
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5683] =>      5683 nucs 'mol-32-1e66-044940_5683'

Score:        5627
Aligned:      5682        nucs
Identic:      5677 (100%) nucs =>      1766 (100%)      3911 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726681,34728446] EXCISED REGION [34728448,34732363]
 second seq =>  [       1,    1766] EXCISED REGION [    1768,    5683]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [1767,1767]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [1765,1766] to [1768,1769]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726681 AGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCC 34726740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCC 60

 34726741 TTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTT 34726800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTT 120

 34726801 CATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTG 34726860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTG 180

 34726861 AGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAA 34726920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAA 240

 34726921 CAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTA 34726980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTA 300

 34726981 ACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATT 34727040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATT 360

 34727041 ATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATT 34727100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATT 420

 34727101 ACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACT 34727160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACT 480

 34727161 TTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTT 34727220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTT 540

 34727221 AGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGA 34727280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGA 600

 34727281 AGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAA 34727340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAA 660

 34727341 ATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGAT 34727400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGAT 720

 34727401 GTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTAT 34727460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTAT 780

 34727461 CCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATC 34727520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATC 840

 34727521 TGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGA 34727580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGA 900

 34727581 AGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCT 34727640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCT 960

 34727641 CTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGT 34727700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGT 1020

 34727701 ATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTC 34727760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTC 1080

 34727761 AAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTC 34727820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTC 1140

 34727821 AGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCA 34727880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCA 1200

 34727881 ATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCT 34727940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCT 1260

 34727941 TGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACAT 34728000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACAT 1320

 34728001 AGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTA 34728060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTA 1380

 34728061 TTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTA 34728120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTA 1440

 34728121 AGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCT 34728180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCT 1500

 34728181 TTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACT 34728240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACT 1560

 34728241 TGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAG 34728300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAG 1620

 34728301 GCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCT 34728360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCT 1680

 34728361 GTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGG 34728420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGG 1740

 34728421 GCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 34728446
          ||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 1766

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1827

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1887

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1947

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 2007

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 2067

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 2127

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 2187

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 2247

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 2307

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 2367

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 2427

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 2487

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 2547

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 2607

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 2667

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 2727

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 2787

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 2847

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 2907

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 2967

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 3027

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 3087

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 3147

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 34729887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 3207

 34729888 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 34729947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 3267

 34729948 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 34730007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 3327

 34730008 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 34730067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 3387

 34730068 TTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 34730127
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 TTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 3447

 34730128 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 34730187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 3507

 34730188 TGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 34730247
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 3567

 34730248 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 34730307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 3627

 34730308 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 34730367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 3687

 34730368 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 34730427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 3747

 34730428 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 34730487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 3807

 34730488 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 34730547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 3867

 34730548 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 34730607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 3927

 34730608 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 34730667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 3987

 34730668 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 34730727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 4047

 34730728 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 34730787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 4107

 34730788 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 34730847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 4167

 34730848 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 34730907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 4227

 34730908 CTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 34730967
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 4287

 34730968 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 34731027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 4347

 34731028 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 34731087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 4407

 34731088 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 34731147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 4467

 34731148 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 34731207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 4527

 34731208 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 34731267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 4587

 34731268 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 34731327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 4647

 34731328 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 34731387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 4707

 34731388 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 34731447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 4767

 34731448 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 34731507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 4827

 34731508 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 34731567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 4887

 34731568 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 34731627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 4947

 34731628 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 34731687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 5007

 34731688 CTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 34731747
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 CTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 5067

 34731748 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 34731807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 5127

 34731808 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 34731867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 5187

 34731868 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 34731927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 5247

 34731928 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 34731987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 5307

 34731988 GCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTC 34732047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 GCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTC 5367

 34732048 TTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAA 34732107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 TTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAA 5427

 34732108 TGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAG 34732167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 TGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAG 5487

 34732168 AATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAACAG 34732227
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5488 AATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAATAG 5547

 34732228 ACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTGCCTTACATGTT 34732287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 ACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTGCCTTACATGTT 5607

 34732288 TAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTATTGTATTAGTG 34732347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 TAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTATTGTATTAGTG 5667

 34732348 TTCTTCCTCTCAAAGA 34732363
          ||||||||||||||||
     5668 TTCTTCCTCTCAAAGA 5683

Alignment time is 4.42054 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5609] =>      5609 nucs 'mol-32-1e7c-121794_5609'

Score:        5553
Aligned:      5608        nucs
Identic:      5603 (100%) nucs =>      1582 (100%)      4021 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726865,34728446] EXCISED REGION [34728448,34732473]
 second seq =>  [       1,    1582] EXCISED REGION [    1584,    5609]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [1583,1583]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [1581,1582] to [1584,1585]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726865 TTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAA 34726924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAA 60

 34726925 CAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTT 34726984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTT 120

 34726985 TTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTT 34727044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTT 180

 34727045 CTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACAT 34727104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACAT 240

 34727105 TGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCA 34727164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCA 300

 34727165 GATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTA 34727224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTA 360

 34727225 TTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGA 34727284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGA 420

 34727285 TATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATAT 34727344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATAT 480

 34727345 GCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTAT 34727404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTAT 540

 34727405 TAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTT 34727464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTT 600

 34727465 GACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCT 34727524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCT 660

 34727525 TGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTT 34727584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTT 720

 34727585 TTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTT 34727644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTT 780

 34727645 AAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATAC 34727704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATAC 840

 34727705 TTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGC 34727764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGC 900

 34727765 TCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAA 34727824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAA 960

 34727825 TGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTT 34727884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTT 1020

 34727885 CAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAA 34727944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAA 1080

 34727945 TTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCT 34728004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCT 1140

 34728005 CTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTT 34728064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTT 1200

 34728065 CCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCA 34728124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCA 1260

 34728125 TTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCC 34728184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCC 1320

 34728185 AGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTA 34728244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTA 1380

 34728245 CAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAG 34728304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAG 1440

 34728305 AGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGC 34728364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGC 1500

 34728365 TAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTG 34728424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTG 1560

 34728425 TGCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 34728446
          ||||||||||||||||||||||
     1561 TGCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 1582

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1643

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1703

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1763

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1823

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 1883

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 1943

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 2003

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 2063

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 2123

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 2183

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 2243

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 2303

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 2363

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 2423

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 2483

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 2543

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 2603

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 2663

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 2723

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 2783

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 2843

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 2903

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 2963

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 34729887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 3023

 34729888 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 34729947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 3083

 34729948 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 34730007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 3143

 34730008 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 34730067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 3203

 34730068 TTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 34730127
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 TTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 3263

 34730128 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 34730187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 3323

 34730188 TGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 34730247
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 TGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 3383

 34730248 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 34730307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 3443

 34730308 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 34730367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 3503

 34730368 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 34730427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 3563

 34730428 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 34730487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 3623

 34730488 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 34730547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 3683

 34730548 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 34730607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 3743

 34730608 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 34730667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 3803

 34730668 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 34730727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 3863

 34730728 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 34730787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 3923

 34730788 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 34730847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 3983

 34730848 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 34730907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 4043

 34730908 CTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 34730967
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 4103

 34730968 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 34731027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 4163

 34731028 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 34731087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 4223

 34731088 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 34731147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 4283

 34731148 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 34731207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 4343

 34731208 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 34731267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 4403

 34731268 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 34731327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 4463

 34731328 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 34731387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 4523

 34731388 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 34731447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 4583

 34731448 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 34731507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 4643

 34731508 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 34731567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 4703

 34731568 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 34731627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 4763

 34731628 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 34731687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 4823

 34731688 CTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 34731747
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 CTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 4883

 34731748 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 34731807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 4943

 34731808 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 34731867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 5003

 34731868 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 34731927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 5063

 34731928 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 34731987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 5123

 34731988 GCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTC 34732047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 GCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTC 5183

 34732048 TTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAA 34732107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 TTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAA 5243

 34732108 TGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAG 34732167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 TGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAG 5303

 34732168 AATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAACAG 34732227
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5304 AATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAATAG 5363

 34732228 ACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTGCCTTACATGTT 34732287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 ACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTGCCTTACATGTT 5423

 34732288 TAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTATTGTATTAGTG 34732347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5424 TAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTATTGTATTAGTG 5483

 34732348 TTCTTCCTCTCAAAGAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAATGGTGGTAAGT 34732407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 TTCTTCCTCTCAAAGAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAATGGTGGTAAGT 5543

 34732408 CTTACCAGCTGTGCTTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGTGACAGATGTTT 34732467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 CTTACCAGCTGTGCTTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGTGACAGATGTTT 5603

 34732468 TTGCTG 34732473
          ||||||
     5604 TTGCTG 5609

Alignment time is 4.22626 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5788] =>      5788 nucs 'mol-32-2110-130146_5788'

Score:        5689
Aligned:      5788        nucs
Identic:      5779 (100%) nucs =>      3619 (100%)      2160 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34724499,34728121] EXCISED REGION [34728617,34730780]
 second seq =>  [       1,    3624] EXCISED REGION [    3625,    5788]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34724499 TATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTG 34724558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTG 60

 34724559 GTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTG 34724618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTG 120

 34724619 ACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTCT 34724678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      121 ACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTGT 180

 34724679 AGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCT 34724738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCT 240

 34724739 CCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGG 34724798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGG 300

 34724799 TCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAG 34724858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAG 360

 34724859 TTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAA 34724918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAA 420

 34724919 ATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTG 34724978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTG 480

 34724979 CAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTG 34725038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTG 540

 34725039 TAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTA 34725098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTA 600

 34725099 TCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTT 34725158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTT 660

 34725159 AAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTT 34725218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTT 720

 34725219 CAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCA 34725278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCA 780

 34725279 ATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTG 34725338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTG 840

 34725339 TCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTT 34725398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTT 900

 34725399 TATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTAT 34725458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTAT 960

 34725459 AGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATA 34725518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATA 1020

 34725519 TCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTA 34725578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTA 1080

 34725579 ATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTT 34725638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTT 1140

 34725639 CATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTAT 34725698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTAT 1200

 34725699 TTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATG 34725758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATG 1260

 34725759 CATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCC 34725818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCC 1320

 34725819 TTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATT 34725878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATT 1380

 34725879 TGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAG 34725938
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAG 1440

 34725939 GAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGAT 34725998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGAT 1500

 34725999 TTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAAT 34726058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAAT 1560

 34726059 GTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCT 34726118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCT 1620

 34726119 GAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGG 34726178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGG 1680

 34726179 TTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAG 34726238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAG 1740

 34726239 AGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTC 34726298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTC 1800

 34726299 TATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGA 34726358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGA 1860

 34726359 TGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATA 34726418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATA 1920

 34726419 ATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAA 34726478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAA 1980

 34726479 GTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTT 34726538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTT 2040

 34726539 ATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACAGATCATT 34726597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2041 ATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCATT 2100

 34726598 GGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATT 34726657
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATT 2160

 34726658 TACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTT 34726717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTT 2220

 34726718 CTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGT 34726777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGT 2280

 34726778 GATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCAT 34726837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCAT 2340

 34726838 GATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGA 34726897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGA 2400

 34726898 CAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCT 34726957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCT 2460

 34726958 GTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGT 34727017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGT 2520

 34727018 CTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAG 34727077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAG 2580

 34727078 GGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTA 34727137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTA 2640

 34727138 CTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTC 34727197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTC 2700

 34727198 TTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGT 34727257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGT 2760

 34727258 CTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAA 34727317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAA 2820

 34727318 CGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTC 34727377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTC 2880

 34727378 CACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGA 34727437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGA 2940

 34727438 TGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGA 34727497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGA 3000

 34727498 GGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTT 34727557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTT 3060

 34727558 GTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTAC 34727617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTAC 3120

 34727618 ACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAG 34727677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAG 3180

 34727678 TCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGT 34727737
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGT 3240

 34727738 GTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTAT 34727797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTAT 3300

 34727798 TAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTA 34727857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTA 3360

 34727858 CTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTT 34727917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTT 3420

 34727918 TGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGA 34727977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGA 3480

 34727978 ATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTAT 34728037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTAT 3540

 34728038 TTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATC 34728097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATC 3600

 34728098 AGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||
     3601 AGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 3624

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 3684

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 3744

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 3804

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 3864

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 3924

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 3984

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 4044

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 4104

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 4164

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 4224

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4225 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 4284

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 4344

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 4404

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 4464

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 4524

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 4584

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 4644

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 4704

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 4764

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 4824

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 4884

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 4944

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 5004

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 5064

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 5124

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 5184

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5185 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 5244

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 5304

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 5364

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 5424

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 5484

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 5544

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 5604

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 5664

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 5724

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 5784

 34730777 CCTT 34730780
          ||||
     5785 CCTT 5788

Alignment time is 4.52554 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2164] =>      2164 nucs 'mol-32-2110-130146_2164'

Score:        2130
Aligned:      2163        nucs
Identic:      2160 (100%) nucs =>       636 (100%)      1524 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34728617,34729252] EXCISED REGION [34729254,34730780]
 second seq =>  [       1,     636] EXCISED REGION [     638,    2164]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34729253,34729253]
 second seq =>         1 nucs [637,637]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34729252,34729252] to [34729254,34729254]
 second seq =>         1 nucs [636,636] to [638,638]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 60

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 120

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 180

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 240

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 300

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 360

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 420

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 480

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 540

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 600

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTC 34729252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTC 636

EXCISED REGION

 34729254 CCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAG 34729313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 CCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAG 697

 34729314 CACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCA 34729373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 CACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCA 757

 34729374 ATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACC 34729433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 ATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACC 817

 34729434 AAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTA 34729493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 AAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTA 877

 34729494 GTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTG 34729553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 GTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTG 937

 34729554 CCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAA 34729613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 CCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAA 997

 34729614 TGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGT 34729673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 TGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGT 1057

 34729674 TTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTG 34729733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTG 1117

 34729734 GGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGA 34729793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 GGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGA 1177

 34729794 TAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTT 34729853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTT 1237

 34729854 TTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTG 34729913
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1238 TTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTG 1297

 34729914 AATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTT 34729973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 AATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTT 1357

 34729974 ATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTA 34730033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 ATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTA 1417

 34730034 AGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAG 34730093
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1418 AGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAG 1477

 34730094 TCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATT 34730153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 TCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATT 1537

 34730154 TTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGT 34730213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1538 TTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGT 1597

 34730214 TTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTG 34730273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 TTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTG 1657

 34730274 TTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATC 34730333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATC 1717

 34730334 TCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTG 34730393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 TCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTG 1777

 34730394 CTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAA 34730453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 CTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAA 1837

 34730454 GTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCT 34730513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 GTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCT 1897

 34730514 AGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAG 34730573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAG 1957

 34730574 GTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTAT 34730633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTAT 2017

 34730634 TCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTC 34730693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTC 2077

 34730694 CTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAA 34730753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAA 2137

 34730754 TGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTT 34730780
          |||||||||||||||||||||||||||
     2138 TGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTT 2164

Alignment time is 1.67437 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4170] =>      4170 nucs 'mol-32-211b-009471_4170'

Score:        4082
Aligned:      4170        nucs
Identic:      4162 (100%) nucs =>      1886 (100%)      2276 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726233,34728121] EXCISED REGION [34728617,34730896]
 second seq =>  [       1,    1890] EXCISED REGION [    1891,    4170]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726233 TCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATT 34726292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATT 60

 34726293 GATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGC 34726352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGC 120

 34726353 ATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCAT 34726412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCAT 180

 34726413 GTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGAT 34726472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGAT 240

 34726473 ATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCA 34726532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCA 300

 34726533 TCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACAG 34726591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
      301 TCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAG 360

 34726592 ATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAG 34726651
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAG 420

 34726652 TCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATT 34726711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      421 TCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAAACTTATGCTTGCCATTTTGTTATT 480

 34726712 TGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGT 34726771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGT 540

 34726772 GAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCA 34726831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCA 600

 34726832 TTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGC 34726891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGC 660

 34726892 AGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTC 34726951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTC 720

 34726952 TACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTA 34727011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTA 780

 34727012 CCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCT 34727071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCT 840

 34727072 ACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTG 34727131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTG 900

 34727132 TGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTT 34727191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTT 960

 34727192 CTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGG 34727251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGG 1020

 34727252 GAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGG 34727311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGG 1080

 34727312 GTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAA 34727371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAA 1140

 34727372 GGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTT 34727431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTT 1200

 34727432 TCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATG 34727491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATG 1260

 34727492 CCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTG 34727551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTG 1320

 34727552 AACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACG 34727611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACG 1380

 34727612 TTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCT 34727671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCT 1440

 34727672 TTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCT 34727731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1441 TTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCT 1500

 34727732 GACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTC 34727791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTC 1560

 34727792 TTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAA 34727851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAA 1620

 34727852 TTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTA 34727911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTA 1680

 34727912 GAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTA 34727971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTA 1740

 34727972 TTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTG 34728031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTG 1800

 34728032 CCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATG 34728091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATG 1860

 34728092 TTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 1890

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1950

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 2010

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 2070

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 2130

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 2190

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 2250

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 2310

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 2370

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 2430

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 2490

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2491 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 2550

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 2610

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 2670

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 2730

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2790

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2850

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 2910

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2970

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 3030

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 3090

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 3150

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 3210

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 3270

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 3330

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 3390

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 3450

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3451 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 3510

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 3570

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 3630

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 3690

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 3750

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 3810

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 3870

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 3930

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 3990

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 4050

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 4110

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 4170

Alignment time is 3.15073 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5674] =>      5674 nucs 'mol-32-2291-075062_5674'

Score:        5575
Aligned:      5674        nucs
Identic:      5665 (100%) nucs =>       257 (100%)      5408 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727964,34728220] EXCISED REGION [34728222,34733638]
 second seq =>  [       1,     257] EXCISED REGION [     259,    5674]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728221,34728221]
 second seq =>         1 nucs [258,258]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [34730800,34730800]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728220,34728220] to [34728221,34728221]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34727964 AACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCT 34728023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCT 60

 34728024 CTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCT 34728083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCT 120

 34728084 TGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAG 34728143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAG 180

 34728144 TCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTG 34728203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTG 240

 34728204 GTCCCCAAGCCCCAAAT 34728220
          |||||||||||||||||
      241 GTCCCCAAGCCCCAAAT 257

EXCISED REGION

 34728222 GCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAA 34728281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      259 GCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAA 318

 34728282 GAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAA 34728341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 GAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAA 378

 34728342 ATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTT 34728401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 ATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTT 438

 34728402 TGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCAGCATAGCACTGAGTC 34728461
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      439 TGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCATCATAGCACTGAGTC 498

 34728462 GTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTTCT 34728521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 GTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTTCT 558

 34728522 TTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGGCC 34728581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 TTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGGCC 618

 34728582 CAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGC 34728641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 CAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGC 678

 34728642 CTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTC 34728701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 CTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTC 738

 34728702 CTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGG 34728761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 CTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGG 798

 34728762 GAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGT 34728821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 GAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGT 858

 34728822 GTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTG 34728881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 GTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTG 918

 34728882 ATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGT 34728941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 ATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGT 978

 34728942 TGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGT 34729001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 TGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGT 1038

 34729002 GCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCT 34729061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 GCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCT 1098

 34729062 TCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGC 34729121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 TCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGC 1158

 34729122 TTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCC 34729181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 TTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCC 1218

 34729182 AGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAG 34729241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 AGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAG 1278

 34729242 CACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCT 34729301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 CACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCT 1338

 34729302 AGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCA 34729361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 AGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCA 1398

 34729362 CTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGT 34729421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 CTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGT 1458

 34729422 GCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATG 34729481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 GCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATG 1518

 34729482 CCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCC 34729541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCC 1578

 34729542 ATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCC 34729601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 ATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCC 1638

 34729602 TACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCA 34729661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCA 1698

 34729662 CCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGT 34729721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 CCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGT 1758

 34729722 GTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGC 34729781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 GTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGC 1818

 34729782 TCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAAC 34729841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAAC 1878

 34729842 TTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTAT 34729901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTAT 1938

 34729902 TTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTT 34729961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTT 1998

 34729962 TAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATAAACTATCTCACATT 34730021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATAAACTATCTCACATT 2058

 34730022 TTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTATTACTACTTTAGCT 34730081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 TTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTATTACTACTTTAGCT 2118

 34730082 GCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACT 34730141
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 GTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACT 2178

 34730142 GCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTATTGTTTAATTTACAT 34730201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 GCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTATTGTTTAATTTACAT 2238

 34730202 ATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTT 34730261
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 ATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTT 2298

 34730262 CATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAA 34730321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 CATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAA 2358

 34730322 CAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATGAACAATGGAAAAGA 34730381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 CAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATGAACAATGGAAAAGA 2418

 34730382 ATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAAT 34730441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 ATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAAT 2478

 34730442 AGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTGTTATCAATTATTGT 34730501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 AGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTGTTATCAATTATTGT 2538

 34730502 GAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAG 34730561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 GAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAG 2598

 34730562 TTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGATGTATTCACTAAAAT 34730621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 TTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGATGTATTCACTAAAAT 2658

 34730622 TAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTT 34730681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 TAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTT 2718

 34730682 CTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATATAGTCATTCTGGAC 34730741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 CTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATATAGTCATTCTGGAC 2778

 34730742 ATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTT 34730801
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2779 ATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTTAATTTACCTGCC-T 2837

 34730802 TTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTATAATGGCACGATCT 34730861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 TTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTATAATGGCACGATCT 2897

 34730862 TGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAG 34730921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2898 TGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAG 2957

 34730922 TAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 34730981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 TAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 3017

 34730982 TGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTG 34731041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTG 3077

 34731042 CCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTT 34731101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 CCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTT 3137

 34731102 TTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGC 34731161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 TTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGC 3197

 34731162 CAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATT 34731221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 CAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATT 3257

 34731222 GAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGAC 34731281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 GAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGAC 3317

 34731282 CCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCC 34731341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 CCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCC 3377

 34731342 TTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTA 34731401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 TTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTA 3437

 34731402 GGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACT 34731461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 GGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACT 3497

 34731462 GATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTG 34731521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 GATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTG 3557

 34731522 TTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTTCATGAACTTTATGT 34731581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 TTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTTCATGAACTTTATGT 3617

 34731582 TCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTA 34731641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 TCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTA 3677

 34731642 ATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTA 34731701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3678 ATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTA 3737

 34731702 TGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGA 34731761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 TGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGA 3797

 34731762 AATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAAAAAATATATACATG 34731821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 AATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAAAAAATATATACATG 3857

 34731822 TATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTT 34731881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 TATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTT 3917

 34731882 AAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTC 34731941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 AAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTC 3977

 34731942 TATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTT 34732001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 TATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTT 4037

 34732002 CTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTT 34732061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 CTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTT 4097

 34732062 ACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAA 34732121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 ACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAA 4157

 34732122 TAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAGAATTTATTTTTGTT 34732181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 TAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAGAATTTATTTTTGTT 4217

 34732182 TGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAACAGACAGCTGTTTTTTA 34732241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4218 TGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAATAGACAGCTGTTTTTTA 4277

 34732242 ACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTGCCTTACATGTTTAATATTTTCAGTT 34732301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 ACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTGCCTTACATGTTTAATATTTTCAGTT 4337

 34732302 CTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTATTGTATTAGTGTTCTTCCTCTCAAA 34732361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 CTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTATTGTATTAGTGTTCTTCCTCTCAAA 4397

 34732362 GAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAATGGTGGTAAGTCTTACCAGCTGTGC 34732421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 GAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAATGGTGGTAAGTCTTACCAGCTGTGC 4457

 34732422 TTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGTGACAGATGTTTTTGCTGGGCTTAGA 34732481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 TTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGTGACAGATGTTTTTGCTGGGCTTAGA 4517

 34732482 ATTTTAGGTTATCAAAAGTTTTTCAGAGTTTAAAAATGCTATTTTCTCTTCTCACTTGCC 34732541
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 ATTTTAGGTTGTCAAAAGTTTTTCAGAGTTTAAAAATGCTATTTTCTCTTCTCACTTGCC 4577

 34732542 TAGATTCTAACAAAAAGGTTACTATCACTCTGATCTTTGTTTCTTTGCATATAGTATGTA 34732601
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4578 TAGATTCTAACAAAAAGGTTACTATCACTCTGATCTTTGTTTCTTTGCATATAATATGTA 4637

 34732602 TACATATTTTAAAGATTTTTCAGATCATCTTTAGTGTTCAGCAATTTGAGTACCACATGT 34732661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 TACATATTTTAAAGATTTTTCAGATCATCTTTAGTGTTCAGCAATTTGAGTACCACATGT 4697

 34732662 CTTTGTCTTGTATTGTTTGTGCTTGTCTTTCTGGGTTTCATTGAAGTATTTGGATCTGAG 34732721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 CTTTGTCTTGTATTGTTTGTGCTTGTCTTTCTGGGTTTCATTGAAGTATTTGGATCTGAG 4757

 34732722 ATTTATTGCATTTGTAAATATTTTGGCCATATTTCTTGAAAAAAAATTTACCGTTTCTTC 34732781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 ATTTATTGCATTTGTAAATATTTTGGCCATATTTCTTGAAAAAAAATTTACCGTTTCTTC 4817

 34732782 TCTTTATAGGACTCCAATTACTTAAATATTAGACCACTTAATATTGTCCCACATGTTACC 34732841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 TCTTTATAGGACTCCAATTACTTAAATATTAGACCACTTAATATTGTCCCACATGTTACC 4877

 34732842 GAGACTTTATTTCTTTTCAATATTTACTCTCTGTAAGATTCACTGTGAAGAGTTTCTATT 34732901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 GAGACTTTATTTCTTTTCAATATTTACTCTCTGTAAGATTCACTGTGAAGAGTTTCTATT 4937

 34732902 GTTCCATCTTCTAGCTCACTAATATTTTCTTATGAAGTGTCTAATCTGCTGTTAATCTTA 34732961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 GTTCCATCTTCTAGCTCACTAATATTTTCTTATGAAGTGTCTAATCTGCTGTTAATCTTA 4997

 34732962 TCCAATGAATTTTCTATTTCAGATATTGTTTTTATTTCTAAAATTTTTATTTGATTTAAA 34733021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 TCCAATGAATTTTCTATTTCAGATATTGTTTTTATTTCTAAAATTTTTATTTGATTTAAA 5057

 34733022 AAATATTTTACATTCCTCTTTCACTATTTTATGTTTTCCTTTAAATATCCGAACATAGTT 34733081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 AAATATTTTACATTCCTCTTTCACTATTTTATGTTTTCCTTTAAATATCCGAACATAGTT 5117

 34733082 AAAATAGTGGTTTTAATGTTCTTTTCTGCTAATTATATCATTTTTGTCATTTATGGTCTG 34733141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 AAAATAGTGGTTTTAATGTTCTTTTCTGCTAATTATATCATTTTTGTCATTTATGGTCTG 5177

 34733142 TTTCTGTTAACTGATTTTTCTCTTGGTTATGGATCACATTTTCCTGCTTGCAATGTCTAA 34733201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 TTTCTGTTAACTGATTTTTCTCTTGGTTATGGATCACATTTTCCTGCTTGCAATGTCTAA 5237

 34733202 GACATTTTTACTGGATAATATGATTTATGTGTTGTCCAATATCTGGATTTTGTTGTTTTT 34733261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 GACATTTTTACTGGATAATATGATTTATGTGTTGTCCAATATCTGGATTTTGTTGTTTTT 5297

 34733262 CTTTACTTTAATGAGTAAGGTTTTCTTCTGATAGGGAGTTAGGTTTCTTGTGATTCAGTG 34733321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 CTTTACTTTAATGAGTAAGGTTTTCTTCTGATAGGGAGTTAGGTTTCTTGTGATTCAGTG 5357

 34733322 TTATCTTTTTCAGCTTTGTTTTTAAGCTTATTAAGGTGGATCTAGCATAGCCTTTATTTT 34733381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 TTATCTTTTTCAGCTTTGTTTTTAAGCTTATTAAGGTGGATCTAGCATAGCCTTTATTTT 5417

 34733382 AAGAATCATTTAATTTCAAATAAGTTGTAGCTTCATTAATAAGTTTTTGGGGATCTTTAC 34733441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 AAGAATCATTTAATTTCAAATAAGTTGTAGCTTCATTAATAAGTTTTTGGGGATCTTTAC 5477

 34733442 TGAATGTAAAAAGTGATCAGTGAGAATTCTCTACTCTGTTTGAAGGTGGAACCCTTCCTC 34733501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 TGAATGTAAAAAGTGATCAGTGAGAATTCTCTACTCTGTTTGAAGGTGGAACCCTTCCTC 5537

 34733502 TGTATATGTAAGCTCTGGGAACCATTCTTCTCATAGATTCTTACTTACTCTTTGACCCAA 34733561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 TGTATATGTAAGCTCTGGGAACCATTCTTCTCATAGATTCTTACTTACTCTTTGACCCAA 5597

 34733562 CTCAAGAAGTTTAACTCTATGCATGTGAATCCTAGTATTCAGGAATAGTCAAGAGAGTGT 34733621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 CTCAAGAAGTTTAACTCTATGCATGTGAATCCTAGTATTCAGGAATAGTCAAGAGAGTGT 5657

 34733622 TGATATGGTTTGGCTTT 34733638
          |||||||||||||||||
     5658 TGATATGGTTTGGCTTT 5674

Alignment time is 4.23429 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4519] =>      4519 nucs 'mol-32-22e9-053264_4519'

Score:        4463
Aligned:      4518        nucs
Identic:      4513 (100%) nucs =>       978 (100%)      3535 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727469,34728446] EXCISED REGION [34728448,34731987]
 second seq =>  [       1,     978] EXCISED REGION [     980,    4519]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [979,979]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [977,978] to [980,981]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34727469 TTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGT 34727528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGT 60

 34727529 GTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCT 34727588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCT 120

 34727589 GACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGG 34727648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGG 180

 34727649 CTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCA 34727708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCA 240

 34727709 TTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCAC 34727768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCAC 300

 34727769 TCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTC 34727828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTC 360

 34727829 AATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAAT 34727888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAAT 420

 34727889 CTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTC 34727948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTC 480

 34727949 TTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCT 34728008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCT 540

 34728009 TTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTG 34728068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTG 600

 34728069 TATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCA 34728128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCA 660

 34728129 TTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCT 34728188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCT 720

 34728189 ATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGG 34728248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGG 780

 34728249 TACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGAC 34728308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGAC 840

 34728309 TCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAG 34728368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAG 900

 34728369 CCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCT 34728428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCT 960

 34728429 GAGTCAGACCTAAAGCCA 34728446
          ||||||||||||||||||
      961 GAGTCAGACCTAAAGCCA 978

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1039

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1099

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1159

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1219

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 1279

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 1339

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 1399

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 1459

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 1519

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 1579

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 1639

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 1699

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 1759

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 1819

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 1879

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 1939

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 1999

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 2059

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 2119

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 2179

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 2239

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 2299

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 2359

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 34729887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 2419

 34729888 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 34729947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 2479

 34729948 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 34730007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 2539

 34730008 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 34730067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 2599

 34730068 TTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 34730127
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 TTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 2659

 34730128 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 34730187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 2719

 34730188 TGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 34730247
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 2779

 34730248 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 34730307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 2839

 34730308 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 34730367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 2899

 34730368 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 34730427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 2959

 34730428 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 34730487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 3019

 34730488 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 34730547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 3079

 34730548 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 34730607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 3139

 34730608 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 34730667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 3199

 34730668 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 34730727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 3259

 34730728 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 34730787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 3319

 34730788 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 34730847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 3379

 34730848 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 34730907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 3439

 34730908 CTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 34730967
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 3499

 34730968 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 34731027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 3559

 34731028 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 34731087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 3619

 34731088 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 34731147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 3679

 34731148 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 34731207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 3739

 34731208 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 34731267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 3799

 34731268 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 34731327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 3859

 34731328 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 34731387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 3919

 34731388 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 34731447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 3979

 34731448 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 34731507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 4039

 34731508 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 34731567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 4099

 34731568 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 34731627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 4159

 34731628 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 34731687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4160 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTTATCCACCAAAGAACCTGAG 4219

 34731688 CTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 34731747
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 CTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 4279

 34731748 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 34731807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 4339

 34731808 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 34731867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 4399

 34731868 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 34731927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 4459

 34731928 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 34731987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 4519

Alignment time is 3.42643 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4705] =>      4705 nucs 'mol-32-23a4-051110_4705'

Score:        4617
Aligned:      4705        nucs
Identic:      4697 (100%) nucs =>       977 (100%)      3720 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727144,34728121] EXCISED REGION [34728617,34732343]
 second seq =>  [       1,     978] EXCISED REGION [     979,    4705]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34727144 CTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAG 34727203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAG 60

 34727204 ATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTAT 34727263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTAT 120

 34727264 TTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTT 34727323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTT 180

 34727324 TTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGA 34727383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGA 240

 34727384 GAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTT 34727443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTT 300

 34727444 TAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGT 34727503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGT 360

 34727504 CTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACC 34727563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACC 420

 34727564 TTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTAT 34727623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTAT 480

 34727624 ATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATT 34727683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATT 540

 34727684 TTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTT 34727743
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTT 600

 34727744 TCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAG 34727803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAG 660

 34727804 ACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGAT 34727863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGAT 720

 34727864 TTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATT 34727923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATT 780

 34727924 TCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTC 34727983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTC 840

 34727984 TTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTT 34728043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTT 900

 34728044 CATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTC 34728103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTC 960

 34728104 TGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||
      961 TGTGCATTGAAGAGTTAA 978

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1038

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1098

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1158

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1218

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1278

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1338

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1398

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1458

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1518

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1578

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1579 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1638

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1698

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 1758

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 1818

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 1878

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 1938

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 1998

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2058

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2118

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2178

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 2238

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 2298

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 2358

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 2418

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 2478

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 2538

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2539 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 2598

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 2658

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 2718

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 2778

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 2838

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 2898

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 2958

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 3018

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 3078

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 3138

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 3198

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 3258

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 3318

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 3378

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 3438

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 3498

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 3558

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 3618

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 3678

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 3738

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 3798

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 3858

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 3918

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 3978

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 4038

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 4098

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 4158

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 4218

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 4278

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 34731976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 4338

 34731977 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 34732036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 4398

 34732037 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 34732096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 4458

 34732097 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 34732156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 4518

 34732157 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 34732216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 4578

 34732217 GCATTAAACAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 34732276
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 GCATTAAATAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 4638

 34732277 CCTTACATGTTTAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTA 34732336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 CCTTACATGTTTAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTA 4698

 34732337 TTGTATT 34732343
          |||||||
     4699 TTGTATT 4705

Alignment time is 3.53947 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5774] =>      5774 nucs 'mol-32-2895-117852_5774'

Score:        5697
Aligned:      5774        nucs
Identic:      5767 (100%) nucs =>      4765 (100%)      1002 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34723352,34728121] EXCISED REGION [34728617,34729619]
 second seq =>  [       1,    4771] EXCISED REGION [    4772,    5774]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34723352 AACTTATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACT 34723411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTTATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACT 60

 34723412 TCCTCCCCTCTGAAGCCCACAAAATCTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGA 34723471
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTCCCCTCTGAAGCCCACAAAAACTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGA 120

 34723472 TGACCTGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACA 34723531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGACCTGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACA 180

 34723532 CTCATTGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGT 34723591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCATTGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGT 240

 34723592 ACTGTCACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTA 34723651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTGTCACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTA 300

 34723652 TTTTTCCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTG 34723711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTCCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTG 360

 34723712 TAACACAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAA 34723771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAACACAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAA 420

 34723772 GGAGAAAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCT 34723831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGAAAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCT 480

 34723832 CCCTGAGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCT 34723891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCTGAGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCT 540

 34723892 TCTGGGTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTC 34723951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTGGGTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTC 600

 34723952 CAGTTGCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGC 34724011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTTGCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGC 660

 34724012 CAGAGTGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCAC 34724071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAGTGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCAC 720

 34724072 CACACCATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAG 34724131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACACCATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAG 780

 34724132 CGCAGTCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCA 34724191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGCAGTCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCA 840

 34724192 AAGGTGCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGA 34724251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGGTGCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGA 900

 34724252 CAATATAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAA 34724311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATATAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAA 960

 34724312 TTTTTTGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATC 34724371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTTGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATC 1020

 34724372 TTTCATTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAA 34724431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCATTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAA 1080

 34724432 TGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTG 34724491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTG 1140

 34724492 AATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATT 34724551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATT 1200

 34724552 TTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGG 34724611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGG 1260

 34724612 TAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGA 34724671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGA 1320

 34724672 CTCCTCTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTT 34724731
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCCTGTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTT 1380

 34724732 GTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAG 34724791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAG 1440

 34724792 CTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTT 34724851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTT 1500

 34724852 TTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATC 34724911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATC 1560

 34724912 AAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGAT 34724971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGAT 1620

 34724972 TGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATG 34725031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATG 1680

 34725032 ATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTA 34725091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTA 1740

 34725092 ATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTT 34725151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTT 1800

 34725152 GGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCC 34725211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCC 1860

 34725212 TATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAA 34725271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAA 1920

 34725272 TTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTT 34725331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTT 1980

 34725332 GATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGG 34725391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGG 2040

 34725392 TAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAA 34725451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAA 2100

 34725452 GAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTT 34725511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTT 2160

 34725512 TTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGG 34725571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGG 2220

 34725572 TTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTG 34725631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTG 2280

 34725632 TTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGT 34725691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGT 2340

 34725692 TTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTT 34725751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTT 2400

 34725752 TAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTA 34725811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTA 2460

 34725812 AAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCAT 34725871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCAT 2520

 34725872 TATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGT 34725931
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2521 TATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACCCATCAGT 2580

 34725932 CATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGT 34725991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGT 2640

 34725992 TATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTT 34726051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTT 2700

 34726052 TTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTAC 34726111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTAC 2760

 34726112 ATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATT 34726171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATT 2820

 34726172 AATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACT 34726231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACT 2880

 34726232 GTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATAT 34726291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATAT 2940

 34726292 TGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTG 34726351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTG 3000

 34726352 CATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCA 34726411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCA 3060

 34726412 TGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGA 34726471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGA 3120

 34726472 TATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCC 34726531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCC 3180

 34726532 ATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACA 34726590
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     3181 ATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACA 3240

 34726591 GATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTA 34726650
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTA 3300

 34726651 GTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTAT 34726710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTAT 3360

 34726711 TTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAG 34726770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAG 3420

 34726771 TGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCC 34726830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCC 3480

 34726831 ATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAG 34726890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAG 3540

 34726891 CAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACT 34726950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACT 3600

 34726951 CTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGT 34727010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGT 3660

 34727011 ACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTC 34727070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTC 3720

 34727071 TACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGT 34727130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGT 3780

 34727131 GTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGT 34727190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGT 3840

 34727191 TCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTG 34727250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTG 3900

 34727251 GGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAG 34727310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAG 3960

 34727311 GGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCA 34727370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCA 4020

 34727371 AGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTT 34727430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTT 4080

 34727431 TTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAAT 34727490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAAT 4140

 34727491 GCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTT 34727550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTT 4200

 34727551 GAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAAC 34727610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAAC 4260

 34727611 GTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCC 34727670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCC 4320

 34727671 TTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTC 34727730
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4321 TTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTC 4380

 34727731 TGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACT 34727790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACT 4440

 34727791 CTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGA 34727850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGA 4500

 34727851 ATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCT 34727910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCT 4560

 34727911 AGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCT 34727970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCT 4620

 34727971 ATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGT 34728030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGT 4680

 34728031 GCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGAT 34728090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGAT 4740

 34728091 GTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 4771

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 4831

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 4891

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 4951

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 5011

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 5071

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 5131

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 5191

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 5251

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 5311

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 5371

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5372 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 5431

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 5491

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 5551

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 5611

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 5671

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 5731

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTC 34729619
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTC 5774

Alignment time is 4.60265 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5921] =>      5921 nucs 'mol-32-299d-019574_5921'

Score:        5800
Aligned:      5921        nucs
Identic:      5910 (100%) nucs =>      1998 (100%)      3912 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726122,34728121] EXCISED REGION [34728617,34732536]
 second seq =>  [       1,    2001] EXCISED REGION [    2002,    5921]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726122 GAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTC 34726181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTC 60

 34726182 ATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGG 34726241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGG 120

 34726242 TCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTAT 34726301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTAT 180

 34726302 CTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGC 34726361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGC 240

 34726362 ATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATG 34726421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATG 300

 34726422 ACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTA 34726481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTA 360

 34726482 TAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATC 34726541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATC 420

 34726542 TTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACAGATCATTGGG 34726600
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
      421 TTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCATTGGG 480

 34726601 TCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTAC 34726660
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTAC 540

 34726661 ATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTG 34726720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTG 600

 34726721 GTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGAT 34726780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGAT 660

 34726781 TTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGAT 34726840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGAT 720

 34726841 TTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAA 34726900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAA 780

 34726901 ATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTA 34726960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTA 840

 34726961 ACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTT 34727020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTT 900

 34727021 GAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGT 34727080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGT 960

 34727081 TTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTC 34727140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTC 1020

 34727141 TTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTT 34727200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTT 1080

 34727201 CAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTT 34727260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTT 1140

 34727261 TATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGT 34727320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGT 1200

 34727321 TTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCAC 34727380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCAC 1260

 34727381 TGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGC 34727440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGC 1320

 34727441 TTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGT 34727500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGT 1380

 34727501 AGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTT 34727560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTT 1440

 34727561 ACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACC 34727620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACC 1500

 34727621 TATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCA 34727680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCA 1560

 34727681 ATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTA 34727740
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTA 1620

 34727741 TTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAA 34727800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAA 1680

 34727801 GAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTT 34727860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTT 1740

 34727861 GATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGA 34727920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGA 1800

 34727921 ATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATA 34727980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATA 1860

 34727981 CTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTA 34728040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTA 1920

 34728041 GTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGT 34728100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGT 1980

 34728101 TTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||
     1981 TTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 2001

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 2061

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 2121

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 2181

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 2241

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 2301

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 2361

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 2421

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 2481

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 2541

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 2601

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2602 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 2661

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 2721

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 2781

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 2841

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2901

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2961

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 3021

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 3081

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 3141

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 3201

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 3261

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 3321

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 3381

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 3441

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 3501

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 3561

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3562 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 3621

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 3681

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 3741

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 3801

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 3861

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 3921

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 3981

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 4041

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 4101

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 4161

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 4221

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 4281

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 4341

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 4401

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 4461

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 4521

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 4581

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 4641

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 4701

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 4761

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 4821

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 4881

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 4941

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 5001

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 5061

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 5121

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 5181

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 5241

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 5301

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 34731976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 5361

 34731977 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 34732036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 5421

 34732037 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 34732096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 5481

 34732097 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 34732156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 5541

 34732157 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 34732216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 5601

 34732217 GCATTAAACAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 34732276
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 GCATTAAATAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 5661

 34732277 CCTTACATGTTTAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTA 34732336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 CCTTACATGTTTAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTA 5721

 34732337 TTGTATTAGTGTTCTTCCTCTCAAAGAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAA 34732396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 TTGTATTAGTGTTCTTCCTCTCAAAGAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAA 5781

 34732397 TGGTGGTAAGTCTTACCAGCTGTGCTTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGT 34732456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 TGGTGGTAAGTCTTACCAGCTGTGCTTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGT 5841

 34732457 GACAGATGTTTTTGCTGGGCTTAGAATTTTAGGTTATCAAAAGTTTTTCAGAGTTTAAAA 34732516
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5842 GACAGATGTTTTTGCTGGGCTTAGAATTTTAGGTTGTCAAAAGTTTTTCAGAGTTTAAAA 5901

 34732517 ATGCTATTTTCTCTTCTCAC 34732536
          ||||||||||||||||||||
     5902 ATGCTATTTTCTCTTCTCAC 5921

Alignment time is 4.59138 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2003] =>      2003 nucs 'mol-32-299d-019574_2003'

Score:        1980
Aligned:      2002        nucs
Identic:      2000 (100%) nucs =>       463 (100%)      1537 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726122,34726584] EXCISED REGION [34726585,34728123]
 second seq =>  [       1,     463] EXCISED REGION [     465,    2003]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [464,464]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [34726617,34726617]
 second seq =>         1 nucs [497,497]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [464,464] to [465,465]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726122 GAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTC 34726181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTC 60

 34726182 ATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGG 34726241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGG 120

 34726242 TCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTAT 34726301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTAT 180

 34726302 CTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGC 34726361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGC 240

 34726362 ATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATG 34726421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATG 300

 34726422 ACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTA 34726481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTA 360

 34726482 TAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATC 34726541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATC 420

 34726542 TTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTA 34726584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTA 463

EXCISED REGION

 34726585 GCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGAT 34726644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      465 GCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGAT 524

 34726645 ATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTT 34726704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 ATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTT 584

 34726705 TGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCC 34726764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 TGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCC 644

 34726765 TTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGA 34726824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 TTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGA 704

 34726825 ATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATAT 34726884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 ATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATAT 764

 34726885 TTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATA 34726944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 TTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATA 824

 34726945 AAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCT 34727004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 AAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCT 884

 34727005 TATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAG 34727064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 TATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAG 944

 34727065 TCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTT 34727124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 TCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTT 1004

 34727125 TTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCAT 34727184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 TTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCAT 1064

 34727185 TAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTT 34727244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 TAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTT 1124

 34727245 TTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTA 34727304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 TTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTA 1184

 34727305 TTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGG 34727364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 TTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGG 1244

 34727365 TCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATT 34727424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATT 1304

 34727425 TTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTA 34727484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 TTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTA 1364

 34727485 TTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTT 34727544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 TTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTT 1424

 34727545 GTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGA 34727604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 GTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGA 1484

 34727605 ATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGAT 34727664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 ATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGAT 1544

 34727665 TTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGT 34727724
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1545 TTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGT 1604

 34727725 TTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGA 34727784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGA 1664

 34727785 TCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAAC 34727844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 TCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAAC 1724

 34727845 TCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTA 34727904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTA 1784

 34727905 TTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAA 34727964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 TTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAA 1844

 34727965 ACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTC 34728024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 ACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTC 1904

 34728025 TTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTT 34728084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTT 1964

 34728085 GTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGC 34728123
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 GTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGC 2003

Alignment time is 1.54748 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6623] =>      6623 nucs 'mol-32-29a8-037910_6623'

Score:        6578
Aligned:      6622        nucs
Identic:      6618 (100%) nucs =>       137 (100%)      6481 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34723230,34723366] EXCISED REGION [34723368,34729851]
 second seq =>  [       1,     137] EXCISED REGION [     139,    6623]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34723367,34723367]
 second seq =>         1 nucs [138,138]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3356,3356]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [34723364,34723367] to [34723365,34723368]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34723366,34723366] to [34723368,34723368]
 second seq =>         1 nucs [137,137] to [139,139]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34723230 GTGGCAGGAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACC 34723289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGCAGGAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACC 60

 34723290 TTTAAGCCAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTG 34723349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAAGCCAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTG 120

 34723350 AGAACTTATTGTGCTTT 34723366
          |||||||||||||||||
      121 AGAACTTATTGTGCTTT 137

EXCISED REGION

 34723368 TCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACTTCCTCCCCTCTGAAGC 34723427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      139 TCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACTTCCTCCCCTCTGAAGC 198

 34723428 CCACAAAATCTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGATGACCTGCTTGTGGAG 34723487
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      199 CCACAAAAACTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGATGACCTGCTTGTGGAG 258

 34723488 AGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACACTCATTGGGATGACCT 34723547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      259 AGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACACTCATTGGGATGACCT 318

 34723548 GCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGTACTGTCACTCAGTAAA 34723607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 GCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGTACTGTCACTCAGTAAA 378

 34723608 GCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTATTTTTCCTGGACATGG 34723667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 GCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTATTTTTCCTGGACATGG 438

 34723668 GACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTGTAACACAAACAGTGCT 34723727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 GACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTGTAACACAAACAGTGCT 498

 34723728 GGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAAGGAGAAAAGAGAGAAG 34723787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 GGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAAGGAGAAAAGAGAGAAG 558

 34723788 GACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTG 34723847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 GACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTG 618

 34723848 TGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCTTCTGGGTGCTGCCACA 34723907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 TGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCTTCTGGGTGCTGCCACA 678

 34723908 TTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTCCAGTTGCAGCAGGGAG 34723967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 TTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTCCAGTTGCAGCAGGGAG 738

 34723968 ACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTGT 34724027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 ACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTGT 798

 34724028 GTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACACCATTCCTGGCT 34724087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 GTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACACCATTCCTGGCT 858

 34724088 TACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGTC 34724147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 TACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGTC 918

 34724148 GAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGTGCCACTGGCCA 34724207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 GAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGTGCCACTGGCCA 978

 34724208 CAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATATAGACATTTTA 34724267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 CAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATATAGACATTTTA 1038

 34724268 ACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTTTGGCATCCTCT 34724327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 ACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTTTGGCATCCTCT 1098

 34724328 CTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCATTTTTTTGGTT 34724387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 CTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCATTTTTTTGGTT 1158

 34724388 AAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGATTATTTTTAAT 34724447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 AAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGATTATTTTTAAT 1218

 34724448 TTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTTTGTATGTTGAT 34724507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 TTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTTTGTATGTTGAT 1278

 34724508 TTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTGGTGGAGTCT 34724567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 TTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTGGTGGAGTCT 1338

 34724568 TAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTGACTTATTCC 34724627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 TAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTGACTTATTCC 1398

 34724628 TTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTCTAGCTAGGAT 34724687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 TTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTCTAGCTAGGAT 1458

 34724688 TTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCTCCAGATCTT 34724747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCTCCAGATCTT 1518

 34724748 ACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGGTCTGTCATA 34724807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 ACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGGTCTGTCATA 1578

 34724808 TATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTTA 34724867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 TATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTTA 1638

 34724868 ATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATGATTATG 34724927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 ATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATGATTATG 1698

 34724928 TGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAAATGTTG 34724987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAAATGTTG 1758

 34724988 AACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAATATATT 34725047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 AACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAATATATT 1818

 34725048 ATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCAGAGATG 34725107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 ATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCAGAGATG 1878

 34725108 TTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAGGTAATA 34725167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAGGTAATA 1938

 34725168 CTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAAAACAAT 34725227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 CTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAAAACAAT 1998

 34725228 TTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATGAAGCCA 34725287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATGAAGCCA 2058

 34725288 TCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCAATTGTT 34725347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 TCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCAATTGTT 2118

 34725348 GTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTATGTGTCT 34725407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 GTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTATGTGTCT 2178

 34725408 AGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGTAGCCAT 34725467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 AGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGTAGCCAT 2238

 34725468 AATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCTGATTTT 34725527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 AATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCTGATTTT 2298

 34725528 ATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATTTTATTC 34725587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 ATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATTTTATTC 2358

 34725588 ATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCATTTCAAT 34725647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 ATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCATTTCAAT 2418

 34725648 TTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTTTTCT 34725707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2419 TTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCCTTTCT 2478

 34725708 TCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCATTGTTAG 34725767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCATTGTTAG 2538

 34725768 ATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTCCTAGTA 34725827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 ATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTCCTAGTA 2598

 34725828 CTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTTAAG 34725887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 CTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTTAAG 2658

 34725888 AAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAGT 34725947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 AAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAGT 2718

 34725948 GTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTTT 34726007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 GTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTTT 2778

 34726008 TATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAAA 34726067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 TATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAAA 2838

 34726068 CTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGATG 34726127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 CTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGATG 2898

 34726128 AATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTTT 34726187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 AATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTTT 2958

 34726188 TTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGTC 34726247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGTC 3018

 34726248 CAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTCT 34726307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 CAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTCT 3078

 34726308 GTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATAT 34726367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 GTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATAT 3138

 34726368 ATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTC 34726427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 ATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTC 3198

 34726428 TTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTA 34726487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 TTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTA 3258

 34726488 CTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGT 34726547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 CTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGT 3318

 34726548 CTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTA-GCAACAGATCATTGGGTCTTGC 34726606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     3319 CTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCATTGGGTCTTGC 3378

 34726607 TTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAA 34726666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAA 3438

 34726667 TGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCT 34726726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 TGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCT 3498

 34726727 TTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCAT 34726786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 TTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCAT 3558

 34726787 TGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTAC 34726846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 TGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTAC 3618

 34726847 TTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAAC 34726906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAAC 3678

 34726907 ACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTG 34726966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 ACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTG 3738

 34726967 TCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAG 34727026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 TCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAG 3798

 34727027 TTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTT 34727086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTT 3858

 34727087 TACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTA 34727146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 TACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTA 3918

 34727147 GTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATT 34727206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 GTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATT 3978

 34727207 GAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTC 34727266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 GAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTC 4038

 34727267 TCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTG 34727326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 TCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTG 4098

 34727327 CTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAA 34727386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4099 CTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAA 4158

 34727387 GTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAA 34727446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 GTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAA 4218

 34727447 GAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTT 34727506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 GAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTT 4278

 34727507 CTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTT 34727566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 CTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTT 4338

 34727567 CTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATA 34727626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 CTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATA 4398

 34727627 TTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTC 34727686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 TTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTC 4458

 34727687 TAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCA 34727746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 TAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCA 4518

 34727747 AATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACT 34727806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 AATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACT 4578

 34727807 GTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTC 34727866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 GTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTC 4638

 34727867 TTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCT 34727926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 TTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCT 4698

 34727927 TATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTT 34727986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 TATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTT 4758

 34727987 CTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCAT 34728046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 CTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCAT 4818

 34728047 TTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGT 34728106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 TTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGT 4878

 34728107 GCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCT 34728166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 GCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCT 4938

 34728167 TTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGT 34728226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 TTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGT 4998

 34728227 GGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATT 34728286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 GGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATT 5058

 34728287 CTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGA 34728346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 CTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGA 5118

 34728347 GTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGA 34728406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 GTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGA 5178

 34728407 CCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCAGCATAGCACTGAGTCGTGCC 34728466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5179 CCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCATCATAGCACTGAGTCGTGCC 5238

 34728467 CAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTTCTTTGGG 34728526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 CAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTTCTTTGGG 5298

 34728527 CCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGGCCCAGAG 34728586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 CCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGGCCCAGAG 5358

 34728587 CAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCT 34728646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 CAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCT 5418

 34728647 TCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTA 34728706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 TCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTA 5478

 34728707 CTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATA 34728766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 CTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATA 5538

 34728767 TACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACT 34728826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 TACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACT 5598

 34728827 ACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAA 34728886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 ACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAA 5658

 34728887 TTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGT 34728946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 TTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGT 5718

 34728947 CTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACT 34729006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 CTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACT 5778

 34729007 ATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACT 34729066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 ATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACT 5838

 34729067 CTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGG 34729126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 CTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGG 5898

 34729127 TTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTG 34729186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 TTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTG 5958

 34729187 GTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTA 34729246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 GTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTA 6018

 34729247 GGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAAC 34729306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 GGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAAC 6078

 34729307 CCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGG 34729366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 CCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGG 6138

 34729367 ATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAG 34729426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 ATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAG 6198

 34729427 CTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAG 34729486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 CTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAG 6258

 34729487 ACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTG 34729546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 ACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTG 6318

 34729547 GCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCC 34729606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 GCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCC 6378

 34729607 TCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGA 34729666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 TCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGA 6438

 34729667 TTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCC 34729726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 TTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCC 6498

 34729727 TTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATT 34729786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 TTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATT 6558

 34729787 TTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAA 34729846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 TTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAA 6618

 34729847 TACTC 34729851
          |||||
     6619 TACTC 6623

Alignment time is 4.86133 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,   11535] =>     11535 nucs 'mol-32-2afd-011270_11535'

Score:       11337
Aligned:     11535        nucs
Identic:     11517 (100%) nucs =>      3688 (100%)      7829 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34724430,34728121] EXCISED REGION [34728617,34736458]
 second seq =>  [       1,    3693] EXCISED REGION [    3694,   11535]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34724430 AATGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTAC 34724489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTAC 60

 34724490 TGAATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAA 34724549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAA 120

 34724550 TTTTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAG 34724609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAG 180

 34724610 GGTAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCT 34724669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCT 240

 34724670 GACTCCTCTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCC 34724729
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTCCTGTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCC 300

 34724730 TTGTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACT 34724789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACT 360

 34724790 AGCTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAG 34724849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAG 420

 34724850 TTTTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCA 34724909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCA 480

 34724910 TCAAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTG 34724969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTG 540

 34724970 ATTGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTA 34725029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTA 600

 34725030 TGATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCAT 34725089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCAT 660

 34725090 TAATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGT 34725149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGT 720

 34725150 TTGGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCT 34725209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCT 780

 34725210 CCTATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAG 34725269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAG 840

 34725270 AATTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCT 34725329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCT 900

 34725330 TTGATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATT 34725389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATT 960

 34725390 GGTAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCT 34725449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCT 1020

 34725450 AAGAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCT 34725509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCT 1080

 34725510 TTTTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAA 34725569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAA 1140

 34725570 GGTTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTAT 34725629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTAT 1200

 34725630 TGTTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGAT 34725689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGAT 1260

 34725690 GTTTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTC 34725749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTC 1320

 34725750 TTTAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTG 34725809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTG 1380

 34725810 TAAAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCC 34725869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCC 1440

 34725870 ATTATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCA 34725929
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1441 ATTATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACCCATCA 1500

 34725930 GTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTT 34725989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTT 1560

 34725990 GTTATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAAT 34726049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAAT 1620

 34726050 TTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGT 34726109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGT 1680

 34726110 ACATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGA 34726169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGA 1740

 34726170 TTAATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTA 34726229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTA 1800

 34726230 CTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTAT 34726289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTAT 1860

 34726290 ATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTAC 34726349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTAC 1920

 34726350 TGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTAT 34726409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTAT 1980

 34726410 CATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCT 34726469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCT 2040

 34726470 GATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTT 34726529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTT 2100

 34726530 CCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAA 34726588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     2101 CCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAA 2160

 34726589 CAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTT 34726648
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTT 2220

 34726649 TAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTT 34726708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTT 2280

 34726709 ATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTC 34726768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTC 2340

 34726769 AGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATAT 34726828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATAT 2400

 34726829 CCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTA 34726888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTA 2460

 34726889 AGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAA 34726948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAA 2520

 34726949 CTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATT 34727008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATT 2580

 34727009 GTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTT 34727068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTT 2640

 34727069 TCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCC 34727128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCC 2700

 34727129 GTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAAT 34727188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAAT 2760

 34727189 GTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTC 34727248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTC 2820

 34727249 TGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCT 34727308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCT 2880

 34727309 AGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTG 34727368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTG 2940

 34727369 CAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTT 34727428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTT 3000

 34727429 TTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAA 34727488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAA 3060

 34727489 ATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCC 34727548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCC 3120

 34727549 TTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAA 34727608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAA 3180

 34727609 ACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTC 34727668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTC 3240

 34727669 CCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCC 34727728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3241 CCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCC 3300

 34727729 TCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAA 34727788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAA 3360

 34727789 CTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTA 34727848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTA 3420

 34727849 GAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTG 34727908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTG 3480

 34727909 CTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAG 34727968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAG 3540

 34727969 CTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTG 34728028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTG 3600

 34728029 GTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGG 34728088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGG 3660

 34728089 ATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 3693

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 3753

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 3813

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 3873

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 3933

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 3993

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 4053

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 4113

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 4173

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 4233

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 4293

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4294 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 4353

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 4413

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 4473

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 4533

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 4593

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 4653

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 4713

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 4773

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 4833

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 4893

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 4953

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 5013

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 5073

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 5133

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 5193

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 5253

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5254 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 5313

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 5373

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 5433

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5434 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAGT 5493

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 5553

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 5613

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 5673

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 5733

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 5793

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 5853

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 5913

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 5973

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 6033

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 6093

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 6153

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 6213

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 6273

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 6333

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6334 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 6393

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 6453

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 6513

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6514 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 6573

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 6633

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6634 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 6693

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6694 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 6753

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6754 AAGAACCTGAGATAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 6813

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6814 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 6873

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6874 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 6933

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6934 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 6993

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 34731976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6994 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 7053

 34731977 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 34732036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7054 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 7113

 34732037 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 34732096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7114 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 7173

 34732097 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 34732156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7174 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 7233

 34732157 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 34732216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7234 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 7293

 34732217 GCATTAAACAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 34732276
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7294 GCATTAAATAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 7353

 34732277 CCTTACATGTTTAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTA 34732336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7354 CCTTACATGTTTAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTA 7413

 34732337 TTGTATTAGTGTTCTTCCTCTCAAAGAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAA 34732396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7414 TTGTATTAGTGTTCTTCCTCTCAAAGAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAA 7473

 34732397 TGGTGGTAAGTCTTACCAGCTGTGCTTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGT 34732456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7474 TGGTGGTAAGTCTTACCAGCTGTGCTTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGT 7533

 34732457 GACAGATGTTTTTGCTGGGCTTAGAATTTTAGGTTATCAAAAGTTTTTCAGAGTTTAAAA 34732516
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7534 GACAGATGTTTTTGCTGGGCTTAGAATTTTAGGTTGTCAAAAGTTTTTCAGAGTTTAAAA 7593

 34732517 ATGCTATTTTCTCTTCTCACTTGCCTAGATTCTAACAAAAAGGTTACTATCACTCTGATC 34732576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7594 ATGCTATTTTCTCTTCTCACTTGCCTAGATTCTAACAAAAAGGTTACTATCACTCTGATC 7653

 34732577 TTTGTTTCTTTGCATATAGTATGTATACATATTTTAAAGATTTTTCAGATCATCTTTAGT 34732636
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7654 TTTGTTTCTTTGCATATAATATGTATACATATTTTAAAGATTTTTCAGATCATCTTTAGT 7713

 34732637 GTTCAGCAATTTGAGTACCACATGTCTTTGTCTTGTATTGTTTGTGCTTGTCTTTCTGGG 34732696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7714 GTTCAGCAATTTGAGTACCACATGTCTTTGTCTTGTATTGTTTGTGCTTGTCTTTCTGGG 7773

 34732697 TTTCATTGAAGTATTTGGATCTGAGATTTATTGCATTTGTAAATATTTTGGCCATATTTC 34732756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7774 TTTCATTGAAGTATTTGGATCTGAGATTTATTGCATTTGTAAATATTTTGGCCATATTTC 7833

 34732757 TTGAAAAAAAATTTACCGTTTCTTCTCTTTATAGGACTCCAATTACTTAAATATTAGACC 34732816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7834 TTGAAAAAAAATTTACCGTTTCTTCTCTTTATAGGACTCCAATTACTTAAATATTAGACC 7893

 34732817 ACTTAATATTGTCCCACATGTTACCGAGACTTTATTTCTTTTCAATATTTACTCTCTGTA 34732876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7894 ACTTAATATTGTCCCACATGTTACCGAGACTTTATTTCTTTTCAATATTTACTCTCTGTA 7953

 34732877 AGATTCACTGTGAAGAGTTTCTATTGTTCCATCTTCTAGCTCACTAATATTTTCTTATGA 34732936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7954 AGATTCACTGTGAAGAGTTTCTATTGTTCCATCTTCTAGCTCACTAATATTTTCTTATGA 8013

 34732937 AGTGTCTAATCTGCTGTTAATCTTATCCAATGAATTTTCTATTTCAGATATTGTTTTTAT 34732996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8014 AGTGTCTAATCTGCTGTTAATCTTATCCAATGAATTTTCTATTTCAGATATTGTTTTTAT 8073

 34732997 TTCTAAAATTTTTATTTGATTTAAAAAATATTTTACATTCCTCTTTCACTATTTTATGTT 34733056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8074 TTCTAAAATTTTTATTTGATTTAAAAAATATTTTACATTCCTCTTTCACTATTTTATGTT 8133

 34733057 TTCCTTTAAATATCCGAACATAGTTAAAATAGTGGTTTTAATGTTCTTTTCTGCTAATTA 34733116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8134 TTCCTTTAAATATCCGAACATAGTTAAAATAGTGGTTTTAATGTTCTTTTCTGCTAATTA 8193

 34733117 TATCATTTTTGTCATTTATGGTCTGTTTCTGTTAACTGATTTTTCTCTTGGTTATGGATC 34733176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8194 TATCATTTTTGTCATTTATGGTCTGTTTCTGTTAACTGATTTTTCTCTTGGTTATGGATC 8253

 34733177 ACATTTTCCTGCTTGCAATGTCTAAGACATTTTTACTGGATAATATGATTTATGTGTTGT 34733236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8254 ACATTTTCCTGCTTGCAATGTCTAAGACATTTTTACTGGATAATATGATTTATGTGTTGT 8313

 34733237 CCAATATCTGGATTTTGTTGTTTTTCTTTACTTTAATGAGTAAGGTTTTCTTCTGATAGG 34733296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8314 CCAATATCTGGATTTTGTTGTTTTTCTTTACTTTAATGAGTAAGGTTTTCTTCTGATAGG 8373

 34733297 GAGTTAGGTTTCTTGTGATTCAGTGTTATCTTTTTCAGCTTTGTTTTTAAGCTTATTAAG 34733356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8374 GAGTTAGGTTTCTTGTGATTCAGTGTTATCTTTTTCAGCTTTGTTTTTAAGCTTATTAAG 8433

 34733357 GTGGATCTAGCATAGCCTTTATTTTAAGAATCATTTAATTTCAAATAAGTTGTAGCTTCA 34733416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8434 GTGGATCTAGCATAGCCTTTATTTTAAGAATCATTTAATTTCAAATAAGTTGTAGCTTCA 8493

 34733417 TTAATAAGTTTTTGGGGATCTTTACTGAATGTAAAAAGTGATCAGTGAGAATTCTCTACT 34733476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8494 TTAATAAGTTTTTGGGGATCTTTACTGAATGTAAAAAGTGATCAGTGAGAATTCTCTACT 8553

 34733477 CTGTTTGAAGGTGGAACCCTTCCTCTGTATATGTAAGCTCTGGGAACCATTCTTCTCATA 34733536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8554 CTGTTTGAAGGTGGAACCCTTCCTCTGTATATGTAAGCTCTGGGAACCATTCTTCTCATA 8613

 34733537 GATTCTTACTTACTCTTTGACCCAACTCAAGAAGTTTAACTCTATGCATGTGAATCCTAG 34733596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8614 GATTCTTACTTACTCTTTGACCCAACTCAAGAAGTTTAACTCTATGCATGTGAATCCTAG 8673

 34733597 TATTCAGGAATAGTCAAGAGAGTGTTGATATGGTTTGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCT 34733656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8674 TATTCAGGAATAGTCAAGAGAGTGTTGATATGGTTTGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCT 8733

 34733657 CATGTCAAGCTGTGGTTGTCAGTGTTGAAGGAGGGGCCGAGTGGGAGGTGATTTAATTGT 34733716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8734 CATGTCAAGCTGTGGTTGTCAGTGTTGAAGGAGGGGCCGAGTGGGAGGTGATTTAATTGT 8793

 34733717 GGGGGTGAACTTACCCCTTGCTGTTCTTGTGATAGAGTTCTCATGAGATCTGGTTGTTTG 34733776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8794 GGGGGTGAACTTACCCCTTGCTGTTCTTGTGATAGAGTTCTCATGAGATCTGGTTGTTTG 8853

 34733777 AAAAGTGTGTGGGACTTCCCCCTTCTCTCTCTCTCTCTTTCCTGCCCACCATGTAAGACA 34733836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8854 AAAAGTGTGTGGGACTTCCCCCTTCTCTCTCTCTCTCTTTCCTGCCCACCATGTAAGACA 8913

 34733837 TGCTTGCTTCCCTTTCACCTTTTGCTATGATTGTAAGTTTCTTAAGGCTTCTCCAGCCAT 34733896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8914 TGCTTGCTTCCCTTTCACCTTTTGCTATGATTGTAAGTTTCTTAAGGCTTCTCCAGCCAT 8973

 34733897 GCTTCCTGTACAACTTGTGGATCATGGGTCAATTAAACTTATTTTCTTCATAAATTACCC 34733956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8974 GCTTCCTGTACAACTTGTGGATCATGGGTCAATTAAACTTATTTTCTTCATAAATTACCC 9033

 34733957 AAGCTCTGGTATGTCTTTATAGCAGTGTGATAATGGACTAATATAGAAAACTGATATTGA 34734016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9034 AAGCTCTGGTATGTCTTTATAGCAGTGTGATAATGGACTAATATAGAAAACTGATATTGA 9093

 34734017 GTAGTGGGGCATTGCTATAAAGATACCTGAAAATATGGAAATGACTTTGGAACTGGGTAA 34734076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9094 GTAGTGGGGCATTGCTATAAAGATACCTGAAAATATGGAAATGACTTTGGAACTGGGTAA 9153

 34734077 CAGACAGAGATTGGAACAGTTCGGAGGGCTGAGAAGAAGACAGGAAGATGAGGGAAAGTT 34734136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9154 CAGACAGAGATTGGAACAGTTCGGAGGGCTGAGAAGAAGACAGGAAGATGAGGGAAAGTT 9213

 34734137 TGGAACTTCCTAGAGATTTGTTGAATGGTTTTGACCAAAATGCTAATAGTGATATGGATA 34734196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9214 TGGAACTTCCTAGAGATTTGTTGAATGGTTTTGACCAAAATGCTAATAGTGATATGGATA 9273

 34734197 TTGAAGTCCAGGCTGATGAGGTCTCAGATGGAAATGAGAAACTTCCTGGGAAATAAAGTA 34734256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9274 TTGAAGTCCAGGCTGATGAGGTCTCAGATGGAAATGAGAAACTTCCTGGGAAATAAAGTA 9333

 34734257 AAGGTCGTTCATGCTATGCTTTAGCAAAGAGATGGGCAGCATTGTGCCACTGCTCTAGGG 34734316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9334 AAGGTCGTTCATGCTATGCTTTAGCAAAGAGATGGGCAGCATTGTGCCACTGCTCTAGGG 9393

 34734317 ATCTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGACGATTTAGGGTATCTAGCAGAAAAAATTTCTA 34734376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9394 ATCTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGACGATTTAGGGTATCTAGCAGAAAAAATTTCTA 9453

 34734377 AGCAGCAAAGAGTTCAATAATGTGACCTGGCTGCTTCTAACAACATATGCTTATATGCAT 34734436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9454 AGCAGCAAAGAGTTCAATAATGTGACCTGGCTGCTTCTAACAACATATGCTTATATGCAT 9513

 34734437 TCACAAAGAGATGCTCTTAAATTGGAACTTATATTTAAAAGTGAAGCAGAGCATAAAAGT 34734496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9514 TCACAAAGAGATGCTCTTAAATTGGAACTTATATTTAAAAGTGAAGCAGAGCATAAAAGT 9573

 34734497 TTGGAAAACGTGCAGCCTGACTATGCGGTAGAAAAGAAAATCCCATTTTCTGTGGAGAAA 34734556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     9574 TTGGAAAACGTGCAGCCTGACTATGCGGTAGAAAAGAAAAACCCATTTTCTGTGGAGAAA 9633

 34734557 TTCAAGCCAGCTACATAAATTTGCATAAGTAAAGAGGAGGAGCCAAATATTAATAGCCAG 34734616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9634 TTCAAGCCAGCTACATAAATTTGCATAAGTAAAGAGGAGGAGCCAAATATTAATAGCCAG 9693

 34734617 GACAATGGGGAAAATGCCTCTAGGGCATTTCAGAGACCTTCACAGCAGGCCCTCCCATCA 34734676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9694 GACAATGGGGAAAATGCCTCTAGGGCATTTCAGAGACCTTCACAGCAGGCCCTCCCATCA 9753

 34734677 CAGACCTGGAGGTGTAGGAGGGAAAAATAGTTTCATGGGCTGTTCCTGGGGCCCTGCTGC 34734736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9754 CAGACCTGGAGGTGTAGGAGGGAAAAATAGTTTCATGGGCTGTTCCTGGGGCCCTGCTGC 9813

 34734737 TCTGTGCAACCTCAGAACATGGCTCCTTTTGTCTCAGCTGCTCCAGCTCCAGTCATGGCT 34734796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9814 TCTGTGCAACCTCAGAACATGGCTCCTTTTGTCTCAGCTGCTCCAGCTCCAGTCATGGCT 9873

 34734797 AAAAGGAGCTAAGGTACAGCTCAGACCCTTGCTTCAGAGTGTGTAAACTCCAAGCTTTGG 34734856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9874 AAAAGGAGCTAAGGTACAGCTCAGACCCTTGCTTCAGAGTGTGTAAACTCCAAGCTTTGG 9933

 34734857 CAGCTTCCACATGGTGTTGGGCCTGTGGGTGCACAGAGGGCAACAGTGGAGACTTGAGAC 34734916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9934 CAGCTTCCACATGGTGTTGGGCCTGTGGGTGCACAGAGGGCAACAGTGGAGACTTGAGAC 9993

 34734917 CTCTGCCTTAATTTCAGAGGATGTATGGAAACACCTAGATGTCCAGGCAGAATTCTGCTG 34734976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9994 CTCTGCCTTAATTTCAGAGGATGTATGGAAACACCTAGATGTCCAGGCAGAATTCTGCTG 10053

 34734977 CAGGGGCAGAGCCCAAATGGAGAACCTCTATTAGAACAGTGAGGAGGGCAAATGTGAGGT 34735036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10054 CAGGGGCAGAGCCCAAATGGAGAACCTCTATTAGAACAGTGAGGAGGGCAAATGTGAGGT 10113

 34735037 TGGAGCCCCCATACATAATCCCCACTGGGGCACTGCCTAGTGGAGCTGTGAGAAGAAGAC 34735096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10114 TGGAGCCCCCATACATAATCCCCACTGGGGCACTGCCTAGTGGAGCTGTGAGAAGAAGAC 10173

 34735097 TACCATCCTCCAGAACCCAGAATGGTAGATCCACTTGCAAACAGCTTGCACCGTGAGCCT 34735156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10174 TACCATCCTCCAGAACCCAGAATGGTAGATCCACTTGCAAACAGCTTGCACCGTGAGCCT 10233

 34735157 GGAAAAGTTGCAGGCACTCAATGCCAGCCCTTGAGAGCAGCCATGGGAGCTGAGCCTTGC 34735216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10234 GGAAAAGTTGCAGGCACTCAATGCCAGCCCTTGAGAGCAGCCATGGGAGCTGAGCCTTGC 10293

 34735217 AGAACCACAGGGGCAGAGCTGTCCAAGGCCTTGGGAGTCCACCCCTTGCATCAGTGTGGC 34735276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
    10294 AGAACCACAGGGGCAGAGCTGTCCAAGGCCTTGGGAGTCCACCCCTTGCATCAGTGTGAC 10353

 34735277 CTGGATGTGAGACATGGAGTCAAAGGAAATTATTTTGGAGCTTTAAGATTTAACAACTGC 34735336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10354 CTGGATGTGAGACATGGAGTCAAAGGAAATTATTTTGGAGCTTTAAGATTTAACAACTGC 10413

 34735337 CCTGCTGGGCTTTGGACTTGCATCTGACCTTTAGCCCCTTGGTTTTGGCCAATTTCTTCC 34735396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10414 CCTGCTGGGCTTTGGACTTGCATCTGACCTTTAGCCCCTTGGTTTTGGCCAATTTCTTCC 10473

 34735397 TTTTGGAAAGGGAGTATTTACCCAATGCCTGTACTCACATTTTATCTTGAAAGTAACTAA 34735456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10474 TTTTGGAAAGGGAGTATTTACCCAATGCCTGTACTCACATTTTATCTTGAAAGTAACTAA 10533

 34735457 CTTGTTTTTTATTTTATAGGCTTATAGGCAGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAAATGAGACT 34735516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10534 CTTGTTTTTTATTTTATAGGCTTATAGGCAGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAAATGAGACT 10593

 34735517 TTGGACTTGGACTTTTGAGTTAATGGTATAATGAGTTAAGACTTTGGGGGACTGTTGGGA 34735576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10594 TTGGACTTGGACTTTTGAGTTAATGGTATAATGAGTTAAGACTTTGGGGGACTGTTGGGA 10653

 34735577 AGGCATGATTATGTTTTGAAATGTGAAAAGGACATGAGATTTGGGAAGAGCCAGGACAGG 34735636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10654 AGGCATGATTATGTTTTGAAATGTGAAAAGGACATGAGATTTGGGAAGAGCCAGGACAGG 10713

 34735637 ATGATATAATTTGGCTCTGTGTCCCCACGCAAGTCTCATGTCAATTTGTGGTTCCCAGTG 34735696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10714 ATGATATAATTTGGCTCTGTGTCCCCACGCAAGTCTCATGTCAATTTGTGGTTCCCAGTG 10773

 34735697 ATGGATGAGGGGCCTGGTGGGAGGTAATTGAATCATGGAAGCAGACTTATTCTTTGTTGT 34735756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10774 ATGGATGAGGGGCCTGGTGGGAGGTAATTGAATCATGGAAGCAGACTTATTCTTTGTTGT 10833

 34735757 GCCTTATGATTGATTTGTCATGCGATTGGTTGTTTGAGAAGTGTGTGGCATTTCCCCACC 34735816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10834 GCCTTATGATTGATTTGTCATGCGATTGGTTGTTTGAGAAGTGTGTGGCATTTCCCCACC 10893

 34735817 TACCCCCACCTCCTGTCCACCACGTAAGATCCGTTTGCTTCTCCTTTACCTTCTGCTATG 34735876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10894 TACCCCCACCTCCTGTCCACCACGTAAGATCCGTTTGCTTCTCCTTTACCTTCTGCTATG 10953

 34735877 ATTGTAAGTTTCCTAAGGCCTCCCCAGCCATGCTTTCTGTAGAGGCTGTAAAACCGTGAG 34735936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10954 ATTGTAAGTTTCCTAAGGCCTCCCCAGCCATGCTTTCTGTAGAGGCTGTAAAACCGTGAG 11013

 34735937 TTGATTAAACCTCTTTTCTTCATAAATTACCCAGTCTCAGGTATGTCTTTATGGCAGTGT 34735996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11014 TTGATTAAACCTCTTTTCTTCATAAATTACCCAGTCTCAGGTATGTCTTTATGGCAGTGT 11073

 34735997 GAGAACAGACTAATACAGATATCTGTTCATATTTTTGTAGCTCTTTTTCTGTAAAGCTTT 34736056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11074 GAGAACAGACTAATACAGATATCTGTTCATATTTTTGTAGCTCTTTTTCTGTAAAGCTTT 11133

 34736057 CTTCTCTTCAGAACTCTAGCACAAAACTTCCAACCACCTCAGCTTTATTGAACTCCAGTA 34736116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11134 CTTCTCTTCAGAACTCTAGCACAAAACTTCCAACCACCTCAGCTTTATTGAACTCCAGTA 11193

 34736117 TCAAAAACTCATCAAGACCACTGCATACTTATCATGATCTCCTTCCCTGTGTTGTAGTCT 34736176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11194 TCAAAAACTCATCAAGACCACTGCATACTTATCATGATCTCCTTCCCTGTGTTGTAGTCT 11253

 34736177 AGAATGTTTTTCAAGAAAGACAGGACACTCATAGGAATCATCTTTTTTGTTTCTCTTCTC 34736236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11254 AGAATGTTTTTCAAGAAAGACAGGACACTCATAGGAATCATCTTTTTTGTTTCTCTTCTC 11313

 34736237 TCAGGTATTACATTTATGCACTGTCTGCTGCCAAAGATCTGAAACCAATGATCTCATATA 34736296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11314 TCAGGTATTACATTTATGCACTGTCTGCTGCCAAAGATCTGAAACCAATGATCTCATATA 11373

 34736297 TATGGTACAGTTTTCTAGTTATTTACAGTGGGAGAGTAAATTATCCATGCTCAGAAGTGT 34736356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11374 TATGGTACAGTTTTCTAGTTATTTACAGTGGGAGAGTAAATTATCCATGCTCAGAAGTGT 11433

 34736357 AAGTCTTGTATGTCTTATTTTAAAAAGTTTCTTAGCTTATTCAGATGCATGATCAGGGTT 34736416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11434 AAGTCTTGTATGTCTTATTTTAAAAAGTTTCTTAGCTTATTCAGATGCATGATCAGGGTT 11493

 34736417 GGGAACCACTCAAAAGTTTTCAATTTTATATTAATGGGGTCT 34736458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11494 GGGAACCACTCAAAAGTTTTCAATTTTATATTAATGGGGTCT 11535

Alignment time is 8.35588 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3695] =>      3695 nucs 'mol-32-2afd-011270_3695'

Score:        3650
Aligned:      3694        nucs
Identic:      3690 (100%) nucs =>       247 (100%)      3443 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34724430,34724676] EXCISED REGION [34724678,34728123]
 second seq =>  [       1,     247] EXCISED REGION [     249,    3695]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34724677,34724677]
 second seq =>         1 nucs [248,248]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2156,2156]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34724676,34724676] to [34724678,34724678]
 second seq =>         1 nucs [247,247] to [249,249]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34724430 AATGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTAC 34724489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTAC 60

 34724490 TGAATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAA 34724549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAA 120

 34724550 TTTTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAG 34724609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAG 180

 34724610 GGTAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCT 34724669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCT 240

 34724670 GACTCCT 34724676
          |||||||
      241 GACTCCT 247

EXCISED REGION

 34724678 TAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGC 34724737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      249 TAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGC 308

 34724738 TCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATG 34724797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      309 TCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATG 368

 34724798 GTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCA 34724857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      369 GTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCA 428

 34724858 GTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAA 34724917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 GTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAA 488

 34724918 AATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTT 34724977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 AATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTT 548

 34724978 GCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTT 34725037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 GCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTT 608

 34725038 GTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTT 34725097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 GTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTT 668

 34725098 ATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTT 34725157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 ATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTT 728

 34725158 TAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTT 34725217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 TAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTT 788

 34725218 TCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGC 34725277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 TCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGC 848

 34725278 AATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTT 34725337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 AATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTT 908

 34725338 GTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTT 34725397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 GTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTT 968

 34725398 TTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTA 34725457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 TTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTA 1028

 34725458 TAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAAT 34725517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 TAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAAT 1088

 34725518 ATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATT 34725577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 ATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATT 1148

 34725578 AATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTT 34725637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 AATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTT 1208

 34725638 TCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTA 34725697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 TCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTA 1268

 34725698 TTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGAT 34725757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGAT 1328

 34725758 GCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTC 34725817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 GCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTC 1388

 34725818 CTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCAT 34725877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 CTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCAT 1448

 34725878 TTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCA 34725937
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1449 TTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCA 1508

 34725938 GGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGA 34725997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 GGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGA 1568

 34725998 TTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAA 34726057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 TTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAA 1628

 34726058 TGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTC 34726117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 TGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTC 1688

 34726118 TGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAG 34726177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 TGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAG 1748

 34726178 GTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGA 34726237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 GTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGA 1808

 34726238 GAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGT 34726297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGT 1868

 34726298 CTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGG 34726357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 CTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGG 1928

 34726358 ATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTAT 34726417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 ATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTAT 1988

 34726418 AATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATA 34726477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 AATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATA 2048

 34726478 AGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTT 34726537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 AGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTT 2108

 34726538 TATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTA-GCAACAGATCAT 34726596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2109 TATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCAT 2168

 34726597 TGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCAT 34726656
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 TGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCAT 2228

 34726657 TTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTT 34726716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 TTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTT 2288

 34726717 TCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGG 34726776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 TCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGG 2348

 34726777 TGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCA 34726836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCA 2408

 34726837 TGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATG 34726896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATG 2468

 34726897 ACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCC 34726956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 ACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCC 2528

 34726957 TGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATG 34727016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATG 2588

 34727017 TCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTA 34727076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 TCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTA 2648

 34727077 GGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTT 34727136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 GGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTT 2708

 34727137 ACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTT 34727196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 ACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTT 2768

 34727197 CTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAG 34727256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 CTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAG 2828

 34727257 TCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAA 34727316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 TCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAA 2888

 34727317 ACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTT 34727376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 ACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTT 2948

 34727377 CCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTG 34727436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTG 3008

 34727437 ATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTG 34727496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 ATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTG 3068

 34727497 AGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCT 34727556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 AGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCT 3128

 34727557 TGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTA 34727616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 TGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTA 3188

 34727617 CACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGA 34727676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 CACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGA 3248

 34727677 GTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTG 34727736
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3249 GTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTG 3308

 34727737 TGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTA 34727796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTA 3368

 34727797 TTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCT 34727856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCT 3428

 34727857 ACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATT 34727916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 ACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATT 3488

 34727917 TTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTG 34727976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 TTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTG 3548

 34727977 AATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTA 34728036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 AATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTA 3608

 34728037 TTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTAT 34728096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTAT 3668

 34728097 CAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGC 34728123
          |||||||||||||||||||||||||||
     3669 CAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGC 3695

Alignment time is 2.83083 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3579] =>      3579 nucs 'mol-32-2e20-212059_3579'

Score:        3528
Aligned:      3572        nucs
Identic:      3568 (100%) nucs =>      3441 (100%)       127 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34724678,34728121] EXCISED REGION [34728617,34728743]
 second seq =>  [       8,    3452] EXCISED REGION [    3453,    3579]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34724678 TAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGC 34724737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 TAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGC 67

 34724738 TCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATG 34724797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 TCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATG 127

 34724798 GTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCA 34724857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 GTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCA 187

 34724858 GTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAA 34724917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 GTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAA 247

 34724918 AATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTT 34724977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 AATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTT 307

 34724978 GCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTT 34725037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 GCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTT 367

 34725038 GTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTT 34725097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 GTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTT 427

 34725098 ATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTT 34725157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 ATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTT 487

 34725158 TAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTT 34725217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 TAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTT 547

 34725218 TCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGC 34725277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 TCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGC 607

 34725278 AATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTT 34725337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 AATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTT 667

 34725338 GTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTT 34725397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 GTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTT 727

 34725398 TTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTA 34725457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 TTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTA 787

 34725458 TAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAAT 34725517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 TAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAAT 847

 34725518 ATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATT 34725577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 ATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATT 907

 34725578 AATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTT 34725637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 AATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTT 967

 34725638 TCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTA 34725697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 TCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTA 1027

 34725698 TTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGAT 34725757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 TTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGAT 1087

 34725758 GCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTC 34725817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 GCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTC 1147

 34725818 CTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCAT 34725877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 CTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCAT 1207

 34725878 TTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCA 34725937
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1208 TTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCA 1267

 34725938 GGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGA 34725997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 GGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGA 1327

 34725998 TTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAA 34726057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 TTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAA 1387

 34726058 TGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTC 34726117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 TGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTC 1447

 34726118 TGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAG 34726177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAG 1507

 34726178 GTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGA 34726237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 GTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGA 1567

 34726238 GAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGT 34726297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 GAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGT 1627

 34726298 CTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGG 34726357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 CTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGG 1687

 34726358 ATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTAT 34726417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 ATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTAT 1747

 34726418 AATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATA 34726477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 AATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATA 1807

 34726478 AGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTT 34726537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 AGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTT 1867

 34726538 TATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACAGATCAT 34726596
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     1868 TATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCAT 1927

 34726597 TGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCAT 34726656
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 TGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCAT 1987

 34726657 TTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTT 34726716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTT 2047

 34726717 TCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGG 34726776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 TCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGG 2107

 34726777 TGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCA 34726836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 TGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCA 2167

 34726837 TGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATG 34726896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 TGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATG 2227

 34726897 ACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCC 34726956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 ACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCC 2287

 34726957 TGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATG 34727016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATG 2347

 34727017 TCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTA 34727076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTA 2407

 34727077 GGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTT 34727136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 GGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTT 2467

 34727137 ACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTT 34727196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 ACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTT 2527

 34727197 CTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAG 34727256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 CTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAG 2587

 34727257 TCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAA 34727316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAA 2647

 34727317 ACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTT 34727376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 ACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTT 2707

 34727377 CCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTG 34727436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 CCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTG 2767

 34727437 ATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTG 34727496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 ATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTG 2827

 34727497 AGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCT 34727556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 AGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCT 2887

 34727557 TGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTA 34727616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 TGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTA 2947

 34727617 CACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGA 34727676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 CACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGA 3007

 34727677 GTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTG 34727736
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3008 GTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTG 3067

 34727737 TGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTA 34727796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 TGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTA 3127

 34727797 TTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCT 34727856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCT 3187

 34727857 ACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATT 34727916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 ACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATT 3247

 34727917 TTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTG 34727976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTG 3307

 34727977 AATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTA 34728036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 AATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTA 3367

 34728037 TTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTAT 34728096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 TTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTAT 3427

 34728097 CAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||
     3428 CAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 3452

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 3512

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 3572

 34728737 CTTTCAC 34728743
          |||||||
     3573 CTTTCAC 3579

Alignment time is 2.62839 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4323] =>      4323 nucs 'mol-32-2e4c-077732_4323'

Score:        4214
Aligned:      4324        nucs
Identic:      4314 (100%) nucs =>       657 (100%)      3657 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727464,34728121] EXCISED REGION [34728617,34732282]
 second seq =>  [       1,     658] EXCISED REGION [     659,    4323]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34727464 TGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGC 34727523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGC 60

 34727524 TTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGT 34727583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGT 120

 34727584 TTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTT 34727643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTT 180

 34727644 TAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATA 34727703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATA 240

 34727704 CTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAG 34727763
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAG 300

 34727764 CTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGA 34727823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGA 360

 34727824 ATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATT 34727883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATT 420

 34727884 TCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGA 34727943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGA 480

 34727944 ATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGC 34728003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGC 540

 34728004 TCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTT 34728063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTT 600

 34728064 TCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 658

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 718

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 778

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 838

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 898

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 958

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1018

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1078

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1138

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1198

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1258

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1259 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1318

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1378

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 1438

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 1498

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 1558

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 1618

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 1678

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 1738

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 1798

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 1858

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 1918

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 1978

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 2038

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 2098

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 2158

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 2218

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2219 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 2278

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 2338

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 2398

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 2458

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 2518

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 2578

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 2638

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 2698

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 2758

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 2818

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCC-TTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 2877

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 2937

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 2997

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 3057

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 3117

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 3177

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 3237

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 3297

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 3357

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 3417

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 3477

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 3537

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 3597

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 3657

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 3717

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 3777

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 3837

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 3897

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 3957

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 34731976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 4017

 34731977 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 34732036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 4077

 34732037 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 34732096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 4137

 34732097 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 34732156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 4197

 34732157 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 34732216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 4257

 34732217 GCATTAAACAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 34732276
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4258 GCATTAAATAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAATATAAGTATTTTATTG 4317

 34732277 CCTTAC 34732282
          ||||||
     4318 CCTTAC 4323

Alignment time is 3.21877 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3466] =>      3466 nucs 'mol-32-2edb-177016_3466'

Score:        3454
Aligned:      3465        nucs
Identic:      3464 (100%) nucs =>      1750 (100%)      1714 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726697,34728446] EXCISED REGION [34728448,34730162]
 second seq =>  [       1,    1750] EXCISED REGION [    1752,    3466]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [1751,1751]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [1749,1750] to [1752,1753]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726697 TGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCC 34726756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCC 60

 34726757 TGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTA 34726816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTA 120

 34726817 TTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTA 34726876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTA 180

 34726877 TGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGA 34726936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGA 240

 34726937 AACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCT 34726996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCT 300

 34726997 CTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTG 34727056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTG 360

 34727057 TTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATT 34727116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATT 420

 34727117 CTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTA 34727176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTA 480

 34727177 TTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAG 34727236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAG 540

 34727237 CTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGG 34727296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGG 600

 34727297 ATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTC 34727356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTC 660

 34727357 TCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATT 34727416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATT 720

 34727417 GTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAG 34727476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAG 780

 34727477 TTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATA 34727536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATA 840

 34727537 ACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTAT 34727596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTAT 900

 34727597 TACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAAC 34727656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAAC 960

 34727657 TCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTT 34727716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTT 1020

 34727717 TCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTT 34727776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTT 1080

 34727777 CTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCAT 34727836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCAT 1140

 34727837 TTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGT 34727896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGT 1200

 34727897 TAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTT 34727956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTT 1260

 34727957 TCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAG 34728016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAG 1320

 34728017 AATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCT 34728076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCT 1380

 34728077 TGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTC 34728136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTC 1440

 34728137 TTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAG 34728196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAG 1500

 34728197 AGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCT 34728256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCT 1560

 34728257 TGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTC 34728316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTC 1620

 34728317 TCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGG 34728376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGG 1680

 34728377 GGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGA 34728436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGA 1740

 34728437 CCTAAAGCCA 34728446
          ||||||||||
     1741 CCTAAAGCCA 1750

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1811

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1871

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1931

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1991

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 2051

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 2111

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 2171

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 2231

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 2291

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 2351

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 2411

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 2471

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 2531

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 2591

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 2651

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 2711

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 2771

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 2831

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 2891

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 2951

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 3011

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 3071

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 3131

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 34729887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 3191

 34729888 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 34729947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 3251

 34729948 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 34730007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 3311

 34730008 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 34730067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 3371

 34730068 TTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 34730127
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 TTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 3431

 34730128 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTG 34730162
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTG 3466

Alignment time is 2.52708 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2595] =>      2595 nucs 'mol-32-2f1d-117957_2595'

Score:        2562
Aligned:      2595        nucs
Identic:      2592 (100%) nucs =>      1157 (100%)      1435 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726964,34728121] EXCISED REGION [34728617,34730053]
 second seq =>  [       1,    1158] EXCISED REGION [    1159,    2595]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726964 TTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAA 34727023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAA 60

 34727024 AAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTA 34727083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTA 120

 34727084 GTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTA 34727143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTA 180

 34727144 CTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAG 34727203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAG 240

 34727204 ATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTAT 34727263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTAT 300

 34727264 TTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTT 34727323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTT 360

 34727324 TTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGA 34727383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGA 420

 34727384 GAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTT 34727443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTT 480

 34727444 TAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGT 34727503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGT 540

 34727504 CTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACC 34727563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACC 600

 34727564 TTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTAT 34727623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTAT 660

 34727624 ATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATT 34727683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATT 720

 34727684 TTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTT 34727743
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTT 780

 34727744 TCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAG 34727803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAG 840

 34727804 ACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGAT 34727863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGAT 900

 34727864 TTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATT 34727923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATT 960

 34727924 TCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTC 34727983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTC 1020

 34727984 TTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTT 34728043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTT 1080

 34728044 CATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTC 34728103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTC 1140

 34728104 TGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||
     1141 TGTGCATTGAAGAGTTAA 1158

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1218

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1278

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1338

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1398

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1458

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1518

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1578

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1638

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1698

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1758

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1759 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1818

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1878

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 1938

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 1998

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2058

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2118

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 2178

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2238

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2298

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2358

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 2418

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 2478

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 2538

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATAT 34730053
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATAT 2595

Alignment time is 1.91353 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5378] =>      5378 nucs 'mol-32-2f28-110955_5378'

Score:        5246
Aligned:      5378        nucs
Identic:      5366 (100%) nucs =>      1831 (100%)      3535 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726288,34728121] EXCISED REGION [34728617,34732159]
 second seq =>  [       1,    1835] EXCISED REGION [    1836,    5378]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726288 ATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCT 34726347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCT 60

 34726348 ACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTT 34726407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTT 120

 34726408 ATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGT 34726467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGT 180

 34726468 CTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATAT 34726527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATAT 240

 34726528 TTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-C 34726586
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
      241 TTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGC 300

 34726587 AACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATAT 34726646
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATAT 360

 34726647 TTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTG 34726706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTG 420

 34726707 TTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTT 34726766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTT 480

 34726767 TCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAAT 34726826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAAT 540

 34726827 ATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTT 34726886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTT 600

 34726887 TAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAA 34726946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAA 660

 34726947 AACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTA 34727006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTA 720

 34727007 TTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTC 34727066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTC 780

 34727067 TTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTT 34727126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTT 840

 34727127 CCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTA 34727186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTA 900

 34727187 ATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTT 34727246
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTCAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTT 960

 34727247 TCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATT 34727306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATT 1020

 34727307 CTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTC 34727366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTC 1080

 34727367 TGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTT 34727426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTT 1140

 34727427 TTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATT 34727486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATT 1200

 34727487 AAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGT 34727546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGT 1260

 34727547 CCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAAT 34727606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAAT 1320

 34727607 AAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTT 34727666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTT 1380

 34727667 TCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTT 34727726
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1381 TCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTT 1440

 34727727 CCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATC 34727786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATC 1500

 34727787 AACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTC 34727846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTC 1560

 34727847 TAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATT 34727906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATT 1620

 34727907 TGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAAC 34727966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAAC 1680

 34727967 AGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTT 34728026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTT 1740

 34728027 TGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGT 34728086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGT 1800

 34728087 GGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 1835

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1895

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1955

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 2015

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 2075

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 2135

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2136 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGCGAACTAGGGCCTGGAA 2195

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 2255

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 2315

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 2375

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 2435

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2436 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 2495

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 2555

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 2615

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 2675

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2735

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2795

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 2855

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2915

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2975

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 3035

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 3095

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 3155

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 3215

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 3275

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 3335

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 3395

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3396 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 3455

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3456 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAGCAACTCCATATGAT 3515

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 3575

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 3635

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 3695

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 3755

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 3815

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 3875

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 3935

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 3995

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 4055

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 4115

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 4175

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 4235

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 4295

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 4355

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 4415

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 4475

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 4535

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 4595

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 4655

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 4715

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 4775

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 4835

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 4895

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 4955

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 5015

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 5075

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 5135

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 34731976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 5195

 34731977 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 34732036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 5255

 34732037 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 34732096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 5315

 34732097 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 34732156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 5375

 34732157 TAT 34732159
          |||
     5376 TAT 5378

Alignment time is 3.97067 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2087] =>      2087 nucs 'mol-32-2f33-069415_2087'

Score:        2032
Aligned:      2087        nucs
Identic:      2082 (100%) nucs =>       467 (100%)      1615 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727654,34728121] EXCISED REGION [34728617,34730235]
 second seq =>  [       1,     468] EXCISED REGION [     469,    2087]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34727654 AACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCT 34727713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
        1 AACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCT 60

 34727714 TTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATT 34727773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATT 120

 34727774 CTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTG 34727833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTG 180

 34727834 CATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTT 34727893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTT 240

 34727894 TGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGA 34727953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGA 300

 34727954 GTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTC 34728013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTC 360

 34728014 CAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAG 34728073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAG 420

 34728074 TCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 468

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 528

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 588

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 648

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 708

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 768

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 828

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 888

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 948

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1008

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1068

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1069 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1128

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1188

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 1248

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 1308

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 1368

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 1428

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 1488

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 1548

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 1608

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 1668

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 1728

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 1788

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 1848

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 1908

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 1968

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 2028

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAG 34730235
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2029 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAG 2087

Alignment time is 1.60986 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5733] =>      5733 nucs 'mol-32-2f3e-103217_5733'

Score:        5710
Aligned:      5732        nucs
Identic:      5730 (100%) nucs =>       662 (100%)      5068 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34723971,34724632] EXCISED REGION [34724634,34729702]
 second seq =>  [       1,     662] EXCISED REGION [     664,    5733]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34724633,34724633]
 second seq =>         1 nucs [663,663]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2615,2615]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34724633,34724633] to [34724634,34724634]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34723971 GTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTGTGTG 34724030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTGTGTG 60

 34724031 CAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACACCATTCCTGGCTTAC 34724090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACACCATTCCTGGCTTAC 120

 34724091 CCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGTCGAA 34724150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGTCGAA 180

 34724151 TGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGTGCCACTGGCCACAG 34724210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGTGCCACTGGCCACAG 240

 34724211 AGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATATAGACATTTTAACA 34724270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATATAGACATTTTAACA 300

 34724271 ACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTTTGGCATCCTCTCTA 34724330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTTTGGCATCCTCTCTA 360

 34724331 ATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCATTTTTTTGGTTAAG 34724390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCATTTTTTTGGTTAAG 420

 34724391 TTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGATTATTTTTAATTTC 34724450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGATTATTTTTAATTTC 480

 34724451 TTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTTTGTATGTTGATTTT 34724510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTTTGTATGTTGATTTT 540

 34724511 GTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTGGTGGAGTCTTAA 34724570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTGGTGGAGTCTTAA 600

 34724571 GGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTGACTTATTCCTTC 34724630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTGACTTATTCCTTC 660

 34724631 CC 34724632
          ||
      661 CC 662

EXCISED REGION

 34724634 ATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTCTAGCTAGGATTTCCAG 34724693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 ATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTCTAGCTAGGATTTCCAG 723

 34724694 TACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCTCCAGATCTTACAGAA 34724753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCTCCAGATCTTACAGAA 783

 34724754 AAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGGTCTGTCATATATGGC 34724813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 AAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGGTCTGTCATATATGGC 843

 34724814 TTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTTAATCATG 34724873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTTAATCATG 903

 34724874 GCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATGATTATGTGGCTT 34724933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 GCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATGATTATGTGGCTT 963

 34724934 TTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAAATGTTGAACCAT 34724993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 TTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAAATGTTGAACCAT 1023

 34724994 CCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAATATATTATTGAA 34725053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 CCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAATATATTATTGAA 1083

 34725054 TTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCAGAGATGTTGGCC 34725113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 TTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCAGAGATGTTGGCC 1143

 34725114 TGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAGGTAATACTGGCC 34725173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 TGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAGGTAATACTGGCC 1203

 34725174 TCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAAAACAATTTGAGT 34725233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 TCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAAAACAATTTGAGT 1263

 34725234 AGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATGAAGCCATCAGGT 34725293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 AGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATGAAGCCATCAGGT 1323

 34725294 CCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCAATTGTTGTTGGT 34725353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 CCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCAATTGTTGTTGGT 1383

 34725354 CTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTATGTGTCTAGGAAT 34725413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 CTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTATGTGTCTAGGAAT 1443

 34725414 ATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGTAGCCATAATAAT 34725473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 ATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGTAGCCATAATAAT 1503

 34725474 CCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCTGATTTTATTTAG 34725533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 CCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCTGATTTTATTTAG 1563

 34725534 GTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATTTTATTCATCATT 34725593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATTTTATTCATCATT 1623

 34725594 TCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCATTTCAATTTCATT 34725653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 TCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCATTTCAATTTCATT 1683

 34725654 TATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTTTTCTTCTACT 34725713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTTTTCTTCTACT 1743

 34725714 AATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCATTGTTAGATTGTT 34725773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCATTGTTAGATTGTT 1803

 34725774 TATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTCCTAGTACTGTTT 34725833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 TATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTCCTAGTACTGTTT 1863

 34725834 TGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTTAAGAAAATT 34725893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTTAAGAAAATT 1923

 34725894 TTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAA 34725953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAA 1983

 34725954 TTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTTTTATTCC 34726013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTTTTATTCC 2043

 34726014 ATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCT 34726073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCT 2103

 34726074 TTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGATGAATGTG 34726133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGATGAATGTG 2163

 34726134 TATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTTTTTCTAT 34726193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTTTTTCTAT 2223

 34726194 AGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGC 34726253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 AGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGC 2283

 34726254 TGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAG 34726313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAG 2343

 34726314 CTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAA 34726373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAA 2403

 34726374 AATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTC 34726433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 AATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTC 2463

 34726434 TCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTG 34726493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTG 2523

 34726494 CTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGT 34726553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGT 2583

 34726554 GTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTA-GCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTA 34726612
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     2584 GTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTA 2643

 34726613 TTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTAT 34726672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 TTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTAT 2703

 34726673 TATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGG 34726732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGG 2763

 34726733 TCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGG 34726792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 TCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGG 2823

 34726793 TATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGG 34726852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 TATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGG 2883

 34726853 TTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGAT 34726912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGAT 2943

 34726913 TGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCC 34726972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 TGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCC 3003

 34726973 ACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATA 34727032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 ACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATA 3063

 34727033 TAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACA 34727092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 TAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACA 3123

 34727093 CCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGG 34727152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 CCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGG 3183

 34727153 TTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAA 34727212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 TTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAA 3243

 34727213 CTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTC 34727272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 CTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTC 3303

 34727273 ATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAG 34727332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 ATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAG 3363

 34727333 CGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGC 34727392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 CGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGC 3423

 34727393 TGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTT 34727452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 TGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTT 3483

 34727453 TTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGG 34727512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 TTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGG 3543

 34727513 GTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAG 34727572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 GTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAG 3603

 34727573 GTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTG 34727632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 GTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTG 3663

 34727633 TACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATC 34727692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 TACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATC 3723

 34727693 TTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGC 34727752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 TTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGC 3783

 34727753 CTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTG 34727812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 CTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTG 3843

 34727813 CATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTC 34727872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 CATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTC 3903

 34727873 ATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCG 34727932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 ATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCG 3963

 34727933 TGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAA 34727992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 TGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAA 4023

 34727993 GGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTA 34728052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 GGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTA 4083

 34728053 AGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTG 34728112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 AGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTG 4143

 34728113 AAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTG 34728172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 AAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTG 4203

 34728173 GGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCT 34728232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 GGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCT 4263

 34728233 TGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGG 34728292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 TGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGG 4323

 34728293 ATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCT 34728352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 ATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCT 4383

 34728353 CTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCA 34728412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 CTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCA 4443

 34728413 CCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCAGCATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGC 34728472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4444 CCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCATCATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGC 4503

 34728473 CTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTAC 34728532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 CTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTAC 4563

 34728533 AGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTC 34728592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 AGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTC 4623

 34728593 CAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGC 34728652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 CAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGC 4683

 34728653 TCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCA 34728712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 TCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCA 4743

 34728713 CTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGG 34728772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 CTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGG 4803

 34728773 GTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGG 34728832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 GTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGG 4863

 34728833 GTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGT 34728892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 GTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGT 4923

 34728893 CAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAA 34728952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 CAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAA 4983

 34728953 ATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTA 34729012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 ATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTA 5043

 34729013 TTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTC 34729072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 TTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTC 5103

 34729073 TCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCAC 34729132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 TCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCAC 5163

 34729133 AAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCT 34729192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 AAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCT 5223

 34729193 TCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTC 34729252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 TCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTC 5283

 34729253 GCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGA 34729312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 GCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGA 5343

 34729313 GCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGC 34729372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 GCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGC 5403

 34729373 AATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAAC 34729432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 AATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAAC 5463

 34729433 CAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCT 34729492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 CAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCT 5523

 34729493 AGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACT 34729552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 AGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACT 5583

 34729553 GCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCA 34729612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 GCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCA 5643

 34729613 ATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTG 34729672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 ATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTG 5703

 34729673 TTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAG 34729702
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 TTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAG 5733

Alignment time is 4.26228 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8049] =>      8049 nucs 'mol-32-2f3e-120270_8049'

Score:        7928
Aligned:      8049        nucs
Identic:      8038 (100%) nucs =>      6259 (100%)      1779 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34721857,34728121] EXCISED REGION [34728617,34730399]
 second seq =>  [       1,    6266] EXCISED REGION [    6267,    8049]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34721857 TTTAACTGAGATGAGATTATATCTCATTGTAGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATCAG 34721916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTAACTGAGATGAGATTATATCTCATTGTAGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATCAG 60

 34721917 TGATATTGAGCACCTTTTCCTATGCCTGCTTGCCATTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATGT 34721976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATATTGAGCACCTTTTCCTATGCCTGCTTGCCATTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATGT 120

 34721977 CTATTTATATTTTTTGCCCATTTTAATTATATTATTATATTTTTCCCTATAAAGTTGTTT 34722036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATTTATATTTTTTGCCCATTTTAATTATATTATTATATTTTTCCCTATAAAGTTGTTT 180

 34722037 GAGCTCTTTATATATTCCAGGTATTAATCTCTTGTAAGATTGGCAGTTTGCAAATATTTT 34722096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCTCTTTATATATTCCAGGTATTAATCTCTTGTAAGATTGGCAGTTTGCAAATATTTT 240

 34722097 CTCCCATTCTGTGGATTGTCTTTTCACTTTGTTGATTGTTTTCATTGCTGTGCAGAAGCT 34722156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCCATTCTGTGGATTGTCTTTTCACTTTGTTGATTGTTTTCATTGCTGTGCAGAAGCT 300

 34722157 TTTAAACTTTATGTGATTCCATTTGTTCATTTTTGCTTTAGTTGTCTGTGCTTGTGGGTT 34722216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAAACTTTATGTGATTCCATTTGTTCATTTTTGCTTTAGTTGTCTGTGCTTGTGGGTT 360

 34722217 ATTACTCAATAAATTTTTGCCCAGAACAATGTCCTGGAGAGTTTTTCCAATGTTTTCTTG 34722276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTACTCAATAAATTTTTGCCCAGAACAATGTCCTGGAGAGTTTTTCCAATGTTTTCTTG 420

 34722277 TAATAGTTTCATACCTTTAAGTCTTTCATCCATTTTGATTTGATCTTTATAGATGGCAAG 34722336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATAGTTTCATACCTTTAAGTCTTTCATCCATTTTGATTTGATCTTTATAGATGGCAAG 480

 34722337 AGCTAGAGATTGAGTTTCATTCTTCTGCATATGGATATCCAGTTTTCCCAGCACCATTTA 34722396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTAGAGATTGAGTTTCATTCTTCTGCATATGGATATCCAGTTTTCCCAGCACCATTTA 540

 34722397 TTGAAGAGATTGTCTTTTCCCCAATGTATGTTTTTGGCACCTTTGTTGAAAATGAGTTCG 34722456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGAAGAGATTGTCTTTTCCCCAATGTATGTTTTTGGCACCTTTGTTGAAAATGAGTTCG 600

 34722457 CTGTAGGTGTATACATTTATTTCTGGGTTATCTACTCTGTTCCATTGGTCTATGTGTCTG 34722516
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTAGGTGTATACATTTATTTCTGGGTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATGTGTCTG 660

 34722517 TTTTTATGACAGTACCATGCTGTTTTGGTTACCATAGCTCTGTGGTTATAATTTCAAGTC 34722576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTATGACAGTACCATGCTGTTTTGGTTACCATAGCTCTGTGGTTATAATTTCAAGTC 720

 34722577 AGGTAATGTGATTCCTCCATTTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATAACTTTGGCTATTCTGGG 34722636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTAATGTGATTCCTCCATTTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATAACTTTGGCTATTCTGGG 780

 34722637 TATTTGGTGGTTCCATATAAATTTTAGTATTGTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAATGTCAT 34722696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTTGGTGGTTCCATATAAATTTTAGTATTGTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAATGTCAT 840

 34722697 TGGTATTTTTGTAAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGTACTATTGATGGCAG 34722756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGTATTTTTGTAAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGTACTATTGATGGCAG 900

 34722757 CAGTGGCCCATCTGGAGTGGCTGCTGCTAAGATACTGGCTGCAGCAGAGGAGGCCTGGGC 34722816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGTGGCCCATCTGGAGTGGCTGCTGCTAAGATACTGGCTGCAGCAGAGGAGGCCTGGGC 960

 34722817 AGGGCTGTTTGCTCTGTGGGGCCCGTGGGAGCCAGGAATGGGTGGGAGCCCCACCCCCGT 34722876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGGCTGTTTGCTCTGTGGGGCCCGTGGGAGCCAGGAATGGGTGGGAGCCCCACCCCCGT 1020

 34722877 CCGAGTTGGTGGGGTGGGAGCCCCGTGCTCCCAGGTGCAGCTGTAGCTGCCCAGCTATGT 34722936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCGAGTTGGTGGGGTGGGAGCCCCGTGCTCCCAGGTGCAGCTGTAGCTGCCCAGCTATGT 1080

 34722937 CTGCTGACCCAGGCATCCTTGTGGTCTTGGGGACACAGAAAATCCTCCTACCCCAACAGG 34722996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCTGACCCAGGCATCCTTGTGGTCTTGGGGACACAGAAAATCCTCCTACCCCAACAGG 1140

 34722997 TTCAGAAGTGCCTGCTCCCACTGCCTGGGCTTTTCCCAATCCTGGTACCCACTCTGATTT 34723056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCAGAAGTGCCTGCTCCCACTGCCTGGGCTTTTCCCAATCCTGGTACCCACTCTGATTT 1200

 34723057 CAGAGTAGAGTTGTGGCTGAGCCTGGGTGCTGTCACTACCTGGTTGGGTGTGCCTGCACT 34723116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGAGTAGAGTTGTGGCTGAGCCTGGGTGCTGTCACTACCTGGTTGGGTGTGCCTGCACT 1260

 34723117 CAGGCCGGTACTGACACACAAATCCCCTACTACTGAAGCCTAGGGTAGCTGAGGGTGACT 34723176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGCCGGTACTGACACACAAATCCCCTACTACTGAAGCCTAGGGTAGCTGAGGGTGACT 1320

 34723177 TGGCACAAGATTGCAGGTTCCCCTTGGCATGAACAGCCTGGGCATCATGAATGGTGGCAG 34723236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCACAAGATTGCAGGTTCCCCTTGGCATGAACAGCCTGGGCATCATGAATGGTGGCAG 1380

 34723237 GAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACCTTTAAGC 34723296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACCTTTAAGC 1440

 34723297 CAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTGAGAACTT 34723356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTGAGAACTT 1500

 34723357 ATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACTTCCTC 34723416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACTTCCTC 1560

 34723417 CCCTCTGAAGCCCACAAAATCTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGATGACC 34723476
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCTCTGAAGCCCACAAAAACTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGATGACC 1620

 34723477 TGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACACTCAT 34723536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACACTCAT 1680

 34723537 TGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGTACTGT 34723596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGTACTGT 1740

 34723597 CACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTATTTTT 34723656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTATTTTT 1800

 34723657 CCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTGTAACA 34723716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTGTAACA 1860

 34723717 CAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAAGGAGA 34723776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAAGGAGA 1920

 34723777 AAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCTCCCTG 34723836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCTCCCTG 1980

 34723837 AGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCTTCTGG 34723896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCTTCTGG 2040

 34723897 GTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTCCAGTT 34723956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTCCAGTT 2100

 34723957 GCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAG 34724016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAG 2160

 34724017 TGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACAC 34724076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACAC 2220

 34724077 CATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAG 34724136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAG 2280

 34724137 TCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGT 34724196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGT 2340

 34724197 GCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATA 34724256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATA 2400

 34724257 TAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTT 34724316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTT 2460

 34724317 TGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCA 34724376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCA 2520

 34724377 TTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGA 34724436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGA 2580

 34724437 TTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTT 34724496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTT 2640

 34724497 TGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTT 34724556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTT 2700

 34724557 TGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATT 34724616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATT 2760

 34724617 TGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCT 34724676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCT 2820

 34724677 CTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTG 34724736
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTG 2880

 34724737 CTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGAT 34724796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGAT 2940

 34724797 GGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTC 34724856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTC 3000

 34724857 AGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATA 34724916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATA 3060

 34724917 AAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATT 34724976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATT 3120

 34724977 TGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTT 34725036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTT 3180

 34725037 TGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTT 34725096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTT 3240

 34725097 TATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTT 34725156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTT 3300

 34725157 TTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTT 34725216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTT 3360

 34725217 TTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAG 34725276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAG 3420

 34725277 CAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCT 34725336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCT 3480

 34725337 TGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGT 34725396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGT 3540

 34725397 TTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATT 34725456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATT 3600

 34725457 ATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAA 34725516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAA 3660

 34725517 TATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTAT 34725576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTAT 3720

 34725577 TAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCT 34725636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCT 3780

 34725637 TTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATT 34725696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATT 3840

 34725697 ATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGA 34725756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGA 3900

 34725757 TGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATT 34725816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATT 3960

 34725817 CCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCA 34725876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCA 4020

 34725877 TTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTC 34725936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTC 4080

 34725937 AGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTG 34725996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTG 4140

 34725997 ATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGA 34726056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGA 4200

 34726057 ATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTT 34726116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTT 4260

 34726117 CTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTA 34726176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTA 4320

 34726177 GGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTG 34726236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTG 4380

 34726237 AGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATG 34726296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATG 4440

 34726297 TCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTG 34726356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTG 4500

 34726357 GATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTA 34726416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTA 4560

 34726417 TAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATAT 34726476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATAT 4620

 34726477 AAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCT 34726536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCT 4680

 34726537 TTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACAGATCA 34726595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4681 TTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCA 4740

 34726596 TTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCA 34726655
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCA 4800

 34726656 TTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTT 34726715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTT 4860

 34726716 TTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAG 34726775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAG 4920

 34726776 GTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGC 34726835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGC 4980

 34726836 ATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGAT 34726895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGAT 5040

 34726896 GACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACC 34726955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACC 5100

 34726956 CTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCAT 34727015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCAT 5160

 34727016 GTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTT 34727075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTT 5220

 34727076 AGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCT 34727135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCT 5280

 34727136 TACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTT 34727195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTT 5340

 34727196 TCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAA 34727255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAA 5400

 34727256 GTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAA 34727315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAA 5460

 34727316 AACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTT 34727375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTT 5520

 34727376 TCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTT 34727435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTT 5580

 34727436 GATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTT 34727495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTT 5640

 34727496 GAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACC 34727555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACC 5700

 34727556 TTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCT 34727615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCT 5760

 34727616 ACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTG 34727675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTG 5820

 34727676 AGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACT 34727735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5821 AGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACT 5880

 34727736 GTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCT 34727795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCT 5940

 34727796 ATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTC 34727855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTC 6000

 34727856 TACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAAT 34727915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAAT 6060

 34727916 TTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTT 34727975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTT 6120

 34727976 GAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTT 34728035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTT 6180

 34728036 ATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTA 34728095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTA 6240

 34728096 TCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||||
     6241 TCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 6266

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6267 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 6326

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6327 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 6386

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6387 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 6446

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6447 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 6506

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6507 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 6566

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6567 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 6626

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6627 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 6686

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6687 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 6746

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6747 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 6806

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6807 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 6866

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6867 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 6926

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6927 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 6986

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6987 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 7046

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7047 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 7106

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7107 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 7166

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7167 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 7226

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7227 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 7286

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7287 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 7346

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7347 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 7406

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7407 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 7466

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7467 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 7526

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7527 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 7586

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7587 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 7646

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7647 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 7706

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     7707 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 7766

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7767 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 7826

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7827 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 7886

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7887 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 7946

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7947 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 8006

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTG 34730399
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8007 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTG 8049

Alignment time is 5.83922 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3483] =>      3483 nucs 'mol-32-2fc2-137928_3483'

Score:        3417
Aligned:      3483        nucs
Identic:      3477 (100%) nucs =>       137 (100%)      3340 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727985,34728121] EXCISED REGION [34728617,34731962]
 second seq =>  [       1,     137] EXCISED REGION [     138,    3483]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34727985 TTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTC 34728044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTC 60

 34728045 ATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCT 34728104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCT 120

 34728105 GTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||
      121 GTGCATTGAAGAGTTAA 137

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      138 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 197

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      198 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 257

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      258 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 317

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      318 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 377

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 437

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 497

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 557

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 617

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 677

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 737

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      738 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 797

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 857

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 917

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 977

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 1037

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 1097

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 1157

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 1217

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 1277

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 1337

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 1397

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 1457

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 1517

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 1577

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 1637

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 1697

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1698 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 1757

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 1817

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 1877

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 1937

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 1997

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 2057

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 2117

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 2177

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 2237

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 2297

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 2357

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 2417

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 2477

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 2537

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 2597

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 2657

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 2717

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 2777

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 2837

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 2897

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 2957

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 3017

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 3077

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 3137

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 3197

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 3257

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 3317

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 3377

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 3437

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTT 34731962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTT 3483

Alignment time is 2.52373 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4555] =>      4555 nucs 'mol-32-2fee-304661_4555'

Score:        4510
Aligned:      4554        nucs
Identic:      4550 (100%) nucs =>       850 (100%)      3700 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727597,34728446] EXCISED REGION [34728448,34732151]
 second seq =>  [       1,     850] EXCISED REGION [     852,    4555]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [851,851]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [849,850] to [852,853]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34727597 TACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAAC 34727656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAAC 60

 34727657 TCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTT 34727716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTT 120

 34727717 TCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTT 34727776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTT 180

 34727777 CTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCAT 34727836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCAT 240

 34727837 TTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGT 34727896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGT 300

 34727897 TAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTT 34727956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTT 360

 34727957 TCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAG 34728016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAG 420

 34728017 AATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCT 34728076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCT 480

 34728077 TGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTC 34728136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTC 540

 34728137 TTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAG 34728196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAG 600

 34728197 AGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCT 34728256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCT 660

 34728257 TGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTC 34728316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTC 720

 34728317 TCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGG 34728376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGG 780

 34728377 GGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGA 34728436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGA 840

 34728437 CCTAAAGCCA 34728446
          ||||||||||
      841 CCTAAAGCCA 850

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 911

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 971

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1031

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1091

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 1151

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 1211

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 1271

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 1331

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 1391

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 1451

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 1511

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 1571

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 1631

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 1691

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 1751

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 1811

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 1871

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 1931

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 1991

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 2051

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 2111

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 2171

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 2231

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 34729887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 2291

 34729888 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 34729947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 2351

 34729948 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 34730007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 2411

 34730008 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 34730067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 2471

 34730068 TTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 34730127
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 TTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 2531

 34730128 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 34730187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 2591

 34730188 TGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 34730247
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 2651

 34730248 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 34730307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 2711

 34730308 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 34730367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 2771

 34730368 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 34730427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 2831

 34730428 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 34730487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 2891

 34730488 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 34730547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 2951

 34730548 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 34730607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 3011

 34730608 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 34730667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 3071

 34730668 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 34730727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 3131

 34730728 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 34730787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 3191

 34730788 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 34730847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 3251

 34730848 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 34730907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 3311

 34730908 CTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 34730967
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 3371

 34730968 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 34731027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 3431

 34731028 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 34731087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 3491

 34731088 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 34731147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 3551

 34731148 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 34731207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 3611

 34731208 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 34731267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 3671

 34731268 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 34731327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 3731

 34731328 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 34731387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 3791

 34731388 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 34731447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 3851

 34731448 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 34731507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 3911

 34731508 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 34731567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 3971

 34731568 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 34731627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 4031

 34731628 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 34731687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 4091

 34731688 CTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 34731747
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 CTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 4151

 34731748 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 34731807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 4211

 34731808 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 34731867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 4271

 34731868 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 34731927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 4331

 34731928 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 34731987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 4391

 34731988 GCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTC 34732047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 GCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTC 4451

 34732048 TTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAA 34732107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 TTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAA 4511

 34732108 TGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTC 34732151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 TGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTC 4555

Alignment time is 3.24559 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8374] =>      8374 nucs 'mol-32-300f-136969_8374'

Score:        8264
Aligned:      8374        nucs
Identic:      8364 (100%) nucs =>      7163 (100%)      1201 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34720952,34728121] EXCISED REGION [34728617,34729819]
 second seq =>  [       1,    7171] EXCISED REGION [    7172,    8374]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34720952 TTTACTTGTTATAATTTAATATCTATAGGACTTGCAGTAATGTCTCATTTTGTATTCTTT 34721011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTACTTGTTATAATTTAATATCTATAGGACTTGCAGTAATGTCTCATTTTGTATTCTTT 60

 34721012 TTATATACATTTTTGTGGGTACATAGTAAGTGTATATATTTGCAGGTTACATAAGATACT 34721071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATATACATTTTTGTGGGTACATAGTAAGTGTATATATTTGCAGGTTACATAAGATACT 120

 34721072 TTGATACAGGCATGTAATGTGTAATAATCACACTGTGGTAAATGGGGTATTTATCCTAAT 34721131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGATACAGGCATGTAATGTGTAATAATCACACTGTGGTAAATGGGGTATTTATCCTAAT 180

 34721132 AAGCATTTATCCTTTGTGTTACAAACAAACCAGTTATAGTCTTTCAGTTATTTTAAAATG 34721191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCATTTATCCTTTGTGTTACAAACAAACCAGTTATAGTCTTTCAGTTATTTTAAAATG 240

 34721192 TACAATTAAATTATTATTGACTATAGTCCCCCTGATGTGCTATCAAATACTAGGTCTTAT 34721251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACAATTAAATTATTATTGACTATAGTCCCCCTGATGTGCTATCAAATACTAGGTCTTAT 300

 34721252 TCATTCTTTCTAACCACTTTTTTTTTTTGTATCCATTGACCACCCCTACTTCTTTCCCCA 34721311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTCTTTCTAACCACTTTTTTTTTTTGTATCCATTGACCACCCCTACTTCTTTCCCCA 360

 34721312 GCCCCCACGACCCTTCCCAGACTTTAGTGACCATCGTTCTATTCTCTGCCTCCATGAGTT 34721371
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCCCCACGACCCTTCCCAGACTTTAGTGACCATCGTTCTATTCTCTGCCTCCATGAGTT 420

 34721372 CAATTGTTTTTTATTTTTAGACCCAACAAATAAATGAGAACATATAAAGTTTGTCTTGCT 34721431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATTGTTTTTTATTTTTAGACCCAACAAATAAATGAGAACATATAAAGTTTGTCTTGCT 480

 34721432 GTGCTTGGCTTATTTCACTTAATGTAATGACTTCCAGTTCCACCCATGTTGCAATGACAA 34721491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGCTTGGCTTATTTCACTTAATGTAATGACTTCCAGTTCCACCCATGTTGCAATGACAA 540

 34721492 GATCACATTCTTTTAATGGCTGAATAATACTCCATTGTGTATATGCAGCACATTTCCTTT 34721551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATCACATTCTTTTAATGGCTGAATAATACTCCATTGTGTATATGCAGCACATTTCCTTT 600

 34721552 ATCCATTCATCTGTCGATGGACACTTAGGTTGCTTCCAAATCTTGGCTACTATGAACAGT 34721611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCATTCATCTGTCGATGGACACTTAGGTTGCTTCCAAATCTTGGCTACTATGAACAGT 660

 34721612 GTTGCAACAAACATGGTGGTGCAGATATCCCTTCCCTATACTGATTTCCTTTCTTCTAGA 34721671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTGCAACAAACATGGTGGTGCAGATATCCCTTCCCTATACTGATTTCCTTTCTTCTAGA 720

 34721672 TATATACTTAGCAGTGGGATTGCTGGATCATATGGCAGCTCTATTTTTAGATTTTTGAGG 34721731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATATACTTAGCAGTGGGATTGCTGGATCATATGGCAGCTCTATTTTTAGATTTTTGAGG 780

 34721732 AACCCCCAAACTGTTCTCCATAGTGGTAGTACTAATTGACATTCGCACTAACAGTATATA 34721791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACCCCCAAACTGTTCTCCATAGTGGTAGTACTAATTGACATTCGCACTAACAGTATATA 840

 34721792 AGTGTTCTCTTTCCTCCACATCCTCGCCAGCATTTGTTATTACCTGTCTTTTGAATATAA 34721851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGTTCTCTTTCCTCCACATCCTCGCCAGCATTTGTTATTACCTGTCTTTTGAATATAA 900

 34721852 GCCATTTTAACTGAGATGAGATTATATCTCATTGTAGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATG 34721911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCATTTTAACTGAGATGAGATTATATCTCATTGTAGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATG 960

 34721912 ATCAGTGATATTGAGCACCTTTTCCTATGCCTGCTTGCCATTGTATGCCTTCTTTTGAGA 34721971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCAGTGATATTGAGCACCTTTTCCTATGCCTGCTTGCCATTGTATGCCTTCTTTTGAGA 1020

 34721972 AATGTCTATTTATATTTTTTGCCCATTTTAATTATATTATTATATTTTTCCCTATAAAGT 34722031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGTCTATTTATATTTTTTGCCCATTTTAATTATATTATTATATTTTTCCCTATAAAGT 1080

 34722032 TGTTTGAGCTCTTTATATATTCCAGGTATTAATCTCTTGTAAGATTGGCAGTTTGCAAAT 34722091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTTGAGCTCTTTATATATTCCAGGTATTAATCTCTTGTAAGATTGGCAGTTTGCAAAT 1140

 34722092 ATTTTCTCCCATTCTGTGGATTGTCTTTTCACTTTGTTGATTGTTTTCATTGCTGTGCAG 34722151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTTCTCCCATTCTGTGGATTGTCTTTTCACTTTGTTGATTGTTTTCATTGCTGTGCAG 1200

 34722152 AAGCTTTTAAACTTTATGTGATTCCATTTGTTCATTTTTGCTTTAGTTGTCTGTGCTTGT 34722211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGCTTTTAAACTTTATGTGATTCCATTTGTTCATTTTTGCTTTAGTTGTCTGTGCTTGT 1260

 34722212 GGGTTATTACTCAATAAATTTTTGCCCAGAACAATGTCCTGGAGAGTTTTTCCAATGTTT 34722271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGTTATTACTCAATAAATTTTTGCCCAGAACAATGTCCTGGAGAGTTTTTCCAATGTTT 1320

 34722272 TCTTGTAATAGTTTCATACCTTTAAGTCTTTCATCCATTTTGATTTGATCTTTATAGATG 34722331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTTGTAATAGTTTCATACCTTTAAGTCTTTCATCCATTTTGATTTGATCTTTATAGATG 1380

 34722332 GCAAGAGCTAGAGATTGAGTTTCATTCTTCTGCATATGGATATCCAGTTTTCCCAGCACC 34722391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAAGAGCTAGAGATTGAGTTTCATTCTTCTGCATATGGATATCCAGTTTTCCCAGCACC 1440

 34722392 ATTTATTGAAGAGATTGTCTTTTCCCCAATGTATGTTTTTGGCACCTTTGTTGAAAATGA 34722451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTTATTGAAGAGATTGTCTTTTCCCCAATGTATGTTTTTGGCACCTTTGTTGAAAATGA 1500

 34722452 GTTCGCTGTAGGTGTATACATTTATTTCTGGGTTATCTACTCTGTTCCATTGGTCTATGT 34722511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTCGCTGTAGGTGTATACATTTATTTCTGGGTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATGT 1560

 34722512 GTCTGTTTTTATGACAGTACCATGCTGTTTTGGTTACCATAGCTCTGTGGTTATAATTTC 34722571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCTGTTTTTATGACAGTACCATGCTGTTTTGGTTACCATAGCTCTGTGGTTATAATTTC 1620

 34722572 AAGTCAGGTAATGTGATTCCTCCATTTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATAACTTTGGCTATT 34722631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGTCAGGTAATGTGATTCCTCCATTTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATAACTTTGGCTATT 1680

 34722632 CTGGGTATTTGGTGGTTCCATATAAATTTTAGTATTGTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAAT 34722691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGGGTATTTGGTGGTTCCATATAAATTTTAGTATTGTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAAT 1740

 34722692 GTCATTGGTATTTTTGTAAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGTACTATTGAT 34722751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCATTGGTATTTTTGTAAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGTACTATTGAT 1800

 34722752 GGCAGCAGTGGCCCATCTGGAGTGGCTGCTGCTAAGATACTGGCTGCAGCAGAGGAGGCC 34722811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCAGCAGTGGCCCATCTGGAGTGGCTGCTGCTAAGATACTGGCTGCAGCAGAGGAGGCC 1860

 34722812 TGGGCAGGGCTGTTTGCTCTGTGGGGCCCGTGGGAGCCAGGAATGGGTGGGAGCCCCACC 34722871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGCAGGGCTGTTTGCTCTGTGGGGCCCGTGGGAGCCAGGAATGGGTGGGAGCCCCACC 1920

 34722872 CCCGTCCGAGTTGGTGGGGTGGGAGCCCCGTGCTCCCAGGTGCAGCTGTAGCTGCCCAGC 34722931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCGTCCGAGTTGGTGGGGTGGGAGCCCCGTGCTCCCAGGTGCAGCTGTAGCTGCCCAGC 1980

 34722932 TATGTCTGCTGACCCAGGCATCCTTGTGGTCTTGGGGACACAGAAAATCCTCCTACCCCA 34722991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGTCTGCTGACCCAGGCATCCTTGTGGTCTTGGGGACACAGAAAATCCTCCTACCCCA 2040

 34722992 ACAGGTTCAGAAGTGCCTGCTCCCACTGCCTGGGCTTTTCCCAATCCTGGTACCCACTCT 34723051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAGGTTCAGAAGTGCCTGCTCCCACTGCCTGGGCTTTTCCCAATCCTGGTACCCACTCT 2100

 34723052 GATTTCAGAGTAGAGTTGTGGCTGAGCCTGGGTGCTGTCACTACCTGGTTGGGTGTGCCT 34723111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTTCAGAGTAGAGTTGTGGCTGAGCCTGGGTGCTGTCACTACCTGGTTGGGTGTGCCT 2160

 34723112 GCACTCAGGCCGGTACTGACACACAAATCCCCTACTACTGAAGCCTAGGGTAGCTGAGGG 34723171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCACTCAGGCCGGTACTGACACACAAATCCCCTACTACTGAAGCCTAGGGTAGCTGAGGG 2220

 34723172 TGACTTGGCACAAGATTGCAGGTTCCCCTTGGCATGAACAGCCTGGGCATCATGAATGGT 34723231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGACTTGGCACAAGATTGCAGGTTCCCCTTGGCATGAACAGCCTGGGCATCATGAATGGT 2280

 34723232 GGCAGGAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACCTT 34723291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCAGGAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACCTT 2340

 34723292 TAAGCCAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTGAG 34723351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAGCCAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTGAG 2400

 34723352 AACTTATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACT 34723411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTTATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACT 2460

 34723412 TCCTCCCCTCTGAAGCCCACAAAATCTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGA 34723471
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCTCCCCTCTGAAGCCCACAAAAACTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGA 2520

 34723472 TGACCTGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACA 34723531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGACCTGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACA 2580

 34723532 CTCATTGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGT 34723591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCATTGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGT 2640

 34723592 ACTGTCACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTA 34723651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTGTCACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTA 2700

 34723652 TTTTTCCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTG 34723711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTTCCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTG 2760

 34723712 TAACACAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAA 34723771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAACACAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAA 2820

 34723772 GGAGAAAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCT 34723831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGAGAAAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCT 2880

 34723832 CCCTGAGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCT 34723891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCTGAGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCT 2940

 34723892 TCTGGGTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTC 34723951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTGGGTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTC 3000

 34723952 CAGTTGCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGC 34724011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGTTGCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGC 3060

 34724012 CAGAGTGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCAC 34724071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAGAGTGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCAC 3120

 34724072 CACACCATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAG 34724131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CACACCATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAG 3180

 34724132 CGCAGTCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCA 34724191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CGCAGTCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCA 3240

 34724192 AAGGTGCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGA 34724251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAGGTGCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGA 3300

 34724252 CAATATAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAA 34724311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAATATAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAA 3360

 34724312 TTTTTTGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATC 34724371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTTTTGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATC 3420

 34724372 TTTCATTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAA 34724431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTCATTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAA 3480

 34724432 TGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTG 34724491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTG 3540

 34724492 AATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATT 34724551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATT 3600

 34724552 TTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGG 34724611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGG 3660

 34724612 TAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGA 34724671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGA 3720

 34724672 CTCCTCTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTT 34724731
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTCCTGTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTT 3780

 34724732 GTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAG 34724791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAG 3840

 34724792 CTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTT 34724851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTT 3900

 34724852 TTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATC 34724911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATC 3960

 34724912 AAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGAT 34724971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGAT 4020

 34724972 TGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATG 34725031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATG 4080

 34725032 ATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTA 34725091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTA 4140

 34725092 ATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTT 34725151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTT 4200

 34725152 GGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCC 34725211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCC 4260

 34725212 TATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAA 34725271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAA 4320

 34725272 TTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTT 34725331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTT 4380

 34725332 GATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGG 34725391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGG 4440

 34725392 TAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAA 34725451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAA 4500

 34725452 GAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTT 34725511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTT 4560

 34725512 TTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGG 34725571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGG 4620

 34725572 TTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTG 34725631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTG 4680

 34725632 TTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGT 34725691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGT 4740

 34725692 TTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTT 34725751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTT 4800

 34725752 TAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTA 34725811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTA 4860

 34725812 AAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCAT 34725871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCAT 4920

 34725872 TATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGT 34725931
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4921 TATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACCCATCAGT 4980

 34725932 CATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGT 34725991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGT 5040

 34725992 TATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTT 34726051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTT 5100

 34726052 TTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTAC 34726111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTAC 5160

 34726112 ATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATT 34726171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATT 5220

 34726172 AATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACT 34726231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACT 5280

 34726232 GTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATAT 34726291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATAT 5340

 34726292 TGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTG 34726351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTG 5400

 34726352 CATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCA 34726411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCA 5460

 34726412 TGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGA 34726471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGA 5520

 34726472 TATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCC 34726531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCC 5580

 34726532 ATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACA 34726590
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     5581 ATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACA 5640

 34726591 GATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTA 34726650
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTA 5700

 34726651 GTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTAT 34726710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTAT 5760

 34726711 TTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAG 34726770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAG 5820

 34726771 TGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCC 34726830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCC 5880

 34726831 ATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAG 34726890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAG 5940

 34726891 CAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACT 34726950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACT 6000

 34726951 CTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGT 34727010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGT 6060

 34727011 ACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTC 34727070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTC 6120

 34727071 TACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGT 34727130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGT 6180

 34727131 GTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGT 34727190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGT 6240

 34727191 TCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTG 34727250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTG 6300

 34727251 GGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAG 34727310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAG 6360

 34727311 GGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCA 34727370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCA 6420

 34727371 AGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTT 34727430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTT 6480

 34727431 TTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAAT 34727490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAAT 6540

 34727491 GCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTT 34727550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTT 6600

 34727551 GAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAAC 34727610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 GAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAAC 6660

 34727611 GTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCC 34727670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCC 6720

 34727671 TTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTC 34727730
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6721 TTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTC 6780

 34727731 TGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACT 34727790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACT 6840

 34727791 CTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGA 34727850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGA 6900

 34727851 ATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCT 34727910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 ATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCT 6960

 34727911 AGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCT 34727970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 AGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCT 7020

 34727971 ATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGT 34728030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGT 7080

 34728031 GCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGAT 34728090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGAT 7140

 34728091 GTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 7171

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 7231

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 7291

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 7351

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7352 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 7411

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7412 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 7471

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7472 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 7531

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7532 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 7591

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7592 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 7651

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7652 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 7711

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7712 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 7771

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7772 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 7831

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7832 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 7891

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7892 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 7951

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7952 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 8011

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8012 TGACAGGGCAGCACTGAGTCCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 8071

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8072 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 8131

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8132 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 8191

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8192 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 8251

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8252 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 8311

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8312 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 8371

 34729817 TCT 34729819
          |||
     8372 TCT 8374

Alignment time is 6.11807 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2197] =>      2197 nucs 'mol-32-301a-012840_2197'

Score:        2196
Aligned:      2196        nucs
Identic:      2196 (100%) nucs =>      1554 (100%)       642 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726893,34728446] EXCISED REGION [34728448,34729089]
 second seq =>  [       1,    1554] EXCISED REGION [    1556,    2197]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [1555,1555]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [1553,1554] to [1556,1557]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726893 GATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCT 34726952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCT 60

 34726953 ACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTAC 34727012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTAC 120

 34727013 CATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTA 34727072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTA 180

 34727073 CTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGT 34727132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGT 240

 34727133 GCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTC 34727192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTC 300

 34727193 TTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGG 34727252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGG 360

 34727253 AAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGG 34727312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGG 420

 34727313 TAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAG 34727372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAG 480

 34727373 GTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTT 34727432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTT 540

 34727433 CTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGC 34727492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGC 600

 34727493 CTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGA 34727552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGA 660

 34727553 ACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGT 34727612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGT 720

 34727613 TCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTT 34727672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTT 780

 34727673 TTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTG 34727732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTG 840

 34727733 ACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCT 34727792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCT 900

 34727793 TCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAAT 34727852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAAT 960

 34727853 TTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAG 34727912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAG 1020

 34727913 AATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTAT 34727972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTAT 1080

 34727973 TTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGC 34728032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGC 1140

 34728033 CTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGT 34728092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGT 1200

 34728093 TTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTT 34728152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTT 1260

 34728153 ATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAG 34728212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAG 1320

 34728213 CCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAA 34728272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAA 1380

 34728273 GAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCC 34728332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCC 1440

 34728333 CTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTT 34728392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTT 1500

 34728393 TGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 34728446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 1554

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1615

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1675

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1735

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1795

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 1855

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 1915

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 1975

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 2035

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 2095

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 2155

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAA 34729089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAA 2197

Alignment time is 1.58555 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8862] =>      8862 nucs 'mol-32-3030-159208_8862'

Score:        8784
Aligned:      8861        nucs
Identic:      8854 (100%) nucs =>       133 (100%)      8721 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34721433,34721565] EXCISED REGION [34721567,34730293]
 second seq =>  [       1,     133] EXCISED REGION [     135,    8862]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34721566,34721566]
 second seq =>         1 nucs [134,134]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5153,5153]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [133,133] to [134,134]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34721433 TGCTTGGCTTATTTCACTTAATGTAATGACTTCCAGTTCCACCCATGTTGCAATGACAAG 34721492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTTGGCTTATTTCACTTAATGTAATGACTTCCAGTTCCACCCATGTTGCAATGACAAG 60

 34721493 ATCACATTCTTTTAATGGCTGAATAATACTCCATTGTGTATATGCAGCACATTTCCTTTA 34721552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCACATTCTTTTAATGGCTGAATAATACTCCATTGTGTATATGCAGCACATTTCCTTTA 120

 34721553 TCCATTCATCTGT 34721565
          |||||||||||||
      121 TCCATTCATCTGT 133

EXCISED REGION

 34721567 GATGGACACTTAGGTTGCTTCCAAATCTTGGCTACTATGAACAGTGTTGCAACAAACATG 34721626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      135 GATGGACACTTAGGTTGCTTCCAAATCTTGGCTACTATGAACAGTGTTGCAACAAACATG 194

 34721627 GTGGTGCAGATATCCCTTCCCTATACTGATTTCCTTTCTTCTAGATATATACTTAGCAGT 34721686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 GTGGTGCAGATATCCCTTCCCTATACTGATTTCCTTTCTTCTAGATATATACTTAGCAGT 254

 34721687 GGGATTGCTGGATCATATGGCAGCTCTATTTTTAGATTTTTGAGGAACCCCCAAACTGTT 34721746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 GGGATTGCTGGATCATATGGCAGCTCTATTTTTAGATTTTTGAGGAACCCCCAAACTGTT 314

 34721747 CTCCATAGTGGTAGTACTAATTGACATTCGCACTAACAGTATATAAGTGTTCTCTTTCCT 34721806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 CTCCATAGTGGTAGTACTAATTGACATTCGCACTAACAGTATATAAGTGTTCTCTTTCCT 374

 34721807 CCACATCCTCGCCAGCATTTGTTATTACCTGTCTTTTGAATATAAGCCATTTTAACTGAG 34721866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 CCACATCCTCGCCAGCATTTGTTATTACCTGTCTTTTGAATATAAGCCATTTTAACTGAG 434

 34721867 ATGAGATTATATCTCATTGTAGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATCAGTGATATTGAG 34721926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 ATGAGATTATATCTCATTGTAGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGATCAGTGATATTGAG 494

 34721927 CACCTTTTCCTATGCCTGCTTGCCATTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATGTCTATTTATAT 34721986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 CACCTTTTCCTATGCCTGCTTGCCATTGTATGCCTTCTTTTGAGAAATGTCTATTTATAT 554

 34721987 TTTTTGCCCATTTTAATTATATTATTATATTTTTCCCTATAAAGTTGTTTGAGCTCTTTA 34722046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 TTTTTGCCCATTTTAATTATATTATTATATTTTTCCCTATAAAGTTGTTTGAGCTCTTTA 614

 34722047 TATATTCCAGGTATTAATCTCTTGTAAGATTGGCAGTTTGCAAATATTTTCTCCCATTCT 34722106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 TATATTCCAGGTATTAATCTCTTGTAAGATTGGCAGTTTGCAAATATTTTCTCCCATTCT 674

 34722107 GTGGATTGTCTTTTCACTTTGTTGATTGTTTTCATTGCTGTGCAGAAGCTTTTAAACTTT 34722166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 GTGGATTGTCTTTTCACTTTGTTGATTGTTTTCATTGCTGTGCAGAAGCTTTTAAACTTT 734

 34722167 ATGTGATTCCATTTGTTCATTTTTGCTTTAGTTGTCTGTGCTTGTGGGTTATTACTCAAT 34722226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 ATGTGATTCCATTTGTTCATTTTTGCTTTAGTTGTCTGTGCTTGTGGGTTATTACTCAAT 794

 34722227 AAATTTTTGCCCAGAACAATGTCCTGGAGAGTTTTTCCAATGTTTTCTTGTAATAGTTTC 34722286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 AAATTTTTGCCCAGAACAATGTCCTGGAGAGTTTTTCCAATGTTTTCTTGTAATAGTTTC 854

 34722287 ATACCTTTAAGTCTTTCATCCATTTTGATTTGATCTTTATAGATGGCAAGAGCTAGAGAT 34722346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 ATACCTTTAAGTCTTTCATCCATTTTGATTTGATCTTTATAGATGGCAAGAGCTAGAGAT 914

 34722347 TGAGTTTCATTCTTCTGCATATGGATATCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTGAAGAGAT 34722406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 TGAGTTTCATTCTTCTGCATATGGATATCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTGAAGAGAT 974

 34722407 TGTCTTTTCCCCAATGTATGTTTTTGGCACCTTTGTTGAAAATGAGTTCGCTGTAGGTGT 34722466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 TGTCTTTTCCCCAATGTATGTTTTTGGCACCTTTGTTGAAAATGAGTTCGCTGTAGGTGT 1034

 34722467 ATACATTTATTTCTGGGTTATCTACTCTGTTCCATTGGTCTATGTGTCTGTTTTTATGAC 34722526
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 ATACATTTATTTCTGGGTTCTCTACTCTGTTCCATTGGTCTATGTGTCTGTTTTTATGAC 1094

 34722527 AGTACCATGCTGTTTTGGTTACCATAGCTCTGTGGTTATAATTTCAAGTCAGGTAATGTG 34722586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 AGTACCATGCTGTTTTGGTTACCATAGCTCTGTGGTTATAATTTCAAGTCAGGTAATGTG 1154

 34722587 ATTCCTCCATTTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATAACTTTGGCTATTCTGGGTATTTGGTGG 34722646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 ATTCCTCCATTTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATAACTTTGGCTATTCTGGGTATTTGGTGG 1214

 34722647 TTCCATATAAATTTTAGTATTGTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTATTTTT 34722706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 TTCCATATAAATTTTAGTATTGTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTATTTTT 1274

 34722707 GTAAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGTACTATTGATGGCAGCAGTGGCCCA 34722766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 GTAAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGTACTATTGATGGCAGCAGTGGCCCA 1334

 34722767 TCTGGAGTGGCTGCTGCTAAGATACTGGCTGCAGCAGAGGAGGCCTGGGCAGGGCTGTTT 34722826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 TCTGGAGTGGCTGCTGCTAAGATACTGGCTGCAGCAGAGGAGGCCTGGGCAGGGCTGTTT 1394

 34722827 GCTCTGTGGGGCCCGTGGGAGCCAGGAATGGGTGGGAGCCCCACCCCCGTCCGAGTTGGT 34722886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 GCTCTGTGGGGCCCGTGGGAGCCAGGAATGGGTGGGAGCCCCACCCCCGTCCGAGTTGGT 1454

 34722887 GGGGTGGGAGCCCCGTGCTCCCAGGTGCAGCTGTAGCTGCCCAGCTATGTCTGCTGACCC 34722946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 GGGGTGGGAGCCCCGTGCTCCCAGGTGCAGCTGTAGCTGCCCAGCTATGTCTGCTGACCC 1514

 34722947 AGGCATCCTTGTGGTCTTGGGGACACAGAAAATCCTCCTACCCCAACAGGTTCAGAAGTG 34723006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 AGGCATCCTTGTGGTCTTGGGGACACAGAAAATCCTCCTACCCCAACAGGTTCAGAAGTG 1574

 34723007 CCTGCTCCCACTGCCTGGGCTTTTCCCAATCCTGGTACCCACTCTGATTTCAGAGTAGAG 34723066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 CCTGCTCCCACTGCCTGGGCTTTTCCCAATCCTGGTACCCACTCTGATTTCAGAGTAGAG 1634

 34723067 TTGTGGCTGAGCCTGGGTGCTGTCACTACCTGGTTGGGTGTGCCTGCACTCAGGCCGGTA 34723126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 TTGTGGCTGAGCCTGGGTGCTGTCACTACCTGGTTGGGTGTGCCTGCACTCAGGCCGGTA 1694

 34723127 CTGACACACAAATCCCCTACTACTGAAGCCTAGGGTAGCTGAGGGTGACTTGGCACAAGA 34723186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 CTGACACACAAATCCCCTACTACTGAAGCCTAGGGTAGCTGAGGGTGACTTGGCACAAGA 1754

 34723187 TTGCAGGTTCCCCTTGGCATGAACAGCCTGGGCATCATGAATGGTGGCAGGAGGCAGACA 34723246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 TTGCAGGTTCCCCTTGGCATGAACAGCCTGGGCATCATGAATGGTGGCAGGAGGCAGACA 1814

 34723247 GGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACCTTTAAGCCAGGGATGGC 34723306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 GGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACCTTTAAGCCAGGGATGGC 1874

 34723307 CTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTGAGAACTTATTGTGCTTT 34723366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 CTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTGAGAACTTATTGTGCTTT 1934

 34723367 TTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACTTCCTCCCCTCTGAAG 34723426
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 CTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACTTCCTCCCCTCTGAAG 1994

 34723427 CCCACAAAATCTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGATGACCTGCTTGTGGA 34723486
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 CCCACAAAAACTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGATGACCTGCTTGTGGA 2054

 34723487 GAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACACTCATTGGGATGACC 34723546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACACTCATTGGGATGACC 2114

 34723547 TGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGTACTGTCACTCAGTAA 34723606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 TGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGTACTGTCACTCAGTAA 2174

 34723607 AGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTATTTTTCCTGGACATG 34723666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 AGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTATTTTTCCTGGACATG 2234

 34723667 GGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTGTAACACAAACAGTGC 34723726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 GGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTGTAACACAAACAGTGC 2294

 34723727 TGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAAGGAGAAAAGAGAGAA 34723786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAAGGAGAAAAGAGAGAA 2354

 34723787 GGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCT 34723846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 GGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCT 2414

 34723847 GTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCTTCTGGGTGCTGCCAC 34723906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 GTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCTTCTGGGTGCTGCCAC 2474

 34723907 ATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTCCAGTTGCAGCAGGGA 34723966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 ATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTCCAGTTGCAGCAGGGA 2534

 34723967 GACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTG 34724026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 GACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTG 2594

 34724027 TGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACACCATTCCTGGC 34724086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 TGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACACCATTCCTGGC 2654

 34724087 TTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGT 34724146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 TTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGT 2714

 34724147 CGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGTGCCACTGGCC 34724206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 CGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGTGCCACTGGCC 2774

 34724207 ACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATATAGACATTTT 34724266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 ACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATATAGACATTTT 2834

 34724267 AACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTTTGGCATCCTC 34724326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 AACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTTTGGCATCCTC 2894

 34724327 TCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCATTTTTTTGGT 34724386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 TCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCATTTTTTTGGT 2954

 34724387 TAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGATTATTTTTAA 34724446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGATTATTTTTAA 3014

 34724447 TTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTTTGTATGTTGA 34724506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 TTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTTTGTATGTTGA 3074

 34724507 TTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTGGTGGAGTC 34724566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 TTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTGGTGGAGTC 3134

 34724567 TTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTGACTTATTC 34724626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 TTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTGACTTATTC 3194

 34724627 CTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTCTAGCTAGGA 34724686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 CTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTCTAGCTAGGA 3254

 34724687 TTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCTCCAGATCT 34724746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 TTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCTCCAGATCT 3314

 34724747 TACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGGTCTGTCAT 34724806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 TACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGGTCTGTCAT 3374

 34724807 ATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTT 34724866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 ATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTT 3434

 34724867 AATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATGATTAT 34724926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 AATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATGATTAT 3494

 34724927 GTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAAATGTT 34724986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 GTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAAATGTT 3554

 34724987 GAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAATATAT 34725046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 GAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAATATAT 3614

 34725047 TATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCAGAGAT 34725106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 TATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCAGAGAT 3674

 34725107 GTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAGGTAAT 34725166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 GTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAGGTAAT 3734

 34725167 ACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAAAACAA 34725226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 ACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAAAACAA 3794

 34725227 TTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATGAAGCC 34725286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 TTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATGAAGCC 3854

 34725287 ATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCAATTGT 34725346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 ATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCAATTGT 3914

 34725347 TGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTATGTGTC 34725406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 TGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTATGTGTC 3974

 34725407 TAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGTAGCCA 34725466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 TAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGTAGCCA 4034

 34725467 TAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCTGATTT 34725526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 TAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCTGATTT 4094

 34725527 TATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATTTTATT 34725586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 TATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATTTTATT 4154

 34725587 CATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCATTTCAA 34725646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 CATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCATTTCAA 4214

 34725647 TTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTTTTC 34725706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 TTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTTTTC 4274

 34725707 TTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCATTGTTA 34725766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 TTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCATTGTTA 4334

 34725767 GATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTCCTAGT 34725826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 GATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTCCTAGT 4394

 34725827 ACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTTAA 34725886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 ACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTTAA 4454

 34725887 GAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAG 34725946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 GAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAG 4514

 34725947 TGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTT 34726006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 TGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTT 4574

 34726007 TTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAA 34726066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 TTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAA 4634

 34726067 ACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGAT 34726126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 ACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGAT 4694

 34726127 GAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTT 34726186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 GAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTT 4754

 34726187 TTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGT 34726246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 TTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGT 4814

 34726247 CCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTC 34726306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 CCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTC 4874

 34726307 TGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATA 34726366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 TGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATA 4934

 34726367 TATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTT 34726426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 TATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTT 4994

 34726427 CTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCT 34726486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 CTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCT 5054

 34726487 ACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAG 34726546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 ACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAG 5114

 34726547 TCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTA-GCAACAGATCATTGGGTCTTG 34726605
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     5115 TCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCATTGGGTCTTG 5174

 34726606 CTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCA 34726665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 CTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCA 5234

 34726666 ATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGC 34726725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 ATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGC 5294

 34726726 TTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCA 34726785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 TTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCA 5354

 34726786 TTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTA 34726845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 TTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTA 5414

 34726846 CTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAA 34726905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 CTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAA 5474

 34726906 CACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTT 34726965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 CACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTT 5534

 34726966 GTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAA 34727025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 GTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAA 5594

 34727026 GTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGT 34727085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 GTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGT 5654

 34727086 TTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACT 34727145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 TTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACT 5714

 34727146 AGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGAT 34727205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 AGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGAT 5774

 34727206 TGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTT 34727265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 TGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTT 5834

 34727266 CTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTT 34727325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 CTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTT 5894

 34727326 GCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGA 34727385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 GCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGA 5954

 34727386 AGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTA 34727445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 AGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTA 6014

 34727446 AGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCT 34727505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 AGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCT 6074

 34727506 TCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTT 34727565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 TCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTT 6134

 34727566 TCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATAT 34727625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 TCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATAT 6194

 34727626 ATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTT 34727685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 ATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTT 6254

 34727686 CTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTC 34727745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 CTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTC 6314

 34727746 AAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGAC 34727805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6315 AAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGAC 6374

 34727806 TGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTT 34727865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6375 TGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTT 6434

 34727866 CTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTC 34727925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6435 CTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTC 6494

 34727926 TTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTT 34727985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6495 TTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTT 6554

 34727986 TCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCA 34728045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6555 TCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCA 6614

 34728046 TTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTG 34728105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6615 TTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTG 6674

 34728106 TGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATC 34728165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6675 TGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATC 6734

 34728166 TTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTG 34728225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6735 TTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTG 6794

 34728226 TGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAAT 34728285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6795 TGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAAT 6854

 34728286 TCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGG 34728345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6855 TCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGG 6914

 34728346 AGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTG 34728405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6915 AGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTG 6974

 34728406 ACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCAGCATAGCACTGAGTCGTGC 34728465
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6975 ACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCATCATAGCACTGAGTCGTGC 7034

 34728466 CCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTTCTTTGG 34728525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7035 CCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTTCTTTGG 7094

 34728526 GCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGGCCCAGA 34728585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7095 GCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGGCCCAGA 7154

 34728586 GCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGC 34728645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7155 GCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGC 7214

 34728646 TTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTT 34728705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7215 TTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTT 7274

 34728706 ACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAAT 34728765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7275 ACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAAT 7334

 34728766 ATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTAC 34728825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7335 ATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTAC 7394

 34728826 TACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTA 34728885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7395 TACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTA 7454

 34728886 ATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTG 34728945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7455 ATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTG 7514

 34728946 TCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCAC 34729005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7515 TCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCAC 7574

 34729006 TATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCAC 34729065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7575 TATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCAC 7634

 34729066 TCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGG 34729125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7635 TCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGG 7694

 34729126 GTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCT 34729185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7695 GTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCT 7754

 34729186 GGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACT 34729245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7755 GGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACT 7814

 34729246 AGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAA 34729305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7815 AGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAA 7874

 34729306 CCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGG 34729365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7875 CCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGG 7934

 34729366 GATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCA 34729425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7935 GATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCA 7994

 34729426 GCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAA 34729485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7995 GCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAA 8054

 34729486 GACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGT 34729545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8055 GACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGT 8114

 34729546 GGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACC 34729605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8115 GGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACC 8174

 34729606 CTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTG 34729665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8175 CTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTG 8234

 34729666 ATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTC 34729725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8235 ATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTC 8294

 34729726 CTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCAT 34729785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8295 CTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCAT 8354

 34729786 TTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCA 34729845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8355 TTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCA 8414

 34729846 ATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTT 34729905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8415 ATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTT 8474

 34729906 TCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGT 34729965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8475 TCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGT 8534

 34729966 TTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTC 34730025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8535 TTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTC 8594

 34730026 TTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAG 34730085
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     8595 TTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAG 8654

 34730086 CTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCT 34730145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8655 CTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCT 8714

 34730146 TTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGC 34730205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8715 TTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGC 8774

 34730206 TGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATT 34730265
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8775 TGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATT 8834

 34730266 CCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATAT 34730293
          ||||||||||||||||||||||||||||
     8835 CCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATAT 8862

Alignment time is 6.35045 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2674] =>      2674 nucs 'mol-32-3046-230623_2674'

Score:        2662
Aligned:      2673        nucs
Identic:      2672 (100%) nucs =>       142 (100%)      2530 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726697,34726838] EXCISED REGION [34726840,34729370]
 second seq =>  [       1,     142] EXCISED REGION [     144,    2674]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34726839,34726839]
 second seq =>         1 nucs [143,143]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [143,147] to [144,148]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726697 TGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCC 34726756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCC 60

 34726757 TGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTA 34726816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTA 120

 34726817 TTTTTTGAATATCCATTGCATG 34726838
          ||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTTGAATATCCATTGCATG 142

EXCISED REGION

 34726840 TTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACA 34726899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      144 TTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACA 203

 34726900 AATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGT 34726959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 AATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGT 263

 34726960 AACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCT 34727019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 AACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCT 323

 34727020 TGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGG 34727079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      324 TGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGG 383

 34727080 TTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACT 34727139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 TTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACT 443

 34727140 CTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTT 34727199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 CTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTT 503

 34727200 TCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCT 34727259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 TCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCT 563

 34727260 TTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACG 34727319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 TTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACG 623

 34727320 TTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCA 34727379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 TTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCA 683

 34727380 CTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATG 34727439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 CTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATG 743

 34727440 CTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGG 34727499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 CTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGG 803

 34727500 TAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGT 34727559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 TAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGT 863

 34727560 TACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACAC 34727619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 TACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACAC 923

 34727620 CTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTC 34727679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 CTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTC 983

 34727680 AATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGT 34727739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 AATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGT 1043

 34727740 ATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTA 34727799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 ATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTA 1103

 34727800 AGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACT 34727859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 AGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACT 1163

 34727860 TGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTG 34727919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 TGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTG 1223

 34727920 AATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAAT 34727979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 AATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAAT 1283

 34727980 ACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTT 34728039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 ACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTT 1343

 34728040 AGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAG 34728099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 AGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAG 1403

 34728100 TTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTG 34728159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 TTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTG 1463

 34728160 CCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAA 34728219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 CCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAA 1523

 34728220 TTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGG 34728279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGG 1583

 34728280 AAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAG 34728339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 AAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAG 1643

 34728340 AAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACC 34728399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 AAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACC 1703

 34728400 TTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCAGCATAGCACTGAG 34728459
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1704 TTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCATCATAGCACTGAG 1763

 34728460 TCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTT 34728519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTCACTGAAGGCCTT 1823

 34728520 CTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGG 34728579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 CTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTCCTTCCCTTCTGG 1883

 34728580 CCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGA 34728639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 CCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGA 1943

 34728640 GCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTC 34728699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 GCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTC 2003

 34728700 TCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCT 34728759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCT 2063

 34728760 GGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATG 34728819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 GGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATG 2123

 34728820 GTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGG 34728879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 GTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGG 2183

 34728880 TGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAG 34728939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 TGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAG 2243

 34728940 GTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTG 34728999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 GTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTG 2303

 34729000 GTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACT 34729059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 GTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAATACCACTTTACT 2363

 34729060 CTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACT 34729119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 CTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACT 2423

 34729120 GCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCC 34729179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 GCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCC 2483

 34729180 CCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTT 34729239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 CCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTT 2543

 34729240 AGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTAC 34729299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 AGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTAC 2603

 34729300 CTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAAC 34729359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 CTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAAC 2663

 34729360 CACTGGGATGG 34729370
          |||||||||||
     2664 CACTGGGATGG 2674

Alignment time is 1.94394 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2215] =>      2215 nucs 'mol-32-30eb-024500_2215'

Score:        2191
Aligned:      2213        nucs
Identic:      2211 (100%) nucs =>       942 (100%)      1269 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727179,34728121] EXCISED REGION [34728617,34729886]
 second seq =>  [       1,     943] EXCISED REGION [     944,    2213]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34727179 GTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCT 34727238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCT 60

 34727239 TTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGAT 34727298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGAT 120

 34727299 ATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTC 34727358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTC 180

 34727359 TCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGT 34727418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGT 240

 34727419 ATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTT 34727478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTT 300

 34727479 TGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAAC 34727538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAAC 360

 34727539 CTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTA 34727598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTA 420

 34727599 CTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTC 34727658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTC 480

 34727659 TTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTC 34727718
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      481 TTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTC 540

 34727719 TTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCT 34727778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCT 600

 34727779 GTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTT 34727838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTT 660

 34727839 TTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTA 34727898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTA 720

 34727899 AATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTC 34727958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTC 780

 34727959 CTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAA 34728018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAA 840

 34728019 TTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTG 34728078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTG 900

 34728079 ATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 943

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1003

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1063

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1123

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1183

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1243

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1303

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1363

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1423

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1483

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1543

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1544 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1603

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1663

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 1723

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 1783

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 1843

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 1903

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 1963

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2023

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2083

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2143

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 2203

 34729877 TCAATTTTCC 34729886
          ||||||||||
     2204 TCAATTTTCC 2213

Alignment time is 1.60945 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,   10380] =>     10380 nucs 'mol-32-310c-113439_10380'

Score:       10215
Aligned:     10380        nucs
Identic:     10365 (100%) nucs =>      3317 (100%)      7048 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34724802,34728121] EXCISED REGION [34728617,34735675]
 second seq =>  [       1,    3321] EXCISED REGION [    3322,   10380]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34724802 GTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTT 34724861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTT 60

 34724862 GTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATG 34724921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATG 120

 34724922 ATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAA 34724981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAA 180

 34724982 ATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAA 34725041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAA 240

 34725042 TATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCA 34725101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCA 300

 34725102 GAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAG 34725161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAG 360

 34725162 GTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAA 34725221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAA 420

 34725222 AACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATG 34725281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATG 480

 34725282 AAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCA 34725341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCA 540

 34725342 ATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTAT 34725401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTAT 600

 34725402 GTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGT 34725461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGT 660

 34725462 AGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCT 34725521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCT 720

 34725522 GATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATT 34725581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATT 780

 34725582 TTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCAT 34725641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCAT 840

 34725642 TTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTC 34725701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTC 900

 34725702 TTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCAT 34725761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCAT 960

 34725762 TGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTC 34725821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTC 1020

 34725822 CTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGT 34725881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGT 1080

 34725882 TTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAG 34725941
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAG 1140

 34725942 CACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTC 34726001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTC 1200

 34726002 TATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTT 34726061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTT 1260

 34726062 TTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAG 34726121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAG 1320

 34726122 GAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTC 34726181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTC 1380

 34726182 ATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGG 34726241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGG 1440

 34726242 TCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTAT 34726301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTAT 1500

 34726302 CTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGC 34726361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGC 1560

 34726362 ATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATG 34726421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATG 1620

 34726422 ACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTA 34726481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTA 1680

 34726482 TAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATC 34726541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATC 1740

 34726542 TTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACAGATCATTGGG 34726600
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     1741 TTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCATTGGG 1800

 34726601 TCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTAC 34726660
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTAC 1860

 34726661 ATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTG 34726720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTG 1920

 34726721 GTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGAT 34726780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGAT 1980

 34726781 TTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGAT 34726840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGAT 2040

 34726841 TTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAA 34726900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAA 2100

 34726901 ATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTA 34726960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTA 2160

 34726961 ACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTT 34727020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTT 2220

 34727021 GAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGT 34727080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGT 2280

 34727081 TTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTC 34727140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTC 2340

 34727141 TTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTT 34727200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTT 2400

 34727201 CAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTT 34727260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTT 2460

 34727261 TATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGT 34727320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGT 2520

 34727321 TTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCAC 34727380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCAC 2580

 34727381 TGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGC 34727440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGC 2640

 34727441 TTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGT 34727500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGT 2700

 34727501 AGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTT 34727560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTT 2760

 34727561 ACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACC 34727620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACC 2820

 34727621 TATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCA 34727680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCA 2880

 34727681 ATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTA 34727740
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTA 2940

 34727741 TTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAA 34727800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAA 3000

 34727801 GAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTT 34727860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTT 3060

 34727861 GATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGA 34727920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGA 3120

 34727921 ATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATA 34727980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATA 3180

 34727981 CTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTA 34728040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTA 3240

 34728041 GTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGT 34728100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGT 3300

 34728101 TTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||
     3301 TTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 3321

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 3381

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 3441

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 3501

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 3561

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 3621

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 3681

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 3741

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 3801

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 3861

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 3921

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3922 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 3981

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 4041

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 4101

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 4161

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 4221

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 4281

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 4341

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 4401

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 4461

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 4521

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 4581

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 4641

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 4701

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 4761

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 4821

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 4881

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4882 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 4941

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 5001

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 5061

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 5121

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 5181

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 5241

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 5301

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 5361

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 5421

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 5481

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 5541

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 5601

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 5661

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 5721

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 5781

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 5841

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 5901

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5902 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 5961

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 6021

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 6081

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 6141

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 6201

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 6261

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 6321

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 6381

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 6441

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6442 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 6501

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6502 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 6561

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6562 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 6621

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 34731976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6622 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 6681

 34731977 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 34732036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6682 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 6741

 34732037 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 34732096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6742 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 6801

 34732097 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 34732156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6802 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 6861

 34732157 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 34732216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6862 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTG 6921

 34732217 GCATTAAACAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 34732276
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6922 GCATTAAATAGACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAAAATAGAGTATAAGTATTTTATTG 6981

 34732277 CCTTACATGTTTAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTA 34732336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6982 CCTTACATGTTTAATATTTTCAGTTCTCTTTATTTCTTAATTTATATCCAAATTTATTTA 7041

 34732337 TTGTATTAGTGTTCTTCCTCTCAAAGAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAA 34732396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7042 TTGTATTAGTGTTCTTCCTCTCAAAGAACTTCTATATCAATTCTTATAATGAAGATGTAA 7101

 34732397 TGGTGGTAAGTCTTACCAGCTGTGCTTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGT 34732456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7102 TGGTGGTAAGTCTTACCAGCTGTGCTTTGACTGAAATATATTTACTTTATCTCCATATGT 7161

 34732457 GACAGATGTTTTTGCTGGGCTTAGAATTTTAGGTTATCAAAAGTTTTTCAGAGTTTAAAA 34732516
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7162 GACAGATGTTTTTGCTGGGCTTAGAATTTTAGGTTGTCAAAAGTTTTTCAGAGTTTAAAA 7221

 34732517 ATGCTATTTTCTCTTCTCACTTGCCTAGATTCTAACAAAAAGGTTACTATCACTCTGATC 34732576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7222 ATGCTATTTTCTCTTCTCACTTGCCTAGATTCTAACAAAAAGGTTACTATCACTCTGATC 7281

 34732577 TTTGTTTCTTTGCATATAGTATGTATACATATTTTAAAGATTTTTCAGATCATCTTTAGT 34732636
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7282 TTTGTTTCTTTGCATATAATATGTATACATATTTTAAAGATTTTTCAGATCATCTTTAGT 7341

 34732637 GTTCAGCAATTTGAGTACCACATGTCTTTGTCTTGTATTGTTTGTGCTTGTCTTTCTGGG 34732696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7342 GTTCAGCAATTTGAGTACCACATGTCTTTGTCTTGTATTGTTTGTGCTTGTCTTTCTGGG 7401

 34732697 TTTCATTGAAGTATTTGGATCTGAGATTTATTGCATTTGTAAATATTTTGGCCATATTTC 34732756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7402 TTTCATTGAAGTATTTGGATCTGAGATTTATTGCATTTGTAAATATTTTGGCCATATTTC 7461

 34732757 TTGAAAAAAAATTTACCGTTTCTTCTCTTTATAGGACTCCAATTACTTAAATATTAGACC 34732816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7462 TTGAAAAAAAATTTACCGTTTCTTCTCTTTATAGGACTCCAATTACTTAAATATTAGACC 7521

 34732817 ACTTAATATTGTCCCACATGTTACCGAGACTTTATTTCTTTTCAATATTTACTCTCTGTA 34732876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7522 ACTTAATATTGTCCCACATGTTACCGAGACTTTATTTCTTTTCAATATTTACTCTCTGTA 7581

 34732877 AGATTCACTGTGAAGAGTTTCTATTGTTCCATCTTCTAGCTCACTAATATTTTCTTATGA 34732936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7582 AGATTCACTGTGAAGAGTTTCTATTGTTCCATCTTCTAGCTCACTAATATTTTCTTATGA 7641

 34732937 AGTGTCTAATCTGCTGTTAATCTTATCCAATGAATTTTCTATTTCAGATATTGTTTTTAT 34732996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7642 AGTGTCTAATCTGCTGTTAATCTTATCCAATGAATTTTCTATTTCAGATATTGTTTTTAT 7701

 34732997 TTCTAAAATTTTTATTTGATTTAAAAAATATTTTACATTCCTCTTTCACTATTTTATGTT 34733056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7702 TTCTAAAATTTTTATTTGATTTAAAAAATATTTTACATTCCTCTTTCACTATTTTATGTT 7761

 34733057 TTCCTTTAAATATCCGAACATAGTTAAAATAGTGGTTTTAATGTTCTTTTCTGCTAATTA 34733116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7762 TTCCTTTAAATATCCGAACATAGTTAAAATAGTGGTTTTAATGTTCTTTTCTGCTAATTA 7821

 34733117 TATCATTTTTGTCATTTATGGTCTGTTTCTGTTAACTGATTTTTCTCTTGGTTATGGATC 34733176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7822 TATCATTTTTGTCATTTATGGTCTGTTTCTGTTAACTGATTTTTCTCTTGGTTATGGATC 7881

 34733177 ACATTTTCCTGCTTGCAATGTCTAAGACATTTTTACTGGATAATATGATTTATGTGTTGT 34733236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7882 ACATTTTCCTGCTTGCAATGTCTAAGACATTTTTACTGGATAATATGATTTATGTGTTGT 7941

 34733237 CCAATATCTGGATTTTGTTGTTTTTCTTTACTTTAATGAGTAAGGTTTTCTTCTGATAGG 34733296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7942 CCAATATCTGGATTTTGTTGTTTTTCTTTACTTTAATGAGTAAGGTTTTCTTCTGATAGG 8001

 34733297 GAGTTAGGTTTCTTGTGATTCAGTGTTATCTTTTTCAGCTTTGTTTTTAAGCTTATTAAG 34733356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8002 GAGTTAGGTTTCTTGTGATTCAGTGTTATCTTTTTCAGCTTTGTTTTTAAGCTTATTAAG 8061

 34733357 GTGGATCTAGCATAGCCTTTATTTTAAGAATCATTTAATTTCAAATAAGTTGTAGCTTCA 34733416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8062 GTGGATCTAGCATAGCCTTTATTTTAAGAATCATTTAATTTCAAATAAGTTGTAGCTTCA 8121

 34733417 TTAATAAGTTTTTGGGGATCTTTACTGAATGTAAAAAGTGATCAGTGAGAATTCTCTACT 34733476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8122 TTAATAAGTTTTTGGGGATCTTTACTGAATGTAAAAAGTGATCAGTGAGAATTCTCTACT 8181

 34733477 CTGTTTGAAGGTGGAACCCTTCCTCTGTATATGTAAGCTCTGGGAACCATTCTTCTCATA 34733536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8182 CTGTTTGAAGGTGGAACCCTTCCTCTGTATATGTAAGCTCTGGGAACCATTCTTCTCATA 8241

 34733537 GATTCTTACTTACTCTTTGACCCAACTCAAGAAGTTTAACTCTATGCATGTGAATCCTAG 34733596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8242 GATTCTTACTTACTCTTTGACCCAACTCAAGAAGTTTAACTCTATGCATGTGAATCCTAG 8301

 34733597 TATTCAGGAATAGTCAAGAGAGTGTTGATATGGTTTGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCT 34733656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8302 TATTCAGGAATAGTCAAGAGAGTGTTGATATGGTTTGGCTTTGTGTCCCCACCCAAATCT 8361

 34733657 CATGTCAAGCTGTGGTTGTCAGTGTTGAAGGAGGGGCCGAGTGGGAGGTGATTTAATTGT 34733716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8362 CATGTCAAGCTGTGGTTGTCAGTGTTGAAGGAGGGGCCGAGTGGGAGGTGATTTAATTGT 8421

 34733717 GGGGGTGAACTTACCCCTTGCTGTTCTTGTGATAGAGTTCTCATGAGATCTGGTTGTTTG 34733776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8422 GGGGGTGAACTTACCCCTTGCTGTTCTTGTGATAGAGTTCTCATGAGATCTGGTTGTTTG 8481

 34733777 AAAAGTGTGTGGGACTTCCCCCTTCTCTCTCTCTCTCTTTCCTGCCCACCATGTAAGACA 34733836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8482 AAAAGTGTGTGGGACTTCCCCCTTCTCTCTCTCTCTCTTTCCTGCCCACCATGTAAGACA 8541

 34733837 TGCTTGCTTCCCTTTCACCTTTTGCTATGATTGTAAGTTTCTTAAGGCTTCTCCAGCCAT 34733896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8542 TGCTTGCTTCCCTTTCACCTTTTGCTATGATTGTAAGTTTCTTAAGGCTTCTCCAGCCAT 8601

 34733897 GCTTCCTGTACAACTTGTGGATCATGGGTCAATTAAACTTATTTTCTTCATAAATTACCC 34733956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8602 GCTTCCTGTACAACTTGTGGATCATGGGTCAATTAAACTTATTTTCTTCATAAATTACCC 8661

 34733957 AAGCTCTGGTATGTCTTTATAGCAGTGTGATAATGGACTAATATAGAAAACTGATATTGA 34734016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8662 AAGCTCTGGTATGTCTTTATAGCAGTGTGATAATGGACTAATATAGAAAACTGATATTGA 8721

 34734017 GTAGTGGGGCATTGCTATAAAGATACCTGAAAATATGGAAATGACTTTGGAACTGGGTAA 34734076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8722 GTAGTGGGGCATTGCTATAAAGATACCTGAAAATATGGAAATGACTTTGGAACTGGGTAA 8781

 34734077 CAGACAGAGATTGGAACAGTTCGGAGGGCTGAGAAGAAGACAGGAAGATGAGGGAAAGTT 34734136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8782 CAGACAGAGATTGGAACAGTTCGGAGGGCTGAGAAGAAGACAGGAAGATGAGGGAAAGTT 8841

 34734137 TGGAACTTCCTAGAGATTTGTTGAATGGTTTTGACCAAAATGCTAATAGTGATATGGATA 34734196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8842 TGGAACTTCCTAGAGATTTGTTGAATGGTTTTGACCAAAATGCTAATAGTGATATGGATA 8901

 34734197 TTGAAGTCCAGGCTGATGAGGTCTCAGATGGAAATGAGAAACTTCCTGGGAAATAAAGTA 34734256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     8902 TTGAAGTCCAGGCTGATGAGGTCTCAGATGGAAACGAGAAACTTCCTGGGAAATAAAGTA 8961

 34734257 AAGGTCGTTCATGCTATGCTTTAGCAAAGAGATGGGCAGCATTGTGCCACTGCTCTAGGG 34734316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8962 AAGGTCGTTCATGCTATGCTTTAGCAAAGAGATGGGCAGCATTGTGCCACTGCTCTAGGG 9021

 34734317 ATCTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGACGATTTAGGGTATCTAGCAGAAAAAATTTCTA 34734376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9022 ATCTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGACGATTTAGGGTATCTAGCAGAAAAAATTTCTA 9081

 34734377 AGCAGCAAAGAGTTCAATAATGTGACCTGGCTGCTTCTAACAACATATGCTTATATGCAT 34734436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9082 AGCAGCAAAGAGTTCAATAATGTGACCTGGCTGCTTCTAACAACATATGCTTATATGCAT 9141

 34734437 TCACAAAGAGATGCTCTTAAATTGGAACTTATATTTAAAAGTGAAGCAGAGCATAAAAGT 34734496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9142 TCACAAAGAGATGCTCTTAAATTGGAACTTATATTTAAAAGTGAAGCAGAGCATAAAAGT 9201

 34734497 TTGGAAAACGTGCAGCCTGACTATGCGGTAGAAAAGAAAATCCCATTTTCTGTGGAGAAA 34734556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     9202 TTGGAAAACGTGCAGCCTGACTATGCGGTAGAAAAGAAAAACCCATTTTCTGTGGAGAAA 9261

 34734557 TTCAAGCCAGCTACATAAATTTGCATAAGTAAAGAGGAGGAGCCAAATATTAATAGCCAG 34734616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9262 TTCAAGCCAGCTACATAAATTTGCATAAGTAAAGAGGAGGAGCCAAATATTAATAGCCAG 9321

 34734617 GACAATGGGGAAAATGCCTCTAGGGCATTTCAGAGACCTTCACAGCAGGCCCTCCCATCA 34734676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9322 GACAATGGGGAAAATGCCTCTAGGGCATTTCAGAGACCTTCACAGCAGGCCCTCCCATCA 9381

 34734677 CAGACCTGGAGGTGTAGGAGGGAAAAATAGTTTCATGGGCTGTTCCTGGGGCCCTGCTGC 34734736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9382 CAGACCTGGAGGTGTAGGAGGGAAAAATAGTTTCATGGGCTGTTCCTGGGGCCCTGCTGC 9441

 34734737 TCTGTGCAACCTCAGAACATGGCTCCTTTTGTCTCAGCTGCTCCAGCTCCAGTCATGGCT 34734796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9442 TCTGTGCAACCTCAGAACATGGCTCCTTTTGTCTCAGCTGCTCCAGCTCCAGTCATGGCT 9501

 34734797 AAAAGGAGCTAAGGTACAGCTCAGACCCTTGCTTCAGAGTGTGTAAACTCCAAGCTTTGG 34734856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9502 AAAAGGAGCTAAGGTACAGCTCAGACCCTTGCTTCAGAGTGTGTAAACTCCAAGCTTTGG 9561

 34734857 CAGCTTCCACATGGTGTTGGGCCTGTGGGTGCACAGAGGGCAACAGTGGAGACTTGAGAC 34734916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9562 CAGCTTCCACATGGTGTTGGGCCTGTGGGTGCACAGAGGGCAACAGTGGAGACTTGAGAC 9621

 34734917 CTCTGCCTTAATTTCAGAGGATGTATGGAAACACCTAGATGTCCAGGCAGAATTCTGCTG 34734976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9622 CTCTGCCTTAATTTCAGAGGATGTATGGAAACACCTAGATGTCCAGGCAGAATTCTGCTG 9681

 34734977 CAGGGGCAGAGCCCAAATGGAGAACCTCTATTAGAACAGTGAGGAGGGCAAATGTGAGGT 34735036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9682 CAGGGGCAGAGCCCAAATGGAGAACCTCTATTAGAACAGTGAGGAGGGCAAATGTGAGGT 9741

 34735037 TGGAGCCCCCATACATAATCCCCACTGGGGCACTGCCTAGTGGAGCTGTGAGAAGAAGAC 34735096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9742 TGGAGCCCCCATACATAATCCCCACTGGGGCACTGCCTAGTGGAGCTGTGAGAAGAAGAC 9801

 34735097 TACCATCCTCCAGAACCCAGAATGGTAGATCCACTTGCAAACAGCTTGCACCGTGAGCCT 34735156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9802 TACCATCCTCCAGAACCCAGAATGGTAGATCCACTTGCAAACAGCTTGCACCGTGAGCCT 9861

 34735157 GGAAAAGTTGCAGGCACTCAATGCCAGCCCTTGAGAGCAGCCATGGGAGCTGAGCCTTGC 34735216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9862 GGAAAAGTTGCAGGCACTCAATGCCAGCCCTTGAGAGCAGCCATGGGAGCTGAGCCTTGC 9921

 34735217 AGAACCACAGGGGCAGAGCTGTCCAAGGCCTTGGGAGTCCACCCCTTGCATCAGTGTGGC 34735276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9922 AGAACCACAGGGGCAGAGCTGTCCAAGGCCTTGGGAGTCCACCCCTTGCATCAGTGTGGC 9981

 34735277 CTGGATGTGAGACATGGAGTCAAAGGAAATTATTTTGGAGCTTTAAGATTTAACAACTGC 34735336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9982 CTGGATGTGAGACATGGAGTCAAAGGAAATTATTTTGGAGCTTTAAGATTTAACAACTGC 10041

 34735337 CCTGCTGGGCTTTGGACTTGCATCTGACCTTTAGCCCCTTGGTTTTGGCCAATTTCTTCC 34735396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10042 CCTGCTGGGCTTTGGACTTGCATCTGACCTTTAGCCCCTTGGTTTTGGCCAATTTCTTCC 10101

 34735397 TTTTGGAAAGGGAGTATTTACCCAATGCCTGTACTCACATTTTATCTTGAAAGTAACTAA 34735456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10102 TTTTGGAAAGGGAGTATTTACCCAATGCCTGTACTCACATTTTATCTTGAAAGTAACTAA 10161

 34735457 CTTGTTTTTTATTTTATAGGCTTATAGGCAGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAAATGAGACT 34735516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10162 CTTGTTTTTTATTTTATAGGCTTATAGGCAGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAAATGAGACT 10221

 34735517 TTGGACTTGGACTTTTGAGTTAATGGTATAATGAGTTAAGACTTTGGGGGACTGTTGGGA 34735576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10222 TTGGACTTGGACTTTTGAGTTAATGGTATAATGAGTTAAGACTTTGGGGGACTGTTGGGA 10281

 34735577 AGGCATGATTATGTTTTGAAATGTGAAAAGGACATGAGATTTGGGAAGAGCCAGGACAGG 34735636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10282 AGGCATGATTATGTTTTGAAATGTGAAAAGGACATGAGATTTGGGAAGAGCCAGGACAGG 10341

 34735637 ATGATATAATTTGGCTCTGTGTCCCCACGCAAGTCTCAT 34735675
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10342 ATGATATAATTTGGCTCTGTGTCCCCACGCAAGTCTCAT 10380

Alignment time is 7.35465 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3323] =>      3323 nucs 'mol-32-310c-113439_3323'

Score:        3289
Aligned:      3322        nucs
Identic:      3319 (100%) nucs =>      1107 (100%)      2212 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34724802,34725908] EXCISED REGION [34725910,34728123]
 second seq =>  [       1,    1107] EXCISED REGION [    1109,    3323]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34725909,34725909]
 second seq =>         1 nucs [1108,1108]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1784,1784]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34725909,34725909] to [34725910,34725910]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34724802 GTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTT 34724861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTT 60

 34724862 GTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATG 34724921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATG 120

 34724922 ATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAA 34724981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAA 180

 34724982 ATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAA 34725041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAA 240

 34725042 TATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCA 34725101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCA 300

 34725102 GAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAG 34725161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAG 360

 34725162 GTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAA 34725221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAA 420

 34725222 AACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATG 34725281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATG 480

 34725282 AAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCA 34725341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCA 540

 34725342 ATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTAT 34725401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTAT 600

 34725402 GTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGT 34725461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGT 660

 34725462 AGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCT 34725521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCT 720

 34725522 GATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATT 34725581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATT 780

 34725582 TTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCAT 34725641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCAT 840

 34725642 TTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTC 34725701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTC 900

 34725702 TTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCAT 34725761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCAT 960

 34725762 TGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTC 34725821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTC 1020

 34725822 CTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGT 34725881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGT 1080

 34725882 TTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTT 34725908
          |||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTT 1107

EXCISED REGION

 34725910 ATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTA 34725969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 ATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTA 1168

 34725970 TAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAG 34726029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 TAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAG 1228

 34726030 ATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACAT 34726089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 ATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACAT 1288

 34726090 GGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTG 34726149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 GGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTG 1348

 34726150 GATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGT 34726209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 GATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGT 1408

 34726210 GATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTG 34726269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 GATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTG 1468

 34726270 AAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGC 34726329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 AAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGC 1528

 34726330 TTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCT 34726389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCT 1588

 34726390 TGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTT 34726449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 TGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTT 1648

 34726450 CCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTC 34726509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 CCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTC 1708

 34726510 CATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGA 34726569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 CATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGA 1768

 34726570 AATATTTTTCTTGTA-GCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTC 34726628
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1769 AATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTC 1828

 34726629 ATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGA 34726688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 ATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGA 1888

 34726689 CTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTC 34726748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 CTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTC 1948

 34726749 TTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTT 34726808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 TTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTT 2008

 34726809 GCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGC 34726868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 GCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGC 2068

 34726869 AAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAA 34726928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 AAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAA 2128

 34726929 CAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTG 34726988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 CAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTG 2188

 34726989 TTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGA 34727048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 TTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGA 2248

 34727049 TGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTC 34727108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 TGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTC 2308

 34727109 ATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATT 34727168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 ATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATT 2368

 34727169 ATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTC 34727228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 ATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTC 2428

 34727229 TCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATT 34727288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 TCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATT 2488

 34727289 TTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCA 34727348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 TTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCA 2548

 34727349 TGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGA 34727408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 TGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGA 2608

 34727409 GCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACC 34727468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 GCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACC 2668

 34727469 TTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGT 34727528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGT 2728

 34727529 GTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCT 34727588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 GTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCT 2788

 34727589 GACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGG 34727648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 GACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGG 2848

 34727649 CTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCA 34727708
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2849 CTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCC 2908

 34727709 TTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCAC 34727768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 TTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCAC 2968

 34727769 TCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTC 34727828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 TCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTC 3028

 34727829 AATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAAT 34727888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 AATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAAT 3088

 34727889 CTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTC 34727948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 CTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTC 3148

 34727949 TTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCT 34728008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 TTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCT 3208

 34728009 TTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTG 34728068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 TTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTG 3268

 34728069 TATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGC 34728123
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 TATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGC 3323

Alignment time is 2.38901 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3723] =>      3723 nucs 'mol-32-3159-174849_3723'

Score:        3700
Aligned:      3722        nucs
Identic:      3720 (100%) nucs =>      1581 (100%)      2139 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726866,34728446] EXCISED REGION [34728448,34730588]
 second seq =>  [       1,    1581] EXCISED REGION [    1583,    3723]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [1582,1582]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [1580,1581] to [1583,1584]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726866 TGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAAC 34726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAAC 60

 34726926 AAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTT 34726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTT 120

 34726986 TTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTC 34727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTC 180

 34727046 TGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATT 34727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATT 240

 34727106 GTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAG 34727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAG 300

 34727166 ATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTAT 34727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTAT 360

 34727226 TTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGAT 34727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGAT 420

 34727286 ATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATG 34727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATG 480

 34727346 CCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATT 34727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATT 540

 34727406 AGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTG 34727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTG 600

 34727466 ACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTT 34727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTT 660

 34727526 GGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTT 34727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTT 720

 34727586 TCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTA 34727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTA 780

 34727646 AGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACT 34727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACT 840

 34727706 TCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCT 34727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCT 900

 34727766 CACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAAT 34727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAAT 960

 34727826 GTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTC 34727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTC 1020

 34727886 AATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAAT 34727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAAT 1080

 34727946 TTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTC 34728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTC 1140

 34728006 TCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTC 34728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTC 1200

 34728066 CTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCAT 34728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCAT 1260

 34728126 TCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCA 34728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCA 1320

 34728186 GCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTAC 34728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTAC 1380

 34728246 AGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGA 34728305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGA 1440

 34728306 GACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCT 34728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCT 1500

 34728366 AAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGT 34728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGT 1560

 34728426 GCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 34728446
          |||||||||||||||||||||
     1561 GCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 1581

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1642

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1702

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1762

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1822

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 1882

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 1942

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 2002

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 2062

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 2122

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 2182

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 2242

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 2302

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 2362

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 2422

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 2482

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 2542

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 2602

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 2662

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 2722

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 2782

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 2842

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 2902

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 2962

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 34729887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 3022

 34729888 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 34729947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 3082

 34729948 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 34730007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 3142

 34730008 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 34730067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 3202

 34730068 TTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 34730127
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 TTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 3262

 34730128 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 34730187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 3322

 34730188 TGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 34730247
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 TGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 3382

 34730248 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 34730307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 3442

 34730308 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 34730367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 3502

 34730368 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 34730427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 3562

 34730428 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 34730487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 3622

 34730488 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 34730547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 3682

 34730548 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTA 34730588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTA 3723

Alignment time is 2.68892 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2548] =>      2548 nucs 'mol-32-3185-088462_2548'

Score:        2504
Aligned:      2548        nucs
Identic:      2544 (100%) nucs =>      1130 (100%)      1414 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726991,34728121] EXCISED REGION [34728617,34730033]
 second seq =>  [       1,    1131] EXCISED REGION [    1132,    2548]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726991 GTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATG 34727050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATG 60

 34727051 GGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCAT 34727110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCAT 120

 34727111 AATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTAT 34727170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTAT 180

 34727171 TTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTC 34727230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTC 240

 34727231 TCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTT 34727290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTT 300

 34727291 TGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATG 34727350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATG 360

 34727351 CCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGC 34727410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGC 420

 34727411 TCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTT 34727470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTT 480

 34727471 TGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGT 34727530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGT 540

 34727531 TCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGA 34727590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGA 600

 34727591 CAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCT 34727650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCT 660

 34727651 AATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATT 34727710
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      661 AATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTT 720

 34727711 CCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTC 34727770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTC 780

 34727771 ATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAA 34727830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAA 840

 34727831 TTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCT 34727890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCT 900

 34727891 CTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTT 34727950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTT 960

 34727951 TGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTT 34728010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTT 1020

 34728011 CTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTA 34728070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTA 1080

 34728071 TAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 1131

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1191

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1251

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1311

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1371

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1431

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 CAGTGGGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1491

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1551

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1611

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1671

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1731

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1732 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1791

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1851

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 1911

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 1971

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2031

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2091

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 2151

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2211

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2271

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2331

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 2391

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 2451

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 2511

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTA 34730033
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTA 2548

Alignment time is 1.82576 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2711] =>      2711 nucs 'mol-32-3190-156328_2711'

Score:        2710
Aligned:      2710        nucs
Identic:      2710 (100%) nucs =>      1299 (100%)      1411 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727148,34728446] EXCISED REGION [34728448,34729858]
 second seq =>  [       1,    1299] EXCISED REGION [    1301,    2711]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [1300,1300]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [1298,1299] to [1301,1302]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34727148 TGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTG 34727207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTG 60

 34727208 AAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCT 34727267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCT 120

 34727268 CTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGC 34727327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGC 180

 34727328 TTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAG 34727387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAG 240

 34727388 TCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAG 34727447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAG 300

 34727448 AACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTC 34727507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTC 360

 34727508 TTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTC 34727567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTC 420

 34727568 TCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATAT 34727627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATAT 480

 34727628 TTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCT 34727687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCT 540

 34727688 AGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAA 34727747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAA 600

 34727748 ATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTG 34727807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTG 660

 34727808 TGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCT 34727867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCT 720

 34727868 TTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTT 34727927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTT 780

 34727928 ATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTC 34727987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTC 840

 34727988 TGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATT 34728047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATT 900

 34728048 TGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTG 34728107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTG 960

 34728108 CATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTT 34728167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTT 1020

 34728168 TCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTG 34728227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTG 1080

 34728228 GTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTC 34728287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTC 1140

 34728288 TCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAG 34728347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAG 1200

 34728348 TCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGAC 34728407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGAC 1260

 34728408 CACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 34728446
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAAGCCA 1299

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1360

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1420

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1480

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1540

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 1600

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 1660

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 1720

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 1780

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 1840

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 1900

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 1960

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 2020

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 2080

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 2140

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 2200

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 2260

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 2320

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 2380

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 2440

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 2500

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 2560

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 2620

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 2680

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAA 34729858
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAA 2711

Alignment time is 1.96119 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2313] =>      2313 nucs 'mol-32-322a-163278_2313'

Score:        2263
Aligned:      2274        nucs
Identic:      2273 (100%) nucs =>      1325 (100%)       948 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727122,34728446] EXCISED REGION [34728448,34729396]
 second seq =>  [       1,    1325] EXCISED REGION [    1327,    2275]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [1326,1326]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [1324,1325] to [1327,1328]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34727122 TTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTT 34727181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTT 60

 34727182 CATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTT 34727241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTT 120

 34727242 GTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATA 34727301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATA 180

 34727302 CTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCC 34727361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCC 240

 34727362 TGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATA 34727421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATA 300

 34727422 ATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGA 34727481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGA 360

 34727482 TTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTT 34727541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTT 420

 34727542 CTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTT 34727601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTT 480

 34727602 TGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTA 34727661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTA 540

 34727662 GATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTT 34727721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTT 600

 34727722 TGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTT 34727781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTT 660

 34727782 TGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTC 34727841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTC 720

 34727842 AACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAAT 34727901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAAT 780

 34727902 TTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTC 34727961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTC 840

 34727962 AAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTG 34728021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTG 900

 34728022 CTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATG 34728081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATG 960

 34728082 CTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTAC 34728141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTAC 1020

 34728142 AGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACT 34728201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACT 1080

 34728202 TGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTG 34728261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTG 1140

 34728262 GTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTC 34728321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTC 1200

 34728322 CCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTG 34728381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTG 1260

 34728382 GGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAA 34728441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAA 1320

 34728442 AGCCA 34728446
          |||||
     1321 AGCCA 1325

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1386

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1446

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1506

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1566

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 1626

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 1686

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTAGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 1746

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 1806

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 1866

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 1926

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 1986

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 2046

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 2106

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 2166

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 2226

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 2275

Alignment time is 1.66019 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3620] =>      3620 nucs 'mol-32-3240-108471_3620'

Score:        3567
Aligned:      3611        nucs
Identic:      3607 (100%) nucs =>      1470 (100%)      2137 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34728613,34730082] EXCISED REGION [34730084,34732224]
 second seq =>  [       1,    1470] EXCISED REGION [    1472,    3611]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34730083,34730083]
 second seq =>         1 nucs [1471,1471]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [34730800,34730800]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34728613 CTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAG 34728672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAGGCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAG 60

 34728673 CTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGA 34728732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTTATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGA 120

 34728733 AGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCAT 34728792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGATCTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCAT 180

 34728793 GTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCA 34728852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCA 240

 34728853 GGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTT 34728912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGCCCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTT 300

 34728913 AAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCT 34728972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGGCAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCT 360

 34728973 GGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCA 34729032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAATAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCA 420

 34729033 AAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGA 34729092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGACACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGA 480

 34729093 GTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTG 34729152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTACTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTG 540

 34729153 GTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCT 34729212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGGCACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCT 600

 34729213 TAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTT 34729272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTCTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTT 660

 34729273 GTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGC 34729332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGTCCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGC 720

 34729333 AAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGC 34729392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGTTTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGC 780

 34729393 TGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCT 34729452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTCCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCT 840

 34729453 GCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGC 34729512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTGTGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGC 900

 34729513 CTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAG 34729572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCAAGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAG 960

 34729573 TGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATG 34729632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGCATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATG 1020

 34729633 AAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTT 34729692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTTAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTT 1080

 34729693 TTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGG 34729752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTGTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGG 1140

 34729753 CTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCT 34729812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCTGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCT 1200

 34729813 TTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTT 34729872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGTTCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTT 1260

 34729873 TTAATCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTAT 34729932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAATCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTAT 1320

 34729933 TATTTTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAG 34729992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTTTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAG 1380

 34729993 GTAGAAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATA 34730052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAGAAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATA 1440

 34730053 TAAATTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTG 34730082
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAATTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTG 1470

EXCISED REGION

 34730084 AGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGC 34730143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 AGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGC 1531

 34730144 CTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTATTGTTTAATTTACATAT 34730203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 CTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTATTGTTTAATTTACATAT 1591

 34730204 GCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCA 34730263
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 GCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCA 1651

 34730264 TTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACA 34730323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACA 1711

 34730324 GATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAAT 34730383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 GATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAAT 1771

 34730384 ACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAG 34730443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 ACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAG 1831

 34730444 CCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGA 34730503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 CCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGA 1891

 34730504 GAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTT 34730563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 GAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTT 1951

 34730564 TCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTA 34730623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTA 2011

 34730624 AGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCT 34730683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCT 2071

 34730684 GGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATATAGTCATTCTGGACAT 34730743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 GGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATATAGTCATTCTGGACAT 2131

 34730744 CTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTT 34730803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     2132 CTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTTAATTTACCTGCC-TTT 2190

 34730804 TTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTG 34730863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTG 2250

 34730864 GCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTA 34730923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2251 GCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTA 2310

 34730924 GCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATG 34730983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 GCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATG 2370

 34730984 TGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCC 34731043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 TGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCC 2430

 34731044 TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTT 34731103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTT 2490

 34731104 TTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCA 34731163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCA 2550

 34731164 GGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGA 34731223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 GGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGA 2610

 34731224 GTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCC 34731283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 GTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCC 2670

 34731284 CAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTT 34731343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 CAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTT 2730

 34731344 ACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGG 34731403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 ACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGG 2790

 34731404 AGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGA 34731463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 AGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGA 2850

 34731464 TACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTT 34731523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 TACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTT 2910

 34731524 TCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTC 34731583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTC 2970

 34731584 TATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAAT 34731643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAAT 3030

 34731644 AATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATG 34731703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3031 AATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATG 3090

 34731704 AGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAA 34731763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 AGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAA 3150

 34731764 TTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAAAAAATATATACATGTA 34731823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAAAAAATATATACATGTA 3210

 34731824 TATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAA 34731883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 TATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAA 3270

 34731884 ATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTA 34731943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 ATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTA 3330

 34731944 TTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCT 34732003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 TTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCT 3390

 34732004 CATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTAC 34732063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 CATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTAC 3450

 34732064 TATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATA 34732123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATA 3510

 34732124 ATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTG 34732183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 ATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTG 3570

 34732184 TTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAA 34732224
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 TTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAA 3611

Alignment time is 2.59054 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5005] =>      5005 nucs 'mol-32-32f0-030762_5005'

Score:        4928
Aligned:      5005        nucs
Identic:      4998 (100%) nucs =>      1455 (100%)      3543 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726666,34728121] EXCISED REGION [34728617,34732165]
 second seq =>  [       1,    1456] EXCISED REGION [    1457,    5005]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726666 ATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGC 34726725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGC 60

 34726726 TTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCA 34726785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCA 120

 34726786 TTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTA 34726845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTA 180

 34726846 CTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAA 34726905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAA 240

 34726906 CACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTT 34726965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTT 300

 34726966 GTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAA 34727025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAA 360

 34727026 GTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGT 34727085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGT 420

 34727086 TTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACT 34727145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACT 480

 34727146 AGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGAT 34727205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGAT 540

 34727206 TGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTT 34727265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTT 600

 34727266 CTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTT 34727325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTT 660

 34727326 GCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGA 34727385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGA 720

 34727386 AGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTA 34727445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTA 780

 34727446 AGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCT 34727505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCT 840

 34727506 TCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTT 34727565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTT 900

 34727566 TCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATAT 34727625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATAT 960

 34727626 ATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTT 34727685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTT 1020

 34727686 CTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTC 34727745
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTC 1080

 34727746 AAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGAC 34727805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGAC 1140

 34727806 TGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTT 34727865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTT 1200

 34727866 CTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTC 34727925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTC 1260

 34727926 TTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTT 34727985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTT 1320

 34727986 TCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCA 34728045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCA 1380

 34728046 TTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTG 34728105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTG 1440

 34728106 TGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||
     1441 TGCATTGAAGAGTTAA 1456

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1516

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1576

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1636

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1696

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1756

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1816

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1876

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1936

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1996

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 2056

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2057 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 2116

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 2176

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 2236

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 2296

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2356

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2416

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 2476

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2536

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2596

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2656

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 2716

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 2776

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 2836

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 2896

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 2956

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 3016

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3017 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 3076

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 3136

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 3196

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 3256

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 3316

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 3376

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 3436

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 3496

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 3556

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 3616

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 3676

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 3736

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 3796

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 3856

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 3916

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 3976

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 4036

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 4096

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 4156

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 4216

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 4276

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 4336

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 4396

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 4456

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 4516

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 4576

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 4636

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 4696

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 4756

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 34731976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 4816

 34731977 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 34732036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 4876

 34732037 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 34732096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 4936

 34732097 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 34732156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 4996

 34732157 TATTGTCAT 34732165
          |||||||||
     4997 TATTGTCAT 5005

Alignment time is 3.62756 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2892] =>      2892 nucs 'mol-32-32fb-161556_2892'

Score:        2880
Aligned:      2891        nucs
Identic:      2890 (100%) nucs =>        14 (100%)      2876 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726986,34726999] EXCISED REGION [34727001,34729877]
 second seq =>  [       1,      14] EXCISED REGION [      16,    2892]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34727000,34727000]
 second seq =>         1 nucs [15,15]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34726998,34726999] to [34726999,34727000]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726986 TTGTTGTTTCTCTT 34726999
          ||||||||||||||
        1 TTGTTGTTTCTCTT 14

EXCISED REGION

 34727001 GTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGT 34727060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       16 GTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGT 75

 34727061 GTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGT 34727120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       76 GTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGT 135

 34727121 GTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGT 34727180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 GTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGT 195

 34727181 TCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTT 34727240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 TCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTT 255

 34727241 TGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATAT 34727300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 TGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATAT 315

 34727301 ACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTC 34727360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 ACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTC 375

 34727361 CTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTAT 34727420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 CTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTAT 435

 34727421 AATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTG 34727480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 AATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTG 495

 34727481 ATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCT 34727540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 ATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCT 555

 34727541 TCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACT 34727600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 TCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACT 615

 34727601 TTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTT 34727660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 TTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTT 675

 34727661 AGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTT 34727720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 AGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTT 735

 34727721 TTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGT 34727780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 TTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGT 795

 34727781 TTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTT 34727840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 TTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTT 855

 34727841 CAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAA 34727900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 CAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAA 915

 34727901 TTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCT 34727960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 TTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCT 975

 34727961 CAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATT 34728020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 CAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATT 1035

 34728021 GCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGAT 34728080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 GCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGAT 1095

 34728081 GCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTA 34728140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 GCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTA 1155

 34728141 CAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGAC 34728200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGAC 1215

 34728201 TTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGT 34728260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 TTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGT 1275

 34728261 GGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTT 34728320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 GGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTT 1335

 34728321 CCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCT 34728380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCT 1395

 34728381 GGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTA 34728440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 GGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTA 1455

 34728441 AAGCCAGCATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCC 34728500
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 AAGCCATCATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCC 1515

 34728501 TATGTTCACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGC 34728560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TATGTTCACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGC 1575

 34728561 TTATGTCCTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCT 34728620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 TTATGTCCTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCT 1635

 34728621 GGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATC 34728680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 GGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATC 1695

 34728681 TAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTT 34728740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 TAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTT 1755

 34728741 CACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGA 34728800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 CACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGA 1815

 34728801 GTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAA 34728860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 GTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAA 1875

 34728861 AGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGT 34728920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 AGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGT 1935

 34728921 GAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGG 34728980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 GAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGG 1995

 34728981 GGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACA 34729040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 GGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACA 2055

 34729041 AGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTAT 34729100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 AGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTAT 2115

 34729101 CATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACA 34729160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 CATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACA 2175

 34729161 AGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTAC 34729220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 AGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTAC 2235

 34729221 TGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTA 34729280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 TGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTA 2295

 34729281 GACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTG 34729340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 GACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTG 2355

 34729341 CTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCAC 34729400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 CTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCAC 2415

 34729401 ATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGAC 34729460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 ATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGAC 2475

 34729461 AGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTG 34729520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTG 2535

 34729521 CACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAG 34729580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 CACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAG 2595

 34729581 GCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAA 34729640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAA 2655

 34729641 ATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGT 34729700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 ATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGT 2715

 34729701 AGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTT 34729760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 AGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTT 2775

 34729761 TGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTT 34729820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 TGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTT 2835

 34729821 GATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAAT 34729877
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 GATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAAT 2892

Alignment time is 2.08762 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4590] =>      4590 nucs 'mol-32-3327-044599_4590'

Score:        4524
Aligned:      4590        nucs
Identic:      4584 (100%) nucs =>       784 (100%)      3800 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727663,34728446] EXCISED REGION [34728448,34732253]
 second seq =>  [       1,     784] EXCISED REGION [     786,    4590]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [785,785]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [34730800,34730800]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [783,784] to [786,787]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34727663 ATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTT 34727722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTT 60

 34727723 GTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTT 34727782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTT 120

 34727783 GATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCA 34727842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCA 180

 34727843 ACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATT 34727902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATT 240

 34727903 TATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCA 34727962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCA 300

 34727963 AAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGC 34728022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGC 360

 34728023 TCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGC 34728082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGC 420

 34728083 TTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACA 34728142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATTGTAGTCTTTACA 480

 34728143 GTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTT 34728202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTATTCAGAGAGACTT 540

 34728203 GGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGG 34728262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTACCGCCTTGGTGG 600

 34728263 TTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCC 34728322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTCTTGTTCTCTTCC 660

 34728323 CTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGG 34728382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCCAACTGGGGCTGG 720

 34728383 GGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAA 34728442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGAGTCAGACCTAAA 780

 34728443 GCCA 34728446
          ||||
      781 GCCA 784

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 845

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 905

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 965

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1025

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 1085

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 1145

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 1205

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 1265

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 1325

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 1385

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 1445

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 1505

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 1565

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 1625

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 1685

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 1745

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 1805

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 1865

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 1925

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 1985

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 2045

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 2105

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 2165

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 34729887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 2225

 34729888 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 34729947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 2285

 34729948 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 34730007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 2345

 34730008 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 34730067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 2405

 34730068 TTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 34730127
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTTTATGCAGTTAA 2465

 34730128 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 34730187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 AATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCTTAGAAATGTAT 2525

 34730188 TGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 34730247
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 TGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGATGTCTTTGTTA 2585

 34730248 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 34730307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGATTTCAATGCTTG 2645

 34730308 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 34730367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTGAATGTTTTATG 2705

 34730368 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 34730427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 AACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAATGTCAATTAGGA 2765

 34730428 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 34730487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 CAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATATATCTATTTTTG 2825

 34730488 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 34730547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTGATTTGTCAATT 2885

 34730548 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 34730607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 TCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAACTTTTATTAGAT 2945

 34730608 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 34730667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 GTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTATCACTATGAAAT 3005

 34730668 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 34730727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 GTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTTTGATTATAATA 3065

 34730728 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 34730787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 TAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTATCCTTTTATTTT 3125

 34730788 AATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 34730847
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 AATTTACCTGCC-TTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTA 3184

 34730848 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 34730907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 TAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGA 3244

 34730908 CTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 34730967
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGT 3304

 34730968 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 34731027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 ATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 3364

 34731028 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 34731087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 AGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTGAGCCACCGTGA 3424

 34731088 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 34731147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 CTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATATAATTTTGGGTG 3484

 34731148 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 34731207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 AAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAAGGGCAACCCAG 3544

 34731208 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 34731267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 AATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACATGCCCCTGGGG 3604

 34731268 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 34731327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 TTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATAATATGTGTGTG 3664

 34731328 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 34731387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 GAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACTCAAAGTTCTTT 3724

 34731388 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 34731447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 GACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAGACTTGAGGTTG 3784

 34731448 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 34731507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 AACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACCATGTGGATATG 3844

 34731508 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 34731567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 GCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGCTTCCTGACCTT 3904

 34731568 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 34731627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 CATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCTGTGGGGCCAAA 3964

 34731628 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 34731687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 GCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCAAAGAACCTGAG 4024

 34731688 CTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 34731747
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 CTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTCTACCTAGGACT 4084

 34731748 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 34731807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 CCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAGTGCCATAGGAA 4144

 34731808 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 34731867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 AAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTATTCATTCTGAA 4204

 34731868 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 34731927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 AATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAATTATTAATTTG 4264

 34731928 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 34731987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 ATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATGTATTCATTGTT 4324

 34731988 GCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTC 34732047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 GCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTATTTAAATTTGTC 4384

 34732048 TTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAA 34732107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 TTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTTTCAGTGCTTAA 4444

 34732108 TGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAG 34732167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 TGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGTTATTGTCATAG 4504

 34732168 AATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAACAG 34732227
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4505 AATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTTGGCATTAAATAG 4564

 34732228 ACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAA 34732253
          ||||||||||||||||||||||||||
     4565 ACAGCTGTTTTTTAACAAAATAAAAA 4590

Alignment time is 3.2631 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2218] =>      2218 nucs 'mol-32-338a-138483_2218'

Score:        2185
Aligned:      2218        nucs
Identic:      2215 (100%) nucs =>       823 (100%)      1392 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727298,34728121] EXCISED REGION [34728617,34730010]
 second seq =>  [       1,     824] EXCISED REGION [     825,    2218]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34727298 TATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCT 34727357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCT 60

 34727358 CTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTG 34727417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTG 120

 34727418 TATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGT 34727477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGT 180

 34727478 TTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAA 34727537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAA 240

 34727538 CCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATT 34727597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATT 300

 34727598 ACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACT 34727657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACT 360

 34727658 CTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTT 34727717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      361 CTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTT 420

 34727718 CTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTC 34727777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTC 480

 34727778 TGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATT 34727837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATT 540

 34727838 TTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTT 34727897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTT 600

 34727898 AAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTT 34727957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTT 660

 34727958 CCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGA 34728017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGA 720

 34728018 ATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTT 34728077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTT 780

 34728078 GATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 824

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 884

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 944

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1004

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1064

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1124

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1184

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1244

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1304

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1364

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1424

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1425 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1484

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1544

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 1604

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 1664

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 1724

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 1784

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 1844

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 1904

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 1964

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2024

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 2084

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 2144

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 2204

 34729997 AAGCTTAGATAAAC 34730010
          ||||||||||||||
     2205 AAGCTTAGATAAAC 2218

Alignment time is 1.59204 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    5125] =>      5125 nucs 'mol-32-3403-028601_5125'

Score:        5015
Aligned:      5125        nucs
Identic:      5115 (100%) nucs =>      1782 (100%)      3333 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726338,34728121] EXCISED REGION [34728617,34731956]
 second seq =>  [       1,    1785] EXCISED REGION [    1786,    5125]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726338 TCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAAT 34726397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAAT 60

 34726398 TGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAA 34726457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAA 120

 34726458 TACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCA 34726517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCA 180

 34726518 TGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTT 34726577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTT 240

 34726578 TCTTGTAG-CAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTT 34726636
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      241 TCTTGTAGGCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTT 300

 34726637 TTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCT 34726696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCT 360

 34726697 TGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCC 34726756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCC 420

 34726757 TGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTA 34726816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTA 480

 34726817 TTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTA 34726876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTA 540

 34726877 TGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGA 34726936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGA 600

 34726937 AACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCT 34726996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCT 660

 34726997 CTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTG 34727056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTG 720

 34727057 TTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATT 34727116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATT 780

 34727117 CTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTA 34727176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTA 840

 34727177 TTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAG 34727236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAG 900

 34727237 CTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGG 34727296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGG 960

 34727297 ATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTC 34727356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTC 1020

 34727357 TCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATT 34727416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATT 1080

 34727417 GTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAG 34727476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAG 1140

 34727477 TTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATA 34727536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATA 1200

 34727537 ACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTAT 34727596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTAT 1260

 34727597 TACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAAC 34727656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAAC 1320

 34727657 TCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTT 34727716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1321 TCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTT 1380

 34727717 TCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTT 34727776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTT 1440

 34727777 CTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCAT 34727836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCAT 1500

 34727837 TTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGT 34727896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGT 1560

 34727897 TAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTT 34727956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTT 1620

 34727957 TCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAG 34728016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAG 1680

 34728017 AATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCT 34728076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCT 1740

 34728077 TGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 1785

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1845

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1905

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1965

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 2025

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 2085

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 2145

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 2205

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 2265

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 2325

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 2385

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2386 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 2445

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 2505

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 2565

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 2625

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2685

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2745

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 2805

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2865

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2925

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2985

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 3045

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 3105

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 3165

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 3225

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 3285

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 3345

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3346 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 3405

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 3465

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 3525

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 3585

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 3645

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 3705

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 3765

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 3825

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 3885

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 3945

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 4005

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 4065

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 4125

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 4185

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 4245

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 4305

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 4365

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 4425

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 4485

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 4545

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 4605

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 4665

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 4725

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 4785

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4786 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGGCAAGACAGTGATCCACCA 4845

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 4905

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 4965

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 5025

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 5085

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATT 34731956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATT 5125

Alignment time is 3.73438 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3386] =>      3386 nucs 'mol-32-3403-188573_3386'

Score:        3385
Aligned:      3385        nucs
Identic:      3385 (100%) nucs =>      1756 (100%)      1629 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726691,34728446] EXCISED REGION [34728448,34730076]
 second seq =>  [       1,    1756] EXCISED REGION [    1758,    3386]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [34728447,34728447]
 second seq =>         1 nucs [1757,1757]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728445,34728446] to [34728448,34728449]
 second seq =>         2 nucs [1755,1756] to [1758,1759]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 34726691 TATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTT 34726750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTT 60

 34726751 CCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGC 34726810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGC 120

 34726811 TTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAA 34726870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAA 180

 34726871 ATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACA 34726930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACA 240

 34726931 AAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTT 34726990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTT 300

 34726991 GTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATG 34727050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATG 360

 34727051 GGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCAT 34727110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCAT 420

 34727111 AATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTAT 34727170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTAT 480

 34727171 TTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTC 34727230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTC 540

 34727231 TCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTT 34727290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTT 600

 34727291 TGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATG 34727350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATG 660

 34727351 CCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGC 34727410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGC 720

 34727411 TCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTT 34727470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTT 780

 34727471 TGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGT 34727530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGT 840

 34727531 TCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGA 34727590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGA 900

 34727591 CAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCT 34727650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCT 960

 34727651 AATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATT 34727710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATT 1020

 34727711 CCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTC 34727770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTC 1080

 34727771 ATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAA 34727830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAA 1140

 34727831 TTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCT 34727890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCT 1200

 34727891 CTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTT 34727950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTT 1260

 34727951 TGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTT 34728010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTT 1320

 34728011 CTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTA 34728070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTA 1380

 34728071 TAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATT 34728130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAAGCATTCATT 1440

 34728131 GTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTAT 34728190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAGTCTTTACAGTCTGGGCTTATTTGTGCCCATCTTTCTTGGGAAGGCTTTCCAGCTAT 1500

 34728191 TCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTA 34728250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCAGAGAGACTTGGTCCCCAAGCCCCAAATTGCTGTGGTTCTTGTAGACTTGTACAGGTA 1560

 34728251 CCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTC 34728310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCGCCTTGGTGGTTTTGGATAAGAGCTGGAAGAATTCTCTGGATTATCAGGCAGAGACTC 1620

 34728311 TTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCC 34728370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGTTCTCTTCCCTTACTTTCCCTCAAAGAAATGGAGTCTCTCTCTCTCTGTGCTAAGCC 1680

 34728371 AACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGA 34728430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTGGGGCTGGGGTGAACCTTTGTGACCTTTGTGACCACCACCACTGGGGCTGTGCTGA 1740

 34728431 GTCAGACCTAAAGCCA 34728446
          ||||||||||||||||
     1741 GTCAGACCTAAAGCCA 1756

EXCISED REGION

 34728448 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 34728507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 CATAGCACTGAGTCGTGCCCAATGCCTGCTGTAATCACTACCTGGCTATGGCCTATGTTC 1817

 34728508 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 34728567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 ACTGAAGGCCTTCTTTGGGCCCTACAGTCAGCAAGTGAGGAAGCCAGCCAGGCTTATGTC 1877

 34728568 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 34728627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 CTTCCCTTCTGGCCCAGAGCAGGTCCAGAAATTCTGTCTAAGAGTCTAGGCCTGGACTCA 1937

 34728628 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 34728687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 GGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGTTATCTAAAGTT 1997

 34728688 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 34728747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 CAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGATCTTTCACCCTA 2057

 34728748 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 34728807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 GCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCTCAGAGTCTCAA 2117

 34728808 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 34728867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 CCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGCCCAAAGCCTGT 2177

 34728868 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 34728927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 TTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGGCAGTGAGTTTC 2237

 34728928 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 34728987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 CTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAATAGGGGCCTGA 2297

 34728988 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 34729047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 CAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGACACAAGACAAA 2357

 34729048 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 34729107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 TACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTACTATCATTGCT 2417

 34729108 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 34729167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 ACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGGCACAAGCAACA 2477

 34729168 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 34729227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 CCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGTCTACTGGCTGT 2537

 34729228 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 34729287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 AAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGTCCTAGACTGCA 2597

 34729288 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 34729347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 TTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGTTTTGCTGAAAC 2657

 34729348 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 34729407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 TCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGTCCACATGCTCC 2717

 34729408 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 34729467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 TTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTGTGACAGGGCAG 2777

 34729468 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 34729527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 CACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCAAGTGCACAGAT 2837

 34729528 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 34729587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 TGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGCATAGGCAATTC 2897

 34729588 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 34729647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 AAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGTTAAAATCAGGT 2957

 34729648 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 34729707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 ACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGTGTGTAGTTAGT 3017

 34729708 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 34729767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTCTGTTTGGCCAT 3077

 34729768 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 34729827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 CTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGTTCTTGATCAGT 3137

 34729828 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 34729887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 CTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAATCAATTTTCCC 3197

 34729888 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 34729947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 TATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATTTTCTTCTTTCT 3257

 34729948 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 34730007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 TGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAGAAGCTTAGATA 3317

 34730008 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 34730067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 AACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAATTTTCTTATTA 3377

 34730068 TTACTACTT 34730076
          |||||||||
     3378 TTACTACTT 3386

Alignment time is 2.79793 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2369] =>      2369 nucs 'mol-32-3487-060218_2369'

Score:        2325
Aligned:      2369        nucs
Identic:      2365 (100%) nucs =>      1259 (100%)      1106 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726860,34728121] EXCISED REGION [34728617,34729723]
 second seq =>  [       1,    1262] EXCISED REGION [    1263,    2369]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726860 GAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAA 34726919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
        1 GAGGCTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGACTGCATAA 60

 34726920 ACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTT 34726979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTT 120

 34726980 AACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTAT 34727039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTAT 180

 34727040 TATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAAT 34727099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAAT 240

 34727100 TACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTAC 34727159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACATTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTAC 300

 34727160 TTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTT 34727219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCAGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTT 360

 34727220 TAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTG 34727279
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      361 TAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCCCTTTCATGCTTG 420

 34727280 AAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTA 34727339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTA 480

 34727340 AATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGA 34727399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATATGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGA 540

 34727400 TGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTA 34727459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTATTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTA 600

 34727460 TCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAAT 34727519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAAT 660

 34727520 CTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGG 34727579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGG 720

 34727580 AAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCC 34727639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGTTTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCC 780

 34727640 TCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGG 34727699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGG 840

 34727700 TATACTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTT 34727759
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTT 900

 34727760 CAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTT 34727819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTT 960

 34727820 CAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTC 34727879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGAATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTC 1020

 34727880 AATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATC 34727939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTTCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATC 1080

 34727940 TTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACA 34727999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACA 1140

 34728000 TAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTT 34728059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTT 1200

 34728060 ATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTT 34728119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTT 1260

 34728120 AA 34728121
          ||
     1261 AA 1262

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1322

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1382

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1442

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1502

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1562

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1622

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1682

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1742

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1802

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1862

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1863 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1922

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1982

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 2042

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 2102

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2162

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2222

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 2282

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2342

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGT 34729723
          |||||||||||||||||||||||||||
     2343 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGT 2369

Alignment time is 2.04592 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8587] =>      8587 nucs 'mol-32-34a8-130175_8587'

Score:        8412
Aligned:      8588        nucs
Identic:      8572 (100%) nucs =>      7226 (100%)      1346 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34720885,34728121] EXCISED REGION [34728617,34729966]
 second seq =>  [       1,    7237] EXCISED REGION [    7238,    8587]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34720885 ATTTATATATAATTTTTAAAAATCTTAAAAGATTAAATAAATCTATTAGTATACATTGGT 34720944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTATATATAATTTTTAAAAATCTTAAAAGATTAAATAAATCTATTAGTATACATTGGT 60

 34720945 TATTATATTTACTTGTTATAATTTAATATCTATAGGACTTGCAGTAATGTCTCATTTTGT 34721004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTATATTTACTTGTTATAATTTAATATCTATAGGACTTGCAGTAATGTCTCATTTTGT 120

 34721005 ATTCTTTTTATATACATTTTTGTGGGTACATAGTAAGTGTATATATTTGCAGGTTACATA 34721064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTCTTTTTATATACATTTTTGTGGGTACATAGTAAGTGTATATATTTGCAGGTTACATA 180

 34721065 AGATACTTTGATACAGGCATGTAATGTGTAATAATCACACTGTGGTAAATGGGGTATTTA 34721124
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATACTTTGATACAGGCACGTAATGTGTAATAATCACACTGTGGTAAATGGGGTATTTA 240

 34721125 TCCTAATAAGCATTTATCCTTTGTGTTACAAACAAACCAGTTATAGTCTTTCAGTTATTT 34721184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCTAATAAGCATTTATCCTTTGTGTTACAAACAAACCAGTTATAGTCTTTCAGTTATTT 300

 34721185 TAAAATGTACAATTAAATTATTATTGACTATAGTCCCCCTGATGTGCTATCAAATACTAG 34721244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAAATGTACAATTAAATTATTATTGACTATAGTCCCCCTGATGTGCTATCAAATACTAG 360

 34721245 GTCTTATTCATTCTTTCTAACCACTTTTTTTTTTTGTATCCATTGACCACCCCTACTTCT 34721304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTTATTCATTCTTTCTAACCACTTTTTTTTTT-GTATCCATTGACCACCCCTACTTCT 419

 34721305 TTCCCCAGCCCCCACGACCCTTCCCAGACTTTAGTGACCATCGTTCTATTCTCTGCCTCC 34721364
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TTCCCCAGTCCCCACGACCCTTCCCAGACTTTAGTGACCATCGTTCTATTCTCTGCCTCC 479

 34721365 ATGAGTTCAATTGTTTTTTATTTTTAGACCCAACAAATAAATGAGAACATATAAAGTTTG 34721424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 ATGAGTTCAATTGTTTTTTATTTTTAGACCCAACAAATAAATGAGAACATATAAAGTTTG 539

 34721425 TCTTGCTGTGCTTGGCTTATTTCACTTAATGTAATGACTTCCAGTTCCACCCATGTTGCA 34721484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TCTTGCTGTGCTTGGCTTATTTCACTTAATGTAATGACTTCCAGTTCCACCCATGTTGCA 599

 34721485 ATGACAAGATCACATTCTTTTAATGGCTGAATAATACTCCATTGTGTATATGCAGCACAT 34721544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATGACAAGATCACATTCTTTTAATGGCTGAATAATACTCCATTGTGTATATGCAGCACAT 659

 34721545 TTCCTTTATCCATTCATCTGTCGATGGACACTTAGGTTGCTTCCAAATCTTGGCTACTAT 34721604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TTCCTTTATCCATTCATCTGTCGATGGACACTTAGGTTGCTTCCAAATCTTGGCTACTAT 719

 34721605 GAACAGTGTTGCAACAAACATGGTGGTGCAGATATCCCTTCCCTATACTGATTTCCTTTC 34721664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GAACAGTGTTGCAACAAACATGGTGGTGCAGATATCCCTTCCCTATACTGATTTCCTTTC 779

 34721665 TTCTAGATATATACTTAGCAGTGGGATTGCTGGATCATATGGCAGCTCTATTTTTAGATT 34721724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTCTAGATATATACTTAGCAGTGGGATTGCTGGATCATATGGCAGCTCTATTTTTAGATT 839

 34721725 TTTGAGGAACCCCCAAACTGTTCTCCATAGTGGTAGTACTAATTGACATTCGCACTAACA 34721784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TTTGAGGAACCCCCAAACTGTTCTCCATAGTGGTAGTACTAATTGACATTCGCACTAACA 899

 34721785 GTATATAAGTGTTCTCTTTCCTCCACATCCTCGCCAGCATTTGTTATTACCTGTCTTTTG 34721844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GTATATAAGTGTTCTCTTTCCTCCACATCCTCGCCAGCATTTGTTATTACCTGTCTTTTG 959

 34721845 AATATAAGCCATTTTAACTGAGATGAGATTATATCTCATTGTAGTTTTGATTTGCATTTC 34721904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AATATAAGCCATTTTAACTGAGATGAGATTATATCTCATTGTAGTTTTGATTTGCATTTC 1019

 34721905 TCTGATGATCAGTGATATTGAGCACCTTTTCCTATGCCTGCTTGCCATTGTATGCCTTCT 34721964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TCTGATGATCAGTGATATTGAGCACCTTTTCCTATGCCTGCTTGCCATTGTATGCCTTCT 1079

 34721965 TTTGAGAAATGTCTATTTATATTTTTTGCCCATTTTAATTATATTATTATATTTTTCCCT 34722024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTTGAGAAATGTCTATTTATATTTTTTGCCCATTTTAATTATATTATTATATTTTTCCCT 1139

 34722025 ATAAAGTTGTTTGAGCTCTTTATATATTCCAGGTATTAATCTCTTGTAAGATTGGCAGTT 34722084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATAAAGTTGTTTGAGCTCTTTATATATTCCAGGTATTAATCTCTTGTAAGATTGGCAGTT 1199

 34722085 TGCAAATATTTTCTCCCATTCTGTGGATTGTCTTTTCACTTTGTTGATTGTTTTCATTGC 34722144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TGCAAATATTTTCTCCCATTCTGTGGATTGTCTTTTCACTTTGTTGATTGTTTTCATTGC 1259

 34722145 TGTGCAGAAGCTTTTAAACTTTATGTGATTCCATTTGTTCATTTTTGCTTTAGTTGTCTG 34722204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TGTGCAGAAGCTTTTAAACTTTATGTGATTCCATTTGTTCATTTTTGCTTTAGTTGTCTG 1319

 34722205 TGCTTGTGGGTTATTACTCAATAAATTTTTGCCCAGAACAATGTCCTGGAGAGTTTTTCC 34722264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGCTTGTGGGTTATTACTCAATAAATTTTTGCCCAGAACAATGTCCTGGAGAGTTTTTCC 1379

 34722265 AATGTTTTCTTGTAATAGTTTCATACCTTTAAGTCTTTCATCCATTTTGATTTGATCTTT 34722324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AATGTTTTCTTGTAATAGTTTCATACCTTTAAGTCTTTCATCCATTTTGATTTGATCTTT 1439

 34722325 ATAGATGGCAAGAGCTAGAGATTGAGTTTCATTCTTCTGCATATGGATATCCAGTTTTCC 34722384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ATAGATGGCAAGAGCTAGAGATTGAGTTTCATTCTTCTGCATATGGATATCCAGTTTTCC 1499

 34722385 CAGCACCATTTATTGAAGAGATTGTCTTTTCCCCAATGTATGTTTTTGGCACCTTTGTTG 34722444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CAGCACCATTTATTGAAGAGATTGTCTTTTCCCCAATGTATGTTTTTGGCACCTTTGTTG 1559

 34722445 AAAATGAGTTCGCTGTAGGTGTATACATTTATTTCTGGGTTATCTACTCTGTTCCATTGG 34722504
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1560 AAAATGAGTTCGCTGTAGGTGTATACATTTATTTCTGGGTTCTCTACTCTGTTCCATTGG 1619

 34722505 TCTATGTGTCTGTTTTTATGACAGTACCATGCTGTTTTGGTTACCATAGCTCTGTGGTTA 34722564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCTATGTGTCTGTTTTTATGACAGTACCATGCTGTTTTGGTTACCATAGCTCTGTGGTTA 1679

 34722565 TAATTTCAAGTCAGGTAATGTGATTCCTCCATTTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATAACTTT 34722624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TAATTTCAAGTCAGGTAATGTGATTCCTCCATTTTTGTTCTTTTTGCTTAGGATAACTTT 1739

 34722625 GGCTATTCTGGGTATTTGGTGGTTCCATATAAATTTTAGTATTGTTTTTTCTATTTCTGT 34722684
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GGCTATTCTGGGTATTTGGCGGTTCCATATAAATTTTAGTATTGTTTTTTCTATTTCTGT 1799

 34722685 GAAGAATGTCATTGGTATTTTTGTAAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGTAC 34722744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GAAGAATGTCATTGGTATTTTTGTAAAGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGTAC 1859

 34722745 TATTGATGGCAGCAGTGGCCCATCTGGAGTGGCTGCTGCTAAGATACTGGCTGCAGCAGA 34722804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TATTGATGGCAGCAGTGGCCCATCTGGAGTGGCTGCTGCTAAGATACTGGCTGCAGCAGA 1919

 34722805 GGAGGCCTGGGCAGGGCTGTTTGCTCTGTGGGGCCCGTGGGAGCCAGGAATGGGTGGGAG 34722864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GGAGGCCTGGGCAGGGCTGTTTGCTCTGTGGGGCCCGTGGGAGCCAGGAATGGGTGGGAG 1979

 34722865 CCCCACCCCCGTCCGAGTTGGTGGGGTGGGAGCCCCGTGCTCCCAGGTGCAGCTGTAGCT 34722924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CCCCACCCCCGTCCGAGTTGGTGGGGTGGGAGCCCCGTGCTCCCAGGTGCAGCTGTAGCT 2039

 34722925 GCCCAGCTATGTCTGCTGACCCAGGCATCCTTGTGGTCTTGGGGACACAGAAAATCCTCC 34722984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GCCCAGCTATGTCTGCTGACCCAGGCATCCTTGTGGTCTTGGGGACACAGAAAATCCTCC 2099

 34722985 TACCCCAACAGGTTCAGAAGTGCCTGCTCCCACTGCCTGGGCTTTTCCCAATCCTGGTAC 34723044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TACCCCAACAGGTTCAGAAGTGCCTGCTCCCACTGCCTGGGCTTTTCCCAATCCTGGTAC 2159

 34723045 CCACTCTGATTTCAGAGTAGAGTTGTGGCTGAGCCTGGGTGCTGTCACTACCTGGTTGGG 34723104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CCACTCTGATTTCAGAGTAGAGTTGTGGCTGAGCCTGGGTGCTGTCACTACCTGGTTGGG 2219

 34723105 TGTGCCTGCACTCAGGCCGGTACTGACACACAAATCCCCTACTACTGAAGCCTAGGGTAG 34723164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGTGCCTGCACTCAGGCCGGTACTGACACACAAATCCCCTACTACTGAAGCCTAGGGTAG 2279

 34723165 CTGAGGGTGACTTGGCACAAGATTGCAGGTTCCCCTTGGCATGAACAGCCTGGGCATCAT 34723224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CTGAGGGTGACTTGGCACAAGATTGCAGGTTCCCCTTGGCATGAACAGCCTGGGCATCAT 2339

 34723225 GAATGGTGGCAGGAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACT 34723284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAATGGTGGCAGGAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATGGGCAGGTCCTTGGTGAAACT 2399

 34723285 CCACCTTTAAGCCAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCA 34723344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CCACCTTTAAGCCAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAGGCTACTAGTTCTGTGGACCA 2459

 34723345 GAGTGAGAACTTATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGC 34723404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GAGTGAGAACTTATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGGCCACCCATGGACCAGTCAGC 2519

 34723405 TTGTACTTCCTCCCCTCTGAAGCCCACAAAATCTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGAT 34723464
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTGTACTTCCTCCCCTCTGAAGCCCACAAAAACTCTGGATTCAGTCAGACTCGGGCAGAT 2579

 34723465 GACAGGATGACCTGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGG 34723524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GACAGGATGACCTGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTGGATCTCCTCTCTGCTGAGGG 2639

 34723525 CTGCACACTCATTGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGA 34723584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CTGCACACTCATTGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGTACTCACTTTGGCTCTCCTGA 2699

 34723585 AATCTGTACTGTCACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACA 34723644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AATCTGTACTGTCACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGCTCACCCTCTAGTAGTCCACA 2759

 34723645 TCTCTTATTTTTCCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAA 34723704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TCTCTTATTTTTCCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACCTGCTAAATGGCAGGGCTGAA 2819

 34723705 AGAGCTGTAACACAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCA 34723764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AGAGCTGTAACACAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCTCGCTTGCCACATTGCAGGCA 2879

 34723765 ACAAGAAGGAGAAAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACAT 34723824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ACAAGAAGGAGAAAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGCCCTTTGGGGAGCCCAGACAT 2939

 34723825 AGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCT 34723884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGGTTCTGTGGTTCCTGGCATCT 2999

 34723885 CCAAGCTTCTGGGTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATG 34723944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CCAAGCTTCTGGGTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAGTGGAAGCCGCTTGCGGTATG 3059

 34723945 TCTGGTCCAGTTGCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCA 34724004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TCTGGTCCAGTTGCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGTGCCTGGAGCTGCCTGCCCCA 3119

 34724005 CTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAA 34724064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCCTGTACTCGCTGCTCATGCAA 3179

 34724065 GCCTCACCACACCATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAA 34724124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GCCTCACCACACCATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATGGTATCCAGGCTGGTAGTGAA 3239

 34724125 AGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAAC 34724184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGCCCAGTGGGCCCAAGCAAAAC 3299

 34724185 TTGGGCAAAGGTGCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGAT 34724244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTGGGCAAAGGTGCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGGCAAAGCAACATCCTAAGGAT 3359

 34724245 CCTGTGACAATATAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATAT 34724304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CCTGTGACAATATAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCCAATCAAGGAACATAAAATAT 3419

 34724305 CGTTCAATTTTTTGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTAC 34724364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CGTTCAATTTTTTGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAGTGTTTTCTAGTTTTCAGTAC 3479

 34724365 AGAGATCTTTCATTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTA 34724424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AGAGATCTTTCATTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTATTTAATTTTATGTGTGGCTA 3539

 34724425 TTATAAATGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAAT 34724484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTATAAATGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTACACTGTGGGCATATAAAAAT 3599

 34724485 GCTACTGAATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGT 34724544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GCTACTGAATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTAAGTTTGTTTACAAGT 3659

 34724545 TCTAATTTTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAA 34724604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TCTAATTTTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATATAAGATCATATCATCTGCAA 3719

 34724605 ACAAGGGTAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCT 34724664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ACAAGGGTAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCCTTTTACTTCTTTCTTTCTCT 3779

 34724665 TGTCTGACTCCTCTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGG 34724724
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TGTCTGACTCCTGTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGAATAATAGTGGTGAAAGTGGG 3839

 34724725 CATCCTTGTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATG 34724784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CATCCTTGTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAGTTTTTTTCCCATTCACTATG 3899

 34724785 ATACTAGCTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATA 34724844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 ATACTAGCTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATATTGAAATATGATCCTTCTATA 3959

 34724845 CCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTT 34724904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTT 4019

 34724905 CAGCATCAAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGTTGATATGATGTATCA 34724964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4020 CAGCATCAAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCATCCTGCTGATATGATGTATCA 4079

 34724965 CACTGATTGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGT 34725024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 CACTGATTGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCATAAAATCAATCCCACTTGGT 4139

 34725025 AATTATGATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTT 34725084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AATTATGATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTTAAGAATTTT 4199

 34725085 TGCATTAATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGT 34725144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TGCATTAATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCTTTTTTTGAACATGTCTTTGT 4259

 34725145 CTGGTTTGGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTAT 34725204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 CTGGTTTGGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGAGTTTGGAAGTATGGAAGTAT 4319

 34725205 TCCCTCCTATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTT 34725264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TCCCTCCTATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCATTAGTTCTTCTTTACATGTTT 4379

 34725265 GGTAGAATTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAA 34725324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GGTAGAATTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCTGCTGGCAGACATTTTATTAA 4439

 34725325 TGGCTTTGATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCA 34725384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TGGCTTTGATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTTTTGGATTTCCTCATGGCTCA 4499

 34725385 ACATTGGTAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTAT 34725444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 ACATTGGTAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTCCTCTAGGTTTTCCAATTTAT 4559

 34725445 TGCCTAAGAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGT 34725504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TGCCTAAGAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTTCTGCATTATCAACAATATGT 4619

 34725505 CTCCTTTTTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGG 34725564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 CTCCTTTTTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCTTATTTCCTTTGTTAGTCTGG 4679

 34725565 CTAAAGGTTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTT 34725624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 CTAAAGGTTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAAACTTCATTTTATTGATCTTT 4739

 34725625 TGTATTGTTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCT 34725684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TGTATTGTTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTGCT 4799

 34725685 CTGATGTTTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCT 34725744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 CTGATGTTTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTTTGGTTTTATCTTGCTTTTCT 4859

 34725745 AGTTCTTTAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTAT 34725804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 AGTTCTTTAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTTTTTTTTATGTAGGCACTTAT 4919

 34725805 AGCTGTAAAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTG 34725864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 AGCTGTAAAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCCATAGGTTTTGCTATGTTGTG 4979

 34725865 TTTCCATTATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTAATTTCATCATTGACC 34725924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4980 TTTCCATTATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCTTCTTGATTTCATCATTGACC 5039

 34725925 CATCAGTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTT 34725984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 CATCAGTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGGGTGTATAGTTTCTAAAATTT 5099

 34725985 CTCTTGTTATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATT 34726044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 CTCTTGTTATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAGAGAAGATGCTGGGTATTATT 5159

 34726045 TCAATTTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGA 34726104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 TCAATTTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTACCACATGGTCTTTCTTTGAGA 5219

 34726105 ATGGTACATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGT 34726164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 ATGGTACATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGCCAGTGGATAACATCATATGT 5279

 34726165 AAAGATTAATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTG 34726224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 AAAGATTAATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTAACTGTGATGTTTCTTTGTTG 5339

 34726225 AATTACTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATT 34726284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 AATTACTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGGTGCTGAAGTCTCCAGCTATT 5399

 34726285 ATTATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGT 34726344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 ATTATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATATTTGCTTTATATATCTGGGT 5459

 34726345 GCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCC 34726404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 GCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTATTCTCTTGCTGAATTGAGCCC 5519

 34726405 TTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTT 34726464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 TTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAGTTTTTCCTTGAAATACATTT 5579

 34726465 TGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTA 34726524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTGGTTTCCATTGGCATGAACTA 5639

 34726525 TATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTA 34726584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 TATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATAGATGAAATATTTTTCTTGTA 5699

 34726585 G-CAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGA 34726643
          | |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5700 GGCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCTACTTCATAGTTTTTTATTGA 5759

 34726644 TATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATT 34726703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 TATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGTAAAGACTTATGCTTGCCATT 5819

 34726704 TTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTC 34726763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 TTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTCTTCTCTTCCATCCTGCTTTC 5879

 34726764 CTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTG 34726823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 CTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCATTTCTTGCTTCTTATTTTTTG 5939

 34726824 AATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATA 34726883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 AATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGGCTTGCAAATACTATGATATA 5999

 34726884 TTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAAT 34726943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 TTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAACAAACAAAAGGAAACTAAT 6059

 34726944 AAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTC 34727003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 AAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTTTTGTTGTTTCTCTTTGTC 6119

 34727004 TTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTA 34727063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTCTGATGGGTTTGTTGTGTA 6179

 34727064 GTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTT 34727123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 GTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATTGTCATAATATTCTGTGTT 6239

 34727124 TTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCA 34727183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 TTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAGATTATTTATTATTGTTCA 6299

 34727184 TTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGT 34727243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 TTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTCTCTCAGCTTTTGT 6359

 34727244 TTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACT 34727303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 TTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTTTGCTGGATATACT 6419

 34727304 ATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTG 34727363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 ATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATGCCACTCTCTCCTG 6479

 34727364 GTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAAT 34727423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 GTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGCTCCATTGTATAAT 6539

 34727424 TTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATT 34727483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 TTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTTTGGGAGTTTGATT 6599

 34727484 ATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCT 34727543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 ATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGTTCTATAACCTTCT 6659

 34727544 TGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTG 34727603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 TGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGACAGTATTACTTTG 6719

 34727604 AATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGA 34727663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 AATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCTAATAACTCTTAGA 6779

 34727664 TTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATTCCTTTTTCTTTTG 34727723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6780 TTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTTCCTTTTTCTTTTG 6839

 34727724 TTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTG 34727783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 TTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTCATTCTTCTGTTTG 6899

 34727784 ATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAA 34727843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 ATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAATTGCATTTTTCAA 6959

 34727844 CTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTT 34727903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 CTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCTCTTTGTTAAATTT 7019

 34727904 ATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAA 34727963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 ATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTTTGAGTTTCCTCAA 7079

 34727964 AACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCT 34728023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 AACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTTCTCCAGAATTGCT 7139

 34728024 CTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCT 34728083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 CTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTATAGTCTTGATGCT 7199

 34728084 TGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 TGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 7237

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7238 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 7297

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7298 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 7357

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7358 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 7417

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7418 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 7477

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7478 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 7537

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7538 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 7597

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7598 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 7657

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     7658 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTG 7717

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7718 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 7777

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7778 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 7837

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7838 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 7897

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7898 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 7957

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7958 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 8017

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8018 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 8077

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8078 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 8137

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8138 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 8197

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8198 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 8257

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8258 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 8317

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8318 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 8377

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8378 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 8437

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     8438 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCCTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 8497

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8498 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 8557

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTT 34729966
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     8558 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTT 8587

Alignment time is 6.43805 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4549] =>      4549 nucs 'mol-32-34a8-167554_4549'

Score:        4462
Aligned:      4550        nucs
Identic:      4542 (100%) nucs =>       950 (100%)      3592 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34727171,34728121] EXCISED REGION [34728617,34732215]
 second seq =>  [       1,     951] EXCISED REGION [     952,    4549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34727171 TTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTC 34727230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTATTTCTC 60

 34727231 TCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTT 34727290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGATATTTT 120

 34727291 TGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATG 34727350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATGCCATG 180

 34727351 CCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGC 34727410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATTAGAGC 240

 34727411 TCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTT 34727470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTGACCTT 300

 34727471 TGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGT 34727530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTTGGTGT 360

 34727531 TCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGA 34727590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTTTCTGA 420

 34727591 CAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCT 34727650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTAAGGCT 480

 34727651 AATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCATT 34727710
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      481 AATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACTTCCTT 540

 34727711 CCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTC 34727770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCTCACTC 600

 34727771 ATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAA 34727830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAATGTCAA 660

 34727831 TTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCT 34727890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTCAATCT 720

 34727891 CTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTT 34727950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAATTTCTT 780

 34727951 TGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTT 34728010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTCTCTTT 840

 34728011 CTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTA 34728070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTCCTGTA 900

 34728071 TAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 951

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1011

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1071

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1131

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1191

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1251

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1311

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1371

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1431

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1491

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1551

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1552 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1611

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1671

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 1731

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 1791

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 1851

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 1911

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 1971

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2031

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2091

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2151

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 34729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCAACTTCAATACTCTTTTCAAAGAACAGCTTTGTTTTAA 2211

 34729877 TCAATTTTCCCTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 34729936
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TCAATTTTCCTTATAGTTTGTCTATTTTTTCTCATTGAATTCTGTCTTATTTTTATTATT 2271

 34729937 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 34729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TTCTTCTTTCTTGTTATTTTGGGTTTAGTTTGCTTTTATTTCTCTAGCTTACTAAGGTAG 2331

 34729997 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 34730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 AAGCTTAGATAAACTATCTCACATTTTTCTTCTTTTAAGGTATACATTTAATAATATAAA 2391

 34730057 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGCAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 34730116
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TTTTCTTATTATTACTACTTTAGCTGTAGCTTTAAAGTCTTCATATTTTGTTTTCATTTT 2451

 34730117 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 34730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TATGCAGTTAAAATGTTTTCTAACTGCCTTTATGATTTTTTACTTGACCCATTAATTGCT 2511

 34730177 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTCAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 34730236
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2512 TAGAAATGTATTGTTTAATTTACATATGCTGTTTAGTTTCCAAAGTTGGCATTATGCAGA 2571

 34730237 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 34730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TGTCTTTGTTATCAATTTCTAATTTCATTCCATCTTGTTGAAAGAACAACTCCATATGAT 2631

 34730297 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 34730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TTCAATGCTTGTGAATTCATTGAAACAGATTTCTATCTCAAAATATGGTTTGTCCTGGTG 2691

 34730357 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 34730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 AATGTTTTATGAACAATGGAAAAGAATACATATTCTGCTGTTGTGTGTAGTTCTATAAAT 2751

 34730417 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 34730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 GTCAATTAGGACAGGTTTGGTTAATAGCCTTTTAAAAGTCATCTATATCTTTACTGATAT 2811

 34730477 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 34730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 ATCTATTTTTGTTATCAATTATTGTGAGAGTAATGCTAGTGTTTCCAGCTATATTTGTTG 2871

 34730537 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 34730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 ATTTGTCAATTTCTTTTATTTTTAGTTTCAAATATAGGTTTTGCATCCTGTATTTGAAAC 2931

 34730597 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 34730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 TTTTATTAGATGTATTCACTAAAATTAAGATTTTTATTCTTGATAAATTGACCCTTTTAT 2991

 34730657 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 34730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 CACTATGAAATGTCTCTTCTTGTTTCTGGTAATATTCCTTATTTTAAAGTCTGCTTTGTT 3051

 34730717 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 34730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TGATTATAATATAGTCATTCTGGACATCTTTGACTAATGTTTCATGATGTATTTTTTTAT 3111

 34730777 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCCTTTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 34730836
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 CCTTTTATTTTAATTTACCTGCC-TTTTTTTTTTTGGACAGATTCTCACTCTTGTTGCCC 3170

 34730837 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 34730896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 AGGCTGGAGTATAATGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCTGGGTTCAAGT 3230

 34730897 GATTCTCCTGACTGAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 34730956
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 GATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAAGCATACACCACCATGCCTGG 3290

 34730957 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 34731016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTGGCCAGATTGGTCTCAAA 3350

 34731017 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 34731076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CTCCTGACCTCAGGTGATATGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACGGACGTG 3410

 34731077 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 34731136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 AGCCACCGTGACTAGCCCTGTGTTTTTTTATTTGACCTAGGTTACTTTTAGACCTAATAT 3470

 34731137 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 34731196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 AATTTTGGGTGAAGTTGGAAGTAGCCAGGGCAGGGGTCCTGGGAATCTAGTGGCTACAAA 3530

 34731197 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 34731256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 GGGCAACCCAGAATGTGGTGTCATTGAGTGCATGGCCATCCTTCCACATGATCAAGGACA 3590

 34731257 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 34731316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TGCCCCTGGGGTTCTATTCCAAGACCCCAGAAGAATGGGCCACCGCTGCCAAGAAGTATA 3650

 34731317 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 34731376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 ATATGTGTGTGGAAGACTATCAGCCTTACTTGGATGATGGCATGGAGTATGGTAACTACT 3710

 34731377 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 34731436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 CAAAGTTCTTTGACCATTCACAGTAGGAGAGGGATCTGTGGTTTGACTGGGACCACCAAG 3770

 34731437 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 34731496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 ACTTGAGGTTGAACTGGGGTGAACTGATACACTGGCATCTGGACAAGTATATCAGGAACC 3830

 34731497 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 34731556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 ATGTGGATATGGCCCTCCACCCCTGTTTCTTGGAATATCATGTTCAATAATCTCTTCAGC 3890

 34731557 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 34731616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 TTCCTGACCTTCATGAACTTTATGTTCTATGTAGTGGAGAATTATTCTACCTACCAGCCT 3950

 34731617 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 34731676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 GTGGGGCCAAAGCAGTATCCTTTTAATAATCTGTACTTGGGACAAGACAGTGATCCACCA 4010

 34731677 AAGAACCTGAGCTAGTGTTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 34731736
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 AAGAACCTGAGCTAGTGGTTCACTATGAGATCTAAGGGCTTCATAAGCTTTTGTGCCCTC 4070

 34731737 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 34731796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TACCTAGGACTCCTTAATTCCTAGAAATTTAACTTGAATGAAATCTTTAACAAAACTTAG 4130

 34731797 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 34731856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TGCCATAGGAAAAAATATATACATGTATATGTACATACATAGTTTTTTCTTACTTTCTTA 4190

 34731857 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 34731916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TTCATTCTGAAAATCTCTGCCTTTTAAATGCAGTGTTTAGACCACCTACATTTAATGCAA 4250

 34731917 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 34731976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 TTATTAATTTGATAGTTGTTAGGTCTATTATCTTATGATTTGTTTTACATTCATGCCATG 4310

 34731977 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 34732036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 TATTCATTGTTGCTCTTTTCTTTTTCTCATGTCCTATCTTCTTTTAATTAATTTTTTTAT 4370

 34732037 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 34732096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 TTAAATTTGTCTTTAGTTTTATCTTACTATTTATTCCTGTTTTAACTTTTATTTATACTT 4430

 34732097 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 34732156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TCAGTGCTTAATGTAAAATGTGCAATAATAATCTGCAAATTCTTTCCTACTGTTCTTTGT 4490

 34732157 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTT 34732215
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 TATTGTCATAGAATTTATTTTTGTTTGTTGTAAAATCCACAACACATTGATATTACCTT 4549

Alignment time is 3.28734 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2479] =>      2479 nucs 'mol-32-34b3-099534_2479'

Score:        2457
Aligned:      2479        nucs
Identic:      2477 (100%) nucs =>      1255 (100%)      1222 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34726866,34728121] EXCISED REGION [34728617,34729839]
 second seq =>  [       1,    1256] EXCISED REGION [    1257,    2479]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34726866 TGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAAC 34726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAAAC 60

 34726926 AAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTT 34726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACTTT 120

 34726986 TTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTC 34727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATTTC 180

 34727046 TGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATT 34727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACATT 240

 34727106 GTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAG 34727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTCAG 300

 34727166 ATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTAT 34727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGTAT 360

 34727226 TTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGAT 34727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGGAT 420

 34727286 ATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATG 34727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATATG 480

 34727346 CCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATT 34727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTATT 540

 34727406 AGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTG 34727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCTTG 600

 34727466 ACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTT 34727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGCTT 660

 34727526 GGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTT 34727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGTTT 720

 34727586 TCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTA 34727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTTTA 780

 34727646 AGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACT 34727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATACT 840

 34727706 TCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCT 34727765
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAGCT 900

 34727766 CACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAAT 34727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGAAT 960

 34727826 GTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTC 34727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATTTC 1020

 34727886 AATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAAT 34727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGAAT 1080

 34727946 TTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTC 34728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGCTC 1140

 34728006 TCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTC 34728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTTTC 1200

 34728066 CTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 1256

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 1316

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 1376

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 1436

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 1496

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 1556

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 1616

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 1676

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 1736

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 1796

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 1856

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1857 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 1916

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 1976

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 2036

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 2096

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 2156

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 2216

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 2276

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 2336

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 2396

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 2456

 34729817 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCA 34729839
          |||||||||||||||||||||||
     2457 TCTTGATCAGTCTAGATATGTCA 2479

Alignment time is 1.80069 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [34718121,34738616] =>     20496 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    7150] =>      7150 nucs 'mol-32-34b3-104538_7150'

Score:        7040
Aligned:      7150        nucs
Identic:      7140 (100%) nucs =>      5929 (100%)      1211 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [34722185,34728121] EXCISED REGION [34728617,34729828]
 second seq =>  [       1,    5938] EXCISED REGION [    5939,    7150]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       495 nucs [34728122,34728616]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [34728122,34728123] to [34728617,34728618]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [34728122,34728122] to [34728616,34728616]
 second seq =>         0 nucs

 34722185 ATTTTTGCTTTAGTTGTCTGTGCTTGTGGGTTATTACTCAATAAATTTTTGCCCAGAACA 34722244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTTTGCTTTAGTTGTCTGTGCTTGTGGGTTATTACTCAATAAATTTTTGCCCAGAACA 60

 34722245 ATGTCCTGGAGAGTTTTTCCAATGTTTTCTTGTAATAGTTTCATACCTTTAAGTCTTTCA 34722304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTCCTGGAGAGTTTTTCCAATGTTTTCTTGTAATAGTTTCATACCTTTAAGTCTTTCA 120

 34722305 TCCATTTTGATTTGATCTTTATAGATGGCAAGAGCTAGAGATTGAGTTTCATTCTTCTGC 34722364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCATTTTGATTTGATCTTTATAGATGGCAAGAGCTAGAGATTGAGTTTCATTCTTCTGC 180

 34722365 ATATGGATATCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTGAAGAGATTGTCTTTTCCCCAATGTA 34722424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATGGATATCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTGAAGAGATTGTCTTTTCCCCAATGTA 240

 34722425 TGTTTTTGGCACCTTTGTTGAAAATGAGTTCGCTGTAGGTGTATACATTTATTTCTGGGT 34722484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTTTTGGCACCTTTGTTGAAAATGAGTTCGCTGTAGGTGTATACATTTATTTCTGGGT 300

 34722485 TATCTACTCTGTTCCATTGGTCTATGTGTCTGTTTTTATGACAGTACCATGCTGTTTTGG 34722544
          |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTACTCTGTTCTATTGGTCTATGTGTCTGTTTTTATGACAGTACCATGCTGTTTTGG 360

 34722545 TTACCATAGCTCTGTGGTTATAATTTCAAGTCAGGTAATGTGATTCCTCCATTTTTGTTC 34722604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTACCATAGCTCTGTGGTTATAATTTCAAGTCAGGTAATGTGATTCCTCCATTTTTGTTC 420

 34722605 TTTTTGCTTAGGATAACTTTGGCTATTCTGGGTATTTGGTGGTTCCATATAAATTTTAGT 34722664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTGCTTAGGATAACTTTGGCTATTCTGGGTATTTGGTGGTTCCATATAAATTTTAGT 480

 34722665 ATTGTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTATTTTTGTAAAGATTGCATTGAAT 34722724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTGTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAATGTCATTGGTATTTTTGTAAAGATTGCATTGAAT 540

 34722725 CTGTAGATTGCTTTTGGTACTATTGATGGCAGCAGTGGCCCATCTGGAGTGGCTGCTGCT 34722784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTAGATTGCTTTTGGTACTATTGATGGCAGCAGTGGCCCATCTGGAGTGGCTGCTGCT 600

 34722785 AAGATACTGGCTGCAGCAGAGGAGGCCTGGGCAGGGCTGTTTGCTCTGTGGGGCCCGTGG 34722844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGATACTGGCTGCAGCAGAGGAGGCCTGGGCAGGGCTGTTTGCTCTGTGGGGCCCGTGG 660

 34722845 GAGCCAGGAATGGGTGGGAGCCCCACCCCCGTCCGAGTTGGTGGGGTGGGAGCCCCGTGC 34722904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGCCAGGAATGGGTGGGAGCCCCACCCCCGTCCGAGTTGGTGGGGTGGGAGCCCCGTGC 720

 34722905 TCCCAGGTGCAGCTGTAGCTGCCCAGCTATGTCTGCTGACCCAGGCATCCTTGTGGTCTT 34722964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCCAGGTGCAGCTGTAGCTGCCCAGCTATGTCTGCTGACCCAGGCATCCTTGTGGTCTT 780

 34722965 GGGGACACAGAAAATCCTCCTACCCCAACAGGTTCAGAAGTGCCTGCTCCCACTGCCTGG 34723024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGGACACAGAAAATCCTCCTACCCCAACAGGTTCAGAAGTGCCTGCTCCCACTGCCTGG 840

 34723025 GCTTTTCCCAATCCTGGTACCCACTCTGATTTCAGAGTAGAGTTGTGGCTGAGCCTGGGT 34723084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTTTTCCCAATCCTGGTACCCACTCTGATTTCAGAGTAGAGTTGTGGCTGAGCCTGGGT 900

 34723085 GCTGTCACTACCTGGTTGGGTGTGCCTGCACTCAGGCCGGTACTGACACACAAATCCCCT 34723144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTGTCACTACCTGGTTGGGTGTGCCTGCACTCAGGCCGGTACTGACACACAAATCCCCT 960

 34723145 ACTACTGAAGCCTAGGGTAGCTGAGGGTGACTTGGCACAAGATTGCAGGTTCCCCTTGGC 34723204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTACTGAAGCCTAGGGTAGCTGAGGGTGACTTGGCACAAGATTGCAGGTTCCCCTTGGC 1020

 34723205 ATGAACAGCCTGGGCATCATGAATGGTGGCAGGAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATG 34723264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGAACAGCCTGGGCATCATGAATGGTGGCAGGAGGCAGACAGGCTCCTGGGTGGAAATG 1080

 34723265 GGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACCTTTAAGCCAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAG 34723324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCAGGTCCTTGGTGAAACTCCACCTTTAAGCCAGGGATGGCCTGAAGCCTGGGGGCCAG 1140

 34723325 GCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTGAGAACTTATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGG 34723384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTACTAGTTCTGTGGACCAGAGTGAGAACTTATTGTGCTTTTTCCAGGCCCACCCATGG 1200

 34723385 CCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACTTCCTCCCCTCTGAAGCCCACAAAATCTCTGGAT 34723444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1201 CCACCCATGGACCAGTCAGCTTGTACTTCCTCCCCTCTGAAGCCCACAAAAACTCTGGAT 1260

 34723445 TCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGATGACCTGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTG 34723504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAGTCAGACTCGGGCAGATGACAGGATGACCTGCTTGTGGAGAGGAGCTACCCACTCTG 1320

 34723505 GATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACACTCATTGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGT 34723564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATCTCCTCTCTGCTGAGGGCTGCACACTCATTGGGATGACCTGCCTGCACATAGAAGGT 1380

 34723565 ACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGTACTGTCACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGC 34723624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTCACTTTGGCTCTCCTGAAATCTGTACTGTCACTCAGTAAAGCATCACTTCACCTTGC 1440

 34723625 TCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTATTTTTCCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACC 34723684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCACCCTCTAGTAGTCCACATCTCTTATTTTTCCTGGACATGGGACAAGAACTCAGGACC 1500

 34723685 TGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTGTAACACAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCT 34723744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTAAATGGCAGGGCTGAAAGAGCTGTAACACAAACAGTGCTGGAACACACCTTCCCCT 1560

 34723745 CGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAAGGAGAAAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGC 34723804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CGCTTGCCACATTGCAGGCAACAAGAAGGAGAAAAGAGAGAAGGACAGAAGCACTGTGGC 1620

 34723805 CCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGG 34723864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTTTGGGGAGCCCAGACATAGGAGCTCCCTGAGCCAGGGCTGTGAGACCCTCTTTGGGG 1680

 34723865 TTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCTTCTGGGTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAG 34723924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTGTGGTTCCTGGCATCTCCAAGCTTCTGGGTGCTGCCACATTTCCCAGTGACCACAG 1740

 34723925 TGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTCCAGTTGCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGT 34723984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAAGCCGCTTGCGGTATGTCTGGTCCAGTTGCAGCAGGGAGACAGTGCTTACGCTGGT 1800

 34723985 GCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCC 34724044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCTGGAGCTGCCTGCCCCACTGCAGCCAGAGTGTCTGGCTGTGTGCAGTGGCCAGACCC 1860

 34724045 TGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACACCATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATG 34724104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTACTCGCTGCTCATGCAAGCCTCACCACACCATTCCTGGCTTACCCTTGGCAGGCATG 1920

 34724105 GTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGC 34724164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTATCCAGGCTGGTAGTGAAAGCCCAGCGCAGTCTGCCAGGTCGAATGGGTGGAATGAGC 1980

 34724165 CCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGTGCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGG 34724224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAGTGGGCCCAAGCAAAACTTGGGCAAAGGTGCCACTGGCCACAGAGGTTTCCAGCTGG 2040

 34724225 CAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATATAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCC 34724284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAAGCAACATCCTAAGGATCCTGTGACAATATAGACATTTTAACAACATTCATTCTTCC 2100

 34724285 AATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTTTGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAG 34724344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATCAAGGAACATAAAATATCGTTCAATTTTTTGGCATCCTCTCTAATTTCTTCCATTAG 2160

 34724345 TGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCATTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTA 34724404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGTTTTCTAGTTTTCAGTACAGAGATCTTTCATTTTTTTGGTTAAGTTAATTCCTAGTTA 2220

 34724405 TTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTA 34724464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTAATTTTATGTGTGGCTATTATAAATGGGATTATTTTTAATTTCTTTTTCAGATTGTA 2280

 34724465 CACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTT 34724524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CACTGTGGGCATATAAAAATGCTACTGAATTTTGTATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTT 2340

 34724525 TACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATA 34724584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACTAAGTTTGTTTACAAGTTCTAATTTTTTTTGGTGGAGTCTTAAGGTTTTTCCAAATA 2400

 34724585 TAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCC 34724644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAGATCATATCATCTGCAAACAAGGGTAATTTGACTTATTCCTTCCCAATTTGAATGCC 2460

 34724645 TTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTCTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGA 34724704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTACTTCTTTCTTTCTCTTGTCTGACTCCTGTAGCTAGGATTTCCAGTACTACACTGA 2520

 34724705 ATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAG 34724764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATAATAGTGGTGAAAGTGGGCATCCTTGTTTGCTCCAGATCTTACAGAAAAGACTTTTAG 2580

 34724765 TTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATAT 34724824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTTTTTCCCATTCACTATGATACTAGCTGATGGTCTGTCATATATGGCTTTTATTATAT 2640

 34724825 TGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTG 34724884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGAAATATGATCCTTCTATACCCAGTTTTTTCAGTTTGTTTTAATCATGGCAGGATGTTG 2700

 34724885 AATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCAT 34724944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATTTTATCAAATGCTTTTTCAGCATCAAATAAAATGATTATGTGGCTTTTGTCCTTCAT 2760

 34724945 CCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCA 34725004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCTGTTGATATGATGTATCACACTGATTGATTTGCAAATGTTGAACCATCCTTGCATCCA 2820

 34725005 TAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCT 34725064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAAAATCAATCCCACTTGGTAATTATGATCTTTGTAATATATTATTGAATTCAGTTTGCT 2880

 34725065 AGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCT 34725124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGTATTTTGTTAAGAATTTTTGCATTAATTTTTATCAGAGATGTTGGCCTGTAGTTTTCT 2940

 34725125 TTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGA 34725184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTTTGAACATGTCTTTGTCTGGTTTGGGTTTTAAGGTAATACTGGCCTCGTAGAATGA 3000

 34725185 GTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCAT 34725244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTTGGAAGTATGGAAGTATTCCCTCCTATTTTTCAAAACAATTTGAGTAGGATTAGCAT 3060

 34725245 TAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCT 34725304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGTTCTTCTTTACATGTTTGGTAGAATTCAGCAATGAAGCCATCAGGTCCCAGGTCTCT 3120

 34725305 GCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTT 34725364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCTGGCAGACATTTTATTAATGGCTTTGATCTTGTCAATTGTTGTTGGTCTGTTTAGGTT 3180

 34725365 TTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTC 34725424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTGGATTTCCTCATGGCTCAACATTGGTAGGTTTTATGTGTCTAGGAATATATCCATTTC 3240

 34725425 CTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTT 34725484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCTAGGTTTTCCAATTTATTGCCTAAGAATTATAGTAGCCATAATAATCCTTTGAATTT 3300

 34725485 CTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCT 34725544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGCATTATCAACAATATGTCTCCTTTTTTAATATCTGATTTTATTTAGGTCTTCTGTCT 3360

 34725545 TATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAA 34725604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATTTCCTTTGTTAGTCTGGCTAAAGGTTTATTAATTTTATTCATCATTTCAAAAAACAA 3420

 34725605 ACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTC 34725664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACTTCATTTTATTGATCTTTTGTATTGTTTCTTTCATTTCAATTTCATTTATTTCTGCTC 3480

 34725665 TGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTT 34725724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGATGTTTATTATTTCTGCTCTGATGTTTATTATTTCTTTTCTTCTACTAATTTGGGGTT 3540

 34725725 TGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTT 34725784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGGTTTTATCTTGCTTTTCTAGTTCTTTAAGATGCATTGTTAGATTGTTTATTTGAAGTT 3600

 34725785 TTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCC 34725844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTTTTATGTAGGCACTTATAGCTGTAAAATTCCTTCCTAGTACTGTTTTGCTGCATCCC 3660

 34725845 ATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCT 34725904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATAGGTTTTGCTATGTTGTGTTTCCATTATCATTTGTTTTAAGAAAATTTTCAATTTTCT 3720

 34725905 TCTTAATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGG 34725964
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTTGATTTCATCATTGACCCATCAGTCATTCAGGAGCACAGTGTTTAATTTCTATGTGG 3780

 34725965 GTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAG 34726024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTGTATAGTTTCTAAAATTTCTCTTGTTATTGATTTCTATTTTTATTCCATTTTGGTCAG 3840

 34726025 AGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTAC 34726084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGAAGATGCTGGGTATTATTTCAATTTTTTGAATGTTTTAAAACTTGCTTTGTGACCTAC 3900

 34726085 CACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGC 34726144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CACATGGTCTTTCTTTGAGAATGGTACATTTTCTGAGGAGATGAATGTGTATTTTGCAGC 3960

 34726145 CAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTA 34726204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAGTGGATAACATCATATGTAAAGATTAATTAGGTTCATTTTTTTCTATAGTGCAAATTA 4020

 34726205 ACTGTGATGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGG 34726264
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ACTGTGACGTTTCTTTGTTGAATTACTGTCTGAGAGGTCTGTCCAGTGCTGAAGATGGGG 4080

 34726265 TGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATA 34726324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGCTGAAGTCTCCAGCTATTATTATATTGATGTCTATCTCTCTGTTTAGCTCTAATAATA 4140

 34726325 TTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTAT 34726384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTTGCTTTATATATCTGGGTGCTACTGCATTGGATGCATATATATTTAAAATTGTTTTAT 4200

 34726385 TCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAG 34726444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCTCTTGCTGAATTGAGCCCTTTATCATGTTATAATGACCTTCTTTGTCTCTTCTTACAG 4260

 34726445 TTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTG 34726504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTTTCCTTGAAATACATTTTGTCTGATATATAAGTATAGCTACTCCTGCTCTTTTCTTG 4320

 34726505 GTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATA 34726564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTTTCCATTGGCATGAACTATATTTCCATCCTTTATCTTTAGTCTATGTGTATCTTTATA 4380

 34726565 GATGAAATATTTTTCTTGTAG-CAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGTCCAGCT 34726623
          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4381 GATGAAATATTTTTCTTGTAGGCAACAGATCATTGGGTCTTGCTTTTTATTCGCCCAGCT 4440

 34726624 ACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGT 34726683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ACTTCATAGTTTTTTATTGATATTTTAGTCCATTTACATTCAATGTTATTATTGAGAAGT 4500

 34726684 AAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTC 34726743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAAGACTTATGCTTGCCATTTTGTTATTTGTTTTCTGGTTGCTTTGTGGTCTTTTCCTTC 4560

 34726744 TTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCAT 34726803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTCTCTTCCATCCTGCTTTCCTTTCAGTGAAGGTGATTTTCATTGGTGGTATATTTTCAT 4620

 34726804 TTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGG 34726863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTCTTGCTTCTTATTTTTTGAATATCCATTGCATGATTTTTACTTGAGGTTACTGTGAGG 4680

 34726864 CTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAA 34726923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTTGCAAATACTATGATATATTTTAAGCAGATGACAAATTAACACTGATTGCATAAACAA 4740

 34726924 ACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACT 34726983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACAAACAAAAGGAAACTAATAAAAACTCTACCCTGTAACTTTGTCTCCCACTTCTTAACT 4800

 34726984 TTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATT 34727043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTTTGTTGTTTCTCTTTGTCTTATTGTACCATGTCTTGAAAAGTTGATATAGTTATTATT 4860

 34727044 TCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACA 34727103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TCTGATGGGTTTGTTGTGTAGTCTTTCTACTTAGGGTTTAGTTTACACACCACAATTACA 4920

 34727104 TTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTC 34727163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTGTCATAATATTCTGTGTTTTTCCGTGTGCTTACTCTTACTAGTGAGGTTTGTACTTTC 4980

 34727164 AGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGT 34727223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGATTATTTATTATTGTTCATTAATGTTCTTTTCTTTCAGATTGAAGAACTCCCTTTAGT 5040

 34727224 ATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGG 34727283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ATTTCTCTCTCAGCTTTTGTTTTTCTGGGAAAGTCTTTATTTCTCTTTCATGCTTGAAGG 5100

 34727284 ATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATA 34727343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ATATTTTTGCTGGATATACTATTCTAGGGTAAAACGTTTTTTGCTTCAGCGCTTTAAATA 5160

 34727344 TGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTA 34727403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGCCATGCCACTCTCTCCTGGTCTGCAAGGTTTCCACTGAGAAGTCTGCTGCCAGATGTA 5220

 34727404 TTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCT 34727463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTAGAGCTCCATTGTATAATTTTTTTTTTCTTGATGCTTTTAAGAACTTTTCTTTATCCT 5280

 34727464 TGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGC 34727523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TGACCTTTGGGAGTTTGATTATTAAATGCCTTGAGGTAGTCTTCTTTGGGTTAAATCTGC 5340

 34727524 TTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGT 34727583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTGGTGTTCTATAACCTTCTTGTCCTTGAACCTTGTTACCTTTCTCTAGGTTTGGGAAGT 5400

 34727584 TTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTT 34727643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTTCTGACAGTATTACTTTGAATAAACGTTCTACACCTATATATTTTTGTACCTCCTCTT 5460

 34727644 TAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATA 34727703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TAAGGCTAATAACTCTTAGATTTTCCCTTTTGAGTCAATTTTCTAGATCTTGTAGGTATA 5520

 34727704 CTTCATTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAG 34727763
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CTTCCTTCCTTTTTCTTTTGTTTCCTCTGACTGTGTATTTTCAAATAGCCTGTCTTCAAG 5580

 34727764 CTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGA 34727823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CTCACTCATTCTTCTGTTTGATCAACTCTTCTATTAAGAGACTGTGGTGCATTCTTCAGA 5640

 34727824 ATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATT 34727883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ATGTCAATTGCATTTTTCAACTCTAGAATTTCTACTTGATTTCTTTTTCATTATTCAATT 5700

 34727884 TCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGA 34727943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TCAATCTCTTTGTTAAATTTATTTGCTAGAATTTTGAATTTCTTATCCGTGTTATCTTGA 5760

 34727944 ATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGC 34728003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATTTCTTTGAGTTTCCTCAAAACAGCTATTTTGAATACTCTTTCTGAAAGGTCACATAGC 5820

 34728004 TCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTT 34728063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TCTCTTTCTCCAGAATTGCTCTTTGGTGCCTTATTTAGTTCATTTGGTAAGGTCTTATTT 5880

 34728064 TCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 34728121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TCCTGTATAGTCTTGATGCTTGTGGATGTTTATCAGTTTCTGTGCATTGAAGAGTTAA 5938

EXCISED REGION

 34728617 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 34728676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 GCCTGGACTCAGGAACCCCAAGAGCCTGCTTCATGCTCTACCCCACTGTGGCTGAGCTGT 5998

 34728677 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 34728736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 TATCTAAAGTTCAAGACAAAGTCTCCTTTACTTGCACTCTGCTTTTCTCAAGCAGAAGAT 6058

 34728737 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 34728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 CTTTCACCCTAGCCACCACAGCTGGGAATATACTGGGTCACACCTGTAGCCAGCATGTCT 6118

 34728797 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 34728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 CAGAGTCTCAACCAAGGCCCATGGTGTACTACTTGGGTATTCTTATTCGTTACTCAGGGC 6178

 34728857 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 34728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 CCAAAGCCTGTTTAGTCAGCAGGTGATTAATTCTGTCAGGATTAGTTCTTCCCTTTAAGG 6238

 34728917 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 34728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 CAGTGAGTTTCCTGCTGGCCCAGGTTGTGTCTAGAAATGTCTGTGAACTAGGGCCTGGAA 6298

 34728977 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 34729036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 TAGGGGCCTGACAACTCTGCCTGGTGCACTATCCTATTGTGGATGAGCTAGTATCAAAGA 6358

 34729037 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 34729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 CACAAGACAAATACCACTTTACTCTTCACTCTCCTCTCCTCAAGCAGAAGGAAGGAGTTA 6418

 34729097 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 34729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 CTATCATTGCTACAAGCTGCACTGCTTGGGTTTCACAAGCTTGGGTTTCACAAGTGGTGG 6478

 34729157 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 34729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 CACAAGCAACACCCTTAGCTGCCCCAGCTGGTGTCTTCCTAGGTCACGTGCTGCCTTAGT 6538

 34729217 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCGCCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 34729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6539 CTACTGGCTGTAAGTCCAGCCTTAGCACTAGGCCTCACCTAGAAATTGCGGTACTTGTGT 6598

 34729277 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 34729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 CCTAGACTGCATTTCAAGTTTACCTAGAACCCAAGAGCACTTTAGCCTGCAGTGGCAAGT 6658

 34729337 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 34729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 TTTGCTGAAACTCAAGTTCCAACCACTGGGATGGGCAATTTCCCTCTGGCTGGGGCTGGT 6718

 34729397 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 34729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 CCACATGCTCCTTCTGTGAGTGGGTGCCAGCTGAACCAAGCAAGGTTTTGCTCCCTGCTG 6778

 34729457 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 34729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 TGACAGGGCAGCACTGAGTTCAATGCCAAGACCCCTAGTCACTGTGCTTGCCCTGCCTCA 6838

 34729517 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 34729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 AGTGCACAGATTGTTTCTCTATGCCATGTGGCCACTGCCAGGGAGTGGAGGAGAAGTGGC 6898

 34729577 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 34729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 ATAGGCAATTCAAGACTGTCTTTCCTACCCTCTTCAATGTCTCTTTCAGCAATATGAAGT 6958

 34729637 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 34729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 TAAAATCAGGTACTGTGATTGCTCACCTGATTTTTGTTTTTTGTGATAGTGCTTTTTTGT 7018

 34729697 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 34729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 GTGTAGTTAGTTGTTAAAATTTAGTGTTCCTTTGGTGGGGGGATAATTGTTGCAGGCTTC 7078

 34729757 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 34729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 TGTTTGGCCATCTTGCTTTGCCCGCTCATTTTCTTGATAATCTGTACCTTTTGTCTTTGT 7138

 34729817 TCTTGATCAGTC 34729828
          ||||||||||||
     7139 TCTTGATCAGTC 7150

Alignment time is 5.47631 s

