGCAGTGAGCCAAG 98951768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACTTGGGAGGCTCTAAGATTGCAGTGAGCCAAG 1500

 98951769 ATCGTGCCACTGCACTACAGCCTGGATGAGAGAGCGAGACTCTGTCTCAGAAAAAAAAAA 98951828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCGTGCCACTGCACTACAGCCTGGATGAGAGAGCGAGACTCTGTCTCAGAAAAAAAAAA 1560

 98951829 AAGAATAAAAAGGGGCTGGACACAGTGGTTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTTAGAAGGC 98951888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGAATAAAAAGGGGCTGGACACAGTGGTTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTTAGAAGGC 1620

 98951889 TGAGGCAGGAGGATTGCCTAAACCCAGGATTTCAAGACCAGCCTGGTCAACATAGTGAAA 98951948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAGGCAGGAGGATTGCCTAAACCCAGGATTTCAAGACCAGCCTGGTCAACATAGTGAAA 1680

 98951949 CCTCATTTCTATTTTAAAAATATATACTTTTAAAATATATAACATTATACAGACAGATAG 98952008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTCATTTCTATTTTAAAAATATATACTTTTAAAATATATAACATTATACAGACAGATAG 1740

 98952009 AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAATTTTTT 98952068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAATTTTTT 1800

 98952069 CTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGTT 98952128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGTT 1860

 98952129 CACTGTAACCTCCTCTTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 98952188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACTGTAACCTCCTCTTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCT 1920

 98952189 GGGATTACAGACATATGTCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGGAGAGACGGG 98952248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGATTACAGACATATGTCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGGAGAGACGGG 1980

 98952249 GTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTA 98952308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTTTGCCATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTA 2040

 98952309 TGATAACAATGCCTTCTTATGGATACCTCTTGAAGGATGTGTCTGAGAATGTTTTACAAT 98952368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGATAACAATGCCTTCTTATGGATACCTCTTGAAGGATGTGTCTGAGAATGTTTTACAAT 2100

 98952369 TAACCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTG 98952428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAACCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTG 2160

 98952429 TAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCAAGTGATTCTCCTGC 98952488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCAAGTGATTCTCCTGC 2220

 98952489 CTCAGCCTCCTGAGTAGTGGGACTACAGGCACGCACCACCACGCCCAGCTGCTAATTTTT 98952548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCAGCCTCCTGAGTAGTGGGACTACAGGCACGCACCACCACGCCCAGCTGCTAATTTTT 2280

 98952549 GCATTTTTAGCAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACC 98952608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCATTTTTAGCAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACC 2340

 98952609 TTGTGATCCACCCACCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGC 98952668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGTGATCCACCCACCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGC 2400

 98952669 CTGGCCTTAACTTTCTTTAAATAAGTAGGAGAAATACTCTAAAATAATGATAAAAAGTAC 98952728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGGCCTTAACTTTCTTTAAATAAGTAGGAGAAATACTCTAAAATAATGATAAAAAGTAC 2460

 98952729 AGTAAACACATAAACCAGTAACACTCATTTATTATCATTATCAAATATTAAGTACTGTAC 98952788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTAAACACATAAACCAGTAACACTCATTTATTATCATTATCAAATATTAAGTACTGTAC 2520

 98952789 ATGATTTTGTTATACTTTTGTATGACTGGCCACACAGTAAGTTTGTGTGACCAGAAATAT 98952848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGATTTTGTTATACTTTTGTATGACTGGCCACACAGTAAGTTTGTGTGACCAGAAATAT 2580

 98952849 GTGAGTACTGAATTGTGCTACATTATGATGGCTACAGTGTCACTAGGCAGTAAGAATTTT 98952908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTGAGTACTGAATTGTGCTACATTATGATGGCTACAGTGTCACTAGGCAGTAAGAATTTT 2640

 98952909 TCAGCCTCTTTATAATCTTATGGGACCACTGTTGTATATGCAGTTCATCATCGACAAAAA 98952968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCAGCCTCTTTATAATCTTATGGGACCACTGTTGTATATGCAGTTCATCATCGACAAAAA 2700

 98952969 CGTCGTTAAGCAGTACATGACTATAAAAAGAAAGCCTGGAAAGAACGCCTCCTGGGTTCA 98953028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CGTCGTTAAGCAGTACATGACTATAAAAAGAAAGCCTGGAAAGAACGCCTCCTGGGTTCA 2760

 98953029 TGTCATTACTCACAGATGACATGATCGTATATGCAAAAAAGCTGAAAGAATCTATAGAAG 98953088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTCATTACTCACAGATGACATGATCGTATATGCAAAAAAGCTGAAAGAATCTATAGAAG 2820

 98953089 AACTATTATAATTAATAGGTTTAATTAGCAAGGGCTCTAAATATAAGATTATTACACTAA 98953148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACTATTATAATTAATAGGTTTAATTAGCAAGGGCTCTAAATATAAGATTATTACACTAA 2880

 98953149 AACCAGTTGTGTTGCTGTGTCAACAAGAAACAAATAGAAAATGAAATTTTGAAAAGTATC 98953208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AACCAGTTGTGTTGCTGTGTCAACAAGAAACAAATAGAAAATGAAATTTTGAAAAGTATC 2940

 98953209 ACTTATAACACCAAAATATATCAAAAAACATTAAATCTAACGATGTCAAAGACCTTTGCA 98953268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTTATAACACCAAAATATATCAAAAAACATTAAATCTAACGATGTCAAAGACCTTTGCA 3000

 98953269 CTAGAAACTACAAACCACTGAGAAAAAAATAAAGAAAAAATAAATACCACATTTATAGAT 98953328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTAGAAACTACAAACCACTGAGAAAAAAATAAAGAAAAAATAAATACCACATTTATAGAT 3060

 98953329 TGGAAGAGTTAATGTTGTAAAGATCTTATTTCTTCCCAAATTGATCTACAAATTTAATAT 98953388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGGAAGAGTTAATGTTGTAAAGATCTTATTTCTTCCCAAATTGATCTACAAATTTAATAT 3120

 98953389 AATCCCAATCAAAATTCCAGCAGATTTTTGGTGTGGAAAGTGATACAACATTTTGACTTA 98953448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATCCCAATCAAAATTCCAGCAGATTTTTGGTGTGGAAAGTGATACAACATTTTGACTTA 3180

 98953449 GTTGATTCTAAAATTTAGATGGCAATGCAAAGACCAAAGAATAGCTAAGGCAAACCTAAA 98953508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTTGATTCTAAAATTTAGATGGCAATGCAAAGACCAAAGAATAGCTAAGGCAAACCTAAA 3240

 98953509 GAAGAACAAACCTGTAAAATGACACTGACTGCTTGATAGCATGCCCTATTATAAAGCTGT 98953568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAAGAACAAACCTGTAAAATGACACTGACTGCTTGATAGCATGCCCTATTATAAAGCTGT 3300

 98953569 GGCAATTCAGACAGTGTGGTTTTGTTCCAACAATAGACAAACAGGCCAATGGAACACAAC 98953628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCAATTCAGACAGTGTGGTTTTGTTCCAACAATAGACAAACAGGCCAATGGAACACAAC 3360

 98953629 AAAGAGTCCACAGACAGGCTGAAGGGTCACCTGATAGATGACAAAGTCAACACTGCTGTG 98953688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAGAGTCCACAGACAGGCTGAAGGGTCACCTGATAGATGACAAAGTCAACACTGCTGTG 3420

 98953689 TAGTGGAGAAAGGCCGGTCTTTTTGGGATGGGCCAATTGAATATCCCTATGGAAAAACAT 98953748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAGTGGAGAAAGGCCGGTCTTTTTGGGATGGGCCAATTGAATATCCCTATGGAAAAACAT 3480

 98953749 TAAACTTGATCCCTACCTCACAATCATTTAAAAGTTACTTTTATTTTTTATTTATTTATT 98953808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAAACTTGATCCCTACCTCACAATCATTTAAAAGTTACTTTTATTTTTTATTTATTTATT 3540

 98953809 TCTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATAATCTCGG 98953868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATAATCTCGG 3600

 98953869 CTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG 98953928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG 3660

 98953929 CTGGGATTACAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAAGTTTTGTTTTTAGTAGATATGGAG 98953988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTGGGATTACAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAAGTTTTGTTTTTAGTAGATATGGAG 3720

 98953989 TTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATATCCCCAATGTC 98954048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATATCCCCAATGTC 3780

 98954049 GGCCTCCTGAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTAAAAGTTACTT 98954108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGCCTCCTGAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTAAAAGTTACTT 3840

 98954109 TTAAAAAAAGTTAGTTTCAGTTGTATTATCCTTAAAATTGGAAAGGTAAAGCAATACATA 98954168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTAAAAAAAGTTAGTTTCAGTTGTATTATCCTTAAAATTGGAAAGGTAAAGCAATACATA 3900

 98954169 TTTTAGAAGAGAGCATAGGAGAAGAATATTTTCATAAACTTTGAGTAGGTAAAACTTTCT 98954228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTTAGAAGAGAGCATAGGAGAAGAATATTTTCATAAACTTTGAGTAGGTAAAACTTTCT 3960

 98954229 TAAATGTTTTTGAAAGGCAGTAATCATAATTAAAACAATTCATACATGGGACTGTAGTAA 98954288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TAAATGTTTTTGAAAGGCAGTAATCATAATTAAAACAATTCATACATGGGACTGTAGTAA 4020

 98954289 AATTAAAAACTTCTGTTCACCAAAAGACATCACCGAAAGAGTGGAAAGGCAAACCAAAGA 98954348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AATTAAAAACTTCTGTTCACCAAAAGACATCACCGAAAGAGTGGAAAGGCAAACCAAAGA 4080

 98954349 GTGGGAGAAAATATTTGCTGTACATGGGTCTGATAAAGCAGTCATATCAAAAATATATAA 98954408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GTGGGAGAAAATATTTGCTGTACATGGGTCTGATAAAGCAGTCATATCAAAAATATATAA 4140

 98954409 AGAACTTCTACAAACTGATCTAAAAAAAAAACTAATATAAAAGTGATCCAAAACTGAGGG 98954468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGAACTTCTACAAACTGATCTAAAAAAAAAACTAATATAAAAGTGATCCAAAACTGAGGG 4200

 98954469 CTTTCACAAAACTGGATGCCTAAATGTGCGATAAATATTCAAAACATATAAAGAACTTCT 98954528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTTTCACAAAACTGGATGCCTAAATGTGCGATAAATATTCAAAACATATAAAGAACTTCT 4260

 98954529 ACCAATAGGCTGGGCATAATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTTCTTTGAGAAGGCAGAGG 98954588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACCAATAGGCTGGGCATAATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTTCTTTGAGAAGGCAGAGG 4320

 98954589 CAGGAGGATCACTTGAGCCCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATACTGAGACCCCC 98954648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAGGAGGATCACTTGAGCCCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATACTGAGACCCCC 4380

 98954649 ACCTGTATTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAATTCCAACAAATAAACGAAGAGACAAC 98954708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACCTGTATTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAATTCCAACAAATAAACGAAGAGACAAC 4440

 98954709 CTTTTGCCAACAATGGGCAAAAGTCTTTAACAAGCAGTTCACACATAGCTAATAAACATT 98954768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTTTTGCCAACAATGGGCAAAAGTCTTTAACAAGCAGTTCACACATAGCTAATAAACATT 4500

 98954769 AAAAAGCGTATGGCATGACTGGTAATTAACCACAGAGAGATATCATTACACACCCATCAG 98954828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAAAAGCGTATGGCATGACTGGTAATTAACCACAGAGAGATATCATTACACACCCATCAG 4560

 98954829 CCTGCTAAAAATTAAATCATGCAATAGCAAAAGAGTATGTGGGGCCAGGAACAGTGGCTC 98954888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CCTGCTAAAAATTAAATCATGCAATAGCAAAAGAGTATGTGGGGCCAGGAACAGTGGCTC 4620

 98954889 ACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGCAGCTGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGT 98954948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGCAGCTGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGT 4680

 98954949 TCGAGACCAGCATGGCCAACATGCTGAAACCCCACCTGTACTAAAAATACCCAAAAAATT 98955008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TCGAGACCAGCATGGCCAACATGCTGAAACCCCACCTGTACTAAAAATACCCAAAAAATT 4740

 98955009 AGCCGGATGCTGTGGCAGGTGCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 98955068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGCCGGATGCTGTGGCAGGTGCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 4800

 98955069 TCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGC 98955128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGC 4860

 98955129 CTGGGCAAAAGAGCGAGACTCCA 98955151
          |||||||||||||||||||||||
     4861 CTGGGCAAAAGAGCGAGACTCCA 4883

EXCISED REGION

 98955156 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTTGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAAT 98955215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTTGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAAT 4949

 98955216 CCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAG 98955275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 CCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAG 5009

 98955276 ATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAA 98955335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 ATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAA 5069

 98955336 ACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGC 98955395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 ACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGC 5129

 98955396 AATTGCAGGCATGAGCCACCGTTCCTGGCCCCACATACTCTTTTGCTATTGCATGATTTA 98955455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 AATTGCAGGCATGAGCCACCGTTCCTGGCCCCACATACTCTTTTGCTATTGCATGATTTA 5189

 98955456 ATTTTTAGCCGGCTGATGGGTGTGTAATGATATCTCTCTGTGGTTTACTTACCAGTCATG 98955515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5190 ATTTTTAGCCGGCTGATGGGTGTGTAATGATATCTCTCTGTGGTTTACTTACCAGTCATG 5249

 98955516 CCATACACTTTTTAATGTTTATTAGCTATGTGTGAACTGCTTGTTAAAGACTTTTGTCCT 98955575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 CCATACACTTTTTAATGTTTATTAGCTATGTGTGAACTGCTTGTTAAAGACTTTTGTCCT 5309

 98955576 TTTTTGGCAAAATATTGTCTCTTCATTTATTTGTTGGAATTTTTTTTTTTTTTAAATACA 98955635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 TTTTTGGCAAAATATTGTCTCTTCATTTATTTGTTGGAATTTTTTTTTTTTTTAAATACA 5369

 98955636 GATGGGGGTCTCAGTATGTTGCCCAGGCTGATCTCAAACTTTTGGGCTCAAGTGATCCTT 98955695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 GATGGGGGTCTCAGTATGTTGCCCAGGCTGATCTCAAACTTTTGGGCTCAAGTGATCCTT 5429

 98955696 GGGGGATACCCAGGTGCACTGGTGGAAGTATAAATTGGAACAACTCTGAAAAGCGGTTTG 98955755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 GGGGGATACCCAGGTGCACTGGTGGAAGTATAAATTGGAACAACTCTGAAAAGCGGTTTG 5489

 98955756 ACATATCTATTCAGCATAGTGTATCCAACAATTGAGTAATACCATGATTAGATATACACC 98955815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 ACATATCTATTCAGCATAGTGTATCCAACAATTGAGTAATACCATGATTAGATATACACC 5549

 98955816 CTAGGTAAATTTTGTTTTTTTTTTTTAACAGTCTTGCTCTTTTGCCCAGACTGGAGTGCA 98955875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 CTAGGTAAATTTTGTTTTTTTTTTTTAACAGTCTTGCTCTTTTGCCCAGACTGGAGTGCA 5609

 98955876 GTGGTGCCATTTCGGCTTATTGCAACCTCCACTTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTACCT 98955935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 GTGGTGCCATTTCGGCTTATTGCAACCTCCACTTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTACCT 5669

 98955936 CACCCTCTCAAATAGCTGAGACTACAGGCACACCACCACCACACCTAGCTAATTTTTTGT 98955995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 CACCCTCTCAAATAGCTGAGACTACAGGCACACCACCACCACACCTAGCTAATTTTTTGT 5729

 98955996 ATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTGGACTC 98956055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5730 ATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTGGACTC 5789

 98956056 AAGTGATCGGCCTGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGC 98956115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5790 AAGTGATCGGCCTGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGC 5849

 98956116 ATGGCCTCTAGGTAAACTCTTACACCTGCAGACCAGAACACATGTAAAGAAAATTTATAG 98956175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 ATGGCCTCTAGGTAAACTCTTACACCTGCAGACCAGAACACATGTAAAGAAAATTTATAG 5909

 98956176 CAGTACTGTTCATAGTTACCAAAAGCCAGAAATATAATATATGTAATGTGTGAATTACTG 98956235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 CAGTACTGTTCATAGTTACCAAAAGCCAGAAATATAATATATGTAATGTGTGAATTACTG 5969

 98956236 CTACACAGCATGGATGAATTTCATGATGTTCAGTAATATATGCAAGTTAAAAGTATTACA 98956295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 CTACACAGCATGGATGAATTTCATGATGTTCAGTAATATATGCAAGTTAAAAGTATTACA 6029

 98956296 TGATATGATTTAAATTCAAGTTGAAAAATAGGTAAAATTATATTGTTTGAGGATGCATAA 98956355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 TGATATGATTTAAATTCAAGTTGAAAAATAGGTAAAATTATATTGTTTGAGGATGCATAA 6089

 98956356 TTAAGTGTTAAAACTATAAAGAGAAGAAAATAATTACCAAAAAAATCAGACTGCTGATAA 98956415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6090 TTAAGTGTTAAAACTATAAAGAGAAGAAAATAATTACCAAAAAAATCAGACTGCTGATAA 6149

 98956416 CCTGTGGAAAGGAGGGAATTGTAATCAGGAAAGGATGCAGGAGAAAGGGAAGGAACTGGG 98956475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6150 CCTGTGGAAAGGAGGGAATTGTAATCAGGAAAGGATGCAGGAGAAAGGGAAGGAACTGGG 6209

 98956476 GAGTGTTGTGTTTCTTGATCAGGGTGGTGGTTAAATAGGTGTTGCTTCATGGTCACGAAA 98956535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6210 GAGTGTTGTGTTTCTTGATCAGGGTGGTGGTTAAATAGGTGTTGCTTCATGGTCACGAAA 6269

 98956536 TTGTATACTTAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTTGAGAGG 98956595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6270 TTGTATACTTAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTTGAGAGG 6329

 98956596 CTGAGGTTGAAGGATCACTTGAACCCAGCAGTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACCTCAC 98956655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6330 CTGAGGTTGAAGGATCACTTGAACCCAGCAGTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACCTCAC 6389

 98956656 TCCAGCCTAGGCAAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAACAACAACAAAAAAAAGTGAGTTGT 98956715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6390 TCCAGCCTAGGCAAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAACAACAACAAAAAAAAGTGAGTTGT 6449

 98956716 GTCTTAGCTGAATAGCAAAAACAATCTTGAAGAAGAGCAAAGTTGGAGGTTTCACACTTT 98956775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6450 GTCTTAGCTGAATAGCAAAAACAATCTTGAAGAAGAGCAAAGTTGGAGGTTTCACACTTT 6509

 98956776 CTGATTTTGTTTTATTAGTAGTATTTTTTTATCTTTTATCTTTTTTTTTTGAGATAGAGT 98956835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     6510 CTGATTTTGTTTTATTAGTAGTATTTTTTTATCTTTTATC-TTTTTTTTTGAGATAGAGT 6568

 98956836 CTCTCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTATGC 98956895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6569 CTCTCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTATGC 6628

 98956896 CTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGCAT 98956955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6629 CTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGCAT 6688

 98956956 GCGC 98956959
          ||||
     6689 GCGC 6692

Alignment time is 6.29037 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2076] =>      2076 nucs 'mol-32-30f6-118947_2076'

Score:        2032
Aligned:      2076        nucs
Identic:      2072 (100%) nucs =>       107 (100%)      1965 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955295,98955401] EXCISED REGION [98959001,98960969]
 second seq =>  [       1,     107] EXCISED REGION [     108,    2076]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955295 GCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAG 98955354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAG 60

 98955355 AGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 98955401
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 107

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      108 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 167

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      168 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 227

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      228 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 287

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      288 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 347

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      348 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 407

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      408 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 467

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 527

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 587

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 647

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 707

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 767

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      768 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 827

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 887

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 947

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1007

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1067

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1127

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1187

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1247

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1307

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1367

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1427

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1487

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1547

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1607

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1667

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1727

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1787

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1847

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 1907

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 1967

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2027

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGAT 98960969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2028 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGAT 2076

Alignment time is 2.15156 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    4036] =>      4036 nucs 'mol-32-30f6-178086_4036'

Score:        4004
Aligned:      4037        nucs
Identic:      4034 (100%) nucs =>      2840 (100%)      1194 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98959001,98961841] EXCISED REGION [98961850,98963045]
 second seq =>  [       1,    2840] EXCISED REGION [    2841,    4036]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [98961842,98961849]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        42 nucs [98961842,98961883] to [98961850,98961891]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [98961842,98961845] to [98961846,98961849]
 second seq =>         0 nucs

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 60

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 120

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 180

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 240

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 300

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 360

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 420

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 480

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 540

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 600

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 660

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 720

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 780

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 840

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 900

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 960

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1020

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1080

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1140

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1200

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1260

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1320

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1380

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1440

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1500

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1560

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1620

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1680

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1740

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 1800

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 1860

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 1920

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 1980

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 98961040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     1981 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TTGTAGGCCGGGTGCA 2039

 98961041 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 98961100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 2099

 98961101 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 98961160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 2159

 98961161 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 98961220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 2219

 98961221 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 98961280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 2279

 98961281 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 98961340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 2339

 98961341 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 98961400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 2399

 98961401 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 98961460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 2459

 98961461 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 98961520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 2519

 98961521 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 98961580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 2579

 98961581 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 98961640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 2639

 98961641 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 98961700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 2699

 98961701 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 98961760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 2759

 98961761 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 98961820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 2819

 98961821 TCTTTCCAGAGATATCACATG 98961841
          |||||||||||||||||||||
     2820 TCTTTCCAGAGATATCACATG 2840

EXCISED REGION

 98961850 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTC 98961909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTC 2900

 98961910 ATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTT 98961969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 ATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTT 2960

 98961970 TGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGT 98962029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 TGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGT 3020

 98962030 TTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTG 98962089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 TTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTG 3080

 98962090 CATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATA 98962149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 CATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATA 3140

 98962150 TCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCA 98962209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 TCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCA 3200

 98962210 AAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACA 98962269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 AAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACA 3260

 98962270 TCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTG 98962329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 TCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTG 3320

 98962330 AGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCGTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATT 98962389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 AGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCGTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATT 3380

 98962390 AGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCCCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 98962449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 AGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCCCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 3440

 98962450 TCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGC 98962509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 TCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGC 3500

 98962510 CTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGT 98962569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 CTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGT 3560

 98962570 CTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAG 98962629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 CTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAG 3620

 98962630 AAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTTGATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGC 98962689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 AAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTTGATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGC 3680

 98962690 CTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTTTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCG 98962749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 CTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTTTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCG 3740

 98962750 CACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGT 98962809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 CACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGT 3800

 98962810 AGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCT 98962869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 AGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCT 3860

 98962870 GTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTGAATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTG 98962929
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 GTCGTGGGAGGGACCCAGTGGTAGGTAATTGAATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTG 3920

 98962930 TTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 98962989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 TTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 3980

 98962990 ATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATC 98963045
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 ATTTATTTAGACAGAGTCCTGCTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATC 4036

Alignment time is 3.84535 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    4407] =>      4407 nucs 'mol-32-3101-014767_4407'

Score:        4396
Aligned:      4407        nucs
Identic:      4406 (100%) nucs =>      3389 (100%)      1017 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98958453,98961841] EXCISED REGION [98961848,98962864]
 second seq =>  [       1,    3390] EXCISED REGION [    3391,    4407]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [98961842,98961847]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        44 nucs [98961842,98961885] to [98961848,98961891]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98961842,98961843] to [98961846,98961847]
 second seq =>         0 nucs

 98958453 AAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATAC 98958512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATAC 60

 98958513 AAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTG 98958572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTG 120

 98958573 GCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAG 98958632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAG 180

 98958633 CCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGAT 98958692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGAT 240

 98958693 CCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGG 98958752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGG 300

 98958753 TTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAG 98958812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAG 360

 98958813 ATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAA 98958872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAA 420

 98958873 AAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTG 98958932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTG 480

 98958933 AACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCG 98958992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCG 540

 98958993 ACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTC 98959052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTC 600

 98959053 TTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGC 98959112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGC 660

 98959113 TCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGC 98959172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGC 720

 98959173 TGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGG 98959232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGG 780

 98959233 GTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTT 98959292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTT 840

 98959293 GGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTT 98959352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTT 900

 98959353 AATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGA 98959412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGA 960

 98959413 TTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAAC 98959472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAAC 1020

 98959473 AGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAA 98959532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAA 1080

 98959533 GATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGG 98959592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGG 1140

 98959593 GATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAG 98959652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAG 1200

 98959653 CCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCA 98959712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCA 1260

 98959713 CCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAA 98959772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAA 1320

 98959773 AATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCT 98959832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCT 1380

 98959833 GAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCA 98959892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCA 1440

 98959893 CTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAA 98959952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAA 1500

 98959953 CAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGC 98960012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGC 1560

 98960013 AGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCA 98960072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCA 1620

 98960073 CACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAA 98960132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAA 1680

 98960133 AAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATG 98960192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATG 1740

 98960193 GTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGG 98960252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGG 1800

 98960253 GCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGC 98960312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGC 1860

 98960313 TTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTA 98960372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTA 1920

 98960373 ATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCT 98960432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCT 1980

 98960433 ACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGC 98960492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGC 2040

 98960493 AGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTA 98960552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTA 2100

 98960553 AAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAA 98960612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAA 2160

 98960613 TTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTA 98960672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTA 2220

 98960673 ATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATAT 98960732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATAT 2280

 98960733 GGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGAT 98960792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGAT 2340

 98960793 GTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTA 98960852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTA 2400

 98960853 GTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAA 98960912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAA 2460

 98960913 TCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAG 98960972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAG 2520

 98960973 CCTGGGCAAAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TTGTAGG 98961031
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     2521 CCTGGGCAAAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGG 2580

 98961032 CCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGAT 98961091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGAT 2640

 98961092 TGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCA 98961151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCA 2700

 98961152 CAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGA 98961211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGA 2760

 98961212 CTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGC 98961271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGC 2820

 98961272 CATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACA 98961331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACA 2880

 98961332 AAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTAT 98961391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTAT 2940

 98961392 TTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTC 98961451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTC 3000

 98961452 ACTGCAACCTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 98961511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTGCAACCTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 3060

 98961512 GGATTACAGGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGT 98961571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGATTACAGGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGT 3120

 98961572 AGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGG 98961631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGG 3180

 98961632 CCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACA 98961691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACA 3240

 98961692 GAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTT 98961751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTT 3300

 98961752 CACCTCTGACCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTT 98961811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CACCTCTGACCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTT 3360

 98961812 GTGTGTGTATCTTTCCAGAGATATCACATG 98961841
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTGTGTGTATCTTTCCAGAGATATCACATG 3390

EXCISED REGION

 98961848 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTCTCTT 98961907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTCTCTT 3450

 98961908 TCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATG 98961967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATG 3510

 98961968 TTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATTAGCA 98962027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 TTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATTAGCA 3570

 98962028 GTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGATTAC 98962087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 GTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGATTAC 3630

 98962088 TGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCA 98962147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 TGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCA 3690

 98962148 TATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGAC 98962207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 TATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGAC 3750

 98962208 CAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCA 98962267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 CAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCA 3810

 98962268 CATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTT 98962327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 CATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTT 3870

 98962328 TGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCGTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAA 98962387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 TGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCGTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAA 3930

 98962388 TTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCCCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAG 98962447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 TTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCCCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAG 3990

 98962448 GATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCA 98962507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 GATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCA 4050

 98962508 GCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAA 98962567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 GCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAA 4110

 98962568 GTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCA 98962627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 GTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCA 4170

 98962628 AGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTTGATAGACAGATGTTGTCTGCATAATAT 98962687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 AGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTTGATAGACAGATGTTGTCTGCATAATAT 4230

 98962688 GCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTTTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTG 98962747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 GCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTTTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTG 4290

 98962748 CGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGAT 98962807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 CGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGAT 4350

 98962808 GTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCC 98962864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 GTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCC 4407

Alignment time is 3.87072 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    5016] =>      5016 nucs 'mol-32-3159-194387_5016'

Score:        4869
Aligned:      5041        nucs
Identic:      5009 ( 99%) nucs =>       165 ( 99%)      4844 ( 99%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955236,98955401] EXCISED REGION [98959001,98963875]
 second seq =>  [       1,     166] EXCISED REGION [     167,    5016]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955236 AATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAG 98955295
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGGTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAG 60

 98955296 CATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGA 98955355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGA 120

 98955356 GCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 98955401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 166

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      167 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 226

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      227 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 286

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      287 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 346

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      347 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 406

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      407 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 466

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 526

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      527 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 586

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 646

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 706

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 766

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 826

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      827 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 886

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 946

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 1006

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1066

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1126

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1186

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1246

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1306

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1366

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1426

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1486

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1546

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1606

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1666

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1726

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 AAGCAACCAACAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1786

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1846

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1906

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 1966

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 2026

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2086

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2087 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 2146

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 98961040
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 AAAGCGTGAAACCATGTCTT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 2204

 98961041 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 98961100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 2264

 98961101 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 98961160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 2324

 98961161 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 98961220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 2384

 98961221 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 98961280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 2444

 98961281 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 98961340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 2504

 98961341 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 98961400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 2564

 98961401 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 98961460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 2624

 98961461 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 98961520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 2684

 98961521 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 98961580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 2744

 98961581 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 98961640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 2804

 98961641 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 98961700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 2864

 98961701 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 98961760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 2924

 98961761 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 98961820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 2984

 98961821 TCTTTCCAGAGATATCACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 98961880
          |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TCTTTCCAGAGATATCACATG--------CACACACACACACACACACACACACACACAC 3036

 98961881 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 98961940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 3096

 98961941 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 98962000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 3156

 98962001 CATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATA 98962060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 CATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATA 3216

 98962061 ATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTA 98962120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 ATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTA 3276

 98962121 ATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAA 98962180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 ATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAA 3336

 98962181 TAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGAT 98962240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 TAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGAT 3396

 98962241 AGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 98962300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 AGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 3456

 98962301 TGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCG 98962360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCG 3516

 98962361 TCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCC 98962420
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 TCGCTAT-AAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCC 3575

 98962421 CAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGT 98962480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 CAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGT 3635

 98962481 GAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAA 98962540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 GAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAA 3695

 98962541 AGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACC 98962600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 AGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACC 3755

 98962601 TCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTT 98962660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 TCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTT 3815

 98962661 GATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTT 98962720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 GATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTT 3875

 98962721 TCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAA 98962780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 TCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAA 3935

 98962781 TATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 98962840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 TATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 3995

 98962841 TTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTG 98962900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 TTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTG 4055

 98962901 AATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTT 98962960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     4056 AATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGT-- 4113

 98962961 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACC 98963020
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 ----------TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACC 4163

 98963021 CAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAG 98963080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 CAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAG 4223

 98963081 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTG 98963140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTG 4283

 98963141 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAA 98963200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAA 4343

 98963201 TCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 98963260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 TCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 4403

 98963261 GCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTC 98963320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 GCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTC 4463

 98963321 TCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTC 98963380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 TCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTC 4523

 98963381 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCT 98963440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCT 4583

 98963441 CAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGG 98963500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 CAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGG 4643

 98963501 GGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATT 98963560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 GGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATT 4703

 98963561 TTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTC 98963620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 TTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTC 4763

 98963621 CTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCA 98963680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 CTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCA 4823

 98963681 AGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATT 98963740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 AGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATT 4883

 98963741 TCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACA 98963800
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4884 TCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCGAATTTGTAATCTGAGTTATTCACA 4943

 98963801 GTCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTG 98963860
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 GTCTG--TTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTG 5001

 98963861 GCACAATCTCGGCTC 98963875
          |||||||||||||||
     5002 GCACAATCTCGGCTC 5016

Alignment time is 4.35969 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    9431] =>      9431 nucs 'mol-32-3185-095358_9431'

Score:        9206
Aligned:      9434        nucs
Identic:      9401 (100%) nucs =>      6723 (100%)      2678 (100%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98948668,98955401] EXCISED REGION [98959001,98961684]
 second seq =>  [       1,    6749] EXCISED REGION [    6750,    9431]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98948668 CACAAAGGAATGAAGAGTGCCAGAAATGGTAAATTTATGGCTAAAGACTTTATTGTTTTT 98948727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACAAAGGAATGAAGAGTGCCAGAAATGGTAAATTTATGGCTAAAGACTTTATTGTTTTT 60

 98948728 CTTTAAAAAGTAGTTTACTGTTCAATACAAAATTGTAGTCATGTATTGTGGGATGTGAAA 98948787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTAAAAAGTAGTTTACTGTTCAATACAAAATTGTAGTCATGTATTGTGGGATGTGAAA 120

 98948788 TGTAAAATGTATGTCAATAAAGATAAAAAATGAATATTGTTATCACGTTCTTATATGTAG 98948847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAAAATGTATGTCAATAAAGATAAAAAATGAATATTGTTATCACGTTCTTATATGTAG 180

 98948848 ATTAATATTATTTGAAGATAGACTGTAATAGGTTAAAGATGCATATTGTAAACCCTAAGG 98948907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAATATTATTTGAAGATAGACTGTAATAGGTTAAAGATGCATATTGTAAACCCTAAGG 240

 98948908 TAGCCATTAATAACAAAACAGAGGTATAGCTAGTAAACTAATGGAGTACATAAAATGTAA 98948967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGCCATTAATAACAAAACAGAGGTATAGCTAGTAAACTAATGGAGTACATAAAATGTAA 300

 98948968 CACTAAGAAAAAGACTCAATCCAAAAGAAAATGGGAAAAGAGGAAAAAACACTGGAGGGT 98949027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTAAGAAAAAGACTCAATCCAAAAGAAAATGGGAAAAGAGGAAAAAACACTGGAGGGT 360

 98949028 TGGGAAAAGTAGAAAACAAGTAATAAGATGGTAGTCTTAAATCCAACTACAGATGCTCCT 98949087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGAAAAGTAGAAAACAAGTAATAAGATGGTAGTCTTAAATCCAACTACAGATGCTCCT 420

 98949088 TGATTTACATTGGGTTTATCCAGATGTTACACCATCATAAGTCAAGGAGTATACTGAACT 98949147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATTTACATTGGGTTTATCCAGATGTTACACCATCATAAGTCAAGGAGTATACTGAACT 480

 98949148 TGTGTTGCTTTAGCAGCATCATAAAATCGAAAAATGGTAAATCGAACTTTTTTTTTTT-- 98949205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
      481 TGTGTTGCTTTAGCAGCATCATAAAATCGAAAAATGGTAAATCGAACTTTTTTTTTTTTT 540

 98949206 ---------GAGACGGATGTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCAATCTCTG 98949256
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTTTTTGAGACGGATGTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCAATCTCTG 600

 98949257 CTCACTGCAAGCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTG 98949316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCACTGCAAGCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTG 660

 98949317 GGACTACAGGCATGCGCCACTACGCCCAGCTAGTTTTTTGTGTTTTAGTAGAGACGGGGT 98949376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGACTACAGGCATGCGCCACTACGCCCAGCTAGTTTTTTGTGTTTTAGTAGAGACGGGGT 720

 98949377 TTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTGGATATCCTGACCTCGTGATCTGTCCGCCTCAGAC 98949436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTGGATATCCTGACCTCGTGATCTGTCCGCCTCAGAC 780

 98949437 TCCCAAAGTGGTTGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCTGCCTGGAACTATCTTAAAT 98949496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCAAAGTGGTTGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCTGCCTGGAACTATCTTAAAT 840

 98949497 TAGGGACTGTCTGTATATCATTGTATTAGAAGTGATTTAAGAAAGTTTATGAATTTGTGT 98949556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGGGACTGTCTGTATATCATTGTATTAGAAGTGATTTAAGAAAGTTTATGAATTTGTGT 900

 98949557 TGGGCCACATGCAGCCGTGGGCTGCGGGTTGGACAACTTTGGTCTAAATTAAAAGGTGGA 98949616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGGCCACATGCAGCCGTGGGCTGCGGGTTGGACAACTTTGGTCTAAATTAAAAGGTGGA 960

 98949617 TACTGTCGGATTGGATTTTTAAAAGTAAGATCCAACTATATGCTGTCTACAAGAAACATT 98949676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTGTCGGATTGGATTTTTAAAAGTAAGATCCAACTATATGCTGTCTACAAGAAACATT 1020

 98949677 TAAAATATTGAGTTACAGGTTTAAAATGAATGAAAGAGTACACCATGAAAAAAACTATAA 98949736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAATATTGAGTTACAGGTTTAAAATGAATGAAAGAGTACACCATGAAAAAAACTATAA 1080

 98949737 TAAATCCAGAATGGTTACATTAATATCAAAGTAGACTTTAGGAAAAGGACTATTACTGTA 98949796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAATCCAGAATGGTTACATTAATATCAAAGTAGACTTTAGGAAAAGGACTATTACTGTA 1140

 98949797 GATTTTTAAAAAGACATTCAGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGGAATCCCAGCACTTT 98949856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATTTTTAAAAAGACATTCAGGCTGGGCACGGTGGCTCACGCCTGGAATCCCAGCACTTT 1200

 98949857 GGGAGGCCGAGGCGGCAGATTACAAGGTCGGGAGATAGAGACCGTCCTGGCTAACACGGT 98949916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGAGGCCGAGGCGGCAGATTACAAGGTCGGGAGATAGAGACCGTCCTGGCTAACACGGT 1260

 98949917 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGT 98949976
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA-TTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGT 1319

 98949977 AGTCCCAGCTACTCGAGAGGCTGATGCAGGAGAATGACGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTT 98950036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGTCCCAGCTACTCGAGAGGCTGATGCAGGAGAATGACGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTT 1379

 98950037 GCAGTGAGCTGCGATCGTGCCACTGCTCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCT 98950096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCAGTGAGCTGCGATCGTGCCACTGCTCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCT 1439

 98950097 CAAAAAATAAAATAAGAATAAAAAGACATTCATAAAGGGTCAGTATTAAAAAGACAAAGT 98950156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CAAAAAATAAAATAAGAATAAAAAGACATTCATAAAGGGTCAGTATTAAAAAGACAAAGT 1499

 98950157 CCTAAATGTGTATGCACTCAGTAACAAAACTTCCAAATACATGAAGCAAAACGTGACAGA 98950216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CCTAAATGTGTATGCACTCAGTAACAAAACTTCCAAATACATGAAGCAAAACGTGACAGA 1559

 98950217 ATCAAAAGGAGAAATAGACAAATACCAAAGTCTAGTTGGAGATTTCAACACTCTTCTTTC 98950276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATCAAAAGGAGAAATAGACAAATACCAAAGTCTAGTTGGAGATTTCAACACTCTTCTTTC 1619

 98950277 AGTAGCTGGTATAACAAAAATTCAGCAAGTTTATAAAAGACATTAACAGTACCTTCAACT 98950336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGTAGCTGGTATAACAAAAATTCAGCAAGTTTATAAAAGACATTAACAGTACCTTCAACT 1679

 98950337 AATTTGACCTAATTGACATTTATAGAATGCTACATCCAATGACAGCAGAATACACATTCT 98950396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AATTTGACCTAATTGACATTTATAGAATGCTACATCCAATGACAGCAGAATACACATTCT 1739

 98950397 TCTCAAGGGCACATGGAGCATTCATAAAGATATAATTTTTGTTGGGTAATAAGTCTCAAT 98950456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TCTCAAGGGCACATGGAGCATTCATAAAGATATAATTTTTGTTGGGTAATAAGTCTCAAT 1799

 98950457 AAAGTCTCAAAAAAATTGAAACAAACTATACTTCCTCATCAGGATAGAATTAAAAGTCAA 98950516
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAAGTCTCAAAAAAATTGAAACAAACTATACTTTCTCATCAGGATAGAATTAAAAGTCAA 1859

 98950517 TAACAAAAGCATATCTGGAAAATCCTCAAATATTTCAAGTTAAATACCATAATTAAATCC 98950576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TAACAAAAGCATATCTGGAAAATCCTCAAATATTTCAAGTTAAATACCATAATTAAATCC 1919

 98950577 ATGGGCCAAAGAAATCACAAGGGAAAGTATTTTGAACCAAATGATAACTCAAATAATCAT 98950636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ATGGGCCAAAGAAATCACAAGGGAAAGTATTTTGAACCAAATGATAACTCAAATAATCAT 1979

 98950637 GCAAATTTAATATAATCACATGTATCTGCATACACAGAGAATATATTTCCATTATATAGA 98950696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCAAATTTAATATAATCACATGTATCTGCATACACAGAGAATATATTTCCATTATATAGA 2039

 98950697 TCTGACAAAGAACTTGTATTCAGAATATATAAAGAAAACCTAAAGAATTGGTCAAGCATG 98950756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCTGACAAAGAACTTGTATTCAGAATATATAAAGAAAACCTAAAGAATTGGTCAAGCATG 2099

 98950757 GTGGCTCACACCTGTAATCCCACCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCA 98950816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GTGGCTCACACCTGTAATCCCACCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCA 2159

 98950817 GGAGTTTCAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATAAAAAAT 98950876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GGAGTTTCAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATAAAAAAT 2219

 98950877 TAGCCAAGTGTGGTGGTGCGCGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGA 98950936
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TAGCCAAGTGTGGTGGCGCGCGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGA 2279

 98950937 ATCACTTGAACCCGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAG 98950996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ATCACTTGAACCCGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCACTCCAG 2339

 98950997 CCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAGAAAAAACTAAAAAGAAAGCCAAAAGAATTG 98951056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAGAAAAAACTAAAAAGAAAGCCAAAAGAATTG 2399

 98951057 AGGGTTTCAGTAGATATTTAACAAAATATAGGAATGGCTAGTAACCACTGGTGCAACATT 98951116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGGGTTTCAGTAGATATTTAACAAAATATAGGAATGGCTAGTAACCACTGGTGCAACATT 2459

 98951117 ATTAGTATTCAGAGGAATGCAAATTAAAATTACAATGGACTACATACCCATTGGAATGCC 98951176
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2460 ATTAGTATTCAGAGGAATGCAAATTAAAATTACAATGAACTACATACCCATTGGAATGCC 2519

 98951177 TAAAATTAAAAAGCTTGACAACAAAATATTGATGAGGATGTGGAGAAGCTGGAACTCATA 98951236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TAAAATTAAAAAGCTTGACAACAAAATATTGATGAGGATGTGGAGAAGCTGGAACTCATA 2579

 98951237 CATTGCTGGTGGGAGTGTAAAACATTTGAAAAACAGTTTGGCAATTGTTGTATATTGTTA 98951296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CATTGCTGGTGGGAGTGTAAAACATTTGAAAAACAGTTTGGCAATTGTTGTATATTGTTA 2639

 98951297 AGCATACACTTACCATAAGATGCAATAATTCCACTCCTAAGTATTTTCTGAAGAGAAGTG 98951356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AGCATACACTTACCATAAGATGCAATAATTCCACTCCTAAGTATTTTCTGAAGAGAAGTG 2699

 98951357 GAAACGTGTCTACAAATCTTTTATTCATAATAGCAAAAAACTAGAAATAACCCAAATATC 98951416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GAAACGTGTCTACAAATCTTTTATTCATAATAGCAAAAAACTAGAAATAACCCAAATATC 2759

 98951417 TAACAAAGGACAGTGGTTAAATTCTAGTATATGCATTCAGTCAGATTTAACAAAGAAGTA 98951476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TAACAAAGGACAGTGGTTAAATTCTAGTATATGCATTCAGTCAGATTTAACAAAGAAGTA 2819

 98951477 TTGATACACACAACAACATATGTGAATCTCAAAAACGCTGAGTAAAAGAAGCAAGGTATG 98951536
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2820 TTGATACACACAACAACATATGTGAATCTCAAAAACGCTGAATAAAAGAAGCAAGGTATG 2879

 98951537 CCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGTCCGAGGTGGGCCAATC 98951596
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGTCCGAGGTGGGCCAATC 2939

 98951597 ACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTACTAAAA 98951656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTACTAAAA 2999

 98951657 ATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCGTGCCTCTAATTCCATCTATCTGGGGGGCTG 98951716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCGTGCCTCTAATTCCATCTATCTGGGGGGCTG 3059

 98951717 AGGCAGGAGAATCACTTGAACTTGGGAGGCTCTAAGATTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCC 98951776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGGCAGGAGAATCACTTGAACTTGGGAGGCTCTAAGATTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCC 3119

 98951777 ACTGCACTACAGCCTGGATGAGAGAGCGAGACTCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAGAATAA 98951836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ACTGCACTACAGCCTGGATGAGAGAGCGAGACTCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAGAATAA 3179

 98951837 AAAGGGGCTGGACACAGTGGTTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTTAGAAGGCTGAGGCAG 98951896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AAAGGGGCTGGACACAGTGGTTCACGCCTGTAACCCCAGCACTTTAGAAGGCTGAGGCAG 3239

 98951897 GAGGATTGCCTAAACCCAGGATTTCAAGACCAGCCTGGTCAACATAGTGAAACCTCATTT 98951956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GAGGATTGCCTAAACCCAGGATTTCAAGACCAGCCTGGTCAACATAGTGAAACCTCATTT 3299

 98951957 CTATTTTAAAAATATATACTTTTAAAATATATAACATTATACAGACAGATAGAGATAGAT 98952016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTATTTTAAAAATATATACTTTTAAAATATATAACATTATACAGACAGATAGAGATAGAT 3359

 98952017 AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAATTTTTTCTTTTGAG 98952076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAATTTTTTCTTTTGAG 3419

 98952077 ACAGAGTCTCACTCTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGTTCACTGTAA 98952136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ACAGAGTCTCACTCTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGTTCACTGTAA 3479

 98952137 CCTCCTCTTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTAC 98952196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CCTCCTCTTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTAC 3539

 98952197 AGACATATGTCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGGAGAGACGGGGTTTTGCC 98952256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AGACATATGTCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAGGAGAGACGGGGTTTTGCC 3599

 98952257 ATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTATGATAACA 98952316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ATTTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTATGATAACA 3659

 98952317 ATGCCTTCTTATGGATACCTCTTGAAGGATGTGTCTGAGAATGTTTTACAATTAACCTCC 98952376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ATGCCTTCTTATGGATACCTCTTGAAGGATGTGTCTGAGAATGTTTTACAATTAACCTCC 3719

 98952377 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGTAGTGGTG 98952436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGTAGTGGTG 3779

 98952437 CGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 98952496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 3839

 98952497 CCTGAGTAGTGGGACTACAGGCACGCACCACCACGCCCAGCTGCTAATTTTTGCATTTTT 98952556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CCTGAGTAGTGGGACTACAGGCACGCACCACCACGCCCAGCTGCTAATTTTTGCATTTTT 3899

 98952557 AGCAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTTGTGATC 98952616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AGCAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTTGTGATC 3959

 98952617 CACCCACCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCTGGCCTT 98952676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CACCCACCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCTGGCCTT 4019

 98952677 AACTTTCTTTAAATAAGTAGGAGAAATACTCTAAAATAATGATAAAAAGTACAGTAAACA 98952736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AACTTTCTTTAAATAAGTAGGAGAAATACTCTAAAATAATGATAAAAAGTACAGTAAACA 4079

 98952737 CATAAACCAGTAACACTCATTTATTATCATTATCAAATATTAAGTACTGTACATGATTTT 98952796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 CATAAACCAGTAACACTCATTTATTATCATTATCAAATATTAAGTACTGTACATGATTTT 4139

 98952797 GTTATACTTTTGTATGACTGGCCACACAGTAAGTTTGTGTGACCAGAAATATGTGAGTAC 98952856
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GTTATACTTTTATATGACTGGCCACACAGTAAGTTTGTGTGACCAGAAATATGTGAGTAC 4199

 98952857 TGAATTGTGCTACATTATGATGGCTACAGTGTCACTAGGCAGTAAGAATTTTTCAGCCTC 98952916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TGAATTGTGCTACATTATGATGGCTACAGTGTCACTAGGCAGTAAGAATTTTTCAGCCTC 4259

 98952917 TTTATAATCTTATGGGACCACTGTTGTATATGCAGTTCATCATCGACAAAAACGTCGTTA 98952976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TTTATAATCTTATGGGACCACTGTTGTATATGCAGTTCATCATCGACAAAAACGTCGTTA 4319

 98952977 AGCAGTACATGACTATAAAAAGAAAGCCTGGAAAGAACGCCTCCTGGGTTCATGTCATTA 98953036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 AGCAGTACATGACTATAAAAAGAAAGCCTGGAAAGAACGCCTCCTGGGTTCATGTCATTA 4379

 98953037 CTCACAGATGACATGATCGTATATGCAAAAAAGCTGAAAGAATCTATAGAAGAACTATTA 98953096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 CTCACAGATGACATGATCGTATATGCAAAAAAGCTGAAAGAATCTATAGAAGAACTATTA 4439

 98953097 TAATTAATAGGTTTAATTAGCAAGGGCTCTAAATATAAGATTATTACACTAAAACCAGTT 98953156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TAATTAATAGGTTTAATTAGCAAGGGCTCTAAATATAAGATTATTACACTAAAACCAGTT 4499

 98953157 GTGTTGCTGTGTCAACAAGAAACAAATAGAAAATGAAATTTTGAAAAGTATCACTTATAA 98953216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GTGTTGCTGTGTCAACAAGAAACAAATAGAAAATGAAATTTTGAAAAGTATCACTTATAA 4559

 98953217 CACCAAAATATATCAAAAAACATTAAATCTAACGATGTCAAAGACCTTTGCACTAGAAAC 98953276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 CACCAAAATATATCAAAAAACATTAAATCTAACGATGTCAAAGACCTTTGCACTAGAAAC 4619

 98953277 TACAAACCACTGAGAAAAAAATAAAGAAAAAATAAATACCACATTTATAGATTGGAAGAG 98953336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TACAAACCACTGAGAAAAAAATAAAGAAAAAATAAATACCACATTTATAGATTGGAAGAG 4679

 98953337 TTAATGTTGTAAAGATCTTATTTCTTCCCAAATTGATCTACAAATTTAATATAATCCCAA 98953396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TTAATGTTGTAAAGATCTTATTTCTTCCCAAATTGATCTACAAATTTAATATAATCCCAA 4739

 98953397 TCAAAATTCCAGCAGATTTTTGGTGTGGAAAGTGATACAACATTTTGACTTAGTTGATTC 98953456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TCAAAATTCCAGCAGATTTTTGGTGTGGAAAGTGATACAACATTTTGACTTAGTTGATTC 4799

 98953457 TAAAATTTAGATGGCAATGCAAAGACCAAAGAATAGCTAAGGCAAACCTAAAGAAGAACA 98953516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TAAAATTTAGATGGCAATGCAAAGACCAAAGAATAGCTAAGGCAAACCTAAAGAAGAACA 4859

 98953517 AACCTGTAAAATGACACTGACTGCTTGATAGCATGCCCTATTATAAAGCTGTGGCAATTC 98953576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 AACCTGTAAAATGACACTGACTGCTTGATAGCATGCCCTATTATAAAGCTGTGGCAATTC 4919

 98953577 AGACAGTGTGGTTTTGTTCCAACAATAGACAAACAGGCCAATGGAACACAACAAAGAGTC 98953636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 AGACAGTGTGGTTTTGTTCCAACAATAGACAAACAGGCCAATGGAACACAACAAAGAGTC 4979

 98953637 CACAGACAGGCTGAAGGGTCACCTGATAGATGACAAAGTCAACACTGCTGTGTAGTGGAG 98953696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CACAGACAGGCTGAAGGGTCACCTGATAGATGACAAAGTCAACACTGCTGTGTAGTGGAG 5039

 98953697 AAAGGCCGGTCTTTTTGGGATGGGCCAATTGAATATCCCTATGGAAAAACATTAAACTTG 98953756
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AAAGGCTGGTCTTTTTGGGATGGGCCAATTGAATATCCCTATGGAAAAACATTAAACTTG 5099

 98953757 ATCCCTACCTCACAATCATTTAAAAGTTACTTTTATTTTTTATTTATTTATTTCTTTTTG 98953816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 ATCCCTACCTCACAATCATTTAAAAGTTACTTTTATTTTTTATTTATTTATTTCTTTTTG 5159

 98953817 AGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATAATCTCGGCTCACTGC 98953876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 AGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATAATCTCGGCTCACTGC 5219

 98953877 AACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 98953936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 AACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 5279

 98953937 ACAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAAGTTTTGTTTTTAGTAGATATGGAGTTTCACCA 98953996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 ACAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAAGTTTTGTTTTTAGTAGATATGGAGTTTCACCA 5339

 98953997 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATATCCCCAATGTCGGCCTCCT 98954056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATATCCCCAATGTCGGCCTCCT 5399

 98954057 GAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTAAAAGTTACTTTTAAAAAA 98954116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTAAAAGTTACTTTTAAAAAA 5459

 98954117 AGTTAGTTTCAGTTGTATTATCCTTAAAATTGGAAAGGTAAAGCAATACATATTTTAGAA 98954176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 AGTTAGTTTCAGTTGTATTATCCTTAAAATTGGAAAGGTAAAGCAATACATATTTTAGAA 5519

 98954177 GAGAGCATAGGAGAAGAATATTTTCATAAACTTTGAGTAGGTAAAACTTTCTTAAATGTT 98954236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 GAGAGCATAGGAGAAGAATATTTTCATAAACTTTGAGTAGGTAAAACTTTCTTAAATGTT 5579

 98954237 TTTGAAAGGCAGTAATCATAATTAAAACAATTCATACATGGGACTGTAGTAAAATTAAAA 98954296
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TTTGAAAAGCAGTAATCATAATTAAAACAATTCATACATGGGACTGTAGTAAAATTAAAA 5639

 98954297 ACTTCTGTTCACCAAAAGACATCACCGAAAGAGTGGAAAGGCAAACCAAAGAGTGGGAGA 98954356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 ACTTCTGTTCACCAAAAGACATCACCGAAAGAGTGGAAAGGCAAACCAAAGAGTGGGAGA 5699

 98954357 AAATATTTGCTGTACATGGGTCTGATAAAGCAGTCATATCAAAAATATATAAAGAACTTC 98954416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 AAATATTTGCTGTACATGGGTCTGATAAAGCAGTCATATCAAAAATATATAAAGAACTTC 5759

 98954417 TACAAACTGATCTAAAAAAAAAACTAATATAAAAGTGATCCAAAACTGAGGGCTTTCACA 98954476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 TACAAACTGATCTAAAAAAAAAACTAATATAAAAGTGATCCAAAACTGAGGGCTTTCACA 5819

 98954477 AAACTGGATGCCTAAATGTGCGATAAATATTCAAAACATATAAAGAACTTCTACCAATAG 98954536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 AAACTGGATGCCTAAATGTGCGATAAATATTCAAAACATATAAAGAACTTCTACCAATAG 5879

 98954537 GCTGGGCATAATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTTCTTTGAGAAGGCAGAGGCAGGAGGA 98954596
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 GCTGGGCATAATGGCTCATACCTGTAATCCCAGTTCTTTGAGAAGGCAGAGGCAGGAGGA 5939

 98954597 TCACTTGAGCCCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATACTGAGACCCCCACCTGTAT 98954656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 TCACTTGAGCCCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATACTGAGACCCCCACCTGTAT 5999

 98954657 TTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAATTCCAACAAATAAACGAAGAGACAACCTTTTGCC 98954716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 TTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAATTCCAACAAATAAACGAAGAGACAACCTTTTGCC 6059

 98954717 AACAATGGGCAAAAGTCTTTAACAAGCAGTTCACACATAGCTAATAAACATTAAAAAGCG 98954776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 AACAATGGGCAAAAGTCTTTAACAAGCAGTTCACACATAGCTAATAAACATTAAAAAGCG 6119

 98954777 TATGGCATGACTGGTAATTAACCACAGAGAGATATCATTACACACCCATCAGCCTGCTAA 98954836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TATGGCATGACTGGTAATTAACCACAGAGAGATATCATTACACACCCATCAGCCTGCTAA 6179

 98954837 AAATTAAATCATGCAATAGCAAAAGAGTATGTGGGGCCAGGAACAGTGGCTCACACCTGT 98954896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 AAATTAAATCATGCAATAGCAAAAGAGTATGTGGGGCCAGGAACAGTGGCTCACACCTGT 6239

 98954897 AATCCCAGTACTTTGGGCAGCTGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACC 98954956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 AATCCCAGTACTTTGGGCAGCTGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACC 6299

 98954957 AGCATGGCCAACATGCTGAAACCCCACCTGTACTAAAAATACCCAAAAAATTAGCCGGAT 98955016
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 AGCATGGCCAACATGCTGAAACCCCGCCTGTACTAAAAATACCCAAAAAATTAGCCGGAT 6359

 98955017 GCTGTGGCAGGTGCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA 98955076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 GCTGTGGCAGGTGCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA 6419

 98955077 ACCTGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA 98955136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 ACCTGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA 6479

 98955137 AAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-----TTAGCTT 98955191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||
     6480 AAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTT 6539

 98955192 GGTGTCGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGG 98955251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 GGTGTCGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGG 6599

 98955252 AGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTG 98955311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 AGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTG 6659

 98955312 AGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGG 98955371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 AGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGG 6719

 98955372 AATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 98955401
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 AATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 6749

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6750 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 6809

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6810 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 6869

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6870 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 6929

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6930 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 6989

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6990 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 7049

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7050 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 7109

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7110 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 7169

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7170 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 7229

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7230 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 7289

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7290 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 7349

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7350 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 7409

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7410 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 7469

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7470 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 7529

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7530 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 7589

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7590 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 7649

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7650 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 7709

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7710 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 7769

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7770 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 7829

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7830 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 7889

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7890 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 7949

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7950 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 8009

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8010 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 8069

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8070 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 8129

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8130 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 8189

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8190 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 8249

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8250 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 8309

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8310 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 8369

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8370 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 8429

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8430 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 8489

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     8490 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 8549

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8550 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 8609

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8610 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 8669

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     8670 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 8729

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 98961040
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8730 AAAGCGTGAAACCATGTCTT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 8787

 98961041 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 98961100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8788 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 8847

 98961101 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 98961160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8848 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 8907

 98961161 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 98961220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8908 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 8967

 98961221 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 98961280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8968 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 9027

 98961281 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 98961340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9028 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 9087

 98961341 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 98961400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9088 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 9147

 98961401 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 98961460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9148 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 9207

 98961461 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 98961520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9208 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 9267

 98961521 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 98961580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9268 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 9327

 98961581 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 98961640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9328 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 9387

 98961641 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTG 98961684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9388 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTG 9431

Alignment time is 7.85354 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2682] =>      2682 nucs 'mol-32-3185-095358_2682'

Score:        2638
Aligned:      2682        nucs
Identic:      2678 (100%) nucs =>      1996 (100%)       682 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98959001,98961000] EXCISED REGION [98961003,98961684]
 second seq =>  [       1,    2000] EXCISED REGION [    2001,    2682]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [98961001,98961002]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [98961001,98961022] to [98961003,98961024]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98961001,98961001] to [98961002,98961002]
 second seq =>         0 nucs

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 60

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 120

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 180

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 240

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 300

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 360

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 420

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 480

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 540

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 600

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 660

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 720

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 780

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 840

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 900

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 960

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1020

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1080

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1140

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1200

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1260

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1320

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1380

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1440

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1500

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1560

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1620

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1680

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1740

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 1800

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 1860

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 1920

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 1980

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTT 98961000
          ||||||||||||||||||||
     1981 AAAGCGTGAAACCATGTCTT 2000

EXCISED REGION

 98961003 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCA 98961062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCA 2060

 98961063 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG 98961122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTG 2120

 98961123 GCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCC 98961182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 GCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCC 2180

 98961183 GGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAG 98961242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 GGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAG 2240

 98961243 GTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAC 98961302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 GTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAC 2300

 98961303 ACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCT 98961362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 ACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCT 2360

 98961363 TTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGG 98961422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGG 2420

 98961423 CGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGA 98961482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 CGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGA 2480

 98961483 TTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCC 98961542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCC 2540

 98961543 GACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCG 98961602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 GACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCG 2600

 98961603 GGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGAT 98961662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 GGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGAT 2660

 98961663 TATACCACTGCACTCCAGCCTG 98961684
          ||||||||||||||||||||||
     2661 TATACCACTGCACTCCAGCCTG 2682

Alignment time is 2.40115 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2286] =>      2286 nucs 'mol-32-322a-005356_2286'

Score:        2285
Aligned:      2285        nucs
Identic:      2285 (100%) nucs =>       497 (100%)      1788 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98958710,98959206] EXCISED REGION [98959208,98960995]
 second seq =>  [       1,     497] EXCISED REGION [     499,    2286]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [98959207,98959207]
 second seq =>         1 nucs [498,498]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98959206,98959206] to [98959207,98959207]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 98958710 GGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCC 98958769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCC 60

 98958770 AGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGT 98958829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGT 120

 98958830 TAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGG 98958889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGG 180

 98958890 TGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGC 98958949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGC 240

 98958950 TTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTT 98959009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTT 300

 98959010 CCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTC 98959069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTC 360

 98959070 TTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCC 98959129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCC 420

 98959130 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGC 98959189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGC 480

 98959190 ACAATCACACCCAGCTA 98959206
          |||||||||||||||||
      481 ACAATCACACCCAGCTA 497

EXCISED REGION

 98959208 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCC 98959267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCC 558

 98959268 TGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCC 98959327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 TGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCC 618

 98959328 ACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAAC 98959387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 ACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAAC 678

 98959388 AGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATT 98959447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 AGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATT 738

 98959448 CAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGA 98959507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 CAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGA 798

 98959508 AATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTC 98959567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 AATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTC 858

 98959568 CTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTA 98959627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 CTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTA 918

 98959628 AGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAG 98959687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 AGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAG 978

 98959688 TTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAC 98959747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 TTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAC 1038

 98959748 ATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCC 98959807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 ATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCC 1098

 98959808 TGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAG 98959867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 TGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAG 1158

 98959868 GTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCA 98959927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 GTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCA 1218

 98959928 TCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGT 98959987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 TCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGT 1278

 98959988 GTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGT 98960047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 GTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGT 1338

 98960048 TTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGG 98960107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 TTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGG 1398

 98960108 GCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGAT 98960167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 GCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGAT 1458

 98960168 ATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTT 98960227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 ATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTT 1518

 98960228 GTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGT 98960287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 GTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGT 1578

 98960288 CTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAA 98960347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 CTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAA 1638

 98960348 TGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTT 98960407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTT 1698

 98960408 TAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGT 98960467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGT 1758

 98960468 AGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCAT 98960527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCAT 1818

 98960528 TACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATA 98960587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATA 1878

 98960588 CTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCC 98960647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 CTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCC 1938

 98960648 CAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGA 98960707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 CAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGA 1998

 98960708 TTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATG 98960767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATG 2058

 98960768 ATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTC 98960827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 ATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTC 2118

 98960828 TGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGC 98960887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 TGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGC 2178

 98960888 TGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCG 98960947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCG 2238

 98960948 CTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCAT 98960995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 CTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCAT 2286

Alignment time is 2.192 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    5124] =>      5124 nucs 'mol-32-322a-012684_5124'

Score:        5113
Aligned:      5124        nucs
Identic:      5123 (100%) nucs =>      4653 (100%)       470 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98957189,98961841] EXCISED REGION [98961844,98962313]
 second seq =>  [       1,    4654] EXCISED REGION [    4655,    5124]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [98961842,98961843]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        48 nucs [98961842,98961889] to [98961844,98961891]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 98957189 AGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 98957248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 60

 98957249 ACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACACACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAAGCTA 98957308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACACACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAAGCTA 120

 98957309 TAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCATAAAGACAGACATATAAACCAATGGAATAGAA 98957368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCATAAAGACAGACATATAAACCAATGGAATAGAA 180

 98957369 TAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCATATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGTGCCA 98957428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCATATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGTGCCA 240

 98957429 AGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGATATCC 98957488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGATATCC 300

 98957489 ATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTTTCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTCAAAT 98957548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTTTCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTCAAAT 360

 98957549 AGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGGCTGA 98957608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGGCTGA 420

 98957609 GACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAAACCC 98957668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAAACCC 480

 98957669 CATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTCACAG 98957728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTCACAG 540

 98957729 CTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATCGAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCTGCAC 98957788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATCGAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCTGCAC 600

 98957789 TCCAGCCTCCATGACAGAGCAAGACCCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-GATTAA 98957847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
      601 TCCAGCCTCCATGACAGAGCAAGACCCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATTAA 660

 98957848 GGACCTAAACATAACACTAAAATAATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCAT 98957907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGACCTAAACATAACACTAAAATAATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCAT 720

 98957908 CATGACATTGAATTTGGCAATGTTTTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAG 98957967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGACATTGAATTTGGCAATGTTTTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAG 780

 98957968 CTAAAATATGCAAATGGAGCTACATGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATC 98958027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAAAATATGCAAATGGAGCTACATGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATC 840

 98958028 TATGGAATGGGAGATACATATCCAGAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAA 98958087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATGGAATGGGAGATACATATCCAGAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAA 900

 98958088 AATCCAAATAACCTAATTTTAAAATAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAA 98958147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATCCAAATAACCTAATTTTAAAATAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAA 960

 98958148 AACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTC 98958207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTC 1020

 98958208 AAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAAC 98958267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAAC 1080

 98958268 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAG 98958327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAG 1140

 98958328 CTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 98958387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 1200

 98958388 CTGAGATCGCGCCATTGCACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAA 98958447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGAGATCGCGCCATTGCACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAA 1260

 98958448 AAAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAA 98958507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAA 1320

 98958508 AATACAAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAG 98958567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATACAAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAG 1380

 98958568 TATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGG 98958627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGG 1440

 98958628 CATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCAT 98958687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCAT 1500

 98958688 ATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGC 98958747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGC 1560

 98958748 AACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTC 98958807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTC 1620

 98958808 AGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 98958867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 1680

 98958868 AAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATG 98958927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATG 1740

 98958928 GCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACT 98958987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACT 1800

 98958988 GGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCC 98959047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCC 1860

 98959048 CTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATC 98959107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATC 1920

 98959108 TTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGA 98959167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGA 1980

 98959168 GTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 98959227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 2040

 98959228 ACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCG 98959287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCG 2100

 98959288 GTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATA 98959347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATA 2160

 98959348 TCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTC 98959407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTC 2220

 98959408 TTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATC 98959467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATC 2280

 98959468 ATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTG 98959527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTG 2340

 98959528 CCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTA 98959587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTA 2400

 98959588 TCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACAT 98959647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACAT 2460

 98959648 AATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTG 98959707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTG 2520

 98959708 GATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTA 98959767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTA 2580

 98959768 TTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGA 98959827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGA 2640

 98959828 AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTG 98959887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTG 2700

 98959888 CACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAAT 98959947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAAT 2760

 98959948 AAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTAC 98960007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTAC 2820

 98960008 TCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTAT 98960067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTAT 2880

 98960068 GATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGT 98960127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGT 2940

 98960128 CTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATAT 98960187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATAT 3000

 98960188 ATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACT 98960247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACT 3060

 98960248 TTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTA 98960307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTA 3120

 98960308 TTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTT 98960367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTT 3180

 98960368 GGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATC 98960427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATC 3240

 98960428 TTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAA 98960487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAA 3300

 98960488 TTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTA 98960547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTA 3360

 98960548 CGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTA 98960607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTA 3420

 98960608 GTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAG 98960667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAG 3480

 98960668 AATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGT 98960727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGT 3540

 98960728 CATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACAC 98960787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACAC 3600

 98960788 TAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTG 98960847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTG 3660

 98960848 AAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCC 98960907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCC 3720

 98960908 TGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAG 98960967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAG 3780

 98960968 ATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTG 98961027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTG 3840

 98961028 TAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTG 98961087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTG 3900

 98961088 GGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCT 98961147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCT 3960

 98961148 ACCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGG 98961207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGG 4020

 98961208 GAGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATG 98961267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATG 4080

 98961268 GCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAA 98961327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAA 4140

 98961328 AACAAAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTT 98961387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AACAAAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTT 4200

 98961388 TTATTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCG 98961447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTATTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCG 4260

 98961448 GCTCACTGCAACCTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTA 98961507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GCTCACTGCAACCTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTA 4320

 98961508 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAG 98961567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAG 4380

 98961568 GTGTAGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTT 98961627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GTGTAGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTT 4440

 98961628 GAGGCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGT 98961687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAGGCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGT 4500

 98961688 GACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCC 98961747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCC 4560

 98961748 CTTTCACCTCTGACCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGT 98961807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTTTCACCTCTGACCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGT 4620

 98961808 TTTTGTGTGTGTATCTTTCCAGAGATATCACATG 98961841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTTGTGTGTGTATCTTTCCAGAGATATCACATG 4654

EXCISED REGION

 98961844 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTC 98961903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTC 4714

 98961904 TCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAAC 98961963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAAC 4774

 98961964 AATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATT 98962023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 AATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATT 4834

 98962024 AGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGA 98962083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 AGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGA 4894

 98962084 TTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTA 98962143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 TTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTA 4954

 98962144 CCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAAT 98962203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 CCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAAT 5014

 98962204 GGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGG 98962263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 GGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGG 5074

 98962264 CTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCT 98962313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 CTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCT 5124

Alignment time is 4.32609 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    5435] =>      5435 nucs 'mol-32-322a-167019_5435'

Score:        5332
Aligned:      5456        nucs
Identic:      5430 (100%) nucs =>       194 (100%)      5236 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955208,98955401] EXCISED REGION [98959001,98964261]
 second seq =>  [       1,     194] EXCISED REGION [     195,    5435]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955208 CCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGT 98955267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGT 60

 98955268 GAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAA 98955327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAA 120

 98955328 AACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGC 98955387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGC 180

 98955388 AATTAAGCAATTGC 98955401
          ||||||||||||||
      181 AATTAAGCAATTGC 194

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 254

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 314

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 374

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 434

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 494

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 554

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 614

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 674

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 734

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 794

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 854

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      855 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 914

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 974

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 1034

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1094

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1154

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1214

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1274

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1334

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1394

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1454

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1514

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1574

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1634

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1694

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1754

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1814

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1874

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1934

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 1994

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 2054

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2114

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2115 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 2174

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGC 98961039
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGC 2234

 98961040 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAG 98961099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAG 2294

 98961100 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACA 98961159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACA 2354

 98961160 AAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGA 98961219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 AAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGA 2414

 98961220 GGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCAC 98961279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 GGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCAC 2474

 98961280 TCCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGA 98961339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TCCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGA 2534

 98961340 ATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGAC 98961399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 ATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGAC 2594

 98961400 GGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAC 98961459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 GGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAAC 2654

 98961460 CTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACA 98961519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 CTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACA 2714

 98961520 GGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGT 98961579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 GGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGT 2774

 98961580 GTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGG 98961639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 GTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGG 2834

 98961640 TCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA 98961699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 TCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA 2894

 98961700 CCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTG 98961759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 CCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTG 2954

 98961760 ACCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGT 98961819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 ACCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGT 3014

 98961820 ATCTTTCCAGAGATATCACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 98961879
          ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 ATCTTTCCAGAGATATCACATG--------CACACACACACACACACACACACACACACA 3066

 98961880 CACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTT 98961939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTT 3126

 98961940 AATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTT 98961999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 AATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTT 3186

 98962000 TCATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCAT 98962059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TCATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCAT 3246

 98962060 AATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGT 98962119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 AATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGT 3306

 98962120 AATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGA 98962179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 AATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGA 3366

 98962180 ATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGA 98962239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 ATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGA 3426

 98962240 TAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 98962299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 TAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAG 3486

 98962300 GTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTC 98962359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 GTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTC 3546

 98962360 GTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTC 98962419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 GTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTC 3606

 98962420 CCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAG 98962479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 CCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAG 3666

 98962480 TGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGA 98962539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 TGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGA 3726

 98962540 AAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCAC 98962599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 AAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCAC 3786

 98962600 CTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTT 98962659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 CTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTT 3846

 98962660 TGATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACT 98962719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TGATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACT 3906

 98962720 TTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAA 98962779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAA 3966

 98962780 ATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCAT 98962839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 ATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCAT 4026

 98962840 CTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATT 98962899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 CTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATT 4086

 98962900 GAATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTT 98962959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4087 GAATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGT- 4145

 98962960 TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCAC 98963019
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 -----------TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCAC 4194

 98963020 CCAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAA 98963079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 CCAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAA 4254

 98963080 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCT 98963139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCT 4314

 98963140 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCA 98963199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCA 4374

 98963200 ATCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 98963259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 ATCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 4434

 98963260 AGCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTT 98963319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 AGCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTT 4494

 98963320 CTCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCT 98963379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 CTCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCT 4554

 98963380 CCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCC 98963439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 CCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCC 4614

 98963440 TCAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATG 98963499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 TCAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATG 4674

 98963500 GGGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCAT 98963559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 GGGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCAT 4734

 98963560 TTTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCT 98963619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TTTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCT 4794

 98963620 CCTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCC 98963679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 CCTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCC 4854

 98963680 AAGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTAT 98963739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 AAGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTAT 4914

 98963740 TTCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCAC 98963799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 TTCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCAC 4974

 98963800 AGTCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGT 98963859
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 AGTCTG-TTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGT 5033

 98963860 GGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA 98963919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 GGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA 5093

 98963920 GCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTT 98963979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 GCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTT 5153

 98963980 TAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGAT 98964039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 TAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGAT 5213

 98964040 CCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCT 98964099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCT 5273

 98964100 ATTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCTTCCCAGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTG 98964159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 ATTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCTTCCCAGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTG 5333

 98964160 AGATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTG 98964219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 AGATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTG 5393

 98964220 CAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGC 98964261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 CAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGC 5435

Alignment time is 4.6064 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    8417] =>      8417 nucs 'mol-32-3332-178923_8417'

Score:        8383
Aligned:      8424        nucs
Identic:      8417 (100%) nucs =>      8282 (100%)       135 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98952712,98961000] EXCISED REGION [98961005,98961139]
 second seq =>  [       1,    8282] EXCISED REGION [    8283,    8417]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [98961001,98961004]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [98961001,98961020] to [98961005,98961024]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98961001,98961002] to [98961003,98961004]
 second seq =>         0 nucs

 98952712 ATAATGATAAAAAGTACAGTAAACACATAAACCAGTAACACTCATTTATTATCATTATCA 98952771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATGATAAAAAGTACAGTAAACACATAAACCAGTAACACTCATTTATTATCATTATCA 60

 98952772 AATATTAAGTACTGTACATGATTTTGTTATACTTTTGTATGACTGGCCACACAGTAAGTT 98952831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATATTAAGTACTGTACATGATTTTGTTATACTTTTGTATGACTGGCCACACAGTAAGTT 120

 98952832 TGTGTGACCAGAAATATGTGAGTACTGAATTGTGCTACATTATGATGGCTACAGTGTCAC 98952891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGTGACCAGAAATATGTGAGTACTGAATTGTGCTACATTATGATGGCTACAGTGTCAC 180

 98952892 TAGGCAGTAAGAATTTTTCAGCCTCTTTATAATCTTATGGGACCACTGTTGTATATGCAG 98952951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGGCAGTAAGAATTTTTCAGCCTCTTTATAATCTTATGGGACCACTGTTGTATATGCAG 240

 98952952 TTCATCATCGACAAAAACGTCGTTAAGCAGTACATGACTATAAAAAGAAAGCCTGGAAAG 98953011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCATCATCGACAAAAACGTCGTTAAGCAGTACATGACTATAAAAAGAAAGCCTGGAAAG 300

 98953012 AACGCCTCCTGGGTTCATGTCATTACTCACAGATGACATGATCGTATATGCAAAAAAGCT 98953071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACGCCTCCTGGGTTCATGTCATTACTCACAGATGACATGATCGTATATGCAAAAAAGCT 360

 98953072 GAAAGAATCTATAGAAGAACTATTATAATTAATAGGTTTAATTAGCAAGGGCTCTAAATA 98953131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAGAATCTATAGAAGAACTATTATAATTAATAGGTTTAATTAGCAAGGGCTCTAAATA 420

 98953132 TAAGATTATTACACTAAAACCAGTTGTGTTGCTGTGTCAACAAGAAACAAATAGAAAATG 98953191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAGATTATTACACTAAAACCAGTTGTGTTGCTGTGTCAACAAGAAACAAATAGAAAATG 480

 98953192 AAATTTTGAAAAGTATCACTTATAACACCAAAATATATCAAAAAACATTAAATCTAACGA 98953251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATTTTGAAAAGTATCACTTATAACACCAAAATATATCAAAAAACATTAAATCTAACGA 540

 98953252 TGTCAAAGACCTTTGCACTAGAAACTACAAACCACTGAGAAAAAAATAAAGAAAAAATAA 98953311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTCAAAGACCTTTGCACTAGAAACTACAAACCACTGAGAAAAAAATAAAGAAAAAATAA 600

 98953312 ATACCACATTTATAGATTGGAAGAGTTAATGTTGTAAAGATCTTATTTCTTCCCAAATTG 98953371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATACCACATTTATAGATTGGAAGAGTTAATGTTGTAAAGATCTTATTTCTTCCCAAATTG 660

 98953372 ATCTACAAATTTAATATAATCCCAATCAAAATTCCAGCAGATTTTTGGTGTGGAAAGTGA 98953431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTACAAATTTAATATAATCCCAATCAAAATTCCAGCAGATTTTTGGTGTGGAAAGTGA 720

 98953432 TACAACATTTTGACTTAGTTGATTCTAAAATTTAGATGGCAATGCAAAGACCAAAGAATA 98953491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACAACATTTTGACTTAGTTGATTCTAAAATTTAGATGGCAATGCAAAGACCAAAGAATA 780

 98953492 GCTAAGGCAAACCTAAAGAAGAACAAACCTGTAAAATGACACTGACTGCTTGATAGCATG 98953551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTAAGGCAAACCTAAAGAAGAACAAACCTGTAAAATGACACTGACTGCTTGATAGCATG 840

 98953552 CCCTATTATAAAGCTGTGGCAATTCAGACAGTGTGGTTTTGTTCCAACAATAGACAAACA 98953611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCTATTATAAAGCTGTGGCAATTCAGACAGTGTGGTTTTGTTCCAACAATAGACAAACA 900

 98953612 GGCCAATGGAACACAACAAAGAGTCCACAGACAGGCTGAAGGGTCACCTGATAGATGACA 98953671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCCAATGGAACACAACAAAGAGTCCACAGACAGGCTGAAGGGTCACCTGATAGATGACA 960

 98953672 AAGTCAACACTGCTGTGTAGTGGAGAAAGGCCGGTCTTTTTGGGATGGGCCAATTGAATA 98953731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTCAACACTGCTGTGTAGTGGAGAAAGGCCGGTCTTTTTGGGATGGGCCAATTGAATA 1020

 98953732 TCCCTATGGAAAAACATTAAACTTGATCCCTACCTCACAATCATTTAAAAGTTACTTTTA 98953791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCCTATGGAAAAACATTAAACTTGATCCCTACCTCACAATCATTTAAAAGTTACTTTTA 1080

 98953792 TTTTTTATTTATTTATTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTG 98953851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTTATTTATTTATTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTG 1140

 98953852 CAATGGCATAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGC 98953911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAATGGCATAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGC 1200

 98953912 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAAGTTTTGT 98953971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTCTGCCACCACACCTGGCTAAGTTTTGT 1260

 98953972 TTTTAGTAGATATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAG 98954031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTAGTAGATATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAG 1320

 98954032 GTGATATCCCCAATGTCGGCCTCCTGAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCC 98954091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGATATCCCCAATGTCGGCCTCCTGAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCC 1380

 98954092 CAGCCTAAAAGTTACTTTTAAAAAAAGTTAGTTTCAGTTGTATTATCCTTAAAATTGGAA 98954151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGCCTAAAAGTTACTTTTAAAAAAAGTTAGTTTCAGTTGTATTATCCTTAAAATTGGAA 1440

 98954152 AGGTAAAGCAATACATATTTTAGAAGAGAGCATAGGAGAAGAATATTTTCATAAACTTTG 98954211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGTAAAGCAATACATATTTTAGAAGAGAGCATAGGAGAAGAATATTTTCATAAACTTTG 1500

 98954212 AGTAGGTAAAACTTTCTTAAATGTTTTTGAAAGGCAGTAATCATAATTAAAACAATTCAT 98954271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTAGGTAAAACTTTCTTAAATGTTTTTGAAAGGCAGTAATCATAATTAAAACAATTCAT 1560

 98954272 ACATGGGACTGTAGTAAAATTAAAAACTTCTGTTCACCAAAAGACATCACCGAAAGAGTG 98954331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATGGGACTGTAGTAAAATTAAAAACTTCTGTTCACCAAAAGACATCACCGAAAGAGTG 1620

 98954332 GAAAGGCAAACCAAAGAGTGGGAGAAAATATTTGCTGTACATGGGTCTGATAAAGCAGTC 98954391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAAGGCAAACCAAAGAGTGGGAGAAAATATTTGCTGTACATGGGTCTGATAAAGCAGTC 1680

 98954392 ATATCAAAAATATATAAAGAACTTCTACAAACTGATCTAAAAAAAAAACTAATATAAAAG 98954451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATATCAAAAATATATAAAGAACTTCTACAAACTGATCTAAAAAAAAAACTAATATAAAAG 1740

 98954452 TGATCCAAAACTGAGGGCTTTCACAAAACTGGATGCCTAAATGTGCGATAAATATTCAAA 98954511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATCCAAAACTGAGGGCTTTCACAAAACTGGATGCCTAAATGTGCGATAAATATTCAAA 1800

 98954512 ACATATAAAGAACTTCTACCAATAGGCTGGGCATAATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTT 98954571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACATATAAAGAACTTCTACCAATAGGCTGGGCATAATGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTT 1860

 98954572 CTTTGAGAAGGCAGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGGT 98954631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTGAGAAGGCAGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGGT 1920

 98954632 AACATACTGAGACCCCCACCTGTATTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAATTCCAACAA 98954691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACATACTGAGACCCCCACCTGTATTTAAAAACAAACAAACAAACAAAAAATTCCAACAA 1980

 98954692 ATAAACGAAGAGACAACCTTTTGCCAACAATGGGCAAAAGTCTTTAACAAGCAGTTCACA 98954751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAAACGAAGAGACAACCTTTTGCCAACAATGGGCAAAAGTCTTTAACAAGCAGTTCACA 2040

 98954752 CATAGCTAATAAACATTAAAAAGCGTATGGCATGACTGGTAATTAACCACAGAGAGATAT 98954811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATAGCTAATAAACATTAAAAAGCGTATGGCATGACTGGTAATTAACCACAGAGAGATAT 2100

 98954812 CATTACACACCCATCAGCCTGCTAAAAATTAAATCATGCAATAGCAAAAGAGTATGTGGG 98954871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATTACACACCCATCAGCCTGCTAAAAATTAAATCATGCAATAGCAAAAGAGTATGTGGG 2160

 98954872 GCCAGGAACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGCAGCTGAGGCGGGTGGAT 98954931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCAGGAACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGCAGCTGAGGCGGGTGGAT 2220

 98954932 CATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCATGGCCAACATGCTGAAACCCCACCTGTACTA 98954991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCATGGCCAACATGCTGAAACCCCACCTGTACTA 2280

 98954992 AAAATACCCAAAAAATTAGCCGGATGCTGTGGCAGGTGCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGG 98955051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAATACCCAAAAAATTAGCCGGATGCTGTGGCAGGTGCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGG 2340

 98955052 AGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCA 98955111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCA 2400

 98955112 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAA 98955171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAA 2460

 98955172 AAAAAAAAAAAAATTAGCTTGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCA 98955231
          ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAAAAAAA---TTAGCTTGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCA 2517

 98955232 GGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACT 98955291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACT 2577

 98955292 CCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAA 98955351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAA 2637

 98955352 AAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGCAGGCATGAGC 98955411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGCAGGCATGAGC 2697

 98955412 CACCGTTCCTGGCCCCACATACTCTTTTGCTATTGCATGATTTAATTTTTAGCCGGCTGA 98955471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CACCGTTCCTGGCCCCACATACTCTTTTGCTATTGCATGATTTAATTTTTAGCCGGCTGA 2757

 98955472 TGGGTGTGTAATGATATCTCTCTGTGGTTTACTTACCAGTCATGCCATACACTTTTTAAT 98955531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TGGGTGTGTAATGATATCTCTCTGTGGTTTACTTACCAGTCATGCCATACACTTTTTAAT 2817

 98955532 GTTTATTAGCTATGTGTGAACTGCTTGTTAAAGACTTTTGTCCTTTTTTGGCAAAATATT 98955591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GTTTATTAGCTATGTGTGAACTGCTTGTTAAAGACTTTTGTCCTTTTTTGGCAAAATATT 2877

 98955592 GTCTCTTCATTTATTTGTTGGAATTTTTTTTTTTTTTAAATACAGATGGGGGTCTCAGTA 98955651
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2878 GTCTCTTCATTTATTTGTTGGAATTTTTTTTTTTTT-AAATACAGATGGGGGTCTCAGTA 2936

 98955652 TGTTGCCCAGGCTGATCTCAAACTTTTGGGCTCAAGTGATCCTTGGGGGATACCCAGGTG 98955711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TGTTGCCCAGGCTGATCTCAAACTTTTGGGCTCAAGTGATCCTTGGGGGATACCCAGGTG 2996

 98955712 CACTGGTGGAAGTATAAATTGGAACAACTCTGAAAAGCGGTTTGACATATCTATTCAGCA 98955771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 CACTGGTGGAAGTATAAATTGGAACAACTCTGAAAAGCGGTTTGACATATCTATTCAGCA 3056

 98955772 TAGTGTATCCAACAATTGAGTAATACCATGATTAGATATACACCCTAGGTAAATTTTGTT 98955831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TAGTGTATCCAACAATTGAGTAATACCATGATTAGATATACACCCTAGGTAAATTTTGTT 3116

 98955832 TTTTTTTTTTAACAGTCTTGCTCTTTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATTTCGGC 98955891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTTTTTTTTTAACAGTCTTGCTCTTTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATTTCGGC 3176

 98955892 TTATTGCAACCTCCACTTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTACCTCACCCTCTCAAATAGC 98955951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TTATTGCAACCTCCACTTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTACCTCACCCTCTCAAATAGC 3236

 98955952 TGAGACTACAGGCACACCACCACCACACCTAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 98956011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TGAGACTACAGGCACACCACCACCACACCTAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 3296

 98956012 GGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTGGACTCAAGTGATCGGCCTGCC 98956071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAATTCCTGGACTCAAGTGATCGGCCTGCC 3356

 98956072 TCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCATGGCCTCTAGGTAAA 98956131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCATGGCCTCTAGGTAAA 3416

 98956132 CTCTTACACCTGCAGACCAGAACACATGTAAAGAAAATTTATAGCAGTACTGTTCATAGT 98956191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CTCTTACACCTGCAGACCAGAACACATGTAAAGAAAATTTATAGCAGTACTGTTCATAGT 3476

 98956192 TACCAAAAGCCAGAAATATAATATATGTAATGTGTGAATTACTGCTACACAGCATGGATG 98956251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TACCAAAAGCCAGAAATATAATATATGTAATGTGTGAATTACTGCTACACAGCATGGATG 3536

 98956252 AATTTCATGATGTTCAGTAATATATGCAAGTTAAAAGTATTACATGATATGATTTAAATT 98956311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AATTTCATGATGTTCAGTAATATATGCAAGTTAAAAGTATTACATGATATGATTTAAATT 3596

 98956312 CAAGTTGAAAAATAGGTAAAATTATATTGTTTGAGGATGCATAATTAAGTGTTAAAACTA 98956371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CAAGTTGAAAAATAGGTAAAATTATATTGTTTGAGGATGCATAATTAAGTGTTAAAACTA 3656

 98956372 TAAAGAGAAGAAAATAATTACCAAAAAAATCAGACTGCTGATAACCTGTGGAAAGGAGGG 98956431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TAAAGAGAAGAAAATAATTACCAAAAAAATCAGACTGCTGATAACCTGTGGAAAGGAGGG 3716

 98956432 AATTGTAATCAGGAAAGGATGCAGGAGAAAGGGAAGGAACTGGGGAGTGTTGTGTTTCTT 98956491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 AATTGTAATCAGGAAAGGATGCAGGAGAAAGGGAAGGAACTGGGGAGTGTTGTGTTTCTT 3776

 98956492 GATCAGGGTGGTGGTTAAATAGGTGTTGCTTCATGGTCACGAAATTGTATACTTAATTAG 98956551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GATCAGGGTGGTGGTTAAATAGGTGTTGCTTCATGGTCACGAAATTGTATACTTAATTAG 3836

 98956552 CTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGTTGAAGGATC 98956611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 CTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGTTGAAGGATC 3896

 98956612 ACTTGAACCCAGCAGTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACCTCACTCCAGCCTAGGCAAGA 98956671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 ACTTGAACCCAGCAGTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACCTCACTCCAGCCTAGGCAAGA 3956

 98956672 GTGAGACCCTGTCTCCAAAACAACAACAAAAAAAAGTGAGTTGTGTCTTAGCTGAATAGC 98956731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GTGAGACCCTGTCTCCAAAACAACAACAAAAAAAAGTGAGTTGTGTCTTAGCTGAATAGC 4016

 98956732 AAAAACAATCTTGAAGAAGAGCAAAGTTGGAGGTTTCACACTTTCTGATTTTGTTTTATT 98956791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 AAAAACAATCTTGAAGAAGAGCAAAGTTGGAGGTTTCACACTTTCTGATTTTGTTTTATT 4076

 98956792 AGTAGTATTTTTTTATCTTTTATCTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTCTCTCTGTCTCCCA 98956851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 AGTAGTATTTTTTTATCTTTTATCTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTCTCTCTGTCTCCCA 4136

 98956852 GGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTATGCCTCCTGGGTTCAAGCG 98956911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTATGCCTCCTGGGTTCAAGCG 4196

 98956912 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGCATGCGCCACCATGCCCAG 98956971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGGCATGCGCCACCATGCCCAG 4256

 98956972 CTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTCACTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAA 98957031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTCACTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAA 4316

 98957032 TGGGGCAATCTTTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTC 98957091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 TGGGGCAATCTTTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTC 4376

 98957092 AGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCATCACACACAGCTAATTTTTGTATT 98957151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 AGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCATCACACACAGCTAATTTTTGTATT 4436

 98957152 TTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCCAGTCTCAAACTTCTGACCTCAGG 98957211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCCAGTCTCAAACTTCTGACCTCAGG 4496

 98957212 TGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTG 98957271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 TGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTG 4556

 98957272 GACACACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAAGCTATAGTAGTCAAAACAGTGTGGTAC 98957331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 GACACACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAAGCTATAGTAGTCAAAACAGTGTGGTAC 4616

 98957332 TGGCATAAAGACAGACATATAAACCAATGGAATAGAATAGAGGGCCCAGAAATAAACCCT 98957391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TGGCATAAAGACAGACATATAAACCAATGGAATAGAATAGAGGGCCCAGAAATAAACCCT 4676

 98957392 AGCATATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGTGCCAAGACTGCTCATGGGGAAAGAACA 98957451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 AGCATATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGTGCCAAGACTGCTCATGGGGAAAGAACA 4736

 98957452 GTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGATATCCATATGTAAAAGAATGAAGGTAGA 98957511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 GTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGATATCCATATGTAAAAGAATGAAGGTAGA 4796

 98957512 CTCTTTCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTCAAATAGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGT 98957571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 CTCTTTCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTCAAATAGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGT 4856

 98957572 GGCTCATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGGCTGAGACAGAAAGATCTCTTGAGCCCA 98957631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 GGCTCATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGGCTGAGACAGAAAGATCTCTTGAGCCCA 4916

 98957632 GGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAGAAA 98957691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 GGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAGAAA 4976

 98957692 ATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTCACAGCTATTCGGGATGTTGAAGTGGGA 98957751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 ATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTCACAGCTATTCGGGATGTTGAAGTGGGA 5036

 98957752 AGATCGAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCTGCACTCCAGCCTCCATGACAGAGCAAG 98957811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 AGATCGAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCTGCACTCCAGCCTCCATGACAGAGCAAG 5096

 98957812 ACCCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATTAAGGACCTAAACATAACACTAAAATA 98957871
          |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 ACCCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA---GATTAAGGACCTAAACATAACACTAAAATA 5153

 98957872 ATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCATCATGACATTGAATTTGGCAATGTT 98957931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 ATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCATCATGACATTGAATTTGGCAATGTT 5213

 98957932 TTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAGCTAAAATATGCAAATGGAGCTACA 98957991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 TTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAGCTAAAATATGCAAATGGAGCTACA 5273

 98957992 TGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATCTATGGAATGGGAGATACATATCCA 98958051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 TGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATCTATGGAATGGGAGATACATATCCA 5333

 98958052 GAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAAAATCCAAATAACCTAATTTTAAAA 98958111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 GAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAAAATCCAAATAACCTAATTTTAAAA 5393

 98958112 TAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAAAACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGG 98958171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 TAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAAAACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGG 5453

 98958172 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTC 98958231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTC 5513

 98958232 GGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 98958291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 GGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 5573

 98958292 TTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 98958351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 TTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 5633

 98958352 AATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCTG 98958411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 AATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCTG 5693

 98958412 GCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGGCCAATAAGCATATG 98958471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 GCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGGCCAATAAGCATATG 5753

 98958472 AAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATACAAGGAGATATCACCTCATA 98958531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 AAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATACAAGGAGATATCACCTCATA 5813

 98958532 CCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTG 98958591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 CCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTG 5873

 98958592 GAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTAT 98958651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 GAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTAT 5933

 98958652 GGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGATCCAGCAAACACACTTCTGG 98958711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 GGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGATCCAGCAAACACACTTCTGG 5993

 98958712 GTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAG 98958771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAG 6053

 98958772 CACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTA 98958831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 CACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTA 6113

 98958832 ACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTG 98958891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 ACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTG 6173

 98958892 GTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTT 98958951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 GTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTT 6233

 98958952 GCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCC 98959011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 GCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCC 6293

 98959012 TTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTT 98959071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 TTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTT 6353

 98959072 GCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTC 98959131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 GCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTC 6413

 98959132 CTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCAC 98959191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 CTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCAC 6473

 98959192 AATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAG 98959251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 AATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAG 6533

 98959252 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGG 98959311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGG 6593

 98959312 ATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACT 98959371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6594 ATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACT 6653

 98959372 GCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATAT 98959431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 GCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATAT 6713

 98959432 TCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTT 98959491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 TCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTT 6773

 98959492 GTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTG 98959551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 GTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTG 6833

 98959552 GCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCAC 98959611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 GCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCAC 6893

 98959612 CACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACA 98959671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 CACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACA 6953

 98959672 CCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAA 98959731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 CCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAA 7013

 98959732 GACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGG 98959791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 GACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGG 7073

 98959792 TGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTG 98959851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 TGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTG 7133

 98959852 AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCA 98959911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7134 AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCA 7193

 98959912 ACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGG 98959971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 ACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGG 7253

 98959972 CTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATC 98960031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 CTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATC 7313

 98960032 CCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTAC 98960091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 CCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTAC 7373

 98960092 TGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTT 98960151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 TGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTT 7433

 98960152 TTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATAACTAAATGTTT 98960211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 TTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATAACTAAATGTTT 7493

 98960212 TCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACC 98960271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 TCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACC 7553

 98960272 ATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTC 98960331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7554 ATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTC 7613

 98960332 CTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATAT 98960391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7614 CTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATAT 7673

 98960392 TCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATA 98960451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 TCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATA 7733

 98960452 CTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTC 98960511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 CTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTC 7793

 98960512 CTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAA 98960571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7794 CTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAA 7853

 98960572 AGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACA 98960631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 AGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACA 7913

 98960632 TGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAG 98960691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 TGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAG 7973

 98960692 GCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGGTATTCC 98960751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 GCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGGTATTCC 8033

 98960752 AGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTG 98960811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 AGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTG 8093

 98960812 TAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAA 98960871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8094 TAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAA 8153

 98960872 TATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGC 98960931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8154 TATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGC 8213

 98960932 TGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAA 98960991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8214 TGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAA 8273

 98960992 CCATGTCTT 98961000
          |||||||||
     8274 CCATGTCTT 8282

EXCISED REGION

 98961005 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGC 98961064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8283 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGC 8342

 98961065 ACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC 98961124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8343 ACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC 8402

 98961125 CAACATGGTGAAACC 98961139
          |||||||||||||||
     8403 CAACATGGTGAAACC 8417

Alignment time is 6.98469 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    5303] =>      5303 nucs 'mol-32-338a-135318_5303'

Score:        5227
Aligned:      5271        nucs
Identic:      5267 (100%) nucs =>        17 (100%)      5250 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98951654,98951670] EXCISED REGION [98955205,98960457]
 second seq =>  [      20,      36] EXCISED REGION [      52,    5303]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3534 nucs [98951671,98955204]
 second seq =>        15 nucs [37,51]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98951670,98951670] to [98955204,98955204]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98951669,98951670] to [98955205,98955206]
 second seq =>         2 nucs [35,36] to [52,53]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 98951654 AAAATACAAAAATTAGC 98951670
          |||||||||||||||||
       20 AAAATACAAAAATTAGC 36

EXCISED REGION

 98955205 GCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGC 98955264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       52 GCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGC 111

 98955265 AGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCA 98955324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 AGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCA 171

 98955325 AAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATA 98955384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 AAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATA 231

 98955385 AGCAATTAAGCAATTGCAGGCATGAGCCACCGTTCCTGGCCCCACATACTCTTTTGCTAT 98955444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 AGCAATTAAGCAATTGCAGGCATGAGCCACCGTTCCTGGCCCCACATACTCTTTTGCTAT 291

 98955445 TGCATGATTTAATTTTTAGCCGGCTGATGGGTGTGTAATGATATCTCTCTGTGGTTTACT 98955504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 TGCATGATTTAATTTTTAGCCGGCTGATGGGTGTGTAATGATATCTCTCTGTGGTTTACT 351

 98955505 TACCAGTCATGCCATACACTTTTTAATGTTTATTAGCTATGTGTGAACTGCTTGTTAAAG 98955564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 TACCAGTCATGCCATACACTTTTTAATGTTTATTAGCTATGTGTGAACTGCTTGTTAAAG 411

 98955565 ACTTTTGTCCTTTTTTGGCAAAATATTGTCTCTTCATTTATTTGTTGGAATTTTTTTTTT 98955624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 ACTTTTGTCCTTTTTTGGCAAAATATTGTCTCTTCATTTATTTGTTGGAATTTTTTTTTT 471

 98955625 TTTTAAATACAGATGGGGGTCTCAGTATGTTGCCCAGGCTGATCTCAAACTTTTGGGCTC 98955684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 TTTTAAATACAGATGGGGGTCTCAGTATGTTGCCCAGGCTGATCTCAAACTTTTGGGCTC 531

 98955685 AAGTGATCCTTGGGGGATACCCAGGTGCACTGGTGGAAGTATAAATTGGAACAACTCTGA 98955744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 AAGTGATCCTTGGGGGATACCCAGGTGCACTGGTGGAAGTATAAATTGGAACAACTCTGA 591

 98955745 AAAGCGGTTTGACATATCTATTCAGCATAGTGTATCCAACAATTGAGTAATACCATGATT 98955804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 AAAGCGGTTTGACATATCTATTCAGCATAGTGTATCCAACAATTGAGTAATACCATGATT 651

 98955805 AGATATACACCCTAGGTAAATTTTGTTTTTTTTTTTTAACAGTCTTGCTCTTTTGCCCAG 98955864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 AGATATACACCCTAGGTAAATTTTGTTTTTTTTTTTTAACAGTCTTGCTCTTTTGCCCAG 711

 98955865 ACTGGAGTGCAGTGGTGCCATTTCGGCTTATTGCAACCTCCACTTCCCAGGTTCAAGCAA 98955924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 ACTGGAGTGCAGTGGTGCCATTTCGGCTTATTGCAACCTCCACTTCCCAGGTTCAAGCAA 771

 98955925 TTCTCCTACCTCACCCTCTCAAATAGCTGAGACTACAGGCACACCACCACCACACCTAGC 98955984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 TTCTCCTACCTCACCCTCTCAAATAGCTGAGACTACAGGCACACCACCACCACACCTAGC 831

 98955985 TAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAA 98956044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 TAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAA 891

 98956045 TTCCTGGACTCAAGTGATCGGCCTGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCATG 98956104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 TTCCTGGACTCAAGTGATCGGCCTGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCATG 951

 98956105 AGCCACCGCGCATGGCCTCTAGGTAAACTCTTACACCTGCAGACCAGAACACATGTAAAG 98956164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 AGCCACCGCGCATGGCCTCTAGGTAAACTCTTACACCTGCAGACCAGAACACATGTAAAG 1011

 98956165 AAAATTTATAGCAGTACTGTTCATAGTTACCAAAAGCCAGAAATATAATATATGTAATGT 98956224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 AAAATTTATAGCAGTACTGTTCATAGTTACCAAAAGCCAGAAATATAATATATGTAATGT 1071

 98956225 GTGAATTACTGCTACACAGCATGGATGAATTTCATGATGTTCAGTAATATATGCAAGTTA 98956284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 GTGAATTACTGCTACACAGCATGGATGAATTTCATGATGTTCAGTAATATATGCAAGTTA 1131

 98956285 AAAGTATTACATGATATGATTTAAATTCAAGTTGAAAAATAGGTAAAATTATATTGTTTG 98956344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 AAAGTATTACATGATATGATTTAAATTCAAGTTGAAAAATAGGTAAAATTATATTGTTTG 1191

 98956345 AGGATGCATAATTAAGTGTTAAAACTATAAAGAGAAGAAAATAATTACCAAAAAAATCAG 98956404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 AGGATGCATAATTAAGTGTTAAAACTATAAAGAGAAGAAAATAATTACCAAAAAAATCAG 1251

 98956405 ACTGCTGATAACCTGTGGAAAGGAGGGAATTGTAATCAGGAAAGGATGCAGGAGAAAGGG 98956464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 ACTGCTGATAACCTGTGGAAAGGAGGGAATTGTAATCAGGAAAGGATGCAGGAGAAAGGG 1311

 98956465 AAGGAACTGGGGAGTGTTGTGTTTCTTGATCAGGGTGGTGGTTAAATAGGTGTTGCTTCA 98956524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 AAGGAACTGGGGAGTGTTGTGTTTCTTGATCAGGGTGGTGGTTAAATAGGTGTTGCTTCA 1371

 98956525 TGGTCACGAAATTGTATACTTAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGC 98956584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 TGGTCACGAAATTGTATACTTAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGC 1431

 98956585 TACTTGAGAGGCTGAGGTTGAAGGATCACTTGAACCCAGCAGTGCAGTGAGCTGAGATCG 98956644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TACTTGAGAGGCTGAGGTTGAAGGATCACTTGAACCCAGCAGTGCAGTGAGCTGAGATCG 1491

 98956645 CACCACCTCACTCCAGCCTAGGCAAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAACAACAACAAAAAA 98956704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 CACCACCTCACTCCAGCCTAGGCAAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAACAACAACAAAAAA 1551

 98956705 AAGTGAGTTGTGTCTTAGCTGAATAGCAAAAACAATCTTGAAGAAGAGCAAAGTTGGAGG 98956764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 AAGTGAGTTGTGTCTTAGCTGAATAGCAAAAACAATCTTGAAGAAGAGCAAAGTTGGAGG 1611

 98956765 TTTCACACTTTCTGATTTTGTTTTATTAGTAGTATTTTTTTATCTTTTATCTTTTTTTTT 98956824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TTTCACACTTTCTGATTTTGTTTTATTAGTAGTATTTTTTTATCTTTTATCTTTTTTTTT 1671

 98956825 TGAGATAGAGTCTCTCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 98956884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 TGAGATAGAGTCTCTCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 1731

 98956885 GCAACCTATGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA 98956944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GCAACCTATGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA 1791

 98956945 CTACAGGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCT 98957004
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CTACAGGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAA-TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCT 1850

 98957005 CACTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAATGGGGCAATCTTTGCTCACTGCAACCTCTGCCT 98957064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 CACTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAATGGGGCAATCTTTGCTCACTGCAACCTCTGCCT 1910

 98957065 CCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCA 98957124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 CCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCA 1970

 98957125 CCATCACACACAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGTCA 98957184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 CCATCACACACAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGTCA 2030

 98957185 GGCCAGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 98957244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GGCCAGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 2090

 98957245 GATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACACACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAA 98957304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 GATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACACACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAA 2150

 98957305 GCTATAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCATAAAGACAGACATATAAACCAATGGAAT 98957364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 GCTATAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCATAAAGACAGACATATAAACCAATGGAAT 2210

 98957365 AGAATAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCATATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGT 98957424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 AGAATAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCATATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGT 2270

 98957425 GCCAAGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGAT 98957484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 GCCAAGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGAT 2330

 98957485 ATCCATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTTTCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTC 98957544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 ATCCATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTTTCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTC 2390

 98957545 AAATAGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGG 98957604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 AAATAGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGG 2450

 98957605 CTGAGACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAA 98957664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 CTGAGACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAA 2510

 98957665 ACCCCATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTC 98957724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 ACCCCATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTC 2570

 98957725 ACAGCTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATCGAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCT 98957784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 ACAGCTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATCGAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCT 2630

 98957785 GCACTCCAGCCTCCATGACAGAGCAAGACCCTCTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA 98957843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     2631 GCACTCCAGCCTCCATGACAGAGCAAGACCCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA 2690

 98957844 TTAAGGACCTAAACATAACACTAAAATAATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAA 98957903
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2691 TTAAGGACCTAAACATAACACTAAAATAATAAAACTATTAGAATAAACCATAAGGGAAAA 2750

 98957904 GCATCATGACATTGAATTTGGCAATGTTTTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACA 98957963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 GCATCATGACATTGAATTTGGCAATGTTTTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACA 2810

 98957964 AAAGCTAAAATATGCAAATGGAGCTACATGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGAC 98958023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AAAGCTAAAATATGCAAATGGAGCTACATGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGAC 2870

 98958024 AATCTATGGAATGGGAGATACATATCCAGAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAAC 98958083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 AATCTATGGAATGGGAGATACATATCCAGAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAAC 2930

 98958084 AAAAAATCCAAATAACCTAATTTTAAAATAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGA 98958143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 AAAAAATCCAAATAACCTAATTTTAAAATAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGA 2990

 98958144 AGAAAACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 98958203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 AGAAAACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 3050

 98958204 GGTCAAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAG 98958263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 GGTCAAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAG 3110

 98958264 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATC 98958323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATC 3170

 98958324 CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAG 98958383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAG 3230

 98958384 TGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAA 98958443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     3231 TGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTC-A 3289

 98958444 AAAAAAAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAA 98958503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 AAAAAAAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAA 3349

 98958504 TCAAAATACAAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAA 98958563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 TCAAAATACAAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAA 3409

 98958564 CAAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAA 98958623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 CAAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAA 3469

 98958624 ATGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTG 98958683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 ATGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTG 3529

 98958684 CCATATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGG 98958743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 CCATATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGG 3589

 98958744 GCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGA 98958803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 GCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGA 3649

 98958804 GGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATAC 98958863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 GGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATAC 3709

 98958864 AAAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAG 98958923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 AAAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAG 3769

 98958924 AATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCA 98958983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 AATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCA 3829

 98958984 GACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCC 98959043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 GACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCC 3889

 98959044 TTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGC 98959103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 TTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGC 3949

 98959104 AATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTC 98959163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 AATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTC 4009

 98959164 CTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 98959223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 CTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 4069

 98959224 AGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCT 98959283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 AGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCT 4129

 98959284 GCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTG 98959343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 GCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTG 4189

 98959344 GATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTT 98959403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 GATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTT 4249

 98959404 TTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGG 98959463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 TTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGG 4309

 98959464 TATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTAT 98959523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 TATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTAT 4369

 98959524 GTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTA 98959583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 GTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTA 4429

 98959584 AGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAG 98959643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 AGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAG 4489

 98959644 ACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTG 98959703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 ACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTG 4549

 98959704 GGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAAC 98959763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 GGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAAC 4609

 98959764 TCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACT 98959823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 TCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACT 4669

 98959824 TTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAG 98959883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 TTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAG 4729

 98959884 ATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAAT 98959943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 ATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAAT 4789

 98959944 AAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAG 98960003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4790 AAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAG 4849

 98960004 CTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTG 98960063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 CTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTG 4909

 98960064 CTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACC 98960123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 CTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACC 4969

 98960124 CTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATT 98960183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 CTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATT 5029

 98960184 ATATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGT 98960243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 ATATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGT 5089

 98960244 CACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAA 98960303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 CACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAA 5149

 98960304 AGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTT 98960363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5150 AGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTT 5209

 98960364 ACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGA 98960423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 ACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGA 5269

 98960424 GATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCC 98960457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 GATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCC 5303

Alignment time is 4.42672 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    3417] =>      3417 nucs 'mol-32-33ab-111693_3417'

Score:        3386
Aligned:      3419        nucs
Identic:      3416 (100%) nucs =>      1603 (100%)      1813 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955373,98956975] EXCISED REGION [98956977,98958792]
 second seq =>  [       1,    1603] EXCISED REGION [    1604,    3417]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [98956976,98956976]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [98958669,98958669]
 second seq =>         1 nucs [3294,3294]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [98956976,98956991] to [98956977,98956992]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 98955373 ATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGCAGGCATGAGCCACCGTTCCTGGCCCCACATA 98955432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGCAGGCATGAGCCACCGTTCCTGGCCCCACATA 60

 98955433 CTCTTTTGCTATTGCATGATTTAATTTTTAGCCGGCTGATGGGTGTGTAATGATATCTCT 98955492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTTTTGCTATTGCATGATTTAATTTTTAGCCGGCTGATGGGTGTGTAATGATATCTCT 120

 98955493 CTGTGGTTTACTTACCAGTCATGCCATACACTTTTTAATGTTTATTAGCTATGTGTGAAC 98955552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTGGTTTACTTACCAGTCATGCCATACACTTTTTAATGTTTATTAGCTATGTGTGAAC 180

 98955553 TGCTTGTTAAAGACTTTTGTCCTTTTTTGGCAAAATATTGTCTCTTCATTTATTTGTTGG 98955612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTTGTTAAAGACTTTTGTCCTTTTTTGGCAAAATATTGTCTCTTCATTTATTTGTTGG 240

 98955613 AATTTTTTTTTTTTTTAAATACAGATGGGGGTCTCAGTATGTTGCCCAGGCTGATCTCAA 98955672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTTTTTTTTTTTTAAATACAGATGGGGGTCTCAGTATGTTGCCCAGGCTGATCTCAA 300

 98955673 ACTTTTGGGCTCAAGTGATCCTTGGGGGATACCCAGGTGCACTGGTGGAAGTATAAATTG 98955732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTTTGGGCTCAAGTGATCCTTGGGGGATACCCAGGTGCACTGGTGGAAGTATAAATTG 360

 98955733 GAACAACTCTGAAAAGCGGTTTGACATATCTATTCAGCATAGTGTATCCAACAATTGAGT 98955792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACAACTCTGAAAAGCGGTTTGACATATCTATTCAGCATAGTGTATCCAACAATTGAGT 420

 98955793 AATACCATGATTAGATATACACCCTAGGTAAATTTTGTTTTTTTTTTTTAACAGTCTTGC 98955852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATACCATGATTAGATATACACCCTAGGTAAATTTTGTTTTTTTTTTTTAACAGTCTTGC 480

 98955853 TCTTTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATTTCGGCTTATTGCAACCTCCACTTCCC 98955912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATTTCGGCTTATTGCAACCTCCACTTCCC 540

 98955913 AGGTTCAAGCAATTCTCCTACCTCACCCTCTCAAATAGCTGAGACTACAGGCACACCACC 98955972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTTCAAGCAATTCTCCTACCTCACCCTCTCAAATAGCTGAGACTACAGGCACACCACC 600

 98955973 ACCACACCTAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAG 98956032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCACACCTAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAG 660

 98956033 GCTAGTCTCGAATTCCTGGACTCAAGTGATCGGCCTGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGG 98956092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTAGTCTCGAATTCCTGGACTCAAGTGATCGGCCTGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGG 720

 98956093 ATTACAGGCATGAGCCACCGCGCATGGCCTCTAGGTAAACTCTTACACCTGCAGACCAGA 98956152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTACAGGCATGAGCCACCGCGCATGGCCTCTAGGTAAACTCTTACACCTGCAGACCAGA 780

 98956153 ACACATGTAAAGAAAATTTATAGCAGTACTGTTCATAGTTACCAAAAGCCAGAAATATAA 98956212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACACATGTAAAGAAAATTTATAGCAGTACTGTTCATAGTTACCAAAAGCCAGAAATATAA 840

 98956213 TATATGTAATGTGTGAATTACTGCTACACAGCATGGATGAATTTCATGATGTTCAGTAAT 98956272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATATGTAATGTGTGAATTACTGCTACACAGCATGGATGAATTTCATGATGTTCAGTAAT 900

 98956273 ATATGCAAGTTAAAAGTATTACATGATATGATTTAAATTCAAGTTGAAAAATAGGTAAAA 98956332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATGCAAGTTAAAAGTATTACATGATATGATTTAAATTCAAGTTGAAAAATAGGTAAAA 960

 98956333 TTATATTGTTTGAGGATGCATAATTAAGTGTTAAAACTATAAAGAGAAGAAAATAATTAC 98956392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATATTGTTTGAGGATGCATAATTAAGTGTTAAAACTATAAAGAGAAGAAAATAATTAC 1020

 98956393 CAAAAAAATCAGACTGCTGATAACCTGTGGAAAGGAGGGAATTGTAATCAGGAAAGGATG 98956452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAAAAAATCAGACTGCTGATAACCTGTGGAAAGGAGGGAATTGTAATCAGGAAAGGATG 1080

 98956453 CAGGAGAAAGGGAAGGAACTGGGGAGTGTTGTGTTTCTTGATCAGGGTGGTGGTTAAATA 98956512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGGAGAAAGGGAAGGAACTGGGGAGTGTTGTGTTTCTTGATCAGGGTGGTGGTTAAATA 1140

 98956513 GGTGTTGCTTCATGGTCACGAAATTGTATACTTAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACC 98956572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTGTTGCTTCATGGTCACGAAATTGTATACTTAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACC 1200

 98956573 TGTAGTCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGTTGAAGGATCACTTGAACCCAGCAGTGCAGT 98956632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTAGTCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGTTGAAGGATCACTTGAACCCAGCAGTGCAGT 1260

 98956633 GAGCTGAGATCGCACCACCTCACTCCAGCCTAGGCAAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAAC 98956692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGCTGAGATCGCACCACCTCACTCCAGCCTAGGCAAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAAC 1320

 98956693 AACAACAAAAAAAAGTGAGTTGTGTCTTAGCTGAATAGCAAAAACAATCTTGAAGAAGAG 98956752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACAACAAAAAAAAGTGAGTTGTGTCTTAGCTGAATAGCAAAAACAATCTTGAAGAAGAG 1380

 98956753 CAAAGTTGGAGGTTTCACACTTTCTGATTTTGTTTTATTAGTAGTATTTTTTTATCTTTT 98956812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAAGTTGGAGGTTTCACACTTTCTGATTTTGTTTTATTAGTAGTATTTTTTTATCTTTT 1440

 98956813 ATCTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTCTCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGA 98956872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTCTCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGA 1500

 98956873 TCTTGGCTCACTGCAACCTATGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCT 98956932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTGGCTCACTGCAACCTATGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCT 1560

 98956933 GAGTAGCTGGGACTACAGGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAA 98956975
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGTAGCTGGGACTACAGGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAA 1603

EXCISED REGION

 98956977 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTCACTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAATGGGG 98957036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAAGTCTCACTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAATGGGG 1663

 98957037 CAATCTTTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 98957096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 CAATCTTTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 1723

 98957097 CCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCATCACACACAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 98957156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 CCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCATCACACACAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 1783

 98957157 TAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCCAGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATC 98957216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 TAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCCAGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATC 1843

 98957217 CACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACAC 98957276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 CACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACAC 1903

 98957277 ACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAAGCTATAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCA 98957336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 ACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAAGCTATAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCA 1963

 98957337 TAAAGACAGACATATAAACCAATGGAATAGAATAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCAT 98957396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TAAAGACAGACATATAAACCAATGGAATAGAATAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCAT 2023

 98957397 ATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGTGCCAAGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTC 98957456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 ATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGTGCCAAGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTC 2083

 98957457 TTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGATATCCATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTT 98957516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 TTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGATATCCATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTT 2143

 98957517 TCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTCAAATAGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTC 98957576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTCAAATAGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTC 2203

 98957577 ATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGGCTGAGACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGT 98957636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 ATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGGCTGAGACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGT 2263

 98957637 TCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAG 98957696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAG 2323

 98957697 CCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTCACAGCTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATC 98957756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 CCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTCACAGCTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATC 2383

 98957757 GAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCTGCACTCCAGCCTCCATGACAGAGCAAGACCCT 98957816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 GAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCTGCACTCCAGCCTCCATGACAGAGCAAGACCCT 2443

 98957817 CTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATTAAGGACCTAAACATAACACTAAAATAATAAA 98957876
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 CTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATTAAGGACCTAAACATAACACTAAAATAATAAA 2502

 98957877 ACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCATCATGACATTGAATTTGGCAATGTTTTTTT 98957936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCATCATGACATTGAATTTGGCAATGTTTTTTT 2562

 98957937 CATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAGCTAAAATATGCAAATGGAGCTACATGAAA 98957996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 CATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAGCTAAAATATGCAAATGGAGCTACATGAAA 2622

 98957997 CTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATCTATGGAATGGGAGATACATATCCAGAATA 98958056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 CTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATCTATGGAATGGGAGATACATATCCAGAATA 2682

 98958057 TATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAAAATCCAAATAACCTAATTTTAAAATAGGC 98958116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAAAATCCAAATAACCTAATTTTAAAATAGGC 2742

 98958117 CAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAAAACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCT 98958176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 CAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAAAACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCT 2802

 98958177 CATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTCGGGAG 98958236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 CATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTCGGGAG 2862

 98958237 TTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGC 98958296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 TTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGC 2922

 98958297 CGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG 98958356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 CGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG 2982

 98958357 CTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCTGGCCTG 98958416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 CTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCTGGCCTG 3042

 98958417 GGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAAAAAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAAT 98958476
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GGCAACAAGAGCAAAACACCATCTC-AAAAAAAAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAAT 3101

 98958477 CATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATACAAGGAGATATCACCTCATACCTAT 98958536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 CATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATACAAGGAGATATCACCTCATACCTAT 3161

 98958537 TAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGC 98958596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 TAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGC 3221

 98958597 CTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGG 98958656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 CTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGG 3281

 98958657 TTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTA 98958716
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 TTTCTAAAAAAACTAAAAATGGTATTGCCATATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTA 3341

 98958717 TATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTT 98958776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 TATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTT 3401

 98958777 TGGGAGGCCAAGGTGA 98958792
          ||||||||||||||||
     3402 TGGGAGGCCAAGGTGA 3417

Alignment time is 2.89247 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2577] =>      2577 nucs 'mol-32-33f8-079804_2577'

Score:        2571
Aligned:      2571        nucs
Identic:      2571 (100%) nucs =>       376 (100%)      2195 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955239,98955614] EXCISED REGION [98955616,98957810]
 second seq =>  [       7,     382] EXCISED REGION [     383,    2577]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [98955615,98955615]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [98955615,98955627] to [98955616,98955628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 98955239 TCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCAT 98955298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 TCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCAT 66

 98955299 GGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCA 98955358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 GGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCA 126

 98955359 TGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGCAGGCATGAGCCACCGTT 98955418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 TGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGCAGGCATGAGCCACCGTT 186

 98955419 CCTGGCCCCACATACTCTTTTGCTATTGCATGATTTAATTTTTAGCCGGCTGATGGGTGT 98955478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 CCTGGCCCCACATACTCTTTTGCTATTGCATGATTTAATTTTTAGCCGGCTGATGGGTGT 246

 98955479 GTAATGATATCTCTCTGTGGTTTACTTACCAGTCATGCCATACACTTTTTAATGTTTATT 98955538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 GTAATGATATCTCTCTGTGGTTTACTTACCAGTCATGCCATACACTTTTTAATGTTTATT 306

 98955539 AGCTATGTGTGAACTGCTTGTTAAAGACTTTTGTCCTTTTTTGGCAAAATATTGTCTCTT 98955598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 AGCTATGTGTGAACTGCTTGTTAAAGACTTTTGTCCTTTTTTGGCAAAATATTGTCTCTT 366

 98955599 CATTTATTTGTTGGAA 98955614
          ||||||||||||||||
      367 CATTTATTTGTTGGAA 382

EXCISED REGION

 98955616 TTTTTTTTTTTTTAAATACAGATGGGGGTCTCAGTATGTTGCCCAGGCTGATCTCAAACT 98955675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 TTTTTTTTTTTTTAAATACAGATGGGGGTCTCAGTATGTTGCCCAGGCTGATCTCAAACT 442

 98955676 TTTGGGCTCAAGTGATCCTTGGGGGATACCCAGGTGCACTGGTGGAAGTATAAATTGGAA 98955735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 TTTGGGCTCAAGTGATCCTTGGGGGATACCCAGGTGCACTGGTGGAAGTATAAATTGGAA 502

 98955736 CAACTCTGAAAAGCGGTTTGACATATCTATTCAGCATAGTGTATCCAACAATTGAGTAAT 98955795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 CAACTCTGAAAAGCGGTTTGACATATCTATTCAGCATAGTGTATCCAACAATTGAGTAAT 562

 98955796 ACCATGATTAGATATACACCCTAGGTAAATTTTGTTTTTTTTTTTTAACAGTCTTGCTCT 98955855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 ACCATGATTAGATATACACCCTAGGTAAATTTTGTTTTTTTTTTTTAACAGTCTTGCTCT 622

 98955856 TTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATTTCGGCTTATTGCAACCTCCACTTCCCAGG 98955915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 TTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCCATTTCGGCTTATTGCAACCTCCACTTCCCAGG 682

 98955916 TTCAAGCAATTCTCCTACCTCACCCTCTCAAATAGCTGAGACTACAGGCACACCACCACC 98955975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 TTCAAGCAATTCTCCTACCTCACCCTCTCAAATAGCTGAGACTACAGGCACACCACCACC 742

 98955976 ACACCTAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCT 98956035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 ACACCTAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCT 802

 98956036 AGTCTCGAATTCCTGGACTCAAGTGATCGGCCTGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATT 98956095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 AGTCTCGAATTCCTGGACTCAAGTGATCGGCCTGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATT 862

 98956096 ACAGGCATGAGCCACCGCGCATGGCCTCTAGGTAAACTCTTACACCTGCAGACCAGAACA 98956155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 ACAGGCATGAGCCACCGCGCATGGCCTCTAGGTAAACTCTTACACCTGCAGACCAGAACA 922

 98956156 CATGTAAAGAAAATTTATAGCAGTACTGTTCATAGTTACCAAAAGCCAGAAATATAATAT 98956215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 CATGTAAAGAAAATTTATAGCAGTACTGTTCATAGTTACCAAAAGCCAGAAATATAATAT 982

 98956216 ATGTAATGTGTGAATTACTGCTACACAGCATGGATGAATTTCATGATGTTCAGTAATATA 98956275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 ATGTAATGTGTGAATTACTGCTACACAGCATGGATGAATTTCATGATGTTCAGTAATATA 1042

 98956276 TGCAAGTTAAAAGTATTACATGATATGATTTAAATTCAAGTTGAAAAATAGGTAAAATTA 98956335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 TGCAAGTTAAAAGTATTACATGATATGATTTAAATTCAAGTTGAAAAATAGGTAAAATTA 1102

 98956336 TATTGTTTGAGGATGCATAATTAAGTGTTAAAACTATAAAGAGAAGAAAATAATTACCAA 98956395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TATTGTTTGAGGATGCATAATTAAGTGTTAAAACTATAAAGAGAAGAAAATAATTACCAA 1162

 98956396 AAAAATCAGACTGCTGATAACCTGTGGAAAGGAGGGAATTGTAATCAGGAAAGGATGCAG 98956455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 AAAAATCAGACTGCTGATAACCTGTGGAAAGGAGGGAATTGTAATCAGGAAAGGATGCAG 1222

 98956456 GAGAAAGGGAAGGAACTGGGGAGTGTTGTGTTTCTTGATCAGGGTGGTGGTTAAATAGGT 98956515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 GAGAAAGGGAAGGAACTGGGGAGTGTTGTGTTTCTTGATCAGGGTGGTGGTTAAATAGGT 1282

 98956516 GTTGCTTCATGGTCACGAAATTGTATACTTAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGT 98956575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 GTTGCTTCATGGTCACGAAATTGTATACTTAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGT 1342

 98956576 AGTCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGTTGAAGGATCACTTGAACCCAGCAGTGCAGTGAG 98956635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 AGTCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGTTGAAGGATCACTTGAACCCAGCAGTGCAGTGAG 1402

 98956636 CTGAGATCGCACCACCTCACTCCAGCCTAGGCAAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAACAAC 98956695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 CTGAGATCGCACCACCTCACTCCAGCCTAGGCAAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAACAAC 1462

 98956696 AACAAAAAAAAGTGAGTTGTGTCTTAGCTGAATAGCAAAAACAATCTTGAAGAAGAGCAA 98956755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 AACAAAAAAAAGTGAGTTGTGTCTTAGCTGAATAGCAAAAACAATCTTGAAGAAGAGCAA 1522

 98956756 AGTTGGAGGTTTCACACTTTCTGATTTTGTTTTATTAGTAGTATTTTTTTATCTTTTATC 98956815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 AGTTGGAGGTTTCACACTTTCTGATTTTGTTTTATTAGTAGTATTTTTTTATCTTTTATC 1582

 98956816 TTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTCTCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCT 98956875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 TTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTCTCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCT 1642

 98956876 TGGCTCACTGCAACCTATGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAG 98956935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 TGGCTCACTGCAACCTATGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAG 1702

 98956936 TAGCTGGGACTACAGGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAG 98956995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TAGCTGGGACTACAGGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAG 1762

 98956996 ACAAAGTCTCACTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAATGGGGCAATCTTTGCTCACTGCAA 98957055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 ACAAAGTCTCACTCTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAATGGGGCAATCTTTGCTCACTGCAA 1822

 98957056 CCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTAC 98957115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 CCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTAC 1882

 98957116 AGGTGCCCACCATCACACACAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCA 98957175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 AGGTGCCCACCATCACACACAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCA 1942

 98957176 TGTTGGTCAGGCCAGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCA 98957235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 TGTTGGTCAGGCCAGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCA 2002

 98957236 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACACACTTTCTGATTTTAAAACA 98957295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACACACTTTCTGATTTTAAAACA 2062

 98957296 TACCACAAAGCTATAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCATAAAGACAGACATATAAAC 98957355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 TACCACAAAGCTATAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCATAAAGACAGACATATAAAC 2122

 98957356 CAATGGAATAGAATAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCATATATGGTCAAGTAATTTTC 98957415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 CAATGGAATAGAATAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCATATATGGTCAAGTAATTTTC 2182

 98957416 ATTAAGCGTGCCAAGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGG 98957475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 ATTAAGCGTGCCAAGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGG 2242

 98957476 AAACTGGATATCCATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTTTCCTTCAACCATGTATAAA 98957535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 AAACTGGATATCCATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTTTCCTTCAACCATGTATAAA 2302

 98957536 ATTTAATTCAAATAGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCACAGGGC 98957595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 ATTTAATTCAAATAGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCACAGGGC 2362

 98957596 TTTGGGAGGCTGAGACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAA 98957655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 TTTGGGAGGCTGAGACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAA 2422

 98957656 CGTAGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTG 98957715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 CGTAGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTG 2482

 98957716 TCTGTAGTCACAGCTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATCGAGTGATCACATCTAGGAG 98957775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 TCTGTAGTCACAGCTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATCGAGTGATCACATCTAGGAG 2542

 98957776 GTCAAGGCTGCACTCCAGCCTCCATGACAGAGCAA 98957810
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 GTCAAGGCTGCACTCCAGCCTCCATGACAGAGCAA 2577

Alignment time is 2.19542 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2850] =>      2850 nucs 'mol-32-33f8-079805_2850'

Score:        2839
Aligned:      2850        nucs
Identic:      2849 (100%) nucs =>       583 (100%)      2266 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98957859,98958441] EXCISED REGION [98958445,98960711]
 second seq =>  [       1,     583] EXCISED REGION [     584,    2850]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [98958442,98958444]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [98958442,98958451] to [98958445,98958454]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98958442,98958442] to [98958444,98958444]
 second seq =>         0 nucs

 98957859 TAACACTAAAATAATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCATCATGACATTGA 98957918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAACACTAAAATAATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCATCATGACATTGA 60

 98957919 ATTTGGCAATGTTTTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAGCTAAAATATGC 98957978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTGGCAATGTTTTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAGCTAAAATATGC 120

 98957979 AAATGGAGCTACATGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATCTATGGAATGGG 98958038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATGGAGCTACATGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATCTATGGAATGGG 180

 98958039 AGATACATATCCAGAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAAAATCCAAATAA 98958098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATACATATCCAGAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAAAATCCAAATAA 240

 98958099 CCTAATTTTAAAATAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAAAACAGACAAAG 98958158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAATTTTAAAATAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAAAACAGACAAAG 300

 98958159 AGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGTGGGCGG 98958218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGTGGGCGG 360

 98958219 ATAACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAACCCCGTCTCTAC 98958278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAACCCCGTCTCTAC 420

 98958279 TAAAAATACAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAGCTACTCAGGAG 98958338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAAATACAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAGCTACTCAGGAG 480

 98958339 GCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCG 98958398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCG 540

 98958399 CCATTGCACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTC 98958441
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATTGCACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTC 583

EXCISED REGION

 98958445 AAAAAAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAAT 98958504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 AAAAAAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAAT 643

 98958505 CAAAATACAAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAAC 98958564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 CAAAATACAAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAAC 703

 98958565 AAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAA 98958624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 AAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAA 763

 98958625 TGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGC 98958684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 TGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGC 823

 98958685 CATATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGG 98958744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 CATATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGG 883

 98958745 CGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAG 98958804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 CGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAG 943

 98958805 GTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACA 98958864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 GTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACA 1003

 98958865 AAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGA 98958924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 AAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGA 1063

 98958925 ATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAG 98958984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 ATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAG 1123

 98958985 ACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCT 98959044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 ACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCT 1183

 98959045 TCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCA 98959104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 TCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCA 1243

 98959105 ATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCC 98959164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 ATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCC 1303

 98959165 TGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 98959224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 TGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 1363

 98959225 GAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTG 98959284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 GAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTG 1423

 98959285 CCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGG 98959344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 CCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGG 1483

 98959345 ATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTT 98959404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 ATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTT 1543

 98959405 TTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGT 98959464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 TTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGT 1603

 98959465 ATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATG 98959524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 ATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATG 1663

 98959525 TTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAA 98959584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAA 1723

 98959585 GTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGA 98959644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 GTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGA 1783

 98959645 CATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGG 98959704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 CATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGG 1843

 98959705 GTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACT 98959764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 GTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACT 1903

 98959765 CTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTT 98959824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 CTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTT 1963

 98959825 TGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 98959884
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TGAAGGCTGAGGCAGGAGAGTCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 2023

 98959885 TTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATA 98959944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 TTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATA 2083

 98959945 AATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGC 98960004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 AATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGC 2143

 98960005 TACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGC 98960064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGC 2203

 98960065 TATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCC 98960124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 TATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCC 2263

 98960125 TGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTA 98960184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTA 2323

 98960185 TATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTC 98960244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 TATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTC 2383

 98960245 ACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAA 98960304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 ACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAA 2443

 98960305 GTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTA 98960364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 GTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTA 2503

 98960365 CTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAG 98960424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 CTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAG 2563

 98960425 ATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAA 98960484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 ATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAA 2623

 98960485 AAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATT 98960544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 AAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATT 2683

 98960545 TTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCT 98960604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCT 2743

 98960605 GTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAAT 98960664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 GTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAAT 2803

 98960665 AAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTA 98960711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 AAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTA 2850

Alignment time is 2.42173 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    4889] =>      4889 nucs 'mol-32-340e-151424_4889'

Score:        4796
Aligned:      4911        nucs
Identic:      4885 ( 99%) nucs =>       104 (100%)      4781 ( 99%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955298,98955401] EXCISED REGION [98959001,98963807]
 second seq =>  [       1,     104] EXCISED REGION [     105,    4889]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955298 TGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGC 98955357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGC 60

 98955358 ATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 98955401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAATTGC 104

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      105 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 164

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      165 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 224

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      225 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 284

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      285 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 344

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      345 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 404

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      405 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 464

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 524

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 584

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 644

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 704

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 764

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      765 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 824

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 884

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 944

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1004

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1064

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1124

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1184

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1244

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1304

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1364

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1424

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1484

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1544

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1604

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1664

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1724

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1784

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1844

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 1904

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 1964

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2024

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2025 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 2084

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 98961040
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 AAAGCGTGAAACCATGTCTT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 2142

 98961041 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 98961100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 2202

 98961101 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 98961160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 2262

 98961161 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 98961220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 2322

 98961221 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 98961280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 2382

 98961281 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 98961340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 2442

 98961341 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 98961400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 2502

 98961401 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 98961460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 2562

 98961461 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 98961520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 2622

 98961521 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 98961580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 2682

 98961581 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 98961640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 2742

 98961641 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 98961700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 2802

 98961701 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 98961760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 2862

 98961761 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 98961820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 2922

 98961821 TCTTTCCAGAGATATCACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 98961880
          |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 TCTTTCCAGAGATATCACATG--------CACACACACACACACACACACACACACACAC 2974

 98961881 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 98961940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 3034

 98961941 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 98962000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 3094

 98962001 CATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATA 98962060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 CATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATA 3154

 98962061 ATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTA 98962120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 ATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTA 3214

 98962121 ATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAA 98962180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 ATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAA 3274

 98962181 TAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGAT 98962240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 TAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGAT 3334

 98962241 AGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 98962300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 AGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 3394

 98962301 TGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCG 98962360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 TGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCG 3454

 98962361 TCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCC 98962420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 TCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCC 3514

 98962421 CAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGT 98962480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 CAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGT 3574

 98962481 GAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAA 98962540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 GAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAA 3634

 98962541 AGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACC 98962600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 AGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACC 3694

 98962601 TCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTT 98962660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 TCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTT 3754

 98962661 GATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTT 98962720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 GATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTT 3814

 98962721 TCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAA 98962780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 TCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAA 3874

 98962781 TATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 98962840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 TATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 3934

 98962841 TTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTG 98962900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 TTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTG 3994

 98962901 AATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTT 98962960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     3995 AATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGT-- 4052

 98962961 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACC 98963020
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 ----------TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACC 4102

 98963021 CAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAG 98963080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4103 CAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAG 4162

 98963081 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTG 98963140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4163 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTG 4222

 98963141 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAA 98963200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4223 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAA 4282

 98963201 TCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 98963260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4283 TCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 4342

 98963261 GCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTC 98963320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4343 GCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTC 4402

 98963321 TCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTC 98963380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4403 TCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTC 4462

 98963381 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCT 98963440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4463 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCT 4522

 98963441 CAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGG 98963500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4523 CAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGG 4582

 98963501 GGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATT 98963560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4583 GGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATT 4642

 98963561 TTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTC 98963620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4643 TTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTC 4702

 98963621 CTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCA 98963680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4703 CTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCA 4762

 98963681 AGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATT 98963740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4763 AGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATT 4822

 98963741 TCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACA 98963800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4823 TCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACA 4882

 98963801 GTCTGTT 98963807
          |||||||
     4883 GTCTGTT 4889

Alignment time is 4.12376 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    2298] =>      2298 nucs 'mol-32-3419-014438_2298'

Score:        2243
Aligned:      2298        nucs
Identic:      2293 (100%) nucs =>       244 (100%)      2049 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98955158,98955401] EXCISED REGION [98959001,98961053]
 second seq =>  [       1,     244] EXCISED REGION [     245,    2298]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98955158 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTTGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAATCC 98955217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTTGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAATCC 60

 98955218 CAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT 98955277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT 120

 98955278 CATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAAC 98955337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAAAC 180

 98955338 AAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAA 98955397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGCAA 240

 98955398 TTGC 98955401
          ||||
      241 TTGC 244

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 304

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 364

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 424

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 484

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 544

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 604

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 664

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 724

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 784

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 844

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 904

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      905 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 964

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 1024

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 1084

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 1144

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 1204

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 1264

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 1324

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 1384

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 1444

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 1504

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 1564

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 1624

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 1684

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 1744

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 1804

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 1864

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 1924

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 1984

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 2044

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 2104

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 2164

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2165 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 2224

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGC 98961039
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGC 2284

 98961040 AGTGGCTCACACCT 98961053
          ||||||||||||||
     2285 AGTGGCTCACACCT 2298

Alignment time is 1.96282 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    6344] =>      6344 nucs 'mol-32-3487-033902_6344'

Score:        6333
Aligned:      6344        nucs
Identic:      6343 (100%) nucs =>      3367 (100%)      2976 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98958475,98961841] EXCISED REGION [98961846,98964822]
 second seq =>  [       1,    3367] EXCISED REGION [    3368,    6344]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [98961842,98961845]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        46 nucs [98961842,98961887] to [98961846,98961891]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98961842,98961843] to [98961844,98961845]
 second seq =>         0 nucs

 98958475 ATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATACAAGGAGATATCACCTCATACCT 98958534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAAATACAAGGAGATATCACCTCATACCT 60

 98958535 ATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAA 98958594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGTATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAA 120

 98958595 GCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGA 98958654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGCATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGA 180

 98958655 GGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTG 98958714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATATGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTG 240

 98958715 TATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCAC 98958774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCAACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCAC 300

 98958775 TTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACA 98958834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACA 360

 98958835 CGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTG 98958894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTG 420

 98958895 GGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCA 98958954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCA 480

 98958955 GTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTC 98959014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTGGGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTC 540

 98959015 CCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCT 98959074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCT 600

 98959075 CTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTG 98959134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTG 660

 98959135 GGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAAT 98959194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAAT 720

 98959195 CACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCT 98959254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCT 780

 98959255 GGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATT 98959314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATT 840

 98959315 ATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCC 98959374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCC 900

 98959375 ACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCA 98959434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCA 960

 98959435 ATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTT 98959494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTT 1020

 98959495 TTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCC 98959554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCC 1080

 98959555 TCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCAC 98959614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTGGCATGAGCCACCAC 1140

 98959615 CTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCT 98959674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCT 1200

 98959675 GTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGAC 98959734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGAC 1260

 98959735 CAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGT 98959794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGT 1320

 98959795 GGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAAC 98959854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAAC 1380

 98959855 CTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA 98959914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACA 1440

 98959915 GAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTG 98959974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTG 1500

 98959975 GGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCT 98960034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCT 1560

 98960035 TGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGC 98960094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGC 1620

 98960095 ACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTT 98960154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTT 1680

 98960155 AAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCT 98960214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATAACTAAATGTTTTCT 1740

 98960215 TATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATA 98960274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATA 1800

 98960275 CCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTT 98960334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTT 1860

 98960335 TATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCT 98960394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCT 1920

 98960395 ACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTA 98960454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATTTTCATACTATACTA 1980

 98960455 CCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTG 98960514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTG 2040

 98960515 ATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGT 98960574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGT 2100

 98960575 AACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGG 98960634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGG 2160

 98960635 ACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCC 98960694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCC 2220

 98960695 GTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGC 98960754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGC 2280

 98960755 CATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAG 98960814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAG 2340

 98960815 TTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATAT 98960874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATAT 2400

 98960875 GTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGA 98960934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGA 2460

 98960935 GGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCA 98960994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCA 2520

 98960995 TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTG 98961054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTG 2580

 98961055 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGA 98961114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGA 2640

 98961115 CCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTG 98961174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTG 2700

 98961175 TGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAA 98961234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAA 2760

 98961235 CACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGAC 98961294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGAC 2820

 98961295 AGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTT 98961354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTT 2880

 98961355 GGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGT 98961414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGT 2940

 98961415 CACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCATCCAGGT 98961474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCATCCAGGT 3000

 98961475 TCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCTC 98961534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCTC 3060

 98961535 GCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCA 98961594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCA 3120

 98961595 GCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGA 98961654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGA 3180

 98961655 GCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAA 98961714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAA 3240

 98961715 AGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGACCCCCACTCTCCAG 98961774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGACCCCCACTCTCCAG 3300

 98961775 TTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTATCTTTCCAGAGATA 98961834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTATCTTTCCAGAGATA 3360

 98961835 TCACATG 98961841
          |||||||
     3361 TCACATG 3367

EXCISED REGION

 98961846 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTCTC 98961905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTCTC 3427

 98961906 TTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAACAA 98961965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 TTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAACAA 3487

 98961966 TGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATTAG 98962025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 TGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATTAG 3547

 98962026 CAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGATT 98962085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGATT 3607

 98962086 ACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTACC 98962145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 ACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTACC 3667

 98962146 CATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGG 98962205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 CATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGG 3727

 98962206 ACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCT 98962265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 ACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCT 3787

 98962266 CACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAG 98962325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 CACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAG 3847

 98962326 TTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCGTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAA 98962385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCGTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAA 3907

 98962386 AATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCCCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGG 98962445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 AATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCCCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGG 3967

 98962446 AGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTT 98962505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 AGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTT 4027

 98962506 CAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATG 98962565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 CAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATG 4087

 98962566 AAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCC 98962625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 AAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCC 4147

 98962626 CAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTTGATAGACAGATGTTGTCTGCATAAT 98962685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 CAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTTGATAGACAGATGTTGTCTGCATAAT 4207

 98962686 ATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTTTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGG 98962745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 ATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTTTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGG 4267

 98962746 TGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTG 98962805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTG 4327

 98962806 ATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCC 98962865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 ATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCC 4387

 98962866 ACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTGAATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCAT 98962925
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 ACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGTAGGTAATTGAATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCAT 4447

 98962926 GCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 98962985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 4507

 98962986 ATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATC 98963045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 ATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATC 4567

 98963046 TTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGA 98963105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 TTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGA 4627

 98963106 GTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAG 98963165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 GTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAG 4687

 98963166 ACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAATCACTTGACCTCATGATCCGCCCAC 98963225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 ACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAATCACTTGACCTCATGATCCGCCCAC 4747

 98963226 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAA 98963285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAA 4807

 98963286 TGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTCTCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGAC 98963345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 TGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTCTCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGAC 4867

 98963346 ATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCC 98963405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 ATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCC 4927

 98963406 ATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCTCAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCG 98963465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 ATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCTCAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCG 4987

 98963466 AAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGGGGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTA 98963525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 AAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGGGGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTA 5047

 98963526 GATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATTTTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTT 98963585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 GATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATTTTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTT 5107

 98963586 TAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTCCTTTGATCCCTATTAATTTTTATCT 98963645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 TAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTCCTTTGATCCCTATTAATTTTTATCT 5167

 98963646 TCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCAAGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAA 98963705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCAAGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAA 5227

 98963706 AGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATTTCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTA 98963765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 AGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATTTCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTA 5287

 98963766 CTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACAGTCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGAGG 98963825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 CTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACAGTCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGAGG 5347

 98963826 GAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCT 98963885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 GAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCT 5407

 98963886 CCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGG 98963945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 CCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGG 5467

 98963946 TGCCCACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTT 98964005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 TGCCCACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTT 5527

 98964006 GGTCAGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGC 98964065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 GGTCAGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGC 5587

 98964066 TGGGATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTATTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCT 98964125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 TGGGATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTATTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCT 5647

 98964126 TCCCAGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCA 98964185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 TCCCAGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCA 5707

 98964186 GGCTGGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCA 98964245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 GGCTGGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCA 5767

 98964246 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGC 98964305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGC 5827

 98964306 TAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGAGGCTGGTCTCGAACTCCT 98964365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5828 TAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGAGGCTGGTCTCGAACTCCT 5887

 98964366 GATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCA 98964425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 GATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCA 5947

 98964426 CCGTGCCCAGCTGCTTTAATGTTGTTTTGTTAATTAACCATATAAATCTTGATGTAAGAG 98964485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 CCGTGCCCAGCTGCTTTAATGTTGTTTTGTTAATTAACCATATAAATCTTGATGTAAGAG 6007

 98964486 GACTTTAACAAAGCTGAACATAAAGAATTGAGTTTATGTATGCATTAAATCCATCAAGTG 98964545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6008 GACTTTAACAAAGCTGAACATAAAGAATTGAGTTTATGTATGCATTAAATCCATCAAGTG 6067

 98964546 AGCATTCAAATGTTCTCTCTATAGTATGTTATTTCAGGGTCTAAATGTGTTGCTACAATA 98964605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 AGCATTCAAATGTTCTCTCTATAGTATGTTATTTCAGGGTCTAAATGTGTTGCTACAATA 6127

 98964606 GATTGCTTTCAAACAGAACTCCTATATTGCTGTGCTGGTTAAGCTATTGTTTCTCCGCTC 98964665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 GATTGCTTTCAAACAGAACTCCTATATTGCTGTGCTGGTTAAGCTATTGTTTCTCCGCTC 6187

 98964666 CAAACCCACTCCTCTATAGTTTCTGACAGTTGGGCTGAGACAATGCAAAAGACTATTATA 98964725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 CAAACCCACTCCTCTATAGTTTCTGACAGTTGGGCTGAGACAATGCAAAAGACTATTATA 6247

 98964726 GGCTCACCTGAACAGGGGGTAGTAAAGGAGATTGGACGGCAGGAGGAGGATGGGACTTGG 98964785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 GGCTCACCTGAACAGGGGGTAGTAAAGGAGATTGGACGGCAGGAGGAGGATGGGACTTGG 6307

 98964786 CTGCTGCTCCTGTCCCACCTCTTCACATCACTTCTTC 98964822
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6308 CTGCTGCTCCTGTCCCACCTCTTCACATCACTTCTTC 6344

Alignment time is 5.30888 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    7848] =>      7848 nucs 'mol-32-34b3-078817_7848'

Score:        7807
Aligned:      7851        nucs
Identic:      7847 (100%) nucs =>      4831 (100%)      3016 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98957009,98961841] EXCISED REGION [98961850,98964867]
 second seq =>  [       1,    4831] EXCISED REGION [    4832,    7848]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [98961842,98961849]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        42 nucs [98961842,98961883] to [98961850,98961891]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [98961842,98961845] to [98961846,98961849]
 second seq =>         0 nucs

 98957009 CTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAATGGGGCAATCTTTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 98957068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTTGCCCAGTCTGGAGTGCAATGGGGCAATCTTTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 60

 98957069 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCAT 98957128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCAT 120

 98957129 CACACACAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCC 98957188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACACACAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGTCAGGCC 180

 98957189 AGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 98957248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTCTCAAACTTCTGACCTCAGGTGATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 240

 98957249 ACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACACACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAAGCTA 98957308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGACACACTTTCTGATTTTAAAACATACCACAAAGCTA 300

 98957309 TAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCATAAAGACAGACATATAAACCAATGGAATAGAA 98957368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTAGTCAAAACAGTGTGGTACTGGCATAAAGACAGACATATAAACCAATGGAATAGAA 360

 98957369 TAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCATATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGTGCCA 98957428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGAGGGCCCAGAAATAAACCCTAGCATATATGGTCAAGTAATTTTCATTAAGCGTGCCA 420

 98957429 AGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGATATCC 98957488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGACTGCTCATGGGGAAAGAACAGTCTCTTCAACTAATGGTGTTGGGAAACTGGATATCC 480

 98957489 ATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTTTCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTCAAAT 98957548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATGTAAAAGAATGAAGGTAGACTCTTTCCTTCAACCATGTATAAAATTTAATTCAAAT 540

 98957549 AGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGGCTGA 98957608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATTAAGGAGGCCAGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCACAGGGCTTTGGGAGGCTGA 600

 98957609 GACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAAACCC 98957668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACAGAAAGATCTCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACGTAGTGAAACCC 660

 98957669 CATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTCACAG 98957728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCTCTACAAAAAATAAAGAAAATTAGCCAGGCCTGGTGACATGTGTCTGTAGTCACAG 720

 98957729 CTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATCGAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCTGCAC 98957788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTATTCGGGATGTTGAAGTGGGAAGATCGAGTGATCACATCTAGGAGGTCAAGGCTGCAC 780

 98957789 TCCAGCCTCCATGACAGAGCAAGACCCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATTAAG 98957848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCAGCCTCCATGACAGAGCAAGACCCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATTAAG 840

 98957849 GACCTAAACATAACACTAAAATAATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCATC 98957908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACCTAAACATAACACTAAAATAATAAAACTATTAGAAGAAACCATAAGGGAAAAGCATC 900

 98957909 ATGACATTGAATTTGGCAATGTTTTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAGC 98957968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGACATTGAATTTGGCAATGTTTTTTTCATATGGCACCAAAAGCATAGGCAACAAAAGC 960

 98957969 TAAAATATGCAAATGGAGCTACATGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATCT 98958028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAAATATGCAAATGGAGCTACATGAAACTTAAAAACATCTGTGCATCAAAAGACAATCT 1020

 98958029 ATGGAATGGGAGATACATATCCAGAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAAA 98958088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGGAATGGGAGATACATATCCAGAATATATAAAGAACTCCTGCAATTCAACAACAAAAA 1080

 98958089 ATCCAAATAACCTAATTTTAAAATAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAAA 98958148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCCAAATAACCTAATTTTAAAATAGGCCAAAGACATGAATAAACATTTCTCTGAAGAAA 1140

 98958149 ACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCA 98958208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGACAAAGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCA 1200

 98958209 AGGTGGGCGGATAACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAACC 98958268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGTGGGCGGATAACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACTAACATGGAGAAACC 1260

 98958269 CCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAGC 98958328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGCCATGGTGGCGCATGCCAGTAATCCCAGC 1320

 98958329 TACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGC 98958388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGC 1380

 98958389 TGAGATCGCGCCATTGCACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAAA 98958448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAGATCGCGCCATTGCACTCTGGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACACCATCTCAAAAAAA 1440

 98958449 AAAAAAGGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAA 98958508
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAA-GGGCCAATAAGCATATGAAAATCATCATTAATCATTAGAGAAATGCAAATCAAA 1499

 98958509 ATACAAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGT 98958568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ATACAAGGAGATATCACCTCATACCTATTAGGACTATTGAAAAAACAGAAAATAACAAGT 1559

 98958569 ATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGC 98958628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATTGGCAAGGATGTGAGAAATTGGAAGCCTTGTGCACTGCCGGTGGGAATGTAAAATGGC 1619

 98958629 ATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATA 98958688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 ATAGCCATTATGGAAAACAGTATGGAGGTTTCTAAAAAAATTAAAAATGGTATTGCCATA 1679

 98958689 TGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCA 98958748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGATCCAGCAAACACACTTCTGGGTGTATATCCAAAAGAATTTAAATCAGGCCGGGCGCA 1739

 98958749 ACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCA 98958808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ACGGTTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGAGCAGATCGCGAGGTCA 1799

 98958809 GGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAA 98958868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GGAGATTGAGACCATCCTGGTTAACACGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAA 1859

 98958869 AAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGG 98958928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAAAAAATTAGCCTGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCGGCTGAGTCAGGAGAATGG 1919

 98958929 CGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTG 98958988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGACTG 1979

 98958989 GGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCC 98959048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GGCGACAGAGCAAGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCC 2039

 98959049 TCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCT 98959108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCTCTTCTTTCTGACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCT 2099

 98959109 TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAG 98959168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAG 2159

 98959169 TAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 98959228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAGCTGGGATTACAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 2219

 98959229 CCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGG 98959288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGG 2279

 98959289 TCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATAT 98959348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TCTTGGCCTCCCAAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATAT 2339

 98959349 CTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCT 98959408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CTTTAATTAATGGAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCT 2399

 98959409 TTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCA 98959468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTGATTAAGGGACCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCA 2459

 98959469 TAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGC 98959528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TAACAGTGACAGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGC 2519

 98959529 CTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTAT 98959588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CTAAGATGGATCTCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTAT 2579

 98959589 CTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATA 98959648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTGGGATTACTGGCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATA 2639

 98959649 ATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGG 98959708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ATAGCCAGGTACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGG 2699

 98959709 ATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTAT 98959768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATCACCTGCGTTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTAT 2759

 98959769 TAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAA 98959828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TAAAAATGCAAAAATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAA 2819

 98959829 GGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGC 98959888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGC 2879

 98959889 ACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATA 98959948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ACCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATA 2939

 98959949 AAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACT 98960008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AAAACAAAATAGATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACT 2999

 98960009 CAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATG 98960068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CAGCAGGCTGAGGCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATG 3059

 98960069 ATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTC 98960128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ATCACACCTGTGAATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTC 3119

 98960129 TCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATA 98960188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TCAAAAAAAAGTCAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATA 3179

 98960189 TATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTT 98960248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TATGGTATTATAACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTT 3239

 98960249 TTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTAT 98960308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTGGGCTATTGTGCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTAT 3299

 98960309 TTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTG 98960368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTGCTTATTATTGTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTG 3359

 98960369 GGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCT 98960428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GGTAATTTCTAACTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCT 3419

 98960429 TTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAAT 98960488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTCTACAGTATTTTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAAT 3479

 98960489 TTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTAC 98960548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TTGCAGATGAATTCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTAC 3539

 98960549 GGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAG 98960608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GGTAAAATTTTGAAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAG 3599

 98960609 TAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGA 98960668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TAAATTCTAATCCAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGA 3659

 98960669 ATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTC 98960728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ATTAATAAGCAGGCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTC 3719

 98960729 ATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACT 98960788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ATATGGCCACAAACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACT 3779

 98960789 AGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGA 98960848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGATGTCGCTGTGAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGA 3839

 98960849 AGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCT 98960908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AGTAGTCTGTCATTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCT 3899

 98960909 GTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGA 98960968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGA 3959

 98960969 TCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGT 98961028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     3960 TCAGCCTGGGCAAAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TTGT 4018

 98961029 AGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGG 98961088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AGGCCGGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGG 4078

 98961089 GATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTA 98961148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTA 4138

 98961149 CCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGG 98961208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 CCACAAGTACAAAAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGG 4198

 98961209 AGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGG 98961268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AGACTGAGGGAGGAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGG 4258

 98961269 CGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAA 98961328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 CGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAA 4318

 98961329 ACAAAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTT 98961388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 ACAAAAAGTGAATTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTT 4378

 98961389 TATTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGG 98961448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TATTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGG 4438

 98961449 CTCACTGCAACCTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAG 98961508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 CTCACTGCAACCTCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAG 4498

 98961509 CTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGG 98961568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 CTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGG 4558

 98961569 TGTAGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTG 98961628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TGTAGTGGCGTGTACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTG 4618

 98961629 AGGCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTG 98961688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 AGGCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTG 4678

 98961689 ACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCC 98961748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 ACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCC 4738

 98961749 TTTCACCTCTGACCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTT 98961808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTTCACCTCTGACCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTT 4798

 98961809 TTTGTGTGTGTATCTTTCCAGAGATATCACATG 98961841
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TTTGTGTGTGTATCTTTCCAGAGATATCACATG 4831

EXCISED REGION

 98961850 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTC 98961909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTC 4891

 98961910 ATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTT 98961969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 ATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTAATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTT 4951

 98961970 TGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGT 98962029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 TGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTTCATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGT 5011

 98962030 TTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTG 98962089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 TTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATAATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTG 5071

 98962090 CATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATA 98962149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 CATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTAATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATA 5131

 98962150 TCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCA 98962209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 TCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAATAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCA 5191

 98962210 AAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACA 98962269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 AAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGATAGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACA 5251

 98962270 TCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTG 98962329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 TCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTG 5311

 98962330 AGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCGTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATT 98962389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 AGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCGTCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATT 5371

 98962390 AGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCCCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 98962449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 AGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCCCAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGA 5431

 98962450 TCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGC 98962509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 TCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGC 5491

 98962510 CTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGT 98962569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 CTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGT 5551

 98962570 CTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAG 98962629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 CTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAG 5611

 98962630 AAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTTGATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGC 98962689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 AAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTTGATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGC 5671

 98962690 CTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTTTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCG 98962749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 CTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTTTCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCG 5731

 98962750 CACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGT 98962809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 CACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAATATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGT 5791

 98962810 AGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCT 98962869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 AGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCT 5851

 98962870 GTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTGAATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTG 98962929
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 GTCGTGGGAGGGACCCAGTGGTAGGTAATTGAATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTG 5911

 98962930 TTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 98962989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 TTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTT 5971

 98962990 ATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGG 98963049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 ATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGG 6031

 98963050 CTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG 98963109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 CTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG 6091

 98963110 CTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAG 98963169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 CTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAG 6151

 98963170 AGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAATCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCA 98963229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 AGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAATCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCA 6211

 98963230 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGT 98963289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGT 6271

 98963290 TTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTCTCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGC 98963349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 TTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTCTCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGC 6331

 98963350 CTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTA 98963409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 CTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTA 6391

 98963410 AACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCTCAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAA 98963469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 AACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCTCAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAA 6451

 98963470 CAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGGGGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATT 98963529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 CAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGGGGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATT 6511

 98963530 ATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATTTTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGC 98963589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 ATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATTTTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGC 6571

 98963590 TGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTCCTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTA 98963649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 TGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTCCTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTA 6631

 98963650 ACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCAAGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGAT 98963709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 ACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCAAGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGAT 6691

 98963710 CAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATTTCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTT 98963769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 CAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATTTCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTT 6751

 98963770 TGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACAGTCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGT 98963829
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     6752 TGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACAGTCTG-TTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGT 6810

 98963830 CTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 98963889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6811 CTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 6870

 98963890 CTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCC 98963949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6871 CTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCC 6930

 98963950 CACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTC 98964009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6931 CACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTC 6990

 98964010 AGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 98964069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6991 AGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGG 7050

 98964070 ATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTATTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCTTCCC 98964129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7051 ATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTATTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCTTCCC 7110

 98964130 AGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCAGGCT 98964189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7111 AGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCAGGCT 7170

 98964190 GGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 98964249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7171 GGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 7230

 98964250 TCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAAT 98964309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7231 TCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAAT 7290

 98964310 TTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATC 98964369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7291 TTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATC 7350

 98964370 TCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGT 98964429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7351 TCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGT 7410

 98964430 GCCCAGCTGCTTTAATGTTGTTTTGTTAATTAACCATATAAATCTTGATGTAAGAGGACT 98964489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7411 GCCCAGCTGCTTTAATGTTGTTTTGTTAATTAACCATATAAATCTTGATGTAAGAGGACT 7470

 98964490 TTAACAAAGCTGAACATAAAGAATTGAGTTTATGTATGCATTAAATCCATCAAGTGAGCA 98964549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7471 TTAACAAAGCTGAACATAAAGAATTGAGTTTATGTATGCATTAAATCCATCAAGTGAGCA 7530

 98964550 TTCAAATGTTCTCTCTATAGTATGTTATTTCAGGGTCTAAATGTGTTGCTACAATAGATT 98964609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7531 TTCAAATGTTCTCTCTATAGTATGTTATTTCAGGGTCTAAATGTGTTGCTACAATAGATT 7590

 98964610 GCTTTCAAACAGAACTCCTATATTGCTGTGCTGGTTAAGCTATTGTTTCTCCGCTCCAAA 98964669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7591 GCTTTCAAACAGAACTCCTATATTGCTGTGCTGGTTAAGCTATTGTTTCTCCGCTCCAAA 7650

 98964670 CCCACTCCTCTATAGTTTCTGACAGTTGGGCTGAGACAATGCAAAAGACTATTATAGGCT 98964729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7651 CCCACTCCTCTATAGTTTCTGACAGTTGGGCTGAGACAATGCAAAAGACTATTATAGGCT 7710

 98964730 CACCTGAACAGGGGGTAGTAAAGGAGATTGGACGGCAGGAGGAGGATGGGACTTGGCTGC 98964789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7711 CACCTGAACAGGGGGTAGTAAAGGAGATTGGACGGCAGGAGGAGGATGGGACTTGGCTGC 7770

 98964790 TGCTCCTGTCCCACCTCTTCACATCACTTCTTCCTCCCTTCACTCTGGCAGCAACAGTTG 98964849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7771 TGCTCCTGTCCCACCTCTTCACATCACTTCTTCCTCCCTTCACTCTGGCAGCAACAGTTG 7830

 98964850 GTTTGTACCCAGCTTTTT 98964867
          ||||||||||||||||||
     7831 GTTTGTACCCAGCTTTTT 7848

Alignment time is 6.3635 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    9089] =>      9089 nucs 'mol-32-34b3-083325_9089'

Score:        8903
Aligned:      9110        nucs
Identic:      9074 (100%) nucs =>      3007 (100%)      6067 (100%)
Gaps:           26 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98952390,98955401] EXCISED REGION [98959001,98965093]
 second seq =>  [       1,    3017] EXCISED REGION [    3018,    9089]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3599 nucs [98955402,98959000]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [98955402,98955403] to [98959001,98959002]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [98955402,98955402] to [98959000,98959000]
 second seq =>         0 nucs

 98952390 TTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGTAGTGGTGCGATCTCGGCTCA 98952449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGTAGTGGTGCGATCTCGGCTCA 60

 98952450 CTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTGGG 98952509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTGGG 120

 98952510 ACTACAGGCACGCACCACCACGCCCAGCTGCTAATTTTTGCATTTTTAGCAGAGACGGGG 98952569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTACAGGCACGCACCACCACGCCCAGCTGCTAATTTTTGCATTTTTAGCAGAGACGGGG 180

 98952570 TTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTTGTGATCCACCCACCTCTGC 98952629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTTGTGATCCACCCACCTCTGC 240

 98952630 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCTGGCCTTAACTTTCTTTAAA 98952689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCTGGCCTTAACTTTCTTTAAA 300

 98952690 TAAGTAGGAGAAATACTCTAAAATAATGATAAAAAGTACAGTAAACACATAAACCAGTAA 98952749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGTAGGAGAAATACTCTAAAATAATGATAAAAAGTACAGTAAACACATAAACCAGTAA 360

 98952750 CACTCATTTATTATCATTATCAAATATTAAGTACTGTACATGATTTTGTTATACTTTTGT 98952809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      361 CACTCATTTATTATCATTATCAAATATTAAGTACTGTACATGATTTTGTTATACTTTTAT 420

 98952810 ATGACTGGCCACACAGTAAGTTTGTGTGACCAGAAATATGTGAGTACTGAATTGTGCTAC 98952869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGACTGGCCACACAGTAAGTTTGTGTGACCAGAAATATGTGAGTACTGAATTGTGCTAC 480

 98952870 ATTATGATGGCTACAGTGTCACTAGGCAGTAAGAATTTTTCAGCCTCTTTATAATCTTAT 98952929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTATGATGGCTACAGTGTCACTAGGCAGTAAGAATTTTTCAGCCTCTTTATAATCTTAT 540

 98952930 GGGACCACTGTTGTATATGCAGTTCATCATCGACAAAAACGTCGTTAAGCAGTACATGAC 98952989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGACCACTGTTGTATATGCAGTTCATCATCGACAAAAACGTCGTTAAGCAGTACATGAC 600

 98952990 TATAAAAAGAAAGCCTGGAAAGAACGCCTCCTGGGTTCATGTCATTACTCACAGATGACA 98953049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATAAAAAGAAAGCCTGGAAAGAACGCCTCCTGGGTTCATGTCATTACTCACAGATGACA 660

 98953050 TGATCGTATATGCAAAAAAGCTGAAAGAATCTATAGAAGAACTATTATAATTAATAGGTT 98953109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATCGTATATGCAAAAAAGCTGAAAGAATCTATAGAAGAACTATTATAATTAATAGGTT 720

 98953110 TAATTAGCAAGGGCTCTAAATATAAGATTATTACACTAAAACCAGTTGTGTTGCTGTGTC 98953169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATTAGCAAGGGCTCTAAATATAAGATTATTACACTAAAACCAGTTGTGTTGCTGTGTC 780

 98953170 AACAAGAAACAAATAGAAAATGAAATTTTGAAAAGTATCACTTATAACACCAAAATATAT 98953229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACAAGAAACAAATAGAAAATGAAATTTTGAAAAGTATCACTTATAACACCAAAATATAT 840

 98953230 CAAAAAACATTAAATCTAACGATGTCAAAGACCTTTGCACTAGAAACTACAAACCACTGA 98953289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAAAAACATTAAATCTAACGATGTCAAAGACCTTTGCACTAGAAACTACAAACCACTGA 900

 98953290 GAAAAAAATAAAGAAAAAATAAATACCACATTTATAGATTGGAAGAGTTAATGTTGTAAA 98953349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAAAAATAAAGAAAAAATAAATACCACATTTATAGATTGGAAGAGTTAATGTTGTAAA 960

 98953350 GATCTTATTTCTTCCCAAATTGATCTACAAATTTAATATAATCCCAATCAAAATTCCAGC 98953409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATCTTATTTCTTCCCAAATTGATCTACAAATTTAATATAATCCCAATCAAAATTCCAGC 1020

 98953410 AGATTTTTGGTGTGGAAAGTGATACAACATTTTGACTTAGTTGATTCTAAAATTTAGATG 98953469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATTTTTGGTGTGGAAAGTGATACAACATTTTGACTTAGTTGATTCTAAAATTTAGATG 1080

 98953470 GCAATGCAAAGACCAAAGAATAGCTAAGGCAAACCTAAAGAAGAACAAACCTGTAAAATG 98953529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAATGCAAAGACCAAAGAATAGCTAAGGCAAACCTAAAGAAGAACAAACCTGTAAAATG 1140

 98953530 ACACTGACTGCTTGATAGCATGCCCTATTATAAAGCTGTGGCAATTCAGACAGTGTGGTT 98953589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACACTGACTGCTTGATAGCATGCCCTATTATAAAGCTGTGGCAATTCAGACAGTGTGGTT 1200

 98953590 TTGTTCCAACAATAGACAAACAGGCCAATGGAACACAACAAAGAGTCCACAGACAGGCTG 98953649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGTTCCAACAATAGACAAACAGGCCAATGGAACACAACAAAGAGTCCACAGACAGGCTG 1260

 98953650 AAGGGTCACCTGATAGATGACAAAGTCAACACTGCTGTGTAGTGGAGAAAGGCCGGTCTT 98953709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1261 AAGGGTCACCTGATAGATGACAAAGTCAACACTGCTGTGTAGTGGAGAAAGGCTGGTCTT 1320

 98953710 TTTGGGATGGGCCAATTGAATATCCCTATGGAAAAACATTAAACTTGATCCCTACCTCAC 98953769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTGGGATGGGCCAATTGAATATCCCTATGGAAAAACATTAAACTTGATCCCTACCTCAC 1380

 98953770 AATCATTTAAAAGTTACTTTTATTTTTTATTTATTTATTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTG 98953829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATCATTTAAAAGTTACTTTTATTTTTTATTTATTTATTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTG 1440

 98953830 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 98953889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 1500

 98953890 TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTCTGCC 98953949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTCTGCC 1560

 98953950 ACCACACCTGGCTAAGTTTTGTTTTTAGTAGATATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 98954009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCACACCTGGCTAAGTTTTGTTTTTAGTAGATATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 1620

 98954010 GGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATATCCCCAATGTCGGCCTCCTGAAGTACTGGGAT 98954069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATATCCCCAATGTCGGCCTCCTGAAGTACTGGGAT 1680

 98954070 TACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTAAAAGTTACTTTTAAAAAAAGTTAGTTTCAGT 98954129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTAAAAGTTACTTTTAAAAAAAGTTAGTTTCAGT 1740

 98954130 TGTATTATCCTTAAAATTGGAAAGGTAAAGCAATACATATTTTAGAAGAGAGCATAGGAG 98954189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTATTATCCTTAAAATTGGAAAGGTAAAGCAATACATATTTTAGAAGAGAGCATAGGAG 1800

 98954190 AAGAATATTTTCATAAACTTTGAGTAGGTAAAACTTTCTTAAATGTTTTTGAAAGGCAGT 98954249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1801 AAGAATATTTTCATAAACTTTGAGTAGGTAAAACTTTCTTAAATGTTTTTGAAAAGCAGT 1860

 98954250 AATCATAATTAAAACAATTCATACATGGGACTGTAGTAAAATTAAAAACTTCTGTTCACC 98954309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATCATAATTAAAACAATTCATACATGGGACTGTAGTAAAATTAAAAACTTCTGTTCACC 1920

 98954310 AAAAGACATCACCGAAAGAGTGGAAAGGCAAACCAAAGAGTGGGAGAAAATATTTGCTGT 98954369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAAGACATCACCGAAAGAGTGGAAAGGCAAACCAAAGAGTGGGAGAAAATATTTGCTGT 1980

 98954370 ACATGGGTCTGATAAAGCAGTCATATCAAAAATATATAAAGAACTTCTACAAACTGATCT 98954429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACATGGGTCTGATAAAGCAGTCATATCAAAAATATATAAAGAACTTCTACAAACTGATCT 2040

 98954430 AAAAAAAAAACTAATATAAAAGTGATCCAAAACTGAGGGCTTTCACAAAACTGGATGCCT 98954489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAAAAAAAACTAATATAAAAGTGATCCAAAACTGAGGGCTTTCACAAAACTGGATGCCT 2100

 98954490 AAATGTGCGATAAATATTCAAAACATATAAAGAACTTCTACCAATAGGCTGGGCATAATG 98954549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATGTGCGATAAATATTCAAAACATATAAAGAACTTCTACCAATAGGCTGGGCATAATG 2160

 98954550 GCTCATGCCTGTAATCCCAGTTCTTTGAGAAGGCAGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCA 98954609
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTCATACCTGTAATCCCAGTTCTTTGAGAAGGCAGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCA 2220

 98954610 GAAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATACTGAGACCCCCACCTGTATTTAAAAACAAACA 98954669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATACTGAGACCCCCACCTGTATTTAAAAACAAACA 2280

 98954670 AACAAACAAAAAATTCCAACAAATAAACGAAGAGACAACCTTTTGCCAACAATGGGCAAA 98954729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACAAACAAAAAATTCCAACAAATAAACGAAGAGACAACCTTTTGCCAACAATGGGCAAA 2340

 98954730 AGTCTTTAACAAGCAGTTCACACATAGCTAATAAACATTAAAAAGCGTATGGCATGACTG 98954789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTCTTTAACAAGCAGTTCACACATAGCTAATAAACATTAAAAAGCGTATGGCATGACTG 2400

 98954790 GTAATTAACCACAGAGAGATATCATTACACACCCATCAGCCTGCTAAAAATTAAATCATG 98954849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTAATTAACCACAGAGAGATATCATTACACACCCATCAGCCTGCTAAAAATTAAATCATG 2460

 98954850 CAATAGCAAAAGAGTATGTGGGGCCAGGAACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTT 98954909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAATAGCAAAAGAGTATGTGGGGCCAGGAACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTT 2520

 98954910 TGGGCAGCTGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCATGGCCAACA 98954969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGGCAGCTGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCATGGCCAACA 2580

 98954970 TGCTGAAACCCCACCTGTACTAAAAATACCCAAAAAATTAGCCGGATGCTGTGGCAGGTG 98955029
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCTGAAACCCCGCCTGTACTAAAAATACCCAAAAAATTAGCCGGATGCTGTGGCAGGTG 2640

 98955030 CCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGG 98955089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGG 2700

 98955090 AGATTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGCGAGACTC 98955149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGATTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGCGAGACTC 2760

 98955150 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-----TTAGCTTGGTGTCGTGGCAC 98955204
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||
     2761 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTTGGTGTCGTGGCAC 2820

 98955205 GCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGC 98955264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCACCTGTAATCCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGC 2880

 98955265 AGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCA 98955324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCA 2940

 98955325 AAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATA 98955384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAAACAATAAACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATA 3000

 98955385 AGCAATTAAGCAATTGC 98955401
          |||||||||||||||||
     3001 AGCAATTAAGCAATTGC 3017

EXCISED REGION

 98959001 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 98959060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 AGACTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCCTTCCCTCTCTTCTTTCT 3077

 98959061 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 98959120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 GACGGAGTCTTGCTCTGTCTCTCAGGCTGGAGTGCAGCGGTGCAATCTTGGCTCACTGCA 3137

 98959121 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 98959180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTA 3197

 98959181 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 98959240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 CAAGTGCGCACAATCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACC 3257

 98959241 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 98959300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 ATGTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCGGTCTTGGCCTCCC 3317

 98959301 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 98959360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 AAAGAGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCAGGCTAGGCTCTGGATATCTTTAATTAATG 3377

 98959361 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 98959420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 GAATGAAGACTGCCACCATCAGATAACAGAACATGTGGAATTTTTTCTTTGATTAAGGGA 3437

 98959421 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 98959480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 CCAGAAGATATTCAATTGAGGTTTATTCAGGTATGTTTTAAGGTATCATAACAGTGACAG 3497

 98959481 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 98959540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 TTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGAAATGGCCTGTTGCTATGTTGCCTAAGATGGATC 3557

 98959541 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 98959600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 TCAAGCTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTAAGCCTTCTAAGTATCTGGGATTACTG 3617

 98959601 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 98959660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 GCATGAGCCACCACCTTCAGTTCCTTAAGGCTATTTAAAGTAGACATAATAGCCAGGTAC 3677

 98959661 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGCGTT 98959720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3678 GGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAGTTTGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGTGTT 3737

 98959721 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 98959780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCAACTCTATTAAAAATGCAAA 3797

 98959781 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 98959840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 AATTAGCAGGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGAAGTCCCAGCTACTTTGAAGGCTGAGGCAGG 3857

 98959841 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 98959900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTC 3917

 98959901 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 98959960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 CAGCCTGAGCAACAGAGTGCGATTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAAACAAAATAG 3977

 98959961 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 98960020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 ATGTAATAGGGCTGGGTTCAGTGGTGTGTATCTGTAGCCCCAGCTACTCAGCAGGCTGAG 4037

 98960021 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 98960080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 GCCAAAGGATCCCTTGAGTCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGTGCTATGATCACACCTGTG 4097

 98960081 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 98960140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 AATAGCTCTACTGCACTCCAGGCCTGGGCAATACAGTGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAGT 4157

 98960141 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 98960200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 CAAAACAATTTTTTAAATAAAGTAGATATAACAGAAAAACATTATATATATGGTATTATA 4217

 98960201 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 98960260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4218 ACTAAATGTTTTCTTATAGATTGTTTTGTTTTTATAAATAAGTCACTTTTGGGCTATTGT 4277

 98960261 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 98960320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 GCATTTTTACCATACCAAAGAGAATGTCTGATAGTAGTCCCAAAGTATTTGCTTATTATT 4337

 98960321 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 98960380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 GTCTGGTACTCCTTTATTAGTCAAGAATGTTGCTGACATTTTTACTTGGGTAATTTCTAA 4397

 98960381 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 98960440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 CTTCCCAATATTCTACAAATAGAATTTTAGTTTTGTGTGCAGAGATCTTTCTACAGTATT 4457

 98960441 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 98960500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 TTCATACTATACTACCCTGTATTAGGTAGCTTCGAATTGAGGAAAAATTTGCAGATGAAT 4517

 98960501 TCGTAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 98960560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 TCATAATATTCCTGATCTTTTTCTCATTACAAACTATGTAAATTTTACGGTAAAATTTTG 4577

 98960561 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 98960620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 AAGCAACCAAAAGTAACTATTTTTATACTGCAGTGTCAACTGCTGTAGTAAATTCTAATC 4637

 98960621 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 98960680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 CAGCTAAAACATGGACAGTGAGAACCCCAAACATTTCGCACAATAAGAATTAATAAGCAG 4697

 98960681 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 98960740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 GCTTTAGTTAGGCCGTTTACTTCAGGATTTAAAAAATAATACGTAGTCATATGGCCACAA 4757

 98960741 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGATTTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 98960800
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 ACTGGTATTCCAGCCATTGAGTTTATGAATTTACAAAAAGAGTACACTAGATGTCGCTGT 4817

 98960801 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 98960860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 GAAACTCAGTGTAGTTTGTAATCGTTCTGCTATAGGAGAGCTCTGTGAAGTAGTCTGTCA 4877

 98960861 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 98960920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 TTTGTTATTAATATGTGAGTTGCTGGCTGGGTGAGGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCA 4937

 98960921 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCAAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 98960980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4938 CTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCGCTTGAGCTCGAGAGTTGGAGATCAGCCTGGGCA 4997

 98960981 AAAGCGTGAAACCATGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 98961040
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 AAAGCGTGAAACCATGTCTT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTAGGCCGGGTGCA 5055

 98961041 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 98961100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5056 GTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGGATTGCCTGAGG 5115

 98961101 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 98961160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5116 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCACAAGTACAA 5175

 98961161 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 98961220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5176 AAATTAGCTGGGTGTGGCGGCCGGCGCCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGACTGAGGGAG 5235

 98961221 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 98961280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5236 GAGAATCGCTTGAACACAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATGGCGCCATTGCACT 5295

 98961281 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 98961340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5296 CCAGCCTGGGCGACAGAGTGACACTCCGTCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAGTGAA 5355

 98961341 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 98961400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5356 TTGCTGTTAGTTTTGGTCTTCTTTTATTATTACTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGACG 5415

 98961401 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 98961460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5416 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCGGAGACTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 5475

 98961461 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 98961520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 TCTGCCATCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAG 5535

 98961521 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 98961580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 GCGTGAGCCATCTCGCCCAGCCGACAAAATATTTAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCGTG 5595

 98961581 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 98961640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 TACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGGACCCCTTGAGGCCAGGAGGT 5655

 98961641 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 98961700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 CAAGGCTGCAGGGAGCTGTGATTATACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 5715

 98961701 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 98961760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 CCTGTCTCAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAACAATGAAAAGTCTCCCTTTCACCTCTGA 5775

 98961761 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 98961820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5776 CCCCCACTCTCCAGTTCCCCACCCCATAGGCAACCAATGTTATTAGTTTTTGTGTGTGTA 5835

 98961821 TCTTTCCAGAGATATCACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 98961880
          |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 TCTTTCCAGAGATATCACATG------CACACACACACACACACACACACACACACACAC 5889

 98961881 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 98961940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5890 ACACACACACAATTTTACTCTTCTCTTTCATAGGTGGTGTCATAATCTACCTACTATTTA 5949

 98961941 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 98962000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 ATACCTTTAATGTTTCATTTAACAATGTTTGGAATCTTTTGACGTCAGTACAAAAGGTTT 6009

 98962001 CATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATA 98962060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 CATTTTATTTATTTATATTTATTAGCAGTTTCATAGTGTTCCATGTGTGGCTGTAGCATA 6069

 98962061 ATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTA 98962120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 ATTTATTTAACCCTATTGATCGATTACTGCATTGTTTCCCATCTGTTGTAGTTATAAGTA 6129

 98962121 ATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAA 98962180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 ATGCTACAATGAATCATCTTGTACCCATATCATTTTGCACATGTGCTGTAATTGTAAGAA 6189

 98962181 TAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGAT 98962240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 TAGTTCCCCAAAATGAAATAAATGGACCAAAGAGTCTATGAGTTTTTTCTTTTAAGAGAT 6249

 98962241 AGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 98962300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 AGGGTCTTGGCCAGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 6309

 98962301 TGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCG 98962360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6310 TGGGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTTGAGACCAGCCTGGGAAAAATGGCGAAAACTCG 6369

 98962361 TCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCC 98962420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6370 TCGCTATAAAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTTGCATGTACCTGTGCTCC 6429

 98962421 CAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGT 98962480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 CAGCTACTTTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGT 6489

 98962481 GAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAA 98962540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 GAGCCATGATGGCGCCACTGTACTTCAGCCTGGGTGGCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAA 6549

 98962541 AGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACC 98962600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6550 AGAGAGGGAAAGAGAGAAAGAGATGAAGTCTCACTACGTTGCCCAGGTGATCTTCCCACC 6609

 98962601 TCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTT 98962660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6610 TCAGCCTCTGGAGTAGCTGGAACCCCAAGAAAACACCACCGTGGCTGGCTTGTGATTTTT 6669

 98962661 GATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTT 98962720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6670 GATAGACAGATGTTGTCTGCATAATATGCCTTGACAGCCAGGATGCTCTTACTGTCACTT 6729

 98962721 TCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAA 98962780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6730 TCTCTGCCCTCTCAACTTATAGGGGTGCGCACGTGTGTGTGTTGTTGTTATAAACAAAAA 6789

 98962781 TATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 98962840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6790 TATCTATAACCATGTAAAGTTGTTGATGTAGTTTGGCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATC 6849

 98962841 TTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTG 98962900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6850 TTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCCACCTGTCGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGGTAATTG 6909

 98962901 AATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGTTT 98962960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     6910 AATCCTGGGGTTGGGTCTTTCCCATGCTGTTCTTGTAAGTTTCATGAGATCTAATGGT-- 6967

 98962961 TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACC 98963020
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6968 ----------TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACC 7017

 98963021 CAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAG 98963080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 CAGGCTAGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGTTCAAG 7077

 98963081 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTG 98963140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCTG 7137

 98963141 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAA 98963200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCGGGATGGTCTCAA 7197

 98963201 TCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 98963260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 TCACTTGACCTCATGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 7257

 98963261 GCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTC 98963320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 GCCACCGTGCCTGGCGGAGATCTAATGGTTTTATAAGGGGGAGTTTCCTTGCACAAGTTC 7317

 98963321 TCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTC 98963380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 TCTTTTGTCTGCCACCATGTAAGACATGCCTTTCGCCTTCCACCATGATTGTGAGGCCTC 7377

 98963381 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCT 98963440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 CCCAGCCATGTGGAACTGTGAGTCCATTAAACCTCTTTTTCTTTATAAATTACCCAGCCT 7437

 98963441 CAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGG 98963500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 CAGGTATGTCTTTATCAGCATTGCGAAAACAGATTAATACAGTTGTTTAATCCTAAATGG 7497

 98963501 GGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATT 98963560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 GGCTGGAGCCAGCTGTATTATTTTAGATTATGAGGTTTTAAAATTCTGGTTCTTCTCATT 7557

 98963561 TTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTC 98963620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 TTTATCTGTTATCTATCCCTCCTTTTAGCTGCCAGCTGACTCGGTATCTAATAGCCTCTC 7617

 98963621 CTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCA 98963680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 CTTTGATCCCTATTAATTTTTATCTTCTAACCTTTTGGTGGTTCAAAATGCTGATCTCCA 7677

 98963681 AGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATT 98963740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 AGCTTACTAGGTTTCAGCCAAGAAAAGATCAAACTGTACTCACTAACATTATGATTTATT 7737

 98963741 TCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACA 98963800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 TCTCAAACTAGAGATCAGAATTCTACTTTTGTTTCAAATTTGTAATCTGAGTTATTCACA 7797

 98963801 GTCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTG 98963860
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7798 GTCTG-TTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCCAGCTGGAGTGCAGTG 7856

 98963861 GCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 98963920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 GCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAG 7916

 98963921 CCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 98963980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 CCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCAAAATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 7976

 98963981 AGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGATC 98964040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 AGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCCCAACCTCCTGACCTCGTGATC 8036

 98964041 CGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTA 98964100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 CGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTA 8096

 98964101 TTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCTTCCCAGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTGA 98964160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 TTCACAGTCTTTGTATGTGTTTTCTTCCCAGTGAGGCTTTAATTTTTCTTTTTTTTTTGA 8156

 98964161 GATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTGC 98964220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 GATGGAGTTTCGCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCATGATCTTGGCTCACTGC 8216

 98964221 AACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 98964280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 AACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 8276

 98964281 ACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCC 98964340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 ACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCC 8336

 98964341 ATGTTGAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAA 98964400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 ATGTTGAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAA 8396

 98964401 GTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGCCCAGCTGCTTTAATGTTGTTTTGTTAATT 98964460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 GTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGCCCAGCTGCTTTAATGTTGTTTTGTTAATT 8456

 98964461 AACCATATAAATCTTGATGTAAGAGGACTTTAACAAAGCTGAACATAAAGAATTGAGTTT 98964520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8457 AACCATATAAATCTTGATGTAAGAGGACTTTAACAAAGCTGAACATAAAGAATTGAGTTT 8516

 98964521 ATGTATGCATTAAATCCATCAAGTGAGCATTCAAATGTTCTCTCTATAGTATGTTATTTC 98964580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8517 ATGTATGCATTAAATCCATCAAGTGAGCATTCAAATGTTCTCTCTATAGTATGTTATTTC 8576

 98964581 AGGGTCTAAATGTGTTGCTACAATAGATTGCTTTCAAACAGAACTCCTATATTGCTGTGC 98964640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8577 AGGGTCTAAATGTGTTGCTACAATAGATTGCTTTCAAACAGAACTCCTATATTGCTGTGC 8636

 98964641 TGGTTAAGCTATTGTTTCTCCGCTCCAAACCCACTCCTCTATAGTTTCTGACAGTTGGGC 98964700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8637 TGGTTAAGCTATTGTTTCTCCGCTCCAAACCCACTCCTCTATAGTTTCTGACAGTTGGGC 8696

 98964701 TGAGACAATGCAAAAGACTATTATAGGCTCACCTGAACAGGGGGTAGTAAAGGAGATTGG 98964760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8697 TGAGACAATGCAAAAGACTATTATAGGCTCACCTGAACAGGGGGTAGTAAAGGAGATTGG 8756

 98964761 ACGGCAGGAGGAGGATGGGACTTGGCTGCTGCTCCTGTCCCACCTCTTCACATCACTTCT 98964820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8757 ACGGCAGGAGGAGGATGGGACTTGGCTGCTGCTCCTGTCCCACCTCTTCACATCACTTCT 8816

 98964821 TCCTCCCTTCACTCTGGCAGCAACAGTTGGTTTGTACCCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 98964880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8817 TCCTCCCTTCACTCTGGCAGCAACAGTTGGTTTGTACCCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 8876

 98964881 TTAGACAGAGTCTAGCTCCATTGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 98964940
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     8877 TTAGACAGAGTCTAGCTCCATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACT 8936

 98964941 GCAACCTCTGCTTCCCGGATTCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGA 98965000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8937 GCAACCTCTGCTTCCCGGATTCAAGAGATTATCCTGCCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGGGA 8996

 98965001 TTACAGGTGCCCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGATGGGGTTTC 98965060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8997 TTACAGGTGCCCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGGATGGGGTTTC 9056

 98965061 ACTGTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGA 98965093
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     9057 ACTGTGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGA 9089

Alignment time is 7.4249 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [98945401,98969000] =>     23600 nucs '12 dna:chromosome chromosome:GRCh37:12:1:133851895:1'
Second seq [       1,    3019] =>      3019 nucs 'mol-32-34b3-083325_3019'

Score:        2959
Aligned:      3014        nucs
Identic:      3009 (100%) nucs =>      2761 (100%)       248 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [98952390,98955155] EXCISED REGION [98955156,98955403]
 second seq =>  [       1,    2766] EXCISED REGION [    2772,    3019]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [2767,2771]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        29 nucs [2767,2795] to [2772,2800]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2767,2768] to [2770,2771]

 98952390 TTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGTAGTGGTGCGATCTCGGCTCA 98952449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGTAGTGGTGCGATCTCGGCTCA 60

 98952450 CTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTGGG 98952509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCAACCTCCGCCTCCCAAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTGGG 120

 98952510 ACTACAGGCACGCACCACCACGCCCAGCTGCTAATTTTTGCATTTTTAGCAGAGACGGGG 98952569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTACAGGCACGCACCACCACGCCCAGCTGCTAATTTTTGCATTTTTAGCAGAGACGGGG 180

 98952570 TTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTTGTGATCCACCCACCTCTGC 98952629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCTTGACCTTGTGATCCACCCACCTCTGC 240

 98952630 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCTGGCCTTAACTTTCTTTAAA 98952689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCTGGCCTTAACTTTCTTTAAA 300

 98952690 TAAGTAGGAGAAATACTCTAAAATAATGATAAAAAGTACAGTAAACACATAAACCAGTAA 98952749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGTAGGAGAAATACTCTAAAATAATGATAAAAAGTACAGTAAACACATAAACCAGTAA 360

 98952750 CACTCATTTATTATCATTATCAAATATTAAGTACTGTACATGATTTTGTTATACTTTTGT 98952809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      361 CACTCATTTATTATCATTATCAAATATTAAGTACTGTACATGATTTTGTTATACTTTTAT 420

 98952810 ATGACTGGCCACACAGTAAGTTTGTGTGACCAGAAATATGTGAGTACTGAATTGTGCTAC 98952869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGACTGGCCACACAGTAAGTTTGTGTGACCAGAAATATGTGAGTACTGAATTGTGCTAC 480

 98952870 ATTATGATGGCTACAGTGTCACTAGGCAGTAAGAATTTTTCAGCCTCTTTATAATCTTAT 98952929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTATGATGGCTACAGTGTCACTAGGCAGTAAGAATTTTTCAGCCTCTTTATAATCTTAT 540

 98952930 GGGACCACTGTTGTATATGCAGTTCATCATCGACAAAAACGTCGTTAAGCAGTACATGAC 98952989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGACCACTGTTGTATATGCAGTTCATCATCGACAAAAACGTCGTTAAGCAGTACATGAC 600

 98952990 TATAAAAAGAAAGCCTGGAAAGAACGCCTCCTGGGTTCATGTCATTACTCACAGATGACA 98953049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATAAAAAGAAAGCCTGGAAAGAACGCCTCCTGGGTTCATGTCATTACTCACAGATGACA 660

 98953050 TGATCGTATATGCAAAAAAGCTGAAAGAATCTATAGAAGAACTATTATAATTAATAGGTT 98953109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATCGTATATGCAAAAAAGCTGAAAGAATCTATAGAAGAACTATTATAATTAATAGGTT 720

 98953110 TAATTAGCAAGGGCTCTAAATATAAGATTATTACACTAAAACCAGTTGTGTTGCTGTGTC 98953169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATTAGCAAGGGCTCTAAATATAAGATTATTACACTAAAACCAGTTGTGTTGCTGTGTC 780

 98953170 AACAAGAAACAAATAGAAAATGAAATTTTGAAAAGTATCACTTATAACACCAAAATATAT 98953229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACAAGAAACAAATAGAAAATGAAATTTTGAAAAGTATCACTTATAACACCAAAATATAT 840

 98953230 CAAAAAACATTAAATCTAACGATGTCAAAGACCTTTGCACTAGAAACTACAAACCACTGA 98953289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAAAAACATTAAATCTAACGATGTCAAAGACCTTTGCACTAGAAACTACAAACCACTGA 900

 98953290 GAAAAAAATAAAGAAAAAATAAATACCACATTTATAGATTGGAAGAGTTAATGTTGTAAA 98953349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAAAAATAAAGAAAAAATAAATACCACATTTATAGATTGGAAGAGTTAATGTTGTAAA 960

 98953350 GATCTTATTTCTTCCCAAATTGATCTACAAATTTAATATAATCCCAATCAAAATTCCAGC 98953409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATCTTATTTCTTCCCAAATTGATCTACAAATTTAATATAATCCCAATCAAAATTCCAGC 1020

 98953410 AGATTTTTGGTGTGGAAAGTGATACAACATTTTGACTTAGTTGATTCTAAAATTTAGATG 98953469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATTTTTGGTGTGGAAAGTGATACAACATTTTGACTTAGTTGATTCTAAAATTTAGATG 1080

 98953470 GCAATGCAAAGACCAAAGAATAGCTAAGGCAAACCTAAAGAAGAACAAACCTGTAAAATG 98953529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAATGCAAAGACCAAAGAATAGCTAAGGCAAACCTAAAGAAGAACAAACCTGTAAAATG 1140

 98953530 ACACTGACTGCTTGATAGCATGCCCTATTATAAAGCTGTGGCAATTCAGACAGTGTGGTT 98953589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACACTGACTGCTTGATAGCATGCCCTATTATAAAGCTGTGGCAATTCAGACAGTGTGGTT 1200

 98953590 TTGTTCCAACAATAGACAAACAGGCCAATGGAACACAACAAAGAGTCCACAGACAGGCTG 98953649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGTTCCAACAATAGACAAACAGGCCAATGGAACACAACAAAGAGTCCACAGACAGGCTG 1260

 98953650 AAGGGTCACCTGATAGATGACAAAGTCAACACTGCTGTGTAGTGGAGAAAGGCCGGTCTT 98953709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1261 AAGGGTCACCTGATAGATGACAAAGTCAACACTGCTGTGTAGTGGAGAAAGGCTGGTCTT 1320

 98953710 TTTGGGATGGGCCAATTGAATATCCCTATGGAAAAACATTAAACTTGATCCCTACCTCAC 98953769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTGGGATGGGCCAATTGAATATCCCTATGGAAAAACATTAAACTTGATCCCTACCTCAC 1380

 98953770 AATCATTTAAAAGTTACTTTTATTTTTTATTTATTTATTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTG 98953829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATCATTTAAAAGTTACTTTTATTTTTTATTTATTTATTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTG 1440

 98953830 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 98953889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 1500

 98953890 TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTCTGCC 98953949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTCTGCC 1560

 98953950 ACCACACCTGGCTAAGTTTTGTTTTTAGTAGATATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 98954009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCACACCTGGCTAAGTTTTGTTTTTAGTAGATATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 1620

 98954010 GGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATATCCCCAATGTCGGCCTCCTGAAGTACTGGGAT 98954069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATATCCCCAATGTCGGCCTCCTGAAGTACTGGGAT 1680

 98954070 TACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTAAAAGTTACTTTTAAAAAAAGTTAGTTTCAGT 98954129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCTAAAAGTTACTTTTAAAAAAAGTTAGTTTCAGT 1740

 98954130 TGTATTATCCTTAAAATTGGAAAGGTAAAGCAATACATATTTTAGAAGAGAGCATAGGAG 98954189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTATTATCCTTAAAATTGGAAAGGTAAAGCAATACATATTTTAGAAGAGAGCATAGGAG 1800

 98954190 AAGAATATTTTCATAAACTTTGAGTAGGTAAAACTTTCTTAAATGTTTTTGAAAGGCAGT 98954249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1801 AAGAATATTTTCATAAACTTTGAGTAGGTAAAACTTTCTTAAATGTTTTTGAAAAGCAGT 1860

 98954250 AATCATAATTAAAACAATTCATACATGGGACTGTAGTAAAATTAAAAACTTCTGTTCACC 98954309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATCATAATTAAAACAATTCATACATGGGACTGTAGTAAAATTAAAAACTTCTGTTCACC 1920

 98954310 AAAAGACATCACCGAAAGAGTGGAAAGGCAAACCAAAGAGTGGGAGAAAATATTTGCTGT 98954369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAAGACATCACCGAAAGAGTGGAAAGGCAAACCAAAGAGTGGGAGAAAATATTTGCTGT 1980

 98954370 ACATGGGTCTGATAAAGCAGTCATATCAAAAATATATAAAGAACTTCTACAAACTGATCT 98954429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACATGGGTCTGATAAAGCAGTCATATCAAAAATATATAAAGAACTTCTACAAACTGATCT 2040

 98954430 AAAAAAAAAACTAATATAAAAGTGATCCAAAACTGAGGGCTTTCACAAAACTGGATGCCT 98954489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAAAAAAAACTAATATAAAAGTGATCCAAAACTGAGGGCTTTCACAAAACTGGATGCCT 2100

 98954490 AAATGTGCGATAAATATTCAAAACATATAAAGAACTTCTACCAATAGGCTGGGCATAATG 98954549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATGTGCGATAAATATTCAAAACATATAAAGAACTTCTACCAATAGGCTGGGCATAATG 2160

 98954550 GCTCATGCCTGTAATCCCAGTTCTTTGAGAAGGCAGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCA 98954609
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTCATACCTGTAATCCCAGTTCTTTGAGAAGGCAGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCA 2220

 98954610 GAAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATACTGAGACCCCCACCTGTATTTAAAAACAAACA 98954669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATACTGAGACCCCCACCTGTATTTAAAAACAAACA 2280

 98954670 AACAAACAAAAAATTCCAACAAATAAACGAAGAGACAACCTTTTGCCAACAATGGGCAAA 98954729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACAAACAAAAAATTCCAACAAATAAACGAAGAGACAACCTTTTGCCAACAATGGGCAAA 2340

 98954730 AGTCTTTAACAAGCAGTTCACACATAGCTAATAAACATTAAAAAGCGTATGGCATGACTG 98954789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTCTTTAACAAGCAGTTCACACATAGCTAATAAACATTAAAAAGCGTATGGCATGACTG 2400

 98954790 GTAATTAACCACAGAGAGATATCATTACACACCCATCAGCCTGCTAAAAATTAAATCATG 98954849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTAATTAACCACAGAGAGATATCATTACACACCCATCAGCCTGCTAAAAATTAAATCATG 2460

 98954850 CAATAGCAAAAGAGTATGTGGGGCCAGGAACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTT 98954909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAATAGCAAAAGAGTATGTGGGGCCAGGAACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTT 2520

 98954910 TGGGCAGCTGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCATGGCCAACA 98954969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGGCAGCTGAGGCGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCATGGCCAACA 2580

 98954970 TGCTGAAACCCCACCTGTACTAAAAATACCCAAAAAATTAGCCGGATGCTGTGGCAGGTG 98955029
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCTGAAACCCCGCCTGTACTAAAAATACCCAAAAAATTAGCCGGATGCTGTGGCAGGTG 2640

 98955030 CCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGG 98955089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGG 2700

 98955090 AGATTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGCGAGACTC 98955149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGATTGCAGTGAGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGCGAGACTC 2760

 98955150 CATCTC 98955155
          ||||||
     2761 CATCTC 2766

EXCISED REGION

 98955156 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTTGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAAT 98955215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCTTGGTGTCGTGGCACGCACCTGTAAT 2831

 98955216 CCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAG 98955275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 CCCAGCTACTGAGGCAGGAGAATTCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAG 2891

 98955276 ATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAA 98955335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 ATCATGCCACTGCACTCCAGCATGGGCCACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAACAATAA 2951

 98955336 ACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGC 98955395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 ACAAACAAAAAAACAAAAGAGCATGTGGAATAATGGAATAATAATAATAAGCAATTAAGC 3011

 98955396 AATTGCAG 98955403
          ||||||||
     3012 AATTGCAG 3019

Alignment time is 2.47585 s

