
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5737] =>      5737 nucs 'mol-32-1e66-074355_5737'

Score:        5692
Aligned:      5736        nucs
Identic:      5732 (100%) nucs =>       219 (100%)      5513 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941711,61941929] EXCISED REGION [61941931,61947446]
 second seq =>  [       1,     219] EXCISED REGION [     221,    5737]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61941930,61941930]
 second seq =>         1 nucs [220,220]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4893,4893]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [219,220] to [220,221]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61941929,61941929] to [61941931,61941931]
 second seq =>         1 nucs [219,219] to [221,221]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61941711 TTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATAAAGTCT 61941770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATAAAGTCT 60

 61941771 GTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTTGTCAGA 61941830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTTGTCAGA 120

 61941831 GCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCATACCCG 61941890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCATACCCG 180

 61941891 TTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCT 61941929
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCT 219

EXCISED REGION

 61941931 TGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAA 61941990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      221 TGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAA 280

 61941991 CAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTG 61942050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      281 CAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTG 340

 61942051 AAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCA 61942110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      341 AAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCA 400

 61942111 CGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGA 61942170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 CGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGA 460

 61942171 TCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGG 61942230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 TCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGG 520

 61942231 ATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAG 61942290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 ATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAG 580

 61942291 CATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCC 61942350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 CATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCC 640

 61942351 CAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCT 61942410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 CAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCT 700

 61942411 GCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGC 61942470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 GCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGC 760

 61942471 GTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGA 61942530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 GTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGA 820

 61942531 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 61942590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 880

 61942591 GAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGT 61942650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 GAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGT 940

 61942651 GCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTT 61942710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 GCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTT 1000

 61942711 TTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGC 61942770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 TTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGC 1060

 61942771 AGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCA 61942830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 AGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCA 1120

 61942831 GCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTT 61942890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 GCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTT 1180

 61942891 TTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACT 61942950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 TTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACT 1240

 61942951 CTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAA 61943010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 CTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAA 1300

 61943011 CTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAG 61943070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 CTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAG 1360

 61943071 GGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGG 61943130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 GGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGG 1420

 61943131 TGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTC 61943190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 TGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTC 1480

 61943191 AGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGA 61943250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 AGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGA 1540

 61943251 TACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATA 61943310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 TACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATA 1600

 61943311 TGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAA 61943370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAA 1660

 61943371 TAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTA 61943430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTA 1720

 61943431 TTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAA 61943490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAA 1780

 61943491 TACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTT 61943550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 TACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTT 1840

 61943551 GGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAA 61943610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 GGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAA 1900

 61943611 TTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTA 61943670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTA 1960

 61943671 TACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCAT 61943730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 TACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCAT 2020

 61943731 TTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATG 61943790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 TTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATG 2080

 61943791 TTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATT 61943850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 TTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATT 2140

 61943851 GTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCT 61943910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 GTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCT 2200

 61943911 CCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTA 61943970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 CCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTA 2260

 61943971 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 61944030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 2320

 61944031 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 61944090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 2380

 61944091 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 61944150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 2440

 61944151 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 61944210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 2500

 61944211 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 61944270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 2560

 61944271 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 61944330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 2620

 61944331 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 61944390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 2680

 61944391 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 61944450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 2740

 61944451 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 61944510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 2800

 61944511 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 61944570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 2860

 61944571 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 61944630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 2920

 61944631 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 61944690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 2980

 61944691 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 61944750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 3040

 61944751 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAG 61944810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAG 3100

 61944811 TATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTAT 61944870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTAT 3160

 61944871 TTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCA 61944930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 TTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCA 3220

 61944931 CCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCAT 61944990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCAT 3280

 61944991 TCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGG 61945050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 TCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGG 3340

 61945051 TCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGAT 61945110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGAT 3400

 61945111 TTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATA 61945170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATA 3460

 61945171 CCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAA 61945230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAA 3520

 61945231 GTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCA 61945290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCA 3580

 61945291 TATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGA 61945350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGA 3640

 61945351 GAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAA 61945410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 GAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAA 3700

 61945411 AGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTC 61945470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 AGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTC 3760

 61945471 CCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTG 61945530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 CCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTG 3820

 61945531 CTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTT 61945590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 CTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTT 3880

 61945591 CCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATAT 61945650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 CCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATAT 3940

 61945651 TCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACC 61945710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACC 4000

 61945711 AAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATA 61945770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 AAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATA 4060

 61945771 GACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTT 61945830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 GACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTT 4120

 61945831 CTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGG 61945890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 CTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGG 4180

 61945891 GTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTT 61945950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 GTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTT 4240

 61945951 TTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAA 61946010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAA 4300

 61946011 AAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAA 61946070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 AAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAA 4360

 61946071 TTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTA 61946130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTA 4420

 61946131 GAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGT 61946190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 GAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGT 4480

 61946191 GTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATG 61946250
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 GTGTCTCCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATG 4540

 61946251 ATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCT 61946310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 ATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCT 4600

 61946311 ACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCT 61946370
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 ACTGTCGTTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCT 4660

 61946371 TACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCA 61946430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 TACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCA 4720

 61946431 TCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAA 61946490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 TCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAA 4780

 61946491 TAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATT 61946550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 TAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATT 4840

 61946551 ACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTT 61946609
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     4841 ACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTT 4900

 61946610 TTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGG 61946669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 TTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGG 4960

 61946670 GTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGT 61946729
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 GTAAATTGCATGGTGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGT 5020

 61946730 AGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGG 61946789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 AGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGG 5080

 61946790 CCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTT 61946849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 CCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTT 5140

 61946850 GTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATG 61946909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 GTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATG 5200

 61946910 GCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTA 61946969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 GCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTA 5260

 61946970 TTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGG 61947029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 TTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGG 5320

 61947030 TTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTC 61947089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTC 5380

 61947090 TTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTC 61947149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 TTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTC 5440

 61947150 GAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTG 61947209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 GAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTG 5500

 61947210 AACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCT 61947269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 AACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCT 5560

 61947270 GCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGAT 61947329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 GCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGAT 5620

 61947330 TTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGC 61947389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 TTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGC 5680

 61947390 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTT 61947446
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTT 5737

Alignment time is 6.53811 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4671] =>      4671 nucs 'mol-32-1f0b-186988_4671'

Score:        4648
Aligned:      4670        nucs
Identic:      4668 (100%) nucs =>      3231 (100%)      1437 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942972,61946202] EXCISED REGION [61946204,61947641]
 second seq =>  [       1,    3231] EXCISED REGION [    3233,    4671]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [3232,3232]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3632,3632]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [3229,3231] to [3233,3235]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942972 CCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAAC 61943031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAAC 60

 61943032 TAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGAT 61943091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGAT 120

 61943092 TTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGA 61943151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGA 180

 61943152 CTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCT 61943211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCT 240

 61943212 GAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACC 61943271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACC 300

 61943272 AGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAAT 61943331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAAT 360

 61943332 CATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAG 61943391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAG 420

 61943392 CCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTT 61943451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTT 480

 61943452 ATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCA 61943511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCA 540

 61943512 GATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAG 61943571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAG 600

 61943572 CTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAAT 61943631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAAT 660

 61943632 TGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATC 61943691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATC 720

 61943692 AGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTC 61943751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTC 780

 61943752 AAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCC 61943811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCC 840

 61943812 CACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACC 61943871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACC 900

 61943872 AACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGT 61943931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGT 960

 61943932 TCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAAT 61943991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAAT 1020

 61943992 TTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGC 61944051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGC 1080

 61944052 TCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 61944111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 1140

 61944112 TGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGG 61944171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGG 1200

 61944172 GTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTT 61944231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTT 1260

 61944232 GGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACT 61944291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACT 1320

 61944292 TTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCA 61944351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCA 1380

 61944352 CTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTT 61944411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTT 1440

 61944412 TTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATT 61944471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATT 1500

 61944472 TGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAG 61944531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAG 1560

 61944532 CATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGA 61944591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGA 1620

 61944592 CCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCA 61944651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCA 1680

 61944652 AATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGAC 61944711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGAC 1740

 61944712 CTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGA 61944771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGA 1800

 61944772 TATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTAT 61944831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTAT 1860

 61944832 ACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACT 61944891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACT 1920

 61944892 CCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTT 61944951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTT 1980

 61944952 TCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATT 61945011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATT 2040

 61945012 GTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTAT 61945071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTAT 2100

 61945072 TAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTA 61945131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTA 2160

 61945132 AGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATG 61945191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATG 2220

 61945192 TTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCA 61945251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCA 2280

 61945252 GAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGA 61945311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGA 2340

 61945312 AATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGAT 61945371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGAT 2400

 61945372 CCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCC 61945431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCC 2460

 61945432 ATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGAT 61945491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGAT 2520

 61945492 AACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA 61945551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA 2580

 61945552 CTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTG 61945611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTG 2640

 61945612 GTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATG 61945671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATG 2700

 61945672 TGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACA 61945731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACA 2760

 61945732 CTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATAT 61945791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATAT 2820

 61945792 TTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATA 61945851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATA 2880

 61945852 ATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTC 61945911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTC 2940

 61945912 ATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGA 61945971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGA 3000

 61945972 TGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATAT 61946031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATAT 3060

 61946032 ATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCT 61946091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCT 3120

 61946092 ACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGAC 61946151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGAC 3180

 61946152 ATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 61946202
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 3231

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 3292

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 3352

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 3412

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 3472

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 3532

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 3592

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3593 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 3652

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 3712

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 3772

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 3832

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 3892

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 3952

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 4012

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 4072

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 4132

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 4192

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 4252

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 4312

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 4372

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 4432

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 4492

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 4552

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 4612

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGC 61947641
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGC 4671

Alignment time is 5.7686 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2899] =>      2899 nucs 'mol-32-1f16-102850_2899'

Score:        2790
Aligned:      2902        nucs
Identic:      2891 (100%) nucs =>       474 (100%)      2417 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61944312,61944787] EXCISED REGION [61945086,61947511]
 second seq =>  [       1,     476] EXCISED REGION [     477,    2899]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61944312 AGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAG 61944371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAG 60

 61944372 GGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATT 61944431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
       61 GGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATT 120

 61944432 TCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTT 61944491
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTTGTGTACATACACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTT 180

 61944492 GATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTC 61944551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTC 240

 61944552 TTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTT 61944611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTT 300

 61944612 GAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAG 61944671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAG 360

 61944672 TGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCC 61944731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCC 420

 61944732 ACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 476

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 536

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 596

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 656

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 716

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 776

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 836

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 896

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
      897 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 954

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 1014

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 1074

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 1134

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 1194

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 1254

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 1314

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 1374

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 1434

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 1494

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 1554

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 1614

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 1674

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TATGTTTCGGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 1734

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 1794

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 1854

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 1914

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1915 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 1974

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 2034

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 2094

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 2154

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 2214

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2215 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 2273

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 2333

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 2393

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 2453

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 2513

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 2573

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 2633

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 2693

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 2753

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 61947425
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATATCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 2813

 61947426 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 61947485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 2873

 61947486 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAG 61947511
          ||||||||||||||||||||||||||
     2874 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAG 2899

Alignment time is 3.74712 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2782] =>      2782 nucs 'mol-32-1f21-185071_2782'

Score:        2617
Aligned:      2784        nucs
Identic:      2768 ( 99%) nucs =>      2020 ( 99%)       748 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942757,61944787] EXCISED REGION [61945086,61945838]
 second seq =>  [       1,    2031] EXCISED REGION [    2032,    2782]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942757 GGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCA 61942816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCA 60

 61942817 ACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTC 61942876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
       61 ACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCATGTGCCACCACACCTGTC 120

 61942877 TAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAG 61942936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAG 180

 61942937 GCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGG 61942996
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      181 GCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAATTGGG 240

 61942997 ATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTT 61943056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTT 300

 61943057 ATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATC 61943116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATC 360

 61943117 ACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGT 61943176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGT 420

 61943177 GGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAG 61943236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      421 GGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGCG 480

 61943237 TTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACT 61943296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACT 540

 61943297 AATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTT 61943356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTT 600

 61943357 AATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATG 61943416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATG 660

 61943417 GATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGAT 61943476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGAT 720

 61943477 GTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGA 61943536
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATCAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGA 780

 61943537 TAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGA 61943596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGA 840

 61943597 TTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATG 61943656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATG 900

 61943657 TTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCT 61943716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCT 960

 61943717 CAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTA 61943776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTA 1020

 61943777 AGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACT 61943836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1021 AGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACT 1080

 61943837 CATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCC 61943896
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1081 CATTTTTCTTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCC 1140

 61943897 ATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCA 61943956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCA 1200

 61943957 ACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTG 61944016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTG 1260

 61944017 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGT 61944076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1261 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGT 1320

 61944077 TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAA 61944136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAA 1380

 61944137 GCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT 61944196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT 1440

 61944197 CTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACA 61944256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACA 1500

 61944257 GGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAAC 61944316
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1501 GGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAAC 1560

 61944317 ATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCA 61944376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCA 1620

 61944377 TCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTT 61944436
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1621 TCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTT 1680

 61944437 GTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTC 61944496
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGTACATACACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTC 1740

 61944497 CATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAA 61944556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAA 1800

 61944557 CATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACT 61944616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACT 1860

 61944617 GTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTT 61944676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTT 1920

 61944677 GAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGG 61944736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGG 1980

 61944737 GCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 2031

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 2091

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 2151

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 2211

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 2271

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 2331

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 2391

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 2451

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     2452 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 2509

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 2569

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 2629

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 2689

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 2749

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCC 61945838
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCC 2782

Alignment time is 3.91163 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3717] =>      3717 nucs 'mol-32-206b-126572_3717'

Score:        3717
Aligned:      3717        nucs
Identic:      3717 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941988,61945704]
 second seq =>  [       1,    3717]

 61941988 CAACAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGT 61942047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAACAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGT 60

 61942048 TTGAAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTA 61942107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTA 120

 61942108 TCACGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTT 61942167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCACGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTT 180

 61942168 AGATCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGG 61942227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGG 240

 61942228 TGGATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTG 61942287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTG 300

 61942288 CAGCATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAA 61942347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAA 360

 61942348 TCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAG 61942407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAG 420

 61942408 CCTGCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGT 61942467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGT 480

 61942468 GGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCG 61942527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCG 540

 61942528 GGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 61942587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 600

 61942588 ACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGT 61942647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGT 660

 61942648 AGTGCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTC 61942707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTGCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTC 720

 61942708 CTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGC 61942767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGC 780

 61942768 AGCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACC 61942827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACC 840

 61942828 TCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAAC 61942887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAAC 900

 61942888 TTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAA 61942947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAA 960

 61942948 ACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGT 61943007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGT 1020

 61943008 GAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCC 61943067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCC 1080

 61943068 TAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATT 61943127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATT 1140

 61943128 TGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAA 61943187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAA 1200

 61943188 CTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATG 61943247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATG 1260

 61943248 TGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGAC 61943307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGAC 1320

 61943308 ATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCT 61943367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCT 1380

 61943368 TAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTT 61943427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTT 1440

 61943428 TTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGT 61943487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGT 1500

 61943488 AAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCA 61943547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCA 1560

 61943548 CTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCA 61943607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCA 1620

 61943608 AAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAAT 61943667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAAT 1680

 61943668 GTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTAT 61943727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTAT 1740

 61943728 CATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAAT 61943787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAAT 1800

 61943788 ATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTA 61943847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTA 1860

 61943848 ATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCC 61943907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCC 1920

 61943908 TCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATT 61943967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATT 1980

 61943968 TTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCT 61944027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCT 2040

 61944028 GGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC 61944087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC 2100

 61944088 TCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAG 61944147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAG 2160

 61944148 TTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCT 61944207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCT 2220

 61944208 AGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA 61944267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA 2280

 61944268 CTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTT 61944327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTT 2340

 61944328 ATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTC 61944387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTC 2400

 61944388 ACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATA 61944447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATA 2460

 61944448 CCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGC 61944507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGC 2520

 61944508 TATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTT 61944567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTT 2580

 61944568 TGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCA 61944627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCA 2640

 61944628 CTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGA 61944687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGA 2700

 61944688 AACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAG 61944747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAG 2760

 61944748 GACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCT 61944807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCT 2820

 61944808 GAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTT 61944867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTT 2880

 61944868 TATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTT 61944927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTT 2940

 61944928 CCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGC 61944987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGC 3000

 61944988 CATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTA 61945047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTA 3060

 61945048 AGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAAT 61945107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAAT 3120

 61945108 GATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAG 61945167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAG 3180

 61945168 ATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTT 61945227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTT 3240

 61945228 GAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGAT 61945287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGAT 3300

 61945288 GCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAA 61945347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAA 3360

 61945348 GGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCT 61945407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCT 3420

 61945408 CAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGT 61945467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGT 3480

 61945468 GTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATC 61945527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATC 3540

 61945528 CTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAA 61945587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAA 3600

 61945588 CTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGA 61945647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGA 3660

 61945648 TATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAAT 61945704
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAAT 3717

Alignment time is 4.25253 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5551] =>      5551 nucs 'mol-32-2076-068987_5551'

Score:        5496
Aligned:      5551        nucs
Identic:      5546 (100%) nucs =>      2398 (100%)      3148 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943805,61946202] EXCISED REGION [61946204,61949355]
 second seq =>  [       1,    2398] EXCISED REGION [    2400,    5551]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [2399,2399]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [2396,2398] to [2400,2402]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943805 AGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCT 61943864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCT 60

 61943865 GTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAA 61943924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAA 120

 61943925 CCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATT 61943984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATT 180

 61943985 TTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAA 61944044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAA 240

 61944045 TCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 61944104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 300

 61944105 GAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAG 61944164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAG 360

 61944165 AAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCAC 61944224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCAC 420

 61944225 CCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATC 61944284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATC 480

 61944285 AAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCT 61944344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCT 540

 61944345 TATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTC 61944404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTC 600

 61944405 ATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCC 61944464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCC 660

 61944465 ATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTG 61944524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTG 720

 61944525 CAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACA 61944584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACA 780

 61944585 AGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTT 61944644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTT 840

 61944645 TCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAG 61944704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAG 900

 61944705 GGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAG 61944764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAG 960

 61944765 TTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATG 61944824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATG 1020

 61944825 ATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGA 61944884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGA 1080

 61944885 GGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAA 61944944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAA 1140

 61944945 AAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGA 61945004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGA 1200

 61945005 CCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTA 61945064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTA 1260

 61945065 GGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGC 61945124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGC 1320

 61945125 TAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGA 61945184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGA 1380

 61945185 AAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCT 61945244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCT 1440

 61945245 ACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCT 61945304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCT 1500

 61945305 TTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACC 61945364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACC 1560

 61945365 ACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAA 61945424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAA 1620

 61945425 AGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTT 61945484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTT 1680

 61945485 GGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGT 61945544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGT 1740

 61945545 CCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATG 61945604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATG 1800

 61945605 TCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGA 61945664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGA 1860

 61945665 CCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTG 61945724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTG 1920

 61945725 AAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGT 61945784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGT 1980

 61945785 TTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTG 61945844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTG 2040

 61945845 TTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTA 61945904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTA 2100

 61945905 CTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATT 61945964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATT 2160

 61945965 TTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTG 61946024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTG 2220

 61946025 GGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCA 61946084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCA 2280

 61946085 TACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAAT 61946144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAAT 2340

 61946145 AGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 61946202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 2398

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 2459

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 2519

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 2579

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 2639

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 2699

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 2759

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2760 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 2819

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 2879

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 2939

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 2999

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 3059

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 3119

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 3179

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 3239

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 3299

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 3359

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 3419

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 3479

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 3539

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 3599

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 3659

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 3719

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 3779

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 61947642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 3839

 61947643 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 61947702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 3899

 61947703 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 61947762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 3959

 61947763 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 61947822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 4019

 61947823 AGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 61947882
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 4078

 61947883 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 61947942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 4138

 61947943 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 61948002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 4198

 61948003 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 61948062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 4258

 61948063 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 61948122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 4318

 61948123 TTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 61948182
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 4378

 61948183 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 61948242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 4438

 61948243 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 61948302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 4498

 61948303 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 61948362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 4558

 61948363 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 61948422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 4618

 61948423 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 61948482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 4678

 61948483 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 61948542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 4738

 61948543 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 61948602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 4798

 61948603 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 61948662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 4858

 61948663 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 61948722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 4918

 61948723 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 61948782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 4978

 61948783 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 61948842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 5038

 61948843 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 61948902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 5098

 61948903 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 61948962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 5158

 61948963 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 61949022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 5218

 61949023 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 61949082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 5278

 61949083 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 61949142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 5338

 61949143 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 61949202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 5398

 61949203 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 61949262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 5458

 61949263 GTGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 61949322
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 GCGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 5518

 61949323 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATT 61949355
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATT 5551

Alignment time is 6.85582 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2105] =>      2105 nucs 'mol-32-20fa-085507_2105'

Score:        2105
Aligned:      2105        nucs
Identic:      2105 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942709,61944813]
 second seq =>  [       1,    2105]

 61942709 TTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCA 61942768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCA 60

 61942769 GCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCT 61942828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCT 120

 61942829 CAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACT 61942888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACT 180

 61942889 TTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAA 61942948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAA 240

 61942949 CTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTG 61943008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTG 300

 61943009 AACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCT 61943068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCT 360

 61943069 AGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTT 61943128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTT 420

 61943129 GGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAAC 61943188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAAC 480

 61943189 TCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGT 61943248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGT 540

 61943249 GATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACA 61943308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACA 600

 61943309 TATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTT 61943368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTT 660

 61943369 AATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTT 61943428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTT 720

 61943429 TATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTA 61943488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTA 780

 61943489 AATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCAC 61943548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCAC 840

 61943549 TTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAA 61943608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAA 900

 61943609 AATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATG 61943668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATG 960

 61943669 TATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATC 61943728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATC 1020

 61943729 ATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATA 61943788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATA 1080

 61943789 TGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAA 61943848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAA 1140

 61943849 TTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCT 61943908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCT 1200

 61943909 CTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTT 61943968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTT 1260

 61943969 TATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTG 61944028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTG 1320

 61944029 GAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCT 61944088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCT 1380

 61944089 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGT 61944148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGT 1440

 61944149 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTA 61944208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTA 1500

 61944209 GCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 61944268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 1560

 61944269 TGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTA 61944328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTA 1620

 61944329 TCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCA 61944388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCA 1680

 61944389 CAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATAC 61944448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATAC 1740

 61944449 CACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCT 61944508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCT 1800

 61944509 ATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTT 61944568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTT 1860

 61944569 GTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCAC 61944628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCAC 1920

 61944629 TTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAA 61944688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAA 1980

 61944689 ACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGG 61944748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGG 2040

 61944749 ACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTG 61944808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTG 2100

 61944809 AGTAT 61944813
          |||||
     2101 AGTAT 2105

Alignment time is 2.78258 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6265] =>      6265 nucs 'mol-32-2b08-086010_6265'

Score:        6090
Aligned:      6270        nucs
Identic:      6252 (100%) nucs =>       813 (100%)      5439 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943971,61944787] EXCISED REGION [61945086,61950538]
 second seq =>  [       1,     817] EXCISED REGION [     818,    6265]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943971 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 61944030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 60

 61944031 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 61944090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
       61 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 120

 61944091 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 61944150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 180

 61944151 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 61944210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 240

 61944211 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 61944270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 300

 61944271 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 61944330
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTATC 360

 61944331 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 61944390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 420

 61944391 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 61944450
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
      421 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACACCA 480

 61944451 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 61944510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 540

 61944511 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 61944570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 600

 61944571 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 61944630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 660

 61944631 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 61944690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 720

 61944691 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 61944750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 780

 61944751 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 817

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 877

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 937

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 997

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 1057

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 1117

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 1177

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 1237

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     1238 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 1295

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 1355

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 1415

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 1475

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 1535

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 1595

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 1655

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 1715

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 1775

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 1835

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 1895

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 1955

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 2015

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 2075

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 2135

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 2195

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 2255

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2256 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 2315

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 2375

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 2435

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 2495

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 2555

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2556 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 2614

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 2674

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 2734

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 2794

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 2854

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 2914

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 2974

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 3034

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 3094

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 61947425
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATATCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 3154

 61947426 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 61947485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 3214

 61947486 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 61947545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 3274

 61947546 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 61947605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 3334

 61947606 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 61947665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 3394

 61947666 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 61947725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 3454

 61947726 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 61947785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 3514

 61947786 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTT 61947845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     3515 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA--TTTTT 3572

 61947846 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 61947905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 3632

 61947906 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 61947965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 3692

 61947966 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 61948025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 3752

 61948026 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 61948085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 3812

 61948086 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTC 61948145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3813 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATTTC 3872

 61948146 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 61948205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 3932

 61948206 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 61948265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 3992

 61948266 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 61948325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 4052

 61948326 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 61948385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 4112

 61948386 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 61948445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 4172

 61948446 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 61948505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 4232

 61948506 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 61948565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 4292

 61948566 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 61948625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 4352

 61948626 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 61948685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 4412

 61948686 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 61948745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 4472

 61948746 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 61948805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 4532

 61948806 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTGGTGA 61948865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4533 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGCGGTGA 4592

 61948866 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 61948925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 4652

 61948926 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 61948985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 4712

 61948986 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 61949045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 4772

 61949046 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 61949105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 4832

 61949106 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 61949165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 4892

 61949166 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 61949225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 4952

 61949226 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 61949285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4953 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 5012

 61949286 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 61949345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 5072

 61949346 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 61949405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 5132

 61949406 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 61949465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 5192

 61949466 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 61949525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 5252

 61949526 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 61949585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 5312

 61949586 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 61949645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 5372

 61949646 CCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 61949705
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 CCAATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 5432

 61949706 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 61949765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 5492

 61949766 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 61949825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 5552

 61949826 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 61949885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 5612

 61949886 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 61949945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 5672

 61949946 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 61950005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5673 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 5732

 61950006 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 61950065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5733 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 5792

 61950066 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 61950125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5793 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 5852

 61950126 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 61950185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5853 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 5912

 61950186 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 61950245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5913 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 5972

 61950246 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 61950305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5973 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 6032

 61950306 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 61950365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6033 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 6092

 61950366 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 61950425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6093 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 6152

 61950426 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 61950485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6153 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 6212

 61950486 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATG 61950538
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6213 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATG 6265

Alignment time is 7.71091 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7083] =>      7083 nucs 'mol-32-2b13-080484_7083'

Score:        6865
Aligned:      7089        nucs
Identic:      7067 (100%) nucs =>      1104 ( 99%)      5963 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943677,61944787] EXCISED REGION [61945086,61951063]
 second seq =>  [       1,    1111] EXCISED REGION [    1112,    7083]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943677 GCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTT 61943736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTT 60

 61943737 GTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTA 61943796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTA 120

 61943797 TTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACT 61943856
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      121 TTAACTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAATTGTAACT 180

 61943857 TTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTA 61943916
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGTACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTA 240

 61943917 TCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATT 61943976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATT 300

 61943977 TATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAG 61944036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAG 360

 61944037 TGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 61944096
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 420

 61944097 AGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATT 61944156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATT 480

 61944157 TTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAG 61944216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAG 540

 61944217 TGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCG 61944276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCG 600

 61944277 GCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGT 61944336
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGT 660

 61944337 GTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGAC 61944396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGAC 720

 61944397 AGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAA 61944456
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
      721 AGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACACCACATTAA 780

 61944457 AAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAA 61944516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAA 840

 61944517 TAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTT 61944576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTT 900

 61944577 TGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACAC 61944636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACAC 960

 61944637 CGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGT 61944696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGT 1020

 61944697 ATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGT 61944756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGT 1080

 61944757 TTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 1111

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 1171

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 1231

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 1291

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 1351

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 1411

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 1471

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 1531

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     1532 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 1589

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 1649

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 1709

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 1769

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 1829

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 1889

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 1949

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 2009

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 2069

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 2129

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 2189

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 2249

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 2309

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 2369

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 2429

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 2489

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 2549

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2550 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 2609

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 AAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 2668

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 2728

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 2788

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 2848

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2849 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 2907

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 2967

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 3027

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 3087

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 3147

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 3207

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 3267

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 3327

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 3387

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 61947425
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATATCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 3447

 61947426 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 61947485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 3507

 61947486 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 61947545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 3567

 61947546 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 61947605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 3627

 61947606 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 61947665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 3687

 61947666 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 61947725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 3747

 61947726 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 61947785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 3807

 61947786 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTT 61947845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     3808 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA--TTTTT 3865

 61947846 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 61947905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 3925

 61947906 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 61947965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 3985

 61947966 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 61948025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 4045

 61948026 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 61948085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 4105

 61948086 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTC 61948145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4106 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATTTC 4165

 61948146 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 61948205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 4225

 61948206 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 61948265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 4285

 61948266 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 61948325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 4345

 61948326 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 61948385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 4405

 61948386 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 61948445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 4465

 61948446 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 61948505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 4525

 61948506 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 61948565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 4585

 61948566 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 61948625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 4645

 61948626 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 61948685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 4705

 61948686 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 61948745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 4765

 61948746 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 61948805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 4825

 61948806 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTGGTGA 61948865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4826 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGCGGTGA 4885

 61948866 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 61948925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 4945

 61948926 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 61948985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 5005

 61948986 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 61949045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 5065

 61949046 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 61949105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 5125

 61949106 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 61949165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 5185

 61949166 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 61949225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 5245

 61949226 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 61949285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5246 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 5305

 61949286 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 61949345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 5365

 61949346 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 61949405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 5425

 61949406 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 61949465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 5485

 61949466 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 61949525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 5545

 61949526 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 61949585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 5605

 61949586 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 61949645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 5665

 61949646 CCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 61949705
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 CCAATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 5725

 61949706 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 61949765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 5785

 61949766 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 61949825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 5845

 61949826 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 61949885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 5905

 61949886 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 61949945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 5965

 61949946 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 61950005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 6025

 61950006 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 61950065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 6085

 61950066 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 61950125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 6145

 61950126 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 61950185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 6205

 61950186 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 61950245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 6265

 61950246 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 61950305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 6325

 61950306 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 61950365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 6385

 61950366 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 61950425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 6445

 61950426 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 61950485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 6505

 61950486 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATGCCCTTCT 61950545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATGCCCTTCT 6565

 61950546 TTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCACTCTGCTACCCAGGCTGGAGT 61950605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 TTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCACTCTGCTACCCAGGCTGGAGT 6625

 61950606 GCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGTGACCTCTGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC 61950665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 GCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGTGACCTCTGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC 6685

 61950666 TACTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACCACACCGAGCTAATTTTTGTATTTTTT 61950725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 TACTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACCACACCGAGCTAATTTTTGTATTTTTT 6745

 61950726 TTTAGGCAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTTGGGTACAGTGGCACAATCTTGGCTCAC 61950785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 TTTAGGCAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTTGGGTACAGTGGCACAATCTTGGCTCAC 6805

 61950786 TGCAACCGCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTTTCATGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG 61950845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 TGCAACCGCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTTTCATGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG 6865

 61950846 ATTACAGGTGTGCACCATCACGCATGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 61950905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 ATTACAGGTGTGCACCATCACGCATGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 6925

 61950906 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGC 61950965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGC 6985

 61950966 CTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGGGCTATTGCTCCTGGCCTAATTTTTGTATTTT 61951025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 CTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGGGCTATTGCTCCTGGCCTAATTTTTGTATTTT 7045

 61951026 TTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCA 61951063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 TTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCA 7083

Alignment time is 8.47721 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4068] =>      4068 nucs 'mol-32-2b34-057033_4068'

Score:        4045
Aligned:      4067        nucs
Identic:      4065 (100%) nucs =>      2829 (100%)      1236 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943374,61946202] EXCISED REGION [61946204,61947440]
 second seq =>  [       1,    2829] EXCISED REGION [    2831,    4068]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [2830,2830]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3230,3230]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [2827,2829] to [2831,2833]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943374 GCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTG 61943433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTG 60

 61943434 CTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATAC 61943493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATAC 120

 61943494 TTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGT 61943553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGT 180

 61943554 TCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTA 61943613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTA 240

 61943614 TTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATAC 61943673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATAC 300

 61943674 ATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTC 61943733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTC 360

 61943734 TTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTA 61943793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTA 420

 61943794 TTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTA 61943853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTA 480

 61943854 ACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCA 61943913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCA 540

 61943914 GTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTT 61943973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTT 600

 61943974 ATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG 61944033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG 660

 61944034 CAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGC 61944093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGC 720

 61944094 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGT 61944153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGT 780

 61944154 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTC 61944213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTC 840

 61944214 AAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGC 61944273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGC 900

 61944274 CCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTAC 61944333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTAC 960

 61944334 TGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAAT 61944393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAAT 1020

 61944394 GACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACAT 61944453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACAT 1080

 61944454 TAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGT 61944513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGT 1140

 61944514 AAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTC 61944573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTC 1200

 61944574 CTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACA 61944633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACA 1260

 61944634 CACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTG 61944693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTG 1320

 61944694 TGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATG 61944753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATG 1380

 61944754 AGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTAT 61944813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTAT 1440

 61944814 AGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTT 61944873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTT 1500

 61944874 TAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCA 61944933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCA 1560

 61944934 ATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCT 61944993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCT 1620

 61944994 AACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCT 61945053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCT 1680

 61945054 ATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTA 61945113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTA 1740

 61945114 TCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCA 61945173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCA 1800

 61945174 CTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTC 61945233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTC 1860

 61945234 TAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATAT 61945293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATAT 1920

 61945294 GCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAA 61945353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAA 1980

 61945354 CCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGT 61945413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGT 2040

 61945414 GATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCT 61945473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCT 2100

 61945474 AGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTG 61945533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTG 2160

 61945534 AGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCG 61945593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCG 2220

 61945594 ACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCA 61945653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCA 2280

 61945654 CTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAA 61945713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAA 2340

 61945714 GCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGAC 61945773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGAC 2400

 61945774 TCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTC 61945833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTC 2460

 61945834 TCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTA 61945893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTA 2520

 61945894 CTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTT 61945953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTT 2580

 61945954 ATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAA 61946013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAA 2640

 61946014 CTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTC 61946073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTC 2700

 61946074 AAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAA 61946133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAA 2760

 61946134 TAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTG 61946193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTG 2820

 61946194 TCTCCATTT 61946202
          |||||||||
     2821 TCTCCATTT 2829

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 2890

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 2950

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 3010

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 3070

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 3130

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 3190

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3191 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 3250

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 3310

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 3370

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 3430

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 3490

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 3550

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 3610

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 3670

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 3730

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 3790

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 3850

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 3910

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 3970

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 4030

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTG 61947440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTG 4068

Alignment time is 5.24234 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6422] =>      6422 nucs 'mol-32-2e57-074178_6422'

Score:        6098
Aligned:      6427        nucs
Identic:      6384 ( 99%) nucs =>      4421 ( 99%)      1963 (100%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61940350,61944787] EXCISED REGION [61945086,61947056]
 second seq =>  [       1,    4455] EXCISED REGION [    4456,    6422]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61940350 TGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAA 61940409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAA 60

 61940410 CATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGG 61940469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGG 120

 61940470 TTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATA 61940529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATA 180

 61940530 CACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATATGT 61940589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATATGT 240

 61940590 TTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGG 61940649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGG 300

 61940650 GTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAGGAT 61940709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAGGAT 360

 61940710 CCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGT 61940769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGT 420

 61940770 CTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAAAGCCATCAACTCATTA 61940829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAAAGCCATCAACTCATTA 480

 61940830 TGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGATTT 61940889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGATTT 540

 61940890 TCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTC 61940949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTC 600

 61940950 TCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCT 61941009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCT 660

 61941010 CTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGC 61941069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGC 720

 61941070 ACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTG 61941129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTG 780

 61941130 CCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGAT 61941189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGAT 840

 61941190 GTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGAGAC 61941249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGAGAC 900

 61941250 TCCTTGACTGACTGAT---------TGACTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC---- 61941296
          |||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
      901 TCCTTGACTGACTGA-CTGACTGACTGACTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC 959

 61941297 TTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGACAAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGC 61941356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGACAAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGC 1019

 61941357 TGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATT 61941416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATT 1079

 61941417 CTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAA 61941476
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1080 CTCATGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCGCCTGCTACCCCACCCAGCTAA 1139

 61941477 TTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACT 61941536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACT 1199

 61941537 CCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCC 61941596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCC 1259

 61941597 ACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTG 61941656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTG 1319

 61941657 CTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAA 61941716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAA 1379

 61941717 CACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATAAAGTCTGTTCAC 61941776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATAAAGTCTGTTCAC 1439

 61941777 TATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTG 61941836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTG 1499

 61941837 GGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAA 61941896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAA 1559

 61941897 AATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGA 61941956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1560 AATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGA 1619

 61941957 CTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTAT 61942016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTAT 1679

 61942017 ACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATG 61942076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATG 1739

 61942077 GAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGA 61942136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGA 1799

 61942137 AGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAA 61942196
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACACTTTAGATCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAA 1859

 61942197 TGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGG 61942256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGG 1919

 61942257 TGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAG 61942316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAG 1979

 61942317 TGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGC 61942376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGC 2039

 61942377 GGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCT 61942436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCT 2099

 61942437 ACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGG 61942496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGG 2159

 61942497 GAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATT 61942556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATT 2219

 61942557 GAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAA 61942616
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAA 2279

 61942617 CAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAGTGAGAAAATATTATTTTG 61942676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAGTGAGAAAATATTATTTTG 2339

 61942677 GAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTT----TTTCTTTTTTTTTT-G 61942731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |
     2340 GAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTG 2399

 61942732 AGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCGTACCTCAGTGC 61942791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCGTACCTCAGTGC 2459

 61942792 ATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCT 61942851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCT 2519

 61942852 ACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGA 61942911
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ACAGGCATGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGA 2579

 61942912 GACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCC 61942971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCC 2639

 61942972 CCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAAC 61943031
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CCCTTCAACCTCCCAAAGAATTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAAC 2699

 61943032 TAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGAT 61943091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGAT 2759

 61943092 TTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGA 61943151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGA 2819

 61943152 CTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCT 61943211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCT 2879

 61943212 GAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACC 61943271
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGCGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACC 2939

 61943272 AGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAAT 61943331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAAT 2999

 61943332 CATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAG 61943391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAG 3059

 61943392 CCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTT 61943451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTT 3119

 61943452 ATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCA 61943511
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3120 ATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATCAATGGGCA 3179

 61943512 GATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAG 61943571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAG 3239

 61943572 CTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAAT 61943631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAAT 3299

 61943632 TGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATC 61943691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATC 3359

 61943692 AGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTC 61943751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTC 3419

 61943752 AAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCC 61943811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCC 3479

 61943812 CACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACC 61943871
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3480 CACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACC 3539

 61943872 AACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGT 61943931
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGT 3599

 61943932 TCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAAT 61943991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAAT 3659

 61943992 TTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGC 61944051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGC 3719

 61944052 TCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 61944111
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 3779

 61944112 TGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGG 61944171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGG 3839

 61944172 GTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTT 61944231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 GTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTT 3899

 61944232 GGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACT 61944291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACT 3959

 61944292 TTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCA 61944351
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCA 4019

 61944352 CTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTT 61944411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTT 4079

 61944412 TTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATT 61944471
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4080 TTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACACCACATTAAAAAAATCCATTTATT 4139

 61944472 TGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAG 61944531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAG 4199

 61944532 CATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGA 61944591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGA 4259

 61944592 CCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCA 61944651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 CCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCA 4319

 61944652 AATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGAC 61944711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 AATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGAC 4379

 61944712 CTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGA 61944771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 CTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGA 4439

 61944772 TATATGTAAGGGGTGA 61944787
          ||||||||||||||||
     4440 TATATGTAAGGGGTGA 4455

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 4515

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 4575

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 4635

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 4695

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 4755

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 4815

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 4875

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     4876 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 4933

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 4993

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 5053

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 5113

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 5173

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 5233

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 5293

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 5353

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 5413

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 5473

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 5533

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 5593

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 5653

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 5713

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 5773

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 5833

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 5893

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5894 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 5953

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     5954 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTG-TTTTTTTAGGTTCAGAGGG 6012

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6013 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 6072

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6073 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 6132

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6133 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 6192

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     6193 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 6251

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6252 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 6311

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6312 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 6371

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAA 61947056
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6372 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAA 6422

Alignment time is 7.64665 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5911] =>      5911 nucs 'mol-32-2edb-028396_5911'

Score:        5834
Aligned:      5911        nucs
Identic:      5904 (100%) nucs =>      2142 (100%)      3762 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61944061,61946202] EXCISED REGION [61946204,61949971]
 second seq =>  [       1,    2142] EXCISED REGION [    2144,    5911]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [2143,2143]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [2140,2142] to [2144,2146]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61944061 CCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTAC 61944120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTAC 60

 61944121 AGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCA 61944180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCA 120

 61944181 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCG 61944240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCG 180

 61944241 AAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCC 61944300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCC 240

 61944301 ACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATA 61944360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATA 300

 61944361 ATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGAC 61944420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGAC 360

 61944421 CTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCA 61944480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCA 420

 61944481 ACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATT 61944540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATT 480

 61944541 GTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGC 61944600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGC 540

 61944601 AACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGT 61944660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGT 600

 61944661 TGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAAT 61944720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAAT 660

 61944721 ATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAA 61944780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAA 720

 61944781 GGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGG 61944840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGG 780

 61944841 TAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGT 61944900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGT 840

 61944901 TTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTC 61944960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTC 900

 61944961 CACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTG 61945020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTG 960

 61945021 ATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTT 61945080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTT 1020

 61945081 TTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCT 61945140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCT 1080

 61945141 TTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCA 61945200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCA 1140

 61945201 CAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATG 61945260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATG 1200

 61945261 CTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACG 61945320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACG 1260

 61945321 AGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATA 61945380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATA 1320

 61945381 GTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAA 61945440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAA 1380

 61945441 GTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGC 61945500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGC 1440

 61945501 CAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTG 61945560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTG 1500

 61945561 TCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGAT 61945620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGAT 1560

 61945621 TCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATT 61945680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATT 1620

 61945681 ATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAG 61945740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAG 1680

 61945741 CATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTG 61945800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTG 1740

 61945801 GGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATC 61945860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATC 1800

 61945861 ATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCT 61945920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCT 1860

 61945921 TTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAAC 61945980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAAC 1920

 61945981 TGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGA 61946040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGA 1980

 61946041 ACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTC 61946100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTC 2040

 61946101 GGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAA 61946160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAA 2100

 61946161 TTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 61946202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 2142

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 2203

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 2263

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 2323

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 TTCATTTCCAAATTGGTGATCGTTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 2383

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 2443

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 2503

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2504 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 2563

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 2623

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 2683

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 2743

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 2803

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 2863

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 2923

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 2983

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 3043

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 3103

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 3163

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 3223

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 3283

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 3343

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 3403

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 3463

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 3523

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 61947642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 3583

 61947643 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 61947702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 3643

 61947703 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 61947762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 3703

 61947763 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 61947822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 3763

 61947823 AGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 61947882
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 AGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 3822

 61947883 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 61947942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 3882

 61947943 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 61948002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 3942

 61948003 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 61948062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 4002

 61948063 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 61948122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 4062

 61948123 TTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 61948182
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 TTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 4122

 61948183 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 61948242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 4182

 61948243 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 61948302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 4242

 61948303 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 61948362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 4302

 61948363 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 61948422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 4362

 61948423 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 61948482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 4422

 61948483 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 61948542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 4482

 61948543 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 61948602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 4542

 61948603 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 61948662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 4602

 61948663 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 61948722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 4662

 61948723 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 61948782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 4722

 61948783 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 61948842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 4782

 61948843 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 61948902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 4842

 61948903 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 61948962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 4902

 61948963 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 61949022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 4962

 61949023 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 61949082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 5022

 61949083 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 61949142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 5082

 61949143 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 61949202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 5142

 61949203 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 61949262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 5202

 61949263 GTGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 61949322
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 GCGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 5262

 61949323 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAAT 61949382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAAT 5322

 61949383 TAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGT 61949442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 TAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGT 5382

 61949443 TCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGA 61949502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 TCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGA 5442

 61949503 GAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATA 61949562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 GAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATA 5502

 61949563 GAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCG 61949622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 GAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCG 5562

 61949623 GTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTT 61949682
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 GCGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTT 5622

 61949683 TATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGT 61949742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 TATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGT 5682

 61949743 TTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTT 61949802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 TTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTT 5742

 61949803 GGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTC 61949862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 GGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTC 5802

 61949863 TGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCA 61949922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 TGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCA 5862

 61949923 CTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGA 61949971
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 CTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGA 5911

Alignment time is 7.3418 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4790] =>      4790 nucs 'mol-32-2edb-132983_4790'

Score:        4756
Aligned:      4789        nucs
Identic:      4786 (100%) nucs =>      3385 (100%)      1401 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942818,61946202] EXCISED REGION [61946204,61947606]
 second seq =>  [       1,    3385] EXCISED REGION [    3387,    4790]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [3386,3386]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3786,3786]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [3383,3385] to [3387,3389]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942818 CTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCT 61942877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCT 60

 61942878 AAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGG 61942937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGG 120

 61942938 CTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGA 61942997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGA 180

 61942998 TTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTA 61943057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTA 240

 61943058 TTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCA 61943117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCA 300

 61943118 CGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTG 61943177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTG 360

 61943178 GGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGT 61943237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGT 420

 61943238 TTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTA 61943297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTA 480

 61943298 ATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTA 61943357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTA 540

 61943358 ATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGG 61943417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGG 600

 61943418 ATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATG 61943477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATG 660

 61943478 TAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGAT 61943537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGAT 720

 61943538 AGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGAT 61943597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGAT 780

 61943598 TTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGT 61943657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGT 840

 61943658 TTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTC 61943717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTC 900

 61943718 AAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAA 61943777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAA 960

 61943778 GATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTC 61943837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTC 1020

 61943838 ATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCA 61943897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCA 1080

 61943898 TTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAA 61943957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAA 1140

 61943958 CATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGT 61944017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGT 1200

 61944018 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTT 61944077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTT 1260

 61944078 CAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAG 61944137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAG 1320

 61944138 CCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTC 61944197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTC 1380

 61944198 TCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAG 61944257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAG 1440

 61944258 GCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACA 61944317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACA 1500

 61944318 TGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCAT 61944377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCAT 1560

 61944378 CCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTG 61944437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTG 1620

 61944438 TGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCC 61944497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCC 1680

 61944498 ATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAAC 61944557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAAC 1740

 61944558 ATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTG 61944617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTG 1800

 61944618 TGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTG 61944677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTG 1860

 61944678 AGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGG 61944737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGG 1920

 61944738 CCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAA 61944797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAA 1980

 61944798 CCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCAT 61944857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCAT 2040

 61944858 ATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTA 61944917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTA 2100

 61944918 ATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATAC 61944977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATAC 2160

 61944978 TTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGAT 61945037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGAT 2220

 61945038 CAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACAT 61945097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACAT 2280

 61945098 TATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAAC 61945157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAAC 2340

 61945158 GATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAA 61945217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAA 2400

 61945218 TAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCT 61945277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCT 2460

 61945278 GATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGG 61945337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGG 2520

 61945338 GAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGAT 61945397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGAT 2580

 61945398 GTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATT 61945457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATT 2640

 61945458 TGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGA 61945517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGA 2700

 61945518 CCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAAT 61945577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAAT 2760

 61945578 GTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAAC 61945637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAAC 2820

 61945638 AGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAA 61945697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAA 2880

 61945698 TGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACA 61945757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACA 2940

 61945758 TTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTAT 61945817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTAT 3000

 61945818 TTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTA 61945877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTA 3060

 61945878 GGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGA 61945937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGA 3120

 61945938 GGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAA 61945997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAA 3180

 61945998 GCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAA 61946057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAA 3240

 61946058 CACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCT 61946117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCT 3300

 61946118 GCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTT 61946177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTT 3360

 61946178 CAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 61946202
          |||||||||||||||||||||||||
     3361 CAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 3385

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 3446

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 3506

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 3566

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 3626

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 3686

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 3746

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3747 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 3806

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 3866

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 3926

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 3986

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 4046

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 4106

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 4166

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 4226

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 4286

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 4346

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 4406

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 4466

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4467 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACGTTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 4526

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 4586

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 4646

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 4706

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 4766

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACT 61947606
          ||||||||||||||||||||||||
     4767 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACT 4790

Alignment time is 5.85263 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8659] =>      8659 nucs 'mol-32-2ee6-150778_8659'

Score:        8593
Aligned:      8659        nucs
Identic:      8653 (100%) nucs =>       115 (100%)      8538 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941815,61941929] EXCISED REGION [61941931,61950473]
 second seq =>  [       1,     115] EXCISED REGION [     117,    8659]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61941930,61941930]
 second seq =>         1 nucs [116,116]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [115,116] to [116,117]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61941929,61941929] to [61941931,61941931]
 second seq =>         1 nucs [115,115] to [117,117]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61941815 ATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTG 61941874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTG 60

 61941875 AGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCT 61941929
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCT 115

EXCISED REGION

 61941931 TGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAA 61941990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      117 TGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAA 176

 61941991 CAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTG 61942050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 CAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTG 236

 61942051 AAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCA 61942110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 AAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCA 296

 61942111 CGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGA 61942170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 CGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGA 356

 61942171 TCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGG 61942230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 TCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGG 416

 61942231 ATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAG 61942290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 ATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAG 476

 61942291 CATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCC 61942350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 CATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCC 536

 61942351 CAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCT 61942410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 CAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCT 596

 61942411 GCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGC 61942470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 GCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGC 656

 61942471 GTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGA 61942530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 GTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGA 716

 61942531 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 61942590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 776

 61942591 GAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGT 61942650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 GAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGT 836

 61942651 GCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTT 61942710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 GCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTT 896

 61942711 TTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGC 61942770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGC 956

 61942771 AGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCA 61942830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 AGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCA 1016

 61942831 GCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTT 61942890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTT 1076

 61942891 TTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACT 61942950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACT 1136

 61942951 CTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAA 61943010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAA 1196

 61943011 CTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAG 61943070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 CTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAG 1256

 61943071 GGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGG 61943130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGG 1316

 61943131 TGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTC 61943190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTC 1376

 61943191 AGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGA 61943250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 AGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGA 1436

 61943251 TACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATA 61943310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATA 1496

 61943311 TGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAA 61943370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAA 1556

 61943371 TAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTA 61943430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTA 1616

 61943431 TTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAA 61943490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAA 1676

 61943491 TACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTT 61943550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTT 1736

 61943551 GGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAA 61943610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAA 1796

 61943611 TTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTA 61943670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTA 1856

 61943671 TACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCAT 61943730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCAT 1916

 61943731 TTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATG 61943790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATG 1976

 61943791 TTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATT 61943850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATT 2036

 61943851 GTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCT 61943910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCT 2096

 61943911 CCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTA 61943970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTA 2156

 61943971 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 61944030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 2216

 61944031 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 61944090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 2276

 61944091 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 61944150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 2336

 61944151 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 61944210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 2396

 61944211 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 61944270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 2456

 61944271 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 61944330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 2516

 61944331 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 61944390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 2576

 61944391 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 61944450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 2636

 61944451 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 61944510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 2696

 61944511 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 61944570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 2756

 61944571 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 61944630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 2816

 61944631 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 61944690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 2876

 61944691 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 61944750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 2936

 61944751 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAG 61944810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAG 2996

 61944811 TATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTAT 61944870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTAT 3056

 61944871 TTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCA 61944930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCA 3116

 61944931 CCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCAT 61944990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCAT 3176

 61944991 TCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGG 61945050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGG 3236

 61945051 TCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGAT 61945110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGAT 3296

 61945111 TTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATA 61945170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATA 3356

 61945171 CCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAA 61945230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAA 3416

 61945231 GTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCA 61945290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCA 3476

 61945291 TATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGA 61945350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGA 3536

 61945351 GAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAA 61945410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 GAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAA 3596

 61945411 AGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTC 61945470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTC 3656

 61945471 CCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTG 61945530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTG 3716

 61945531 CTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTT 61945590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTT 3776

 61945591 CCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATAT 61945650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATAT 3836

 61945651 TCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACC 61945710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACC 3896

 61945711 AAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATA 61945770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 AAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATA 3956

 61945771 GACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTT 61945830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTT 4016

 61945831 CTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGG 61945890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGG 4076

 61945891 GTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTT 61945950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTT 4136

 61945951 TTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAA 61946010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAA 4196

 61946011 AAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAA 61946070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 AAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAA 4256

 61946071 TTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTA 61946130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 TTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTA 4316

 61946131 GAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGT 61946190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 GAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGT 4376

 61946191 GTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATG 61946250
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GTGTCTCCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATG 4436

 61946251 ATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCT 61946310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 ATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCT 4496

 61946311 ACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCT 61946370
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 ACTGTCGTTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCT 4556

 61946371 TACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCA 61946430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCA 4616

 61946431 TCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAA 61946490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAA 4676

 61946491 TAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATT 61946550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATT 4736

 61946551 ACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTT 61946609
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     4737 ACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTT 4796

 61946610 TTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGG 61946669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGG 4856

 61946670 GTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGT 61946729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 GTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGT 4916

 61946730 AGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGG 61946789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 AGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGG 4976

 61946790 CCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTT 61946849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 CCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTT 5036

 61946850 GTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATG 61946909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 GTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATG 5096

 61946910 GCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTA 61946969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 GCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTA 5156

 61946970 TTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGG 61947029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 TTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGG 5216

 61947030 TTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTC 61947089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 TTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTC 5276

 61947090 TTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTC 61947149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 TTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTC 5336

 61947150 GAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTG 61947209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 GAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTG 5396

 61947210 AACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCT 61947269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCT 5456

 61947270 GCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGAT 61947329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 GCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGAT 5516

 61947330 TTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGC 61947389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGC 5576

 61947390 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGT 61947449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGT 5636

 61947450 TTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC 61947509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC 5696

 61947510 AGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCC 61947569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 AGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCC 5756

 61947570 AGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCC 61947629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 AGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCC 5816

 61947630 ACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTG 61947689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 ACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTG 5876

 61947690 TTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTT 61947749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 TTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTT 5936

 61947750 CTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCT 61947809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCT 5996

 61947810 CTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCA 61947869
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 CTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCA 6055

 61947870 TCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTT 61947929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 TCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTT 6115

 61947930 TTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTT 61947989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 TTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTT 6175

 61947990 TTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATC 61948049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 TTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATC 6235

 61948050 CCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTC 61948109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 CCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTC 6295

 61948110 TAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTG 61948169
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6296 TAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTG 6355

 61948170 GTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGA 61948229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6356 GTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGA 6415

 61948230 AGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCA 61948289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6416 AGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCA 6475

 61948290 GACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGT 61948349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6476 GACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGT 6535

 61948350 TATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATT 61948409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6536 TATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATT 6595

 61948410 TTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTT 61948469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6596 TTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTT 6655

 61948470 TGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTAC 61948529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6656 TGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTAC 6715

 61948530 CTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGA 61948589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6716 CTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGA 6775

 61948590 TTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATT 61948649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6776 TTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATT 6835

 61948650 TTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCT 61948709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6836 TTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCT 6895

 61948710 TTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTA 61948769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6896 TTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTA 6955

 61948770 GTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGC 61948829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6956 GTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGC 7015

 61948830 TAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCT 61948889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7016 TAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCT 7075

 61948890 GGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTT 61948949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7076 GGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTT 7135

 61948950 ACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTT 61949009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7136 ACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTT 7195

 61949010 TATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGT 61949069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7196 TATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGT 7255

 61949070 TTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAA 61949129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7256 TTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAA 7315

 61949130 TACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTA 61949189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7316 TACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTA 7375

 61949190 TTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTT 61949249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7376 TTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTT 7435

 61949250 TCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGG 61949309
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7436 TCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGG 7495

 61949310 GGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATA 61949369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7496 GGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATA 7555

 61949370 TGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCT 61949429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7556 TGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCT 7615

 61949430 TTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCT 61949489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7616 TTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCT 7675

 61949490 GGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTA 61949549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7676 GGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTA 7735

 61949550 GTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGG 61949609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7736 GTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGG 7795

 61949610 GGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTC 61949669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7796 GGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTC 7855

 61949670 TCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATA 61949729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7856 TCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATA 7915

 61949730 ACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTT 61949789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7916 ACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTT 7975

 61949790 CAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTT 61949849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7976 CAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTT 8035

 61949850 TTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATG 61949909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8036 TTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATG 8095

 61949910 TGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCA 61949969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8096 TGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCA 8155

 61949970 GAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCT 61950029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8156 GAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCT 8215

 61950030 TCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTG 61950089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8216 TCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTG 8275

 61950090 TATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTG 61950149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8276 TATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTG 8335

 61950150 TGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGGGAATTGTTTTATGGCCAATCATGT 61950209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8336 TGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGGGAATTGTTTTATGGCCAATCATGT 8395

 61950210 GGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCT 61950269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8396 GGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCT 8455

 61950270 GGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTTGATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCT 61950329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8456 GGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTTGATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCT 8515

 61950330 GAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGTCTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGA 61950389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8516 GAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGTCTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGA 8575

 61950390 AGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTCTTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTT 61950449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8576 AGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTCTTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTT 8635

 61950450 GTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTG 61950473
          ||||||||||||||||||||||||
     8636 GTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTG 8659

Alignment time is 10.1267 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5264] =>      5264 nucs 'mol-32-2ef1-058056_5264'

Score:        5209
Aligned:      5264        nucs
Identic:      5259 (100%) nucs =>      3380 (100%)      1879 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61944457,61947838] EXCISED REGION [61947841,61949721]
 second seq =>  [       1,    3383] EXCISED REGION [    3384,    5264]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [61947839,61947840]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [61947839,61947851] to [61947841,61947853]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839] to [61947840,61947840]
 second seq =>         0 nucs

 61944457 AAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAA 61944516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAA 60

 61944517 TAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTT 61944576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTT 120

 61944577 TGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACAC 61944636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACAC 180

 61944637 CGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGT 61944696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGT 240

 61944697 ATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGT 61944756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGT 300

 61944757 TTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGA 61944816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGA 360

 61944817 GAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAA 61944876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAA 420

 61944877 TTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATA 61944936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATA 480

 61944937 GTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAAC 61944996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAAC 540

 61944997 AGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATT 61945056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATT 600

 61945057 AAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCA 61945116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCA 660

 61945117 GCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTT 61945176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTT 720

 61945177 GATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAG 61945236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAG 780

 61945237 AGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCC 61945296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCC 840

 61945297 TTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCA 61945356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCA 900

 61945357 ATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGAT 61945416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGAT 960

 61945417 CCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGA 61945476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGA 1020

 61945477 ATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGG 61945536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGG 1080

 61945537 ACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACC 61945596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACC 1140

 61945597 CTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTT 61945656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTT 1200

 61945657 GGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCC 61945716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCC 1260

 61945717 AGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCA 61945776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCA 1320

 61945777 GATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCC 61945836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCC 1380

 61945837 CCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTT 61945896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTT 1440

 61945897 TTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATC 61945956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATC 1500

 61945957 ACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTC 61946016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTC 1560

 61946017 ACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAA 61946076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAA 1620

 61946077 ACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAA 61946136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAA 1680

 61946137 TTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCT 61946196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCT 1740

 61946197 CCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTA 61946256
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTA 1800

 61946257 TTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTC 61946316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTC 1860

 61946317 GTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGG 61946376
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGG 1920

 61946377 AAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTT 61946436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTT 1980

 61946437 TCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAAT 61946496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAAT 2040

 61946497 ACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTA 61946556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTA 2100

 61946557 CTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTT-CTT 61946615
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     2101 CTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTT 2160

 61946616 TCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAAT 61946675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAAT 2220

 61946676 TGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACC 61946735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACC 2280

 61946736 CAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGG 61946795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGG 2340

 61946796 TATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGT 61946855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGT 2400

 61946856 GAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCT 61946915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCT 2460

 61946916 AACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCAC 61946975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCAC 2520

 61946976 AGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATT 61947035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATT 2580

 61947036 CCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGG 61947095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGG 2640

 61947096 GCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGG 61947155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGG 2700

 61947156 TAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAA 61947215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAA 2760

 61947216 TTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCT 61947275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCT 2820

 61947276 GTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCAT 61947335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCAT 2880

 61947336 TTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCT 61947395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCT 2940

 61947396 TCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTT 61947455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTT 3000

 61947456 GTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 61947515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 3060

 61947516 ACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTT 61947575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTT 3120

 61947576 AAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTG 61947635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTG 3180

 61947636 CCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAG 61947695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAG 3240

 61947696 TTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCA 61947755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCA 3300

 61947756 TTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAG 61947815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAG 3360

 61947816 TTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA 61947838
          |||||||||||||||||||||||
     3361 TTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA 3383

EXCISED REGION

 61947841 TTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTAT 61947900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 TTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTAT 3443

 61947901 GTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGT 61947960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 GTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGT 3503

 61947961 TAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTC 61948020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 TAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTC 3563

 61948021 AATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTT 61948080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 AATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTT 3623

 61948081 TTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTT 61948140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 TTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTT 3683

 61948141 GTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAG 61948200
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 ATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAG 3743

 61948201 ACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTC 61948260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 ACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTC 3803

 61948261 TTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGA 61948320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 TTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGA 3863

 61948321 ATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAAT 61948380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 ATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAAT 3923

 61948381 CTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAAT 61948440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 CTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAAT 3983

 61948441 ATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTT 61948500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 ATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTT 4043

 61948501 TTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTT 61948560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 TTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTT 4103

 61948561 ATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGAC 61948620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 ATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGAC 4163

 61948621 GATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTT 61948680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 GATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTT 4223

 61948681 CCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTA 61948740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTA 4283

 61948741 CAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCA 61948800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 CAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCA 4343

 61948801 GTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGT 61948860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 GTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGT 4403

 61948861 GGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGC 61948920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 GGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGC 4463

 61948921 CCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTT 61948980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 CCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTT 4523

 61948981 CCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGT 61949040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 CCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGT 4583

 61949041 CATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACA 61949100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 CATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACA 4643

 61949101 TATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTT 61949160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 TATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTT 4703

 61949161 GATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATC 61949220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 GATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATC 4763

 61949221 AGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGG 61949280
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4764 AGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGG 4823

 61949281 AATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAAT 61949340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 AATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAAT 4883

 61949341 AGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCT 61949400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 AGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCT 4943

 61949401 TTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTAT 61949460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 TTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTAT 5003

 61949461 TGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAG 61949520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 TGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAG 5063

 61949521 GAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTC 61949580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 GAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTC 5123

 61949581 TGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGT 61949640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 TGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGT 5183

 61949641 CATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAG 61949700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 CATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAG 5243

 61949701 TCTATCAATCTTATTTATTCT 61949721
          |||||||||||||||||||||
     5244 TCTATCAATCTTATTTATTCT 5264

Alignment time is 6.58798 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7623] =>      7623 nucs 'mol-32-2f12-014292_7623'

Score:        7568
Aligned:      7623        nucs
Identic:      7618 (100%) nucs =>      6314 (100%)      1304 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941522,61947838] EXCISED REGION [61947841,61949145]
 second seq =>  [       1,    6318] EXCISED REGION [    6319,    7623]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [61947839,61947840]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [61947839,61947851] to [61947841,61947853]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839] to [61947840,61947840]
 second seq =>         0 nucs

 61941522 GGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGA 61941581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGA 60

 61941582 TTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTCTAT 61941641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTCTAT 120

 61941642 TGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAGCCC 61941701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAGCCC 180

 61941702 CACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCAC 61941761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCAC 240

 61941762 ATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGC 61941821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGC 300

 61941822 CTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTT 61941881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTT 360

 61941882 GCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTGTTGAATAGA 61941941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      361 GCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTGTTGAATAGA 420

 61941942 ATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACAATAAATGGA 61942001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACAATAAATGGA 480

 61942002 ATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAATTCC 61942061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAATTCC 540

 61942062 AAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAAAAAG 61942121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAAAAAG 600

 61942122 TGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATCTGGGTTATG 61942181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATCTGGGTTATG 660

 61942182 GATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGAAGGG 61942241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGAAGGG 720

 61942242 TCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATGAACA 61942301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATGAACA 780

 61942302 GCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAG 61942361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAG 840

 61942362 GAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAATATGG 61942421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAATATGG 900

 61942422 TAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTA 61942481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTA 960

 61942482 ATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAGGTTG 61942541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAGGTTG 1020

 61942542 CAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTC 61942601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTC 1080

 61942602 TGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAGTGA 61942661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAGTGA 1140

 61942662 GAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTTTTCT 61942721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTTTTCT 1200

 61942722 TTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCGT 61942781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCGT 1260

 61942782 ACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGT 61942841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGT 1320

 61942842 AGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTG 61942901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTG 1380

 61942902 TTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAA 61942961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAA 1440

 61942962 GCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCT 61943021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCT 1500

 61943022 GGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACA 61943081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACA 1560

 61943082 GGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTG 61943141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTG 1620

 61943142 AAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAG 61943201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAG 1680

 61943202 CAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGA 61943261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGA 1740

 61943262 CCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAAT 61943321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAAT 1800

 61943322 TTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGG 61943381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGG 1860

 61943382 CTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATG 61943441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATG 1920

 61943442 AGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACA 61943501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACA 1980

 61943502 TAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAA 61943561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAA 2040

 61943562 TTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTT 61943621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTT 2100

 61943622 AATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATA 61943681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATA 2160

 61943682 ATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGT 61943741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGT 2220

 61943742 GAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAAC 61943801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAAC 2280

 61943802 TACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTA 61943861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTA 2340

 61943862 CCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGG 61943921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGG 2400

 61943922 TAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTT 61943981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTT 2460

 61943982 ATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGG 61944041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGG 2520

 61944042 CAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 61944101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT 2580

 61944102 CCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAG 61944161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAG 2640

 61944162 TAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATC 61944221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATC 2700

 61944222 CACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAG 61944281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAG 2760

 61944282 ATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTG 61944341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTG 2820

 61944342 GCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTAT 61944401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTAT 2880

 61944402 TTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAA 61944461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAA 2940

 61944462 TCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTT 61944521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTT 3000

 61944522 CTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCAT 61944581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCAT 3060

 61944582 ACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTT 61944641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTT 3120

 61944642 TTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATG 61944701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATG 3180

 61944702 GAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTG 61944761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTG 3240

 61944762 CAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGA 61944821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGA 3300

 61944822 ATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTT 61944881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTT 3360

 61944882 TGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGG 61944941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGG 3420

 61944942 TAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTA 61945001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTA 3480

 61945002 TGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTC 61945061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTC 3540

 61945062 TTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCAC 61945121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCAC 3600

 61945122 TGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATAT 61945181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATAT 3660

 61945182 GGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATT 61945241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATT 3720

 61945242 TCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTG 61945301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTG 3780

 61945302 TCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTG 61945361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTG 3840

 61945362 ACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTT 61945421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTT 3900

 61945422 AAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATC 61945481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATC 3960

 61945482 CTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGG 61945541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGG 4020

 61945542 AGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCT 61945601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCT 4080

 61945602 ATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACT 61945661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACT 4140

 61945662 TGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATT 61945721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATT 4200

 61945722 CTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTT 61945781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTT 4260

 61945782 AGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTG 61945841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTG 4320

 61945842 TTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCT 61945901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCT 4380

 61945902 TTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTT 61945961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTT 4440

 61945962 ATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAG 61946021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAG 4500

 61946022 TTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAA 61946081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAA 4560

 61946082 GCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAG 61946141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAG 4620

 61946142 AATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATT 61946201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATT 4680

 61946202 TGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTT 61946261
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTT 4740

 61946262 AAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTAC 61946321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTAC 4800

 61946322 TATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGT 61946381
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGT 4860

 61946382 GATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATT 61946441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATT 4920

 61946442 ATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAA 61946501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAA 4980

 61946502 ATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCC 61946561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCC 5040

 61946562 TAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTT-CTTTCCAA 61946620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     5041 TAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAA 5100

 61946621 CTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCAT 61946680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCAT 5160

 61946681 GGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATA 61946740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATA 5220

 61946741 GGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCT 61946800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCT 5280

 61946801 CTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAA 61946860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAA 5340

 61946861 CATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTT 61946920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTT 5400

 61946921 CATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCT 61946980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCT 5460

 61946981 ATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGG 61947040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGG 5520

 61947041 CCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGA 61947100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGA 5580

 61947101 ATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTT 61947160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTT 5640

 61947161 CTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTAC 61947220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTAC 5700

 61947221 ATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAG 61947280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAG 5760

 61947281 TAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTC 61947340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTC 5820

 61947341 TAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTT 61947400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTT 5880

 61947401 TGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTG 61947460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTG 5940

 61947461 TTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGT 61947520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGT 6000

 61947521 CATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCG 61947580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCG 6060

 61947581 ATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGG 61947640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGG 6120

 61947641 CCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCT 61947700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 CCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCT 6180

 61947701 TTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTG 61947760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTG 6240

 61947761 TAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAA 61947820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAA 6300

 61947821 CTAGGTCCCATGTGTCAA 61947838
          ||||||||||||||||||
     6301 CTAGGTCCCATGTGTCAA 6318

EXCISED REGION

 61947841 TTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTAT 61947900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 TTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTAT 6378

 61947901 GTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGT 61947960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 GTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGT 6438

 61947961 TAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTC 61948020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 TAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTC 6498

 61948021 AATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTT 61948080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 AATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTT 6558

 61948081 TTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTT 61948140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 TTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTT 6618

 61948141 GTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAG 61948200
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 ATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAG 6678

 61948201 ACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTC 61948260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 ACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTC 6738

 61948261 TTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGA 61948320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 TTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGA 6798

 61948321 ATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAAT 61948380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 ATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAAT 6858

 61948381 CTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAAT 61948440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 CTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAAT 6918

 61948441 ATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTT 61948500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 ATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTT 6978

 61948501 TTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTT 61948560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 TTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTT 7038

 61948561 ATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGAC 61948620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 ATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGAC 7098

 61948621 GATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTT 61948680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 GATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTT 7158

 61948681 CCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTA 61948740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 CCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTA 7218

 61948741 CAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCA 61948800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 CAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCA 7278

 61948801 GTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGT 61948860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 GTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGT 7338

 61948861 GGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGC 61948920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 GGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGC 7398

 61948921 CCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTT 61948980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 CCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTT 7458

 61948981 CCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGT 61949040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 CCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGT 7518

 61949041 CATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACA 61949100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 CATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACA 7578

 61949101 TATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATG 61949145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 TATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATG 7623

Alignment time is 9.29497 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6184] =>      6184 nucs 'mol-32-2f1d-006085_6184'

Score:        6118
Aligned:      6184        nucs
Identic:      6178 (100%) nucs =>        87 (100%)      6091 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61944016,61944102] EXCISED REGION [61944104,61950199]
 second seq =>  [       1,      87] EXCISED REGION [      89,    6184]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61944103,61944103]
 second seq =>         1 nucs [88,88]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [61944102,61944103] to [61944103,61944104]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61944102,61944102] to [61944104,61944104]
 second seq =>         1 nucs [87,87] to [89,89]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61944016 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGG 61944075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGG 60

 61944076 TTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 61944102
          |||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 87

EXCISED REGION

 61944104 CGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTA 61944163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       89 CGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTA 148

 61944164 GAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCA 61944223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      149 GAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCA 208

 61944224 CCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGAT 61944283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      209 CCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGAT 268

 61944284 CAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGC 61944343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      269 CAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGC 328

 61944344 TTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTT 61944403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      329 TTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTT 388

 61944404 CATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATC 61944463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      389 CATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATC 448

 61944464 CATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCT 61944523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      449 CATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCT 508

 61944524 GCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATAC 61944583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      509 GCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATAC 568

 61944584 AAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTT 61944643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      569 AAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTT 628

 61944644 TTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGA 61944703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      629 TTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGA 688

 61944704 GGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCA 61944763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      689 GGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCA 748

 61944764 GTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAAT 61944823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      749 GTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAAT 808

 61944824 GATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTG 61944883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      809 GATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTG 868

 61944884 AGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTA 61944943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 AGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTA 928

 61944944 AAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATG 61945003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      929 AAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATG 988

 61945004 ACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTT 61945063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      989 ACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTT 1048

 61945064 AGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTG 61945123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 AGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTG 1108

 61945124 CTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGG 61945183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 CTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGG 1168

 61945184 AAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTC 61945243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 AAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTC 1228

 61945244 TACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTC 61945303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTC 1288

 61945304 TTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGAC 61945363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 TTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGAC 1348

 61945364 CACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAA 61945423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 CACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAA 1408

 61945424 AAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCT 61945483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 AAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCT 1468

 61945484 TGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAG 61945543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 TGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAG 1528

 61945544 TCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTAT 61945603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTAT 1588

 61945604 GTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTG 61945663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 GTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTG 1648

 61945664 ACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCT 61945723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 ACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCT 1708

 61945724 GAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAG 61945783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 GAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAG 1768

 61945784 TTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTT 61945843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 TTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTT 1828

 61945844 GTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTT 61945903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 GTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTT 1888

 61945904 ACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTAT 61945963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 ACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTAT 1948

 61945964 TTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTT 61946023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 TTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTT 2008

 61946024 GGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGC 61946083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 GGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGC 2068

 61946084 ATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAA 61946143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 ATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAA 2128

 61946144 TAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTG 61946203
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2129 TAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTA 2188

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 2248

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 2308

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 2368

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 2428

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 2488

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 2548

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2549 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 2608

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 2668

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 2728

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 2788

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 2848

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 2908

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 2968

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 3028

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 3088

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 3148

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 3208

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 3268

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 3328

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 3388

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 3448

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 3508

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 3568

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 61947642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 3628

 61947643 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 61947702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 3688

 61947703 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 61947762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 3748

 61947763 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 61947822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 3808

 61947823 AGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 61947882
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 AGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 3867

 61947883 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 61947942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 3927

 61947943 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 61948002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 3987

 61948003 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 61948062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 4047

 61948063 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 61948122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 4107

 61948123 TTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 61948182
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 4167

 61948183 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 61948242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 4227

 61948243 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 61948302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 4287

 61948303 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 61948362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 4347

 61948363 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 61948422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 4407

 61948423 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 61948482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 4467

 61948483 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 61948542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 4527

 61948543 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 61948602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 4587

 61948603 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 61948662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 4647

 61948663 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 61948722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 4707

 61948723 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 61948782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 4767

 61948783 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 61948842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 4827

 61948843 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 61948902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 4887

 61948903 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 61948962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 4947

 61948963 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 61949022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 5007

 61949023 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 61949082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 5067

 61949083 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 61949142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 5127

 61949143 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 61949202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 5187

 61949203 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 61949262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 5247

 61949263 GTGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 61949322
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 GCGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 5307

 61949323 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAAT 61949382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAAT 5367

 61949383 TAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGT 61949442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 TAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGT 5427

 61949443 TCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGA 61949502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 TCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGA 5487

 61949503 GAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATA 61949562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 GAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATA 5547

 61949563 GAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCG 61949622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 GAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCG 5607

 61949623 GTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTT 61949682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 GTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTT 5667

 61949683 TATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGT 61949742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 TATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGT 5727

 61949743 TTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTT 61949802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 TTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTT 5787

 61949803 GGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTC 61949862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 GGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTC 5847

 61949863 TGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCA 61949922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 TGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCA 5907

 61949923 CTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTAT 61949982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 CTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTAT 5967

 61949983 GTTTTATCCATTTTCACTAGTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTT 61950042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 GTTTTATCCATTTTCACTAGTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTT 6027

 61950043 TACCCAAAAGTCATTCAGGAGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGA 61950102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6028 TACCCAAAAGTCATTCAGGAGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGA 6087

 61950103 GATCTTAGTGTTGATTTCTATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGAT 61950162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6088 GATCTTAGTGTTGATTTCTATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGAT 6147

 61950163 TTCACTTGGTTTGAATTTGCTGGGAATTGTTTTATGG 61950199
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6148 TTCACTTGGTTTGAATTTGCTGGGAATTGTTTTATGG 6184

Alignment time is 7.45361 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4361] =>      4361 nucs 'mol-32-2f1d-082701_4361'

Score:        4164
Aligned:      4364        nucs
Identic:      4345 (100%) nucs =>      1941 ( 99%)      2404 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942836,61944787] EXCISED REGION [61945086,61947497]
 second seq =>  [       1,    1952] EXCISED REGION [    1953,    4361]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942836 CTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTT 61942895
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGAGTAGATGGGCCTACAGGCATGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTT 60

 61942896 TGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGG 61942955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGG 120

 61942956 GCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACT 61943015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      121 GCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAATTGGGATTACAGGCGTGAACTACT 180

 61943016 GCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTAT 61943075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTAT 240

 61943076 GACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAAT 61943135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAAT 300

 61943136 AAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAAC 61943195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAAC 360

 61943196 TTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACAT 61943255
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      361 TTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGCGTTTGTGACATGTGATACAT 420

 61943256 TGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTAT 61943315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTAT 480

 61943316 TTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGC 61943375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGC 540

 61943376 TGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCT 61943435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCT 600

 61943436 AAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTT 61943495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTT 660

 61943496 GTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTC 61943555
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTACATCAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTC 720

 61943556 TCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATT 61943615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATT 780

 61943616 ATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACAT 61943675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACAT 840

 61943676 TGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTT 61943735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTT 900

 61943736 TGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATT 61943795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATT 960

 61943796 ATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAAC 61943855
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      961 ATTAACTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAATTGTAAC 1020

 61943856 TTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGT 61943915
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGT 1080

 61943916 ATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTAT 61943975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTAT 1140

 61943976 TTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCA 61944035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCA 1200

 61944036 GTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCT 61944095
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCT 1260

 61944096 CAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTAT 61944155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTAT 1320

 61944156 TTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAA 61944215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAA 1380

 61944216 GTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCC 61944275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCC 1440

 61944276 GGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTG 61944335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTATCTACTG 1500

 61944336 TGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGA 61944395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGA 1560

 61944396 CAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTA 61944455
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1561 CAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACACCACATTA 1620

 61944456 AAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAA 61944515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAA 1680

 61944516 ATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCT 61944575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCT 1740

 61944576 TTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACA 61944635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACA 1800

 61944636 CCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTG 61944695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTG 1860

 61944696 TATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAG 61944755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAG 1920

 61944756 TTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 1952

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 2012

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 2072

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 2132

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 2192

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 2252

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 2312

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 2372

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     2373 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 2430

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 2490

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 2550

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 2610

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 2670

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 2730

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 2790

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 2850

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 2910

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 2970

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 3030

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 3090

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 3150

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 3210

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 3270

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 3330

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 3390

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3391 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 3450

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 3510

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 3570

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 3630

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 3690

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     3691 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 3749

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 3809

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 3869

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 3929

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 3989

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 4049

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 4109

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 4169

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 4229

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 61947425
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATATCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 4289

 61947426 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 61947485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 4349

 61947486 GCCCTGTTGCCC 61947497
          ||||||||||||
     4350 GCCCTGTTGCCC 4361

Alignment time is 5.32359 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6873] =>      6873 nucs 'mol-32-2f3e-001604_6873'

Score:        6786
Aligned:      6863        nucs
Identic:      6856 (100%) nucs =>      1156 (100%)      5700 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61940107,61941264] EXCISED REGION [61941273,61946976]
 second seq =>  [       8,    1164] EXCISED REGION [    1169,    6873]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [61941265,61941272]
 second seq =>         4 nucs [1165,1168]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [1154,1166] to [1158,1170]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61940107 TCACAGTTATCTGTCAGTCAAGCACCTGACCGTAATGGAAGTCAACAAATAAAACGCATC 61940166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 TCACAGTTATCTGTCAGTCAAGCACCTGACCGTAATGGAAGTCAACAAATAAAACGCATC 67

 61940167 ACTTGAGACCGGATAAAGAACACAGGATGAGCATGAGTTTAATCCTTGTCCATCCTCTTT 61940226
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 ACTTGAGACTGGATAAAGAACACAGGATGAGCATGAGTTTAATCCTTGTCCATCCTCTTT 127

 61940227 AGAAATCTGAAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGGCAAACTCTA 61940286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 AGAAATCTGAAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGGCAAACTCTA 187

 61940287 CAGTATAGTGGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGCTTTTCTGAT 61940346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 CAGTATAGTGGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGCTTTTCTGAT 247

 61940347 GGATGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTC 61940406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 GGATGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTC 307

 61940407 AAACATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATT 61940466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 AAACATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATT 367

 61940467 AGGTTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAA 61940526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 AGGTTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAA 427

 61940527 ATACACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATA 61940586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 ATACACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATA 487

 61940587 TGTTTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGA 61940646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 TGTTTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGA 547

 61940647 AGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAG 61940706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 AGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAG 607

 61940707 GATCCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTC 61940766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 GATCCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTC 667

 61940767 AGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAAAGCCATCAACTCA 61940826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      668 AGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAA-GCCATCAACTCA 726

 61940827 TTATGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGA 61940886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 TTATGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGA 786

 61940887 TTTTCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTG 61940946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 TTTTCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTG 846

 61940947 GTCTCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAG 61941006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 GTCTCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAG 906

 61941007 TCTCTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCC 61941066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 TCTCTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCC 966

 61941067 AGCACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCG 61941126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 AGCACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCG 1026

 61941127 CTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGA 61941186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 CTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGA 1086

 61941187 GATGTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGA 61941246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GATGTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGA 1146

 61941247 GACTCCTTGACTGACTGA 61941264
          ||||||||||||||||||
     1147 GACTCCTTGACTGACTGA 1164

EXCISED REGION

 61941273 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 61941332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 1228

 61941333 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 61941392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 1288

 61941393 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 61941452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 1348

 61941453 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 61941512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 1408

 61941513 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 61941572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 1468

 61941573 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 61941632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 1528

 61941633 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 61941692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 1588

 61941693 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 61941752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 1648

 61941753 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 61941812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 1708

 61941813 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 61941872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 1768

 61941873 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTG 61941932
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1769 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTG 1828

 61941933 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 61941992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 1888

 61941993 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 61942052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 1948

 61942053 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 61942112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 2008

 61942113 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 61942172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 2068

 61942173 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 61942232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 2128

 61942233 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 61942292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 2188

 61942293 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 61942352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 2248

 61942353 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 61942412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 2308

 61942413 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 61942472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 2368

 61942473 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 61942532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 2428

 61942533 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 61942592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 2488

 61942593 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 61942652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 2548

 61942653 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 61942712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 2608

 61942713 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 61942772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 2668

 61942773 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 61942832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 2728

 61942833 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 61942892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 2788

 61942893 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 61942952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 2848

 61942953 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 61943012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 2908

 61943013 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 61943072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 2968

 61943073 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 61943132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 3028

 61943133 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 61943192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 3088

 61943193 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 61943252
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 AACTTGCAGAAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 3148

 61943253 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 61943312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 3208

 61943313 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 61943372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 3268

 61943373 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 61943432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 3328

 61943433 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 61943492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 3388

 61943493 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 61943552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 3448

 61943553 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 61943612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 3508

 61943613 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 61943672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 3568

 61943673 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 61943732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 3628

 61943733 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 61943792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 3688

 61943793 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 61943852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 3748

 61943853 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 61943912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 3808

 61943913 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 61943972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 3868

 61943973 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 61944032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 3928

 61944033 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 61944092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 3988

 61944093 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 61944152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 4048

 61944153 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 61944212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 4108

 61944213 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 61944272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 4168

 61944273 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 61944332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 4228

 61944333 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 61944392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 4288

 61944393 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 61944452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 4348

 61944453 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 61944512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 4408

 61944513 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 61944572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 4468

 61944573 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 61944632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 4528

 61944633 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 61944692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 4588

 61944693 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 61944752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 4648

 61944753 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 61944812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 4708

 61944813 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 61944872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 4768

 61944873 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 61944932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 4828

 61944933 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 61944992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 4888

 61944993 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 61945052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 4948

 61945053 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 61945112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 5008

 61945113 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 61945172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 5068

 61945173 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGT 61945232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGT 5128

 61945233 CTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATA 61945292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 CTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATA 5188

 61945293 TGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGA 61945352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 TGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGA 5248

 61945353 ACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAG 61945412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 ACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAG 5308

 61945413 TGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCC 61945472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5309 TGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCC 5368

 61945473 TAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCT 61945532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5369 TAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCT 5428

 61945533 GAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCC 61945592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5429 GAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCC 5488

 61945593 GACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTC 61945652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5489 GACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTC 5548

 61945653 ACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAA 61945712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 ACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAA 5608

 61945713 AGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGA 61945772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5609 AGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGA 5668

 61945773 CTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCT 61945832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5669 CTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCT 5728

 61945833 CTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGT 61945892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 CTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGT 5788

 61945893 ACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTT 61945952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 ACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTT 5848

 61945953 TATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAA 61946012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 TATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAA 5908

 61946013 ACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATT 61946072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 ACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATT 5968

 61946073 CAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGA 61946132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 CAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGA 6028

 61946133 ATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGT 61946192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6029 ATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGT 6088

 61946193 GTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGAT 61946252
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6089 GTCTCCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGAT 6148

 61946253 TTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTAC 61946312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6149 TTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTAC 6208

 61946313 TGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTA 61946372
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6209 TGTCGTTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTA 6268

 61946373 CAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATC 61946432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6269 CAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATC 6328

 61946433 AGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATA 61946492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6329 AGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATA 6388

 61946493 AAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTAC 61946552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6389 AAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTAC 6448

 61946553 TGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTT 61946611
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     6449 TGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTT 6508

 61946612 TCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGT 61946671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6509 TCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGT 6568

 61946672 AAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAG 61946731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6569 AAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAG 6628

 61946732 TACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCC 61946791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6629 TACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCC 6688

 61946792 CTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGT 61946851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6689 CTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGT 6748

 61946852 AAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGC 61946911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6749 AAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGC 6808

 61946912 CTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATT 61946971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6809 CTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATT 6868

 61946972 CCACA 61946976
          |||||
     6869 CCACA 6873

Alignment time is 8.14162 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6214] =>      6214 nucs 'mol-32-2fb7-069181_6214'

Score:        6007
Aligned:      6218        nucs
Identic:      6198 (100%) nucs =>       768 ( 99%)      5430 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61944016,61944787] EXCISED REGION [61945086,61950531]
 second seq =>  [       1,     772] EXCISED REGION [     773,    6214]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61944016 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGG 61944075
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
        1 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGG 60

 61944076 TTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCA 61944135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCA 120

 61944136 AGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 61944195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 180

 61944196 TCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTAC 61944255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTAC 240

 61944256 AGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAA 61944315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      241 AGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAA 300

 61944316 CATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTC 61944375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTC 360

 61944376 ATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTT 61944435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      361 ATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTT 420

 61944436 TGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATT 61944495
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGTACATACACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATT 480

 61944496 CCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGA 61944555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGA 540

 61944556 ACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAAC 61944615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAAC 600

 61944616 TGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTT 61944675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTT 660

 61944676 TGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAG 61944735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAG 720

 61944736 GGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 772

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 832

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 892

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 952

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 1012

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 1072

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 1132

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 1192

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     1193 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 1250

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 1310

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 1370

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 1430

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 1490

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 1550

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 1610

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 1670

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 1730

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 1790

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 1850

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 1910

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 1970

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 2030

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 2090

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 2150

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 2210

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2211 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 2270

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 2330

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 2390

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 2450

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 2510

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2511 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 2569

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 2629

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 2689

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 2749

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 2809

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 2869

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 2929

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 2989

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 3049

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 61947425
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATATCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 3109

 61947426 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 61947485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 3169

 61947486 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 61947545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 3229

 61947546 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 61947605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 3289

 61947606 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 61947665
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 CGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 3349

 61947666 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 61947725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 3409

 61947726 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 61947785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 3469

 61947786 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTT 61947845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     3470 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTT 3528

 61947846 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 61947905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 3588

 61947906 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 61947965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 3648

 61947966 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 61948025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 3708

 61948026 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 61948085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 3768

 61948086 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTC 61948145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
     3769 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGCGTGACTTTATTTC 3828

 61948146 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 61948205
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGTTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 3888

 61948206 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 61948265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 3948

 61948266 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 61948325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 4008

 61948326 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 61948385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 4068

 61948386 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 61948445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 4128

 61948446 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 61948505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 4188

 61948506 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 61948565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 4248

 61948566 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 61948625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 4308

 61948626 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 61948685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 4368

 61948686 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 61948745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 4428

 61948746 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 61948805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 4488

 61948806 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTGGTGA 61948865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4489 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGCGGTGA 4548

 61948866 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 61948925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 4608

 61948926 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 61948985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 4668

 61948986 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 61949045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 4728

 61949046 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 61949105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 4788

 61949106 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 61949165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 4848

 61949166 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 61949225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 4908

 61949226 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 61949285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4909 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 4968

 61949286 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 61949345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 5028

 61949346 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 61949405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 5088

 61949406 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 61949465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 5148

 61949466 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 61949525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 5208

 61949526 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 61949585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 5268

 61949586 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 61949645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 5328

 61949646 CCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 61949705
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 CCAATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 5388

 61949706 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 61949765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 5448

 61949766 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 61949825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 5508

 61949826 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 61949885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 5568

 61949886 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 61949945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 5628

 61949946 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 61950005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 5688

 61950006 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 61950065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 5748

 61950066 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 61950125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 5808

 61950126 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 61950185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 5868

 61950186 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 61950245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5869 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 5928

 61950246 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 61950305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 5988

 61950306 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 61950365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 6048

 61950366 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 61950425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6049 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 6108

 61950426 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 61950485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 6168

 61950486 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTA 61950531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTA 6214

Alignment time is 7.06567 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8000] =>      8000 nucs 'mol-32-2fe3-358815_8000'

Score:        7849
Aligned:      8000        nucs
Identic:      7983 (100%) nucs =>      3281 (100%)      4702 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61937972,61941264] EXCISED REGION [61941273,61945976]
 second seq =>  [       1,    3292] EXCISED REGION [    3297,    8000]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [61941265,61941272]
 second seq =>         4 nucs [3293,3296]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [3282,3294] to [3286,3298]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61937972 GTGTGGGATAGTGTCCCCTGAGCCACCTTCTTTCTCAAATTGCTGTTATATTGTCTTAAT 61938031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGGGATAGTGTCCCCTGAGCCACCTTCTTTCTCAAATTGCTGTTATATTGTCTTAAT 60

 61938032 CCACAAGGAAGGTCTTGTGTGAACATATGTATACATCCAGAGTGTTCTGGTAGAATTATA 61938091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACAAGGAAGGTCTTGTGTGAACATATGTATACATCCAGAGTGTTCTGGTAGAATTATA 120

 61938092 GCTCCCCTTGCACTAAGGGGTGCCCGGGGCACTTACATGATGTGTACTTGTTGTTAACCA 61938151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||
      121 GCTCCCCTTGCACTAAGGGGTGCCCGGGGCACTTACATGATGTGTACTTGTT---AACCA 177

 61938152 CCGCTCCCCAGGGGCTGGATCTTATCCCCTGTGCATAATCAGAAGCAGTTTCCCTAGTCT 61938211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 CCGCTCCCCAGGGGCTGGATCTTATCCCCTGTGCATAATCAGAAGCAGTTTCCCTAGTCT 237

 61938212 TGGTTCACCTGGTTGCAGTTCTCACCCTCTTCCTAGGAGTCCACTCTGCTGAGTTCCCAT 61938271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 TGGTTCACCTGGTTGCAGTTCTCACCCTCTTCCTAGGAGTCCACTCTGCTGAGTTCCCAT 297

 61938272 CAGGTCTTCTTCTGCACTGACTCTATGCCAGGTAGCTGGAGGTTAGACTGTTCCTTCAGC 61938331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 CAGGTCTTCTTCTGCACTGACTCTATGCCAGGTAGCTGGAGGTTAGACTGTTCCTTCAGC 357

 61938332 CTAGGTACTTTCTTTCTTCACCTCTTCATCATGTCCTCCAAAAAGCCTCCTATGTATAGG 61938391
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 CTAGGTACTTTCTTTCTTTACCTCTTCATCATGTCCTCCAAAAAGCCTCCTATGTATAGG 417

 61938392 TTGGTTTACGTGGCCATTTTTTTTT---TCTTTCTTTCTTTCTTTTGTTTTGTTTTGTTT 61938448
          |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TTGGTTTACGTGGCCATTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTGTTTTGTTTTGTTT 477

 61938449 TTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACGGGGTCTGGCTCTATCACCCAGGCTGGAGTGCAGT 61938508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACGGGGTCTGGCTCTATCACCCAGGCTGGAGTGCAGT 537

 61938509 GGTGCGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGCTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA 61938568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      538 GGTGCGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGCTCAAGCGATTCCCCTGCCTCA 597

 61938569 GCCTCCAGAGTAGCTGGGATTATAGGCGCGCGCCATCAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTT 61938628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 GCCTCCAGAGTAGCTGGGATTATAGGCGCGCGCCATCAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTT 657

 61938629 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGTG 61938688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 TTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGTG 717

 61938689 ATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACAGCGCCCGGC 61938748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      718 ATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGTGTGAGCCACAGCGCCCGGC 777

 61938749 CCGTTTTATTCTTTTAATTACCAAAGGCTGGCCTGTAGTAGGAGATGTCTGATGAGTTTT 61938808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 CCGTTTTATTCTTTTAATTACCAAAGGCTGGCCTGTAGTAGGAGATGTCTGATGAGTTTT 837

 61938809 TCTTAAATTGAACGCCAACAATAAGGTTTGAGCCTCAAGGTGGCGCCATTTCATGTAGAG 61938868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCTTAAATTGAACGCCAACAATAAGGTTTGAGCCTCAAGGTGGCGCCATTTCATGTAGAG 897

 61938869 TCTGGAATCTCTGAACACTTGAAATAGACCATCCGTCACTAGCAGGAGCCCTTGCGTTCC 61938928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TCTGGAATCTCTGAACACTTGAAATAGACCATCCGTCACTAGCAGGAGCCCTTGCGTTCC 957

 61938929 GTTCCTGGATGCCGTTCTCAAAGTGAACACAATGAAATACAAGTTTCACTCGTGTTTGCA 61938988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GTTCCTGGATGCCGTTCTCAAAGTGAACACAATGAAATACAAGTTTCACTCGTGTTTGCA 1017

 61938989 TAAGGTCAAAACAACTGACAGGGTCGTTTCTTCTTGAGAGGACTGTGCGTTATCCTAGCA 61939048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TAAGGTCAAAACAACTGACAGGGTCGTTTCTTCTTGAGAGGACTGTGCGTTATCCTAGCA 1077

 61939049 GGTGTATATACTATTTATCTCGTCAGATTTCTTACCAAGGAGACAGAAGCTGAGAAGAAA 61939108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GGTGTATATACTATTTATCTCGTCAGATTTCTTACCAAGGAGACAGAAGCTGAGAAGAAA 1137

 61939109 TGAGATTAGGGGTTGTCTATCAAGGACAGAGGGAAAGAAGGGGGTAGCTGCGACTGTGTT 61939168
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TGAGATTAGGTGTTGTCTATCAAGGACAGAGGGAAAGAAGGGGGTAGCTGCGACTGTGTT 1197

 61939169 TGTGGTGTGTGGGATGAAAAGGAAGATTTGAAGGATAAAACTAGAAGGGAAGTGAAGATG 61939228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TGTGGTGTGTGGGATGAAAAGGAAGATTTGAAGGATAAAACTAGAAGGGAAGTGAAGATG 1257

 61939229 ACTCCAAAGTGCCTTATTTGGAGCGGGATGAGACTGACTGGATGGTTCATGTTAAAGGGA 61939288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ACTCCAAAGTGCCTTATTTGGAGCGGGATGAGACTGACTGGATGGTTCATGTTAAAGGGA 1317

 61939289 TCGTCTCAGCACAGCTGAGGGTTTTTCACACATACTATTATTTAATTCTACTGACTTTCA 61939348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TCGTCTCAGCACAGCTGAGGGTTTTTCACACATACTATTATTTAATTCTACTGACTTTCA 1377

 61939349 CGTAAAGAAAGTGTAGTCTTTATTTACTGAGACTTAAAAAGATTAAATGGCTTTTCCAAG 61939408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CGTAAAGAAAGTGTAGTCTTTATTTACTGAGACTTAAAAAGATTAAATGGCTTTTCCAAG 1437

 61939409 CTCACACAGTCCATATAACCCAGAGATGGGAAAATATATCTGGACCCCAAATCCTTAATT 61939468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CTCACACAGTCCATATAACCCAGAGATGGGAAAATATATCTGGACCCCAAATCCTTAATT 1497

 61939469 TTACTTGTCTGCCTGCCCGCCTCTTCCCTGTTGAACCTGGGGAGGCATCAGGGCATCCTG 61939528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1498 TTACTTGTCTGCCTGCCCGCCTCTTCCCTGTTGAACCTGGGGAGGCATCAGGGCATCCGG 1557

 61939529 TTAGTGGTGTCCCACAGATAGACAAATTTTACCCTGGATTACGAAAAGCTGGATTAGCTT 61939588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTAGTGGTGTCCCACAGATAGACAAATTTTACCCTGGATTACGAAAAGCTGGATTAGCTT 1617

 61939589 TCTTACTTAAACAATACTGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTT 61939648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCTTACTTAAACAATACTGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTT 1677

 61939649 GGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAGCATGG 61939708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAGCATGG 1737

 61939709 TGAAACCCCGTCTCTTCTAAAATACAAAAAGTAAATTAGCTGGGCACGATGGCGCCTGCC 61939768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TGAAACCCCGTCTCTTCTAAAATACAAAAAGTAAATTAGCTGGGCACGATGGCGCCTGCC 1797

 61939769 TGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGGGAATCGGTTGAACCTGGGAGGCGGAG 61939828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGGGAATCGGTTGAACCTGGGAGGCGGAG 1857

 61939829 ATTGCAGTGAGCCAAAATCACGCCACTGCACTGCAGCCTGGCAACAGAGCAAGACTCTGT 61939888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATTGCAGTGAGCCAAAATCACGCCACTGCACTGCAGCCTGGCAACAGAGCAAGACTCTGT 1917

 61939889 CTGAAAACAAAACAAAACAAGAAATAATACTGGAACTTCTTTCCCTGCTGTTGCTCCAAT 61939948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CTGAAAACAAAACAAAACAAGAAATAATACTGGAACTTCTTTCCCTGCTGTTGCTCCAAT 1977

 61939949 TCCCTTCCCTGGATTATTTTCCTCTTTGTCACTACCACACATCTAGAAAGATTAGCATTT 61940008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TCCCTTCCCTGGATTATTTTCCTCTTTGTCACTACCACACATCTAGAAAGATTAGCATTT 2037

 61940009 CTATTACAGAAGCAAATGTCAAAAGGAGATTTAGAGGGAGTTACAGTTGCTTAAAAAAAA 61940068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CTATTACAGAAGCAAATGTCAAAAGGAGATTTAGAGGGAGTTACAGTTGCTTAAAAAAAA 2097

 61940069 AAAAACCCCTGCCCTTTGCCATCACAAGCCCATGATCGTCACAGTTATCTGTCAGTCAAG 61940128
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2098 AAAAACCCCTGCCCTTTGCCATCACAAGCCCATGATCATCACAGTTATCTGTCAGTCAAG 2157

 61940129 CACCTGACCGTAATGGAAGTCAACAAATAAAACGCATCACTTGAGACCGGATAAAGAACA 61940188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2158 CACCTGACCGTAATGGAAGTCAACAAATAAAACGCATCACTTGAGACTGGATAAAGAACA 2217

 61940189 CAGGATGAGCATGAGTTTAATCCTTGTCCATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAACAA 61940248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CAGGATGAGCATGAGTTTAATCCTTGTCCATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAACAA 2277

 61940249 CTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGGCAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCAAG 61940308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGGCAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCAAG 2337

 61940309 TGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGATGA 61940368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGATGA 2397

 61940369 AATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAAAC 61940428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAAAC 2457

 61940429 CTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGGAT 61940488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGGAT 2517

 61940489 AATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGACAG 61940548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 AATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGACAG 2577

 61940549 CGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGTTT 61940608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGTTT 2637

 61940609 TTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCA 61940668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCA 2697

 61940669 GAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGTTC 61940728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGTTC 2757

 61940729 AGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTC 61940788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTC 2817

 61940789 TTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAAAGCCATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTAAC 61940848
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAA-GCCATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTAAC 2876

 61940849 CCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGCAC 61940908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGCAC 2936

 61940909 CTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTTGG 61940968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTTGG 2996

 61940969 GTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGGAC 61941028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGGAC 3056

 61941029 AGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCGGG 61941088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCGGG 3116

 61941089 GATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTG 61941148
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3117 GATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCCTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTG 3176

 61941149 ACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCTCA 61941208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 ACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCTCA 3236

 61941209 CGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGA 61941264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGA 3292

EXCISED REGION

 61941273 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 61941332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 3356

 61941333 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 61941392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 3416

 61941393 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 61941452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 3476

 61941453 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 61941512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 3536

 61941513 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 61941572
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TGCTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 3596

 61941573 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 61941632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 3656

 61941633 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 61941692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 3716

 61941693 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 61941752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 3776

 61941753 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 61941812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 3836

 61941813 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 61941872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 3896

 61941873 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTG 61941932
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3897 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTG 3956

 61941933 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 61941992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 4016

 61941993 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 61942052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 4076

 61942053 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 61942112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 4136

 61942113 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 61942172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 4196

 61942173 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 61942232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 4256

 61942233 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 61942292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 4316

 61942293 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 61942352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 4376

 61942353 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 61942412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 4436

 61942413 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 61942472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 4496

 61942473 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 61942532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 4556

 61942533 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 61942592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 4616

 61942593 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 61942652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 4676

 61942653 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 61942712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 4736

 61942713 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 61942772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 4796

 61942773 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 61942832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 4856

 61942833 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 61942892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 4916

 61942893 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 61942952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 4976

 61942953 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 61943012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 5036

 61943013 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 61943072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 5096

 61943073 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 61943132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 5156

 61943133 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 61943192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 5216

 61943193 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 61943252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 5276

 61943253 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 61943312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 5336

 61943313 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 61943372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 5396

 61943373 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 61943432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 5456

 61943433 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 61943492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 5516

 61943493 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 61943552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 5576

 61943553 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 61943612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 5636

 61943613 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 61943672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 5696

 61943673 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 61943732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 5756

 61943733 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 61943792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 5816

 61943793 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 61943852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 5876

 61943853 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 61943912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 5936

 61943913 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 61943972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 5996

 61943973 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 61944032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 6056

 61944033 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 61944092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 6116

 61944093 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 61944152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 6176

 61944153 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 61944212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 6236

 61944213 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 61944272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 6296

 61944273 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 61944332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 6356

 61944333 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 61944392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 6416

 61944393 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 61944452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 6476

 61944453 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 61944512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 6536

 61944513 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 61944572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 6596

 61944573 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 61944632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 6656

 61944633 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 61944692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 6716

 61944693 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 61944752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 6776

 61944753 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 61944812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 6836

 61944813 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 61944872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 6896

 61944873 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 61944932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 6956

 61944933 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 61944992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 7016

 61944993 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 61945052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 7076

 61945053 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 61945112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 7136

 61945113 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 61945172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 7196

 61945173 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGT 61945232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGT 7256

 61945233 CTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATA 61945292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 CTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATA 7316

 61945293 TGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGA 61945352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 TGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGA 7376

 61945353 ACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAG 61945412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 ACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAG 7436

 61945413 TGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCC 61945472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 TGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCC 7496

 61945473 TAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCT 61945532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 TAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCT 7556

 61945533 GAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCC 61945592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 GAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCC 7616

 61945593 GACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTC 61945652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 GACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTC 7676

 61945653 ACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAA 61945712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 ACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAA 7736

 61945713 AGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGA 61945772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 AGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGA 7796

 61945773 CTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCT 61945832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 CTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCT 7856

 61945833 CTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGT 61945892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 CTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGT 7916

 61945893 ACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTT 61945952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 ACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTT 7976

 61945953 TATCACCTTATTTTACAGATGAGG 61945976
          ||||||||||||||||||||||||
     7977 TATCACCTTATTTTACAGATGAGG 8000

Alignment time is 9.01688 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7986] =>      7986 nucs 'mol-32-2ff9-020571_7986'

Score:        7920
Aligned:      7986        nucs
Identic:      7980 (100%) nucs =>      2706 (100%)      5274 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942556,61945261] EXCISED REGION [61945263,61950541]
 second seq =>  [       1,    2706] EXCISED REGION [    2708,    7986]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61945262,61945262]
 second seq =>         1 nucs [2707,2707]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2706,2707] to [2707,2708]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61945261,61945261] to [61945263,61945263]
 second seq =>         1 nucs [2706,2706] to [2708,2708]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942556 TGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAA 61942615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAA 60

 61942616 ACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAGTGAGAAAATATTATTTT 61942675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAGTGAGAAAATATTATTTT 120

 61942676 GGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGAC 61942735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGAC 180

 61942736 GGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCC 61942795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCC 240

 61942796 TTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAG 61942855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAG 300

 61942856 GCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACA 61942915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACA 360

 61942916 GGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCT 61942975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCT 420

 61942976 TCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAG 61943035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAG 480

 61943036 AATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAG 61943095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAG 540

 61943096 ACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTC 61943155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTC 600

 61943156 AGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGT 61943215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGT 660

 61943216 ATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCA 61943275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCA 720

 61943276 GAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATT 61943335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATT 780

 61943336 AAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCT 61943395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCT 840

 61943396 TTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTC 61943455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTC 900

 61943456 ATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATG 61943515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATG 960

 61943516 GGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTAT 61943575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTAT 1020

 61943576 AGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGAC 61943635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGAC 1080

 61943636 ACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGG 61943695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGG 1140

 61943696 TAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAA 61943755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAA 1200

 61943756 TCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACT 61943815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACT 1260

 61943816 GAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACC 61943875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACC 1320

 61943876 GCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTA 61943935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTA 1380

 61943936 CTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTT 61943995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTT 1440

 61943996 TTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCAC 61944055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCAC 1500

 61944056 TGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG 61944115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG 1560

 61944116 ATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCT 61944175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCT 1620

 61944176 CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCC 61944235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCC 1680

 61944236 TCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAG 61944295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAG 1740

 61944296 ATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTT 61944355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTT 1800

 61944356 ACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTT 61944415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTT 1860

 61944416 ATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCT 61944475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCT 1920

 61944476 TTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATG 61944535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATG 1980

 61944536 GGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCT 61944595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCT 2040

 61944596 TGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATG 61944655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATG 2100

 61944656 TCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTT 61944715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTT 2160

 61944716 TGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATA 61944775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATA 2220

 61944776 TGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTC 61944835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTC 2280

 61944836 TGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCAT 61944895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCAT 2340

 61944896 ACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTT 61944955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTT 2400

 61944956 TTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGG 61945015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGG 2460

 61945016 TTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAG 61945075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAG 2520

 61945076 GTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGAC 61945135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGAC 2580

 61945136 CTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGT 61945195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGT 2640

 61945196 TATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGT 61945255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGT 2700

 61945256 CCATGC 61945261
          ||||||
     2701 CCATGC 2706

EXCISED REGION

 61945263 CTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAG 61945322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 CTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAG 2767

 61945323 AGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGT 61945382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 AGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGT 2827

 61945383 AAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGT 61945442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 AAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGT 2887

 61945443 GTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCA 61945502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 GTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCA 2947

 61945503 AAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTC 61945562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 AAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTC 3007

 61945563 TTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTC 61945622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 TTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTC 3067

 61945623 ATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTAT 61945682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 ATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTAT 3127

 61945683 CTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCA 61945742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 CTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCA 3187

 61945743 TAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGG 61945802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 TAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGG 3247

 61945803 ATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCAT 61945862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 ATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCAT 3307

 61945863 TGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTT 61945922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTT 3367

 61945923 ATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTG 61945982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 ATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTG 3427

 61945983 TGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAAC 61946042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 TGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAAC 3487

 61946043 AATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGG 61946102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 AATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGG 3547

 61946103 ATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATT 61946162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 ATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATT 3607

 61946163 TTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCT 61946222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3608 TTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCT 3667

 61946223 TTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAAT 61946282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 TTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAAT 3727

 61946283 ACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTT 61946342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3728 ACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCAATGGTATAATTTT 3787

 61946343 TTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGA 61946402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGA 3847

 61946403 TCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAA 61946462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAA 3907

 61946463 TATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGAT 61946522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 TATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGAT 3967

 61946523 GGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATT 61946582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 GGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATT 4027

 61946583 TAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAG 61946641
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 TAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAG 4087

 61946642 AGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACA 61946701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 AGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACA 4147

 61946702 GATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACC 61946761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 GATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACC 4207

 61946762 CTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCC 61946821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 CTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCC 4267

 61946822 ATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTG 61946881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 ATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTG 4327

 61946882 TTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGA 61946941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 TTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGA 4387

 61946942 TCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTA 61947001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 TCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTA 4447

 61947002 CCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTG 61947061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 CCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTG 4507

 61947062 TGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGT 61947121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 TGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGT 4567

 61947122 ATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAA 61947181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 ATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAA 4627

 61947182 ATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAA 61947241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 ATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAA 4687

 61947242 ACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTG 61947301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 ACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTG 4747

 61947302 TAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGC 61947361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 TAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGC 4807

 61947362 ATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTC 61947421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 ATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTC 4867

 61947422 TTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGG 61947481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 TTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGG 4927

 61947482 TCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCA 61947541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 TCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCA 4987

 61947542 TGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTC 61947601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 TGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTC 5047

 61947602 AAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGG 61947661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 AAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGG 5107

 61947662 GATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTT 61947721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 GATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTT 5167

 61947722 TGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGA 61947781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGA 5227

 61947782 TGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTT 61947841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     5228 TGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA-TT 5286

 61947842 TTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATG 61947901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATG 5346

 61947902 TCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTT 61947961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTT 5406

 61947962 AAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCA 61948021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 AAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCA 5466

 61948022 ATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTT 61948081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 ATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTT 5526

 61948082 TTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTG 61948141
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5527 TTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTA 5586

 61948142 TTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGA 61948201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 TTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGA 5646

 61948202 CTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCT 61948261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 CTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCT 5706

 61948262 TTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAA 61948321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 TTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAA 5766

 61948322 TAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATC 61948381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 TAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATC 5826

 61948382 TGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATA 61948441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATA 5886

 61948442 TGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTT 61948501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 TGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTT 5946

 61948502 TATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTA 61948561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTA 6006

 61948562 TTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACG 61948621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACG 6066

 61948622 ATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTC 61948681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 ATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTC 6126

 61948682 CTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTAC 61948741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 CTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTAC 6186

 61948742 AGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAG 61948801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 AGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAG 6246

 61948802 TTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTG 61948861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 TTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTG 6306

 61948862 GTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCC 61948921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 GTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCC 6366

 61948922 CATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTC 61948981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 CATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTC 6426

 61948982 CTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTC 61949041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 CTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTC 6486

 61949042 ATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACAT 61949101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 ATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACAT 6546

 61949102 ATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTG 61949161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 ATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTG 6606

 61949162 ATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCA 61949221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 ATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCA 6666

 61949222 GGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGGA 61949281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6667 GGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGGA 6726

 61949282 ATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATA 61949341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 ATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATA 6786

 61949342 GTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTT 61949401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 GTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTT 6846

 61949402 TTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATT 61949461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 TTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATT 6906

 61949462 GGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGG 61949521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 GGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGG 6966

 61949522 AATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCT 61949581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 AATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCT 7026

 61949582 GAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTC 61949641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 GAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTC 7086

 61949642 ATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGT 61949701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 ATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGT 7146

 61949702 CTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTG 61949761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 CTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTG 7206

 61949762 GTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTG 61949821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 GTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTG 7266

 61949822 CCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTT 61949881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 CCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTT 7326

 61949882 TATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAA 61949941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 TATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAA 7386

 61949942 CACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTA 61950001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 CACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTA 7446

 61950002 GTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGG 61950061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 GTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGG 7506

 61950062 AGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCT 61950121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 AGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCT 7566

 61950122 ATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTG 61950181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 ATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTG 7626

 61950182 CTGGGAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGAT 61950241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 CTGGGAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGAT 7686

 61950242 GAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCT 61950301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 GAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCT 7746

 61950302 ATTTGATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGAC 61950361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 ATTTGATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGAC 7806

 61950362 CTGTCTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAG 61950421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 CTGTCTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAG 7866

 61950422 TCTCTTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATA 61950481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 TCTCTTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATA 7926

 61950482 TATAAGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATGCCC 61950541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 TATAAGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATGCCC 7986

Alignment time is 9.29034 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5950] =>      5950 nucs 'mol-32-2ff9-341371_5950'

Score:        5906
Aligned:      5950        nucs
Identic:      5946 (100%) nucs =>      3240 (100%)      2706 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942963,61946202] EXCISED REGION [61946204,61948912]
 second seq =>  [       1,    3240] EXCISED REGION [    3242,    5950]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [3241,3241]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [3238,3240] to [3242,3244]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942963 CGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTG 61943022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTG 60

 61943023 GCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAG 61943082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAG 120

 61943083 GTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGA 61943142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGA 180

 61943143 AGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGC 61943202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGC 240

 61943203 AAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGAC 61943262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGAC 300

 61943263 CTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATT 61943322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATT 360

 61943323 TTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGC 61943382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGC 420

 61943383 TTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGA 61943442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGA 480

 61943443 GACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACAT 61943502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACAT 540

 61943503 AAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAAT 61943562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAAT 600

 61943563 TCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTA 61943622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTA 660

 61943623 ATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAA 61943682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAA 720

 61943683 TGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTG 61943742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTG 780

 61943743 AGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACT 61943802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACT 840

 61943803 ACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTAC 61943862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTAC 900

 61943863 CTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGT 61943922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGT 960

 61943923 AACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTA 61943982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTA 1020

 61943983 TTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGC 61944042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGC 1080

 61944043 AATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 61944102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 1140

 61944103 CCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGT 61944162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGT 1200

 61944163 AGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCC 61944222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCC 1260

 61944223 ACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGA 61944282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGA 1320

 61944283 TCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGG 61944342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGG 1380

 61944343 CTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATT 61944402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATT 1440

 61944403 TCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAAT 61944462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAAT 1500

 61944463 CCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTC 61944522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTC 1560

 61944523 TGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATA 61944582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATA 1620

 61944583 CAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTT 61944642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTT 1680

 61944643 TTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGG 61944702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGG 1740

 61944703 AGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGC 61944762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGC 1800

 61944763 AGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAA 61944822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAA 1860

 61944823 TGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTT 61944882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTT 1920

 61944883 GAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGT 61944942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGT 1980

 61944943 AAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTAT 61945002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTAT 2040

 61945003 GACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCT 61945062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCT 2100

 61945063 TAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACT 61945122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACT 2160

 61945123 GCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATG 61945182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATG 2220

 61945183 GAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTT 61945242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTT 2280

 61945243 CTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGT 61945302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGT 2340

 61945303 CTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGA 61945362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGA 2400

 61945363 CCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTA 61945422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTA 2460

 61945423 AAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCC 61945482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCC 2520

 61945483 TTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGA 61945542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGA 2580

 61945543 GTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTA 61945602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTA 2640

 61945603 TGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTT 61945662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTT 2700

 61945663 GACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTC 61945722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTC 2760

 61945723 TGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTA 61945782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTA 2820

 61945783 GTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGT 61945842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGT 2880

 61945843 TGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTT 61945902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTT 2940

 61945903 TACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTA 61945962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTA 3000

 61945963 TTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGT 61946022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGT 3060

 61946023 TGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAG 61946082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAG 3120

 61946083 CATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGA 61946142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGA 3180

 61946143 ATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 61946202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 3240

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 3301

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 3361

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 3421

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 3481

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 3541

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 3601

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3602 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 3661

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 3721

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 3781

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 3841

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 3901

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 3961

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 4021

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 4081

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 4141

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 4201

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 4261

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 4321

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 4381

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4382 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 4441

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 4501

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 4561

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 4621

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 61947642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 4681

 61947643 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 61947702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 4741

 61947703 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 61947762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 4801

 61947763 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 61947822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 4861

 61947823 AGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 61947882
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 AGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 4920

 61947883 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 61947942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 4980

 61947943 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 61948002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 5040

 61948003 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 61948062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 5100

 61948063 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 61948122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 5160

 61948123 TTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 61948182
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 5220

 61948183 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 61948242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 5280

 61948243 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 61948302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 5340

 61948303 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 61948362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 5400

 61948363 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 61948422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 5460

 61948423 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 61948482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 5520

 61948483 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 61948542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 5580

 61948543 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 61948602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 5640

 61948603 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 61948662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 5700

 61948663 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 61948722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 5760

 61948723 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 61948782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 5820

 61948783 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 61948842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 5880

 61948843 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 61948902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 5940

 61948903 AATGCTTACA 61948912
          ||||||||||
     5941 AATGCTTACA 5950

Alignment time is 7.39797 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6513] =>      6513 nucs 'mol-32-300f-039021_6513'

Score:        6176
Aligned:      6516        nucs
Identic:      6472 ( 99%) nucs =>      5035 ( 99%)      1437 (100%)
Gaps:           21 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61939732,61944787] EXCISED REGION [61945086,61946527]
 second seq =>  [       1,    5073] EXCISED REGION [    5074,    6513]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61939732 ACAAAAAGTAAATTAGCTGGGCACGATGGCGCCTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGA 61939791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAAAAAGTAAATTAGCTGGGCACGATGGCGCCTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGA 60

 61939792 CTGAGGCAGGGGAATCGGTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCAAAATCACGC 61939851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGAGGCAGGGGAATCGGTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCAAAATCACGC 120

 61939852 CACTGCACTGCAGCCTGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTGAAAACAAAACAAAACAAGAA 61939911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTGCACTGCAGCCTGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTGAAAACAAAACAAAACAAGAA 180

 61939912 ATAATACTGGAACTTCTTTCCCTGCTGTTGCTCCAATTCCCTTCCCTGGATTATTTTCCT 61939971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAATACTGGAACTTCTTTCCCTGCTGTTGCTCCAATTCCCTTCCCTGGATTATTTTCCT 240

 61939972 CTTTGTCACTACCACACATCTAGAAAGATTAGCATTTCTATTACAGAAGCAAATGTCAAA 61940031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTGTCACTACCACACATCTAGAAAGATTAGCATTTCTATTACAGAAGCAAATGTCAAA 300

 61940032 AGGAGATTTAGAGGGAGTTACAGTTGCTTAAAAAAAAAAAAACCCCTGCCCTTTGCCATC 61940091
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      301 AGGAGATTTAGAGGGAGTTACAGTTGCTTAAAAAAAAAAAACCCCCTGCCCTTTGCCATC 360

 61940092 ACAAGCCCATGATCGTCACAGTTATCTGTCAGTCAAGCACCTGACCGTAATGGAAGTCAA 61940151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAGCCCATGATCGTCACAGTTATCTGTCAGTCAAGCACCTGACCGTAATGGAAGTCAA 420

 61940152 CAAATAAAACGCATCACTTGAGACCGGATAAAGAACACAGGATGAGCATGAGTTTAATCC 61940211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAATAAAACGCATCACTTGAGACCGGATAAAGAACACAGGATGAGCATGAGTTTAATCC 480

 61940212 TTGTCCATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAAAGAACA 61940271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTCCATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAAAGAACA 540

 61940272 AAGTGGCAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAGAAATAT 61940331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTGGCAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAGAAATAT 600

 61940332 TTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAG 61940391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAG 660

 61940392 AGGAAACTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGA 61940451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGAAACTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGA 720

 61940452 AAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGC 61940511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGC 780

 61940512 AGGATGAGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTG 61940571
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      781 AGGATGAGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCATACCACTTTGCTCTG 840

 61940572 TTCTTCTGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAG 61940631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      841 TTCTTCTGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCTCTTCAGTGCAAAG 900

 61940632 GACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAA 61940691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAA 960

 61940692 ATAATTGCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAA 61940751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAATTGCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAA 1020

 61940752 GTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAA 61940811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAA 1080

 61940812 AAAGCCATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATA 61940871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGCCATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATA 1140

 61940872 TGAAAAAAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAAC 61940931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAAAAAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAAC 1200

 61940932 TGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTG 61940991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTG 1260

 61940992 CTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTA 61941051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTA 1320

 61941052 TCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGG 61941111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGG 1380

 61941112 GCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGT 61941171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGT 1440

 61941172 TCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGA 61941231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGA 1500

 61941232 ACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGAT---------TGACTTCCTTCCTTCCT 61941282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||
     1501 ACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGA-CTGACTGACTGACTTCCTTCCTTCCT 1559

 61941283 TCCTTCCTTCCTTC----TTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGACAAAGAA 61941338
          ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGACAAAGAA 1619

 61941339 TCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCC 61941398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCC 1679

 61941399 TCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGTGCCT 61941458
          |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1680 TCCCGGGTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCGCCT 1739

 61941459 GCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGG 61941518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGG 1799

 61941519 CCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTA 61941578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTA 1859

 61941579 GGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTC 61941638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTC 1919

 61941639 TATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAG 61941698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAG 1979

 61941699 CCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGC 61941758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGC 2039

 61941759 CACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATAT 61941818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATAT 2099

 61941819 AGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGC 61941878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGC 2159

 61941879 TTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTGTTGAAT 61941938
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2160 TTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTGTTGAAT 2219

 61941939 AGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACAATAAAT 61941998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACAATAAAT 2279

 61941999 GGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAAT 61942058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAAT 2339

 61942059 TCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAAA 61942118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAAA 2399

 61942119 AAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATCTGGGTT 61942178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2400 AAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACACTTTAGATCTGGGTT 2459

 61942179 ATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGAA 61942238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGAA 2519

 61942239 GGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATGA 61942298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATGA 2579

 61942299 ACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTT 61942358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTT 2639

 61942359 TAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAATA 61942418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAATA 2699

 61942419 TGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCCT 61942478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCCT 2759

 61942479 GTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAGG 61942538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAGG 2819

 61942539 TTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGA 61942598
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGA 2879

 61942599 CTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAG 61942658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAG 2939

 61942659 TGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTT-- 61942716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     2940 TGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTCT 2999

 61942717 --TTTCTTTTTTTTTT-GAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGC 61942773
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTTTTCTTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGC 3059

 61942774 ATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCC 61942833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCC 3119

 61942834 TCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTG 61942893
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCATGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTG 3179

 61942894 TTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTT 61942953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTT 3239

 61942954 GGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTA 61943013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3240 GGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAATTGGGATTACAGGCGTGAACTA 3299

 61943014 CTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGT 61943073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGT 3359

 61943074 ATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGA 61943133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGA 3419

 61943134 ATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGA 61943193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGA 3479

 61943194 ACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATAC 61943253
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3480 ACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGCGTTTGTGACATGTGATAC 3539

 61943254 ATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGT 61943313
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3540 ATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGC 3599

 61943314 ATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAA 61943373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAA 3659

 61943374 GCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTG 61943433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTG 3719

 61943434 CTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATAC 61943493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATAC 3779

 61943494 TTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGT 61943553
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTGTTACATCAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGT 3839

 61943554 TCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTA 61943613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTA 3899

 61943614 TTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATAC 61943673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATAC 3959

 61943674 ATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTC 61943733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 ATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTC 4019

 61943734 TTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTA 61943793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTA 4079

 61943794 TTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTA 61943853
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4080 TTATTAACTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAATTGTA 4139

 61943854 ACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCA 61943913
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 ACTTTGTACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCA 4199

 61943914 GTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTT 61943973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTT 4259

 61943974 ATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG 61944033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 ATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG 4319

 61944034 CAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGC 61944093
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4320 CAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGC 4379

 61944094 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGT 61944153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGT 4439

 61944154 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTC 61944213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTC 4499

 61944214 AAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGC 61944273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 AAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGC 4559

 61944274 CCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTAC 61944333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4560 CCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTATCTAC 4619

 61944334 TGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAAT 61944393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAAT 4679

 61944394 GACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACAT 61944453
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
     4680 GACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACACCACAT 4739

 61944454 TAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGT 61944513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGT 4799

 61944514 AAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTC 61944573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 AAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTC 4859

 61944574 CTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACA 61944633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 CTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACA 4919

 61944634 CACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTG 61944693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 CACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTG 4979

 61944694 TGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATG 61944753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATG 5039

 61944754 AGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 5073

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 5133

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 5193

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 5253

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 5313

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 5373

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 5433

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 5493

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     5494 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 5551

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 5611

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 5671

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 5731

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 5791

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 5851

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 5911

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 5971

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 6031

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 6091

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 6151

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 6211

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 6271

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 6331

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 6391

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 6451

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 6511

 61946526 TG 61946527
          ||
     6512 TG 6513

Alignment time is 7.91176 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7035] =>      7035 nucs 'mol-32-3030-004385_7035'

Score:        6971
Aligned:      7026        nucs
Identic:      7021 (100%) nucs =>      1028 (100%)      5993 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61940236,61941264] EXCISED REGION [61941273,61947268]
 second seq =>  [       1,    1028] EXCISED REGION [    1033,    7029]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [61941265,61941272]
 second seq =>         4 nucs [1029,1032]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [1018,1030] to [1022,1034]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61940236 AAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGGCAAACTCTACAGTATAGT 61940295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGGCAAACTCTACAGTATAGT 60

 61940296 GGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGA 61940355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGA 120

 61940356 GCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAACATGTG 61940415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAACATGTG 180

 61940416 CTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAG 61940475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAG 240

 61940476 ATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATACACAAT 61940535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATACACAAT 300

 61940536 GAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATATGTTTTTTT 61940595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATATGTTTTTTT 360

 61940596 TCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTC 61940655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTC 420

 61940656 CCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAGGATCCTAGG 61940715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAGGATCCTAGG 480

 61940716 TGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTT 61940775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTT 540

 61940776 CTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAAAGCCATCAACTCATTATGGGTG 61940835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
      541 CTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAA-GCCATCAACTCATTATGGGTG 599

 61940836 CCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGATTTTCATCA 61940895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGATTTTCATCA 659

 61940896 TCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGAC 61940955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGAC 719

 61940956 TCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTT 61941015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTT 779

 61941016 TTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACT 61941075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACT 839

 61941076 TACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGC 61941135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGC 899

 61941136 AGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTG 61941195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTG 959

 61941196 GAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTG 61941255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTG 1019

 61941256 ACTGACTGA 61941264
          |||||||||
     1020 ACTGACTGA 1028

EXCISED REGION

 61941273 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 61941332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 1092

 61941333 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 61941392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 1152

 61941393 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 61941452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 1212

 61941453 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 61941512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 1272

 61941513 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 61941572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 1332

 61941573 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 61941632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 1392

 61941633 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 61941692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 1452

 61941693 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 61941752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 1512

 61941753 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 61941812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 1572

 61941813 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 61941872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 1632

 61941873 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTG 61941932
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1633 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTG 1692

 61941933 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 61941992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 1752

 61941993 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 61942052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 1812

 61942053 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 61942112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 1872

 61942113 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 61942172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 1932

 61942173 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 61942232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 1992

 61942233 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 61942292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 2052

 61942293 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 61942352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 2112

 61942353 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 61942412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 2172

 61942413 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 61942472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 2232

 61942473 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 61942532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 2292

 61942533 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 61942592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 2352

 61942593 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 61942652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 2412

 61942653 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 61942712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 2472

 61942713 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 61942772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 2532

 61942773 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 61942832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 2592

 61942833 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 61942892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 2652

 61942893 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 61942952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 2712

 61942953 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 61943012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 2772

 61943013 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 61943072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 2832

 61943073 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 61943132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 2892

 61943133 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 61943192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 2952

 61943193 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 61943252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 3012

 61943253 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 61943312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 3072

 61943313 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 61943372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 3132

 61943373 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 61943432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 3192

 61943433 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 61943492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 3252

 61943493 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 61943552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 3312

 61943553 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 61943612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 3372

 61943613 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 61943672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 3432

 61943673 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 61943732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 3492

 61943733 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 61943792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 3552

 61943793 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 61943852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 3612

 61943853 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 61943912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 3672

 61943913 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 61943972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 3732

 61943973 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 61944032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 3792

 61944033 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 61944092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 3852

 61944093 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 61944152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 3912

 61944153 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 61944212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 3972

 61944213 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 61944272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 4032

 61944273 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 61944332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 4092

 61944333 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 61944392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 4152

 61944393 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 61944452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 4212

 61944453 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 61944512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 4272

 61944513 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 61944572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 4332

 61944573 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 61944632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 4392

 61944633 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 61944692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 4452

 61944693 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 61944752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 4512

 61944753 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 61944812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 4572

 61944813 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 61944872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 4632

 61944873 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 61944932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4633 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 4692

 61944933 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 61944992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 4752

 61944993 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 61945052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4753 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 4812

 61945053 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 61945112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4813 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 4872

 61945113 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 61945172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4873 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 4932

 61945173 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGT 61945232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGT 4992

 61945233 CTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATA 61945292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4993 CTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATA 5052

 61945293 TGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGA 61945352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 TGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGA 5112

 61945353 ACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAG 61945412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5113 ACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAG 5172

 61945413 TGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCC 61945472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5173 TGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCC 5232

 61945473 TAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCT 61945532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5233 TAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCT 5292

 61945533 GAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCC 61945592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5293 GAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCC 5352

 61945593 GACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTC 61945652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5353 GACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTC 5412

 61945653 ACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAA 61945712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5413 ACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAA 5472

 61945713 AGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGA 61945772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5473 AGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGA 5532

 61945773 CTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCT 61945832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5533 CTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCT 5592

 61945833 CTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGT 61945892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5593 CTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGT 5652

 61945893 ACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTT 61945952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5653 ACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTT 5712

 61945953 TATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAA 61946012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5713 TATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAA 5772

 61946013 ACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATT 61946072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5773 ACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATT 5832

 61946073 CAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGA 61946132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5833 CAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGA 5892

 61946133 ATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGT 61946192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5893 ATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGT 5952

 61946193 GTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGAT 61946252
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5953 GTCTCCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGAT 6012

 61946253 TTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTAC 61946312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6013 TTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTAC 6072

 61946313 TGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTA 61946372
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6073 TGTCGTTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTA 6132

 61946373 CAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATC 61946432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6133 CAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATC 6192

 61946433 AGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATA 61946492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6193 AGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATA 6252

 61946493 AAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTAC 61946552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6253 AAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTAC 6312

 61946553 TGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTT 61946611
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     6313 TGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTT 6372

 61946612 TCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGT 61946671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6373 TCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGT 6432

 61946672 AAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAG 61946731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6433 AAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAG 6492

 61946732 TACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCC 61946791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6493 TACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCC 6552

 61946792 CTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGT 61946851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6553 CTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGT 6612

 61946852 AAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGC 61946911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6613 AAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGC 6672

 61946912 CTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATT 61946971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6673 CTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATT 6732

 61946972 CCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTT 61947031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6733 CCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTT 6792

 61947032 AATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTT 61947091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6793 AATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTT 6852

 61947092 TAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGA 61947151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6853 TAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGA 6912

 61947152 ATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAA 61947211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6913 ATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAA 6972

 61947212 CTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTC 61947268
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6973 CTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTC 7029

Alignment time is 8.36704 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5353] =>      5353 nucs 'mol-32-3030-156688_5353'

Score:        5309
Aligned:      5353        nucs
Identic:      5349 (100%) nucs =>      3280 (100%)      2069 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942923,61946202] EXCISED REGION [61946204,61948275]
 second seq =>  [       1,    3280] EXCISED REGION [    3282,    5353]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [3281,3281]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [3278,3280] to [3282,3284]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942923 GCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCT 61942982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCT 60

 61942983 CCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCT 61943042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCT 120

 61943043 GATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCAC 61943102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCAC 180

 61943103 AGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTC 61943162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTC 240

 61943163 CTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATG 61943222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATG 300

 61943223 AGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTC 61943282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTC 360

 61943283 TTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAA 61943342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAA 420

 61943343 TGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGAT 61943402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGAT 480

 61943403 TTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTC 61943462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTC 540

 61943463 TCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAG 61943522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAG 600

 61943523 AATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAA 61943582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAA 660

 61943583 AGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAAT 61943642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAAT 720

 61943643 ACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAA 61943702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAA 780

 61943703 CATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTC 61943762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTC 840

 61943763 TTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGAT 61943822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGAT 900

 61943823 AGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCC 61943882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCC 960

 61943883 ATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTA 61943942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTA 1020

 61943943 CTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAAT 61944002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAAT 1080

 61944003 GAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACC 61944062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACC 1140

 61944063 TCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAG 61944122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAG 1200

 61944123 GCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATG 61944182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATG 1260

 61944183 TTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAA 61944242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAA 1320

 61944243 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCAC 61944302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCAC 1380

 61944303 TTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAAT 61944362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAAT 1440

 61944363 GTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCT 61944422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCT 1500

 61944423 AATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAAC 61944482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAAC 1560

 61944483 ACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGT 61944542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGT 1620

 61944543 AGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAA 61944602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAA 1680

 61944603 CATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTG 61944662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTG 1740

 61944663 AAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATAT 61944722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATAT 1800

 61944723 AGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGG 61944782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGG 1860

 61944783 GGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTA 61944842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTA 1920

 61944843 GGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTT 61944902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTT 1980

 61944903 TTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCA 61944962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCA 2040

 61944963 CATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGAT 61945022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGAT 2100

 61945023 TTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTT 61945082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTT 2160

 61945083 GCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTT 61945142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTT 2220

 61945143 GAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACA 61945202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACA 2280

 61945203 AAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCT 61945262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCT 2340

 61945263 CTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAG 61945322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAG 2400

 61945323 AGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGT 61945382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGT 2460

 61945383 AAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGT 61945442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGT 2520

 61945443 GTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCA 61945502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCA 2580

 61945503 AAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTC 61945562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTC 2640

 61945563 TTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTC 61945622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTC 2700

 61945623 ATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTAT 61945682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTAT 2760

 61945683 CTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCA 61945742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCA 2820

 61945743 TAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGG 61945802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGG 2880

 61945803 ATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCAT 61945862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCAT 2940

 61945863 TGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTT 61945922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTT 3000

 61945923 ATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTG 61945982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTG 3060

 61945983 TGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAAC 61946042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAAC 3120

 61946043 AATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGG 61946102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGG 3180

 61946103 ATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATT 61946162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATT 3240

 61946163 TTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 61946202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 3280

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 3341

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 3401

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 3461

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 3521

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 3581

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 3641

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3642 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 3701

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 3761

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 3821

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 3881

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 3941

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 4001

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 4061

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 4121

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 4181

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 4241

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 4301

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 4361

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 4421

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 4481

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 4541

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 4601

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 4661

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 61947642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 4721

 61947643 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 61947702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 4781

 61947703 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 61947762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 4841

 61947763 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 61947822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 4901

 61947823 AGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 61947882
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 AGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 4960

 61947883 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 61947942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 5020

 61947943 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 61948002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 5080

 61948003 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 61948062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 5140

 61948063 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 61948122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 5200

 61948123 TTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 61948182
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 TTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 5260

 61948183 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 61948242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 5320

 61948243 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATT 61948275
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATT 5353

Alignment time is 6.54582 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3284] =>      3284 nucs 'mol-32-303b-128477_3284'

Score:        3261
Aligned:      3283        nucs
Identic:      3281 (100%) nucs =>      2417 (100%)       864 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943786,61946202] EXCISED REGION [61946204,61947068]
 second seq =>  [       1,    2417] EXCISED REGION [    2419,    3284]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [2418,2418]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2818,2818]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [2415,2417] to [2419,2421]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943786 ATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCC 61943845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCC 60

 61943846 TAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTAC 61943905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTAC 120

 61943906 CCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTA 61943965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTA 180

 61943966 TTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGG 61944025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGG 240

 61944026 CTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGAT 61944085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGAT 300

 61944086 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTA 61944145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTA 360

 61944146 AGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTC 61944205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTC 420

 61944206 CTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGC 61944265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGC 480

 61944266 CACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTAT 61944325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTAT 540

 61944326 TTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTG 61944385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTG 600

 61944386 TCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATA 61944445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATA 660

 61944446 TACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTA 61944505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTA 720

 61944506 GCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGAT 61944565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGAT 780

 61944566 TTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTC 61944625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTC 840

 61944626 CACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGT 61944685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGT 900

 61944686 GAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGC 61944745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGC 960

 61944746 AGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCC 61944805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCC 1020

 61944806 CTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGT 61944865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGT 1080

 61944866 TTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATAT 61944925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATAT 1140

 61944926 TTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATA 61944985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATA 1200

 61944986 GCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTAT 61945045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTAT 1260

 61945046 TAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTA 61945105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTA 1320

 61945106 ATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATT 61945165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATT 1380

 61945166 AGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCT 61945225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCT 1440

 61945226 TTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGG 61945285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGG 1500

 61945286 ATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGG 61945345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGG 1560

 61945346 AAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGAT 61945405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGAT 1620

 61945406 CTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACT 61945465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACT 1680

 61945466 GTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACA 61945525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACA 1740

 61945526 TCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCC 61945585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCC 1800

 61945586 AACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAAT 61945645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAAT 1860

 61945646 GATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATG 61945705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATG 1920

 61945706 AAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTAT 61945765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTAT 1980

 61945766 TAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTG 61945825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTG 2040

 61945826 ACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGT 61945885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGT 2100

 61945886 ACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATG 61945945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATG 2160

 61945946 CTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAG 61946005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAG 2220

 61946006 CTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTT 61946065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTT 2280

 61946066 CAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAAT 61946125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAAT 2340

 61946126 TTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAA 61946185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAA 2400

 61946186 GGTGTGTGTCTCCATTT 61946202
          |||||||||||||||||
     2401 GGTGTGTGTCTCCATTT 2417

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 2478

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 2538

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 2598

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 2658

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 2718

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 2778

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2779 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 2838

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 2898

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 2958

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 3018

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 3078

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 3138

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 3198

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 3258

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAAT 61947068
          ||||||||||||||||||||||||||
     3259 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAAT 3284

Alignment time is 4.23346 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3971] =>      3971 nucs 'mol-32-3046-202934_3971'

Score:        3948
Aligned:      3970        nucs
Identic:      3968 (100%) nucs =>      2715 (100%)      1253 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943488,61946202] EXCISED REGION [61946204,61947457]
 second seq =>  [       1,    2715] EXCISED REGION [    2717,    3971]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [2716,2716]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3116,3116]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [2713,2715] to [2717,2719]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943488 AAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCA 61943547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCA 60

 61943548 CTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCA 61943607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCA 120

 61943608 AAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAAT 61943667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAAT 180

 61943668 GTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTAT 61943727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTAT 240

 61943728 CATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAAT 61943787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAAT 300

 61943788 ATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTA 61943847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTA 360

 61943848 ATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCC 61943907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCC 420

 61943908 TCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATT 61943967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATT 480

 61943968 TTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCT 61944027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCT 540

 61944028 GGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC 61944087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC 600

 61944088 TCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAG 61944147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAG 660

 61944148 TTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCT 61944207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCT 720

 61944208 AGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA 61944267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA 780

 61944268 CTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTT 61944327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTT 840

 61944328 ATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTC 61944387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTC 900

 61944388 ACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATA 61944447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATA 960

 61944448 CCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGC 61944507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGC 1020

 61944508 TATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTT 61944567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTT 1080

 61944568 TGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCA 61944627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCA 1140

 61944628 CTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGA 61944687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGA 1200

 61944688 AACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAG 61944747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAG 1260

 61944748 GACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCT 61944807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCT 1320

 61944808 GAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTT 61944867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTT 1380

 61944868 TATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTT 61944927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTT 1440

 61944928 CCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGC 61944987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGC 1500

 61944988 CATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTA 61945047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTA 1560

 61945048 AGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAAT 61945107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAAT 1620

 61945108 GATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAG 61945167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAG 1680

 61945168 ATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTT 61945227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTT 1740

 61945228 GAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGAT 61945287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGAT 1800

 61945288 GCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAA 61945347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAA 1860

 61945348 GGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCT 61945407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCT 1920

 61945408 CAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGT 61945467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGT 1980

 61945468 GTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATC 61945527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATC 2040

 61945528 CTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAA 61945587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAA 2100

 61945588 CTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGA 61945647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGA 2160

 61945648 TATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAA 61945707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAA 2220

 61945708 ACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTA 61945767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTA 2280

 61945768 ATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGAC 61945827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGAC 2340

 61945828 TTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTAC 61945887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTAC 2400

 61945888 TGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCT 61945947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCT 2460

 61945948 TTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCT 61946007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCT 2520

 61946008 GAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCA 61946067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCA 2580

 61946068 GAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTT 61946127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTT 2640

 61946128 GTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGG 61946187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGG 2700

 61946188 TGTGTGTCTCCATTT 61946202
          |||||||||||||||
     2701 TGTGTGTCTCCATTT 2715

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 2776

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 2836

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 2896

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 2956

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 3016

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 3076

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3077 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 3136

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 3196

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 3256

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 3316

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 3376

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 3436

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 3496

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 3556

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 3616

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 3676

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 3736

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 3796

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 3856

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 3916

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGT 61947457
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGT 3971

Alignment time is 5.25457 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8248] =>      8248 nucs 'mol-32-30f6-179553_8248'

Score:        7854
Aligned:      8255        nucs
Identic:      8203 ( 99%) nucs =>      4673 ( 99%)      3530 (100%)
Gaps:           27 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61940098,61944787] EXCISED REGION [61945086,61948630]
 second seq =>  [       1,    4707] EXCISED REGION [    4708,    8248]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61940098 CCATGATCGTCACAGTTATCTGTCAGTCAAGCACCTGACCGTAATGGAAGTCAACAAATA 61940157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATGATCGTCACAGTTATCTGTCAGTCAAGCACCTGACCGTAATGGAAGTCAACAAATA 60

 61940158 AAACGCATCACTTGAGACCGGATAAAGAACACAGGATGAGCATGAGTTTAATCCTTGTCC 61940217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACGCATCACTTGAGACCGGATAAAGAACACAGGATGAGCATGAGTTTAATCCTTGTCC 120

 61940218 ATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGG 61940277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGG 180

 61940278 CAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGC 61940337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGC 240

 61940338 TTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAA 61940397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAA 300

 61940398 CTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAA 61940457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAA 360

 61940458 GAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATG 61940517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATG 420

 61940518 AGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTC 61940577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTC 480

 61940578 TGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTAT 61940637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTAT 540

 61940638 TGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATT 61940697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATT 600

 61940698 GCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTG 61940757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTG 660

 61940758 GGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAAAGCC 61940817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAAAGCC 720

 61940818 ATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAA 61940877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAA 780

 61940878 AAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTC 61940937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTC 840

 61940938 TTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGAC 61940997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGAC 900

 61940998 GTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAA 61941057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAA 960

 61941058 GCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGG 61941117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGG 1020

 61941118 CTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCA 61941177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCA 1080

 61941178 GGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAG 61941237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAG 1140

 61941238 GATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGAT---------TGACTTCCTTCCTTCCTTCCTTC 61941288
          |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||
     1141 GATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGA-CTGACTGACTGACTTCCTTCCTTCCTTCCTTC 1199

 61941289 CTTCCTTC----TTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGACAAAGAATCACTC 61941344
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGACAAAGAATCACTC 1259

 61941345 TGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGG 61941404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGG 1319

 61941405 GTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGTGCCTGCTACC 61941464
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1320 GTTCAAGCGATTCTCATGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCGCCTGCTACC 1379

 61941465 CCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGC 61941524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGC 1439

 61941525 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTG 61941584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTG 1499

 61941585 CAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTCTATTGC 61941644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTCTATTGC 1559

 61941645 AGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAGCCCCAC 61941704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAGCCCCAC 1619

 61941705 AGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATA 61941764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATA 1679

 61941765 AAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTT 61941824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTT 1739

 61941825 GTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCA 61941884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCA 1799

 61941885 TACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTGTTGAATAGAATT 61941944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1800 TACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTGTTGAATAGAATT 1859

 61941945 GCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACAATAAATGGAATT 61942004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACAATAAATGGAATT 1919

 61942005 GGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAATTCCAAA 61942064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAATTCCAAA 1979

 61942065 TACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAAAAAGTGC 61942124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAAAAAGTGC 2039

 61942125 CTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATCTGGGTTATGGAT 61942184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2040 CTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACACTTTAGATCTGGGTTATGGAT 2099

 61942185 GTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGAAGGGTCC 61942244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGAAGGGTCC 2159

 61942245 CCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATGAACAGCA 61942304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATGAACAGCA 2219

 61942305 CAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAG 61942364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAG 2279

 61942365 GCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAATATGGTAA 61942424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAATATGGTAA 2339

 61942425 AAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAATC 61942484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAATC 2399

 61942485 CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAG 61942544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAG 2459

 61942545 TGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTGT 61942604
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGAGCCGAGATTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTGT 2519

 61942605 CTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAGTGAGAA 61942664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACAGTGAGAA 2579

 61942665 AATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTT----TTTC 61942720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||
     2580 AATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTCTTTTTTC 2639

 61942721 TTTTTTTTTT-GAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATC 61942779
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATC 2699

 61942780 GTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGA 61942839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGA 2759

 61942840 GTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTT 61942899
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GTAGATGGGCCTACAGGCATGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTT 2819

 61942900 TGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTT 61942959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTT 2879

 61942960 AAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCAC 61943019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2880 AAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAATTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCAC 2939

 61943020 CTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACA 61943079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACA 2999

 61943080 CAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAG 61943139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAG 3059

 61943140 TGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGC 61943199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGC 3119

 61943200 AGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGT 61943259
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3120 AGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGCGTTTGTGACATGTGATACATTGGT 3179

 61943260 GACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCA 61943319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCA 3239

 61943320 ATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAG 61943379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAG 3299

 61943380 GGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAA 61943439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAA 3359

 61943440 TGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTA 61943499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTA 3419

 61943500 CATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTG 61943559
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CATCAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTG 3479

 61943560 AATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTT 61943619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTT 3539

 61943620 TTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCA 61943679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCA 3599

 61943680 TAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTG 61943739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTG 3659

 61943740 GTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTA 61943799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTA 3719

 61943800 ACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTG 61943859
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3720 ACTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAATTGTAACTTTG 3779

 61943860 TACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCT 61943919
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCT 3839

 61943920 GGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTAT 61943979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 GGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTAT 3899

 61943980 TTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 61944039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 3959

 61944040 GGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC 61944099
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC 4019

 61944100 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTT 61944159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTT 4079

 61944160 AGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGA 61944219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGA 4139

 61944220 TCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCC 61944279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCC 4199

 61944280 AGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTC 61944339
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTC 4259

 61944340 TGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGT 61944399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGT 4319

 61944400 ATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAA 61944459
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4320 ATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACACCACATTAAAAA 4379

 61944460 AATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAG 61944519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 AATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAG 4439

 61944520 TTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGC 61944579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGC 4499

 61944580 ATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGC 61944639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 ATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGC 4559

 61944640 TTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATA 61944699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATA 4619

 61944700 TGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTG 61944759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTG 4679

 61944760 TGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 4707

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 4767

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 4827

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 4887

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 TGTTAAGATTCTGATGAGGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 4947

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4948 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAATAAA 5007

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 5067

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 5127

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     5128 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 5185

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 5245

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 5305

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 5365

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 5425

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 5485

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 5545

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 5605

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 5665

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 5725

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 5785

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 5845

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 5905

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 5965

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 6025

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 6085

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 6145

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6146 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 6205

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 6265

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 6325

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 6385

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 6445

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     6446 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 6504

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 6564

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 6624

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 6684

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 6744

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 6804

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 6864

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 6924

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6925 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 6984

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGT--CTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTT 61947423
          ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||
     6985 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCAT--ACCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTT 7042

 61947424 TTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTC 61947483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7043 TTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTC 7102

 61947484 TTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATG 61947543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7103 TTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATG 7162

 61947544 GCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAA 61947603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7163 GCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAA 7222

 61947604 ACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGA 61947663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7223 ACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGA 7282

 61947664 TTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTG 61947723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7283 TTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTG 7342

 61947724 TTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATG 61947783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7343 TTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATG 7402

 61947784 ATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTT 61947843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     7403 ATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA-TTTT 7461

 61947844 TTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTC 61947903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7462 TTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTC 7521

 61947904 TAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAA 61947963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7522 TAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAA 7581

 61947964 GTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAAT 61948023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7582 GTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAAT 7641

 61948024 CTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTT 61948083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7642 CTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTT 7701

 61948084 CCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTT 61948143
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7702 CCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATT 7761

 61948144 TCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACT 61948203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7762 TCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGATT 7821

 61948204 GTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTT 61948263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7822 GTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTT 7881

 61948264 TTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATA 61948323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7882 TTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATA 7941

 61948324 ACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTG 61948383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7942 ACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTG 8001

 61948384 TAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATG 61948443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8002 TAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATG 8061

 61948444 GAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTA 61948503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8062 GAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTA 8121

 61948504 TAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATT 61948563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8122 TAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATT 8181

 61948564 TTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGAT 61948623
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     8182 TTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGACTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGAT 8241

 61948624 ATTGGTG 61948630
          |||||||
     8242 ATTGGTG 8248

Alignment time is 9.8453 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3541] =>      3541 nucs 'mol-32-30f6-179553_3541'

Score:        3410
Aligned:      3539        nucs
Identic:      3524 (100%) nucs =>       294 (100%)      3230 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61945086,61945380] EXCISED REGION [61945389,61948630]
 second seq =>  [       1,     295] EXCISED REGION [     304,    3541]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [61945381,61945388]
 second seq =>         8 nucs [296,303]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 60

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 120

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 180

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTAAGATTCTGATGAGGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 240

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATA 61945380
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATA 295

EXCISED REGION

 61945389 CTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGT 61945448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 CTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGT 363

 61945449 TCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGA 61945508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGA 423

 61945509 CACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGG 61945568
          ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
      424 CACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTGGGG 481

 61945569 ATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAG 61945628
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 ATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAG 541

 61945629 GATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAAC 61945688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 GATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAAC 601

 61945689 TGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGAT 61945748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 TGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGAT 661

 61945749 AAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAG 61945808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 AAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAG 721

 61945809 GTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACAT 61945868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 GTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACAT 781

 61945869 TTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAA 61945928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 TTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAA 841

 61945929 ATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTG 61945988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 ATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTG 901

 61945989 CAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCA 61946048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 CAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCA 961

 61946049 TATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTG 61946108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 TATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTG 1021

 61946109 ATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAA 61946168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 ATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAA 1081

 61946169 AATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGT 61946228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 AATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGT 1141

 61946229 AAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATAT 61946288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 AAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATAT 1201

 61946289 GTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCT 61946348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 GTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCT 1261

 61946349 GTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTA 61946408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 GTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTA 1321

 61946409 TTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTAT 61946468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 TTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTAT 1381

 61946469 GTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGA 61946528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 GTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGA 1441

 61946529 TGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAG 61946588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1442 TGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAAAAG 1501

 61946589 CCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTAC 61946648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 CCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTAC 1561

 61946649 ATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATT 61946708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 ATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATT 1621

 61946709 TCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCC 61946768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 TCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCC 1681

 61946769 CACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTA 61946828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 CACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTA 1741

 61946829 TTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAAT 61946888
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     1742 TTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTCAAT 1800

 61946889 GTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATT 61946948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATT 1860

 61946949 CTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTC 61947008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTC 1920

 61947009 CACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAAT 61947068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAAT 1980

 61947069 GAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATC 61947128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATC 2040

 61947129 CAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCA 61947188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCA 2100

 61947189 AACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCC 61947248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCC 2160

 61947249 TATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACG 61947308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACG 2220

 61947309 GTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTT 61947368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTT 2280

 61947369 GTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGT--CTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTG 61947426
          |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTATGCTTGTTGGCCACGAGCAT--ACCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTG 2338

 61947427 CCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTG 61947486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTG 2398

 61947487 CCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCT 61947546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCT 2458

 61947547 CCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACT 61947606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACT 2518

 61947607 GCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTG 61947666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTG 2578

 61947667 TTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTG 61947726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTG 2638

 61947727 GATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATA 61947786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATA 2698

 61947787 GTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTT 61947846
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     2699 GTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTT 2757

 61947847 TTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAG 61947906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAG 2817

 61947907 AATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTC 61947966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTC 2877

 61947967 TTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTT 61948026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTT 2937

 61948027 CTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCT 61948086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCT 2997

 61948087 TGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCT 61948146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2998 TGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCT 3057

 61948147 GAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTT 61948206
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3058 GAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGATTGTT 3117

 61948207 TTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTG 61948266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTG 3177

 61948267 CTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAACT 61948326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 CTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAACT 3237

 61948327 TTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTAA 61948386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTAA 3297

 61948387 ATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGAA 61948446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 ATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGAA 3357

 61948447 TATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAA 61948506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAA 3417

 61948507 TTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTTT 61948566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTTT 3477

 61948567 ATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATATT 61948626
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ATGGATGGCTATTGTGAACGAGACTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATATT 3537

 61948627 GGTG 61948630
          ||||
     3538 GGTG 3541

Alignment time is 4.57962 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2891] =>      2891 nucs 'mol-32-3143-187757_2891'

Score:        2890
Aligned:      2890        nucs
Identic:      2890 (100%) nucs =>      2760 (100%)       130 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943080,61945839] EXCISED REGION [61945841,61945970]
 second seq =>  [       1,    2760] EXCISED REGION [    2762,    2891]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61945840,61945840]
 second seq =>         1 nucs [2761,2761]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61945839,61945839] to [61945840,61945840]
 second seq =>         1 nucs [2761,2761] to [2762,2762]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943080 CAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAG 61943139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAG 60

 61943140 TGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGC 61943199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGC 120

 61943200 AGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGT 61943259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGT 180

 61943260 GACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCA 61943319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCA 240

 61943320 ATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAG 61943379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAG 300

 61943380 GGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAA 61943439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAA 360

 61943440 TGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTA 61943499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTA 420

 61943500 CATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTG 61943559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTG 480

 61943560 AATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTT 61943619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTT 540

 61943620 TTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCA 61943679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCA 600

 61943680 TAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTG 61943739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTG 660

 61943740 GTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTA 61943799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTA 720

 61943800 ACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTG 61943859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTG 780

 61943860 TACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCT 61943919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCT 840

 61943920 GGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTAT 61943979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTAT 900

 61943980 TTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 61944039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 960

 61944040 GGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC 61944099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC 1020

 61944100 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTT 61944159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTT 1080

 61944160 AGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGA 61944219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGA 1140

 61944220 TCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCC 61944279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCC 1200

 61944280 AGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTC 61944339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTC 1260

 61944340 TGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGT 61944399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGT 1320

 61944400 ATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAA 61944459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAA 1380

 61944460 AATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAG 61944519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAG 1440

 61944520 TTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGC 61944579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGC 1500

 61944580 ATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGC 61944639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGC 1560

 61944640 TTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATA 61944699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATA 1620

 61944700 TGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTG 61944759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTG 1680

 61944760 TGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAA 61944819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAA 1740

 61944820 GAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTT 61944879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTT 1800

 61944880 TTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTG 61944939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTG 1860

 61944940 GGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGG 61944999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGG 1920

 61945000 TATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAG 61945059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAG 1980

 61945060 TCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCC 61945119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCC 2040

 61945120 ACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGAT 61945179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGAT 2100

 61945180 ATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGA 61945239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGA 2160

 61945240 TTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTC 61945299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTC 2220

 61945300 TGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATG 61945359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATG 2280

 61945360 TGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCC 61945419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCC 2340

 61945420 TTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATA 61945479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATA 2400

 61945480 TCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACG 61945539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACG 2460

 61945540 GGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTT 61945599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTT 2520

 61945600 CTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGA 61945659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGA 2580

 61945660 CTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGA 61945719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGA 2640

 61945720 TTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGAT 61945779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGAT 2700

 61945780 TTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCT 61945839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCT 2760

EXCISED REGION

 61945841 GTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCC 61945900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 GTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCC 2821

 61945901 TTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCT 61945960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 TTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCT 2881

 61945961 TATTTTACAG 61945970
          ||||||||||
     2882 TATTTTACAG 2891

Alignment time is 3.97371 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3038] =>      3038 nucs 'mol-32-3159-074110_3038'

Score:        3015
Aligned:      3037        nucs
Identic:      3035 (100%) nucs =>      1803 (100%)      1232 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61944400,61946202] EXCISED REGION [61946204,61947436]
 second seq =>  [       1,    1803] EXCISED REGION [    1805,    3038]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [1804,1804]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2204,2204]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [1801,1803] to [1805,1807]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61944400 ATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAA 61944459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAA 60

 61944460 AATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAG 61944519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAG 120

 61944520 TTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGC 61944579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGC 180

 61944580 ATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGC 61944639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGC 240

 61944640 TTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATA 61944699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATA 300

 61944700 TGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTG 61944759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTG 360

 61944760 TGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAA 61944819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAA 420

 61944820 GAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTT 61944879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTT 480

 61944880 TTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTG 61944939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTG 540

 61944940 GGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGG 61944999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGG 600

 61945000 TATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAG 61945059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAG 660

 61945060 TCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCC 61945119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCC 720

 61945120 ACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGAT 61945179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGAT 780

 61945180 ATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGA 61945239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGA 840

 61945240 TTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTC 61945299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTC 900

 61945300 TGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATG 61945359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATG 960

 61945360 TGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCC 61945419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCC 1020

 61945420 TTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATA 61945479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATA 1080

 61945480 TCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACG 61945539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACG 1140

 61945540 GGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTT 61945599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTT 1200

 61945600 CTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGA 61945659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGA 1260

 61945660 CTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGA 61945719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGA 1320

 61945720 TTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGAT 61945779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGAT 1380

 61945780 TTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCT 61945839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCT 1440

 61945840 TGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTC 61945899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTC 1500

 61945900 CTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACC 61945959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACC 1560

 61945960 TTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACA 61946019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACA 1620

 61946020 AGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACA 61946079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACA 1680

 61946080 AAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTG 61946139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTG 1740

 61946140 AGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCA 61946199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCA 1800

 61946200 TTT 61946202
          |||
     1801 TTT 1803

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 1864

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 1924

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 1984

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 2044

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 2104

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 2164

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2165 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 2224

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 2284

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 2344

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 2404

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 2464

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 2524

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 2584

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 2644

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 2704

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 2764

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 2824

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 2884

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 2944

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 3004

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTT 61947436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTT 3038

Alignment time is 4.12892 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7796] =>      7796 nucs 'mol-32-3164-232413_7796'

Score:        7730
Aligned:      7796        nucs
Identic:      7790 (100%) nucs =>      6157 (100%)      1633 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941679,61947838] EXCISED REGION [61947841,61949475]
 second seq =>  [       1,    6161] EXCISED REGION [    6162,    7796]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [61947839,61947840]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [61947839,61947851] to [61947841,61947853]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839] to [61947840,61947840]
 second seq =>         0 nucs

 61941679 ATGATTTCACAGGAGCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAG 61941738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGATTTCACAGGAGCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAG 60

 61941739 ACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTT 61941798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTT 120

 61941799 TTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGT 61941858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGT 180

 61941859 TGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTT 61941918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTT 240

 61941919 GTTCTGAGTCTCTGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGA 61941978
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTCTGAGTCTTTGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGA 300

 61941979 ATAAGCCCTCAACAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATC 61942038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAGCCCTCAACAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATC 360

 61942039 GATTGGAGTTTGAAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGG 61942098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTGGAGTTTGAAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGG 420

 61942099 TAAAAGGTATCACGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAAC 61942158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAAGGTATCACGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAAC 480

 61942159 GTACTCTTTAGATCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCA 61942218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTACTCTTTAGATCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCA 540

 61942219 ATTTAAAGGTGGATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGC 61942278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTAAAGGTGGATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGC 600

 61942279 ACTGGTTTGCAGCATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCA 61942338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTGGTTTGCAGCATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCA 660

 61942339 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTT 61942398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTT 720

 61942399 CGAGACGAGCCTGCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCC 61942458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGAGACGAGCCTGCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCC 780

 61942459 TGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGC 61942518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGCGTGGTGGCGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGC 840

 61942519 TCAAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCA 61942578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCA 900

 61942579 GCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAAC 61942638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCTGGGCAACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAAC 960

 61942639 AAATAGGGTAGTGCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAG 61942698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATAGGGTAGTGCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAG 1020

 61942699 AATCTTTTCCTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGG 61942758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCTTTTCCTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGG 1080

 61942759 CTGGAGTGCAGCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAAC 61942818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGGAGTGCAGCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAAC 1140

 61942819 TCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTA 61942878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTA 1200

 61942879 AGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGC 61942938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTTAAAACTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGC 1260

 61942939 TGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGAT 61942998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGTCTCAAACTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGAT 1320

 61942999 TACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTAT 61943058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACAGGCGTGAACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTAT 1380

 61943059 TCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCAC 61943118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTTCTTCCTAGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCAC 1440

 61943119 GGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGG 61943178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCAAGATTTGGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGG 1500

 61943179 GACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTT 61943238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GACTTACAACTCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTT 1560

 61943239 TGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAA 61943298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTGACATGTGATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAA 1620

 61943299 TGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAA 61943358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGACCTGACATATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAA 1680

 61943359 TATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGA 61943418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGA 1740

 61943419 TTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGT 61943478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTATATTTTTTATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGT 1800

 61943479 AAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATA 61943538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATA 1860

 61943539 GTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATT 61943598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATT 1920

 61943599 TATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTT 61943658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTT 1980

 61943659 TTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCA 61943718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCA 2040

 61943719 AACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAG 61943778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAG 2100

 61943779 ATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCA 61943838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCA 2160

 61943839 TTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCAT 61943898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCAT 2220

 61943899 TCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAAC 61943958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAAC 2280

 61943959 ATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTT 61944018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTT 2340

 61944019 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTC 61944078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTC 2400

 61944079 AAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGC 61944138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGC 2460

 61944139 CCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCT 61944198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCT 2520

 61944199 CGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGG 61944258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGG 2580

 61944259 CGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACAT 61944318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACAT 2640

 61944319 GTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATC 61944378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATC 2700

 61944379 CATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGT 61944438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGT 2760

 61944439 GTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCA 61944498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCA 2820

 61944499 TATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACA 61944558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACA 2880

 61944559 TACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGT 61944618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGT 2940

 61944619 GCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGA 61944678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGA 3000

 61944679 GGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGC 61944738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGC 3060

 61944739 CGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAAC 61944798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAAC 3120

 61944799 CAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATA 61944858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATA 3180

 61944859 TGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAA 61944918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAA 3240

 61944919 TTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACT 61944978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACT 3300

 61944979 TGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATC 61945038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATC 3360

 61945039 AGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATT 61945098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATT 3420

 61945099 ATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACG 61945158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACG 3480

 61945159 ATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAAT 61945218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAAT 3540

 61945219 AGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTG 61945278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTG 3600

 61945279 ATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGG 61945338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGG 3660

 61945339 AGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATG 61945398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATG 3720

 61945399 TGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTT 61945458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTT 3780

 61945459 GAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGAC 61945518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGAC 3840

 61945519 CAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATG 61945578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATG 3900

 61945579 TTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACA 61945638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACA 3960

 61945639 GCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAAT 61945698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAAT 4020

 61945699 GTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACAT 61945758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACAT 4080

 61945759 TCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATT 61945818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATT 4140

 61945819 TTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAG 61945878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAG 4200

 61945879 GCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAG 61945938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAG 4260

 61945939 GTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAG 61945998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAG 4320

 61945999 CAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAAC 61946058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAAC 4380

 61946059 ACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTG 61946118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTG 4440

 61946119 CCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTC 61946178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTC 4500

 61946179 AGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACG 61946238
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACG 4560

 61946239 TAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTAT 61946298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTAT 4620

 61946299 ATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAAT 61946358
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAAT 4680

 61946359 GCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAAC 61946418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAAC 4740

 61946419 TTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTT 61946478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTT 4800

 61946479 TCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCAT 61946538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCAT 4860

 61946539 TCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGA 61946598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGA 4920

 61946599 TGGCTTTTTTTTTT-CTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGG 61946657
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGG 4980

 61946658 TTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCA 61946717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCA 5040

 61946718 GGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCA 61946777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCA 5100

 61946778 CCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTT 61946837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTT 5160

 61946838 TAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTG 61946897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTG 5220

 61946898 TTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTAC 61946957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTAC 5280

 61946958 GGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGA 61947017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGA 5340

 61947018 TGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATG 61947077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATG 5400

 61947078 CATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGA 61947137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGA 5460

 61947138 GATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTT 61947197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTT 5520

 61947198 CCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCT 61947257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCT 5580

 61947258 GCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACAT 61947317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACAT 5640

 61947318 TGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTG 61947377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTG 5700

 61947378 TTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTT 61947437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTT 5760

 61947438 TTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCC 61947497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCC 5820

 61947498 AGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAA 61947557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAA 5880

 61947558 CCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTA 61947617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTA 5940

 61947618 CAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTG 61947677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTG 6000

 61947678 CTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTG 61947737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTG 6060

 61947738 TGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGT 61947797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGT 6120

 61947798 TGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA 61947838
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA 6161

EXCISED REGION

 61947841 TTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTAT 61947900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 TTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTAT 6221

 61947901 GTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGT 61947960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 GTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGT 6281

 61947961 TAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTC 61948020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 TAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTC 6341

 61948021 AATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTT 61948080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 AATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTT 6401

 61948081 TTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTT 61948140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 TTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTT 6461

 61948141 GTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAG 61948200
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 ATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAG 6521

 61948201 ACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTC 61948260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 ACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTC 6581

 61948261 TTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGA 61948320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 TTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGA 6641

 61948321 ATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAAT 61948380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6642 ATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAAT 6701

 61948381 CTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAAT 61948440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 CTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAAT 6761

 61948441 ATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTT 61948500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6762 ATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTT 6821

 61948501 TTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTT 61948560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 TTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTT 6881

 61948561 ATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGAC 61948620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 ATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGAC 6941

 61948621 GATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTT 61948680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6942 GATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTT 7001

 61948681 CCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTA 61948740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7002 CCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTA 7061

 61948741 CAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCA 61948800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7062 CAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCA 7121

 61948801 GTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGT 61948860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7122 GTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGT 7181

 61948861 GGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGC 61948920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7182 GGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGC 7241

 61948921 CCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTT 61948980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7242 CCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTT 7301

 61948981 CCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGT 61949040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7302 CCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGT 7361

 61949041 CATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACA 61949100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7362 CATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACA 7421

 61949101 TATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTT 61949160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7422 TATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTT 7481

 61949161 GATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATC 61949220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7482 GATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATC 7541

 61949221 AGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGG 61949280
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7542 AGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGG 7601

 61949281 AATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAAT 61949340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7602 AATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAAT 7661

 61949341 AGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCT 61949400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7662 AGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCT 7721

 61949401 TTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTAT 61949460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7722 TTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTAT 7781

 61949461 TGGTCTGTTCAGAGT 61949475
          |||||||||||||||
     7782 TGGTCTGTTCAGAGT 7796

Alignment time is 9.14014 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3626] =>      3626 nucs 'mol-32-322a-039421_3626'

Score:        3625
Aligned:      3625        nucs
Identic:      3625 (100%) nucs =>       419 (100%)      3206 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941511,61941929] EXCISED REGION [61941931,61945136]
 second seq =>  [       1,     419] EXCISED REGION [     421,    3626]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61941930,61941930]
 second seq =>         1 nucs [420,420]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [419,420] to [420,421]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61941929,61941929] to [61941931,61941931]
 second seq =>         1 nucs [419,419] to [421,421]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61941511 TATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCA 61941570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCA 60

 61941571 AAGTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGA 61941630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGA 120

 61941631 ATCTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAG 61941690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAG 180

 61941691 GAGCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGG 61941750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGG 240

 61941751 TTTTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAAT 61941810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAAT 300

 61941811 TTGTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATG 61941870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATG 360

 61941871 TCTGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCT 61941929
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCT 419

EXCISED REGION

 61941931 TGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAA 61941990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAA 480

 61941991 CAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTG 61942050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTG 540

 61942051 AAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCA 61942110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCA 600

 61942111 CGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGA 61942170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGA 660

 61942171 TCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGG 61942230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGG 720

 61942231 ATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAG 61942290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAG 780

 61942291 CATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCC 61942350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCC 840

 61942351 CAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCT 61942410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCT 900

 61942411 GCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGC 61942470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGC 960

 61942471 GTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGA 61942530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGA 1020

 61942531 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 61942590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 1080

 61942591 GAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGT 61942650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGT 1140

 61942651 GCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTT 61942710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTT 1200

 61942711 TTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGC 61942770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGC 1260

 61942771 AGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCA 61942830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCA 1320

 61942831 GCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTT 61942890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTT 1380

 61942891 TTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACT 61942950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACT 1440

 61942951 CTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAA 61943010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAA 1500

 61943011 CTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAG 61943070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAG 1560

 61943071 GGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGG 61943130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGG 1620

 61943131 TGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTC 61943190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTC 1680

 61943191 AGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGA 61943250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGA 1740

 61943251 TACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATA 61943310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATA 1800

 61943311 TGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAA 61943370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAA 1860

 61943371 TAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTA 61943430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTA 1920

 61943431 TTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAA 61943490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAA 1980

 61943491 TACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTT 61943550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTT 2040

 61943551 GGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAA 61943610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAA 2100

 61943611 TTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTA 61943670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTA 2160

 61943671 TACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCAT 61943730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCAT 2220

 61943731 TTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATG 61943790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATG 2280

 61943791 TTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATT 61943850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATT 2340

 61943851 GTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCT 61943910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCT 2400

 61943911 CCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTA 61943970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTA 2460

 61943971 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 61944030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 2520

 61944031 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 61944090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 2580

 61944091 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 61944150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 2640

 61944151 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 61944210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 2700

 61944211 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 61944270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 2760

 61944271 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 61944330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 2820

 61944331 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 61944390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 2880

 61944391 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 61944450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 2940

 61944451 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 61944510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 3000

 61944511 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 61944570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 3060

 61944571 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 61944630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 3120

 61944631 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 61944690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 3180

 61944691 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 61944750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 3240

 61944751 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAG 61944810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAG 3300

 61944811 TATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTAT 61944870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTAT 3360

 61944871 TTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCA 61944930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCA 3420

 61944931 CCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCAT 61944990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCAT 3480

 61944991 TCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGG 61945050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGG 3540

 61945051 TCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGAT 61945110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGAT 3600

 61945111 TTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACC 61945136
          ||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACC 3626

Alignment time is 4.67216 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8547] =>      8547 nucs 'mol-32-3240-155891_8547'

Score:        8492
Aligned:      8547        nucs
Identic:      8542 (100%) nucs =>      4205 (100%)      4337 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941998,61946202] EXCISED REGION [61946204,61950544]
 second seq =>  [       1,    4205] EXCISED REGION [    4207,    8547]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [4206,4206]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [4203,4205] to [4207,4209]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61941998 TGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAA 61942057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAAGTTAA 60

 61942058 TTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAA 61942117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACGATTAA 120

 61942118 AAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATCTGGGT 61942177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATCTGGGT 180

 61942178 TATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGA 61942237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGATGAAGA 240

 61942238 AGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATG 61942297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCATTATG 300

 61942298 AACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACT 61942357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACT 360

 61942358 TTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAAT 61942417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGCCCAAT 420

 61942418 ATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCC 61942477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGTGTGCC 480

 61942478 TGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAG 61942537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGGTGGAG 540

 61942538 GTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAG 61942597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTAAG 600

 61942598 ACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACA 61942657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGCATACA 660

 61942658 GTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTT 61942717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTTCTTTT 720

 61942718 TTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGA 61942777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGA 780

 61942778 TCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCT 61942837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCT 840

 61942838 GAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTG 61942897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTG 900

 61942898 TTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGC 61942957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGC 960

 61942958 TTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGC 61943017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGC 1020

 61943018 ACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGA 61943077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGA 1080

 61943078 CACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAA 61943137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAA 1140

 61943138 AGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTT 61943197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTT 1200

 61943198 GCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTG 61943257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTG 1260

 61943258 GTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTT 61943317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTT 1320

 61943318 CAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTG 61943377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTG 1380

 61943378 AGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAA 61943437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAA 1440

 61943438 AATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGT 61943497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGT 1500

 61943498 TACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTC 61943557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTC 1560

 61943558 TGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTAT 61943617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTAT 1620

 61943618 TTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTG 61943677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTG 1680

 61943678 CATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTG 61943737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTG 1740

 61943738 TGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTAT 61943797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTAT 1800

 61943798 TAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTT 61943857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTT 1860

 61943858 TGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTAT 61943917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTAT 1920

 61943918 CTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTT 61943977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTT 1980

 61943978 ATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGT 61944037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGT 2040

 61944038 GGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA 61944097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA 2100

 61944098 GCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTT 61944157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTT 2160

 61944158 TTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGT 61944217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGT 2220

 61944218 GATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGG 61944277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGG 2280

 61944278 CCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTG 61944337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTG 2340

 61944338 TCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACA 61944397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACA 2400

 61944398 GTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAA 61944457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAA 2460

 61944458 AAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAAT 61944517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAAT 2520

 61944518 AGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTT 61944577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTT 2580

 61944578 GCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACC 61944637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACC 2640

 61944638 GCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTA 61944697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTA 2700

 61944698 TATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTT 61944757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTT 2760

 61944758 TGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAG 61944817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAG 2820

 61944818 AAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAAT 61944877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAAT 2880

 61944878 TTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAG 61944937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAG 2940

 61944938 TGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACA 61944997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACA 3000

 61944998 GGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTA 61945057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTA 3060

 61945058 AGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAG 61945117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAG 3120

 61945118 CCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTG 61945177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTG 3180

 61945178 ATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGA 61945237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGA 3240

 61945238 GATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCT 61945297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCT 3300

 61945298 TCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAA 61945357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAA 3360

 61945358 TGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATC 61945417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATC 3420

 61945418 CCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAA 61945477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAA 3480

 61945478 TATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGA 61945537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGA 3540

 61945538 CGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCC 61945597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCC 3600

 61945598 TTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTG 61945657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTG 3660

 61945658 GACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCA 61945717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCA 3720

 61945718 GATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAG 61945777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAG 3780

 61945778 ATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCC 61945837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCC 3840

 61945838 CTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTT 61945897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTT 3900

 61945898 TCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCA 61945957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCA 3960

 61945958 CCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCA 61946017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCA 4020

 61946018 CAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAA 61946077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAA 4080

 61946078 CAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAAT 61946137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAAT 4140

 61946138 TGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTC 61946197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTC 4200

 61946198 CATTT 61946202
          |||||
     4201 CATTT 4205

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 4266

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 4326

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 4386

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 4446

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 4506

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 4566

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     4567 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 4626

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 4686

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 4746

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 4806

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 4866

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 4926

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 4986

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 5046

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 5106

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 5166

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 5226

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 5286

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 5346

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 5406

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 5466

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 5526

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 5586

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 61947642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 5646

 61947643 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 61947702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 5706

 61947703 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 61947762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 5766

 61947763 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 61947822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 5826

 61947823 AGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 61947882
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 AGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 5885

 61947883 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 61947942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 5945

 61947943 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 61948002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5946 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 6005

 61948003 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 61948062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6006 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 6065

 61948063 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 61948122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6066 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 6125

 61948123 TTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 61948182
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6126 TTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 6185

 61948183 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 61948242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6186 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 6245

 61948243 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 61948302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6246 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 6305

 61948303 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 61948362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6306 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 6365

 61948363 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 61948422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6366 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 6425

 61948423 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 61948482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6426 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 6485

 61948483 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 61948542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6486 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 6545

 61948543 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 61948602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6546 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 6605

 61948603 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 61948662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 6665

 61948663 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 61948722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 6725

 61948723 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 61948782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 6785

 61948783 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 61948842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 6845

 61948843 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 61948902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 6905

 61948903 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 61948962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 6965

 61948963 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 61949022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 7025

 61949023 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 61949082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 7085

 61949083 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 61949142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 7145

 61949143 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 61949202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 7205

 61949203 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 61949262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 7265

 61949263 GTGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 61949322
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 GCGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 7325

 61949323 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAAT 61949382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAAT 7385

 61949383 TAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGT 61949442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 TAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGT 7445

 61949443 TCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGA 61949502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 TCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGA 7505

 61949503 GAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATA 61949562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 GAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATA 7565

 61949563 GAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCG 61949622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 GAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCG 7625

 61949623 GTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTT 61949682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 GTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTT 7685

 61949683 TATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGT 61949742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 TATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGT 7745

 61949743 TTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTT 61949802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 TTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTT 7805

 61949803 GGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTC 61949862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 GGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTC 7865

 61949863 TGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCA 61949922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 TGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCA 7925

 61949923 CTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTAT 61949982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 CTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTAT 7985

 61949983 GTTTTATCCATTTTCACTAGTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTT 61950042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 GTTTTATCCATTTTCACTAGTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTT 8045

 61950043 TACCCAAAAGTCATTCAGGAGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGA 61950102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 TACCCAAAAGTCATTCAGGAGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGA 8105

 61950103 GATCTTAGTGTTGATTTCTATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGAT 61950162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 GATCTTAGTGTTGATTTCTATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGAT 8165

 61950163 TTCACTTGGTTTGAATTTGCTGGGAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGA 61950222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 TTCACTTGGTTTGAATTTGCTGGGAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGA 8225

 61950223 GTATGTGTCATGTGCAGATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCT 61950282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 GTATGTGTCATGTGCAGATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCT 8285

 61950283 GCAGATGTCTGTTAGGTCTATTTGATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTT 61950342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 GCAGATGTCTGTTAGGTCTATTTGATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTT 8345

 61950343 AGTTTTCTGCTTCGATGACCTGTCTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTAT 61950402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 AGTTTTCTGCTTCGATGACCTGTCTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTAT 8405

 61950403 TATTATGTGGTTATGTAAGTCTCTTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTG 61950462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 TATTATGTGGTTATGTAAGTCTCTTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTG 8465

 61950463 CTCCAGTGTTGGGTGCATATATAAGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCT 61950522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 CTCCAGTGTTGGGTGCATATATAAGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCT 8525

 61950523 TTATCATTACGTAATGCCCTTC 61950544
          ||||||||||||||||||||||
     8526 TTATCATTACGTAATGCCCTTC 8547

Alignment time is 10.2345 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,   12809] =>     12809 nucs 'mol-32-3311-010785_12809'

Score:       11767
Aligned:     12079        nucs
Identic:     12049 (100%) nucs =>      2067 ( 99%)      9982 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942710,61944787] EXCISED REGION [61945086,61955085]
 second seq =>  [       7,    2085] EXCISED REGION [    2086,   12079]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942710 TTTCTTTTTTCTTTTTTTTTT-GAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCA 61942768
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 TTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCA 66

 61942769 GCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCT 61942828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 GCAGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCT 126

 61942829 CAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACT 61942888
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      127 CAGCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCATGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACT 186

 61942889 TTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAA 61942948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 TTTTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAA 246

 61942949 CTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTG 61943008
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      247 CTCTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAATTGGGATTACAGGCGTG 306

 61943009 AACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCT 61943068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 AACTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCT 366

 61943069 AGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTT 61943128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 AGGGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTT 426

 61943129 GGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAAC 61943188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 GGTGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAAC 486

 61943189 TCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGT 61943248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      487 TCAGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGCGTTTGTGACATGT 546

 61943249 GATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACA 61943308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 GATACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACA 606

 61943309 TATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTT 61943368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 TATGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTT 666

 61943369 AATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTT 61943428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 AATAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTT 726

 61943429 TATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTA 61943488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 TATTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTA 786

 61943489 AATACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCAC 61943548
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 AATACTTGTTACATCAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCAC 846

 61943549 TTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAA 61943608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 TTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAA 906

 61943609 AATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATG 61943668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 AATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATG 966

 61943669 TATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATC 61943728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 TATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATC 1026

 61943729 ATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATA 61943788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 ATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATA 1086

 61943789 TGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAA 61943848
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
     1087 TGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAA 1146

 61943849 TTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCT 61943908
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 TTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCT 1206

 61943909 CTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTT 61943968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 CTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTT 1266

 61943969 TATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTG 61944028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 TATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTG 1326

 61944029 GAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCT 61944088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1327 GAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCT 1386

 61944089 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGT 61944148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGT 1446

 61944149 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTA 61944208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTA 1506

 61944209 GCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 61944268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 1566

 61944269 TGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTA 61944328
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1567 TGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTA 1626

 61944329 TCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCA 61944388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 TCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCA 1686

 61944389 CAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATAC 61944448
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
     1687 CAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACAC 1746

 61944449 CACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCT 61944508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 CACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCT 1806

 61944509 ATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTT 61944568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 ATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTT 1866

 61944569 GTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCAC 61944628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCAC 1926

 61944629 TTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAA 61944688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAA 1986

 61944689 ACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGG 61944748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGG 2046

 61944749 ACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 ACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 2085

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 2145

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 2205

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 2265

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 2325

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 2385

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 2445

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 2505

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     2506 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 2563

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 2623

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 2683

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 2743

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 2803

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 2863

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 2923

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 2983

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 3043

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 3103

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 3163

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 3223

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 3283

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 3343

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 3403

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 3463

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 3523

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3524 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 3583

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 3643

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 3703

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 3763

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 3823

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     3824 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 3882

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 3942

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 4002

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 4062

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 4122

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 4182

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 4242

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 4302

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 4362

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 61947425
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATATCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 4422

 61947426 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 61947485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 4482

 61947486 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 61947545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 4542

 61947546 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 61947605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 4602

 61947606 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 61947665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 4662

 61947666 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 61947725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 4722

 61947726 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 61947785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 4782

 61947786 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTT 61947845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     4783 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA--TTTTT 4840

 61947846 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 61947905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 4900

 61947906 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 61947965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 4960

 61947966 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 61948025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 5020

 61948026 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 61948085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 5080

 61948086 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTC 61948145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5081 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATTTC 5140

 61948146 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 61948205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 5200

 61948206 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 61948265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 5260

 61948266 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 61948325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 5320

 61948326 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 61948385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 5380

 61948386 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 61948445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 5440

 61948446 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 61948505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 5500

 61948506 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 61948565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 5560

 61948566 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 61948625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 5620

 61948626 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 61948685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 5680

 61948686 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 61948745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 5740

 61948746 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 61948805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 5800

 61948806 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTGGTGA 61948865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5801 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGCGGTGA 5860

 61948866 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 61948925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 5920

 61948926 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 61948985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 5980

 61948986 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 61949045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 6040

 61949046 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 61949105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 6100

 61949106 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 61949165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 6160

 61949166 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 61949225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 6220

 61949226 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 61949285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6221 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 6280

 61949286 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 61949345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 6340

 61949346 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 61949405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 6400

 61949406 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 61949465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 6460

 61949466 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 61949525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 6520

 61949526 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 61949585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 6580

 61949586 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 61949645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 6640

 61949646 CCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 61949705
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 CCAATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 6700

 61949706 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 61949765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 6760

 61949766 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 61949825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 6820

 61949826 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 61949885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 6880

 61949886 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 61949945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6881 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 6940

 61949946 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 61950005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6941 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 7000

 61950006 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 61950065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7001 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 7060

 61950066 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 61950125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7061 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 7120

 61950126 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 61950185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7121 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 7180

 61950186 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 61950245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7181 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 7240

 61950246 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 61950305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7241 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 7300

 61950306 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 61950365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7301 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 7360

 61950366 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 61950425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7361 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 7420

 61950426 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 61950485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7421 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 7480

 61950486 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATGCCCTTCT 61950545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7481 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATGCCCTTCT 7540

 61950546 TTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCACTCTGCTACCCAGGCTGGAGT 61950605
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7541 TTGT-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCACTCTGCTACCCAGGCTGGAGT 7599

 61950606 GCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGTGACCTCTGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC 61950665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7600 GCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGTGACCTCTGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC 7659

 61950666 TACTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACCACACCGAGCTAATTTTTGTATTTTTT 61950725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7660 TACTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACCACACCGAGCTAATTTTTGTATTTTTT 7719

 61950726 TTTAGGCAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTTGGGTACAGTGGCACAATCTTGGCTCAC 61950785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7720 TTTAGGCAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTTGGGTACAGTGGCACAATCTTGGCTCAC 7779

 61950786 TGCAACCGCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTTTCATGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG 61950845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7780 TGCAACCGCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTTTCATGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG 7839

 61950846 ATTACAGGTGTGCACCATCACGCATGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 61950905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7840 ATTACAGGTGTGCACCATCACGCATGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 7899

 61950906 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGC 61950965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7900 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGC 7959

 61950966 CTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGGGCTATTGCTCCTGGCCTAATTTTTGTATTTT 61951025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7960 CTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGGGCTATTGCTCCTGGCCTAATTTTTGTATTTT 8019

 61951026 TTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCAAGCTCCTAGCC 61951085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8020 TTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCAAGCTCCTAGCC 8079

 61951086 TCAAATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACTGT 61951145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8080 TCAAATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACTGT 8139

 61951146 GCCTGGCTTTCTTTGTCTTTTTTTGATCATTGTTGGTTTAAAGCCTTTTTTGTCTAAAAT 61951205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8140 GCCTGGCTTTCTTTGTCTTTTTTTGATCATTGTTGGTTTAAAGCCTTTTTTGTCTAAAAT 8199

 61951206 TAGAATAGCAATGCCTGCTCTTTTATGTTTTCTGTTTGCTTGGTAGATTTTTTCCATTTC 61951265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8200 TAGAATAGCAATGCCTGCTCTTTTATGTTTTCTGTTTGCTTGGTAGATTTTTTCCATTTC 8259

 61951266 TTTGAGCCTATGGGTATCATGCCTATGAGATGAGTTTCTTGAAGACAGCATACAGTTGGG 61951325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8260 TTTGAGCCTATGGGTATCATGCCTATGAGATGAGTTTCTTGAAGACAGCATACAGTTGGG 8319

 61951326 TCGTTCTTCTTTATCCAACTTGCCAGTCTGTGCCTTTTAATTGGAGTATTTAGCCTGTTT 61951385
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8320 TTGTTCTTCTTTATCCAACTTGCCAGTCTGTGCCTTTTAATTGGAGTATTTAGCCTGTTT 8379

 61951386 ATGTTCAAAGTTAATATTGATATGTGCAGATTTGATTGTCATTGTGTTATTAGCTGGTTG 61951445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8380 ATGTTCAAAGTTAATATTGATATGTGCAGATTTGATTGTCATTGTGTTATTAGCTGGTTG 8439

 61951446 TCATATAGACTTGATTGTGTCATTGTTTTATAGTGTCAATGGTCATGTACTTAAGTGTGT 61951505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8440 TCATATAGACTTGATTGTGTCATTGTTTTATAGTGTCAATGGTCATGTACTTAAGTGTGT 8499

 61951506 TTTTGTGGTGGCCAGTAGTGGTTTTTCATTTCCATGTTTGGCATTCTGTTAAGGACTTCT 61951565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8500 TTTTGTGGTGGCCAGTAGTGGTTTTTCATTTCCATGTTTGGCATTCTGTTAAGGACTTCT 8559

 61951566 TGTAAGGCAGGTCTCGTGGTACTAAATTTCCTTAGCAGTTGCTTGTCTGAAAAGAATCTT 61951625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8560 TGTAAGGCAGGTCTCGTGGTACTAAATTTCCTTAGCAGTTGCTTGTCTGAAAAGAATCTT 8619

 61951626 ATTTCTCCTTCACTTATGAACCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTTGGTTGGGATTTA 61951685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8620 ATTTCTCCTTCACTTATGAACCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTTGGTTGGGATTTA 8679

 61951686 TTTTCTTTAAGAATTCTGAATATAGGTTCCCAGTCTTTTCTGGCTTGTAGAGTTTTTGCT 61951745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8680 TTTTCTTTAAGAATTCTGAATATAGGTTCCCAGTCTTTTCTGGCTTGTAGAGTTTTTGCT 8739

 61951746 GAAAGGTACAGTTAGCTTGATGAGGTTCCCTTTGTTGATGACCTGCCCCTTCTCTCTAGC 61951805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8740 GAAAGGTACAGTTAGCTTGATGAGGTTCCCTTTGTTGATGACCTGCCCCTTCTCTCTAGC 8799

 61951806 TGCCTTTTTTTCTTCCATGTTAACCTTGGTTAATCTGACAATTATGAGTCTTGAGGATGG 61951865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8800 TGCCTTTTTTTCTTCCATGTTAACCTTGGTTAATCTGACAATTATGAGTCTTGAGGATGG 8859

 61951866 TCACCTTGTATACTATCATCTAACAGGGGTTCCCTGCATTTCCTGAATTTCAATGTTGAC 61951925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8860 TCACCTTGTATACTATCATCTAACAGGGGTTCCCTGCATTTCCTGAATTTCAATGTTGAC 8919

 61951926 CTCTTTAGCAAGGTTGCAGAAATTTTTGCAGAGAATATCCTCAAATATGTTTTCCGGCCA 61951985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8920 CTCTTTAGCAAGGTTGCAGAAATTTTTGCAGAGAATATCCTCAAATATGTTTTCCGGCCA 8979

 61951986 GGCACGGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACC 61952045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8980 GGCACGGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACC 9039

 61952046 TGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCCCGTCTCTATTAAAAA 61952105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9040 TGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCCCGTCTCTATTAAAAA 9099

 61952106 TACAAAAAAATTAGCCAGGAGTGGTGGTGAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCT 61952165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9100 TACAAAAAAATTAGCCAGGAGTGGTGGTGAGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCT 9159

 61952166 AAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCA 61952225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9160 AAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCA 9219

 61952226 TTGCACTCCAACCTGGACAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAAATGTTTTCC 61952285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9220 TTGCACTCCAACCTGGACAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAATAAAAATGTTTTCC 9279

 61952286 AAGTTGCTTGCTCTCTCCCCTTTTCTTTCAGGGATGCCAGTGAGCTGTGCGTTTGGTCTT 61952345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9280 AAGTTGCTTGCTCTCTCCCCTTTTCTTTCAGGGATGCCAGTGAGCTGTGCGTTTGGTCTT 9339

 61952346 TTTACATAATCCCATATTTCTTAGAGGTTTTGTTCATTCTTTTTTATTCCTTTTTCTTTA 61952405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9340 TTTACATAATCCCATATTTCTTAGAGGTTTTGTTCATTCTTTTTTATTCCTTTTTCTTTA 9399

 61952406 TTTTTGTCTGACTGAGTTGATTTGAAGAATCGTTCTTTGAGCTCTGAGATTCTTTCCTCA 61952465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9400 TTTTTGTCTGACTGAGTTGATTTGAAGAATCGTTCTTTGAGCTCTGAGATTCTTTCCTCA 9459

 61952466 GCTTGGTGTATTCTGTTGTTAATACTTCCGATTGTATTACACAATTTTTTGTAGTGAGTT 61952525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9460 GCTTGGTGTATTCTGTTGTTAATACTTCCGATTGTATTACACAATTTTTTGTAGTGAGTT 9519

 61952526 TTTCAGCTCTATCAGATCAGTTTGGTTCTTTCTTAAAACGACTATTTTCTCTTTCAGCTC 61952585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9520 TTTCAGCTCTATCAGATCAGTTTGGTTCTTTCTTAAAACGACTATTTTCTCTTTCAGCTC 9579

 61952586 TTGTCTCATTTTATTGGATTCCTTAGATTCCTTGAATTGGGTTTTGGCCTTCTCCTGAAT 61952645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9580 TTGTCTCATTTTATTGGATTCCTTAGATTCCTTGAATTGGGTTTTGGCCTTCTCCTGAAT 9639

 61952646 GTCATTGATCTTCGTTCCTATTCAGATTGTGAATTCTGTGTCTGTCGTTTCAGCCATTTG 61952705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9640 GTCATTGATCTTCGTTCCTATTCAGATTGTGAATTCTGTGTCTGTCGTTTCAGCCATTTG 9699

 61952706 AGCTTGTTGGGGAAACCAGCCCCACACCACCTGGCGGGTACCCCGAGTCCAGCCGAGACA 61952765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9700 AGCTTGTTGGGGAAACCAGCCCCACACCACCTGGCGGGTACCCCGAGTCCAGCCGAGACA 9759

 61952766 AAGGAGTTAGAAAGAGACAGAATAAAATTTTAAAAGGCAGGTCCAAGGGACCGGAGCGTC 61952825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9760 AAGGAGTTAGAAAGAGACAGAATAAAATTTTAAAAGGCAGGTCCAAGGGACCGGAGCGTC 9819

 61952826 AGAGGCTTGCTCAGGGCCCAGAGCTCTTCGGCTCCACCTAATTTATTGGTTTACAAGTTC 61952885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9820 AGAGGCTTGCTCAGGGCCCAGAGCTCTTCGGCTCCACCTAATTTATTGGTTTACAAGTTC 9879

 61952886 TTTGTTCTTAGGGCAGATGGGAAGGGTAGGAAGGGATGAGGAAAAGGATTAATCAACGAA 61952945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9880 TTTGTTCTTAGGGCAGATGGGAAGGGTAGGAAGGGATGAGGAAAAGGATTAATCAACGAA 9939

 61952946 GGAGAATTCGTGCGTCGTTCAATAAGATGTATAGCAGTGGCGGTTTCTGTGAATTTCCTT 61953005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9940 GGAGAATTCGTGCGTCGTTCAATAAGATGTATAGCAGTGGCGGTTTCTGTGAATTTCCTT 9999

 61953006 GAGCAAAGGCGTGTGTCTAAACTACTTAAGATCTTTAACTTATCCGGAATGAAATGGGTG 61953065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10000 GAGCAAAGGCGTGTGTCTAAACTACTTAAGATCTTTAACTTATCCGGAATGAAATGGGTG 10059

 61953066 GGAGTGGGTTTCAGGGGGAGCCAAGATGTTTGATTATACTCCACTGCTTCAAGGGAGTGT 61953125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10060 GGAGTGGGTTTCAGGGGGAGCCAAGATGTTTGATTATACTCCACTGCTTCAAGGGAGTGT 10119

 61953126 TATCTCCCCAAGCAACCTCTGGAATGCCGCTGAGCTGTTATGCTTTAGGGGCAAAAAGAC 61953185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10120 TATCTCCCCAAGCAACCTCTGGAATGCCGCTGAGCTGTTATGCTTTAGGGGCAAAAAGAC 10179

 61953186 ATGAAGGCAATAAGGAGACTTTTCTCCTCAAAGGCCACCCATGGCTTCCCATGGGTGTCT 61953245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10180 ATGAAGGCAATAAGGAGACTTTTCTCCTCAAAGGCCACCCATGGCTTCCCATGGGTGTCT 10239

 61953246 CACACAGGGGAGACCAACTCATCTGGCATCCCAGAAACTCTCTTTCCCACAGAGCTGATT 61953305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10240 CACACAGGGGAGACCAACTCATCTGGCATCCCAGAAACTCTCTTTCCCACAGAGCTGATT 10299

 61953306 AAGAACCATTGCTGGGGAACTAGTGTGGTCATTTGGAGGTAAGACGACACTCTGGCTTTT 61953365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10300 AAGAACCATTGCTGGGGAACTAGTGTGGTCATTTGGAGGTAAGACGACACTCTGGCTTTT 10359

 61953366 TGAGTTGCCAGAGTTTTTGTGCTGATTCTTTCTCATCTGAGTGGACTGATGTTCTTTTAA 61953425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10360 TGAGTTGCCAGAGTTTTTGTGCTGATTCTTTCTCATCTGAGTGGACTGATGTTCTTTTAA 10419

 61953426 TCTTTGAAGTTGCTGTCCCTTGGATGGGCCTCAGCCTCCAAAGTAACTGGGACTACAGGC 61953485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10420 TCTTTGAAGTTGCTGTCCCTTGGATGGGCCTCAGCCTCCAAAGTAACTGGGACTACAGGC 10479

 61953486 ATGCACCACCGCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGACGAAGTTTCACCATGTT 61953545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10480 ATGCACCACCGCGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTATTAGAGACGAAGTTTCACCATGTT 10539

 61953546 AGCCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCATGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAATGC 61953605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10540 AGCCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTCATGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCGAAAATGC 10599

 61953606 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCCGGCCCGGTTTTTTTCTTTTGCATTCTTTGAT 61953665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10600 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCCGGCCCGGTTTTTTTCTTTTGCATTCTTTGAT 10659

 61953666 GCCCTTGAGGGTTTGACTGTGGTATCAGTTGGGTTCAGTTGACTGGGCTTTGTTTCTGGA 61953725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10660 GCCCTTGAGGGTTTGACTGTGGTATCAGTTGGGTTCAGTTGACTGGGCTTTGTTTCTGGA 10719

 61953726 AGATTTCAGAAGGCCAAGGTTCAGTTCAGTTCAGCACTCCTGGGCTGCTTGCTCTAACCC 61953785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10720 AGATTTCAGAAGGCCAAGGTTCAGTTCAGTTCAGCACTCCTGGGCTGCTTGCTCTAACCC 10779

 61953786 TGGAGGCCTGGTACCAGGCCCATTGCTTTGTTCTCCGGCCCCTTGAGGTTAAGCACCCGC 61953845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10780 TGGAGGCCTGGTACCAGGCCCATTGCTTTGTTCTCCGGCCCCTTGAGGTTAAGCACCCGC 10839

 61953846 TGTGCTGGTGAGGTGGAGGTGTTCCCAGTCTGCTGGCAACAACACCCTGCCAAAGCACTT 61953905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10840 TGTGCTGGTGAGGTGGAGGTGTTCCCAGTCTGCTGGCAACAACACCCTGCCAAAGCACTT 10899

 61953906 CATCAGAGCAGTGGCAGCAGGATCTGTGCTCATGTGAATGCATGCTGGCAGCTGTGGTGG 61953965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10900 CATCAGAGCAGTGGCAGCAGGATCTGTGCTCATGTGAATGCATGCTGGCAGCTGTGGTGG 10959

 61953966 CAAATCAATATTGACAGTTTTTCTAGTGGATTGTCTTAAATTTCCCTGATAGTTGAATAA 61954025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10960 CAAATCAATATTGACAGTTTTTCTAGTGGATTGTCTTAAATTTCCCTGATAGTTGAATAA 11019

 61954026 CTATCTATAAATAATGACCAATTTATGTTCATGGATTTATCTTTTATATGAATTTTGCCC 61954085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11020 CTATCTATAAATAATGACCAATTTATGTTCATGGATTTATCTTTTATATGAATTTTGCCC 11079

 61954086 TTTGTTTGAAGAGAATATTGTTAACATCATGTTTCTCTCCATACAATTTTTTTAATTTAA 61954145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11080 TTTGTTTGAAGAGAATATTGTTAACATCATGTTTCTCTCCATACAATTTTTTTAATTTAA 11139

 61954146 ATAGACAAATAATAATTGTATATATATATTTTTCTTTAATTTTTTTTTTGAGACAGAGTC 61954205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11140 ATAGACAAATAATAATTGTATATATATATTTTTCTTTAATTTTTTTTTTGAGACAGAGTC 11199

 61954206 TCATTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCC 61954265
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
    11200 TCATTCTGTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCCGCC 11259

 61954266 TCCCAGGTTCAAGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGGATTACAGACACCC 61954325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11260 TCCCAGGTTCAAGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAGCAGCTGGGATTACAGACACCC 11319

 61954326 AGCACCAAACCTAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTTGCTATGTTGGTC 61954385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11320 AGCACCAAACCTAGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTTGCTATGTTGGTC 11379

 61954386 AGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTAATCTGCCCACCTCAGTCTCCCAAAGTGCTG 61954445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11380 AGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTAATCTGCCCACCTCAGTCTCCCAAAGTGCTG 11439

 61954446 TGATTATAGGCACGAGCCACTGAGCCTGACCTAAACTTGTATATTTTTATGGCATACAAT 61954505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11440 TGATTATAGGCACGAGCCACTGAGCCTGACCTAAACTTGTATATTTTTATGGCATACAAT 11499

 61954506 ATAATGTTTTGATGTATGTTTACAATACACACATCAAATACAATCAAATTAATTAACAAA 61954565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11500 ATAATGTTTTGATGTATGTTTACAATACACACATCAAATACAATCAAATTAATTAACAAA 11559

 61954566 TCCATCACTTCACATACTTTTTTTTGCATTAAAAACGTTTATTTTATTTTATTTCATGTT 61954625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
    11560 TCCATCACTTCACATACTTTTTTTTGCATTAAAAACATTTATTTTATTTTATTTCATGTT 11619

 61954626 TTTAGAGACAAATTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATAATCAGGGCTC 61954685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11620 TTTAGAGACAAATTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATAATCAGGGCTC 11679

 61954686 ACTGTAGCCTGAAACTCCTGGGCTCATGCAATCCTCCCACCTCAACCTCTTTAGTGGCTG 61954745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11680 ACTGTAGCCTGAAACTCCTGGGCTCATGCAATCCTCCCACCTCAACCTCTTTAGTGGCTG 11739

 61954746 TGAATACAGGCACCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAAATTGTTTATAGAGACAAGG 61954805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11740 TGAATACAGGCACCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTAAAATTGTTTATAGAGACAAGG 11799

 61954806 TCTTGTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAATGATCCACCTGCCTTGG 61954865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11800 TCTTGTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAATGATCCACCTGCCTTGG 11859

 61954866 CCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAATGAGAAGATC 61954925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11860 CCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAATGAGAAGATC 11919

 61954926 TTAAGCCAACCAGGGAAGGAGTAGAGCAGTCATCAAAAGTACCACCTATGAAAACTAGAA 61954985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11920 TTAAGCCAACCAGGGAAGGAGTAGAGCAGTCATCAAAAGTACCACCTATGAAAACTAGAA 11979

 61954986 AAAGCCCCGAGCAGATGTTAAGAGCTACAGGAATGATAAAAATATGTGGGAAGCAATCCT 61955045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11980 AAAGCCCCGAGCAGATGTTAAGAGCTACAGGAATGATAAAAATATGTGGGAAGCAATCCT 12039

 61955046 CTTTCAGATATACACATCCTTCCTAATGGAATATACAGAT 61955085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12040 CTTTCAGATATACACATCCTTCCTAATGGAATATACAGAT 12079

Alignment time is 14.64 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2085] =>      2085 nucs 'mol-32-3311-010785_2085'

Score:        1960
Aligned:      2081        nucs
Identic:      2070 ( 99%) nucs =>        14 (100%)      2056 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941308,61941321] EXCISED REGION [61942721,61944787]
 second seq =>  [       3,      16] EXCISED REGION [      19,    2085]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1399 nucs [61941322,61942720]
 second seq =>         2 nucs [17,18]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61941322,61941322] to [61942721,61942721]
 second seq =>         1 nucs [16,16] to [18,18]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [61941316,61941321] to [61942721,61942726]
 second seq =>         6 nucs [11,16] to [19,24]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61941308 TTTCTTTCTTTTTT 61941321
          ||||||||||||||
        3 TTTCTTTCTTTTTT 16

EXCISED REGION

 61942721 TTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCG 61942780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       19 TTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAGCATGATCG 78

 61942781 TACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAG 61942840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       79 TACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGCCTCCTGAG 138

 61942841 TAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTT 61942900
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      139 TAGATGGGCCTACAGGCATGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTTGTTTGTTT 198

 61942901 GTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTA 61942960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      199 GTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTTA 258

 61942961 AGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACC 61943020
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      259 AGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAATTGGGATTACAGGCGTGAACTACTGCACC 318

 61943021 TGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACAC 61943080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 TGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGTATGACAC 378

 61943081 AGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGT 61943140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 AGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGAATAAAGT 438

 61943141 GAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCA 61943200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 GAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGAACTTGCA 498

 61943201 GCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATACATTGGTG 61943260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      499 GCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGCGTTTGTGACATGTGATACATTGGTG 558

 61943261 ACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAA 61943320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 ACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGTATTTCAA 618

 61943321 TTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGG 61943380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 TTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGG 678

 61943381 GCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAAT 61943440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 GCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAAT 738

 61943441 GAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTAC 61943500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 GAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTAC 798

 61943501 ATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGA 61943560
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 ATCAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGA 858

 61943561 ATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTT 61943620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 ATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTT 918

 61943621 TAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCAT 61943680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 TAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCAT 978

 61943681 AATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGG 61943740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 AATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGG 1038

 61943741 TGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAA 61943800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 TGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAA 1098

 61943801 CTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGT 61943860
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1099 CTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAATTGTAACTTTGT 1158

 61943861 ACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTG 61943920
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 ACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTG 1218

 61943921 GTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATT 61943980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 GTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATT 1278

 61943981 TATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGG 61944040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 TATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGG 1338

 61944041 GCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCC 61944100
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 GCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCC 1398

 61944101 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTA 61944160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTA 1458

 61944161 GTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGAT 61944220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 GTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGAT 1518

 61944221 CCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCA 61944280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCA 1578

 61944281 GATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCT 61944340
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 GATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCT 1638

 61944341 GGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTA 61944400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 GGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTA 1698

 61944401 TTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAA 61944460
          |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1699 TTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACACCACATTAAAAAA 1758

 61944461 ATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGT 61944520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 ATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGT 1818

 61944521 TCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCA 61944580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCA 1878

 61944581 TACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCT 61944640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCT 1938

 61944641 TTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATAT 61944700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATAT 1998

 61944701 GGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGT 61944760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 GGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGT 2058

 61944761 GCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          |||||||||||||||||||||||||||
     2059 GCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 2085

Alignment time is 2.81632 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7220] =>      7220 nucs 'mol-32-3311-177279_7220'

Score:        7144
Aligned:      7221        nucs
Identic:      7214 (100%) nucs =>       383 (100%)      6831 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61941547,61941929] EXCISED REGION [61941931,61948767]
 second seq =>  [       1,     383] EXCISED REGION [     385,    7220]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61941930,61941930]
 second seq =>         1 nucs [384,384]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5056,5056]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [383,384] to [384,385]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61941929,61941929] to [61941931,61941931]
 second seq =>         1 nucs [383,383] to [385,385]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61941547 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCG 61941606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCG 60

 61941607 GCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCT 61941666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAATCTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCT 120

 61941667 CCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGC 61941726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGAGCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGC 180

 61941727 ATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTAT 61941786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTTTTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTAT 240

 61941787 GTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGT 61941846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTTGTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGT 300

 61941847 GGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAA 61941906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGATATATGGTTGTAATTTGATGTCTGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAA 360

 61941907 AATGAGACCCTTGTTCTGAGTCT 61941929
          |||||||||||||||||||||||
      361 AATGAGACCCTTGTTCTGAGTCT 383

EXCISED REGION

 61941931 TGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAA 61941990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 TGTTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAA 444

 61941991 CAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTG 61942050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 CAATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTG 504

 61942051 AAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCA 61942110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 AAGTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCA 564

 61942111 CGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGA 61942170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 CGATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGA 624

 61942171 TCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGG 61942230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TCTGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGG 684

 61942231 ATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAG 61942290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 ATGAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAG 744

 61942291 CATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCC 61942350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 CATTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCC 804

 61942351 CAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCT 61942410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 CAGCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCT 864

 61942411 GCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGC 61942470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 GCCCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGC 924

 61942471 GTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGA 61942530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 GTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGA 984

 61942531 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 61942590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 1044

 61942591 GAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGT 61942650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 GAGTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGT 1104

 61942651 GCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTT 61942710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GCATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTT 1164

 61942711 TTCTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGC 61942770
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 TTCTTTTTTC-TTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGC 1223

 61942771 AGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCA 61942830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 AGCATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCA 1283

 61942831 GCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTT 61942890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 GCCTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTT 1343

 61942891 TTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACT 61942950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 TTGTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACT 1403

 61942951 CTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAA 61943010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 CTTGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAA 1463

 61943011 CTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAG 61943070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 CTACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAG 1523

 61943071 GGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGG 61943130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 GGTATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGG 1583

 61943131 TGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTC 61943190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 TGAATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTC 1643

 61943191 AGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGA 61943250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 AGAACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGA 1703

 61943251 TACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATA 61943310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 TACATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATA 1763

 61943311 TGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAA 61943370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TGTATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAA 1823

 61943371 TAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTA 61943430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 TAAGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTA 1883

 61943431 TTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAA 61943490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TTGCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAA 1943

 61943491 TACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTT 61943550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 TACTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTT 2003

 61943551 GGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAA 61943610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 GGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAA 2063

 61943611 TTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTA 61943670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTA 2123

 61943671 TACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCAT 61943730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 TACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCAT 2183

 61943731 TTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATG 61943790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 TTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATG 2243

 61943791 TTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATT 61943850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 TTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATT 2303

 61943851 GTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCT 61943910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 GTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCT 2363

 61943911 CCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTA 61943970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 CCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTA 2423

 61943971 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 61944030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 TTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGA 2483

 61944031 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 61944090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 GTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCC 2543

 61944091 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 61944150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTT 2603

 61944151 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 61944210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGC 2663

 61944211 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 61944270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 CTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 2723

 61944271 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 61944330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 TGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATC 2783

 61944331 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 61944390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 TACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACA 2843

 61944391 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 61944450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 AATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCA 2903

 61944451 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 61944510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 CATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTAT 2963

 61944511 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 61944570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 TGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGT 3023

 61944571 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 61944630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTT 3083

 61944631 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 61944690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 ACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAAC 3143

 61944691 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 61944750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 TTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGAC 3203

 61944751 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAG 61944810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 ATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAG 3263

 61944811 TATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTAT 61944870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 TATAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTAT 3323

 61944871 TTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCA 61944930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 TTTTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCA 3383

 61944931 CCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCAT 61944990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 CCAATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCAT 3443

 61944991 TCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGG 61945050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 TCTAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGG 3503

 61945051 TCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGAT 61945110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 TCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGAT 3563

 61945111 TTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATA 61945170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 TTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATA 3623

 61945171 CCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAA 61945230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 CCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAA 3683

 61945231 GTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCA 61945290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 GTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCA 3743

 61945291 TATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGA 61945350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 TATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGA 3803

 61945351 GAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAA 61945410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 GAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAA 3863

 61945411 AGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTC 61945470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 AGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTC 3923

 61945471 CCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTG 61945530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 CCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTG 3983

 61945531 CTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTT 61945590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 CTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTT 4043

 61945591 CCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATAT 61945650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 CCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATAT 4103

 61945651 TCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACC 61945710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 TCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACC 4163

 61945711 AAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATA 61945770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 AAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATA 4223

 61945771 GACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTT 61945830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 GACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTT 4283

 61945831 CTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGG 61945890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 CTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGG 4343

 61945891 GTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTT 61945950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 GTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTT 4403

 61945951 TTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAA 61946010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 TTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAA 4463

 61946011 AAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAA 61946070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 AAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAA 4523

 61946071 TTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTA 61946130
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 CTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTA 4583

 61946131 GAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGT 61946190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 GAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGT 4643

 61946191 GTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATG 61946250
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 GTGTCTCCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATG 4703

 61946251 ATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCT 61946310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 ATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCT 4763

 61946311 ACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCT 61946370
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 ACTGTCGTTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCT 4823

 61946371 TACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCA 61946430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 TACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCA 4883

 61946431 TCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAA 61946490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 TCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAA 4943

 61946491 TAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATT 61946550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 TAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATT 5003

 61946551 ACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTT 61946609
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     5004 ACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTT 5063

 61946610 TTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGG 61946669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 TTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGG 5123

 61946670 GTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGT 61946729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 GTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGT 5183

 61946730 AGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGG 61946789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 AGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGG 5243

 61946790 CCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTT 61946849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 CCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTT 5303

 61946850 GTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATG 61946909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 GTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATG 5363

 61946910 GCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTA 61946969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 GCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTA 5423

 61946970 TTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGG 61947029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5424 TTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGG 5483

 61947030 TTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTC 61947089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 TTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTC 5543

 61947090 TTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTC 61947149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 TTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTC 5603

 61947150 GAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTG 61947209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 GAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTG 5663

 61947210 AACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCT 61947269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 AACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCT 5723

 61947270 GCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGAT 61947329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 GCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGAT 5783

 61947330 TTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGC 61947389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5784 TTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGC 5843

 61947390 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGT 61947449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGT 5903

 61947450 TTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC 61947509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 TTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC 5963

 61947510 AGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCC 61947569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 AGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCC 6023

 61947570 AGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCC 61947629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6024 AGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCC 6083

 61947630 ACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTG 61947689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 ACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTG 6143

 61947690 TTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTT 61947749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6144 TTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTT 6203

 61947750 CTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCT 61947809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 CTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCT 6263

 61947810 CTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCA 61947869
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 CTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCA 6322

 61947870 TCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTT 61947929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6323 TCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTT 6382

 61947930 TTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTT 61947989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6383 TTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTT 6442

 61947990 TTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATC 61948049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6443 TTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATC 6502

 61948050 CCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTC 61948109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6503 CCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTC 6562

 61948110 TAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTG 61948169
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6563 TAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTG 6622

 61948170 GTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGA 61948229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6623 GTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGA 6682

 61948230 AGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCA 61948289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6683 AGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCA 6742

 61948290 GACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGT 61948349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6743 GACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGT 6802

 61948350 TATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATT 61948409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6803 TATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATT 6862

 61948410 TTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTT 61948469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6863 TTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTT 6922

 61948470 TGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTAC 61948529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6923 TGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTAC 6982

 61948530 CTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGA 61948589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6983 CTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGA 7042

 61948590 TTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATT 61948649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7043 TTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATT 7102

 61948650 TTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCT 61948709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7103 TTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCT 7162

 61948710 TTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGG 61948767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7163 TTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGG 7220

Alignment time is 8.7064 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3451] =>      3451 nucs 'mol-32-3327-076176_3451'

Score:        3417
Aligned:      3450        nucs
Identic:      3447 (100%) nucs =>      1504 (100%)      1943 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943450,61944953] EXCISED REGION [61944955,61946899]
 second seq =>  [       1,    1504] EXCISED REGION [    1506,    3451]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61944954,61944954]
 second seq =>         1 nucs [1505,1505]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3154,3154]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61944954,61944956] to [61944955,61944957]
 second seq =>         1 nucs [1504,1504] to [1505,1505]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [61944950,61944953] to [61944955,61944958]
 second seq =>         4 nucs [1501,1504] to [1506,1509]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943450 TTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGG 61943509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATAAATGGG 60

 61943510 CAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTG 61943569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATTCCTCTG 120

 61943570 AGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTA 61943629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAATTTTTA 180

 61943630 ATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAA 61943689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAATGATCAA 240

 61943690 TCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACAT 61943749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGAGAACAT 300

 61943750 TCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCG 61943809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTACAGTCG 360

 61943810 CCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGA 61943869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACCTGTTGA 420

 61943870 CCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACT 61943929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTAACCACT 480

 61943930 GTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAA 61943989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTATTTTTAA 540

 61943990 ATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGG 61944049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCAATCTGG 600

 61944050 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA 61944109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTA 660

 61944110 GCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACA 61944169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTAGAAACA 720

 61944170 GGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACC 61944229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCACCCACC 780

 61944230 TTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAA 61944289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAA 840

 61944290 CTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTT 61944349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTT 900

 61944350 CACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCT 61944409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCT 960

 61944410 TTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTA 61944469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTA 1020

 61944470 TTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATA 61944529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATA 1080

 61944530 AGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTT 61944589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTT 1140

 61944590 GACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAAC 61944649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAAC 1200

 61944650 CAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTG 61944709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTG 1260

 61944710 ACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTT 61944769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTT 1320

 61944770 GATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGT 61944829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAATGATTGT 1380

 61944830 ATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAA 61944889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTGAGGAAA 1440

 61944890 CTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGT 61944949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTAAAAGGT 1500

 61944950 TTTC 61944953
          ||||
     1501 TTTC 1504

EXCISED REGION

 61944955 TTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTG 61945014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 TTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATGACCTAATTGTG 1565

 61945015 GTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAA 61945074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTTAGGTCTATTAA 1625

 61945075 GGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGA 61945134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 GGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGA 1685

 61945135 CCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTG 61945194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 CCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTG 1745

 61945195 TTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAG 61945254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAG 1805

 61945255 TCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAAT 61945314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAAT 1865

 61945315 GGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCA 61945374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 GGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCA 1925

 61945375 TAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATC 61945434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATC 1985

 61945435 CCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAAC 61945494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 CCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAAC 2045

 61945495 CTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTC 61945554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 CTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTC 2105

 61945555 TGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTC 61945614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 TGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTC 2165

 61945615 CAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGA 61945674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 CAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGA 2225

 61945675 GTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTT 61945734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 GTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTT 2285

 61945735 TGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTT 61945794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTT 2345

 61945795 ACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATT 61945854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 ACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATT 2405

 61945855 GCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATT 61945914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATT 2465

 61945915 TATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGA 61945974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGA 2525

 61945975 GGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATC 61946034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATC 2585

 61946035 CAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACC 61946094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 CAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACC 2645

 61946095 CTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATC 61946154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 CTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATC 2705

 61946155 TTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCC 61946214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2706 TTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTATTTAGATTCCC 2765

 61946215 TTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATA 61946274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATA 2825

 61946275 TTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGT 61946334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2826 TTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCAATGGT 2885

 61946335 ATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAA 61946394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 ATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAA 2945

 61946395 ATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTT 61946454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 ATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTT 3005

 61946455 CTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACC 61946514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 CTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACC 3065

 61946515 AGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTT 61946574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTT 3125

 61946575 GAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTT 61946633
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTT 3185

 61946634 AGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTT 61946693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTT 3245

 61946694 GGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAA 61946753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAA 3305

 61946754 TCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCT 61946813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 TCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCT 3365

 61946814 TTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTC 61946873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 TTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTC 3425

 61946874 ATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTT 61946899
          ||||||||||||||||||||||||||
     3426 ATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTT 3451

Alignment time is 4.48246 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8959] =>      8959 nucs 'mol-32-3395-103441_8959'

Score:        8893
Aligned:      8959        nucs
Identic:      8953 (100%) nucs =>      2879 (100%)      6074 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943324,61946202] EXCISED REGION [61946204,61952282]
 second seq =>  [       1,    2879] EXCISED REGION [    2881,    8959]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [61946203,61946203]
 second seq =>         1 nucs [2880,2880]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [61946200,61946202] to [61946204,61946206]
 second seq =>         3 nucs [2877,2879] to [2881,2883]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943324 TTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCT 61943383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAAGCTGAGGGCT 60

 61943384 TAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAG 61943443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTGCTAAAATGAG 120

 61943444 ACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATA 61943503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATACTTGTTACATA 180

 61943504 AATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATT 61943563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGTTCTCTGAATT 240

 61943564 CCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAA 61943623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTATTATTTTTAA 300

 61943624 TTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAAT 61943683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATACATTGCATAAT 360

 61943684 GATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGA 61943743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTGTGGTGA 420

 61943744 GAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTA 61943803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTATTAACTA 480

 61943804 CAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACC 61943863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTTTGTACC 540

 61943864 TGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTA 61943923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTATCTGGTA 600

 61943924 ACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTAT 61943983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTTATTTAT 660

 61943984 TTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCA 61944043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCA 720

 61944044 ATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 61944103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 780

 61944104 CGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTA 61944163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTTTTAGTA 840

 61944164 GAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCA 61944223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGTGATCCA 900

 61944224 CCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGAT 61944283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGAT 960

 61944284 CAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGC 61944343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGC 1020

 61944344 TTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTT 61944403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTT 1080

 61944404 CATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATC 61944463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATC 1140

 61944464 CATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCT 61944523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCT 1200

 61944524 GCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATAC 61944583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATAC 1260

 61944584 AAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTT 61944643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTT 1320

 61944644 TTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGA 61944703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGA 1380

 61944704 GGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCA 61944763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCA 1440

 61944764 GTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAAT 61944823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAGAAGAAT 1500

 61944824 GATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTG 61944883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAATTTTTTG 1560

 61944884 AGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTA 61944943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAGTGGGTA 1620

 61944944 AAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATG 61945003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACAGGTATG 1680

 61945004 ACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTT 61945063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTAAGTCTT 1740

 61945064 AGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTG 61945123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTG 1800

 61945124 CTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGG 61945183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGG 1860

 61945184 AAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTC 61945243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTC 1920

 61945244 TACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTC 61945303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTC 1980

 61945304 TTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGAC 61945363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGAC 2040

 61945364 CACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAA 61945423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAA 2100

 61945424 AAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCT 61945483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCT 2160

 61945484 TGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAG 61945543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAG 2220

 61945544 TCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTAT 61945603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTAT 2280

 61945604 GTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTG 61945663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTG 2340

 61945664 ACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCT 61945723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCT 2400

 61945724 GAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAG 61945783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAG 2460

 61945784 TTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTT 61945843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTT 2520

 61945844 GTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTT 61945903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTT 2580

 61945904 ACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTAT 61945963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTAT 2640

 61945964 TTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTT 61946023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTT 2700

 61946024 GGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGC 61946083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGC 2760

 61946084 ATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAA 61946143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAA 2820

 61946144 TAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 61946202
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTT 2879

EXCISED REGION

 61946204 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 61946263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAA 2940

 61946264 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 61946323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTA 3000

 61946324 TTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 61946383
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGA 3060

 61946384 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 61946443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTAT 3120

 61946444 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 61946503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAAT 3180

 61946504 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 61946563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTA 3240

 61946564 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGC-TTTTTTTTTTCTTTCCAACT 61946622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3241 AGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTTCCAACT 3300

 61946623 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 61946682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGG 3360

 61946683 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 61946742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGG 3420

 61946743 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 61946802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCT 3480

 61946803 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 61946862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACA 3540

 61946863 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 61946922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCA 3600

 61946923 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 61946982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTAT 3660

 61946983 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 61947042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCC 3720

 61947043 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 61947102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAAT 3780

 61947103 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 61947162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCT 3840

 61947163 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 61947222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACAT 3900

 61947223 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 61947282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTA 3960

 61947283 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 61947342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTA 4020

 61947343 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 61947402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTG 4080

 61947403 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 61947462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTT 4140

 61947463 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 61947522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCA 4200

 61947523 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 61947582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGAT 4260

 61947583 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 61947642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCC 4320

 61947643 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 61947702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTT 4380

 61947703 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 61947762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTA 4440

 61947763 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 61947822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACT 4500

 61947823 AGGTCCCATGTGTCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 61947882
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAA 4559

 61947883 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 61947942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 ACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTAT 4619

 61947943 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 61948002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 AGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGA 4679

 61948003 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 61948062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 AAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAA 4739

 61948063 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 61948122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGG 4799

 61948123 TTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 61948182
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TTGTAGGTGTGTGACTTTATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTG 4859

 61948183 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 61948242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 TTTTTGTACCAGTGCCAGACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTT 4919

 61948243 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 61948302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 ATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGG 4979

 61948303 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 61948362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TTCCATATGAATTTTAGAATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTG 5039

 61948363 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 61948422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 CTAGGAATAGCATTGAATCTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGA 5099

 61948423 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 61948482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 GCCTTTCCATCCATGAATATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTG 5159

 61948483 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 61948542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 ATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGC 5219

 61948543 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 61948602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 TGTATTCCTAGGTATTTTATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAG 5279

 61948603 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 61948662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 TTAGCTCTCATCTTGGACGATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGAT 5339

 61948663 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 61948722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 TTTGTATCCTGAAACTTTCCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGAC 5399

 61948723 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 61948782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 TATGGGGTTTTATAGGTACAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTC 5459

 61948783 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 61948842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 TTTTCCTATTTGGATGCAGTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGT 5519

 61948843 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 61948902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 ACTATGTTAAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGG 5579

 61948903 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 61948962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 AATGCTTACAGTGTTTGCCCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTT 5639

 61948963 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 61949022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 ATTATTTTGAGGTATGTTCCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTT 5699

 61949023 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 61949082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 TTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTATGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAAT 5759

 61949083 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 61949142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 CACATGTATTGATTTACATATGTTCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATC 5819

 61949143 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 61949202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 ATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGTGCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGAT 5879

 61949203 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 61949262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TTTGCATCTATGTTCATCAGGAATGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCT 5939

 61949263 GTGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 61949322
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 GCGAGGTTTTGGTATCGGAATGATTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTC 5999

 61949323 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAAT 61949382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 CCCTCAATTTTTCGGAATAGTTTCTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAAT 6059

 61949383 TAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGT 61949442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 TAGGCTGTGAATCCATCTTTTCCAGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGT 6119

 61949443 TCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGA 61949502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TCTCCTAGAACTTGTTATTGGTCTGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGA 6179

 61949503 GAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATA 61949562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 GAGGTTGTATGCTTCCAGGAATTTATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATA 6239

 61949563 GAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCG 61949622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 GAGGTGTGTAATACTCTCTGAGGGTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCG 6299

 61949623 GTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTT 61949682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 GTGGTAATGTCCCTTTGTCATTTCCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTT 6359

 61949683 TATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGT 61949742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 TATTAGTCTAGCTAGCAGTCTATCAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGT 6419

 61949743 TTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTT 61949802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 TTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTTTTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTT 6479

 61949803 GGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTC 61949862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 GGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAGCTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTC 6539

 61949863 TGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCA 61949922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 TGGGGATCACGTTAGGTTTTATTTGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCA 6599

 61949923 CTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTAT 61949982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 CTATAAGCTTTCCTTTTAACACTTCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTAT 6659

 61949983 GTTTTATCCATTTTCACTAGTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTT 61950042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 GTTTTATCCATTTTCACTAGTTTCAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTT 6719

 61950043 TACCCAAAAGTCATTCAGGAGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGA 61950102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 TACCCAAAAGTCATTCAGGAGCATGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGA 6779

 61950103 GATCTTAGTGTTGATTTCTATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGAT 61950162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 GATCTTAGTGTTGATTTCTATTTTTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGAT 6839

 61950163 TTCACTTGGTTTGAATTTGCTGGGAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGA 61950222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 TTCACTTGGTTTGAATTTGCTGGGAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGA 6899

 61950223 GTATGTGTCATGTGCAGATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCT 61950282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 GTATGTGTCATGTGCAGATGAGAAGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCT 6959

 61950283 GCAGATGTCTGTTAGGTCTATTTGATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTT 61950342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 GCAGATGTCTGTTAGGTCTATTTGATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTT 7019

 61950343 AGTTTTCTGCTTCGATGACCTGTCTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTAT 61950402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 AGTTTTCTGCTTCGATGACCTGTCTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTAT 7079

 61950403 TATTATGTGGTTATGTAAGTCTCTTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTG 61950462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 TATTATGTGGTTATGTAAGTCTCTTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTG 7139

 61950463 CTCCAGTGTTGGGTGCATATATAAGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCT 61950522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 CTCCAGTGTTGGGTGCATATATAAGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCT 7199

 61950523 TTATCATTACGTAATGCCCTTCTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCC 61950582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 TTATCATTACGTAATGCCCTTCTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCC 7259

 61950583 CACTCTGCTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGTGACCTCTGCCT 61950642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 CACTCTGCTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGTGACCTCTGCCT 7319

 61950643 CAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTACTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACCACA 61950702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 CAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTACTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACCACA 7379

 61950703 CCGAGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGGCAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTTGGGT 61950762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 CCGAGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTAGGCAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTTGGGT 7439

 61950763 ACAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGCAACCGCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTTTCATG 61950822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 ACAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGCAACCGCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTTTCATG 7499

 61950823 CTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCATCACGCATGGCTAATTTTTT 61950882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 CTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCATCACGCATGGCTAATTTTTT 7559

 61950883 GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACC 61950942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACC 7619

 61950943 TCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGGGCTATTGC 61951002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 TCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGGGCTATTGC 7679

 61951003 TCCTGGCCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCC 61951062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 TCCTGGCCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCC 7739

 61951063 AGGCTAGTCTCAAGCTCCTAGCCTCAAATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 61951122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7740 AGGCTAGTCTCAAGCTCCTAGCCTCAAATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 7799

 61951123 GGATTACAGGGGTGAGCCACTGTGCCTGGCTTTCTTTGTCTTTTTTTGATCATTGTTGGT 61951182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 GGATTACAGGGGTGAGCCACTGTGCCTGGCTTTCTTTGTCTTTTTTTGATCATTGTTGGT 7859

 61951183 TTAAAGCCTTTTTTGTCTAAAATTAGAATAGCAATGCCTGCTCTTTTATGTTTTCTGTTT 61951242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 TTAAAGCCTTTTTTGTCTAAAATTAGAATAGCAATGCCTGCTCTTTTATGTTTTCTGTTT 7919

 61951243 GCTTGGTAGATTTTTTCCATTTCTTTGAGCCTATGGGTATCATGCCTATGAGATGAGTTT 61951302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 GCTTGGTAGATTTTTTCCATTTCTTTGAGCCTATGGGTATCATGCCTATGAGATGAGTTT 7979

 61951303 CTTGAAGACAGCATACAGTTGGGTCGTTCTTCTTTATCCAACTTGCCAGTCTGTGCCTTT 61951362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 CTTGAAGACAGCATACAGTTGGGTCGTTCTTCTTTATCCAACTTGCCAGTCTGTGCCTTT 8039

 61951363 TAATTGGAGTATTTAGCCTGTTTATGTTCAAAGTTAATATTGATATGTGCAGATTTGATT 61951422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8040 TAATTGGAGTATTTAGCCTGTTTATGTTCAAAGTTAATATTGATATGTGCAGATTTGATT 8099

 61951423 GTCATTGTGTTATTAGCTGGTTGTCATATAGACTTGATTGTGTCATTGTTTTATAGTGTC 61951482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 GTCATTGTGTTATTAGCTGGTTGTCATATAGACTTGATTGTGTCATTGTTTTATAGTGTC 8159

 61951483 AATGGTCATGTACTTAAGTGTGTTTTTGTGGTGGCCAGTAGTGGTTTTTCATTTCCATGT 61951542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 AATGGTCATGTACTTAAGTGTGTTTTTGTGGTGGCCAGTAGTGGTTTTTCATTTCCATGT 8219

 61951543 TTGGCATTCTGTTAAGGACTTCTTGTAAGGCAGGTCTCGTGGTACTAAATTTCCTTAGCA 61951602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 TTGGCATTCTGTTAAGGACTTCTTGTAAGGCAGGTCTCGTGGTACTAAATTTCCTTAGCA 8279

 61951603 GTTGCTTGTCTGAAAAGAATCTTATTTCTCCTTCACTTATGAACCTTAGTTTGGCTGGAT 61951662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 GTTGCTTGTCTGAAAAGAATCTTATTTCTCCTTCACTTATGAACCTTAGTTTGGCTGGAT 8339

 61951663 ATGAAATTCTTGGTTGGGATTTATTTTCTTTAAGAATTCTGAATATAGGTTCCCAGTCTT 61951722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 ATGAAATTCTTGGTTGGGATTTATTTTCTTTAAGAATTCTGAATATAGGTTCCCAGTCTT 8399

 61951723 TTCTGGCTTGTAGAGTTTTTGCTGAAAGGTACAGTTAGCTTGATGAGGTTCCCTTTGTTG 61951782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 TTCTGGCTTGTAGAGTTTTTGCTGAAAGGTACAGTTAGCTTGATGAGGTTCCCTTTGTTG 8459

 61951783 ATGACCTGCCCCTTCTCTCTAGCTGCCTTTTTTTCTTCCATGTTAACCTTGGTTAATCTG 61951842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 ATGACCTGCCCCTTCTCTCTAGCTGCCTTTTTTTCTTCCATGTTAACCTTGGTTAATCTG 8519

 61951843 ACAATTATGAGTCTTGAGGATGGTCACCTTGTATACTATCATCTAACAGGGGTTCCCTGC 61951902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 ACAATTATGAGTCTTGAGGATGGTCACCTTGTATACTATCATCTAACAGGGGTTCCCTGC 8579

 61951903 ATTTCCTGAATTTCAATGTTGACCTCTTTAGCAAGGTTGCAGAAATTTTTGCAGAGAATA 61951962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8580 ATTTCCTGAATTTCAATGTTGACCTCTTTAGCAAGGTTGCAGAAATTTTTGCAGAGAATA 8639

 61951963 TCCTCAAATATGTTTTCCGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACTTTGG 61952022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8640 TCCTCAAATATGTTTTCCGGCCAGGCACGGTGGCTCATGCCCATAATCCCAGCACTTTGG 8699

 61952023 GAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGG 61952082
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8700 GAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGG 8759

 61952083 TAAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGAGTGGTGGTGAGTGCCTG 61952142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8760 TAAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGAGTGGTGGTGAGTGCCTG 8819

 61952143 TAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTAAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGT 61952202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8820 TAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTAAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGT 8879

 61952203 TGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAACCTGGACAACAGAGTGAGACTCTGTC 61952262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8880 TGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAACCTGGACAACAGAGTGAGACTCTGTC 8939

 61952263 TCAAAAAAATAAAAATGTTT 61952282
          ||||||||||||||||||||
     8940 TCAAAAAAATAAAAATGTTT 8959

Alignment time is 10.6584 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7475] =>      7475 nucs 'mol-32-33a0-188219_7475'

Score:        7257
Aligned:      7479        nucs
Identic:      7458 (100%) nucs =>      1232 ( 99%)      6226 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943549,61944787] EXCISED REGION [61945086,61951325]
 second seq =>  [       1,    1239] EXCISED REGION [    1240,    7475]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61943549 TTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAA 61943608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGTTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAA 60

 61943609 AATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATG 61943668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATG 120

 61943669 TATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATC 61943728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATACATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATC 180

 61943729 ATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATA 61943788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTCTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATA 240

 61943789 TGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAA 61943848
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
      241 TGTTATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAA 300

 61943849 TTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCT 61943908
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTAACTTTGTACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCT 360

 61943909 CTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTT 61943968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCAGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTT 420

 61943969 TATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTG 61944028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTTATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTG 480

 61944029 GAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCT 61944088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      481 GAGTGCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCT 540

 61944089 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGT 61944148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGT 600

 61944149 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTA 61944208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTA 660

 61944209 GCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 61944268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 720

 61944269 TGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTA 61944328
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      721 TGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTA 780

 61944329 TCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCA 61944388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCA 840

 61944389 CAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATAC 61944448
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
      841 CAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACAC 900

 61944449 CACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCT 61944508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCT 960

 61944509 ATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTT 61944568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTT 1020

 61944569 GTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCAC 61944628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCAC 1080

 61944629 TTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAA 61944688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAA 1140

 61944689 ACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGG 61944748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGG 1200

 61944749 ACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 1239

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 1299

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 1359

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 1419

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 1479

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 1539

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 1599

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 1659

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     1660 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 1717

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 1777

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 1837

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 1897

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 1957

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 2017

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 2077

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 2137

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 2197

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 2257

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 2317

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 2377

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 2437

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 2497

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 2557

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 2617

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 2677

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2678 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 2737

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 2797

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 2857

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 2917

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 2977

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2978 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 3036

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 3096

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 3156

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 3216

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 3276

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 3336

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 3396

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 3456

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 3516

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 61947425
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATATCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 3576

 61947426 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 61947485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 3636

 61947486 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 61947545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 3696

 61947546 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 61947605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 3756

 61947606 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 61947665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 3816

 61947666 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 61947725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 3876

 61947726 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 61947785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 3936

 61947786 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTT 61947845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     3937 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTT 3995

 61947846 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 61947905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 4055

 61947906 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 61947965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 4115

 61947966 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 61948025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 4175

 61948026 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 61948085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 4235

 61948086 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTC 61948145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4236 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATTTC 4295

 61948146 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 61948205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 4355

 61948206 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 61948265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 4415

 61948266 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 61948325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 4475

 61948326 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 61948385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 4535

 61948386 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 61948445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 4595

 61948446 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 61948505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 4655

 61948506 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 61948565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 4715

 61948566 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 61948625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 4775

 61948626 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 61948685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 4835

 61948686 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 61948745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 4895

 61948746 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 61948805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 4955

 61948806 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTGGTGA 61948865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4956 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGCGGTGA 5015

 61948866 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 61948925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 5075

 61948926 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 61948985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 5135

 61948986 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 61949045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 5195

 61949046 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 61949105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 5255

 61949106 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 61949165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 5315

 61949166 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 61949225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 5375

 61949226 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 61949285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5376 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 5435

 61949286 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 61949345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 5495

 61949346 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 61949405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 5555

 61949406 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 61949465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 5615

 61949466 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 61949525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 5675

 61949526 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 61949585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 5735

 61949586 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 61949645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 5795

 61949646 CCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 61949705
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 CCAATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 5855

 61949706 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 61949765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 5915

 61949766 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 61949825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 5975

 61949826 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 61949885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5976 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 6035

 61949886 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 61949945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6036 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 6095

 61949946 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 61950005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6096 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 6155

 61950006 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 61950065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 6215

 61950066 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 61950125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6216 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 6275

 61950126 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 61950185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6276 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 6335

 61950186 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 61950245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6336 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 6395

 61950246 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 61950305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6396 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 6455

 61950306 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 61950365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6456 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 6515

 61950366 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 61950425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6516 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 6575

 61950426 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 61950485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6576 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 6635

 61950486 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATGCCCTTCT 61950545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6636 AGTAGGACAGTTAAGTCTTCCTGTTGAATTGAACCCTTTATCATTACGTAATGCCCTTCT 6695

 61950546 TTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCACTCTGCTACCCAGGCTGGAGT 61950605
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6696 TTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCCCACTCTGCTACCCAGGCTGGAGT 6755

 61950606 GCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGTGACCTCTGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC 61950665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6756 GCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGTGACCTCTGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC 6815

 61950666 TACTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACCACACCGAGCTAATTTTTGTATTTTTT 61950725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6816 TACTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACCACACCGAGCTAATTTTTGTATTTTTT 6875

 61950726 TTTAGGCAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTTGGGTACAGTGGCACAATCTTGGCTCAC 61950785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6876 TTTAGGCAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTTGGGTACAGTGGCACAATCTTGGCTCAC 6935

 61950786 TGCAACCGCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTTTCATGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG 61950845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6936 TGCAACCGCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTTTCATGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG 6995

 61950846 ATTACAGGTGTGCACCATCACGCATGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 61950905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6996 ATTACAGGTGTGCACCATCACGCATGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 7055

 61950906 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGC 61950965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7056 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGC 7115

 61950966 CTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGGGCTATTGCTCCTGGCCTAATTTTTGTATTTT 61951025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7116 CTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGGGCTATTGCTCCTGGCCTAATTTTTGTATTTT 7175

 61951026 TTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCAAGCTCCTAGCC 61951085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7176 TTTTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCAAGCTCCTAGCC 7235

 61951086 TCAAATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACTGT 61951145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7236 TCAAATGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGAGCCACTGT 7295

 61951146 GCCTGGCTTTCTTTGTCTTTTTTTGATCATTGTTGGTTTAAAGCCTTTTTTGTCTAAAAT 61951205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7296 GCCTGGCTTTCTTTGTCTTTTTTTGATCATTGTTGGTTTAAAGCCTTTTTTGTCTAAAAT 7355

 61951206 TAGAATAGCAATGCCTGCTCTTTTATGTTTTCTGTTTGCTTGGTAGATTTTTTCCATTTC 61951265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7356 TAGAATAGCAATGCCTGCTCTTTTATGTTTTCTGTTTGCTTGGTAGATTTTTTCCATTTC 7415

 61951266 TTTGAGCCTATGGGTATCATGCCTATGAGATGAGTTTCTTGAAGACAGCATACAGTTGGG 61951325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7416 TTTGAGCCTATGGGTATCATGCCTATGAGATGAGTTTCTTGAAGACAGCATACAGTTGGG 7475

Alignment time is 9.08648 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5943] =>      5943 nucs 'mol-32-33b6-050343_5943'

Score:        5769
Aligned:      5947        nucs
Identic:      5930 (100%) nucs =>       538 ( 99%)      5392 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61944247,61944787] EXCISED REGION [61945086,61950491]
 second seq =>  [       1,     541] EXCISED REGION [     542,    5943]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61944247 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTAT 61944306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTAT 60

 61944307 GAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTC 61944366
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTC 120

 61944367 TTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATA 61944426
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      121 TTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATA 180

 61944427 GTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTG 61944486
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTATTTCTTTGTGTACATACACCACATTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTG 240

 61944487 AGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGAT 61944546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGAT 300

 61944547 GTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATG 61944606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATG 360

 61944607 GGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAA 61944666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAA 420

 61944667 TGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGG 61944726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGG 480

 61944727 GTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTG 61944786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTG 540

 61944787 A 61944787
          |
      541 A 541

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 601

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 661

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 721

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 781

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 841

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 901

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 961

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
      962 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 1019

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 1079

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 1139

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 1199

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 1259

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1260 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTCACATAATTGCAATCATTGA 1319

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 61945925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATA 1379

 61945926 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 61945985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGG 1439

 61945986 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 61946045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAAT 1499

 61946046 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 61946105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATT 1559

 61946106 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 61946165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTC 1619

 61946166 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 61946225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTG 1679

 61946226 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 61946285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACA 1739

 61946286 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 61946345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTT 1799

 61946346 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 61946405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCA 1859

 61946406 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 61946465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATAT 1919

 61946466 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 61946525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATACAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGA 1979

 61946526 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAA 61946585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1980 TGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTACTCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATATAA 2039

 61946586 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 61946645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTCTTTCCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGG 2099

 61946646 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 61946705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATTGCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATT 2159

 61946706 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 61946765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCC 2219

 61946766 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 61946825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGTATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATAT 2279

 61946826 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTC 61946885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2280 GTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTGAGAACATGCAATATTTCA-TTTCTGTTTC 2338

 61946886 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 61946945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTAACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTC 2398

 61946946 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 61947005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACAGTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCA 2458

 61947006 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 61947065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTCCAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGC 2518

 61947066 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 61947125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGGCAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATAT 2578

 61947126 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 61947185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGTAGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTT 2638

 61947186 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 61947245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAATTTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACAT 2698

 61947246 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 61947305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTGTTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAG 2758

 61947306 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 61947365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTT 2818

 61947366 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 61947425
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATATCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTT 2878

 61947426 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 61947485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTT 2938

 61947486 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 61947545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGC 2998

 61947546 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 61947605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTAAGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAAC 3058

 61947606 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 61947665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATT 3118

 61947666 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 61947725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTT 3178

 61947726 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 61947785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCATTTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGAT 3238

 61947786 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAATTTTTTT 61947845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     3239 AGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGGTCCCATGTGTCAA-TTTTTT 3297

 61947846 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 61947905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTATGTCTA 3357

 61947906 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 61947965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGTTAAGT 3417

 61947966 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 61948025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTCAATCT 3477

 61948026 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 61948085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTTTTTCC 3537

 61948086 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTGTTTC 61948145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3538 TTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTTATTTC 3597

 61948146 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 61948205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAGACTGT 3657

 61948206 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 61948265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTCTTTTT 3717

 61948266 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 61948325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGAATAAC 3777

 61948326 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 61948385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAATCTGTA 3837

 61948386 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 61948445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 AATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAATATGGA 3897

 61948446 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 61948505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 ATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTTTTATA 3957

 61948506 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 61948565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTTATTTT 4017

 61948566 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 61948625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGACGATAT 4077

 61948626 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 61948685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTTCCTAA 4137

 61948686 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 61948745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 AGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTACAGAA 4197

 61948746 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 61948805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCAGTTTC 4257

 61948806 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGTGGTGA 61948865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4258 TTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGCGGTGA 4317

 61948866 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 61948925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGCCCATT 4377

 61948926 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 61948985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 CAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTT 4437

 61948986 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 61949045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 AAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGTCATTA 4497

 61949046 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 61949105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TGTGGTTTTTGTTTTTAGTTCTGTTTATGTGATAAATCACATGTATTGATTTACATATGT 4557

 61949106 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 61949165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TCAACCAAACTTGCATCCTGGAAATACCTACTTGATCATGGTGGGTTAGTTTTTTGATGT 4617

 61949166 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 61949225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GCTGCTGGATTTGGTTTGCTAGTATTTTGTTGAGGATTTTGCATCTATGTTCATCAGGAA 4677

 61949226 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGTGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 61949285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4678 TGTTGACCTGAAGTTTTCTTTTTTTCATTGTGTCTCTGCGAGGTTTTGGTATCGGAATGA 4737

 61949286 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 61949345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TTCTGGCCTTATAGAATGAGTTGGGGAGGAGTCCCTCCCCTCAATTTTTCGGAATAGTTT 4797

 61949346 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 61949405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 CTATAGGATTGGTGCAACTCTATATGTGTAACAGAATTAGGCTGTGAATCCATCTTTTCC 4857

 61949406 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 61949465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 AGGGCTTTTTCTGGTTGGTAGGCTTTTTATTACAAGTTCTCCTAGAACTTGTTATTGGTC 4917

 61949466 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 61949525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 TGTTCAGAGTTTCAATTTCTTCCTGGTTCAATCTTGAGAGGTTGTATGCTTCCAGGAATT 4977

 61949526 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 61949585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 TATCCATTTCTTCTTGGTTTTCTAGTTTGTGTGCATAGAGGTGTGTAATACTCTCTGAGG 5037

 61949586 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 61949645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 GTTTTTGTATTTTGTTGGGGTCGGGGGGAGGGGGTCGGTGGTAATGTCCCTTTGTCATTT 5097

 61949646 CCGATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 61949705
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 CCAATTGTATTTATTTGGATCTTCTCTCTTTTTTCTTTATTAGTCTAGCTAGCAGTCTAT 5157

 61949706 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 61949765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 CAATCTTATTTATTCTTTCAAATAACGAAATTTTGGTTTCATTCAGCTTTTGTGTGGTTT 5217

 61949766 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 61949825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TTCACATCTCAGTTTCATTCAGTTCAGCTCTGAATTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCCAG 5277

 61949826 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 61949885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 CTTTGGGGTTGGTTTGCTGTTGTTTTTATAGTTCTTCTGGGGATCACGTTAGGTTTTATT 5337

 61949886 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 61949945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 TGAGATCTTTCTAACTTTTCGATGTGGGCATTTAGCACTATAAGCTTTCCTTTTAACACT 5397

 61949946 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 61950005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TCTTTACTTAACACTTCTGTTCCAGAGATTCTGGTATGTTTTATCCATTTTCACTAGTTT 5457

 61950006 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 61950065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 CAAAGAATTTCTTGATTTCTGCCTTCATTTAATTGTTTACCCAAAAGTCATTCAGGAGCA 5517

 61950066 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 61950125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TGTTGTTTACTTTCCATGTAATTGTATGGTGTTGAGAGATCTTAGTGTTGATTTCTATTT 5577

 61950126 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 61950185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 TTATTGCACTGTCGTTCAAGGGTGTGGCTAGTACGATTTCACTTGGTTTGAATTTGCTGG 5637

 61950186 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 61950245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 GAATTGTTTTATGGCCAATCATGTGGTCAATTTTAGAGTATGTGTCATGTGCAGATGAGA 5697

 61950246 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 61950305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 AGAATGTATATTCTGTTGTTTTCTGGTGGAGTGTTCTGCAGATGTCTGTTAGGTCTATTT 5757

 61950306 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 61950365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 GATCAAGTGTTGAGTTCTGGTCCTGAATATCACTGTTAGTTTTCTGCTTCGATGACCTGT 5817

 61950366 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 61950425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 CTAATACTGTCAGTAGGGTGTTGAAGTCTCCCACTATTATTATGTGGTTATGTAAGTCTC 5877

 61950426 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 61950485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TTTGTGAGTCTCTGAAAACTTGTTGTATAAATAGGTGCTCCAGTGTTGGGTGCATATATA 5937

 61950486 AGTAGG 61950491
          ||||||
     5938 AGTAGG 5943

Alignment time is 7.23248 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    9160] =>      9160 nucs 'mol-32-3403-160471_9160'

Score:        8998
Aligned:      9160        nucs
Identic:      9142 (100%) nucs =>      3924 (100%)      5218 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61937330,61941264] EXCISED REGION [61941273,61946493]
 second seq =>  [       1,    3935] EXCISED REGION [    3940,    9160]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [61941265,61941272]
 second seq =>         4 nucs [3936,3939]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [3925,3937] to [3929,3941]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61937330 ATTGTGAGGTTTTTGATACCTTTTTATAGTTTTATGTTGTCATCTTTGTTTTAAGGAATA 61937389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGTGAGGTTTTTGATACCTTTTTATAGTTTTATGTTGTCATCTTTGTTTTAAGGAATA 60

 61937390 TGTGAAGTTGTTTCAAAATTGGGAACAAGAATTGTCACATTCTTTTGTTTTTTCTTCATA 61937449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGAAGTTGTTTCAAAATTGGGAACAAGAATTGTCACATTCTTTTGTTTTTTCTTCATA 120

 61937450 TTTTCTCCATATTTTTCTTGTTTTCCTCTTTTGCCCTCCAGTCCTGGGAGGAAAGTAAGT 61937509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTCTCCATATTTTTCTTGTTTTCCTCTTTTGCCCTCCAGTCCTGGGAGGAAAGTAAGT 180

 61937510 GTCATGGGTGAGGACTTTCCACTTCCTGGACCATTGGAGTCTCTGGGACCATCCACAGTC 61937569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCATGGGTGAGGACTTTCCACTTCCTGGACCATTGGAGTCTCTGGGACCATCCACAGTC 240

 61937570 CCTAAGCCTGGGAAAGTGCTCTGTTCTTTAGCATATTAAAAATGGCCCTAGCCTGTCCTT 61937629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAAGCCTGGGAAAGTGCTCTGTTCTTTAGCATATTAAAAATGGCCCTAGCCTGTCCTT 300

 61937630 AAATGACTCTAGAGGGGTCATTCAAGTGCATGTTTGTATGTGGAAAGATGATTAATATGT 61937689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATGACTCTAGAGGGGTCATTCAAGTGCATGTTTGTATGTGGAAAGATGATTAATATGT 360

 61937690 CACATATGGCTTAAAGGAGCCAGCAGGATCTTGAGACACAGTAAAAATATCCCCCC-GCC 61937748
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
      361 CACATATGGCTTAAAGGAGCCAGCAGGATCTTGAGACACAGTAAAAATATCCCCCCTGCC 420

 61937749 ACCCTTCAGAGGTGGGGAATTTTGATTCCTCCCTGGTAAATCTCTGTCAAATTACTAATT 61937808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCCTTCAGAGGTGGGGAATTTTGATTCCTCCCTGGTAAATCTCTGTCAAATTACTAATT 480

 61937809 ATTGATCTCTGATAATTACCAATTATTGATCCCTAACTCATGACTGTCTCCTTTACAGCT 61937868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTGATCTCTGATAATTACCAATTATTGATCCCTAACTCATGACTGTCTCCTTTACAGCT 540

 61937869 GGTGAGCAAGCCACTGATTCTAGACTTTCATGACTTTCTGATGACTTCCTGATGACTTCC 61937928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGAGCAAGCCACTGATTCTAGACTTTCATGACTTTCTGATGACTTCCTGATGACTTCC 600

 61937929 TACTGACCAAATGATAAACCGCTCAGAATTTCCTGTCTGCACTGTGTGGGATAGTGTCCC 61937988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACTGACCAAATGATAAACCGCTCAGAATTTCCTGTCTGCACTGTGTGGGATAGTGTCCC 660

 61937989 CTGAGCCACCTTCTTTCTCAAATTGCTGTTATATTGTCTTAATCCACAAGGAAGGTCTTG 61938048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAGCCACCTTCTTTCTCAAATTGCTGTTATATTGTCTTAATCCACAAGGAAGGTCTTG 720

 61938049 TGTGAACATATGTATACATCCAGAGTGTTCTGGTAGAATTATAGCTCCCCTTGCACTAAG 61938108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGAACATATGTATACATCCAGAGTGTTCTGGTAGAATTATAGCTCCCCTTGCACTAAG 780

 61938109 GGGTGCCCGGGGCACTTACATGATGTGTACTTGTTGTTAACCACCGCTCCCCAGGGGCTG 61938168
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
      781 GGGTGCCCGGGGCACTTACATGATGTGTACTTGTT---AACCACCGCTCCCCAGGGGCTG 837

 61938169 GATCTTATCCCCTGTGCATAATCAGAAGCAGTTTCCCTAGTCTTGGTTCACCTGGTTGCA 61938228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 GATCTTATCCCCTGTGCATAATCAGAAGCAGTTTCCCTAGTCTTGGTTCACCTGGTTGCA 897

 61938229 GTTCTCACCCTCTTCCTAGGAGTCCACTCTGCTGAGTTCCCATCAGGTCTTCTTCTGCAC 61938288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 GTTCTCACCCTCTTCCTAGGAGTCCACTCTGCTGAGTTCCCATCAGGTCTTCTTCTGCAC 957

 61938289 TGACTCTATGCCAGGTAGCTGGAGGTTAGACTGTTCCTTCAGCCTAGGTACTTTCTTTCT 61938348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TGACTCTATGCCAGGTAGCTGGAGGTTAGACTGTTCCTTCAGCCTAGGTACTTTCTTTCT 1017

 61938349 TCACCTCTTCATCATGTCCTCCAAAAAGCCTCCTATGTATAGGTTGGTTTACGTGGCCAT 61938408
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TTACCTCTTCATCATGTCCTCCAAAAAGCCTCCTATGTATAGGTTGGTTTACGTGGCCAT 1077

 61938409 TTTTTTTT---TCTTTCTTTCTTTCTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTT 61938465
          ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTT 1137

 61938466 TTTGAGACGGGGTCTGGCTCTATCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGTCTCA 61938525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TTTGAGACGGGGTCTGGCTCTATCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGTCTCA 1197

 61938526 CTGCAACCTCTGCCTCCCAGGCTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGG 61938585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CTGCAACCTCTGCCTCCCAGGCTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGG 1257

 61938586 GATTATAGGCGCGCGCCATCAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT 61938645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GATTATAGGCGCGCGCCATCAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT 1317

 61938646 TCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGTGATCCACCCGCCTCGGCC 61938705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGGTGATCCACCCGCCTCGGCC 1377

 61938706 TCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACAGCGCCCGGCCCGTTTTATTCTTTTAA 61938765
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGTGTGAGCCACAGCGCCCGGCCCGTTTTATTCTTTTAA 1437

 61938766 TTACCAAAGGCTGGCCTGTAGTAGGAGATGTCTGATGAGTTTTTCTTAAATTGAACGCCA 61938825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TTACCAAAGGCTGGCCTGTAGTAGGAGATGTCTGATGAGTTTTTCTTAAATTGAACGCCA 1497

 61938826 ACAATAAGGTTTGAGCCTCAAGGTGGCGCCATTTCATGTAGAGTCTGGAATCTCTGAACA 61938885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ACAATAAGGTTTGAGCCTCAAGGTGGCGCCATTTCATGTAGAGTCTGGAATCTCTGAACA 1557

 61938886 CTTGAAATAGACCATCCGTCACTAGCAGGAGCCCTTGCGTTCCGTTCCTGGATGCCGTTC 61938945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CTTGAAATAGACCATCCGTCACTAGCAGGAGCCCTTGCGTTCCGTTCCTGGATGCCGTTC 1617

 61938946 TCAAAGTGAACACAATGAAATACAAGTTTCACTCGTGTTTGCATAAGGTCAAAACAACTG 61939005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCAAAGTGAACACAATGAAATACAAGTTTCACTCGTGTTTGCATAAGGTCAAAACAACTG 1677

 61939006 ACAGGGTCGTTTCTTCTTGAGAGGACTGTGCGTTATCCTAGCAGGTGTATATACTATTTA 61939065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 ACAGGGTCGTTTCTTCTTGAGAGGACTGTGCGTTATCCTAGCAGGTGTATATACTATTTA 1737

 61939066 TCTCGTCAGATTTCTTACCAAGGAGACAGAAGCTGAGAAGAAATGAGATTAGGGGTTGTC 61939125
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1738 TCTCGTCAGATTTCTTACCAAGGAGACAGAAGCTGAGAAGAAATGAGATTAGGTGTTGTC 1797

 61939126 TATCAAGGACAGAGGGAAAGAAGGGGGTAGCTGCGACTGTGTTTGTGGTGTGTGGGATGA 61939185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TATCAAGGACAGAGGGAAAGAAGGGGGTAGCTGCGACTGTGTTTGTGGTGTGTGGGATGA 1857

 61939186 AAAGGAAGATTTGAAGGATAAAACTAGAAGGGAAGTGAAGATGACTCCAAAGTGCCTTAT 61939245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AAAGGAAGATTTGAAGGATAAAACTAGAAGGGAAGTGAAGATGACTCCAAAGTGCCTTAT 1917

 61939246 TTGGAGCGGGATGAGACTGACTGGATGGTTCATGTTAAAGGGATCGTCTCAGCACAGCTG 61939305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TTGGAGCGGGATGAGACTGACTGGATGGTTCATGTTAAAGGGATCGTCTCAGCACAGCTG 1977

 61939306 AGGGTTTTTCACACATACTATTATTTAATTCTACTGACTTTCACGTAAAGAAAGTGTAGT 61939365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AGGGTTTTTCACACATACTATTATTTAATTCTACTGACTTTCACGTAAAGAAAGTGTAGT 2037

 61939366 CTTTATTTACTGAGACTTAAAAAGATTAAATGGCTTTTCCAAGCTCACACAGTCCATATA 61939425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CTTTATTTACTGAGACTTAAAAAGATTAAATGGCTTTTCCAAGCTCACACAGTCCATATA 2097

 61939426 ACCCAGAGATGGGAAAATATATCTGGACCCCAAATCCTTAATTTTACTTGTCTGCCTGCC 61939485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 ACCCAGAGATGGGAAAATATATCTGGACCCCAAATCCTTAATTTTACTTGTCTGCCTGCC 2157

 61939486 CGCCTCTTCCCTGTTGAACCTGGGGAGGCATCAGGGCATCCTGTTAGTGGTGTCCCACAG 61939545
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2158 CGCCTCTTCCCTGTTGAACCTGGGGAGGCATCAGGGCATCCGGTTAGTGGTGTCCCACAG 2217

 61939546 ATAGACAAATTTTACCCTGGATTACGAAAAGCTGGATTAGCTTTCTTACTTAAACAATAC 61939605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 ATAGACAAATTTTACCCTGGATTACGAAAAGCTGGATTAGCTTTCTTACTTAAACAATAC 2277

 61939606 TGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGC 61939665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGC 2337

 61939666 AGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAGCATGGTGAAACCCCGTCTCTTC 61939725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAGCATGGTGAAACCCCGTCTCTTC 2397

 61939726 TAAAATACAAAAAGTAAATTAGCTGGGCACGATGGCGCCTGCCTGTAGTCCCAGCTACTC 61939785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TAAAATACAAAAAGTAAATTAGCTGGGCACGATGGCGCCTGCCTGTAGTCCCAGCTACTC 2457

 61939786 GGGAGACTGAGGCAGGGGAATCGGTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCAAAA 61939845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GGGAGACTGAGGCAGGGGAATCGGTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCAAAA 2517

 61939846 TCACGCCACTGCACTGCAGCCTGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTGAAAACAAAACAAAA 61939905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TCACGCCACTGCACTGCAGCCTGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTGAAAACAAAACAAAA 2577

 61939906 CAAGAAATAATACTGGAACTTCTTTCCCTGCTGTTGCTCCAATTCCCTTCCCTGGATTAT 61939965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CAAGAAATAATACTGGAACTTCTTTCCCTGCTGTTGCTCCAATTCCCTTCCCTGGATTAT 2637

 61939966 TTTCCTCTTTGTCACTACCACACATCTAGAAAGATTAGCATTTCTATTACAGAAGCAAAT 61940025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TTTCCTCTTTGTCACTACCACACATCTAGAAAGATTAGCATTTCTATTACAGAAGCAAAT 2697

 61940026 GTCAAAAGGAGATTTAGAGGGAGTTACAGTTGCTTAAAAAAAAAAAAACCCCTGCCCTTT 61940085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GTCAAAAGGAGATTTAGAGGGAGTTACAGTTGCTTAAAAAAAAAAAAACCCCTGCCCTTT 2757

 61940086 GCCATCACAAGCCCATGATCGTCACAGTTATCTGTCAGTCAAGCACCTGACCGTAATGGA 61940145
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GCCATCACAAGCCCATGATCATCACAGTTATCTGTCAGTCAAGCACCTGACCGTAATGGA 2817

 61940146 AGTCAACAAATAAAACGCATCACTTGAGACCGGATAAAGAACACAGGATGAGCATGAGTT 61940205
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AGTCAACAAATAAAACGCATCACTTGAGACTGGATAAAGAACACAGGATGAGCATGAGTT 2877

 61940206 TAATCCTTGTCCATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAA 61940265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TAATCCTTGTCCATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAACAACTTAAAATGACAACAAA 2937

 61940266 AGAACAAAGTGGCAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAG 61940325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AGAACAAAGTGGCAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCAAGTGACAATATTTGATGAG 2997

 61940326 AAATATTTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAA 61940385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 AAATATTTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGATGAAATCTACAGAGAAATAA 3057

 61940386 GATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCT 61940445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAAACCTTCAGATAGAGGAGCT 3117

 61940446 TTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAAT 61940505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGGATAATTATTGAAATTGAAT 3177

 61940506 ACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTT 61940565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 ACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGACAGCGACCTCACACCACTTT 3237

 61940566 GCTCTGTTCTTCTGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGT 61940625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GCTCTGTTCTTCTGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGTTTTTATTGTTCCCTTCAGT 3297

 61940626 GCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAA 61940685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAGCAGAAAACCGTGAGATTAA 3357

 61940686 GCAAAAATAATTGCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCA 61940745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GCAAAAATAATTGCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGTTCAGAAGTTTGCTGGTCCA 3417

 61940746 TTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAA 61940805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGTTCTTCTAGAATTCTGTTAA 3477

 61940806 AAAAAAAAAGCCATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGC 61940865
          |||||||| |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AAAAAAAA-GCCATTAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTAACCCCTTTTCCTTCTAGGC 3536

 61940866 TAAATATGAAAAAAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGAT 61940925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TAAATATGAAAAAAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGCACCTGTTTTTGCAGAGGAT 3596

 61940926 ACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTG 61940985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 ACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTTGGGTGGTACCTTTGATGTG 3656

 61940986 GTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATG 61941045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGGACAGACTTACCATGAGATG 3716

 61941046 CAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGT 61941105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCGGGGATGGTCAAGATAGGGT 3776

 61941106 GTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAG 61941165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTCTGACATTCCTTTAGGTAAG 3836

 61941166 ATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTG 61941225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 ATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCTCACGTTGGTGTCAGCCTTG 3896

 61941226 ACAGGAACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGA 61941264
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 ACAGGAACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGA 3935

EXCISED REGION

 61941273 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 61941332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 3999

 61941333 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 61941392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 4059

 61941393 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 61941452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 4119

 61941453 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 61941512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 4179

 61941513 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 61941572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 4239

 61941573 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 61941632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 4299

 61941633 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 61941692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 4359

 61941693 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 61941752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 4419

 61941753 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 61941812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 4479

 61941813 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 61941872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 4539

 61941873 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTG 61941932
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4540 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTG 4599

 61941933 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 61941992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 4659

 61941993 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 61942052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 4719

 61942053 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 61942112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 4779

 61942113 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 61942172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 4839

 61942173 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 61942232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 4899

 61942233 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 61942292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 4959

 61942293 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 61942352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 5019

 61942353 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 61942412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 5079

 61942413 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 61942472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 5139

 61942473 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 61942532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 5199

 61942533 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 61942592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 5259

 61942593 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 61942652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 5319

 61942653 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 61942712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 5379

 61942713 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 61942772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5380 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 5439

 61942773 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 61942832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5440 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 5499

 61942833 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 61942892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5500 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 5559

 61942893 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 61942952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5560 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 5619

 61942953 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 61943012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5620 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 5679

 61943013 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 61943072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5680 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 5739

 61943073 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 61943132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 5799

 61943133 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 61943192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 5859

 61943193 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 61943252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 5919

 61943253 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 61943312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 5979

 61943313 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 61943372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 6039

 61943373 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 61943432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 6099

 61943433 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 61943492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 6159

 61943493 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 61943552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 6219

 61943553 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 61943612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 6279

 61943613 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 61943672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 6339

 61943673 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 61943732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6340 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 6399

 61943733 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 61943792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 6459

 61943793 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 61943852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 6519

 61943853 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 61943912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6520 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 6579

 61943913 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 61943972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6580 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 6639

 61943973 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 61944032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6640 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 6699

 61944033 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 61944092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6700 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 6759

 61944093 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 61944152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6760 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 6819

 61944153 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 61944212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6820 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 6879

 61944213 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 61944272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6880 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 6939

 61944273 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 61944332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6940 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 6999

 61944333 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 61944392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7000 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 7059

 61944393 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 61944452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7060 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 7119

 61944453 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 61944512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7120 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 7179

 61944513 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 61944572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7180 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 7239

 61944573 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 61944632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7240 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 7299

 61944633 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 61944692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7300 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 7359

 61944693 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 61944752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7360 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 7419

 61944753 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 61944812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7420 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 7479

 61944813 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 61944872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7480 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 7539

 61944873 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 61944932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7540 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 7599

 61944933 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 61944992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7600 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 7659

 61944993 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 61945052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7660 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 7719

 61945053 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 61945112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7720 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 7779

 61945113 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 61945172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7780 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 7839

 61945173 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGT 61945232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7840 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGT 7899

 61945233 CTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATA 61945292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7900 CTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATA 7959

 61945293 TGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGA 61945352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7960 TGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGA 8019

 61945353 ACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAG 61945412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8020 ACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAG 8079

 61945413 TGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCC 61945472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8080 TGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCC 8139

 61945473 TAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCT 61945532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8140 TAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCT 8199

 61945533 GAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCC 61945592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8200 GAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCC 8259

 61945593 GACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTC 61945652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8260 GACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTC 8319

 61945653 ACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAA 61945712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8320 ACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAA 8379

 61945713 AGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGA 61945772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8380 AGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGA 8439

 61945773 CTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCT 61945832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8440 CTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCT 8499

 61945833 CTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGT 61945892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8500 CTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGT 8559

 61945893 ACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTT 61945952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8560 ACTTTTCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTT 8619

 61945953 TATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAA 61946012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8620 TATCACCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAA 8679

 61946013 ACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATT 61946072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8680 ACTCACAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATT 8739

 61946073 CAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGA 61946132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8740 CAAAACAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGA 8799

 61946133 ATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGT 61946192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8800 ATAATTGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGT 8859

 61946193 GTCTCCATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGAT 61946252
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8860 GTCTCCATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGAT 8919

 61946253 TTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTAC 61946312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8920 TTTATTGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTAC 8979

 61946313 TGTCGTTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTA 61946372
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8980 TGTCGTTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTA 9039

 61946373 CAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATC 61946432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9040 CAGGAAAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATC 9099

 61946433 AGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATA 61946492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9100 AGTTTCATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATA 9159

 61946493 A 61946493
          |
     9160 A 9160

Alignment time is 10.7814 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5362] =>      5362 nucs 'mol-32-3403-203252_5362'

Score:        5307
Aligned:      5362        nucs
Identic:      5357 (100%) nucs =>      4159 (100%)      1198 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61943678,61947838] EXCISED REGION [61947841,61949040]
 second seq =>  [       1,    4162] EXCISED REGION [    4163,    5362]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [61947839,61947840]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [61947839,61947851] to [61947841,61947853]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [61947839,61947839] to [61947840,61947840]
 second seq =>         0 nucs

 61943678 CATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTG 61943737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTCTTTG 60

 61943738 TGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTAT 61943797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTATTAT 120

 61943798 TAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTT 61943857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTAACTT 180

 61943858 TGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTAT 61943917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCAGTAT 240

 61943918 CTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTT 61943977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTTATTT 300

 61943978 ATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGT 61944037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGT 360

 61944038 GGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA 61944097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA 420

 61944098 GCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTT 61944157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGTATTT 480

 61944158 TTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGT 61944217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTCAAGT 540

 61944218 GATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGG 61944277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGG 600

 61944278 CCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTG 61944337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTACTGTG 660

 61944338 TCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACA 61944397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAATGACA 720

 61944398 GTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAA 61944457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACATTAAA 780

 61944458 AAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAAT 61944517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGTAAAT 840

 61944518 AGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTT 61944577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTCCTTT 900

 61944578 GCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACC 61944637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACACACC 960

 61944638 GCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTA 61944697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTGTGTA 1020

 61944698 TATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTT 61944757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATGAGTT 1080

 61944758 TGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAG 61944817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTATAGAG 1140

 61944818 AAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAAT 61944877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTTTTAAT 1200

 61944878 TTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAG 61944937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACCAATAG 1260

 61944938 TGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACA 61944997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTCTAACA 1320

 61944998 GGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTA 61945057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTCTATTA 1380

 61945058 AGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAG 61945117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAG 1440

 61945118 CCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTG 61945177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTG 1500

 61945178 ATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGA 61945237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGA 1560

 61945238 GATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCT 61945297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTGTGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCT 1620

 61945298 TCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAA 61945357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGTGATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAA 1680

 61945358 TGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATC 61945417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAAAGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATC 1740

 61945418 CCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAA 61945477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTGTGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAA 1800

 61945478 TATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGA 61945537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAAGGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGA 1860

 61945538 CGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCC 61945597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTGGGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCC 1920

 61945598 TTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTG 61945657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATTAAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTG 1980

 61945658 GACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCA 61945717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTTAACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCA 2040

 61945718 GATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAG 61945777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAGGATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAG 2100

 61945778 ATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCC 61945837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATTGAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCC 2160

 61945838 CTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTT 61945897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGACATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTT 2220

 61945898 TCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCA 61945957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCTTTACTAATTCATTTATTCTTTATACAAATCCTATGAGGTAGATGCTTTTTTTATCA 2280

 61945958 CCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCA 61946017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTTATTTTACAGATGAGGAAACTGTGGCTGCAAGGCTAAGCAACGAGCTGAAAAACTCA 2340

 61946018 CAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAA 61946077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAGTTGGGTATATATCCAGAGAACAATTCATATTCCAAACACCACTTCAGAATTCAAAA 2400

 61946078 CAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAAT 61946137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAAAGCATACAGCTACCCTATTCGGATTCTGATGGGGGCTGCCTGAATTTGTAGAATAAT 2460

 61946138 TGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTC 61946197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAGAATAGTTGACATCTTAAAATTTTCCAAAATTTGCTTCAGAACAAGGTGTGTGTCTC 2520

 61946198 CATTTGTTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTAT 61946257
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATTTATTTAGATTCCCTTTTATCTTTGTGTAAATTTCACGTAAAATTTCATGATTTTAT 2580

 61946258 TGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCG 61946317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTTAAAAGTTTGTATATTTCCAATACATATGTTTCAGTATATTTTTGTTGCTACTGTCG 2640

 61946318 TTACTATTGTCGATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGA 61946377
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTACTATTGTCAATGGTATAATTTTTTTCCTGTTATGTAATGCAATAGCTGCTTACAGGA 2700

 61946378 AAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTT 61946437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTGATTCATTTCCAAATTGGTGATCATTATTCAGCTAACTTGATAAACTCATCAGTTT 2760

 61946438 CATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATA 61946497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATTATTTATTTATTTTCTAATTAATATTATGTAATTTTTTTCTTAAGGAAAATAAAATA 2820

 61946498 CAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTAC 61946557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAAAATTATCAGACACCAGAACGATGGATGATGGAATTCATTCAGCATCTATTACTGTAC 2880

 61946558 TCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTT-CTTT 61946616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     2881 TCCCTAAGTTTCCAGTTGAAATATTTAAAAGCCATGATAGATGGCTTTTTTTTTTTCTTT 2940

 61946617 CCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATT 61946676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCAACTTTGTTTTTTTTAGGTTCAGAGGGTACATGTCCAGGTTTGCTATATGGGTAAATT 3000

 61946677 GCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCC 61946736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCATGGCGTGGGGGTTTGGTGTACAGATTATTTCATCATCAGGTAATAAGCGTAGTACCC 3060

 61946737 AATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGT 61946796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATAGGTAGTTTTTCAATCTTCACCCTCCTCCCACTCTCCACCCTCAGGTAGGCCCTGGT 3120

 61946797 ATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTG 61946856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATCTCTTGTTCCCTTCTTTGTGTCCATATGTATTCAATGTTTAGCCCCCACTTGTAAGTG 3180

 61946857 AGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTA 61946916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGAACATGCAATATTTCATTTTCTGTTTCAATGTTAATTTGTTTAGGATAATGGCCTCTA 3240

 61946917 ACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACA 61946976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACTTCATTGCTGCAAAAAAACATGATCTCATTCTTTTTTACGGATGTATAGTATTCCACA 3300

 61946977 GTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTC 61947036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTCTATATGTACCACGTTTTCTTTACCCAGTCCACCGCTGATGGGCGTCTAGGTTAATTC 3360

 61947037 CAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGG 61947096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAGGCCTTTGCTATTGCGAATAGTGTGGCAATGAACATATGCATGCATATGTCTTTAGGG 3420

 61947097 CAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGT 61947156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGAATAATTCATATTCCTTTGGGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCGAATGGT 3480

 61947157 AGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAAT 61947216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGTTCTGCTTTAAGTTCTTTGAGAAATTTCCAAACTGCTTTCCACAATGGCTGAACTAAT 3540

 61947217 TTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTG 61947276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTACATTCCCACCAGCAGCGTACAAACATTCCTATTTCTCTGCAAACTTGTCTGCATCTG 3600

 61947277 TTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATT 61947336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTAGTAATAGCCATTCTGACTGGTGTAAGACGGTATCACATTGTGGCTTTGATTTGCATT 3660

 61947337 TCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTT 61947396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCTCTAATGATTAGTGATGTTGGGCATTTTTTGTATGCTTGTTGGCCACGAGCATGTCTT 3720

 61947397 CTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTG 61947456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCTTTTGCCAACTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTGTTTG 3780

 61947457 TTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 61947516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTGTTTGTTTGTTTTTAGGCAGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCA 3840

 61947517 CAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTA 61947576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGTCATGGCTCCAAATTGCAGTCATGGCTCCAAACTGCAACCTCAGCCTCCCAGGCTTA 3900

 61947577 AGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGC 61947636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGCGATCCTCCCACGTCGGCCTCTCAAACTGCTGGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGC 3960

 61947637 CTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGT 61947696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTGGCCTTTGCCAACTTTTTAATGGGATTGTTTGTTTTTTGCTTGTTAATTTGTTTAAGT 4020

 61947697 TCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCAT 61947756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCCTTTTAGATTCTGGATAGACCTTTGTTGGATGCGTAGTGTGCAAATATTTTCTTCCAT 4080

 61947757 TTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGT 61947816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTTGTAGATTGTCTGTTTACTCTGATGATAGTATATTTCGTTGTGCAGAAGCTCTTTAGT 4140

 61947817 TTAACTAGGTCCCATGTGTCAA 61947838
          ||||||||||||||||||||||
     4141 TTAACTAGGTCCCATGTGTCAA 4162

EXCISED REGION

 61947841 TTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTAT 61947900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4163 TTTTTTTTTTTTTGCAATTACTTTTGCCATCTTCATCACGAAACCTTTGGTAGGGCCTAT 4222

 61947901 GTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGT 61947960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4223 GTCTAGAATCGTATTTCCTAGGTTTTCTTTTAGAGTTTTTATAGTTTCAGGTTTTACAGT 4282

 61947961 TAAGTCTTTAATATATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTC 61948020
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4283 TAAGTCTTTAATGTATTTTGAGTTGACTTTTGCATATGGTGAAAGGAAGGGTCTCGTTTC 4342

 61948021 AATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTT 61948080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4343 AATCTTCTGCATATAGCTAACCAGTTATCCCAGCATGATTAATTGAATAGGGAGTCCTTT 4402

 61948081 TTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTT 61948140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4403 TTTCCTTGCTTGTTTTTATCAACCTTGTCTAAGATTCGATGGTTGTAGGTGTGTGACTTT 4462

 61948141 GTTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAG 61948200
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4463 ATTTCTGAGTTCTCCATTCTGTTCCACTGGTCTATGTGTCTGTTTTTGTACCAGTGCCAG 4522

 61948201 ACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTC 61948260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4523 ACTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTTTGAAGTAGGTAATGTTATGTCTCCAGCTTTGTTC 4582

 61948261 TTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGA 61948320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4583 TTTTTGCTTAGGATTGCTTTGGCTAGTCAGACTCTTTTTTGGTTCCATATGAATTTTAGA 4642

 61948321 ATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAAT 61948380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4643 ATAACTTTTTCCAATTCTGTGAAAGATGTTATTGGTGGTTTGCTAGGAATAGCATTGAAT 4702

 61948381 CTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAAT 61948440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4703 CTGTAAATTGCTTTGGGTGTATGGCCATTTTAACAATATGGAGCCTTTCCATCCATGAAT 4762

 61948441 ATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTT 61948500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4763 ATGGAATATGAAATGTTTTTCCATATGTTTGTGTTGTCTCTGATTTCCTTCAGTGGTGTT 4822

 61948501 TTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTT 61948560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4823 TTATAATTCTCATTGTAGAGATATTTTACCTCCCTGGTTAGCTGTATTCCTAGGTATTTT 4882

 61948561 ATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGAC 61948620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4883 ATTTTTATGGATGGCTATTGTGAACGAGATTGTGTTTTTGAGTTAGCTCTCATCTTGGAC 4942

 61948621 GATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTT 61948680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4943 GATATTGGTGTATAGATATGCTACTGATTTTTGTGCACTGATTTTGTATCCTGAAACTTT 5002

 61948681 CCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTA 61948740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5003 CCTAAAGTTGTTTAATAGCAATTGGAGCTTTTGGGCAGAGACTATGGGGTTTTATAGGTA 5062

 61948741 CAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCA 61948800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5063 CAGAATCAAATCATCTGCAAACAGGGGTAGTTTGACTTCCTCTTTTCCTATTTGGATGCA 5122

 61948801 GTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGT 61948860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5123 GTTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTCTGGCTAGGACTTCTAGTACTATGTTAAATAGGAGT 5182

 61948861 GGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGC 61948920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5183 GGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTCTGGTTCTCAAGGGGAATGCTTACAGTGTTTGC 5242

 61948921 CCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTT 61948980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5243 CCATTCAGTATGTTGTCTGTGGGTTTGTTACAGATGGCTGTTATTATTTTGAGGTATGTT 5302

 61948981 CCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGT 61949040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5303 CCTTTAAAGCCTAGTTTGTTGAGGGTTTTTATCAGAAGCCTTTTCTGCCTCTTTTGAGGT 5362

Alignment time is 6.55716 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6530] =>      6530 nucs 'mol-32-349d-054876_6530'

Score:        6428
Aligned:      6527        nucs
Identic:      6518 (100%) nucs =>      2572 (100%)      3946 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61938687,61941264] EXCISED REGION [61941273,61945221]
 second seq =>  [       1,    2577] EXCISED REGION [    2582,    6530]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [61941265,61941272]
 second seq =>         4 nucs [2578,2581]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [2567,2579] to [2571,2583]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61938687 TGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACAGCGCCCG 61938746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
        1 TGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGTGTGAGCCACAGCGCCCG 60

 61938747 GCCCGTTTTATTCTTTTAATTACCAAAGGCTGGCCTGTAGTAGGAGATGTCTGATGAGTT 61938806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCCGTTTTATTCTTTTAATTACCAAAGGCTGGCCTGTAGTAGGAGATGTCTGATGAGTT 120

 61938807 TTTCTTAAATTGAACGCCAACAATAAGGTTTGAGCCTCAAGGTGGCGCCATTTCATGTAG 61938866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTTAAATTGAACGCCAACAATAAGGTTTGAGCCTCAAGGTGGCGCCATTTCATGTAG 180

 61938867 AGTCTGGAATCTCTGAACACTTGAAATAGACCATCCGTCACTAGCAGGAGCCCTTGCGTT 61938926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTCTGGAATCTCTGAACACTTGAAATAGACCATCCGTCACTAGCAGGAGCCCTTGCGTT 240

 61938927 CCGTTCCTGGATGCCGTTCTCAAAGTGAACACAATGAAATACAAGTTTCACTCGTGTTTG 61938986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCGTTCCTGGATGCCGTTCTCAAAGTGAACACAATGAAATACAAGTTTCACTCGTGTTTG 300

 61938987 CATAAGGTCAAAACAACTGACAGGGTCGTTTCTTCTTGAGAGGACTGTGCGTTATCCTAG 61939046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATAAGGTCAAAACAACTGACAGGGTCGTTTCTTCTTGAGAGGACTGTGCGTTATCCTAG 360

 61939047 CAGGTGTATATACTATTTATCTCGTCAGATTTCTTACCAAGGAGACAGAAGCTGAGAAGA 61939106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGGTGTATATACTATTTATCTCGTCAGATTTCTTACCAAGGAGACAGAAGCTGAGAAGA 420

 61939107 AATGAGATTAGGGGTTGTCTATCAAGGACAGAGGGAAAGAAGGGGGTAGCTGCGACTGTG 61939166
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGAGATTAGGTGTTGTCTATCAAGGACAGAGGGAAAGAAGGGGGTAGCTGCGACTGTG 480

 61939167 TTTGTGGTGTGTGGGATGAAAAGGAAGATTTGAAGGATAAAACTAGAAGGGAAGTGAAGA 61939226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGTGGTGTGTGGGATGAAAAGGAAGATTTGAAGGATAAAACTAGAAGGGAAGTGAAGA 540

 61939227 TGACTCCAAAGTGCCTTATTTGGAGCGGGATGAGACTGACTGGATGGTTCATGTTAAAGG 61939286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGACTCCAAAGTGCCTTATTTGGAGCGGGATGAGACTGACTGGATGGTTCATGTTAAAGG 600

 61939287 GATCGTCTCAGCACAGCTGAGGGTTTTTCACACATACTATTATTTAATTCTACTGACTTT 61939346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATCGTCTCAGCACAGCTGAGGGTTTTTCACACATACTATTATTTAATTCTACTGACTTT 660

 61939347 CACGTAAAGAAAGTGTAGTCTTTATTTACTGAGACTTAAAAAGATTAAATGGCTTTTCCA 61939406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACGTAAAGAAAGTGTAGTCTTTATTTACTGAGACTTAAAAAGATTAAATGGCTTTTCCA 720

 61939407 AGCTCACACAGTCCATATAACCCAGAGATGGGAAAATATATCTGGACCCCAAATCCTTAA 61939466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCTCACACAGTCCATATAACCCAGAGATGGGAAAATATATCTGGACCCCAAATCCTTAA 780

 61939467 TTTTACTTGTCTGCCTGCCCGCCTCTTCCCTGTTGAACCTGGGGAGGCATCAGGGCATCC 61939526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTACTTGTCTGCCTGCCCGCCTCTTCCCTGTTGAACCTGGGGAGGCATCAGGGCATCC 840

 61939527 TGTTAGTGGTGTCCCACAGATAGACAAATTTTACCCTGGATTACGAAAAGCTGGATTAGC 61939586
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTAGTGGTGTCCCACAGATAGACAAATTTTACCCTGGATTACGAAAAGCTGGATTAGC 900

 61939587 TTTCTTACTTAAACAATACTGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACT 61939646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCTTACTTAAACAATACTGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGTCTGTAATCCCAGCACT 960

 61939647 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAGCAT 61939706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCCAGCAT 1020

 61939707 GGTGAAACCCCGTCTCTTCTAAAATACAAAAAGTAAATTAGCTGGGCACGATGGCGCCTG 61939766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTGAAACCCCGTCTCTTCTAAAATACAAAAAGTAAATTAGCTGGGCACGATGGCGCCTG 1080

 61939767 CCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGGGAATCGGTTGAACCTGGGAGGCGG 61939826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGGGAATCGGTTGAACCTGGGAGGCGG 1140

 61939827 AGATTGCAGTGAGCCAAAATCACGCCACTGCACTGCAGCCTGGCAACAGAGCAAGACTCT 61939886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATTGCAGTGAGCCAAAATCACGCCACTGCACTGCAGCCTGGCAACAGAGCAAGACTCT 1200

 61939887 GTCTGAAAACAAAACAAAACAAGAAATAATACTGGAACTTCTTTCCCTGCTGTTGCTCCA 61939946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTCTGAAAACAAAACAAAACAAGAAATAATACTGGAACTTCTTTCCCTGCTGTTGCTCCA 1260

 61939947 ATTCCCTTCCCTGGATTATTTTCCTCTTTGTCACTACCACACATCTAGAAAGATTAGCAT 61940006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTCCCTTCCCTGGATTATTTTCCTCTTTGTCACTACCACACATCTAGAAAGATTAGCAT 1320

 61940007 TTCTATTACAGAAGCAAATGTCAAAAGGAGATTTAGAGGGAGTTACAGTTGCTTAAAAAA 61940066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTATTACAGAAGCAAATGTCAAAAGGAGATTTAGAGGGAGTTACAGTTGCTTAAAAAA 1380

 61940067 AAAAAAACCCCTGCCCTTTGCCATCACAAGCCCATGATCGTCACAGTTATCTGTCAGTCA 61940126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1381 AAAAAAACCCCTGCCCTTTGCCATCACAAGCCCATGATCATCACAGTTATCTGTCAGTCA 1440

 61940127 AGCACCTGACCGTAATGGAAGTCAACAAATAAAACGCATCACTTGAGACCGGATAAAGAA 61940186
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1441 AGCACCTGACCGTAATGGAAGTCAACAAATAAAACGCATCACTTGAGACTGGATAAAGAA 1500

 61940187 CACAGGATGAGCATGAGTTTAATCCTTGTCCATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAAC 61940246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACAGGATGAGCATGAGTTTAATCCTTGTCCATCCTCTTTAGAAATCTGAAAAAAATAAC 1560

 61940247 AACTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGGCAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCA 61940306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACTTAAAATGACAACAAAAGAACAAAGTGGCAAACTCTACAGTATAGTGGAAACAAGCA 1620

 61940307 AGTGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGAT 61940366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTGACAATATTTGATGAGAAATATTTAAGCTTTTCTGATGGATGGAGAGCAGATAGGAT 1680

 61940367 GAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAA 61940426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAATCTACAGAGAAATAAGATGAGAGGAAACTGAAGTTCAAACATGTGCTGGAGAAAAA 1740

 61940427 ACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGG 61940486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCTTCAGATAGAGGAGCTTTTGGAAAGAAAGAGGAAATTAGGTTTAAGATAGGTCTTGG 1800

 61940487 ATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGAC 61940546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAATTATTGAAATTGAATACAGGCAGGATGAGAGTTGAAATACACAATGAGATGTGGAC 1860

 61940547 AGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGT 61940606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCGACCTCACACCACTTTGCTCTGTTCTTCTGCAATATATGTTTTTTTTCACATAATGT 1920

 61940607 TTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAG 61940666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTATTGTTCCCTTCAGTGCAAAGGACTATTGGGGAAGAAGGGTCTTCCCAGTGGGCAG 1980

 61940667 CAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGT 61940726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGAAAACCGTGAGATTAAGCAAAAATAATTGCTATCAAGGATCCTAGGTGAGTATGAGT 2040

 61940727 TCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGT 61940786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAGAAGTTTGCTGGTCCATTACAAGTCTTGGGGTTATTCAGTCTGCTTCTCTGTGCAGT 2100

 61940787 TCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAAAGCCATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTA 61940846
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTCTAGAATTCTGTTAAAAAAAAAA-GCCATCAACTCATTATGGGTGCCAAAGGGGTA 2159

 61940847 ACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGC 61940906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACCCCTTTTCCTTCTAGGCTAAATATGAAAAAAAATCTGATTTTCATCATCCTAAGTGGC 2219

 61940907 ACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTT 61940966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ACCTGTTTTTGCAGAGGATACCAACTGCCTCTTTTGGGTGGTCTCAGACTCCCCTTCTTT 2279

 61940967 GGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGG 61941026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GGGTGGTACCTTTGATGTGGTTGTGCTTGACGTTCTCAAGTCTCTGGTTTTCAAGGTGGG 2339

 61941027 ACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCG 61941086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ACAGACTTACCATGAGATGCAGGTATCTCAAGCAAGGTCCAGCACGACTTACTAACTGCG 2399

 61941087 GGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTC 61941146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GGGATGGTCAAGATAGGGTGTTAGGGCCTGGCTTACTTCGCTGCCAGGCAGTTCTTTCTC 2459

 61941147 TGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCT 61941206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGACATTCCTTTAGGTAAGATCAGTTCCCCAGGTAGAAGAGATGTATTGGAAGAGAGCCT 2519

 61941207 CACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGA 61941264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CACGTTGGTGTCAGCCTTGACAGGAACTTAGGATGAAGGAGACTCCTTGACTGACTGA 2577

EXCISED REGION

 61941273 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 61941332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTTTTTATTTTGAGAC 2641

 61941333 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 61941392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 AAAGAATCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACC 2701

 61941393 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 61941452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 TCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTAGGATTACAG 2761

 61941453 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 61941512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 GTGCCTGCTACCCCACCCAGCTAATTTTTTTGTGTTTATAGTAGAGACGGGGTTTCACTA 2821

 61941513 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 61941572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAA 2881

 61941573 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 61941632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 GTGCTAGGATTGCAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCCAAAACTCCTTGACTTTCAAGAAT 2941

 61941633 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 61941692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 CTGCTCTATTGCAGAGGAAAATTGCTGGACCTCTCCTGGGGCCATGATGATTTCACAGGA 3001

 61941693 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 61941752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 GCAGAGCCCCACAGCTGATTTGAACACATCCTGCATGTTCATCAAGACATTAGGAGGGTT 3061

 61941753 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 61941812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 TTAGGCCACATAAAGTCTGTTCACTATAGTTTATGTCACCTCTGTTTTGCCACTGAATTT 3121

 61941813 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 61941872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 GTATATAGCCTTGTCAGAGCTCTGGGGAGGGTGTGGGATATATGGTTGTAATTTGATGTC 3181

 61941873 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTCTG 61941932
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3182 TGAGGCTTTGCATACCCGTTGGAAAATTCCGTAAAATGAGACCCTTGTTCTGAGTCTTTG 3241

 61941933 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 61941992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 TTGAATAGAATTGCCCCAAGGAGACTGTATTACTAAAGCAAATGGAATAAGCCCTCAACA 3301

 61941993 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 61942052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 ATAAATGGAATTGGGTAAAGCTATACAGACATATCATTGCAACATCGATTGGAGTTTGAA 3361

 61942053 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 61942112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 GTTAATTCCAAATACAAAGTTATGGAATTGTATTGTATTACTGAGGTAAAAGGTATCACG 3421

 61942113 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 61942172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 ATTAAAAAGTGCCTGCTTTCCAGAAGCTTCAGGCCATCCAGAGAACGTACTCTTTAGATC 3481

 61942173 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 61942232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 TGGGTTATGGATGTACTCCACTAATGGGAGATGATGTATGAAGTCAATTTAAAGGTGGAT 3541

 61942233 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 61942292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 GAAGAAGGGTCCCCAAACTCTAGGTGGTGTCCCAAATGGTATCTGCACTGGTTTGCAGCA 3601

 61942293 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 61942352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 TTATGAACAGCACAAGTAGGGTAGTGCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 3661

 61942353 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 61942412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 GCACTTTAGGAGGCTGAGGTGGGCGGATTGCTTGAGGTCGGGAGTTCGAGACGAGCCTGC 3721

 61942413 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 61942472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 CCAATATGGTAAAAACCGATCGCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCGT 3781

 61942473 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 61942532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCACGAGAATTGCTCAAACCCGGGAGG 3841

 61942533 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 61942592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 TGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGA 3901

 61942593 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 61942652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 GTAAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAATAAACAAAACAAATAGGGTAGTGC 3961

 61942653 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 61942712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 ATACAGTGAGAAAATATTATTTTGGAAAATTCAAGAACAAACTAAGAATCTTTTCCTTTT 4021

 61942713 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 61942772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 CTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACGGACTCTTGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGCAG 4081

 61942773 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 61942832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 CATGATCGTACCTCAGTGCATCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAACTCTCCCACCTCAGC 4141

 61942833 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 61942892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 CTCCTGAGTAGATGGGCCTACAGGCAAGTGCCACCACACCTGTCTAAGTTAAAACTTTTT 4201

 61942893 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 61942952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 GTTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 4261

 61942953 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 61943012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 TGGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACT 4321

 61943013 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 61943072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 ACTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGG 4381

 61943073 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 61943132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4382 TATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTG 4441

 61943133 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 61943192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 AATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAG 4501

 61943193 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 61943252
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 AACTTGCAGCAAGAATTCTGAGCATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATA 4561

 61943253 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 61943312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 CATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATG 4621

 61943313 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 61943372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 TATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATA 4681

 61943373 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 61943432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 AGCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATT 4741

 61943433 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 61943492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 GCTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATA 4801

 61943493 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 61943552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 CTTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGG 4861

 61943553 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 61943612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 TTCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATT 4921

 61943613 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 61943672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 ATTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATA 4981

 61943673 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 61943732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4982 CATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTT 5041

 61943733 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 61943792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5042 CTTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTT 5101

 61943793 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 61943852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5102 ATTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGT 5161

 61943853 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 61943912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5162 AACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCC 5221

 61943913 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 61943972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5222 AGTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATT 5281

 61943973 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 61944032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5282 TATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGT 5341

 61944033 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 61944092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5342 GCAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 5401

 61944093 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 61944152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5402 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTG 5461

 61944153 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 61944212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5462 TATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCT 5521

 61944213 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 61944272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5522 CAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTG 5581

 61944273 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 61944332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5582 CCCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTA 5641

 61944333 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 61944392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5642 CTGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAA 5701

 61944393 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 61944452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5702 TGACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACA 5761

 61944453 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTG 61944512
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5762 TTAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTACCTATTG 5821

 61944513 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 61944572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5822 TAAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTT 5881

 61944573 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 61944632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5882 CCTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTAC 5941

 61944633 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 61944692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5942 ACACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTT 6001

 61944693 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 61944752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6002 GTGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACAT 6061

 61944753 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 61944812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6062 GAGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGAGTGCCTGGAACCAATCCCCTGAGTA 6121

 61944813 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 61944872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6122 TAGAGAAGAATGATTGTATACTCTGTGGTAGGATTGCTGGATCATATGGTTGTTTTATTT 6181

 61944873 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 61944932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6182 TTAATTTTTTGAGGAAACTCCATACTGTTTTTCATGACCGTACTAATTTATATTTCCACC 6241

 61944933 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 61944992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6242 AATAGTGGGTAAAAGGTTTTCTTTTCTCCACATCCTCGATAATACTTGTAATAGCCATTC 6301

 61944993 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 61945052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6302 TAACAGGTATGACCTAATTGTGGTTTTGATTTGCACTTCTCTGATCAGTCTATTAAGGTC 6361

 61945053 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 61945112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6362 TATTAAGTCTTAGGTCTATTAAGGTCTTTTGCCTATTTTAAACATTATTTTTAATGATTT 6421

 61945113 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 61945172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6422 ATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAGTTTATTAAAAACGATAAATTAGATACC 6481

 61945173 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGT 61945221
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6482 ACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAACAATACTTTAAATAGT 6530

Alignment time is 7.89725 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [61934787,61955085] =>     20299 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2705] =>      2705 nucs 'mol-32-34a8-071440_2705'

Score:        2551
Aligned:      2707        nucs
Identic:      2692 ( 99%) nucs =>      1884 ( 99%)       808 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [61942894,61944787] EXCISED REGION [61945086,61945898]
 second seq =>  [       1,    1894] EXCISED REGION [    1895,    2705]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       298 nucs [61944788,61945085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 61942894 TTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTT 61942953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGTTTGTTTTTGCAGAGACAGGGTCTTGCCATATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTT 60

 61942954 GGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAACTGGGATTACAGGCGTGAACTA 61943013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
       61 GGGCTTAAGCGATCTGCCCCCTTCAACCTCCCAAAGAATTGGGATTACAGGCGTGAACTA 120

 61943014 CTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGT 61943073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCACCTGGCCCCAAACTAAGAATTTCTGATTTCTTTCCTTTATTCTTCTTCCTAGGGT 180

 61943074 ATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGA 61943133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGACACAGGTAAAGGATTTAGACAGCACAGGACCAGTTGATCACGGCAAGATTTGGTGA 240

 61943134 ATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGA 61943193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAAAGTGAAGGAAACGACTTCAGAGGTCCTTTTCCATATTGTGGGACTTACAACTCAGA 300

 61943194 ACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGAGTTTGTGACATGTGATAC 61943253
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      301 ACTTGCAGCAAGAATTCTGAGTATGTATGAGGTCTGCAAGGCGTTTGTGACATGTGATAC 360

 61943254 ATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGT 61943313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGGTGACCTGGGTACCAGCAGAGATTCTTGAAGCTTTGACTAATGACCTGACATATGT 420

 61943314 ATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAA 61943373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTCAATTTTTGATAATCATTAAATAAATGAAGTAACATGTTAATATATCTCTTAATAA 480

 61943374 GCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTG 61943433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTGAGGGCTTAATGAAGCCCTTTTTGATTTTGTATATTCATGGATTATATTTTTTATTG 540

 61943434 CTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATAC 61943493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAAAATGAGACAATTTTATTCATGTTTCTCATCTTCAAAGATGTAAAATCTGTAAATAC 600

 61943494 TTGTTACATAAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGT 61943553
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGTTACATCAATGGGCAGATGGGAAAAGAATGACTATTGCGATAGTGATACCACTTGGT 660

 61943554 TCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTA 61943613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCTGAATTCCTCTGAGCTATAGGCTAAAGATGACATAGTGATTTATCACTCAAAATTA 720

 61943614 TTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATAC 61943673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATTTTTAATTTTTAATTGACACCTAATACAAAAATGTGATGTTTTAATAAATGTATAC 780

 61943674 ATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTC 61943733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGCATAATGATCAATCAGGGTAATTAACATATCCATCATCTCAAACATTTATCATTTC 840

 61943734 TTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTA 61943793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGTGGTGAGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTATTTTAAGATACCCAATATGTTA 900

 61943794 TTATTAACTACAGTCGCCCACTGAGTGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCCTAATTGTA 61943853
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      901 TTATTAACTACAGTCGCCCACTGAATGATAGGACATCAGAACTCATTTTTCTTAATTGTA 960

 61943854 ACTTTGTACCTGTTGACCAACCGCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCA 61943913
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTTGTACCTGTTGACCAACCTCTCTCCATCCTCTCTCTTCCATTCCGTACCCTCTCCA 1020

 61943914 GTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTT 61943973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTATCTGGTAACCACTGTTCTACTCTCTACTTCTATGAGATCAACATTTTTATTTTATTT 1080

 61943974 ATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG 61944033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTATTTATTTTTAAATTTTTTTGAAATGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG 1140

 61944034 CAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGC 61944093
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTGGGGCAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGC 1200

 61944094 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGT 61944153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGTCACCAAGCCCGGCTAAGTTTTGT 1260

 61944154 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTC 61944213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTCTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAGCCTC 1320

 61944214 AAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGC 61944273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGC 1380

 61944274 CCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGTGAGAACATGTGTTATTTATCTAC 61944333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1381 CCGGCCAGATCAAAAACTTTAGATTCCACTTATGAGGGAGAACATGTGTTATTTATCTAC 1440

 61944334 TGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAAT 61944393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTGTCTGGCTTATTTCACTTTACATAATGTTCTTCAGGGTCATCCATGTTGTCACAAAT 1500

 61944394 GACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCTAATAGTATTTCTTTGTGTACATATACCACAT 61944453
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
     1501 GACAGTATTTCATTCTTTTTTTATGACCCAATAGTATTTCTTTGTGTACATACACCACAT 1560

 61944454 TAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGT 61944513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAAAAAATCCATTTATTTGCTTTTCAACACTGAGGTTGATTCCATATCTTAGCTATTGT 1620

 61944514 AAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTC 61944573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATAGTTCTGCAATAAGCATGGGATTGTAGATGTCTCTTGAACATACTGATTTTGTTTC 1680

 61944574 CTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACA 61944633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTGCATACAAGGTTGACCCTTGAGCAACATGGGTTTGAACTGTGCAGGTCCACTTACA 1740

 61944634 CACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTG 61944693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACCGCTTTTTTCAACCAAATGTCAGTTGAAAATGCAGTGTTTGAGGCATGTGAAACTTG 1800

 61944694 TGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATG 61944753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTATATGGAGGGCTGACCTTTTGAATATAGGGGTTCCACAGGGCCGAATGCAGGACATG 1860

 61944754 AGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 61944787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTTTGTGCAGTTTTTGATATATGTAAGGGGTGA 1894

EXCISED REGION

 61945086 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 61945145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 TATTTTAAACATTATTTTTAATGATTTATCAGCCACTGCTAAATTAAGACCTCCTTTGAG 1954

 61945146 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 61945205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TTTATTAAAAACGATAAATTAGATACCACTTGATATGGAAAAAATGTTGTTATCACAAAA 2014

 61945206 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 61945265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 CAATACTTTAAATAGTTTCTTTGAAGTCTAGAGATTTCTACCTGCAGAGTCCATGCTCTG 2074

 61945266 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 61945325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TGTTAAGATTCTGATGAAGGATGCATATGCCTTCTGTCTTTAGTGAAATGGAACGAGAGT 2134

 61945326 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 61945385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 GATTATGGAAGGGAGGTAGGAAGGAGAACCAATGTGACCACATGATCCATAAATAGTAAA 2194

 61945386 AGCCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 61945445
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 AGTCTATATGATGTGAGGATCTCAAAGTGATCCCTTAAAAGTCTCCATCCCCCAAGTGTG 2254

 61945446 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 61945505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 TGTTCATCAATTTGAACACTGTGTCCCTAGAATATCCTTGGATGATAACCTCAGCCAAAA 2314

 61945506 GGACACTTGCGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGACTCTGTGTGTCTTG 61945565
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     2315 GGACACTTGTGACCAGCACATCCTGCTGAGGACGGGAGTCCAGAGA--CTGTGTGTCTTG 2372

 61945566 GGGATTGGTAATGTTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 61945625
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 GGGATTGGTAATATTTACCCAACTTCCGACCCTTCTATGTCCTTTGGTCCAAGATTCATT 2432

 61945626 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 61945685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 AAGGATATTAACAGCACAATGATATTCACTTGGACTTGACCATATGTGAGTAATTATCTT 2492

 61945686 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 61945745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 AACTGTGAGAAATGTCAATGAAACCAAAGCCAGATTCTGAAGCACACTTTGGTAGCATAG 2552

 61945746 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 61945805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 GATAAATAAACATTCCTTATTAATAGACTCAGATTTAGTTTGATATTTTACTTTGGGATT 2612

 61945806 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 61945865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 GAGGTGATTTATTTTATTTGACTTTCTCTCCCCTTGTTGTTACATAATTGCAATCATTGA 2672

 61945866 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTT 61945898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 CATTTACTGCTAGGCACTGTACTGGGTACTTTT 2705

Alignment time is 3.78925 s

