
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3481] =>      3481 nucs 'mol-32-1e7c-020756_3481'

Score:        3179
Aligned:      3486        nucs
Identic:      3454 ( 99%) nucs =>       158 (100%)      3296 ( 99%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292571,10292728] EXCISED REGION [10293835,10297159]
 second seq =>  [       1,     158] EXCISED REGION [     159,    3481]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292571 AGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACA 10292630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACA 60

 10292631 TATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAG 10292690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAG 120

 10292691 ACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 10292728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 158

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      159 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 218

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      219 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 278

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      279 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 338

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      339 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 398

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      399 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 458

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      459 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 518

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      519 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 578

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      579 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 638

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 698

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 758

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      759 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 818

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 878

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      879 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 938

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 994

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1054

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1055 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1114

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1115 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1174

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1175 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1234

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1294

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1354

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1414

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1415 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1474

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1534

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1594

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1654

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1714

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1774

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1834

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1894

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1954

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 2014

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2074

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2134

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2194

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2254

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2314

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2374

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2375 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2434

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2494

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGG 10296231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2495 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACGTAGGAGGTGG 2554

 10296232 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 10296291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 2614

 10296292 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 10296351
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 CATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 2673

 10296352 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 10296411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 2733

 10296412 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 10296471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 2793

 10296472 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 10296531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 2853

 10296532 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 10296591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 2913

 10296592 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 10296651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 2973

 10296652 TCCAGAAACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 10296711
          |.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 TTCAGAAACTAAGTCTATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 3033

 10296712 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGA 10296771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3034 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAGAGAGAGAACACCAGA 3093

 10296772 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 10296831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 3153

 10296832 AGGTGTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 10296891
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 AGGTCTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 3213

 10296892 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 10296951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 3273

 10296952 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 10297011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 3333

 10297012 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 10297071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 3393

 10297072 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 10297131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 3453

 10297132 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTT 10297159
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3454 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTT 3481

Alignment time is 2.67183 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3677] =>      3677 nucs 'mol-32-1e87-054230_3677'

Score:        3362
Aligned:      3684        nucs
Identic:      3649 ( 99%) nucs =>       135 (100%)      3514 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292594,10292728] EXCISED REGION [10293835,10297380]
 second seq =>  [       1,     135] EXCISED REGION [     136,    3677]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292594 ACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATG 10292653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATG 60

 10292654 CCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAA 10292713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAA 120

 10292714 TTGCAAAACCAAGGA 10292728
          |||||||||||||||
      121 TTGCAAAACCAAGGA 135

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      136 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 195

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 255

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 315

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      316 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 375

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 435

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 495

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      496 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 555

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      556 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 615

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 675

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 735

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      736 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 795

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 855

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      856 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 915

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 971

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1031

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1032 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1091

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1092 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1151

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1152 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1211

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1271

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1331

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1391

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1392 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1451

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1511

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1571

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1631

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1691

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1751

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1811

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1871

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1931

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 1991

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2051

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2111

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2171

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2231

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2291

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2351

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2352 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2411

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2471

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGG 10296231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2472 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACGTAGGAGGTGG 2531

 10296232 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 10296291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 2591

 10296292 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 10296351
          ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 CATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 2648

 10296352 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 10296411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 2708

 10296412 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 10296471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 2768

 10296472 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 10296531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 2828

 10296532 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 10296591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 2888

 10296592 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 10296651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2889 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAGTAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 2948

 10296652 TCCAGAAACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 10296711
          |.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 TTCAGAAACTAAGTCTATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 3008

 10296712 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGA 10296771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3009 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAGAGAGAGAACACCAGA 3068

 10296772 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 10296831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 3128

 10296832 AGGTGTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 10296891
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 AGGTCTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 3188

 10296892 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 10296951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 3248

 10296952 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 10297011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 3308

 10297012 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 10297071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 3368

 10297072 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 10297131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 3428

 10297132 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 10297191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 3488

 10297192 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 10297251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 3548

 10297252 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 10297311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 3608

 10297312 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 10297371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 3668

 10297372 TACTAGGTG 10297380
          |||||||||
     3669 TACTAGGTG 3677

Alignment time is 2.81563 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2403] =>      2403 nucs 'mol-32-1f63-000506_2403'

Score:        2402
Aligned:      2402        nucs
Identic:      2402 (100%) nucs =>      1998 (100%)       404 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292815,10294812] EXCISED REGION [10294814,10295217]
 second seq =>  [       1,    1998] EXCISED REGION [    2000,    2403]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10294813,10294813]
 second seq =>         1 nucs [1999,1999]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1999,1999] to [2000,2000]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292815 TACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAACATTTTTAAATATATGAAATTCTGTATTTCTT 10292874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAACATTTTTAAATATATGAAATTCTGTATTTCTT 60

 10292875 TAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCAAATCTGCTTC 10292934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCAAATCTGCTTC 120

 10292935 ATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTCCAAAGAAGT 10292994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTCCAAAGAAGT 180

 10292995 TTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAA 10293054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAA 240

 10293055 AATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACTTTCTG 10293114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACTTTCTG 300

 10293115 GTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAA 10293174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAA 360

 10293175 CTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTT 10293234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTT 420

 10293235 CCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTA 10293294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTA 480

 10293295 GTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATC 10293354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATC 540

 10293355 TTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTC 10293414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTC 600

 10293415 CTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGG 10293474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGG 660

 10293475 ACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAG 10293534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAG 720

 10293535 ACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCG 10293594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCG 780

 10293595 AGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACA 10293654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACA 840

 10293655 CCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCT 10293714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCT 900

 10293715 GCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGC 10293774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGC 960

 10293775 TGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTG 10293834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTG 1020

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 1080

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 1140

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 1200

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 1260

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 1320

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 1380

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 1440

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 10294314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 1500

 10294315 ATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTT 10294374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTT 1560

 10294375 TGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACAT 10294434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACAT 1620

 10294435 GGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTG 10294494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTG 1680

 10294495 TAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGT 10294554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGT 1740

 10294555 TGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTC 10294614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTC 1800

 10294615 TCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGC 10294674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGC 1860

 10294675 CTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATT 10294734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATT 1920

 10294735 ATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAA 10294794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAA 1980

 10294795 GGGATAGGACAAGCTTTC 10294812
          ||||||||||||||||||
     1981 GGGATAGGACAAGCTTTC 1998

EXCISED REGION

 10294814 GAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTG 10294873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 GAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTG 2059

 10294874 AACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAA 10294933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 AACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAA 2119

 10294934 ATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAA 10294993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 ATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAA 2179

 10294994 AAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAAT 10295053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 AAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAAT 2239

 10295054 ATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGT 10295113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGT 2299

 10295114 AACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGAT 10295173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 AACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGAT 2359

 10295174 GTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTG 10295217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTG 2403

Alignment time is 1.82461 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2308] =>      2308 nucs 'mol-32-220d-029722_2308'

Score:        2297
Aligned:      2308        nucs
Identic:      2307 (100%) nucs =>       198 (100%)      2109 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292546,10292743] EXCISED REGION [10292746,10294855]
 second seq =>  [       1,     198] EXCISED REGION [     199,    2308]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [10292744,10292745]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [10292744,10292759] to [10292746,10292761]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10292744,10292744] to [10292745,10292745]
 second seq =>         0 nucs

 10292546 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGAT 10292605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGAT 60

 10292606 GCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACC 10292665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACC 120

 10292666 CACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAA 10292725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAA 180

 10292726 GGACAGCAATCTTGATTC 10292743
          ||||||||||||||||||
      181 GGACAGCAATCTTGATTC 198

EXCISED REGION

 10292746 TTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAGAATTCTTTTAGGTTGTAATATTTTCATGTTAGTTT 10292805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      199 TTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAGAATTCTTTTAGGTTGTAATATTTTCATGTTAGTTT 258

 10292806 TTAATCATTTACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAACATTTTTAAATATATGAAATTCT 10292865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      259 TTAATCATTTACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAACATTTTTAAATATATGAAATTCT 318

 10292866 GTATTTCTTTAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCAA 10292925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 GTATTTCTTTAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCAA 378

 10292926 ATCTGCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTC 10292985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 ATCTGCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTC 438

 10292986 CAAAGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCC 10293045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 CAAAGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCC 498

 10293046 ATTTAGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTG 10293105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 ATTTAGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTG 558

 10293106 TACTTTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGG 10293165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 TACTTTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGG 618

 10293166 AATAAATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACT 10293225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 AATAAATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACT 678

 10293226 ATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATA 10293285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 ATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATA 738

 10293286 GAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTT 10293345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 GAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTT 798

 10293346 TTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAA 10293405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 TTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAA 858

 10293406 ATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTT 10293465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 ATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTT 918

 10293466 GGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGT 10293525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 GGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGT 978

 10293526 TTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAA 10293585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 TTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAA 1038

 10293586 CTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCA 10293645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 CTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCA 1098

 10293646 GCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGC 10293705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 GCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGC 1158

 10293706 TCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCT 10293765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 TCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCT 1218

 10293766 ACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCC 10293825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 ACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCC 1278

 10293826 TAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGG 10293885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 TAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGG 1338

 10293886 CTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTC 10293945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 CTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTC 1398

 10293946 TTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGAT 10294005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 TTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGAT 1458

 10294006 TTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACA 10294065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACA 1518

 10294066 CTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGC 10294125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGC 1578

 10294126 CAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTG 10294185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 CAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTG 1638

 10294186 GCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAG 10294245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 GCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAG 1698

 10294246 AGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCT 10294305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 AGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCT 1758

 10294306 TGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATC 10294365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 TGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATC 1818

 10294366 CCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCT 10294425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 CCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCT 1878

 10294426 GGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGC 10294485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 GGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGC 1938

 10294486 ACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGA 10294545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 ACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGA 1998

 10294546 GACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGA 10294605
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1999 GACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGAGTGACAGAGTGA 2058

 10294606 GACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCT 10294665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 GACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCT 2118

 10294666 GGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGA 10294725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 GGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGA 2178

 10294726 TAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGT 10294785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGT 2238

 10294786 CAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTT 10294845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 CAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTT 2298

 10294846 AAATCAGCCC 10294855
          ||||||||||
     2299 AAATCAGCCC 2308

Alignment time is 1.76503 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2211] =>      2211 nucs 'mol-32-22b2-117977_2211'

Score:        2189
Aligned:      2213        nucs
Identic:      2210 (100%) nucs =>      1692 (100%)       518 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10290849,10292541] EXCISED REGION [10292544,10293063]
 second seq =>  [       1,    1693] EXCISED REGION [    1694,    2211]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [10292542,10292543]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [10292542,10292566] to [10292544,10292568]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10292542,10292542] to [10292543,10292543]
 second seq =>         0 nucs

 10290849 TCTTACCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGCCAGTTTGTTCCAAAAGAAAAC 10290908
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTACCTTAGTCATCCTAGTGGGAGAAGATAGGCGTGCCAGTTTGTTCCAAAAGAAAAC 60

 10290909 ACCCAAGCTCTAACCGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAGGGTAACTAGGACTGAAACTTT 10290968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCAAGCTCTAACCGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAGGGTAACTAGGACTGAAACTTT 120

 10290969 CCCTGGAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAGGAAGGGATGCCAGGAAGAAAA 10291028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCTGGAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAGGAAGGGATGCCAGGAAGAAAA 180

 10291029 TTCACATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCGGCAGTTCCATTTCTATGATGA 10291088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCACATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCGGCAGTTCCATTTCTATGATGA 240

 10291089 AAATGTGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTACTTTACATGAAATAACTCATTT 10291148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATGTGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTACTTTACATGAAATAACTCATTT 300

 10291149 AATCTTCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTTACTATTATCCAATTTTATGAA 10291208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCTTCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTTACTATTATCCAATTTTATGAA 360

 10291209 TGCAGAAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAAAGCCAGAACTACTAGGAGGCA 10291268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCAGAAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAAAGCCAGAACTACTAGGAGGCA 420

 10291269 AAACCAAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCACACTTTATCTATTTTTGTAGA 10291328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACCAAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCACACTTTATCTATTTTTGTAGA 480

 10291329 AATGGGGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTAGTGCAATCATAGCTCACTGGA 10291388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGGGGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTAGTGCAATCATAGCTCACTGGA 540

 10291389 ACCTCAAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAACTTGCTGGGATTA 10291448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTCAAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAACTTGCTGGGATTA 600

 10291449 CAGGAGTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCTAACTTTTCTACTACTAAAATT 10291508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGGAGTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCTAACTTTTCTACTACTAAAATT 660

 10291509 TACTGCCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAATGCAAAAATCTGGCTAGAACA 10291568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACTGCCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAATGCAAAAATCTGGCTAGAACA 720

 10291569 ATTCATCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAAATAACAAAATTATCTAACCAT 10291628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCATCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAAATAACAAAATTATCTAACCAT 780

 10291629 GAGATTAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATATTAAAATGATAAAAACATTTTG 10291688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGATTAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATATTAAAATGATAAAAACATTTTG 840

 10291689 TAGTTAATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAAGTTGTCCCTGGAATAACTCAA 10291748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGTTAATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAAGTTGTCCCTGGAATAACTCAA 900

 10291749 GGGTTAGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTACATATAACTTATGACTCCCCAA 10291808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGTTAGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTACATATAACTTATGACTCCCCAA 960

 10291809 AAAACTTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCCTTACAGATAACATAAATGGTA 10291868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAACTTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCCTTACAGATAACATAAATGGTA 1020

 10291869 GATTAATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAATGTATTCTACAATAAAGCAGA 10291928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATTAATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAATGTATTCTACAATAAAGCAGA 1080

 10291929 CTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAAACACAGTTACTATTAAGTGGA 10291988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAAACACAGTTACTATTAAGTGGA 1140

 10291989 AGCAGATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCATGTTGAGTAGGCTGAGGAGGA 10292048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCAGATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCATGTTGAGTAGGCTGAGGAGGA 1200

 10292049 GGAAGAGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCAGAGGCAGAAAAAAATGTGTAT 10292108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAAGAGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCAGAGGCAGAAAAAAATGTGTAT 1260

 10292109 AAGTGGACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAGTCAACTGTATATAGAACATGG 10292168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGTGGACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAGTCAACTGTATATAGAACATGG 1320

 10292169 AAAGCTTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACAGCTTATATAAATGGATAGATG 10292228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGCTTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACAGCTTATATAAATGGATAGATG 1380

 10292229 CTATAAACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATC 10292288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTATAAACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATC 1440

 10292289 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGATTGAGACCATTGTG 10292348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGATTGAGACCATTGTG 1500

 10292349 GCTAACACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTTAGCCAAGCCTGGTG 10292408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTAACACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTTAGCCAAGCCTGGTG 1560

 10292409 GCGGGGGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGG 10292468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCGGGGGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGG 1620

 10292469 GAGGCGGACCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC 10292528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGGCGGACCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC 1680

 10292529 AAGACTCTGTCTC 10292541
          |||||||||||||
     1681 AAGACTCTGTCTC 1693

EXCISED REGION

 10292544 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGG 10292603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGG 1753

 10292604 ATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTA 10292663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 ATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTA 1813

 10292664 CCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACC 10292723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 CCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACC 1873

 10292724 AAGGACAGCAATCTTGATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAGAATTCTTTTAGGT 10292783
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 AAGGACAGCAATCTTGATTC--TTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAGAATTCTTTTAGGT 1931

 10292784 TGTAATATTTTCATGTTAGTTTTTAATCATTTACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAAC 10292843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 TGTAATATTTTCATGTTAGTTTTTAATCATTTACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAAC 1991

 10292844 ATTTTTAAATATATGAAATTCTGTATTTCTTTAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGA 10292903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 ATTTTTAAATATATGAAATTCTGTATTTCTTTAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGA 2051

 10292904 AACGTAAGAATACAAAAATCAAATCTGCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATG 10292963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 AACGTAAGAATACAAAAATCAAATCTGCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATG 2111

 10292964 CACATCATAACATTAACTTTTCCAAAGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTG 10293023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CACATCATAACATTAACTTTTCCAAAGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTG 2171

 10293024 TTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAAAATCAAGAC 10293063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAAAATCAAGAC 2211

Alignment time is 1.6816 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2591] =>      2591 nucs 'mol-32-23a4-056965_2591'

Score:        2343
Aligned:      2595        nucs
Identic:      2568 ( 99%) nucs =>       142 (100%)      2426 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292587,10292728] EXCISED REGION [10293835,10296284]
 second seq =>  [       1,     142] EXCISED REGION [     143,    2591]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292587 CATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAG 10292646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAG 60

 10292647 CAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGA 10292706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGA 120

 10292707 GTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 10292728
          ||||||||||||||||||||||
      121 GTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 142

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      143 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 202

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      203 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 262

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      263 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 322

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      323 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 382

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 442

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 502

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      503 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 562

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      563 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 622

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 682

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 742

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      743 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 802

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 862

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      863 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 922

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 978

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1038

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1039 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1098

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1099 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1158

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1159 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1218

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1278

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1338

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1398

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1399 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1458

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1518

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1578

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1638

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1698

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1758

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1818

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1878

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1938

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 1998

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2058

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2118

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2178

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2238

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2298

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2358

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2359 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2418

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2478

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGG 10296231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2479 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACGTAGGAGGTGG 2538

 10296232 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGC 10296284
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGC 2591

Alignment time is 1.98203 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4989] =>      4989 nucs 'mol-32-23af-090946_4989'

Score:        4989
Aligned:      4989        nucs
Identic:      4989 (100%) nucs =>      2970 (100%)      2019 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10289774,10292743] EXCISED REGION [10292745,10294763]
 second seq =>  [       1,    2970] EXCISED REGION [    2971,    4989]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10292744,10292744]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [10292744,10292760] to [10292745,10292761]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10289774 CAAGCAGATGTCATTAACTATACAGATTTTTTTTTCCACTTAAAAACTTGCCACAAAACC 10289833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAGCAGATGTCATTAACTATACAGATTTTTTTTTCCACTTAAAAACTTGCCACAAAACC 60

 10289834 ACTTATTTTCTTTAAACAAGAATCTTCCATTTTAAGTTCTTAAACCTATATTTTAAATTA 10289893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTATTTTCTTTAAACAAGAATCTTCCATTTTAAGTTCTTAAACCTATATTTTAAATTA 120

 10289894 CTATAAGGACAGAATGTTTGCTTGAAGAAAAAAAATAGAGAGATGTCAAGTTCCCAAACA 10289953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATAAGGACAGAATGTTTGCTTGAAGAAAAAAAATAGAGAGATGTCAAGTTCCCAAACA 180

 10289954 ATTTGTTTTCTTCAAATCATGGTATTAGTGAACCTTGTAAATTATTAATACAGTACACAA 10290013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTGTTTTCTTCAAATCATGGTATTAGTGAACCTTGTAAATTATTAATACAGTACACAA 240

 10290014 AAAGCTACAATGGATCAACGAAAAAGATGACATTTATAGAATGGTGTCATCAGTGGAAAA 10290073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGCTACAATGGATCAACGAAAAAGATGACATTTATAGAATGGTGTCATCAGTGGAAAA 300

 10290074 TAGCCCTTTCCAGAAACAACACAAATTCTTTCTCCTAACTCAGTCTGTTAGGAAAATCAC 10290133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGCCCTTTCCAGAAACAACACAAATTCTTTCTCCTAACTCAGTCTGTTAGGAAAATCAC 360

 10290134 CAAAAGCCCTTCAACTGTCTACTCAATAAACAATCAGTAAATAATTGTTTACTTCCCAGT 10290193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAAAGCCCTTCAACTGTCTACTCAATAAACAATCAGTAAATAATTGTTTACTTCCCAGT 420

 10290194 GTGTAAAGCATTCTGCTAAAAAAGTAGTAGTCTCTCTGTTGAAAGGACATTTTTTCCAGT 10290253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTAAAGCATTCTGCTAAAAAAGTAGTAGTCTCTCTGTTGAAAGGACATTTTTTCCAGT 480

 10290254 TTCAAAAGTTTCTCTACGGATAGCATACTGTGATATATTTGGGCCATGCTCTCAAGGAAC 10290313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCAAAAGTTTCTCTACGGATAGCATACTGTGATATATTTGGGCCATGCTCTCAAGGAAC 540

 10290314 TCTTTTTCAGTCTAAAAAAATTAGACAAATGTAAACGGAAAGACCTTGAAATTTTCAGAA 10290373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTTTCAGTCTAAAAAAATTAGACAAATGTAAACGGAAAGACCTTGAAATTTTCAGAA 600

 10290374 CTCCAATTCCTTGTTTCAAACATTTCTAGGACACAGTAAAGACCAAAGACAAGCAGCAAA 10290433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCAATTCCTTGTTTCAAACATTTCTAGGACACAGTAAAGACCAAAGACAAGCAGCAAA 660

 10290434 ATGTTTCAGAGATGTAATCTGAAGGTCTGATCTCTCTGAACCAGCCCCTTAGCATCTTCG 10290493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTTTCAGAGATGTAATCTGAAGGTCTGATCTCTCTGAACCAGCCCCTTAGCATCTTCG 720

 10290494 TCTTCATGAAGCTATGCAGTTTCCTCTGTTGTTTCTTAAGCAATACCTCATTAAGTGATT 10290553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTCATGAAGCTATGCAGTTTCCTCTGTTGTTTCTTAAGCAATACCTCATTAAGTGATT 780

 10290554 TTTTTTTCCTAATTAAAATCTCCCTGAAGGAAGTAGGTATACTCCCATACTACTACTGAG 10290613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTTCCTAATTAAAATCTCCCTGAAGGAAGTAGGTATACTCCCATACTACTACTGAG 840

 10290614 AGTATAAACTGACACATCTTTCTGCAAGGCATTTTAGCAATATACCTCAAAACTATTCAA 10290673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTATAAACTGACACATCTTTCTGCAAGGCATTTTAGCAATATACCTCAAAACTATTCAA 900

 10290674 AATGTTCTTTTGGCTTTCAGAAACAGCTGGAACCAGAAGTTTAGATAATGTTTCCAGAGC 10290733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATGTTCTTTTGGCTTTCAGAAACAGCTGGAACCAGAAGTTTAGATAATGTTTCCAGAGC 960

 10290734 TATGTCTGTCTTTTCATTTTTTGACTATCCTTGCCTCAGCTTGTGTTCAATACTCAGAGA 10290793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGTCTGTCTTTTCATTTTTTGACTATCCTTGCCTCAGCTTGTGTTCAATACTCAGAGA 1020

 10290794 CTCTCTAAACACAGTAAGGAAAACACACACTGGCAGCCTCAACTTAATCACAGTATCTTA 10290853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCTCTAAACACAGTAAGGAAAACACACACTGGCAGCCTCAACTTAATCACAGTATCTTA 1080

 10290854 CCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGCCAGTTTGTTCCAAAAGAAAACACCCA 10290913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGCCAGTTTGTTCCAAAAGAAAACACCCA 1140

 10290914 AGCTCTAACCGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAGGGTAACTAGGACTGAAACTTTCCCTG 10290973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCTCTAACCGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAGGGTAACTAGGACTGAAACTTTCCCTG 1200

 10290974 GAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAGGAAGGGATGCCAGGAAGAAAATTCAC 10291033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAGGAAGGGATGCCAGGAAGAAAATTCAC 1260

 10291034 ATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCGGCAGTTCCATTTCTATGATGAAAATG 10291093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCGGCAGTTCCATTTCTATGATGAAAATG 1320

 10291094 TGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTACTTTACATGAAATAACTCATTTAATCT 10291153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTACTTTACATGAAATAACTCATTTAATCT 1380

 10291154 TCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTTACTATTATCCAATTTTATGAATGCAG 10291213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTTACTATTATCCAATTTTATGAATGCAG 1440

 10291214 AAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAAAGCCAGAACTACTAGGAGGCAAAACC 10291273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAAAGCCAGAACTACTAGGAGGCAAAACC 1500

 10291274 AAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCACACTTTATCTATTTTTGTAGAAATGG 10291333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCACACTTTATCTATTTTTGTAGAAATGG 1560

 10291334 GGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTAGTGCAATCATAGCTCACTGGAACCTC 10291393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTAGTGCAATCATAGCTCACTGGAACCTC 1620

 10291394 AAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAACTTGCTGGGATTACAGGA 10291453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAACTTGCTGGGATTACAGGA 1680

 10291454 GTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCTAACTTTTCTACTACTAAAATTTACTG 10291513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCTAACTTTTCTACTACTAAAATTTACTG 1740

 10291514 CCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAATGCAAAAATCTGGCTAGAACAATTCA 10291573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAATGCAAAAATCTGGCTAGAACAATTCA 1800

 10291574 TCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAAATAACAAAATTATCTAACCATGAGAT 10291633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAAATAACAAAATTATCTAACCATGAGAT 1860

 10291634 TAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATATTAAAATGATAAAAACATTTTGTAGTT 10291693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATATTAAAATGATAAAAACATTTTGTAGTT 1920

 10291694 AATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAAGTTGTCCCTGGAATAACTCAAGGGTT 10291753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAAGTTGTCCCTGGAATAACTCAAGGGTT 1980

 10291754 AGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTACATATAACTTATGACTCCCCAAAAAAC 10291813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTACATATAACTTATGACTCCCCAAAAAAC 2040

 10291814 TTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCCTTACAGATAACATAAATGGTAGATTA 10291873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCCTTACAGATAACATAAATGGTAGATTA 2100

 10291874 ATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAATGTATTCTACAATAAAGCAGACTAGA 10291933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAATGTATTCTACAATAAAGCAGACTAGA 2160

 10291934 GAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAAACACAGTTACTATTAAGTGGAAGCAG 10291993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAAACACAGTTACTATTAAGTGGAAGCAG 2220

 10291994 ATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCATGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAGGAAG 10292053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCATGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAGGAAG 2280

 10292054 AGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCAGAGGCAGAAAAAAATGTGTATAAGTG 10292113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCAGAGGCAGAAAAAAATGTGTATAAGTG 2340

 10292114 GACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAGTCAACTGTATATAGAACATGGAAAGC 10292173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAGTCAACTGTATATAGAACATGGAAAGC 2400

 10292174 TTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACAGCTTATATAAATGGATAGATGCTATA 10292233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACAGCTTATATAAATGGATAGATGCTATA 2460

 10292234 AACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 10292293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 2520

 10292294 ACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGATTGAGACCATTGTGGCTAA 10292353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGATTGAGACCATTGTGGCTAA 2580

 10292354 CACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTTAGCCAAGCCTGGTGGCGGG 10292413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTTAGCCAAGCCTGGTGGCGGG 2640

 10292414 GGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 10292473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 2700

 10292474 GGACCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 10292533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGACCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 2760

 10292534 TCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATAT 10292593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATAT 2820

 10292594 ACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATG 10292653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATG 2880

 10292654 CCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAA 10292713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAA 2940

 10292714 TTGCAAAACCAAGGACAGCAATCTTGATTC 10292743
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGCAAAACCAAGGACAGCAATCTTGATTC 2970

EXCISED REGION

 10292745 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAGAATTCTTTTAGGTTGTAATATTTTCATGTTAGTT 10292804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAGAATTCTTTTAGGTTGTAATATTTTCATGTTAGTT 3030

 10292805 TTTAATCATTTACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAACATTTTTAAATATATGAAATTC 10292864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 TTTAATCATTTACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAACATTTTTAAATATATGAAATTC 3090

 10292865 TGTATTTCTTTAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCA 10292924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TGTATTTCTTTAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCA 3150

 10292925 AATCTGCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTT 10292984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 AATCTGCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTT 3210

 10292985 CCAAAGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCC 10293044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 CCAAAGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCC 3270

 10293045 CATTTAGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTT 10293104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 CATTTAGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTT 3330

 10293105 GTACTTTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATG 10293164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 GTACTTTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATG 3390

 10293165 GAATAAATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAAC 10293224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 GAATAAATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAAC 3450

 10293225 TATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTAT 10293284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTAT 3510

 10293285 AGAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTT 10293344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 AGAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTT 3570

 10293345 TTTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAA 10293404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 TTTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAA 3630

 10293405 AATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTT 10293464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 AATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTT 3690

 10293465 TGGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTG 10293524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 TGGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTG 3750

 10293525 TTTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAA 10293584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 TTTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAA 3810

 10293585 ACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCC 10293644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 ACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCC 3870

 10293645 AGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAG 10293704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 AGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAG 3930

 10293705 CTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTC 10293764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 CTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTC 3990

 10293765 TACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTC 10293824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 TACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTC 4050

 10293825 CTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAG 10293884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 CTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAG 4110

 10293885 GCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTT 10293944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 GCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTT 4170

 10293945 CTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGA 10294004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 CTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGA 4230

 10294005 TTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCAC 10294064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 TTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCAC 4290

 10294065 ACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAG 10294124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 ACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAG 4350

 10294125 CCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGT 10294184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 CCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGT 4410

 10294185 GGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCA 10294244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 GGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCA 4470

 10294245 GAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACC 10294304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 GAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACC 4530

 10294305 TTGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAAT 10294364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 TTGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAAT 4590

 10294365 CCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCC 10294424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 CCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCC 4650

 10294425 TGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGG 10294484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 TGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGG 4710

 10294485 CACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGG 10294544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 CACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGG 4770

 10294545 AGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTG 10294604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 AGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTG 4830

 10294605 AGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCC 10294664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 AGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCC 4890

 10294665 TGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTG 10294724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 TGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTG 4950

 10294725 ATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACA 10294763
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 ATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACA 4989

Alignment time is 3.7057 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3123] =>      3123 nucs 'mol-32-29b3-080314_3123'

Score:        3123
Aligned:      3123        nucs
Identic:      3123 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292989,10296111]
 second seq =>  [       1,    3123]

 10292989 AGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATT 10293048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATT 60

 10293049 TAGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTAC 10293108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTAC 120

 10293109 TTTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAAT 10293168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAAT 180

 10293169 AAATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATT 10293228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATT 240

 10293229 TTCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAA 10293288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAA 300

 10293289 ATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTG 10293348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTG 360

 10293349 TTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATT 10293408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATT 420

 10293409 CTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGC 10293468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGC 480

 10293469 TATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTT 10293528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTT 540

 10293529 CTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTT 10293588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTT 600

 10293589 CTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCT 10293648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCT 660

 10293649 GGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCT 10293708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCT 720

 10293709 GCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACC 10293768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACC 780

 10293769 AAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAG 10293828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAG 840

 10293829 GGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTT 10293888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTT 900

 10293889 ACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTC 10293948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTC 960

 10293949 AATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTC 10294008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTC 1020

 10294009 ACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTG 10294068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTG 1080

 10294069 GCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAG 10294128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAG 1140

 10294129 GGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCA 10294188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCA 1200

 10294189 TGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGG 10294248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGG 1260

 10294249 CTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGT 10294308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGT 1320

 10294309 CTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCA 10294368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCA 1380

 10294369 GCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGC 10294428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGC 1440

 10294429 CAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACA 10294488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACA 1500

 10294489 TGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGAC 10294548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGAC 1560

 10294549 AGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 10294608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 1620

 10294609 TCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGA 10294668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGA 1680

 10294669 GTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAA 10294728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAA 1740

 10294729 CTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAA 10294788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAA 1800

 10294789 ATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAA 10294848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAA 1860

 10294849 TCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAA 10294908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAA 1920

 10294909 CATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACA 10294968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACA 1980

 10294969 GAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTAT 10295028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTAT 2040

 10295029 TTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTAT 10295088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTAT 2100

 10295089 GAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGT 10295148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGT 2160

 10295149 GGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTT 10295208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTT 2220

 10295209 CTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGAT 10295268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGAT 2280

 10295269 AAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGA 10295328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGA 2340

 10295329 CATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAAT 10295388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAAT 2400

 10295389 AGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAG 10295448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAG 2460

 10295449 ATGACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGA 10295508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGA 2520

 10295509 CTACAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTAT 10295568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTACAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTAT 2580

 10295569 TCTCTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCA 10295628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTCTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCA 2640

 10295629 GCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTT 10295688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTT 2700

 10295689 AAGAAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTC 10295748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGAAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTC 2760

 10295749 AAGCCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAG 10295808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGCCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAG 2820

 10295809 GGTTTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCAT 10295868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGTTTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCAT 2880

 10295869 CGTGACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTT 10295928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CGTGACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTT 2940

 10295929 TAAAATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTT 10295988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAAAATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTT 3000

 10295989 CATTTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCA 10296048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCA 3060

 10296049 TCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 10296108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 3120

 10296109 CCA 10296111
          |||
     3121 CCA 3123

Alignment time is 2.06144 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6848] =>      6848 nucs 'mol-32-2dff-055292_6848'

Score:        6512
Aligned:      6854        nucs
Identic:      6818 ( 99%) nucs =>      5666 (100%)      1152 ( 98%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10287048,10292728] EXCISED REGION [10293835,10295004]
 second seq =>  [       1,    5679] EXCISED REGION [    5680,    6848]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10287048 GGGAGAGGTGGGGGGGTATCAACACAGGGTATCTTTTTAAAATATGTCAATGAATATACA 10287107
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGAGAGGTGGGGGGGGATCAACACAGGGTATCTTTTTAAAATATGTCAATGAATATACA 60

 10287108 AACATACAGTCAATATAAAAAATCTAGAGAACTCAATGAAAACCACATGCAGCTTAAATT 10287167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACATACAGTCAATATAAAAAATCTAGAGAACTCAATGAAAACCACATGCAGCTTAAATT 120

 10287168 CTGTGAAACACGCCTAAATATTATGGACTTATGTGAAGAACATATATGCACCTATGTAAA 10287227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTGAAACACGCCTAAATATTATGGACTTATGTGAAGAACATATATGCACCTATGTAAA 180

 10287228 TAATAATAGCTGCCTTCTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTACA 10287287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATAATAGCTGCCTTCTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTTACCCAGGTTGGAGTACA 240

 10287288 AGTGGTGCAATCATGGCTCACCACAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGCACTCCTCCCTCC 10287347
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGGTGCAATCATGGCTCACCGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGCACTCCTCCCTCC 300

 10287348 TGCCTCAGCCTCTCAAGTAGATGGGATCACAGGTGCACACCACCAGGCCAGGCTAATTGT 10287407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCCTCAGCCTCTCAAGTAGATGGGATCACAGGTGCACACCACCAGGCCAGGCTAATTGT 360

 10287408 GTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCATGTGTGTGTGTGTTTTAGAGATGGGGGTCTCATTT 10287467
          |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGTGTGTGTGTG--CGCGCGCGCATGTGTGTGTGTGTTTTAGAGATGGGGGTCTCATTT 418

 10287468 TGTTGCCCAGGCTGGTTTTGAACTTCTAGCCTCAAGTGATCCTCTCACCTTGGTCTCCCA 10287527
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TGTTGCCCAGGCTGGTTTTGAACTTCTAGTCTCAAGTGATCCTCTCACCTTGGTCTCCCA 478

 10287528 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCAGCCCAACCTGCCATTTTTTTT 10287587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCAGCCCAACCTGCCATTTTTTTT 538

 10287588 AGTACTTTTTCGGCTAGGCAGAAGACCTTGCTTATCAGTTCATTTAATCCTCATAACAAT 10287647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 AGTACTTTTTCGGCTAGGCAGAAGACCTTGCTTATCAGTTCATTTAATCCTCATAACAAT 598

 10287648 CACATGAGGCAGCTACTACTCATACTTTTATCCCAGATTTACAGAGGATAAACTCAGCTC 10287707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CACATGAGGCAGCTACTACTCATACTTTTATCCCAGATTTACAGAGGATAAACTCAGCTC 658

 10287708 TGTAGTTAAATGATTTGTCCACAGCCACATTCCAATAGGTGGCTAAGCACAAACTCAGGT 10287767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TGTAGTTAAATGATTTGTCCACAGCCACATTCCAATAGGTGGCTAAGCACAAACTCAGGT 718

 10287768 TGTTTGACGCTAGAACTTAATGCTACTTGTGACCAGTCAATCGCCATGCTACCTCATACA 10287827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TGTTTGACGCTAGAACTTAATGCTACTTGTGACCAGTCAATCGCCATGCTACCTCATACA 778

 10287828 GACCCTCACTGCAGAATTACAGAGGAGAGGACACTATTTGTGCAATTAAAGACCTCTCGG 10287887
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      779 GACCCTCACTGCAGAATTACAGAGGAGAGGACACTATTTGTGCCATTAAAGACCTCTCGG 838

 10287888 CCAAGGACAGAGCACTGAGACTGTAAAGGACTAGGAGACACTGATCACTATGGGGAGGGG 10287947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CCAAGGACAGAGCACTGAGACTGTAAAGGACTAGGAGACACTGATCACTATGGGGAGGGG 898

 10287948 ATATCCCTGCATGCAGGACAACAGGACCCAGGCTAGATACGGGTAAATGCAGATTTCCTC 10288007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      899 ATATCCCTGCATGCAGGACAACAGGACCCAGGCTAGATACAGGTAAATGCAGATTTCCTC 958

 10288008 TGCTACTGACACTGTTTAGATACCGTGAGACATTCTGAGTATGAAGTTGAAGCTAGTAGC 10288067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TGCTACTGACACTGTTTAGATACCGTGAGACATTCTGAGTATGAAGTTGAAGCTAGTAGC 1018

 10288068 AAACTACTCAAAGATTAAATACAAAGTGACATAAACATTCCTTTTAAAAAAAAATTACTC 10288127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AAACTACTCAAAGATTAAATACAAAGTGACATAAACATTCCTTTTAAAAAAAAATTACTC 1078

 10288128 TGGTGGCAATATGGAACTAGCTAGAGAAGAATTTAACTGAAAGCAAGGAAATAAAGAGAT 10288187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TGGTGGCAATATGGAACTAGCTAGAGAAGAATTTAACTGAAAGCAAGGAAATAAAGAGAT 1138

 10288188 GTCTACACTTGATTAGTTATTTCCTAACAGCTATGATGATGATGACAGTGATGATGATGG 10288247
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1139 GTCTACACTTGATTAGTTATTTCCTAACAGCTATGATGATGATGACAATGATGATGATGG 1198

 10288248 TGATAACAGAAGCTCCAATTTTAACATGAGGGATATGGACCACATTTCCCAGGATAAGTT 10288307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TGATAACAGAAGCTCCAATTTTAACATGAGGGATATGGACCACATTTCCCAGGATAAGTT 1258

 10288308 TTGGCCAAAGGAAACGTAGTTGATTTTGGCCTTTAAACGGAAGAGGGTCCGGGCGTGGTT 10288367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TTGGCCAAAGGAAACGTAGTTGATTTTGGCCTTTAAACGGAAGAGGGTCCGGGCGTGGTT 1318

 10288368 GCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAAGCCGAGGCTGGCAGATGGTTTGAGGTCAG 10288427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 GCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAAGCCGAGGCTGGCAGATGGTTTGAGGTCAG 1378

 10288428 GAGTTCGAGACCAGCCTGGCCACCACAGTAAAACCCCGTCTCTACCGAAAATATAATACA 10288487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GAGTTCGAGACCAGCCTGGCCACCACAGTAAAACCCCGTCTCTACCGAAAATATAATACA 1438

 10288488 AAAATTAGCCAAGTGTAGTGGCACATGCCTTTAATCCCAGCTACTTAGAAGGCTGAGGCA 10288547
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 AAAATTAGCCAAGTGTGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAGCTACTTAGAAGGCTGAGGCA 1498

 10288548 GGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGATGAAGTTGCAATGGGCCGAGATCGTGCCACTGCAC 10288607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGATGAAGTTGCAATGGGCCGAGATCGTGCCACTGCAC 1558

 10288608 TCCAGCCTGGGTGACAGTGAGACTCCATCTCAAAAATAAATTAAATTAAATTAAATTACA 10288667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TCCAGCCTGGGTGACAGTGAGACTCCATCTCAAAAATAAATTAAATTAAATTAAATTACA 1618

 10288668 TTAAATTAAATTAAAAAGGGAAGGGGGCTATCTCTTCTTCCCTACTTCCTCCATCCTCCT 10288727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TTAAATTAAATTAAAAAGGGAAGGGGGCTATCTCTTCTTCCCTACTTCCTCCATCCTCCT 1678

 10288728 ACTTGGAATATAGATGGGATGGAGCTGAGATGCTAAGTACAAAGCTAGAAGCAGCCTGGT 10288787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ACTTGGAATATAGATGGGATGGAGCTGAGATGCTAAGTACAAAGCTAGAAGCAGCCTGGT 1738

 10288788 CCAGATGGCTATACAAACCCGAAACTGTCTACACCCAGACTTTAACTTTTAAAGAAATAA 10288847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CCAGATGGCTATACAAACCCGAAACTGTCTACACCCAGACTTTAACTTTTAAAGAAATAA 1798

 10288848 GTTTCTATATTGTTTGAGACACTTAAGTCCCTATTACTGGAAGCCAAACCTCTATCCTAA 10288907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GTTTCTATATTGTTTGAGACACTTAAGTCCCTATTACTGGAAGCCAAACCTCTATCCTAA 1858

 10288908 CAGAGTGCACTTTATAGTAATCCGAGTAAGAACTGATAAGGGCCTAAACTATGGCAGTGA 10288967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CAGAGTGCACTTTATAGTAATCCGAGTAAGAACTGATAAGGGCCTAAACTATGGCAGTGA 1918

 10288968 CTGTGAAAACAGAGGAAAAAAAAGATGTGAGAAAATTTTGAGGGAAAAAAAAACAACACT 10289027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTGTGAAAACAGAGGAAAAAAAAGATGTGAGAAAATTTTGAGGGAAAAAAAAACAACACT 1978

 10289028 TTGAAGTGAAGGTGAGAGAGAAAGGAGTGTGGCAAGTTTCTGACTTGAGCGAATGGCCAA 10289087
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTAAAGTGAAGGTGAGAGAGAAAGGAGTGTGGCAAGTTTCTGACTTGAGCGAATGGCCAA 2038

 10289088 GGGGAAGAGGTTTGAATGAGCCAGATATGCTTGAACATGCTGCATTTTCTTTTCTTTCTT 10289147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2039 GGGGAAGAGGTTTGAATGAGCCAGATATGCTTGAACATGCTGAATTTTCTTTTCTTTCTT 2098

 10289148 TTTTTTTGAGACAGGGTCTTACTCCTACTTGGAATATAGATGGGATGGAGCTGAGTGGCT 10289207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTTTTTTGAGACAGGGTCTTACTCCTACTTGGAATATAGATGGGATGGAGCTGAGTGGCT 2158

 10289208 AAGTACAAAGCTAGAAGCAGCCTGGTCCAGATGGCTATACAAACCCGAAACTGTCTACAC 10289267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AAGTACAAAGCTAGAAGCAGCCTGGTCCAGATGGCTATACAAACCCGAAACTGTCTACAC 2218

 10289268 CCAGACTTTATTCTTCTACAACCAAATTCCTCAAACACACAATCTGAACAGTAGCAGTGA 10289327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCAGACTTTATTCTTCTACAACCAAATTCCTCAAACACACAATCTGAACAGTAGCAGTGA 2278

 10289328 AAGGGAGTTTAAGGTGGGGGTGAGGGAGAAGGGAGTAATATGGTTTTTTAGTAATATAGT 10289387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AAGGGAGTTTAAGGTGGGGGTGAGGGAGAAGGGAGTAATATGGTTTTTTAGTAATATAGT 2338

 10289388 AATTTACATTTTCAAAAATCTTCAGTGTTTCACTATCTTAAATGAATATTTATTCTGTTG 10289447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AATTTACATTTTCAAAAATCTTCAGTGTTTCACTATCTTAAATGAATATTTATTCTGTTG 2398

 10289448 TTCCTCTCATTTCTTTCCTCCTGTTAAAAAAATGACTTTTATTAACTCCAATCTCATGTG 10289507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTCCTCTCATTTCTTTCCTCCTGTTAAAAAAATGACTTTTATTAACTCCAATCTCATGTG 2458

 10289508 GATTTGGGTTTACTCACGCTAAGATTTGGTAAAACATCTGTCTCCAAAGAAAAACAAGTA 10289567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GATTTGGGTTTACTCACGCTAAGATTTGGTAAAACATCTGTCTCCAAAGAAAAACAAGTA 2518

 10289568 ACATTCTTTTCAAATTCCCTAGAAGACCGCGTAGGACAAGTATATGAAGCATTTATAAAA 10289627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ACATTCTTTTCAAATTCCCTAGAAGACCGCGTAGGACAAGTATATGAAGCATTTATAAAA 2578

 10289628 TTCACTCCAGTCCCAACTGCTACTTTCCACTGTGAATTAATTTTCATACTATTATTGTCC 10289687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TTCACTCCAGTCCCAACTGCTACTTTCCACTGTGAATTAATTTTCATACTATTATTGTCC 2638

 10289688 AAGTTTGTTCTGACACTTGATTTCTCTCTGTAAATGTTACTAGAATTAACTTAAGCTAGG 10289747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AAGTTTGTTCTGACACTTGATTTCTCTCTGTAAATGTTACTAGAATTAACTTAAGCTAGG 2698

 10289748 AAAAACAAAGGACATAGTTTTACCTACAAGCAGATGTCATTAACTATACAGATTTTTTTT 10289807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AAAAACAAAGGACATAGTTTTACCTACAAGCAGATGTCATTAACTATACAGATTTTTTTT 2758

 10289808 TCCACTTAAAAACTTGCCACAAAACCACTTATTTTCTTTAAACAAGAATCTTCCATTTTA 10289867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TCCACTTAAAAACTTGCCACAAAACCACTTATTTTCTTTAAACAAGAATCTTCCATTTTA 2818

 10289868 AGTTCTTAAACCTATATTTTAAATTACTATAAGGACAGAATGTTTGCTTGAAGAAAAAAA 10289927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AGTTCTTAAACCTATATTTTAAATTACTATAAGGACAGAATGTTTGCTTGAAGAAAAAAA 2878

 10289928 ATAGAGAGATGTCAAGTTCCCAAACAATTTGTTTTCTTCAAATCATGGTATTAGTGAACC 10289987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ATAGAGAGATGTCAAGTTCCCAAACAATTTGTTTTCTTCAAATCATGGTATTAGTGAACC 2938

 10289988 TTGTAAATTATTAATACAGTACACAAAAAGCTACAATGGATCAACGAAAAAGATGACATT 10290047
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TTGTAAATTATTAATACAGTACAAAAAAAGCTACAATGGATCAACGAAAAAGATGACATT 2998

 10290048 TATAGAATGGTGTCATCAGTGGAAAATAGCCCTTTCCAGAAACAACACAAATTCTTTCTC 10290107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TATAGAATGGTGTCATCAGTGGAAAATAGCCCTTTCCAGAAACAACACAAATTCTTTCTC 3058

 10290108 CTAACTCAGTCTGTTAGGAAAATCACCAAAAGCCCTTCAACTGTCTACTCAATAAACAAT 10290167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTAACTCAGTCTGTTAGGAAAATCACCAAAAGCCCTTCAACTGTCTACTCAATAAACAAT 3118

 10290168 CAGTAAATAATTGTTTACTTCCCAGTGTGTAAAGCATTCTGCTAAAAAAGTAGTAGTCTC 10290227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CAGTAAATAATTGTTTACTTCCCAGTGTGTAAAGCATTCTGCTAAAAAAGTAGTAGTCTC 3178

 10290228 TCTGTTGAAAGGACATTTTTTCCAGTTTCAAAAGTTTCTCTACGGATAGCATACTGTGAT 10290287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCTGTTGAAAGGACATTTTTTCCAGTTTCAAAAGTTTCTCTACGGATAGCATACTGTGAT 3238

 10290288 ATATTTGGGCCATGCTCTCAAGGAACTCTTTTTCAGTCTAAAAAAATTAGACAAATGTAA 10290347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ATATTTGGGCCATGCTCTCAAGGAACTCTTTTTCAGTCTAAAAAAATTAGACAAATGTAA 3298

 10290348 ACGGAAAGACCTTGAAATTTTCAGAACTCCAATTCCTTGTTTCAAACATTTCTAGGACAC 10290407
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 ACGGAAAGACCTTGAAATTTTCACAACTCCAATTCCTTGTTTCAAACATTTCTAGGACAC 3358

 10290408 AGTAAAGACCAAAGACAAGCAGCAAAATGTTTCAGAGATGTAATCTGAAGGTCTGATCTC 10290467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AGTAAAGACCAAAGACAAGCAGCAAAATGTTTCAGAGATGTAATCTGAAGGTCTGATCTC 3418

 10290468 TCTGAACCAGCCCCTTAGCATCTTCGTCTTCATGAAGCTATGCAGTTTCCTCTGTTGTTT 10290527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TCTGAACCAGCCCCTTAGCATCTTCGTCTTCATGAAGCTATGCAGTTTCCTCTGTTGTTT 3478

 10290528 CTTAAGCAATACCTCATTAAGTGATTTTTTTTTCCTAATTAAAATCTCCCTGAAGGAAGT 10290587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CTTAAGCAATACCTCATTAAGTGATTTTTTTTTCCTAATTAAAATCTCCCTGAAGGAAGT 3538

 10290588 AGGTATACTCCCATACTACTACTGAGAGTATAAACTGACACATCTTTCTGCAAGGCATTT 10290647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AGGTATACTCCCATACTACTACTGAGAGTATAAACTGACACATCTTTCTGCAAGGCATTT 3598

 10290648 TAGCAATATACCTCAAAACTATTCAAAATGTTCTTTTGGCTTTCAGAAACAGCTGGAACC 10290707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TAGCAATATACCTCAAAACTATTCAAAATGTTCTTTTGGCTTTCAGAAACAGCTGGAACC 3658

 10290708 AGAAGTTTAGATAATGTTTCCAGAGCTATGTCTGTCTTTTCATTTTTTGACTATCCTTGC 10290767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 AGAAGTTTAGATAATGTTTCCAGAGCTATGTCTGTCTTTTCATTTTTTGACTATCCTTGC 3718

 10290768 CTCAGCTTGTGTTCAATACTCAGAGACTCTCTAAACACAGTAAGGAAAACACACACTGGC 10290827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 CTCAGCTTGTGTTCAATACTCAGAGACTCTCTAAACACAGTAAGGAAAACACACACTGGC 3778

 10290828 AGCCTCAACTTAATCACAGTATCTTACCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGC 10290887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AGCCTCAACTTAATCACAGTATCTTACCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGC 3838

 10290888 CAGTTTGTTCCAAAAGAAAACACCCAAGCTCTAACCGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAG 10290947
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3839 CAGTTTGTTCCAAAAGAAAACACCCAAGCTCTAACTGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAG 3898

 10290948 GGTAACTAGGACTGAAACTTTCCCTGGAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAG 10291007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GGTAACTAGGACTGAAACTTTCCCTGGAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAG 3958

 10291008 GAAGGGATGCCAGGAAGAAAATTCACATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCG 10291067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GAAGGGATGCCAGGAAGAAAATTCACATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCG 4018

 10291068 GCAGTTCCATTTCTATGATGAAAATGTGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTAC 10291127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GCAGTTCCATTTCTATGATGAAAATGTGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTAC 4078

 10291128 TTTACATGAAATAACTCATTTAATCTTCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTT 10291187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TTTACATGAAATAACTCATTTAATCTTCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTT 4138

 10291188 ACTATTATCCAATTTTATGAATGCAGAAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAA 10291247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 ACTATTATCCAATTTTATGAATGCAGAAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAA 4198

 10291248 AGCCAGAACTACTAGGAGGCAAAACCAAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCA 10291307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AGCCAGAACTACTAGGAGGCAAAACCAAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCA 4258

 10291308 CACTTTATCTATTTTTGTAGAAATGGGGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTA 10291367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 CACTTTATCTATTTTTGTAGAAATGGGGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTA 4318

 10291368 GTGCAATCATAGCTCACTGGAACCTCAAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAG 10291427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GTGCAATCATAGCTCACTGGAACCTCAAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAG 4378

 10291428 CCTCCCAACTTGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCT 10291487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CCTCCCAACTTGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCT 4438

 10291488 AACTTTTCTACTACTAAAATTTACTGCCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAA 10291547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AACTTTTCTACTACTAAAATTTACTGCCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAA 4498

 10291548 TGCAAAAATCTGGCTAGAACAATTCATCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAA 10291607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TGCAAAAATCTGGCTAGAACAATTCATCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAA 4558

 10291608 ATAACAAAATTATCTAACCATGAGATTAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATAT 10291667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 ATAACAAAATTATCTAACCATGAGATTAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATAT 4618

 10291668 TAAAATGATAAAAACATTTTGTAGTTAATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAA 10291727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TAAAATGATAAAAACATTTTGTAGTTAATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAA 4678

 10291728 GTTGTCCCTGGAATAACTCAAGGGTTAGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTAC 10291787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GTTGTCCCTGGAATAACTCAAGGGTTAGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTAC 4738

 10291788 ATATAACTTATGACTCCCCAAAAAACTTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCC 10291847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 ATATAACTTATGACTCCCCAAAAAACTTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCC 4798

 10291848 TTACAGATAACATAAATGGTAGATTAATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAA 10291907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TTACAGATAACATAAATGGTAGATTAATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAA 4858

 10291908 TGTATTCTACAATAAAGCAGACTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAA 10291967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TGTATTCTACAATAAAGCAGACTAGAGAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAA 4918

 10291968 ACACAGTTACTATTAAGTGGAAGCAGATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCA 10292027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ACACAGTTACTATTAAGTGGAAGCAGATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCA 4978

 10292028 TGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAGGAAGAGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCA 10292087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAGGAAGAGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCA 5038

 10292088 GAGGCAGAAAAAAATGTGTATAAGTGGACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAG 10292147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 GAGGCAGAAAAAAATGTGTATAAGTGGACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAG 5098

 10292148 TCAACTGTATATAGAACATGGAAAGCTTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACA 10292207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TCAACTGTATATAGAACATGGAAAGCTTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACA 5158

 10292208 GCTTATATAAATGGATAGATGCTATAAACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCG 10292267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 GCTTATATAAATGGATAGATGCTATAAACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCG 5218

 10292268 CGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGAT 10292327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGAT 5278

 10292328 CAGGAGATTGAGACCATTGTGGCTAACACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAA 10292387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CAGGAGATTGAGACCATTGTGGCTAACACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAA 5338

 10292388 AAAAGTTAGCCAAGCCTGGTGGCGGGGGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGC 10292447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AAAAGTTAGCCAAGCCTGGTGGCGGGGGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGC 5398

 10292448 AGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGACCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCA 10292507
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCA 5458

 10292508 CTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 10292567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 CTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 5518

 10292568 AGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAAT 10292627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 AGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAAT 5578

 10292628 ACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAA 10292687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 ACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAA 5638

 10292688 AAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 10292728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 AAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 5679

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5680 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 5739

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 5799

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 5859

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5860 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 5919

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 5979

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 6039

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6040 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 6099

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
     6100 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 6159

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 6219

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 6279

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6280 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 6339

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6340 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 6399

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6400 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 6459

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 6515

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6516 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 6575

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6576 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 6635

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6636 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 6695

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     6696 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 6755

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6756 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 6815

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATG 10295004
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     6816 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATG 6848

Alignment time is 5.04397 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3766] =>      3766 nucs 'mol-32-2e20-117701_3766'

Score:        3454
Aligned:      3767        nucs
Identic:      3732 ( 99%) nucs =>       180 (100%)      3552 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292549,10292728] EXCISED REGION [10293835,10297418]
 second seq =>  [       8,     187] EXCISED REGION [     188,    3766]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292549 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCA 10292608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCA 67

 10292609 CACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCAC 10292668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 CACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCAC 127

 10292669 TGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 10292728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 TGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 187

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      188 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 247

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 307

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 367

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      368 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 427

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 487

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 547

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      548 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 607

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      608 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 667

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 727

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 787

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      788 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 847

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 907

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      908 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 967

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 1023

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1083

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1084 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1143

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1144 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1203

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1204 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1263

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1323

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1383

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1443

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1444 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1503

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1563

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1623

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1683

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1743

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1803

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1863

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1923

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1983

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 2043

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2103

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2163

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2223

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2283

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2343

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2403

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2404 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2463

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2523

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGG 10296231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2524 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACGTAGGAGGTGG 2583

 10296232 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 10296291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 2643

 10296292 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 10296351
          ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CATCTC----AAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 2699

 10296352 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 10296411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 2759

 10296412 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 10296471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 2819

 10296472 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 10296531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 2879

 10296532 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 10296591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 2939

 10296592 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 10296651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 2999

 10296652 TCCAGAAACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 10296711
          |.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTCAGAAACTAAGTCTATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 3059

 10296712 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGA 10296771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3060 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAGAGAGAGAACACCAGA 3119

 10296772 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 10296831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 3179

 10296832 AGGTGTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 10296891
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AGGTCTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 3239

 10296892 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 10296951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 3299

 10296952 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 10297011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 3359

 10297012 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 10297071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 3419

 10297072 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 10297131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 3479

 10297132 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 10297191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 3539

 10297192 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 10297251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 3599

 10297252 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 10297311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 3659

 10297312 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 10297371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 3719

 10297372 TACTAGGTGACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATG 10297418
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TACTAGGTGACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATG 3766

Alignment time is 2.80401 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3024] =>      3024 nucs 'mol-32-2e20-138054_3024'

Score:        3012
Aligned:      3023        nucs
Identic:      3022 (100%) nucs =>      1312 (100%)      1710 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10293111,10294422] EXCISED REGION [10294424,10296134]
 second seq =>  [       1,    1312] EXCISED REGION [    1314,    3024]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10294423,10294423]
 second seq =>         1 nucs [1313,1313]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10294423,10294423] to [10294424,10294424]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10293111 TCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAA 10293170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAA 60

 10293171 ATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTT 10293230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTT 120

 10293231 CCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAAT 10293290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAAT 180

 10293291 CTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTT 10293350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTT 240

 10293351 TATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCT 10293410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCT 300

 10293411 ATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTA 10293470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTA 360

 10293471 TAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCT 10293530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCT 420

 10293531 TGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCT 10293590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCT 480

 10293591 CTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGG 10293650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGG 540

 10293651 AACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGC 10293710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGC 600

 10293711 AGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAA 10293770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAA 660

 10293771 GAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGG 10293830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGG 720

 10293831 GCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTAC 10293890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTAC 780

 10293891 TTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAA 10293950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAA 840

 10293951 TAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCAC 10294010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCAC 900

 10294011 CATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGC 10294070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGC 960

 10294071 TTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGG 10294130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGG 1020

 10294131 CAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATG 10294190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATG 1080

 10294191 TGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCT 10294250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCT 1140

 10294251 GCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCT 10294310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCT 1200

 10294311 TAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGC 10294370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGC 1260

 10294371 ACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAG 10294422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAG 1312

EXCISED REGION

 10294424 CTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTG 10294483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTG 1373

 10294484 GCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGG 10294543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 GCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGG 1433

 10294544 GAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGT 10294603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 GAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGT 1493

 10294604 GAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCC 10294663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 GAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCC 1553

 10294664 CTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTT 10294723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTT 1613

 10294724 GATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGA 10294783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGA 1673

 10294784 GTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAG 10294843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 GTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAG 1733

 10294844 TTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGC 10294903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGC 1793

 10294904 TTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATC 10294963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATC 1853

 10294964 AAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAA 10295023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAA 1913

 10295024 CTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTG 10295083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 CTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTG 1973

 10295084 TGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCA 10295143
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1974 TGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACGTCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCA 2033

 10295144 TGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTAT 10295203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTAT 2093

 10295204 CTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCT 10295263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 CTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCT 2153

 10295264 TGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAA 10295323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAA 2213

 10295324 ACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACA 10295383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 ACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACA 2273

 10295384 GGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAG 10295443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 GGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAG 2333

 10295444 GCAAGATGACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTA 10295503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 GCAAGATGACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTA 2393

 10295504 GGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAA 10295563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 GGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAA 2453

 10295564 GTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTG 10295623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 GTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTG 2513

 10295624 CTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGA 10295683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 CTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGA 2573

 10295684 ATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTG 10295743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 ATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTG 2633

 10295744 AGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGG 10295803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 AGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGG 2693

 10295804 ACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAA 10295863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 ACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAA 2753

 10295864 TTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTA 10295923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTA 2813

 10295924 GTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAA 10295983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAA 2873

 10295984 AGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAA 10296043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 AGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAA 2933

 10296044 TCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAG 10296103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 TCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAG 2993

 10296104 CCTGGCCAACATAGTGAAACACTGTCTCTAC 10296134
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CCTGGCCAACATAGTGAAACACTGTCTCTAC 3024

Alignment time is 2.26742 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2497] =>      2497 nucs 'mol-32-2e57-110757_2497'

Score:        2249
Aligned:      2501        nucs
Identic:      2474 ( 99%) nucs =>       131 (100%)      2343 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292598,10292728] EXCISED REGION [10293835,10296201]
 second seq =>  [       1,     131] EXCISED REGION [     132,    2497]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292598 ATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCAC 10292657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCAC 60

 10292658 TTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGC 10292717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGC 120

 10292718 AAAACCAAGGA 10292728
          |||||||||||
      121 AAAACCAAGGA 131

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      132 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 191

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      192 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 251

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      252 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 311

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      312 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 371

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 431

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 491

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      492 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 551

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      552 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 611

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 671

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 731

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      732 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 791

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 851

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      852 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 911

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 967

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1027

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1028 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1087

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1088 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1147

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1148 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1207

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1267

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1327

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1387

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||
     1388 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCCAGGACCACGGGTGGC 1447

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1507

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1567

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1627

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1687

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1747

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1807

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1867

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1927

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 1987

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2047

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2107

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2167

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2227

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2287

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2347

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2348 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2407

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2467

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAG 10296201
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAG 2497

Alignment time is 1.87852 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2833] =>      2833 nucs 'mol-32-2f1d-082491_2833'

Score:        2832
Aligned:      2832        nucs
Identic:      2832 (100%) nucs =>       532 (100%)      2300 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10293280,10293811] EXCISED REGION [10293813,10296112]
 second seq =>  [       1,     532] EXCISED REGION [     534,    2833]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10293812,10293812]
 second seq =>         1 nucs [533,533]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [10293810,10293811] to [10293813,10293814]
 second seq =>         2 nucs [531,532] to [534,535]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10293280 GGTATAGAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTA 10293339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTATAGAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTA 60

 10293340 AGGTTTTTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTA 10293399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTTTTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTA 120

 10293400 TTTAAAATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGT 10293459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAAAATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGT 180

 10293460 GATTTTGGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAA 10293519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTTTGGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAA 240

 10293520 AAGTGTTTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTC 10293579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTGTTTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTC 300

 10293580 AGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTA 10293639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTA 360

 10293640 CTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGT 10293699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGT 420

 10293700 TGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGC 10293759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGC 480

 10293760 TGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGG 10293811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGG 532

EXCISED REGION

 10293813 GGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTC 10293872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 GGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTC 593

 10293873 ACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTC 10293932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 ACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTC 653

 10293933 TTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGG 10293992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGG 713

 10293993 CAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATAC 10294052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATAC 773

 10294053 CAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCA 10294112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 CAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCA 833

 10294113 GTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 10294172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 GTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 893

 10294173 GCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGA 10294232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 GCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGA 953

 10294233 GCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA 10294292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAA 1013

 10294293 CAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCT 10294352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCT 1073

 10294353 CCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAG 10294412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 CCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAG 1133

 10294413 TTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGC 10294472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGC 1193

 10294473 CAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTA 10294532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTA 1253

 10294533 CTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTG 10294592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTG 1313

 10294593 GGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAA 10294652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 GGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAA 1373

 10294653 TAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTT 10294712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTT 1433

 10294713 TTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTG 10294772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTG 1493

 10294773 TACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTT 10294832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTT 1553

 10294833 AATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTT 10294892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 AATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTT 1613

 10294893 TAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTC 10294952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTC 1673

 10294953 AGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATG 10295012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 AGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATG 1733

 10295013 CTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGT 10295072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 CTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGT 1793

 10295073 GCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAA 10295132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 GCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAA 1853

 10295133 TGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTG 10295192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTG 1913

 10295193 TATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTA 10295252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTA 1973

 10295253 GTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCAT 10295312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCAT 2033

 10295313 ACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGA 10295372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 ACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGA 2093

 10295373 TAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAA 10295432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 TAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAA 2153

 10295433 CATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTG 10295492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 CATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTG 2213

 10295493 GAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTA 10295552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 GAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTA 2273

 10295553 CTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTT 10295612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTT 2333

 10295613 TTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGA 10295672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGA 2393

 10295673 GTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAA 10295732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 GTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAA 2453

 10295733 CTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTC 10295792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTC 2513

 10295793 AACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTAC 10295852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTAC 2573

 10295853 CTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGC 10295912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGC 2633

 10295913 AGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAA 10295972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 AGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAA 2693

 10295973 GAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCT 10296032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCT 2753

 10296033 CACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAG 10296092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 CACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAG 2813

 10296093 TTCAAGACCAGCCTGGCCAA 10296112
          ||||||||||||||||||||
     2814 TTCAAGACCAGCCTGGCCAA 2833

Alignment time is 2.14993 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6434] =>      6434 nucs 'mol-32-2f28-064044_6434'

Score:        5998
Aligned:      6447        nucs
Identic:      6389 ( 99%) nucs =>       450 ( 99%)      5939 ( 99%)
Gaps:           28 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292275,10292728] EXCISED REGION [10293835,10299812]
 second seq =>  [       1,     451] EXCISED REGION [     452,    6434]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292275 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGA 10292334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGA 60

 10292335 TTGAGACCATTGTGGCTAACACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTT 10292394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAGACCATTGTGGCTAACACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTT 120

 10292395 AGCCAAGCCTGGTGGCGGGGGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 10292454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCCAAGCCTGGTGGCGGGGGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 180

 10292455 TGGCGTGAACCCGGGAGGCGGACCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 10292514
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 240

 10292515 CTGGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTA 10292574
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
      241 CTGGGCGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA---GTAGTA 297

 10292575 AAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATG 10292634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 AAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATG 357

 10292635 TTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAG 10292694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAG 417

 10292695 AATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 10292728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 AATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 451

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      452 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 511

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 571

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 631

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      632 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 691

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 751

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 811

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      812 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 871

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      872 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 931

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 991

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 1051

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1052 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 1111

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 1171

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1172 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 1231

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 1287

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1347

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1348 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1407

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1408 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1467

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1468 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1527

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1587

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1647

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1707

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1708 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1767

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1827

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1887

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1947

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 2007

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 2067

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 2127

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 2187

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 2247

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 2307

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2367

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2427

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2487

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2547

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2607

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2667

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2668 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2727

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2787

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGG 10296231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2788 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACGTAGGAGGTGG 2847

 10296232 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 10296291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 2907

 10296292 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 10296351
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 CATCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 2965

 10296352 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 10296411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 3025

 10296412 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 10296471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 3085

 10296472 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 10296531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 3145

 10296532 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 10296591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 3205

 10296592 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 10296651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 3265

 10296652 TCCAGAAACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 10296711
          |.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 TTCAGAAACTAAGTCTATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 3325

 10296712 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGA 10296771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3326 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAGAGAGAGAACACCAGA 3385

 10296772 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 10296831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 3445

 10296832 AGGTGTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 10296891
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 AGGTCTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 3505

 10296892 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 10296951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 3565

 10296952 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 10297011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 3625

 10297012 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 10297071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 3685

 10297072 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 10297131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 3745

 10297132 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 10297191
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     3746 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTT-AAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 3804

 10297192 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 10297251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 3864

 10297252 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 10297311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 3924

 10297312 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 10297371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 3984

 10297372 TACTAGGTGACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATGTGATGTTTCATTG 10297431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TACTAGGTGACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATGTGATGTTTCATTG 4044

 10297432 CTGTCTCTAAATTTATGTGGTATTCATAACACTACAGATTACAACATGCTATACAGGTTT 10297491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 CTGTCTCTAAATTTATGTGGTATTCATAACACTACAGATTACAACATGCTATACAGGTTT 4104

 10297492 CAACATTTGAAAATTCTCTGGAGTTGTAATCATAGTTAAAAGCAAAGCATTAAATTCAAG 10297551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 CAACATTTGAAAATTCTCTGGAGTTGTAATCATAGTTAAAAGCAAAGCATTAAATTCAAG 4164

 10297552 AAGCTTGAAAAAAAGCAATGTTTTCTGAGAATGATCTTTTAACAGTGGTCAATTTGCATA 10297611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 AAGCTTGAAAAAAAGCAATGTTTTCTGAGAATGATCTTTTAACAGTGGTCAATTTGCATA 4224

 10297612 GTTTTTTACTTTCTACAAAATACTTTACTGATGAGGGGAAAAATTATTTTCTACCATAAT 10297671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 GTTTTTTACTTTCTACAAAATACTTTACTGATGAGGGGAAAAATTATTTTCTACCATAAT 4284

 10297672 TAGGAATCTGGACTTAACCTGTTATGCCAAAAACAGCAACCATACTTTGCAACAAAAAAA 10297731
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TAGGAATCCGGACTTAACCTGTTATGCCAAAAACAGCAACCATACTTTGCAACAAAAAAA 4344

 10297732 ATTTTCAAAAGCATTTTCAATCTTCCTGACTACCAAAGTTTCCACTACCAAAAGTGAAAA 10297791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 ATTTTCAAAAGCATTTTCAATCTTCCTGACTACCAAAGTTTCCACTACCAAAAGTGAAAA 4404

 10297792 CACTTTTAAACCTTCCTGTGTAACAAGTTTTAAATTTTCTTTTATTTATTTGTATCAATT 10297851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 CACTTTTAAACCTTCCTGTGTAACAAGTTTTAAATTTTCTTTTATTTATTTGTATCAATT 4464

 10297852 TTCTCACCTGTGGCTGCCAAAATATCAAGAATTTCAACTCCAGAGAAGGAGGACAGAAGA 10297911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 TTCTCACCTGTGGCTGCCAAAATATCAAGAATTTCAACTCCAGAGAAGGAGGACAGAAGA 4524

 10297912 AACACAATGTAAAGTGGTTGGCCTAGTAAAATAGTTGGAAAAAAAACTGTTTTGGCTGCT 10297971
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4525 AACACAATGTAAAGTGGTTGGCCTAGTAAAATAGTTGGAAAAAAACCTGTTTTGGCTGCT 4584

 10297972 CTAATATAATCTTCATTTATTACTCATTAGTTCTCTTCTTATGGTCCCAATATTCCAGCC 10298031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 CTAATATAATCTTCATTTATTACTCATTAGTTCTCTTCTTATGGTCCCAATATTCCAGCC 4644

 10298032 AAATTGAGAATCTACTCACTGTTTATCAATTCAGTGCCTTTGCCACTACTCATCTCCACC 10298091
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 AAATTGAGAATCTACTCATTGTTTATCAATTCAGTGCCTTTGCCACTACTCATCTCCACC 4704

 10298092 TCCCAGTCCCCACAATGTATTTATAGACAAAAGTTTTGATTTAAAGCCAGAAAACTGGGT 10298151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 TCCCAGTCCCCACAATGTATTTATAGACAAAAGTTTTGATTTAAAGCCAGAAAACTGGGT 4764

 10298152 TCAAGTTTCATTTAATCCCTTTTAATTCCATTCATGATCAGTATGAACATGGACAAATTA 10298211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 TCAAGTTTCATTTAATCCCTTTTAATTCCATTCATGATCAGTATGAACATGGACAAATTA 4824

 10298212 TTTTACCTTTATGCACCTTCAAGGATAACTCAGTGTAACCATGAAGAGTCAATGCAATAA 10298271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TTTTACCTTTATGCACCTTCAAGGATAACTCAGTGTAACCATGAAGAGTCAATGCAATAA 4884

 10298272 TGTGAACACACTCAATTTTTTTAAATGAATGAAGATTCAATCTGATAGTCTCTGCTTGTA 10298331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 TGTGAACACACTCAATTTTTTTAAATGAATGAAGATTCAATCTGATAGTCTCTGCTTGTA 4944

 10298332 AAACAAGTGTATAGAGAAATGTAGGCTGTGACACTAGATCCCAAGAAAGTATCTACTGGT 10298391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 AAACAAGTGTATAGAGAAATGTAGGCTGTGACACTAGATCCCAAGAAAGTATCTACTGGT 5004

 10298392 TGTTATCAATATAATAATATGGAGAAAACAGGTGGCACTAGTAATTTAAAGTTAGAACAA 10298451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 TGTTATCAATATAATAATATGGAGAAAACAGGTGGCACTAGTAATTTAAAGTTAGAACAA 5064

 10298452 GGAACACAACACAAATTTAAGCCTTTCTTAAAACTGTGTAAAACAGGCTCGGTACAATGG 10298511
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 AGAACACAACACAAATTTAAGCCTTTCTTAAAACTGTGTAAAACAGGCTCGGTACAATGG 5124

 10298512 CTCATGCCTGTAATATCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTCCTTGAGGCCAGG 10298571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 CTCATGCCTGTAATATCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTCCTTGAGGCCAGG 5184

 10298572 GGTTCCAGGCCAGCCTGGTGAACATAGGGAGACCCCATCTCTACAAAAAACTTTAAAAAG 10298631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 GGTTCCAGGCCAGCCTGGTGAACATAGGGAGACCCCATCTCTACAAAAAACTTTAAAAAG 5244

 10298632 ATAGTGCCACTGCACTCCTGCCTGGGCAACAGAGCGAGACCCCATCTCAAAAAAAAAAAA 10298691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
     5245 ATAGTGCCACTGCACTCCTGCCTGGGCAACAGAGCGAGACCCCATCTC---AAAAAAAAA 5301

 10298692 AAAAAAAAAAAAGGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCGCTTG 10298751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 AAAAAAAAAAAAGGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCGCTTG 5361

 10298752 AGCCCGGGAGTTTGAGACCAGCCTAGGCATCACAAAGACTCTGTCTCT------------ 10298799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
     5362 AGCCCGGGAGTTTGAGACCAGCCTAGGCATCACAAAGACTCTGTCTCTAAACAAACAAAC 5421

 10298800 AAACAAACAAACAAAAAATCATGCAAAGCTATGTATCTGTCTTCCAAGGAATTCTGAATT 10298859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 AAACAAACAAACAAAAAATCATGCAAAGCTATGTATCTGTCTTCCAAGGAATTCTGAATT 5481

 10298860 TTCTACAGCTTATTTTTCAATGAAGTATTTAGAGTGGATGCTGATTTAACTTGTAATGTT 10298919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 TTCTACAGCTTATTTTTCAATGAAGTATTTAGAGTGGATGCTGATTTAACTTGTAATGTT 5541

 10298920 GTGGGAGTGATTCCTATTTCATATGTTTGGCTTTTTGAATAATTTTGTTTGTTGCAAAAT 10298979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 GTGGGAGTGATTCCTATTTCATATGTTTGGCTTTTTGAATAATTTTGTTTGTTGCAAAAT 5601

 10298980 TGTTTTTAAAAAATTAAGCCTATTTAGCACTGTTCTATCCAGATAGATTTCCTAATATTT 10299039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 TGTTTTTAAAAAATTAAGCCTATTTAGCACTGTTCTATCCAGATAGATTTCCTAATATTT 5661

 10299040 ACAAACTACTATTATTATAATAACTGCATGAACCATTGTGTTTGTGGTGAGTTGAATAGC 10299099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 ACAAACTACTATTATTATAATAACTGCATGAACCATTGTGTTTGTGGTGAGTTGAATAGC 5721

 10299100 GTTGTCCAAAAATTCACGTCCATCAGAATCTCATAATGTGACTTTATTTGGAAACAGGGT 10299159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 GTTGTCCAAAAATTCACGTCCATCAGAATCTCATAATGTGACTTTATTTGGAAACAGGGT 5781

 10299160 CTTTGCAGATATAGTTAAGGATCTTCTGATGAAAATTATCATGGATTTAGGGTGAGCCCT 10299219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 CTTTGCAGATATAGTTAAGGATCTTCTGATGAAAATTATCATGGATTTAGGGTGAGCCCT 5841

 10299220 AAATCCAATGATTAGCATCTTTATAAAAGAAAAGAAAGGGAGATTTGGACACAGTAACAG 10299279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 AAATCCAATGATTAGCATCTTTATAAAAGAAAAGAAAGGGAGATTTGGACACAGTAACAG 5901

 10299280 AGAATGCGGCCATGTGATGACAGAGAAAGAGATCAGAGTTATGCTACCACCAATCAAGGA 10299339
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5902 AGAATGCGGCCATGTGATGACAGAGAAAGAGATCAGAGTTACGCTACCACCAATCAAGGA 5961

 10299340 GCCCCTGGGGCCACCAGATGCTGGAAGAGGGAAAGGAAGGATCCTTCCCTAAATCCTTCA 10299399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 GCCCCTGGGGCCACCAGATGCTGGAAGAGGGAAAGGAAGGATCCTTCCCTAAATCCTTCA 6021

 10299400 GAGAGACTGAGGCCCTCCTGTCACCTTAACTTCAGACTTCTAGTCTCCAGAATTGTGAGA 10299459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 GAGAGACTGAGGCCCTCCTGTCACCTTAACTTCAGACTTCTAGTCTCCAGAATTGTGAGA 6081

 10299460 GAATGGTGTTTGTTTTAAATCACGAGTTTGTAGTAATTTGTTATGGCAACCCCAAGAAAC 10299519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 GAATGGTGTTTGTTTTAAATCACGAGTTTGTAGTAATTTGTTATGGCAACCCCAAGAAAC 6141

 10299520 TAGCAGAGTGTTGGAGCTTAACTAAGCACTATTGTTTAAACATTTTAAAGTGAGAATTCT 10299579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 TAGCAGAGTGTTGGAGCTTAACTAAGCACTATTGTTTAAACATTTTAAAGTGAGAATTCT 6201

 10299580 CTGTACTTCCCTGCAATAGTATTAATTTTCCCAAAAGACCCAAACTTTTTTATCTTCTTA 10299639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 CTGTACTTCCCTGCAATAGTATTAATTTTCCCAAAAGACCCAAACTTTTTTATCTTCTTA 6261

 10299640 GTTAACAATCTTTTTGTTCCTATACTCTAGATCAATCTATACTGTTTGAAATTCATTTAA 10299699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 GTTAACAATCTTTTTGTTCCTATACTCTAGATCAATCTATACTGTTTGAAATTCATTTAA 6321

 10299700 ACTTAAGCAGTTATGTGAAATATTTCCCTAGGCAAAATTAGTTTTTAATTTTCTTTCAAG 10299759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 ACTTAAGCAGTTATGTGAAATATTTCCCTAGGCAAAATTAGTTTTTAATTTTCTTTCAAG 6381

 10299760 TAAACAATGAAACCTACAGCTATAACTAAAAACTTATGAAAAATTTTATGATG 10299812
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 TAAACAATGAAACCTACAGCTATAACTAAAAACTTATGAAAAATTTTATGATG 6434

Alignment time is 4.84467 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4178] =>      4178 nucs 'mol-32-2fc2-014261_4178'

Score:        4178
Aligned:      4178        nucs
Identic:      4178 (100%) nucs =>      3286 (100%)       892 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10293012,10296297] EXCISED REGION [10296299,10297190]
 second seq =>  [       1,    3286] EXCISED REGION [    3287,    4178]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10296298,10296298]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [10296298,10296314] to [10296299,10296315]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10293012 CCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAAAATCAAGACATCAGTTG 10293071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAAAATCAAGACATCAGTTG 60

 10293072 ATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACTTTCTGGTCTTCATTTAGGAATT 10293131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACTTTCTGGTCTTCATTTAGGAATT 120

 10293132 ATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAACTTCCAGGAACAACAGT 10293191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAACTTCCAGGAACAACAGT 180

 10293192 TTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACATC 10293251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACATC 240

 10293252 CAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAA 10293311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAA 300

 10293312 GAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACT 10293371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACT 360

 10293372 TGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTC 10293431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTC 420

 10293432 ACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAG 10293491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAG 480

 10293492 GGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATT 10293551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATT 540

 10293552 CATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGC 10293611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGC 600

 10293612 ACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATC 10293671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATC 660

 10293672 CTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGAT 10293731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGAT 720

 10293732 CCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCT 10293791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCT 780

 10293792 AGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTT 10293851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTT 840

 10293852 TAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTA 10293911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTA 900

 10293912 CTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCC 10293971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCC 960

 10293972 ACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTA 10294031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTA 1020

 10294032 TTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCAC 10294091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCAC 1080

 10294092 TACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCT 10294151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCT 1140

 10294152 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTT 10294211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTT 1200

 10294212 GGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACC 10294271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACC 1260

 10294272 ACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATAAT 10294331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATAAT 1320

 10294332 AACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGA 10294391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGA 1380

 10294392 CAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCT 10294451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCT 1440

 10294452 ACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTG 10294511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTG 1500

 10294512 GAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATC 10294571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATC 1560

 10294572 GCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAA 10294631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAA 1620

 10294632 ATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAA 10294691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAA 1680

 10294692 ATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTA 10294751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTA 1740

 10294752 GTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTT 10294811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTT 1800

 10294812 CAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTT 10294871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTT 1860

 10294872 TGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAA 10294931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAA 1920

 10294932 AAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATT 10294991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATT 1980

 10294992 AAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAA 10295051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAA 2040

 10295052 ATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAG 10295111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAG 2100

 10295112 GTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAG 10295171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAG 2160

 10295172 ATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGT 10295231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGT 2220

 10295232 AGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAG 10295291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAG 2280

 10295292 CATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAACC 10295351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAACC 2340

 10295352 AGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATC 10295411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATC 2400

 10295412 TAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATGATGGCA 10295471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATGATGGCA 2460

 10295472 GACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAAAC 10295531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAAAC 2520

 10295532 TATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTTTA 10295591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTTTA 2580

 10295592 TTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGT 10295651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGT 2640

 10295652 ATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATGAG 10295711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATGAG 2700

 10295712 ATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAGAG 10295771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAGAG 2760

 10295772 GCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATT 10295831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATT 2820

 10295832 TTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGATAT 10295891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGATAT 2880

 10295892 GTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTTTA 10295951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTTTA 2940

 10295952 TTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATAAA 10296011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATAAA 3000

 10296012 GTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGA 10296071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGA 3060

 10296072 CGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACACTGTCTC 10296131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACACTGTCTC 3120

 10296132 TACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCA 10296191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCA 3180

 10296192 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCGAGAT 10296251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCGAGAT 3240

 10296252 TGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTC 10296297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTC 3286

EXCISED REGION

 10296299 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAAACAAATT 10296358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAAACAAATT 3346

 10296359 CATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTTCTGTAAT 10296418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 CATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTTCTGTAAT 3406

 10296419 GCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCACAGGCAC 10296478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 GCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCACAGGCAC 3466

 10296479 GTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATGCAGCAGA 10296538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 GTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATGCAGCAGA 3526

 10296539 ACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGATGAGCAG 10296598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 ACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGATGAGCAG 3586

 10296599 AGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAGTCCAGAA 10296658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 AGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAGTCCAGAA 3646

 10296659 ACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTATAGAGAA 10296718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 ACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTATAGAGAA 3706

 10296719 AGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGACAATCAA 10296778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 AGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGACAATCAA 3766

 10296779 TCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCAAGGTGTT 10296838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 TCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCAAGGTGTT 3826

 10296839 ACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTTAGTGGCA 10296898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 ACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTTAGTGGCA 3886

 10296899 AAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTGACGGGTA 10296958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 AAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTGACGGGTA 3946

 10296959 TGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATTTTAAGTT 10297018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 TGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATTTTAAGTT 4006

 10297019 ATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACAGTAAAAT 10297078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 ATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACAGTAAAAT 4066

 10297079 ACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATTAACTTGT 10297138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 ACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATTAACTTGT 4126

 10297139 ATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATC 10297190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 ATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATC 4178

Alignment time is 3.17313 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2517] =>      2517 nucs 'mol-32-301a-083442_2517'

Score:        2280
Aligned:      2521        nucs
Identic:      2495 ( 99%) nucs =>       142 (100%)      2353 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292587,10292728] EXCISED REGION [10293835,10296210]
 second seq =>  [       1,     142] EXCISED REGION [     143,    2517]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292587 CATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAG 10292646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAG 60

 10292647 CAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGA 10292706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGA 120

 10292707 GTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 10292728
          ||||||||||||||||||||||
      121 GTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 142

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      143 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 202

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      203 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 262

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      263 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 322

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      323 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 382

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 442

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 502

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      503 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 562

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      563 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 622

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 682

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 742

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      743 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 802

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 862

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      863 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 922

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 978

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1038

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1039 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1098

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1099 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1158

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1159 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1218

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1278

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1338

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1398

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1399 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1458

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1518

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1578

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1638

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1698

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1758

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1818

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1878

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1938

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 1998

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2058

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2118

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2178

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2238

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2298

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2358

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2359 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2418

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2478

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 10296210
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 2517

Alignment time is 1.89814 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2843] =>      2843 nucs 'mol-32-3030-046952_2843'

Score:        2840
Aligned:      2840        nucs
Identic:      2840 (100%) nucs =>       171 (100%)      2669 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292573,10292743] EXCISED REGION [10292746,10295414]
 second seq =>  [       4,     174] EXCISED REGION [     175,    2843]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [10292744,10292745]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [10292744,10292759] to [10292746,10292761]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10292744,10292744] to [10292745,10292745]
 second seq =>         0 nucs

 10292573 TAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATA 10292632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 TAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATA 63

 10292633 TGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGAC 10292692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 TGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGAC 123

 10292693 AGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGACAGCAATCTTGATTC 10292743
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 AGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAAGGACAGCAATCTTGATTC 174

EXCISED REGION

 10292746 TTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAGAATTCTTTTAGGTTGTAATATTTTCATGTTAGTTT 10292805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      175 TTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAGAATTCTTTTAGGTTGTAATATTTTCATGTTAGTTT 234

 10292806 TTAATCATTTACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAACATTTTTAAATATATGAAATTCT 10292865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      235 TTAATCATTTACAATGTTCTGTGGGTCACATTTTAAACATTTTTAAATATATGAAATTCT 294

 10292866 GTATTTCTTTAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCAA 10292925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      295 GTATTTCTTTAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCAA 354

 10292926 ATCTGCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTC 10292985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 ATCTGCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTC 414

 10292986 CAAAGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCC 10293045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 CAAAGAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCC 474

 10293046 ATTTAGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTG 10293105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 ATTTAGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTG 534

 10293106 TACTTTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGG 10293165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 TACTTTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGG 594

 10293166 AATAAATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACT 10293225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 AATAAATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACT 654

 10293226 ATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATA 10293285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 ATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATA 714

 10293286 GAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTT 10293345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 GAAATCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTT 774

 10293346 TTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAA 10293405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 TTGTTTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAA 834

 10293406 ATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTT 10293465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 ATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTT 894

 10293466 GGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGT 10293525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 GGCTATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGT 954

 10293526 TTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAA 10293585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 TTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAA 1014

 10293586 CTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCA 10293645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 CTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCA 1074

 10293646 GCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGC 10293705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 GCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGC 1134

 10293706 TCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCT 10293765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 TCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCT 1194

 10293766 ACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCC 10293825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 ACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCC 1254

 10293826 TAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGG 10293885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 TAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGG 1314

 10293886 CTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTC 10293945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 CTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTC 1374

 10293946 TTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGAT 10294005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGAT 1434

 10294006 TTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACA 10294065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACA 1494

 10294066 CTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGC 10294125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 CTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGC 1554

 10294126 CAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTG 10294185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 CAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTG 1614

 10294186 GCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAG 10294245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 GCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAG 1674

 10294246 AGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCT 10294305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 AGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCT 1734

 10294306 TGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATC 10294365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATC 1794

 10294366 CCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCT 10294425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 CCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCT 1854

 10294426 GGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGC 10294485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 GGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGC 1914

 10294486 ACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGA 10294545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 ACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGA 1974

 10294546 GACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGA 10294605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 GACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGA 2034

 10294606 GACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCT 10294665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCT 2094

 10294666 GGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGA 10294725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 GGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGA 2154

 10294726 TAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGT 10294785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGT 2214

 10294786 CAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTT 10294845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 CAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTT 2274

 10294846 AAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTT 10294905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 AAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTT 2334

 10294906 CAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAA 10294965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 CAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAA 2394

 10294966 ACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACT 10295025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 ACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACT 2454

 10295026 TATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTG 10295085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTG 2514

 10295086 TATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATG 10295145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATG 2574

 10295146 GGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCT 10295205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 GGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCT 2634

 10295206 CTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTG 10295265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 CTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTG 2694

 10295266 GATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAAC 10295325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAAC 2754

 10295326 AGACATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGG 10295385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 AGACATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGG 2814

 10295386 AATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAG 10295414
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2815 AATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAG 2843

Alignment time is 2.11868 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3174] =>      3174 nucs 'mol-32-303b-165826_3174'

Score:        3174
Aligned:      3174        nucs
Identic:      3174 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292946,10296119]
 second seq =>  [       1,    3174]

 10292946 CGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTCCAAAGAAGTTTGCTAAGAAT 10293005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTCCAAAGAAGTTTGCTAAGAAT 60

 10293006 CTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAAAATCAAGACAT 10293065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAAAATCAAGACAT 120

 10293066 CAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACTTTCTGGTCTTCATTTA 10293125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACTTTCTGGTCTTCATTTA 180

 10293126 GGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAACTTCCAGGAAC 10293185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAACTTCCAGGAAC 240

 10293186 AACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTTCCTAAAATGTA 10293245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTTCCTAAAATGTA 300

 10293246 AACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTAGTAACTCACTT 10293305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTAGTAACTCACTT 360

 10293306 ATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATCTTATGTATAAA 10293365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATCTTATGTATAAA 420

 10293366 AGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTCCTTCACCCAGT 10293425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTCCTTCACCCAGT 480

 10293426 TTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGGACCAGGCCACA 10293485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGGACCAGGCCACA 540

 10293486 GGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAGACTTGAAGGCA 10293545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAGACTTGAAGGCA 600

 10293546 GTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAG 10293605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAG 660

 10293606 TAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAG 10293665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAG 720

 10293666 GGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGAC 10293725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGAC 780

 10293726 CTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCT 10293785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCT 840

 10293786 CGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTG 10293845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTG 900

 10293846 ATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTAC 10293905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTAC 960

 10293906 CAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCA 10293965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCA 1020

 10293966 TGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTA 10294025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTA 1080

 10294026 AAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCC 10294085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCC 1140

 10294086 CAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACC 10294145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACC 1200

 10294146 CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAG 10294205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAG 1260

 10294206 CTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGAT 10294265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGAT 1320

 10294266 GATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAAT 10294325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAAT 1380

 10294326 AATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCA 10294385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCA 1440

 10294386 GGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTC 10294445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTC 1500

 10294446 ATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCT 10294505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCT 1560

 10294506 ACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCC 10294565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCC 1620

 10294566 AAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAA 10294625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAA 1680

 10294626 AAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAAC 10294685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAAC 1740

 10294686 ATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAA 10294745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAA 1800

 10294746 TTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACA 10294805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACA 1860

 10294806 AGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGA 10294865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGA 1920

 10294866 TGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAG 10294925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAG 1980

 10294926 TAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAA 10294985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAA 2040

 10294986 TCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAA 10295045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAA 2100

 10295046 CAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGT 10295105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGT 2160

 10295106 TTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAA 10295165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAA 2220

 10295166 ACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTA 10295225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTA 2280

 10295226 TAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTC 10295285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTC 2340

 10295286 CTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACT 10295345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACT 2400

 10295346 GGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCC 10295405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCC 2460

 10295406 ACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATG 10295465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATG 2520

 10295466 ATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGA 10295525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGA 2580

 10295526 GGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATC 10295585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATC 2640

 10295586 TTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAAT 10295645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAAT 2700

 10295646 AAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTC 10295705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTC 2760

 10295706 CATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCAT 10295765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCAT 2820

 10295766 ACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAG 10295825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAG 2880

 10295826 AGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAG 10295885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAG 2940

 10295886 AGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTT 10295945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTT 3000

 10295946 GTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAAT 10296005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAAT 3060

 10296006 TATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGA 10296065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGA 3120

 10296066 GGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTG 10296119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTG 3174

Alignment time is 2.05022 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    6928] =>      6928 nucs 'mol-32-30f6-031315_6928'

Score:        6501
Aligned:      6941        nucs
Identic:      6883 ( 99%) nucs =>       138 (100%)      6745 ( 99%)
Gaps:           28 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292591,10292728] EXCISED REGION [10293835,10300622]
 second seq =>  [       1,     138] EXCISED REGION [     139,    6928]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292591 TATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGT 10292650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGT 60

 10292651 ATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAG 10292710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAG 120

 10292711 CAATTGCAAAACCAAGGA 10292728
          ||||||||||||||||||
      121 CAATTGCAAAACCAAGGA 138

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      139 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 198

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      199 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 258

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      259 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 318

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      319 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 378

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 438

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 498

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      499 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 558

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      559 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 618

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 678

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 738

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      739 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 798

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 858

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      859 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 918

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 974

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1034

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1035 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1094

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1095 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1154

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1155 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1214

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1274

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1334

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1394

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1395 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1454

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1514

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1574

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1634

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1694

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1754

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1814

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CAGACTGAAAAGGAGGGAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1874

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1934

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 1994

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2054

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2114

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2174

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2234

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2294

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2354

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2355 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2414

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2474

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGG 10296231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2475 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACGTAGGAGGTGG 2534

 10296232 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 10296291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 2594

 10296292 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 10296351
          ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CATCTC-----AAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 2649

 10296352 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 10296411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 2709

 10296412 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 10296471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 2769

 10296472 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 10296531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 2829

 10296532 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 10296591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 2889

 10296592 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 10296651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 2949

 10296652 TCCAGAAACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 10296711
          |.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TTCAGAAACTAAGTCTATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 3009

 10296712 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGA 10296771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3010 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAGAGAGAGAACACCAGA 3069

 10296772 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 10296831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 3129

 10296832 AGGTGTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 10296891
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 AGGTCTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 3189

 10296892 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 10296951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 3249

 10296952 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 10297011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 3309

 10297012 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 10297071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 3369

 10297072 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 10297131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 3429

 10297132 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 10297191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 3489

 10297192 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 10297251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 3549

 10297252 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 10297311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 3609

 10297312 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 10297371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 3669

 10297372 TACTAGGTGACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATGTGATGTTTCATTG 10297431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 TACTAGGTGACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATGTGATGTTTCATTG 3729

 10297432 CTGTCTCTAAATTTATGTGGTATTCATAACACTACAGATTACAACATGCTATACAGGTTT 10297491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 CTGTCTCTAAATTTATGTGGTATTCATAACACTACAGATTACAACATGCTATACAGGTTT 3789

 10297492 CAACATTTGAAAATTCTCTGGAGTTGTAATCATAGTTAAAAGCAAAGCATTAAATTCAAG 10297551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 CAACATTTGAAAATTCTCTGGAGTTGTAATCATAGTTAAAAGCAAAGCATTAAATTCAAG 3849

 10297552 AAGCTTGAAAAAAAGCAATGTTTTCTGAGAATGATCTTTTAACAGTGGTCAATTTGCATA 10297611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 AAGCTTGAAAAAAAGCAATGTTTTCTGAGAATGATCTTTTAACAGTGGTCAATTTGCATA 3909

 10297612 GTTTTTTACTTTCTACAAAATACTTTACTGATGAGGGGAAAAATTATTTTCTACCATAAT 10297671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 GTTTTTTACTTTCTACAAAATACTTTACTGATGAGGGGAAAAATTATTTTCTACCATAAT 3969

 10297672 TAGGAATCTGGACTTAACCTGTTATGCCAAAAACAGCAACCATACTTTGCAACAAAAAAA 10297731
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 TAGGAATCCGGACTTAACCTGTTATGCCAAAAACAGCAACCATACTTTGCAACAAAAAAA 4029

 10297732 ATTTTCAAAAGCATTTTCAATCTTCCTGACTACCAAAGTTTCCACTACCAAAAGTGAAAA 10297791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 ATTTTCAAAAGCATTTTCAATCTTCCTGACTACCAAAGTTTCCACTACCAAAAGTGAAAA 4089

 10297792 CACTTTTAAACCTTCCTGTGTAACAAGTTTTAAATTTTCTTTTATTTATTTGTATCAATT 10297851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 CACTTTTAAACCTTCCTGTGTAACAAGTTTTAAATTTTCTTTTATTTATTTGTATCAATT 4149

 10297852 TTCTCACCTGTGGCTGCCAAAATATCAAGAATTTCAACTCCAGAGAAGGAGGACAGAAGA 10297911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 TTCTCACCTGTGGCTGCCAAAATATCAAGAATTTCAACTCCAGAGAAGGAGGACAGAAGA 4209

 10297912 AACACAATGTAAAGTGGTTGGCCTAGTAAAATAGTTGGAAAAAAAACTGTTTTGGCTGCT 10297971
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4210 AACACAATGTAAAGTGGTTGGCCTAGTAAAATAGTTGGAAAAAAACCTGTTTTGGCTGCT 4269

 10297972 CTAATATAATCTTCATTTATTACTCATTAGTTCTCTTCTTATGGTCCCAATATTCCAGCC 10298031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 CTAATATAATCTTCATTTATTACTCATTAGTTCTCTTCTTATGGTCCCAATATTCCAGCC 4329

 10298032 AAATTGAGAATCTACTCACTGTTTATCAATTCAGTGCCTTTGCCACTACTCATCTCCACC 10298091
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 AAATTGAGAATCTACTCATTGTTTATCAATTCAGTGCCTTTGCCACTACTCATCTCCACC 4389

 10298092 TCCCAGTCCCCACAATGTATTTATAGACAAAAGTTTTGATTTAAAGCCAGAAAACTGGGT 10298151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 TCCCAGTCCCCACAATGTATTTATAGACAAAAGTTTTGATTTAAAGCCAGAAAACTGGGT 4449

 10298152 TCAAGTTTCATTTAATCCCTTTTAATTCCATTCATGATCAGTATGAACATGGACAAATTA 10298211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 TCAAGTTTCATTTAATCCCTTTTAATTCCATTCATGATCAGTATGAACATGGACAAATTA 4509

 10298212 TTTTACCTTTATGCACCTTCAAGGATAACTCAGTGTAACCATGAAGAGTCAATGCAATAA 10298271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 TTTTACCTTTATGCACCTTCAAGGATAACTCAGTGTAACCATGAAGAGTCAATGCAATAA 4569

 10298272 TGTGAACACACTCAATTTTTTTAAATGAATGAAGATTCAATCTGATAGTCTCTGCTTGTA 10298331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 TGTGAACACACTCAATTTTTTTAAATGAATGAAGATTCAATCTGATAGTCTCTGCTTGTA 4629

 10298332 AAACAAGTGTATAGAGAAATGTAGGCTGTGACACTAGATCCCAAGAAAGTATCTACTGGT 10298391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 AAACAAGTGTATAGAGAAATGTAGGCTGTGACACTAGATCCCAAGAAAGTATCTACTGGT 4689

 10298392 TGTTATCAATATAATAATATGGAGAAAACAGGTGGCACTAGTAATTTAAAGTTAGAACAA 10298451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 TGTTATCAATATAATAATATGGAGAAAACAGGTGGCACTAGTAATTTAAAGTTAGAACAA 4749

 10298452 GGAACACAACACAAATTTAAGCCTTTCTTAAAACTGTGTAAAACAGGCTCGGTACAATGG 10298511
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 AGAACACAACACAAATTTAAGCCTTTCTTAAAACTGTGTAAAACAGGCTCGGTACAATGG 4809

 10298512 CTCATGCCTGTAATATCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTCCTTGAGGCCAGG 10298571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 CTCATGCCTGTAATATCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTCCTTGAGGCCAGG 4869

 10298572 GGTTCCAGGCCAGCCTGGTGAACATAGGGAGACCCCATCTCTACAAAAAACTTTAAAAAG 10298631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 GGTTCCAGGCCAGCCTGGTGAACATAGGGAGACCCCATCTCTACAAAAAACTTTAAAAAG 4929

 10298632 ATAGTGCCACTGCACTCCTGCCTGGGCAACAGAGCGAGACCCCATCTCAAAAAAAAAAAA 10298691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
     4930 ATAGTGCCACTGCACTCCTGCCTGGGCAACAGAGCGAGACCCCATCTC---AAAAAAAAA 4986

 10298692 AAAAAAAAAAAAGGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCGCTTG 10298751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 AAAAAAAAAAAAGGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCGCTTG 5046

 10298752 AGCCCGGGAGTTTGAGACCAGCCTAGGCATCACAAAGACTCTGTCTCT------------ 10298799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
     5047 AGCCCGGGAGTTTGAGACCAGCCTAGGCATCACAAAGACTCTGTCTCTAAACAAACAAAC 5106

 10298800 AAACAAACAAACAAAAAATCATGCAAAGCTATGTATCTGTCTTCCAAGGAATTCTGAATT 10298859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 AAACAAACAAACAAAAAATCATGCAAAGCTATGTATCTGTCTTCCAAGGAATTCTGAATT 5166

 10298860 TTCTACAGCTTATTTTTCAATGAAGTATTTAGAGTGGATGCTGATTTAACTTGTAATGTT 10298919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 TTCTACAGCTTATTTTTCAATGAAGTATTTAGAGTGGATGCTGATTTAACTTGTAATGTT 5226

 10298920 GTGGGAGTGATTCCTATTTCATATGTTTGGCTTTTTGAATAATTTTGTTTGTTGCAAAAT 10298979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 GTGGGAGTGATTCCTATTTCATATGTTTGGCTTTTTGAATAATTTTGTTTGTTGCAAAAT 5286

 10298980 TGTTTTTAAAAAATTAAGCCTATTTAGCACTGTTCTATCCAGATAGATTTCCTAATATTT 10299039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TGTTTTTAAAAAATTAAGCCTATTTAGCACTGTTCTATCCAGATAGATTTCCTAATATTT 5346

 10299040 ACAAACTACTATTATTATAATAACTGCATGAACCATTGTGTTTGTGGTGAGTTGAATAGC 10299099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 ACAAACTACTATTATTATAATAACTGCATGAACCATTGTGTTTGTGGTGAGTTGAATAGC 5406

 10299100 GTTGTCCAAAAATTCACGTCCATCAGAATCTCATAATGTGACTTTATTTGGAAACAGGGT 10299159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 GTTGTCCAAAAATTCACGTCCATCAGAATCTCATAATGTGACTTTATTTGGAAACAGGGT 5466

 10299160 CTTTGCAGATATAGTTAAGGATCTTCTGATGAAAATTATCATGGATTTAGGGTGAGCCCT 10299219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 CTTTGCAGATATAGTTAAGGATCTTCTGATGAAAATTATCATGGATTTAGGGTGAGCCCT 5526

 10299220 AAATCCAATGATTAGCATCTTTATAAAAGAAAAGAAAGGGAGATTTGGACACAGTAACAG 10299279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 AAATCCAATGATTAGCATCTTTATAAAAGAAAAGAAAGGGAGATTTGGACACAGTAACAG 5586

 10299280 AGAATGCGGCCATGTGATGACAGAGAAAGAGATCAGAGTTATGCTACCACCAATCAAGGA 10299339
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5587 AGAATGCGGCCATGTGATGACAGAGAAAGAGATCAGAGTTACGCTACCACCAATCAAGGA 5646

 10299340 GCCCCTGGGGCCACCAGATGCTGGAAGAGGGAAAGGAAGGATCCTTCCCTAAATCCTTCA 10299399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 GCCCCTGGGGCCACCAGATGCTGGAAGAGGGAAAGGAAGGATCCTTCCCTAAATCCTTCA 5706

 10299400 GAGAGACTGAGGCCCTCCTGTCACCTTAACTTCAGACTTCTAGTCTCCAGAATTGTGAGA 10299459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 GAGAGACTGAGGCCCTCCTGTCACCTTAACTTCAGACTTCTAGTCTCCAGAATTGTGAGA 5766

 10299460 GAATGGTGTTTGTTTTAAATCACGAGTTTGTAGTAATTTGTTATGGCAACCCCAAGAAAC 10299519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 GAATGGTGTTTGTTTTAAATCACGAGTTTGTAGTAATTTGTTATGGCAACCCCAAGAAAC 5826

 10299520 TAGCAGAGTGTTGGAGCTTAACTAAGCACTATTGTTTAAACATTTTAAAGTGAGAATTCT 10299579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TAGCAGAGTGTTGGAGCTTAACTAAGCACTATTGTTTAAACATTTTAAAGTGAGAATTCT 5886

 10299580 CTGTACTTCCCTGCAATAGTATTAATTTTCCCAAAAGACCCAAACTTTTTTATCTTCTTA 10299639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 CTGTACTTCCCTGCAATAGTATTAATTTTCCCAAAAGACCCAAACTTTTTTATCTTCTTA 5946

 10299640 GTTAACAATCTTTTTGTTCCTATACTCTAGATCAATCTATACTGTTTGAAATTCATTTAA 10299699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 GTTAACAATCTTTTTGTTCCTATACTCTAGATCAATCTATACTGTTTGAAATTCATTTAA 6006

 10299700 ACTTAAGCAGTTATGTGAAATATTTCCCTAGGCAAAATTAGTTTTTAATTTTCTTTCAAG 10299759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 ACTTAAGCAGTTATGTGAAATATTTCCCTAGGCAAAATTAGTTTTTAATTTTCTTTCAAG 6066

 10299760 TAAACAATGAAACCTACAGCTATAACTAAAAACTTATGAAAAATTTTATGATGAAGACAT 10299819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TAAACAATGAAACCTACAGCTATAACTAAAAACTTATGAAAAATTTTATGATGAAGACAT 6126

 10299820 TGATAAGTATATGGGAAAATAAAATTATCAACTTATAAAAGTTATATTTGCCTTCGCAAT 10299879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 TGATAAGTATATGGGAAAATAAAATTATCAACTTATAAAAGTTATATTTGCCTTCGCAAT 6186

 10299880 GTAAATTATGGTAATAACAATTTTAAATAAATAACTTTTACTCAATAAACAACTGCATAA 10299939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 GTAAATTATGGTAATAACAATTTTAAATAAATAACTTTTACTCAATAAACAACTGCATAA 6246

 10299940 CCAACCCCAAAAATTTCGAGAGCTCAGCAATAATAGGATATTAAATCTTATAATATTTAA 10299999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 CCAACCCCAAAAATTTCGAGAGCTCAGCAATAATAGGATATTAAATCTTATAATATTTAA 6306

 10300000 TGATCTCAGTTCTGACCATAATAATGTTTTAAAATTAAGAAATACTGGCAGGGCGCAGAG 10300059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 TGATCTCAGTTCTGACCATAATAATGTTTTAAAATTAAGAAATACTGGCAGGGCGCAGAG 6366

 10300060 GCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATTACCTGAGGTCAG 10300119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 GCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATTACCTGAGGTCAG 6426

 10300120 GAGTTTGAGATCAGTCCGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT 10300179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 GAGTTTGAGATCAGTCCGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT 6486

 10300180 ATTAGCCGGGCATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGA 10300239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 ATTAGCCGGGCATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGA 6546

 10300240 GAATAGCTTGAATCGGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACCGAGCCCCATTGCACT 10300299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 GAATAGCTTGAATCGGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACCGAGCCCCATTGCACT 6606

 10300300 CCAGCCTGGGCAACAAGAACGAAACTCCATCTCAATAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATACA 10300359
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     6607 CCAGCCTGGGCAACAAGAACGAAACTCCATCTCAAT-AAAAAAAAAAAAAAAGAAATACA 6665

 10300360 ATTCCAGCAACACAATGATTTAATCAATGCCTTCACTTTCCTAACAGTTTTTAATAAAAA 10300419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 ATTCCAGCAACACAATGATTTAATCAATGCCTTCACTTTCCTAACAGTTTTTAATAAAAA 6725

 10300420 TGATCTTTATCATATTGGGCATAACAACCTATAATATACAAATTAACCTACAATTAGGAA 10300479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 TGATCTTTATCATATTGGGCATAACAACCTATAATATACAAATTAACCTACAATTAGGAA 6785

 10300480 ATAAAACTATTCAAAAAGTTATTTCAAGGCTGGGCGCAATGGCTTAATCTCAGCGCTTTG 10300539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 ATAAAACTATTCAAAAAGTTATTTCAAGGCTGGGCGCAATGGCTTAATCTCAGCGCTTTG 6845

 10300540 GGTGGCCGAGGTGAAAGAATGGCTGAGGCCATGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATC 10300599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 GGTGGCCGAGGTGAAAGAATGGCTGAGGCCATGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATC 6905

 10300600 GCACTTCTGCAGGCATTCCAGCC 10300622
          |||||||||||||||||||||||
     6906 GCACTTCTGCAGGCATTCCAGCC 6928

Alignment time is 5.1199 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2460] =>      2460 nucs 'mol-32-3143-143174_2460'

Score:        2449
Aligned:      2460        nucs
Identic:      2459 (100%) nucs =>       927 (100%)      1532 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10293692,10294618] EXCISED REGION [10294620,10296152]
 second seq =>  [       1,     927] EXCISED REGION [     928,    2460]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10294619,10294619]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [10295362,10295362]
 second seq =>         1 nucs [1670,1670]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [10294619,10294627] to [10294620,10294628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10293692 AGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCA 10293751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCA 60

 10293752 ACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGG 10293811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGG 120

 10293812 CGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTT 10293871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTT 180

 10293872 CACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGT 10293931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGT 240

 10293932 CTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGG 10293991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGG 300

 10293992 GCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATA 10294051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATA 360

 10294052 CCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACC 10294111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACC 420

 10294112 AGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 10294171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 480

 10294172 AGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTG 10294231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTG 540

 10294232 AGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 10294291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCA 600

 10294292 ACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGC 10294351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGC 660

 10294352 TCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGA 10294411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGA 720

 10294412 GTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAG 10294471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAG 780

 10294472 CCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATT 10294531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATT 840

 10294532 ACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCT 10294591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCT 900

 10294592 GGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCG 10294618
          |||||||||||||||||||||||||||
      901 GGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCG 927

EXCISED REGION

 10294620 AAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTT 10294679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 AAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTT 987

 10294680 TGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCT 10294739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 TGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCT 1047

 10294740 GTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGAT 10294799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 GTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGAT 1107

 10294800 AGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGA 10294859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 AGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGA 1167

 10294860 TCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTT 10294919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 TCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTT 1227

 10294920 ACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTAC 10294979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 ACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTAC 1287

 10294980 AATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAG 10295039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAG 1347

 10295040 AAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGA 10295099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 AAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGA 1407

 10295100 CCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGT 10295159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 CCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGT 1467

 10295160 ACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCT 10295219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 ACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCT 1527

 10295220 AAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAA 10295279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 AAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAA 1587

 10295280 TATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGG 10295339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 TATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGG 1647

 10295340 AAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGT 10295399
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 AAAACTGGAACCAGGAAAATGGTCCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGT 1707

 10295400 CTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCAT 10295459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 CTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCAT 1767

 10295460 CATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGA 10295519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 CATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGA 1827

 10295520 AAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTC 10295579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 AAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTC 1887

 10295580 ATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCA 10295639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 ATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCA 1947

 10295640 GCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTG 10295699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTG 2007

 10295700 GCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCT 10295759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 GCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCT 2067

 10295760 TCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTT 10295819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 TCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTT 2127

 10295820 ATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAAT 10295879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 ATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAAT 2187

 10295880 CTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAG 10295939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 CTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAG 2247

 10295940 GGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAA 10295999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 GGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAA 2307

 10296000 GAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGA 10296059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 GAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGA 2367

 10296060 GGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTG 10296119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 GGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTG 2427

 10296120 AAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAG 10296152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 AAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAG 2460

Alignment time is 1.85238 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2429] =>      2429 nucs 'mol-32-3164-148276_2429'

Score:        2192
Aligned:      2433        nucs
Identic:      2407 ( 99%) nucs =>       123 (100%)      2284 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292606,10292728] EXCISED REGION [10293835,10296141]
 second seq =>  [       1,     123] EXCISED REGION [     124,    2429]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292606 GCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACC 10292665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTACC 60

 10292666 CACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAA 10292725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCAA 120

 10292726 GGA 10292728
          |||
      121 GGA 123

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      124 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 183

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 243

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 303

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      304 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 363

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 423

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 483

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      484 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 543

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      544 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 603

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 663

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 723

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      724 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 783

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 843

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      844 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 903

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 959

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1019

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1020 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1079

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1080 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1139

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1140 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1199

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1259

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1319

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1379

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1380 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1439

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1499

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1559

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1619

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1679

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1739

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1799

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1859

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1919

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 1979

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2039

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2099

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2159

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2219

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2279

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2339

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2340 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2399

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAAT 10296141
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAAT 2429

Alignment time is 1.83986 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2907] =>      2907 nucs 'mol-32-317a-016855_2907'

Score:        2647
Aligned:      2914        nucs
Identic:      2884 ( 99%) nucs =>       143 (100%)      2741 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292586,10292728] EXCISED REGION [10293835,10296602]
 second seq =>  [       1,     143] EXCISED REGION [     144,    2907]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292586 ACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCA 10292645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATATATACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCA 60

 10292646 GCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGG 10292705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGTATGCCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGG 120

 10292706 AGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 10292728
          |||||||||||||||||||||||
      121 AGTAGCAATTGCAAAACCAAGGA 143

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      144 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 203

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 263

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 323

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      324 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 383

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 443

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 503

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      504 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 563

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
      564 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 623

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 683

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 743

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      744 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 803

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 863

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      864 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 923

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 979

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 1039

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1040 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 1099

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1100 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 1159

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     1160 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 1219

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 1279

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 1339

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 1399

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1400 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 1459

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 1519

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 1579

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 1639

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 1699

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 1759

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 1819

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 1879

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 1939

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 1999

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 2059

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 2119

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 2179

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 2239

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 2299

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 2359

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2360 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 2419

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 2479

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGG 10296231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2480 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACGTAGGAGGTGG 2539

 10296232 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 10296291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 2599

 10296292 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 10296351
          ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 CATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 2656

 10296352 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 10296411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 2716

 10296412 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 10296471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 2776

 10296472 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 10296531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 2836

 10296532 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 10296591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 2896

 10296592 TGAGCAGAGTT 10296602
          |||||||||||
     2897 TGAGCAGAGTT 2907

Alignment time is 2.18455 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4691] =>      4691 nucs 'mol-32-32fb-042985_4691'

Score:        4671
Aligned:      4693        nucs
Identic:      4691 (100%) nucs =>      1689 (100%)      3002 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292930,10294618] EXCISED REGION [10294620,10297623]
 second seq =>  [       1,    1689] EXCISED REGION [    1690,    4691]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10294619,10294619]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [10294619,10294627] to [10294620,10294628]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292930 GCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTCCAAA 10292989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTTCATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTCCAAA 60

 10292990 GAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTT 10293049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGTTTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTT 120

 10293050 AGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACT 10293109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAAATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACT 180

 10293110 TTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATA 10293169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTGGTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATA 240

 10293170 AATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTT 10293229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAACTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTT 300

 10293230 TCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAA 10293289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTTCCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAA 360

 10293290 TCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGT 10293349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTAGTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGT 420

 10293350 TTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTC 10293409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATCTTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTC 480

 10293410 TATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCT 10293469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTCCTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCT 540

 10293470 ATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTC 10293529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGGACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTC 600

 10293530 TTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTC 10293589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGAGACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTC 660

 10293590 TCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTG 10293649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTG 720

 10293650 GAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTG 10293709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTG 780

 10293710 CAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCA 10293769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCA 840

 10293770 AGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGG 10293829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGG 900

 10293830 GGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTA 10293889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTA 960

 10293890 CTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCA 10293949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCA 1020

 10293950 ATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCA 10294009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCA 1080

 10294010 CCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGG 10294069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCATACCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGG 1140

 10294070 CTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGG 10294129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGG 1200

 10294130 GCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCAT 10294189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCAT 1260

 10294190 GTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGC 10294249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGC 1320

 10294250 TGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTC 10294309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTC 1380

 10294310 TTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAG 10294369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAAAATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAG 1440

 10294370 CACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCC 10294429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCC 1500

 10294430 AACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACAT 10294489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACAT 1560

 10294490 GCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACA 10294549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACA 1620

 10294550 GAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACT 10294609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACT 1680

 10294610 CCGTCTCCG 10294618
          |||||||||
     1681 CCGTCTCCG 1689

EXCISED REGION

 10294620 AAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTT 10294679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 AAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTT 1749

 10294680 TGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCT 10294739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCT 1809

 10294740 GTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGAT 10294799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 GTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGAT 1869

 10294800 AGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGA 10294859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 AGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGA 1929

 10294860 TCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTT 10294919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTT 1989

 10294920 ACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTAC 10294979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 ACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTAC 2049

 10294980 AATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAG 10295039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 AATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAG 2109

 10295040 AAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGA 10295099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 AAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGA 2169

 10295100 CCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGT 10295159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 CCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGT 2229

 10295160 ACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCT 10295219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 ACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCT 2289

 10295220 AAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAA 10295279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 AAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAA 2349

 10295280 TATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGG 10295339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGG 2409

 10295340 AAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGT 10295399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 AAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGT 2469

 10295400 CTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCAT 10295459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 CTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCAT 2529

 10295460 CATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGA 10295519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 CATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGA 2589

 10295520 AAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTC 10295579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 AAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTC 2649

 10295580 ATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCA 10295639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 ATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCA 2709

 10295640 GCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTG 10295699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 GCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTG 2769

 10295700 GCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCT 10295759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 GCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCT 2829

 10295760 TCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTT 10295819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 TCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTT 2889

 10295820 ATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAAT 10295879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 ATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAAT 2949

 10295880 CTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAG 10295939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 CTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAG 3009

 10295940 GGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAA 10295999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 GGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAA 3069

 10296000 GAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGA 10296059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGA 3129

 10296060 GGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTG 10296119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 GGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTG 3189

 10296120 AAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCTGTAAT 10296179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 AAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCTGTAAT 3249

 10296180 CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGATTGCA 10296239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGATTGCA 3309

 10296240 GTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAA 10296299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 GTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAA 3369

 10296300 AAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAAACAAATTC 10296359
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 AAAAAAAAAAAAAAAA-AAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAAACAAATTC 3428

 10296360 ATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTTCTGTAATG 10296419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 ATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTTCTGTAATG 3488

 10296420 CTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCACAGGCACG 10296479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCACAGGCACG 3548

 10296480 TCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATGCAGCAGAA 10296539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 TCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATGCAGCAGAA 3608

 10296540 CCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGATGAGCAGA 10296599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 CCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGATGAGCAGA 3668

 10296600 GTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAGTCCAGAAA 10296659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 GTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAGTCCAGAAA 3728

 10296660 CTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTATAGAGAAA 10296719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 CTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTATAGAGAAA 3788

 10296720 GGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGACAATCAAT 10296779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 GGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGACAATCAAT 3848

 10296780 CTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCAAGGTGTTA 10296839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 CTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCAAGGTGTTA 3908

 10296840 CCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTTAGTGGCAA 10296899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 CCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTTAGTGGCAA 3968

 10296900 AACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTGACGGGTAT 10296959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 AACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTGACGGGTAT 4028

 10296960 GACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATTTTAAGTTA 10297019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 GACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATTTTAAGTTA 4088

 10297020 TTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACAGTAAAATA 10297079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 TTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACAGTAAAATA 4148

 10297080 CATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATTAACTTGTA 10297139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 CATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATTAACTTGTA 4208

 10297140 TTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCCCAATCCTC 10297199
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     4209 TTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTT-AAAAAAAAAAAAAAAGTATCCCAATCCTC 4267

 10297200 CTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATACACTAGAAG 10297259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 CTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATACACTAGAAG 4327

 10297260 GAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAATATTTTAAC 10297319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 GAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAATATTTTAAC 4387

 10297320 AAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTCTACTAGGT 10297379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 AAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTCTACTAGGT 4447

 10297380 GACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATGTGATGTTTCATTGCTGTCTCT 10297439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATGTGATGTTTCATTGCTGTCTCT 4507

 10297440 AAATTTATGTGGTATTCATAACACTACAGATTACAACATGCTATACAGGTTTCAACATTT 10297499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 AAATTTATGTGGTATTCATAACACTACAGATTACAACATGCTATACAGGTTTCAACATTT 4567

 10297500 GAAAATTCTCTGGAGTTGTAATCATAGTTAAAAGCAAAGCATTAAATTCAAGAAGCTTGA 10297559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 GAAAATTCTCTGGAGTTGTAATCATAGTTAAAAGCAAAGCATTAAATTCAAGAAGCTTGA 4627

 10297560 AAAAAAGCAATGTTTTCTGAGAATGATCTTTTAACAGTGGTCAATTTGCATAGTTTTTTA 10297619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 AAAAAAGCAATGTTTTCTGAGAATGATCTTTTAACAGTGGTCAATTTGCATAGTTTTTTA 4687

 10297620 CTTT 10297623
          ||||
     4688 CTTT 4691

Alignment time is 3.49048 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3089] =>      3089 nucs 'mol-32-3395-168259_3089'

Score:        3089
Aligned:      3089        nucs
Identic:      3089 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10293130,10296218]
 second seq =>  [       1,    3089]

 10293130 TTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAACTTCCAGGAACAACA 10293189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAACTTCCAGGAACAACA 60

 10293190 GTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACA 10293249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTTCCTAAAATGTAAACA 120

 10293250 TCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTAGTAACTCACTTATGA 10293309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTAGTAACTCACTTATGA 180

 10293310 AAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATCTTATGTATAAAAGTA 10293369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATCTTATGTATAAAAGTA 240

 10293370 CTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTC 10293429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTCCTTCACCCAGTTTTC 300

 10293430 TCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGGACCAGGCCACAGGAA 10293489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGGACCAGGCCACAGGAA 360

 10293490 AGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCA 10293549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAGACTTGAAGGCAGTCA 420

 10293550 TTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAA 10293609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAA 480

 10293610 GCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCA 10293669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCA 540

 10293670 TCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTG 10293729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTG 600

 10293730 ATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCG 10293789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCG 660

 10293790 CTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTC 10293849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTC 720

 10293850 TTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGT 10293909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGT 780

 10293910 TACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAG 10293969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAG 840

 10293970 CCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAAT 10294029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAAT 900

 10294030 TATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGC 10294089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGC 960

 10294090 ACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGT 10294149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGT 1020

 10294150 CTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTAC 10294209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTAC 1080

 10294210 TTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATA 10294269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATA 1140

 10294270 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATA 10294329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATA 1200

 10294330 ATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTG 10294389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTG 1260

 10294390 GACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCT 10294449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCT 1320

 10294450 CTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTG 10294509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTG 1380

 10294510 TGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 10294569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 1440

 10294570 TCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAAT 10294629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAAT 1500

 10294630 AAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGT 10294689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGT 1560

 10294690 AAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAATTAT 10294749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAATTAT 1620

 10294750 TAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCT 10294809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCT 1680

 10294810 TTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTT 10294869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTT 1740

 10294870 TTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAAT 10294929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAAT 1800

 10294930 AAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAA 10294989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAA 1860

 10294990 TTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGA 10295049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGA 1920

 10295050 AAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCT 10295109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCT 1980

 10295110 AGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAA 10295169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAA 2040

 10295170 AGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAAT 10295229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAAT 2100

 10295230 GTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGA 10295289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGA 2160

 10295290 AGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAA 10295349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAA 2220

 10295350 CCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCA 10295409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCA 2280

 10295410 TCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATGATGG 10295469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATGATGG 2340

 10295470 CAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAA 10295529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAA 2400

 10295530 ACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTT 10295589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTT 2460

 10295590 TATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAA 10295649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAA 2520

 10295650 GTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATG 10295709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATG 2580

 10295710 AGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAG 10295769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAG 2640

 10295770 AGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAA 10295829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAA 2700

 10295830 TTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGAT 10295889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGAT 2760

 10295890 ATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTT 10295949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTT 2820

 10295950 TATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATA 10296009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATA 2880

 10296010 AAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCA 10296069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCA 2940

 10296070 GACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACACTGTC 10296129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACACTGTC 3000

 10296130 TCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACT 10296189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACT 3060

 10296190 CAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA 10296218
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA 3089

Alignment time is 1.96753 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    3499] =>      3499 nucs 'mol-32-3403-064768_3499'

Score:        3499
Aligned:      3499        nucs
Identic:      3499 (100%) nucs =>      2741 (100%)       758 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10293557,10296297] EXCISED REGION [10296299,10297056]
 second seq =>  [       1,    2741] EXCISED REGION [    2742,    3499]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10296298,10296298]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [10296298,10296314] to [10296299,10296315]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10293557 CTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGG 10293616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCGAGTCTTCAGAGTAAAGCACAGG 60

 10293617 ATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGC 10293676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACACCCACCAGCAGGGCATCCTTGC 120

 10293677 AGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCT 10293736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCTGCCTGAGAGACCTTGATCCTCT 180

 10293737 CCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCC 10293796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGCTGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCC 240

 10293797 CGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGA 10293856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTGCAGCAATCTTGATTCTTTAGGA 300

 10293857 GAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCAC 10293916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTACTTGCTAGTTACCAGTTACTCAC 360

 10293917 ACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAG 10293976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAACTTCAAACCTCATGAGCCACAAG 420

 10293977 TACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCAT 10294036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATACCATTTCTTTAAAATTATTCAT 480

 10294037 TAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCA 10294096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTACGCCTGTAATCCCAGCACTACCA 540

 10294097 AAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACT 10294156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAACACGGCAAAACCCCGTCTCTACT 600

 10294157 AAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAG 10294216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAG 660

 10294217 GCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGC 10294276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAGTGGGCTGTGATGATACCACTGC 720

 10294277 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACAT 10294336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAAATAATAATAATAATAATAACAT 780

 10294337 GCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGAT 10294396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGAT 840

 10294397 CACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAA 10294456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACATGGTAAAACCTCATCTCTACTAA 900

 10294457 TAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGC 10294516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGC 960

 10294517 TGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCC 10294576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCC 1020

 10294577 ACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAA 10294636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAA 1080

 10294637 TAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGA 10294696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGA 1140

 10294697 AGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGA 10294756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGA 1200

 10294757 AAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAA 10294816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAA 1260

 10294817 ATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAAC 10294876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAAC 1320

 10294877 TCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATT 10294936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCATGCTTACTAAGTAATAAAAATT 1380

 10294937 GTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAA 10294996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAGACTACAATGAATCAATTAAAAA 1440

 10294997 TAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATA 10295056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATA 1500

 10295057 AAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAAC 10295116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGTTATGACCATGTTTCTAGGTAAC 1560

 10295117 ATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTC 10295176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAACAGGTACAAAAACAAAGATGTC 1620

 10295177 CCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAG 10295236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAG 1680

 10295237 ACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAG 10295296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAATGGAATATCTCCTGAAGCATAG 1740

 10295297 CCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAA 10295356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAA 1800

 10295357 AATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGG 10295416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGG 1860

 10295417 CCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATGATGGCAGACCA 10295476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACCTTCATCATATGATGGCAGACCA 1920

 10295477 CAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAAACTATAC 10295536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAGACTGAAAAGGAGGAAACTATAC 1980

 10295537 CTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTT 10295596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTT 2040

 10295597 AACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAA 10295656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAA 2100

 10295657 TGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATGAGATCAC 10295716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAAAAGTGGCACTCCATGAGATCAC 2160

 10295717 TGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGG 10295776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGG 2220

 10295777 CGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAA 10295836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAA 2280

 10295837 GTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGATATGTACT 10295896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGACAAAATCTGAAGAGATATGTACT 2340

 10295897 ACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAG 10295956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAG 2400

 10295957 GGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTC 10296016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTC 2460

 10296017 AGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGAT 10296076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGAT 2520

 10296077 CACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACACTGTCTCTACTA 10296136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACACTGTCTCTACTA 2580

 10296137 ATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 10296196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 2640

 10296197 CTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGC 10296256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGC 2700

 10296257 CACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTC 10296297
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTC 2741

EXCISED REGION

 10296299 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAAACAAATT 10296358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAAACAAATT 2801

 10296359 CATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTTCTGTAAT 10296418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 CATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTTCTGTAAT 2861

 10296419 GCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCACAGGCAC 10296478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 GCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCACAGGCAC 2921

 10296479 GTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATGCAGCAGA 10296538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 GTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATGCAGCAGA 2981

 10296539 ACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGATGAGCAG 10296598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 ACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGATGAGCAG 3041

 10296599 AGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAGTCCAGAA 10296658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 AGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAGTCCAGAA 3101

 10296659 ACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTATAGAGAA 10296718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 ACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTATAGAGAA 3161

 10296719 AGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGACAATCAA 10296778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 AGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGACAATCAA 3221

 10296779 TCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCAAGGTGTT 10296838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 TCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCAAGGTGTT 3281

 10296839 ACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTTAGTGGCA 10296898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 ACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTTAGTGGCA 3341

 10296899 AAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTGACGGGTA 10296958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 AAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTGACGGGTA 3401

 10296959 TGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATTTTAAGTT 10297018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 TGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATTTTAAGTT 3461

 10297019 ATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTG 10297056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 ATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTG 3499

Alignment time is 2.58392 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    8908] =>      8908 nucs 'mol-32-34a8-023669_8908'

Score:        8437
Aligned:      8923        nucs
Identic:      8860 ( 99%) nucs =>      2110 (100%)      6750 ( 99%)
Gaps:           30 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10290614,10292728] EXCISED REGION [10293835,10300627]
 second seq =>  [       1,    2112] EXCISED REGION [    2113,    8908]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1106 nucs [10292729,10293834]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [10292729,10292746] to [10293835,10293852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10290614 AGTATAAACTGACACATCTTTCTGCAAGGCATTTTAGCAATATACCTCAAAACTATTCAA 10290673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTATAAACTGACACATCTTTCTGCAAGGCATTTTAGCAATATACCTCAAAACTATTCAA 60

 10290674 AATGTTCTTTTGGCTTTCAGAAACAGCTGGAACCAGAAGTTTAGATAATGTTTCCAGAGC 10290733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGTTCTTTTGGCTTTCAGAAACAGCTGGAACCAGAAGTTTAGATAATGTTTCCAGAGC 120

 10290734 TATGTCTGTCTTTTCATTTTTTGACTATCCTTGCCTCAGCTTGTGTTCAATACTCAGAGA 10290793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGTCTGTCTTTTCATTTTTTGACTATCCTTGCCTCAGCTTGTGTTCAATACTCAGAGA 180

 10290794 CTCTCTAAACACAGTAAGGAAAACACACACTGGCAGCCTCAACTTAATCACAGTATCTTA 10290853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTCTAAACACAGTAAGGAAAACACACACTGGCAGCCTCAACTTAATCACAGTATCTTA 240

 10290854 CCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGCCAGTTTGTTCCAAAAGAAAACACCCA 10290913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGCCAGTTTGTTCCAAAAGAAAACACCCA 300

 10290914 AGCTCTAACCGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAGGGTAACTAGGACTGAAACTTTCCCTG 10290973
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTCTAACTGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAGGGTAACTAGGACTGAAACTTTCCCTG 360

 10290974 GAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAGGAAGGGATGCCAGGAAGAAAATTCAC 10291033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAGGAAGGGATGCCAGGAAGAAAATTCAC 420

 10291034 ATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCGGCAGTTCCATTTCTATGATGAAAATG 10291093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCGGCAGTTCCATTTCTATGATGAAAATG 480

 10291094 TGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTACTTTACATGAAATAACTCATTTAATCT 10291153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTACTTTACATGAAATAACTCATTTAATCT 540

 10291154 TCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTTACTATTATCCAATTTTATGAATGCAG 10291213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTTACTATTATCCAATTTTATGAATGCAG 600

 10291214 AAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAAAGCCAGAACTACTAGGAGGCAAAACC 10291273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAAAGCCAGAACTACTAGGAGGCAAAACC 660

 10291274 AAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCACACTTTATCTATTTTTGTAGAAATGG 10291333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCACACTTTATCTATTTTTGTAGAAATGG 720

 10291334 GGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTAGTGCAATCATAGCTCACTGGAACCTC 10291393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTAGTGCAATCATAGCTCACTGGAACCTC 780

 10291394 AAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAACTTGCTGGGATTACAGGA 10291453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAACTTGCTGGGATTACAGGA 840

 10291454 GTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCTAACTTTTCTACTACTAAAATTTACTG 10291513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCTAACTTTTCTACTACTAAAATTTACTG 900

 10291514 CCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAATGCAAAAATCTGGCTAGAACAATTCA 10291573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAATGCAAAAATCTGGCTAGAACAATTCA 960

 10291574 TCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAAATAACAAAATTATCTAACCATGAGAT 10291633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAAATAACAAAATTATCTAACCATGAGAT 1020

 10291634 TAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATATTAAAATGATAAAAACATTTTGTAGTT 10291693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATATTAAAATGATAAAAACATTTTGTAGTT 1080

 10291694 AATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAAGTTGTCCCTGGAATAACTCAAGGGTT 10291753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAAGTTGTCCCTGGAATAACTCAAGGGTT 1140

 10291754 AGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTACATATAACTTATGACTCCCCAAAAAAC 10291813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTACATATAACTTATGACTCCCCAAAAAAC 1200

 10291814 TTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCCTTACAGATAACATAAATGGTAGATTA 10291873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCCTTACAGATAACATAAATGGTAGATTA 1260

 10291874 ATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAATGTATTCTACAATAAAGCAGACTAGA 10291933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAATGTATTCTACAATAAAGCAGACTAGA 1320

 10291934 GAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAAACACAGTTACTATTAAGTGGAAGCAG 10291993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAAACACAGTTACTATTAAGTGGAAGCAG 1380

 10291994 ATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCATGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAGGAAG 10292053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCATGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAGGAAG 1440

 10292054 AGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCAGAGGCAGAAAAAAATGTGTATAAGTG 10292113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCAGAGGCAGAAAAAAATGTGTATAAGTG 1500

 10292114 GACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAGTCAACTGTATATAGAACATGGAAAGC 10292173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAGTCAACTGTATATAGAACATGGAAAGC 1560

 10292174 TTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACAGCTTATATAAATGGATAGATGCTATA 10292233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACAGCTTATATAAATGGATAGATGCTATA 1620

 10292234 AACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 10292293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 1680

 10292294 ACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGATTGAGACCATTGTGGCTAA 10292353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGATTGAGACCATTGTGGCTAA 1740

 10292354 CACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTTAGCCAAGCCTGGTGGCGGG 10292413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTTAGCCAAGCCTGGTGGCGGG 1800

 10292414 GGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 10292473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 1860

 10292474 GGACCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 10292533
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 1920

 10292534 TCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATAT 10292593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA---GTAGTAAAATTAATTATACATATAT 1977

 10292594 ACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATG 10292653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ACGTATATGGATGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATG 2037

 10292654 CCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAA 10292713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CCACTTCTTACCCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAA 2097

 10292714 TTGCAAAACCAAGGA 10292728
          |||||||||||||||
     2098 TTGCAAAACCAAGGA 2112

EXCISED REGION

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2113 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAT 2172

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 2232

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 2292

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2293 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTCAC 2352

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 2412

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 2472

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2473 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTCGGAAGCAGAGGCTGCAG 2532

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAA- 10294313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
     2533 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 2592

 10294314 --AATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 10294371
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 ATAATAATAATAATAATAATAACATGTCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCA 2652

 10294372 CTTTGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 10294431
          ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 CTTTGGGAGGCCGAGGTGGACGGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAA 2712

 10294432 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGC 10294491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2713 CATGGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCATGC 2772

 10294492 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 10294551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 CTGTAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGA 2832

 10294552 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCC 10294611
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2833 GGTTGCAGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGTTGACAGAGTGAGACTCC 2892

 10294612 GTCTCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 10294671
          |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 GTCTCCG----AAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTG 2948

 10294672 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 10294731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 AGCCTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTA 3008

 10294732 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATG 10294791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3009 ATTATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTATACAAAAGGGAGTCAAATG 3068

 10294792 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCA 10294851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3069 AAAGGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCAGAAGTTAAATCA 3128

 10294852 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACAT 10294911
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
     3129 GCCCAGGATCTAGATGTTTTTGAATTCGAATTACTTTTTTTTAAAAAATTCCTTCAACAT 3188

 10294912 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 10294971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TCATGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAA 3248

 10294972 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 10295031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AAGACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTT 3308

 10295032 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 10295091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TCTTTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAA 3368

 10295092 TGTTATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGC 10295151
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3369 TGTTATGACCACGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCACGGGTGGC 3428

 10295152 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 10295211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 AAACAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTT 3488

 10295212 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 10295271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CTTGTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAG 3548

 10295272 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 10295331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 AAATGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACAT 3608

 10295332 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 10295391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TTGGATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGG 3668

 10295392 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 10295451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 TTGTCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATG 3728

 10295452 ACCTTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 10295511
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 ACCTTCATCATATGACGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTA 3788

 10295512 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 10295571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 CAGACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCT 3848

 10295572 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 10295631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 CTGGTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCT 3908

 10295632 TTGCCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 10295691
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 TTGCCTCAGCAAATAAAAGGATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAG 3968

 10295692 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 10295751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 AAAAAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAG 4028

 10295752 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 10295811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 CCAATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGT 4088

 10295812 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 10295871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 TTCATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGT 4148

 10295872 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 10295931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 GACAAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAA 4208

 10295932 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 10295991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 AATTACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCAT 4268

 10295992 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 10296051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 TTTATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCA 4328

 10296052 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 10296111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4329 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCA 4388

 10296112 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 10296171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 ACATAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCA 4448

 10296172 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGG 10296231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4449 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACGTAGGAGGTGG 4508

 10296232 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 10296291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 AGATTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTC 4568

 10296292 CATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 10296351
          ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 CATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGAA 4625

 10296352 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 10296411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 ACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTTT 4685

 10296412 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 10296471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 CTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGCA 4745

 10296472 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 10296531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 CAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATATG 4805

 10296532 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 10296591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 CAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAGA 4865

 10296592 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 10296651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 TGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCAG 4925

 10296652 TCCAGAAACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 10296711
          |.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 TTCAGAAACTAAGTCTATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTTA 4985

 10296712 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAGA 10296771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4986 TAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAGAGAGAGAACACCAGA 5045

 10296772 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 10296831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 CAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCCA 5105

 10296832 AGGTGTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 10296891
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 AGGTCTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTTT 5165

 10296892 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 10296951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 AGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTTG 5225

 10296952 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 10297011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 ACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATATT 5285

 10297012 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 10297071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 TTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATACTGTTTTACTATTCGTGTTCTTAGTTTCTACA 5345

 10297072 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 10297131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 GTAAAATACATGTATACCTTACAAAACTAAAATTGCTTTTTACTTACATGACTTTTCATT 5405

 10297132 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 10297191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5406 AACTTGTATTCTACGGTTTAACATTCTTTCATTAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAGTATCC 5465

 10297192 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 10297251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5466 CAATCCTCCTCATTTCCAAGGCTGCAACAGAATCTTAAAACAAAACAAAAAAACCAATAC 5525

 10297252 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 10297311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5526 ACTAGAAGGAGTAAAACAAAAACTGCTTCTTGGGGAACAATTCATTGTTTCAAAATAAAT 5585

 10297312 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 10297371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5586 ATTTTAACAAAAAATTCTATAGGCTCTATCCATTTTTAATCATACCTACCAGTGAGAGTC 5645

 10297372 TACTAGGTGACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATGTGATGTTTCATTG 10297431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5646 TACTAGGTGACTTCTTAAGTCAACATTTAAGAGTGGGGAAAAAAATGTGATGTTTCATTG 5705

 10297432 CTGTCTCTAAATTTATGTGGTATTCATAACACTACAGATTACAACATGCTATACAGGTTT 10297491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5706 CTGTCTCTAAATTTATGTGGTATTCATAACACTACAGATTACAACATGCTATACAGGTTT 5765

 10297492 CAACATTTGAAAATTCTCTGGAGTTGTAATCATAGTTAAAAGCAAAGCATTAAATTCAAG 10297551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5766 CAACATTTGAAAATTCTCTGGAGTTGTAATCATAGTTAAAAGCAAAGCATTAAATTCAAG 5825

 10297552 AAGCTTGAAAAAAAGCAATGTTTTCTGAGAATGATCTTTTAACAGTGGTCAATTTGCATA 10297611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5826 AAGCTTGAAAAAAAGCAATGTTTTCTGAGAATGATCTTTTAACAGTGGTCAATTTGCATA 5885

 10297612 GTTTTTTACTTTCTACAAAATACTTTACTGATGAGGGGAAAAATTATTTTCTACCATAAT 10297671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 GTTTTTTACTTTCTACAAAATACTTTACTGATGAGGGGAAAAATTATTTTCTACCATAAT 5945

 10297672 TAGGAATCTGGACTTAACCTGTTATGCCAAAAACAGCAACCATACTTTGCAACAAAAAAA 10297731
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5946 TAGGAATCCGGACTTAACCTGTTATGCCAAAAACAGCAACCATACTTTGCAACAAAAAAA 6005

 10297732 ATTTTCAAAAGCATTTTCAATCTTCCTGACTACCAAAGTTTCCACTACCAAAAGTGAAAA 10297791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6006 ATTTTCAAAAGCATTTTCAATCTTCCTGACTACCAAAGTTTCCACTACCAAAAGTGAAAA 6065

 10297792 CACTTTTAAACCTTCCTGTGTAACAAGTTTTAAATTTTCTTTTATTTATTTGTATCAATT 10297851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6066 CACTTTTAAACCTTCCTGTGTAACAAGTTTTAAATTTTCTTTTATTTATTTGTATCAATT 6125

 10297852 TTCTCACCTGTGGCTGCCAAAATATCAAGAATTTCAACTCCAGAGAAGGAGGACAGAAGA 10297911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6126 TTCTCACCTGTGGCTGCCAAAATATCAAGAATTTCAACTCCAGAGAAGGAGGACAGAAGA 6185

 10297912 AACACAATGTAAAGTGGTTGGCCTAGTAAAATAGTTGGAAAAAAAACTGTTTTGGCTGCT 10297971
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6186 AACACAATGTAAAGTGGTTGGCCTAGTAAAATAGTTGGAAAAAAACCTGTTTTGGCTGCT 6245

 10297972 CTAATATAATCTTCATTTATTACTCATTAGTTCTCTTCTTATGGTCCCAATATTCCAGCC 10298031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6246 CTAATATAATCTTCATTTATTACTCATTAGTTCTCTTCTTATGGTCCCAATATTCCAGCC 6305

 10298032 AAATTGAGAATCTACTCACTGTTTATCAATTCAGTGCCTTTGCCACTACTCATCTCCACC 10298091
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6306 AAATTGAGAATCTACTCATTGTTTATCAATTCAGTGCCTTTGCCACTACTCATCTCCACC 6365

 10298092 TCCCAGTCCCCACAATGTATTTATAGACAAAAGTTTTGATTTAAAGCCAGAAAACTGGGT 10298151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6366 TCCCAGTCCCCACAATGTATTTATAGACAAAAGTTTTGATTTAAAGCCAGAAAACTGGGT 6425

 10298152 TCAAGTTTCATTTAATCCCTTTTAATTCCATTCATGATCAGTATGAACATGGACAAATTA 10298211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6426 TCAAGTTTCATTTAATCCCTTTTAATTCCATTCATGATCAGTATGAACATGGACAAATTA 6485

 10298212 TTTTACCTTTATGCACCTTCAAGGATAACTCAGTGTAACCATGAAGAGTCAATGCAATAA 10298271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6486 TTTTACCTTTATGCACCTTCAAGGATAACTCAGTGTAACCATGAAGAGTCAATGCAATAA 6545

 10298272 TGTGAACACACTCAATTTTTTTAAATGAATGAAGATTCAATCTGATAGTCTCTGCTTGTA 10298331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6546 TGTGAACACACTCAATTTTTTTAAATGAATGAAGATTCAATCTGATAGTCTCTGCTTGTA 6605

 10298332 AAACAAGTGTATAGAGAAATGTAGGCTGTGACACTAGATCCCAAGAAAGTATCTACTGGT 10298391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 AAACAAGTGTATAGAGAAATGTAGGCTGTGACACTAGATCCCAAGAAAGTATCTACTGGT 6665

 10298392 TGTTATCAATATAATAATATGGAGAAAACAGGTGGCACTAGTAATTTAAAGTTAGAACAA 10298451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 TGTTATCAATATAATAATATGGAGAAAACAGGTGGCACTAGTAATTTAAAGTTAGAACAA 6725

 10298452 GGAACACAACACAAATTTAAGCCTTTCTTAAAACTGTGTAAAACAGGCTCGGTACAATGG 10298511
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 AGAACACAACACAAATTTAAGCCTTTCTTAAAACTGTGTAAAACAGGCTCGGTACAATGG 6785

 10298512 CTCATGCCTGTAATATCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTCCTTGAGGCCAGG 10298571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 CTCATGCCTGTAATATCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTCCTTGAGGCCAGG 6845

 10298572 GGTTCCAGGCCAGCCTGGTGAACATAGGGAGACCCCATCTCTACAAAAAACTTTAAAAAG 10298631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 GGTTCCAGGCCAGCCTGGTGAACATAGGGAGACCCCATCTCTACAAAAAACTTTAAAAAG 6905

 10298632 ATAGTGCCACTGCACTCCTGCCTGGGCAACAGAGCGAGACCCCATCTCAAAAAAAAAAAA 10298691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||
     6906 ATAGTGCCACTGCACTCCTGCCTGGGCAACAGAGCGAGACCCCATCTC----AAAAAAAA 6961

 10298692 AAAAAAAAAAAAGGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCGCTTG 10298751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6962 AAAAAAAAAAAAGGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCGCTTG 7021

 10298752 AGCCCGGGAGTTTGAGACCAGCCTAGGCATCACAAAGACTCTGTCTCT------------ 10298799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
     7022 AGCCCGGGAGTTTGAGACCAGCCTAGGCATCACAAAGACTCTGTCTCTAAACAAACAAAC 7081

 10298800 AAACAAACAAACAAAAAATCATGCAAAGCTATGTATCTGTCTTCCAAGGAATTCTGAATT 10298859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7082 AAACAAACAAACAAAAAATCATGCAAAGCTATGTATCTGTCTTCCAAGGAATTCTGAATT 7141

 10298860 TTCTACAGCTTATTTTTCAATGAAGTATTTAGAGTGGATGCTGATTTAACTTGTAATGTT 10298919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7142 TTCTACAGCTTATTTTTCAATGAAGTATTTAGAGTGGATGCTGATTTAACTTGTAATGTT 7201

 10298920 GTGGGAGTGATTCCTATTTCATATGTTTGGCTTTTTGAATAATTTTGTTTGTTGCAAAAT 10298979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7202 GTGGGAGTGATTCCTATTTCATATGTTTGGCTTTTTGAATAATTTTGTTTGTTGCAAAAT 7261

 10298980 TGTTTTTAAAAAATTAAGCCTATTTAGCACTGTTCTATCCAGATAGATTTCCTAATATTT 10299039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7262 TGTTTTTAAAAAATTAAGCCTATTTAGCACTGTTCTATCCAGATAGATTTCCTAATATTT 7321

 10299040 ACAAACTACTATTATTATAATAACTGCATGAACCATTGTGTTTGTGGTGAGTTGAATAGC 10299099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7322 ACAAACTACTATTATTATAATAACTGCATGAACCATTGTGTTTGTGGTGAGTTGAATAGC 7381

 10299100 GTTGTCCAAAAATTCACGTCCATCAGAATCTCATAATGTGACTTTATTTGGAAACAGGGT 10299159
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7382 GTTGTCCAAAAGTTCACGTCCATCAGAATCTCATAATGTGACTTTATTTGGAAACAGGGT 7441

 10299160 CTTTGCAGATATAGTTAAGGATCTTCTGATGAAAATTATCATGGATTTAGGGTGAGCCCT 10299219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7442 CTTTGCAGATATAGTTAAGGATCTTCTGATGAAAATTATCATGGATTTAGGGTGAGCCCT 7501

 10299220 AAATCCAATGATTAGCATCTTTATAAAAGAAAAGAAAGGGAGATTTGGACACAGTAACAG 10299279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7502 AAATCCAATGATTAGCATCTTTATAAAAGAAAAGAAAGGGAGATTTGGACACAGTAACAG 7561

 10299280 AGAATGCGGCCATGTGATGACAGAGAAAGAGATCAGAGTTATGCTACCACCAATCAAGGA 10299339
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     7562 AGAATGCGGCCATGTGATGACAGAGAAAGAGATCAGAGTTACGCTACCACCAATCAAGGA 7621

 10299340 GCCCCTGGGGCCACCAGATGCTGGAAGAGGGAAAGGAAGGATCCTTCCCTAAATCCTTCA 10299399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7622 GCCCCTGGGGCCACCAGATGCTGGAAGAGGGAAAGGAAGGATCCTTCCCTAAATCCTTCA 7681

 10299400 GAGAGACTGAGGCCCTCCTGTCACCTTAACTTCAGACTTCTAGTCTCCAGAATTGTGAGA 10299459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7682 GAGAGACTGAGGCCCTCCTGTCACCTTAACTTCAGACTTCTAGTCTCCAGAATTGTGAGA 7741

 10299460 GAATGGTGTTTGTTTTAAATCACGAGTTTGTAGTAATTTGTTATGGCAACCCCAAGAAAC 10299519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7742 GAATGGTGTTTGTTTTAAATCACGAGTTTGTAGTAATTTGTTATGGCAACCCCAAGAAAC 7801

 10299520 TAGCAGAGTGTTGGAGCTTAACTAAGCACTATTGTTTAAACATTTTAAAGTGAGAATTCT 10299579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7802 TAGCAGAGTGTTGGAGCTTAACTAAGCACTATTGTTTAAACATTTTAAAGTGAGAATTCT 7861

 10299580 CTGTACTTCCCTGCAATAGTATTAATTTTCCCAAAAGACCCAAACTTTTTTATCTTCTTA 10299639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7862 CTGTACTTCCCTGCAATAGTATTAATTTTCCCAAAAGACCCAAACTTTTTTATCTTCTTA 7921

 10299640 GTTAACAATCTTTTTGTTCCTATACTCTAGATCAATCTATACTGTTTGAAATTCATTTAA 10299699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7922 GTTAACAATCTTTTTGTTCCTATACTCTAGATCAATCTATACTGTTTGAAATTCATTTAA 7981

 10299700 ACTTAAGCAGTTATGTGAAATATTTCCCTAGGCAAAATTAGTTTTTAATTTTCTTTCAAG 10299759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7982 ACTTAAGCAGTTATGTGAAATATTTCCCTAGGCAAAATTAGTTTTTAATTTTCTTTCAAG 8041

 10299760 TAAACAATGAAACCTACAGCTATAACTAAAAACTTATGAAAAATTTTATGATGAAGACAT 10299819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8042 TAAACAATGAAACCTACAGCTATAACTAAAAACTTATGAAAAATTTTATGATGAAGACAT 8101

 10299820 TGATAAGTATATGGGAAAATAAAATTATCAACTTATAAAAGTTATATTTGCCTTCGCAAT 10299879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8102 TGATAAGTATATGGGAAAATAAAATTATCAACTTATAAAAGTTATATTTGCCTTCGCAAT 8161

 10299880 GTAAATTATGGTAATAACAATTTTAAATAAATAACTTTTACTCAATAAACAACTGCATAA 10299939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8162 GTAAATTATGGTAATAACAATTTTAAATAAATAACTTTTACTCAATAAACAACTGCATAA 8221

 10299940 CCAACCCCAAAAATTTCGAGAGCTCAGCAATAATAGGATATTAAATCTTATAATATTTAA 10299999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8222 CCAACCCCAAAAATTTCGAGAGCTCAGCAATAATAGGATATTAAATCTTATAATATTTAA 8281

 10300000 TGATCTCAGTTCTGACCATAATAATGTTTTAAAATTAAGAAATACTGGCAGGGCGCAGAG 10300059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8282 TGATCTCAGTTCTGACCATAATAATGTTTTAAAATTAAGAAATACTGGCAGGGCGCAGAG 8341

 10300060 GCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATTACCTGAGGTCAG 10300119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8342 GCTCATGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATTACCTGAGGTCAG 8401

 10300120 GAGTTTGAGATCAGTCCGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT 10300179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8402 GAGTTTGAGATCAGTCCGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT 8461

 10300180 ATTAGCCGGGCATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGA 10300239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8462 ATTAGCCGGGCATGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGTTGAGGCAGGA 8521

 10300240 GAATAGCTTGAATCGGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACCGAGCCCCATTGCACT 10300299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8522 GAATAGCTTGAATCGGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACCGAGCCCCATTGCACT 8581

 10300300 CCAGCCTGGGCAACAAGAACGAAACTCCATCTCAATAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATACA 10300359
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     8582 CCAGCCTGGGCAACAAGAACGAAACTCCATCTCAAT-AAAAAAAAAAAAAAAGAAATACA 8640

 10300360 ATTCCAGCAACACAATGATTTAATCAATGCCTTCACTTTCCTAACAGTTTTTAATAAAAA 10300419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 ATTCCAGCAACACAATGATTTAATCAATGCCTTCACTTTCCTAACAGTTTTTAATAAAAA 8700

 10300420 TGATCTTTATCATATTGGGCATAACAACCTATAATATACAAATTAACCTACAATTAGGAA 10300479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 TGATCTTTATCATATTGGGCATAACAACCTATAATATACAAATTAACCTACAATTAGGAA 8760

 10300480 ATAAAACTATTCAAAAAGTTATTTCAAGGCTGGGCGCAATGGCTTAATCTCAGCGCTTTG 10300539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 ATAAAACTATTCAAAAAGTTATTTCAAGGCTGGGCGCAATGGCTTAATCTCAGCGCTTTG 8820

 10300540 GGTGGCCGAGGTGAAAGAATGGCTGAGGCCATGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATC 10300599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 GGTGGCCGAGGTGAAAGAATGGCTGAGGCCATGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATC 8880

 10300600 GCACTTCTGCAGGCATTCCAGCCTGGGC 10300627
          ||||||||||||||||||||||||||||
     8881 GCACTTCTGCAGGCATTCCAGCCTGGGC 8908

Alignment time is 6.56792 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    2130] =>      2130 nucs 'mol-32-34a8-023669_2130'

Score:        2108
Aligned:      2130        nucs
Identic:      2128 (100%) nucs =>      1926 (100%)       202 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10290614,10292541] EXCISED REGION [10292545,10292746]
 second seq =>  [       1,    1928] EXCISED REGION [    1929,    2130]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [10292542,10292544]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [10292542,10292565] to [10292545,10292568]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10292542,10292542] to [10292544,10292544]
 second seq =>         0 nucs

 10290614 AGTATAAACTGACACATCTTTCTGCAAGGCATTTTAGCAATATACCTCAAAACTATTCAA 10290673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTATAAACTGACACATCTTTCTGCAAGGCATTTTAGCAATATACCTCAAAACTATTCAA 60

 10290674 AATGTTCTTTTGGCTTTCAGAAACAGCTGGAACCAGAAGTTTAGATAATGTTTCCAGAGC 10290733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGTTCTTTTGGCTTTCAGAAACAGCTGGAACCAGAAGTTTAGATAATGTTTCCAGAGC 120

 10290734 TATGTCTGTCTTTTCATTTTTTGACTATCCTTGCCTCAGCTTGTGTTCAATACTCAGAGA 10290793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGTCTGTCTTTTCATTTTTTGACTATCCTTGCCTCAGCTTGTGTTCAATACTCAGAGA 180

 10290794 CTCTCTAAACACAGTAAGGAAAACACACACTGGCAGCCTCAACTTAATCACAGTATCTTA 10290853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTCTAAACACAGTAAGGAAAACACACACTGGCAGCCTCAACTTAATCACAGTATCTTA 240

 10290854 CCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGCCAGTTTGTTCCAAAAGAAAACACCCA 10290913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTAGTCATCCTAGTGGGAAAAGATAGGCGTGCCAGTTTGTTCCAAAAGAAAACACCCA 300

 10290914 AGCTCTAACCGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAGGGTAACTAGGACTGAAACTTTCCCTG 10290973
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTCTAACTGGTCCAGCTTAAAGTAGAGGGTAGGGTAACTAGGACTGAAACTTTCCCTG 360

 10290974 GAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAGGAAGGGATGCCAGGAAGAAAATTCAC 10291033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACCGTAGAGAAAAGAAGGCATGGTTCCCAAAGGAAGGGATGCCAGGAAGAAAATTCAC 420

 10291034 ATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCGGCAGTTCCATTTCTATGATGAAAATG 10291093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATGTCCATATAAACATACATATCCTTGACCCGGCAGTTCCATTTCTATGATGAAAATG 480

 10291094 TGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTACTTTACATGAAATAACTCATTTAATCT 10291153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGCACTATTATTGTGTACCAGACACTGTTTTACTTTACATGAAATAACTCATTTAATCT 540

 10291154 TCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTTACTATTATCCAATTTTATGAATGCAG 10291213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACAACATCTCTATGAGGTAGATACTACTATTTACTATTATCCAATTTTATGAATGCAG 600

 10291214 AAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAAAGCCAGAACTACTAGGAGGCAAAACC 10291273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACTGAGACAGAAAAATTAAGTAACTTGTCTAAAGCCAGAACTACTAGGAGGCAAAACC 660

 10291274 AAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCACACTTTATCTATTTTTGTAGAAATGG 10291333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAATCAAGCTCAGACTATGTGGCTCCATCCCACACTTTATCTATTTTTGTAGAAATGG 720

 10291334 GGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTAGTGCAATCATAGCTCACTGGAACCTC 10291393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTCCCACTCTGTCACCTAGGCTAGAGTACAGTAGTGCAATCATAGCTCACTGGAACCTC 780

 10291394 AAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAACTTGCTGGGATTACAGGA 10291453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATTCCTGGTTTGAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAACTTGCTGGGATTACAGGA 840

 10291454 GTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCTAACTTTTCTACTACTAAAATTTACTG 10291513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGAGCCACCACATCTAGCTCATCCCACACTTCTAACTTTTCTACTACTAAAATTTACTG 900

 10291514 CCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAATGCAAAAATCTGGCTAGAACAATTCA 10291573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTCTCTATTTGATCCTGAGAAATTAAAAATCAATGCAAAAATCTGGCTAGAACAATTCA 960

 10291574 TCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAAATAACAAAATTATCTAACCATGAGAT 10291633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACAGCACTATTTATAACAGCAAAAATTTGGAAATAACAAAATTATCTAACCATGAGAT 1020

 10291634 TAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATATTAAAATGATAAAAACATTTTGTAGTT 10291693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAACTGATAAATTTATTTACTTTAAATTATATATTAAAATGATAAAAACATTTTGTAGTT 1080

 10291694 AATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAAGTTGTCCCTGGAATAACTCAAGGGTT 10291753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAAAAATTGATGTTATGTTTTATATATACAAAGTTGTCCCTGGAATAACTCAAGGGTT 1140

 10291754 AGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTACATATAACTTATGACTCCCCAAAAAAC 10291813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATGCACCAACCCCTGTGCAGTCAAAAATCTACATATAACTTATGACTCCCCAAAAAAC 1200

 10291814 TTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCCTTACAGATAACATAAATGGTAGATTA 10291873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTACTACTAATAGCCTACTCTTGACCAGAAGCCTTACAGATAACATAAATGGTAGATTA 1260

 10291874 ATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAATGTATTCTACAATAAAGCAGACTAGA 10291933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATACATATTGTTAATGTTTATATGTATTATATAATGTATTCTACAATAAAGCAGACTAGA 1320

 10291934 GAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAAACACAGTTACTATTAAGTGGAAGCAG 10291993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAAAGAAAATGTTATTAATAAAATCATAAGAAAACACAGTTACTATTAAGTGGAAGCAG 1380

 10291994 ATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCATGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAGGAAG 10292053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCATCACAAAGGTCTTCATCCTTATTGTCCTCATGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAGGAAG 1440

 10292054 AGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCAGAGGCAGAAAAAAATGTGTATAAGTG 10292113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGAAGGGTTATTCTTGCTGTCTCAAGGGTAGCAGAGGCAGAAAAAAATGTGTATAAGTG 1500

 10292114 GACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAGTCAACTGTATATAGAACATGGAAAGC 10292173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GACCAACGCAGTTCAAATCCATGTTGTTGAAGAGTCAACTGTATATAGAACATGGAAAGC 1560

 10292174 TTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACAGCTTATATAAATGGATAGATGCTATA 10292233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCAATAACATGCAGATAAGTTTTAAAAACACAGCTTATATAAATGGATAGATGCTATA 1620

 10292234 AACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 10292293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AACATGTTTTTAAGAAGTAAAATGAGGACGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 1680

 10292294 ACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGATTGAGACCATTGTGGCTAA 10292353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTTGGGAGGCCGAGGTAGGCGGATCACAAGATCAGGAGATTGAGACCATTGTGGCTAA 1740

 10292354 CACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTTAGCCAAGCCTGGTGGCGGG 10292413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAACGGAAAAAAGTTAGCCAAGCCTGGTGGCGGG 1800

 10292414 GGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 10292473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 1860

 10292474 GGACCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 10292533
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 1920

 10292534 TCTGTCTC 10292541
          ||||||||
     1921 TCTGTCTC 1928

EXCISED REGION

 10292545 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGA 10292604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTAAAATTAATTATACATATATACGTATATGGA 1988

 10292605 TGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTAC 10292664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TGCACACAAAAATCTCTGGAAATACATATGTTAAAATGTCAGCAGTATGCCACTTCTTAC 2048

 10292665 CCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCA 10292724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CCACTGGAGTGGTTATGATCAAAAAGACAGAATAACAAGGGAGTAGCAATTGCAAAACCA 2108

 10292725 AGGACAGCAATCTTGATTCTTT 10292746
          ||||||||||||||||||||||
     2109 AGGACAGCAATCTTGATTCTTT 2130

Alignment time is 1.57424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10282728,10303834] =>     21107 nucs '11 dna:chromosome chromosome:GRCh37:11:1:135006516:1'
Second seq [       1,    4166] =>      4166 nucs 'mol-32-34c9-010195_4166'

Score:        4165
Aligned:      4165        nucs
Identic:      4165 (100%) nucs =>      3415 (100%)       750 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10292875,10296289] EXCISED REGION [10296291,10297040]
 second seq =>  [       1,    3415] EXCISED REGION [    3417,    4166]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10296290,10296290]
 second seq =>         1 nucs [3416,3416]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [3415,3417] to [3416,3418]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10296289,10296289] to [10296291,10296291]
 second seq =>         1 nucs [3415,3415] to [3417,3417]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10292875 TAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCAAATCTGCTTC 10292934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGTACAGCCACAACTACAAAGCAGAGAAACGTAAGAATACAAAAATCAAATCTGCTTC 60

 10292935 ATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTCCAAAGAAGT 10292994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTATATACACGATGGGGCAGCCTAATGCACATCATAACATTAACTTTTCCAAAGAAGT 120

 10292995 TTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAA 10293054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCTAAGAATCTGCTCCCATAATTAGTGTTAAAAATAAAGCAATCTTCCCATTTAGAAA 180

 10293055 AATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACTTTCTG 10293114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCAAGACATCAGTTGATTAATAAAGCCTATTCTTCCTCCCAGCAATTTGTACTTTCTG 240

 10293115 GTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAA 10293174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTTCATTTAGGAATTATAAATTCATGAGAAAAGAACAAATTTTTTATGGAATAAATAA 300

 10293175 CTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTT 10293234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTCCAGGAACAACAGTTTATAAGTATTCAGTTGTTTAAATAAACAAAACTATTTTCCTT 360

 10293235 CCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTA 10293294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTAAAATGTAAACATCCAGTAAATGAAACATACATGATATTCCAGGTATAGAAATCTTA 420

 10293295 GTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATC 10293354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTAACTCACTTATGAAAGAGGTGCATTTTGGTATGTTTGGTGGTAAGGTTTTTGTTTATC 480

 10293355 TTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTC 10293414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATGTATAAAAGTACTTGCACAAAAAAACAAGCAGTTATTACTATTTAAAATTCTATTC 540

 10293415 CTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGG 10293474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCACCCAGTTTTCTCACTCAAGTAGAAACTCATGAATATCTGTGATTTTGGCTATAGG 600

 10293475 ACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAG 10293534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCAGGCCACAGGAAAGGGCTGAAATATCTCTAAAAGTTAGGTAAAAGTGTTTTCTTGAG 660

 10293535 ACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCG 10293594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTTGAAGGCAGTCATTCATCACTTTGTGCTTGAAGGCATTCCTCAGCAAACTTCTCTCG 720

 10293595 AGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACA 10293654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTCTTCAGAGTAAAGCACAGGATCTAGGCTCCCGGAAGGGGTTACTTCCAGCTGGAACA 780

 10293655 CCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCT 10293714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCACCAGCAGGGCATCCTTGCAGGCATTCTGCATACAGTACTGTTGAAGCTCTGCAGCT 840

 10293715 GCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGC 10293774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCTGAGAGACCTTGATCCTCTCCACGCCAGCCTCCAACTTGAGCTGCTCTACCAAGAGC 900

 10293775 TGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTG 10293834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCAGGGCGCTCGCGCTAGCCCCGGAGGACATGGCGGCGGCGCTGGGCTCCTAGGGGCTG 960

 10293835 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 10293894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGCAATCTTGATTCTTTAGGAGAATGACAAGTCGTTCACTGTAACTAAGGCTTACTTAC 1020

 10293895 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 10293954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCTAGTTACCAGTTACTCACACAATTTCCTTAAGTCTTGCAACAATTTCTTCAATAAC 1080

 10293955 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 10294014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCAAACCTCATGAGCCACAAGTACAAACAACCCTGGGCAAACACGGTGATTTCACCATA 1140

 10294015 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 10294074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATTTCTTTAAAATTATTCATTAAAAATAAAAAATACCAGGCCAGGCACACTGGCTTAC 1200

 10294075 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 10294134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCTGTAATCCCAGCACTACCAAAGTGCGAACTCACCAGTTCAAGACCAGCCAGGGCAAC 1260

 10294135 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 10294194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCC 1320

 10294195 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 10294254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGATTGGCTTGAGCCTGGGAAGCAGAGGCTGCAG 1380

 10294255 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 10294314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGCTGTGATGATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACCTTGTCTTAAA 1440

 10294315 ATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTT 10294374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAATAATAATAATAATAACATGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTGTAATCCCAGCACTT 1500

 10294375 TGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACAT 10294434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGAGGCCCAGGTGGACAGATCACCTGAGGTCAAGAGTTCGAGAGAGCCTGGCCAACAT 1560

 10294435 GGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTG 10294494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTAAAACCTCATCTCTACTAATAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTG 1620

 10294495 TAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGT 10294554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAATCCTAGCTACTGTGGAGGCTGAGGCAGGACAATTACTTGAACCTGGGAGACAGAGGT 1680

 10294555 TGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTC 10294614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTC 1740

 10294615 TCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGC 10294674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCGAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAATAAATAAATCCCTGGAGTGAGC 1800

 10294675 CTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATT 10294734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTTTGTAACATGTAAATAGAAGACCGTTTTTAGTTTTTGAATTATTTGATAACTAATT 1860

 10294735 ATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAA 10294794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTCTGTTTAATTATTAGTAGAAAGAACAGACCCATTGTACAAAAGGGAGTCAAATGAAA 1920

 10294795 GGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCC 10294854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGATAGGACAAGCTTTCAGAAATCATTACTTCAACTTAATTGCACAAGTTAAATCAGCC 1980

 10294855 CAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCA 10294914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGGATCTAGATGTTTTTGAACTCGAATTACTGTTTTTTAAAAAATTGCTTCAACATTCA 2040

 10294915 TGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAG 10294974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCTTACTAAGTAATAAAAATTGTATCATTATTTGTTCAGATTAAAATCAAACAGAAAAG 2100

 10294975 ACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCT 10295034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTACAATGAATCAATTAAAAATAAATATGAGCACATGCTTCTAAAGAACTTATTTTTCT 2160

 10295035 TTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGT 10295094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTAGAAGAAACAGAAAATATAAAGCTTATTTAGCTGTGCTTTGATTTGTGTATGAATGT 2220

 10295095 TATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAA 10295154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATGACCATGTTTCTAGGTAACATCAAAGTTTTGTCAATGCTAGGACCATGGGTGGCAAA 2280

 10295155 CAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTT 10295214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAGGTACAAAAACAAAGATGTCCCTTCCCACACTGCTGTATGTGTGTATCTCTTCTTCTT 2340

 10295215 GTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAA 10295274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGCTAAATTATAATGTAGCAGACCAGTTAGTGCTGTAGTTTAAGGCCTTGGATAAGAAA 2400

 10295275 TGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTG 10295334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGAATATCTCCTGAAGCATAGCCCTGATATCAATCATACAGAAAAGAAACAGACATTTG 2460

 10295335 GATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTG 10295394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATGGAAAACTGGAACCAGGAAAATGGACCTCATTAGATAGACCTGACAGGAATAGGTTG 2520

 10295395 TCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACC 10295454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTGTCTTGCCACCATCTAGGGCCTAGACTTAAGGAAACATGCTGAAAGGCAAGATGACC 2580

 10295455 TTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAG 10295514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCATCATATGATGGCAGACCACAAACTAGGCAGGGTGGAATCCCTTTAGGAGACTACAG 2640

 10295515 ACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTG 10295574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTGAAAAGGAGGAAACTATACCTTGCAAACCAGACTACTGACTTAAAAGTTATTCTCTG 2700

 10295575 GTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTG 10295634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTTCATTATCTTTTTATTTTTAACCTTTAGAAAAGTTTTATTTCACTGCTGCAGCTTTG 2760

 10295635 CCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAA 10295694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCTCAGCAAATAAAAGTATGAATGATTTGGCAGTGGGAGTTAGGCCAGAATGTTAAGAAA 2820

 10295695 AAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCA 10295754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGTGGCACTCCATGAGATCACTGGAGAAATAGAAGAACTGGAGCTTTGAGTTCAAGCCA 2880

 10295755 ATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTC 10295814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATCCTTCCCATACAGAGGCAGGCGCTCCTTCCGCTGTCAACCTTGGAGGACTAGGGTTTC 2940

 10295815 ATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGAC 10295874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTTTATTAAGAGAATTTTAAAGTTTCTGTTCAGGTACCTAGAACTAAATTCATCGTGAC 3000

 10295875 AAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAAT 10295934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAATCTGAAGAGATATGTACTACATTCAAGAGTCAGCAGGTTTCTGTAGTGTTTAAAAT 3060

 10295935 TACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTT 10295994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TACAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGTTTCATTTTATTAAGAGAATTAGAAAGTTTCATTTT 3120

 10295995 ATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTT 10296054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTAAGAGAATTATAAAGTTTCAGCCAGAGTAGTCGCTCACGCCTATAATCCCATCACTT 3180

 10296055 TGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACA 10296114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGGGAGGCCGAGGCAGACGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACA 3240

 10296115 TAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCT 10296174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAGTGAAACACTGTCTCTACTAATAATACAAAAATGAGCTGGGAGTGGTGGTGGGCACCT 3300

 10296175 GTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGA 10296234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGA 3360

 10296235 TTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGAC 10296289
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGAC 3415

EXCISED REGION

 10296291 CCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGA 10296350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAATTAGAAAGTTTCTGTTCAAGTACCTAGA 3476

 10296351 AACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTT 10296410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 AACAAATTCATTGTGATAAGATCTGTAGAGCTATGTACTACATTCAAGAGTCTGCAAGTT 3536

 10296411 TCTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGC 10296470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TCTGTAATGCTTAAAATTTTTAACAAGTATGTATTACTACTGTAAGTAAAACAGTTTAGC 3596

 10296471 ACAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATAT 10296530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 ACAGGCACGTCAGTGGAAGCAATATGCAAATGAATATGCAGAAGCATGCACCAGAAATAT 3656

 10296531 GCAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAG 10296590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GCAGCAGAACCACCACCATCCTGGTTATGAATTAAAAGTAAAAACTGGGTAGAAAAATAG 3716

 10296591 ATGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCA 10296650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 ATGAGCAGAGTTTCCAAATCACATGGACACCTGAACTCAATAGCCAGGGAGAAAGGATCA 3776

 10296651 GTCCAGAAACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTT 10296710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GTCCAGAAACTAAGTCCATAAGGAGGTAAAGTCAAATGTGAGTAAAACAAAACACAGTTT 3836

 10296711 ATAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAG 10296770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 ATAGAGAAAGGAGACCGAGAAAAGAGAGAGAAGAGAAAAAAAAGAAAGAGAGAACACCAG 3896

 10296771 ACAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCC 10296830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 ACAATCAATCTGAAAGCAAAGGCAATTAACCTGGTTCCTTTGAGAGCCAGAACTTTTCCC 3956

 10296831 AAGGTGTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTT 10296890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AAGGTGTTACCCCCATTTGTGCTTGTAACTATAAAAGCACAATATGGCTTTAAAAGTCTT 4016

 10296891 TAGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTT 10296950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TAGTGGCAAAACTCTAAATTCTAAGACCAAAGTATATTTGATTCTCTGTTGGAGCATCTT 4076

 10296951 GACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATAT 10297010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GACGGGTATGACACCCATCTCCGCATGACTTCCTACTTACACAAGATAAAACTAAAATAT 4136

 10297011 TTTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATAC 10297040
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TTTAAGTTATTTGTAGGATGTACTGAATAC 4166

Alignment time is 3.08648 s

