
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6028] =>      6028 nucs 'mol-32-1f0b-021468_6028'

Score:        5954
Aligned:      6009        nucs
Identic:      6004 (100%) nucs =>      3545 (100%)      2459 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054040,47057588] EXCISED REGION [47063712,47066171]
 second seq =>  [       1,    3547] EXCISED REGION [    3570,    6028]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3548,3569]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47054040 AATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATA 47054099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATA 60

 47054100 ACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCA 47054159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCA 120

 47054160 AAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCC 47054219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCC 180

 47054220 TGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAA 47054279
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAATAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAA 240

 47054280 AGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAA 47054339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAA 300

 47054340 TGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAA 47054399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAA 360

 47054400 ATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTT 47054459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTT 420

 47054460 ACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATT 47054519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATT 480

 47054520 CCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATAT 47054579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATAT 540

 47054580 ATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGA 47054639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGA 600

 47054640 TGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGG 47054699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGG 660

 47054700 CAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATG 47054759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATG 720

 47054760 AAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATA 47054819
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATA 779

 47054820 TGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCAT 47054879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCAT 839

 47054880 GTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAA 47054939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAA 899

 47054940 TGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCT 47054999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCT 959

 47055000 GGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTG 47055059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTG 1019

 47055060 ATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTC 47055119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTC 1079

 47055120 TTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTG 47055179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTG 1139

 47055180 AAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCA 47055239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCA 1199

 47055240 ATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTG 47055299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTG 1259

 47055300 ATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTG 47055359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTG 1319

 47055360 TAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTG 47055419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTG 1379

 47055420 TTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGG 47055479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGG 1439

 47055480 GTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCT 47055539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCT 1499

 47055540 GCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATA 47055599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATA 1559

 47055600 TGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATA 47055659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATA 1619

 47055660 TATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCT 47055719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCT 1679

 47055720 GACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGG 47055779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGG 1739

 47055780 CTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGG 47055839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGG 1799

 47055840 GGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAA 47055899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAA 1859

 47055900 ATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTAC 47055959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTAC 1919

 47055960 TAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGA 47056019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGA 1979

 47056020 AGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGG 47056079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1980 AGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGG 2038

 47056080 TCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAA 47056139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAA 2098

 47056140 TTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTG 47056199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTG 2158

 47056200 TGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCA 47056259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCA 2218

 47056260 AGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGG 47056319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGG 2278

 47056320 GATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGA 47056379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGA 2338

 47056380 AACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTT 47056439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTT 2398

 47056440 AAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCT 47056499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCT 2458

 47056500 TTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAG 47056559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAG 2518

 47056560 ATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTT 47056619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTT 2578

 47056620 TTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGT 47056679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGT 2638

 47056680 AGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCAT 47056739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCAT 2698

 47056740 TTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGC 47056799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGC 2758

 47056800 AATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCA 47056859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCA 2818

 47056860 TCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTG 47056919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTG 2878

 47056920 AACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTT 47056979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTT 2938

 47056980 ACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGAT 47057039
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGAT 2998

 47057040 ACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTA 47057099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTA 3058

 47057100 TAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTT 47057159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTT 3118

 47057160 GCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTG 47057219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTG 3178

 47057220 CTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATG 47057279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATG 3238

 47057280 GACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGT 47057339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGT 3298

 47057340 GTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTC 47057399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTC 3358

 47057400 TAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGC 47057459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGC 3418

 47057460 TGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACA 47057519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACA 3478

 47057520 GGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGT 47057579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGT 3538

 47057580 GAAAAGATA 47057588
          |||||||||
     3539 GAAAAGATA 3547

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 3629

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 3689

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 3749

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 3808

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 3868

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 3928

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 3988

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 4048

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 4108

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 4168

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 4228

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 4288

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 4348

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 4408

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 4468

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 4528

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 4588

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 4648

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 4708

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 4768

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 4828

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 4888

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 4948

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 5008

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 5068

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 5128

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 5188

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 5248

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 5308

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5309 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 5368

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5369 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 5428

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5429 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 5488

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5489 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 5548

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 5608

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5609 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 5668

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5669 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 5728

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 5788

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 5848

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 5908

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 5968

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 6028

Alignment time is 9.23485 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2459] =>      2459 nucs 'mol-32-1f0b-021468_2459'

Score:        2459
Aligned:      2459        nucs
Identic:      2459 (100%) nucs =>       185 (100%)      2274 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47063896] EXCISED REGION [47063898,47066171]
 second seq =>  [       1,     185] EXCISED REGION [     186,    2459]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47063897,47063897]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [47063897,47063911] to [47063898,47063912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 60

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 120

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 180

 47063892 TTCTG 47063896
          |||||
      181 TTCTG 185

EXCISED REGION

 47063898 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 47063957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 245

 47063958 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 47064017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 305

 47064018 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 47064077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 365

 47064078 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 47064137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 425

 47064138 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 47064197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 485

 47064198 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 47064257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 545

 47064258 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 47064317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 605

 47064318 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 47064377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 665

 47064378 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 47064437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 725

 47064438 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 47064497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 785

 47064498 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 47064557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 845

 47064558 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 47064617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 905

 47064618 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 47064677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 965

 47064678 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 47064737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 1025

 47064738 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 47064797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 1085

 47064798 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 47064857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 1145

 47064858 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 47064917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 1205

 47064918 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 47064977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 1265

 47064978 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 47065037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 1325

 47065038 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 47065097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 1385

 47065098 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 47065157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 1445

 47065158 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 47065217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 1505

 47065218 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 47065277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 1565

 47065278 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 47065337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 1625

 47065338 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 47065397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 1685

 47065398 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 47065457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 1745

 47065458 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 47065517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 1805

 47065518 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 47065577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 1865

 47065578 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 47065637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 1925

 47065638 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 47065697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 1985

 47065698 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 47065757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 2045

 47065758 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 47065817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 2105

 47065818 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 47065877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 2165

 47065878 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 47065937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 2225

 47065938 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 47065997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 2285

 47065998 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 47066057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 2345

 47066058 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 47066117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 2405

 47066118 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 2459

Alignment time is 4.04127 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3483] =>      3483 nucs 'mol-32-1f58-026805_3483'

Score:        3439
Aligned:      3463        nucs
Identic:      3460 (100%) nucs =>       304 (100%)      3156 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47057285,47057588] EXCISED REGION [47063712,47066870]
 second seq =>  [       1,     304] EXCISED REGION [     327,    3483]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [305,326]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47057285 GTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGG 47057344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGG 60

 47057345 ATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATA 47057404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATA 120

 47057405 TATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTC 47057464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTC 180

 47057465 AAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAG 47057524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAG 240

 47057525 AATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAA 47057584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAA 300

 47057585 GATA 47057588
          ||||
      301 GATA 304

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 386

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 446

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 506

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 564

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 624

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 684

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 744

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 804

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 864

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 924

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 984

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 1044

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 1104

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 1164

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 1224

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 1284

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1285 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 1344

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 1404

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 1464

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 1524

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 1584

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 1644

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 1704

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 1764

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 1824

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 1884

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 1944

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 2004

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 2064

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 2124

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 2184

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 2244

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 2304

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 2364

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 2424

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 2484

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 2544

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 2604

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 2664

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 2724

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 2784

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 2844

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 2904

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 2964

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 3024

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 3084

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 3144

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 3204

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 3264

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 3324

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 3384

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 3444

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCA 47066870
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCA 3483

Alignment time is 5.38755 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7164] =>      7164 nucs 'mol-32-20fa-116614_7164'

Score:        7090
Aligned:      7145        nucs
Identic:      7140 (100%) nucs =>      5876 (100%)      1264 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47051709,47057588] EXCISED REGION [47063712,47064976]
 second seq =>  [       1,    5878] EXCISED REGION [    5901,    7164]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [5879,5900]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47051709 ATCAGAAGACAAGTTCAATTCCAATTCTAACAGAAGATAATCCACTCTAATGAGCTGGCC 47051768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCAGAAGACAAGTTCAATTCCAATTCTAACAGAAGATAATCCACTCTAATGAGCTGGCC 60

 47051769 TGGTTTTAGAAAGAAAAAAAGGAGACAGGAGAATGGCCTAGGAAGACTCAACTGCCATCA 47051828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGTTTTAGAAAGAAAAAAAGGAGACAGGAGAATGGCCTAGGAAGACTCAACTGCCATCA 120

 47051829 TCCAGTTAAACAGTGCAGGTCAAGATTCACTGGCCGTTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGG 47051888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCAGTTAAACAGTGCAGGTCAAGATTCACTGGCCGTTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGG 180

 47051889 AGCACCTGGAGGACATAGAGTGCTGTTGGAGTTTTGAAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAA 47051948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCACCTGGAGGACATAGAGTGCTGTTGGAGTTTTGAAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAA 240

 47051949 GAATGAGCTGGAATATTTTAATTTGGTCCTCTTGCCCATGTCTTTATTACTTCTATATGT 47052008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAATGAGCTGGAATATTTTAATTTGGTCCTCTTGCCCATGTCTTTATTACTTCTATATGT 300

 47052009 GGAATGTGAATAGCTATTTATATATAGATCCAGTATGGTTACAGTTATTTATTTATTTAC 47052068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAATGTGAATAGCTATTTATATATAGATCCAGTATGGTTACAGTTATTTATTTATTTAC 360

 47052069 TTATTTATTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGTACTTGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAAC 47052128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATTTATTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGTACTTGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAAC 420

 47052129 TTGTGTTGTGGGGGTTTGTGGTACAGATTATTTCATCACTCAGGTATTAAGCCTAGTACC 47052188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTGTTGTGGGGGTTTGTGGTACAGATTATTTCATCACTCAGGTATTAAGCCTAGTACC 480

 47052189 CATTAGTTGTTTTCCCTGATCTTTTCCCTCTTCCCATCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCA 47052248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTAGTTGTTTTCCCTGATCTTTTCCCTCTTCCCATCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCA 540

 47052249 GTGTGTGTTGTTCCCCTCTATGCATCCGTGTGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAG 47052308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGTGTGTTGTTCCCCTCTATGCATCCGTGTGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAG 600

 47052309 TGAGAACATGCAGAATTTGGCTTTCTCTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTC 47052368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGAACATGCAGAATTTGGCTTTCTCTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTC 660

 47052369 CAGCTACATGAATGTTCCTGCAGAGGACATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTA 47052428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGCTACATGAATGTTCCTGCAGAGGACATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTA 720

 47052429 TTCCATAGTGTGTATGTACCACATTTTCTTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTG 47052488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCATAGTGTGTATGTACCACATTTTCTTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTG 780

 47052489 AGGAATCCTCAAAGATCTAAAGTCAGAAATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAG 47052548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGAATCCTCAAAGATCTAAAGTCAGAAATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAG 840

 47052549 TATATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTT 47052608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTT 900

 47052609 AATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATT 47052668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATT 960

 47052669 CTTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACA 47052728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACA 1020

 47052729 TAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATT 47052788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATT 1080

 47052789 CTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATC 47052848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATC 1140

 47052849 AAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTA 47052908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTA 1200

 47052909 ACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGC 47052968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGC 1260

 47052969 ATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTA 47053028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTA 1320

 47053029 GCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAA 47053088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAA 1380

 47053089 AATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT 47053148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT 1440

 47053149 GAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCA 47053208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCA 1500

 47053209 CTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAA 47053268
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1501 CTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAA 1560

 47053269 AAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAG 47053328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAG 1620

 47053329 GGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCA 47053388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCA 1680

 47053389 CACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAA 47053448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAA 1740

 47053449 ACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATG 47053508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATG 1800

 47053509 TAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAG 47053568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAG 1860

 47053569 CTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTT 47053628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTT 1920

 47053629 CCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGA 47053688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGA 1980

 47053689 TCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGC 47053748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGC 2040

 47053749 TAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTT 47053808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTT 2100

 47053809 GTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAAT 47053868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAAT 2160

 47053869 TTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAA 47053928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAA 2220

 47053929 TCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATC 47053988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATC 2280

 47053989 TTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGC 47054048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGC 2340

 47054049 ATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAA 47054108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAA 2400

 47054109 TAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTT 47054168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTT 2460

 47054169 AATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCT 47054228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCT 2520

 47054229 TATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCT 47054288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCT 2580

 47054289 ATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTT 47054348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTT 2640

 47054349 GAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATA 47054408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATA 2700

 47054409 TAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGC 47054468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGC 2760

 47054469 ATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACA 47054528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACA 2820

 47054529 AAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTAT 47054588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTAT 2880

 47054589 TCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTG 47054648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTG 2940

 47054649 GCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGA 47054708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGA 3000

 47054709 AGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACAT 47054768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACAT 3060

 47054769 GGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAA 47054828
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAA 3119

 47054829 TTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAA 47054888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAA 3179

 47054889 GAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTT 47054948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTT 3239

 47054949 GTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGT 47055008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGT 3299

 47055009 TCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTT 47055068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTT 3359

 47055069 AGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATA 47055128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATA 3419

 47055129 TCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGC 47055188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGC 3479

 47055189 ACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTT 47055248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTT 3539

 47055249 TCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTAT 47055308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTAT 3599

 47055309 CAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCC 47055368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCC 3659

 47055369 TTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGC 47055428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGC 3719

 47055429 AAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGG 47055488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGG 3779

 47055489 GACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATT 47055548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATT 3839

 47055549 AATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAA 47055608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAA 3899

 47055609 CCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAA 47055668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAA 3959

 47055669 AAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGG 47055728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 AAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGG 4019

 47055729 AAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTA 47055788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTA 4079

 47055789 CAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAG 47055848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 CAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAG 4139

 47055849 CTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAG 47055908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAG 4199

 47055909 TTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTG 47055968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTG 4259

 47055969 TCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCT 47056028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCT 4319

 47056029 TTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGT 47056088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     4320 TTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGT 4378

 47056089 GTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGC 47056148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGC 4438

 47056149 TCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCAC 47056208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCAC 4498

 47056209 AGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTT 47056268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 AGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTT 4558

 47056269 CAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 47056328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 4618

 47056329 CATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTT 47056388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTT 4678

 47056389 GCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAA 47056448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAA 4738

 47056449 CTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCT 47056508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 CTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCT 4798

 47056509 TCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTA 47056568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTA 4858

 47056569 GGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACA 47056628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 GGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACA 4918

 47056629 AGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGC 47056688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 AGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGC 4978

 47056689 AACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGA 47056748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 AACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGA 5038

 47056749 AATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACT 47056808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 AATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACT 5098

 47056809 TTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTG 47056868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTG 5158

 47056869 ACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATG 47056928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 ACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATG 5218

 47056929 AAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAA 47056988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 AAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAA 5278

 47056989 ATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAAC 47057048
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 ATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAAC 5338

 47057049 ACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTAC 47057108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 ACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTAC 5398

 47057109 AGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATT 47057168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATT 5458

 47057169 TCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTT 47057228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 TCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTT 5518

 47057229 AACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGT 47057288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 AACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGT 5578

 47057289 CTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGC 47057348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 CTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGC 5638

 47057349 ACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATT 47057408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 ACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATT 5698

 47057409 TATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAG 47057468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAG 5758

 47057469 GTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATA 47057528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 GTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATA 5818

 47057529 AACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 AACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 5878

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 5960

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5961 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 6020

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6021 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 6080

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6081 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 6139

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 6199

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 6259

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 6319

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 6379

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 6439

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 6499

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 6559

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 6619

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 6679

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 6739

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 6799

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 6859

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6860 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 6919

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6920 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 6979

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6980 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 7039

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7040 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 7099

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7100 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 7159

 47064972 TTACA 47064976
          |||||
     7160 TTACA 7164

Alignment time is 10.8797 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2722] =>      2722 nucs 'mol-32-2110-017276_2722'

Score:        2639
Aligned:      2661        nucs
Identic:      2659 (100%) nucs =>       395 (100%)      2264 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47057194,47057588] EXCISED REGION [47063712,47065977]
 second seq =>  [       1,     395] EXCISED REGION [     418,    2682]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [396,417]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47057194 TATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTAT 47057253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTAT 60

 47057254 ATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACA 47057313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACA 120

 47057314 TACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTA 47057373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTA 180

 47057374 AATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAG 47057433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAG 240

 47057434 TAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGC 47057493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGC 300

 47057494 TCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTA 47057553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTA 360

 47057554 TCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 395

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 477

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 537

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 597

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 656

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 716

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 776

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 836

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 896

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 956

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 1016

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 1076

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 1136

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 1196

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 1256

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 1316

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 1376

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 1436

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 1496

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 1556

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 1616

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 1676

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 1736

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 1796

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 1856

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 1916

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 1976

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 2036

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 2096

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 2156

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCCGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 2216

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 2276

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 2336

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 2396

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 2456

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 2516

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 2576

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 2636

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGG 47065977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGG 2682

Alignment time is 4.6213 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3559] =>      3559 nucs 'mol-32-22d3-033792_3559'

Score:        3505
Aligned:      3540        nucs
Identic:      3536 (100%) nucs =>      3480 (100%)        56 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054105,47057588] EXCISED REGION [47063712,47063767]
 second seq =>  [       1,    3481] EXCISED REGION [    3504,    3559]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3482,3503]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47054105 CAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAA 47054164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAA 60

 47054165 TTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAAC 47054224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAAC 120

 47054225 TTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGAT 47054284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGAT 180

 47054285 ATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGC 47054344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGC 240

 47054345 CCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCA 47054404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCA 300

 47054405 CATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAA 47054464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAA 360

 47054465 TAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTAC 47054524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTAC 420

 47054525 AACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTA 47054584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTA 480

 47054585 CTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTA 47054644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTA 540

 47054645 AGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGG 47054704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGG 600

 47054705 AAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAAC 47054764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAAC 660

 47054765 ACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTA 47054824
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTA 719

 47054825 CCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCAT 47054884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCAT 779

 47054885 AAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCA 47054944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCA 839

 47054945 GTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCAC 47055004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCAC 899

 47055005 TGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTC 47055064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTC 959

 47055065 TGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGC 47055124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGC 1019

 47055125 CATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTC 47055184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTC 1079

 47055185 ATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGC 47055244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGC 1139

 47055245 TTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTT 47055304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTT 1199

 47055305 CTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATG 47055364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATG 1259

 47055365 GGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGG 47055424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGG 1319

 47055425 GGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGC 47055484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGC 1379

 47055485 CAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACC 47055544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACC 1439

 47055545 CATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAA 47055604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAA 1499

 47055605 CAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATAT 47055664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATAT 1559

 47055665 ATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTT 47055724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTT 1619

 47055725 CAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCT 47055784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCT 1679

 47055785 TGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTA 47055844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTA 1739

 47055845 CCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGT 47055904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGT 1799

 47055905 AGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATA 47055964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATA 1859

 47055965 AGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATA 47056024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATA 1919

 47056025 TCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCA 47056084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
     1920 TCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCA 1977

 47056085 CTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCT 47056144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 CTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCT 2037

 47056145 GTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCA 47056204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCA 2097

 47056205 CCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTG 47056264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 CCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTG 2157

 47056265 GTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTA 47056324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTA 2217

 47056325 CAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTT 47056384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTT 2277

 47056385 GTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCC 47056444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 GTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCC 2337

 47056445 AAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGA 47056504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGA 2397

 47056505 CCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCAT 47056564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCAT 2457

 47056565 ATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAA 47056624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAA 2517

 47056625 GACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTG 47056684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTG 2577

 47056685 CAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATC 47056744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATC 2637

 47056745 TTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTC 47056804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTC 2697

 47056805 AACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACT 47056864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACT 2757

 47056865 AGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACAC 47056924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACAC 2817

 47056925 GATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGG 47056984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGG 2877

 47056985 AGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTG 47057044
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTG 2937

 47057045 CAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTA 47057104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTA 2997

 47057105 GTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTA 47057164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 GTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTA 3057

 47057165 CATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAA 47057224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAA 3117

 47057225 TGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTA 47057284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTA 3177

 47057285 GTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGG 47057344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGG 3237

 47057345 ATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATA 47057404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 ATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATA 3297

 47057405 TATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTC 47057464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTC 3357

 47057465 AAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAG 47057524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 AAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAG 3417

 47057525 AATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAA 47057584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAA 3477

 47057585 GATA 47057588
          ||||
     3478 GATA 3481

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATA 47063767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATA 3559

Alignment time is 5.88767 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2182] =>      2182 nucs 'mol-32-2399-037075_2182'

Score:        2138
Aligned:      2162        nucs
Identic:      2159 (100%) nucs =>      1978 (100%)       181 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055608,47057588] EXCISED REGION [47063712,47063892]
 second seq =>  [       1,    1979] EXCISED REGION [    2002,    2182]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [1980,2001]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055608 ACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATA 47055667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATA 60

 47055668 AAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAG 47055727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAG 120

 47055728 GAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGT 47055787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGT 180

 47055788 ACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCA 47055847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCA 240

 47055848 GCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGA 47055907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGA 300

 47055908 GTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGT 47055967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGT 360

 47055968 GTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCC 47056027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCC 420

 47056028 TTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTG 47056087
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
      421 TTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTG 478

 47056088 TGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTG 47056147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTG 538

 47056148 CTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCA 47056207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCA 598

 47056208 CAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTT 47056267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTT 658

 47056268 TCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAG 47056327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAG 718

 47056328 GCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTT 47056387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTT 778

 47056388 TGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAA 47056447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAA 838

 47056448 ACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCC 47056507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 ACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCC 898

 47056508 TTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATT 47056567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATT 958

 47056568 AGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGAC 47056627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGAC 1018

 47056628 AAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAG 47056687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAG 1078

 47056688 CAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTG 47056747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTG 1138

 47056748 AAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAAC 47056807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAAC 1198

 47056808 TTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGT 47056867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGT 1258

 47056868 GACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGAT 47056927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGAT 1318

 47056928 GAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGA 47056987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 GAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGA 1378

 47056988 AATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAA 47057047
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 AATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAA 1438

 47057048 CACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTA 47057107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTA 1498

 47057108 CAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACAT 47057167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACAT 1558

 47057168 TTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGT 47057227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGT 1618

 47057228 TAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTG 47057287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTG 1678

 47057288 TCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATG 47057347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATG 1738

 47057348 CACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATAT 47057407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATAT 1798

 47057408 TTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAA 47057467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAA 1858

 47057468 GGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAAT 47057527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAAT 1918

 47057528 AAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGAT 47057587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGAT 1978

 47057588 A 47057588
          |
     1979 A 1979

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 2061

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 2121

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 2181

 47063892 T 47063892
          |
     2182 T 2182

Alignment time is 3.76959 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4467] =>      4467 nucs 'mol-32-23c5-000625_4467'

Score:        4413
Aligned:      4448        nucs
Identic:      4444 (100%) nucs =>      1809 (100%)      2635 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055778,47057588] EXCISED REGION [47063712,47066348]
 second seq =>  [       1,    1810] EXCISED REGION [    1833,    4467]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [1811,1832]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055778 GGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCA 47055837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCA 60

 47055838 GGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACA 47055897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACA 120

 47055898 AAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTT 47055957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTT 180

 47055958 ACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAG 47056017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAG 240

 47056018 GAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAG 47056077
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
      241 GAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAG 299

 47056078 GGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCG 47056137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCG 359

 47056138 AATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCT 47056197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCT 419

 47056198 TGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCC 47056257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCC 479

 47056258 CAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCT 47056317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCT 539

 47056318 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTG 47056377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTG 599

 47056378 GAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTT 47056437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTT 659

 47056438 TTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAG 47056497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAG 719

 47056498 CTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTC 47056557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTC 779

 47056558 AGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTG 47056617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTG 839

 47056618 TTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGAT 47056677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGAT 899

 47056678 GTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTC 47056737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTC 959

 47056738 ATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAA 47056797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAA 1019

 47056798 GCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGG 47056857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGG 1079

 47056858 CATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTAC 47056917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTAC 1139

 47056918 TGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAAT 47056977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAAT 1199

 47056978 TTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAG 47057037
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAG 1259

 47057038 ATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTAT 47057097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTAT 1319

 47057098 TATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGT 47057157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGT 1379

 47057158 TTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTT 47057217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTT 1439

 47057218 TGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAA 47057277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAA 1499

 47057278 TGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATAT 47057337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATAT 1559

 47057338 GTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATT 47057397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATT 1619

 47057398 TCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCAT 47057457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCAT 1679

 47057458 GCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACA 47057517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACA 1739

 47057518 CAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGA 47057577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGA 1799

 47057578 GTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||
     1800 GTGAAAAGATA 1810

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 1892

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 1952

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 2012

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 2070

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 2130

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 2190

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 2250

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 2310

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 2370

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 2430

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 2490

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 2550

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 2610

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 2670

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 2730

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 2790

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 2850

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 2910

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 2970

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 3030

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 3090

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 3150

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 3210

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 3270

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 3330

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 3390

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 3450

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 3510

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 3570

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 3630

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 3690

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 3750

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 3810

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 3870

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 3930

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 3990

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 4050

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 4110

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 4170

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 4230

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 4290

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 4350

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 4410

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCT 47066348
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCT 4467

Alignment time is 7.05544 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2581] =>      2581 nucs 'mol-32-29be-075288_2581'

Score:        2536
Aligned:      2562        nucs
Identic:      2558 (100%) nucs =>      2002 (100%)       556 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055583,47057588] EXCISED REGION [47063712,47064267]
 second seq =>  [       1,    2003] EXCISED REGION [    2026,    2581]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [2004,2025]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055583 TGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAA 47055642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAA 60

 47055643 AGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTA 47055702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTA 120

 47055703 CCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATG 47055762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATG 180

 47055763 GTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTT 47055822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTT 240

 47055823 TCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCT 47055882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCT 300

 47055883 GACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGC 47055942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGC 360

 47055943 TTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCAT 47056002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCAT 420

 47056003 TAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTT 47056062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTT 480

 47056063 TTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATA 47056122
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTT---AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATA 537

 47056123 ATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAG 47056182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 ATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAG 597

 47056183 CTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGG 47056242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGG 657

 47056243 TTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCA 47056302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 TTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCA 717

 47056303 GCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTT 47056362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTT 777

 47056363 TCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTG 47056422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTG 837

 47056423 ATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGG 47056482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGG 897

 47056483 CATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATG 47056542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 CATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATG 957

 47056543 ACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACT 47056602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 ACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACT 1017

 47056603 CCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTT 47056662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTT 1077

 47056663 TTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGT 47056722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGT 1137

 47056723 CCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATC 47056782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATC 1197

 47056783 TATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCT 47056842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCT 1257

 47056843 TGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGG 47056902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGG 1317

 47056903 TTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTT 47056962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTT 1377

 47056963 ACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACA 47057022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1378 ACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACA 1437

 47057023 TGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGC 47057082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGC 1497

 47057083 TATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGA 47057142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGA 1557

 47057143 TTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTG 47057202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTG 1617

 47057203 TGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATG 47057262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATG 1677

 47057263 TAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAA 47057322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAA 1737

 47057323 AAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGA 47057382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 AAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGA 1797

 47057383 AATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCAC 47057442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCAC 1857

 47057443 ACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAG 47057502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAG 1917

 47057503 AAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGA 47057562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGA 1977

 47057563 TGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||
     1978 TGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2003

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 2085

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 2145

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 2205

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 2265

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 2325

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 2385

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 2445

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 2505

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 2565

 47064252 AAAATCTGTTTATGGC 47064267
          ||||||||||||||||
     2566 AAAATCTGTTTATGGC 2581

Alignment time is 4.2429 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8075] =>      8075 nucs 'mol-32-2b13-001459_8075'

Score:        7932
Aligned:      8056        nucs
Identic:      8030 (100%) nucs =>      2904 (100%)      5126 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054681,47057588] EXCISED REGION [47063712,47068840]
 second seq =>  [       1,    2906] EXCISED REGION [    2929,    8075]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [2907,2928]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47054681 CTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCA 47054740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCA 60

 47054741 CACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGT 47054800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
       61 CACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGT 119

 47054801 CTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCT 47054860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 CTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCT 179

 47054861 GTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACT 47054920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 GTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACT 239

 47054921 CTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCC 47054980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 CTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCC 299

 47054981 CTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTC 47055040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTC 359

 47055041 TGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTG 47055100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      360 TGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTCGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTG 419

 47055101 GGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGG 47055160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGG 479

 47055161 CTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGA 47055220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGA 539

 47055221 ATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTA 47055280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTA 599

 47055281 ATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTT 47055340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTT 659

 47055341 TCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGG 47055400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGG 719

 47055401 CTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTG 47055460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTG 779

 47055461 TTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGG 47055520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGG 839

 47055521 CAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAA 47055580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAA 899

 47055581 CATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTT 47055640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTT 959

 47055641 AAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCAT 47055700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCAT 1019

 47055701 TACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAA 47055760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAA 1079

 47055761 TGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCT 47055820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCT 1139

 47055821 TTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAAC 47055880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAAC 1199

 47055881 CTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGT 47055940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGT 1259

 47055941 GCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGC 47056000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGC 1319

 47056001 ATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTT 47056060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTT 1379

 47056061 TTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTA 47056120
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTA 1438

 47056121 TAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGT 47056180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGT 1498

 47056181 AGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGG 47056240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGG 1558

 47056241 GGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCT 47056300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCT 1618

 47056301 CAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAAT 47056360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAAT 1678

 47056361 TTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCC 47056420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCC 1738

 47056421 TGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACT 47056480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACT 1798

 47056481 GGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAA 47056540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAA 1858

 47056541 TGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCA 47056600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCA 1918

 47056601 CTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATG 47056660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATG 1978

 47056661 TTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATT 47056720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATT 2038

 47056721 GTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAA 47056780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAA 2098

 47056781 TCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTT 47056840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTT 2158

 47056841 CTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGA 47056900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGA 2218

 47056901 GGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTT 47056960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTT 2278

 47056961 TTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCA 47057020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2279 TTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCA 2338

 47057021 CATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTG 47057080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTG 2398

 47057081 GCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTAT 47057140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTAT 2458

 47057141 GATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTC 47057200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTC 2518

 47057201 TGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAA 47057260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAA 2578

 47057261 TGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTT 47057320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTT 2638

 47057321 AAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCT 47057380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCT 2698

 47057381 GAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCC 47057440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCC 2758

 47057441 ACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTG 47057500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTG 2818

 47057501 AGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAA 47057560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAA 2878

 47057561 GATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2906

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 2988

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 3048

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 3108

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 3167

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 3227

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 3287

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 3347

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 3407

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 3467

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 3527

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 3587

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 3647

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 3707

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 3767

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 AAATTAATATAAATTCATCTGACGAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 3827

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 3887

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 3947

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 4007

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 4067

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 4127

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 4187

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 4247

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 4307

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 4367

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 4427

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 4487

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 4547

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 4607

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 4667

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 4727

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 4787

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 4847

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 4907

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 4967

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 5027

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 5087

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 5147

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 5207

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5208 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 5267

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 5327

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 5387

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 5447

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 5507

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5508 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 5567

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5568 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 5627

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5628 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 5687

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5688 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 5747

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 5807

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 5867

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5868 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 5927

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 5987

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 6047

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6048 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 6107

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 6167

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 6227

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6228 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 6287

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6288 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 6347

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6348 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 6407

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6408 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 6467

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6468 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 6527

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6528 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 6587

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6588 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 6647

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6648 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 6707

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6708 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 6767

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6768 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCCCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 6827

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6828 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 6887

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6888 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 6947

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6948 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 7007

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 47067851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7008 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7067

 47067852 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 47067911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7068 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 7127

 47067912 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 47067971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7128 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 7187

 47067972 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 47068031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7188 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 7247

 47068032 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 47068091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7248 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 7307

 47068092 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTTC 47068151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7308 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTTC 7367

 47068152 TACCCAAAGCAATCTACTGATTCAACACAATTTTCTTTTCTTTTCTTTTATCTTCTTTTC 47068211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7368 TACCCAAAGCAATCTACTGATTCAACACAATTTTCTTTTCTTTTCTTTTATCTTCTTTTC 7427

 47068212 -------------------TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTC 47068252
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7428 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTC 7487

 47068253 TGCCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAG 47068312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7488 TGCCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAG 7547

 47068313 GTTCAAGTGATTCTCCTGCTCAGAATCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCACCACCA 47068372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7548 GTTCAAGTGATTCTCCTGCTCAGAATCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCACCACCA 7607

 47068373 TGCCCGACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG 47068432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7608 TGCCCGACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGG 7667

 47068433 TTGATTGAACACAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCTC 47068492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7668 TTGATTGAACACAATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCTC 7727

 47068493 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCAATCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAA 47068552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7728 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCAATCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAA 7787

 47068553 GCGGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCAGAAAAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCACACCT 47068612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7788 GCGGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCAGAAAAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCACACCT 7847

 47068613 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGATACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTG 47068672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7848 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGATACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTG 7907

 47068673 AACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCGTCAACCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGACG 47068732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7908 AACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCGTCAACCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGACG 7967

 47068733 TGAGCCACCGCACCTGGCGATTCAACAAAATTTCTATCAAAATAAATAGGCTTTTTCACT 47068792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7968 TGAGCCACCGCACCTGGCGATTCAACAAAATTTCTATCAAAATAAATAGGCTTTTTCACT 8027

 47068793 GAGAGAAGAAGCTAATCCTCAAAATCATATGGAATAGCCAGGACAATC 47068840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8028 GAGAGAAGAAGCTAATCCTCAAAATCATATGGAATAGCCAGGACAATC 8075

Alignment time is 12.3413 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2906] =>      2906 nucs 'mol-32-2b13-001459_2906'

Score:        2874
Aligned:      2907        nucs
Identic:      2904 (100%) nucs =>       100 (100%)      2804 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054681,47054780] EXCISED REGION [47054782,47057588]
 second seq =>  [       1,     100] EXCISED REGION [     101,    2906]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47054781,47054781]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47055075,47055075]
 second seq =>         1 nucs [394,394]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [47054781,47054787] to [47054782,47054788]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47054681 CTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCA 47054740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCA 60

 47054741 CACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGA 47054780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGA 100

EXCISED REGION

 47054782 TTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATT 47054841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      101 TTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATT 160

 47054842 TGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCA 47054901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      161 TGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCA 220

 47054902 GTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCT 47054961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      221 GTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCT 280

 47054962 GCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCA 47055021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      281 GCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCA 340

 47055022 CCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTT 47055081
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      341 CCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTCGAATTT 400

 47055082 CTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTT 47055141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 CTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTT 460

 47055142 TCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGAT 47055201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 TCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGAT 520

 47055202 GCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAG 47055261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 GCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAG 580

 47055262 TGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTC 47055321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 TGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTC 640

 47055322 CATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTA 47055381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 CATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTA 700

 47055382 TAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGAC 47055441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 TAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGAC 760

 47055442 CATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAAT 47055501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 CATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAAT 820

 47055502 TCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTA 47055561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 TCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTA 880

 47055562 CGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTG 47055621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 CGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTG 940

 47055622 CGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATA 47055681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 CGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATA 1000

 47055682 AAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATG 47055741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 AAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATG 1060

 47055742 AAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAAC 47055801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 AAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAAC 1120

 47055802 TGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAG 47055861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 TGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAG 1180

 47055862 GGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCT 47055921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 GGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCT 1240

 47055922 TCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCAT 47055981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCAT 1300

 47055982 TTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGA 47056041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGA 1360

 47056042 TTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTG 47056101
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TTTTTAAAAGCTTC-TTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTG 1419

 47056102 GAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTC 47056161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 GAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTC 1479

 47056162 ATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTT 47056221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 ATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTT 1539

 47056222 TTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGC 47056281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 TTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGC 1599

 47056282 TCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGC 47056341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 TCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGC 1659

 47056342 ACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGT 47056401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 ACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGT 1719

 47056402 TGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAAT 47056461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAAT 1779

 47056462 TATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCT 47056521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCT 1839

 47056522 GCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCT 47056581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 GCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCT 1899

 47056582 TTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTA 47056641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 TTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTA 1959

 47056642 TTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGA 47056701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGA 2019

 47056702 ATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAA 47056761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 ATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAA 2079

 47056762 CCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACG 47056821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 CCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACG 2139

 47056822 TCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGG 47056881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGG 2199

 47056882 GTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAG 47056941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 GTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAG 2259

 47056942 AACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCAT 47057001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 AACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCAT 2319

 47057002 GCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACT 47057061
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 GCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACT 2379

 47057062 GCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACA 47057121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 GCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACA 2439

 47057122 GTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATG 47057181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 GTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATG 2499

 47057182 AATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAAC 47057241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 AATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAAC 2559

 47057242 AGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTAT 47057301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 AGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTAT 2619

 47057302 GCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGT 47057361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 GCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGT 2679

 47057362 GAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAA 47057421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 GAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAA 2739

 47057422 TCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATAT 47057481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 TCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATAT 2799

 47057482 ACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAA 47057541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 ACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAA 2859

 47057542 TGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 TGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2906

Alignment time is 4.66599 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6051] =>      6051 nucs 'mol-32-2e15-132781_6051'

Score:        5987
Aligned:      6033        nucs
Identic:      6028 (100%) nucs =>      4072 (100%)      1956 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47053513,47057588] EXCISED REGION [47063712,47065668]
 second seq =>  [       1,    4073] EXCISED REGION [    4096,    6051]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [4074,4095]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47053513 CTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGG 47053572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGG 60

 47053573 CTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCA 47053632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCA 120

 47053633 GCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAA 47053692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAA 180

 47053693 TACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAAT 47053752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAAT 240

 47053753 AAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTAC 47053812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTAC 300

 47053813 TCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTA 47053872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTA 360

 47053873 CTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCAC 47053932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCAC 420

 47053933 TTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCT 47053992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCT 480

 47053993 GGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCT 47054052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCT 540

 47054053 TCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAA 47054112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAA 600

 47054113 TTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATT 47054172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATT 660

 47054173 TTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATT 47054232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATT 720

 47054233 CATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTT 47054292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTT 780

 47054293 TATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAAC 47054352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAAC 840

 47054353 AACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAAT 47054412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAAT 900

 47054413 TTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTA 47054472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTA 960

 47054473 AAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGT 47054532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGT 1020

 47054533 AAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCAT 47054592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCAT 1080

 47054593 TAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTG 47054652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTG 1140

 47054653 AGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAG 47054712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAG 1200

 47054713 GTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTG 47054772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTG 1260

 47054773 ATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTT 47054832
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTT 1319

 47054833 TCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAG 47054892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAG 1379

 47054893 TCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTT 47054952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTT 1439

 47054953 TCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAG 47055012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAG 1499

 47055013 AAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCT 47055072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCT 1559

 47055073 CTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCA 47055132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCA 1619

 47055133 CAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAA 47055192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAA 1679

 47055193 CATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCA 47055252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCA 1739

 47055253 TAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGG 47055312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGG 1799

 47055313 ATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAA 47055372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAA 1859

 47055373 AGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGT 47055432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGT 1919

 47055433 ATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACA 47055492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACA 1979

 47055493 TTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATT 47055552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATT 2039

 47055553 CATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTG 47055612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTG 2099

 47055613 CACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAAT 47055672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAAT 2159

 47055673 AAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGA 47055732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGA 2219

 47055733 ATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAAC 47055792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAAC 2279

 47055793 ACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTT 47055852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTT 2339

 47055853 ATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAG 47055912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAG 2399

 47055913 CCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCT 47055972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCT 2459

 47055973 TTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTT 47056032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTT 2519

 47056033 CCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTG 47056092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
     2520 CCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTG 2577

 47056093 CCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGA 47056152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGA 2637

 47056153 GTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTC 47056212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTC 2697

 47056213 GGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAA 47056272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAA 2757

 47056273 CTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATG 47056332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATG 2817

 47056333 AGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTG 47056392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTG 2877

 47056393 CCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTT 47056452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTT 2937

 47056453 TTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCAC 47056512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCAC 2997

 47056513 CTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGT 47056572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 CTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGT 3057

 47056573 CATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTT 47056632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTT 3117

 47056633 AAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACT 47056692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACT 3177

 47056693 GCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATG 47056752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATG 3237

 47056753 AAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTAT 47056812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 AAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTAT 3297

 47056813 CTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACAC 47056872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACAC 3357

 47056873 TTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAA 47056932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAA 3417

 47056933 ATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGA 47056992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 ATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGA 3477

 47056993 ACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTT 47057052
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTT 3537

 47057053 GTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTA 47057112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 GTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTA 3597

 47057113 TGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTC 47057172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTC 3657

 47057173 TCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACT 47057232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACT 3717

 47057233 TTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTAC 47057292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTAC 3777

 47057293 ATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAG 47057352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 ATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAG 3837

 47057353 TTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATT 47057412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 TTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATT 3897

 47057413 GAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCA 47057472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCA 3957

 47057473 ACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACC 47057532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACC 4017

 47057533 AGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 AGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 4073

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 4155

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 4215

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 4275

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 4334

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 4394

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 4454

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 4514

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 4574

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 4634

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 4694

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 4754

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 4814

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 4874

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 4934

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 4994

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 5054

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 5114

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 5174

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 5234

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 5294

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 5354

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 5414

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 5474

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 5534

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 5594

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 5654

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 5714

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 5774

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 5834

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 5894

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 5954

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 6014

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAG 47065668
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAG 6051

Alignment time is 9.34267 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7777] =>      7777 nucs 'mol-32-2f12-080935_7777'

Score:        7681
Aligned:      7758        nucs
Identic:      7751 (100%) nucs =>      5041 (100%)      2710 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47052543,47057588] EXCISED REGION [47063712,47066423]
 second seq =>  [       1,    5044] EXCISED REGION [    5067,    7777]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [5045,5066]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47052543 ACTGAGTATATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTT 47052602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGAGTATATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTT 60

 47052603 ATATTTAATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAA 47052662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTTAATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAA 120

 47052663 TCAATTCTTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACAT 47052722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAATTCTTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACAT 180

 47052723 CATACATAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAAT 47052782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATACATAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAAT 240

 47052783 AGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAAT 47052842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAAT 300

 47052843 TGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAA 47052902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAA 360

 47052903 TTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAG 47052962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAG 420

 47052963 CTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATT 47053022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATT 480

 47053023 GCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAA 47053082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAA 540

 47053083 AAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGG 47053142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGG 600

 47053143 GAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATC 47053202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATC 660

 47053203 GTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTT 47053262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTT 720

 47053263 TTTTAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCT 47053322
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTAAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCT 780

 47053323 CTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATT 47053382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATT 840

 47053383 AACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGC 47053442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGC 900

 47053443 CAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGA 47053502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGA 960

 47053503 AAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTA 47053562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTA 1020

 47053563 TTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCT 47053622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCT 1080

 47053623 GCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACAC 47053682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACAC 1140

 47053683 CCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATA 47053742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATA 1200

 47053743 TTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAG 47053802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAG 1260

 47053803 AGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAA 47053862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAA 1320

 47053863 CCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAA 47053922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAA 1380

 47053923 TTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGAT 47053982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGAT 1440

 47053983 TATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAAT 47054042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAAT 1500

 47054043 GGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACT 47054102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACT 1560

 47054103 CACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAA 47054162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAA 1620

 47054163 AATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGA 47054222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGA 1680

 47054223 ACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGG 47054282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGG 1740

 47054283 ATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGG 47054342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGG 1800

 47054343 GCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATC 47054402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATC 1860

 47054403 CACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACC 47054462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACC 1920

 47054463 AATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCT 47054522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCT 1980

 47054523 ACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATT 47054582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATT 2040

 47054583 TACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGT 47054642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGT 2100

 47054643 TAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAG 47054702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAG 2160

 47054703 GGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAA 47054762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAA 2220

 47054763 ACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGG 47054822
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGG 2279

 47054823 TACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTC 47054882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTC 2339

 47054883 ATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGT 47054942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGT 2399

 47054943 CAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGC 47055002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGC 2459

 47055003 ACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATG 47055062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATG 2519

 47055063 TCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTT 47055122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTT 2579

 47055123 GCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAG 47055182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAG 2639

 47055183 TCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATG 47055242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATG 2699

 47055243 GCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATG 47055302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATG 2759

 47055303 TTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAA 47055362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAA 2819

 47055363 TGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTT 47055422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTT 2879

 47055423 GGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTG 47055482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTG 2939

 47055483 GCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCA 47055542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCA 2999

 47055543 CCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGT 47055602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGT 3059

 47055603 AACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATAT 47055662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATAT 3119

 47055663 ATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGAC 47055722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGAC 3179

 47055723 TTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTT 47055782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTT 3239

 47055783 CTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGT 47055842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGT 3299

 47055843 TACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATA 47055902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATA 3359

 47055903 GTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAA 47055962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAA 3419

 47055963 TAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGA 47056022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGA 3479

 47056023 TATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCT 47056082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     3480 TATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCT 3538

 47056083 CACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTC 47056142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTC 3598

 47056143 CTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGC 47056202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGC 3658

 47056203 CACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGC 47056262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGC 3718

 47056263 TGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGAT 47056322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGAT 3778

 47056323 TACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAAC 47056382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAAC 3838

 47056383 TTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAG 47056442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAG 3898

 47056443 CCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTA 47056502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTA 3958

 47056503 GACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATC 47056562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATC 4018

 47056563 ATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTC 47056622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 ATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTC 4078

 47056623 AAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGC 47056682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGC 4138

 47056683 TGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTA 47056742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTA 4198

 47056743 TCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAAT 47056802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAAT 4258

 47056803 TCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCA 47056862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCA 4318

 47056863 CTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAAC 47056922
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4319 CTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGGGGTTTATGGTTTTGTACTGAAC 4378

 47056923 ACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACT 47056982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 ACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACT 4438

 47056983 GGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACT 47057042
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 GGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACT 4498

 47057043 TGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAG 47057102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAG 4558

 47057103 TAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCT 47057162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCT 4618

 47057163 TACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTA 47057222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTA 4678

 47057223 AATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGAC 47057282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 AATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGAC 4738

 47057283 TAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTA 47057342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTA 4798

 47057343 GGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAA 47057402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 GGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAA 4858

 47057403 TATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGT 47057462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGT 4918

 47057463 TCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGA 47057522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGA 4978

 47057523 AGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAA 47057582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 AGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAA 5038

 47057583 AAGATA 47057588
          ||||||
     5039 AAGATA 5044

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 5126

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 5186

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 5246

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 5305

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 5365

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 5425

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 5485

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 5545

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 5605

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 5665

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 5725

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 5785

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 5845

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 5905

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 5965

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 6025

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6026 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 6085

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 6145

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 6205

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 6265

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 6325

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 6385

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 6445

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 6505

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 6565

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 6625

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 6685

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 6745

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 6805

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 6865

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 6925

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 6985

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 7045

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 7105

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 7165

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 7225

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 7285

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 7345

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 7405

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 7465

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 7525

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 7585

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 7645

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 7705

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7706 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 7765

 47066412 GTCATGCTACTG 47066423
          ||||||||||||
     7766 GTCATGCTACTG 7777

Alignment time is 12.1218 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2711] =>      2711 nucs 'mol-32-2f12-080935_2711'

Score:        2700
Aligned:      2711        nucs
Identic:      2710 (100%) nucs =>       185 (100%)      2525 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47063896] EXCISED REGION [47063898,47066423]
 second seq =>  [       1,     185] EXCISED REGION [     186,    2711]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47063897,47063897]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47064710,47064710]
 second seq =>         1 nucs [998,998]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [47063897,47063911] to [47063898,47063912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 60

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 120

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 180

 47063892 TTCTG 47063896
          |||||
      181 TTCTG 185

EXCISED REGION

 47063898 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 47063957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 245

 47063958 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 47064017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 305

 47064018 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 47064077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 365

 47064078 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 47064137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 425

 47064138 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 47064197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 485

 47064198 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 47064257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 545

 47064258 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 47064317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 605

 47064318 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 47064377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 665

 47064378 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 47064437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 725

 47064438 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 47064497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 785

 47064498 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 47064557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 845

 47064558 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 47064617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 905

 47064618 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 47064677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 965

 47064678 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 47064737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      966 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 1025

 47064738 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 47064797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 1085

 47064798 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 47064857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 1145

 47064858 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 47064917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 1205

 47064918 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 47064977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 1265

 47064978 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 47065037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 1325

 47065038 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 47065097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 1385

 47065098 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 47065157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 1445

 47065158 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 47065217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 1505

 47065218 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 47065277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 1565

 47065278 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 47065337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 1625

 47065338 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 47065397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 1685

 47065398 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 47065457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 1745

 47065458 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 47065517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 1805

 47065518 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 47065577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 1865

 47065578 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 47065637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 1925

 47065638 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 47065697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 1985

 47065698 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 47065757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 2045

 47065758 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 47065817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 2105

 47065818 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 47065877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 2165

 47065878 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 47065937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 2225

 47065938 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 47065997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 2285

 47065998 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 47066057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 2345

 47066058 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 47066117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 2405

 47066118 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 47066177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 2465

 47066178 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 47066237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 2525

 47066238 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 47066297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 2585

 47066298 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 47066357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 2645

 47066358 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 47066417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 2705

 47066418 CTACTG 47066423
          ||||||
     2706 CTACTG 2711

Alignment time is 4.57576 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8342] =>      8342 nucs 'mol-32-2f1d-070786_8342'

Score:        8255
Aligned:      8330        nucs
Identic:      8315 (100%) nucs =>      2186 (100%)      6129 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055401,47057588] EXCISED REGION [47063712,47069849]
 second seq =>  [       1,    2187] EXCISED REGION [    2210,    8342]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [2188,2209]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055401 CTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTG 47055460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTG 60

 47055461 TTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGG 47055520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGG 120

 47055521 CAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAA 47055580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAA 180

 47055581 CATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTT 47055640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTT 240

 47055641 AAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCAT 47055700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCAT 300

 47055701 TACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAA 47055760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAA 360

 47055761 TGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCT 47055820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCT 420

 47055821 TTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAAC 47055880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAAC 480

 47055881 CTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGT 47055940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGT 540

 47055941 GCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGC 47056000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGC 600

 47056001 ATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTT 47056060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTT 660

 47056061 TTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTA 47056120
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTA 719

 47056121 TAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGT 47056180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGT 779

 47056181 AGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGG 47056240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGG 839

 47056241 GGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCT 47056300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCT 899

 47056301 CAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAAT 47056360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAAT 959

 47056361 TTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCC 47056420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCC 1019

 47056421 TGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACT 47056480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACT 1079

 47056481 GGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAA 47056540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAA 1139

 47056541 TGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCA 47056600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCA 1199

 47056601 CTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATG 47056660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATG 1259

 47056661 TTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATT 47056720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATT 1319

 47056721 GTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAA 47056780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAA 1379

 47056781 TCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTT 47056840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTT 1439

 47056841 CTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGA 47056900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGA 1499

 47056901 GGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTT 47056960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTT 1559

 47056961 TTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCA 47057020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1560 TTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCA 1619

 47057021 CATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTG 47057080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTG 1679

 47057081 GCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTAT 47057140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTAT 1739

 47057141 GATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTC 47057200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTC 1799

 47057201 TGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAA 47057260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAA 1859

 47057261 TGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTT 47057320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTT 1919

 47057321 AAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCT 47057380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCT 1979

 47057381 GAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCC 47057440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCC 2039

 47057441 ACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTG 47057500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTG 2099

 47057501 AGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAA 47057560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAA 2159

 47057561 GATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2187

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 2269

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 2329

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 2389

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 2447

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 2507

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 2567

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 2627

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 2687

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 2747

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 2807

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 2867

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 2927

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 2987

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 3047

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 3107

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 3167

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 3227

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 3287

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 3347

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 3407

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 3467

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 3527

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 3587

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 3647

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 3707

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 3767

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 3827

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 3887

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 3947

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 4007

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 4067

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 4127

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 4187

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 4247

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 4307

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 4367

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 4427

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 4487

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 4547

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 4607

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 4667

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 4727

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 4787

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 4847

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 4907

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 4967

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 5027

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 5087

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 5147

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 5207

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5208 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 5267

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 5327

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 5387

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 5447

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 5507

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5508 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 5567

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5568 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 5627

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5628 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 5687

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5688 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 5747

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 5807

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 5867

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5868 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 5927

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 5987

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 6047

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6048 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 6107

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 6167

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 6227

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6228 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 6287

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 47067851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6288 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6347

 47067852 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 47067911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6348 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 6407

 47067912 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 47067971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6408 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 6467

 47067972 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 47068031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6468 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 6527

 47068032 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 47068091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6528 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 6587

 47068092 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTTC 47068151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6588 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTTC 6647

 47068152 TACCCAAAGCAATCTACTGATTCAACACAATTTTCTTTTCTTTTCTTTTATCTTCTTTTC 47068211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6648 TACCCAAAGCAATCTACTGATTCAACACAATTTTCTTTTCTTTTCTTTTATCTTCTTTTC 6707

 47068212 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA--CAGAGTCTCACTCTGCCACCCAGGCTGGAG 47068269
          ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||
     6708 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----TGCAGAGTCTCACTCTGCCACCCAGGCTGGAG 6763

 47068270 TGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCT 47068329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 TGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCT 6823

 47068330 GCTCAGAATCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCACCACCATGCCCGACTAATTTTTG 47068389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 GCTCAGAATCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCACCACCATGCCCGACTAATTTTTG 6883

 47068390 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTTGATTGAACACAATTT 47068449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTTGATTGAACACAATTT 6943

 47068450 CTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGT 47068509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 CTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGT 7003

 47068510 GGCTCAATCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGGTTCTTCTGCCTCA 47068569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 GGCTCAATCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGGTTCTTCTGCCTCA 7063

 47068570 GCCTCCAGAAAAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTT 47068629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7064 GCCTCCAGAAAAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTT 7123

 47068630 TTAGTAGATACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 47068689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7124 TTAGTAGATACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGT 7183

 47068690 GATCTGCCCGCGTCAACCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGAGCCACCGCACCTGG 47068749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7184 GATCTGCCCGCGTCAACCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGAGCCACCGCACCTGG 7243

 47068750 CGATTCAACAAAATTTCTATCAAAATAAATAGGCTTTTTCACTGAGAGAAGAAGCTAATC 47068809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7244 CGATTCAACAAAATTTCTATCAAAATAAATAGGCTTTTTCACTGAGAGAAGAAGCTAATC 7303

 47068810 CTCAAAATCATATGGAATAGCCAGGACAATCTTGAAAAAAGAATATAAAATTGGAAAGTT 47068869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7304 CTCAAAATCATATGGAATAGCCAGGACAATCTTGAAAAAAGAATATAAAATTGGAAAGTT 7363

 47068870 CAAACTTCCCAACTATAAAACTAGCTATGAAGCCACAGTAATTCAAGTATTATGGTCCTG 47068929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7364 CAAACTTCCCAACTATAAAACTAGCTATGAAGCCACAGTAATTCAAGTATTATGGTCCTG 7423

 47068930 GCATAAGGACAAACATATAGACCACTGGAATAGATTAGGAAGC--CCAGAAATAAATCTT 47068987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||
     7424 GCATAAGGACAAACATATAGACCACTGGAATAGATTAGGA---GGCCAGAAATAAATCTT 7480

 47068988 TACATATATGGTCATTTGATTTCCTGCAAAGGTGCAATTCAATAGGGAAAGGACAGTCTT 47069047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7481 TACATATATGGTCATTTGATTTCCTGCAAAGGTGCAATTCAATAGGGAAAGGACAGTCTT 7540

 47069048 TTCAACCAATGGTGCTGGGAAAACTGGATATCCACGTGTGAAAGAATGAAATTGGACTAC 47069107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7541 TTCAACCAATGGTGCTGGGAAAACTGGATATCCACGTGTGAAAGAATGAAATTGGACTAC 7600

 47069108 AACACTCTTAGAAGAAAACAGGGGACAGTTTTCATAACATTAAATTTAGCAATTATTTCA 47069167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7601 AACACTCTTAGAAGAAAACAGGGGACAGTTTTCATAACATTAAATTTAGCAATTATTTCA 7660

 47069168 TGGATATAACACCAAAAGCATAAGGAACAAAAAATATAGATAAATTGGACTTCATCAAAA 47069227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7661 TGGATATAACACCAAAAGCATAAGGAACAAAAAATATAGATAAATTGGACTTCATCAAAA 7720

 47069228 TTAAGAACTTTTGTGCATCAAAGGATACTATCATGAAAGTGAAAGGACAACCTACACAAT 47069287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7721 TTAAGAACTTTTGTGCATCAAAGGATACTATCATGAAAGTGAAAGGACAACCTACACAAT 7780

 47069288 AGAAGAAAATATTTGCAAATCATATATCCAATAAGGAATTAATATCCAGAATATGTAAAG 47069347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7781 AGAAGAAAATATTTGCAAATCATATATCCAATAAGGAATTAATATCCAGAATATGTAAAG 7840

 47069348 AACTCCTGCAACTCAACAACAACAAAACAACCCAATTTAAAAATGGGCAAAGGACTTGAA 47069407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7841 AACTCCTGCAACTCAACAACAACAAAACAACCCAATTTAAAAATGGGCAAAGGACTTGAA 7900

 47069408 GAGACATTTCTCCAAAGAAGATATCCAAATGGCCAACACATGAAAAGATGCTCAACATCA 47069467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7901 GAGACATTTCTCCAAAGAAGATATCCAAATGGCCAACACATGAAAAGATGCTCAACATCA 7960

 47069468 TTAGTCATTGGTAAAATGCAAATCAAAACAACAATAAGATGCCACTTCACATCTTCTAGG 47069527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7961 TTAGTCATTGGTAAAATGCAAATCAAAACAACAATAAGATGCCACTTCACATCTTCTAGG 8020

 47069528 TTGGCTGTTTTTTAAAAAGGAAAATAGCATGTGTTGCTGAGGAGGTGGACAAATTGGAGC 47069587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8021 TTGGCTGTTTTTTAAAAAGGAAAATAGCATGTGTTGCTGAGGAGGTGGACAAATTGGAGC 8080

 47069588 CCTTGTGCATTGCTAGTGAGAATGTAAAATAGTACAGCTGCTCTGGAAAACAGTTCGGTT 47069647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8081 CCTTGTGCATTGCTAGTGAGAATGTAAAATAGTACAGCTGCTCTGGAAAACAGTTCGGTT 8140

 47069648 GTTTCTCAAAAGGTTAAACCTATAACTACCATATGACCCAGCAATTGCACTTGTAGGTAT 47069707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8141 GTTTCTCAAAAGGTTAAACCTATAACTACCATATGACCCAGCAATTGCACTTGTAGGTAT 8200

 47069708 ACATCTAAAAGAATTAAAGAAGGAACTGAAACAGATACTTGTATACAAATCATAGCAGCA 47069767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8201 ACATCTAAAAGAATTAAAGAAGGAACTGAAACAGATACTTGTATACAAATCATAGCAGCA 8260

 47069768 TTATTCACAATAGCCAAAAGGTGGAAGTAACCCAAGGGTCCATCAACAGATCAATGGATA 47069827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8261 TTATTCACAATAGCCAAAAGGTGGAAGTAACCCAAGGGTCCATCAACAGATCAATGGATA 8320

 47069828 AACAATAGATGGTACATACATA 47069849
          ||||||||||||||||||||||
     8321 AACAATAGATGGTACATACATA 8342

Alignment time is 13.2619 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2187] =>      2187 nucs 'mol-32-2f1d-070786_2187'

Score:        2176
Aligned:      2187        nucs
Identic:      2186 (100%) nucs =>       655 (100%)      1531 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055401,47056055] EXCISED REGION [47056057,47057588]
 second seq =>  [       1,     655] EXCISED REGION [     656,    2187]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47056056,47056056]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47057009,47057009]
 second seq =>         1 nucs [1608,1608]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [47056056,47056069] to [47056057,47056070]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47055401 CTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTG 47055460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTG 60

 47055461 TTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGG 47055520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGG 120

 47055521 CAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAA 47055580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAA 180

 47055581 CATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTT 47055640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTT 240

 47055641 AAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCAT 47055700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCAT 300

 47055701 TACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAA 47055760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAA 360

 47055761 TGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCT 47055820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCT 420

 47055821 TTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAAC 47055880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAAC 480

 47055881 CTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGT 47055940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGT 540

 47055941 GCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGC 47056000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGC 600

 47056001 ATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTC 47056055
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTC 655

EXCISED REGION

 47056057 TTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATG 47056116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 TTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATG 715

 47056117 ATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTT 47056176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 ATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTT 775

 47056177 TAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAG 47056236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 TAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAG 835

 47056237 ATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCC 47056296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 ATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCC 895

 47056297 ACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAA 47056356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 ACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAA 955

 47056357 TAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTT 47056416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 TAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTT 1015

 47056417 CCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTT 47056476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 CCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTT 1075

 47056477 TACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCAT 47056536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCAT 1135

 47056537 ATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCC 47056596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 ATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCC 1195

 47056597 TGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGC 47056656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGC 1255

 47056657 AATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTAT 47056716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 AATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTAT 1315

 47056717 AATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATC 47056776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 AATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATC 1375

 47056777 TCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCT 47056836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCT 1435

 47056837 GTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTAT 47056896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTAT 1495

 47056897 TTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCA 47056956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 TTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCA 1555

 47056957 CTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGC 47057016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1556 CTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGC 1615

 47057017 ATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGA 47057076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 ATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGA 1675

 47057077 GTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAG 47057136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAG 1735

 47057137 TTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTAT 47057196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTAT 1795

 47057197 GGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATT 47057256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 GGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATT 1855

 47057257 TTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATAC 47057316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATAC 1915

 47057317 TTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAAT 47057376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAAT 1975

 47057377 TGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAG 47057436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAG 2035

 47057437 ACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCA 47057496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 ACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCA 2095

 47057497 TCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCT 47057556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCT 2155

 47057557 CTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2187

Alignment time is 3.2649 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4413] =>      4413 nucs 'mol-32-2f1d-100206_4413'

Score:        4358
Aligned:      4395        nucs
Identic:      4390 (100%) nucs =>      1655 (100%)      2735 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055931,47057588] EXCISED REGION [47063712,47066448]
 second seq =>  [       1,    1656] EXCISED REGION [    1679,    4413]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [1657,1678]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055931 AAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCT 47055990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCT 60

 47055991 TAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAA 47056050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAA 120

 47056051 GCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGT 47056110
          ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGT 178

 47056111 GGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAG 47056170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 GGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAG 238

 47056171 CCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTG 47056230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 CCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTG 298

 47056231 GTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAT 47056290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 GTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAT 358

 47056291 CCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTG 47056350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 CCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTG 418

 47056351 CCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATG 47056410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 CCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATG 478

 47056411 CTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACC 47056470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 CTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACC 538

 47056471 ATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGT 47056530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 ATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGT 598

 47056531 TGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAG 47056590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAG 658

 47056591 AAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAA 47056650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 AAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAA 718

 47056651 AAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTT 47056710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 AAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTT 778

 47056711 GTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTG 47056770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTG 838

 47056771 CAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATT 47056830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATT 898

 47056831 TTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAG 47056890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAG 958

 47056891 TGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAG 47056950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAG 1018

 47056951 AGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATG 47057010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1019 AGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAG 1078

 47057011 ATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCA 47057070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 ATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCA 1138

 47057071 ACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTT 47057130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 ACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTT 1198

 47057131 ATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACC 47057190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 ATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACC 1258

 47057191 ATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTG 47057250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 ATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTG 1318

 47057251 TATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGG 47057310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGG 1378

 47057311 ACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTT 47057370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTT 1438

 47057371 TTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTAT 47057430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTAT 1498

 47057431 AAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATC 47057490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATC 1558

 47057491 TGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCA 47057550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCA 1618

 47057551 TTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 1656

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 1738

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 1798

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 1858

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 1916

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 1976

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 2036

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 2096

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 2156

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 2216

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 2276

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 2336

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 2396

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 2456

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 2516

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 2576

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 2636

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 2696

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 2756

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 2816

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 2876

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 2936

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 2996

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 3056

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 3116

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 3176

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 3236

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 3296

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 3356

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 3416

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 3476

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 3536

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 3596

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 3656

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 3716

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 3776

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 3836

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 3896

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 3956

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 4016

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 4076

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 4136

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 4196

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 4256

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 4316

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 4376

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGA 47066448
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGA 4413

Alignment time is 6.50041 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5797] =>      5797 nucs 'mol-32-2fb7-115363_5797'

Score:        5733
Aligned:      5777        nucs
Identic:      5773 (100%) nucs =>      1314 (100%)      4459 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47056274,47057588] EXCISED REGION [47063712,47068173]
 second seq =>  [       1,    1315] EXCISED REGION [    1338,    5797]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [1316,1337]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47056274 TCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 47056333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 60

 47056334 GCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGC 47056393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGC 120

 47056394 CTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTT 47056453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTT 180

 47056454 TCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACC 47056513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACC 240

 47056514 TTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTC 47056573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTC 300

 47056574 ATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTA 47056633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTA 360

 47056634 AAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTG 47056693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTG 420

 47056694 CTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGA 47056753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGA 480

 47056754 AGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATC 47056813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATC 540

 47056814 TTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACT 47056873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACT 600

 47056874 TCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAA 47056933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAA 660

 47056934 TACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAA 47056993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAA 720

 47056994 CTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTG 47057053
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTG 780

 47057054 TGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTAT 47057113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTAT 840

 47057114 GAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCT 47057173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCT 900

 47057174 CCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTT 47057233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTT 960

 47057234 TTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACA 47057293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACA 1020

 47057294 TATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGT 47057353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGT 1080

 47057354 TGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTG 47057413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTG 1140

 47057414 AAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAA 47057473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAA 1200

 47057474 CTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCA 47057533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCA 1260

 47057534 GAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 1315

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 1397

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 1457

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 1517

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 1576

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 1636

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 1696

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 1756

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 1816

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 1876

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 1936

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 1996

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 2056

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 2116

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 2176

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 2236

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 2296

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2297 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 2356

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 2416

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 2476

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 2536

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 2596

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 2656

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 2716

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 2776

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 2836

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 2896

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 2956

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 3016

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 3076

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 3136

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 3196

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 3256

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 3316

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 3376

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 3436

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 3496

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 3556

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 3616

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 3676

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 3736

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 3796

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 3856

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 3916

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 3976

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 4036

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 4096

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 4156

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 4216

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 4276

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 4336

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 4396

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 4456

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 4516

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 4576

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 4636

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 4696

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 4756

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 4816

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 4876

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 4936

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 4996

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 5056

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 5116

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 5176

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 5236

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 5296

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 5356

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 5416

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 47067851
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     5417 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAG-AAAAAAAAAAAAAAAAA 5475

 47067852 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 47067911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 5535

 47067912 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 47067971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 5595

 47067972 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 47068031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 5655

 47068032 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 47068091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 5715

 47068092 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTTC 47068151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTTC 5775

 47068152 TACCCAAAGCAATCTACTGATT 47068173
          ||||||||||||||||||||||
     5776 TACCCAAAGCAATCTACTGATT 5797

Alignment time is 8.5372 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,   10153] =>     10153 nucs 'mol-32-2fe3-031805_10153'

Score:       10067
Aligned:     10135        nucs
Identic:     10128 (100%) nucs =>      6039 (100%)      4089 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47051545,47057588] EXCISED REGION [47063712,47067802]
 second seq =>  [       1,    6041] EXCISED REGION [    6064,   10153]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [6042,6063]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47051545 GTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACACAGGCGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAACTAG 47051604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACACAGGCGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAACTAG 60

 47051605 GAATTTGAAGCTGCAGTGAGCTATGATCGTACTACTGTACTCCAGCCTTGGTAACAGAAT 47051664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATTTGAAGCTGCAGTGAGCTATGATCGTACTACTGTACTCCAGCCTTGGTAACAGAAT 120

 47051665 AAGACCCTGCCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCTATCAGAAGACAAGTTC 47051724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGACCCTGCCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCTATCAGAAGACAAGTTC 180

 47051725 AATTCCAATTCTAACAGAAGATAATCCACTCTAATGAGCTGGCCTGGTTTTAGAAAGAAA 47051784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTCCAATTCTAACAGAAGATAATCCACTCTAATGAGCTGGCCTGGTTTTAGAAAGAAA 240

 47051785 AAAAGGAGACAGGAGAATGGCCTAGGAAGACTCAACTGCCATCATCCAGTTAAACAGTGC 47051844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGGAGACAGGAGAATGGCCTAGGAAGACTCAACTGCCATCATCCAGTTAAACAGTGC 300

 47051845 AGGTCAAGATTCACTGGCCGTTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGGAGCACCTGGAGGACAT 47051904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGTCAAGATTCACTGGCCGTTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGGAGCACCTGGAGGACAT 360

 47051905 AGAGTGCTGTTGGAGTTTTGAAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAAGAATGAGCTGGAATAT 47051964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGTGCTGTTGGAGTTTTGAAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAAGAATGAGCTGGAATAT 420

 47051965 TTTAATTTGGTCCTCTTGCCCATGTCTTTATTACTTCTATATGTGGAATGTGAATAGCTA 47052024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAATTTGGTCCTCTTGCCCATGTCTTTATTACTTCTATATGTGGAATGTGAATAGCTA 480

 47052025 TTTATATATAGATCCAGTATGGTTACAGTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTTTAACT 47052084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTATATATAGATCCAGTATGGTTACAGTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTTTAACT 540

 47052085 TTTAAGTTCAGGGGTACTTGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTTGTGGGGGTT 47052144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTAAGTTCAGGGGTACTTGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTTGTGGGGGTT 600

 47052145 TGTGGTACAGATTATTTCATCACTCAGGTATTAAGCCTAGTACCCATTAGTTGTTTTCCC 47052204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGGTACAGATTATTTCATCACTCAGGTATTAAGCCTAGTACCCATTAGTTGTTTTCCC 660

 47052205 TGATCTTTTCCCTCTTCCCATCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCAGTGTGTGTTGTTCCCC 47052264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATCTTTTCCCTCTTCCCATCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCAGTGTGTGTTGTTCCCC 720

 47052265 TCTATGCATCCGTGTGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGCAGAAT 47052324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTATGCATCCGTGTGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGCAGAAT 780

 47052325 TTGGCTTTCTCTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTACATGAATGTT 47052384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGGCTTTCTCTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTACATGAATGTT 840

 47052385 CCTGCAGAGGACATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTATTCCATAGTGTGTATG 47052444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTGCAGAGGACATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTATTCCATAGTGTGTATG 900

 47052445 TACCACATTTTCTTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTGAGGAATCCTCAAAGAT 47052504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCACATTTTCTTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTGAGGAATCCTCAAAGAT 960

 47052505 CTAAAGTCAGAAATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGGAA 47052564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAAAGTCAGAAATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGGAA 1020

 47052565 TATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTTAATTCTTTCTTGGTAG 47052624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTTAATTCTTTCTTGGTAG 1080

 47052625 TCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATTCTTGCTTTTTGCTAGT 47052684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATTCTTGCTTTTTGCTAGT 1140

 47052685 TAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAATTT 47052744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAATTT 1200

 47052745 GTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTTTCT 47052804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTTTCT 1260

 47052805 GTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATTAGC 47052864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATTAGC 1320

 47052865 TTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGCTGT 47052924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGCTGT 1380

 47052925 GTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACGTCT 47052984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACGTCT 1440

 47052985 GTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGA 47053044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGA 1500

 47053045 CCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGC 47053104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGC 1560

 47053105 CAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGC 47053164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGC 1620

 47053165 TTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGA 47053224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGA 1680

 47053225 GCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGAGATCTCTTAAAA 47053284
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1681 GCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAGAGATCTCTTAAAA 1740

 47053285 AAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGA 47053344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGA 1800

 47053345 ATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCC 47053404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCC 1860

 47053405 CACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAG 47053464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAG 1920

 47053465 TCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAG 47053524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAG 1980

 47053525 GCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAG 47053584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAG 2040

 47053585 CTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTC 47053644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTC 2100

 47053645 AAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCC 47053704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCC 2160

 47053705 TTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAA 47053764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAA 2220

 47053765 CTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTC 47053824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTC 2280

 47053825 ATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGA 47053884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGA 2340

 47053885 ACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTA 47053944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTA 2400

 47053945 TTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGA 47054004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGA 2460

 47054005 CTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTC 47054064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTC 2520

 47054065 ATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAA 47054124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAA 2580

 47054125 AAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTG 47054184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTG 2640

 47054185 GTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTA 47054244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTA 2700

 47054245 AAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTT 47054304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTT 2760

 47054305 TGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTT 47054364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTT 2820

 47054365 ACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACC 47054424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACC 2880

 47054425 AAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATT 47054484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATT 2940

 47054485 AACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAA 47054544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAA 3000

 47054545 AGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTG 47054604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTG 3060

 47054605 GATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAG 47054664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAG 3120

 47054665 AGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTA 47054724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTA 3180

 47054725 GAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTT 47054784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTT 3240

 47054785 TTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGC 47054844
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGC 3299

 47054845 TTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTC 47054904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTC 3359

 47054905 TTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCT 47054964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCT 3419

 47054965 TCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCT 47055024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCT 3479

 47055025 TCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTC 47055084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTC 3539

 47055085 CAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCA 47055144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCA 3599

 47055145 TGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCA 47055204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCA 3659

 47055205 GTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGG 47055264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGG 3719

 47055265 CATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCAT 47055324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCAT 3779

 47055325 AGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAA 47055384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAA 3839

 47055385 CCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCAT 47055444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCAT 3899

 47055445 TTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCA 47055504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCA 3959

 47055505 AAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGT 47055564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 AAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGT 4019

 47055565 TAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGC 47055624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGC 4079

 47055625 ATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAA 47055684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 ATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAA 4139

 47055685 ATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAA 47055744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 ATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAA 4199

 47055745 CCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGG 47055804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGG 4259

 47055805 CAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGC 47055864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 CAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGC 4319

 47055865 AGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCC 47055924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 AGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCC 4379

 47055925 TGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTT 47055984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTT 4439

 47055985 TCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTT 47056044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTT 4499

 47056045 TTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAG 47056104
          ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAG 4557

 47056105 TCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATG 47056164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATG 4617

 47056165 CTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTA 47056224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 CTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTA 4677

 47056225 TTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCA 47056284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCA 4737

 47056285 AGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACC 47056344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 AGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACC 4797

 47056345 TGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGG 47056404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGG 4857

 47056405 CAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTAT 47056464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 CAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTAT 4917

 47056465 CAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCT 47056524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 CAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCT 4977

 47056525 TTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTC 47056584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 TTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTC 5037

 47056585 TTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTT 47056644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 TTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTT 5097

 47056645 CACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATT 47056704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 CACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATT 5157

 47056705 TCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCA 47056764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCA 5217

 47056765 CAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCA 47056824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 CAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCA 5277

 47056825 TGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTC 47056884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTC 5337

 47056885 CGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAAC 47056944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 CGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAAC 5397

 47056945 CATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCA 47057004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCA 5457

 47057005 GAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCA 47057064
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCA 5517

 47057065 ATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTT 47057124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 ATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTT 5577

 47057125 AATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAAT 47057184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 AATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAAT 5637

 47057185 GGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGA 47057244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 GGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGA 5697

 47057245 TTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCA 47057304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCA 5757

 47057305 TTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAG 47057364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 TTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAG 5817

 47057365 TTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCC 47057424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCC 5877

 47057425 ATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACA 47057484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 ATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACA 5937

 47057485 TGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGA 47057544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGA 5997

 47057545 GATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 GATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 6041

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6064 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 6123

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6124 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 6183

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6184 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 6243

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6244 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 6302

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 6362

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 6422

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 6482

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 6542

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 6602

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 6662

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 6722

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 6782

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 6842

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 6902

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 6962

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6963 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 7022

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7023 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 7082

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7083 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 7142

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7143 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 7202

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7203 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 7262

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7263 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 7322

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7323 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 7382

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7383 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 7442

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7443 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 7502

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7503 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 7562

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7563 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 7622

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7623 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 7682

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7683 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 7742

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7743 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 7802

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7803 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 7862

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7863 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 7922

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7923 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 7982

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7983 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 8042

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8043 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 8102

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8103 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 8162

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8163 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 8222

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8223 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 8282

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8283 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 8342

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8343 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 8402

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8403 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 8462

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8463 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 8522

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8523 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 8582

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8583 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 8642

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8643 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 8702

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8703 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 8762

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8763 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 8822

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8823 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 8882

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8883 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 8942

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8943 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 9002

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9003 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 9062

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9063 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 9122

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9123 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 9182

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9183 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 9242

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9243 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 9302

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9303 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 9362

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9363 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 9422

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9423 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 9482

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9483 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 9542

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9543 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 9602

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9603 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 9662

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9663 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 9722

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9723 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 9782

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9783 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 9842

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9843 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 9902

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9903 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 9962

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9963 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 10022

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10023 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 10082

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10083 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 10142

 47067792 TGGTCCTATGC 47067802
          |||||||||||
    10143 TGGTCCTATGC 10153

Alignment time is 15.4489 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4090] =>      4090 nucs 'mol-32-2fe3-031805_4090'

Score:        4079
Aligned:      4090        nucs
Identic:      4089 (100%) nucs =>       185 (100%)      3904 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47063896] EXCISED REGION [47063898,47067802]
 second seq =>  [       1,     185] EXCISED REGION [     186,    4090]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47063897,47063897]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47064710,47064710]
 second seq =>         1 nucs [998,998]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [47063897,47063911] to [47063898,47063912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 60

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 120

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 180

 47063892 TTCTG 47063896
          |||||
      181 TTCTG 185

EXCISED REGION

 47063898 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 47063957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 245

 47063958 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 47064017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 305

 47064018 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 47064077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 365

 47064078 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 47064137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 425

 47064138 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 47064197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 485

 47064198 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 47064257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 545

 47064258 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 47064317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 605

 47064318 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 47064377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 665

 47064378 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 47064437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 725

 47064438 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 47064497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 785

 47064498 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 47064557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 845

 47064558 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 47064617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 905

 47064618 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 47064677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 965

 47064678 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 47064737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      966 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 1025

 47064738 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 47064797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 1085

 47064798 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 47064857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 1145

 47064858 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 47064917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 1205

 47064918 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 47064977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 1265

 47064978 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 47065037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 1325

 47065038 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 47065097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 1385

 47065098 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 47065157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 1445

 47065158 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 47065217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 1505

 47065218 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 47065277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 1565

 47065278 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 47065337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 1625

 47065338 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 47065397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 1685

 47065398 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 47065457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 1745

 47065458 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 47065517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 1805

 47065518 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 47065577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 1865

 47065578 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 47065637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 1925

 47065638 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 47065697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 1985

 47065698 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 47065757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 2045

 47065758 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 47065817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 2105

 47065818 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 47065877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 2165

 47065878 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 47065937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 2225

 47065938 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 47065997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 2285

 47065998 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 47066057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 2345

 47066058 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 47066117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 2405

 47066118 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 47066177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 2465

 47066178 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 47066237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 2525

 47066238 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 47066297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 2585

 47066298 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 47066357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 2645

 47066358 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 47066417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 2705

 47066418 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 47066477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 2765

 47066478 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 47066537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 2825

 47066538 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 47066597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 2885

 47066598 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 47066657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 2945

 47066658 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 47066717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 3005

 47066718 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 47066777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 3065

 47066778 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 47066837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 3125

 47066838 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 47066897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 3185

 47066898 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 47066957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 3245

 47066958 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 47067017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 3305

 47067018 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 47067077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 3365

 47067078 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 47067137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 3425

 47067138 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 47067197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 3485

 47067198 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 47067257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 3545

 47067258 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 47067317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 3605

 47067318 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 47067377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 3665

 47067378 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTA 47067437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTA 3725

 47067438 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACC 47067497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACC 3785

 47067498 TGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTT 47067557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTT 3845

 47067558 GTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 47067617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 GTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 3905

 47067618 GAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTGTCCTGT 47067677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 GAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTGTCCTGT 3965

 47067678 AGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCAAAAGAA 47067737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 AGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCAAAAGAA 4025

 47067738 ATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACATGGTCC 47067797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 ATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACATGGTCC 4085

 47067798 TATGC 47067802
          |||||
     4086 TATGC 4090

Alignment time is 6.52096 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5691] =>      5691 nucs 'mol-32-3004-032412_5691'

Score:        5604
Aligned:      5672        nucs
Identic:      5665 (100%) nucs =>      1258 (100%)      4407 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47056330,47057588] EXCISED REGION [47063712,47068124]
 second seq =>  [       1,    1259] EXCISED REGION [    1282,    5691]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [1260,1281]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47056330 ATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTG 47056389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTG 60

 47056390 CTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAAC 47056449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAAC 120

 47056450 TTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTT 47056509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTT 180

 47056510 CACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAG 47056569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAG 240

 47056570 GGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAA 47056629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAA 300

 47056630 GTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCA 47056689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCA 360

 47056690 ACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAA 47056749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAA 420

 47056750 ATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTT 47056809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTT 480

 47056810 TATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGA 47056869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGA 540

 47056870 CACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGA 47056929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGA 600

 47056930 AAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAA 47056989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAA 660

 47056990 TGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACA 47057049
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACA 720

 47057050 CTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACA 47057109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACA 780

 47057110 GTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTT 47057169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTT 840

 47057170 CTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTA 47057229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTA 900

 47057230 ACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTC 47057289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTC 960

 47057290 TACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCA 47057349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCA 1020

 47057350 CAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTT 47057409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTT 1080

 47057410 ATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGG 47057469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGG 1140

 47057470 TCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAA 47057529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAA 1200

 47057530 ACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 1259

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 1341

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 1401

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 1461

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 1519

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 1579

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 1639

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 1699

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 1759

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 1819

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 1879

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 1939

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 1999

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 2059

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 2119

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 2179

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 2239

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2240 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 2299

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 2359

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 2419

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 2479

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 2539

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 2599

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 2659

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 2719

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 2779

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 2839

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 2899

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 2959

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 3019

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 3079

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 3139

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 3199

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 3259

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 3319

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 3379

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 3439

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 3499

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 3559

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 3619

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 3679

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 3739

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 3799

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 3859

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 3919

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 3979

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 4039

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 4099

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 4159

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 4219

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 4279

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 4339

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 4399

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 4459

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 4519

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 4579

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 4639

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 4699

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 4759

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 ATCCTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 4819

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 4879

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 4939

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 4999

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 5059

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 5119

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCCCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 5179

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 5239

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 5299

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 5359

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 47067851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     5360 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAA-AAAAAAAAAAAAAAAAAA 5418

 47067852 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 47067911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 5478

 47067912 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 47067971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 5538

 47067972 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 47068031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 5598

 47068032 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 47068091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 5658

 47068092 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGAT 47068124
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGAT 5691

Alignment time is 8.98605 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5773] =>      5773 nucs 'mol-32-300f-169908_5773'

Score:        5709
Aligned:      5753        nucs
Identic:      5749 (100%) nucs =>      1305 (100%)      4444 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47056283,47057588] EXCISED REGION [47063712,47068158]
 second seq =>  [       1,    1306] EXCISED REGION [    1329,    5773]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [1307,1328]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47056283 CAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 47056342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 60

 47056343 CCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTT 47056402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTT 120

 47056403 GGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATT 47056462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATT 180

 47056463 ATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTG 47056522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTG 240

 47056523 CTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTT 47056582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTT 300

 47056583 TCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTAT 47056642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTAT 360

 47056643 TTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAA 47056702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAA 420

 47056703 TTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAAC 47056762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAAC 480

 47056763 CACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGT 47056822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGT 540

 47056823 CATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGG 47056882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGG 600

 47056883 TCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGA 47056942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGA 660

 47056943 ACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATG 47057002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATG 720

 47057003 CAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTG 47057062
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTG 780

 47057063 CAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAG 47057122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAG 840

 47057123 TTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGA 47057182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGA 900

 47057183 ATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACA 47057242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACA 960

 47057243 GATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATG 47057302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATG 1020

 47057303 CATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTG 47057362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTG 1080

 47057363 AGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAAT 47057422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAAT 1140

 47057423 CCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATA 47057482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATA 1200

 47057483 CATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAAT 47057542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAAT 1260

 47057543 GAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 1306

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 1388

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 1448

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 1508

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 1567

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 1627

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 1687

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 1747

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 1807

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 1867

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 1927

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 1987

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 2047

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 2107

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 2167

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 2227

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 2287

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2288 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 2347

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 2407

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 2467

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 2527

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 2587

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 2647

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 2707

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 2767

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 2827

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 2887

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 2947

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 3007

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 3067

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 3127

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 3187

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 3247

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 3307

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 3367

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 3427

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 3487

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 3547

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 3607

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 3667

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 3727

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 3787

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 3847

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 3907

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 3967

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 4027

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 4087

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 4147

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 4207

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 4267

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 4327

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 4387

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 4447

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 4507

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 4567

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 4627

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 4687

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 4747

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 4807

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 4867

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 4927

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 4987

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 5047

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 5107

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 5167

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 5227

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 5287

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 5347

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 5407

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 47067851
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     5408 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAG-AAAAAAAAAAAAAAAAA 5466

 47067852 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 47067911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 5526

 47067912 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 47067971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 5586

 47067972 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 47068031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 5646

 47068032 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 47068091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 5706

 47068092 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTTC 47068151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTTC 5766

 47068152 TACCCAA 47068158
          |||||||
     5767 TACCCAA 5773

Alignment time is 9.09469 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8087] =>      8087 nucs 'mol-32-3025-094198_8087'

Score:        7991
Aligned:      8068        nucs
Identic:      8061 (100%) nucs =>      3962 (100%)      4099 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47053623,47057588] EXCISED REGION [47063712,47067813]
 second seq =>  [       1,    3964] EXCISED REGION [    3987,    8087]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3965,3986]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47053623 GCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACAC 47053682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACAC 60

 47053683 CCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATA 47053742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATA 120

 47053743 TTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAG 47053802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAG 180

 47053803 AGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAA 47053862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAA 240

 47053863 CCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAA 47053922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAA 300

 47053923 TTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGAT 47053982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGAT 360

 47053983 TATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAAT 47054042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAAT 420

 47054043 GGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACT 47054102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACT 480

 47054103 CACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAA 47054162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAA 540

 47054163 AATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGA 47054222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGA 600

 47054223 ACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGG 47054282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGG 660

 47054283 ATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGG 47054342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGG 720

 47054343 GCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATC 47054402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATC 780

 47054403 CACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACC 47054462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACC 840

 47054463 AATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCT 47054522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCT 900

 47054523 ACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATT 47054582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATT 960

 47054583 TACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGT 47054642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGT 1020

 47054643 TAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAG 47054702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAG 1080

 47054703 GGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAA 47054762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1081 GGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTGTGAAA 1140

 47054763 ACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGG 47054822
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGG 1199

 47054823 TACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTC 47054882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTC 1259

 47054883 ATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGT 47054942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGT 1319

 47054943 CAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGC 47055002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGC 1379

 47055003 ACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATG 47055062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATG 1439

 47055063 TCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTT 47055122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTT 1499

 47055123 GCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAG 47055182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAG 1559

 47055183 TCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATG 47055242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATG 1619

 47055243 GCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATG 47055302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATG 1679

 47055303 TTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAA 47055362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAA 1739

 47055363 TGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTT 47055422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTT 1799

 47055423 GGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTG 47055482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTG 1859

 47055483 GCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCA 47055542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCA 1919

 47055543 CCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGT 47055602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGT 1979

 47055603 AACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATAT 47055662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATAT 2039

 47055663 ATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGAC 47055722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGAC 2099

 47055723 TTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTT 47055782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTT 2159

 47055783 CTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGT 47055842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGT 2219

 47055843 TACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATA 47055902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATA 2279

 47055903 GTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAA 47055962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAA 2339

 47055963 TAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGA 47056022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGA 2399

 47056023 TATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCT 47056082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2400 TATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCT 2458

 47056083 CACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTC 47056142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTC 2518

 47056143 CTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGC 47056202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGC 2578

 47056203 CACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGC 47056262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGC 2638

 47056263 TGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGAT 47056322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGAT 2698

 47056323 TACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAAC 47056382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAAC 2758

 47056383 TTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAG 47056442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAG 2818

 47056443 CCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTA 47056502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTA 2878

 47056503 GACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATC 47056562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATC 2938

 47056563 ATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTC 47056622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTC 2998

 47056623 AAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGC 47056682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGC 3058

 47056683 TGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTA 47056742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTA 3118

 47056743 TCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAAT 47056802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAAT 3178

 47056803 TCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCA 47056862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCA 3238

 47056863 CTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAAC 47056922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAAC 3298

 47056923 ACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACT 47056982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 ACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACT 3358

 47056983 GGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACT 47057042
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACT 3418

 47057043 TGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAG 47057102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAG 3478

 47057103 TAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCT 47057162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCT 3538

 47057163 TACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTA 47057222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTA 3598

 47057223 AATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGAC 47057282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGAC 3658

 47057283 TAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTA 47057342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTA 3718

 47057343 GGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAA 47057402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAA 3778

 47057403 TATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGT 47057462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGT 3838

 47057463 TCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGA 47057522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGA 3898

 47057523 AGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAA 47057582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 AGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAA 3958

 47057583 AAGATA 47057588
          ||||||
     3959 AAGATA 3964

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 4046

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 4106

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 4166

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 4225

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 4285

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 4345

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 4405

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 4465

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 4525

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 4585

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 4645

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 4705

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 4765

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 4825

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 4885

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 4945

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4946 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 5005

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 5065

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 5125

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 5185

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 5245

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 5305

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 5365

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 5425

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 5485

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 5545

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 5605

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 5665

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 5725

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 5785

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 5845

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 5905

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 5965

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 6025

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 6085

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 6145

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 6205

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 6265

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 6325

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 6385

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 6445

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 6505

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 6565

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 6625

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 6685

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 6745

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 6805

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 6865

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 6925

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 6985

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 7045

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 7105

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 7165

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 7225

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 7285

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 7345

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 7405

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 7465

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 7525

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 7585

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 7645

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 7705

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7706 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 7765

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7766 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 7825

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7826 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCCCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 7885

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7886 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 7945

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7946 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 8005

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8006 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 8065

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCAT 47067813
          ||||||||||||||||||||||
     8066 TGGTCCTATGCATAAAAAGCAT 8087

Alignment time is 12.209 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3964] =>      3964 nucs 'mol-32-3025-094198_3964'

Score:        3932
Aligned:      3965        nucs
Identic:      3962 (100%) nucs =>      1134 (100%)      2828 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47053623,47054756] EXCISED REGION [47054758,47057588]
 second seq =>  [       1,    1134] EXCISED REGION [    1136,    3964]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47054757,47054757]
 second seq =>         1 nucs [1135,1135]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47054781,47054781]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47054756,47054756] to [47054758,47054758]
 second seq =>         1 nucs [1134,1134] to [1136,1136]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47053623 GCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACAC 47053682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACAC 60

 47053683 CCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATA 47053742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATA 120

 47053743 TTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAG 47053802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAG 180

 47053803 AGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAA 47053862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAA 240

 47053863 CCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAA 47053922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAA 300

 47053923 TTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGAT 47053982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGAT 360

 47053983 TATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAAT 47054042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAAT 420

 47054043 GGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACT 47054102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACT 480

 47054103 CACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAA 47054162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAA 540

 47054163 AATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGA 47054222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGA 600

 47054223 ACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGG 47054282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGG 660

 47054283 ATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGG 47054342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGG 720

 47054343 GCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATC 47054402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATC 780

 47054403 CACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACC 47054462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACC 840

 47054463 AATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCT 47054522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCT 900

 47054523 ACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATT 47054582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATT 960

 47054583 TACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGT 47054642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGT 1020

 47054643 TAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAG 47054702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAG 1080

 47054703 GGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTT 47054756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTT 1134

EXCISED REGION

 47054758 TGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTA 47054817
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TGAAAACACATGGTGATTTCTGA-TTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTA 1194

 47054818 TATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTC 47054877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 TATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTC 1254

 47054878 ATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCT 47054937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 ATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCT 1314

 47054938 AATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTT 47054997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 AATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTT 1374

 47054998 CTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTG 47055057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 CTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTG 1434

 47055058 TGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCT 47055117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCT 1494

 47055118 TCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTG 47055177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTG 1554

 47055178 TGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCT 47055237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 TGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCT 1614

 47055238 CAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCT 47055297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCT 1674

 47055298 TGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATG 47055357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATG 1734

 47055358 TGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTG 47055417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTG 1794

 47055418 TGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCT 47055477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 TGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCT 1854

 47055478 GGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTG 47055537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 GGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTG 1914

 47055538 CTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGA 47055597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 CTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGA 1974

 47055598 TATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATA 47055657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 TATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATA 2034

 47055658 TATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATC 47055717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATC 2094

 47055718 CTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAG 47055777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 CTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAG 2154

 47055778 GGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCA 47055837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 GGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCA 2214

 47055838 GGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACA 47055897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 GGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACA 2274

 47055898 AAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTT 47055957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 AAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTT 2334

 47055958 ACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAG 47056017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 ACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAG 2394

 47056018 GAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAG 47056077
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     2395 GAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTC-TTTTTTTTTTTTTTAGAGCAG 2453

 47056078 GGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCG 47056137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 GGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCG 2513

 47056138 AATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCT 47056197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCT 2573

 47056198 TGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCC 47056257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 TGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCC 2633

 47056258 CAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCT 47056317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 CAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCT 2693

 47056318 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTG 47056377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTG 2753

 47056378 GAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTT 47056437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTT 2813

 47056438 TTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAG 47056497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 TTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAG 2873

 47056498 CTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTC 47056557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTC 2933

 47056558 AGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTG 47056617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 AGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTG 2993

 47056618 TTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGAT 47056677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 TTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGAT 3053

 47056678 GTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTC 47056737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 GTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTC 3113

 47056738 ATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAA 47056797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAA 3173

 47056798 GCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGG 47056857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 GCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGG 3233

 47056858 CATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTAC 47056917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 CATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTAC 3293

 47056918 TGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAAT 47056977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAAT 3353

 47056978 TTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAG 47057037
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAG 3413

 47057038 ATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTAT 47057097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 ATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTAT 3473

 47057098 TATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGT 47057157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 TATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGT 3533

 47057158 TTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTT 47057217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 TTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTT 3593

 47057218 TGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAA 47057277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAA 3653

 47057278 TGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATAT 47057337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATAT 3713

 47057338 GTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATT 47057397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 GTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATT 3773

 47057398 TCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCAT 47057457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 TCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCAT 3833

 47057458 GCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACA 47057517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 GCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACA 3893

 47057518 CAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGA 47057577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 CAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGA 3953

 47057578 GTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||
     3954 GTGAAAAGATA 3964

Alignment time is 6.45304 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3720] =>      3720 nucs 'mol-32-3030-281495_3720'

Score:        3678
Aligned:      3689        nucs
Identic:      3688 (100%) nucs =>       185 (100%)      3503 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47063896] EXCISED REGION [47063898,47067401]
 second seq =>  [      32,     216] EXCISED REGION [     217,    3720]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47063897,47063897]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47064710,47064710]
 second seq =>         1 nucs [1029,1029]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [47063897,47063911] to [47063898,47063912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       32 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 91

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       92 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 151

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      152 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 211

 47063892 TTCTG 47063896
          |||||
      212 TTCTG 216

EXCISED REGION

 47063898 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 47063957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 276

 47063958 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 47064017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 336

 47064018 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 47064077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 396

 47064078 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 47064137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 456

 47064138 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 47064197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 516

 47064198 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 47064257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 576

 47064258 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 47064317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 636

 47064318 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 47064377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 696

 47064378 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 47064437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 756

 47064438 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 47064497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 816

 47064498 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 47064557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 876

 47064558 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 47064617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 936

 47064618 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 47064677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 996

 47064678 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 47064737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      997 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 1056

 47064738 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 47064797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 1116

 47064798 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 47064857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 1176

 47064858 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 47064917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 1236

 47064918 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 47064977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 1296

 47064978 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 47065037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 1356

 47065038 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 47065097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 1416

 47065098 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 47065157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 1476

 47065158 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 47065217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 1536

 47065218 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 47065277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 1596

 47065278 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 47065337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 1656

 47065338 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 47065397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 1716

 47065398 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 47065457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 1776

 47065458 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 47065517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 1836

 47065518 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 47065577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 1896

 47065578 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 47065637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 1956

 47065638 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 47065697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 2016

 47065698 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 47065757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 2076

 47065758 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 47065817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 2136

 47065818 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 47065877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 2196

 47065878 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 47065937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 2256

 47065938 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 47065997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 2316

 47065998 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 47066057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 2376

 47066058 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 47066117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 2436

 47066118 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 47066177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 2496

 47066178 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 47066237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 2556

 47066238 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 47066297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 2616

 47066298 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 47066357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 2676

 47066358 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 47066417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 2736

 47066418 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 47066477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 2796

 47066478 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 47066537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 2856

 47066538 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 47066597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 2916

 47066598 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 47066657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 2976

 47066658 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 47066717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 3036

 47066718 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 47066777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 3096

 47066778 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 47066837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 3156

 47066838 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 47066897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 3216

 47066898 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 47066957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 3276

 47066958 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 47067017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 3336

 47067018 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 47067077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 3396

 47067078 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 47067137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 3456

 47067138 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 47067197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 3516

 47067198 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 47067257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 3576

 47067258 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 47067317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 3636

 47067318 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 47067377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 3696

 47067378 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCC 47067401
          ||||||||||||||||||||||||
     3697 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCC 3720

Alignment time is 5.86816 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3373] =>      3373 nucs 'mol-32-3046-153042_3373'

Score:        3320
Aligned:      3353        nucs
Identic:      3350 (100%) nucs =>      3260 (100%)        90 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054326,47057588] EXCISED REGION [47063712,47063801]
 second seq =>  [       1,    3261] EXCISED REGION [    3284,    3373]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3262,3283]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47054326 AAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCT 47054385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCT 60

 47054386 TCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGT 47054445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGT 120

 47054446 CTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTA 47054505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTA 180

 47054506 TTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAAT 47054565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAAT 240

 47054566 CAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCAT 47054625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCAT 300

 47054626 CTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGC 47054685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGC 360

 47054686 TGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTC 47054745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTC 420

 47054746 GGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTA 47054805
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
      421 GGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTA 479

 47054806 AAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATC 47054865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATC 539

 47054866 ACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCT 47054925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCT 599

 47054926 GCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCT 47054985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCT 659

 47054986 ATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTA 47055045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTA 719

 47055046 ATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACC 47055105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACC 779

 47055106 CTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTG 47055165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTG 839

 47055166 TCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTA 47055225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTA 899

 47055226 TTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCT 47055285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCT 959

 47055286 CCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAA 47055345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAA 1019

 47055346 CAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAA 47055405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAA 1079

 47055406 TTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAA 47055465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAA 1139

 47055466 CTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTC 47055525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTC 1199

 47055526 CATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGG 47055585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGG 1259

 47055586 CACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGT 47055645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGT 1319

 47055646 ATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCA 47055705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCA 1379

 47055706 GCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTT 47055765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTT 1439

 47055766 CTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCC 47055825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCC 1499

 47055826 CTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGAC 47055885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGAC 1559

 47055886 TGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTG 47055945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTG 1619

 47055946 CATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAA 47056005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAA 1679

 47056006 AAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTT 47056065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTT 1739

 47056066 TTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATT 47056125
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATT 1798

 47056126 CACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTG 47056185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTG 1858

 47056186 GGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTT 47056245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTT 1918

 47056246 TTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCC 47056305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCC 1978

 47056306 TTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCT 47056365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCT 2038

 47056366 TAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATA 47056425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATA 2098

 47056426 TCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCAT 47056485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCAT 2158

 47056486 TAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACT 47056545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACT 2218

 47056546 TCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCT 47056605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCT 2278

 47056606 ATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTT 47056665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 ATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTT 2338

 47056666 ATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCT 47056725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCT 2398

 47056726 TACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTAT 47056785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTAT 2458

 47056786 GATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGG 47056845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGG 2518

 47056846 GAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTT 47056905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTT 2578

 47056906 ATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACT 47056965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACT 2638

 47056966 GTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGG 47057025
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2639 GTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGG 2698

 47057026 TGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTAT 47057085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTAT 2758

 47057086 GAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTT 47057145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTT 2818

 47057146 AATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGT 47057205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGT 2878

 47057206 GTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAG 47057265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAG 2938

 47057266 TAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAA 47057325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAA 2998

 47057326 TTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAAT 47057385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAAT 3058

 47057386 CCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACA 47057445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACA 3118

 47057446 GTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAA 47057505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAA 3178

 47057506 AAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGT 47057565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 AAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGT 3238

 47057566 TAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||
     3239 TAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 3261

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 3343

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGA 47063801
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGA 3373

Alignment time is 5.55336 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3546] =>      3546 nucs 'mol-32-30eb-054527_3546'

Score:        3493
Aligned:      3526        nucs
Identic:      3523 (100%) nucs =>      3436 (100%)        87 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054150,47057588] EXCISED REGION [47063712,47063798]
 second seq =>  [       1,    3437] EXCISED REGION [    3460,    3546]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3438,3459]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47054150 GCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCAT 47054209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCAT 60

 47054210 AGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGA 47054269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGA 120

 47054270 ATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAAT 47054329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAAT 180

 47054330 AAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCAC 47054389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCAC 240

 47054390 TTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTAC 47054449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTAC 300

 47054450 TATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTT 47054509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTT 360

 47054510 ATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAA 47054569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAA 420

 47054570 AGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTT 47054629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTT 480

 47054630 TTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTC 47054689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTC 540

 47054690 TTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTG 47054749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTG 600

 47054750 TAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAA 47054809
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
      601 TAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAA 659

 47054810 TGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTG 47054869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTG 719

 47054870 AAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCA 47054929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCA 779

 47054930 GATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTC 47054989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTC 839

 47054990 CTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTC 47055049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTC 899

 47055050 CTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTC 47055109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTC 959

 47055110 CCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGT 47055169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGT 1019

 47055170 AAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGT 47055229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGT 1079

 47055230 TTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCA 47055289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCA 1139

 47055290 GACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGA 47055349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGA 1199

 47055350 GTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAG 47055409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAG 1259

 47055410 AAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCA 47055469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCA 1319

 47055470 TGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATG 47055529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATG 1379

 47055530 TTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACA 47055589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACA 1439

 47055590 TGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAA 47055649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAA 1499

 47055650 TAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAA 47055709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAA 1559

 47055710 GGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCA 47055769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCA 1619

 47055770 TTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTC 47055829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTC 1679

 47055830 AAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTG 47055889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTG 1739

 47055890 TTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATC 47055949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATC 1799

 47055950 TCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAA 47056009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAA 1859

 47056010 CTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT 47056069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT 1919

 47056070 TAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACA 47056129
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 -AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACA 1978

 47056130 CCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGAC 47056189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGAC 2038

 47056190 TACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCC 47056249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCC 2098

 47056250 ATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCC 47056309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 ATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCC 2158

 47056310 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAAT 47056369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAAT 2218

 47056370 GGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCT 47056429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCT 2278

 47056430 GATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAA 47056489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAA 2338

 47056490 TTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCAC 47056549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCAC 2398

 47056550 TTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAA 47056609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAA 2458

 47056610 AAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGC 47056669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGC 2518

 47056670 CTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACC 47056729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACC 2578

 47056730 TTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATG 47056789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATG 2638

 47056790 TATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGC 47056849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGC 2698

 47056850 ACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGG 47056909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGG 2758

 47056910 TTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGA 47056969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGA 2818

 47056970 TACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTT 47057029
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2819 TACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTT 2878

 47057030 TTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAAT 47057089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAAT 2938

 47057090 GAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATA 47057149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATA 2998

 47057150 CTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGT 47057209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGT 3058

 47057210 GTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAA 47057269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAA 3118

 47057270 TGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTT 47057329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTT 3178

 47057330 TCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCT 47057389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCT 3238

 47057390 CCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTC 47057449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTC 3298

 47057450 AAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAA 47057509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAA 3358

 47057510 TATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGT 47057569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGT 3418

 47057570 GAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||
     3419 GAAATGGAGTGAAAAGATA 3437

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 3519

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGAT 47063798
          |||||||||||||||||||||||||||
     3520 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGAT 3546

Alignment time is 5.73025 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7756] =>      7756 nucs 'mol-32-30f6-074573_7756'

Score:        7690
Aligned:      7738        nucs
Identic:      7732 (100%) nucs =>      4886 (100%)      2846 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47052698,47057588] EXCISED REGION [47063712,47066557]
 second seq =>  [       1,    4888] EXCISED REGION [    4911,    7756]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [4889,4910]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47052698 TAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTT 47052757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTT 60

 47052758 CAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGT 47052817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGT 120

 47052818 TTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTAC 47052877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTAC 180

 47052878 AAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATAT 47052937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATAT 240

 47052938 ATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGC 47052997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGC 300

 47052998 TTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAA 47053057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAA 360

 47053058 CATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGC 47053117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGC 420

 47053118 GCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAG 47053177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAG 480

 47053178 TTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAA 47053237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAA 540

 47053238 ACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-AAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCT 47053296
          |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTT--AAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCT 598

 47053297 GAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATAT 47053356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 GAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATAT 658

 47053357 ATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCA 47053416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 ATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCA 718

 47053417 TCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTA 47053476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTA 778

 47053477 GGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCT 47053536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCT 838

 47053537 TTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTG 47053596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTG 898

 47053597 TGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTC 47053656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTC 958

 47053657 CTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTT 47053716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTT 1018

 47053717 GACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTA 47053776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTA 1078

 47053777 TTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACT 47053836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACT 1138

 47053837 TTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCA 47053896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCA 1198

 47053897 CATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAG 47053956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAG 1258

 47053957 CCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAA 47054016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAA 1318

 47054017 TACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATA 47054076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATA 1378

 47054077 TCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAA 47054136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAA 1438

 47054137 CTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGG 47054196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGG 1498

 47054197 CTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATT 47054256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATT 1558

 47054257 CAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGG 47054316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGG 1618

 47054317 AAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGAC 47054376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGAC 1678

 47054377 CTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACT 47054436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACT 1738

 47054437 ACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTT 47054496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTT 1798

 47054497 GTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTAT 47054556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTAT 1858

 47054557 TAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAA 47054616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAA 1918

 47054617 GACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGT 47054676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGT 1978

 47054677 TGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCA 47054736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCA 2038

 47054737 GGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTC 47054796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     2039 GGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTC 2097

 47054797 ATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGT 47054856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 ATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGT 2157

 47054857 GCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGG 47054916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGG 2217

 47054917 AACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCT 47054976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCT 2277

 47054977 TCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGT 47055036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGT 2337

 47055037 CTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATAT 47055096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATAT 2397

 47055097 CTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGA 47055156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGA 2457

 47055157 TTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGC 47055216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGC 2517

 47055217 AGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGG 47055276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 AGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGG 2577

 47055277 TGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGT 47055336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGT 2637

 47055337 CCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTA 47055396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTA 2697

 47055397 GGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTT 47055456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTT 2757

 47055457 GGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAA 47055516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAA 2817

 47055517 AAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTC 47055576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTC 2877

 47055577 CTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGA 47055636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGA 2937

 47055637 ACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGT 47055696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGT 2997

 47055697 CCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAA 47055756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 CCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAA 3057

 47055757 AAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTT 47055816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTT 3117

 47055817 ATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCAT 47055876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 ATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCAT 3177

 47055877 AAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCC 47055936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCC 3237

 47055937 TGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCAT 47055996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCAT 3297

 47055997 CTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCT 47056056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCT 3357

 47056057 TTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATG 47056116
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATG 3416

 47056117 ATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTT 47056176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 ATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTT 3476

 47056177 TAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAG 47056236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAG 3536

 47056237 ATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCC 47056296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 ATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCC 3596

 47056297 ACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAA 47056356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 ACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAA 3656

 47056357 TAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTT 47056416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTT 3716

 47056417 CCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTT 47056476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTT 3776

 47056477 TACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCAT 47056536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCAT 3836

 47056537 ATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCC 47056596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 ATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCC 3896

 47056597 TGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGC 47056656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGC 3956

 47056657 AATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTAT 47056716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTAT 4016

 47056717 AATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATC 47056776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 AATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATC 4076

 47056777 TCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCT 47056836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 TCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCT 4136

 47056837 GTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTAT 47056896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTAT 4196

 47056897 TTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCA 47056956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCA 4256

 47056957 CTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGC 47057016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4257 CTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGC 4316

 47057017 ATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGA 47057076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 ATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGA 4376

 47057077 GTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAG 47057136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAG 4436

 47057137 TTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTAT 47057196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTAT 4496

 47057197 GGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATT 47057256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 GGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATT 4556

 47057257 TTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATAC 47057316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATAC 4616

 47057317 TTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAAT 47057376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAAT 4676

 47057377 TGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAG 47057436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAG 4736

 47057437 ACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCA 47057496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 ACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCA 4796

 47057497 TCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCT 47057556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCT 4856

 47057557 CTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 CTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 4888

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 4970

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 5030

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 5090

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 5150

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 5210

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 5270

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 5330

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 5390

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 5450

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 5510

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5511 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 5570

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 5630

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 5690

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 5750

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 5810

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 5870

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 5930

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 5990

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 6050

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6051 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 6110

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 6170

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 6230

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 6290

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 6350

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 6410

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 6470

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 6530

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 6590

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 6650

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 6710

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 6770

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 6830

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 6890

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 6950

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 7010

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 7070

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 7130

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7131 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 7190

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7191 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 7250

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 7310

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 7370

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 7430

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 7490

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 7550

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 7610

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 7670

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 7730

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGG 47066557
          ||||||||||||||||||||||||||
     7731 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGG 7756

Alignment time is 11.9379 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2846] =>      2846 nucs 'mol-32-30f6-074573_2846'

Score:        2846
Aligned:      2846        nucs
Identic:      2846 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47066557]
 second seq =>  [       1,    2846]

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 60

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 120

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 180

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 240

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 300

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 360

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 420

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 480

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 540

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 600

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 660

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 720

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 780

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 840

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 900

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 960

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 1020

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 1080

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 1140

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 1200

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 1260

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 1320

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 1380

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 1440

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 1500

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 1560

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 1620

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 1680

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 1740

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 1800

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 1860

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 1920

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 1980

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 2040

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 2100

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 2160

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 2220

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 2280

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 2340

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 2400

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 2460

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 2520

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 2580

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 2640

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 2700

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 2760

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 2820

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGG 47066557
          ||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGG 2846

Alignment time is 4.25712 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6898] =>      6898 nucs 'mol-32-30f6-141717_6898'

Score:        6835
Aligned:      6879        nucs
Identic:      6875 (100%) nucs =>      3002 (100%)      3873 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054584,47057588] EXCISED REGION [47063712,47067585]
 second seq =>  [       1,    3003] EXCISED REGION [    3026,    6898]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3004,3025]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47054584 ACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTT 47054643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTT 60

 47054644 AAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGG 47054703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGG 120

 47054704 GAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAA 47054763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAA 180

 47054764 CACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGT 47054823
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGT 239

 47054824 ACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCA 47054883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 ACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCA 299

 47054884 TAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTC 47054943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTC 359

 47054944 AGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCA 47055003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCA 419

 47055004 CTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGT 47055063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGT 479

 47055064 CTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTG 47055123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTG 539

 47055124 CCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGT 47055183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGT 599

 47055184 CATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGG 47055243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGG 659

 47055244 CTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGT 47055303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGT 719

 47055304 TCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAAT 47055363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAAT 779

 47055364 GGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTG 47055423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTG 839

 47055424 GGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGG 47055483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGG 899

 47055484 CCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCAC 47055543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCAC 959

 47055544 CCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTA 47055603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTA 1019

 47055604 ACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATA 47055663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATA 1079

 47055664 TATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACT 47055723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACT 1139

 47055724 TCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTC 47055783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTC 1199

 47055784 TTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTT 47055843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTT 1259

 47055844 ACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAG 47055903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAG 1319

 47055904 TAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAAT 47055963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAAT 1379

 47055964 AAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGAT 47056023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGAT 1439

 47056024 ATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTC 47056083
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     1440 ATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCTC 1498

 47056084 ACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCC 47056143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 ACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCC 1558

 47056144 TGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCC 47056203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCC 1618

 47056204 ACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCT 47056263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCT 1678

 47056264 GGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATT 47056323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATT 1738

 47056324 ACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACT 47056383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACT 1798

 47056384 TGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGC 47056443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGC 1858

 47056444 CAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAG 47056503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAG 1918

 47056504 ACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCA 47056563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCA 1978

 47056564 TATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCA 47056623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCA 2038

 47056624 AGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCT 47056683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCT 2098

 47056684 GCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTAT 47056743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTAT 2158

 47056744 CTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATT 47056803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATT 2218

 47056804 CAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCAC 47056863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCAC 2278

 47056864 TAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACA 47056923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACA 2338

 47056924 CGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTG 47056983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTG 2398

 47056984 GAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTT 47057043
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTT 2458

 47057044 GCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGT 47057103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGT 2518

 47057104 AGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTT 47057163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTT 2578

 47057164 ACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAA 47057223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAA 2638

 47057224 ATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACT 47057283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACT 2698

 47057284 AGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAG 47057343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAG 2758

 47057344 GATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAAT 47057403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAAT 2818

 47057404 ATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTT 47057463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTT 2878

 47057464 CAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAA 47057523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAA 2938

 47057524 GAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAA 47057583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAA 2998

 47057584 AGATA 47057588
          |||||
     2999 AGATA 3003

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 3085

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 3145

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 3205

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 3264

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 3324

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 3384

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 3444

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 3504

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 3564

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 3624

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 3684

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 3744

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 3804

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 3864

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 3924

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 3984

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 4044

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 4104

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 4164

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 4224

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 4284

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 4344

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 4404

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 4464

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 4524

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 4584

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 4644

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 4704

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 4764

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 4824

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 4884

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 4944

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 5004

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 5064

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 5124

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 5184

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 5244

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 5304

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 5364

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 5424

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 5484

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 5544

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 5604

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 5664

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 5724

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 5784

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 5844

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 5904

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 5964

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 6024

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 6084

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 6144

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 6204

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 6264

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 6324

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 6384

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 6444

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 6504

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 6564

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 6624

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 6684

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 6744

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 6804

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 6864

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCC 47067585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCC 6898

Alignment time is 10.6725 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3003] =>      3003 nucs 'mol-32-30f6-141717_3003'

Score:        2982
Aligned:      3004        nucs
Identic:      3002 (100%) nucs =>       197 (100%)      2805 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054584,47054780] EXCISED REGION [47054782,47057588]
 second seq =>  [       1,     197] EXCISED REGION [     198,    3003]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47054781,47054781]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47057009,47057009]
 second seq =>         1 nucs [2424,2424]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [47054781,47054787] to [47054782,47054788]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47054584 ACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTT 47054643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTT 60

 47054644 AAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGG 47054703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGG 120

 47054704 GAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAA 47054763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAA 180

 47054764 CACATGGTGATTTCTGA 47054780
          |||||||||||||||||
      181 CACATGGTGATTTCTGA 197

EXCISED REGION

 47054782 TTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATT 47054841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      198 TTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATT 257

 47054842 TGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCA 47054901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      258 TGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCA 317

 47054902 GTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCT 47054961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      318 GTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCT 377

 47054962 GCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCA 47055021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 GCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCA 437

 47055022 CCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTT 47055081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 CCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTT 497

 47055082 CTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTT 47055141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 CTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTT 557

 47055142 TCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGAT 47055201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 TCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGAT 617

 47055202 GCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAG 47055261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 GCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAG 677

 47055262 TGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTC 47055321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 TGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTC 737

 47055322 CATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTA 47055381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 CATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTA 797

 47055382 TAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGAC 47055441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 TAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGAC 857

 47055442 CATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAAT 47055501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 CATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAAT 917

 47055502 TCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTA 47055561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 TCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTA 977

 47055562 CGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTG 47055621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 CGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTG 1037

 47055622 CGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATA 47055681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 CGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATA 1097

 47055682 AAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATG 47055741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 AAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATG 1157

 47055742 AAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAAC 47055801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 AAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAAC 1217

 47055802 TGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAG 47055861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 TGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAG 1277

 47055862 GGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCT 47055921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 GGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCT 1337

 47055922 TCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCAT 47055981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 TCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCAT 1397

 47055982 TTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGA 47056041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGA 1457

 47056042 TTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTG 47056101
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 TTTTTAAAAGCTTC-TTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTG 1516

 47056102 GAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTC 47056161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 GAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTC 1576

 47056162 ATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTT 47056221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 ATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTT 1636

 47056222 TTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGC 47056281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 TTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGC 1696

 47056282 TCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGC 47056341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGC 1756

 47056342 ACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGT 47056401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 ACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGT 1816

 47056402 TGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAAT 47056461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAAT 1876

 47056462 TATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCT 47056521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 TATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCT 1936

 47056522 GCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCT 47056581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 GCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCT 1996

 47056582 TTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTA 47056641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 TTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTA 2056

 47056642 TTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGA 47056701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 TTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGA 2116

 47056702 ATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAA 47056761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 ATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAA 2176

 47056762 CCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACG 47056821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 CCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACG 2236

 47056822 TCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGG 47056881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 TCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGG 2296

 47056882 GTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAG 47056941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 GTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAG 2356

 47056942 AACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCAT 47057001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 AACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCAT 2416

 47057002 GCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACT 47057061
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 GCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACT 2476

 47057062 GCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACA 47057121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 GCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACA 2536

 47057122 GTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATG 47057181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 GTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATG 2596

 47057182 AATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAAC 47057241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 AATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAAC 2656

 47057242 AGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTAT 47057301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 AGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTAT 2716

 47057302 GCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGT 47057361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 GCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGT 2776

 47057362 GAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAA 47057421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 GAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAA 2836

 47057422 TCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATAT 47057481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 TCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATAT 2896

 47057482 ACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAA 47057541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 ACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAA 2956

 47057542 TGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 TGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 3003

Alignment time is 4.78978 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8296] =>      8296 nucs 'mol-32-3101-240236_8296'

Score:        8166
Aligned:      8282        nucs
Identic:      8269 (100%) nucs =>      7874 (100%)       395 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47049705,47057588] EXCISED REGION [47063712,47064108]
 second seq =>  [       1,    7879] EXCISED REGION [    7902,    8296]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [7880,7901]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47049705 ACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCA 47049764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCATCA 60

 47049765 CGCCCGGCCACATCTCTATTTTCTATAGCATTTACAATTATTTCTTTGTAGCCAACAGAA 47049824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCCCGGCCACATCTCTATTTTCTATAGCATTTACAATTATTTCTTTGTAGCCAACAGAA 120

 47049825 AAGTTGCACTCAATGAACCTATCAATTCATGATGCATATCCGTGGGGAGAAGCTCATTCC 47049884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTTGCACTCAATGAACCTATCAATTCATGATGCATATCCGTGGGGAGAAGCTCATTCC 180

 47049885 GAATACATCATATGTTAAATTTATCCTTGGATTCAGGATCATATTGTTCACTTACTTTTT 47049944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATACATCATATGTTAAATTTATCCTTGGATTCAGGATCATATTGTTCACTTACTTTTT 240

 47049945 CCTGTAGTCAGCATGTTGTAATTTTGAACAATAGAATAATAGATAACAACAGCCTACTAG 47050004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGTAGTCAGCATGTTGTAATTTTGAACAATAGAATAATAGATAACAACAGCCTACTAG 300

 47050005 AGAATTAGAAATACTGTAGTTCTAAGAACTGTAGTAATTAGAAATACTGTAGTTCTAAGA 47050064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAATTAGAAATACTGTAGTTCTAAGAACTGTAGTAATTAGAAATACTGTAGTTCTAAGA 360

 47050065 ACTGTAGTTCTTAGAAATACTGCATTCAACTTTTGTAAAGAAACTTTTTTGTATCACTAT 47050124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGTAGTTCTTAGAAATACTGCATTCAACTTTTGTAAAGAAACTTTTTTGTATCACTAT 420

 47050125 ATAAGAAAGAAGCTGGTGTGTAAGGCAACTTCTGTGCAAATATGTTGTCTAAACTGCTTT 47050184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAGAAAGAAGCTGGTGTGTAAGGCAACTTCTGTGCAAATATGTTGTCTAAACTGCTTT 480

 47050185 GGGGTTCTGTAACATAGACTAGCTGACTTGCCTCACTGATTTCTCTTATCAAGTTAGCAT 47050244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGGTTCTGTAACATAGACTAGCTGACTTGCCTCACTGATTTCTCTTATCAAGTTAGCAT 540

 47050245 TGCCAAATTCTATAGCTGATAGGCAATGGGAAGAAAACATTTCAGGGCTTTAGGCTTCCT 47050304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCCAAATTCTATAGCTGATAGGCAATGGGAAGAAAACATTTCAGGGCTTTAGGCTTCCT 600

 47050305 CTGAATTTCACAAGGAAACAAAGAACAAATCCAGGGATTGTTAGGTCAGGAGACAAAATC 47050364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAATTTCACAAGGAAACAAAGAACAAATCCAGGGATTGTTAGGTCAGGAGACAAAATC 660

 47050365 ATGCCATAGGAATATATATCTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTGAGACAAGGTCTGGCTGT 47050424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGCCATAGGAATATATATCTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTGAGACAAGGTCTGGCTGT 720

 47050425 GTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTAATCTTGGCTCACTGTAACCTCTCCCTCCCGGG 47050484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGTAATCTTGGCTCACTGTAACCTCTCCCTCCCGGG 780

 47050485 CTCAAGCCGTCTTCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCAGGCCACCA 47050544
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      781 CTCAAGCCGTCTTCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCTCAGGCCACCA 840

 47050545 TGCCCAGCTAATTTTCATATTTTTTTTTTTTGGTAGAGACGGGATTTCACTATGTTGCCC 47050604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCCCAGCTAATTTTCATATTTTTTTTTTTTGGTAGAGACGGGATTTCACTATGTTGCCC 900

 47050605 AAGCTGATCTCAAACTCCTAGGCACAAGCAATTCATCTGCCTCGGGCTCCCAAAATGCTG 47050664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGCTGATCTCAAACTCCTAGGCACAAGCAATTCATCTGCCTCGGGCTCCCAAAATGCTG 960

 47050665 GGATTACAAGTGTGAGCCACTGCACCCAGCCACAGAAATATATCTTTAGAGCCTGGTGAC 47050724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGATTACAAGTGTGAGCCACTGCACCCAGCCACAGAAATATATCTTTAGAGCCTGGTGAC 1020

 47050725 TTTGTGCAAAACAAAACTGCAGTTAGCCAACCTGTTAGTGGAAAATATGCCCCAAAAGTC 47050784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTGCAAAACAAAACTGCAGTTAGCCAACCTGTTAGTGGAAAATATGCCCCAAAAGTC 1080

 47050785 TTCTCCTCCCAGCTTGCCCCTTTCCAACTCAGAATATATTTTTTCCTTCTGTTTATAGAA 47050844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTCCTCCCAGCTTGCCCCTTTCCAACTCAGAATATATTTTTTCCTTCTGTTTATAGAA 1140

 47050845 GCAACACAAGGTTACTTTAAATCATAATTTTGGCCAGGCATGGTGGCTCACTCCTGTAAT 47050904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAACACAAGGTTACTTTAAATCATAATTTTGGCCAGGCATGGTGGCTCACTCCTGTAAT 1200

 47050905 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGT 47050964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGT 1260

 47050965 CTAGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCATGG 47051024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCATGG 1320

 47051025 TGGTGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTAAGAAGCTGAGGCAGCAGAATCTCTTGAACCT 47051084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGTGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTTAAGAAGCTGAGGCAGCAGAATCTCTTGAACCT 1380

 47051085 GAGAGGTGGAAGTTGCAGTGAGCCAAGATACAAGATTGTGCCACTGCGCTCCAGCCTGGG 47051144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGAGGTGGAAGTTGCAGTGAGCCAAGATACAAGATTGTGCCACTGCGCTCCAGCCTGGG 1440

 47051145 CGACAGAGTGAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAATCATAATTTCATAATTTTTCCCA 47051204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGACAGAGTGAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAATCATAATTTCATAATTTTTCCCA 1500

 47051205 AGATGTTTTGGATCTTTGGTCTTATATATTCTGTGGAGGCCAATTCATATGCTGTGTTTG 47051264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGATGTTTTGGATCTTTGGTCTTATATATTCTGTGGAGGCCAATTCATATGCTGTGTTTG 1560

 47051265 AATCACCTTAGTGTGGCCAGTTTGTGCTGCATAGTTGGATGTGATCTGCTCTCCTGTTTT 47051324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATCACCTTAGTGTGGCCAGTTTGTGCTGCATAGTTGGATGTGATCTGCTCTCCTGTTTT 1620

 47051325 ACTTCTTGGCAGATATATTTAGGATTCCTTGAAAAAAAAAAAGGCTGGGCACAGTGGCTC 47051384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     1621 ACTTCTTGGCAGATATATTTAGGATTCCTTGAAAAAAAAAA-GGCTGGGCACAGTGGCTC 1679

 47051385 ACACCTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAAACAGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGAGT 47051444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ACACCTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAAACAGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGAGT 1739

 47051445 TCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGGCCTCGTCTCTACTGGAAAAAAAAAAAAAAAG 47051504
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     1740 TCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGGCCTCGTCTCTACTGGAAAAAAAAAAAAAA-G 1798

 47051505 AAAGAAAGGAAGAAAGAAAGAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAG 47051564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AAAGAAAGGAAGAAAGAAAGAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAG 1858

 47051565 CTACACAGGCGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAACTAGGAATTTGAAGCTGCAGTGAG 47051624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTACACAGGCGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAACTAGGAATTTGAAGCTGCAGTGAG 1918

 47051625 CTATGATCGTACTACTGTACTCCAGCCTTGGTAACAGAATAAGACCCTGCCTCAAAACAA 47051684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTATGATCGTACTACTGTACTCCAGCCTTGGTAACAGAATAAGACCCTGCCTCAAAACAA 1978

 47051685 AACAAAACAAAACAAAAAAAACCTATCAGAAGACAAGTTCAATTCCAATTCTAACAGAAG 47051744
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AACAAAACAAAACAAAAAAAAACTATCAGAAGACAAGTTCAATTCCAATTCTAACAGAAG 2038

 47051745 ATAATCCACTCTAATGAGCTGGCCTGGTTTTAGAAAGAAAAAAAGGAGACAGGAGAATGG 47051804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ATAATCCACTCTAATGAGCTGGCCTGGTTTTAGAAAGAAAAAAAGGAGACAGGAGAATGG 2098

 47051805 CCTAGGAAGACTCAACTGCCATCATCCAGTTAAACAGTGCAGGTCAAGATTCACTGGCCG 47051864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CCTAGGAAGACTCAACTGCCATCATCCAGTTAAACAGTGCAGGTCAAGATTCACTGGCCG 2158

 47051865 TTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGGAGCACCTGGAGGACATAGAGTGCTGTTGGAGTTTTG 47051924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGGAGCACCTGGAGGACATAGAGTGCTGTTGGAGTTTTG 2218

 47051925 AAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAAGAATGAGCTGGAATATTTTAATTTGGTCCTCTTGCC 47051984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAAGAATGAGCTGGAATATTTTAATTTGGTCCTCTTGCC 2278

 47051985 CATGTCTTTATTACTTCTATATGTGGAATGTGAATAGCTATTTATATATAGATCCAGTAT 47052044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CATGTCTTTATTACTTCTATATGTGGAATGTGAATAGCTATTTATATATAGATCCAGTAT 2338

 47052045 GGTTACAGTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGTACTTG 47052104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GGTTACAGTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTTTAACTTTTAAGTTCAGGGGTACTTG 2398

 47052105 TGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTTGTGGGGGTTTGTGGTACAGATTATTTCAT 47052164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTTGTGGGGGTTTGTGGTACAGATTATTTCAT 2458

 47052165 CACTCAGGTATTAAGCCTAGTACCCATTAGTTGTTTTCCCTGATCTTTTCCCTCTTCCCA 47052224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CACTCAGGTATTAAGCCTAGTACCCATTAGTTGTTTTCCCTGATCTTTTCCCTCTTCCCA 2518

 47052225 TCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCAGTGTGTGTTGTTCCCCTCTATGCATCCGTGTGTTCT 47052284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCAGTGTGTGTTGTTCCCCTCTATGCATCCGTGTGTTCT 2578

 47052285 CATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGCAGAATTTGGCTTTCTCTTCCTGCAT 47052344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGCAGAATTTGGCTTTCTCTTCCTGCAT 2638

 47052345 TAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTACATGAATGTTCCTGCAGAGGACATGATCTC 47052404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTACATGAATGTTCCTGCAGAGGACATGATCTC 2698

 47052405 ATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTATTCCATAGTGTGTATGTACCACATTTTCTTCATCCC 47052464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTATTCCATAGTGTGTATGTACCACATTTTCTTCATCCC 2758

 47052465 GTCTATCACTGATGGGACAGTGTGAGGAATCCTCAAAGATCTAAAGTCAGAAATACCATT 47052524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GTCTATCACTGATGGGACAGTGTGAGGAATCCTCAAAGATCTAAAGTCAGAAATACCATT 2818

 47052525 CGACCCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAA 47052584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CGACCCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAA 2878

 47052585 AGATGTGTGGTTACATTTATATTTAATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTATTGCCCACT 47052644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AGATGTGTGGTTACATTTATATTTAATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTATTGCCCACT 2938

 47052645 TCACCAGAATAATTTAAATCAATTCTTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAATTAAGATG 47052704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TCACCAGAATAATTTAAATCAATTCTTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAATTAAGATG 2998

 47052705 TTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGA 47052764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGA 3058

 47052765 AAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTAC 47052824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTAC 3118

 47052825 TAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTC 47052884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTC 3178

 47052885 TGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTG 47052944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTG 3238

 47052945 GAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGA 47053004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGA 3298

 47053005 TGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACG 47053064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACG 3358

 47053065 AGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTC 47053124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTC 3418

 47053125 TGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGG 47053184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGG 3478

 47053185 CTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCAT 47053244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCAT 3538

 47053245 CTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-AAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTA 47053303
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CTCTTTTTTTTTTTTTTTTT--AAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTA 3596

 47053304 AATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAA 47053363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAA 3656

 47053364 GGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAA 47053423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAA 3716

 47053424 GCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGG 47053483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGG 3776

 47053484 AAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACA 47053543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 AAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACA 3836

 47053544 TTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCAC 47053603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCAC 3896

 47053604 TCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGC 47053663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGC 3956

 47053664 AACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTC 47053723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTC 4016

 47053724 AATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATT 47053783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 AATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATT 4076

 47053784 GTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAAT 47053843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAAT 4136

 47053844 TTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGA 47053903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGA 4196

 47053904 TGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAG 47053963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAG 4256

 47053964 TGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAAC 47054023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 TGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAAC 4316

 47054024 ATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTA 47054083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 ATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTA 4376

 47054084 AGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCAT 47054143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 AGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCAT 4436

 47054144 GTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATA 47054203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 GTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATA 4496

 47054204 ATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCC 47054263
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 ATCCATAGGGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCC 4556

 47054264 CTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGA 47054323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 CTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGA 4616

 47054324 GGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCT 47054383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 GGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCT 4676

 47054384 CTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATA 47054443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 CTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATA 4736

 47054444 GTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATG 47054503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 GTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATG 4796

 47054504 TATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAA 47054563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAA 4856

 47054564 ATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCC 47054623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 ATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCC 4916

 47054624 ATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTT 47054683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 ATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTT 4976

 47054684 GCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACAC 47054743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACAC 5036

 47054744 TCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTT 47054803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     5037 TCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTT 5095

 47054804 TAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTA 47054863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 TAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTA 5155

 47054864 TCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTT 47054923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 TCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTT 5215

 47054924 CTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTT 47054983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 CTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTT 5275

 47054984 CTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGT 47055043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 CTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGT 5335

 47055044 TAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGA 47055103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 TAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGA 5395

 47055104 CCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTC 47055163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 CCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTC 5455

 47055164 TGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATC 47055223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 TGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATC 5515

 47055224 TATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATC 47055283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 TATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATC 5575

 47055284 CTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCC 47055343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 CTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCC 5635

 47055344 AACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTG 47055403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 AACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTG 5695

 47055404 AATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTG 47055463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 AATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTG 5755

 47055464 AACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAG 47055523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 AACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAG 5815

 47055524 TCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACAT 47055583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 TCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACAT 5875

 47055584 GGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAA 47055643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 GGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAA 5935

 47055644 GTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTAC 47055703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 GTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTAC 5995

 47055704 CAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGG 47055763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 CAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGG 6055

 47055764 TTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTT 47055823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 TTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTT 6115

 47055824 CCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTG 47055883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6116 CCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTG 6175

 47055884 ACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCT 47055943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6176 ACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCT 6235

 47055944 TGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATT 47056003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6236 TGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATT 6295

 47056004 AAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTT 47056063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6296 AAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTT 6355

 47056064 TTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAA 47056123
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6356 TTTTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAA 6414

 47056124 TTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGC 47056183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 TTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGC 6474

 47056184 TGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGT 47056243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 TGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGT 6534

 47056244 TTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAG 47056303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 TTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAG 6594

 47056304 CCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTT 47056363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 CCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTT 6654

 47056364 CTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGA 47056423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 CTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGA 6714

 47056424 TATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGC 47056483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 TATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGC 6774

 47056484 ATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGA 47056543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 ATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGA 6834

 47056544 CTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTC 47056603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 CTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTC 6894

 47056604 CTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTT 47056663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6895 CTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTT 6954

 47056664 TTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTC 47056723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 TTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTC 7014

 47056724 CTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCT 47056783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7015 CTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCT 7074

 47056784 ATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTT 47056843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7075 ATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTT 7134

 47056844 GGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGT 47056903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7135 GGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGT 7194

 47056904 TTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTA 47056963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7195 TTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTA 7254

 47056964 CTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACAT 47057023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7255 CTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACAT 7314

 47057024 GGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCT 47057083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7315 GGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCT 7374

 47057084 ATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGAT 47057143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7375 ATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGAT 7434

 47057144 TTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGT 47057203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7435 TTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGT 7494

 47057204 GTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGT 47057263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7495 GTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGT 7554

 47057264 AGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAA 47057323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7555 AGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAA 7614

 47057324 AATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAA 47057383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7615 AATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAA 7674

 47057384 ATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACA 47057443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7675 ATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACA 7734

 47057444 CAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGA 47057503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7735 CAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGA 7794

 47057504 AAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGAT 47057563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7795 AAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGAT 7854

 47057564 GTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||
     7855 GTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 7879

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7902 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 7961

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7962 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 8021

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8022 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 8081

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8082 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 8139

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8140 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 8199

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8200 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 8259

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGA 47064108
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8260 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGA 8296

Alignment time is 12.5297 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8144] =>      8144 nucs 'mol-32-3101-253488_8144'

Score:        8021
Aligned:      8135        nucs
Identic:      8114 (100%) nucs =>      1854 (100%)      6260 (100%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055732,47057588] EXCISED REGION [47063712,47069984]
 second seq =>  [       1,    1855] EXCISED REGION [    1878,    8144]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [1856,1877]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055732 AATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAA 47055791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAA 60

 47055792 CACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTT 47055851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTT 120

 47055852 TATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTA 47055911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTA 180

 47055912 GCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCC 47055971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCC 240

 47055972 TTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTT 47056031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTT 300

 47056032 TCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTT 47056091
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
      301 TCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGTGTT 358

 47056092 GCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCG 47056151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCG 418

 47056152 AGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGT 47056211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 AGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGT 478

 47056212 CGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAA 47056271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 CGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAA 538

 47056272 ACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 47056331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 ACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAT 598

 47056332 GAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCT 47056391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 GAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCT 658

 47056392 GCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTT 47056451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTT 718

 47056452 TTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCA 47056511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCA 778

 47056512 CCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGG 47056571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGG 838

 47056572 TCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGT 47056631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGT 898

 47056632 TAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAAC 47056691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAAC 958

 47056692 TGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAAT 47056751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAAT 1018

 47056752 GAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTA 47056811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTA 1078

 47056812 TCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACA 47056871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACA 1138

 47056872 CTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAA 47056931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAA 1198

 47056932 AATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATG 47056991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 AATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATG 1258

 47056992 AACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACT 47057051
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACT 1318

 47057052 TGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGT 47057111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGT 1378

 47057112 ATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCT 47057171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCT 1438

 47057172 CTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAAC 47057231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAAC 1498

 47057232 TTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTA 47057291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTA 1558

 47057292 CATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACA 47057351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACA 1618

 47057352 GTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTAT 47057411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTAT 1678

 47057412 TGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTC 47057471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTC 1738

 47057472 AACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAAC 47057531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAAC 1798

 47057532 CAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 1855

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 1937

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 1997

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 2057

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 2115

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 2175

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 2235

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 2295

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 2355

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 2415

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 2475

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 2535

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 2595

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 2655

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 2715

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 2775

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 2835

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2836 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 2895

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 2955

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 3015

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 3075

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 3135

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 3195

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 3255

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 3315

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 3375

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 3435

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 3495

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 3555

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 3615

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 3675

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 3735

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 3795

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 3855

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 3915

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 3975

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 4035

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 4095

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 4155

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 4215

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 4275

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 4335

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 4395

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 4455

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 4515

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 4575

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 4635

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 4695

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 4755

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 4815

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 4875

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 4935

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4936 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 4995

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4996 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 5055

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5056 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 5115

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5116 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 5175

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5176 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 5235

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5236 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 5295

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5296 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 5355

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5356 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 5415

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5416 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 5475

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 5535

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 5595

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 5655

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 5715

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 5775

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5776 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 5835

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 5895

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5896 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 5955

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAG-AAAAAAAAAAAAAAAAA 47067850
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     5956 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6015

 47067851 ACTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAA 47067910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6016 ACTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAA 6075

 47067911 ATCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATT 47067970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6076 ATCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATT 6135

 47067971 CTGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTG 47068030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6136 CTGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTG 6195

 47068031 AAAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAAT 47068090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6196 AAAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAAT 6255

 47068091 AAATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTT 47068150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6256 AAATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTCAGTT 6315

 47068151 CTACCCAAAGCAATCTACTGATTCAACACAATTTTCTTTTCTTTTCTTTTATCTTCTTTT 47068210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||     
     6316 CTACCCAAAGCAATCTACTGATTCAACACAATTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTCTT----- 6370

 47068211 C--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGCCACCCAGGCTGGA 47068268
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6371 -TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGCCACCCAGGCTGGA 6429

 47068269 GTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCC 47068328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 GTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCC 6489

 47068329 TGCTCAGAATCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCACCACCATGCCCGACTAATTTTT 47068388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 TGCTCAGAATCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCACCACCATGCCCGACTAATTTTT 6549

 47068389 GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTTGATTGAACACAATT 47068448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6550 GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTTGATTGAACACAATT 6609

 47068449 TCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAG 47068508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6610 TCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAG 6669

 47068509 TGGCTCAATCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGGTTCTTCTGCCTC 47068568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6670 TGGCTCAATCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGGTTCTTCTGCCTC 6729

 47068569 AGCCTCCAGAAAAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATT 47068628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6730 AGCCTCCAGAAAAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATT 6789

 47068629 TTTAGTAGATACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGG 47068688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6790 TTTAGTAGATACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGG 6849

 47068689 TGATCTGCCCGCGTCAACCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGAGCCACCGCACCTG 47068748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6850 TGATCTGCCCGCGTCAACCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGAGCCACCGCACCTG 6909

 47068749 GCGATTCAACAAAATTTCTATCAAAATAAATAGGCTTTTTCACTGAGAGAAGAAGCTAAT 47068808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6910 GCGATTCAACAAAATTTCTATCAAAATAAATAGGCTTTTTCACTGAGAGAAGAAGCTAAT 6969

 47068809 CCTCAAAATCATATGGAATAGCCAGGACAATCTTGAAAAAAGAATATAAAATTGGAAAGT 47068868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6970 CCTCAAAATCATATGGAATAGCCAGGACAATCTTGAAAAAAGAATATAAAATTGGAAAGT 7029

 47068869 TCAAACTTCCCAACTATAAAACTAGCTATGAAGCCACAGTAATTCAAGTATTATGGTCCT 47068928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7030 TCAAACTTCCCAACTATAAAACTAGCTATGAAGCCACAGTAATTCAAGTATTATGGTCCT 7089

 47068929 GGCATAAGGACAAACATATAGACCACTGGAATAGATTAGGAAGC--CCAGAAATAAATCT 47068986
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||
     7090 GGCATAAGGACAAACATATAGACCACTGGAATAGATTAGGA---GGCCAGAAATAAATCT 7146

 47068987 TTACATATATGGTCATTTGATTTCCTGCAAAGGTGCAATTCAATAGGGAAAGGACAGTCT 47069046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 TTACATATATGGTCATTTGATTTCCTGCAAAGGTGCAATTCAATAGGGAAAGGACAGTCT 7206

 47069047 TTTCAACCAATGGTGCTGGGAAAACTGGATATCCACGTGTGAAAGAATGAAATTGGACTA 47069106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 TTTCAACCAATGGTGCTGGGAAAACTGGATATCCACGTGTGAAAGAATGAAATTGGACTA 7266

 47069107 CAACACTCTTAGAAGAAAACAGGGGACAGTTTTCATAACATTAAATTTAGCAATTATTTC 47069166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 CAACACTCTTAGAAGAAAACAGGGGACAGTTTTCATAACATTAAATTTAGCAATTATTTC 7326

 47069167 ATGGATATAACACCAAAAGCATAAGGAACAAAAAATATAGATAAATTGGACTTCATCAAA 47069226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 ATGGATATAACACCAAAAGCATAAGGAACAAAAAATATAGATAAATTGGACTTCATCAAA 7386

 47069227 ATTAAGAACTTTTGTGCATCAAAGGATACTATCATGAAAGTGAAAGGACAACCTACACAA 47069286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 ATTAAGAACTTTTGTGCATCAAAGGATACTATCATGAAAGTGAAAGGACAACCTACACAA 7446

 47069287 TAGAAGAAAATATTTGCAAATCATATATCCAATAAGGAATTAATATCCAGAATATGTAAA 47069346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 TAGAAGAAAATATTTGCAAATCATATATCCAATAAGGAATTAATATCCAGAATATGTAAA 7506

 47069347 GAACTCCTGCAACTCAACAACAACAAAACAACCCAATTTAAAAATGGGCAAAGGACTTGA 47069406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 GAACTCCTGCAACTCAACAACAACAAAACAACCCAATTTAAAAATGGGCAAAGGACTTGA 7566

 47069407 AGAGACATTTCTCCAAAGAAGATATCCAAATGGCCAACACATGAAAAGATGCTCAACATC 47069466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 AGAGACATTTCTCCAAAGAAGATATCCAAATGGCCAACACATGAAAAGATGCTCAACATC 7626

 47069467 ATTAGTCATTGGTAAAATGCAAATCAAAACAACAATAAGATGCCACTTCACATCTTCTAG 47069526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 ATTAGTCATTGGTAAAATGCAAATCAAAACAACAATAAGATGCCACTTCACATCTTCTAG 7686

 47069527 GTTGGCTGTTTTTTAAAAAGGAAAATAGCATGTGTTGCTGAGGAGGTGGACAAATTGGAG 47069586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 GTTGGCTGTTTTTTAAAAAGGAAAATAGCATGTGTTGCTGAGGAGGTGGACAAATTGGAG 7746

 47069587 CCCTTGTGCATTGCTAGTGAGAATGTAAAATAGTACAGCTGCTCTGGAAAACAGTTCGGT 47069646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 CCCTTGTGCATTGCTAGTGAGAATGTAAAATAGTACAGCTGCTCTGGAAAACAGTTCGGT 7806

 47069647 TGTTTCTCAAAAGGTTAAACCTATAACTACCATATGACCCAGCAATTGCACTTGTAGGTA 47069706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 TGTTTCTCAAAAGGTTAAACCTATAACTACCATATGACCCAGCAATTGCACTTGTAGGTA 7866

 47069707 TACATCTAAAAGAATTAAAGAAGGAACTGAAACAGATACTTGTATACAAATCATAGCAGC 47069766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 TACATCTAAAAGAATTAAAGAAGGAACTGAAACAGATACTTGTATACAAATCATAGCAGC 7926

 47069767 ATTATTCACAATAGCCAAAAGGTGGAAGTAACCCAAGGGTCCATCAACAGATCAATGGAT 47069826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 ATTATTCACAATAGCCAAAAGGTGGAAGTAACCCAAGGGTCCATCAACAGATCAATGGAT 7986

 47069827 AAACAATAGATGGTACATACATACAAAGGAATATTATTCTGCTTTAAAAAGAAAATAAAT 47069886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7987 AAACAATAGATGGTACATACATACAAAGGAATATTATTCTGCTTTAAAAAGAAAATAAAT 8046

 47069887 TTATGGCCCTGCAGTGGCTTACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAAGGTACGGTTGAAG 47069946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8047 TTATGGCCCTGCAGTGGCTTACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAAGGTACGGTTGAAG 8106

 47069947 GATCATTTAAGGCCAGGAGTTCAAGGCTTGAGACCAGC 47069984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8107 GATCATTTAAGGCCAGGAGTTCAAGGCTTGAGACCAGC 8144

Alignment time is 12.437 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5642] =>      5642 nucs 'mol-32-317a-041748_5642'

Score:        5556
Aligned:      5624        nucs
Identic:      5617 (100%) nucs =>      4518 (100%)      1099 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47053067,47057588] EXCISED REGION [47063712,47064813]
 second seq =>  [       1,    4520] EXCISED REGION [    4543,    5642]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [4521,4542]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47053067 ACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTG 47053126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTG 60

 47053127 AGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCT 47053186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCT 120

 47053187 ACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCT 47053246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCT 180

 47053247 CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAAT 47053306
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAAT 240

 47053307 ATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGG 47053366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGG 300

 47053367 GAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCT 47053426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCT 360

 47053427 GAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAG 47053486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAG 420

 47053487 CATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTT 47053546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTT 480

 47053547 TTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCA 47053606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCA 540

 47053607 GATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAAC 47053666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAAC 600

 47053667 ACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAAT 47053726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAAT 660

 47053727 ATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTC 47053786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTC 720

 47053787 AAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTT 47053846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTT 780

 47053847 TTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGC 47053906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGC 840

 47053907 AAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGT 47053966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGT 900

 47053967 ATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATA 47054026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATA 960

 47054027 TTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGG 47054086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGG 1020

 47054087 TTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTC 47054146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTC 1080

 47054147 ACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATC 47054206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATC 1140

 47054207 CATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTG 47054266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTG 1200

 47054267 TGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGA 47054326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGA 1260

 47054327 AATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTT 47054386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTT 1320

 47054387 CACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTC 47054446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTC 1380

 47054447 TACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTAT 47054506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTAT 1440

 47054507 TTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATC 47054566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATC 1500

 47054567 AAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATC 47054626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATC 1560

 47054627 TTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCT 47054686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCT 1620

 47054687 GTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCG 47054746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCG 1680

 47054747 GTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAA 47054806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     1681 GTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAA 1739

 47054807 AAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCA 47054866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCA 1799

 47054867 CTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTG 47054926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTG 1859

 47054927 CCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTA 47054986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTA 1919

 47054987 TTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAA 47055046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAA 1979

 47055047 TTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCC 47055106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCC 2039

 47055107 TTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGT 47055166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGT 2099

 47055167 CGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTAT 47055226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTAT 2159

 47055227 TGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTC 47055286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTC 2219

 47055287 CCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAAC 47055346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAAC 2279

 47055347 AGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAAT 47055406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAAT 2339

 47055407 TAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAAC 47055466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAAC 2399

 47055467 TCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCC 47055526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCC 2459

 47055527 ATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGC 47055586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGC 2519

 47055587 ACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTA 47055646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTA 2579

 47055647 TAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAG 47055706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAG 2639

 47055707 CAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTC 47055766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTC 2699

 47055767 TCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCC 47055826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCC 2759

 47055827 TTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACT 47055886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACT 2819

 47055887 GTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGC 47055946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGC 2879

 47055947 ATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAA 47056006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAA 2939

 47056007 AAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTT 47056066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTT 2999

 47056067 TTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTC 47056126
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTC 3058

 47056127 ACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGG 47056186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGG 3118

 47056187 GACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTT 47056246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTT 3178

 47056247 TCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCT 47056306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCT 3238

 47056307 TCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTT 47056366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTT 3298

 47056367 AATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATAT 47056426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATAT 3358

 47056427 CCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATT 47056486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATT 3418

 47056487 AAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTT 47056546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTT 3478

 47056547 CACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTA 47056606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTA 3538

 47056607 TAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTA 47056666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTA 3598

 47056667 TGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTT 47056726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTT 3658

 47056727 ACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATG 47056786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 ACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATG 3718

 47056787 ATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGG 47056846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 ATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGG 3778

 47056847 AGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTA 47056906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTA 3838

 47056907 TGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTG 47056966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTG 3898

 47056967 TGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGT 47057026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3899 TGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGT 3958

 47057027 GTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATG 47057086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATG 4018

 47057087 AATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTA 47057146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTA 4078

 47057147 ATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTG 47057206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 ATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTG 4138

 47057207 TGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGT 47057266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGT 4198

 47057267 AAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAAT 47057326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAAT 4258

 47057327 TTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATC 47057386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATC 4318

 47057387 CCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAG 47057446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAG 4378

 47057447 TTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAA 47057506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAA 4438

 47057507 AAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTT 47057566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTT 4498

 47057567 AGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||
     4499 AGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 4520

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 4602

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 4662

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 4722

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 4780

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 4840

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 4900

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 4960

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 5020

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 5080

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 5140

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 5200

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 5260

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 5320

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 5380

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 5440

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 5500

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5501 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 5560

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 5620

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTA 47064813
          ||||||||||||||||||||||
     5621 TTACATAAAACCTGGAGGTTTA 5642

Alignment time is 8.58916 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4393] =>      4393 nucs 'mol-32-321f-099233_4393'

Score:        4328
Aligned:      4374        nucs
Identic:      4369 (100%) nucs =>       143 (100%)      4226 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47057446,47057588] EXCISED REGION [47063712,47067942]
 second seq =>  [       1,     143] EXCISED REGION [     166,    4393]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [144,165]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47057446 GTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAA 47057505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAA 60

 47057506 AAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGT 47057565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGT 120

 47057566 TAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||
      121 TAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 143

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      166 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 225

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      226 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 285

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      286 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 345

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      346 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 404

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      405 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 464

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 524

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 584

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 644

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 704

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 764

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 824

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 884

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 944

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 1004

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 1064

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 1124

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1125 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 1184

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 1244

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 1304

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 1364

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 1424

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 1484

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 1544

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 1604

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 1664

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 1724

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 1784

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 1844

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 1904

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 1964

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 2024

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 2084

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 2144

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 2204

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 2264

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 2324

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 2384

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 2444

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 2504

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 2564

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 2624

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 2684

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 2744

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 2804

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 2864

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 2924

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 2984

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 3044

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 3104

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGTGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 3164

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 3224

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 3284

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 3344

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 3404

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 3464

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 3524

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 3584

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 3644

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 3704

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 3764

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 3824

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 3884

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 3944

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 4004

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 4064

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 4124

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 4184

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 4244

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 47067851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
     4245 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAA--AAAAAAAAAAAAAAAAAA 4302

 47067852 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 47067911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 4362

 47067912 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAA 47067942
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAA 4393

Alignment time is 7.10221 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5175] =>      5175 nucs 'mol-32-321f-206813_5175'

Score:        5101
Aligned:      5156        nucs
Identic:      5151 (100%) nucs =>      3992 (100%)      1159 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47053594,47057588] EXCISED REGION [47063712,47064872]
 second seq =>  [       1,    3993] EXCISED REGION [    4016,    5175]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3994,4015]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47053594 TTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAAT 47053653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAAT 60

 47053654 CTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAG 47053713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAG 120

 47053714 TTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAAT 47053773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAAT 180

 47053774 TTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTT 47053833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTT 240

 47053834 ACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCT 47053893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCT 300

 47053894 TCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACA 47053953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACA 360

 47053954 AAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAAT 47054013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAAT 420

 47054014 TAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATT 47054073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATT 480

 47054074 ATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTT 47054133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTT 540

 47054134 TAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTG 47054193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTG 600

 47054194 TGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAAC 47054253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAAC 660

 47054254 ATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATA 47054313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATA 720

 47054314 AGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCC 47054373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCC 780

 47054374 GACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTA 47054433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTA 840

 47054434 ACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATAC 47054493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATAC 900

 47054494 CTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGT 47054553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGT 960

 47054554 TATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGAT 47054613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGAT 1020

 47054614 AAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGG 47054673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGG 1080

 47054674 AGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAG 47054733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAG 1140

 47054734 GCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTT 47054793
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     1141 GCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTT 1199

 47054794 TTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTC 47054853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTC 1259

 47054854 AGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGT 47054913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGT 1319

 47054914 TGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCT 47054973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCT 1379

 47054974 TCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGT 47055033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGT 1439

 47055034 TGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCA 47055093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCA 1499

 47055094 TATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCT 47055153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCT 1559

 47055154 TGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCC 47055213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCC 1619

 47055214 AGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAA 47055273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAA 1679

 47055274 TGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGAC 47055333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGAC 1739

 47055334 AGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGAC 47055393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGAC 1799

 47055394 TTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACC 47055453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACC 1859

 47055454 TTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTT 47055513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTT 1919

 47055514 TAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATAT 47055573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATAT 1979

 47055574 CTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCT 47055633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCT 2039

 47055634 AGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGC 47055693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGC 2099

 47055694 AGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCA 47055753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCA 2159

 47055754 GAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTA 47055813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTA 2219

 47055814 TTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAAT 47055873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAAT 2279

 47055874 CATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAA 47055933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAA 2339

 47055934 TCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAG 47055993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAG 2399

 47055994 CATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCT 47056053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCT 2459

 47056054 TCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGC 47056113
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGC 2518

 47056114 ATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCT 47056173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCT 2578

 47056174 CTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTA 47056233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTA 2638

 47056234 GAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCT 47056293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCT 2698

 47056294 CCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCT 47056353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCT 2758

 47056354 CAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTA 47056413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTA 2818

 47056414 CTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATC 47056473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATC 2878

 47056474 CTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGT 47056533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGT 2938

 47056534 CATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAA 47056593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAA 2998

 47056594 TCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAG 47056653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAG 3058

 47056654 TGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTT 47056713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTT 3118

 47056714 TATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAG 47056773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAG 3178

 47056774 ATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTC 47056833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTC 3238

 47056834 TCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGT 47056893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGT 3298

 47056894 TATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGA 47056953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGA 3358

 47056954 TCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATT 47057013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3359 TCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATT 3418

 47057014 AGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACA 47057073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACA 3478

 47057074 GGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATA 47057133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATA 3538

 47057134 CAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATG 47057193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATG 3598

 47057194 TATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTAT 47057253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTAT 3658

 47057254 ATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACA 47057313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 ATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACA 3718

 47057314 TACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTA 47057373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTA 3778

 47057374 AATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAG 47057433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAG 3838

 47057434 TAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGC 47057493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGC 3898

 47057494 TCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTA 47057553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTA 3958

 47057554 TCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 3993

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 4075

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 4135

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 4195

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 4254

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 4314

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 4374

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 4434

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 4494

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 4554

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 4614

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 4674

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 4734

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 4794

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 4854

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 4914

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 4974

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4975 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 5034

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5035 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 5094

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 5154

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAA 47064872
          |||||||||||||||||||||
     5155 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAA 5175

Alignment time is 7.91412 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3723] =>      3723 nucs 'mol-32-322a-203294_3723'

Score:        3660
Aligned:      3704        nucs
Identic:      3700 (100%) nucs =>      3377 (100%)       323 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054209,47057588] EXCISED REGION [47063712,47064035]
 second seq =>  [       1,    3378] EXCISED REGION [    3401,    3723]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3379,3400]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47054209 TAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTG 47054268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTG 60

 47054269 AATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAA 47054328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAA 120

 47054329 TAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCA 47054388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCA 180

 47054389 CTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTA 47054448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTA 240

 47054449 CTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTT 47054508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTT 300

 47054509 TATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAA 47054568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAA 360

 47054569 AAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTT 47054628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTT 420

 47054629 TTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGT 47054688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGT 480

 47054689 CTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGT 47054748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGT 540

 47054749 GTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAA 47054808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
      541 GTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAA 599

 47054809 ATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACT 47054868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACT 659

 47054869 GAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCC 47054928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCC 719

 47054929 AGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATT 47054988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATT 779

 47054989 CCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATT 47055048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATT 839

 47055049 CCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTT 47055108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTT 899

 47055109 CCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCG 47055168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCG 959

 47055169 TAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTG 47055228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTG 1019

 47055229 TTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCC 47055288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCC 1079

 47055289 AGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAG 47055348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAG 1139

 47055349 AGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTA 47055408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTA 1199

 47055409 GAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTC 47055468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTC 1259

 47055469 ATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCAT 47055528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCAT 1319

 47055529 GTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCAC 47055588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCAC 1379

 47055589 ATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATA 47055648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATA 1439

 47055649 ATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCA 47055708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCA 1499

 47055709 AGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTC 47055768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTC 1559

 47055769 ATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTT 47055828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTT 1619

 47055829 CAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGT 47055888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGT 1679

 47055889 GTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCAT 47055948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCAT 1739

 47055949 CTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAA 47056008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAA 1799

 47056009 ACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT 47056068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT 1859

 47056069 TTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCAC 47056128
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 T-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCAC 1918

 47056129 ACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGA 47056188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGA 1978

 47056189 CTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTC 47056248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTC 2038

 47056249 CATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTC 47056308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTC 2098

 47056309 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAA 47056368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAA 2158

 47056369 TGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCC 47056428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCC 2218

 47056429 TGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAA 47056488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAA 2278

 47056489 ATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCA 47056548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 ATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCA 2338

 47056549 CTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATA 47056608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATA 2398

 47056609 AAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATG 47056668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATG 2458

 47056669 CCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTAC 47056728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTAC 2518

 47056729 CTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGAT 47056788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGAT 2578

 47056789 GTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAG 47056848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAG 2638

 47056849 CACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATG 47056908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATG 2698

 47056909 GTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTG 47056968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTG 2758

 47056969 ATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGT 47057028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2759 ATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGT 2818

 47057029 TTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAA 47057088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAA 2878

 47057089 TGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAAT 47057148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAAT 2938

 47057149 ACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTG 47057208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTG 2998

 47057209 TGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAA 47057268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAA 3058

 47057269 ATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTT 47057328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTT 3118

 47057329 TTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCC 47057388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCC 3178

 47057389 TCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTT 47057448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTT 3238

 47057449 CAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAA 47057508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAA 3298

 47057509 ATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAG 47057568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 ATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAG 3358

 47057569 TGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||
     3359 TGAAATGGAGTGAAAAGATA 3378

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 3460

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 3520

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 3580

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 3639

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 3699

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGA 47064035
          ||||||||||||||||||||||||
     3700 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGA 3723

Alignment time is 5.84816 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,   10278] =>     10278 nucs 'mol-32-32f0-002991_10278'

Score:       10181
Aligned:     10260        nucs
Identic:     10252 (100%) nucs =>      6207 (100%)      4045 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47051377,47057588] EXCISED REGION [47063712,47067759]
 second seq =>  [       1,    6209] EXCISED REGION [    6232,   10278]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [6210,6231]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47051377 AGTGGCTCACACCTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAAACAGGAGGATCGCTTGAGC 47051436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGGCTCACACCTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAAACAGGAGGATCGCTTGAGC 60

 47051437 CCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGGCCTCGTCTCTACTGGAAAAAAAA 47051496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGGCCTCGTCTCTACTGGAAAAAAAA 120

 47051497 AAAAAAAGAAAGAAAGGAAGAAAGAAAGAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCACACCTGT 47051556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAAGAAAGAAAGGAAGAAAGAAAGAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCACACCTGT 180

 47051557 AGTCCCAGCTACACAGGCGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAACTAGGAATTTGAAGCT 47051616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTCCCAGCTACACAGGCGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAACTAGGAATTTGAAGCT 240

 47051617 GCAGTGAGCTATGATCGTACTACTGTACTCCAGCCTTGGTAACAGAATAAGACCCTGCCT 47051676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAGTGAGCTATGATCGTACTACTGTACTCCAGCCTTGGTAACAGAATAAGACCCTGCCT 300

 47051677 CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCTATCAGAAGACAAGTTCAATTCCAATTCT 47051736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCTATCAGAAGACAAGTTCAATTCCAATTCT 360

 47051737 AACAGAAGATAATCCACTCTAATGAGCTGGCCTGGTTTTAGAAAGAAAAAAAGGAGACAG 47051796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAGAAGATAATCCACTCTAATGAGCTGGCCTGGTTTTAGAAAGAAAAAAAGGAGACAG 420

 47051797 GAGAATGGCCTAGGAAGACTCAACTGCCATCATCCAGTTAAACAGTGCAGGTCAAGATTC 47051856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAATGGCCTAGGAAGACTCAACTGCCATCATCCAGTTAAACAGTGCAGGTCAAGATTC 480

 47051857 ACTGGCCGTTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGGAGCACCTGGAGGACATAGAGTGCTGTTG 47051916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGGCCGTTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGGAGCACCTGGAGGACATAGAGTGCTGTTG 540

 47051917 GAGTTTTGAAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAAGAATGAGCTGGAATATTTTAATTTGGTC 47051976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGTTTTGAAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAAGAATGAGCTGGAATATTTTAATTTGGTC 600

 47051977 CTCTTGCCCATGTCTTTATTACTTCTATATGTGGAATGTGAATAGCTATTTATATATAGA 47052036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTTGCCCATGTCTTTATTACTTCTATATGTGGAATGTGAATAGCTATTTATATATAGA 660

 47052037 TCCAGTATGGTTACAGTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTTTAACTTTTAAGTTCAGG 47052096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCAGTATGGTTACAGTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTTTAACTTTTAAGTTCAGG 720

 47052097 GGTACTTGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTTGTGGGGGTTTGTGGTACAGAT 47052156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTACTTGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTTGTGGGGGTTTGTGGTACAGAT 780

 47052157 TATTTCATCACTCAGGTATTAAGCCTAGTACCCATTAGTTGTTTTCCCTGATCTTTTCCC 47052216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTTCATCACTCAGGTATTAAGCCTAGTACCCATTAGTTGTTTTCCCTGATCTTTTCCC 840

 47052217 TCTTCCCATCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCAGTGTGTGTTGTTCCCCTCTATGCATCCG 47052276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTCCCATCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCAGTGTGTGTTGTTCCCCTCTATGCATCCG 900

 47052277 TGTGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGCAGAATTTGGCTTTCTCT 47052336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGCAGAATTTGGCTTTCTCT 960

 47052337 TCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTACATGAATGTTCCTGCAGAGGAC 47052396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTACATGAATGTTCCTGCAGAGGAC 1020

 47052397 ATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTATTCCATAGTGTGTATGTACCACATTTTC 47052456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTATTCCATAGTGTGTATGTACCACATTTTC 1080

 47052457 TTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTGAGGAATCCTCAAAGATCTAAAGTCAGAA 47052516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTGAGGAATCCTCAAAGATCTAAAGTCAGAA 1140

 47052517 ATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGGAATATAAATCATTC 47052576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGGAATATAAATCATTC 1200

 47052577 TATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTTAATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTAT 47052636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTTAATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTAT 1260

 47052637 TGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATTCTTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAA 47052696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATTCTTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAA 1320

 47052697 TTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTT 47052756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTT 1380

 47052757 TCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCG 47052816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCG 1440

 47052817 TTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTA 47052876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTA 1500

 47052877 CAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATA 47052936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATA 1560

 47052937 TATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATG 47052996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATG 1620

 47052997 CTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCA 47053056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCA 1680

 47053057 ACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAG 47053116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAG 1740

 47053117 CGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGA 47053176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGA 1800

 47053177 GTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAA 47053236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAA 1860

 47053237 AACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCT 47053296
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCT 1920

 47053297 GAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATAT 47053356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATAT 1980

 47053357 ATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCA 47053416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCA 2040

 47053417 TCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTA 47053476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTA 2100

 47053477 GGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCT 47053536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCT 2160

 47053537 TTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTG 47053596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTG 2220

 47053597 TGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTC 47053656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTC 2280

 47053657 CTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTT 47053716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTT 2340

 47053717 GACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTA 47053776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTA 2400

 47053777 TTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACT 47053836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACT 2460

 47053837 TTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCA 47053896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCA 2520

 47053897 CATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAG 47053956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAG 2580

 47053957 CCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAA 47054016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAA 2640

 47054017 TACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATA 47054076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATA 2700

 47054077 TCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAA 47054136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAA 2760

 47054137 CTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGG 47054196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGG 2820

 47054197 CTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATT 47054256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATT 2880

 47054257 CAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGG 47054316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGG 2940

 47054317 AAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGAC 47054376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGAC 3000

 47054377 CTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACT 47054436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACT 3060

 47054437 ACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTT 47054496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTT 3120

 47054497 GTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTAT 47054556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTAT 3180

 47054557 TAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAA 47054616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAA 3240

 47054617 GACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGT 47054676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGT 3300

 47054677 TGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCA 47054736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCA 3360

 47054737 GGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTC 47054796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     3361 GGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTC 3419

 47054797 ATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGT 47054856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGT 3479

 47054857 GCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGG 47054916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGG 3539

 47054917 AACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCT 47054976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCT 3599

 47054977 TCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGT 47055036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGT 3659

 47055037 CTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATAT 47055096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATAT 3719

 47055097 CTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGA 47055156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGA 3779

 47055157 TTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGC 47055216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGC 3839

 47055217 AGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGG 47055276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGG 3899

 47055277 TGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGT 47055336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGT 3959

 47055337 CCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTA 47055396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTA 4019

 47055397 GGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTT 47055456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 GGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTT 4079

 47055457 GGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAA 47055516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 GGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAA 4139

 47055517 AAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTC 47055576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTC 4199

 47055577 CTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGA 47055636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGA 4259

 47055637 ACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGT 47055696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 ACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGT 4319

 47055697 CCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAA 47055756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 CCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAA 4379

 47055757 AAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTT 47055816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 AAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTT 4439

 47055817 ATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCAT 47055876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCAT 4499

 47055877 AAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCC 47055936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 AAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCC 4559

 47055937 TGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCAT 47055996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCAT 4619

 47055997 CTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCT 47056056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 CTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCT 4679

 47056057 TTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATG 47056116
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATG 4737

 47056117 ATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTT 47056176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 ATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTT 4797

 47056177 TAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAG 47056236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAG 4857

 47056237 ATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCC 47056296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 ATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCC 4917

 47056297 ACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAA 47056356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 ACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAA 4977

 47056357 TAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTT 47056416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 TAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTT 5037

 47056417 CCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTT 47056476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 CCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTT 5097

 47056477 TACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCAT 47056536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCAT 5157

 47056537 ATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCC 47056596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 ATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCC 5217

 47056597 TGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGC 47056656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGC 5277

 47056657 AATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTAT 47056716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 AATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTAT 5337

 47056717 AATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATC 47056776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 AATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATC 5397

 47056777 TCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCT 47056836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCT 5457

 47056837 GTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTAT 47056896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTAT 5517

 47056897 TTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCA 47056956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 TTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCA 5577

 47056957 CTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGC 47057016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5578 CTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGC 5637

 47057017 ATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGA 47057076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 ATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGA 5697

 47057077 GTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAG 47057136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 GTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAG 5757

 47057137 TTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTAT 47057196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 TTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTAT 5817

 47057197 GGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATT 47057256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 GGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATT 5877

 47057257 TTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATAC 47057316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATAC 5937

 47057317 TTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAAT 47057376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAAT 5997

 47057377 TGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAG 47057436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAG 6057

 47057437 ACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCA 47057496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 ACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCA 6117

 47057497 TCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCT 47057556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 TCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCT 6177

 47057557 CTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 CTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 6209

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 6291

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 6351

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 6411

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 6470

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 6530

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 6590

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 6650

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 6710

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 6770

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 6830

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 6890

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 6950

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 7010

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 7070

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 7130

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7131 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 7190

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7191 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 7250

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 7310

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 7370

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 7430

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 7490

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 7550

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 7610

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 7670

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 7730

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 7790

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 7850

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 7910

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 7970

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 8030

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8031 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 8090

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 8150

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8151 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 8210

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8211 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 8270

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8271 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 8330

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8331 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 8390

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8391 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 8450

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8451 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 8510

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8511 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 8570

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8571 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 8630

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8631 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 8690

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8691 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 8750

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8751 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 8810

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8811 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 8870

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8871 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 8930

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8931 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 8990

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8991 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 9050

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9051 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 9110

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9111 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 9170

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9171 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 9230

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9231 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 9290

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9291 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 9350

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9351 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 9410

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9411 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 9470

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9471 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 9530

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9531 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 9590

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9591 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 9650

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9651 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 9710

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9711 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 9770

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9771 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 9830

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9831 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 9890

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9891 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 9950

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9951 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 10010

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10011 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 10070

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
    10071 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCCCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 10130

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10131 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 10190

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10191 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 10250

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAA 47067759
          ||||||||||||||||||||||||||||
    10251 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAA 10278

Alignment time is 15.3503 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4047] =>      4047 nucs 'mol-32-32f0-002991_4047'

Score:        4025
Aligned:      4047        nucs
Identic:      4045 (100%) nucs =>       185 (100%)      3860 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47063896] EXCISED REGION [47063898,47067759]
 second seq =>  [       1,     185] EXCISED REGION [     186,    4047]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47063897,47063897]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47064710,47064710]
 second seq =>         1 nucs [998,998]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [47063897,47063911] to [47063898,47063912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 60

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 120

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 180

 47063892 TTCTG 47063896
          |||||
      181 TTCTG 185

EXCISED REGION

 47063898 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 47063957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 245

 47063958 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 47064017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 305

 47064018 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 47064077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 365

 47064078 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 47064137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 425

 47064138 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 47064197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 485

 47064198 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 47064257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 545

 47064258 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 47064317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 605

 47064318 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 47064377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 665

 47064378 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 47064437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 725

 47064438 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 47064497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 785

 47064498 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 47064557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 845

 47064558 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 47064617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 905

 47064618 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 47064677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 965

 47064678 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 47064737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      966 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 1025

 47064738 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 47064797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 1085

 47064798 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 47064857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 1145

 47064858 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 47064917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 1205

 47064918 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 47064977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 1265

 47064978 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 47065037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 1325

 47065038 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 47065097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 1385

 47065098 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 47065157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 1445

 47065158 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 47065217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 1505

 47065218 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 47065277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 1565

 47065278 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 47065337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 1625

 47065338 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 47065397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 1685

 47065398 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 47065457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 1745

 47065458 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 47065517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 1805

 47065518 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 47065577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 1865

 47065578 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 47065637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 1925

 47065638 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 47065697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 1985

 47065698 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 47065757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 2045

 47065758 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 47065817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 2105

 47065818 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 47065877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 2165

 47065878 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 47065937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 2225

 47065938 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 47065997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 2285

 47065998 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 47066057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 2345

 47066058 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 47066117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 2405

 47066118 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 47066177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 2465

 47066178 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 47066237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 2525

 47066238 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 47066297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 2585

 47066298 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 47066357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 2645

 47066358 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 47066417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 2705

 47066418 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 47066477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 2765

 47066478 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 47066537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 2825

 47066538 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 47066597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 2885

 47066598 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 47066657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 2945

 47066658 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 47066717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 3005

 47066718 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 47066777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 3065

 47066778 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 47066837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 3125

 47066838 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 47066897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 3185

 47066898 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 47066957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 3245

 47066958 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 47067017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 3305

 47067018 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 47067077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 3365

 47067078 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 47067137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 3425

 47067138 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 47067197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 3485

 47067198 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 47067257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 3545

 47067258 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 47067317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 3605

 47067318 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 47067377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 3665

 47067378 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTA 47067437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTA 3725

 47067438 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACC 47067497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACC 3785

 47067498 TGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTT 47067557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTT 3845

 47067558 GTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 47067617
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 GTACTCCTGACTTCATGATGCCCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 3905

 47067618 GAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTGTCCTGT 47067677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 GAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTGTCCTGT 3965

 47067678 AGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCAAAAGAA 47067737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 AGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCAAAAGAA 4025

 47067738 ATAAATGACATCCAAATTGGAA 47067759
          ||||||||||||||||||||||
     4026 ATAAATGACATCCAAATTGGAA 4047

Alignment time is 6.59438 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8536] =>      8536 nucs 'mol-32-33a0-192815_8536'

Score:        8428
Aligned:      8518        nucs
Identic:      8509 (100%) nucs =>      4671 (100%)      3838 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47052911,47057588] EXCISED REGION [47063712,47067551]
 second seq =>  [       1,    4675] EXCISED REGION [    4698,    8536]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [4676,4697]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47052911 ACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCAT 47052970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCAT 60

 47052971 GGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGC 47053030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGC 120

 47053031 TCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAA 47053090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAA 180

 47053091 TAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 47053150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGA 240

 47053151 GGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACT 47053210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACT 300

 47053211 GCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAA 47053270
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      301 GCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAA 360

 47053271 GAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGG 47053330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGG 420

 47053331 ATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACA 47053390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACA 480

 47053391 CAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAAC 47053450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAAC 540

 47053451 TGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTA 47053510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTA 600

 47053511 GCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCT 47053570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCT 660

 47053571 GGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCC 47053630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCC 720

 47053631 CAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATC 47053690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATC 780

 47053691 AATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTA 47053750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTA 840

 47053751 ATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGT 47053810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGT 900

 47053811 ACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTT 47053870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTT 960

 47053871 TACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATC 47053930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATC 1020

 47053931 ACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTT 47053990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTT 1080

 47053991 CTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCAT 47054050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCAT 1140

 47054051 CTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATA 47054110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATA 1200

 47054111 AATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAA 47054170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAA 1260

 47054171 TTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTA 47054230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTA 1320

 47054231 TTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTAT 47054290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTAT 1380

 47054291 TTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGA 47054350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGA 1440

 47054351 ACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATA 47054410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATA 1500

 47054411 ATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCAT 47054470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCAT 1560

 47054471 TAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAA 47054530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAA 1620

 47054531 GTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTC 47054590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTC 1680

 47054591 ATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGC 47054650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGC 1740

 47054651 TGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAG 47054710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAG 1800

 47054711 AGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGG 47054770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGG 1860

 47054771 TGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATT 47054830
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATT 1919

 47054831 TTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGA 47054890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGA 1979

 47054891 AGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGT 47054950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGT 2039

 47054951 TTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTC 47055010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTC 2099

 47055011 AGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAG 47055070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAG 2159

 47055071 CTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATC 47055130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATC 2219

 47055131 CACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCAC 47055190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCAC 2279

 47055191 AACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTC 47055250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTC 2339

 47055251 CATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCA 47055310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCA 2399

 47055311 GGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTT 47055370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTT 2459

 47055371 AAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAA 47055430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAA 2519

 47055431 GTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGA 47055490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGA 2579

 47055491 CATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAA 47055550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAA 2639

 47055551 TTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACC 47055610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACC 2699

 47055611 TGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAA 47055670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAA 2759

 47055671 ATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAA 47055730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAA 2819

 47055731 GAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACA 47055790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACA 2879

 47055791 ACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCT 47055850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCT 2939

 47055851 TTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTT 47055910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTT 2999

 47055911 AGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTC 47055970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTC 3059

 47055971 CTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTT 47056030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTT 3119

 47056031 TTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGT 47056090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
     3120 TTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGTGT 3177

 47056091 TGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTC 47056150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTC 3237

 47056151 GAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAG 47056210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAG 3297

 47056211 TCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCA 47056270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCA 3357

 47056271 AACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCA 47056330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 AACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCA 3417

 47056331 TGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGC 47056390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGC 3477

 47056391 TGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACT 47056450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACT 3537

 47056451 TTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTC 47056510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTC 3597

 47056511 ACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGG 47056570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 ACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGG 3657

 47056571 GTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAG 47056630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAG 3717

 47056631 TTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAA 47056690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAA 3777

 47056691 CTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAA 47056750
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 CTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAGTTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAA 3837

 47056751 TGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTT 47056810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 TGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTT 3897

 47056811 ATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGAC 47056870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 ATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGAC 3957

 47056871 ACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAA 47056930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAA 4017

 47056931 AAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAAT 47056990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 AAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAAT 4077

 47056991 GAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACAC 47057050
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACAC 4137

 47057051 TTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAG 47057110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAG 4197

 47057111 TATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTC 47057170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTC 4257

 47057171 TCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAA 47057230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4258 TCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGCCAGTTTTGCTAAATGTTAA 4317

 47057231 CTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCT 47057290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 CTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCT 4377

 47057291 ACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCAC 47057350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCAC 4437

 47057351 AGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTA 47057410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 AGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTA 4497

 47057411 TTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGT 47057470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGT 4557

 47057471 CAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAA 47057530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 CAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAA 4617

 47057531 CCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 CCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 4675

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 4757

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 4817

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 4877

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 4936

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 4996

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 5056

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 5116

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 5176

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 5236

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 5296

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 5356

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 5416

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 5476

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 5536

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 5596

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 5656

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5657 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 5716

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 5776

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 5836

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 5896

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 5956

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 6016

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6017 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 6076

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 6136

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 6196

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 6256

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6257 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 6316

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6317 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 6376

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6377 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 6436

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6437 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 6496

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6497 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 6556

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6557 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 6616

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6617 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 6676

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6677 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 6736

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6737 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 6796

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6797 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 6856

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6857 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 6916

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6917 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 6976

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6977 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 7036

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7037 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 7096

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7097 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 7156

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7157 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 7216

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7217 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 7276

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7277 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 7336

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7337 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 7396

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7397 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 7456

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7457 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 7516

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7517 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 7576

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7577 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 7636

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7637 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 7696

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7697 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 7756

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7757 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 7816

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7817 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 7876

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7877 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 7936

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7937 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 7996

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7997 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 8056

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8057 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 8116

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8117 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 8176

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8177 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 8236

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8237 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 8296

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8297 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 8356

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8357 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 8416

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8417 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 8476

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8477 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 8536

Alignment time is 13.0509 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3839] =>      3839 nucs 'mol-32-33a0-192815_3839'

Score:        3828
Aligned:      3839        nucs
Identic:      3838 (100%) nucs =>       185 (100%)      3653 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47063896] EXCISED REGION [47063898,47067551]
 second seq =>  [       1,     185] EXCISED REGION [     186,    3839]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47063897,47063897]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47064710,47064710]
 second seq =>         1 nucs [998,998]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [47063897,47063911] to [47063898,47063912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 60

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 120

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 180

 47063892 TTCTG 47063896
          |||||
      181 TTCTG 185

EXCISED REGION

 47063898 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 47063957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 245

 47063958 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 47064017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 305

 47064018 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 47064077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 365

 47064078 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 47064137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 425

 47064138 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 47064197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 485

 47064198 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 47064257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 545

 47064258 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 47064317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 605

 47064318 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 47064377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 665

 47064378 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 47064437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 725

 47064438 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 47064497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 785

 47064498 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 47064557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 845

 47064558 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 47064617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 905

 47064618 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 47064677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 965

 47064678 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 47064737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      966 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 1025

 47064738 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 47064797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 1085

 47064798 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 47064857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 1145

 47064858 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 47064917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 1205

 47064918 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 47064977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 1265

 47064978 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 47065037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 1325

 47065038 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 47065097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 1385

 47065098 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 47065157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 1445

 47065158 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 47065217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 1505

 47065218 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 47065277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 1565

 47065278 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 47065337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 1625

 47065338 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 47065397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 1685

 47065398 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 47065457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 1745

 47065458 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 47065517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 1805

 47065518 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 47065577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 1865

 47065578 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 47065637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 1925

 47065638 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 47065697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 1985

 47065698 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 47065757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 2045

 47065758 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 47065817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 2105

 47065818 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 47065877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 2165

 47065878 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 47065937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 2225

 47065938 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 47065997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 2285

 47065998 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 47066057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 2345

 47066058 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 47066117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 2405

 47066118 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 47066177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 2465

 47066178 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 47066237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 2525

 47066238 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 47066297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 2585

 47066298 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 47066357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 2645

 47066358 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 47066417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 2705

 47066418 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 47066477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 2765

 47066478 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 47066537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 2825

 47066538 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 47066597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 2885

 47066598 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 47066657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 2945

 47066658 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 47066717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 3005

 47066718 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 47066777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 3065

 47066778 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 47066837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 3125

 47066838 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 47066897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 3185

 47066898 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 47066957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 3245

 47066958 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 47067017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 3305

 47067018 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 47067077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 3365

 47067078 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 47067137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 3425

 47067138 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 47067197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 3485

 47067198 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 47067257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 3545

 47067258 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 47067317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 3605

 47067318 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 47067377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 3665

 47067378 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTA 47067437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTA 3725

 47067438 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACC 47067497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACC 3785

 47067498 TGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 3839

Alignment time is 6.27563 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    9166] =>      9166 nucs 'mol-32-33f8-110590_9166'

Score:        9077
Aligned:      9151        nucs
Identic:      9141 (100%) nucs =>      5212 (100%)      3929 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47052370,47057588] EXCISED REGION [47063712,47067642]
 second seq =>  [       1,    5215] EXCISED REGION [    5238,    9166]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [5216,5237]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47052370 AGCTACATGAATGTTCCTGCAGAGGACATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTAT 47052429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTACATGAATGTTCCTGCAGAGGACATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTAT 60

 47052430 TCCATAGTGTGTATGTACCACATTTTCTTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTGA 47052489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCATAGTGTGTATGTACCACATTTTCTTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTGA 120

 47052490 GGAATCCTCAAAGATCTAAAGTCAGAAATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAGT 47052549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATCCTCAAAGATCTAAAGTCAGAAATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAGT 180

 47052550 ATATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTTA 47052609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATACCCAAAGGAATATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTTA 240

 47052610 ATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATTC 47052669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCTTTCTTGGTAGTCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATTC 300

 47052670 TTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACAT 47052729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGCTTTTTGCTAGTTAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACAT 360

 47052730 AAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTC 47052789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATTCTTAGAATTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTC 420

 47052790 TGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCA 47052849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCA 480

 47052850 AGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAA 47052909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAA 540

 47052910 CACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCA 47052969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCA 600

 47052970 TGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAG 47053029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAG 660

 47053030 CTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAA 47053089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAA 720

 47053090 ATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 47053149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTG 780

 47053150 AGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCAC 47053209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCAC 840

 47053210 TGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-AA 47053268
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
      841 TGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTT--AAA 898

 47053269 AAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAG 47053328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAG 958

 47053329 GGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCA 47053388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCA 1018

 47053389 CACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAA 47053448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAA 1078

 47053449 ACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATG 47053508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 ACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATG 1138

 47053509 TAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAG 47053568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAG 1198

 47053569 CTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTT 47053628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTT 1258

 47053629 CCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGA 47053688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGA 1318

 47053689 TCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGC 47053748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGC 1378

 47053749 TAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTT 47053808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTT 1438

 47053809 GTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAAT 47053868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAAT 1498

 47053869 TTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAA 47053928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAA 1558

 47053929 TCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATC 47053988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATC 1618

 47053989 TTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGC 47054048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGC 1678

 47054049 ATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAA 47054108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAA 1738

 47054109 TAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTT 47054168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTT 1798

 47054169 AATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCT 47054228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCT 1858

 47054229 TATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCT 47054288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCT 1918

 47054289 ATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTT 47054348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTT 1978

 47054349 GAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATA 47054408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATA 2038

 47054409 TAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGC 47054468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGC 2098

 47054469 ATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACA 47054528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 ATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACA 2158

 47054529 AAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTAT 47054588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTAT 2218

 47054589 TCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTG 47054648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTG 2278

 47054649 GCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGA 47054708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGA 2338

 47054709 AGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACAT 47054768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACAT 2398

 47054769 GGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAA 47054828
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAA 2457

 47054829 TTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAA 47054888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAA 2517

 47054889 GAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTT 47054948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTT 2577

 47054949 GTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGT 47055008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGT 2637

 47055009 TCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTT 47055068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTT 2697

 47055069 AGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATA 47055128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATA 2757

 47055129 TCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGC 47055188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGC 2817

 47055189 ACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTT 47055248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 ACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTT 2877

 47055249 TCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTAT 47055308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTAT 2937

 47055309 CAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCC 47055368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCC 2997

 47055369 TTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGC 47055428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGC 3057

 47055429 AAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGG 47055488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGG 3117

 47055489 GACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATT 47055548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATT 3177

 47055549 AATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAA 47055608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAA 3237

 47055609 CCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAA 47055668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAA 3297

 47055669 AAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGG 47055728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 AAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGG 3357

 47055729 AAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTA 47055788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 AAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTA 3417

 47055789 CAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAG 47055848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAG 3477

 47055849 CTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAG 47055908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 CTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAG 3537

 47055909 TTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTG 47055968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTG 3597

 47055969 TCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCT 47056028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCT 3657

 47056029 TTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGT 47056088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
     3658 TTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGT 3715

 47056089 GTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGC 47056148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 GTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGC 3775

 47056149 TCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCAC 47056208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 TCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCAC 3835

 47056209 AGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTT 47056268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 AGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTT 3895

 47056269 CAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 47056328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 3955

 47056329 CATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTT 47056388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 CATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTT 4015

 47056389 GCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAA 47056448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 GCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAA 4075

 47056449 CTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCT 47056508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 CTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCT 4135

 47056509 TCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTA 47056568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 TCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTA 4195

 47056569 GGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACA 47056628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 GGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACA 4255

 47056629 AGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGC 47056688
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 AGTCAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGC 4315

 47056689 AACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGA 47056748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 AACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGA 4375

 47056749 AATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACT 47056808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 AATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACT 4435

 47056809 TTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTG 47056868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTG 4495

 47056869 ACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATG 47056928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 ACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATG 4555

 47056929 AAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAA 47056988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 AAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAA 4615

 47056989 ATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAAC 47057048
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 ATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAAC 4675

 47057049 ACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTAC 47057108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 ACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTAC 4735

 47057109 AGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATT 47057168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 AGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATT 4795

 47057169 TCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTT 47057228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 TCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTT 4855

 47057229 AACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGT 47057288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 AACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGT 4915

 47057289 CTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGC 47057348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 CTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGC 4975

 47057349 ACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATT 47057408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 ACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATT 5035

 47057409 TATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAG 47057468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 TATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAG 5095

 47057469 GTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATA 47057528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 GTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATA 5155

 47057529 AACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 AACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 5215

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 5297

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 5357

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 5417

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 TTCTG--TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 5475

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 5535

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 5595

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 5655

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 5715

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 5775

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5776 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 5835

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 5895

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5896 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 5955

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5956 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 6015

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6016 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 6075

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6076 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 6135

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6136 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 6195

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6196 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 6255

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6256 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 6315

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6316 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 6375

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6376 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 6435

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6436 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 6495

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6496 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 6555

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6556 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 6615

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6616 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 6675

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6676 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 6735

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6736 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 6795

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6796 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 6855

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6856 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 6915

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6916 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 6975

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6976 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 7035

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7036 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 7095

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7096 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 7155

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7156 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 7215

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7216 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 7275

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7276 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 7335

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7336 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 7395

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7396 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 7455

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7456 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 7515

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7516 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 7575

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7576 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 7635

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7636 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 7695

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7696 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 7755

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7756 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 7815

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7816 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 7875

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7876 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 7935

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7936 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 7995

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7996 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 8055

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8056 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 8115

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8116 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 8175

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8176 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 8235

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8236 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 8295

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8296 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 8355

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8356 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 8415

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8416 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 8475

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8476 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 8535

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8536 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 8595

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8596 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 8655

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8656 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 8715

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8716 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 8775

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8776 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 8835

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8836 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 8895

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8896 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 8955

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8956 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 9015

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9016 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 9075

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9076 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 9135

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTG 47067642
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     9136 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTG 9166

Alignment time is 14.0447 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3929] =>      3929 nucs 'mol-32-33f8-110590_3929'

Score:        3929
Aligned:      3929        nucs
Identic:      3929 (100%) nucs =>       185 (100%)      3744 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47063896] EXCISED REGION [47063899,47067642]
 second seq =>  [       1,     185] EXCISED REGION [     186,    3929]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [47063897,47063898]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [47063897,47063910] to [47063899,47063912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47063897,47063897] to [47063898,47063898]
 second seq =>         0 nucs

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 60

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 120

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 180

 47063892 TTCTG 47063896
          |||||
      181 TTCTG 185

EXCISED REGION

 47063899 TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCTT 47063958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 TTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCTT 245

 47063959 AAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGTG 47064018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 AAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGTG 305

 47064019 TGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACAT 47064078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 TGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACAT 365

 47064079 TTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTAA 47064138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTAA 425

 47064139 ATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCAA 47064198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 ATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCAA 485

 47064199 CAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATCT 47064258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 CAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATCT 545

 47064259 GTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTTT 47064318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 GTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTTT 605

 47064319 TTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAATA 47064378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAATA 665

 47064379 CAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTGG 47064438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 CAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTGG 725

 47064439 ATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACAC 47064498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 ATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACAC 785

 47064499 ATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTAA 47064558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 ATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTAA 845

 47064559 TATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACCA 47064618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 TATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACCA 905

 47064619 CATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAATG 47064678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 CATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAATG 965

 47064679 GTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCTC 47064738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 GTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCTC 1025

 47064739 CACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACATA 47064798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACATA 1085

 47064799 AAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAAG 47064858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAAG 1145

 47064859 CTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGA 47064918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 CTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGA 1205

 47064919 CCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAGC 47064978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 CCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAGC 1265

 47064979 CAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAAT 47065038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 CAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAAT 1325

 47065039 ATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTCC 47065098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 ATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTCC 1385

 47065099 ACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATAC 47065158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 ACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATAC 1445

 47065159 ATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTCC 47065218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 ATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTCC 1505

 47065219 AGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCTC 47065278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 AGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCTC 1565

 47065279 ACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAGT 47065338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 ACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAGT 1625

 47065339 TTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATATA 47065398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATATA 1685

 47065399 AAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTTA 47065458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTTA 1745

 47065459 AATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATCT 47065518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATCT 1805

 47065519 ACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCAC 47065578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 ACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCAC 1865

 47065579 CCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAA 47065638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAA 1925

 47065639 CCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCCT 47065698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 CCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCCT 1985

 47065699 GGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCA 47065758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 GGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCA 2045

 47065759 CAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTG 47065818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 CAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTG 2105

 47065819 TGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTGT 47065878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 TGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTGT 2165

 47065879 TTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTGT 47065938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTGT 2225

 47065939 ATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTTG 47065998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 ATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTTG 2285

 47065999 CAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTTA 47066058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 CAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTTA 2345

 47066059 AAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGCT 47066118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGCT 2405

 47066119 ACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAATA 47066178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 ACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAATA 2465

 47066179 TTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGGC 47066238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 TTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGGC 2525

 47066239 TGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTACA 47066298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 TGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTACA 2585

 47066299 AAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAG 47066358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAAG 2645

 47066359 CTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATGC 47066418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 CTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATGC 2705

 47066419 TACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGGC 47066478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 TACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGGC 2765

 47066479 TGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAAA 47066538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 TGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAAA 2825

 47066539 TAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATTG 47066598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATTG 2885

 47066599 TTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTTT 47066658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 TTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTTT 2945

 47066659 GCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGAG 47066718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 GCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGAG 3005

 47066719 AAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATAA 47066778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 AAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATAA 3065

 47066779 AGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAAG 47066838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAAG 3125

 47066839 AACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTGA 47066898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 AACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTGA 3185

 47066899 AGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTAG 47066958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTAG 3245

 47066959 TTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCAC 47067018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 TTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCAC 3305

 47067019 TGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGTT 47067078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 TGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGTT 3365

 47067079 ATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCAG 47067138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 ATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCAG 3425

 47067139 AAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTAT 47067198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 AAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTAT 3485

 47067199 TTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGTG 47067258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGTG 3545

 47067259 AGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAAG 47067318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 AGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAAG 3605

 47067319 TAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATGC 47067378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 TAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATGC 3665

 47067379 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTAA 47067438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTAA 3725

 47067439 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACCT 47067498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACCT 3785

 47067499 GGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTG 47067558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 GGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTG 3845

 47067559 TACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 47067618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 3905

 47067619 AGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTG 47067642
          ||||||||||||||||||||||||
     3906 AGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTG 3929

Alignment time is 6.47244 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2344] =>      2344 nucs 'mol-32-340e-115121_2344'

Score:        2300
Aligned:      2324        nucs
Identic:      2321 (100%) nucs =>      2153 (100%)       168 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055433,47057588] EXCISED REGION [47063712,47063879]
 second seq =>  [       1,    2154] EXCISED REGION [    2177,    2344]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [2155,2176]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055433 ATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACA 47055492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACA 60

 47055493 TTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATT 47055552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATT 120

 47055553 CATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTG 47055612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTG 180

 47055613 CACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAAT 47055672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAAT 240

 47055673 AAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGA 47055732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGA 300

 47055733 ATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAAC 47055792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAAC 360

 47055793 ACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTT 47055852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTT 420

 47055853 ATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAG 47055912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAG 480

 47055913 CCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCT 47055972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCT 540

 47055973 TTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTT 47056032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTT 600

 47056033 CCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTG 47056092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
      601 CCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTG 658

 47056093 CCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGA 47056152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGA 718

 47056153 GTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTC 47056212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTC 778

 47056213 GGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAA 47056272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAA 838

 47056273 CTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATG 47056332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATG 898

 47056333 AGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTG 47056392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTG 958

 47056393 CCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTT 47056452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTT 1018

 47056453 TTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCAC 47056512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCAC 1078

 47056513 CTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGT 47056572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGT 1138

 47056573 CATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTT 47056632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTT 1198

 47056633 AAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACT 47056692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 AAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACT 1258

 47056693 GCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATG 47056752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATG 1318

 47056753 AAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTAT 47056812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTAT 1378

 47056813 CTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACAC 47056872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACAC 1438

 47056873 TTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAA 47056932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAA 1498

 47056933 ATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGA 47056992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 ATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGA 1558

 47056993 ACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTT 47057052
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTT 1618

 47057053 GTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTA 47057112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTA 1678

 47057113 TGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTC 47057172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTC 1738

 47057173 TCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACT 47057232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACT 1798

 47057233 TTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTAC 47057292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTAC 1858

 47057293 ATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAG 47057352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAG 1918

 47057353 TTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATT 47057412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATT 1978

 47057413 GAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCA 47057472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCA 2038

 47057473 ACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACC 47057532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACC 2098

 47057533 AGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2154

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 2236

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 2296

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCT 47063879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCT 2344

Alignment time is 3.85183 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2744] =>      2744 nucs 'mol-32-349d-182150_2744'

Score:        2701
Aligned:      2723        nucs
Identic:      2721 (100%) nucs =>      2556 (100%)       165 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055031,47057588] EXCISED REGION [47063712,47063876]
 second seq =>  [       1,    2557] EXCISED REGION [    2580,    2744]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [2558,2579]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055031 AGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGAT 47055090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGAT 60

 47055091 CCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCT 47055150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCT 120

 47055151 CCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTC 47055210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTC 180

 47055211 TCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTT 47055270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTT 240

 47055271 CAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTT 47055330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTT 300

 47055331 GACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCT 47055390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCT 360

 47055391 GACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGAT 47055450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGAT 420

 47055451 ACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAA 47055510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAA 480

 47055511 CTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTA 47055570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTA 540

 47055571 TATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTAC 47055630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTAC 600

 47055631 CCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAA 47055690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAA 660

 47055691 GGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGT 47055750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGT 720

 47055751 CCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTG 47055810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTG 780

 47055811 GTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCT 47055870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCT 840

 47055871 AATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCT 47055930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCT 900

 47055931 AAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCT 47055990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCT 960

 47055991 TAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAA 47056050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAA 1020

 47056051 GCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGT 47056110
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGT 1079

 47056111 GGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAG 47056170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAG 1139

 47056171 CCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTG 47056230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTG 1199

 47056231 GTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAT 47056290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAT 1259

 47056291 CCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTG 47056350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTG 1319

 47056351 CCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATG 47056410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATG 1379

 47056411 CTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACC 47056470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACC 1439

 47056471 ATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGT 47056530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGT 1499

 47056531 TGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAG 47056590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAG 1559

 47056591 AAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAA 47056650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAA 1619

 47056651 AAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTT 47056710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTT 1679

 47056711 GTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTG 47056770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTG 1739

 47056771 CAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATT 47056830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATT 1799

 47056831 TTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAG 47056890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAG 1859

 47056891 TGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAG 47056950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAG 1919

 47056951 AGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATG 47057010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1920 AGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAG 1979

 47057011 ATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCA 47057070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCA 2039

 47057071 ACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTT 47057130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTT 2099

 47057131 ATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACC 47057190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACC 2159

 47057191 ATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTG 47057250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTG 2219

 47057251 TATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGG 47057310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGG 2279

 47057311 ACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTT 47057370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTT 2339

 47057371 TTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTAT 47057430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTAT 2399

 47057431 AAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATC 47057490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATC 2459

 47057491 TGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCA 47057550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCA 2519

 47057551 TTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2557

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 2639

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 2699

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTT 47063876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTT 2744

Alignment time is 4.63789 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3577] =>      3577 nucs 'mol-32-34b3-022484_3577'

Score:        3514
Aligned:      3558        nucs
Identic:      3554 (100%) nucs =>      3256 (100%)       298 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47054330,47057588] EXCISED REGION [47063712,47064010]
 second seq =>  [       1,    3257] EXCISED REGION [    3280,    3577]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [3258,3279]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47054330 AAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCAC 47054389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCAC 60

 47054390 TTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTAC 47054449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTAC 120

 47054450 TATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTT 47054509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTT 180

 47054510 ATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAA 47054569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAA 240

 47054570 AGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTT 47054629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTT 300

 47054630 TTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTC 47054689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTC 360

 47054690 TTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTG 47054749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTG 420

 47054750 TAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAA 47054809
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
      421 TAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAA 479

 47054810 TGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTG 47054869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTG 539

 47054870 AAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCA 47054929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCA 599

 47054930 GATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTC 47054989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTC 659

 47054990 CTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTC 47055049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTC 719

 47055050 CTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTC 47055109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTC 779

 47055110 CCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGT 47055169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGT 839

 47055170 AAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGT 47055229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGT 899

 47055230 TTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCA 47055289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCA 959

 47055290 GACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGA 47055349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGA 1019

 47055350 GTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAG 47055409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAG 1079

 47055410 AAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCA 47055469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCA 1139

 47055470 TGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATG 47055529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATG 1199

 47055530 TTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACA 47055589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACA 1259

 47055590 TGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAA 47055649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAA 1319

 47055650 TAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAA 47055709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAA 1379

 47055710 GGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCA 47055769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCA 1439

 47055770 TTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTC 47055829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTC 1499

 47055830 AAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTG 47055889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTG 1559

 47055890 TTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATC 47055949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATC 1619

 47055950 TCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAA 47056009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAA 1679

 47056010 CTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT 47056069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT 1739

 47056070 TAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACA 47056129
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 -AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACA 1798

 47056130 CCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGAC 47056189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGAC 1858

 47056190 TACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCC 47056249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCC 1918

 47056250 ATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCC 47056309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCC 1978

 47056310 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAAT 47056369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAAT 2038

 47056370 GGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCT 47056429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCT 2098

 47056430 GATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAA 47056489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAA 2158

 47056490 TTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCAC 47056549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCAC 2218

 47056550 TTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAA 47056609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAA 2278

 47056610 AAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGC 47056669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGC 2338

 47056670 CTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACC 47056729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACC 2398

 47056730 TTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATG 47056789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATG 2458

 47056790 TATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGC 47056849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGC 2518

 47056850 ACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGG 47056909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGG 2578

 47056910 TTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGA 47056969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGA 2638

 47056970 TACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTT 47057029
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2639 TACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTT 2698

 47057030 TTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAAT 47057089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAAT 2758

 47057090 GAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATA 47057149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATA 2818

 47057150 CTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGT 47057209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGT 2878

 47057210 GTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAA 47057269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAA 2938

 47057270 TGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTT 47057329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTT 2998

 47057330 TCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCT 47057389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCT 3058

 47057390 CCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTC 47057449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTC 3118

 47057450 AAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAA 47057509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAA 3178

 47057510 TATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGT 47057569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGT 3238

 47057570 GAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||
     3239 GAAATGGAGTGAAAAGATA 3257

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 3339

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 3399

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 3459

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 3518

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTG 47064010
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTG 3577

Alignment time is 5.61255 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6243] =>      6243 nucs 'mol-32-34be-059675_6243'

Score:        6168
Aligned:      6223        nucs
Identic:      6218 (100%) nucs =>      6043 (100%)       175 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47051542,47057588] EXCISED REGION [47063712,47063887]
 second seq =>  [       1,    6045] EXCISED REGION [    6068,    6243]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [6046,6067]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47051542 GTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACACAGGCGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAAC 47051601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACACAGGCGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAAAC 60

 47051602 TAGGAATTTGAAGCTGCAGTGAGCTATGATCGTACTACTGTACTCCAGCCTTGGTAACAG 47051661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGAATTTGAAGCTGCAGTGAGCTATGATCGTACTACTGTACTCCAGCCTTGGTAACAG 120

 47051662 AATAAGACCCTGCCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCTATCAGAAGACAAG 47051721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATAAGACCCTGCCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCTATCAGAAGACAAG 180

 47051722 TTCAATTCCAATTCTAACAGAAGATAATCCACTCTAATGAGCTGGCCTGGTTTTAGAAAG 47051781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAATTCCAATTCTAACAGAAGATAATCCACTCTAATGAGCTGGCCTGGTTTTAGAAAG 240

 47051782 AAAAAAAGGAGACAGGAGAATGGCCTAGGAAGACTCAACTGCCATCATCCAGTTAAACAG 47051841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAAAGGAGACAGGAGAATGGCCTAGGAAGACTCAACTGCCATCATCCAGTTAAACAG 300

 47051842 TGCAGGTCAAGATTCACTGGCCGTTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGGAGCACCTGGAGGA 47051901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCAGGTCAAGATTCACTGGCCGTTTTCAGTTTGAGTGAGAACAAGGAGCACCTGGAGGA 360

 47051902 CATAGAGTGCTGTTGGAGTTTTGAAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAAGAATGAGCTGGAA 47051961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATAGAGTGCTGTTGGAGTTTTGAAGTTTTGCCTCTTTGCACATTAAGAATGAGCTGGAA 420

 47051962 TATTTTAATTTGGTCCTCTTGCCCATGTCTTTATTACTTCTATATGTGGAATGTGAATAG 47052021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTTTAATTTGGTCCTCTTGCCCATGTCTTTATTACTTCTATATGTGGAATGTGAATAG 480

 47052022 CTATTTATATATAGATCCAGTATGGTTACAGTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTTTA 47052081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATTTATATATAGATCCAGTATGGTTACAGTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTTTA 540

 47052082 ACTTTTAAGTTCAGGGGTACTTGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTTGTGGGG 47052141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTTTTAAGTTCAGGGGTACTTGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTTGTGGGG 600

 47052142 GTTTGTGGTACAGATTATTTCATCACTCAGGTATTAAGCCTAGTACCCATTAGTTGTTTT 47052201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTGTGGTACAGATTATTTCATCACTCAGGTATTAAGCCTAGTACCCATTAGTTGTTTT 660

 47052202 CCCTGATCTTTTCCCTCTTCCCATCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCAGTGTGTGTTGTTC 47052261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTGATCTTTTCCCTCTTCCCATCCTCCACCCTCCAATAGGCCCCAGTGTGTGTTGTTC 720

 47052262 CCCTCTATGCATCCGTGTGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGCAG 47052321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCTCTATGCATCCGTGTGTTCTCATCATTTAGCTCCCACTTATAAGTGAGAACATGCAG 780

 47052322 AATTTGGCTTTCTCTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTACATGAAT 47052381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTTGGCTTTCTCTTCCTGCATTAGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTACATGAAT 840

 47052382 GTTCCTGCAGAGGACATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTATTCCATAGTGTGT 47052441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTCCTGCAGAGGACATGATCTCATTCTTTTCTATGGCTGCAGACTATTCCATAGTGTGT 900

 47052442 ATGTACCACATTTTCTTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTGAGGAATCCTCAAA 47052501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTACCACATTTTCTTCATCCCGTCTATCACTGATGGGACAGTGTGAGGAATCCTCAAA 960

 47052502 GATCTAAAGTCAGAAATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAG 47052561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATCTAAAGTCAGAAATACCATTCGACCCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAG 1020

 47052562 GAATATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTTAATTCTTTCTTGG 47052621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATATAAATCATTCTATTATAAAGATGTGTGGTTACATTTATATTTAATTCTTTCTTGG 1080

 47052622 TAGTCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATTCTTGCTTTTTGCT 47052681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGTCCCTGAGCTATTGCCCACTTCACCAGAATAATTTAAATCAATTCTTGCTTTTTGCT 1140

 47052682 AGTTAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAA 47052741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTTAATAGCCAAAATTAAGATGTTTATGTGGAATTGACATCATACATAAATTCTTAGAA 1200

 47052742 TTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTT 47052801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTGTATCTAGTTTTTCAGGAGAAAATAGATACCACTTAATAGAATTCTGTATGACTTTT 1260

 47052802 TCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATT 47052861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAATTGTATCAAGAACTCCCATT 1320

 47052862 AGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGC 47052921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAATTTTTAACACAGCTCCTGC 1380

 47052922 TGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACG 47052981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAGCTGGGCATGGTGGCTCACG 1440

 47052982 TCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTG 47053041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTTAGCTCAGGAGTTTG 1500

 47053042 AGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATT 47053101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAAAAATAAAATAAACAAAATT 1560

 47053102 AGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGAT 47053161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGGGGAT 1620

 47053162 CGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCC 47053221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCC 1680

 47053222 TGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGAGATCTCTTA 47053281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1681 TGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAGAGATCTCTTA 1740

 47053282 AAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAAT 47053341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTCTCTAGAGGGATGGAACTAAT 1800

 47053342 GGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGG 47053401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTATTAACTCACACAATCACAAGG 1860

 47053402 TCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTG 47053461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAGCCAGTAAACTGAAGAACTTG 1920

 47053462 GAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGG 47053521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAGAAAGATGTAGCCTGGAAGGG 1980

 47053522 TAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGG 47053581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTTATTCTAGCTGGCTAGACTGG 2040

 47053582 CAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGA 47053641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTCTGCCTTTCCCAGCCCACCGA 2100

 47053642 CTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTA 47053701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACACCCAGGATCAATACTTTGTA 2160

 47053702 TCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGA 47053761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAATATTAAGCTAATAAAATAGGA 2220

 47053762 AAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCAT 47053821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGAGAGATTTGTACTCAGCCCAT 2280

 47053822 TTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTG 47053881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAAACCAAATTTTACTACTGTTG 2340

 47053882 TGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACA 47053941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTAATTATAATCACTTAGTGACA 2400

 47053942 GTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGT 47054001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGATTATATCTTCTGGAGAGAGT 2460

 47054002 TGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCAT 47054061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAATGGAAGCATCTTCAGACCAT 2520

 47054062 TTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTT 47054121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAACTCACAAATAAATTTTAATTT 2580

 47054122 AAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTT 47054181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAAAAATTTTAATTTTGATGTTT 2640

 47054182 CTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGC 47054241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTGAACTTCTTATTCATGATAGC 2700

 47054242 TTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACT 47054301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAGGATATCTATTTTATGCTACT 2760

 47054302 TTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGG 47054361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATGGGCCCTTGAACAACATGAGG 2820

 47054362 GTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTC 47054421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAATCCACATATAATTTTGGACTC 2880

 47054422 ACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTG 47054481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTACCAATAGCATTAAAACAGTTG 2940

 47054482 ATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAG 47054541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCCTACAACAAAGTAAGCTAGAG 3000

 47054542 AAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAA 47054601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATATTTACTATTCATTAAGTTAAA 3060

 47054602 GTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGA 47054661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATGTTAAGTGGCTGAGGAAGAGA 3120

 47054662 AAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATT 47054721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCAGGGAAGAAGAGGTGGAGATT 3180

 47054722 GTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGAT 47054781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAAAACACATGGTGATTTCTGAT 3240

 47054782 TTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATT 47054841
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATGGTACCAATTTTTCTTCCATT 3299

 47054842 TGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCA 47054901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGTCATAAAAGAAGTCAAAAGCA 3359

 47054902 GTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCT 47054961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATGTCAGTTTGTTTTCTGGCCCT 3419

 47054962 GCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCA 47055021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGGCACTGGTTCAGAAGCACTCA 3479

 47055022 CCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTT 47055081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGATGTCTGTTAGCTCTTGAATTT 3539

 47055082 CTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTT 47055141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTTTGCCATATCCACAATCTCTT 3599

 47055142 TCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGAT 47055201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAAGTCATGCACAACATCTGGAT 3659

 47055202 GCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAG 47055261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAATGGCTTTTTCCATAACAACAG 3719

 47055262 TGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTC 47055321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGATGTTCTATCAGGATTCTCTTC 3779

 47055322 CATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTA 47055381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTAATGGGCCTTAAAGGTCCTTA 3839

 47055382 TAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGAC 47055441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTTTGGGGGCAAGTATTACAGAC 3899

 47055442 CATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAAT 47055501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGTGGCCAGGGACATTGTCCAAT 3959

 47055502 TCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTA 47055561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTA 4019

 47055562 CGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTG 47055621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTTGTG 4079

 47055622 CGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATA 47055681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 CGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAAATA 4139

 47055682 AAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATG 47055741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTGATG 4199

 47055742 AAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAAC 47055801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAAAAC 4259

 47055802 TGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAG 47055861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGATAAG 4319

 47055862 GGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCT 47055921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 GGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATCCCT 4379

 47055922 TCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCAT 47055981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGGCAT 4439

 47055982 TTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGA 47056041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAATGA 4499

 47056042 TTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTG 47056101
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTG 4558

 47056102 GAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTC 47056161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTC 4618

 47056162 ATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTT 47056221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTT 4678

 47056222 TTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGC 47056281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGC 4738

 47056282 TCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGC 47056341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGC 4798

 47056342 ACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGT 47056401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 ACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGT 4858

 47056402 TGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAAT 47056461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAAT 4918

 47056462 TATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCT 47056521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCT 4978

 47056522 GCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCT 47056581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 GCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCT 5038

 47056582 TTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTA 47056641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTA 5098

 47056642 TTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGA 47056701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGA 5158

 47056702 ATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAA 47056761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 ATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAA 5218

 47056762 CCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACG 47056821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACG 5278

 47056822 TCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGG 47056881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 TCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGG 5338

 47056882 GTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAG 47056941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 GTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAG 5398

 47056942 AACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCAT 47057001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCAT 5458

 47057002 GCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACT 47057061
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 GCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACT 5518

 47057062 GCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACA 47057121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 GCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACA 5578

 47057122 GTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATG 47057181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 GTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATG 5638

 47057182 AATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAAC 47057241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 AATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAAC 5698

 47057242 AGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTAT 47057301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 AGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTAT 5758

 47057302 GCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGT 47057361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 GCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGT 5818

 47057362 GAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAA 47057421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 GAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAA 5878

 47057422 TCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATAT 47057481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 TCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATAT 5938

 47057482 ACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAA 47057541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 ACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAA 5998

 47057542 TGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 TGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 6045

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 6127

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 6187

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTT 47063887
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6188 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCCAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTT 6243

Alignment time is 9.55313 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    9259] =>      9259 nucs 'mol-32-34c9-046087_9259'

Score:        9161
Aligned:      9242        nucs
Identic:      9233 (100%) nucs =>      4801 (100%)      4432 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47052783,47057588] EXCISED REGION [47063712,47068146]
 second seq =>  [       1,    4803] EXCISED REGION [    4826,    9259]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [4804,4825]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47052783 AGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAAT 47052842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAATTCTGTATGACTTTTTCTGTGCAAACAGCGTTTGTTACTAGAAGAGAACATGAAAT 60

 47052843 TGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAA 47052902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTATCAAGAACTCCCATTAGCTTAACATGTTTACAAATGTCTGATTATAAAATTATTAA 120

 47052903 TTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAG 47052962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTAACACAGCTCCTGCTGTGTTTTCTTAATATATTACTGGAGAAAACTGCCCTAGAG 180

 47052963 CTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATT 47053022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGGCATGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAATGCTTTGAGATGCTGAGGTGGGAGGATT 240

 47053023 GCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAA 47053082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTTAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAACGAGACTCTGTCTTTACAAA 300

 47053083 AAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGG 47053142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATAAAATAAACAAAATTAGCCAGGCATGGTAGCGCATGTCTGAGTCCCAGCTACTTGG 360

 47053143 GAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATC 47053202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGCTGAGGCAGGGGGATCGCTTCAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATC 420

 47053203 GTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTT 47053262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGAGAAAAACCCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTT 480

 47053263 TTTT-AAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTC 47053321
          ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TT--AAAAAGAGATCTCTTAAAAAAAAATTGCCCTGAAGTTAAATATTGTATTAGGGTTC 538

 47053322 TCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTAT 47053381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TCTAGAGGGATGGAACTAATGGAATAGATTTATATATATAAAGGGGAGTTTACTAAGTAT 598

 47053382 TAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAG 47053441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TAACTCACACAATCACAAGGTCCCACAATAGGCCATCTGCAAGCTGAGGAGCAAGGATAG 658

 47053442 CCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAG 47053501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CCAGTAAACTGAAGAACTTGGAGTCCAATGTTTTAGGGCAGGAAGCATCCAGCATGGGAG 718

 47053502 AAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTT 47053561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 AAAGATGTAGCCTGGAAGGGTAGGCCAGTCTCTCTTTTCACATTTTTCTGCCTGCATTTT 778

 47053562 ATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTC 47053621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ATTCTAGCTGGCTAGACTGGCAGCTAATTAGATTGTGCTCACTCAGATTAAGGGTAGGTC 838

 47053622 TGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACA 47053681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TGCCTTTCCCAGCCCACCGACTCAAAGTTAATCTCCTTTGGCAACACCCTCACCGACACA 898

 47053682 CCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAAT 47053741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CCCAGGATCAATACTTTGTATCCTTCAATCAGTTTGACACTCAATATTAACATGACAAAT 958

 47053742 ATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGA 47053801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 ATTAAGCTAATAAAATAGGAAAACTATGGAATTTATTTTATTGTCAAAACTAAATTAAGA 1018

 47053802 GAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAA 47053861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GAGATTTGTACTCAGCCCATTTCATTTTTTTTACTTTAGAATTTTTTAATTTCCAGTGAA 1078

 47053862 ACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTA 47053921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 ACCAAATTTTACTACTGTTGTGAACACAGCCTTCACATTTGATGCAAATGGGAGGGCTTA 1138

 47053922 ATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGA 47053981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 ATTATAATCACTTAGTGACAGTATTGTAGACAAAGCCAATAGTGTATGGCACATAGATGA 1198

 47053982 TTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAA 47054041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTATATCTTCTGGAGAGAGTTGACTTTACAATTAATACAAACATATTTGACTAAAGAAAA 1258

 47054042 TGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAAC 47054101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TGGAAGCATCTTCAGACCATTTCATCTTAATTATATCTTGTAAGGTTAAAAATATATAAC 1318

 47054102 TCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAA 47054161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TCACAAATAAATTTTAATTTAAAAAATTTTTTTAACTTTCATGTCACAGCCAAGTCCAAA 1378

 47054162 AAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTG 47054221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 AAATTTTAATTTTGATGTTTCTGGTTCTCTTGTGGCTAGATAATCCATAGAGATTTCCTG 1438

 47054222 AACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAG 47054281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 AACTTCTTATTCATGATAGCTTAAAAAGAAACATTCAGATCCCTGTGAATTGGACAAAAG 1498

 47054282 GATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATG 47054341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GATATCTATTTTATGCTACTTTTTGTAGCATAAGGAAGAAGAGGAAATAAAAACACAATG 1558

 47054342 GGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAAT 47054401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GGCCCTTGAACAACATGAGGGTTACAGGTGCCGACCTCTCCTCTTCACTTAGTCTAAAAT 1618

 47054402 CCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTAC 47054461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CCACATATAATTTTGGACTCACCAAGAACTTAACTACTGATAGTCTACTATTGACCTTAC 1678

 47054462 CAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCC 47054521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CAATAGCATTAAAACAGTTGATTAACACATACCTTGTATATGTATTTTATACTGTATTCC 1738

 47054522 TACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATAT 47054581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TACAACAAAGTAAGCTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCAAAAGGAAAATATAT 1798

 47054582 TTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATG 47054641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTACTATTCATTAAGTTAAAGTGGATCATGATAAAGACCTCCATCTTTTTCTTCTTGATG 1858

 47054642 TTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCA 47054701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTAAGTGGCTGAGGAAGAGAAAGAGGAGGAGGAGTTGGTCTTGCTGTCTTAAGCGTGGCA 1918

 47054702 GGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAA 47054761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GGGAAGAAGAGGTGGAGATTGTAGAAGGGGAGGCAGGCACACTCGGTGTAGCTTTATGAA 1978

 47054762 AACACATGGTGATTTCTGATTTTTTTTGCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATG 47054821
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AACACATGGTGATTTCTGATTTTTTT-GCCTTTTCATGTCTTTAAAAATGTTTCTATATG 2037

 47054822 GTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGT 47054881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GTACCAATTTTTCTTCCATTTGCTTTAGTTTCAGTGCCTGTATCACTGAAGAGTTCATGT 2097

 47054882 CATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATG 47054941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 CATAAAAGAAGTCAAAAGCAGTCTTGAATAGTTGGAACTCTTCTGCCAGATGGTCTAATG 2157

 47054942 TCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGG 47055001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TCAGTTTGTTTTCTGGCCCTGCTTCTGTGTCTTCTTCCCCTTCTATTCCTTCTTTTCTGG 2217

 47055002 CACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGAT 47055061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CACTGGTTCAGAAGCACTCACCTTCATCAAGTTGTCTTCTGTTAATTCCTCTGGTGTGAT 2277

 47055062 GTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTT 47055121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 GTCTGTTAGCTCTTGAATTTCTCCAAGATCCATATCTTGGGACCCTTCCCCCACCTTCTT 2337

 47055122 TGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAA 47055181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TGCCATATCCACAATCTCTTTCATGATCTCCTTGATTGGCTCTGTCGTAAATCCTGTGAA 2397

 47055182 GTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAAT 47055241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 GTCATGCACAACATCTGGATGCAGTTTTCTCCAGCAGGAATCTATTGTTTGGGGCTCAAT 2457

 47055242 GGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGAT 47055301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GGCTTTTTCCATAACAACAGTGGCATCTTCAATGGTGTAATCCTCCCAGACTTTCTTGAT 2517

 47055302 GTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTA 47055361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GTTCTATCAGGATTCTCTTCCATAGCGTTGACAGTCCTTTCCAACAGAGTACTATGTGTA 2577

 47055362 ATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTT 47055421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 ATGGGCCTTAAAGGTCCTTATAACCCCCTGACTTAGGGGCTGAATTAGAAACATTGTGTT 2637

 47055422 TGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGT 47055481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TGGGGGCAAGTATTACAGACCATTTTGATACCTTTGGTGTTGAACTCATGGGTTCTGGGT 2697

 47055482 GGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGC 47055541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GGCCAGGGACATTGTCCAATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGC 2757

 47055542 ACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATG 47055601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ACCCATTAATTCATCATTTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATG 2817

 47055602 TAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATA 47055661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TAACAAACCTGCACGTTGTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATA 2877

 47055662 TATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGA 47055721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TATATAAAAATAAAAAAATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGA 2937

 47055722 CTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCT 47055781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CTTCAGGAAGAATGTTGATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCT 2997

 47055782 TCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGG 47055841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TCTTGTACAACACCCAAAACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGG 3057

 47055842 TTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAAT 47055901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TTACCAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAAT 3117

 47055902 AGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTA 47055961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AGTAGAGTTAGCCCATCCCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTA 3177

 47055962 ATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAG 47056021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 ATAAGTGTCCTTTGTGGCATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAG 3237

 47056022 ATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTC 47056081
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     3238 ATATCCTTTTTCCTCAATGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTT-AGAGCAGGGTC 3296

 47056082 TCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATT 47056141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATT 3356

 47056142 CCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTG 47056201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTG 3416

 47056202 CCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAG 47056261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAG 3476

 47056262 CTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 47056321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGA 3536

 47056322 TTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAA 47056381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAA 3596

 47056382 CTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAA 47056441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAA 3656

 47056442 GCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTT 47056501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTT 3716

 47056502 AGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGAT 47056561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 AGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGAT 3776

 47056562 CATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTT 47056621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTT 3836

 47056622 CAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAG 47056681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 CAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAG 3896

 47056682 CTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTT 47056741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 CTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTT 3956

 47056742 ATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAA 47056801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 ATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAA 4016

 47056802 TTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATC 47056861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATC 4076

 47056862 ACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAA 47056921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 ACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAA 4136

 47056922 CACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTAC 47056981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 CACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTAC 4196

 47056982 TGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATAC 47057041
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATAC 4256

 47057042 TTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATA 47057101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 TTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATA 4316

 47057102 GTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGC 47057161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 GTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGC 4376

 47057162 TTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCT 47057221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 TTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCT 4436

 47057222 AAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGA 47057281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 AAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGA 4496

 47057282 CTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGT 47057341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 CTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGT 4556

 47057342 AGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTA 47057401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 AGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTA 4616

 47057402 ATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTG 47057461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 ATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTG 4676

 47057462 TTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGG 47057521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGG 4736

 47057522 AAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGA 47057581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 AAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGA 4796

 47057582 AAAGATA 47057588
          |||||||
     4797 AAAGATA 4803

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 4885

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 4945

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 5005

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TTCTG-TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 5064

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 5124

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 5184

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 5244

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 5304

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 5364

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 5424

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 5484

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 5544

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 5604

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 5664

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 5724

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 5784

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 5844

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 5904

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 5964

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 6024

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 6084

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 6144

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 6204

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 6264

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 6324

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6325 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 6384

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6385 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 6444

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6445 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 6504

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6505 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 6564

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6565 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 6624

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6625 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 6684

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6685 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 6744

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6745 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 6804

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6805 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 6864

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6865 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 6924

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6925 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 6984

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6985 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 7044

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7045 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 7104

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7105 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 7164

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7165 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 7224

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7225 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 7284

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7285 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 7344

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7345 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 7404

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7405 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 7464

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7465 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 7524

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7525 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 7584

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7585 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 7644

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7645 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 7704

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7705 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 7764

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7765 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 7824

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7825 CTGAGAGAAGATAAGCAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 7884

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7885 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 7944

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7945 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 8004

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8005 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 8064

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8065 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 8124

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8125 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 8184

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8185 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 8244

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8245 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 8304

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8305 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 8364

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8365 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 8424

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8425 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 8484

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8485 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 8544

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8545 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 8604

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 47067551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8605 CACACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCT 8664

 47067552 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 47067611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8665 GGTCTTGTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 8724

 47067612 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 47067671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8725 AGGCGTGAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTG 8784

 47067672 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 47067731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8785 TCCTGTAGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCA 8844

 47067732 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 47067791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8845 AAAGAAATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACA 8904

 47067792 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 47067851
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     8905 TGGTCCTATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8964

 47067852 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 47067911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8965 CTTCTAGAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAA 9024

 47067912 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 47067971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9025 TCAGTTGTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTC 9084

 47067972 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 47068031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9085 TGTTTAAAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGA 9144

 47068032 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 47068091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9145 AAGACTTGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATA 9204

 47068092 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTC 47068146
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9205 AATAGAAAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTC 9259

Alignment time is 13.957 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4434] =>      4434 nucs 'mol-32-34c9-046087_4434'

Score:        4412
Aligned:      4434        nucs
Identic:      4432 (100%) nucs =>       185 (100%)      4247 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47063712,47063896] EXCISED REGION [47063898,47068146]
 second seq =>  [       1,     185] EXCISED REGION [     186,    4434]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [47063897,47063897]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [47066727,47066727]
 second seq =>         1 nucs [3015,3015]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [47063897,47063911] to [47063898,47063912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 60

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 120

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 180

 47063892 TTCTG 47063896
          |||||
      181 TTCTG 185

EXCISED REGION

 47063898 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 47063957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 TTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACTTACTCT 245

 47063958 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 47064017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGTGTGTGT 305

 47064018 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 47064077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATATTCACA 365

 47064078 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 47064137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 TTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTTTTGGTA 425

 47064138 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 47064197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 AATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAAACTTCA 485

 47064198 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 47064257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 ACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGCAAAATC 545

 47064258 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 47064317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGGAACTTT 605

 47064318 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 47064377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAGTCAAAT 665

 47064378 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 47064437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTTGTTTTG 725

 47064438 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 47064497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTTCATACA 785

 47064498 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 47064557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATAAAATTA 845

 47064558 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 47064617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACTGTAACC 905

 47064618 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 47064677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 ACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTCTTGAAT 965

 47064678 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 47064737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 GGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTTTTGCCT 1025

 47064738 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 47064797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGCTTACAT 1085

 47064798 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 47064857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTTTGGAAA 1145

 47064858 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 47064917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 1205

 47064918 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 47064977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCCTTACAG 1265

 47064978 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 47065037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 CCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATATCCCTAA 1325

 47065038 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 47065097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGGTCTGTC 1385

 47065098 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 47065157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 CACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCTAAAATA 1445

 47065158 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 47065217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAATTTACTC 1505

 47065218 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 47065277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAGGTGGCT 1565

 47065278 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 47065337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 CACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCCCAGGAG 1625

 47065338 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 47065397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCTAGATAT 1685

 47065398 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 47065457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATTATCTTT 1745

 47065458 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 47065517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAATGTATC 1805

 47065518 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 47065577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCA 1865

 47065578 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 47065637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 1925

 47065638 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 47065697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 ACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCATCACGCC 1985

 47065698 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 47065757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTC 2045

 47065758 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 47065817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 ACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGT 2105

 47065818 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 47065877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGACTTCTG 2165

 47065878 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 47065937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATACATGTG 2225

 47065938 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 47065997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTGAATCTT 2285

 47065998 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 47066057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAATAATTT 2345

 47066058 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 47066117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTAAAAAGC 2405

 47066118 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 47066177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGAAGCAAT 2465

 47066178 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 47066237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 ATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTTGGGAGG 2525

 47066238 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 47066297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 CTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCATCTCTAC 2585

 47066298 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 47066357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 AAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAA 2645

 47066358 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 47066417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 GCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATGGTCATG 2705

 47066418 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 47066477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATATGTGGG 2765

 47066478 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 47066537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 CTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCAAGATAA 2825

 47066538 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 47066597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 ATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAGAAAATT 2885

 47066598 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 47066657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 GTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACAGCAGTT 2945

 47066658 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 47066717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 TGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTGCTGAGA 3005

 47066718 GAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 47066777
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GAAGATAAGCAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGTAAAATA 3065

 47066778 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 47066837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTGCTGAAA 3125

 47066838 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 47066897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAAAACCTG 3185

 47066898 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 47066957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 AAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCTAAACTA 3245

 47066958 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 47067017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 GTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATATGTTTCA 3305

 47067018 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 47067077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGAAGGTGT 3365

 47067078 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 47067137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 TATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCCAAACCA 3425

 47067138 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 47067197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 GAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGGATCTTA 3485

 47067198 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 47067257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAACAGTAGT 3545

 47067258 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 47067317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTTTTTAAA 3605

 47067318 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 47067377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 GTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGATG 3665

 47067378 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTA 47067437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCGGGTTTA 3725

 47067438 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACC 47067497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACACC 3785

 47067498 TGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTT 47067557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTT 3845

 47067558 GTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 47067617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 GTACTCCTGACTTCATGATGCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 3905

 47067618 GAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTGTCCTGT 47067677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 GAGCCACCACTCCCAGCCTAAAGTGGTAATTTTTACATTTAAAAAGGTATATTGTCCTGT 3965

 47067678 AGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCAAAAGAA 47067737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 AGGTATGGGGGTGAATTTTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAGGTAGATATCAAAAGAA 4025

 47067738 ATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACATGGTCC 47067797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 ATAAATGACATCCAAATTGGAAAGTAAAAGGTAAAACTATATTCACAGGTTACATGGTCC 4085

 47067798 TATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTCTA 47067857
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4086 TATGCATAAAAAGCATCCTAAAGAATCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTCTA 4145

 47067858 GAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAATCAGTT 47067917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 GAGCTTATAAATGAATTCAGCAAAGTTGCAGGGGACAAGAGCAACACATAAAAATCAGTT 4205

 47067918 GTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTCTGTTTA 47067977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 GTTTCTATATACCATCAATGAACAATCTAAAAAGGAAATTAAGAAAAGCAATTCTGTTTA 4265

 47067978 AAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGAAAGACT 47068037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 AAAGAGCATCCAAAAGATTTAGTCTATTAGGAATAAGTCTAACTGAGGAGGTGAAAGACT 4325

 47068038 TGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATAAATAGA 47068097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 TGCACACTGAAAACTATAAAACATTGCTGAATGAAATTAAAGAAGAGCTAAATAAATAGA 4385

 47068098 AAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTC 47068146
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 AAGACACCCTGAGTACATGGATAGGATGATGTAACACTGTTAACATGTC 4434

Alignment time is 7.21233 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5907] =>      5907 nucs 'mol-32-34c9-198641_5907'

Score:        5830
Aligned:      5891        nucs
Identic:      5883 (100%) nucs =>      2087 (100%)      3796 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055499,47057588] EXCISED REGION [47063712,47067512]
 second seq =>  [       1,    2088] EXCISED REGION [    2111,    5907]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6123 nucs [47057589,47063711]
 second seq =>        22 nucs [2089,2110]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47057589,47057589] to [47063711,47063711]
 second seq =>         0 nucs

 47055499 AATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCAT 47055558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCAT 60

 47055559 TTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTT 47055618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTT 120

 47055619 GTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAA 47055678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAA 180

 47055679 ATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTG 47055738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTG 240

 47055739 ATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAA 47055798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAA 300

 47055799 AACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGAT 47055858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGAT 360

 47055859 AAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATC 47055918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATC 420

 47055919 CCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGG 47055978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGG 480

 47055979 CATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAA 47056038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAA 540

 47056039 TGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGG 47056098
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATTTTTAAAAGCTTCTTTTTTTTTTTTT--AGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGG 598

 47056099 CTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGT 47056158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CTGGAGTCCAGTGGCATGATTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGT 658

 47056159 TTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAA 47056218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TTCATGCTTCAGCCTCTTTAGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAA 718

 47056219 TTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTG 47056278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TTTTTATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTG 778

 47056279 GGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAC 47056338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAC 838

 47056339 TGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTT 47056398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TGCACCTGGTTGCCTCAATAATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTT 898

 47056399 GGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAA 47056458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 GGTTGGCAGATGCTACTTCCCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAA 958

 47056459 AATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCT 47056518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AATTATCAAACCATCCTTTACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCT 1018

 47056519 TCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATG 47056578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TCTGCTTTAAGTTGTCATATAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATG 1078

 47056579 CCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAA 47056638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CCTTTCTTATAGAAATCCTGCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAA 1138

 47056639 GTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCA 47056698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GTATTTCACCAAAAGTGCAATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCA 1198

 47056699 TGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCC 47056758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TGAATTTCCTTTGTTTATAATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCC 1258

 47056759 AAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTA 47056818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AAACCACAGCTGCAGATCTCAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTA 1318

 47056819 ACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTA 47056878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 ACGTCATGAATTTTCTCTGTTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTA 1378

 47056879 TGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACAT 47056938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TGGGTCCGATAGTGTTATTTGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACAT 1438

 47056939 GAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCC 47056998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GAGAACCATGAGAGATCACTTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCC 1498

 47056999 CATGCAGAGATGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTC 47057058
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CATGCAGAGAAGATTAGCATCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTC 1558

 47057059 ACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCT 47057118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ACTGCAATAGCAACAGGAGTTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCT 1618

 47057119 ACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACT 47057178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ACAGTTAATTTTATACAGTTATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACT 1678

 47057179 ATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTAT 47057238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ATGAATGGCACCATGTATGGTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTAT 1738

 47057239 AACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTT 47057298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AACAGATTTGTGTATATTTTAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTT 1798

 47057299 TATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTC 47057358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TATGCATTCAGGACATACTTTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTC 1858

 47057359 TGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAA 47057418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TGTGAGTTTTTTTTAAATTGCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAA 1918

 47057419 AAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTA 47057478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAATCCATGTATAAGTAGACCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTA 1978

 47057479 TATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGAT 47057538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TATACATGTATCTGCTCATCTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGAT 2038

 47057539 GAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GAATGAGATTCATTATCTCTAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2088

EXCISED REGION

 47063712 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 47063771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGTCCCTGTCCAAAAAAATAAAAAATAAAAT 2170

 47063772 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 47063831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AAAGAAAGAGAGGAAGGAAGGAAGGATGGATGGATGGAAGAAAGATTTCATTATTTTTAG 2230

 47063832 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 47063891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 GGAATATTTTTAGGAATTCCTTATTTCCTAATTTTTATTTATCTTGCTCAGCACTTTGAC 2290

 47063892 TTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 47063951
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTCTG---TTTTTTTTTTTTTGAAATACTGTAGGAGTAAACAAGCGTCACGTCTATAACT 2347

 47063952 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 47064011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TACTCTTAAATAGTTCCAAAAAATGATAATATGTATATACATATGTACTTATATGTCTGT 2407

 47064012 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 47064071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAGAGTGAGTGAGAGTAAATGTAGCAAAATA 2467

 47064072 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 47064131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 TTCACATTTGAGTAATCCAGGTAAAGGATATTCAGGAATTCTTTGTGCTATTATAACTTT 2527

 47064132 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 47064191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TTGGTAAATTTGAAATTACAATATGTCAAAATTTTTAAAAATTAAAATCTTCAAGGAAAA 2587

 47064192 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 47064251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 ACTTCAACAACTTAAAGAATAAAAAAAATTGCTCAATGAAATTTGAATACTCGTTTTGGC 2647

 47064252 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 47064311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 AAAATCTGTTTATGGCAGACATATGGTGTACTTCTGTATGGCCTTTAAGATATTTTTAGG 2707

 47064312 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 47064371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 AACTTTTTTGTTTTACTTTAGAGGAAAGATTAATGTCTATTAAAGAACTTTGTAGTTTAG 2767

 47064372 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 47064431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 TCAAATACAATGAAAAATTAGTGCAAATATGCATTTTTAAGCTTGGTAGGTCAAATGTTT 2827

 47064432 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 47064491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GTTTTGGATTTCTGGTCATGATGGCTTGCAGTGTTCATGACTTGGGCCTCTTATTCATTT 2887

 47064492 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 47064551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CATACACATGGTAATGATACATAAAATTTTCTAAGATTTTTAAGGACATAGCCATGTATA 2947

 47064552 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 47064611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 AAATTAATATAAATTCATCTGACTAGGAACTCACTAAACCACAATGCAGTAAGTGGGACT 3007

 47064612 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 47064671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 GTAACCACATGCCTCCTGTGCTCTGGATTCAGAAGGCGTAGGTAACTGAAAGCTCATTTC 3067

 47064672 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCAGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 47064731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3068 TTGAATGGTGGAGACTCAAAATGTTATACACACAGTGCCGGAGACTGGAGCTAGCCCCTT 3127

 47064732 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 47064791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TTGCCTCCACCACTTTAAGAAAGACTCAAAAAAAGTTATGACTGCTACCTGAGAAATGGC 3187

 47064792 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 47064851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 TTACATAAAACCTGGAGGTTTAGCCAGGTGCGGTGGTGCACACCTGTAGCCCCAGCTGTT 3247

 47064852 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 47064911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TGGAAAGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACAT 3307

 47064912 AGTGAGACCCCGTCTATTAAAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 47064971
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 AGTGAGACCCCGTCTATT-AAAAAACAAAAACCTTGAGGTGTGGGAGGAAGCAGACAGCC 3366

 47064972 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 47065031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 TTACAGCCAGGTCTTAGTGGTCCAACCTCCTTAGGGGTACAGTGACAATCTGTATGATAT 3426

 47065032 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 47065091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CCCTAATATCAGGAATGGAGCCATAAGCCATCCAATACAAGACCTGGTTCTGGACTAGGG 3486

 47065092 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 47065151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TCTGTCCACAAGAGAGAGTAGAAACCTCCCACTTCACATGAACTTATACGCTGAAATTCT 3546

 47065152 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 47065211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 AAAATACATGAGGAACACTGATGTTGAGAAAGATAGTCAATAAACCCAATAAACATAAAT 3606

 47065212 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 47065271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TTACTCCAGAGAAAACAAAAATAGTTGAACATTTAAAACTGACTTTGAGGCCAGGTTGAG 3666

 47065272 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 47065331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 GTGGCTCACACCTGTAATCCTGGCATTTTCAGAGGCCAAAGTGGGTGGATCACTTGAGCC 3726

 47065332 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 47065391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACAATCCTGTCTCT 3786

 47065392 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 47065451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 AGATATAAAAAGGCATGGTGGCATGCGCCTGTAGATTCAGCTACTTGGGAGGCACTTATT 3846

 47065452 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 47065511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 ATCTTTAAATTATTCATTCTCTATTCTGTCTGGTCAGCCTGAATAATGCAGGTTCTACAA 3906

 47065512 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 47065571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TGTATCTACCATGTAGGTTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCT 3966

 47065572 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 47065631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 4026

 47065632 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 47065691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 GGTTCAACCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCAT 4086

 47065692 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 47065751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 CACGCCTGGCTAATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGG 4146

 47065752 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 47065811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 CTGGTCACAAATTCCTGACCTTGTGACCCACCCGCCTCGACCTCCCAAAATGCTGGGATT 4206

 47065812 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 47065871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 ACAGGTGTGAGCCACCGCTCCTGGACAGTTTATTTTTATTTATCTTACTCAGCACTTTGA 4266

 47065872 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 47065931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 CTTCTGTTTTGTTTTTTGTTGTTGTTGTTAGTTCTGGAAAATTCTCAGCCAATATATATA 4326

 47065932 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 47065991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 CATGTGTATTTCTTGAGATAGGATCTCACATTATTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTCACGTG 4386

 47065992 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 47066051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 AATCTTGCAGAATTGTAGAATCTGCATTACTTAGGCTGAACAGACAGAATAGAGAATGAA 4446

 47066052 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 47066111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TAATTTAAAAGATAATAACATAAAGAGATAAAAAACTATGAAGACAGGTAAGAGGCATTA 4506

 47066112 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 47066171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 AAAAGCTACAATGTATATCTAATAGGAAACAGAAGAAAATGATATAGGGAATGGCAAAGA 4566

 47066172 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 47066231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 AGCAATATTTTAAAAAGAATTGGGGGGTGCAGTGACTCACATCTATAATTCTAGTACTTT 4626

 47066232 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 47066291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 GGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGCTCCCAT 4686

 47066292 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 47066351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 CTCTACAAAAAAATTAAGTTTAGCCAGGCATGGTTGTGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACT 4746

 47066352 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 47066411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 CAGGAAGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGCTTCTAGTGAGCTATG 4806

 47066412 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 47066471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 GTCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGTGAGATCCTGTCTCAAAAAATGTATA 4866

 47066472 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 47066531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TGTGGGCTGAGAATTTTCCTGAACTGACAAAAAACAGAAGTCAGTTTAAAGTACTGAGCA 4926

 47066532 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 47066591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 AGATAAATAAAAATAAACCTACATGGTAGATACATTGTAGAATCTGCATTAATGATAAAG 4986

 47066592 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 47066651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 AAAATTGTTTATATGAATTATAAGAATGATTAACTCCAAAGGAATGGCAGGAGTTTGACA 5046

 47066652 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 47066711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 GCAGTTTGCTTGATATCAGTGATAGGTGCGAGGTGACAACTGGGTGGTATCTTTAAAGTG 5106

 47066712 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 47066771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 CTGAGAGAAGATAAGTAACAACCAGAATTCTCCACTGAATTAAATTTCACTCCAGAAGGT 5166

 47066772 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 47066831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 AAAATAAAGATATTTTGAGGTAGATGAAAACTGAGAGCATTTACCACTCACAGGCTTTTG 5226

 47066832 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 47066891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CTGAAAGAACTACAGGTTTATGTATATTAATAAATTTCACAATTCAAAAAAAGCTTTGAA 5286

 47066892 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 47066951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 AACCTGAAGTTGTCCTTTGGTAAGTTTTCAGCAACCTCATTTGTGGGGCAAACTTGACCT 5346

 47066952 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 47067011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 AAACTAGTTCATGGGCTAATTTTGGTCTTTGTTTATCCCACTTAGTGTGAATACTTATAT 5406

 47067012 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 47067071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 GTTTCACTGTGGAGACTTTAATATGTTTGAATCCATGGGGTGCTATCCCAACCCTGCTGA 5466

 47067072 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 47067131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 AGGTGTTATATCACATCTGGTTTGTGCAACCTTTATAAAATCTCAAAATTTGTCACTTCC 5526

 47067132 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 47067191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 AAACCAGAAAGGTCCCAGGATTTCAGATAAGTGATTATGGATCTTATTAAAGGATTATGG 5586

 47067192 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 47067251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 ATCTTATTTCTTTAGCAAGAAATAATTGAACCAAGAGTGAAGGAGCAGAATGTGGGAAAC 5646

 47067252 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 47067311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 AGTAGTGAGCATGAAAATTGATTTGATAAATGTAGGTAAACTTAATTAATTATTGATTTT 5706

 47067312 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 47067371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 TTTAAAGTAGTCATTTTTTTCTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCACT 5766

 47067372 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 47067431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 CTGATGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTAGGCTCACTGCAACCTCCGTCCCCCG 5826

 47067432 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 47067491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 GGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 5886

 47067492 CACACCTGGGTAATTTTTGTA 47067512
          |||||||||||||||||||||
     5887 CACACCTGGGTAATTTTTGTA 5907

Alignment time is 9.13048 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [47047588,47073711] =>     26124 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2088] =>      2088 nucs 'mol-32-34c9-198641_2088'

Score:        2077
Aligned:      2088        nucs
Identic:      2087 (100%) nucs =>       557 (100%)      1530 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [47055499,47056055] EXCISED REGION [47056058,47057588]
 second seq =>  [       1,     557] EXCISED REGION [     558,    2088]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [47056056,47056057]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [47056056,47056068] to [47056058,47056070]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [47056056,47056056] to [47056057,47056057]
 second seq =>         0 nucs

 47055499 AATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCAT 47055558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTCAAAAGAACTTTAAAAGGCAGTCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCAT 60

 47055559 TTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTT 47055618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACGTTAGGTATATCTCCTAACATGGCACATGTATAGATATGTAACAAACCTGCACGTT 120

 47055619 GTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAA 47055678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCGCATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAATATATATATATAAAAATAAAAAA 180

 47055679 ATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTG 47055738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAAAATAAAAGGCAGTCCATTACCAGCAAGGTACATCCTGACTTCAGGAAGAATGTTG 240

 47055739 ATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAA 47055798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAAACCCAGTCCAGAAAAAATGGTTCTCATTATCCAGGGCTTCTTGTACAACACCCAA 300

 47055799 AACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGAT 47055858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTGGCAACTGGTATTTATCTTTTCCCTTCAAAGCTCAGGGGTTACCAGCTTTATAGAT 360

 47055859 AAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATC 47055918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGGCAGTCCTAATCATAAACCTGACTGTGTTTGCACAAAATAGTAGAGTTAGCCCATC 420

 47055919 CCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGG 47055978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTCCTGCCCTAAATCCTGGTGCTTGCATCTCTTCCTTACTAATAAGTGTCCTTTGTGG 480

 47055979 CATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAA 47056038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTTTCCCCTTAGCATCTGCATTAAAAAACTGCTCAGGAAGATATCCTTTTTCCTCAA 540

 47056039 TGATTTTTAAAAGCTTC 47056055
          |||||||||||||||||
      541 TGATTTTTAAAAGCTTC 557

EXCISED REGION

 47056058 TTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGA 47056117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 TTTTTTTTTTTTTAGAGCAGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCATGA 617

 47056118 TTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTT 47056177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 TTATAATTCACACCACCTCGAATTCCTGTGCTCGAGTGAGTTTCATGCTTCAGCCTCTTT 677

 47056178 AGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGA 47056237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 AGTAGCTGGGACTACAGGCTTGTGCCACCACAGTCGGCTAATTTTTATTTTTGGTAGAGA 737

 47056238 TGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCA 47056297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 TGGGGTTTTTCCATGTTGCCCAAGCTGGTTTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCA 797

 47056298 CCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAAT 47056357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 CCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCTGGTTGCCTCAAT 857

 47056358 AATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTC 47056417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 AATTTTCTTAATGGCATCTGGAAACTTGTTTGCTGCCTCTTGGTTGGCAGATGCTACTTC 917

 47056418 CCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTT 47056477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 CCCTGATATCCTGATATTTTTTAAGCCAAAACTTTTTCTAAAATTATCAAACCATCCTTT 977

 47056478 ACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATA 47056537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 ACTGGCATTAAATTCTCCAGCTTTAGACCCTTCACCTTTCTTCTGCTTTAAGTTGTCATA 1037

 47056538 TAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCT 47056597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 TAATGACTTCACTTTTTCTCAGATCATATTAGGGTCATATGCCTTTCTTATAGAAATCCT 1097

 47056598 GCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCA 47056657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 GCACTCCTATAAAAGCTGTGTTTTCAAGACAAGTTAAAAAAGTATTTCACCAAAAGTGCA 1157

 47056658 ATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATA 47056717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 ATGTTTTTATGCCTGCTGATGTAGCTGCAGCAACTGCTTCATGAATTTCCTTTGTTTATA 1217

 47056718 ATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCT 47056777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 ATTGTCCTTACCTTAGATTCATTTATCTTGAAATGAAGGCCAAACCACAGCTGCAGATCT 1277

 47056778 CAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTG 47056837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 CAATCTATGATGTATGTCAAGCAATTCAACTTTATCTTGTAACGTCATGAATTTTCTCTG 1337

 47056838 TTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATT 47056897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 TTTCTTGGGAGCACTTCCGGCATCACTAGTGACACTTCGTATGGGTCCGATAGTGTTATT 1397

 47056898 TGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCAC 47056957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TGAGGTTTATGGTTTTGTACTGAACACGATGAAAAATACATGAGAACCATGAGAGATCAC 1457

 47056958 TTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGATGATTAGCA 47057017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1458 TTTTTACTGTGATACACAATTTACTGGAGAAATGAACTGCCCATGCAGAGAAGATTAGCA 1517

 47057018 TCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAG 47057077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 TCACATGGTGTTTTAAGCAGATACTTGCAACACTTGTGCTCACTGCAATAGCAACAGGAG 1577

 47057078 TTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGT 47057137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 TTGGCTATGAATGAAATTATTATAGTAGTACAGTATGAGCTACAGTTAATTTTATACAGT 1637

 47057138 TATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATG 47057197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 TATGATTTAATACTGTATGTTTGCTTACATTTCTCTCCACTATGAATGGCACCATGTATG 1697

 47057198 GTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTT 47057257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 GTCTGTGTGTGTGTCAGTTTTGCTAAATGTTAACTTTTTATAACAGATTTGTGTATATTT 1757

 47057258 TAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACT 47057317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 TAATGTAGTAAATGATAAAATGGACTAGTGTCTACATATTTTATGCATTCAGGACATACT 1817

 47057318 TTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATT 47057377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 TTTAAAAATTTTTCCAATATGTGTAGGATGCACAGTTGGTCTGTGAGTTTTTTTTAAATT 1877

 47057378 GCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGA 47057437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 GCTGAAATCCCTCCAAAATTTCTAATATATTTATTGAAAAAAAATCCATGTATAAGTAGA 1937

 47057438 CCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCAT 47057497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 CCCACACAGTTCAAATCCATGCTGTTCAAAGGTCAACTGTATATACATGTATCTGCTCAT 1997

 47057498 CTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTC 47057557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CTGAGAAAAAAATATGCACACAGGAAGAATAAACCAGAGATGAATGAGATTCATTATCTC 2057

 47057558 TAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 47057588
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 TAAGATGTTAGTGAAATGGAGTGAAAAGATA 2088

Alignment time is 3.62858 s

